##fileformat=VCFv4.2
##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
##FORMAT=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele fractions of alternate alleles in the tumor">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth (reads with MQ=255 or with bad mates are filtered)">
##FORMAT=<ID=F1R2,Number=R,Type=Integer,Description="Count of reads in F1R2 pair orientation supporting each allele">
##FORMAT=<ID=F2R1,Number=R,Type=Integer,Description="Count of reads in F2R1 pair orientation supporting each allele">
##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##FORMAT=<ID=PGT,Number=1,Type=String,Description="Physical phasing haplotype information, describing how the alternate alleles are phased in relation to one another">
##FORMAT=<ID=PID,Number=1,Type=String,Description="Physical phasing ID information, where each unique ID within a given sample (but not across samples) connects records within a phasing group">
##FORMAT=<ID=PL,Number=G,Type=Integer,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for genotypes as defined in the VCF specification">
##FORMAT=<ID=PS,Number=1,Type=Integer,Description="Phasing set (typically the position of the first variant in the set)">
##FORMAT=<ID=SB,Number=4,Type=Integer,Description="Per-sample component statistics which comprise the Fisher's Exact Test to detect strand bias.">
##GATKCommandLine=<ID=Mutect2,CommandLine="Mutect2  --tumor-sample CAN2_R --panel-of-normals /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Refseq/HPON.vcf --output /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/08_variant_calling/mutect2/CAN2_R.vcf --max-reads-per-alignment-start 500 --activity-profile-out CAN2_R_activity_profile --assembly-region-out CAN2_R_assembly_region --intervals /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Refseq/seqCap_VCRome_V2_intervals_list.intervals --interval-set-rule UNION --interval-padding 100 --interval-exclusion-padding 0 --interval-merging-rule ALL --input /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/07_BQSR/BQSR/CAN2_R.bam --read-validation-stringency SILENT --reference /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Reference_genome/ucsc.hg19.fasta  --f1r2-median-mq 50 --f1r2-min-bq 20 --f1r2-max-depth 200 --genotype-pon-sites false --genotype-germline-sites false --af-of-alleles-not-in-resource -1.0 --mitochondria-mode false --tumor-lod-to-emit 3.0 --initial-tumor-lod 2.0 --pcr-snv-qual 40 --pcr-indel-qual 40 --max-population-af 0.01 --downsampling-stride 1 --callable-depth 10 --max-suspicious-reads-per-alignment-start 0 --normal-lod 2.2 --ignore-itr-artifacts false --gvcf-lod-band -2.5 --gvcf-lod-band -2.0 --gvcf-lod-band -1.5 --gvcf-lod-band -1.0 --gvcf-lod-band -0.5 --gvcf-lod-band 0.0 --gvcf-lod-band 0.5 --gvcf-lod-band 1.0 --minimum-allele-fraction 0.0 --genotype-filtered-alleles false --disable-adaptive-pruning false --dont-trim-active-regions false --max-disc-ar-extension 25 --max-gga-ar-extension 300 --padding-around-indels 150 --padding-around-snps 20 --kmer-size 10 --kmer-size 25 --dont-increase-kmer-sizes-for-cycles false --allow-non-unique-kmers-in-ref false --num-pruning-samples 1 --min-dangling-branch-length 4 --recover-all-dangling-branches false --max-num-haplotypes-in-population 128 --min-pruning 2 --adaptive-pruning-initial-error-rate 0.001 --pruning-lod-threshold 2.302585092994046 --max-unpruned-variants 100 --debug-assembly false --debug-graph-transformations false --capture-assembly-failure-bam false --error-correct-reads false --kmer-length-for-read-error-correction 25 --min-observations-for-kmer-to-be-solid 20 --likelihood-calculation-engine PairHMM --base-quality-score-threshold 18 --pair-hmm-gap-continuation-penalty 10 --pair-hmm-implementation FASTEST_AVAILABLE --pcr-indel-model CONSERVATIVE --phred-scaled-global-read-mismapping-rate 45 --native-pair-hmm-threads 4 --native-pair-hmm-use-double-precision false --bam-writer-type CALLED_HAPLOTYPES --dont-use-soft-clipped-bases false --min-base-quality-score 10 --smith-waterman JAVA --emit-ref-confidence NONE --max-mnp-distance 1 --min-assembly-region-size 50 --max-assembly-region-size 300 --assembly-region-padding 100 --active-probability-threshold 0.002 --max-prob-propagation-distance 50 --force-active false --seconds-between-progress-updates 10.0 --disable-sequence-dictionary-validation false --create-output-bam-index true --create-output-bam-md5 false --create-output-variant-index true --create-output-variant-md5 false --lenient false --add-output-sam-program-record true --add-output-vcf-command-line true --cloud-prefetch-buffer 40 --cloud-index-prefetch-buffer -1 --disable-bam-index-caching false --sites-only-vcf-output false --help false --version false --showHidden false --verbosity INFO --QUIET false --use-jdk-deflater false --use-jdk-inflater false --gcs-max-retries 20 --gcs-project-for-requester-pays  --disable-tool-default-read-filters false --max-read-length 2147483647 --min-read-length 30 --minimum-mapping-quality 20 --disable-tool-default-annotations false --enable-all-annotations false",Version="4.1.2.0",Date="March 1, 2022 4:34:34 PM CET">
##INFO=<ID=CONTQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled qualities that alt allele are not due to contamination">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth; some reads may have been filtered">
##INFO=<ID=ECNT,Number=1,Type=Integer,Description="Number of events in this haplotype">
##INFO=<ID=GERMQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles are not germline variants">
##INFO=<ID=MBQ,Number=R,Type=Integer,Description="median base quality">
##INFO=<ID=MFRL,Number=R,Type=Integer,Description="median fragment length">
##INFO=<ID=MMQ,Number=R,Type=Integer,Description="median mapping quality">
##INFO=<ID=MPOS,Number=A,Type=Integer,Description="median distance from end of read">
##INFO=<ID=NALOD,Number=A,Type=Float,Description="Negative log 10 odds of artifact in normal with same allele fraction as tumor">
##INFO=<ID=NCount,Number=1,Type=Integer,Description="Count of N bases in the pileup">
##INFO=<ID=NLOD,Number=A,Type=Float,Description="Normal log 10 likelihood ratio of diploid het or hom alt genotypes">
##INFO=<ID=OCM,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alt reads whose original alignment doesn't match the current contig.">
##INFO=<ID=PON,Number=0,Type=Flag,Description="site found in panel of normals">
##INFO=<ID=POPAF,Number=A,Type=Float,Description="negative log 10 population allele frequencies of alt alleles">
##INFO=<ID=ROQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled qualities that alt allele are not due to read orientation artifact">
##INFO=<ID=RPA,Number=.,Type=Integer,Description="Number of times tandem repeat unit is repeated, for each allele (including reference)">
##INFO=<ID=RU,Number=1,Type=String,Description="Tandem repeat unit (bases)">
##INFO=<ID=SEQQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles are not sequencing errors">
##INFO=<ID=STR,Number=0,Type=Flag,Description="Variant is a short tandem repeat">
##INFO=<ID=STRANDQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality of strand bias artifact">
##INFO=<ID=STRQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles in STRs are not polymerase slippage errors">
##INFO=<ID=TLOD,Number=A,Type=Float,Description="Log 10 likelihood ratio score of variant existing versus not existing">
##INFO=<ID=UNIQ_ALT_READ_COUNT,Number=1,Type=Integer,Description="Number of ALT reads with unique start and mate end positions at a variant site">
##MutectVersion=2.2
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##filtering_status=Warning: unfiltered Mutect 2 calls.  Please run FilterMutectCalls to remove false positives.
##source=Mutect2
##tumor_sample=CAN2_R
#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	CAN2_R
chr1	69461	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=123,118;MMQ=25,22;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:11,0:13,5:10,14,0,5
chr1	566130	.	C	T	.	.	DP=337;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=1007.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,325:0.994:326:0,157:1,164:1,0,238,87
chr1	566206	.	A	G	.	.	DP=647;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:599,25:0.040:624:297,15:292,9:327,272,15,10
chr1	566371	.	A	G	.	.	DP=239;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=963.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,231:0.996:231:0,118:0,106:0,0,26,205
chr1	866319	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	866511	.	C	CCCCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=374,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CCCT;STR;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr1	871334	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=199,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,2:1,0:0,1,0,3
chr1	876499	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,7,4
chr1	877715	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	878314	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr1	880238	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	883625	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,12,6
chr1	883666	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=149,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:3,5,2,0
chr1	883770	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=226,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:883770_T_C:883770:1,1,0,1
chr1	883772	.	C	CTCCTATTCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=226,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:883770_T_C:883770:1,1,0,1
chr1	887560	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,2,12
chr1	889158	.	GA	CC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	892745	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,5:0,0:0,0,0,6
chr1	898323	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	900285	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:900285_CA_TG:900285:0,0,2,0
chr1	900299	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=10,12;MFRL=198,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.637:3:0,0:0,0:0|1:900285_CA_TG:900285:1,0,2,0
chr1	906229	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,0:0,6:1,5,0,6
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chr1	906688	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.460:11:1,1:4,4:0|1:906683_A_AGC:906683:1,5,5,0
chr1	906694	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=123,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:2,0:6,4:0|1:906683_A_AGC:906683:3,6,4,0
chr1	906698	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=122,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.311:14:2,0:7,4:0|1:906683_A_AGC:906683:4,6,4,0
chr1	911496	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=176,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	914192	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=198,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr1	916590	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:8,5:3,3:4,7,3,5
chr1	948846	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0|1:948846_T_TA:948846:0,0,6,1
chr1	948870	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0|1:948846_T_TA:948846:0,0,9,3
chr1	949925	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=210,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr1	955597	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	970549	.	TGG	T,TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,24,28;MFRL=0,164,168;MMQ=60,60,60;MPOS=31,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=G;STR;TLOD=5.82,5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.477,0.394:5:0,2,2:0,1,0:0,0,5,0
chr1	970568	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=16,12;MFRL=191,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:0,0:3,1,2,0
chr1	970584	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=141,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:1,0:4,2,2,0
chr1	977330	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr1	977570	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	978603	.	CCT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=178,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,5:1,2:3,3,3,4
chr1	980460	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	981087	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,9,6
chr1	982941	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,18:0,6:0,0,8,17
chr1	985266	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=109,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:3,1,5,0
chr1	985337	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=141,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:2,9,1,2
chr1	985443	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=G;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.785:2:0,1:0,0:0|1:985443_AG_A:985443:0,0,2,0
chr1	985450	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.775:2:0,1:0,0:0|1:985443_AG_A:985443:0,0,2,0
chr1	986443	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,3,14
chr1	986459	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=181,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:5,3:1,1:1,5,0,5
chr1	988932	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	990380	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=206,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.451:11:6,2:0,1:3,3,3,2
chr1	990417	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,26;MFRL=201,194;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,2:0,1:1,0,1,2
chr1	1021415	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	1118212	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=195,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:0,2:3,1:3,0,3,1
chr1	1159380	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=179,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:1159380_A_T:1159380:0,1,0,1
chr1	1159382	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,31;MFRL=179,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1159380_A_T:1159380:0,1,0,1
chr1	1159385	.	G	GTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=179,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1159380_A_T:1159380:0,1,0,1
chr1	1168672	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	1168984	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,3:7,0:10,4,2,1
chr1	1192291	.	AGG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	1225612	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=189,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:2,2:2,1:3,1,2,2
chr1	1229573	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.150:24:14,3:7,0:8,13,1,2
chr1	1229680	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,230;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,0,3
chr1	1231968	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=158,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr1	1243928	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:1243928_G_GT:1243928:0,0,1,0
chr1	1243934	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1243928_G_GT:1243928:0,0,1,0
chr1	1243946	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1243928_G_GT:1243928:0,0,1,0
chr1	1243948	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,16;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1243928_G_GT:1243928:0,0,1,0
chr1	1243950	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1243928_G_GT:1243928:0,0,1,0
chr1	1247589	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.700:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr1	1248121	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=247,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.644:15:4,4:1,5:1,4,2,8
chr1	1254136	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	1268781	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=8,12;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.585:5:0,0:0,0:0|1:1268781_C_G:1268781:0,2,0,3
chr1	1268787	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=16,12;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.585:5:0,0:0,1:0|1:1268781_C_G:1268781:0,2,0,3
chr1	1268847	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	1273259	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=197,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:1273259_A_C:1273259:2,0,1,0
chr1	1273264	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=196,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:1273259_A_C:1273259:3,0,1,0
chr1	1273273	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,17;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:1273259_A_C:1273259:3,0,1,0
chr1	1273278	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0|1:1273259_A_C:1273259:0,0,5,0
chr1	1276973	.	G	GACAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=AC;STR;TLOD=38.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,2:0,0,9,0
chr1	1278237	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	1284490	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr1	1288583	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=12,27;MFRL=199,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.823:7:0,4:0,2:1,0,6,0
chr1	1288823	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr1	1289367	.	CTG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,0:0,8:0,0,4,4
chr1	1289911	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr1	1292127	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:5,1:0,9,3,0
chr1	1293764	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	1293779	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=222,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr1	1293802	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=59,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.770:5:0,1:0,1:1,1,3,0
chr1	1309836	.	C	CAGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=319,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1309836_C_CAGAT:1309836:1,0,0,1
chr1	1309838	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=319,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1309836_C_CAGAT:1309836:1,0,0,1
chr1	1323078	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr1	1323143	.	CCT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr1	1326141	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=120,103;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.315:33:12,10:10,0:15,8,10,0
chr1	1354589	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:3,2,1,4
chr1	1375819	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,0:0|1:1375819_A_C:1375819:1,3,2,0
chr1	1375823	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:1375819_A_C:1375819:2,3,2,0
chr1	1375827	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:0|1:1375819_A_C:1375819:2,4,2,0
chr1	1387667	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr1	1389739	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=180,195;MMQ=27,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:3,2,2,0
chr1	1389820	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=217,156;MMQ=40,26;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,1:3,1:5,0,0,2
chr1	1389902	.	TC	GG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=238,195;MMQ=60,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:1389902_TC_GG:1389902:1,3,0,2
chr1	1389906	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=238,195;MMQ=60,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:0|1:1389902_TC_GG:1389902:1,3,0,2
chr1	1390766	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:5,2,0,4
chr1	1413945	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=150,87;MMQ=57,29;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:10,2,2,0
chr1	1420637	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,204;MMQ=46,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	1421822	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr1	1458073	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=92,149;MMQ=38,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,2,0
chr1	1469501	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=205,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,2:4,4:1,4,2,4
chr1	1469546	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	1475804	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=225,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	1560100	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	1563789	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr1	1564131	.	G	GGTTCATCCGTATTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=166,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:3,2:2,0:0,5,1,1
chr1	1564194	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=213,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	1564952	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=188,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr1	1565586	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,289;MMQ=60,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1565586_G_C:1565586:0,0,1,0
chr1	1565591	.	CAG	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,289;MMQ=60,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1565586_G_C:1565586:0,0,1,0
chr1	1565596	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,35;MFRL=0,289;MMQ=60,24;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1565586_G_C:1565586:0,0,1,0
chr1	1565598	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,289;MMQ=60,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1565586_G_C:1565586:0,0,1,0
chr1	1565606	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,289;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1565586_G_C:1565586:0,0,1,0
chr1	1565608	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,289;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1565586_G_C:1565586:0,0,1,0
chr1	1565611	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,289;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1565586_G_C:1565586:0,0,1,0
chr1	1565681	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:1565681_A_T:1565681:0,0,2,0
chr1	1565689	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:1565681_A_T:1565681:0,0,2,0
chr1	1565691	.	C	CGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,21;RU=G;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:1565681_A_T:1565681:0,0,2,0
chr1	1571640	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=204,199;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	1571760	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=146,169;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:3,8,1,1
chr1	1571812	.	GGCC	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=179,36;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:8,2:5,0:0|1:1571812_GGCC_G:1571812:7,6,1,1
chr1	1571818	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=164,36;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:0|1:1571812_GGCC_G:1571812:7,5,1,1
chr1	1572939	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=142,210;MMQ=59,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:3,2:2,1:0,6,0,3
chr1	1575616	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	1575836	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=180,178;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr1	1599888	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=80,216;MMQ=52,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,5:2,3:4,5,7,1
chr1	1599974	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=173,151;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,2:2,0:2,3,0,2
chr1	1599981	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=165,173;MMQ=27,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,2,3
chr1	1601015	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr1	1601052	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=197,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,5:0,9:0,1,11,3
chr1	1635619	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:6,5:0,4:5,1,3,7
chr1	1636274	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=202,163;MMQ=40,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:1,1,4,0
chr1	1637012	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=133,107;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr1	1639801	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=212,191;MMQ=57,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr1	1647722	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=36,28;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,2:0,0:0|1:1647722_G_T:1647722:2,0,3,0
chr1	1647725	.	GT	AG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=36,31;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0|1:1647722_G_T:1647722:2,0,3,0
chr1	1647729	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=35,28;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0|1:1647722_G_T:1647722:2,0,3,0
chr1	1647745	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:5,0,5,0
chr1	1647753	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=35,27;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:5,6:2,1:6,1,7,0
chr1	1647778	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=91,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,6:3,3:5,3,9,0
chr1	1647814	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=27,33;MFRL=102,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.416:34:10,8:10,6:10,10,9,5
chr1	1647893	.	C	CTTTCTT	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=178,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTCTT;STR;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.293:32:16,3:7,5:9,14,1,8
chr1	1647928	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=26,35;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:7,5:7,2:5,9,3,4
chr1	1647968	.	C	CAT	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=27,36;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.332:13:5,1:3,3:0|1:1647968_C_CAT:1647968:0,9,0,4
chr1	1647971	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=158,180;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:6,1:3,2:0|1:1647968_C_CAT:1647968:0,9,0,3
chr1	1647983	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=30,29;MFRL=190,180;MMQ=55,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:6,1:3,2:0|1:1647983_T_A:1647983:0,10,0,3
chr1	1647990	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=208,180;MMQ=45,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:7,1:3,2:0|1:1647983_T_A:1647983:0,10,0,3
chr1	1648002	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=212,210;MMQ=40,58;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr1	1650920	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:9,0:6,4:4,11,1,3
chr1	1650938	.	CGG	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.648:15:3,4:1,4:0|1:1650938_CGG_C:1650938:0,5,0,10
chr1	1650942	.	A	AAG	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=139,191;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:3,5:1,3:0|1:1650938_CGG_C:1650938:0,5,0,9
chr1	1650960	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=172,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:3,5:1,2:0|1:1650938_CGG_C:1650938:0,4,0,7
chr1	1650967	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=205,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:1,6:1,1:0|1:1650938_CGG_C:1650938:0,3,0,9
chr1	1653004	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,4,5
chr1	1653028	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,6,8
chr1	1653885	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	1654007	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,33;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.763:2:0,0:0,2:0|1:1654007_A_T:1654007:0,0,0,2
chr1	1654011	.	TAC	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,33;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:1654007_A_T:1654007:0,0,0,2
chr1	1654017	.	T	TTTGTTAA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,33;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1654007_A_T:1654007:0,0,0,1
chr1	1654038	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,240;MMQ=60,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	1654058	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:1654058_C_T:1654058:0,0,1,1
chr1	1654064	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:1654058_C_T:1654058:0,0,1,1
chr1	1654065	.	AGCG	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:1654058_C_T:1654058:0,0,1,1
chr1	1663831	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,2:4,3:4,1,3,2
chr1	1663851	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=128,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:0|1:1663851_G_C:1663851:5,2,4,1
chr1	1663861	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:0|1:1663851_G_C:1663851:6,2,4,1
chr1	1664019	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	1669734	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=211,228;MMQ=51,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:4,2,2,0
chr1	1669748	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=216,198;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,3,2
chr1	1670570	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=198,190;MMQ=30,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:3,8,0,2
chr1	1684347	.	C	CCCT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=187,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=CCT;STR;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:0,1:3,3:3,0,4,2
chr1	1685921	.	TCCCTGGGACCGAAGTCGCCCCA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=220,250;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.574:14:4,2:2,6:2,4,3,5
chr1	1686943	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:1686943_T_C:1686943:0,0,0,2
chr1	1686962	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:1686943_T_C:1686943:0,0,0,4
chr1	1687625	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=102,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:4,1,4,0
chr1	1687830	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=196,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:2,2,1,1
chr1	1688469	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	1688513	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=188,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:6,3:0,1:3,3,2,2
chr1	1689762	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=108,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,6:6,2:4,5,5,3
chr1	1696659	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,12,0
chr1	1737890	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=115,88;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,1:8,1:6,6,2,0
chr1	1847856	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:4,1,3,2
chr1	1848109	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:1,1,2,2
chr1	1848734	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	1849923	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=165,213;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,2:9,1:9,6,0,3
chr1	1855450	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	1858309	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,5:4,2:2,4,4,3
chr1	1887091	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:0,2:2,1,1,2
chr1	1887111	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=252,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,1,2
chr1	1895326	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=159,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,2:7,0:0|1:1895326_C_T:1895326:3,6,1,1
chr1	1895327	.	A	AGGATT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=159,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,2:7,0:0|1:1895326_C_T:1895326:3,6,1,1
chr1	1895330	.	T	TGGATCA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=159,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:6,0:0|1:1895326_C_T:1895326:3,6,1,1
chr1	1897753	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,1:3,5:3,1,4,2
chr1	1900106	.	T	TCTC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=167,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:9,2:4,2:6,7,0,4
chr1	1900332	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=241,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0|1:1900332_A_G:1900332:0,2,0,3
chr1	1900339	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=241,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,1:0|1:1900332_A_G:1900332:0,2,0,3
chr1	1916890	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=223,84;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,5:2,2:1,2,3,4
chr1	1920434	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=107,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	1922303	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,5:2,5:1,2,8,2
chr1	1956362	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,11,3
chr1	1957219	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	1959121	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=163,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:6,6:1,3:3,4,4,5
chr1	1959186	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=173,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr1	1960926	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	1961470	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:3,4,1,1
chr1	1987993	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=129,322;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,1:7,2:7,5,2,1
chr1	1991014	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:6,3,1,1
chr1	2005818	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=68,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2005818_G_A:2005818:1,0,0,1
chr1	2005826	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=68,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2005818_G_A:2005818:1,0,0,1
chr1	2075560	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=149,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:2075560_T_G:2075560:3,0,2,0
chr1	2075570	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=168,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0|1:2075560_T_G:2075560:5,0,2,0
chr1	2077409	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=204,238;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,4:2,3:2,0,6,1
chr1	2082458	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=17,32;MFRL=202,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.640:6:1,1:0,2:0,2,0,4
chr1	2082489	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=203,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr1	2118539	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,9,2
chr1	2118724	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=181,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	2121118	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,2:0,0,6,8
chr1	2234903	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=319,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	2235662	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=189,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.703:15:4,4:0,6:0|1:2235662_G_A:2235662:2,2,7,4
chr1	2235672	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=205,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:4,3:1,6:0|1:2235662_G_A:2235662:2,3,5,4
chr1	2235751	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=204,243;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:26,3:11,0:12,25,0,3
chr1	2252759	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=198,248;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr1	2286879	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:2286879_G_T:2286879:6,3,1,1
chr1	2286881	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:2286879_G_T:2286879:6,3,1,1
chr1	2286947	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr1	2316315	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	2316583	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,1,1
chr1	2319720	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=168,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:10,3:6,0:7,9,2,1
chr1	2328714	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,4,11
chr1	2332391	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=109,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:6,2:2,5:4,5,4,3
chr1	2338126	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:3,3:3,2:3,3,4,2
chr1	2419085	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=121,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,1:9,1:7,7,2,0
chr1	2420590	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=215,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr1	2420806	.	ATCCTCGT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=233,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2420806_ATCCTCGT_A:2420806:1,0,0,1
chr1	2420815	.	AAGG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=233,218;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2420806_ATCCTCGT_A:2420806:1,0,0,1
chr1	2421263	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=176,95;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.181:18:9,2:6,0:10,5,3,0
chr1	2422614	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr1	2428874	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	2430617	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=219,142;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:0,6:2,9:1,1,5,10
chr1	2430992	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	2460944	.	C	CGCG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GCG;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	2461381	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:2461381_G_C:2461381:3,5,1,1
chr1	2461383	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=155,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:2461381_G_C:2461381:3,5,1,1
chr1	2461384	.	G	GTCCCTCACCC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:2461381_G_C:2461381:3,5,1,1
chr1	2489176	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=114,68;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:9,0:10,12:10,9,2,10
chr1	2492180	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:5,0:10,2:0|1:2492180_T_TC:2492180:8,7,1,1
chr1	2492183	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:5,0:10,2:0|1:2492180_T_TC:2492180:8,7,1,1
chr1	2519242	.	GCGGGAACCCTTGGGTAGCGTGGGGT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=191,169;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,1:3,1:4,2,0,2
chr1	2520302	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,0:1,3:5,1,3,0
chr1	2523125	.	G	GAGGCATAATCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=183,268;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	2535496	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	2537072	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=202,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:3,4,1,3
chr1	2537095	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=127,270;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,2:2,0:2,3,1,1
chr1	2938407	.	CAGA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=194,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:2,2,2,0
chr1	2938547	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:4,4,2,0
chr1	3319339	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=247,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:1,1,3,3
chr1	3347706	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,26;MFRL=266,243;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:3347706_G_A:3347706:0,1,0,2
chr1	3347709	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=265,221;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3347706_G_A:3347706:0,2,0,1
chr1	3347717	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=265,221;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3347706_G_A:3347706:0,2,0,1
chr1	3383665	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	3385330	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	3394640	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,2,6
chr1	3394674	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,1,2
chr1	3395229	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	3397188	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	3413426	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=223,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	3417960	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	3425345	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=220,253;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	3426384	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=318,132;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr1	3427387	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=186,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:6,1,1,1
chr1	3428737	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,2:1,0:1,5,0,2
chr1	3440647	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	3440824	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,4:5,4:1,6,3,5
chr1	3496328	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr1	3496433	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=215,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:2,5,1,1
chr1	3518944	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=181,260;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr1	3519179	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=224,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,2:2,1:1,3,1,2
chr1	3541970	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=194,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.299:11:1,2:3,0:5,3,3,0
chr1	3542106	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:3,2:2,1:0,8,1,2
chr1	3545175	.	GTTCTGGGAGCTCCTCCCCC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=195,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCTGGGAGCTCCTCCCCC;STR;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.735:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr1	3549862	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr1	3553743	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=159,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.314:4:2,1:1,0:0|1:3553743_G_GA:3553743:0,3,0,1
chr1	3553745	.	A	AAGATCCAGCAATAGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=159,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:3553743_G_GA:3553743:0,3,0,1
chr1	3563428	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=220,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.231:14:3,1:8,1:0,11,0,3
chr1	3566625	.	AGCAGGCTG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=169,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.501:8:2,3:2,1:0|1:3566625_AGCAGGCTG_A:3566625:0,4,0,4
chr1	3566631	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,4:0.857:4:0,2:0,2:1|0:3566625_AGCAGGCTG_A:3566625:0,0,0,4
chr1	3638832	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=288,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:3638832_G_T:3638832:0,3,0,1
chr1	3638834	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=246,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.408:3:1,1:1,0:0|1:3638832_G_T:3638832:0,2,0,1
chr1	3638836	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,30;MFRL=288,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:3638832_G_T:3638832:0,3,0,1
chr1	3638838	.	G	GCGTCCCTTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=288,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:3638832_G_T:3638832:0,3,0,1
chr1	3638840	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=36,29;MFRL=288,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:3638832_G_T:3638832:0,3,0,1
chr1	3640134	.	TCTGC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	3644349	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr1	3644374	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	3645835	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,3:0,3:0|1:3645835_C_A:3645835:0,0,7,1
chr1	3645844	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:3645835_C_A:3645835:0,0,7,1
chr1	3647962	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	3659657	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=131,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,3,0
chr1	3662646	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,99;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:6,0:10,5:10,6,0,5
chr1	3662845	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=293,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	3672156	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=173,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:1,3,0,3
chr1	3673481	.	GG	CC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=188,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:3,0:0|1:3673481_GG_CC:3673481:0,12,2,0
chr1	3673489	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=171,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:3673481_GG_CC:3673481:0,12,2,0
chr1	3673494	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=165,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,0:0|1:3673481_GG_CC:3673481:0,11,2,0
chr1	3673496	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,3:5,0:0,8,0,3
chr1	3679139	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=163,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,0:3,4:0|1:3679139_T_C:3679139:3,3,3,1
chr1	3679146	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=163,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,0:4,4:0|1:3679139_T_C:3679139:3,3,3,1
chr1	3684107	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=242,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	3697700	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=132,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:3,4,2,2
chr1	3703698	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=192,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:2,5,0,2
chr1	3732044	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,3,0
chr1	3732103	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:3,0,2,4
chr1	3732172	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	3732782	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:2,1,3,3
chr1	3742824	.	TTA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr1	3743109	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,2,2
chr1	3743391	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:5,5,0,2
chr1	3743433	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr1	3745787	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,5:2,5:2,0,10,0
chr1	3746254	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=162,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:1,1:3,0,2,0
chr1	3746432	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=117,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:11,2:7,2:12,6,1,3
chr1	3746583	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=133,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:3,3:4,2:0|1:3746583_G_T:3746583:0,7,1,4
chr1	3746589	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=109,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:1,4:3,3:0|1:3746583_G_T:3746583:0,6,1,6
chr1	3747580	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=165,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:3,2,5,1
chr1	3747603	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.720:16:3,2:1,9:1,3,10,2
chr1	3751459	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,254;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:3,2:7,2:9,1,4,0
chr1	3753013	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=186,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	3755675	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=115,172;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:3,6:2,7:4,2,8,5
chr1	3759784	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:5,2,3,4
chr1	3759788	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=35,20;MFRL=170,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:0|1:3759788_C_T:3759788:7,5,1,1
chr1	3759794	.	CAA	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=161,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:3759788_C_T:3759788:8,5,1,1
chr1	3759797	.	A	ATCTGT	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=170,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:3759788_C_T:3759788:9,5,1,1
chr1	3759802	.	TG	GA	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=178,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:8,2:0|1:3759788_C_T:3759788:10,5,1,1
chr1	3761650	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=220,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:1,3,1,4
chr1	3762015	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,26;MFRL=213,226;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3762015_G_A:3762015:0,1,0,1
chr1	3762018	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=215,226;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:3762015_G_A:3762015:0,2,0,1
chr1	3762020	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=215,226;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:3762015_G_A:3762015:0,2,0,1
chr1	3762029	.	GGTGT	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=215,226;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:3762029_GGTGT_G:3762029:0,2,0,1
chr1	3762034	.	G	GCACA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=215,226;MMQ=60,48;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:3762029_GGTGT_G:3762029:0,2,0,1
chr1	3765095	.	C	CAAAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,22;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.690:1:0,0:0,1:0|1:3765095_C_CAAAAAA:3765095:0,0,1,0
chr1	3765113	.	AGC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,17;MFRL=181,164;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:3765095_C_CAAAAAA:3765095:1,2,1,0
chr1	3769033	.	AA	TT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	3774130	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=185,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,1:6,1:0|1:3774130_A_G:3774130:11,5,2,0
chr1	3774138	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=155,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,1:8,1:0|1:3774130_A_G:3774130:12,7,2,0
chr1	3774296	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=202,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,2:2,1:0,8,0,3
chr1	3775454	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	3788968	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=145,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	3789195	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,1,4
chr1	3806643	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=125,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,4:4,1:2,7,2,3
chr1	3807122	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr1	3816683	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,0:1,2:1,2,0,2
chr1	4715420	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=106,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr1	4772717	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=179,82;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,6:5,1:0,6,4,3
chr1	4829835	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=58,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr1	4834420	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,5:2,3:6,1,7,1
chr1	4834606	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=175,251;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:2,1,0,3
chr1	5925371	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	5934490	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=210,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0|1:5934490_A_G:5934490:4,0,5,0
chr1	5934500	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=190,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:0|1:5934490_A_G:5934490:3,0,7,0
chr1	5934837	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,2:1,5:3,2,3,4
chr1	5935162	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	5937091	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,5,1
chr1	5937391	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,5:2,4:0,3,4,5
chr1	5937413	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=245,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,5:2,1:0,3,2,4
chr1	5947485	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=193,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:6,1:6,2:5,7,1,2
chr1	5969139	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=186,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:1,6:4,1:2,3,4,3
chr1	6029086	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,156;MMQ=48,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.750:8:1,3:1,2:2,0,4,2
chr1	6046432	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=192,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	6101896	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,0:4,2:10,1,0,2
chr1	6145365	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,3:2,5:1,3,0,8
chr1	6155332	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr1	6157434	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr1	6160063	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=152,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:4,1:2,0:0,6,3,0
chr1	6166767	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,233;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:8,0:10,5,2,0
chr1	6170424	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=286,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,3:0,0:1,0,1,2
chr1	6171992	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=183,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:4,2:2,1:3,3,1,3
chr1	6183959	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=157,154;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,0:5,0,4,0
chr1	6184221	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:6184221_C_G:6184221:0,3,0,1
chr1	6184233	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:6184221_C_G:6184221:0,3,0,1
chr1	6185064	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=136,314;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	6185532	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=214,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr1	6188546	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=198,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:6,2:2,2:5,3,3,1
chr1	6195493	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=213,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr1	6195548	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	6196493	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=176,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	6196517	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=151,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,3,2
chr1	6196943	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6196943_A_G:6196943:0,1,0,1
chr1	6196951	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6196943_A_G:6196943:0,0,0,1
chr1	6202245	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,2:6,0:6,2,1,1
chr1	6203853	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=204,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0|1:6203853_A_C:6203853:0,1,3,0
chr1	6203857	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=204,251;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:6203853_A_C:6203853:0,1,2,0
chr1	6203858	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=36,19;MFRL=204,251;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:6203853_A_C:6203853:0,1,2,0
chr1	6203862	.	T	TGGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,18;MFRL=199,251;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,1:0|1:6203853_A_C:6203853:1,1,2,0
chr1	6203868	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=199,251;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,1:0|1:6203853_A_C:6203853:1,1,2,0
chr1	6204266	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=213,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr1	6211257	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=145,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	6272293	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,1:5,1:6,2,2,0
chr1	6311373	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,3:6,0:5,4,2,1
chr1	6341370	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=19,12;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.634:9:1,0:0,0:1,2,0,6
chr1	6399412	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=213,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	6453520	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	6473292	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=158,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:7,0:0|1:6473292_G_A:6473292:4,12,0,2
chr1	6473295	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=158,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:0|1:6473292_G_A:6473292:4,12,0,2
chr1	6524501	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=158,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:9,2:3,0:7,5,2,0
chr1	6528468	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=160,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:5,5,1,1
chr1	6529748	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=164,262;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,2:3,1:7,3,1,2
chr1	6530435	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=188,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,0:3,4:4,5,2,2
chr1	6530965	.	C	CG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr1	6531650	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=185,292;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:1,5,1,3
chr1	6535048	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=163,297;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,1:7,1:8,2,2,0
chr1	6556643	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=114,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:15,3:10,0:10,15,3,0
chr1	6579607	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	6586070	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,6,7
chr1	6593532	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=156,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:1,9,0,2
chr1	6609559	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	6609563	.	CAT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr1	6609851	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	6610382	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,0:3,0,2,0
chr1	6610773	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	6614391	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0|1:6614391_A_C:6614391:0,0,1,5
chr1	6614415	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6614391_A_C:6614391:0,0,1,0
chr1	6614653	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	6615690	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6615690_A_G:6615690:0,0,0,1
chr1	6615695	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6615690_A_G:6615690:0,0,0,1
chr1	6631319	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=180,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	6631352	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=168,110;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0,2,0,2
chr1	6635132	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=188,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:6,4,0,2
chr1	6642140	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=125,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,5:6,0:6,7,5,0
chr1	6674197	.	GA	CC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.489:8:2,0:2,0:0|1:6674197_GA_CC:6674197:0,4,4,0
chr1	6674201	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.489:8:2,1:2,1:0|1:6674197_GA_CC:6674197:0,4,4,0
chr1	6679848	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=124,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,0:4,6:4,2,5,1
chr1	6681744	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr1	6685442	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	6688774	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:0,0:7,2:1,6,0,2
chr1	6694045	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=125,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:4,4,2,0
chr1	6694207	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,5:0,1:0,3,0,6
chr1	6695802	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=91.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,12:0,0,16,12
chr1	6700131	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.835:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr1	7151479	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=262,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:0,2,2,2
chr1	7527996	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=258,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,8:1,5:0,1,1,12
chr1	7700674	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:3,0:0,3:1,2,0,4
chr1	7737799	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=237,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr1	7792520	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=231,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,4:5,1:5,4,4,1
chr1	7797096	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=80,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:4,7,0,2
chr1	7798113	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,4:3,0:4,4,4,0
chr1	7805072	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=107,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:7,2:4,0:6,5,1,1
chr1	7826653	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=184,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:7826653_G_A:7826653:0,4,0,2
chr1	7826666	.	CGT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=192,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:7826653_G_A:7826653:0,5,0,2
chr1	7837432	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,17;MFRL=142,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,0:0,0:0,1,0,2
chr1	7861153	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:3,1,3,1
chr1	7861345	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=201,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr1	7869915	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=170,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,6:6,4:9,3,8,2
chr1	7870144	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:2,4:1,3,1,8
chr1	7907961	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=223,49;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:0|1:7907961_A_G:7907961:3,4,1,1
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chr1	7907980	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=222,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,0:0,2:0|1:7907961_A_G:7907961:2,4,1,1
chr1	7907983	.	GA	CC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=230,49;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:0,2:0|1:7907961_A_G:7907961:2,5,1,1
chr1	7913398	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=133,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:9,8:10,0:12,7,9,0
chr1	7913430	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=82,90;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.372:22:7,8:7,0:10,4,3,5
chr1	7998963	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr1	8022753	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=180,221;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:8022753_T_G:8022753:3,0,4,0
chr1	8022772	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=180,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0|1:8022753_T_G:8022753:2,0,5,0
chr1	8029446	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=126,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:2,2:10,2:6,6,1,3
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chr1	8029510	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=18,29;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:0,2:0,2:0,1,1,3
chr1	8384268	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	8385485	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=138,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:2,2:1,5,0,3
chr1	8390246	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr1	8390495	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=251,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:1,1,2,3
chr1	8399674	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,3:7,1:7,4,1,3
chr1	8404093	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr1	8404169	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	8415290	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=168,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,1,1
chr1	8422676	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=190,252;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:5,0,5,0
chr1	8526142	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,3:1,4:1,3,0,7
chr1	8716268	.	C	CTTATCTTT	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=35,20;MFRL=152,162;MMQ=53,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.231:15:6,2:5,1:0|1:8716268_C_CTTATCTTT:8716268:8,4,0,3
chr1	8716271	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=152,162;MMQ=53,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:7,2:5,1:0|1:8716268_C_CTTATCTTT:8716268:8,4,0,3
chr1	8716276	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=159,162;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:8,2:6,1:0|1:8716268_C_CTTATCTTT:8716268:8,6,0,3
chr1	8716278	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=159,162;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:8,2:6,1:0|1:8716268_C_CTTATCTTT:8716268:8,6,0,3
chr1	8716280	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=159,162;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:8,2:6,1:0|1:8716268_C_CTTATCTTT:8716268:8,6,0,3
chr1	8716285	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=160,162;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.220:16:7,1:6,1:0|1:8716268_C_CTTATCTTT:8716268:7,6,0,3
chr1	8923088	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=165,168;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,0:3,3:1,7,0,3
chr1	8926285	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0,0,9,0
chr1	8935033	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=177,233;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,0:7,6:0,11,0,6
chr1	9006127	.	T	TTTCCTGGTCTTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=106,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	9017204	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=209,137;MMQ=60,31;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:5,2:0,14:3,2,12,4
chr1	9019104	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,0:6,3:2,14,0,3
chr1	9027843	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=118,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:9027843_C_T:9027843:9,6,1,1
chr1	9027846	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=118,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:9027843_C_T:9027843:8,6,1,1
chr1	9027876	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=120,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,1:7,1:4,6,0,2
chr1	9034598	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	9034814	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=190,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	9034815	.	C	CAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=217,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	9064743	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=178,259;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:8,1,2,0
chr1	9067432	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=166,241;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:4,6,1,1
chr1	9070152	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,18;MFRL=54,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:9070152_C_G:9070152:2,0,1,0
chr1	9070155	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=108,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:9070152_C_G:9070152:2,1,1,0
chr1	9070165	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,15;MFRL=108,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:9070152_C_G:9070152:3,1,1,0
chr1	9074932	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:1,2,1,3
chr1	9075160	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,102;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:6,2,0,2
chr1	9075369	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	9078412	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:5,4,0,2
chr1	9085006	.	G	GGCCCACCTTGT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GCCCACCTTGT;STR;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.521:13:4,5:2,0:4,2,2,5
chr1	9099987	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=179,66;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:9099987_C_T:9099987:8,3,1,1
chr1	9099999	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=179,66;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:9099987_C_T:9099987:8,1,1,1
chr1	9100017	.	CAG	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=179,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:4,0:0|1:9099987_C_T:9099987:6,4,1,1
chr1	9100024	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=176,66;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,2:4,0:0|1:9099987_C_T:9099987:5,4,1,1
chr1	9107849	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:0,3,1,4
chr1	9171238	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=8,23;MFRL=257,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr1	9305163	.	GTC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:8,1:10,6,0,2
chr1	9307230	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=178,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.203:13:4,0:5,2:0,11,0,2
chr1	9415984	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=105,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.137:24:9,2:12,0:11,10,0,3
chr1	9416722	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=221,728;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,5:1,0:0,2,0,5
chr1	9599823	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=206,124;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr1	9633387	.	GT	G,GTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35,32;MFRL=0,152,176;MMQ=60,60,60;MPOS=19,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,14;RU=T;STR;TLOD=5.10,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.513,0.331:3:0,1,0:0,1,1:0,0,2,1
chr1	9642329	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=163,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:4,3:5,2:7,2,4,1
chr1	9642424	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,246;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:3,5:2,5:1,4,2,8
chr1	9657006	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:2,10,0,2
chr1	9658465	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr1	9658707	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	9667593	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=88,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr1	9714348	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=169,62;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:12,0:9,2:0|1:9714348_C_T:9714348:11,10,1,1
chr1	9714359	.	G	GCCTCCTGGGTAGC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=169,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:12,0:8,2:0|1:9714348_C_T:9714348:11,10,1,1
chr1	9781412	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=216,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,2:1,6:1,0,2,6
chr1	9782556	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:4,3,0,2
chr1	9815404	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=230,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,0:5,6:0,10,0,6
chr1	9815457	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,36;MFRL=282,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	9816620	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=299,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.865:13:0,3:1,7:0,1,3,9
chr1	9993029	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=272,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:9993029_G_C:9993029:0,3,0,1
chr1	9993035	.	C	CTACAAGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=272,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:9993029_G_C:9993029:0,3,0,1
chr1	9993037	.	C	CAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=272,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:9993029_G_C:9993029:0,3,0,1
chr1	9993039	.	G	GCTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=272,214;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:9993029_G_C:9993029:0,3,0,1
chr1	10041311	.	T	TGCTCCTCTG	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=150,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:5,1:0,0:1,4,0,1
chr1	10041324	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,34;MFRL=0,191;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:10041324_G_C:10041324:1,2,0,1
chr1	10041325	.	C	CTA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,35;MFRL=75,191;MMQ=50,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:10041324_G_C:10041324:1,1,0,1
chr1	10041327	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,33;MFRL=75,191;MMQ=50,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:10041324_G_C:10041324:1,1,0,1
chr1	10041330	.	TCA	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=22,27;MFRL=150,191;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:0,1:0|1:10041324_G_C:10041324:1,2,0,1
chr1	10041344	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,25;MFRL=176,150;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:10041344_G_A:10041344:0,3,0,1
chr1	10041348	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,32;MFRL=176,150;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:10041344_G_A:10041344:0,3,0,1
chr1	10042711	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,109;MMQ=60,26;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:2,1,0,4
chr1	10068159	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=174,282;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:10068159_C_A:10068159:1,0,1,0
chr1	10068164	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=174,282;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:10068159_C_A:10068159:1,0,1,0
chr1	10068168	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=174,282;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:10068159_C_A:10068159:1,0,1,0
chr1	10132300	.	CTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=36.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:4,4:3,6:1,7,5,5
chr1	10177680	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.440:16:1,3:7,4:1,8,2,5
chr1	10207145	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:11,0:7,3:10,9,1,2
chr1	10342629	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=259,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr1	10357206	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.748:8:1,2:1,3:2,0,4,2
chr1	10381747	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=174,262;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,4:4,0:5,1,4,0
chr1	10386506	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=207,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:1,3,0,2
chr1	10394562	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=156,125;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:10394562_T_C:10394562:4,4,2,0
chr1	10394565	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=156,125;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:10394562_T_C:10394562:4,4,2,0
chr1	10397080	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr1	10402027	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=214,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,1:1,1:0|1:10402027_C_A:10402027:2,0,2,0
chr1	10402034	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:10402027_C_A:10402027:4,0,1,0
chr1	10412636	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:1,3:4,0:5,1,3,0
chr1	10425063	.	CAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=222,254;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.350:4:1,0:1,1:3,0,1,0
chr1	10425163	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,214;MMQ=60,33;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,10:4,0:6,1,10,0
chr1	10431132	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=201,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr1	10478830	.	CAA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=124,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:1,1:2,1:2,3,2,0
chr1	10479635	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:8,2:1,4:5,4,3,3
chr1	10502307	.	ATT	A,AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29,29;MFRL=237,141,151;MMQ=60,60,60;MPOS=15,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=T;STR;TLOD=3.55,19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,8:0.214,0.644:11:0,1,3:1,1,5:1,0,9,1
chr1	10510136	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=124,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:10510136_T_C:10510136:5,3,0,2
chr1	10510138	.	G	GCCTGTGTAACTGTGATTCAATTGAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=124,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:10510136_T_C:10510136:5,3,0,2
chr1	10511634	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.201:23:6,0:12,4:4,15,0,4
chr1	10529194	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr1	10529326	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,3:10,1:9,7,4,0
chr1	10555257	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=65,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,22:0.887:24:0,10:2,11:1,1,17,5
chr1	10596388	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr1	10684486	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=177,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,0:9,3:5,13,1,2
chr1	10699014	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	10710721	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=130,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,1:4,1:9,4,2,0
chr1	10714436	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,5:1,5:2,1,5,5
chr1	10719905	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.826:4:0,0:0,0:0,0,0,4
chr1	11017022	.	C	CAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=75,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,3:2,2,4,2
chr1	11017609	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=207,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:0|1:11017609_T_C:11017609:3,0,4,0
chr1	11017617	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=207,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:0|1:11017609_T_C:11017609:3,0,4,0
chr1	11017634	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=122,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,3:3,2:9,1,4,1
chr1	11018723	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=249,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr1	11024353	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=74,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	11073933	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:12,2:9,3:9,12,3,2
chr1	11080723	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	11087109	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.332:28:9,9:10,0:11,8,9,0
chr1	11090916	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,14,7
chr1	11095039	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	11105106	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0|1:11105106_C_T:11105106:0,0,0,8
chr1	11105122	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:11105106_C_T:11105106:0,0,0,7
chr1	11116030	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=162,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.305:11:4,1:1,0:0|1:11116030_A_C:11116030:3,5,3,0
chr1	11116035	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.284:12:6,1:2,0:0|1:11116030_A_C:11116030:3,6,3,0
chr1	11116040	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=140,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.265:13:6,0:4,1:0|1:11116030_A_C:11116030:4,6,3,0
chr1	11128001	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=203,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,6:3,4:4,1,8,2
chr1	11129848	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	11132217	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,102;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,6:2,5:2,1,3,8
chr1	11133951	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=108,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:5,6,0,2
chr1	11133956	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=39,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:7,2:3,2:4,6,0,4
chr1	11134157	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=193,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,1:3,4:0,3,3,2
chr1	11137778	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,4:3,2:1,3,1,5
chr1	11167524	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,129;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:8,0:13,8:13,8,0,8
chr1	11175617	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,0:1,4:0,5,0,4
chr1	11181288	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:6,5,2,0
chr1	11187082	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=134,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,3:5,0:6,4,3,0
chr1	11187111	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=134,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.235:18:6,3:8,0:7,7,3,1
chr1	11187893	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr1	11206829	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=126,110;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:8,0:9,4:9,9,0,4
chr1	11227514	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=144,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:0|1:11227514_T_C:11227514:0,3,1,1
chr1	11227518	.	AT	TA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=144,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:11227514_T_C:11227514:0,3,0,1
chr1	11227523	.	A	ACCGGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=144,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:11227514_T_C:11227514:0,3,0,1
chr1	11227524	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=144,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:11227514_T_C:11227514:0,3,0,1
chr1	11254781	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,37;MFRL=224,252;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr1	11255156	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,0:7,4:0,11,0,4
chr1	11288633	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	11292666	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,263;MMQ=60,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	11297887	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=210,186;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:8,3:2,0:10,0,4,0
chr1	11307609	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	11317320	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	11575331	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=213,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,1:4,1:5,1,2,0
chr1	11575375	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=227,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,2:3,9:2,2,7,4
chr1	11579354	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.580:5:0,0:1,0:1,1,3,0
chr1	11593793	.	T	TGCACACACGCAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr1	11596641	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:3,4,1,1
chr1	11708736	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr1	11709051	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=27,26;MFRL=261,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:0,1:2,1:0|1:11709051_A_AG:11709051:0,2,1,2
chr1	11709052	.	C	CCCAG	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=36,32;MFRL=261,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0|1:11709051_A_AG:11709051:0,2,2,2
chr1	11709114	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=22,20;MFRL=202,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:0,1:1,0:0|1:11709114_A_C:11709114:1,1,2,0
chr1	11709118	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,35;MFRL=200,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:11709114_A_C:11709114:2,1,1,0
chr1	11709119	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,29;MFRL=200,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:11709114_A_C:11709114:2,1,1,0
chr1	11709122	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,33;MFRL=200,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:11709114_A_C:11709114:2,1,1,0
chr1	11709126	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=24,25;MFRL=202,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:11709114_A_C:11709114:3,1,1,0
chr1	11709130	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=24,29;MFRL=202,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:11709114_A_C:11709114:3,1,1,0
chr1	11735652	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=183,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,1:5,2:6,1,1,2
chr1	11735877	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=203,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,1:1,1:3,2,0,2
chr1	11737051	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=214,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,0:4,4:1,3,0,4
chr1	11740358	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,2:1,1:1,0,1,2
chr1	11772303	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	11772491	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=179,148;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,2:1,1:1,1,1,3
chr1	11772526	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=190,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	11779762	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=178,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:6,6:6,2:6,6,3,5
chr1	11796168	.	CGGGCG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGCG;STR;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	11807426	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	11832311	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,7,6
chr1	11832376	.	AC	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:11832376_AC_GT:11832376:0,4,0,1
chr1	11832379	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:11832376_AC_GT:11832376:0,4,0,1
chr1	11836441	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	11838791	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=153,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:9,0:0,4:2,7,0,4
chr1	11838848	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0,0,3,7
chr1	11842144	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	11844330	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,4,4
chr1	11845169	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	11848879	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr1	11849447	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr1	11850644	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=232,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:5,4:2,0:0|1:11850644_C_A:11850644:7,0,2,2
chr1	11850648	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=206,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:5,4:3,0:0|1:11850644_C_A:11850644:8,0,2,2
chr1	11852435	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:2,1,0,2
chr1	11854244	.	C	CAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=310,235;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11854244_C_CAAG:11854244:1,0,0,1
chr1	11854246	.	A	AGCTGCAACTAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=310,235;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11854244_C_CAAG:11854244:1,0,0,1
chr1	11854457	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,8:0,0,7,4
chr1	11854755	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.580:15:2,5:4,2:6,0,6,3
chr1	11876760	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=136,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:9,3:13,0:11,13,2,1
chr1	11906158	.	A	AAAAGAAAAAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=140,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:2,2,1,1
chr1	11917620	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.481:6:0,2:3,1:3,0,2,1
chr1	11980449	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:2,3,1,3
chr1	11982544	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,7:1,3:1,0,7,3
chr1	11983206	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=128,216;MMQ=60,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,0:5,4:4,5,4,0
chr1	12010462	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=155,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:5,0:1,2:0|1:12010462_C_T:12010462:1,5,2,0
chr1	12010469	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=177,137;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:4,1:0,3:0|1:12010462_C_T:12010462:0,4,3,1
chr1	12015018	.	G	GGCCTCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=94,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,2:1,0:1,4,0,2
chr1	12024383	.	G	GTTTCTGTCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=133,70832080;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:12024383_G_GTTTCTGTCC:12024383:1,1,1,0
chr1	12024386	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=133,70832080;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12024383_G_GTTTCTGTCC:12024383:1,1,1,0
chr1	12024391	.	CA	GG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=133,70832080;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:12024383_G_GTTTCTGTCC:12024383:1,1,1,0
chr1	12024923	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,2:1,1:0,3,0,3
chr1	12026278	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:6,5,3,0
chr1	12027204	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr1	12033113	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:12033113_A_G:12033113:0,2,0,4
chr1	12033120	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0|1:12033113_A_G:12033113:0,2,0,4
chr1	12056440	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	12057452	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=178,73;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr1	12059024	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=181,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:3,6,0,2
chr1	12062205	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr1	12067044	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	12071680	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	12082208	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:5,5,1,1
chr1	12157288	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:10,0:1,4:3,8,3,1
chr1	12183245	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=225,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr1	12195694	.	A	ATCTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=226,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:2,2:8,1,1,1
chr1	12248942	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:2,6,2,1
chr1	12248965	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:2,6,1,4
chr1	12249020	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=236,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:2,1:2,1:0,4,0,3
chr1	12249031	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=191,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	12251765	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=105,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:4,2,2,0
chr1	12251808	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=119,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,1:2,6:3,3,4,3
chr1	12251961	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:1,3,0,5
chr1	12252892	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=125,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:3,1,4,0
chr1	12252955	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=159,199;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,1:6,3:5,2,2,2
chr1	12254746	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,2:0,4,1,4
chr1	12318064	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:12318064_C_T:12318064:5,13,0,2
chr1	12318067	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:12318064_C_T:12318064:5,13,0,2
chr1	12318069	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=134,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:7,2:0|1:12318064_C_T:12318064:5,14,0,2
chr1	12318074	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:4,2:0|1:12318064_C_T:12318064:4,11,0,2
chr1	12318076	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:9,0:4,2:0|1:12318064_C_T:12318064:4,10,0,2
chr1	12359455	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=119,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:1,5:3,0:2,3,2,3
chr1	12368725	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:12368725_T_C:12368725:1,2,0,1
chr1	12368727	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:0,1:0|1:12368725_T_C:12368725:1,2,0,1
chr1	12390076	.	G	GAGTGAGGTAGACTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	12402041	.	GG	AA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=201,185;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr1	12409302	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=198,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,0:8,2:7,10,1,1
chr1	12464123	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=191,250;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.384:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr1	12567232	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr1	12628471	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=110,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,0:6,4:1,6,2,2
chr1	12632845	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=113,53;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,2:8,2:8,6,3,1
chr1	12639018	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=225,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	12639226	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=215,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr1	12704466	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=211,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	12704773	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=122,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:12704773_C_T:12704773:3,1,0,1
chr1	12704781	.	G	GGTCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=140,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:12704773_C_T:12704773:2,1,0,1
chr1	12704783	.	T	TTTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=117,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:12704773_C_T:12704773:1,1,0,1
chr1	12776218	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=271,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr1	12781028	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.709:1:0,0:0,1:0|1:12781028_G_T:12781028:0,0,1,0
chr1	12781038	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:12781028_G_T:12781028:0,0,1,0
chr1	12785093	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	12785295	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,272;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,3:5,1:8,3,1,3
chr1	12837547	.	TG	CA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=157,242;MMQ=60,24;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:12,2:6,1:5,14,2,1
chr1	12837564	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=178,242;MMQ=60,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:11,2:7,1:0|1:12837564_G_T:12837564:6,14,2,1
chr1	12837570	.	GA	AG	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=176,242;MMQ=60,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:10,2:8,1:0|1:12837564_G_T:12837564:7,14,2,1
chr1	12837634	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=51,152;MMQ=25,44;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,3:7,1:16,2,3,1
chr1	12837652	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=100,152;MMQ=60,44;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.353:12:2,3:6,1:5,3,3,1
chr1	12837664	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=36,27;MFRL=144,54;MMQ=60,42;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,1:7,1:3,5,1,1
chr1	12837728	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=193,222;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,2:3,2:1,10,0,4
chr1	12837764	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=242,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:1,4,0,4
chr1	12853977	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=164,209;MMQ=50,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	12854414	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=155,116;MMQ=50,25;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:4,2:9,3:6,7,2,3
chr1	12854713	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr1	12856153	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=139,174;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,2:1,4:2,1,0,6
chr1	12885087	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=191,204;MMQ=30,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12885087_TG_CA:12885087:1,1,0,1
chr1	12885097	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=191,204;MMQ=30,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:12885087_TG_CA:12885087:1,1,0,1
chr1	12907169	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=176,186;MMQ=40,31;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	12907199	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=150,179;MMQ=40,31;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:2,1,5,0
chr1	12907212	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=150,156;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:2,1,3,0
chr1	12907316	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=27,33;MFRL=92,176;MMQ=54,35;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.280:9:5,1:1,1:2,5,0,2
chr1	12907438	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=25,29;MFRL=139,181;MMQ=52,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.289:12:2,2:6,1:0|1:12907438_A_G:12907438:5,4,2,1
chr1	12907446	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=138,181;MMQ=52,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,2:5,1:0|1:12907438_A_G:12907438:4,4,2,1
chr1	12907450	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=20,35;MFRL=113,181;MMQ=52,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,2:2,1:0|1:12907438_A_G:12907438:3,4,2,1
chr1	12907457	.	AT	GA	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=20,30;MFRL=113,181;MMQ=40,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0|1:12907438_A_G:12907438:2,4,2,1
chr1	12907465	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=20,36;MFRL=113,181;MMQ=40,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0|1:12907438_A_G:12907438:2,5,2,1
chr1	12907469	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=20,35;MFRL=113,181;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0|1:12907438_A_G:12907438:2,5,2,1
chr1	12907483	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=138,183;MMQ=40,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:12907438_A_G:12907438:2,6,2,0
chr1	12907768	.	A	AACTGGCTAGC	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=29,23;MFRL=151,176;MMQ=52,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:11,5,0,2
chr1	12907777	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=135,222;MMQ=52,30;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:4,3:8,2:0|1:12907777_T_C:12907777:7,5,6,0
chr1	12907781	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=135,222;MMQ=52,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:4,2:8,3:0|1:12907777_T_C:12907777:7,5,6,0
chr1	12907798	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=122,191;MMQ=52,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:6,3:7,3:0|1:12907777_T_C:12907777:7,6,6,0
chr1	12907802	.	CC	TT	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=122,191;MMQ=52,36;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:6,3:7,3:0|1:12907777_T_C:12907777:7,7,6,0
chr1	12907837	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=147,197;MMQ=52,36;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.306:21:5,2:9,4:9,6,6,0
chr1	12908236	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=128,169;MMQ=29,40;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:0|1:12908236_G_T:12908236:2,4,4,1
chr1	12908243	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=135,176;MMQ=41,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:1,1:6,2:0|1:12908236_G_T:12908236:2,6,2,1
chr1	12908333	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,235;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr1	12918784	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=205,192;MMQ=60,28;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12918784_T_C:12918784:2,0,1,0
chr1	12918793	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=199,192;MMQ=60,28;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:12918784_T_C:12918784:4,0,1,0
chr1	12918814	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,36;MFRL=168,192;MMQ=60,28;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr1	12918934	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=157,219;MMQ=49,32;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:7,6,2,0
chr1	12918945	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=157,219;MMQ=49,32;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:5,6,2,0
chr1	12919237	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=201,211;MMQ=60,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:1,8,0,2
chr1	12919587	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=175,257;MMQ=43,32;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.219:12:4,1:3,0:0|1:12919587_T_C:12919587:3,7,0,2
chr1	12919589	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=160,257;MMQ=40,32;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.234:11:6,1:3,1:0|1:12919587_T_C:12919587:3,6,0,2
chr1	12919642	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=180,293;MMQ=50,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,1:7,2:8,5,0,3
chr1	12921716	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,298;MMQ=26,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,3:4,4:1,3,1,6
chr1	12943277	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=37,27;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,1,3
chr1	12953244	.	TG	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,356;MMQ=24,22;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,1,0
chr1	12954491	.	GAGGAATGGAGAGTCCAAGTC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=80,36;MMQ=50,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:1,0:2,4,1,1
chr1	13182899	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=178,174;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,4,1
chr1	13182929	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=169,169;MMQ=34,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr1	13182942	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=167,169;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr1	13183012	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=147,197;MMQ=49,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,2:7,1:0|1:13183012_G_C:13183012:6,7,0,3
chr1	13183014	.	TG	CC	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=147,197;MMQ=49,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,2:5,1:0|1:13183012_G_C:13183012:6,7,0,3
chr1	13183053	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=33,21;MFRL=131,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,1:3,3:3,5,2,2
chr1	13183511	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=104,203;MMQ=52,48;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.589:15:5,3:1,6:0|1:13183511_T_C:13183511:3,3,1,8
chr1	13183528	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=25,36;MFRL=109,177;MMQ=52,48;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:7,2:1,4:0|1:13183511_T_C:13183511:5,5,0,7
chr1	13183532	.	CC	TT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=115,194;MMQ=52,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:6,2:2,4:0|1:13183511_T_C:13183511:6,4,0,6
chr1	13183567	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=177,111;MMQ=52,48;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,2:9,1:10,5,1,2
chr1	13183966	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,127;MMQ=40,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.399:13:4,0:3,5:0|1:13183966_G_T:13183966:4,4,3,2
chr1	13183973	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=137,174;MMQ=36,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,3:0.267:13:3,2:7,1:1|0:13183966_G_T:13183966:4,6,3,0
chr1	13448084	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,248;MMQ=60,25;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	13448116	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,248;MMQ=60,25;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	13668983	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,243;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:13668983_C_T:13668983:0,0,1,0
chr1	13668986	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,243;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:13668983_C_T:13668983:0,0,1,0
chr1	13695974	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,151;MMQ=60,24;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	13716732	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,244;MMQ=60,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:13716732_T_G:13716732:0,0,1,0
chr1	13716741	.	GC	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:13716732_T_G:13716732:0,0,1,0
chr1	13719052	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,81;MMQ=60,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	13743192	.	C	CCCAAGAAAAGAACAAAGGAACTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=208,171;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	13910346	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:11,4,1,1
chr1	13936822	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,7:0,0,6,4
chr1	13937089	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=247,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	14057460	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,10;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,0:6,0:14,4,2,0
chr1	14059395	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.384:37:18,8:5,6:13,10,4,10
chr1	14068753	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=218,165;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr1	14099763	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr1	14105139	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=156,115;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:7,3:9,3:13,3,5,1
chr1	14106271	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:8,9,0,2
chr1	14149601	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=119,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:8,4:3,1:6,5,5,0
chr1	14149622	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=132,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,4:6,1:5,7,5,0
chr1	14507131	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,158;MMQ=60,20;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:5,0:6,3:3,8,0,3
chr1	15390145	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=183,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,4:3,0:0|1:15390145_A_G:15390145:1,4,1,3
chr1	15390178	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=187,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,2:1,1:0|1:15390145_A_G:15390145:1,5,0,3
chr1	15390211	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0|1:15390145_A_G:15390145:0,2,0,4
chr1	15420616	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,240;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	15427982	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=150,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:3,2,2,0
chr1	15428358	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	15438825	.	ATGTGTGTGTGTGTGTG	A,ATG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,151,160;MMQ=60,60,60;MPOS=25,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,14,15;RU=TG;STR;TLOD=9.34,10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,4:0.458,0.458:8:0,3,3:0,1,1:0,0,8,0
chr1	15439083	.	A	AAGGTCTTTTTTTTCTTCTCCCAGCGGC,AAGGTCTTTTTTTTTCTTCTCCCAGCGGC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28,30;MFRL=0,108,173;MMQ=60,60,60;MPOS=11,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.41,4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.522,0.382:5:0,1,1:0,2,1:0,0,1,4
chr1	15495100	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:8,2:5,5:6,7,5,2
chr1	15495110	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,7:4,6:6,2,6,7
chr1	15497844	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr1	15541537	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	15578195	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=229,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,6,1
chr1	15616183	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	15651062	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,2:5,4:2,6,3,3
chr1	15653503	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=168,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	15708540	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,0:3,6:3,6,5,1
chr1	15709555	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=113,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,2:5,3:5,5,3,2
chr1	15755248	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=150,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:0,3,1,6
chr1	15769139	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr1	15769876	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	15772057	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=114,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:2,2:1,2:2,1,4,1
chr1	15772933	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=234,250;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr1	15783117	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	15788051	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=189,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:3,3:6,1:5,4,3,1
chr1	15789176	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=152,227;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:7,0,3,0
chr1	15789885	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=206,222;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:4,3,1,1
chr1	15808289	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=184,147;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,2:7,0:2,8,0,2
chr1	15808702	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=192,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr1	15809706	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=165,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr1	15813751	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr1	15813969	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,1,4
chr1	15820576	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	15832383	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	15834297	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=213,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.826:13:0,6:1,5:1,1,8,3
chr1	15844926	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=173,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:1,3,0,5
chr1	15873386	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=169,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.648:18:3,9:3,2:4,2,4,8
chr1	15874961	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=188,216;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:1,4,0,3
chr1	15890342	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=175,217;MMQ=37,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.723:5:0,3:0,1:1,0,4,0
chr1	15892419	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:6,6,2,0
chr1	15901336	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=136,129;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:9,3:4,0:6,7,0,3
chr1	15909624	.	TGAGTACAG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=221,234;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr1	15909895	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=133,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	15911349	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr1	15959886	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr1	15986983	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=163,207;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,0:6,4:6,7,0,5
chr1	16011005	.	G	GGGC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=119,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GGC;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:2,1:0,0:2,0,2,0
chr1	16042724	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=198,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:16042724_TC_T:16042724:1,0,1,0
chr1	16042729	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:16042724_TC_T:16042724:3,0,1,0
chr1	16042766	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,4:4,1:3,1,2,3
chr1	16042802	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:4,4,0,2
chr1	16043157	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,3:1,4:2,0,5,2
chr1	16044929	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=241,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	16044945	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=188,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	16045174	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=112,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,2,2
chr1	16047726	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:16047726_T_C:16047726:1,0,2,0
chr1	16047738	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:16047726_T_C:16047726:1,1,2,0
chr1	16047742	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=19,22;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.520:4:1,0:0,1:1,1,2,0
chr1	16062916	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	16101183	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=101,151;MMQ=53,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,1,1
chr1	16101217	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=170,105;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:1,3,3,2
chr1	16101220	.	CC	TG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=170,63;MMQ=60,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:4,4,1,1
chr1	16101335	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,95882405;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:7,4,1,1
chr1	16101571	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=287,249;MMQ=45,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	16101583	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,249;MMQ=60,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:16101583_C_T:16101583:0,0,0,1
chr1	16101586	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,249;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16101583_C_T:16101583:0,0,0,1
chr1	16101588	.	GC	TT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,249;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16101583_C_T:16101583:0,0,0,1
chr1	16134200	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:5,12,0,2
chr1	16255279	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:8,5:13,0:16,5,5,0
chr1	16258348	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:13,6:11,0:10,14,6,0
chr1	16258397	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,3:8,0:9,9,1,2
chr1	16260447	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=13,20;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:1,2:2,0:6,2,3,0
chr1	16264264	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:6,3,1,2
chr1	16265422	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr1	16266010	.	G	GCCTCAGCCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16266010_G_GCCTCAGCCTC:16266010:0,1,0,1
chr1	16266014	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16266010_G_GCCTCAGCCTC:16266010:0,1,0,1
chr1	16266016	.	G	GCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16266010_G_GCCTCAGCCTC:16266010:0,1,0,1
chr1	16268766	.	A	ACCAGGCGCAAGGCAGGCTCTGTAG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=179,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.220:11:4,0:5,2:5,4,1,1
chr1	16269595	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,0:3,3:5,4,3,0
chr1	16274769	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,3:6,2:11,3,4,1
chr1	16342350	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=157,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,1:0,2,0,3
chr1	16344730	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	16345619	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,2:0,2:2,0,3,1
chr1	16346009	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=244,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr1	16351275	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=142,156;MMQ=56,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:3,2:2,1:4,2,3,0
chr1	16354280	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,255;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	16354394	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=196,145;MMQ=40,24;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr1	16354433	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=168,145;MMQ=40,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:16354433_A_AT:16354433:5,0,0,2
chr1	16354435	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=168,145;MMQ=40,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:16354433_A_AT:16354433:5,0,0,2
chr1	16354441	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=139,145;MMQ=40,24;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,0,2
chr1	16356315	.	GTT	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=127,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:0|1:16356315_GTT_G:16356315:4,4,1,1
chr1	16356319	.	T	TAA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=127,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:1,0:0|1:16356315_GTT_G:16356315:4,4,1,1
chr1	16356322	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=137,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,3:2,0:4,3,1,2
chr1	16356501	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:5,4,3,2
chr1	16356583	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:1,2:5,4:4,2,2,4
chr1	16358148	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=221,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,3,3
chr1	16358348	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=148,176;MMQ=58,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,1:6,1:2,14,2,0
chr1	16358685	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,6:1,8:1,0,12,2
chr1	16359051	.	CA	AG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,2:3,3:4,5,2,3
chr1	16359052	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.478:14:5,3:2,4:3,4,3,4
chr1	16359106	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr1	16359123	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=157,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr1	16370899	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=197,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr1	16372003	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=175,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	16372971	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=207,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:2,0,6,0
chr1	16373199	.	CCTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=162,263;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr1	16374330	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:1,6:5,2:6,0,9,0
chr1	16374622	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	16375838	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,344;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	16376191	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=305,167;MMQ=40,40;MPOS=33;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr1	16376230	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=117,238;MMQ=34,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0|1:16376230_A_AT:16376230:3,1,4,1
chr1	16376232	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=117,238;MMQ=34,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0|1:16376230_A_AT:16376230:3,1,4,1
chr1	16376238	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=23,27;MFRL=117,238;MMQ=34,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.629:11:1,3:3,4:3,1,6,1
chr1	16376278	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=118,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,4:2,10:2,3,10,4
chr1	16376458	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=181,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,6:3,3:0,5,1,8
chr1	16378649	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:4,2,2,1
chr1	16382086	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=173,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:4,2:1,3:1,4,4,2
chr1	16382827	.	CTCT	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:0,0,7,0
chr1	16382831	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:0,0,7,0
chr1	16382834	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	16382877	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,4:3,5:3,1,7,2
chr1	16382935	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=131,33;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:4,6,0,2
chr1	16383329	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=145,126;MMQ=52,44;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:16383329_T_TC:16383329:0,4,0,2
chr1	16383336	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=145,126;MMQ=52,44;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:16383329_T_TC:16383329:0,4,0,2
chr1	16383448	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,8:0,0,4,15
chr1	16383605	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=184,262;MMQ=34,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:6,0,1,1
chr1	16383668	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr1	16385248	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=126,186;MMQ=44,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0|1:16385248_C_T:16385248:0,2,1,2
chr1	16385250	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=126,186;MMQ=44,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0|1:16385248_C_T:16385248:0,2,1,2
chr1	16385980	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=0,162;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,3:2,5:0,7,4,4
chr1	16386008	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=197,140;MMQ=52,50;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:4,2:1,4:2,3,4,3
chr1	16386334	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,9975;MMQ=60,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16386334_G_GC:16386334:0,0,0,1
chr1	16386336	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,9975;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16386334_G_GC:16386334:0,0,0,1
chr1	16386341	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=248,9975;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:16386334_G_GC:16386334:1,0,0,1
chr1	16388556	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=92,127;MMQ=60,44;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:16388556_C_T:16388556:4,0,2,0
chr1	16388565	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=83,127;MMQ=60,44;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:0|1:16388556_C_T:16388556:4,1,2,0
chr1	16388709	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr1	16388756	.	CACCCAT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=204,147;MMQ=39,42;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:2,1:3,1,0,2
chr1	16388766	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr1	16388875	.	GCCCCC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=269,186;MMQ=51,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,9;RU=C;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.332:4:0,0:3,1:3,0,0,1
chr1	16389118	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=334,25758594;MMQ=60,45;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr1	16456994	.	CAGGGG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,191;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGGGG;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr1	16458814	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=201,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,2:4,1:3,6,3,0
chr1	16525056	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=190,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,7:1,5:1,0,7,6
chr1	16525549	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	16528233	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	16528439	.	CCAG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=194,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	16528823	.	GCCATGGGGACGGGGTGCCCA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	16529117	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr1	16529128	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=176,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,0:6,3:1,8,1,2
chr1	16534002	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,6:0,4:1,0,6,4
chr1	16534730	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=213,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr1	16543175	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	16578304	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=255,161;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,0:3,6:0,5,0,6
chr1	16727446	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=215,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:0,4,1,2
chr1	16730324	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=169,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:7,8,0,2
chr1	16731406	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr1	16731609	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,6:1,2:1,3,1,7
chr1	16731646	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr1	16748153	.	CCT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=218,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16748153_CCT_C:16748153:0,1,0,1
chr1	16748161	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=218,146;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16748153_CCT_C:16748153:0,1,0,1
chr1	16775582	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=131,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,0:6,3:9,4,2,1
chr1	16778265	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=127,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,3:3,3:7,1,5,1
chr1	16890421	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=149,153;MMQ=44,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.450:38:11,9:10,8:18,3,11,6
chr1	16890441	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=146,201;MMQ=60,46;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,7:0.149:51:26,5:18,2:24,20,7,0
chr1	16890737	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=160,214;MMQ=48,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.137:27:14,0:10,3:0|1:16890737_C_A:16890737:6,18,2,1
chr1	16890760	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=155,156;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,8:0.333:25:12,6:5,2:1|0:16890737_C_A:16890737:5,12,0,8
chr1	16890771	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=160,156;MMQ=52,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:12,5:8,1:4,17,0,6
chr1	16893841	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=165,207;MMQ=40,39;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.087:55:22,2:29,2:8,43,0,4
chr1	16893854	.	A	C	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=167,180;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,5:0.094:61:28,0:28,5:7,49,0,5
chr1	16893884	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=193,180;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,25:0.650:38:8,11:5,14:0,13,3,22
chr1	16907164	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=145,121;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,7:0.159:48:21,3:20,4:26,15,3,4
chr1	16907165	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=125,164;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.102:47:21,2:22,2:26,17,2,2
chr1	16907204	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=156,120;MMQ=44,32;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,8:0.181:47:18,5:21,3:23,16,7,1
chr1	16907466	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=184,228;MMQ=27,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,1:6,2:0,11,0,3
chr1	16909000	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=172,152;MMQ=27,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,1:7,4:4,7,0,5
chr1	16913633	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=112,144;MMQ=52,22;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:7,4:13,0:11,9,1,3
chr1	16914159	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=158,142;MMQ=51,23;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:18,3:11,2:18,13,3,2
chr1	16914160	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=142,175;MMQ=52,26;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.231:37:17,4:11,4:15,14,6,2
chr1	16914168	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=148,187;MMQ=52,28;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.368:36:14,7:9,6:11,12,10,3
chr1	16914176	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=158,71;MMQ=50,29;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.142:40:20,3:15,2:22,13,4,1
chr1	16914393	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=150,185;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:16914393_G_T:16914393:1,5,0,2
chr1	16914396	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=150,185;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,0:3,2:0|1:16914393_G_T:16914393:1,5,0,2
chr1	16915609	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=179,136;MMQ=21,20;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr1	16918255	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=192,213;MMQ=24,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,2:6,3:14,1,5,0
chr1	16918427	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=148,60;MMQ=52,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:27,2:27,1:23,32,2,1
chr1	16918429	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=154,60;MMQ=52,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,2:0.049:59:27,2:28,0:0|1:16918429_C_T:16918429:25,32,1,1
chr1	16918430	.	T	TGATGA	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=148,60;MMQ=53,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,2:0.051:57:27,2:28,0:0|1:16918429_C_T:16918429:24,31,1,1
chr1	16918502	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=197,175;MMQ=56,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,4:4,5:4,4,3,6
chr1	16918611	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,180;MMQ=22,20;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,1:6,2:1,7,2,1
chr1	17248532	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,15:0,0,15,7
chr1	17251055	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:1,2:1,4:0,2,1,6
chr1	17256313	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=220,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	17257187	.	G	GTCCGAGGGAGCACTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=181,258;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	17264090	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=183,168;MMQ=50,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:4,3,5,0
chr1	17264296	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=133,168;MMQ=54,55;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.547:11:1,2:3,4:2,3,1,5
chr1	17264863	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=128,107;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,1:5,6:5,6,5,2
chr1	17265366	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,3:6,2:8,4,2,3
chr1	17265396	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=160,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.159:21:8,2:7,0:4,14,3,0
chr1	17266512	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=158,0;MMQ=60,29;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:4,6,0,2
chr1	17266536	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=0,144;MMQ=30,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,2,3
chr1	17280022	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0|1:17280022_A_T:17280022:0,0,0,3
chr1	17280025	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:17280022_A_T:17280022:0,0,0,3
chr1	17280045	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:17280022_A_T:17280022:0,0,0,2
chr1	17280051	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:17280022_A_T:17280022:0,0,0,2
chr1	17280057	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,24;MFRL=0,217;MMQ=60,45;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:17280022_A_T:17280022:0,0,0,2
chr1	17280061	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,29;MFRL=0,244;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17280022_A_T:17280022:0,0,0,1
chr1	17280074	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,26;MFRL=0,244;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17280022_A_T:17280022:0,0,0,1
chr1	17280077	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,244;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17280022_A_T:17280022:0,0,0,1
chr1	17281382	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:0,3,0,4
chr1	17282573	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,220;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,2:4,0:5,7,2,0
chr1	17296463	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=164,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr1	17297200	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=106,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,5:6,4:6,6,6,3
chr1	17297289	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=135,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,6:0,4:1,0,1,9
chr1	17299013	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	17301672	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,5:1,2:2,0,7,0
chr1	17303354	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=185,74;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,3:5,0:2,9,2,1
chr1	17303589	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=202,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:2,9:0,7:0,2,7,9
chr1	17303792	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	17313157	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	17323449	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=228,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,2:0,4:3,0,6,0
chr1	17326767	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:4,6,4,0
chr1	17328562	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=141,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,2:11,0:8,9,1,1
chr1	17328838	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,0:10,2:7,11,2,0
chr1	17330912	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.421:29:14,0:2,12:1,16,0,12
chr1	17331676	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=177,268;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr1	17345434	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:1,14,0,2
chr1	17349266	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:1,9,0,2
chr1	17359676	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr1	17395521	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=214,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:5,0,1,2
chr1	17396498	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=253,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr1	17398066	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=160,238;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:17398066_G_C:17398066:0,3,0,1
chr1	17398069	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=186,238;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:17398066_G_C:17398066:0,2,0,1
chr1	17401283	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=306,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr1	17402135	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:1,1,3,1
chr1	17402159	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.725:8:0,4:1,2:0,2,4,2
chr1	17402347	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr1	17405916	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:1,1,1,2
chr1	17405949	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	17409017	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=211,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,1:2,3:2,2,5,0
chr1	17409241	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=140,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	17410364	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=221,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	17418883	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,7,2
chr1	17418929	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=144,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.350:6:2,0:2,1:3,1,0,2
chr1	17550225	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr1	17555103	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=182,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:3,5:3,1:2,4,5,2
chr1	17557039	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=26,32;MFRL=167,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,4:4,2:5,2,5,1
chr1	17557118	.	G	GCCTCACCACCCTGTTTCCCTGCACTCCTC	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=143,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:3,2:15,0:0|1:17557118_G_GCCTCACCACCCTGTTTCCCTGCACTCCTC:17557118:5,13,0,2
chr1	17557122	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=30,31;MFRL=143,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:3,2:15,0:0|1:17557118_G_GCCTCACCACCCTGTTTCCCTGCACTCCTC:17557118:5,14,0,2
chr1	17557125	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=26,32;MFRL=149,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:3,2:13,0:0|1:17557118_G_GCCTCACCACCCTGTTTCCCTGCACTCCTC:17557118:5,13,0,2
chr1	17557133	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=29,30;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,1:5,10:2,5,3,8
chr1	17557178	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=27,32;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,0:3,4:0,5,1,3
chr1	17557208	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,23;MFRL=155,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:17557208_G_A:17557208:0,3,0,1
chr1	17557211	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=34,23;MFRL=151,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:17557208_G_A:17557208:0,4,0,1
chr1	17592121	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=148,243;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:4,2,2,0
chr1	17597721	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=201,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:2,5,0,2
chr1	17601345	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:17601345_G_A:17601345:0,3,0,1
chr1	17601348	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:17601345_G_A:17601345:0,3,0,1
chr1	17607068	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=204,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,1:3,2:6,2,3,0
chr1	17660499	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.818:20:1,6:2,11:1,2,7,10
chr1	17660697	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:1,5:0,7:1,0,9,3
chr1	17660802	.	A	ATT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.935:10:0,8:0,2:0,0,4,6
chr1	17662541	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	17662573	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=176,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,1:0,1:6,0,2,0
chr1	17662751	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,10:0,0,7,16
chr1	17662804	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	17666095	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	17668623	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=129,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.530:19:3,2:5,8:2,7,4,6
chr1	17672642	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:6,1:0,2:2,4,0,3
chr1	17674402	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=108,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr1	17683041	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=183,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,2:1,1:0,3,0,4
chr1	17689954	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=183,261;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:8,1:1,1:7,2,2,0
chr1	17707739	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=156,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr1	17707752	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=211,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:17707752_A_G:17707752:0,3,0,1
chr1	17707757	.	CG	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=165,345;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	17707758	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:17707752_A_G:17707752:0,2,0,1
chr1	17708580	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=129,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:6,0:10,4:4,12,0,4
chr1	17718671	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr1	17720439	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=190,298;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:4,1:1,1:4,1,1,1
chr1	17720615	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=131,231;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr1	17721695	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.798:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	17736578	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,4:5,3:3,6,2,5
chr1	17739586	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=151,295;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:7,1:2,1:7,2,1,1
chr1	17740079	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=186,0;MMQ=60,29;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,3:11,0:8,8,0,3
chr1	17764857	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=20,33;MFRL=186,187;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:17764857_C_T:17764857:0,2,0,1
chr1	17764866	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=186,187;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:17764857_C_T:17764857:0,2,0,1
chr1	17764870	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=186,187;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:17764857_C_T:17764857:0,2,0,1
chr1	17764877	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,35;MFRL=190,187;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17764857_C_T:17764857:0,1,0,1
chr1	17764880	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,27;MFRL=190,187;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17764857_C_T:17764857:0,1,0,1
chr1	17764882	.	A	ACTCAGGAAACCAGGGT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=190,187;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17764857_C_T:17764857:0,1,0,1
chr1	17914846	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=157,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:4,1,3,0
chr1	17929972	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=126,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:0|1:17929972_G_T:17929972:4,2,1,2
chr1	17929980	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=116,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,4:0.455:9:1,2:4,2:1|0:17929972_G_T:17929972:2,3,3,1
chr1	17929990	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=135,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:1,1:5,2:0|1:17929972_G_T:17929972:4,3,1,2
chr1	17944749	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr1	17965194	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,250;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:5,6,1,1
chr1	17981230	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=181,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,1:5,1:1,5,0,2
chr1	17982441	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=116,47202789;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:6,1:16,1:13,9,1,1
chr1	17982628	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr1	18021867	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	18023290	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	18554345	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=143,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr1	18554356	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=183,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:3,2,2,0
chr1	18702988	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	18703208	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr1	18704829	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=218,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr1	18704862	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=116,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,1,2
chr1	18808292	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=194,143;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:4,4,1,2
chr1	18812478	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=182,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.401:10:3,2:2,0:3,3,2,2
chr1	18960722	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	19018305	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=175,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:4,3,1,2
chr1	19199473	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.686:14:2,6:2,3:0,4,1,9
chr1	19200908	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=201,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr1	19202006	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:4,2:1,0:0|1:19202006_G_GA:19202006:2,3,1,1
chr1	19202009	.	G	GACATGGTGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:4,2:1,0:0|1:19202006_G_GA:19202006:2,3,1,1
chr1	19202768	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=178,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:3,2:0,0:0|1:19202768_G_A:19202768:3,0,1,1
chr1	19202770	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0|1:19202768_G_A:19202768:0,0,4,1
chr1	19204154	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=202,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:0,1,2,5
chr1	19204173	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=87,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	19208145	.	G	GGGTTGCCT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,10,3
chr1	19209543	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr1	19209615	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=171,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,1:8,1:8,8,1,1
chr1	19211925	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:19211925_A_C:19211925:0,0,3,0
chr1	19211930	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:19211925_A_C:19211925:0,0,3,0
chr1	19211935	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:19211925_A_C:19211925:0,0,3,0
chr1	19215834	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,6:0,0,8,3
chr1	19215877	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=158,69;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,1:3,3:6,3,4,0
chr1	19235237	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=190,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr1	19238001	.	T	TTTTA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=409,133;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=TTTA;STR;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	19408294	.	G	GC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.447:18:5,5:5,2:2,8,1,7
chr1	19408380	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=206,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:2,0:6,2:1,7,0,3
chr1	19420392	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=226,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:4,2:1,1:3,2,3,1
chr1	19426199	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:2,3,1,4
chr1	19431032	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=253,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	19431779	.	T	TGTCTTACTCTCTTTCTCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=187,263;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	19437185	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=199,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:5,0,5,0
chr1	19441212	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=327,238;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	19447843	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=185,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:2,3:11,3:6,7,1,5
chr1	19447973	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=94.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,30:0.689:43:6,0:7,30:1,12,0,30
chr1	19448326	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=154,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	19448608	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=180,185;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	19454758	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=142,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,0:11,2:7,14,1,1
chr1	19465751	.	CAAA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,0:5,4:4,7,0,4
chr1	19467445	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=143,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr1	19476307	.	GAA	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,17;MFRL=179,89;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.170:20:1,1:6,0:4,13,1,2
chr1	19479018	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=157,125;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:7,2:0|1:19479018_C_T:19479018:4,8,0,2
chr1	19479027	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=151,125;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:5,2:0|1:19479018_C_T:19479018:3,7,0,2
chr1	19486839	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=236,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:0,6,0,4
chr1	19488839	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=204,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr1	19491857	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=277,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	19499835	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=202,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0,4,2,2
chr1	19528281	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=141,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,1:13,1:9,9,1,1
chr1	19557713	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:4,2,1,1
chr1	19564529	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=123,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:7,1:9,5,2,0
chr1	19566296	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=123,40;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,1:6,3:7,3,2,2
chr1	19566525	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:2,0:5,2:1,7,1,1
chr1	19566833	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=151,18;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.152:37:18,0:14,5:21,11,5,0
chr1	19578053	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,1:4,5:0,5,0,6
chr1	19578192	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=195,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,3,1
chr1	19578404	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.556:14:1,3:5,4:1,5,2,6
chr1	19582563	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=211,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,1,3
chr1	19583726	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=190,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	19583734	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=190,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	19593748	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.475:17:6,6:3,2:7,2,5,3
chr1	19595892	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,4:2,6:2,3,0,10
chr1	19597420	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,3:6,2:3,9,4,1
chr1	19611410	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr1	19612404	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,142;MMQ=52,44;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:6,7,2,0
chr1	19638309	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr1	19644385	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=126,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:3,9,1,1
chr1	19651277	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:1,4,1,1
chr1	19652110	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,36;MFRL=86,246;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:0,0:3,1:1,2,0,1
chr1	19652127	.	AGTT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=86,245;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	19652642	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,311;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	19654021	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,10;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:1,0:1,0:0|1:19654021_C_A:19654021:2,1,1,0
chr1	19654023	.	A	ATCCCTCCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=15,28;MFRL=139,0;MMQ=60,42;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TCCC;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:0,0:0,1:1,0,0,1
chr1	19654028	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=79,139;MMQ=51,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:19654021_C_A:19654021:1,1,1,0
chr1	19654032	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=79,139;MMQ=51,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:19654021_C_A:19654021:1,1,1,0
chr1	19654036	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=0,139;MMQ=42,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:19654021_C_A:19654021:0,1,1,0
chr1	19666017	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=161,67;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,0:4,3:5,5,2,1
chr1	19670918	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=118,189;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:9,0:9,6:10,8,0,6
chr1	19972444	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:4,6:13,0:9,8,6,0
chr1	19981451	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=104,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr1	19981467	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=210,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:19981467_C_T:19981467:3,0,1,0
chr1	19981476	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=238,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:19981467_C_T:19981467:3,0,1,0
chr1	19981791	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,2:3,8:5,1,5,5
chr1	20027207	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:7,1,2,0
chr1	20066325	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:7,1:8,5,1,1
chr1	20066485	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=298,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:0|1:20066485_G_A:20066485:0,2,3,4
chr1	20066490	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=298,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:0,3:1,3:0|1:20066485_G_A:20066485:0,2,3,3
chr1	20067186	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=205,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr1	20073146	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,10:0,3:0,1,7,6
chr1	20107018	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr1	20216860	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=211,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,3:1,6:1,1,7,2
chr1	20248709	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:9,0,2,1
chr1	20250169	.	AC	TT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=159,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0|1:20250169_AC_TT:20250169:0,1,0,1
chr1	20250173	.	CCTG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=160,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:20250169_AC_TT:20250169:0,2,0,1
chr1	20305065	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,1,5
chr1	20411234	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=116,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,3:1,0:2,1,1,2
chr1	20411300	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=174,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.555:12:3,5:2,2:5,0,4,3
chr1	20442831	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=187,41;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,5:5,3:4,3,3,5
chr1	20518628	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,2:6,3:8,4,3,2
chr1	20520028	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,3:10,0:8,7,2,1
chr1	20522363	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=129,172;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.175:38:18,6:13,0:18,14,6,0
chr1	20645120	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,2:6,3:4,5,4,1
chr1	20649814	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	20657352	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=282,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:3,4:1,11:3,1,6,9
chr1	20664128	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,3:1,7:0,1,6,4
chr1	20680760	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=25,35;MFRL=219,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,2,3
chr1	20680775	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=177,213;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:1,1:2,0:0|1:20680775_G_GA:20680775:0,3,0,1
chr1	20680777	.	G	GCACGAGAA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=177,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:20680775_G_GA:20680775:0,3,0,1
chr1	20680779	.	G	GGCTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=177,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:20680775_G_GA:20680775:0,3,0,1
chr1	20680830	.	T	TTGAAACC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=270,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0|1:20680830_T_TTGAAACC:20680830:0,1,0,1
chr1	20680832	.	G	GTGGTAGCAGAGCCTACAT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=270,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0|1:20680830_T_TTGAAACC:20680830:0,1,0,1
chr1	20880554	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=142,273;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr1	20940258	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,1:0,0,9,2
chr1	20964328	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,8,9
chr1	20972048	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,6,4
chr1	20972304	.	GGTTTTGTGTTCTAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr1	20975168	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	20977221	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	20978832	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	20979307	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr1	20980787	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=107,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,1:9,1:12,10,1,1
chr1	20980880	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=75,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:3,10:8,4:7,4,7,7
chr1	20991273	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:1,6:5,2:2,4,1,7
chr1	21030902	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=189,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	21053475	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,3:6,0:6,4,3,0
chr1	21091861	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,1:0,6:1,0,6,1
chr1	21094061	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:2,3:8,0:7,3,3,0
chr1	21102502	.	CAAAA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,34;MFRL=94,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=A;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.311:7:2,0:0,2:1,4,0,2
chr1	21175855	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	21179969	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	21180181	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,2:0,10:0,0,3,9
chr1	21180250	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	21188703	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.921:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr1	21220089	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=173,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:5,5,2,0
chr1	21220142	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=172,112;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:2,7,0,2
chr1	21221851	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,60;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:9,2,2,0
chr1	21267993	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:2,2,2,2
chr1	21327637	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	21377314	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	21415549	.	TCAAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAAA;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr1	21494648	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=150,0;MMQ=55,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:1,12,2,0
chr1	21546438	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,3:8,0:10,8,2,1
chr1	21548293	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,107529728;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:5,3,1,1
chr1	21551721	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr1	21560120	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=66,257;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:3,5,0,2
chr1	21571601	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=127,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:8,5:7,2:8,7,2,5
chr1	21582348	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=216,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:5,0,4,0
chr1	21583925	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=197,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:7,0,3,0
chr1	21583973	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=156,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.458:11:1,1:5,4:3,3,4,1
chr1	21599413	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:0,9,0,2
chr1	21795432	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=242,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.823:15:1,8:1,5:0,2,5,8
chr1	21797221	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=105,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,1:8,3:8,8,3,1
chr1	21797996	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=194,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:4,2,2,0
chr1	21799489	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=74.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:1,8:0,15:0,1,9,14
chr1	21799823	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=53.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,13,2
chr1	21801346	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,43;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	21804815	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr1	21805730	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,155;MMQ=60,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr1	21805978	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	21806525	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=205,153;MMQ=40,41;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,1:0,4:0,1,4,1
chr1	21806751	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	21807521	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=185,155;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	21889506	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=251,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr1	21889635	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=140,110;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:1,1:5,10:4,2,6,5
chr1	21889784	.	CG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=175,202;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:2,0:1,5,1,1
chr1	21890464	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	21896767	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,104;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:6,1,1,1
chr1	21902950	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=257,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	21926187	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	21929260	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	21929456	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr1	21932530	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	21934667	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,0:2,6:1,1,5,1
chr1	21936792	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,1:6,2:4,9,1,2
chr1	21938008	.	G	GA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:14,0:11,3:11,14,0,3
chr1	21938375	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=174,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:1,3,3,3
chr1	21939741	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=190,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,1:5,4:3,3,2,3
chr1	21944352	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:1,4,3,1
chr1	21946415	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	21952843	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:6,4,0,2
chr1	22007443	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	22016678	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=184,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	22033152	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=187,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:5,0:5,5:2,9,5,0
chr1	22033228	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=133,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,2:7,3:8,4,3,2
chr1	22047551	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=148,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:9,0:2,2:0|1:22047551_C_T:22047551:6,5,1,1
chr1	22047554	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=148,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:9,0:2,2:0|1:22047551_C_T:22047551:6,5,1,1
chr1	22063149	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	22083000	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,15;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.268:12:4,0:5,0:3,6,3,0
chr1	22147963	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:11,5:6,0:11,6,5,0
chr1	22148164	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,0,3
chr1	22151228	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=195,52;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,0:6,4:7,7,0,4
chr1	22155841	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,4:3,0:0|1:22155841_T_C:22155841:4,2,2,2
chr1	22155853	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=154,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:0|1:22155841_T_C:22155841:4,2,1,2
chr1	22157689	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=175,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,3:4,0:4,2,2,1
chr1	22158120	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=147,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=104.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,38:0.829:45:4,18:3,19:4,3,38,0
chr1	22160111	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:1,5,2,4
chr1	22161072	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	22165983	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=173,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:0|1:22165983_C_T:22165983:4,5,2,0
chr1	22165987	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=179,141;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:0|1:22165983_C_T:22165983:4,3,2,2
chr1	22167988	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=200,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:3,2,3,1
chr1	22168216	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr1	22168968	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=181,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	22170828	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=245,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	22173762	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	22174600	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr1	22175612	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,219;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,0:3,2:0,4,0,3
chr1	22176500	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=219,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:3,1,4,2
chr1	22176831	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,0:0,2,1,3
chr1	22180700	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=170,208;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:22180700_G_A:22180700:4,4,0,2
chr1	22180702	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=170,208;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,2:5,0:0|1:22180700_G_A:22180700:4,4,0,2
chr1	22180848	.	G	GCCC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=193,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:22180848_G_GCCC:22180848:1,6,1,1
chr1	22180849	.	G	GCC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=193,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:22180848_G_GCCC:22180848:1,6,1,1
chr1	22180850	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=193,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,1:0|1:22180848_G_GCCC:22180848:1,6,1,1
chr1	22183471	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	22186234	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,4,7
chr1	22186479	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,0:7,3:6,6,3,0
chr1	22199081	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr1	22199821	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr1	22200835	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	22202109	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	22205408	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr1	22205466	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr1	22207235	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,12,9
chr1	22207804	.	ACCCAGGGTGGCAG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,2:0,0,4,4
chr1	22208030	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr1	22211222	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr1	22214386	.	CTCCCCTGGCACCCAAACCACTCGTGGCCCCGGACA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=216,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,2:1,0:3,0,1,1
chr1	22215088	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	22216279	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr1	22303702	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=0,176;MMQ=24,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,0,3
chr1	22307743	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	22307757	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	22310104	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=197,168;MMQ=59,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:4,0,0,1
chr1	22310139	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=172,151;MMQ=40,56;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0|1:22310139_T_G:22310139:0,2,4,0
chr1	22310145	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=172,155;MMQ=40,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0|1:22310139_T_G:22310139:0,2,5,0
chr1	22310662	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr1	22310674	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,6,8
chr1	22313161	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr1	22313197	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=211,165;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr1	22329407	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=195,160;MMQ=60,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0|1:22329407_G_C:22329407:3,0,2,0
chr1	22329414	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=160,195;MMQ=34,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,3:0.571:5:2,2:0,1:1|0:22329407_G_C:22329407:2,0,3,0
chr1	22332253	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=142,206;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,4:6,0:6,7,4,0
chr1	22336120	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=174,166;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr1	22336371	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=161,122;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:1,5:4,8:2,3,8,5
chr1	22408106	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=252,243;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	22447645	.	C	CTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	22827931	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:2,1,3,2
chr1	22832743	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,1,10
chr1	22837586	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=199,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.379:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr1	22837849	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=217,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:3,3:2,1:1,4,1,4
chr1	22838426	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.186:32:8,0:17,4:14,12,0,6
chr1	22838551	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=115,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:0|1:22838551_C_CT:22838551:14,9,0,2
chr1	22838552	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=115,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:0|1:22838551_C_CT:22838551:14,9,0,2
chr1	22838557	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=115,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,0:13,2:0|1:22838551_C_CT:22838551:12,9,0,2
chr1	22846452	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=178,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	22849003	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.852:11:0,3:1,7:0|1:22849003_A_C:22849003:0,1,1,9
chr1	22849009	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=174,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:1,1:6,1:0|1:22849003_A_C:22849003:0,7,0,2
chr1	22852715	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=150,85;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.351:18:5,3:6,3:7,5,4,2
chr1	22852880	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=250,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:1,3,1,4
chr1	22913153	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=88,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:0,1:3,4:0,3,1,4
chr1	22920280	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	22922546	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=259,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr1	22922560	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=259,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr1	22922722	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:1,3,1,3
chr1	22924418	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,1:5,2:0,11,0,3
chr1	22924536	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,265;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:3,1:5,1,1,2
chr1	22925292	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr1	22927314	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr1	22927326	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr1	22928265	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	22970790	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,15;MFRL=163,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:22970790_A_T:22970790:0,1,0,1
chr1	22970797	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=163,238;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:22970790_A_T:22970790:0,1,0,2
chr1	22986015	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:3,2:6,0:8,1,2,0
chr1	22986186	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=207,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=41.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:5,0:5,13:0,10,0,13
chr1	22987958	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	23108089	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	23191746	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:2,4:4,2:0,6,1,6
chr1	23232400	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=120,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.713:4:0,0:0,3:0,1,2,1
chr1	23236826	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	23289568	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=193,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:2,2,4,2
chr1	23289703	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:5,2:9,3:3,11,0,5
chr1	23380198	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=103,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:5,0,6,2
chr1	23392552	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,0:9,4:7,10,0,4
chr1	23399932	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=146,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:1,3,0,3
chr1	23419261	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=211,188;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:3,8:8,5:9,2,9,4
chr1	23420076	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,38;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:12,0:5,2:10,7,1,1
chr1	23640112	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=126,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,6:6,4:4,7,5,5
chr1	23696481	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=190,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,0:8,4:5,11,0,4
chr1	23697898	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,163;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.250:34:14,8:12,0:14,12,8,0
chr1	23698042	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=128,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,2:11,0:6,18,2,0
chr1	23710805	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr1	23713952	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	23720402	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,0:8,2:10,5,1,1
chr1	23724183	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=391,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:1,0,1,6
chr1	23735241	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,6,9
chr1	23745527	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=104,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr1	23758134	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,3,3
chr1	23782749	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=204,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr1	23850835	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,8;MFRL=158,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.574:5:0,0:2,0:0|1:23850835_T_A:23850835:2,0,3,0
chr1	23850841	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=12,12;MFRL=161,244;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:1,1:0,0:0|1:23850835_T_A:23850835:3,1,3,0
chr1	23850846	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,23;MFRL=161,244;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:2,2:0,1:0|1:23850835_T_A:23850835:3,1,3,0
chr1	23850850	.	CAGAGG	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=161,244;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,1:2,0:0|1:23850835_T_A:23850835:3,3,3,0
chr1	23885599	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=178,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:5,8:6,10:2,9,7,11
chr1	23956136	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=129,189;MMQ=60,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:23956136_A_G:23956136:0,1,0,1
chr1	23956139	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=155,189;MMQ=60,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:23956136_A_G:23956136:0,2,0,1
chr1	23956146	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=155,189;MMQ=60,46;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:23956136_A_G:23956136:0,2,0,1
chr1	23965517	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=196,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr1	23966894	.	T	TAAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAG;STR;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,2:6,2:6,2,3,1
chr1	24019079	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=180,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,5:4,2:4,6,3,4
chr1	24080813	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=148,112;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:3,9:8,0:3,8,9,0
chr1	24106510	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	24119627	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=114,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,6:2,5:2,1,8,3
chr1	24120254	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=149,233;MMQ=60,42;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:7,0:10,8,0,2
chr1	24120262	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=146,233;MMQ=60,42;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,1:7,0:9,8,0,2
chr1	24120814	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,12;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.256:10:3,0:1,0:4,4,2,0
chr1	24122986	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=241,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,1:2,7:2,0,8,0
chr1	24124801	.	CT	C,CTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,36,36;MFRL=194,165,95;MMQ=60,60,59;MPOS=16,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=10.63,3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,6,2:0.463,0.199:12:3,2,0:1,4,2:0,4,0,8
chr1	24140629	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:1,0:5,2:5,2,2,0
chr1	24143932	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,10,2
chr1	24200969	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:24200969_T_C:24200969:0,0,2,0
chr1	24200983	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:24200969_T_C:24200969:0,0,4,0
chr1	24201262	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	24201919	.	TT	CC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,3:2,6:0,3,5,4
chr1	24202224	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=274,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24202224_T_A:24202224:0,1,0,1
chr1	24202225	.	G	GAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=274,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24202224_T_A:24202224:0,1,0,1
chr1	24288221	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=151,48;MMQ=52,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,2:14,0:13,11,1,1
chr1	24288239	.	T	TGA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=155,48;MMQ=45,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,2:14,0:0|1:24288239_T_TGA:24288239:11,11,1,1
chr1	24288240	.	T	TAAAATAAGAAATA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=163,48;MMQ=40,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:7,2:14,0:0|1:24288239_T_TGA:24288239:11,10,1,1
chr1	24288404	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=173,117;MMQ=54,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.499:24:4,6:8,6:2,10,5,7
chr1	24288432	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=215,149;MMQ=56,45;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,7:2,5:3,1,2,10
chr1	24288529	.	TAAAC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=141,155;MMQ=52,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:4,4:9,2:7,6,3,3
chr1	24289891	.	ATGAATG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,1:4,2:1,9,0,3
chr1	24294249	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,9,14
chr1	24294362	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=202,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:5,1:3,2:4,4,2,2
chr1	24298263	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=210,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:1,1,2,2
chr1	24298440	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,69;MMQ=60,30;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.223:20:6,0:10,4:11,5,1,3
chr1	24305397	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=194,233;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr1	24383819	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	24388371	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr1	24388417	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=115,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,4:2,5:3,3,7,2
chr1	24388679	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr1	24390731	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	24392600	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=229,140;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:1,1,1,3
chr1	24392671	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=87,183;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:7,4:6,7:6,7,5,6
chr1	24392796	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr1	24393656	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=178,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.570:19:6,6:2,5:2,6,4,7
chr1	24394424	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=113,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:4,2,2,2
chr1	24394673	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=121,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr1	24398560	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,32;MFRL=0,0;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:24398560_G_T:24398560:1,2,0,1
chr1	24398566	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=0,0;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:24398560_G_T:24398560:1,2,0,1
chr1	24400584	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=85,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.785:7:0,4:1,1:1,0,5,1
chr1	24400623	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=22,12;MFRL=92,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.295:10:6,0:1,0:7,0,0,3
chr1	24400625	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=35,24;MFRL=142,92;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,4:4,0:4,3,4,0
chr1	24400633	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=49.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr1	24408414	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=106,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr1	24418768	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=131,91;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,3:1,4:1,5,3,4
chr1	24421334	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:6,2,4,2
chr1	24421875	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=160,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.387:16:2,3:8,3:8,2,3,3
chr1	24434595	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr1	24447214	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	24447943	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,117;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:4,4:1,2:2,3,5,2
chr1	24463563	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	24463854	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=180,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:3,2:2,0:0,5,0,3
chr1	24484441	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	24485518	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=70.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,17:0,5:0,0,14,8
chr1	24486078	.	G	GTGC	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=109,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:14,2:16,0:19,11,0,2
chr1	24657999	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=153,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.251:30:7,4:15,3:6,17,0,7
chr1	24668842	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=123,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,5:1,1:0,5,0,6
chr1	24669457	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:4,4,3,2
chr1	24669497	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=183,64;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:7,7,1,1
chr1	24669509	.	TG	CA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=187,64;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:4,2:0|1:24669509_TG_CA:24669509:6,7,1,1
chr1	24669512	.	AGGGGT	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=189,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0|1:24669509_TG_CA:24669509:5,7,1,1
chr1	24671464	.	ACCCTCCACACCTGTGCC	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=115,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCTCCACACCTGTGCC;STR;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.345:17:3,1:5,4:3,9,1,4
chr1	24673866	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=238,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr1	24690764	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:11,0:11,3:9,13,3,0
chr1	24695749	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:6,2,3,1
chr1	24746205	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,5:5,0:0,6,0,5
chr1	24766764	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,0:8,6:4,8,0,6
chr1	24768778	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=531,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr1	24784139	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=272,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr1	24784197	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=176,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:3,1,3,2
chr1	24792617	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=235,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:1,6,1,3
chr1	24921969	.	CATG	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=162,53;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:1,0:0|1:24921969_CATG_C:24921969:5,4,1,1
chr1	24921974	.	CCACCAGGGGAGA	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=138,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:2,0:0|1:24921969_CATG_C:24921969:6,4,1,1
chr1	24921993	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=135,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:24921969_CATG_C:24921969:5,1,1,1
chr1	24927561	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=197,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr1	24969963	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:24969963_G_C:24969963:1,2,0,1
chr1	24969973	.	ACCC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=19,16;MFRL=122,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:24969963_G_C:24969963:1,1,0,1
chr1	24978166	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,3:0,15,0,3
chr1	24978892	.	CAA	C,CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34,35;MFRL=133,219,0;MMQ=60,60,60;MPOS=24,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.25,5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,3:0.229,0.314:10:3,1,2:2,1,1:5,0,5,0
chr1	24989762	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	25072123	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:3,3,1,3
chr1	25124406	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:25124406_T_TC:25124406:0,1,0,1
chr1	25124408	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:25124406_T_TC:25124406:0,1,0,1
chr1	25124412	.	T	TTTCCACTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:25124406_T_TC:25124406:0,1,0,1
chr1	25153692	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	25233660	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=9,32;MFRL=194,231;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr1	25254317	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=242,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr1	25611035	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,31;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,10,8
chr1	25633177	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=279,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:1,2:0,2,1,4
chr1	25678002	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=267,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr1	25678238	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr1	25729136	.	TCCA	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=187,72;MMQ=52,53;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCA;STR;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.289:14:4,4:6,0:0|1:25729136_TCCA_T:25729136:7,3,2,2
chr1	25729151	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=184,72;MMQ=60,52;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:25729136_TCCA_T:25729136:11,4,0,2
chr1	25780893	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=27,33;MFRL=88,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.449:11:2,3:4,2:0|1:25780893_A_G:25780893:4,2,4,1
chr1	25780909	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=20,33;MFRL=101,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.400:5:0,2:3,0:0|1:25780893_A_G:25780893:1,2,1,1
chr1	25780913	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=101,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.400:5:0,1:2,0:0|1:25780893_A_G:25780893:1,2,1,1
chr1	25780944	.	T	TAG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,30;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25780944_T_TAG:25780944:0,0,0,1
chr1	25780947	.	G	GCA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,101;MMQ=60,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25780944_T_TAG:25780944:0,0,0,1
chr1	25780952	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,35;MFRL=0,101;MMQ=60,30;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25780944_T_TAG:25780944:0,0,0,1
chr1	25780955	.	G	GACATTTAA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,101;MMQ=60,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25780944_T_TAG:25780944:0,0,0,1
chr1	25783066	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=164,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,3:2,3:6,0,5,1
chr1	25893242	.	TG	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	26085048	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr1	26098107	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,14,5
chr1	26098333	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	26107688	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	26109237	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr1	26110065	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	26110143	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,5,4
chr1	26127655	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=116,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.334:25:5,0:12,8:8,9,0,8
chr1	26138136	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=262,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,2:0,8:0,2,6,4
chr1	26138262	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=231,117;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.908:19:1,11:0,7:1,0,11,7
chr1	26138451	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=22,32;MFRL=231,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr1	26138466	.	CA	AC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26138466_CA_AC:26138466:0,2,0,1
chr1	26138469	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=218,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:26138466_CA_AC:26138466:0,3,0,1
chr1	26139137	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=206,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:1,7:2,5:2,1,6,6
chr1	26139296	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=142,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:7,2:3,1:4,7,0,3
chr1	26140500	.	GCAGGAA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:9,0:10,9,0,2
chr1	26152758	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=375,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,6:1,2:1,0,6,2
chr1	26158337	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr1	26161975	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:15,0:6,9:10,12,0,9
chr1	26310394	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=183,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	26310836	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=151,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:4,1,5,0
chr1	26317383	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=182,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:3,3:1,2:0,5,0,5
chr1	26349948	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=137,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:0|1:26349948_G_A:26349948:1,2,0,1
chr1	26349958	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,13;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.509:4:0,0:1,0:0|1:26349948_G_A:26349948:0,2,0,2
chr1	26349967	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=137,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.618:3:0,1:1,1:0|1:26349948_G_A:26349948:0,1,0,2
chr1	26357855	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr1	26365549	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr1	26369215	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=36,30;MFRL=129,158;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:2,0:6,4:0|1:26369215_C_T:26369215:1,7,0,4
chr1	26369221	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=129,158;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:2,0:6,4:0|1:26369215_C_T:26369215:1,7,0,4
chr1	26369297	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	26383645	.	CCAGGGGT	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=135,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr1	26383664	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=165,196;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:7,7:2,0:0|1:26383664_A_C:26383664:9,1,7,0
chr1	26383668	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=165,196;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.382:19:7,7:5,0:0|1:26383664_A_C:26383664:9,3,7,0
chr1	26496455	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr1	26510402	.	C	CCTGGTGTGTGATG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26510402_C_CCTGGTGTGTGATG:26510402:0,0,0,1
chr1	26510404	.	T	TCCCTGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26510402_C_CCTGGTGTGTGATG:26510402:0,0,0,1
chr1	26511700	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=178,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:1,6,2,1
chr1	26515529	.	ACCAGACT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCAGACT;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.766:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	26517321	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=122,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,4:6,0:5,7,3,1
chr1	26517773	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=141,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:26517773_T_C:26517773:3,1,1,1
chr1	26517794	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=141,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:26517773_T_C:26517773:3,1,1,1
chr1	26524706	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr1	26526533	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=100,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.160:29:12,2:9,2:0|1:26526533_G_A:26526533:14,11,2,2
chr1	26526554	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=134,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,19:0.497:38:14,13:5,5:0|1:26526533_G_A:26526533:6,13,3,16
chr1	26527255	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=88,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:1,1:0|1:26527255_G_A:26527255:2,0,3,0
chr1	26527260	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=88,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0|1:26527255_G_A:26527255:2,0,3,0
chr1	26527304	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=192,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:2,5:6,2:0|1:26527304_T_C:26527304:7,1,6,1
chr1	26527310	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=192,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:1,5:7,2:0|1:26527304_T_C:26527304:7,1,6,1
chr1	26527809	.	AG	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=299,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,3:2,2:4,2,4,1
chr1	26528922	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=187,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:11,0:4,2:12,3,2,0
chr1	26583998	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	26597435	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=344,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:1,0,4,3
chr1	26597583	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=174,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:6,4,2,0
chr1	26597673	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	26601385	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr1	26601570	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:1,5,0,7
chr1	26603883	.	G	GAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=214,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr1	26607392	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,104;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,0:7,5:4,7,0,5
chr1	26607726	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=123,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr1	26608782	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:5,1:4,1:6,3,1,2
chr1	26609307	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=211,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,10:1,5:0,1,8,7
chr1	26612297	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=193,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.381:29:7,7:11,3:11,7,7,4
chr1	26620846	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	26624479	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=198,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.492:24:5,5:7,5:6,6,6,6
chr1	26629465	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=208,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr1	26644399	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=218,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr1	26646611	.	TA	T,TAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,26,26;MFRL=0,172,197;MMQ=60,44,56;MPOS=29,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=10.44,3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,1:0.558,0.224:6:0,0,0:0,4,1:0,1,5,0
chr1	26648838	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	26650550	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	26655208	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=217,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,3:1,5:1,1,7,1
chr1	26658102	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=145,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:2,3,0,2
chr1	26662774	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=259,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:2,1,7,1
chr1	26665991	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=236,167;MMQ=60,56;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr1	26698884	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=100974072,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr1	26698938	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:4,0,7,0
chr1	26699103	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=133,67;MMQ=60,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,4:8,1:3,11,2,4
chr1	26699157	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=179,150;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:0,4,0,4
chr1	26752992	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=116,155;MMQ=52,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:2,3:4,3:2,4,2,4
chr1	26769403	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=157,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0|1:26769403_A_T:26769403:1,5,0,2
chr1	26769405	.	C	CAG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=157,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:2,1:0|1:26769403_A_T:26769403:1,5,0,2
chr1	26769406	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=157,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:2,1:0|1:26769403_A_T:26769403:1,5,0,2
chr1	26774281	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=191,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:26774281_CA_TG:26774281:0,3,0,1
chr1	26774295	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=191,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:26774281_CA_TG:26774281:0,3,0,1
chr1	26774301	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=214,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:26774281_CA_TG:26774281:0,2,0,1
chr1	26774303	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=214,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:26774281_CA_TG:26774281:0,2,0,1
chr1	26795299	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:26795299_T_A:26795299:0,0,1,0
chr1	26795301	.	T	TTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:26795299_T_A:26795299:0,0,1,0
chr1	26795302	.	GCC	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:26795299_T_A:26795299:0,0,1,0
chr1	26800558	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=143,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:26800558_T_C:26800558:9,6,1,1
chr1	26800565	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=151,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:26800558_T_C:26800558:8,6,1,1
chr1	26800566	.	C	CCTCCCTCCCTTCCTT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:26800558_T_C:26800558:8,6,1,1
chr1	26801713	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=270,165;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:26801713_A_C:26801713:0,3,0,1
chr1	26801719	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=256,165;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:26801713_A_C:26801713:0,4,0,1
chr1	26801740	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=121,283;MMQ=45,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26801740_T_A:26801740:1,1,0,1
chr1	26801743	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=121,283;MMQ=45,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26801740_T_A:26801740:1,1,0,1
chr1	26801749	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=121,283;MMQ=45,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26801740_T_A:26801740:1,1,0,1
chr1	26878086	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:6,3,0,2
chr1	26900699	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=166,129;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:5,0:8,4:6,7,0,4
chr1	26900708	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,4:5,2:3,4,2,4
chr1	26900735	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=237,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,6:1,5:1,1,5,6
chr1	26900805	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:3,0,2,3
chr1	27057621	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=166,255;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,3:7,1:14,1,4,0
chr1	27057940	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,0:11,2:2,13,0,2
chr1	27089446	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=200,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,3:2,1:4,2,2,2
chr1	27094509	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:2,4,0,2
chr1	27105671	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,139;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.250:34:16,0:10,8:7,19,0,8
chr1	27124320	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,0:5,8:9,4,0,8
chr1	27158844	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=221,279;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:8,0,2,0
chr1	27190821	.	GGTGTGTGT	G,GGT,GGTGT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32,32,24;MFRL=136,148,161,160;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,23,9;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,13,14,15;RU=GT;STR;TLOD=7.58,7.67,7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,3,4,3:0.215,0.267,0.260:14:4,1,0,1:0,2,4,2:1,3,6,4
chr1	27217803	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	27220020	.	CTTTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,21;MFRL=253,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=21,16;RU=T;STR;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.681:4:0,0:1,2:0,1,0,3
chr1	27272600	.	A	ATCT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=133,417;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,1:7,7,2,0
chr1	27277139	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,0:0|1:27277139_A_C:27277139:1,6,2,0
chr1	27277143	.	TC	AA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,0:0|1:27277139_A_C:27277139:1,7,2,0
chr1	27332982	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=228,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:5,4,1,1
chr1	27428321	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,2:3,4:3,5,4,2
chr1	27435974	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,19;MFRL=257,259;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:27435974_G_C:27435974:1,0,2,0
chr1	27435980	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=257,259;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:27435974_G_C:27435974:1,0,2,0
chr1	27435985	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,22;MFRL=257,259;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:27435974_G_C:27435974:1,0,2,0
chr1	27435988	.	AAG	CCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,17;MFRL=312,259;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,0:0|1:27435974_G_C:27435974:2,0,2,0
chr1	27435994	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,21;MFRL=312,259;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:0|1:27435974_G_C:27435974:2,0,2,0
chr1	27609980	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.919:11:0,4:0,7:0,0,3,8
chr1	27621026	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=184,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:3,5,2,0
chr1	27630237	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=166,86;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:12,0:4,3:8,8,1,2
chr1	27658709	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=173,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:4,2:1,6,1,2
chr1	27659965	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	27660568	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=214,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:2,2,2,3
chr1	27661135	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=173,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:3,5,2,0
chr1	27661231	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=107,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,4:6,2:6,4,2,4
chr1	27675858	.	GGCTC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=191,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:5,3,1,1
chr1	27678108	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=272,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	27682440	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=186,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.418:10:2,3:4,0:3,3,1,3
chr1	27682481	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=111,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,4:4,5:3,5,3,6
chr1	27683897	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:11,3:12,0:14,9,3,0
chr1	27686063	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr1	27688128	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:11,2:3,0:8,6,2,0
chr1	27690359	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	27690644	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=201,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:2,1,1,3
chr1	27696011	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	27700537	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=218,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,0:4,8:0,5,0,8
chr1	27745368	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=208,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	27941543	.	TCA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=192,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:27941543_TCA_T:27941543:0,4,0,1
chr1	27941549	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=192,186;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:27941543_TCA_T:27941543:0,4,0,1
chr1	27992800	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=0,124;MMQ=47,40;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0|1:27992800_CAA_C:27992800:1,0,1,0
chr1	27992825	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,13;MFRL=129,124;MMQ=48,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,0:0|1:27992800_CAA_C:27992800:3,0,1,0
chr1	27992830	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,15;MFRL=129,124;MMQ=48,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,0:0|1:27992800_CAA_C:27992800:3,0,1,0
chr1	27992833	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=33,10;MFRL=171,124;MMQ=54,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:27992800_CAA_C:27992800:4,0,1,0
chr1	27992836	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,15;MFRL=213,124;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:27992800_CAA_C:27992800:3,0,1,0
chr1	27992838	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,15;MFRL=213,124;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:27992800_CAA_C:27992800:3,0,1,0
chr1	27992840	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=32,15;MFRL=206,124;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:27992800_CAA_C:27992800:3,1,1,0
chr1	27992844	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=32,15;MFRL=206,124;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:27992800_CAA_C:27992800:3,1,1,0
chr1	27992966	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=136,63;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.163:16:8,0:6,2:0|1:27992966_C_T:27992966:9,5,1,1
chr1	27992984	.	C	CG	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=161,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:7,2:0|1:27992966_C_T:27992966:7,9,1,1
chr1	27992987	.	C	CACA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=163,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:27992966_C_T:27992966:6,7,1,1
chr1	27992988	.	T	TCACA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=163,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,1:0|1:27992966_C_T:27992966:6,7,1,1
chr1	27995077	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,6,8
chr1	28054163	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=190,85;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr1	28081934	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=185,159;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,0:0,6:0,3,0,6
chr1	28086955	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=159,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:3,1,2,0
chr1	28116179	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=172,91;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,0:6,4:4,11,0,4
chr1	28138537	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,0:3,7:1,8,0,7
chr1	28144352	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=148,169;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:6,2,2,0
chr1	28159396	.	ACC	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=C;STR;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:11,0:7,3:0|1:28159396_ACC_A:28159396:2,19,3,0
chr1	28159402	.	TCTCCTG	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:11,0:7,3:0|1:28159396_ACC_A:28159396:1,19,3,0
chr1	28212272	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=218,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,2:3,0,5,0
chr1	28241083	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=191,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:7,5,0,2
chr1	28261593	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:28261593_T_C:28261593:5,0,2,0
chr1	28261600	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,1:3,0:0|1:28261593_T_C:28261593:5,0,2,0
chr1	28261658	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,1:4,1,2,1
chr1	28268706	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=122,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:3,1,3,0
chr1	28268829	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=151,104;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.785:12:1,5:1,5:0,2,6,4
chr1	28268833	.	C	CG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=104,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.191:14:3,1:7,1:8,4,0,2
chr1	28268835	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr1	28282556	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,0:6,4:5,9,4,0
chr1	28290231	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,3,14
chr1	28303732	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	28374815	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr1	28477205	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,2:8,1:12,3,3,0
chr1	28555426	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,4:4,1:3,3,3,2
chr1	28559574	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=192,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.747:6:1,2:0,3:0,1,1,4
chr1	28562676	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr1	28785729	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,3:10,0:5,11,0,3
chr1	28807187	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.327:7:4,0:1,2:0|1:28807187_GT_G:28807187:1,4,0,2
chr1	28807192	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=21,34;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:28807187_GT_G:28807187:1,4,0,2
chr1	28807194	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:28807187_GT_G:28807187:1,4,0,2
chr1	28807196	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0|1:28807187_GT_G:28807187:1,4,0,2
chr1	28818183	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=141,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:6,1:8,2:6,8,1,2
chr1	28891130	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr1	28906141	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:7,2:6,0:6,7,1,1
chr1	28906515	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=64,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,0:6,3:3,7,1,2
chr1	29010342	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=349,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	29016715	.	GTT	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=22,35;MFRL=227,0;MMQ=60,21;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:0,1:1,0:0|1:29016715_GTT_G:29016715:0,1,1,0
chr1	29016718	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=227,0;MMQ=60,21;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,1:1,0:0|1:29016715_GTT_G:29016715:0,1,1,0
chr1	29016739	.	CA	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,10;MFRL=227,0;MMQ=60,21;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:29016715_GTT_G:29016715:0,1,1,0
chr1	29016744	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,15;MFRL=222,0;MMQ=60,21;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:29016715_GTT_G:29016715:0,2,1,0
chr1	29023342	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr1	29023674	.	CATATATATATAT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=171,164;MMQ=47,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=19,13;RU=AT;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.520:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr1	29029152	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	29063559	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,11,3
chr1	29323636	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=223,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr1	29342090	.	GAAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=79,226;MMQ=58,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:3,1,1,0
chr1	29345009	.	C	CTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr1	29345027	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=199,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr1	29387045	.	G	GTCTCAAGCAGGGTCTCAAGACTTCTCC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=157,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:4,9,1,1
chr1	29442397	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=180,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr1	29475341	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,5,8
chr1	29542435	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	29557224	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:2,3:1,7:1,2,6,5
chr1	29585371	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.376:6:1,0:3,2:0|1:29585371_G_T:29585371:0,4,0,2
chr1	29585375	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:29585371_G_T:29585371:0,4,0,2
chr1	29585376	.	AGTTAGAATG	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:29585371_G_T:29585371:0,4,0,2
chr1	29585387	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,36;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:29585371_G_T:29585371:0,3,0,2
chr1	29587104	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,8;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr1	29605438	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr1	29631236	.	C	CTA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,0:5,3,2,3
chr1	29631782	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	29642705	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=161,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.304:16:7,5:4,0:0|1:29642705_C_T:29642705:4,7,3,2
chr1	29642708	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=161,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.304:16:7,4:4,0:0|1:29642705_C_T:29642705:4,7,3,2
chr1	29651670	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.248:23:4,4:7,0:9,9,5,0
chr1	31186387	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=115,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.181:18:9,0:6,2:3,12,1,2
chr1	31188972	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:13,7,2,0
chr1	31191522	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=8,12;MFRL=223,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0|1:31191522_G_C:31191522:2,0,2,0
chr1	31191527	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,12;MFRL=223,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,0:0|1:31191522_G_C:31191522:2,0,2,0
chr1	31191530	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=223,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,0:0|1:31191522_G_C:31191522:2,0,2,0
chr1	31206637	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr1	31206806	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=124,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:0,3:3,5:1,2,2,6
chr1	31214570	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,137;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,2:7,0:6,9,2,0
chr1	31230668	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr1	31346199	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:6,0:3,3:5,4,3,3
chr1	31347133	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:3,1,3,0
chr1	31415040	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	31465513	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=152,194;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,0:3,11:1,7,0,11
chr1	31467958	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=117,157;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.286:33:9,0:15,9:12,12,0,9
chr1	31478638	.	AAGAGAG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=50,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=AG;STR;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.494:8:2,2:0,2:2,2,2,2
chr1	31501755	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,1:5,4:0,7,0,5
chr1	31734353	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,3:3,0:3,3,1,2
chr1	31740668	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=339,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,5:1,5:1,0,8,2
chr1	31740706	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=217,291;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:3,4,4,1
chr1	31742261	.	G	GGAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr1	31744168	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	31764693	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=215,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,1:3,3:3,0,4,0
chr1	31764713	.	C	CAAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=215,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,2:3,3:3,0,5,1
chr1	31764930	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr1	31840426	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr1	31882582	.	G	GGCCTCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:4,3,5,0
chr1	31897493	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=60.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,12,5
chr1	31898132	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=178,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,8:2,3:1,2,8,3
chr1	31898162	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=221,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:0,10:3,4:1,2,7,7
chr1	31898279	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=245,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,7:2,3:4,0,4,6
chr1	31898536	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=222,256;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr1	31899684	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,0,13
chr1	31899704	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr1	31905730	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	31905889	.	A	ACAG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=260,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CAG;STR;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.841:10:1,1:0,5:1,0,6,3
chr1	31906882	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	31907102	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr1	32044817	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=123,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:9,3:11,0:7,13,0,3
chr1	32051139	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=186,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:32051139_G_GA:32051139:1,2,0,1
chr1	32051142	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=186,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:32051139_G_GA:32051139:1,2,0,1
chr1	32051306	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=191,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:10,2,2,0
chr1	32084904	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=188,173;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,5:6,0:5,3,4,1
chr1	32084908	.	T	TCTCCTGCCTCAAC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=180,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:8,3,1,1
chr1	32118160	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,250;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.486:12:2,6:4,0:6,0,6,0
chr1	32119347	.	AACACAC	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=321,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=AC;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,1:1,0:1,1,0,1
chr1	32119431	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=211,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,2:5,6:3,4,6,2
chr1	32121083	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=145,184;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:4,0:10,6:0|1:32121083_T_C:32121083:6,8,0,6
chr1	32121087	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=145,184;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:4,0:10,6:0|1:32121083_T_C:32121083:6,8,0,6
chr1	32122164	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	32126135	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=111,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,3:3,8:5,4,9,2
chr1	32127911	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:1,3:4,2,2,1
chr1	32127953	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.557:14:4,2:2,5:3,3,5,3
chr1	32128283	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=204,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr1	32133737	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr1	32136168	.	G	C,T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,20,28;MFRL=181,124,161;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=23.95,26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,11,11:0.448,0.440:24:1,6,8:1,5,2:1,1,7,15
chr1	32140733	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:2,3,3,1
chr1	32145009	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	32146425	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=80,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:1,1:3,2:3,1,2,2
chr1	32146764	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=221,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr1	32148571	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,11,6
chr1	32151719	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,127;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:12,0:9,2:12,9,0,2
chr1	32155284	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=140,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.502:10:5,5:0,0:4,1,5,0
chr1	32155911	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=120,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,2:3,5:1,2,4,3
chr1	32155929	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=123,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.236:18:4,1:10,2:6,8,2,2
chr1	32156869	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr1	32160918	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	32161675	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.560:5:1,1:1,0:0|1:32161675_A_C:32161675:0,2,3,0
chr1	32161681	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.562:5:1,1:1,1:0|1:32161675_A_C:32161675:0,2,3,0
chr1	32196647	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=202,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:3,1:5,3:6,2,2,3
chr1	32203163	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=169,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,1:9,1:7,6,0,2
chr1	32203218	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=156,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:14,1:16,1:6,24,2,1
chr1	32203260	.	AGGCGGCATAGAT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,2:14,0:14,10,2,0
chr1	32203401	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=222,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:2,0:0,4,0,2
chr1	32209765	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:5,3,2,0
chr1	32221913	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=211,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:4,5,1,6
chr1	32222807	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:3,0:9,6:7,6,0,6
chr1	32222849	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=150,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,4:7,0:7,8,2,2
chr1	32258805	.	AAGAG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=AG;STR;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.353:12:6,1:2,3:8,0,3,1
chr1	32262324	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=193,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:5,3:6,0:4,7,1,2
chr1	32266026	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=195,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,5:2,7:3,3,5,7
chr1	32280610	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=118,189;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.564:16:3,4:3,5:3,4,7,2
chr1	32280697	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=158,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:5,10,2,0
chr1	32381552	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=102,86;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:10,0:18,3:0|1:32381552_C_T:32381552:17,11,3,0
chr1	32381577	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=84,86;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:7,0:12,3:0|1:32381552_C_T:32381552:16,11,3,0
chr1	32479632	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	32505181	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:18,4,0,2
chr1	32505193	.	G	GTGT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,0:13,2:17,3,0,2
chr1	32541464	.	T	TCTAATATTACG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	32620192	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=155,69;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,3:8,0:9,6,2,1
chr1	32620226	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=155,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,3:11,0:8,9,2,1
chr1	32653818	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=231,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr1	32658062	.	G	GGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=336,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,2:0,1:1,0,1,2
chr1	32660473	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=108,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:3,2:8,2:6,5,3,1
chr1	32692163	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,11;MFRL=171,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.441:9:5,0:0,0:1,4,0,4
chr1	32692168	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,3:0,0:0,0,1,3
chr1	32692210	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=36,16;MFRL=272,66;MMQ=60,58;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:1,1:2,0:0|1:32692210_C_CA:32692210:0,3,1,1
chr1	32692213	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,23;MFRL=272,66;MMQ=60,58;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:1,1:2,0:0|1:32692210_C_CA:32692210:0,3,1,1
chr1	32800706	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=116,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,3:0,1:1,2,1,3
chr1	32832314	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=169,47;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:6,4,1,1
chr1	32832331	.	T	TTCA	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=188,47;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0|1:32832331_T_TTCA:32832331:2,6,1,1
chr1	32832332	.	G	GATCT	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=35,20;MFRL=188,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0|1:32832331_T_TTCA:32832331:2,6,1,1
chr1	32832336	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=175,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:32832331_T_TTCA:32832331:1,6,1,1
chr1	32832337	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=35,20;MFRL=188,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:32832331_T_TTCA:32832331:1,5,1,1
chr1	32842030	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=106,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,0:8,3:10,6,0,3
chr1	32842369	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=250,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	33065947	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0|1:33065947_G_C:33065947:0,0,4,8
chr1	33065955	.	G	GAATCCT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=158,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:33065947_G_C:33065947:3,8,1,1
chr1	33087566	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,16;MFRL=107,78566050;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.396:6:1,0:1,0:0|1:33087566_AG_A:33087566:2,2,0,2
chr1	33087568	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,14;MFRL=107,78566050;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.396:6:2,0:2,0:0|1:33087566_AG_A:33087566:2,2,0,2
chr1	33087646	.	T	TAGAAAACATACCTGCAGAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	33117071	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,4,8
chr1	33134774	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=204,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:1,14:0,5:0,1,9,10
chr1	33134890	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=132,100;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.289:29:5,8:16,0:6,15,8,0
chr1	33134989	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,7:0,0,9,7
chr1	33138169	.	T	TTGACC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,0:6,2:8,4,0,2
chr1	33138516	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,2,8
chr1	33146113	.	CT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=153,174;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:5,6:10,6:10,8,10,2
chr1	33160878	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,4,5
chr1	33231380	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.294:19:8,1:2,4:7,7,4,1
chr1	33231398	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=169,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,2:9,0:0|1:33231398_C_CT:33231398:9,11,1,1
chr1	33231399	.	C	CTTTCTACTCCTTCCTACAA	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,19;MFRL=163,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,1:9,0:0|1:33231398_C_CT:33231398:9,10,1,1
chr1	33231403	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.419:19:7,1:3,5:4,7,4,4
chr1	33233323	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	33233645	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:13,6:6,0:10,9,6,0
chr1	33234452	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=220,169;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,0:0,4:1,1,0,4
chr1	33237878	.	T	TCCCCCCCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,24;RU=C;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.563:19:6,3:2,3:0,8,11,0
chr1	33244953	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=223,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:4,2,2,0
chr1	33252099	.	TCACATGCATGACTATTCCTAGCC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	33256884	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=199,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:2,8:1,6:0,3,1,13
chr1	33276424	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr1	33293748	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr1	33318634	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr1	33318868	.	C	CATTTGAGGTCAGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,288;MMQ=60,36;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	33330432	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	33333893	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:7,1:15,1:10,12,0,2
chr1	33359206	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=206,64;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:6,0:2,3:3,5,2,1
chr1	33402334	.	GA	G,GAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,35,34;MFRL=153,151,145;MMQ=60,60,60;MPOS=23,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=4.24,5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,4:0.221,0.388:11:2,2,1:2,1,2:4,0,5,2
chr1	33402616	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:9,0:9,2:12,7,0,2
chr1	33402647	.	CC	AA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=147,121;MMQ=60,32;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:5,3:12,0:10,7,3,0
chr1	33404176	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=187,76;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,0:1,3:0,6,1,2
chr1	33409551	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=157,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr1	33409693	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.476:23:6,3:6,7:7,5,4,7
chr1	33412093	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=128,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:2,6,2,0
chr1	33415402	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:1,8,0,2
chr1	33476292	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=158,25620358;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:10,0,3,0
chr1	33476385	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=152,307;MMQ=60,47;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,6:0.189:35:10,3:18,3:0|1:33476385_C_G:33476385:15,14,3,3
chr1	33476387	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=152,307;MMQ=60,47;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,6:0.179:37:11,3:18,3:0|1:33476385_C_G:33476385:16,15,3,3
chr1	33476396	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=152,307;MMQ=60,47;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.175:38:11,3:16,3:0|1:33476385_C_G:33476385:15,17,3,3
chr1	33476404	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=150,307;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,6:0.180:37:11,3:15,3:0|1:33476385_C_G:33476385:14,17,3,3
chr1	33478920	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=143,149;MMQ=60,26;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:16,1:10,2:11,15,0,3
chr1	33478931	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=148,75;MMQ=60,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:14,1:7,3:9,14,1,3
chr1	33478959	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=167,0;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:8,2:15,3:11,12,4,1
chr1	33478983	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=175,0;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:8,2:16,2:9,15,4,0
chr1	33487219	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=135,67;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:11,2:6,0:0|1:33487219_G_T:33487219:8,10,1,1
chr1	33487227	.	A	ATTTACTCCAACCCATGTGGGC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=136,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,2:5,0:0|1:33487219_G_T:33487219:8,9,1,1
chr1	33560338	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,4,16
chr1	33567592	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=135,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr1	33585814	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=222,222;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr1	33760743	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,9,4
chr1	33760862	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=140,140;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,22:0.420:53:24,0:5,21:10,21,0,22
chr1	33773152	.	ACTCCCACCCCAC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=215,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	33778591	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	33794416	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=194,327;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	33795572	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:1,0,4,1
chr1	33795590	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=271,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:2,5:0,3:2,0,7,2
chr1	33798005	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=172,114;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:8,0:2,4:4,6,0,5
chr1	33798024	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=180,114;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,0:4,5:2,10,0,5
chr1	33820033	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=105,276;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,2:5,2:4,10,3,1
chr1	33944881	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:5,2,1,1
chr1	33954352	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	33955255	.	G	GTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=216,74;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr1	33955291	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0|1:33955291_A_T:33955291:0,4,0,4
chr1	33955296	.	T	TTTTCCAGCTCAAGG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,36;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0|1:33955291_A_T:33955291:0,4,0,4
chr1	33955299	.	G	GGTTACCATGTCTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=191,175;MMQ=60,34;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:33955291_A_T:33955291:0,2,0,1
chr1	33956743	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,0:6,2:6,0,1,1
chr1	33961147	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr1	33985353	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:9,6:5,3:7,7,3,6
chr1	33985521	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=140,104;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:9,2:9,11,0,2
chr1	34033248	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,2:13,1:11,10,1,2
chr1	34038339	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	34042810	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=137,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr1	34042834	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=137,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr1	34043169	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	34052305	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=132,311;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr1	34052605	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=268,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.618:8:2,2:0,3:3,0,4,1
chr1	34070826	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr1	34071434	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,4:2,4:6,2,8,0
chr1	34098959	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=144,270;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,3:3,1:5,1,4,0
chr1	34099159	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.305:34:21,0:3,10:3,21,0,10
chr1	34112452	.	T	TGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:34112452_T_TGC:34112452:0,0,1,0
chr1	34112456	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:34112452_T_TGC:34112452:1,0,1,0
chr1	34112462	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:34112452_T_TGC:34112452:1,0,1,0
chr1	34112467	.	ACT	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,15;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:34112452_T_TGC:34112452:1,1,1,0
chr1	34158472	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=220,248;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:0|1:34158472_C_T:34158472:4,1,3,1
chr1	34158482	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=219,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:0|1:34158472_C_T:34158472:3,1,5,1
chr1	34164286	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:1,2:5,0,3,0
chr1	34166207	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=131,142;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,5:6,0:4,5,5,0
chr1	34189917	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=195,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,4:2,6:0,4,5,5
chr1	34189957	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,3,7
chr1	34190184	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=165,93;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:4,2:11,0:5,10,2,0
chr1	34254131	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,10;MFRL=218,201;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr1	34257966	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,1:2,0:0,3,1,0
chr1	34663612	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=165,238;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,2:0,3,0,3
chr1	34667863	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=130,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,1:6,3:4,8,1,3
chr1	34677724	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:7,0:0,2:7,0,2,0
chr1	34684463	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	35261044	.	CAG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=177,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,2:6,1:3,7,2,1
chr1	35334251	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=154,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:2,2:9,0:3,8,0,2
chr1	35477592	.	AT	TG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,126;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:5,0:10,8:6,9,0,8
chr1	35486072	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=161,50;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:1,0:5,1:0,6,0,2
chr1	35561510	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,2,15
chr1	35563206	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr1	35576145	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	35655061	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=208,254;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	35734535	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=287,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:1,3:1,0:2,0,3,1
chr1	35826968	.	T	TTTTGGTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=85,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr1	35836212	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=150,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:0|1:35836212_T_G:35836212:0,8,1,1
chr1	35836219	.	G	GTC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=172,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,0:5,2:0|1:35836212_T_G:35836212:0,11,1,1
chr1	35855649	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=120,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,1:0|1:35855649_T_C:35855649:7,5,1,1
chr1	35855657	.	A	AGATTGCAC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=120,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:35855649_T_C:35855649:8,6,1,1
chr1	35870944	.	ACTTTT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=144,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTTTT;STR;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:3,5:8,2:6,6,4,3
chr1	35913868	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=137,275;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,3:11,1:12,8,1,3
chr1	35925861	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr1	36019913	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=114,192;MMQ=39,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:1,1:4,2:12,1,3,0
chr1	36055731	.	G	GATTGGCTGAGTCAGGCTGGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=115,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	36056280	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=147,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:3,1:9,1:7,6,2,0
chr1	36068950	.	AG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=169,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:8,0:13,3:7,14,0,3
chr1	36205166	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr1	36212676	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=220,176;MMQ=50,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:36212676_C_T:36212676:0,2,0,1
chr1	36212681	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=220,176;MMQ=50,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:36212676_C_T:36212676:0,2,0,1
chr1	36213712	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr1	36282417	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=17,22;MFRL=182,156;MMQ=41,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.781:15:1,6:0,3:3,0,12,0
chr1	36282441	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=158,153;MMQ=60,53;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:4,3:2,1:8,2,6,0
chr1	36291713	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:0,5,0,2
chr1	36297333	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:8,2,2,0
chr1	36298033	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,10;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.581:8:0,0:2,0:2,1,5,0
chr1	36316381	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=167,190;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,2:1,1:1,0,3,2
chr1	36316418	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.888:15:1,3:0,7:1,0,3,11
chr1	36316539	.	C	CATTTAAATGAGCACCTACAA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=162,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:10,0:7,3:0|1:36316539_C_CATTTAAATGAGCACCTACAA:36316539:10,7,0,3
chr1	36316544	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=163,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.187:19:9,0:7,3:0|1:36316539_C_CATTTAAATGAGCACCTACAA:36316539:9,7,0,3
chr1	36316571	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,9:0,0,7,14
chr1	36383132	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=359,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr1	36437530	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr1	36550722	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:9,7,1,1
chr1	36553817	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:36553817_T_A:36553817:4,0,0,1
chr1	36553819	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:36553817_T_A:36553817:4,0,0,1
chr1	36554442	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	36563158	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,6:0,0,8,5
chr1	36565584	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	36565617	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr1	36602943	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:3,3:4,4:1,6,0,8
chr1	36641729	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=230,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,2:1,0:3,0,2,0
chr1	36642048	.	GC	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=237,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:36642048_GC_TA:36642048:0,1,1,1
chr1	36642051	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=237,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:36642048_GC_TA:36642048:0,1,1,1
chr1	36755361	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,1:4,1:2,6,1,1
chr1	36759529	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=125,1169;MMQ=60,33;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:6,7:12,0:8,10,0,7
chr1	36762396	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr1	36773046	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=202,102497526;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,0:5,2:0|1:36773046_C_T:36773046:5,1,2,0
chr1	36773065	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=192,102497526;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:36773046_C_T:36773046:10,1,2,0
chr1	36773819	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr1	36785270	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:4,1:4,3:6,3,4,0
chr1	36788353	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36788353_G_T:36788353:0,0,1,0
chr1	36788356	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36788353_G_T:36788353:0,0,1,0
chr1	36826860	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:10,8:2,0:8,4,8,0
chr1	36887702	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=246,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:2,0,8,1
chr1	36888302	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=215,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.605:10:4,4:0,1:4,0,5,1
chr1	36923494	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=232,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:1,4:1,6:1,1,5,6
chr1	36926446	.	C	CCAAAAAATACAAGTAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	36932789	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:4,4:10,0:7,7,2,2
chr1	36933585	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:5,7,1,1
chr1	37307281	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chr1	37324683	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,2:5,1:10,5,3,0
chr1	37335458	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	37335485	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:37335485_A_G:37335485:0,0,0,4
chr1	37335494	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:37335485_A_G:37335485:0,0,0,4
chr1	37949096	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:12,0:8,9:10,10,0,9
chr1	37959450	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,6,12
chr1	37959470	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,3,12
chr1	37959499	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,1:0,0,1,7
chr1	37961608	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=214,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr1	38006359	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	38030639	.	G	GTCCTGATCATGTCATGGCCACATA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=108,109343603;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,1:3,1:4,4,2,0
chr1	38032706	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38032706_T_TC:38032706:0,0,0,1
chr1	38032709	.	CCCG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38032706_T_TC:38032706:0,0,0,1
chr1	38041223	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=118,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:6,5:7,5:6,7,6,4
chr1	38049552	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr1	38078630	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,2,3
chr1	38079650	.	ATC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=167,245;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,1,0
chr1	38082122	.	GC	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,1:1,1,3,2
chr1	38149076	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,2:5,2:3,9,1,3
chr1	38149083	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=126,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:7,0:4,2:2,9,0,2
chr1	38155265	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:7,0:2,7:8,1,6,1
chr1	38158258	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:1,1,4,0
chr1	38161694	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,1:5,2:0,11,0,3
chr1	38164581	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:6,5,2,0
chr1	38164613	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,2:9,0:8,9,2,0
chr1	38164724	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=127,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,1,3
chr1	38167345	.	TAAAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,12;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr1	38184316	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=190,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,2:7,2:6,4,4,0
chr1	38186294	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,2:4,4:3,4,1,5
chr1	38187346	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:10,8,0,2
chr1	38188841	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,3:2,1:3,3,2,2
chr1	38189142	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=236,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	38220055	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=198,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	38265148	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	38301250	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	38301476	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	38327935	.	CAG	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=234,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,9:1,3:3,0,8,4
chr1	38327982	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr1	38334317	.	TC	AA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr1	38345896	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	38351339	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:8,0:4,2:7,5,2,0
chr1	38411350	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=187,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr1	38425724	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=123,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,2:2,4:2,0,5,1
chr1	38425895	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr1	38425931	.	TAGGA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=243,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr1	38435281	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.206:22:7,2:11,2:0|1:38435281_A_T:38435281:12,6,2,2
chr1	38435284	.	T	TGACAG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.207:22:7,2:11,2:0|1:38435281_A_T:38435281:12,6,2,2
chr1	38435291	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,1:8,1:0|1:38435281_A_T:38435281:11,4,0,2
chr1	38444333	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr1	38444749	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=111,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,1:1,6:2,2,2,5
chr1	38455389	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=213,243;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,2:2,3,4,2
chr1	38463904	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=191,311;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr1	38464639	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=111.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,14:0,17:0,0,13,18
chr1	38483296	.	ATT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=162,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.254:17:3,2:9,1:7,6,2,2
chr1	39305403	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=171,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:0,4,0,4
chr1	39322587	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=164,55;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:11,0:9,3:8,12,2,1
chr1	39325063	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,13,3
chr1	39330399	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=127,212;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:8,3:8,2:9,7,1,4
chr1	39333118	.	C	CAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=217,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,21;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.403:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr1	39352083	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	39353559	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=142,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:4,3,2,0
chr1	39361569	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=155,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,3:2,0:6,0,2,1
chr1	39361615	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,8:1,3:0,2,6,5
chr1	39550210	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	39759207	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=165,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,3:7,0:8,7,1,2
chr1	39761509	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=97,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:15,0:10,4:17,8,4,0
chr1	39763242	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=354,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	39766055	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:1,3,1,6
chr1	39785438	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=134,46;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:0|1:39785438_A_T:39785438:0,3,1,1
chr1	39785440	.	AA	TT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=134,46;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:39785438_A_T:39785438:0,3,1,1
chr1	39785450	.	A	ATGAACCAACTTGC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=134,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:39785438_A_T:39785438:0,3,1,1
chr1	39785452	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=134,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,1:0|1:39785438_A_T:39785438:0,3,1,1
chr1	39796844	.	CTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=35,21;MFRL=190,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=28,17;RU=T;STR;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:1,2:0,0:1,0,4,0
chr1	39796875	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=16,16;MFRL=237,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:1,0:0,0:0|1:39796875_G_T:39796875:4,0,1,0
chr1	39796880	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=21,17;MFRL=206,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:39796875_G_T:39796875:4,0,1,0
chr1	39796884	.	GC	AA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,15;MFRL=206,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:39796875_G_T:39796875:4,0,1,0
chr1	39796891	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,16;MFRL=225,154;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:39796875_G_T:39796875:3,0,1,0
chr1	39796898	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,15;MFRL=225,154;MMQ=60,60;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:39796875_G_T:39796875:3,0,1,0
chr1	39799473	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=159,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,1:7,2:9,9,2,1
chr1	39799906	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=174,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:9,0:9,3:11,8,1,2
chr1	39812620	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr1	39815344	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,1:6,2:3,8,0,3
chr1	39823032	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=162,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:8,2:5,2:10,3,0,4
chr1	39826391	.	A	ATTAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=193,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:3,0,4,0
chr1	39845095	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=181,111;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,0:8,3:5,6,0,3
chr1	39853687	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=207,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,3:4,2:3,8,3,2
chr1	39853811	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,132;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:9,5,0,2
chr1	39881006	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=129,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.319:17:6,4:5,0:8,4,1,4
chr1	39881040	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=120,192;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr1	39881599	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=177,171;MMQ=60,22;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,0:8,3:6,11,0,3
chr1	39888329	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:9,3,1,1
chr1	39889677	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=116,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:9,1:4,2:10,4,3,0
chr1	39893093	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=108,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,2:4,5:9,2,5,2
chr1	39893720	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:6,6:9,0:10,5,6,0
chr1	39894839	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,4:3,6:4,1,9,1
chr1	39895460	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=168,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:2,2:4,0:5,1,2,0
chr1	39900058	.	CTTTTTTT	C,CTTTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,13,31;MFRL=152,150,141;MMQ=60,60,60;MPOS=24,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,10,14;RU=T;STR;TLOD=3.17,3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.246,0.368:3:1,0,0:0,0,1:1,0,2,0
chr1	39903624	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,1:7,1:3,6,0,2
chr1	39908360	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=167,218;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,2:5,0:4,7,2,0
chr1	39908506	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=124,209;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,2:7,1:6,6,1,2
chr1	39913074	.	CTG	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TG;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,1:6,1:9,9,2,0
chr1	39913351	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,2:2,5:3,1,2,5
chr1	39927507	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr1	39929240	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=198,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.507:14:4,1:2,6:4,3,7,0
chr1	39935278	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=159,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:10,5:12,0:10,12,5,0
chr1	39988219	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=189,108;MMQ=52,21;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39988219_C_T:39988219:1,0,0,1
chr1	39988238	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,21;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39988219_C_T:39988219:0,0,0,1
chr1	40028180	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=163,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr1	40029441	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:13,0:13,5:20,6,0,5
chr1	40035686	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=81,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:2,3,1,2
chr1	40036847	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,232;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:2,1:5,2:6,2,2,1
chr1	40041371	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=193,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr1	40041699	.	T	TCGGAGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=191,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CGGAGC;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr1	40092089	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	40096053	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=204,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr1	40129027	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:4,5:10,0:8,6,5,0
chr1	40149865	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40149865_G_C:40149865:0,0,1,0
chr1	40149869	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40149865_G_C:40149865:0,0,1,0
chr1	40149874	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=269,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:40149865_G_C:40149865:0,1,1,0
chr1	40207169	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,5:1,1:1,5,0,6
chr1	40209408	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	40214525	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=139,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:7,1,3,0
chr1	40226046	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	40229319	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=207,232;MMQ=40,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:6,1,2,1
chr1	40230531	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,263;MMQ=27,38;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,2:6,2:3,9,2,2
chr1	40313849	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=125,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,4:2,4:0,3,0,8
chr1	40367125	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	40536074	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,8:0,0,9,7
chr1	40545964	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,14,0
chr1	40556922	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr1	40557656	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	40558256	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	40559555	.	CAA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=15,33;MFRL=73,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=A;STR;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.570:9:0,3:1,1:1,3,4,1
chr1	40559773	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=217,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr1	40562993	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	40713845	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=132,11523231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:2,5,1,1
chr1	40726594	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:13,0:16,4:19,10,0,4
chr1	40737516	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr1	40737589	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,1:7,1:11,9,1,1
chr1	40771973	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=192,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr1	40776112	.	GGA	CTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=190,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	40776431	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=80,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,0:2,5:1,3,0,5
chr1	40777800	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.704:21:2,7:3,7:5,1,7,8
chr1	40777842	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:1,5,0,4
chr1	40777884	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=36,28;MFRL=157,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:1,0:4,1:0,5,0,2
chr1	40778377	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:9,6:10,4:9,10,8,2
chr1	40840270	.	T	TGC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=146,139;MMQ=45,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.571:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr1	40840294	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=155,139;MMQ=56,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,3:2,0:9,0,3,0
chr1	40840296	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=127,155;MMQ=53,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.796:19:1,7:1,7:4,0,14,1
chr1	40879808	.	G	C,T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,36,28;MFRL=0,148,189;MMQ=60,60,60;MPOS=12,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.35,28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,10:0.200,0.733:12:0,1,6:0,1,4:0,0,7,5
chr1	40881041	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,11,13
chr1	40887831	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=144,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40887831_G_A:40887831:0,1,0,1
chr1	40887833	.	C	CCCAGTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=144,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40887831_G_A:40887831:0,1,0,1
chr1	40887835	.	C	CACTAGGTTGCTGGGACAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=144,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40887831_G_A:40887831:0,1,0,1
chr1	40928552	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,245;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,0:3,3:7,3,2,1
chr1	40955156	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,0:0,4:3,0,3,1
chr1	40955375	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=105,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr1	41006482	.	A	ACGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=326,285;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41006482_A_ACGTC:41006482:0,1,0,1
chr1	41006484	.	GCTTA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=326,285;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41006482_A_ACGTC:41006482:0,1,0,1
chr1	41101572	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,4:2,9:2,3,8,5
chr1	41107360	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,3:4,5:3,2,4,4
chr1	41107612	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,3:2,7:2,3,1,9
chr1	41232194	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr1	41235177	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=215,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,5:6,1:1,7,1,5
chr1	41236181	.	AC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=243,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.292:8:4,1:2,1:5,1,0,2
chr1	41284366	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=135,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,2,2
chr1	41284406	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=186,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,0:0,4:0,1,2,2
chr1	41284509	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=214,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr1	41284524	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:2,1:0|1:41284524_G_A:41284524:4,0,3,0
chr1	41284527	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0|1:41284524_G_A:41284524:4,0,3,0
chr1	41285171	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=169,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:3,5:5,1:2,6,2,5
chr1	41298652	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	41456808	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=199,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr1	41466803	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,5:8,5:1,12,5,5
chr1	41474400	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,1:6,1:3,10,0,2
chr1	41475085	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,5:3,3:5,0,6,2
chr1	41486408	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=191,260;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	41494222	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=79,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.793:17:1,7:2,7:2,1,7,7
chr1	41540853	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=190,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:2,5:1,3:0|1:41540853_A_T:41540853:2,1,4,5
chr1	41540861	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.706:15:2,6:2,4:0|1:41540853_A_T:41540853:3,1,5,6
chr1	41618248	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,3:10,0:10,6,3,0
chr1	41618442	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=173,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,0:1,8:0,4,0,8
chr1	41625333	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=170,37;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,0:15,2:15,10,1,1
chr1	41627220	.	T	TTTTGAACATTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=188,239;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	41828087	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:1,3,0,2
chr1	41949628	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	41950312	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr1	42049727	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=169,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,1:8,1:3,7,2,0
chr1	42619303	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	42629040	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	42776699	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.410:10:0,1:4,2:4,2,3,1
chr1	42880159	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=209,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,4:5,0:5,2,4,0
chr1	42915727	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=166,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:2,1:2,2:1,3,1,3
chr1	42915753	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:2,1:3,1:1,4,0,3
chr1	42922879	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=118,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:6,0:10,2:10,6,2,0
chr1	42922945	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:9,0:18,4:11,16,4,0
chr1	42925688	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=302,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	43021810	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:9,3:5,2:11,3,5,0
chr1	43032005	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=181,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:6,2,0,2
chr1	43054909	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=16,35;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr1	43119661	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=77,162;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,4:6,1:4,5,1,4
chr1	43124859	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=221,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:2,3,6,2
chr1	43126671	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=156,179;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,3:5,0:1,7,0,3
chr1	43166409	.	GAGA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:6,1:10,3,0,2
chr1	43200808	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=127,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=57.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,23:0.533:43:8,0:12,23:9,11,0,23
chr1	43201534	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:4,3,0,3
chr1	43201576	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=177,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,2:0,0:2,3,0,2
chr1	43212291	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=194,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr1	43212431	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.955:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr1	43213499	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:2,3,0,3
chr1	43228189	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr1	43239395	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr1	43273064	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=167,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:3,2:2,2:3,3,3,1
chr1	43296118	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=116,198;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,1:7,2:10,9,3,0
chr1	43296173	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=198,71;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:11,2:8,7:8,11,2,7
chr1	43296195	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=159,177;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,1:5,2:4,7,1,2
chr1	43300663	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	43300921	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	43302971	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=210,255;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	43316760	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=100,142;MMQ=60,23;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:1,9:8,0:8,1,9,0
chr1	43393245	.	G	GGGTGAGAAAT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=116,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.220:25:12,2:8,2:13,7,4,1
chr1	43395229	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:5,2:3,0:7,2,0,2
chr1	43652369	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,8,8
chr1	43663376	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,3,11
chr1	43664064	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr1	43672537	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:6,4,0,2
chr1	43672636	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=294,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr1	43680855	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	43687724	.	CT	AA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=190,110;MMQ=60,55;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:4,2:4,0:0|1:43687724_CT_AA:43687724:7,2,3,0
chr1	43687729	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=181,110;MMQ=60,55;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:4,2:4,0:0|1:43687724_CT_AA:43687724:6,2,3,0
chr1	43692782	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:15,1:11,1:16,10,0,2
chr1	43699935	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr1	43700140	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr1	43738340	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	43748872	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=128,0;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,0:0|1:43748872_AG_CC:43748872:0,3,1,0
chr1	43748876	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,15;MFRL=142,0;MMQ=60,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:43748872_AG_CC:43748872:1,3,1,0
chr1	43748878	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=128,0;MMQ=60,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,0:2,0:0|1:43748872_AG_CC:43748872:2,3,1,0
chr1	43748894	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=131,41;MMQ=60,42;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.242:11:3,0:5,1:3,6,2,0
chr1	43770729	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,1:9,1:9,5,1,1
chr1	43770760	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:9,1:8,9,1,1
chr1	43771016	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.424:19:5,6:6,2:5,6,3,5
chr1	43773033	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,1:5,2:3,3,1,2
chr1	43774878	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:1,3,1,4
chr1	43777324	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=188,76;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,0:0,2:5,1,2,0
chr1	43777344	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=188,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:5,2,2,0
chr1	43777852	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr1	43777873	.	C	CTAATATTTTCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=196,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:1,3,0,1
chr1	43779564	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:11,4:2,3:11,2,4,3
chr1	43782846	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.645:21:2,5:5,6:7,0,10,4
chr1	43782918	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:6,2:8,0:7,8,0,2
chr1	43784956	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,198;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.560:19:3,5:5,6:6,2,5,6
chr1	43785061	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,0,2
chr1	43787437	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr1	43804454	.	A	ACTTCGTCTTGCATTGAGTAAACACCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr1	43812075	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=138,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:4,2,5,1
chr1	43814864	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=235,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,4:0,2:2,0,5,1
chr1	43817853	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:43817853_A_C:43817853:4,0,1,0
chr1	43817855	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,15;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:43817853_A_C:43817853:4,0,1,0
chr1	43826312	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,4,5
chr1	43830250	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:9,0:10,4:15,5,0,4
chr1	43850722	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,71;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,3:7,0:8,11,1,2
chr1	43853942	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=16,12;MFRL=216,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.734:8:0,0:0,0:2,0,6,0
chr1	43855546	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=203,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.324:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr1	43855578	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr1	43869235	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:1,2,1,3
chr1	43901011	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr1	43903589	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:2,4,0,5
chr1	43904316	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,5,0
chr1	43904603	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=164,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.162:16:5,0:9,2:0|1:43904603_AT_A:43904603:6,8,1,1
chr1	43904607	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=164,77;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.161:16:4,0:9,1:0|1:43904603_AT_A:43904603:6,8,1,1
chr1	43907092	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=179,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,4:5,4:2,5,8,0
chr1	43908407	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=270,251;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr1	43909265	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=244,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,3,1
chr1	43912590	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=130,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	43917409	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=185,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,2:2,4:1,1,4,2
chr1	43917637	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=200,111;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,3:3,7:2,3,4,6
chr1	43918179	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,58;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:43918179_C_T:43918179:0,0,0,1
chr1	43918188	.	C	CTTTCATTTGTCAGCTTCTGAGTTGTATTTTTATAATAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=200,120;MMQ=60,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43918179_C_T:43918179:1,0,0,1
chr1	44035472	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=154,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:0,4,1,5
chr1	44044468	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:4,2,3,2
chr1	44054597	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=186,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:3,4,0,2
chr1	44063378	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=15,12;MFRL=170,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:3,1,1,0
chr1	44064319	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr1	44067859	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=165,250;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	44071853	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	44072420	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	44075227	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	44078359	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=57,219;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0|1:44078359_T_A:44078359:4,0,3,0
chr1	44078384	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,15:0.843:17:0,8:2,6:0|1:44078359_T_A:44078359:2,0,14,1
chr1	44079411	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr1	44083015	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	44083110	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr1	44083507	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,9:1,15:0,1,12,13
chr1	44083519	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,8:1,12:0,1,8,12
chr1	44085012	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,0:7,2:12,5,2,0
chr1	44086080	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr1	44087496	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	44125962	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=132,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.665:10:0,0:3,7:2,1,3,4
chr1	44386293	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.843:4:0,1:0,0:0,0,0,4
chr1	44386300	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=15,23;MFRL=272,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,0:0,1:0,2,0,2
chr1	44386305	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	44386396	.	TCCCAGCCCTCCAGCTGAACTCTGCATGCCTTCTCTCAC	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=183,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.135:21:7,0:5,1:17,2,1,1
chr1	44386445	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:14,3,1,1
chr1	44386615	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr1	44395786	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,10:0,0,10,4
chr1	44426025	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,13:0,5:0,0,7,12
chr1	44426948	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,4,10
chr1	44432500	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,2,3
chr1	44437058	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=118,90;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,3:11,0:6,10,3,0
chr1	44438266	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:10,0:3,7:1,12,0,7
chr1	44447006	.	TAGC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=217,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AGC;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	44450677	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=147,144;MMQ=60,58;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,2:12,0:8,9,0,2
chr1	44455871	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=307,267;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	44457650	.	GACCT	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.232:11:5,2:3,0:0|1:44457650_GACCT_G:44457650:3,6,1,1
chr1	44457656	.	AGCCTGGAGCTGCGGGCGGAGGTGGGG	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:3,0:0|1:44457650_GACCT_G:44457650:3,6,1,1
chr1	44457739	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	44461391	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=186,238;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:6,0:13,10:3,16,0,10
chr1	44476519	.	G	GAGTGCTGTGGCATGA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,194;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.184:15:5,2:7,0:0|1:44476519_G_GAGTGCTGTGGCATGA:44476519:3,10,0,2
chr1	44476521	.	C	CTTGGCTCACTACAAGCTCTG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=159,194;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.184:15:5,2:7,0:0|1:44476519_G_GAGTGCTGTGGCATGA:44476519:3,10,0,2
chr1	44489914	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=175,107;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,0:5,5:7,3,0,5
chr1	44594966	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=136,19501006;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr1	44595113	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr1	44679552	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=178,66;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,1:10,0:6,15,0,2
chr1	44679556	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:7,3:3,8:3,8,3,8
chr1	44684995	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=100,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr1	44687386	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=100,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44687386_T_G:44687386:0,1,0,1
chr1	44687395	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44687386_T_G:44687386:0,0,0,1
chr1	44713586	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=189,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:13,0:15,5,1,1
chr1	44805031	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=234,0;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:44805031_G_A:44805031:0,2,1,0
chr1	44805035	.	AGAAAG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=234,0;MMQ=60,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:44805031_G_A:44805031:0,2,1,0
chr1	44818439	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=224,0;MMQ=60,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:44818439_C_T:44818439:2,0,1,0
chr1	44818442	.	C	CCG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,18;MFRL=224,0;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:44818439_C_T:44818439:2,0,1,0
chr1	44818443	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,17;MFRL=98,0;MMQ=60,49;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:44818439_C_T:44818439:3,0,1,0
chr1	45098142	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=191,9262192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr1	45169747	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,10;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.348:26:7,3:9,0:8,8,10,0
chr1	45169805	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:13,4:4,0:5,12,0,4
chr1	45213158	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=138,216;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,4:6,0:3,10,0,4
chr1	45213175	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=217,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,4:4,0:4,6,0,4
chr1	45219382	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.285:9:2,1:5,0:6,1,2,0
chr1	45223901	.	TATTAGCTG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=215,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTAGCTG;STR;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.456:7:1,2:3,1:1,3,0,3
chr1	45225921	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=211,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	45226370	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=240,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.267:9:3,0:4,2:0|1:45226370_G_GC:45226370:2,5,1,1
chr1	45226374	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=185,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.244:10:3,0:5,1:0|1:45226370_G_GC:45226370:2,6,1,1
chr1	45228375	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:45228375_TC_T:45228375:0,4,0,1
chr1	45228377	.	AGTATG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:45228375_TC_T:45228375:0,4,0,1
chr1	45241374	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr1	45241685	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=97,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.169:27:12,0:11,4:13,10,2,2
chr1	45253304	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:6,0:10,4:7,9,0,4
chr1	45266912	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=190,159;MMQ=40,32;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr1	45362992	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=210,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,1:2,5:1,2,4,2
chr1	45446902	.	AAAG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45446902_AAAG_A:45446902:0,1,0,1
chr1	45446908	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45446902_AAAG_A:45446902:0,1,0,1
chr1	45446910	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45446902_AAAG_A:45446902:0,1,0,1
chr1	45446916	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=17,29;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:45446902_AAAG_A:45446902:0,1,0,1
chr1	45470130	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,6,3
chr1	45471532	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:15,0:6,5:9,12,0,5
chr1	45472798	.	TTGTGTG	T,TTG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,26,28;MFRL=198,192,171;MMQ=60,60,60;MPOS=16,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=TG;STR;TLOD=13.44,4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,2:0.563,0.268:8:0,3,2:1,1,0:1,0,4,3
chr1	45473316	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	45474157	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=220,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,8:0,6:0,1,6,8
chr1	45474356	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,0:3,6:2,6,0,6
chr1	45475566	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,9,2
chr1	45476069	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,8,6
chr1	45478554	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,15;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.208:21:11,0:3,0:0|1:45478554_A_C:45478554:3,14,4,0
chr1	45478560	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=156,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.162:23:14,1:3,1:0|1:45478554_A_C:45478554:4,16,3,0
chr1	45478566	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=134,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:16,1:6,1:0|1:45478554_A_C:45478554:4,18,3,0
chr1	45479791	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,230;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.257:33:13,0:12,8:7,18,0,8
chr1	45480733	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,14:0,9:0,0,6,18
chr1	45486272	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	45500107	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=100,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:2,1:5,3:3,5,3,1
chr1	45502026	.	CTTTTTTT	C,CTTTTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=17,22,18;MFRL=140,155,159;MMQ=53,60,60;MPOS=13,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,11,16;RU=T;STR;TLOD=5.75,9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.248,0.421:10:0,2,1:0,1,0:2,1,0,7
chr1	45504524	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	45524213	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	45794426	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	45796269	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=221,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,2:1,5:0,3,5,2
chr1	45797196	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=215,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:2,5,2,0
chr1	45798555	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=242,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,7:0,5:1,0,7,5
chr1	45798729	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=197,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,9:4,0:7,3,9,0
chr1	45805566	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,11:0,0,6,13
chr1	45806882	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:16,3:9,0:10,15,3,0
chr1	45812359	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.223:25:9,5:10,0:13,7,5,0
chr1	45851537	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=160,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr1	45887375	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=134,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:7,1,1,1
chr1	45965307	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=226,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,6:1,4:0,4,3,7
chr1	45965340	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:0,5,1,4
chr1	45973240	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=181,100;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,0:2,2:4,7,0,2
chr1	45981258	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=157,167;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	45981418	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=121,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:6,3:15,0:7,14,0,3
chr1	45981480	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=138,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:2,0:8,2:1,9,2,0
chr1	45981512	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=193,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,1:2,5:1,2,1,5
chr1	46032324	.	TGGGG	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=137,241;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:11,1:7,0:0|1:46032324_TGGGG_T:46032324:8,10,0,2
chr1	46032330	.	GGCCCTGAA	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=137,241;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,1:7,0:0|1:46032324_TGGGG_T:46032324:8,10,0,2
chr1	46065998	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=48.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr1	46080947	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=70.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.917:22:0,9:1,11:0,1,13,8
chr1	46081940	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=45.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr1	46081960	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=176,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.856:19:0,7:2,9:1,1,14,3
chr1	46082431	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	46083706	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.750:26:3,14:3,6:5,1,11,9
chr1	46085852	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	46085879	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	46086329	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=118,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	46086913	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr1	46087879	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr1	46099248	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=154,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,1:9,2:9,9,1,2
chr1	46099842	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=108,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:4,0:12,2:7,9,1,1
chr1	46124585	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=212,198;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:7,0,2,0
chr1	46124663	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=120,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.495:16:3,6:5,1:4,4,2,6
chr1	46158837	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=167,144;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,7:5,0:9,0,7,0
chr1	46180059	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:4,4,1,2
chr1	46193522	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46193522_A_C:46193522:0,1,0,1
chr1	46193526	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46193522_A_C:46193522:0,1,0,1
chr1	46193529	.	GT	AG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46193522_A_C:46193522:0,0,0,1
chr1	46347910	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:4,2:1,2:6,0,4,0
chr1	46424964	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	46487560	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=195,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,3,0
chr1	46491423	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,1:12,2:8,13,2,1
chr1	46495434	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=270,304;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr1	46499443	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=157,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:6,4,0,2
chr1	46658328	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=228,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:5,1:0,4:0|1:46658328_A_G:46658328:0,5,1,4
chr1	46658343	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=253,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:5,1:0,4:0|1:46658328_A_G:46658328:1,5,1,4
chr1	46659104	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,3:3,2:5,4,2,3
chr1	46659363	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,2:2,4,2,3
chr1	46660240	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,0:7,4:9,7,0,4
chr1	46660295	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,5:4,2:3,6,4,3
chr1	46739974	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,22;MFRL=210,72;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr1	46740439	.	C	CATACGGGGTCAAATGGGTTTTTCTTGCTGCCTTCTA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=191,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.245:11:3,2:5,0:2,7,1,1
chr1	46745170	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,0:9,2:7,14,2,0
chr1	46806429	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=176,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:3,4:2,4:6,0,8,0
chr1	46806480	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=192,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=43.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.708:22:2,6:4,10:2,4,12,4
chr1	46810842	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,362;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	46812519	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=195,312;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	46818508	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	46826587	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,319;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	46827214	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr1	46827591	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	46871088	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=210,34763419;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:5,3,1,1
chr1	46874936	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=228,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:3,0:10,4:0,13,0,4
chr1	46877180	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr1	47013364	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,10:0,0,10,7
chr1	47014821	.	A	AAAAG,AAAAAG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29,31;MFRL=140,113,137;MMQ=60,46,42;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.34,7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,8,4:0.448,0.259:18:3,3,2:3,5,2:3,3,7,5
chr1	47016761	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=117,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.570:40:9,12:8,10:7,10,13,10
chr1	47025839	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=214,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:4,1,3,0
chr1	47034144	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=151,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.150:24:13,1:8,2:10,11,1,2
chr1	47059819	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:3,7,0,2
chr1	47059934	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,304;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	47108828	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr1	47110766	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	47138444	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr1	47181920	.	CAAAAAAAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=60757586,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=26,17;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:0,1:1,0:1,1,1,0
chr1	47278099	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,16;MFRL=175,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.576:3:0,0:1,0:1,0,2,0
chr1	47278102	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=17,16;MFRL=175,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:1,0,2,0
chr1	47278107	.	CT	GG,GT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=12,16,33;MFRL=175,251,157;MMQ=60,60,60;MPOS=7,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.04,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:0,0,0:1,0,2,0
chr1	47280085	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=185,241;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	47280746	.	GAT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=111,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,1:6,1:5,5,2,0
chr1	47280859	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=117,241;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:5,2:4,5,2,1
chr1	47280884	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=139,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,3:5,2:4,6,2,3
chr1	47282772	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=187,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:8,3,1,2
chr1	47282888	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:8,1:2,2:2,8,1,2
chr1	47398743	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=248,159;MMQ=56,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,6:1,3:1,1,4,5
chr1	47400059	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	47402487	.	TTG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,15;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=TG;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.645:3:0,0:1,0:0,1,0,2
chr1	47495605	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=154,250;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:2,2:1,1:3,1,3,0
chr1	47501704	.	T	TATACTTC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=133,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,2:5,0:0|1:47501704_T_TATACTTC:47501704:9,6,1,1
chr1	47501705	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=133,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:0|1:47501704_T_TATACTTC:47501704:9,6,1,1
chr1	47504470	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47504470_G_A:47504470:0,2,0,1
chr1	47504473	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47504470_G_A:47504470:0,2,0,1
chr1	47560403	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=146,130;MMQ=50,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:47560403_G_T:47560403:0,4,0,1
chr1	47560409	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=154,134;MMQ=40,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0|1:47560403_G_T:47560403:0,1,0,2
chr1	47560413	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=154,134;MMQ=40,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:47560403_G_T:47560403:0,1,0,2
chr1	47560416	.	AG	GA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=154,134;MMQ=40,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:47560403_G_T:47560403:0,1,0,2
chr1	47560419	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=154,134;MMQ=40,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:47560403_G_T:47560403:0,1,0,2
chr1	47571902	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=146,187;MMQ=52,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:12,3:15,0:0|1:47571902_C_T:47571902:12,16,3,0
chr1	47571905	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=148,187;MMQ=52,40;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:10,2:16,0:0|1:47571902_C_T:47571902:12,14,3,0
chr1	47571943	.	CTTT	C,CTT,CTTTT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,35,33,19;MFRL=235,205,191,169;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,26,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,15,17;RU=T;STR;TLOD=3.93,3.25,8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,2,5:0.191,0.237,0.424:10:1,1,1,1:0,1,1,1:0,1,2,7
chr1	47571996	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=201,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:8,2:3,1:0,11,0,3
chr1	47582246	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,5:2,0:5,3,4,1
chr1	47582292	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=59,139;MMQ=27,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:19,1:1,1:15,5,2,0
chr1	47607762	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=153,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:6,3,3,2
chr1	47607785	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=169,195;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,4:6,2:4,4,3,3
chr1	47607851	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=197,213;MMQ=60,51;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:4,2,3,4
chr1	47609668	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	47611849	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=109,212;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,1:2,1:4,6,0,2
chr1	47614434	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,170;MMQ=52,46;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:3,5,1,1
chr1	47649788	.	GCACTTGTGACAGTAATAGCTTCCAGAATAAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=197,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.285:5:1,1:1,0:0,4,0,1
chr1	47735280	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	47746811	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=154,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:5,3:9,0:3,11,1,2
chr1	47753405	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr1	47765490	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=298,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr1	47767141	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=229,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	47770786	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	47838725	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:9,4:8,0:6,11,4,0
chr1	47840627	.	G	GCAAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0,7,1,1
chr1	47841038	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,253;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr1	47903846	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47903846_C_T:47903846:0,0,1,0
chr1	47903856	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47903846_C_T:47903846:0,0,1,0
chr1	47905017	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=206,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr1	47905555	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=253,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,1:1,2:4,1,2,1
chr1	47905782	.	CTTTT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=23,19;RU=T;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.705:9:0,0:2,4:1,2,0,6
chr1	47906425	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	48695081	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=159,136;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.760:23:2,10:3,8:3,2,6,12
chr1	48701330	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:6,1:11,0,2,0
chr1	48701567	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=37,28;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr1	48705137	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=170,88;MMQ=60,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.185:23:12,3:7,0:8,11,4,0
chr1	48705252	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0|1:48705252_CCT_C:48705252:1,3,0,1
chr1	48705258	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:48705252_CCT_C:48705252:1,0,0,2
chr1	48869453	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:8,10,1,1
chr1	49056695	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=146,246;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,1:1,4:0,3,0,6
chr1	49056741	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=286,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.253:6:1,0:4,1:0|1:49056741_A_AT:49056741:0,5,0,1
chr1	49056749	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=223,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:49056741_A_AT:49056741:0,3,0,1
chr1	49056753	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,30;MFRL=306,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49056741_A_AT:49056741:0,1,0,1
chr1	49100332	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,254;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr1	49128720	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=213,336;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr1	49332969	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr1	50513886	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50513886_C_T:50513886:0,0,1,0
chr1	50513889	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513886_C_T:50513886:0,0,1,0
chr1	50574915	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=170,49;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,2:5,0:0|1:50574915_G_T:50574915:3,9,1,1
chr1	50574917	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=181,49;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:5,0:0|1:50574915_G_T:50574915:3,10,1,1
chr1	50574919	.	GAAAA	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=181,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:50574915_G_T:50574915:3,8,1,1
chr1	50574925	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=181,49;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:50574915_G_T:50574915:3,8,1,1
chr1	50575675	.	CTG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=120,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TG;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:0,1:2,1,1,1
chr1	50661361	.	CCCAGCCAGAAGT	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=142,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,0:9,2:10,12,1,1
chr1	50661411	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,11:0,0,12,10
chr1	50666515	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=117,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:2,4:3,2:0,5,2,5
chr1	50884778	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	50957509	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr1	51001207	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51001207_G_T:51001207:0,0,0,1
chr1	51001208	.	A	AGTGGCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51001207_G_T:51001207:0,0,0,1
chr1	51001212	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51001207_G_T:51001207:0,0,0,1
chr1	51253765	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.180:24:4,3:14,0:10,10,4,0
chr1	51611401	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=151,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:5,5,0,2
chr1	51761796	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=132,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,0:8,3:10,7,0,3
chr1	51767352	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:4,4,0,3
chr1	51767462	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51767462_A_C:51767462:0,0,0,1
chr1	51767463	.	T	TGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51767462_A_C:51767462:0,0,0,1
chr1	51767466	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51767462_A_C:51767462:0,0,0,1
chr1	51768011	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=167,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:14,2:9,0:9,15,1,1
chr1	51864651	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,100;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr1	51912861	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=193,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:51912861_T_G:51912861:0,2,0,1
chr1	51912867	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=193,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:51912861_T_G:51912861:0,2,0,1
chr1	51937334	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=123,105;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,11:0.218:53:17,11:25,0:35,7,11,0
chr1	52082682	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,10;MFRL=198,280;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.587:3:0,0:1,0:0|1:52082682_G_C:52082682:1,0,2,0
chr1	52082686	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=15,12;MFRL=160,280;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:0,0:0,0:0|1:52082682_G_C:52082682:1,1,2,0
chr1	52082689	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=21,16;MFRL=122,270;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.665:4:1,0:0,0:0|1:52082682_G_C:52082682:0,1,3,0
chr1	52082693	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=122,270;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.665:4:1,0:0,1:0|1:52082682_G_C:52082682:0,1,3,0
chr1	52279650	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,10,5
chr1	52290984	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=175,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,6:2,3:2,2,3,6
chr1	52293570	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr1	52293638	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	52306027	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=108,200;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:6,1:12,2:9,9,1,2
chr1	52306063	.	ATCT	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=143,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCT;STR;TLOD=46.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.612:21:3,9:5,4:1,7,5,8
chr1	52402956	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	52489322	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,1,5
chr1	52499517	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=179,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:52499517_T_C:52499517:0,2,0,1
chr1	52499527	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:52499517_T_C:52499517:0,3,0,1
chr1	52517412	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr1	52729425	.	T	TGGGGGCGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,17;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr1	52729436	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	52732311	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=176,187;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr1	52820226	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr1	52821418	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:0|1:52821418_G_GA:52821418:4,12,1,1
chr1	52821419	.	G	GTAGCTGGGATTAC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:0|1:52821418_G_GA:52821418:4,12,1,1
chr1	52825297	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=196,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:4,3,2,0
chr1	52827212	.	TTCCTCC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=65,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=TCC;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:4,2,0,2
chr1	52850801	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:2,11:3,0:4,1,11,0
chr1	52870325	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,188;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:5,0,4,0
chr1	52896751	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:9,1:9,1:8,10,0,2
chr1	52902670	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	52912122	.	TA	T,TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=19,26,27;MFRL=200,238,203;MMQ=60,60,60;MPOS=11,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.22,10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,5:0.214,0.429:11:2,0,1:0,2,3:1,3,1,6
chr1	52947350	.	TAA	T,TA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,24,24;MFRL=243,191,239;MMQ=60,60,60;MPOS=15,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.80,4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,3:0.203,0.213:16:5,1,2:5,2,1:5,5,6,0
chr1	52959319	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:17,3:19,0:15,21,0,3
chr1	52991506	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.145:46:19,0:19,6:27,13,5,1
chr1	53153432	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,4:4,0:2,3,1,3
chr1	53250650	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=111,186;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:7,4:7,2:4,10,1,5
chr1	53261954	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=159,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:3,6:12,0:9,6,4,2
chr1	53262569	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	53267474	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=147,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:4,1,2,0
chr1	53267488	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,10;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:1,0:2,0:3,2,4,0
chr1	53282362	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=117,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:1,3,0,3
chr1	53308665	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=200,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:1,1,2,3
chr1	53323492	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	53363177	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=129,102;MMQ=60,22;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:4,0:10,5:4,10,0,5
chr1	53364976	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr1	53377366	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:53377366_AG_CC:53377366:1,3,1,0
chr1	53377371	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:53377366_AG_CC:53377366:1,3,1,0
chr1	53387215	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=169,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:7,2,2,1
chr1	53387379	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr1	53453640	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=110,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:5,1,3,1
chr1	53453683	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:9,1:2,5:3,8,5,1
chr1	53453714	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:9,0:3,3:6,7,3,0
chr1	53493784	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=223,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,0:1,2:0|1:53493784_CT_C:53493784:0,2,1,1
chr1	53493791	.	AA	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=215,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,0:1,1:0|1:53493784_CT_C:53493784:0,3,1,1
chr1	53513423	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr1	53527793	.	C	CGGG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,7;RU=G;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.378:5:3,1:0,1:0|1:53527793_C_CGGG:53527793:3,0,2,0
chr1	53527798	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr1	53527799	.	G	GGGT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGT;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr1	53527802	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.286:7:3,1:0,0:0|1:53527793_C_CGGG:53527793:5,0,2,0
chr1	53527807	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.286:7:5,1:0,0:0|1:53527793_C_CGGG:53527793:5,0,2,0
chr1	53527996	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	53532609	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:6,2:1,1:2,6,1,2
chr1	53535478	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=135,183;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.784:12:1,5:1,4:0|1:53535478_G_A:53535478:2,0,7,3
chr1	53535499	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=178,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,3:0.306:11:3,2:5,1:1|0:53535478_G_A:53535478:4,4,3,0
chr1	53543112	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	53543312	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=121,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:0,3:3,0,4,0
chr1	53546606	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=226,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr1	53547840	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=224,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	53547843	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=207,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	53554533	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=182,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,2,1
chr1	53556242	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=228,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:1,2:3,0:1,3,2,0
chr1	53556250	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=216,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,3,0
chr1	53568980	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=205,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:4,2,4,1
chr1	53571288	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	53608133	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=151,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:2,3,0,3
chr1	53683921	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=111,132;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=59.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.668:28:4,15:5,4:3,6,1,18
chr1	53686383	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,302;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	53699244	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=137,57;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:0|1:53699244_C_T:53699244:7,13,1,1
chr1	53699248	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=137,57;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:0|1:53699244_C_T:53699244:7,13,1,1
chr1	53716416	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=181,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,5:5,5:6,2,6,4
chr1	53723190	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=238,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:1,2:5,1:1,5,0,3
chr1	53736613	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=189,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:8,0,2,0
chr1	53742506	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	53930450	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=230,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.304:8:2,0:3,1:0|1:53930450_G_C:53930450:1,5,2,0
chr1	53930453	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,18;MFRL=230,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.304:8:2,0:3,1:0|1:53930450_G_C:53930450:1,5,2,0
chr1	53930456	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=229,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,1:0|1:53930450_G_C:53930450:1,6,2,0
chr1	53974987	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,7,7
chr1	54266314	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=167,35;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr1	54298189	.	CTTA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTA;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,0:12,2:17,7,1,1
chr1	54298297	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=135,231;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,2:5,0:2,7,0,2
chr1	54303827	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:54303827_C_G:54303827:0,0,1,0
chr1	54303830	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:54303827_C_G:54303827:0,0,1,0
chr1	54303834	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54303827_C_G:54303827:0,0,1,0
chr1	54303839	.	GA	CC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:54303827_C_G:54303827:0,0,1,0
chr1	54344282	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=108,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr1	54344296	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=157,242;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,5:4,0:7,2,5,0
chr1	54370264	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=132,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,0:3,3:4,2,3,0
chr1	54370516	.	CCCACTGT	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:1,2:0|1:54370516_CCCACTGT_C:54370516:3,6,0,2
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chr1	54370529	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:54370516_CCCACTGT_C:54370516:3,6,0,2
chr1	54370532	.	T	TTC	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=175,198;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:54370516_CCCACTGT_C:54370516:3,5,0,2
chr1	54370535	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=163,198;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:54370516_CCCACTGT_C:54370516:3,4,0,2
chr1	54375701	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=189,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:1,4,0,3
chr1	54477726	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	54483694	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=199,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.611:13:2,1:2,7:3,2,3,5
chr1	54483792	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=86,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:9,1:5,2:9,6,2,1
chr1	54502436	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=111,60;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr1	54561916	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:1,8:2,4:3,0,9,3
chr1	54605319	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=93,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.843:17:1,5:1,10:1,1,6,9
chr1	54607157	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr1	54618435	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=16365647,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:2,3:0,4:1,1,5,2
chr1	54670658	.	CCTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr1	54675849	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:1,5,0,3
chr1	54683732	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	54686464	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=113,187;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:6,5:4,5:4,6,5,5
chr1	54692854	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=208,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	54694214	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=169,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:3,4,2,1
chr1	54703702	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=189,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:2,2,1,2
chr1	54704629	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr1	54707939	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=154,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:2,6,0,2
chr1	54871551	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=111,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,1:0|1:54871551_G_C:54871551:1,0,2,0
chr1	54871555	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,19;MFRL=111,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:54871551_G_C:54871551:1,0,2,0
chr1	54871562	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=141,252;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:54871551_G_C:54871551:1,1,1,0
chr1	54871566	.	ACCGC	CCCGC,A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,12,28;MFRL=0,252,141;MMQ=60,60,60;MPOS=2,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.333,0.500:3:0,0,0:0,0,2:0,0,2,1
chr1	54871709	.	T	TCGC,TCGCCGC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32,28;MFRL=0,141,145;MMQ=60,60,60;MPOS=23,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,9,10;RU=CGC;STR;TLOD=3.07,15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,4:0.247,0.659:5:0,0,1:0,1,2:0,0,2,3
chr1	55069986	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=231,193;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:0,2:2,1:3,0,3,0
chr1	55072726	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=253,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr1	55072856	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:6,7,1,1
chr1	55074570	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,12;MFRL=144,195;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.604:8:0,0:0,0:3,0,5,0
chr1	55074840	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:1,3,0,4
chr1	55074922	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=233,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,2,1
chr1	55080612	.	GGTGT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=GT;STR;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0|1:55080612_GGTGT_G:55080612:0,0,0,4
chr1	55080629	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:55080612_GGTGT_G:55080612:0,0,0,5
chr1	55118566	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,11:0,4:0,0,10,5
chr1	55130931	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=143,50;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:7,4:1,0:4,5,1,3
chr1	55130946	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=160,50;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:4,4:0,0:1,4,1,3
chr1	55130972	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	55134487	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=174,328;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:3,2,2,3
chr1	55134526	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=205,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,2:8,1:6,7,1,2
chr1	55134585	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.686:14:2,2:2,7:1,3,3,7
chr1	55136067	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr1	55136148	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=148,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,3:4,2:7,4,1,4
chr1	55136330	.	C	CCCAG	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=34,16;MFRL=233,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,0:0,3,2,0
chr1	55136333	.	T	C,TTTCCTTACCAGAATCTAGAACTTCTAAGG	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=32,32,29;MFRL=212,189,286;MMQ=60,60,60;MPOS=25,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.36,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.375,0.250:5:0,1,1:2,1,0:0,2,2,1
chr1	55136338	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=35,12;MFRL=233,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,0:0|1:55136338_CAA_C:55136338:0,3,2,0
chr1	55136344	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=35,33;MFRL=233,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0|1:55136338_CAA_C:55136338:0,3,2,0
chr1	55136350	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,34;MFRL=233,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0|1:55136338_CAA_C:55136338:0,3,2,0
chr1	55136355	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=242,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:3,0:0|1:55136338_CAA_C:55136338:0,5,2,0
chr1	55136356	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=194,261;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:3,1:2,2,0,2
chr1	55136357	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=35,23;MFRL=246,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,0:0|1:55136338_CAA_C:55136338:0,4,2,0
chr1	55138673	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:5,2:7,0,2,0
chr1	55139912	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=209,279;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	55144525	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=157,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,5:3,1:3,5,2,4
chr1	55174819	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr1	55197149	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,1:2,6:2,1,3,4
chr1	55199420	.	ATTTTTTTT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=26,18;RU=T;STR;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.886:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	55253575	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	55253594	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=206,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,1:1,1:3,1,0,2
chr1	55266845	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=175,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr1	55271774	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=191,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	55273422	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=254,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:1,1,0,4
chr1	55277430	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	55277440	.	C	CGGGGGGGGGGGGCGGGCG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=162,252;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:55277440_C_CGGGGGGGGGGGGCGGGCG:55277440:0,2,1,0
chr1	55277441	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,0;MFRL=162,252;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:55277440_C_CGGGGGGGGGGGGCGGGCG:55277440:0,2,1,0
chr1	55279708	.	G	GTTAATATTTTTAAGTCAACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=105,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:55279708_G_GTTAATATTTTTAAGTCAACT:55279708:1,3,0,1
chr1	55279710	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=105,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:55279708_G_GTTAATATTTTTAAGTCAACT:55279708:1,3,0,1
chr1	55330966	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,8,5
chr1	55336950	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=186,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr1	55446664	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:55446664_G_C:55446664:0,0,3,0
chr1	55446671	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:55446664_G_C:55446664:0,0,3,1
chr1	55446697	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.828:4:0,2:0,0:0,0,3,1
chr1	55457815	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	55464790	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=241,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,1:0,5:1,0,7,0
chr1	55473010	.	G	GATGGATCACTTGAGGCCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=201,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	55505552	.	ACTG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=177,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CTG;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:3,0:5,7,1,1
chr1	55505732	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr1	55517861	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=274,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:2,0,5,0
chr1	55517883	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr1	55518166	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=203,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,1,5
chr1	55518316	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:15,1:6,3:15,7,2,2
chr1	55518528	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	55521899	.	GGGGCGGA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGCGGA;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.715:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	55524116	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=185,93;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=72.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.933:28:1,11:0,13:1,0,26,1
chr1	55525400	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	55527323	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	55538022	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=138,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.144:19:9,0:7,2:0|1:55538022_C_T:55538022:7,10,0,2
chr1	55538027	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=143,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:55538022_C_T:55538022:8,10,0,2
chr1	55538028	.	A	ATT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=143,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:55538022_C_T:55538022:8,10,0,2
chr1	55538039	.	GAGA	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=163,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,1:7,2:8,9,0,3
chr1	55538385	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	55546895	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	55551718	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=280,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,1:3,5:2,4,2,4
chr1	55555285	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr1	55557859	.	A	ATT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=47.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,5:0,3:0|1:55557859_A_ATT:55557859:0,0,0,11
chr1	55557864	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0|1:55557859_A_ATT:55557859:0,0,0,11
chr1	55558661	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr1	55562125	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,11:0,3:0,0,13,1
chr1	55563396	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=147,272;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.362:12:2,1:2,2:2,6,1,3
chr1	55564131	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,5:5,2:6,5,8,0
chr1	55566411	.	TTAGTC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,9,0
chr1	55567410	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr1	55572867	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,9:0,0,10,3
chr1	55589174	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,1:9,1:7,5,1,1
chr1	55600181	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=230,183;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,0:0,5:0,3,5,0
chr1	55604692	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:5,2:13,1:0,18,0,3
chr1	55614036	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	55619422	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	55643837	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=197,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=49.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:1,8:0,6:0,1,1,14
chr1	57111169	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=144,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,2:3,5:2,2,1,6
chr1	57158051	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:9,2:7,2:9,7,1,3
chr1	57185818	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=164,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,4:0,6:1,1,8,2
chr1	57202879	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=198,229;MMQ=60,46;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,0:1,3:0|1:57202879_A_C:57202879:0,3,0,4
chr1	57202882	.	T	TTA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=198,229;MMQ=60,46;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0|1:57202879_A_C:57202879:0,3,0,4
chr1	57216739	.	C	CAATCTTTA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=205,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:57216739_C_CAATCTTTA:57216739:3,1,1,1
chr1	57216741	.	G	GAAGCATTTTAATGTTAAAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=205,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.368:6:3,0:1,2:0|1:57216739_C_CAATCTTTA:57216739:3,1,1,1
chr1	57219539	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=121,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,2:4,1:5,7,2,1
chr1	57219631	.	G	GAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=105,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	57233537	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,43;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,3:5,0:11,2,2,1
chr1	57320593	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,4:6,0:3,9,4,0
chr1	57347205	.	A	AAATG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=151,81;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:8,1:2,1:3,7,0,2
chr1	57395251	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr1	57395294	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	57409329	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=143,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,1:5,3:5,5,3,1
chr1	57417633	.	G	GGGATGTGTCCAAGGTCACACA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=273,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,3:3,0,5,0
chr1	57420285	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr1	57425888	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:7,1:1,1:1,7,0,2
chr1	57480896	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=190,232;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:1,3,1,1
chr1	57491662	.	A	AGATGGATATGAGAGCTCTAATAT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=174,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:4,2:7,0:8,3,1,1
chr1	57535198	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=196,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	57535205	.	GGC	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=189,194;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr1	57602211	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=167,66;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:10,2:0|1:57602211_C_T:57602211:7,5,2,0
chr1	57602218	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=167,66;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:9,2:0|1:57602211_C_T:57602211:7,5,2,0
chr1	57602334	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:3,1:4,1:1,6,1,1
chr1	58971831	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:4,3:10,3:5,9,4,2
chr1	58971940	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	58996203	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	59004979	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	59043204	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=172,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:14,2:0|1:59043204_G_C:59043204:17,5,2,0
chr1	59043214	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=165,75;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:12,2:0|1:59043204_G_C:59043204:17,7,2,0
chr1	59125894	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=186,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0|1:59125894_A_G:59125894:0,5,0,3
chr1	59125899	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=186,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0|1:59125894_A_G:59125894:0,5,0,3
chr1	59127024	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=225,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:2,6,3,1
chr1	59127193	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=205,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,5:2,2:2,6,1,6
chr1	59131311	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr1	59134586	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,1:6,4:10,1,4,1
chr1	59134607	.	C	CAG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,4:0,14:0,0,12,7
chr1	59139223	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:7,6:7,1:11,3,5,2
chr1	59147420	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,2:6,3:7,3,4,1
chr1	59150941	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,5,9
chr1	59150997	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=181,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.254:10:5,1:2,1:0,8,0,2
chr1	59156155	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,4:2,5:0,6,0,9
chr1	59158632	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=121,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:4,0:0,2:1,3,1,1
chr1	59160724	.	TAAA	T,TAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28,25;MFRL=145,150,140;MMQ=60,60,60;MPOS=24,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,1,0:1,0,1:1,2,2,0
chr1	59160735	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:2,1,1,2
chr1	59160982	.	ATACT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=194,206;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr1	59844471	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:3,5:12,5:4,11,6,4
chr1	60019769	.	ATTTGTT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=207,70;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTGTT;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:6,0:7,2:16,4,1,1
chr1	60091792	.	T	TGAAGATA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=147,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:0|1:60091792_T_TGAAGATA:60091792:1,6,0,2
chr1	60091794	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=147,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:0|1:60091792_T_TGAAGATA:60091792:1,6,0,2
chr1	60228310	.	T	TTC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=206,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:1,8:1,4:0,2,6,6
chr1	60280749	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	60287421	.	GT	G,GTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33,33;MFRL=0,162,173;MMQ=60,60,60;MPOS=11,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.23,4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.424,0.430:4:0,0,1:0,2,1:0,0,4,0
chr1	60314648	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=211,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,2:5,1:8,0,3,0
chr1	60314703	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=172,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:0,5:7,3:7,1,7,1
chr1	60324818	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=172,327;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr1	60328613	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=207,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:0,5,0,5
chr1	60331664	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=221,54;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,3:4,0:5,2,1,2
chr1	60338684	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=161,252;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,3:7,0:1,11,0,3
chr1	60463521	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	60466814	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=186,207;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:4,3:1,1:3,2,2,3
chr1	60466911	.	ACAG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	60491030	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,35;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:6,2:5,0:10,2,1,1
chr1	60505578	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr1	60505783	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,4:7,1:7,3,0,5
chr1	60506744	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=119,268;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,0:4,3:6,6,1,2
chr1	60521102	.	T	TCTAGGGTAGGG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=119,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,2:2,0:1,3,1,1
chr1	60538311	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=154,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:60538311_G_A:60538311:0,5,1,1
chr1	60538313	.	C	CAAAACA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=154,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:60538311_G_A:60538311:0,5,1,1
chr1	61548344	.	TTCTC	T,TTC	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,25,25;MFRL=148,197,0;MMQ=60,60,60;MPOS=13,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=TC;STR;TLOD=3.71,5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,2,3:0.101,0.159:22:8,0,3:6,2,0:14,3,5,0
chr1	61554048	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=168,256;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,3:5,0:6,6,1,2
chr1	61872215	.	GCCC	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=149,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=C;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.706:5:0,1:1,3:0|1:61872215_GCCC_G:61872215:0,1,0,4
chr1	61872228	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=200,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.456:9:2,3:3,1:0|1:61872215_GCCC_G:61872215:0,5,1,3
chr1	61892170	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=170,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:17,3:10,0:15,12,3,0
chr1	61892301	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=43.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr1	62149237	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,1:7,1:4,12,0,2
chr1	62160542	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	62189405	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,114;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,0:10,2:11,10,0,2
chr1	62189427	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=141,114;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:10,12,0,2
chr1	62231924	.	T	TTGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=138,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGA;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr1	62274312	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=53483670,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	62293170	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,181;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:6,0:9,12:7,8,0,12
chr1	62299478	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:5,0:0,3:0,5,0,3
chr1	62340855	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=173,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr1	62350123	.	GTTTTTT	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=22,16;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr1	62350141	.	T	TAAGATAGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=146,155;MMQ=60,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:62350141_T_TAAGATAGG:62350141:0,4,0,1
chr1	62350143	.	T	TCTCGCTCTG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=146,155;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:62350141_T_TAAGATAGG:62350141:0,4,0,1
chr1	62350145	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=146,155;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:62350141_T_TAAGATAGG:62350141:0,4,0,1
chr1	62365217	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=179,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	62366878	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=148,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	62366968	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=191,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:7,6:7,0:7,7,5,1
chr1	62380270	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,10,8
chr1	62380298	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=101,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:8,2:4,5:9,3,3,4
chr1	62393394	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr1	62393468	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=167,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:10,3:7,0:8,9,3,0
chr1	62417951	.	A	AG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=155,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.852:22:2,11:1,8:2,1,18,1
chr1	62418129	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=90,90;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.251:38:17,0:11,9:7,22,0,9
chr1	62456014	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:4,3:5,4,3,4
chr1	62456048	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:3,2,0,3
chr1	62550128	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr1	62550173	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=208,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:3,2,3,1
chr1	62550230	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=203,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:1,3,4,3
chr1	62566018	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=112,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:9,2:4,0:11,3,2,0
chr1	62579672	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	62587014	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	62588754	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:3,2,0,2
chr1	62594677	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=188,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr1	62673037	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr1	62675619	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=70,129;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,31:0.830:37:1,22:4,8:2,4,17,14
chr1	62675644	.	ACCTCAGGGCTGGAGGAGGAGGAGGAAGAGC	A	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=72.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.824:22:3,10:1,7:4,1,7,10
chr1	62677048	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=34.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr1	62704048	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=182,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:62704048_G_C:62704048:4,10,1,1
chr1	62704054	.	C	CAAGGTTATACCAGTTTTCACTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=204,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:62704048_G_C:62704048:3,8,1,1
chr1	62729015	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,2,6
chr1	62733939	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:3,2,2,1
chr1	62739324	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,0:5,4:2,7,0,4
chr1	62939634	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr1	62953183	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr1	62961928	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	62973795	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	63001120	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr1	63027411	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,1,13
chr1	63044415	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=149,172;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:1,0:5,1,2,0
chr1	63044425	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=165,144;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,0:2,1:0|1:63044425_G_A:63044425:6,1,3,0
chr1	63044429	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,15;MFRL=165,144;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,0:2,0:0|1:63044425_G_A:63044425:6,1,3,0
chr1	63044645	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:4,4:1,0:3,5,1,3
chr1	63052103	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,349;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	63066947	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=151,71754962;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr1	63085714	.	GG	AA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,99;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:5,2:0|1:63085714_GG_AA:63085714:4,13,1,1
chr1	63085717	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=151,99;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:6,2:0|1:63085714_GG_AA:63085714:4,13,1,1
chr1	63085719	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=151,99;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:6,2:0|1:63085714_GG_AA:63085714:4,13,1,1
chr1	63096948	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=136,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:19,0:15,6:7,27,0,6
chr1	63113511	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	63113689	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	63113719	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	63153987	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:63153987_G_A:63153987:0,2,0,1
chr1	63153992	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:63153987_G_A:63153987:0,2,0,1
chr1	63270823	.	CTT	C,CT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,31,32;MFRL=114,138,138;MMQ=60,60,60;MPOS=19,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.77,3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,3:0.160,0.249:14:6,1,1:1,1,2:7,2,5,0
chr1	63270923	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:15,5:11,0:9,17,0,5
chr1	63307303	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=231,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr1	63329699	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=157,106;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:11,0:7,9:8,10,0,9
chr1	63872017	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:6,0:10,6:7,9,0,6
chr1	63872871	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=198,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0,5,0,5
chr1	63872905	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=200,248;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr1	63912546	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.282:9:5,0:2,2:4,3,0,2
chr1	63920090	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:11,0:14,7,0,2
chr1	63920515	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=94,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:2,0,3,2
chr1	63988904	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=224,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr1	63997633	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,1:4,1:5,3,2,0
chr1	63998326	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,1:7,2:10,0,3,0
chr1	64021096	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,2:6,1:8,6,2,1
chr1	64036838	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,3:3,2:2,7,1,4
chr1	64038107	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=110,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,1:10,2:9,10,1,2
chr1	64100478	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=172,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,3:6,2:9,4,3,2
chr1	64102114	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=245,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr1	64117537	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:1,8,0,2
chr1	64125234	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,3:7,0:7,3,2,1
chr1	64125368	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=196,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:6,4:6,4:3,10,2,6
chr1	64125439	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=203,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr1	64608059	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,4:1,0:4,0,1,3
chr1	64624612	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	64624842	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=159,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:6,6,1,2
chr1	64643277	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,3:6,4:6,6,7,0
chr1	64644069	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=103,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:9,2:8,2:10,7,2,2
chr1	64644409	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=174,136;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:7,6:8,0:6,9,6,0
chr1	64644545	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,0:5,4:2,6,0,4
chr1	64680682	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,155;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr1	64707243	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	64726414	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:3,2:2,2:2,3,0,4
chr1	65068638	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr1	65099701	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr1	65099978	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,2,11
chr1	65138787	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.643:9:1,2:2,1:3,0,4,2
chr1	65141676	.	TTAATAATAATAATAA	T,TTAATAATAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,29,33;MFRL=188,210,227;MMQ=60,60,60;MPOS=29,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,10,13;RU=TAA;STR;TLOD=8.94,7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.287,0.472:7:1,2,0:0,1,3:0,1,1,5
chr1	65143881	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=132,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:6,0:10,3:10,8,0,3
chr1	65255018	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,3,0
chr1	65278477	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=150,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:7,5,2,0
chr1	65310489	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=115,201;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:8,6:5,1:7,6,3,4
chr1	65316675	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,3:4,1:0,9,0,4
chr1	65321388	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:14,4:8,3:7,15,3,4
chr1	65330590	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,103;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.283:37:8,0:18,10:12,15,0,10
chr1	65330682	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:1,6,0,4
chr1	65335103	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=127,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:12,3:14,0:13,13,0,3
chr1	65614260	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr1	65830297	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=242,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,2:2,1:0|1:65830297_G_T:65830297:3,1,4,0
chr1	65830299	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=242,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,1:3,2:0|1:65830297_G_T:65830297:3,1,4,0
chr1	65860687	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=115,119;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:3,7,2,2
chr1	65867391	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=233,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr1	65874519	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=146,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr1	66036501	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	66037984	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=91,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr1	66062325	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=180,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,1,1
chr1	66064293	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=173,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,1,1
chr1	66067563	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.438:30:5,0:12,13:8,9,0,13
chr1	66085574	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=172,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,4:2,3:2,3,4,3
chr1	66085630	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=181,207;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,14:0.469:30:5,14:11,0:0|1:66085630_G_C:66085630:7,9,14,0
chr1	66085635	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=181,207;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,14:0.469:30:5,13:10,0:0|1:66085630_G_C:66085630:7,9,14,0
chr1	66088701	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=185,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr1	66102168	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=185,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,0:4,4:1,10,0,4
chr1	66102459	.	AAG	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=160,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AG;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,2:8,0:8,4,0,2
chr1	66732299	.	G	GTGTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=195,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TGTTT;STR;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:3,4:3,0:4,2,4,0
chr1	66732529	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=355,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr1	66829262	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=83.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,1,22
chr1	67000103	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:3,2,2,2
chr1	67109335	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=208,166;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,3:6,2:5,5,4,1
chr1	67126114	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	67138877	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=149,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:8,0,2,0
chr1	67142675	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=150,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,4:6,4:3,6,5,3
chr1	67145322	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr1	67149706	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=217,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	67154730	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=70,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:0,3:1,0:1,1,3,0
chr1	67155862	.	TCTC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,4:2,5:5,1,6,3
chr1	67160981	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=132,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:10,3:0,1:8,2,2,2
chr1	67194911	.	TTC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TC;STR;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,3:6,3:7,2,3,3
chr1	67206895	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,179;MMQ=60,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:5,4:3,0:7,1,5,0
chr1	67288045	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr1	67292473	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=175,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0|1:67292473_A_AT:67292473:0,1,1,2
chr1	67292478	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=55,224;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.503:6:2,2:1,1:0|1:67292473_A_AT:67292473:1,2,1,2
chr1	67293616	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=188,216;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,2:4,0:1,8,0,2
chr1	67396222	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=205,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	67423997	.	T	TTTCTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	67425311	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,6:0,4:0,1,7,4
chr1	67425476	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=162,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,5:1,7,3,3
chr1	67425494	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.460:9:1,3:4,1:1,4,0,4
chr1	67428898	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr1	67438535	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=175,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr1	67447450	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,1:14,2:17,8,2,1
chr1	67450431	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=126,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,4:7,4:8,6,3,5
chr1	67470162	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=229,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:2,5,0,2
chr1	67474921	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,176;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.818:20:0,0:3,17:0,3,0,17
chr1	67487119	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=240,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr1	67508080	.	CCACT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr1	67512903	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr1	67512920	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr1	67560897	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	67562106	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	67577367	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,7:0,2:0,0,3,6
chr1	67591347	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=178,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr1	67591660	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	67591689	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=203,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	67648460	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr1	67666401	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=141,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.348:14:6,3:3,2:8,1,4,1
chr1	67672765	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=177,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,2:1,0:2,4,0,2
chr1	67685443	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=206,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr1	67721562	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=124,91;MMQ=60,56;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:3,0:14,3:7,10,1,2
chr1	67792626	.	T	TTTTATTTATTTA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,42;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=TTTA;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.704:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr1	67796258	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	67890526	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.266:28:8,6:13,1:11,10,4,3
chr1	67891891	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=175,51;MMQ=60,31;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,0:13,2:12,13,0,2
chr1	68151980	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	68173264	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=181,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:7,2,3,1
chr1	68591884	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,4:5,3:4,4,4,3
chr1	68620762	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=175,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:8,0,2,1
chr1	68620998	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=196,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,0:0,3:0,4,0,3
chr1	68905358	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=141,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:0,3,1,5
chr1	68915479	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=152,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:3,2,4,1
chr1	68943436	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=184,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:0|1:68943436_G_A:68943436:5,2,2,0
chr1	68943442	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=183,226;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:0|1:68943436_G_A:68943436:6,2,3,0
chr1	68943665	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:1,9,0,2
chr1	68947318	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:0,5:3,6:0,4,1,10
chr1	68955352	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=216,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr1	70034370	.	C	CCAGCCGCGTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,0:2,0,0,3
chr1	70225832	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=224,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr1	70618215	.	AG	CA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=131,226;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=68.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:6,0:13,18:9,10,0,18
chr1	70639163	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,1:5,1:7,8,2,0
chr1	70654981	.	GAAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,14;MFRL=126,278;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=A;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.614:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr1	70712592	.	TA	CC	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=110,50;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:12,0:11,4:0|1:70712592_TA_CC:70712592:9,16,2,2
chr1	70712596	.	GT	TG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=114,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:10,0:10,4:0|1:70712592_TA_CC:70712592:9,14,2,2
chr1	70712602	.	T	TATATATATATA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=114,50;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:10,0:9,4:0|1:70712592_TA_CC:70712592:8,11,2,2
chr1	70715663	.	G	GTTTCAAACCTGCTCTAT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,0:12,2:11,6,0,2
chr1	70820802	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.293:32:11,6:12,3:9,14,6,3
chr1	70833460	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,265;MMQ=60,41;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	70881775	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=172,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,0:3,8:0,6,8,0
chr1	70887183	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	70896154	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=101,172;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.369:5:0,1:2,0:0|1:70896154_G_A:70896154:0,4,0,1
chr1	70896157	.	A	ATTTATATTCTTGCCTCTTATTTTTAATGTATCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=162,172;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:70896154_G_A:70896154:0,2,0,1
chr1	70896159	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=221,172;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	70904523	.	T	TTG,TTGTGTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30,33;MFRL=130,191,178;MMQ=60,60,60;MPOS=13,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,17;RU=TG;STR;TLOD=6.42,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.438,0.278:4:1,2,0:0,0,1:0,1,0,3
chr1	71478215	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=215,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	71512426	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=213,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr1	71533287	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,2:3,6:5,3,5,3
chr1	71537943	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=229,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:3,2,2,6
chr1	71544079	.	CAAG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=221,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.823:15:1,4:1,9:2,0,10,3
chr1	72058405	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	72242039	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	74492550	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:8,2:4,1:4,8,0,3
chr1	74506942	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,9:6,1:3,7,5,5
chr1	74507315	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=111,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,9:4,4:4,4,9,4
chr1	74540253	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=217,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	74540517	.	T	TTCAAAAAG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=149,34;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.364:6:3,2:1,0:0|1:74540517_T_TTCAAAAAG:74540517:0,4,0,2
chr1	74540519	.	T	TTA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=149,34;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.364:6:3,2:1,0:0|1:74540517_T_TTCAAAAAG:74540517:0,4,0,2
chr1	74540520	.	G	GTTATATGAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=149,34;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:74540517_T_TTCAAAAAG:74540517:0,4,0,2
chr1	74610232	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,21;MFRL=182,173;MMQ=60,52;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:74610232_G_T:74610232:3,1,0,1
chr1	74610233	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=182,173;MMQ=60,52;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:74610232_G_T:74610232:3,1,0,1
chr1	74646514	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	74648408	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:3,4,1,4
chr1	74664149	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=202,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,2:5,0:0,5,0,2
chr1	74669973	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,325;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	74701295	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	74701950	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=200,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr1	74797265	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=182,57;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,2:6,0:0,8,0,2
chr1	74801864	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=222,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:0,3,1,3
chr1	74818936	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:3,2,1,1
chr1	74819077	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,7,13
chr1	74819108	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=174,127;MMQ=60,45;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,0:2,5:1,6,0,5
chr1	74901739	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=85,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=T;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:0,3:0,0:0,2,3,0
chr1	74937749	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=160,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,3:4,6:3,4,5,4
chr1	75006027	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:1,2,1,2
chr1	75006076	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	75036783	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	75036812	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr1	75037857	.	CCCT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=198,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCT;STR;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,5:4,0:3,6,1,4
chr1	75042637	.	A	AGTTGCC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=141,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:7,3:5,0:0|1:75042637_A_AGTTGCC:75042637:2,10,0,3
chr1	75042640	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=141,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:7,3:5,0:0|1:75042637_A_AGTTGCC:75042637:2,10,0,3
chr1	75042709	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75042709_A_C:75042709:0,0,0,1
chr1	75042712	.	GCAAAT	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75042709_A_C:75042709:0,0,0,1
chr1	75055419	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:10,3:6,4:9,7,5,2
chr1	75072264	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,4:1,4:1,0,8,0
chr1	75086412	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=248,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,1,2
chr1	75086665	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,0:0,3:0,4,0,3
chr1	75108863	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=161,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	75172756	.	TAA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:4,4:0,5:2,4,4,5
chr1	75199103	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=170,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:13,0:15,3:0|1:75199103_G_C:75199103:9,19,2,1
chr1	75199108	.	G	GT	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=180,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:12,0:14,3:0|1:75199103_G_C:75199103:8,19,2,1
chr1	75199111	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=181,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:12,0:14,3:0|1:75199103_G_C:75199103:8,18,2,1
chr1	75199152	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,1,18
chr1	75214390	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=167,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.556:9:3,3:0,2:0,4,3,2
chr1	75214441	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:8,2:4,0:7,5,1,1
chr1	75614380	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=102,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.680:10:1,2:1,4:1,2,4,3
chr1	75626420	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	75679569	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=163,300;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,2,1
chr1	75680433	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=223,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr1	75681351	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=219,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	75684529	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	75685403	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=211,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:7,0,4,0
chr1	75685643	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=228,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:0,7,0,4
chr1	75704099	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75704099_G_A:75704099:0,0,1,0
chr1	75704100	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75704099_G_A:75704099:0,0,1,0
chr1	75704103	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75704099_G_A:75704099:0,0,1,0
chr1	75704107	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=263,234;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75704099_G_A:75704099:1,0,1,0
chr1	75707652	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,0:4,3:5,3,2,1
chr1	75708529	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,28;MFRL=72,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:1,1,3,0
chr1	75708579	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=186,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:7,0:0|1:75708579_G_C:75708579:4,6,1,1
chr1	75708581	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=186,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:75708579_G_C:75708579:4,6,1,1
chr1	75708583	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=186,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:75708579_G_C:75708579:4,6,1,1
chr1	75708585	.	CAGTGGTCT	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=161,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:7,0:0|1:75708579_G_C:75708579:6,7,1,1
chr1	75716925	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=263,116;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.740:25:3,13:3,6:3,3,9,10
chr1	75740640	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,0:5,2:5,3,2,0
chr1	75740831	.	C	CCTTTCCACCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=219,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	76194229	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	76198436	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:2,0:8,3:3,7,1,2
chr1	76198785	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=164,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:8,6,2,0
chr1	76226906	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:8,5,0,2
chr1	76252011	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.499:34:9,6:8,11:7,10,9,8
chr1	76255613	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,2:2,1:4,4,3,0
chr1	76269372	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=189,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.366:9:2,1:3,2:4,2,2,1
chr1	76313874	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=57,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:4,0,4,1
chr1	76333172	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=159,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,1:7,5:10,2,4,2
chr1	76333288	.	T	TGTAAA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=107,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,2:5,0:0|1:76333288_T_TGTAAA:76333288:6,5,0,2
chr1	76333292	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=107,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:76333288_T_TGTAAA:76333288:6,5,0,2
chr1	76333297	.	C	CAAAGAAAA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=104,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:76333288_T_TGTAAA:76333288:6,4,0,2
chr1	76333302	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=104,158;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:6,2:4,0:0|1:76333288_T_TGTAAA:76333288:6,4,0,2
chr1	76344011	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=191,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:1,1,2,5
chr1	76344856	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=148,248;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr1	76345640	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:5,0,4,1
chr1	76346832	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=212,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	76346920	.	C	CAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,8,3
chr1	76349534	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,0:2,3:1,7,1,2
chr1	76363505	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	76378357	.	ATATT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=185,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:3,1,1,0
chr1	76878156	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=192,254;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	77042405	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=198,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	77334268	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=154,218;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,4:7,1:3,10,1,4
chr1	77334292	.	G	GCAGCAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=149,174;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,2:3,1:2,6,1,2
chr1	77510222	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=185,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:10,12,0,2
chr1	77620035	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	77627096	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,5,8
chr1	77951907	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=230,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr1	78024345	.	C	CTAT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAT;STR;TLOD=114.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,14,14
chr1	78033981	.	AAAATG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATG;STR;TLOD=55.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,4:0,9:0,0,3,11
chr1	78045369	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr1	78098403	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,1:12,2:8,13,1,2
chr1	78099099	.	ATGT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:78099099_ATGT_A:78099099:0,3,0,1
chr1	78099110	.	AT	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=185,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:78099099_ATGT_A:78099099:0,3,0,1
chr1	78099113	.	ATGAG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=185,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:78099099_ATGT_A:78099099:0,3,0,1
chr1	78105067	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	78183670	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=166,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.217:16:10,2:3,1:8,5,2,1
chr1	78184345	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:11,1:9,2:11,9,3,0
chr1	78187444	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=194,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr1	78196274	.	AAAG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAG;STR;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr1	78200167	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=130,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr1	78207502	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,6:2,0:0,8,0,6
chr1	78245432	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=22,16;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:0,0:2,0:1,3,0,4
chr1	78245437	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=11,13;MFRL=24051878,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.620:6:0,1:0,0:0|1:78245437_C_G:78245437:1,1,0,4
chr1	78245442	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=19,13;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.703:5:0,1:0,0:0|1:78245437_C_G:78245437:0,1,0,4
chr1	78245447	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=168,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.538:5:1,2:0,0:0,2,0,3
chr1	78281002	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	78332055	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=189,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:7,2:1,1:7,1,1,3
chr1	78338617	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	78383221	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=108,89;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:6,0:0|1:78383221_CT_C:78383221:10,6,2,0
chr1	78383225	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=106,89;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:78383221_CT_C:78383221:10,7,2,0
chr1	78383257	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=109,89;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,2:5,0:0|1:78383221_CT_C:78383221:10,11,2,0
chr1	78383264	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=115,89;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,2:6,0:0|1:78383221_CT_C:78383221:8,13,2,0
chr1	78383467	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	78392446	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,223;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.289:15:8,3:3,1:5,6,3,1
chr1	78399207	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:0|1:78399207_C_G:78399207:0,5,1,3
chr1	78399212	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=195,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,5:0.500:10:1,1:4,4:1|0:78399207_C_G:78399207:1,4,0,5
chr1	78414310	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32,32;MFRL=190,186,193;MMQ=60,60,60;MPOS=2,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,20;RU=A;STR;TLOD=4.86,5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.334,0.332:9:2,1,1:1,2,0:3,0,6,0
chr1	78429215	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=172,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:2,2:9,2:10,1,4,0
chr1	78430689	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=47.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr1	78432647	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.186:20:7,1:6,1:11,6,1,2
chr1	78433801	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,2:6,2:5,8,2,2
chr1	78435701	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.303:17:4,1:7,4:4,8,1,4
chr1	78444734	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=203,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,0:2,4:0,6,0,4
chr1	78471049	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:0,1:3,2:0,7,1,2
chr1	78471060	.	T	TTC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=147,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TC;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:1,2:2,3:1,2,0,6
chr1	78478675	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,3:0,2:1,0,5,1
chr1	78479281	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=184,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	78481640	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=162,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:1,1,4,0
chr1	78512053	.	CCGCCGCGCCG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=179,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=CGCCG;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr1	78591740	.	TAAC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	79093910	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=199,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:5,2:7,3:8,4,3,2
chr1	79094081	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=162,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,2:3,5:2,6,1,6
chr1	79094593	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,12:0,5:0,0,10,7
chr1	79095339	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr1	79106899	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr1	79107304	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:12,0:4,3:6,10,0,3
chr1	79119975	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,161;MMQ=60,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:13,3:12,0:15,10,3,0
chr1	79120083	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,44028893;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:1,7,0,2
chr1	79128320	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=282,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	79128570	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=218,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.739:21:1,10:3,6:5,0,8,8
chr1	79355596	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=46,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.912:25:0,11:1,12:1,1,4,19
chr1	79358702	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=198,97;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr1	79383300	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:2,4,1,2
chr1	79383458	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=110,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:5,5:3,3:3,5,4,4
chr1	79387242	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=321,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,0:1,4:2,0,4,0
chr1	79392813	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=231,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0,4,0,1
chr1	79401927	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=202,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	79403450	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=146,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:1,4:6,3:6,1,7,0
chr1	79411888	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=167,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.758:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr1	82302600	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=162,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,3:5,1:9,0,4,0
chr1	82408874	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,1:4,1:5,5,0,2
chr1	82415814	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	82416220	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=262,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:2,0:0,7:0,2,1,6
chr1	82418682	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=129,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:10,2:5,2:8,7,1,3
chr1	82418710	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=152,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:7,2:0|1:82418710_G_C:82418710:10,13,1,1
chr1	82418716	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=139,82;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.108:26:13,0:8,2:0|1:82418710_G_C:82418710:12,12,1,1
chr1	82432242	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:10,5,0,2
chr1	82436281	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=200,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,1,4
chr1	82437548	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=153,108;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:5,4,2,0
chr1	82437670	.	ATTTGT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=153,50007929;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:0,1:0,5,0,2
chr1	82437682	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=157,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:0,1:0,5,0,3
chr1	82452565	.	GTT	G,GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,33,33;MFRL=170,187,163;MMQ=60,60,60;MPOS=16,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.79,4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.251,0.328:9:3,1,1:1,1,2:4,0,5,0
chr1	84383322	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=116,98;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:13,0:12,7:8,17,0,7
chr1	84386943	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=125,50;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,1:7,1:9,6,2,0
chr1	84412868	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:9,0:6,6:10,5,0,6
chr1	84765340	.	G	GTATATA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=TA;STR;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,3:0,2:0,0,2,4
chr1	84791239	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	84864314	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=119,71;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:10,3:10,0:10,10,2,1
chr1	84876501	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=133,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,1:7,1:12,6,2,0
chr1	84878124	.	ACCAGGGCCAGCTCATCAGAGATTCCTGGCAGGCTCCTCACCACACTTCAGTCGGC	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=163,264;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,9:0.127:32:3,3:8,2:0|1:84878124_ACCAGGGCCAGCTCATCAGAGATTCCTGGCAGGCTCCTCACCACACTTCAGTCGGC_A:84878124:11,12,2,7
chr1	84878177	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,2:0.171:15:5,0:8,2:1|0:84878124_ACCAGGGCCAGCTCATCAGAGATTCCTGGCAGGCTCCTCACCACACTTCAGTCGGC_A:84878124:9,4,0,2
chr1	84878183	.	GG	TT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:20,2:0.130:22:12,0:7,1:1|0:84878124_ACCAGGGCCAGCTCATCAGAGATTCCTGGCAGGCTCCTCACCACACTTCAGTCGGC_A:84878124:9,11,0,2
chr1	84946745	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	84955478	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=166,240;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr1	84955999	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,16:0.377:43:13,16:13,0:12,15,16,0
chr1	84986213	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr1	84988200	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=113,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr1	84998445	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr1	84998637	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:5,4:4,7:4,5,6,5
chr1	84999571	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=185,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0,3,0,4
chr1	85009864	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,1:4,2:8,4,3,0
chr1	85014464	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=147,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.520:14:4,2:2,4:2,5,2,5
chr1	85014690	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=235,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:3,6,0,2
chr1	85016112	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:8,4:5,2:4,9,1,5
chr1	85020979	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=176,164;MMQ=60,24;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.654:2:0,0:0,1:0|1:85020979_G_GT:85020979:0,1,0,1
chr1	85020983	.	A	ATGGATTGGAATGGAATGGAATGGAATGAAAGGGAATGGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=222,164;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.653:2:0,0:0,0:0|1:85020979_G_GT:85020979:0,1,0,1
chr1	85035839	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,1,4
chr1	85036239	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=210,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:6,3,2,0
chr1	85039998	.	CGCAGCGCCA	C,CGCAGCGCCAGCAGCGCCA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,27,30;MFRL=218,161,166;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=3,2,4;RU=GCAGCGCCA;STR;TLOD=27.63,35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,8,9:0.358,0.540:18:0,4,3:1,4,6:0,1,1,16
chr1	85096589	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=129,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.673:10:0,2:3,5:1,2,0,7
chr1	85097247	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=128,233;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:6,2,2,0
chr1	85121983	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:4,2,4,0
chr1	85128262	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=195,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,1:1,4:1,1,1,4
chr1	85128280	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=121,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,2:0,3:0,1,1,5
chr1	85128311	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=187,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	85131982	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr1	85132005	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=182,65;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:2,0:0,7,0,2
chr1	85135655	.	T	TGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=178,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	85331808	.	G	GAGA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=212,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=103.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.930:26:0,10:1,15:1,0,4,21
chr1	85397286	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:0,2,1,6
chr1	85397340	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	85406629	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,66;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,0:7,3:8,7,1,2
chr1	85418307	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=173,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	85422061	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=242,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	85424182	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:2,0,4,2
chr1	85424479	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=186,218;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	85462582	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=230,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:0,4:3,4:2,1,2,7
chr1	85462652	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=242,241;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr1	85462665	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=242,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr1	85488154	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr1	85537522	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr1	85538655	.	A	AAAG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=132,0;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAG;STR;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.692:14:1,4:1,5:3,1,4,6
chr1	85547945	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=111,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr1	85550156	.	A	AAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=174,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AT;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.673:3:1,0:0,1:1,0,2,0
chr1	85551468	.	A	ATCAGTTTTTCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=182,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:2,2:0,1:1,1,4,0
chr1	85559118	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	85559302	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=139,92;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,1:11,1:10,10,2,0
chr1	85561546	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,11,1
chr1	85564138	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=177,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	85573705	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr1	85575838	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:3,1:1,2:3,2,2,1
chr1	85583323	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr1	85589939	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=60,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.583:17:4,6:3,4:2,5,5,5
chr1	85590031	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	85592126	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	85595645	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=118,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:4,5:1,5:4,1,8,2
chr1	85598527	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,8:0,3:0,0,6,5
chr1	85647713	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,11,2
chr1	85648620	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr1	85666327	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	85725032	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=157,243;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:13,3:5,0:13,5,2,1
chr1	85725353	.	GCCGGAAA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCGGAAA;STR;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.603:13:3,4:1,4:0,5,1,7
chr1	85741921	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=55.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,3:0,0,14,2
chr1	85787114	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr1	85824387	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:1,1:9,1:7,3,1,1
chr1	86046561	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=187,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,3:1,1:2,0,5,0
chr1	86047311	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=186,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:0,3,1,4
chr1	86119898	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=179,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	86167957	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr1	86173298	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=126,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.702:14:2,4:1,6:3,1,8,2
chr1	86200555	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=142,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:86200555_G_A:86200555:9,9,1,1
chr1	86200561	.	T	TTCAGGG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=141,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:0|1:86200555_G_A:86200555:8,9,1,1
chr1	86210546	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	86246849	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr1	86249063	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	86249187	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=112,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,0:9,2:6,9,1,1
chr1	86249911	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr1	86252025	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,2,3
chr1	86252165	.	A	ACTACCAGCCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=193,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr1	86334150	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:3,0,4,0
chr1	86340262	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=71,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,3:2,5:1,1,5,3
chr1	86340880	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	86342866	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=148,178;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:2,0:7,2:0|1:86342866_A_T:86342866:4,6,0,3
chr1	86342870	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=145,178;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:2,0:9,3:0|1:86342866_A_T:86342866:6,7,0,3
chr1	86361802	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0,7,1,1
chr1	86362184	.	AT	A,ATT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28,27;MFRL=202,199,93;MMQ=60,60,60;MPOS=24,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.66,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.273,0.272:8:2,0,0:2,2,2:0,4,0,4
chr1	86435957	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=124,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.258:19:6,2:8,3:2,12,0,5
chr1	86453237	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=206,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,1:0,4:2,0,4,1
chr1	86453265	.	CTCT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=146,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCT;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,2:6,1:6,2,3,0
chr1	86453409	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=210,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,7:0,3:0,1,3,7
chr1	86482922	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,5:1,4:2,3,0,9
chr1	86487981	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr1	86487992	.	A	AACAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.887:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr1	86497647	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=154,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,1:6,1:3,11,0,2
chr1	86529390	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=186,127;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:4,5:9,1:10,3,5,1
chr1	86554813	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.328:12:3,2:5,1:0|1:86554813_G_GA:86554813:7,1,3,1
chr1	86554821	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=58.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,18:0.827:21:0,13:3,5:0|1:86554813_G_GA:86554813:2,1,16,2
chr1	86820385	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,257;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,1:6,1:1,7,0,2
chr1	86821194	.	A	ACT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=195,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr1	86826250	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:86826250_A_T:86826250:0,10,0,2
chr1	86826252	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:2,0:0|1:86826250_A_T:86826250:0,10,0,2
chr1	86826254	.	G	GAGGCA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:86826250_A_T:86826250:0,8,0,2
chr1	86826258	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:2,0:0|1:86826250_A_T:86826250:0,8,0,2
chr1	86890931	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,6:1,5:1,1,11,0
chr1	86891005	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,26:0.750:34:4,15:4,11:6,2,16,10
chr1	86891179	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=47.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:3,7:5,7:2,6,4,10
chr1	86896541	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:7,5:5,3:8,4,4,4
chr1	86896706	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr1	86897973	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:0,1:1,5:1,0,5,1
chr1	86900491	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr1	86900525	.	GG	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=196,189;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:86900525_GG_CA:86900525:0,4,0,1
chr1	86900528	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=196,189;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:86900525_GG_CA:86900525:0,4,0,1
chr1	86909703	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:4,4:2,1:2,5,3,2
chr1	86919011	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=210,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	86939194	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=177,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,0:11,2:13,12,2,0
chr1	86939390	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,6:5,2:6,3,5,3
chr1	86948051	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=108,197;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.386:24:8,0:6,9:7,8,0,9
chr1	86951039	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=135,146;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:19,4:13,0:0|1:86951039_G_A:86951039:23,11,4,0
chr1	86951042	.	CA	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=136,146;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:21,4:14,0:0|1:86951039_G_A:86951039:24,11,4,0
chr1	86952399	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,3:6,0:3,11,3,0
chr1	86959014	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	86959796	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=243,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr1	86959989	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=169,55;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:0|1:86959989_C_T:86959989:10,9,1,1
chr1	86960006	.	G	GCTCCTCAAAACCTACCCACCTTCACAGAACTTC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=171,55;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:86959989_C_T:86959989:10,7,1,1
chr1	86964185	.	AAGAAAAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.589:8:2,2:0,3:2,1,5,0
chr1	87012728	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=160,73;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr1	87025819	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=172,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:5,1:5,4,2,1
chr1	87029337	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:6,3:5,3:9,2,3,3
chr1	87036746	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=267,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:1,0,5,3
chr1	87036946	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=207,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr1	87038240	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:1,2:3,1:3,1,4,0
chr1	87038415	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:5,0:7,6:5,8,0,6
chr1	87045896	.	TCCTACA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=199,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,2:6,2:7,5,1,3
chr1	87045902	.	A	ACCTACT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=247,174;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CCTACT;STR;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.707:8:1,2:1,4:2,0,4,2
chr1	87100226	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr1	87101245	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=134,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:8,1,0,2
chr1	87101861	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=166,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	87102593	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=134,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:6,7:3,9:2,7,8,8
chr1	87181515	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,78;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:9,4:13,0:7,15,4,0
chr1	87458695	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	87549858	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr1	87563668	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr1	87570398	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	87633761	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	87633918	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:87633918_G_A:87633918:1,2,0,1
chr1	87633924	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=163,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0|1:87633918_G_A:87633918:1,3,0,1
chr1	89150164	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,17;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.695:1:0,0:0,0:0|1:89150164_C_G:89150164:0,0,1,0
chr1	89150168	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,17;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:89150164_C_G:89150164:0,0,1,0
chr1	89150170	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,10;MFRL=233,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:0,0:0|1:89150164_C_G:89150164:1,0,1,0
chr1	89150172	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,17;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:89150164_C_G:89150164:0,0,1,0
chr1	89150176	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=0,15;MFRL=210,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,0:0|1:89150164_C_G:89150164:3,0,1,0
chr1	89150179	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,10;MFRL=210,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:89150164_C_G:89150164:3,0,1,0
chr1	89150182	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,10;MFRL=210,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:89150164_C_G:89150164:3,0,1,0
chr1	89150189	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=17,12;MFRL=210,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,0:0|1:89150164_C_G:89150164:3,0,1,0
chr1	89236029	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=107,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:3,2,4,2
chr1	89271574	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,5:7,5:8,5,4,6
chr1	89289938	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=200,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:89289938_C_T:89289938:3,0,1,0
chr1	89289949	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=192,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:89289938_C_T:89289938:4,0,1,0
chr1	89289954	.	ATT	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=209,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.427:5:1,1:2,1:1|0:89289938_C_T:89289938:3,0,2,0
chr1	89318880	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=120,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:1,2:5,1:6,1,3,0
chr1	89357092	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:1,4:5,3:7,0,7,0
chr1	89430420	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	89449361	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=139,164;MMQ=48,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.117:40:22,0:12,4:21,15,4,0
chr1	89449390	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=136,148;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:23,3:15,1:24,16,2,2
chr1	89449483	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=145,209;MMQ=52,32;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.080:52:20,3:27,0:18,30,2,2
chr1	89449508	.	AT	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.138:43:13,6:22,1:16,20,5,2
chr1	89475230	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=191,250;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr1	89478854	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=99,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.805:13:0,7:2,4:1,1,8,3
chr1	89478868	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,3:6,2:9,5,3,2
chr1	89520329	.	GAAAAAC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=236,163;MMQ=52,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:0,5:1,4:2,1,8,1
chr1	89520574	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,3,20
chr1	89520636	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0|1:89520636_G_A:89520636:0,0,3,7
chr1	89520643	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0|1:89520636_G_A:89520636:0,0,3,7
chr1	89522512	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,5:5,6:3,3,8,3
chr1	89522646	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=213,176;MMQ=45,49;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.875:22:2,8:0,12:2,0,12,8
chr1	89523927	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=123,235;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,2:1,0:4,5,1,1
chr1	89524718	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=118,140;MMQ=52,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:7,8,2,0
chr1	89525086	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=116,101;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:12,0:16,4:11,17,4,0
chr1	89525812	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:12,4:8,0:0|1:89525812_C_G:89525812:16,4,2,2
chr1	89525820	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=165,191;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:13,3:7,0:0|1:89525812_C_G:89525812:15,5,1,2
chr1	89574026	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=223,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:0,3,0,8
chr1	89582690	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=241,159;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:0,8:3,4:2,1,7,5
chr1	89582746	.	T	TAAGAAAA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=156,846;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,1:8,0:0|1:89582746_T_TAAGAAAA:89582746:7,8,2,0
chr1	89582747	.	C	CTACAGAAAA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=156,846;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:89582746_T_TAAGAAAA:89582746:7,8,2,0
chr1	89582751	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=156,846;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:7,2:8,0:0|1:89582746_T_TAAGAAAA:89582746:7,8,2,0
chr1	89583544	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr1	89597755	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=198,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,2:3,5:3,0,7,0
chr1	89615979	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=178,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,4:2,7:1,1,8,3
chr1	89650850	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=211,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,4:2,3:2,0,7,0
chr1	89652071	.	TC	CT	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=185,149;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:2,6:1,3:0|1:89652071_TC_CT:89652071:0,3,4,5
chr1	89652078	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=185,143;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:2,4:1,3:0|1:89652071_TC_CT:89652071:0,3,4,4
chr1	89652087	.	CC	TG	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=189,149;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,2:2,2:0|1:89652071_TC_CT:89652071:0,4,2,3
chr1	89652090	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=189,151;MMQ=60,42;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,1:2,2:0|1:89652071_TC_CT:89652071:0,4,2,2
chr1	89652094	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=193,138;MMQ=60,35;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:89652071_TC_CT:89652071:0,3,1,1
chr1	89652097	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=193,88;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,2:1,1:0|1:89652071_TC_CT:89652071:0,3,4,1
chr1	89652102	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=25,25;MFRL=193,88;MMQ=60,40;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.601:8:2,3:1,0:0|1:89652071_TC_CT:89652071:0,3,4,1
chr1	89726592	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:0,5,0,5
chr1	89730723	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=225,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr1	89731959	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr1	89733273	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=228,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	89734389	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.130:29:13,2:12,1:15,11,1,2
chr1	89845926	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,7:0,2:0,0,9,1
chr1	89847153	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=199,319;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	89848146	.	AC	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=111,1050;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr1	89849201	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,11,13
chr1	89849350	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr1	89849574	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr1	89849812	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=101,113;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:12,0:12,8:6,18,0,8
chr1	89851100	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=150,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr1	90178268	.	GT	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.173:33:10,0:17,5:15,13,0,5
chr1	90178743	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,11,12
chr1	90493026	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=111,130;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.496:28:8,8:6,5:8,6,12,2
chr1	91404959	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:11,1:7,1:8,11,0,2
chr1	91727835	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:2,4,0,2
chr1	91728202	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	91739208	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	91781304	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	91781506	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=102,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:1,4,0,4
chr1	91782011	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=109,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,1:4,1:7,5,1,1
chr1	91813148	.	TC	CG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=220,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	91818302	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=166,256;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr1	91841301	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr1	91843745	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:4,9,1,1
chr1	91845858	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=219,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr1	91846374	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,290;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	91846595	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	91846654	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	91973557	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr1	91989572	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,10:0,5:0,0,13,2
chr1	92149277	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=223,260;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	92163786	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=277,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr1	92174375	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=179,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:10,0:5,4:2,13,0,4
chr1	92184814	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,4:3,0:8,0,3,1
chr1	92200593	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	92446112	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	92446398	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	92447004	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr1	92447227	.	GAGCAGCAGCAGC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=125,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,3;RU=AGC;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,2:8,0:4,8,1,1
chr1	92456631	.	GGC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=292,262;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:92456631_GGC_G:92456631:1,0,1,0
chr1	92456634	.	A	ATG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=292,262;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:92456631_GGC_G:92456631:1,0,1,0
chr1	92456643	.	TGT	CAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=260,262;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:92456631_GGC_G:92456631:2,0,1,0
chr1	92508301	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,15;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.740:2:0,0:0,0:0|1:92508301_G_T:92508301:0,0,2,0
chr1	92508312	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,15;MFRL=211,177;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:92508301_G_T:92508301:1,0,2,0
chr1	92508318	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,10;MFRL=152,186;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:92508301_G_T:92508301:2,0,1,0
chr1	92508320	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,15;MFRL=152,186;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:92508301_G_T:92508301:2,0,1,0
chr1	92508325	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,15;MFRL=197,186;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:92508301_G_T:92508301:3,0,1,0
chr1	92508329	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,15;MFRL=155,186;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:92508301_G_T:92508301:4,0,1,0
chr1	92508331	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,15;MFRL=155,186;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:92508301_G_T:92508301:4,0,1,0
chr1	92528649	.	A	AC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=149,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,2:7,0:0|1:92528649_A_AC:92528649:8,8,0,3
chr1	92528653	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=149,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,2:9,1:0|1:92528649_A_AC:92528649:8,8,0,3
chr1	92568263	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=168,271;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr1	92606627	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:9,2,2,1
chr1	92632496	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,1:2,1:5,1,2,0
chr1	92632609	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:13,9,0,2
chr1	92634557	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=153,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:2,6,0,2
chr1	92645826	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=142,28683793;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:4,8,2,0
chr1	92649335	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=149,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.658:4:1,1:0,0:1,0,3,0
chr1	92697087	.	A	ACTTCTTTACC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=180,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:4,4,0,2
chr1	92709689	.	T	TAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=199,240;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr1	92711067	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,6:4,6:2,4,7,5
chr1	92712266	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr1	92712598	.	GAA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=220,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,6,1
chr1	92735359	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,5:3,1:2,4,1,5
chr1	92754470	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=78,192;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:9,10:3,0:5,7,10,0
chr1	92755943	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=182,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	92763091	.	CA	C,CAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,36,33;MFRL=129,154,96;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=7.54,5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,4:0.280,0.269:17:0,2,2:6,4,1:1,6,2,8
chr1	92765848	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=84,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.733:9:1,4:1,3:0,2,2,5
chr1	92765880	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	92801916	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,9:0.204:47:3,8:34,0:34,4,9,0
chr1	92852504	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=151,185;MMQ=60,53;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:1,0,8,0
chr1	92944122	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=136,16025;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,1:12,1:10,9,2,0
chr1	92944314	.	C	CAGAG,CAGAGAGAG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=17,17,17;MFRL=126,138,48;MMQ=55,60,32;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,20,22;RU=AG;STR;TLOD=7.11,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.498,0.343:6:0,0,0:0,1,0:0,1,1,4
chr1	93071048	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	93163385	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	93167610	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,9,0
chr1	93308853	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr1	93426866	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:93426866_T_C:93426866:0,0,2,0
chr1	93426869	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:93426866_T_C:93426866:0,0,2,0
chr1	93545157	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,6:1,1:0,3,3,4
chr1	93575839	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:7,7,1,1
chr1	93580992	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.292:11:4,1:3,1:3,5,0,3
chr1	93581024	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,4:4,2:6,4,2,4
chr1	93584870	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.393:10:3,2:2,2:4,2,4,0
chr1	93599300	.	T	TTCTTCTTGTACTTTCTAATA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=156,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.323:7:1,2:4,0:4,1,1,1
chr1	93602194	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,8,1
chr1	93620393	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:2,6:9,5:2,9,4,7
chr1	93621483	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	93648816	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	93649111	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=201,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr1	93649732	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,5:1,1:0,4,0,6
chr1	93659350	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	93671130	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=164,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:5,5:10,0:0|1:93671130_C_T:93671130:7,8,5,0
chr1	93671138	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:4,5:10,0:0|1:93671130_C_T:93671130:6,8,5,0
chr1	93672688	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=105,114;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:13,6:1,5:11,3,8,3
chr1	93672706	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=110,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:11,9:10,0:13,8,7,2
chr1	93672723	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,14:0,10:0,0,11,13
chr1	93672839	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=139,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,1:7,1:11,9,0,2
chr1	93676314	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=202,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:2,4:2,0,3,1
chr1	93676578	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=183,188;MMQ=54,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	93683193	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=198,140;MMQ=60,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr1	93683210	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	93691855	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=82,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.549:16:3,4:3,3:3,5,5,3
chr1	93691926	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=102,104;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,3:10,0:4,15,0,3
chr1	93692081	.	AAT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=164,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AT;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	93704793	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.541:11:3,3:2,3:4,1,6,0
chr1	93704903	.	GCTGT	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=146,287;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:10,0:0|1:93704903_GCTGT_G:93704903:18,7,2,0
chr1	93704910	.	AAAATG	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=146,287;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,1:13,0:0|1:93704903_GCTGT_G:93704903:18,7,2,0
chr1	93711782	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=122,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:1,0,2,5
chr1	93913982	.	GGAGGGT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=264,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAGGGT;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,0:0,2,0,2
chr1	93998640	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=127,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:5,5:0,3:1,4,1,7
chr1	94009830	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:1,7,0,2
chr1	94028070	.	TA	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=316,178;MMQ=40,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	94041787	.	G	GAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AC;STR;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	94048352	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,3:8,0:8,3,3,0
chr1	94312482	.	T	TC	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=73.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,9,12
chr1	94312528	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,4,8
chr1	94312533	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,1,8
chr1	94312542	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,1,9
chr1	94312544	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,2:0,6:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,1,9
chr1	94312554	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,3:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,1,6
chr1	94312559	.	CGGCTGGGTCGGGCG	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,33;MFRL=151,163;MMQ=52,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0|1:94312559_CGGCTGGGTCGGGCG_C:94312559:0,1,0,3
chr1	94312576	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:94312559_CGGCTGGGTCGGGCG_C:94312559:0,0,0,3
chr1	94335194	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=275,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:0,1:4,1:2,2,2,0
chr1	94335585	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=175,208;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr1	94341137	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:3,1,4,0
chr1	94344580	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.553:14:2,3:4,3:5,1,5,3
chr1	94360316	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=140,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.204:21:6,2:11,1:5,12,1,3
chr1	94473896	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:9,1:6,9,0,2
chr1	94474328	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=93,222;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:9,3:16,1:10,15,1,3
chr1	94474452	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=136,241;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:1,1:5,2:1,6,0,3
chr1	94476555	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=221,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:1,0:0,4:1,1,0,4
chr1	94476991	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=170,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr1	94486992	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=177,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:1,4,1,1
chr1	94487285	.	AAC	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=138,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:4,4:4,5,3,3
chr1	94487354	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,3:6,3:9,4,2,4
chr1	94495930	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr1	94496602	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,0:4,6:2,8,6,0
chr1	94508378	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=111,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:11,6:9,0:12,8,6,0
chr1	94544971	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=143,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:5,3:14,0:9,11,0,3
chr1	94568491	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=201,239;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:2,4:0,3:2,0,7,0
chr1	94574053	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:8,0,3,0
chr1	94574342	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=226,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr1	94576968	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=139,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,4:6,0:2,7,2,2
chr1	94639337	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	94643143	.	ATT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=136,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:7,1,1,1
chr1	94645181	.	CT	GA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,16;MFRL=0,231;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:94645181_CT_GA:94645181:0,0,1,0
chr1	94645185	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=0,231;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:94645181_CT_GA:94645181:0,0,1,0
chr1	94645189	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=230,231;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:94645181_CT_GA:94645181:1,0,1,0
chr1	94645198	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=230,231;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:94645181_CT_GA:94645181:1,0,1,0
chr1	94645203	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=230,231;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,0:0|1:94645181_CT_GA:94645181:1,0,1,0
chr1	94654909	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:9,7,0,3
chr1	94667430	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=179,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,4:1,1:0,1,0,7
chr1	94674295	.	TA	CG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=153,120;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:4,1:8,0,2,0
chr1	94674723	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:94674723_G_A:94674723:0,0,7,2
chr1	94674726	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:94674723_G_A:94674723:0,0,7,2
chr1	94924046	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=175,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr1	94941376	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	94980671	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=71.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,9:0,10:0,0,15,4
chr1	94997924	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=132,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:6,3:12,0:9,9,3,0
chr1	95001600	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,6,11
chr1	95286658	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=200,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,3:2,3:0,3,1,5
chr1	95286675	.	GTCCCAAATGTAAA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=203,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr1	95290003	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=197,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,2:1,5:3,0,7,0
chr1	95290051	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.178:24:12,3:8,0:14,6,3,1
chr1	95293005	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=113,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,0:1,2:0,1,2,0
chr1	95305440	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=112,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:1,1,6,1
chr1	95332814	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:3,0,6,0
chr1	95332864	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=182,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:4,6:7,0:10,1,3,4
chr1	95358009	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=151,81;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:11,9,2,0
chr1	95358035	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=140,41;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,2:13,0:12,10,1,1
chr1	95363698	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=193,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr1	95367136	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	95367416	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=221,157;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:2,4,0,3
chr1	95367669	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=158,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,0:1,4:2,4,3,1
chr1	95367894	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	95368574	.	T	TAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=183,84;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=A;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr1	95368706	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,0:6,4:7,6,0,4
chr1	95615671	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	97250520	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	97278804	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=217,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,1:5,3,5,1
chr1	97544771	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	97547831	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	97700589	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=119,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr1	97771947	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=203,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:1,3,0,3
chr1	97847874	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=336,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr1	98039541	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:4,2:7,1:1,11,2,1
chr1	98164998	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,117;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,0:7,5:5,5,0,5
chr1	99127392	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr1	99150635	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr1	99164377	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,3:12,0:11,9,0,3
chr1	99358542	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=194,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,1:7,4:7,3,4,1
chr1	99358761	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr1	99387628	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=259,256;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,0:3,3:1,5,2,2
chr1	99772424	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=183,62;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:99772424_C_T:99772424:4,7,1,1
chr1	99772440	.	TTCCCGCGA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=195,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:99772424_C_T:99772424:2,8,1,1
chr1	99772453	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=204,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:99772424_C_T:99772424:1,9,1,1
chr1	100111956	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=192,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,5:7,6:1,11,6,5
chr1	100152443	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.783:21:1,9:3,8:3,1,10,7
chr1	100203704	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,111;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:10,5:18,0:12,16,5,0
chr1	100316765	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	100329889	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	100330237	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	100335883	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	100340225	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr1	100342227	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr1	100343153	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=222,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	100345409	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=216,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:2,5:0,4:2,0,7,2
chr1	100346741	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=215,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,4:1,2:0,1,3,3
chr1	100353675	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr1	100357141	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=116,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,9:1,1:1,2,6,4
chr1	100358200	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	100366446	.	GTTT	G,GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20,30;MFRL=0,151,204;MMQ=60,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.06,3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.455,0.423:5:0,1,1:0,1,1:0,0,1,4
chr1	100376448	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0|1:100376448_G_A:100376448:0,0,0,11
chr1	100376456	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0|1:100376448_G_A:100376448:0,0,0,11
chr1	100381109	.	A	AT,ATT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27,26;MFRL=0,148,165;MMQ=60,60,60;MPOS=21,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=8.32,3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.569,0.331:6:0,1,1:0,3,1:0,0,0,6
chr1	100381869	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr1	100533960	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=277,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,4,0
chr1	100542702	.	CTT	C,CT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,31,34;MFRL=172,165,171;MMQ=60,60,60;MPOS=29,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.34,5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,3:0.217,0.235:15:2,0,3:3,3,0:8,1,6,0
chr1	100542718	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,10;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.284:20:0,0:8,0:10,4,6,0
chr1	100546162	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=164,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.392:21:8,3:5,5:5,8,5,3
chr1	100547830	.	T	TTGATTGATAAATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	100598866	.	GC	AT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=270,145;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=142.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,34:0.814:41:4,21:3,13:2,5,5,29
chr1	100617887	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr1	100626033	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=88,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:7,1:12,2:17,5,2,1
chr1	100671865	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.359:9:3,1:2,2:0|1:100671865_T_TA:100671865:0,6,1,2
chr1	100671866	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=226,161;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.750:9:1,4:1,3:0,2,1,6
chr1	100671885	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=155,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:3,0:3,0:0|1:100671865_T_TA:100671865:0,7,1,1
chr1	100680593	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,1:0,1:0,0,0,4
chr1	100715454	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=171,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:0,4:2,6:0,2,0,10
chr1	100731819	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=246,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:1,2:2,4:0|1:100731819_C_CA:100731819:3,0,7,0
chr1	100731820	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=246,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:1,1:2,4:0|1:100731819_C_CA:100731819:3,0,7,0
chr1	100733207	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,0:0,2:0,0,0,7
chr1	100750733	.	AGTTTT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=276,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GTTTT;STR;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr1	100750846	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=151,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,3:7,0:11,5,0,3
chr1	100818464	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=42.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr1	100908521	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:10,0:14,2:13,12,0,2
chr1	100964925	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=196,139;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:3,0:7,4:0,10,0,4
chr1	101188976	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=286,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.640:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	101190218	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=184,210;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,2:5,0:8,6,0,2
chr1	101194965	.	GT	G,GTT,GTTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33,35,25;MFRL=245,193,200,182;MMQ=60,60,60,60;MPOS=30,16,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,10,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.48,5.92,3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,3,2:0.251,0.336,0.249:8:1,1,0,0:0,1,3,1:0,1,0,7
chr1	101199979	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=275,267;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	101203698	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=220,172;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,5:1,4:1,3,7,2
chr1	101342497	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	101372607	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	101437919	.	T	TGTGGTAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.690:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	101704532	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=247,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:4,1,5,0
chr1	101704687	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=190,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.195:27:13,0:9,4:8,14,5,0
chr1	101705764	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=158,162;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,1:11,0:0|1:101705764_C_A:101705764:18,6,2,0
chr1	101705766	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=158,162;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,2:12,0:0|1:101705764_C_A:101705764:18,6,2,0
chr1	102271774	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=209,351;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr1	102296290	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,0:8,4:5,12,0,4
chr1	102462446	.	GTCAGT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=211,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:1,6,0,4
chr1	103354138	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0,0,9,5
chr1	103354939	.	C	CTGTGTGTGTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=239,156;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=13,18;RU=TG;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	103356168	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=208,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	103379300	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:0,9,0,2
chr1	103380285	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=223,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.181:25:10,0:11,4:11,10,4,0
chr1	103380377	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,15;MFRL=168,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.264:19:0,0:7,1:2,12,0,5
chr1	103380379	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,5:1,5:2,1,1,12
chr1	103381129	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:9,3:3,1:6,6,1,3
chr1	103400491	.	GA	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr1	103428389	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,2,13
chr1	103449598	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	103455020	.	AAT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr1	103455217	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	103461508	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,13,8
chr1	103463928	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=170,274;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.202:22:5,4:11,0:2,16,0,4
chr1	103463976	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr1	103467615	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	103471456	.	CCATCAT	C,CCAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32,35;MFRL=0,311,197;MMQ=60,60,60;MPOS=26,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=CAT;STR;TLOD=3.01,19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,5:0.214,0.696:6:0,0,2:0,1,3:0,0,1,5
chr1	103471734	.	A	AAAATAAAT,AAAATAAATAAAT,AAAATAAATAAATAAAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27,29,24;MFRL=0,181,173,166;MMQ=60,60,40,40;MPOS=26,15,5;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=7,9,10,11;RU=AAAT;STR;TLOD=7.55,11.39,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,3,1:0.334,0.406,0.187:6:0,1,0,1:0,1,3,0:0,0,1,5
chr1	103471934	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=189,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:103471934_T_C:103471934:0,4,0,1
chr1	103471936	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,18;MFRL=189,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:103471934_T_C:103471934:0,4,0,1
chr1	103471940	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=189,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:103471934_T_C:103471934:0,4,0,1
chr1	103478062	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:7,0:4,12:2,9,0,12
chr1	103483514	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	103487374	.	CTTTCTTTCTTTCTTTTCTTCTTTTTTTT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=191,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.259:11:3,0:2,2:0,9,1,1
chr1	103487394	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.880:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	103496620	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,4,4
chr1	103496805	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.857:8:1,5:0,1:0,1,1,6
chr1	103548319	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=40.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr1	103573547	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	104093684	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=144,162;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=58.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,25:0.578:43:9,0:9,25:6,12,0,25
chr1	104093719	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=165,162;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=57.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,25:0.703:35:6,0:4,25:2,8,0,25
chr1	104116312	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,1:5,7:6,2,4,4
chr1	107601494	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=157,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=49.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.500:38:7,0:12,19:5,14,0,19
chr1	108023196	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:0|1:108023196_G_C:108023196:0,5,6,0
chr1	108023198	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,0:2,2:0|1:108023196_G_C:108023196:0,5,6,0
chr1	108023202	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:3,0:2,1:0|1:108023196_G_C:108023196:1,6,6,0
chr1	108023205	.	C	CCCCCCCCCCCCACAA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.465:13:4,2:3,4:0|1:108023196_G_C:108023196:1,6,6,0
chr1	108138772	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=226,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr1	108139003	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=205,182;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=103.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,32:0.917:34:0,4:2,28:0,2,3,29
chr1	108160260	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.661:13:1,3:2,4:3,1,3,6
chr1	108299775	.	ATGTG	A,ATG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30,26;MFRL=150,198,195;MMQ=40,60,60;MPOS=1,1;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=TG;STR;TLOD=7.11,6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.402,0.401:7:1,2,2:0,1,1:1,0,6,0
chr1	108307642	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,10,4
chr1	108315305	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	108507209	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=235,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	108507541	.	GGCCGCC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=222,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=GCC;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	108679323	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:13,8,2,0
chr1	108681600	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:4,0,4,0
chr1	108697845	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=197,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0,6,0,2
chr1	108700316	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:0,10,0,3
chr1	108724518	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,6:1,1:2,0,4,3
chr1	108724693	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=233,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr1	108766424	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=161,164;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr1	108771524	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=239,244;MMQ=37,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:2,1,2,0
chr1	109167249	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=145,89;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,0:9,4:9,7,1,3
chr1	109170746	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,10,3
chr1	109235166	.	T	TGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=142,300;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:0|1:109235166_T_TGG:109235166:1,2,1,0
chr1	109235172	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=142,300;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,0:2,0:0|1:109235166_T_TGG:109235166:1,2,1,0
chr1	109235298	.	TGCG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCG;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:8,1:7,0:12,4,2,0
chr1	109241967	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:19,0:11,3:18,12,0,3
chr1	109255513	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr1	109260357	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	109261321	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	109265029	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=224,119;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:1,5:0,4:1,0,3,6
chr1	109271473	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,0:14,2:5,14,1,1
chr1	109289236	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:0,2:7,5:7,0,7,0
chr1	109289487	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=176,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,4:6,5:0,8,0,9
chr1	109299453	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=218,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,2:0,4:0,3,0,6
chr1	109301250	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.601:21:5,4:3,9:0,8,4,9
chr1	109315211	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:3,0,4,0
chr1	109321824	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=199,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr1	109325028	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=156,278;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr1	109325436	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr1	109337482	.	A	ACCATTGCACTCCAGC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=104,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,0:7,2:5,6,1,1
chr1	109339414	.	GT	G,GTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32,32;MFRL=257,226,279;MMQ=60,60,60;MPOS=13,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.57,3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.365,0.357:8:0,1,1:2,2,1:0,2,0,6
chr1	109358755	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=205,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.378:11:4,2:3,2:6,1,4,0
chr1	109358958	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=174,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,3:6,3:1,10,3,3
chr1	109363075	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=204,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	109365782	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=113,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:15,1:7,1:13,9,2,0
chr1	109366370	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	109369791	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=136,249;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0|1:109369791_G_A:109369791:0,3,2,0
chr1	109369797	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=136,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:109369791_G_A:109369791:0,3,3,0
chr1	109391486	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,4,10
chr1	109465174	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=165,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,0:1,2:2,7,0,2
chr1	109466562	.	TTTTTTTG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTTTG;STR;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:3,2:9,1:11,4,3,0
chr1	109486240	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=96,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,2:9,1:14,8,1,2
chr1	109492879	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=116,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.496:24:5,5:7,6:8,4,10,2
chr1	109525421	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=233,257;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr1	109529322	.	T	TAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr1	109545046	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	109648794	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=126,242;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:1,0:8,3:0,9,2,1
chr1	109714403	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr1	109714635	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=129,217;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,2:9,1:5,7,2,1
chr1	109727653	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=224,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,4:4,5:3,3,5,4
chr1	109727832	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=182,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:0,7,1,4
chr1	109731858	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=151,129;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,0:5,7:0,9,0,7
chr1	109732387	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=216,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:0,4,0,6
chr1	109734157	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=156,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:0,4,1,5
chr1	109734541	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=125,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	109734567	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=185,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:109734567_G_T:109734567:0,1,0,1
chr1	109734570	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,24;MFRL=185,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109734567_G_T:109734567:0,1,0,1
chr1	109734572	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=185,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109734567_G_T:109734567:0,1,0,1
chr1	109734575	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,25;MFRL=185,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109734567_G_T:109734567:0,1,0,1
chr1	109735504	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=226,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:3,3,2,4
chr1	109737314	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=54.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr1	109740310	.	AGT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=GT;STR;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:0,6,0,4
chr1	109742452	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=126,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,3:1,8:4,1,9,2
chr1	109742485	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=126,190;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.587:17:5,3:1,7:5,2,7,3
chr1	109745618	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=122,123;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:5,9:2,3:3,4,6,6
chr1	109773705	.	ATT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=291,0;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.832:9:1,1:0,5:0,1,0,8
chr1	109774357	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:12,0:5,3:8,9,0,3
chr1	109778577	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=282,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:0,4:2,8:2,0,11,1
chr1	109779556	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr1	109795858	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:15,4:5,0:9,12,4,0
chr1	109805463	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=156,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.140:21:7,2:8,0:0|1:109805463_G_A:109805463:9,9,2,1
chr1	109805465	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=156,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.138:20:9,2:8,0:0|1:109805463_G_A:109805463:9,9,1,1
chr1	109806442	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=192,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr1	109806991	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,0:4,5:1,5,0,5
chr1	109812173	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:7,3,2,0
chr1	109813020	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=229,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,5,0
chr1	109813236	.	TTCCCAGTCTTGGGG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.706:8:2,4:0,2:0,2,1,5
chr1	109815252	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=109,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,2:4,3:7,5,4,1
chr1	109815509	.	C	CAGAGCATCAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=229,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:0|1:109815509_C_CAGAGCATCAA:109815509:3,2,1,1
chr1	109815511	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=229,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,0:2,1:0|1:109815509_C_CAGAGCATCAA:109815509:3,2,1,1
chr1	109816176	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	109838833	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0,0,14,4
chr1	109838873	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=166,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,0:8,3:9,9,3,0
chr1	109839063	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=156,180;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.763:6:0,0:0,1:0,1,0,5
chr1	109839392	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=94,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.923:24:0,13:1,10:0,1,10,13
chr1	109839954	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=202,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr1	109840697	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,33;MFRL=224,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:109840697_GC_G:109840697:3,0,1,0
chr1	109840702	.	T	TGC	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=201,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:109840697_GC_G:109840697:4,0,1,0
chr1	109840704	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=25,34;MFRL=78,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr1	109840707	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=26,28;MFRL=201,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:109840697_GC_G:109840697:4,0,1,0
chr1	109840709	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=34,27;MFRL=201,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:109840697_GC_G:109840697:4,0,1,0
chr1	109840712	.	GGA	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=33,36;MFRL=201,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:109840697_GC_G:109840697:4,0,1,0
chr1	109840716	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,29;MFRL=178,78;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:109840697_GC_G:109840697:3,0,1,0
chr1	109840719	.	TGG	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=201,78;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:109840697_GC_G:109840697:4,0,1,0
chr1	109840918	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=150,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:1,5,0,3
chr1	109856842	.	TGG	T,TG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,29,27;MFRL=239,191,204;MMQ=60,60,60;MPOS=14,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=G;STR;TLOD=5.57,15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,6:0.285,0.503:11:0,2,4:2,0,2:2,0,6,3
chr1	109856856	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=204,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,0:1,0:0|1:109856856_C_A:109856856:6,4,2,0
chr1	109856864	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=204,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:8,0:0,1:0|1:109856856_C_A:109856856:6,4,2,0
chr1	109883576	.	C	CAT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=195,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.412:5:1,0:2,1:0,3,0,2
chr1	109958035	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=142,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:0,8,0,2
chr1	110018148	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	110029667	.	G	GCCCCCCC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,11;RU=C;STR;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.323:19:8,4:5,2:0,13,6,0
chr1	110029672	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.217:19:7,2:6,1:1,14,4,0
chr1	110029678	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=25,12;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.218:19:7,1:6,0:0|1:110029678_A_C:110029678:1,14,4,0
chr1	110029681	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.203:17:8,2:6,1:0|1:110029678_A_C:110029678:1,13,3,0
chr1	110029684	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=26,19;MFRL=179,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.202:17:8,0:4,0:0|1:110029678_A_C:110029678:2,12,3,0
chr1	110030895	.	GTC	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr1	110030945	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	110035159	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=173,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:4,8:8,5:8,4,9,4
chr1	110035318	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=142,230;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.639:14:3,4:2,5:0,5,0,9
chr1	110036919	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=170,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,6:5,2:4,8,7,1
chr1	110036998	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=219,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:3,4,4,2
chr1	110037838	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=135,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.441:23:7,6:6,4:8,5,5,5
chr1	110086141	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=190,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:5,5:13,0:9,10,5,0
chr1	110087178	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=135,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:9,0:14,4:8,15,1,3
chr1	110091271	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=144,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:4,0,6,0
chr1	110128928	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=186,79;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:15,6:12,0:11,16,1,5
chr1	110145987	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=147,210;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:6,5:7,0:8,5,5,0
chr1	110153198	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,3:1,2:1,1,0,5
chr1	110155355	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=143,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,0:7,3:10,1,1,2
chr1	110155524	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=189,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,3:6,3:0,9,1,5
chr1	110163879	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:4,7:10,5:8,6,9,4
chr1	110168888	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.739:21:5,5:0,11:2,3,7,9
chr1	110169957	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=208,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:2,0,0,5
chr1	110170640	.	GC	TT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=190,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:4,3:6,2,4,4
chr1	110171705	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=227,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,4:0,2:1,0,5,1
chr1	110172346	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=180,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:1,0,7,0
chr1	110172362	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=172,226;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:4,3:5,1,3,0
chr1	110200360	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=106,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:23,2:17,2:20,21,3,1
chr1	110201580	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,13,11
chr1	110201809	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,14:0,12:0|1:110201809_G_T:110201809:0,0,7,19
chr1	110201812	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=116.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,14:0,12:0|1:110201809_G_T:110201809:0,0,8,19
chr1	110210780	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,14:0,0,10,9
chr1	110211681	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	110212293	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=201,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr1	110230767	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr1	110231284	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,19644;MMQ=52,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:2,5,5,0
chr1	110231295	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=159,19644;MMQ=40,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,0:6,5:3,8,5,0
chr1	110232801	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr1	110233147	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=20,29;MFRL=59,131;MMQ=52,57;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:2,5:0,6:1,1,4,7
chr1	110233178	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=157,59;MMQ=40,52;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:0|1:110233178_C_T:110233178:6,8,1,1
chr1	110233197	.	C	CG	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=157,59;MMQ=40,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:0|1:110233178_C_T:110233178:6,8,1,1
chr1	110233199	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=152,59;MMQ=40,52;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,2:3,0:0|1:110233178_C_T:110233178:5,8,1,1
chr1	110233247	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,57;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,3,5
chr1	110254812	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,1:5,0,2,0
chr1	110255126	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=203,159;MMQ=60,55;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,4:6,0:0|1:110255126_G_A:110255126:12,1,4,0
chr1	110255129	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=208,159;MMQ=60,55;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:7,4:6,0:0|1:110255126_G_A:110255126:12,2,4,0
chr1	110256430	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=156,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:0|1:110256430_G_A:110256430:2,4,0,2
chr1	110256435	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=179,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:110256430_G_A:110256430:2,6,0,2
chr1	110279821	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:7,2:1,3:6,2,2,3
chr1	110281941	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=93,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	110282972	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,3:1,3,0,5
chr1	110295890	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr1	110300072	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=178,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:3,7,2,0
chr1	110301766	.	AGTGT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=83,244;MMQ=58,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=GT;STR;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.687:7:0,3:2,2:1,1,4,1
chr1	110464422	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=165,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:6,4:6,0:0|1:110464422_G_A:110464422:10,2,4,0
chr1	110464432	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=165,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:6,4:6,0:0|1:110464422_G_A:110464422:11,3,4,0
chr1	110465872	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=173,52;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:0|1:110465872_C_T:110465872:3,7,1,1
chr1	110465889	.	GCC	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=166,52;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:110465872_C_T:110465872:3,4,1,1
chr1	110465893	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=166,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:110465872_C_T:110465872:3,4,1,1
chr1	110465898	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=168,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:110465872_C_T:110465872:3,3,1,1
chr1	110465901	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=169,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:110465872_C_T:110465872:3,4,1,1
chr1	110465906	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=169,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:110465872_C_T:110465872:3,4,1,1
chr1	110466867	.	C	CAAGACCGCACCACTGCACTCAGCCTGAGTGACAGAGCAAGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=347,180;MMQ=60,39;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.662:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	110558094	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=161,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:16,2:15,0:0|1:110558094_T_G:110558094:16,15,2,0
chr1	110558100	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=151,193;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:16,2:17,0:0|1:110558094_T_G:110558094:17,16,2,0
chr1	110581780	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=128,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,1:13,1:12,10,1,1
chr1	110589487	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=217,154;MMQ=53,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	110592048	.	CTTTT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=194,310;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=T;STR;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:2,2:2,1:0|1:110592048_CTTTT_C:110592048:11,2,2,1
chr1	110592058	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=184,194;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,9:0.487:18:5,8:4,1:1|0:110592048_CTTTT_C:110592048:5,4,9,0
chr1	110603283	.	CAGAGGTGGGCTGGGAGCGACTGGGAATGGAAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.351:4:0,1:1,0:2,1,1,0
chr1	110656454	.	TCC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=169,237;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,0:5,1:7,6,0,2
chr1	110716511	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,3:3,1:2,1,4,0
chr1	110734575	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:5,4:10,0:10,5,4,0
chr1	110735037	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=233,244;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr1	110740688	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,1,1
chr1	110765535	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=217,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr1	110766466	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=201,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:6,3:11,0:7,10,1,2
chr1	110924235	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,2:2,7:2,2,5,4
chr1	110950295	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:3,8:11,3:11,3,8,3
chr1	111059812	.	C	CGA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=206,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=GA;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	111060153	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=202,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:4,2:7,2,2,1
chr1	111060649	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:8,4:1,1:5,4,5,0
chr1	111060669	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,13:0,4:0,0,14,4
chr1	111136541	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:0|1:111136541_C_T:111136541:6,9,1,1
chr1	111136551	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:10,2:0|1:111136541_C_T:111136541:9,8,1,1
chr1	111136553	.	A	ATGTTCC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:0|1:111136541_C_T:111136541:9,8,1,1
chr1	111136554	.	A	AC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:0|1:111136541_C_T:111136541:9,8,1,1
chr1	111145966	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=149,141;MMQ=60,33;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:8,0:13,4:10,11,0,4
chr1	111434170	.	CTGGTG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=125,237;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr1	111436857	.	TC	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=267,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:2,0,6,0
chr1	111661413	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=46.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,6:4,8:2,6,7,7
chr1	111661467	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=142,58;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:15,4:15,0:19,11,4,0
chr1	111661528	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:11,5:7,7:8,10,5,7
chr1	111703791	.	GGAAC	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=122,48;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,0:9,2:0|1:111703791_GGAAC_G:111703791:16,11,1,1
chr1	111703796	.	TTGTA	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=118,48;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:14,0:11,2:0|1:111703791_GGAAC_G:111703791:17,13,1,1
chr1	111726026	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=307,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:3,0,6,0
chr1	111726213	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,13,15
chr1	111726288	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=331,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr1	111737183	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:0,5:5,8:5,0,8,5
chr1	111737398	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,4:3,4:0,7,0,8
chr1	111739771	.	G	GCAGGACAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:2,3:0,2:2,0,6,0
chr1	111743061	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=167,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:17,2:12,2:15,14,1,3
chr1	111770423	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:3,5,0,3
chr1	111773273	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=251,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	111778241	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr1	111778468	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=200,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:1,3,0,5
chr1	111778824	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=148,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.605:12:0,2:1,5:1,4,1,6
chr1	111784148	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	111784816	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:5,0,2,1
chr1	111833441	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=197,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:6,1,3,0
chr1	111833488	.	C	CCT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=172,150;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,1:6,2:5,6,2,2
chr1	111833517	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=138,79955;MMQ=60,43;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:4,5,0,2
chr1	111833661	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,387;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	111853060	.	A	AGCCAATCTAG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:11,2:4,2:11,4,3,1
chr1	111854207	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=212,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:3,0,6,0
chr1	111854223	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=195,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:4,1,5,0
chr1	111854741	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=214,192;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:5,0,2,0
chr1	111854755	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr1	111857087	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=77,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.755:9:1,2:0,5:1,1,5,2
chr1	111857107	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:6,3:1,2:5,2,5,0
chr1	111857120	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,3:2,2:7,2,5,0
chr1	111857154	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=195,186;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,5:1,3:3,1,7,1
chr1	111861202	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:111861202_C_T:111861202:9,8,2,0
chr1	111861210	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,49;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:7,0:8,2:0|1:111861202_C_T:111861202:9,6,2,0
chr1	111861714	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=127,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,1:2,3:4,3,4,0
chr1	111862078	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:10,4:6,1:6,11,3,2
chr1	111890244	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=97,322;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:2,1:0|1:111890244_C_T:111890244:2,0,1,0
chr1	111890246	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=97,322;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:2,1:0|1:111890244_C_T:111890244:2,0,1,0
chr1	111891192	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,3:8,0:5,11,2,1
chr1	111892905	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=175,208;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:111892905_T_C:111892905:0,2,0,1
chr1	111892909	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=175,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:111892905_T_C:111892905:0,2,0,1
chr1	111893788	.	G	GTTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=20,23;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	111893837	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=151,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:4,3,1,1
chr1	111957245	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:7,6:3,4:8,2,7,3
chr1	111969294	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=336,192;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:2,1,0,2
chr1	111990265	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=199,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr1	111991845	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	111992095	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.418:24:6,3:8,6:9,5,6,4
chr1	112028334	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=207,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,1:1,1:1,3,4,0
chr1	112029150	.	AG	CC	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=15,22;MFRL=193,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:0,1:0|1:112029150_AG_CC:112029150:4,0,2,0
chr1	112029156	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=26,12;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,0:0|1:112029150_AG_CC:112029150:5,0,2,0
chr1	112029160	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=25,10;MFRL=203,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,0:0|1:112029150_AG_CC:112029150:7,0,2,0
chr1	112029163	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=27,22;MFRL=203,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:2,1:0|1:112029150_AG_CC:112029150:7,0,2,0
chr1	112029168	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=29,21;MFRL=202,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,1:0|1:112029150_AG_CC:112029150:7,1,2,0
chr1	112029171	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=26,12;MFRL=202,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,0:0|1:112029150_AG_CC:112029150:7,1,2,0
chr1	112029189	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=31,29;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,5:7,2:7,2,4,3
chr1	112029193	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=234,189;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.832:16:1,5:1,8:2,0,9,5
chr1	112029325	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=213,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:1,6:0,5:0,1,1,10
chr1	112032126	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=232,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:112032126_T_C:112032126:3,0,3,0
chr1	112032131	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=232,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:112032126_T_C:112032126:3,0,3,0
chr1	112032347	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr1	112032372	.	CACAGGGCTGAAAACAG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=207,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr1	112033454	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=88,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.415:6:2,1:2,0:0|1:112033454_G_GA:112033454:0,4,0,2
chr1	112033456	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=88,230;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.415:6:2,1:2,1:0|1:112033454_G_GA:112033454:0,4,0,2
chr1	112042732	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.342:36:11,7:13,5:14,10,6,6
chr1	112043139	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,1:6,2:8,6,2,1
chr1	112106444	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,3,4
chr1	112237915	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,287;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,1:3,2:8,1,2,1
chr1	112281899	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:5,2,4,3
chr1	112298829	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	112298875	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:112298875_G_A:112298875:0,0,0,1
chr1	112298878	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:112298875_G_A:112298875:0,0,0,1
chr1	112298881	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:112298875_G_A:112298875:0,0,0,1
chr1	112302208	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:2,7,0,3
chr1	112302219	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=159,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:1,6,0,4
chr1	112303237	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,2:4,5:5,4,2,5
chr1	112303622	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=170,250;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.139:41:16,5:20,0:21,15,5,0
chr1	112303791	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=191,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:8,4:2,5:3,7,4,5
chr1	112305305	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:5,2,2,0
chr1	112305406	.	TAAAAA	T,TAAAA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,30,25;MFRL=133,175,196;MMQ=60,60,60;MPOS=18,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,11,15;RU=A;STR;TLOD=5.75,4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,3:0.184,0.271:13:5,1,1:3,1,1:3,5,3,2
chr1	112305437	.	T	TTTAAGGGGAGG	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=204,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTAAGGGGAGG;STR;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.372:22:4,0:10,4:9,5,4,4
chr1	112322841	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,18;MFRL=213,41;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:9,0:8,1:0|1:112322841_A_C:112322841:10,7,1,1
chr1	112322848	.	GTG	TCA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=196,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:8,2:0|1:112322841_A_C:112322841:11,8,1,1
chr1	112322854	.	T	TCCTATTTTTATAAAAA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=193,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:8,0:8,1:0|1:112322841_A_C:112322841:9,7,1,1
chr1	112329580	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=197,83;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:7,6,1,1
chr1	112998767	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,16:0.378:43:15,0:12,16:15,12,0,16
chr1	113063125	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=117,183;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:5,2:11,2:6,10,3,1
chr1	113063204	.	C	CACACACACACACACACACA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr1	113140583	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=172,203;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,2:5,0:11,2,2,0
chr1	113159448	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=125,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:25,3:18,0:18,25,0,3
chr1	113196179	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=213,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.534:7:3,2:0,1:3,0,4,0
chr1	113196197	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=237,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.772:10:2,3:0,1:2,0,6,2
chr1	113202417	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=244,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,5:1,5:0,1,3,7
chr1	113231999	.	T	TTCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=283,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:113231999_T_TTCC:113231999:0,1,2,0
chr1	113232003	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=283,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,1:0|1:113231999_T_TTCC:113231999:0,1,2,0
chr1	113232007	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,0:0,0:0|1:113231999_T_TTCC:113231999:1,0,2,0
chr1	113234456	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=374,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,5:1,5:0,3,3,8
chr1	113239382	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=137,163;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,2:3,0:5,8,1,1
chr1	113239478	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=279,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr1	113240790	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=189,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,0:7,2:3,4,0,2
chr1	113240987	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=143,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:7,4:9,0:6,10,2,2
chr1	113242488	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=244,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,22:0.697:31:8,9:1,13:5,4,8,14
chr1	113244433	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	113245160	.	G	GCA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:9,1:4,1:0|1:113245160_G_GCA:113245160:11,3,2,0
chr1	113245163	.	C	CTGATGGCA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,1:5,1:0|1:113245160_G_GCA:113245160:11,3,2,0
chr1	113246229	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=229,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:4,0,7,0
chr1	113246506	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=233,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr1	113254484	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	113255686	.	TTGTG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=145,173;MMQ=50,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=TG;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr1	113255719	.	T	TGTCATGTGTATGTGTGTGTTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=198,125;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	113456668	.	TTGCCAAAAGTCGATAATTGATGCCCA	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=149,93;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:12,0:15,2:15,21,1,1
chr1	113460567	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=202,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,5:5,0:5,7,5,0
chr1	113636252	.	G	GTTGATTGGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=189,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	113636924	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr1	113653075	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,0:1,2:2,3,0,2
chr1	113658887	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:4,2,5,1
chr1	113659065	.	ACT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=204,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:2,4,2,2
chr1	114092111	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.365:9:3,1:1,2:5,1,3,0
chr1	114092306	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=199,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr1	114133022	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	114137013	.	C	CAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	114189067	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,4:3,2:3,3,3,3
chr1	114189185	.	GA	TG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=157,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:114189185_GA_TG:114189185:3,6,1,1
chr1	114189189	.	A	ACTCTTAATTTGCC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=155,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:114189185_GA_TG:114189185:3,7,1,1
chr1	114191994	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=183,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.472:17:5,4:4,4:4,5,4,4
chr1	114196364	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=232,254;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr1	114196723	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:1,2:8,1:0,9,0,3
chr1	114224782	.	ATT	A,ATTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32,28;MFRL=170,247,179;MMQ=60,60,60;MPOS=33,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=T;STR;TLOD=5.57,5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.272,0.497:6:0,2,0:1,0,2:1,0,3,2
chr1	114226705	.	CTT	C,CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35,34;MFRL=249,249,206;MMQ=60,60,60;MPOS=15,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.32,7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,4:0.197,0.370:11:2,0,2:3,2,2:0,5,0,6
chr1	114240319	.	T	TA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=85.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,13:0,0,16,11
chr1	114248622	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:7,0:9,5:9,7,0,5
chr1	114249382	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr1	114255828	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=98,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	114256139	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,1,1
chr1	114267347	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	114280717	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=172,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:2,2:10,1:9,3,1,2
chr1	114309172	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,312;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	114339956	.	C	CTAAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=141.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,12:0,17:0,0,21,11
chr1	114354739	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=173,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,0:1,0:0|1:114354739_T_G:114354739:1,4,2,0
chr1	114354741	.	CT	GG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=173,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:4,0:1,0:0|1:114354739_T_G:114354739:1,4,2,0
chr1	114372332	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:2,3,1,3
chr1	114372528	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=180,222;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:6,0,2,1
chr1	114377093	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,5,9
chr1	114377568	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,12,19
chr1	114377640	.	TAACAATTGTTAATTAG	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:7,0:1,14,0,2
chr1	114399075	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=259,155;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:0,12:1,0:1,0,12,0
chr1	114401088	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=175,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:7,0:16,3:20,3,3,0
chr1	114401114	.	CC	TT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=167,104;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.120:22:9,0:9,2:13,7,2,0
chr1	114401231	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:6,3,3,4
chr1	114401273	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=166,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,0:1,5:0|1:114401273_T_TC:114401273:0,5,0,5
chr1	114401279	.	T	TTAACAA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,38;MFRL=166,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,0:1,5:0|1:114401273_T_TC:114401273:0,5,0,5
chr1	114401282	.	G	GAAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=166,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:114401273_T_TC:114401273:0,4,0,1
chr1	114401904	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=168,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:2,2:0,3:2,0,3,2
chr1	114423653	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:11,1:2,4:12,2,3,2
chr1	114429340	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=247,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr1	114429956	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=114,75;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,3:8,0:10,6,2,1
chr1	114438071	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,6:6,0:6,6,5,1
chr1	114443035	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=193,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:6,5:3,6:2,7,2,9
chr1	114483379	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:6,3,1,1
chr1	114495348	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=194,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.390:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr1	114495565	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=136,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:9,4:15,0:11,13,0,4
chr1	114504860	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=158,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr1	114510971	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=190,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,8:3,0:5,0,8,0
chr1	114523168	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.366:39:9,13:16,0:12,13,14,0
chr1	114641685	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.785:12:1,6:1,4:2,0,10,0
chr1	114940211	.	GTTTT	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=0,195;MMQ=52,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,12;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0|1:114940211_GTTTT_G:114940211:3,0,1,0
chr1	114940228	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,5:0.334:14:2,2:3,2:1|0:114940211_GTTTT_G:114940211:5,4,3,2
chr1	114940229	.	G	GGT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,16;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,5:0.334:14:5,0:4,0:1|0:114940211_GTTTT_G:114940211:5,4,3,2
chr1	114940632	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.846:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	114963067	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,1:9,1:10,10,2,0
chr1	114973610	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=177,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:114973610_T_C:114973610:0,3,0,1
chr1	114973619	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=177,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:114973610_T_C:114973610:0,3,0,1
chr1	115006230	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=121,250;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:1,1:0,5,0,3
chr1	115110683	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,130;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:5,1,5,0
chr1	115110785	.	T	TGG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=122,53;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:8,9,1,1
chr1	115110797	.	TGC	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=122,53;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:11,2:0|1:115110797_TGC_T:115110797:10,11,1,1
chr1	115110801	.	T	TTA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=127,53;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:0|1:115110797_TGC_T:115110797:9,11,1,1
chr1	115128087	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=194,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr1	115144703	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,7,6
chr1	115166350	.	ATTGT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTGT;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	115218413	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=184,261;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:8,2,3,1
chr1	115236202	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr1	115238016	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34,16,35;MFRL=0,199,183,225;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,11,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.88,3.57,7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,2,3:0.273,0.273,0.365:7:0,1,0,2:0,1,0,0:0,0,4,3
chr1	115238177	.	T	TCCTTCAAAAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=187,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:3,2:8,0:3,9,0,2
chr1	115256669	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr1	115280193	.	CA	C,CAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=158,197,196;MMQ=60,60,60;MPOS=23,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.64,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,3,3:0.143,0.155:23:8,3,1:7,0,2:4,13,1,5
chr1	115398044	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,9:0,2:0,0,7,4
chr1	115399788	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=156,91;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.315:8:2,0:1,2:2,4,1,1
chr1	115399940	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:6,1:9,3:6,9,0,4
chr1	115401136	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr1	115418751	.	AT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=176,61;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.137:26:10,0:13,3:10,13,0,3
chr1	115420905	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=99,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr1	115601528	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:8,1:11,7,1,1
chr1	115601615	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,9:0,0,5,10
chr1	115615636	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:8,1:1,2:3,6,0,3
chr1	115631924	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr1	116224940	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr1	116225180	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=234,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:1,7:0,5:0,1,1,11
chr1	116228220	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=261,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,4:2,2:0,2,0,6
chr1	116243874	.	ATCG	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:7,1:18,1:7,18,0,2
chr1	116243877	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=198,128;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:3,5:7,11:2,8,6,10
chr1	116245655	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:1,5,1,2
chr1	116260532	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:3,1:4,2:4,4,3,0
chr1	116260544	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:3,4,3,0
chr1	116268178	.	GAA	G,GAAAAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,17,34;MFRL=0,155,0;MMQ=60,60,60;MPOS=7,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=23,21,27;RU=A;STR;TLOD=3.72,4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.382,0.503:5:0,0,2:0,0,0:0,0,2,3
chr1	116283343	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,12:0,5:0,0,11,6
chr1	116283526	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	116311198	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	116383010	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,148;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:21,4:24,0:19,26,4,0
chr1	116383145	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:10,0:3,2:6,7,1,1
chr1	116383333	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=191,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,0:6,4:2,13,3,1
chr1	116383364	.	A	ATTTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,20;RU=T;STR;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.846:4:0,0:0,2:0,0,2,2
chr1	116384534	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=128,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.334:19:7,2:6,4:6,7,2,4
chr1	116385467	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=190,198;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.826:15:1,6:1,7:1,1,9,4
chr1	116386243	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=191,93;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,1:3,2:5,3,2,1
chr1	116386244	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=153,194;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:3,4,4,0
chr1	116562210	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=161,78;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:4,3:17,0:11,10,3,0
chr1	116577981	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr1	116609126	.	TC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.736:16:0,7:4,5:1,3,9,3
chr1	116655272	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=125,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,3:12,0:13,9,1,2
chr1	116663724	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:3,7,0,2
chr1	116670774	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.223:21:9,2:3,2:11,6,2,2
chr1	116671061	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=234,229;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr1	116931984	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=220,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,0:4,2:10,0,2,0
chr1	116933372	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=158,254;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,2:8,0:14,3,2,0
chr1	116940481	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.495:10:1,2:1,2:2,3,4,1
chr1	116946469	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,2:6,3:10,5,4,1
chr1	116946605	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,3:7,0:4,11,0,3
chr1	116946635	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=148,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,3:4,2:2,7,1,4
chr1	117122285	.	G	GTCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=109,240;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.317:4:1,0:1,1:0|1:117122285_G_GTCC:117122285:1,2,0,1
chr1	117122288	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=109,138;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:1,1:2,2:0|1:117122285_G_GTCC:117122285:1,2,0,3
chr1	117142531	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=191,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:3,2:2,7:6,0,9,0
chr1	117142700	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=179,92;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.348:41:9,6:18,8:15,12,4,10
chr1	117142736	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=201,138;MMQ=60,37;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.234:36:10,5:18,3:15,13,5,3
chr1	117142855	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.255:37:13,5:15,4:15,13,8,1
chr1	117142868	.	CA	TG	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=180,160;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.235:36:13,4:15,4:14,14,6,2
chr1	117142977	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=184,195;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:1,15,0,2
chr1	117149041	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=138,175;MMQ=52,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,1:6,2:8,5,1,2
chr1	117150928	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=182,167;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.267:28:7,6:10,1:0|1:117150928_C_T:117150928:4,17,2,5
chr1	117150933	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=182,167;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.266:28:9,4:12,1:0|1:117150928_C_T:117150928:4,17,2,5
chr1	117150966	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=172,190;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:8,3:7,2:4,12,0,5
chr1	117151017	.	A	ACCCCCTCC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,18;MFRL=179,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,0:0,4,1,1
chr1	117156326	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=198,184;MMQ=52,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:6,2:7,1:0|1:117156326_C_T:117156326:12,1,3,0
chr1	117156333	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=190,184;MMQ=52,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:6,1:9,1:0|1:117156326_C_T:117156326:14,1,3,0
chr1	117156459	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=172,187;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,12:0.282:44:14,8:18,4:19,13,4,8
chr1	117156490	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=156,162;MMQ=60,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.177:43:19,5:17,2:20,16,1,6
chr1	117156584	.	TG	CA	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=189,207;MMQ=58,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:15,3:18,1:19,14,0,4
chr1	117156600	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=178,233;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:11,4:13,0:13,11,0,4
chr1	117158690	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=173,86;MMQ=49,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:7,3:13,3:11,9,2,4
chr1	117158857	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=30,24;MFRL=134,160;MMQ=28,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:9,0:9,2:0|1:117158857_C_T:117158857:8,12,3,0
chr1	117158862	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=139,160;MMQ=30,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:9,0:10,3:0|1:117158857_C_T:117158857:7,12,3,0
chr1	117158898	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=33,26;MFRL=156,160;MMQ=25,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,3:5,10,3,0
chr1	117158909	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=30,22;MFRL=196,144;MMQ=30,24;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:9,0:8,4:7,10,3,1
chr1	117158972	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=29,35;MFRL=202,147;MMQ=48,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:9,2:12,3:14,7,3,2
chr1	117159024	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=181,131;MMQ=25,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:7,2:5,3:4,8,1,4
chr1	117214318	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=156,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:3,1,2,2
chr1	117487710	.	AT	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,3,14
chr1	117509981	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.428:19:6,6:5,2:0|1:117509981_G_A:117509981:2,9,1,7
chr1	117509987	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:5,4:5,1:0|1:117509981_G_A:117509981:2,8,1,7
chr1	117560818	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=178,211;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,3:6,5:6,5,5,3
chr1	117603188	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,5:2,6,2,4
chr1	117605130	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.511:13:1,5:3,1:0,6,1,6
chr1	117618722	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	117622286	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=291,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:0,2,2,4
chr1	117629155	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=106,40;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.159:17:10,0:4,2:0|1:117629155_G_A:117629155:5,10,1,1
chr1	117629160	.	A	AGTCGCGTGATCTCG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=106,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:10,0:1,2:0|1:117629155_G_A:117629155:3,8,1,1
chr1	117631391	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=111,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:7,7:1,5:4,4,8,4
chr1	117633133	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:7,3:4,0:7,5,3,0
chr1	117638946	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=168,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,1:10,1:8,12,1,1
chr1	117659416	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.457:22:6,0:5,9:0,12,0,10
chr1	117660608	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=64,240;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:1,1,6,1
chr1	117661130	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:4,9,0,2
chr1	117690272	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,0:3,9:6,2,7,2
chr1	117695862	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=221,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,1:5,1:3,7,2,0
chr1	117696037	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=197,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,2:6,3:1,12,1,4
chr1	117712629	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,272;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	117957288	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=287,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,2,1
chr1	117957505	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=233,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:4,1:7,3:0,11,0,4
chr1	117984776	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=227,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr1	118065817	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,2:4,0:6,6,2,0
chr1	118166750	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=186,107;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.525:23:7,5:2,7:6,5,9,3
chr1	118167727	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=191,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:3,2:8,1:8,4,3,1
chr1	118168804	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=172,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,2:10,5,1,2
chr1	118168826	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=207,151;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,5:7,7:6,5,6,6
chr1	118168970	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:5,4:11,0:8,8,4,0
chr1	118170466	.	CTG	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,240;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TG;STR;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.566:14:1,5:4,3:3,3,3,5
chr1	118171000	.	CATTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=193,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:1,4,0,4
chr1	118488616	.	ATCTG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr1	118491213	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,15;MFRL=238,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:1,0:3,0:0,5,0,2
chr1	118491215	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=238,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.466:9:2,0:3,1:0,5,0,4
chr1	118502087	.	CT	C,CTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,32,32;MFRL=118,135,195;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.60,4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.257,0.249:9:2,1,0:3,1,2:1,4,3,1
chr1	118502099	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=118,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,0:2,5,2,0
chr1	118514496	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=142,67;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:8,0:8,2:0|1:118514496_C_T:118514496:11,5,1,1
chr1	118514508	.	T	TGGTCTGTGCC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=162,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:8,2:0|1:118514496_C_T:118514496:10,7,1,1
chr1	118526592	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	118566105	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=146,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:4,0:0|1:118566105_T_C:118566105:2,4,1,1
chr1	118566107	.	T	TATCCACCATGATCAAG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=146,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:118566105_T_C:118566105:2,4,1,1
chr1	118617274	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=99,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.232:24:11,4:7,1:7,12,2,3
chr1	118644430	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=187,217;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:11,1:8,2:0|1:118644430_A_G:118644430:8,18,1,2
chr1	118644436	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=142,201;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:22,7:0.250:29:13,0:9,6:1|0:118644430_A_G:118644430:8,14,0,7
chr1	118693998	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,1:12,1:6,13,1,1
chr1	119433449	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	119466275	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=65,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr1	119925490	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=174,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:5,3,2,0
chr1	119935232	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=109,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,2:7,0:9,7,1,1
chr1	120166453	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=141,295;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	120166570	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:7,0:13,7:10,10,4,3
chr1	120263799	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=163,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.209:30:12,5:12,0:15,9,6,0
chr1	120269567	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:11,3:9,2:12,8,3,2
chr1	120285482	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,109;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,0:8,7:7,10,0,7
chr1	120293367	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr1	120293394	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=231,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:5,2,3,4
chr1	120293568	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=231,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:1,3,0,4
chr1	120296033	.	AACAC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=268,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=AC;STR;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.689:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	120298314	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=160,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr1	120302539	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,0:6,2:10,7,2,0
chr1	120379932	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=148,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.278:27:13,0:6,7:8,12,2,5
chr1	120380008	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,5,8
chr1	120383054	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=124,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr1	120437547	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:4,15,1,1
chr1	120465425	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=166,141;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.352:18:7,0:4,5:5,7,0,6
chr1	120471857	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=194,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:5,2:0,9,1,2
chr1	120478177	.	GC	CT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.162:41:18,0:16,6:15,20,0,6
chr1	120478285	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=181,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr1	120480394	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr1	120480709	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=255,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	120484421	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=193,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:0,2:5,2:1,4,0,4
chr1	120496119	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=178,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:5,3:3,1:0|1:120496119_A_T:120496119:7,1,1,3
chr1	120496127	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:0|1:120496119_A_T:120496119:9,1,2,3
chr1	120512104	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr1	120529750	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:0,8,1,4
chr1	120548095	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=140,178;MMQ=40,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:10,2:4,0:4,10,0,2
chr1	120572466	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,379;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	120927081	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=206,137;MMQ=25,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,5:1,3:2,0,8,0
chr1	143912316	.	G	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=101,130;MMQ=25,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,21:0.366:58:16,0:21,21:14,23,0,21
chr1	144013853	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=194,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.401:38:13,9:9,6:21,2,12,3
chr1	144013865	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=189,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,14:0.326:44:17,9:13,5:24,6,11,3
chr1	144617992	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=179,134;MMQ=42,23;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:144617992_T_G:144617992:5,3,0,2
chr1	144617997	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=179,134;MMQ=42,23;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:0|1:144617992_T_G:144617992:5,3,0,2
chr1	144816724	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=184,129;MMQ=31,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr1	144825525	.	AG	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=207,139;MMQ=50,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:144825525_AG_CT:144825525:0,1,0,1
chr1	144825528	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=207,139;MMQ=50,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:144825525_AG_CT:144825525:0,1,0,1
chr1	144828484	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=154,185;MMQ=52,32;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,1:0|1:144828484_G_A:144828484:6,4,0,2
chr1	144828497	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=145,187;MMQ=40,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:0|1:144828484_G_A:144828484:4,3,1,3
chr1	144828532	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=122,219;MMQ=34,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:1,3,1,3
chr1	144828748	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=188,199;MMQ=30,23;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,2:3,4:4,5,6,0
chr1	144828764	.	GA	TT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=194,194;MMQ=52,23;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:5,2:8,4:3,10,7,0
chr1	144828784	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=201,203;MMQ=52,24;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,1:8,4:4,9,4,1
chr1	144852321	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=232,211;MMQ=51,35;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,3:3,1:6,0,4,0
chr1	144852545	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=125,239;MMQ=42,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr1	144854052	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=36,30;MFRL=325,195;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,4:1,4:2,1,8,0
chr1	144854083	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=187,190;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,6:6,2:7,4,8,0
chr1	144854087	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=190,224;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:8,3:4,4:0|1:144854087_A_G:144854087:13,1,4,3
chr1	144854095	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=197,224;MMQ=60,43;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:9,3:6,4:0|1:144854087_A_G:144854087:14,1,4,3
chr1	144854277	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=197,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,4:2,10:1,4,1,13
chr1	144854454	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=223,206;MMQ=60,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:9,2:6,3:13,3,4,1
chr1	144854491	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=174,208;MMQ=56,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.556:25:6,3:5,11:0|1:144854491_T_G:144854491:8,3,10,4
chr1	144854497	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=116,232;MMQ=56,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,11:0.546:20:4,2:5,9:0|1:144854491_T_G:144854491:6,3,7,4
chr1	144854501	.	CCT	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=175,191;MMQ=56,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:5,1:11,1:11,6,2,0
chr1	144854528	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=28,35;MFRL=183,206;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,0:16,2:0|1:144854528_A_G:144854528:15,11,0,2
chr1	144854537	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=27,34;MFRL=156,174;MMQ=60,27;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:12,1:18,2:0|1:144854528_A_G:144854528:15,15,0,3
chr1	144854730	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=166,132;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,5:5,0:1,10,0,5
chr1	144855935	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=140,186;MMQ=52,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:11,1:2,4:3,10,0,5
chr1	144857068	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=148,177;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,2:4,2:3,6,1,3
chr1	144859720	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,16,2
chr1	144859889	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,299;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:20,1:14,2:16,19,1,2
chr1	144860026	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.692:24:5,8:2,9:0,7,5,12
chr1	144863505	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=217,209;MMQ=60,37;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,2:4,4:0,9,0,6
chr1	144866509	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=195,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,1:3,7:7,0,7,1
chr1	144868170	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=124,191;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:7,4:8,2:6,9,2,4
chr1	144868204	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:0,7,1,5
chr1	144868239	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=191,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:0,6,0,6
chr1	144871889	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=116,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:4,5:9,8:2,11,5,8
chr1	144873794	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:5,6:1,2:5,1,8,0
chr1	144873818	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.577:26:8,9:2,6:7,4,13,2
chr1	144873840	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.634:28:5,9:5,9:6,4,12,6
chr1	144873962	.	CT	C	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=129,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.396:41:8,7:17,9:8,17,8,8
chr1	144874038	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=226,164;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:6,6:7,6:3,10,2,10
chr1	144874070	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=210,187;MMQ=60,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,4:3,4:0,7,0,8
chr1	144874088	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=205,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,2:4,2:0,10,0,4
chr1	144874641	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=133,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:9,3:5,7:13,1,8,2
chr1	144874760	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=137,162;MMQ=60,49;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:6,3:11,6:11,6,5,4
chr1	144874950	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=208,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,1:4,6:0,7,0,7
chr1	144877366	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=206,264;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:1,4,1,3
chr1	144881389	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:6,5:13,7:14,5,8,4
chr1	144881711	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=241,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:1,3:9,0:0,10,0,3
chr1	144882912	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,233;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.628:11:2,0:1,7:0,4,1,6
chr1	144886063	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.590:22:4,7:4,6:5,4,10,3
chr1	144886092	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:6,7:6,10:5,7,10,7
chr1	144886409	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=154,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,4:2,3:1,3,0,7
chr1	144892089	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=253,214;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chr1	144892149	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=164,169;MMQ=59,58;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,3:8,3:13,1,5,1
chr1	144906159	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=139,223;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,3:13,0:7,14,0,3
chr1	144916486	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=178,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:7,0,5,0
chr1	144916493	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=178,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.498:14:3,3:4,4:7,0,7,0
chr1	144916676	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=180,191;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:6,8:8,4:5,9,7,5
chr1	144917827	.	CA	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=172,140;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=79.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,26:0.574:45:10,14:9,12:11,8,14,12
chr1	144917841	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=169,140;MMQ=42,43;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,35:0.655:53:9,18:9,17:12,6,20,15
chr1	144922109	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,2:7,6:3,7,1,7
chr1	144922171	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=173,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:3,4,3,2
chr1	144923823	.	TAGGAAGAAACGGCA	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGAAGAAACGGCA;STR;TLOD=128.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.971:29:0,13:0,15:0,0,14,15
chr1	144923887	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=205,272;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.172:16:7,0:7,2:2,12,0,2
chr1	144930571	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=145,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.452:38:12,11:8,6:13,8,13,4
chr1	144930596	.	C	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=145,182;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,22:0.435:51:14,13:14,9:16,13,15,7
chr1	144931727	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=199,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.703:15:2,2:2,8:1,3,1,10
chr1	144946768	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=190,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,3:6,7:1,7,0,10
chr1	145016020	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=142.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,41:0.956:42:0,20:1,20:0,1,13,28
chr1	145016032	.	C	CA	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=178,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:8,2:12,4:5,15,0,8
chr1	145016035	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=171,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.125:33:13,2:16,2:8,21,0,4
chr1	145021024	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:9,3:7,6:0|1:145021024_G_C:145021024:14,2,9,0
chr1	145021034	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,11:0.400:28:8,3:9,8:0|1:145021024_G_C:145021024:17,0,11,0
chr1	145021265	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=200,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,2:7,1:0,16,0,3
chr1	145074882	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=196,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:10,2:13,4:22,1,5,1
chr1	145074919	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=167,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.064:44:17,1:25,1:31,11,2,0
chr1	145074939	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,23:0.500:46:12,8:11,15:17,6,11,12
chr1	145075903	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=201,258;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,2:5,3:0,13,0,5
chr1	145075923	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=234,249;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:8,0:0,15,0,2
chr1	145103844	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.424:43:13,10:11,8:20,5,16,2
chr1	145104052	.	AGT	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:5,3:6,5:0,11,0,8
chr1	145104075	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=194,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,1:8,2:0,15,0,3
chr1	145109430	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=186,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:7,1,3,0
chr1	145109456	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:5,4:9,1:13,1,4,1
chr1	145109468	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=67.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,16,2
chr1	145109493	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=146,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:12,2:12,3:23,1,4,1
chr1	145112284	.	CCG	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=184,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:10,2:13,2:0|1:145112284_CCG_C:145112284:23,2,4,0
chr1	145112287	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=191,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:7,6:10,5:17,0,9,2
chr1	145112288	.	G	GCA	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=184,196;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:10,1:13,2:0|1:145112284_CCG_C:145112284:23,2,4,0
chr1	145112313	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=199,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.308:37:9,6:17,5:22,4,7,4
chr1	145115658	.	TATTTTTAA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=195,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:7,4:11,5:20,0,9,0
chr1	145115820	.	T	C	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,17:0.193:91:32,7:37,10:33,41,9,8
chr1	145273473	.	T	C	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=163,175;MMQ=51,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,22:0.304:73:25,13:26,9:15,36,5,17
chr1	145273520	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=202,203;MMQ=27,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:8,3:10,1:2,16,1,3
chr1	145281361	.	TC	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=186,145;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,14:0.269:53:27,4:11,10:19,20,8,6
chr1	145281780	.	T	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=199,179;MMQ=57,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,15:0.277:55:13,9:26,5:13,27,7,8
chr1	145282093	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,191;MMQ=49,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,1:11,3:4,19,0,4
chr1	145290317	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=8;MBQ=32,26;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,10:0.199:53:22,4:20,6:40,3,10,0
chr1	145290320	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=8;MBQ=32,25;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,22:0.434:51:16,10:13,12:27,2,21,1
chr1	145290346	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=130,168;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,35:0.584:60:13,16:11,18:17,8,25,10
chr1	145290351	.	A	G	.	.	DP=76;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=155,170;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,15:0.213:73:27,8:28,7:39,19,9,6
chr1	145290377	.	T	C	.	.	DP=82;ECNT=8;MBQ=26,34;MFRL=136,175;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,26:0.334:79:27,12:26,14:22,31,14,12
chr1	145290398	.	G	A	.	.	DP=96;ECNT=8;MBQ=33,26;MFRL=159,158;MMQ=52,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,20:0.236:87:27,14:38,6:29,38,6,14
chr1	145290401	.	T	G	.	.	DP=90;ECNT=8;MBQ=27,35;MFRL=158,175;MMQ=52,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,12:0.143:89:39,3:36,9:0|1:145290401_T_G:145290401:33,44,4,8
chr1	145290409	.	G	A	.	.	DP=93;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=162,175;MMQ=52,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,13:0.152:90:39,4:36,9:0|1:145290401_T_G:145290401:37,40,4,9
chr1	145290498	.	T	G	.	.	DP=87;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=159,183;MMQ=52,50;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,14:0.178:82:31,5:37,9:34,34,4,10
chr1	145290535	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=160,152;MMQ=60,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,9:0.153:63:23,3:31,6:16,38,2,7
chr1	145290547	.	C	A	.	.	DP=56;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=162,152;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,7:0.140:55:21,2:26,5:11,37,1,6
chr1	145290553	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,14:0.273:53:16,7:22,7:7,32,3,11
chr1	145290560	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=162,138;MMQ=60,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.119:48:19,1:23,4:7,36,1,4
chr1	145290570	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=7;MBQ=32,25;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,12:0.270:46:15,8:19,4:6,28,1,11
chr1	145290583	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=169,230;MMQ=60,33;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:14,0:16,2:3,27,1,1
chr1	145298070	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=214,169;MMQ=40,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:8,2:11,3:16,3,4,1
chr1	145298089	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=212,204;MMQ=25,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,1:5,4:7,3,4,1
chr1	145298095	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=193,231;MMQ=24,29;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:3,3:5,0:5,3,2,1
chr1	145298129	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=170,124;MMQ=38,23;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:145298129_C_CTT:145298129:0,4,0,1
chr1	145298130	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=170,124;MMQ=38,23;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:145298129_C_CTT:145298129:0,4,0,1
chr1	145298416	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=218,226;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr1	145438702	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=236,277;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:9,0,2,0
chr1	145439634	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=141,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:6,13,2,0
chr1	145456732	.	GAA	G,GA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32,32;MFRL=199,144,150;MMQ=60,60,60;MPOS=17,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=5.41,12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,5,7:0.224,0.355:21:2,2,2:4,2,4:2,7,1,11
chr1	145473898	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=181,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.274:27:12,7:8,0:11,9,7,0
chr1	145475584	.	TG	AT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=169,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:9,0:11,13:11,9,0,13
chr1	145475728	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=251,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	145487217	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,3:5,0:8,0,3,0
chr1	145507826	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=211,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:2,3:8,5:3,7,4,5
chr1	145510376	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,238;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	145518051	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.249:30:8,7:15,0:19,4,7,0
chr1	145518092	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=152,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:15,0:25,4:20,20,2,2
chr1	145525223	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=203,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:1,10,0,2
chr1	145530254	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=130,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.280:16:4,3:7,1:4,8,1,3
chr1	145530939	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=172,324;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:3,1:11,2:9,5,3,0
chr1	145532043	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=208,232;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:145532043_TG_T:145532043:1,0,1,0
chr1	145532045	.	TGTG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,15;MFRL=208,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:145532043_TG_T:145532043:1,0,1,0
chr1	145532050	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:145532043_TG_T:145532043:0,0,1,0
chr1	145532994	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.572:12:2,4:2,3:0|1:145532994_GT_G:145532994:4,1,7,0
chr1	145533001	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:0|1:145532994_GT_G:145532994:4,2,8,0
chr1	145533314	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=200,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.628:11:2,4:1,3:2,2,4,3
chr1	145535921	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,3:2,2:2,0,2,3
chr1	145536143	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=199,138;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:6,0:3,7:0|1:145536143_A_C:145536143:3,6,0,7
chr1	145536146	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=199,138;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:6,0:3,6:0|1:145536143_A_C:145536143:3,6,0,7
chr1	145538664	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	145538915	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,0:8,5:3,10,0,5
chr1	145549292	.	AT	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=219,235;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,1,0
chr1	145555653	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:1,8:2,5:3,0,11,2
chr1	145556986	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=182,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:5,0,4,0
chr1	145558565	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr1	145558824	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=208,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.444:18:4,2:6,5:8,2,6,2
chr1	145560918	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=139,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:10,1:5,1:9,6,1,2
chr1	145562073	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:7,1,4,2
chr1	145578792	.	GC	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:14,0:7,2:7,14,0,2
chr1	145579090	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,249;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,0:1,2:2,4,0,2
chr1	145579272	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=191,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,1:7,1:0,9,0,2
chr1	145581644	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:0,0:0,2,0,3
chr1	145585317	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	145586780	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:5,4:7,3:8,4,5,2
chr1	145587250	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr1	145587539	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=262,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:3,5,1,1
chr1	145587631	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=188,266;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.595:3:0,1:1,0:0|1:145587631_G_C:145587631:1,0,1,1
chr1	145587634	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=21,31;MFRL=203,266;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:2,0,1,1
chr1	145587640	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=216,245;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:145587631_G_C:145587631:3,0,1,0
chr1	145587644	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,36;MFRL=216,245;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:145587631_G_C:145587631:3,0,1,0
chr1	145588536	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:3,2:7,11:8,2,2,11
chr1	145589491	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	145597116	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr1	145597417	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	145598459	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,4:0,0,4,2
chr1	145601861	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=52.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,6,11
chr1	145663414	.	G	GCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=203,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	145687100	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=211,278;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:1,6,0,3
chr1	145696694	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr1	145706856	.	A	AAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:145706856_A_AAAT:145706856:0,0,0,1
chr1	145706857	.	C	CAGGAATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:145706856_A_AAAT:145706856:0,0,0,1
chr1	145747133	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=133,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:11,0:12,9,1,1
chr1	145826770	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=195,134;MMQ=57,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr1	146633933	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=134,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	146638519	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=162,110;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:21,0:10,3:10,21,0,3
chr1	146639588	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=196,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,1:3,2:0,9,0,3
chr1	146643492	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:14,0,2,0
chr1	146643495	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,1:6,4:11,0,5,0
chr1	146643555	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.449:36:12,7:7,9:9,11,8,8
chr1	146643580	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.384:37:18,4:5,10:6,17,5,9
chr1	146656040	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,8:4,3:6,2,9,2
chr1	146656097	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=115,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,10:7,3:4,9,6,7
chr1	146673178	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	146680394	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=195,64;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:3,3:6,0:7,2,2,1
chr1	146683873	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=204,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr1	146684131	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,257;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	146685121	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=209,273;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	146687250	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	146696435	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=208,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:5,1,3,0
chr1	146714255	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	146714281	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=237,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	146714392	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=150,182;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,2:3,0:3,1,1,2
chr1	146714427	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=136,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:4,0:0,5:1,3,2,3
chr1	146724408	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=153,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,1:6,6:0,8,3,4
chr1	146728149	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:7,4:4,8:7,5,9,3
chr1	146728162	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=87.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,13,12
chr1	146739039	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=178,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr1	146739068	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=227,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:4,1,2,1
chr1	146739277	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:0,4,0,7
chr1	146740576	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,7:1,3:0,2,0,10
chr1	146747153	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=149,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,2:2,5:0,6,0,7
chr1	146747232	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=247,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr1	146751782	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr1	146756222	.	AAAAC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=99,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAAC;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr1	146759320	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:2,4:2,4:4,0,7,1
chr1	146763089	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr1	146766069	.	C	CAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,3:0,0,6,3
chr1	146766105	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=154,89;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,1:6,2:10,5,3,0
chr1	146767062	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=267,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,0:2,4:4,2,1,3
chr1	147085066	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	147086504	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=204,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:0,4,0,4
chr1	147087721	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=107,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr1	147096794	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=268,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,7:0,4:0,1,0,11
chr1	147096828	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr1	147131005	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=118,147;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.200:43:9,8:26,0:32,3,8,0
chr1	147131465	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr1	147131501	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=117,262;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,1:5,2:3,8,0,3
chr1	147131663	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=122,197;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:5,4,2,0
chr1	147131729	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=202,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:2,0:8,2:6,5,1,1
chr1	147131945	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr1	147230217	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=170,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,0:4,5:6,0,5,0
chr1	147381411	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=202,1122916;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:3,0:1,2:0|1:147381411_C_A:147381411:1,4,2,0
chr1	147381413	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=205,1122916;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.301:8:2,0:2,0:0|1:147381411_C_A:147381411:1,5,2,0
chr1	147381415	.	C	CTTCATTTTTGAAAGT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=207,1122916;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,0:3,0:0|1:147381411_C_A:147381411:0,5,2,0
chr1	147381444	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,36;MFRL=259,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr1	148004475	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=147,253;MMQ=40,22;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr1	148009318	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=220,207;MMQ=40,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,1:12,1:20,5,2,0
chr1	148009349	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=204,181;MMQ=40,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:21,1:10,4:28,3,5,0
chr1	148009510	.	G	A	.	.	DP=135;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,24:0.199:123:55,8:44,15:45,54,12,12
chr1	148252164	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=148,166;MMQ=47,22;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:11,3:4,4:6,9,1,6
chr1	148342066	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,139;MMQ=44,20;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,1:5,3:2,5,0,4
chr1	148644408	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,22;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr1	148644428	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=215,161;MMQ=24,22;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr1	148756347	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,183;MMQ=60,22;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr1	148756397	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=215,115;MMQ=23,23;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	148756448	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=115,188;MMQ=23,23;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,2:1,3:0,3,3,2
chr1	149755813	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=188,156;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,0:5,3:7,4,3,0
chr1	149783975	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=164,384853;MMQ=50,22;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,13:0.207:65:37,0:15,13:14,38,0,13
chr1	149880650	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=205,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	149882087	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,14;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.846:4:0,1:0,0:0|1:149882087_A_C:149882087:0,0,4,0
chr1	149882092	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.831:4:0,2:0,0:0|1:149882087_A_C:149882087:0,0,4,0
chr1	149882097	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.709:5:1,2:0,0:0|1:149882087_A_C:149882087:1,0,4,0
chr1	149882103	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,15;MFRL=96,252;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.560:5:2,0:0,0:0|1:149882087_A_C:149882087:2,0,3,0
chr1	149882105	.	CA	GC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,16;MFRL=96,252;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,0:0,0:0|1:149882087_A_C:149882087:2,0,1,0
chr1	149897701	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:11,9:7,0:10,9,9,0
chr1	149897864	.	TG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=174,278;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:3,0:7,1:9,9,1,1
chr1	149900985	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=244,236;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.416:12:3,3:3,1:5,2,4,1
chr1	149902342	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=158,315;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,1:8,2:12,7,2,1
chr1	149906024	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=196,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,4:7,0:10,4,4,0
chr1	149906167	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=118,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:18,0:11,3:10,19,1,2
chr1	149906272	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=161,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:15,2:4,0:11,8,1,1
chr1	149907175	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=211,258;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,1:3,0:1,8,1,1
chr1	149907259	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:11,6:6,2:9,8,4,4
chr1	149922148	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=219,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr1	149939361	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.239:14:2,1:6,1:3,8,3,0
chr1	149943157	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:4,8,1,1
chr1	150049934	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=198,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr1	150053893	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:6,0:10,3,1,1
chr1	150082563	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,307;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:2,2:6,0:9,1,2,0
chr1	150122493	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	150128425	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=243,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:2,1:3,1:0,5,1,2
chr1	150129267	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	150195530	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.257:33:9,0:16,8:13,12,0,8
chr1	150199039	.	CTCCTCT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=126,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCCTCT;STR;TLOD=32.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.532:17:2,2:6,7:0,8,4,5
chr1	150201638	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150201638_T_TC:150201638:0,0,0,1
chr1	150201657	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=212,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150201638_T_TC:150201638:0,1,0,1
chr1	150235055	.	A	ACTC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,18;MFRL=205,37;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:2,1:2,0:0|1:150235055_A_ACTC:150235055:2,2,1,1
chr1	150235061	.	T	TAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=205,37;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:2,2:2,0:0|1:150235055_A_ACTC:150235055:2,2,1,1
chr1	150235062	.	C	CTCCAGGTACACA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=205,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:2,2:2,0:0|1:150235055_A_ACTC:150235055:2,2,1,1
chr1	150236171	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,272;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:4,1:14,1:11,7,0,2
chr1	150241230	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=193,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.377:24:9,4:6,4:4,11,3,6
chr1	150257152	.	A	AC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=176,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:4,0:4,5:0|1:150257152_A_AC:150257152:0,9,0,5
chr1	150257161	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=185,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:3,0:4,5:0|1:150257152_A_AC:150257152:0,8,0,5
chr1	150258838	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:9,1:6,6:9,6,7,1
chr1	150297350	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=136,66;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:9,1:0,0:0|1:150297350_TA_T:150297350:5,6,2,0
chr1	150297353	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,16;MFRL=139,66;MMQ=60,50;MPOS=-1073741819;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:1,0:0|1:150297350_TA_T:150297350:6,8,2,0
chr1	150297357	.	AG	TT	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=25,15;MFRL=136,66;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:2,0:0|1:150297350_TA_T:150297350:6,9,2,0
chr1	150297360	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=25,16;MFRL=139,66;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:2,0:0|1:150297350_TA_T:150297350:6,10,2,0
chr1	150297363	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,21;MFRL=139,66;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:13,1:2,0:0|1:150297350_TA_T:150297350:6,10,2,0
chr1	150300727	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,3:2,1:6,0,2,2
chr1	150305182	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=104,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.149:31:9,4:17,0:22,5,2,2
chr1	150305374	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=201,165;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.461:22:3,10:8,0:7,5,10,0
chr1	150315719	.	AAAAAAAT	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=137,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:0,1:9,1:9,0,2,0
chr1	150315722	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.580:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr1	150315724	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,0:0,9:0,0,9,0
chr1	150337420	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=155,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.204:37:12,0:18,6:9,21,0,7
chr1	150432870	.	GGTT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GTT;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.717:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	150445819	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=88,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,8:8,2:7,6,6,4
chr1	150471848	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.726:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	150477061	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=136,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:5,1,5,1
chr1	150484395	.	ACC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=176,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=C;STR;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	150524787	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=166,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:12,4,1,1
chr1	150524800	.	A	ACACACGTGATTCAGGATG	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=165,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:13,0:3,2:18,3,1,1
chr1	150524875	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=178,61;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:17,2:13,0:13,17,0,2
chr1	150524878	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=136,252;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:18,2:11,1:11,18,1,2
chr1	150526020	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=153,151;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.194:22:8,0:10,3:7,11,0,4
chr1	150526044	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,3:5,7:4,5,2,8
chr1	150526134	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=125,212;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,0:7,4:3,11,0,4
chr1	150526787	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,21;MFRL=135,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.408:5:2,0:1,1:0|1:150526787_C_A:150526787:3,0,2,0
chr1	150526806	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,10;MFRL=68,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.352:6:1,0:1,0:0|1:150526787_C_A:150526787:3,1,2,0
chr1	150526810	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=68,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:150526787_C_A:150526787:3,1,1,0
chr1	150528090	.	G	GACAC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=AC;STR;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr1	150528118	.	T	TACAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=AC;STR;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	150529322	.	T	TAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr1	150529665	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,12;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:150529665_G_C:150529665:1,0,2,0
chr1	150529669	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=16,33;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0|1:150529665_G_C:150529665:1,0,2,0
chr1	150529673	.	CGGA	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=131,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:150529665_G_C:150529665:2,0,1,0
chr1	150529681	.	AGG	CCC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:150529665_G_C:150529665:2,1,1,0
chr1	150529685	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:150529665_G_C:150529665:2,1,1,0
chr1	150529689	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=150,136;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:150529665_G_C:150529665:2,2,1,0
chr1	150530548	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:11,1:10,1:15,7,1,1
chr1	150531380	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=209,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.815:8:0,2:1,4:1,0,7,0
chr1	150532626	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=211,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.692:21:3,7:3,6:3,3,6,9
chr1	150534614	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.456:35:10,7:8,8:9,10,5,11
chr1	150550019	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=50.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,1,13
chr1	150671243	.	AC	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:2,6:6,7:4,4,4,9
chr1	150676485	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=212,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr1	150676674	.	TA	T,TAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,26,30;MFRL=201,216,194;MMQ=60,60,60;MPOS=14,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=6.67,3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,2:0.358,0.233:10:2,2,1:2,1,1:1,3,2,4
chr1	150679104	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.257:29:7,7:15,0:11,11,7,0
chr1	150679358	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=182,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:0,3,0,4
chr1	150686547	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=149,180;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.314:33:11,9:12,0:12,11,10,0
chr1	150686654	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=132,76;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,0:11,2:8,11,0,2
chr1	150730279	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	150769317	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,0:7,2:6,6,1,1
chr1	150771703	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,17:0,17:0,0,14,20
chr1	150789906	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,2:6,5:7,5,2,5
chr1	150789961	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=103,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:1,2,0,6
chr1	150790313	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=13,16;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:1,0:2,0:0|1:150790313_C_A:150790313:8,0,2,0
chr1	150790318	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=9,11;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:1,0:2,0:0|1:150790313_C_A:150790313:8,0,2,0
chr1	150790321	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=15,23;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:1,0:2,1:0|1:150790313_C_A:150790313:9,0,2,0
chr1	150790340	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:2,0:5,0:0|1:150790313_C_A:150790313:10,0,2,0
chr1	150790345	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,10;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:2,0:4,0:0|1:150790313_C_A:150790313:9,0,2,0
chr1	150799019	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=132,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:19,0:14,3:19,14,3,0
chr1	150804392	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=191,302;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:1,2,3,0
chr1	150804424	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=211,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:150804424_CG_C:150804424:1,3,1,0
chr1	150804429	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=206,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,0,3
chr1	150804431	.	CTC	AAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=174,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:150804424_CG_C:150804424:0,3,1,0
chr1	150825320	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:0|1:150825320_A_T:150825320:3,12,1,1
chr1	150825324	.	T	TATCTCTAGAG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:150825320_A_T:150825320:3,12,1,1
chr1	150848912	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:6,0:3,3:7,3,3,0
chr1	150849071	.	ACC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=C;STR;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.886:5:0,3:0,1:0,0,1,4
chr1	150923774	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=142,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:4,4:0,7:4,0,8,3
chr1	150933658	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,126;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.430:16:5,0:4,5:2,7,0,7
chr1	150938571	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=143,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,4:1,3:5,1,5,2
chr1	150938616	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,8:0,0,9,8
chr1	150939042	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=149,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.107:40:20,3:16,0:22,14,2,2
chr1	150939744	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr1	150940357	.	GC	TT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:7,6:6,6:7,6,5,7
chr1	150941381	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.761:19:1,10:3,4:2,2,13,2
chr1	150958977	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:1,3,0,3
chr1	150970836	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=279,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr1	150972538	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr1	150974162	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=238,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:1,7:1,5:1,1,9,3
chr1	150981267	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	150990466	.	C	CAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=167,248;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr1	150997940	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:2,0,5,3
chr1	150999863	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	151011155	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:4,7,0,2
chr1	151018318	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=125,253;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:5,4:9,0:8,7,0,4
chr1	151026815	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,3,10
chr1	151028234	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,10,13
chr1	151039609	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	151079555	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=159,38;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:5,4,1,1
chr1	151079559	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=142,69;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,0:3,3:3,4,2,1
chr1	151089803	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=105,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:4,4,2,0
chr1	151090795	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=190,107;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:3,0:3,9:0|1:151090795_AG_A:151090795:1,5,0,9
chr1	151090798	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=190,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:3,0:3,9:0|1:151090795_AG_A:151090795:1,5,0,9
chr1	151104950	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,14,0
chr1	151108137	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,10:0,1:0,0,4,7
chr1	151109641	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	151110981	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=168,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:0|1:151110981_CTG_C:151110981:1,2,1,0
chr1	151110985	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=168,214;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,0:1,0:0|1:151110981_CTG_C:151110981:1,2,1,0
chr1	151114882	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr1	151115186	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	151139073	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.280:9:4,2:2,0:0,7,0,2
chr1	151139680	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=129,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:20,4:15,0:20,15,2,2
chr1	151143166	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:1,0:0,7,0,2
chr1	151143408	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,1:4,1:8,2,2,0
chr1	151144057	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=267,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:4,2,8,0
chr1	151146171	.	G	GAACCATGGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	151146186	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr1	151149601	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr1	151209297	.	CTTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.700:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr1	151210789	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=201,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:0,2,1,4
chr1	151237589	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr1	151239570	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=211,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.737:13:2,4:1,6:2,1,6,4
chr1	151252694	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,2:10,1:12,7,3,0
chr1	151278829	.	AG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=155,53;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:7,13,1,1
chr1	151282841	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=205,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:6,1:0,15,0,2
chr1	151288159	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=174,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:5,3:11,0:9,8,1,2
chr1	151288172	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=140,188;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:6,3:4,6:4,7,6,3
chr1	151314379	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=212,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:0,2:2,2:2,1,4,0
chr1	151337788	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=193,242;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:2,4:0,7:0,2,2,9
chr1	151341703	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=142,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,4:1,3:1,2,0,7
chr1	151341728	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=175,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr1	151342812	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,1,1
chr1	151373200	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=106.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,13:0,0,15,14
chr1	151377244	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=251,211;MMQ=60,56;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:151377244_A_C:151377244:1,3,1,0
chr1	151377248	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:151377244_A_C:151377244:0,0,2,3
chr1	151377250	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=251,211;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:151377244_A_C:151377244:1,3,1,0
chr1	151378736	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=90,74;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,4:0.111:43:20,0:15,3:0|1:151378736_C_T:151378736:22,17,2,2
chr1	151378749	.	GGGGT	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=97,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,4:0.100:48:24,0:18,4:0|1:151378736_C_T:151378736:25,19,2,2
chr1	151379818	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:2,6,0,4
chr1	151380505	.	AAAG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAG;STR;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	151380727	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.337:19:11,4:2,1:4,9,2,4
chr1	151381320	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=49.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.860:19:0,4:1,11:0,2,3,14
chr1	151384052	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=136,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:1,1:6,3:6,2,4,0
chr1	151384711	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=228,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	151395782	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	151396037	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,2,10
chr1	151396124	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=214,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	151400942	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,1:1,6:0,1,0,7
chr1	151402045	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=110,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:3,0,7,0
chr1	151492610	.	C	CT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:10,2:5,2:15,0,5,1
chr1	151497140	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:6,3:3,3:2,7,3,5
chr1	151497376	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=196,262;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	151499635	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,8:0,2:0,1,2,8
chr1	151501737	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,285;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	151502396	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=151,314;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,1:4,1:13,4,1,1
chr1	151502427	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,4:5,1:8,3,4,1
chr1	151504778	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	151505008	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=109,72;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:8,4:14,0:10,12,3,1
chr1	151505088	.	CTTT	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=19,19;MFRL=168,266;MMQ=44,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=T;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr1	151505103	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=234,168;MMQ=60,44;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:151505103_T_TG:151505103:0,3,0,1
chr1	151505112	.	CC	TT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=224,168;MMQ=60,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:151505103_T_TG:151505103:0,4,0,1
chr1	151505127	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=185,168;MMQ=60,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:151505103_T_TG:151505103:0,4,0,1
chr1	151507620	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.330:21:9,1:5,1:0,14,7,0
chr1	151512802	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=182,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.279:15:6,1:5,2:9,2,2,2
chr1	151542099	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,5:1,2:6,1,5,2
chr1	151546931	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,3:2,5:0,7,1,7
chr1	151551320	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=125,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:1,4,0,3
chr1	151552301	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,3:4,4:0,4,0,7
chr1	151634803	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,247;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	151665550	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,183;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:9,0:10,9:2,17,0,10
chr1	151665554	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=153,183;MMQ=60,39;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=32.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:5,0:9,9:1,17,0,9
chr1	151666826	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:3,1:8,2,1,1
chr1	151681567	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,2:7,2:7,7,2,2
chr1	151686983	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=188,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:10,0,2,0
chr1	151688298	.	T	TACCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=242,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr1	151688317	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=223,162;MMQ=60,60;MPOS=-1073741814;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,0:3,1:3,2,3,0
chr1	151688328	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=223,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:1,0:3,0:3,2,1,0
chr1	151700189	.	C	CCTG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,5:0,0,0,9
chr1	151700214	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=216,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr1	151701345	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:4,3,0,3
chr1	151733385	.	A	AGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=136,93;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:151733385_A_AGG:151733385:1,2,0,1
chr1	151733387	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=136,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:151733385_A_AGG:151733385:1,2,0,1
chr1	151735582	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:9,1:2,1:1,10,1,1
chr1	151740479	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,2:0,16:0,0,13,5
chr1	151742550	.	GGAGAGA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,47;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=GA;STR;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:151742550_GGAGAGA_G:151742550:0,0,4,1
chr1	151742565	.	GGGAGACCATGGGGAGACGGAGAC	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=106,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.805:8:0,4:1,3:0|1:151742550_GGAGAGA_G:151742550:1,0,5,2
chr1	151742682	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=152,107;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,0:10,2:11,12,0,2
chr1	151747043	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,5:1,6:0,1,5,6
chr1	151747733	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr1	151747799	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr1	151748425	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr1	151751081	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=214,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,5:1,3:1,0,6,2
chr1	151754112	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	151755370	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:9,7,2,0
chr1	151780177	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=182,268;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr1	151789588	.	C	CTG,CTGTGTG,CTGTGTGTG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,35,31,34;MFRL=0,132,181,183;MMQ=60,59,41,40;MPOS=25,13,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,11,13,14;RU=TG;STR;TLOD=3.02,4.99,6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,1,2,4:0.165,0.298,0.469:7:0,1,0,2:0,0,2,1:0,0,7,0
chr1	151789609	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr1	151789611	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=139,150;MMQ=60,41;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:1,0,8,1
chr1	151789647	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=250,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,5:0,5:1,1,8,3
chr1	151802012	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=198,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:2,9,0,2
chr1	151810304	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=196,298;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr1	151810909	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	151811566	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=156,65;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:3,8,1,1
chr1	151811585	.	AG	GC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=163,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:4,0:0|1:151811585_AG_GC:151811585:3,10,1,1
chr1	151811589	.	A	ACTGCATCTGCC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=163,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:6,0:0|1:151811585_AG_GC:151811585:2,9,1,1
chr1	151825991	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=215,117;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:4,7:2,8:0,6,7,8
chr1	152005327	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=182,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:0,3,0,8
chr1	152009530	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	152080631	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:15,0:14,3:14,16,3,0
chr1	152082956	.	GCTC	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=198,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTC;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:5,0:4,2:6,4,1,1
chr1	152086620	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=162,171;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:152086620_T_A:152086620:0,1,0,1
chr1	152086626	.	T	TTCCAACGAAGGCCTCAAAGAGGTCCAAATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=162,171;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:152086620_T_A:152086620:0,1,0,1
chr1	152127279	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=116,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.139:45:19,3:19,2:11,28,2,4
chr1	152185762	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,1598;MMQ=60,53;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0|1:152185762_C_G:152185762:0,0,6,2
chr1	152185768	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,901;MMQ=60,43;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:152185762_C_G:152185762:0,0,2,2
chr1	152185774	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,38;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:152185762_C_G:152185762:0,0,0,2
chr1	152185780	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,38;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:152185762_C_G:152185762:0,0,0,2
chr1	152188176	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=143,210;MMQ=25,25;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.090:53:19,3:30,1:29,20,1,3
chr1	152188463	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,145;MMQ=27,25;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,21:0.391:54:17,10:15,10:17,16,7,14
chr1	152191051	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=165,210;MMQ=60,54;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,1:11,3:10,10,2,2
chr1	152192114	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=126,158;MMQ=34,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:0,18:1,10:1,0,16,13
chr1	152193990	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,2,8
chr1	152195728	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.882:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	152276040	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=159,7670;MMQ=60,29;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:11,3:5,0:8,8,0,3
chr1	152278010	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,0;MFRL=196,97;MMQ=27,22;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.408:20:7,0:5,0:0|1:152278010_T_A:152278010:3,9,8,0
chr1	152278017	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=195,97;MMQ=27,22;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.390:21:7,8:6,0:0|1:152278010_T_A:152278010:4,9,8,0
chr1	152278036	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=154,97;MMQ=27,22;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,8:5,0:7,6,8,0
chr1	152282838	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=173,144;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:16,0:11,2:15,12,2,0
chr1	152283742	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=186,207;MMQ=45,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,1:5,5:4,6,5,1
chr1	152326487	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,188;MMQ=60,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:21,4:13,0:8,26,4,0
chr1	152330166	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=188,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:2,5,0,2
chr1	152384498	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,3:3,0,7,0
chr1	152538358	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=209,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,1:5,3:8,0,4,0
chr1	152538646	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=157,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.240:20:8,1:3,1:7,8,0,5
chr1	152552123	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=180,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:6,2,2,0
chr1	152552461	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=110,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:4,3:10,3:5,9,1,5
chr1	152671778	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:12,6:2,0:8,6,6,0
chr1	152681543	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,10:0,2:0,0,8,4
chr1	152681680	.	C	CAGCTCTGGGGGCTGCTGT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=119,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.365:17:5,3:6,2:6,5,3,3
chr1	152733184	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,0:8,2:12,6,2,0
chr1	152759678	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=185,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:7,0,4,0
chr1	152759950	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=125,152;MMQ=45,37;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:6,2:4,2:5,6,3,1
chr1	153004721	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=203,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,6:1,2:2,1,8,0
chr1	153004778	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=90,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,1:7,2:17,3,2,1
chr1	153004809	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=126,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:8,4:8,3:11,5,3,4
chr1	153066044	.	GTGGGGAAGGTGT	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=184,81;MMQ=52,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,0:8,2:0|1:153066044_GTGGGGAAGGTGT_G:153066044:16,12,0,2
chr1	153066057	.	CACAGGAGGACATTTT	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=213,81;MMQ=53,51;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:12,0:11,2:0|1:153066044_GTGGGGAAGGTGT_G:153066044:15,15,0,2
chr1	153085306	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,276;MMQ=38,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:1,1,0,4
chr1	153122310	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=110,252;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:5,5:1,1:5,1,5,2
chr1	153122620	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=203,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr1	153234602	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	153279462	.	TAAG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	153283004	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=45.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,13:0,3:0,0,17,0
chr1	153283179	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=97,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,6:4,8:3,4,4,10
chr1	153312792	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=176,120;MMQ=60,35;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,4:4,0:6,3,4,0
chr1	153314347	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr1	153315467	.	T	TAAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr1	153315784	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	153317723	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:9,3:7,4:9,7,6,1
chr1	153362788	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=213,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:4,1:3,6:3,4,4,4
chr1	153430249	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=191,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.240:11:4,2:3,0:7,2,2,0
chr1	153509890	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.380:19:5,5:5,2:0|1:153509890_T_C:153509890:4,8,5,2
chr1	153509892	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=175,131;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,8:0.428:19:6,5:4,3:1|0:153509890_T_C:153509890:7,4,2,6
chr1	153517092	.	GC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=179,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:2,2:7,1:7,2,3,0
chr1	153520138	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:6,2:10,3:14,3,3,2
chr1	153520784	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=212,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:2,3:5,1:0|1:153520784_C_A:153520784:7,0,3,1
chr1	153520790	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=212,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:2,4:5,1:0|1:153520784_C_A:153520784:7,0,3,2
chr1	153520804	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=185,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:3,4:5,0:8,1,2,2
chr1	153521018	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr1	153533898	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=132,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,2:9,2:14,4,3,1
chr1	153587308	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr1	153587702	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:8,6:9,2:11,6,4,4
chr1	153587913	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=193,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	153601076	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=200,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,0:6,2:0,8,0,2
chr1	153604112	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=161,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,2:4,4:3,2,2,4
chr1	153609039	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=91,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,3:6,4:5,3,4,3
chr1	153614712	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.461:37:6,5:14,12:15,5,9,8
chr1	153631701	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.305:17:6,0:6,4:6,6,0,5
chr1	153635425	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=158,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,4:0,2:3,0,3,3
chr1	153636468	.	CTA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:4,1:0|1:153636468_CTA_C:153636468:10,0,1,1
chr1	153636471	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:4,1:0|1:153636468_CTA_C:153636468:10,0,1,1
chr1	153640665	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=253,292;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,1,1
chr1	153640827	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=175,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	153654276	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:15,3:15,0:14,16,1,2
chr1	153658187	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=143,73;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:5,1,1,1
chr1	153658767	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	153660514	.	AC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=172,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.250:25:9,3:9,2:4,15,3,3
chr1	153661374	.	CG	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=162,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,1:3,3:7,2,4,0
chr1	153661408	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=192,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.357:16:4,0:4,0:4,6,6,0
chr1	153661414	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.210:16:4,1:4,0:7,6,3,0
chr1	153662331	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:15,0:5,2:0|1:153662331_G_A:153662331:6,14,1,1
chr1	153662340	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,12:0.591:20:5,7:3,5:0|1:153662331_G_A:153662331:2,6,4,8
chr1	153665566	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,10:5,0:7,2,10,0
chr1	153665919	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=265,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,6:2,2:3,4,1,7
chr1	153733254	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,1:7,1:8,1,1,1
chr1	153742142	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=131,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:7,1:5,2:12,0,3,0
chr1	153743289	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=138,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr1	153743317	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr1	153746474	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:2,0:5,7:1,7,1,7
chr1	153750207	.	C	CCTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=224,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:1,2:5,4:0|1:153750207_C_CCTT:153750207:6,0,6,0
chr1	153750214	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=263,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.530:13:2,2:3,5:0|1:153750207_C_CCTT:153750207:6,0,6,1
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chr1	153752320	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=133,28;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:10,1:5,0:0|1:153752314_A_ACATGACATACCTGCTCCCTCTTTGCCTT:153752314:8,7,0,2
chr1	153784666	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.697:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	153790054	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr1	153791165	.	AGAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=217,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr1	153800582	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,0:7,2:7,10,0,2
chr1	153907346	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=184,256;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:6,10,0,2
chr1	153909294	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr1	153912855	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,99;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.229:26:12,4:7,0:11,9,6,0
chr1	153926140	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=155,120;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:6,0:5,8:2,9,0,9
chr1	153926159	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=213,120;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,0:3,9:0,10,0,9
chr1	153941114	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:9,1:10,2:9,11,1,2
chr1	153949135	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=122,355;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.274:13:8,1:2,2:5,5,3,0
chr1	153955345	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=210,152;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,1:6,1:2,7,0,2
chr1	154033329	.	ATAAG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAAG;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	154042656	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=168,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:1,0:2,2:4,0,2,0
chr1	154061855	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr1	154072666	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=117,120;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:4,6,0,2
chr1	154098854	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:7,0:5,11,3,0
chr1	154110733	.	GAA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=145,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.597:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr1	154141908	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:0,7,0,5
chr1	154144673	.	GA	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:13,2:4,3:6,17,2,3
chr1	154144781	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=147,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:14,3:16,0:19,13,3,0
chr1	154145532	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=118,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,3:5,2:5,7,4,1
chr1	154164586	.	G	GACACTTTTACATGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr1	154178079	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=208,149;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:3,2:5,0:2,6,1,2
chr1	154178197	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=256,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr1	154178202	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=256,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	154178821	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=155,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:1,8,1,1
chr1	154185159	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=192,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:154185159_T_C:154185159:0,3,0,1
chr1	154185167	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=192,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:154185159_T_C:154185159:0,3,0,1
chr1	154185190	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=192,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154185190_G_T:154185190:0,1,0,1
chr1	154185192	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=192,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154185190_G_T:154185190:0,1,0,1
chr1	154185195	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=192,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154185190_G_T:154185190:0,1,0,1
chr1	154186918	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=138,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:1,6:12,2:5,9,5,3
chr1	154192463	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=178,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:2,1:4,5:0,6,0,6
chr1	154207834	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:4,1,0,4
chr1	154226450	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,0:9,2:10,10,2,0
chr1	154227239	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=204,245;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,1:8,0,4,0
chr1	154228287	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,3:1,3:0,4,0,6
chr1	154229975	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:154229975_T_C:154229975:0,3,0,1
chr1	154229977	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:154229975_T_C:154229975:0,3,0,1
chr1	154229979	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:154229975_T_C:154229975:0,4,0,1
chr1	154241846	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.101:27:15,0:10,2:13,12,0,2
chr1	154243246	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=235,199;MMQ=40,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:0,1:1,0:0|1:154243246_G_GT:154243246:1,0,2,0
chr1	154243261	.	TTG	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,15;MFRL=173,235;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,0:1,0:1|0:154243246_G_GT:154243246:2,1,1,0
chr1	154243263	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=36,20;MFRL=0,199;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,1:1,0:0|1:154243246_G_GT:154243246:0,1,2,0
chr1	154243271	.	TC	GA,GC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,16,16;MFRL=58,235,173;MMQ=60,40,40;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.39,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.298,0.250:4:1,0,0:1,0,0:1,1,2,0
chr1	154243274	.	TC	AA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,15;MFRL=128,173;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:154243246_G_GT:154243246:2,2,1,0
chr1	154245142	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:9,1:13,3:12,11,4,0
chr1	154247576	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:9,7,0,2
chr1	154247927	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,144;MMQ=60,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,0:11,2:12,8,0,2
chr1	154293675	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=216,155;MMQ=52,51;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,5:0,4:0,1,4,5
chr1	154303705	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=213,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,2:1,4:2,1,1,5
chr1	154305010	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	154305190	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=228,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=83.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.926:24:0,12:1,11:1,0,11,12
chr1	154309884	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:13,4:9,0:0|1:154309884_C_G:154309884:11,12,4,0
chr1	154309894	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=152,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:15,4:10,0:0|1:154309884_C_G:154309884:13,12,4,0
chr1	154310223	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=192,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,3:2,5:0,4,0,8
chr1	154313232	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:2,1,3,2
chr1	154313598	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	154316798	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=195,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:11,9,2,0
chr1	154317281	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=178,94;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=52.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:4,12:4,6:2,6,9,9
chr1	154318172	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=205,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:2,1,3,1
chr1	154318716	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=169,59;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:13,4:4,0:8,9,4,0
chr1	154321072	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr1	154321084	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=368,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.691:8:0,3:2,1:1,1,0,6
chr1	154321663	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=199,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr1	154437600	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=157,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.259:21:7,2:8,3:0|1:154437600_T_G:154437600:10,6,2,3
chr1	154437606	.	GAA	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=127,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.155:30:14,2:9,1:0|1:154437600_T_G:154437600:16,10,1,3
chr1	154437609	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,2:11,0:0|1:154437600_T_G:154437600:16,9,1,1
chr1	154437896	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	154458932	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr1	154459197	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr1	154461511	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=182,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:5,1:4,1:9,0,2,0
chr1	154471615	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=169,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,2:0|1:154471615_G_A:154471615:9,6,1,1
chr1	154471622	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=172,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:154471615_G_A:154471615:11,8,1,1
chr1	154471624	.	AA	TT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=178,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:10,2:0|1:154471615_G_A:154471615:13,8,1,1
chr1	154479657	.	C	CAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,3:0,0,8,2
chr1	154479670	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr1	154492702	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	154493721	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,5,1
chr1	154517385	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=118,63;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,1:3,0:3,7,1,1
chr1	154523588	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	154524973	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:9,4:8,2:5,12,2,4
chr1	154528086	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr1	154548174	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,2:5,3:6,0,4,1
chr1	154557685	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=197,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.370:11:1,2:6,1:6,1,2,2
chr1	154562625	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,365;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr1	154574075	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=237,142;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,3:3,0:6,2,3,0
chr1	154744528	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,3:8,0:10,9,0,3
chr1	154744540	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:9,2:7,0:8,10,1,1
chr1	154744937	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,2:4,3:0,11,0,5
chr1	154832304	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=141,240;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	154832322	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr1	154924015	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,1:7,1:3,7,0,2
chr1	154936227	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=152,110;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:5,4:5,0:0|1:154936227_A_G:154936227:9,7,4,0
chr1	154936230	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=152,110;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:9,4:7,0:0|1:154936227_A_G:154936227:9,7,4,0
chr1	154938106	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:16,0:7,7:12,11,0,7
chr1	154941213	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:13,0:5,2:15,5,1,1
chr1	154960996	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:11,1:15,3:13,13,1,3
chr1	154987697	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=157,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.229:14:5,0:2,0:0|1:154987697_A_C:154987697:3,8,3,0
chr1	154987700	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,13;MFRL=157,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.229:14:6,0:2,0:0|1:154987697_A_C:154987697:3,8,3,0
chr1	154987705	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=193,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:4,5,1,1
chr1	154987706	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=157,218;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:7,0:2,0:0|1:154987697_A_C:154987697:3,6,2,0
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chr1	154988343	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=142,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.370:15:4,1:3,0:2,7,0,6
chr1	155001929	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,3:5,0:1,4,0,3
chr1	155002721	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=197,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.490:20:2,0:8,8:1,9,0,10
chr1	155004236	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=164,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,1:5,1:2,8,0,2
chr1	155006450	.	CC	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,2,1
chr1	155007293	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=186,222;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155007293_C_T:155007293:0,1,0,1
chr1	155007302	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=186,222;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155007293_C_T:155007293:0,1,0,1
chr1	155014426	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=181,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	155020444	.	GCA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=181,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CA;STR;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:3,0:2,3:1,4,0,3
chr1	155028966	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=162,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.293:8:3,0:3,2:0|1:155028966_C_A:155028966:1,5,1,1
chr1	155028970	.	C	CAACCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=162,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:155028966_C_A:155028966:1,5,1,1
chr1	155030364	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=204,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,1:8,1:4,9,2,0
chr1	155034688	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.268:12:5,0:2,2:0|1:155034688_A_C:155034688:1,8,3,0
chr1	155034690	.	CTAAG	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.205:16:7,0:2,3:0|1:155034688_A_C:155034688:3,10,3,0
chr1	155034697	.	GG	CC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:9,0:4,0:0|1:155034688_A_C:155034688:3,10,2,0
chr1	155051431	.	CGCT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCT;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,1:5,1:9,1,1,1
chr1	155057499	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr1	155058579	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:0|1:155058579_T_TG:155058579:0,7,3,0
chr1	155058584	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:3,1:7,2:0|1:155058579_T_TG:155058579:1,10,3,0
chr1	155058588	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:2,1:7,1:0|1:155058579_T_TG:155058579:1,9,3,0
chr1	155058590	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:2,1:6,1:0|1:155058579_T_TG:155058579:2,9,3,0
chr1	155058595	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=154,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:3,1:11,0:0|1:155058579_T_TG:155058579:4,10,2,0
chr1	155105882	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=188,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	155106550	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=47,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,5:2,7:1,3,4,8
chr1	155108287	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=196,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:2,2:3,1:2,3,2,2
chr1	155108663	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr1	155109483	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=231,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:0,11,0,2
chr1	155142210	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=113,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.576:17:2,2:5,7:6,1,7,3
chr1	155142229	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=110,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:3,5:9,7:10,2,9,3
chr1	155142262	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=100,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:17,0:16,2:26,7,2,0
chr1	155152084	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=127,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:2,6,0,2
chr1	155165047	.	T	TC	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.278:23:12,3:3,2:0|1:155165047_T_TC:155165047:1,16,6,0
chr1	155165059	.	GG	CC	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.316:20:7,3:5,1:0|1:155165047_T_TC:155165047:1,13,6,0
chr1	155165067	.	GG	CC	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.248:18:7,2:5,1:0|1:155165047_T_TC:155165047:1,13,4,0
chr1	155165071	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=29,12;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.275:16:7,1:5,0:0|1:155165047_T_TC:155165047:0,12,4,0
chr1	155165076	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.275:16:7,3:5,0:0|1:155165047_T_TC:155165047:0,12,4,0
chr1	155165078	.	TA	CC	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.275:16:7,2:5,0:0|1:155165047_T_TC:155165047:0,12,4,0
chr1	155169521	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=185,169;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:155169521_A_G:155169521:4,0,1,0
chr1	155169524	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=185,169;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:155169521_A_G:155169521:4,0,1,0
chr1	155171036	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=198,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=50.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:5,0:9,18:2,12,0,18
chr1	155174881	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=139,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,0:13,3:15,14,0,3
chr1	155175892	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=224,248;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	155178500	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	155180279	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,77;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:16,3:15,0:19,13,3,0
chr1	155181843	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=188,210;MMQ=43,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,5:1,0:6,0,4,1
chr1	155182164	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=198,206;MMQ=52,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.154:23:7,1:13,2:9,11,2,1
chr1	155183010	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=235,261;MMQ=27,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155183010_C_T:155183010:0,1,0,1
chr1	155183016	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=235,261;MMQ=27,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155183010_C_T:155183010:0,1,0,1
chr1	155183023	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,261;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:155183010_C_T:155183010:0,0,0,1
chr1	155184975	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=122,187;MMQ=27,33;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.504:8:1,1:3,3:2,2,0,4
chr1	155194531	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=176,188;MMQ=45,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr1	155194679	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:12,3:6,4:4,14,3,4
chr1	155205669	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,4:0,0,2,5
chr1	155209360	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=133,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:5,0:7,2:8,4,3,0
chr1	155217812	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=146,85;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:7,6:6,0:0|1:155217812_A_C:155217812:12,3,6,0
chr1	155217815	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=146,85;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:7,6:8,0:0|1:155217812_A_C:155217812:12,3,6,0
chr1	155218168	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=149,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:9,2:10,2:12,7,2,2
chr1	155218365	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=182,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr1	155224091	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=180,323;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:9,1,1,1
chr1	155224301	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,201;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:1,6,1,2
chr1	155224761	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=212,240;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:0,1:0|1:155224761_A_C:155224761:0,1,0,1
chr1	155224762	.	C	CGTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=212,240;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:0,1:0|1:155224761_A_C:155224761:0,1,0,1
chr1	155224766	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,26;MFRL=212,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:0,1:0|1:155224761_A_C:155224761:0,1,0,1
chr1	155231545	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,256;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,1:11,1:1,17,1,1
chr1	155231877	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,105;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:19,0:12,3:14,18,0,3
chr1	155254532	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,0:10,3:8,9,2,1
chr1	155271200	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=153,87;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:15,0:0|1:155271200_G_A:155271200:17,8,0,2
chr1	155271204	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=153,87;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:15,0:0|1:155271200_G_A:155271200:17,8,0,2
chr1	155289545	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=150,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.225:38:13,3:17,5:14,16,4,4
chr1	155294772	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=88.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,16:0,0,12,13
chr1	155311658	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,0,2
chr1	155313047	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr1	155330245	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=164,72;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:2,2:0|1:155330245_T_G:155330245:1,5,1,1
chr1	155330266	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=142,72;MMQ=56,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0|1:155330245_T_G:155330245:0,4,1,1
chr1	155385689	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,1:8,2:6,13,3,0
chr1	155429725	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=160,251;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:1,7,1,1
chr1	155450991	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=197,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:5,5,1,1
chr1	155451205	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=193,48;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:5,4,1,1
chr1	155491266	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,1:7,1:6,8,0,2
chr1	155581311	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=141,241;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,1:5,2:6,8,2,1
chr1	155630752	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=201,234;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr1	155679543	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.404:8:3,2:0,1:3,2,2,1
chr1	155686739	.	CAA	C,CA,CAAAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35,34,28;MFRL=127,211,119,87;MMQ=60,60,60,50;MPOS=26,17,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,15,16,19;RU=A;STR;TLOD=3.05,4.15,3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,3,2:0.186,0.274,0.267:9:2,2,2,2:0,0,1,0:2,0,5,2
chr1	155695904	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,17;MFRL=149,286;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr1	155701055	.	CA	C,CAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35,23;MFRL=183,194,218;MMQ=60,60,60;MPOS=15,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=7.63,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,2:0.421,0.289:8:2,3,1:0,1,0:2,0,4,2
chr1	155733307	.	G	GCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=156,121;MMQ=58,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:155733307_G_GCC:155733307:2,2,0,1
chr1	155733308	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=156,121;MMQ=58,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:155733307_G_GCC:155733307:2,2,0,1
chr1	155736345	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=164,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:7,10,1,1
chr1	155737425	.	AACAC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,226;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=AC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	155746340	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=188,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.732:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr1	155747369	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:2,3:9,1:9,3,3,1
chr1	155753676	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,5,11
chr1	155785578	.	CAACT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=95.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,12:0,0,13,9
chr1	155785789	.	T	TAAATAAACAAACTTCTTATAACCTGAATGACAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=181,192;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	155786128	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=233,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=34.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,0:2,13:0,5,0,13
chr1	155796746	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:10,9,0,2
chr1	155823002	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	155838639	.	G	GGAATTGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=217,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:155838639_G_GGAATTGCT:155838639:0,1,0,1
chr1	155838643	.	A	ACGTTGGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=217,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:155838639_G_GGAATTGCT:155838639:0,1,0,1
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chr1	155880760	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.932:13:1,6:0,6:0,1,1,11
chr1	155899020	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.910:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr1	155903408	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=310,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,7:0,4:2,0,4,7
chr1	155917880	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr1	155921435	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=181,81002738;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:4,7,2,0
chr1	155927752	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=203,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr1	155928232	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0|1:155928232_T_C:155928232:0,0,5,9
chr1	155928242	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,5:0,6:0|1:155928232_T_C:155928232:0,0,3,9
chr1	155931368	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=266,246;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr1	155934683	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=155,202;MMQ=50,45;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	155934707	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,15;MFRL=154,150;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:2,1:2,1,4,0
chr1	155935244	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,1:7,4:0,12,2,3
chr1	155981529	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=184,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,3:3,0:8,0,3,0
chr1	156011444	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=126,179;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:4,5:1,9:1,4,3,11
chr1	156011469	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=187,141;MMQ=60,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:7,0:8,1:3,12,1,1
chr1	156012511	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=242,520;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,3,1
chr1	156107441	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=212,233;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:5,0:4,3,3,0
chr1	156131050	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	156132909	.	GCA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,383;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr1	156142524	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=211,236;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,7:3,0:4,0,0,7
chr1	156142537	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=202,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,7:3,0:4,0,0,7
chr1	156145360	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=159,99;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,5:7,0:9,6,5,0
chr1	156169610	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=104,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	156182710	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:2,0:6,2:8,0,2,0
chr1	156203399	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=186,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,0:0,4:3,0,3,1
chr1	156203605	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=176,115;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:156203605_C_T:156203605:0,4,0,1
chr1	156203614	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=176,115;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:156203605_C_T:156203605:0,4,0,1
chr1	156206121	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=195,196;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,2:6,2:8,8,3,1
chr1	156206158	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.443:20:5,2:6,5:7,4,3,6
chr1	156206297	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,0:4,4:0,8,0,4
chr1	156209319	.	T	TCTGTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=150,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:13,0:12,8,1,1
chr1	156215562	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=184,300;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr1	156219450	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,5:1,2:3,1,5,2
chr1	156230141	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=189,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr1	156230206	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=162,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:7,2,3,2
chr1	156231266	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=183,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr1	156231283	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=186,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:0,7,0,2
chr1	156237516	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=202,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:0|1:156237516_G_A:156237516:0,6,1,1
chr1	156237517	.	G	GTTT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=201,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0|1:156237516_G_A:156237516:0,7,1,1
chr1	156237520	.	G	GTT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=201,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:4,0:0|1:156237516_G_A:156237516:0,7,1,1
chr1	156247907	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=209,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:1,6,0,3
chr1	156255833	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,3:0,0,0,9
chr1	156256000	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=162,333;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,2:6,0:5,2,1,1
chr1	156263097	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=166,239;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:4,4,1,1
chr1	156265439	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=180,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.433:30:9,6:8,6:10,7,6,7
chr1	156280296	.	GATAA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ATAA;STR;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr1	156280934	.	AGGAGAACATTGCGACACACTTGCATGGCATCCTGGAGGTTGCGTTCTACTTCCTT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=175,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:8,0:5,2:10,14,1,1
chr1	156281020	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=205,242;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr1	156287403	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=133,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr1	156303527	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=249,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	156304488	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=123,138;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:8,4:5,0:9,4,4,0
chr1	156304782	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:3,3:0,1:1,3,0,4
chr1	156308031	.	GGA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GA;STR;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,0:3,3:2,6,1,2
chr1	156347834	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,1:3,5,5,3
chr1	156351792	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=233,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:2,3,2,5
chr1	156352447	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr1	156354347	.	TC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=112,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.282:16:6,3:6,1:4,8,0,4
chr1	156354367	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.784:12:1,4:1,5:0,2,3,7
chr1	156374256	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=156,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:2,1,3,0
chr1	156437482	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:6,0:4,12:3,7,0,12
chr1	156446242	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,12,7
chr1	156449656	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=218,83;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr1	156496188	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr1	156496417	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=123,110;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.232:14:3,0:8,2:2,9,0,3
chr1	156498673	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=166,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr1	156500128	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=182,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr1	156502991	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=77,252;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,0:1,5:0,2,0,5
chr1	156503541	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.944:15:0,6:0,8:0|1:156503541_T_C:156503541:0,0,11,4
chr1	156503560	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:4,2:4,5:0|1:156503541_T_C:156503541:5,3,4,3
chr1	156504937	.	T	TGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=4,19;RU=G;STR;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.410:17:4,1:5,0:9,1,0,7
chr1	156505061	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=186,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:3,9:1,3:0,4,2,10
chr1	156509552	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	156520173	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr1	156524221	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=101,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,5:3,1:2,5,0,6
chr1	156526234	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr1	156526564	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=157,233;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:1,2:5,3:1,6,0,5
chr1	156531871	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	156532344	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,1:7,5:8,4,3,3
chr1	156532908	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.363:25:9,4:7,4:12,4,3,6
chr1	156534525	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=261,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:2,0:8,3:2,8,0,3
chr1	156534539	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=235,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:0,8,0,2
chr1	156536123	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.896:17:0,6:1,10:0|1:156536123_T_C:156536123:1,0,15,1
chr1	156536133	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=71.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0|1:156536123_T_C:156536123:0,0,15,2
chr1	156536353	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr1	156539154	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,9,8
chr1	156539335	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=124,123;MMQ=60,44;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr1	156551228	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.289:29:11,0:10,8:9,12,0,8
chr1	156553102	.	AG	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.681:26:4,8:4,10:5,3,12,6
chr1	156553762	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr1	156562008	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,8,11
chr1	156562143	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,18,7
chr1	156563898	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,4:0,13:0,0,3,14
chr1	156564922	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=296,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr1	156565049	.	A	AAC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,10:0,18:0,0,8,20
chr1	156565834	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,6:4,6:5,1,7,5
chr1	156593560	.	G	GTGAGGGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=186,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:4,0,0,1
chr1	156594364	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=173,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr1	156617968	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	156621500	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	156626920	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	156628717	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=319,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:1,2,7,0
chr1	156639671	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=25,31;MFRL=177,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:4,4:0,4:0|1:156639671_A_C:156639671:0,4,9,0
chr1	156639674	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=32,26;MFRL=177,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:4,5:0,3:0|1:156639671_A_C:156639671:0,4,9,0
chr1	156639677	.	CAG	C	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=176,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:4,5:0,4:0|1:156639671_A_C:156639671:0,5,9,0
chr1	156639683	.	C	CCCCCG	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=173,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:6,4:0,2:0|1:156639671_A_C:156639671:0,6,8,0
chr1	156639684	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=30,23;MFRL=173,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:6,2:0,1:0|1:156639671_A_C:156639671:0,6,8,0
chr1	156639688	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=29,20;MFRL=173,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:6,1:0,2:0|1:156639671_A_C:156639671:0,6,6,0
chr1	156639692	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=29,19;MFRL=172,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:6,0:1,2:0|1:156639671_A_C:156639671:1,6,5,0
chr1	156639697	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=29,12;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.330:10:6,0:1,0:0|1:156639671_A_C:156639671:1,6,3,0
chr1	156640678	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:1,5,1,1
chr1	156646668	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	156670388	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=154,164;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:8,0:4,4:7,5,0,4
chr1	156670545	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr1	156698866	.	TCGCTCCCCG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=174,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:10,0,2,0
chr1	156704328	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=239,150;MMQ=60,41;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.432:5:1,0:2,1:0,3,0,2
chr1	156706559	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,2,5
chr1	156707461	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=201,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:12,2:5,1:9,8,1,2
chr1	156707775	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=99.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,19:0,10:0,0,22,8
chr1	156708244	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=192,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:11,6:6,3:8,9,5,4
chr1	156721032	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=213,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:0,3:2,1:2,0,5,0
chr1	156752231	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=206,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	156761618	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=155,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,1:2,2:3,4,2,1
chr1	156785083	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=176,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:1,0:8,11:1,8,0,12
chr1	156785762	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=195,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:3,4:4,5:0|1:156785762_AG_A:156785762:2,5,4,5
chr1	156785771	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=188,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:4,4:4,4:0|1:156785762_AG_A:156785762:3,5,4,5
chr1	156785779	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=308,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:0,9:2,8:1,1,9,8
chr1	156812066	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=200,251;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,0:0,3:0|1:156812066_A_T:156812066:0,2,0,4
chr1	156812072	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=200,251;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.627:6:2,0:0,3:0|1:156812066_A_T:156812066:0,2,0,4
chr1	156814478	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=218,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,0:3,2:5,9,2,0
chr1	156823600	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=200,25661885;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,2:8,0:4,8,1,1
chr1	156838141	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,35;MFRL=292,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.530:2:0,1:0,0:0,1,1,0
chr1	156875092	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=194,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,5:0,0:0|1:156875092_G_A:156875092:1,0,4,1
chr1	156875097	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=194,223;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,5:0,0:0|1:156875092_G_A:156875092:1,0,4,1
chr1	156875107	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=181,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:1,4:1,1:0|1:156875092_G_A:156875092:2,0,4,2
chr1	156875985	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=223,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:0,3:0,1,3,0
chr1	156878887	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:4,2:3,0:0,9,0,2
chr1	156879504	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr1	156881959	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=217,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr1	156883617	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=139,272;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:10,5:5,0:5,10,2,3
chr1	156884365	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=208,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:2,3:0,3:2,0,6,0
chr1	156884399	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:8,2:5,1:12,1,2,1
chr1	156894353	.	C	CCCGG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=299,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0|1:156894353_C_CCCGG:156894353:2,1,6,0
chr1	156894356	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=299,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:1,3:0,1:0|1:156894353_C_CCCGG:156894353:2,1,6,0
chr1	156894363	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=371,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,3:0,2:0|1:156894353_C_CCCGG:156894353:0,1,6,0
chr1	156894367	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=371,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0|1:156894353_C_CCCGG:156894353:0,1,6,0
chr1	156894825	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.222:19:9,2:5,1:4,11,1,3
chr1	156897350	.	AGGCGCTGTCCACG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=148,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:5,7,1,1
chr1	156899592	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=118,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:2,5,0,2
chr1	156901888	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=178,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:0,8,0,4
chr1	156902222	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.303:17:8,3:4,1:7,5,3,2
chr1	156902254	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,3:6,0:8,8,0,3
chr1	156902259	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,7:2,4:4,4,4,7
chr1	156902281	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=178,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,7:7,0:4,11,1,6
chr1	156906065	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,0:5,3:2,6,0,3
chr1	156906881	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=265,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:3,3,0,2
chr1	156907031	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=122,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,3:4,4:5,5,5,2
chr1	156909303	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=184,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	156912564	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=92,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:10,1:5,1:6,9,0,2
chr1	156914070	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=287,221;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:2,3,4,0
chr1	156914172	.	CCT	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=143,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:0|1:156914172_CCT_C:156914172:7,7,1,1
chr1	156914180	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=152,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,1:6,0:0|1:156914172_CCT_C:156914172:8,7,1,1
chr1	156914183	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=175,62;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,1:6,0:0|1:156914172_CCT_C:156914172:7,7,1,1
chr1	156914240	.	CCATTCATT	C,CCATT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,35,34;MFRL=241,179,130;MMQ=60,60,60;MPOS=23,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,6,7;RU=CATT;STR;TLOD=15.57,6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.517,0.296:7:1,0,1:0,4,1:1,0,2,4
chr1	156916027	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	156925435	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=198,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:2,2,4,0
chr1	156928776	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=210,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:7,3:9,3:13,3,4,2
chr1	156929023	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=152,268;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr1	156939175	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:1,3:9,2:5,5,0,5
chr1	156941412	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=241,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr1	156946898	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,1,2
chr1	156947902	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=205,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:9,0,2,0
chr1	156947928	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=173,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:5,1:7,2:12,1,3,0
chr1	156947953	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=85,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,1:9,3:12,4,4,0
chr1	156948021	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=173,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.242:33:8,6:16,0:8,17,1,7
chr1	156948049	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=136,138;MMQ=60,43;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.282:37:17,0:9,10:10,17,0,10
chr1	156954267	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:4,7,0,2
chr1	157062364	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr1	157062594	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:8,5:6,2:5,9,1,6
chr1	157062696	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:1,7:7,3:4,4,3,8
chr1	157485561	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=136,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,4:1,4:3,1,5,3
chr1	157485720	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,11,9
chr1	157491173	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=198,289;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr1	157508801	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=215,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,6:3,3:4,1,9,0
chr1	157509025	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,225;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:3,8:1,7:0,4,9,6
chr1	157522016	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=196,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,2:5,1:9,0,3,0
chr1	157545231	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=267,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:5,0,5,0
chr1	157548669	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=244,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:4,5:0,5:2,2,4,6
chr1	157550066	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=129,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:13,4:6,3:11,8,2,5
chr1	157557957	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=254,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr1	157566019	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,1:0,4:2,0,5,0
chr1	157566211	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=191,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:0,4,2,3
chr1	157567751	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,12,9
chr1	157652929	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=265,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.686:11:0,5:3,3:2,1,7,1
chr1	157669580	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:7,1:0,4:1,6,2,3
chr1	157718283	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:1,0,7,1
chr1	157718430	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=185,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:4,0:5,5:5,4,3,2
chr1	157718486	.	C	CTAGAGT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=197,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:0|1:157718486_C_CTAGAGT:157718486:2,4,1,1
chr1	157718490	.	A	AATCTATTTTCTTGCTAC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=197,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.292:8:2,1:4,0:0|1:157718486_C_CTAGAGT:157718486:2,4,1,1
chr1	157718645	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=200,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,1:2,3:2,5,2,2
chr1	157718780	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:3,4,1,4
chr1	157718835	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr1	157737504	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=122,255;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	157738435	.	C	CCCCCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=138,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:1,2:8,0:3,6,1,1
chr1	157738539	.	GAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=250,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr1	157740186	.	GTC	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=158,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:4,1:5,2:0|1:157740186_GTC_G:157740186:6,4,1,3
chr1	157740189	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=158,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:4,2:6,2:0|1:157740186_GTC_G:157740186:6,4,1,3
chr1	157767056	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=193,251;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	157772060	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=225,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:1,5,0,2
chr1	157802979	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr1	157806006	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	157811392	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,17,7
chr1	158054379	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=165,241;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:0,9,1,1
chr1	158056299	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=203,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr1	158058109	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=213,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.907:20:1,4:0,11:1,0,11,8
chr1	158151609	.	T	TTCTTCAAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=189,314;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:158151609_T_TTCTTCAAAG:158151609:2,1,0,1
chr1	158151611	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=189,314;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:158151609_T_TTCTTCAAAG:158151609:2,1,0,1
chr1	158152685	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=144,96;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:10,0:17,3:19,8,3,0
chr1	158152850	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=149,92;MMQ=60,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.239:27:9,0:12,6:8,13,1,5
chr1	158153996	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	158224575	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:2,6,0,2
chr1	158226667	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,172;MMQ=52,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,1:12,2:9,12,2,1
chr1	158227452	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=113,220;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:14,4:19,0:11,23,4,0
chr1	158260878	.	CTT	C,CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31,29;MFRL=141,169,175;MMQ=60,60,60;MPOS=25,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=4.39,5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,3:0.256,0.281:13:4,1,1:3,2,2:5,2,6,0
chr1	158298679	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:1,2:9,1:7,4,3,0
chr1	158325891	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=183,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:7,1:5,3:2,10,2,2
chr1	158368392	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=186,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,2:7,1:8,2,2,1
chr1	158369188	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=174,129;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:3,7,0,2
chr1	158369319	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=160,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr1	158389630	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=159,205;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr1	158389659	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=146,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:7,5,3,0
chr1	158435250	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr1	158435278	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=178,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr1	158436299	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=186,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,2:2,2:2,6,1,3
chr1	158436354	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=251,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr1	158517142	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,7:5,2:3,5,4,5
chr1	158532405	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=197,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:6,4:6,4:11,2,5,3
chr1	158549492	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=135,172;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:4,4:7,5:5,6,5,4
chr1	158549511	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,8:6,3:5,5,5,6
chr1	158549627	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=172,125;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:7,3:8,0:8,7,3,0
chr1	158582543	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0|1:158582543_G_A:158582543:3,0,4,0
chr1	158582552	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=116,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0|1:158582543_G_A:158582543:3,0,4,0
chr1	158582838	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=186,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr1	158584091	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=197,252;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,2:6,3:4,6,1,5
chr1	158584101	.	A	AAT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=187,259;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.219:15:5,2:7,1:4,8,0,3
chr1	158584103	.	GA	G,GAA,AA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=10,18,29,25;MFRL=149,211,202,259;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,9,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=4.66,15.50,4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,5,3:0.196,0.412,0.201:12:0,0,2,2:0,0,1,1:0,2,1,9
chr1	158585230	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,5:4,3:0,5,1,7
chr1	158587784	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr1	158595824	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=290,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr1	158595842	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=197,226;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	158606449	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,210;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:6,13,1,2
chr1	158607788	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	158612548	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=162,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:4,2,1,4
chr1	158618223	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=219,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	158618455	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:1,1,2,5
chr1	158619728	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,6,13
chr1	158619822	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:0,4,0,4
chr1	158627383	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=134,45824;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,0:9,3:8,11,3,0
chr1	158631171	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=153,202;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:2,7:7,1:3,6,3,5
chr1	158644105	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,3:5,4:6,2,6,1
chr1	158647631	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr1	158647669	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:0,7,2,3
chr1	158654852	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=141,253;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,1:6,2:7,1,1,2
chr1	158655162	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	158656347	.	C	CAGAG,CAGAGAGAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33,34;MFRL=0,289,215;MMQ=60,60,60;MPOS=31,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,11,13;RU=AG;STR;TLOD=3.72,3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.443,0.429:2:0,1,0:0,0,1:0,0,0,2
chr1	158725427	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=106,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:12,3:19,0:17,14,3,0
chr1	158735691	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:2,6:5,7:3,4,5,8
chr1	158747506	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=226,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:1,6,0,3
chr1	158908886	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=182,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,2:2,1:6,3,3,0
chr1	158909164	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,16,8
chr1	158913525	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,5:0,0,12,4
chr1	158913532	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=122,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,5:6,1:8,2,3,3
chr1	158984651	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,73;MMQ=60,44;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.147:45:22,0:17,6:17,22,1,5
chr1	158985652	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=164,294;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:10,2:8,2:13,5,3,1
chr1	158985831	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=153,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:5,2:16,0:3,18,0,2
chr1	158986225	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	158986477	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,40:0.855:46:5,22:1,18:0,6,24,16
chr1	158986561	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=163,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,1:9,2:1,17,2,1
chr1	158987941	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=213,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,4,0
chr1	158990412	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=256,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	159002222	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=199,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr1	159002301	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=225,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:7,0,4,0
chr1	159002557	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=233,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,2:4,5:0,5,0,7
chr1	159002577	.	TGGATTG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=233,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,2:4,4:0,5,0,6
chr1	159163119	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=232,257;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr1	159166612	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=165,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr1	159174824	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,2,13
chr1	159174885	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=168,348;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr1	159275706	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=190,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	159284490	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=189,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:0,7,1,2
chr1	159409533	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=108,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,0:1,5:3,1,4,1
chr1	159409584	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,1:7,1:10,4,2,0
chr1	159410278	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=153,47;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:13,1:11,1:16,9,0,2
chr1	159410340	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=131,254;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.268:12:4,0:5,2:2,7,2,1
chr1	159684186	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=137,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.569:33:8,5:6,13:4,10,6,13
chr1	159750802	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=334,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	159778699	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=223,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.315:10:4,0:3,2:7,0,3,0
chr1	159779122	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.502:12:2,2:3,4:1,5,3,3
chr1	159785370	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,266;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,2:6,3:5,7,3,2
chr1	159799599	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=45.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,4:0,0,10,5
chr1	159802627	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=293,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.176:21:11,0:2,3:17,1,2,1
chr1	159803114	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=116,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:10,2:12,4:10,12,2,4
chr1	159804940	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=121,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,4:5,2:5,6,5,1
chr1	159810958	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.301:27:11,0:8,7:10,9,1,7
chr1	159825061	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=184,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,0:2,2:3,4,0,2
chr1	159825916	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:1,7,1,1
chr1	159827703	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=178,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,2:8,0:9,8,0,2
chr1	159828128	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,2:2,8:1,4,3,7
chr1	159828746	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	159832425	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=201,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	159842691	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:2,2:3,1:6,0,3,0
chr1	159846280	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:4,4:8,0:12,0,4,0
chr1	159854392	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=224,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.770:14:1,4:1,7:1,2,4,7
chr1	159858290	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=206,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,5:2,2:1,5,3,4
chr1	159860259	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.572:33:10,5:4,14:10,4,15,4
chr1	159860488	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=194,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:1,6,0,5
chr1	159889686	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=237,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	159897126	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=179,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:8,4:8,6:11,5,7,3
chr1	159897327	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:15,3:9,1:9,15,1,3
chr1	159897681	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,30,28,27;MFRL=144,132,104,146;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,18,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.24,7.47,9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,4,5,6:0.238,0.315,0.354:16:1,1,4,1:0,3,1,5:0,1,3,12
chr1	159902526	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=273,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	159904202	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=210,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:8,4:9,3:9,8,3,4
chr1	159922369	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,5:0,0:0,0,0,6
chr1	160012406	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=294,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	160057697	.	A	ACTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:160057697_A_ACTC:160057697:0,1,0,1
chr1	160057698	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,23;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:160057697_A_ACTC:160057697:0,1,0,1
chr1	160057701	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:160057697_A_ACTC:160057697:0,1,0,1
chr1	160090674	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,6:0,10:0,0,14,2
chr1	160090681	.	CCCTT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,7:0,14:0,0,19,2
chr1	160091136	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,2:1,1:0,6,0,3
chr1	160093222	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,8:0,0,3,13
chr1	160093911	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	160093927	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=260,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:0,5,1,1
chr1	160095127	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=179,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr1	160097315	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,2:1,2:5,2,3,1
chr1	160097666	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr1	160098927	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=254,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=38.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.862:12:0,5:1,6:1,0,4,7
chr1	160105367	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=160,196;MMQ=55,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,3:3,5:3,4,7,1
chr1	160109408	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=116,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.448:7:1,2:1,1:3,1,3,0
chr1	160109636	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,1:0,4:2,1,3,2
chr1	160109656	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:2,1:0,2:1,2,2,1
chr1	160109788	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=197,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:1,4:3,1:2,2,2,4
chr1	160109835	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	160111217	.	C	CCAAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,0:7,2:0,10,0,2
chr1	160121873	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=185,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,3:8,4:9,6,5,2
chr1	160121899	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=108,154;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:5,2:9,5:9,5,3,4
chr1	160124875	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,7:0,0,8,11
chr1	160124904	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=147,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.336:21:8,1:6,0:2,12,7,0
chr1	160124907	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=137,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.204:22:7,0:7,0:4,14,4,0
chr1	160128994	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr1	160136225	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=200,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr1	160137300	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	160140950	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=195,309;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr1	160140998	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=189,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:8,2:5,3:7,6,5,0
chr1	160141164	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=183,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,1:11,1:6,10,1,1
chr1	160141196	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,8,8
chr1	160141222	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=190,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:4,8,2,0
chr1	160141268	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=148,241;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:2,2:8,3:3,7,1,4
chr1	160141285	.	CC	TG	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:5,1:3,6,1,2
chr1	160141286	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=161,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.484:12:3,3:3,3:3,3,1,5
chr1	160141636	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=222,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	160146173	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=229,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:4,3:3,3,2,1
chr1	160147502	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=162,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.282:12:4,0:4,2:0|1:160147502_T_G:160147502:0,9,0,3
chr1	160147510	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:0|1:160147502_T_G:160147502:0,10,0,4
chr1	160151421	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=218,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:5,1:7,2,4,0
chr1	160151450	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=129,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:4,4:8,1:5,7,3,2
chr1	160151624	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=205,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,6:3,3:1,5,6,3
chr1	160163446	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	160163449	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=157,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:5,1:0,2:5,0,3,0
chr1	160163509	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,4:2,4:4,2,5,3
chr1	160168368	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr1	160178356	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,9,2
chr1	160181518	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.264:16:4,0:5,0:4,8,0,4
chr1	160182974	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=200,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:10,3:5,2:8,7,1,4
chr1	160195360	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,71;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:0|1:160195360_C_T:160195360:7,5,1,1
chr1	160195366	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=166,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:5,2:0|1:160195360_C_T:160195360:7,6,1,1
chr1	160267555	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,0:7,2:0,9,0,2
chr1	160275434	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=134,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.486:16:3,3:5,3:3,5,4,4
chr1	160281748	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=156,92;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:8,5:10,0:10,8,5,0
chr1	160295462	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=121,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:6,1:14,2:7,13,1,2
chr1	160309664	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=155,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,2:8,1:8,6,2,1
chr1	160313330	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,309;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:11,0:4,3:6,9,2,1
chr1	160318940	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:2,5,1,3
chr1	160321656	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=186,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,1:3,1:2,4,0,2
chr1	160322580	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=202,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,10:3,0:6,0,10,0
chr1	160322700	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:9,3:18,0:11,16,3,0
chr1	160322904	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,1:10,1:10,5,1,1
chr1	160341514	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:7,4,2,0
chr1	160341680	.	GAA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.224:11:4,2:4,0:5,4,1,1
chr1	160390179	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,3,1
chr1	160394173	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=235,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,4:2,0:0,6,0,4
chr1	160458782	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=172,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:2,0:0,3:2,0,4,0
chr1	160459909	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,4,1
chr1	160460099	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=197,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr1	160518202	.	G	GTCCTGTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=230,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	160519812	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=170,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.449:18:5,4:5,4:0|1:160519812_C_CA:160519812:1,9,1,7
chr1	160519815	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=170,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.449:18:5,4:5,4:0|1:160519812_C_CA:160519812:1,9,1,7
chr1	160582213	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=86,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.623:6:1,2:1,2:1,1,4,0
chr1	160582248	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:5,1,5,2
chr1	160650913	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=47.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,12,1
chr1	160681649	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=18,14;MFRL=204,254;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:1,0:1,0:0|1:160681649_G_T:160681649:0,9,0,2
chr1	160681651	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=17,11;MFRL=204,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:1,0:0,0:0|1:160681649_G_T:160681649:0,9,0,3
chr1	160681652	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=16,17;MFRL=204,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:0,0:1,1:0|1:160681649_G_T:160681649:0,9,0,3
chr1	160681653	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=12,28;MFRL=203,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.309:11:0,1:1,2:0|1:160681649_G_T:160681649:0,8,0,3
chr1	160717938	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,92;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:11,8:6,0:14,3,8,0
chr1	160720074	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=141,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.150:38:14,5:19,0:17,16,3,2
chr1	160722064	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=107.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,12:0,21:0,0,11,22
chr1	160766179	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=251,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:1,5:1,7:0,2,0,12
chr1	160783477	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=174,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:5,1:5,1:6,4,1,1
chr1	160786670	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=175,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,1:3,2:1,6,0,3
chr1	160789196	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr1	160803802	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=117,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:9,8:11,3:14,6,7,4
chr1	160810957	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=207,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:0,2:6,0,2,0
chr1	160849030	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=50.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,14,1
chr1	160849060	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,8:0,0,9,9
chr1	160849082	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=235,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=87.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,27:0.904:29:1,13:1,14:0,2,11,16
chr1	160850280	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=356,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr1	160850936	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=188,83;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,3:3,5:1,2,5,3
chr1	160852022	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=186,189;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:3,5:0,2:1,2,2,5
chr1	160852046	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=303,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,4:0,1:0,2,0,5
chr1	160854526	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=273,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:2,1:5,0,2,0
chr1	160917902	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=168,268;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr1	160920809	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=162,171;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.647:23:3,5:4,10:6,2,6,9
chr1	160920813	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,55;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=100.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,12,12
chr1	160924544	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:5,8,0,2
chr1	160968538	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=155,185;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=29.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,13:4,0:6,0,13,0
chr1	160968745	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.128:37:14,0:18,4:0|1:160968745_A_C:160968745:18,15,0,4
chr1	160968749	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:15,0:19,4:0|1:160968745_A_C:160968745:18,16,0,4
chr1	160969585	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.827:21:2,6:1,12:1,2,9,9
chr1	160969930	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=165,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:7,3,0,2
chr1	160970968	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=173,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,1:10,2:6,10,3,0
chr1	160971015	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=187,289;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,3:9,1:8,5,3,1
chr1	160990875	.	TC	CA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=175,116;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.572:19:1,7:5,4:0|1:160990875_TC_CA:160990875:4,4,2,9
chr1	160990878	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=175,116;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.572:19:1,7:6,4:0|1:160990875_TC_CA:160990875:4,4,2,9
chr1	160990906	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=155,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:1,11,0,2
chr1	161008535	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=243,252;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,2:2,0:4,6,2,0
chr1	161008572	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=217,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:8,1:1,1:5,5,1,1
chr1	161008803	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,251;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,1:3,1:2,8,0,2
chr1	161010774	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	161011041	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,184;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:0,2:8,0:8,0,2,0
chr1	161011716	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr1	161012760	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=234,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,1:6,1:0,7,0,2
chr1	161013121	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.173:27:10,1:12,3:11,12,2,2
chr1	161022047	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=149,96;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:3,6:9,0:12,0,6,0
chr1	161022380	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,3:1,4:4,2,6,1
chr1	161022639	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=209,246;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr1	161023252	.	TTCTCTC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,237;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=TC;STR;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.491:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	161049358	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,7,5
chr1	161058927	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=191,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.495:16:3,2:5,5:5,3,5,3
chr1	161058990	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=142,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:8,10,2,0
chr1	161068240	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=236,255;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,2:1,1:4,0,4,0
chr1	161089450	.	C	CTAAACT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.386:16:6,4:4,2:2,8,2,4
chr1	161126975	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,6:5,1:8,3,6,1
chr1	161133999	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,102;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.200:43:16,0:18,8:14,21,0,8
chr1	161136843	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,3:3,7:4,1,8,2
chr1	161141666	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:17,3:12,0:16,13,3,0
chr1	161143312	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=216,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr1	161160872	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr1	161163633	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=205,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:2,2:0,3:0,2,3,2
chr1	161166352	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,409;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:7,13:11,3:9,9,0,16
chr1	161166723	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=190,255;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr1	161167698	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=172,254;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,3:5,0,7,0
chr1	161176137	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr1	161179877	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=117,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:9,4:1,3:3,7,3,4
chr1	161185236	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=192,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.223:11:4,0:4,2:0,9,1,1
chr1	161197244	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=186,265;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:0,6,2,5
chr1	161200586	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=156,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:2,1:8,2:7,4,2,1
chr1	161254280	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:6,7:3,2:2,7,4,5
chr1	161275652	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:7,5,0,2
chr1	161276434	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,14:0,3:0,0,12,6
chr1	161276487	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=160,74;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:9,7:10,0:3,17,6,1
chr1	161276803	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=195,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:1,3,0,1
chr1	161276804	.	CAAAAAAAA	C,CAAAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,18,32;MFRL=283,166,386;MMQ=60,60,60;MPOS=27,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=24,16,20;RU=A;STR;TLOD=3.22,3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.222,0.393:3:0,0,0:0,0,1:0,1,1,1
chr1	161293492	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=150,133;MMQ=49,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:2,1:0,1:1,2,0,2
chr1	161332091	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=138,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.339:21:5,3:6,4:12,2,6,1
chr1	161475173	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=193,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr1	161475295	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=193,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:9,6,2,0
chr1	161479745	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=145,216;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:10,1:18,1:0|1:161479745_A_G:161479745:8,20,1,1
chr1	161479753	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=159,127;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,10:0.333:31:12,0:9,10:1|0:161479745_A_G:161479745:10,11,0,10
chr1	161479851	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,137;MMQ=52,22;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.418:43:15,0:10,17:13,12,0,18
chr1	161487887	.	AAACATCTACCTGACTCTTCCTCCCAACGACCATGTC	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=182,155;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.092:31:11,0:5,1:12,17,1,1
chr1	161487914	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=180,223;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:10,2:7,0:7,10,0,2
chr1	161488017	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=238,151;MMQ=39,46;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr1	161495820	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,189;MMQ=57,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:22,2:8,1:16,15,3,0
chr1	161495970	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,100;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.080:48:26,0:18,3:23,22,0,3
chr1	161518908	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=132,245;MMQ=39,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr1	161519411	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=189,207;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:10,0,2,0
chr1	161559327	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=161,132;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.566:28:7,6:5,10:10,2,9,7
chr1	161561234	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=142,180;MMQ=39,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:1,11,0,2
chr1	161561287	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	161565479	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,172;MMQ=52,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:1,6,1,4
chr1	161594226	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,16,7
chr1	161594246	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,9,8
chr1	161594525	.	GT	CG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr1	161596283	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,279;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	161599693	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=223,119;MMQ=27,27;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr1	161600109	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=142,196;MMQ=51,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,2:10,1:10,11,2,1
chr1	161600744	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=189,243;MMQ=59,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:1,2:7,2:8,0,4,0
chr1	161600787	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,43;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr1	161600792	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=144,241;MMQ=50,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:1,2:6,1:3,4,3,0
chr1	161600832	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=35,26;MFRL=162,150;MMQ=52,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,3:6,7:9,3,4,6
chr1	161600995	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.512:37:9,9:9,10:7,11,11,8
chr1	161644976	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,160;MMQ=40,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:5,1,3,1
chr1	161676904	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=187,264;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr1	161680159	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=195,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr1	161681297	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=175,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0|1:161681297_G_GT:161681297:0,6,1,1
chr1	161681298	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=175,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0|1:161681297_G_GT:161681297:0,6,1,1
chr1	161681300	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=175,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,1:0|1:161681297_G_GT:161681297:0,6,1,1
chr1	161681661	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,5:0,2:2,0,7,0
chr1	161721402	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:11,2,2,1
chr1	161722272	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,296;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,5:8,0:2,11,1,4
chr1	161722779	.	C	CAAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,13;RU=A;STR;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.634:17:4,4:2,7:6,0,11,0
chr1	161772145	.	T	TCAAGAAAGTGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=231,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	161822959	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=190,245;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr1	161823011	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,6:3,0:6,2,4,2
chr1	161823197	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	161829973	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=101,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.560:20:4,6:5,5:8,1,11,0
chr1	161967784	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=169,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.435:23:4,4:9,5:7,6,0,10
chr1	161976099	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:14,2:11,1:14,11,3,0
chr1	161976272	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,4:0,2:0,0,1,7
chr1	161976309	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=273,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	162257033	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,41165721;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr1	162313597	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,6,6
chr1	162313735	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=150,202;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:14,1:12,2:0|1:162313735_C_T:162313735:18,9,1,2
chr1	162313736	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=187,96;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:24,5:0.194:29:10,5:12,0:1|0:162313735_C_T:162313735:14,10,5,0
chr1	162335424	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	162343774	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr1	162344172	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,1:7,6:6,5,3,4
chr1	162345199	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=116,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.436:21:6,4:6,5:7,5,1,8
chr1	162348637	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:5,1,2,0
chr1	162348662	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,3:0,0,10,4
chr1	162351586	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=181,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:10,0,2,0
chr1	162352941	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,1:3,4:4,4,5,0
chr1	162367235	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	162381833	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=117,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,2:4,3:2,8,2,3
chr1	162560300	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=140,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:12,1:14,3:10,16,2,2
chr1	162722846	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0,0,13,0
chr1	162725655	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	162740327	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,6,11
chr1	162741794	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=186,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:8,4:1,3:6,3,5,2
chr1	162743418	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,4:0,9:0,0,4,9
chr1	162745733	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=218,255;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:0,5,1,2
chr1	162748588	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr1	162760554	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	162760565	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=138,165;MMQ=34,33;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:6,1:4,2:9,1,3,0
chr1	162766476	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=140,206;MMQ=56,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:3,3,4,4
chr1	162769510	.	CTT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,162;MMQ=45,21;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,0:8,2:12,3,2,0
chr1	162822771	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	162825457	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=136,157;MMQ=60,59;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.467:17:3,5:6,2:6,3,1,7
chr1	163038613	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr1	163038853	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=213,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,1:5,6:3,3,0,7
chr1	163122356	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=104,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:163122356_G_T:163122356:9,4,1,1
chr1	163122364	.	GAA	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=116,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:7,2:0|1:163122356_G_T:163122356:12,4,1,1
chr1	163122368	.	T	TTCGTTTATG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=116,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:7,2:0|1:163122356_G_T:163122356:12,4,1,1
chr1	163187232	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=281,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr1	163187263	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=218,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr1	163298767	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=17,16;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.413:19:1,1:2,1:4,7,0,8
chr1	163298768	.	TA	T,TAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,30,28;MFRL=149,182,178;MMQ=60,60,60;MPOS=20,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.06,16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,7:0.193,0.568:12:1,1,4:1,1,2:0,3,1,8
chr1	163307944	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr1	163309302	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,2,10
chr1	163313695	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,0:6,3:1,7,0,3
chr1	163318934	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=246,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,3:1,4:1,5,0,7
chr1	164789444	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,7,8
chr1	165175306	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:1,4,1,4
chr1	165179874	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=178,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:1,3,3,1
chr1	165180089	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr1	165182908	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=201,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:7,3,3,0
chr1	165218792	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,170;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,2:10,2:4,15,1,3
chr1	165376043	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=128,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,6:3,0:5,3,3,3
chr1	165376229	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:165376229_C_G:165376229:0,0,0,1
chr1	165376233	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:165376229_C_G:165376229:0,0,0,1
chr1	165377389	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr1	165377552	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.881:14:1,6:0,7:1,0,4,9
chr1	165378729	.	TACAC	T,TAC	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=20,23,28;MFRL=59,148,177;MMQ=60,60,60;MPOS=14,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=AC;STR;TLOD=3.45,25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,7:0.198,0.537:12:3,1,6:0,1,1:2,1,7,2
chr1	165378733	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=24,27;MFRL=131,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.385:14:6,5:1,0:0|1:165378733_C_T:165378733:6,3,5,0
chr1	165378735	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=95,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:5,5:2,0:0|1:165378733_C_T:165378733:5,3,5,0
chr1	165378757	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=141,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:8,3:7,0:0|1:165378757_C_T:165378757:11,6,2,1
chr1	165378760	.	A	ATATTT	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=148,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:9,3:8,0:0|1:165378757_C_T:165378757:12,6,2,1
chr1	165378992	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,0:4,3:0,4,0,3
chr1	165533075	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:5,1:6,1:5,7,1,1
chr1	165601365	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=152,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,3:5,1:6,0,4,0
chr1	165601566	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:8,3:10,1:6,12,1,3
chr1	165623693	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=211,245;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr1	165624799	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr1	165630784	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=103,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,0:1,2:0,1,0,3
chr1	165634356	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=170,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:6,12,2,0
chr1	165634425	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=157,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr1	165636749	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=260,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr1	165648886	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=162,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:1,1:0|1:165648886_G_A:165648886:0,3,0,3
chr1	165648894	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=162,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0|1:165648886_G_A:165648886:0,3,0,3
chr1	165649715	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=199,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:4,3:4,5,4,3
chr1	165651502	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=193,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,6:1,2:1,1,1,7
chr1	165652325	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=151,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:0|1:165652325_G_A:165652325:7,10,1,1
chr1	165652331	.	A	AC	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=110,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:11,2:0|1:165652325_G_A:165652325:7,10,1,1
chr1	165652332	.	T	TGCCTAC	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=107,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:11,2:0|1:165652325_G_A:165652325:7,9,1,1
chr1	165652335	.	C	CTTACATATTCA	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=107,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:10,2:0|1:165652325_G_A:165652325:7,9,1,1
chr1	165652348	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=195,84;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:3,6,0,2
chr1	165652445	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=199,256;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr1	165664724	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=23,20;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.710:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr1	165712555	.	GAAAAAA	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=17,35;MFRL=158,245;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,9;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.218:7:0,0:0,1:1,5,0,1
chr1	165721223	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=267,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr1	165859630	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,2,10
chr1	165859640	.	G	GTGT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=223,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGT;STR;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:0,2:1,1,0,3
chr1	166123874	.	GGGGGCA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGGCA;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:6,1,2,0
chr1	166124108	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=166,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,1:1,1:1,5,1,1
chr1	166124134	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,8:0,1:0,0,0,9
chr1	166826773	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=216,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,5:0,6:0,1,11,0
chr1	166831676	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:166831676_T_A:166831676:2,1,0,1
chr1	166831677	.	T	TAACTGTCACAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:166831676_T_A:166831676:2,1,0,1
chr1	166831703	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	166833199	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,1:6,5:1,9,1,5
chr1	166839166	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.252:6:5,1:0,0:0,5,0,1
chr1	166908811	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=120,201;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:5,3:6,2:4,7,3,2
chr1	166958937	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=142,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:2,1:17,1:14,5,1,1
chr1	166961857	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=202,198;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr1	166974420	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=197,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:4,6,1,3
chr1	167059575	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:2,3:7,0:1,8,1,2
chr1	167082869	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=182,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:0,2:2,2:2,0,5,0
chr1	167088473	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=163,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:8,3:4,3:10,3,5,1
chr1	167095765	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=148,230;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:5,3:7,4:8,4,6,1
chr1	167097567	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:4,5:4,6,7,2
chr1	167353258	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:2,4:0,4:0,2,1,7
chr1	167367193	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=221,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,6,1
chr1	167381640	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=164,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr1	167382374	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:3,4:4,10:4,3,1,13
chr1	167382399	.	AGTGTGT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=128827731,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=GT;STR;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.738:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr1	167384723	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=189,297;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:7,1,2,0
chr1	167385178	.	G	GA,GAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33,35;MFRL=199,87,226;MMQ=60,60,60;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=A;STR;TLOD=3.24,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.333,0.332:6:2,0,1:0,2,0:2,0,3,1
chr1	167385324	.	TAA	T,TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=16,26,19;MFRL=110,163,143;MMQ=60,60,60;MPOS=24,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=A;STR;TLOD=8.18,4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,8,4:0.533,0.297:14:1,1,0:0,5,2:0,2,1,11
chr1	167403369	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr1	167408670	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:3,4:3,4:1,5,3,6
chr1	167487586	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:4,2,2,2
chr1	167515272	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,7,4
chr1	167654598	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=148,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,0:7,4:10,3,2,2
chr1	167734793	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,7,0
chr1	167741808	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	167793670	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,1:5,4:9,2,4,1
chr1	167802226	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,0:3,4:7,3,2,2
chr1	167805646	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,1:4,1:6,8,0,2
chr1	167815167	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=182,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:2,1,3,2
chr1	167823512	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr1	167825718	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=187,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,2:4,1:0,4,0,3
chr1	167839679	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:4,3,1,3
chr1	167847584	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=203,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	167849318	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=129,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:8,2:4,2:10,2,3,1
chr1	167889145	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:7,0,2,1
chr1	167893759	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,5:6,8:8,1,6,7
chr1	167905411	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr1	167992344	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,5:3,4:1,3,1,8
chr1	168013916	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:11,0:5,6:9,8,0,6
chr1	168044791	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=219,179;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=60.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,23:0.858:26:1,13:2,9:0,3,0,23
chr1	168056724	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	168059796	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=172,98;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:4,9,2,0
chr1	168074145	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=248,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	168165767	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=211,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.440:7:4,0:0,2:3,1,3,0
chr1	168169146	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=162,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:10,0:13,8,2,0
chr1	168200733	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=157,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.780:16:2,8:1,5:3,0,11,2
chr1	168205862	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,71;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.217:30:12,6:12,0:8,16,5,1
chr1	168206118	.	GTTTAA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=148,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTAA;STR;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr1	168208308	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=82,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,7:1,8:1,1,11,4
chr1	168216466	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:168216466_TA_T:168216466:0,4,0,1
chr1	168216468	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:168216466_TA_T:168216466:0,4,0,1
chr1	168262289	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0|1:168262289_A_G:168262289:0,0,8,0
chr1	168262299	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:168262289_A_G:168262289:0,0,6,0
chr1	168262570	.	T	TATGGGTTGTGTGTGTGGTATA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=163,95;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	168274201	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr1	168282261	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=200,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,1:6,5:5,8,4,2
chr1	168510122	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=220,141;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr1	168511155	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,184;MMQ=52,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,7:1,1:3,0,6,2
chr1	168511349	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=159,171;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:2,1,1,1
chr1	168513243	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=191,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:4,6:9,11:4,9,4,13
chr1	168545758	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=262,299;MMQ=27,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,2:6,1:9,0,3,0
chr1	168545821	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=208,189;MMQ=60,42;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:10,3,1,1
chr1	168549254	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,150;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:6,1,3,0
chr1	168549422	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=218,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,9:3,6:1,5,3,12
chr1	168550535	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=200,128;MMQ=44,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,7:1,4:0,2,1,10
chr1	168665747	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=174,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:2,1,4,2
chr1	168683461	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,213;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:7,8,2,0
chr1	168698173	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=192,157;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.419:22:2,5:10,4:8,5,5,4
chr1	169076212	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=108,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:5,2:2,2:1,6,0,5
chr1	169094100	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=191,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,7:0,4:1,0,9,2
chr1	169101280	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,38;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0|1:169101280_G_T:169101280:0,0,2,0
chr1	169101289	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=13,16;MFRL=0,201;MMQ=35,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:169101280_G_T:169101280:1,0,1,0
chr1	169101291	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=18,10;MFRL=0,201;MMQ=35,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:169101280_G_T:169101280:1,0,1,0
chr1	169101295	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=24,10;MFRL=169,201;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:169101280_G_T:169101280:3,0,1,0
chr1	169101300	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,16;MFRL=169,201;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:169101280_G_T:169101280:3,0,1,0
chr1	169101305	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,15;MFRL=169,201;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:169101280_G_T:169101280:3,0,1,0
chr1	169101312	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,17;MFRL=169,201;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:169101280_G_T:169101280:3,0,1,0
chr1	169272451	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0|1:169272451_A_T:169272451:0,0,4,10
chr1	169272453	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0|1:169272451_A_T:169272451:0,0,4,10
chr1	169279196	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=166,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:9,1:3,2:7,5,1,2
chr1	169345704	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr1	169349914	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:1,5,0,5
chr1	169351596	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=261,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr1	169366598	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,2:8,1:10,8,3,0
chr1	169390674	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,155;MMQ=60,22;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,3:6,0:9,5,3,0
chr1	169394226	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	169435027	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	169446945	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,1:8,2:10,7,3,0
chr1	169483762	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=203,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:0,6,0,3
chr1	169492676	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=184,198;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:1,6:0,0:0,1,0,7
chr1	169494196	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,1,9
chr1	169498834	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=84.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,17,8
chr1	169499951	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,7:1,3:1,0,10,0
chr1	169500210	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,1:6,1:3,4,0,2
chr1	169505838	.	CT	AG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:7,5:11,0:7,11,5,0
chr1	169510118	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=122,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:8,4:12,3:12,8,4,3
chr1	169510524	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=98,142;MMQ=33,31;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.633:9:1,4:2,1:2,1,3,3
chr1	169511734	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:4,6:1,4:2,3,4,6
chr1	169513436	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=230,239;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	169515874	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=162,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr1	169515916	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=167,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	169528571	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr1	169528580	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=191,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr1	169529973	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:12,1:6,3:7,11,4,0
chr1	169530070	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,36;MFRL=293,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	169530093	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=242,226;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr1	169564167	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=237,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,1:5,2:2,6,1,2
chr1	169572230	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=164,124;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:0|1:169572230_T_C:169572230:3,2,2,0
chr1	169572238	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=182,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:0|1:169572230_T_C:169572230:4,2,2,0
chr1	169580717	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=114,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,1:6,2:7,5,2,1
chr1	169580972	.	C	CAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=143,237;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:1,3,0,2
chr1	169586220	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.428:10:4,2:1,2:4,2,4,0
chr1	169599254	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=102,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=87.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,29:0.650:44:4,12:11,14:8,7,20,9
chr1	169665551	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,4:2,3:5,0,7,0
chr1	169665632	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=170,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=50.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:5,4:2,13:2,5,9,8
chr1	169672595	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=10,17;MFRL=191,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.433:13:0,0:0,1:0,7,1,5
chr1	169679553	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:5,9:6,5:8,3,12,2
chr1	169697166	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=199,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:8,1:14,2,1,1
chr1	169698825	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=143,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,6:2,0:1,3,1,5
chr1	169699819	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=200,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr1	169762472	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=182,572;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.296:35:10,10:15,0:19,6,0,10
chr1	169763042	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=18,10;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.466:10:1,0:1,0:0|1:169763042_G_T:169763042:1,4,0,5
chr1	169763046	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,10;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.593:8:0,0:1,0:0|1:169763042_G_T:169763042:1,2,0,5
chr1	169771872	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=174,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:7,0:10,8:0|1:169771872_T_A:169771872:6,11,0,8
chr1	169771884	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=174,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.359:23:6,0:9,8:0|1:169771872_T_A:169771872:6,9,0,8
chr1	169772245	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,4:4,0:9,1,4,0
chr1	169796407	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=201,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:6,0:1,6:0,7,0,6
chr1	169823655	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=166,100;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.316:20:7,0:7,6:2,12,0,6
chr1	169823660	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=115,179;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:3,5:10,4:2,11,1,8
chr1	169824995	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=127,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:13,1:14,2:15,12,3,0
chr1	169831690	.	CTCTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=148,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,4:2,1:4,0,4,1
chr1	169831993	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=115,246;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,7:4,1:1,4,1,7
chr1	169835950	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=187,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,5:4,1:4,0,6,0
chr1	169838278	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=200,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr1	169847683	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr1	169890933	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=198,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=68.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.871:21:2,7:0,12:0,2,0,19
chr1	169941761	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.898:17:1,6:0,10:0,1,5,11
chr1	169947146	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=107,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	169951748	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	169952385	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr1	169993762	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=190,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:1,6,0,2
chr1	170001151	.	ATACTCATT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.439:14:3,2:4,4:1,7,1,5
chr1	170004508	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=228,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	170115453	.	T	TTAAGAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=197,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:170115453_T_TTAAGAA:170115453:0,3,0,1
chr1	170115455	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=197,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:170115453_T_TTAAGAA:170115453:0,3,0,1
chr1	170115457	.	T	TTAATTAGACAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=197,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:170115453_T_TTAAGAA:170115453:0,3,0,1
chr1	170135669	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=117,252;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:7,1:7,8:9,5,5,4
chr1	170135828	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=252,111;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,2:6,1:6,5,2,1
chr1	170501456	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=171,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.306:21:11,2:3,3:2,13,2,4
chr1	170501521	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=224,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	170511604	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,1:2,3:4,3,3,1
chr1	170521277	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=121,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:15,2:7,4:17,5,4,2
chr1	170927570	.	C	CTT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.312:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr1	170927590	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:2,0:4,4,2,0
chr1	170927597	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,15;MFRL=111,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,0:4,0:0|1:170927597_C_A:170927597:3,4,2,0
chr1	170927611	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,16;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:4,0:6,0:0|1:170927597_C_A:170927597:5,6,2,0
chr1	170927668	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,3:14,0:10,13,0,3
chr1	170934394	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:5,5,0,2
chr1	170993444	.	G	GGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,58;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=GT;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.779:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	171072862	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=218,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:4,1,4,0
chr1	171077165	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=235,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:5,1,1,1
chr1	171077198	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=175,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:5,6:7,4:7,5,7,3
chr1	171080203	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=196,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:2,0:2,2:1,4,0,2
chr1	171083174	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=188,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,4:7,4:4,7,6,2
chr1	171083242	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=193,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:1,6:7,4:5,3,4,6
chr1	171083537	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,0:1,2:1,2,0,2
chr1	171085314	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=165,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.287:22:9,2:7,4:7,9,3,3
chr1	171115567	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.558:32:10,9:4,9:6,8,10,8
chr1	171115645	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=125,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:9,5:6,5:5,10,4,6
chr1	171116760	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=210,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:1,1:5,2:6,0,3,0
chr1	171118840	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=185,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,2:6,4:8,4,3,3
chr1	171121173	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.309:24:8,4:8,3:7,10,3,4
chr1	171121268	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=222,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:14,5:4,3:8,10,3,6
chr1	171121421	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=197,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:1,9,0,2
chr1	171227216	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:12,2:2,1:10,4,2,1
chr1	171227382	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=172,84;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:12,0:5,2:4,14,0,2
chr1	171252240	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=158,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:10,0:10,4:13,8,4,0
chr1	171252303	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:7,0:13,3:14,6,3,0
chr1	171252410	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=180,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:2,2,1,0
chr1	171252419	.	A	G,ACAGAGACAAGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,32,27;MFRL=151,0,233;MMQ=60,60,60;MPOS=2,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.09,7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,2:0.223,0.334:6:3,0,0:0,1,2:0,3,1,2
chr1	171300959	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=251,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:0,7:6,8:0,6,2,13
chr1	171302094	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=238,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr1	171303925	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=217,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.750:18:2,6:2,8:2,2,5,9
chr1	171311003	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=326,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr1	171486743	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=135,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:17,4:17,0:13,21,3,1
chr1	171491264	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,1:5,2:13,1,3,0
chr1	171496895	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr1	171509014	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	171509058	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:4,2,4,1
chr1	171511165	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,0:10,2:8,7,0,2
chr1	171514731	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=109,163;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:7,7:6,1:2,11,7,1
chr1	171514848	.	T	TTTTA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TTTA;STR;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.710:10:1,5:2,1:0,3,0,7
chr1	171526570	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=117,159;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.445:21:8,4:1,5:9,3,3,6
chr1	171526743	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=108,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:19,1:18,2:21,17,3,0
chr1	171527322	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:2,3:4,2:1,6,0,6
chr1	171548868	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	171557595	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,49;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:11,0:12,3:11,12,0,3
chr1	171607702	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr1	171673749	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,1:6,2:0,11,0,3
chr1	171679958	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,1:11,2:4,14,2,1
chr1	171751051	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.297:15:4,0:6,4:9,2,4,0
chr1	171755071	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:6,2:13,2:8,11,1,3
chr1	171755182	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=134,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:8,3:9,3:9,8,4,2
chr1	171761458	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=217,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr1	171763549	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,4:3,2:7,4,3,3
chr1	171765965	.	A	ATGTCCTTCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=228,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:171765965_A_ATGTCCTTCTT:171765965:0,1,0,1
chr1	171765967	.	A	AAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=228,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:171765965_A_ATGTCCTTCTT:171765965:0,1,0,1
chr1	171810960	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=233,272;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:1,3,0,4
chr1	172001552	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:15,0:17,5:19,13,5,0
chr1	172038079	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:3,9,0,2
chr1	172113808	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=198,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:10,3:8,3:4,14,0,6
chr1	172356582	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,177;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,4:0,5:0,1,0,9
chr1	172410769	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=966,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,5:7,0:5,6,5,0
chr1	172410967	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.585:22:5,8:4,5:5,4,8,5
chr1	172411496	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,261;MMQ=60,51;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.437:16:4,2:5,4:4,5,2,5
chr1	172425529	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,10:2,1:6,0,10,1
chr1	172431210	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=217,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr1	172434375	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,22:0.804:27:2,15:2,6:1,4,19,3
chr1	172502041	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,326;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	172526801	.	TA	CT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=167,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:15,2:13,0:16,13,2,0
chr1	172548330	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:15,2:7,1:10,12,2,1
chr1	172558148	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:12,6:7,0:3,16,6,0
chr1	172577864	.	CTT	C,CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32,34;MFRL=133,187,167;MMQ=60,60,60;MPOS=15,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=7.13,8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,5:0.238,0.321:17:3,1,3:2,3,2:4,4,8,1
chr1	172628780	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=219,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,0:5,2:1,10,0,2
chr1	172633480	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,103;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.249:36:9,7:18,0:11,16,9,0
chr1	172634734	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	173019971	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,91;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:14,3:9,0:13,10,3,0
chr1	173157541	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=201,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr1	173490547	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=164,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.243:25:3,0:10,4:2,17,1,5
chr1	173490616	.	C	CTATATA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=285,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,13;RU=TA;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	173504959	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,1240;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.222:34:12,0:15,7:14,13,7,0
chr1	173735426	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:9,3:17,0:12,14,1,2
chr1	173795803	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=210,193;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:1,0:2,3,1,0
chr1	173797451	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:0,5,1,3
chr1	173819421	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=17,32,33;MFRL=175,237,182;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,17;RU=A;STR;TLOD=4.94,3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,2:0.351,0.270:9:1,1,1:0,3,1:1,2,6,0
chr1	173825692	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=193,236;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	173840219	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=154,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,0:9,3:7,14,1,2
chr1	173855298	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=139,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:2,3,0,3
chr1	173950205	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=210,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:1,2,0,5
chr1	173961807	.	AACAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=AC;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.751:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	174188285	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:5,11:6,5:5,6,10,6
chr1	174190291	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=170,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,2:8,1:2,14,1,2
chr1	174210539	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=164,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	174274328	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:174274328_A_AT:174274328:0,4,0,1
chr1	174274330	.	G	GTTGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:174274328_A_AT:174274328:0,4,0,1
chr1	174274333	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:174274328_A_AT:174274328:0,4,0,1
chr1	174274349	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=236,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	174417231	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=157,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,9:2,3:3,1,10,2
chr1	174945278	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=119,81;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:17,0:11,3:14,14,0,3
chr1	174969271	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=112,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,7:5,6:4,4,9,4
chr1	175046488	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=208,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:4,0,2,1
chr1	175052828	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=251,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,1,1
chr1	175053069	.	C	CAATTATTCCTTTGACGAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=175,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:2,0:8,2:1,9,1,1
chr1	175087677	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=133,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,5:2,3:2,3,6,2
chr1	175092840	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=207,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:1,5:3,8:0,4,2,11
chr1	175097331	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=235,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:1,5:4,3:0,5,4,5
chr1	175097349	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=496,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:0,4:1,2:1,0,1,6
chr1	175097755	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=179,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.175:38:17,6:15,0:11,21,6,0
chr1	175105880	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr1	175105942	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0,0,12,1
chr1	175116046	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,34,32;MFRL=237,74,140;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,16;RU=T;STR;TLOD=5.81,8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,7:0.185,0.590:11:1,2,1:0,0,5:1,1,7,2
chr1	175116065	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.305:16:1,0:6,0:7,4,5,0
chr1	175116252	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=49.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,6:0,0,5,11
chr1	175129945	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=155,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.896:17:0,7:1,7:0|1:175129945_TC_T:175129945:1,0,8,8
chr1	175129947	.	TTCTTCTTG	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=155,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.895:17:0,8:1,8:0|1:175129945_TC_T:175129945:1,0,8,8
chr1	175293424	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr1	175336530	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=219,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,2:1,3:0,1,0,6
chr1	175355128	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=267,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,5:2,5:1,2,7,3
chr1	175355152	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=222,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,3:3,6:4,3,4,5
chr1	175914315	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,66;MMQ=60,29;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,5:4,0:6,3,4,1
chr1	175916267	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr1	176012807	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr1	176050430	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=10,35;MFRL=192,296;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.459:3:0,0:0,1:0|1:176050430_GA_G:176050430:0,2,0,1
chr1	176050437	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=179,296;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.308:5:2,0:2,1:0|1:176050430_GA_G:176050430:0,4,0,1
chr1	176105710	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,0:0,3:1,0,1,3
chr1	176132913	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=142,90;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.429:21:6,8:6,0:7,5,9,0
chr1	176145007	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=201,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr1	176153658	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	176525360	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	176664842	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=302,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,4:1,5:1,3,6,3
chr1	176668823	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=184,361;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	176671881	.	T	TTGTGTGTG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=208,199;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=16,20;RU=TG;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.386:8:1,2:4,0:0,5,0,3
chr1	176675566	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=128,57;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:12,3:10,0:10,12,3,0
chr1	176681165	.	ATG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=217,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=TG;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr1	176734756	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=114,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.688:11:1,3:2,4:2,1,7,1
chr1	176769358	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr1	176857156	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=209,81;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:7,1:0,1:7,0,3,0
chr1	176857347	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,6,6
chr1	177199323	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=149,293;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:1,2,0,2
chr1	177898948	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,133;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,3:13,0:11,12,3,0
chr1	177899121	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,0:4,4:2,5,0,4
chr1	177901713	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:3,7:8,4:1,10,6,5
chr1	177901741	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,6:2,5:0,4,4,7
chr1	177902387	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:5,4:6,5:0|1:177902387_C_A:177902387:5,6,4,5
chr1	177902388	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,7:0.363:20:7,2:6,5:1|0:177902387_C_A:177902387:6,7,3,4
chr1	177902482	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,1:1,6:0,4,1,6
chr1	177911253	.	G	GACTGAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=225,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr1	177915474	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr1	177915698	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,346;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:1,6,0,2
chr1	177916859	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=155,190;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:177916859_T_G:177916859:1,0,1,0
chr1	177916866	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=169,190;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:177916859_T_G:177916859:2,0,1,0
chr1	177916868	.	GGA	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=20,16;MFRL=169,190;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:177916859_T_G:177916859:2,0,1,0
chr1	177916872	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=17,20;MFRL=169,190;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:177916859_T_G:177916859:2,0,1,0
chr1	177916878	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=169,190;MMQ=60,51;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:177916859_T_G:177916859:2,0,1,0
chr1	177917479	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=152,255;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:6,1,4,0
chr1	177929379	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:5,0,2,1
chr1	177929501	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,6:5,2:6,4,4,4
chr1	177930642	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=261,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr1	177930894	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=241,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:0,3,1,4
chr1	177933443	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=235,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:8,1:1,3:2,7,0,4
chr1	177933505	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=194,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	177934351	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr1	177935203	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=239,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	177936960	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,4:6,1:3,9,5,0
chr1	178063551	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	178408795	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=296,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	178433368	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=152,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,1:2,4:4,3,4,1
chr1	178442190	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:7,6:6,9:9,4,10,6
chr1	178442208	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:20,3:14,0:24,10,3,0
chr1	178442267	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=141,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:13,0:19,4:16,16,0,4
chr1	178483198	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=91,88;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:7,6,2,0
chr1	178483231	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=162,86;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,0:6,3:7,3,2,1
chr1	178489978	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:4,2:11,6:10,5,6,2
chr1	178514165	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=116,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,0:6,3:5,8,2,1
chr1	178514203	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,4:7,4:4,8,3,5
chr1	178514560	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=36.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:0,9:6,4:0,6,1,12
chr1	178515135	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	178745778	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=172,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:178745778_C_T:178745778:3,0,1,0
chr1	178745792	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=172,119;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:178745778_C_T:178745778:3,0,1,0
chr1	178745830	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=161,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:11,3:3,0:11,3,3,0
chr1	178858711	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:6,2:4,1:10,1,3,0
chr1	178861475	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=179,78;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:7,0:12,4:0|1:178861475_C_T:178861475:8,11,1,3
chr1	178861477	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=179,78;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:7,0:12,4:0|1:178861475_C_T:178861475:8,11,1,3
chr1	178861504	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=172,78;MMQ=60,53;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:2,0:8,3:2,8,0,3
chr1	178863023	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:8,2:5,5:4,10,3,4
chr1	178871430	.	TCA	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=186,258;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:178871430_TCA_T:178871430:0,2,0,1
chr1	178871435	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=186,258;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:178871430_TCA_T:178871430:0,2,0,1
chr1	178871438	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=186,258;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:178871430_TCA_T:178871430:0,2,0,1
chr1	178871439	.	T	TCTTTACTCAGTA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=186,258;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:178871430_TCA_T:178871430:0,2,0,1
chr1	179012947	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=151,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:7,0,1,1
chr1	179041011	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=188,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,6:4,2:6,1,5,3
chr1	179054692	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:7,7:4,5:5,6,7,5
chr1	179077450	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=142,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.270:15:3,0:5,1:8,3,0,4
chr1	179087934	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,5:7,3:3,8,3,5
chr1	179089239	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.326:13:6,3:3,1:9,0,4,0
chr1	179271948	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.402:10:4,3:2,1:1,5,0,4
chr1	179304892	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	179312102	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,1:0,13:0,0,5,10
chr1	179312708	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=135,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:6,2:0|1:179312708_G_C:179312708:12,4,1,1
chr1	179312721	.	T	TCTTTCTCTC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=159,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.163:16:6,0:7,2:0|1:179312708_G_C:179312708:11,3,1,1
chr1	179316687	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=132,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:5,3:4,1:7,2,2,2
chr1	179317895	.	ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	A,ATG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30,32;MFRL=0,200,199;MMQ=60,60,60;MPOS=18,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=27,13,14;RU=TG;STR;TLOD=5.37,5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.437,0.435:4:0,1,2:0,1,0:0,0,4,0
chr1	179319580	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.868:12:0,8:1,3:1,0,3,8
chr1	179320404	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=167,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,2:7,0:13,4,1,1
chr1	179320665	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=195,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr1	179339099	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,101;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:9,2,1,1
chr1	179364391	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=128,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,1,2
chr1	179380472	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.461:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr1	179398563	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=123,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	179401379	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=132,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.306:8:2,0:4,2:5,1,1,1
chr1	179401484	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=119,127;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,0:5,4:11,3,4,0
chr1	179401564	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=91,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:1,0,0,4
chr1	179452194	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=143,272;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,2,2
chr1	179462149	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	179494595	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=170,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:18,3:6,0:10,14,3,0
chr1	179494612	.	CTACA	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=218,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TACA;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr1	179494665	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr1	179503806	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=133,267;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,3:6,0:8,0,3,0
chr1	179504025	.	AAAG	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=125,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAG;STR;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:4,4:4,1:0|1:179504025_AAAG_A:179504025:4,5,2,3
chr1	179504043	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=86,231;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.306:21:8,5:6,1:0|1:179504025_AAAG_A:179504025:6,9,2,4
chr1	179520254	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr1	179520506	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:7,7:5,6:8,4,7,6
chr1	179561683	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=206,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr1	179600001	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,3:7,1:5,6,2,2
chr1	179605058	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=171,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	179632727	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=199,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	179815963	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=196,61;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,0:5,3:3,7,1,2
chr1	179858333	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	179873078	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=218,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:4,3,0,5
chr1	179983665	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,0,14
chr1	179992076	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	180010702	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	180010938	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=113,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:18,0:16,2:12,23,1,1
chr1	180022343	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr1	180023117	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=198,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0,11,0,2
chr1	180023156	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=190,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0|1:180023156_C_A:180023156:0,3,0,1
chr1	180023159	.	T	TCTCACAACAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=190,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:180023156_C_A:180023156:0,3,0,1
chr1	180023161	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=190,218;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:180023156_C_A:180023156:0,3,0,1
chr1	180043109	.	TTTG	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=206,135;MMQ=60,45;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:6,0:0,4:0|1:180043109_TTTG_T:180043109:0,7,0,4
chr1	180043115	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=190,135;MMQ=60,45;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:6,0:0,4:0|1:180043109_TTTG_T:180043109:0,6,0,4
chr1	180043135	.	T	TCTGTCTGCTTTATG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=204,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	180053219	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.419:41:9,17:15,0:15,9,17,0
chr1	180059811	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr1	180064589	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=141,69;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:17,3,2,0
chr1	180080115	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=63.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,15,3
chr1	180155376	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:2,4:7,1:0,9,0,5
chr1	180155382	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,3:1,7:0,3,0,11
chr1	180155402	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=181,138;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:5,0:7,3:0,12,0,4
chr1	180158668	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	180159797	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=202,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr1	180163390	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=192,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,6:5,3:4,5,7,2
chr1	180240510	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=197,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:6,6:3,6:5,4,7,5
chr1	180240752	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=289,247;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.609:6:0,1:2,1:1,1,1,3
chr1	180257692	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr1	180601229	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=179,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:8,10:2,0:10,0,10,0
chr1	180757007	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,2:9,1:2,10,0,3
chr1	180804082	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:6,2:8,7,2,0
chr1	180849494	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=207,251;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	180853261	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=120,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,0:2,3:0,6,0,3
chr1	180897521	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr1	180905352	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:5,2,6,1
chr1	180991665	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=194,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:2,0,3,0
chr1	181018180	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=176,137;MMQ=40,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:8,2,4,1
chr1	181018236	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=168,159;MMQ=59,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:9,3:9,0:8,10,2,1
chr1	181022895	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr1	181058540	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=217,234;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr1	181058618	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=261,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,1,2
chr1	181058643	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr1	181452781	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	181453186	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:181453186_G_T:181453186:0,4,0,1
chr1	181453192	.	C	CATTTTTTTTTTCCTTTTTCTAAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:181453186_G_T:181453186:0,4,0,1
chr1	181479756	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=208,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,0:4,2:0|1:181479756_G_C:181479756:0,13,0,2
chr1	181479757	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=194,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:4,2:0|1:181479756_G_C:181479756:0,15,0,2
chr1	181479765	.	GG	TC	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=208,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:8,2:0|1:181479756_G_C:181479756:0,17,0,2
chr1	181479770	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=210,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:181479756_G_C:181479756:0,16,0,2
chr1	181479775	.	CC	TT	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=212,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,1:0|1:181479756_G_C:181479756:0,17,0,2
chr1	181549963	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=209,184;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:2,0:2,10:0|1:181549963_G_T:181549963:0,5,0,10
chr1	181549971	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:2,0:4,1:0|1:181549963_G_T:181549963:0,6,0,10
chr1	181549972	.	G	GTTCA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:2,0:4,1:0|1:181549963_G_T:181549963:0,6,0,10
chr1	181680101	.	AAG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=177,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,0:10,2:14,5,1,2
chr1	181684605	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,4:0,1:1,2,0,5
chr1	181686216	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=73,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr1	181688832	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=252,189;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:5,0,4,0
chr1	181688868	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=253,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,0:4,3:7,3,3,0
chr1	181706598	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=166,234;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,6:2,0:8,0,6,0
chr1	181719679	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:1,5,0,3
chr1	181719738	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=219,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:181719738_T_TG:181719738:0,1,0,1
chr1	181719739	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=219,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:181719738_T_TG:181719738:0,1,0,1
chr1	181727030	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=194,244;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,2:5,1:9,1,3,0
chr1	181727273	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=158,237;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,3:4,7:2,6,3,7
chr1	181731667	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=217,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.399:11:4,2:3,2:7,0,4,0
chr1	181732695	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=191,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:5,8,0,3
chr1	181750469	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=160,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:7,0,4,0
chr1	181752923	.	AAGCTT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=159,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGCTT;STR;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.567:14:2,1:4,7:2,4,1,7
chr1	181754803	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=200,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,2:4,4:9,1,6,0
chr1	182027022	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:1,5,3,0
chr1	182027044	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:7,2:15,0:17,6,2,0
chr1	182354850	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=252,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:1,6:3,9:2,2,12,3
chr1	182354890	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=158,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,1:8,2:12,7,3,0
chr1	182355046	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,5:3,4:3,6,2,7
chr1	182441719	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=230,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:2,0:1,6:0,3,0,7
chr1	182491107	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=262,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,3,1
chr1	182501933	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,10:1,5:0,1,2,13
chr1	182509292	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	182509602	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	182509617	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr1	182509646	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr1	182517357	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	182556036	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	182573227	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	182812410	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=169,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,3:2,0:10,1,3,0
chr1	182854017	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,232;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	182993358	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=195,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.264:16:6,1:6,2:0,12,0,4
chr1	183077615	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=225,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:183077615_C_T:183077615:0,4,0,2
chr1	183077618	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=225,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:0|1:183077615_C_T:183077615:0,4,0,2
chr1	183079853	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=242,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:1,3,0,5
chr1	183084607	.	AC	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,6:1,5:3,0,10,1
chr1	183085696	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=188,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:4,2,4,1
chr1	183087075	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=194,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,7:8,0:10,5,7,0
chr1	183090919	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=151,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:15,2:2,0:11,7,1,1
chr1	183095185	.	TAAA	T,TA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,28,28;MFRL=188,236,140;MMQ=60,60,60;MPOS=26,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=A;STR;TLOD=5.14,8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,4:0.215,0.438:9:1,1,3:2,1,1:3,0,6,0
chr1	183095234	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:4,5:10,8:6,8,10,4
chr1	183095477	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=80,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	183096634	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=228,246;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr1	183097754	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,4:6,0:7,6,4,0
chr1	183097956	.	G	GTTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=220,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr1	183099701	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=287,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:3,8:4,4:1,6,2,11
chr1	183100327	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,184;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:183100327_G_T:183100327:0,0,1,0
chr1	183100333	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,184;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:183100327_G_T:183100327:0,0,1,0
chr1	183100338	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,184;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,0:0,0:0|1:183100327_G_T:183100327:0,0,1,0
chr1	183101441	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=243,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:183101441_A_C:183101441:2,0,2,0
chr1	183101448	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=209,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.614:3:1,0:0,2:0|1:183101441_A_C:183101441:1,0,2,0
chr1	183101471	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=208,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr1	183101686	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=200,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr1	183102719	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=227,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,4:5,2:1,9,0,6
chr1	183104003	.	GGTCTGT	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=198,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,2:7,2:2,8,1,3
chr1	183104013	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:4,1:2,3:2,4,2,3
chr1	183104340	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=221,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:1,4:0,5,0,6
chr1	183105534	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=181,137;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.654:27:5,8:4,9:6,3,9,9
chr1	183106739	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr1	183176970	.	GTT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,2:2,0:8,1,2,0
chr1	183177218	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.438:21:6,6:5,3:7,5,5,4
chr1	183184524	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=251,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr1	183187494	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=186,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,4:5,1:11,0,4,1
chr1	183191144	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=229,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr1	183191367	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=188,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,4:4,5:3,8,3,6
chr1	183205523	.	CAAAA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,0;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=A;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:2,2:5,1:7,5,2,1
chr1	183207603	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:3,6,0,2
chr1	183209086	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=198,240;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,0:5,3:9,0,3,0
chr1	183209127	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,0;MFRL=182,132;MMQ=60,59;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:2,0:6,0:0|1:183209127_C_G:183209127:7,2,5,0
chr1	183209133	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=175,132;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:2,5:8,0:0|1:183209127_C_G:183209127:8,2,5,0
chr1	183212548	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:4,4,0,5
chr1	183230516	.	ATCCGC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=212,266;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:0,2:0,3,0,3
chr1	183253213	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr1	183253959	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.846:17:2,5:0,10:1,1,7,8
chr1	183496658	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,4:2,6:8,0,9,1
chr1	183496758	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=48.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,16:0.304:54:18,16:20,0:18,20,16,0
chr1	183498191	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:3,0:6,3:0,9,0,3
chr1	183513616	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=125,125;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:21,0:12,4:13,20,0,4
chr1	183516440	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,0:6,4:2,11,0,4
chr1	183525452	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	183533175	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,4:5,3:5,5,3,4
chr1	183534935	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,8:4,2:2,6,2,8
chr1	183538212	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=190,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,0:3,3:3,3,1,2
chr1	183542387	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,4:8,6:7,6,5,5
chr1	183592570	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:3,3:4,4:0|1:183592570_C_T:183592570:4,4,3,4
chr1	183592594	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,4:0.333:13:5,1:4,3:1|0:183592570_C_T:183592570:6,3,1,3
chr1	183596703	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,27:0.683:39:6,23:6,4:6,6,9,18
chr1	183599638	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:7,4:9,1:13,3,2,3
chr1	183602308	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:7,9:3,3:4,6,6,6
chr1	183616781	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=160,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0|1:183616781_G_T:183616781:1,0,3,0
chr1	183616805	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=161,227;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,0:3,1:0|1:183616781_G_T:183616781:4,0,2,0
chr1	183616884	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=159,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,3:4,1:5,3,2,2
chr1	183617094	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:9,4:8,4:14,3,6,2
chr1	183617105	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,23:0.751:30:3,15:4,8:6,1,14,9
chr1	183617311	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=179,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:12,3:7,6:5,15,6,3
chr1	183617413	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=208,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:8,6:6,3:6,8,4,5
chr1	183617693	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=196,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,3:8,4:4,8,4,3
chr1	183711483	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=164,250;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	183775597	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=174,73;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:10,0:11,2:13,8,2,0
chr1	183775638	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:2,3:5,8:1,7,3,8
chr1	183775704	.	CTT	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=176,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.262:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr1	183852914	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.419:22:9,5:3,4:6,7,5,4
chr1	183869220	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=175,74;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,1:7,0:0|1:183869220_G_A:183869220:17,0,1,1
chr1	183869225	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=175,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:9,2:6,0:0|1:183869220_G_A:183869220:16,0,1,1
chr1	183871637	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=195,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:0,7:2,7:1,1,9,5
chr1	183895178	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=220,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr1	183909934	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:0,7,2,3
chr1	183920334	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=210,224;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,0:3,4:0,5,0,4
chr1	183938304	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=234,308;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0|1:183938304_C_A:183938304:1,0,4,0
chr1	183938313	.	G	GTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=234,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.753:6:0,2:1,3:0|1:183938304_C_A:183938304:1,0,5,0
chr1	183942950	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	184024034	.	GTA	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,0:13,2:0|1:184024034_GTA_G:184024034:4,17,0,2
chr1	184024037	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:13,2:0|1:184024034_GTA_G:184024034:4,17,0,2
chr1	184039911	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=189,318;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr1	184476621	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=184,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,5:0,2:1,0,7,0
chr1	184537506	.	ACTC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=140,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,3:1,2:4,3,3,2
chr1	184588639	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=158,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,3:3,0:7,2,3,0
chr1	184680963	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=130,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,2:8,0:8,9,2,0
chr1	184681065	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=150,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.616:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	184688237	.	CGT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=201,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GT;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:6,1:2,1:9,0,2,0
chr1	184692812	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=304,265;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr1	184695571	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=181,237;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:0,5,0,4
chr1	184706212	.	GT	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,263;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:4,2:12,4:6,11,2,4
chr1	184718750	.	GAAAAAA	G,GA,GAAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32,35,19;MFRL=145,183,151,174;MMQ=60,60,60,60;MPOS=19,22,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,11,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.70,3.65,7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,2,2,5:0.157,0.173,0.361:13:1,1,1,2:1,1,1,0:2,2,2,7
chr1	184723535	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:6,15:11,0:17,0,20,0
chr1	184764067	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	184764410	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=194,237;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:3,3,1,1
chr1	184777467	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=178,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr1	184787677	.	AAGG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=149,65;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:4,0:9,1,1,1
chr1	184787681	.	G	GAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:9,1,1,1
chr1	184943502	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=262,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:184943502_C_A:184943502:2,0,0,1
chr1	184943509	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=262,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:184943502_C_A:184943502:2,0,0,1
chr1	185060851	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=83,64;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:8,0:4,2:0|1:185060851_C_T:185060851:9,3,1,1
chr1	185060872	.	G	GAATTCTCCACA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=131,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:185060851_C_T:185060851:8,4,1,1
chr1	185069235	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=209,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr1	185094277	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	185137454	.	T	TAAATGATAGAC	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=118.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,29:0.682:42:4,13:9,6:0|1:185137454_T_TAAATGATAGAC:185137454:5,8,20,9
chr1	185137461	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,26:0.659:39:3,14:9,10:0|1:185137454_T_TAAATGATAGAC:185137454:5,8,21,5
chr1	185137464	.	T	TAA	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,25:0.666:37:3,14:8,10:0|1:185137454_T_TAAATGATAGAC:185137454:4,8,20,5
chr1	185137628	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=257,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr1	185153545	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr1	185259731	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=239,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr1	185267114	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=210,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,5:2,3:2,1,7,1
chr1	185833565	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:1,1,1,2
chr1	185834851	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=114,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:0,0:0,2:2,0,3,0
chr1	185951607	.	C	CACTACTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=188,72;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:185951607_C_CACTACTT:185951607:0,4,0,1
chr1	185951609	.	G	GCCCCCAGAGGCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=188,72;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:185951607_C_CACTACTT:185951607:0,4,0,1
chr1	185951610	.	T	TTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=188,72;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:185951607_C_CACTACTT:185951607:0,4,0,1
chr1	185956764	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=240,172;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,0:2,7:0,2,0,7
chr1	186022032	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=245,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr1	186030900	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=191,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:186030900_C_T:186030900:3,0,2,0
chr1	186030902	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=193,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0|1:186030900_C_T:186030900:2,0,3,0
chr1	186039006	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=236,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr1	186047150	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=214,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,1:3,5:9,0,6,0
chr1	186055371	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=240,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:6,2:0,6:4,2,5,3
chr1	186057181	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=220,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:4,2,1,4
chr1	186081918	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=180,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:2,1,4,0
chr1	186083201	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=155,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:16,4:10,0:16,10,3,1
chr1	186086578	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=218,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:2,2,3,0
chr1	186089072	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=266,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:3,2:8,7:9,2,4,5
chr1	186089102	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=191,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.209:19:4,0:10,4:10,5,3,1
chr1	186089112	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=184,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:3,1:8,10:7,4,7,4
chr1	186089363	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=325,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	186092076	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr1	186105949	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=130,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:4,4:9,2:6,8,2,4
chr1	186106861	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=208,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:8,5,1,1
chr1	186106949	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:5,2:7,0:6,8,2,0
chr1	186113852	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=230,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr1	186141301	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=199,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,6:4,1:1,5,1,6
chr1	186143799	.	C	CAGAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=158,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:186143799_C_CAGAA:186143799:7,4,1,1
chr1	186143802	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=158,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:186143799_C_CAGAA:186143799:7,4,1,1
chr1	186151493	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=225,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:0,5,0,9
chr1	186265948	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	186281488	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=206,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,2:4,0:2,10,0,2
chr1	186292720	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=142,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,1:5,2:4,1,3,0
chr1	186304298	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=168,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:4,3:10,0:4,10,1,2
chr1	186313249	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=44.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr1	186315474	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=200,239;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:8,0:1,3:0,9,0,3
chr1	186329869	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=139,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,1:7,1:11,7,1,1
chr1	186330695	.	TAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=128,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.328:10:4,1:3,2:7,0,2,1
chr1	186357523	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr1	186360814	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,1:11,2:14,8,2,1
chr1	186363211	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=118,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	186368092	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=144,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,1:10,2:6,10,0,3
chr1	186370598	.	T	TTCTG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TCTG;STR;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:1,4:1,4,1,4
chr1	186370630	.	TTC	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TC;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:2,1:0,6,0,2
chr1	186386861	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=185,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr1	186413205	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=185,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:5,0:7,3:7,6,2,1
chr1	186908385	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr1	186919675	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=220,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:6,0,3,0
chr1	186919732	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr1	186925552	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	190250905	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,0:4,2:2,9,0,2
chr1	192127788	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=119,105;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:18,0:16,4:0|1:192127788_C_T:192127788:19,16,4,0
chr1	192127794	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=119,105;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:19,0:15,4:0|1:192127788_C_T:192127788:17,18,4,0
chr1	192335271	.	C	CTAAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=232,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAT;STR;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr1	192545099	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,3:0,5:0,1,0,8
chr1	192548316	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.109:39:15,0:20,3:16,19,0,4
chr1	192778159	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=170,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.174:27:11,1:8,3:17,6,2,2
chr1	192779227	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=183,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr1	192780088	.	GCT	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.249:30:10,1:11,6:9,14,3,4
chr1	192780337	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=254,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	192780498	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,2:9,2:17,1,4,0
chr1	193038360	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:6,1:9,1:9,7,1,1
chr1	193051685	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=145,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.591:25:6,8:4,6:8,2,11,4
chr1	193051925	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=105,118;MMQ=40,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:193051925_C_A:193051925:0,1,1,0
chr1	193051931	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,118;MMQ=60,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:193051925_C_A:193051925:0,0,1,0
chr1	193053675	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=224,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:3,2,2,0
chr1	193053762	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,289;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,2:6,1:11,5,1,2
chr1	193094375	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	193104805	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,18;MFRL=219,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0,4,0,1
chr1	193104827	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=175,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	193117124	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:14,0:6,2:5,15,0,2
chr1	193205370	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:2,0:3,0:4,4,3,0
chr1	196227578	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=198,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:1,7,0,2
chr1	196251522	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr1	196254970	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr1	196398619	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=256,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr1	196398974	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	196461513	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr1	196642072	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=199,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,4,2
chr1	196642969	.	C	CTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=T;STR;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,1:3,3:4,2,5,1
chr1	196659237	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=132,166;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.615:24:3,3:6,12:3,6,6,9
chr1	196684625	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=204,285;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:2,0,4,0
chr1	196705926	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=146,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:0,2:2,0,4,0
chr1	196757258	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=153,141;MMQ=59,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:1,1,3,0
chr1	196796184	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=125,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr1	196797123	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=174,147;MMQ=56,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,1:2,1:4,0,2,0
chr1	196801190	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:1,3,1,2
chr1	196879488	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:12,0:20,2:11,22,0,2
chr1	196881825	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,177;MMQ=55,33;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:6,3,2,0
chr1	196920148	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.407:15:4,2:4,3:2,7,4,2
chr1	196920178	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=164,298;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.497:8:1,4:3,0:3,1,0,4
chr1	196946869	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,3:6,2:6,7,2,3
chr1	196967458	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:1,8,0,3
chr1	196973890	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,1:3,1:4,5,0,2
chr1	197009631	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.221:21:5,2:9,2:13,4,4,0
chr1	197009798	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=172,207;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:11,1:6,1:8,9,1,1
chr1	197026672	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=294,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,1:0,4:0,2,0,5
chr1	197053373	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=337,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	197053561	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:2,0:4,3:0,7,0,3
chr1	197055925	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=220,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,2:3,10:4,1,7,5
chr1	197059221	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.228:16:2,0:8,2:5,8,1,2
chr1	197059878	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=239,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr1	197059892	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=207,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,4:1,4:3,0,8,0
chr1	197059928	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,4:1,7:3,0,10,1
chr1	197063352	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=264,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,6:2,4:0,5,1,9
chr1	197071363	.	AAGT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=196,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,2:10,0:9,10,0,2
chr1	197071774	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:22,0:15,4:20,17,0,4
chr1	197091808	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=256,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,4:1,6:0,3,0,10
chr1	197097891	.	AAAAT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=227,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:1,1:6,4:0,7,0,5
chr1	197101303	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=273,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:2,0,6,0
chr1	197101374	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=158,105;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.383:32:14,12:6,0:12,8,12,0
chr1	197104149	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	197109042	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=229,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,5:1,12:0,2,2,15
chr1	197113073	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=105,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,27:0.878:30:3,8:0,19:1,2,21,6
chr1	197141243	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=299,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,6:0,6:1,0,10,2
chr1	197150256	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.436:7:1,2:2,1:0,4,0,3
chr1	197297540	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=183,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,4:6,9:5,4,9,4
chr1	197316408	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=133,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr1	197316435	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	197325908	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	197398632	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=213,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:6,7:10,0:11,5,7,0
chr1	197411404	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=201,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,3:8,0:5,6,3,0
chr1	197447037	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr1	197480927	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.550:38:9,10:8,11:6,11,10,11
chr1	197482167	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	197510025	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,14:0,8:0,0,16,6
chr1	197515777	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	197515981	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=211,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,1:3,5:0,7,1,5
chr1	197576307	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=46.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr1	197741951	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr1	197742171	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	197890422	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr1	197898395	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=199,272;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr1	198492490	.	CT	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.130:29:13,1:13,2:16,10,2,1
chr1	198687125	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=217,262;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	198711170	.	CA	C,CAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32,35;MFRL=138,171,204;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=6.77,4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,3:0.254,0.185:19:5,3,2:3,2,0:5,6,3,5
chr1	198717218	.	GTTTT	G,GTTTTT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=24,34,32;MFRL=139,186,115;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,12,17;RU=T;STR;TLOD=3.40,16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,12:0.112,0.633:20:3,1,4:0,1,7:3,3,10,4
chr1	198717235	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=36,10;MFRL=103,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.489:28:2,1:10,1:2,12,14,0
chr1	198719611	.	GT	TC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=156,60993601;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,2:10,0:9,11,1,1
chr1	198721441	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,195;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.273:31:12,8:11,0:9,14,8,0
chr1	198721651	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=164,273;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:4,1,0,2
chr1	200014762	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=275,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr1	200017289	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,14;MFRL=199,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.465:11:2,1:3,1:3,3,5,0
chr1	200080463	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:2,1,2,4
chr1	200080487	.	T	TAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:200080487_T_TAC:200080487:0,3,0,1
chr1	200080488	.	T	TGAGCACACAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:200080487_T_TAC:200080487:0,3,0,1
chr1	200089872	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,1:0,4:4,0,5,0
chr1	200090120	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr1	200143064	.	CTTTT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=212,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=T;STR;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.592:10:1,5:2,1:3,1,6,0
chr1	200143143	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=182,56;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:12,3:13,0:14,11,3,0
chr1	200182654	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	200182709	.	CGCCGGAGAGGAG	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=262,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:4,2:3,3:6,1,5,0
chr1	200182799	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=198,161;MMQ=60,52;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:9,4:8,2:7,10,2,4
chr1	200182834	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=198,176;MMQ=60,50;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:12,4:7,3:9,10,2,5
chr1	200312534	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:7,3:8,0:6,13,0,3
chr1	200312546	.	CAAA	C,CA,CAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,33,20,17;MFRL=175,222,223,162;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,17,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=9.15,6.57,6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,6,4,4:0.345,0.257,0.259:16:0,2,2,1:2,2,0,0:2,0,0,14
chr1	200377259	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=160,175;MMQ=60,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:6,0:10,4:12,4,0,4
chr1	200522566	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=115,177;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,8:1,6:0,1,5,9
chr1	200523514	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	200524415	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=198,153;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=46.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.643:23:5,15:3,0:8,0,15,0
chr1	200549590	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:0,1,0,6
chr1	200550243	.	G	GAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=227,151;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,21;RU=A;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr1	200569183	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=169,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=56.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,21:0.458:46:16,0:8,20:0|1:200569183_A_C:200569183:13,12,0,21
chr1	200569189	.	T	TCATCTTGAAAAACAACCCATGCATTACA	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=169,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=56.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,21:0.458:46:17,0:7,21:0|1:200569183_A_C:200569183:13,12,0,21
chr1	200569392	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,2,4
chr1	200574499	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,2:6,1:3,4,0,3
chr1	200578093	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	200594240	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	200619478	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	200619530	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	200619614	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=162,52211570;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,2:8,0:9,6,0,2
chr1	200801540	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:1,1:5,1:0,7,0,2
chr1	200811203	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:8,11,0,2
chr1	200816520	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:200816520_TG_T:200816520:0,0,0,2
chr1	200816522	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:200816520_TG_T:200816520:0,0,0,2
chr1	200816658	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr1	200821747	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.170:39:16,0:17,6:16,17,0,6
chr1	200826552	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=171,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,0:6,3:0,9,0,3
chr1	200843305	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr1	200860825	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:3,3:12,0:6,9,0,3
chr1	200877089	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=171,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:6,0:6,2:2,10,1,1
chr1	200877786	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	200877850	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=137,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:7,4:9,2:10,6,3,3
chr1	200943793	.	CAGGA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGA;STR;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr1	200944840	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=225,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:0,5:3,1:0,3,0,7
chr1	200960307	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,5:7,3:6,6,2,6
chr1	200967490	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,1:6,3:12,2,4,0
chr1	200968613	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=176,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.185:19:8,0:8,3:2,14,2,1
chr1	200969766	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=184,245;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,2:2,1:8,1,1,2
chr1	200969942	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=147,242;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:9,10,1,1
chr1	200971521	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=190,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:0|1:200971521_G_A:200971521:0,9,0,3
chr1	200971528	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=190,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,1:5,2:0|1:200971521_G_A:200971521:0,9,0,3
chr1	201009556	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=204,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,2,2
chr1	201009897	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	201012578	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=145,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:9,11,2,0
chr1	201012597	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:5,4,1,6
chr1	201017687	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:5,1:6,3:7,4,3,1
chr1	201019623	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:3,7,1,1
chr1	201020105	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.549:29:8,9:5,6:8,5,7,9
chr1	201021619	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:5,1:11,1:16,1,1,1
chr1	201022773	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=177,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:0,0:3,0:0|1:201022773_G_GC:201022773:0,3,0,1
chr1	201022775	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,15;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.498:6:0,0:3,0:0|1:201022773_G_GC:201022773:0,3,0,3
chr1	201022779	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,19;MFRL=264,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.622:6:0,1:2,1:0|1:201022773_G_GC:201022773:0,2,0,4
chr1	201022784	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,12;MFRL=264,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.622:6:0,0:1,0:0|1:201022773_G_GC:201022773:0,2,0,4
chr1	201031059	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,0,2
chr1	201031307	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=190,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:0,4,0,7
chr1	201043845	.	ACT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	201044748	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,1:2,6:1,4,2,5
chr1	201052199	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,1:2,1:9,0,2,0
chr1	201052310	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:5,3:5,3:0|1:201052310_A_T:201052310:6,6,3,3
chr1	201052312	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:7,3:5,3:0|1:201052310_A_T:201052310:6,6,3,3
chr1	201052474	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.317:17:3,3:7,2:2,10,1,4
chr1	201058692	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=209,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:0,9,0,4
chr1	201079235	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=176,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:7,3,6,0
chr1	201079458	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=196,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,6:3,3:1,3,0,9
chr1	201081283	.	AC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=12,29;MFRL=214,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,1:0,6:1,0,6,3
chr1	201113118	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,5:0,1:0,0,1,6
chr1	201115822	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=204,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:1,9:0,3:0,1,11,1
chr1	201116018	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=46.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,2,12
chr1	201169601	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=229,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,2:2,3:1,4,0,5
chr1	201170772	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	201170824	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,3,2
chr1	201171007	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	201173104	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=181,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr1	201174204	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.802:18:1,7:2,8:2,1,10,5
chr1	201182647	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=188,143;MMQ=60,25;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:7,0:9,13:9,7,0,13
chr1	201185908	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,24;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,2:0,0:0,1,0,2
chr1	201187828	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=208,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr1	201193767	.	AGCTTCCCCTTCTCAACTTTTCCTTCCTCTCCTTTCTCAGGCCATGCCCATGCCTGAGGTGACCTGGCTGAAGGATG	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.123:43:4,0:13,5:21,15,1,6
chr1	201253119	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=194,229;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr1	201285909	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=162,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	201286614	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=191,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.662:16:1,4:4,7:4,1,9,2
chr1	201286628	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=290,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:1,8:6,9:6,1,14,3
chr1	201286678	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,13:0.333:40:12,7:15,6:16,11,8,5
chr1	201288007	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=220,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,0:0,4:0,1,1,3
chr1	201288898	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=66.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,14,4
chr1	201288955	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:8,4:9,5:12,5,5,4
chr1	201288982	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:5,2:11,4:9,8,4,2
chr1	201291066	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=225,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,3:3,7:3,2,7,3
chr1	201291283	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,2:6,0:0,9,0,2
chr1	201292110	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr1	201293970	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	201293985	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:5,1,3,0
chr1	201328272	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:3,1:5,1,3,0
chr1	201328824	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.214:29:12,1:11,4:10,13,3,3
chr1	201328913	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=180,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr1	201331249	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=221,79;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:1,7,0,2
chr1	201331554	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=121,181;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.622:24:4,7:4,8:5,4,9,6
chr1	201331664	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=214,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr1	201332422	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=146,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:10,0:11,11,1,1
chr1	201332470	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,0:11,4:6,13,0,4
chr1	201335899	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr1	201338553	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr1	201338586	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=180,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	201338896	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,2:7,2:6,4,3,1
chr1	201339043	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=205,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:2,6:6,5:1,7,2,9
chr1	201341175	.	CAGAAG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=223,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAAG;STR;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,2:3,4:1,5,2,4
chr1	201341341	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr1	201358196	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=195,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	201368463	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr1	201383643	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr1	201438087	.	G	GGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	201465428	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=125,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.208:13:5,2:5,0:4,7,1,1
chr1	201617699	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,18;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:201617699_T_G:201617699:0,0,1,0
chr1	201617702	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:201617699_T_G:201617699:0,0,1,0
chr1	201617705	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:201617699_T_G:201617699:0,0,1,0
chr1	201617711	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:201617699_T_G:201617699:0,0,1,0
chr1	201687451	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=230,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr1	201749520	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,5:5,8:8,1,10,3
chr1	201754606	.	G	GCTGCTTATTTATTAGACAAAATCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=190,8457803;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.245:11:4,2:3,0:0|1:201754606_G_GCTGCTTATTTATTAGACAAAATCA:201754606:0,9,0,2
chr1	201754609	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=186,8457803;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:2,0:0|1:201754606_G_GCTGCTTATTTATTAGACAAAATCA:201754606:0,8,0,2
chr1	201755469	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=227,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:3,2:2,5:5,0,6,2
chr1	201763499	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=192,242;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	201772863	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=15,19;MFRL=136,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.821:7:0,1:0,2:0,1,0,6
chr1	201772903	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=231,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	201773566	.	CT	C,CTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31,35;MFRL=77,139,140;MMQ=60,60,60;MPOS=31,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=6.10,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.333,0.249:9:3,1,2:1,2,0:3,1,5,0
chr1	201816639	.	ATCTTTT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=139,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:6,3,2,3
chr1	201824390	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:1,6,0,3
chr1	201826340	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:0,5,3,5
chr1	201827919	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,2:4,7:8,0,8,1
chr1	201837934	.	CGTGT	C,CGT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,27,27;MFRL=166,213,186;MMQ=60,60,60;MPOS=25,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=GT;STR;TLOD=4.79,22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,9:0.219,0.680:13:0,3,8:1,0,1:0,1,3,9
chr1	201840059	.	GTTATT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTATT;STR;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.821:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	201840464	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=68.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,11,9
chr1	201843997	.	AGAG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=150,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAG;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:4,0:3,2:4,3,1,1
chr1	201844128	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,5,5
chr1	201861016	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:3,2:10,0:3,10,2,0
chr1	201869257	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=136,177;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,4:4,4:9,1,6,2
chr1	201952294	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=275,275;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:201952294_C_G:201952294:0,1,0,1
chr1	201952310	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=261,275;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:201952294_C_G:201952294:0,2,0,1
chr1	201952574	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:3,8:7,4:6,4,7,5
chr1	201952755	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=224,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,1,4
chr1	201970748	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=196,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,4:0,1:3,1,1,4
chr1	201970971	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=226,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:201970971_T_G:201970971:1,2,0,1
chr1	201970976	.	GA	TT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=226,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:201970971_T_G:201970971:1,2,0,1
chr1	201970979	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=226,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:201970971_T_G:201970971:1,2,0,1
chr1	201970983	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=226,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:201970971_T_G:201970971:1,2,0,1
chr1	201970985	.	A	ATG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=226,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:201970971_T_G:201970971:1,2,0,1
chr1	201970986	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=223,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1|0:201970971_T_G:201970971:0,2,1,1
chr1	201970988	.	C	CTTTATTTTTTAGAGCAG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,35;MFRL=226,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:201970971_T_G:201970971:1,2,0,1
chr1	201981354	.	TG	CC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,2:3,5:1,9,3,4
chr1	201984351	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:9,6,0,2
chr1	202092046	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr1	202096815	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,2:1,7:0,1,5,4
chr1	202107422	.	AACACAC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=225,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=AC;STR;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.566:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr1	202121643	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=217,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr1	202122783	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:4,1,3,0
chr1	202122840	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=180,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.201:23:14,2:4,2:13,6,3,1
chr1	202163621	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,4:5,1:10,2,3,2
chr1	202166497	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:7,1:11,7,2,0
chr1	202194441	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:9,0,2,0
chr1	202197161	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,3:3,1:2,7,2,2
chr1	202266547	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=214,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr1	202266607	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,4:3,0:6,3,3,1
chr1	202270434	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=0,218;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,2:0,5,0,3
chr1	202274936	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,4:2,3:1,5,2,5
chr1	202287156	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,2:8,1:9,4,3,0
chr1	202288000	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,0:5,2:4,5,0,2
chr1	202302232	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=206,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,1:9,3:6,7,3,1
chr1	202318316	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:0,5,1,5
chr1	202386075	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr1	202400761	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,54;MMQ=60,55;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,2:10,0:5,10,0,2
chr1	202443000	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=151,244;MMQ=55,58;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:5,2:13,2:10,8,3,1
chr1	202536848	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=117,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,1:1,1:4,2,2,0
chr1	202568484	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,1:13,2:6,15,0,3
chr1	202710733	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,2:3,4:1,7,2,4
chr1	202711546	.	A	ATGTATGTATT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=164,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:0|1:202711546_A_ATGTATGTATT:202711546:7,6,1,1
chr1	202711547	.	C	CTTAT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=164,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:7,2:0|1:202711546_A_ATGTATGTATT:202711546:7,6,1,1
chr1	202711778	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=108,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.447:27:8,9:6,2:7,8,9,3
chr1	202715139	.	TGAGACGTGTAGCTTTG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=150,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:4,6,1,1
chr1	202715499	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=255,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:202715499_C_T:202715499:0,2,0,1
chr1	202715517	.	A	ATATGCATGGGTCCTGTTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=255,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:202715499_C_T:202715499:0,2,0,1
chr1	202718028	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=140,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:4,3:1,3:4,1,3,3
chr1	202718262	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=181,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.288:33:14,0:8,9:5,19,0,9
chr1	202731986	.	C	CCTCAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=249,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,1:1,3:0,2,1,4
chr1	202861566	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,13,0
chr1	202887295	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=215,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.844:17:1,7:1,8:1,1,6,9
chr1	202888971	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=148,86;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:10,0:7,3:10,7,0,3
chr1	202910609	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,140;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:4,9:9,0:13,0,9,0
chr1	202914356	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr1	202931839	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr1	202931958	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=37,28;MFRL=149,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.825:9:1,4:0,4:1,0,7,1
chr1	202931998	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=149,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,6:0,2:0,1,5,3
chr1	202933657	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=138,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,5:1,5:2,0,10,0
chr1	202936456	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	202990056	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=103,274;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:22,0:21,3:0|1:202990056_A_T:202990056:32,13,0,3
chr1	202990058	.	GGGAATGATATTTACTCTGGTAAGTGGGGACTCAGGATGTCATTCTCAGCT	G	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=103,274;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,3:0.069:56:23,0:22,3:0|1:202990056_A_T:202990056:32,21,0,3
chr1	202990110	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=160,293;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:1,1:0,0:0,2,0,2
chr1	203012661	.	CGT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=47,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.328:9:4,0:2,3:3,3,0,3
chr1	203012705	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	203024710	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:13,1:17,1:17,14,0,2
chr1	203025428	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:4,3,2,1
chr1	203029017	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=196,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:1,3,3,4
chr1	203030071	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,3:2,4:6,0,5,2
chr1	203030685	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=208,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,2:7,2:8,2,3,1
chr1	203032922	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr1	203033146	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:4,2:3,0:1,6,0,3
chr1	203036757	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=232,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,4,1
chr1	203040740	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	203040922	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:4,3:1,6:0,5,6,4
chr1	203045369	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,546;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	203053741	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=132,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:8,1:16,3:15,9,3,1
chr1	203053768	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=118.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,11:0,23:0,0,17,17
chr1	203054523	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	203055101	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=182,273;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.451:18:2,2:8,6:6,4,3,5
chr1	203137784	.	A	ACT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=51.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr1	203148633	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,14:0,13:0,0,10,17
chr1	203153634	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=119,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,3:1,5:3,0,5,3
chr1	203154532	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=158,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:1,3,3,3
chr1	203155882	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=180,270;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr1	203188692	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=260,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	203192567	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,3:4,1:4,4,3,1
chr1	203192820	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=218,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,0:0,6,0,4
chr1	203192844	.	C	CAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=230,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.321:4:2,1:1,0:0|1:203192844_C_CAG:203192844:0,3,0,1
chr1	203192846	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=230,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:203192844_C_CAG:203192844:0,3,0,1
chr1	203194758	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=177,291;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:203194758_A_C:203194758:0,1,1,0
chr1	203194761	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=176,291;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:203194758_A_C:203194758:2,1,1,0
chr1	203194764	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,15;MFRL=177,291;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:203194758_A_C:203194758:3,1,1,0
chr1	203194768	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=177,291;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:3,1,1,0
chr1	203198842	.	T	TTTG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=219,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,1:4,1:0|1:203198842_T_TTTG:203198842:0,6,1,1
chr1	203198843	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=219,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,1:4,0:0|1:203198842_T_TTTG:203198842:0,6,1,1
chr1	203198845	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=196,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr1	203274936	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr1	203311644	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=191,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:12,4:10,1:9,13,2,3
chr1	203317162	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.815:25:1,10:3,9:3,1,13,8
chr1	203452929	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=147,291;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,1:6,3:10,4,3,1
chr1	203455902	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=209,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.200:33:15,2:12,4:13,14,1,5
chr1	203465362	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=115,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:9,1:1,1:4,6,0,2
chr1	203465396	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=114,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,3:2,0:2,6,1,2
chr1	203668627	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=127,146;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.284:26:10,0:9,7:12,7,0,7
chr1	203679934	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=201,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:5,3,3,1
chr1	203709034	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=193,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr1	203709068	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	203740458	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=136,299;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,1:7,1:0|1:203740458_C_A:203740458:9,2,2,0
chr1	203740462	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=113,299;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,1:11,1:0|1:203740458_C_A:203740458:10,5,2,0
chr1	203740615	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,1:7,1:3,11,0,3
chr1	203741368	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=285,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	203786224	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=163,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:9,2:6,0:9,6,2,0
chr1	203797335	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,37;MFRL=173,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:6,2:6,0:13,0,2,0
chr1	203797384	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:9,2:17,3:16,10,3,2
chr1	203800735	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,3:3,0:5,1,2,1
chr1	203803016	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,0,8
chr1	203807233	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=179,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	203807273	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=180,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	203821200	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr1	203831261	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=144,250;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:7,0:13,6:15,6,3,3
chr1	203832964	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=178,246;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr1	204082323	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,0,4
chr1	204085609	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=212,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:5,4:5,4,6,3
chr1	204094902	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,334;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	204095280	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:5,9:4,0:6,3,2,7
chr1	204101421	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=166,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,4:4,0:4,4,2,2
chr1	204103618	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=243,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,2,0
chr1	204115934	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=205,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:5,1:3,3,1,1
chr1	204120976	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=122,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:3,2,0,5
chr1	204130376	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=194,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,2,1
chr1	204131060	.	TGA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,3:6,0:8,0,3,0
chr1	204131229	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=136,105;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:8,6:15,0:17,6,6,0
chr1	204159611	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:4,1,5,0
chr1	204159787	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:1,3,3,3
chr1	204167672	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=233,228;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr1	204170825	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=138,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:7,3:11,2:6,12,0,5
chr1	204210539	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=193,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:0|1:204210539_C_T:204210539:8,5,1,1
chr1	204210552	.	G	GTACAAATTATTTTCAACTGCTAA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=199,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:204210539_C_T:204210539:7,7,1,1
chr1	204210997	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=68643952,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,1,4
chr1	204216410	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	204216468	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=193,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,3,2
chr1	204216601	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=104,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:2,4,1,4
chr1	204219559	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=203,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr1	204219821	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=183,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:0,3,1,3
chr1	204219850	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=189,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	204234196	.	GGT	G	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=135,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.089:33:15,2:11,1:6,24,2,1
chr1	204234216	.	AGC	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=172,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,3:8,0:6,12,1,2
chr1	204234222	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=144,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.485:18:7,3:2,6:2,7,2,7
chr1	204234225	.	G	A,GCA	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,29,20;MFRL=172,178,109;MMQ=60,60,60;MPOS=18,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.74,5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,6,3:0.329,0.194:17:5,1,3:3,5,0:1,7,3,6
chr1	204242731	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:6,1,4,2
chr1	204379758	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=176,208;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:6,0:14,8:8,12,0,8
chr1	204379804	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=156,283;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:6,0:14,6:9,11,0,6
chr1	204380404	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:14,3:16,1:8,22,2,2
chr1	204394731	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,15;MFRL=129,136;MMQ=60,58;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:1,0:10,0:7,8,2,0
chr1	204394888	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,1:5,1:1,7,1,1
chr1	204402500	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=216,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:8,3:6,3:5,10,3,3
chr1	204402898	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:12,5:4,6:10,6,7,4
chr1	204408135	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=167,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:8,4:9,1:11,6,4,1
chr1	204409281	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,8,4
chr1	204409288	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=191,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.428:17:7,3:2,3:5,5,6,1
chr1	204410532	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=177,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,5:2,1:5,0,6,0
chr1	204410795	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=198,250;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,1:1,2:0,6,1,2
chr1	204413236	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=144,67;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,19:0.336:57:21,11:17,7:22,16,0,19
chr1	204413297	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,15:0.516:29:10,10:4,4:0|1:204413297_C_T:204413297:3,11,8,7
chr1	204413299	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,15:0.516:29:10,9:4,5:0|1:204413297_C_T:204413297:3,11,8,7
chr1	204415304	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,95;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:10,0:5,2:4,11,0,3
chr1	204416501	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:6,1,4,1
chr1	204416717	.	A	AACAACAGTTAAAGG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=180,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:204416717_A_AACAACAGTTAAAGG:204416717:4,1,1,1
chr1	204416719	.	A	AGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=180,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:204416717_A_AACAACAGTTAAAGG:204416717:4,1,1,1
chr1	204418889	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:5,0,5,0
chr1	204418939	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=118,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:4,4:7,5:5,6,6,3
chr1	204426036	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.907:9:0,1:0,7:0,0,9,0
chr1	204426069	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,1:6,2:7,1,2,1
chr1	204426295	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=170,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0,11,1,1
chr1	204429838	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=208,234;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,1:3,4:1,4,0,5
chr1	204433093	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=165,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,3:5,4:7,1,4,3
chr1	204433511	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,2:0,0,7,1
chr1	204434277	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr1	204438869	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=197,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:14,2:7,0:9,12,0,2
chr1	204506507	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:6,2,2,0
chr1	204512100	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,37;MFRL=167,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,0:5,2:0,10,0,2
chr1	204515863	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=110,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:8,2:2,3:8,3,3,2
chr1	204516025	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=132,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:3,5,1,4
chr1	204588004	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,2:12,0:9,10,2,0
chr1	204589854	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:13,0:4,4:8,9,0,4
chr1	204589866	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,7:3,1:3,6,5,3
chr1	204590688	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=189,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,7:2,2:2,3,4,5
chr1	204921258	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=177,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:4,4,0,3
chr1	204921312	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=234,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr1	204926980	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=221,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,1:1,2:0,7,0,3
chr1	204943285	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,14,3
chr1	204943991	.	CA	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.876:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr1	204954993	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=180,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:4,1,3,0
chr1	204955329	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=208,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,3:1,1:0,6,0,4
chr1	204978643	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:7,2,2,0
chr1	205027165	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:5,8,1,1
chr1	205027525	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,422;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	205027561	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=240,265;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr1	205028152	.	A	AC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:1,2:9,0:10,0,2,0
chr1	205028823	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=165,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,2:7,1:5,7,0,3
chr1	205033371	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=206,165;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,9:4,0:5,2,9,0
chr1	205033803	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:5,3,0,2
chr1	205038731	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=196,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr1	205039288	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=187,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,0:2,4:1,7,0,4
chr1	205041015	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=185,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr1	205052734	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=133,132;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.203:21:9,0:8,3:9,8,0,4
chr1	205063949	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=212,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,0:8,2:10,1,1,1
chr1	205064080	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,8:5,0:3,9,8,0
chr1	205083865	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=171,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:5,1,4,2
chr1	205084120	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:3,2:8,5:3,8,2,5
chr1	205085068	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:1,11,0,3
chr1	205090885	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=201,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr1	205091105	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,291;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr1	205119981	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=215,311;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr1	205129466	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.840:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	205138321	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:4,5,2,0
chr1	205272620	.	C	CAACTGGG	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=160,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:8,2:14,0:0|1:205272620_C_CAACTGGG:205272620:11,11,1,1
chr1	205272623	.	T	TACGCCACCC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=160,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:8,2:13,0:0|1:205272620_C_CAACTGGG:205272620:11,11,1,1
chr1	205273333	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=161,54;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:11,3:12,0:9,14,2,1
chr1	205277781	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=222,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.526:32:7,10:8,6:8,7,7,10
chr1	205277883	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=217,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:4,4:9,3:2,11,1,6
chr1	205290633	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.194:39:17,0:15,7:12,20,0,7
chr1	205290794	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=258,234;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr1	205306590	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=190,194;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,2:6,4:4,5,4,2
chr1	205307742	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=259,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.666:19:2,6:4,7:2,4,1,12
chr1	205308591	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=251,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:2,1,0,7
chr1	205417586	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=319,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,5:2,4:0,2,1,8
chr1	205493545	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=254,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	205495392	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=198,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:0,1,4,3
chr1	205495976	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,4,10
chr1	205499355	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=215,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:8,1,2,0
chr1	205499577	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=202,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.595:13:0,5:5,2:1,4,5,3
chr1	205499701	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:6,3,5,2
chr1	205499921	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=164,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,0,4
chr1	205500543	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:9,4:4,5:7,6,6,3
chr1	205549122	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=198,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,1:0,1:1,4,0,2
chr1	205549751	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=226,325;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:205549751_A_C:205549751:0,1,1,0
chr1	205549757	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=116,325;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.344:4:0,0:1,1:0|1:205549751_A_C:205549751:1,2,1,0
chr1	205549763	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=134,325;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.293:5:1,0:2,1:0|1:205549751_A_C:205549751:1,3,1,0
chr1	205555145	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,5:7,3:8,3,5,3
chr1	205561493	.	GCT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,337;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.877:5:0,3:0,1:0|1:205561493_GCT_G:205561493:0,0,0,5
chr1	205561511	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:205561493_GCT_G:205561493:0,0,0,5
chr1	205568213	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=130,284;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:5,1:6,2:11,0,3,0
chr1	205568442	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=203,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,2:2,2:0,6,0,4
chr1	205588009	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=194,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr1	205687348	.	CTTTTTTCTTT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=163,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTTTCTTT;STR;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:2,5:1,0:8,1,5,0
chr1	205687365	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,3:2,1:9,0,3,1
chr1	205689807	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr1	205739396	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=224,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:0,3:2,3:2,0,6,0
chr1	205740824	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=168,194;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:5,0:0|1:205740824_G_A:205740824:2,7,0,2
chr1	205740829	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=182,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:205740824_G_A:205740824:2,6,0,2
chr1	205744138	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.436:16:4,2:5,4:0,9,2,5
chr1	205764433	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=263,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:5,2:4,5:7,3,7,0
chr1	205764640	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=172,267;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:2,5:5,5:3,4,2,8
chr1	205766159	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,6:3,5:1,7,2,9
chr1	205768875	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,1:7,1:10,6,2,0
chr1	205814671	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=199,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:2,0:3,8:1,4,0,9
chr1	205816923	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=209,226;MMQ=40,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr1	205883972	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=212,114;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:6,5:10,0:15,1,5,0
chr1	205884646	.	CTGTGTGTG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=246,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=TG;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.406:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	205886381	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=227,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,3:6,2,5,2
chr1	205888143	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=127,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:1,4,0,3
chr1	205892411	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=131,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:3,1:8,1:0|1:205892411_T_C:205892411:8,3,1,1
chr1	205892415	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=131,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,1:7,1:0|1:205892411_T_C:205892411:8,3,1,1
chr1	205896293	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,1:2,5:5,1,4,2
chr1	205896475	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr1	205896948	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=226,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,1:4,1:6,1,0,2
chr1	205901788	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=211,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:8,1,3,0
chr1	205902242	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:5,0:8,4:5,8,2,2
chr1	206224997	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=168,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:7,1:3,1:6,4,1,1
chr1	206516159	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=263,304;MMQ=34,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:1,1,3,0
chr1	206566000	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=123,261;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:5,0,2,0
chr1	206566195	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=145,93;MMQ=27,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,15:0.237:65:21,7:28,8:25,25,6,9
chr1	206566860	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=193,170;MMQ=60,21;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.370:17:2,2:8,4:6,5,6,0
chr1	206566904	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=121,152;MMQ=60,27;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,19:0.434:44:15,11:10,8:12,13,12,7
chr1	206567100	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=183,198;MMQ=60,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,1:8,2:0,13,0,3
chr1	206579936	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=160,156;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,7:2,0:4,0,7,0
chr1	206592731	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=141,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,2:13,0:7,13,0,2
chr1	206623685	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=120,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,5:3,5:7,2,7,3
chr1	206623866	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:6,3:4,7:1,9,0,10
chr1	206626779	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=243,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,5:1,2:0,2,0,7
chr1	206648378	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=230,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:5,4:1,7:2,4,1,10
chr1	206649952	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,263;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:2,2:8,4:6,4,6,0
chr1	206651467	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,1:6,3:6,3,4,0
chr1	206653520	.	G	GTGTACCGGTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=253,320;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,0:1,1:0|1:206653520_G_GTGTACCGGTT:206653520:1,0,0,1
chr1	206653523	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=253,320;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:206653520_G_GTGTACCGGTT:206653520:1,0,0,1
chr1	206670827	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=217,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr1	206758077	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=220,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:1,4:1,2:0,2,0,7
chr1	206760474	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=235,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	206769047	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,4:8,2:9,5,5,1
chr1	206776203	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	206776612	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=217,234;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:5,0:4,7:0,10,7,0
chr1	206810946	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	206858615	.	TCCCC	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=270,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:206858615_TCCCC_T:206858615:1,1,1,0
chr1	206858624	.	CGG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,22;MFRL=292,221;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:206858615_TCCCC_T:206858615:1,0,1,0
chr1	206858630	.	CGCCGCCGCAG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=292,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:206858615_TCCCC_T:206858615:1,0,1,0
chr1	206858647	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,35;MFRL=191,221;MMQ=60,60;MPOS=-12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:1,1:1,0:0|1:206858615_TCCCC_T:206858615:2,0,1,0
chr1	206904464	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,3:6,3:7,5,4,2
chr1	206905299	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.155:27:8,0:12,1:16,7,0,4
chr1	206943351	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr1	206944233	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,24:0.863:27:2,17:1,7:2,1,14,10
chr1	206944645	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:0,4:1,7:1,0,8,3
chr1	206944861	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,1:0,2:0,1,1,3
chr1	207009910	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	207014472	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=180,271;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:1,0:9,5:3,7,1,4
chr1	207016036	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,3:6,1:0,8,0,4
chr1	207040659	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=192,13808516;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:7,1,2,0
chr1	207083509	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,9:0.222:43:18,8:16,0:27,7,9,0
chr1	207087053	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,224;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	207109167	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,276;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:9,1:18,2:14,13,0,3
chr1	207110363	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=178,247;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:3,0,6,0
chr1	207139046	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=116,268;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,1:5,1:9,7,2,0
chr1	207143550	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=116,226;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:1,7,0,3
chr1	207235954	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,1:10,1:10,8,1,1
chr1	207237199	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:2,7,1,1
chr1	207237281	.	C	CAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=204,168;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr1	207241440	.	A	AGTGTGTGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,15;RU=GT;STR;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.504:12:2,4:4,0:4,2,6,0
chr1	207243846	.	T	TCCGGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=202,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:207243846_T_TCCGGG:207243846:0,4,0,1
chr1	207243849	.	C	CCTGCCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=202,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:207243846_T_TCCGGG:207243846:0,4,0,1
chr1	207243851	.	A	G,AC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,35,23;MFRL=165,225,143;MMQ=60,60,60;MPOS=16,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.37,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,1:0.500,0.250:5:0,1,1:1,2,0:0,1,0,4
chr1	207243853	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=202,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:207243846_T_TCCGGG:207243846:0,4,0,1
chr1	207262914	.	G	GTGTGTGT	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=130,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:8,2:20,0:0|1:207262914_G_GTGTGTGT:207262914:10,19,0,2
chr1	207262916	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=132,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:8,2:21,0:0|1:207262914_G_GTGTGTGT:207262914:11,19,0,2
chr1	207262918	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=134,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:9,2:21,0:0|1:207262914_G_GTGTGTGT:207262914:12,19,0,2
chr1	207262921	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=141,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:10,2:22,0:0|1:207262914_G_GTGTGTGT:207262914:13,20,0,2
chr1	207262923	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=141,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:11,2:21,0:0|1:207262914_G_GTGTGTGT:207262914:13,20,0,2
chr1	207262980	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=142,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,3:7,4:2,8,2,5
chr1	207263829	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=176,72;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,1:5,4:3,10,2,3
chr1	207265189	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=123,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:2,6,0,2
chr1	207288897	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:1,2,1,3
chr1	207300259	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,6:3,4:1,3,2,8
chr1	207500072	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=128,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:11,0:16,3:20,8,1,2
chr1	207500131	.	C	CA	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=135,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:18,0:18,2:21,15,0,2
chr1	207504669	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,3,7
chr1	207510126	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.272:42:12,0:18,10:13,18,0,11
chr1	207510596	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,7:0,0,16,0
chr1	207532861	.	C	CTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=171,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=20,22;RU=T;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.769:6:1,3:0,1:1,0,5,0
chr1	207640209	.	C	CTGTAAACATGTTTTG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=149,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:10,2:6,0:5,11,1,1
chr1	207640345	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	207680119	.	TCCAGTTCGGATC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=172,111;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:5,0:8,11,1,1
chr1	207726023	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=178,47;MMQ=25,55;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:7,2:1,0:0|1:207726023_G_GC:207726023:4,4,1,1
chr1	207726025	.	A	ATTCACT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=178,47;MMQ=25,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:7,2:1,0:0|1:207726023_G_GC:207726023:4,4,1,1
chr1	207737670	.	GAC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=208,63;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:2,1:2,1:1,3,1,1
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chr1	207787912	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0,12,0,2
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chr1	207870936	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,94;MMQ=60,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:5,6:10,7:9,6,13,0
chr1	207881485	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=146,163;MMQ=56,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:4,4:7,1:0|1:207881485_TA_T:207881485:8,3,3,2
chr1	207881489	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=146,163;MMQ=56,52;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:4,4:7,1:0|1:207881485_TA_T:207881485:9,4,3,2
chr1	207881491	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=146,163;MMQ=56,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:5,3:8,1:0|1:207881485_TA_T:207881485:9,4,3,2
chr1	207956559	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,3:0,5:2,1,7,1
chr1	207959070	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=162,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:1,5,0,3
chr1	207959122	.	CTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=T;STR;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr1	207959136	.	T	TAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=A;STR;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	207975949	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,243;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:2,0:4,2:0,7,0,2
chr1	207992546	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=238,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:3,3:0,4:0,3,0,8
chr1	208062260	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=248,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,0:0,5:1,2,0,5
chr1	208062471	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=116,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:3,11:4,2:4,3,8,5
chr1	208062973	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=239,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.638:23:2,9:6,5:4,4,3,12
chr1	208063067	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,24:0.756:31:4,12:3,10:3,4,14,10
chr1	208200737	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=141,266;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr1	208206946	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=193,264;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,2:5,1:0,6,0,3
chr1	208208034	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=248,229;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr1	208211887	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr1	208212397	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=243,170;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr1	208213125	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr1	208213518	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=204,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:0,6,1,3
chr1	208219164	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	208225674	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=200,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:6,2,1,1
chr1	208252681	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=163,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,2:9,0:8,12,2,0
chr1	208255877	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:0,6:3,3:0,3,1,8
chr1	208257629	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=229,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr1	208272239	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=201,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:10,2:10,0:11,9,2,0
chr1	208276399	.	C	CCTCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=CT;STR;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	208315692	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=186,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:3,3:7,0:8,2,3,0
chr1	209605636	.	TAGCAGCAGCAGC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=211,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=AGC;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.301:15:3,2:3,2:0,11,0,4
chr1	209779805	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,249;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:8,2:3,3:2,9,0,5
chr1	209784856	.	AGCCTCCAG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,19;MFRL=150,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:4,0:2,6,1,1
chr1	209784927	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr1	209786078	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	209788514	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=235,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:5,1:5,1,2,0
chr1	209792015	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr1	209804095	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.789:17:1,4:2,10:1,2,1,13
chr1	209805895	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:4,6:9,6:6,7,5,7
chr1	209811829	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=226,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,4:2,0:5,2,4,0
chr1	209812063	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=86,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,4:0,1:0,2,0,5
chr1	209849002	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.392:21:7,2:6,6:7,6,5,3
chr1	209849399	.	AG	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=121,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,10:0.367:28:7,5:11,5:0|1:209849399_AG_A:209849399:12,6,3,7
chr1	209849406	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,14:0,16:0|1:209849399_AG_A:209849399:0,0,14,17
chr1	209849714	.	TA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=78.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,17:0,12:0,0,13,17
chr1	209880259	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=205,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,3:5,4:4,7,5,2
chr1	209880508	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=260,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.628:14:1,4:2,2:1,4,3,6
chr1	209905734	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.394:6:2,0:2,2:0|1:209905734_G_C:209905734:4,0,2,0
chr1	209905743	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=167,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.297:5:2,0:2,0:0|1:209905734_G_C:209905734:4,0,1,0
chr1	209933331	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=184,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:3,2:5,2:7,2,2,2
chr1	209933757	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:3,5,0,3
chr1	209935778	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=196,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	209936060	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=209,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:9,1:9,2:0|1:209936060_A_G:209936060:10,9,0,3
chr1	209936064	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=209,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:9,1:9,2:0|1:209936060_A_G:209936060:10,9,0,3
chr1	209936074	.	C	CTTAGTAACTAGCTG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=209,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,1:10,1:0|1:209936060_A_G:209936060:10,9,0,2
chr1	209936571	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=200,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,4:9,4:8,6,3,5
chr1	209936631	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,3:6,0:8,6,0,3
chr1	209936964	.	T	TCA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:13,3:8,2:8,13,1,4
chr1	209948711	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=125,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:7,0:11,6:11,7,4,2
chr1	209949055	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:3,7,1,3
chr1	209950681	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,4:8,5:7,5,4,5
chr1	209950848	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=115,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:11,0:18,4:10,19,0,4
chr1	209951422	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:8,7:14,0:16,6,7,0
chr1	209951583	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=163,55;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,3:5,0:2,11,0,3
chr1	209952865	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:2,5,2,5
chr1	209956542	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.249:34:14,4:12,4:13,13,4,4
chr1	209963803	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:9,6,1,1
chr1	209965587	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=138,256;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,4:4,0:5,2,2,2
chr1	209969902	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=127,249;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,3:5,5:8,4,2,6
chr1	209974528	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=160,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=A;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.574:7:0,3:2,0:2,1,3,1
chr1	209974723	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=185,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,3:3,0:5,4,0,3
chr1	210001586	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=140,247;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr1	210003388	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=176,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:6,0,3,2
chr1	210003402	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,3:1,4:4,0,5,2
chr1	210003445	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:9,7,1,1
chr1	210004332	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:11,1:16,2:11,16,2,1
chr1	210006437	.	GC	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	210006603	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=185,196;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,18:0.576:31:10,11:3,7:0|1:210006603_C_T:210006603:8,5,8,10
chr1	210006604	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=185,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,5:0.176:32:17,4:10,1:1|0:210006603_C_T:210006603:11,16,5,0
chr1	210008367	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.800:18:2,10:1,5:3,0,12,3
chr1	210012102	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	210015568	.	GCT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr1	210111733	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=332,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	210194460	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=121,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.299:24:6,6:11,0:8,9,7,0
chr1	210267893	.	TGAA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=112,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAA;STR;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,5:4,2:4,7,4,3
chr1	210273696	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:7,3:11,1:10,8,1,3
chr1	210273886	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=185,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	210406940	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=237,243;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,4,0
chr1	210407031	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,200;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,3:4,5:2,3,7,1
chr1	210407329	.	GTT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=191,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	210411266	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=215,111;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.376:11:3,2:2,2:0|1:210411266_GT_G:210411266:6,1,4,0
chr1	210411281	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,11;MFRL=170,111;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.223:19:4,0:7,0:0|1:210411266_GT_G:210411266:8,7,4,0
chr1	210411286	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=170,92;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.219:17:3,0:6,0:0|1:210411266_GT_G:210411266:7,7,3,0
chr1	210414871	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=36,36;MFRL=181,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.395:13:5,2:1,1:8,0,5,0
chr1	210414879	.	CTT	C,TCT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,32,26;MFRL=118,184,145;MMQ=60,60,60;MPOS=14,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.41,5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,2,4:0.139,0.208:18:5,1,3:3,1,1:7,5,6,0
chr1	210536078	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,33;MFRL=207,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:210536078_C_G:210536078:1,0,1,0
chr1	210536088	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=207,183;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:210536078_C_G:210536078:1,0,1,0
chr1	210591742	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=176,238;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.730:5:1,2:0,1:0,1,0,4
chr1	210686570	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr1	210761344	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=182,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.309:24:9,5:7,2:9,8,2,5
chr1	210761462	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr1	210856585	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=122,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr1	210856604	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=125,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr1	210857457	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	210857483	.	GGA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=209,249;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GA;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr1	210970823	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=192,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,4:7,0:8,3,2,2
chr1	211276828	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=167,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,5:3,1:6,1,4,2
chr1	211280724	.	TAA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=173,88;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.574:5:1,0:0,3:0|1:211280724_TAA_T:211280724:0,2,0,3
chr1	211280737	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=133,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,2:0.366:6:1,1:3,0:1|0:211280724_TAA_T:211280724:0,4,0,2
chr1	211447435	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr1	211451393	.	TATC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=143,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	211452529	.	TAA	T,TA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,28,27;MFRL=202,122,167;MMQ=60,60,60;MPOS=19,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.28,7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,4:0.353,0.466:8:0,3,2:1,0,2:1,0,4,3
chr1	211452678	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=123,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:6,0:13,3:8,11,1,2
chr1	211545442	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=153,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.603:8:1,1:0,4:0|1:211545442_CT_C:211545442:3,0,5,0
chr1	211545459	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=18,10;MFRL=231,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.670:7:0,0:0,0:0|1:211545442_CT_C:211545442:2,0,5,0
chr1	211652755	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=222,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,1:0,2:0,2,0,3
chr1	211749427	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:10,5:5,0:10,6,5,0
chr1	212142054	.	GAA	GA,G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,22,32;MFRL=156,161,166;MMQ=60,60,60;MPOS=16,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,12;RU=A;STR;TLOD=6.87,5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,3:0.383,0.266:11:1,1,2:2,1,1:2,2,1,6
chr1	212151860	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,0:7,2:2,8,0,2
chr1	212209367	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=201,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:0,4,0,6
chr1	212217944	.	GAA	G,GA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,35,35;MFRL=139,233,194;MMQ=42,60,60;MPOS=16,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.40,5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.325,0.349:9:2,2,2:1,1,1:3,0,6,0
chr1	212217971	.	C	CTT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=51.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,3:0,6:1,1,12,3
chr1	212236157	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr1	212240063	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=182,245;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	212240141	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,57;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,0:9,3:9,9,2,1
chr1	212241714	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29,31,29;MFRL=133,134,293,224;MMQ=60,60,60,60;MPOS=27,28,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.89,3.21,6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,2,4:0.215,0.215,0.355:10:2,1,0,2:0,1,2,2:0,2,0,8
chr1	212274082	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=153,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,1:8,1:9,10,0,2
chr1	212274503	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=174,271;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.632:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	212520750	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:15,3:9,0:15,9,3,0
chr1	212521639	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=155,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr1	212521770	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=155,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:14,0:7,2:0|1:212521770_T_C:212521770:13,8,1,1
chr1	212521777	.	T	TTCTGAGCATACCACTACA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=147,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,0:6,2:0|1:212521770_T_C:212521770:12,7,1,1
chr1	212530192	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr1	212530659	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=193,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.435:8:2,1:2,1:1,4,0,3
chr1	212583736	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=150,66;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:16,3:13,0:17,12,3,0
chr1	212588206	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=192,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr1	212615875	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=64,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:2,2,2,0
chr1	212617692	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=137,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:0|1:212617692_C_T:212617692:6,5,2,0
chr1	212617717	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=141,83;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:0|1:212617692_C_T:212617692:7,6,2,0
chr1	212900434	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,4:4,3:6,0,6,1
chr1	212911739	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=173,242;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,1:6,3:5,7,3,1
chr1	212960866	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=150,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,5:6,0:7,3,3,2
chr1	212969842	.	CT	C,CTT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,32,32;MFRL=163,137,129;MMQ=60,60,60;MPOS=22,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.99,15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,11:0.195,0.498:21:1,1,0:4,3,8:3,3,10,5
chr1	212969856	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,12;MFRL=140,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.205:28:5,0:12,3:9,12,7,0
chr1	212970375	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	212977690	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=125,172;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=42.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.516:31:8,16:7,0:9,6,16,0
chr1	212977908	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=165,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,0:7,3:10,4,2,1
chr1	213032568	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=101,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:0,4,1,6
chr1	213036987	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,2:1,1:6,1,3,0
chr1	213037310	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=195,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr1	213056819	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	213056892	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	213061362	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:2,7,0,4
chr1	213062017	.	T	TTTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=224,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TTG;STR;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.825:9:1,3:0,5:0,1,1,7
chr1	213068233	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=149,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,6:0,2:1,0,8,0
chr1	213068404	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=159,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:9,1:2,5:4,7,1,5
chr1	213068436	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:3,1,3,2
chr1	213068542	.	C	CTGAT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAT;STR;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:0,6:6,5:4,2,6,5
chr1	213068595	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.604:16:3,5:3,3:2,4,3,7
chr1	213139748	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=229,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:0,7,0,4
chr1	213140362	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=193,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:6,0,4,1
chr1	213140398	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,0,3
chr1	213161825	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=191,191;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.227:37:12,5:16,0:21,7,9,0
chr1	213173696	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,247;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,3:15,0:7,16,1,2
chr1	213178340	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	213180441	.	GAA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=117,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:2,2:1,1:2,1,2,2
chr1	213180467	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=127,187;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,0:8,0:7,9,2,0
chr1	213188855	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=177,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.668:7:0,0:1,0:0|1:213188855_T_C:213188855:0,2,5,0
chr1	213188857	.	G	GGCC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,19;MFRL=177,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,0:2,0:0|1:213188855_T_C:213188855:0,2,5,0
chr1	213188861	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=35,13;MFRL=177,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,1:2,1:0|1:213188855_T_C:213188855:0,2,5,0
chr1	213188866	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=36,33;MFRL=177,293;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:213188855_T_C:213188855:0,2,2,0
chr1	213188871	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=177,293;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,1:2,0:0|1:213188855_T_C:213188855:0,2,2,0
chr1	213224719	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=166,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.656:15:2,4:2,5:5,0,9,1
chr1	213341188	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:4,1:6,1,2,0
chr1	213349849	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:12,0:6,3:8,10,0,3
chr1	213405414	.	GGCAACTGAGGAT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCAACTGAGGAT;STR;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.413:15:2,2:4,4:6,3,3,3
chr1	213416013	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=131,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:12,0:6,13:5,13,1,12
chr1	214170167	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=168,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:11,5:12,0:15,8,5,0
chr1	214478459	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr1	214491536	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=188,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:3,9:1,3:2,2,4,8
chr1	214500907	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=312,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr1	214503489	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=142,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:12,2:6,5:11,7,4,3
chr1	214505282	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=186,276;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:9,0,2,0
chr1	214549501	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=70,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr1	214551276	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=152,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,4:7,1:5,5,3,2
chr1	214558228	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=102,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	214558230	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,19;MFRL=242,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0,3,0,1
chr1	214564442	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,1:10,1:0,18,0,2
chr1	214566952	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:2,0,6,0
chr1	214567013	.	CG	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=162,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.530:24:5,9:5,4:6,5,6,7
chr1	214637882	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=221,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,1:1,4:6,0,5,0
chr1	214638172	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=232,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr1	214791895	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:7,5:7,5:7,7,6,4
chr1	214804041	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,249;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:3,2:5,1:2,7,0,3
chr1	214816162	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=192,218;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:14,0:11,4:11,14,0,4
chr1	214817856	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=171,283;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,1:2,1:8,0,2,0
chr1	214818633	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=203,143;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.183:26:10,0:9,4:0|1:214818633_T_C:214818633:14,8,0,4
chr1	214818636	.	G	GATACTCTACTAACTTTGCACTTCTTATTTTTTTT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=203,143;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.183:26:11,0:10,4:0|1:214818633_T_C:214818633:14,8,0,4
chr1	214826364	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=166,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,0:4,4:1,7,2,2
chr1	214828812	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=141,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:0,7,0,4
chr1	214830617	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=150,112;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:3,3:7,5:6,5,4,4
chr1	215256781	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=322,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:215256781_C_T:215256781:0,1,0,1
chr1	215256790	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=358,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:215256781_C_T:215256781:0,1,0,1
chr1	215256888	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=313,264;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	215259613	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,1:3,1:8,0,2,0
chr1	215345263	.	GTCTCTC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=128,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,8;RU=TC;STR;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.616:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	215368514	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	215749406	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:2,2:6,3:2,7,0,5
chr1	215753355	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=115,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:8,2:1,1:0,9,0,3
chr1	215781574	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=186,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,4:0,7:0,2,2,9
chr1	215785187	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=76.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,26:0.441:59:17,25:15,0:17,16,26,0
chr1	215791420	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=152,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,3:9,0:10,6,3,0
chr1	215824195	.	GAAA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=18,17;MFRL=200,0;MMQ=60,58;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.489:6:0,1:0,0:0,3,0,3
chr1	215849044	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=249,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	215853748	.	GTT	G,GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33,33;MFRL=0,62,150;MMQ=60,60,60;MPOS=20,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.76,9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.334,0.571:6:0,1,3:0,1,1:0,0,1,5
chr1	215914646	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:10,0,3,0
chr1	215916728	.	ATG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=210,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=TG;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	215916732	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=210,217;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	215931922	.	CT	C,CTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,35,32;MFRL=131,147,155;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.43,4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.248,0.247:9:3,2,0:2,0,2:5,0,4,0
chr1	215931928	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=149,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:10,0,3,1
chr1	215932957	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:9,3,1,1
chr1	215956304	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=186,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:1,4:3,6:1,3,2,8
chr1	216019426	.	GAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=A;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr1	216062079	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=174,187;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:6,7:8,0:11,4,7,0
chr1	216062110	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=122,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.268:28:9,7:10,0:14,7,7,0
chr1	216246675	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=159,262;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr1	216348764	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,8:0,0,5,6
chr1	216348916	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=233,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr1	216370130	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	216373476	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=19,10;MFRL=169,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.486:8:1,0:0,0:1,3,0,4
chr1	216390694	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr1	216424241	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=193,102;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:5,5,2,1
chr1	216465765	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=219,132;MMQ=60,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:4,0:1,3:1,4,0,4
chr1	216495416	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=41.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,16:0.496:32:10,0:6,14:0|1:216495416_G_T:216495416:0,16,0,16
chr1	216495421	.	T	TTTTTATAAACA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=41.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,16:0.511:31:10,0:3,16:0|1:216495416_G_T:216495416:0,15,0,16
chr1	216692477	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=144,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:7,3,2,0
chr1	216741314	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:9,2:6,4:9,6,4,2
chr1	216896541	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=194,257;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:216896541_G_C:216896541:2,1,1,0
chr1	216896543	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=194,257;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:216896541_G_C:216896541:2,1,1,0
chr1	217604777	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=180,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.181:15:5,1:8,1:1,12,0,2
chr1	217671771	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=206,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:1,3,0,5
chr1	217784372	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:13,0:7,4:9,11,0,4
chr1	217793938	.	T	TTAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAA;STR;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,3:0,3:0,3,0,6
chr1	217822135	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=182,69;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,1,1
chr1	217856787	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=177,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	217856803	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=204,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr1	218458557	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=233,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:1,3:2,0,5,0
chr1	218610662	.	CTT	C,CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29,33;MFRL=144,154,193;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=4.08,7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,4:0.220,0.308:14:2,2,2:3,0,1:4,3,6,1
chr1	218683530	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:13,3:15,0:11,17,0,3
chr1	219366400	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.890:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	219383848	.	A	ACTTTTT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,5:0,8:0,0,13,2
chr1	219383867	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:0,10:1,9:0,1,13,6
chr1	219384959	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=135,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:6,5,1,1
chr1	220142070	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=234,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr1	220145371	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,4:2,5:5,1,5,4
chr1	220145584	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=210,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	220153332	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=208,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:2,0:0,1:2,0,0,1
chr1	220154659	.	TAAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=191,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.815:7:1,6:0,0:1,0,6,0
chr1	220156090	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=193,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:5,9:4,6:6,3,11,4
chr1	220157527	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=116,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:9,0:5,5:5,9,0,5
chr1	220160433	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr1	220162195	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr1	220178717	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	220191932	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=11,27;MFRL=208,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:1,1:0,5,0,2
chr1	220192495	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr1	220197545	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=193,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	220207017	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=177,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.866:13:1,9:0,2:1,0,5,7
chr1	220208154	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=303,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr1	220231180	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.799:18:3,9:0,6:2,1,9,6
chr1	220269426	.	CT	C,CTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35,33;MFRL=148,212,183;MMQ=60,60,60;MPOS=15,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.03,3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.334,0.333:6:2,2,1:0,0,1:2,0,4,0
chr1	220280539	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:1,8,0,2
chr1	220299989	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=205,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr1	220307743	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:7,5,2,0
chr1	220331298	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=184,240;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	220771832	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=218,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr1	220789236	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr1	220789362	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr1	220791604	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=181,163;MMQ=60,49;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:4,5:7,0:0|1:220791604_A_T:220791604:8,4,5,0
chr1	220791610	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=172,163;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:6,3:7,0:0|1:220791604_A_T:220791604:9,4,5,0
chr1	220808921	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=228,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr1	220824115	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=198,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:1,3,1,2
chr1	220825523	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,3:0,12:0,0,2,13
chr1	220825543	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:5,2:0,9,0,3
chr1	220957215	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:10,4:18,0:22,6,4,0
chr1	220978645	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:4,8:5,6:3,6,4,10
chr1	220982320	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=194,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.646:12:0,4:4,4:0,4,0,8
chr1	221055463	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=180,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,2:3,7:5,1,7,2
chr1	222697088	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,2:9,0:2,11,1,1
chr1	222700416	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,5:6,3:3,7,1,7
chr1	222705270	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=199,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,1:7,1:9,2,2,0
chr1	222721333	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=189,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:222721333_G_T:222721333:11,7,1,1
chr1	222721339	.	C	CAGCTGTGT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=193,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:222721333_G_T:222721333:13,6,1,1
chr1	222736498	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=140,310;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:8,4:1,1:3,6,4,1
chr1	222737568	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	222751034	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr1	222791646	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0,6,0,2
chr1	222802006	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,12,7
chr1	222802606	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,131;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,9:0.197:47:20,8:18,0:25,13,9,0
chr1	222802848	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=155,100;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:6,0:17,3:15,8,0,3
chr1	222802866	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=155,100;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:6,0:13,3:14,5,0,3
chr1	222805698	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,1:2,5,0,2
chr1	222805725	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=125,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:1,6,0,2
chr1	222823529	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=226,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr1	222823743	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=200,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.714:21:4,10:2,5:2,4,6,9
chr1	222825717	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=62.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.777:25:3,8:2,11:1,4,4,16
chr1	222825761	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr1	222826481	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:1,7:4,12:1,4,10,9
chr1	222832010	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=190,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.238:22:7,2:10,2:15,2,3,2
chr1	222833538	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:6,6:10,2:8,8,3,5
chr1	222867687	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=227,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:0,5,0,5
chr1	222892400	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=147,102;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,2:5,0:0|1:222892400_T_C:222892400:3,9,0,2
chr1	222892413	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=165,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:0|1:222892400_T_C:222892400:2,12,0,2
chr1	222904869	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.241:15:3,1:8,2:4,8,0,3
chr1	222920135	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=170,143;MMQ=60,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:3,0:7,11:0,10,0,11
chr1	222923001	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr1	223152868	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	223156382	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,15:0,10:0,0,8,17
chr1	223156406	.	CTTT	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=T;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:8,1:10,1:5,17,1,1
chr1	223168205	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.127:26:11,1:10,2:19,4,3,0
chr1	223179250	.	AT	CC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=160,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,0:5,2:0|1:223179250_AT_CC:223179250:1,8,1,1
chr1	223179253	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=160,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,0:5,1:0|1:223179250_AT_CC:223179250:1,8,1,1
chr1	223397037	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=172,340;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr1	223532570	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,1:1,2:1,5,0,3
chr1	223568522	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:4,2:9,0:8,6,1,1
chr1	223712863	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=186,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,1:2,2:1,4,1,2
chr1	223712870	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=109,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr1	223712903	.	G	GGCTGA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:223712903_G_GGCTGA:223712903:0,0,0,1
chr1	223712913	.	GCA	CTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=257,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:223712903_G_GGCTGA:223712903:0,2,0,1
chr1	223715248	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:7,4:8,3:5,10,2,5
chr1	223716349	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	223717379	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	223718518	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	223718567	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=168,115;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,2:8,0:7,6,3,0
chr1	223722646	.	T	TA,TAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,25,28;MFRL=120,209,152;MMQ=60,60,60;MPOS=14,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=A;STR;TLOD=16.37,4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,8,3:0.542,0.235:14:1,2,2:2,6,1:3,0,9,2
chr1	223722780	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=162,222;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr1	223814671	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,5:0,4:1,0,7,2
chr1	223816322	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=47.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,8:0,5:0,1,12,1
chr1	223816347	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,8:0,5:0,1,11,2
chr1	223816577	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	223853440	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	223900408	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,14:0,4:0,0,8,10
chr1	223900612	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.438:23:7,5:6,5:2,11,2,8
chr1	223938565	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=197,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=94.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.936:29:1,16:0,12:1,0,13,15
chr1	223959994	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:1,0:2,2:0,4,0,2
chr1	223984092	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=181,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.195:18:8,2:7,1:7,8,2,1
chr1	223984306	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=239,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.305:8:1,1:4,1:0,6,0,2
chr1	223990623	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:5,2:3,1:0,8,1,2
chr1	224301749	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=114,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr1	224302154	.	T	TGAG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=64.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,1,14
chr1	224318151	.	T	TTTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTG;STR;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr1	224321984	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	224341053	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=227,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:224341053_A_C:224341053:0,4,0,1
chr1	224341055	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=227,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:224341053_A_C:224341053:0,4,0,1
chr1	224345012	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr1	224380234	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=217,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr1	224418834	.	CAA	C,CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34,33;MFRL=264,138,265;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.19,3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,2:0.248,0.388:5:1,1,1:1,0,1:2,0,3,0
chr1	224444628	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr1	224444901	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr1	224492381	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chr1	224505570	.	T	TAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=53.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,6,8
chr1	224505719	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	224514275	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	224517907	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=47.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,2,13
chr1	224544529	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr1	224599311	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=170,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:224599311_G_A:224599311:1,2,0,1
chr1	224599313	.	GTAATAA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=170,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=TAA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:224599311_G_A:224599311:1,2,0,1
chr1	224868596	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr1	224872443	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=157,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,3:7,3:7,5,4,2
chr1	224872473	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=149,95;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.383:24:9,6:6,3:5,10,4,5
chr1	225142710	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:8,4:15,2:9,15,2,4
chr1	225142722	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=145,143;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:13,0:14,4:13,14,0,4
chr1	225230608	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,8:0,0,11,8
chr1	225230895	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	225231636	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=167,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.364:17:4,0:7,6:3,8,1,5
chr1	225237850	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr1	225267274	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=234,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:2,1:0,5,1,1
chr1	225341515	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:11,3:14,0:7,18,3,0
chr1	225346975	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=163,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr1	225380414	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,98;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,3:4,0:7,3,3,0
chr1	225380561	.	CAAAG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAG;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:3,0:5,4,1,1
chr1	225439988	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=196,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,4:5,3:5,3,6,1
chr1	225445589	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=194,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.409:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr1	225445652	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:8,1:4,3:10,2,4,0
chr1	225460626	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=254,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr1	225460884	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,27;MFRL=175,127;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:225460884_C_T:225460884:0,3,0,1
chr1	225460886	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=35,24;MFRL=175,127;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:225460884_C_T:225460884:0,3,0,1
chr1	225460897	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=33,30;MFRL=175,127;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225460897_G_T:225460897:0,1,0,1
chr1	225460899	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=33,30;MFRL=238,127;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:225460897_G_T:225460897:0,2,0,1
chr1	225460901	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=30,25;MFRL=301,127;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:225460897_G_T:225460897:0,3,0,1
chr1	225460903	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=23,31;MFRL=301,127;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:225460897_G_T:225460897:0,3,0,1
chr1	225460905	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=30,29;MFRL=301,127;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:225460897_G_T:225460897:0,3,0,1
chr1	225460909	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=35,28;MFRL=301,127;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:225460897_G_T:225460897:0,3,0,1
chr1	225460912	.	A	ATTGCT	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=27,23;MFRL=333,127;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:225460897_G_T:225460897:0,2,0,1
chr1	225477869	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr1	225521044	.	T	TATTGTTATAATAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=210,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:5,0:1,2:4,2,1,1
chr1	225521077	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=230,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:4,0:4,3,1,2
chr1	225562385	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,13,9
chr1	225576058	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,11,0
chr1	225577648	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr1	225586752	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=148,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr1	225600351	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=134,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:7,6:9,3:4,12,3,6
chr1	225603029	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=195,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:9,7:5,9:10,4,6,10
chr1	225603103	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	225605661	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,159;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:9,5:10,0:15,4,5,0
chr1	225605840	.	A	AG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:8,0:8,7:7,9,0,7
chr1	225611845	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,4:1,5:0,1,0,9
chr1	225685621	.	TAAG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	225686222	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:8,0:4,5:0,12,0,5
chr1	225688923	.	T	TGG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=195,262;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:3,0:0|1:225688923_T_TGG:225688923:0,7,0,2
chr1	225688926	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=195,262;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:2,0:0|1:225688923_T_TGG:225688923:0,7,0,2
chr1	225707271	.	GAAA	G,GAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=17,25,17;MFRL=58,149,176;MMQ=60,60,60;MPOS=14,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.74,9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,5:0.185,0.455:11:0,1,0:1,0,1:0,4,0,7
chr1	225965527	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=187,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,4:2,4:8,0,7,1
chr1	226016492	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=173,69;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:7,2:14,1:10,11,2,1
chr1	226016633	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:1,2:4,2:1,4,1,3
chr1	226027067	.	GGTGT	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=218,239;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=GT;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.280:7:3,0:1,2:0,5,0,2
chr1	226027103	.	TCCTCTAAGAA	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=196,170;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.235:18:4,4:4,0:0|1:226027103_TCCTCTAAGAA_T:226027103:0,14,0,4
chr1	226027116	.	GGACC	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=196,170;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.263:16:6,3:5,0:0|1:226027103_TCCTCTAAGAA_T:226027103:0,12,0,4
chr1	226033030	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,4:3,0:0,4,2,2
chr1	226034839	.	TCTG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=189,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CTG;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:3,1:8,1:11,6,1,1
chr1	226036309	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=166,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,5:3,1:0,3,0,6
chr1	226043474	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=214,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr1	226044489	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.915:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr1	226044500	.	GC	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=202,248;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,0:4,4:5,7,2,2
chr1	226044591	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=174,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.372:19:6,5:6,1:9,3,5,2
chr1	226048746	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,1,3
chr1	226049909	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=204,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,2:3,1:7,1,3,0
chr1	226050222	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=157,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:8,0:14,3:11,12,0,3
chr1	226061956	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=116,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.273:31:7,5:16,3:12,11,3,5
chr1	226074373	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=178,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	226075410	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=259,133;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	226108894	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.285:26:7,5:10,2:0|1:226108894_C_T:226108894:10,9,5,2
chr1	226108899	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.310:27:8,6:11,2:0|1:226108894_C_T:226108894:9,10,5,3
chr1	226125178	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=181,221;MMQ=52,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,0:3,2:10,3,1,1
chr1	226125543	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=51.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,3,11
chr1	226127443	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	226180026	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=234,233;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr1	226252232	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=76.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,13:0,0,2,22
chr1	226253316	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=58.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,9:0,0,15,5
chr1	226334578	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	226334605	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,37;MFRL=220,204;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:226334605_T_C:226334605:0,3,0,1
chr1	226334611	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=220,204;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:226334605_T_C:226334605:0,3,0,1
chr1	226334615	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=220,204;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:226334605_T_C:226334605:0,3,0,1
chr1	226340049	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=130,50;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:7,2:11,1:8,11,1,2
chr1	226352498	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=119,126;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:1,5:5,5:3,3,6,4
chr1	226353521	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,6:2,4:6,2,6,4
chr1	226353593	.	AC	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=90,117;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.149:45:16,6:15,0:33,6,6,0
chr1	226420722	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,5:2,1:3,0,6,0
chr1	226438449	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=163,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr1	226455784	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=179,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:8,0:6,6:7,7,0,6
chr1	226465693	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=231,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr1	226485327	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=131,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr1	226485496	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,1:7,2:3,11,1,2
chr1	226488826	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=12382833,240;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr1	226496811	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=195,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,4:6,2:2,10,5,1
chr1	226550741	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=128,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:5,4,4,0
chr1	226556094	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	226567563	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=165,273;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:4,2,2,0
chr1	226573402	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=188,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,1:5,4:1,8,1,4
chr1	226576270	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=245,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,4:3,3:6,0,6,1
chr1	226576296	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=175,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:9,1,3,1
chr1	226578047	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr1	226578099	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0,0,10,9
chr1	226579981	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=167,87;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:4,0:15,3:8,12,1,2
chr1	226580021	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=171,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:8,2:7,1:4,11,1,2
chr1	226589709	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=263,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.770:14:1,5:1,6:3,0,11,0
chr1	226595647	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=182,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:3,6:0,10:0,3,8,8
chr1	226822594	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:226822594_A_G:226822594:6,6,0,2
chr1	226822601	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:5,0:0|1:226822594_A_G:226822594:5,7,0,2
chr1	226825341	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=163,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:1,3,4,1
chr1	226923146	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=219,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.674:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr1	226923264	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.586:22:6,7:3,6:6,3,6,7
chr1	227069677	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=216,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,26:0.750:34:4,10:4,16:5,3,13,13
chr1	227069737	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=215,159;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.778:25:4,9:1,11:0,5,7,13
chr1	227071364	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=195,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,8:2,5:5,1,12,1
chr1	227071377	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=218,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,7:4,6:7,2,11,2
chr1	227073410	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=219,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr1	227078955	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:4,5:3,4:0|1:227078955_T_C:227078955:6,3,6,3
chr1	227078964	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:18,2:0.136:20:10,2:8,0:1|0:227078955_T_C:227078955:11,7,2,0
chr1	227081622	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=228,111759071;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr1	227081850	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=291,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.711:12:2,2:1,6:0,3,0,9
chr1	227170768	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:2,2,2,2
chr1	227171584	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	227171736	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=210,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr1	227171738	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=210,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr1	227171769	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=196,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,3:5,0:9,3,3,0
chr1	227171958	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr1	227172518	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=194,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:3,0,3,3
chr1	227172903	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	227172935	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=201,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	227174122	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=206,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,6:0,0:1,0,4,2
chr1	227174145	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,3,3
chr1	227181923	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,10,1
chr1	227182179	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	227192579	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=235,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:2,1,2,3
chr1	227198775	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=98,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.815:14:0,6:2,6:0,2,4,8
chr1	227216421	.	C	CATTA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=160,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:6,2:1,0:0|1:227216421_C_CATTA:227216421:3,5,1,1
chr1	227216423	.	G	GCTGACAGCTCATCAGTAGAAGC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=160,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.242:10:7,2:1,0:0|1:227216421_C_CATTA:227216421:3,5,1,1
chr1	227216775	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=140,198;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,1:6,2:7,5,2,1
chr1	227218069	.	C	CAT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=126,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,3:1,0,4,2
chr1	227218085	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.503:14:5,3:2,4:3,4,4,3
chr1	227221222	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr1	227222515	.	G	GACAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAA;STR;TLOD=40.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,3:0,0,0,10
chr1	227223367	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=208,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,1,1
chr1	227239562	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,1:13,2:15,8,2,1
chr1	227239739	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:2,1:6,2:0|1:227239739_T_A:227239739:0,8,0,3
chr1	227239746	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=122,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0|1:227239739_T_A:227239739:0,4,0,5
chr1	227247016	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,3:6,0:9,4,2,1
chr1	227259884	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,2:8,4:5,9,5,1
chr1	227288655	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:2,7:2,7:3,1,12,2
chr1	227299978	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,228;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:5,1,4,1
chr1	227300277	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=173,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,4,2
chr1	227330759	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=250,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,3:3,3:1,2,2,4
chr1	227330783	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=219,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:2,2,0,4
chr1	227387361	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,5:1,3:0,4,3,5
chr1	227400792	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,7:2,6:4,2,11,2
chr1	227400833	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:15,0:12,4:15,12,0,4
chr1	227504613	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	227834233	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=181,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.810:8:1,2:0,5:1,0,4,3
chr1	227834400	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=181,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:3,6:0,4:1,2,2,8
chr1	227920061	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=117,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:0,9:5,3:2,3,5,7
chr1	227920665	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=188,181;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:4,6,1,4
chr1	227920667	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=187,90;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:5,8,0,2
chr1	227921236	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=174,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,0:9,2:8,7,1,1
chr1	227922640	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=88,252;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,1,3
chr1	227935355	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,0:0,8:0,0,7,1
chr1	227935762	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=208,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:3,4,2,3
chr1	228109319	.	C	CATCCTCTCCA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=180,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:0|1:228109319_C_CATCCTCTCCA:228109319:7,15,1,1
chr1	228109320	.	G	GATGCCCAGCCTCATT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=180,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:11,2:11,0:0|1:228109319_C_CATCCTCTCCA:228109319:7,15,1,1
chr1	228112121	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=314,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:0,9:2,3:2,0,3,9
chr1	228290033	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,0:5,2:6,3,1,1
chr1	228295926	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=146,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.173:42:15,6:20,0:17,18,7,0
chr1	228401329	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=173,198;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,2:6,1:0,8,0,3
chr1	228402121	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=125,242;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:5,3:6,3:7,4,3,3
chr1	228404668	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=320,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr1	228404690	.	CC	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=157,250;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:4,0,1,0
chr1	228412106	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=212,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,4,2
chr1	228412227	.	TG	CA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,4:2,7:5,1,5,8
chr1	228412272	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=162,178;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,0:11,2:9,12,2,0
chr1	228412308	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=191,158;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,23:0.775:29:3,10:2,13:1,5,13,10
chr1	228430956	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=135,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:1,0:11,1:0|1:228430956_C_T:228430956:8,5,1,1
chr1	228430963	.	C	CAGCTCAGCGGCCGTCTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=137,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:1,0:12,2:0|1:228430956_C_T:228430956:8,6,1,1
chr1	228431095	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=200,155;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.724:27:3,11:4,9:4,3,11,9
chr1	228431235	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=206,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:0,4,0,7
chr1	228431930	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:7,4:1,3:8,0,7,0
chr1	228434602	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	228437603	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.665:19:3,3:3,9:6,0,12,1
chr1	228444297	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=224,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:4,2,4,2
chr1	228444318	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:3,6:0,3:2,1,8,1
chr1	228456147	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=301,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,7:1,1:1,0,8,0
chr1	228461381	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=219,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:2,2:5,3:6,2,3,2
chr1	228461408	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,2:0,8:0,0,6,4
chr1	228461757	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=70,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,5:2,1:1,2,2,4
chr1	228462154	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,0:6,2:3,11,1,1
chr1	228462412	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=203,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,4:3,0:3,4,4,0
chr1	228464154	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,274;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	228464842	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=277,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:0,7:1,4:0,1,9,2
chr1	228465370	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	228466750	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=236,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,3,1
chr1	228466856	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=173,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,1:5,1:7,6,1,1
chr1	228469796	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=154,192;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.243:31:12,6:11,1:12,12,7,0
chr1	228469870	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=149,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.222:34:19,5:8,2:15,12,3,4
chr1	228471200	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,152;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:11,0:8,4:11,8,0,5
chr1	228474840	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=286,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr1	228475747	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=191,162;MMQ=60,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:3,7:12,0:10,5,7,0
chr1	228476414	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=125,255;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:12,7,1,1
chr1	228480964	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	228481315	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:3,4,0,2
chr1	228496066	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:4,2:5,2:5,5,2,2
chr1	228497053	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.690:11:2,6:1,1:1,2,2,6
chr1	228497286	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=132,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:1,1:4,1:2,3,0,2
chr1	228504645	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=289,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	228505699	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=241,126;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.827:21:1,7:2,11:2,1,10,8
chr1	228505727	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=130,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,1:9,1:9,8,0,2
chr1	228505739	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=228,122;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:1,8:3,8:2,2,6,10
chr1	228506661	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,4:4,6:2,8,3,7
chr1	228509427	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=252,207;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:2,3:3,3:6,0,2,4
chr1	228523412	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=154,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,3:4,0:3,1,3,0
chr1	228523442	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=128,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,5:3,0:4,3,4,1
chr1	228523447	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,10,5
chr1	228523618	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=183,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:2,5,0,3
chr1	228525898	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=207,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,1,1
chr1	228529826	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:4,0:7,6,1,1
chr1	228547256	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=124,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:3,3,1,2
chr1	228548197	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=205,283;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:3,2,0,2
chr1	228556788	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:3,4:1,2:4,0,2,4
chr1	228558522	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=192,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:1,8,0,2
chr1	228559654	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,3:5,2:6,7,2,3
chr1	228564844	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:228564844_A_G:228564844:1,3,0,1
chr1	228564849	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:228564844_A_G:228564844:1,2,0,1
chr1	228565445	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=195,269;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:2,2,2,0
chr1	228584930	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.279:15:5,0:4,0:0|1:228584930_T_C:228584930:1,10,4,0
chr1	228584935	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.281:15:5,0:5,2:0|1:228584930_T_C:228584930:1,10,4,0
chr1	228584940	.	TG	CC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.281:15:5,0:5,1:0|1:228584930_T_C:228584930:1,10,4,0
chr1	228588654	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=219,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr1	228595893	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:6,5,1,1
chr1	228601638	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr1	228602660	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=199,291;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:9,13,1,1
chr1	228613052	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=211,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.802:18:1,8:2,7:1,2,3,12
chr1	228645063	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,1:0,10:0,0,11,0
chr1	228646356	.	C	CGTGT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=GT;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.445:18:5,4:4,2:6,4,6,2
chr1	228646473	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.108:43:21,4:18,0:19,20,0,4
chr1	228647697	.	ATT	A,AT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,25,29;MFRL=189,198,150;MMQ=60,54,60;MPOS=14,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.15,13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,8:0.205,0.386:20:5,3,3:3,1,5:3,5,4,8
chr1	229385407	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=125,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,2:5,1:4,4,1,2
chr1	229385927	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,17;MFRL=302,249;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:229385927_G_A:229385927:2,0,1,0
chr1	229385932	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=302,249;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:229385927_G_A:229385927:2,0,1,0
chr1	229385938	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=285,249;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:229385927_G_A:229385927:3,0,1,0
chr1	229386324	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=187,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:7,7:18,0:15,10,7,0
chr1	229422193	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:9,4:2,0:7,4,2,2
chr1	229462408	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=174,18800975;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0|1:229462408_C_T:229462408:12,0,2,0
chr1	229462415	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=170,18800975;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:0|1:229462408_C_T:229462408:13,0,2,0
chr1	229568231	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr1	229600326	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=226,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:1,1,2,1
chr1	229606493	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=123,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:3,2:10,1:6,7,3,0
chr1	229633790	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr1	229662901	.	CAA	C,CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34,35;MFRL=154,170,226;MMQ=60,60,60;MPOS=14,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.47,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.250,0.327:7:1,2,2:1,0,0:3,0,4,0
chr1	229663064	.	GAGGAA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGGAA;STR;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.922:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr1	229730691	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,3:8,2:7,7,1,4
chr1	229738170	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,10:0,21:0,0,21,10
chr1	229738193	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:8,0:9,7:12,5,4,3
chr1	229746019	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr1	229779534	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=174,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr1	229781532	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr1	229781744	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,2,10
chr1	229783236	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0|1:229783236_T_C:229783236:0,0,12,0
chr1	229783240	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,4:0,6:0|1:229783236_T_C:229783236:0,0,12,0
chr1	229790048	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=295,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.820:20:2,6:1,11:3,0,8,9
chr1	229795045	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=186,217;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:2,3:12,4:1,13,2,5
chr1	229795070	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=208,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,4:5,8:2,8,0,12
chr1	230313911	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=188,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:3,3,1,4
chr1	230371883	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=230,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:0,7:4,5:2,2,3,9
chr1	230372061	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=212,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:5,3,2,2
chr1	230384843	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=186,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr1	230386341	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=222,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr1	230398445	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=257,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.615:8:2,2:0,3:2,1,2,3
chr1	230410162	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.236:18:5,1:8,2:9,5,2,2
chr1	230410374	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr1	230415025	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,12:0,7:0,0,14,5
chr1	230415293	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=226,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	230459433	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=176,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	230473103	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=217,281;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	230497940	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	230503684	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,10,5
chr1	230503925	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:12,4:5,2:3,14,0,6
chr1	230778243	.	AC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,2:0,6:2,0,8,0
chr1	230778491	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=190,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr1	230795177	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=193,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,1:3,6:4,0,4,3
chr1	230798864	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.402:20:5,2:7,6:8,4,7,1
chr1	230800358	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=194,56;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:0,5,0,4
chr1	230819295	.	ATTC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=133,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTC;STR;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,2:5,0:3,6,2,0
chr1	230819479	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,22;MFRL=228,321;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:0,0:0,1,0,2
chr1	230822607	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=209,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,6:1,2:2,0,8,0
chr1	230822903	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=222,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:1,5,0,4
chr1	230825942	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=226,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,3:0,0:0,1,0,4
chr1	230828987	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=215,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:0,6:1,9:0,1,11,4
chr1	230838940	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=214,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:7,6,1,1
chr1	230841687	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,120;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.667:25:0,6:8,11:2,6,9,8
chr1	230845900	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:3,3,1,1
chr1	230883466	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=176,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,1:9,2:6,8,1,2
chr1	230883484	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=232,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,1:3,5:3,3,1,5
chr1	230883499	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=226,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,1:1,6:1,3,1,6
chr1	230891248	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=80,266;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr1	230898615	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=240,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr1	230904911	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,1:5,3:4,7,3,1
chr1	230914706	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:8,1:6,4:0|1:230914706_C_A:230914706:9,6,4,1
chr1	230914729	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=172,118;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,13:0.523:25:6,6:4,7:0|1:230914706_C_A:230914706:8,4,4,9
chr1	230915827	.	CGTGTGTGT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=220,277;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=GT;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr1	230923187	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=229,93;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:4,1,3,0
chr1	230928089	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=171,156;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:5,8:3,0:8,0,9,0
chr1	230928512	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,225;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:6,0,4,0
chr1	230937435	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=147,232;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,0:9,4:2,15,0,4
chr1	231047310	.	TAC	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.964:22:0,5:0,17:0,0,10,12
chr1	231047392	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr1	231051977	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,58;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,2:11,0:11,12,0,2
chr1	231057310	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr1	231060736	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	231064611	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=183,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:1,0,7,0
chr1	231066951	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=318,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	231067236	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=324,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:2,2:0,14:0,2,2,14
chr1	231067318	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=302,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:1,1,3,2
chr1	231069652	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr1	231081304	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=279,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,1:2,5:0,3,0,6
chr1	231094050	.	GAAAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,35;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,12;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.280:5:1,1:0,0:2,2,1,0
chr1	231114915	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=160,284;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:5,1:5,1:7,5,2,0
chr1	231377081	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,277;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:7,2:4,1:9,3,2,1
chr1	231396485	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=185,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:0,0:5,2:0,5,0,2
chr1	231401596	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=165,212;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,3:3,1:2,9,1,3
chr1	231480507	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=184,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=45.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.849:15:1,5:0,8:2,0,5,8
chr1	231486989	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=105,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr1	231487017	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=109,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:3,5:0,5:2,1,7,3
chr1	231502310	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=201,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,0,3
chr1	231509769	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,112;MMQ=60,35;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:13,0:14,6:17,10,0,6
chr1	231665038	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:16,2:9,3:13,12,4,1
chr1	231936016	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	232002392	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=215,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,0:7,3:1,13,1,2
chr1	232094560	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,536;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:10,0:12,5:6,16,5,0
chr1	232535030	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr1	232535060	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=221,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	232538161	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,2:9,0:12,9,2,0
chr1	232551416	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=213,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:4,4:0,4:1,3,0,8
chr1	232564162	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=138,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:13,5:4,6:8,9,6,5
chr1	232568293	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=232,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,4:1,6:0,1,1,9
chr1	232581247	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,3:2,9:5,0,11,1
chr1	232581436	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=180,106;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:3,2:12,6:4,11,2,6
chr1	232601208	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=228,304;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr1	232607050	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=153,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.587:10:0,4:4,2:3,1,6,0
chr1	232607094	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,8:3,0:4,1,6,2
chr1	232619629	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.273:30:12,0:10,7:10,12,0,8
chr1	232629475	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:0,4,0,6
chr1	232943980	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,97;MMQ=60,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,2:12,0:8,14,2,0
chr1	232944176	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.250:38:15,9:14,0:20,9,9,0
chr1	233091276	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=217,206;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=T;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.303:12:5,3:3,0:8,1,3,0
chr1	233091305	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,16;MFRL=132,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.298:18:7,0:3,0:0|1:233091305_G_T:233091305:3,10,5,0
chr1	233091315	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=33,15;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.210:26:11,1:6,0:0|1:233091305_G_T:233091305:7,14,5,0
chr1	233091318	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=33,22;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.177:31:13,2:7,1:0|1:233091305_G_T:233091305:8,18,5,0
chr1	233091322	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=142,137;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.158:29:12,0:11,0:0|1:233091305_G_T:233091305:7,18,4,0
chr1	233119951	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=214,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,6:1,0:2,0,6,0
chr1	233121884	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.420:22:5,6:7,3:4,9,6,3
chr1	233135198	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=16,17;MFRL=131,115;MMQ=54,41;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.551:7:0,0:0,1:0,3,0,4
chr1	233152910	.	A	AAAAGCAAGATTTTGAGTCCTCACAGCTATTCT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.206:19:7,1:8,0:4,12,0,3
chr1	233160950	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=202,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.298:28:11,5:9,3:10,10,4,4
chr1	233225957	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,3:5,1:1,8,2,2
chr1	233295992	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=250,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.313:10:2,2:3,1:6,1,3,0
chr1	233337912	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=129,54;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:18,0:18,3:16,22,0,3
chr1	233388450	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:12,3:11,4:9,14,5,2
chr1	233397752	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:4,0,4,1
chr1	233398670	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr1	233398927	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:233398927_C_G:233398927:0,6,0,2
chr1	233398931	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:5,0:0|1:233398927_C_G:233398927:0,6,0,2
chr1	233431030	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:9,4:10,1:14,5,2,3
chr1	233431241	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=161,249;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,2:5,0:2,7,0,2
chr1	233489499	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=279,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr1	233489529	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=193,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,2:3,6:2,2,7,1
chr1	233489707	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=190,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.790:22:3,9:1,9:2,2,9,9
chr1	233490536	.	A	AATGTCTTGGGGATAATCTG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=295,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.800:13:1,4:1,0:0|1:233490536_A_AATGTCTTGGGGATAATCTG:233490536:2,0,10,1
chr1	233490543	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=266,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=47.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,12:0.764:15:2,7:1,5:0|1:233490536_A_AATGTCTTGGGGATAATCTG:233490536:3,0,11,1
chr1	233490764	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=164,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,4:1,7:1,2,3,8
chr1	233490776	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=255,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:1,4,1,8
chr1	233508042	.	T	TATCCATGTCGGTAGCTGCAAACAGCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=371,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	233511913	.	TAGAG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=197,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=AG;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr1	233512362	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=329,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	233749855	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,37;MFRL=158,399;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	233802576	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:20,1:9,2:10,19,0,3
chr1	233802779	.	TTTTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTA;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.718:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	233807093	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,2:9,0:14,7,2,0
chr1	234444761	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,1:4,2:9,0,3,0
chr1	234454405	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	234509876	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,16;MFRL=163,225;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:2,0:0,0:2,1,3,0
chr1	234563405	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=154,76;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.132:35:19,0:12,4:17,14,1,3
chr1	234563556	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=183,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,3:6,3:0,10,0,6
chr1	234565078	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=214,234;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:4,3,1,1
chr1	234565787	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=167,242;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.297:15:8,3:2,1:7,4,3,1
chr1	234569192	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=150,236;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:8,3:3,1:7,5,3,1
chr1	234573171	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=113,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:11,3:7,0:1,17,0,3
chr1	234573172	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=113,113;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:14,0:3,4:1,16,0,4
chr1	234582457	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=174,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:0,2:1,1:0|1:234582457_C_T:234582457:1,0,4,0
chr1	234582461	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=256,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0|1:234582457_C_T:234582457:3,0,3,0
chr1	234582651	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,3:4,7:3,4,4,6
chr1	234593403	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:3,6:4,11:4,3,7,10
chr1	234596202	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	234607055	.	TG	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.206:12:5,1:5,1:2,8,0,2
chr1	234744413	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=230,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr1	234744503	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,333;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	234745009	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	235285740	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,3:1,2:3,4,1,4
chr1	235295214	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:7,7,0,2
chr1	235301496	.	CAA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=120,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:4,0:6,1:5,10,0,2
chr1	235357259	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	235357303	.	A	ATG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=199,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr1	235357314	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=174,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:6,0,3,0
chr1	235357543	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,2:6,3:1,8,2,3
chr1	235384838	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=220,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,1:0,1:2,0,2,0
chr1	235394554	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=195,126;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr1	235403595	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=139,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:9,3,2,0
chr1	235505313	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=188,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.525:13:3,4:3,3:4,2,4,3
chr1	235506853	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.537:28:7,9:5,6:7,6,8,7
chr1	235506865	.	C	CA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=113,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.432:26:6,8:9,2:7,8,4,7
chr1	235507466	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=294,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.652:6:1,2:0,0:1,1,0,4
chr1	235543281	.	TCC	AAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=16,10;MFRL=164,169;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0|1:235543281_TCC_AAA:235543281:4,0,1,0
chr1	235543286	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,10;MFRL=164,169;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:235543281_TCC_AAA:235543281:4,0,1,0
chr1	235543291	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=17,16;MFRL=164,169;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0|1:235543281_TCC_AAA:235543281:4,0,1,0
chr1	235582924	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=200,249;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:3,2:4,0:0,8,0,2
chr1	235594182	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=203,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	235611801	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=209,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:235611801_C_CT:235611801:4,5,0,2
chr1	235611807	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=209,99;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:235611801_C_CT:235611801:4,5,0,2
chr1	235618788	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=136,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:4,2:1,0:4,1,2,0
chr1	235628908	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,6:2,6:3,2,9,3
chr1	235647631	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,5:1,2:4,0,4,3
chr1	235715523	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=172,221;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:1,5,1,5
chr1	235715556	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=206,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr1	235826382	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=114,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.707:8:2,3:0,3:0,2,0,6
chr1	235856860	.	A	AGAGAATTCTGCTTCCTCTCATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=199,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	235860340	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr1	235866014	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=208,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:7,0,4,0
chr1	235872665	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=214,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr1	235896726	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	235915331	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:13,4:11,0:13,12,4,0
chr1	235918688	.	C	CAAAAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,344;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AAAAG;STR;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.781:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	235922196	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=198,237;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr1	235938388	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=191,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,1:3,0:2,5,1,1
chr1	235945480	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,283;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	236141366	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:0,9,0,2
chr1	236176846	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,1:13,1:11,11,2,0
chr1	236205121	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=278,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,1:2,1:1,1,3,0
chr1	236208688	.	AT	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=229,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	236209024	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=213,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr1	236209081	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=360,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	236368391	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=173,250;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:10,3,2,0
chr1	236381897	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=139,255;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:8,1:13,2:15,6,1,2
chr1	236381981	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,0:8,7:0,15,0,7
chr1	236381987	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=140,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:4,1:13,1:0|1:236381987_A_G:236381987:0,17,0,2
chr1	236381989	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=35,25;MFRL=140,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,1:7,1:0|1:236381987_A_G:236381987:0,17,0,2
chr1	236384278	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=191,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,3:1,6:1,4,2,7
chr1	236385116	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=196,246;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	236385165	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:1,1:7,3:0|1:236385165_G_C:236385165:8,0,3,1
chr1	236385173	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=151,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:2,1:7,3:0|1:236385165_G_C:236385165:8,1,3,1
chr1	236385360	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=126,255;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,3:5,0:1,9,0,3
chr1	236385379	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=136,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:0,8,0,3
chr1	236389500	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=167,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr1	236389859	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=177,328;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:2,0:5,2:5,3,1,1
chr1	236389926	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=177,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,0:4,2:8,5,1,1
chr1	236390131	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=150,271;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	236393654	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr1	236396048	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:3,4:8,1:7,4,5,0
chr1	236396144	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=178,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,2:11,0:7,18,0,2
chr1	236399752	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=270,262;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	236399772	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=270,262;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	236433135	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr1	236557771	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,16,5
chr1	236572475	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:2,3:4,3:6,0,6,1
chr1	236590659	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=206,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr1	236590816	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=130,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,0:1,5:1,3,0,5
chr1	236631633	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=171,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,7:2,4:2,4,3,8
chr1	236700807	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=145,212;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:3,2,1,5
chr1	236700823	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,1:6,4:6,4,2,3
chr1	236700857	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=107,222;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,1:6,4:9,4,3,2
chr1	236700982	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=214,266;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr1	236702117	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=159,271;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:7,1,2,1
chr1	236702153	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=131,271;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:2,1:10,2:7,6,1,2
chr1	236702374	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=108,334;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:13,0:6,4:9,10,2,2
chr1	236702447	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=161,244;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:2,2:0|1:236702447_T_G:236702447:1,5,1,2
chr1	236702450	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,36;MFRL=162,244;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0|1:236702447_T_G:236702447:1,4,1,2
chr1	236702475	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=231,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr1	236703767	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=171,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr1	236703832	.	CG	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=164,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:11,0:3,2:11,3,1,1
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chr1	236704891	.	TAAA	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=126,240;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:4,2:5,3:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:8,4,4,1
chr1	236704897	.	ATT	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=126,240;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:5,2:8,3:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:8,5,4,1
chr1	236706352	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=176,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:1,6,1,1
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chr1	236708022	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr1	236708224	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=139,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:6,2:4,12,1,1
chr1	236711297	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=98,271;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,3:3,1:6,3,4,0
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chr1	236714335	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,3:9,0:1,12,0,3
chr1	236714384	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr1	236716833	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,1:1,1:8,1,2,0
chr1	236717102	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=187,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:2,4:6,1:0|1:236717102_A_T:236717102:0,8,0,5
chr1	236717104	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=179,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,7:0.534:13:4,1:1,6:1|0:236717102_A_T:236717102:0,6,0,7
chr1	236718524	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=153,298;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	236718561	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=156,245;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr1	236719259	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=172,299;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:3,2,2,4
chr1	236721452	.	GA	G,GAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35,36;MFRL=196,221,216;MMQ=60,60,60;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.58,3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.334,0.246:9:2,2,2:2,1,0:4,0,5,0
chr1	236722489	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=144,267;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:0,3:0,2,1,4
chr1	236723177	.	GC	AA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=107,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.349:24:9,4:6,4:3,13,0,8
chr1	236724605	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=126,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.334:19:2,2:11,4:4,9,2,4
chr1	236729867	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=199,280;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr1	236732197	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:236732197_AC_A:236732197:1,0,2,0
chr1	236732202	.	AAAAAAAAAC	A,CAAAAAAAAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,23,32;MFRL=155,181,205;MMQ=60,60,60;MPOS=18,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,0,0:1,1,1:2,0,2,0
chr1	236732204	.	AAAAAAACT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=155,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:1,1:0|1:236732197_AC_A:236732197:2,0,1,0
chr1	236735939	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=170,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:4,6:5,2:7,2,6,3
chr1	236737888	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=220,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr1	236740039	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.415:15:2,3:6,2:5,4,5,1
chr1	236744712	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=171,279;MMQ=60,60;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,2:0,1:0,2,0,3
chr1	236744720	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=279,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.710:5:1,1:0,2:0,1,0,4
chr1	236746275	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=146,257;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,2:6,1:6,4,2,1
chr1	236748570	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=200,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,1:4,5:0,4,0,6
chr1	236749022	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=197,240;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr1	236749026	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=197,240;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr1	236749451	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=117,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:2,0,6,0
chr1	236749649	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=138,240;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:8,2:6,5:9,5,2,5
chr1	236755814	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=196,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,0:4,5:4,2,5,0
chr1	236755837	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=156,236;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,0:4,5:3,6,4,1
chr1	236759060	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=188,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:2,3,4,5
chr1	236766447	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=183,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:0,2:10,2:8,2,3,1
chr1	236767176	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=191,267;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:5,0,5,0
chr1	236767178	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=172,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,1:1,5:4,0,6,0
chr1	236882110	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	236883564	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	236894647	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,268;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:3,11,0,2
chr1	236899042	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=158,222;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,1:6,2:3,12,1,2
chr1	236900597	.	G	GTATATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=171,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:236900597_G_GTATATA:236900597:0,2,0,1
chr1	236900598	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=171,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:0,3:0|1:236900597_G_GTATATA:236900597:0,2,0,3
chr1	236902532	.	ATT	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:2,2:2,0:3,1,2,1
chr1	236902560	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:4,1,2,1
chr1	236902594	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=255,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:1,3:2,6:0,3,6,3
chr1	236902865	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=209,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,2:3,1:1,6,1,2
chr1	236907847	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=185,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:4,3,2,0
chr1	236912597	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=183,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,4:3,1:3,2,1,4
chr1	236917151	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:236917151_T_A:236917151:0,0,1,0
chr1	236917155	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:236917151_T_A:236917151:0,0,1,0
chr1	236917161	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=113,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:236917151_T_A:236917151:1,0,1,0
chr1	236923197	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=230,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	236924506	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr1	236972186	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=270,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,1,4
chr1	237024414	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.554:7:1,2:0,0:0|1:237024414_G_T:237024414:2,1,4,0
chr1	237024416	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.498:8:2,0:1,0:0|1:237024414_G_T:237024414:3,1,4,0
chr1	237024423	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,15;MFRL=132,146;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,0:2,0:0|1:237024414_G_T:237024414:3,2,2,0
chr1	237037051	.	A	AGCAATATCTGCATTGCAGG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=135,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:5,6,1,1
chr1	237038161	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=350,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:2,7:0,7:0,2,6,8
chr1	237057608	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr1	237057923	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=205,291;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0,12,0,2
chr1	237519137	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	237519165	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	237532763	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=218,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:6,1,2,0
chr1	237540615	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:8,2,3,1
chr1	237551376	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=185,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,6:4,4:8,2,5,5
chr1	237619875	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=184,245;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.461:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr1	237620049	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.880:23:0,13:2,7:0,2,5,16
chr1	237659767	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:5,2:5,1:9,4,3,0
chr1	237670140	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:3,1:4,1:2,5,3,0
chr1	237711644	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	237729774	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr1	237730124	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr1	237730169	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	237732395	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:6,0,2,1
chr1	237753074	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=203,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,6:1,0:2,0,6,0
chr1	237753364	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=227,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	237753390	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=227,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	237754340	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=312,279;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	237755188	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=37,32;MFRL=85,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,2:2,4:0,2,2,4
chr1	237755203	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=85,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr1	237765470	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,4:0,4,1,7
chr1	237788862	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	237802559	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	237814783	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,260;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,1:3,2:5,6,2,1
chr1	237824332	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	237831103	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,9,2
chr1	237862164	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=217,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:7,0,4,0
chr1	237862436	.	TA	CA,CG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33,30;MFRL=180,245,223;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.84,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.428,0.286:4:0,1,0:1,1,1:0,1,0,3
chr1	237863439	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr1	237863790	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=139,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:1,0:2,3:2,3,1,2
chr1	237865203	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	237872714	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=333,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chr1	237875040	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=180,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,0:3,4:3,4,4,0
chr1	237893674	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr1	237923053	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	237944814	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=204,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,1:8,4:12,1,4,1
chr1	237946964	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=182,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,10:3,4:6,3,6,8
chr1	237947552	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=199,171;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,4:8,0:8,9,5,0
chr1	237951451	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=184,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,4:4,6:3,3,2,8
chr1	237955682	.	CGT	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:237955682_CGT_C:237955682:0,0,0,1
chr1	237955698	.	CGTGTGTGTGTGTGTGT	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,5;RU=GT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:237955682_CGT_C:237955682:0,0,0,1
chr1	237955715	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:237955682_CGT_C:237955682:0,0,0,1
chr1	237955723	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,24;MFRL=191,146;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:237955682_CGT_C:237955682:0,1,0,1
chr1	237957146	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=128,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,7:1,8:1,0,13,2
chr1	237957161	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,7:1,6:1,0,10,3
chr1	237957309	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,4,9
chr1	237995986	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=205,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:237995986_C_CA:237995986:0,4,0,1
chr1	237995987	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=205,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:237995986_C_CA:237995986:0,4,0,1
chr1	237995994	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=207,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:237995986_C_CA:237995986:0,3,0,1
chr1	237996035	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,36;MFRL=395,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	238053118	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=24,16;MFRL=133,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.749:6:1,2:0,0:0|1:238053118_A_C:238053118:0,1,5,0
chr1	238053123	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=133,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.598:8:1,4:0,0:0|1:238053118_A_C:238053118:2,1,5,0
chr1	238053129	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=18,35;MFRL=114,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.425:12:1,5:1,0:0|1:238053118_A_C:238053118:3,4,5,0
chr1	238053132	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=114,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.425:12:3,3:2,0:0|1:238053118_A_C:238053118:3,4,5,0
chr1	238053137	.	CACAAGA	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=133,263;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,1:4,0:0|1:238053118_A_C:238053118:8,5,2,0
chr1	238053524	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,261;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,2:4,6:0,6,1,7
chr1	240070680	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=235,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,2:6,0:8,0,2,0
chr1	240072721	.	G	GA,GAA,GAAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,33,17,27;MFRL=105,179,132,222;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,11,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,11,12,13;RU=A;STR;TLOD=7.10,9.71,4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,4,5,2:0.234,0.305,0.150:17:1,1,0,1:5,2,2,0:4,2,6,5
chr1	240073619	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=208,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:2,3:2,2:2,2,3,4
chr1	240073884	.	GA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.248:24:11,2:6,4:11,7,4,2
chr1	240074554	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.237:21:4,4:9,0:8,8,1,4
chr1	240075307	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:12,0:15,8,2,0
chr1	240076975	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=203,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,7:7,3:5,8,5,5
chr1	240255568	.	GGGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.784:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	240341119	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=238,387;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr1	240341164	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=178,346;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	240351628	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr1	240371983	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=162,291538;MMQ=60,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:7,9,2,0
chr1	240421383	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	240421437	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,304;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	240492543	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=233,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.804:13:2,5:0,6:1,1,3,8
chr1	240492734	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,4:7,7:1,11,4,7
chr1	240519251	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C,CA	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=30,23,27;MFRL=177,146,139;MMQ=60,60,60;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=35,15,16;RU=A;STR;TLOD=3.05,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,5,2:0.347,0.203:13:1,2,0:2,1,1:0,6,0,7
chr1	240519266	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.396:8:3,1:2,2:0|1:240519266_A_G:240519266:1,4,0,3
chr1	240519270	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCTACAAG	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=151,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.396:8:1,1:2,2:0|1:240519266_A_G:240519266:0,5,0,3
chr1	240519296	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=34,22;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,1:6,2:0|1:240519266_A_G:240519266:0,11,0,3
chr1	240519300	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:0|1:240519266_A_G:240519266:0,7,0,3
chr1	240601269	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	240656530	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=209,363;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:4,11,2,0
chr1	240656824	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=238,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,3:2,2:0,5,0,5
chr1	240939391	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:4,0,2,1
chr1	240964859	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=109,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:1,2,0,2
chr1	240975213	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,1:7,2:7,8,2,1
chr1	240975435	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=179,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr1	240976878	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=217,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:4,5,3,0
chr1	240977964	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=105,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:1,1,3,0
chr1	240979663	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.323:32:11,0:11,8:7,15,0,10
chr1	240979803	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	241146322	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=219,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	241519098	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr1	241661248	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,66;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:10,3:9,0:13,6,2,1
chr1	241663925	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=157,151;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:1,0:8,3:0|1:241663925_G_C:241663925:1,8,0,3
chr1	241663929	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=157,151;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:1,0:7,3:0|1:241663925_G_C:241663925:1,8,0,3
chr1	241663933	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=157,151;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:1,0:6,3:0|1:241663925_G_C:241663925:1,6,0,3
chr1	241663937	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,36;MFRL=157,151;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,0:6,3:1,6,0,3
chr1	241667244	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr1	241712246	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=164,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:5,0:0|1:241712246_C_A:241712246:5,5,1,1
chr1	241712249	.	G	GCCTTTATCCCA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=164,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:241712246_C_A:241712246:5,5,1,1
chr1	241767930	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	241847018	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=185,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,3:2,8:1,2,5,6
chr1	241907691	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:3,3:1,4:1,4,2,5
chr1	241913062	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=224,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=53.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.909:19:1,7:0,11:0,1,3,15
chr1	241920562	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=139,239;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,1:4,1:9,3,2,0
chr1	241933876	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=179,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.849:15:0,8:1,5:1,1,7,6
chr1	241946766	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=245,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr1	241951106	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=86,231;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:3,2:24,1:25,2,3,0
chr1	241951329	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=145,116;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,4:4,0:0,6,1,3
chr1	241954005	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=235,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.550:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr1	241958401	.	C	CTTGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=210,248;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr1	241958595	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=185,39;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:241958595_T_C:241958595:3,9,1,1
chr1	241958597	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=185,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:241958595_T_C:241958595:3,9,1,1
chr1	241964559	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:0,3,1,5
chr1	242016590	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	242042141	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:8,6:7,5:13,2,11,0
chr1	242042690	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=161,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr1	242045275	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,9,10
chr1	242048514	.	G	GTAAA,GTAAATAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35,36;MFRL=109,140,204;MMQ=60,60,60;MPOS=24,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=5,6,7;RU=TAAA;STR;TLOD=11.92,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,1:0.523,0.255:5:1,2,1:0,1,0:1,0,4,0
chr1	242383201	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=221,267;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	242383352	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:8,10:5,0:7,6,10,0
chr1	242383510	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=192,272;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr1	242511556	.	AACAAAG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACAAAG;STR;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.879:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	243327520	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=203,178;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,5:2,2:3,0,7,0
chr1	243328915	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,174;MMQ=39,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,1:11,1:10,5,1,1
chr1	243332884	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=198,190;MMQ=40,24;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:1,2,2,0
chr1	243419429	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=182,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:9,4:16,3:16,9,3,4
chr1	243433654	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=196,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr1	243507680	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=193,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=43.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:2,12:2,3:0,4,3,12
chr1	243736210	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.661:10:1,3:2,3:3,0,7,0
chr1	243736301	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:4,2:8,1:8,5,1,2
chr1	243809237	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=126,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:11,3:6,0:6,11,3,0
chr1	244219033	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=200,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.279:12:3,2:6,1:4,5,1,2
chr1	244219893	.	CTCTT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:7,3:6,3:11,3,4,2
chr1	244528127	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,4:0,1,1,9
chr1	244574520	.	C	CAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,209;MMQ=56,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,16;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.281:5:0,0:4,1:4,0,1,0
chr1	244587644	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=162,329;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:5,6:12,0:5,12,0,6
chr1	244595958	.	A	ATTT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=157,239;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,6;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.259:9:1,1:5,0:1,6,0,2
chr1	244595962	.	CTTTTTTT	C,TTTTTTTT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,21,32;MFRL=158,141,249;MMQ=60,60,40;MPOS=21,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.69,6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.268,0.371:8:0,0,1:2,2,2:0,3,0,5
chr1	244596022	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=205,149;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	244601152	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=202,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,1:2,6:0,3,0,7
chr1	244624635	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=230,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr1	244624887	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=217,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	244735547	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=262,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:0|1:244735547_A_G:244735547:7,0,3,0
chr1	244735556	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0|1:244735547_A_G:244735547:0,0,9,0
chr1	244773514	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:4,2,4,0
chr1	244803205	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,6:0,3:1,0,9,0
chr1	245006461	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=148,125;MMQ=52,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.422:43:14,10:11,8:13,12,5,13
chr1	245021291	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.307:21:10,0:4,5:9,6,5,1
chr1	245022642	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=163,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:9,2:10,1:7,12,0,3
chr1	245133539	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chr1	245133549	.	GGC	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=173,254;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GC;STR;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,2,1
chr1	245133574	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=214,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:245133574_G_C:245133574:0,2,1,0
chr1	245133579	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=214,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:245133574_G_C:245133574:0,2,1,0
chr1	245180639	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=152,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.798:13:1,8:1,3:0,2,5,6
chr1	245180671	.	A	AAC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=140,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:245180671_A_AAC:245180671:2,5,1,1
chr1	245180672	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=140,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:245180671_A_AAC:245180671:2,5,1,1
chr1	245222634	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr1	245222839	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,0:0,8:0,0,0,8
chr1	245318688	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,1:2,2:6,3,2,1
chr1	245530218	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=225,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:7,1:7,1:3,12,0,2
chr1	245850296	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,1:7,3:8,4,0,4
chr1	245912840	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=189,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,6:6,3:7,3,8,1
chr1	245927242	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=243,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,2:2,2:7,0,4,0
chr1	246022071	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	246027024	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,8,0
chr1	246027029	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,9,1
chr1	246027034	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=44.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,8,3
chr1	246489706	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=188,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,1:0,2:0,1,0,6
chr1	246490438	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:246490438_T_C:246490438:0,0,5,1
chr1	246490442	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:246490438_T_C:246490438:0,0,5,1
chr1	246490452	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=133,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.402:8:3,3:2,0:0|1:246490438_T_C:246490438:4,1,2,1
chr1	246670333	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	246704563	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=239,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	246707816	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:4,5,3,0
chr1	246711789	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	246714475	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=202,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,8:3,0:4,1,8,0
chr1	246727558	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	246903654	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=196,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	246927543	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=193,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,0:7,5:8,7,0,5
chr1	246929483	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=203,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:1,3,1,2
chr1	246939610	.	A	ATATT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TATT;STR;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:3,3:2,2:2,3,3,4
chr1	246940179	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=205,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:0|1:246940179_G_A:246940179:6,2,2,0
chr1	246940182	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=205,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,1:2,1:0|1:246940179_G_A:246940179:6,2,2,0
chr1	246940442	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=238,257;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:8,5:2,1:8,3,5,2
chr1	246940790	.	TAAAGA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=235,239;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:0,2:3,1:0,4,0,3
chr1	246943547	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:15,3:4,0:15,4,3,0
chr1	247004099	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=146,241;MMQ=27,51;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,2:4,1:7,4,3,0
chr1	247007013	.	TAAATA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATA;STR;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:0,1:5,5:5,1,6,0
chr1	247007042	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:6,2:4,7:9,1,7,2
chr1	247025207	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=169,297;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,0:1,5:5,1,5,0
chr1	247025531	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=258,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr1	247039256	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:5,1,2,0
chr1	247054344	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=166,126;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,2:10,1:8,7,1,2
chr1	247055018	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=131,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,2:4,5:5,1,7,0
chr1	247061466	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=186,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,4:2,0:6,0,3,1
chr1	247063729	.	A	ACCCGCCTCGG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=180,173;MMQ=51,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:5,2:0|1:247063729_A_ACCCGCCTCGG:247063729:8,6,0,2
chr1	247063733	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=176,173;MMQ=52,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:0|1:247063729_A_ACCCGCCTCGG:247063729:9,6,0,2
chr1	247068785	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=144,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr1	247109014	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,4,1
chr1	247109168	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=142,254;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:4,2:2,5,0,2
chr1	247162658	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,16,12
chr1	247162681	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:5,1:6,2:5,7,0,3
chr1	247163187	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr1	247202032	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=37,25;MFRL=235,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,1:2,4:5,1,5,0
chr1	247241795	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=208,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:4,3,5,1
chr1	247275608	.	G	GTGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:247275608_G_GTGA:247275608:0,0,0,1
chr1	247275612	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:247275608_G_GTGA:247275608:0,0,0,1
chr1	247319830	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=183,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:7,2:2,2:6,3,4,0
chr1	247320258	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=199,156;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,2:9,1:9,10,1,2
chr1	247322967	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=160,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,2:4,0:11,4,2,0
chr1	247419509	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr1	247473546	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=240,24428174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	247486421	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=153,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:2,2,3,1
chr1	247582187	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,2:4,0:8,4,1,1
chr1	247582461	.	TATA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:247582461_TATA_T:247582461:0,0,0,1
chr1	247582466	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:247582461_TATA_T:247582461:0,0,0,1
chr1	247588927	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:247588927_T_C:247588927:0,0,0,1
chr1	247588933	.	C	CCGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:247588927_T_C:247588927:0,0,0,1
chr1	247599232	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=186,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,3:5,2:4,1,4,1
chr1	247614553	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=215,207;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:2,6,2,2
chr1	247614802	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=185,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:7,4:10,2:6,11,2,4
chr1	247615252	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=204,242;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:2,4,1,4
chr1	247615261	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.764:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr1	247654498	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=176,195;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:2,8,0,5
chr1	247655102	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=198,223;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,2:9,1:8,10,0,3
chr1	247655275	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=152,190;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.261:25:6,0:12,6:12,7,3,3
chr1	247694822	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=192,137;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,0:3,9:6,2,9,0
chr1	247729115	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	247729206	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.497:11:4,5:1,0:4,2,5,0
chr1	247729211	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=147,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.376:11:6,4:1,0:5,2,4,0
chr1	247752019	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=212,130;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:3,6:6,8:3,6,5,9
chr1	247752367	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=192,120;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,16:0.369:44:19,11:9,5:16,12,4,12
chr1	247835352	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	247835779	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=177,291;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,2:13,0:8,14,0,2
chr1	247835792	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,66;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:8,0:10,9,0,2
chr1	247875314	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,3:4,2:5,7,2,3
chr1	247886949	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=123,158;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:8,4:2,3:5,5,5,2
chr1	247921412	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=110,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:5,7:2,7:4,3,7,7
chr1	247921789	.	AGT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=172,313;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=GT;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.623:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	247978087	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr1	247978541	.	AAGG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=278,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.787:7:0,2:1,3:1,0,3,3
chr1	248004551	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=121,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.212:31:9,0:16,6:0|1:248004551_C_T:248004551:10,15,0,6
chr1	248004561	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=106,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,6:0.184:36:13,0:16,6:0|1:248004551_C_T:248004551:14,16,0,6
chr1	248004566	.	A	AG	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=25,36;MFRL=106,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.175:38:15,0:16,6:0|1:248004551_C_T:248004551:15,17,0,6
chr1	248004568	.	A	ATCGTATTTCTCCTTC	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=106,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.175:38:16,0:16,1:0|1:248004551_C_T:248004551:15,17,0,6
chr1	248004614	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,7,15
chr1	248005213	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	248024073	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr1	248058797	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	248058845	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	248058879	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr1	248059703	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,4:2,2:3,4,2,4
chr1	248059712	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.417:12:5,3:2,2:3,4,2,3
chr1	248059779	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=231,259;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:2,6,1,3
chr1	248059873	.	G	GTACTCTAGCCTGGGCGACAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=234,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	248084554	.	A	ACTAAACCTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=214,48;MMQ=25,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:1,2,1,1
chr1	248084825	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=273,147;MMQ=24,24;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	248084829	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=143,152;MMQ=24,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr1	248085341	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=190,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:0,2,0,7
chr1	248097154	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,154;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,0:7,3:7,3,0,3
chr1	248186214	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=175,16157;MMQ=60,29;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:8,4,0,3
chr1	248201550	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=150,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:4,3,2,1
chr1	248224595	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=171,132;MMQ=60,49;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.393:31:10,6:9,6:7,12,6,6
chr1	248224618	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=169,68;MMQ=58,42;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,2:8,2:8,10,1,3
chr1	248224625	.	A	AGAAAAGAT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=163,47;MMQ=55,37;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:10,0:11,11,1,1
chr1	248224713	.	C	CATCACTCAGTCATACCCAAAGT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=36,33;MFRL=145,28896;MMQ=59,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:1,7,0,2
chr1	248262644	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=199,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:2,0,5,0
chr1	248308673	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=101,118;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,3:13,0:13,15,0,3
chr1	248343379	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=103,143;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.250:34:13,0:13,8:16,10,0,8
chr1	248458223	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=204,169;MMQ=25,21;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,42:0.811:51:5,40:4,0:4,5,42,0
chr1	248458941	.	T	TCTTGGGTTGGGGGAAAGCTCCTCAGTGGCTCTGG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=147,86;MMQ=40,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.335:7:5,1:0,0:0,6,0,1
chr1	248458974	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	248486895	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr1	248486913	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,9,2
chr1	248512064	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr1	248512094	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,6:0,14:0,0,6,14
chr1	248512099	.	TGGAATTTCTCC	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=173,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:4,2:14,0:7,14,1,1
chr1	248513023	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr1	248513088	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	248524799	.	AAC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=199,239;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:2,1:4,1,4,0
chr1	248525066	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,305;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:2,4:13,0:8,7,0,4
chr1	248525638	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=192,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:3,6:3,5:2,4,2,9
chr1	248569282	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=166,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr1	248570440	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,4,16
chr1	248637685	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=146,239;MMQ=27,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr1	248651985	.	TG	GC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=187,49;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:248651985_TG_GC:248651985:3,6,1,1
chr1	248651990	.	T	TTAGCTGAGTCATTGTATGTAG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=187,49;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:248651985_TG_GC:248651985:3,6,1,1
chr1	248685544	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,64;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:5,0:10,3:0|1:248685544_C_T:248685544:9,6,1,2
chr1	248685567	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=140,64;MMQ=60,59;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:6,0:8,1:0|1:248685544_C_T:248685544:10,5,1,2
chr1	248685919	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,31;MFRL=74,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:248685919_C_T:248685919:1,2,0,1
chr1	248685922	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,32;MFRL=74,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:248685919_C_T:248685919:1,2,0,1
chr1	248685926	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,30;MFRL=74,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:248685919_C_T:248685919:1,2,0,1
chr1	248685928	.	C	CATGA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,35;MFRL=74,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:248685919_C_T:248685919:1,2,0,1
chr1	248685933	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,33;MFRL=74,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:248685919_C_T:248685919:1,2,0,1
chr1	248685936	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,32;MFRL=74,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:248685919_C_T:248685919:1,2,0,1
chr1	248685951	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=271,74;MMQ=58,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr1	248722722	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=137,122;MMQ=53,21;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:10,0:6,4:6,10,3,1
chr1	248722883	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:248722883_A_G:248722883:0,0,0,2
chr1	248722888	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:248722883_A_G:248722883:0,0,0,2
chr1	248737293	.	GC	AG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=173,125;MMQ=33,48;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,2:5,0,4,0
chr1	248737319	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=151,145;MMQ=52,50;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:4,5:9,3:10,3,6,2
chr1	248757165	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	248789454	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr1	248801944	.	TCAGCACG	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,4:0,11:0,0,5,10
chr1	248801982	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=116,126;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0|1:248801982_G_A:248801982:1,2,0,1
chr1	248801984	.	C	CTGGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=121,105;MMQ=27,27;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	248801986	.	T	TTTGCTTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=116,126;MMQ=27,27;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:248801982_G_A:248801982:0,3,0,1
chr1	248813135	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=198,182;MMQ=52,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr1	248814209	.	GAT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=264,202;MMQ=57,27;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:248814209_GAT_G:248814209:0,1,0,1
chr1	248814216	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=264,202;MMQ=57,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:248814209_GAT_G:248814209:0,1,0,1
chr1	249110906	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=218,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:3,2,4,2
chr1	249144376	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=115,75;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:15,7:4,0:15,5,7,1
chr1	249145072	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=183,295;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:0,6,0,4
chr1	249149486	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=134,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr1	249212725	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=157,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:4,3,0,2
chr1	249213360	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,103;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:7,2,2,0
chr2	45895	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	224970	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,2:4,1:3,9,0,3
chr2	234130	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=226,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,2:2,0:5,2,2,0
chr2	242732	.	T	TAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=213,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAC;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:0,1:4,1:3,1,2,0
chr2	243493	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,36;MFRL=104,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,3:7,3:9,4,5,1
chr2	243504	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=159,105;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:9,0:7,5:10,6,5,0
chr2	243533	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=159,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:13,2:0|1:243533_C_T:243533:14,8,1,1
chr2	243548	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=132,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.130:20:5,0:13,2:0|1:243533_C_T:243533:11,7,1,1
chr2	243567	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=169,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:2,2:15,4:1,16,1,5
chr2	262553	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,4:0,2:6,0,5,1
chr2	264895	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr2	271998	.	CAAA	C,CA,CAA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,34,35,32;MFRL=214,224,247,222;MMQ=60,60,60,60;MPOS=2,17,11;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15;RU=A;STR;TLOD=4.15,13.48,24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,3,8,14:0.106,0.261,0.454:30:3,3,4,9:2,0,4,4:2,3,14,11
chr2	275055	.	G	GT,GTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35,36;MFRL=334,234,73;MMQ=60,60,60;MPOS=26,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=8.79,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.505,0.298:7:0,2,2:1,2,0:1,0,6,0
chr2	276908	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,4:0,7:1,0,9,2
chr2	276942	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=201,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.346:21:8,1:6,6:6,8,4,3
chr2	283231	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=135,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.861:12:0,4:1,7:0,1,0,11
chr2	672745	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=186,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,3:6,2:11,0,5,0
chr2	677423	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,4:2,2:0,7,1,5
chr2	906044	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=194,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,3:1,7,2,5
chr2	1079130	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=128,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,2:0,2:0|1:1079130_G_A:1079130:1,0,4,1
chr2	1079132	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=128,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0|1:1079130_G_A:1079130:1,0,4,1
chr2	1079143	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr2	1079442	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=266,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:0,0:1,2:0,1,0,3
chr2	1093965	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=257,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.815:25:2,11:2,10:2,2,11,10
chr2	1099065	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=119,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.344:13:5,1:2,2:5,4,1,3
chr2	1099109	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=138,153;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr2	1133188	.	G	GCACA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=184,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=CA;STR;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.581:10:2,1:2,5:4,0,5,1
chr2	1168756	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.879:14:1,4:0,9:0,1,9,4
chr2	1168865	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:5,7,1,1
chr2	1241592	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	1243447	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=159,252;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,6:7,1:8,7,6,1
chr2	1251087	.	A	AAAGGTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=181,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:0|1:1251087_A_AAAGGTT:1251087:6,1,4,0
chr2	1251088	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=181,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,1:4,2:0|1:1251087_A_AAAGGTT:1251087:6,1,4,0
chr2	1271110	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:3,1:7,1:4,6,1,1
chr2	1271426	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=259,238;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr2	1426787	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=187,250;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:13,1:8,3:15,6,3,1
chr2	1437410	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:1,2,0,4
chr2	1442476	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=218,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	1442551	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:8,0,1,1
chr2	1457364	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	1459806	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=69.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:0,12:1,9:1,0,14,7
chr2	1488668	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=127,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,1,6
chr2	1499728	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:4,1,4,0
chr2	1546327	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=227,152;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,1:5,4:5,8,2,3
chr2	1639151	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:5,1,4,2
chr2	1642537	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0|1:1642537_T_C:1642537:0,0,12,0
chr2	1642539	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0|1:1642537_T_C:1642537:0,0,13,0
chr2	1642544	.	CC	TG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=191,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:8,2:1,3:9,0,5,0
chr2	1642545	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,15,0
chr2	1642680	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:13,3:7,1:10,10,0,4
chr2	1651842	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:5,0,5,0
chr2	1667310	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	1805430	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=211,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:5,3,2,1
chr2	1805489	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=215,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,5:3,1:4,3,3,3
chr2	1844458	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,4:1,4:1,0,8,0
chr2	1844464	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=169,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr2	1844652	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=84,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr2	1891188	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=166,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,3:7,0:12,2,2,1
chr2	1891283	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=203,1566;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.197:33:10,0:17,6:17,10,3,3
chr2	1925993	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=186,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:8,0,2,0
chr2	1927132	.	CAAGTCA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=256,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr2	1946914	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=91,161;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.548:24:7,9:2,4:5,6,6,7
chr2	1982915	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=232,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.172:25:10,3:8,1:17,4,1,3
chr2	1983241	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,3:2,8:2,6,7,4
chr2	1983374	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=216,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:5,1:9,6,0,2
chr2	1983619	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=251,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:1,3,0,4
chr2	3212817	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=299,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	3217908	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,8,7
chr2	3322555	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=213,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:4,0,3,0
chr2	3322797	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr2	3342009	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=89,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr2	3356953	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,12,3
chr2	3358295	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,3:6,3:9,4,4,2
chr2	3358458	.	ATTATGAAGTTAGAT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,11:0,4:0,0,3,12
chr2	3392513	.	TT	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	3393565	.	C	CAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:8,1:5,4:3,10,1,5
chr2	3428508	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=225,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr2	3460870	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:2,1,3,0
chr2	3469278	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=327,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	3470186	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.818:20:1,10:2,7:1,2,5,12
chr2	3470254	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=163,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr2	3481637	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,6:2,3:0,2,0,9
chr2	3481659	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr2	3482722	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=158,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.254:10:2,1:4,1:3,5,2,0
chr2	3482796	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=158,236;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,2,1
chr2	3482912	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,4:2,3:3,0,7,0
chr2	3502709	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=207,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,4:2,9:6,0,10,3
chr2	3502909	.	A	ACTT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=243,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.785:7:1,2:0,4:0|1:3502909_A_ACTT:3502909:0,1,0,6
chr2	3502910	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=243,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.783:7:1,1:0,3:0|1:3502909_A_ACTT:3502909:0,1,0,6
chr2	3502932	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=226,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr2	3504819	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=252,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr2	3599700	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr2	3623540	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:2,8:2,6:1,3,3,11
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chr2	3660856	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=195,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,1:7,3:5,4,4,0
chr2	3685046	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.694:21:3,8:3,6:6,0,9,6
chr2	3685074	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=163,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:4,7:3,8:4,3,8,8
chr2	3688836	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=171,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:18,3:9,0:15,12,3,0
chr2	3718723	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=90,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,3:8,2:8,5,5,0
chr2	3721766	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=127,226;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,1:10,1:6,8,0,2
chr2	3730431	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=200,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	3774519	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,7,3
chr2	3800496	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=206,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr2	3815532	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=102,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr2	3826324	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=207,253;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.319:13:2,3:7,0:7,2,2,2
chr2	5834249	.	G	GTGA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=364,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TGA;STR;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.495:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr2	5834751	.	A	AT	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=29,28;MFRL=123,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.205:17:9,0:5,3:8,6,1,2
chr2	5834798	.	ATTTTT	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,23;MFRL=103,265;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=32,27;RU=T;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,0:0,2,1,1
chr2	5834814	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,35;MFRL=265,103;MMQ=50,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:5834814_T_C:5834814:1,1,0,2
chr2	5834817	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=30,35;MFRL=250,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:5834814_T_C:5834814:1,2,0,2
chr2	5834820	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,35;MFRL=250,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:5834814_T_C:5834814:1,2,0,2
chr2	5834823	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=29,34;MFRL=250,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:1,2:0|1:5834814_T_C:5834814:2,3,0,2
chr2	5834831	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=249,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:5834814_T_C:5834814:3,3,0,2
chr2	5834833	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=28,17;MFRL=199,265;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:3,0:2,4,1,1
chr2	5835335	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:0|1:5835335_TA_T:5835335:9,0,0,3
chr2	5835352	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=197,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,5:0.299:18:3,3:9,0:1|0:5835335_TA_T:5835335:8,5,5,0
chr2	5835359	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=174,71;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,1:9,0:0|1:5835335_TA_T:5835335:14,2,0,2
chr2	5835564	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:3,3:4,5:4,5,7,1
chr2	5835697	.	GTTTTT	G,GTTTT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,32,13;MFRL=390,199,171;MMQ=60,60,60;MPOS=18,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,14,18;RU=T;STR;TLOD=6.35,7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,7:0.198,0.617:11:1,1,1:1,1,0:0,2,2,7
chr2	5835727	.	TC	GA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=216,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:9,0:5,16,1,1
chr2	5837271	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=227,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:2,3:3,2:4,2,3,3
chr2	5837291	.	G	GACTCTAATGAAAA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=212,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:8,6,1,1
chr2	5838030	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=232,136;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:7,6:5,2:7,5,5,3
chr2	5838161	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=220,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.467:11:3,5:3,0:4,2,1,4
chr2	5838482	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=35,10;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,0:5,0:0|1:5838482_C_G:5838482:16,2,0,2
chr2	5838489	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.163:22:11,0:5,0:0|1:5838482_C_G:5838482:17,2,0,3
chr2	5838492	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=151,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.281:26:11,0:7,1:0|1:5838482_C_G:5838482:16,3,1,6
chr2	5838496	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=145,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.208:27:8,2:10,3:0|1:5838482_C_G:5838482:17,5,0,5
chr2	5838683	.	TAAA	T,TAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27,27;MFRL=132,134,224;MMQ=60,60,60;MPOS=15,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=A;STR;TLOD=19.42,9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,7,5:0.400,0.334:16:1,2,3:2,3,2:0,4,6,6
chr2	5839811	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=230,196;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:1,5,0,4
chr2	5839841	.	CTTTTTT	C,CTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25,25;MFRL=172,227,100;MMQ=60,60,60;MPOS=9,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.38,8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,4:0.306,0.518:7:0,0,1:1,1,3:1,0,3,3
chr2	5840563	.	AAAAG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=166,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:4,2:9,2:5,8,1,3
chr2	7001233	.	ACG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=186,172;MMQ=24,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.804:8:1,3:0,3:1,0,6,1
chr2	7005069	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr2	7017903	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr2	7027323	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,7,15
chr2	7136981	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=194,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,2:5,1:5,0,3,0
chr2	7154826	.	A	AT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=200,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:17,0:10,3:10,17,1,2
chr2	7164483	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,2:7,5:6,5,4,3
chr2	7179961	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0,11,0,2
chr2	7208324	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=176,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:3,2:7,6:2,8,6,2
chr2	7208422	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=152,244;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,5:3,6:4,3,4,7
chr2	8822912	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=201,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.486:19:3,5:3,4:10,0,2,7
chr2	8870814	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	8871342	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=140,264;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,2:8,1:6,8,1,2
chr2	8890179	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=232,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,2:4,0:14,0,2,0
chr2	8910987	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr2	8911010	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=198,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr2	8916847	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,13,1
chr2	8943291	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr2	8946542	.	T	TAATTGGATTGTTTGTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=150,102;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:8946542_T_TAATTGGATTGTTTGTA:8946542:0,4,0,1
chr2	8946545	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=150,102;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:8946542_T_TAATTGGATTGTTTGTA:8946542:0,4,0,1
chr2	8946568	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=129,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:7,0:0,2:0,7,0,2
chr2	8998775	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=189,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:3,1:1,4:4,0,5,0
chr2	9013489	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=198,88;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,2:3,1:1,10,0,3
chr2	9022603	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=209,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,1:6,2:9,8,2,1
chr2	9419411	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=192,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,10:0.734:13:2,7:1,3:0|1:9419411_G_A:9419411:3,0,8,2
chr2	9419415	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=192,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,10:0.733:13:2,7:1,3:0|1:9419411_G_A:9419411:3,0,8,2
chr2	9463454	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,10:0,5:0,0,0,15
chr2	9475200	.	TTG	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TG;STR;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,2:7,1:14,1,2,1
chr2	9484561	.	TAAAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,6;RU=A;STR;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.870:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	9496291	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=147,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:10,3:9,4:7,12,4,3
chr2	9499046	.	T	TAGAATGCCAAAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:8,0:6,2:0|1:9499046_T_TAGAATGCCAAAA:9499046:2,12,0,2
chr2	9499048	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:7,0:6,1:0|1:9499046_T_TAGAATGCCAAAA:9499046:2,12,0,2
chr2	9528607	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=182,142;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=34.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:9,0:9,12:2,16,0,12
chr2	9543410	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:7,8,2,0
chr2	9554255	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=146,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:2,8:6,4:3,5,7,5
chr2	9554280	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=117,266;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:4,4:17,1:9,12,2,3
chr2	9554461	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=210,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,3:3,5:0,6,1,7
chr2	9569972	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=258,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr2	9571054	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=293,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:0,5,1,3
chr2	9572872	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr2	9580540	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	9616035	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.710:29:5,8:3,13:6,2,12,9
chr2	9630231	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=151,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr2	9630244	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=130,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	9631340	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:0,8,1,2
chr2	9633137	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,6:5,3:6,4,2,7
chr2	9642478	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=184,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	9657947	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:5,5:4,1:9,0,5,1
chr2	9667891	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=149,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:10,3,1,1
chr2	9728406	.	T	TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=135,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.128:36:16,4:16,0:0|1:9728406_T_TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC:9728406:13,19,2,2
chr2	9728408	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=135,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.130:36:16,4:16,0:0|1:9728406_T_TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC:9728406:13,19,2,2
chr2	9728412	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=135,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:14,1:17,0:0|1:9728406_T_TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC:9728406:12,20,1,2
chr2	9983591	.	A	AG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=86.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,20,8
chr2	9986162	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=222,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:5,7:11,6:10,6,6,7
chr2	9989570	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=181,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:4,2:2,2:2,5,0,4
chr2	10023016	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=290,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	10044941	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=200,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:2,1:4,2:0|1:10044941_G_T:10044941:5,2,3,0
chr2	10044951	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=218,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,6:0.638:9:1,1:1,5:1|0:10044941_G_T:10044941:2,1,4,2
chr2	10045147	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=85.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,11:0,0,7,19
chr2	10051053	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.715:26:4,6:3,13:1,6,6,13
chr2	10051792	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=209,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,1:4,6:0,5,0,7
chr2	10059097	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:8,0,1,1
chr2	10094992	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=178,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:4,7:1,9:5,0,16,0
chr2	10095103	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=156,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,13:0.285:47:12,10:21,3:15,19,5,8
chr2	10126416	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:3,1:5,3:2,6,1,4
chr2	10135956	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:11,0,2,0
chr2	10140651	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,5:1,3:2,1,6,2
chr2	10183748	.	TGCC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=291,259;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCC;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr2	10225241	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,7,10
chr2	10226306	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=160,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr2	10267078	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:13,1:2,1:9,7,2,0
chr2	10268962	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=156,289112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:13,0:3,3:9,7,3,0
chr2	10281903	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr2	10563236	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=142,206;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.880:23:0,8:2,12:0,2,14,7
chr2	10563297	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=176,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:1,1:4,2:1,4,0,3
chr2	10566804	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=168,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:7,5,2,0
chr2	10566864	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=170,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:11,2:9,1:12,8,2,1
chr2	10583523	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,237;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,1:14,1:7,14,1,1
chr2	10583735	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=133,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:7,1:8,5:8,7,2,4
chr2	10583989	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,224;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:10,3:13,0:9,16,0,3
chr2	10595534	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=171,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:6,6:10,6:12,4,7,5
chr2	10717714	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:6,2,8,0
chr2	10729897	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr2	10743153	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=137,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,3:7,3:8,4,5,1
chr2	10743191	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:7,4:9,4:13,3,6,2
chr2	10762302	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=45.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,2,13
chr2	10808776	.	C	CAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=127.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,15:0,0,19,13
chr2	10811657	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,3:9,0:6,10,3,0
chr2	10813782	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	10911891	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,0:1,3:3,0,3,0
chr2	10912092	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=229,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,1:0,5:1,1,3,3
chr2	10914867	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=242,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.345:7:1,1:2,1:4,1,2,0
chr2	10922516	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=205,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:2,5,0,4
chr2	10924524	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	10927345	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=218,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,5:1,3:2,2,8,0
chr2	10928777	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,9:1,6:0,1,10,5
chr2	10928906	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=168,196;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.915:21:0,11:1,8:1,0,9,11
chr2	10928962	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr2	10929133	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=109,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,8:1,7:1,0,5,10
chr2	10929867	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=68.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:1,9:0,13:1,0,15,7
chr2	10930050	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,5:1,4:1,0,2,7
chr2	10930106	.	ATTT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.860:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	10931001	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr2	10931046	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,268;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr2	10932082	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,3,7
chr2	10933195	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,7:3,4:4,1,10,1
chr2	10933421	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	10942567	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr2	10942644	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=191,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:6,0:12,3:12,6,3,0
chr2	10959292	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=187,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr2	10959461	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:9,4:4,3:4,9,3,4
chr2	10959475	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:8,4:3,2:3,8,3,3
chr2	10987572	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	10994418	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	11300732	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=204,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,24:0.782:30:4,15:2,9:4,2,11,13
chr2	11300869	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=80,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.877:22:2,9:0,10:1,1,5,15
chr2	11300927	.	TAAAA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=10,10;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=A;STR;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.764:6:0,0:0,1:0,1,0,5
chr2	11312016	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:4,2,1,2
chr2	11312181	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,4,4
chr2	11312224	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	11334037	.	TATTA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=217,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	11348364	.	C	CTAACT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=300,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.780:7:1,4:0,1:1,0,6,0
chr2	11348609	.	CAAAT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=300,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,4:0,4:0,1,0,8
chr2	11355237	.	AAC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=164,152;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,3:9,0:6,9,0,3
chr2	11356190	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:1,8:1,2:2,0,6,4
chr2	11359031	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr2	11597454	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=222,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	11716433	.	CAA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=132,0;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:4,1:3,1:6,4,1,1
chr2	11716463	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:15,2:12,0:13,14,0,2
chr2	11718591	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=204,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,3:3,5,2,2
chr2	11720858	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=180,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:5,1:4,10,1,1
chr2	11720986	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=169,231;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:5,1:5,1:4,6,1,1
chr2	11725241	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=105,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:6,5:7,5:10,4,7,3
chr2	11725947	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=116,272;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:7,6:1,4:6,2,2,8
chr2	11726061	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=193,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.323:10:3,2:4,1:2,5,2,1
chr2	11729096	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=171,249;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr2	11736229	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=139,158;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:8,2:9,0:0|1:11736229_T_A:11736229:11,7,3,0
chr2	11736234	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=139,158;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.180:20:8,3:8,0:0|1:11736229_T_A:11736229:10,7,3,0
chr2	11736305	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,1:3,3:4,4,2,2
chr2	11738765	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chr2	11741193	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	11742458	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=215,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,5:2,2:2,0,7,0
chr2	11750918	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:5,2:4,0:8,1,2,0
chr2	11751166	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=136,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:3,1:11,1:7,9,1,1
chr2	11755443	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,1,3
chr2	11905636	.	GT	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=176,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=54.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.821:26:1,7:3,14:4,0,17,5
chr2	11905648	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=185,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.201:38:11,7:17,0:21,10,7,0
chr2	11905857	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:12,2:13,0:7,18,1,1
chr2	11905876	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=172,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:5,4:5,9:3,7,5,8
chr2	11924950	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,4:0,4:1,0,5,3
chr2	11931931	.	A	AT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:8,4:10,5:8,10,6,3
chr2	11932074	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:17,0:10,3:9,18,0,4
chr2	11932173	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,5:1,8:0,1,0,13
chr2	11936798	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=217,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:0,5:2,7:2,0,11,1
chr2	11937047	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=149,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:3,7,0,2
chr2	11944746	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=121,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr2	11945108	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=239,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.642:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	12863770	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,3:7,0:0,13,0,3
chr2	12865048	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=218,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr2	14776975	.	CTTTCTT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,46;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTCTT;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:11,1:10,1:15,9,1,1
chr2	14778525	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=172,80;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:12,3:10,0:12,10,1,2
chr2	14779227	.	T	TAC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=102,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=AC;STR;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.435:14:3,1:4,3:4,4,4,2
chr2	14780256	.	AT	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	15319070	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.265:16:6,0:2,4:9,3,4,0
chr2	15359124	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=189,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:8,0:8,7:2,14,0,7
chr2	15378822	.	G	GAATT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr2	15427173	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.280:16:6,3:5,1:6,6,3,1
chr2	15448311	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=188,74;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:4,4,3,3
chr2	15468025	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=190,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:8,1:2,2:2,8,0,3
chr2	15492018	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=175,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:3,2:4,0:8,0,2,0
chr2	15493881	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr2	15519992	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,3,9
chr2	15523266	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr2	15523307	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=53.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,8:0,0,15,4
chr2	15533689	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	15533734	.	G	GAAATGAAAGCGTATGTCTACAC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAATGAAAGCGTATGTCTACAC;STR;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,1:0,4:0,0,8,5
chr2	15533779	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,15:0,0,13,9
chr2	15533884	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0|1:15533884_C_A:15533884:0,0,4,8
chr2	15533895	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0|1:15533884_C_A:15533884:0,0,3,8
chr2	15533899	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0|1:15533884_C_A:15533884:0,0,2,7
chr2	15536509	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.220:17:6,2:6,1:12,2,3,0
chr2	15555651	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,319;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:6,3,1,1
chr2	15601287	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,11:0,0,16,3
chr2	15608013	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	15616013	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,3,13
chr2	15616030	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:0,7:1,6:0,1,1,12
chr2	15623608	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	15644401	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr2	15676456	.	CAA	C,CA,CAAA,CAAAA	.	.	DP=454;ECNT=1;MBQ=32,32,32,33,32;MFRL=221,278,221,231,225;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=14,20,12,17;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=11,9,10,12,13;RU=A;STR;TLOD=11.63,103.85,15.86,3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:263,9,62,17,4:0.026,0.171,0.048,0.013:355:131,3,27,9,3:130,6,35,8,0:252,11,83,9
chr2	15676686	.	G	A	.	.	DP=698;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=181,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=1736.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,652:0.997:653:1,320:0,322:0,1,96,556
chr2	15676703	.	TAA	T,TA,TAAA,TAAAA	.	.	DP=551;ECNT=2;MBQ=17,29,17,15,15;MFRL=220,230,227,223,206;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=19,21,20,18;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14,15;RU=A;STR;TLOD=8.23,60.31,70.40,17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:271,8,45,52,17:0.019,0.110,0.138,0.044:393:57,2,9,6,1:74,6,12,16,3:5,266,6,116
chr2	15694164	.	T	TA	.	.	DP=1022;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=228,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3775.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,955:0.998:956:0,471:1,451:1,0,669,286
chr2	15697051	.	TA	T,TAA	.	.	DP=781;ECNT=1;MBQ=28,28,28;MFRL=207,263,204;MMQ=60,60,60;MPOS=23,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=A;STR;TLOD=9.35,5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:599,12,12:0.019,0.018:623:310,8,7:286,4,4:64,535,1,23
chr2	15701212	.	A	C	.	.	DP=92;ECNT=2;MBQ=18,31;MFRL=217,264;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,8:0.099:87:12,3:10,5:71,8,8,0
chr2	15701216	.	A	C	.	.	DP=151;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=223,266;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,14:0.104:118:44,3:31,5:95,9,14,0
chr2	15731998	.	A	G	.	.	DP=777;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=205,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=2322.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,706:0.989:715:4,336:3,365:7,2,591,115
chr2	15735419	.	G	A	.	.	DP=976;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=188,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=2922.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,915:0.989:924:6,451:3,460:1,8,297,618
chr2	15735430	.	G	GT	.	.	DP=989;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=227,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:775,10:0.013:785:372,4:400,6:282,493,3,7
chr2	15742587	.	AT	A,ATT	.	.	DP=1155;ECNT=1;MBQ=29,28,28;MFRL=213,210,190;MMQ=60,60,60;MPOS=10,1;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=T;STR;TLOD=10.41,8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:921,15,15:0.015,0.016:951:465,7,6:442,7,7:774,147,26,4
chr2	15744484	.	CT	C	.	.	DP=545;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=181,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=1678.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,495:0.987:501:2,252:3,231:5,1,475,20
chr2	15746047	.	ATC	A	.	.	DP=932;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=209,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=58.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:715,32:0.043:747:341,18:337,14:516,199,26,6
chr2	15753307	.	ATT	A,AT,ATTT,ATTTT	.	.	DP=1041;ECNT=1;MBQ=30,30,30,28,28;MFRL=208,176,199,214,186;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=15,12,6,2;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14,15;RU=T;STR;TLOD=28.93,179.36,94.54,21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:512,24,126,71,20:0.027,0.153,0.113,0.030:753:265,10,78,37,8:234,14,44,33,6:387,125,200,41
chr2	15768846	.	AT	A	.	.	DP=1736;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=207,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1463,24:0.015:1487:748,17:646,5:779,684,8,16
chr2	15768876	.	G	A	.	.	DP=1695;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=152,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5013.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,1581:0.991:1596:8,812:7,762:8,7,833,748
chr2	16082088	.	GC	G	.	.	DP=715;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=233,290;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:614,9:0.015:623:301,6:293,3:565,49,9,0
chr2	16082103	.	GC	G	.	.	DP=742;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=223,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:629,9:0.013:638:304,5:298,4:578,51,8,1
chr2	16082110	.	A	C	.	.	DP=771;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=218,247;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:563,136:0.124:699:121,7:174,1:499,64,136,0
chr2	16082123	.	A	C	.	.	DP=823;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=216,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:684,75:0.027:759:228,1:253,2:608,76,75,0
chr2	16082313	.	AC	A	.	.	DP=1754;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=213,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1442,29:0.020:1471:730,16:645,12:679,763,13,16
chr2	16086264	.	AT	A,ATT	.	.	DP=1564;ECNT=1;MBQ=27,27,28;MFRL=222,220,228;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=53.92,21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1062,53,29:0.042,0.024:1144:515,25,12:535,28,15:155,907,13,69
chr2	16734284	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:6,4:8,7:6,8,6,5
chr2	16734295	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=175,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:7,3:10,5:8,9,4,4
chr2	16743287	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=169,72;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,1:13,1:20,8,2,0
chr2	16743453	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=231,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr2	16746897	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:9,6:4,3:3,10,2,7
chr2	17773524	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=216,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=39.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:4,10:4,5:3,5,3,12
chr2	17883218	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:1,6,0,4
chr2	17888457	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=163,238;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:5,2:10,3:10,6,4,1
chr2	17890091	.	G	GTATA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=186,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TA;STR;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	17898326	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,273;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:9,3:4,2:8,5,2,3
chr2	17899558	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=161,255;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr2	17899584	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=190,286;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr2	17927275	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=148,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:0,2,0,8
chr2	17941423	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=214,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr2	17950049	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=192,176;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:12,11:9,0:9,12,11,0
chr2	17954140	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	17954647	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=220,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,3:1,5:0,6,1,7
chr2	17959420	.	TAC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AC;STR;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:0,2:0|1:17959420_TAC_T:17959420:0,1,0,4
chr2	17959443	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:0|1:17959420_TAC_T:17959420:0,1,0,4
chr2	18114295	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=16,35;MFRL=384,323;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:1,0,0,1
chr2	18758121	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:6,0:12,6:8,11,0,6
chr2	18765728	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=240,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,5:5,3:5,1,7,1
chr2	18766123	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=172,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:2,3,0,3
chr2	18766156	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=203,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0,5,0,2
chr2	20097721	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=171,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:15,5:8,0:13,10,5,0
chr2	20113221	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=215,237;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	20131079	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,2:7,5:5,5,4,4
chr2	20131184	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr2	20166496	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=120,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,1:5,3:9,5,3,1
chr2	20173255	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=126,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,4:1,1:3,0,4,1
chr2	20175368	.	AC	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=155,96;MMQ=60,56;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,0:10,2:12,12,0,2
chr2	20189089	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=142,254;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.457:15:4,3:4,2:1,7,1,6
chr2	20201930	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=243,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr2	20205423	.	A	AAAAG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=219,277;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,2:9,0:12,0,2,0
chr2	20212322	.	GGCA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	20251070	.	T	TGCCC	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.697:8:2,3:0,2:0|1:20251070_T_TGCCC:20251070:2,0,6,0
chr2	20251075	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:20251070_T_TGCCC:20251070:0,0,7,0
chr2	20251080	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=206,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,4:0,1:0|1:20251070_T_TGCCC:20251070:1,0,7,0
chr2	20251083	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,18;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:0,0:0|1:20251070_T_TGCCC:20251070:1,1,4,0
chr2	20251087	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,1:0|1:20251070_T_TGCCC:20251070:1,1,4,0
chr2	20403794	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,5,10
chr2	20405041	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=194,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,0:0,3:5,0,3,0
chr2	20405050	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr2	20455176	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=221,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.631:6:0,2:0,1:0,2,0,4
chr2	20648933	.	AT	A,ATT,ATTT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,27,28,28;MFRL=199,191,115,158;MMQ=60,60,60,60;MPOS=8,19,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,11,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.73,22.14,5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,4,13,4:0.123,0.479,0.153:28:2,3,6,1:5,1,6,1:5,2,14,7
chr2	20699667	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=95,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:4,7:1,3:3,2,7,3
chr2	20699814	.	GC	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.425:24:7,5:6,5:7,7,7,3
chr2	20700900	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr2	20701120	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,221;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr2	20792087	.	T	TAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20792087_T_TAA:20792087:0,0,1,0
chr2	20792093	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:20792087_T_TAA:20792087:1,0,1,0
chr2	20792098	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20792087_T_TAA:20792087:1,0,1,0
chr2	20792103	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:20792087_T_TAA:20792087:1,0,1,0
chr2	20823612	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=105,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.837:16:2,5:0,9:1,1,8,6
chr2	20823724	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,8:0,0,11,4
chr2	20823816	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=172,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,1,3
chr2	20823850	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	20824658	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:5,7:2,9:3,4,5,11
chr2	20824708	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=188,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,3:1,7:0,4,1,9
chr2	20845273	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=255,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,5:0,0:0,1,1,4
chr2	20871190	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,6,7
chr2	20884550	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=191,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:8,0,1,1
chr2	21224853	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=203,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:6,5,2,3
chr2	21225629	.	C	CCCGCT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=214,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:6,2:6,0:0|1:21225629_C_CCCGCT:21225629:6,6,1,1
chr2	21225632	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=214,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0|1:21225629_C_CCCGCT:21225629:6,6,1,1
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chr2	21232195	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=206,183;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,3:6,3:8,3,2,4
chr2	21233832	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=190,182;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,0:6,4:7,7,0,4
chr2	21236482	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr2	21237238	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=129,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr2	21245813	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:4,5:10,2:9,5,5,2
chr2	21265141	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=241,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,6:1,0:3,0,4,2
chr2	21361576	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=134,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,1:8,2:6,12,1,2
chr2	21365965	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,72;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,3:10,0:8,11,2,1
chr2	23698353	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=202,199;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr2	23698467	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:11,3:19,0:14,16,0,3
chr2	23862187	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=224,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,1:7,2:2,8,0,3
chr2	23865139	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=184,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,0:5,4:7,0,4,0
chr2	23865176	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=192,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,0:7,5:8,3,3,2
chr2	23914776	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=253,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,2:1,1:0,7,1,2
chr2	23916038	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=212,301;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr2	23925980	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=233,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:4,0,5,1
chr2	24009163	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=247,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr2	24021231	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=190,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:1,9,0,2
chr2	24042550	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	24046471	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:0,8,0,2
chr2	24087771	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:9,0:9,7:5,13,0,7
chr2	24110611	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=200,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr2	24194314	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,2:5,5:2,7,1,6
chr2	24222649	.	T	TGAAAACACACACACACACA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:4,3,0,2
chr2	24246175	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=240,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr2	24246679	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,316;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,6:2,2:0,2,0,8
chr2	24255862	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,3,7
chr2	24276736	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,55;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,4:5,1:3,7,1,4
chr2	24342352	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=171,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,0,2
chr2	24360925	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:0,7:7,3:5,2,4,6
chr2	24384553	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=141,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,0:0,6:0,5,0,7
chr2	24387178	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr2	24398281	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	24400769	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,1:5,2:3,10,0,3
chr2	24402127	.	C	CAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=93.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,9:0,12:0,0,7,14
chr2	24429234	.	CCCGGCGGGAAGGAAGGTGGAGATGCAGGGGG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=250,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.447:9:1,0:2,3:0,5,0,4
chr2	24432620	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	24432667	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=57.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr2	24475205	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=64.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,10,8
chr2	24484150	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr2	24521493	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,2,2
chr2	24521766	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	24550867	.	CAA	C,CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34,33;MFRL=111,188,198;MMQ=60,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=8.69,9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,4:0.456,0.391:10:0,4,3:1,1,1:1,0,7,2
chr2	24896389	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=182,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:0,1,0,8
chr2	24929516	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:10,0:13,2:13,10,0,2
chr2	24949602	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=192,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:10,1:4,3:5,9,2,2
chr2	24952740	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	24952754	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=323,122;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:24952754_A_G:24952754:0,2,0,1
chr2	24952756	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=323,122;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:24952754_A_G:24952754:0,2,0,1
chr2	24962252	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=124,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:5,4,3,0
chr2	24974945	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,15:0,9:0,0,16,8
chr2	24985621	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:7,2:10,0:8,9,2,0
chr2	25013523	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=212,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr2	25038268	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr2	25045458	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:9,0:18,2:12,17,2,0
chr2	25046297	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=215,103;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:1,6,0,2
chr2	25047408	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=231,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,8:2,5:2,4,3,10
chr2	25048847	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr2	25061270	.	GGGGTGGGGT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,257;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGTGGGGT;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.432:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr2	25061810	.	ATTT	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=166,186;MMQ=50,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr2	25061827	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr2	25061858	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=234,177;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:25061858_A_C:25061858:0,3,0,1
chr2	25061868	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=234,177;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:25061858_A_C:25061858:0,3,0,1
chr2	25064079	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,251;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,2:2,0:3,0,3,0
chr2	25065106	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:10,1,2,0
chr2	25100738	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,5:5,4:8,2,6,3
chr2	25100902	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,7:3,3:0,6,1,9
chr2	25458546	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,6:6,4:6,2,7,3
chr2	25462478	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=186,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0|1:25462478_C_A:25462478:0,2,1,1
chr2	25462484	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=138,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1|0:25462478_C_A:25462478:0,2,0,1
chr2	25462493	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=163,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.329:4:2,1:1,0:1|0:25462478_C_A:25462478:0,3,0,1
chr2	25463483	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,2:6,4:7,5,3,3
chr2	25466888	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=399,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:0,9:1,5:0,1,5,9
chr2	25469913	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=243,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:0,6:1,3:0,1,5,4
chr2	25551692	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=216,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:1,3,0,5
chr2	25602142	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:3,4:5,5:6,3,7,2
chr2	25602310	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=212,292;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr2	25610287	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=144,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,2:6,2:2,6,1,3
chr2	25642294	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,2:6,2:13,0,3,1
chr2	25656880	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,12:0,4:0,0,5,11
chr2	25875585	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=174,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.269:12:4,2:4,0:0,9,0,3
chr2	25973309	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=172,75;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr2	25994412	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=204,57;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.181:15:4,1:9,1:3,10,0,2
chr2	26203678	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,12:0,5:0,0,5,12
chr2	26203942	.	GCAC	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CAC;STR;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,1:12,2:12,13,2,1
chr2	26350136	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=235,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,7:0,6:0,1,5,8
chr2	26357748	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,8,5
chr2	26405985	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr2	26410086	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=176,65;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:12,0,2,0
chr2	26417533	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,10:0,0,8,11
chr2	26420708	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr2	26454996	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr2	26477125	.	G	GACT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACT;STR;TLOD=117.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.969:27:0,9:0,15:0,0,15,12
chr2	26499990	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=179,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.089:42:25,0:14,3:24,15,3,0
chr2	26500098	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,0:1,0:1,2,0,3
chr2	26532491	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,7:2,3:0,3,1,9
chr2	26533023	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=136,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.311:27:11,4:8,4:6,13,3,5
chr2	26536555	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=151,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr2	26537499	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=98.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,14:0,12:0,0,14,12
chr2	26539806	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:16,2:11,1:12,15,2,1
chr2	26587076	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,15;MFRL=210,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:2,1:3,0:5,0,3,0
chr2	26590084	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:3,4,2,3
chr2	26590118	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=216,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:1,3,0,4
chr2	26609176	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:8,0,3,0
chr2	26609469	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=234,162;MMQ=60,36;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,7:3,0:0,6,0,7
chr2	26625042	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=201,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr2	26652671	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr2	26653826	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,0:0|1:26653826_CT_C:26653826:1,2,0,1
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chr2	26663187	.	T	TTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=277,159;MMQ=60,56;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=TG;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr2	26671389	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=124,111;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:9,0:3,3:1,12,0,3
chr2	26671544	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,288;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:1,4:2,4:2,1,6,2
chr2	26679394	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:8,4:4,4:7,5,4,4
chr2	26689600	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=199,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:3,3:11,0:5,9,1,2
chr2	26691352	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,11:0.248:45:23,0:10,10:9,25,0,11
chr2	26726752	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:5,5:7,8:3,9,1,12
chr2	26739247	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,10,4
chr2	26750645	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,20,1
chr2	26781418	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,0:5,3:6,7,0,3
chr2	26799091	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=197,285;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	26801586	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:2,1,3,2
chr2	26801795	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=251,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:1,1,0,4
chr2	26804122	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=187,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:2,3:2,6:4,0,9,1
chr2	26804143	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr2	26818006	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=270,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:0,6:1,7:0,1,12,1
chr2	26818021	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=194,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:0,6:4,8:3,1,11,3
chr2	26863503	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=163,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:3,3:2,1:0,5,0,5
chr2	26951449	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	26997042	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:6,1,2,0
chr2	27014980	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,251;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,1:3,2:4,6,2,1
chr2	27015118	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,3:6,3:2,8,2,4
chr2	27015141	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:1,2:6,2:1,6,2,2
chr2	27015969	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=252,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:3,2:4,1:7,0,4,0
chr2	27156017	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=192,82;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:10,1,0,2
chr2	27157396	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=221,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:2,3:0,1:2,0,5,0
chr2	27157400	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	27164806	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=193,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.576:24:4,7:6,7:7,3,8,6
chr2	27167784	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=247,276;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr2	27249245	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=189,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,1:5,4:2,6,1,4
chr2	27262763	.	GGGA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGA;STR;TLOD=48.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr2	27263122	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=222,243;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr2	27276202	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=258,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,2:5,1:5,3,1,2
chr2	27279416	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	27280092	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=309,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr2	27280127	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.320:20:8,3:5,3:12,2,5,1
chr2	27291661	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=246,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr2	27292651	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,3:1,5:0,4,0,8
chr2	27293150	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=214,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.394:23:5,4:9,4:7,7,5,4
chr2	27302165	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,5:2,1:0,3,0,6
chr2	27307769	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=195,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:7,1:0,1:7,0,2,0
chr2	27327272	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.223:19:11,2:4,1:8,7,2,2
chr2	27327581	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=150,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:0|1:27327581_A_C:27327581:3,9,1,1
chr2	27327584	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=150,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:27327581_A_C:27327581:3,9,1,1
chr2	27351279	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=168,238;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,1:4,2:9,1,2,1
chr2	27354173	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr2	27354971	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:9,1:9,3:10,8,4,0
chr2	27355422	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=18,12;MFRL=238,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.628:9:0,1:1,0:2,1,6,0
chr2	27355425	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=233,273;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.438:9:2,0:2,0:0|1:27355425_A_C:27355425:4,1,4,0
chr2	27355427	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=22,12;MFRL=233,273;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.438:9:1,0:2,0:0|1:27355425_A_C:27355425:4,1,4,0
chr2	27355454	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr2	27356278	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=189,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:4,1:3,2:5,3,3,0
chr2	27360804	.	G	GA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,164;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.177:32:16,0:11,5:21,6,0,5
chr2	27424496	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr2	27424962	.	AG	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=138,89;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,0:13,2:0|1:27424962_AG_A:27424962:10,11,0,2
chr2	27424968	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=149,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:0|1:27424962_AG_A:27424962:10,10,0,2
chr2	27428147	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr2	27428815	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,8:1,7:1,0,15,0
chr2	27435374	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=243,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,4:1,3:0,3,0,7
chr2	27438710	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=148,265;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,4:6,0:5,5,0,4
chr2	27439372	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=205,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:6,7:6,0:11,1,6,2
chr2	27440742	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:14,4:8,2:8,14,2,4
chr2	27445315	.	G	GT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=60.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.714:26:2,11:5,8:4,3,10,9
chr2	27448184	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=303,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27448184_T_C:27448184:0,3,0,1
chr2	27448187	.	T	TCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=303,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27448184_T_C:27448184:0,3,0,1
chr2	27449293	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=179,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,6:4,5:2,6,7,4
chr2	27462405	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=180,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:4,1:1,2:2,3,0,3
chr2	27464680	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	27466258	.	CTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=211,304;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=T;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:1,1:1,1:2,0,1,2
chr2	27481522	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,11;MFRL=215,210;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27481522_C_A:27481522:1,0,1,0
chr2	27481524	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,10;MFRL=215,210;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:27481522_C_A:27481522:1,0,1,0
chr2	27481527	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,16;MFRL=0,210;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:27481522_C_A:27481522:0,0,1,0
chr2	27481532	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27481522_C_A:27481522:0,0,1,0
chr2	27481535	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=0,210;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:27481522_C_A:27481522:0,0,1,0
chr2	27505782	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=148,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,5:3,1:2,7,2,4
chr2	27528692	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=101,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,1:0,1:2,2,0,2
chr2	27532869	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=172,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,16:0.411:38:17,0:5,12:0|1:27532869_C_T:27532869:13,9,0,16
chr2	27532870	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=236,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:29,10:0.256:39:10,5:17,3:1|0:27532869_C_T:27532869:6,23,7,3
chr2	27535311	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=61.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0,0,9,9
chr2	27549833	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=241,289;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,2:0,2:0,2,1,3
chr2	27550229	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=186,199;MMQ=60,30;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr2	27550967	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:1,3:9,4:6,4,2,5
chr2	27556721	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=205,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:3,4,2,3
chr2	27587266	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=115,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:3,0:15,2:9,9,2,0
chr2	27589651	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,161;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:12,6:12,0:7,17,6,0
chr2	27589810	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:4,3:4,5:2,7,1,7
chr2	27591804	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,4:2,0:6,0,4,0
chr2	27592423	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=98,246;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.249:34:12,3:14,5:5,21,2,6
chr2	27597190	.	AT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.279:20:7,2:6,3:12,3,5,0
chr2	27597620	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,2:7,1:8,10,1,2
chr2	27598097	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=161,163;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:1,2:1,4:0,2,0,7
chr2	27599132	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,249;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:7,3:16,2:12,11,2,3
chr2	27601052	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr2	27656822	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=150,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,0:7,3:6,6,1,3
chr2	27657681	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,1:4,4:1,7,1,4
chr2	27659832	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.228:22:5,2:11,3:10,7,3,2
chr2	27663215	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=137,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,1:3,2:5,3,1,2
chr2	27663416	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:5,1:5,1:5,6,1,1
chr2	27665361	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:3,6,0,4
chr2	27670307	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=184,243;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr2	27681598	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,259;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:6,2:0,3:5,1,5,0
chr2	27684734	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=84,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,0:4,4:4,6,0,4
chr2	27688601	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=105,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.370:11:2,1:5,2:4,3,3,1
chr2	27706056	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=194,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,1:6,1:9,0,2,0
chr2	27715207	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=180,289;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:5,2:2,1:8,0,3,0
chr2	27715416	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,270;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,3:6,3:3,6,3,3
chr2	27720321	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=227,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.146:19:2,0:11,2:4,13,0,2
chr2	27721510	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=200,127;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,5:7,0:15,0,5,0
chr2	27721971	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=147,315;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,2:6,1:8,1,1,2
chr2	27722416	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	27729480	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,269;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:5,4,3,4
chr2	27804432	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=228,141;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.649:31:0,8:8,10:5,6,10,10
chr2	27830990	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr2	27839107	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=213,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:1,7:2,6:3,0,7,6
chr2	27849810	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,228;MMQ=52,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:11,3:11,2:11,11,3,2
chr2	27852117	.	A	AGGTCTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=237,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:1,3:5,6:0|1:27852117_A_AGGTCTT:27852117:2,4,1,9
chr2	27852118	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=237,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:1,2:5,6:0|1:27852117_A_AGGTCTT:27852117:2,4,1,9
chr2	27852150	.	C	CG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=234,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,0:7,3:8,7,2,1
chr2	27852637	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=234,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,3:2,5:7,0,8,0
chr2	27855397	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=177,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr2	27857992	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=206,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.513:37:14,10:4,9:15,3,15,4
chr2	27858167	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=216,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr2	27861707	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=144,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,2:3,7:7,1,8,1
chr2	27888086	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=153,106;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:22,3:20,0:24,18,3,0
chr2	27892023	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=214,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.384:6:3,0:1,2:3,1,2,0
chr2	27898467	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=152,98;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:10,0:13,2:12,11,0,2
chr2	27900569	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.629:11:1,5:2,2:3,1,5,2
chr2	27910706	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,3:8,6:11,1,9,0
chr2	27997428	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:9,1:10,3:6,13,2,2
chr2	28467620	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=155,107;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:6,5:8,0:14,1,5,0
chr2	28718897	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,290;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,12,0
chr2	28748857	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,5,10
chr2	28748916	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=229,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr2	28752498	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	28752555	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=54.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr2	28752727	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0|1:28752727_C_G:28752727:0,0,0,12
chr2	28752741	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0|1:28752727_C_G:28752727:0,0,0,10
chr2	28761257	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=106.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,13:0,0,5,26
chr2	28761282	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=78.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,9:0,0,1,22
chr2	28763374	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=211,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:0,6,0,4
chr2	28766254	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=194,268;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,4:1,6:0,1,0,10
chr2	28771452	.	CTA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr2	28771624	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr2	28771897	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=190,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,0:6,4:0,7,0,4
chr2	28773037	.	G	GTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=158,166;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.631:6:1,3:1,0:0,2,0,4
chr2	28795962	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=236,230;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr2	28800894	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=141,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:3,3:6,0,2,1
chr2	28804836	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=200,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr2	28816814	.	C	CTTT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=280,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,17;RU=T;STR;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.695:18:2,7:2,4:3,2,11,2
chr2	28816948	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=182,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,31:0.696:44:7,9:6,22:3,10,16,15
chr2	28821662	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=73.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,8,16
chr2	28824303	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr2	28824940	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=166,268;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:1,1,1,3
chr2	28825607	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=201,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:5,1:5,4:10,0,5,0
chr2	28827625	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=167,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.418:29:8,9:9,3:5,12,6,6
chr2	28827644	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:7,6:10,2:4,13,3,5
chr2	28828908	.	G	GATAAAAAAGAGGCTGGGACCATAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.486:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr2	28840691	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,8:5,5:2,6,1,12
chr2	28843871	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=169,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:13,3:3,5:6,10,3,5
chr2	28843909	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:2,1:1,8,0,2
chr2	28847806	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:5,4:0,2:5,0,6,0
chr2	28849461	.	CCCCGAGCTCCTTGCT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=94,239;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.643:9:1,2:2,4:2,1,0,6
chr2	28853352	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=198,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr2	28853377	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=178,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,4:2,3:2,0,6,1
chr2	28854816	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=138,253;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:5,0,6,0
chr2	28855918	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=59.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,12:0,0,2,15
chr2	28863738	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,1:4,4:3,1,4,1
chr2	28865968	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0|1:28865968_T_C:28865968:0,0,4,8
chr2	28865977	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=232,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.361:9:5,2:1,1:0|1:28865968_T_C:28865968:2,4,1,2
chr2	28975107	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:2,4:2,0:0,5,0,4
chr2	29001991	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=204,277;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr2	29004734	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.265:9:5,1:2,1:2,5,0,2
chr2	29004798	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=189,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr2	29045323	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr2	29052256	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,18685932;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	29052283	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,14;MFRL=227,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,0:0,1,0,2
chr2	29075170	.	T	TGAGAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,253;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	29075178	.	CAAAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=201,251;MMQ=50,59;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=25,20;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.410:3:1,1:0,0:1,1,1,0
chr2	29075208	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,21;MFRL=284,253;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,0:2,1,2,0
chr2	29087814	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=300,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr2	29129300	.	ATT	A,AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30,30;MFRL=166,133,175;MMQ=60,60,60;MPOS=17,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.84,7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,5:0.214,0.474:10:0,0,2:3,2,3:2,1,6,1
chr2	29140711	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=203,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	29145681	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=17,11;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:0,0:1,0,4,0
chr2	29145687	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=17,15;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:0,0:3,0,2,0
chr2	29145698	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=16,16;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:1,0:4,2,2,0
chr2	29145725	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=104,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:3,3,1,4
chr2	29149282	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,2:8,1:13,0,2,1
chr2	29152376	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=187,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:4,1,5,0
chr2	29169194	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=237,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:3,0,3,0
chr2	29226343	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=208,98;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:8,3:6,0:9,5,2,1
chr2	29226559	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=154,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:6,2:7,3:6,7,2,3
chr2	29237448	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=184,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,2:5,0:3,8,0,2
chr2	29239942	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=162,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:7,1,2,0
chr2	29240005	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=155,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:9,4:4,3:10,3,3,4
chr2	29240582	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=161,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:6,2:3,2:9,0,4,0
chr2	29245075	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:16,2:12,0:13,15,0,2
chr2	29249903	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,234;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:1,8,0,5
chr2	29274704	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=187,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,3:7,2:9,5,4,1
chr2	29274720	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=203,203;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.289:19:7,3:5,2:8,6,4,1
chr2	29287708	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr2	29287926	.	C	CGCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GCT;STR;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,3:0,5:0,0,3,6
chr2	29295389	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:5,6:5,2:4,7,7,1
chr2	29295866	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=188,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:8,5:10,3:10,8,3,5
chr2	29296984	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=206,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:10,4:7,0:4,13,2,2
chr2	29356728	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=184,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr2	29366830	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=167,260;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:3,3:9,2:2,10,1,4
chr2	29366875	.	C	CACAG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=40.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,7:1,3:0,1,1,9
chr2	29383374	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:0,6:1,8:0,1,4,10
chr2	29386646	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=190,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,1:4,2:7,5,3,0
chr2	29390299	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=214,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:7,1,0,4
chr2	29416025	.	C	CATTG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=173,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATTG;STR;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,1:6,2:12,1,2,1
chr2	29416794	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:5,2:10,5:6,9,2,5
chr2	29419591	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=196,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:7,2,3,0
chr2	29446128	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=222,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr2	29446184	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=192,240;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,0:8,4:11,2,4,0
chr2	29449697	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=216,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,1,1
chr2	29455267	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.571:16:5,6:0,3:3,4,4,5
chr2	29498210	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr2	29917940	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	30379557	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,11:0.279:41:12,0:18,11:18,12,0,11
chr2	30379574	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.299:38:10,0:17,10:13,14,0,11
chr2	30454501	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,1:6,2:9,1,3,0
chr2	30682470	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=180,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:16,2:13,1:15,14,1,2
chr2	30682630	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,4:5,1:4,5,0,5
chr2	30756196	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,6:2,3:1,8,2,7
chr2	30828792	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:0,3:2,3:2,0,7,0
chr2	30955528	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=259,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr2	30959262	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=230,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,3:4,2:4,0,5,0
chr2	30977073	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=204,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	30986989	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr2	30987143	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=185,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:15,0:4,2:9,10,0,2
chr2	31009977	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=251,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,4:4,5:3,4,6,3
chr2	31133939	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=182,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:1,7,0,3
chr2	31189236	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=300,355;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr2	31397696	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=217,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr2	31399414	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:2,0:4,5:6,0,3,2
chr2	31399591	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=228,269;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:1,9,0,2
chr2	31400502	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=264,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:0|1:31400502_A_C:31400502:6,0,2,1
chr2	31400510	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=259,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0|1:31400502_A_C:31400502:5,0,2,1
chr2	31400722	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.358:17:4,1:7,4:2,9,2,4
chr2	31401290	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr2	31401499	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:1,6,1,2
chr2	31410708	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,1,15
chr2	31410728	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,2:4,3:0,9,0,5
chr2	31411184	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=191,122;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:11,3:6,0:11,8,1,2
chr2	31415955	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=211,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:2,0:1,0:3,1,1,0
chr2	31415957	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,12;MFRL=211,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:3,1,1,0
chr2	31415967	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=184,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:0,1,5,0
chr2	31420245	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:0,11,1,1
chr2	31422452	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=210,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,2:6,4:1,10,3,3
chr2	31422514	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=212,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr2	31424885	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=126,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.748:14:2,4:1,6:0,3,5,6
chr2	31428030	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=198,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,4:6,2:8,1,6,0
chr2	31428084	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,78;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,0:10,3:12,8,1,2
chr2	31467079	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=288,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	31467351	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=146,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr2	31484334	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	31488965	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	31570376	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=127,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=42.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:3,10:4,3:6,1,11,3
chr2	31571241	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=173,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:2,6:0,7:0,2,4,9
chr2	31572482	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr2	31588288	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=102,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:0,6:7,10:4,3,10,6
chr2	31589654	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr2	31590759	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=214,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr2	31590785	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=210,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:8,2:3,0:8,3,1,1
chr2	31600146	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:0,2,0,7
chr2	31609448	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,11:0,0,6,13
chr2	31611029	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=178,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:6,3,4,1
chr2	31621598	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.621:19:4,10:2,2:0,7,2,10
chr2	31626045	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:5,4:5,2:0,11,0,6
chr2	31628705	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=116,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:4,4:7,9:7,4,10,3
chr2	31758917	.	C	CGTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=349,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31758917_C_CGTT:31758917:0,1,0,1
chr2	31758918	.	A	ATTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=18,25;MFRL=349,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:31758917_C_CGTT:31758917:0,1,0,1
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chr2	32264285	.	TC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:7,5:7,4:0|1:32264285_TC_T:32264285:10,4,7,2
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chr2	32264594	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,80;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr2	32369901	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	32400532	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=277,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr2	32422366	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.388:18:3,3:7,3:6,5,3,4
chr2	32434701	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr2	32449871	.	ATTTT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=159,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,4;RU=T;STR;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.705:15:2,6:2,5:0,4,0,11
chr2	32449879	.	T	TAAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=165,249;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=A;STR;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,5:1,3:0,3,0,8
chr2	32461493	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr2	32466029	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	32481793	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=49.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0|1:32481793_AT_A:32481793:0,0,6,6
chr2	32481795	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0|1:32481793_AT_A:32481793:0,0,6,6
chr2	32481939	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr2	32532184	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=130,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:16,6:11,0:14,13,6,0
chr2	32620589	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=189,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:7,0:14,3:12,9,1,2
chr2	32626399	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=214,143;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:5,3,0,4
chr2	32641218	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=128,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,3:9,0:6,12,3,0
chr2	32661267	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=187,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:4,3,0,2
chr2	32661310	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=217,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr2	32667058	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:32667058_C_A:32667058:0,0,4,1
chr2	32667061	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0|1:32667058_C_A:32667058:0,0,5,1
chr2	32667182	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,10,5
chr2	32690109	.	AT	A	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=173,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.225:38:18,3:10,6:25,4,7,2
chr2	32690176	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.114:50:27,0:18,5:20,25,5,0
chr2	32690253	.	ATT	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:1,0:7,4:4,5,1,3
chr2	32694600	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.108:56:27,6:23,0:24,26,6,0
chr2	32695219	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=174,191;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:10,5:7,0:14,3,5,0
chr2	32706579	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr2	32712875	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,5,13
chr2	32733196	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:7,5:12,0:13,6,5,0
chr2	32740138	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=199,186;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:1,6:6,4:3,5,3,7
chr2	32749880	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,9,0
chr2	32749890	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,12,2
chr2	32749893	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=70.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,12,4
chr2	32749903	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,13,4
chr2	32757201	.	CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	C,CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,31,34;MFRL=0,105,184;MMQ=60,60,56;MPOS=26,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,8,23;RU=GT;STR;TLOD=5.37,24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,7:0.108,0.814:9:0,2,2:0,0,0:0,0,5,4
chr2	32757256	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=101,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.079:41:14,2:20,0:12,26,3,0
chr2	32757349	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.328:28:11,2:7,6:3,16,0,9
chr2	32822729	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr2	32823096	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=288,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:4,0:0,3:0,4,4,0
chr2	32836574	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=173,204;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:8,5:7,0:0|1:32836574_G_T:32836574:10,5,5,0
chr2	32836579	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=167,204;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:8,5:6,0:0|1:32836574_G_T:32836574:9,5,5,0
chr2	32927863	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=131,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:9,2:9,3:10,8,3,2
chr2	32958838	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=187,263;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:7,1,2,0
chr2	32959024	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=141,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,4:5,0:2,12,2,2
chr2	32961745	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,10,6
chr2	32961858	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,2:6,1:10,7,1,2
chr2	33007817	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=177,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:1,4,1,4
chr2	33036324	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=117,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,1:3,2:2,4,1,2
chr2	33045867	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:10,3,2,0
chr2	33174072	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=205,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,4:2,2:0,2,2,5
chr2	33246146	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:9,1:9,1:5,13,1,1
chr2	33335847	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.590:22:2,5:6,8:7,2,4,9
chr2	33413640	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=355,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr2	33414009	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr2	33442549	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=247,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:8,0,3,0
chr2	33498691	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:2,2:7,0,1,1
chr2	33540138	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=315,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:1,0,8,0
chr2	33540172	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,5:1,3:5,0,5,3
chr2	33568113	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr2	33572461	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=177,61;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:13,0:16,2:18,11,1,1
chr2	33572472	.	GAAGCCT	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=177,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:10,0:17,2:0|1:33572472_GAAGCCT_G:33572472:18,11,1,1
chr2	33572480	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=177,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:9,0:17,2:0|1:33572472_GAAGCCT_G:33572472:17,10,1,1
chr2	33586464	.	C	CTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:2,2:5,1:6,1,3,0
chr2	33614187	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,259;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.424:17:3,4:6,3:8,2,7,0
chr2	33622448	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=211,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	33623387	.	AT	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr2	33744958	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,7:0,0,12,9
chr2	33748913	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=259,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,3,1
chr2	33752152	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=188,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:2,3:5,0:7,0,3,0
chr2	33759395	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=189,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.252:18:6,2:6,2:12,2,3,1
chr2	33810455	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=200,84;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.181:26:8,4:9,0:5,17,0,4
chr2	36605417	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=113,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,6:5,1:5,5,6,1
chr2	36605585	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr2	36669670	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,0:4,4:8,0,4,0
chr2	36691600	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,2:6,0:12,1,2,0
chr2	36739553	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=88.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,1,26
chr2	36740643	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=210,256;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:7,4,2,0
chr2	36756288	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=184,126;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,2:0,9:0,1,2,9
chr2	36771701	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=162,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr2	36779144	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=137,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.256:10:3,0:3,2:4,4,1,1
chr2	36783215	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=147,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:4,7,0,2
chr2	36785667	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=195,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,2:1,0:0,3,1,2
chr2	36806021	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,2:10,1:0,14,1,2
chr2	36810473	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=144,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,0:4,2:8,3,1,1
chr2	36810654	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=183,196;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,0:8,3:1,12,0,3
chr2	36824956	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,324;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	36825170	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	36825330	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	36943419	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,7,0
chr2	36982078	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=110,93;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:11,6:7,0:11,7,6,0
chr2	36994439	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=80,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:3,5,1,3
chr2	37000877	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=230,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:4,0,6,1
chr2	37010574	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=229,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:3,9:1,6:0,4,7,8
chr2	37032686	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=109,109;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:2,3:19,0:14,7,4,0
chr2	37036091	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:8,8,0,2
chr2	37077015	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	37078095	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.871:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	37096970	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	37111045	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=223,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,8:1,5:2,1,10,3
chr2	37152337	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=120,229;MMQ=58,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:9,2:21,0:0|1:37152337_G_A:37152337:12,19,2,0
chr2	37152340	.	GG	AA	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=120,229;MMQ=58,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:9,2:20,0:0|1:37152337_G_A:37152337:12,19,2,0
chr2	37235964	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=141,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:0|1:37235964_T_C:37235964:5,6,1,1
chr2	37235967	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=150,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:37235964_T_C:37235964:4,6,1,1
chr2	37247122	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=182,128;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37247122_T_C:37247122:0,1,0,1
chr2	37247128	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=182,128;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37247122_T_C:37247122:0,1,0,1
chr2	37247132	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=182,128;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37247122_T_C:37247122:0,1,0,1
chr2	37287775	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=130,48;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,2:13,0:0|1:37287775_C_T:37287775:12,13,1,1
chr2	37287784	.	CCT	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=131,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,2:9,0:0|1:37287775_C_T:37287775:12,12,1,1
chr2	37302556	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,13,0
chr2	37316717	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:1,1:2,0:3,2,2,3
chr2	37373982	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,8,4
chr2	37402270	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.501:28:6,8:8,6:7,7,6,8
chr2	37402373	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=133,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,1:2,1:2,6,1,1
chr2	37406761	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.417:15:6,2:2,4:2,7,3,3
chr2	37410537	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=214,210;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:5,1,3,1
chr2	37414431	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	37415496	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	37428743	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,16,1
chr2	37429119	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=173,91;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,0:6,3:0,11,0,3
chr2	37429848	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:9,1:0,1:8,1,2,0
chr2	37430037	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=123,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:5,4:12,0:10,7,3,1
chr2	37447463	.	A	AAG	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=200,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr2	37447464	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=30,28;MFRL=198,181;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:7,0,2,0
chr2	37447465	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=195,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr2	37447472	.	ATAT	A	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=202,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.645:9:2,4:1,2:3,0,6,0
chr2	37447473	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,6:0,8:0|1:37447473_T_A:37447473:0,0,14,2
chr2	37447475	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0|1:37447473_T_A:37447473:0,0,14,2
chr2	37447477	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=26,28;MFRL=201,93;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=28.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,4:4,4:8,0,7,2
chr2	37447479	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=24,26;MFRL=200,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.366:17:4,3:6,3:11,0,4,2
chr2	37447627	.	C	CA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.227:32:11,3:13,4:9,16,1,6
chr2	37450377	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,35;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:11,0:16,2:16,11,1,1
chr2	37475273	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=181,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:7,3,1,1
chr2	37475458	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:6,5:6,0:6,7,1,4
chr2	37480249	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=224,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr2	37481327	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:16,2:7,0:14,9,2,0
chr2	37483771	.	ATTTTTTT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=31,24;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.517:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	37494489	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=225,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.435:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr2	37494521	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,17;MFRL=190,229;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:4,0,1,0
chr2	37499406	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=241,143;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:1,2:0,14:1,0,16,0
chr2	37501792	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,2:8,0:7,11,1,1
chr2	37513285	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=215,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:3,2,2,1
chr2	37586681	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=137,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:5,1:9,0,3,0
chr2	37595696	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=184,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.479:17:4,5:4,3:7,2,6,2
chr2	38177525	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=184,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	38178362	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,3:1,0:2,3,2,1
chr2	38179414	.	CTG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,2:2,2:1,3,0,4
chr2	38202502	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=170,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr2	38208606	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=253,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr2	38216766	.	CT	C,CTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32,21;MFRL=209,169,147;MMQ=60,60,60;MPOS=24,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.97,6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,4:0.242,0.282:15:4,1,1:2,3,1:1,6,3,5
chr2	38218281	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=237,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:2,0,3,1
chr2	38218470	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=188,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:1,7,0,2
chr2	38244417	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=117,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,2:8,3:7,6,4,1
chr2	38244818	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=239,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:0|1:38244818_A_C:38244818:1,5,0,4
chr2	38244824	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=239,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:0|1:38244818_A_C:38244818:1,5,0,4
chr2	38244826	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=206,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.250:10:3,1:5,1:1|0:38244818_A_C:38244818:0,8,1,1
chr2	38298203	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr2	38302544	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=104,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:1,2,1,3
chr2	38526333	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=126,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr2	38526547	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=166,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,3:3,0:0,6,0,3
chr2	38537626	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:2,1:15,1:4,13,0,2
chr2	38570327	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=245,218;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:38570327_G_T:38570327:4,0,1,0
chr2	38570330	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=245,218;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:38570327_G_T:38570327:4,0,1,0
chr2	38791356	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=184,90;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:11,0:10,3:12,9,0,3
chr2	38975332	.	GT	G,GTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,35,32;MFRL=244,182,346;MMQ=60,60,60;MPOS=22,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.98,4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.298,0.295:10:3,1,1:0,2,1:0,4,1,5
chr2	38977371	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:0,3,0,8
chr2	38977402	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=200,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,4:3,4:0,3,0,8
chr2	39025174	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=130,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:9,14:4,0:8,5,14,0
chr2	39025607	.	A	AACTAACCTGATTG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39025607_A_AACTAACCTGATTG:39025607:0,3,0,1
chr2	39025609	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39025607_A_AACTAACCTGATTG:39025607:0,3,0,1
chr2	39025610	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39025607_A_AACTAACCTGATTG:39025607:0,3,0,1
chr2	39025632	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	39030074	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,1,4
chr2	39042639	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr2	39043366	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=177,210;MMQ=60,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,0:7,4:2,12,0,4
chr2	39050061	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	39074202	.	AG	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=158,144;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,1:5,7,0,2
chr2	39075356	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=231,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,4:1,7:1,1,9,2
chr2	39083645	.	CTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,27;MFRL=161,172;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:1,1:0,0:1,4,1,1
chr2	39088323	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=174,202;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:7,2:9,2:9,8,2,2
chr2	39090688	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=204,162;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:4,3:0,6,0,3
chr2	39090696	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr2	39090717	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=212,162;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0|1:39090717_C_T:39090717:0,4,0,3
chr2	39090721	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=212,162;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0|1:39090717_C_T:39090717:0,4,0,3
chr2	39095410	.	TCCA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCA;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	39107750	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,0:2,3:5,2,3,0
chr2	39117117	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=247,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:1,9:0,10:1,0,6,13
chr2	39157032	.	ACC	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:0,1:3,0:0|1:39157032_ACC_A:39157032:0,3,0,1
chr2	39157035	.	TGGTA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:39157032_ACC_A:39157032:0,3,0,1
chr2	39157049	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=170,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr2	39162947	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,69;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:9,0:11,3:11,9,1,2
chr2	39184018	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:9,1:5,4:10,4,4,1
chr2	39185186	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:6,4,2,1
chr2	39196644	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:9,5:9,2:8,10,0,7
chr2	39198966	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=68,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.741:25:2,9:4,10:5,1,13,6
chr2	39199075	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=178,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:10,0:11,6:7,14,0,6
chr2	39199087	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=178,119;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:5,0:14,6:6,13,0,6
chr2	39214821	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	39224351	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,4,1
chr2	39224597	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:9,0:2,10:0,11,0,10
chr2	39224615	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=137,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr2	39233500	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=174,231;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr2	39234342	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=217,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr2	39239572	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=173,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr2	39251375	.	T	TCAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAC;STR;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,4:3,4:0,4,1,7
chr2	39281730	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=181,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,5:2,5:4,0,7,3
chr2	39440727	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr2	39479122	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,3:0,0,0,9
chr2	39494469	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=138,231;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr2	39514136	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=127,306;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,1,2
chr2	39514204	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	39526842	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,11,3
chr2	39530136	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=212,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:3,0,6,0
chr2	39553271	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=139,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:8,9:4,3:5,7,6,6
chr2	39564620	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=69,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:4,3:3,4:5,2,5,2
chr2	39570427	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=117,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr2	39893460	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	39944055	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=216,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr2	39993167	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=172,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.759:23:2,9:3,8:4,1,12,6
chr2	39997047	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=184,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,3:9,0:10,7,3,0
chr2	40402275	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr2	40404839	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,9,7
chr2	40404913	.	A	AAGTAC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=170,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:10,8,1,1
chr2	40655563	.	CCACA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=CA;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	42275819	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	42275914	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=157,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:0,2:1,0:0,2,1,1
chr2	42281307	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:10,0:10,4:11,9,0,4
chr2	42284884	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=212,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:3,2:1,1:0,5,1,2
chr2	42488198	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=242,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr2	42491951	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=174,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:1,6,3,0
chr2	42511903	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=124,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:2,5,1,1
chr2	42513554	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:0,6,0,5
chr2	42522562	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=146,124;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.268:39:17,10:12,0:17,12,10,0
chr2	42552711	.	TTA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=116,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.314:11:3,2:5,1:0|1:42552711_TTA_T:42552711:1,7,0,3
chr2	42552742	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=313,169;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.555:2:0,1:1,0:0|1:42552711_TTA_T:42552711:0,1,0,1
chr2	42553210	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=237,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,6:3,3:5,1,7,2
chr2	42556022	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=164,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:8,2:4,2:7,5,3,1
chr2	42578274	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=188,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr2	42588195	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:7,0,5,0
chr2	42797716	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=169,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:42797716_G_GA:42797716:0,3,0,1
chr2	42797718	.	G	GGATATGTGCATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=169,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:42797716_G_GA:42797716:0,3,0,1
chr2	42836516	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=151,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr2	42836588	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=155,112;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,7:7,0:13,2,7,0
chr2	42925001	.	T	TAAAGAAACAATTGAAACTCAGCAAG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=116,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,2:10,0:6,8,1,1
chr2	42925079	.	TTTC	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=236,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTC;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr2	42935961	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=144,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,5:6,4:5,4,7,2
chr2	42935979	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=157,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,3:5,5:4,5,6,2
chr2	42989994	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=191,250;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr2	42990010	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=125,227;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr2	42991468	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=306,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	42994995	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=131,66;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:10,0:4,2:12,3,0,2
chr2	42996750	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=178,239;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.341:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr2	42996759	.	AAGAG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AG;STR;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr2	42997040	.	AG	CC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=206,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,1:6,1:0|1:42997040_AG_CC:42997040:0,10,3,0
chr2	42997045	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=205,230;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,0:4,2:0|1:42997040_AG_CC:42997040:0,9,3,0
chr2	43015612	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=150,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:5,1,5,0
chr2	43015814	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=224,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr2	43019730	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=215,269;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	43452183	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	43514036	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,3:4,3:7,1,3,3
chr2	43625078	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=142,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,1:11,1:11,4,1,1
chr2	43754992	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:6,2,5,1
chr2	43768233	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=157,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.235:14:6,2:5,1:10,1,2,1
chr2	43768504	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=150,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,1:10,1:0,23,0,2
chr2	43778857	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:0,1:6,0,3,1
chr2	43787576	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr2	43798792	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=169,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	43800174	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=192,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:2,3,1,5
chr2	43801630	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,1:8,1:7,10,2,0
chr2	43802261	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	43804229	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.588:20:5,5:3,6:4,4,5,7
chr2	43813764	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=146,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,0:11,3:13,5,2,1
chr2	43817950	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:1,4:9,2:5,5,2,4
chr2	43871983	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=190,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:2,3:2,5:2,2,0,8
chr2	43902511	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,7:1,2:1,2,3,6
chr2	43903354	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=105,228;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,4:6,4:4,4,4,4
chr2	43903483	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=182,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,5:3,2:2,2,3,4
chr2	43921489	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=259,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,1,1
chr2	43926890	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=167,107;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:9,0:11,3:0|1:43926890_A_T:43926890:11,10,0,3
chr2	43926894	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=180,107;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:8,0:14,3:0|1:43926890_A_T:43926890:12,11,0,3
chr2	43931055	.	CTTTTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=126,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=25,19;RU=T;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.510:2:0,0:0,1:0|1:43931055_CTTTTTT_C:43931055:0,1,1,0
chr2	43931082	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=136,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.399:3:2,0:0,0:0|1:43931055_CTTTTTT_C:43931055:1,1,1,0
chr2	43937485	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,0:3,3:2,7,0,3
chr2	43947760	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=201,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:5,0,3,2
chr2	43947849	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=160,97;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,2:3,0:2,7,2,0
chr2	43953664	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=239,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr2	43965558	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=163,72;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:7,5:7,0:5,9,4,1
chr2	43965709	.	T	TGTTTGTTTTGAGACAGGGTTTCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr2	43965733	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=235,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	43968050	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,6:3,2:5,3,7,1
chr2	43973196	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	43984328	.	A	AAATATATTGAAAAGAGTT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=166,10842886;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,1:7,0:8,11,0,2
chr2	43985940	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	43986027	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=218,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:10,0,2,0
chr2	43991310	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=206,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr2	43991357	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,4:4,7:4,3,6,5
chr2	44001139	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=203,233;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:1,0,8,0
chr2	44004099	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=229,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr2	44010620	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=227,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,3:1,6:2,1,6,3
chr2	44022970	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,6:0,2:0,1,6,2
chr2	44023109	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,2:9,0:8,9,0,2
chr2	44047110	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,189;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:11,2:14,0:10,15,2,0
chr2	44050098	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=178,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:7,0:7,5:2,12,0,5
chr2	44101214	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=182,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	44101649	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=129,40;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:0,3:1,0:1,1,0,4
chr2	44104610	.	ACT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=215,252;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr2	44116836	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=119,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:3,1,3,1
chr2	44117578	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=148,116;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.251:22:12,4:4,1:5,12,1,4
chr2	44123672	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=195,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr2	44123759	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=201,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,2:5,3:7,5,4,1
chr2	44145374	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=145,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:2,2,5,1
chr2	44152180	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=194,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.320:13:2,0:7,3:7,2,3,1
chr2	44172444	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=148,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,2:2,4:5,3,4,2
chr2	44175648	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=179,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.163:20:7,0:10,2:6,11,0,3
chr2	44190789	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=165,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,0:4,2:5,3,1,1
chr2	44201259	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=113,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,3:7,0:10,4,3,0
chr2	44201376	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=176,145;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:4,7:9,3:7,6,7,3
chr2	44202420	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=212,324;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr2	44207042	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:14,0:14,2:14,14,0,2
chr2	44428483	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=159,120;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:14,1:21,1:23,13,0,2
chr2	44428873	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,1:4,1:4,9,2,0
chr2	44445685	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=156,43;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:9,0:11,2:0|1:44445685_T_A:44445685:5,15,1,1
chr2	44445696	.	A	AAATTTTCTTGGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=157,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:44445685_T_A:44445685:3,14,1,1
chr2	44471313	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.432:8:2,1:1,2:2,3,3,0
chr2	44512971	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=225,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:0,2:2,2:0,2,0,5
chr2	44528267	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:1,4,2,2
chr2	44531484	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,5:3,4:2,4,3,6
chr2	44548414	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:12,0:6,2:16,2,2,0
chr2	44548613	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:3,6:4,2:1,7,1,7
chr2	44556298	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr2	44559529	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=206,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr2	44559896	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	44565447	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	44566523	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=178,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.267:9:2,2:5,0:0|1:44566523_A_AG:44566523:0,7,1,1
chr2	44566524	.	T	TGAGTGAGAGA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=178,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,2:4,0:0|1:44566523_A_AG:44566523:0,7,1,1
chr2	44569474	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr2	44569700	.	AAAT	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=187,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:2,5:3,5:2,3,4,6
chr2	44569739	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=152,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.448:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	44570804	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	44573624	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr2	44617324	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=127,321;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,0:1,2:3,0,2,1
chr2	44933475	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,2:8,0:8,10,2,0
chr2	44942384	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,230;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.618:8:1,4:1,1:2,1,1,4
chr2	44981119	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=221,258;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,0:1,2:5,0,2,0
chr2	45647043	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr2	45773816	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr2	45774050	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	45780962	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr2	45826526	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	46070269	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr2	46583235	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=202,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr2	46583271	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,22;MFRL=146,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:3,1,1,0
chr2	46583278	.	C	CG	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=195,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0|1:46583278_C_CG:46583278:2,2,2,0
chr2	46583279	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:1,0:0|1:46583278_C_CG:46583278:1,2,2,1
chr2	46583281	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=195,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.441:7:3,3:1,0:0|1:46583278_C_CG:46583278:2,2,2,1
chr2	46587713	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=210,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,4:7,0:14,1,4,0
chr2	46603671	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=60,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:0,5:4,7:2,2,7,5
chr2	46605954	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=134,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.692:16:2,5:1,6:1,4,1,10
chr2	46739157	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=169,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:3,0,3,3
chr2	46770870	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:10,2:17,1:14,13,3,0
chr2	46808243	.	GGA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=137,243;MMQ=40,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:4,3,1,1
chr2	46818992	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=128,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,5:7,1:8,5,4,2
chr2	46819815	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=129,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr2	46839487	.	GA	G,GAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=18,32,17;MFRL=157,152,153;MMQ=60,60,60;MPOS=20,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=12.00,4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,7,3:0.305,0.151:23:2,1,0:3,4,0:2,11,2,8
chr2	46988727	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=153,198;MMQ=54,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,1:12,2:14,12,1,2
chr2	47045267	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,0:4,5:4,3,4,1
chr2	47083046	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=216,421;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:6,1,1,1
chr2	47177665	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=231,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:3,6,0,2
chr2	47221525	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=190,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:6,3:5,1:9,2,2,2
chr2	47221693	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=222,241;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,2,3
chr2	47222236	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.172:21:7,2:11,1:0|1:47222236_G_T:47222236:12,6,1,2
chr2	47222243	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=130,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,2:0.119:23:10,0:11,2:1|0:47222236_G_T:47222236:14,7,0,2
chr2	47233048	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=138,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:7,1:1,2:6,2,1,2
chr2	47233720	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=173,256;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:6,3:1,0:0|1:47233720_G_T:47233720:6,1,3,0
chr2	47233722	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=173,256;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:6,3:1,0:0|1:47233720_G_T:47233720:6,1,3,0
chr2	47233749	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=173,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.404:18:7,5:3,2:6,5,6,1
chr2	47256618	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=169,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr2	47273668	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=68,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	47277035	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=184,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:47277035_C_T:47277035:9,0,0,2
chr2	47277043	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=184,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,3:0.308:11:2,3:6,0:1|0:47277035_C_T:47277035:6,2,3,0
chr2	47277207	.	CA	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr2	47278823	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=228,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,3,1
chr2	47314052	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=226,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr2	47357458	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=95,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,6:1,4:0,2,2,8
chr2	47380145	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=177,107;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.331:19:9,1:4,5:8,5,3,3
chr2	47380203	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=143,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:1,7,2,4
chr2	47380250	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:4,2:0,2:1,3,0,4
chr2	47382214	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr2	47388766	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	47389328	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:11,2,2,0
chr2	47389342	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=175,67;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:4,2:0,3:3,1,4,2
chr2	47397750	.	CAT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,4:6,3:7,0,7,0
chr2	47399601	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,3:6,3:3,8,2,4
chr2	47597034	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,303;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	47613870	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=200,286;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	47630550	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:3,8,2,0
chr2	47630639	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=201,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr2	47693959	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:6,1:0,4:2,4,1,4
chr2	48010654	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=199,266;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr2	48018081	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=80,203;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,4:5,3:7,5,4,3
chr2	48018314	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=206,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.762:6:1,2:0,3:0,1,1,4
chr2	48030458	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	48030838	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=112,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,3:4,7:1,5,2,8
chr2	48032740	.	AT	A,ATT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=150,168,123;MMQ=60,60,60;MPOS=23,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.27,3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,4:0.214,0.305:13:4,2,2:2,1,0:6,0,5,2
chr2	48032874	.	ACTAT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTAT;STR;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.929:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr2	48032937	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	48033546	.	C	CT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:16,4:4,2:7,13,2,4
chr2	48033551	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=106.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,20:0,7:0,0,11,17
chr2	48033890	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=160,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.552:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr2	48033934	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,15;MFRL=134,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.214:15:7,0:4,0:5,7,3,0
chr2	48035631	.	TTTATA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	48040477	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.162:41:17,0:17,5:15,20,0,6
chr2	48040588	.	G	GTTTTTTTTTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,14;MFRL=155,149;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:48040588_G_GTTTTTTTTTT:48040588:0,3,0,1
chr2	48040592	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=163,149;MMQ=60,30;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:48040588_G_GTTTTTTTTTT:48040588:0,4,0,1
chr2	48040598	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=163,149;MMQ=60,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:48040588_G_GTTTTTTTTTT:48040588:0,4,0,1
chr2	48040851	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=200,126;MMQ=57,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:48040851_C_A:48040851:2,0,1,0
chr2	48040855	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=200,126;MMQ=57,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:48040851_C_A:48040851:2,0,1,0
chr2	48040904	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr2	48046012	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=243,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:5,3:2,2:5,4,1,4
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chr2	48725786	.	CCCAGGAA	C,TCCAGGAA	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,20,20;MFRL=144,62,69;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.28,3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,2,2:0.100,0.130:20:7,0,0:9,2,2:10,6,2,2
chr2	48734576	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
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chr2	48738687	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
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chr2	48808882	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=195,121;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,2:9,1:7,4,2,1
chr2	48808898	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=181,305;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:8,4,2,1
chr2	48844968	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=321,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:2,10:0,5:2,0,13,2
chr2	48847918	.	G	GAATA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=AATA;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,1:0,0:0,0,1,0
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chr2	48906625	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,2,6
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chr2	48925986	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,0:0,0,1,4
chr2	48948802	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=133,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:3,1:11,1:8,6,1,1
chr2	48948856	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=136,227;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,2:6,2:4,6,2,2
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chr2	48956417	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,2,0
chr2	48956475	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
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chr2	49216284	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=223,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr2	49244559	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:2,1,2,2
chr2	49381585	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=15845309,279;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:0,1,1,3
chr2	50201383	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=154,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:11,5:5,2:5,11,1,6
chr2	50434759	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=406,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr2	50574038	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr2	50692560	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=197,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,0:3,3:9,2,2,1
chr2	50693504	.	AAC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:4,1:3,5:7,0,5,1
chr2	50724541	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=226,289;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	50758309	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=207,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,4:1,3:0,1,7,0
chr2	50765822	.	TGTTATA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=181,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:6,2:2,14,1,1
chr2	50858107	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:4,1,3,0
chr2	51148872	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=146,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr2	53832072	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=132,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,3:4,6:3,5,3,6
chr2	53941493	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,225;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:5,10:9,0:13,1,10,0
chr2	53943696	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:4,2:7,1:6,6,3,0
chr2	53943933	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=217,228;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=40.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,10:0.688:14:2,0:2,10:0|1:53943933_C_T:53943933:0,4,0,10
chr2	53943940	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=212,228;MMQ=60,49;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.648:15:2,0:3,9:0|1:53943933_C_T:53943933:0,5,0,10
chr2	53992593	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:7,5:9,1:12,4,5,1
chr2	54001762	.	AAACTTTTATTTT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=205,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.403:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	54014558	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=203,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr2	54021679	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=173,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr2	54023247	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	54024626	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=209,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:8,3:6,4:11,3,3,4
chr2	54042180	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=195,136;MMQ=60,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	54093415	.	A	AAACAGCAATTCAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=199,20952089;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:4,2:0,0:1,3,0,2
chr2	54114967	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,4:7,4:8,5,7,1
chr2	54115097	.	G	GACTACAGGCACACGCCGC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,2:8,0:0|1:54115097_G_GACTACAGGCACACGCCGC:54115097:5,17,0,2
chr2	54115100	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,2:8,0:0|1:54115097_G_GACTACAGGCACACGCCGC:54115097:5,17,0,2
chr2	54115102	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:13,2:8,0:0|1:54115097_G_GACTACAGGCACACGCCGC:54115097:5,17,0,2
chr2	54115845	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:7,1,1,1
chr2	54116003	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=194,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr2	54119870	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=153,248;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,0:5,3:6,1,3,0
chr2	54120820	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,7:3,5:6,2,8,4
chr2	54122956	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=137,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr2	54125102	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=101,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:9,2:26,0:14,21,2,0
chr2	54125185	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=191,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,1:6,3:0,11,0,4
chr2	54131154	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,3:2,1:4,3,3,1
chr2	54135429	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:2,3:9,3:5,6,5,1
chr2	54137136	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=175,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,1:4,3:8,3,4,0
chr2	54146387	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=167,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.455:11:2,0:2,1:2,4,0,5
chr2	54148331	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	54150079	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=203,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr2	54152927	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=230,322;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:3,1,0,2
chr2	54155240	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:4,2,4,1
chr2	54158957	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=154,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,4:4,1:7,5,4,1
chr2	54159999	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=219,322;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	54161885	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=263,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr2	54483325	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=184,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:5,8:12,0:8,9,7,1
chr2	54483443	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=209,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.827:21:1,8:2,9:2,1,3,15
chr2	54494370	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,11,3
chr2	54558079	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=220,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,6:6,2:8,2,6,2
chr2	54570995	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=137,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:6,5:10,2:6,10,3,4
chr2	54839276	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=197,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:1,6:3,8:2,2,9,5
chr2	54844911	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=246,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr2	54845117	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=194,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr2	54850583	.	C	CAG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=122,176;MMQ=60,46;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.310:27:7,8:12,0:0|1:54850583_C_CAG:54850583:16,3,8,0
chr2	54850586	.	TAC	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=132,176;MMQ=60,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,8:0.300:28:7,7:12,0:0|1:54850583_C_CAG:54850583:16,4,8,0
chr2	54855137	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=295,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,5:0,2:3,0,7,0
chr2	54855454	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=198,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr2	54877146	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	54882381	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=216,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,4:0,6,0,8
chr2	54893237	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=213,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:6,4:6,1:2,10,1,4
chr2	55040426	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,9,9
chr2	55071101	.	TTGTGTGTGTGTGTG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=198,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,13;RU=TG;STR;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.616:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	55077061	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=179,262;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr2	55077241	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=123,256;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:3,0:10,5:8,5,0,5
chr2	55080703	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=185,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	55091029	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=249,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,5:1,4:2,2,6,3
chr2	55093842	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=191,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:4,2:7,0,3,0
chr2	55098600	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=161,230;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:7,6,0,2
chr2	55122589	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=153,217;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr2	55126730	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,2:5,3:8,2,4,1
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chr2	55138272	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,1,3
chr2	55155672	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=188,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.384:19:4,3:7,4:6,6,3,4
chr2	55179848	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:9,1:3,3:2,10,0,4
chr2	55181351	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr2	55181382	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr2	55186229	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr2	55187297	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr2	55200253	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,3:7,0:15,4,3,0
chr2	55200800	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=84.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,7,16
chr2	55201038	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,2:0,9:0,0,3,8
chr2	55214618	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr2	55214912	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr2	55252469	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.165:40:16,0:18,6:25,9,0,6
chr2	55407935	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	55439963	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	55445151	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:11,2:4,0:5,10,0,2
chr2	55460605	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=192,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.801:23:2,14:2,5:1,3,5,14
chr2	55471407	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr2	55473371	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=217,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	55473386	.	CAT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=305,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr2	55473681	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	55489629	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=201,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr2	55518742	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	55527108	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	55528257	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr2	55528514	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	55530348	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:55530348_G_GC:55530348:0,4,0,1
chr2	55530349	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:55530348_G_GC:55530348:0,4,0,1
chr2	55566538	.	CTATT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=193,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATT;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr2	55576634	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=262,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,5:0,3:1,0,4,4
chr2	55582684	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	55589364	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=242,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr2	55589434	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=214,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:4,6:1,9:3,2,11,4
chr2	55747471	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:5,0,2,1
chr2	55760940	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr2	55764754	.	AATATGAATAC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=119,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:1,4:6,0:2,20,0,4
chr2	55765882	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=157,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.323:12:3,0:3,2:5,3,2,2
chr2	55771050	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=114,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:2,7:5,3:3,4,6,4
chr2	55795557	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=237,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr2	55800937	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=163,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,2:8,0:0|1:55800937_A_C:55800937:3,9,1,1
chr2	55800942	.	A	ATAAGTCTTAGTTATCTAGTAGGT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=176,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:55800937_A_C:55800937:1,8,1,1
chr2	55844445	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,4:6,1:1,7,1,4
chr2	55867845	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=191,66;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,0:1,3:1,4,1,2
chr2	55867938	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=178,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0,6,0,2
chr2	55881966	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=178,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr2	55883509	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:9,2:3,1:3,9,0,3
chr2	55887176	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=313,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	55889061	.	CG	TA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=154,62;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.164:22:7,0:12,3:0|1:55889061_CG_TA:55889061:11,8,2,1
chr2	55889062	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,22:0.959:22:0,7:0,14:1|0:55889061_CG_TA:55889061:0,0,13,9
chr2	55894247	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:2,2,1,2
chr2	55899228	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr2	55900283	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=168,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	56097778	.	CACA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=186,296;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=ACA;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr2	56098272	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:10,2:3,2:2,11,0,4
chr2	56102130	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=109,56;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:16,0:16,4:18,14,0,4
chr2	56108765	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=138,251;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,1:9,1:11,10,1,1
chr2	56108839	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=180,177;MMQ=60,35;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:10,3:7,0:4,14,3,0
chr2	56145270	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,1:6,7:6,8,5,3
chr2	56149475	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,1:9,2:12,3,2,1
chr2	56216052	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr2	56603118	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=219,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,5:2,4:2,3,3,6
chr2	56611543	.	C	CAAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=129,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAG;STR;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr2	58285542	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=201,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:4,9,0,2
chr2	58311273	.	GGTAA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:5,3:7,4:9,5,5,2
chr2	58362160	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	58392789	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=214,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr2	58392797	.	TTTA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=209,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:3,2:8,1,3,0
chr2	58431446	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=181,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr2	59482217	.	T	TGACTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GACTC;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	59504636	.	CTTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,17;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=25,21;RU=T;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:1,0:2,0,0,2
chr2	59504688	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=140,262;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:6,7,0,2
chr2	60768978	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=107,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:2,2:8,1:6,4,1,2
chr2	60769080	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,3:9,0:9,12,2,1
chr2	60773035	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr2	60997757	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,36,23;MFRL=0,304,203;MMQ=60,60,60;MPOS=25,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.55,6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.333,0.500:3:0,0,0:0,1,1:0,0,0,3
chr2	60997770	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=304,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	61007782	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr2	61009788	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=25,26;RU=T;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.768:6:0,3:0,2:0,1,5,0
chr2	61009909	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=180,98;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,31:0.788:39:2,18:5,13:2,6,15,16
chr2	61009938	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=174,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.575:15:4,4:2,4:4,2,1,8
chr2	61014075	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,5:8,0:9,6,5,0
chr2	61018820	.	A	AAAAGGGAATTTTCAAGGTATC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=165,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.261:9:4,2:3,0:5,2,1,1
chr2	61021349	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=223,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:0,4:2,2:0,2,0,6
chr2	61108829	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	61119005	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=185,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:3,1:11,2:3,11,0,3
chr2	61121492	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr2	61128284	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:0,1:1,1:0,1,1,2
chr2	61145523	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=234,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:3,0:4,0:0|1:61145523_G_T:61145523:4,3,2,0
chr2	61145525	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=204,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:4,0:0|1:61145523_G_T:61145523:5,3,2,0
chr2	61149070	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.174:27:10,4:11,0:10,13,4,0
chr2	61192218	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.146:39:17,0:16,5:18,16,0,5
chr2	61235855	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=62,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,0:5,3:4,1,3,0
chr2	61298691	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=132,143;MMQ=40,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,3:5,0:5,0,3,0
chr2	61300556	.	CT	C,CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32,24;MFRL=154,196,166;MMQ=60,60,60;MPOS=17,0;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.07,4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,3:0.242,0.248:14:3,0,0:4,3,3:6,1,7,0
chr2	61304002	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=153,229;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:4,0,4,1
chr2	61308517	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=136,242;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr2	61308569	.	ATT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.506:12:3,4:1,2:4,2,6,0
chr2	61361325	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=126,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,0:9,2:6,8,1,1
chr2	61385248	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=242,259;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr2	61389609	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,5:5,1:8,2,5,2
chr2	61412559	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,62473650;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	61413037	.	TATTA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=126,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,2:2,0:1,7,0,2
chr2	61413723	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=220,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:1,8:1,8:2,0,7,9
chr2	61417617	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=218,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:0,7:2,9:1,1,10,7
chr2	61420140	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=151,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,3:9,0:3,11,2,1
chr2	61448776	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,0:11,3:6,13,1,2
chr2	61456592	.	T	TAAAAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,78;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=18,25;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.761:2:0,1:0,0:0|1:61456592_T_TAAAAAAA:61456592:0,0,2,0
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chr2	61576517	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
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chr2	61605379	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=206,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr2	61605614	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:5,1:3,7,1,1
chr2	61622251	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=188,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:3,3,2,2
chr2	61622374	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=143,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:6,0:12,3:5,13,1,2
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chr2	61709551	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=37.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,13:0.389:34:14,13:7,0:1|0:61709462_GAGCCACTGTGCCCGACCAGGAACATTCTACGTTTATTAAAAGGTATATTTACTCTTGTAGGTGAGGGAAGGCCGACTTAAGGAGATT_G:61709462:12,9,13,0
chr2	61709747	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=396,263;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:1,2:0,1:1,0,1,2
chr2	61722519	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=231,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:2,0,6,0
chr2	61722833	.	AAG	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=210,199;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:0|1:61722833_AAG_A:61722833:0,3,0,2
chr2	61722838	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=207,199;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:61722833_AAG_A:61722833:0,2,0,2
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chr2	61722847	.	T	TCG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=207,201;MMQ=60,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:61722833_AAG_A:61722833:0,2,0,1
chr2	61727084	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=305,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0,2,1,1
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chr2	61729268	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:61729258_A_G:61729258:0,0,6,4
chr2	61749690	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=137,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,1:0,7:1,0,7,2
chr2	61749716	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,3:1,8:2,0,8,3
chr2	62053546	.	CGCT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=179,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,1:5,2:9,6,3,0
chr2	62063093	.	TAA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.328:10:3,2:3,1:6,1,3,0
chr2	62063110	.	AC	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,0:5,2:8,2,4,0
chr2	62063341	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr2	62065851	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:4,3:4,3:1,7,1,5
chr2	62067189	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=207,114;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,0:4,4:1,9,0,4
chr2	62067433	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=109,146;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:14,5:4,3:6,12,3,5
chr2	62081217	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	62107376	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr2	62729747	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=141,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,4:2,3:0,2,4,3
chr2	63170905	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=103,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.334:28:7,3:11,6:12,7,6,3
chr2	63176139	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=157,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:5,2:11,3:12,4,1,4
chr2	63182611	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.510:10:3,2:2,1:4,1,4,1
chr2	63272232	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=161,41;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:9,0:19,3:14,14,1,2
chr2	63282567	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=181,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:8,0,5,0
chr2	63380809	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr2	63401973	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=204,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.575:10:1,5:3,0:0,4,2,4
chr2	63540324	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:2,1,6,1
chr2	63540523	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=183,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr2	63605430	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=194,245;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr2	63609017	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:4,2,2,4
chr2	63666804	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=223,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	63719887	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,5:4,4:5,0,9,0
chr2	64069311	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,172;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:3,3:4,3:1,6,6,1
chr2	64085114	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr2	64126765	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=216,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr2	64126775	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=128,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	64139831	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.420:14:3,3:3,3:1,7,2,4
chr2	64140301	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,2:0,4:0,1,4,2
chr2	64169646	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=143,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:15,1:13,0:12,16,1,1
chr2	64169659	.	CTG	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=134,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,2:13,0:0|1:64169659_CTG_C:64169659:12,14,1,1
chr2	64169662	.	G	GAGA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=131,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,2:12,0:0|1:64169659_CTG_C:64169659:11,12,1,1
chr2	64195997	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,32,34;MFRL=68,199,248;MMQ=60,60,60;MPOS=15,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=A;STR;TLOD=3.88,7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,4:0.263,0.439:8:2,0,2:0,2,2:2,0,6,0
chr2	64210979	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=207,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:1,1:3,3:3,2,3,1
chr2	64323751	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.385:10:2,4:3,0:0,6,1,3
chr2	64682364	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=199,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:5,0,4,0
chr2	64685502	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,76;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:8,11,1,1
chr2	64779509	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,2:8,2:7,9,3,1
chr2	64796817	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=197,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:7,3:3,3:3,7,3,4
chr2	64819220	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.182:15:7,1:5,1:6,7,2,0
chr2	65216886	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=207,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr2	65217391	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,294;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,2:3,1:0,11,0,3
chr2	65231063	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.872:13:0,7:1,5:1,0,8,4
chr2	65237924	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=181,81;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:2,1:8,1:1,9,2,0
chr2	65315880	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:1,3,0,6
chr2	65315903	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,0,3
chr2	65481008	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=145,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:4,1:4,2:1,7,1,2
chr2	65488538	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=162,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:5,2:4,0:0|1:65488538_G_A:65488538:1,9,1,2
chr2	65488543	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=173,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:0|1:65488538_G_A:65488538:1,9,1,1
chr2	65495887	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,148;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:1,5,1,4
chr2	65540693	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=174,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:13,2:0|1:65540693_C_T:65540693:11,10,1,1
chr2	65540700	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=176,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:14,2:0|1:65540693_C_T:65540693:9,11,1,1
chr2	65559027	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=221,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	65604914	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=274,272;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	66665146	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=177,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:1,5,0,3
chr2	66667200	.	A	AACACACACACAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,18;RU=AC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	66668519	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,80;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.214:35:13,7:14,0:10,18,6,1
chr2	66798282	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=243,228;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:4,0,5,1
chr2	66798621	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=145,85;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:14,0:18,3:0|1:66798621_C_T:66798621:16,16,0,3
chr2	66798630	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=156,85;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:16,0:13,3:0|1:66798621_C_T:66798621:14,17,0,3
chr2	67624799	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=229,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:2,5,0,3
chr2	67632081	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:7,0:8,8:7,8,0,8
chr2	67637196	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,7,14
chr2	68269960	.	CGGG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=130,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=G;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.505:2:1,1:0,0:0|1:68269960_CGGG_C:68269960:1,0,1,0
chr2	68269979	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,16;MFRL=154,87;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:68269960_CGGG_C:68269960:4,0,1,0
chr2	68269981	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=157,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:68269960_CGGG_C:68269960:4,0,1,0
chr2	68273085	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:9,4,1,1
chr2	68274510	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,0:1,2:0,5,1,1
chr2	68358341	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=192,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.627:19:2,4:4,8:5,2,6,6
chr2	68358653	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=172,252;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr2	68389276	.	GA	G,GAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=209,208,210;MMQ=60,60,60;MPOS=18,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=5.25,7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,5:0.200,0.292:17:4,0,2:5,3,3:9,0,8,0
chr2	68389481	.	CTT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=169,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:13,7:9,2:6,16,1,8
chr2	68402012	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=183,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr2	68415563	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34,35,32;MFRL=207,185,180,185;MMQ=60,60,60,60;MPOS=28,26,28;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.31,4.98,9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,2,4,5:0.144,0.205,0.308:17:3,0,3,2:3,2,1,3:6,0,10,1
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chr2	68546304	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=324,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr2	68592551	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:16,2:12,0:13,16,0,2
chr2	68592584	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:7,7:3,9:3,7,2,14
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chr2	68615654	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,1:3,2:2,7,1,2
chr2	68620410	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,6:5,1:1,8,3,4
chr2	68620463	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=175,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr2	68621338	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=197,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.475:23:5,7:7,3:5,7,5,6
chr2	68622952	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.389:21:7,5:6,3:9,4,3,5
chr2	68740314	.	AAG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=172,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:5,9,0,2
chr2	68753240	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:4,4,2,0
chr2	68762501	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=173,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.149:45:25,3:14,3:3,36,4,2
chr2	68881938	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=384,266;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:0,2:2,1,2,0
chr2	68962258	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,155;MMQ=60,43;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:17,2,2,0
chr2	68962417	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:11,0:9,6:9,12,1,5
chr2	69002281	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,291;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:5,1,1,1
chr2	69009304	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,1:8,1:10,1,2,0
chr2	69043539	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,2:2,7:1,6,3,6
chr2	69053115	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=115,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.548:9:1,3:3,2:2,2,5,0
chr2	69177997	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=186,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr2	69201894	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,5:1,3:1,1,2,6
chr2	69205942	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,2:5,2:6,2,4,0
chr2	69298817	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,3:3,2:6,4,5,0
chr2	69300087	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=170,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,1:6,1:0|1:69300087_G_C:69300087:9,4,2,1
chr2	69300088	.	GGAC	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=170,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,2:6,1:0|1:69300087_G_C:69300087:9,4,2,1
chr2	69300093	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=170,220;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.220:16:7,2:6,1:0|1:69300087_G_C:69300087:9,4,2,1
chr2	69304719	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr2	69317925	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,7,3
chr2	69318129	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	69330118	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=242,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,1:7,2:2,8,1,2
chr2	69409029	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:7,3:6,7:4,9,3,7
chr2	69475343	.	GT	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=154,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.161:27:8,1:13,3:12,11,1,3
chr2	69554272	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,0:5,2:0,7,0,2
chr2	69573029	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:4,5:3,2:6,1,7,0
chr2	69586370	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=124,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,3:6,1:5,7,4,0
chr2	69623536	.	A	AAATTAAATCACCTTTTGAAGAAACCCAATTCAAAACCCCTTCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=239,142;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	69627442	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr2	69642513	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=342,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.511:6:1,1:2,1:0|1:69642513_CT_C:69642513:0,3,0,3
chr2	69642524	.	T	TTG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=182,229;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.327:4:2,1:1,0:1|0:69642513_CT_C:69642513:0,3,0,1
chr2	69642530	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=177,229;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1|0:69642513_CT_C:69642513:0,2,0,1
chr2	69709783	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=167,189;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:12,4:6,0:7,11,4,0
chr2	69736629	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:2,3,0,2
chr2	69741562	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.239:19:6,2:8,1:11,4,4,0
chr2	69741753	.	CTGT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=134,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGT;STR;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:5,2:0,4:3,3,3,3
chr2	69741854	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,7,8
chr2	69746165	.	TGTTGCTGCTTGAGGAAGA	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:15,0:11,2:14,15,1,1
chr2	69746207	.	GCCTGGGCCTGAGCGGGCAGAC	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:7,0:7,2:13,15,1,1
chr2	69748167	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=164,281;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:7,0:4,6:0,11,0,6
chr2	69771484	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr2	69771716	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,0:4,6:0,9,0,6
chr2	70015108	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=231,269;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:5,0,2,0
chr2	70031797	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,3:7,5:2,8,2,6
chr2	70033649	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,2:8,1:10,10,2,1
chr2	70039677	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=163,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr2	70045840	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.294:32:9,9:14,0:7,16,9,0
chr2	70047969	.	C	CCTGCATCTGGTCCGAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=156,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:5,6,1,1
chr2	70066571	.	C	CTT	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=189,251;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:11,2:8,0:15,5,2,0
chr2	70066614	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=170,70;MMQ=52,37;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:16,2:13,0:15,14,2,0
chr2	70066682	.	GA	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:25,3:8,0:14,19,0,3
chr2	70068258	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr2	70070184	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=185,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:6,0:3,2:9,0,3,0
chr2	70076954	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=120,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr2	70096862	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=151,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.225:16:6,0:4,3:9,4,2,1
chr2	70098808	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	70121197	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.443:32:9,7:8,7:7,11,3,11
chr2	70164034	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=209,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr2	70189331	.	GACAC	G,GAC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32,34;MFRL=168,182,229;MMQ=60,60,60;MPOS=24,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=AC;STR;TLOD=9.04,7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,3:0.362,0.373:9:1,2,3:0,2,0:0,2,5,2
chr2	70315448	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=173,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:19,1:18,3:18,20,3,1
chr2	70377769	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,0:2,5:0,8,0,6
chr2	70456452	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,1:4,2:3,4,1,2
chr2	70458050	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=176,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr2	70463334	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,33,22;MFRL=159,268,103;MMQ=60,60,60;MPOS=10,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=T;STR;TLOD=3.37,4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.290,0.245:8:2,1,0:2,1,1:0,4,2,2
chr2	70463362	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,15;MFRL=184,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0,4,1,0
chr2	70485252	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	70529037	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,5:1,4:3,1,3,6
chr2	70677913	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=222,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:5,4,1,1
chr2	70741998	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=160,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:11,1:12,2:10,13,2,1
chr2	70901785	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=222,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,2:2,0:0|1:70901785_A_G:70901785:5,8,2,0
chr2	70901788	.	GGT	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=222,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,2:2,0:0|1:70901785_A_G:70901785:5,8,2,0
chr2	70905099	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=213,290;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr2	70906115	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:1,8,1,3
chr2	70910991	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=136,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:0,5,0,5
chr2	70915134	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=222,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:9,1,1,1
chr2	70923542	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:9,1:4,12,0,2
chr2	71004368	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=207,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:1,0,7,0
chr2	71004413	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.290:15:6,2:2,2:7,4,1,3
chr2	71017516	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=129,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,1,1
chr2	71043467	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,3:8,1:9,6,3,1
chr2	71058144	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=206,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:4,1,1,1
chr2	71058795	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=124,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.408:15:5,4:4,2:4,5,4,2
chr2	71058811	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=120,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:6,4:2,2:2,6,2,4
chr2	71058835	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=204,158;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:9,3:3,5:3,9,4,4
chr2	71060733	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=226,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr2	71060936	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=110,147;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.766:19:2,8:2,7:1,3,11,4
chr2	71061001	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:9,2:5,6:5,9,3,5
chr2	71062744	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=216,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:1,3:9,0:4,6,3,0
chr2	71062833	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=63.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,7:0,0,11,8
chr2	71160421	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr2	71162996	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,4:0,4:3,0,8,0
chr2	71163225	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=124,290;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.442:11:0,1:6,2:1,5,2,3
chr2	71185391	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=178,236;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,4:7,2:6,7,4,2
chr2	71190228	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.471:10:2,0:1,0:2,3,5,0
chr2	71205976	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,5:2,5:0,5,0,10
chr2	71219173	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=161,107;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:2,0:6,2:2,7,0,2
chr2	71221897	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,1:6,1:0|1:71221897_A_C:71221897:3,10,2,0
chr2	71221901	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,1:8,0:0|1:71221897_A_C:71221897:3,12,2,0
chr2	71221905	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,0:0|1:71221897_A_C:71221897:3,11,2,0
chr2	71221962	.	ACCG	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=221,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CCG;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr2	71297982	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.249:29:12,2:10,4:6,16,5,2
chr2	71305359	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,3:6,0:9,0,3,0
chr2	71357417	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=156,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,1:11,2:8,14,2,1
chr2	71360108	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,270;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:14,3:7,0:9,12,0,3
chr2	71360723	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=160,169;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.415:10:3,3:3,1:0|1:71360723_A_G:71360723:0,6,0,4
chr2	71360735	.	T	TTCC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=160,160;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TCC;STR;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:2,2:1,1:0|1:71360723_A_G:71360723:0,4,0,3
chr2	71366876	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=131,253;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:11,3,1,1
chr2	71375065	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,0:3,3:6,3,3,0
chr2	71376419	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=187,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:4,0:10,3:10,5,1,2
chr2	71417183	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:7,10,1,1
chr2	71620563	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,265;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:7,4:11,2:13,5,4,2
chr2	71620818	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=193,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr2	71626735	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=141,141;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,8:0.218:40:20,0:10,8:0|1:71626735_T_C:71626735:16,16,0,8
chr2	71626740	.	A	AATTTAGCAGCCATATCTGCCATAGTGTCC	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=141,141;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,8:0.191:45:19,0:13,7:0|1:71626735_T_C:71626735:17,20,0,8
chr2	71631109	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:10,0:8,2:4,14,1,1
chr2	71635462	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	71635931	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,1:4,2:4,9,2,1
chr2	71645828	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,0:5,3:2,7,1,2
chr2	71651939	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.804:13:1,3:1,8:0,2,0,11
chr2	71654450	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=167,282;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:11,3:10,1:10,11,0,4
chr2	71655586	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=185,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr2	71658364	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=155,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,1:2,1:9,1,2,0
chr2	71660495	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=179,245;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	71661855	.	C	CA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=244,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=71.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,25:0.866:28:1,10:2,15:3,0,13,12
chr2	71738968	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:2,2:8,2:9,2,2,2
chr2	71738987	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:7,7,0,2
chr2	71742892	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=102,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,5:6,2:3,9,0,7
chr2	71742978	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=201,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:0,8,0,2
chr2	71743206	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=203,248;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	71743242	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=221,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,0:1,4:4,0,3,1
chr2	71743411	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=158,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:6,4,1,3
chr2	71747235	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,9,5
chr2	71747851	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr2	71747855	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=184,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:5,0,6,0
chr2	71747899	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=212,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:5,1,3,2
chr2	71748088	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=180,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:7,2:8,3:1,14,1,4
chr2	71753572	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	71755380	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr2	71762232	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=216,155;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.689:24:3,6:4,8:2,5,10,7
chr2	71762310	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,7,9
chr2	71762413	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=184,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:6,6:2,5:5,3,6,5
chr2	71778829	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=217,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:3,4,1,3
chr2	71781161	.	GAC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=184,248;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AC;STR;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr2	71783052	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:5,4,1,1
chr2	71796865	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	71801267	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=155,286;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr2	71801334	.	C	CAGGCGG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=191,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGGCGG;STR;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.498:12:5,3:1,3:6,0,3,3
chr2	71829821	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	71871039	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=194,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,6:2,3:0,2,6,3
chr2	71871106	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:12,0:8,4:10,12,4,0
chr2	71871236	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=334,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:0,11:1,6:1,0,8,9
chr2	71871263	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=135,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	71891361	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,4:1,6:2,2,9,1
chr2	71901286	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	71906171	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=243,252;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:1,1,6,1
chr2	71909822	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=203,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.488:16:4,3:3,3:2,6,4,4
chr2	72359312	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=183,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:4,1:8,1,2,0
chr2	72692272	.	A	AAG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=74.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,9:0,9:0,0,15,4
chr2	72741728	.	TAA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=209,187;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.543:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr2	72741732	.	TAA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=134,179;MMQ=60,46;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr2	72742083	.	GAC	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=141,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AC;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr2	72742160	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=130,178;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:12,3:24,0:14,22,3,0
chr2	72786528	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=214,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:5,1,5,1
chr2	72958022	.	T	TAAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	73188268	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=209,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.513:14:4,3:1,4:2,5,4,3
chr2	73195490	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,18;MFRL=190,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:73195490_T_G:73195490:2,0,1,0
chr2	73195492	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=190,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:73195490_T_G:73195490:2,0,1,0
chr2	73195500	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=190,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:73195490_T_G:73195490:2,0,1,0
chr2	73226090	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=115,257;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,1:4,1:7,6,1,1
chr2	73249746	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,14;MFRL=165,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.386:3:0,0:1,0:0|1:73249746_T_G:73249746:0,2,0,1
chr2	73249753	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=142,77;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:73249746_T_G:73249746:0,1,0,1
chr2	73249756	.	G	GATAACATTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=77,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	73285752	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=199,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:4,1:7,1:5,7,1,1
chr2	73339430	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,1:0,6:1,0,6,1
chr2	73430234	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	73435786	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=212,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,4:0,2:0,2,1,5
chr2	73447736	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=146,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,3,0
chr2	73447775	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:4,3,1,1
chr2	73450139	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=71,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:3,1,5,2
chr2	73455747	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,3:4,0:1,9,1,2
chr2	73467676	.	GAA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=103,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,3:2,3:4,5,2,4
chr2	73471653	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=202,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,3:7,3:11,1,5,1
chr2	73477351	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=174,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:7,4:3,0:10,0,3,1
chr2	73497888	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=200,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:1,1:8,1:8,1,2,0
chr2	73518533	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:2,2,1,2
chr2	73613031	.	TGGAGGA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=200,154;MMQ=40,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=GGA;STR;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.730:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr2	73613341	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,0,2
chr2	73649928	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=225,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,1,1
chr2	73650122	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=97,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.613:16:0,6:6,4:2,4,0,10
chr2	73675019	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	73675227	.	T	TCTC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTC;STR;TLOD=57.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,4:0,0,8,5
chr2	73678616	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=194,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,3:5,1:8,4,2,2
chr2	73761881	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:5,2,2,0
chr2	73784477	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,1:4,3:4,6,1,3
chr2	73799563	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=178,165;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:14,0:5,4:11,9,0,4
chr2	73828310	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	73830454	.	AC	TT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=168,187;MMQ=60,34;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0|1:73830454_AC_TT:73830454:0,4,0,2
chr2	73830458	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=168,187;MMQ=60,34;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:73830454_AC_TT:73830454:0,4,0,2
chr2	73868366	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.395:28:8,6:9,4:7,10,4,7
chr2	73868496	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=178,111;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:9,3:7,3:7,9,0,6
chr2	73868538	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=182,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:4,2:8,3:6,6,1,4
chr2	73927931	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,5,10
chr2	73928078	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=185,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,3:4,1:7,2,2,2
chr2	73928098	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=166,195;MMQ=60,59;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.739:21:3,8:2,8:4,1,12,4
chr2	73957227	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr2	73994074	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr2	73996554	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=184,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:73996554_T_C:73996554:0,4,0,1
chr2	73996557	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=184,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:73996554_T_C:73996554:0,4,0,1
chr2	74000908	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,127;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:10,7:10,0:10,10,7,0
chr2	74005370	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=170,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,0:6,2:9,5,1,1
chr2	74040982	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:10,2:3,1:5,8,2,1
chr2	74086336	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=172,74;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:4,0:7,2:7,4,2,0
chr2	74089266	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=238,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.449:8:3,2:0,1:4,1,3,0
chr2	74128361	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:74128361_T_G:74128361:0,0,8,0
chr2	74128369	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0|1:74128361_T_G:74128361:0,0,9,0
chr2	74128391	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	74128433	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,10:0,0,17,5
chr2	74128677	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74128677_G_C:74128677:0,1,0,1
chr2	74128679	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74128677_G_C:74128677:0,1,0,1
chr2	74128681	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74128677_G_C:74128677:0,1,0,1
chr2	74128685	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,23;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74128677_G_C:74128677:0,1,0,1
chr2	74128688	.	TG	GT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74128677_G_C:74128677:0,0,0,1
chr2	74129474	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,8,1
chr2	74129664	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=60.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,10,9
chr2	74129712	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,5,13
chr2	74129895	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,3,10
chr2	74135380	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,10,3
chr2	74135732	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	74135797	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,7,4
chr2	74135898	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,8:0,0,8,13
chr2	74140581	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,11,4
chr2	74140789	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr2	74140830	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=142,110;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,0:2,5:0,6,0,5
chr2	74143990	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	74274180	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=218,403;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:7,0:5,0:3,11,2,0
chr2	74274353	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=188,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,3:9,0:10,6,3,0
chr2	74326443	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=101,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:10,4,1,1
chr2	74327528	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=122,65;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:0|1:74327528_C_T:74327528:5,12,1,1
chr2	74327537	.	GGA	TTT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=122,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,0:11,2:0|1:74327528_C_T:74327528:8,13,1,1
chr2	74386266	.	CTCTTGCAGCTGCATCACAGAAT	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:9,2:9,12,1,1
chr2	74386299	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,1:6,2:0|1:74386299_GT_G:74386299:4,8,1,2
chr2	74386302	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,1:6,2:0|1:74386299_GT_G:74386299:4,8,1,2
chr2	74386305	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:5,1:6,1:0|1:74386299_GT_G:74386299:4,8,1,2
chr2	74386463	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	74435784	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=99,119;MMQ=60,35;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:20,4:11,0:12,19,4,0
chr2	74448655	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=239,133;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:6,2,2,6
chr2	74450125	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=96,247;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:1,2,0,3
chr2	74454291	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=196,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr2	74469074	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=143,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,0:4,2:4,3,1,1
chr2	74512800	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=231,282;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr2	74531583	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=186,292;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:5,1,1,1
chr2	74589900	.	G	GAGGCTGACTGGA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:1,8,0,2
chr2	74598716	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,337;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,0:9,2:8,12,1,1
chr2	74601371	.	G	GCCCCCCCCCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=37,36;MFRL=211,279;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,15;RU=C;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.523:2:1,1:0,0:0|1:74601371_G_GCCCCCCCCCC:74601371:1,0,1,0
chr2	74601377	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,36;MFRL=144,279;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.342:4:0,1:0,0:0|1:74601371_G_GCCCCCCCCCC:74601371:3,0,1,0
chr2	74643417	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=194,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
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chr2	74746322	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=112,227;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:6,1:13,1:10,10,0,2
chr2	74749790	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,183;MMQ=60,44;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:11,8,2,0
chr2	74750213	.	GTTT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=196,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=T;STR;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,4:7,2:8,5,5,1
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chr2	74754818	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=236,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:4,5,2,2
chr2	74755778	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=188,355;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:10,0,3,0
chr2	74756111	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=198,271;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.237:18:3,0:11,4:5,9,0,4
chr2	74756176	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=187,264;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,4:3,4:6,1,6,2
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chr2	74761422	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=164,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:7,1:1,2:6,2,2,1
chr2	74761539	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=132,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:7,1:2,5:5,4,5,1
chr2	74783252	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,15;MFRL=248,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.405:5:2,0:1,0:1,2,0,2
chr2	74783626	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=121,239;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:4,4:8,0:7,6,4,0
chr2	74783824	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=179,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:11,5:11,2:10,12,5,2
chr2	74786974	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=206,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr2	74882505	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=192,58;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,0:10,2:0|1:74882505_C_A:74882505:5,12,1,1
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chr2	74882514	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=197,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:9,2:0|1:74882505_C_A:74882505:5,11,1,1
chr2	74882519	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=203,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:74882505_C_A:74882505:4,10,1,1
chr2	74882523	.	GA	TT	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=201,58;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:8,1:0|1:74882505_C_A:74882505:4,11,1,1
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chr2	74902855	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=149,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,2:9,1:6,5,0,3
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chr2	75099381	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,10:0.276:38:15,3:12,7:25,3,8,2
chr2	75101454	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,101;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.418:34:11,9:8,5:9,11,9,5
chr2	75104218	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=184,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:8,0,4,2
chr2	75105798	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=133.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,24:0,13:0,0,22,16
chr2	75107367	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=224,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr2	75108744	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,1:4,2:12,0,3,0
chr2	75113572	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,4:1,0,3,7
chr2	75116627	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=127,83;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=76.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,27:0.758:35:3,14:5,13:2,6,8,19
chr2	75276846	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=216,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:1,1:8,1:2,7,1,1
chr2	75425623	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:1,0:2,3:3,0,4,0
chr2	75745081	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=189,291;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:6,1,2,1
chr2	75874390	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=171,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:2,8,1,2
chr2	75881828	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=273,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr2	75882156	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=17,34;MFRL=212,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.659:5:0,2:0,1:0,2,3,0
chr2	75900700	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=177,278;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.377:17:3,3:8,3:0,11,0,6
chr2	75907435	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=146,36;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,1:0|1:75907435_C_T:75907435:1,7,1,1
chr2	75907439	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=146,36;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:5,0:3,2:0|1:75907435_C_T:75907435:1,7,1,1
chr2	75919272	.	AATAT	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=AT;STR;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.511:6:0,0:2,3:0|1:75919272_AATAT_A:75919272:0,3,0,3
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chr2	75933830	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr2	75933858	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=275,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr2	76975772	.	G	GACAGGCCAGCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr2	77746750	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:8,1:8,1:10,8,1,1
chr2	77747000	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=183,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,1,1
chr2	79253150	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:9,0,4,0
chr2	79253375	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,71;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:1,7,0,2
chr2	79253818	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=207,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:2,2:4,1:7,1,1,2
chr2	79253987	.	ATAGGGGAAAGT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=209,155;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:79253987_ATAGGGGAAAGT_A:79253987:3,5,1,1
chr2	79254000	.	CATGCA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=215,155;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.335:7:2,2:2,0:0|1:79253987_ATAGGGGAAAGT_A:79253987:3,2,1,1
chr2	79254101	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=203,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,1:4,2:9,3,1,2
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chr2	79314081	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=197,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.713:12:0,3:3,5:0,3,3,6
chr2	79314094	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=150,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:0,1,2,6
chr2	79348145	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=269,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0,2,1,0
chr2	79348148	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=223,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:79348148_G_C:79348148:0,3,1,0
chr2	79348152	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,10;MFRL=223,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:79348148_G_C:79348148:0,3,1,0
chr2	79348154	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,15;MFRL=223,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:79348148_G_C:79348148:0,3,1,0
chr2	79348156	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=223,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:79348148_G_C:79348148:0,3,1,0
chr2	79350186	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=232,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,1:4,3:4,6,2,2
chr2	79384917	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	79385946	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=220,236;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,1:1,0:0,1,0,6
chr2	79914570	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr2	80101515	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=274,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:1,2:1,0:0,3,0,3
chr2	80136693	.	TTG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=135,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,0:6,2:7,3,2,0
chr2	80530632	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:6,7,1,1
chr2	80531022	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.402:33:11,0:8,13:8,12,0,13
chr2	80772972	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=192,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr2	80801524	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=247,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	80809027	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=202,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr2	80846147	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=164,274;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:3,2:0,2:3,1,4,0
chr2	81421230	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.413:22:9,6:4,3:6,7,6,3
chr2	81421464	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:11,3:4,0:8,7,3,0
chr2	84650826	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,90;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:7,0:0|1:84650826_G_A:84650826:8,10,1,1
chr2	84650832	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=119,90;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,1:6,0:0|1:84650826_G_A:84650826:8,9,1,1
chr2	84676163	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr2	84676886	.	TAAA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=25,22;RU=A;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.888:5:0,2:0,2:0,0,1,4
chr2	84755996	.	A	ATT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=198,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr2	84756008	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,11;MFRL=198,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,0:0,0:3,0,5,0
chr2	84756341	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	84784930	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.290:22:9,2:7,4:0|1:84784930_G_T:84784930:8,8,0,6
chr2	84784938	.	A	ATTTTAAG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=201,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:8,2:6,4:0|1:84784930_G_T:84784930:7,7,0,6
chr2	84800605	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,10,9
chr2	84800621	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=187,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:4,4:10,2:9,6,3,3
chr2	84806553	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	84811234	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=141,73;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:14,2:10,0:13,11,2,1
chr2	84822715	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr2	84831767	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	84834063	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr2	84834237	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr2	84897361	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	84899360	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	84912420	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=207,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,2:2,1:5,0,3,0
chr2	84915469	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=162,271;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr2	84940477	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr2	84950006	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=216,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr2	85024731	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=149,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.270:24:7,0:10,6:8,10,3,3
chr2	85035596	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,2:7,1:5,8,0,3
chr2	85041316	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=174,254;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	85051122	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=172,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:12,1:10,2:14,8,2,1
chr2	85059255	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=164,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,5:7,5:2,7,6,4
chr2	85066245	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,2:8,1:7,7,1,2
chr2	85069180	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=254,177;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,0:2,5:0,3,0,5
chr2	85108252	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	85262213	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,0;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:15,4,0,2
chr2	85270887	.	G	GGA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=162,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.318:4:2,1:1,0:0|1:85270887_G_GGA:85270887:0,3,0,1
chr2	85270889	.	T	TGCAATGGCACCATCGCGGCACAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=162,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:1,0:0|1:85270887_G_GGA:85270887:0,3,0,1
chr2	85276516	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=190,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:12,0:8,2:9,11,0,2
chr2	85360828	.	GGGC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=238,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GGC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	85510777	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=176,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr2	85570273	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr2	85570942	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=140,195;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,3:4,1:3,4,1,3
chr2	85571710	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=189,128;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,6:1,4:2,0,7,3
chr2	85573033	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=200,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr2	85573049	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=158,240;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr2	85578212	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,11;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:85578212_G_T:85578212:0,1,0,1
chr2	85578219	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:85578212_G_T:85578212:0,1,0,1
chr2	85579054	.	AAAG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=217,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	85590299	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=164,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,2:2,3,2,0
chr2	85596739	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=126,232;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:6,4:13,3:15,4,5,2
chr2	85598381	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=228,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:5,0:3,5:2,6,0,6
chr2	85662017	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,2,1
chr2	85662650	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,5:2,5:1,3,4,6
chr2	85769246	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,14,4
chr2	85769975	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=149,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,3:4,4:9,0,5,2
chr2	85776965	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,16;MFRL=255,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:85776965_AC_A:85776965:2,0,1,0
chr2	85776971	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=255,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:85776965_AC_A:85776965:2,0,1,0
chr2	85776973	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,15;MFRL=255,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:85776965_AC_A:85776965:2,0,1,0
chr2	85777633	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=194,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:7,1:13,1,2,0
chr2	85778837	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=236,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:5,4,2,0
chr2	85779785	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=174,181;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:5,5:4,0:2,7,5,0
chr2	85781318	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,10,16
chr2	85788140	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=240,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,4:5,3:2,4,2,5
chr2	85788401	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,368;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	85804825	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=138,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.183:19:3,1:13,2:0|1:85804825_G_GA:85804825:8,8,2,1
chr2	85804826	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=138,67;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.186:19:3,1:13,2:0|1:85804825_G_GA:85804825:8,8,2,1
chr2	85806068	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=86,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr2	85807081	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=195,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.543:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr2	85808871	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=111,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:1,2:9,1:2,8,0,3
chr2	85824084	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,359;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,1:6,2:5,11,1,2
chr2	85826225	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,128;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.274:19:7,0:7,4:7,7,0,5
chr2	85826931	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=180,182;MMQ=60,43;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.320:26:10,0:7,7:12,6,0,8
chr2	85828986	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=120,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:9,4:6,7:12,3,6,5
chr2	85836153	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=185,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.304:17:8,4:4,0:6,6,5,0
chr2	85836661	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=163,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:7,1:10,2:10,8,0,3
chr2	85848747	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:1,2:0,1:1,2,0,3
chr2	85890771	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=120,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:0,4:4,4:3,1,8,0
chr2	85890859	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:2,7,0,2
chr2	85893741	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=116,195;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:4,2,2,1
chr2	85924899	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=164,275;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr2	85925756	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=169,283;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:3,1,0,2
chr2	86075582	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,2:2,1:0,9,1,2
chr2	86079932	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=205,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:10,3,2,0
chr2	86258784	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.277:19:9,2:3,2:6,8,1,4
chr2	86275985	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr2	86292656	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=172,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,5:1,3:0,2,0,8
chr2	86302103	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr2	86304934	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,249;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,0:0,0,4,0
chr2	86305123	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=69.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,9,10
chr2	86310110	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=214,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	86332809	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.699:18:3,3:2,9:2,3,10,3
chr2	86334199	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,6:2,5:2,1,7,4
chr2	86335718	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,5,5
chr2	86338252	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=141,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,0:13,2:9,14,0,2
chr2	86344095	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:4,0,4,1
chr2	86344367	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	86352010	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=145,248;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	86352825	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=176,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr2	86357842	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=194,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,0:4,3:7,5,3,0
chr2	86358244	.	T	TAGG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=169,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,2:12,0:0|1:86358244_T_TAGG:86358244:10,13,1,1
chr2	86358248	.	TTAA	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=169,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,2:12,0:0|1:86358244_T_TAGG:86358244:10,13,1,1
chr2	86358254	.	T	TAG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=166,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,1:11,0:0|1:86358244_T_TAGG:86358244:9,14,1,1
chr2	86359405	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr2	86360225	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:3,1,4,0
chr2	86360573	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:4,2:3,8,1,1
chr2	86362204	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=259,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:2,9:0,3:0,2,0,12
chr2	86364706	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr2	86378518	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=109,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:16,1:7,1:12,11,0,2
chr2	86378593	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=136,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:9,3:12,0:0|1:86378593_G_A:86378593:8,14,2,1
chr2	86378596	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=136,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:9,3:12,0:0|1:86378593_G_A:86378593:8,14,2,1
chr2	86385886	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr2	86393802	.	CC	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	86408385	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,3:9,0:7,5,2,1
chr2	86422416	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,16:0.340:48:15,8:17,8:0|1:86422416_T_C:86422416:11,21,13,3
chr2	86422421	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,15:0.327:47:12,6:14,8:0|1:86422416_T_C:86422416:11,21,12,3
chr2	86437551	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,9,2
chr2	86478980	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=247,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:5,0,6,0
chr2	86479035	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:6,3:1,6:4,3,5,4
chr2	86479287	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=255,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr2	86491245	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=274,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.536:7:1,1:2,1:0,3,0,4
chr2	86509267	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=122,53;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,1:7,3:9,3,2,2
chr2	86509388	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=124,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:6,8:6,2:3,9,6,4
chr2	86678124	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr2	86683539	.	ATTT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=T;STR;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.426:8:2,3:2,0:4,1,3,0
chr2	86683569	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=115,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.172:28:9,0:12,0:9,14,5,0
chr2	86691250	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=107,242;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:4,2:12,3:3,13,3,2
chr2	86707504	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=121,283;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:6,3:5,0:5,6,1,2
chr2	86716658	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=193,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:9,9,0,2
chr2	86719203	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=182,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,0:7,3:9,7,0,3
chr2	86737393	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=0,17;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.782:2:0,0:0,0:0|1:86737393_C_G:86737393:0,0,2,0
chr2	86737397	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,23;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:86737393_C_G:86737393:0,0,2,0
chr2	86737401	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,27;MFRL=868,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:86737393_C_G:86737393:1,0,2,0
chr2	86737405	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=24,12;MFRL=235,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,0:0|1:86737393_C_G:86737393:2,1,2,0
chr2	86737408	.	TC	GA	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=24,17;MFRL=223,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:3,0:0|1:86737393_C_G:86737393:2,2,2,0
chr2	86737412	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=25,12;MFRL=223,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,0:0|1:86737393_C_G:86737393:2,2,2,0
chr2	86737415	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=32,18;MFRL=235,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.325:7:2,0:3,0:0|1:86737393_C_G:86737393:3,2,2,0
chr2	86737649	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr2	86756280	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=232,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr2	86831055	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=124,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,2:3,0:3,3,2,0
chr2	86850022	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:11,1:7,1:3,15,2,0
chr2	86992337	.	T	TAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,1:6,1:3,11,0,2
chr2	86998659	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=130,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=T;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	87073743	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,215;MMQ=52,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr2	87073879	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=125,204;MMQ=52,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:8,2:7,1:0|1:87073879_T_C:87073879:4,12,3,0
chr2	87073883	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=138,97;MMQ=52,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,5:0.299:18:9,0:4,5:1|0:87073879_T_C:87073879:6,7,0,5
chr2	87088964	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	87808726	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=151,179;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,3:6,1:3,4,1,3
chr2	88384084	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=245,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr2	88396080	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=123,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,4:5,1:8,2,5,0
chr2	88410102	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	88472925	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=184,313;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	88474370	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	88484808	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,3:0,0,6,3
chr2	88484958	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=164,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:4,6,1,1
chr2	88485392	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=59.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,15,1
chr2	88748201	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=153,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.297:14:5,3:5,0:6,4,2,2
chr2	88748390	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=171,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,13:0.305:44:7,2:23,11:0,31,2,11
chr2	88825315	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=161,328;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.616:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr2	88826071	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=187,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:0,8,0,4
chr2	88870632	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr2	88874469	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=159,167;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:10,0:14,4:9,15,0,4
chr2	88882942	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=160,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:0,4:7,1:5,2,2,3
chr2	88885313	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,6:3,0:7,2,6,0
chr2	88926510	.	C	CTCTCTGTCTCTCTCT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:9,0:3,2:0|1:88926510_C_CTCTCTGTCTCTCTCT:88926510:3,10,1,1
chr2	88926511	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:8,0:2,1:0|1:88926510_C_CTCTCTGTCTCTCTCT:88926510:3,10,1,1
chr2	89160909	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.595:5:0,2:1,1:2,0,2,1
chr2	89196757	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,3:2,1:8,0,4,0
chr2	89196906	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=193,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.330:16:6,0:5,5:4,7,2,3
chr2	89197190	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,4:2,4:3,4,4,4
chr2	89247007	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=225,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,4:6,0:6,6,3,1
chr2	89265717	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=235,74;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.402:15:5,2:4,3:7,2,3,3
chr2	89265785	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=194,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,4:11,0:14,8,4,0
chr2	89292201	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=266,156;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,0:3,2:6,3,0,2
chr2	89292476	.	T	TTGTGCCCTGGGAACATGCAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,37;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,3:0,0,0,7
chr2	89309424	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=244,69;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,1:7,3:9,2,2,2
chr2	89417087	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=206,100;MMQ=40,30;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:9,1:7,1:0|1:89417087_G_T:89417087:8,8,3,0
chr2	89417090	.	AG	CA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=206,100;MMQ=40,30;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:9,2:7,1:0|1:89417087_G_T:89417087:8,8,3,0
chr2	89544163	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,146;MMQ=27,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	89544473	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=175,168;MMQ=27,27;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,2:1,1:1,4,1,2
chr2	90024874	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=182,145;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,4:2,4:6,3,4,4
chr2	90043717	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,27;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	90078066	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=180,109;MMQ=49,21;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,27:0.683:39:7,0:5,27:8,4,0,27
chr2	90078370	.	TA	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	90108416	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	90108778	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:1,10:0,7:1,0,13,5
chr2	90139116	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,127;MMQ=27,33;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:6,3:4,4:9,1,4,3
chr2	90211898	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=164,57;MMQ=50,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:10,9,1,1
chr2	90211936	.	T	TGCTTTTTCTCATCGTTGCATA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=178,176;MMQ=40,23;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:9,8,0,2
chr2	90211969	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=185,158;MMQ=40,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,3:7,4:5,6,3,4
chr2	95542363	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=189,181;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,1:4,1:5,3,1,1
chr2	95542376	.	GC	TT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=185,181;MMQ=60,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:4,5,1,1
chr2	95542415	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=177,144;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:95542415_CA_TG:95542415:5,5,2,0
chr2	95542419	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=169,144;MMQ=60,25;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:3,0:4,2:0|1:95542415_CA_TG:95542415:4,5,2,0
chr2	95846118	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=237,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:1,7,0,2
chr2	95847040	.	TGCG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCG;STR;TLOD=89.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,12,10
chr2	95847826	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:5,7,2,0
chr2	95942897	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr2	95944902	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr2	95945568	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=185,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,3:4,4:3,1,6,1
chr2	95945830	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	95952177	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	95952622	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:3,5,0,2
chr2	95963242	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	96012907	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=131,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.710:11:2,5:0,3:1,2,2,6
chr2	96040560	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=185,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:4,1,3,0
chr2	96048862	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:96048862_C_T:96048862:0,0,1,0
chr2	96048867	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,13;MFRL=0,177;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:96048862_C_T:96048862:0,0,1,0
chr2	96048872	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,16;MFRL=0,177;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:96048862_C_T:96048862:0,0,1,0
chr2	96048875	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,12;MFRL=0,177;MMQ=60,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:96048862_C_T:96048862:0,0,1,0
chr2	96048879	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,23;MFRL=0,177;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:96048862_C_T:96048862:0,0,1,0
chr2	96048883	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:96048862_C_T:96048862:0,0,1,0
chr2	96048888	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=24,15;MFRL=218,177;MMQ=60,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:96048862_C_T:96048862:1,0,1,0
chr2	96048891	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=29,12;MFRL=218,177;MMQ=60,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:96048862_C_T:96048862:1,0,1,0
chr2	96048895	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=29,26;MFRL=218,177;MMQ=60,49;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:96048862_C_T:96048862:1,0,1,0
chr2	96049917	.	T	TAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=AC;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.789:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr2	96071285	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=176,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:5,0:8,3:10,3,2,1
chr2	96072754	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=180,160;MMQ=60,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,1:15,2:12,13,1,2
chr2	96076409	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,3,7
chr2	96076797	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=155,76;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,0:4,2:5,4,2,0
chr2	96260979	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	96780569	.	GC	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:9,7,1,1
chr2	96780986	.	C	CTCCTCCTCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=206,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCCTCCTCT;STR;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,5:1,3:1,1,2,6
chr2	96781986	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=289,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr2	96789953	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=150,77;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:11,3:14,0:15,10,1,2
chr2	96790056	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=211,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:96790056_A_C:96790056:0,4,0,1
chr2	96790059	.	T	TCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=211,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:96790056_A_C:96790056:0,4,0,1
chr2	96799062	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=246,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr2	96858914	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:5,3:4,1:4,5,4,1
chr2	96860715	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,99;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:13,0:13,4:20,6,0,4
chr2	96861159	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:10,2:8,3:11,7,0,5
chr2	96873853	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,12;MFRL=149,84;MMQ=60,53;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:5,0:2,11,2,0
chr2	96906148	.	ACTC	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:3,3:7,4:6,7,4,4
chr2	96906353	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=140,314;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:8,1:17,2:10,15,3,0
chr2	96943473	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=232,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,6:3,2:2,2,2,6
chr2	96952833	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=384,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:1,4:0,7:1,0,4,7
chr2	96955480	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=216,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,4:0,5:1,0,9,0
chr2	96956315	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=66.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,9,9
chr2	96963360	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,2:8,1:11,9,2,1
chr2	96966661	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:5,0,5,1
chr2	96970664	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=180,214;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,0:9,3:1,17,0,3
chr2	96991492	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:1,7:4,4:3,2,5,6
chr2	97001694	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=105,315;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:1,2,0,2
chr2	97020170	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=196,115;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:0,5,0,5
chr2	97216820	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=218,43;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:6,2,2,0
chr2	97267293	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=242,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:4,0,4,0
chr2	97269907	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=167,205;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr2	97313450	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=210,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr2	97319534	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=191,269;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,1:1,1:0,5,0,2
chr2	97328077	.	T	TTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=142,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	97329354	.	C	CTAATATGGTGAAACCCCATCTCTATGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	97353725	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:6,5:1,5:1,6,3,7
chr2	97359442	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=120,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,1:8,3:3,12,1,3
chr2	97360079	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=216,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:4,1,2,1
chr2	97366303	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.832:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	97400324	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,1:1,8:0,3,1,8
chr2	97426708	.	AGCG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=288,308;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr2	97465215	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:7,1,2,0
chr2	97465340	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=144,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.188:28:13,0:9,4:9,14,4,1
chr2	97506312	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=202,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:1,1:9,1:4,6,0,2
chr2	97529360	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=174,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:6,1,2,1
chr2	97543591	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,266;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:7,1,2,0
chr2	97544089	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=18,34;MFRL=175,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.685:7:0,4:1,1:2,0,5,0
chr2	97568453	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=133,248;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:12,2:10,0:8,14,1,1
chr2	97587049	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr2	97595109	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,1,9
chr2	97595158	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=184,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=62.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.732:28:3,0:3,21:0,7,0,21
chr2	97613647	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:9,1:7,1:8,8,1,2
chr2	97617227	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,4,12
chr2	97638352	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr2	97757509	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr2	97784155	.	C	CCTACTAG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=147,64642713;MMQ=50,38;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.101:27:8,2:17,0:0|1:97784155_C_CCTACTAG:97784155:8,17,0,2
chr2	97784157	.	T	TATATGG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=147,64642713;MMQ=50,38;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:8,1:17,0:0|1:97784155_C_CCTACTAG:97784155:8,17,0,2
chr2	97784295	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,220;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	98128172	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=199,155;MMQ=25,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:1,4:0,8:0,1,11,1
chr2	98128194	.	GGT	CAC	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=259,169;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=72.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,8:1,8:0,2,16,1
chr2	98128228	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=128,175;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,1:6,2:8,4,3,0
chr2	98128256	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,25;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:98128256_C_T:98128256:0,0,0,7
chr2	98128258	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=0,36;MFRL=0,144;MMQ=60,25;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0|1:98128256_C_T:98128256:0,0,0,7
chr2	98128300	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=27,34;MFRL=164,172;MMQ=25,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:0,4,1,5
chr2	98128313	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=33,26;MFRL=177,192;MMQ=26,26;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:0,4,1,5
chr2	98128364	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=10;MBQ=25,27;MFRL=285,210;MMQ=25,25;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,2:1,0,3,4
chr2	98128387	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=10;MBQ=33,27;MFRL=273,251;MMQ=25,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr2	98128402	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=285,251;MMQ=25,25;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr2	98128421	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=0,34;MFRL=0,251;MMQ=60,25;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	98128449	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=10;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	98128473	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=10;MBQ=30,32;MFRL=174,191;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr2	98128515	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=10;MBQ=34,27;MFRL=114,155;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0|1:98128515_C_T:98128515:1,0,4,0
chr2	98128520	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=10;MBQ=35,30;MFRL=114,155;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0|1:98128515_C_T:98128515:1,0,4,0
chr2	98128531	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=34,29;MFRL=114,155;MMQ=25,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	98128574	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=34,32;MFRL=200,191;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,6:1,7:0,2,0,13
chr2	98129586	.	GG	AT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=167,223;MMQ=27,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:0|1:98129586_GG_AT:98129586:5,2,2,0
chr2	98129589	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=167,223;MMQ=27,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:2,1:0|1:98129586_GG_AT:98129586:5,2,2,0
chr2	98129603	.	TAA	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=175,210;MMQ=27,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:3,2,4,0
chr2	98129670	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=163,162;MMQ=25,25;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:4,4,2,0
chr2	98129682	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=30,33;MFRL=163,143;MMQ=27,25;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:0|1:98129682_TG_CA:98129682:2,4,5,0
chr2	98129690	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=28,33;MFRL=163,134;MMQ=27,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:4,2:2,2:0|1:98129682_TG_CA:98129682:2,4,5,0
chr2	98129707	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=33,25;MFRL=178,121;MMQ=27,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:3,6:3,4:0|1:98129707_G_T:98129707:2,4,10,0
chr2	98129716	.	AC	GT	.	.	DP=20;ECNT=12;MBQ=28,28;MFRL=167,121;MMQ=27,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.619:19:4,5:3,4:0|1:98129707_G_T:98129707:3,4,11,1
chr2	98129731	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=12;MBQ=32,27;MFRL=163,134;MMQ=27,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=127.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,30:0.816:36:3,9:3,15:0|1:98129731_C_T:98129731:3,3,22,8
chr2	98129733	.	AT	CC	.	.	DP=38;ECNT=12;MBQ=26,32;MFRL=163,139;MMQ=27,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=132.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,32:0.825:38:3,13:3,17:0|1:98129731_C_T:98129731:3,3,22,10
chr2	98129744	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=12;MBQ=32,25;MFRL=137,145;MMQ=27,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=149.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,40:0.805:49:2,18:7,22:0|1:98129731_C_T:98129731:3,6,27,13
chr2	98129802	.	C	CTTTTTT	.	.	DP=28;ECNT=12;MBQ=35,22;MFRL=142,77;MMQ=25,37;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=7,13;RU=T;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.150:17:6,0:9,2:5,10,0,2
chr2	98129817	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=29,34;MFRL=141,132;MMQ=25,25;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:2,2,1,4
chr2	98129879	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=26,32;MFRL=163,161;MMQ=25,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,2:6,2:0,11,0,4
chr2	98129924	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=12;MBQ=32,27;MFRL=199,224;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr2	98154551	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=215,176;MMQ=27,35;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	98154803	.	G	GATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,23;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	98164084	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,224;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	98169519	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=164,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,6:0,2:0,1,7,1
chr2	98169544	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=161,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,7:0,2:1,1,8,1
chr2	98169583	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=158,137;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	98169742	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=251,168;MMQ=52,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,3:2,6:5,1,4,5
chr2	98169901	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=236,194;MMQ=40,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr2	98171807	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=204,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,1:0,6:0,1,2,5
chr2	98173368	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=206,164;MMQ=50,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:0,11:1,5:1,0,9,8
chr2	98192743	.	A	AAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=201,181;MMQ=58,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:98192743_A_AAC:98192743:3,0,2,0
chr2	98192749	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=195,181;MMQ=59,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:98192743_A_AAC:98192743:2,0,2,0
chr2	98196849	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=110,136;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.846:11:1,2:0,6:0|1:98196849_G_A:98196849:1,0,9,1
chr2	98196859	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=110,128;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.848:11:1,2:0,8:0|1:98196849_G_A:98196849:1,0,8,2
chr2	98196987	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,78;MMQ=52,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:10,0:17,5:13,14,0,5
chr2	98205924	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=210,203;MMQ=50,36;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr2	98206188	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=263,147;MMQ=44,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.848:18:0,3:2,11:0,2,5,11
chr2	98273290	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:2,1,4,2
chr2	98276014	.	CCCTCACCTGCCCTGACCAGAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTCACCTGCCCTGACCAGAA;STR;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.791:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	98340485	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	98351654	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=182,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,5:2,1:6,0,6,0
chr2	98351986	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=445,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr2	98353847	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=193,261;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:2,0,3,0
chr2	98354139	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=226,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:0,1:4,2:1,3,2,2
chr2	98355929	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:16,0:5,4:0|1:98355929_A_C:98355929:6,15,0,4
chr2	98355931	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:16,0:5,4:0|1:98355929_A_C:98355929:6,15,0,4
chr2	98355990	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,6:0,1:0,1,0,7
chr2	98373770	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=225,50;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.079:41:20,0:18,2:12,26,0,3
chr2	98376989	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr2	98382886	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=138,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:2,6:0,11:2,0,9,8
chr2	98392302	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=203,41;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,6:5,0:6,3,3,3
chr2	98413469	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:11,0:3,10:3,11,0,10
chr2	98413781	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=200,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,4:1,3:6,0,4,3
chr2	98418812	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr2	98421642	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=128,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:19,0:4,2:12,12,1,1
chr2	98449796	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,6,10
chr2	98451036	.	TAA	T,TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25,26;MFRL=184,131,152;MMQ=60,60,60;MPOS=27,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.86,5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,4:0.181,0.289:14:5,0,2:3,2,2:4,4,5,1
chr2	98460742	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,3:4,1:1,8,1,3
chr2	98475985	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=199,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:3,1:0,6,0,2
chr2	98543829	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=190,138;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:7,6:6,0:10,3,6,0
chr2	98544058	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=182,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,2:6,3:0,12,1,4
chr2	98795873	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=192,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,3:1,4:0,2,0,8
chr2	98797744	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	98872570	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.232:22:12,2:3,3:11,6,2,3
chr2	98872662	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:2,1:0,1:0,2,1,1
chr2	98907052	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=126,83;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:13,2:19,0:21,15,0,2
chr2	98907089	.	GT	G,GTT	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,33,33;MFRL=126,192,118;MMQ=60,60,60;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.22,6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,4,5:0.147,0.196:28:12,1,0:7,2,4:10,9,6,3
chr2	98994309	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=170,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.152:18:5,2:8,0:3,13,0,2
chr2	98996730	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=173,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:3,9,1,1
chr2	99013338	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=225,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:2,2:10,0:3,9,1,1
chr2	99154229	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=184,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	99165524	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=132,162;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.261:17:6,0:7,4:0|1:99165524_T_C:99165524:1,12,0,4
chr2	99165528	.	C	CCAGTCGT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:5,0:6,4:0|1:99165524_T_C:99165524:0,12,0,4
chr2	99184977	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,4:5,0:7,0,4,0
chr2	99220707	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=162,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0,12,1,1
chr2	99227409	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:0,6,1,5
chr2	99232873	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,2:8,3:6,5,5,0
chr2	99234586	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=188,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.559:10:3,3:1,2:4,0,5,1
chr2	99237792	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=225,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:4,0,5,0
chr2	99272057	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=332,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:0,2,1,5
chr2	99294714	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99294714_T_A:99294714:0,0,1,0
chr2	99294716	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,229;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99294714_T_A:99294714:0,0,1,0
chr2	99295003	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=223,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr2	99414067	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	99443369	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=184,255;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.399:6:1,2:2,0:4,0,2,0
chr2	99449536	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=314,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	99688127	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=139,238;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.255:10:5,2:3,0:6,2,1,1
chr2	99689440	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,168;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.202:26:10,4:10,0:12,9,5,0
chr2	99689610	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=161,14624;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:0,10,0,2
chr2	99721804	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.541:7:1,3:1,1:2,1,4,0
chr2	99725223	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	99725479	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=202,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=56.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:0,8:1,8:0,1,4,12
chr2	99766927	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr2	99778840	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:9,5,1,1
chr2	99779653	.	AAC	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=184,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.220:11:3,1:5,1:2,7,0,2
chr2	99779655	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=74,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.775:16:1,5:2,8:0,3,3,10
chr2	99802820	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	99936182	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=109,108;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,2:12,1:14,9,2,1
chr2	99936265	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=176,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:3,2:3,1:1,5,1,2
chr2	99980159	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=117,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:11,4:8,0:9,10,5,0
chr2	99995458	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=16,31,29,32;MFRL=142,130,183,140;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,14,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.46,14.92,3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,3,8,3:0.142,0.355,0.165:21:1,2,2,2:2,1,5,1:3,4,13,1
chr2	99995571	.	G	GTGAAGTAGCCCACCTGAGGTC	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=132,42;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:13,1:20,2:13,20,1,2
chr2	99995804	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:8,2:12,2:12,8,1,3
chr2	100006620	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=167,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,1:4,2:4,6,2,1
chr2	100006649	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=159,270;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,0:6,3:8,7,3,0
chr2	100006890	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=196,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:4,2:2,1:1,7,3,0
chr2	100029242	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:22,0:9,4:16,15,0,4
chr2	100079159	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=182,47820305;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr2	100081561	.	A	AAAGTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=190,255;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr2	100176775	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:1,2:9,1:9,1,3,0
chr2	100210614	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,1:7,1:6,7,0,2
chr2	100368849	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=187,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,0:6,4:0,10,0,4
chr2	100454085	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr2	100623130	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr2	100628034	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=164,122;MMQ=60,29;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,0:7,2:2,9,0,2
chr2	100628052	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=154,122;MMQ=60,29;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,0:5,2:0|1:100628052_C_T:100628052:1,7,0,2
chr2	100628055	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=154,122;MMQ=60,29;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:100628052_C_T:100628052:1,7,0,2
chr2	100721050	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=263,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr2	100915629	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:3,1,6,1
chr2	101011877	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=195,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr2	101014363	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=94,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:9,5:2,6:5,6,5,6
chr2	101031561	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=176,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:5,4:8,2:2,12,1,5
chr2	101031588	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.270:12:3,2:6,1:0,9,0,3
chr2	101086966	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=152,81;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:1,5,2,0
chr2	101096903	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=206,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,4:3,1:6,3,3,2
chr2	101437762	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=205,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr2	101521173	.	ATT	A,AT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27,24;MFRL=190,46,103;MMQ=60,60,60;MPOS=3,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=8.03,8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,6,8:0.331,0.405:19:2,1,6:2,5,0:3,2,8,6
chr2	101541798	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,6:2,3:4,3,1,8
chr2	101564628	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr2	101581294	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.445:11:4,1:2,3:6,0,4,1
chr2	101611775	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=192,58;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr2	101612051	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=193,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:1,1,0,4
chr2	101619283	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,5:2,8:0,5,2,11
chr2	101619321	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,4:1,5:0,3,0,9
chr2	101622696	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=113,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr2	101627343	.	CAAAAA	C,CAAAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,36,32;MFRL=228,174,159;MMQ=45,40,53;MPOS=18,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,11,15;RU=A;STR;TLOD=3.13,7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,3:0.201,0.472:6:2,1,0:0,0,3:2,0,4,0
chr2	101627367	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=137,199;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:4,0:7,0:6,7,2,0
chr2	101627852	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:4,1,5,0
chr2	101675808	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=280,248;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr2	101874442	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=149,272;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,2:4,3:2,10,2,3
chr2	101881549	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=146,238;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,1:7,3:5,11,0,4
chr2	101883046	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	101885656	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.252:18:5,2:9,2:8,6,4,0
chr2	101911385	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=142,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:14,1:4,1:15,3,1,1
chr2	101925026	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,0:2,4:0,3,1,3
chr2	101967346	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr2	102000210	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,4:1,5:0,3,0,9
chr2	102003962	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	102027050	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=132,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.318:15:4,2:4,3:9,1,4,1
chr2	102027178	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=182,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:6,14,0,2
chr2	102027188	.	A	ACGTCCCCTGAGCTAATTCCAGCC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=196,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,3:9,0:4,10,0,3
chr2	102029548	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:10,1:2,5:2,10,1,5
chr2	102031489	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	102083183	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=152,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:9,2:5,2:11,4,2,2
chr2	102314437	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=196,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:3,0,7,0
chr2	102407332	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=209,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:0,4,0,5
chr2	102440581	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=102,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:102440581_G_GC:102440581:1,0,0,1
chr2	102440586	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=102,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102440581_G_GC:102440581:1,0,0,1
chr2	102448164	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:19,1:11,2:21,10,2,1
chr2	102505434	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:1,8,2,0
chr2	102632582	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=224,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr2	102641201	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=250,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:0,7,0,7
chr2	102642558	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,1:6,1,0,2
chr2	102785158	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=152,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.467:9:1,1:4,3:2,3,1,3
chr2	102788409	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr2	102792760	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	102849348	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=186,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr2	102954653	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.594:17:4,4:1,6:5,2,7,3
chr2	102957026	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=203,200;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.556:25:5,1:4,0:0|1:102957026_T_C:102957026:11,0,14,0
chr2	102957035	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=203,200;MMQ=60,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=48.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,15:0.565:26:6,14:4,1:0|1:102957026_T_C:102957026:11,0,15,0
chr2	102957348	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	102957628	.	C	CTT,CTTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,35,19;MFRL=126,156,158;MMQ=60,60,60;MPOS=24,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,17,18;RU=T;STR;TLOD=3.23,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,1:0.555,0.223:6:0,3,0:1,0,0:1,0,4,1
chr2	102957644	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,11;MFRL=126,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.444:9:2,0:2,0:3,2,4,0
chr2	102967928	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	102984624	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	103006448	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr2	103010912	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,14,2
chr2	103013408	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr2	103039686	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,2:6,1:8,2,3,0
chr2	103039873	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,7:2,4:0,5,2,9
chr2	103040177	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0|1:103040177_A_T:103040177:0,0,8,0
chr2	103040182	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=112,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.819:9:0,2:1,6:0|1:103040177_A_T:103040177:1,0,8,0
chr2	103040247	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=59.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.942:15:0,2:0,12:0|1:103040247_T_TG:103040247:0,0,10,5
chr2	103040249	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.944:15:0,2:0,13:0|1:103040247_T_TG:103040247:0,0,10,5
chr2	103040797	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:6,8,0,2
chr2	103057668	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr2	103057892	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=283,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,7:1,0:1,0,3,4
chr2	103059613	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr2	103059874	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,294;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	103061714	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:11,6,2,0
chr2	103063489	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:1,3,5,1
chr2	103063520	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=182,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,3:1,1:3,1,0,4
chr2	103068156	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=206,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr2	103120232	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr2	103121654	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=223,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr2	103125457	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0|1:103125457_A_G:103125457:0,0,0,9
chr2	103125466	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0|1:103125457_A_G:103125457:0,0,0,8
chr2	103136309	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=65.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,13,6
chr2	103136446	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr2	103141447	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr2	103141651	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,3,5
chr2	103149162	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,0,16
chr2	103149182	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr2	103236646	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=209,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	103281540	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=211,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,3:3,2:4,0,4,2
chr2	103300506	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr2	103324820	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,265;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:9,4,2,0
chr2	103324998	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=217,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:6,1:3,2:2,8,0,3
chr2	103335719	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,0:2,3:0,7,0,3
chr2	103343234	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=307,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=82.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,12:1,12:1,0,24,1
chr2	103343275	.	GAA	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:2,1:2,3,5,0
chr2	103343309	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:11,0:15,4:12,14,4,0
chr2	103343339	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=100,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.178:35:15,1:14,4:8,21,3,3
chr2	103348789	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:15,0:10,4:12,13,0,4
chr2	103378857	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=220,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,5:4,4:3,6,0,9
chr2	105654716	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:7,3:3,2:2,8,2,3
chr2	105713697	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,4:7,0:5,7,2,2
chr2	105713868	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=203,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:105713868_A_G:105713868:0,5,0,2
chr2	105713877	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=203,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:105713868_A_G:105713868:0,5,0,2
chr2	105859249	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=180,259;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:13,2:6,1:6,13,1,2
chr2	105897261	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr2	105924017	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=180,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr2	105961703	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=59.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,21:0.757:27:3,2:3,18:6,0,19,2
chr2	105979730	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,8:7,5:4,9,7,6
chr2	105979827	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=175,248;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,2:11,0:0|1:105979827_T_G:105979827:11,10,2,0
chr2	105979830	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=175,248;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,2:11,0:0|1:105979827_T_G:105979827:11,10,2,0
chr2	105983987	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=144,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr2	105994498	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=125,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:2,2:12,6:8,6,3,5
chr2	105994564	.	C	CATCAA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=189,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:4,6:9,5:8,5,6,5
chr2	106013147	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=120,102;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,21:0.629:33:8,4:4,17:6,6,11,10
chr2	106013155	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=120,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.188:35:15,0:14,6:13,16,1,5
chr2	106013216	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.404:22:6,7:7,1:2,11,1,8
chr2	106471825	.	CA	C,CAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,34,32;MFRL=245,287,198;MMQ=60,60,60;MPOS=19,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.71,8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,4:0.230,0.485:8:0,1,2:2,1,1:0,2,0,6
chr2	106509654	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr2	106682365	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=264,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr2	106687456	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=134,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:2,3:7,2:5,4,2,3
chr2	106690542	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=227,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,5:3,3:2,1,0,8
chr2	106715342	.	G	A,T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27,30;MFRL=0,226,235;MMQ=60,60,60;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.71,5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.500,0.375:5:0,1,1:0,2,1:0,0,0,5
chr2	106717647	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.590:25:4,0:6,14:2,8,0,15
chr2	106717656	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=197,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:1,3:17,3:0,18,1,5
chr2	106729102	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=184,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,1:8,1:9,3,2,0
chr2	106742177	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=233,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,9:0,5:0,1,2,12
chr2	106746247	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=183,96;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:10,0:5,3:4,11,0,3
chr2	106780015	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	106780055	.	C	CTG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,9,5
chr2	106782398	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr2	107032279	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=0,148;MMQ=24,28;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,4,2
chr2	107032404	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=168,68;MMQ=47,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:8,0:10,5:7,11,2,3
chr2	107057642	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=173,140;MMQ=53,46;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:5,0,2,2
chr2	107073501	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,7,9
chr2	107423128	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=183,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:4,6,1,1
chr2	107446430	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr2	107449174	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=162,178;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:1,7,0,2
chr2	107460474	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	108488331	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=104,895209;MMQ=57,29;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,3:8,0:7,8,0,3
chr2	108507032	.	ACCC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=169,295;MMQ=27,25;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=C;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:1,0:1,1,1,1
chr2	108875198	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=131,58;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:7,2:6,3:4,9,1,4
chr2	108921795	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=183,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,5:2,3:3,3,5,3
chr2	108994808	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,134;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:5,4,3,3
chr2	108999022	.	A	AAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=135,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AT;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	108999786	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:8,3,1,1
chr2	109065858	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,247;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,0:8,5:2,9,1,4
chr2	109087062	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=157,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.162:35:12,0:18,5:12,18,0,5
chr2	109089404	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,1:2,5:2,5,2,4
chr2	109092121	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:5,2:14,3:5,14,3,2
chr2	109103108	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=110,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,1:7,2:7,7,0,3
chr2	109106381	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=151,232;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:14,2:8,3:14,8,4,1
chr2	109113658	.	CA	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=183,137;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:4,1:4,9,1,1
chr2	109123950	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=136,341;MMQ=57,55;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,2:6,2:10,4,1,3
chr2	109237905	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=163,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:15,0:6,3:8,13,0,3
chr2	109276178	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=153,129;MMQ=25,25;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,4:6,4:6,5,4,4
chr2	109278823	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=171,195;MMQ=60,49;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,2:7,2:4,10,0,4
chr2	109292280	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	109300258	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr2	109370225	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=194,240;MMQ=55,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:10,3,2,0
chr2	109381283	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=164,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,0:11,2:10,9,1,1
chr2	109393522	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	109407894	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=209,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr2	109411248	.	GAATAT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AATAT;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	109455815	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=184,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	109490104	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	109490146	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	109513321	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,3:0,2:0,0,7,0
chr2	109513786	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr2	109522720	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr2	109527087	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	109988086	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:5,1:8,7,2,0
chr2	109988215	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr2	110053248	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chr2	110323270	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,116;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:5,1,2,0
chr2	110332142	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:1,2:3,7:4,0,8,1
chr2	110343358	.	GCAAACTCT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,119;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,2:10,0:11,13,1,1
chr2	110372192	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	110373938	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.581:22:4,8:5,5:4,5,5,8
chr2	110374215	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=183,254;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:7,1:12,2:10,9,2,1
chr2	110375592	.	CAAAAA	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=95,209;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=18,13;RU=A;STR;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:4,1:3,5:4,10,5,1
chr2	110375685	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:13,5:13,0:12,15,0,5
chr2	110376288	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:5,5:9,5:3,11,5,5
chr2	110886686	.	A	AGACCAGAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:0,4:6,0:5,1,4,0
chr2	110905664	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=207,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	110922064	.	CAA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=238,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:0,1:0,2:2,0,3,0
chr2	110922703	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=145,245;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:9,1:15,2:6,19,1,2
chr2	110925982	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.328:13:4,2:4,2:7,2,4,0
chr2	111397237	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.444:5:0,1:3,1:2,1,2,0
chr2	111406968	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=15,25;MFRL=58,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.520:8:0,1:1,1:0,4,2,2
chr2	111408282	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=181,109;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.171:19:10,0:6,2:9,7,0,3
chr2	111644475	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,0:1,3:1,0,1,2
chr2	111644491	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	111721142	.	ATGTGTGTG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=198,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=TG;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:0,1:1,1:3,0,2,0
chr2	111753449	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=151,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,3:6,3:5,4,4,2
chr2	111753627	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:1,7,0,2
chr2	111875388	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,345;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:5,1:0,8,0,2
chr2	111907691	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,211;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:7,3:13,2:7,13,2,3
chr2	112582766	.	CTT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,135;MMQ=50,46;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:5,2:12,5:11,6,2,5
chr2	112583476	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=193,144;MMQ=60,52;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:6,4:7,2:6,7,3,3
chr2	112604685	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=201,135;MMQ=25,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:2,3:8,2:5,5,5,0
chr2	112605465	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr2	112625575	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=222,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,4:3,5:6,2,4,5
chr2	112631255	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,175;MMQ=40,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,0:9,4:13,6,0,4
chr2	112686689	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=148,74;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:4,3:9,0:9,4,2,1
chr2	112687157	.	A	ATATTTATTTATT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=123,307;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,7;RU=TATT;STR;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.651:4:0,1:1,1:0|1:112687157_A_ATATTTATTTATT:112687157:0,1,0,3
chr2	112687176	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=165,228;MMQ=60,58;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.367:6:3,0:1,1:0|1:112687157_A_ATATTTATTTATT:112687157:0,4,0,2
chr2	112702647	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:0,5,0,6
chr2	112705157	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=132,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:8,3:1,9:2,7,3,9
chr2	112705185	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:4,4:0,8:0,4,0,12
chr2	112725684	.	A	ATGTG,ATGTGTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,17,28;MFRL=212,195,154;MMQ=60,60,60;MPOS=8,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,9,10;RU=TG;STR;TLOD=6.35,7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,4:0.370,0.409:9:0,1,2:2,0,1:2,0,4,3
chr2	112740373	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr2	112751727	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=265,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:112751727_G_A:112751727:4,0,0,1
chr2	112751737	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=261,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:112751727_G_A:112751727:4,0,1,1
chr2	112751928	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=132,204;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.371:25:10,5:6,4:8,8,7,2
chr2	112754880	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=77,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:3,0,6,1
chr2	112754943	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=77,123;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,21:0.783:26:2,8:3,9:2,3,7,14
chr2	112761653	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,5:2,2:0,3,0,7
chr2	112767483	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=157,271;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,3:6,1:6,2,4,0
chr2	112767739	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=198,255;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	112776913	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=170,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:3,0:6,0,2,0
chr2	112776979	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=157,253;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,1:8,3:7,4,3,1
chr2	112786413	.	CCTCAGAAGG	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=170,66;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:11,2:10,0:13,11,1,1
chr2	112813163	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=202,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:1,0,3,1
chr2	112813391	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=68.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.915:21:0,13:1,7:1,0,6,14
chr2	112817630	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.450:38:7,0:14,17:10,11,0,17
chr2	112821880	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=206,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr2	112832535	.	CAAT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=111,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:9,6:4,4:9,5,1,9
chr2	112847164	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,7:7,2:9,1,8,1
chr2	112854563	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.349:12:5,3:2,1:6,2,4,0
chr2	112856165	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.637:31:2,12:9,8:6,5,12,8
chr2	112858122	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr2	112865517	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr2	112945188	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0,5,0,5
chr2	112990804	.	T	TATAAAGA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:1,2:4,6:3,2,7,4
chr2	112991609	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=230,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,1,1
chr2	113074775	.	CTT	C,CT	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,32,19;MFRL=143,183,123;MMQ=60,60,60;MPOS=20,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.36,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,2,5:0.102,0.235:20:7,0,2:2,2,0:9,4,4,3
chr2	113074866	.	A	AATT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=129,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.205:27:9,4:13,0:5,17,0,5
chr2	113088520	.	TAA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0|1:113088520_TAA_T:113088520:5,1,3,1
chr2	113088524	.	TTTATTA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0|1:113088520_TAA_T:113088520:5,1,3,1
chr2	113147889	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=229,304;MMQ=25,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr2	113300330	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=193,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	113305150	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,4:2,5:2,5,4,5
chr2	113308622	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr2	113309653	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr2	113310197	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=126,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,4:1,4:2,0,8,0
chr2	113315523	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.127:21:6,2:13,0:14,5,2,0
chr2	113315735	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=243,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:4,2:0,4:0,4,1,5
chr2	113321900	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=154,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,3:5,1:6,1,1,3
chr2	113326281	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr2	113326502	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,6,11
chr2	113332323	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,292;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.739:2:0,0:0,0:0|1:113332323_G_T:113332323:0,0,2,0
chr2	113332329	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,329;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113332323_G_T:113332323:0,0,1,0
chr2	113342269	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,7:0.174:44:19,0:17,7:13,24,0,7
chr2	113343488	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:1,2:0,7:1,0,8,2
chr2	113346512	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,5:0,0,2,9
chr2	113479745	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,307;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr2	113480726	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=119,80;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,0:9,2:9,12,0,2
chr2	113480938	.	G	GCACA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,112;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=CA;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.796:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	113481105	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=231,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:3,3,1,2
chr2	113481442	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=201,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:113481442_C_T:113481442:0,2,0,1
chr2	113481446	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=201,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:113481442_C_T:113481442:0,2,0,1
chr2	113481448	.	AA	TG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,32;MFRL=201,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:113481442_C_T:113481442:0,2,0,1
chr2	113481453	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=22,31;MFRL=201,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:113481442_C_T:113481442:0,2,0,1
chr2	113481455	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,27;MFRL=216,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113481442_C_T:113481442:0,1,0,1
chr2	113481458	.	GA	TC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=216,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:113481442_C_T:113481442:0,1,0,1
chr2	113481547	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr2	113484319	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,5:0,19:0,0,12,12
chr2	113484353	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=49.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,5,11
chr2	113513504	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=200,110;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr2	113514180	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=128,262;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:11,1:10,1:7,15,2,0
chr2	113514763	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=140,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:3,2:8,1:6,6,0,3
chr2	113514883	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=92655774,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr2	113532885	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:1,2,2,6
chr2	113535770	.	GGT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=GT;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.804:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	113537148	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=157,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:17,0:13,4:17,13,4,0
chr2	113539363	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=196,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,4:5,3:5,6,2,5
chr2	113540177	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=191,247;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr2	113540205	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=159,247;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr2	113588793	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=203,291;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:6,0,5,0
chr2	113590297	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:9,0:12,8:10,11,1,7
chr2	113590467	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,4:2,1:0,7,0,5
chr2	113671303	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=176,60;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,5:1,3:2,2,8,0
chr2	113671410	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=221,109;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.595:22:6,4:1,9:3,6,12,1
chr2	113671518	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=241,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:0,4,1,5
chr2	113672795	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,100;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,0:11,4:12,10,0,4
chr2	113783909	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=191,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr2	113816940	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.463:11:6,2:0,3:0|1:113816940_C_G:113816940:5,1,4,1
chr2	113816942	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.463:11:6,2:0,3:0|1:113816940_C_G:113816940:5,1,4,1
chr2	113816999	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=149,92;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:7,6:16,0:11,12,6,0
chr2	113819614	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=239,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:7,0,3,0
chr2	113830201	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=217,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:6,0,4,0
chr2	113832044	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,111;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,0:6,6:3,10,0,6
chr2	113887335	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=115,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.773:11:2,3:0,6:0,2,0,9
chr2	113940839	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=174,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:3,2:6,8:5,4,5,5
chr2	113942891	.	ACCTCTCTGTGTATCCAGGGCTCATGGGAATGCCTTTG	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=128,235;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.128:23:2,2:2,0:0|1:113942891_ACCTCTCTGTGTATCCAGGGCTCATGGGAATGCCTTTG_A:113942891:13,8,2,0
chr2	113942903	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=243,57;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.327:7:4,1:1,1:1|0:113942891_ACCTCTCTGTGTATCCAGGGCTCATGGGAATGCCTTTG_A:113942891:3,2,2,0
chr2	113943470	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.462:22:8,5:3,5:9,3,5,5
chr2	113953401	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,8:0,6:0,0,4,10
chr2	113953657	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=144,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:4,0,4,2
chr2	113953952	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=195,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,4:2,4:1,6,1,7
chr2	113953973	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0|1:113953973_A_AT:113953973:0,5,0,4
chr2	113953974	.	GACA	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0|1:113953973_A_AT:113953973:0,5,0,4
chr2	113953984	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=35,25;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr2	113955074	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr2	113956821	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:1,2,1,2
chr2	113977862	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr2	113999736	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=210,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:2,1:0,3:1,2,0,4
chr2	114000458	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	114004237	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	114256759	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=165,124;MMQ=24,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:3,1:6,4:8,1,3,2
chr2	114258779	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=205,177;MMQ=25,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,2:5,7:5,3,6,3
chr2	114340469	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=159,141;MMQ=22,22;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.165:34:10,2:19,3:24,5,4,1
chr2	114340494	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=139,201;MMQ=22,22;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,19:0.317:61:15,13:27,6:28,14,12,7
chr2	114340511	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=168,105;MMQ=22,22;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,14:0.181:80:30,3:35,11:38,28,9,5
chr2	114340663	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=144,156;MMQ=40,22;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,23:0.489:47:11,11:13,12:12,12,7,16
chr2	114340677	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=158,139;MMQ=32,22;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,15:0.371:41:13,6:13,9:15,11,2,13
chr2	114340706	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=154,136;MMQ=38,23;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.211:45:23,5:13,4:11,25,3,6
chr2	114386353	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114386353_C_T:114386353:0,0,1,0
chr2	114386361	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,117;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:114386353_C_T:114386353:0,0,1,0
chr2	114399145	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=176,193;MMQ=57,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,3:2,5:2,6,1,7
chr2	114475418	.	T	TCTCTCTCTCTCTCCCCCTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=155,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.265:9:5,2:2,0:4,3,1,1
chr2	114480812	.	A	AAAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAC;STR;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	114486907	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=188,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,2,2
chr2	114492135	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=115,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,3:0,2:1,1,3,2
chr2	114493260	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,3:4,7:11,0,9,1
chr2	114493509	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,280;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	114500473	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=95,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.616:6:2,2:0,2:0,2,1,3
chr2	114513386	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:6,4:1,2:7,0,6,0
chr2	114513901	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=204,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:6,6:2,4:6,2,8,2
chr2	114684848	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=190,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,3:3,1:9,0,4,0
chr2	114691809	.	GT	G,GTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=163,235,148;MMQ=60,60,60;MPOS=7,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.10,5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,4:0.213,0.301:14:2,0,0:4,3,3:5,2,6,1
chr2	115822286	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:2,2,4,1
chr2	115919677	.	CT	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr2	116066984	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr2	116485344	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr2	116497479	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,7,14
chr2	116497528	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	116534922	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=205,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr2	116539846	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,0:0,4:5,0,4,0
chr2	116548820	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,8,8
chr2	116593675	.	ATG	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	116593695	.	GAT	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=223,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AT;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:3,1,3,0
chr2	116594221	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,2:4,1:3,7,3,0
chr2	116599927	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,1,9
chr2	118578691	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.750:13:2,6:1,4:3,0,8,2
chr2	118579618	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=183,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:5,10,1,1
chr2	118582936	.	A	ATAAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=218,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr2	118582951	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=151,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:118582951_C_G:118582951:4,0,1,0
chr2	118582953	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=151,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:118582951_C_G:118582951:4,0,1,0
chr2	118688711	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:9,0:12,8:10,11,0,8
chr2	118688754	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,4,15
chr2	118694393	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr2	118698699	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=233,281;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr2	118704478	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,9:0,0,6,16
chr2	118704503	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,5:5,3:2,5,0,8
chr2	118705570	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	118706879	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr2	118709122	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=175,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr2	118743736	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=T;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.699:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr2	118753148	.	A	ATC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	118764242	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=148,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.532:15:4,1:3,6:4,3,5,3
chr2	118766024	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	118766178	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,45;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:9,0:7,9,1,1
chr2	118771663	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr2	118771682	.	TGCC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=235,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GCC;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr2	119732042	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=219,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,4:7,4:6,6,3,5
chr2	119735073	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:7,3:5,0:8,4,0,3
chr2	119735333	.	C	CAAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=242,452;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:0|1:119735333_C_CAAA:119735333:10,0,0,2
chr2	119735336	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=242,452;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:5,2:5,0:0|1:119735333_C_CAAA:119735333:10,0,0,2
chr2	119739127	.	C	CATTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=252,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.568:11:3,3:2,1:2,3,2,4
chr2	119739269	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=122,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,2:1,6:0,4,2,6
chr2	119749477	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,5,7
chr2	119915132	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr2	119915509	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=217,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.508:8:1,1:2,3:4,0,2,2
chr2	120003642	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	120005840	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	120014985	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr2	120014995	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=208,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:8,2,2,0
chr2	120059988	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:5,3:2,1:5,2,3,1
chr2	120078689	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=154,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,1:4,3:8,1,4,0
chr2	120078778	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=160,94;MMQ=60,54;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,26:0.693:37:6,5:5,20:4,7,20,6
chr2	120078797	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:12,2:8,0:11,9,1,1
chr2	120125363	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=197,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,1:1,2:4,2,2,1
chr2	120125936	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr2	120125973	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=175,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:0,6,0,4
chr2	120194651	.	A	AGTGTGC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=137.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,12:0,0,16,15
chr2	120197670	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=126,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:5,0,5,1
chr2	120209689	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,5,7
chr2	120230998	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,4,6
chr2	120231165	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr2	120236332	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:4,2,2,0
chr2	120362407	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,6,19
chr2	120362897	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr2	120366057	.	GTT	G,GTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33,35;MFRL=0,228,174;MMQ=60,60,60;MPOS=27,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=T;STR;TLOD=3.21,12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,4:0.250,0.625:5:0,0,2:0,1,2:0,0,5,0
chr2	120366070	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=17,10;MFRL=225,174;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.741:5:0,0:0,0:1,0,4,0
chr2	120366240	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=155,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:120366240_G_A:120366240:0,3,0,1
chr2	120366246	.	GGA	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=155,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:120366240_G_A:120366240:0,3,0,1
chr2	120366255	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=155,228;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:120366240_G_A:120366240:0,3,0,1
chr2	120387619	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	120387637	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	120404629	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.766:6:1,2:0,3:0,1,1,4
chr2	120404671	.	T	TTTTTTGTTTTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:120404671_T_TTTTTTGTTTTG:120404671:0,3,0,1
chr2	120404673	.	C	CTTGTTTTGTTTTGAGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:120404671_T_TTTTTTGTTTTG:120404671:0,3,0,1
chr2	120414083	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=231,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:1,6:1,5:1,1,1,10
chr2	120439758	.	GT	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=210,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	120439760	.	G	GTGATCTTGGCTTGCTACA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=195,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	120567392	.	AT	A,ATT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,33,24;MFRL=204,143,210;MMQ=60,60,60;MPOS=18,1;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=6.21,4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,3:0.352,0.283:11:3,3,2:1,1,1:2,2,6,1
chr2	120620092	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:4,1:4,2:8,0,3,0
chr2	120689905	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=233,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	120704164	.	A	AT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=95.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,24:0.927:25:1,6:0,18:0|1:120704164_A_AT:120704164:1,0,9,15
chr2	120704166	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=37,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,24:0.927:25:1,6:0,17:0|1:120704164_A_AT:120704164:1,0,9,15
chr2	120718322	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	120830815	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,9,6
chr2	120831654	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.420:10:1,2:5,2:6,0,4,0
chr2	120889172	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.249:13:9,1:1,2:0|1:120889172_TG_T:120889172:10,0,3,0
chr2	120889173	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=200,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.679:14:4,7:0,3:4,0,10,0
chr2	120889176	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.249:13:9,1:1,1:0|1:120889172_TG_T:120889172:10,0,3,0
chr2	120900736	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:0,9,0,2
chr2	120918585	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=217,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,0:0,4:0,2,0,4
chr2	121036385	.	TT	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:5,4:2,6:2,5,3,7
chr2	121043403	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr2	121106850	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=223,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,5:8,0:11,6,4,1
chr2	121709091	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	121712729	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	121713022	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0|1:121713022_C_G:121713022:0,0,0,2
chr2	121713030	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:121713022_C_G:121713022:0,0,0,2
chr2	121713041	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	121729490	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chr2	121729686	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr2	121740190	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:121740190_C_T:121740190:0,0,3,0
chr2	121740194	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:121740190_C_T:121740190:0,0,3,0
chr2	121740294	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=168,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:9,2:7,1:15,1,2,1
chr2	121740505	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	121744225	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=127,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,2,4
chr2	121982011	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=125,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:2,2:4,3:1,5,2,4
chr2	121989489	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=178,200;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:5,1:5,4,0,3
chr2	121992954	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=178,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,0,1
chr2	121995511	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:5,0:8,2:3,10,0,2
chr2	121997120	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:6,2,2,0
chr2	122004596	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=206,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:0,2,1,6
chr2	122005928	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=207,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:0,8,0,2
chr2	122042750	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	122098360	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=132,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:3,0,3,1
chr2	122184950	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=137,104;MMQ=60,48;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,31:0.736:42:6,20:5,11:8,3,28,3
chr2	122185031	.	GA	AT	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=114,83;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,9:0.199:48:27,0:11,8:9,30,0,9
chr2	122219996	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:3,3:12,0:15,0,3,0
chr2	122273187	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,5:2,3:7,0,8,0
chr2	122485106	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,220;MMQ=59,56;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr2	122516480	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=203,99;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:0,6,0,2
chr2	125405302	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=212,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:7,2:4,4:5,6,4,2
chr2	125505013	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=333,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr2	125671948	.	C	CTCT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=36,36;MFRL=107,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:125671948_C_CTCT:125671948:0,1,0,1
chr2	125671951	.	TCTC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:125671948_C_CTCT:125671948:0,2,0,1
chr2	125671957	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=170,132;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125671948_C_CTCT:125671948:0,1,0,1
chr2	125671964	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=206,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:125671948_C_CTCT:125671948:0,2,0,1
chr2	125671966	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=206,132;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:125671948_C_CTCT:125671948:0,2,0,1
chr2	127447763	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=170,111;MMQ=52,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:1,3:0,3:1,0,5,2
chr2	127808161	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=208,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:0|1:127808161_G_A:127808161:0,10,0,3
chr2	127808170	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=233,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,1:4,2:0|1:127808161_G_A:127808161:0,9,0,3
chr2	127808532	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,228;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:3,2:4,6,0,2
chr2	127821085	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=200,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:7,4:1,3:7,1,7,0
chr2	127821452	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=187,291;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:7,3,2,0
chr2	127821499	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=178,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,2:5,3:10,1,4,1
chr2	127834136	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=175,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:7,3,2,0
chr2	127834369	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=177,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:127834369_C_T:127834369:0,3,0,4
chr2	127834384	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=185,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0|1:127834369_C_T:127834369:0,4,0,4
chr2	127944781	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,2,1
chr2	127950904	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=186,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,6:2,3:2,1,2,7
chr2	127951458	.	GC	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=155,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:1,8:12,1:5,8,2,7
chr2	127961180	.	A	ACTCTCTGTGCCTATCTTCTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:127961180_A_ACTCTCTGTGCCTATCTTCTGT:127961180:0,0,0,1
chr2	127961186	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=226,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:127961180_A_ACTCTCTGTGCCTATCTTCTGT:127961180:0,1,0,1
chr2	128015367	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=220,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	128029065	.	GAA	G,GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=243,142,150;MMQ=60,60,60;MPOS=17,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=3.73,5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.228,0.342:9:2,2,2:1,0,0:0,4,1,4
chr2	128050134	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr2	128051381	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=266,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr2	128081682	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:7,0,4,2
chr2	128178986	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=167,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:4,3:7,0:4,8,1,2
chr2	128181028	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	128186595	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=206,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	128263014	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:9,5:8,1:11,6,4,2
chr2	128263377	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=234,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:128263377_C_T:128263377:0,4,0,2
chr2	128263379	.	AT	TC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=234,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:128263377_C_T:128263377:0,4,0,2
chr2	128324125	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	128334236	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=237,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:1,7,2,0
chr2	128339456	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=193,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,4:4,2:4,1,5,1
chr2	128341603	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=213,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr2	128341769	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:10,0:5,5:6,9,5,0
chr2	128342547	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr2	128345960	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:2,2,2,4
chr2	128346228	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	128347801	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=123,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.309:8:3,0:1,2:1,5,1,1
chr2	128350551	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,3:1,6:0,4,3,6
chr2	128350578	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr2	128354024	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=160,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,3:5,1:6,3,3,1
chr2	128363530	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,3:0,0,1,8
chr2	128363608	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	128364684	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=170,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr2	128370200	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=209,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr2	128381594	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr2	128382842	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	128382859	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	128388485	.	TGCCCCCCAGCCCCGCTCCGCCTCATTGCACCCCCACC	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,15;MFRL=145,239;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.168:22:6,0:8,0:0|1:128388485_TGCCCCCCAGCCCCGCTCCGCCTCATTGCACCCCCACC_T:128388485:9,10,0,3
chr2	128388526	.	CAGCCCCACCTCACCTCATTGCACCCCCTGCT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=181,199;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.352:12:4,1:2,0:0|1:128388485_TGCCCCCCAGCCCCGCTCCGCCTCATTGCACCCCCACC_T:128388485:0,8,0,4
chr2	128389343	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=192,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:1,5:3,3:1,3,4,4
chr2	128389422	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=285,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:0,4,0,4
chr2	128393261	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:4,3,1,1
chr2	128393289	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,3:7,2:5,5,3,2
chr2	128394875	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.402:10:1,1:5,3:0|1:128394875_C_CA:128394875:3,3,4,0
chr2	128394877	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=146,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:1,1:5,5:0|1:128394875_C_CA:128394875:3,3,4,2
chr2	128396807	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=191,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr2	128399592	.	C	CCCCCTGCTCT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=157,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,0:4,2:5,3,1,1
chr2	128407499	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr2	128410244	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=184,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr2	128411934	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	128411950	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr2	128431188	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=144,264;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:3,1:4,1,1,1
chr2	128520547	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,235;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:5,1,2,0
chr2	128526579	.	TTAAA	T,TTAAATAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30,33;MFRL=0,200,219;MMQ=60,60,60;MPOS=29,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=TAAA;STR;TLOD=3.71,3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.420,0.402:2:0,1,0:0,0,1:0,0,0,2
chr2	128528266	.	AAAATAAATAAAT	A,AAAAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29,31;MFRL=194,221,391;MMQ=60,55,40;MPOS=11,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,8,9;RU=AAAT;STR;TLOD=5.81,3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.387,0.434:4:0,1,1:1,1,0:1,0,3,0
chr2	128608168	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=102,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,3:5,0:6,9,0,3
chr2	128608290	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=169,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.511:10:2,4:3,1:1,4,1,4
chr2	128610719	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=164,287;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:1,6,1,1
chr2	128610747	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=205,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr2	128615500	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=136,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	128699750	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,47779204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:0,1:4,1:0,4,1,1
chr2	128707503	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:8,0:5,2:5,8,2,0
chr2	128708063	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	128712953	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=217,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:128712953_A_G:128712953:0,4,0,1
chr2	128712961	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=196,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:128712953_A_G:128712953:0,3,0,1
chr2	128712963	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=196,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:128712953_A_G:128712953:0,3,0,1
chr2	128744580	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=146,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:0,3:5,4:1,4,0,7
chr2	128753854	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr2	128757804	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,5,2
chr2	128770731	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:1,1:5,1:0,8,0,2
chr2	128773928	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:6,2,2,0
chr2	128854948	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=231,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.404:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr2	128855206	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=182,276;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	128867131	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=196,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr2	128877837	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	128880899	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	128890878	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr2	128927864	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:8,2,1,1
chr2	128936000	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=139,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,1:7,2:10,4,1,2
chr2	128944207	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=139,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr2	128944424	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=113,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,6:3,1:5,5,3,4
chr2	130739444	.	TGAAGACG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=270,150;MMQ=60,53;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAAGACG;STR;TLOD=71.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:0,6:1,11:1,1,12,5
chr2	130739646	.	TTAAC	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=105,125;MMQ=60,47;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:2,9:2,8:1,5,13,5
chr2	130739712	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=144,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.246:17:8,1:5,3:6,7,3,1
chr2	130833159	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=260,261;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,1:5,3:0,6,1,3
chr2	130897055	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	130899642	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=274,184;MMQ=44,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr2	130900699	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=177,193;MMQ=55,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:10,4,2,0
chr2	130910847	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:5,1:0,3:3,2,3,1
chr2	130925088	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=180,165;MMQ=52,52;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:4,3:5,3:3,6,4,2
chr2	130929962	.	AG	GC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=95,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:15,2:14,0:16,13,1,1
chr2	130930819	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,125;MMQ=40,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,3:2,1:2,0,3,1
chr2	130939288	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=141,244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:2,7:6,4:3,5,4,7
chr2	130940090	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=284,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,3,3
chr2	130949303	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=181,272;MMQ=60,47;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	130952038	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=137,212;MMQ=57,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr2	130952053	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=151,212;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:2,5,2,0
chr2	130952613	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=228,109;MMQ=52,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,1:4,2:5,7,1,2
chr2	130952625	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=233,109;MMQ=52,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,1:4,2:5,8,1,2
chr2	131097159	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,58;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:8,3:13,0:16,6,2,1
chr2	131103133	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=130,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,2:8,0:9,10,2,0
chr2	131104049	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=152,299;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:3,2:10,1:5,8,2,1
chr2	131116404	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=168,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:7,0,5,1
chr2	131117120	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=186,296;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:1,0:5,2:2,6,0,2
chr2	131129928	.	AGACGGG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GACGGG;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.812:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	131130588	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=219,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,2:2,1:2,7,2,1
chr2	131130678	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=163,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,5:3,6:4,0,7,4
chr2	131132361	.	C	CCTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=139,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:131132361_C_CCTCT:131132361:0,1,0,1
chr2	131132365	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=202,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:131132361_C_CCTCT:131132361:0,2,0,1
chr2	131221170	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=124,126;MMQ=25,25;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:2,2,3,0
chr2	131390238	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=198,168;MMQ=29,30;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr2	131813195	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,266;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,1:8,1:7,9,1,1
chr2	131883287	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=142,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	131888361	.	ATT	A,AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,25,27;MFRL=95,118,96;MMQ=60,60,60;MPOS=12,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.28,3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,3:0.216,0.238:14:4,3,0:4,0,3:2,6,1,5
chr2	132021201	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=317,211;MMQ=25,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	132021860	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=180,100;MMQ=24,22;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.331:22:9,4:6,3:4,11,2,5
chr2	132021878	.	CG	TA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=202,98;MMQ=25,22;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:1,8,0,2
chr2	132021908	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=206,122;MMQ=24,25;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	132110828	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,366;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	132110862	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,366;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	132120501	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=209,214;MMQ=57,57;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.873:13:1,6:0,6:0,1,8,4
chr2	132121686	.	T	TTCGGCTTCCCCAGCCGCCGCCGCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCGGCTTCCCCAGCCGCCGCCGCC;STR;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.843:4:0,2:0,1:0,0,1,3
chr2	132233676	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=270,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,1,1
chr2	132237608	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=94,219;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,1:2,2:2,1,2,1
chr2	132237643	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=148,179;MMQ=40,24;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,0:1,1:5,2,2,0
chr2	132238043	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=204,187;MMQ=44,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr2	132240047	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,161;MMQ=40,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	132248330	.	G	GGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=162,124;MMQ=60,56;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:5,2:8,2:0|1:132248330_G_GGC:132248330:9,6,1,3
chr2	132248336	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=162,142;MMQ=60,57;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:5,2:9,3:0|1:132248330_G_GGC:132248330:9,6,2,3
chr2	132249372	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,275;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	132905664	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=123,280;MMQ=48,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:0|1:132905664_G_T:132905664:6,7,1,1
chr2	132905682	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=123,280;MMQ=26,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,1:6,0:0|1:132905664_G_T:132905664:7,9,1,1
chr2	132911056	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=209,215;MMQ=39,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:2,2,1,1
chr2	132911314	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=197,203;MMQ=49,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	133402607	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=254,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,4,0
chr2	133425912	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,246;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr2	133426183	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=233,245;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr2	133486440	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=177,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:9,5:8,0:9,9,5,0
chr2	133539460	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=151,299;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,1:3,1:7,1,2,0
chr2	133539669	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=123,50199212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:8,11,2,0
chr2	133539732	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=162,88;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,3:6,0:5,13,3,0
chr2	133541107	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=125,214;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:4,3:11,0:6,9,3,0
chr2	133541444	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=127,213;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.500:20:7,7:2,3:0|1:133541444_T_C:133541444:4,6,7,3
chr2	133541454	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=127,210;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:9,7:1,4:0|1:133541444_T_C:133541444:4,6,8,3
chr2	133618220	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=210,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr2	135102453	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=112,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:3,3:3,1:4,2,3,1
chr2	135160755	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,5:2,3:0,3,1,7
chr2	135214259	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=226,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,4:3,6:3,1,5,5
chr2	135214358	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=187,77;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:5,8,0,2
chr2	135470735	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=156,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:7,4:9,5:13,3,7,2
chr2	135619446	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,152;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.394:26:10,10:6,0:11,5,10,0
chr2	135628469	.	TAACATCACTGAATTCTTCTTGGTGGGGTG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=183,175;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,0:2,4:9,5,4,0
chr2	135677471	.	A	AGTTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=142,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.383:24:7,1:7,7:8,7,1,8
chr2	135694324	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	135694354	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:5,0,6,0
chr2	135694379	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,14,3
chr2	135700151	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:8,3:12,3:10,11,4,2
chr2	135705558	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr2	135710322	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,8,10
chr2	135745448	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=188,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr2	135762980	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=130,212;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:3,5,1,2
chr2	135780951	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=180,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:9,9:4,0:7,6,9,0
chr2	135809912	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=185,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:11,0:16,3:13,14,3,0
chr2	135887514	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=195,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:3,2:5,1,2,1
chr2	135893372	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=190,181;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,4:6,2:4,8,1,5
chr2	135982079	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=158,67;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:2,9,2,0
chr2	135988416	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,1:4,4:3,5,4,1
chr2	136023128	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=115,145;MMQ=60,21;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:4,6:4,0:6,2,6,0
chr2	136023150	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=115,145;MMQ=60,21;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.428:14:3,5:5,0:7,1,6,0
chr2	136148401	.	AA	TT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=117,180;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,1:1,2,0,2
chr2	136379194	.	GT	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.196:28:14,2:9,3:6,17,1,4
chr2	136407445	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=145,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.297:15:6,3:4,1:7,4,4,0
chr2	136407479	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=123,167;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:4,9:8,6:5,7,13,2
chr2	136409466	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=167,86;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,1:7,1:1,9,2,0
chr2	136467119	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=137,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:5,5:10,3:7,8,3,5
chr2	136467164	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr2	136511291	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=193,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	136511874	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:4,3,0,2
chr2	136546110	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,124;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:1,1:5,1:4,3,0,2
chr2	136547067	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,218;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,1:6,2:7,0,3,0
chr2	136548169	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	136548192	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr2	136552188	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=112,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:3,2:7,1:6,5,3,0
chr2	136558157	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=183,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.421:19:4,4:7,3:6,5,4,4
chr2	136561735	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=37,25;MFRL=156,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr2	136565028	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr2	136566631	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=211,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:2,3,2,0
chr2	136567633	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,53;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	136570613	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=213,266;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr2	136575534	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr2	136575568	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=147,159;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.459:20:6,9:4,0:8,3,9,0
chr2	136575704	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=164,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	136614255	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=191,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr2	136617008	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,1:7,1:3,6,0,2
chr2	136622543	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=157,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:4,1,3,0
chr2	136622825	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	136633771	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,4:3,2:4,0,5,1
chr2	136633962	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr2	136664812	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=147,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr2	136668781	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=180,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.451:31:6,0:11,13:9,8,0,14
chr2	136674028	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr2	136680534	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=148,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:0,9,0,2
chr2	136690414	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=197,258;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:0,3:2,3:1,5,0,6
chr2	136690425	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=219,222;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,3:3,2:1,6,0,5
chr2	136740900	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=155,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:1,2:2,2:3,0,4,1
chr2	136743143	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=183,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:6,3:4,4:3,7,2,5
chr2	136873458	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:11,9,1,1
chr2	137748604	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137748604_G_A:137748604:0,1,0,1
chr2	137748610	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137748604_G_A:137748604:0,1,0,1
chr2	137748614	.	TA	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:137748604_G_A:137748604:0,1,0,1
chr2	137814804	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=213,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,5:1,6:2,0,9,2
chr2	137872961	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=249,219;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr2	137988722	.	CAT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,0:8,1:9,9,0,2
chr2	137988729	.	T	TAA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=165,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,1:10,1:10,9,0,2
chr2	137999979	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=210,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:4,1,5,0
chr2	138000226	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	138030271	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr2	138163391	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr2	138169158	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr2	138208631	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr2	138375896	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=211,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:138375896_G_A:138375896:3,0,3,0
chr2	138375898	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:1,1:2,1:0|1:138375896_G_A:138375896:4,0,3,0
chr2	138378351	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=163,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr2	138378388	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=265,320;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr2	138727872	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=97,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.306:8:5,1:0,1:1,5,0,2
chr2	138762873	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=216,228;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	138771760	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=186,260;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr2	139308191	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=175,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:6,7:6,5:5,7,9,3
chr2	139308397	.	T	TTCTCTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,14;RU=TC;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.688:7:2,4:0,1:1,1,5,0
chr2	139316934	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=208,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,3:4,5:4,4,3,5
chr2	139318315	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:2,4:8,5:9,1,8,1
chr2	139318332	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.697:19:1,4:5,8:5,1,11,2
chr2	139429286	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=193,274;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr2	140992337	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,11,6
chr2	140997197	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=249,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr2	141027926	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=251,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,6:0,6:0,1,3,9
chr2	141032220	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=167,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:0,5,0,3
chr2	141092084	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=160,243;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.305:17:5,2:7,2:6,6,3,2
chr2	141260507	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:8,1,2,1
chr2	141283603	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,5,10
chr2	141294285	.	GAAAA	G,GAAA,GAAAAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,19,26,27;MFRL=176,238,194,230;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,18,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,9,12,14;RU=A;STR;TLOD=6.66,13.57,3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,3,8,2:0.199,0.485,0.156:15:0,1,1,1:1,0,4,0:1,1,2,11
chr2	141298674	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=189,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:0|1:141298674_T_C:141298674:3,6,1,2
chr2	141298682	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:4,1:4,2:0|1:141298674_T_C:141298674:3,5,1,3
chr2	141298749	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=198,253;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:0,8,0,5
chr2	141299317	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=194,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:2,2:3,1:4,1,3,0
chr2	141359287	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=246,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr2	141473505	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=274,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,4,3
chr2	141474402	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=258,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.590:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	141528592	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:0,3:5,4:0,5,1,6
chr2	141533573	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=212,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	141533662	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=175,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,6:2,0:4,1,4,2
chr2	141571440	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=184,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:1,2:4,2:0,6,0,4
chr2	141571456	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=193,237;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr2	141598473	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,3:0,0,9,1
chr2	141625630	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=145,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:1,0:3,0,3,0
chr2	141625834	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=11,18;MFRL=257,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.683:6:0,1:0,1:0,2,2,2
chr2	141762830	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=226,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:3,0,2,1
chr2	141771058	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=187,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr2	141777763	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,322;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	141812617	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=121,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,3:1,0:3,0,3,0
chr2	141819877	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	141945949	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr2	142012036	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=145,252;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr2	142237868	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=124,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	142567910	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=225,176;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:5,8:8,7:3,10,7,8
chr2	142568019	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=183,328;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr2	143676141	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=182,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.478:10:3,2:2,2:5,0,3,2
chr2	143787161	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,1:2,0,3,2
chr2	143787274	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=67.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,9,14
chr2	143913004	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr2	143973860	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=210,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:2,1,7,1
chr2	143986143	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=133,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:17,2:9,0:19,7,2,0
chr2	144193151	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=315,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.649:6:1,1:1,2:2,0,3,1
chr2	144525534	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=215,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:3,1:6,0,2,0
chr2	145155789	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr2	145156244	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=159,79;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:7,5:9,0:9,7,5,0
chr2	145156807	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=220,69;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:8,3,0,2
chr2	145274732	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=196,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:3,3:2,3:5,0,7,0
chr2	148674893	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=134,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:12,2:6,1:6,12,2,1
chr2	148701099	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,24;MFRL=178,74;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:0,0:0,1:0,6,1,1
chr2	148730342	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=134,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:7,2:12,1:10,9,1,2
chr2	148731002	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,160;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:10,12:8,0:6,12,12,0
chr2	148733548	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr2	149225934	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:8,1:17,2:16,9,0,3
chr2	149243260	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr2	149270523	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=168,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:4,0:10,4:2,12,2,2
chr2	149520214	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=195,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:1,4:1,8:2,0,7,5
chr2	149529043	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=192,113;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr2	149539325	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=168,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,13:0.273:49:20,6:16,7:15,21,5,8
chr2	149633149	.	C	CGGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,8;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.805:3:0,0:0,0:0,0,3,0
chr2	149639328	.	T	C	.	.	DP=440;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=198,104;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=1329.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,415:0.970:427:9,189:3,218:8,4,320,95
chr2	149853960	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	149861805	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=269,174;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	150064999	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=30,34;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150064999_T_G:150064999:0,1,0,1
chr2	150065002	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,33;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150064999_T_G:150064999:0,1,0,1
chr2	150065005	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=24,27;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150064999_T_G:150064999:0,1,0,1
chr2	150065009	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=30,30;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150064999_T_G:150064999:0,1,0,1
chr2	150065010	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=22,28;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150064999_T_G:150064999:0,1,0,1
chr2	150065012	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=29,34;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150064999_T_G:150064999:0,1,0,1
chr2	150065019	.	TT	GG	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150064999_T_G:150064999:0,0,0,1
chr2	150065026	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150064999_T_G:150064999:0,0,0,1
chr2	150069645	.	C	CGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=203,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GT;STR;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:3,3:4,3:2,5,3,3
chr2	150305703	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:1,1,0,3
chr2	150320627	.	TA	T,TAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25,26;MFRL=238,118,140;MMQ=60,60,60;MPOS=13,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=16.18,3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,9,2:0.623,0.187:13:1,4,1:1,5,1:1,1,11,0
chr2	150426399	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	150427516	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,4:3,4:3,0,8,0
chr2	150432377	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:6,10:1,5:3,4,3,12
chr2	150433128	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr2	150435889	.	C	CAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	150443689	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=83.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,7,16
chr2	151328284	.	GAA	G,GA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,19,19;MFRL=0,259,146;MMQ=60,60,60;MPOS=14,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.00,28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,12:0.192,0.759:15:0,1,2:0,0,3:0,0,0,15
chr2	151343988	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.849:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr2	151857799	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=197,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:7,4:7,2:9,5,4,2
chr2	151900223	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,10,3
chr2	151900390	.	TAAAAACAAAAAC	T,TAAAAAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31,30;MFRL=0,130,204;MMQ=60,60,60;MPOS=25,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,4,5;RU=AAAAAC;STR;TLOD=3.01,16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,4:0.219,0.675:5:0,0,2:0,1,2:0,0,0,5
chr2	152108261	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	152117780	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=169,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,5:7,5:7,3,9,1
chr2	152118338	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:2,4:5,1:1,6,0,5
chr2	152135270	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=266,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,2:2,2:7,0,4,0
chr2	152135514	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=175,270;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:0,8,0,2
chr2	152139271	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr2	152139493	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,4:5,1:2,4,1,4
chr2	152214352	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=147,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:152214352_A_T:152214352:0,2,0,1
chr2	152214359	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=147,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:152214352_A_T:152214352:0,2,0,1
chr2	152222567	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,0:6,3:9,6,0,3
chr2	152236045	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=11,30;MFRL=214,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.565:5:0,0:0,2:0,2,0,3
chr2	152267072	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.359:26:7,4:9,5:8,9,6,3
chr2	152267672	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	152267721	.	ATT	A,AT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,20,26;MFRL=195,91,147;MMQ=60,60,60;MPOS=24,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=5.76,24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,14:0.166,0.489:29:4,5,6:4,0,8:7,3,10,9
chr2	152267897	.	G	GT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.542:15:6,4:1,4:0|1:152267897_G_GT:152267897:0,7,0,8
chr2	152267919	.	TT	GG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=194,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,1:3,1:0|1:152267897_G_GT:152267897:0,13,0,2
chr2	152273503	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=228,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr2	152289767	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:1,4,0,4
chr2	152292169	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	152299824	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,3:4,0:3,8,3,0
chr2	152300262	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr2	152303171	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	152314547	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	152318713	.	TATC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=231,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,1:4,3:10,4,4,1
chr2	152342481	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=188,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr2	152348842	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=156,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:2,4,2,3
chr2	152349026	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=262,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:1,0,2,6
chr2	152349960	.	C	CACAATTTGTTCATGTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=229,231;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	152350462	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=274,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,3:5,1:1,5,0,4
chr2	152353395	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,0:4,3:8,1,2,1
chr2	152359276	.	AT	A,ATT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30,31;MFRL=177,153,101;MMQ=60,60,60;MPOS=21,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=20.48,8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,10,5:0.462,0.287:19:1,8,3:3,2,2:4,0,13,2
chr2	152374800	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=223,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,4:2,6:2,1,7,3
chr2	152382454	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,12,5
chr2	152383913	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=224,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:1,5:2,4:3,0,8,1
chr2	152388228	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,8,1
chr2	152388415	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:2,8:1,6:0,3,4,10
chr2	152394534	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=221,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.780:16:1,7:1,6:1,2,0,13
chr2	152403014	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	152404294	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=214,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,1:0,6:0,1,1,6
chr2	152410106	.	G	GACATGAAGGAAACTGAATT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:152410106_G_GACATGAAGGAAACTGAATT:152410106:0,0,0,1
chr2	152410108	.	C	CACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:152410106_G_GACATGAAGGAAACTGAATT:152410106:0,0,0,1
chr2	152417064	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,258;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr2	152417311	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=250,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,2:1,0:2,1,0,2
chr2	152421593	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=109,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:13,4:13,0:14,12,4,0
chr2	152424933	.	TA	T,TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,28,28;MFRL=167,165,236;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.59,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.334,0.247:9:1,1,1:1,2,1:0,4,2,3
chr2	152425692	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=196,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:3,0,4,0
chr2	152432886	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:0,1:5,2:1,4,0,3
chr2	152466728	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=246,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr2	152474001	.	A	AAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AG;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	152475938	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=156,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:4,2,3,0
chr2	152476028	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=160,80;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.332:13:4,1:5,3:0|1:152476028_C_G:152476028:4,5,3,1
chr2	152476050	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=161,88;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,6:0.280:23:9,6:8,0:1|0:152476028_C_G:152476028:11,6,6,0
chr2	152481977	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,3,0
chr2	152487574	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=336,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:1,1,5,0
chr2	152520395	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=245,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr2	152528985	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=182,72;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:12,0:6,3:10,8,2,1
chr2	152544786	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.282:23:8,6:8,0:11,6,6,0
chr2	152548656	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,246;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,2:7,0:3,10,0,2
chr2	152552062	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=210,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,3:1,6:1,0,6,3
chr2	152573902	.	A	AGGC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=178,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGC;STR;TLOD=60.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,8:1,7:1,0,10,5
chr2	152581866	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	152584153	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	152671599	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=189,64;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:10,0,2,0
chr2	152671754	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.379:11:4,2:3,2:3,4,2,2
chr2	152684704	.	A	AC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=107,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.477:22:5,1:7,6:3,9,3,7
chr2	152955550	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=185,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.587:15:3,4:3,5:1,5,3,6
chr2	152977337	.	A	AACTGGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=133,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,1,1
chr2	153000337	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:4,2,5,0
chr2	153004825	.	AAAG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:5,2:10,0:1,16,0,2
chr2	153192324	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=209,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr2	153378574	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=161,91;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,1:4,4:0,4,1,4
chr2	153415170	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	153415229	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.461:9:2,2:2,1:5,0,3,1
chr2	153415234	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=155,271;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr2	153415244	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=155,229;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,2:2,4:4,1,7,0
chr2	153415376	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:3,2,0,3
chr2	153417325	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr2	153464015	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.447:7:2,0:1,3:0|1:153464015_A_G:153464015:0,4,0,3
chr2	153464017	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.447:7:2,0:1,3:0|1:153464015_A_G:153464015:0,4,0,3
chr2	153464018	.	C	CATG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.402:8:2,0:1,3:0|1:153464015_A_G:153464015:0,5,0,3
chr2	153464020	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:0|1:153464015_A_G:153464015:0,4,0,3
chr2	153468187	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr2	153473521	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,2:1,5:0,1,7,0
chr2	153473794	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr2	153476066	.	G	GCCA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,0,13
chr2	153481943	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,13:0,9:0,0,10,13
chr2	153483257	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr2	153492910	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr2	153514583	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=218,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr2	153519524	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=195,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,7:1,4:1,0,10,1
chr2	153520782	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:4,4:0,8:1,3,5,7
chr2	153520819	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=202,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,2:0,3:0,3,0,5
chr2	153533260	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:12,1:3,1:4,11,1,1
chr2	153535670	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,11,10
chr2	153572438	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr2	153574145	.	TGG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=G;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr2	153577013	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=259,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:2,10:2,5:3,1,9,6
chr2	155099146	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=215,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr2	155099242	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=156,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,1:3,2:8,2,1,2
chr2	155115579	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=149,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:10,0:3,3:6,7,2,1
chr2	155252653	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=199,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr2	155265623	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr2	155295162	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,4:5,0:3,6,4,0
chr2	155306885	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,14,3
chr2	157182849	.	AA	TT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=168,127;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=45.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:6,0:8,12:5,9,0,12
chr2	157183211	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,6,2
chr2	157352734	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.334:22:5,2:9,5:7,8,2,5
chr2	157370018	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=183,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.445:8:2,0:2,3:2,3,1,2
chr2	157406296	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=117,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:4,1:16,7:4,16,2,6
chr2	157427593	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	157467106	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=228,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr2	158165004	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	158272233	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=141,72;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:20,4:20,0:17,23,3,1
chr2	158272578	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=188,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:11,0:10,5:5,16,5,0
chr2	158275111	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.860:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr2	158291107	.	TAG	T,TAGAG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,24,27;MFRL=195,117,155;MMQ=60,60,60;MPOS=13,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=AG;STR;TLOD=7.98,16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,6:0.240,0.433:15:2,0,3:3,4,0:4,1,8,2
chr2	158300586	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=211,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0,9,2,0
chr2	158390468	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=194,159;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,5:3,1:3,4,2,4
chr2	158395079	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr2	158400908	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:5,1,4,2
chr2	158401137	.	TG	CA,CG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31,30;MFRL=179,123,206;MMQ=60,60,60;MPOS=7,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.35,23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,8:0.166,0.501:15:2,0,3:3,2,5:2,3,4,6
chr2	158406601	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=148,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr2	158412542	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	158443889	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,1,9
chr2	158485075	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:5,2:5,4,1,2
chr2	158485076	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:4,5,2,1
chr2	158637136	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=130,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.453:11:3,5:1,0:0|1:158637136_GA_G:158637136:0,6,0,5
chr2	158637137	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,8:0,0:0,0,2,9
chr2	158637138	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=130,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.453:11:4,4:2,0:0|1:158637136_GA_G:158637136:0,6,0,5
chr2	158655883	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:0,5:1,2:1,0,7,0
chr2	158655984	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,3:10,0:10,8,0,3
chr2	158958461	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:158958461_T_G:158958461:3,0,1,0
chr2	158958471	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=161,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:158958461_T_G:158958461:2,0,1,0
chr2	158958551	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=175,283;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:4,7,1,1
chr2	158958605	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,3:5,1:2,5,2,2
chr2	158958679	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr2	158978178	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr2	158980230	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=184,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:3,4,2,0
chr2	159028800	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=190,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:0,1,0,6
chr2	159035344	.	A	ATT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=238,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=T;STR;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,1:2,3:3,1,4,0
chr2	159077019	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=194,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	159195225	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=201,282;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,5,1
chr2	159389727	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:11,0:8,4:11,8,0,4
chr2	159389762	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=193,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,4:6,3:8,5,4,3
chr2	159434802	.	ATC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=132,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TC;STR;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:2,4:3,3:0,5,2,5
chr2	159477439	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=T;STR;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:1,2:4,0,3,0
chr2	159498940	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	159499306	.	CAGGTA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=244,320;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0,3,0,1
chr2	159519368	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=165,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.263:32:6,7:18,1:22,2,6,2
chr2	159522879	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,4:5,0:7,2,2,2
chr2	159523058	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=220,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,1:7,1:4,7,0,2
chr2	159526461	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:8,2:8,5:4,12,2,5
chr2	159652035	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=196,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:1,11,0,2
chr2	159652059	.	AC	CT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:8,2:0|1:159652059_AC_CT:159652059:1,11,0,2
chr2	159652063	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:7,2:0|1:159652059_AC_CT:159652059:1,10,0,2
chr2	159672251	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=172,104;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.235:18:8,3:6,0:8,6,2,2
chr2	159672256	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:8,7,1,1
chr2	159683047	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=150,114;MMQ=50,42;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.377:6:2,0:0,1:0|1:159683047_G_A:159683047:2,2,1,1
chr2	159683050	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=113,114;MMQ=40,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:159683047_G_A:159683047:1,2,0,1
chr2	159954420	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=252,217;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	160005600	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=137,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,0:3,4:8,0,4,0
chr2	160019863	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,20:0,11:0,0,18,13
chr2	160032843	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr2	160042430	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:5,4:5,8:1,9,5,7
chr2	160055448	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,12,4
chr2	160074181	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,258;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,1:8,1:2,7,0,2
chr2	160082354	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=196,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,4:0,4,1,4
chr2	160084263	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=151,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	160084534	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=191,305;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	160085289	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=173,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,5:4,1:4,4,4,2
chr2	160086395	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=178,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,1:6,1:8,8,1,1
chr2	160086692	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.725:16:3,7:1,5:2,2,4,8
chr2	160087535	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=193,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,2:4,4:1,7,1,5
chr2	160092703	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=194,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:1,2:2,0:0,5,1,1
chr2	160116281	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,2:10,1:7,10,2,1
chr2	160132196	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,1:2,5:0,2,0,6
chr2	160176943	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=65.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,7,12
chr2	160181552	.	TATTA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:160181552_TATTA_T:160181552:0,0,0,1
chr2	160181561	.	T	TTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:160181552_TATTA_T:160181552:0,0,0,1
chr2	160182302	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=188,83;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:8,6:5,3:7,6,5,4
chr2	160203934	.	A	C,T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31,26;MFRL=0,175,183;MMQ=60,60,60;MPOS=14,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=15.55,4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,2:0.600,0.300:7:0,0,1:0,5,1:0,0,6,1
chr2	160231108	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr2	160241936	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=182,252;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,2:5,1:0,11,0,3
chr2	160243183	.	TA	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=202,288;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr2	160261387	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=194,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.278:15:5,0:6,3:5,6,3,1
chr2	160261568	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:10,1:8,2:8,10,1,2
chr2	160261721	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=302,187;MMQ=47,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	160261729	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	160287304	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=227,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:160287304_C_T:160287304:2,0,1,0
chr2	160287311	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=227,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:160287304_C_T:160287304:2,0,1,0
chr2	160289911	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=174,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr2	160294779	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=208,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr2	160295732	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=157,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.499:20:7,6:3,4:6,4,2,8
chr2	160585740	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=134,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr2	160599595	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:5,0:7,4:6,6,3,1
chr2	160605484	.	CTTTTCTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=187,127;MMQ=50,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:0,0:0,1:0|1:160605484_CTTTTCTTT_C:160605484:0,2,0,1
chr2	160605513	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=187,127;MMQ=50,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:160605484_CTTTTCTTT_C:160605484:0,2,0,1
chr2	160609162	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=194,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,1:2,1:0,8,0,2
chr2	160615943	.	AAAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	160634564	.	ACC	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=150,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,4:2,0:0,2,0,4
chr2	160634582	.	TAATATC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.812:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	160637324	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	160663435	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:8,0,2,0
chr2	160663678	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:1,2:6,6:0,7,4,4
chr2	160667004	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr2	160676427	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,4,9
chr2	160676445	.	A	AT,ATT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25,26;MFRL=0,136,168;MMQ=60,60,60;MPOS=11,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,7,8;RU=T;STR;TLOD=6.59,10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,5:0.367,0.550:8:0,2,1:0,1,3:0,0,0,8
chr2	160688351	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=90,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr2	160691978	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=201,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:2,2,2,2
chr2	160698700	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=200,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr2	160708645	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=219,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,1,2
chr2	160708933	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=194,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.559:9:0,2:2,1:0,4,0,5
chr2	160711556	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr2	160714990	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=140,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,0:4,2:1,4,1,1
chr2	160729134	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr2	160729186	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr2	160737495	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	160737560	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr2	160738721	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:11,7,0,2
chr2	160742862	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:7,0,3,1
chr2	160746800	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,3:6,3:6,6,2,4
chr2	160833354	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=210,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:160833354_T_C:160833354:0,3,0,1
chr2	160833363	.	C	CAGGTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=210,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:0|1:160833354_T_C:160833354:0,3,0,1
chr2	160840370	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr2	160843623	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.442:16:4,1:4,5:7,2,5,2
chr2	160862094	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=208,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:2,2:3,1:5,1,3,0
chr2	160873270	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:0,7,1,4
chr2	160873294	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=176,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr2	160876827	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=207,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr2	160889673	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=113,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:1,3,0,5
chr2	160958145	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=234,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr2	160958349	.	GAA	G,GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,215,178;MMQ=60,60,60;MPOS=24,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.04,19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,9:0.212,0.724:11:0,2,4:0,0,5:0,0,3,8
chr2	160968743	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,7:3,3:4,1,0,10
chr2	160994180	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:8,7,2,0
chr2	161028992	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=188,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,6:2,1:4,0,7,0
chr2	161135000	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=181,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:6,12:7,5:13,0,14,3
chr2	161169828	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=226,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,1,2
chr2	161223688	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=171,238;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.227:12:4,1:6,1:8,2,2,0
chr2	162059969	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=145,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:2,1:14,4:9,7,4,1
chr2	162080591	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=192,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:0|1:162080591_CA_C:162080591:0,10,0,2
chr2	162080599	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,2:0.213:12:7,1:3,1:1|0:162080591_CA_C:162080591:0,10,0,2
chr2	162081128	.	AT	A,ATT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29,31;MFRL=171,177,191;MMQ=60,60,60;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=10.72,4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,3:0.330,0.219:16:5,4,1:1,2,1:6,1,7,2
chr2	162091836	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=166,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:9,5:13,1:13,9,5,1
chr2	162175290	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,10:0,5:0,0,13,2
chr2	162224193	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=195,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.774:11:0,5:2,4:2,0,3,6
chr2	162224495	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=168,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,0:5,3:0,6,0,3
chr2	162247772	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=213,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,3:1,4:0,2,1,6
chr2	162265270	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,2,2
chr2	162280748	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:0,0:1,3:0,1,3,2
chr2	162280752	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,12;MFRL=180,310;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,0:1,0:0,1,2,1
chr2	162661056	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=173,148;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,4:8,0:4,10,4,0
chr2	162799267	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=286,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr2	162813807	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=163,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr2	162865838	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=195,260;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:14,0:8,5:4,18,0,5
chr2	162868303	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=167,167;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,16:0.362:45:10,16:18,0:20,9,16,0
chr2	162873188	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	162873410	.	A	ATTTT	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=26,21;MFRL=153,129731968;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:6,0:0|1:162873410_A_ATTTT:162873410:2,9,0,2
chr2	162873411	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=153,129731968;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:162873410_A_ATTTT:162873410:2,9,0,2
chr2	162873413	.	ATG	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=153,129731968;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:162873410_A_ATTTT:162873410:2,9,0,2
chr2	162873421	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=157,129731968;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,2:3,0:0|1:162873410_A_ATTTT:162873410:2,10,0,2
chr2	162873423	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,23;MFRL=163,129731968;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:162873410_A_ATTTT:162873410:2,8,0,2
chr2	162876828	.	CA	TT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=10,28;MFRL=159,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.309:8:0,2:1,0:5,1,1,1
chr2	162877041	.	CA	C,CAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32,24;MFRL=146,175,123;MMQ=60,60,60;MPOS=21,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=6.56,6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,4,6:0.188,0.265:22:5,1,4:7,3,0:9,3,6,4
chr2	162881513	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	162890175	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=59,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.874:13:0,5:1,7:0,1,1,11
chr2	162891848	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr2	162894766	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=136,255;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,1:8,2:8,4,3,0
chr2	163030336	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,1:2,6:3,3,4,3
chr2	163076254	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=226,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr2	163080245	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:0,8,1,2
chr2	163144899	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=154,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:0,2,1,6
chr2	163374254	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=189,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:4,7,2,0
chr2	163694878	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=251,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:0|1:163694878_C_G:163694878:3,0,6,0
chr2	163694886	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=251,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:0|1:163694878_C_G:163694878:3,0,7,0
chr2	164466039	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=197,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr2	164468328	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,1:10,1:4,10,0,2
chr2	164468360	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=142,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:0,7,1,4
chr2	165349459	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=286,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr2	165358672	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr2	165381580	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=45.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.405:40:7,0:17,16:7,17,0,16
chr2	165383686	.	AATATATATATATATATAT	A,AAT,AATAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25,27,28;MFRL=0,233,250,225;MMQ=60,60,60,60;MPOS=32,30,26;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=22,13,14,15;RU=AT;STR;TLOD=8.24,4.69,4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,3,2,3:0.342,0.253,0.328:8:0,2,1,1:0,1,1,2:0,0,0,8
chr2	165560236	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=142,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,1:6,1:3,13,0,2
chr2	165578581	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=246,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.761:19:1,7:3,7:4,0,10,5
chr2	165579065	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=194,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,2:6,2:7,5,1,3
chr2	165584407	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=193,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr2	165586652	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=179,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,1:4,1:3,5,1,1
chr2	165630100	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	165636332	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=201,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr2	165793968	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr2	165809138	.	ATG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=192,263;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:3,1:1,2:2,2,1,2
chr2	165811653	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,295;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:18,5:7,0:18,7,5,0
chr2	165946623	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:165946623_TA_T:165946623:0,0,1,0
chr2	165946631	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:165946623_TA_T:165946623:0,0,1,0
chr2	165971883	.	AT	A,ATT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30,29;MFRL=204,210,207;MMQ=60,60,60;MPOS=19,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.16,9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,6:0.169,0.397:16:3,1,3:4,2,3:7,0,9,0
chr2	166003573	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=266,234;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:0,2,0,3
chr2	166012203	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	166018764	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=194,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:4,3:0,0:3,2,2,1
chr2	166153499	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,8:0,0,17,5
chr2	166170073	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=167,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:1,2:2,8:3,0,9,1
chr2	166170080	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=183,243;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:3,1:9,1:12,0,1,1
chr2	166170127	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,8:0,0,11,6
chr2	166172317	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	166179650	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr2	166221569	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=273,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.787:7:0,2:0,4:1,0,6,0
chr2	166229922	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	166514594	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=160,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,1:1,4:0,3,0,6
chr2	166535640	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=187,4680716;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:6,0:8,7,2,0
chr2	166616096	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,1:5,2:2,9,1,2
chr2	166621354	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=46.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr2	166626606	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr2	166740578	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=201,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:2,5:1,2:0,3,2,5
chr2	166747444	.	AGT	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=120,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:14,0:4,2:0|1:166747444_AGT_A:166747444:8,11,1,1
chr2	166747449	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=120,62;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:13,0:4,1:0|1:166747444_AGT_A:166747444:8,9,1,1
chr2	166756257	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=47.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.454:38:10,17:8,0:15,6,17,0
chr2	166758447	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,275;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.327:13:2,1:4,3:1,8,0,4
chr2	166770120	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=174,183;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:3,2:6,4:5,4,4,2
chr2	166771663	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,1:7,3:10,2,3,1
chr2	166781242	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:5,2:6,1:1,10,1,2
chr2	166786973	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	166788336	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,7:0,14:0,0,13,8
chr2	166797450	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=71,272;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,4,0
chr2	166799893	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr2	166810161	.	G	GCCCGCTCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CCCGCTCA;STR;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.797:6:1,2:0,1:1,0,4,1
chr2	166848349	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=191,751817;MMQ=60,46;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:6,5,2,0
chr2	166848612	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,183;MMQ=58,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:14,3:14,0:15,13,3,0
chr2	166859002	.	A	AAAT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=211,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.279:12:2,3:7,0:0|1:166859002_A_AAAT:166859002:6,3,2,1
chr2	166859004	.	C	CATGAAGATGGGAAAAAAATAGCA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=211,56;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.275:12:2,3:7,0:0|1:166859002_A_AAAT:166859002:6,3,2,1
chr2	166892712	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.268:39:16,10:13,0:10,19,10,0
chr2	166893081	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=189,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr2	166895913	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32,34;MFRL=183,145,106;MMQ=60,60,60;MPOS=16,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,15;RU=T;STR;TLOD=7.12,3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,3:0.476,0.350:9:0,2,2:0,3,1:0,1,8,0
chr2	166896143	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:3,5,0,5
chr2	166896178	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:1,5,0,6
chr2	166897989	.	GAAAA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=12,32;MFRL=238,257;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.217:7:0,0:1,1:1,5,0,1
chr2	166898717	.	CCCAACTCACAAATATATTTGTTTGAAATGAGACAATATAAGTTTGGTGAAAATAATTGAAACGAAAATAGAATTTGTTA	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=186,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.122:24:5,0:3,2:15,6,1,2
chr2	166898740	.	TGAAATGAGACAATATAAGTTTGGTGAAAATAATTGAAACGAAAATAGAATTTGTTACCAACCTTCTACTGTATTTGTTA	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=194,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.191:27:2,4:4,1:13,8,4,2
chr2	166901897	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=169,257;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	166903188	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=268,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr2	166903228	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=286,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,1:1,1:2,4,2,0
chr2	166903445	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:4,4:1,4,3,4
chr2	166905375	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=160,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,4:5,2:7,3,3,3
chr2	166905480	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=165,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:3,3,2,2
chr2	166905572	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=259,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr2	166909477	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=144,116;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:10,0:11,3:7,14,0,3
chr2	166909544	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=194,173;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,3:6,3:6,5,4,2
chr2	166930214	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	167055313	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:13,0:13,5:13,13,0,5
chr2	167060449	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=182,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,2:5,1:3,2,2,1
chr2	167060517	.	G	GAA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=155,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:5,2:0|1:167060517_G_GAA:167060517:6,4,1,1
chr2	167060521	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=153,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:167060517_G_GAA:167060517:7,4,1,1
chr2	167060980	.	GAAAC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=254,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAC;STR;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:1,2:1,1:0,3,1,2
chr2	167085124	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=187,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr2	167085141	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=126,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,3:0,1:3,0,3,1
chr2	167090042	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=205,236;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr2	167137119	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=242,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:0|1:167137119_G_A:167137119:0,6,2,3
chr2	167137120	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=149,256;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,5:0.461:11:2,2:4,3:1|0:167137119_G_A:167137119:2,4,0,5
chr2	167145212	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=277,114;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,0:3,3:0,7,0,3
chr2	167149693	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,5,0
chr2	167160658	.	AGT	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=191,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:8,0:5,3:0|1:167160658_AGT_A:167160658:6,8,0,3
chr2	167160661	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=191,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:9,0:5,3:0|1:167160658_AGT_A:167160658:6,8,0,3
chr2	167160664	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=197,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:9,0:4,3:0|1:167160658_AGT_A:167160658:6,9,0,3
chr2	167160674	.	CAAACGAACAAAGA	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=181,87;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:9,0:5,2:0|1:167160658_AGT_A:167160658:7,9,0,3
chr2	167162277	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr2	167163199	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	167163372	.	TC	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=142,273;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,1,1
chr2	167163663	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr2	167299920	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=156,117;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,4:3,0:6,0,4,0
chr2	167327064	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:5,1,4,0
chr2	167328750	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=136,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0|1:167328750_C_T:167328750:1,0,6,0
chr2	167328754	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=178,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0|1:167328750_C_T:167328750:4,0,4,0
chr2	167334234	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=181,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,1:3,4:1,8,2,3
chr2	167759948	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	167760451	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=129,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr2	168041152	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=152,89;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,3:8,0:3,13,1,2
chr2	168096268	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,5:1,1:2,0,6,0
chr2	168098199	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=271,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	168099738	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=179,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:4,4,1,1
chr2	168099775	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:168099775_C_G:168099775:5,6,1,1
chr2	168099796	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=178,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.399:13:3,5:5,0:0|1:168099775_C_G:168099775:3,5,2,3
chr2	168100610	.	AA	GG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=153,118;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,3:7,0:12,8,3,0
chr2	168103304	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:10,4:6,1:6,10,1,4
chr2	168103863	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=241,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:8,5:2,3:6,4,4,4
chr2	168104199	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:4,4,0,4
chr2	168104370	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=140,80;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:11,6:5,4:8,8,5,5
chr2	168104627	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.344:24:9,3:7,5:8,8,3,5
chr2	168104988	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=200,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:7,2:8,3:9,6,5,0
chr2	168106085	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,1:7,3:5,8,2,2
chr2	168106246	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,1:6,2:7,3,2,1
chr2	168106423	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:9,8:9,0:10,8,8,0
chr2	168106885	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=155,104;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:8,0:10,5:7,11,0,5
chr2	168107491	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.297:25:9,1:8,6:10,8,2,5
chr2	168108357	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=164,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,1:6,2:3,8,2,1
chr2	168115769	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:5,4:5,2:8,3,3,3
chr2	168115797	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=187,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.330:16:9,3:2,2:5,6,2,3
chr2	168116187	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=196,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,2:6,1:0|1:168116187_C_A:168116187:6,6,2,1
chr2	168116189	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=196,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,2:5,1:0|1:168116187_C_A:168116187:6,6,2,1
chr2	168116318	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=196,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.570:5:1,1:1,1:0,2,0,3
chr2	168920066	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:6,3:22,0:14,14,3,0
chr2	168931467	.	TAATA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=157,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AATA;STR;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.377:11:3,2:2,2:5,2,3,1
chr2	168986154	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=111.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,12:0,18:0,0,17,14
chr2	168986188	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=143,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:10,0:18,4:13,15,0,4
chr2	168986376	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	168996775	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=244,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:6,1,2,2
chr2	168997097	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr2	169487610	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.777:11:0,3:2,6:1,1,0,9
chr2	169622332	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=145,291;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr2	169681278	.	T	TTTTGTTTG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=135,256;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=TTTG;STR;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,1:1,1:0,1,1,4
chr2	169699644	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=197,114;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:3,0:9,4:2,10,0,4
chr2	169716114	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,2:9,1:10,9,2,1
chr2	169721377	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=150,195;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0|1:169721377_G_A:169721377:1,3,3,1
chr2	169721381	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=174,178;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0|1:169721377_G_A:169721377:3,3,1,1
chr2	169727879	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	169728069	.	GAAA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=116,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:0,1:3,1:2,3,2,1
chr2	169763148	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr2	169780366	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,266;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,2,1
chr2	169783565	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=200,317;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:0|1:169783565_T_G:169783565:7,0,3,0
chr2	169783567	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=200,317;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,0:5,1:0|1:169783565_T_G:169783565:7,0,3,0
chr2	169801488	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,6:6,3:5,7,3,6
chr2	169824964	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.188:28:7,0:16,4:10,13,0,5
chr2	169824988	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=134,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:5,0:20,3:7,18,0,3
chr2	169825992	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:11,7,2,0
chr2	169828277	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=180,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr2	169828325	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=209,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:5,9:3,5:4,4,10,4
chr2	169828410	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,2:8,0:0|1:169828410_C_G:169828410:10,10,0,2
chr2	169828412	.	AT	GG	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:8,0:0|1:169828410_C_G:169828410:10,10,0,2
chr2	169830155	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,276;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,0:4,5:6,0,5,0
chr2	169830443	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=215,266;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	169836321	.	G	GGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.623:3:1,1:0,1:0|1:169836321_G_GGC:169836321:1,0,2,0
chr2	169836326	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0|1:169836321_G_GGC:169836321:0,0,3,0
chr2	169842809	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=120,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,0,5
chr2	169853073	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,202;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,4:1,0:7,0,4,0
chr2	169870753	.	CA	GG	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=159,126;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:9,5:17,0:16,10,5,0
chr2	169873205	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:7,4:4,4:8,3,8,0
chr2	169873241	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:10,0:15,8,1,1
chr2	169874712	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=148,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr2	169994021	.	AAG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=178,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:1,2:0,4,1,2
chr2	170009390	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=170,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:13,1:8,3:8,13,4,0
chr2	170022389	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=208,101;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,3:1,0:7,0,3,0
chr2	170025198	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:1,1:6,1:2,5,0,2
chr2	170050472	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr2	170053580	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=206,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr2	170055255	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=188,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:2,2,3,2
chr2	170059190	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=216,130;MMQ=60,49;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,1:7,7:9,1,8,0
chr2	170077170	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=199,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr2	170082013	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=297,251;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	170088351	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=164,106;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:4,5:10,4:7,7,3,6
chr2	170089824	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=222,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:6,0,3,0
chr2	170092395	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:2,1:3,3:2,4,3,1
chr2	170096095	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,3:3,1:4,5,2,2
chr2	170096291	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=106,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:3,0:7,3:2,8,1,2
chr2	170099446	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=200,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:3,3,2,2
chr2	170099473	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:5,3,3,3
chr2	170099895	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=197,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.638:9:1,3:1,3:0|1:170099895_A_C:170099895:1,2,6,0
chr2	170099899	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=197,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:0|1:170099895_A_C:170099895:1,2,6,0
chr2	170100011	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,270;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,1:4,1:8,5,1,1
chr2	170101156	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=128,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr2	170104104	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=285,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	170115807	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=184,68487256;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:0|1:170115807_T_A:170115807:0,6,0,2
chr2	170115809	.	T	TCCCTAGGTATA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=184,68487256;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:170115807_T_A:170115807:0,6,0,2
chr2	170129636	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=117,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr2	170134191	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	170139346	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=169,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr2	170148682	.	TAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=184,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=A;STR;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr2	170151250	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:3,0:0,1:2,3,0,1
chr2	170163743	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=123,73;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,3:5,0:3,7,2,1
chr2	170175473	.	G	GGCAAATAGTTAGCACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	170218816	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr2	170218847	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,6,8
chr2	170336024	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=54.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr2	170344193	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr2	170355912	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=374,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr2	170355944	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=152,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,4:0,5:2,0,9,0
chr2	170371073	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=107,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:5,2:7,3,2,0
chr2	170371545	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=160,156;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.329:12:3,2:3,0:0,8,0,4
chr2	170386294	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr2	170394487	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=171,282;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:2,3:8,1:6,4,1,3
chr2	170402752	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=174,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,1,1
chr2	170417368	.	TTTTTTGTA	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,30;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170417368_TTTTTTGTA_T:170417368:0,0,0,1
chr2	170417379	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,30;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170417368_TTTTTTGTA_T:170417368:0,0,0,1
chr2	170417381	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,30;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170417368_TTTTTTGTA_T:170417368:0,0,0,1
chr2	170417385	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,228;MMQ=60,30;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170417368_TTTTTTGTA_T:170417368:0,0,0,1
chr2	170441001	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:6,1:11,2:6,11,3,1
chr2	170460846	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=227,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:170460846_T_G:170460846:0,2,0,1
chr2	170460858	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=227,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:170460846_T_G:170460846:0,2,0,1
chr2	170463547	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=160,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,2:6,1:0|1:170463547_T_C:170463547:5,3,2,1
chr2	170463551	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=90,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,3:0.332:10:3,1:4,2:1|0:170463547_T_C:170463547:4,3,2,1
chr2	170488454	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=195,219;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr2	170492567	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=97,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,1:2,6:2,1,5,2
chr2	170492584	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.721:16:1,4:3,7:3,1,4,8
chr2	170493234	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=175,158;MMQ=60,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:9,0:14,4:10,13,4,0
chr2	170505684	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=131,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:8,1:5,4:8,5,4,1
chr2	170531572	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.525:17:5,3:3,6:2,6,4,5
chr2	170531614	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr2	170550727	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=194,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.348:18:5,4:7,2:6,6,4,2
chr2	170632896	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=128,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:5,5,2,0
chr2	170632960	.	C	CA,CAA	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=31,32,31;MFRL=124,147,100;MMQ=60,60,60;MPOS=16,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,9,10;RU=A;STR;TLOD=19.80,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,12,4:0.491,0.167:24:3,6,2:5,5,1:3,5,9,7
chr2	170632969	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=116,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.771:24:2,10:3,9:2,3,10,9
chr2	170633001	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=122,297;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,2:13,0:10,9,1,1
chr2	170633023	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=23,28;MFRL=116,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.714:15:1,6:3,5:3,1,3,8
chr2	170633067	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=118,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,5:2,1:0,2,0,6
chr2	170633103	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	170665108	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr2	170668106	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr2	170668813	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr2	170671883	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=166,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:7,10:3,0:10,0,10,0
chr2	170676227	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr2	170677805	.	A	ACACACACACACACACACACACAC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=171,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.291:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr2	170677855	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	170732524	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	170762487	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,2:0,4:0,0,5,2
chr2	170782037	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	170782338	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=265,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr2	170783092	.	CAAAAACA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=240,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAAACA;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.516:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	170783769	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=385,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr2	170804033	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=159,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,2:7,2:8,3,4,0
chr2	170804306	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=205,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr2	170850738	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	170871976	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	170917544	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:7,1,7,1
chr2	170917983	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.904:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	170938410	.	C	CCAATTGCCTATCAGA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,2:4,1:2,10,0,3
chr2	171055942	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=111,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,1:0,1:0,2,0,3
chr2	171056569	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=252,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr2	171070810	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=242,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:2,0:8,3:10,0,3,0
chr2	171070850	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=161,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.460:24:7,3:6,8:9,4,10,1
chr2	171092445	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=208,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.734:9:0,4:2,3:2,0,6,1
chr2	171225841	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,4:7,6:5,7,5,5
chr2	171239560	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:5,1,2,1
chr2	171256597	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=220,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr2	171260708	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr2	171260787	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,10,13
chr2	171260797	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=151,124;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:12,2:7,4:7,13,4,2
chr2	171260803	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:16,0:8,4:12,12,0,4
chr2	171260820	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,16:0,9:0,0,11,14
chr2	171300575	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:0,4,1,7
chr2	171319996	.	AAG	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=140,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,2:2,0:0|1:171319996_AAG_A:171319996:2,5,1,1
chr2	171319997	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:1,4:1,1:0,2,2,3
chr2	171319999	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=140,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:171319996_AAG_A:171319996:2,5,1,1
chr2	171320002	.	TG	CA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=140,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:1,0:0|1:171319996_AAG_A:171319996:2,6,1,1
chr2	171323280	.	CTGTGTCCTAAGAT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:3,2:4,3:0,9,1,4
chr2	171358211	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr2	171358474	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	171371350	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=201,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=37.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,13:3,0:6,0,13,0
chr2	171399309	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=214,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr2	171503330	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=197,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,4,1
chr2	171508056	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,1:1,5:3,0,6,0
chr2	171508262	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,3:3,2:2,7,2,3
chr2	171508490	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	171570488	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=261,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,3:0,4:1,3,4,3
chr2	171573185	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=232,240;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr2	171654663	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=93,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr2	171702480	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:13,4:5,3:10,8,3,4
chr2	171710537	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:9,2:6,0:5,11,2,0
chr2	171786169	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	171786239	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=223,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.629:25:2,13:7,3:6,3,8,8
chr2	171793253	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=174,148;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr2	171818289	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr2	171822466	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0,0,7,12
chr2	171822576	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=134,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:12,1:10,4:8,14,4,1
chr2	171850200	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=179,221;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:171850200_AG_A:171850200:2,0,1,0
chr2	171850207	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=191,221;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:171850200_AG_A:171850200:3,0,1,0
chr2	171850212	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=195,221;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:171850200_AG_A:171850200:4,0,1,0
chr2	171850329	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=103,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:13,1:5,2:8,10,2,1
chr2	171862578	.	TA	T,TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27,28;MFRL=243,157,229;MMQ=60,60,60;MPOS=9,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.55,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.248,0.248:9:2,1,2:3,1,0:5,0,4,0
chr2	171902604	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	171902653	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.251:17:6,3:6,0:11,2,4,0
chr2	171902955	.	TGAA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=187,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0|1:171902955_TGAA_T:171902955:0,4,1,1
chr2	171902959	.	A	ATT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=198,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0|1:171902955_TGAA_T:171902955:0,3,1,1
chr2	171906469	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.433:16:5,3:3,4:3,6,1,6
chr2	171911713	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=21,26,18;MFRL=181,110,115;MMQ=60,60,60;MPOS=18,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,17;RU=A;STR;TLOD=8.53,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,4,3:0.176,0.202:18:3,1,0:3,1,0:1,10,0,7
chr2	171912911	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=165,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr2	171916371	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=212,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr2	172016717	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=249,280;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:172016717_G_T:172016717:2,0,2,0
chr2	172016727	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=232,239;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	172016729	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=239,239;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:172016717_G_T:172016717:3,0,1,0
chr2	172182292	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,247;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:16,1:8,2:14,10,2,1
chr2	172188368	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=115,243;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:14,3:3,3:10,7,1,5
chr2	172305177	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr2	172309653	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=154,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:17,4:4,0:12,10,4,0
chr2	172378818	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,6:3,4:1,4,4,6
chr2	172378889	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=209,265;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.548:7:1,2:2,2:0|1:172378889_C_G:172378889:0,3,2,2
chr2	172378893	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=209,265;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,2:0,2:0|1:172378889_C_G:172378889:0,3,2,2
chr2	172379686	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=146,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:5,0,3,3
chr2	172398311	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=224,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.617:16:1,5:4,4:2,4,4,6
chr2	172549248	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=90.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,11:0,16:0,0,19,8
chr2	172582104	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=140,0;MMQ=60,44;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.175:28:15,3:8,1:22,1,0,5
chr2	172582108	.	GTT	G,GTTT	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=30,35,35;MFRL=55,155,151;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=T;STR;TLOD=3.55,16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,3,10:0.124,0.393:25:4,2,5:2,1,3:2,10,13,0
chr2	172582125	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=55,155;MMQ=59,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.388:33:8,2:8,1:3,17,13,0
chr2	172582136	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=138,0;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,3:12,0:10,16,0,3
chr2	172582281	.	A	ATTAC	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=88.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.960:20:0,14:0,6:0,0,2,18
chr2	172582344	.	AAC	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=217,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr2	172600716	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=144,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,1,4
chr2	172644229	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=61.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,11,6
chr2	172647907	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=175,85;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,2:6,0:13,1,2,0
chr2	172671619	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=149,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:13,1:11,1:17,7,2,0
chr2	172683461	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=228,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.532:9:0,1:3,4:0|1:172683461_C_CA:172683461:0,4,1,4
chr2	172683481	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=213,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.601:8:0,1:3,4:0|1:172683461_C_CA:172683461:0,3,1,4
chr2	172690418	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=149,235;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,1:1,1:6,1,1,1
chr2	172693780	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=194,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,5:4,2:3,3,2,5
chr2	172712433	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=166,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:9,3:3,0:3,9,2,1
chr2	172712480	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr2	172865009	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=203,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,8:1,0:0,1,1,9
chr2	172942448	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=222,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr2	172943886	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=187,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.592:10:4,1:0,5:2,2,5,1
chr2	172945107	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:14,4:13,2:12,15,2,4
chr2	173344474	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:9,3:10,7:7,12,6,4
chr2	173354339	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=146,109;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.250:34:8,0:18,8:9,17,0,8
chr2	173368989	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=138,244;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:7,2:12,0:7,15,0,3
chr2	173369000	.	A	AT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=172,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.342:28:9,3:8,7:4,14,3,7
chr2	173428874	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:1,4,0,5
chr2	173451163	.	C	CATTCCATTCCATTCGATT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,20;MFRL=147,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.319:4:1,1:2,0:0|1:173451163_C_CATTCCATTCCATTCGATT:173451163:0,3,0,1
chr2	173451168	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=147,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:173451163_C_CATTCCATTCCATTCGATT:173451163:0,3,0,1
chr2	173600783	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	173659913	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,6,7
chr2	173662238	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,3:3,0:7,1,2,1
chr2	173662354	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,5:2,2:0,8,2,5
chr2	173848200	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:2,2:2,0:5,0,1,1
chr2	173861340	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=220,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,6:2,5:0,3,1,10
chr2	173913258	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,7:6,2:9,3,6,3
chr2	173913309	.	T	TC	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:13,2:11,0:0|1:173913309_T_TC:173913309:16,8,0,2
chr2	173913315	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,1:12,0:0|1:173913309_T_TC:173913309:17,10,0,2
chr2	174055731	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=189,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,4:3,2:4,7,3,3
chr2	174074407	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=134,251;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,3:2,5:4,1,8,0
chr2	174094345	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	174094500	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=107,217;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:3,1:4,3:2,6,1,3
chr2	174230153	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.667:16:4,7:1,4:0|1:174230153_C_G:174230153:5,0,8,3
chr2	174230162	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,1:4,1:0|1:174230153_C_G:174230153:15,1,0,2
chr2	174230974	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,2:9,1:12,1,3,0
chr2	174230983	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=206,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.731:13:2,3:1,7:3,0,9,1
chr2	174232076	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=179,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:2,5,1,4
chr2	174774753	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.127:21:10,0:9,2:7,12,1,1
chr2	174777699	.	ATC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=167,282;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	174783338	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=133,101;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.134:28:18,3:6,0:9,16,3,0
chr2	174943876	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=153,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:1,8,0,4
chr2	174946001	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:2,9,1,1
chr2	175093978	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:3,3:4,3:3,4,6,1
chr2	175213540	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=181,114;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,3:7,0:6,9,3,0
chr2	175264627	.	CTT	C,CT	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,34,35;MFRL=167,189,160;MMQ=60,60,60;MPOS=12,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=4.21,4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,2:0.360,0.289:8:0,3,2:3,0,0:3,0,5,0
chr2	175264647	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=80,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:3,0:3,1:7,5,3,0
chr2	175264649	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:5,0:0|1:175264649_G_T:175264649:8,5,2,0
chr2	175264662	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:5,0:0|1:175264649_G_T:175264649:6,7,2,0
chr2	175264668	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=35,15;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:7,0:0|1:175264649_G_T:175264649:7,8,2,0
chr2	175300997	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:6,1:12,2:12,7,1,2
chr2	175310003	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=258,252;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	175318387	.	CAAAAAAAAGA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=106,227;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.600:4:0,2:0,1:0,1,3,0
chr2	175326258	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:7,5:8,0:9,6,3,2
chr2	175335076	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	175427243	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=139,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:17,0:7,2:15,10,0,2
chr2	175431707	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:3,0,4,0
chr2	175436580	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,133;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,10:0.256:40:10,9:20,0:10,20,10,0
chr2	175439512	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr2	175439536	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=144,252;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,1:5,2:13,2,3,0
chr2	175439681	.	TA	T,TAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,28,30;MFRL=97,173,144;MMQ=60,60,60;MPOS=22,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=13.42,7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,8,5:0.319,0.253:22:2,5,0:6,3,5:2,7,4,9
chr2	175613059	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=232,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	175613600	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	175614908	.	CAA	C,CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34,33;MFRL=0,173,208;MMQ=60,60,60;MPOS=25,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=4.46,3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.308,0.562:5:0,1,1:0,1,1:0,0,0,5
chr2	175622788	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,14:0,5:0,0,7,12
chr2	175624107	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=132,272;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:6,0:5,4:8,7,1,3
chr2	175629021	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:9,0:4,7:9,4,4,3
chr2	175677022	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=179,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:11,8:3,1:8,6,6,3
chr2	175677111	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=214,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,0:6,3:8,9,1,2
chr2	175689342	.	C	CTATA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=280,268;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=TA;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr2	175742915	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr2	175957450	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	175982957	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:6,2:8,2:11,4,3,1
chr2	175994967	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=137,255;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:10,2:2,4:5,7,2,4
chr2	176032377	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:22,0:10,3:12,20,0,3
chr2	176044008	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,232;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:8,1:4,3:2,10,0,4
chr2	176947237	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:2,3,0,3
chr2	176964947	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,246;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:4,3,4,1
chr2	176983598	.	CAAAACCAAAACA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=231,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.505:8:2,0:2,4:4,0,3,1
chr2	176988290	.	C	CGCA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=175,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GCA;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,3:5,0:2,8,0,3
chr2	176996015	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=230,295;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:0|1:176996015_TC_T:176996015:4,0,1,1
chr2	176996023	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=252,309;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,5:0.537:9:3,3:1,2:1|0:176996015_TC_T:176996015:3,1,5,0
chr2	177014970	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:2,3:5,2:7,0,4,3
chr2	177033779	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,3,1
chr2	177036531	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:4,6,1,1
chr2	177054411	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:4,4:3,3:3,5,0,7
chr2	177054769	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=174,132;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:5,10:5,4:5,5,2,12
chr2	178129390	.	TGGC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=198,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr2	178301428	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr2	178326838	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0|1:178326838_C_G:178326838:0,0,0,7
chr2	178326847	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=140,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:1,3:0|1:178326838_C_G:178326838:0,3,0,3
chr2	178357852	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.451:7:4,0:0,3:3,1,3,0
chr2	178362572	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr2	178364464	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=174,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:178364464_G_T:178364464:3,13,1,1
chr2	178364472	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=178,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:11,2:0|1:178364464_G_T:178364464:3,13,1,1
chr2	178364475	.	AT	TG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=178,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:10,2:0|1:178364464_G_T:178364464:3,14,1,1
chr2	178364478	.	A	ATTTC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=178,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,1:0|1:178364464_G_T:178364464:3,13,1,1
chr2	178378452	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,234;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr2	178402786	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=138,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:7,6:6,6:9,4,9,3
chr2	178417540	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:19,4:22,0:23,18,4,0
chr2	178417609	.	A	T	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=158,121;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,8:0.140:62:31,0:23,8:20,34,0,8
chr2	178417835	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	178494173	.	G	GGGA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGA;STR;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,3:4,8:4,4,9,3
chr2	178528703	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=188,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:4,7:1,4:3,2,3,8
chr2	178534110	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=223,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr2	178534324	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=239,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	178540293	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:6,2,1,5
chr2	178540366	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=202,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:7,0:12,6:8,11,0,6
chr2	178545713	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	178565775	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=224,337;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr2	178565815	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,10,6
chr2	178681534	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=189,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.649:18:3,6:3,6:6,0,9,3
chr2	178681716	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=210,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,1:0,4:0,2,0,5
chr2	178682558	.	A	ATATAAAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=220,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr2	178684878	.	A	AAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=189,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:0|1:178684878_A_AAG:178684878:5,1,4,0
chr2	178684879	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=189,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:0|1:178684878_A_AAG:178684878:5,1,4,0
chr2	178684921	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,5:5,5:6,3,7,3
chr2	178685129	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=223,326;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	178764364	.	A	AAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=AT;STR;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr2	178769992	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	178936614	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,7:0,0,11,6
chr2	178937048	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.151:44:15,6:23,0:21,17,6,0
chr2	178969206	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:2,4,1,1
chr2	178977620	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=248,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr2	178988219	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=184,251;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:7,1:6,7,2,0
chr2	178990447	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=101,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:7,1:5,2:8,4,1,2
chr2	178990941	.	CAT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:4,2:1,3:0,5,2,3
chr2	179200947	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=198,244;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr2	179208974	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.184:34:14,5:12,0:16,12,3,3
chr2	179236831	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=219,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,8:2,3:2,1,9,2
chr2	179238841	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=236,234;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,1:0,3:0,4,0,4
chr2	179247998	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=160,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:1,6,0,2
chr2	179300971	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,2783;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:9,0:4,6:3,10,5,1
chr2	179315031	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,1803;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:15,2:13,0:15,13,1,1
chr2	179315726	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=142,820;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,2:4,0:0|1:179315726_G_A:179315726:4,1,1,2
chr2	179315734	.	GGC	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=149,820;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:0|1:179315726_G_A:179315726:5,1,1,2
chr2	179324025	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=220,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,0:2,4:0,5,0,4
chr2	179325632	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,15;MFRL=252,190;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.263:6:2,0:1,0:5,0,1,0
chr2	179330468	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	179341953	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=151,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:9,5:7,3:4,12,3,5
chr2	179363909	.	AT	A,ATT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32,30;MFRL=153,144,120;MMQ=60,60,60;MPOS=10,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=9.66,8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,6,7:0.236,0.266:26:8,4,2:5,2,1:8,5,13,0
chr2	179392080	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,2:7,2:4,7,3,1
chr2	179392573	.	A	ATGCACACACCCCACCTGTTCTACGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=207,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	179398153	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=229,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,2:7,1:14,3,3,0
chr2	179400585	.	GAA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=198,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.371:9:1,2:3,0:4,2,2,1
chr2	179403593	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:6,4,0,4
chr2	179404786	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=274,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:3,1,0,3
chr2	179406191	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=206,132;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,1:5,3:5,4,2,2
chr2	179407662	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:10,3:8,1:11,7,1,3
chr2	179410704	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=182,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,1:6,2:4,8,2,1
chr2	179414633	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=246,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,1:7,2:4,4,1,2
chr2	179418703	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=184,116;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:0,0:2,1,1,0
chr2	179426327	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,135;MMQ=60,22;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:10,0:14,4:9,15,0,4
chr2	179429523	.	TT	AC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=156,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:179429523_TT_AC:179429523:8,7,0,2
chr2	179429528	.	G	GTTGCAAACTTTTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=185,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:4,2:0|1:179429523_TT_AC:179429523:8,5,0,2
chr2	179442139	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:5,0:3,3:2,6,0,3
chr2	179443626	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,0:11,3:9,10,1,2
chr2	179449131	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:9,3:6,5:5,10,4,4
chr2	179449799	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,0:5,2:0|1:179449799_C_CT:179449799:7,11,0,2
chr2	179449800	.	C	CTA	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,0:5,2:0|1:179449799_C_CT:179449799:7,11,0,2
chr2	179449801	.	ATG	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,0:5,2:0|1:179449799_C_CT:179449799:7,13,0,2
chr2	179449807	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=142,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:0|1:179449799_C_CT:179449799:6,12,0,2
chr2	179454861	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,1:3,1:6,6,1,1
chr2	179455270	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=142,115;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:8,1:9,1:11,6,0,3
chr2	179460214	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=231,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.422:12:5,4:2,1:7,0,5,0
chr2	179466070	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,2:8,1:8,10,0,3
chr2	179470523	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=A;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	179477332	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=133,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	179482506	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=164,52;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:7,4:10,0:8,9,4,0
chr2	179483475	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=176,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.224:20:10,0:6,4:8,8,2,2
chr2	179486478	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=189,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:11,3:6,1:7,10,2,2
chr2	179489454	.	G	GACCACTGTGTCTGTCGAACACA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=197,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.264:9:2,2:4,0:1,6,1,1
chr2	179497976	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=141,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:5,10,1,1
chr2	179499546	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:3,7,2,0
chr2	179504795	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,1:8,1:10,9,2,0
chr2	179510831	.	TTATA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=172,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=TA;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr2	179511767	.	GTATATA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,248;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,8;RU=TA;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.262:12:5,2:2,1:8,1,1,2
chr2	179514433	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=203,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,1:7,2:5,6,2,1
chr2	179516006	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,84;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:13,0:7,4:14,6,0,4
chr2	179517019	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=144,203;MMQ=43,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,3:7,2:2,9,2,3
chr2	179528746	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,137;MMQ=60,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,0:5,5:9,3,0,6
chr2	179547860	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:6,2,4,0
chr2	179548695	.	AT	A,ATT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29,24;MFRL=182,187,224;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=5.34,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.358,0.301:9:2,0,1:0,2,0:2,1,3,3
chr2	179548980	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=186,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,0,1
chr2	179549048	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:7,6,1,1
chr2	179553542	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,0:2,3:0,6,0,3
chr2	179553888	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=171,190;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,3:8,0:8,5,0,3
chr2	179558282	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=195,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.301:18:4,1:8,4:11,2,2,3
chr2	179563457	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=217,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:9,0,2,0
chr2	179563643	.	TAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,16;MFRL=123,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.365:9:1,1:3,0:3,3,0,3
chr2	179566146	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	179566802	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=154,284;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.161:16:6,1:3,1:8,6,1,1
chr2	179572417	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=241,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:4,2,3,2
chr2	179575559	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=208,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:12,7,1,1
chr2	179576596	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chr2	179578108	.	T	TACAAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=ACAAA;STR;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.432:7:2,1:2,2:1,3,0,3
chr2	179582605	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=206,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:4,5,3,1
chr2	179583398	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=188,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.388:21:8,5:5,3:8,5,6,2
chr2	179587101	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=175,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,0:6,7:2,6,0,7
chr2	179587130	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=193,158;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:1,4,3,0
chr2	179590460	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=182,125;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:4,3:12,0:7,9,0,3
chr2	179593270	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=145,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,1:7,3:10,6,2,2
chr2	179595372	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=184,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:5,1:8,3:7,6,2,2
chr2	179597108	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:2,5,2,0
chr2	179599473	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,2:8,0:0|1:179599473_C_T:179599473:8,13,1,1
chr2	179599479	.	T	TTAG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=101,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,2:9,0:0|1:179599473_C_T:179599473:7,14,1,1
chr2	179600563	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr2	179611691	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=195,88;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.551:27:5,4:7,11:7,5,15,0
chr2	179614952	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,4,13
chr2	179616770	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=253,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,1:0,2:0,1,0,7
chr2	179618019	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	179623939	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr2	179631362	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=224,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,4:7,1:2,9,2,3
chr2	179632710	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:4,8:3,8:3,4,8,8
chr2	179633298	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=15,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	179634376	.	GTA	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=168,277;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.671:12:2,3:2,5:0|1:179634376_GTA_G:179634376:4,0,8,0
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chr2	179635882	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	179636059	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=184,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:5,3:7,0:7,5,1,2
chr2	179639297	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	179640233	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=159,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,0:8,2:11,7,2,0
chr2	179640868	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:9,0:6,7:8,7,0,7
chr2	179642425	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,7,6
chr2	179643886	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr2	179643934	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr2	179647824	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=256,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr2	179650954	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=177,292;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	179666830	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=205,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,1:6,2:11,1,2,1
chr2	179667090	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,2:4,8:3,4,1,9
chr2	179702268	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,9,9
chr2	179702319	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,3:6,0:2,11,3,0
chr2	179732980	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr2	179736940	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,1:9,1:11,8,2,0
chr2	179753245	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:9,4:9,3:11,7,6,1
chr2	179783696	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,323;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	179826241	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=125,338;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr2	179839888	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=213,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,1:4,4:4,6,1,4
chr2	179843310	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:6,2:15,1:15,6,0,3
chr2	179974761	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:5,3:7,1:5,7,1,3
chr2	179980053	.	G	GAAATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=173,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	179980070	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr2	179988395	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=136,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:0,2:0,2:1,0,4,0
chr2	179989039	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=165,226;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr2	180015941	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=139,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,2:5,0:9,1,2,0
chr2	180036775	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=229,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:5,0,1,1
chr2	180039068	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,5:3,4:4,0,8,1
chr2	180047746	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=139,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:4,0,6,1
chr2	180307879	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	180725481	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	180815528	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=198,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:0,9:2,2:2,0,7,4
chr2	180829244	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=149,195;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,3:7,0:11,2,3,0
chr2	180835589	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,9:0,11:0,0,6,14
chr2	180837806	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:2,5:1,5:3,0,11,0
chr2	180843126	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=151,256;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	180846743	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=193,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,2:1,4:0,3,2,4
chr2	181851996	.	TT	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,3:4,8:7,0,8,3
chr2	181925374	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=140,244;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:4,3:6,2,3,0
chr2	182344846	.	G	GT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=118,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.681:24:7,6:1,7:7,1,8,8
chr2	182350743	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=197,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:0,1,1,7
chr2	182359613	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	182374328	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:7,1:9,3:14,2,4,0
chr2	182374534	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=175,194;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:0,5:2,3:0,2,1,8
chr2	182376546	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=67.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,7:0,12:0,0,4,17
chr2	182387133	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	182392143	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:1,8,0,2
chr2	182395345	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=101,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,6:0,5:1,1,3,8
chr2	182399497	.	A	ATT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=210,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,3:1,1:3,1,4,0
chr2	182399685	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=137,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,2:5,1:4,9,0,3
chr2	182402790	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=227,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr2	182403792	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,4,4
chr2	182412633	.	G	GACACACACACACAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=50211368,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,11;RU=AC;STR;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.690:8:0,1:2,4:0,2,0,6
chr2	182413602	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr2	182430120	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=138,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:2,4:2,5:2,2,8,1
chr2	182778704	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=190,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:1,5,0,5
chr2	182852689	.	A	ATGGAATGGAATCGAATGCAATG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=215,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.290:8:3,2:3,0:0,6,1,1
chr2	182852729	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=171,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr2	182928555	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,11:0,5:0,0,5,11
chr2	182981846	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr2	183053658	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,269;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:8,3,2,0
chr2	183066171	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=122,93;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,3:8,0:10,5,3,0
chr2	183066276	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:9,0:17,3:15,11,3,0
chr2	183066377	.	C	CAAAA,CAAAAAA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,32,32;MFRL=228,183,209;MMQ=60,60,60;MPOS=9,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,17,19;RU=A;STR;TLOD=6.26,3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,2:0.456,0.280:8:1,1,0:0,3,2:1,1,5,1
chr2	183066394	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=202,209;MMQ=33,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.186:23:4,0:13,2:4,15,4,0
chr2	183088584	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=224,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,7:1,2:3,0,7,2
chr2	183593451	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=190,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.633:9:2,3:1,3:1,2,1,5
chr2	183597318	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr2	183616592	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr2	183616748	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr2	183622319	.	AATAAT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=11015246,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATAAT;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:2,0,2,0
chr2	183622439	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,2:6,0:12,7,1,1
chr2	183627619	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr2	183793653	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=194,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,2:7,3:3,12,2,3
chr2	183806893	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.342:16:0,4:11,1:3,8,1,4
chr2	183827018	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=108,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:2,2,3,1
chr2	183827056	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=161,78;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:4,0:0,6,1,1
chr2	183832100	.	CAA	C,CA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34,33;MFRL=172,188,213;MMQ=60,60,60;MPOS=29,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=4.40,6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,2,4:0.124,0.221:20:4,1,4:4,1,0:1,13,1,5
chr2	183841691	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=145,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.549:7:2,1:1,1:3,0,0,4
chr2	183848114	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:1,2,2,4
chr2	183851058	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	183867004	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=215,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr2	183960143	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=153,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:5,1,2,0
chr2	183995115	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=110,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.727:4:0,3:1,0:1,0,2,1
chr2	183995142	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=185,234;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,0:2,0:0|1:183995142_G_T:183995142:5,2,2,0
chr2	183995144	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,15;MFRL=185,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,0:0|1:183995142_G_T:183995142:5,2,2,0
chr2	183995153	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=148,234;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,0:0|1:183995142_G_T:183995142:6,2,2,0
chr2	184024143	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=221,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr2	185463815	.	C	CCT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CT;STR;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.375:17:6,5:4,1:4,7,0,6
chr2	185798504	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=121,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=50.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,5:0,9:0,1,3,11
chr2	185802211	.	C	CACA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=208,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACA;STR;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,1:2,1,1,3
chr2	185802243	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=212,180;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,4:1,5:1,0,4,5
chr2	185803074	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:3,3:10,0:9,5,3,0
chr2	186670104	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,9,7
chr2	186671973	.	T	TGATCCAAGTACTTCCTTCTC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=163,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:10,4,1,1
chr2	186672897	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=167,106;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,8:2,2:3,2,6,4
chr2	186678241	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:2,5:3,1:4,1,5,1
chr2	186680041	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=208,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:1,1:2,7:2,1,4,4
chr2	186692859	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=111,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.315:11:3,1:5,2:7,1,3,0
chr2	186697876	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,10:0,6:0,0,11,5
chr2	187351020	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=216,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,2:5,4:6,0,6,0
chr2	187364811	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr2	187364878	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,7:1,10:1,1,9,8
chr2	187369013	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:187369013_T_TG:187369013:0,0,0,7
chr2	187369037	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=188,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:187369013_T_TG:187369013:0,3,0,1
chr2	187455278	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr2	187466921	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=131,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:5,0:0,3:0,5,0,3
chr2	187490371	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=80.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,10:0,0,5,14
chr2	187490389	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0|1:187490389_G_T:187490389:0,0,2,13
chr2	187490405	.	T	TGTGTGA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=164,191;MMQ=46,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.719:5:0,1:1,2:0|1:187490389_G_T:187490389:0,1,0,4
chr2	187497988	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:5,0,5,0
chr2	187501682	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=150,256;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr2	187503226	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.502:16:5,5:3,3:4,4,1,7
chr2	187505738	.	T	TGTCCTTGAGAAATGATG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=248,125;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	187529823	.	ATTT	A,ATT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,30,30;MFRL=157,148,99;MMQ=60,60,60;MPOS=27,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,16;RU=T;STR;TLOD=3.34,5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.285,0.431:4:0,0,0:1,1,2:1,0,3,0
chr2	187529841	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:187529841_G_T:187529841:3,0,1,0
chr2	187529844	.	CT	AT,AA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=17,10,10;MFRL=99,148,157;MMQ=60,60,60;MPOS=6,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,0,0:0,0,0:2,0,2,0
chr2	187529848	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,10;MFRL=74,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:187529841_G_T:187529841:2,0,1,0
chr2	187529860	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=110,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:187529841_G_T:187529841:2,1,1,0
chr2	187529975	.	TC	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:187529975_TC_CT:187529975:1,1,0,1
chr2	187529979	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:187529975_TC_CT:187529975:1,1,0,1
chr2	187532010	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,3:2,4:0,6,0,7
chr2	187532373	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=137,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:3,1,5,2
chr2	187559029	.	A	ACAGCAG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=208,252;MMQ=60,52;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=CAG;STR;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.496:6:0,0:2,1:2,1,1,2
chr2	187559047	.	G	GCAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=246,180;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CAA;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:2,2:3,4:3,2,3,3
chr2	187559222	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr2	187611748	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	187627567	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=172,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,2:7,1:3,8,1,2
chr2	187693104	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:6,2:13,1:11,9,1,2
chr2	187693521	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=183,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr2	187697883	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=186,103;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,6:5,3:5,3,4,5
chr2	187697996	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=190,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:4,2:2,0:2,4,0,2
chr2	187698037	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr2	187703983	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=190,116;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr2	187709415	.	AC	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=106,155;MMQ=54,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.091:51:13,2:30,2:42,5,3,1
chr2	187709553	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=200,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.392:21:10,5:3,3:0|1:187709553_A_G:187709553:4,9,0,8
chr2	187709555	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:11,4:6,0:0|1:187709553_A_G:187709553:4,14,0,4
chr2	187709557	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=182,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:11,4:7,0:0|1:187709553_A_G:187709553:4,15,0,4
chr2	187709559	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=182,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:12,4:7,0:0|1:187709553_A_G:187709553:4,15,0,4
chr2	188216807	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr2	188224057	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	188224086	.	A	ATTCATGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	188225486	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:12,2:3,1:0,16,0,3
chr2	188243633	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	188250301	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,10:0,7:0,0,10,7
chr2	189434711	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.391:11:2,2:5,0:6,1,3,1
chr2	189448896	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	189454355	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=164,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:4,1,5,0
chr2	189849773	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	189855674	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=139,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:5,13:2,2:5,2,12,3
chr2	189859131	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=223,157;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,0:6,5:4,8,0,5
chr2	189859434	.	CTT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:5,2:7,0:8,5,2,0
chr2	189861031	.	T	TAC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=102,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=AC;STR;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.708:8:1,3:1,3:1,1,3,3
chr2	189862203	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	189863389	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,297;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,2:10,1:9,10,2,1
chr2	189867805	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=175,53;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:17,2:0|1:189867805_T_A:189867805:2,22,1,1
chr2	189867811	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=35,20;MFRL=175,53;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:15,2:0|1:189867805_T_A:189867805:2,19,1,1
chr2	189867813	.	C	CTGT	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=35,20;MFRL=175,53;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:15,2:0|1:189867805_T_A:189867805:2,19,1,1
chr2	189867815	.	A	ATC	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=175,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:6,2:0|1:189867805_T_A:189867805:2,19,1,1
chr2	189867819	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=158,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:189867805_T_A:189867805:1,10,1,1
chr2	189867844	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=156,271;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr2	189867882	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=212,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr2	189872236	.	GC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=181,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:4,0:3,5,6,0
chr2	189872864	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=174,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,0:4,3:0,7,1,2
chr2	189872907	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=186,49;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,0:6,4:0,9,0,5
chr2	189874873	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=114,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,4:4,2:6,3,6,0
chr2	189876305	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=162,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr2	189899541	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	189899572	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,10,0
chr2	189901295	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr2	189910066	.	ATG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=168,267;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TG;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr2	189918787	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,6:1,3:1,0,5,4
chr2	189922016	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	189923104	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr2	189923630	.	ATT	A,AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,28,28;MFRL=152,150,172;MMQ=60,60,60;MPOS=26,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=6.63,31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,15:0.218,0.699:20:1,1,6:0,3,9:0,1,7,12
chr2	189925548	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,6,10
chr2	189926229	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=103,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:3,2:6,1:7,2,3,0
chr2	189927506	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	189928834	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=225,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr2	189936687	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=222,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:2,1,2,1
chr2	189943121	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr2	189949786	.	TG	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,3:4,3:5,0,5,1
chr2	189964747	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:4,1,1,1
chr2	190313276	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=154,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:190313276_G_A:190313276:4,10,1,1
chr2	190313281	.	T	TGGGAAGAAAGTGCAGGACTGTCTTTTGCCGGATTGAAGG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=156,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:190313276_G_A:190313276:3,10,1,1
chr2	190313396	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr2	190319966	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr2	190319990	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	190321967	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr2	190322196	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	190323453	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=226,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr2	190327126	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr2	190331057	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=183,213;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr2	190443304	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	190444630	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,6,10
chr2	190445076	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=233,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:3,0,6,1
chr2	190445284	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=169,350;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.268:12:3,0:6,2:0,9,0,3
chr2	190535538	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	190554305	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,59;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr2	190570001	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr2	190593168	.	ATTTTT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=131,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,1:12,2:10,13,0,3
chr2	190593311	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr2	190603201	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,4:1,3:1,0,7,0
chr2	190611084	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=190,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,3:3,5:3,1,5,3
chr2	190611414	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr2	190615305	.	C	CTGAAGCAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:9,0:9,7,0,2
chr2	190636411	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=223,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr2	190640434	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=174,282;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,2:13,0:8,14,1,1
chr2	190640475	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=264,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,4:2,4:0,2,1,7
chr2	190647108	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,5,6
chr2	190670539	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.296:14:4,3:6,1:5,5,2,2
chr2	190926859	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,297;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:10,0,2,0
chr2	191065236	.	TTTTG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=288,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTG;STR;TLOD=56.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:3,8:1,6:4,0,9,5
chr2	191065782	.	A	AGAT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=194,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAT;STR;TLOD=54.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.826:15:1,7:1,6:2,0,8,5
chr2	191066769	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,10,8
chr2	191067766	.	T	TTC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=235,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.841:23:1,10:2,8:1,2,12,8
chr2	191109533	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:0,2,4,2
chr2	191116355	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:0,2,0,5
chr2	191155224	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=18,25;MFRL=260,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:191155224_G_A:191155224:0,1,0,1
chr2	191155233	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=260,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:191155224_G_A:191155224:0,1,0,1
chr2	191175639	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	191184524	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=117,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.933:28:0,8:1,19:1,0,12,15
chr2	191224752	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=220,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,2:2,8:3,0,9,1
chr2	191227235	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	191227492	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=268,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,4:2,3:1,1,1,6
chr2	191231458	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,4:3,6:3,3,5,5
chr2	191231503	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:1,3:4,8:2,3,5,6
chr2	191235760	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=138,127;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:11,0:14,5:10,16,0,5
chr2	191235761	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:10,1:17,2:10,17,0,3
chr2	191235785	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=157,127;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:5,0:12,5:6,11,0,5
chr2	191300770	.	AGTT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=152,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:5,0:0|1:191300770_AGTT_A:191300770:6,6,1,1
chr2	191300774	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=152,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:5,0:0|1:191300770_AGTT_A:191300770:6,6,1,1
chr2	191301368	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=130,180;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:9,5:8,2:7,10,4,3
chr2	191301518	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=165,19765286;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:7,5,0,2
chr2	191302277	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,0:9,2:5,9,1,1
chr2	191334459	.	A	ATTTTTAT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTTTAT;STR;TLOD=81.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,6:0,0,16,3
chr2	191354491	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=167,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,2:7,3:8,2,3,2
chr2	191354658	.	C	CCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	191383348	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=207,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,5,1
chr2	191390126	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,242;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:4,13,1,1
chr2	191523862	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.388:8:3,0:2,2:5,0,3,0
chr2	191523894	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.238:11:2,0:3,1:4,5,2,0
chr2	191537793	.	GTT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=206,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr2	191746233	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:12,6:5,5:4,13,0,11
chr2	191765206	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=176,238;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr2	191789206	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=208,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,0:2,4:6,0,4,0
chr2	191795063	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=194,107;MMQ=60,36;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr2	191839464	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=148,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:10,1,2,0
chr2	191839976	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:7,0,3,0
chr2	191841759	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:5,2:7,2:2,12,2,2
chr2	191848312	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr2	191851485	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=252,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr2	191851805	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:8,4:7,1:5,10,1,4
chr2	191851897	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:2,3:0,6,1,2
chr2	191854423	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=171,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:8,5:9,3:4,13,3,5
chr2	191875035	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.451:27:7,3:7,9:9,6,6,6
chr2	191898256	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:11,4:17,0:15,13,4,0
chr2	191899148	.	C	CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=239,199;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=A;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr2	191899346	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=194,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:8,2:6,2:4,10,2,2
chr2	191900808	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=204,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr2	191923026	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=167,184;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr2	191923064	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	191923375	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=141,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:8,0:12,4:13,7,2,2
chr2	191923543	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:7,3:1,5:3,5,1,7
chr2	191996518	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=102,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,3:0,1:2,1,4,0
chr2	192214833	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:2,3,3,1
chr2	192225294	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=338,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,4:1,4:2,1,8,0
chr2	192225477	.	G	GTGTTGT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=TGT;STR;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.637:7:1,2:1,3:1,1,2,3
chr2	192226908	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=214,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr2	192228433	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.280:15:2,1:9,3:10,1,4,0
chr2	192246208	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,63;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,0:6,2:4,8,1,1
chr2	192246243	.	T	TCACCA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=187,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:5,2:4,5,1,1
chr2	192250543	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr2	192250568	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,15,7
chr2	192261256	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,0:4,5:1,9,0,5
chr2	192283457	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	192711162	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,12,9
chr2	192711385	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=156,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:11,3:10,3:12,10,4,2
chr2	192814958	.	TGTCTTA	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=207,161;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:192814958_TGTCTTA_T:192814958:5,0,2,0
chr2	192814967	.	CTTTTG	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=54,161;MMQ=60,44;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:1,2:0|1:192814958_TGTCTTA_T:192814958:6,1,2,0
chr2	192814973	.	T	TAAAA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=69,161;MMQ=60,44;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:1,2:0|1:192814958_TGTCTTA_T:192814958:7,1,2,0
chr2	192818609	.	ATT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,15;MFRL=187,157;MMQ=35,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=24,22;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.540:4:0,0:2,0:0,2,0,2
chr2	192818646	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=198,334;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr2	192820898	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	193056509	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=227,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:8,3:1,0:0|1:193056509_G_T:193056509:9,0,3,0
chr2	193056514	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=217,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:8,2:2,0:0|1:193056509_G_T:193056509:10,0,3,0
chr2	196545217	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:11,7:4,0:9,6,7,0
chr2	196578151	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=125,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:2,0:10,2:6,6,2,0
chr2	196578312	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=180,56;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:7,0:12,2:0|1:196578312_T_C:196578312:4,15,1,1
chr2	196578327	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=167,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:196578312_T_C:196578312:1,9,1,1
chr2	196578330	.	CAAA	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=167,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,1:0|1:196578312_T_C:196578312:1,9,1,1
chr2	196581295	.	T	TGTCTAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,4:0,0,13,0
chr2	196602559	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=170,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:8,0,2,0
chr2	196602582	.	A	AAAT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAT;STR;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,10,0
chr2	196602914	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=187,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:4,0:3,9:0,7,0,10
chr2	196636662	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	196642488	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,1:7,1:7,4,2,0
chr2	196663997	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,9,5
chr2	196681284	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	196682630	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	196722195	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=186,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,0:7,7:5,10,0,7
chr2	196753659	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=143,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:8,2:0|1:196753659_A_T:196753659:11,10,1,1
chr2	196753666	.	C	CATG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=151,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:8,1:0|1:196753659_A_T:196753659:10,10,1,1
chr2	196753669	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=151,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:8,2:0|1:196753659_A_T:196753659:10,10,1,1
chr2	196756535	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=208,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr2	196825238	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=196,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,1:1,1:2,3,1,1
chr2	196891449	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	196912067	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chr2	197010580	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=124,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,0:8,3:11,4,2,1
chr2	197010823	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	197021086	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	197021141	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=60.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,8:0,0,13,8
chr2	197021276	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,14:0,11:0,0,13,12
chr2	197065964	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=79.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,19,4
chr2	197066174	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=203,211;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.346:8:3,0:1,3:0|1:197066174_GT_G:197066174:0,5,0,3
chr2	197066175	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	197066176	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=203,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.345:8:3,0:1,3:0|1:197066174_GT_G:197066174:0,5,0,3
chr2	197106759	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=215,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=75.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.889:25:1,10:1,13:2,0,15,8
chr2	197118729	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,24:0,13:0,0,8,29
chr2	197122493	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=312,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr2	197122528	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=272,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:4,2:3,5:5,2,4,3
chr2	197171175	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=184,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.349:18:7,5:5,1:0|1:197171175_C_T:197171175:9,3,6,0
chr2	197171183	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.332:19:7,5:6,1:0|1:197171175_C_T:197171175:10,3,6,0
chr2	197172816	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:4,4:7,2:3,8,1,5
chr2	197172856	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=209,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:0,9,0,3
chr2	197184267	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=184,72;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:3,1:9,2:6,6,1,2
chr2	197194333	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:15,0:5,3:14,6,0,3
chr2	197208531	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr2	197298222	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:197298222_T_C:197298222:0,0,0,8
chr2	197298232	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=209,242;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,2:1,3:0|1:197298222_T_C:197298222:0,1,0,6
chr2	197504473	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=143,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:18,3:6,5:12,12,4,4
chr2	197534692	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	197541296	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=116,62;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:10,1:7,2:0|1:197541296_G_A:197541296:9,8,2,1
chr2	197541314	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=131,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,0:4,2:0|1:197541296_G_A:197541296:8,9,1,1
chr2	197541316	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=131,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:5,2:0|1:197541296_G_A:197541296:8,9,1,1
chr2	197590701	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=132,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:6,0:17,2:0|1:197590701_C_A:197590701:13,13,1,1
chr2	197590707	.	A	AGGC	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=165,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:11,2:0|1:197590701_C_A:197590701:13,7,1,1
chr2	197590710	.	GA	TC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=165,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:0|1:197590701_C_A:197590701:13,6,1,1
chr2	197593868	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=185,85;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:8,0,2,0
chr2	197594203	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	197595762	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	197664437	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:3,0:4,3:2,6,1,2
chr2	197664521	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	197744755	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=165,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:4,4,1,1
chr2	197777589	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr2	197854233	.	T	TAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=118,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr2	197863214	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=205,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,4:1,8:0,3,0,12
chr2	197863668	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.321:29:11,0:9,9:9,11,0,9
chr2	197863851	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=426,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,2:0,7:0,1,0,9
chr2	197872727	.	T	TTCTC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=382,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=TC;STR;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.820:9:1,5:0,3:0,1,1,7
chr2	197873563	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=220,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr2	197943382	.	ATG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=197,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.386:16:4,3:5,2:4,6,4,2
chr2	197946392	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=126,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,1:10,1:9,5,1,1
chr2	197948310	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=212,177;MMQ=60,36;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,2:6,1:0,9,1,2
chr2	197953372	.	TAAGTC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGTC;STR;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr2	197954780	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,4,8
chr2	197986048	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,10,4
chr2	197990509	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,11,0
chr2	198001443	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,9:0,10:0,0,1,18
chr2	198011904	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr2	198051678	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=262,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr2	198175179	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=206,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	198257652	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=153,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.515:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	198265173	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,7:0,4:1,0,2,10
chr2	198266943	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr2	198267243	.	GAA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=230,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:1,1:2,1:3,1,2,0
chr2	198267770	.	G	GAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=A;STR;TLOD=68.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,5,14
chr2	198283364	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,0:4,4:2,7,1,3
chr2	198285940	.	AAT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=225,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	198318758	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:19,0:9,3:0|1:198318758_G_T:198318758:14,15,0,3
chr2	198318764	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:21,0:9,3:0|1:198318758_G_T:198318758:15,15,0,3
chr2	198359530	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=167,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:0|1:198359530_T_C:198359530:1,7,0,2
chr2	198359534	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=167,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:0|1:198359530_T_C:198359530:1,7,0,2
chr2	198359537	.	CCTT	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=168,226;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,1:7,1:0|1:198359530_T_C:198359530:1,8,0,2
chr2	198365043	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,18:0,8:0,0,23,3
chr2	198571340	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=193,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:198571340_G_T:198571340:9,10,1,1
chr2	198571347	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=200,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:10,2:0|1:198571340_G_T:198571340:9,12,1,1
chr2	198571349	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=200,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:9,2:0|1:198571340_G_T:198571340:9,12,1,1
chr2	198643631	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=79,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.593:5:0,2:0,1:0|1:198643631_G_A:198643631:1,1,2,1
chr2	198643651	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=79,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.725:8:0,4:1,1:0|1:198643631_G_A:198643631:1,1,3,3
chr2	198646515	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,7:9,0:7,8,7,0
chr2	198669869	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:198669869_G_A:198669869:0,0,1,0
chr2	198669871	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:198669869_G_A:198669869:0,0,1,0
chr2	198670032	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	198951040	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=211,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:198951040_A_C:198951040:0,4,0,1
chr2	198951042	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=211,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:198951040_A_C:198951040:0,4,0,1
chr2	200137304	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=153,65;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:13,0:5,3:9,9,1,2
chr2	200173684	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,6,10
chr2	200245245	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	200246318	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr2	200298313	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr2	200800572	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=234,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.459:11:3,1:3,4:6,0,5,0
chr2	200813082	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=147,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.223:28:7,5:15,0:13,9,6,0
chr2	200820505	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=187,270;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:2,2:5,1:7,1,1,2
chr2	201171014	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=150,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.922:23:0,8:1,14:1,0,11,11
chr2	201171355	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	201194279	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr2	201254049	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,3,9
chr2	201277011	.	CT	C,CTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31,35;MFRL=228,223,173;MMQ=60,60,60;MPOS=11,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.53,6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.358,0.358:8:2,1,2:0,1,1:2,0,5,1
chr2	201277181	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=204,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,4:3,2:0,9,0,6
chr2	201280996	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.859:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr2	201337806	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=14,17;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:0,0:0,0:0,2,0,3
chr2	201371768	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=62.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,6,13
chr2	201397647	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=238,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,3:2,4:2,0,7,0
chr2	201445152	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=140,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,3:0,3:4,0,4,2
chr2	201459998	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=202,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,0:11,2:11,5,1,1
chr2	201460104	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=197,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:6,2:4,9,0,2
chr2	201464295	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=180,257;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr2	201470233	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=239,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.438:7:3,3:0,0:2,2,3,0
chr2	201473674	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,7,8
chr2	201474179	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=160,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,2:4,0:4,6,1,1
chr2	201474234	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=185,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	201474237	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr2	201477581	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	201488758	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=268,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,5:1,4:1,2,1,8
chr2	201501568	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=261,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:3,1,2,1
chr2	201505953	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=146,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,2:0,4,2,1
chr2	201515939	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,6:0,7:1,0,1,12
chr2	201521509	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=177,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr2	201521731	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr2	201541626	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,1:8,1:8,6,0,2
chr2	201677454	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.657:30:7,9:3,11:4,6,14,6
chr2	201683695	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=164,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,3:3,5:0,7,0,8
chr2	201686121	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=274,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:201686121_A_AC:201686121:0,2,0,1
chr2	201686122	.	T	C,TGACCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,36,32;MFRL=0,274,88;MMQ=60,60,60;MPOS=28,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.46,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,0,0:0,2,1:0,0,0,3
chr2	201686124	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=274,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:201686121_A_AC:201686121:0,2,0,1
chr2	201686127	.	T	TTGACTTCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=274,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:201686121_A_AC:201686121:0,2,0,1
chr2	201719258	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.830:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr2	201719916	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=231,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr2	201721782	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,2:2,0:0,2,0,3
chr2	201778717	.	T	TAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=192,51013112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.491:4:0,1:0,1:0,2,1,1
chr2	201796248	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=184,168;MMQ=60,21;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr2	201950166	.	CT	C,CTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32,32;MFRL=142,229,125;MMQ=60,60,60;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.10,4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,3:0.180,0.241:14:5,1,2:3,1,1:7,2,5,0
chr2	202013826	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:1,1:10,4:4,7,0,5
chr2	202025131	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:0,0:3,0,2,0
chr2	202025137	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,22;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr2	202025375	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:13,5:9,0:6,16,2,3
chr2	202028491	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=177,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,5:6,1:8,1,4,2
chr2	202052617	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=211,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr2	202070735	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=191,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.581:10:3,1:1,5:0,4,0,6
chr2	202072973	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=189,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr2	202073989	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:12,0:8,5:10,11,0,5
chr2	202074098	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:13,4:6,1:8,11,3,2
chr2	202139739	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=188,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:4,1:3,2:1,6,0,3
chr2	202151163	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=155,317;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:4,0,2,1
chr2	202151400	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=199,172;MMQ=44,41;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr2	202211443	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=212,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr2	202215426	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=103,260;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:2,0:10,3:0|1:202215426_AT_A:202215426:10,4,3,0
chr2	202215428	.	ACTTACTTTGGGG	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=103,260;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:4,0:10,3:0|1:202215426_AT_A:202215426:10,7,3,0
chr2	202245244	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=150,287;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:2,2,3,1
chr2	202245944	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,24,28;MFRL=78,159,97;MMQ=60,60,60;MPOS=30,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,18;RU=A;STR;TLOD=5.07,4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.300,0.407:7:0,0,2:2,1,0:0,2,2,3
chr2	202245955	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:2,5,0,2
chr2	202246034	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=207,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,1,4
chr2	202248788	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,276;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:4,2,2,0
chr2	202248979	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,3:3,1:2,9,1,3
chr2	202252478	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=163,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.501:30:5,4:10,11:8,7,9,6
chr2	202254288	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=261,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr2	202257666	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:9,1:11,5,2,0
chr2	202264316	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=200,246;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr2	202272032	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=248,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr2	202285100	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=178,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:6,1,1,3
chr2	202337730	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,181;MMQ=52,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:9,4:10,3:12,7,3,4
chr2	202342737	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,1:9,1:12,1,1,1
chr2	202342802	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=216,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=60.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.724:27:3,11:4,9:5,2,12,8
chr2	202344179	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=274,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=33.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:0,6:1,8:1,0,8,6
chr2	202352649	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,0,4
chr2	202402250	.	AAC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr2	202410300	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:6,1,5,0
chr2	202410395	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:0,2,1,2
chr2	202430543	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=173,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:7,4:10,0:8,9,0,4
chr2	202430669	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=207,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr2	202447009	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=175,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr2	202469472	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr2	202491995	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:3,1,1,1
chr2	202499683	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,5:7,5:4,6,6,4
chr2	202501448	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=188,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr2	202505545	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:6,6:7,8:11,2,11,3
chr2	202505740	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=195,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.845:17:2,12:0,3:0,2,0,15
chr2	202507982	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.902:8:0,3:0,3:0,0,4,4
chr2	202523347	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=196,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,0:0,4:1,0,0,4
chr2	202528830	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=40.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,9:0,0,6,9
chr2	202531136	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr2	202546113	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,5,1
chr2	202550645	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.252:30:15,7:6,0:19,4,7,0
chr2	202566741	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	202569992	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,6,7
chr2	202570232	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr2	202571651	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:2,7,1,1
chr2	202572806	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=218,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	202574825	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	202575907	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	202580370	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,8:0,2:0,0,7,3
chr2	202606639	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	202626528	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=143,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:7,2:10,0:8,10,0,2
chr2	202626566	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:2,2:3,0:1,8,0,3
chr2	202688293	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	202712095	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr2	202736953	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=144,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:11,1:2,1:10,3,0,2
chr2	202737075	.	TTTAAGGGA	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:8,4:3,0:0|1:202737075_TTTAAGGGA_T:202737075:4,7,0,4
chr2	202737085	.	CTTT	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:7,4:3,0:0|1:202737075_TTTAAGGGA_T:202737075:4,6,0,4
chr2	202901910	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=121,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:6,2:8,3:8,6,2,3
chr2	202902385	.	TAA	T,TA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,22,24;MFRL=131,166,157;MMQ=60,60,60;MPOS=13,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=5.77,12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,3,8:0.120,0.283:29:11,0,5:4,2,3:14,4,8,3
chr2	202902870	.	ATTAAAG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=184,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:5,1:5,4,3,0
chr2	202939836	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=112,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,1:7,1:6,9,1,1
chr2	202955454	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=237,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,1:2,6:2,1,6,1
chr2	202962310	.	CTTTTT	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=19,35;MFRL=148,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,11;RU=T;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:3,1:1,1:1,8,0,2
chr2	202962335	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:0|1:202962335_C_T:202962335:0,11,0,2
chr2	202962337	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:202962335_C_T:202962335:0,11,0,2
chr2	202962358	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=165,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr2	202964517	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=128,157;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,1,3
chr2	202964528	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=246,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr2	202964986	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:5,0,6,0
chr2	202965222	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=163,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:1,2,0,4
chr2	202979369	.	G	GACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	202979615	.	T	TTGAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=216,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TGAA;STR;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:2,3,2,0
chr2	202979791	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=188,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,0:5,3:0,9,0,3
chr2	203003066	.	GGT	G,GGTGTGT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32,32;MFRL=85,186,180;MMQ=60,60,60;MPOS=15,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,6,9;RU=GT;STR;TLOD=4.65,29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,8:0.199,0.601:12:0,2,4:2,0,3:2,0,7,3
chr2	203003085	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=65,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:10,1:3,1:8,5,1,1
chr2	203029951	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,3,0
chr2	203051886	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr2	203079025	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=124,254;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.338:16:3,3:7,2:8,3,5,0
chr2	203103035	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,36;MFRL=268,247;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:0,1:1,0:0|1:203103035_A_C:203103035:1,1,1,0
chr2	203103038	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,12;MFRL=268,247;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:0,0:1,0:0|1:203103035_A_C:203103035:1,1,1,0
chr2	203139738	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	203142654	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=224,113;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:3,1:1,2:3,1,3,0
chr2	203152410	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=129,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:9,10,0,2
chr2	203160626	.	T	TTTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=186,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.318:5:2,0:1,1:0|1:203160626_T_TTTA:203160626:1,3,0,1
chr2	203160629	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=186,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.318:5:2,0:1,1:0|1:203160626_T_TTTA:203160626:1,3,0,1
chr2	203168235	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,1:7,1:3,9,0,2
chr2	203379604	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:4,1:7,1:8,3,0,2
chr2	203384776	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.440:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr2	203589804	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr2	203630102	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=117,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.518:8:2,3:2,1:3,1,4,0
chr2	203653587	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:1,8:8,1:6,3,7,2
chr2	203680554	.	TAA	T,TAAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25,27;MFRL=0,180,163;MMQ=60,60,60;MPOS=30,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,15;RU=A;STR;TLOD=3.34,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.410,0.404:2:0,0,1:0,1,0:0,0,2,0
chr2	203690387	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	203693559	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=119,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,1:0,9:1,0,7,3
chr2	203748544	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr2	203834829	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=153,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:1,0:4,2:0|1:203834829_T_TA:203834829:1,6,1,1
chr2	203834831	.	A	ATC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=153,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:2,0:5,2:0|1:203834829_T_TA:203834829:1,6,1,1
chr2	203834833	.	T	TAAAAGATGGGCTGAATGAACC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=153,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:1,0:5,1:0|1:203834829_T_TA:203834829:1,6,1,1
chr2	203880992	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=216,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr2	203921270	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=79.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,9,13
chr2	203942441	.	CTTAT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTAT;STR;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,1:7,2:9,2,3,0
chr2	203964456	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=134,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.378:9:4,0:1,3:1,5,1,2
chr2	203991488	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=195,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:2,2,4,2
chr2	203996635	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=203,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,5,0
chr2	203996870	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr2	203997912	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:9,3:3,4:6,6,2,5
chr2	204002809	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	204009437	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=220,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:3,2,2,0
chr2	204022457	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:5,2:4,3,2,0
chr2	204062061	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,7,7
chr2	204103895	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=206,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:4,2:3,0:0,7,1,2
chr2	204111394	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0|1:204111394_T_C:204111394:0,0,6,0
chr2	204111398	.	GTTAA	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:204111394_T_C:204111394:0,0,6,0
chr2	204111443	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr2	204111705	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=37.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr2	204116660	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=85,236;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:6,0,4,0
chr2	204116690	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,12,2
chr2	204116887	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	204143508	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:204143508_T_A:204143508:0,0,0,1
chr2	204143512	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:204143508_T_A:204143508:0,0,0,1
chr2	204154686	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	204304307	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,169;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:5,0:15,4:10,10,0,4
chr2	204305009	.	TC	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=142,278;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,1:9,1:10,8,2,0
chr2	204305087	.	AGGT	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=152,260;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGT;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:6,0:11,6,1,1
chr2	204305093	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=185,152;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:7,5:1,6:6,2,6,5
chr2	204305330	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,1:4,1:7,4,0,2
chr2	204322298	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=188,212;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,1:3,1:7,7,1,1
chr2	204324635	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=180,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.122:30:15,3:12,0:13,14,2,1
chr2	204326558	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:9,5:11,0:12,8,6,0
chr2	204594512	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:3,3:6,2:2,7,2,3
chr2	204732850	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr2	204736141	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.289:29:7,8:14,0:16,5,8,0
chr2	204821494	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=163,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.451:18:7,4:3,4:3,7,1,7
chr2	204824178	.	AGT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GT;STR;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.885:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr2	204824200	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr2	204824324	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:9,4:6,2:6,9,3,3
chr2	205912210	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=211,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr2	205978114	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	205986321	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=218,192;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:3,3,2,1
chr2	206036918	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:1,0,6,2
chr2	206041337	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=206,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.215:17:6,1:4,2:1,13,1,2
chr2	206041366	.	TAA	T,TA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=15,16,24;MFRL=223,195,138;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.54,3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.393,0.373:6:0,1,0:0,0,1:0,1,0,5
chr2	206364791	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=150,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:2,5,2,5
chr2	206418032	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,8,11
chr2	206480393	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,231;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:6,2:11,3:10,7,4,1
chr2	206480593	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=191,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:0|1:206480593_GC_G:206480593:2,12,0,2
chr2	206480597	.	TTTCTAAA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=191,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:0|1:206480593_GC_G:206480593:2,14,0,2
chr2	206562250	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0,0,20,5
chr2	206590879	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=206,285;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr2	206592534	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr2	206614646	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,0,17
chr2	206628658	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=186,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,0:5,2:0|1:206628658_C_T:206628658:5,12,1,1
chr2	206628666	.	G	GTGAATA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=186,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:0|1:206628658_C_T:206628658:5,13,1,1
chr2	206884595	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=101,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.295:12:5,0:4,3:3,6,0,3
chr2	206911191	.	C	CA,CAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32,32;MFRL=220,147,111;MMQ=60,60,60;MPOS=15,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=12.34,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,2:0.597,0.258:9:1,2,2:0,4,0:1,0,8,0
chr2	206911228	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=244,138;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.595:23:4,4:5,8:6,3,10,4
chr2	206995010	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=237,342;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr2	207006716	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=165,53;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:9,5,1,1
chr2	207006730	.	A	AGTAGCCTAATAGGC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=151,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:8,5,1,1
chr2	207024886	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	207025444	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=170,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,2:10,1:5,14,1,2
chr2	207027407	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:5,2:10,1:9,7,3,1
chr2	207413181	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=269,161;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	207451965	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,242;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,1:4,2:7,1,2,1
chr2	207452151	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.936:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr2	207527648	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:6,2,2,0
chr2	207527840	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=113,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:12,4:1,2:6,7,3,3
chr2	207564692	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=238,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:6,3,0,2
chr2	207569715	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:1,7,0,2
chr2	207582852	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,2:4,0:7,0,2,0
chr2	207604427	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=196,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr2	207605882	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:3,5,1,4
chr2	207610909	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr2	207610948	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=123,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:4,3,2,0
chr2	207613690	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=200,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	207613980	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=399,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr2	207625567	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=128,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,1:5,2:6,1,2,1
chr2	207629904	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.445:34:7,8:12,7:14,5,12,3
chr2	207630012	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=148,100;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.110:52:23,0:24,5:28,19,0,5
chr2	207630093	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:8,4:9,2:0,17,0,6
chr2	207653474	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=216,0;MMQ=60,34;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:2,1,1,0
chr2	207653653	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:0,7,0,5
chr2	207656613	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=281,236;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	207824548	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=241,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,3:2,6:0,4,1,8
chr2	207825656	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=93,193;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:6,4:1,4:3,4,4,4
chr2	207833848	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=262,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr2	208576731	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=215,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:4,3:8,9:11,1,5,7
chr2	208602105	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:10,2:3,5:6,7,4,3
chr2	208605479	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,16;MFRL=104,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,0:6,0:0|1:208605479_T_G:208605479:4,10,2,0
chr2	208605482	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,15;MFRL=104,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:4,0:0|1:208605479_T_G:208605479:4,10,2,0
chr2	208605489	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:3,0:3,6,2,1
chr2	208606875	.	CAAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=245,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,1:1,0:2,1,1,0
chr2	208632340	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=185,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:9,4,2,0
chr2	208693261	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=201,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:1,4,1,1
chr2	208811284	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	208986385	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,4:7,2:5,6,4,2
chr2	209025664	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=209,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:8,0:5,9:6,7,0,9
chr2	209027871	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=226,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr2	209028421	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=198,229;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr2	209035658	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,10:0,0:0,0,6,4
chr2	209035849	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr2	209036605	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr2	209049830	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=265,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.650:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr2	209051586	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:5,1,2,1
chr2	209101905	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	209163556	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=119,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:1,1,0,3
chr2	209168853	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	209169716	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=170,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:14,2:0|1:209169716_C_T:209169716:16,10,0,2
chr2	209169722	.	C	CCCTGCCCCCTAATTCCTAGCCCACAT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=175,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.089:31:13,0:14,2:0|1:209169716_C_T:209169716:18,11,0,2
chr2	209184999	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=130,186;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,6:5,3:4,5,4,5
chr2	209189912	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=220,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:3,1,6,1
chr2	209194696	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	209195491	.	G	GAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=208,269;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr2	209199945	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,0:2,2:7,0,2,0
chr2	209201528	.	CAT	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=163,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.170:21:7,2:9,1:12,6,2,1
chr2	209201590	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=143,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,2:9,0:15,9,2,0
chr2	209201739	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	209203122	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	209204714	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:10,4:6,4:10,6,3,5
chr2	209209997	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	209215448	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,1:1,5:2,1,6,0
chr2	209219190	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	209292981	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=188,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,2:6,0:4,5,1,1
chr2	209315573	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:5,8:1,3:1,5,2,9
chr2	209345944	.	CTTTTT	C,CTTTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,37,20;MFRL=134,209,170;MMQ=41,40,48;MPOS=17,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,12,16;RU=T;STR;TLOD=3.09,3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,3:0.230,0.572:5:0,0,0:0,1,2:0,1,0,4
chr2	209353656	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=210,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.758:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr2	210594540	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr2	210594622	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=199,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:4,10,0,3
chr2	210594717	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	210594768	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr2	210683750	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=154,37;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:4,0:7,4:0|1:210683750_C_T:210683750:4,7,5,0
chr2	210683760	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=159,37;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:5,0:9,5:0|1:210683750_C_T:210683750:5,9,5,0
chr2	210690608	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=162,89;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	210745681	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	210786137	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	210810528	.	AA	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=190,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:5,1,2,0
chr2	210824471	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=176,126;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:6,0:12,2:3,15,0,2
chr2	210834640	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,2:4,1:4,7,2,1
chr2	210880893	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=77.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,26:0.887:29:1,13:1,12:2,1,9,17
chr2	210889759	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr2	211069438	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,2:0,11:0,0,3,10
chr2	211070619	.	C	CAAAAACCCCTGCCTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=234,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.486:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	211163063	.	TAC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=AC;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr2	211168202	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=187,253;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:0,1:8,1:6,2,2,0
chr2	211168346	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,0:4,5:3,3,1,4
chr2	211319824	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=183,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:6,1,3,2
chr2	211319847	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=154,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:3,0:13,3:11,5,3,0
chr2	211319943	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:6,1:16,1:12,10,2,0
chr2	211320041	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=191,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,1:2,1:0,3,0,2
chr2	211341156	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=190,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.681:20:3,9:3,5:2,4,5,9
chr2	211341204	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr2	211342502	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=283,152;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.702:25:4,6:3,11:2,5,8,10
chr2	211421452	.	A	ATCT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=110,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,3:4,5:3,8,4,5
chr2	211481257	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,239;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,4:1,5:2,2,3,6
chr2	211513118	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	211514995	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=189,265;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:4,0,4,0
chr2	211515058	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=259,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:3,5:6,6:6,3,5,6
chr2	211521227	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31,33,32;MFRL=80,157,161,205;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,21,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.98,4.93,8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,3,3,5:0.204,0.249,0.364:13:0,1,2,1:2,2,1,3:2,0,10,1
chr2	211521270	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=157,266;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:8,0:17,2,2,0
chr2	211523457	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=198,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,3:1,1:1,4,0,4
chr2	211527827	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.693:8:0,3:2,3:1,1,5,1
chr2	211533070	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	212252809	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=190,68;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr2	212285103	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=137,359;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	212295875	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=177,256;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr2	212488870	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	212495377	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=219,139;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr2	212530240	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=193,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr2	212543691	.	CAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=330,110;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=25,22;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	212543924	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:2,4,3,3
chr2	212569983	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=163,238;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr2	212578379	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=142,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.603:10:3,2:1,3:0,4,0,6
chr2	212589986	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=255,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:1,6,0,2
chr2	212615516	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=259,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:1,2,0,3
chr2	213403091	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=169,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr2	213872836	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.201:17:3,1:6,2:2,12,1,2
chr2	213872853	.	TACA	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=182,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ACA;STR;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.505:16:2,2:4,6:2,6,0,8
chr2	213872868	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,2:4,5:1,4,0,7
chr2	213914343	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	214012403	.	CAA	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=A;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:5,0:5,2:8,3,2,0
chr2	214012405	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,11:0,0,16,3
chr2	214012446	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=146,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:18,0:13,3:21,10,2,1
chr2	214012508	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=146,184;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,3:8,0:2,17,1,2
chr2	214162120	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=133,220;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,2:9,1:4,13,1,2
chr2	214174767	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:4,1,2,3
chr2	214182100	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr2	214228959	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=132,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:0,3,0,5
chr2	214727150	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=218,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:8,1,2,0
chr2	214727221	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=214,130;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.316:14:4,1:5,3:5,5,1,3
chr2	214727367	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=215,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,3:4,0:1,8,0,3
chr2	215013801	.	GTA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TA;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	215593522	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=170,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:10,2:8,3:13,5,2,3
chr2	215617335	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=212,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr2	215632124	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=207,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	215632155	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	215632192	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,5:0,3:1,0,8,0
chr2	215632255	.	CA	TG	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:2,6:2,10:3,1,5,11
chr2	215632256	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.953:20:0,8:0,12:0,0,8,12
chr2	215634055	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=207,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:0,3:5,7:0,5,3,7
chr2	215661716	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,1:5,1:7,3,2,0
chr2	215661933	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	215674090	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=197,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:4,4:3,2:4,4,5,1
chr2	215674323	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,283;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	215797332	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=190,258;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:2,2:4,3:4,2,5,1
chr2	215809768	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=147,115;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:11,0:8,3:13,6,0,3
chr2	215809798	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=146,115;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:7,5,0,3
chr2	215809847	.	C	CAAAA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=149,281;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,9;RU=A;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,0:3,2:3,8,0,2
chr2	215812297	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=199,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:2,3,0,2
chr2	215812360	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=180,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.617:14:2,0:3,7:0,5,0,9
chr2	215813919	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr2	215819853	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=169,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:8,0,4,0
chr2	215821549	.	CAA	C,CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,33,32;MFRL=186,211,233;MMQ=60,60,60;MPOS=8,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=6.04,5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.308,0.346:9:0,1,2:2,2,1:0,3,0,6
chr2	215833415	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=192,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,2:3,7:4,1,6,3
chr2	215833622	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=274,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr2	215840829	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=279,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr2	215851246	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr2	215851303	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=171,129;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.586:17:2,2:4,8:5,2,7,3
chr2	215855780	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=174,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:4,7:7,4:4,7,2,9
chr2	215862383	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.761:23:0,9:5,8:4,1,15,3
chr2	215862542	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=145,112;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.453:18:8,0:2,8:2,8,0,8
chr2	215862633	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	215865575	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=132,216;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:16,2:10,1:16,11,2,1
chr2	215874965	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr2	215875251	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr2	215876603	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=18,23;MFRL=292,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,0:0,1:0|1:215876603_C_A:215876603:2,1,1,0
chr2	215876607	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,15;MFRL=285,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:215876603_C_A:215876603:2,2,1,0
chr2	215876610	.	CT	AA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,15;MFRL=278,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,0:1,0:0|1:215876603_C_A:215876603:3,2,1,0
chr2	215883988	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	215890312	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	215890324	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=262,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr2	215890352	.	GTT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	215891471	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr2	215901592	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=294,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,4:0,2:3,0,6,0
chr2	215928972	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,5:3,2:1,3,2,5
chr2	215929028	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr2	215976231	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	216182769	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	216190654	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr2	216190691	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	216191515	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,3:2,2:2,0,2,3
chr2	216197971	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=225,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:10,0,2,0
chr2	216198049	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=98,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,3:6,0:9,4,1,2
chr2	216200907	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,1:8,3:3,12,0,4
chr2	216209472	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,5:6,4:9,3,7,2
chr2	216211712	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,1,13
chr2	216226336	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=106,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.149:22:8,2:11,0:10,9,3,0
chr2	216226642	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=158,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:0,3:7,3:6,1,6,0
chr2	216229671	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=174,257;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:4,4,2,2
chr2	216229692	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=230,210;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:4,2,0,2
chr2	216232556	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=171,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:3,2,4,1
chr2	216240126	.	AAC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:2,3:5,1:1,6,0,4
chr2	216243832	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,9:0,7:0,0,13,3
chr2	216247962	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=168,90;MMQ=60,37;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr2	216248305	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=140,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:0,3,0,6
chr2	216248707	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	216249587	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=122,143;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.624:22:3,9:5,5:4,4,7,7
chr2	216251316	.	TTG	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=157,437;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:216251316_TTG_T:216251316:1,0,1,0
chr2	216251320	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=157,437;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:216251316_TTG_T:216251316:1,0,1,0
chr2	216251323	.	CT	GG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,16;MFRL=157,437;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:216251316_TTG_T:216251316:1,0,1,0
chr2	216251697	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=95,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.356:20:6,2:7,4:8,5,4,3
chr2	216253039	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,1:7,2:2,8,0,3
chr2	216256615	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=214,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,4:1,5:0,2,0,9
chr2	216262302	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=296,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	216262621	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=177,264;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,5:0,3:0,1,0,8
chr2	216263926	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr2	216263938	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr2	216269028	.	TTTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=324,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr2	216272819	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr2	216272900	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0|1:216272900_T_G:216272900:0,0,4,5
chr2	216272907	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.747:10:0,4:2,2:0|1:216272900_T_G:216272900:1,1,3,5
chr2	216274853	.	AAC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=244,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.620:11:1,3:3,4:0,4,1,6
chr2	216283958	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=184,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:7,3,2,2
chr2	216295337	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,0:5,4:7,0,4,0
chr2	216295520	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=164,61;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:9,2:0|1:216295520_C_T:216295520:10,10,1,1
chr2	216295527	.	T	TCCC	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=170,61;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=C;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:216295520_C_T:216295520:8,10,1,1
chr2	216295531	.	C	CCTTAAAATTCA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=175,61;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:216295520_C_T:216295520:7,10,1,1
chr2	216295533	.	A	AGT	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=175,61;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,1:0|1:216295520_C_T:216295520:7,10,1,1
chr2	216298230	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=119,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,4:3,2:0,3,1,5
chr2	216299550	.	GC	AA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=97,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=48.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:2,5:3,7:0,5,5,7
chr2	216299571	.	T	TTAC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAC;STR;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,2,5
chr2	216299629	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr2	216300482	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr2	216810468	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:2,4,0,2
chr2	216811707	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,5:2,5:2,2,9,1
chr2	216861043	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=139,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:7,0:11,3:0|1:216861043_C_A:216861043:9,9,1,2
chr2	216861049	.	G	GCA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=150,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,0:11,2:0|1:216861043_C_A:216861043:8,9,1,1
chr2	216861273	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	216904016	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=140,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:2,5,1,4
chr2	216990772	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=214,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:2,6,0,2
chr2	217001834	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,210;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:17,4:14,0:20,11,4,0
chr2	217012887	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,1:11,1:8,16,2,0
chr2	217012901	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,13:0,0,7,19
chr2	217059809	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=263,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr2	217069151	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=103,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,3:3,5:3,1,2,6
chr2	217123958	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	217142311	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=176,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr2	217148546	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	217234580	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=159,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:5,3:10,0:5,11,1,2
chr2	217280261	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=208,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:0,1:1,2:0,2,0,4
chr2	217281150	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=252,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr2	217342000	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=199,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr2	217498311	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	217541582	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=112.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,19:0,13:0,0,17,15
chr2	217724544	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=270,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:4,5,1,1
chr2	218672891	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=176,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.373:11:4,1:2,0:1,6,4,0
chr2	218675144	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	218679599	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=146,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.712:12:1,5:2,3:3,0,5,4
chr2	218694510	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=51.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0|1:218694510_CT_C:218694510:0,0,7,5
chr2	218694512	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0|1:218694510_CT_C:218694510:0,0,7,5
chr2	218694551	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=141,209;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,4:6,3:9,3,5,2
chr2	218694675	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=188,270;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.310:5:2,1:2,0:0|1:218694675_G_A:218694675:0,4,0,1
chr2	218694691	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=209,270;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.264:6:1,1:4,0:0|1:218694675_G_A:218694675:0,5,0,1
chr2	218694962	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,213;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	218745685	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=282,155;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:1,6:1,10:2,0,8,8
chr2	218750453	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:2,0:8,2:7,3,2,0
chr2	218758123	.	GCA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=144,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=CA;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:1,0:2,2,2,0
chr2	218938244	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=251,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:1,10,0,2
chr2	218940344	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=129,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr2	218941095	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=187,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,0:6,2:12,7,1,1
chr2	218999467	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=143,260;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	219000992	.	CAA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.279:12:1,1:1,1:1,8,0,3
chr2	219082119	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,5:0,13:0,0,13,6
chr2	219082330	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr2	219103313	.	CTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=T;STR;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.846:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	219103580	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr2	219114671	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=196,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:2,6,1,3
chr2	219127350	.	CAGGAGG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	219142023	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,10,2
chr2	219142492	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr2	219142773	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	219146803	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,15:0,0,18,8
chr2	219187901	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	219206919	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr2	219209393	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	219221982	.	G	GTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,13;MFRL=164,238;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=TC;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:2,0:0,0:0,3,0,2
chr2	219232247	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=183,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:13,4:8,0:9,12,2,2
chr2	219232354	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr2	219257688	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr2	219266518	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=144,226;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	219267705	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=36,32;MFRL=164,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.560:5:0,1:1,2:0|1:219267705_CA_C:219267705:1,1,3,0
chr2	219267711	.	CACACTG	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,12;MFRL=184,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,0:2,1:2,1,3,0
chr2	219267721	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=193,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.347:9:0,0:4,0:0|1:219267705_CA_C:219267705:4,2,3,0
chr2	219267724	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,10;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,0:6,0:0|1:219267705_CA_C:219267705:4,2,2,0
chr2	219267730	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:0,0:6,1:0|1:219267705_CA_C:219267705:4,3,2,0
chr2	219267901	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:8,3:3,3:3,8,5,2
chr2	219267913	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,7:5,2:6,5,4,6
chr2	219288899	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=129,255;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	219296545	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=104,275;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,1:7,3:5,6,3,1
chr2	219305404	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=233,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.728:13:1,3:2,5:0,3,6,4
chr2	219313852	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr2	219320207	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=315,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr2	219339283	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=242,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:7,0,5,0
chr2	219350358	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=24,25;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.657:4:0,1:1,0:1,0,2,1
chr2	219353195	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=211,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr2	219362396	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:6,1,0,2
chr2	219433597	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=219,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.777:25:0,9:4,10:4,1,17,3
chr2	219447612	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=231,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	219452372	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.262:25:9,0:9,6:8,11,0,6
chr2	219480804	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=209,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:0,4:2,1:0,2,1,5
chr2	219487299	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=210,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	219498759	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=207,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,0:0,4:2,0,4,0
chr2	219501133	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:3,2,3,2
chr2	219501328	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=195,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:4,4,2,6
chr2	219507979	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:7,2:13,3:10,10,4,1
chr2	219508372	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=122,271;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,4:6,5:2,7,6,3
chr2	219527005	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=166,253;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:5,1:10,1:3,12,0,2
chr2	219529348	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=238,289;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,1,1
chr2	219530032	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	219530674	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.255:41:18,0:13,10:9,22,0,10
chr2	219532903	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=152,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:2,4:8,4:0|1:219532903_C_T:219532903:4,6,4,4
chr2	219532905	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=152,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:1,3:8,3:0|1:219532903_C_T:219532903:4,6,4,4
chr2	219533438	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=120,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr2	219537586	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.262:37:13,9:14,0:13,15,9,0
chr2	219540243	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,19;MFRL=186,139;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=21,22;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr2	219541056	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=197,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	219544058	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=204,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:1,8,0,2
chr2	219544388	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=220,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,1:3,6:4,7,4,3
chr2	219545309	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=212,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,7:2,3:4,1,8,2
chr2	219553468	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=187,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.449:38:13,7:8,10:10,11,10,7
chr2	219563602	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:9,3:6,3:6,9,2,4
chr2	219609762	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=222,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:8,0,3,0
chr2	219609776	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.827:15:1,9:1,4:2,0,11,2
chr2	219609995	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=221,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.791:12:0,4:2,6:0,2,0,10
chr2	219610322	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=178,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr2	219612282	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,7:1,4:2,1,9,2
chr2	219612401	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,13;MFRL=149,50;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,0:8,0:0|1:219612401_G_A:219612401:8,11,1,1
chr2	219612417	.	T	TCACAGTATAATGTAAAGTC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=149,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:11,2:10,0:0|1:219612401_G_A:219612401:10,11,1,1
chr2	219612843	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=167,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,2:13,0:10,14,0,2
chr2	219618237	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,306;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	219618497	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=215,287;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,7:1,6:0,2,0,13
chr2	219619166	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=194,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:0,9,0,2
chr2	219691566	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,302;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	219692527	.	G	GC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=62.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,6:0,13:0,0,9,10
chr2	219692790	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=45.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,4:0,10:0,0,6,9
chr2	219694615	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	219696014	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=167,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.916:14:0,5:0,8:0,1,9,4
chr2	219826149	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=108,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:21,4:14,0:15,20,4,0
chr2	219826934	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=216,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,2:6,2:0,10,0,4
chr2	219870111	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=163,93;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,4:5,0:8,2,4,0
chr2	219883883	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=178,97;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,1:10,1:6,9,0,2
chr2	219886552	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=187,71;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:8,2:4,0:9,3,1,1
chr2	219895514	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=192,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:8,3:5,1:9,4,0,4
chr2	219896008	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=148,92;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:5,0:8,3:6,8,0,3
chr2	219896333	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.331:19:7,2:6,4:4,9,0,6
chr2	219903723	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,106;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,4:4,3:4,1,5,2
chr2	219903787	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=131,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:0,4:5,4:1,5,0,9
chr2	219905304	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:14,7:9,0:12,11,7,0
chr2	219922073	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	220011568	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220011568_C_CA:220011568:0,0,0,1
chr2	220011571	.	C	CCTTTGTATGACCTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220011568_C_CA:220011568:0,0,0,1
chr2	220012576	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=202,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:0,3,0,4
chr2	220022176	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,11:0,0,12,6
chr2	220022435	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:7,3:2,3:2,7,1,5
chr2	220029887	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,0:2,3:5,4,2,1
chr2	220032740	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=109,124;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,25:0.419:60:15,0:18,24:6,29,0,25
chr2	220033956	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,5:2,5:4,0,9,1
chr2	220034497	.	C	CCA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=271,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CA;STR;TLOD=45.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:2,4:1,9:1,2,9,5
chr2	220039506	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,3:6,0:9,0,2,1
chr2	220040216	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=182,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.664:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr2	220040330	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=119,179;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.255:41:14,6:17,4:10,21,3,7
chr2	220041433	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=152,250;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr2	220041455	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,6:0,0,10,4
chr2	220045035	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=218,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,3:0,7:1,0,1,9
chr2	220046349	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=245,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.783:21:3,8:1,9:1,3,9,8
chr2	220047393	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=205,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,1:0,4:0,3,0,5
chr2	220071803	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=211,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,2:1,9:0,2,2,9
chr2	220071879	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=222,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	220072766	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=84.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,11:0,15:0,0,10,17
chr2	220072852	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=114,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:3,10:9,6:4,8,8,8
chr2	220073118	.	TG	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=168,168;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:19,0:13,2:19,13,0,2
chr2	220078496	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,10,8
chr2	220079710	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=178,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:11,2:4,1:8,7,2,1
chr2	220082365	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.403:14:5,0:4,5:5,4,2,3
chr2	220083453	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,1:0,1:0,3,0,2
chr2	220085056	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:9,0,2,0
chr2	220085845	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,13,12
chr2	220087075	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=187,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:6,3:12,0:9,9,0,3
chr2	220087354	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=197,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.350:21:3,3:10,4:8,6,5,2
chr2	220088248	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr2	220089590	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,16;MFRL=190,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:0,0:0,2,0,4
chr2	220096809	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=40.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:4,0:10,16:3,11,0,16
chr2	220100683	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=205,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,1:9,5:6,8,4,2
chr2	220100922	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=231,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:4,3,2,2
chr2	220101222	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=202,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	220101974	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,4:6,3:6,6,3,4
chr2	220102932	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,3:10,0:14,7,3,0
chr2	220107938	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=146,112;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.152:28:10,0:14,2:12,12,0,4
chr2	220112957	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.170:39:18,0:15,6:17,16,1,5
chr2	220115222	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,125;MMQ=60,44;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,8:0.195:44:18,0:18,8:24,12,0,8
chr2	220118672	.	CG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=122,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.457:14:4,3:1,1:5,3,0,6
chr2	220145286	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.560:30:7,10:6,6:9,4,10,7
chr2	220146402	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:0,3:5,5:4,1,5,3
chr2	220146609	.	C	CG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=180,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,1:5,2:5,3,4,0
chr2	220146651	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:4,3:8,1:11,1,4,0
chr2	220147595	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.236:35:15,7:12,0:16,11,8,0
chr2	220147732	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,5:4,5:3,8,6,4
chr2	220161306	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:4,3,1,3
chr2	220173703	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=86,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:7,6,0,2
chr2	220194247	.	A	AATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=232,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATT;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr2	220195446	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:3,1:1,3:3,1,4,1
chr2	220197207	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:4,0:0,2:4,1,2,0
chr2	220197835	.	ATAATATTATATATTAT	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.333:34:9,5:10,4:21,2,7,4
chr2	220197929	.	CTTTTT	C,CTTT	.	.	DP=93;ECNT=2;MBQ=32,27,20;MFRL=0,115,195;MMQ=60,60,60;MPOS=19,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,15,18;RU=T;STR;TLOD=5.62,4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,3:0.120,0.225:14:3,1,2:5,1,0:7,2,0,5
chr2	220239534	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr2	220239561	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,5,12
chr2	220239828	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=174,356;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:220239828_G_GT:220239828:0,1,0,1
chr2	220239830	.	G	GTGGCTCACAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=174,356;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:220239828_G_GT:220239828:0,1,0,1
chr2	220246218	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,8,6
chr2	220250322	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,5:0,12:0,0,13,8
chr2	220250826	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,7:0,0,2,13
chr2	220250897	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=41.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chr2	220251178	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr2	220251208	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=193,223;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr2	220251528	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,5:6,0:4,8,6,0
chr2	220251592	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=210,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.390:13:2,0:6,0:0|1:220251592_A_C:220251592:0,8,5,0
chr2	220251598	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=210,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.390:13:2,0:6,0:0|1:220251592_A_C:220251592:0,8,5,0
chr2	220251603	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=204,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,0:5,1:0|1:220251592_A_C:220251592:0,7,3,0
chr2	220264543	.	C	CAT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,14,1
chr2	220283826	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,346;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	220284717	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	220284779	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.571:21:3,4:5,8:4,5,3,9
chr2	220285309	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=176,147;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,9:6,0:4,4,5,4
chr2	220306413	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=122,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,1:4,2:1,3,0,3
chr2	220316579	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	220327142	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:1,6,0,5
chr2	220329106	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=286,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr2	220330642	.	TGTGCGCGC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,370;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.689:1:0,1:0,0:0|1:220330642_TGTGCGCGC_T:220330642:0,0,1,0
chr2	220330657	.	GTGCA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,370;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.689:1:0,1:0,0:0|1:220330642_TGTGCGCGC_T:220330642:0,0,1,0
chr2	220331851	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=169,213;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	220336517	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	220336723	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=332,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,0,2
chr2	220341935	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:220341935_A_AG:220341935:0,0,2,0
chr2	220341938	.	C	CGGGGCCTGGTACAGCGGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.748:2:0,1:0,1:0|1:220341935_A_AG:220341935:0,0,2,0
chr2	220353104	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=153,247;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,3:1,3:0,3,4,2
chr2	220353217	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=184,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:6,0:2,2:4,4,2,0
chr2	220353440	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=197,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:2,2,2,0
chr2	220353532	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=145,255;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.288:11:4,0:4,2:3,5,1,2
chr2	220356806	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr2	220361265	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr2	220361435	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,283;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	220361486	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=202,248;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	220366824	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=231,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,2:3,1:0,10,0,3
chr2	220370255	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=194,66;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:4,9,2,0
chr2	220371181	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr2	220379175	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=148,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,2:2,6:2,4,4,4
chr2	220402099	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=235,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:220402099_G_A:220402099:2,1,0,1
chr2	220402106	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=235,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:220402099_G_A:220402099:2,1,0,1
chr2	220402624	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=171,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:6,3,1,2
chr2	220404648	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=141,222;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.237:22:5,1:12,2:11,6,1,4
chr2	220406239	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=233,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr2	220412889	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,462;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	220415646	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=169,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr2	220416164	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	220416570	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	220416591	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	220416803	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,3:0,10:0,0,8,5
chr2	220416967	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,3:0,4:1,0,2,7
chr2	220418334	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=162,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,5:8,2:7,8,2,5
chr2	220421417	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=353,152;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:0,14:1,8:0,1,13,9
chr2	220422400	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=166,326;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	220424160	.	CCAAGGTCACGGCGAT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.352:24:8,2:5,6:10,6,4,4
chr2	220427996	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr2	220428381	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=154,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr2	220430093	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=198,66;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:4,9,1,1
chr2	220431919	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr2	220432630	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=171,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:9,0:14,4:12,11,2,2
chr2	220432709	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:7,6:7,4:4,10,6,4
chr2	220462814	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=177,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.230:28:10,0:7,1:6,15,7,0
chr2	220466344	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	220471116	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=51.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,5,10
chr2	220471716	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=224,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,0:7,2:8,6,1,1
chr2	220476645	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr2	220479055	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=136,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,1:8,2:1,10,1,2
chr2	220480520	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=180,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:220480520_C_CT:220480520:4,13,1,1
chr2	220480522	.	C	CTT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=180,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:220480520_C_CT:220480520:4,13,1,1
chr2	220480523	.	G	GTCT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=180,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:0|1:220480520_C_CT:220480520:4,13,1,1
chr2	220480693	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,292;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	220494118	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,2:0,0,8,5
chr2	220500321	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=208,270;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:3,1,1,1
chr2	220502367	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=256,166;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,9:1,5:1,0,4,10
chr2	220505421	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:2,2:6,1:5,4,0,3
chr2	220505752	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=196,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr2	222301357	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=213,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:1,5:2,7:0,3,0,12
chr2	222301713	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=241,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,4:2,4:2,0,8,0
chr2	222301912	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=183,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:0,4,0,6
chr2	222301960	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	222307534	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=122,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,1:3,6:5,2,4,3
chr2	222307778	.	CAAGATGA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=198,251;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:1,2:0,0:0,2,1,1
chr2	222307831	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=158,213;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:222307831_T_C:222307831:0,2,0,1
chr2	222307834	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=158,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:222307831_T_C:222307831:0,2,0,1
chr2	222320427	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=124,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.641:17:3,9:2,2:1,5,2,9
chr2	222365893	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,140;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.171:25:15,0:6,3:7,14,0,4
chr2	222429106	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=139,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:12,0:4,7:4,12,0,7
chr2	222436870	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:11,4,1,1
chr2	223065870	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.291:29:10,5:10,3:12,9,5,3
chr2	223066017	.	AC	A,CC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,25,12;MFRL=204,152,266;MMQ=60,60,60;MPOS=13,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.47,9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,4:0.159,0.248:16:6,2,0:4,0,0:0,10,4,2
chr2	223066029	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=179,289;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:8,0:6,0:0|1:223066029_A_C:223066029:3,12,3,0
chr2	223066036	.	TA	GT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,16;MFRL=188,289;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:8,0:7,0:0|1:223066029_A_C:223066029:7,9,3,0
chr2	223066919	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.371:25:9,3:7,6:4,12,2,7
chr2	223085886	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=160,94;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,4:4,0:6,1,4,0
chr2	223085955	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=102,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,6:4,1:3,4,3,4
chr2	223096709	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	223158424	.	ACT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CT;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,1:5,1:10,7,1,1
chr2	223160316	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:8,3:10,3:10,8,5,1
chr2	223161624	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=182,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	223162024	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr2	223339533	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,1:0,0,0,4
chr2	223386439	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:5,5,1,1
chr2	223436607	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,12,10
chr2	223489249	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=137,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr2	223489293	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=173,243;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:3,1,2,2
chr2	223493435	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	223499077	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=168,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:6,0,3,1
chr2	223520905	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=371,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr2	223781018	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:7,0,5,1
chr2	223785846	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,3:3,5:2,3,2,6
chr2	223787559	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=195,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:1,0,2,6
chr2	223787691	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,3:4,0:3,2,2,1
chr2	223789080	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=146,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,6:2,2:2,0,8,0
chr2	223793471	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=89,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0|1:223793471_C_T:223793471:1,1,4,0
chr2	223793480	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:223793471_C_T:223793471:0,0,5,1
chr2	223797797	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=151,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr2	223799207	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	223806192	.	TTC	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=189,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.377:9:2,1:4,2:0|1:223806192_TTC_T:223806192:6,0,3,0
chr2	223806194	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,25;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,8:0.815:9:1,2:0,6:1|0:223806192_TTC_T:223806192:1,0,8,0
chr2	223919674	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=287,219;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr2	223919877	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,3:0,2:2,0,7,3
chr2	224629876	.	C	CCAT,CCATCAT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30,32;MFRL=179,166,154;MMQ=60,60,60;MPOS=4,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,8,9;RU=CAT;STR;TLOD=5.97,10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.270,0.362:8:0,2,2:2,0,1:1,2,4,1
chr2	224746864	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=224,127;MMQ=54,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:224746864_C_T:224746864:0,4,0,1
chr2	224746868	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=224,127;MMQ=54,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:224746864_C_T:224746864:0,4,0,1
chr2	224758906	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,15,1
chr2	224763816	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr2	224765894	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr2	224770780	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	224770812	.	A	AAATTACCTGGGCATGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=202,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	224777094	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0|1:224777094_T_C:224777094:0,0,7,10
chr2	224777105	.	G	GTGAT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAT;STR;TLOD=55.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,6:0,5:0|1:224777094_T_C:224777094:0,0,4,10
chr2	224824617	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:4,4:8,4:5,7,4,4
chr2	224866387	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=163,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,1:9,2:9,4,1,2
chr2	224866576	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,0:1,4:1,4,1,3
chr2	224866694	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=155,300;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:224866694_CT_C:224866694:0,1,0,1
chr2	224866712	.	CAGAT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=155,300;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:224866694_CT_C:224866694:0,1,0,1
chr2	225362384	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=249,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr2	225362492	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=229,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:5,4:5,3:6,4,5,2
chr2	225367718	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=176,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,3:6,0:5,7,2,1
chr2	225368321	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=205,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,1,1
chr2	225376032	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,1:9,1:13,6,1,1
chr2	225422585	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,11;MFRL=166,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:225422585_A_T:225422585:2,1,0,1
chr2	225422599	.	AC	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=155,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,1:1,0:0|1:225422585_A_T:225422585:1,0,0,2
chr2	225669776	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=190,112;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:7,0:13,3:10,10,0,3
chr2	225669794	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=192,112;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:7,1:14,3:12,9,1,3
chr2	225695334	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=127,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:10,2:7,2:8,9,1,3
chr2	225702565	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=198,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:0,3:2,0:2,0,0,3
chr2	225719781	.	G	GACAC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=18,20;RU=AC;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.795:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr2	225848390	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=167,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:2,4:3,0,5,0
chr2	225848579	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.647:23:2,7:5,8:2,6,6,9
chr2	226491755	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:5,0:11,2:0|1:226491755_G_T:226491755:6,10,2,0
chr2	226491759	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:9,2:0|1:226491755_G_T:226491755:6,9,2,0
chr2	226491770	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,6,8
chr2	227660776	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=174,208;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:9,3:9,2:9,9,2,3
chr2	227663855	.	AGC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=168,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GC;STR;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:2,1:7,2:8,3,2,2
chr2	227771389	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=166,46390873;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:8,1,2,0
chr2	227773466	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=153,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:7,1,2,1
chr2	227860250	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=167,83;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:6,0:15,4:6,15,0,4
chr2	227874957	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=208,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,3:6,1:8,5,4,0
chr2	227877037	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,5:4,3:3,4,0,8
chr2	227886925	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=178,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,3:5,3:4,3,0,6
chr2	227892720	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,4:4,1:1,6,1,4
chr2	227896652	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=107,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.319:17:3,4:8,1:7,5,4,1
chr2	227912331	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=61,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:1,1,1,5
chr2	227915601	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=179,265;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:3,0,3,0
chr2	227915924	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=234,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,2:0,1:1,4,0,3
chr2	227922104	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=245,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,2:0,2:0|1:227922104_T_C:227922104:1,0,5,0
chr2	227922109	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=245,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.757:6:1,2:0,2:0|1:227922104_T_C:227922104:1,0,5,0
chr2	227922321	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=197,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,4:5,1:6,6,2,3
chr2	227954525	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,79;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:5,2,2,1
chr2	227954599	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=117,146;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:3,2,3,1
chr2	227966148	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr2	227966298	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=49,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.585:12:4,3:1,4:2,3,3,4
chr2	227966309	.	A	AAAGGAGCTGCTCTGAGAGCAG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=182,49;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.260:12:3,3:5,0:3,6,2,1
chr2	227967601	.	ACAATATTTCAGCAATAGGGAAAG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.921:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr2	227967830	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=218,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:1,5:0,5:1,1,4,7
chr2	227973410	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr2	227973623	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,4:0,9:0,0,5,8
chr2	227973968	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=122,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:2,2:5,0:4,3,0,2
chr2	227974113	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	227979484	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=161,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr2	227983394	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=174,279;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,1:3,3:5,4,2,2
chr2	228104760	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr2	228109626	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.592:10:2,2:2,3:3,1,5,1
chr2	228109784	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr2	228112186	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=45.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr2	228113175	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr2	228118156	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=191,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:7,1:1,1:1,7,0,2
chr2	228118392	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:5,4,2,0
chr2	228119461	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=215,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:5,3,1,2
chr2	228144706	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr2	228145543	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr2	228146991	.	AATAT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=212,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=AT;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	228149107	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=148,249;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr2	228158418	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=100,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,4:6,4:5,4,5,3
chr2	228158531	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,98;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,3:9,0:6,13,3,0
chr2	228159660	.	GTT	G,GT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,32,33;MFRL=109,180,167;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.52,6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.330,0.458:6:1,0,2:0,2,1:1,0,3,2
chr2	228159677	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:1,0:3,2,2,0
chr2	228169632	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=140,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr2	228194480	.	AG	TT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:6,2:15,0:8,13,1,1
chr2	228194570	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr2	228197368	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr2	228204929	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	228204982	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr2	228207625	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	228211074	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr2	228220528	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,2:4,3:1,9,0,5
chr2	228243905	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=114,232;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:6,1:16,4:11,11,2,3
chr2	228356364	.	GTT	G,GT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33,34;MFRL=141,136,140;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=17.03,26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,10,15:0.335,0.493:30:2,7,8:3,3,7:3,2,9,16
chr2	228373404	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=259,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr2	228384735	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=146,119;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:4,9:7,2:5,6,7,4
chr2	228395825	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:15,0:5,2:11,9,0,2
chr2	228399480	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	228401306	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:6,3:5,1:9,2,3,1
chr2	228416818	.	T	TGGCA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=164,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,2:14,0:0|1:228416818_T_TGGCA:228416818:8,16,0,2
chr2	228416820	.	T	TTTGTGGG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=161,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,2:16,0:0|1:228416818_T_TGGCA:228416818:8,17,0,2
chr2	228416822	.	A	AGG	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=161,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,2:15,0:0|1:228416818_T_TGGCA:228416818:8,17,0,2
chr2	228493211	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=191,154;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:10,1:4,4:8,6,4,1
chr2	228560800	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,5:0,6:0,0,7,4
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chr2	228565936	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:228565934_C_CATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTT:228565934:0,0,0,1
chr2	228680153	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:2,2:2,1:4,0,2,1
chr2	228736341	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,0:6,5:5,6,3,2
chr2	228750239	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:1,1,0,6
chr2	228756144	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,345;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	228758456	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,0:6,3:7,0,3,0
chr2	228767618	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	228767631	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=200,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr2	228776938	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=192,252;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	228783447	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=181,243;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:9,1:11,4,2,0
chr2	228884686	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:4,3:7,2:5,6,3,2
chr2	228886413	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=147,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:4,2:2,0:3,6,2,0
chr2	228890166	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:3,1:8,1:8,3,2,0
chr2	228973660	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=195,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,5:2,2:1,5,1,6
chr2	228973723	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=218,237;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.412:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr2	230096837	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	230135711	.	G	GC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=89.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,14:0,12:0,0,14,13
chr2	230231889	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	230252994	.	TG	CA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=127,54;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:9,5,1,1
chr2	230253006	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=121,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,0:4,2:0|1:230253006_A_C:230253006:8,4,1,1
chr2	230253007	.	C	CTGGCT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=121,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:7,0:5,2:0|1:230253006_A_C:230253006:8,4,1,1
chr2	230341979	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=164,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr2	230453214	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.732:9:0,3:1,3:1,1,3,4
chr2	230656987	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=117,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:5,2:3,3:0,8,0,5
chr2	230663576	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=210,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,5:4,5:5,0,8,2
chr2	230666898	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=157,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr2	230668489	.	AGC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=184,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:230668489_AGC_A:230668489:0,1,0,1
chr2	230668492	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=184,135;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:230668489_AGC_A:230668489:0,1,0,1
chr2	230668858	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=122,110;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:10,6:5,7:8,7,8,5
chr2	230668968	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,3:4,2:1,4,2,3
chr2	230668982	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:1,2,1,4
chr2	230705516	.	TA	T,TAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27,24;MFRL=139,201,174;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=7.13,3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,3:0.294,0.243:13:3,3,1:3,0,1:5,1,5,2
chr2	230723777	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.274:27:8,4:12,3:9,11,0,7
chr2	230841074	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=179,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,4:3,0:2,5,3,1
chr2	231035575	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=198,228;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr2	231036311	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=301,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr2	231036754	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=225,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:2,2,2,2
chr2	231036768	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=205,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,2:0,3:1,3,2,3
chr2	231036860	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=143,287;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:4,1:7,3,1,1
chr2	231036866	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=238,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,5:2,4:2,1,5,4
chr2	231037616	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=133,264;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:13,2:9,3:15,7,1,4
chr2	231037770	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=206,220;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,0:1,7:0,4,0,7
chr2	231065503	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=209,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr2	231076289	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=322,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:0,8:2,5:1,1,6,8
chr2	231077110	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=132,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.194:34:16,3:11,3:17,11,3,3
chr2	231077155	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=168,276;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:23,0:9,2:13,19,0,2
chr2	231077676	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:7,0:7,4:9,5,2,2
chr2	231081711	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=211,172;MMQ=56,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:231081711_G_A:231081711:0,4,0,1
chr2	231081713	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=211,172;MMQ=56,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:231081711_G_A:231081711:0,4,0,1
chr2	231081723	.	GG	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=223,172;MMQ=52,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:231081711_G_A:231081711:0,3,0,1
chr2	231110737	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=198,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr2	231113499	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=191,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr2	231120255	.	CGG	C,CG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28,29;MFRL=0,163,145;MMQ=60,60,60;MPOS=22,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=G;STR;TLOD=8.36,12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,6:0.427,0.511:12:0,1,3:0,5,3:0,0,5,7
chr2	231149108	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,15:0,0,12,17
chr2	231152633	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,0:9,2:11,10,0,2
chr2	231155269	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,236;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,1:8,2:7,12,1,2
chr2	231157512	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=92,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:15,2:14,2:7,22,0,4
chr2	231157527	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=82,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:8,6:12,2:1,19,0,8
chr2	231175763	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,240;MMQ=56,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,1,1
chr2	231176376	.	A	ATTCCATACTATTATTATGTAAGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=164,45107;MMQ=27,21;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:231176376_A_ATTCCATACTATTATTATGTAAGT:231176376:2,4,0,2
chr2	231176379	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=164,45107;MMQ=27,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:231176376_A_ATTCCATACTATTATTATGTAAGT:231176376:2,4,0,2
chr2	231177200	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chr2	231222499	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,266;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:7,2,2,0
chr2	231223880	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=129,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,0:6,4:3,10,1,3
chr2	231226488	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=283,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:2,2:0,1:0,2,0,4
chr2	231253183	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:4,1:4,2:6,2,3,0
chr2	231253216	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,3:5,3,4,1
chr2	231253434	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=192,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:1,6,1,1
chr2	231254570	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=156,261;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr2	231256861	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=169,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:7,12:7,0:10,4,12,0
chr2	231327294	.	T	TATATAATTAAAATTATAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=208,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.315:4:3,1:0,0:1,2,0,1
chr2	231331799	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:2,1,6,0
chr2	231334532	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.331:30:14,6:6,2:12,8,2,8
chr2	231337960	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=154,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	231359225	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=131,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:19,0:10,3:7,22,2,1
chr2	231363252	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=126,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:7,4:2,8:2,10,2,11
chr2	231368897	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=119,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,1:6,3:7,4,2,2
chr2	231372772	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:7,3:10,0:11,6,3,0
chr2	231375865	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:2,6:10,3:8,5,6,3
chr2	231375974	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr2	231380033	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=180,68;MMQ=60,44;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,0:10,2:15,7,2,0
chr2	231406529	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=185,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr2	231407519	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,5:3,5:3,3,5,5
chr2	231407663	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:7,4:2,8:6,3,6,6
chr2	231674958	.	A	AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,1:9,1:13,6,3,0
chr2	231678888	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=102,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:13,0:16,4:4,25,0,4
chr2	231742711	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=265,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:3,7:5,6:3,5,4,9
chr2	231860848	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr2	231864600	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=270,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:0,3,0,7
chr2	231865018	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:7,2,2,0
chr2	231865047	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:6,2:12,2:12,6,3,1
chr2	231865144	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=186,138;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,6:5,4:6,4,4,6
chr2	231927382	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,2:14,0:10,12,2,0
chr2	231940295	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.459:24:4,7:7,4:7,6,7,4
chr2	231943277	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	231943556	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=213,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:231943556_C_T:231943556:0,3,0,1
chr2	231943567	.	G	GACATGATCAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=232,120;MMQ=55,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:231943556_C_T:231943556:0,2,0,1
chr2	231944373	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=209,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.414:15:3,4:6,2:5,4,0,6
chr2	231948178	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=291,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr2	231948391	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=131,240;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:12,9,0,2
chr2	231978627	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.282:37:10,0:17,10:9,18,0,10
chr2	232030510	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=327,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr2	232030555	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=327,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	232035429	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=196,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,4:6,3:5,5,3,4
chr2	232121407	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,1,2
chr2	232135541	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=230,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:3,4,2,2
chr2	232196472	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:4,3,1,2
chr2	232317402	.	CA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=221,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:5,6:5,8:6,4,6,8
chr2	232321956	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=183,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:8,3:6,4:7,7,4,3
chr2	232378381	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=193,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:1,4:0,3,1,5
chr2	232390151	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:2,2:5,5:2,5,0,7
chr2	232458201	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=158,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,3:7,0:6,7,1,2
chr2	232572381	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=203,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,6:2,4:3,0,9,1
chr2	232574807	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,242;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr2	232576661	.	GG	CT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=126,174;MMQ=54,20;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:13,0:11,6:5,19,0,6
chr2	232577421	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=268,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,5:3,1:4,3,4,2
chr2	232577586	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=205,165;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,3:4,1:8,2,2,2
chr2	232597631	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:7,5,0,2
chr2	232653481	.	A	ACT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=118,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CT;STR;TLOD=52.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:1,5:2,7:1,2,2,11
chr2	232879564	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=154,246;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr2	233028070	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	233243660	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,7,8
chr2	233243981	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=62,159;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:0,6:3,3:1,2,5,4
chr2	233244000	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:9,0:4,3:7,6,1,2
chr2	233245090	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=100,154;MMQ=45,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:2,2,4,1
chr2	233246562	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233246562_T_C:233246562:0,0,0,1
chr2	233246565	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233246562_T_C:233246562:0,0,0,1
chr2	233246567	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,188;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233246562_T_C:233246562:0,0,0,1
chr2	233246569	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233246562_T_C:233246562:0,0,0,1
chr2	233271697	.	TAC	T,TACAC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,28,27;MFRL=181,161,233;MMQ=60,56,60;MPOS=14,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=AC;STR;TLOD=6.01,8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.248,0.333:9:3,1,2:1,1,1:1,3,3,2
chr2	233271853	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=185,105;MMQ=52,29;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,1:5,1:5,4,0,2
chr2	233272162	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=238,220;MMQ=56,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,3,1
chr2	233274145	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,39;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	233274169	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,39;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	233321371	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=200,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.538:22:4,0:6,11:5,5,0,12
chr2	233321723	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=171,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,0:6,3:6,7,2,1
chr2	233321836	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=201,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,3:3,1:5,2,2,2
chr2	233322424	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=113,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.487:15:3,5:2,2:4,4,5,2
chr2	233323177	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr2	233323205	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=186,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:2,2,1,1
chr2	233344991	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=107,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:1,3,2,1
chr2	233345249	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=211,230;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:0,7,0,2
chr2	233346662	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	233347290	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=176,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,0:6,3:3,7,0,3
chr2	233347919	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=230,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,2:3,6:1,2,1,7
chr2	233348647	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=182,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr2	233350000	.	C	G,CGCGGGCG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25,24;MFRL=0,159,70;MMQ=60,60,60;MPOS=20,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.89,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.634,0.245:5:0,2,0:0,2,1:0,0,1,4
chr2	233350001	.	A	ATGCGGCGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,17;MFRL=159,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:1,3,0,1
chr2	233396009	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=151,242;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:3,1,1,1
chr2	233400074	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=206,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr2	233404334	.	C	CGGGCTGGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=228,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGCTGGCT;STR;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	233404590	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=96,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,1,2
chr2	233407120	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,2:4,1:5,5,1,2
chr2	233407510	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=232,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:233407510_CT_C:233407510:1,0,1,0
chr2	233407516	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=232,215;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:233407510_CT_C:233407510:1,0,1,0
chr2	233408190	.	A	ACCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=240,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=C;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,1:2,2,0,2
chr2	233408220	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr2	233408239	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=285,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,3:1,0,2,2
chr2	233415978	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=126,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.521:19:6,4:3,5:2,7,3,7
chr2	233421284	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr2	233428927	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=102,243;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:13,2:6,2:12,8,0,4
chr2	233429144	.	GTATTT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TATTT;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.699:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	233470931	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=182,242;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:6,11,1,1
chr2	233536926	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=123,216;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	233612413	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,100235600;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:2,13,0,2
chr2	233641010	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr2	233641083	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=238,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,4:2,6:2,0,6,4
chr2	233655361	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=185,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,0:6,2:7,0,2,0
chr2	233660704	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=227,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr2	233660846	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.467:11:3,1:2,4:2,4,2,3
chr2	233661032	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	233677041	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=209,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.431:5:1,0:1,2:0|1:233677041_CT_C:233677041:1,2,2,0
chr2	233677056	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.335:7:2,0:2,0:0|1:233677041_CT_C:233677041:3,2,2,0
chr2	233681512	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr2	233697763	.	TGCA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCA;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:3,0:0,7,0,2
chr2	233708806	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,79;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.802:18:0,11:3,4:1,2,7,8
chr2	233711987	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=161,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:5,0,4,0
chr2	233712049	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=222,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:2,6:1,10:2,1,11,5
chr2	233712208	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=148,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:233712208_G_A:233712208:7,11,1,1
chr2	233712212	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=156,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:0|1:233712208_G_A:233712208:6,12,1,1
chr2	233712226	.	CACA	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=244,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=60.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:1,7:1,7:0,2,4,12
chr2	233712248	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:8,1:4,4:0,12,1,4
chr2	233712296	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=222,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,3:0,6:0,1,1,8
chr2	233721455	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=209,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,2:1,5:2,3,4,3
chr2	233740227	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=235,124;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:0,4:1,5:1,0,6,4
chr2	233744130	.	GCCC	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,19;MFRL=260,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:233744130_GCCC_G:233744130:1,0,1,0
chr2	233744141	.	CCCA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,12;MFRL=159,260;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr2	233744148	.	TC	AG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=15,10;MFRL=260,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:233744130_GCCC_G:233744130:1,0,1,0
chr2	233744161	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,10;MFRL=196,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:233744130_GCCC_G:233744130:2,0,1,0
chr2	233744163	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,15;MFRL=196,159;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:233744130_GCCC_G:233744130:2,0,1,0
chr2	233744478	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	233750074	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:6,2:2,4:4,5,4,2
chr2	233750118	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=200,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.777:10:0,5:1,3:1,1,3,5
chr2	233752639	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	233757683	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=171,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,1:6,2:6,6,1,2
chr2	233757697	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,4,7
chr2	233759362	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=211,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	233759695	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=149,287;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0,5,0,5
chr2	233791988	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	233834975	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=70,198;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,4:5,4:4,5,6,2
chr2	233877867	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=160,53;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,3:8,0:12,5,2,1
chr2	233899377	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=185,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,3:6,3:6,7,4,2
chr2	233899554	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=237,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:3,3,3,0
chr2	233925406	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,0:7,4:0,14,0,4
chr2	233990412	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=191,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,1:6,2:6,4,2,1
chr2	234072626	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	234091135	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=171,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:2,10,0,3
chr2	234091158	.	TG	CA,CG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,35,27;MFRL=206,187,166;MMQ=60,60,60;MPOS=13,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.76,6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,3:0.265,0.266:12:2,1,3:4,2,0:1,5,1,5
chr2	234093035	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=133,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:8,3,2,0
chr2	234104029	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=188,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.344:18:4,2:7,3:7,5,4,2
chr2	234160669	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=191,251;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr2	234178624	.	CTTT	C,CTT,CTTTT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=34,34,32,26;MFRL=127,181,179,161;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,10,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.62,12.14,13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,2,6,7:0.117,0.309,0.369:19:3,1,2,2:0,1,3,1:3,1,11,4
chr2	234178781	.	AT	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.305:26:8,2:10,4:5,13,1,7
chr2	234181556	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=187,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:11,2:6,4:15,2,5,1
chr2	234181593	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.575:38:13,12:3,10:12,4,17,5
chr2	234183468	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=157,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr2	234186261	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=120,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,1:9,2:8,12,0,3
chr2	234201017	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:15,0:7,3:13,11,3,0
chr2	234227693	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=158,254;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	234229395	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,2:7,3:4,11,4,1
chr2	234235749	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,269;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.633:9:2,1:1,4:1,2,4,2
chr2	234238254	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,0,2
chr2	234294561	.	T	TTC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=217,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:3,6:1,7:2,2,9,4
chr2	234296944	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=149,48;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:12,0:17,3:16,13,0,3
chr2	234343086	.	TGGATTGCA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=146,76;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,0:9,2:12,12,1,1
chr2	234347091	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=160,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr2	234363127	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,252;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:6,9,0,2
chr2	234375944	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,247;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr2	234378074	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=142,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,1:8,1:6,15,1,1
chr2	234398195	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=257,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:6,0:1,2:0,7,1,1
chr2	234429739	.	T	TTTC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=129,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTC;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:5,14,1,1
chr2	234429764	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=179,111;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:5,0:7,5:4,9,0,5
chr2	234438246	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	234442437	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=152,173;MMQ=57,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,2:1,5:0,4,1,6
chr2	234449462	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=231,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr2	234450822	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,291;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	234457877	.	TAAAAGAAAAAAGAACAAAAATATTGATATAGTTTTCATAAAATGCTGATAATAATC	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,10:0.137:32:10,3:6,4:0|1:234457877_TAAAAGAAAAAAGAACAAAAATATTGATATAGTTTTCATAAAATGCTGATAATAATC_T:234457877:7,15,3,7
chr2	234457900	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=167,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,13:0.796:16:1,9:2,4:1|0:234457877_TAAAAGAAAAAAGAACAAAAATATTGATATAGTTTTCATAAAATGCTGATAATAATC_T:234457877:2,1,4,9
chr2	234469974	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=228,199;MMQ=31,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr2	234602277	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=140,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:9,4:9,2:11,7,4,2
chr2	234698065	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	234704495	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=226,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:2,2:8,1:2,8,0,3
chr2	234704746	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=239,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,1,2
chr2	234707341	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=252,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,4:2,1:2,0,5,0
chr2	234708570	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,4:1,3:1,3,3,4
chr2	234712921	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=224,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,3:1,4:2,2,1,6
chr2	234713812	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=266,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr2	234727250	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,4,4
chr2	234738472	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:0,8,0,3
chr2	234740797	.	C	CAAAA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=159,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.410:15:6,2:2,3:0|1:234740797_C_CAAAA:234740797:6,3,5,1
chr2	234740798	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=159,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.411:15:6,3:3,3:0|1:234740797_C_CAAAA:234740797:6,3,5,1
chr2	234740809	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=162,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:7,2:8,1:11,4,2,1
chr2	234740985	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=182,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:234740985_G_A:234740985:1,1,0,2
chr2	234740987	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=182,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:234740985_G_A:234740985:1,1,0,2
chr2	234741022	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=244,277;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr2	234750400	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,1:6,1:12,5,2,0
chr2	234753008	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr2	234754273	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=198,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,1,1
chr2	234754506	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=121,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:2,4,0,3
chr2	234761355	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,4:3,4:0,6,1,7
chr2	234763226	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=138,240;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,3:3,1:0,3,0,4
chr2	234846198	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	234890391	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=37,28;MFRL=180,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,2:0,6:1,0,5,3
chr2	234967410	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=192,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr2	234969154	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:2,6:9,2:3,8,3,5
chr2	235405561	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:235405561_G_A:235405561:0,0,0,1
chr2	235405566	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:235405561_G_A:235405561:0,0,0,1
chr2	235405629	.	TGCTCCC	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCTCCC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	235943682	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=166,49;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.264:13:4,0:4,3:0|1:235943682_T_C:235943682:5,5,2,1
chr2	235943684	.	GC	TT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=166,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,0:4,3:0|1:235943682_T_C:235943682:5,5,2,1
chr2	235943691	.	T	TTAGCCACAGTCCTGTTC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=145,49;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,0:5,3:0|1:235943682_T_C:235943682:5,6,2,1
chr2	235943693	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=145,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,0:5,1:0|1:235943682_T_C:235943682:5,6,2,1
chr2	236433161	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,1:5,1:5,6,1,1
chr2	236433282	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=157,76;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:5,4:7,0:5,7,3,1
chr2	236433331	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=138,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr2	236682856	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=238,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr2	236682914	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=276,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:4,2,4,0
chr2	236685532	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=226,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr2	236685731	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=136,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:2,6,2,1
chr2	236706510	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=156,39;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:8,2:0|1:236706510_T_A:236706510:7,5,1,1
chr2	236706515	.	C	CGATGACACT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=156,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0|1:236706510_T_A:236706510:7,5,1,1
chr2	236761396	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:4,9:7,4:6,5,4,9
chr2	236761414	.	C	CCAGG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAGG;STR;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.270:20:9,2:6,3:8,7,2,3
chr2	236817629	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	236877066	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.751:13:2,7:0,3:1,2,7,3
chr2	236923361	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.317:12:4,3:3,1:7,1,2,2
chr2	237028849	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=172,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.223:11:6,1:3,0:5,4,1,1
chr2	237029026	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,1:4,1:8,3,0,2
chr2	237029163	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:0,10,0,2
chr2	237032523	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=121,249;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:1,1:3,1:4,1,0,2
chr2	237032574	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=146,249;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,2:11,2:9,10,2,2
chr2	237032837	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=146,227;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr2	237032856	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=184,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr2	237076711	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	237105050	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=126,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:3,3,2,1
chr2	237255303	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,1:7,4:6,4,4,1
chr2	237255500	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=208,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	237289197	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=114,234;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,2:8,1:10,5,3,0
chr2	237327743	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=133,69;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:4,4:12,0:9,7,2,2
chr2	237396935	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,319;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	237405766	.	CAAA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,314;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,5;RU=A;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:7,3,2,0
chr2	237995981	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=167,279;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:9,2:2,2:7,4,3,1
chr2	238005515	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,0:11,2:7,18,2,0
chr2	238166147	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=178,133;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:2,5:0,4:0,2,0,9
chr2	238243429	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=142,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:14,2:9,1:11,13,2,1
chr2	238243464	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,16:0,6:0,0,12,10
chr2	238249771	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:2,7,0,2
chr2	238256544	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=221,102;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,0:14,3:5,18,0,3
chr2	238259675	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=280,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:0,7:1,2:1,0,10,0
chr2	238261112	.	GC	AA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=203,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:3,7:0,9:3,0,12,4
chr2	238265995	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,0:10,2:9,14,0,2
chr2	238266019	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:11,0:8,2:8,11,0,2
chr2	238266633	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	238267058	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=268,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	238268681	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=117,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,3:6,1:8,4,3,1
chr2	238269871	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:10,1:3,2:6,8,0,4
chr2	238270411	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=113,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:8,2,2,0
chr2	238283472	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,0:10,3:10,8,2,1
chr2	238285592	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,161;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.142:23:9,2:11,0:11,9,3,0
chr2	238287514	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:11,8,1,1
chr2	238289817	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=234,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:3,1:5,2:4,4,2,1
chr2	238296807	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:11,4:9,1:8,12,3,2
chr2	238330273	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,292;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,1:9,1:11,9,0,2
chr2	238330797	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=117,275;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,2:9,0:8,13,1,1
chr2	238461723	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,102;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,0:5,3:10,6,0,3
chr2	238484222	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=150,222;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	238486629	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,3:7,0:6,5,2,1
chr2	238494123	.	T	TGCC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.331:16:6,1:5,3:0|1:238494123_T_TGCC:238494123:1,10,5,0
chr2	238494127	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=118,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:5,2:5,3:0|1:238494123_T_TGCC:238494123:1,9,5,0
chr2	238494132	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,2:4,2:0|1:238494123_T_TGCC:238494123:0,9,5,0
chr2	238494136	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,1:6,2:0|1:238494123_T_TGCC:238494123:0,13,4,0
chr2	238499988	.	C	CCTCTTCTTCCAGCTTCTAATATAGCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=200,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	238636409	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=205,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:8,0,4,0
chr2	238636606	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=206,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:12,4:8,1:7,13,1,4
chr2	238641117	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:9,2:3,4:1,11,0,6
chr2	238642489	.	CGCA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:11,2:4,1:0,15,3,0
chr2	238656936	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=105,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:5,1,3,2
chr2	238658030	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=249,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:0,3,0,5
chr2	238661870	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=203,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr2	238662154	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=221,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	238664831	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.286:26:10,7:9,0:11,8,7,0
chr2	238666081	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,2:9,1:10,9,1,2
chr2	238667501	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=249,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:2,0:0,1:0,2,0,2
chr2	238688244	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr2	238722438	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=313,175;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	238726702	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,1:8,3:4,9,2,2
chr2	238730317	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr2	238732220	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,2:13,0:4,17,0,2
chr2	238742837	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,1:7,2:7,7,1,2
chr2	238896494	.	CT	C,CAT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,35,33;MFRL=196,164,185;MMQ=60,60,60;MPOS=27,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.71,3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.334,0.333:6:2,2,1:0,0,1:2,0,4,0
chr2	238896495	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.615:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr2	238896496	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr2	238903310	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	238912120	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,5:0,1:0,2,1,6
chr2	238939370	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=264,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:0,7,0,5
chr2	238944441	.	ACT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=167,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:5,1,3,0
chr2	238991557	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=245,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.451:9:1,2:4,2:0|1:238991557_CT_C:238991557:5,0,4,0
chr2	238991560	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=234,258;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.353:9:3,0:3,3:6,0,3,0
chr2	238991562	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=245,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.466:9:1,2:4,2:0|1:238991557_CT_C:238991557:5,0,4,0
chr2	239002480	.	CTTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:1,2,7,1
chr2	239005465	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=137,225;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:3,2:14,0:9,8,2,0
chr2	239007806	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr2	239007850	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=123,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:4,4:3,1:4,4,3,2
chr2	239007991	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=153,122;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,4:4,3:1,4,1,6
chr2	239007997	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:1,7,1,3
chr2	239010577	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=226,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr2	239016466	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:5,2,4,2
chr2	239025523	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=144,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:1,4:7,3:5,3,5,2
chr2	239034043	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=184,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,2:5,1:5,4,1,2
chr2	239036416	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,6:1,1:0,2,0,7
chr2	239037273	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,261;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:10,0,4,0
chr2	239039896	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=251,149;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,5,1
chr2	239053436	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr2	239053685	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	239054504	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=189,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,4:1,11:0,2,6,9
chr2	239073046	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,0,2
chr2	239082166	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=164,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,4:1,6:4,0,8,2
chr2	239092474	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=234,372;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,2,1
chr2	239093788	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=199,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr2	239102856	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=205,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr2	239103574	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=216,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:2,4,2,4
chr2	239103603	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=198,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,1,3
chr2	239133843	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,5:3,3:6,2,4,5
chr2	239139907	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=59,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,3:0,7:0,2,5,5
chr2	239147792	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:8,0:3,2:6,5,0,2
chr2	239148970	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:8,2,4,0
chr2	239148996	.	CCCGT	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCGT;STR;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,2:4,4:5,3,1,5
chr2	239165636	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,6:6,1:7,4,4,3
chr2	239168596	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.232:19:6,1:8,3:11,4,3,1
chr2	239181851	.	T	TCA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.638:9:2,1:1,4:0|1:239181851_T_TCA:239181851:1,2,0,6
chr2	239181860	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:2,1:1,5:0|1:239181851_T_TCA:239181851:1,3,0,6
chr2	239181904	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=197,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,0:2,4:0,7,0,4
chr2	239186589	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.463:11:2,3:4,2:3,3,1,4
chr2	239241445	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.324:16:5,2:5,3:9,2,3,2
chr2	239242719	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=204,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.438:7:2,2:1,1:1,3,2,1
chr2	239247174	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	239353136	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=168,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,1:12,1:9,14,1,1
chr2	239988606	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=178,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,2:4,1:7,4,2,2
chr2	240016771	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:9,5:4,3:5,8,3,5
chr2	240016824	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=161,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:0,12,0,2
chr2	240024654	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=169,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr2	240029736	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,14,1
chr2	240055901	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=179,238;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,0:2,4:3,0,4,0
chr2	240066417	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,4,12
chr2	240078488	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:1,4,0,3
chr2	240085403	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=200,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,6,0
chr2	240085674	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:1,0,1,5
chr2	240098165	.	T	TC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=153,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:8,14,0,2
chr2	240111477	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=234,233;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr2	240504878	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	240721598	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.384:19:5,5:6,2:5,7,2,5
chr2	240900607	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=177,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,6:3,1:4,5,0,7
chr2	240921463	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=146,276;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	240923146	.	TC	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=122,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,4:5,6:2,6,1,9
chr2	240954110	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=143,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,3:5,2:4,2,5,0
chr2	240957312	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=179,83;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:3,7,0,2
chr2	240958129	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:0,6,0,4
chr2	240961728	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:5,6:5,6:6,4,6,6
chr2	240961852	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=176,250;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr2	240981179	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=230,244;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:0,3:4,1:4,0,5,0
chr2	240985279	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=203,50;MMQ=27,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:12,6:8,0:9,11,6,0
chr2	241066280	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=226,139;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:0,6:3,3:1,2,3,6
chr2	241073450	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=211,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,5:1,3:2,3,2,6
chr2	241075538	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,346;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:241075538_GC_G:241075538:0,0,1,0
chr2	241075545	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=175,346;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:241075538_GC_G:241075538:0,1,1,0
chr2	241075548	.	CC	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=204,346;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:241075538_GC_G:241075538:0,2,1,0
chr2	241075809	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=187,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,2,4
chr2	241389280	.	C	CCAGCTGCAACACTA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=156,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:0|1:241389280_C_CCAGCTGCAACACTA:241389280:6,7,1,1
chr2	241389282	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=156,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:0|1:241389280_C_CCAGCTGCAACACTA:241389280:6,7,1,1
chr2	241390002	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=188,72;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,3:3,0:9,3,2,1
chr2	241394317	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=79,63;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.414:8:0,3:3,0:3,2,3,0
chr2	241395482	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:241395482_C_G:241395482:2,2,0,1
chr2	241395500	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=152,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:241395482_C_G:241395482:0,2,1,0
chr2	241395503	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=139,186;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:241395482_C_G:241395482:0,1,1,1
chr2	241403955	.	GTGACGCCTGCGTGTGCGTGTCAACGCCTGTGTGCGCGCGT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.719:12:2,3:0,6:2,1,8,1
chr2	241404213	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=181,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:7,3,0,2
chr2	241404237	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,5:4,2:2,3,4,3
chr2	241405400	.	C	CGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr2	241439809	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr2	241439962	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,0:3,2:8,5,0,2
chr2	241440020	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=136,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,3:4,0:1,4,1,2
chr2	241452198	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=207,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.858:19:1,7:1,10:1,1,13,4
chr2	241452212	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=207,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.880:23:1,8:1,13:1,1,15,6
chr2	241465118	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=148,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,2:12,0:0|1:241465118_G_A:241465118:14,9,1,1
chr2	241465122	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=139,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,2:13,0:0|1:241465118_G_A:241465118:14,10,1,1
chr2	241471592	.	AAAG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=136,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:6,7,1,1
chr2	241492255	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=194,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr2	241496567	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=254,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.866:20:2,12:0,6:2,0,11,7
chr2	241500674	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=183,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,4:5,1,7,1
chr2	241500896	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=181,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:7,4:1,6:1,7,5,5
chr2	241512470	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr2	241534188	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=209,231;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr2	241534381	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=239,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr2	241538229	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr2	241555784	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=233,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:4,1,3,0
chr2	241570249	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:1,3:4,2:4,1,0,6
chr2	241570284	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=178,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:2,3,2,1
chr2	241570736	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=184,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:2,4:0,1:1,1,0,6
chr2	241627767	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=219,263;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr2	241659368	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,5:0,1:0,3,0,6
chr2	241663019	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=178,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr2	241663432	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=157,86;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.141:26:11,2:11,1:0|1:241663432_G_A:241663432:7,16,1,2
chr2	241663436	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=109,213;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:19,6:0.259:25:13,0:6,6:1|0:241663432_G_A:241663432:7,12,0,6
chr2	241674222	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=233,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.892:16:0,7:1,8:1,0,5,10
chr2	241680644	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	241696840	.	ATCC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=225,189;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TCC;STR;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:1,4:1,5:2,2,4,5
chr2	241702403	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=245,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:241702403_G_C:241702403:1,0,0,1
chr2	241702408	.	GC	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,27;MFRL=245,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:241702403_G_C:241702403:1,0,0,1
chr2	241702412	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=245,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:241702403_G_C:241702403:1,0,0,1
chr2	241702561	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	241726646	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:4,1:3,2:7,1,3,0
chr2	241727441	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=118,340;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:241727441_T_TG:241727441:0,1,1,0
chr2	241727448	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=118,340;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:241727441_T_TG:241727441:0,1,1,0
chr2	241727452	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,12;MFRL=118,340;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:241727441_T_TG:241727441:0,1,1,0
chr2	241808792	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr2	241813289	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	241813496	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:2,5:2,2:3,1,4,4
chr2	241815307	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	241815473	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=199,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:0,7:2,8:1,1,5,10
chr2	241827650	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=143,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	241827676	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:1,3:1,1:2,0,5,2
chr2	241827696	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.755:9:0,4:1,3:2,0,4,3
chr2	241828138	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	241834830	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=288,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,4:3,1:3,0,5,0
chr2	241834875	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=288,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,6:1,3:1,0,7,2
chr2	241858338	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:8,1:1,1:5,4,0,2
chr2	241859307	.	G	GGCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=204,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:241859307_G_GGCCC:241859307:1,0,1,0
chr2	241859309	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=204,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:241859307_G_GGCCC:241859307:1,0,1,0
chr2	241861904	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=187,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	241870583	.	C	CAGCGGTGGGGCTGGACTCTCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=227,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr2	241870593	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	241871821	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=153,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:9,2:11,0:9,13,1,1
chr2	241871847	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:9,2:6,8:6,9,3,7
chr2	241874559	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,335;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:0,5,2,1
chr2	241889171	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=216,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:1,1,1,7
chr2	241889937	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,9,10
chr2	241898947	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=297,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.621:9:2,2:1,1:0,3,0,6
chr2	241973977	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=202,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.366:9:2,0:1,3:4,2,1,2
chr2	241976615	.	CG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=120,250;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:5,2,4,1
chr2	242003558	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr2	242004199	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=224,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,5:2,4:2,1,9,0
chr2	242004219	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr2	242011151	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr2	242011330	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,0:1,2:1,4,0,2
chr2	242047529	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,142;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:2,5:8,0:10,0,5,0
chr2	242062130	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.714:26:3,9:4,10:4,3,11,8
chr2	242065601	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,4:2,7:3,1,7,4
chr2	242072280	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=122,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,7:3,7:4,2,6,8
chr2	242075192	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,279;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	242075423	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=134,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:11,0:7,5:7,11,0,5
chr2	242077348	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=138,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.212:20:13,2:3,1:13,3,1,3
chr2	242078057	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=201,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,5:2,0:4,2,4,1
chr2	242079103	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=134,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:0,9,0,4
chr2	242079210	.	G	GTCACCCAAACCACTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=255,460;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:3,1,0,1
chr2	242079233	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=201,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr2	242079261	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=183,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr2	242082480	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,35;MFRL=357,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.803:6:0,1:0,4:1,0,2,3
chr2	242099961	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr2	242105939	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=230,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:1,8,0,2
chr2	242139491	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,320;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	242142737	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr2	242146949	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,15;MFRL=293,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.664:4:0,0:1,0:1,0,3,0
chr2	242149010	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=198,117;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,2,0
chr2	242149027	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	242174860	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=207,149862254;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:7,3,2,0
chr2	242176019	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=99,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.243:31:8,3:15,4:20,4,1,6
chr2	242186391	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=181,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:7,1,1,2
chr2	242202390	.	CCA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=172,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:3,0:0,7,0,2
chr2	242259614	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:0,5:1,8:1,0,9,4
chr2	242263615	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,2:10,0:12,7,3,0
chr2	242265313	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=176,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr2	242276377	.	CGT	C,TGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,27,28;MFRL=224,291,176;MMQ=35,40,40;MPOS=16,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:2,1,1:0,0,0:0,2,0,2
chr2	242276382	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=239,176;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr2	242276386	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,265;MMQ=60,35;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	242276389	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=291,239;MMQ=40,30;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	242282597	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=194,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:242282597_G_GC:242282597:0,1,0,1
chr2	242282598	.	T	TTCCATGCTTGCCCTGTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=194,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:242282597_G_GC:242282597:0,1,0,1
chr2	242283071	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	242283094	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	242285545	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=127,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:8,3:2,4:7,3,4,3
chr2	242289663	.	C	CATT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATT;STR;TLOD=66.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,5:0,0,0,15
chr2	242352633	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=228,255;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr2	242374519	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	242375813	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=203,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr2	242402087	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:0,7,0,4
chr2	242429426	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=128,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:3,2:8,0:7,5,1,1
chr2	242433348	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,7:0,1:1,0,6,2
chr2	242440126	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:4,1:6,1,1,1
chr2	242441220	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	242592868	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=168,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,0:7,7:4,8,0,7
chr2	242598862	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:1,1:2,2,1,1
chr2	242607483	.	GC	TT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=182,275;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	242611525	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr2	242615462	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	242618050	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:2,10:3,4:3,2,4,10
chr2	242624280	.	A	AAAGAAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=187,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:2,0:1,4,0,1
chr2	242648545	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,299;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:242648545_C_T:242648545:0,0,3,0
chr2	242648549	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,299;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:242648545_C_T:242648545:0,0,3,0
chr2	242662761	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=115,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.353:18:6,2:5,4:4,8,0,6
chr2	242674959	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	242680366	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:4,1,3,0
chr2	242682029	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=140,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,2:4,1:3,11,0,3
chr2	242707101	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:5,2,1,1
chr2	242707195	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,4:2,1:3,3,1,4
chr2	242738596	.	TGCCCCGGGTACCTCCTAACA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=213,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:2,5,1,1
chr2	242742842	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=210,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:9,0,2,1
chr2	242742875	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:6,6:4,2:7,3,5,3
chr2	242743651	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=199,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:4,0:0,6,0,3
chr2	242755465	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	242755645	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=189,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:6,1,3,0
chr2	242756826	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=115,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:8,0:5,10,2,0
chr2	242812080	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,33;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.400:11:2,1:1,3:0,7,2,2
chr2	242813202	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=221,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:0|1:242813202_G_A:242813202:2,3,2,5
chr2	242813205	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=221,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:0|1:242813202_G_A:242813202:2,3,2,4
chr2	242813241	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=186,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr2	242841399	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	242842382	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=264,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	242842634	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=156,47;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr3	367757	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=142,238;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,1:5,2:7,6,1,2
chr3	367825	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=184,289;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	370051	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=160,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:6,2:4,1:1,9,0,3
chr3	386247	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr3	391001	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=135,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,7:5,2:8,0,9,0
chr3	391027	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.162:16:9,0:5,1:0|1:391027_A_G:391027:12,2,1,1
chr3	391029	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.162:16:9,0:5,2:0|1:391027_A_G:391027:12,2,1,1
chr3	403288	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0|1:403288_G_A:403288:0,0,4,0
chr3	403297	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:403288_G_A:403288:0,0,4,0
chr3	403308	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=293,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr3	403345	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr3	424417	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=196,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,1:0,3,0,2
chr3	440088	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr3	1269607	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=167,61;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:9,4:10,3:9,10,2,5
chr3	1269625	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=152,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,2:8,0:0|1:1269625_C_CT:1269625:8,15,1,1
chr3	1269628	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=152,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,2:9,0:0|1:1269625_C_CT:1269625:6,15,1,1
chr3	1269680	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=198,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:9,3:7,1:3,13,4,0
chr3	1269763	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:0,3,1,1
chr3	1320271	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=142,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr3	1337203	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	1339680	.	GGTTTTT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GTTTTT;STR;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.702:11:2,4:1,4:1,2,2,6
chr3	1369278	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=206,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,2:1,6:1,3,2,6
chr3	1415195	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=270,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr3	1418792	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:7,0:3,4:2,8,0,4
chr3	1418859	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	1425168	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=204,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr3	1427204	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=122,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr3	1445139	.	GC	AA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:0|1:1445139_GC_AA:1445139:3,13,0,3
chr3	1445144	.	TC	AA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:0|1:1445139_GC_AA:1445139:3,13,0,3
chr3	2908335	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	2908667	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=207,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr3	2928832	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:9,0:0,4:3,6,1,3
chr3	3067759	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=233,110;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:7,1,2,0
chr3	3076284	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=165,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,4:5,3:7,3,4,3
chr3	3076315	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=165,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,2:10,0:8,6,1,1
chr3	3076401	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=197,92;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:5,4:1,7:4,2,7,4
chr3	3078795	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=152,1789;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr3	3078840	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=192,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,2:5,2:5,5,4,0
chr3	3079012	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=177,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:2,10,1,1
chr3	3080527	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr3	3082025	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=237,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr3	3084570	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=84,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:3084570_A_G:3084570:2,0,1,0
chr3	3084575	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=84,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:3084570_A_G:3084570:2,0,1,0
chr3	3116438	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,4:6,2:6,5,6,0
chr3	3118142	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=260,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,4:2,0:2,0,3,1
chr3	3170910	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr3	3171502	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=261,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr3	3171713	.	G	GCCTGACT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr3	3179089	.	TCGGATGA	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=153,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:12,0:14,2:0|1:3179089_TCGGATGA_T:3179089:15,14,0,2
chr3	3179101	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=145,73;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,0:15,2:0|1:3179089_TCGGATGA_T:3179089:14,13,0,2
chr3	3179104	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=145,73;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,0:15,2:0|1:3179089_TCGGATGA_T:3179089:14,13,0,2
chr3	3179106	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=145,73;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,0:15,1:0|1:3179089_TCGGATGA_T:3179089:14,13,0,2
chr3	3188165	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=187,130;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:3188165_G_T:3188165:4,7,0,2
chr3	3188170	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=193,130;MMQ=60,25;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0|1:3188165_G_T:3188165:3,8,0,2
chr3	3188172	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=190,130;MMQ=60,25;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:4,0:4,2:0|1:3188165_G_T:3188165:3,7,0,2
chr3	3188362	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:0,1,0,8
chr3	3189059	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	3189398	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=276,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.803:18:0,7:3,8:1,2,5,10
chr3	3192524	.	A	ATAAC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=263,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAC;STR;TLOD=32.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,0:1,6:3,0,4,4
chr3	3195600	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=196,72;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.259:17:4,0:9,3:9,4,2,2
chr3	3195606	.	TAAAACATGGGCATCA	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=169,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:5,0:8,3:12,11,2,2
chr3	3197871	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,12:0,0,12,8
chr3	3215954	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,3,14
chr3	3221430	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=264,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.701:15:3,6:1,3:1,3,3,8
chr3	3889067	.	CTT	C,CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,309,301;MMQ=60,60,60;MPOS=23,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.54,4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.334,0.525:4:0,1,1:0,1,1:0,0,4,0
chr3	4354692	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=171,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.175:14:7,2:5,0:0|1:4354692_T_G:4354692:5,7,1,1
chr3	4354695	.	C	CACTTTCTTAATATAACAGGG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=171,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:4354692_T_G:4354692:5,7,1,1
chr3	4403767	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=142,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.662:10:1,5:2,1:2,1,6,1
chr3	4403817	.	TT	AC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=134,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=51.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,4:2,8:5,3,9,4
chr3	4403837	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=128,201;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,2:2,7:5,2,6,3
chr3	4452676	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=153,82;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:4,8,0,2
chr3	4452737	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=173,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr3	4461698	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,0:0,5:0,0,3,2
chr3	4491046	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:6,3:8,6:6,8,1,8
chr3	4562667	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=115,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,6:6,3:6,3,8,1
chr3	4562844	.	G	GGT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=152,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GT;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.437:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr3	4686995	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=176,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,0:4,2:5,2,2,0
chr3	4687470	.	G	GCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CT;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.693:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	4693937	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,6,11
chr3	4712710	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	4722956	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=188,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr3	4735161	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=145,229;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,1:3,2:11,2,1,2
chr3	4739034	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=130,254;MMQ=50,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:4739034_G_A:4739034:0,4,0,2
chr3	4739038	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=130,254;MMQ=50,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:4739034_G_A:4739034:0,4,0,2
chr3	4739040	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=130,254;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:4739034_G_A:4739034:0,4,0,2
chr3	4819128	.	G	GTATA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=202,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.252:6:3,1:2,0:0|1:4819128_G_GTATA:4819128:0,5,0,1
chr3	4819133	.	TGG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=212,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:4819128_G_GTATA:4819128:0,4,0,1
chr3	4819137	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=212,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:4819128_G_GTATA:4819128:0,4,0,1
chr3	4856993	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr3	4859725	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=105.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,16:0,0,25,8
chr3	5022981	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,1:3,1:10,0,3,0
chr3	5025098	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=173,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:18,0:17,2:0|1:5025098_T_C:5025098:20,17,1,1
chr3	5025106	.	T	TATGA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=163,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:21,0:17,2:0|1:5025098_T_C:5025098:22,17,1,1
chr3	5241223	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr3	6903601	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=141,249;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:1,6:0,3:0,1,3,7
chr3	7188063	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=230,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:4,1,3,1
chr3	7188072	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=185,244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:5,1:7,2,2,0
chr3	7188116	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=175,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:8,3:9,2:15,3,3,2
chr3	7188243	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:11,0:10,8:5,16,0,8
chr3	7456675	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=103,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:4,4:3,3:4,4,6,1
chr3	7494245	.	TTGTGTGTGTG	T,TTGTGTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27,26;MFRL=0,231,196;MMQ=60,60,60;MPOS=8,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,9,12;RU=TG;STR;TLOD=13.65,6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,2:0.388,0.261:9:1,1,1:2,3,1:2,1,4,2
chr3	7621093	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,3:3,7:0,3,3,7
chr3	8543601	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=192,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:8,5:7,4:9,6,6,3
chr3	8543713	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr3	8543757	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:0,7,0,7
chr3	8609071	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=193,193;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=89.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,32:0.785:40:6,17:2,13:5,3,30,2
chr3	8609220	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:15,0:15,2:19,11,0,2
chr3	8667896	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,5:0,10:0,0,9,6
chr3	8669361	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,12:0.392:31:10,8:9,4:0|1:8669361_C_A:8669361:9,10,6,6
chr3	8669367	.	TG	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=98.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.969:30:0,18:0,12:0|1:8669361_C_A:8669361:0,0,15,15
chr3	8671319	.	C	CTGACTCACCAGTGGTTCACAGA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGACTCACCAGTGGTTCACAGA;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.335:23:6,2:9,1:10,5,5,3
chr3	8672476	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=177,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,2:7,0:8,11,0,2
chr3	8675318	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=228,256;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr3	8787247	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=162,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:7,2:8,0:6,9,2,1
chr3	8787313	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=136,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:8,4:2,4:6,4,4,4
chr3	8931984	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=199,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:2,0,8,0
chr3	8932189	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=125,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.586:17:3,7:3,3:4,3,2,8
chr3	8943988	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=163,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,6:0,3:1,0,9,0
chr3	8955240	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=204,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr3	8983554	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,265;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr3	8988809	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=169,228;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr3	8990302	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=175,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:2,13,0,2
chr3	9032159	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=143,419;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:7,2,2,0
chr3	9034558	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.249:13:5,2:5,0:8,2,1,2
chr3	9034774	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=171,340;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	9036010	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=167,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:7,1:5,2:8,4,2,1
chr3	9055293	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=256,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr3	9066853	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=153,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr3	9069747	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=116,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.518:23:3,7:8,5:5,6,5,7
chr3	9089254	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr3	9406661	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=231,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:6,1,4,0
chr3	9407094	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=253,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:0,4,0,4
chr3	9408524	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=255,214;MMQ=22,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,1:7,1:7,0,2,0
chr3	9422334	.	TAG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=230,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr3	9426026	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=196,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:12,4:6,1:0|1:9426026_T_C:9426026:11,7,0,5
chr3	9426028	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=183,209;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,6:0.279:23:10,6:7,0:1|0:9426026_T_C:9426026:5,12,6,0
chr3	9488715	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=110,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,3:8,1:8,6,2,2
chr3	9489334	.	A	ATTTC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=193,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTC;STR;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:0|1:9489334_A_ATTTC:9489334:4,0,5,0
chr3	9489340	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=193,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:2,1:4,5:0|1:9489334_A_ATTTC:9489334:6,0,6,0
chr3	9489767	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	9495385	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=174,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:6,3:5,3:7,4,5,1
chr3	9506356	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=123,232;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:3,4,0,2
chr3	9512104	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=119,271;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:15,3:10,0:19,6,3,0
chr3	9514856	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=156,314;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:10,0,2,0
chr3	9517375	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:3,1:11,2:4,10,1,2
chr3	9547950	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=188,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.784:7:0,2:1,4:0|1:9547950_G_C:9547950:0,1,0,6
chr3	9547959	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=188,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:9547950_G_C:9547950:0,1,0,4
chr3	9730319	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:7,2,2,0
chr3	9754144	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=211,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr3	9754334	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=182,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,2:7,1:5,5,2,1
chr3	9754621	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=219,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,2:5,1:3,5,2,1
chr3	9757086	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=184,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=67.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:1,7:4,12:3,2,11,8
chr3	9757582	.	CCCT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:4,4:4,0:0|1:9757582_CCCT_C:9757582:7,3,3,1
chr3	9757586	.	ATGGGCCTCACTT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:4,4:6,0:0|1:9757582_CCCT_C:9757582:9,3,3,1
chr3	9757727	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=139,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,1:9,2:5,9,2,1
chr3	9757754	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=209,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:1,6,2,4
chr3	9783147	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=189,238;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,0,3
chr3	9798140	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,66;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:3,3:2,2:4,2,3,2
chr3	9799113	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=266,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:5,1:2,2:2,5,3,0
chr3	9803126	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=121,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,4:3,6:1,4,6,4
chr3	9804600	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=136,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:3,2:7,0:4,7,0,2
chr3	9831680	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=195,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:1,4,1,4
chr3	9839458	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:9,0:3,11:5,7,0,11
chr3	9841989	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,3:0,5:1,0,3,6
chr3	9854865	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=200,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,5:4,3:3,4,2,6
chr3	9854913	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=36,24;MFRL=206,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:2,3:5,2:2,5,1,4
chr3	9859376	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=116,63;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:12,0:2,2:7,7,1,1
chr3	9859395	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:10,0:3,2:5,8,1,1
chr3	9859408	.	G	GCCCA	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=134,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:9,0:2,2:3,8,1,1
chr3	9859456	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=134,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,2:3,0:4,2,0,2
chr3	9859460	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=187,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,1:2,1:2,3,1,1
chr3	9860623	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=182,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:0,2,5,2
chr3	9867625	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=206,174;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,27:0.792:33:2,5:4,12:3,3,3,24
chr3	9867651	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=169,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=71.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,22:0.794:27:4,0:1,22:3,2,0,22
chr3	9870857	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=153,187;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,1:5,2:6,7,1,2
chr3	9870888	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=165,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:9,7,2,0
chr3	9876301	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	9908736	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=214,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:9908736_G_A:9908736:3,0,1,0
chr3	9908741	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=207,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:9908736_G_A:9908736:2,0,1,0
chr3	9918861	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=218,171;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.513:21:6,6:4,3:2,8,6,5
chr3	9918890	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,1:4,1:3,8,0,2
chr3	9920247	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=135,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:3,6,0,2
chr3	9932337	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=191,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,6:0,7:0,1,13,0
chr3	9944937	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=181,262;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr3	9947997	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:7,4:2,6:6,3,9,1
chr3	9948241	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=207,257;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,2:4,4:2,3,3,3
chr3	9951038	.	TAC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr3	9952788	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=254,208;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:2,1,1,2
chr3	9956279	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=2898590,174;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.732:9:2,6:0,1:1,1,6,1
chr3	9956299	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:5,4,1,1
chr3	9960070	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=216,190;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:9,3:4,10:9,4,5,8
chr3	9962157	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:3,2:3,0,1,1
chr3	9962767	.	TATTC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=278,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=ATTC;STR;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	9969932	.	TGG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=265,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:2,1,4,3
chr3	9970081	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=190,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr3	9972021	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=172,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,3:6,0:7,2,3,0
chr3	9972493	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=178,237;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr3	9974204	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=210,29026912;MMQ=60,55;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:11,0,2,0
chr3	9974982	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:5,2,1,1
chr3	9975353	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	9979660	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=209,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr3	9982445	.	A	AAGGGAGAGGGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=215,200;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=AGGGAG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr3	9984989	.	TGA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=198,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GA;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,2:6,0:11,1,3,0
chr3	10016224	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:10016224_G_A:10016224:0,2,0,1
chr3	10016227	.	CT	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:10016224_G_A:10016224:0,2,0,1
chr3	10089723	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:9,2:6,1:6,9,1,2
chr3	10089738	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,2:5,1:6,9,1,2
chr3	10089749	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=205,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,2:5,1:4,11,1,2
chr3	10089772	.	CA	GG	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=102,156;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:7,1:4,1:0|1:10089772_CA_GG:10089772:3,8,0,2
chr3	10089775	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=102,156;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,1:3,1:0|1:10089772_CA_GG:10089772:3,8,0,2
chr3	10091035	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=194,202;MMQ=52,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:4,0:0,3:1,3,1,3
chr3	10094265	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=181,143;MMQ=58,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:10094265_C_T:10094265:0,4,0,2
chr3	10094271	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=163,143;MMQ=55,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:10094265_C_T:10094265:0,3,0,2
chr3	10094278	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=198,143;MMQ=48,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0|1:10094265_C_T:10094265:0,3,0,2
chr3	10094281	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=198,143;MMQ=48,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:10094265_C_T:10094265:0,3,0,2
chr3	10103811	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=194,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:0,4:2,10:0,3,12,2
chr3	10103843	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:7,0:13,6:0|1:10103843_C_T:10103843:12,9,6,0
chr3	10103845	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:7,0:14,6:0|1:10103843_C_T:10103843:12,9,6,0
chr3	10103931	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=127,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:1,2:3,1:3,3,0,4
chr3	10108951	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=147,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,3:6,1:4,3,4,0
chr3	10157542	.	CCG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:7,2:2,0:4,5,0,2
chr3	10167380	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=131,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:9,0:8,3:0|1:10167380_C_T:10167380:9,8,1,2
chr3	10167387	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=138,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:6,0:7,2:0|1:10167380_C_T:10167380:7,7,1,2
chr3	10168108	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=245,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:1,3,0,4
chr3	10219729	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=172,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,4:1,1:0,3,1,4
chr3	10241987	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.565:16:4,6:2,3:6,1,8,1
chr3	10242243	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=194,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:7,4:2,2:1,8,1,5
chr3	10251196	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,2:4,1:3,1,1,2
chr3	10258762	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=118,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,2:9,0:7,10,1,1
chr3	10301805	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=188,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,1:4,1:6,4,3,0
chr3	10302045	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=153,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:10,3:9,2:0|1:10302045_C_T:10302045:14,6,2,3
chr3	10302056	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=156,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:13,3:10,2:0|1:10302045_C_T:10302045:14,10,2,3
chr3	10302369	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=178,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,1,1
chr3	10320200	.	GGGT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=139,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGT;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,1:0,0:0|1:10320200_GGGT_G:10320200:1,2,0,1
chr3	10320205	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=139,84;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:10320200_GGGT_G:10320200:1,2,0,1
chr3	10342876	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,171;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:4,7:4,7:5,4,8,6
chr3	10380129	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10380129_T_TC:10380129:0,0,0,1
chr3	10380132	.	T	TGCAGCCCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10380129_T_TC:10380129:0,0,0,1
chr3	10380136	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:10380129_T_TC:10380129:0,0,0,1
chr3	10382111	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=192,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,3:1,4:2,0,3,4
chr3	10382148	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=202,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,4:1,6:2,1,4,6
chr3	10387059	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=111,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.816:9:0,1:1,6:1,0,8,0
chr3	10400643	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=234,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	10401856	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=253,323;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr3	10413715	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=123,192;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.653:27:4,10:5,7:7,2,4,14
chr3	10417313	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=167,140;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:16,0:5,3:9,12,0,3
chr3	10420875	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=214,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:3,0:5,7:3,5,3,4
chr3	10442779	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=147,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,2:6,1:2,10,0,3
chr3	10452231	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr3	10967711	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=165,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:6,1:8,7,0,2
chr3	10967739	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:11,2:4,1:10,5,2,1
chr3	10971050	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=160,188;MMQ=60,41;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:6,0:8,7,0,2
chr3	10971062	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=158,188;MMQ=60,41;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,16;RU=GT;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:6,0:5,8,0,2
chr3	10975745	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=195,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:6,6:4,5:5,6,3,8
chr3	10976973	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:0,4,0,3
chr3	11071131	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=259,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr3	11075503	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	11076184	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,17;MFRL=266,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:0,0:1,0:0|1:11076184_C_G:11076184:2,0,1,0
chr3	11076186	.	CCCT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=254,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,1:1,0:0|1:11076184_C_G:11076184:3,0,1,0
chr3	11076189	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=193,254;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1|0:11076184_C_G:11076184:1,0,1,0
chr3	11076193	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=193,254;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:2,0:0,1:1|0:11076184_C_G:11076184:2,0,1,0
chr3	11076400	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:3,7,1,1
chr3	11300707	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,13,1
chr3	11350553	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=159,252;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:9,2:14,3:7,16,3,2
chr3	11383560	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr3	11744544	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=225,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	11744584	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=212,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr3	11831953	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=182,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,1:4,3:8,2,3,1
chr3	11832084	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=182,60;MMQ=60,51;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:7,11,0,2
chr3	11880816	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=202,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:1,4,0,7
chr3	12045986	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,6:0,1:0,0,9,0
chr3	12046013	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,3:0,0,7,5
chr3	12046124	.	AG	GC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,4
chr3	12046131	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,4
chr3	12046148	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,1:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,4
chr3	12046168	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,2
chr3	12208652	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr3	12208671	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,13,4
chr3	12208783	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=173,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:4,13,1,1
chr3	12231997	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:14,10,0,2
chr3	12232208	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	12475390	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=150,90;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:3,7,0,2
chr3	12537955	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,1:1,3:1,0,3,2
chr3	12560763	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=124,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:1,2:1,4:0,3,0,6
chr3	12571420	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.735:9:0,4:2,3:1,1,2,5
chr3	12611640	.	C	CACGT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=114,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.278:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr3	12616460	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=161,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:11,4:8,0:10,9,4,0
chr3	12616533	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,2:3,4:2,7,2,4
chr3	12618139	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=182,154;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:9,4:8,0:0|1:12618139_A_T:12618139:11,6,4,0
chr3	12618144	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=182,154;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:11,4:8,0:0|1:12618139_A_T:12618139:11,8,4,0
chr3	12618262	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=128,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:10,3:7,0:9,8,0,3
chr3	12618269	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,6:3,2:2,6,3,5
chr3	12626516	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=163,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:5,3,2,0
chr3	12650482	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr3	12660291	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=189,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:0,1,0,4
chr3	12778020	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=218,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:6,2,2,0
chr3	12778209	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=191,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,0:1,2:2,4,2,0
chr3	12779187	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,56;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,3:5,0:7,3,2,1
chr3	12790241	.	G	GTAACAAAATTTCAAGAATTAGTTTTCT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=198,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:3,2:5,0:5,3,1,1
chr3	12790338	.	C	CCCTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=156,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:12790338_C_CCCTTT:12790338:0,4,0,1
chr3	12790339	.	A	AGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=156,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:12790338_C_CCCTTT:12790338:0,4,0,1
chr3	12791172	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:3,6:0,5:2,1,10,1
chr3	12845158	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr3	12848822	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,9,8
chr3	12849011	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr3	12849031	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=160,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.391:6:3,0:1,1:0,4,0,2
chr3	12856552	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	12857823	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=179,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr3	12868857	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=74,249;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr3	12942408	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=194,279;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr3	12942850	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	12944158	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=121,218;MMQ=56,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.566:9:2,4:2,1:0|1:12944158_CA_C:12944158:3,1,5,0
chr3	12944170	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=171,157;MMQ=60,56;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=24,23;RU=A;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.269:9:5,0:1,2:1|0:12944158_CA_C:12944158:6,1,2,0
chr3	12944206	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,15;MFRL=131,157;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,2:0.154:17:4,0:8,0:1|0:12944158_CA_C:12944158:5,10,2,0
chr3	12944208	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,15;MFRL=131,157;MMQ=60,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,2:0.154:17:3,0:10,0:1|0:12944158_CA_C:12944158:5,10,2,0
chr3	12949778	.	CTGAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,2:1,1:3,0,3,0
chr3	12954868	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=136,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,5:2,3:4,1,6,2
chr3	12956531	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:4,0,5,2
chr3	12963610	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=186,62;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,2:3,0:10,3,2,0
chr3	12976863	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=261,247;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	12983423	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	13114408	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=233,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr3	13384829	.	G	GGGAAAGAGAAGGAGGAGGAAGAGAAAGCAGGGAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=54,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.311:6:2,1:3,0:0|1:13384829_G_GGGAAAGAGAAGGAGGAGGAAGAGAAAGCAGGGAA:13384829:3,2,0,1
chr3	13384832	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=97,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,1:0.301:7:1,1:2,0:0|1:13384829_G_GGGAAAGAGAAGGAGGAGGAAGAGAAAGCAGGGAA:13384829:3,3,0,1
chr3	13399948	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=211,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr3	13415146	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	13417999	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=125,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:3,2:2,1:1,5,0,3
chr3	13419123	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,30;MFRL=182,165;MMQ=60,44;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr3	13421320	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=192,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.630:11:2,4:1,3:0,4,0,7
chr3	13427998	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=156,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr3	13438830	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr3	13439005	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=164,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr3	13522973	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	13522977	.	G	GAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=164,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:13522977_G_GAT:13522977:0,2,0,1
chr3	13522980	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=164,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:13522977_G_GAT:13522977:0,2,0,1
chr3	13544310	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:4,0,3,0
chr3	13669537	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=281,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,6:2,1:1,1,0,7
chr3	13670837	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=206,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr3	13679044	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=203,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,4:4,3:5,1,7,0
chr3	13896153	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=160,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:8,0:14,4:12,11,1,3
chr3	13916407	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,3:2,5:2,0,6,2
chr3	14173963	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=254,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,7:3,3:5,0,10,0
chr3	14174146	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=254,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,6:5,5:4,5,2,9
chr3	14176446	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=326,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr3	14187345	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=193,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,3:3,6:6,0,9,0
chr3	14187699	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=234,259;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:14187699_T_C:14187699:0,2,0,1
chr3	14187710	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=234,259;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:14187699_T_C:14187699:0,2,0,1
chr3	14188700	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=235,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr3	14188762	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=131,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.300:24:4,4:13,2:10,7,5,2
chr3	14189340	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,3:4,3:9,0,6,0
chr3	14190237	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=301,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:1,6:1,7:2,0,9,4
chr3	14190268	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=207,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,3:6,4:6,5,6,1
chr3	14201400	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr3	14208625	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,4:5,4:8,2,5,3
chr3	14208647	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:10,2:8,3:14,5,3,2
chr3	14211941	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=173,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:11,5,1,1
chr3	14214524	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=152,244;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:11,1:14,2:13,12,1,2
chr3	14220095	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=182,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,2:7,2:7,6,1,3
chr3	14220517	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=185,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr3	14223224	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=235,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,4:1,5:1,3,1,8
chr3	14519885	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,6:2,0:2,0,6,0
chr3	14520164	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,1:4,2:0,10,0,3
chr3	14520560	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:2,2:2,0:1,3,3,0
chr3	14526538	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,0:4,4:0,5,1,3
chr3	14537867	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=175,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:6,0,2,1
chr3	14538072	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=254,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr3	14548494	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=133,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:8,2:2,5:7,3,6,1
chr3	14555367	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=174,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr3	14555409	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=187,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:14555409_T_C:14555409:0,3,0,1
chr3	14555411	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=187,254;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:14555409_T_C:14555409:0,3,0,1
chr3	14555739	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=150,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,3:7,2:8,1,5,0
chr3	14555758	.	C	CAGTT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=170,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.498:10:2,1:3,3:4,1,5,0
chr3	14561627	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=45.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,7,6
chr3	14563244	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=166,95;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:7,0:2,2:0,9,0,2
chr3	14563258	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=189,154;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:0,7,0,5
chr3	14702982	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,5,3
chr3	14708918	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,10,8
chr3	14725668	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	14725878	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.319:13:5,2:4,1:4,5,2,2
chr3	14744694	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,146;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.402:25:12,0:3,9:10,5,0,10
chr3	14745762	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=232,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	14745813	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	14745857	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=49,157;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,2:1,9:0,2,4,7
chr3	14756730	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr3	14763381	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=150,1032448;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr3	14768534	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=179,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:6,3,2,1
chr3	14768554	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=102,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,4:0,5:1,1,5,4
chr3	14801550	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,0:3,4:1,6,0,4
chr3	14939088	.	GA	AT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=117,240;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,3:5,1:5,5,2,2
chr3	14939198	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=215,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,2,3
chr3	14939364	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:5,0,3,1
chr3	14939679	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=192,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr3	14942024	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=189,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:0,4:1,3:0,1,1,6
chr3	14942675	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr3	14949102	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=112,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,5:7,3:9,4,5,3
chr3	14949268	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=228,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:0,6,0,6
chr3	14960170	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr3	14965466	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:1,0,10,0
chr3	14965507	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0,0,6,2
chr3	15064945	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=288,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15064945_C_CA:15064945:0,1,0,1
chr3	15064947	.	C	CACTTTAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=288,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15064945_C_CA:15064945:0,1,0,1
chr3	15073944	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,149;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,0:10,2:8,9,1,1
chr3	15258903	.	CCTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:3,3:5,1:6,2,1,3
chr3	15259865	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	15301297	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=145,45;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:6,0:9,5:12,3,0,5
chr3	15301363	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:1,7,1,6
chr3	15311464	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	15455717	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=95,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr3	15471528	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=207,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.552:12:3,6:2,1:1,4,2,5
chr3	15473515	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:6,0,6,0
chr3	15478009	.	C	CGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTTTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=191,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.156:16:8,2:6,0:6,8,0,2
chr3	15507761	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=110,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,7:1,1:1,0,8,0
chr3	15512054	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=196,152;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:10,6:12,0:14,8,6,0
chr3	15515695	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=89,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.750:17:1,11:2,1:3,1,7,6
chr3	15515874	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	15516820	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:0,5:1,4:1,0,9,0
chr3	15516910	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.710:22:2,10:4,6:3,3,9,7
chr3	15517025	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,6:3,3:0,5,1,8
chr3	15518731	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=57,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,6:4,1:2,5,2,5
chr3	15520639	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=201,310;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,3,0
chr3	15613347	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=267,257;MMQ=40,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15613347_T_C:15613347:0,1,0,1
chr3	15613355	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=267,257;MMQ=40,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15613347_T_C:15613347:0,1,0,1
chr3	15613371	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=267,257;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15613347_T_C:15613347:0,1,0,1
chr3	15632999	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=201,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr3	15643043	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr3	15643435	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=213,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.434:11:2,0:2,0:1,5,0,5
chr3	15718652	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=254,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr3	15736385	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr3	15737610	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	15752830	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr3	15756039	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,5:0,4:0,0,9,1
chr3	15756215	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr3	15762696	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=205,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr3	15807725	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,4,4
chr3	15900950	.	C	CGCCGCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=250,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GCCGCT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15900950_C_CGCCGCT:15900950:0,1,0,1
chr3	15900973	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:15900950_C_CGCCGCT:15900950:0,0,0,4
chr3	15900975	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=217,250;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.329:4:3,0:0,1:1|0:15900950_C_CGCCGCT:15900950:0,3,0,1
chr3	16242101	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=73,265;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:3,1,3,0
chr3	16242381	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=195,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr3	16254172	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,0:5,3:1,9,2,1
chr3	16264037	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=195,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:6,0,3,0
chr3	16305717	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:9,14,0,2
chr3	16343092	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=243,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:0,9:2,7:0,2,14,2
chr3	16343155	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=128,79;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:18,2:21,0:0|1:16343155_C_G:16343155:24,16,2,0
chr3	16343158	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=127,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:17,2:21,0:0|1:16343155_C_G:16343155:23,16,2,0
chr3	16450872	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=159,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:4,4,3,0
chr3	16535229	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=77,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,3:4,0:4,2,2,1
chr3	16636093	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=124,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:2,2:11,1:4,10,0,3
chr3	17051081	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=202,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr3	17131421	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=134,300;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:5,1:1,5,0,2
chr3	17208484	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=272,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	17209202	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=224,256;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,1:2,2:1,8,1,2
chr3	17226694	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:5,5,2,0
chr3	17300133	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=200,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,5:0,2,0,8
chr3	17413531	.	A	AAAACAAACAAACAAAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=252,244;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,8;RU=AAAC;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.404:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr3	17425385	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=173,95;MMQ=60,21;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:11,4:8,0:13,6,4,0
chr3	17469887	.	ATG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr3	17470114	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=145,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:0,6,0,6
chr3	18390770	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:12,2:0|1:18390770_C_T:18390770:14,9,0,2
chr3	18390784	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=184,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:10,2:0|1:18390770_C_T:18390770:7,7,0,2
chr3	18390788	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=194,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:11,2:0|1:18390770_C_T:18390770:8,6,0,2
chr3	18390791	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:3,0:10,2:0|1:18390770_C_T:18390770:9,6,0,2
chr3	18390795	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=184,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:10,2:0|1:18390770_C_T:18390770:10,7,0,2
chr3	18390796	.	TATA	T	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=186,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:18390770_C_T:18390770:10,8,0,2
chr3	18391132	.	CCTG	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CTG;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,1:7,1:5,8,0,2
chr3	18419859	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=110,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:0,5,1,5
chr3	18427924	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=109,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:3,9:5,9:5,3,7,11
chr3	19295089	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	19436587	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:3,3:10,3:5,8,2,4
chr3	19498221	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr3	19925807	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	19926027	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,55;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:9,2:17,0:12,14,2,0
chr3	19930003	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=107,157;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:7,3:4,6:8,3,3,6
chr3	19947105	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,3:2,4:5,1,7,0
chr3	19947296	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=213,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr3	19956962	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=132,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr3	19956995	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=176,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr3	19974700	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,5:0,8:1,0,10,3
chr3	19975582	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	20017489	.	GG	CG,CC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30,32;MFRL=288,140,125;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=33.43,17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,12,6:0.605,0.307:19:0,5,4:1,7,2:1,0,9,9
chr3	20082151	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	20113989	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=213,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,3:0,3:0,3,0,6
chr3	20114044	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:20114044_T_C:20114044:0,0,0,3
chr3	20114048	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:20114044_T_C:20114044:0,0,0,3
chr3	20136959	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=193,297;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,2:3,0:0,6,0,2
chr3	20141301	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=191,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:6,1,5,0
chr3	20143020	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	20156302	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:2,0,5,1
chr3	20168875	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:7,4,2,0
chr3	20168996	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:10,0:14,11:11,13,0,11
chr3	20181676	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr3	20212189	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=198,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,5:2,4:2,1,6,3
chr3	20212762	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:19,0:4,5:2,21,0,5
chr3	20212796	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=208,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:5,4:3,1:1,8,0,5
chr3	20216376	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:11,4:9,0:12,8,4,0
chr3	20219885	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,7:3,2:1,3,1,8
chr3	21606027	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr3	23848835	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:8,4:20,1:13,15,2,3
chr3	23848923	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=176,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:7,2:7,2:4,11,0,4
chr3	23932176	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,19;MFRL=227,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.610:6:1,0:0,2:0,2,0,4
chr3	23934772	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=114,321;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,0:3,2:6,7,2,0
chr3	23959921	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.201:33:13,3:13,3:18,9,6,0
chr3	23987002	.	A	AGGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GGC;STR;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	24001078	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=291,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	24006744	.	T	TGG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=199,146;MMQ=44,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.339:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr3	24006753	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=199,245;MMQ=44,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr3	24009279	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	24270493	.	C	CACCTTTCCGA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=176,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:2,2:7,0:0|1:24270493_C_CACCTTTCCGA:24270493:3,6,0,2
chr3	24270496	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=172,76;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:0|1:24270493_C_CACCTTTCCGA:24270493:3,7,0,2
chr3	25542812	.	AATGTAAGTGGAGT	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=154,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:2,2:0|1:25542812_AATGTAAGTGGAGT_A:25542812:4,7,1,1
chr3	25542827	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=168,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:25542812_AATGTAAGTGGAGT_A:25542812:2,7,1,1
chr3	25542830	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=168,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:25542812_AATGTAAGTGGAGT_A:25542812:2,7,1,1
chr3	25542834	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=168,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:25542812_AATGTAAGTGGAGT_A:25542812:2,7,1,1
chr3	25611472	.	GACACAC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=212,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=AC;STR;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.690:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr3	25639973	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:3,1:1,2:0,4,1,2
chr3	25648796	.	GTCA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TCA;STR;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:4,1:8,2:10,5,1,2
chr3	25660094	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,37;MFRL=165,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.383:13:6,3:2,1:4,4,3,2
chr3	25661557	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr3	25674091	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:10,2:2,0:6,6,1,1
chr3	25775356	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr3	25777500	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=187,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:3,1,1,0
chr3	25805879	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	25833108	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:13,7,2,0
chr3	25836023	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr3	26752199	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=231,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:26752199_C_T:26752199:0,2,0,1
chr3	26752206	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=166,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:26752199_C_T:26752199:0,3,0,1
chr3	27173447	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=200,61;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:5,10,0,2
chr3	27203864	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=213,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:5,0,3,0
chr3	27233498	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=197,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr3	27233716	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:1,7,0,2
chr3	27243119	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=243,274;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,2,0
chr3	27243871	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr3	27332282	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=271,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0|1:27332282_C_T:27332282:0,2,0,4
chr3	27332302	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=168,271;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.333:7:1,1:3,1:1|0:27332282_C_T:27332282:0,5,0,2
chr3	27332820	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:5,3:4,1:5,5,2,2
chr3	27350384	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:8,6:2,4:5,5,6,4
chr3	27353716	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=105,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,6:2,3:0,4,1,8
chr3	27355767	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=114,257;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.156:36:11,0:20,5:14,17,0,5
chr3	27363637	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.604:10:2,5:2,1:3,1,6,0
chr3	27394419	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=182,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:1,2,0,4
chr3	27427521	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.618:32:7,10:5,10:4,8,8,12
chr3	27475351	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=180,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:4,1,3,1
chr3	27478834	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=154,176;MMQ=58,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:1,1:3,1,3,0
chr3	27478842	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=173,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.458:7:3,0:1,2:4,0,1,2
chr3	27759308	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.239:10:3,0:1,0:0|1:27759308_T_A:27759308:0,8,0,2
chr3	27759312	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=18,18;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.219:11:2,0:1,0:0|1:27759308_T_A:27759308:0,9,0,2
chr3	27759314	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=18,14;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.262:13:2,0:2,0:0|1:27759308_T_A:27759308:0,10,0,3
chr3	27759338	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.659:10:2,2:1,5:0,3,0,7
chr3	28304768	.	CT	C	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=110,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,5:0.091:59:17,3:36,2:0|1:28304768_CT_C:28304768:46,8,4,1
chr3	28304801	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=138,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:15,1:13,1:0|1:28304768_CT_C:28304768:19,11,0,2
chr3	28454802	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,118;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,0:4,2:10,3,0,2
chr3	28557063	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.148:29:18,0:7,3:17,8,4,0
chr3	28557206	.	C	CTGTG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=181,198;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=TG;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.464:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr3	28562695	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=202,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	29476428	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:2,5,1,2
chr3	29529907	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0|1:29529907_G_A:29529907:0,0,10,0
chr3	29529913	.	TTC	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TC;STR;TLOD=43.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0|1:29529907_G_A:29529907:0,0,11,0
chr3	29628718	.	G	GTTTTTT	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=22,28;RU=T;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.928:9:0,4:0,3:0|1:29628718_G_GTTTTTT:29628718:0,0,7,2
chr3	29628741	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.841:3:0,2:0,1:0|1:29628718_G_GTTTTTT:29628718:0,0,0,3
chr3	29628743	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.831:3:0,2:0,1:0|1:29628718_G_GTTTTTT:29628718:0,0,0,3
chr3	29804300	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr3	29804487	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,3:5,5:5,7,3,5
chr3	29804509	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,6:4,4:3,4,1,9
chr3	29938822	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=166,112;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,5:7,0:10,3,5,0
chr3	29977739	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr3	30686414	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:3,8:6,8:4,5,5,11
chr3	30713126	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:5,4:4,1:7,2,3,2
chr3	30732821	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=187,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:5,1:1,1:6,0,3,0
chr3	30769948	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=37,30;MFRL=196,248;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr3	30819708	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=159,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.351:35:11,12:12,0:18,5,12,0
chr3	30842346	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=225,226;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AG;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:2,0:3,0,2,0
chr3	30842597	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=97,242;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr3	30885806	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=210,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:7,4:7,2:8,6,5,1
chr3	31574393	.	T	TTCCTCC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=236,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=TCC;STR;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.494:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr3	31621228	.	T	TAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr3	31642037	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=216,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,1:5,2:0,6,0,3
chr3	31663515	.	A	AGTGTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr3	31674403	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,0:12,3:14,8,1,2
chr3	31677395	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr3	31705649	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:11,6:2,2:6,7,3,5
chr3	31710054	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=74,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,3:3,0:7,3,3,0
chr3	31710396	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=153,247;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr3	31725691	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	32022333	.	GCACA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=206,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=CA;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr3	32030544	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,4:6,1:7,7,2,3
chr3	32031355	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=138,0;MMQ=60,29;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:8,0:7,8,0,3
chr3	32032408	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=178,69;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.146:18:9,0:7,2:0|1:32032408_C_T:32032408:10,6,1,1
chr3	32032430	.	A	AATGACAAATAATTGGCAAAG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=169,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,0:6,2:0|1:32032408_C_T:32032408:9,7,1,1
chr3	32200322	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,3:1,0:3,0,3,0
chr3	32490894	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=201,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,3:3,9:7,1,10,2
chr3	32491084	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,5:2,1:1,8,1,5
chr3	32533478	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=208,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	32571684	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=180,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:6,0,4,0
chr3	32571823	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=262,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.526:13:1,1:2,3:2,4,4,3
chr3	32576183	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=157,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,1:9,2:3,8,1,2
chr3	32746288	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=146,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.372:21:9,3:3,5:9,4,5,3
chr3	32761674	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,1:8,2:5,10,1,2
chr3	32766905	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr3	32804328	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=161,2314;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:2,6,0,2
chr3	32805840	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,147;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	32915214	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr3	32933344	.	G	GTC,GTCTC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34,32;MFRL=100,203,185;MMQ=60,60,55;MPOS=19,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=TC;STR;TLOD=5.08,5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.333,0.335:6:0,1,0:2,1,2:1,1,0,4
chr3	32995220	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,2:6,0:0|1:32995220_G_T:32995220:9,8,1,1
chr3	32995224	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:6,0:0|1:32995220_G_T:32995220:10,8,1,1
chr3	32995652	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,3:5,1:8,3,2,2
chr3	32997239	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=209,174;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:32997239_C_T:32997239:0,2,0,1
chr3	32997244	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=209,174;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:32997239_C_T:32997239:0,2,0,1
chr3	32997254	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,209;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:32997254_C_A:32997254:0,0,0,2
chr3	32997256	.	CA	AG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,209;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:32997254_C_A:32997254:0,0,0,2
chr3	32997262	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:32997254_C_A:32997254:0,0,0,2
chr3	33063050	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=177,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,1:6,4:11,3,4,1
chr3	33093190	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,5,5
chr3	33114226	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,154;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:9,0:6,5:6,10,0,5
chr3	33171659	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=179,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr3	33174156	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=149,183;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,7:3,6:3,3,5,8
chr3	33174168	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:3,6:4,6:4,3,4,8
chr3	33175793	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,8:0,0,5,14
chr3	33175854	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=175,239;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr3	33194138	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	33216357	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=220,262;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:1,1,2,3
chr3	33249488	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,54;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:0,7,1,1
chr3	33255592	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=174,102;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:1,9:2,7:0,3,7,9
chr3	33339136	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr3	33414468	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	33414923	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=270,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,8:2,3:0,3,5,6
chr3	33419736	.	ACC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=250,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr3	33426900	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=212,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	33434954	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.396:10:3,3:3,1:0,6,0,4
chr3	33444286	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,9:7,2:8,4,7,4
chr3	33481400	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=153,247;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr3	33552004	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=111,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,0:3,5:4,3,3,2
chr3	33557605	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=205,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:4,0:9,5:7,6,0,5
chr3	33558407	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:3,1:3,1:7,0,1,1
chr3	33612364	.	TAA	T,TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28,19;MFRL=0,196,252;MMQ=60,60,60;MPOS=17,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.27,7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.389,0.514:7:0,1,1:0,1,1:0,0,0,7
chr3	33626186	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=115,327;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	33626229	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=115,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:7,1:0,1:4,3,2,0
chr3	33645814	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=278,167;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.406:13:4,0:4,5:1,7,0,5
chr3	33648301	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33648301_C_A:33648301:0,0,0,1
chr3	33648303	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33648301_C_A:33648301:0,0,0,1
chr3	33648308	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33648301_C_A:33648301:0,0,0,1
chr3	33648309	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33648301_C_A:33648301:0,0,0,1
chr3	33653622	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,1,1
chr3	33668662	.	ATTAAGT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=132,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:1,0:1,5,0,2
chr3	33673767	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=162,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,2:10,1:11,7,1,2
chr3	33729801	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.147:29:11,2:14,2:10,15,2,2
chr3	33866868	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=100,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:2,7:2,4:2,2,1,10
chr3	33866929	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=170,250;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr3	33870363	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=146,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.185:21:9,0:7,3:10,8,0,3
chr3	33870393	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:14,2:4,0:5,13,2,0
chr3	33877500	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=236,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.461:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr3	33879602	.	CTA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,1:3,4:3,0,5,0
chr3	33887102	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=161,207;MMQ=60,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:0,7,0,4
chr3	33893929	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:0,1:1,1,3,0
chr3	33893958	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,19;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.627:9:0,1:3,2:1,2,6,0
chr3	33893987	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=112,88;MMQ=49,31;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,1:5,2:3,6,1,2
chr3	33907835	.	T	TCTCC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:7,6:9,2:5,11,5,5
chr3	33907945	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:5,2:4,2:7,2,4,0
chr3	35724256	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr3	35731710	.	A	ATAATTGTGCTGCTTCAGTATAAACTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=180,233;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr3	35731725	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	35780734	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=182,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:4,2:3,1:0|1:35780734_G_T:35780734:7,0,3,0
chr3	35780735	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,3:0.286:12:4,2:5,1:1|0:35780734_G_T:35780734:9,0,3,0
chr3	35785296	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:6,1,3,0
chr3	36422064	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=170,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr3	36422126	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=184,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:5,2:7,5:0|1:36422126_C_T:36422126:7,5,5,2
chr3	36422135	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:5,2:5,5:0|1:36422126_C_T:36422126:6,5,5,2
chr3	36422216	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=170,205;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:9,5:2,4:5,6,4,5
chr3	36422286	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=185,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:0|1:36422286_T_A:36422286:5,12,1,1
chr3	36422288	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=185,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,2:9,0:0|1:36422286_T_A:36422286:5,12,1,1
chr3	36422290	.	C	CTTA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=185,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,2:9,0:0|1:36422286_T_A:36422286:4,12,1,1
chr3	36524405	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=186,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:5,4:2,1:8,0,5,0
chr3	36534622	.	CTCTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,4:3,0:5,6,2,2
chr3	36570279	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=196,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:5,4,1,1
chr3	36872819	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=183,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,0:3,2:6,2,2,0
chr3	36887973	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,3:1,0:0,6,0,3
chr3	36896653	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,6,3
chr3	36896794	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,1:12,1:8,12,2,0
chr3	37032770	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:16,0:10,3:12,14,0,3
chr3	37048633	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=330,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr3	37062040	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=224,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr3	37067050	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr3	37096057	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=223,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:0,10,0,2
chr3	37107470	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=252,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,5:1,4:1,1,1,8
chr3	37133124	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=205,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr3	37144535	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=250,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.800:18:1,6:2,9:1,2,3,12
chr3	37150988	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,5:1,4:1,2,6,3
chr3	37170717	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=287,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr3	37190376	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=209,72;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:5,0:9,2:12,4,1,1
chr3	37285152	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=213,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.461:22:7,6:4,3:5,7,3,7
chr3	37360696	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=136,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.268:17:8,3:5,1:7,6,1,3
chr3	37366876	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:16,1:12,1:19,9,2,0
chr3	37369209	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=135,73;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,3:10,0:11,9,2,1
chr3	37370065	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=152,165;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.239:23:9,0:9,5:0|1:37370065_C_T:37370065:4,14,0,5
chr3	37370068	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=152,165;MMQ=60,57;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:9,0:9,5:0|1:37370065_C_T:37370065:4,14,0,5
chr3	37376500	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=118,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,1:3,5:3,0,5,1
chr3	37476427	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=202,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:7,1:4,1:4,7,2,0
chr3	37512646	.	TG	CC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	37514881	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=150,103;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:14,0:13,3:16,11,1,2
chr3	37514968	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:3,6,0,2
chr3	37522875	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=236,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,0:4,6:6,1,6,0
chr3	37549983	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	37550027	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.508:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr3	37560708	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,1:4,4:6,3,5,0
chr3	37575039	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr3	37670876	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,6:2,0:0,6,0,6
chr3	37778481	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=128,205;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,1:8,2:7,7,1,2
chr3	37818805	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:6,0,6,0
chr3	37988787	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=218,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:37988787_A_G:37988787:0,2,0,1
chr3	37988789	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=218,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:37988787_A_G:37988787:0,2,0,1
chr3	38012899	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=197,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:9,2:5,0:10,5,2,0
chr3	38022163	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=137,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr3	38035508	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:3,13,0,2
chr3	38040909	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,23;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:13,2:18,0:17,14,1,1
chr3	38044592	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chr3	38047527	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=174,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:5,4,0,2
chr3	38050159	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:3,6,1,1
chr3	38051211	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=150,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,1:5,2:3,9,1,2
chr3	38053206	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=151,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,1:3,1:1,7,0,2
chr3	38087024	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=248,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,3:3,5:3,3,5,3
chr3	38105467	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,15;MFRL=138,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.193:26:7,0:4,0:4,17,0,5
chr3	38105487	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=178,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.304:17:7,0:4,4:0,12,0,5
chr3	38134438	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr3	38138797	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=204,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,0:5,12:4,7,0,12
chr3	38139324	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:8,2:10,2:7,11,2,2
chr3	38153096	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=190,277;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr3	38153840	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=99,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:15,0:9,14,1,1
chr3	38158982	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=221,265;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,2:4,1:5,4,2,1
chr3	38159546	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=242,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:2,1,0,4
chr3	38168125	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:4,1:5,3:2,8,2,2
chr3	38168210	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=203,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:2,7,0,3
chr3	38182136	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,5:2,3:4,5,3,5
chr3	38207529	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=218,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:2,0:5,3:0,7,0,4
chr3	38257567	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.363:22:7,3:7,5:13,1,8,0
chr3	38289251	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=205,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:0|1:38289251_C_G:38289251:1,7,2,6
chr3	38289275	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=212,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0|1:38289251_C_G:38289251:0,3,3,2
chr3	38293904	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,3:5,3:2,5,1,5
chr3	38307803	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=171,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr3	38347633	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=171,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,4:4,1:3,5,3,2
chr3	38347851	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=235,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,1:2,5:3,3,2,4
chr3	38348686	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=206,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:0,1,5,1
chr3	38350630	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,5:3,0:1,7,2,3
chr3	38355176	.	T	TGTGTGTGTGTGTGCGCGCGC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=234,122;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.513:13:3,4:2,2:4,2,6,1
chr3	38355184	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=122,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.220:11:7,1:2,1:6,3,1,1
chr3	38355225	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=167,242;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.377:21:7,2:6,4:5,8,5,3
chr3	38355509	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=247,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr3	38390020	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,9:0,4:0,0,8,5
chr3	38401839	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,11,9
chr3	38401918	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,3:0,12:0,0,5,10
chr3	38402007	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr3	38406648	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,7:0,8:0,0,11,5
chr3	38406773	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,8,9
chr3	38406793	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chr3	38408248	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr3	38408459	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	38409600	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr3	38411742	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,0:2,1:0|1:38411742_C_T:38411742:0,3,0,1
chr3	38411752	.	C	CATATATACGCACGTAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=226,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:38411742_C_T:38411742:0,3,0,1
chr3	38438457	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr3	38442490	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,5:1,10:0,2,7,8
chr3	38454497	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,2:5,0:5,10,0,2
chr3	38521156	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:3,12:1,3:1,3,7,8
chr3	38524592	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=177,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:13,1:5,1:13,5,2,0
chr3	38548388	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=183,52;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,5:7,0:9,5,5,0
chr3	38598136	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	38627629	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	38646423	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr3	38648062	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	38739845	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=224,157;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,8:4,4:2,4,4,8
chr3	38739847	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=163,250;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:5,11,1,1
chr3	38751047	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=187,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:8,0:7,2:0|1:38751047_G_C:38751047:8,7,0,2
chr3	38751057	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=199,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,1:0|1:38751047_G_C:38751047:9,7,0,2
chr3	38753977	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr3	38780971	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,2:1,0:6,3,2,0
chr3	38784029	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=95,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:4,2:1,3:3,2,2,3
chr3	38791605	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:38791605_C_A:38791605:6,4,1,1
chr3	38791606	.	T	TTGTGGTTGG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=163,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:38791605_C_A:38791605:6,4,1,1
chr3	38798724	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38798724_G_A:38798724:0,0,0,1
chr3	38798725	.	AGTTTTATGTC	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=217,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:38798724_G_A:38798724:0,1,0,1
chr3	38798737	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=217,97;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38798724_G_A:38798724:0,1,0,1
chr3	38798744	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=217,97;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38798724_G_A:38798724:0,1,0,1
chr3	38812708	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=192,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr3	38888740	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=221,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:0|1:38888740_G_T:38888740:3,4,2,0
chr3	38888743	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=221,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:38888740_G_T:38888740:3,4,2,0
chr3	38913189	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:2,2:3,3:3,3,1,5
chr3	38926912	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=189,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,4:4,2:2,7,1,5
chr3	38938299	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=215,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.858:8:1,2:0,2:1,0,5,2
chr3	38949363	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr3	38951753	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=257,232;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	38961537	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:0,1:9,1:0,9,1,1
chr3	38962577	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:2,1:8,1:8,2,0,2
chr3	38967103	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.321:8:1,2:4,0:0,6,0,2
chr3	39108056	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=118,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:7,3:4,0:8,4,1,2
chr3	39110246	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=143,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:2,4:7,4:5,4,7,1
chr3	39110376	.	TA	T,TAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,28,28;MFRL=105,123,114;MMQ=60,60,60;MPOS=19,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.86,14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,9:0.158,0.412:22:6,2,4:4,1,5:2,8,5,7
chr3	39119615	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,0:6,4:6,5,4,0
chr3	39125609	.	CTTAATA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,2:2,6:3,1,6,2
chr3	39129742	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=251,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:3,2,2,2
chr3	39144910	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,5:2,3:2,0,6,2
chr3	39149092	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,327;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	39152248	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	39152575	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=208,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr3	39161456	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:6,3:3,4:0|1:39161456_G_A:39161456:3,7,2,5
chr3	39161464	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:7,2:4,4:0|1:39161456_G_A:39161456:3,8,2,4
chr3	39166484	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr3	39166509	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	39166701	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=301,288;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:39166701_G_T:39166701:1,2,0,1
chr3	39166708	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=301,288;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:39166701_G_T:39166701:1,2,0,1
chr3	39166711	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=301,288;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:39166701_G_T:39166701:1,2,0,1
chr3	39166743	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0,0,5,5
chr3	39167905	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr3	39170732	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=153,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.331:25:8,0:9,7:14,3,0,8
chr3	39170747	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=146,111;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:8,0:11,7:15,5,0,9
chr3	39170763	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=139,111;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:8,0:9,9:12,5,0,9
chr3	39171676	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=194,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:3,3,5,1
chr3	39174462	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,0:2,4:8,0,3,1
chr3	39177949	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=207,49;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:7,2:6,0:6,7,2,0
chr3	39178899	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:1,5:2,0:3,0,2,4
chr3	39179859	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,2:5,2:6,6,1,3
chr3	39179909	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:1,6:5,6:3,3,6,6
chr3	39180162	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=141,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:7,4:9,2:7,9,3,3
chr3	39180263	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=166,129;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:6,5:0,4:0|1:39180263_G_A:39180263:1,5,5,4
chr3	39180272	.	GG	TT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=177,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:0|1:39180263_G_A:39180263:5,8,1,1
chr3	39180275	.	C	CCAAAACCT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=166,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,2:3,0:0|1:39180263_G_A:39180263:5,7,1,1
chr3	39184522	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:6,5:8,0:13,2,5,0
chr3	39185968	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=118,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr3	39186038	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=118,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	39187955	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,1:11,0:11,8,2,0
chr3	39188182	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=156,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:5,4:3,4:5,4,4,4
chr3	39225585	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,4:6,1:4,8,2,3
chr3	39227899	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,10;MFRL=119,58;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,0:13,0:0|1:39227899_T_A:39227899:17,6,1,1
chr3	39227903	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=119,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:14,2:0|1:39227899_T_A:39227899:16,6,1,1
chr3	39227905	.	G	GTA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=119,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:14,2:0|1:39227899_T_A:39227899:16,6,1,1
chr3	39373902	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:8,2:4,2:6,6,2,2
chr3	39374488	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=186,232;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,0:8,5:7,8,5,0
chr3	39374587	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=194,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.214:15:5,2:7,0:6,6,1,2
chr3	39375140	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=146,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:4,1:4,1:1,7,1,1
chr3	39431996	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:15,0:7,9:9,13,0,9
chr3	39433147	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,3,13
chr3	39435865	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=140,246;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,0:3,2:8,3,2,1
chr3	39437800	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	39450065	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=134,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:7,3:11,1:12,6,2,2
chr3	39450276	.	C	CAT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=137,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:3,1:6,1:1,8,0,2
chr3	39453057	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=264,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr3	39453160	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=194,104;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:5,0:0,1:0,5,0,1
chr3	39453183	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=150,142;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39453183_A_T:39453183:0,3,0,1
chr3	39453185	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=150,142;MMQ=40,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39453183_A_T:39453183:0,3,0,1
chr3	39453610	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:3,2,0,2
chr3	39543487	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=201,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr3	39554946	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:6,4:8,4:7,7,5,3
chr3	40204178	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=126,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr3	40231383	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=182,95;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,0:6,3:4,6,2,1
chr3	40251282	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=155,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr3	40251392	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.817:12:1,6:0,4:0,2,4,6
chr3	40251628	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,4:0,4:0,2,0,8
chr3	40275461	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,2:5,3:7,5,2,3
chr3	40291836	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:7,6,0,2
chr3	40291983	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=148,286;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,1:11,2:12,7,0,3
chr3	40352355	.	ATTT	A,ATT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29,29;MFRL=138,96,187;MMQ=60,60,60;MPOS=20,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=T;STR;TLOD=6.92,12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,7:0.272,0.502:14:0,1,4:2,2,2:2,1,8,3
chr3	40352640	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr3	40352884	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=259,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,2:6,2:8,0,4,0
chr3	40352995	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=134,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:19,0:7,3:15,11,2,1
chr3	40353425	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=194,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:1,3,2,0
chr3	40429437	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=278,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr3	40503809	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=40,26;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:6,6:0,2:0,6,0,8
chr3	40528242	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	40552916	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=108,67;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:1,5:4,1:2,3,4,2
chr3	40557271	.	TTG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=237,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=TG;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr3	40557821	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=159,220;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:4,0:8,5:0|1:40557821_C_A:40557821:4,8,0,5
chr3	40557824	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=159,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.315:17:4,0:8,5:0|1:40557821_C_A:40557821:4,8,0,5
chr3	41266708	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=164,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,3:11,0:10,11,0,3
chr3	41267243	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.101:32:20,0:9,2:15,14,0,3
chr3	41267307	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=155,107;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:6,0:13,2:10,9,0,3
chr3	41274764	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr3	41277915	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:12,1:8,3:6,14,0,4
chr3	41279440	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:15,1:4,2:15,4,3,0
chr3	41291081	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=140,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,3:7,0:5,7,1,2
chr3	41607701	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	41756845	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=147,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.221:21:8,4:8,0:6,11,1,3
chr3	41841716	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=148,185;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,3:5,2:3,4,2,3
chr3	41877473	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.403:10:3,1:3,2:1,5,0,4
chr3	41925260	.	CAGAGAAAAAACAAGTGA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	41925301	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr3	41938500	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr3	41939993	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=211,158;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.899:18:0,13:1,3:0,1,7,10
chr3	41942199	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr3	41952781	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=68.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,14,9
chr3	41961168	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=152,100;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:4,3,1,2
chr3	41977214	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	41977488	.	CCT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,0,9
chr3	41996275	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,3,10
chr3	42133149	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr3	42201759	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=252,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:0,1:2,1:2,0,3,0
chr3	42202061	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=196,244;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	42226151	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=301,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.761:19:3,5:1,9:3,1,14,1
chr3	42234758	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=225,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:0,4,0,6
chr3	42235280	.	TATCTTAGGAAGTG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=173,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:8,2:7,2:8,11,2,2
chr3	42244321	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,2:2,5:0,2,0,7
chr3	42251577	.	CGGA	C,CGGAGGA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30,28;MFRL=241,181,194;MMQ=60,60,60;MPOS=11,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=GGA;STR;TLOD=12.84,13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,5:0.338,0.444:11:1,0,4:1,4,0:1,1,4,5
chr3	42305131	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=69.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,7,13
chr3	42438754	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=229,154;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.779:25:3,12:2,8:4,1,14,6
chr3	42448296	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=210,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr3	42560882	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=170,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,0:4,2:2,4,0,2
chr3	42569715	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=260,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	42573767	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=209,153;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:8,10,0,2
chr3	42576776	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,240;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:2,0:7,3:8,2,0,3
chr3	42598980	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:1,0,5,1
chr3	42599049	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=240,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.376:11:3,2:4,2:7,0,3,1
chr3	42599091	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=235,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.613:21:3,8:4,4:5,3,6,7
chr3	42599234	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=239,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:0,4:6,6:0,6,1,9
chr3	42605006	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,80;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:9,7:15,0:19,5,6,1
chr3	42672010	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=119,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,7:0.235:32:15,7:9,0:0|1:42672010_C_G:42672010:12,13,7,0
chr3	42672012	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=120,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,7:0.229:33:15,7:9,0:0|1:42672010_C_G:42672010:12,14,7,0
chr3	42672019	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=122,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,7:0.242:31:14,7:10,0:0|1:42672010_C_G:42672010:10,14,7,0
chr3	42679327	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=183,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,4:8,0:8,2,4,0
chr3	42728144	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=70,138;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.782:16:2,6:1,7:1,2,4,9
chr3	42733341	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:7,2,4,0
chr3	42738297	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=136,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,2,2
chr3	42738311	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.498:6:1,0:1,0:0|1:42738311_A_C:42738311:0,3,3,0
chr3	42738317	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:1,0:2,0:0|1:42738311_A_C:42738311:2,3,3,0
chr3	42772180	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=223,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	42774475	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=185,240;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr3	42784630	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	42799554	.	TACACACAC	T,TACACACACACACAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28,23;MFRL=321,209,177;MMQ=60,60,40;MPOS=24,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,13,20;RU=AC;STR;TLOD=5.42,3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.433,0.283:4:1,2,0:0,0,1:1,0,3,0
chr3	42799858	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr3	42827437	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=130,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,0:1,5:4,0,5,0
chr3	42906345	.	C	CGTTGTAGGGTGTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=127,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:2,3,0,2
chr3	42907411	.	T	TCTCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CTCC;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.318:7:2,0:4,1:0,6,0,1
chr3	42908370	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,21;MFRL=173,266;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.514:4:0,1:1,0:1,1,0,2
chr3	42947776	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,313;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	42956790	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:9,2:10,4:9,10,1,5
chr3	43094974	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,164;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.195:27:10,4:12,0:22,0,5,0
chr3	43097045	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=160,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:0|1:43097045_T_A:43097045:6,7,1,1
chr3	43097047	.	G	GTGATTAGAGCTAT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=160,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,2:8,0:0|1:43097045_T_A:43097045:6,7,1,1
chr3	43121385	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=200,140;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.229:20:5,0:10,4:10,6,0,4
chr3	43408582	.	G	GGAAATCAGATTCTCTCCCTTCCCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=183,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,1:3,0:0,5,0,1
chr3	43591142	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=15215367,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,0:1,6:2,0,5,1
chr3	43642126	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=98,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr3	43756577	.	C	CTG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=214,263;MMQ=60,56;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=TG;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.495:8:1,0:3,4:0,4,0,4
chr3	44283525	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr3	44308662	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=204,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:44308662_C_T:44308662:1,5,1,1
chr3	44308664	.	T	TCGTA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=204,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0|1:44308662_C_T:44308662:1,5,1,1
chr3	44332176	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr3	44345646	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr3	44364825	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=222,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:0,6,1,3
chr3	44373384	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=149,89;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,0:9,2:10,8,0,2
chr3	44373517	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,37,29;MFRL=159,187,211;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.64,3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,2:0.212,0.229:10:1,0,1:2,2,1:0,6,0,4
chr3	44399668	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=253,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:0,1:1,5:1,0,6,0
chr3	44408864	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	44434311	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=103,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,5:5,3:4,5,6,2
chr3	44437870	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=77.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0,0,16,7
chr3	44489880	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,2:5,3:8,2,3,2
chr3	44609829	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,3:10,0:4,13,0,3
chr3	44612158	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,1:2,1:2,4,0,2
chr3	44612895	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr3	44816851	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,0:6,3:6,8,3,0
chr3	44827967	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=126,261;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:5,8,0,2
chr3	44839100	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,3:8,0:6,7,3,0
chr3	44846477	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=86,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.364:11:2,2:1,2:6,1,3,1
chr3	44867681	.	T	TC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=171,105;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:8,0:11,7:10,9,0,7
chr3	44871505	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:1,9:7,2:4,4,8,3
chr3	44893815	.	ATGTCAGGCTTGCTGAGGTAAACCT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=174,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,1:8,1:2,21,0,2
chr3	44905770	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=106,286;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:11,3:14,2:10,15,5,0
chr3	44926857	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=168,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:6,3:9,3:10,5,4,2
chr3	44938303	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=198,161;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.216:15:9,0:3,2:8,4,0,3
chr3	44952407	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=199,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:6,0,4,1
chr3	44974570	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=180,133;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,2:11,0:11,7,2,0
chr3	45017782	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,2:3,1:6,5,2,1
chr3	45030564	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,1:7,1:8,3,2,0
chr3	45030749	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=190,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:8,4:10,1:6,12,2,3
chr3	45042934	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.378:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr3	45076972	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=196,163;MMQ=60,39;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr3	45130582	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=116,192;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,0:13,3:16,11,0,3
chr3	45132577	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=181,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr3	45132637	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=160,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.572:7:2,0:0,4:2,1,4,0
chr3	45137087	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,9:1,8:0,2,6,11
chr3	45151954	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=112,77;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.115:32:11,3:18,0:15,14,2,1
chr3	45153676	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:7,10,2,0
chr3	45187671	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=100,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,5:3,5:2,1,7,3
chr3	45267058	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=218,283;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,1,2
chr3	45461102	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=57.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,10:0,0,13,5
chr3	45500174	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr3	45515648	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr3	45527099	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	45527218	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,7:0,18:0,0,12,13
chr3	45542083	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:2,6,0,3
chr3	45557707	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.479:17:5,4:3,4:4,5,4,4
chr3	45559621	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=190,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr3	45583297	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=197,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:2,4:2,2:4,0,5,1
chr3	45637439	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=188,190;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,7:2,4:4,4,7,4
chr3	45637830	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:9,2:4,4:6,7,2,4
chr3	45677635	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=63.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.943:15:0,12:0,3:0|1:45677635_C_CT:45677635:0,0,9,6
chr3	45677638	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=63.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,12:0,3:0|1:45677635_C_CT:45677635:0,0,9,6
chr3	45677815	.	G	GAGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,4:0,4,1,6
chr3	45715767	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=116,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:2,2,1,3
chr3	45718602	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=250,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr3	45730910	.	CGCGGG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=150,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCGGG;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,2:5,0:13,4,1,1
chr3	45748429	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=131,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:0|1:45748429_G_A:45748429:2,5,1,5
chr3	45748435	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:0|1:45748429_G_A:45748429:1,5,0,5
chr3	45754749	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=201,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr3	45755579	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:10,3:8,0:8,10,0,3
chr3	45761115	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,3:2,3:0,5,2,4
chr3	45763635	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=115,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,9:2,2:0,3,2,9
chr3	45764544	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	45765132	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=180,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:1,4,0,2
chr3	45772742	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=137,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:4,2:3,3:3,4,3,2
chr3	45772772	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:8,4:5,10:5,8,9,5
chr3	45773732	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,216;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr3	45784963	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=158,250;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:0|1:45784963_T_C:45784963:2,0,2,0
chr3	45784972	.	GGT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=158,294;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:45784963_T_C:45784963:2,0,1,0
chr3	45804391	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=188,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:3,3,2,2
chr3	45812650	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,272;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr3	45813025	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	45814094	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:2,7,1,1
chr3	45821624	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,1,4
chr3	45943595	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,254;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,0:7,4:11,5,3,1
chr3	45977866	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=167,302;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:7,2,2,0
chr3	45977899	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr3	46007702	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=209,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	46016850	.	G	GTTCCTC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=191,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.162:16:7,2:6,0:0|1:46016850_G_GTTCCTC:46016850:4,10,1,1
chr3	46016851	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,6:0.389:16:6,2:3,4:1|0:46016850_G_GTTCCTC:46016850:2,8,3,3
chr3	46016852	.	T	TGTCTATCACTATGAAACAG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=191,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,1:7,0:0|1:46016850_G_GTTCCTC:46016850:4,10,1,1
chr3	46026259	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=182,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:5,1,4,0
chr3	46400756	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,216;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=43.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:13,0:7,15:8,13,0,15
chr3	46416371	.	GAGGATGGGAAGGAGGGAGGTATTCGTA	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.133:30:8,2:7,1:13,14,2,1
chr3	46416470	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,15:0.590:25:5,5:5,9:0|1:46416470_G_T:46416470:5,5,4,11
chr3	46416491	.	GGA	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:12,1:15,1:0|1:46416470_G_T:46416470:10,17,0,2
chr3	46417069	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=120,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,4:4,2:6,5,3,3
chr3	46450131	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=191,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:5,3,2,0
chr3	46450297	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=179,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:12,1:9,2:10,11,1,2
chr3	46479668	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr3	46484898	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=104,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.630:17:2,6:4,4:4,2,9,2
chr3	46501284	.	C	CCTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,6:0,4:0,0,2,9
chr3	46592879	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr3	46593147	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr3	46713102	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=127,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:10,2:4,2:6,8,1,3
chr3	46714797	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=143,309;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:3,1,2,0
chr3	46714821	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=153,309;MMQ=60,60;MPOS=34;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,1:0,1:4,2,2,0
chr3	46717931	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=176,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr3	46717957	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr3	46718298	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:0,4,1,4
chr3	46719835	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,1:5,1:4,6,0,2
chr3	46722692	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=201,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr3	46726948	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,4:2,5:3,0,9,0
chr3	46730749	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:6,2:3,2:10,0,3,1
chr3	46750553	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr3	46751073	.	TAAG	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AAG;STR;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:4,3:3,0:7,2,2,1
chr3	46785452	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=166,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.205:17:8,3:6,0:9,5,2,1
chr3	46902399	.	AG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=214,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:6,0:7,8,2,0
chr3	46925180	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	46963502	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=117,270;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,1:8,3:9,4,4,0
chr3	46965197	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=146,235;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,1:9,1:6,16,0,2
chr3	46966898	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.659:18:4,9:1,3:1,5,7,5
chr3	46967040	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.709:22:4,8:2,8:5,1,5,11
chr3	46982503	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=142,243;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,1:6,2:7,7,1,2
chr3	46982530	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=146,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,5:6,0:5,9,5,0
chr3	47021509	.	CGCGCGCGCGG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	47033937	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,248;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:1,1:9,1:8,2,1,1
chr3	47035900	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=198,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr3	47036073	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=207,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:1,5,0,2
chr3	47037096	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=184,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:4,3:4,3,1,2
chr3	47038135	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr3	47041471	.	G	GCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=87,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47041471_G_GCT:47041471:1,1,0,1
chr3	47041472	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=87,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47041471_G_GCT:47041471:1,1,0,1
chr3	47041474	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=87,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47041471_G_GCT:47041471:1,1,0,1
chr3	47041478	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47041471_G_GCT:47041471:0,1,0,1
chr3	47043386	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=244,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:3,3,2,2
chr3	47044122	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=52.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,4:0,13:0,0,10,7
chr3	47047176	.	A	AG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=185,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,1:9,1:7,7,2,0
chr3	47047358	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=184,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,1:10,2:10,9,1,2
chr3	47048452	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	47048818	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=194,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:7,2,0,2
chr3	47049017	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=189,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:9,0:9,7,2,0
chr3	47050631	.	GGTGGGGAGGCCCCTCGAACGGGGCGGGGC	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=227,46;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.231:16:3,0:4,3:10,3,3,0
chr3	47059323	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=187,283;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:5,1:0,9,0,3
chr3	47098695	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=168,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:13,2:14,0:19,8,0,2
chr3	47103861	.	GTTT	G,GTT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,32,32;MFRL=134,180,128;MMQ=60,60,60;MPOS=15,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.32,9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,5,6:0.153,0.233:31:4,2,2:7,2,2:0,20,0,11
chr3	47108515	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:6,5,2,0
chr3	47125229	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=154,65;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,2:10,0:11,4,2,0
chr3	47125916	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=16,20;MFRL=190,210;MMQ=50,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:0,0:0,2,0,2
chr3	47129747	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=148,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.307:14:7,0:3,4:5,5,2,2
chr3	47205502	.	CGCGGCGGCG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=261,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=GCG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr3	47277885	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,248;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:0,1:8,2:7,1,3,0
chr3	47286227	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr3	47287603	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0|1:47287603_A_AT:47287603:0,0,7,3
chr3	47287615	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=160,32;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,0:6,1:0|1:47287603_A_AT:47287603:7,7,1,1
chr3	47287622	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=172,32;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:0|1:47287603_A_AT:47287603:6,8,1,1
chr3	47305928	.	TTTTTA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.777:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	47316725	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	47318747	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,12,7
chr3	47361082	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=222,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:0,4:1,1:1,0,2,3
chr3	47363971	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	47376095	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	47451378	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=154,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:6,2:0|1:47451378_A_T:47451378:11,2,1,1
chr3	47451385	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=150,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:47451378_A_T:47451378:10,4,1,1
chr3	47451411	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,4:0,7:0,0,7,7
chr3	47452025	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=124,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	47452118	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=184,137;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:1,4:3,1,1,8
chr3	47452137	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,17;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,0:0|1:47452137_G_C:47452137:0,5,2,0
chr3	47452142	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,0:0|1:47452137_G_C:47452137:0,3,2,0
chr3	47452148	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0|1:47452137_G_C:47452137:0,3,2,0
chr3	47452156	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=134,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0,4,1,0
chr3	47453216	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=208,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,1,2
chr3	47454381	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=163,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.404:5:0,0:3,0:0,3,2,0
chr3	47454399	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=8,27;MFRL=116,163;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.795:6:0,1:0,4:1,0,0,5
chr3	47455261	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=212,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr3	47456225	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,8,6
chr3	47459237	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,243;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,0:9,2:2,12,0,2
chr3	47459564	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=234,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr3	47462587	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0|1:47462587_A_G:47462587:0,0,1,9
chr3	47462591	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=140,36898649;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.275:9:1,2:5,0:0|1:47462587_A_G:47462587:0,7,0,2
chr3	47463859	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:5,0,4,0
chr3	47539751	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	47543389	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=182,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr3	47604258	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=227,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47604258_G_GC:47604258:2,1,0,1
chr3	47604259	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=227,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47604258_G_GC:47604258:2,1,0,1
chr3	47604261	.	G	GCTA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=227,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47604258_G_GC:47604258:2,1,0,1
chr3	47604266	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=202,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:47604258_G_GC:47604258:1,1,0,1
chr3	47604299	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	47614413	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=184,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:0,6,0,4
chr3	47676902	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr3	47680119	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=198,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,1:1,7:0,1,8,0
chr3	47734700	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=165,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:2,3:6,0:4,5,1,2
chr3	47779460	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:6,4,2,0
chr3	47882727	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	47913498	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=213,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:4,5:9,3:7,6,4,4
chr3	47956424	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,3:4,1:1,6,2,2
chr3	47956506	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=171,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr3	48019258	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr3	48209486	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	48219320	.	AAC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.933:11:0,5:0,5:0,0,10,1
chr3	48219537	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=224,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr3	48222216	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=168,48;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:5,5,0,2
chr3	48222240	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=168,48;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:48222240_G_A:48222240:6,4,0,2
chr3	48222247	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=181,48;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:6,2:6,0:0|1:48222240_G_A:48222240:8,4,0,2
chr3	48228083	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,19;MFRL=178,177;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,1:2,0:6,0,2,0
chr3	48228098	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=173,96;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,3:4,0:12,0,3,0
chr3	48282620	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=135,65942820;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:10,4:10,0:11,9,1,3
chr3	48282651	.	TGCGC	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=GC;STR;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,2:4,3:4,9,3,2
chr3	48282695	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=118,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,0:6,4:2,7,1,3
chr3	48338173	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=222,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:7,0,3,0
chr3	48342669	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=217,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr3	48342882	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=172,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:4,3:4,3:0,8,1,6
chr3	48348564	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=226,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,1:6,3:1,7,0,4
chr3	48351560	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=345,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:0,6,1,2
chr3	48360992	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=189,169;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:5,3,1,3
chr3	48414197	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr3	48414215	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.278:11:4,0:4,3:6,2,2,1
chr3	48414820	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:10,3:8,0:8,10,3,0
chr3	48415007	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=235,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:1,5:1,11:2,0,12,4
chr3	48416756	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	48419723	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=125,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr3	48420103	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,235;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.772:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr3	48423614	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=173,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:5,2:3,1:3,5,0,3
chr3	48450706	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=153,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,2:3,0:6,2,2,0
chr3	48450808	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=132,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:10,0:15,4:6,19,4,0
chr3	48450952	.	C	CACACACACACACACACA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=216,176;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,0:8,3:2,10,0,3
chr3	48453305	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=125,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.558:32:5,8:9,10:3,11,8,10
chr3	48463618	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=197,250;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,0:9,3:6,8,0,3
chr3	48463711	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,1:2,7,0,2
chr3	48505302	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=153,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,1:6,2:5,7,0,3
chr3	48505927	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:6,3,2,0
chr3	48506805	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:9,7,1,1
chr3	48602523	.	G	GGGC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,9:0,0,8,12
chr3	48605980	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=182,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,1:4,1:3,10,1,1
chr3	48607420	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=173,177;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,1:4,0:0|1:48607420_A_G:48607420:2,4,2,0
chr3	48607422	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=173,177;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,0:0|1:48607420_A_G:48607420:2,4,2,0
chr3	48607507	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=201,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,0,1
chr3	48628315	.	T	TGCCTCCCGGCAGAGAGAAGTCCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=221,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48628315_T_TGCCTCCCGGCAGAGAGAAGTCCA:48628315:0,1,0,1
chr3	48628318	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=221,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48628315_T_TGCCTCCCGGCAGAGAGAAGTCCA:48628315:0,1,0,1
chr3	48628342	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	48629501	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,0:8,2:10,9,2,0
chr3	48629793	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=140,20328;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:8,8,0,2
chr3	48637151	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=171,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.290:15:5,4:6,0:7,4,2,2
chr3	48668170	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:0,6,2,2
chr3	48670876	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=185,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:7,10,1,1
chr3	48681631	.	TCCAG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=170,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCAG;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:3,0:7,2:5,6,1,1
chr3	48681765	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=213,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.617:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr3	48682390	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,181;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.546:16:5,4:2,3:5,2,0,9
chr3	48686489	.	TATCTGGGG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=212,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:1,2:5,1:4,4,3,0
chr3	48693293	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:0,1:1,0:1,0,1,1
chr3	48716741	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=230,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:2,2,3,1
chr3	48717048	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=141,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.263:20:7,0:7,4:9,6,2,3
chr3	48719638	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=192,255;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:0,2:1,0:1,1,1,1
chr3	48731718	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.112:34:11,0:17,3:6,25,2,1
chr3	48897078	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr3	48921467	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:2,0:5,3:2,5,0,3
chr3	48921494	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:2,4,0,2
chr3	48955609	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=248,169;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr3	48956862	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=223,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:0,2:1,1:0,2,0,3
chr3	49004723	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=156,259;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:2,11,1,1
chr3	49011036	.	C	A,G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=17,10,17;MFRL=183,179,177;MMQ=60,60,40;MPOS=24,34;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.20,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,1:0.524,0.250:5:0,0,0:0,0,0:1,0,4,0
chr3	49011042	.	CA	AA,AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,10,10;MFRL=0,181,177;MMQ=60,60,40;MPOS=25,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.53,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.623,0.250:5:0,0,0:0,0,0:0,0,5,0
chr3	49011050	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=193,177;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.430:7:4,0:0,0:0|1:49011050_G_T:49011050:4,0,3,0
chr3	49011067	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,16;MFRL=193,166;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:3,0:0,0:0|1:49011050_G_T:49011050:4,0,2,0
chr3	49020465	.	G	GCTCAGCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=183,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,2:2,0:3,4,1,1
chr3	49052785	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=199,247;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0,4,1,2
chr3	49053219	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=156,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:5,8,0,2
chr3	49054692	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=142,198;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.199:28:8,2:15,3:0|1:49054692_T_C:49054692:17,6,3,2
chr3	49054697	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:26,4:0.156:30:9,4:17,0:1|0:49054692_T_C:49054692:15,11,4,0
chr3	49056090	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr3	49063829	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=129,39;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,2:11,0:9,14,1,1
chr3	49063869	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=170,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,3:9,0:7,9,0,3
chr3	49070499	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=232,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:3,2,3,3
chr3	49094832	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:9,7,0,2
chr3	49114404	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,1:8,1:9,8,1,1
chr3	49133351	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=144,0;MMQ=60,45;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:49133351_G_C:49133351:4,0,1,0
chr3	49133353	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=144,0;MMQ=60,45;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:49133351_G_C:49133351:4,0,1,0
chr3	49137692	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=155,106;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:5,0:12,4:4,13,0,4
chr3	49137904	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:8,2:3,6:2,9,3,5
chr3	49139966	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=146,278;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:1,7,0,3
chr3	49140001	.	CTA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=153,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	49140792	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:7,2,2,0
chr3	49146656	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=250,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:3,1:4,1:0,8,0,2
chr3	49148890	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=250,252;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:2,2,3,2
chr3	49152813	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,111;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.121:23:13,2:8,0:11,10,0,2
chr3	49154152	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=198,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr3	49156676	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=165,301;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr3	49158657	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:10,2,1,1
chr3	49166069	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:7,2:3,3:4,6,3,3
chr3	49166561	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=302,311;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:4,4,2,0
chr3	49169782	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=182,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:8,2:13,2:13,8,2,2
chr3	49249381	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=203,278;MMQ=47,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	49278804	.	C	CAAAAA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,9;RU=A;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:7,1:0|1:49278804_C_CAAAAA:49278804:4,8,0,2
chr3	49278809	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:49278804_C_CAAAAA:49278804:4,8,0,2
chr3	49278811	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:49278804_C_CAAAAA:49278804:4,8,0,2
chr3	49292991	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,152;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=T;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.795:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr3	49321424	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=225,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:0,1:5,2:3,2,1,2
chr3	49321851	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=141,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:4,0,0,2
chr3	49322426	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=232,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.322:7:4,2:1,0:0|1:49322426_G_GC:49322426:1,4,1,1
chr3	49322427	.	A	ATGCACCTAAAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=232,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.325:7:4,2:1,0:0|1:49322426_G_GC:49322426:1,4,1,1
chr3	49362429	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=141,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:2,10,2,1
chr3	49365269	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=166,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr3	49406080	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=132,311;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,2:1,1:0,3,0,3
chr3	49459114	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=171,270;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr3	49463926	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr3	49548294	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	49569398	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,2:7,4:7,8,4,2
chr3	49570189	.	G	GCAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=181,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:4,3,1,1
chr3	49592137	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:49592137_A_C:49592137:0,0,1,0
chr3	49592152	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:49592137_A_C:49592137:0,0,1,0
chr3	49592167	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:49592137_A_C:49592137:0,0,1,0
chr3	49592169	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:49592137_A_C:49592137:0,0,1,0
chr3	49679800	.	CC	TT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:4,7,1,1
chr3	49680063	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=185,225;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:4,4,1,1
chr3	49698656	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,143;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,0:6,4:11,3,0,4
chr3	49712629	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=180,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:12,3:11,0:14,9,3,0
chr3	49713753	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,8,7
chr3	49715051	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=179,90;MMQ=60,47;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,0:11,2:5,12,1,1
chr3	49719789	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=209,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:11,0:2,3:6,8,2,1
chr3	49720393	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=228,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:1,3,2,3
chr3	49720679	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:5,7:10,0:0|1:49720679_C_A:49720679:7,9,7,0
chr3	49720686	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:5,7:11,0:0|1:49720679_C_A:49720679:8,8,7,0
chr3	49724048	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=199,190;MMQ=50,25;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,1:4,1:8,1,2,0
chr3	49725948	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,127;MMQ=56,36;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:4,2,2,0
chr3	49736565	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=248,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr3	49739086	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=119,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.305:24:1,4:16,3:0,17,3,4
chr3	49750188	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=223,279;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	49753003	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=121,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,2:3,4:3,2,2,4
chr3	49753788	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=125,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:2,4,2,6
chr3	49758764	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=150,280;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:9,2:5,1:4,10,1,2
chr3	49828155	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	49828285	.	CTG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TG;STR;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:3,0:5,2:4,4,1,1
chr3	49828911	.	GAA	G,GA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,35,35;MFRL=126,135,133;MMQ=60,60,60;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=6.25,6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,4,4:0.203,0.226:20:5,3,2:7,1,2:5,7,3,5
chr3	49834451	.	A	AAAAAGAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=137,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,2:7,0:4,4,1,1
chr3	49836707	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,223;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:10,3:11,1:11,10,3,1
chr3	49842881	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=241,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.665:10:2,1:1,5:1,2,4,3
chr3	49847623	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=196,287;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,0:7,2:11,3,1,1
chr3	49847642	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:2,1:4,1,2,1
chr3	49848414	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,3:8,1:9,7,4,0
chr3	49866584	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=156,91;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,9:0.333:28:11,1:8,8:0|1:49866584_T_G:49866584:6,13,3,6
chr3	49866605	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=144,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:24,3:0.137:27:11,0:13,3:1|0:49866584_T_G:49866584:11,13,0,3
chr3	49878395	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=194,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:3,2,4,3
chr3	49881134	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=137,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr3	49884913	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,239;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:6,1:9,1,2,0
chr3	49897830	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=273,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:0,11:1,3:0,1,8,6
chr3	49898000	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr3	49898318	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=171,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,11:0.750:14:1,7:2,4:0|1:49898318_C_G:49898318:1,2,7,4
chr3	49898320	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0|1:49898318_C_G:49898318:7,5,1,1
chr3	49899447	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=239,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:4,0:2,0:0|1:49899447_A_C:49899447:2,7,2,0
chr3	49899452	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=244,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.251:10:4,0:3,0:0|1:49899447_A_C:49899447:2,6,2,0
chr3	49899838	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=146,83;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,0:6,5:4,9,0,5
chr3	49935910	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=199,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,2:5,0:9,1,1,1
chr3	49940317	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,80;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,0:9,2:12,12,0,2
chr3	49967162	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=218,153;MMQ=60,60;MPOS=-18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,0:2,1:2,3,0,1
chr3	50091942	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=216,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr3	50095103	.	CTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr3	50095816	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=204,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:1,5:8,0:7,2,5,0
chr3	50112589	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=116,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.402:10:1,0:4,2:5,1,2,2
chr3	50129374	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,13,0
chr3	50129399	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=195,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,1:2,2:8,0,3,0
chr3	50137307	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=212,250;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr3	50153045	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:12,0:7,6:8,11,0,6
chr3	50155887	.	T	TGA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=130,261;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=GA;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:1,1:2,0:0,4,0,2
chr3	50211536	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,1:6,1:9,7,0,2
chr3	50212512	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=230,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,10:1,3:3,0,6,7
chr3	50220171	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:4,7,1,1
chr3	50221058	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr3	50221071	.	A	ACAGAGTCCCCTTTATTCTTACCTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=148,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr3	50223977	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:2,1:4,2,2,0
chr3	50230902	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=225,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,2:7,1:7,7,1,2
chr3	50251833	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.923:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr3	50253196	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:6,8,1,1
chr3	50255663	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=214,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0|1:50255663_C_T:50255663:1,1,3,1
chr3	50255666	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=214,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0|1:50255663_C_T:50255663:1,1,3,1
chr3	50293591	.	G	GGC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:50293591_G_GGC:50293591:1,3,2,0
chr3	50293601	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:50293591_G_GGC:50293591:0,4,1,0
chr3	50306752	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr3	50308718	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr3	50312393	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=191,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,1:4,0:3,10,2,0
chr3	50312998	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,1:6,1:9,7,1,1
chr3	50329626	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=163,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr3	50377912	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	50380253	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,5:0,0:5,0,5,0
chr3	50389409	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=178,245;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:10,4:13,0:15,8,4,0
chr3	50389497	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=165,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:7,7:11,7:8,10,8,6
chr3	50403460	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:11,2:5,0:10,8,2,0
chr3	50404533	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.240:18:1,1:10,2:6,8,0,4
chr3	50404542	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,13;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.302:20:2,0:8,2:5,9,0,6
chr3	50404553	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=15,15;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:0,1:1,1:1,6,0,6
chr3	50417407	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:12,5,1,1
chr3	50608463	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:12,0,2,0
chr3	50609123	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,18,7
chr3	50615302	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,0:12,3:10,12,3,0
chr3	50615416	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=183,232;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr3	50644967	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=198,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr3	50644992	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=182,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:3,0:4,2:5,3,2,0
chr3	50645635	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr3	50645793	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,15,5
chr3	50678001	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr3	50683258	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:6,0:5,6:0,11,0,6
chr3	50684489	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,10,1
chr3	50971400	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,4:7,2:4,6,3,3
chr3	51127848	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=235,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:1,2,1,3
chr3	51246360	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	51264940	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=120,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr3	51266880	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:1,1:3,2:4,1,3,0
chr3	51273711	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,8,2
chr3	51274902	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=213,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:1,3:3,3:2,2,5,1
chr3	51312525	.	TG	CC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=139,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:3,6,1,1
chr3	51349357	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=204,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr3	51349887	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=195,101;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=39.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:1,9:4,5:4,1,12,2
chr3	51393457	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=186,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	51393706	.	C	CAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.887:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr3	51399933	.	CCTG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTG;STR;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,4:2,0:6,1,3,1
chr3	51419046	.	A	ACTAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51419046_A_ACTAT:51419046:0,0,0,1
chr3	51419048	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51419046_A_ACTAT:51419046:0,0,0,1
chr3	51419051	.	TG	GT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51419046_A_ACTAT:51419046:0,0,0,1
chr3	51426316	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=212,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,3:7,2:10,1,5,0
chr3	51429584	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=252,285;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51429584_TA_T:51429584:1,0,0,1
chr3	51429586	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=252,285;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51429584_TA_T:51429584:1,0,0,1
chr3	51430821	.	GCCA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=253,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CCA;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:5,0:2,2:4,3,2,0
chr3	51431679	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,1:8,2:11,5,1,2
chr3	51431981	.	C	CTTAT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.258:21:6,3:10,2:9,7,3,2
chr3	51433343	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=193,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:8,1:9,4:10,7,4,1
chr3	51433932	.	AACTT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ACTT;STR;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,5:7,1:4,9,3,3
chr3	51435059	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=122,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:3,3:19,0:13,9,3,0
chr3	51436289	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=203,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:51436289_T_C:51436289:1,0,0,1
chr3	51436295	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=203,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:51436289_T_C:51436289:1,0,0,1
chr3	51436296	.	T	TTAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=203,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:51436289_T_C:51436289:1,0,0,1
chr3	51440548	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,2:5,3,3,0
chr3	51440602	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=219,258;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:5,4,0,2
chr3	51458204	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=213,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:13,1:4,1:10,7,1,1
chr3	51459974	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,193;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,0:3,5:0,5,0,5
chr3	51465085	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	51467552	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,37;MMQ=60,58;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:8,4,1,1
chr3	51679215	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,4:11,0:9,11,4,0
chr3	51697493	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	51747021	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=178,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,6:5,0:6,4,6,0
chr3	51752166	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=175,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.467:11:1,3:4,2:1,5,0,5
chr3	51864849	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=225,230;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	51864862	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=301,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr3	51864879	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=301,230;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:51864879_A_T:51864879:0,2,0,1
chr3	51864882	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,22;MFRL=301,230;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:51864879_A_T:51864879:0,2,0,1
chr3	51895850	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:3,2:4,5:4,3,4,3
chr3	51907736	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	51908226	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	51929360	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,4,9
chr3	51936949	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,1:2,6:2,0,7,0
chr3	51975395	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=149,78;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:8,3,2,0
chr3	51975577	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:2,3:5,3:0,7,0,7
chr3	51978220	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,4:0,15:0,0,9,10
chr3	51993023	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=194,253;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:4,0:0|1:51993023_A_C:51993023:2,5,2,0
chr3	51993029	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,10;MFRL=174,253;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:5,0:0|1:51993023_A_C:51993023:3,7,2,0
chr3	51993034	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=158,253;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:4,0:0|1:51993023_A_C:51993023:4,6,2,0
chr3	51993038	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,10;MFRL=158,253;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:4,0:6,0:0|1:51993023_A_C:51993023:4,6,2,0
chr3	51995170	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,1:7,3:7,3,2,2
chr3	52021196	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=171,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:3,7,0,2
chr3	52022742	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=149,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.359:26:10,3:6,6:8,9,4,5
chr3	52022852	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=158,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,2:8,3:7,8,0,5
chr3	52029326	.	TGAA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=159,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,1:8,1:0|1:52029326_TGAA_T:52029326:10,2,1,1
chr3	52029330	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=159,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,1:8,1:0|1:52029326_TGAA_T:52029326:10,2,1,1
chr3	52088276	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:14,1:11,2:5,20,3,0
chr3	52097303	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:13,0:8,5:11,10,0,6
chr3	52110089	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:3,1:0,5,0,3
chr3	52236762	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=192,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,23:0.828:27:2,5:2,18:1,3,7,16
chr3	52238656	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr3	52238677	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,3:2,5:3,0,9,0
chr3	52240088	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr3	52258372	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=272,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,3:0,4:0,2,0,7
chr3	52293312	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=184,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,4:5,4:7,6,4,4
chr3	52293859	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=209,96;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:3,5:5,2:0|1:52293859_A_G:52293859:5,3,1,6
chr3	52293861	.	A	AAG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=165,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:7,0:0|1:52293859_A_G:52293859:5,10,1,1
chr3	52293862	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=165,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:7,0:0|1:52293859_A_G:52293859:5,10,1,1
chr3	52325759	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=309,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,7:1,8:2,0,9,6
chr3	52379420	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=185,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr3	52390555	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=215,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr3	52390845	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=204,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr3	52396944	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr3	52400740	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:4,1:2,3:3,4,2,2
chr3	52404111	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=248,220;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:2,2:4,1:2,4,2,1
chr3	52404212	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=214,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:2,5,3,0
chr3	52415865	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr3	52420901	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=217,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,4:5,1:2,5,2,3
chr3	52428988	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=176,126;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:3,5,1,5
chr3	52429022	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=153,79;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:9,4,0,2
chr3	52431671	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=231,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,4,1
chr3	52454262	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=248,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:1,1:3,0,2,0
chr3	52456973	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=162,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,8:4,4:2,4,4,8
chr3	52471942	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,1,1
chr3	52472044	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:8,2,2,0
chr3	52489677	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=197,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,1:1,1:4,0,2,0
chr3	52491836	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=139,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:6,4:11,2:9,8,5,1
chr3	52505758	.	G	GAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr3	52506282	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr3	52506426	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,2,6
chr3	52506491	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr3	52510592	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr3	52510697	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	52512318	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=167,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:0,1:1,8:0,1,7,2
chr3	52513940	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr3	52522659	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	52523765	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=393,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr3	52536308	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	52537969	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,1,7
chr3	52540153	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,4:5,0:8,2,5,0
chr3	52544104	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=186,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:4,1:5,1:7,2,2,0
chr3	52546487	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr3	52546820	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=202,255;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,2:2,0:0,2,1,2
chr3	52551265	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=155,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,3:1,2:0|1:52551265_T_C:52551265:2,0,5,0
chr3	52551284	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=126,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:52551265_T_C:52551265:2,0,3,0
chr3	52553625	.	TGTAA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=112,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.562:7:0,2:3,2:1,2,4,0
chr3	52555957	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=135,120;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:1,1,2,4
chr3	52557038	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,7:4,2:2,5,3,6
chr3	52559167	.	CGGGG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=G;STR;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.820:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	52561779	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=206,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,2:3,5:3,2,2,5
chr3	52561919	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=194,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:7,6,2,0
chr3	52584715	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,1,4
chr3	52588655	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:6,1:1,1:7,0,1,1
chr3	52597571	.	G	GGGCACAAAGCGGC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=200,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52597571_G_GGGCACAAAGCGGC:52597571:0,3,0,1
chr3	52597575	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=200,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52597571_G_GGGCACAAAGCGGC:52597571:0,3,0,1
chr3	52597576	.	G	GGGC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=200,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52597571_G_GGGCACAAAGCGGC:52597571:0,3,0,1
chr3	52597605	.	C	CTTCACCAAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=256,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52597605_C_CTTCACCAAA:52597605:0,1,0,1
chr3	52597607	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,23;MFRL=256,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52597605_C_CTTCACCAAA:52597605:0,1,0,1
chr3	52637486	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr3	52643307	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,1:6,6:5,3,5,2
chr3	52661351	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=129,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,4:6,0:1,8,2,2
chr3	52692124	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	52692359	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=209,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:1,2,0,3
chr3	52722266	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=169,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr3	52725735	.	TTT	GCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=130,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr3	52727189	.	G	GTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.240:10:5,2:3,0:6,2,2,0
chr3	52727257	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:4,4:8,6:7,5,3,7
chr3	52727493	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=185,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:10,5:7,2:6,11,5,2
chr3	52728312	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=144,224;MMQ=46,43;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.410:10:3,4:3,0:1,5,0,4
chr3	52740920	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=136,66;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.209:31:17,0:8,5:6,19,0,6
chr3	52745875	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:8,2:7,0:7,8,0,2
chr3	52778347	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=139,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,3:5,1:2,6,2,2
chr3	52780005	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=177,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:5,1,2,0
chr3	52804641	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=208,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:3,2:5,2,2,0
chr3	52814256	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.234:11:5,1:3,1:3,6,1,1
chr3	52815905	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=194,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr3	52819327	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr3	52821666	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:6,3:10,0:7,10,2,1
chr3	52821992	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=270,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:2,5:0,5:1,1,7,5
chr3	52825462	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=215,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr3	52825528	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=146,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:8,0,3,0
chr3	52833150	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=188,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.303:11:2,0:2,0:0|1:52833150_T_G:52833150:1,7,0,3
chr3	52833153	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=188,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.303:11:3,1:1,0:0|1:52833150_T_G:52833150:1,7,0,3
chr3	52833536	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=167,113;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.295:25:9,0:9,7:3,15,0,7
chr3	52833558	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:5,2:2,1:0,7,1,2
chr3	52837855	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr3	52847601	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=194,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr3	52847908	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	52848207	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:5,2,3,0
chr3	52848355	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=152,74;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:4,8,2,0
chr3	52851137	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=228,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	52852060	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=79,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:1,7,0,3
chr3	52853340	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr3	52853401	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,6:2,2:4,4,3,5
chr3	52854186	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=173,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:6,0,4,0
chr3	52858197	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=187,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr3	52864689	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=152,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:52864689_G_T:52864689:3,6,1,1
chr3	52864693	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=152,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:0|1:52864689_G_T:52864689:3,6,1,1
chr3	52867288	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr3	52867595	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.764:15:1,5:2,6:2,1,10,2
chr3	52867811	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr3	52874446	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	52874706	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=194,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:52874706_C_A:52874706:0,2,0,1
chr3	52874711	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,13;MFRL=194,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:52874706_C_A:52874706:0,2,0,1
chr3	52874713	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=194,212;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.491:4:0,0:2,0:0|1:52874706_C_A:52874706:0,2,0,2
chr3	52874715	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=194,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.491:4:0,2:1,0:0|1:52874706_C_A:52874706:0,2,0,2
chr3	52877647	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:52877647_C_CA:52877647:0,0,3,1
chr3	52877649	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:52877647_C_CA:52877647:0,0,3,1
chr3	52877720	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,1:0,0,7,4
chr3	52878746	.	C	CAG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,0:0,5:0,0,8,0
chr3	52878825	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,5:0,13:0,0,11,7
chr3	52886605	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=211,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:7,4:3,3:7,3,6,1
chr3	52960013	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=58.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,12,4
chr3	52968726	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	52968801	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	53003021	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	53126143	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=174,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr3	53126504	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:6,3:13,0:11,8,3,0
chr3	53126672	.	TTGCCCTGGACAAGGC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.533:15:2,3:3,5:1,6,3,5
chr3	53133526	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr3	53154132	.	ATTAACT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=241,299;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:0,0:4,2:0,5,0,2
chr3	53212574	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=107,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:3,2,0,4
chr3	53213538	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr3	53213815	.	C	CGTGT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=GT;STR;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.735:9:0,1:2,5:0,2,0,7
chr3	53215141	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=193,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr3	53215799	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=170,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.328:13:2,1:7,3:2,7,1,3
chr3	53217413	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=176,225;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr3	53218818	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=169,266;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,1:8,2:9,3,3,0
chr3	53219675	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=155,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,2:2,0:2,5,0,2
chr3	53220444	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,4,3
chr3	53220569	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,305;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:4,2,1,1
chr3	53220763	.	GCTCAGAGC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:0,10,0,3
chr3	53223286	.	GCTGGT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=210,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,1,0
chr3	53223291	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr3	53259996	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=167,232;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,1,2
chr3	53260716	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=149,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr3	53260903	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=188,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,2:5,3:4,8,2,3
chr3	53262000	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=129,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:4,1,2,2
chr3	53262400	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=221,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:1,5,1,3
chr3	53262472	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=228,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr3	53263279	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,4:4,1:3,4,4,1
chr3	53267100	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=183,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:3,1:4,2:8,0,2,1
chr3	53267133	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=18,33;MFRL=37,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.879:14:0,6:0,6:0,1,5,8
chr3	53267155	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=135,276;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,2:6,2:6,9,2,2
chr3	53267296	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,1:5,5:5,7,3,3
chr3	53269275	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=246,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr3	53276052	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,17;MFRL=195,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.485:6:2,1:1,0:3,0,3,0
chr3	53324819	.	ATGGCAC	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGCAC;STR;TLOD=79.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.959:18:0,6:0,12:0,0,3,15
chr3	53324915	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:0,6:1,3:0,1,2,7
chr3	53326795	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=141,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.219:11:4,0:5,2:0,9,1,1
chr3	53353319	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=221,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr3	53529121	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=24,25;MFRL=211,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,0:1,1:0|1:53529121_T_TC:53529121:1,0,1,0
chr3	53529127	.	T	TACCCCCCCCCC	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=15,24;MFRL=211,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:53529121_T_TC:53529121:1,0,1,0
chr3	53529128	.	T	TG,C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,25,32;MFRL=0,211,163;MMQ=60,60,60;MPOS=20,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,1,1:0,0,2,0
chr3	53529131	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,22;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:53529121_T_TC:53529121:0,0,2,0
chr3	53529137	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,21;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.762:2:0,0:0,1:0|1:53529121_T_TC:53529121:0,0,2,0
chr3	53529140	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=164,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,0:1,1:1|0:53529121_T_TC:53529121:3,0,1,0
chr3	53529143	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,13;MFRL=186,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,0:1|0:53529121_T_TC:53529121:2,0,1,0
chr3	53529145	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=186,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:53529121_T_TC:53529121:2,0,1,0
chr3	53685039	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr3	53776995	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.811:19:1,8:2,8:3,0,12,4
chr3	53777176	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=230,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:1,3,2,4
chr3	53778875	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:5,8:6,6:4,7,7,7
chr3	53779580	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=225,263;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr3	53806803	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:2,6:1,7:3,0,10,3
chr3	53806817	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=209,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:5,4:1,7:5,2,9,2
chr3	53814197	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=194,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,1,2
chr3	53820776	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=167,0;MMQ=60,45;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:53820776_G_C:53820776:2,0,1,0
chr3	53820783	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=115,0;MMQ=60,45;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:53820776_G_C:53820776:3,0,1,0
chr3	53820787	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=123,0;MMQ=60,45;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:53820776_G_C:53820776:4,0,1,0
chr3	53853009	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=92,291;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,1:7,2:5,7,1,2
chr3	53853490	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:5,1:0,1:4,1,2,0
chr3	53880789	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	53882661	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=160,281;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,0:4,5:4,6,3,2
chr3	53882663	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=281,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:0,6:5,4:3,2,4,6
chr3	53882673	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.913:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr3	53890787	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	53904229	.	C	CCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr3	53906334	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=243,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,0:2,2:9,1,2,0
chr3	53909952	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=188,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,2:1,5:4,1,3,4
chr3	53910117	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=183,30;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,3:1,5:0,4,2,6
chr3	53910118	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=60,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.265:13:4,2:6,1:0|1:53910118_A_G:53910118:3,7,0,3
chr3	53910121	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=60,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,2:6,1:0|1:53910118_A_G:53910118:3,7,0,3
chr3	53910122	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=149,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:1,3:0,6:0,1,3,6
chr3	53911270	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=197,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,1:10,1:13,4,2,0
chr3	53911338	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=141,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.249:38:15,8:14,0:17,12,9,0
chr3	53911728	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:8,4,2,0
chr3	53911783	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=169,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,6:4,2:4,5,4,4
chr3	53912341	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=227,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:1,4:1,1,8,0
chr3	53912380	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=194,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:10,2:8,3:12,6,5,0
chr3	53914093	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=132,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.389:39:15,8:8,7:11,13,8,7
chr3	53916130	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:14,5:10,2:8,16,2,5
chr3	53919720	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=256,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,3:4,1:6,3,2,2
chr3	53921028	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=216,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:0,3:2,6:1,1,0,9
chr3	54157710	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=221,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr3	54420721	.	G	GTTT	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=30,36;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=18,21;RU=T;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:1,2:0,1:0|1:54420721_G_GTTT:54420721:0,2,3,0
chr3	54420740	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,15;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:1,0:1,0:0|1:54420721_G_GTTT:54420721:0,2,2,0
chr3	54420742	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,16;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:54420721_G_GTTT:54420721:0,2,1,0
chr3	54420744	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,16;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:54420721_G_GTTT:54420721:0,2,1,0
chr3	54420749	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,16;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:54420721_G_GTTT:54420721:0,2,1,0
chr3	54420752	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,16;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:54420721_G_GTTT:54420721:0,2,1,0
chr3	54596815	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=207,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr3	54604188	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=173,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:4,2:2,4:0,6,0,7
chr3	54615971	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr3	54913354	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=126,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,4:2,1:2,1,4,1
chr3	54913369	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,11;MFRL=195,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,0:1,0:3,4,3,0
chr3	54919272	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,0:5,7:4,2,4,3
chr3	54962013	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=159,239;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,3:2,5:3,4,3,5
chr3	55003733	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=47,236;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,4,1
chr3	55038898	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,6,9
chr3	55107558	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=192,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:6,0:9,6:6,9,6,0
chr3	55108055	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=274,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,1:2,4:2,1,5,0
chr3	55508274	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=199,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,5:5,0:10,0,5,0
chr3	55514766	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.402:23:7,2:6,7:12,2,6,3
chr3	55733390	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=97,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,4:6,5:10,2,6,3
chr3	55769009	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=145,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr3	56026034	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,238;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:9,0,4,0
chr3	56041187	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=156,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,1:6,2:10,3,2,1
chr3	56052839	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=212,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,1:3,3:7,0,4,0
chr3	56207593	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=198,48;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:4,4,1,1
chr3	56207609	.	T	TTTTTGTTTGTTTGC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=202,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:1,7,1,1
chr3	56591178	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=349,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.811:12:1,6:0,4:2,0,10,0
chr3	56591278	.	T	TGGGGTAAGCA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=285,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGTAAGCA;STR;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.874:13:0,9:1,2:0,1,6,6
chr3	56593543	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=228,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.750:18:3,9:1,5:4,0,6,8
chr3	56593647	.	C	CCT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=176,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:9,2:7,0:0|1:56593647_C_CCT:56593647:9,7,1,1
chr3	56593653	.	T	TCC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=177,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:56593647_C_CCT:56593647:10,7,1,1
chr3	56593654	.	T	TTAGTGCACC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=177,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:6,0:0|1:56593647_C_CCT:56593647:10,7,1,1
chr3	56593680	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=219,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,4:1,4:1,4,2,6
chr3	56597688	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=294,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr3	56601115	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=125,252;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,2:0,5:0,2,0,7
chr3	56605334	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=143,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:8,2:6,4:10,4,2,4
chr3	56605404	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=151,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.712:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr3	56627598	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,10:0,6:0,0,11,5
chr3	56647799	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=120,257;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,1:6,1:9,11,1,1
chr3	56650054	.	T	TCTC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=143,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:8,1:4,4:6,6,4,1
chr3	56650178	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=140,273;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr3	56653201	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	56653609	.	CGT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=209,261;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,4:1,1:1,5,3,2
chr3	56658871	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=108,226;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,7:0.200:38:14,3:16,4:0|1:56658871_T_C:56658871:13,18,2,5
chr3	56658890	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=172,108;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,4:0.147:32:14,0:14,4:1|0:56658871_T_C:56658871:12,16,0,4
chr3	56661715	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=154,113;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:14,0:17,5:12,19,0,5
chr3	56662727	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	56674190	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=223,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,0:2,6:1,1,0,6
chr3	56683063	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,122;MMQ=60,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:11,4:11,0:13,9,4,0
chr3	56695060	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=126,241;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:5,3:3,0:2,7,0,3
chr3	56763228	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr3	56763328	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=126,243;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:8,1:8,4:5,11,3,2
chr3	56766435	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=129,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:6,1:22,3:7,21,1,3
chr3	56771243	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:9,0:12,3:0|1:56771243_A_T:56771243:12,11,0,3
chr3	56771248	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=131,87;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:9,0:15,3:0|1:56771243_A_T:56771243:11,13,0,3
chr3	56807854	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=188,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.438:11:3,1:3,3:0,6,0,5
chr3	56808956	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=115,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,3:0,4:2,0,6,1
chr3	57069226	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=221,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr3	57132200	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=202,161;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,7:2,4:1,3,4,7
chr3	57136585	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:6,2:2,7:2,6,3,6
chr3	57137090	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=117,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:0,3:5,4:4,2,6,3
chr3	57137232	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:0,5,1,4
chr3	57137272	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:57137272_C_T:57137272:0,3,0,1
chr3	57137278	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:57137272_C_T:57137272:0,3,0,1
chr3	57139833	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,4:2,1:2,0,3,2
chr3	57139972	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,216;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,4:5,3:3,4,5,2
chr3	57140108	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=151,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,5:4,8:3,3,4,9
chr3	57144258	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:6,0:6,1:8,4,1,1
chr3	57232928	.	TG	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=153,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:0|1:57232928_TG_T:57232928:5,11,0,2
chr3	57232930	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=153,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:0|1:57232928_TG_T:57232928:5,11,0,2
chr3	57232933	.	TCCCA	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=155,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,1:9,1:0|1:57232928_TG_T:57232928:5,12,0,2
chr3	57261995	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=234,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr3	57264872	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:1,1:3,1:1,3,0,3
chr3	57276258	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=270,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,2:0,7:0,1,0,9
chr3	57294085	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,4:2,6:0,2,5,5
chr3	57294295	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,310;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	57294884	.	CAAATT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATT;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	57335705	.	TACACACACAC	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=25,20;RU=AC;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.793:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	57335876	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=190,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.827:21:2,9:1,9:3,0,10,8
chr3	57386148	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=147,111;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,0:5,3:5,6,1,2
chr3	57386170	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=158,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.183:14:3,2:9,0:0|1:57386170_G_T:57386170:6,6,1,1
chr3	57386176	.	C	CAAG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=157,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:8,0:0|1:57386170_G_T:57386170:5,8,1,1
chr3	57386178	.	T	TTGA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=158,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,1:8,0:0|1:57386170_G_T:57386170:5,7,1,1
chr3	57391284	.	GTTCA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=173,262;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr3	57422824	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=161,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,1,3
chr3	57422876	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=216,246;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	57430626	.	TG	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=219,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:57430626_TG_GT:57430626:0,3,0,2
chr3	57430629	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=219,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:57430626_TG_GT:57430626:0,3,0,2
chr3	57431740	.	ATAAATAAATAAT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:0,1:0,4:1,0,5,0
chr3	57432064	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr3	57432418	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr3	57443817	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=120,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,5:4,3:5,1,5,3
chr3	57456093	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=128,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.578:5:0,2:2,1:1,1,3,0
chr3	57456371	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=197,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:2,3,0,5
chr3	57457123	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	57469053	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	57469097	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:1,1,5,2
chr3	57469272	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=165,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr3	57475351	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=129,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.537:15:4,7:2,1:2,5,6,2
chr3	57488279	.	T	TTTC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr3	57563120	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:1,2:8,0:4,5,1,2
chr3	57582718	.	GAAA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,4;RU=A;STR;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:4,5:1,2:5,0,6,1
chr3	57627500	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr3	57631951	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:10,0,2,0
chr3	57632095	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,0:5,3:8,5,0,3
chr3	57743337	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=204,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,1:3,2:8,1,2,1
chr3	57835653	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=253,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57835653_G_C:57835653:0,2,0,1
chr3	57835659	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=253,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57835653_G_C:57835653:0,2,0,1
chr3	57846577	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.388:21:4,4:8,4:4,9,1,7
chr3	57850505	.	CT	C,CTT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,30,32;MFRL=149,174,109;MMQ=60,60,60;MPOS=15,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.18,4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,3:0.276,0.218:15:2,2,2:5,2,1:3,5,5,2
chr3	57850593	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=119,135;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:11,6:6,0:7,10,6,0
chr3	57908594	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=261,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:1,1:4,1,2,1
chr3	58080505	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=178,252;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	58083446	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	58089585	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=222,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:5,0,5,0
chr3	58089877	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=126,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,5:1,5,2,7
chr3	58094157	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=85,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:2,4:3,3:4,1,7,0
chr3	58094852	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:1,8:2,6:3,0,12,2
chr3	58095466	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=199,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr3	58095500	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=201,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	58111285	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=136,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,2:6,6:5,3,7,1
chr3	58112251	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=232,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr3	58112556	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	58116369	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=162,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:4,0,5,1
chr3	58118555	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=99,136;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:3,5:0,7:2,1,7,5
chr3	58118700	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=111,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,3:5,2:1,5,0,5
chr3	58121626	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=181,247;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr3	58134636	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:58134636_G_A:58134636:0,0,0,1
chr3	58134639	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:58134636_G_A:58134636:0,0,0,1
chr3	58145263	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=110,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,4:0,3:1,2,3,4
chr3	58179028	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr3	58186719	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=163,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:2,5,2,2
chr3	58186911	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	58194051	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=215,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.255:18:7,3:7,1:4,10,2,2
chr3	58196639	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=194,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,1:7,3:7,8,1,3
chr3	58242292	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=136,77;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,2:8,0:10,6,2,0
chr3	58270963	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=170,262;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,4:3,2:1,2,4,2
chr3	58296209	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.493:10:2,4:3,1:3,2,4,1
chr3	58296421	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=160,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr3	58303069	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=198,320;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr3	58351660	.	CTTT	C,CTT,CTTTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=19,35,27,26;MFRL=146,81,190,67;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,23,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,14,16;RU=T;STR;TLOD=10.91,7.23,5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,5,4,4:0.251,0.238,0.235:18:0,1,1,1:2,4,2,1:1,4,2,11
chr3	58355273	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=136,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,2,2
chr3	58355283	.	G	GAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=190,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr3	58376992	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=184,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,1:6,2:3,7,0,3
chr3	58384995	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=233,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:4,2,3,1
chr3	58385194	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr3	58410431	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=226,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:5,4:5,3:7,3,5,2
chr3	58410554	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=207,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.379:16:8,2:2,3:5,5,2,4
chr3	58410596	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=63.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,21:0.478:44:10,21:12,0:11,12,21,0
chr3	58413662	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=194,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr3	58413669	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=200,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr3	58414382	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=224,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0,4,1,3
chr3	58415590	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,3:0,5:0,2,1,7
chr3	58416535	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=155,112;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:8,2:6,1:0|1:58416535_C_T:58416535:8,6,2,1
chr3	58416538	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0|1:58416535_C_T:58416535:0,0,11,7
chr3	58417190	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=221,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	58417345	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=166,104;MMQ=60,31;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:13,0:16,4:11,18,0,4
chr3	58417416	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=175,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,6:4,4:9,3,8,2
chr3	58484429	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=162,162;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=43.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,18:0.314:58:11,17:29,0:34,6,18,0
chr3	58490918	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=134,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,0:6,2:0|1:58490918_G_C:58490918:12,6,1,1
chr3	58490924	.	GTTGC	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=141,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,0:7,2:0|1:58490918_G_C:58490918:11,7,1,1
chr3	58490932	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=141,84;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,0:6,1:0|1:58490918_G_C:58490918:10,8,1,1
chr3	58520306	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr3	58520731	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:6,6:12,3:9,9,5,4
chr3	58520859	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr3	58555343	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr3	58555386	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=115,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:5,1,5,0
chr3	58621935	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	58625975	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=438,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,5:0,4:0,1,0,9
chr3	58631184	.	G	GAAATA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=AAATA;STR;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.872:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr3	58635197	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	58641352	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,285;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:2,1:15,2:8,9,0,3
chr3	58849417	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:17,3:10,0:14,13,0,3
chr3	58849569	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=253,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:1,6,0,2
chr3	58870321	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=155,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.201:23:9,2:9,2:7,12,4,0
chr3	59996969	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=199,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,0:6,3:7,0,3,0
chr3	59999690	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,3:2,4:4,0,4,3
chr3	61734539	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:3,11:4,7:6,1,14,4
chr3	62142723	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,114;MMQ=60,23;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:13,0:12,3:19,6,0,3
chr3	62189189	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=211,195;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,9:3,2:3,4,5,6
chr3	62253355	.	TGAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=198,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:2,3,1,1
chr3	62267213	.	C	CTTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,16;RU=T;STR;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:2,2:2,2:4,0,4,2
chr3	62357611	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=342,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr3	62423865	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=181,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:5,1:4,5,2,1
chr3	62431367	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=158,158;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.369:12:3,4:2,0:8,0,4,0
chr3	62431387	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,18;MFRL=150,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.619:9:2,1:1,1:3,0,3,3
chr3	62431402	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=127,109;MMQ=60,47;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:5,1:4,0:8,4,2,0
chr3	62431415	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=113,137;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.795:17:1,6:1,7:3,0,9,5
chr3	62459763	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=223,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:62459763_G_A:62459763:2,0,1,0
chr3	62459773	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=223,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:62459763_G_A:62459763:2,0,1,0
chr3	62477933	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=251,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,2:1,2:6,1,3,1
chr3	62498378	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	62499344	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=154,36;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:6,2:6,3,1,1
chr3	62571037	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,293;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:1,9,1,1
chr3	62578336	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:7,0:4,3:7,4,2,1
chr3	62631553	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=233,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:1,3,0,3
chr3	62636826	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	62647904	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=181,254;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,3:0,1:3,0,5,0
chr3	62647928	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=21,35;MFRL=99,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,3:1,1:2,2,4,0
chr3	62648142	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=212,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,6:2,1:0,4,0,7
chr3	62739067	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=187,82;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:4,0,0,4
chr3	62739092	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0,0,11,1
chr3	63638501	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:11,0:3,2:6,8,0,2
chr3	63640601	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=155,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr3	63645575	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=185,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,0:2,4:1,5,0,4
chr3	63821914	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr3	63898360	.	G	GGCAGCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=251,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=GCA;STR;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.827:9:0,3:1,4:0,1,0,8
chr3	63976033	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=144,53;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.180:31:16,0:9,5:15,11,2,3
chr3	63996262	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,1:7,1:9,0,2,0
chr3	63999322	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:1,8,1,1
chr3	64145759	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=149,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:1,4:5,6:0,6,1,9
chr3	64518994	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr3	64526717	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr3	64526942	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr3	64527321	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr3	64527336	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr3	64527378	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr3	64527465	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,2:0,9:0,0,11,0
chr3	64553963	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=199,227;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr3	64554254	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=225,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,5:1,7:0,1,4,8
chr3	64580169	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=183,350;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:1,6,2,0
chr3	64589851	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=161,224;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,5:3,1:2,2,4,2
chr3	64599279	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=190,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr3	64601550	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=191,260;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:6,0,2,0
chr3	64607901	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.307:37:11,0:15,11:16,10,0,11
chr3	64617070	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=135,239;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:3,1,4,2
chr3	64617423	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,266;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,2:4,1,2,1
chr3	64617690	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=263,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:64617690_A_G:64617690:0,3,0,1
chr3	64617699	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=263,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,1:2,2:0|1:64617690_A_G:64617690:0,3,0,3
chr3	64619048	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=135,251;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr3	64640206	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=58.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0|1:64640206_TA_T:64640206:0,0,7,8
chr3	64640212	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=173,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.612:16:5,5:1,5:0|1:64640206_TA_T:64640206:5,1,3,7
chr3	64667059	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,1:2,5:2,3,1,5
chr3	65350478	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=186,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.374:30:12,1:7,10:17,2,11,0
chr3	65350694	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=173,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:1,3:0,1,1,7
chr3	65369200	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,2:8,0:7,5,2,0
chr3	65416648	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	65425560	.	T	TCTG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=151,262;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=CTG;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.225:16:6,2:6,0:13,0,2,1
chr3	65464223	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr3	65464522	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=250,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr3	65607592	.	T	TCA,TCACACACACA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,31,0;MFRL=155,112,107;MMQ=60,60,60;MPOS=2,50;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,17;RU=CA;STR;TLOD=3.55,10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.270,0.360:8:1,1,0:2,1,0:1,2,3,2
chr3	65607637	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=159,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.688:30:3,10:6,11:4,5,10,11
chr3	65607754	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=164,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:14,2:0|1:65607754_A_T:65607754:5,16,1,1
chr3	65607763	.	C	CATCTACTTTTAAGAACCCTTGTT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=162,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:13,2:0|1:65607754_A_T:65607754:4,16,1,1
chr3	66293766	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=255,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,1:2,2:2,2,1,2
chr3	66428282	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=218,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:1,4:8,2:0,9,1,5
chr3	66432680	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=224,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:4,0,6,0
chr3	66433312	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=176,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr3	66434372	.	T	TCACA,TCACACA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,23,26;MFRL=198,173,136;MMQ=60,60,59;MPOS=3,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,14,15;RU=CA;STR;TLOD=7.53,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.387,0.190:6:1,0,0:2,2,1:1,2,3,0
chr3	66463251	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,4:0,5:0,0,11,1
chr3	66465259	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=187,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:2,0,6,0
chr3	67053788	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,1:10,1:11,12,0,2
chr3	67058329	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=226,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.582:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr3	67426125	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=213,186;MMQ=60,47;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:8,1:1,3:9,0,4,0
chr3	67559216	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=169,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,1:0,1:3,2,2,0
chr3	67659817	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.528:15:4,5:3,3:7,0,7,1
chr3	67660028	.	A	ACTCAGC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=304,240;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.318:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr3	67660040	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=339,271;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:67660040_G_A:67660040:0,1,0,2
chr3	67660049	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,32;MFRL=339,271;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:67660040_G_A:67660040:0,1,0,2
chr3	68587884	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=128,59348183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:5,2,1,1
chr3	68788248	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,316;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:7,1:5,10,0,2
chr3	68788363	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,1:6,1:2,5,0,2
chr3	68801921	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=189,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr3	69036524	.	GA	G,GAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32,36;MFRL=0,188,151;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=7.30,6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.401,0.498:7:0,1,3:0,2,1:0,0,7,0
chr3	69036678	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=186,203;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:9,3:4,2:2,11,2,3
chr3	69036683	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=188,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:8,4:4,2:2,10,2,4
chr3	69036707	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=130,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.536:15:2,7:4,1:2,5,1,7
chr3	69047141	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=129,237;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:1,1:6,2:4,3,3,0
chr3	69053447	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	69054266	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=146,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:1,3:3,3:3,1,4,2
chr3	69072481	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=187,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.608:21:5,11:3,2:2,6,5,8
chr3	69073410	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=230,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,1:1,1:1,3,0,3
chr3	69073419	.	G	GTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=173,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=T;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:3,1:0,0:0,3,0,2
chr3	69074878	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=120,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,3:4,4:1,5,2,5
chr3	69074930	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=165,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr3	69082657	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=209,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,1,1
chr3	69084161	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,1:7,3:6,5,3,1
chr3	69088918	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=275,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr3	69093598	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=100,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:2,6:1,7:2,1,10,3
chr3	69104695	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=136.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,29:0,18:0,0,9,38
chr3	69104752	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=89.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,12:0,0,5,23
chr3	69106304	.	CC	TG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=197,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,1:7,4:11,0,6,0
chr3	69111084	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=196,214;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,2:7,1:4,9,2,1
chr3	69112049	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=140,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:7,0,4,1
chr3	69112658	.	CAA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,17;MFRL=160,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,0:2,0:3,5,0,2
chr3	69113153	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=166,60;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,2:4,1:8,2,2,1
chr3	69113185	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,2:6,3:6,8,2,3
chr3	69124733	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=189,214;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.538:24:6,13:5,0:0|1:69124733_T_A:69124733:1,10,0,13
chr3	69124738	.	T	TCCTTTGTCCCTTAGAAAGGAAGGAATC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,37;MFRL=189,214;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,13:0.583:22:5,13:4,0:0|1:69124733_T_A:69124733:0,9,0,13
chr3	69127133	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=157,255;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:6,2:0,9,0,3
chr3	69153854	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=212,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr3	69225588	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,15,0
chr3	69225875	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr3	69229976	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr3	69230026	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,13,3
chr3	69230061	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,10,8
chr3	69242770	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr3	69244162	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,15,3
chr3	69245454	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,13,14
chr3	69245949	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr3	69246152	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,9,11
chr3	69246274	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	69265371	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=104,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,2:2,2:1,1,4,0
chr3	69267578	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,1,4
chr3	69271036	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,0:11,2:6,11,0,2
chr3	69273656	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	69351460	.	AAG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=79,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:7,6:2,5:6,4,3,8
chr3	69360315	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:3,1:2,1:5,0,3,0
chr3	69362706	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=273,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,0,7
chr3	69988437	.	GT	G,GTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35,16;MFRL=218,178,289;MMQ=60,60,60;MPOS=14,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=5.37,5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.308,0.370:10:1,2,0:2,1,1:0,3,1,6
chr3	71015021	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=94,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.807:13:2,2:0,9:1,1,9,2
chr3	71247576	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	71739332	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=103,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.514:8:1,2:0,1:1,3,1,3
chr3	72427690	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=152,164;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,13:0.329:40:15,6:12,6:11,16,0,13
chr3	72495593	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=145,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.475:7:1,2:3,1:2,2,3,0
chr3	72495777	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=94.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,15:0,13:0,0,12,16
chr3	72897558	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=239,225;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:1,7,0,3
chr3	73004157	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=68,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr3	73006471	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:8,0:2,5:2,8,0,6
chr3	73016635	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=222,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr3	73024106	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=160,276;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:3,2:6,3,1,1
chr3	73024350	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:1,8:1,4:1,1,4,8
chr3	73096591	.	A	ATAAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,2:3,4:0,5,1,5
chr3	73108092	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=177,88;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr3	73110076	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=140,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr3	73111481	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=195,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.318:23:4,5:12,2:8,8,2,5
chr3	73111503	.	T	TTGG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGG;STR;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:3,5:10,2:7,6,3,5
chr3	73112489	.	A	AAAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=216,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:4,1:1,9,0,2
chr3	73112919	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=59,234;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:6,2:7,3:4,9,1,4
chr3	73112974	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=201,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:2,6,0,2
chr3	73434086	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=207,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,2:5,1:6,5,2,1
chr3	73437112	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:1,3,3,1
chr3	73437146	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=173,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:7,4,0,2
chr3	73440108	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=183,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:2,2:2,4:4,0,5,1
chr3	73651469	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=171,223;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:1,2,3,2
chr3	73651621	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.764:6:0,4:1,1:0,1,1,4
chr3	74315580	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,2:1,1:2,0,4,0
chr3	74347060	.	AAAT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr3	74351863	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=197,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:8,1:3,1:3,8,1,1
chr3	74570197	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.229:18:6,4:8,0:11,3,2,2
chr3	74570373	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=194,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.481:8:2,0:2,4:1,3,0,4
chr3	75679812	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=19;MBQ=35,27;MFRL=176,198;MMQ=25,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,4:2,3:10,0,6,3
chr3	75679833	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=32,27;MFRL=184,198;MMQ=25,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:0|1:75679833_C_T:75679833:15,3,2,0
chr3	75679834	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=28,26;MFRL=192,160;MMQ=25,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:7,4:6,2:0|1:75679834_G_T:75679834:13,0,3,3
chr3	75679836	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=31,25;MFRL=201,160;MMQ=25,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,4:6,2:12,0,3,3
chr3	75679841	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=19;MBQ=32,25;MFRL=192,145;MMQ=25,31;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.363:20:7,4:6,1:0|1:75679834_G_T:75679834:13,0,4,3
chr3	75679843	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=19;MBQ=33,32;MFRL=175,198;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:8,0:0|1:75679833_C_T:75679833:14,3,2,0
chr3	75679850	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=19;MBQ=32,30;MFRL=192,152;MMQ=25,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.391:21:7,5:6,3:0|1:75679834_G_T:75679834:12,1,5,3
chr3	75679863	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=19;MBQ=34,33;MFRL=172,152;MMQ=25,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.259:25:9,4:8,2:0|1:75679863_C_G:75679863:13,6,4,2
chr3	75679866	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=19;MBQ=28,30;MFRL=171,152;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:10,3:9,2:0|1:75679863_C_G:75679863:13,7,4,2
chr3	75679876	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=19;MBQ=33,30;MFRL=161,174;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:11,4:7,8:13,6,9,3
chr3	75679881	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=19;MBQ=33,26;MFRL=171,161;MMQ=25,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,6:0.194:34:11,3:14,3:0|1:75679863_C_G:75679863:21,7,4,2
chr3	75679891	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=19;MBQ=34,31;MFRL=170,156;MMQ=25,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.333:31:6,7:15,3:0|1:75679891_G_A:75679891:14,7,7,3
chr3	75679892	.	GC	CG	.	.	DP=34;ECNT=19;MBQ=35,32;MFRL=170,158;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:15,0:13,3:22,9,2,1
chr3	75679893	.	C	T,G	.	.	DP=34;ECNT=19;MBQ=32,27,35;MFRL=171,161,164;MMQ=25,25,25;MPOS=19,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=38.82,4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,11,5:0.352,0.150:32:4,7,2:10,3,3:10,6,12,4
chr3	75679899	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=19;MBQ=29,30;MFRL=164,161;MMQ=25,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,11:0.375:30:6,8:12,3:0|1:75679891_G_A:75679891:12,7,8,3
chr3	75679914	.	CC	TT	.	.	DP=33;ECNT=19;MBQ=33,28;MFRL=161,164;MMQ=25,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.176:32:13,2:13,2:0|1:75679863_C_G:75679863:17,10,4,1
chr3	75679930	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=19;MBQ=27,34;MFRL=175,171;MMQ=25,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=91.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,24:0.556:43:7,13:12,11:0|1:75679930_A_C:75679930:7,12,14,10
chr3	75679938	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=19;MBQ=28,34;MFRL=175,177;MMQ=25,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=98.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,26:0.574:45:7,14:10,11:0|1:75679930_A_C:75679930:7,12,15,11
chr3	75679945	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=19;MBQ=33,32;MFRL=177,176;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.130:44:19,2:18,3:17,22,2,3
chr3	75679958	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=176,172;MMQ=25,25;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,10:0.177:60:24,6:21,4:0|1:75679958_C_T:75679958:21,29,5,5
chr3	75679963	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=13;MBQ=32,26;MFRL=171,197;MMQ=25,46;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,8:0.142:61:23,4:26,4:20,33,6,2
chr3	75679965	.	C	A	.	.	DP=63;ECNT=13;MBQ=33,28;MFRL=173,171;MMQ=25,26;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=105.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,28:0.446:63:16,10:17,13:0|1:75679965_C_A:75679965:15,20,10,18
chr3	75679973	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=13;MBQ=26,32;MFRL=187,163;MMQ=26,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,7:0.116:67:27,4:30,3:0|1:75679958_C_T:75679958:22,38,4,3
chr3	75679975	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=185,177;MMQ=25,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=107.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,29:0.423:69:20,14:20,14:0|1:75679965_C_A:75679965:16,24,11,18
chr3	75679988	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=13;MBQ=27,34;MFRL=185,165;MMQ=29,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=102.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,27:0.444:61:14,13:16,13:0|1:75679965_C_A:75679965:14,20,9,18
chr3	75679993	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=13;MBQ=33,25;MFRL=178,192;MMQ=25,48;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.114:50:20,2:22,3:14,31,5,0
chr3	75679997	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=185,156;MMQ=43,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=83.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,22:0.460:48:11,10:14,10:0|1:75679965_C_A:75679965:10,16,7,15
chr3	75680010	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=13;MBQ=29,27;MFRL=192,173;MMQ=26,48;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.169:45:16,3:21,4:14,24,2,5
chr3	75680037	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=13;MBQ=33,30;MFRL=234,188;MMQ=34,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,13:0.483:27:5,10:9,3:0|1:75680037_G_T:75680037:1,13,3,10
chr3	75680045	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=13;MBQ=27,32;MFRL=229,188;MMQ=31,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=48.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,13:0.500:26:5,9:8,3:0|1:75680037_G_T:75680037:0,13,3,10
chr3	75680081	.	TGTG	T	.	.	DP=16;ECNT=13;MBQ=30,32;MFRL=212,176;MMQ=43,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,1:6,1:0|1:75680081_TGTG_T:75680081:0,12,0,2
chr3	75680108	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=13;MBQ=29,28;MFRL=211,176;MMQ=46,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0|1:75680081_TGTG_T:75680081:0,4,0,2
chr3	75713442	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=28,25;MFRL=200,248;MMQ=31,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:0|1:75713442_G_A:75713442:11,2,0,2
chr3	75713444	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=200,234;MMQ=31,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:10,3,1,1
chr3	75713449	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=13;MBQ=29,33;MFRL=211,306;MMQ=31,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:8,2:5,0:0|1:75713442_G_A:75713442:11,2,1,2
chr3	75713472	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=13;MBQ=33,29;MFRL=200,300;MMQ=31,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.334:19:5,6:7,0:11,2,3,3
chr3	75713496	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=13;MBQ=31,29;MFRL=171,300;MMQ=50,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,5:6,0:9,3,4,2
chr3	75713507	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=13;MBQ=33,28;MFRL=191,341;MMQ=55,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,3:5,0:7,3,2,1
chr3	75713561	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=13;MBQ=32,26;MFRL=196,199;MMQ=51,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:8,2:10,3:0|1:75713561_C_T:75713561:13,7,4,1
chr3	75713563	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=13;MBQ=32,32;MFRL=192,199;MMQ=50,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.214:26:9,2:11,3:0|1:75713561_C_T:75713561:14,7,4,1
chr3	75713564	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=13;MBQ=28,27;MFRL=196,192;MMQ=34,51;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:8,3:8,7:12,4,6,4
chr3	75713566	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=13;MBQ=25,32;MFRL=192,196;MMQ=51,25;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:8,3:10,5:11,7,7,1
chr3	75713618	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=13;MBQ=28,28;MFRL=173,198;MMQ=46,36;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:12,4:12,2:17,7,4,2
chr3	75713654	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=13;MBQ=33,28;MFRL=182,173;MMQ=50,34;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,10:0.249:42:15,5:17,5:18,14,4,6
chr3	75713669	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=13;MBQ=27,28;MFRL=177,167;MMQ=50,37;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,13:0.285:47:15,5:19,8:19,15,6,7
chr3	75713725	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=167,157;MMQ=42,41;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,17:0.339:51:14,7:20,10:15,19,8,9
chr3	75713738	.	T	G	.	.	DP=51;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=152,161;MMQ=41,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,17:0.353:49:13,7:18,10:11,21,6,11
chr3	75713748	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=167,172;MMQ=40,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.162:47:17,2:22,5:12,28,4,3
chr3	75713751	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=8;MBQ=34,28;MFRL=169,165;MMQ=41,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,9:0.221:43:14,5:19,4:10,24,3,6
chr3	75713757	.	AGG	A	.	.	DP=48;ECNT=8;MBQ=29,28;MFRL=172,167;MMQ=41,49;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=67.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,19:0.400:48:16,7:13,10:0|1:75713757_AGG_A:75713757:9,20,7,12
chr3	75713762	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=173,170;MMQ=42,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=64.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,18:0.380:48:16,7:14,9:0|1:75713757_AGG_A:75713757:10,20,6,12
chr3	75713782	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=172,195;MMQ=60,42;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=78.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,26:0.614:42:8,8:8,15:7,9,5,21
chr3	75713794	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=8;MBQ=30,33;MFRL=195,172;MMQ=55,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,11:0.279:41:10,8:20,3:9,21,2,9
chr3	75713858	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=30,34;MFRL=203,211;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:5,1,2,6
chr3	75713879	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=34,26;MFRL=192,175;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,1:11,3:11,9,0,4
chr3	75713897	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=29,34;MFRL=184,212;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,2:6,5:7,5,2,5
chr3	75713903	.	AT	GA	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=203,172;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:8,1:9,2:12,8,0,3
chr3	75713909	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=33,35;MFRL=187,212;MMQ=60,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,2:7,5:9,6,2,5
chr3	75714034	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=180,212;MMQ=40,25;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,0:10,3:7,12,1,2
chr3	75714039	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=33,20;MFRL=211,107;MMQ=31,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:75714039_C_T:75714039:7,11,1,1
chr3	75714041	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=33,20;MFRL=211,107;MMQ=31,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:75714039_C_T:75714039:7,11,1,1
chr3	75714095	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=146,221;MMQ=25,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:11,1:9,2:0|1:75714095_G_A:75714095:11,10,1,2
chr3	75714102	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=146,221;MMQ=25,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:10,1:7,1:0|1:75714095_G_A:75714095:10,9,1,2
chr3	75714139	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=258,177;MMQ=60,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,6:3,2:4,3,4,4
chr3	75714146	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=199,285;MMQ=33,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,3:5,0:5,5,1,2
chr3	75714185	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=210,221;MMQ=50,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:2,1:10,1:8,4,2,0
chr3	75714202	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=197,209;MMQ=44,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:1,1:11,2:9,3,2,1
chr3	75714263	.	CA	TT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=173,186;MMQ=50,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:1,3:7,4:6,2,4,3
chr3	75714298	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=191,129;MMQ=60,25;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.394:36:9,8:13,6:11,11,10,4
chr3	75714345	.	G	T	.	.	DP=73;ECNT=11;MBQ=34,27;MFRL=136,108;MMQ=60,45;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,12:0.172:71:26,9:31,2:34,25,8,4
chr3	75714382	.	G	C,T	.	.	DP=71;ECNT=11;MBQ=32,33,25;MFRL=139,107,144;MMQ=60,60,40;MPOS=14,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=34.71,22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:44,16,8:0.240,0.128:68:18,14,4:23,2,4:27,17,15,9
chr3	75714388	.	G	T	.	.	DP=63;ECNT=11;MBQ=32,25;MFRL=136,144;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,8:0.139:63:29,4:23,3:31,24,7,1
chr3	75714391	.	G	T	.	.	DP=59;ECNT=11;MBQ=32,28;MFRL=112,138;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,17:0.302:58:24,7:16,8:0|1:75714391_G_T:75714391:24,17,9,8
chr3	75714394	.	G	T	.	.	DP=55;ECNT=11;MBQ=32,28;MFRL=111,138;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,15:0.283:55:23,6:16,7:0|1:75714391_G_T:75714391:22,18,7,8
chr3	75714396	.	T	TG	.	.	DP=53;ECNT=11;MBQ=28,30;MFRL=125,144;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,14:0.276:52:21,6:16,6:0|1:75714391_G_T:75714391:20,18,7,7
chr3	75714422	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=11;MBQ=34,26;MFRL=154,136;MMQ=48,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:12,3:16,1:10,18,0,4
chr3	75714423	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=33,29;MFRL=161,154;MMQ=56,38;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.333:31:9,5:12,5:5,16,4,6
chr3	75714447	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=30,31;MFRL=203,162;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:5,4:10,6:6,9,1,9
chr3	75714459	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=32,25;MFRL=181,184;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,2:13,0:7,15,1,2
chr3	75714465	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=11;MBQ=33,33;MFRL=167,186;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:8,2:8,5:6,16,2,5
chr3	75714608	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=35,25;MFRL=206,196;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:8,4:7,5:11,4,7,2
chr3	75714648	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=166,127;MMQ=49,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:17,2:5,3:15,7,4,1
chr3	75714663	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=165,127;MMQ=49,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.313:36:18,6:7,5:17,8,8,3
chr3	75714674	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=135,147;MMQ=50,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.333:37:18,7:7,5:13,12,8,4
chr3	75714702	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=27,33;MFRL=160,153;MMQ=60,50;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,32:0.787:40:6,20:2,11:4,4,18,14
chr3	75714709	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=169,200;MMQ=56,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,11:0.278:41:18,7:10,4:14,16,7,4
chr3	75714771	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=17;MBQ=28,32;MFRL=173,168;MMQ=50,25;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:19,2:17,2:14,22,1,3
chr3	75714788	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=17;MBQ=29,30;MFRL=156,128;MMQ=49,31;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.081:47:19,0:24,3:0|1:75714788_A_C:75714788:14,30,0,3
chr3	75714805	.	TG	T	.	.	DP=47;ECNT=17;MBQ=29,27;MFRL=156,167;MMQ=31,43;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=58.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,16:0.362:45:9,9:17,6:0|1:75714805_TG_T:75714805:10,19,7,9
chr3	75714807	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=17;MBQ=32,28;MFRL=156,161;MMQ=31,42;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,17:0.375:46:12,10:17,6:0|1:75714805_TG_T:75714805:10,19,8,9
chr3	75714809	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=17;MBQ=32,30;MFRL=156,172;MMQ=47,25;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,4:0.104:46:21,2:21,2:0|1:75714788_A_C:75714788:16,26,2,2
chr3	75714819	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=17;MBQ=28,29;MFRL=175,172;MMQ=50,25;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.175:38:16,3:16,3:0|1:75714788_A_C:75714788:18,14,3,3
chr3	75714825	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=17;MBQ=33,28;MFRL=186,161;MMQ=52,39;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,19:0.513:37:7,10:9,8:0|1:75714805_TG_T:75714805:14,4,10,9
chr3	75714831	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=17;MBQ=29,30;MFRL=173,172;MMQ=44,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:13,3:12,3:0|1:75714788_A_C:75714788:19,8,4,2
chr3	75714835	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=17;MBQ=32,29;MFRL=174,172;MMQ=44,26;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,8:0.231:36:11,4:13,3:0|1:75714788_A_C:75714788:20,8,5,3
chr3	75714840	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=17;MBQ=29,32;MFRL=193,169;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,26:0.729:35:3,13:6,12:8,1,16,10
chr3	75714843	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=17;MBQ=25,28;MFRL=189,165;MMQ=54,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,19:0.513:37:7,9:11,9:0|1:75714805_TG_T:75714805:14,4,11,8
chr3	75714853	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=17;MBQ=29,29;MFRL=195,174;MMQ=50,41;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,18:0.487:37:8,10:11,8:0|1:75714805_TG_T:75714805:15,4,11,7
chr3	75714898	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=17;MBQ=33,28;MFRL=163,135;MMQ=54,50;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.212:45:11,4:25,5:21,15,6,3
chr3	75714917	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=17;MBQ=33,28;MFRL=155,168;MMQ=50,46;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,12:0.228:55:18,4:23,6:0|1:75714917_G_A:75714917:28,15,5,7
chr3	75714923	.	G	C	.	.	DP=58;ECNT=17;MBQ=32,32;MFRL=149,202;MMQ=50,47;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.068:57:23,1:28,2:30,24,3,0
chr3	75714929	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=17;MBQ=32,27;MFRL=146,174;MMQ=50,47;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,11:0.197:59:21,4:25,7:0|1:75714917_G_A:75714917:28,20,5,6
chr3	75714950	.	C	A	.	.	DP=70;ECNT=17;MBQ=32,28;MFRL=151,174;MMQ=50,39;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,11:0.174:67:27,4:27,7:0|1:75714917_G_A:75714917:34,22,5,6
chr3	75715173	.	CT	TG	.	.	DP=62;ECNT=10;MBQ=33,25;MFRL=183,212;MMQ=60,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,6:0.113:60:28,2:26,4:0|1:75715173_CT_TG:75715173:27,27,5,1
chr3	75715181	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=177,212;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,6:0.115:59:26,2:25,4:0|1:75715173_CT_TG:75715173:26,27,5,1
chr3	75715199	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=10;MBQ=28,34;MFRL=171,188;MMQ=50,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,16:0.378:43:12,7:15,8:0|1:75715199_T_G:75715199:11,16,7,9
chr3	75715202	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=10;MBQ=33,34;MFRL=183,198;MMQ=50,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,14:0.349:41:11,6:14,8:0|1:75715199_T_G:75715199:11,16,6,8
chr3	75715205	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=180,187;MMQ=53,42;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.194:39:15,2:16,5:14,18,3,4
chr3	75715220	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=10;MBQ=34,28;MFRL=187,177;MMQ=49,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:10,1:15,4:8,20,2,3
chr3	75715222	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=10;MBQ=28,33;MFRL=185,177;MMQ=50,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.293:31:7,4:15,5:5,17,3,6
chr3	75715261	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=29,30;MFRL=191,181;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:3,8:9,3:2,10,1,10
chr3	75715264	.	CC	TG	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=34,30;MFRL=188,170;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:5,5:11,1:3,14,0,6
chr3	75715268	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=181,171;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:7,3:11,1:2,17,1,3
chr3	75785996	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=16;MBQ=33,28;MFRL=158,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.724:27:3,9:4,11:7,0,19,1
chr3	75785999	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=16;MBQ=30,35;MFRL=169,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,18:0.613:29:4,8:7,8:0|1:75785999_A_G:75785999:11,0,17,1
chr3	75786007	.	CA	TG	.	.	DP=35;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=158,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,20:0.568:35:6,9:6,8:0|1:75785999_A_G:75785999:14,1,19,1
chr3	75786013	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=16;MBQ=33,33;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.158:36:16,2:12,2:0|1:75786013_G_C:75786013:29,2,5,0
chr3	75786031	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=16;MBQ=30,34;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:17,3:18,1:0|1:75786013_G_C:75786013:34,3,4,0
chr3	75786035	.	G	GA	.	.	DP=47;ECNT=16;MBQ=34,32;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=51.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,21:0.468:45:16,10:8,11:21,3,20,1
chr3	75786036	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=16;MBQ=30,32;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,5:0.120:48:23,3:18,2:0|1:75786013_G_C:75786013:39,4,5,0
chr3	75786042	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=16;MBQ=33,30;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=137.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,34:0.648:52:10,17:7,14:0|1:75785999_A_G:75785999:15,3,33,1
chr3	75786059	.	CA	TA,TG	.	.	DP=56;ECNT=16;MBQ=33,27,25;MFRL=143,158,112;MMQ=60,60,60;MPOS=23,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=89.44,59.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,24,17:0.434,0.312:55:8,13,3:6,9,13:10,4,35,6
chr3	75786071	.	C	A	.	.	DP=68;ECNT=16;MBQ=32,30;MFRL=128,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=120.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,32:0.471:68:10,19:24,11:0|1:75786071_C_A:75786071:24,12,27,5
chr3	75786073	.	C	G	.	.	DP=69;ECNT=16;MBQ=32,36;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,3:0.058:66:27,2:36,1:47,16,3,0
chr3	75786079	.	CG	TA	.	.	DP=77;ECNT=16;MBQ=31,27;MFRL=124,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=122.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,34:0.473:72:9,20:26,12:0|1:75786071_C_A:75786071:26,12,25,9
chr3	75786080	.	G	T,A	.	.	DP=76;ECNT=16;MBQ=26,26,28;MFRL=142,159,117;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.76,68.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,27:0.138,0.607:42:4,2,7:6,3,20:7,3,17,15
chr3	75786132	.	T	C	.	.	DP=137;ECNT=16;MBQ=29,30;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=190.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,59:0.513:115:20,37:32,21:0|1:75786132_T_C:75786132:27,29,28,31
chr3	75786163	.	C	T	.	.	DP=117;ECNT=16;MBQ=33,27;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=192.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,61:0.540:113:20,32:26,21:0|1:75786132_T_C:75786132:25,27,29,32
chr3	75786175	.	C	A	.	.	DP=108;ECNT=16;MBQ=33,28;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,11:0.110:107:46,5:39,6:50,46,7,4
chr3	75786202	.	TG	CA	.	.	DP=103;ECNT=13;MBQ=29,33;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:93,10:0.105:103:50,6:41,4:0|1:75786202_TG_CA:75786202:46,47,7,3
chr3	75786211	.	A	G	.	.	DP=101;ECNT=13;MBQ=28,32;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=159.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,49:0.499:98:20,30:28,18:0|1:75786211_A_G:75786211:26,23,22,27
chr3	75786221	.	G	A	.	.	DP=91;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,12:0.140:91:38,6:37,6:0|1:75786202_TG_CA:75786202:33,46,7,5
chr3	75786225	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=13;MBQ=32,27;MFRL=151,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,13:0.152:87:35,7:33,5:28,46,8,5
chr3	75786230	.	C	T	.	.	DP=84;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,8:0.102:81:35,4:31,3:28,45,2,6
chr3	75786243	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=13;MBQ=33,28;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=91.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,25:0.351:72:24,14:20,10:0|1:75786211_A_G:75786211:19,28,4,21
chr3	75786245	.	T	A	.	.	DP=73;ECNT=13;MBQ=28,25;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=91.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,25:0.347:73:25,14:18,9:0|1:75786211_A_G:75786211:19,29,4,21
chr3	75786251	.	GG	AT	.	.	DP=68;ECNT=13;MBQ=32,25;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,19:0.286:68:26,11:19,6:0|1:75786202_TG_CA:75786202:13,36,9,10
chr3	75786252	.	G	T	.	.	DP=66;ECNT=13;MBQ=32,30;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,25:0.507:50:14,14:9,10:0|1:75786211_A_G:75786211:10,15,4,21
chr3	75786256	.	T	A	.	.	DP=66;ECNT=13;MBQ=28,25;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,24:0.368:66:25,13:14,9:0|1:75786211_A_G:75786211:16,26,3,21
chr3	75786278	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=13;MBQ=25,33;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,21:0.407:52:17,12:10,8:0|1:75786211_A_G:75786211:10,21,4,17
chr3	75786302	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=13;MBQ=32,26;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=81.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,21:0.500:42:12,14:8,7:0|1:75786211_A_G:75786211:8,13,5,16
chr3	75786314	.	CCTACATTCT	C	.	.	DP=39;ECNT=13;MBQ=32,33;MFRL=175,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=73.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,19:0.488:39:10,13:6,6:0|1:75786211_A_G:75786211:9,11,4,15
chr3	75786379	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=39;MBQ=28,32;MFRL=197,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:3,9:11,8:8,8,9,8
chr3	75786381	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=39;MBQ=29,33;MFRL=225,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.368:36:9,3:12,9:12,11,6,7
chr3	75786385	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=39;MBQ=31,33;MFRL=227,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=117.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,29:0.750:38:2,11:7,16:5,4,15,14
chr3	75786387	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=39;MBQ=26,33;MFRL=214,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,9:0.227:42:13,3:18,6:0|1:75786387_T_C:75786387:17,16,3,6
chr3	75786403	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=39;MBQ=28,28;MFRL=189,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,11:0.235:49:17,3:18,7:0|1:75786387_T_C:75786387:19,19,6,5
chr3	75786415	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=39;MBQ=33,25;MFRL=183,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,10:0.207:51:18,4:21,6:0|1:75786387_T_C:75786387:22,19,7,3
chr3	75786417	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=39;MBQ=25,34;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=94.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,26:0.509:51:9,14:15,11:0|1:75786417_T_C:75786417:16,9,12,14
chr3	75786421	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=39;MBQ=32,30;MFRL=178,249;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,3:0.077:50:21,2:24,1:0|1:75786421_G_T:75786421:26,21,1,2
chr3	75786423	.	T	TTC	.	.	DP=50;ECNT=39;MBQ=28,30;MFRL=178,249;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TC;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,3:0.077:50:21,2:25,1:0|1:75786421_G_T:75786421:26,21,1,2
chr3	75786430	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=39;MBQ=32,29;MFRL=189,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,8:0.173:50:18,6:24,2:21,21,5,3
chr3	75786438	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=39;MBQ=33,29;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=121.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,31:0.542:57:10,16:13,12:0|1:75786417_T_C:75786417:15,11,16,15
chr3	75786440	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=39;MBQ=32,28;MFRL=168,182;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=183.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,45:0.837:53:3,21:5,22:5,3,26,19
chr3	75786449	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=39;MBQ=32,25;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,9:0.175:55:21,3:23,6:27,19,6,3
chr3	75786450	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=39;MBQ=31,29;MFRL=167,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=117.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,30:0.544:55:10,15:14,15:0|1:75786417_T_C:75786417:15,10,18,12
chr3	75786453	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=39;MBQ=32,28;MFRL=175,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=154.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,38:0.697:54:8,15:8,19:9,7,24,14
chr3	75786469	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=39;MBQ=33,29;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,14:0.288:50:15,8:20,6:0|1:75786469_G_A:75786469:23,13,9,5
chr3	75786476	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=39;MBQ=33,31;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,15:0.291:53:12,9:24,4:0|1:75786469_G_A:75786469:22,16,11,4
chr3	75786483	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=39;MBQ=33,30;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,14:0.306:47:15,6:18,8:18,15,9,5
chr3	75786490	.	C	G	.	.	DP=55;ECNT=39;MBQ=33,35;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,14:0.263:55:15,9:21,5:0|1:75786469_G_A:75786469:17,24,11,3
chr3	75786499	.	CA	TG	.	.	DP=60;ECNT=39;MBQ=31,30;MFRL=161,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,5:0.097:60:25,3:25,2:28,27,2,3
chr3	75786500	.	AT	GA,GT	.	.	DP=60;ECNT=39;MBQ=28,29,28;MFRL=175,160,137;MMQ=60,60,60;MPOS=12,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=60.45,72.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,17,20:0.310,0.362:55:8,10,8:10,5,10:6,12,21,16
chr3	75786506	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=39;MBQ=28,32;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,22:0.354:63:22,10:18,11:0|1:75786506_T_C:75786506:21,20,10,12
chr3	75786515	.	GG	AG,AT	.	.	DP=70;ECNT=39;MBQ=32,27,30;MFRL=168,157,177;MMQ=60,60,60;MPOS=13,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=191.91,15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,48,6:0.671,0.095:70:6,27,4:8,16,2:4,12,28,26
chr3	75786518	.	A	C	.	.	DP=66;ECNT=39;MBQ=26,32;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,19:0.294:66:22,14:23,5:0|1:75786469_G_A:75786469:19,28,12,7
chr3	75786521	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=39;MBQ=32,29;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,20:0.313:65:21,14:23,6:0|1:75786469_G_A:75786469:18,27,13,7
chr3	75786533	.	T	G	.	.	DP=67;ECNT=39;MBQ=28,32;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=83.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,24:0.362:67:23,13:16,10:0|1:75786506_T_C:75786506:22,21,11,13
chr3	75786555	.	C	CTG	.	.	DP=84;ECNT=39;MBQ=35,33;MFRL=168,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=217.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,55:0.712:77:13,30:8,19:11,11,28,27
chr3	75786572	.	T	C	.	.	DP=82;ECNT=39;MBQ=27,28;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,26:0.335:78:27,16:22,8:34,18,12,14
chr3	75786586	.	G	T	.	.	DP=81;ECNT=39;MBQ=32,29;MFRL=146,202;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,8:0.108:81:37,6:31,2:0|1:75786586_G_T:75786586:48,25,4,4
chr3	75786593	.	C	A	.	.	DP=81;ECNT=39;MBQ=32,27;MFRL=146,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,9:0.120:81:39,6:33,2:0|1:75786586_G_T:75786586:47,25,5,4
chr3	75786597	.	C	T	.	.	DP=84;ECNT=39;MBQ=31,28;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,16:0.198:84:35,9:30,7:0|1:75786597_C_T:75786597:45,23,7,9
chr3	75786598	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=39;MBQ=30,29;MFRL=146,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,9:0.114:86:38,5:35,3:0|1:75786586_G_T:75786586:48,29,5,4
chr3	75786607	.	C	T	.	.	DP=92;ECNT=39;MBQ=32,28;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,17:0.191:92:33,7:39,8:0|1:75786597_C_T:75786597:48,27,7,10
chr3	75786608	.	C	T	.	.	DP=90;ECNT=39;MBQ=32,28;MFRL=146,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,7:0.087:90:35,4:41,3:0|1:75786586_G_T:75786586:49,34,5,2
chr3	75786610	.	T	G	.	.	DP=91;ECNT=39;MBQ=28,33;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,15:0.172:91:33,6:38,7:0|1:75786597_C_T:75786597:49,27,6,9
chr3	75786619	.	T	C	.	.	DP=91;ECNT=39;MBQ=28,27;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,15:0.174:90:31,6:36,9:0|1:75786597_C_T:75786597:49,26,7,8
chr3	75786620	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=39;MBQ=33,30;MFRL=146,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,4:0.057:85:35,2:42,2:0|1:75786586_G_T:75786586:49,32,4,0
chr3	75786623	.	G	T	.	.	DP=88;ECNT=39;MBQ=33,25;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=117.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,48:0.562:85:13,24:23,22:23,14,30,18
chr3	75786628	.	G	C	.	.	DP=84;ECNT=39;MBQ=33,31;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,10:0.132:81:30,3:36,7:38,33,6,4
chr3	75786662	.	A	T	.	.	DP=96;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=156,221;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,5:0.061:96:45,4:45,1:45,46,2,3
chr3	75786670	.	G	A	.	.	DP=106;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,52:0.514:101:24,33:23,19:26,23,21,31
chr3	75786672	.	C	T	.	.	DP=104;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=156,136;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,5:0.056:104:51,4:37,0:46,53,2,3
chr3	75786681	.	G	A	.	.	DP=97;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=270.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,69:0.730:94:12,42:13,23:14,11,30,39
chr3	75786684	.	G	T	.	.	DP=96;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=156,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,4:0.052:93:53,4:34,0:40,49,2,2
chr3	75786687	.	A	T	.	.	DP=95;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:86,8:0.093:94:50,4:32,4:42,44,2,6
chr3	75786737	.	A	T	.	.	DP=84;ECNT=26;MBQ=29,29;MFRL=161,185;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=215.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,56:0.678:82:11,26:14,28:15,11,27,29
chr3	75786740	.	CA	GG	.	.	DP=82;ECNT=26;MBQ=32,34;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,12:0.157:81:26,8:36,4:0|1:75786740_CA_GG:75786740:33,36,8,4
chr3	75786741	.	A	G	.	.	DP=81;ECNT=26;MBQ=28,30;MFRL=161,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=170.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,46:0.670:68:9,19:12,23:0|1:75786741_A_G:75786741:12,10,22,24
chr3	75786748	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=26;MBQ=32,28;MFRL=179,198;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,8:0.103:85:34,5:38,3:0|1:75786748_C_T:75786748:39,38,4,4
chr3	75786753	.	C	T	.	.	DP=88;ECNT=26;MBQ=31,29;MFRL=189,172;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,17:0.204:86:31,5:32,11:36,33,7,10
chr3	75786754	.	G	T	.	.	DP=93;ECNT=26;MBQ=31,28;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,15:0.168:93:31,9:39,4:0|1:75786740_CA_GG:75786740:37,41,9,6
chr3	75786759	.	T	C	.	.	DP=91;ECNT=26;MBQ=28,33;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=257.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,63:0.688:91:14,30:13,31:12,16,33,30
chr3	75786760	.	TC	T	.	.	DP=90;ECNT=26;MBQ=29,28;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:84,6:0.076:90:39,5:42,1:0|1:75786748_C_T:75786748:41,43,3,3
chr3	75786764	.	C	CT	.	.	DP=90;ECNT=26;MBQ=30,32;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=52.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,16:0.185:90:36,8:37,7:0|1:75786740_CA_GG:75786740:35,39,10,6
chr3	75786773	.	T	A	.	.	DP=88;ECNT=26;MBQ=28,28;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=170.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,44:0.504:88:23,19:18,21:0|1:75786741_A_G:75786741:22,22,22,22
chr3	75786784	.	T	C	.	.	DP=71;ECNT=26;MBQ=29,30;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,12:0.178:71:26,7:29,3:0|1:75786740_CA_GG:75786740:29,30,7,5
chr3	75786802	.	G	C,A	.	.	DP=63;ECNT=26;MBQ=31,35,28;MFRL=171,198,187;MMQ=60,60,60;MPOS=26,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.70,110.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,4,29:0.076,0.455:63:17,1,17:10,3,12:13,17,17,16
chr3	75786817	.	CACATTCATT	C,AACATTCATT	.	.	DP=70;ECNT=26;MBQ=33,35,28;MFRL=163,172,198;MMQ=60,60,60;MPOS=7,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=26.17,10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:51,9,4:0.150,0.068:64:24,4,1:17,5,3:28,23,6,7
chr3	75786827	.	A	T	.	.	DP=55;ECNT=26;MBQ=28,28;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=159.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,39:0.715:54:6,19:8,15:7,8,22,17
chr3	75786832	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=26;MBQ=31,28;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=153.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,39:0.690:56:7,22:7,14:9,8,24,15
chr3	75786845	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=26;MBQ=30,32;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=200.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,49:0.769:63:6,24:8,22:5,9,28,21
chr3	75786854	.	A	T	.	.	DP=71;ECNT=26;MBQ=29,28;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=108.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,37:0.535:69:13,19:16,18:17,15,22,15
chr3	75786866	.	G	T	.	.	DP=85;ECNT=26;MBQ=32,30;MFRL=165,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,19:0.230:85:26,10:34,8:0|1:75786866_G_T:75786866:37,29,9,10
chr3	75786888	.	C	T	.	.	DP=94;ECNT=26;MBQ=30,28;MFRL=172,136;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,15:0.168:93:32,9:43,6:0|1:75786888_C_T:75786888:33,45,9,6
chr3	75786892	.	A	C	.	.	DP=96;ECNT=26;MBQ=29,30;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=63.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,19:0.204:96:33,8:38,9:0|1:75786866_G_T:75786866:36,41,8,11
chr3	75786894	.	GT	G	.	.	DP=96;ECNT=26;MBQ=32,32;MFRL=172,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=47.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,16:0.175:94:32,9:44,6:0|1:75786888_C_T:75786888:33,45,9,7
chr3	75786899	.	T	C	.	.	DP=94;ECNT=26;MBQ=28,34;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=63.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,19:0.208:94:29,7:42,11:0|1:75786866_G_T:75786866:34,41,8,11
chr3	75786916	.	C	A	.	.	DP=105;ECNT=26;MBQ=33,28;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=66.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:85,20:0.196:105:40,8:40,10:0|1:75786866_G_T:75786866:39,46,10,10
chr3	75786919	.	A	T	.	.	DP=109;ECNT=26;MBQ=27,28;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:85,20:0.196:105:42,8:38,10:0|1:75786866_G_T:75786866:38,47,10,10
chr3	75786921	.	G	A	.	.	DP=107;ECNT=26;MBQ=32,29;MFRL=145,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,14:0.140:105:47,8:41,6:41,50,7,7
chr3	75786942	.	C	A	.	.	DP=111;ECNT=26;MBQ=33,28;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:97,10:0.093:107:48,8:46,2:40,57,6,4
chr3	75786965	.	C	T	.	.	DP=115;ECNT=18;MBQ=33,29;MFRL=126,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=177.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,56:0.499:112:32,30:20,25:0|1:75786965_C_T:75786965:24,32,22,34
chr3	75786991	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=18;MBQ=33,28;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=132.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,38:0.448:85:26,16:17,21:0|1:75786965_C_T:75786965:17,30,13,25
chr3	75786993	.	T	A	.	.	DP=83;ECNT=18;MBQ=29,28;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,5:0.070:83:39,4:37,1:28,50,2,3
chr3	75787015	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=18;MBQ=32,28;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,21:0.297:72:21,13:25,8:0|1:75787015_C_T:75787015:18,33,8,13
chr3	75787032	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=18;MBQ=28,30;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=82.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,24:0.347:70:27,9:18,11:0|1:75787032_T_C:75787032:16,30,10,14
chr3	75787042	.	G	GAAAT	.	.	DP=69;ECNT=18;MBQ=32,32;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=91.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,25:0.366:69:24,11:19,12:0|1:75787032_T_C:75787032:16,28,10,15
chr3	75787043	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=18;MBQ=32,25;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,17:0.240:73:24,12:22,4:0|1:75787015_C_T:75787015:22,34,6,11
chr3	75787044	.	A	ACTT	.	.	DP=74;ECNT=18;MBQ=26,27;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=103.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,28:0.382:74:24,10:15,10:0|1:75787032_T_C:75787032:18,28,11,17
chr3	75787047	.	G	GACTTATA	.	.	DP=69;ECNT=18;MBQ=33,32;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,17:0.254:69:20,12:27,4:0|1:75787015_C_T:75787015:21,31,7,10
chr3	75787049	.	C	A	.	.	DP=68;ECNT=18;MBQ=33,25;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,11:0.174:67:26,7:27,3:22,34,4,7
chr3	75787057	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=18;MBQ=35,27;MFRL=196,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=217.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,54:0.743:72:6,30:12,17:8,10,24,30
chr3	75787081	.	A	T	.	.	DP=75;ECNT=18;MBQ=28,29;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,16:0.221:75:32,8:25,2:0|1:75787015_C_T:75787015:26,33,5,11
chr3	75787098	.	CCT	C	.	.	DP=74;ECNT=18;MBQ=32,30;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,22:0.329:68:23,14:20,8:23,23,9,13
chr3	75787116	.	T	G	.	.	DP=73;ECNT=18;MBQ=28,32;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,13:0.187:73:33,8:21,5:0|1:75787015_C_T:75787015:30,30,6,7
chr3	75787127	.	G	T	.	.	DP=72;ECNT=18;MBQ=32,28;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,13:0.189:72:32,9:23,4:0|1:75787015_C_T:75787015:31,28,7,6
chr3	75787145	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=18;MBQ=27,27;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=107.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,31:0.432:72:20,21:19,7:0|1:75787145_T_C:75787145:25,16,13,18
chr3	75787159	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=18;MBQ=30,29;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,24:0.362:67:21,15:18,6:0|1:75787145_T_C:75787145:27,16,9,15
chr3	75787169	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=18;MBQ=30,28;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=140.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,37:0.596:62:11,26:12,11:14,11,19,18
chr3	75787186	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=21;MBQ=33,28;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,34:0.540:63:13,13:15,16:16,13,17,17
chr3	75787199	.	A	C	.	.	DP=63;ECNT=21;MBQ=28,32;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,20:0.328:62:18,10:18,8:0|1:75787199_A_C:75787199:20,22,12,8
chr3	75787218	.	T	A	.	.	DP=60;ECNT=21;MBQ=29,29;MFRL=141,137;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,4:0.082:59:27,1:22,3:0|1:75787218_T_A:75787218:25,30,2,2
chr3	75787221	.	CA	TG,TA	.	.	DP=59;ECNT=21;MBQ=33,31,25;MFRL=127,137,166;MMQ=60,57,60;MPOS=24,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.84,68.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,4,19:0.081,0.323:59:20,1,9:14,3,7:14,22,12,11
chr3	75787224	.	C	T,G	.	.	DP=55;ECNT=21;MBQ=28,27,32;MFRL=122,137,176;MMQ=60,57,60;MPOS=21,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.00,61.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,4,17:0.086,0.310:55:16,1,8:15,2,6:13,21,11,10
chr3	75787236	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=21;MBQ=32,29;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,17:0.305:57:22,9:17,6:0|1:75787199_A_C:75787199:17,23,8,9
chr3	75787240	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=21;MBQ=27,34;MFRL=146,130;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,3:0.068:57:31,1:17,2:0|1:75787218_T_A:75787218:22,32,1,2
chr3	75787244	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=21;MBQ=25,33;MFRL=157,130;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,3:0.070:55:33,1:18,2:0|1:75787218_T_A:75787218:20,32,1,2
chr3	75787266	.	CCT	C	.	.	DP=49;ECNT=21;MBQ=32,33;MFRL=141,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,16:0.333:49:15,7:13,8:0|1:75787199_A_C:75787199:11,22,6,10
chr3	75787269	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=21;MBQ=32,28;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,15:0.355:43:16,7:10,8:0|1:75787199_A_C:75787199:11,17,5,10
chr3	75787279	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=21;MBQ=24,30;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.392:39:13,5:8,9:10,14,5,10
chr3	75787288	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=21;MBQ=28,33;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,13:0.389:34:11,5:8,8:0|1:75787199_A_C:75787199:10,11,5,8
chr3	75787298	.	TG	CA	.	.	DP=33;ECNT=21;MBQ=28,33;MFRL=150,176;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,13:0.400:33:11,1:9,9:0|1:75787199_A_C:75787199:9,11,3,10
chr3	75787302	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=21;MBQ=29,32;MFRL=156,174;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.382:32:10,1:7,9:0|1:75787199_A_C:75787199:8,12,3,9
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chr3	75787353	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=21;MBQ=33,30;MFRL=179,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,11:0.240:48:18,6:15,4:0|1:75787347_TCCC_T:75787347:20,17,8,3
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chr3	75787405	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=16;MBQ=33,27;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,19:0.377:51:17,10:14,8:0|1:75787405_C_T:75787405:16,16,12,7
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chr3	75787424	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=16;MBQ=27,32;MFRL=176,190;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,27:0.540:51:11,10:8,15:9,15,17,10
chr3	75787427	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=16;MBQ=27,33;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,19:0.370:53:12,10:18,7:0|1:75787405_C_T:75787405:14,20,11,8
chr3	75787455	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=16;MBQ=28,32;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,11:0.194:60:23,2:25,8:0|1:75787455_A_G:75787455:22,27,4,7
chr3	75787458	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=16;MBQ=33,27;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,6:0.109:62:23,2:27,4:26,30,1,5
chr3	75787462	.	GC	AT	.	.	DP=63;ECNT=16;MBQ=33,28;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,11:0.185:63:25,2:25,9:0|1:75787455_A_G:75787455:23,29,4,7
chr3	75787464	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=16;MBQ=34,29;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=91.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,25:0.400:63:12,15:21,10:0|1:75787464_C_T:75787464:14,24,13,12
chr3	75787474	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=16;MBQ=33,28;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,12:0.186:68:27,3:24,8:0|1:75787455_A_G:75787455:29,27,3,9
chr3	75787476	.	C	T,A	.	.	DP=70;ECNT=16;MBQ=33,25,28;MFRL=164,155,176;MMQ=60,60,60;MPOS=17,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=39.06,43.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,20,13:0.295,0.192:68:14,13,3:19,6,8:15,20,17,16
chr3	75787486	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=16;MBQ=32,27;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=175.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,44:0.592:74:12,23:18,20:14,16,23,21
chr3	75787490	.	A	T	.	.	DP=77;ECNT=16;MBQ=28,32;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,12:0.165:77:32,3:26,9:0|1:75787455_A_G:75787455:34,31,2,10
chr3	75787511	.	C	A	.	.	DP=68;ECNT=16;MBQ=33,28;MFRL=174,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,11:0.171:68:31,4:22,7:0|1:75787455_A_G:75787455:33,24,4,7
chr3	75787516	.	C	G	.	.	DP=67;ECNT=16;MBQ=33,35;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=114.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,30:0.449:67:14,21:21,9:0|1:75787464_C_T:75787464:20,17,17,13
chr3	75787519	.	CT	AG	.	.	DP=71;ECNT=16;MBQ=32,29;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=116.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,31:0.451:69:14,21:20,10:0|1:75787464_C_T:75787464:19,19,17,14
chr3	75787520	.	T	G	.	.	DP=70;ECNT=16;MBQ=26,30;MFRL=164,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,13:0.338:39:9,5:16,7:0|1:75787455_A_G:75787455:14,12,6,7
chr3	75787620	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=10;MBQ=28,31;MFRL=178,159;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,7:0.131:55:25,2:22,5:19,29,4,3
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chr3	75787645	.	GAA	G	.	.	DP=62;ECNT=10;MBQ=32,32;MFRL=170,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=73.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,21:0.349:61:13,10:21,9:0|1:75787637_C_T:75787637:16,24,8,13
chr3	75787679	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=10;MBQ=25,33;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,15:0.340:45:9,8:18,5:0|1:75787679_T_C:75787679:13,17,4,11
chr3	75787688	.	T	A	.	.	DP=55;ECNT=10;MBQ=28,28;MFRL=178,183;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=74.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,24:0.438:55:9,11:21,13:0|1:75787679_T_C:75787679:15,16,11,13
chr3	75787702	.	C	G	.	.	DP=55;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,35:0.667:52:4,11:13,24:7,10,19,16
chr3	75787726	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=10;MBQ=30,29;MFRL=177,166;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=172.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,42:0.768:54:3,13:7,27:8,4,24,18
chr3	75787728	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=10;MBQ=30,25;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,9:0.167:58:17,2:28,6:28,21,7,2
chr3	75787732	.	A	C	.	.	DP=67;ECNT=10;MBQ=29,29;MFRL=155,173;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,26:0.429:60:10,10:24,13:21,13,15,11
chr3	75787739	.	A	T	.	.	DP=75;ECNT=10;MBQ=25,26;MFRL=205,159;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=294.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,71:0.961:73:2,24:0,47:1,1,41,30
chr3	75787770	.	C	T	.	.	DP=91;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,6:0.078:86:34,1:43,5:36,44,5,1
chr3	75787794	.	A	G	.	.	DP=95;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=286.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,76:0.803:94:9,35:9,41:8,10,32,44
chr3	75787801	.	TG	CA	.	.	DP=95;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=113.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,32:0.359:90:30,11:26,20:23,35,15,17
chr3	75787809	.	T	C	.	.	DP=83;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,32:0.388:83:25,12:25,18:17,34,16,16
chr3	75787840	.	C	A	.	.	DP=59;ECNT=12;MBQ=33,28;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,6:0.120:56:27,2:22,4:0|1:75787840_C_A:75787840:20,30,1,5
chr3	75787863	.	AT	TA	.	.	DP=52;ECNT=12;MBQ=28,29;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,5:0.111:52:20,1:18,3:0|1:75787840_C_A:75787840:21,26,0,5
chr3	75787869	.	CA	TG	.	.	DP=51;ECNT=12;MBQ=33,28;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=172.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,41:0.824:49:3,19:5,19:0|1:75787869_CA_TG:75787869:3,5,18,23
chr3	75787876	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=156,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=158.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,38:0.830:45:2,20:5,16:0|1:75787869_CA_TG:75787869:2,5,16,22
chr3	75787880	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=12;MBQ=26,32;MFRL=144,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,15:0.321:48:13,10:16,5:12,21,6,9
chr3	75787897	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=12;MBQ=29,27;MFRL=185,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,25:0.500:50:12,9:13,16:10,15,8,17
chr3	75787918	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=12;MBQ=33,28;MFRL=180,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,4:0.096:50:21,3:24,1:0|1:75787918_C_T:75787918:18,28,2,2
chr3	75787926	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=12;MBQ=28,34;MFRL=185,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,4:0.092:52:20,3:23,1:0|1:75787918_C_T:75787918:18,30,2,2
chr3	75787927	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=12;MBQ=28,32;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=126.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,35:0.693:50:7,15:8,18:7,8,11,24
chr3	75787949	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=12;MBQ=34,29;MFRL=207,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=148.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,37:0.808:45:3,13:5,18:3,5,15,22
chr3	75787961	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=12;MBQ=27,32;MFRL=207,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,13:0.281:47:17,5:15,7:17,17,5,8
chr3	75787962	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=12;MBQ=32,34;MFRL=208,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,18:0.396:46:11,11:16,7:11,17,10,8
chr3	75788010	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=408,189;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=167.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,43:0.937:45:1,15:1,25:0|1:75788010_A_C:75788010:1,1,25,18
chr3	75788023	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,24:0.498:48:11,7:13,16:0|1:75788010_A_C:75788010:16,8,13,11
chr3	75788028	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,13:0.279:48:12,4:21,9:0|1:75788010_A_C:75788010:22,13,8,5
chr3	75788040	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=181,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,6:0.118:57:21,2:30,4:0|1:75788010_A_C:75788010:30,21,5,1
chr3	75788068	.	A	C	.	.	DP=63;ECNT=29;MBQ=29,31;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,25:0.422:61:16,7:20,17:22,14,16,9
chr3	75788076	.	A	C	.	.	DP=67;ECNT=29;MBQ=27,32;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=196.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,51:0.765:66:7,21:8,27:9,6,31,20
chr3	75788085	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=29;MBQ=27,33;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,5:0.092:63:20,2:30,3:0|1:75788085_A_G:75788085:32,26,5,0
chr3	75788105	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=29;MBQ=32,28;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,7:0.111:70:27,3:32,4:0|1:75788085_A_G:75788085:34,29,4,3
chr3	75788109	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=29;MBQ=33,29;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,8:0.123:71:26,3:31,5:0|1:75788085_A_G:75788085:37,26,5,3
chr3	75788114	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=29;MBQ=33,26;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,13:0.194:70:25,3:30,9:0|1:75788085_A_G:75788085:34,23,10,3
chr3	75788115	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=29;MBQ=31,29;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=173.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,44:0.634:69:10,17:14,25:1|0:75788085_A_G:75788085:16,9,27,17
chr3	75788130	.	C	T,A	.	.	DP=76;ECNT=29;MBQ=33,26,30;MFRL=192,173,160;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=62.25,89.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:29,18,27:0.240,0.369:74:16,4,10:11,11,15:16,13,28,17
chr3	75788137	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=29;MBQ=34,27;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,19:0.259:75:25,6:25,12:0|1:75788085_A_G:75788085:34,22,10,9
chr3	75788150	.	A	AG	.	.	DP=79;ECNT=29;MBQ=29,29;MFRL=190,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=105.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,33:0.438:76:19,15:24,18:25,18,20,13
chr3	75788152	.	T	C,G	.	.	DP=82;ECNT=29;MBQ=28,32,32;MFRL=198,160,202;MMQ=60,60,60;MPOS=18,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=201.62,30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,54,12:0.695,0.145:78:6,21,6:5,32,5:7,5,39,27
chr3	75788192	.	T	C	.	.	DP=82;ECNT=29;MBQ=28,33;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,16:0.205:81:28,9:35,7:0|1:75788192_T_C:75788192:28,37,7,9
chr3	75788195	.	A	T	.	.	DP=84;ECNT=29;MBQ=28,29;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,16:0.198:84:28,9:34,7:0|1:75788192_T_C:75788192:27,41,6,10
chr3	75788199	.	T	C	.	.	DP=86;ECNT=29;MBQ=28,29;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=99.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,40:0.479:83:21,18:21,22:18,25,15,25
chr3	75788200	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=29;MBQ=32,28;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,16:0.193:86:31,7:36,6:0|1:75788192_T_C:75788192:28,42,6,10
chr3	75788211	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=29;MBQ=33,29;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,11:0.145:81:32,7:35,4:0|1:75788192_T_C:75788192:27,43,5,6
chr3	75788226	.	CA	GG,AG	.	.	DP=79;ECNT=29;MBQ=35,32,26;MFRL=180,152,160;MMQ=60,60,60;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=91.87,95.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,26,29:0.346,0.385:75:10,18,13:10,7,16:8,12,19,36
chr3	75788230	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=29;MBQ=33,27;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,11:0.150:79:33,7:28,4:24,44,5,6
chr3	75788245	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=29;MBQ=33,27;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,14:0.187:78:30,9:33,4:22,42,9,5
chr3	75788258	.	C	A	.	.	DP=77;ECNT=29;MBQ=33,28;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=208.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,55:0.709:77:11,28:10,25:0|1:75788258_C_A:75788258:11,11,20,35
chr3	75788260	.	C	A	.	.	DP=85;ECNT=29;MBQ=33,28;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,13:0.163:84:31,6:31,3:0|1:75788260_C_A:75788260:26,45,6,7
chr3	75788270	.	A	T	.	.	DP=81;ECNT=29;MBQ=28,29;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,14:0.181:81:29,7:33,7:0|1:75788260_C_A:75788260:29,38,8,6
chr3	75788273	.	G	T	.	.	DP=88;ECNT=29;MBQ=32,28;MFRL=165,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,15:0.181:87:31,5:37,4:0|1:75788273_G_T:75788273:34,38,9,6
chr3	75788281	.	T	C	.	.	DP=93;ECNT=29;MBQ=28,30;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=276.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,67:0.716:93:12,28:10,37:0|1:75788258_C_A:75788258:13,13,32,35
chr3	75788291	.	AT	GA	.	.	DP=95;ECNT=29;MBQ=28,33;MFRL=167,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=110.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,32:0.337:95:32,10:28,18:0|1:75788291_AT_GA:75788291:33,30,14,18
chr3	75788292	.	T	A	.	.	DP=94;ECNT=29;MBQ=27,29;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,36:0.555:65:15,18:12,18:14,15,20,16
chr3	75788294	.	A	G	.	.	DP=94;ECNT=29;MBQ=28,30;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:80,14:0.156:94:35,5:41,8:0|1:75788260_C_A:75788260:38,42,9,5
chr3	75788314	.	T	C	.	.	DP=85;ECNT=29;MBQ=28,32;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=61.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,22:0.251:85:25,11:30,11:0|1:75788273_G_T:75788273:31,32,8,14
chr3	75788316	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=29;MBQ=32,28;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,25:0.309:82:22,11:27,13:0|1:75788291_AT_GA:75788291:24,33,13,12
chr3	75788366	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=13;MBQ=33,25;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=46.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,15:0.291:53:20,7:18,8:14,24,4,11
chr3	75788376	.	G	C,GTT	.	.	DP=49;ECNT=13;MBQ=33,32,33;MFRL=168,182,159;MMQ=60,60,60;MPOS=15,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=25.68,18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,10,6:0.221,0.157:41:10,4,5:15,6,1:11,14,5,11
chr3	75788382	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,6:0.163:41:12,5:21,1:0|1:75788382_C_T:75788382:14,21,2,4
chr3	75788390	.	A	C,ACTGC	.	.	DP=40;ECNT=13;MBQ=28,32,25;MFRL=174,159,180;MMQ=60,60,60;MPOS=10,6;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=19.06,4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,6,2:0.163,0.077:36:8,5,2:20,0,0:11,17,2,6
chr3	75788391	.	A	AGACAAAGGGT	.	.	DP=40;ECNT=13;MBQ=27,26;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:13,2:20,0:13,21,0,2
chr3	75788394	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=13;MBQ=32,30;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,5:0.167:34:10,5:17,0:0|1:75788382_C_T:75788382:11,18,2,3
chr3	75788434	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=33,31;MFRL=213,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,2:4,6:1,6,0,8
chr3	75788506	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=13;MBQ=32,32;MFRL=211,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.604:10:3,4:1,2:0,4,0,6
chr3	75788513	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=13;MBQ=31,26;MFRL=216,227;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.437:12:6,2:0,3:0,7,0,5
chr3	75788532	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=13;MBQ=29,32;MFRL=222,251;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.375:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr3	75788545	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=13;MBQ=32,26;MFRL=227,266;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr3	75788564	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=13;MBQ=31,30;MFRL=266,258;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr3	75788565	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=13;MBQ=25,34;MFRL=227,281;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr3	75790370	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=13;MBQ=28,32;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=85.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,22:0.657:33:5,10:5,7:0|1:75790370_A_C:75790370:6,5,19,3
chr3	75790376	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=13;MBQ=28,32;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=98.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,26:0.692:37:5,14:6,12:0|1:75790370_A_C:75790370:6,5,22,4
chr3	75790394	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=13;MBQ=32,33;MFRL=170,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,3:0.071:54:24,1:22,2:0|1:75790394_C_G:75790394:30,21,3,0
chr3	75790405	.	TG	AA	.	.	DP=61;ECNT=13;MBQ=29,29;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.079:61:26,2:26,2:35,22,3,1
chr3	75790406	.	G	C	.	.	DP=61;ECNT=13;MBQ=34,32;MFRL=180,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=136.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,35:0.621:56:9,18:12,15:11,10,23,12
chr3	75790409	.	TG	CA,CT	.	.	DP=64;ECNT=13;MBQ=29,32,35;MFRL=192,155,176;MMQ=60,60,60;MPOS=17,31;POPAF=7.30,7.30;TLOD=177.74,10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,44,4:0.693,0.077:62:6,24,2:7,18,2:5,9,33,15
chr3	75790419	.	TG	CA	.	.	DP=66;ECNT=13;MBQ=28,31;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,8:0.132:66:32,3:24,4:0|1:75790394_C_G:75790394:33,25,7,1
chr3	75790427	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=13;MBQ=33,27;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,9:0.130:75:33,4:27,4:0|1:75790394_C_G:75790394:37,29,7,2
chr3	75790446	.	GG	TA	.	.	DP=77;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,9:0.133:73:31,6:31,2:0|1:75790446_GG_TA:75790446:36,28,4,5
chr3	75790448	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=13;MBQ=28,33;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,9:0.135:72:33,4:29,5:0|1:75790394_C_G:75790394:33,30,6,3
chr3	75790466	.	G	T	.	.	DP=72;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=155,195;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,9:0.137:71:31,6:29,2:0|1:75790446_GG_TA:75790446:36,26,4,5
chr3	75790472	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=13;MBQ=33,30;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,5:0.082:71:32,4:30,1:37,29,1,4
chr3	75790479	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,25:0.388:65:22,13:17,12:19,21,11,14
chr3	75790513	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=9;MBQ=27,33;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=201.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,50:0.946:52:0,26:2,24:0|1:75790513_T_C:75790513:1,1,19,31
chr3	75790516	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=9;MBQ=29,29;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,14:0.283:51:18,7:18,6:0|1:75790513_T_C:75790513:14,23,4,10
chr3	75790527	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.102:47:22,2:21,2:0|1:75790513_T_C:75790513:14,29,0,4
chr3	75790536	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=27,31;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,12:0.260:48:17,5:15,7:0|1:75790513_T_C:75790513:10,26,1,11
chr3	75790542	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=9;MBQ=34,28;MFRL=152,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=89.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,25:0.578:43:6,15:11,10:0|1:75790513_T_C:75790513:4,14,6,19
chr3	75790554	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=9;MBQ=32,29;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=89.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,29:0.660:44:8,14:7,12:0|1:75790513_T_C:75790513:4,11,7,22
chr3	75790583	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=9;MBQ=32,25;MFRL=212,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=101.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,26:0.592:44:11,16:6,9:0|1:75790513_T_C:75790513:6,12,9,17
chr3	75790585	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=9;MBQ=33,32;MFRL=212,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=104.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,27:0.601:45:12,15:6,10:0|1:75790513_T_C:75790513:6,12,9,18
chr3	75790607	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=9;MBQ=33,27;MFRL=215,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,18:0.475:38:13,10:6,7:0|1:75790513_T_C:75790513:7,13,6,12
chr3	75790668	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=15;MBQ=34,27;MFRL=174,341;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:4,3:6,2:6,4,5,0
chr3	75790704	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=15;MBQ=32,27;MFRL=169,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=64.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:7,8:10,9:14,3,15,2
chr3	75790705	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=15;MBQ=32,25;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:14,1:16,3:0|1:75790705_C_T:75790705:26,5,4,0
chr3	75790717	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=15;MBQ=33,30;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=123.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,31:0.627:49:9,12:9,15:0|1:75790717_G_A:75790717:14,4,26,5
chr3	75790724	.	A	T	.	.	DP=56;ECNT=15;MBQ=30,25;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,14:0.258:56:22,2:18,12:33,9,10,4
chr3	75790726	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=15;MBQ=27,32;MFRL=163,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=148.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,37:0.623:59:11,12:8,23:0|1:75790717_G_A:75790717:17,5,30,7
chr3	75790730	.	A	T	.	.	DP=61;ECNT=15;MBQ=30,25;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=152.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,38:0.619:61:14,13:8,23:0|1:75790717_G_A:75790717:17,6,31,7
chr3	75790733	.	C	G	.	.	DP=62;ECNT=15;MBQ=32,27;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,9:0.150:62:28,2:24,6:0|1:75790705_C_T:75790705:40,13,8,1
chr3	75790747	.	C	G	.	.	DP=58;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=162,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=112.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,29:0.517:56:17,11:9,18:0|1:75790717_G_A:75790717:17,10,22,7
chr3	75790758	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=15;MBQ=34,24;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.091:52:24,2:24,2:32,16,1,3
chr3	75790797	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=15;MBQ=28,25;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,7:0.221:34:12,4:14,3:0|1:75790797_C_T:75790797:13,14,4,3
chr3	75790810	.	G	GT	.	.	DP=33;ECNT=15;MBQ=32,26;MFRL=148,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:9,4:16,2:0|1:75790797_C_T:75790797:16,11,3,3
chr3	75790811	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=15;MBQ=32,27;MFRL=148,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:10,4:17,2:0|1:75790797_C_T:75790797:16,11,3,3
chr3	75790814	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=15;MBQ=32,28;MFRL=145,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,6:0.206:32:9,4:17,2:0|1:75790797_C_T:75790797:14,12,3,3
chr3	75790822	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=15;MBQ=29,29;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,25:0.742:33:6,9:2,14:5,3,14,11
chr3	75790972	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=157,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.419:14:6,2:2,2:4,4,3,3
chr3	77147112	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=240,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr3	77572047	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=191,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,6:6,2:5,4,3,5
chr3	77572057	.	A	ATTTTTTTTGTTGTTGTTGTT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=211,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:6,0:4,8,1,1
chr3	77599877	.	TCC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=211,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:4,2:7,0,1,1
chr3	77607070	.	A	AC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=237,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:1,4:2,4:2,1,5,4
chr3	77645946	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=121,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:3,3:1,2:2,2,0,5
chr3	77645984	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=166,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0,6,0,4
chr3	78663873	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=181,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:8,2:9,2:5,12,4,0
chr3	78664011	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=221,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:3,1:1,2:1,4,0,3
chr3	78676405	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=112,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,5:5,0:5,2,4,1
chr3	78676467	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=122,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:2,9:5,4:4,3,9,4
chr3	78680265	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=180,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,3:8,0:13,6,3,0
chr3	78680468	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=176,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:9,0:0,3:0,9,0,3
chr3	78695185	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.222:34:16,4:11,3:26,1,7,0
chr3	78695326	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=139,68;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.122:38:11,0:22,4:14,20,2,2
chr3	78695366	.	A	AATAAAAAAAGCTGT	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=154,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:8,0:13,2:0|1:78695366_A_AATAAAAAAAGCTGT:78695366:6,19,0,2
chr3	78695370	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=154,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:12,2:0|1:78695366_A_AATAAAAAAAGCTGT:78695366:6,19,0,2
chr3	78706502	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=221,252;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr3	78706514	.	C	CCCAAAAACGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=252,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr3	78706519	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=252,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr3	78709044	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=265,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.572:7:1,3:1,1:0,3,0,4
chr3	78711299	.	C	CCAACCTCTCTTCACTCTTCAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr3	81548209	.	T	TAAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=182,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,3,1
chr3	81584268	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=194,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.608:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr3	81630214	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=16,31;MFRL=260,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,3:0,1:1,0,4,0
chr3	81698119	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=135,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,1:5,1:4,10,1,1
chr3	81720076	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,284;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:6,6,1,2
chr3	81810516	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=214,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=79.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,29:0.789:36:4,16:3,13:1,6,15,14
chr3	81810702	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	86010600	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=181,244;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,0:5,3:3,3,2,1
chr3	87313507	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,1:7,3:9,6,2,2
chr3	87325558	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:9,1:5,10,0,2
chr3	88042501	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:2,4:3,3:3,2,4,3
chr3	88042990	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr3	88188420	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,6:4,3:6,1,5,4
chr3	88188723	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:9,5:16,0:13,12,4,1
chr3	88189927	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:12,6:3,4:7,8,3,7
chr3	88199179	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:4,12:11,3:5,10,10,5
chr3	88199185	.	T	TC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=156,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.453:26:5,9:9,3:4,10,7,5
chr3	88205293	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,0:2,5:3,7,1,4
chr3	88205539	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=66,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:15,3:16,0:20,12,3,0
chr3	89259624	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=166,76;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,2:3,0:1,2,1,1
chr3	89390264	.	T	TACCATGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=347,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	89456555	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=190,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:3,6,0,7
chr3	89480265	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=186,259;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:7,0,1,1
chr3	89498619	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr3	89521602	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=148,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,1:9,1:5,6,3,0
chr3	89521725	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=141,204;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,2:4,1:7,5,1,2
chr3	89521820	.	TTG	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.358:12:4,4:4,0:0|1:89521820_TTG_T:89521820:0,8,0,4
chr3	89521824	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:0|1:89521820_TTG_T:89521820:0,8,0,4
chr3	89521828	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:0|1:89521820_TTG_T:89521820:0,8,0,4
chr3	89521831	.	TGAAAG	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,4:4,0:0|1:89521820_TTG_T:89521820:0,8,0,4
chr3	89521838	.	TTTG	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=152,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:4,4:3,0:0|1:89521820_TTG_T:89521820:0,7,0,4
chr3	89528461	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=194,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,0:2,3:7,0,3,0
chr3	89528477	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=190,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,0:3,3:8,0,3,0
chr3	93722401	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=209,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,3:1,0:2,0,4,0
chr3	93754286	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=113,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.491:15:1,7:6,0:3,5,4,3
chr3	93768420	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=18,35;MFRL=140,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.526:12:2,0:0,4:1,5,0,6
chr3	96533884	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,19;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.391:11:1,1:0,1:0,7,0,4
chr3	97367230	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,0:2,4:1,2,1,3
chr3	97467361	.	ATCTC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=71,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=TC;STR;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr3	97499532	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,3:10,0:7,14,2,1
chr3	97600097	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=111,162;MMQ=60,34;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,0:8,2:0|1:97600097_A_C:97600097:5,14,0,2
chr3	97600102	.	ATT	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=123,162;MMQ=60,34;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:7,2:0|1:97600097_A_C:97600097:5,15,0,2
chr3	97605460	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.357:20:5,1:8,6:11,2,6,1
chr3	97605677	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr3	97611916	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=155,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:0,5,0,7
chr3	97619250	.	C	CAACTA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.267:24:9,2:9,4:5,13,6,0
chr3	97660084	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:11,3:4,5:9,6,4,4
chr3	97660198	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=181,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,6:0,5:0,1,2,9
chr3	97669543	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr3	97727727	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:7,0,1,2
chr3	97727753	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,1:5,1,2,3
chr3	97731434	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:1,2:5,3:0,6,0,5
chr3	97753883	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=156,11;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,0:3,13:0,6,13,0
chr3	97753931	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=208,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr3	97805954	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=146,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	97806220	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=195,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:5,0:9,4:7,7,0,4
chr3	97806999	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	97851475	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=200,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr3	97851998	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=130,178;MMQ=52,37;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:7,4:7,3:6,8,5,2
chr3	97852229	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=164,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:4,3:11,2:8,7,3,2
chr3	97887865	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=125,208;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,1:8,2:4,7,1,2
chr3	97983117	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=178,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:4,7:3,0:6,1,5,2
chr3	97983207	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,3:7,0:10,4,1,2
chr3	97983257	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=195,146;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,8:4,3:2,4,5,6
chr3	97983265	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=196,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.419:17:4,5:6,2:5,5,3,4
chr3	97983374	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=169,132;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:6,2:8,5:8,6,4,3
chr3	97983391	.	C	G,T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,33,28;MFRL=131,132,206;MMQ=60,40,60;MPOS=19,19;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=13.14,17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,5,7:0.273,0.364:19:2,2,4:5,3,3:6,1,5,7
chr3	97983487	.	TTGTAACCAC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTAACCAC;STR;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.502:16:3,2:5,6:1,7,2,6
chr3	98001662	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=279,442;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:98001662_C_CA:98001662:1,0,1,0
chr3	98001664	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=279,442;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:98001662_C_CA:98001662:1,0,1,0
chr3	98001670	.	CA	AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=257,442;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:0,1:0|1:98001662_C_CA:98001662:2,0,1,0
chr3	98073591	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	98109489	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=186,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,5:2,0,7,0
chr3	98109996	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=182,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,0:0,2:2,4,0,2
chr3	98110406	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.543:11:1,5:4,1:2,3,3,3
chr3	98236026	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:9,0:12,4:6,15,0,4
chr3	98251093	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=194,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,0:10,4:7,9,0,4
chr3	98251120	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=188,224;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,0:10,4:5,11,0,4
chr3	98311994	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=202,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,0:6,2:4,7,1,1
chr3	98487206	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=206,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,2:8,1:14,1,2,1
chr3	98489686	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=195,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.320:20:5,2:8,4:8,6,4,2
chr3	98491619	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:8,0:1,5:4,5,3,2
chr3	98491853	.	T	TGAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=224,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	98503776	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=167,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,3:7,3:7,4,4,2
chr3	98503941	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=201,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr3	98507134	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,7:6,0:5,8,4,4
chr3	98512610	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=183,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:9,1:9,8,0,2
chr3	98518160	.	T	TA,TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,25,26;MFRL=460,225,194;MMQ=60,60,60;MPOS=20,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=13.85,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,2:0.591,0.247:9:0,2,1:1,4,1:1,0,7,1
chr3	98519481	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=213,140;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,2:5,6:9,2,5,3
chr3	98531342	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=259,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr3	98536571	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=192,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:6,0,1,1
chr3	98540982	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=185,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr3	98541012	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr3	98541422	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=135,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,2:3,5:4,0,6,1
chr3	98541633	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=158,303;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr3	98544123	.	CAAA	C,CA,CAA,CAAAA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,33,31,33,32;MFRL=96,174,222,165,167;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=12,13,22,12;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=9.67,4.56,6.54,10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:3,8,3,4,5:0.316,0.148,0.179,0.215:23:1,5,1,2,2:2,2,2,2,2:3,0,17,3
chr3	98544203	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=121,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.085:49:22,0:22,3:16,29,1,3
chr3	98544304	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=223,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,4:7,4:0,10,0,8
chr3	98544323	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=224,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:2,1:7,3:0,10,0,5
chr3	98600284	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=208,223;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	99643175	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.402:28:9,5:7,6:9,8,6,5
chr3	99865772	.	TGA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=140,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GA;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,2:3,0:4,6,1,1
chr3	100000706	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=111,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:9,0:4,2:4,9,0,2
chr3	100009610	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=353,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	100015146	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:4,7:1,3:2,3,1,9
chr3	100016726	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.433:12:5,1:2,4:7,0,5,0
chr3	100034849	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr3	100053684	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=215,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,2:1,1,1,3
chr3	100057846	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=252,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,5,0
chr3	100058102	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=229,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr3	100084432	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=162,248;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.606:23:5,5:3,9:6,3,5,9
chr3	100086861	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,7,7
chr3	100092526	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:100092526_A_AG:100092526:0,0,0,6
chr3	100092528	.	T	TGCA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0|1:100092526_A_AG:100092526:0,0,0,7
chr3	100170825	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=176,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,2:1,1:0,1,1,3
chr3	100174722	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:8,12:3,5:4,7,8,9
chr3	100277476	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=119,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=39.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.575:24:9,8:1,5:3,7,3,11
chr3	100277514	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=169,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:5,3:0,1:0,5,0,4
chr3	100287901	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr3	100328623	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=196,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:8,2,4,0
chr3	100354508	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=173,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.457:22:6,6:6,4:5,7,9,1
chr3	100354524	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=138,258;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:12,2:14,2:14,12,2,2
chr3	100354683	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,3:1,5:0,1,1,7
chr3	100354698	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr3	100365491	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=154,229;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,2:8,1:12,3,2,1
chr3	100368692	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr3	100387709	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr3	100387990	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=128,788;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:3,7,0,2
chr3	100432752	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=222,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.664:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr3	100438784	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=262,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.691:11:1,4:2,3:3,0,7,1
chr3	100438797	.	CTT	C,CT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29,29;MFRL=136,185,191;MMQ=60,60,60;MPOS=3,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=4.70,4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,3,3:0.168,0.183:20:5,0,1:9,3,2:11,3,6,0
chr3	100447791	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=183,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr3	100455609	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=256,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:0,4,1,6
chr3	100463651	.	TTGTG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=TG;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:12,1:6,1:17,4,2,0
chr3	100467097	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=155,76;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,10:0.261:40:16,0:14,10:16,14,0,10
chr3	100471885	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=245,204;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr3	100493607	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr3	100499155	.	A	ATGAGTTTCAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100499155_A_ATGAGTTTCAT:100499155:0,0,0,1
chr3	100499157	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100499155_A_ATGAGTTTCAT:100499155:0,0,0,1
chr3	100511446	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=187,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr3	100515197	.	ATT	A,AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33,30;MFRL=135,207,177;MMQ=60,60,60;MPOS=12,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=3.27,6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,2,4:0.135,0.253:17:2,2,1:7,0,3:10,1,6,0
chr3	100523771	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=146,243;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:6,1:3,3:1,8,0,4
chr3	100566555	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=202,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr3	100567592	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:5,0,2,1
chr3	100567799	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=194,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr3	100567811	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=194,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr3	100569452	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=202,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:3,1,2,0
chr3	100581261	.	ATT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=222,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.242:14:2,2:2,1:1,10,0,3
chr3	100583651	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.620:11:1,2:3,5:2,2,6,1
chr3	100585694	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=116,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:4,2:8,3:8,4,4,1
chr3	100594326	.	CGGCATA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:7,6:1,3:4,6,7,2
chr3	100605206	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	100621426	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=209,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,3:0,10:0,1,10,4
chr3	100712059	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=199,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,2:6,1:8,0,3,0
chr3	100992385	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr3	101038339	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=227,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,1:2,2:1,3,3,0
chr3	101039107	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=107,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:2,2,3,4
chr3	101046671	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:7,6:1,4:4,4,1,9
chr3	101049219	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=132,84;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,0:5,3:5,8,1,2
chr3	101051794	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,5:1,4:0,5,5,4
chr3	101060716	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	101066964	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=234,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,4:1,0:0,4,0,4
chr3	101066992	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	101080652	.	AAT	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=151,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.139:20:5,0:13,2:0|1:101080652_AAT_A:101080652:7,11,1,1
chr3	101080656	.	CTGGAAATGTTCTCCATGACAGGATTATATGGGCATAAT	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.105:27:5,0:13,2:0|1:101080652_AAT_A:101080652:9,16,1,1
chr3	101083895	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=204,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:101083895_G_T:101083895:0,1,0,1
chr3	101083899	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=204,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:101083895_G_T:101083895:0,1,0,1
chr3	101085208	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=215,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr3	101085683	.	TAAAAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=201,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,3;RU=A;STR;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr3	101136340	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=231,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr3	101136385	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	101177901	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.459:9:4,3:1,1:1,4,0,4
chr3	101212889	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr3	101219818	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=165,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,5,0
chr3	101231823	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=8,12;MFRL=171,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.594:5:0,0:0,0:0|1:101231823_G_C:101231823:2,0,3,0
chr3	101231829	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=24,26;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,0:0,2:1,0,3,0
chr3	101231833	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=25,12;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:1,0:0|1:101231823_G_C:101231823:3,0,3,0
chr3	101231835	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=24,12;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:2,0:0|1:101231823_G_C:101231823:3,0,3,0
chr3	101231841	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=26,25;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:2,2:0|1:101231823_G_C:101231823:4,1,3,0
chr3	101231843	.	GG	CC	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=28,12;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,0:2,0:0|1:101231823_G_C:101231823:4,1,3,0
chr3	101231871	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=33,27;MFRL=98,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:5,2,4,2
chr3	101231894	.	TA	GT	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=27,33;MFRL=161,191;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,0:8,2:12,4,1,2
chr3	101231921	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=29,31;MFRL=141,191;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:5,4:4,6:7,2,9,2
chr3	101232057	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=124,178;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.593:3:1,1:0,0:0,1,1,1
chr3	101232093	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	101298573	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,5:2,0:2,2,5,0
chr3	101370551	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	101373480	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=236,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,1:4,4:4,0,5,0
chr3	101383321	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr3	101383562	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=102,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,0:7,4:2,8,0,4
chr3	101399910	.	GAA	G,GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,35,35;MFRL=220,215,144;MMQ=60,60,60;MPOS=22,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=9.10,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,2:0.335,0.222:11:2,3,1:1,1,1:5,0,5,1
chr3	101400167	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=274,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:6,2:0,2:0,6,0,4
chr3	101404813	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:0,6,0,4
chr3	101443461	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=62.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,9:0,0,15,2
chr3	101504624	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr3	101540149	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=126,240;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr3	101572000	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:12,2:14,0:13,13,2,0
chr3	101573345	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=207,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.477:12:3,0:2,5:5,1,6,0
chr3	101573361	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,12;MFRL=173,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.585:15:4,0:1,1:2,4,9,0
chr3	101574503	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr3	101575877	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:3,1:2,5:0|1:101575877_AT_A:101575877:7,0,7,0
chr3	101575882	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,35;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,4:6,3:7,0,7,0
chr3	101575883	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:4,1:3,6:0|1:101575877_AT_A:101575877:7,0,7,0
chr3	101576029	.	T	TACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=91.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,6:0,5:0,0,8,13
chr3	101576404	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	105238890	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.361:13:2,1:4,4:0|1:105238890_CT_C:105238890:4,4,4,1
chr3	105238901	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.313:15:4,1:6,4:0|1:105238890_CT_C:105238890:5,5,4,1
chr3	105243350	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=127,88;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,0:5,2:6,10,0,2
chr3	105252377	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=196,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:7,1,4,1
chr3	105266412	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=204,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr3	105412286	.	C	CTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=75.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,5:0,13:0,0,16,2
chr3	105422988	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,18:0.393:46:14,0:14,17:14,14,0,18
chr3	105423088	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr3	105438806	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr3	105452751	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	105453034	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr3	105455955	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=243,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,5:3,4:4,0,6,3
chr3	105470228	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=183,229;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr3	105495432	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr3	105588069	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=260,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr3	107451771	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=137,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:4,0:12,2:10,7,0,2
chr3	107451907	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr3	107510197	.	A	ATAAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAG;STR;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr3	107519843	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr3	107776511	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr3	107790015	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,88;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.171:39:18,6:15,0:15,18,5,1
chr3	107882643	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr3	107884211	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr3	107910327	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,67;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:4,0:0,1:4,0,1,1
chr3	107932819	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=165,106;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:7,0:13,3:7,13,0,3
chr3	107932839	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=186,106;MMQ=60,46;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,0:10,3:3,15,0,3
chr3	107937286	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	107937571	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr3	107938240	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,11,6
chr3	108070556	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=133,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:2,5:0,4:2,0,8,1
chr3	108072243	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=164,258;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	108072704	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=223,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr3	108081175	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=176,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:5,3:2,0:4,3,3,0
chr3	108096227	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	108103433	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	108107925	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=131,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:9,6:9,4:6,12,5,5
chr3	108135606	.	TAA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:1,2:6,2:0|1:108135606_TAA_T:108135606:6,1,4,0
chr3	108135607	.	AA	TT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr3	108135609	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:0,2:6,2:0|1:108135606_TAA_T:108135606:6,1,4,0
chr3	108135799	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,3:2,7:0,2,0,10
chr3	108140148	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	108147295	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.587:8:1,2:2,1:2,1,4,1
chr3	108156633	.	A	AAAAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=193,242;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAG;STR;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr3	108158574	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=110,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:6,1,4,2
chr3	108172817	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,2:5,5:6,2,3,4
chr3	108179063	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=245,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:6,0,4,1
chr3	108179219	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.751:12:1,3:2,6:0,3,1,8
chr3	108181904	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	108189750	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,1,5
chr3	108211869	.	A	AAAGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAGG;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.691:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	108214537	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr3	108224685	.	CAAAAA	C,CAAAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,20,35;MFRL=106,86,164;MMQ=60,60,60;MPOS=28,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,10,14;RU=A;STR;TLOD=5.04,6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,3:0.166,0.266:13:5,2,2:3,0,1:3,5,2,3
chr3	108229437	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=146,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.767:12:2,1:1,2:1,2,1,8
chr3	108271012	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=156,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:9,0,2,1
chr3	108272414	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=214,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,2:1,0,4,0
chr3	108276217	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=136,227;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:6,0:24,2:16,14,0,2
chr3	108276264	.	C	CAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=A;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.226:15:3,0:8,2:3,9,1,2
chr3	108286947	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=182,249;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:6,2:2,1:8,0,3,0
chr3	108295067	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,6:0,6:1,0,10,2
chr3	108298469	.	CA	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=119,134;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:11,0:24,2:14,21,0,2
chr3	108298483	.	C	CA	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:9,0:17,6:12,14,0,6
chr3	108324365	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=224,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr3	108327050	.	T	TAAC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,8:0,0,1,16
chr3	108344636	.	TA	T,TAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,21,25;MFRL=273,202,49;MMQ=60,60,60;MPOS=1,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.93,5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.443,0.334:6:1,1,0:0,2,2:1,0,5,0
chr3	108344771	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:8,3:5,4:9,4,6,1
chr3	108355423	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	108355475	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=137,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.132:36:20,4:12,0:22,10,4,0
chr3	108355575	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,34,33,33;MFRL=78,74,136,156;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,27,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,9,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.33,9.31,10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,5,5:0.148,0.343,0.344:14:0,1,2,2:2,1,2,3:1,1,1,11
chr3	108356501	.	T	TTTAAGGTAGTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr3	108362961	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr3	108366978	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=224,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,5:2,2:2,1,2,5
chr3	108394771	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=187,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,2:2,5:1,2,0,7
chr3	108403019	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:1,4:4,3:3,2,7,0
chr3	108405410	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=186,61;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:15,2:0|1:108405410_C_T:108405410:9,12,1,1
chr3	108405418	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=186,61;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:5,0:15,2:0|1:108405410_C_T:108405410:10,11,1,1
chr3	108406724	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=181,286;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	108549431	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=249,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr3	108565815	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	108566077	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=206,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	108567923	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,220;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:5,1,2,0
chr3	108639270	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:8,2:22,1:14,16,1,2
chr3	108672335	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=192,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,1:0,1:5,1,2,0
chr3	108678002	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=156,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:2,5,0,4
chr3	108703518	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=153,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:2,4:0,4:1,1,5,3
chr3	108703548	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=153,105;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:2,3:0,6:0,2,4,5
chr3	108703702	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=169,223;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	108705715	.	A	AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.406:12:5,1:2,4:6,1,3,2
chr3	108725759	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=181,320;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	108725848	.	ATTGC	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=181,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:0|1:108725848_ATTGC_A:108725848:4,3,1,1
chr3	108725862	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=181,159;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:0|1:108725848_ATTGC_A:108725848:4,3,2,1
chr3	108725984	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=116,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:0,3:3,2:1,2,0,6
chr3	108746836	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	108754146	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,3:0,5:0,0,8,1
chr3	108754238	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,4:0,14:0,0,11,7
chr3	108754260	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.774:20:2,3:2,13:3,1,9,7
chr3	108754320	.	T	TAA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,0:0,7:0,0,0,9
chr3	108754346	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr3	108773772	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=217,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr3	108776343	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,3,10
chr3	108782160	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=257,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,2:0,1:0,2,0,3
chr3	108788461	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=143,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,3:1,0:1,0,2,1
chr3	108813715	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=198,85;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,4:6,0:8,1,4,0
chr3	109027157	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=200,260;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,2,3
chr3	109027820	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,3:0,2:1,1,4,1
chr3	109049720	.	C	CTAAGGGT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,0:0,3,0,4
chr3	109052934	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	109213091	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=189,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:0,8,1,1
chr3	110790859	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=187,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.247:13:3,1:7,1:10,0,0,3
chr3	111260975	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,2:0,3:2,0,5,0
chr3	111261242	.	G	GCTGCTGAAATTGATCACCA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTGCTGAAATTGATCACCA;STR;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.881:6:0,1:0,2:0,0,0,6
chr3	111298145	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,2:6,3:2,6,1,4
chr3	111316886	.	C	CTTATG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=201,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.366:6:3,1:1,0:4,0,2,0
chr3	111343069	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=179,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr3	111394208	.	TC	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=174,265;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:4,2:15,0:3,16,2,0
chr3	111564839	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,35;MFRL=252,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:1,3,0,4
chr3	111564873	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=229,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:111564873_TA_T:111564873:0,3,0,1
chr3	111564876	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=229,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:111564873_TA_T:111564873:0,3,0,1
chr3	111564878	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=229,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:111564873_TA_T:111564873:0,3,0,1
chr3	111564882	.	GA	TC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=177,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:111564873_TA_T:111564873:0,2,0,1
chr3	111564883	.	AG	TC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=229,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	111602828	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=197,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr3	111632132	.	ACCCACTGACCT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=132,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.436:21:3,2:8,7:7,5,9,0
chr3	111637904	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,18:0,7:0,0,18,7
chr3	111638132	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	111639353	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	111658290	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,3:3,3:4,1,6,0
chr3	111658486	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,4,13
chr3	111658514	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=173,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:0,9,0,5
chr3	111659377	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,8:0,0,9,13
chr3	111664064	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:4,6,2,0
chr3	111685374	.	GGTGT	G,GGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33,26;MFRL=0,203,132;MMQ=60,59,60;MPOS=27,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=GT;STR;TLOD=6.52,4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.382,0.486:4:0,1,1:0,1,1:0,0,3,1
chr3	111685572	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:7,4:7,3:2,12,2,5
chr3	111685607	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=182,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:5,1:0,9,0,3
chr3	111686738	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	111692693	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,1:5,9:4,6,3,7
chr3	111697867	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,2:1,5:2,1,7,0
chr3	111698098	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=175,219;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:0,10,0,2
chr3	111705275	.	G	GTTTGT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=113,165;MMQ=60,47;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTGT;STR;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.497:10:3,2:2,2:1,4,0,5
chr3	111705287	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=168,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:111705287_T_A:111705287:0,16,1,1
chr3	111705294	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=182,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:111705287_T_A:111705287:0,13,1,1
chr3	111705298	.	T	TTATTTTTTCCTA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=181,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:8,0:4,2:0|1:111705287_T_A:111705287:0,12,1,1
chr3	111705727	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,37;MFRL=197,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:3,0:6,0,2,0
chr3	111705992	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=163,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,2:2,2:0,4,0,4
chr3	111710140	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=213,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr3	111710201	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=210,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,1:3,2:7,1,3,0
chr3	111710206	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=233,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:7,0,4,1
chr3	111710398	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=178,207;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:16,1:11,1:8,19,0,2
chr3	111719835	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=208,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:2,6,0,2
chr3	111719879	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=224,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr3	111730546	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=162,260;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,1:8,2:11,3,3,0
chr3	111730591	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,22;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:10,1:10,3:15,5,2,2
chr3	111760771	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,15,1
chr3	111763278	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr3	111766559	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,6:0,0,14,0
chr3	111768736	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=165,118;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:10,5:7,0:8,9,5,0
chr3	111769417	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr3	111785208	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=167,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr3	111793316	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,3:0,7:1,0,3,7
chr3	111794365	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=245,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,11:3,3:1,5,7,7
chr3	111795976	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=130,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:18,4:20,0:21,18,3,1
chr3	111805438	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=112,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=49.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,5:0,9:0,1,1,13
chr3	111828384	.	G	GT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=110,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:9,2:22,1:16,15,1,2
chr3	111828476	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=85,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,2:4,0:4,6,1,1
chr3	111851817	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=154,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:9,0,2,0
chr3	111851890	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=145,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:16,3:12,0:17,11,2,1
chr3	111873899	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,17;MFRL=193,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:1,1:4,0:0|1:111873899_G_T:111873899:2,8,0,2
chr3	111873902	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,17;MFRL=209,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,4:0.634:6:0,1:1,1:1|0:111873899_G_T:111873899:0,2,0,4
chr3	111899383	.	C	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=174,161;MMQ=48,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,9:0.182:53:16,9:27,0:40,4,9,0
chr3	111899432	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=124,53;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:12,4:18,0:14,16,4,0
chr3	111918215	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=219,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.720:20:2,5:3,10:3,2,6,9
chr3	111918216	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=234,164;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.789:17:2,4:1,10:1,2,8,6
chr3	111921010	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=202,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.713:12:3,5:0,3:3,0,9,0
chr3	111921042	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,4:6,0:8,3,4,0
chr3	111923047	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=205,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:1,0,4,1
chr3	111936200	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	111936491	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	111981696	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=257,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,1:2,5:0|1:111981696_CA_C:111981696:3,0,6,0
chr3	111981704	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=257,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:1,1:2,6:0|1:111981696_CA_C:111981696:3,0,7,0
chr3	111983197	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.908:19:1,9:0,8:0,1,5,13
chr3	111985048	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,2:8,1:12,6,1,2
chr3	111988992	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=122,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr3	111993691	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=228,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,0:0,6:2,0,6,0
chr3	111993716	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,13,1
chr3	111996730	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=197,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,7:3,3:0,6,3,7
chr3	111997791	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=209,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr3	112052173	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	112184927	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=61.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,8:0,0,11,7
chr3	112185021	.	G	GGTTTTTTTTT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=171,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:8,2:10,0:10,8,0,2
chr3	112185025	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,7:0,10:0,0,10,7
chr3	112185138	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:11,0:4,2:6,9,0,2
chr3	112198293	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=172,91;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.140:41:17,5:19,0:21,15,5,0
chr3	112253058	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=186,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:0,2:0,6:0,1,7,2
chr3	112253193	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.424:12:5,0:2,4:1,6,2,3
chr3	112256837	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=278,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:3,1,3,2
chr3	112267523	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr3	112277331	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=186,261;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:4,2:7,0:0,12,0,2
chr3	112280218	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr3	112289320	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr3	112289372	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr3	112301458	.	C	CCTTAGTAAT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,10,3
chr3	112335773	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr3	112338027	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr3	112357683	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=160,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.176:24:13,3:7,0:13,7,2,2
chr3	112357710	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=133,90;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:13,4:11,0:17,7,4,0
chr3	112538571	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr3	112642568	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,8,7
chr3	112647613	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	112648125	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,17:0.900:18:1,9:0,8:0|1:112648125_G_T:112648125:0,1,12,5
chr3	112648127	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,17:0.900:18:1,9:0,7:0|1:112648125_G_T:112648125:0,1,12,5
chr3	112666859	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr3	112709828	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr3	112711845	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=119,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:14,5,2,0
chr3	112718470	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=187,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,0:6,3:1,11,0,3
chr3	112719791	.	CAA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=175,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.356:7:0,0:3,1:2,3,0,2
chr3	112727288	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=203,187;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,0:5,7:3,9,7,0
chr3	112732298	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=173,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:0,2:6,0:1,7,1,1
chr3	112732309	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=17,33;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.387:11:1,0:2,4:2,5,0,4
chr3	112738318	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	112991196	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,7:4,1:5,0,8,0
chr3	112997725	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=271,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	112999611	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=240,282;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:1,3,0,3
chr3	113004123	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=179,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:5,0,5,0
chr3	113005753	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,237;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.370:11:1,1:5,2:0,7,0,4
chr3	113120117	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=141,173;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:6,0:10,10:11,5,0,10
chr3	113127955	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:8,7,2,0
chr3	113169372	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,18;MFRL=168,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:1,0:2,1:1,6,0,3
chr3	113285185	.	TTGTG	T,TTG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,22,25;MFRL=159,189,188;MMQ=60,60,60;MPOS=3,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=TG;STR;TLOD=5.81,12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,5:0.212,0.346:15:3,0,2:3,3,3:6,1,8,0
chr3	113320477	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=206,134;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,4:8,2:8,6,2,4
chr3	113376110	.	TTGCTGC	T,TTGC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27,28;MFRL=0,253,223;MMQ=60,60,60;MPOS=12,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=TGC;STR;TLOD=6.21,27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,7:0.228,0.701:9:0,1,4:0,1,3:0,0,6,3
chr3	113377481	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,2:2,2:2,4,2,2
chr3	113379865	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=216,179;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:3,6:5,2:0|1:113379865_G_C:113379865:4,4,6,2
chr3	113379868	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:8,2:7,0:0|1:113379865_G_C:113379865:9,6,1,1
chr3	113380332	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	113442198	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,3:3,4:8,0,5,2
chr3	113464859	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=187,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,5:6,4:4,8,5,4
chr3	113503354	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr3	113508499	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=241,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:4,1:4,2:7,1,3,0
chr3	113522544	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:2,4,1,2
chr3	113524425	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=154,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr3	113524465	.	G	GTGCGATCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	113557787	.	AGCC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr3	113594377	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,5:3,1:3,2,0,6
chr3	113595156	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr3	113619872	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,13,7
chr3	113649716	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,2:0,1:1,4,0,3
chr3	113656833	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=165,203;MMQ=38,42;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	113656982	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:12,3:9,0:0|1:113656982_G_A:113656982:12,12,0,3
chr3	113656991	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:13,3:7,0:0|1:113656982_G_A:113656982:10,11,0,3
chr3	113656995	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:12,3:8,0:0|1:113656982_G_A:113656982:10,11,0,3
chr3	113664183	.	CAG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=155,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,6:3,1:8,0,5,2
chr3	113672657	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=144,78;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:14,3:11,0:14,11,2,1
chr3	113677316	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.227:23:9,0:9,4:8,10,0,5
chr3	113720624	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	113750720	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=195,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:113750720_C_A:113750720:0,3,0,1
chr3	113750725	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=195,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:113750720_C_A:113750720:0,3,0,1
chr3	113755447	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,100;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:9,5:9,0:11,8,5,0
chr3	113789422	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=193,172;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,4:1,0:5,0,4,0
chr3	113955055	.	GAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,316;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.713:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	113955320	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr3	113956021	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,270;MMQ=44,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,1:6,2:0,12,0,3
chr3	114027065	.	C	CGTGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=217,259;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=GT;STR;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.325:10:5,0:2,2:0,7,0,3
chr3	114070090	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=242,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:3,5,2,0
chr3	115382818	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=197,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,3:1,1:0,2,1,3
chr3	115529092	.	G	GTCTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TC;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr3	115529360	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr3	115561349	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:10,7,0,2
chr3	118864980	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=70,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:118864980_AG_CC:118864980:1,1,1,0
chr3	118864985	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,35;MFRL=70,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:118864980_AG_CC:118864980:1,1,1,0
chr3	118864991	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,12;MFRL=70,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:118864980_AG_CC:118864980:2,1,1,0
chr3	118866376	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=147,91;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.499:24:6,10:6,2:6,6,2,10
chr3	118866515	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr3	118870025	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr3	118906555	.	T	TGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118906555_T_TGG:118906555:0,0,1,0
chr3	118906559	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=174,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:118906555_T_TGG:118906555:2,0,1,0
chr3	118906616	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.280:16:4,2:7,2:9,3,4,0
chr3	118909962	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,4,14
chr3	118909987	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,2,11
chr3	118913261	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=218,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,2:5,1:0,6,0,3
chr3	118922654	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=136,206;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,0:4,3:6,0,3,0
chr3	118931389	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,8,4
chr3	118945614	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=228,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr3	119013878	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.307:8:2,0:2,1:0|1:119013878_G_C:119013878:2,4,1,1
chr3	119013898	.	TG	CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=197,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,0:0|1:119013878_G_C:119013878:0,2,0,1
chr3	119101039	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=192,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:1,0:7,4:8,0,4,0
chr3	119101925	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,1:5,4:8,3,4,1
chr3	119118037	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=129,112;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:1,2:8,0:8,2,2,0
chr3	119128628	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.428:23:6,5:7,5:5,8,6,4
chr3	119128634	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:6,3:6,4:5,8,4,3
chr3	119128712	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=214,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0,4,0,5
chr3	119171280	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=125,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,2:7,3:4,6,3,2
chr3	119196334	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=242,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:6,1:1,3:0,7,0,4
chr3	119198873	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:8,5:5,0:10,3,3,2
chr3	119204063	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr3	119204311	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=180,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.233:19:8,3:7,1:0,15,0,4
chr3	119205752	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,3:12,0:10,10,3,0
chr3	119235977	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=202,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr3	119236017	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=220,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:5,0,7,0
chr3	119263680	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=131,125;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,5:3,4:6,2,4,5
chr3	119327604	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=207,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:5,2:7,0:8,5,2,0
chr3	119334986	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=229,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr3	119338352	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=135,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.490:16:7,8:1,0:7,1,7,1
chr3	119348345	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,19;MFRL=262,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:2,0:2,1:1,4,0,3
chr3	119373257	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=155,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:7,0,7,0
chr3	119373301	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=153,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,1:5,8:6,4,6,3
chr3	119373315	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,2:6,6:6,4,4,4
chr3	119501580	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=209,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:1,3:6,3:4,3,3,4
chr3	119501780	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr3	119501798	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr3	119529113	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	119531709	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=199,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:6,2:9,3:6,9,0,5
chr3	119533773	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	119534153	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,295;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:4,1,4,2
chr3	119535823	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr3	119721171	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,244;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	119892121	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=241,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:6,1,1,2
chr3	119900260	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	119904125	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr3	119904315	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	119905641	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr3	119912297	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:8,1:1,1:0,9,0,2
chr3	120053931	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=153,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,0:7,2:7,7,1,1
chr3	120114637	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=132,242;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,1:5,2:0,6,0,3
chr3	120130883	.	GACACACACACACACATACATGC	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=218,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.422:15:3,4:5,2:0,9,0,6
chr3	120130897	.	CAT	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=205,262;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr3	120130899	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.920:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr3	120134720	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=253,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:3,4:4,6:8,0,9,1
chr3	120134883	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=215,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.714:26:3,8:4,11:1,6,6,13
chr3	120169641	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	120371369	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=245,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:2,2,2,1
chr3	120371414	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=125,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:5,6:1,4:2,4,4,6
chr3	120371579	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,15;MFRL=115,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:120371579_T_A:120371579:0,3,0,1
chr3	120371581	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=115,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:120371579_T_A:120371579:0,3,0,1
chr3	120371585	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,16;MFRL=115,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:120371579_T_A:120371579:0,3,0,1
chr3	120371595	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=115,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,0:0|1:120371579_T_A:120371579:0,3,0,1
chr3	120389429	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=225,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,1,2
chr3	120413158	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,1,5
chr3	120833994	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=224,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,1,1
chr3	120976056	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=179,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,1:3,1:8,2,1,1
chr3	121100116	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	121132268	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=210,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr3	121137976	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=206,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,3:1,4:1,1,2,5
chr3	121138015	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:0,1,1,5
chr3	121155198	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=245,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr3	121168344	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=241,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.826:21:3,14:0,4:0,3,17,1
chr3	121178915	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:8,0:12,6:13,7,0,6
chr3	121186543	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	121195302	.	TACAC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=244,256;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=AC;STR;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr3	121202131	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	121202433	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=97,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:5,3:1,4:2,4,1,8
chr3	121202449	.	AAG	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=171,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:6,2:7,0:0|1:121202449_AAG_A:121202449:3,10,0,2
chr3	121202453	.	A	AC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=138,97;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:5,0:0|1:121202449_AAG_A:121202449:3,9,0,2
chr3	121208703	.	CTTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=181,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=T;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,2:6,1:11,7,3,0
chr3	121212277	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=275,247;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr3	121217297	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=147,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:7,1:5,1:9,4,1,1
chr3	121228833	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,3:3,7:2,1,9,1
chr3	121238819	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=129,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:12,8,0,2
chr3	121238853	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=130,77;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:13,4:8,0:11,10,3,1
chr3	121238863	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=89,218;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:14,2:7,1:12,9,2,1
chr3	121239027	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=231,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,2:1,6:0,1,0,8
chr3	121241058	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=255,41914206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr3	121339354	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=222,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,4:1,3:1,0,6,1
chr3	121340910	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=115,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:3,0:6,2:5,5,1,1
chr3	121345829	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=169,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chr3	121350966	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,10,5
chr3	121351315	.	G	GGGCTCAGGCTCA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=112,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=GGCTCA;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:7,3:2,4:3,6,2,5
chr3	121353254	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr3	121354670	.	C	CTGAGGGCCTGCGTTCCGAGT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,16;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.420:5:0,1:3,0:0|1:121354670_C_CTGAGGGCCTGCGTTCCGAGT:121354670:1,2,1,1
chr3	121354672	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,10;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.424:5:0,0:3,0:0|1:121354670_C_CTGAGGGCCTGCGTTCCGAGT:121354670:1,2,1,1
chr3	121354677	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:121354670_C_CTGAGGGCCTGCGTTCCGAGT:121354670:1,2,0,1
chr3	121361787	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,2:6,1:3,4,1,2
chr3	121361820	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=176,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,0:6,2:2,9,0,2
chr3	121366123	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=203,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:5,0:7,4:8,4,4,0
chr3	121366377	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=190,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,1:1,1:0,7,0,2
chr3	121383297	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,4:3,4:3,0,7,1
chr3	121387060	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=169,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:1,5,0,2
chr3	121396059	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=264,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.533:9:2,2:2,3:4,0,4,1
chr3	121400725	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	121414217	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:4,5,2,5
chr3	121418765	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr3	121418799	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=199,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr3	121500699	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=160,270;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:13,0:4,3:7,10,2,1
chr3	121508830	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	121514212	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=238,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:9,1:3,4:12,0,5,0
chr3	121514458	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=100,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.785:13:0,5:2,5:0,3,1,9
chr3	121517997	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=121,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,2:5,8:8,4,9,1
chr3	121526099	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=187,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:9,0,4,0
chr3	121563271	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,1:8,2:10,1,3,0
chr3	121563494	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:1,6,0,2
chr3	121573729	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,3:1,0:0,5,0,3
chr3	121613330	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=165,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:4,0:9,3:7,6,1,2
chr3	121615212	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:5,3:6,2:6,5,5,0
chr3	121630328	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=160,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,1:6,1:5,1,2,0
chr3	121631841	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=225,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,5:1,4:1,1,5,4
chr3	121641528	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr3	121643143	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.280:12:1,2:7,1:8,1,3,0
chr3	121643163	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=166,123;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.789:17:2,2:1,12:3,0,10,4
chr3	121643170	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:4,2:12,1:12,4,3,0
chr3	121643699	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=180,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr3	121643893	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,2:7,1:3,12,2,2
chr3	121646495	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=193,201;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr3	121646759	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=207,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:8,0:2,3:0,10,0,3
chr3	121647782	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,251;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,1:5,1:11,1,2,0
chr3	121659197	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr3	121712051	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.328:25:10,3:6,4:5,12,5,3
chr3	121724038	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=218,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:0,1:3,1:0|1:121724038_G_A:121724038:2,1,2,1
chr3	121724049	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,8;MFRL=221,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.334:4:0,0:2,0:1|0:121724038_G_A:121724038:1,2,1,0
chr3	121724056	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=230,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0,3,1,0
chr3	121774281	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=123,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,2:1,0:2,2,1,1
chr3	121810427	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=50.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.959:19:0,8:0,11:0,0,14,5
chr3	121836966	.	TGA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GA;STR;TLOD=71.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,12:0,6:0,0,7,11
chr3	121973063	.	CC	TT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=155,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:7,0:9,3:12,6,0,3
chr3	121973091	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=170,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,0:8,2:13,5,0,3
chr3	121976253	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr3	122000871	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=132,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:1,0,6,1
chr3	122003717	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,1:9,2:6,11,0,3
chr3	122003769	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=184,222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,4:5,1:6,7,1,4
chr3	122004098	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	122081881	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=165,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.229:16:6,1:5,2:1,12,1,2
chr3	122128519	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,2:5,1:8,1,2,1
chr3	122134889	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=198,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.231:27:13,2:7,3:10,11,1,5
chr3	122145810	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr3	122186141	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=145,240;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:3,2,2,0
chr3	122247606	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=176,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr3	122255886	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=167,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,0:8,3:7,12,2,1
chr3	122275016	.	AAAAAG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=171,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0|1:122275016_AAAAAG_A:122275016:0,2,1,0
chr3	122275026	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,15;MFRL=171,113;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,0:0|1:122275016_AAAAAG_A:122275016:0,2,1,0
chr3	122287289	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=186,289;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr3	122329434	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=155,138;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.325:38:11,0:15,12:16,10,0,12
chr3	122329447	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=150,138;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.351:35:10,0:13,12:13,10,0,12
chr3	122406077	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=172,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	122418750	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.371:25:11,5:5,4:9,7,5,4
chr3	122437834	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=156,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.202:16:7,2:6,0:2,11,1,2
chr3	122446733	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.238:40:15,8:15,0:14,17,9,0
chr3	122459290	.	G	GAGA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=211,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:8,1:9,6:9,8,3,5
chr3	122459732	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=192,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:2,3,2,1
chr3	122471407	.	TAA	T,TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28,28;MFRL=173,155,178;MMQ=60,60,60;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=4.82,4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,5:0.238,0.296:15:2,2,3:2,1,2:4,3,6,2
chr3	122471562	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.221:34:10,0:17,7:4,23,1,6
chr3	122474284	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=137,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.368:12:3,1:5,3:5,3,1,3
chr3	122474305	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=142,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=43.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.794:16:0,4:2,8:1,2,5,8
chr3	122478032	.	C	CCACACA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=CA;STR;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,2:0,0,5,0
chr3	122512631	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,234;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr3	122514252	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=212,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:2,2,1,2
chr3	122564645	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:11,8,0,2
chr3	122578968	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=130,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:10,0:8,3:10,8,1,2
chr3	122598291	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=185,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:0,8,0,4
chr3	122629589	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	122629656	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=170,182;MMQ=53,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,1:2,1:2,4,2,0
chr3	122630416	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=231,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:5,1:3,1:2,6,0,3
chr3	122631896	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	122642401	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	122642415	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr3	122680141	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,3:3,3:1,9,1,5
chr3	122680171	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=203,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:2,7:1,3:0,3,0,10
chr3	122807995	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=207,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:0,5:2,4:2,0,6,3
chr3	122811351	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr3	122821385	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr3	122821478	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=282,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	122821671	.	AT	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=227,177;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,4:2,7:2,2,5,6
chr3	122829918	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=72482199,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr3	122835210	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	122843020	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,1:9,2:8,8,2,1
chr3	122843024	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=179,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,1:7,1:0|1:122843024_TC_T:122843024:7,6,0,2
chr3	122843026	.	TAAAGCTCA	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,1:7,1:0|1:122843024_TC_T:122843024:6,8,0,2
chr3	122843212	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=239,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,3:5,2:1,4,1,4
chr3	122865136	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=142,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:0,1:1,4:0,2,1,4
chr3	122873923	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr3	122880118	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=208,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:2,1,2,5
chr3	122942358	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=193,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr3	122942402	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=188,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:3,0,7,0
chr3	122964900	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=171,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,3:3,4:1,3,1,6
chr3	122978486	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,6:0,4:0,2,1,9
chr3	123003448	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=199,36;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:2,2:7,0:7,3,1,1
chr3	123008519	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	123010276	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=172,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.350:15:6,3:4,2:5,5,1,4
chr3	123014877	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=195,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,3,1
chr3	123014904	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=213,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:2,1,4,0
chr3	123015094	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr3	123019147	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=159,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:6,5,0,2
chr3	123021838	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr3	123021870	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr3	123037047	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr3	123047395	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr3	123047478	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,2:6,0:6,2,2,0
chr3	123047666	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,2:2,0:2,6,1,1
chr3	123049707	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:5,3:10,1:9,6,4,0
chr3	123051484	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,1:11,1:10,12,2,0
chr3	123066555	.	A	AAAGG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGG;STR;TLOD=47.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,6:0,0,10,2
chr3	123301205	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:7,0:8,8:5,10,0,8
chr3	123332875	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.370:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr3	123401060	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=183,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:7,4:11,1:12,7,4,1
chr3	123418913	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,8,5
chr3	123440967	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,5:0,0,10,4
chr3	123441179	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,256;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr3	123452508	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=207,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	123454314	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=201,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,0:5,4:0,7,0,4
chr3	123454374	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=244,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0,4,2,0
chr3	123456294	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:4,1:17,1:8,13,1,1
chr3	123456432	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	123456458	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=205,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:123456458_C_T:123456458:0,2,0,1
chr3	123456464	.	A	ATG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=205,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:123456458_C_T:123456458:0,2,0,1
chr3	123456466	.	T	TTGAGGCCTCCCCAG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=205,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:123456458_C_T:123456458:0,2,0,1
chr3	123456470	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=208,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123456458_C_T:123456458:0,1,0,1
chr3	123457711	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,4,4
chr3	123633612	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,7:4,3:4,2,7,3
chr3	123650432	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr3	123650447	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=162,266;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:0,1:0,1,0,4
chr3	123652476	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=102,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,3:3,0:4,3,2,1
chr3	123666192	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	123667482	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,3:6,1:11,3,4,0
chr3	123674879	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.321:25:8,2:6,5:12,5,2,6
chr3	123983604	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=213,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr3	124113929	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:0,10:1,7:1,0,12,5
chr3	124132263	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=195,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	124165217	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,306;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr3	124195987	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	124210344	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=196,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,7:2,1:1,2,0,8
chr3	124211666	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=138,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,1:8,2:7,7,1,2
chr3	124281980	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,6:4,2:2,8,1,7
chr3	124303786	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:4,3:2,0:4,3,0,3
chr3	124352860	.	T	TTTAAGTCTTTAGTAAGACTAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=205,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr3	124369640	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=108,239;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.590:15:2,3:4,6:3,3,5,4
chr3	124369744	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=118,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,1:8,1:7,5,2,0
chr3	124377196	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=249,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr3	124378386	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=125,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	124379716	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=121,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:8,8:2,0:6,4,8,0
chr3	124379748	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,13:1,4:0,2,13,4
chr3	124380793	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=142,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:2,1:6,1:4,5,1,2
chr3	124390796	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=265,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,6:1,4:1,0,1,9
chr3	124397249	.	ATT	A,AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20,28;MFRL=233,271,261;MMQ=60,60,60;MPOS=31,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.91,7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.300,0.403:7:0,1,0:1,0,3:0,2,0,5
chr3	124420940	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,71;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:5,9,0,2
chr3	124431798	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=185,41;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:6,2:10,0:9,7,1,1
chr3	124438399	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=185,350;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:124438399_T_C:124438399:0,3,0,1
chr3	124438404	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=185,350;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:124438399_T_C:124438399:0,3,0,1
chr3	124438413	.	C	CAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,36;MFRL=185,350;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:124438399_T_C:124438399:0,3,0,1
chr3	124438416	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=185,350;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:124438399_T_C:124438399:0,3,0,1
chr3	124449505	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,129;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.257:22:8,0:9,5:5,12,0,5
chr3	124458816	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=124,229;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr3	124462710	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,0:5,2:8,3,2,0
chr3	124629222	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=122,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:6,5:2,0:7,2,4,1
chr3	124635428	.	C	CTCGTGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=190,236;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	124642586	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=377,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	124646926	.	CTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,318;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	124692785	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=133,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:1,2:3,0:2,3,0,2
chr3	124728472	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr3	124729193	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=263,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,0:0,5:1,0,5,0
chr3	124732842	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=198,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,7:2,2:0,3,0,9
chr3	124802677	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	124802881	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:6,3:1,2:5,2,2,4
chr3	124802888	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:6,3:1,4:4,3,2,5
chr3	124854425	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	124896861	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr3	124997930	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=145,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,0:8,4:8,2,4,0
chr3	124998098	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=86,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.473:16:4,2:5,5:2,7,2,5
chr3	125199069	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=142,90;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,3:11,0:14,7,3,0
chr3	125249251	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=207,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:125249251_C_T:125249251:2,0,1,0
chr3	125249258	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=207,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:125249251_C_T:125249251:2,0,1,0
chr3	125271404	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=153,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,0:6,3:8,7,1,2
chr3	125651602	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=270,128;MMQ=60,39;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.557:5:0,2:2,0:0,2,2,1
chr3	125725268	.	TAACA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AACA;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.192:23:6,0:12,4:12,7,3,1
chr3	125727476	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=225,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.580:5:0,0:1,0:0|1:125727476_A_C:125727476:2,0,3,0
chr3	125727482	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,21;MFRL=272,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.658:4:0,0:0,1:0|1:125727476_A_C:125727476:1,0,3,0
chr3	125731523	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:3,1:8,1:6,6,1,1
chr3	125734272	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,3:6,0:8,1,3,0
chr3	125734465	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,1:9,1:5,6,1,1
chr3	125741771	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=143,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:125741771_C_T:125741771:8,9,0,2
chr3	125741790	.	AG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:125741771_C_T:125741771:5,10,0,2
chr3	125769757	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=165,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:2,2,3,0
chr3	125775428	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr3	125786695	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=282,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr3	125786760	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=285,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:2,1,2,3
chr3	125787126	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=343,81;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,1,1
chr3	125831572	.	GGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=211,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:0,1:3,0,1,1
chr3	125849031	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=144,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,1:3,3:4,2,3,1
chr3	125850169	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=204,248;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:4,1,3,0
chr3	125850193	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=186,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:4,3,3,2
chr3	125850381	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=150,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:10,2:2,1:5,9,1,2
chr3	125850434	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=184,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr3	125854311	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=167,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	125855620	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=187,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:4,3:6,0:8,3,2,1
chr3	125874388	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,1,6
chr3	125877376	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=111,318;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:6,3,1,1
chr3	126071467	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:4,6,3,2
chr3	126125990	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=153,252;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:3,2:7,3:5,5,3,3
chr3	126132880	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=196,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,4,1
chr3	126135070	.	C	CCGCGTCCCCGGCCTCAGGTCCG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,1:0,0,4,0
chr3	126135365	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,6:1,1:0,1,5,2
chr3	126138462	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=171,39;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:126138462_C_T:126138462:3,1,1,1
chr3	126138465	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=171,39;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0|1:126138462_C_T:126138462:3,1,1,1
chr3	126138778	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=56.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,10,6
chr3	126142496	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=192,431;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:1,8,0,2
chr3	126142512	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=218,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:6,0:0,11,0,2
chr3	126152980	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=208,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,1,1
chr3	126154319	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr3	126158622	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=186,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.696:8:2,2:0,3:0|1:126158622_A_C:126158622:0,2,0,6
chr3	126158639	.	G	GCAAATCTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=242,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:126158622_A_C:126158622:0,4,0,1
chr3	126178390	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=175,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:7,0,2,0
chr3	126184941	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.366:17:5,2:6,4:11,0,5,1
chr3	126184948	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.202:18:5,2:9,1:13,2,3,0
chr3	126185238	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr3	126189919	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,4:4,6:0,6,1,9
chr3	126201096	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=272,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr3	126202147	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=251,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr3	126207222	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=194,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr3	126208249	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,4:0,1:0,1,1,4
chr3	126216829	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,1:0,1:0,0,5,0
chr3	126219030	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr3	126219086	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	126219733	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr3	126219973	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,8,1
chr3	126226518	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr3	126227185	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=188,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr3	126228410	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:5,6:1,6:3,3,7,5
chr3	126236348	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	126255166	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=236,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:3,2:5,1:5,3,2,2
chr3	126268783	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:8,0:4,3:6,6,3,0
chr3	126268953	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=139,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,1:1,1:0,3,2,2
chr3	126270757	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr3	126290985	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=183,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:5,0:10,2:9,6,0,2
chr3	126452133	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=195,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,5:3,2:0,4,0,8
chr3	126633419	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=283,250;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr3	126724881	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr3	126749154	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=156,132;MMQ=60,22;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,0:1,3:7,2,0,3
chr3	126749165	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=140,132;MMQ=60,22;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,0:2,3:6,3,0,3
chr3	126751689	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr3	126752889	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:6,0:12,6:8,10,0,6
chr3	127298657	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:5,8,2,0
chr3	127336934	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=289,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.852:11:1,7:0,3:0,1,2,8
chr3	127379790	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=206,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:11,3:4,0:6,9,3,0
chr3	127391018	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	127396220	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=216,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:0,1,4,0
chr3	127410959	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=17,25;MFRL=263,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:0,0:0,1:2,0,1,0
chr3	127410961	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=12,17;MFRL=263,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:2,0,1,0
chr3	127410971	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,10;MFRL=242,252;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,0:0,0:2,0,2,0
chr3	127411206	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=168,373;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:1,8,0,2
chr3	127429567	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=186,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,2:3,2:1,2,1,3
chr3	127440083	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=181,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr3	127703085	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,201;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,0:4,3:3,7,0,3
chr3	127820310	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:10,0,2,0
chr3	128181471	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,4:6,3:5,5,2,5
chr3	128182816	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=185,90;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:2,4:6,4:4,4,4,5
chr3	128182997	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	128200072	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=122,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.134:28:15,0:9,3:12,13,2,1
chr3	128204919	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=154,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:3,0:2,2:4,4,0,2
chr3	128292062	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=190,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.430:9:0,2:3,2:2,3,4,0
chr3	128348735	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:2,1,3,0
chr3	128351054	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=154,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr3	128356852	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=228,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:4,8:3,4:3,4,6,6
chr3	128516905	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.411:32:12,1:7,12:3,16,0,13
chr3	128598469	.	CGT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=202,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GT;STR;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,3:2,3:4,0,6,0
chr3	128614133	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=116,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,5:3,9:5,4,12,2
chr3	128624880	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=160,228;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:3,0,7,0
chr3	128627753	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,1:3,4:6,4,4,1
chr3	128629505	.	C	CTGAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=154,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAT;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:5,2,2,0
chr3	128631481	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=208,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr3	128690036	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=218,40;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,2:9,0:8,4,1,1
chr3	128712042	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:11,3:13,0:10,14,3,0
chr3	128722958	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	128749803	.	A	ACACCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	128755814	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,2:2,6:1,3,4,4
chr3	128755953	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:2,3:0,2,1,3
chr3	128755971	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=192,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,1,2
chr3	128757560	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:6,0,5,0
chr3	128781258	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.581:7:0,1:2,1:0,3,1,3
chr3	128840034	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	128853622	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr3	128859202	.	C	CTTAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr3	128864520	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:128864520_C_G:128864520:0,0,6,1
chr3	128864540	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:128864520_C_G:128864520:0,0,7,0
chr3	128877521	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	128890101	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=184,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:5,2:0|1:128890101_T_C:128890101:6,10,1,1
chr3	128890106	.	C	CTCAGACACCA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=184,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:128890101_T_C:128890101:6,10,1,1
chr3	128890108	.	C	CTGCA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=184,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:128890101_T_C:128890101:6,10,1,1
chr3	128890350	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,21:0,14:0,0,18,17
chr3	128890618	.	TG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=165,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,2:13,0:5,19,0,2
chr3	128991839	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,155;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:13,0:6,10:0,19,0,10
chr3	129020778	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	129034828	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:129034828_G_GA:129034828:0,4,0,1
chr3	129034830	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,29;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:129034828_G_GA:129034828:0,4,0,1
chr3	129034832	.	GG	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=148,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:129034828_G_GA:129034828:0,3,0,1
chr3	129035031	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=118,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.259:17:6,0:7,2:10,3,2,2
chr3	129120743	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=218,263;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr3	129123294	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=191,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:5,0:1,3:0,7,0,3
chr3	129130022	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=120,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:4,2,3,0
chr3	129140489	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=162,192;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,2:6,4:9,4,2,4
chr3	129140738	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=232,293;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr3	129147370	.	GAA	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=123,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.082:34:19,0:12,2:0|1:129147370_GAA_G:129147370:10,22,1,1
chr3	129147379	.	T	TGTGTAAGATAGA	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=123,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,0:11,1:0|1:129147370_GAA_G:129147370:6,21,1,1
chr3	129147380	.	C	CA	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,36;MFRL=123,52;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,0:12,1:0|1:129147370_GAA_G:129147370:6,21,1,1
chr3	129151927	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.267:24:9,3:9,3:9,9,3,3
chr3	129152144	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=193,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,2:3,1:0,10,0,3
chr3	129153036	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:8,3:4,1:1,11,0,4
chr3	129155547	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=188,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.279:12:4,1:5,2:3,6,1,2
chr3	129156536	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=171,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:5,4,4,0
chr3	129168854	.	CTTTT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,36,33,34;MFRL=145,162,261,180;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,10,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,11,13,14;RU=T;STR;TLOD=5.65,3.77,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,2,2:0.214,0.300,0.298:7:0,0,1,1:1,2,1,1:0,1,0,6
chr3	129185641	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=227,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr3	129185661	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr3	129185924	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=235,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr3	129188325	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:1,7,0,5
chr3	129202316	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.257:33:12,3:13,5:14,11,5,3
chr3	129202336	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=159,75;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.113:41:21,2:16,2:19,18,2,2
chr3	129214511	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr3	129218944	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=139,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.122:39:8,2:27,2:3,32,1,3
chr3	129231261	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,89;MMQ=60,39;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,0:13,2:9,13,0,2
chr3	129234259	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=105,248;MMQ=52,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,3:4,4:5,4,2,5
chr3	129247551	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=18,30;MFRL=106,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.483:11:3,3:0,2:3,3,2,3
chr3	129247606	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=203,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:13,2:8,0:11,10,0,2
chr3	129251263	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=201,307;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:6,2:4,0:8,6,2,0
chr3	129252604	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=213,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,1,3
chr3	129266162	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=133,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:4,2,2,1
chr3	129275403	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,3:7,1:8,1,3,1
chr3	129275619	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=211,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr3	129275870	.	GA	CC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,17;MFRL=224,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:0,0:0,1:0|1:129275870_GA_CC:129275870:1,0,2,0
chr3	129275877	.	GA	CC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=17,12;MFRL=206,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:129275870_GA_CC:129275870:3,0,1,0
chr3	129275883	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,15;MFRL=206,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:129275870_GA_CC:129275870:3,0,1,0
chr3	129275886	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,13;MFRL=206,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:129275870_GA_CC:129275870:3,0,1,0
chr3	129275888	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,15;MFRL=190,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:129275870_GA_CC:129275870:4,0,1,0
chr3	129275890	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,15;MFRL=190,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:129275870_GA_CC:129275870:4,0,1,0
chr3	129275892	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,10;MFRL=190,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:129275870_GA_CC:129275870:4,0,1,0
chr3	129278446	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:5,3,0,2
chr3	129279570	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=114,209;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:16,0:18,3:14,20,1,2
chr3	129279597	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.942:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr3	129280631	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=175,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:13,0,2,0
chr3	129281866	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=83,230;MMQ=57,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:4,8,1,2
chr3	129282137	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=159,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr3	129284150	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=176,310;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:7,2:5,1:9,4,3,0
chr3	129286531	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.249:17:6,1:7,2:7,6,2,2
chr3	129286635	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,213;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,2:10,1:10,9,0,3
chr3	129289831	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=128,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,4:6,2:4,8,3,3
chr3	129290187	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=167,270;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.238:15:5,2:4,1:4,8,0,3
chr3	129290322	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=313,230;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.493:4:2,0:0,0:0|1:129290322_T_A:129290322:1,1,2,0
chr3	129290325	.	C	CCCCCCAAACGCCCCCCCAATCCAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=313,230;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:129290322_T_A:129290322:1,1,2,0
chr3	129293394	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr3	129294294	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=162,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,1:2,1:7,2,2,0
chr3	129294456	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:3,1:1,6,0,2
chr3	129303197	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr3	129303436	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=218,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:4,4:3,2:2,6,0,6
chr3	129308096	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	129694934	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	129695538	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr3	129800783	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=130,150;MMQ=54,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.379:16:5,4:5,1:6,4,3,3
chr3	129800895	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=154,138;MMQ=51,30;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:0,3:8,3:5,4,4,4
chr3	129800934	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=154,136;MMQ=52,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:4,1:5,8:0|1:129800934_C_G:129800934:2,7,3,6
chr3	129800938	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=154,136;MMQ=52,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:4,1:5,8:0|1:129800934_C_G:129800934:2,7,3,6
chr3	129801012	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=176,185;MMQ=52,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	129811073	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=191,95;MMQ=60,53;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,1,3
chr3	129811872	.	GAAAAAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=119,266;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=25,19;RU=A;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,0:0,2:0,1,2,0
chr3	129814847	.	CG	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=133,137;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.298:15:6,2:5,2:7,4,4,0
chr3	129814863	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=147,139;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,2:6,3:4,7,5,0
chr3	129814869	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=144,139;MMQ=60,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,3:6,4:5,6,5,2
chr3	129814934	.	GC	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=144,158;MMQ=43,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=45.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.654:21:4,7:3,7:0,7,5,9
chr3	129815930	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,152;MMQ=54,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr3	130095031	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:8,1,3,0
chr3	130109923	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=251,202;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:4,0,1,0
chr3	130114408	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	130116388	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=112,112;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:0,5:8,0:8,0,5,0
chr3	130122409	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.859:9:0,4:1,4:0,1,8,0
chr3	130122549	.	CTGT	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.179:20:7,0:10,3:0|1:130122549_CTGT_C:130122549:6,11,2,1
chr3	130122552	.	TACAC	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=AC;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.264:9:3,1:2,1:1|0:130122549_CTGT_C:130122549:0,7,0,2
chr3	130124491	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.923:24:0,11:1,12:0,1,8,15
chr3	130124989	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=149,199;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,7:2,4:4,2,5,6
chr3	130129035	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=203,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr3	130132302	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:130132302_T_A:130132302:0,0,8,1
chr3	130132304	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0|1:130132302_T_A:130132302:0,0,8,1
chr3	130132509	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=72,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,4:1,1:1,1,0,5
chr3	130132851	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr3	130135575	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,9,7
chr3	130137866	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=74,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr3	130140113	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=182,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.363:25:4,2:12,6:10,6,6,3
chr3	130142584	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=174,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:5,2:1,0:6,1,2,0
chr3	130142587	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=239,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.723:9:2,6:0,1:2,0,6,1
chr3	130144984	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr3	130145175	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:8,2:12,4:11,9,2,4
chr3	130148510	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=213,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:2,5,0,4
chr3	130158343	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=190,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,4:1,5:2,0,6,3
chr3	130187570	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	130282383	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,1:8,1:6,14,1,1
chr3	130285553	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:10,2:7,0:9,8,2,0
chr3	130285929	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,4:7,3:3,9,2,5
chr3	130286886	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=142,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr3	130287191	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:21,2:6,0:5,22,0,2
chr3	130289617	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	130311343	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=174,144;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,8:5,0:7,3,8,0
chr3	130311366	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=198,144;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,8:8,0:11,2,8,0
chr3	130313017	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=228,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr3	130317341	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr3	130360600	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=170,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.397:24:5,5:9,3:6,8,2,8
chr3	130361930	.	AC	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=173,243;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:4,1:2,7,0,2
chr3	130367860	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:3,1:2,2:5,1,3,0
chr3	130393973	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=197,310;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr3	130427085	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=186,268;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr3	130452998	.	T	TAC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=186,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:8,2:13,2:6,15,2,2
chr3	130660392	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.241:18:3,4:11,0:11,3,4,0
chr3	130674022	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	130678263	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,1:7,2:0,10,0,3
chr3	130683005	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=203,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr3	130712710	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=223,233;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:7,1,2,0
chr3	130733046	.	CT	C,CTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33,30;MFRL=155,157,107;MMQ=60,60,60;MPOS=19,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=10.62,5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,6,3:0.344,0.198:17:4,4,0:4,2,3:3,5,4,5
chr3	130733206	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=162,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:9,3:10,0:6,14,1,2
chr3	130734887	.	GT	G,GTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32,34;MFRL=227,300,224;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.45,5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.335,0.441:6:0,0,2:1,2,1:1,0,5,0
chr3	130737632	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	130748733	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,0:5,2:1,9,0,2
chr3	130799205	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=258,285;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:0,2:8,0:8,0,3,0
chr3	130828790	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:9,4:6,1:5,10,3,2
chr3	130851686	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=193,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:1,4,2,1
chr3	130881409	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=192,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,2:6,6:2,7,3,5
chr3	130884417	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,0:9,8:1,13,0,8
chr3	130887626	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=118,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,4:4,2:8,2,3,3
chr3	130887748	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=118,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,12:0.261:48:12,12:22,0:20,16,12,0
chr3	130962181	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr3	131102022	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=192,74;MMQ=60,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:12,2:7,2:8,11,3,1
chr3	131186893	.	CAA	C,CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34,22;MFRL=161,178,141;MMQ=60,60,60;MPOS=13,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=6.05,3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.332,0.334:7:1,3,0:1,0,1:1,1,4,1
chr3	131217208	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=203,290;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:8,3:1,0:0,9,0,3
chr3	131261662	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,2,3
chr3	131268824	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,218;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,1:5,3:10,4,1,3
chr3	131404625	.	A	AAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AC;STR;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,3:1,0:2,1,3,0
chr3	131404641	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=175,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,1:1,1:5,1,1,1
chr3	131404826	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=166,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,1:5,4:0,7,0,5
chr3	131415340	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,300;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,2:2,1:5,3,3,0
chr3	131418719	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=155,241;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:6,0:2,3:4,5,0,3
chr3	131418898	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=126,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=T;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr3	131624385	.	GAC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=215,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AC;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	132063914	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=216,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,1,4
chr3	132068876	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:1,6:1,1:0,2,1,7
chr3	132075554	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:1,3:7,5:6,2,6,3
chr3	132075604	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=180,78;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,0:6,4:5,5,0,4
chr3	132075746	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=299,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:1,4:0,2,4,4
chr3	132153333	.	T	TAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=134,236;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:7,0,3,1
chr3	132166148	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.423:22:6,5:7,4:12,1,7,2
chr3	132166765	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:6,0:5,11,0,3
chr3	132169705	.	TA	T,AA,TAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,27,25,28;MFRL=165,110,175,180;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,16,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=3.65,10.86,4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,3,7,3:0.145,0.287,0.154:21:3,2,4,1:5,1,3,2:0,8,2,11
chr3	132172395	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=152,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:11,3:8,0:12,8,3,0
chr3	132173004	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=168,59;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:4,2:7,2:5,6,1,3
chr3	132176152	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=131,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,3:13,0:11,12,3,0
chr3	132179072	.	GTT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,65;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:4,0:3,2:2,8,2,0
chr3	132182443	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=288,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,4:3,1:3,0,5,0
chr3	132196761	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.361:28:8,8:10,1:8,10,5,5
chr3	132196816	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=171,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:1,5:3,5:3,1,6,4
chr3	132197995	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=133,265;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr3	132198156	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=135,215;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,0:7,2:4,8,0,2
chr3	132202449	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=163,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:2,5,1,2
chr3	132211285	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=206,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:7,2:6,6:7,7,5,3
chr3	132217957	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=130,236;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:9,0:15,2:12,13,1,1
chr3	132219554	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=160,242;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:5,3:4,1:9,0,4,0
chr3	132221076	.	CTTTT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,34,32,35;MFRL=0,177,149,80;MMQ=60,60,60,59;MPOS=17,12,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,12,14,15;RU=T;STR;TLOD=5.94,5.44,5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,2,2:0.301,0.301,0.300:6:0,2,2,2:0,0,0,0:0,0,5,1
chr3	132221097	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,17;MFRL=157,80;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:2,0:7,5,2,0
chr3	132221139	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:9,7:9,3:14,4,5,5
chr3	132221167	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:14,3:13,0:19,8,0,3
chr3	132224128	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,1:10,1:18,6,2,0
chr3	132242642	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=221,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr3	132247160	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=148,244;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:7,2:5,8,2,0
chr3	132320802	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=158,149;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.367:22:7,5:7,3:5,9,6,2
chr3	132321036	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.150:25:10,1:12,2:18,4,2,1
chr3	132322262	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=236,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr3	132338346	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:7,3:11,2:8,10,4,1
chr3	132394556	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:10,2:12,2:11,11,0,4
chr3	132407567	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,70;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.186:41:16,6:16,1:27,7,6,1
chr3	132413796	.	C	CATCTATTGCAATGAATAACAAAAAATGTA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=243,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.245:11:3,0:5,2:5,4,1,1
chr3	132415672	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=166,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,1:7,3:4,9,0,4
chr3	133108978	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,3:3,3:8,1,3,3
chr3	133114893	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr3	133185834	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,4,14
chr3	133191453	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr3	133329901	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=119,445;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:9,2:13,0:8,14,0,2
chr3	133329943	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,5,11
chr3	133331163	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=148,155;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,0:1,2:4,1,2,0
chr3	133335787	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr3	133335960	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	133335977	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr3	133347604	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=126,300;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,3:3,0:4,8,0,3
chr3	133359065	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,0:4,6:1,6,0,6
chr3	133368199	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr3	133368334	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=180,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,1:7,3:4,7,1,3
chr3	133368362	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,8,9
chr3	133375785	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=210,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,6:0,0:0,1,0,6
chr3	133380026	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.186:24:12,2:8,2:5,15,1,3
chr3	133472558	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=130,92;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.180:29:13,0:11,4:6,18,1,4
chr3	133476852	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr3	133524591	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,300;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	133526756	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,69;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:0,9,0,2
chr3	133547692	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,3:2,3:2,3,2,4
chr3	133553554	.	C	CCATTTACCACAACATGAATAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	133556972	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=181,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr3	133583577	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr3	133661397	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=132,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:7,2:11,3:13,5,5,0
chr3	133666360	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,0:3,4:0,7,0,4
chr3	133692497	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=161,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:1,0,7,1
chr3	133692648	.	T	TG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:12,2:10,0:0|1:133692648_T_TG:133692648:7,15,0,2
chr3	133692650	.	A	ACC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:12,2:10,0:0|1:133692648_T_TG:133692648:7,15,0,2
chr3	133692652	.	G	GGAGA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,2:10,0:0|1:133692648_T_TG:133692648:7,15,0,2
chr3	133692743	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=252,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,4:1,5:0,1,0,9
chr3	133698280	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=231,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:4,1,3,1
chr3	133877113	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=88,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,5:6,1:3,7,2,4
chr3	133894390	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:5,5:1,6:6,0,9,2
chr3	134078433	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr3	134080661	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr3	134214042	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=227,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr3	134226159	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=89,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.576:17:5,4:2,5:2,5,3,7
chr3	134256159	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr3	134266124	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=197,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:2,1,1,0
chr3	134266148	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr3	134266321	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=196,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:4,3:3,3:2,6,1,6
chr3	134277195	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=190,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.253:13:3,2:7,1:1,9,1,2
chr3	134280395	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr3	134323112	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=216,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,1:8,1:7,8,2,0
chr3	134323156	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr3	134327421	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=194,180;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,5:4,0:8,0,6,0
chr3	134514579	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,4,8
chr3	134644636	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=203,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,4:1,4:2,0,7,1
chr3	134825512	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,267;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,1:3,3:1,9,0,4
chr3	134885886	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=122,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:3,2,0,2
chr3	134920489	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=121,311;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,0:6,2:6,8,1,1
chr3	134967368	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0,4,3,2
chr3	135720241	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,487;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	135720783	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=130,168;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:5,0:7,4:5,7,0,4
chr3	135741887	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=209,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:7,1,3,0
chr3	135742057	.	G	GTGTTTTGTTT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=222,147;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TGTTT;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.295:7:0,1:5,0:0,5,0,2
chr3	135759669	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=194,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,1:4,2:7,4,3,0
chr3	135768232	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.875:5:0,0:0,4:0,0,2,3
chr3	135975486	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=159,41;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:135975486_T_TC:135975486:7,9,1,1
chr3	135975497	.	CTT	GAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=166,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:4,2:0|1:135975486_T_TC:135975486:7,10,1,1
chr3	136035737	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,3:2,2:2,1,3,2
chr3	136059537	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr3	136060387	.	C	CCAGCCCTAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=181,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,1,1
chr3	136139878	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=187,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.635:9:1,3:2,3:2,1,5,1
chr3	136196071	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr3	136287679	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:13,0:14,5:19,8,0,5
chr3	136287686	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=138,28972543;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:13,0:17,2:0|1:136287686_C_T:136287686:17,14,1,1
chr3	136287698	.	CA	AC	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=162,28972543;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:11,1:0|1:136287686_C_T:136287686:12,12,1,1
chr3	136573284	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=133,164;MMQ=60,31;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:0|1:136573284_G_A:136573284:10,6,2,0
chr3	136573289	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,16:0.773:20:1,7:3,9:0|1:136573284_G_A:136573284:4,0,9,7
chr3	136574578	.	T	TTAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=91.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,22:0.854:25:0,7:3,15:2,1,9,13
chr3	136664589	.	A	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,16:0.304:54:17,16:21,0:20,18,16,0
chr3	136677064	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=155,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:7,2:7,13,1,1
chr3	136728886	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=222,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr3	137717991	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=169,267;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr3	137783700	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	137787192	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=181,128;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,14:1,10:0,1,9,16
chr3	137787282	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	137799291	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr3	137799498	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,5,7
chr3	137800656	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,6,6
chr3	137805944	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=140,212;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr3	137843018	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.872:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr3	137843073	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:9,6:10,0:14,5,6,0
chr3	137843106	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,11:0,0,17,10
chr3	137843708	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=174,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:12,4:9,0:7,14,2,2
chr3	137850003	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,2:0,12:0,0,8,6
chr3	137880695	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr3	137882377	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr3	137882752	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr3	137892530	.	CG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=188,271;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,0:8,2:0,11,0,2
chr3	137893395	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=221,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.535:7:2,0:1,1:0,3,4,0
chr3	137907220	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=185,249;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:2,0:3,0,2,0
chr3	137907242	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:3,0:6,0,2,0
chr3	137940690	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=210,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr3	137958438	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=177,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr3	137982718	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=266,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:0,1,1,5
chr3	137988855	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:2,0:6,2:8,0,2,0
chr3	138009460	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=164,35;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:4,4:13,0:0|1:138009460_C_A:138009460:11,6,2,2
chr3	138009462	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=153,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.164:22:5,3:14,0:0|1:138009460_C_A:138009460:11,8,2,1
chr3	138025136	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=222,285;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr3	138025396	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	138091701	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr3	138116364	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=213,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:3,1:5,1:1,7,0,3
chr3	138170788	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr3	138171042	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	138176533	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=226,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,6:1,5:0,1,1,10
chr3	138189031	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr3	138189658	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	138193038	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,12;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,0:2,0:9,0,3,0
chr3	138195529	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,5:0,5:1,0,7,3
chr3	138213849	.	ATTTGT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=168,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:6,6,0,2
chr3	138251447	.	CGGTAT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=150,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGTAT;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,0:6,2:7,11,1,1
chr3	138341284	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.763:6:0,3:1,2:1,0,1,4
chr3	138348081	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=183,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:0,5,0,4
chr3	138383993	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:14,0:5,4:10,9,4,0
chr3	138403390	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=253,172;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr3	138413666	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=168,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:8,2:10,6,0,2
chr3	138413778	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=187,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:1,6,0,2
chr3	138417989	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=171,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,0:2,5:0,2,0,5
chr3	138433568	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=200,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:1,6:0,4:0,1,2,8
chr3	138724212	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:9,0,2,0
chr3	138739143	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=157,64;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:8,3:6,0:9,5,2,1
chr3	138763627	.	GTGC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGC;STR;TLOD=58.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,12:0,2:0,0,10,4
chr3	139066902	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	139069771	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:7,8:9,0:8,8,8,0
chr3	139075938	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=208,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr3	139077527	.	GA	G,GAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,29,33;MFRL=167,180,157;MMQ=60,60,60;MPOS=10,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.32,9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,4:0.229,0.409:10:1,0,1:1,2,2:2,2,5,1
chr3	139090736	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=158,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,3:3,1:1,7,0,4
chr3	139098357	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:0,5,1,3
chr3	139102120	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,8:1,7:1,0,12,3
chr3	139108250	.	C	CTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=294,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:0,4:1,3:1,0,10,0
chr3	139180919	.	ATG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=130,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,0:6,3:6,1,2,1
chr3	139195177	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:6,5:0,5:3,3,5,5
chr3	139257545	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=132,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,3:1,1:1,0,3,1
chr3	139257603	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=132,241;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,5:7,1:9,6,4,2
chr3	139280328	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,1:0,1,0,6
chr3	139894697	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=31462617,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr3	140140213	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=203,278;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr3	140178638	.	CCCT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.570:14:2,2:4,6:4,2,2,6
chr3	140282084	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=276,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,2,5
chr3	140285115	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,10:0,1:0,0,3,8
chr3	140419715	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=217,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.702:18:3,5:2,8:3,2,5,8
chr3	140675348	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,0:3,1:5,0,1,1
chr3	140678384	.	TA	T,TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30,21;MFRL=202,144,200;MMQ=60,60,60;MPOS=21,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.32,3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.299,0.297:7:1,1,0:1,1,1:0,3,0,4
chr3	140689795	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=132,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:11,4:14,0:13,12,4,0
chr3	140692486	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=218,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr3	140784929	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=162,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:0,3:1,2:1,0,4,1
chr3	140979115	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=217,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chr3	140979184	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,363;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	140998214	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=85.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,14:0,0,18,8
chr3	141235118	.	TTATTATTTATTTTA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=166,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:4,2:14,2,1,1
chr3	141277651	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=188,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,2:5,1:12,0,3,0
chr3	141327593	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=197,212;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:0,10,0,2
chr3	141464146	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,4:7,5:4,7,3,6
chr3	141497195	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:5,8,1,1
chr3	141625999	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,5:3,6:4,0,6,5
chr3	141626123	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=83,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:2,5:9,3:5,6,5,3
chr3	141644274	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=399,236;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141644274_G_C:141644274:1,0,1,0
chr3	141644278	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=399,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141644274_G_C:141644274:1,0,1,0
chr3	141678537	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,86;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,0:11,2:11,5,2,0
chr3	141682825	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,299;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,2:3,2:3,6,0,4
chr3	141689017	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=202,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.527:17:3,4:5,5:0|1:141689017_T_C:141689017:2,6,1,8
chr3	141689025	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=227,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:0|1:141689017_T_C:141689017:1,5,1,7
chr3	141712485	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr3	141713823	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=134,241;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,1:7,2:9,4,3,0
chr3	141904808	.	TCA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=154,90;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:141904808_TCA_T:141904808:6,11,1,1
chr3	141904811	.	TCCACTG	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=148,90;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:8,2:0|1:141904808_TCA_T:141904808:8,13,1,1
chr3	141904977	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:1,6:5,9:5,1,10,5
chr3	141905253	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=250,157;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:12,2:3,2:0|1:141905253_C_A:141905253:19,0,4,0
chr3	141905259	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=250,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:14,2:5,3:0|1:141905253_C_A:141905253:19,0,5,0
chr3	141905261	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=250,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.230:24:13,2:5,3:0|1:141905253_C_A:141905253:19,0,5,0
chr3	141906446	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	141917810	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=224,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,1,2
chr3	141923506	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=55,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,1:5,7:4,5,5,3
chr3	141932531	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=221,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr3	142051147	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=239,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr3	142076059	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,243;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr3	142089990	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=184,175;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:1,0:6,0,2,0
chr3	142089997	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,0:1,0:5,0,2,0
chr3	142090008	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,13;MFRL=178,191;MMQ=60,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,0:2,0:6,1,2,0
chr3	142094816	.	G	GCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=205,196;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=CA;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.348:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr3	142119301	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.202:21:7,0:5,0:9,8,0,4
chr3	142131378	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:4,2:3,4,2,1
chr3	142178144	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,108;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,2:13,0:12,6,2,0
chr3	142218425	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,2:11,1:11,6,1,2
chr3	142231254	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=146,179;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:8,7:7,2:9,6,0,9
chr3	142241692	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=137,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.551:7:0,2:0,1:0,3,0,4
chr3	142255090	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=179,342;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:1,13,0,2
chr3	142259706	.	CA	C,CAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32,29;MFRL=147,200,160;MMQ=60,60,60;MPOS=4,1;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=5.10,12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,6:0.235,0.412:14:3,0,1:2,3,5:4,1,8,1
chr3	142272314	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=227,191;MMQ=60,21;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,4:1,8:0,1,0,12
chr3	142274739	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=157,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:1,0:7,2:7,1,3,0
chr3	142277399	.	AATAGATAG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=151,148;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=ATAG;STR;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.260:10:2,0:3,2:3,5,2,0
chr3	142287047	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,4:2,2:1,6,1,5
chr3	142413407	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:1,2:4,3:0,5,2,4
chr3	142430389	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,73;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:12,2:15,1:9,18,1,2
chr3	142467310	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,1:4,1:4,9,0,2
chr3	142521224	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.355:14:5,3:4,2:1,8,1,4
chr3	142523555	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=299,282;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,2:7,0:0,8,0,2
chr3	142548492	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=196,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,0:6,2:8,1,2,0
chr3	142567030	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=164,312;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:9,2,1,1
chr3	142567327	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	142720348	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,6,1
chr3	142735816	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=69.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,23:0.462:50:15,0:12,23:7,20,0,23
chr3	142746095	.	GG	TC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:142746095_GG_TC:142746095:2,17,0,2
chr3	142746098	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:8,2:0|1:142746095_GG_TC:142746095:2,17,0,2
chr3	142752293	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	142773738	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=261,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:1,11:0,7:1,0,10,8
chr3	142985837	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=210,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.378:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr3	143371003	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=183,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr3	143513975	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=203,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr3	143567207	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=81.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,15:0,9:0,0,3,21
chr3	143691889	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	145788467	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=169,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:7,5:7,7:11,3,9,3
chr3	145788803	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=189,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:10,1,5,0
chr3	145794776	.	CTTTA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=231,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr3	145796891	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,4:4,4:5,5,6,2
chr3	145803138	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=229,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0|1:145803138_T_C:145803138:0,6,1,4
chr3	145803142	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=229,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:2,2:3,3:0|1:145803138_T_C:145803138:0,6,1,4
chr3	145804524	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=202,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:3,1:6,1:9,0,3,0
chr3	145820684	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,2:4,2:1,9,1,3
chr3	145824478	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=183,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr3	145824504	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=202,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:0,4,0,4
chr3	145828256	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr3	145838895	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr3	145841854	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr3	145878591	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=190,272;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr3	145878621	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=171,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:0|1:145878621_C_T:145878621:7,0,2,0
chr3	145878629	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=171,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:4,3:3,0:0|1:145878621_C_T:145878621:7,0,2,1
chr3	145912299	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,6:0,2:2,0,0,8
chr3	145924632	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=211,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr3	145938528	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:4,0,6,1
chr3	145938782	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=204,270;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,1:8,2:0,11,0,3
chr3	145939916	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:3,3,2,1
chr3	146166913	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=247,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,2:6,2:8,0,4,0
chr3	146167163	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,3:6,0:0,11,0,3
chr3	146176075	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=174,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,7,0
chr3	146251430	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=220,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0|1:146251430_A_G:146251430:0,2,0,4
chr3	146251433	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=220,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0|1:146251430_A_G:146251430:0,2,0,4
chr3	146254478	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=187,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	146303750	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=183,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,1:0,5:1,1,6,0
chr3	146303911	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=143,204;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=42.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,16:0.348:47:12,0:18,16:15,16,0,16
chr3	146307371	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr3	146307487	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:4,8,2,0
chr3	146307635	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=209,260;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr3	146311937	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:1,3:3,3:1,3,0,6
chr3	146312941	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,3:3,3:3,5,1,5
chr3	148459395	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:9,4:7,2:9,7,4,2
chr3	148558447	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=297,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:1,1,4,2
chr3	148562397	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.769:11:2,3:0,6:0|1:148562397_G_C:148562397:0,2,2,7
chr3	148562399	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.769:11:1,3:0,5:0|1:148562397_G_C:148562397:0,2,2,7
chr3	148562425	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=170,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:4,6,1,2
chr3	148562620	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=98,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr3	148563493	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:0,6,0,4
chr3	148575380	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=159,247;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,0:9,3:0,13,0,3
chr3	148597482	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=243,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr3	148714025	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=320,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:4,0,5,2
chr3	148727223	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=184,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:9,0:4,13:5,9,0,13
chr3	148750245	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,511;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	148756825	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,10,3
chr3	148757290	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=181,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr3	148759542	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=245,290;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr3	148760079	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=175,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,0:8,2:5,17,0,2
chr3	148764090	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=161,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,2:6,1:1,6,0,3
chr3	148791966	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,5:4,0:7,1,5,0
chr3	148793854	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=220,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr3	148857714	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=244,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr3	148858987	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=167,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.417:8:3,3:1,0:1,4,1,2
chr3	148871532	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr3	148879878	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,5:0,6:0|1:148879878_A_G:148879878:0,0,11,1
chr3	148879883	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=212,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.572:12:1,5:4,2:0|1:148879878_A_G:148879878:4,1,7,0
chr3	148885077	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=240,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr3	148885779	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:3,5:1,0:2,2,2,3
chr3	148885851	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	148891654	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=197,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:148891654_T_TA:148891654:0,9,0,2
chr3	148891656	.	T	TCCCGTTTCCAACG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=197,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:148891654_T_TA:148891654:0,9,0,2
chr3	148895531	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr3	148896430	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,1:5,4:0,7,0,5
chr3	148901407	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=148,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.661:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr3	148924030	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=180,130;MMQ=60,33;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,0:8,7:5,10,0,7
chr3	148925257	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=180,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:9,1:8,7,1,1
chr3	148925418	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:5,6,0,2
chr3	149039324	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=97,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.816:14:2,6:0,6:1,1,6,6
chr3	149040186	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,1376;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,1:8,1:13,7,0,2
chr3	149050925	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr3	149087714	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,6,19
chr3	149192564	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=199,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr3	149192851	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr3	149216761	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=146,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:1,8,0,2
chr3	149238595	.	C	CTTAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=171,40;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:6,2:8,2:4,10,2,2
chr3	149243715	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=185,247;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr3	149290605	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=132,17181301;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr3	149459341	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,8,6
chr3	149469181	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=131,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:17,3:9,0:13,13,3,0
chr3	149469333	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=363,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:0,5:1,4:0,1,0,9
chr3	149485901	.	T	TG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=186,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.613:24:4,7:4,6:3,6,9,6
chr3	149613232	.	ATT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.927:10:0,3:0,5:0,0,9,1
chr3	149678534	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=99,144;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.877:22:0,12:2,8:2,0,5,15
chr3	149684096	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=178,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:3,3:5,1:4,5,1,3
chr3	149686076	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=195,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr3	149686366	.	AAC	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:5,1:6,2:2,9,1,2
chr3	149686367	.	AC	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=225,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:3,4:0,8:0,3,3,9
chr3	150128154	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=181,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,0:7,2:10,2,2,0
chr3	150128392	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=236,305;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,3:4,0:2,7,0,3
chr3	150128484	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=328,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr3	150129171	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=172,302;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	150176389	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=128,42;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:15,0:12,2:0|1:150176389_A_C:150176389:13,16,1,1
chr3	150176394	.	CCACAGCA	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=131,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:14,0:16,2:0|1:150176389_A_C:150176389:14,17,1,1
chr3	150262318	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=66.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,25:0.530:47:14,9:8,16:8,14,8,17
chr3	150263783	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=220,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,2:8,5:10,3,7,0
chr3	150264003	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=182,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,0:10,2:0,13,0,2
chr3	150270077	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:6,0,7,0
chr3	150276151	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.499:10:1,3:4,2:0|1:150276151_A_AT:150276151:4,1,4,1
chr3	150276153	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.521:10:1,3:4,2:0|1:150276151_A_AT:150276151:4,1,4,1
chr3	150280253	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=199,272;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr3	150280506	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,0:0,3:0,4,0,3
chr3	150282061	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=286,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.424:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr3	150285664	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:5,9:6,3:7,4,8,4
chr3	150290399	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=222,196;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:150290399_C_T:150290399:0,2,0,1
chr3	150290408	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=222,196;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:150290399_C_T:150290399:0,2,0,1
chr3	150290416	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=222,196;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:150290399_C_T:150290399:0,2,0,1
chr3	150340114	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	150384807	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr3	150404208	.	A	AAAGAAGTGGCATTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=197,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,1,1
chr3	150421590	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,19;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.254:16:4,0:5,1:6,6,1,3
chr3	150421707	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:6,0:14,2:5,15,0,2
chr3	150661472	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=249,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:1,0,5,1
chr3	150661495	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=249,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,2:1,6:1,0,6,2
chr3	150690439	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=181,157;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.270:24:10,1:7,5:4,14,4,2
chr3	150690566	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=189,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr3	150804629	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	150804908	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=234,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr3	150845574	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:3,4,6,1
chr3	150845795	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=213,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr3	150883600	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=192,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:8,1,1,1
chr3	150906314	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=165,197;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:6,0:1,2:0,8,0,2
chr3	150916131	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=182,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,3:5,6:7,0,9,0
chr3	150916715	.	G	GCCAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=177,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,0:6,2:5,2,1,1
chr3	150931137	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:13,0:7,3:5,15,0,3
chr3	151046135	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=170,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:9,3:11,0:0|1:151046135_C_A:151046135:10,10,2,1
chr3	151046149	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=176,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.180:20:7,3:10,0:0|1:151046135_C_A:151046135:7,10,2,1
chr3	151046150	.	C	CTACTTCCATCTCTCTTTCTCTTTG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=176,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.177:20:7,3:10,0:0|1:151046135_C_A:151046135:7,10,2,1
chr3	151046604	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:17,2:8,1:10,16,2,1
chr3	151078216	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=151,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:7,3,2,0
chr3	151083695	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=162,104;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:4,3:16,0:8,13,3,0
chr3	151085842	.	AAAT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=174,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr3	151094995	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=258,244;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr3	151102790	.	ACT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=185,229;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,1:5,2:12,4,2,1
chr3	151102901	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=154,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,0:14,2:12,14,0,2
chr3	151131074	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=126,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,12:0.296:42:14,0:14,10:17,13,0,12
chr3	151131183	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=213,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr3	151134104	.	AGCAGCCCCAGCAGCCCCAGCCCCAGCAGCCTCCCCAGCCCCAGCAGTCCTCGCAGTCCCAGAGTCAGACCCTTGGTCTCCAAGCAAT	A	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=147,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,24:0.074:97:10,4:4,5:41,32,17,7
chr3	151148113	.	CCAG	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=174,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CAG;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.118:31:12,3:14,0:15,13,1,2
chr3	151150422	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=204,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr3	151155758	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:10,4:9,1:8,11,4,1
chr3	151161612	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:5,5,0,2
chr3	151166343	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=212,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:4,1,1,1
chr3	151461960	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=192,102;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.425:14:6,3:1,3:4,4,2,4
chr3	151463421	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,217;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,1:7,2:5,9,0,3
chr3	151531894	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,1:2,5:6,0,6,0
chr3	151535422	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr3	151542408	.	AAAAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=22,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAC;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chr3	151545318	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,5,0
chr3	151545321	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,5,0
chr3	151545323	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,5,0
chr3	151546041	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=237,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:4,1:0,3:0,5,0,4
chr3	152017897	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=89,263;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:0,1:4,0,3,0
chr3	152164599	.	AG	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=247,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,0:4,2:3,10,0,2
chr3	152174242	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=204,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:0,5,0,5
chr3	152881441	.	TC	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=222,231;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:5,1:1,2:2,4,3,1
chr3	152881449	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=202,174;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.734:15:1,3:2,4:3,1,3,8
chr3	152881453	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=192,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.792:14:0,5:2,4:2,1,3,8
chr3	152881852	.	AT	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=92,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.299:30:13,6:6,2:17,4,4,5
chr3	152881927	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=145,259;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,8:0.184:47:25,0:14,8:25,14,0,8
chr3	152881936	.	GGT	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=170,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GT;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.109:24:14,1:8,0:14,8,1,1
chr3	152883389	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=156,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,11:0.245:47:12,11:20,0:32,4,11,0
chr3	152883395	.	CTT	C,CT	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=34,32,32;MFRL=165,215,121;MMQ=60,60,60;MPOS=10,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.05,9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,3,7:0.075,0.166:44:20,1,2:12,2,3:32,2,7,3
chr3	152883481	.	AT	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:14,2:10,2:7,19,1,3
chr3	152884097	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=162,323;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:9,6:11,0:17,3,6,0
chr3	153839959	.	CT	TC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=291,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,20:0.877:22:0,8:2,12:0|1:153839959_CT_TC:153839959:2,0,9,11
chr3	153839960	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,22:0.958:22:0,8:0,14:1|0:153839959_CT_TC:153839959:0,0,11,11
chr3	153840898	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=161,259;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,1:9,1:3,11,0,2
chr3	153870511	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=259,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,6:0,8:1,0,14,0
chr3	153958173	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=155,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,1:5,4:2,8,2,3
chr3	153970796	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr3	153972500	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,7,5
chr3	153973083	.	AC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=113,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:3,2:9,2:12,1,3,1
chr3	153994502	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr3	153995307	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=124,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr3	154002357	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=146,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.301:16:6,2:5,3:5,6,4,1
chr3	154007682	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr3	154010515	.	AAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=AC;STR;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr3	154021063	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,12,4
chr3	154024165	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	154029544	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=238,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:154029544_G_A:154029544:0,2,0,1
chr3	154029549	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=238,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:154029544_G_A:154029544:0,2,0,1
chr3	154033066	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=136,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:11,2:11,3:10,12,1,4
chr3	154147149	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=149,79;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:6,4:11,0:10,8,5,0
chr3	154834379	.	GTA	G,GTATATATA,GTATATATATA,GTATATATATATA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33,33,32,33;MFRL=119,219,171,122,324;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=23,17,8,8;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=8,7,11,12,13;RU=TA;STR;TLOD=13.00,13.30,7.23,4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:1,4,5,3,3:0.249,0.293,0.191,0.176:16:0,2,2,2,2:1,2,3,1,1:1,0,9,6
chr3	154866453	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=287,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,6:1,5:2,1,4,7
chr3	154878158	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=182,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,1:3,5:0,7,3,3
chr3	155205993	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=254,241;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr3	155212325	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=116,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,3:1,5:0,1,2,6
chr3	155241593	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	155241740	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=127,176;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,5:3,3,3,6
chr3	155241872	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:155241872_C_A:155241872:0,3,0,1
chr3	155241873	.	A	AGAATAGTATTTGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:155241872_C_A:155241872:0,3,0,1
chr3	155241885	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	155271825	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=124,232;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:0,3:5,6:1,4,8,1
chr3	155520239	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:7,1,2,0
chr3	155547696	.	C	CTTGTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0|1:155547696_C_CTTGTGG:155547696:0,0,0,1
chr3	155547699	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:155547696_C_CTTGTGG:155547696:0,0,0,1
chr3	155551206	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	155611557	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=145,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr3	155628877	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,277;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:11,2:12,2:16,7,1,3
chr3	155637190	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=176,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,0:4,4:0,7,1,3
chr3	155643189	.	CTT	C,CT	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=36,32,35;MFRL=163,102,144;MMQ=57,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.53,7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,3,7:0.078,0.153:46:4,1,4:32,1,3:3,33,4,6
chr3	155643196	.	T	TC	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=138,163;MMQ=60,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=75.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,28:0.568:49:12,0:9,28:0|1:155643196_T_TC:155643196:8,13,0,28
chr3	155643198	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=138,163;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=76.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,28:0.568:49:12,0:8,28:0|1:155643196_T_TC:155643196:8,13,0,28
chr3	155649472	.	T	TTAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=194,352;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.293:5:2,0:2,1:0|1:155649472_T_TTAA:155649472:4,0,1,0
chr3	155649492	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=195,352;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:155649472_T_TTAA:155649472:2,1,1,0
chr3	155649494	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=195,352;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:155649472_T_TTAA:155649472:2,1,1,0
chr3	155652860	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=172,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:9,2:3,2:7,5,2,2
chr3	155655279	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,314;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr3	155861240	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,2:4,0:4,6,0,2
chr3	156009614	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=127,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr3	156266642	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr3	156266880	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=253,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr3	156411797	.	G	GT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=211,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:9,2:17,1:23,4,2,1
chr3	156421525	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	156742775	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,5:1,4:0,1,0,9
chr3	156867776	.	G	GAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=A;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.182:14:7,2:5,0:3,9,0,2
chr3	156876605	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:7,0:11,3:18,0,3,0
chr3	157004323	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,3:2,3:4,3,4,2
chr3	157082082	.	C	CAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=209,305;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,0:2,1,2,0
chr3	157131650	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,85;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:5,5:10,0:12,3,5,0
chr3	157154768	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=131,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:8,6,0,2
chr3	157154861	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=210,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:8,2:10,3:6,12,2,3
chr3	157155623	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	157188045	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr3	157188378	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=214,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr3	157289936	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr3	157318257	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=186,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr3	157820423	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=197,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:0,1:1,5:1,0,7,0
chr3	157822821	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=C;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr3	158072602	.	GT	AA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,2:10,0:12,14,0,2
chr3	158072623	.	AT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.331:25:11,4:4,4:7,10,4,4
chr3	158178856	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:1,5,1,3
chr3	158254806	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=132,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:7,0,6,1
chr3	158310153	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=125,253;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr3	158314810	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,6:2,2:0,6,0,8
chr3	158318015	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr3	158364613	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=148,103;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:8,5:19,0:11,16,5,0
chr3	158367007	.	A	ACAACAGGTGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:158367007_A_ACAACAGGTGCT:158367007:0,1,0,1
chr3	158367011	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:158367007_A_ACAACAGGTGCT:158367007:0,2,0,1
chr3	158378836	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=165,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0,11,0,2
chr3	158384733	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=180,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr3	158384883	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:6,4:4,10:4,6,6,8
chr3	158384920	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=154,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,1:8,1:0,16,1,1
chr3	158387271	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,9:0.192:50:19,9:22,0:26,15,9,0
chr3	158387487	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=179,276;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr3	158399757	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.302:14:5,3:5,1:9,1,3,1
chr3	158409093	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=142,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:6,1:8,2:0|1:158409093_C_CA:158409093:12,3,1,2
chr3	158409106	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=142,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.155:24:10,1:11,2:0|1:158409093_C_CA:158409093:14,7,1,2
chr3	158409262	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=96,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:2,6,1,1
chr3	158415402	.	TAGA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=180,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,1:4,3:6,0,4,0
chr3	158415840	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=203,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr3	158428809	.	A	AAGGC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=185,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AGGC;STR;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr3	158523248	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=131,131;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.142:40:22,0:13,5:10,25,0,5
chr3	158526942	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=135,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,1:2,1:6,2,2,0
chr3	158526958	.	C	A,G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,10,17;MFRL=109,219,62;MMQ=60,60,60;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.59,3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,4:0.232,0.464:8:0,0,0:2,0,0:0,2,6,0
chr3	158531676	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,0:2,2:7,0,2,0
chr3	158537415	.	CTTTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=114,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,11;RU=T;STR;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.732:9:0,3:1,4:0|1:158537415_CTTTTT_C:158537415:2,0,6,1
chr3	158537443	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=88,145;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.648:15:2,4:2,5:0|1:158537415_CTTTTT_C:158537415:2,3,8,2
chr3	158539294	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=148,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:6,0,5,1
chr3	158539486	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=95,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:8,7:2,6:4,6,8,5
chr3	158539961	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=178,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:1,8:4,3:4,1,4,7
chr3	158970613	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=39.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.407:30:9,0:9,12:9,9,0,12
chr3	158980279	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr3	158991724	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr3	159482271	.	GGCA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=221,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCA;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:5,5,1,1
chr3	159609921	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=177,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:12,5,2,0
chr3	159609989	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=207,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,3:5,1:4,5,1,3
chr3	160073723	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr3	160075370	.	T	TAGTCCTTGCTTATTTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=177,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:2,8,1,1
chr3	160083969	.	GC	TG	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=175,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,1:7,1:2,12,0,2
chr3	160083978	.	CTTT	C	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=189,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,1:7,1:0|1:160083978_CTTT_C:160083978:2,12,0,2
chr3	160083982	.	AATT	A	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=26,24;MFRL=191,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATT;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,1:7,1:0|1:160083978_CTTT_C:160083978:2,13,0,2
chr3	160083988	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=28,33;MFRL=193,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,1:6,1:0|1:160083978_CTTT_C:160083978:2,12,0,2
chr3	160084034	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,32;MFRL=232,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:160084034_A_C:160084034:0,4,0,1
chr3	160084036	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=232,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:160084034_A_C:160084034:0,4,0,1
chr3	160084037	.	A	ATTCTTCT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,24;MFRL=232,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.297:5:3,1:1,0:0|1:160084034_A_C:160084034:0,4,0,1
chr3	160102249	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=169,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	160131236	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=145,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.333:12:6,2:1,2:6,2,3,1
chr3	160134208	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,15;MFRL=165,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.328:16:4,2:4,0:5,6,0,5
chr3	160141294	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:22,3:11,0:8,25,1,2
chr3	160141656	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.425:12:6,2:1,2:2,5,1,4
chr3	160142810	.	ATGTG	A,ATG	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=15,25,20;MFRL=151,129,140;MMQ=60,60,60;MPOS=21,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=TG;STR;TLOD=6.23,5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,3:0.221,0.257:13:1,1,2:2,1,0:0,7,1,5
chr3	160148756	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=187,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:5,0:11,3:10,6,2,1
chr3	160219837	.	CAT	C,CATAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30,33;MFRL=115,194,78;MMQ=60,60,60;MPOS=13,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=AT;STR;TLOD=4.40,4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.250,0.276:8:1,1,1:3,1,0:3,1,4,0
chr3	160227606	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=164,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:5,2:2,0:5,2,1,1
chr3	160249220	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,24,25,27;MFRL=143,130,187,136;MMQ=60,60,60,60;MPOS=7,12,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=A;STR;TLOD=10.18,10.61,7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,5,6,4:0.223,0.264,0.185:23:4,2,2,2:4,3,4,2:3,5,14,1
chr3	160395561	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,249;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:11,3:11,0:12,10,3,0
chr3	160474540	.	CGT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=GT;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.798:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	160679422	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	160679744	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr3	160939732	.	A	AATCCCAAC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=144,250;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATCCCAAC;STR;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.603:13:2,5:2,2:0|1:160939732_A_AATCCCAAC:160939732:5,0,7,1
chr3	160939746	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=144,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=30,13;RU=T;STR;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.624:14:3,3:2,4:0|1:160939732_A_AATCCCAAC:160939732:5,0,7,2
chr3	160939776	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=175,185;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.716:12:2,4:0,4:0|1:160939732_A_AATCCCAAC:160939732:3,0,5,4
chr3	160942727	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:7,5:7,0:10,4,5,0
chr3	160951094	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:1,0:1,2:2,0,3,0
chr3	160955879	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=228,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,1:7,0,4,3
chr3	160955882	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,32,23,32;MFRL=186,166,191,144;MMQ=60,60,60,60;MPOS=17,16,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=T;STR;TLOD=8.01,5.81,8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,4,3,3:0.277,0.239,0.279:12:2,3,0,1:0,0,2,2:2,0,7,3
chr3	160964271	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr3	160967354	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.514:27:7,7:6,6:8,5,4,10
chr3	161064193	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,4:3,3:0,3,0,7
chr3	161216912	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=176,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:10,3,2,0
chr3	164697082	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:8,0,3,0
chr3	164699998	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,5:4,3:4,5,6,2
chr3	164700734	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=194,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:4,0,2,2
chr3	164710040	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=120,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,1:4,3:7,3,1,3
chr3	164714296	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=96,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,3,1
chr3	164724567	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,1:4,5:3,2,3,3
chr3	164733721	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr3	164741534	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=204,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,1:7,5:6,6,3,3
chr3	164748687	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,28;MFRL=124,0;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.244:11:2,1:1,1:3,6,1,1
chr3	164755664	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=118,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,2:4,5:8,0,6,1
chr3	164758630	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=206,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr3	164766835	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=185,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr3	164772957	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=108,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:3,1,4,1
chr3	164776913	.	C	CAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,2:4,2:3,6,1,3
chr3	164777677	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:2,3:4,3:6,1,3,3
chr3	164781368	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=112,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,7:3,3:2,3,3,7
chr3	164785338	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr3	164786413	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=215,200;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr3	164786629	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=187,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,2:6,2:2,9,2,2
chr3	164793648	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,1:7,3:10,2,3,1
chr3	164905648	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=123,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:3,1:7,1,3,0
chr3	164908195	.	TTCTGAAGACATC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:6,0:3,10,1,1
chr3	166958643	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=178,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:0|1:166958643_C_T:166958643:5,10,1,1
chr3	166958646	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=178,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:5,2:0|1:166958643_C_T:166958643:5,10,1,1
chr3	166960278	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=119,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,7:2,3:3,1,7,3
chr3	167000256	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:7,1:8,10,1,1
chr3	167078544	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,5:3,5:6,3,5,5
chr3	167164352	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr3	167167100	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:4,2:9,4:7,6,4,2
chr3	167170829	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=171,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr3	167506967	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,1:8,3:9,9,1,3
chr3	167506996	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,0:8,3:5,14,3,0
chr3	167508062	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr3	167542351	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=163,100;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:3,9,0,2
chr3	167745703	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,3:7,2:0,10,0,5
chr3	167747543	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=141,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:12,5,1,1
chr3	167754573	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,3:2,5:2,1,8,0
chr3	167754852	.	A	ATCTATGAATGCC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr3	167761070	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=203,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	167762678	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33,34;MFRL=221,65,147;MMQ=60,60,60;MPOS=15,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=A;STR;TLOD=5.37,8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,4:0.229,0.429:9:0,1,2:3,1,2:1,2,4,2
chr3	167764820	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=125,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:11,6:2,1:4,9,6,1
chr3	168269756	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=169,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,3:6,2:3,10,2,3
chr3	168810980	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,263;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:0,5,0,6
chr3	168818560	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	168819788	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,8,3
chr3	168840571	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr3	168840607	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr3	169486144	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=172,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr3	169492016	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,3:3,0:8,0,3,0
chr3	169539926	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=177,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:0|1:169539926_AT_A:169539926:8,8,1,1
chr3	169539930	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=178,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:6,0:0|1:169539926_AT_A:169539926:8,9,1,1
chr3	169539932	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=177,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,1:6,0:0|1:169539926_AT_A:169539926:8,10,1,1
chr3	169540459	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=193,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:7,10,1,1
chr3	169550759	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=85,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,3:7,0:7,6,1,2
chr3	169550796	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=131,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:7,0:8,8:5,10,0,8
chr3	169637195	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,2:1,0:5,1,2,0
chr3	169644945	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=125,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,0:7,3:8,9,3,0
chr3	169654252	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:13,4:9,0:7,15,2,2
chr3	169710363	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=186,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,1:4,1:5,3,2,0
chr3	169803231	.	GGAA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=189,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr3	169815009	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=185,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,0:8,2:0|1:169815009_A_C:169815009:15,6,1,1
chr3	169815013	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=187,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:7,2:0|1:169815009_A_C:169815009:15,7,1,1
chr3	169847291	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=177,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:7,4:12,5:12,7,2,7
chr3	169988154	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:8,2,1,1
chr3	169988364	.	C	CTTTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,35;MFRL=224,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,24;RU=T;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.411:5:0,1:1,0:0,3,1,1
chr3	169991161	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=169,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:15,3:4,1:3,17,2,2
chr3	169999670	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,1:7,1:8,3,1,1
chr3	170016808	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=119,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,2:5,0:7,8,2,0
chr3	170078232	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=239,141;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,31:0.915:33:1,14:1,17:1,1,16,15
chr3	170079240	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=121,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:5,1:11,2:3,14,0,3
chr3	170099218	.	ATTAT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=115,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTAT;STR;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.625:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	170109112	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.549:7:2,0:0,3:1,2,0,4
chr3	170140974	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:9,6:9,0:13,6,6,0
chr3	170198967	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=115,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:6,3:2,3:3,5,5,1
chr3	170218862	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=188,93;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,2:6,6:5,8,5,3
chr3	170584074	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=209,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:2,1:6,0,2,0
chr3	170586057	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:2,3:8,5:5,5,6,2
chr3	170715878	.	AGG	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=145,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:19,2:13,0:16,16,0,2
chr3	170720299	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=196,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:2,1:1,1:6,0,3,0
chr3	170723276	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=171,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:2,4:6,0:0,9,0,4
chr3	170723664	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:9,0:0|1:170723664_A_G:170723664:10,4,2,0
chr3	170723668	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:4,2:10,0:0|1:170723664_A_G:170723664:10,4,2,0
chr3	170724883	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:4,0,3,3
chr3	170727739	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=186,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:3,2:1,3:3,2,2,3
chr3	170732300	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=143,67;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:3,4:9,1:12,0,3,2
chr3	170732599	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	170784283	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=203,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.291:11:3,0:5,0:4,4,3,0
chr3	170784423	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=127,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:4,4:10,0:7,7,0,4
chr3	170801912	.	TAAAAA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=164,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=19,14;RU=A;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,1:5,1:7,7,1,1
chr3	170825905	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr3	170825920	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=172,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,0:3,4:1,5,1,3
chr3	170844016	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=221,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.641:6:2,1:0,2:0,2,0,4
chr3	170846676	.	CAAA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=67,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=A;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.350:12:0,2:5,2:4,4,0,4
chr3	170857166	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=172,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:3,1:10,0,2,0
chr3	170857240	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=98,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.173:33:13,3:12,2:7,21,2,3
chr3	170885097	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=243,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr3	170893070	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=126,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.634:28:2,8:8,10:6,4,9,9
chr3	170906609	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.231:37:18,0:10,8:8,21,0,8
chr3	170912469	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=205,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,4:6,3:1,10,1,6
chr3	171405384	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,3:2,0:0,8,0,3
chr3	171405424	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	171452645	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=187,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,2:6,2:7,2,4,0
chr3	171969423	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=349,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr3	172003831	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=192,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:2,1:2,1:1,5,0,2
chr3	172046695	.	G	GTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=114,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.478:13:3,3:4,1:6,1,4,2
chr3	172046933	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:5,3:16,5:1,20,0,8
chr3	172052897	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,19;MFRL=104,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:0,0:7,2:3,4,0,5
chr3	172052903	.	T	TG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=179,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:13,2:0|1:172052903_T_TG:172052903:6,11,1,1
chr3	172052913	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=163,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:8,2:0|1:172052903_T_TG:172052903:2,10,1,1
chr3	172052916	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=147,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:8,2:0|1:172052903_T_TG:172052903:2,9,1,1
chr3	172058906	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,3:10,0:11,7,3,0
chr3	172059121	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=266,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr3	172064091	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:6,1,3,1
chr3	172065051	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,141;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,3:6,0:8,9,3,0
chr3	172224769	.	GC	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0|1:172224769_GC_G:172224769:0,0,0,11
chr3	172224771	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0|1:172224769_GC_G:172224769:0,0,0,11
chr3	172227199	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	172240999	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=103,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:3,3,2,4
chr3	172351917	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=191,274;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr3	172365619	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=166,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,5:5,6:8,2,10,1
chr3	172473194	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=156,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:7,1:4,10,1,1
chr3	172480173	.	A	ATT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=77.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,19:0.741:25:4,8:2,10:0|1:172480173_A_ATT:172480173:4,2,13,6
chr3	172480174	.	AC	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,19:0.741:25:4,8:2,11:0|1:172480173_A_ATT:172480173:4,2,13,6
chr3	172520818	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	172534428	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=223,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,6:3,4:5,2,7,3
chr3	172537850	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=293,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr3	172634039	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,10;MFRL=227,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:172634039_C_A:172634039:2,1,1,0
chr3	172634044	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=227,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:172634039_C_A:172634039:2,1,1,0
chr3	172634047	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=227,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:172634039_C_A:172634039:2,1,1,0
chr3	172634054	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,15;MFRL=197,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:172634039_C_A:172634039:2,2,1,0
chr3	174951631	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=239,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr3	174974177	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=179,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,3:8,0:13,4,1,2
chr3	175165201	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	175185060	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	175189406	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=47.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,4:0,9:0,0,9,4
chr3	175189417	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,4:1,11:0,1,9,6
chr3	175189447	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.870:21:0,7:2,12:1,1,11,8
chr3	175293752	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=223,264;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.596:5:0,2:1,1:1,1,3,0
chr3	175455116	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=153,278;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:10,4,1,1
chr3	176756048	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=198,138;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:11,0:9,8:10,11,0,8
chr3	176765253	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=104.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,33:0.971:33:0,12:0,21:0|1:176765253_G_A:176765253:0,0,22,11
chr3	176765269	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=110,227;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:16,2:23,0:0|1:176765253_G_A:176765253:21,18,1,1
chr3	178545952	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:9,4:6,3:10,5,3,4
chr3	178560693	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=204,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:2,14,0,2
chr3	178785549	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.714:26:2,7:5,12:1,6,4,15
chr3	178919397	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,15;MFRL=207,185;MMQ=58,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.664:7:0,0:1,1:0,2,0,5
chr3	178922274	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=231,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr3	178922430	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,0,4
chr3	178936082	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=184,111;MMQ=40,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.126:37:10,3:22,1:10,23,3,1
chr3	178936094	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=184,184;MMQ=60,21;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.367:36:9,0:14,13:11,12,1,12
chr3	178942431	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,3:6,3:9,0,6,0
chr3	178960607	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=175,212;MMQ=49,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr3	178960766	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,187;MMQ=40,50;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,1:9,1:5,18,0,2
chr3	178962491	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=222,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:2,1:0,5,0,2
chr3	178968660	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:12,2:6,1:7,11,0,3
chr3	178968888	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=112,100;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:8,0:7,8:5,10,0,8
chr3	178976591	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=206,140;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,4:4,0:6,0,3,1
chr3	178976777	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=181,145;MMQ=60,57;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:6,5:12,6:11,7,8,3
chr3	178976821	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=187,144;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:8,2:11,2:10,9,2,2
chr3	179051745	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=211,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:9,0:7,6:6,10,0,6
chr3	179085722	.	G	GTA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,337;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TA;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:1,0:5,1,1,1
chr3	179092989	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:11,6,1,1
chr3	179109735	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=160,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:8,0,3,0
chr3	179298584	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=247,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.461:9:4,4:1,0:3,2,2,2
chr3	179304255	.	GAAAAAAA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=213,0;MMQ=50,57;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=19,12;RU=A;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.408:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr3	179320386	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=G;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr3	179320401	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=171,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:5,0:6,3,2,0
chr3	179419003	.	G	GTGTCTGTGTGTGCCTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=217,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	179439357	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=193,74;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:8,0:12,4:11,9,1,3
chr3	179439466	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=193,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:0,4,0,6
chr3	179448066	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=75,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,4:1,2:2,0,1,5
chr3	179448383	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=242,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:1,5:0,8:0,1,8,5
chr3	179463076	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0|1:179463076_A_G:179463076:1,0,1,4
chr3	179463081	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0|1:179463076_A_G:179463076:1,0,0,4
chr3	179469995	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	179472674	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=185,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,6:3,2:1,2,2,6
chr3	179474767	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=204,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr3	179481955	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=79,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:9,3:5,0:7,8,1,2
chr3	179481971	.	CTG	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=99,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=TG;STR;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:0,2:0,2,0,6
chr3	179501993	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0,4,0,2
chr3	179527459	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,1:0,0,0,5
chr3	179592053	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	179592240	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,3:3,5:0,4,0,8
chr3	179593072	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=122,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,4:3,2:2,1,6,0
chr3	179593352	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	179597775	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=203,292665;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:10,3,2,0
chr3	179597979	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=191,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:1,7,0,4
chr3	180320897	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=198,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,4:6,1:6,3,4,1
chr3	180322080	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,89;MMQ=60,22;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.160:35:16,0:13,5:8,22,0,5
chr3	180322260	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=156,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.278:15:4,0:4,0:4,7,4,0
chr3	180334623	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,160;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,3:9,0:12,6,1,2
chr3	180372448	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=15,26;MFRL=215,234;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.334:6:0,1:0,1:0|1:180372448_C_A:180372448:4,0,2,0
chr3	180372451	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=21,15;MFRL=215,234;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.334:6:3,0:0,0:0|1:180372448_C_A:180372448:4,0,2,0
chr3	180372455	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=232,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.322:7:4,2:0,0:5,0,2,0
chr3	180372457	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=231,241;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:0,0:5,0,3,0
chr3	180372461	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,17;MFRL=207,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,0:1,0:3,1,3,0
chr3	180396974	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=239,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:8,0,2,0
chr3	180397129	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,141;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:10,0:12,5:11,11,0,5
chr3	180630565	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:17,3:14,0:9,22,2,1
chr3	180679235	.	CTT	C,CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32,33;MFRL=155,145,100;MMQ=60,60,60;MPOS=19,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=7.95,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,2:0.325,0.236:11:3,2,1:2,2,1:4,1,5,1
chr3	180687878	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=208,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,0:11,3:14,2,2,1
chr3	180693215	.	GTT	G,GT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=129,127,142;MMQ=60,60,60;MPOS=17,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.07,10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,8:0.136,0.313:28:7,1,7:8,3,1:8,8,4,8
chr3	181431226	.	GA	G,GAA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,33,34;MFRL=170,136,148;MMQ=60,60,60;MPOS=9,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.18,3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,4,3:0.140,0.137:26:10,2,1:8,2,2:11,8,5,2
chr3	182546017	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,4:0,13:0,0,6,11
chr3	182559753	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=222,76;MMQ=58,26;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr3	182575631	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,10:1,5:0,1,11,4
chr3	182576923	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,13,5
chr3	182590354	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr3	182598863	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=290,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,7:0,1:0,1,0,8
chr3	182681740	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=187,148;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,2:5,7:2,6,5,4
chr3	182681853	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=100,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,3:0,5:1,1,1,7
chr3	182698377	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=139,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	182735182	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	182735211	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=195,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr3	182804385	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=201,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr3	182810144	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,3:0,3:4,0,6,0
chr3	182810171	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=154,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,1:3,1:11,0,2,0
chr3	182817328	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr3	182858287	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=243,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,5:7,3:6,4,5,3
chr3	182858461	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=244,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:6,4:3,6:1,8,0,11
chr3	182870082	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr3	182880480	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=126,249;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,0:1,2:2,3,0,2
chr3	182913092	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:1,1:5,3:0,7,1,3
chr3	182933912	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=194,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:1,10,0,2
chr3	182946002	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr3	182947413	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=206,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:1,1,2,1
chr3	183013198	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=138,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,3:13,0:11,14,3,0
chr3	183015011	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=156,990;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:5,2:2,0:1,7,1,1
chr3	183040924	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=207,252;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,2:6,1:11,1,3,0
chr3	183432983	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,1:6,2:9,8,3,0
chr3	183490383	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=131,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr3	183491612	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=143,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:1,10,0,2
chr3	183521761	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr3	183528164	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=286,212;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr3	183528442	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=171,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,3:5,0:0,7,1,2
chr3	183535763	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=123,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,1:3,5:6,1,6,0
chr3	183558481	.	C	CT	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=135,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:12,1:2,3:11,11,3,4
chr3	183558497	.	C	CT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=173,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.421:16:1,0:4,4:1,8,0,7
chr3	183558517	.	A	ATT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=142,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:6,2:1,12,0,2
chr3	183560292	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr3	183663833	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr3	183665062	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:3,5:5,5:6,2,6,5
chr3	183677501	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=173,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:8,1:13,4,1,1
chr3	183679532	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=249,241;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:2,2:0,1:0,2,0,4
chr3	183682897	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,5:6,2:12,0,5,2
chr3	183689448	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=149,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,13:0.307:43:18,12:12,0:12,18,13,0
chr3	183699421	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,70;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr3	183700211	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:9,3:7,3:9,7,4,2
chr3	183754253	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=169,151;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:9,5:8,0:9,9,5,0
chr3	183754768	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=183,344;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0,8,0,2
chr3	183756426	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=114,139;MMQ=60,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.462:22:5,8:5,2:2,10,1,9
chr3	183756780	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,3:5,5:3,6,2,6
chr3	183756808	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:0,6,1,5
chr3	183773250	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=221,178;MMQ=46,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr3	183776469	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	183777210	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=101,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:4,0:3,3:5,3,3,0
chr3	183777895	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=205,189;MMQ=52,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,1:4,2:5,5,0,3
chr3	183777919	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=253,189;MMQ=52,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:3,3,2,3
chr3	183818416	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=199,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.541:18:5,5:3,3:2,6,2,8
chr3	183818511	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=98,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr3	183823863	.	G	GAAGA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGA;STR;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:4,3,3,3
chr3	183824013	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=158,228;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.333:12:6,1:1,0:2,6,4,0
chr3	183857809	.	CAAAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=97,334;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,11;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.290:5:1,0:0,1:2,2,1,0
chr3	183860907	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=167,89;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:16,2:11,1:15,12,3,0
chr3	183860989	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=194,267;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,1:9,1:1,16,0,2
chr3	183884550	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=217,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,3:3,4:4,6,2,5
chr3	183885529	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=191,205;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,0:2,0:0|1:183885529_T_G:183885529:5,1,0,2
chr3	183885533	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=191,205;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:183885529_T_G:183885529:5,1,0,2
chr3	183885937	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=214,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	183888514	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.216:35:13,0:15,7:13,15,0,7
chr3	183896641	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=218,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=65.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.809:24:2,10:2,10:2,2,14,6
chr3	183900680	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:10,3:2,3:3,9,2,4
chr3	183900729	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=179,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,5:1,4:0,4,0,9
chr3	183903937	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=318,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr3	183904226	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=209,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.199:23:6,1:13,3:0|1:183904226_C_T:183904226:9,10,2,2
chr3	183904232	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=368,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,17:0.693:24:0,7:5,9:0|1:183904226_C_T:183904226:0,7,11,6
chr3	183904520	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:1,3:3,0:2,4,1,2
chr3	183905103	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:7,1,2,0
chr3	183906515	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=246,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.811:19:1,6:2,10:0,3,10,6
chr3	183909143	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=247,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,0,3
chr3	183955231	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=159,98;MMQ=60,48;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:183955231_T_C:183955231:1,3,0,1
chr3	183955234	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=159,98;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:183955231_T_C:183955231:1,3,0,1
chr3	183955238	.	A	ATCTCTGT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=149,98;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:183955231_T_C:183955231:0,2,0,1
chr3	183955240	.	G	GAGTCCTAGGAGATAGTAGAGAAGC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=149,98;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:183955231_T_C:183955231:0,2,0,1
chr3	183961337	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.229:33:13,7:12,0:16,10,7,0
chr3	183994536	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=183,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:1,4,1,3
chr3	183995341	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=207,334;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr3	183995854	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=158,271;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:9,3:3,4:6,6,2,5
chr3	183996213	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=90,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:1,2,2,1
chr3	184003194	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:6,0,4,0
chr3	184005825	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=240,151;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:184005825_G_A:184005825:0,3,0,1
chr3	184005827	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=240,151;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:184005825_G_A:184005825:0,3,0,1
chr3	184005836	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=228,151;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:184005825_G_A:184005825:0,2,0,1
chr3	184020100	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=41.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,6:1,6:3,0,11,1
chr3	184025069	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr3	184025732	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:13,2:3,0:8,8,2,0
chr3	184038969	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=187,263;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:7,2:4,0:10,3,2,0
chr3	184045799	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=324,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr3	184049442	.	G	GAGATTTGGACCGCTTTGAGGCCTAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=169,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.305:4:3,0:0,1:1,2,0,1
chr3	184064916	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=162,315;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr3	184070675	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:4,3,2,5
chr3	184075218	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=202,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:9,2:3,0:10,2,1,1
chr3	184076037	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=130,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.137:26:13,3:10,0:12,11,1,2
chr3	184090242	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=106,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:19,1:8,2:26,1,3,0
chr3	184090266	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:8,14:4,4:10,2,13,5
chr3	184094183	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr3	184098647	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	184100574	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=197,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.267:17:3,4:7,0:7,6,1,3
chr3	184100611	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=201,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:8,3:11,0:9,12,0,3
chr3	184100961	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=195,245;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr3	184102579	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,0,2
chr3	184105889	.	GA	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=296,193;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,0:1,8:0,3,0,8
chr3	184106757	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=197,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,0:3,2:0|1:184106757_GT_G:184106757:3,6,1,1
chr3	184106763	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=197,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:6,0:3,1:0|1:184106757_GT_G:184106757:3,6,1,1
chr3	184289152	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,8:4,2:3,4,5,5
chr3	184297166	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=183,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:7,5:1,0:7,1,5,0
chr3	184429133	.	A	ATCC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=221,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TCC;STR;TLOD=50.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.875:13:0,5:1,4:0,1,4,8
chr3	184557636	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=224,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr3	184587434	.	AAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=199,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:3,2:3,0:0,6,1,1
chr3	184616504	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=131,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:0,4,0,7
chr3	184642587	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=104,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.686:7:2,3:0,2:1,1,5,0
chr3	184654166	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr3	184658058	.	T	TTA,TTATA,TTATATA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30,30,29;MFRL=197,112,145,178;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,24,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=9,10,11,12;RU=TA;STR;TLOD=7.36,16.83,9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,3,6,4:0.212,0.410,0.286:14:1,2,5,2:0,1,0,0:1,0,1,12
chr3	184675359	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,5:0,10:0,0,4,12
chr3	184682214	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	184700418	.	C	CCCCGCCTTTTTTTTTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=154,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:12,2:8,0:8,12,0,2
chr3	184717703	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	185155430	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=147,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr3	185169030	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr3	185212593	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=165,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,1:7,1:0,9,0,2
chr3	185226492	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,4:3,5:4,0,9,0
chr3	185232169	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=172,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr3	185234895	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:6,3:5,2:4,8,0,5
chr3	185252918	.	C	CTTTTCTTTCTTTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=102,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	185252919	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	185308069	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,1,3
chr3	185330304	.	TTGA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=346,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr3	185337185	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:8,3,2,0
chr3	185339575	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=196,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,6:2,0:3,1,5,1
chr3	185341970	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=347,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:1,3:1,1:0,2,0,6
chr3	185347459	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=228,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr3	185766711	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=97,276;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,1,1
chr3	185782260	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=115,127;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:17,0:9,7:7,19,0,7
chr3	185879296	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr3	185882643	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:2,0,5,1
chr3	185906246	.	CGTGT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=GT;STR;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.849:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	185960192	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	185960414	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr3	185982972	.	TC	CC,CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33,14;MFRL=203,181,171;MMQ=60,60,60;MPOS=14,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.56,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,1:0.445,0.222:6:1,2,0:1,1,0:1,1,4,0
chr3	185993415	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=201,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,2:9,1:13,8,3,0
chr3	186006618	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,256;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,3:6,2:9,4,1,4
chr3	186015283	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=70,149;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.657:12:2,7:1,1:2,2,5,3
chr3	186015303	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.654:9:2,5:0,1:2,1,3,3
chr3	186015315	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=227,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:0,2,0,5
chr3	186262054	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=183,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.386:19:2,4:8,3:5,7,3,4
chr3	186276393	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=13455301,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,3:1,6:0,2,1,8
chr3	186293820	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr3	186295417	.	AT	A,ATT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,29,17;MFRL=167,183,190;MMQ=60,60,60;MPOS=16,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=9.98,10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,6,6:0.258,0.302:21:1,2,1:6,4,1:6,3,9,3
chr3	186295674	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=188,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,0:6,3:0,10,0,3
chr3	186302391	.	A	AGTGTGTGTGT,AGTGTGTGTGTGT,ATTGTGTGTGTGT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,20,24,26;MFRL=0,125,73,131;MMQ=60,40,60,60;MPOS=10,24,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=6.88,3.01,16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,3,2,6:0.442,0.303,0.212:11:0,0,1,1:0,2,1,3:0,0,1,10
chr3	186302412	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=155,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,0:3,3:3,11,0,3
chr3	186337827	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,252;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr3	186338540	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=188,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,1:8,2:9,10,1,2
chr3	186384015	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=179,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,3:8,1:3,11,1,3
chr3	186386664	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	186395231	.	GCATCCCCATGGACACCACCCCCATGGACACCATCCTCATGGACACCACCCCCATGGACAC	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,12;MFRL=157,65;MMQ=60,31;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.156:43:4,0:6,2:11,25,1,6
chr3	186435583	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,1:0,1:0,3,0,2
chr3	186438037	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=73,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:4,0:4,3:3,5,1,2
chr3	186442833	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,1:2,5:2,0,5,1
chr3	186456969	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=108,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:8,5,1,1
chr3	186459227	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,3,0
chr3	186501502	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,25:0.649:38:3,13:10,11:3,10,5,20
chr3	186502665	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=190,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,1:6,2:12,1,2,1
chr3	186504148	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=197,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:6,6,2,0
chr3	186505706	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=173,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:10,3:7,2:2,17,1,4
chr3	186507922	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=168,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,13:0.412:32:7,8:12,5:0|1:186507922_C_T:186507922:11,8,5,8
chr3	186507928	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:18,9:0.345:27:8,4:10,5:1|0:186507922_C_T:186507922:9,9,7,2
chr3	186518806	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=208,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,0:6,0,2,0
chr3	186571123	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,2:1,4:0,5,0,6
chr3	186938897	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=140,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,2:16,0:12,14,2,0
chr3	186938956	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=189,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:6,4:8,2:1,13,1,5
chr3	186953932	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,257;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:6,5,1,1
chr3	186961478	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	186965268	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=211,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	186967942	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=228,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,1,1
chr3	186967952	.	C	CTCAGCCTCCCAAGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:3,0,0,1
chr3	187009351	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=141,269;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,2:12,0:15,10,1,1
chr3	187387107	.	TGG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=160,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:1,0:1,1:0|1:187387107_TGG_T:187387107:0,2,0,1
chr3	187387112	.	AGGAC	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=160,96;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:1,1:0|1:187387107_TGG_T:187387107:0,2,0,1
chr3	187387119	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=172,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:187387107_TGG_T:187387107:0,1,0,1
chr3	187387122	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=172,96;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:187387107_TGG_T:187387107:0,1,0,1
chr3	187387126	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=172,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:187387107_TGG_T:187387107:0,1,0,1
chr3	187387896	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=239,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:4,4:0,4:2,2,4,4
chr3	187416253	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,0:5,4:8,1,3,1
chr3	187419661	.	G	GCCTGCC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.535:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr3	187419728	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:4,4,3,2
chr3	187444656	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=155,234;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,1:13,1:10,15,1,1
chr3	187446191	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=159,65;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,2:10,1:12,7,1,2
chr3	187446211	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.638:23:3,3:5,11:4,4,8,7
chr3	188123819	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=174,254;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr3	188202550	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=87.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0|1:188202550_A_T:188202550:0,0,1,20
chr3	188202582	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=86.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0|1:188202550_A_T:188202550:0,0,0,20
chr3	188425999	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=243,259;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,7:1,0:5,0,7,0
chr3	188426021	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=253,259;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:12,0,2,0
chr3	188426256	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=209,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,1:3,2:0,7,0,3
chr3	188590358	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr3	188592160	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,2:10,0:13,7,2,0
chr3	188933213	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,5:3,2:1,4,1,6
chr3	189028117	.	AT	A,ATT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30,28;MFRL=141,148,155;MMQ=60,60,60;MPOS=2,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=8.27,14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,8:0.298,0.447:17:1,3,4:3,2,4:3,1,13,0
chr3	189038648	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr3	189349247	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:3,6:2,4:3,2,8,2
chr3	189507518	.	C	CAGAG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=210,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,3:7,2:9,0,4,1
chr3	189547652	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=154,230;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,3:4,0:11,0,3,0
chr3	189547697	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=141,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:19,1:8,2:14,13,2,1
chr3	189582249	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=142,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr3	189584420	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.267:27:10,6:10,0:16,4,7,0
chr3	189587091	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:13,7:8,4:14,7,8,3
chr3	189587274	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=216,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr3	189590824	.	GG	CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=108,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.629:16:4,5:2,5:2,4,4,6
chr3	189604149	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,4:2,4:4,0,7,1
chr3	189604160	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,5:1,7:3,0,11,1
chr3	189607152	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,210;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.263:21:7,0:7,5:12,4,2,3
chr3	189688569	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.731:24:3,10:3,8:1,5,12,6
chr3	189690816	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=129,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.603:6:0,1:1,1:0,2,1,3
chr3	189690861	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr3	189692565	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=219,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr3	189702395	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=214,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,5:1,5:1,1,3,7
chr3	189705337	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=122,61;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.132:21:11,0:6,2:9,10,0,2
chr3	189712089	.	GG	AA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=203,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:2,7:1,9:0,3,4,12
chr3	189712094	.	A	AAAAC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=168,149;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AAAC;STR;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.300:11:3,2:5,1:0,8,0,3
chr3	189837993	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:3,5:0,7:3,0,11,2
chr3	189838018	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=171,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.427:21:4,5:8,4:7,5,5,4
chr3	190030726	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:15,0:9,6:11,13,0,6
chr3	190106071	.	AG	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=138,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:8,1:7,3:0|1:190106071_AG_A:190106071:12,6,2,2
chr3	190106074	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=138,199;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:11,1:7,2:0|1:190106071_AG_A:190106071:12,6,2,2
chr3	190106242	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,0:6,5:4,8,2,3
chr3	190106332	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=191,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr3	190167647	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,6:3,2:2,4,3,5
chr3	190282197	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:0,2,1,5
chr3	190322271	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:0|1:190322271_T_C:190322271:0,2,0,7
chr3	190322277	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:0|1:190322271_T_C:190322271:0,2,0,7
chr3	190341241	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=73,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,4:0,4:1,1,2,6
chr3	190341292	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr3	190345043	.	TTTTTG	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=132,115;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTTG;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr3	190345098	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=103,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.837:18:2,7:1,7:2,1,6,9
chr3	190347391	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	190362220	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=186,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr3	190363588	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.212:31:10,0:14,6:0|1:190363588_A_C:190363588:13,12,0,6
chr3	190363590	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.212:31:11,0:12,6:0|1:190363588_A_C:190363588:13,12,0,6
chr3	190363594	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=122,174;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:8,4:13,4:7,14,4,4
chr3	190573263	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=190,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:5,0:6,2:0|1:190573263_G_A:190573263:7,5,1,1
chr3	190573267	.	C	CATTTTGCTCCTAGACATCATA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=190,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:190573263_G_A:190573263:7,5,1,1
chr3	190573594	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=132,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,0:6,2:9,10,1,1
chr3	190967718	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr3	190967778	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=146,57;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:4,2,2,0
chr3	190967779	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:2,3:1,1:1,2,4,0
chr3	190986110	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,6:0,7:1,0,10,4
chr3	190995847	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=196,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.741:25:4,11:2,8:3,3,13,6
chr3	190999790	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=251,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr3	190999872	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=206,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:4,8:5,9:5,4,11,6
chr3	190999990	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:0,5:5,7:1,4,6,6
chr3	191074796	.	TAA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=131,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr3	191075012	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr3	191093384	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=179,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,5:3,5:3,5,5,5
chr3	191093434	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=217,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:3,4:3,8:0,6,0,12
chr3	191093475	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=183,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:1,2:11,1:0,12,0,3
chr3	191097908	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:2,0,5,1
chr3	191097928	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.488:16:6,5:1,2:7,1,7,1
chr3	191097966	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=183,132;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,25:0.785:31:5,12:1,8:1,5,16,9
chr3	191098121	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,3:3,5:1,4,1,7
chr3	191098731	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=232,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:3,5:3,9:3,3,3,11
chr3	191100448	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=203,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,6:0,4:1,0,10,0
chr3	191107192	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:8,0,4,0
chr3	191109465	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=150,150;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=46.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.463:39:7,17:14,0:18,3,18,0
chr3	192053274	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:3,1:6,3:2,7,2,3
chr3	192444899	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=140,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.309:20:7,2:7,3:10,4,3,3
chr3	192635348	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr3	193016895	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,15,4
chr3	193023255	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=205,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:2,2,5,0
chr3	193023361	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=150,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:9,3:5,0:8,6,2,1
chr3	193044923	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr3	193062906	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,3,8
chr3	193068800	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	193080414	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,1:8,2:5,6,2,1
chr3	193081830	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr3	193081864	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=163,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,1:2,7:3,0,7,1
chr3	193081866	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=188,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:1,0:7,2:7,1,2,0
chr3	193151703	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=151,391;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:193151703_T_TG:193151703:5,9,2,0
chr3	193151704	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=151,391;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:193151703_T_TG:193151703:5,9,2,0
chr3	193153562	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,2:0,11:0,0,2,11
chr3	193153611	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:193153611_AG_A:193153611:0,5,0,2
chr3	193153616	.	AGG	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:193153611_AG_A:193153611:0,5,0,2
chr3	193153625	.	A	AAAAAAAAGAAAACAAAAAAC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:193153625_A_AAAAAAAAGAAAACAAAAAAC:193153625:0,4,0,1
chr3	193153629	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:193153625_A_AAAAAAAAGAAAACAAAAAAC:193153625:0,4,0,1
chr3	193180510	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:4,2,5,0
chr3	193180661	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr3	193180732	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr3	193185128	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=195,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:11,5:7,3:10,8,6,2
chr3	193209018	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=193,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:3,2:0,2:3,0,5,0
chr3	193209281	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=221,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:193209281_T_G:193209281:0,1,0,1
chr3	193209284	.	T	TTGGTTGTTTGCTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=221,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0|1:193209281_T_G:193209281:0,1,0,1
chr3	193210596	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=234,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr3	193220219	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=170,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr3	193272442	.	CGTGTGTGTGT	C,CGTGT,CGTGTGTGT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32,34,8;MFRL=0,144,154,0;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,25,6;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,12,14,16;RU=GT;STR;TLOD=3.04,6.18,6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,1,3,3:0.185,0.358,0.377:7:0,0,2,1:0,1,1,0:0,0,5,2
chr3	193272703	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=212,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr3	193332420	.	C	CTGTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=183,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=TG;STR;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr3	193365974	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=197,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,2:4,0:0,10,1,1
chr3	193386239	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=0;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:12,2:7,1:9,10,2,1
chr3	193854148	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=25,25,25,25;MFRL=155,199,162,168;MMQ=60,60,60,60;MPOS=9,14,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=13.32,10.83,9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,9,7,8:0.204,0.244,0.321:29:2,4,2,3:1,4,2,2:3,2,16,8
chr3	193854245	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.108:53:26,5:22,0:18,30,0,5
chr3	193854283	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.162:35:18,5:10,0:7,23,0,5
chr3	193856061	.	C	CCCACTTTCACCTGAACGGTGATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=284,228;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	194061906	.	TG	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,3:2,7:2,2,4,6
chr3	194079943	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,242;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	194084001	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=174,79;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:0,0:5,2:5,0,2,0
chr3	194084153	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:5,7,1,1
chr3	194165532	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=144,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:19,0:17,3:17,19,3,0
chr3	194168500	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,236;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:8,0,5,0
chr3	194176712	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,1:9,2:3,11,1,2
chr3	194180743	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:1,8,0,2
chr3	194324982	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,4:11,0:12,8,2,2
chr3	194325006	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.291:29:9,4:11,4:9,12,4,4
chr3	194325010	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.205:27:7,5:15,0:11,11,2,3
chr3	194346544	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:194346544_T_A:194346544:0,0,1,0
chr3	194346553	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:194346544_T_A:194346544:0,0,1,0
chr3	194346803	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=165,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,3:1,8:0,2,0,11
chr3	194349027	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=206,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr3	194353772	.	C	CCCGCCCGACAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCGCCCGACAG;STR;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	194354032	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	194362721	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr3	194371801	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=172,0;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,1:7,0:0|1:194371801_G_T:194371801:7,13,0,2
chr3	194371810	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=170,0;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:0|1:194371801_G_T:194371801:9,13,0,2
chr3	194373832	.	TG	CA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,12,13
chr3	194379596	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr3	194379646	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,7:1,5:1,0,6,6
chr3	194379905	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=32.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr3	194379959	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr3	194380687	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	194386881	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr3	194387300	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,1,20
chr3	194390713	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,10,7
chr3	194390869	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=60.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,6,15
chr3	194408704	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	194409257	.	T	TA,TAAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,25,28;MFRL=177,179,153;MMQ=60,60,60;MPOS=23,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,18;RU=A;STR;TLOD=12.79,4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,8,3:0.451,0.191:18:3,2,0:4,5,2:4,3,5,6
chr3	194409729	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=171,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:1,7,0,2
chr3	194409809	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=252,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:194409809_G_T:194409809:0,2,0,1
chr3	194409813	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=278,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:194409809_G_T:194409809:0,1,0,1
chr3	194409815	.	GACCC	G,GGTACCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30,32;MFRL=0,278,188;MMQ=60,60,60;MPOS=4,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr3	194409816	.	A	ATTTTTATTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:194409809_G_T:194409809:0,0,0,1
chr3	194790641	.	C	CATAGTTACAGGAGTGCCTATTCCA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=94,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,2:5,0:2,8,1,1
chr3	194877355	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:2,6,1,2
chr3	194991220	.	AA	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	194999996	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr3	195022627	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=219,255;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,0,2
chr3	195022917	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,3:9,0:6,10,0,3
chr3	195053916	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=186,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr3	195065978	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:16,2:10,4:15,11,3,3
chr3	195102590	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,2:6,1:21,0,3,0
chr3	195102787	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:6,2:3,2:2,8,0,4
chr3	195245771	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=184,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:1,2:8,2:7,2,4,0
chr3	195245805	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:9,4:8,6:10,7,6,4
chr3	195295704	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:1,3:5,0,2,1
chr3	195295708	.	G	GGGT,GGGGT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,32,35;MFRL=242,161,122;MMQ=60,60,60;MPOS=4,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.05,7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,4:0.371,0.460:8:1,0,3:0,3,1:1,0,6,1
chr3	195300676	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr3	195300740	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=158,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:9,1:0,15,1,1
chr3	195447795	.	CCCT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:0|1:195447795_CCCT_C:195447795:4,2,3,0
chr3	195447805	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=175,142;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.253:10:5,1:2,1:1|0:195447795_CCCT_C:195447795:6,2,2,0
chr3	195452951	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=153,150;MMQ=51,59;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,3:2,5:3,5,2,6
chr3	195453017	.	GC	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=158,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:6,0:11,3:8,10,1,2
chr3	195456478	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:4,2,2,0
chr3	195456638	.	AGT	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=216,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:195456638_AGT_A:195456638:1,5,1,1
chr3	195456642	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=216,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:195456638_AGT_A:195456638:1,5,1,1
chr3	195456644	.	G	GATCA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=216,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:195456638_AGT_A:195456638:1,5,1,1
chr3	195456708	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=175,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr3	195475989	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=204,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr3	195477713	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=153,173;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.819:9:0,5:0,2:0|1:195477713_G_A:195477713:1,0,8,0
chr3	195477715	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=153,173;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.822:9:0,5:1,3:0|1:195477713_G_A:195477713:1,0,8,0
chr3	195478012	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,9:0,3:0,0,10,2
chr3	195479226	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=177,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:2,0:2,3:4,1,4,0
chr3	195479256	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=208,162;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.871:13:0,5:1,6:1,0,5,7
chr3	195484244	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,6,7
chr3	195485949	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=159,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:195485949_C_T:195485949:4,0,1,0
chr3	195485952	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=159,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:195485949_C_T:195485949:4,0,1,0
chr3	195485953	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:195485953_T_C:195485953:4,0,1,0
chr3	195485954	.	A	AACC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,15;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:195485953_T_C:195485953:4,0,1,0
chr3	195487737	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.290:19:5,2:7,3:6,8,3,2
chr3	195489669	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=152,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr3	195490284	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr3	195490838	.	ATCC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,10;MFRL=199,170;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:2,1,1,0
chr3	195492027	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr3	195501258	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=252,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.662:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr3	195505072	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=391,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:0|1:195505072_C_T:195505072:2,0,6,0
chr3	195505091	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0|1:195505072_C_T:195505072:0,0,7,0
chr3	195505251	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=110,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,2:14,0:0|1:195505251_G_A:195505251:17,12,1,1
chr3	195505254	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=111,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:11,2:14,0:0|1:195505251_G_A:195505251:16,12,1,1
chr3	195505417	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=297,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:2,2,1,4
chr3	195506037	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=71,101;MMQ=48,52;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:0,6:3,3:2,1,5,5
chr3	195506415	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=123,56;MMQ=33,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:3,1:4,0:0|1:195506415_A_T:195506415:6,2,2,1
chr3	195506420	.	T	TGGTAGC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=123,80;MMQ=33,38;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:2,0:0|1:195506415_A_T:195506415:6,2,2,0
chr3	195507166	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=164,96;MMQ=29,30;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.750:26:1,13:5,6:4,2,11,9
chr3	195507226	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=17,31;MFRL=73,115;MMQ=46,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.428:15:2,6:1,2:4,3,7,1
chr3	195508336	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=105,80;MMQ=52,49;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.187:35:14,0:14,6:15,14,3,3
chr3	195508402	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=108,0;MMQ=60,29;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:13,0:11,3:16,8,1,2
chr3	195511142	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=177,118;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.296:32:12,5:9,4:16,7,5,4
chr3	195512245	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=129,179;MMQ=50,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.888:16:0,7:1,6:0,1,5,10
chr3	195512933	.	AGGTGGTGTCACCTGTGGATGCTGAGGAAGCGTCGGTGACAGGAAGAGGGGTGGTGTCACCTGTGGATGCTGAGGAAGGGCTGGTGACAGGAAGAGGGATGGCCTGACCTGTGGATGCCGAGGAAACGTCGGTGACAGGAAGACG	A	.	.	DP=147;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=123,98;MMQ=59,58;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:133,14:0.024:147:25,5:12,5:76,57,9,5
chr3	195513102	.	A	G	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=90,130;MMQ=60,49;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,28:0.351:77:30,15:19,10:23,26,12,16
chr3	195513146	.	C	CTGAGAGAGACGGTTCTGCGCA	.	.	DP=61;ECNT=6;MBQ=33,36;MFRL=121,1484;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,5:0.112:50:28,0:15,4:0|1:195513146_C_CTGAGAGAGACGGTTCTGCGCA:195513146:22,23,0,5
chr3	195513153	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=123,1484;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,5:0.109:53:30,0:16,5:0|1:195513146_C_CTGAGAGAGACGGTTCTGCGCA:195513146:24,24,0,5
chr3	195513157	.	T	G	.	.	DP=52;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=121,1484;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,5:0.111:52:22,0:14,4:0|1:195513146_C_CTGAGAGAGACGGTTCTGCGCA:195513146:23,24,0,5
chr3	195513173	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=124,81;MMQ=60,57;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,6:0.178:37:18,2:10,4:0|1:195513173_G_A:195513173:17,14,2,4
chr3	195513180	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=124,91;MMQ=60,50;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.116:32:17,1:8,1:0|1:195513173_G_A:195513173:16,13,0,3
chr3	195513207	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=128,86;MMQ=60,48;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.221:28:14,1:8,3:17,5,3,3
chr3	195513364	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=119,152;MMQ=39,29;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,10:0.214:48:10,7:23,0:0|1:195513364_C_T:195513364:12,26,7,3
chr3	195513383	.	T	A	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=117,157;MMQ=43,33;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,9:0.167:56:20,5:20,2:0|1:195513364_C_T:195513364:10,37,6,3
chr3	195513398	.	CGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCGTGACCGGTGGATGCTGAGGAAGTGCT	C	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=104,125;MMQ=46,40;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.166:43:19,1:2,2:15,24,1,3
chr3	195515190	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,92;MMQ=37,39;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:2,3:7,2:5,4,4,1
chr3	195515437	.	TGACC	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=161,247;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:13,2:2,0:0|1:195515437_TGACC_T:195515437:12,5,2,0
chr3	195515443	.	GTGGATA	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=162,247;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,1:2,0:0|1:195515437_TGACC_T:195515437:14,7,2,0
chr3	195515454	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=150,247;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:16,2:6,0:0|1:195515437_TGACC_T:195515437:15,7,2,0
chr3	195515566	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=136,141;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:17,0:9,2:0|1:195515566_G_A:195515566:15,12,1,1
chr3	195515568	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=154,121;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:8,9:6,5:7,7,9,5
chr3	195515572	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=132,141;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:17,0:8,2:0|1:195515566_G_A:195515566:14,13,1,1
chr3	195515582	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:17,0:10,2:0|1:195515566_G_A:195515566:15,13,0,2
chr3	195515594	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,31:0.889:34:2,18:1,13:2,1,13,18
chr3	195515617	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=106,124;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.945:34:0,21:1,11:0,1,11,22
chr3	195517124	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=145,181;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,2:7,1:6,12,1,2
chr3	195518112	.	T	TGTCTCCTGCGTAACA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,5:0,3:0,1,6,5
chr3	195538501	.	TTC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=166,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TC;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:3,2:4,2,2,0
chr3	195593904	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=170,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:8,1,2,0
chr3	195596501	.	T	TAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=193,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AG;STR;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.609:11:2,4:2,3:0,4,1,6
chr3	195596907	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:5,0,4,0
chr3	195599085	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=186,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:1,6:3,2:4,1,7,1
chr3	195778996	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=153,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:4,3:10,0:7,7,2,1
chr3	195782176	.	CA	TG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:6,3:9,4:0|1:195782176_CA_TG:195782176:7,8,4,3
chr3	195782184	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.364:20:4,3:8,2:0|1:195782176_CA_TG:195782176:6,7,4,3
chr3	195785328	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:6,2:6,1:8,5,2,1
chr3	195789376	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=192,187;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,0:5,3:6,0,3,0
chr3	195789414	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:2,3:8,4:5,5,6,1
chr3	195789428	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:0,8:1,10:1,0,11,8
chr3	195789708	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,6:2,2:3,1,5,3
chr3	195792288	.	CGGG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=G;STR;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:195792288_CGGG_C:195792288:0,0,6,0
chr3	195792301	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=12,26;MFRL=70,101;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.839:7:0,3:0,3:0|1:195792288_CGGG_C:195792288:0,1,6,0
chr3	195792485	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=264,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:1,3:0,5,0,3
chr3	195798258	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=255,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:4,4:0,4:4,0,6,2
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chr3	195804021	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,4:2,1:3,5,1,4
chr3	195925103	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=109,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr3	195925216	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,3:7,0:4,9,0,3
chr3	195936446	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=191,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:1,4,0,4
chr3	195937410	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	195937659	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=149,251;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:1,2,0,5
chr3	195937678	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=253,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0,6,0,2
chr3	195943475	.	G	GGCCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,37;MFRL=209,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:195943475_G_GGCCC:195943475:1,0,1,0
chr3	195943482	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=198,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:1,0:0|1:195943475_G_GGCCC:195943475:2,1,1,0
chr3	195943486	.	CGG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=198,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:195943475_G_GGCCC:195943475:1,2,1,0
chr3	195953775	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,4:5,4:5,2,7,1
chr3	195954078	.	C	CCGTCACTTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=135,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr3	195956726	.	AAGAG	A,AAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31,32;MFRL=181,181,207;MMQ=60,60,60;MPOS=19,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=AG;STR;TLOD=5.48,5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.272,0.365:6:1,1,1:1,1,1:2,0,4,0
chr3	195959215	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=184,76;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:8,4,2,0
chr3	195959416	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=202,68;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:2,8,0,2
chr3	195959859	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=168,3841485;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr3	195959924	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:0,2:3,2:2,2,2,2
chr3	195974170	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=200,239;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:8,0,2,0
chr3	195974181	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=200,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:8,0,2,0
chr3	195984575	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:1,9:3,0:4,0,10,0
chr3	196044894	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,4:4,3:8,3,3,4
chr3	196044943	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=163,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:5,6,0,2
chr3	196051403	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=219,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,5:2,6:0,2,3,8
chr3	196054488	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=192,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,4:3,3:2,2,2,5
chr3	196088809	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=183,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.471:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr3	196096451	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=202,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr3	196118621	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=115,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr3	196199070	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:8,2:13,0:12,9,2,0
chr3	196210590	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=208,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,2,1
chr3	196210808	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=202,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:0,3,0,7
chr3	196215451	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=110,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,2:3,6:5,0,6,2
chr3	196215660	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=190,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:2,4:0,2,1,3
chr3	196281379	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,130;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:18,0:15,5:19,14,0,5
chr3	196434364	.	AGTCTG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=127,306;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr3	196532154	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:8,3:1,0:7,2,3,0
chr3	196554020	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=103,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:5,1,4,4
chr3	196554266	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=192,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:1,1,0,3
chr3	196612193	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:11,0:5,4:8,9,2,2
chr3	196613245	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:4,5:10,0:0|1:196613245_G_T:196613245:8,6,5,0
chr3	196613249	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=175,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:4,5:11,0:0|1:196613245_G_T:196613245:9,6,5,0
chr3	196627335	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=213,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:0,8,0,5
chr3	196627356	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=213,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,1:2,2:0|1:196627356_C_T:196627356:0,6,0,4
chr3	196627361	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=213,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0|1:196627356_C_T:196627356:0,6,0,4
chr3	196656501	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=144,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,0:12,3:15,6,1,2
chr3	196657670	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=209,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.525:23:5,4:6,8:4,7,6,6
chr3	196666059	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=158,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:5,2,2,0
chr3	196674259	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,2:7,0:7,7,1,1
chr3	196675384	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=171,30;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:12,0:3,2:0|1:196675384_C_T:196675384:8,7,1,1
chr3	196675387	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=176,30;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:3,2:0|1:196675384_C_T:196675384:8,6,1,1
chr3	196678838	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=123,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:11,1:11,2:9,13,1,2
chr3	196733371	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=221,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr3	196742395	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,6:3,2:3,6,4,4
chr3	196749798	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=208,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:0,5:1,6:1,0,8,4
chr3	196750016	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	196778438	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=127,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,1:4,1:4,5,0,2
chr3	196803647	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=167,235;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr3	196846437	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,3:6,7:2,9,1,9
chr3	196869518	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=115,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,2:9,0:10,3,1,1
chr3	196869688	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr3	196876600	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=150,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.629:25:5,8:4,8:5,4,7,9
chr3	197023445	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=176,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr3	197239266	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=198,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,3:1,0,0,5
chr3	197273186	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=183,69;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,3:9,0:10,5,2,1
chr3	197401268	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=180,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:8,1,2,1
chr3	197403844	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=182,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,1:4,1:7,5,1,1
chr3	197410287	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=143,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:19,0:17,3:16,20,0,3
chr3	197421203	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=182,248;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:7,1,1,1
chr3	197427557	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,2:13,0:10,12,0,2
chr3	197432000	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=152,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,2:10,1:9,11,1,2
chr3	197432029	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=145,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,2:11,1:6,11,1,2
chr3	197483279	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,30:0.940:31:0,16:1,13:1,0,18,12
chr3	197496984	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,12,3
chr3	197544200	.	C	CGTGTGTGTGTGT,CGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,29,29;MFRL=0,83,153;MMQ=60,60,60;MPOS=1,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=43.70,5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,16,4:0.725,0.214:21:0,11,1:1,4,3:1,0,11,9
chr3	197544201	.	A	ATTTTGTGTGTGTGTGCG	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=8,26;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=102.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.942:30:0,12:0,6:1,0,18,11
chr3	197544231	.	G	GTATATATATATATATATA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,36;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,18;RU=TA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	197547332	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=183,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:0,6,2,5
chr3	197557635	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,3:2,5:2,6,6,2
chr3	197557731	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=167,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:12,2:0|1:197557731_T_A:197557731:8,14,1,1
chr3	197557737	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=167,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:11,2:0|1:197557731_T_A:197557731:8,14,1,1
chr3	197557739	.	G	GCTCC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=177,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,0:11,2:0|1:197557731_T_A:197557731:8,13,1,1
chr3	197566084	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=198,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr3	197574248	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:9,6:7,8:11,5,13,2
chr3	197574936	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:2,2:1,7,0,4
chr3	197574960	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=196,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,2:1,1:0,4,0,4
chr3	197581147	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr3	197585598	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=172,234;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,1:2,3:8,0,4,0
chr3	197592449	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,232;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=43.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,0:4,13:0,8,0,13
chr3	197597194	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=218,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0,4,1,1
chr3	197616627	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:6,1:0,3:0,6,2,2
chr3	197619577	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=120,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.382:32:8,0:12,12:0|1:197619577_T_A:197619577:10,10,0,12
chr3	197619581	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=118,119;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,12:0.361:34:9,0:13,12:0|1:197619577_T_A:197619577:11,11,0,12
chr3	197665561	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=179,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,0:8,3:9,10,1,2
chr3	197701913	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,300;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:11,10,0,2
chr3	197717643	.	A	ATATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=170,277;MMQ=60,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	197762623	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=218,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	197765432	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,0:10,3:13,6,1,2
chr3	197880130	.	GGCAGCAGCA	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,141;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=GCA;STR;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,3:6,4:8,2,0,8
chr3	197894800	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=179,147;MMQ=51,28;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:15,2:5,2:8,12,4,0
chr4	53360	.	C	G	.	.	DP=63;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=167,120;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,6:0.112:60:29,1:24,5:29,25,3,3
chr4	53364	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.082:58:24,3:29,1:27,27,3,1
chr4	53428	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=126.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,22:0,18:0,0,13,28
chr4	53446	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:16,1:12,2:6,24,0,3
chr4	53498	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,1,16
chr4	59299	.	C	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,5:0.100:57:31,3:21,2:42,10,3,2
chr4	59469	.	A	G	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=174,132;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,8:0.121:72:28,3:36,5:23,41,2,6
chr4	60087	.	GC	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.060:47:21,1:24,1:13,32,0,2
chr4	85526	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=168,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr4	85562	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,4,0
chr4	86101	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,47;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=54.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,4,11
chr4	86798	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:3,2:5,5:5,4,4,3
chr4	87277	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,5:0,11:0,0,10,6
chr4	87313	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=60.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,7:0,12:0,0,6,13
chr4	331658	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,1:6,2:0|1:331658_T_C:331658:9,1,3,0
chr4	331666	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:4,1:6,3:0|1:331658_T_C:331658:9,1,4,0
chr4	331693	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=47.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr4	337474	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=162,113;MMQ=49,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:6,0,3,0
chr4	338186	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=116,197;MMQ=60,45;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,2:9,1:11,10,0,3
chr4	338197	.	T	TGA	.	.	DP=25;ECNT=10;MBQ=26,32;MFRL=116,96;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:12,1:9,1:0|1:338197_T_TGA:338197:11,11,0,3
chr4	338200	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=10;MBQ=31,36;MFRL=116,96;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:13,1:8,2:0|1:338197_T_TGA:338197:11,12,0,3
chr4	338201	.	ATC	A	.	.	DP=27;ECNT=10;MBQ=24,29;MFRL=116,48;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:13,1:8,2:0|1:338197_T_TGA:338197:11,12,1,3
chr4	338205	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=27,34;MFRL=116,48;MMQ=60,43;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.178:26:14,1:8,3:0|1:338197_T_TGA:338197:10,12,1,3
chr4	338246	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=32,28;MFRL=132,0;MMQ=60,44;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:11,2:4,3:0|1:338246_G_A:338246:4,11,2,3
chr4	338252	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=10;MBQ=32,28;MFRL=132,0;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:10,2:5,2:0|1:338246_G_A:338246:4,11,2,2
chr4	338258	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=31,27;MFRL=132,0;MMQ=60,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:8,2:5,2:0|1:338246_G_A:338246:4,10,2,2
chr4	338260	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=26,34;MFRL=132,0;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,2:5,2:0|1:338246_G_A:338246:3,10,2,2
chr4	338266	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=33,30;MFRL=138,0;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:6,2:4,1:0|1:338246_G_A:338246:2,10,2,2
chr4	344138	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=190,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr4	499439	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=228,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,1:0,1:2,1,1,1
chr4	515577	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:15,2:14,1:16,14,2,1
chr4	515632	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=136,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:18,0:21,3:21,18,1,2
chr4	517481	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,2:10,0:10,8,0,2
chr4	521068	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr4	650749	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=174,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,0:4,3:2,7,2,1
chr4	651283	.	GGTGCGGCGGGGCAGGACGTCCAGGGGTCACCCAGGGGTCACGGCT	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=162,149;MMQ=60,32;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.181:26:12,2:7,2:8,14,1,3
chr4	651290	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=159,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.139:20:10,2:7,0:6,12,2,0
chr4	654495	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=206,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:0,2:3,0:0,4,0,2
chr4	658582	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=232,105;MMQ=41,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:2,1:0,0:4,0,1,0
chr4	672675	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:11,4:6,2:9,8,3,3
chr4	677077	.	G	GAGCTGCCCA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:10,2:4,0:0|1:677077_G_GAGCTGCCCA:677077:6,8,0,2
chr4	677082	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=145,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:0|1:677077_G_GAGCTGCCCA:677077:5,8,0,2
chr4	677349	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,13;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:677349_A_C:677349:1,0,1,0
chr4	677352	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,12;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:677349_A_C:677349:1,1,1,0
chr4	677356	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:677349_A_C:677349:1,2,1,0
chr4	677360	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:677349_A_C:677349:2,2,1,0
chr4	755025	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=212,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:8,6:2,6:8,2,10,2
chr4	755129	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:12,4:4,5:7,9,4,5
chr4	759709	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:1,0,9,0
chr4	759733	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr4	780286	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,5:2,1:2,0,4,2
chr4	786401	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=171,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr4	818248	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=21,14;MFRL=166,274;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.388:6:1,0:1,0:0|1:818248_A_C:818248:2,2,2,0
chr4	818254	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=160,274;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.336:7:2,1:1,0:0|1:818248_A_C:818248:2,3,2,0
chr4	818264	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=148,274;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.337:7:2,0:2,0:0|1:818248_A_C:818248:1,4,2,0
chr4	843622	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=C;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.520:6:1,0:2,0:0,3,0,3
chr4	845772	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr4	871675	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	877865	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=89,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,1:5,1:4,7,2,0
chr4	882845	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:882845_C_T:882845:0,0,0,3
chr4	882849	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:882845_C_T:882845:0,0,0,3
chr4	898664	.	A	ATCTCG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=198,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:898664_A_ATCTCG:898664:0,4,1,1
chr4	898665	.	A	AGGCCCCCTTTCGTGCGACAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=198,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:898664_A_ATCTCG:898664:0,4,1,1
chr4	906647	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr4	946226	.	TGGGGTCGTGCAGGTAGGGGGCCTGGGGGGCCTGCACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATCACCATC	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=110,143;MMQ=60,41;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.238:13:5,1:3,0:7,4,1,1
chr4	946301	.	TG	AA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=0,125;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:946301_TG_AA:946301:0,1,0,1
chr4	946307	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=0,125;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:946301_TG_AA:946301:0,1,0,1
chr4	952156	.	C	CCTGTCATGGAGATCAGTGATATTCTG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=168,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:3,3,1,1
chr4	952178	.	T	TCAGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=240,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:952178_T_TCAGG:952178:1,3,0,1
chr4	952182	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=240,120;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:952178_T_TCAGG:952178:1,3,0,1
chr4	954311	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=252,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	960713	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=198,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr4	961373	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=192,156;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,7:3,3:3,1,6,4
chr4	961375	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,2:6,0:9,4,1,1
chr4	984138	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=173,43;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:4,6,0,2
chr4	1006200	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr4	1006365	.	GCCCAGCCCGGCCAGCCTGGCCTCCGCCAGCGCCGCCCCCTTCCCGCCCGGCCCTGAA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=207,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr4	1006386	.	CTC	ACG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=214,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	1019054	.	CCA	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=150,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:3,3:10,1:11,5,3,1
chr4	1067032	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:4,3:0,1:1,3,1,4
chr4	1067267	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr4	1075329	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:13,0:5,6:8,10,0,6
chr4	1084723	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,99;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	1102050	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr4	1107278	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr4	1161480	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=231,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,1,3
chr4	1164378	.	AGAG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,3:6,5:3,10,4,4
chr4	1165587	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=202,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,2:1,5:1,3,7,0
chr4	1165748	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=177,212;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.429:17:4,4:4,3:5,5,7,0
chr4	1207445	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=178,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr4	1219373	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=207,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr4	1232201	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=256,246;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	1235157	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=172,42;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:0|1:1235157_G_T:1235157:4,5,1,1
chr4	1235158	.	A	ATCAGCTC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=172,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,2:3,0:0|1:1235157_G_T:1235157:4,5,1,1
chr4	1244267	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=229,332;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr4	1305802	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,2:12,1:16,10,3,0
chr4	1332175	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=126,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:0,2:6,2:4,2,3,1
chr4	1343720	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=241,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr4	1345647	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:6,2:3,1:1,9,0,3
chr4	1348691	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,16;MFRL=181,328;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.713:4:1,1:0,0:0,1,2,1
chr4	1348806	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=192,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:3,1:3,2:5,2,2,1
chr4	1369093	.	CT	GG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=114,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.742:11:0,3:3,5:2,1,8,0
chr4	1373751	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr4	1373896	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:6,4,1,1
chr4	1374695	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=129,102;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,5:3,4:7,1,5,4
chr4	1374710	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=102,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:9,4,2,0
chr4	1657086	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	1670480	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=162,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:4,8,2,0
chr4	1701317	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=136,119;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:8,4:1,8:6,3,7,5
chr4	1720346	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	1725651	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr4	1729347	.	AT	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=234,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr4	1729425	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:1,5:4,7:3,2,6,6
chr4	1730262	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=156,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,2:13,0:13,7,1,1
chr4	1730299	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=98,141;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:2,8:5,7:3,4,10,5
chr4	1732734	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,3:1,6:1,3,0,9
chr4	1737109	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=248,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,4:1,1:1,0,1,4
chr4	1737404	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	1737585	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr4	1739252	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,4:2,4:2,1,6,2
chr4	1741325	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=203,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr4	1742779	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=200,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,0:4,4:0,9,0,4
chr4	1746229	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=169,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,0:1,3:3,0,1,2
chr4	1746844	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr4	1805573	.	TCTG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTG;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr4	1806739	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.531:9:1,0:1,1:0,4,0,5
chr4	1807595	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:1,5,0,6
chr4	1817523	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=178,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:4,1,0,2
chr4	1920076	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:6,6:10,0:0|1:1920076_T_G:1920076:6,10,6,0
chr4	1920080	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:5,6:9,0:0|1:1920076_T_G:1920076:6,8,6,0
chr4	1920100	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=153,182;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.287:26:10,7:8,0:15,4,7,0
chr4	1940337	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	1954774	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,363;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	1961137	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,5:4,5:6,1,8,2
chr4	1961359	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=187,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:9,2:5,0:8,7,0,2
chr4	1976737	.	A	AAGAGCTGAAGTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=158,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.223:11:5,2:4,0:1,8,1,1
chr4	1985257	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=205,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,1:1,1:2,4,2,0
chr4	1988188	.	C	CCT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:0|1:1988188_C_CCT:1988188:2,3,1,3
chr4	1988193	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=192,155;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0|1:1988188_C_CCT:1988188:2,3,1,2
chr4	2065946	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	2082795	.	C	CTTATCTTCCTCCCACTTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:3,4,1,1
chr4	2158408	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,5,1
chr4	2176546	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.270:11:2,0:2,0:0|1:2176546_G_C:2176546:1,7,0,3
chr4	2176551	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=19,20;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.302:10:2,0:1,2:0|1:2176546_G_C:2176546:1,6,0,3
chr4	2322039	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=166,248;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,1:2,2:3,3,0,3
chr4	2337603	.	GC	TT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=254,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	2343150	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=260,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,2:0,4:2,1,5,1
chr4	2343349	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=226,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:6,4:1,1:1,6,2,3
chr4	2502299	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr4	2513620	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=113,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:3,5:11,1:0|1:2513620_G_A:2513620:9,5,4,2
chr4	2513624	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=117,248;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:5,3:10,1:0|1:2513620_G_A:2513620:10,5,3,1
chr4	2691219	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=172,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.480:8:2,2:2,1:1,3,3,1
chr4	2717690	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=145,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:7,4,2,0
chr4	2746285	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=215,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,2:1,0:1,3,0,2
chr4	2746307	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=225,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr4	2822289	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=116,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.856:12:0,3:1,7:1,0,9,2
chr4	2829077	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=64,231;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.590:15:0,4:6,5:3,3,2,7
chr4	2831341	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=123,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.570:5:1,1:1,1:0|1:2831341_A_C:2831341:0,2,3,0
chr4	2831347	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=190,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:2,0:1,1:0|1:2831341_A_C:2831341:1,2,3,0
chr4	2831383	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=95,144;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:1,1,1,4
chr4	2886199	.	TA	CC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=169,207;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:2886199_TA_CC:2886199:5,0,2,0
chr4	2886202	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=169,207;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:2886199_TA_CC:2886199:5,0,2,0
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chr4	2916762	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,214;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:3,4,2,2
chr4	2933271	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:3,3,3,3
chr4	2934308	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:1,5:1,5:0,2,5,5
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chr4	2956334	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=218,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,1:2,1:0,6,0,2
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chr4	3039311	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.463:9:3,2:1,2:0,5,0,4
chr4	3040044	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=194,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr4	3040279	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.790:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	3088747	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=163,128;MMQ=60,33;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.489:43:13,0:9,21:11,11,1,20
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chr4	3144441	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=289,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
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chr4	3161958	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,7:6,0:6,4,7,0
chr4	3180021	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=86,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.590:22:4,6:4,7:9,0,8,5
chr4	3201682	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:4,0:6,5:4,6,0,6
chr4	3208684	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=145,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:10,5:16,0:13,14,3,2
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chr4	3240526	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr4	3257699	.	AGGC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0,3,1,0
chr4	3427151	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=179,109;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,6:3,0:4,1,6,0
chr4	3443783	.	T	TTCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TCC;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	3444503	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=33;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:8,4,2,0
chr4	3445745	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,5,0
chr4	3446820	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr4	3449781	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=225,280;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:2,3,2,0
chr4	3475107	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=215,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr4	3475122	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=249,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr4	3475390	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:0,0:3,3:0,3,1,2
chr4	3478013	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:3478013_G_A:3478013:0,0,3,0
chr4	3478051	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:3478013_G_A:3478013:0,0,6,3
chr4	3478323	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr4	3487237	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,11,3
chr4	3516689	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr4	3516742	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=165,246;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr4	3769789	.	G	GGGGGAGCTTTCCCAGAGACCC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGAGCTTTCCCAGAGACCC;STR;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.816:7:0,1:1,3:1,0,5,1
chr4	4190507	.	C	CTTG	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=125,108;MMQ=60,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,12:0.351:35:10,7:13,4:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:12,11,6,6
chr4	4190508	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=125,108;MMQ=60,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,12:0.351:35:10,7:13,4:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:12,11,6,6
chr4	4190511	.	G	GTCACTTGTTA	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=129,97;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=68.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,19:0.444:43:11,8:13,5:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:12,12,10,9
chr4	4190688	.	G	GCT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=124,58;MMQ=60,21;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,2:13,0:0|1:4190688_G_GCT:4190688:10,13,1,1
chr4	4190689	.	A	AAG	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=124,58;MMQ=60,21;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,2:13,0:0|1:4190688_G_GCT:4190688:10,13,1,1
chr4	4190723	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=162,174;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,1:6,1:3,9,0,2
chr4	4190792	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr4	4198815	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=305,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr4	4199261	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=157,180;MMQ=60,52;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:7,5,2,0
chr4	4239516	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=193,144;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,15:0.432:35:10,4:8,10:0|1:4239516_C_T:4239516:10,10,11,4
chr4	4239539	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=167,144;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,7:0.234:32:8,1:14,6:0|1:4239516_C_T:4239516:13,12,0,7
chr4	4239697	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=209,272;MMQ=52,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,4:8,1:3,11,0,5
chr4	4241953	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=262,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr4	4249414	.	AT	GC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=154,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:3,3:0,6,0,6
chr4	4249483	.	CA	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr4	4249855	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=207,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:1,2,3,0
chr4	4249884	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:4,2:0,0:1,3,2,1
chr4	4249974	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:0,2,0,4
chr4	4269560	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=142,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:6,0,2,0
chr4	4275280	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=159,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:6,1:5,3:0|1:4275280_C_T:4275280:7,5,3,1
chr4	4275287	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=143,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.332:16:5,2:4,3:0|1:4275280_C_T:4275280:6,5,4,1
chr4	4281570	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=320,240;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr4	4283676	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=198,258;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,2:0,5:0,3,0,7
chr4	4285265	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	4304437	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=191,60;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:5,5,0,2
chr4	4317464	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:15,2:7,1:9,13,3,0
chr4	4317777	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=158,256;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,0:2,3:1,6,0,3
chr4	4322275	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr4	4425422	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	5016841	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr4	5016972	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=219,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:8,4:3,1:5,6,2,3
chr4	5018702	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=214,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:3,9:3,2:1,5,5,6
chr4	5021008	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=214,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:1,5:5,0:5,2,3,2
chr4	5418485	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=190,250;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:4,1,5,0
chr4	5418539	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=114,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:0,9:1,5:1,0,7,7
chr4	5527008	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,2:2,5:5,1,6,1
chr4	5527249	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=240,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:2,2,1,2
chr4	5528115	.	ATT	A,AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27,27;MFRL=200,183,145;MMQ=60,60,60;MPOS=15,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=6.56,5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,3:0.452,0.372:8:1,2,0:0,2,3:0,1,1,6
chr4	5577884	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr4	5617295	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=105,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.673:10:1,7:1,0:2,1,1,6
chr4	5617369	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=260,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr4	5630470	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:1,3:0,3:0,1,0,7
chr4	5642274	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,1:8,5:6,6,3,4
chr4	5687263	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	5693112	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:2,1,0,5
chr4	5710106	.	C	CAGAGCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	5730954	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr4	5733068	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:5,0,5,0
chr4	5746916	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.644:15:2,7:3,2:5,0,7,3
chr4	5747072	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,1:2,4:4,5,2,3
chr4	5747078	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.735:17:1,7:3,5:1,3,5,8
chr4	5747106	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=246,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr4	5747131	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=36,25;MFRL=162,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr4	5749784	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=196,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0|1:5749784_G_A:5749784:1,0,3,0
chr4	5749804	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=165,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:5749784_G_A:5749784:2,0,2,0
chr4	5750084	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr4	5754544	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,4:7,1:8,3,5,0
chr4	5757932	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0|1:5757932_GA_G:5757932:0,0,3,1
chr4	5757944	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=140,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0|1:5757932_GA_G:5757932:2,1,2,1
chr4	5798721	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=165,49;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.207:13:3,1:2,0:7,4,2,0
chr4	5803669	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=199,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,7:2,4:5,1,9,2
chr4	5803829	.	AC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=193,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,1:4,1:2,7,0,2
chr4	5809915	.	TT	CC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=235,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,2,1
chr4	5812195	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.656:12:0,3:3,5:2,2,3,5
chr4	5812778	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=185,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.825:9:1,6:0,2:0,1,2,6
chr4	5812817	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr4	5830414	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=187,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:2,5:2,9:2,2,4,10
chr4	5843196	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,252;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:5,2:0,9,0,3
chr4	5863032	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	5966905	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,3:1,5:0,1,3,5
chr4	5966943	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	5969113	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,6,4
chr4	5969235	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,3,10
chr4	5969252	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr4	5969292	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	5969303	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	5975538	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=192,191;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,6:1,1:1,1,0,7
chr4	5981849	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=273,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,3:2,2:9,0,3,2
chr4	5982108	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=126,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,4:2,5,0,7
chr4	5982135	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=141,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:2,2:3,2:1,5,0,4
chr4	6055971	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=211,252;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr4	6062061	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=109,257;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr4	6081920	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,1:7,1:7,5,0,2
chr4	6114420	.	GCC	TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=235,373;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,2:3,0:5,2,2,0
chr4	6279194	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=207,41;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:11,0:5,2:0|1:6279194_C_G:6279194:11,5,1,1
chr4	6279200	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=207,41;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:0|1:6279194_C_G:6279194:11,5,1,1
chr4	6279203	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=207,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:0|1:6279194_C_G:6279194:11,5,1,1
chr4	6279206	.	GGGC	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=35,20;MFRL=202,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:5,2:0|1:6279194_C_G:6279194:13,7,1,1
chr4	6279211	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=202,41;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,0:6,2:0|1:6279194_C_G:6279194:13,7,1,1
chr4	6292909	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=169,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:0|1:6292909_C_T:6292909:4,4,1,2
chr4	6292915	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=169,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:0|1:6292909_C_T:6292909:4,4,1,2
chr4	6302519	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=140,145;MMQ=60,59;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:2,1:6,10:2,6,7,4
chr4	6303277	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,2:3,0:5,5,1,1
chr4	6304242	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	6304286	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=227,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr4	6325018	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=107,240;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.538:20:4,2:5,7:5,4,7,4
chr4	6330938	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:8,0,1,1
chr4	6335203	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=185,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr4	6374189	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr4	6374230	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=164,239;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:3,1,2,1
chr4	6374468	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=176,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:0,4,1,5
chr4	6377530	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=148,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:3,2,5,1
chr4	6377534	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr4	6377713	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	6577164	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6577164_G_A:6577164:0,1,0,1
chr4	6577173	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6577164_G_A:6577164:0,0,0,1
chr4	6577176	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6577164_G_A:6577164:0,0,0,1
chr4	6578318	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,2:8,0:13,4,2,0
chr4	6578487	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr4	6580283	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr4	6594827	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr4	6596476	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=239,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,4:1,4:0,2,4,4
chr4	6596515	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,1,7
chr4	6602255	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	6602516	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr4	6606864	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=172,196;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.876:22:0,8:2,12:2,0,10,10
chr4	6610889	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=111,180;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,5:1,2:3,1,4,3
chr4	6619052	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr4	6623032	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,1,10
chr4	6719092	.	TAGTC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=269,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:1,7:0,6:0,1,5,8
chr4	6955922	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.448:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr4	6956134	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=202,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.845:17:0,6:2,9:0,2,6,9
chr4	6968942	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=250,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr4	6969163	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=55,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr4	6996129	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=156,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:0,4,0,3
chr4	7002803	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,7,4
chr4	7006524	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=176,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,0:2,2:6,1,2,0
chr4	7006541	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=148,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:7,2:5,2:11,1,3,1
chr4	7027041	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=313,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,3:0,6:0,1,0,9
chr4	7044357	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:7044357_A_G:7044357:0,0,0,5
chr4	7044380	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:7044357_A_G:7044357:0,0,0,3
chr4	7064010	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:7064010_A_C:7064010:0,0,1,0
chr4	7064015	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=185,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:7064010_A_C:7064010:2,0,1,0
chr4	7064016	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=185,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:2,0:0|1:7064010_A_C:7064010:2,0,1,0
chr4	7064214	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=352,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,4:0,1,1,7
chr4	7064243	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=352,173;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,2:0,1,0,5
chr4	7064277	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=284,254;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr4	7069606	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=267,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,2:1,0,5,0
chr4	7069804	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=226,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:2,5:0,7:0,2,0,12
chr4	7434988	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=166,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr4	7435009	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=261,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,1:0,1:1,0,3,0
chr4	7663167	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=152,238;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:5,0:3,2:9,0,2,0
chr4	7666212	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=127,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,2:8,1:5,6,1,2
chr4	7666241	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=127,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:3,1:2,2:1,4,0,4
chr4	7684641	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=191,273;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,0:5,3:3,6,1,2
chr4	7684661	.	CT	AC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=191,340;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:2,5,0,2
chr4	7691193	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr4	7726847	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=203,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr4	7728472	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=130,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,7:0,0:1,0,6,1
chr4	7728658	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:1,0,0,7
chr4	7731310	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=157,244;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,4:0,2:3,2,4,2
chr4	7738730	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	7765566	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:1,7,0,2
chr4	7817698	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,0:5,2:7,0,2,0
chr4	7820727	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr4	7820795	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.541:18:3,3:5,5:2,6,6,4
chr4	7870503	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=204,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:0,5,1,5
chr4	7985343	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=151,99;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,1:7,1:3,7,0,2
chr4	8006928	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=242,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr4	8006988	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=171,229;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:3,1:2,2:6,0,3,0
chr4	8009759	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=110,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:2,10:0,2:1,1,7,5
chr4	8034497	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:3,2:1,4:1,3,1,6
chr4	8062638	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr4	8062871	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=167,273;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr4	8089880	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=144,71;MMQ=60,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,3:8,0:11,5,2,1
chr4	8090028	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,2:4,8:4,4,1,9
chr4	8207154	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:2,1:4,2:0,7,0,3
chr4	8214636	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	8216389	.	AACTGGTGCTTTGTTTATTTATTT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=188,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.318:6:0,1:2,1:0,4,0,2
chr4	8217829	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=205,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.335:16:9,1:1,4:8,3,4,1
chr4	8221058	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:10,4:2,7:5,7,6,5
chr4	8228627	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.696:8:1,2:1,3:0|1:8228627_G_C:8228627:2,0,6,0
chr4	8228632	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0|1:8228627_G_C:8228627:0,0,9,0
chr4	8228894	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,3:0,0,9,5
chr4	8230456	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	8235262	.	AGG	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=166,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.210:12:5,2:5,0:0|1:8235262_AGG_A:8235262:3,7,1,1
chr4	8235269	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=172,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:3,0:0|1:8235262_AGG_A:8235262:2,9,1,1
chr4	8235273	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=167,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:3,0:0|1:8235262_AGG_A:8235262:2,9,1,1
chr4	8237096	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,4:0,0,8,1
chr4	8239389	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,17;MFRL=98,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.246:13:5,0:5,0:0|1:8239389_G_C:8239389:8,2,0,3
chr4	8239399	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=101,231;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.345:9:3,0:2,0:0|1:8239389_G_C:8239389:4,2,0,3
chr4	8239403	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=176,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.428:7:3,0:1,0:0|1:8239389_G_C:8239389:3,1,0,3
chr4	8288370	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=168,82;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:7,0:13,5:8,12,0,5
chr4	8288581	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=169,329;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	8304137	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=217,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,3:5,5:4,2,8,0
chr4	8306028	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=178,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:4,6,0,3
chr4	8375342	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:4,6,5,0
chr4	8376835	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=198,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:5,1:4,3:4,6,1,3
chr4	8383167	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=352,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr4	8390859	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=148,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:2,1,1,1
chr4	8391049	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=206,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,6:0,1:1,4,3,4
chr4	8417534	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=122,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:9,0:9,3:14,4,0,3
chr4	8465689	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=125,80;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:5,6,0,2
chr4	8465721	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=119,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,3:8,6:3,10,4,6
chr4	8469777	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:6,1:13,2:11,8,1,2
chr4	8584448	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=236,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr4	8588685	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,328;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	8589023	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=202,161;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,1:6,1:3,10,0,2
chr4	8594574	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	8602793	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	8602816	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	8613908	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=207,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:8613908_G_A:8613908:1,1,2,0
chr4	8613917	.	CG	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:8613908_G_A:8613908:0,0,1,0
chr4	8620325	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=219,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr4	8621392	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=232,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr4	9446325	.	AG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=210,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,6:3,3:5,2,1,8
chr4	9785354	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=179,161;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:6,3:3,2:3,6,3,2
chr4	9889261	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=189,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:6,4,3,3
chr4	9909850	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,3:6,2:6,5,4,1
chr4	9921931	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.557:14:4,6:2,1:6,0,7,1
chr4	9922170	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.355:20:8,4:5,2:1,12,2,5
chr4	9982191	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:4,3:10,2:8,6,3,2
chr4	9998605	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,3:3,5:3,4,2,6
chr4	10020564	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=130,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.457:15:6,3:2,2:8,0,7,0
chr4	10020757	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:3,1:0,5,0,2
chr4	10027643	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,0:7,3:1,11,1,2
chr4	10079351	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:2,4:9,1:7,4,4,1
chr4	10084570	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr4	10086015	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=223,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,3,0
chr4	10086188	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:2,6,3,2
chr4	10089489	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:7,1:11,4,1,1
chr4	10089865	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.497:28:5,6:9,7:11,3,11,3
chr4	10089966	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=152,52;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:15,4:15,0:8,22,4,0
chr4	10090178	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr4	10099277	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,1:2,4:5,1,3,2
chr4	10099542	.	CAAAA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=207,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=A;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.432:5:0,1:2,0:2,1,0,2
chr4	10117728	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:15,4:13,8:19,9,4,8
chr4	10118377	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=187,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr4	10445508	.	AG	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=144,192;MMQ=60,56;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:10,4:10,0:7,13,4,0
chr4	10446385	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,5,14
chr4	10446906	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,17:0,0,14,10
chr4	10447985	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,4:3,5:3,9,2,7
chr4	10509699	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:1,2,0,5
chr4	10534027	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=221,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr4	10542058	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=136,272;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:0,1:2,0,2,0
chr4	13578405	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr4	13583838	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:8,4:8,1:11,6,5,0
chr4	13589212	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=216,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr4	13603107	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=143,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,0:6,2:8,8,1,1
chr4	13603465	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=197,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,3:6,0:3,10,3,0
chr4	13605242	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=114,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:11,0:13,3:16,9,2,1
chr4	13615293	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=216,245;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:2,6:3,3:1,4,3,6
chr4	13616922	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,3:8,0:10,5,3,0
chr4	13617012	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=156,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:6,6:13,4:9,10,6,4
chr4	15005604	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,2:2,4:4,2,3,3
chr4	15009232	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=207,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,5:2,0:1,3,0,5
chr4	15482477	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.863:19:2,9:0,8:1,1,7,10
chr4	15504026	.	GTTTTGT	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=100,45;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTGT;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:13,2:9,0:19,7,0,2
chr4	15538744	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr4	15539498	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,12,5
chr4	15568992	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=123,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.222:34:18,4:8,3:12,15,5,2
chr4	15569018	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=133,123;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,27:0.823:32:3,16:2,10:5,0,11,16
chr4	15569146	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=192,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.276:23:6,3:11,3:10,7,1,5
chr4	15575718	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=241,229;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,3,1
chr4	15575751	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=222,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:2,2,5,1
chr4	15587897	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr4	15589345	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,24;MFRL=149,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,1:0,2:1,0,3,0
chr4	15602773	.	C	CTTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	15603069	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=206,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr4	15629409	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:15629409_T_C:15629409:2,0,1,0
chr4	15629419	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,11;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:15629409_T_C:15629409:2,0,1,0
chr4	15632228	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr4	15632315	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,80;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:12,8,2,0
chr4	15689632	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,164;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.501:26:5,3:8,10:6,7,5,8
chr4	15706502	.	G	GTC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=174,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,2:8,1:11,3,2,1
chr4	15717321	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=161,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,6:2,1:4,1,5,2
chr4	15937526	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.330:16:2,1:9,4:7,4,3,2
chr4	15964040	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=197,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:4,3,3,0
chr4	15972549	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	15980975	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=206,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:5,1,4,1
chr4	15981665	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=204,204;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:15,0:1,4:1,15,0,4
chr4	15981948	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=16,15;MFRL=146,146;MMQ=27,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr4	15982166	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:1,2:0,5:0,1,2,5
chr4	15982222	.	TTGG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=278,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15982222_TTGG_T:15982222:0,1,0,1
chr4	15982226	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=278,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15982222_TTGG_T:15982222:0,1,0,1
chr4	15982232	.	TT	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=278,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15982222_TTGG_T:15982222:0,1,0,1
chr4	15982237	.	TT	CA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15982222_TTGG_T:15982222:0,0,0,1
chr4	15986042	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr4	15987512	.	T	TGCTTATTTAATCTGTATTAAATATTTAATACAGATAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=164,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.780:7:0,1:1,1:1,0,4,2
chr4	15989191	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	15991275	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=341,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,3,2
chr4	15994002	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,3:3,1:7,2,0,4
chr4	16002050	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr4	16024885	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	16026841	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=116,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:3,2:17,1:13,8,2,1
chr4	16035209	.	CTTTTTTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=247,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=21,12;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:1,2,0,1
chr4	16168512	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=236,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr4	16172181	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr4	16175827	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:8,0:14,2:14,8,1,1
chr4	16181301	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:5,2:8,0:5,8,0,2
chr4	16189991	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr4	16204226	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.230:23:2,0:7,3:3,15,0,5
chr4	16215537	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=195,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,3:3,5:2,7,2,6
chr4	16504335	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,13:0.311:43:23,0:7,13:7,23,0,13
chr4	16510131	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=215,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:7,2:3,2:10,0,4,0
chr4	16513748	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=187,262;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,1:2,1:1,7,1,1
chr4	16597280	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,3:0,0,10,5
chr4	16597366	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:11,0:6,7:8,9,1,6
chr4	16899946	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=73,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,6:3,3:7,3,6,3
chr4	17494054	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,354;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	17503544	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=97,341;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:1,2,0,2
chr4	17506164	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=118,7643047;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr4	17513724	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=210,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr4	17513757	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=224,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr4	17517242	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=219,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr4	17524570	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=187,296;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:7,1:12,2:10,10,2,1
chr4	17581617	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=242,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,8:3,4:0,4,3,9
chr4	17581643	.	CAG	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=240,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,7:1,2:0,3,0,9
chr4	17585014	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=223,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:1,3:5,0,3,0
chr4	17590686	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.831:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr4	17600149	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=127,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:14,1:13,2:12,15,0,3
chr4	17608620	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=204,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:0,1:2,5:0,2,0,6
chr4	17616214	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.825:21:2,4:1,13:3,0,16,2
chr4	17625209	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:3,14:4,1:3,4,7,8
chr4	17634213	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,6,8
chr4	17634255	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=269,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:1,1,2,3
chr4	17634256	.	C	CAA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=269,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,3:2,2:1,1,2,3
chr4	17635556	.	CAAAAT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=337,246;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr4	17636535	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=246,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr4	17636676	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=163,319;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.226:29:13,6:9,0:16,7,6,0
chr4	17640858	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=144,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:3,0,5,1
chr4	17643620	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	17654648	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=288,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,0:2,5:1,2,0,5
chr4	17659936	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=155,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:5,3,4,4
chr4	17660237	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=315,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr4	17661737	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=177,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:2,5,1,1
chr4	17661762	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=177,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:17661762_C_CAT:17661762:0,1,0,1
chr4	17661768	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,27;MFRL=177,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17661762_C_CAT:17661762:0,1,0,1
chr4	17666303	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,17;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.592:3:0,0:0,0:1,0,0,2
chr4	17689974	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	17694880	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=211,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,1:1,7:1,2,7,1
chr4	17694916	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=216,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,4:4,5:1,5,7,2
chr4	17694943	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=204,142;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,6:4,5:1,5,6,5
chr4	17706928	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=177,300;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr4	17710726	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=67046296,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr4	17812615	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=184,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,5:1,1:5,0,4,2
chr4	17812796	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:11,1:8,1:9,10,0,2
chr4	17814110	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=177,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:3,2:4,1:0,7,0,3
chr4	17841848	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:2,5:10,2:3,9,2,5
chr4	17842156	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,2:4,3,4,1
chr4	17844029	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:2,6,1,3
chr4	17885296	.	A	AAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=59,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=AC;STR;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.586:10:2,3:2,3:2,2,5,1
chr4	17963474	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=181,136;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,8:5,0:8,2,8,0
chr4	20259621	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=198,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:6,3:2,0:0|1:20259621_A_AT:20259621:0,8,0,3
chr4	20259622	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=198,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:6,2:2,0:0|1:20259621_A_AT:20259621:0,8,0,3
chr4	20270600	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=187,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:1,8,0,4
chr4	20469517	.	TAAA	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=241,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0|1:20469517_TAAA_T:20469517:0,6,0,2
chr4	20469524	.	TC	GG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=241,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:20469517_TAAA_T:20469517:0,7,0,2
chr4	20469528	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=241,162;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:20469517_TAAA_T:20469517:0,7,0,2
chr4	20487975	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,295;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:0,6,0,3
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chr4	20533700	.	A	AT,ATT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20,31;MFRL=181,118,246;MMQ=60,60,60;MPOS=19,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,9,10;RU=T;STR;TLOD=8.46,3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,7,2:0.449,0.183:14:2,2,2:3,5,0:3,2,6,3
chr4	20535276	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:10,0:12,4:9,13,0,4
chr4	20541005	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:4,3:7,0:0|1:20541005_AG_A:20541005:7,4,1,2
chr4	20541008	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,3:7,0:0|1:20541005_AG_A:20541005:7,4,1,2
chr4	20620683	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,5:0,13:0,0,2,16
chr4	20706067	.	CT	C,CTT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,30,31;MFRL=132,227,173;MMQ=60,60,60;MPOS=9,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=14.09,6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,11,4:0.356,0.170:28:4,7,0:5,4,3:9,4,12,3
chr4	20709411	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:7,2,3,1
chr4	20728966	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=215,92;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.496:25:6,2:6,10:6,7,4,8
chr4	20729046	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=220,158;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,4:7,0:1,10,0,4
chr4	20733708	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=201,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.679:20:3,8:3,6:1,5,5,9
chr4	20736416	.	A	AAAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAC;STR;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,1:0,3,1,5
chr4	20751278	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=100,134;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.623:6:0,3:2,1:1,1,3,1
chr4	20760387	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=164,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:5,2,2,1
chr4	21305525	.	TTCATGGTCAGCTAGG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=144,250;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:5,0:7,7,2,0
chr4	22390256	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=209,159;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,0:8,3:10,7,0,3
chr4	22394193	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:10,14,2,0
chr4	22414708	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=254,73;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr4	22426062	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=166,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:0,2,0,6
chr4	22449028	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=172,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.559:12:2,5:3,2:4,1,6,1
chr4	22456381	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=215,255;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr4	22456431	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr4	22463486	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=269,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:0,5,0,4
chr4	22750485	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=152,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:0|1:22750485_A_T:22750485:9,6,1,1
chr4	22750488	.	T	TCAAATTG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=152,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:4,2:0|1:22750485_A_T:22750485:10,5,1,1
chr4	22750493	.	G	GACCCTATTAACTT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=36,20;MFRL=153,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:0|1:22750485_A_T:22750485:9,5,1,1
chr4	23814419	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=114,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,0:8,2:0|1:23814419_C_T:23814419:12,8,1,1
chr4	23814428	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=117,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:0|1:23814419_C_T:23814419:14,8,1,1
chr4	23814431	.	T	TTCACTGCAATCAGAATCAC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=119,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:11,2:0|1:23814419_C_T:23814419:14,9,1,1
chr4	23816242	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=10,23;MFRL=158,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,2:0,2:0,2,0,5
chr4	23826219	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=234,307;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23826219_A_C:23826219:0,1,0,1
chr4	23826223	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=234,307;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23826219_A_C:23826219:0,1,0,1
chr4	23826225	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,36;MFRL=234,307;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23826219_A_C:23826219:0,1,0,1
chr4	23826229	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=234,307;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23826219_A_C:23826219:0,1,0,1
chr4	23886323	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr4	24521943	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=165,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:4,4,0,2
chr4	24534572	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:13,3:12,0:14,11,3,0
chr4	24578260	.	T	TCCTCTCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:2,14,0,2
chr4	24801354	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	24802323	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr4	24824076	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=164,243;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:4,1:3,2:7,6,3,0
chr4	24836685	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=141,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.314:11:4,2:2,1:1,7,0,3
chr4	25028492	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,93;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:11,3:12,0:11,14,2,1
chr4	25030312	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=211,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr4	25125802	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,4:8,0:7,9,0,4
chr4	25129031	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,0:4,5:1,7,0,5
chr4	25146307	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	25160732	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=216,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.311:16:7,1:1,3:0,11,2,3
chr4	25262251	.	TATATATATATATAC	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=195,219;MMQ=52,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.194:18:6,0:8,3:1,14,0,3
chr4	25262285	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=215,218;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:8,0:1,4:0,10,0,4
chr4	25262293	.	CA	TG	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=199,218;MMQ=60,40;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:9,0:1,4:0|1:25262293_CA_TG:25262293:0,10,0,4
chr4	25262297	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,25;MFRL=203,218;MMQ=60,40;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:8,0:1,4:0|1:25262293_CA_TG:25262293:0,9,0,4
chr4	25262301	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=209,218;MMQ=60,40;MPOS=-13;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:8,0:1,4:0|1:25262293_CA_TG:25262293:0,10,0,4
chr4	25315637	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=170,252;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.527:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr4	25334977	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=174,66;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,0:10,2:6,8,0,2
chr4	25366059	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:4,1:7,2:7,5,2,1
chr4	25370840	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=215,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr4	25393889	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=218,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,4:1,5:0,2,7,2
chr4	25394078	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr4	25396413	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=182,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:14,6,0,2
chr4	25404553	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=137,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:1,8:0,5:0,1,11,2
chr4	25408724	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:0,4:2,8:2,0,12,0
chr4	25417244	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=374,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,3:1,2:0,1,0,6
chr4	25669492	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=173,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:3,3,2,0
chr4	25674905	.	TCACA	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,2,6
chr4	25674911	.	G	GAGGGA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,2,6
chr4	25674913	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,2:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,2,6
chr4	25678396	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=194,263;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:3,4,2,0
chr4	25750261	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=228,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr4	25759128	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,15;MFRL=185,255;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,0:4,1,2,0
chr4	25760693	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=193,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:2,6,1,3
chr4	25767064	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:1,11,0,2
chr4	25767133	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	25769129	.	CC	GG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=126,113;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:8,3:8,3:9,7,6,0
chr4	25769135	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,8:7,4:9,2,8,4
chr4	25769319	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:0|1:25769319_T_C:25769319:6,4,2,2
chr4	25769327	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:0|1:25769319_T_C:25769319:5,5,2,1
chr4	25780599	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=170,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr4	25780891	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=200,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr4	25792247	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=224,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:25792247_A_G:25792247:0,3,0,1
chr4	25792249	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=224,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:25792247_A_G:25792247:0,3,0,1
chr4	25803830	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:3,0,3,3
chr4	25804063	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=195,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,0:7,7:7,8,0,7
chr4	26364300	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=179,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,0,5
chr4	26387959	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=110,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.462:21:1,6:4,4:6,5,6,4
chr4	26417068	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.312:11:5,1:2,1:3,5,1,2
chr4	26422255	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,46;MMQ=60,29;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:13,4:16,0:15,14,3,1
chr4	26483208	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:5,2:3,2:9,0,4,0
chr4	26491156	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=261,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr4	26491974	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr4	26615982	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr4	26616196	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=314,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr4	26690045	.	A	ACATATCTGTGAAGC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=168,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:1,8,0,2
chr4	26719692	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=189,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:1,4,0,3
chr4	26721578	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=213,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr4	26737063	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,7:1,4:1,1,6,7
chr4	26959207	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:8,0,3,0
chr4	26997101	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:5,10,0,2
chr4	27000995	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:1,3,0,5
chr4	27004490	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr4	27009062	.	CT	C,CTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34,33;MFRL=189,212,233;MMQ=60,60,60;MPOS=25,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.55,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.300,0.300:7:0,1,1:3,1,1:3,0,4,0
chr4	27019664	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=240,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27019664_A_T:27019664:0,1,0,1
chr4	27019665	.	G	GTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=240,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27019664_A_T:27019664:0,1,0,1
chr4	27019666	.	G	GCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=240,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27019664_A_T:27019664:0,1,0,1
chr4	30723330	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=183,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:9,5,1,1
chr4	30726180	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=167,98;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,3:2,0:3,5,1,2
chr4	36109409	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=202,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr4	36123024	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=193,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr4	36130375	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=200,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.662:10:1,5:2,2:1,2,2,5
chr4	36149025	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:0,5:3,8:0,3,4,9
chr4	36149113	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr4	36160340	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:3,1:9,3:8,4,3,1
chr4	36162273	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=90,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr4	37447753	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=193,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:9,3:12,0:8,13,3,0
chr4	37590570	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=212,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr4	37592602	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=45.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.656:30:6,8:4,12:0,10,0,20
chr4	37592674	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=221,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr4	37636750	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=181,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,4:4,1:0,8,1,4
chr4	37841430	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=140,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,0:4,5:3,2,4,1
chr4	37848530	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=65,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,3:3,1,2,3
chr4	37848827	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:8,0:17,4:11,14,0,4
chr4	37850312	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=194,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:1,4,1,1
chr4	38019917	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,0:6,2:8,1,2,0
chr4	38022167	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:7,5:3,6:8,2,8,3
chr4	38047545	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=195,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:1,2:6,3:2,5,0,6
chr4	38047613	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=204,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:0,8,1,1
chr4	38047618	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=193,270;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:1,7,0,2
chr4	38055946	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=146,147;MMQ=60,21;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,0:9,4:6,10,0,4
chr4	38097478	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr4	38119885	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=206,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:0,8,0,5
chr4	38134423	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,31,32,32;MFRL=147,146,130,142;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,18,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=T;STR;TLOD=5.46,6.78,6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:13,3,5,7:0.113,0.177,0.247:28:7,2,4,3:6,1,1,4:9,4,11,4
chr4	38134442	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=14,16;MFRL=128,130;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,13:0.202:60:12,0:5,0:36,11,13,0
chr4	38698924	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=191,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:4,6:1,8:1,4,2,12
chr4	38829163	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=137,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,1:15,1:12,12,2,0
chr4	38880046	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=142,217;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,1:10,1:4,12,2,0
chr4	38880136	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=198,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr4	38930921	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=138,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:3,5,1,2
chr4	38930985	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,10;MFRL=150,304;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,0:1,0:0|1:38930985_T_TAA:38930985:0,2,0,1
chr4	38930995	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=187,304;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.296:5:1,1:3,0:0|1:38930985_T_TAA:38930985:0,4,0,1
chr4	38933859	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,0:9,2:7,8,1,1
chr4	38942697	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=19,35;MFRL=162,225;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:0,1:1,2:0,3,1,2
chr4	38944976	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,313;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	39064126	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=251,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:0,7:2,6:2,0,11,2
chr4	39064162	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.915:21:0,11:1,9:1,0,14,6
chr4	39105183	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=222,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,0:2,8:0,3,0,8
chr4	39109399	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=209,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr4	39114559	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=196,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr4	39114637	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=153,39;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:9,4,1,1
chr4	39116775	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=204,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,8:3,1:4,3,6,3
chr4	39122577	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=193,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:7,2,3,1
chr4	39184297	.	AAG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=202,255;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AG;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr4	39187521	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.506:6:1,0:2,3:0|1:39187521_TG_T:39187521:0,3,0,3
chr4	39187522	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,6:0.883:6:0,2:0,4:1|0:39187521_TG_T:39187521:0,0,0,6
chr4	39205365	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr4	39216377	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=166,270;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.219:12:4,2:2,0:0,10,0,2
chr4	39226486	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.503:8:3,2:0,2:4,0,4,0
chr4	39233948	.	G	GAATACTTTTACACTGTTGGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=251,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.313:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	39233977	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=244,314;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr4	39241821	.	A	ATT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,251;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39241821_A_ATT:39241821:0,0,1,0
chr4	39241822	.	AGG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,251;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39241821_A_ATT:39241821:0,0,1,0
chr4	39255496	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=107,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,2:6,1:5,3,2,1
chr4	39271541	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,258;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,1,1
chr4	39276623	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,2,2
chr4	39279724	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=156,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.587:20:3,5:4,2:2,6,10,2
chr4	39279790	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:14,3:10,0:13,11,0,3
chr4	39279907	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:6,3:5,1:3,8,0,4
chr4	39297200	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=170,286;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:39297200_G_A:39297200:6,4,2,0
chr4	39297211	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=238,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,6:0.466:13:2,3:5,3:1|0:39297200_G_A:39297200:4,3,4,2
chr4	39301605	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:2,1,4,0
chr4	39303925	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:4,5:5,5,5,4
chr4	39308187	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=97,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:6,8:3,4:6,3,5,7
chr4	39318706	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=171,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr4	39321969	.	CAA	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=130,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=A;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.420:14:3,2:1,2:4,4,4,2
chr4	39321987	.	AAAAC	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=129,215;MMQ=60,52;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.113:34:15,1:12,1:15,16,3,0
chr4	39329102	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=73,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:1,1,5,2
chr4	39343940	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,4:3,4:3,3,7,1
chr4	39353122	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr4	39408882	.	A	ATGGAATGGAATGGAATGG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=134,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,2:10,0:10,8,0,2
chr4	39409416	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0,7,1,2
chr4	39439478	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,4:8,0:5,10,0,4
chr4	39447972	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,91;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:6,2,2,0
chr4	39448529	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=205,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:2,2,0,2
chr4	39448542	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr4	39449824	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	39456392	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,3:1,4:2,0,6,1
chr4	39459154	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=146,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,2:10,1:11,6,2,1
chr4	39459724	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr4	39463903	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=197,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:5,5:6,6:7,4,5,6
chr4	39469279	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:8,2:8,0:10,6,1,1
chr4	39472786	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:2,2,3,1
chr4	39472946	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=213,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.411:8:2,1:2,1:4,1,1,2
chr4	39478832	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=261,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr4	39501722	.	CAAAA	C,CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,35,33;MFRL=0,168,175;MMQ=60,60,60;MPOS=19,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,15;RU=A;STR;TLOD=7.26,13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,11:0.274,0.540:19:1,3,6:1,2,4:2,1,8,8
chr4	39511530	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=176,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.296:11:3,2:5,1:0,8,0,3
chr4	39747536	.	A	G	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=246.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,65:0.986:65:0,26:0,38:0,0,0,65
chr4	39776627	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=247,131;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr4	39847505	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=109,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.290:16:8,1:3,3:5,7,0,4
chr4	39851058	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=132,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr4	39871117	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=195,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.596:8:0,3:2,2:0,3,1,4
chr4	39903924	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=141,238;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:10,3,2,0
chr4	39904136	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=19,11;MFRL=200,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.413:7:0,0:1,0:0,4,0,3
chr4	39904142	.	ATTT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=176,301;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr4	39910172	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=249,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	39918636	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=130,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.590:8:1,1:2,2:3,0,2,3
chr4	39924372	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=16,28;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:0,2:0,1:0,1,2,3
chr4	39928382	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=99,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,2:5,1:10,3,2,1
chr4	40123351	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=123,36;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:16,0:11,2:14,13,1,1
chr4	40245005	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=171,192;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:16,4:16,0:14,18,4,0
chr4	40245036	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=164,192;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:21,5:16,0:18,19,4,1
chr4	40337944	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=197,140;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,7:4,2:3,6,3,6
chr4	40438576	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.791:22:1,4:3,13:4,0,8,10
chr4	40809207	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=221,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:2,1:3,4,1,1
chr4	40818013	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr4	40818114	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=129,124;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,0:10,3:8,9,0,3
chr4	41266046	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=186,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:8,2,2,0
chr4	41270055	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=135,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,3:11,0:9,9,2,1
chr4	41615249	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=376,262;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,6:1,3:0,1,0,9
chr4	41615664	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=130,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:9,0:13,2:0|1:41615664_G_T:41615664:10,13,1,1
chr4	41615669	.	AGCAGCG	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=142,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:10,0:14,2:0|1:41615664_G_T:41615664:10,17,1,1
chr4	41615690	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=221,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.801:23:2,10:2,9:0,4,6,13
chr4	41646651	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=195,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:9,1:9,3:11,7,3,1
chr4	41652442	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,2:6,5:7,4,5,2
chr4	41684342	.	C	CATCTTGACAGTT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=191,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:41684342_C_CATCTTGACAGTT:41684342:3,2,1,1
chr4	41684345	.	C	CCAGG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=191,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:41684342_C_CATCTTGACAGTT:41684342:3,2,1,1
chr4	41684346	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=191,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.324:7:3,2:2,0:0|1:41684342_C_CATCTTGACAGTT:41684342:3,2,1,1
chr4	41691709	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=85,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	41699137	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=164,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.231:37:13,8:16,0:18,11,8,0
chr4	41699154	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=128,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:24,0:11,2:0|1:41699154_G_GT:41699154:19,16,0,2
chr4	41699157	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=128,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:23,0:12,2:0|1:41699154_G_GT:41699154:20,16,0,2
chr4	41748007	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,355;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	41941462	.	G	GTGTAGCTGTCATTATGTTGAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=212,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.289:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr4	41956251	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=144,262;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:41956251_G_A:41956251:1,10,0,2
chr4	41956255	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=145,262;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:7,2:0|1:41956251_G_A:41956251:1,9,0,2
chr4	41985272	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.693:10:1,3:2,3:1,2,4,3
chr4	41986857	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=203,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.858:19:0,9:2,8:0,2,7,10
chr4	41987125	.	G	GTA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=170,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TA;STR;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:6,2:4,3:7,3,3,2
chr4	41987233	.	CA	C,CAA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,35,36;MFRL=136,171,186;MMQ=60,60,24;MPOS=25,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=5.35,21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,4,10:0.172,0.400:25:5,2,2:6,2,8:4,7,2,12
chr4	41987266	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=179,186;MMQ=60,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:9,0:10,6:5,14,0,6
chr4	41988385	.	TAC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=226,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:1,5:1,2,1,7
chr4	42003671	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:1,7:0,7:1,0,8,6
chr4	42003835	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:1,10:1,4:0,2,4,10
chr4	42024982	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr4	42025049	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	42040947	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr4	42065144	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,98;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,0:6,3:6,8,0,3
chr4	42069029	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	42080152	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:6,0,2,0
chr4	42402992	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=128,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:4,1,5,0
chr4	42403561	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=199,228;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr4	42457516	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=117,115;MMQ=60,22;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:7,7:13,0:13,7,7,0
chr4	42466641	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,3:0,2:3,0,4,1
chr4	42571074	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=62.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,17,3
chr4	42580397	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=169,209;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:11,0:5,5:8,9,0,5
chr4	42580428	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=178,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,3:3,1:1,5,0,4
chr4	42582047	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr4	42592935	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=216,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr4	42602606	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,6,10
chr4	42626521	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=132,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:7,0:10,6:11,6,6,0
chr4	42626659	.	GAAA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=19,26;MFRL=93,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.208:19:4,1:1,1:3,12,2,2
chr4	42627805	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	42658902	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=180,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,4:5,2:1,6,1,5
chr4	42965159	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,9:4,2:2,4,4,7
chr4	43032612	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=220,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,4:1,5:0,2,0,9
chr4	44631514	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,1:2,1:6,4,2,0
chr4	44631587	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=196,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:4,1:0,4:1,4,1,5
chr4	44651968	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=197,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:2,1,3,0
chr4	44652187	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=160,245;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,2:1,7:0,1,0,9
chr4	44652214	.	A	AACACTG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=197,244;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,0:2,4:0|1:44652214_A_AACACTG:44652214:0,6,0,4
chr4	44652217	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=197,244;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,0:2,4:0|1:44652214_A_AACACTG:44652214:0,6,0,4
chr4	44682661	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:9,3:8,2:13,7,3,2
chr4	44684455	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,4,20
chr4	44684507	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr4	44685224	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0|1:44685224_T_TA:44685224:0,0,6,4
chr4	44685225	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0|1:44685224_T_TA:44685224:0,0,6,4
chr4	44685236	.	ATT	A,AT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,32,28;MFRL=112,119,155;MMQ=60,60,60;MPOS=12,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=4.04,6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,4:0.184,0.254:18:4,2,4:7,1,0:7,4,6,1
chr4	44691206	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	44691795	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,3:4,4:6,0,7,0
chr4	44696538	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,4,14
chr4	44699484	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:5,5:0,3:2,3,5,3
chr4	44699506	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=183,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:5,6:0,1:1,4,3,4
chr4	44709695	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr4	44712908	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=166,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr4	44713156	.	T	TGCACCTTTACTATCAG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=158,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:7,2:3,0:4,6,1,1
chr4	44713235	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:2,4:0,3:0,2,0,7
chr4	44719048	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=173,229;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr4	44720248	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=174,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=44.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:2,9:0,5:2,0,14,0
chr4	46263862	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=233,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:46263862_A_AG:46263862:1,0,3,0
chr4	46263864	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=233,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:46263862_A_AG:46263862:1,0,3,0
chr4	46314593	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=117,176;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,1:6,1:5,9,2,0
chr4	46388044	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=188,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:8,1,2,0
chr4	47033770	.	TCG	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.438:21:8,4:4,5:0|1:47033770_TCG_T:47033770:4,8,4,5
chr4	47033772	.	GCT	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CT;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,7:0.479:14:4,4:2,3:1|0:47033770_TCG_T:47033770:2,5,2,5
chr4	47034032	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=140,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,0:11,3:4,12,3,0
chr4	47034081	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=136,267;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:1,0:0|1:47034081_G_C:47034081:0,3,0,3
chr4	47034088	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,15;MFRL=136,267;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:2,0:0|1:47034081_G_C:47034081:0,3,0,3
chr4	47034104	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0|1:47034081_G_C:47034081:0,0,0,3
chr4	47163253	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=14,20;MFRL=358,268;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.486:4:0,0:0,1:0|1:47163253_C_G:47163253:2,0,2,0
chr4	47163263	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=254,358;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.600:3:0,0:1,0:1|0:47163253_C_G:47163253:1,0,2,0
chr4	47163277	.	CA	AC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,10;MFRL=358,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:47163253_C_G:47163253:2,0,1,0
chr4	47524961	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=197,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:7,1,4,0
chr4	47524997	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.316:16:5,1:5,4:11,0,4,1
chr4	47525009	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,14,5
chr4	47527537	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,2:13,0:13,5,1,1
chr4	47538044	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,6:7,4:7,6,4,6
chr4	47538360	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=214,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:3,4:0,8:3,0,12,0
chr4	47560386	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=247,248;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr4	47561141	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr4	47589299	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr4	47592997	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0|1:47592997_G_GT:47592997:2,0,3,0
chr4	47593008	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,35;MFRL=211,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:0,1:0|1:47592997_G_GT:47592997:1,0,3,0
chr4	47605318	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=201,271;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	47625811	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,1,3
chr4	47625968	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=206,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:7,5,0,2
chr4	47667257	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=203,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:9,4:6,0:7,8,4,0
chr4	47679928	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:3,1,3,2
chr4	47853843	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=255,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:2,0,2,2
chr4	47857040	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=187,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.601:28:6,6:5,11:6,5,8,9
chr4	47881191	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:0,8,0,2
chr4	47886319	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,2:3,2:8,1,2,2
chr4	47886329	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=175,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:3,3:4,0:4,4,3,0
chr4	47898491	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr4	47901155	.	CAAAAAA	C,CAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34,17;MFRL=144,156,180;MMQ=60,60,60;MPOS=15,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,16,19;RU=A;STR;TLOD=7.96,6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.447,0.341:6:1,0,0:0,3,0:0,1,1,4
chr4	47901315	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr4	47905158	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,6:0,4:1,0,9,1
chr4	47944029	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	47945275	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=137,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,0:15,3:11,12,2,1
chr4	47945295	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.211:30:9,0:12,5:10,14,5,1
chr4	47951945	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=403,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,5:0,7:0,1,5,7
chr4	47953515	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=218,242;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	48037926	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:3,5:0,4:2,1,3,6
chr4	48069725	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:5,8:1,3:0,6,5,6
chr4	48073501	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:1,0,6,1
chr4	48076091	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,1:3,1:6,5,1,1
chr4	48078593	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=173,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	48081896	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.709:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr4	48082208	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr4	48088419	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=177,355;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:5,3,1,1
chr4	48088446	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr4	48114397	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=171,100;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:8,3:17,0:14,11,3,0
chr4	48139565	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:1,3,0,3
chr4	48147612	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=181,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr4	48152960	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=138,226;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:12,8,0,2
chr4	48165834	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=200,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.330:10:6,2:1,1:0|1:48165834_T_C:48165834:1,6,0,3
chr4	48165835	.	T	TGAAA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=200,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GAAA;STR;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.330:10:6,2:1,1:0|1:48165834_T_C:48165834:1,6,0,3
chr4	48165888	.	CTTA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=223,285;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTA;STR;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr4	48169769	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=128,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:4,4:2,7:4,2,6,5
chr4	48170669	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=195,186;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:1,0:7,5:1,7,2,3
chr4	48172218	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=178,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:6,0,4,0
chr4	48173547	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=207,222;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:0,6,0,3
chr4	48178003	.	A	AAATCAGCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AATCAGCC;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:4,0,3,0
chr4	48343693	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=197,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:4,1:7,1:10,1,2,0
chr4	48343732	.	AGGC	A,AGGCGGCGGC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29,28;MFRL=157,193,147;MMQ=60,60,60;MPOS=27,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=5,4,7;RU=GGC;STR;TLOD=6.34,10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.212,0.343:9:3,0,0:1,2,3:4,0,4,1
chr4	48372085	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=218,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	48492434	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	48516970	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr4	48523041	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:3,8:9,0:8,4,0,9
chr4	48529683	.	TAA	T,TA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,28,28;MFRL=216,173,116;MMQ=60,60,60;MPOS=17,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=9.18,10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,7:0.341,0.444:15:1,2,5:1,2,2:0,3,1,11
chr4	48529733	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,2,5
chr4	48533148	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr4	48537603	.	T	TACACAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,45;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=14,17;RU=AC;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	48541973	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,9:0,0,20,2
chr4	48553586	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=183,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,3:6,0:5,9,1,2
chr4	48572782	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:10,1,0,2
chr4	48573028	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	48577121	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,10:0,0,10,8
chr4	48582836	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	48583061	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=219,203;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr4	48591791	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=142,51;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:7,0:10,4:11,6,2,2
chr4	48596036	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=133,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:2,4:3,4:3,2,2,6
chr4	48607938	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	48610961	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.578:17:4,4:3,6:6,1,8,2
chr4	48611153	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr4	48611929	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=168,236;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,2:3,6:0,4,0,8
chr4	48625086	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,0:12,3:14,7,3,0
chr4	48625204	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=125,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.304:15:4,2:6,3:0,10,3,2
chr4	48625212	.	AC	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=117,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:3,2:8,1:3,8,0,3
chr4	48625213	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,5:0,11:0,0,3,13
chr4	48636434	.	AT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=91,250;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.204:23:10,3:8,1:7,12,1,3
chr4	48894981	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr4	48896125	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr4	48990476	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.895:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr4	48993610	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:3,1:3,2:3,4,0,3
chr4	48994138	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:4,4:2,8:0,6,2,10
chr4	49034669	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.306:24:11,3:6,4:8,9,2,5
chr4	52729635	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=139,48;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:17,0:10,2:0|1:52729635_G_T:52729635:16,11,1,1
chr4	52729640	.	T	TTA	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=166,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:16,0:12,2:0|1:52729635_G_T:52729635:15,14,1,1
chr4	52729644	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=166,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:17,0:11,2:0|1:52729635_G_T:52729635:15,16,1,1
chr4	52729646	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=168,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:18,0:12,2:0|1:52729635_G_T:52729635:14,16,1,1
chr4	52779651	.	G	GTTA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=220,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TTA;STR;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:5,1:3,1:5,3,0,2
chr4	52860887	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=182,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,4:7,0:5,5,4,0
chr4	52863824	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=158,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:3,1:2,1:6,0,2,0
chr4	52894142	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=175,127;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,3:9,0:10,7,3,0
chr4	52894797	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=139,267;MMQ=60,41;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr4	52894798	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=196,124;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr4	52895891	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:9,0:12,4:11,10,0,4
chr4	52896050	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=149,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr4	52927113	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=180,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,5:1,4:0,3,0,9
chr4	52928352	.	GTT	G,GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33,35;MFRL=0,209,164;MMQ=60,60,60;MPOS=17,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=5.36,5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.444,0.444:6:0,1,2:0,2,1:0,0,6,0
chr4	52946161	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	52951206	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=158,90736703;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr4	52951213	.	CTT	C,CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35,36;MFRL=0,92,90736703;MMQ=60,60,60;MPOS=21,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.20,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.587,0.248:3:0,1,0:0,1,1:0,0,0,3
chr4	52960908	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=189,220;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:1,0,3,4
chr4	53463763	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=206,68;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:4,1,2,2
chr4	53476693	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=176,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,0:6,4:11,2,1,3
chr4	53729429	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:6,3:8,6:8,6,4,5
chr4	53740236	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=185,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.303:17:5,1:6,3:6,6,2,3
chr4	54179854	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,2:10,0:11,13,2,0
chr4	54232001	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=172,38022107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:0,7,1,1
chr4	54243905	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	54244174	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:2,7:3,4:0,5,0,11
chr4	54245476	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=122.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,17:0,21:0,0,10,29
chr4	54248502	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=210,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,0:9,3:9,9,2,1
chr4	54280705	.	GAA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=167,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr4	54291954	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=217,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:10,0,2,0
chr4	54310188	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,7,5
chr4	54310340	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr4	54319011	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr4	54327211	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,0:4,2:0,6,0,2
chr4	54327235	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,0,11
chr4	54327584	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,11,3
chr4	54362150	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=145,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:3,0,3,1
chr4	54373464	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=216,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.334:25:11,5:5,3:13,4,3,5
chr4	54852693	.	CTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,5;RU=TTTTA;STR;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr4	54880331	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=158,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:5,2:4,12,0,2
chr4	54966830	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,9,5
chr4	54967709	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=222,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:5,0,5,1
chr4	55125058	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=165,231;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,1:2,1:0,6,2,0
chr4	55131001	.	TAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=258,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr4	55139978	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr4	55144447	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	55146406	.	T	TTGTAGGTCCCCCAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=47.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,10,1
chr4	55151711	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr4	55151958	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr4	55156380	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr4	55156400	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr4	55161254	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr4	55161517	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr4	55161537	.	G	GTTTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=297,235;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:55161537_G_GTTTT:55161537:0,3,0,1
chr4	55161538	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=297,235;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:55161537_G_GTTTT:55161537:0,3,0,1
chr4	55946081	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0,0,12,3
chr4	55948108	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr4	55955232	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	55955737	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=281,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:1,1:1,3:1,1,3,2
chr4	55961159	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=211,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,3:2,1:3,5,0,4
chr4	55967986	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	55968053	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=170,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr4	55976947	.	TA	T,TAA,TAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,18,20,11;MFRL=60,49,76,113;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,20,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,12,14,15;RU=A;STR;TLOD=5.35,8.27,3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,4,6,4:0.235,0.365,0.241:16:0,1,3,0:1,1,1,1:0,2,5,9
chr4	55980239	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=191,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:4,2,1,1
chr4	55987207	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=217,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,0:5,2:6,0,2,0
chr4	55987454	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,0:4,8:0,8,0,8
chr4	56235897	.	CAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=222,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr4	56235928	.	TTGCGAGTGAAGTGGTGAAACTTTCTTTTCAAACCTTTAAATGCTTATGAGATCTTCTTTTACCCTTTCAGGAG	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=145,106;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.185:21:1,1:3,3:11,6,4,0
chr4	56235931	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=216,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:0,1:1,1:2,0,1,1
chr4	56236091	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=153,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,1:7,2:8,8,0,3
chr4	56262374	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr4	56291479	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=156,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:1,1:3,2:5,0,3,0
chr4	56291528	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=146,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:7,3:3,8:6,4,9,2
chr4	56291620	.	CAA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=110,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:7,5:8,4:4,11,2,7
chr4	56319350	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=181,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,0:6,2:3,4,0,2
chr4	56322244	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=255,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,1:1,5:2,0,6,1
chr4	56342326	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=226,358;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:1,0:1,2:0,2,0,3
chr4	56428820	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=202,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:1,3,0,6
chr4	56435849	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,1:0,2:5,0,2,1
chr4	56448235	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=139,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr4	56465418	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr4	56466653	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,2:0,5:4,0,6,1
chr4	56471551	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=127,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:2,4:4,4:2,4,2,7
chr4	56502307	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	56734701	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:6,6:6,7:4,8,5,8
chr4	56736794	.	T	TTTTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=169,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TTTG;STR;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr4	56758700	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=184,296;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr4	56758857	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=184,31;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:5,2:2,0:0|1:56758857_A_C:56758857:2,5,1,1
chr4	56758858	.	C	CTCCCCCATTCCT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=184,31;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:5,2:2,0:0|1:56758857_A_C:56758857:2,5,1,1
chr4	56759773	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,23;MFRL=182,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:3,3,2,0
chr4	56768601	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=152,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,2:8,1:8,7,2,1
chr4	56768790	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=261,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr4	56830605	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr4	56835114	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=199,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr4	56840846	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr4	56858007	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=182,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr4	56865884	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:56865884_G_A:56865884:0,3,0,1
chr4	56865897	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=186,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:56865884_G_A:56865884:0,4,0,1
chr4	56865900	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=186,138;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:56865884_G_A:56865884:0,4,0,1
chr4	56878193	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=198,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,3:7,1:0,12,0,4
chr4	56884079	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=196,217;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	56885581	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=135,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:14,1:9,2:13,10,0,3
chr4	57176955	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,319;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:57176955_T_TC:57176955:0,0,0,3
chr4	57176974	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=237,272;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:57176955_T_TC:57176955:0,3,0,1
chr4	57189498	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=162,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,1:2,4:2,0,4,1
chr4	57193762	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,246;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr4	57208955	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=215,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:3,2:7,0,3,0
chr4	57211352	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=156,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:3,4:9,2:5,7,3,3
chr4	57248591	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr4	57267124	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,4:4,1:3,1,2,3
chr4	57269363	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:8,5,0,2
chr4	57269579	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=220,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:1,7,1,4
chr4	57269646	.	A	AAAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr4	57272612	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=192,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:57272612_C_T:57272612:4,0,1,0
chr4	57272620	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=192,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:57272612_C_T:57272612:4,0,2,0
chr4	57301478	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=189,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr4	57312387	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=219,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr4	57314903	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=160,131;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,0:8,4:6,10,4,0
chr4	57319694	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.280:5:1,0:2,1:4,0,1,0
chr4	57333927	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=229,252;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:13,0:8,2:8,14,0,2
chr4	57340592	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,5:1,2:1,3,1,6
chr4	57349282	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=195,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:4,4,6,2
chr4	57384894	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:14,5:14,0:12,16,5,0
chr4	57516896	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,115;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:3,7:1,3:1,3,4,6
chr4	57521972	.	GGCTCAGCC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=191,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr4	57522232	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=304,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:57522232_G_A:57522232:0,2,0,1
chr4	57522240	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=304,230;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:57522232_G_A:57522232:0,2,0,1
chr4	57523869	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=192,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:0,5:5,5:3,2,6,4
chr4	57686849	.	C	CTAGAGTGCAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=174,246;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:57686849_C_CTAGAGTGCAG:57686849:0,4,0,1
chr4	57686852	.	G	GCGCAATCTCGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=174,246;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:57686849_C_CTAGAGTGCAG:57686849:0,4,0,1
chr4	57777283	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,95;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:13,0:8,3:10,11,0,4
chr4	57796900	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=196,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.349:17:7,2:4,1:7,4,6,0
chr4	57798174	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=135,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,4:6,2:5,5,2,4
chr4	57830501	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=117,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr4	57830663	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=175,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:3,3,2,5
chr4	57861091	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,10;MFRL=281,209;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,0:0|1:57861091_G_T:57861091:0,3,0,3
chr4	57861095	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,15;MFRL=281,209;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:0,0:0|1:57861091_G_T:57861091:0,3,0,3
chr4	57861096	.	GAAAAAAAA	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=10,32;MFRL=286,291;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,8;RU=A;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.618:3:0,2:0,0:1|0:57861091_G_T:57861091:0,1,0,2
chr4	57861097	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,10;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.819:3:0,0:0,0:0|1:57861091_G_T:57861091:0,0,0,3
chr4	57861117	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:57861091_G_T:57861091:0,0,0,5
chr4	57861358	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=232,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr4	57871400	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.408:15:5,2:4,4:6,3,4,2
chr4	57871750	.	T	TTC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=161,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.218:20:7,3:7,2:12,3,2,3
chr4	57881581	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	57883175	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=126,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,5:0,6:0,1,9,2
chr4	57887252	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:1,1:2,2:0,4,0,3
chr4	57888510	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=218,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0,4,0,4
chr4	57891239	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=225,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr4	57897570	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,258;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr4	57906986	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,2:1,0:4,3,2,0
chr4	62453209	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=237,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr4	62599289	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=133,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:3,5:5,3:1,7,3,6
chr4	62758398	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=205,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:9,2:6,6:8,7,4,4
chr4	62758491	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=139,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,2:3,2:5,4,3,1
chr4	62758736	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=32,22;MFRL=217,228;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.568:12:3,0:2,6:0|1:62758736_G_A:62758736:0,5,0,7
chr4	62758741	.	CTTTTCCTTTTCCTT	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=30,36;MFRL=217,228;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.566:12:2,0:2,6:0|1:62758736_G_A:62758736:0,5,0,7
chr4	62758761	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=215,228;MMQ=60,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:62758736_G_A:62758736:0,2,0,1
chr4	62758767	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=215,228;MMQ=60,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:62758736_G_A:62758736:0,2,0,1
chr4	62758771	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,19;MFRL=215,228;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:62758736_G_A:62758736:0,2,0,1
chr4	62758773	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=215,228;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:62758736_G_A:62758736:0,2,0,1
chr4	62775479	.	ATGTG	A,ATG	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,28,25;MFRL=0,232,160;MMQ=60,60,60;MPOS=15,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,18,19;RU=TG;STR;TLOD=3.59,61.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,24:0.119,0.851:27:0,1,15:0,2,8:0,0,5,22
chr4	62775485	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=232,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,24:0.875:27:1,14:1,6:0,3,5,19
chr4	62800554	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,8,8
chr4	62800728	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr4	62861941	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=131,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:1,8:2,2:2,1,7,4
chr4	62861964	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=131,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:1,10:2,4:2,1,10,4
chr4	62897192	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=123,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,2:7,0:6,8,1,1
chr4	65145955	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0|1:65145955_T_G:65145955:0,0,0,9
chr4	65145966	.	T	TAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:65145955_T_G:65145955:0,0,0,8
chr4	65146700	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr4	65146711	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,2:0,10:0,0,8,4
chr4	65165660	.	CG	TA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.233:15:8,1:4,2:0|1:65165660_CG_TA:65165660:9,3,1,2
chr4	65165661	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,17:0.947:17:0,10:0,7:1|0:65165660_CG_TA:65165660:0,0,10,7
chr4	65165849	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=196,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr4	65180310	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.686:17:3,9:2,2:5,0,10,2
chr4	65240805	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,6,0
chr4	65240822	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:7,2:0,0:4,3,2,0
chr4	65240967	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:0,5,2,4
chr4	66218728	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.889:25:1,8:1,15:1,1,12,11
chr4	66218805	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,0:5,2:3,8,1,1
chr4	66218917	.	G	GTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=194,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TA;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	66231686	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:11,3:9,1:7,13,1,3
chr4	66233029	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=171,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr4	66286088	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr4	66286100	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr4	66286237	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=119,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,2:5,0:0|1:66286237_GT_G:66286237:6,5,1,1
chr4	66286244	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=143,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:0|1:66286237_GT_G:66286237:6,6,1,1
chr4	66356248	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,0:6,2:9,10,0,2
chr4	66509194	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,3:1,5:0,5,0,8
chr4	67142470	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=165,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.318:13:3,3:6,0:6,3,3,1
chr4	67142691	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=203,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:2,0:3,2:0,5,0,3
chr4	67142703	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=230,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr4	68360955	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=120,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.835:16:2,3:0,11:1,1,3,11
chr4	68374597	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=136,183;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.288:18:7,2:6,2:6,7,4,1
chr4	68384861	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=129,247;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,0:3,3:8,1,3,0
chr4	68384908	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=114,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:9,3:6,4:8,7,7,0
chr4	68385143	.	A	AT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=133,130;MMQ=60,28;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.422:36:12,0:8,15:12,9,0,15
chr4	68396525	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,237;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:6,1,0,2
chr4	68406882	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=199,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr4	68410009	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=272,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:68410009_C_T:68410009:0,4,0,2
chr4	68410030	.	T	TCTCTCACACAGCTCTGCTGAGGGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=302,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:2,1:1,0:0|1:68410009_C_T:68410009:0,3,0,1
chr4	68441091	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=214,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,3:1,6:4,1,5,4
chr4	68442968	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=195,109;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:0,9:1,7:0,1,12,5
chr4	68447200	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=205,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:5,9:1,3:4,2,4,8
chr4	68447249	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:0,4,2,0
chr4	68458937	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,56;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:4,1:7,1:10,2,2,0
chr4	68490019	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,4:3,7:1,5,4,7
chr4	68490044	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=154,232;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr4	68490650	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:8,0,3,0
chr4	68492060	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,5,1
chr4	68492244	.	T	TAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr4	68496080	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=165,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,3,1
chr4	68497333	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=177,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,5,1
chr4	68499205	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,2:3,0:0,6,0,2
chr4	68500052	.	AAAAGAAAAAAAAAATTACAAATAGAAGTCTGTTTAAAGTCAGAAATATCTTCTTTCTCACTTC	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.090:32:7,2:7,0:16,14,1,1
chr4	68514739	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=153,254;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,0:5,4:4,3,2,2
chr4	68528744	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=211,262;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr4	68543240	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr4	68544318	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=202,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:0,3,1,5
chr4	68547165	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,2:6,0,4,2
chr4	68547774	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:9,0,2,0
chr4	68547809	.	A	ATAC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=130,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.708:22:2,6:4,10:4,2,13,3
chr4	68620063	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68620063_G_A:68620063:0,1,0,1
chr4	68620068	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,30;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68620063_G_A:68620063:0,1,0,1
chr4	68620070	.	GCTT	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68620063_G_A:68620063:0,1,0,1
chr4	68620075	.	AAG	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,26;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68620063_G_A:68620063:0,1,0,1
chr4	68620079	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,32;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68620063_G_A:68620063:0,1,0,1
chr4	68620086	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=36,27;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:1,1:0|1:68620063_G_A:68620063:0,1,0,1
chr4	68703866	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=174,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:10,8:8,0:12,6,8,0
chr4	68777054	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=176,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:6,6:5,0:7,4,3,3
chr4	68780253	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=299,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:4,2,6,0
chr4	68780512	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=299,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr4	68788719	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=109,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr4	68789778	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=189,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:3,1,3,1
chr4	68789815	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=133,78;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,3:7,0:8,6,2,1
chr4	68829004	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.496:10:3,5:2,0:5,0,5,0
chr4	68829207	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=179,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:1,1,0,3
chr4	68919617	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=123,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:3,4:6,3:7,3,4,3
chr4	68934252	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=237,251;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr4	68934306	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=166,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:2,4:0,4:1,1,7,1
chr4	68937948	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=AT;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	68938002	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=126,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr4	68939842	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=228,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=39.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,0:2,13:0,4,0,13
chr4	68956422	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=267,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr4	68964768	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,37;MFRL=185,263;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr4	69057073	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,2,1
chr4	69083563	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=198,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,6:3,2:3,3,6,2
chr4	69094926	.	TTAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:2,3:4,1:3,3,2,2
chr4	69097150	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr4	69098006	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=205,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,2:1,3:2,0,6,0
chr4	69100137	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=163,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr4	69101798	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,4:5,0:4,4,4,0
chr4	69101997	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr4	69203634	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=177,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,2:2,0:0,6,0,2
chr4	69215349	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	69327543	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=90.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,29:0.601:48:10,29:9,0:6,13,29,0
chr4	69340500	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=145,16142641;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:9,6,1,1
chr4	69342169	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=178,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,1:7,1:3,14,1,1
chr4	69362301	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr4	69362527	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=126,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:4,9:0,4:1,3,5,9
chr4	69416353	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=263,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,5:0,4:1,0,5,4
chr4	69417450	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr4	69433714	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=213,126;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,21:0.787:26:3,11:2,9:4,1,9,12
chr4	69434217	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr4	69528890	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chr4	69536084	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,11:0,3:1,0,4,10
chr4	69681675	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	69682471	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr4	69682555	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	69683953	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr4	69687964	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,17:0,9:0,0,20,6
chr4	69687987	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,22:0,9:0,0,10,21
chr4	69795871	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,0,10
chr4	69796548	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr4	69796838	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,8,3
chr4	69810923	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	69962966	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=178,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.568:12:2,3:3,4:0,5,3,4
chr4	69964209	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=363,290;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr4	69964337	.	AT	TC	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=96,294;MMQ=31,55;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:16,2:14,1:44,11,2,1
chr4	69978554	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=152,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.353:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr4	70066205	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=166,94183;MMQ=59,20;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.283:33:13,9:11,0:12,12,9,0
chr4	70146423	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=224,136;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,1:6,5:6,7,4,2
chr4	70146687	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=172,162;MMQ=60,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.497:40:15,19:5,0:7,13,20,0
chr4	70146704	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=197,170;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:10,7:5,0:9,6,3,4
chr4	70152685	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=186,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,0:5,2:1,4,0,2
chr4	70155477	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=158,166;MMQ=51,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:4,4,0,2
chr4	70160309	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=169,211;MMQ=60,51;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,1:5,3:3,8,1,3
chr4	70160338	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=133,215;MMQ=55,36;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:7,4:6,2:0|1:70160338_G_C:70160338:10,3,1,5
chr4	70160342	.	TG	CC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=139,215;MMQ=55,36;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:6,4:6,2:0|1:70160338_G_C:70160338:10,4,1,5
chr4	70346680	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=29,30;MFRL=144,297;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:70346680_G_A:70346680:4,4,1,1
chr4	70346693	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=24,25;MFRL=133,165;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.329:4:2,1:1,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,3,0,1
chr4	70346695	.	ACC	A	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=24,24;MFRL=133,165;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.329:4:2,1:1,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,3,0,1
chr4	70346700	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=33,27;MFRL=133,165;MMQ=60,24;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,3,0,1
chr4	70346706	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=34,28;MFRL=133,165;MMQ=60,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,3,0,1
chr4	70346711	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=314,165;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,1,0,1
chr4	70346715	.	CC	GG	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=31,32;MFRL=314,165;MMQ=60,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,1,0,1
chr4	70346721	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=26,31;MFRL=257,165;MMQ=52,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,2,0,1
chr4	70346723	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=30,26;MFRL=257,165;MMQ=52,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:0,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,2,0,1
chr4	70346727	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=27,27;MFRL=199,165;MMQ=43,24;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,1,0,1
chr4	70355380	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=186,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:2,2,1,2
chr4	70361182	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=189,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:2,3:7,3:4,5,3,3
chr4	70455084	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=158,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:7,1,2,0
chr4	70465153	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr4	70592790	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=138,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:4,2:0,2:4,0,4,1
chr4	70599073	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,4,0
chr4	70620708	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr4	70713584	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=207,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0,9,0,2
chr4	70723444	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,4:0,0:0,4,0,4
chr4	70798436	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=195,290;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr4	70803380	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=269,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr4	70805829	.	TCA	T,TCACACA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31,32;MFRL=0,158,170;MMQ=60,60,40;MPOS=9,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,18,21;RU=CA;STR;TLOD=4.31,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.553,0.314:3:0,1,0:0,1,1:0,0,0,3
chr4	70811806	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:5,1,3,1
chr4	70824865	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=248,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr4	70824887	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=200,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr4	70826810	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=135,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	70864065	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr4	70896355	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=239,230;MMQ=49,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,2:3,5:5,0,7,0
chr4	70899037	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	70921164	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,6:0,3:0,0,3,7
chr4	70921337	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=115,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:1,0,2,4
chr4	71020205	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr4	71021888	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr4	71024010	.	T	TACAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAA;STR;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr4	71027213	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=201,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:2,1,4,2
chr4	71062308	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=212,123;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,6:7,1:2,7,5,2
chr4	71062342	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=219,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:6,3:10,2:6,10,2,3
chr4	71067317	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=183,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr4	71110639	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:2,2:6,1:2,6,0,3
chr4	71227802	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,177;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,3:5,2:1,5,4,1
chr4	71227998	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=267,259;MMQ=52,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,2,0
chr4	71228001	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr4	71232493	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=169,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:5,1:10,0:0|1:71232493_T_A:71232493:6,12,1,1
chr4	71232497	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=169,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,1:8,1:0|1:71232493_T_A:71232493:5,11,1,1
chr4	71250308	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr4	71250399	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr4	71255370	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=230,145;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:4,4:3,1:5,2,5,1
chr4	71255593	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=196,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:2,3:5,6:1,6,5,4
chr4	71275012	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	71275480	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=128,121;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:10,0:17,4:18,9,0,4
chr4	71275889	.	C	CTAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TAAA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	71347694	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	71396989	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,2:7,1:7,8,1,2
chr4	71471966	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=155,155;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:23,0:14,4:12,26,0,4
chr4	71471974	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.201:27:13,0:9,5:11,11,0,5
chr4	71507969	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=173,101;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.395:26:10,0:5,10:4,12,0,10
chr4	71554619	.	CGAG	C	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=127,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GAG;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.088:34:16,1:11,2:15,16,3,0
chr4	71554626	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=127,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:22,0:13,2:20,19,1,1
chr4	71554690	.	GGGA	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=175,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GGA;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.115:23:9,0:11,1:13,8,0,2
chr4	71629196	.	ATG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TG;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:3,2:4,0:5,3,2,0
chr4	71656830	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=313,225;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0|1:71656830_TG_T:71656830:2,0,3,0
chr4	71656834	.	T	TAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=263,252;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0|1:71656830_TG_T:71656830:3,0,2,0
chr4	71656836	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=263,252;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0|1:71656830_TG_T:71656830:3,0,2,0
chr4	71691743	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	71698183	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,1,9
chr4	71892513	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,2:0,10:0,0,3,9
chr4	71894941	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=248,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr4	72306560	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=279,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr4	72316822	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,8,1
chr4	72397710	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	72397964	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr4	72411967	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr4	72423624	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr4	72429409	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	72429433	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=195,270;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr4	72429452	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr4	72433481	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:3,2:4,0:6,1,2,0
chr4	72620865	.	C	CTATTTATT,CTATTTATTTATT,CTATTTATTTATTTATT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,36,33,36;MFRL=0,186,369,272;MMQ=60,54,46,40;MPOS=25,23,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=7,9,10,11;RU=TATT;STR;TLOD=4.54,3.29,7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,1,2:0.286,0.256,0.390:5:0,0,1,0:0,2,0,2:0,0,0,5
chr4	72622403	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,2:0,7:0,0,6,3
chr4	72634211	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,30;MFRL=136,126;MMQ=40,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:72634211_A_T:72634211:0,3,0,1
chr4	72634214	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=136,126;MMQ=40,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:72634211_A_T:72634211:0,3,0,1
chr4	72634216	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=27,29;MFRL=136,126;MMQ=40,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:72634211_A_T:72634211:0,3,0,1
chr4	72634219	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,29;MFRL=136,126;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:72634211_A_T:72634211:0,3,0,1
chr4	72634220	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=136,126;MMQ=40,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:72634211_A_T:72634211:0,3,0,1
chr4	72634225	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=24,29;MFRL=136,126;MMQ=40,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:72634211_A_T:72634211:0,3,0,1
chr4	72634246	.	T	TACAACGTCG	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=28,27;MFRL=221,136;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.480:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	72634249	.	G	GCACA	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=213,161;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr4	72934632	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr4	73012963	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=187,150;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,0:8,2:8,4,0,2
chr4	73164077	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=154,88;MMQ=60,35;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:6,3:13,0:7,12,3,0
chr4	73175093	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,2:0,14:0,0,9,7
chr4	73178188	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=185,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,1:5,2:4,8,0,3
chr4	73188746	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,109;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:12,0:5,2:8,9,0,2
chr4	73433122	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:3,3,3,2
chr4	73434379	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=54.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,15,6
chr4	73930615	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=46.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,18:0.405:45:17,0:8,18:7,20,0,18
chr4	73933671	.	ATGTGTG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=TG;STR;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:0,9:1,0:1,2,9,1
chr4	73944311	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=176,71;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr4	73990623	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=126,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,2:12,0:14,7,1,1
chr4	73991006	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,13:0,9:0,0,15,8
chr4	74007870	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr4	74008554	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=189,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr4	74012462	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:0,6:3,7:3,0,9,4
chr4	74282092	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=275,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:2,4:0,2:0,2,2,4
chr4	74285204	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,11;MFRL=178,211;MMQ=44,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:1,0:8,0,2,0
chr4	74285239	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=134,191;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:1,6:0,9:1,0,11,4
chr4	74285254	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,8:7,0:9,5,8,0
chr4	74302151	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	74304118	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr4	74310844	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=233,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,3:1,7:1,2,2,8
chr4	74313169	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=86.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,15,10
chr4	74354469	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:3,7,1,1
chr4	74357851	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	74361163	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=165,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,3:6,0:5,6,1,2
chr4	74364992	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.651:9:1,2:1,3:0,3,0,6
chr4	74447452	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=155,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,1:3,2:4,1,3,1
chr4	74448078	.	ATCT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=220,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr4	74450830	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=228,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,2:6,1:9,0,3,0
chr4	74451073	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=195,133;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.332:16:6,3:4,2:0|1:74451073_A_G:74451073:2,9,3,2
chr4	74451092	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:0|1:74451073_A_G:74451073:1,7,2,5
chr4	74453656	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:12,4:5,7:7,10,5,6
chr4	74453691	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=201,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,0:4,7:5,6,1,6
chr4	74464285	.	T	TTG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TG;STR;TLOD=38.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,11,1
chr4	74464443	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.882:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr4	74486052	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr4	74486264	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr4	74607412	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,111;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.089:31:15,2:14,0:9,20,2,0
chr4	74713799	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=201,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.693:7:0,2:1,3:0,2,0,5
chr4	74713950	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=157,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr4	74714003	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=163,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,4:9,2:12,2,5,1
chr4	74719925	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr4	74735150	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=289,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr4	74735244	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=175,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:3,0:3,3:6,1,1,2
chr4	74736144	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,2:3,5:3,1,6,1
chr4	74847292	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr4	74853684	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=116,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:12,7,2,0
chr4	74903134	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=244,292;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr4	75040944	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,1:0,9:0,0,9,1
chr4	75065735	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:0,10,0,2
chr4	75147056	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=144,309;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,2:3,0:8,1,2,0
chr4	75167331	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=171,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:8,1,2,0
chr4	75245343	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr4	75248544	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr4	75673363	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	75675706	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	75680978	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=384,248;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr4	75681217	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=177,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,6:3,0:0,7,1,5
chr4	75938373	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=238,257;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr4	76415985	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr4	76416779	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=106,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,4:8,4:9,3,7,1
chr4	76434352	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=171,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,4:4,3:5,0,5,2
chr4	76525648	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr4	76572191	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:5,3,2,0
chr4	76580894	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=232,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:10,0,1,1
chr4	76649924	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:0,5:1,4:1,0,9,0
chr4	76650176	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,1,12
chr4	76678576	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=152,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,5:0,5:2,0,10,0
chr4	76695810	.	TTCTC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=199,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,2:2,5:8,1,5,2
chr4	76721414	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=164,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:4,0,5,0
chr4	76721459	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=117,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,2:4,6:4,3,7,1
chr4	76721705	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=228,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,2:2,1,5,0
chr4	76722041	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=213,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,4:0,4:0,1,2,6
chr4	76722422	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:0,2,0,7
chr4	76725245	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr4	76726528	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=157,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.721:9:1,2:1,4:0|1:76726528_T_C:76726528:0,2,1,6
chr4	76726539	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:76726528_T_C:76726528:0,2,1,2
chr4	76727576	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=143,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.731:13:2,4:1,6:3,0,9,1
chr4	76730004	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=173,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:2,0,7,0
chr4	76730061	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.502:14:3,2:4,5:4,3,5,2
chr4	76730201	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=125,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:6,2:9,2:3,12,1,3
chr4	76730258	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=203,158;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr4	76733417	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=175,105;MMQ=60,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:10,2:3,0:6,7,2,0
chr4	76734266	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:4,1:7,0,2,0
chr4	76734343	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:9,5:7,10:5,11,5,10
chr4	76782138	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=174,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:2,3:4,0:0,7,3,0
chr4	76785716	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:76785716_C_T:76785716:0,0,1,3
chr4	76785723	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:76785716_C_T:76785716:0,0,1,1
chr4	76785736	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	76804067	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr4	76805692	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr4	76805962	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	76805978	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,291;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	76809319	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr4	76857268	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,4:7,0:4,5,4,0
chr4	76861137	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=251,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,4:1,5:1,0,7,2
chr4	76861859	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=195,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr4	76878956	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=213,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,0:6,3:6,2,2,1
chr4	76878982	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=182,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,1:3,7:2,2,7,1
chr4	76879074	.	G	GTA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=132,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:6,2:9,2:9,6,2,2
chr4	76879082	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=161,72;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=43.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:5,2:7,14:7,5,2,14
chr4	76881392	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:76881392_C_T:76881392:0,11,0,2
chr4	76881401	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,4:0.384:11:3,1:4,3:1|0:76881392_C_T:76881392:0,7,0,4
chr4	76885423	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=186,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr4	76895403	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=223,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:12,0:1,11:0,13,0,11
chr4	76903036	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:1,3:1,5:2,0,6,3
chr4	76924933	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=297,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr4	76928428	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=228,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr4	76942943	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=197,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr4	76943677	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=129,255;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:1,1:1,2:0,2,2,2
chr4	76943764	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:5,1:8,0,5,1
chr4	76944491	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=224,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,3:1,5:3,1,6,2
chr4	76956289	.	C	CAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,3:5,4:4,4,2,5
chr4	76956528	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=82,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:1,4:1,4:1,1,2,6
chr4	76957171	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.753:24:4,12:1,6:1,4,8,11
chr4	76996958	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.594:13:1,1:4,7:3,2,7,1
chr4	77002952	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:4,3,2,5
chr4	77021433	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.392:13:4,1:4,4:6,2,3,2
chr4	77022286	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=165,234;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr4	77024982	.	C	CT,CTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33,35;MFRL=163,217,136;MMQ=60,60,60;MPOS=16,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.23,3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.428,0.287:4:0,1,1:1,1,0:1,0,3,0
chr4	77024996	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=17,15;MFRL=194,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.336:4:0,0:0,0:3,0,1,0
chr4	77033697	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:0,5,0,1
chr4	77033700	.	C	CTTTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,10;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:77033700_C_CTTTTTTT:77033700:0,4,0,1
chr4	77033705	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,29;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:77033700_C_CTTTTTTT:77033700:0,4,0,1
chr4	77033708	.	GA	TT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:77033700_C_CTTTTTTT:77033700:0,4,0,1
chr4	77033711	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,29;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:77033700_C_CTTTTTTT:77033700:0,4,0,1
chr4	77033725	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=182,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	77038807	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=196,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,7:4,2:10,1,5,4
chr4	77038974	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=212,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:4,3:0,9,0,7
chr4	77039174	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=193,78;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr4	77039193	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=237,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,3,1
chr4	77045777	.	TGG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=115,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=G;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:1,1:7,1,2,0
chr4	77052288	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,1:3,1:11,0,2,0
chr4	77052451	.	AA	TC	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=130,186;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=97.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,25:0.542:46:7,0:14,25:7,14,0,25
chr4	77052530	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=176,324;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	77053642	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=173,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:10,1,2,0
chr4	77055474	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.368:19:6,0:5,5:8,4,2,5
chr4	77057501	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:7,2:7,5:7,7,3,4
chr4	77065264	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=194,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:4,2,5,2
chr4	77065318	.	C	CTGT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=147,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGT;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,3:6,0:8,6,3,0
chr4	77065476	.	TAAAA	T,TAA,TAAA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,30,25,28;MFRL=67,244,206,154;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,20,31;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,11,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.99,14.43,9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,7,5:0.147,0.402,0.303:16:1,1,2,4:1,1,5,1:0,2,5,9
chr4	77065518	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.723:27:3,7:4,12:3,4,9,11
chr4	77065580	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=185,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.293:32:12,2:11,7:12,11,5,4
chr4	77097758	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=200,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	77134786	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=226,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:3,1:3,1:0,6,0,3
chr4	77199400	.	GAT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=182,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr4	77201332	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:1,0,8,0
chr4	77204500	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=154,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,5:3,3:2,4,7,1
chr4	77272940	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=114,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:8,0:11,4:0|1:77272940_T_C:77272940:5,15,0,4
chr4	77272945	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=114,124;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:7,0:12,4:0|1:77272940_T_C:77272940:5,14,0,4
chr4	77274242	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,0:1,3:4,2,2,1
chr4	77303898	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0|1:77303898_C_T:77303898:0,0,1,8
chr4	77303906	.	A	AAAATCTAC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=165,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:77303898_C_T:77303898:0,6,1,1
chr4	77324472	.	CTA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=220,308;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr4	77662309	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=229,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:2,1:2,2,5,0
chr4	77675746	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=168,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,2:11,0:8,9,2,0
chr4	77699987	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=126,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:7,5:6,2:12,1,6,1
chr4	77816837	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.307:30:11,0:9,8:12,9,0,9
chr4	77871016	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	77949885	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=122,69;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:10,4:13,0:8,15,2,2
chr4	77949997	.	TGGTCCAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:2,2:2,1:0,5,0,3
chr4	77969825	.	GA	G,GAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,18,33;MFRL=153,230,127;MMQ=60,60,60;MPOS=24,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.21,3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.333,0.333:6:0,0,1:1,0,1:0,2,0,4
chr4	77987351	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	78079695	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=122,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.205:37:19,3:11,4:15,15,4,3
chr4	78086900	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=207,279;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:3,2:9,0:11,1,2,0
chr4	78532232	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=227,279;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	78666116	.	GC	AA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	78694206	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:4,1:13,2:11,6,2,1
chr4	78694327	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=186,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.486:12:0,5:5,1:1,5,1,5
chr4	78697552	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=182,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,7:1,4:0,3,1,10
chr4	78815272	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.301:15:10,4:1,0:10,1,3,1
chr4	78870940	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=192,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,5:6,3:7,2,6,2
chr4	78873605	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:7,4:1,9:7,1,12,1
chr4	78873629	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=144,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.645:29:9,8:1,11:7,3,12,7
chr4	78987157	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=147,249;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:16,1:14,2:13,17,1,2
chr4	79176325	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr4	79176361	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,8,3
chr4	79188160	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=242,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:0,1,1,5
chr4	79199873	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:11,0:2,3:4,9,0,3
chr4	79202486	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:2,2,2,4
chr4	79204209	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	79205699	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=109,111;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,6:4,3:3,4,6,3
chr4	79205747	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=170,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:0,5,2,4
chr4	79207784	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr4	79229435	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=230,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:0,4,0,3
chr4	79238448	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=218,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr4	79238496	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,2:10,1:9,5,3,0
chr4	79238649	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=25,29;MFRL=89,180;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,4:1,5:2,2,2,7
chr4	79238657	.	GCAAAGGTATCGTTGGTGTCA	G	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=173,38;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:4,0:0|1:79238657_GCAAAGGTATCGTTGGTGTCA_G:79238657:3,10,1,1
chr4	79238684	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=173,38;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:79238657_GCAAAGGTATCGTTGGTGTCA_G:79238657:1,6,1,1
chr4	79238687	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=173,38;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:79238657_GCAAAGGTATCGTTGGTGTCA_G:79238657:1,6,1,1
chr4	79240196	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=149,255;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:0,0:6,3:0,6,0,3
chr4	79295418	.	C	CTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=176,244;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:0,3,0,6
chr4	79321972	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:4,4:16,0:13,7,3,1
chr4	79334264	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=177,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:5,1:2,1:0,8,1,1
chr4	79340016	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr4	79350200	.	C	CTGTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=183,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=TG;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:5,0:0,2:4,1,3,0
chr4	79369296	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=164,71;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:2,0:6,2:4,4,2,0
chr4	79371474	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=131,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:2,2:6,4:4,4,5,1
chr4	79372856	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=298,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr4	79372930	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=90,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:1,1,3,0
chr4	79373254	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=144,241;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:2,1,4,1
chr4	79385803	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=126,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr4	79387278	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=203,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:5,0,6,0
chr4	79391036	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	79391256	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=52.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,6,8
chr4	79391327	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:0,5,0,5
chr4	79393269	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=186,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,1:3,2:6,1,3,0
chr4	79393390	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=142,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:10,2:12,2:12,10,1,3
chr4	79403682	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=172,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:10,3:5,2:5,10,1,4
chr4	79403747	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:0,2,0,7
chr4	79409997	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=221,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:3,3,6,0
chr4	79417863	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr4	79420787	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=279,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,1:2,3:5,0,4,1
chr4	79420864	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=123,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:5,4:6,2:0|1:79420864_T_C:79420864:8,3,5,1
chr4	79420870	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=123,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:5,2:5,3:0|1:79420864_T_C:79420864:8,3,5,1
chr4	79421011	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,269;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,3:6,1:3,10,1,3
chr4	79428796	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,64;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:7,1:5,1:1,11,0,2
chr4	79430170	.	G	GAAGCCTTTGTCAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=172,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr4	79430211	.	GTTGTTCT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=155,293;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	79434685	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,3:4,3:3,5,0,6
chr4	79436875	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=174,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:7,0,4,1
chr4	79436888	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=180,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,3:3,3:8,0,5,1
chr4	79437178	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=174,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.478:19:7,5:3,4:2,8,2,7
chr4	79440425	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	79442799	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=206,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.683:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr4	79443738	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,15;MFRL=190,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:79443738_C_A:79443738:3,1,1,0
chr4	79443741	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,18;MFRL=190,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:79443738_C_A:79443738:3,1,1,0
chr4	79443746	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,17;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:79443738_C_A:79443738:2,1,1,0
chr4	79443748	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,10;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:79443738_C_A:79443738:2,1,1,0
chr4	79443774	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	79443837	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=29,29;MFRL=159,244;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:5,3:5,2:6,4,3,2
chr4	79443850	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=29,28;MFRL=158,192;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:4,5:2,6:5,1,5,6
chr4	79444029	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=200,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr4	79444043	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr4	79455858	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	79458112	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=87,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr4	79461956	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:3,3,1,1
chr4	79462311	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=186,241;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:1,5,0,3
chr4	79494343	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=154,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:3,3,1,1
chr4	79503230	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	79503378	.	TCTCATGGTGGCC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=142,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,0:12,2:11,12,1,1
chr4	79512800	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:1,3,1,5
chr4	79522598	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=196,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.393:16:5,3:4,3:7,3,5,1
chr4	79525584	.	A	ATTTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=280,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,8;RU=T;STR;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:79525584_A_ATTTT:79525584:1,2,0,3
chr4	79525590	.	CCCT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=280,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:1,2:0|1:79525584_A_ATTTT:79525584:1,2,0,3
chr4	79531186	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=121,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,5:4,1:7,1,4,2
chr4	79531202	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,5:4,1:6,3,4,2
chr4	79531308	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,4:0,2:0,1,1,5
chr4	79531381	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=191,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr4	79754716	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=176,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.366:9:1,1:5,2:5,1,3,0
chr4	79786974	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=198,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr4	79793969	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=165,76;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:2,8,0,2
chr4	80246380	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=184,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,2:9,1:7,13,2,1
chr4	80828668	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=53,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,2:1,1:0,2,1,3
chr4	80828740	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,315;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	80899219	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.178:38:24,6:7,0:18,14,6,0
chr4	80899329	.	C	CCACAG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=195,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,2:7,0:0|1:80899329_C_CCACAG:80899329:3,10,0,2
chr4	80899334	.	AA	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=208,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:5,0:0|1:80899329_C_CCACAG:80899329:2,10,0,2
chr4	80905851	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr4	80906131	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	80939979	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=218,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr4	80957195	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.294:20:4,0:3,4:2,12,1,5
chr4	80975372	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,11:0,0,11,8
chr4	80976420	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,30:0.755:39:3,13:6,15:6,3,22,8
chr4	81124596	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=204,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:3,4:4,9:5,2,8,5
chr4	81207649	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=212,199;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:13,4:27,0:14,26,4,0
chr4	81884610	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr4	81974755	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=269,0;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,0:1,1:0|1:81974755_G_T:81974755:0,5,0,1
chr4	81974779	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=186,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:81974755_G_T:81974755:0,4,0,1
chr4	82013619	.	AAAGGAAGGAAGG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=120,267;MMQ=54,58;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=AAGG;STR;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.415:8:1,1:3,2:2,3,0,3
chr4	82025691	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,0,4
chr4	82056440	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=161,49;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:6,0:12,2:7,11,0,2
chr4	82369160	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr4	82369205	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:10,4,2,0
chr4	83347309	.	TAAGA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=177,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.341:18:6,3:5,3:5,7,0,6
chr4	83347787	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=128,118;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,0:10,3:10,11,0,3
chr4	83376098	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=204,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr4	83424089	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=168,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.318:13:5,1:4,2:6,3,3,1
chr4	83552412	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=243,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr4	83557880	.	C	CCTGACAATTT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=165,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:9,1:9,1:12,6,0,2
chr4	83582064	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:9,5:8,1:9,8,4,2
chr4	83602150	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=319,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	83626382	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=208,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:3,1,3,1
chr4	83763690	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:0,4,0,4
chr4	83765691	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:1,4,1,4
chr4	83774687	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr4	83787875	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=185,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.784:21:1,9:3,8:4,0,17,0
chr4	83788139	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:9,4:11,2:8,12,3,3
chr4	83788562	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr4	83793243	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=94,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,2:7,4:7,5,2,4
chr4	83800181	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	83825823	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=203,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:4,1,3,0
chr4	83827822	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=184,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,5:1,2:0,2,0,7
chr4	83838262	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:10,6:10,7:3,17,5,8
chr4	83852065	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=48.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr4	83857108	.	AT	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,2,2
chr4	83857402	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,12,5
chr4	83900260	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	83905258	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	83970297	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,45;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.319:7:3,1:1,1:4,1,2,0
chr4	83989516	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	84189012	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr4	84193366	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr4	84205618	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,15:0,10:0,0,20,5
chr4	84205872	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr4	84223461	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr4	84229897	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=122,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,3:2,2:2,1,4,1
chr4	84231340	.	G	GTAAGTATGTCTCCTATTCTTAATACTAGGAAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=231,123;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr4	84232104	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	84234190	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=78,180;MMQ=36,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr4	84234195	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=186,155;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr4	84234229	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,5:1,5:2,1,8,2
chr4	84234253	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=180,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:6,2:11,5,1,1
chr4	84240654	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	84240680	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	84255641	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=192,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr4	84350824	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=181,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:6,0:9,5:4,12,0,5
chr4	84352750	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=195,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:6,0,2,0
chr4	84361149	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=111,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,13:0.334:40:16,13:11,0:15,12,13,0
chr4	84362443	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:8,4,2,1
chr4	84364808	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:1,5,0,3
chr4	84367286	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:1,1:4,3:0,5,0,5
chr4	84370091	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.263:21:9,4:6,1:7,9,2,3
chr4	84370124	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=118,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.439:12:3,4:4,1:1,6,2,3
chr4	84374927	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=186,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,0:6,5:5,7,0,5
chr4	84393475	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=221,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,0:2,5:1,6,0,5
chr4	84458001	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=189,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:0,10,0,2
chr4	84465613	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:4,0,5,1
chr4	84465855	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=206,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr4	84509465	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr4	84515968	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=132,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr4	84517995	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=193,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:5,2:7,2,2,1
chr4	84519775	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=115,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.641:17:4,5:2,6:4,2,7,4
chr4	84525976	.	TTTTTG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr4	85414741	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=195,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:0,6,1,3
chr4	85552882	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=213,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,4:2,4:3,0,8,0
chr4	85555196	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=194,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr4	85560000	.	T	TTA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=TA;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,0:4,1,3,1
chr4	85618001	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=215,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.358:9:2,1:4,2:1,5,1,2
chr4	85656350	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=247,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.596:5:0,3:1,0:0,2,0,3
chr4	85699579	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=177,199;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:5,2,3,0
chr4	85710822	.	ACC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=156,171;MMQ=57,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=C;STR;TLOD=57.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.907:22:0,3:2,13:2,0,15,5
chr4	85738482	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=235,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:4,1,4,0
chr4	86643026	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=123,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.115:41:16,4:21,0:18,19,4,0
chr4	86643029	.	T	TACTAGTATATAAACCTGCAGTCATTA	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=151,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:18,2:20,0:20,19,1,1
chr4	86844948	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:4,1,0,4
chr4	86863166	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=166,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr4	86863206	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=108,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.605:10:3,6:1,0:2,2,4,2
chr4	86952648	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:0,5,0,3
chr4	87024228	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=18,34;MFRL=211,214;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=21,22;RU=TG;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.665:4:0,3:0,0:1,0,3,0
chr4	87610268	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=141,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:12,4:16,8:9,19,6,6
chr4	87638364	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,286;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	87643538	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=142,69;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,0:14,2:14,13,2,0
chr4	87671907	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=130,101;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:13,0:6,4:13,6,0,4
chr4	87717945	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr4	87728676	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:8,2,2,0
chr4	87731238	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=194,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr4	87754419	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:5,5:1,5:6,0,9,1
chr4	87809330	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:87809330_G_T:87809330:7,12,0,2
chr4	87809337	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,1:0|1:87809330_G_T:87809330:7,12,0,2
chr4	87812564	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=118,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:1,1:3,1:4,1,2,0
chr4	87812586	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=57,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.807:14:0,6:1,6:2,0,8,4
chr4	87928652	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=161,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.400:10:3,0:1,1:0|1:87928652_T_G:87928652:4,2,0,4
chr4	87928654	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=161,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.401:10:3,0:2,0:0|1:87928652_T_G:87928652:4,2,0,4
chr4	87968798	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=243,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr4	88005203	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,6:3,6:4,2,7,5
chr4	88029482	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=192,267;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,3:4,0:0,10,0,3
chr4	88052219	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,4:2,6:4,3,7,3
chr4	88056719	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=58,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.664:19:4,6:2,7:4,2,7,6
chr4	88056925	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr4	88226480	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=173,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr4	88231339	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=184,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.434:7:0,0:4,3:2,2,1,2
chr4	88234874	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr4	88238448	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr4	88239609	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=134,242;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:2,0:9,3:4,7,1,2
chr4	88261828	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=147,217;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr4	88295786	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=216,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,5:4,2:4,0,7,0
chr4	88296051	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=227,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr4	88312293	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=220,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr4	88356111	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=106,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:1,1,5,1
chr4	88362904	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=241,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:0,5:1,4:1,0,9,1
chr4	88362916	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=171,96;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:6,12:9,0:12,3,12,0
chr4	88532182	.	A	AGTGT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=195,261;MMQ=60,58;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=GT;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.466:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	88533163	.	TTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=TG;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.784:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	88536520	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=74,103;MMQ=55,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.506:18:4,5:3,3:6,3,4,5
chr4	88536818	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=155,85;MMQ=54,45;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.679:23:3,7:3,6:2,5,7,9
chr4	88537737	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr4	88577573	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=117,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,4:3,2:2,1,6,0
chr4	88578310	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr4	88732453	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	88732531	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,9,6
chr4	88732692	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.374:30:5,6:14,5:8,11,5,6
chr4	88733085	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=157,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr4	88755828	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,10,3
chr4	88755967	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:2,3:5,0:3,5,0,3
chr4	88759690	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,5,1
chr4	88902748	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:11,0:10,4:11,10,0,4
chr4	88959381	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,371;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr4	88959493	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=153,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:5,7,2,0
chr4	88979080	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=203,285;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr4	89015857	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:0,3:1,5:1,0,1,8
chr4	89016782	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr4	89018565	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=252,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,2:0,8:1,0,7,3
chr4	89022362	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=225,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:0,6:1,7:0,1,9,4
chr4	89022518	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=212,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89022518_T_A:89022518:0,1,0,1
chr4	89022519	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=212,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89022518_T_A:89022518:0,1,0,1
chr4	89022525	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,31;MFRL=212,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89022518_T_A:89022518:0,1,0,1
chr4	89022527	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=212,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89022518_T_A:89022518:0,1,0,1
chr4	89028359	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:5,0:4,6:0|1:89028359_A_C:89028359:3,6,0,6
chr4	89028361	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:5,0:4,6:0|1:89028359_A_C:89028359:3,6,0,6
chr4	89326847	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=194,191;MMQ=60,23;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:0,7,0,5
chr4	89349921	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=161,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:3,9,0,2
chr4	89352469	.	CTT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=151,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:1,1:7,1:3,8,1,1
chr4	89361230	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,87;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:11,0:8,5:8,11,0,5
chr4	89389640	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=181,291;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	89391771	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=182,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.463:26:8,2:6,10:8,6,4,8
chr4	89397091	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:5,6:3,4:2,6,3,7
chr4	89400435	.	CAAAA	C,CAAAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31,35;MFRL=242,125,136;MMQ=50,40,40;MPOS=32,33;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,19;RU=A;STR;TLOD=3.34,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.285,0.284:4:1,0,1:1,1,0:2,0,2,0
chr4	89400460	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=125,156;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:4,1:7,3,2,0
chr4	89588689	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=163,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,3:9,1:1,12,1,3
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chr4	89589113	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:8,3:10,0:0|1:89589111_G_GAATT:89589111:7,11,1,2
chr4	89589119	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=163,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,2:9,0:0|1:89589111_G_GAATT:89589111:8,13,1,1
chr4	89649659	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=190,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:6,3:3,4:7,2,4,3
chr4	89658633	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=133,113;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:8,0:9,4:10,7,0,4
chr4	89660237	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=182,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:15,2:11,1:9,17,3,0
chr4	89680032	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:3,2:9,0:5,7,2,0
chr4	89708850	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	89711690	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=144,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.256:18:4,1:10,3:8,6,3,1
chr4	89711849	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=282,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:89711849_T_C:89711849:1,0,0,3
chr4	89711854	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=282,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89711849_T_C:89711849:1,0,0,1
chr4	89726073	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=57.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.871:21:1,6:1,12:2,0,14,5
chr4	89726283	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=206,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,4:0,5:1,1,0,9
chr4	89827492	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=154,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,1:6,6:6,5,2,5
chr4	90168882	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,2:5,5:5,3,7,0
chr4	90171478	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	90647865	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,2:6,1:3,5,0,3
chr4	90743317	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0|1:90743317_T_TC:90743317:1,0,6,0
chr4	90743331	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=142,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.672:7:0,4:2,1:0|1:90743317_T_TC:90743317:2,0,5,0
chr4	90816023	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr4	90816790	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=233,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,4:0,9:0,1,1,12
chr4	90855932	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr4	90874095	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	91234250	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=215,234;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr4	91549156	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=118,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:1,2:1,4:5,0,4,2
chr4	91701720	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	91737018	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=85,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:2,2,2,2
chr4	93225703	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,9:4,0:5,0,9,0
chr4	93511481	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=112,142;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,1:4,2:1,9,0,3
chr4	94032125	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:6,6,1,1
chr4	94750058	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,1:8,1:7,7,2,0
chr4	94751372	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:3,4,4,0
chr4	95161996	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=113,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr4	95194740	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=182,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,2:4,2:11,0,3,1
chr4	95197660	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:1,7,0,2
chr4	95255637	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,4:1,6:1,1,7,3
chr4	95445051	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:1,8,0,2
chr4	95496882	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=168,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:11,6:6,2:8,9,2,6
chr4	95506214	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=228,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:11,4:6,5:6,11,3,6
chr4	95508134	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,10;MFRL=131,260;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.172:19:9,0:5,0:9,7,3,0
chr4	95561651	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=184,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	95575601	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=186,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:5,5:9,2:8,6,5,2
chr4	95578719	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=137,96;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:12,0:9,6:6,16,0,6
chr4	96035796	.	GAC	G,GACAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31,34;MFRL=0,227,170;MMQ=60,60,60;MPOS=11,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=AC;STR;TLOD=5.76,6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.438,0.433:4:0,0,1:0,2,1:0,0,3,1
chr4	96051304	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=173,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	96073956	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr4	96091250	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=195,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:5,5:2,7:6,1,12,0
chr4	96091524	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=217,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,1:5,4:0,6,0,5
chr4	96761220	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=199,241;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:6,1,2,0
chr4	96761256	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=205,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:7,1,5,0
chr4	96762629	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,320;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	96762698	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	98761900	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,4:3,1:8,0,5,0
chr4	98893334	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=207,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr4	98893388	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=171,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,4:2,0:5,1,4,0
chr4	98902278	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=105,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,6:2,4:4,0,6,4
chr4	98902492	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=188,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:98902492_G_A:98902492:0,5,1,1
chr4	98902493	.	C	CCT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=188,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:98902492_G_A:98902492:0,5,1,1
chr4	98902495	.	A	ACTGCTGGGAATCTC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=188,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:98902492_G_A:98902492:0,5,1,1
chr4	99027137	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,7:3,5:3,1,7,5
chr4	99027159	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=136,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,1:10,1:7,10,2,0
chr4	99027184	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,6:3,4:2,2,4,6
chr4	99027218	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=114,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.707:8:0,4:2,2:1,1,3,3
chr4	99049593	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:6,2:2,4:3,5,3,3
chr4	99055406	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=135,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr4	99055480	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=136,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.552:16:3,3:4,5:5,2,8,1
chr4	99055637	.	CAGATA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,232;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGATA;STR;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,1:6,2:2,12,0,3
chr4	99064336	.	AGG	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=192,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,2:8,0:0|1:99064336_AGG_A:99064336:6,14,0,2
chr4	99064339	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=192,221;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:8,0:0|1:99064336_AGG_A:99064336:6,14,0,2
chr4	99064342	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=191,221;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:7,0:0|1:99064336_AGG_A:99064336:4,13,0,2
chr4	99337881	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,4:1,4:0,3,6,2
chr4	99338058	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=253,89;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:4,4,1,2
chr4	99339708	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:5,2:0,1:5,0,3,0
chr4	99341156	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=150,232;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,1:11,1:11,7,1,1
chr4	99358083	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=175,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,2:2,1:3,5,2,1
chr4	99408106	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,1,4
chr4	99808136	.	CTTAAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,1:1,1:4,0,2,0
chr4	99964627	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=356,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:99964627_C_T:99964627:0,1,0,1
chr4	99964630	.	CCTGTACTTA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=356,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:99964627_C_T:99964627:0,1,0,1
chr4	99996106	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=129,32;MMQ=46,58;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,1:7,1:9,9,2,0
chr4	100009738	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=201,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:2,6:1,6:3,0,11,1
chr4	100045500	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=204,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,6:0,5:2,0,11,0
chr4	100048327	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=58.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,15,2
chr4	100048506	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0|1:100048506_G_A:100048506:0,0,7,8
chr4	100048509	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=142,278;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:0|1:100048506_G_A:100048506:4,8,2,0
chr4	100052963	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr4	100057858	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr4	100065509	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=240,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr4	100128530	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=199,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:8,0,2,0
chr4	100128725	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=147,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,0:15,2:0|1:100128725_G_C:100128725:10,17,0,2
chr4	100128732	.	C	CCACTCTGTCCCCAA	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=156,250;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:13,0:15,2:0|1:100128725_G_C:100128725:10,18,0,2
chr4	100128753	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=215,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:4,5:2,10:3,3,5,10
chr4	100131163	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	100131746	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=188,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.260:6:3,1:1,0:0,5,0,1
chr4	100134713	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,8:0,1:0,0,5,4
chr4	100137344	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=184,89;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:10,3:4,0:6,9,0,3
chr4	100200509	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	100203447	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,4:7,0:11,0,4,0
chr4	100205819	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=145,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.476:19:5,3:5,6:0|1:100205819_C_A:100205819:8,2,5,4
chr4	100205829	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=136,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.428:19:4,3:7,5:0|1:100205819_C_A:100205819:8,3,4,4
chr4	100212173	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=83,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:100212173_A_T:100212173:2,4,0,2
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chr4	100258054	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,0,14
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chr4	100260681	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.720:8:1,1:0,1:2,0,5,1
chr4	100268131	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,3:2,4:5,1,6,1
chr4	100348837	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=152,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr4	100356337	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:7,2:13,1:12,8,2,1
chr4	100356466	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:11,2:3,1:5,9,1,2
chr4	100443561	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=202,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:6,4:2,2:8,0,6,0
chr4	100445589	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr4	100472004	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr4	100479378	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,3:4,0:0,6,0,3
chr4	100496105	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=157,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:1,7:8,10:4,5,10,7
chr4	100513027	.	TTGTG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=218,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=TG;STR;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.809:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr4	100518247	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:2,2,2,3
chr4	100521805	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=244,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,9:4,4:3,3,9,4
chr4	100530143	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=222,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,5:7,1:2,7,1,5
chr4	100532222	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr4	100532425	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,83;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,0:6,2:6,10,0,3
chr4	100533973	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=201,237;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:0,2:3,2:3,0,5,0
chr4	100534041	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=174,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,4,1
chr4	100540099	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=190,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr4	100543836	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,10:3,0:3,6,10,0
chr4	100784118	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=132,241;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:10,3:28,0:33,5,3,0
chr4	100784142	.	TTG	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=120,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.153:36:14,3:13,2:13,18,3,2
chr4	100784884	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.654:18:2,12:4,0:6,0,12,0
chr4	100806727	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:12,0:22,2:21,13,0,2
chr4	100813221	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=136,76;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.178:37:8,3:23,3:17,14,0,6
chr4	100824844	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,2:8,3:11,4,3,2
chr4	100827622	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=173,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:5,1,4,1
chr4	100851508	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=186,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr4	101337150	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr4	101338217	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,9,1
chr4	101950251	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=128,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.265:28:12,7:9,0:13,8,7,0
chr4	101953322	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	102001793	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=155,115;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.266:28:9,0:12,6:5,16,0,7
chr4	102020924	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr4	102116994	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=238,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr4	102267821	.	AA	CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr4	102268034	.	A	ACGCCGC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=164,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=CGC;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,0:1,2:0,6,0,2
chr4	102776406	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=128,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr4	102776418	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:102776418_G_T:102776418:0,3,0,1
chr4	102776427	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:102776418_G_T:102776418:0,4,0,1
chr4	102776430	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:102776418_G_T:102776418:0,4,0,1
chr4	102776432	.	CATTA	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:102776418_G_T:102776418:0,4,0,1
chr4	102776437	.	G	GCTGT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:102776418_G_T:102776418:0,4,0,1
chr4	102839183	.	A	ACATTT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=149,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:5,0:13,2:0|1:102839183_A_ACATTT:102839183:11,9,0,2
chr4	102839186	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=149,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:5,0:15,2:0|1:102839183_A_ACATTT:102839183:12,10,0,2
chr4	102839190	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=149,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:5,0:17,2:0|1:102839183_A_ACATTT:102839183:12,10,0,2
chr4	102839362	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,1,11
chr4	102942761	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=166,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.620:19:4,10:3,2:0|1:102942761_C_T:102942761:4,3,4,8
chr4	102942765	.	TTA	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=187,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TA;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:6,0:0|1:102942761_C_T:102942761:6,12,0,2
chr4	102946347	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,1:4,6:8,1,5,2
chr4	102951254	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=113,169;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:19,0:12,5:19,12,0,5
chr4	102992517	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,3:6,2:3,8,0,5
chr4	103189114	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:2,2:14,0:7,9,1,1
chr4	103228545	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=190,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:9,2:5,5:9,5,3,4
chr4	103505784	.	CAAA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.319:10:1,0:5,3:5,2,3,0
chr4	103506023	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=128,110;MMQ=60,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:103506023_T_A:103506023:0,4,0,1
chr4	103506025	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=128,110;MMQ=60,30;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:103506023_T_A:103506023:0,4,0,1
chr4	103506027	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=128,110;MMQ=60,30;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:103506023_T_A:103506023:0,4,0,1
chr4	103533821	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,4:4,3:0,5,0,7
chr4	103553447	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=252,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.808:8:1,0:0,4:0,1,1,6
chr4	103557192	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=232,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:1,5:0,7:0,1,2,10
chr4	103557219	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr4	103557251	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=191,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr4	103571686	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=109,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:9,2:3,1:9,3,2,1
chr4	103610872	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=291,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,4:1,7:1,1,1,10
chr4	103731067	.	CAAAT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,4:1,4:1,2,2,6
chr4	103747541	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=207,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.709:22:3,10:2,6:4,2,13,3
chr4	103789782	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=218,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:4,5:3,8:5,2,10,3
chr4	103789810	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.838:23:1,9:2,8:1,2,12,8
chr4	103790186	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=261,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,6:2,4:3,0,10,0
chr4	103806308	.	CTA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,1:2,6:3,1,7,1
chr4	103826635	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=185,153;MMQ=60,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,3:1,5:2,1,5,3
chr4	103866480	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.667:25:2,10:6,7:4,4,5,12
chr4	103911159	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=226,260;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr4	103971560	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=202,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:1,7,1,3
chr4	103987761	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=247,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:5,1:0,1:0,5,0,2
chr4	104041293	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:14,8,1,1
chr4	104053941	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=126,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.171:25:12,3:9,0:12,9,4,0
chr4	104057248	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=154,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:4,1:5,1:7,2,3,0
chr4	104061331	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:2,2,1,1
chr4	104063071	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=98,270;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:3,6,0,2
chr4	104066176	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0|1:104066176_CA_C:104066176:5,0,4,0
chr4	104066202	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=108,72;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,2:0.150:18:3,0:7,1:1|0:104066176_CA_C:104066176:11,5,2,0
chr4	104068838	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=107,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:104068838_AG_A:104068838:2,2,0,1
chr4	104068842	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=107,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:104068838_AG_A:104068838:2,2,0,1
chr4	104079424	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:5,2,1,1
chr4	104084374	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,68;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:11,3:5,0:5,11,2,1
chr4	104084765	.	CAAAA	C,CAAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,35,32;MFRL=192,133,150;MMQ=60,60,60;MPOS=13,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,13,16;RU=A;STR;TLOD=6.04,3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,3:0.170,0.338:11:2,1,0:2,1,2:2,4,1,4
chr4	104510766	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=248,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr4	105393361	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr4	106155751	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,1:6,2:4,7,1,2
chr4	106159271	.	AGT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:9,2:4,4:7,6,5,1
chr4	106159701	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.263:36:16,0:11,9:11,16,0,9
chr4	106160231	.	G	GTTTTTTTGTTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=154,145;MMQ=40,43;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,3:0,4:0,1,6,2
chr4	106160244	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=145,158;MMQ=41,53;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.366:11:1,0:3,1:4,3,3,1
chr4	106163108	.	TTTC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=164,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.442:19:4,4:5,5:5,5,2,7
chr4	106163109	.	TTC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.691:15:1,5:3,6:3,1,2,9
chr4	106194000	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=158,99;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:18,0:14,4:17,15,0,4
chr4	106196920	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=199,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:4,10,0,2
chr4	106196951	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=222,198;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:2,4,5,3
chr4	106196963	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=223,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,3:7,0:7,6,3,0
chr4	106292109	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,1:5,5:1,8,3,3
chr4	106292121	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr4	106317370	.	T	TATAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=216,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,1:4,1:6,0,3,1
chr4	106317498	.	CCAAA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CAAA;STR;TLOD=40.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.737:13:1,5:2,5:0,3,3,7
chr4	106317511	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=174,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.386:13:4,2:4,3:2,6,1,4
chr4	106359209	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=263,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:1,0:0,4:0,1,1,3
chr4	106534691	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=200,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,5:3,2:1,4,1,6
chr4	106620983	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,8:2,4:4,1,12,0
chr4	106638697	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=270,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr4	106647679	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=223,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr4	106766496	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=190,254;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr4	106766746	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=194,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:106766746_C_T:106766746:4,8,1,1
chr4	106766755	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=194,232;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,1:0|1:106766746_C_T:106766746:4,8,1,1
chr4	106818983	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=181,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:3,2,4,0
chr4	106848524	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.335:25:7,5:9,3:7,10,4,4
chr4	106879592	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.652:14:4,4:1,5:2,3,7,2
chr4	106888263	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:4,4:0,4:4,0,9,0
chr4	107116007	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=41.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,0:3,13:1,4,0,13
chr4	107152952	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=148,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,0:16,2:10,14,0,2
chr4	107154273	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	107156365	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr4	107165685	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr4	107169345	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=170,105;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:6,5:11,0:14,3,5,0
chr4	107169364	.	GG	AA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=170,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:6,5:11,0:11,6,5,0
chr4	107258228	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.266:17:5,2:6,2:3,10,2,2
chr4	108575955	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=206,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:4,1:9,4:7,7,1,4
chr4	108608100	.	CTCTAACACT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=214,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:1,3:1,0,8,0
chr4	108622241	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=195,85;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr4	108622475	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:2,3:4,4:0,6,0,8
chr4	108641169	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	108641317	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=109,163;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:4,4:5,6:4,5,5,5
chr4	108641437	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=339,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	108817135	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.158:27:11,0:12,3:13,10,0,4
chr4	108820650	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr4	108824307	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,0:4,2:11,0,2,0
chr4	108853295	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=235,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.320:13:4,2:5,1:1,8,0,4
chr4	108853384	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	108866058	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=198,227;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr4	108868515	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=83,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,5:1,3:2,2,4,4
chr4	108870764	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=185,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr4	108931039	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,19:0,15:0,0,16,18
chr4	108935768	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.360:11:1,2:3,1:0|1:108935768_CT_C:108935768:0,7,0,4
chr4	108935770	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=203,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.554:11:2,1:2,4:0,5,0,6
chr4	108935771	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.360:11:2,2:4,2:0|1:108935768_CT_C:108935768:0,7,0,4
chr4	108944579	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr4	108944821	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	108948928	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=128,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,0:7,2:4,8,0,2
chr4	108953505	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=157,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:12,2:4,1:6,10,1,2
chr4	108985388	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr4	108985517	.	TCTCTTC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=125,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTCTTC;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:5,7,1,1
chr4	108991979	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	108999300	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr4	108999366	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr4	109010207	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,13,0
chr4	109010312	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=161,104;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.384:27:8,10:7,0:7,10,10,0
chr4	109546420	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	109576622	.	C	CAAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=7,11;RU=A;STR;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,2:2,1:2,0,4,1
chr4	109576843	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=123,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:0,0:4,4:2,2,0,4
chr4	109578572	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	109588323	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=195,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:4,2,4,1
chr4	109669319	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=158,290;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.365:9:3,1:3,2:1,5,0,3
chr4	109669378	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=113,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr4	109734959	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,5,0
chr4	109735133	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:8,0:7,6:0|1:109735133_T_C:109735133:7,8,1,5
chr4	109735146	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=135,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:8,0:7,5:0|1:109735133_T_C:109735133:7,8,1,4
chr4	109735209	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=169,252;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr4	109748227	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:7,1,4,0
chr4	109762918	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=138,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:1,3,3,2
chr4	109766290	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,5:0,5:0,2,6,4
chr4	109769899	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,73;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:1,2,3,2
chr4	109780823	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:8,1:18,1:13,13,0,2
chr4	109780921	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,1:4,1:3,11,0,2
chr4	109782249	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	109784409	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=203,191;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,5:8,0:8,3,5,0
chr4	109784622	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=249,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr4	109790361	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=160,153;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=43.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.567:30:6,0:6,16:4,9,0,17
chr4	109790373	.	TAAATA	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=199,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr4	109790374	.	AAAT	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.408:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	109810975	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,0:3,9:0,8,0,9
chr4	109811003	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr4	109817962	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	109820195	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,1:0,5:0|1:109820195_C_A:109820195:0,0,5,2
chr4	109820202	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0|1:109820195_C_A:109820195:0,0,5,2
chr4	109820446	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	109895718	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=194,238;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.760:6:0,3:1,2:1,0,1,4
chr4	109931455	.	AC	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=116,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=50.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,13:0.610:21:2,7:5,6:0|1:109931455_AC_A:109931455:6,2,8,5
chr4	109931457	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=116,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,13:0.610:21:3,7:5,6:0|1:109931455_AC_A:109931455:6,2,8,5
chr4	109969183	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=168,249;MMQ=47,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr4	109969337	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=103,219;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.328:28:7,4:11,4:11,8,2,7
chr4	110384047	.	G	GCTTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTTTT;STR;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr4	110384147	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=191,128;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,3:1,0:4,2,3,0
chr4	110441477	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=89,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:110441477_T_A:110441477:2,0,1,0
chr4	110441487	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=89,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:110441477_T_A:110441477:2,0,1,0
chr4	110446454	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,5:2,5:2,0,10,0
chr4	110580084	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr4	110585578	.	CTTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.321:4:3,1:0,0:2,1,0,1
chr4	110585645	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,222;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	110606394	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	110608643	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:12,0:4,2:9,7,0,2
chr4	110615762	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:8,11,0,2
chr4	110619534	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=75.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,7:0,15:0,0,5,17
chr4	110635488	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=212,215;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,6:1,1:2,0,5,2
chr4	110650657	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=179,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:8,0,2,0
chr4	110670807	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	110678819	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=198,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:3,2:1,2:2,3,3,1
chr4	110678979	.	T	TTTTAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.899:7:0,4:0,3:0|1:110678979_T_TTTTAA:110678979:0,0,0,7
chr4	110679002	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:110678979_T_TTTTAA:110678979:0,0,0,6
chr4	110681618	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,6,7
chr4	110737549	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr4	110745095	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=150,113;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:10,4:5,4:12,4,6,2
chr4	110754499	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=220,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:0,6,0,4
chr4	110758499	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=238,255;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:1,0,2,0
chr4	110758769	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=168,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr4	110765361	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,6,9
chr4	110765372	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,6:0,5:0,1,4,7
chr4	110772730	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,1:7,1:7,4,1,1
chr4	110786290	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	110791543	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,2:7,2:7,9,3,1
chr4	110864370	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=186,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.519:23:3,0:8,12:8,3,12,0
chr4	110864566	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=103,103;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:15,0:2,3:6,11,0,3
chr4	110896050	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=188,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr4	110897316	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=151,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:7,0:14,3:11,10,2,1
chr4	111398208	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=135,191;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:4,11:3,5:5,2,8,8
chr4	111398252	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=203,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:11,2:4,2:3,12,1,3
chr4	111412391	.	GTT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,29;MFRL=253,234;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,1:0,1:0,1,0,3
chr4	111469295	.	GTTTTT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=128,172;MMQ=50,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=25,20;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr4	111469323	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,15;MFRL=129,128;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.323:7:0,0:4,0:2,3,2,0
chr4	111474659	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:4,2:1,2:1,4,1,4
chr4	111781650	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:6,0,5,0
chr4	113066831	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	113107829	.	C	CTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=198,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:2,1:3,1:0|1:113107829_C_CTT:113107829:5,1,2,0
chr4	113107852	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=181,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:3,0:0|1:113107829_C_CTT:113107829:9,6,2,0
chr4	113178857	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:9,3:4,4:6,7,5,2
chr4	113178894	.	ATTTGT	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:11,5:5,5:6,10,5,5
chr4	113178966	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=144,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.211:22:9,4:8,1:8,9,1,4
chr4	113179077	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=217,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:0|1:113179077_C_T:113179077:0,3,0,5
chr4	113179080	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=217,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,3:0,2:0|1:113179077_C_T:113179077:0,3,0,5
chr4	113184202	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=137,457;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,1:10,1:8,12,1,1
chr4	113184233	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=113,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,3:11,0:11,8,0,3
chr4	113187786	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,92;MMQ=60,35;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:12,3:16,0:13,15,3,0
chr4	113346714	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=173,293;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr4	113356259	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,4:3,0:5,1,4,0
chr4	113356495	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=194,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr4	113359883	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=182,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr4	113479555	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113479555_A_G:113479555:0,0,0,1
chr4	113479562	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113479555_A_G:113479555:0,0,0,1
chr4	113483446	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:8,0,5,0
chr4	113506885	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,25;MFRL=241,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:0,0:1,1:0,3,0,2
chr4	113540785	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.214:17:7,3:7,0:7,7,3,0
chr4	113541270	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,0;MFRL=133,115;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.394:23:6,0:8,0:0|1:113541270_C_T:113541270:10,4,9,0
chr4	113541279	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=110,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.378:24:6,8:9,0:0|1:113541270_C_T:113541270:10,5,9,0
chr4	113554385	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:7,6:1,3:3,5,1,8
chr4	113565886	.	AAAG	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=32.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:9,5:8,5:12,5,4,6
chr4	113568126	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.313:10:2,1:3,2:3,4,2,1
chr4	113569135	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.453:20:6,3:5,6:7,4,8,1
chr4	113570639	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,12,2
chr4	113578418	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=130,138;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.112:38:22,3:11,0:8,26,0,4
chr4	113578433	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:18,4:12,0:9,23,0,4
chr4	113825548	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=189,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,2:4,0:12,1,2,0
chr4	114028149	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=63,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:1,2,0,2
chr4	114117481	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:6,2,2,0
chr4	114179628	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=144,157;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.154:17:10,0:5,2:0|1:114179628_G_GT:114179628:0,15,0,2
chr4	114179629	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=144,157;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:10,0:5,2:0|1:114179628_G_GT:114179628:0,15,0,2
chr4	114204106	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=174,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:1,3,0,4
chr4	114238807	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=215,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,1:5,3:8,1,4,0
chr4	114260538	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:0,10,0,2
chr4	114267023	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,8:0,13:0,0,17,5
chr4	114269552	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=123,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,1,1
chr4	114274507	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=165,241;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,13:0.326:41:18,13:10,0:15,13,13,0
chr4	114274531	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=169,241;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,13:0.324:40:17,11:10,0:14,13,13,0
chr4	114279870	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=194,157;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:9,0:10,4:11,8,0,4
chr4	114284645	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=205,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:1,2,0,5
chr4	114286357	.	ATG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=15,25;MFRL=196,155;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=TG;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.634:3:0,2:0,0:0,1,0,2
chr4	114376932	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:17,4:8,0:15,10,4,0
chr4	115544150	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,7:7,0:4,6,7,0
chr4	115544714	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,6,6
chr4	115544834	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=163,141;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,0:5,4:1,5,0,4
chr4	115544848	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,25;MFRL=163,141;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,0:5,4:1,5,0,4
chr4	115589159	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr4	115589302	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,5,8
chr4	115748914	.	A	ATT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=168,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,1:5,0:8,2,1,1
chr4	115748918	.	A	AT,T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,29,30;MFRL=201,58,235;MMQ=60,60,60;MPOS=11,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.69,6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,2:0.237,0.200:10:4,1,1:2,1,1:4,2,3,1
chr4	115751064	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,1:5,2:2,10,1,2
chr4	115898522	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	118976065	.	A	ATAAAAGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=215,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr4	119035948	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr4	119064666	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=144,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:3,0:2,2:5,0,1,1
chr4	119064668	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=56,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.662:7:0,3:2,2:1,1,5,0
chr4	119161619	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr4	119174563	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=237,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr4	119174640	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr4	119176703	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:4,1,4,1
chr4	119216054	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=215,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,6:7,2:10,3,5,3
chr4	119217114	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr4	119234470	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=126,58;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,0:4,4:7,5,2,2
chr4	119239788	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=205,260;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr4	119609039	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr4	119609182	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=140,137;MMQ=50,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:0,2:0,1:0,2,1,5
chr4	119615544	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=237,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:1,1:2,3:3,0,3,2
chr4	119653822	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=136,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:7,2,2,1
chr4	119666217	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=10,20;MFRL=144,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,0:0,1:0,5,0,2
chr4	119736598	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=98,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,3:1,7:2,2,9,1
chr4	119947961	.	AAAG	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=207,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=75.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.626:30:3,8:7,11:5,6,11,8
chr4	119947985	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=198,166;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.391:34:7,7:13,6:12,9,7,6
chr4	119950975	.	A	ATTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=191,229;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,16;RU=T;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr4	119978892	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,340;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,13:0.305:44:19,13:12,0:17,14,13,0
chr4	120071926	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	120072233	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,1:2,2:0|1:120072233_G_C:120072233:1,3,0,3
chr4	120072238	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:2,2:0|1:120072233_G_C:120072233:1,3,0,3
chr4	120079159	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,3:2,7:3,1,6,4
chr4	120079387	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=216,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr4	120107098	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,245;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr4	120169956	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=129,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:11,5:6,0:8,9,4,1
chr4	120177522	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=149,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.615:16:3,7:3,3:4,2,6,4
chr4	120177708	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=192,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:4,4:1,4,2,5
chr4	120181724	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=183,155;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.346:21:7,5:7,2:6,8,3,4
chr4	120192436	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=174,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr4	120193005	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=163,154;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:5,0:15,6:14,6,0,6
chr4	120194718	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=241,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,5:0,3:0,1,8,1
chr4	120212425	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=249,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:4,4:0,4:1,3,1,7
chr4	120212514	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=353,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr4	120221425	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=221,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,4:0,2:6,0,6,0
chr4	120240131	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:7,7:1,4:7,1,10,1
chr4	120240802	.	C	CATAATAATA	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,13;RU=ATA;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.565:5:1,1:1,0:0,2,0,3
chr4	120240812	.	AT	CA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,36;MFRL=191,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:120240812_AT_CA:120240812:0,4,0,1
chr4	120240817	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,35;MFRL=191,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:120240812_AT_CA:120240812:0,4,0,1
chr4	120240825	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=170,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:120240812_AT_CA:120240812:0,4,0,1
chr4	120240833	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,36;MFRL=170,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:120240812_AT_CA:120240812:0,4,0,1
chr4	120240835	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=170,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:120240812_AT_CA:120240812:0,4,0,1
chr4	120243336	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr4	120423719	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=170,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:5,4:1,3:0|1:120423719_C_T:120423719:8,0,5,2
chr4	120423729	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:4,2:2,3:0|1:120423719_C_T:120423719:7,0,4,2
chr4	120425777	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:7,4:1,1:1,7,2,3
chr4	120446868	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=182,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:0,0:0,3,0,2
chr4	120463856	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr4	120481431	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=217,279;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,2:5,2:7,2,1,3
chr4	120483931	.	TATAGAA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=186,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:2,1:6,2:7,3,3,0
chr4	120486402	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=218,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:4,0,4,1
chr4	120527929	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=168,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:16,4:8,0:13,11,4,0
chr4	120528524	.	ATCT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=346,433;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	120981214	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=142,188;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:3,0,6,0
chr4	120983086	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.610:16:1,4:5,6:6,0,8,2
chr4	120983259	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.546:29:8,6:5,9:2,11,3,13
chr4	121702270	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=189,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:7,0,6,0
chr4	121719584	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr4	121720771	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=125,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.418:10:2,4:4,0:4,2,4,0
chr4	121720941	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=199,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:0,3,0,5
chr4	121720960	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr4	121737767	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=178,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:2,4,1,5
chr4	121739411	.	G	GCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=186,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CA;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,1:4,1:3,1,2,0
chr4	121828550	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,10;MFRL=172,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:7,0:4,0:12,1,3,0
chr4	121843611	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=147,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:3,3:4,0:7,0,3,0
chr4	121957734	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,10,7
chr4	121961031	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=228,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr4	121961279	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=218,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:0,4,1,5
chr4	121961295	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=206,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr4	122068133	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:10,0,3,1
chr4	122082481	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=225,270;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr4	122253910	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=198,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:2,15:6,0:7,1,15,0
chr4	122258063	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=121,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,1:3,2:2,8,1,2
chr4	122261785	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=231,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,4:2,5:2,4,3,6
chr4	122590906	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.258:13:3,1:7,1:1,9,1,2
chr4	122590913	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,0:4,3:1,6,1,2
chr4	122617631	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=181,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,3:8,1:9,3,4,0
chr4	122617654	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=184,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.324:19:4,3:9,2:10,3,6,0
chr4	122617688	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=171,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.280:30:8,5:14,3:11,11,5,3
chr4	122617718	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=171,118;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.351:32:8,6:13,5:10,11,5,6
chr4	122681373	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,1:2,3:7,0,4,0
chr4	122722693	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:8,6:7,2:5,10,2,6
chr4	122732899	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=101,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr4	122735225	.	C	CTTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,3:1,3:2,0,2,4
chr4	122737487	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,187;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,0:6,2:12,1,2,0
chr4	122739183	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,3:3,1:10,0,4,0
chr4	122749436	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:5,4,1,1
chr4	122756480	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=191,202;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:3,0:7,4:0,10,0,4
chr4	122789142	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=128,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:7,6:5,7:7,5,9,4
chr4	122791601	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=276,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr4	122831281	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:9,1:1,3:10,0,4,0
chr4	122833314	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	122835967	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.298:35:14,10:10,0:9,16,10,0
chr4	122846338	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=185,118;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.306:30:10,0:11,8:8,13,1,8
chr4	122853500	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:4,4,0,2
chr4	123097178	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=205,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,0:5,8:0,8,0,8
chr4	123108762	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	123128692	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=170,152;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,2:3,3:5,1,6,0
chr4	123130886	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=223,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:0,2:6,3:6,0,5,0
chr4	123140739	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,6,16
chr4	123155881	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=214,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr4	123175900	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=183,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.540:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr4	123178574	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,276;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:13,2:7,1:15,6,1,2
chr4	123185682	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr4	123187869	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=203,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr4	123222417	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.565:7:1,4:2,0:2,1,4,0
chr4	123222483	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=177,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,3:5,0:5,9,2,1
chr4	123239432	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=113,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.239:19:8,0:6,4:6,9,0,4
chr4	123246825	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=122,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,0:9,3:11,8,3,0
chr4	123246971	.	GTT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.200:21:6,1:5,3:9,8,3,1
chr4	123333671	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=243,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:3,0,4,0
chr4	123342616	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=187,236;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	123374819	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,207;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:3,2:6,1,2,0
chr4	123662997	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=119,227;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:8,1,3,0
chr4	123665366	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=182,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,1:6,1:7,11,1,1
chr4	123666156	.	A	AC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:0,4,0,7
chr4	123854495	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	123855925	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=173,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=36.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:5,0:6,14:0,11,0,14
chr4	123856827	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=197,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,0:3,3:6,2,2,1
chr4	123949267	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=150,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,2:0,1:5,0,3,0
chr4	123949556	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,5,9
chr4	124324242	.	CCTT	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=118.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,9:0,19:0,0,16,12
chr4	125631108	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=150,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:8,1,1,1
chr4	126237726	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,1:9,1:4,15,1,1
chr4	126240717	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=197,56;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,0:11,3:8,12,1,2
chr4	126315034	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr4	126335978	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr4	126336990	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr4	126337555	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr4	126355609	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,3,11
chr4	126373570	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=187,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,2:6,0:5,5,0,2
chr4	126384905	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr4	126389627	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr4	126390010	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:0,8,0,4
chr4	126390022	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:0,8,0,3
chr4	126400825	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=182,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr4	126402618	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=215,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr4	126411179	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=155,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.257:29:8,7:14,0:13,9,7,0
chr4	128554404	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:4,5:1,6:0,5,0,11
chr4	128621144	.	CTT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=107,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.280:12:4,2:4,1:6,3,3,0
chr4	128627050	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=220,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr4	128628019	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:12,3:4,0:9,7,3,0
chr4	128632023	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=170,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:4,0,4,0
chr4	128665981	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=147,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr4	128688444	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=222,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr4	128724855	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:8,2:9,0:9,9,2,0
chr4	128739528	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=112,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.229:33:9,7:17,0:16,10,6,1
chr4	128741498	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:8,0,2,0
chr4	128751775	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr4	128802922	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=185,75;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,3:4,0:11,2,2,1
chr4	128803159	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=137,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr4	128812152	.	C	CAGAGGAGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=179,241;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr4	128814425	.	AT	A,ATT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31,29;MFRL=119,167,167;MMQ=60,60,46;MPOS=20,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=9.34,10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,7:0.237,0.310:23:7,4,1:2,1,6:8,3,12,0
chr4	128851890	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:6,0:10,5:10,6,0,5
chr4	128865056	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=185,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:7,11,0,2
chr4	128886330	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=144,91;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:10,0:10,6:4,17,0,6
chr4	128932965	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr4	128995989	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=208,229;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr4	129121807	.	AA	GC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=140,33;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,0:6,2:7,4,1,1
chr4	129193739	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	129767748	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=245,276;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:129767748_A_G:129767748:0,3,0,1
chr4	129767758	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=251,276;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:129767748_A_G:129767748:0,2,0,1
chr4	129770068	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,345;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,1:4,3:6,3,4,0
chr4	129776983	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=221,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.577:17:3,7:4,3:1,6,3,7
chr4	129789060	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:10,0:14,5:11,13,0,5
chr4	129805716	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=132,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,0:5,2:3,3,0,2
chr4	129873987	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:4,6,0,2
chr4	129878342	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=171,259;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:1,4,0,3
chr4	130023759	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=196,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.864:20:1,8:1,9:1,1,11,7
chr4	138442119	.	TTTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=143,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,1,0
chr4	138449812	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,4:3,3:3,7,4,3
chr4	139093228	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=225,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	139103366	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr4	139140388	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr4	139965724	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=243,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr4	139965977	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:4,3:10,4:10,4,4,3
chr4	139981918	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=199,245;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr4	140217010	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:1,5:1,9:1,1,4,10
chr4	140255423	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:13,5:12,0:11,14,0,5
chr4	140308984	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=213,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,2:0,6:1,0,6,2
chr4	140375296	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=205,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,11:2,3:5,0,13,1
chr4	140439236	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=123,105;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,0:5,3:4,5,0,3
chr4	140450204	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,4:4,6:7,5,6,4
chr4	140450455	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0|1:140450455_G_C:140450455:0,0,0,3
chr4	140450464	.	T	TTATTGTGTGGGAGTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=283,155;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:1,0:0,1:0|1:140450455_G_C:140450455:0,1,0,1
chr4	140454523	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=194,57;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:140454523_G_T:140454523:3,5,1,1
chr4	140454525	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=203,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:140454523_G_T:140454523:3,6,1,1
chr4	140454532	.	GG	TT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=206,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:0|1:140454523_G_T:140454523:2,8,1,1
chr4	140616462	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:10,4:2,3:4,8,1,6
chr4	140625139	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,6:7,0:9,6,6,0
chr4	140625323	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,2,11
chr4	140641419	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=190,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,0:15,3:11,12,0,3
chr4	140646929	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:11,4:10,0:9,12,4,0
chr4	140651584	.	TCTG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CTG;STR;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr4	140810637	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.342:30:15,7:5,3:11,9,6,4
chr4	140810682	.	TTGCTGC	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=170,81;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=TGC;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:26,2:12,0:22,19,1,1
chr4	140810700	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=177,129;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.455:42:17,13:6,6:14,9,6,13
chr4	141264871	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=162,251;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:15,2:7,1:10,12,1,2
chr4	141264896	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=155,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:13,3:7,2:9,11,1,4
chr4	141310450	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=142,49;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:0|1:141310450_T_G:141310450:4,12,1,1
chr4	141310458	.	TCTAGAAAA	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=164,49;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:5,2:0|1:141310450_T_G:141310450:2,9,1,1
chr4	141310470	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=149,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:141310450_T_G:141310450:1,6,1,1
chr4	141310474	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=144,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:141310450_T_G:141310450:0,6,1,1
chr4	141311960	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr4	141448595	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=186,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.329:16:4,3:4,2:4,7,4,1
chr4	141448705	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.371:19:8,2:3,5:4,8,0,7
chr4	141458485	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr4	141481203	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=16,27;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.440:8:0,1:2,2:1,4,0,3
chr4	141489057	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=178,65;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:14,0:10,3:13,12,0,3
chr4	141549393	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,4:3,1,8,0
chr4	141555062	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=175,276;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr4	141578155	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,1:6,4:7,0,5,0
chr4	141598220	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=187,90;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:7,3:0,0:2,5,0,3
chr4	141677006	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr4	141847077	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr4	141847110	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=194,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,3:2,5:3,1,5,3
chr4	141847279	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	141868736	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=152,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:3,6:7,5:9,1,7,4
chr4	142147855	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:6,0,3,0
chr4	142153726	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=107,50;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:20,4:21,0:20,21,4,0
chr4	142153856	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.329:18:3,0:9,6:1,11,0,6
chr4	142155193	.	T	TTTATCAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=148,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:0|1:142155193_T_TTTATCAA:142155193:0,3,0,1
chr4	142155195	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=148,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:142155193_T_TTTATCAA:142155193:0,3,0,1
chr4	142155214	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=196,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	142640538	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=124,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:1,7:0,10:1,0,11,6
chr4	142651159	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:3,5:0,7:2,1,3,9
chr4	142949864	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:10,0,2,0
chr4	143003155	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=37,33;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=36.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.918:15:1,6:0,8:1,0,6,8
chr4	143007197	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	143007419	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=96,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr4	143007460	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr4	143029391	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=180,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:1,9,0,2
chr4	143043397	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:6,0:11,5:4,13,3,2
chr4	143043404	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:4,2:12,2:6,10,0,4
chr4	143044666	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	143066925	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr4	143067053	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=135,242;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:11,2:9,1:0|1:143067053_C_T:143067053:8,12,2,1
chr4	143067054	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,11:0.480:23:7,6:5,5:1|0:143067053_C_T:143067053:5,7,5,6
chr4	143130034	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr4	143130219	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:3,5,0,3
chr4	143181731	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=118,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.362:11:2,3:2,1:0,7,1,3
chr4	143181747	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=130,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.609:11:3,4:1,2:1,3,0,7
chr4	143226768	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=206,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr4	143324036	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:3,0,3,1
chr4	143326312	.	AAGAG	A,AAGAGAGAGAG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29,30;MFRL=131,199,175;MMQ=60,60,60;MPOS=1,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,13;RU=AG;STR;TLOD=6.59,8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,6:0.183,0.381:16:3,1,2:1,2,3:4,3,8,1
chr4	144108906	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,1:9,1,2,0
chr4	144124492	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr4	144130642	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.566:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr4	144136193	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0,1,0,7
chr4	144354912	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:5,0:1,5:0,6,0,5
chr4	144378766	.	TTTA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,15;MFRL=0,266;MMQ=60,46;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:2,0:0,0:0|1:144378766_TTTA_T:144378766:1,1,1,0
chr4	144378775	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,15;MFRL=0,266;MMQ=60,46;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:144378766_TTTA_T:144378766:2,1,1,0
chr4	144378777	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=0,266;MMQ=60,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:144378766_TTTA_T:144378766:2,1,1,0
chr4	144378783	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=68,266;MMQ=60,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:144378766_TTTA_T:144378766:1,1,1,0
chr4	144387217	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:2,1:4,1,2,1
chr4	144446519	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr4	144447630	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:1,10:1,6:1,1,5,11
chr4	144449220	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=219,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	144456124	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,6,16
chr4	144466050	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=137,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.806:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr4	144469383	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=215,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr4	144471174	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,0:11,4:12,10,0,4
chr4	144797848	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=150,213;MMQ=52,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,1:6,3:5,3,3,1
chr4	144797949	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=156,66;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:7,9,1,1
chr4	144801662	.	C	G,T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,34,29;MFRL=227,126,180;MMQ=60,46,57;MPOS=22,10;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=28.17,20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,8,7:0.474,0.421:16:1,4,5:0,3,2:0,1,5,10
chr4	144801671	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=189,119;MMQ=57,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.528:15:5,4:2,4:2,5,2,6
chr4	144917514	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,231;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr4	144918867	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=200,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr4	144920480	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=172,117;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,4:3,1:7,3,4,1
chr4	144940333	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=201,240;MMQ=52,34;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:5,3,2,0
chr4	145035788	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,1,1
chr4	145037980	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,33;MFRL=97,170;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.877:10:0,3:0,6:1,0,5,4
chr4	145040784	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=125,187;MMQ=50,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,3,2
chr4	145040962	.	CA	GT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=101,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr4	145040999	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=185,172;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr4	145041011	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=203,172;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr4	145041036	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=185,192;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	145041741	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=153,249;MMQ=40,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:1,0,1,2
chr4	145061822	.	CA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,292;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.202:23:10,4:9,0:11,8,2,2
chr4	145573954	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.425:10:0,2:6,2:1,5,0,4
chr4	145579907	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,3:0,5:1,0,5,3
chr4	146031323	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,145;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:13,4:15,0:13,15,0,4
chr4	146033368	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=21,33;MFRL=143,125;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.177:14:2,2:3,0:4,8,2,0
chr4	146033386	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,11;MFRL=147,125;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:5,0:8,0:0|1:146033386_C_A:146033386:10,13,2,0
chr4	146033389	.	AG	TT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,16;MFRL=147,125;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,0:12,0:0|1:146033386_C_A:146033386:10,13,2,0
chr4	146033577	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=176,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,9:0.333:28:9,9:10,0:0|1:146033577_A_G:146033577:0,19,9,0
chr4	146033584	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=177,193;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,9:0.333:28:9,8:10,0:0|1:146033577_A_G:146033577:0,19,9,0
chr4	146042445	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:8,2:12,1:11,10,1,2
chr4	146046123	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=200,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.423:19:4,2:7,6:0|1:146046123_AT_A:146046123:6,5,5,3
chr4	146046138	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=89.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,10:0,13:0|1:146046123_AT_A:146046123:0,0,13,11
chr4	146048583	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr4	146059446	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=177,103;MMQ=52,22;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.134:28:11,0:13,3:0|1:146059446_A_C:146059446:9,16,0,3
chr4	146059450	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=179,103;MMQ=52,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:11,0:11,3:0|1:146059446_A_C:146059446:8,15,0,3
chr4	146065006	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,9:0,0,12,2
chr4	146067487	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.216:35:12,7:16,0:18,10,7,0
chr4	146073850	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=198,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:1,0:6,2:1,7,0,2
chr4	146076632	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:6,2:7,2:8,7,1,3
chr4	146077132	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=109,205;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:9,3:13,2:12,10,1,4
chr4	146083703	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=194,186;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,2:3,1:5,1,3,0
chr4	146475243	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,29;MFRL=81,270;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.617:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr4	146650449	.	A	ATTTTTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,0;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=24,33;RU=T;STR;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.815:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr4	146686396	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=249,262;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr4	146686414	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=249,1625902;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:1,4,0,2
chr4	146744690	.	AGG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=15,24;MFRL=256,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.247:6:0,1:1,0:2,3,0,1
chr4	147110891	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=230,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:1,7,1,2
chr4	147204439	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,128;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,0:6,2:3,16,0,2
chr4	147214029	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:3,1,2,2
chr4	147425114	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=222,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:2,6,0,8
chr4	147438084	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=367,265;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	147560457	.	T	TGGC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=GGC;STR;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,1:0,0,4,3
chr4	147754924	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,1,0
chr4	148457021	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=211,244;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:4,0:4,0:0|1:148457021_C_A:148457021:5,5,2,0
chr4	148457031	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=199,244;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:5,0:4,0:0|1:148457021_C_A:148457021:7,5,2,0
chr4	148463840	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr4	148564160	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=176,131;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr4	148575543	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=188,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:4,3:10,0:9,5,1,2
chr4	148589677	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,7,0
chr4	148591769	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,1:0,8:0,0,8,2
chr4	148591873	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:6,0:10,2:4,12,0,2
chr4	148604886	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,2:0,3:0,0,3,6
chr4	148778685	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.773:11:2,3:0,3:1,1,4,5
chr4	148800299	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr4	148803101	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=116,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:1,6,3,3
chr4	148827747	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,6:4,2:6,1,6,2
chr4	148827920	.	T	TGGTTGCGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=56,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr4	148827933	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	148968080	.	CA	AG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:10,0:6,2:8,8,0,2
chr4	148985720	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=194,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,1,3
chr4	149002409	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=155,229;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:7,0,3,0
chr4	149035449	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:0,9,0,2
chr4	149073555	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr4	149116035	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr4	149358014	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=259,275;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	151161470	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=262,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr4	151161490	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr4	151161502	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=35,22;MFRL=178,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.764:15:1,6:2,6:1,2,8,4
chr4	151177340	.	CC	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr4	151177432	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	151207054	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=128,72;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:11,0:6,5:10,7,1,4
chr4	151231371	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=291,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,5:2,4:2,1,6,3
chr4	151356900	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=220,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr4	151357816	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chr4	151408800	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=119,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr4	151504131	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=199,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:4,2,2,0
chr4	151505624	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,7:1,6:0,1,0,13
chr4	151656589	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr4	151683003	.	TA	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:13,3:13,1:10,18,2,2
chr4	151719263	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=121,152;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:9,2:12,2:8,13,1,3
chr4	151765243	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=51.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,10,6
chr4	151773512	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=176,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,1:7,2:5,6,3,0
chr4	151789381	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,4:6,4:3,6,4,4
chr4	151817507	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=152,267;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:6,3,1,1
chr4	151829659	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,7,9
chr4	151835502	.	GAA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.206:12:0,1:2,1:2,8,0,2
chr4	152020736	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=178,91;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.183:18:6,2:6,0:7,8,3,0
chr4	152025273	.	G	GCTTAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTTAT;STR;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,4:0,0,7,4
chr4	152048936	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr4	152053408	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr4	152095955	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.220:26:7,0:8,0:15,5,0,6
chr4	152201018	.	G	GCAGGT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=141,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAGGT;STR;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.497:12:2,1:4,3:3,3,3,3
chr4	152201053	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=221,193;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:3,2,3,3
chr4	152201204	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr4	152203664	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=422,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	152204403	.	GC	AG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=170,36;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:152204403_GC_AG:152204403:8,6,1,1
chr4	152204409	.	G	GGTTTCA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=170,36;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:152204403_GC_AG:152204403:8,6,1,1
chr4	152204412	.	A	AGAATATG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=170,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:152204403_GC_AG:152204403:8,6,1,1
chr4	152212704	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr4	152510130	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=127,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,5:6,0:1,8,0,5
chr4	152559717	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.520:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr4	152583907	.	C	CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=102,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=T;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.359:7:2,1:2,1:3,2,1,1
chr4	152592469	.	A	ATTAC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=193,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTAC;STR;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.205:17:6,1:8,2:0,14,0,3
chr4	152609694	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=225,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:152609694_A_G:152609694:4,0,2,0
chr4	152609700	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=225,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,1:1,1:0|1:152609694_A_G:152609694:4,0,2,0
chr4	152681952	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:6,1:3,1:6,3,2,0
chr4	153245523	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,2:6,1:4,13,1,2
chr4	153245525	.	T	TGGC	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,0:6,2:0|1:153245525_T_TGGC:153245525:4,13,0,2
chr4	153245527	.	AC	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:5,2:0|1:153245525_T_TGGC:153245525:4,14,0,2
chr4	153245532	.	ATGG	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:6,2:0|1:153245525_T_TGGC:153245525:4,14,0,2
chr4	153245537	.	T	TACATTAAAA	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:0|1:153245525_T_TGGC:153245525:4,14,0,2
chr4	153247401	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:9,0:18,3:0|1:153247401_G_A:153247401:4,24,0,3
chr4	153247403	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:10,0:16,3:0|1:153247401_G_A:153247401:4,24,0,3
chr4	153249365	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=200,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:15,3:12,0:0|1:153249365_T_C:153249365:15,13,3,0
chr4	153249367	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=195,249;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,3:0.124:30:17,2:10,1:1|0:153249365_T_C:153249365:17,10,0,3
chr4	153268227	.	CAA	C,CA,AAA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,27,23,22;MFRL=177,175,173,71;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,24,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=6.07,14.76,4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:12,4,9,4:0.156,0.317,0.118:29:3,1,3,2:6,2,2,1:4,8,5,12
chr4	153549745	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,4,9
chr4	153549852	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,333;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	153565641	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=159,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:9,1:3,3:2,11,1,3
chr4	153574173	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=180,455;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:3,10:1,0:0,4,0,10
chr4	153791955	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=200,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:6,1:8,3:5,9,2,2
chr4	153864378	.	T	TG	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=29,21;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.165:22:8,1:9,2:0|1:153864378_T_TG:153864378:0,19,3,0
chr4	153864383	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=29,12;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:9,0:8,0:0|1:153864378_T_TG:153864378:0,19,3,0
chr4	153864386	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=30,12;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:8,0:8,0:0|1:153864378_T_TG:153864378:0,17,3,0
chr4	153864389	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=26,12;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:8,1:8,0:0|1:153864378_T_TG:153864378:0,16,3,0
chr4	153864395	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=25,31;MFRL=157,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.197:19:6,1:8,1:0|1:153864378_T_TG:153864378:1,15,3,0
chr4	153864398	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=25,25;MFRL=163,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.187:20:7,0:9,2:0|1:153864378_T_TG:153864378:1,16,3,0
chr4	153864401	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=29,18;MFRL=163,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.179:21:7,0:9,1:0|1:153864378_T_TG:153864378:1,17,3,0
chr4	153864403	.	CACTT	C	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=33,12;MFRL=163,118;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.147:19:8,0:7,0:0|1:153864378_T_TG:153864378:1,16,2,0
chr4	153882002	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=178,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.173:19:6,0:10,2:5,11,1,2
chr4	154191710	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=194,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:2,3:3,2:0,5,1,5
chr4	154330064	.	GTATA	G,GTA,GTATATATATATA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33,30,34;MFRL=134,149,152,137;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,2,28;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,9,10,15;RU=TA;STR;TLOD=4.33,4.23,7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,2,2,4:0.153,0.174,0.344:12:2,1,0,1:2,1,2,1:4,0,7,1
chr4	154388336	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:5,1:8,1:6,7,2,0
chr4	154395112	.	C	CCAA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:154395112_C_CCAA:154395112:3,13,0,2
chr4	154395115	.	T	TCC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:7,2:0|1:154395112_C_CCAA:154395112:3,13,0,2
chr4	154395116	.	A	ATTCTATCCACTC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:7,2:0|1:154395112_C_CCAA:154395112:2,12,0,2
chr4	154476924	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:9,3:4,1:10,3,3,1
chr4	154478300	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr4	154525458	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=197,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,4:4,5:2,4,8,1
chr4	154542037	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=149,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.169:33:17,1:11,4:15,13,2,3
chr4	154542814	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=220,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:4,6:4,1:7,1,6,1
chr4	154548909	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=184,274;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:1,2:3,0:0,5,0,2
chr4	154556798	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr4	154557383	.	ATG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=46.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,11,0
chr4	154557405	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=109,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:0,4:1,6:1,0,11,0
chr4	154633580	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr4	154633734	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=190,49;MMQ=60,28;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,3:4,1:3,4,2,2
chr4	154641489	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=215,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,5:4,4:0,5,1,8
chr4	154644454	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr4	154644537	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:7,5:4,3:5,6,7,1
chr4	154669993	.	C	CAAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=A;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,2:6,2:0,13,2,2
chr4	154709480	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr4	155158236	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:7,0:11,4:9,9,0,4
chr4	155161666	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,12,4
chr4	155225784	.	AAAACAAAC	A,CAAACAAAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29,32;MFRL=0,204,109;MMQ=60,60,60;MPOS=33,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.40,13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.286,0.612:7:0,0,3:0,3,1:0,0,7,0
chr4	155226421	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=160,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr4	155242383	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr4	155244401	.	TTTTG	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTG;STR;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.943:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr4	155244475	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,9,7
chr4	155244486	.	C	CA,CAA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,24,32;MFRL=274,219,245;MMQ=60,60,60;MPOS=15,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=A;STR;TLOD=5.35,4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,3:0.393,0.322:10:1,1,1:2,1,1:3,0,2,5
chr4	155249431	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr4	155250915	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=240,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:5,4:4,2:0,9,1,5
chr4	155252934	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=190,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr4	155287317	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:4,3,2,0
chr4	155305430	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=181,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155305430_C_T:155305430:1,0,1,0
chr4	155305432	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=181,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155305430_C_T:155305430:1,0,1,0
chr4	155305491	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=256,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:2,0,4,2
chr4	155407569	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr4	155410407	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,280;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,3,0
chr4	155412141	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=180,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,2:2,2:3,4,1,3
chr4	155412398	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=201,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,1:5,1:5,4,0,2
chr4	155457781	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr4	155458728	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr4	155460459	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=177,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr4	155461687	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=179,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:8,0,4,0
chr4	155465535	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:5,1,2,0
chr4	155466935	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,0:5,3:9,2,2,1
chr4	155467187	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=165,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:9,2:3,5:5,7,6,1
chr4	155486470	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr4	155487221	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=218,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	155488858	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=127,63;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,0:5,2:6,10,1,1
chr4	155488887	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:155488887_G_A:155488887:1,6,1,1
chr4	155488891	.	G	GCC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:155488887_G_A:155488887:1,6,1,1
chr4	155507962	.	CC	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,121;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,4:6,0:8,8,4,0
chr4	155508627	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,1:1,6:1,0,6,1
chr4	155510224	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr4	155511897	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr4	155525970	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:4,0,5,1
chr4	155720349	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,259;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:4,5,2,0
chr4	156136705	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=183,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,1:5,5:7,1,4,2
chr4	156274377	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,1:8,2:9,6,2,1
chr4	156290032	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	156296868	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=192,246;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:6,0,6,0
chr4	156297060	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=167,255;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,3:1,2:2,4,0,5
chr4	156617994	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=190,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:4,3:1,4:3,2,6,2
chr4	156629276	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=194,181;MMQ=60,32;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr4	156631707	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=162,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,4:3,1:5,5,4,1
chr4	156632034	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=175,35;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,1:11,3:11,12,3,1
chr4	156634157	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=331,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr4	156643176	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,11,7
chr4	156721187	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=161,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:5,0:11,4:8,8,1,3
chr4	156721198	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:5,1:11,3:7,10,1,3
chr4	156750959	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,5:1,2:1,0,5,2
chr4	156757789	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=103,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.855:10:0,4:1,3:1,0,6,3
chr4	156757818	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:9,1:10,2:13,6,3,0
chr4	156787340	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,12,5
chr4	156826166	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,3:0,12:0,0,8,7
chr4	156830023	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=193,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:2,1,2,2
chr4	156831444	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=239,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr4	156832841	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,2:1,7:0,1,1,8
chr4	156839462	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	156847230	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=137,166;MMQ=50,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,12:0.822:14:0,9:1,3:0|1:156847230_A_G:156847230:0,2,4,8
chr4	156847237	.	AG	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.887:14:0,10:1,3:0|1:156847230_A_G:156847230:0,1,4,9
chr4	156863528	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,63;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:13,3:11,0:10,15,2,1
chr4	157732191	.	G	GGAACAAAAAGATTATGGA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:2,17,0,2
chr4	158041896	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=1196,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr4	158242540	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr4	158254014	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=171,64;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:25,0:11,3:24,13,0,3
chr4	159154032	.	T	TAG	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=48.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:15,13:4,0:14,5,13,0
chr4	159443131	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:5,1:6,1:6,5,0,2
chr4	159514466	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=220,306;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	159529091	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=172,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr4	159548100	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=243,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr4	159549720	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:7,2,1,1
chr4	159568383	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	159572962	.	A	AG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.232:24:7,5:10,0:13,6,5,0
chr4	159590922	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=165,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.286:11:1,1:5,2:3,5,0,3
chr4	159616585	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=230,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr4	159618695	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=194,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:5,1:7,1,2,0
chr4	159630817	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=169,255;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,7,0
chr4	159638426	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,37;MFRL=225,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr4	159642576	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:4,0:6,2:4,6,2,0
chr4	159644494	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=194,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,1:3,3:0|1:159644494_G_C:159644494:0,7,0,4
chr4	159644501	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=205,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,1:3,2:0|1:159644494_G_C:159644494:0,6,0,4
chr4	159754865	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=202,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:2,1:2,1:0,5,0,2
chr4	159780244	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=140,393;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:7,1:8,1:9,6,2,0
chr4	159789441	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,212;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:1,4,1,1
chr4	159881328	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=245,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:0,2:3,0,3,0
chr4	159894250	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr4	159894283	.	G	GGAGAA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=155,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,0:6,2:0|1:159894283_G_GGAGAA:159894283:7,5,1,1
chr4	159894286	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=155,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:0|1:159894283_G_GGAGAA:159894283:7,5,1,1
chr4	159894305	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,7,8
chr4	160189200	.	CT	C,CTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32,34;MFRL=209,184,190;MMQ=60,60,60;MPOS=19,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.17,4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,2:0.200,0.237:10:2,1,2:4,1,0:6,0,4,0
chr4	160252704	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=187,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:6,2:3,8:6,3,2,8
chr4	160271268	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,2:3,2:6,3,3,1
chr4	160274613	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=203,272;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:4,3:9,0:14,5,3,0
chr4	160277276	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:5,5,2,4
chr4	160279317	.	CG	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=162,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:2,10,0,3
chr4	162307060	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=180,147;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.386:29:9,8:9,3:8,10,5,6
chr4	162459299	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr4	162463660	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,221;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:4,0:6,3:7,3,1,2
chr4	162841814	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr4	164069397	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=269,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr4	164087954	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr4	164436633	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=173,104;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:10,0:7,8:4,13,0,8
chr4	164438523	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=124,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:6,2,2,0
chr4	164440461	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.450:9:1,1:3,2:4,1,2,2
chr4	164466970	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:0,6,0,5
chr4	164507104	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,4:4,2:3,2,0,6
chr4	165118066	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=185,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,3:6,2:8,0,5,0
chr4	165118652	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=111,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:3,7:4,7:4,3,5,9
chr4	165878170	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr4	165879215	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164,289;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:4,0:5,6,1,1
chr4	165962078	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:2,1,0,1
chr4	166009844	.	T	TCTCATTTGGATAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=186,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	166149870	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,200;MMQ=52,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:5,11:10,0:15,0,11,0
chr4	166150086	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=157,122;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.153:39:10,3:23,3:7,26,2,4
chr4	166215662	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=177,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.367:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr4	166232715	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=163,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.091:30:16,0:12,2:0|1:166232715_G_A:166232715:15,13,1,1
chr4	166232720	.	A	AGCGTCAGGAAATCTTCT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=166,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:14,0:10,2:0|1:166232715_G_A:166232715:14,12,1,1
chr4	166259161	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=196,75;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:166259161_C_T:166259161:0,2,0,2
chr4	166259163	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,19;MFRL=196,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,0:0|1:166259161_C_T:166259161:0,2,0,2
chr4	166259168	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=220,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:166259161_C_T:166259161:0,3,0,1
chr4	166307302	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	166336465	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,2:1,3:0,7,1,4
chr4	166403574	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=133,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:1,8,0,4
chr4	166405640	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,54;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:8,0:11,2:11,8,1,1
chr4	166408782	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,251;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:1,1:0,2:0,1,0,4
chr4	166910665	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,2:6,1:3,8,0,3
chr4	166916362	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=170,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:1,0:6,2:0,7,0,2
chr4	166929276	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr4	166960481	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:3,4:13,1:10,6,3,2
chr4	166978539	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=201,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:0,10,0,2
chr4	166981419	.	A	AGAACTGC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:3,0:0|1:166981419_A_AGAACTGC:166981419:0,10,0,2
chr4	166981422	.	A	AAGG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=182,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:166981419_A_AGAACTGC:166981419:0,11,0,2
chr4	167012241	.	GTTT	G,GTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34,33;MFRL=0,165,277;MMQ=60,60,60;MPOS=13,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,6,8;RU=T;STR;TLOD=32.99,5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,12,3:0.712,0.233:15:0,5,0:0,5,3:0,0,14,1
chr4	167012250	.	T	TAA,A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27,28;MFRL=0,165,277;MMQ=60,60,60;MPOS=17,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=32.99,5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,12,3:0.712,0.233:15:0,6,0:0,6,2:0,0,14,1
chr4	167012480	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,1,15
chr4	167012506	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,35;MFRL=106,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:1,1:0,5:0,1,1,5
chr4	167012543	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr4	167020778	.	CAA	C,CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,32,25;MFRL=268,196,247;MMQ=60,60,60;MPOS=29,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.60,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.437,0.341:6:0,1,1:1,2,0:0,1,0,5
chr4	167656073	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:7,0,7,0
chr4	167656278	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:4,2:2,6,1,2
chr4	167675635	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=227,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr4	167983844	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=199,150;MMQ=60,33;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:4,0:2,3:0,7,0,3
chr4	169083757	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:6,2:5,9,1,1
chr4	169085249	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=205,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:4,13:6,0:10,0,13,0
chr4	169086540	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	169098984	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=192,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,3:6,2:7,8,1,4
chr4	169143035	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=215,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,4:6,3:2,9,2,5
chr4	169143091	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=160,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr4	169158369	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,0:4,5:6,0,5,0
chr4	169158471	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:8,4:10,6:9,9,6,4
chr4	169158489	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:8,3:12,5:13,7,4,4
chr4	169172098	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=219,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,0:2,5:3,3,4,1
chr4	169183789	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=57.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,13,4
chr4	169188927	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,6,12
chr4	169190129	.	CAA	C,CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35,32;MFRL=255,207,158;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=6.03,4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,3:0.307,0.286:12:3,2,0:1,2,3:2,3,2,5
chr4	169206467	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=183,128;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:1,0:6,2:7,0,2,0
chr4	169213001	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,98;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:6,1:8,6,2,0
chr4	169213139	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	169223582	.	A	AGAGGAGTTGCAAG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=167,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:2,11,1,1
chr4	169282187	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=194,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,0:6,2:7,0,2,0
chr4	169282232	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=184,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:3,1,5,1
chr4	169292759	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=102,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:2,8:5,8:3,4,12,4
chr4	169296472	.	TAACC	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=168,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:11,3:4,2:15,0,5,0
chr4	169299676	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=281,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr4	169301059	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=174,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,1:3,5:0,4,0,6
chr4	169301077	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=199,290;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:0,1:3,1:0,4,0,2
chr4	169312800	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=137,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:2,2:2,3:1,7,0,6
chr4	169312801	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=92,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.758:9:0,0:2,0:2,1,0,6
chr4	169312802	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=137,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.403:14:5,0:3,3:1,7,0,6
chr4	169315571	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=53.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,13,3
chr4	169317081	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=212,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr4	169317279	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=193,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:5,1:0,11,0,2
chr4	169317284	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31,31,20;MFRL=202,219,170,527;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,18,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.15,12.09,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,2,5,2:0.186,0.378,0.186:12:1,0,2,0:2,2,3,1:0,3,0,9
chr4	169325124	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=164,227;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:13,0:10,10,2,0
chr4	169325282	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.666:12:2,5:2,2:2,2,0,8
chr4	169325297	.	AATTTGTGGAAACAG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=154,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:5,1:2,11,0,2
chr4	169327905	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,1:6,1:1,9,0,2
chr4	169340431	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:5,1:17,1:13,9,1,1
chr4	169362557	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,7:2,4:1,3,7,4
chr4	169374487	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=195,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,7:0,7:0,1,1,13
chr4	169382822	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=344,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,5:2,0,5,2
chr4	169382991	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,204;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:5,5,3,0
chr4	169393972	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=224,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,1:0,5:0,2,0,6
chr4	169432892	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=192,197;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:7,10:17,0:16,8,11,0
chr4	169604080	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=209,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.550:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr4	169612441	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=138,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.101:46:25,2:16,2:19,23,2,2
chr4	169612461	.	GT	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=116,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.235:23:7,4:9,1:5,13,0,5
chr4	169819902	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:7,2:0,0:2,5,0,2
chr4	169835048	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=199,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:1,8:2,8:2,1,12,4
chr4	169842707	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=171,116;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:7,6:9,0:10,6,6,0
chr4	169842976	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr4	169846255	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=91.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,26:0.844:30:2,16:2,10:2,2,8,18
chr4	169846359	.	GCT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=210,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CT;STR;TLOD=46.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.830:15:1,9:1,4:0,2,9,4
chr4	169931268	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=247,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=130.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,32:0.892:35:1,17:2,14:0|1:169931268_G_A:169931268:2,1,12,20
chr4	169931274	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=214,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=108.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,25:0.897:27:0,13:2,12:0|1:169931268_G_A:169931268:1,1,8,17
chr4	169931288	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=247,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,20:0.913:21:0,11:1,8:0|1:169931268_G_A:169931268:0,1,5,15
chr4	169931326	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=21,26;MFRL=147,248;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.754:10:0,1:1,4:0,2,0,8
chr4	170017860	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=282,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,4:3,6:1,4,2,8
chr4	170038575	.	AA	TT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=200,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:1,4:4,0,6,0
chr4	170345644	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=228,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr4	170354836	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:2,1,0,4
chr4	170354873	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=179,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	170359222	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=164,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:5,4,1,1
chr4	170398717	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=184,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:6,5:1,3:0,7,0,8
chr4	170428843	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=212,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:6,1,4,3
chr4	170429359	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr4	170483153	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=170,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:0,6:1,2:1,0,3,5
chr4	170501954	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=200,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,8:3,3:6,2,5,6
chr4	170506629	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=190,151;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:10,0:10,8:9,11,0,8
chr4	170508586	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:8,0,5,0
chr4	170601449	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=183,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr4	170613564	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=214,174;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:0,6,0,4
chr4	170616918	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr4	170618697	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=186,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,2:4,0:4,10,2,0
chr4	170628474	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr4	170638891	.	ACT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,1:5,2:10,2,2,1
chr4	170640993	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:4,1,6,1
chr4	170658731	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,1:3,4:3,0,5,0
chr4	170658944	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=58,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.440:7:1,1:3,1:0,4,0,3
chr4	170663321	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	170669824	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:4,0,5,0
chr4	170985855	.	A	ACCT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCT;STR;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:2,1:3,1,4,1
chr4	170985927	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=164,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:10,4:11,0:11,10,4,0
chr4	170989708	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=250,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:1,2:3,2:4,0,2,2
chr4	170994554	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr4	172735897	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,0,10
chr4	173232679	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	173232944	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,5,11
chr4	173269915	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr4	173803914	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=173,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,4:0,1,8,2
chr4	173852247	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=155,57;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,0:5,2:9,1,2,0
chr4	173873170	.	TG	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,17,4
chr4	173930479	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,4,6
chr4	174242817	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=156,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,0:9,3:3,13,1,2
chr4	174253938	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=168,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.348:29:10,6:9,3:10,9,5,5
chr4	174294990	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr4	174449862	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=227,247;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr4	174537063	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr4	174537471	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,164;MMQ=60,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,3:5,2:2,7,4,1
chr4	175237536	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=220,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:1,2:4,1:2,3,1,3
chr4	175414246	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	175414278	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr4	175429808	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=167,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:6,1,2,0
chr4	175580119	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=155,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,1:6,3:7,0,4,0
chr4	175649861	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,4:0,4:0|1:175649861_T_G:175649861:0,0,3,10
chr4	175649873	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=19,18;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.558:7:0,0:1,1:0|1:175649861_T_G:175649861:0,3,0,4
chr4	177049880	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=131,57;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:17,1:10,2:14,13,1,2
chr4	177083166	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:2,0,6,0
chr4	177093505	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=213,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.543:11:3,4:1,2:2,3,4,2
chr4	177095908	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr4	177113764	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr4	177113779	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,1:2,3:5,0,2,2
chr4	177116463	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr4	177116779	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=281,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,6:2,4:0,2,1,9
chr4	177142776	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr4	177143664	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	177248446	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:6,7,1,1
chr4	177605081	.	CTCA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCA;STR;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.885:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr4	177608775	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr4	177608875	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr4	177650614	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=307,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr4	178256759	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=188,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.448:7:1,2:2,1:3,1,3,0
chr4	178257516	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=176,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr4	178272748	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=195,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,5:1,1:1,0,3,3
chr4	178353046	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	178355668	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr4	178361414	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=174,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:9,3:3,6:6,6,5,4
chr4	178361491	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=159,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.251:29:14,0:7,6:11,11,0,7
chr4	178361621	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=161,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,4:5,0:1,6,1,3
chr4	178363378	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,5:4,8:9,1,11,2
chr4	178882120	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr4	178897192	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	183063751	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=201,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:11,3:6,2:8,9,0,5
chr4	183267728	.	TAA	T,TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26,25;MFRL=161,172,218;MMQ=60,60,60;MPOS=10,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.69,12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,6:0.294,0.553:10:1,2,3:0,1,3:1,0,9,0
chr4	183268148	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr4	183268174	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr4	183522021	.	C	CAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=341,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AT;STR;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr4	183522409	.	TTTG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=401,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTG;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr4	183550030	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=141,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.132:36:15,0:16,4:15,17,0,4
chr4	183600752	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,139;MMQ=57,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:6,1:4,2:10,0,3,0
chr4	183601666	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=180,272;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,1:7,3:7,7,2,2
chr4	183601847	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=121,196;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.239:23:4,2:14,3:0|1:183601847_T_C:183601847:7,11,3,2
chr4	183601849	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=141,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:20,2:0.123:22:7,0:13,2:1|0:183601847_T_C:183601847:9,11,1,1
chr4	183601857	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=162,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,2:0.120:23:7,0:9,2:1|0:183601847_T_C:183601847:7,14,1,1
chr4	183601858	.	A	ATTCTGTCCTATTTTTC	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=162,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,2:0.120:23:8,0:9,2:1|0:183601847_T_C:183601847:7,14,1,1
chr4	183673226	.	T	TA,TAA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,29,25;MFRL=175,173,138;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=A;STR;TLOD=9.81,4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,4:0.382,0.257:17:3,0,1:3,5,2:1,6,1,9
chr4	183673247	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,12:0,0,1,16
chr4	183674577	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,10,2
chr4	183814169	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=188,62;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:4,2,0,2
chr4	183814198	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=165,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,1:6,1:6,8,0,2
chr4	184170025	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,4,11
chr4	184171187	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=64.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:1,12:0,6:0,1,4,14
chr4	184180920	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=194,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:3,2:4,3:3,4,1,4
chr4	184182001	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,7:0,0,13,5
chr4	184190355	.	A	AC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:3,1,2,5
chr4	184190535	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=120,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,3:3,5:7,3,3,5
chr4	184192183	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=224,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr4	184201909	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,2:6,1:6,3,3,0
chr4	184202148	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	184207232	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=225,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:2,8,2,0
chr4	184236951	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=115,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:1,4,1,3
chr4	184366629	.	T	TGCACA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=215,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCACA;STR;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,2:2,5:2,0,7,1
chr4	184367558	.	TCTG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=202,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.841:23:1,8:2,11:2,1,12,8
chr4	184426526	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,16:0,10:0,0,11,15
chr4	184427580	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=253,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:2,6:0,5:0,2,0,12
chr4	184431719	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=139,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:16,1:13,1:13,17,2,0
chr4	184567431	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.404:8:4,1:1,2:4,1,3,0
chr4	184567663	.	C	CCCGCCAAAAAAA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=114,148;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:13,0:19,4:19,14,0,4
chr4	184570723	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=197,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.632:14:4,3:1,6:1,4,1,8
chr4	184572341	.	GA	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.162:29:9,1:14,3:17,8,4,0
chr4	184577177	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=227,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=49.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.833:16:0,5:2,9:0,2,4,10
chr4	184588121	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,1:6,1:7,0,2,0
chr4	184588305	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,1:7,2:4,7,0,3
chr4	184596309	.	CT	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.543:24:5,6:6,7:6,5,2,11
chr4	184596446	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:0,2:5,2:1,4,1,3
chr4	184600601	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=175,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,6:4,2:4,5,1,7
chr4	184605467	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:9,2:5,0:7,7,2,0
chr4	184922669	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=198,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,2:6,1:1,6,0,3
chr4	184932332	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=136,220;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:6,3:14,3:10,10,3,3
chr4	184932609	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr4	185012398	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:5,4:3,3:5,3,5,2
chr4	185074686	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=212,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,5:5,1:2,5,3,3
chr4	185312027	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=214,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:0,3,0,7
chr4	185320095	.	TGCA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=158,86;MMQ=60,55;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:7,2:16,0:14,9,2,0
chr4	185329227	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:6,0,5,1
chr4	185339641	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=175,250;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:5,3:2,0:7,0,3,0
chr4	185350307	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=253,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr4	185552135	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=199,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,2:4,4:10,0,6,0
chr4	185552345	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=200,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:0,7,0,3
chr4	185553098	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:1,9:0,10:0,1,8,11
chr4	185553353	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,5,1
chr4	185559487	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:2,7:0,5:2,0,8,4
chr4	185578485	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:8,1:2,2:3,7,0,3
chr4	185580420	.	ACATT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:3,0,0,1
chr4	185583092	.	C	CTATT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,1,7
chr4	185593699	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,3:2,8:0,4,0,11
chr4	185612627	.	CT	C,CTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=15,31,19;MFRL=204,162,53;MMQ=60,60,60;MPOS=5,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=14.36,3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,8,2:0.605,0.240:11:0,5,0:0,2,0:0,1,5,5
chr4	185612953	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=221,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr4	185615764	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=125,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,13:0.518:25:7,8:5,4:0|1:185615764_C_A:185615764:5,7,4,9
chr4	185615768	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=125,144;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.500:24:7,8:5,4:0|1:185615764_C_A:185615764:5,7,4,8
chr4	185623312	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=149,214;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:10,3:7,3:7,10,1,5
chr4	185631338	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=174,89940230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0,4,1,1
chr4	185634144	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=182,107;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.329:16:5,0:6,5:3,8,2,3
chr4	185634171	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=214,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.377:13:3,1:2,4:0,8,1,4
chr4	185634218	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=188,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,2:2,1:0,3,1,2
chr4	185638231	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=225,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:3,0,6,0
chr4	185646047	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr4	185650276	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,1,3
chr4	185652201	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=189,249;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,1:2,3:1,2,1,4
chr4	185652213	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:1,2:0,3,0,2
chr4	185681475	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr4	185681753	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=154,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr4	185684247	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:6,0,4,0
chr4	185686948	.	AAC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=220,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:3,3:3,0:7,1,3,0
chr4	185694697	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=148,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr4	185694776	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.313:30:11,4:9,5:16,5,6,3
chr4	185694877	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=151,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.192:19:8,2:7,1:4,12,0,3
chr4	185701620	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=217,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	185709891	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=193,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:9,5:7,5:6,10,7,3
chr4	185724457	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:10,2:11,1:16,5,2,1
chr4	185940461	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=226,300;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr4	185940952	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:13,0:4,3:9,9,2,1
chr4	185941089	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	186065844	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=293,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:6,0,5,0
chr4	186097045	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=115,221;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:6,3:1,6:2,5,4,5
chr4	186097219	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=130,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr4	186097284	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=147,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr4	186168387	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr4	186185551	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=250,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,2:1,5:1,0,6,1
chr4	186188348	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr4	186188373	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.832:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	186272540	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=230,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:5,1,3,0
chr4	186320666	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr4	186321067	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr4	186321447	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=369,262;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:1,0,6,0
chr4	186324841	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	186336465	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.321:23:10,5:5,2:7,9,4,3
chr4	186336583	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	186347055	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=202,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,31:0.914:33:1,17:1,11:0,2,11,20
chr4	186347073	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,15:0,12:0,0,4,23
chr4	186347092	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,0,21
chr4	186361876	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr4	186361924	.	G	GGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	186366181	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,260;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,3:6,0:4,8,2,1
chr4	186366315	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr4	186366382	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr4	186370727	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=97,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,2:6,2:9,7,0,4
chr4	186380515	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=176,217;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:1,2,2,3
chr4	186423677	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=223,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,8:0,3:0,1,1,10
chr4	186423734	.	TCA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=239,248;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	186427841	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=258,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:0,2:2,1:0,3,0,3
chr4	186427871	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=235,258;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr4	186429645	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,0:10,2:8,5,0,2
chr4	186444698	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=516,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,3:1,1:0|1:186444698_A_C:186444698:0,1,0,5
chr4	186444704	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=516,260;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0|1:186444698_A_C:186444698:0,1,0,4
chr4	186456617	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr4	186508723	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=152,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:9,4:2,4:9,2,8,0
chr4	186541367	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=183,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,0:5,3:1,7,0,3
chr4	186545448	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=173,70;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:11,0:8,3:9,10,2,1
chr4	186551624	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr4	186567901	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=110,192;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:13,7,0,2
chr4	186567943	.	A	AACACGCTTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,0,2
chr4	186570521	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=222,255;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:10,0,2,0
chr4	186570855	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=210,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,0:7,3:2,8,0,3
chr4	186578529	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=199,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:8,1,2,0
chr4	186583185	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:9,0,2,0
chr4	186599992	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=205,181;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.696:17:3,8:1,4:2,3,6,6
chr4	186611576	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,37;MFRL=202,257;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	186997806	.	G	GTAGAGATA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=56,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:8,0:2,2:2,8,1,1
chr4	187000256	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=168,238;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:0,6,0,4
chr4	187004294	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=115,335;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:5,7,2,0
chr4	187005376	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=170,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.784:12:1,5:1,4:0,2,1,9
chr4	187005379	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=44.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,4:0,0,1,11
chr4	187073030	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	187077393	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	187078785	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,10,9
chr4	187078922	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,6:2,2:0,2,3,5
chr4	187078938	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,0:1,2:1,4,0,2
chr4	187093018	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.413:17:6,4:4,2:7,3,5,2
chr4	187115632	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,6:3,3:7,0,7,2
chr4	187115841	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,271;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr4	187118040	.	TTC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=151,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:1,4:1,2:3,0,6,0
chr4	187118358	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=165,326;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr4	187118662	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:6,3:5,5:8,3,5,3
chr4	187122304	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:10,2:8,4:10,8,1,5
chr4	187122319	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=134,190;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:10,4:8,2:9,9,2,4
chr4	187129995	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=151,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:11,1:8,2:11,10,1,2
chr4	187130198	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:2,2:6,5:4,5,2,5
chr4	187171355	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr4	187172280	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=220,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,2,1
chr4	187172353	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.432:7:3,1:1,2:2,2,2,1
chr4	187178300	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr4	187178599	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr4	187178613	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,2:1,1:0,3,0,3
chr4	187179210	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,11,12
chr4	187197328	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=204,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:187197328_G_A:187197328:2,0,2,0
chr4	187197337	.	CTG	AGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=188,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:187197328_G_A:187197328:4,0,1,0
chr4	187209559	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=215,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:5,3,2,0
chr4	187209702	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=160,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,1:3,2:4,5,0,3
chr4	187454961	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=162,195;MMQ=60,23;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:8,5:6,0:6,8,0,5
chr4	187518980	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=207,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:0,4:1,6:0,1,4,6
chr4	187530313	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chr4	187531191	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=201,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:2,5,0,3
chr4	187532981	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=215,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.557:5:0,0:1,2:0,2,0,3
chr4	187534542	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=249,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:0,6,0,4
chr4	187535552	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=184,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr4	187535588	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=264,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr4	187538133	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=137,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,3:0,6:1,1,8,1
chr4	187584502	.	TTTGTACATGAGC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=172,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:5,0:10,4,1,1
chr4	187584771	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr4	187627659	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=465,461;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.711:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr4	187628312	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=130,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,1:9,1:13,9,0,2
chr4	187630989	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=233,252;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:0,5,0,4
chr4	188924050	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=196,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:3,9:12,1:5,10,4,6
chr4	188925176	.	T	TGAC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:9,7:0,4:3,6,7,4
chr4	188925388	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,34;MFRL=209,190;MMQ=52,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:188925388_T_G:188925388:0,2,0,1
chr4	188925392	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=238,190;MMQ=43,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:188925388_T_G:188925388:0,1,0,1
chr4	188925395	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,32;MFRL=238,190;MMQ=43,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:188925388_T_G:188925388:0,1,0,1
chr4	188925399	.	G	GATTGAAGC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=238,190;MMQ=43,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:188925388_T_G:188925388:0,1,0,1
chr4	188925422	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=22,31;MFRL=423,238;MMQ=60,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:188925422_T_G:188925422:1,0,0,1
chr4	188925425	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=423,238;MMQ=60,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:188925422_T_G:188925422:1,0,0,1
chr4	189025972	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.430:19:5,4:6,4:5,6,6,2
chr4	189061675	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=148,229;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:7,1:1,2:6,2,3,0
chr4	189063361	.	CGTGTGTGTGT	C,CGTGT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32,31;MFRL=0,82,133;MMQ=30,60,60;MPOS=9,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,13,15;RU=GT;STR;TLOD=14.54,10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,3:0.476,0.375:8:1,2,1:0,2,2:1,0,7,0
chr4	189064873	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=219,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:3,0,2,1
chr4	189065055	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,2:5,1:6,4,2,1
chr4	189065104	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr4	190862083	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=175,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:3,1,4,1
chr4	190862155	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:6,8:2,8:3,5,9,7
chr4	190862182	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=167,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.657:30:6,9:4,11:3,7,12,8
chr4	190862239	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=188,150;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,15:0.444:34:12,6:7,9:0|1:190862239_G_C:190862239:9,10,13,2
chr4	190862242	.	TG	CC	.	.	DP=34;ECNT=15;MBQ=28,32;MFRL=188,150;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,15:0.444:34:12,6:6,9:0|1:190862239_G_C:190862239:9,10,13,2
chr4	190862259	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=15;MBQ=28,30;MFRL=188,143;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,13:0.467:28:10,6:5,6:0|1:190862239_G_C:190862239:5,10,7,6
chr4	190862285	.	CG	C	.	.	DP=31;ECNT=15;MBQ=27,34;MFRL=169,143;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,13:0.451:29:11,5:4,5:0|1:190862285_CG_C:190862285:2,14,0,13
chr4	190862287	.	C	T,CTCG	.	.	DP=29;ECNT=15;MBQ=29,28,35;MFRL=165,167,143;MMQ=50,60,52;MPOS=14,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=25.46,49.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,9,13:0.331,0.438:28:4,7,5:2,2,5:0,6,1,21
chr4	190862288	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=26,31;MFRL=154,152;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:13,3:13,0:0|1:190862288_A_G:190862288:2,24,0,4
chr4	190862289	.	AC	A	.	.	DP=35;ECNT=15;MBQ=25,25;MFRL=170,143;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,13:0.437:30:10,5:5,7:0|1:190862285_CG_C:190862285:2,15,0,13
chr4	190862290	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=15;MBQ=33,24;MFRL=176,152;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.204:22:7,3:5,1:0|1:190862288_A_G:190862288:2,16,0,4
chr4	190862302	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=15;MBQ=34,29;MFRL=157,151;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.162:35:11,3:17,1:0|1:190862288_A_G:190862288:1,29,0,5
chr4	190862307	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=15;MBQ=34,31;MFRL=157,151;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.162:35:12,4:17,1:0|1:190862288_A_G:190862288:1,29,0,5
chr4	190862318	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=15;MBQ=29,30;MFRL=173,152;MMQ=60,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,6:0.159:42:13,5:22,1:0|1:190862288_A_G:190862288:1,35,0,6
chr4	190862319	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=15;MBQ=32,28;MFRL=164,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,6:0.159:42:16,2:18,4:0|1:190862319_G_A:190862319:1,35,0,6
chr4	190862330	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=15;MBQ=35,25;MFRL=181,177;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,5:0.143:40:12,4:22,1:0|1:190862288_A_G:190862288:1,34,0,5
chr4	190862341	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=15;MBQ=29,32;MFRL=185,190;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:8,7:11,11:1,18,0,18
chr4	190862342	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=15;MBQ=33,28;MFRL=189,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,6:0.179:37:12,2:18,4:0|1:190862319_G_A:190862319:1,30,0,6
chr4	190873254	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.529:11:5,4:0,2:3,2,4,2
chr4	190873436	.	AAAG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=151,186;MMQ=50,23;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:7,1:4,11,2,0
chr4	190873543	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=201,165;MMQ=40,23;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:6,2:3,2:2,8,1,3
chr4	190874167	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=10;MBQ=32,25;MFRL=141,133;MMQ=48,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=85.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,29:0.493:59:16,15:13,13:20,10,11,18
chr4	190874175	.	A	G	.	.	DP=79;ECNT=10;MBQ=27,32;MFRL=151,126;MMQ=48,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,4:0.067:72:38,1:26,3:35,33,4,0
chr4	190874183	.	C	A	.	.	DP=88;ECNT=10;MBQ=33,24;MFRL=148,134;MMQ=47,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,17:0.200:86:32,9:34,7:39,30,6,11
chr4	190874199	.	T	A	.	.	DP=101;ECNT=10;MBQ=28,28;MFRL=146,137;MMQ=48,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:87,13:0.137:100:40,7:44,6:0|1:190874199_T_A:190874199:40,47,10,3
chr4	190874206	.	T	A	.	.	DP=105;ECNT=10;MBQ=28,30;MFRL=141,137;MMQ=48,43;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:90,13:0.133:103:42,7:44,6:0|1:190874199_T_A:190874199:38,52,10,3
chr4	190874234	.	C	T	.	.	DP=103;ECNT=10;MBQ=32,28;MFRL=136,131;MMQ=48,43;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,16:0.173:96:38,8:42,8:32,48,10,6
chr4	190874255	.	A	T	.	.	DP=98;ECNT=10;MBQ=25,25;MFRL=122,110;MMQ=49,49;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,20:0.224:91:31,15:39,5:31,40,10,10
chr4	190874290	.	T	A	.	.	DP=67;ECNT=10;MBQ=28,26;MFRL=133,134;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,13:0.211:65:25,10:24,3:19,33,1,12
chr4	190874315	.	TA	GA,GT	.	.	DP=48;ECNT=10;MBQ=27,32,34;MFRL=149,134,144;MMQ=40,40,32;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=28.74,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,9,2:0.203,0.062:45:21,7,1:13,2,1:8,26,0,11
chr4	190874352	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=32,31;MFRL=151,157;MMQ=40,35;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,2:6,0:5,15,0,2
chr4	190876134	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=189,184;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:7,11:7,0:13,1,11,0
chr4	190876195	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=20;MBQ=29,25;MFRL=116,126;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:8,6:5,7:9,4,9,4
chr4	190876242	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=20;MBQ=33,28;MFRL=156,110;MMQ=60,37;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=124.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,47:0.623:75:12,23:16,24:13,15,36,11
chr4	190876247	.	G	C	.	.	DP=85;ECNT=20;MBQ=32,28;MFRL=122,112;MMQ=46,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,2:0.034:85:40,1:42,1:0|1:190876247_G_C:190876247:52,31,1,1
chr4	190876250	.	G	A	.	.	DP=95;ECNT=20;MBQ=32,25;MFRL=115,112;MMQ=47,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:92,2:0.031:94:42,1:45,1:0|1:190876247_G_C:190876247:54,38,1,1
chr4	190876256	.	C	T	.	.	DP=98;ECNT=20;MBQ=27,25;MFRL=115,141;MMQ=46,31;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:91,6:0.070:97:43,2:46,4:0|1:190876256_C_T:190876256:52,39,3,3
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chr4	190876269	.	T	C	.	.	DP=93;ECNT=20;MBQ=25,20;MFRL=126,103;MMQ=42,37;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,6:0.075:89:36,4:47,2:43,40,3,3
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chr4	190876278	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=20;MBQ=31,27;MFRL=106,156;MMQ=41,20;MPOS=33;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,5:0.072:81:32,2:40,3:0|1:190876256_C_T:190876256:34,42,2,3
chr4	190876287	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=20;MBQ=31,28;MFRL=115,113;MMQ=40,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,6:0.089:77:27,2:40,3:0|1:190876268_A_G:190876268:28,43,2,4
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chr4	190876301	.	C	A	.	.	DP=67;ECNT=20;MBQ=32,24;MFRL=114,126;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,5:0.087:64:26,2:30,3:0|1:190876301_C_A:190876301:15,44,2,3
chr4	190876305	.	A	T	.	.	DP=61;ECNT=20;MBQ=25,30;MFRL=114,156;MMQ=40,37;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,4:0.081:60:25,2:24,2:0|1:190876301_C_A:190876301:14,42,1,3
chr4	190876307	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=20;MBQ=32,23;MFRL=125,113;MMQ=40,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,4:0.087:55:26,1:21,3:0|1:190876268_A_G:190876268:9,42,1,3
chr4	190876319	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=20;MBQ=25,30;MFRL=169,106;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.403:40:12,9:11,7:3,21,1,15
chr4	190876335	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=20;MBQ=29,34;MFRL=148,167;MMQ=40,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:17,1:14,1:0|1:190876335_T_C:190876335:1,30,0,2
chr4	190876343	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=20;MBQ=32,27;MFRL=166,167;MMQ=40,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:17,1:12,1:0|1:190876335_T_C:190876335:1,30,0,2
chr4	190876349	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=20;MBQ=33,28;MFRL=175,156;MMQ=58,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.272:31:12,7:11,1:1,22,0,8
chr4	190876351	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=20;MBQ=32,32;MFRL=170,139;MMQ=40,32;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:17,2:13,0:1,29,0,2
chr4	190876359	.	GT	G	.	.	DP=28;ECNT=20;MBQ=32,32;MFRL=182,164;MMQ=60,23;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:8,7:7,2:1,17,0,9
chr4	190878452	.	TG	CA	.	.	DP=71;ECNT=18;MBQ=27,33;MFRL=194,237;MMQ=48,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,5:0.083:70:35,3:28,2:46,19,5,0
chr4	190878463	.	T	G	.	.	DP=76;ECNT=18;MBQ=27,33;MFRL=195,205;MMQ=51,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,22:0.303:74:31,11:18,11:36,16,16,6
chr4	190878485	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=18;MBQ=33,29;MFRL=182,213;MMQ=51,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,18:0.311:59:24,9:17,8:25,16,10,8
chr4	190878504	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=18;MBQ=34,28;MFRL=182,169;MMQ=42,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,9:0.270:35:16,5:8,4:0|1:190878504_C_T:190878504:16,10,5,4
chr4	190878506	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=18;MBQ=35,28;MFRL=176,181;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,21:0.628:33:8,13:4,8:8,4,13,8
chr4	190878512	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=18;MBQ=30,34;MFRL=182,157;MMQ=41,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,8:0.273:31:15,4:8,3:0|1:190878504_C_T:190878504:14,9,4,4
chr4	190878538	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=18;MBQ=27,28;MFRL=196,197;MMQ=54,40;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.483:16:6,4:1,4:3,5,5,3
chr4	190878563	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=18;MBQ=33,28;MFRL=171,191;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.129:52:30,6:14,0:29,17,3,3
chr4	190878567	.	G	C	.	.	DP=63;ECNT=18;MBQ=33,32;MFRL=171,141;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,5:0.092:63:34,5:18,0:0|1:190878567_G_C:190878567:35,23,3,2
chr4	190878569	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=18;MBQ=28,31;MFRL=172,141;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,5:0.086:68:37,5:21,0:0|1:190878567_G_C:190878567:37,26,3,2
chr4	190878580	.	A	G	.	.	DP=85;ECNT=18;MBQ=29,33;MFRL=173,169;MMQ=40,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,19:0.238:82:42,13:20,6:40,23,11,8
chr4	190878583	.	T	C	.	.	DP=89;ECNT=18;MBQ=29,32;MFRL=170,122;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,6:0.077:89:54,5:26,1:0|1:190878567_G_C:190878567:53,30,4,2
chr4	190878597	.	C	T	.	.	DP=99;ECNT=18;MBQ=33,28;MFRL=170,170;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,36:0.366:99:46,21:16,15:40,23,23,13
chr4	190878599	.	A	G	.	.	DP=103;ECNT=18;MBQ=30,33;MFRL=170,141;MMQ=40,40;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:96,7:0.076:103:60,6:29,1:0|1:190878567_G_C:190878567:61,35,4,3
chr4	190878600	.	TGAAGCAGGGGACATAGAA	T	.	.	DP=140;ECNT=18;MBQ=28,28;MFRL=168,141;MMQ=40,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:129,7:0.058:136:61,6:31,1:0|1:190878567_G_C:190878567:81,48,4,3
chr4	190878654	.	C	G	.	.	DP=142;ECNT=18;MBQ=33,32;MFRL=139,163;MMQ=40,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:117,22:0.163:139:72,15:42,7:43,74,12,10
chr4	190878661	.	A	T	.	.	DP=142;ECNT=18;MBQ=25,29;MFRL=143,151;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=103.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,45:0.321:141:58,32:38,13:38,58,14,31
chr4	190878662	.	T	C	.	.	DP=144;ECNT=18;MBQ=29,27;MFRL=151,123;MMQ=40,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:123,19:0.138:142:81,9:39,10:45,78,7,12
chr4	190878700	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=147,146;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,11:0.145:76:40,5:24,6:14,51,1,10
chr4	190878703	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=148,144;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,9:0.123:73:37,4:24,4:13,51,0,9
chr4	190878728	.	AATG	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=180,144;MMQ=60,37;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:6,2:11,1:3,18,1,2
chr4	190878742	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=180,207;MMQ=48,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:8,3:6,6:1,14,2,8
chr4	190878750	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=179,205;MMQ=52,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:11,4:13,1:4,20,0,5
chr4	190881826	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=214,329;MMQ=30,21;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:4,4,3,2
chr4	190881895	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=30,24;MFRL=180,311;MMQ=27,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,0:6,3:10,7,3,0
chr4	190881933	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=222,139;MMQ=40,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,2:4,1:5,4,3,0
chr4	190881969	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=171,120;MMQ=40,31;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.331:34:13,4:10,7:13,10,5,6
chr4	190881992	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=28,27;MFRL=170,139;MMQ=41,31;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,19:0.426:45:14,9:12,10:0|1:190881992_T_C:190881992:14,12,6,13
chr4	190881997	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=167,139;MMQ=41,31;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=71.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,19:0.426:45:13,9:11,10:0|1:190881992_T_C:190881992:13,13,6,13
chr4	190882098	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=34,0;MFRL=166,290;MMQ=60,34;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,0:0,6,0,2
chr4	190882909	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=20;MBQ=26,35;MFRL=176,167;MMQ=40,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.122:47:17,2:24,3:34,8,4,1
chr4	190882911	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=20;MBQ=30,25;MFRL=168,185;MMQ=40,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,5:0.118:49:17,3:25,2:0|1:190882911_A_T:190882911:35,9,5,0
chr4	190882917	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=20;MBQ=30,35;MFRL=168,185;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,5:0.115:50:16,3:28,2:0|1:190882911_A_T:190882911:35,10,5,0
chr4	190882928	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=20;MBQ=33,30;MFRL=168,180;MMQ=37,34;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.099:48:16,2:28,2:32,12,3,1
chr4	190882949	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=20;MBQ=28,32;MFRL=171,164;MMQ=37,29;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,8:0.155:56:17,2:31,6:28,20,7,1
chr4	190882973	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=20;MBQ=28,35;MFRL=167,207;MMQ=52,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:10,0:14,4:9,16,0,4
chr4	190882998	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=20;MBQ=29,34;MFRL=168,198;MMQ=52,26;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.090:53:23,0:24,4:18,31,2,2
chr4	190883001	.	C	G	.	.	DP=62;ECNT=20;MBQ=32,35;MFRL=175,165;MMQ=52,31;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,9:0.164:59:23,4:26,5:21,29,2,7
chr4	190883007	.	A	G	.	.	DP=65;ECNT=20;MBQ=28,35;MFRL=172,168;MMQ=49,39;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:28,2:31,1:24,37,1,2
chr4	190883026	.	G	T	.	.	DP=64;ECNT=20;MBQ=33,28;MFRL=169,147;MMQ=45,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,5:0.090:64:32,2:26,3:23,36,1,4
chr4	190883030	.	G	T	.	.	DP=65;ECNT=20;MBQ=32,30;MFRL=168,187;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:32,2:27,1:24,37,0,3
chr4	190883046	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=20;MBQ=32,23;MFRL=169,145;MMQ=48,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.074:58:28,4:23,0:23,31,2,2
chr4	190883051	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=20;MBQ=30,27;MFRL=171,179;MMQ=60,27;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,17:0.383:45:15,9:13,8:15,13,2,15
chr4	190883075	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=20;MBQ=30,28;MFRL=165,179;MMQ=50,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:13,2:16,1:13,18,1,2
chr4	190883080	.	CT	AG	.	.	DP=35;ECNT=20;MBQ=35,24;MFRL=169,185;MMQ=40,34;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:13,1:17,1:13,20,0,2
chr4	190883092	.	CTATT	C	.	.	DP=33;ECNT=20;MBQ=35,36;MFRL=168,205;MMQ=50,25;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATT;STR;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:11,1:13,3:11,15,0,4
chr4	190883100	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=20;MBQ=30,32;MFRL=177,160;MMQ=52,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:11,1:14,4:9,16,3,2
chr4	190883110	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=20;MBQ=33,32;MFRL=169,230;MMQ=52,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.222:34:13,2:14,5:10,17,0,7
chr4	190883115	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=20;MBQ=27,33;MFRL=180,201;MMQ=52,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:12,1:17,1:10,24,0,2
chr4	190883117	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=20;MBQ=30,35;MFRL=180,230;MMQ=52,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:12,1:17,2:9,20,0,3
chr4	190883174	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,201;MMQ=60,31;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,3:5,1:2,8,0,4
chr4	190884168	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=164,156;MMQ=52,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,1:6,2:8,5,0,3
chr4	190884225	.	T	TTTC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=123,168;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,6:3,6:2,3,8,4
chr4	190904644	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=211,121;MMQ=40,23;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:3,0:1,1:4,0,1,0
chr4	190904717	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=135,191;MMQ=25,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:1,3,3,0
chr4	190905595	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=228,221;MMQ=51,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr4	190905897	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=182,220;MMQ=40,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:190905897_C_T:190905897:3,0,1,0
chr4	190905904	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=182,181;MMQ=40,23;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0|1:190905897_C_T:190905897:3,0,2,0
chr4	190906025	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=142,106;MMQ=54,50;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:5,7:4,3:4,5,4,6
chr4	190906057	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=133,131;MMQ=52,35;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:0|1:190906057_G_A:190906057:2,5,0,5
chr4	190906060	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=133,131;MMQ=52,35;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:0|1:190906057_G_A:190906057:2,5,0,5
chr4	190906080	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=144,132;MMQ=52,32;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr4	190906142	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	156218	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,1:5,1:5,4,1,1
chr5	169763	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=233,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr5	172971	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:3,1,3,1
chr5	182077	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=201,255;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:2,2,3,0
chr5	192152	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	192437	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=166,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.270:23:8,0:9,5:10,7,5,1
chr5	194857	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=138,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:11,0:14,4:12,13,0,4
chr5	195507	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	224633	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=144,178;MMQ=49,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:7,1:12,3:9,11,1,3
chr5	224692	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=169,188;MMQ=51,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,2:5,2:4,10,0,4
chr5	225768	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=234,339;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:1,2,0,4
chr5	225941	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=231,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:2,1,2,0
chr5	226222	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=189,185;MMQ=56,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:0,6,0,4
chr5	228278	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=194,189;MMQ=60,46;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr5	230980	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=145,138;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:3,7:5,9:5,3,11,5
chr5	231111	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=119,181;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:8,6:1,8:3,6,3,11
chr5	231143	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=141,161;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:1,9,1,1
chr5	233517	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=324,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	233572	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=128,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,2,2
chr5	235249	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=114,126;MMQ=58,22;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.390:39:12,0:12,15:14,10,0,15
chr5	235548	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=204,227;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,1:6,2:0,10,0,3
chr5	236753	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=167,165;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0|1:236753_C_T:236753:1,3,0,3
chr5	236760	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=167,165;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,1:2,1:0|1:236753_C_T:236753:1,3,0,3
chr5	240663	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=179,155;MMQ=57,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,1:4,1:2,6,0,2
chr5	254442	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
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chr5	254711	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=194,140;MMQ=57,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:3,0:3,2:0|1:254706_G_A:254706:2,6,2,0
chr5	304220	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,299;MMQ=27,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:9,3,2,0
chr5	311478	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=181,175;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.238:22:8,4:9,0:6,11,1,4
chr5	354051	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=125,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,0:2,2:3,3,0,2
chr5	413428	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr5	413594	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=206,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,7:1,1:1,2,1,7
chr5	413621	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr5	422752	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr5	423906	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr5	428166	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:2,6:2,6:0,4,1,11
chr5	432905	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.338:24:8,3:8,4:10,6,2,6
chr5	433952	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=203,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,1:8,4:8,6,3,2
chr5	434981	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	434998	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=189,221;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr5	442571	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	453498	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:18,4:9,0:13,14,3,1
chr5	456915	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=221,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr5	457955	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=192,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr5	458161	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=114,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,1:3,1:5,8,2,0
chr5	459415	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,238;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:6,0,4,0
chr5	462465	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=171,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,2:5,1:3,12,1,2
chr5	464339	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=177,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr5	466811	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,9,2
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chr5	475585	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,16;MFRL=209,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:475585_T_G:475585:4,0,1,0
chr5	475589	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=209,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:475585_T_G:475585:4,0,1,0
chr5	475591	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,29;MFRL=208,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:475585_T_G:475585:3,0,1,0
chr5	475621	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:0,6:2,2:0|1:475621_T_TG:475621:2,0,8,0
chr5	475626	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.771:11:0,6:2,3:0|1:475621_T_TG:475621:2,0,9,0
chr5	476530	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,3,9
chr5	477634	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	479879	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	479905	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	481610	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,10,1
chr5	482653	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=121,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,9:0,2:1,0,7,4
chr5	491944	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,1:1,1:4,5,2,0
chr5	612414	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	619333	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	647896	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,243;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:16,3:5,0:19,3,3,0
chr5	653204	.	T	TGGGCCACC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=159,315;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr5	666323	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	801362	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr5	878461	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,229;MMQ=60,30;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:5,3,2,0
chr5	879989	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=182,210;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:5,0,2,0
chr5	884104	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:10,6,2,0
chr5	904444	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=183,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	1034784	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=183,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr5	1034952	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=137,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:6,3,1,1
chr5	1035399	.	T	TAATG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AATG;STR;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr5	1035482	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,6,4
chr5	1036521	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=220,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	1053396	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=208,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,5:2,0,7,0
chr5	1053697	.	GAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=223,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	1060366	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr5	1060400	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr5	1065383	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,2:8,0:6,6,2,0
chr5	1065683	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=177,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:1065683_A_C:1065683:0,2,0,2
chr5	1065689	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:1065683_A_C:1065683:0,0,0,4
chr5	1073689	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr5	1078898	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr5	1079506	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=180,52657;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:6,4,1,1
chr5	1081668	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=208,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:3,9:1,4:3,1,11,2
chr5	1081702	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=207,120;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.834:22:3,12:0,7:2,1,10,9
chr5	1085322	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=165,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.321:7:1,1:2,0:3,2,2,0
chr5	1085604	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=120,255;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr5	1093609	.	G	GGGGCGGGGACT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGCGGGGACT;STR;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	1094389	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=214,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:0,1,2,3
chr5	1212357	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	1212503	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,0:3,6:5,4,0,6
chr5	1214005	.	CCCT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=213,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	1214264	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr5	1218928	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=202,267;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr5	1221199	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	1225564	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr5	1225626	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,7:0,0,8,7
chr5	1225653	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=186,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:7,2:9,0:6,12,1,1
chr5	1225676	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,2:6,1:3,13,2,1
chr5	1225687	.	CT	TC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,6,12
chr5	1225801	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=189,249;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:1,4,0,3
chr5	1232274	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chr5	1232276	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:1232276_G_C:1232276:0,0,2,0
chr5	1232279	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:1232276_G_C:1232276:0,0,2,0
chr5	1232491	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,3,4
chr5	1232775	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=199,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr5	1240848	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	1243009	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=179,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:1,5,1,5
chr5	1253744	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	1258718	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:5,5,1,1
chr5	1266616	.	CCA	GAG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=158,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:1266616_CCA_GAG:1266616:3,6,1,1
chr5	1266620	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=158,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:1266616_CCA_GAG:1266616:3,6,1,1
chr5	1320722	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,1:5,5:5,2,5,1
chr5	1325767	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=152,239;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr5	1325803	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=152,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.297:15:6,3:4,1:7,4,2,2
chr5	1334507	.	GA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=121,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:6,8:6,2:4,8,4,6
chr5	1335385	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=176,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr5	1338078	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=157,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:6,3:8,2:7,8,2,3
chr5	1338940	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,0:9,2:8,6,2,0
chr5	1344458	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:8,6:6,7:7,7,8,5
chr5	1394815	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:4,4,1,3
chr5	1409127	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr5	1409985	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.541:20:7,8:2,2:1,8,5,6
chr5	1411412	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:2,3:2,3:3,3,4,2
chr5	1414823	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:5,4,2,0
chr5	1442974	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=276,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.657:7:1,1:1,2:2,0,4,1
chr5	1442979	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=175,264;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,1,1
chr5	1442987	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=238,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,1:3,1:2,2,3,0
chr5	1464028	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=136,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr5	1466813	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=188,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,1:1,1:1,1,2,0
chr5	1470900	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=139,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:4,3:4,5:5,3,8,1
chr5	1471109	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	1473977	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	1474752	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=180,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:2,1:10,1:8,4,2,0
chr5	1479678	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr5	1481148	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr5	1501542	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.298:15:5,1:6,3:9,2,4,0
chr5	1801689	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr5	1814369	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=162,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chr5	1814395	.	TTGTA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTA;STR;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr5	1878496	.	TGGC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,18;MFRL=238,80;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GGC;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,1:0,1,1,1
chr5	1881916	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=147,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:9,1:3,3:8,4,0,4
chr5	5140958	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:5140958_T_A:5140958:0,0,0,2
chr5	5140970	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=225,251;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:5140958_T_A:5140958:0,1,0,1
chr5	5146200	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=227,214;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:0,3:7,1:7,0,4,0
chr5	5146223	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr5	5187776	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=232,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,5:1,1,6,2
chr5	5190162	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=193,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:12,2:4,0:7,9,2,0
chr5	5200220	.	A	ATC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=190,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TC;STR;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr5	5223073	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:1,2,0,3
chr5	5232398	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	5235028	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	5235096	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	5239783	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=172,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,5:5,0:8,4,5,0
chr5	5262766	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=154,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,1:7,3:8,5,3,1
chr5	5303349	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=257,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:2,2:3,2,5,2
chr5	5303614	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=204,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,2:7,0:5,3,0,2
chr5	5441371	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.409:27:3,0:13,10:3,13,0,11
chr5	5460569	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:1,11:1,5:1,1,10,6
chr5	5465088	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=185,15791956;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,0:12,2:9,14,2,0
chr5	5465158	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:9,11,0,2
chr5	5476250	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,1:0,0,0,5
chr5	6372585	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=209,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:10,3:6,5:8,8,6,2
chr5	6378614	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr5	6491497	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:3,1:9,3:4,9,1,3
chr5	6491532	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=189,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.273:12:4,1:5,2:0,9,0,3
chr5	6602668	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,3:1,5:0,1,2,6
chr5	6605532	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,3,7
chr5	6605540	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=237,736;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:3,6,0,2
chr5	6607125	.	GAAC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr5	6611238	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=162,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:14,0:9,4:2,21,0,4
chr5	6611757	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr5	6611983	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr5	6617011	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	6618186	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr5	6620459	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr5	6623405	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=198,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,0:1,2:1,5,0,2
chr5	6623432	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr5	6632067	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=154,70;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:12,1:9,2:8,13,1,2
chr5	6632143	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr5	6632875	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=231,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.783:21:2,4:2,13:2,2,8,9
chr5	6632909	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=319,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,4:1,7:0,3,2,9
chr5	6632942	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=227,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,2:1,6:0,3,0,8
chr5	6633042	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=265,281;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr5	6737571	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=252,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr5	6748518	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=221,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,5:1,5:2,0,6,4
chr5	6754762	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=175,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,4:0,0:1,0,4,0
chr5	7690707	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr5	7690754	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=161,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,3:7,0:8,4,3,0
chr5	7695845	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=208,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,4:1,4:1,2,6,2
chr5	7696028	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=212,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr5	7743787	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=132,156;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:2,3:8,3:7,3,3,3
chr5	7757705	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr5	7757715	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.936:12:0,7:0,4:0,0,5,7
chr5	7782231	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr5	7835616	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:3,5:0,3:1,2,4,7
chr5	7835685	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	7859523	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,5:8,2:11,4,6,1
chr5	7861470	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=223,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:2,8,0,2
chr5	7861638	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=237,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,5:1,3:2,1,7,1
chr5	7862926	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:7,2,2,1
chr5	7863141	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=236,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7863141_G_A:7863141:0,1,0,1
chr5	7863144	.	A	AATTCTAATGCCTGATTTGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=236,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7863141_G_A:7863141:0,1,0,1
chr5	7866135	.	TTGAGG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=146,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:2,2:0,6,0,4
chr5	7875307	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,2:2,1:7,1,3,0
chr5	7883188	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr5	7885782	.	AT	A,ATT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30,30;MFRL=169,191,147;MMQ=60,60,60;MPOS=22,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.43,10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,5:0.211,0.431:11:3,1,3:1,1,2:4,0,7,0
chr5	7886026	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr5	7891610	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=177,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr5	7893080	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr5	7893106	.	A	ACCTTACACC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=185,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:7893106_A_ACCTTACACC:7893106:0,4,0,1
chr5	7893109	.	T	TCTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=185,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:7893106_A_ACCTTACACC:7893106:0,4,0,1
chr5	7893121	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=172,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr5	7896957	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=80,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:11,3:5,0:15,4,2,1
chr5	9043142	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr5	9050410	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=246,224;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	9066464	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,310;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr5	9108333	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:8,2:9,4:9,8,4,2
chr5	9108427	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=202,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:10,1:4,2:2,12,0,3
chr5	9122926	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=251,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:5,5:11,3:7,9,3,5
chr5	10227548	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=198,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.530:7:0,3:3,1:3,0,2,2
chr5	10227823	.	C	CCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr5	10235220	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=203,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr5	10250047	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=0,143;MMQ=49,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.913:19:0,8:1,8:0,1,0,18
chr5	10250430	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=266,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=115.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,40:0.837:47:4,20:3,20:3,4,24,16
chr5	10250443	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=266,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=136.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,40:0.837:47:4,21:3,19:3,4,24,16
chr5	10255021	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=195,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:1,3:1,4:0,2,0,7
chr5	10256161	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=212,164;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.680:26:2,11:5,7:4,4,11,7
chr5	10256365	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=237,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:0,4:1,1:0,2,0,5
chr5	10258125	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=215,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,3:1,6:1,1,8,1
chr5	10262740	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=204,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,8:1,1:0,1,1,8
chr5	10263453	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,1,0,7
chr5	10263457	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:1,2:0,4:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,1,0,8
chr5	10263461	.	GGGA	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:1,2:0,4:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,1,0,7
chr5	10264962	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr5	10282479	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	10394911	.	ATTT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=121,174;MMQ=60,53;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=T;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:2,1:6,5,0,2
chr5	10397473	.	CT	C,CTT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,34,32;MFRL=166,108,103;MMQ=60,60,60;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=8.32,4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,6,3:0.305,0.204:17:0,4,0:7,2,3:0,8,3,6
chr5	10411441	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:9,7,1,1
chr5	10417589	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr5	10442496	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	10748231	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr5	10748338	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,0:16,2:15,11,0,2
chr5	10748462	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr5	10761009	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr5	11023076	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:12,1:8,2:12,8,3,0
chr5	11082762	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=183,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr5	11159657	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:5,7:1,2:2,5,5,4
chr5	11412302	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	13701327	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=211,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr5	13701351	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=167,158;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr5	13714740	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,3:4,0:4,6,0,3
chr5	13721378	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=163,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:1,1,0,4
chr5	13729714	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=198,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:2,1,0,6
chr5	13735147	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	13735892	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=171,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:2,6:6,2:5,3,7,1
chr5	13737700	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=219,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr5	13759172	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=226,263;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr5	13769257	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=108,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:3,1:5,3:2,6,2,2
chr5	13770757	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=260,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr5	13770989	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:8,0:11,3:9,10,0,3
chr5	13789035	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,1:6,2:1,6,0,3
chr5	13792356	.	TTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,1,0
chr5	13793985	.	CT	AC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=189,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:13793985_CT_AC:13793985:2,0,1,0
chr5	13793990	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:13793985_CT_AC:13793985:3,0,1,0
chr5	13807886	.	G	GAATCGGATGGAATGGAATTGAATGTATTGGAGTCGAGTAGAACA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=176,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.298:7:3,1:0,0:0,6,0,1
chr5	13807894	.	T	TCAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:13807894_T_TCAG:13807894:0,3,0,1
chr5	13807898	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:13807894_T_TCAG:13807894:0,3,0,1
chr5	13810149	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.369:11:4,3:3,0:5,2,2,2
chr5	13810441	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=187,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:7,3:2,1:0,9,0,4
chr5	13810451	.	CAT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr5	13830866	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=181,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:9,0:4,6:3,11,0,6
chr5	13842045	.	A	AAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr5	13845107	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=199,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:6,1:4,10,0,2
chr5	13850739	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:6,1:2,3:4,4,1,3
chr5	13850750	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,5:2,3:0,3,3,5
chr5	13851016	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	13859743	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=185,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:2,5,0,3
chr5	13859807	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=222,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:0,2,0,4
chr5	13862600	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr5	13864728	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:10,4:8,2:13,5,5,1
chr5	13865717	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:2,4,2,1
chr5	13866450	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,1,2
chr5	13868103	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=177,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,2:1,1:2,6,2,1
chr5	13882958	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,4:7,1:5,8,0,5
chr5	13885023	.	GCA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:1,1:2,2:5,1,1,2
chr5	13914120	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr5	13914556	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	13914775	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=209,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,3:5,3:1,4,1,5
chr5	13914796	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=243,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr5	13914819	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=243,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr5	14290805	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=260,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr5	14366904	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=195,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:9,4:2,1:10,1,5,0
chr5	14374487	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr5	14378068	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:2,0,5,0
chr5	14381174	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=223,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:4,1,2,0
chr5	14387489	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:5,1,5,1
chr5	14394283	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,5:2,3:0,6,1,7
chr5	14398902	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr5	14405895	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=237,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:2,0,6,0
chr5	14462816	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=144,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:2,4:1,10:3,0,9,5
chr5	14471666	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=250,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr5	14472626	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,9,0
chr5	14479938	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	14481270	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=117,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.754:5:0,0:1,4:0,1,4,0
chr5	14481771	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=125,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0|1:14481771_C_T:14481771:1,10,0,2
chr5	14481774	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=125,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:14481771_C_T:14481771:1,10,0,2
chr5	14481779	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:14481771_C_T:14481771:1,10,0,2
chr5	14481784	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=36,34;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:14481771_C_T:14481771:1,8,0,2
chr5	14481787	.	GGATT	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:0|1:14481771_C_T:14481771:1,8,0,2
chr5	14481795	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=219,185;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:14481771_C_T:14481771:0,6,0,2
chr5	14487763	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=156,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr5	14492938	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:3,11,0,2
chr5	14610184	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr5	14673696	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=210,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,7:3,2:5,1,7,2
chr5	14678762	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:4,3:9,2:10,4,5,0
chr5	14742066	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=274,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:3,2,0,2
chr5	14769075	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.407:32:10,2:9,10:12,7,8,5
chr5	14871620	.	AGGGGCGAC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGGCGAC;STR;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.836:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	15927907	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,15;MFRL=227,141;MMQ=50,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:15927907_G_A:15927907:2,0,1,0
chr5	15927912	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=227,141;MMQ=50,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:15927907_G_A:15927907:2,0,1,0
chr5	15927917	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=194,141;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:15927907_G_A:15927907:3,0,1,0
chr5	15927921	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,15;MFRL=180,141;MMQ=60,40;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.284:5:4,0:0,0:0|1:15927907_G_A:15927907:4,0,1,0
chr5	16091242	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=247,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.776:7:1,0:0,3:0,1,0,6
chr5	16177807	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=185,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:0,7:3,2:2,1,4,5
chr5	16177909	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,76;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:9,0:9,6:9,9,1,5
chr5	16477751	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=175,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:5,9:0,0:4,1,7,2
chr5	16478120	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=187,267;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:8,4,1,2
chr5	16479151	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=118,236;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr5	16481062	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=150,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,3:2,1:5,3,1,3
chr5	16667003	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	16668370	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=178,240;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:6,2:12,2:8,10,2,2
chr5	16670618	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=112,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:5,8:4,4:6,3,6,6
chr5	16679966	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=193,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr5	16681966	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,2:6,3:8,3,2,3
chr5	16684109	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=143,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,5:4,2:0,8,0,7
chr5	16684143	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0,12,1,1
chr5	16699512	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:6,3,2,0
chr5	16704688	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,1:3,1:8,2,2,0
chr5	16711365	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=36.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,7:0,0,8,9
chr5	16711451	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	16762646	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr5	16762789	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=201,113;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:0,5,0,4
chr5	16763725	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=144,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.321:13:4,1:3,3:5,4,0,4
chr5	16763908	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.373:9:1,1:3,2:2,4,2,1
chr5	16764334	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=114,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,5:6,3:5,6,2,6
chr5	16766093	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	16783437	.	T	TAAAC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=136,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:1,0:10,4:7,4,4,1
chr5	16794916	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:13,1:8,3:16,5,2,2
chr5	16794924	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=177,103;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.286:26:8,7:11,0:12,7,7,0
chr5	16795012	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=101,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr5	16818363	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=235,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr5	16877640	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=187,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr5	16877671	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=209,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:0|1:16877671_AC_A:16877671:6,2,3,0
chr5	16877673	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=209,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:0|1:16877671_AC_A:16877671:6,2,3,0
chr5	17276053	.	CCTCT	C,CCT,CCTCTCT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,34,35,20;MFRL=135,240,191,67;MMQ=60,60,60,60;MPOS=28,13,28;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=CT;STR;TLOD=4.13,25.94,4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,2,9,3:0.140,0.485,0.184:17:1,0,4,2:1,2,5,1:1,2,5,9
chr5	17276742	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,22;MFRL=223,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:1,2:0,0:1,0,1,3
chr5	17276848	.	C	CA,CAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32,31;MFRL=122,136,185;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=8.71,8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,7,4:0.570,0.317:12:1,2,1:0,3,3:1,0,8,3
chr5	17276986	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr5	17277018	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=199,208;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,4:3,0:0,6,0,4
chr5	19520932	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:0,4,0,6
chr5	21755735	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=184,39;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:12,4,0,2
chr5	21854985	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=171,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,1:3,1:0,7,0,2
chr5	23510203	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,41;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr5	23510224	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=170,149;MMQ=47,41;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:23510224_CAT_C:23510224:0,3,0,1
chr5	23510227	.	G	GCT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=170,149;MMQ=47,41;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:23510224_CAT_C:23510224:0,3,0,1
chr5	23510232	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=217,155;MMQ=54,41;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr5	23510235	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=189,160;MMQ=44,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr5	23518072	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,262;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr5	23523348	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr5	23527919	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,0,17
chr5	24509947	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr5	24511368	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=153,242;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr5	24511654	.	CAGAGAGAGAG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=242,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=23,18;RU=AG;STR;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.729:4:0,0:0,1:0,1,0,3
chr5	24537481	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.322:16:6,2:5,2:8,3,3,2
chr5	24593325	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=202,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:6,1,3,0
chr5	26886200	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=202,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.290:15:5,3:6,1:1,10,1,3
chr5	26890441	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=201,227;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr5	31322851	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.920:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr5	31405874	.	CTTTTTTTTTT	C,CTTTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,19,19;MFRL=143,148,189;MMQ=60,60,60;MPOS=25,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=24,14,18;RU=T;STR;TLOD=3.05,9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,3:0.220,0.449:6:0,0,0:0,0,0:0,2,0,4
chr5	31407139	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr5	31409115	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=287,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.768:11:0,5:2,4:2,0,9,0
chr5	31421407	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=155,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:15,4:8,0:11,12,4,0
chr5	31435975	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:2,2:1,1:0,5,0,3
chr5	31472087	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,2:7,2:11,0,3,1
chr5	31472117	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=144,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:6,3:11,2:12,5,4,1
chr5	31483596	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:6,2:14,4:14,6,3,3
chr5	31483753	.	GAA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.650:9:0,1:0,1:0,3,2,4
chr5	31484992	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:10,13:12,0:8,14,13,0
chr5	31485152	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:0,2,0,9
chr5	31486578	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=219,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:1,2:5,0,3,0
chr5	31504840	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=207,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr5	31508933	.	G	GT,GTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34,32;MFRL=0,200,317;MMQ=60,60,49;MPOS=29,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.90,3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.513,0.332:3:0,1,1:0,1,0:0,0,0,3
chr5	31508945	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=200,317;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	31511106	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=145,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:7,3,2,2
chr5	31515373	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=212,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,2:1,5:3,1,2,5
chr5	31526850	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,38;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:15,2:11,0:17,9,1,1
chr5	31529299	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:31529299_A_G:31529299:0,0,0,6
chr5	31529306	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:31529299_A_G:31529299:0,0,0,4
chr5	31532429	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,11:0,0,15,5
chr5	31532685	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=254,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr5	31799658	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,7:2,2:4,2,4,5
chr5	31995769	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=192,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:7,6,0,2
chr5	32054014	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:2,3,0,2
chr5	32057651	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr5	32059318	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=170,114;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:12,0,2,0
chr5	32069863	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr5	32071404	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=215,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr5	32072213	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=278,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,3:0,2:3,0,5,0
chr5	32087228	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,1:9,3:8,8,3,1
chr5	32087253	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=183,181;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,1:9,2:6,9,1,2
chr5	32087802	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=177,126;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,5:3,0:2,3,1,4
chr5	32101168	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=125,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,1:3,8:4,2,9,0
chr5	32135599	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=207,256;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	32242062	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=301,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	32242341	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=215,289;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr5	32379210	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,13:0,0,12,8
chr5	32387654	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=198,110;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:8,0:16,4:15,9,0,4
chr5	32395502	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	32404171	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=123,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:0|1:32404171_T_TA:32404171:4,5,0,2
chr5	32404173	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=147,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:5,0:0|1:32404171_T_TA:32404171:5,6,0,2
chr5	32404175	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=147,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:32404171_T_TA:32404171:5,6,0,2
chr5	32415360	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	32417694	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	32419849	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	32444286	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr5	32601005	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:0,1:7,2:7,0,3,0
chr5	32710896	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:8,5:8,3:11,5,5,3
chr5	32710965	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:3,1:1,0:0,6,0,3
chr5	32775047	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	32790616	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=188,205;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,6:3,2:3,2,4,4
chr5	33453416	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:4,15,1,1
chr5	33457535	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=206,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr5	33458636	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=169,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,4:2,3:2,0,7,0
chr5	33458833	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=219,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr5	33467745	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,2:6,4:3,8,1,5
chr5	33546113	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=275,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr5	33588684	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=126,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:5,4:12,4:12,5,5,3
chr5	33595996	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=214,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:3,2,4,0
chr5	33596193	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:2,1,1,4
chr5	33596224	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=236,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr5	33614255	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=196,174;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.542:13:2,7:2,0:6,0,7,0
chr5	33615904	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=192,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:3,1,4,1
chr5	33624496	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=163,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:0,9,3,0
chr5	33630839	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:6,3,3,0
chr5	33637596	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=186,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr5	33637891	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=215,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0|1:33637891_C_A:33637891:1,1,0,4
chr5	33637899	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=19,26;MFRL=215,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,2:0,2:0|1:33637891_C_A:33637891:1,1,0,4
chr5	33643395	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=255,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:5,0,4,0
chr5	33643617	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=195,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:0,7,0,6
chr5	33648906	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=163,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:2,2,4,3
chr5	33649598	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=213,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:9,1,2,0
chr5	33649637	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,1:5,1,4,2
chr5	33649797	.	CC	TT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=160,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:9,1:0|1:33649797_CC_TT:33649797:6,11,1,1
chr5	33649807	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.524:19:4,3:5,7:0|1:33649797_CC_TT:33649797:3,6,4,6
chr5	33751454	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr5	33938009	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=177,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:1,5,1,1
chr5	33938018	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=191,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:1,3,0,1
chr5	33938338	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=169,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.568:12:1,4:2,1:3,2,3,4
chr5	33951826	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chr5	33963731	.	AAAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAC;STR;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr5	33964049	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=154,113;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,0:7,3:15,4,3,0
chr5	33964210	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=183,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr5	34020768	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:18,0:18,3:18,18,2,1
chr5	34687794	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,99;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.298:20:11,4:3,0:7,7,6,0
chr5	34688210	.	CGACAAA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=118,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,0:5,3:8,1,1,2
chr5	34757505	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=282,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr5	34803848	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=119,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:13,4:15,0:16,12,0,4
chr5	34811794	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=225,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	34818976	.	G	GT,GTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=35,34,35;MFRL=190,98,148;MMQ=60,60,60;MPOS=30,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.62,5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,4:0.193,0.306:13:5,0,2:2,2,1:4,3,3,3
chr5	34818988	.	C	CAA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=140,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.247:14:5,1:3,2:0|1:34818988_C_CAA:34818988:7,4,0,3
chr5	34818989	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=140,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.247:14:7,1:3,2:0|1:34818988_C_CAA:34818988:7,4,0,3
chr5	34821825	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=173,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,5:6,1:6,6,3,3
chr5	34824371	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=155,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,1:6,1:5,8,2,0
chr5	34863220	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,5:2,2:0,2,0,7
chr5	34915068	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=181,64;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:0,7,0,4
chr5	34923288	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=161,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.111:42:20,4:18,0:22,16,3,1
chr5	34925423	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,10:0.237:43:24,9:9,0:13,20,0,10
chr5	34945797	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=179,267;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.327:13:3,2:5,1:0|1:34945797_CT_C:34945797:3,6,3,1
chr5	34945812	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0|1:34945797_CT_C:34945797:0,0,10,9
chr5	34954588	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr5	34954668	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=126,89;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.293:34:17,8:7,0:14,10,10,0
chr5	34954778	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:16,0:6,2:9,13,2,0
chr5	35026683	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.876:6:0,1:0,2:0,0,0,6
chr5	35032769	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=281,171;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:6,0,3,0
chr5	35033526	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:1,6:0,3:1,0,7,2
chr5	35033706	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=228,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:3,4,0,3
chr5	35037006	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=18,31;MFRL=158,257;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.593:5:0,0:1,3:0,2,3,0
chr5	35084480	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=205,152;MMQ=60,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,6:4,0:4,0,6,0
chr5	35628715	.	ACAAGGTCTTGT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=324,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.506:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	35659130	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=135,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:12,2:5,1:6,11,2,1
chr5	35692775	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=193,164;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,4:4,4:5,4,4,4
chr5	35695844	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=124,254;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:10,2:3,2:4,9,2,2
chr5	35697963	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=172,310;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr5	35700940	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr5	35704584	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr5	35713007	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=327,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.774:11:1,3:1,6:1,1,0,9
chr5	35739960	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	35740343	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,0:3,8:0,7,0,9
chr5	35753715	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=214,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=45.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,3:1,10:0,1,6,7
chr5	35753924	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=207,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr5	35763818	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,2:8,1:2,9,0,3
chr5	35763877	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=285,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr5	35763895	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	35771917	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=179,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,1:10,1:4,13,0,2
chr5	35792356	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	35799987	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=137,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr5	35799994	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr5	35807132	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:3,2:9,2:5,7,0,4
chr5	35857177	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=228,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,5:1,6:0,3,1,10
chr5	35857235	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=267,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:0,1,0,8
chr5	35857262	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	35861152	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.534:13:3,0:3,7:0|1:35861152_C_G:35861152:2,4,2,5
chr5	35861159	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,2:0.231:11:2,1:7,1:1|0:35861152_C_G:35861152:2,7,1,1
chr5	35875593	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:1,2:7,3:6,2,4,1
chr5	35910419	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=126,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,3:3,0:4,2,3,0
chr5	35921069	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=148,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:3,0,4,2
chr5	35921266	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,1:2,2:0,2,1,3
chr5	35954588	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=147,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:10,2:6,4:5,11,2,4
chr5	35957202	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:1,3:2,0,3,0
chr5	35968122	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=138,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:6,3,2,0
chr5	36111167	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=214,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,4:0,3:2,0,7,0
chr5	36122537	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=153,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,2:9,1:7,14,1,2
chr5	36123065	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=15,17;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.327:14:3,1:0,0:2,7,1,4
chr5	36136349	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=231,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:0,7:2,9:2,0,11,5
chr5	36136675	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=199,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr5	36137620	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr5	36141386	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,5:0,2:0,2,0,7
chr5	36142589	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=235,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,1:2,3:4,0,4,1
chr5	36143392	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=209,148;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.808:24:2,9:2,11:3,1,10,10
chr5	36143414	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:10,0:10,3:16,5,0,4
chr5	36166827	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=350,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.818:6:0,0:1,3:0,1,0,5
chr5	36168582	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr5	36195448	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,0:5,5:0,6,0,5
chr5	36201336	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr5	36207424	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	36217764	.	G	GTTAATCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,0:0,0,7,0
chr5	36217997	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.603:13:1,7:4,1:3,2,4,4
chr5	36241922	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	36253839	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:16,0:9,3:14,11,0,3
chr5	36253937	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,10:0,1:0,0,1,10
chr5	36260976	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,4,11
chr5	36268218	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr5	36271491	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr5	36301362	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.724:9:1,1:1,4:0|1:36301362_T_A:36301362:1,1,6,1
chr5	36301369	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.747:10:1,3:1,4:0|1:36301362_T_A:36301362:1,1,7,1
chr5	36301420	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=217,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:8,6:2,1:5,5,5,2
chr5	36608727	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=156,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,0:4,1:0,4,0,2
chr5	36629529	.	CTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=162,231;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr5	36674256	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr5	36683888	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=175,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,2:6,1:0|1:36683888_G_A:36683888:6,3,3,0
chr5	36683903	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=220,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,15:0.800:18:2,4:1,11:1|0:36683888_G_A:36683888:3,0,10,5
chr5	36986369	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=253,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,2,0
chr5	37003501	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,1:7,3:1,11,0,4
chr5	37027576	.	GTT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=133,221;MMQ=54,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.208:12:2,1:5,1:1,9,0,2
chr5	37036449	.	GTATATA	G,GTA,GTATA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33,31,34;MFRL=144,175,180,173;MMQ=60,60,60,60;MPOS=8,10,29;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,7,8,9;RU=TA;STR;TLOD=4.95,14.67,8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,2,5,4:0.119,0.265,0.235:18:3,1,2,3:2,1,3,1:4,3,8,3
chr5	37036558	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=129,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:14,3:8,0:9,13,0,3
chr5	37049225	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,88;MMQ=60,29;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.402:30:9,0:9,11:7,11,1,11
chr5	37063924	.	TGAA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=176,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAA;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,2:6,0:0|1:37063924_TGAA_T:37063924:8,7,1,1
chr5	37063936	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=172,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:0|1:37063924_TGAA_T:37063924:11,7,1,1
chr5	37108441	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:10,2:18,0:6,22,2,0
chr5	37115240	.	TGA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	37180351	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=218,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:2,2:0,5,0,3
chr5	37196094	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=128,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:5,1:6,5,1,1
chr5	37206229	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr5	37213658	.	TACCTG	T	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=27,25;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.140:27:10,0:13,3:0|1:37213658_TACCTG_T:37213658:11,13,2,1
chr5	37213666	.	TTAATATGAA	T	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=28,25;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:10,0:11,3:0|1:37213658_TACCTG_T:37213658:11,14,2,1
chr5	37213679	.	GGGGAAGAACATT	G	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:8,0:10,3:0|1:37213658_TACCTG_T:37213658:9,11,2,1
chr5	37213694	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:8,0:8,3:0|1:37213658_TACCTG_T:37213658:9,11,2,1
chr5	37213696	.	TGA	T	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=27,25;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:10,0:10,3:0|1:37213658_TACCTG_T:37213658:11,14,2,1
chr5	37213700	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:11,0:11,3:0|1:37213658_TACCTG_T:37213658:11,12,2,1
chr5	37213702	.	GGGGGCAA	G	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:11,0:12,3:0|1:37213658_TACCTG_T:37213658:12,12,2,1
chr5	37213712	.	TGC	T	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=25,33;MFRL=127,150;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:8,0:12,1:0|1:37213658_TACCTG_T:37213658:9,11,2,1
chr5	37244686	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=119,117;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:4,0:11,4:5,10,0,4
chr5	37244787	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=239,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:37244787_T_A:37244787:0,2,1,0
chr5	37244804	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=239,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:37244787_T_A:37244787:0,2,1,0
chr5	37244808	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,15;MFRL=239,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:37244787_T_A:37244787:0,2,1,0
chr5	37247700	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=52.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,11,5
chr5	37303424	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=211,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:6,3,1,1
chr5	37303548	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=169,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:37303548_T_A:37303548:0,3,0,1
chr5	37303550	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=169,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:37303548_T_A:37303548:0,3,0,1
chr5	37307315	.	ACAT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=231,158;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:4,1:0|1:37307315_ACAT_A:37307315:6,1,2,0
chr5	37307323	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=14,31;MFRL=228,158;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:1,1:2,1:0|1:37307315_ACAT_A:37307315:7,1,2,0
chr5	37326073	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=201,77;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr5	37333604	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=132,161;MMQ=60,22;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:11,5:4,0:5,10,5,0
chr5	37350390	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=139,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:1,11,0,2
chr5	37364443	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,6,7
chr5	37605122	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=119,260;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.633:6:1,2:0,1:2,0,2,2
chr5	37724990	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr5	37752497	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	37752709	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:10,0:5,2:5,10,0,2
chr5	38407273	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=145,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,1:7,2:2,10,0,3
chr5	38407888	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,1:7,2:10,5,0,3
chr5	38438617	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr5	38490251	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=113,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,3:5,0:8,4,0,3
chr5	38504303	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr5	38512154	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr5	38527228	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,3:2,5:4,1,6,2
chr5	38528969	.	CACACACACACAG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=137,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.681:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr5	38876573	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	38881877	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=133,105;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,0:8,3:5,8,0,3
chr5	38885353	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=206,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr5	38885647	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=208,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr5	38886040	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	38886250	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=183,61;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,0:9,2:9,3,0,2
chr5	38904082	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:7,4:6,5:7,6,4,5
chr5	38904363	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr5	38917574	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr5	38923171	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr5	38931919	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,2:0,6:3,0,8,0
chr5	38932466	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr5	38942554	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=201,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.764:6:0,0:1,4:0,1,0,5
chr5	38945919	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=197,225;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr5	38953665	.	G	GA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=112,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.886:20:2,5:0,11:0,2,9,9
chr5	38954994	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr5	38958524	.	GAAAATTTACTT	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=177,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,0:9,2:11,14,1,1
chr5	38958774	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,250;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.323:32:11,10:11,0:16,6,10,0
chr5	38958968	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=207,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.923:11:1,6:0,4:0,1,0,10
chr5	38959794	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	38962543	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,5,8
chr5	39074296	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.739:21:4,7:1,9:3,2,6,10
chr5	39119222	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	39119561	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	39119723	.	C	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.568:35:10,12:5,8:6,9,6,14
chr5	39124508	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	39127960	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=153,62;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr5	39134295	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,3:4,2:10,1,3,2
chr5	39139268	.	TG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=154,175;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:12,6,2,0
chr5	39153605	.	G	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=94,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,5:0.088:65:22,5:36,0:25,35,5,0
chr5	39341667	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=179,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:8,6:7,4:8,7,4,6
chr5	39342308	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:4,8,0,2
chr5	39375082	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:4,5:0,7:2,2,8,4
chr5	39377418	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=68,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,5:0,5:0,1,2,8
chr5	39390061	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,3:0,9:0,0,4,8
chr5	40681254	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.183:36:13,2:17,4:16,14,3,3
chr5	40716153	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	40728383	.	C	CAAAAAAAAAAAAAAAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,241;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,30;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40728383_C_CAAAAAAAAAAAAAAAA:40728383:0,0,1,0
chr5	40728398	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,15;MFRL=151,241;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:40728383_C_CAAAAAAAAAAAAAAAA:40728383:1,0,1,0
chr5	40728400	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,10;MFRL=151,241;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:40728383_C_CAAAAAAAAAAAAAAAA:40728383:1,0,1,0
chr5	40746885	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:9,1:1,3:8,2,2,2
chr5	40747164	.	CTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=150,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=T;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:1,1:0,3,0,2
chr5	40763014	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,123;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:12,5:16,0:17,11,5,0
chr5	40767498	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=132,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	40777531	.	T	TTA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=266,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:4,0,3,3
chr5	40841739	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=123,52;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:19,2:17,0:0|1:40841739_G_T:40841739:18,18,1,1
chr5	40841749	.	A	AACAGCTGTCC	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=129,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:19,2:16,0:0|1:40841739_G_T:40841739:16,22,1,1
chr5	40843493	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=173,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:10,6:7,3:8,9,6,3
chr5	40928574	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=212,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	40934393	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=190,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:10,2:4,2:13,1,4,0
chr5	40945526	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	40949997	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr5	40950187	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=186,246;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr5	40964816	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,3:2,4:5,3,5,2
chr5	40964852	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=159,130;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,4:4,1:7,4,3,2
chr5	40972769	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=201,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr5	40979790	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=177,244;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:3,3,2,2
chr5	40980086	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=218,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr5	40981689	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=205,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:3,3,0,6
chr5	40981768	.	CCTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=319,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr5	40998196	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=203,233;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,2,2
chr5	40998851	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=184,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,2:1,1:0,1,2,2
chr5	40999900	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=179,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:2,4,1,3
chr5	41000243	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,289;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr5	41001023	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr5	41004807	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:2,1:3,3:5,0,4,1
chr5	41008650	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=274,253;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.637:14:2,4:2,5:5,0,7,2
chr5	41012615	.	AA	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	41032998	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=173,290;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:1,3,1,2
chr5	41033309	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=241,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:41033309_A_G:41033309:0,3,0,1
chr5	41033311	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=241,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:41033309_A_G:41033309:0,3,0,1
chr5	41038850	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:3,4,0,2
chr5	41039000	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=137,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr5	41039451	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=195,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:3,13:4,0:6,1,13,0
chr5	41042284	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=105,76;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,5:3,5,2,4
chr5	41042300	.	CAA	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=113,38;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:0|1:41042300_CAA_C:41042300:3,6,1,1
chr5	41042305	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=113,38;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,0:4,2:0|1:41042300_CAA_C:41042300:3,6,1,1
chr5	41042321	.	AAAGAT	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=57,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr5	41045768	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=265,315;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr5	41045835	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,3:6,4:5,2,6,1
chr5	41050999	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=203,240;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr5	41051041	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:41051041_A_G:41051041:4,1,2,0
chr5	41051043	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:41051041_A_G:41051041:4,1,2,0
chr5	41057562	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=139,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr5	41061871	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=139,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.483:11:1,2:2,3:1,5,2,3
chr5	41149284	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=221,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,0:7,2:9,1,2,0
chr5	41154150	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,5:1,1:1,2,3,3
chr5	41159341	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=185,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:0|1:41159341_G_A:41159341:12,3,1,1
chr5	41159345	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=188,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:41159341_G_A:41159341:13,5,1,1
chr5	41159351	.	T	TTGGCCAACA	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=190,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:41159341_G_A:41159341:13,6,1,1
chr5	41159354	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,36;MFRL=190,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:8,1:0|1:41159341_G_A:41159341:13,6,1,1
chr5	41203344	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=207,251;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr5	41381901	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr5	41475766	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=113,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,7:4,3:5,5,3,7
chr5	41805575	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=203,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,3:4,0:7,0,3,0
chr5	41842746	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=186,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:4,1:6,4:5,5,3,2
chr5	41909830	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,31,29;MFRL=114,138,134;MMQ=60,60,60;MPOS=31,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=T;STR;TLOD=7.20,6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,4:0.187,0.295:16:2,1,3:1,2,0:7,2,6,1
chr5	41917196	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=127,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:6,0:12,5:10,8,0,5
chr5	41927423	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:5,3:1,6,0,3
chr5	41929926	.	GG	AT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=161,142;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.346:24:6,0:10,8:0|1:41929926_GG_AT:41929926:10,6,0,8
chr5	41929930	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=160,142;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.360:23:4,0:9,8:0|1:41929926_GG_AT:41929926:10,5,0,8
chr5	42718335	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=315,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr5	42719239	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=155,228;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:7,0:12,2:7,12,0,2
chr5	42769632	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=202,265;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr5	42769647	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=151,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:5,0,2,1
chr5	42769844	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=121,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	42779686	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:3,3:1,3:0,4,2,5
chr5	42783581	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,3:3,1:7,4,3,1
chr5	42799719	.	T	TTTA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=198,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=46.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,6:0,4:1,0,8,3
chr5	42800808	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,228;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:7,1,2,1
chr5	42804758	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=147,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.161:23:8,0:10,3:0|1:42804758_C_T:42804758:11,9,2,1
chr5	42804762	.	AG	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=147,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:11,2:0|1:42804758_C_T:42804758:13,9,1,1
chr5	42804765	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=149,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:0|1:42804758_C_T:42804758:13,9,1,1
chr5	42804768	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=149,47;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:0|1:42804758_C_T:42804758:13,9,1,1
chr5	42810707	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=247,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr5	43122348	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=23,22;RU=T;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.788:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	43122371	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	43161337	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:1,3,3,0
chr5	43173567	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=95,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,5:2,1:1,1,2,5
chr5	43175103	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:3,8:7,7:8,2,7,8
chr5	43245922	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,174;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:8,6:7,4:6,9,5,5
chr5	43291181	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=96,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr5	43291187	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=139,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,1,0
chr5	43291193	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:1,3,1,0
chr5	43291198	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:3,0:1,1:1,3,1,0
chr5	43292483	.	C	CTTACTATGAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=203,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr5	43292908	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=255,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:1,7:1,2:2,0,7,3
chr5	43297032	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	43297144	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,9,11
chr5	43298093	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=205,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,3:5,0:9,2,2,1
chr5	43298544	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=229,285;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0|1:43298544_A_G:43298544:4,1,3,0
chr5	43298557	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0|1:43298544_A_G:43298544:0,0,6,0
chr5	43492265	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr5	43493592	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	43509462	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr5	43527398	.	G	GAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,256;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr5	43527673	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	43530035	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:2,1:0,4,0,5
chr5	43533992	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr5	43535754	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,2:3,6:0,5,2,6
chr5	43536855	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	43609272	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,4:8,3:6,6,5,2
chr5	43612984	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:1,11:1,6:1,1,15,2
chr5	43613181	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:18,3:13,0:10,22,0,3
chr5	44305309	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=119,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,4:4,1:3,2,2,3
chr5	44310492	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=161,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,4:8,4:7,5,5,3
chr5	44388714	.	AAGC	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AGC;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:7,1:12,2:14,10,1,2
chr5	45303999	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=204,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr5	45353422	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:2,0:4,12:0,7,0,12
chr5	49698986	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=203,161;MMQ=60,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.248:13:4,2:6,0:9,1,3,0
chr5	49701519	.	CTGT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=122,91;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TGT;STR;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,6:6,4:6,7,7,3
chr5	49701755	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=162,135;MMQ=57,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr5	50046139	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	50055456	.	CT	C,CTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,32,35;MFRL=163,120,196;MMQ=60,60,60;MPOS=23,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=10.66,6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,7,4:0.467,0.293:14:2,1,3:0,5,0:1,2,9,2
chr5	50084508	.	C	CCTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=222,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr5	50122645	.	GTT	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.278:12:6,3:2,0:5,4,1,2
chr5	50683541	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=191,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:3,1:8,4:2,9,2,3
chr5	50683655	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr5	52084365	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	52097183	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr5	52161500	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=127,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,1:1,3:1,1,2,2
chr5	52183805	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=229,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:0|1:52183805_T_A:52183805:0,5,1,1
chr5	52183806	.	G	GAGCCAAGGGACTCT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=229,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:52183805_T_A:52183805:0,5,1,1
chr5	52193414	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr5	52201508	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=3668,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr5	52204848	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=188,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.297:18:7,2:6,3:2,11,2,3
chr5	52204943	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr5	52211375	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:13,0:17,3:16,14,0,3
chr5	52223350	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr5	52223516	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=194,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,4:0,2:2,2,0,6
chr5	52235582	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=221,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:2,1:2,2,2,0
chr5	52235802	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr5	52243361	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=243,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:1,5:2,5:0,3,0,10
chr5	52322721	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:5,4:4,6:1,8,2,8
chr5	52337908	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=131,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:14,2:8,2:14,8,4,0
chr5	52338083	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=192,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.419:17:4,5:6,2:2,8,3,4
chr5	52344610	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=185,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,4:2,3:0,2,0,7
chr5	52351413	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,3:4,4:7,4,6,1
chr5	52351532	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,0:7,2:0,11,0,2
chr5	52351746	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:4,8:2,6:5,1,11,3
chr5	52355854	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,3:4,5:3,4,3,5
chr5	52358761	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=105,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.264:16:5,1:6,3:0,12,0,4
chr5	52366138	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:5,7:2,6:1,6,1,12
chr5	52366162	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=167,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:8,2:3,2:1,10,0,4
chr5	52367666	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr5	52367706	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=124,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:2,0,6,0
chr5	52368366	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=165,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:1,0:6,2:6,1,2,1
chr5	52368546	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:6,1:13,4:5,14,2,3
chr5	52368922	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=69,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,5:3,2:4,2,4,3
chr5	52370174	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,4:2,6:6,1,8,2
chr5	52382748	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=151,251;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr5	52385993	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=226,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr5	52404312	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=200,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,8:6,3:10,2,10,1
chr5	52781597	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:5,3:3,4:1,7,2,5
chr5	52781902	.	CAAAAA	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=233,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=21,16;RU=A;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.344:13:2,1:3,3:0|1:52781902_CAAAAA_C:52781902:6,2,1,4
chr5	52781924	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=191,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,5:0.346:16:4,1:3,3:1|0:52781902_CAAAAA_C:52781902:1,10,5,0
chr5	52781930	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=187,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,5:0.374:14:3,0:4,3:1|0:52781902_CAAAAA_C:52781902:1,8,5,0
chr5	52954514	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr5	53450542	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=229,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,2:1,5:0,2,0,7
chr5	53814052	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr5	53815413	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.194:39:12,3:20,4:13,19,3,4
chr5	54275119	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:11,3,2,0
chr5	54277925	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:14,0:8,4:13,9,0,4
chr5	54320700	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=229,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,2:2,6:0,3,1,7
chr5	54403957	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr5	54404015	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,13,11
chr5	54423075	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=206,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:2,4,2,1
chr5	54439513	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=183,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,0:6,4:2,10,0,4
chr5	54466544	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=174,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:5,2:9,2:6,8,1,3
chr5	54468921	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=299,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr5	54528393	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:4,4,1,5
chr5	54557146	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=203,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.353:12:4,0:4,4:6,2,3,1
chr5	54569062	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:8,2,4,0
chr5	54593016	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=280,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr5	54603822	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,3:5,8:9,1,10,1
chr5	54603936	.	G	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,12:0.198:62:22,0:27,11:29,21,0,12
chr5	54639292	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=180,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.179:37:18,0:13,6:10,21,0,6
chr5	54640496	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=152,388;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:2,1:1,7,1,1
chr5	54642783	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=157,138;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:7,11:7,0:12,2,11,0
chr5	54648918	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=205,341;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr5	54683977	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:1,8,1,1
chr5	54693374	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,4:1,6:1,2,1,9
chr5	54693402	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=131,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,0,4
chr5	54706325	.	T	TTTTAAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=293,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.879:14:0,3:1,6:0,1,7,6
chr5	54709943	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr5	54710072	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=102,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.478:9:1,4:3,0:1,4,1,3
chr5	54718618	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=256,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,7:1,3:4,0,10,0
chr5	54721619	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=213,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.609:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr5	54721642	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=340,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.747:10:0,4:2,2:2,0,8,0
chr5	54737791	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=379,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr5	54830295	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	54941810	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=278,242;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr5	54944976	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:3,1,2,0
chr5	54952688	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.851:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr5	54964974	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,37;MFRL=184,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr5	54965513	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=189,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,4:6,2:2,8,1,5
chr5	54993829	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:2,2,3,2
chr5	55112262	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.321:10:5,1:1,2:6,1,3,0
chr5	55168328	.	C	CCTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,306;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr5	55178976	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:4,4,2,4
chr5	55179052	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr5	55204530	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=257,261;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55204530_CG_C:55204530:0,1,0,1
chr5	55204534	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=257,261;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55204530_CG_C:55204530:0,1,0,1
chr5	55204538	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=257,261;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55204530_CG_C:55204530:0,1,0,1
chr5	55206444	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.349:29:12,5:7,4:4,15,6,4
chr5	55212379	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	55213023	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr5	55237066	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=158,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:55237066_C_T:55237066:7,9,0,2
chr5	55237069	.	T	TTTAGGGAA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=156,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:0|1:55237066_C_T:55237066:7,6,0,2
chr5	55237072	.	C	CTATG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=156,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:0|1:55237066_C_T:55237066:7,6,0,2
chr5	55251931	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=166,118;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:5,8:1,7:4,2,7,8
chr5	55252984	.	C	CA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:6,3:2,1:8,1,5,1
chr5	55398217	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=89,289;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr5	55398269	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,11,2
chr5	55412347	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=132,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,5:4,3:6,0,8,0
chr5	55422681	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,236;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,2:7,1:10,0,3,0
chr5	55830865	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,2768313;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	55851872	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=179,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:9,4:9,6:14,4,6,4
chr5	56152387	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=167,190;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,7:4,0:7,1,7,0
chr5	56152416	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=190,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.479:23:8,6:3,4:12,0,8,3
chr5	56177148	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=220,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,3:2,0:0,7,0,3
chr5	56177848	.	TCAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=269,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CAA;STR;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:1,4:1,4:1,1,3,5
chr5	56179341	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=185,91;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:5,1,1,2
chr5	56180480	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=200,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:5,3,2,1
chr5	56205643	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=191,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:0|1:56205643_A_G:56205643:0,9,1,3
chr5	56205662	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=191,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,1:4,2:0|1:56205643_A_G:56205643:0,7,1,3
chr5	56206073	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=189,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:5,0,5,0
chr5	56209043	.	CTTTA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=191,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTA;STR;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:1,8,0,3
chr5	56212595	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,4,4
chr5	56224714	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr5	56224782	.	ACTCT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=203,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=CT;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr5	56226410	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr5	56226605	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:0,6,1,4
chr5	56229288	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=184,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr5	56231388	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=215,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,0:4,7:1,8,0,7
chr5	56233541	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=156,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:1,2:13,0:5,9,1,1
chr5	56233551	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:1,2:9,0:4,6,0,2
chr5	56246500	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=133,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:9,0:5,6:2,12,0,6
chr5	56246610	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr5	56255277	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,186;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,0:10,2:6,8,0,2
chr5	56517174	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=147,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,0:7,3:7,7,2,1
chr5	56526783	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:4,2,4,1
chr5	56526819	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=179,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.354:9:3,3:3,0:2,4,2,1
chr5	56527224	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	56527247	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=184,170;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr5	56547059	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr5	56778235	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=164,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:8,4:9,2:9,8,0,6
chr5	57750350	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=127,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:7,4,2,0
chr5	57753456	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:6,3:0,6:0,6,0,9
chr5	57754132	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr5	57754808	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.473:28:7,7:6,6:7,8,8,5
chr5	57790337	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:5,3:7,4:8,4,5,2
chr5	57790924	.	T	TAAGTGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=261,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:57790924_T_TAAGTGGG:57790924:0,4,0,1
chr5	57790927	.	TC	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=261,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:57790924_T_TAAGTGGG:57790924:0,4,0,1
chr5	57792506	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=175,339;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:14,0:9,4:12,11,4,0
chr5	58021809	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=200,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,0:8,1:9,3,1,2
chr5	58270412	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:4,1:1,1:6,0,2,0
chr5	58271713	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,4:0,3:0,0,1,7
chr5	58284283	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr5	58285813	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=206,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr5	58286625	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr5	58286737	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=230,247;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:1,0:0,0:1,4,0,2
chr5	58289334	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr5	58289364	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=193,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr5	58334645	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=92.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:0,20:1,9:0,1,22,7
chr5	58489218	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	58882102	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,4:2,0:5,2,4,0
chr5	59899413	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=186,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr5	59934483	.	CA	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:4,0,4,0
chr5	59940502	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=176,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:4,1,4,1
chr5	59940765	.	G	GTTATCCTCTCCACTGTTCTGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=175,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr5	60050391	.	T	TGCATAGGTAAGTGACA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:3,1:6,0:9,0,4,0
chr5	60063576	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=203,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,1:3,2:10,0,2,1
chr5	60083166	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:5,3:8,4:7,6,4,3
chr5	60083275	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:0,5,1,3
chr5	60170512	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,2:1,0:2,2,0,2
chr5	60170605	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=228,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:1,1,0,4
chr5	60186618	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=162,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr5	60186975	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=149,237;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr5	60186982	.	G	GAAAA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=237,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,7;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:60186982_G_GAAAA:60186982:0,3,0,1
chr5	60186986	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=237,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:60186982_G_GAAAA:60186982:0,3,0,1
chr5	60186988	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=237,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:60186982_G_GAAAA:60186982:0,3,0,1
chr5	60186991	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,25;MFRL=282,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:60186982_G_GAAAA:60186982:0,2,0,1
chr5	60186995	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=282,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:60186982_G_GAAAA:60186982:0,2,0,1
chr5	60199363	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=156,273;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	60199402	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=178,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:4,0:5,1,3,0
chr5	60240986	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=197,281;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,3:2,5:2,2,4,4
chr5	60241268	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr5	60369083	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.782:21:2,7:2,9:1,3,5,12
chr5	60628181	.	A	AGCG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GCG;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	60628591	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,329;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	60768742	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=164,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:3,2:17,0:0|1:60768742_G_A:60768742:11,9,1,1
chr5	60768744	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=164,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:3,2:17,0:0|1:60768742_G_A:60768742:11,9,1,1
chr5	60817142	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:5,0:14,2:12,7,0,2
chr5	60840167	.	G	GAGTGGGATTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=179,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr5	61602215	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=125,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:61602215_T_C:61602215:0,1,1,0
chr5	61602219	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=125,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:61602215_T_C:61602215:0,1,1,0
chr5	61602221	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=125,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:61602215_T_C:61602215:0,1,1,0
chr5	61642873	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=154,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr5	61643816	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=209,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:2,0,5,2
chr5	61648323	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=195,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,3,1
chr5	61648394	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=190,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:7,3:8,0:16,1,3,0
chr5	61657228	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=201,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:1,3,2,3
chr5	61657377	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=106,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,4:1,1:1,1,2,3
chr5	61659094	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=152,69;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,1:7,1:9,8,0,2
chr5	61659110	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,3:11,0:8,13,0,3
chr5	61662223	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=193,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.354:9:3,1:3,2:4,2,2,1
chr5	61669490	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=187,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,1:6,3:12,0,3,1
chr5	61669503	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=186,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:5,0:6,5:11,0,2,3
chr5	61673670	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr5	61676902	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:61676902_G_T:61676902:6,0,1,1
chr5	61676911	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:1,2:4,0:0|1:61676902_G_T:61676902:5,0,1,1
chr5	61686647	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=204,201;MMQ=52,29;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:2,1:9,4:9,2,5,0
chr5	61688892	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=192,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr5	61690443	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:0|1:61690443_A_G:61690443:7,9,0,3
chr5	61690447	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=132,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,0:9,3:0|1:61690443_A_G:61690443:6,8,0,3
chr5	61699231	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.702:18:2,6:3,7:0,5,1,12
chr5	61699451	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=179,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr5	61715040	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=139,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:0,1,2,2
chr5	61745737	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.490:22:3,4:8,7:8,3,10,1
chr5	61747500	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=181,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,1:4,1:7,0,2,0
chr5	61762880	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=192,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr5	61781127	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr5	61785027	.	TAATTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=238,243;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AATTG;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr5	61785936	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=202,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:3,2:7,2:7,3,2,2
chr5	61826663	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr5	61846210	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=139,74;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,1:7,1:6,7,0,2
chr5	61923204	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=113,242;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:0,7,0,3
chr5	62073118	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr5	63513099	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=135,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr5	63802632	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=97,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:8,0:5,2:0|1:63802632_G_T:63802632:8,6,1,1
chr5	63802639	.	TT	CA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=97,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:0|1:63802632_G_T:63802632:7,5,1,1
chr5	63802649	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=102,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,1:0|1:63802632_G_T:63802632:5,4,1,1
chr5	63803688	.	TTGGCTG	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:0|1:63803688_TTGGCTG_T:63803688:3,15,0,2
chr5	63803695	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:0|1:63803688_TTGGCTG_T:63803688:3,15,0,2
chr5	63905068	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,3:0,12:0,0,5,10
chr5	63905082	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=141,10534574;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,1:9,1:2,9,2,0
chr5	64023924	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.369:28:5,4:12,6:11,7,7,3
chr5	64023981	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=241,163;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.792:22:2,10:2,8:3,1,6,12
chr5	64096046	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:11,1:3,2:10,4,2,1
chr5	64447777	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=181,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,2,2
chr5	64483759	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=229,283;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr5	64629853	.	ACC	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,15;MFRL=136,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:3,0:18,0:15,9,1,1
chr5	64747918	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:10,0,1,1
chr5	64838584	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=200,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:4,2:6,2,5,0
chr5	64838758	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=240,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:0,5,0,7
chr5	64847543	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=124,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,3:3,3:0,3,0,6
chr5	64863484	.	TA	T,TAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30,28;MFRL=147,125,131;MMQ=60,60,60;MPOS=26,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.41,4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.363,0.351:8:1,1,1:1,2,2:0,2,1,5
chr5	64865405	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=189,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,5:2,5:4,1,9,1
chr5	64878858	.	CCTT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=193,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,8:5,2:8,1,8,2
chr5	64886193	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:6,2:2,0:0,8,0,2
chr5	64890479	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:3,2:5,4:3,5,0,7
chr5	64906617	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=146,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:4,0:7,0,3,0
chr5	64919991	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=210,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:7,8:4,8:7,4,7,9
chr5	64920803	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:6,0,6,0
chr5	64933457	.	CAA	C,AAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34,22;MFRL=117,162,129;MMQ=56,60,60;MPOS=14,0;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.12,3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.318,0.285:9:1,3,1:1,0,1:2,1,3,3
chr5	64933638	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=28,22;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,1:0|1:64933638_T_A:64933638:2,7,0,2
chr5	64933641	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:4,1:0|1:64933638_T_A:64933638:2,7,0,2
chr5	64933643	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0|1:64933638_T_A:64933638:2,6,0,2
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chr5	64933652	.	G	GTT	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0|1:64933638_T_A:64933638:2,6,0,2
chr5	64942799	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=197,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
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chr5	64954159	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=225,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr5	64957779	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=211,119;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr5	64960311	.	A	ATCTC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=204,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=TC;STR;TLOD=53.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.605:23:4,5:5,7:4,5,11,3
chr5	64968170	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=116,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.564:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr5	65073224	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr5	65105622	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,301;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr5	65308055	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=241,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:1,2:3,3:0,4,1,5
chr5	65310477	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.229:18:10,3:2,1:12,2,2,2
chr5	65310507	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:16,0:6,4:13,9,0,4
chr5	65338809	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=258,241;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:65338809_G_A:65338809:2,0,1,0
chr5	65338814	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=258,241;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:65338809_G_A:65338809:2,0,1,0
chr5	65346680	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:12,7:14,0:13,13,7,0
chr5	65372793	.	CT	C,CTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,35,36;MFRL=119,99,196;MMQ=60,60,60;MPOS=14,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.05,7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,4:0.175,0.350:12:3,1,0:3,1,3:2,4,0,6
chr5	65455250	.	ATCT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=207,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCT;STR;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,2:2,1:0,4,0,3
chr5	65455258	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=183,239;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:1,1:0,5,0,2
chr5	65466659	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=129,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,13:0.215:63:20,13:30,0:24,26,13,0
chr5	65892712	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	65892803	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	66195681	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=156,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,2,1
chr5	66195701	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,2:2,6:3,1,7,1
chr5	66226652	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=204,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:0,2:3,0:1,3,0,2
chr5	66300721	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=205,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.464:13:2,4:4,2:7,0,6,0
chr5	66391516	.	CTT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,36;MFRL=190,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:1,0:4,3:2,7,0,3
chr5	66429329	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,8,7
chr5	66448494	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=157,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:11,0:12,2:9,14,1,1
chr5	67569391	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=208,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0,9,0,2
chr5	67569746	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.615:24:7,6:2,9:8,1,8,7
chr5	67575344	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=223,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:5,2:1,1:7,0,3,1
chr5	67575642	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=225,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,2:7,0:0,8,0,2
chr5	67584512	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:6,2:2,1:8,1,3,0
chr5	67587994	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:9,0,3,0
chr5	67591046	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,107;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:19,3:20,0:18,22,3,0
chr5	68396580	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:4,3,4,1
chr5	68399969	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=196,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr5	68400583	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:1,3:3,2:3,2,2,3
chr5	68400594	.	ATAT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=207,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAT;STR;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:1,3:1,1:0,3,0,4
chr5	68409094	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,3:0,0,4,10
chr5	68410962	.	GAAAAAAAAAAAAAAAA	G,GAAAAAAAAAAAAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32,32;MFRL=166,187,149;MMQ=44,55,60;MPOS=27,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=30,14,27;RU=A;STR;TLOD=11.20,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,1:0.405,0.237:6:0,1,0:0,2,1:2,0,4,0
chr5	68411010	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,25;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,2:2,5:0,2,6,1
chr5	68412048	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=250,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:1,3:0,7:1,0,6,4
chr5	68413042	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.905:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr5	68414334	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:2,5,4,3
chr5	68417755	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=119,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,4:0,5:1,1,2,7
chr5	68463014	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=108,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,1:7,2:5,8,2,1
chr5	68464234	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:68464234_A_G:68464234:0,2,0,2
chr5	68464243	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,1:0|1:68464234_A_G:68464234:0,3,0,2
chr5	68487709	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=102,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.257:41:18,0:12,10:19,12,0,10
chr5	68491714	.	T	TAGTCAAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=141,257;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGTCAAG;STR;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:3,0:0,3:2,1,0,3
chr5	68513572	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=167,235;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:8,0,2,0
chr5	68513599	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=193,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.823:15:0,7:2,5:2,0,12,1
chr5	68524006	.	CT	C,CTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34,29;MFRL=139,183,160;MMQ=60,60,60;MPOS=12,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.93,5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.308,0.306:10:2,2,1:2,1,1:4,0,5,1
chr5	68531253	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,210;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.267:24:12,4:6,2:9,9,4,2
chr5	68548389	.	T	TGC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=161,218;MMQ=35,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:14,2:3,0:0|1:68548389_T_TGC:68548389:0,19,0,2
chr5	68548390	.	A	AGTGG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=161,218;MMQ=35,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:13,1:5,0:0|1:68548389_T_TGC:68548389:0,19,0,2
chr5	68550348	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.867:4:0,0:0,0:0,0,0,4
chr5	68564985	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=120,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.330:11:4,0:3,2:6,2,1,2
chr5	68602746	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,5:5,0:3,6,2,3
chr5	68667263	.	TCCC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=C;STR;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr5	68680543	.	ATG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TG;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr5	68680706	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=116,55;MMQ=60,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,2:10,0:16,7,0,2
chr5	68692375	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=209,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.447:5:2,1:0,1:0,3,0,2
chr5	68695940	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=139,155;MMQ=60,56;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,2:3,2:5,2,1,3
chr5	68696035	.	G	GTTTATTTA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=153,146;MMQ=40,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=TTTA;STR;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.791:7:0,3:1,2:0,1,2,4
chr5	68696093	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:68696093_G_A:68696093:1,2,0,1
chr5	68696096	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:68696093_G_A:68696093:1,2,0,1
chr5	68706252	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr5	68706438	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr5	68728544	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:2,2,0,5
chr5	68862365	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=149,176;MMQ=43,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.445:10:4,3:2,1:6,0,1,3
chr5	68863565	.	CTTTGTAGAG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=113,82;MMQ=25,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:68863565_CTTTGTAGAG_C:68863565:0,1,0,1
chr5	68863578	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=113,82;MMQ=25,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:68863565_CTTTGTAGAG_C:68863565:0,1,0,1
chr5	68863581	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=149,82;MMQ=25,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:68863565_CTTTGTAGAG_C:68863565:0,2,0,1
chr5	70265904	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=331,307;MMQ=25,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70265904_T_C:70265904:0,1,0,1
chr5	70265906	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=331,307;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70265904_T_C:70265904:0,1,0,1
chr5	70757811	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=176,182;MMQ=60,40;MPOS=-1073741817;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr5	70760056	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=177,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0|1:70760056_T_C:70760056:1,9,0,2
chr5	70760061	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=177,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0|1:70760056_T_C:70760056:1,9,0,2
chr5	70763088	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=212,302;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr5	70766415	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=146,249;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr5	70779611	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,0:7,3:13,3,3,0
chr5	70785407	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=133,174;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:6,3:9,0:0|1:70785407_A_T:70785407:9,8,3,0
chr5	70785413	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=137,174;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:6,3:10,0:0|1:70785407_A_T:70785407:10,8,3,0
chr5	70797500	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,11;MFRL=374,190;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=A;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.629:3:0,0:1,0:0,1,0,2
chr5	70800473	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=169,79;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.211:25:10,0:10,4:13,7,1,4
chr5	70800475	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=124,148;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.361:23:5,4:9,4:7,8,6,2
chr5	70800503	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=191,79;MMQ=60,55;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.239:23:10,0:7,4:0|1:70800503_T_A:70800503:11,7,1,4
chr5	70800505	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=191,79;MMQ=60,55;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.239:23:11,0:7,4:0|1:70800503_T_A:70800503:11,7,1,4
chr5	70800538	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=142,190;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:7,6:8,4:7,8,7,3
chr5	70805272	.	GC	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=181,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.479:16:3,7:2,1:7,1,7,1
chr5	70805277	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=118,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.440:16:8,3:1,4:8,1,6,1
chr5	70806649	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=167,187;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:3,3:0,6,3,3
chr5	70807016	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,213;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:3,3:2,1:0,5,0,4
chr5	70807991	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=191,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,5:3,1:7,0,6,0
chr5	70808069	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:4,4:11,0:6,9,4,0
chr5	70809065	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=152,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.317:39:11,12:16,0:15,12,12,0
chr5	70809269	.	GTT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=222,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr5	70811821	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=236,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,4:3,0:6,0,4,0
chr5	70818329	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33,19;MFRL=137,167,190;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,18;RU=A;STR;TLOD=10.48,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,7,3:0.409,0.235:16:3,4,0:2,3,1:0,6,0,10
chr5	70818877	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=194,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr5	70834833	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,4:6,4:5,7,3,5
chr5	70837295	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,7:0,5:0,1,4,8
chr5	70852611	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=201,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr5	70852686	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=125,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.179:21:12,2:6,1:12,6,2,1
chr5	70858268	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=142,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,2:2,0:5,8,2,0
chr5	70860493	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=134,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,6:0,1:1,0,7,0
chr5	70888665	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=101,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.428:7:2,2:0,1:2,2,3,0
chr5	70888918	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr5	70892027	.	GATTAAGT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=69,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:1,1:2,0,4,0
chr5	70922616	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr5	70927856	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=221,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,4:0,4:1,0,6,2
chr5	70928083	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=164,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,1,3
chr5	70930966	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=225,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:2,8:6,5:5,3,8,5
chr5	70948654	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr5	70952506	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,6,1
chr5	71016481	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:7,1:1,1:0,8,0,2
chr5	71403306	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,807;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	71411718	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=200,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:0,8,0,4
chr5	71490916	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=175,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:16,0:10,3:13,13,1,2
chr5	71491233	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=134,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:17,2:19,0:23,15,1,1
chr5	71493539	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,253;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,2:5,0:6,8,0,2
chr5	71494173	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:13,1:3,1:7,9,1,1
chr5	71494702	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:6,5:21,0:15,12,5,0
chr5	71494906	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=179,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,3:7,1:3,6,2,2
chr5	71522125	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,7:0,0,0,10
chr5	71609906	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:13,3:11,0:11,13,3,0
chr5	71739546	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=221,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:1,0,8,0
chr5	71743024	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	71743322	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=214,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,0,6
chr5	72112421	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:72112421_T_C:72112421:0,0,7,0
chr5	72112430	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:72112421_T_C:72112421:0,0,7,0
chr5	72144209	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:6,3:12,3:10,8,3,3
chr5	72182857	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,2:3,4:1,2,4,2
chr5	72182909	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=172,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,0:12,2:0|1:72182909_C_T:72182909:13,8,1,1
chr5	72182926	.	C	CTCCATCTCTATAGTT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:0|1:72182909_C_T:72182909:12,8,1,1
chr5	72185591	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:1,1:4,3:5,3,4,0
chr5	72201058	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr5	72252034	.	G	GGGC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=219,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GGC;STR;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,2:0,4,0,5
chr5	72349971	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=145,91;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,7:0.170:45:23,7:15,0:0|1:72349971_T_C:72349971:20,18,7,0
chr5	72349977	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=124,91;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,7:0.163:47:21,7:16,0:0|1:72349971_T_C:72349971:20,20,7,0
chr5	72350290	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=220,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,0:4,4:4,2,3,1
chr5	72364673	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=185,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,2:0,7:0,1,0,9
chr5	72370745	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,0:1,5:0,3,0,5
chr5	72378703	.	ATT	A,AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=16,19,17;MFRL=214,109,152;MMQ=60,60,60;MPOS=20,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.05,9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,5:0.210,0.434:11:0,0,2:1,1,0:0,4,0,7
chr5	72427353	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=232,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,1:0|1:72427353_C_T:72427353:5,1,2,0
chr5	72427363	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=228,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:72427353_C_T:72427353:6,1,2,0
chr5	72798502	.	GTT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr5	72798724	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=352,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,4,0
chr5	72800125	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=97,113;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.172:29:9,0:8,0:10,14,5,0
chr5	72800129	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=104,105;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.121:32:11,0:10,0:13,15,4,0
chr5	72850282	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=196,224;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:2,5:0,4:1,1,1,8
chr5	72858532	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=173,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,0:9,3:6,10,2,1
chr5	72872766	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,7:2,2:3,1,2,7
chr5	72873925	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=205,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,1,1
chr5	72874801	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=183,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,3,1
chr5	72875635	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=210,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr5	73072504	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=140,262;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,2:8,1:6,9,0,3
chr5	73076474	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.338:13:5,2:4,2:8,1,2,2
chr5	73076511	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:6,3:4,4:5,5,4,3
chr5	73090165	.	A	AGTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=153,259;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GTT;STR;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,1:8,3:8,2,3,1
chr5	73091126	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:5,3:8,1:12,1,3,1
chr5	73091149	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,2:11,1:17,3,2,1
chr5	73136409	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:12,0:3,3:9,7,0,3
chr5	73142380	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=165,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:0,4:7,0:0,7,0,4
chr5	73153389	.	TACAC	T,TAC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,24,25;MFRL=159,196,177;MMQ=60,60,60;MPOS=14,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=AC;STR;TLOD=5.38,4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.249,0.279:8:2,1,2:1,1,0:4,0,4,0
chr5	73160730	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=167,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:2,2,0,4
chr5	73163861	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,5,6
chr5	73189145	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=199,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,1:6,3:0,9,1,3
chr5	73190119	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr5	73190264	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=190,153;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,3:10,0:10,5,3,0
chr5	73197200	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr5	73205463	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=205,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:3,2:4,1:1,7,0,3
chr5	73205697	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	73205717	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	73930442	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=151,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:1,0,8,0
chr5	73931246	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=220,249;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,7:1,3:0,3,2,8
chr5	73992609	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=292,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,7:0,4:0,1,4,7
chr5	74001095	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:13,7:6,0:6,13,7,0
chr5	74011541	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,10;MFRL=136,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:1,1:0,0:0,1,0,3
chr5	74012386	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:6,0,0,2
chr5	74017664	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:7,0:2,9:0,9,0,10
chr5	74021485	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=95,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:16,4:3,0:0|1:74021485_C_G:74021485:6,14,4,0
chr5	74021492	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=95,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:15,4:3,0:0|1:74021485_C_G:74021485:6,13,4,0
chr5	74028752	.	GACACACACAC	G,GACACACAC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,35,31;MFRL=0,150,212;MMQ=60,54,40;MPOS=13,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=26,21,25;RU=AC;STR;TLOD=7.59,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.438,0.392:3:0,2,0:0,0,1:0,0,3,0
chr5	74028812	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=119,150;MMQ=60,54;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:2,0:0|1:74028812_G_T:74028812:9,3,2,0
chr5	74028814	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,19;MFRL=119,150;MMQ=60,54;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:9,0:2,0:0|1:74028812_G_T:74028812:9,3,2,0
chr5	74069863	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=127,195;MMQ=60,56;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:5,2:3,2:2,7,1,3
chr5	74072339	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=162,254;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr5	74091944	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=212,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,1:12,1:12,5,2,0
chr5	74096792	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:9,7,0,3
chr5	74324437	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=178,297;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr5	74326530	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=112,171;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:2,1:11,3:6,7,1,3
chr5	74639638	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,12:4,0:7,1,12,0
chr5	74651084	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,266;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:7,3:3,1:3,7,2,2
chr5	74655870	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=191,38;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,0:8,1:8,11,1,1
chr5	74655880	.	G	GGGGTTAATGTGTAGTTT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=200,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,0:9,2:8,10,1,1
chr5	74685520	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,1:2,1:3,7,1,1
chr5	74712651	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:10,0,2,0
chr5	74715068	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=142,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr5	74879042	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:6,6:6,0:0|1:74879042_T_G:74879042:12,0,6,0
chr5	74879045	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:6,6:5,0:0|1:74879042_T_G:74879042:11,0,6,0
chr5	74880496	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=191,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.372:9:0,3:6,0:6,0,3,0
chr5	74889660	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr5	74892002	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=129,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,1:1,1:6,3,1,1
chr5	74981173	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=155,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,0:11,3:7,10,1,2
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chr5	75927595	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=179,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr5	75927606	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=195,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr5	75927635	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:2,3,3,1
chr5	75927938	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=177,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr5	75933097	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	75936944	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=168,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:0,4:3,0:0,3,1,4
chr5	75948474	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr5	75948650	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=89,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.737:13:1,5:2,5:2,1,4,6
chr5	75948685	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=248,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:0,1,1,7
chr5	75950193	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	75950707	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=321,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.863:9:0,5:0,3:0,1,7,1
chr5	75954521	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=137,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.709:22:6,0:0,16:3,3,0,16
chr5	75954537	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=125,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.739:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr5	75954577	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=195,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:0,4,0,2
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chr5	75970219	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr5	75996837	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,3:5,1:8,0,4,0
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chr5	76259350	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.628:11:1,5:2,2:0,4,0,7
chr5	76332606	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0,4,0,5
chr5	76607841	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=129,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.443:23:9,6:3,4:6,7,7,3
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chr5	76640845	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:1,3,0,2
chr5	76703374	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=122,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr5	76704849	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,5,8
chr5	76722443	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,2:6,4:0,6,0,6
chr5	76729193	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr5	76747087	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=208,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,2:0,6:2,0,5,3
chr5	76760495	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,2:5,5:9,2,6,1
chr5	76760657	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:1,2:5,3:2,4,2,4
chr5	76785405	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.364:16:1,3:9,3:1,9,3,3
chr5	76787957	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=176,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,0:10,2:14,3,2,0
chr5	76926194	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=281,137;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:76926194_G_A:76926194:1,0,0,1
chr5	76926197	.	C	CAGGAGAATCGCTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=281,137;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:76926194_G_A:76926194:1,0,0,1
chr5	76926202	.	C	CCG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=281,137;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:76926194_G_A:76926194:1,0,0,1
chr5	76926206	.	GAC	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=219,137;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:76926194_G_A:76926194:2,0,0,1
chr5	76926211	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=219,137;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:76926194_G_A:76926194:2,0,0,1
chr5	77003971	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=216,222;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=58.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.686:26:1,18:6,0:4,4,0,18
chr5	77004117	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=141,61;MMQ=60,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,0:8,2:0|1:77004117_T_G:77004117:11,10,0,2
chr5	77004122	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=155,61;MMQ=60,22;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:0|1:77004117_T_G:77004117:12,8,0,2
chr5	77412045	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:3,4,1,1
chr5	77425028	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,6,7
chr5	77512158	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=232,292;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr5	77524068	.	TA	T,TAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28,29;MFRL=163,141,151;MMQ=60,60,60;MPOS=16,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=A;STR;TLOD=4.35,4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.299,0.297:7:1,2,1:2,0,1:0,3,0,4
chr5	77524091	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr5	77536713	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,47;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:10,0:25,2:0|1:77536713_C_T:77536713:16,19,1,1
chr5	77536715	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,47;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:9,0:25,2:0|1:77536713_C_T:77536713:16,19,1,1
chr5	77563263	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=178,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,3:3,7:5,0,9,1
chr5	77745740	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:4,0:5,2,3,0
chr5	77745853	.	C	CA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=94.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,11:0,17:0,0,11,17
chr5	77755035	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,9,9
chr5	78076160	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,295;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,3:9,0:13,0,3,0
chr5	78135276	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,3:6,0:4,12,0,3
chr5	78251347	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=130,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,6:3,1:0,6,1,6
chr5	78265092	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=161,243;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:78265092_C_T:78265092:0,1,0,4
chr5	78265096	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=161,243;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:78265092_C_T:78265092:0,1,0,4
chr5	78301309	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=230,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.290:5:2,0:2,1:0|1:78301309_G_C:78301309:0,4,0,1
chr5	78301313	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=230,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:78301309_G_C:78301309:0,4,0,1
chr5	78320085	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=175,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.273:31:13,5:10,3:11,12,3,5
chr5	78324470	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=150,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:8,6,1,1
chr5	78324482	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=164,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,0:5,3:9,5,1,2
chr5	78340062	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,4,1
chr5	78340411	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=163,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr5	78351581	.	CAT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=239,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr5	78351607	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,6:3,1:3,2,3,4
chr5	78351636	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:5,4:2,3:3,4,3,4
chr5	78373251	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=226,284;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.327:10:3,3:2,0:6,1,3,0
chr5	78384220	.	TGG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=187,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.305:8:3,0:3,0:6,0,2,0
chr5	78411822	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr5	78416416	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,240;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,1:4,2:0,12,0,3
chr5	78421780	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr5	78426729	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=197,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:6,2:5,0:10,1,2,0
chr5	78533584	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=292,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr5	78586914	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	78587135	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=192,95;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,1:3,2:1,7,1,2
chr5	78608354	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=98,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.594:10:1,1:2,5:0,4,0,6
chr5	78608368	.	TT	GA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=173,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.204:12:2,1:8,1:0,10,0,2
chr5	78610448	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=186,235;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.232:15:9,0:3,1:0|1:78610448_A_C:78610448:0,12,3,0
chr5	78610451	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=186,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.232:15:8,1:3,0:0|1:78610448_A_C:78610448:0,12,3,0
chr5	78671747	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=17,15;MFRL=236,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:78671747_G_T:78671747:1,0,1,0
chr5	78671750	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=12,16;MFRL=236,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:78671747_G_T:78671747:1,0,1,0
chr5	78671754	.	C	A,G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,10,17;MFRL=246,236,175;MMQ=60,60,60;MPOS=23,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.286,0.356:3:1,0,0:0,0,0:1,0,2,0
chr5	78671757	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=187,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:1,0:1|0:78671747_G_T:78671747:4,0,1,0
chr5	78742980	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=159,241;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr5	78752857	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:1,0:7,4:2,6,0,5
chr5	78944371	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:6,1,2,0
chr5	78944784	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=274,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr5	79024734	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:2,1:4,2:5,2,3,0
chr5	79025737	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=181,276;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:3,9,1,1
chr5	79027853	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:6,12,0,2
chr5	79028917	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=180,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,0:3,2:5,4,1,1
chr5	79029495	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=180,230;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,0:6,5:8,5,0,5
chr5	79030292	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,71;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:10,6:11,0:6,15,5,1
chr5	79031798	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,135;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,0:5,2:4,8,0,2
chr5	79041057	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:6,1:4,5,2,2
chr5	79058817	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=187,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:0,1:6,1:5,1,2,0
chr5	79086903	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=173,59;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:3,3,0,2
chr5	79089528	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	79095119	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=158,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr5	79351544	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr5	79351852	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,5:0,6:0|1:79351852_A_T:79351852:0,0,8,4
chr5	79351859	.	GG	AA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0|1:79351852_A_T:79351852:0,0,8,4
chr5	79354147	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr5	79354184	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=208,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr5	79354647	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,1,4
chr5	79354702	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=146,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	79355192	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr5	79355471	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:3,1,4,1
chr5	79361402	.	CATAAT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=228,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr5	79363754	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=209,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:6,1,2,0
chr5	79363959	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=141,250;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:5,2:8,0:0|1:79363959_T_TC:79363959:3,11,0,2
chr5	79363960	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=141,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:0|1:79363959_T_TC:79363959:3,11,0,2
chr5	79366080	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=122,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.503:10:3,2:2,3:3,2,5,0
chr5	79366249	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=158,255;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.644:11:1,6:0,1:0,4,1,6
chr5	79368016	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	79369223	.	T	TGAGA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr5	79369258	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=200,184;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:79369258_G_A:79369258:0,1,0,1
chr5	79369260	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=22,32;MFRL=200,184;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:79369258_G_A:79369258:0,1,0,1
chr5	79369265	.	GG	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=200,184;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:79369258_G_A:79369258:0,1,0,1
chr5	79369273	.	C	CATAGT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79369258_G_A:79369258:0,0,0,1
chr5	79373803	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=205,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,0:1,2:7,0,2,0
chr5	79375724	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:2,3:8,1:5,5,2,2
chr5	79378447	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=186,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr5	79378783	.	TGCGGGGCGTCCTGG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=180,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:3,2:7,1:11,0,3,0
chr5	79443169	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr5	79473059	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr5	79498623	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:6,1:1,1:8,0,2,0
chr5	79551867	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	79616854	.	T	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=188,188;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,9:0.197:47:11,8:27,0:28,10,9,0
chr5	79617357	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=125,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:4,2:8,2:6,6,2,2
chr5	79734170	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:8,5,1,1
chr5	79734297	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,8,8
chr5	79734797	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:2,11,0,2
chr5	79735858	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr5	79741018	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,298;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr5	79743821	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,10,2
chr5	79747291	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr5	79773028	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	79809658	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=347,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.611:6:2,0:0,2:0,2,0,4
chr5	79817983	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=155,124;MMQ=60,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,0:5,4:0|1:79817983_A_G:79817983:3,10,1,3
chr5	79817988	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=164,124;MMQ=60,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:4,0:5,3:0|1:79817983_A_G:79817983:0,9,1,3
chr5	79855372	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,6,4
chr5	79855876	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,4:0,7:0,1,5,6
chr5	79950163	.	C	CTGGCGCGTCCCGCCCAGGT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.739:21:3,5:2,9:4,1,16,0
chr5	79950497	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=266,379;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:79950497_C_T:79950497:0,1,2,0
chr5	79950512	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=266,349;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:79950497_C_T:79950497:0,1,1,0
chr5	79950781	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=175,220;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:7,5:8,2:2,13,1,8
chr5	79960955	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=173,133;MMQ=60,30;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:14,0:10,8:17,7,8,0
chr5	79968258	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=198,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr5	79968271	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr5	79974646	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr5	80021193	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr5	80021445	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=154,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,1:2,3:0,4,1,4
chr5	80088461	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr5	80149981	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=301,156;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:1,6:1,6:1,1,6,6
chr5	80160596	.	AAATG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=295,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:1,7:0,10:1,0,12,5
chr5	80256909	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=230,329;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr5	80388823	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=190,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:0,6,1,2
chr5	80390225	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,0,2
chr5	80390290	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=193,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr5	80404715	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=178,202;MMQ=60,52;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr5	80408702	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=237,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr5	80508355	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=179,250;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:8,4,1,1
chr5	80521485	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=123,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,1:8,2:10,5,2,1
chr5	80562176	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr5	80600859	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.307:37:10,11:16,0:13,13,11,0
chr5	80600877	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=122,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.325:38:7,12:19,0:14,12,11,1
chr5	80604733	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=111,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:3,6:6,1:4,5,6,1
chr5	80631511	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=187,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:7,0,4,1
chr5	80641789	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=127,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:3,1:12,2:8,7,2,1
chr5	80667715	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80667715_T_A:80667715:0,1,0,1
chr5	80667717	.	A	AAATACTCTACTTGTTTAGACTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80667715_T_A:80667715:0,1,0,1
chr5	80756855	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:1,4,3,1
chr5	80785011	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=190,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,6:2,3:4,1,5,4
chr5	81474225	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=163,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,1,2
chr5	81474400	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=105,159;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:15,1:6,1:16,5,2,0
chr5	81549216	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:5,6:1,3:3,3,4,5
chr5	81571846	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=235,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.804:13:1,4:1,7:2,0,9,2
chr5	81571896	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=120,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:11,2:17,0:14,14,1,1
chr5	81572184	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=257,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,8:2,1:2,1,8,1
chr5	81573992	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=357,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr5	81601142	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=173,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr5	82353083	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0|1:82353083_C_T:82353083:0,2,0,4
chr5	82353087	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,0:1,3:0|1:82353083_C_T:82353083:0,2,0,5
chr5	82360783	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=168,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:1,6:12,9:12,1,8,7
chr5	82499307	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr5	82834956	.	TG	CT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=187,1274;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,0:15,2:11,13,2,0
chr5	82835126	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=179,196;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,2:1,0:4,3,2,0
chr5	82835272	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,267;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.150:38:15,0:18,5:14,19,0,5
chr5	82843711	.	T	TATC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=268,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATC;STR;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr5	82849120	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	82875800	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,10,9
chr5	82940273	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=195,184;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,5:0,9:1,0,9,5
chr5	82940510	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr5	82940548	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=139,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr5	82948458	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,4:6,0:6,8,4,0
chr5	83259225	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr5	83476194	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=146,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:3,2,3,2
chr5	83525735	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=182,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.142:23:4,0:15,2:6,14,0,3
chr5	83550057	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=161,244;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:6,0:3,16,0,2
chr5	83550060	.	AT	A,ATT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,28,25;MFRL=124,196,275;MMQ=60,60,60;MPOS=12,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=5.36,5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,3:0.233,0.231:14:5,1,3:3,2,0:1,7,0,6
chr5	86564564	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=187,255;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,1:5,3:4,5,3,1
chr5	86637164	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.211:22:8,1:10,3:5,13,1,3
chr5	86644978	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:9,7:4,0:13,0,7,0
chr5	86667856	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=241,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr5	86670546	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=244,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr5	86679676	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,35;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:1,1:2,2:0,5,0,3
chr5	86704044	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=216,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86704044_G_A:86704044:1,0,0,1
chr5	86704046	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=216,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86704044_G_A:86704044:1,0,0,1
chr5	86705005	.	TTCTC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=335,183;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=TC;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	87494728	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.453:11:4,2:1,3:5,1,5,0
chr5	87501822	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=193,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:1,6,0,2
chr5	87502324	.	GG	TA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,11;MFRL=164,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.238:21:3,1:9,0:6,10,1,4
chr5	87502325	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=18,26;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.743:18:1,5:0,9:0,4,6,8
chr5	87502338	.	A	AAAAGGCT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=169,62;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.139:24:10,2:8,1:5,16,1,2
chr5	87503087	.	GACT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=98,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:1,1,0,3
chr5	88018388	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:4,1,2,0
chr5	89701608	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=175,72;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,2:10,0:2,13,0,2
chr5	89705390	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=191,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.589:23:3,3:6,7:8,1,11,3
chr5	89757280	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=179,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,1:6,1:12,5,2,0
chr5	89769647	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.410:22:6,5:7,1:8,5,6,3
chr5	89781594	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=183,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr5	89793406	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=209,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	89918582	.	C	CAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=201,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:89918582_C_CAG:89918582:0,4,0,1
chr5	89918588	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=201,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:89918582_C_CAG:89918582:0,4,0,1
chr5	89918592	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=227,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:89918582_C_CAG:89918582:0,3,0,1
chr5	89923659	.	G	GGTACAGGTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=183,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:89923659_G_GGTACAGGTA:89923659:0,4,0,1
chr5	89923665	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=183,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:89923659_G_GGTACAGGTA:89923659:0,4,0,1
chr5	89923667	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=165,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr5	89924976	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	89931159	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:1,4,0,3
chr5	89938587	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr5	89943655	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	89954184	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=287,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr5	89968626	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,1:0,8:0,0,0,9
chr5	89971358	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=220,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr5	89975432	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=126,74;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:9,0:18,2:7,20,0,2
chr5	89979589	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr5	89988412	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=227,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,6:3,2:2,3,6,2
chr5	89990545	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=206,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr5	90000210	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:7,2,0,2
chr5	90001988	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=108,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr5	90002220	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=242,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.644:8:1,3:2,1:0,3,1,4
chr5	90006981	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=144,146;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:13,0:8,5:13,8,0,5
chr5	90007196	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr5	90012614	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	90015792	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr5	90016129	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	90016871	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:6,3,1,2
chr5	90020868	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,8,6
chr5	90021499	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=203,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:2,5:0,0:1,1,1,4
chr5	90041161	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,8493;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	90041510	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=198,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:10,4:2,3:6,6,1,6
chr5	90052263	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=203,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:0,2:1,2:1,0,2,2
chr5	90052289	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=203,103;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:5,4,1,2
chr5	90053056	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr5	90059347	.	C	CATTCATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=194,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:90059347_C_CATTCATA:90059347:0,3,0,2
chr5	90059350	.	T	TGAATCGATTCTCTCTCTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=194,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:90059347_C_CATTCATA:90059347:0,3,0,2
chr5	90074646	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=212,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:4,5,2,0
chr5	90074705	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=170,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,1:4,1:3,5,2,0
chr5	90151589	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=181,108;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,3:2,7:2,0,6,4
chr5	90159580	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,1:6,2:12,3,0,3
chr5	90445829	.	T	TTC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=132,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.438:12:5,2:2,3:5,2,5,0
chr5	90445954	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=140,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:13,0:22,3:20,16,3,0
chr5	90446080	.	GTC	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=139,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.181:14:8,0:4,2:1,11,0,2
chr5	90449031	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:2,1,3,2
chr5	90669400	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr5	92956623	.	T	TCGA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=224,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CGA;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr5	93788638	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,7:3,5:3,2,6,6
chr5	93905185	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=151,80;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.153:49:16,2:24,4:18,24,4,3
chr5	93905189	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=111,151;MMQ=60,29;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,12:0.245:51:15,5:23,7:15,24,7,5
chr5	93905243	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=152,71;MMQ=60,28;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.263:43:15,6:12,4:15,17,3,8
chr5	93905255	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=152,95;MMQ=60,21;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:20,2:12,1:16,18,1,2
chr5	94006668	.	G	GTTTATAAGTTGATTTTGCCTGTCCTCAGAAATTTAACATATA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=157,52;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.156:25:13,1:8,2:9,13,2,1
chr5	94043353	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:0,7,0,5
chr5	94050447	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:2,2,4,0
chr5	94050487	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=227,181;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,7:3,1:4,2,6,2
chr5	94206957	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.360:11:6,3:1,1:7,0,3,1
chr5	94208748	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	94245149	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=204,92;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr5	94259621	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=177,98;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.316:20:6,4:8,2:7,7,4,2
chr5	94259682	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,4:7,6:7,4,3,7
chr5	94728631	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	94749903	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=145,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.772:20:2,8:2,8:0,4,3,13
chr5	94749969	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=276,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr5	94805685	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33,22;MFRL=187,211,274;MMQ=60,60,60;MPOS=26,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=T;STR;TLOD=3.68,7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.281,0.391:8:2,1,0:0,2,3:0,2,0,6
chr5	94852180	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:12,3:5,1:7,10,1,3
chr5	94878911	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,2:9,0:12,11,2,0
chr5	94879053	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=214,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:2,3,0,2
chr5	94903527	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr5	94903575	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,2:3,1:6,2,3,0
chr5	94922530	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr5	94927426	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=200,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr5	94957175	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=171,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,0:3,3:3,6,0,3
chr5	94988734	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=200,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:8,0,3,0
chr5	94990174	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=210,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr5	94992039	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=178,208;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr5	95116141	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.273:31:15,4:7,4:8,15,4,4
chr5	95224700	.	GAAAA	G,GA,GAAA,GAAAAAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,32,28,25,36;MFRL=118,168,227,245,128;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=25,17,11,24;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=18,14,15,17,20;RU=A;STR;TLOD=7.52,5.33,3.08,4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:1,4,3,2,3:0.210,0.202,0.150,0.295:13:1,3,2,0,2:0,0,0,1,1:1,0,9,3
chr5	95224804	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:19,4:7,0:8,19,0,4
chr5	95414786	.	T	TTAAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr5	95732986	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=209,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,4:4,0:2,3,2,2
chr5	95747963	.	TCTC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=179,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,4:4,2:6,3,6,0
chr5	95761448	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,16;MFRL=92,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:95761448_T_A:95761448:4,0,1,0
chr5	95761456	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,17;MFRL=116,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:95761448_T_A:95761448:4,0,1,0
chr5	95761469	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=54,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.275:8:5,0:1,1:6,0,1,1
chr5	95768847	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=184,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr5	96062617	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:3,2:6,0:3,6,0,2
chr5	96064961	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=110,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:7,2:2,0:1,8,0,2
chr5	96066576	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=156,267;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:6,11,1,1
chr5	96078295	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=186,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:12,4:8,0:20,0,4,0
chr5	96078309	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=154,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,5:8,2:16,1,7,0
chr5	96078337	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=160,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:7,3:10,2:11,6,2,3
chr5	96086334	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,3:5,1:8,6,2,2
chr5	96093386	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.329:16:2,1:5,2:4,7,0,5
chr5	96093389	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=197,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.280:15:1,2:9,1:2,9,2,2
chr5	96093391	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.333:15:2,0:5,4:4,6,0,5
chr5	96101031	.	TAA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,18;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=26,24;RU=A;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.626:3:1,1:0,0:0|1:96101031_TAA_T:96101031:1,0,0,2
chr5	96101066	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=213,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.702:8:2,3:0,3:0|1:96101031_TAA_T:96101031:0,2,0,6
chr5	96103110	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:5,2,3,2
chr5	96112005	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=110,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr5	96112083	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,4:8,0:9,5,3,1
chr5	96112295	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr5	96116112	.	ATT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=186,230;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,2:3,1:6,1,3,0
chr5	96116286	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:0,6,0,3
chr5	96116940	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,3:3,2:0,10,1,4
chr5	96117300	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=249,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr5	96117579	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,1,1
chr5	96119579	.	A	ACT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=121,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.469:13:4,1:2,4:5,2,4,2
chr5	96230858	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:4,0,6,0
chr5	96230883	.	A	ATT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=T;STR;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,7:3,4:4,0,11,0
chr5	96232142	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=118,154;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.433:37:14,8:7,7:9,12,5,11
chr5	96232222	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:2,10:2,2:1,3,3,9
chr5	96232250	.	G	GAAA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=180,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,7:2,2:2,2,3,7
chr5	96232286	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=182,249;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:1,2,4,2
chr5	96232345	.	CAT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=183,291;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,2:5,1:7,2,2,1
chr5	96232402	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:0,6:7,5:7,0,10,1
chr5	96237114	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=57,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:2,1,2,0
chr5	96237413	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=231,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr5	96239294	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:6,2:0,8:2,4,2,8
chr5	96244585	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=98803,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,4:1,3:1,1,6,1
chr5	96244638	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=97,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,5:3,4:4,2,8,1
chr5	96245518	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr5	96253104	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=195,185;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:6,1,2,0
chr5	96332085	.	TC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=147,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.505:22:7,9:4,2:7,4,7,4
chr5	96339102	.	ACT	A,AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25,31;MFRL=0,194,153;MMQ=60,60,60;MPOS=30,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.18,7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.375,0.500:5:0,1,2:0,0,1:0,0,5,0
chr5	96339273	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,2,2
chr5	96341750	.	T	TTA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TA;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.379:9:3,1:2,2:6,0,2,1
chr5	96342077	.	TAA	T,TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,28,27;MFRL=110,174,134;MMQ=60,60,60;MPOS=11,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=6.81,13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,7:0.228,0.393:19:3,3,4:3,1,3:6,2,7,4
chr5	96363407	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.780:10:0,2:1,6:2,0,6,2
chr5	96363459	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=112,208;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,5:4,9:3,5,4,10
chr5	96364063	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	96514717	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.351:12:2,1:6,3:6,2,4,0
chr5	96514982	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	96518792	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.288:18:9,3:4,1:9,4,2,3
chr5	96518927	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=196,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,6:5,6:4,6,5,7
chr5	98106245	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=202,229;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:8,2:5,2:13,0,2,2
chr5	98106505	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=292,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr5	98109838	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	98128914	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.249:29:11,0:11,6:12,10,0,7
chr5	98129109	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=158,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:4,9,0,2
chr5	98199048	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=169,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	98199077	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	98210690	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=169,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,3:5,6:3,4,8,1
chr5	98216982	.	CCT	GGG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,16;MFRL=138,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:6,0:5,6,2,0
chr5	98218734	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.623:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr5	98230221	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=163,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:8,2,2,0
chr5	98236689	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.316:36:15,0:10,11:13,12,0,11
chr5	98236831	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,1:6,4:5,6,3,2
chr5	98237139	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=189,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	99871228	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:10,4:13,0:13,11,4,0
chr5	99871696	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:1,5,1,2
chr5	101592809	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=169,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,1:3,8:3,1,6,3
chr5	101595831	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=183,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	101595885	.	T	TGA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=130,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GA;STR;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,3:0,0:3,0,7,0
chr5	101596032	.	AAAAT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=206,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:0,1:0,3,1,4
chr5	101606518	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,4:4,5:1,5,3,6
chr5	101627411	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=194,260;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr5	101631592	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=141,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr5	101724307	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,2,2
chr5	101726648	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=214,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:1,0,4,3
chr5	101726770	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=194,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:0,3,1,5
chr5	101726851	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=156,269;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr5	101755430	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr5	101795490	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=240,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,4:1,9:0,1,4,10
chr5	101811346	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	101816104	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=154,116;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:3,2,0,4
chr5	101816228	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=263,248;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr5	102202043	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=194,49;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,2:7,0:0,13,0,2
chr5	102249546	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr5	102282472	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	102295504	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=236,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:5,0,4,1
chr5	102295723	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=120,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:13,4:13,0:9,17,2,2
chr5	102296846	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=159,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,0:10,2:15,7,1,1
chr5	102310166	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr5	102325878	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=248,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr5	102340782	.	GATTA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=146,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTA;STR;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:1,4:2,2,5,1
chr5	102363858	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=171,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:3,3,5,1
chr5	102364542	.	A	AAT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,2:5,3:5,4,2,3
chr5	102423576	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:102423576_A_G:102423576:0,0,4,0
chr5	102423579	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:102423576_A_G:102423576:0,0,4,0
chr5	102489511	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=95,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:4,6:2,5:4,2,8,3
chr5	102494751	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=209,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr5	102518877	.	CTTTTTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=37,30;RU=T;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.733:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	102518978	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=104,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:12,4:22,0:8,27,0,4
chr5	102537193	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=115,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.214:19:7,2:7,1:13,2,4,0
chr5	102537200	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=131,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.547:20:6,6:3,5:8,1,10,1
chr5	102537231	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=114,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:13,5:13,0:13,13,5,0
chr5	102537298	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=138,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.524:40:8,12:11,9:6,13,6,15
chr5	102537379	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=206,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,6:2,3:1,3,4,5
chr5	102614324	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=175,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,14:0.517:27:6,9:7,5:0|1:102614324_G_A:102614324:7,6,6,8
chr5	102614327	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:20,5:0.221:25:12,2:8,3:1|0:102614324_G_A:102614324:9,11,2,3
chr5	102886512	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=221,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.533:11:2,5:3,1:4,1,6,0
chr5	102890560	.	G	GA,GAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=37,26,26;MFRL=195,124,161;MMQ=60,60,60;MPOS=13,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.72,3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.380,0.377:5:1,0,0:0,1,1:1,0,0,4
chr5	102895209	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=165,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr5	102895241	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=187,234;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr5	102895752	.	A	AC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=137,197;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:9,9:7,0:9,7,9,0
chr5	106722858	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=185,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,3:9,0:13,3,3,0
chr5	106723107	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=256,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	107700460	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=129,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,2:5,0:0|1:107700460_G_T:107700460:8,8,1,1
chr5	107700468	.	C	CCCTCCTCTTTCT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=134,72;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:9,1:6,0:0|1:107700460_G_T:107700460:9,8,1,1
chr5	107703446	.	CAAG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=39.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr5	108168451	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=140,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,2:0,1:2,0,3,1
chr5	108168470	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,0:3,0:3,4,2,0
chr5	108203451	.	GTT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=141,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:1,1:4,1,2,0
chr5	108219238	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,1:5,1:0,8,0,2
chr5	108436008	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=230,106;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:108436008_C_G:108436008:3,0,1,0
chr5	108436014	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=230,106;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:108436008_C_G:108436008:3,0,1,0
chr5	108516629	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,4:0,0,5,9
chr5	108521893	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:6,7:1,4:6,1,6,5
chr5	108523293	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=226,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,5:5,3:5,4,1,7
chr5	108679822	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,16;MFRL=278,164;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:108679822_G_A:108679822:2,0,1,0
chr5	108679824	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,16;MFRL=278,164;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:108679822_G_A:108679822:2,0,1,0
chr5	108679826	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,16;MFRL=278,164;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:108679822_G_A:108679822:2,0,1,0
chr5	108679870	.	T	TTTAA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTAA;STR;TLOD=83.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,8:0,0,13,6
chr5	108691738	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr5	108717157	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,4:0,3:3,0,7,0
chr5	109049486	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=159,243;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.122:27:10,0:9,2:9,15,0,3
chr5	109049507	.	CTT	C,GTT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,28,32;MFRL=163,89,247;MMQ=60,60,60;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.41,8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,2,3:0.162,0.166:16:4,1,1:6,1,2:2,9,1,4
chr5	109051820	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:15,1:6,1:17,4,2,0
chr5	109125264	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,49;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:14,0:15,3:12,17,0,3
chr5	109183341	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=122,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:9,6,1,1
chr5	109190935	.	TCTC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,2:12,0:13,9,1,1
chr5	110082153	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=192,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr5	110408705	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=144,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:2,8,0,2
chr5	110430488	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,3:2,4:7,0,7,0
chr5	110436450	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,7:5,5:2,6,4,8
chr5	110443228	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=142,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr5	110446455	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.349:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr5	110446741	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=224,247;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:0,2,3,1
chr5	110448751	.	ATT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.882:8:0,3:0,2:2,0,5,1
chr5	110448810	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:10,3:10,0:13,8,3,0
chr5	110454681	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=130,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,2,1
chr5	110459629	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=199,3001;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.325:22:8,6:7,0:5,10,0,7
chr5	110560140	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=183,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr5	110560413	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr5	110679657	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr5	110679873	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr5	110710699	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr5	110712491	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr5	110730557	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr5	111500738	.	TGTG	T	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=116,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:15,1:18,1:19,15,1,1
chr5	111500816	.	C	CTAAAA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=168,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAAA;STR;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,5:1,3:1,4,3,6
chr5	111500822	.	T	TAAA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:9,1:3,1:0|1:111500822_T_TAAA:111500822:3,9,1,1
chr5	111500824	.	T	TAC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,1:3,1:0|1:111500822_T_TAAA:111500822:3,9,1,1
chr5	111595633	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,91;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:3,2:8,0:2,9,2,0
chr5	111595745	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	111611160	.	TATA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=181,416;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATA;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:9,2:1,0:0,10,0,2
chr5	112116632	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=170,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:2,7,0,2
chr5	112175617	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:10,3:5,4:7,8,3,4
chr5	112175832	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,239;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:11,1:9,1:9,11,1,1
chr5	112196949	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=247,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,6:3,7:6,0,12,1
chr5	112196983	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=169,250;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:11,2:12,2:21,3,4,0
chr5	112197132	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=181,245;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.107:35:14,3:16,0:0|1:112197132_G_A:112197132:9,23,1,2
chr5	112197140	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=180,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:16,2:16,0:0|1:112197132_G_A:112197132:9,24,1,1
chr5	112200098	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr5	112200457	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=136,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:11,2:0|1:112200457_G_A:112200457:6,16,1,1
chr5	112200463	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=140,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:0|1:112200457_G_A:112200457:5,17,1,1
chr5	112200465	.	AT	CA	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=140,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:0|1:112200457_G_A:112200457:5,17,1,1
chr5	112200473	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=137,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,0:11,2:0|1:112200473_C_T:112200473:4,17,1,1
chr5	112200477	.	T	TATC	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:10,1:0|1:112200473_C_T:112200473:3,17,1,1
chr5	112203162	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=142,199;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,9:0.210:44:21,0:14,8:13,22,0,9
chr5	112238300	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,241;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr5	112257908	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:8,2:8,1:5,13,0,3
chr5	112312528	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=185,222;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,2:8,0:10,1,2,0
chr5	112312736	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,0:13,2:8,18,1,1
chr5	112328481	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,0:6,8:5,8,0,8
chr5	112343544	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr5	112346416	.	ATG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=170,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr5	112346431	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr5	112349070	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=74,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.872:21:2,9:0,9:1,1,9,10
chr5	112385004	.	CA	GC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=238,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.843:17:1,5:1,10:0,2,2,13
chr5	112385035	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=238,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:1,5:1,3:0,2,0,9
chr5	112389747	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=223,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr5	112399934	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr5	112406718	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr5	112437714	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=153,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,1:1,1:0,5,0,2
chr5	112440132	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=261,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr5	112440142	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=181,261;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	112487137	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,9:0,14:0,0,5,18
chr5	112676191	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=232,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:2,0,9,0
chr5	112720648	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=127,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.671:16:3,1:2,10:4,1,10,1
chr5	112824039	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=152,223;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr5	112824048	.	T	TGCC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=201,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GCC;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:1,4,0,2
chr5	112824166	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,302;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	112849801	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,36;MFRL=199,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:7,0:1,2:0,8,0,2
chr5	112849823	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=178,243;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:6,1:1,3:0,7,0,4
chr5	112851088	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=293,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,3:0,8:1,1,1,10
chr5	112851121	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr5	112860910	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=173,236;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:9,0:4,3:1,12,0,3
chr5	112868693	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.263:36:13,5:14,4:14,13,5,4
chr5	112876584	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	112876889	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,303;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr5	112884197	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr5	112884594	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=156,274;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,1:5,2:10,2,2,1
chr5	112888854	.	CTTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=196,151;MMQ=40,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=20,15;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0|1:112888854_CTTTTT_C:112888854:1,0,1,0
chr5	112888871	.	T	TAA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,25;MFRL=151,196;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.499:2:1,0:0,1:1|0:112888854_CTTTTT_C:112888854:1,0,1,0
chr5	112888872	.	TTTCAG	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,16;MFRL=188,196;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:0,0:1|0:112888854_CTTTTT_C:112888854:2,0,1,0
chr5	112888875	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,10;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:112888854_CTTTTT_C:112888854:0,0,1,0
chr5	112888880	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,16;MFRL=188,196;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:0,0:1|0:112888854_CTTTTT_C:112888854:2,0,1,0
chr5	112888883	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=21,15;MFRL=156,196;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,0:0,0:1|0:112888854_CTTTTT_C:112888854:3,0,1,0
chr5	112888900	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=32,17;MFRL=133,174;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,0:0|1:112888854_CTTTTT_C:112888854:5,5,2,0
chr5	112889566	.	ATCT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=184,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:4,1:6,8,2,0
chr5	112889821	.	CCTCTA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr5	112898969	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=231,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr5	112901494	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:112901494_G_C:112901494:0,0,5,0
chr5	112901496	.	CG	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=214,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:112901494_G_C:112901494:4,0,1,0
chr5	112926755	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.359:17:8,1:3,4:7,4,3,3
chr5	112926982	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,3:1,4:0,2,0,7
chr5	112927686	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,4:3,2:7,2,3,3
chr5	112927888	.	AT	A,ATTT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,28,22;MFRL=166,207,153;MMQ=60,60,60;MPOS=23,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,13;RU=T;STR;TLOD=3.89,13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,5:0.242,0.430:10:1,0,0:2,2,2:1,2,1,6
chr5	112927900	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=180,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.426:12:2,2:5,3:1,6,1,4
chr5	113699791	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=201,163;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:0,8,0,3
chr5	114462589	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr5	114462630	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=159,213;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,2:1,2:0,7,0,4
chr5	114611356	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	114860363	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=176,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:10,2:8,2:7,11,2,2
chr5	114860951	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=162,138;MMQ=60,47;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,3:6,0:12,5,3,0
chr5	115167564	.	CA	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.439:18:5,5:5,3:2,8,2,6
chr5	115167595	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=120,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,1:8,2:0,16,0,3
chr5	115168259	.	AATTT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=226,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.342:10:5,1:2,2:7,0,3,0
chr5	115177668	.	G	GAGATTACGAGGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=218,0;MMQ=60,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.408:15:5,5:4,1:7,2,6,0
chr5	115177721	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=173,149;MMQ=52,56;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:9,3:7,1:9,8,3,1
chr5	115249078	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=162,158;MMQ=60,27;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:9,2:10,4:5,14,6,0
chr5	115249271	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,207;MMQ=27,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:1,2:2,5:1,2,1,7
chr5	115323691	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=152,161;MMQ=23,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:0,6:8,4:0,8,1,9
chr5	115338704	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,105;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,6:4,1:0,6,0,7
chr5	115339086	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:3,2,1,2
chr5	115341638	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=121,193;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,6:5,2:5,6,3,5
chr5	115341657	.	T	TTTGCCTTC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=165,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:0|1:115341657_T_TTTGCCTTC:115341657:4,11,1,1
chr5	115341660	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=157,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:0|1:115341657_T_TTTGCCTTC:115341657:3,11,1,1
chr5	115351150	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,352;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	115351224	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=222,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,3,0
chr5	115351498	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr5	115358151	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:14,2:16,0:16,14,2,0
chr5	115426746	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=126,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:11,5:7,8:12,6,11,2
chr5	115426932	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=199,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:9,1:7,3:0,17,0,4
chr5	115428439	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=172,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr5	115469773	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:4,1,5,0
chr5	115628120	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=163,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.495:6:2,1:0,2:2,1,3,0
chr5	115811321	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=131,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:2,4,1,2
chr5	115822384	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0|1:115822384_C_A:115822384:3,2,2,0
chr5	115822392	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:4,2:6,0:0|1:115822384_C_A:115822384:8,2,1,1
chr5	115827356	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=278,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,4:2,4:6,0,8,0
chr5	115827407	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=252,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.818:14:1,3:1,9:2,0,8,4
chr5	115831092	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=240,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:4,4:2,1:6,1,3,2
chr5	115831305	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	115832056	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:6,3:8,2:2,12,1,4
chr5	115838117	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:0,3,0,5
chr5	115840528	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,237;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:6,4:9,1:12,3,3,2
chr5	118176842	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=188,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr5	118280395	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr5	118437730	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=126,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:2,7,0,2
chr5	118445891	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=125,127;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.205:37:20,7:10,0:16,14,7,0
chr5	118465215	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	118468730	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=212,386;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr5	118484467	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:11,7:4,0:6,9,5,2
chr5	118500981	.	TAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=110,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:2,2:2,2,0,3
chr5	118513246	.	C	CTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=185,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,1:3,2:0,9,0,3
chr5	118513876	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=125,301;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,2:13,1:11,10,1,2
chr5	118529605	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=165,64;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,2:10,0:10,12,2,0
chr5	118532034	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,3:2,5:2,2,7,1
chr5	118532247	.	A	ACACTCTCTTTGAGACTTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=189,222;MMQ=60,33;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:118532247_A_ACACTCTCTTTGAGACTTCT:118532247:0,4,0,1
chr5	118532249	.	A	AATTAAAGTCAAGTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=189,222;MMQ=60,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:118532247_A_ACACTCTCTTTGAGACTTCT:118532247:0,4,0,1
chr5	118556350	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr5	118691693	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=208,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:6,7:3,3:10,0,10,0
chr5	118691737	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=149,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.368:22:7,4:7,3:10,4,5,3
chr5	118691888	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=160,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.379:16:7,4:3,1:3,7,2,4
chr5	118691929	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,10:0,2:0,0,1,11
chr5	118728953	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:11,1:7,8:4,14,0,9
chr5	118788196	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:8,2,3,1
chr5	118809533	.	CCA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:0,4:4,1:4,0,5,0
chr5	118811313	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:8,0,6,0
chr5	118813240	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=156,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.404:23:9,3:4,6:7,7,1,8
chr5	118832433	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=155,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr5	118837658	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=146,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:6,0,2,3
chr5	118837833	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,1,4
chr5	118862971	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:8,3:9,5:3,14,1,7
chr5	118867173	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=176,333;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:1,5,0,3
chr5	118872085	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=130,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,2:16,0:18,7,2,0
chr5	118877558	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.156:24:6,0:9,3:0|1:118877558_C_T:118877558:13,8,3,0
chr5	118877575	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=51,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:19,3:0.166:22:6,0:11,3:1|0:118877558_C_T:118877558:9,10,2,1
chr5	120021819	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,8:0,15:0,0,14,10
chr5	120022398	.	CGT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=297,340;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr5	121330223	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,14,3
chr5	121362852	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,0:5,3:1,7,0,3
chr5	121413090	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=174,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:7,8,1,1
chr5	121488487	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=109,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:9,9,1,1
chr5	121488635	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=242,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:2,4,0,2
chr5	121726714	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=227,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr5	121761021	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=192,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:12,0:1,2:8,5,1,1
chr5	121767643	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:7,3:7,1:10,5,2,2
chr5	122111005	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,3:6,1:0,11,0,4
chr5	122135323	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:8,0,2,0
chr5	122137708	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=197,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,3:5,5:5,5,3,5
chr5	122163401	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=234,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,2,1
chr5	122272489	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=175,28;MMQ=60,57;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,2:8,0:11,6,1,1
chr5	122281709	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.422:14:4,3:4,2:7,1,6,0
chr5	122343354	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=174,95;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.260:10:3,1:1,0:8,0,2,0
chr5	122359502	.	AAC	A,AACACACACACACACAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29,30;MFRL=0,174,151;MMQ=60,60,60;MPOS=6,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,22;RU=AC;STR;TLOD=5.53,6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.375,0.517:6:0,0,0:0,2,2:0,0,6,0
chr5	122372402	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=227,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr5	122682154	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr5	122685801	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr5	122713989	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr5	122714134	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=192,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.366:6:2,1:0,1:1,3,0,2
chr5	122720923	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr5	122726783	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,2:5,1:12,3,2,1
chr5	122728913	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=252,75;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr5	122754309	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:122754309_G_A:122754309:0,3,0,2
chr5	122754310	.	AGATGGAGTC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:122754309_G_A:122754309:0,3,0,2
chr5	122888781	.	AT	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:18,2:9,1:13,14,2,1
chr5	122940383	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=152,227;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:8,0,2,0
chr5	122940544	.	GTT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,0:11,2:6,12,1,1
chr5	123973701	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=182,219;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:0,5,0,4
chr5	123983915	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,203;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,4:6,7:6,5,6,5
chr5	123985306	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=162,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.154:37:19,5:13,0:24,8,5,0
chr5	123985320	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=180,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:9,7:10,3:15,4,6,4
chr5	123985443	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=186,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.406:25:9,3:6,7:2,13,2,8
chr5	123985464	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,1:4,4:0,10,1,4
chr5	123985484	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr5	125759418	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=195,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:0|1:125759418_G_A:125759418:5,16,1,1
chr5	125759423	.	A	ATCACTT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=195,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:12,2:0|1:125759418_G_A:125759418:5,15,1,1
chr5	125759425	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=197,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:0|1:125759418_G_A:125759418:4,14,1,1
chr5	125759427	.	C	CCCACG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=199,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:11,2:0|1:125759418_G_A:125759418:4,13,1,1
chr5	125802027	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,176;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:4,7:1,6:3,2,8,5
chr5	125809145	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=167,246;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr5	125887685	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:2,2,6,0
chr5	125929067	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=89,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,0:12,3:6,17,1,2
chr5	125939522	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=147,106;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:13,3:5,0:0|1:125939522_T_G:125939522:14,6,3,0
chr5	125939526	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=147,106;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:14,3:6,0:0|1:125939522_T_G:125939522:14,6,3,0
chr5	125944219	.	G	GTGTTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TGTTTT;STR;TLOD=39.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr5	125952994	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=112,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,7:6,2:5,6,5,4
chr5	126145771	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr5	126156531	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr5	126168319	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr5	126206303	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:7,5:9,5:11,5,5,5
chr5	126250723	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=205,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:6,3:14,0:9,11,1,2
chr5	126869270	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=191,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:6,4:1,1:6,1,5,1
chr5	126994381	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	127420135	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:7,0,5,0
chr5	127485599	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr5	127613791	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	127622983	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=223,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:0,6:1,6:0,1,9,3
chr5	127624312	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=240,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:127624312_A_T:127624312:0,1,0,1
chr5	127624315	.	A	AGGCTGCCATACCTCCATAGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=240,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:127624312_A_T:127624312:0,1,0,1
chr5	127624819	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=182,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:9,6,2,0
chr5	127626456	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=177,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,0:8,2:7,6,2,0
chr5	127640783	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,7,11
chr5	127640861	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	127670603	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=139,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,3:4,0:0,6,1,2
chr5	127671657	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=193,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:6,1,2,0
chr5	127680042	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:6,0:1,5:4,3,1,4
chr5	127685624	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,2:5,3:11,0,3,2
chr5	127729053	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,1:6,1:2,9,1,1
chr5	128301736	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=216,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr5	128301742	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=153,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:2,0,7,0
chr5	128301824	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,3:1,4:1,2,2,5
chr5	128301957	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=122,307;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,1:7,3:7,8,1,3
chr5	128301971	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=130,144;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:2,7:6,6:3,5,6,7
chr5	128321068	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=110,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:2,5,0,3
chr5	128326090	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:6,1:9,3:9,6,0,4
chr5	128326177	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=145,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:6,1:5,1:2,9,2,0
chr5	128351492	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=117,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr5	128359247	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	128359297	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr5	128362830	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:3,1:10,1:9,5,0,2
chr5	128365489	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=97,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	128440571	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=206,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr5	128440864	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=209,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:7,4:8,0:10,5,4,0
chr5	128797410	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=178,209;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	128863471	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,15,13
chr5	129015452	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=256,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,2:5,4:4,5,4,2
chr5	129015668	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr5	129040056	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=165,135;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:4,1:10,3:4,10,4,0
chr5	129072943	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,11:0,0,3,11
chr5	129240972	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,306;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	129244065	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:9,0:12,9:8,13,0,9
chr5	129244122	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=189,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,2:5,1:1,9,0,3
chr5	129244133	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr5	129519874	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	130522697	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=134,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,2:5,1:9,4,2,1
chr5	130535204	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:3,1:7,2:9,1,3,0
chr5	130766613	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,148;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,0:7,2:15,3,0,2
chr5	130769379	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=36,30;MFRL=189,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:130769379_C_T:130769379:0,3,0,2
chr5	130769381	.	A	AGGTGG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=203,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:3,0:0|1:130769379_C_T:130769379:0,4,0,2
chr5	130769385	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=204,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:130769379_C_T:130769379:0,5,0,2
chr5	130769387	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=204,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0|1:130769379_C_T:130769379:0,5,0,2
chr5	130769424	.	GA	G,GAA	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,26,18;MFRL=266,225,217;MMQ=60,60,60;MPOS=27,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=9.95,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,1:0.555,0.222:6:1,1,0:0,2,0:0,1,0,5
chr5	130808198	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	130831365	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=92.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,11,14
chr5	130843872	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=149,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.141:40:13,5:22,0:13,22,3,2
chr5	130857217	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:9,2:4,1:4,9,0,3
chr5	130982768	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,4:0,9:0,0,8,5
chr5	131006082	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,4:0,7:1,0,11,0
chr5	131006356	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,17:0,0,7,21
chr5	131006381	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=199,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.449:7:2,1:2,1:0,4,0,3
chr5	131039995	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,2:8,1:0,20,0,3
chr5	131066577	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=278,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,9:0,5:1,0,10,4
chr5	131290007	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=210,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:7,6,2,0
chr5	131309048	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:10,0:7,4:6,11,0,4
chr5	131312238	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=184,212;MMQ=60,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.716:22:3,1:2,12:5,1,16,0
chr5	131322666	.	CCACACACTCACA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=206,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.432:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr5	131323807	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:4,8,0,2
chr5	131324250	.	C	CTG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TG;STR;TLOD=54.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,6,8
chr5	131325888	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr5	131326522	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,25;MFRL=234,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,2:0,2:1,0,0,5
chr5	131347520	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:3,1,5,0
chr5	131409903	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=187,61617081;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr5	131534499	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=227,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:3,1,4,0
chr5	131544830	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=125,125;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.267:28:5,7:15,0:16,5,7,0
chr5	131546280	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,5:2,3:0,3,0,8
chr5	131553428	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,25;MFRL=64,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,5:1,4:1,3,8,1
chr5	131602166	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=107,139;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:1,7:7,4:4,4,4,7
chr5	131607402	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.447:14:1,5:5,1:6,2,4,2
chr5	131630852	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,3:4,8:6,2,5,6
chr5	131657903	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:7,3:13,0:13,7,2,1
chr5	131658085	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr5	131660119	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=209,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr5	131670624	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,17041470;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:2,6,0,2
chr5	131671460	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,251;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:4,2:7,0,3,0
chr5	131671769	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=188,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,0:0,2:0,1,1,2
chr5	131719999	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0,0,5,20
chr5	131720070	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=180,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr5	131721174	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=155,209;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:8,3:5,4:1,12,4,3
chr5	131721204	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:0,6,0,5
chr5	131730052	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=29.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,1:0,8:0,0,0,9
chr5	131755477	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	131792639	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=196,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:2,7:1,1:3,0,8,0
chr5	131796163	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=242,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr5	131796573	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr5	131796609	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,312;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	131819970	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=195,254;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:3,0:12,2:0|1:131819970_T_C:131819970:15,0,0,2
chr5	131819977	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=178,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:0|1:131819970_T_C:131819970:9,0,1,2
chr5	131820275	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=152,294;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr5	131822055	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=182,180;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:1,6,0,2
chr5	131822072	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=189,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:2,7,1,1
chr5	131822133	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=187,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.403:10:2,0:4,3:3,3,2,2
chr5	131822224	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=141,250;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:2,4:8,0:7,3,3,1
chr5	131822575	.	T	TG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=172,226;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:10,0:13,3:10,13,0,3
chr5	131823519	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=208,250;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	131878882	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=141,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,2:9,2:3,13,1,3
chr5	131892979	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,11,9
chr5	131915213	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=175,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:3,4,0,3
chr5	131923557	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:4,1,1,1
chr5	131931451	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=145,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.206:13:8,1:1,1:0,11,0,2
chr5	131972781	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=130,101;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:9,13:13,0:14,8,13,0
chr5	131995843	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=143,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr5	132009710	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:8,3,2,0
chr5	132036252	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=135,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:5,6:0,2:3,2,5,3
chr5	132036489	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:0,3,0,5
chr5	132038199	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:5,0,4,1
chr5	132039132	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,3:1,5:1,0,7,1
chr5	132046789	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,4:0,4:0,2,0,8
chr5	132070242	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	132149322	.	G	GGCCGCC,GGCCGCCGCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33,33;MFRL=0,374,244;MMQ=60,60,60;MPOS=16,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=5,7,8;RU=GCC;STR;TLOD=3.78,3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.422,0.417:2:0,0,0:0,1,1:0,0,2,0
chr5	132149684	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	132150019	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:132150019_G_T:132150019:0,0,0,1
chr5	132150024	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:132150019_G_T:132150019:0,0,0,1
chr5	132159520	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=194,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:3,3,3,0
chr5	132198287	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	132219135	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.314:20:10,3:4,3:5,9,3,3
chr5	132219304	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	132232793	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=128,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.226:29:11,6:11,0:0|1:132232793_C_T:132232793:11,12,6,0
chr5	132232803	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=128,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.226:29:11,6:12,0:0|1:132232793_C_T:132232793:11,12,6,0
chr5	132234152	.	C	CG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr5	132234182	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,33;MFRL=108,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr5	132234702	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,6:1,8:1,0,13,1
chr5	132239939	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=14,31;MFRL=321,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.635:8:1,3:0,1:3,0,5,0
chr5	132240151	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.927:9:0,3:0,5:0,0,0,9
chr5	132267850	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=240,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,14:0.714:19:2,5:3,7:0|1:132267850_A_AT:132267850:3,2,8,6
chr5	132267859	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=240,106;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,16:0.737:21:2,8:3,8:0|1:132267850_A_AT:132267850:3,2,9,7
chr5	132334252	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=279,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr5	132334474	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=114,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,1:7,4:4,6,3,2
chr5	132387979	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:6,2,3,1
chr5	132388068	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=178,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.554:16:2,4:5,5:2,5,5,4
chr5	132403341	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=209,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr5	132408905	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32,32;MFRL=189,224,213;MMQ=60,60,60;MPOS=21,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,14;RU=T;STR;TLOD=4.40,3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,2:0.325,0.283:8:1,1,0:2,2,1:3,0,5,0
chr5	132409650	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=183,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,4:3,1:6,0,5,0
chr5	132409867	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=184,258;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,1,1
chr5	132422448	.	TTTTTG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=197,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTG;STR;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:6,0,4,0
chr5	132425415	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,10;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.727:10:1,0:1,0:2,0,0,8
chr5	132428499	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=101,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.410:18:5,2:2,4:9,2,7,0
chr5	132433049	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:0,5,1,3
chr5	132437603	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=139,217;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.305:24:7,2:5,0:6,11,0,7
chr5	132437608	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=148,209;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.236:23:5,0:4,0:6,12,0,5
chr5	132439510	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=214,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.211:31:11,6:14,0:23,2,6,0
chr5	132546059	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=287,236;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr5	132556523	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=175,257;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:6,3:13,1:11,8,1,3
chr5	132559950	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=200,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.678:16:2,7:2,4:1,4,4,7
chr5	132561277	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:7,1,3,0
chr5	132569032	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:0,3:6,0:6,0,3,0
chr5	132763335	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=171,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:6,5:8,1:8,7,0,6
chr5	133316325	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=210,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr5	133316568	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=129,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:15,0:14,4:17,12,4,0
chr5	133316707	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,21;MFRL=264,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.350:9:2,2:1,0:1,5,0,3
chr5	133327915	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,147;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:6,1:1,2:7,0,3,0
chr5	133328570	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=182,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:11,1:7,3:14,4,4,0
chr5	133451557	.	GC	TT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=163,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:8,2,2,0
chr5	133509736	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=128,262;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:0|1:133509736_A_G:133509736:0,8,0,2
chr5	133509752	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=144,262;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,1:6,1:0|1:133509736_A_G:133509736:0,6,0,2
chr5	133537438	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=258,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr5	133537479	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=223,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,5:2,1:2,0,6,0
chr5	133541548	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=277,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr5	133561589	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:1,4:2,3:1,2,0,7
chr5	133655067	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,2:3,3:5,1,4,1
chr5	133657610	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=207,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,4:6,3:2,5,1,6
chr5	133701964	.	C	CAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=169,338;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr5	133738717	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=370,274;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	133880124	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:4,0:2,6:4,2,4,2
chr5	133897829	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	133900111	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,11:0,2:0,0,10,3
chr5	133909475	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,7,9
chr5	133914448	.	AACC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,17;MFRL=160,273;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=ACC;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,0:7,0:8,5,2,0
chr5	133944043	.	ATT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=218,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.379:11:4,2:2,1:7,0,3,1
chr5	133945288	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:7,5:6,5:5,8,5,5
chr5	134010211	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	134015276	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=142,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:6,0,1,1
chr5	134033777	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr5	134074545	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0,17,0,2
chr5	134079558	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=181,132;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:134079558_A_AT:134079558:1,0,1,0
chr5	134079561	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=181,132;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:134079558_A_AT:134079558:1,0,1,0
chr5	134079564	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=181,132;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:134079558_A_AT:134079558:1,0,1,0
chr5	134099865	.	C	CTAGAATGTTTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	134102723	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=104,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:134102723_G_T:134102723:5,10,0,2
chr5	134102727	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=145,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:134102723_G_T:134102723:5,10,0,2
chr5	134106506	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=213,171;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr5	134106761	.	CTCTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=37,30;MFRL=169,92;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCTT;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr5	134190510	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=210,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr5	134190898	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:11,0:4,2:5,10,1,1
chr5	134192330	.	CAAAT	C,CAAATAAAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32,33;MFRL=0,154,229;MMQ=60,47,47;MPOS=27,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=AAAT;STR;TLOD=11.16,7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.575,0.330:6:0,2,1:0,2,1:0,0,6,0
chr5	134331921	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:4,0,1,1
chr5	134344497	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr5	134365070	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=209,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr5	134365091	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr5	134366873	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=246,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr5	134688832	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,0:2,7:0,4,0,7
chr5	134724622	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=198,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:11,4:14,0:13,12,4,0
chr5	134782414	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:4,5:8,3:7,5,7,1
chr5	134782450	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:2,5:5,7:2,5,7,5
chr5	135170658	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=139,304;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,1:5,1:4,7,0,2
chr5	135178220	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=162,218;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,0:2,9:0,4,0,9
chr5	135178231	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.686:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr5	135188214	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.524:17:2,4:6,5:4,4,6,3
chr5	135276201	.	AGTT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=46.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:6,5:1,7:5,3,6,6
chr5	135276384	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=162,256;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr5	135276701	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,8,11
chr5	135277394	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr5	135283222	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=220,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,4:3,6:0,3,0,10
chr5	135283270	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=244,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr5	135391326	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,2,1
chr5	135392507	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:4,5:10,0:6,8,2,3
chr5	135396452	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=240,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.707:15:3,5:1,6:0|1:135396452_A_G:135396452:3,1,8,3
chr5	135396468	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=250,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,13:0.738:17:1,4:3,9:0|1:135396452_A_G:135396452:3,1,7,6
chr5	135396669	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=190,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:1,9:0,4:0,1,7,6
chr5	135398279	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:13,2:9,1:18,4,2,1
chr5	135496820	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=140,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.271:16:4,2:7,2:1,11,1,3
chr5	135498944	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=121,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.409:8:3,2:1,1:4,1,3,0
chr5	135508381	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,4:3,2:3,4,3,3
chr5	135510033	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:5,8:9,1:11,3,8,1
chr5	135513085	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,11,7
chr5	135561133	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=218,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr5	135692608	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=204,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:10,2:4,1:4,10,0,3
chr5	136315200	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=222,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0,1,0,7
chr5	136328367	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=270,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,3:2,6:0,3,0,9
chr5	136476303	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,1:15,2:13,13,1,2
chr5	136969637	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=181,268;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:2,2:4,3:7,0,5,0
chr5	136975686	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=227,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:3,3:5,3:0|1:136975686_C_T:136975686:1,8,1,5
chr5	136975687	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=197,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,4:0.293:15:3,3:7,1:1|0:136975686_C_T:136975686:2,9,0,4
chr5	136993767	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:5,4,2,0
chr5	136997803	.	A	AAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=AG;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	137027953	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,12,6
chr5	137033906	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=188,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr5	137219163	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=209,284;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,16:0.315:52:12,16:22,0:22,14,16,0
chr5	137257288	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr5	137259251	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr5	137282031	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=174,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.261:14:4,0:4,2:1,10,0,3
chr5	137282045	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,0:0,8,1,3
chr5	137289941	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=184,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,0:7,3:7,9,0,3
chr5	137292133	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,5:2,2:2,0,6,1
chr5	137295823	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.633:28:4,6:6,12:3,7,10,8
chr5	137323117	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=185,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:0,3:3,4:3,0,6,1
chr5	137346646	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,23;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:137346646_TAA_T:137346646:0,0,1,0
chr5	137346669	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=125,0;MMQ=60,23;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:137346646_TAA_T:137346646:0,1,1,0
chr5	137347403	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=148,155;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:1,1:1,2:2,0,4,0
chr5	137354851	.	CA	C,CAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27,24;MFRL=122,143,120;MMQ=60,60,60;MPOS=12,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.82,4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.335,0.445:6:0,0,1:1,1,2:0,1,0,5
chr5	137419725	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=207,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:4,3:3,3:0|1:137419725_A_G:137419725:8,0,5,1
chr5	137419728	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=157,210;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,6:0.437:14:5,2:1,4:1|0:137419725_A_G:137419725:7,1,6,0
chr5	137420376	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	137423652	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=148,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137423652_A_AT:137423652:0,1,0,1
chr5	137423654	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,28;MFRL=148,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:137423652_A_AT:137423652:0,1,0,1
chr5	137426447	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=193,209;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,3:6,4:5,7,4,3
chr5	137476416	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,11,14
chr5	137481546	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=153,100;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:9,3,0,2
chr5	137481558	.	T	TCTC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=165,36;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0|1:137481558_T_TCTC:137481558:8,4,1,1
chr5	137481560	.	GA	CC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=165,36;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:0|1:137481558_T_TCTC:137481558:8,4,1,1
chr5	137485292	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,3:0,0,12,2
chr5	137486651	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=223,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,0:4,4:4,4,0,4
chr5	137486684	.	A	AAAAATTTCATGACCTAAGTGGAGTAGGAGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=142,139;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.446:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	137498740	.	A	AGGAAGAAAGAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.898:7:0,1:0,4:0,0,7,0
chr5	137499926	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=211,188;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,0:3,6:7,4,0,6
chr5	137499976	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=106,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,4:8,0:5,10,4,0
chr5	137501415	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=115,170;MMQ=40,40;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:137501415_CA_C:137501415:1,0,1,0
chr5	137501433	.	AGC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=15,30;MFRL=46590292,115;MMQ=50,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:0,0:0,1:1|0:137501415_CA_C:137501415:1,1,1,0
chr5	137501436	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=46590265,170;MMQ=50,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:137501415_CA_C:137501415:1,1,1,0
chr5	137501437	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,19;MFRL=46590292,115;MMQ=50,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.460:3:0,0:1,0:1|0:137501415_CA_C:137501415:1,1,1,0
chr5	137504227	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,66;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:11,5:7,0:7,11,4,1
chr5	137504839	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=164,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	137507104	.	TAAA	T,TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,28,26;MFRL=375,156,197;MMQ=60,60,60;MPOS=32,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.57,3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.300,0.352:6:0,1,1:1,1,1:0,2,1,3
chr5	137513369	.	G	GAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=A;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:0,1:0,1,2,1
chr5	137515331	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,5:5,0:10,2,5,0
chr5	137520901	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=252,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,0:6,4:0,10,0,4
chr5	137527917	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=228,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:5,0,4,1
chr5	137548809	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.322:17:3,3:6,2:6,6,4,1
chr5	137622388	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	137661434	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	137661764	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=85,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:0|1:137661764_C_A:137661764:6,13,1,1
chr5	137661767	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=85,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:9,0:0|1:137661764_C_A:137661764:6,13,1,1
chr5	137677579	.	TAC	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=108,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:15,0:8,4:8,17,2,2
chr5	137677592	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:9,0:7,2:0|1:137677592_C_A:137677592:4,12,0,2
chr5	137677594	.	A	ATGTGT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,0:6,2:0|1:137677592_C_A:137677592:4,12,0,2
chr5	137682312	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,188;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:3,0:9,3:11,1,3,0
chr5	137715332	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=112,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:6,0:6,3:8,6,3,0
chr5	137728774	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,251;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr5	137735754	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=177,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:0,4,0,7
chr5	137760036	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,256;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,0:8,2:6,10,0,2
chr5	137762570	.	GAAAAAA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,301;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:137762570_GAAAAAA_G:137762570:0,0,1,0
chr5	137762580	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,301;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:137762570_GAAAAAA_G:137762570:0,0,1,0
chr5	137763615	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=133,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:6,2,3,0
chr5	137765537	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,2:3,1:5,4,3,0
chr5	137780368	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=218,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,0,3
chr5	137801683	.	ACAG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=193,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CAG;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,1:6,1:5,5,0,2
chr5	137802404	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:2,7:5,6:5,2,10,3
chr5	137844274	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=185,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr5	137846155	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr5	137847078	.	TACACACACAC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=183,244;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,1;RU=AC;STR;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:0,2:1,0,6,0
chr5	137849422	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=199,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0,15,0,2
chr5	137897174	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:6,2:2,1:8,1,3,0
chr5	137902297	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,58;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:8,4,2,0
chr5	137902868	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,245;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:1,1:2,1:1,4,0,2
chr5	137903084	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=151,259;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:7,2,2,0
chr5	137909358	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,15;MFRL=232,141;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:137909358_G_A:137909358:1,0,1,0
chr5	137909360	.	GC	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=232,141;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:137909358_G_A:137909358:1,0,1,0
chr5	137909365	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=232,141;MMQ=60,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137909358_G_A:137909358:1,0,1,0
chr5	137909368	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,15;MFRL=88,141;MMQ=60,47;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:137909358_G_A:137909358:3,0,1,0
chr5	137909372	.	CTC	AAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,10;MFRL=88,141;MMQ=60,47;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:137909358_G_A:137909358:3,0,1,0
chr5	137909674	.	GAGA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=152,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,1:8,3:13,4,1,3
chr5	138160489	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=183,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,0:12,2:6,13,1,1
chr5	138208848	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=139,41989677;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:7,2:9,13,0,2
chr5	138264958	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:3,4,0,3
chr5	138463538	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=177,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:10,2:10,9:10,10,3,8
chr5	138643062	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=188,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.748:19:2,5:3,9:5,0,14,0
chr5	138714474	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr5	138715628	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=203,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:6,0:9,2:8,7,0,2
chr5	138718825	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=245,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:2,0:0,1:2,0,2,0
chr5	138718878	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	138724126	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr5	138727778	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:8,5,1,1
chr5	138728672	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=157,27767998;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:7,6,1,1
chr5	138739582	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.207:18:4,0:6,1:6,8,4,0
chr5	138739611	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=154,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.243:37:12,7:15,0:16,12,9,0
chr5	138749834	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,1:8,2:12,7,3,0
chr5	138775173	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:2,10:0,5:0,2,1,14
chr5	138857919	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=193,171;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:1,5:5,2:2,5,5,2
chr5	139189473	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	139193023	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=188,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.347:27:8,9:9,0:13,5,9,0
chr5	139202400	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=148,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:3,0:5,3:2,7,0,3
chr5	139213452	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr5	139215386	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=203,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,1:10,2:8,7,2,1
chr5	139216901	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr5	139217332	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,133;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,3:7,0:8,6,3,0
chr5	139227951	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	139239515	.	C	CG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=115,138;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.553:18:3,8:5,2:7,1,6,4
chr5	139245086	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:6,3:3,6:2,7,3,7
chr5	139251469	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,3:3,1:2,8,2,2
chr5	139260428	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=156,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.279:15:5,2:6,1:7,4,2,2
chr5	139422232	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=197,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:4,5,0,2
chr5	139494787	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=175,253;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.308:37:10,11:15,0:11,15,11,0
chr5	139494846	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=24,27,27,26;MFRL=110,108,82,153;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,19,10;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=12.04,13.01,5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:20,7,10,8:0.151,0.209,0.188:45:10,5,6,6:9,2,4,1:10,10,15,10
chr5	139494950	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=124,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.079:61:29,0:28,4:15,42,0,4
chr5	139497988	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,245;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.130:44:15,5:24,0:18,21,5,0
chr5	139503941	.	TG	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=172,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,1:11,1:16,9,0,3
chr5	139508062	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=189,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,2:11,0:9,7,2,0
chr5	139574050	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=112,216;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,1:9,2:7,10,2,1
chr5	139680085	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,0:7,2:10,9,1,1
chr5	139742130	.	GGT	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=115,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GT;STR;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:5,7:9,6:7,8,7,6
chr5	139744067	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=189,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,0:16,2:9,17,0,2
chr5	139817996	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=114,266;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:7,1,2,0
chr5	139893108	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,13;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.691:4:0,0:0,1:0,1,0,3
chr5	139907552	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=151,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.194:34:10,6:17,0:14,14,6,0
chr5	139907750	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=201,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,1:0,1:3,0,2,1
chr5	139936980	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=210,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.785:15:0,6:2,6:2,1,7,5
chr5	139940036	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:19,0:17,4:17,19,0,4
chr5	139940887	.	GC	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:2,1:5,1:5,2,2,0
chr5	139941318	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.632:36:7,12:6,11:3,10,10,13
chr5	140021858	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.676:19:3,9:2,4:4,2,8,5
chr5	140022436	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:4,2:2,4:4,2,5,2
chr5	140023238	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=98,125;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.691:27:3,10:5,9:4,4,6,13
chr5	140024491	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=174,261;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,1:3,5:4,0,4,2
chr5	140027216	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=184,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,3:2,8:0,3,2,9
chr5	140027629	.	GTA	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=82,160;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.522:4:1,0:1,2:0|1:140027629_GTA_G:140027629:1,1,0,2
chr5	140027637	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=164,136;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:140027629_GTA_G:140027629:0,1,0,1
chr5	140027641	.	GT	AC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=274,136;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:140027629_GTA_G:140027629:0,2,0,1
chr5	140027648	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=274,136;MMQ=60,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:140027629_GTA_G:140027629:0,2,0,1
chr5	140037272	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=204,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.663:13:3,4:1,4:2,2,1,8
chr5	140038484	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:9,0:12,4:10,11,0,4
chr5	140039315	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=131,120;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.307:37:7,11:19,0:18,8,11,0
chr5	140039864	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=265,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,0:5,3:0,9,0,5
chr5	140039877	.	CTTTTTTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,19;MFRL=292,265;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=22,14;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,0:2,0:0,3,0,1
chr5	140050940	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=140,150;MMQ=50,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.234:32:13,2:12,5:14,11,7,0
chr5	140051983	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,2:4,3:8,1,4,1
chr5	140052271	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=212,224;MMQ=60,38;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr5	140054257	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:4,7:5,10:7,2,8,9
chr5	140054485	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,4:2,4:3,4,4,4
chr5	140073870	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.408:32:9,0:10,12:9,10,0,13
chr5	140075011	.	C	CAGTTGATAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr5	140077699	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,3,13
chr5	140081791	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=184,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,2:0,5:0,2,1,6
chr5	140180737	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,0:3,3:3,1,3,0
chr5	140181306	.	CTGAA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=191,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,4:4,1:5,2,2,3
chr5	140201264	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=213,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:9,0,3,0
chr5	140207710	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=169,30944;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:11,0:8,4:0|1:140207710_C_T:140207710:10,10,4,0
chr5	140207723	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=165,30944;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:11,0:6,4:0|1:140207710_C_T:140207710:9,10,4,0
chr5	140208161	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=188,110;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:9,0:16,3:12,13,0,3
chr5	140221046	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=183,177;MMQ=40,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:7,9,0,2
chr5	140228410	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=174,185;MMQ=50,35;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.411:15:8,3:1,2:0|1:140228410_A_G:140228410:4,5,0,6
chr5	140228413	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=174,185;MMQ=50,35;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:8,3:1,2:0|1:140228410_A_G:140228410:4,5,0,6
chr5	140229086	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=125,197;MMQ=52,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.827:15:0,7:2,6:1,1,9,4
chr5	140230370	.	AA	CC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.936:29:1,14:0,14:1,0,14,14
chr5	140232218	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=189,191;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:11,0:14,4:16,9,0,4
chr5	140232558	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=196,177;MMQ=52,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:140232558_T_G:140232558:0,4,0,1
chr5	140232562	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=181,177;MMQ=44,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:140232558_T_G:140232558:0,3,0,1
chr5	140232564	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=181,177;MMQ=44,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:140232558_T_G:140232558:0,3,0,1
chr5	140232567	.	CA	GG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=181,177;MMQ=44,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:140232558_T_G:140232558:0,3,0,1
chr5	140232692	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=233,172;MMQ=51,47;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr5	140237158	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,201;MMQ=48,49;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:6,2:11,2:5,12,0,4
chr5	140307518	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=205,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:6,0:10,5:6,10,0,5
chr5	140516042	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=192,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:6,5,1,1
chr5	140531097	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=159,112;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,2:12,0:10,9,1,1
chr5	140532284	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:11,0:12,6:12,12,0,6
chr5	140532409	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=258,145;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,6:2,4:3,4,4,6
chr5	140554713	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=167,1160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,8:0.158:55:16,8:31,0:24,23,0,8
chr5	140557658	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,186;MMQ=39,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:7,2:5,0:0,12,0,2
chr5	140559914	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=144,190;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,2:4,5:4,4,2,5
chr5	140564982	.	CTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=36,36;MFRL=242,0;MMQ=60,42;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.404:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr5	140565046	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=181,256;MMQ=57,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr5	140565083	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	140568034	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=65.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,9,9
chr5	140573844	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=227,209;MMQ=28,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,4:5,3:1,7,0,7
chr5	140573922	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=273,240;MMQ=20,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:1,0,0,3
chr5	140574209	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=212,307;MMQ=40,46;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:3,2,1,1
chr5	140580660	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,0:6,2:10,8,1,1
chr5	140581090	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=220,252;MMQ=24,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:140581090_G_C:140581090:0,4,0,1
chr5	140581094	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=235,252;MMQ=23,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:140581090_G_C:140581090:0,2,0,1
chr5	140581102	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=239,252;MMQ=25,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:140581090_G_C:140581090:0,2,0,1
chr5	140591702	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=218,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,6:2,4:3,3,2,8
chr5	140598554	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=217,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:3,4,3,1
chr5	140627276	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=209,195;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:7,1,3,0
chr5	140683619	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=317,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140683619_GC_G:140683619:0,1,0,1
chr5	140683622	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=317,252;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140683619_GC_G:140683619:0,1,0,1
chr5	140699840	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=227,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,4:7,5:6,6,5,4
chr5	140712299	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=185,177;MMQ=40,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:8,2:7,2:6,11,1,3
chr5	140732313	.	TAACCAGGC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=192,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:2,0:0,8,0,2
chr5	140740558	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,271;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:11,1:2,1:3,10,1,1
chr5	140744566	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=178,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:8,1:10,1,2,0
chr5	140755537	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:8,8,1,1
chr5	140767491	.	CTGCCAG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=147,153;MMQ=27,34;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	140783087	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=184,190;MMQ=52,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.289:29:9,0:12,8:13,8,0,8
chr5	140785038	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=19,35;MFRL=198,186;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:140785038_A_G:140785038:0,2,0,1
chr5	140785049	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=198,186;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:140785038_A_G:140785038:0,1,0,1
chr5	140785062	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:140785038_A_G:140785038:0,0,0,1
chr5	140794792	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=205,131;MMQ=52,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:3,3:8,5:4,8,4,4
chr5	140803325	.	G	GCCAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=16,31;MFRL=121,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:140803325_G_GCCAAAAT:140803325:1,0,0,1
chr5	140803326	.	G	GACCGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=121,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140803325_G_GCCAAAAT:140803325:1,0,0,1
chr5	140812775	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:1,1:3,1:2,5,0,2
chr5	140866847	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=153,185;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:0|1:140866847_G_C:140866847:6,10,0,3
chr5	140866853	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=153,185;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:7,0:8,3:0|1:140866847_G_C:140866847:6,10,0,3
chr5	140870949	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=202,206;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,1:3,5:2,3,3,3
chr5	140870968	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=202,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:4,5,1,1
chr5	140898522	.	TCTC	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=149,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTC;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:21,1:15,1:17,21,2,0
chr5	140907266	.	TAAAAA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=15,10;MFRL=151,190;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=23,18;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.352:6:0,0:0,0:0,4,0,2
chr5	140955777	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.480:29:6,7:9,6:11,4,10,4
chr5	141016276	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=82.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,9:0,12:0|1:141016276_T_C:141016276:0,0,12,10
chr5	141016288	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=200,200;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:5,2:9,5:0|1:141016276_T_C:141016276:5,9,5,2
chr5	141023723	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=204,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,1:2,1:0|1:141023723_T_C:141023723:7,1,2,0
chr5	141023733	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=198,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:7,2:2,1:0|1:141023723_T_C:141023723:7,2,2,1
chr5	141023997	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=185,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,2:5,1:2,9,1,2
chr5	141024136	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=195,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:3,6:2,3:3,3,6,3
chr5	141025581	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=234,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:2,2:6,2:8,1,4,0
chr5	141026094	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=214,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,4,1
chr5	141026884	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=241,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,4:7,1:6,6,3,2
chr5	141027462	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=206,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr5	141035374	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:7,1:4,3:5,6,3,1
chr5	141035746	.	G	GGATTCTA	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.066:43:21,2:18,0:0|1:141035746_G_GGATTCTA:141035746:19,22,1,1
chr5	141035750	.	A	ATGTATGCTTTTG	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=137,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:22,2:19,0:0|1:141035746_G_GGATTCTA:141035746:21,22,1,1
chr5	141041435	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=280,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,4:1,5:0,3,2,7
chr5	141044472	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=89,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.330:28:7,3:10,5:7,12,2,7
chr5	141049407	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=200,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:4,8:2,6:1,5,7,7
chr5	141052426	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=104,427;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:141052426_G_T:141052426:2,0,1,0
chr5	141052428	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=104,427;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.404:3:1,1:0,0:0|1:141052426_G_T:141052426:2,0,1,0
chr5	141052430	.	G	GACCTGGAACTTGTTGTCCTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,36;MFRL=95,427;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141052426_G_T:141052426:1,0,1,0
chr5	141052870	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr5	141053166	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=189,258;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:0,0:6,0:0|1:141053166_A_C:141053166:4,4,2,0
chr5	141053170	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=189,258;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:2,0:4,1:0|1:141053166_A_C:141053166:4,4,2,0
chr5	141234058	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:141234058_G_T:141234058:0,0,0,1
chr5	141234062	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:141234058_G_T:141234058:0,0,0,1
chr5	141234070	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:141234058_G_T:141234058:0,0,0,1
chr5	141234077	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,19;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:141234058_G_T:141234058:0,0,0,1
chr5	141303633	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,26;MFRL=199,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:1,4:0,0:0,2,0,4
chr5	141304318	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=169,204;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:141304318_T_TA:141304318:0,4,0,1
chr5	141304329	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=169,204;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:141304318_T_TA:141304318:0,4,0,1
chr5	141316946	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=190,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0,7,0,2
chr5	141334921	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,268;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,1:7,1:4,10,0,2
chr5	141335241	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:2,8:2,5:1,3,6,7
chr5	141353069	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=163,247;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:10,1,2,0
chr5	141364511	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=164,128;MMQ=39,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.333:34:5,2:18,9:2,21,5,6
chr5	141364532	.	C	CT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=168,164;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:5,0:10,14:3,12,0,14
chr5	141367202	.	GA	TT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr5	141382584	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:2,0,6,0
chr5	141387336	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,1:7,5:10,3,3,3
chr5	141511525	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=133,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.291:18:6,3:6,2:2,11,0,5
chr5	141975067	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=236,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,3:3,7:2,2,3,7
chr5	141993487	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=186,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,3:11,0:14,5,3,0
chr5	141993498	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=209,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.634:20:3,6:4,6:4,3,10,3
chr5	142258993	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,164;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:9,0:12,4:10,11,0,4
chr5	142259083	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=174,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:0,9,0,2
chr5	142288318	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=169,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,3:6,0:6,2,3,0
chr5	142288527	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.270:20:10,4:5,1:0,15,1,4
chr5	142393562	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=140,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:5,5:3,3:7,1,6,3
chr5	142416741	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=67.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,13,6
chr5	142421296	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=194,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,3:5,0:7,4,3,0
chr5	142421317	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=172,310;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.186:19:9,1:6,0:9,7,3,0
chr5	142513686	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=275,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:0,7:1,3:0,1,4,7
chr5	142545657	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=202,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:7,2:5,7,0,2
chr5	142601978	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:17,0:11,2:13,15,0,2
chr5	142689824	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=241,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:1,3,0,5
chr5	142779552	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,315;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,14:0.334:43:13,1:16,13:13,16,0,14
chr5	143543648	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=186,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:7,2:9,5:8,8,7,0
chr5	145144419	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr5	145197411	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr5	145199430	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr5	145199680	.	TTTTTTG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=213,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr5	145199681	.	TTTTTG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.832:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	145252574	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=140,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:3,7:0,2:0,3,2,7
chr5	145393518	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=141,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:12,0:5,3:8,9,1,2
chr5	145427527	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	145483679	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr5	145483713	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=190,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:1,1:2,2:1,2,4,0
chr5	145500055	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,92;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:3,8,0,2
chr5	145508174	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,12:4,0:7,2,12,0
chr5	145508457	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=220,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:0|1:145508457_T_C:145508457:3,2,4,0
chr5	145508471	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=220,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,2:4,1:0|1:145508457_T_C:145508457:3,2,4,0
chr5	145508688	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=208,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:1,2:1,4,0,2
chr5	145509573	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:5,5:7,3:6,7,4,4
chr5	145512390	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=269,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:3,1:8,0,2,0
chr5	145515346	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=157,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:1,1,0,3
chr5	145522674	.	T	TTATATA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=TA;STR;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.496:8:3,3:1,0:0,4,0,4
chr5	145522912	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	145531486	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=175,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,0:11,3:10,7,0,3
chr5	145532859	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:1,0:0|1:145532859_T_C:145532859:0,2,0,4
chr5	145532876	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=200,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0|1:145532859_T_C:145532859:0,2,0,3
chr5	145533418	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=113,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,5:4,4:2,5,6,3
chr5	145538924	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:3,6:5,2:5,3,7,1
chr5	145539123	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=203,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr5	145547893	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=175,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr5	145562143	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:0,7,1,6
chr5	145640215	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr5	145640338	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=146,58;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,0:8,3:7,5,0,3
chr5	145643048	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,1:1,3:3,3,2,2
chr5	145647151	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,0:3,2:5,2,2,0
chr5	145647187	.	CTT	C,CT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,34,33;MFRL=146,163,149;MMQ=60,60,60;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=3.20,9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,6:0.143,0.327:18:5,0,4:3,2,2:6,4,7,1
chr5	145650963	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=127,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr5	145827085	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=158,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0,11,0,2
chr5	145834529	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=187,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:5,1,3,0
chr5	145838440	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=211,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:1,9:1,8:1,1,10,7
chr5	145850328	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=171,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:4,6,0,2
chr5	145851163	.	ATT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=107,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.243:14:7,2:4,1:3,8,0,3
chr5	145859763	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=166,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:0,7,0,3
chr5	145872381	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr5	145878290	.	G	GTATA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=155,235;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:0|1:145878290_G_GTATA:145878290:3,12,0,2
chr5	145878294	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=155,235;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:0|1:145878290_G_GTATA:145878290:3,12,0,2
chr5	145878296	.	G	GTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=155,235;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:5,0:0|1:145878290_G_GTATA:145878290:3,12,0,2
chr5	146030055	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr5	146657584	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=202,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,3:2,1:4,0,4,0
chr5	146657838	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=205,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,2:5,2:0,7,0,4
chr5	146722479	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:7,2,3,0
chr5	146728149	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=197,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,4:0,2:1,0,4,2
chr5	146773737	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,17;MFRL=202,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.320:7:2,0:1,0:1,4,0,2
chr5	147258535	.	A	T,ATT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32,16;MFRL=187,196,196;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.286,0.357:3:1,0,0:0,1,0:0,1,0,2
chr5	147276579	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=133,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,1:5,1:7,9,0,2
chr5	147281308	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=96,230;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:14,4:23,0:13,25,2,2
chr5	147281313	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=154,96;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,13:0.341:39:16,0:9,13:14,12,0,13
chr5	147285899	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,5:1,1:5,0,5,1
chr5	147444785	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=197,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr5	147444989	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:5,2:0,2:2,3,1,3
chr5	147449855	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=115,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.313:30:11,4:10,5:9,12,6,3
chr5	147450085	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=184,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,0:1,5:0,2,0,5
chr5	147468234	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,5:5,9:0,8,3,11
chr5	147468971	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	147475488	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=82,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.500:36:9,9:9,9:12,6,9,9
chr5	147475513	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=158,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:5,4:4,9:3,6,3,10
chr5	147477351	.	T	TTTTAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,2:3,6:3,0,10,0
chr5	147478785	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=120,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,22:0.767:28:1,8:5,14:2,4,13,9
chr5	147478981	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=86,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr5	147479991	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=129,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,2:2,7:4,3,8,1
chr5	147480007	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=150,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:6,4:1,8:4,3,10,2
chr5	147480027	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:6,4:3,7:6,3,7,4
chr5	147480868	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=133,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:4,1,5,1
chr5	147480955	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,2:3,7:4,2,8,1
chr5	147481018	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=110,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:5,5:6,10:6,5,4,11
chr5	147484465	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=109,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,4:1,11:1,0,13,2
chr5	147486774	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:1,3,0,5
chr5	147486818	.	CGT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=197,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	147491532	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=216,237;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0|1:147491532_T_C:147491532:0,3,0,3
chr5	147491543	.	C	CTAGTGTTTAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=229,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,0:4,1:1|0:147491532_T_C:147491532:0,4,0,1
chr5	147493831	.	C	CT,CTT	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,31,35;MFRL=0,209,191;MMQ=60,60,40;MPOS=11,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=1,2,3;RU=T;STR;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,1:0,1,0:0,0,2,0
chr5	147493833	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:147493833_C_T:147493833:0,0,2,0
chr5	147493846	.	C	A,T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,17,15;MFRL=0,157,191;MMQ=60,60,40;MPOS=26,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.29,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,0,0:0,0,0:0,0,3,0
chr5	147493848	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,15;MFRL=157,191;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:147493833_C_T:147493833:2,0,1,0
chr5	147493856	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,15;MFRL=142,191;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:147493833_C_T:147493833:3,0,1,0
chr5	147493863	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,13;MFRL=142,191;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:147493833_C_T:147493833:3,0,1,0
chr5	147493865	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,12;MFRL=142,191;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:2,0:0|1:147493833_C_T:147493833:3,0,1,0
chr5	147493871	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,1:0|1:147493833_C_T:147493833:1,0,4,0
chr5	147497932	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr5	147498496	.	ATCCAGGGTCAATATTTGTTAACAAGATGAATATTCACTTTTTTCTCC	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:3,0:4,2:13,4,1,1
chr5	147498523	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=130,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,2,2
chr5	147498652	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=87,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:6,2:5,5:3,9,2,5
chr5	147498669	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:147498669_G_A:147498669:2,3,0,2
chr5	147498672	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=22,27;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:3,1:0|1:147498669_G_A:147498669:2,3,0,2
chr5	147499874	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:5,2:3,1:7,1,3,0
chr5	147504305	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=133,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,3:2,0:0|1:147504305_C_CT:147504305:5,0,5,0
chr5	147504315	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=133,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0|1:147504305_C_CT:147504305:5,0,5,0
chr5	147505227	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.694:21:3,8:3,6:5,1,8,7
chr5	147510776	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=165,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,1:0,6:4,1,6,1
chr5	147510866	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,2:1,7:2,3,3,6
chr5	147549416	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=151,143;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,0:4,8:2,10,0,9
chr5	147554997	.	TTTTTTCC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,6:0,8:0,0,6,8
chr5	147555029	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr5	147693826	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,1:6,5:2,5,1,5
chr5	147695283	.	C	CTCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=237,218;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TCA;STR;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.495:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr5	147781732	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=146,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:6,3:7,5:1,12,4,5
chr5	147788798	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=162,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:9,4:7,6:8,8,3,7
chr5	147795677	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,10;MFRL=195,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.170:16:2,0:7,0:2,12,0,2
chr5	147803557	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=96,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr5	147812901	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=161,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr5	147819366	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,0:8,3:6,8,0,3
chr5	147821469	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=203,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr5	147856232	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=85,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:2,2,7,0
chr5	147856257	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=141,54;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.408:12:4,3:3,1:4,3,4,1
chr5	147856392	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=163,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:3,1:9,4:2,10,0,5
chr5	148206348	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	148206375	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr5	148207447	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:8,8:2,7:4,6,8,7
chr5	148207633	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.578:24:6,3:3,11:3,7,6,8
chr5	148207667	.	C	CCG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=120,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.643:20:5,6:2,6:0,7,0,13
chr5	148389763	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=164,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:3,2:10,2:13,0,4,0
chr5	148406386	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=215,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:2,4,2,3
chr5	148408055	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=163,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:8,5:8,4:8,8,2,7
chr5	148521799	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,0,10
chr5	148562981	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=202,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:10,5:8,5:15,3,7,3
chr5	148580025	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.856:12:0,6:1,4:0,1,2,9
chr5	148590423	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:2,4,1,5
chr5	148596693	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=172,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.393:8:3,0:2,3:0,5,1,2
chr5	148618708	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:2,2:4,2:5,1,4,0
chr5	148618749	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=155,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,7:0.258:29:8,4:13,3:0|1:148618749_C_T:148618749:14,8,6,1
chr5	148618752	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=155,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,7:0.258:29:8,4:14,3:0|1:148618749_C_T:148618749:14,8,6,1
chr5	148618964	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=210,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:0,5,0,5
chr5	148620224	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:4,2:8,6:10,3,6,2
chr5	148625972	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:3,1,3,1
chr5	148627252	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=218,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr5	148627503	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=308,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:3,2:0,3:1,2,2,4
chr5	148678994	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=205,248;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:2,3:6,0,3,0
chr5	148679301	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr5	148682188	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=330,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:0,1,0,6
chr5	148689735	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=199,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,0:6,4:1,7,0,4
chr5	148729348	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,0:8,2:5,7,1,1
chr5	148737811	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	148758642	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=195,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:4,12:3,0:7,0,12,0
chr5	148758695	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,1:13,1:16,6,1,1
chr5	148977613	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:0,7,0,7
chr5	148989312	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=236,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0|1:148989312_A_G:148989312:0,1,0,5
chr5	148989320	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=236,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,1:0|1:148989312_A_G:148989312:0,1,0,4
chr5	148997686	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=74.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,15:0,0,14,10
chr5	148999881	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=224,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:3,0,6,2
chr5	149000039	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=232,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:3,9:1,7:1,3,7,9
chr5	149001283	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:1,3:8,7:3,6,8,2
chr5	149006837	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=188,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,7:1,6:0,3,1,12
chr5	149006879	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=182,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0,1,0,7
chr5	149112300	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:8,4:3,4:7,4,5,3
chr5	149214167	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=197,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr5	149214377	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=233,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:4,8:1,1:1,4,0,9
chr5	149221788	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr5	149221885	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=149,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:11,0:13,3:11,13,1,2
chr5	149221992	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=200,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:1,6,0,3
chr5	149240571	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:3,5:6,1:2,7,0,6
chr5	149247828	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=184,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr5	149294643	.	G	GACGGTCTCAATCTCTTGAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=272,102;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:149294643_G_GACGGTCTCAATCTCTTGAC:149294643:0,2,0,1
chr5	149294646	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=272,102;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:149294643_G_GACGGTCTCAATCTCTTGAC:149294643:0,2,0,1
chr5	149294668	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=360,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:149294668_G_A:149294668:0,1,0,1
chr5	149294669	.	C	CTTTATT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=360,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:149294668_G_A:149294668:0,1,0,1
chr5	149361257	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=150,259;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:7,4,2,0
chr5	149374879	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:8,4:6,8:10,4,3,9
chr5	149424966	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	149427387	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	149431223	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	149431259	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=230,296;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr5	149435608	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,1:5,5:2,10,2,4
chr5	149437190	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=189,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,4:2,4:0,2,1,7
chr5	149441000	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,1:0,2:0,0,5,0
chr5	149441005	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,22;MFRL=320,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.448:5:2,0:0,1:3,0,2,0
chr5	149441008	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=320,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.448:5:1,0:0,2:3,0,2,0
chr5	149441011	.	CTA	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,10;MFRL=128,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,0:0,0:1,0,2,0
chr5	149441041	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=23,16;MFRL=81,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.277:8:1,0:5,0:2,4,2,0
chr5	149449790	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,6:5,0:5,6,6,0
chr5	149449815	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.341:18:5,5:7,0:5,7,6,0
chr5	149452793	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=255,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr5	149456771	.	CT	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=174,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr5	149456811	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=118,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,2:4,4:5,4,3,3
chr5	149497177	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=195,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,1:5,9:4,6,5,5
chr5	149503932	.	AATGGGGGCCCCAGGCCAGGCCCAGTCATGGAGGCTCC	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=147,51;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:13,2:13,0:0|1:149503932_AATGGGGGCCCCAGGCCAGGCCCAGTCATGGAGGCTCC_A:149503932:11,21,1,1
chr5	149503937	.	GGGCCCCAGGCCAGGCCCAGTCATGGAGGCTCCATGGA	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,2:0.097:30:11,0:11,2:1|0:149503932_AATGGGGGCCCCAGGCCAGGCCCAGTCATGGAGGCTCC_A:149503932:7,21,1,1
chr5	149509270	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	149511636	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:8,7:8,3:10,6,3,7
chr5	149513626	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=277,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr5	149515074	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	149516480	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr5	149546426	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=192,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.522:8:1,4:1,0:4,0,1,3
chr5	149576233	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=325,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,4,1
chr5	149576273	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=250,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,2,5
chr5	149578999	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr5	149580819	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=304,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:1,5:0,4:0,1,4,5
chr5	149582103	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=257,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,5:0,9:0,1,7,7
chr5	149582132	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=181,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,0:8,2:9,8,1,1
chr5	149583300	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,7:0,21:0|1:149583300_T_C:149583300:0,0,18,11
chr5	149583336	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,5:0,23:0|1:149583300_T_C:149583300:0,0,12,17
chr5	149584197	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,238;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,2:6,2:4,9,2,2
chr5	149584341	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,7,2
chr5	149584969	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr5	149584981	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=262,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,3,1
chr5	149602363	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=224,275;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,2,0
chr5	149602824	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=255,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:0,1:0,3,1,2
chr5	149624901	.	GCCT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=207,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=CCT;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr5	149627423	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=114,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:1,2,4,0
chr5	149629683	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=227,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr5	149631413	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=59.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:4,12:1,6:3,3,9,9
chr5	149632955	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,1:7,2:7,3,3,0
chr5	149636073	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=240,255;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:6,0,2,1
chr5	149636109	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=277,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:3,0,4,2
chr5	149737221	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr5	149755462	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=178,366;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:11,0:9,4:6,14,4,0
chr5	149755937	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:14,2,1,1
chr5	149775921	.	C	CATTATCACAACGAAGAAACTTTTTTTTTTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=148,268;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:10,0:9,11,0,2
chr5	149784616	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.237:23:12,5:5,0:10,8,4,1
chr5	149784745	.	T	TGGAGCAGGTGCATC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=151,1509;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,0:8,2:0|1:149784745_T_TGGAGCAGGTGCATC:149784745:3,11,2,0
chr5	149784749	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=152,1509;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:4,0:9,2:0|1:149784745_T_TGGAGCAGGTGCATC:149784745:3,10,2,0
chr5	149823785	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr5	149827098	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,2:13,1:11,10,3,0
chr5	149901373	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=14,34;MFRL=181,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr5	149914401	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=123,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.573:7:0,3:2,1:1,2,2,2
chr5	149921251	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=141,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.698:18:2,6:3,6:1,4,5,8
chr5	149931222	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=155,256;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr5	150029415	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:3,5,1,1
chr5	150049990	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=182,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr5	150051078	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.180:21:7,2:10,1:13,5,3,0
chr5	150051958	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,14:0,8:0,0,14,8
chr5	150056219	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=208,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:9,0,0,2
chr5	150072693	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:3,3:0,3:3,1,5,1
chr5	150076546	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=245,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr5	150111501	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=183,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:0,0:7,2:3,5,1,1
chr5	150113130	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=214,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr5	150135900	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=202,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,0:6,2:10,0,2,0
chr5	150138634	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,2:3,4:0,9,0,6
chr5	150174892	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr5	150227615	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=172,186;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:5,2:3,0:9,0,2,0
chr5	150407456	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=125,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:3,4:9,3:4,8,5,2
chr5	150407705	.	CAT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=156,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:1,12,0,2
chr5	150413406	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:4,2:2,4:1,5,1,5
chr5	150415338	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr5	150422003	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	150439895	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:11,5,0,2
chr5	150441822	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,1:5,1:1,13,0,2
chr5	150483147	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:13,3:11,0:14,10,3,0
chr5	150484787	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=112,230;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:13,1:11,2:13,11,2,1
chr5	150484889	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:10,2:11,2:7,14,2,2
chr5	150506086	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:3,1:5,3:3,5,2,3
chr5	150506104	.	AACACACACAC	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=149,279;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,9;RU=AC;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr5	150515892	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=174,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,1:9,1:8,12,2,0
chr5	150516702	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:2,0,2,0
chr5	150518358	.	AG	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=45,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,2:4,7:3,3,6,3
chr5	150518435	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=204,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,3:2,2:0,7,0,5
chr5	150518892	.	GC	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,2:5,4:8,3,4,2
chr5	150564973	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=205,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:4,2:13,1:8,9,0,3
chr5	150564975	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=207,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:2,4:3,11:1,4,7,8
chr5	150565008	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=300,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:1,4:1,10:0,2,9,5
chr5	150565724	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=165,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:3,4:0,8:1,2,2,10
chr5	150565770	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.825:9:0,5:1,3:0,1,0,8
chr5	150567049	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr5	150567074	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=233,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr5	150632676	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=209,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,2:7,1:14,0,3,0
chr5	150639224	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr5	150646888	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,337;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,3:9,0:9,12,2,1
chr5	150660769	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=217,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0|1:150660769_A_G:150660769:3,2,1,4
chr5	150660794	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,22;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:0|1:150660769_A_G:150660769:2,3,1,3
chr5	150663565	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:4,2,2,0
chr5	150682975	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr5	150683005	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr5	150696301	.	C	CAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=208,175;MMQ=40,50;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=23,25;RU=A;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0|1:150696301_C_CAA:150696301:1,0,2,0
chr5	150696325	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,21;MFRL=192,149;MMQ=50,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:150696301_C_CAA:150696301:2,0,1,0
chr5	150696333	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,15;MFRL=179,149;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:150696333_T_A:150696333:4,0,1,0
chr5	150696344	.	GTC	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=182,149;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.257:6:0,0:3,0:0|1:150696333_T_A:150696333:5,0,1,0
chr5	150712821	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.213:20:11,0:5,3:8,8,4,0
chr5	150726870	.	GTCT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,237;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:4,3,2,3
chr5	150838284	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=230,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:2,5:1,3:0|1:150838284_C_G:150838284:3,0,8,0
chr5	150838293	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0|1:150838284_C_G:150838284:0,0,11,0
chr5	150843996	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr5	150846663	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:9,1,2,0
chr5	150846706	.	AGCATT	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=130,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCATT;STR;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:10,3:4,7:14,2,8,2
chr5	150846865	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,18;MFRL=142,126;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.444:9:1,0:3,2:2,3,0,4
chr5	150846882	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=0,168;MMQ=58,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr5	150846935	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=168,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:2,2:0,1:0,3,0,3
chr5	150847505	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=125,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.501:18:2,3:7,6:0|1:150847505_T_C:150847505:3,6,2,7
chr5	150847509	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=125,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.501:18:2,3:6,6:0|1:150847505_T_C:150847505:3,6,2,7
chr5	150847554	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr5	150847581	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,294;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr5	150853193	.	CTTTTGCTTTG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=177,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTGCTTTG;STR;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.706:8:1,4:0,2:0,2,4,2
chr5	150853412	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=186,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr5	150856107	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=135,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.578:24:4,8:6,6:7,3,8,6
chr5	150859151	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,285;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr5	150885489	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.298:24:7,6:10,0:9,8,6,1
chr5	150886616	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=339,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr5	150886882	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=190,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:8,8:5,6:7,6,9,5
chr5	150889805	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=165,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr5	150891663	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=198,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,3:1,9:3,0,9,3
chr5	150901613	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=296,170;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:0,4:3,7:2,1,8,3
chr5	150905485	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=195,155;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,15:0.432:35:10,6:10,9:0|1:150905485_C_T:150905485:9,11,6,9
chr5	150905509	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=157,61;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:12,2:0|1:150905485_C_T:150905485:12,14,1,1
chr5	150905515	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=155,61;MMQ=60,55;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:13,0:14,2:0|1:150905485_C_T:150905485:14,15,1,1
chr5	150905517	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=155,61;MMQ=60,55;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,0:14,2:0|1:150905485_C_T:150905485:14,15,1,1
chr5	150905519	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=153,61;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:14,0:11,2:0|1:150905485_C_T:150905485:15,15,1,1
chr5	150905521	.	G	GACGGAAATCTGTGATGTCGTT	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=156,61;MMQ=60,55;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:15,0:12,2:0|1:150905485_C_T:150905485:15,13,1,1
chr5	150906721	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=209,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:9,0,2,0
chr5	150908812	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=143,296;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:7,1:9,3:8,8,3,1
chr5	150917545	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr5	150921805	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=190,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,3:3,2:6,0,5,0
chr5	150923528	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=203,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:12,2:4,1:11,5,2,1
chr5	150924410	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:11,0:10,4:8,13,0,4
chr5	150925144	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,14,7
chr5	150925155	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=112,47;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,0:6,2:8,8,1,1
chr5	150925170	.	C	CAATTTATTTGGCTGCTATTTTTCTT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=114,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:9,9,1,1
chr5	150943085	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=195,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.589:25:4,7:6,7:6,4,6,9
chr5	150946436	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,5:3,2:2,1,2,5
chr5	150948537	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	151043573	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=162,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:9,0,1,1
chr5	151049404	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=199,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:1,3,0,5
chr5	151052659	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=196,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,4:3,6:4,4,4,6
chr5	151170713	.	T	TATAAATTTATTA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,2:3,1:0,11,0,3
chr5	151180469	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=213,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,1:6,5:1,7,0,6
chr5	151202160	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.266:17:5,4:6,0:11,2,4,0
chr5	151236039	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=194,267;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,3:4,1:0,9,0,4
chr5	151239470	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=124,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:11,1:13,2:14,10,1,2
chr5	151239509	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=137,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:6,9,1,1
chr5	151239518	.	C	CCCCAGTCTCATTCCAGACACCAGACCAA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=123,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:6,7,1,1
chr5	151771937	.	GGTC	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:20,2:15,0:20,17,0,2
chr5	152873649	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:2,5,0,2
chr5	153026570	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:12,4:6,0:10,8,4,0
chr5	153065746	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=173,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:5,2:6,3:7,4,4,1
chr5	153085668	.	T	TTTTGTTTG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TTTG;STR;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:2,1:1,2:0,3,0,4
chr5	153144216	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:2,5:0,7:0,2,0,12
chr5	153149742	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,1:11,1:0|1:153149742_TG_T:153149742:12,8,1,1
chr5	153149744	.	TGTTTGA	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,1:12,1:0|1:153149742_TG_T:153149742:12,8,1,1
chr5	153149756	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=154,89;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:6,1:9,1:0|1:153149742_TG_T:153149742:8,8,1,2
chr5	153149758	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=153,77;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:8,0:7,2:0|1:153149742_TG_T:153149742:10,7,0,2
chr5	153174310	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=239,150;MMQ=33,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:1,0:9,2:0,13,1,2
chr5	153372525	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=179,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,4:6,3:8,5,4,3
chr5	153414545	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:3,1:6,3:0,9,0,4
chr5	153429187	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=309,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr5	153433296	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:11,7,2,0
chr5	153570349	.	C	CCGGGCGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,334;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CGGGCGGA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr5	153674536	.	TTGTGTG	T,TTG	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=23,16,29;MFRL=202,153,200;MMQ=60,60,53;MPOS=28,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,14;RU=TG;STR;TLOD=12.77,5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,6,2:0.424,0.254:11:0,1,1:1,1,1:0,3,0,8
chr5	153674562	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:10,2:0|1:153674562_G_A:153674562:0,17,0,2
chr5	153674564	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:9,1:0|1:153674562_G_A:153674562:0,15,0,2
chr5	153760260	.	AG	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=315,301;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr5	153760270	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=264,70819355;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr5	153783587	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=131,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.334:25:9,3:7,5:9,8,4,4
chr5	153795274	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	153832966	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=165,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:153832966_A_C:153832966:7,4,1,1
chr5	153832970	.	G	GTTATCCATGGTTCTTTTGTATATTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=165,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0|1:153832966_A_C:153832966:7,4,1,1
chr5	153856974	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:4,0,4,0
chr5	153857653	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	154174839	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=158,91;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,0:11,3:10,9,3,0
chr5	154183957	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=216,246;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:154183957_GA_G:154183957:0,2,0,2
chr5	154183961	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=216,246;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:154183957_GA_G:154183957:0,2,0,2
chr5	154191192	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=196,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.517:29:8,5:6,10:7,7,0,15
chr5	154193735	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	154245034	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=216,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:1,1,0,3
chr5	154271391	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	154275962	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=210,245;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr5	154278888	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=52.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,3,13
chr5	154287115	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr5	154291219	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	154291496	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,4:0,11:0,0,4,11
chr5	154296795	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=150,273;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	154308282	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	154308307	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	154311235	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr5	154311576	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr5	154315354	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,1:7,3:15,0,3,1
chr5	154395433	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=161,168;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.262:36:16,0:11,9:11,16,0,9
chr5	155771421	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=181,108;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:4,1:2,0:4,2,1,1
chr5	155771773	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=193,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr5	156074654	.	TAAATTGA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.870:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr5	156353313	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=130,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:10,0:22,3:13,19,0,3
chr5	156375372	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=183,206;MMQ=60,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,4:2,0:4,0,3,1
chr5	156376703	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,10:0,18:0,0,7,22
chr5	156381370	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr5	156390297	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=161,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,4:1,5:0,2,0,9
chr5	156464212	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	156464242	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr5	156479323	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:2,1,4,0
chr5	156479509	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=115,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.690:27:5,9:3,10:3,5,7,12
chr5	156479557	.	GTTGGAACAGTCGTCA	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.505:14:3,3:3,4:3,4,3,4
chr5	156479568	.	C	CGTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.464:10:2,3:2,2:2,3,2,3
chr5	156482640	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=204,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:156482640_A_G:156482640:0,1,0,1
chr5	156482642	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=204,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:156482640_A_G:156482640:0,1,0,1
chr5	156531736	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=112,86;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.451:20:2,5:9,4:3,8,4,5
chr5	156644775	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr5	156659391	.	TTCTTTTGGACACAGTAAGTCTCCTTAACCTG	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.129:22:12,0:5,2:8,12,1,1
chr5	156670646	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=156,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:0,0:14,3:9,5,2,1
chr5	156670896	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,3:5,1:1,6,0,4
chr5	156679576	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:4,5:5,7:8,1,12,0
chr5	156721863	.	T	TC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=67.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,7,17
chr5	156738830	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,6:5,7:1,7,3,10
chr5	156742186	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=177,244;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:3,0:5,3:0,8,0,3
chr5	156747614	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=267,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,3:3,1:6,2,3,1
chr5	156747632	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=270,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,4:5,1:7,3,4,1
chr5	156747669	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.314:26:7,5:11,2:12,6,5,3
chr5	156766037	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,4:7,2:9,2,5,1
chr5	156766273	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,2,3
chr5	156887133	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=193,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,2:4,1:6,3,2,1
chr5	156894173	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=98,235;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr5	156894181	.	T	TCTGCATCTCCATGAGA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=182,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.489:4:1,1:1,0:0,2,1,1
chr5	156898899	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr5	156899869	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr5	156916017	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=131,303;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:156916017_G_A:156916017:3,0,1,0
chr5	156916021	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=160,303;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:156916017_G_A:156916017:4,0,1,0
chr5	156916037	.	C	CAAAAAGAA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=194,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAAAGAA;STR;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,1:4,1,3,1
chr5	156929931	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=150,56;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:13,0:12,5:5,21,0,5
chr5	156929982	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,2:9,0:7,14,2,0
chr5	156936549	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,253;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr5	156957741	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:4,1,4,0
chr5	157002552	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	157075719	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=133,151;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,1:2,0:6,2,2,0
chr5	157075943	.	TAC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=198,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:1,1:0,5,0,2
chr5	157102063	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=156,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:3,1:3,2:4,2,2,2
chr5	157106785	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr5	157158372	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=170,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,2:3,2:7,0,4,0
chr5	157158414	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=174,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,3:9,1:15,4,2,2
chr5	157158439	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=169,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:14,3:7,1:16,5,1,3
chr5	157164889	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=197,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:5,1,2,2
chr5	157170986	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,236;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr5	157178592	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,7:0,1:0,0,3,5
chr5	157180930	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=264,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.598:8:1,3:1,2:3,0,5,0
chr5	157180959	.	AAAT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=194,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAT;STR;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:8,2:2,1:9,1,2,1
chr5	157241367	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr5	158140222	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=222,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr5	158511794	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=205,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,2:2,0:3,6,0,2
chr5	158522577	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:1,5:0,10:0,1,7,8
chr5	158526270	.	AGCTGCC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCTGCC;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr5	158526534	.	TAA	T,TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30,24;MFRL=58,219,79;MMQ=60,60,60;MPOS=16,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.77,28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,15:0.167,0.706:20:1,0,6:1,2,4:1,1,4,14
chr5	158588633	.	GAAAAA	G,GAAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,33,26;MFRL=191,218,177;MMQ=60,60,60;MPOS=21,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,10,13;RU=A;STR;TLOD=47.73,5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,12,2:0.655,0.173:16:0,5,0:1,6,1:0,2,2,12
chr5	158589898	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:3,7:4,5:6,1,11,1
chr5	158603571	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,7:5,5:8,2,10,2
chr5	158608880	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,2:6,0:16,0,2,0
chr5	158697468	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=191,6395402;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:3,8,2,0
chr5	158697481	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,1:1,6:2,3,3,4
chr5	158697716	.	GT	G,GTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,32,34;MFRL=180,225,261;MMQ=60,60,60;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=8.44,3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,2:0.386,0.228:10:1,3,1:1,1,1:0,4,0,6
chr5	158710419	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=163,230;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr5	158750013	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,2:3,5:4,0,6,1
chr5	159463687	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,2:4,1:7,3,2,1
chr5	159478089	.	GTT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=13,35;MFRL=120,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.617:3:0,2:0,0:0,1,2,0
chr5	159640652	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=83,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,6:1,4:2,0,10,0
chr5	159661723	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=173,239;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:5,0,5,0
chr5	159665523	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=162,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.752:10:1,5:1,3:0|1:159665523_C_T:159665523:2,0,7,1
chr5	159665527	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=162,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:0|1:159665523_C_T:159665523:2,0,7,1
chr5	159665534	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:0|1:159665523_C_T:159665523:2,0,8,1
chr5	159665726	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=123,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:6,4:0,4:0|1:159665726_C_T:159665726:1,5,2,7
chr5	159665733	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=123,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:6,2:0,5:0|1:159665726_C_T:159665726:1,5,1,6
chr5	159831664	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=228,252;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,0:3,6:2,3,1,5
chr5	159835173	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=229,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:2,9,1,1
chr5	159839530	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=207,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:2,2:1,0:2,1,0,2
chr5	159839545	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=1894,131;MMQ=33,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:11,0:6,4:13,4,0,4
chr5	159840688	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=200,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr5	159840700	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=236,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr5	159849778	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.121:47:20,0:22,5:23,19,0,5
chr5	159851211	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr5	159855760	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=209,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:0,6,0,6
chr5	159992751	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:9,2:10,3:9,10,4,1
chr5	160026025	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,1,2
chr5	160029516	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=110,248;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:8,2,2,0
chr5	160043071	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=220,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr5	160044855	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr5	160047265	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	160049355	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr5	160097429	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	160097453	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr5	160114730	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr5	160763616	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=124,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,2:5,5:8,0,2,5
chr5	160763792	.	TAC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,17;MFRL=138,0;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:2,1:3,4,1,1
chr5	161119218	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:7,7,1,1
chr5	161281245	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:8,2:6,2:7,8,2,2
chr5	161292685	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,1:8,2:11,3,1,2
chr5	161302728	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,3:5,2:0,6,0,5
chr5	161318132	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:0|1:161318132_A_G:161318132:0,1,0,2
chr5	161318142	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=221,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:161318132_A_G:161318132:0,3,0,1
chr5	161318144	.	AA	GG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=221,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:161318132_A_G:161318132:0,3,0,1
chr5	161322889	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,4:1,2:0,4,0,6
chr5	161569089	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=214,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr5	162868910	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,246;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:13,1:15,2:15,13,3,0
chr5	162884142	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,18;MFRL=232,257;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:1,1:4,0:1,6,0,2
chr5	162884145	.	GT	G,GTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=15,13,29;MFRL=261,257,163;MMQ=60,60,60;MPOS=27,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=4.35,6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.271,0.490:6:0,0,1:0,0,1:0,1,1,4
chr5	162887650	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=127,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.172:33:13,1:13,4:15,13,3,2
chr5	162891894	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=246,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr5	162910199	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=186,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,1:9,1:6,11,1,1
chr5	162910280	.	T	TG	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=120,132;MMQ=60,57;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=60.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,20:0.468:43:10,20:13,0:16,7,20,0
chr5	162910310	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=166,132;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=61.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.480:42:6,20:15,0:11,11,20,0
chr5	162910435	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=113,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:7,2:3,2:2,8,0,4
chr5	162932822	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:4,2:5,5:0,11,0,7
chr5	162938940	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=115,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:2,4:0,2:2,0,5,1
chr5	162940739	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr5	162940774	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.410:20:7,8:5,0:11,1,8,0
chr5	162944709	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:1,2:0,4,1,5
chr5	162945387	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=75,237;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr5	167303239	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=260,289;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr5	167379580	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=155,78;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.146:23:8,0:11,2:16,4,1,2
chr5	167489049	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=209,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.515:10:2,3:3,2:4,1,5,0
chr5	167517785	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr5	167589628	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=139,59;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:11,3:14,0:15,11,3,0
chr5	167622107	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=183,272;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,5,0
chr5	167626890	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:167626890_C_T:167626890:2,1,1,0
chr5	167626894	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:167626890_C_T:167626890:2,1,1,0
chr5	167627140	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=156,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,0:9,4:8,9,0,4
chr5	167653364	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=247,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr5	167689728	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=165,22;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:6,3:11,1:12,5,3,1
chr5	167798585	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=226,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:0,4:2,7:0,2,1,10
chr5	167868809	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=224,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:11,8:2,5:5,8,5,9
chr5	167868838	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=197,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:12,1:2,1:7,8,1,1
chr5	167868930	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=208,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:1,4:0,0:0,2,0,4
chr5	167891668	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=239,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:3,0,5,1
chr5	167913459	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=163,298;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:12,1:10,2:10,12,2,1
chr5	167913661	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=255,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr5	167919623	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=198,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr5	167921047	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr5	167927541	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=214,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr5	167933673	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=171,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.390:9:2,1:4,2:6,0,2,1
chr5	167946076	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=120,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,1:10,1:19,6,2,0
chr5	167988073	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=196,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0,10,0,2
chr5	168100155	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=188,110;MMQ=60,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,3:6,0:9,1,3,0
chr5	168137879	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.167:21:11,0:6,1:0|1:168137879_T_G:168137879:16,2,0,3
chr5	168137885	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=162,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:20,5:0.221:25:11,3:9,2:1|0:168137879_T_G:168137879:15,5,3,2
chr5	168176541	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=190,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:8,1:2,1:7,3,0,2
chr5	168187760	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=203,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,0:6,2:6,0,1,1
chr5	168189501	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=177,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:8,5:6,1:10,4,5,1
chr5	168213007	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,237;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,1:4,4:2,8,1,4
chr5	168233413	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=198,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,3:4,8:6,1,8,3
chr5	168244256	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=170,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:3,0,1,3
chr5	168244506	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr5	168244543	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=188,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,3:1,4:0,2,0,7
chr5	168250429	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr5	168620435	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=154,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,1:5,2:8,5,1,2
chr5	169018234	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=178,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:7,3:11,0:5,14,0,3
chr5	169020337	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=207,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.239:11:5,2:3,0:9,0,2,0
chr5	169020421	.	G	GACTGCACTTCCCCCTTTATATGTAATGT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=117,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,2:8,0:13,8,0,2
chr5	169025558	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,0:6,2:10,10,0,2
chr5	169025605	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0|1:169025605_T_A:169025605:5,9,0,2
chr5	169025611	.	GATGAA	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:6,2:0|1:169025605_T_A:169025605:6,11,0,2
chr5	169025619	.	TGTCAC	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:0|1:169025605_T_A:169025605:5,9,0,2
chr5	169031218	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=267,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:0,1,1,5
chr5	169081315	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=211,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:9,0,2,0
chr5	169096207	.	T	TAAAAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=48,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAAC;STR;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:2,2:2,0,1,3
chr5	169097474	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=225,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr5	169097505	.	T	TTTTTA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=207,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTTA;STR;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr5	169098176	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,2:11,0:10,11,0,2
chr5	169126326	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=197,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,3:6,0:6,2,2,1
chr5	169138879	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:3,2:0,0:3,1,3,0
chr5	169138909	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=89,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:11,4:0,1:7,4,4,1
chr5	169188457	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=174,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,1,0
chr5	169291267	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=133,239;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:9,3:4,1:6,7,2,2
chr5	169454831	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=215,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:6,4:2,3:0|1:169454831_G_A:169454831:6,3,5,2
chr5	169454833	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=215,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:6,4:3,3:0|1:169454831_G_A:169454831:6,3,5,2
chr5	169461399	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=180,93;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:9,3,2,0
chr5	169468243	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=186,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr5	169472765	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=241,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr5	169494611	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=155,209;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.265:28:13,0:8,7:11,10,0,7
chr5	169496051	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=188,262;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:4,0,4,0
chr5	169503118	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.244:14:4,0:3,2:0|1:169503118_T_G:169503118:3,8,0,3
chr5	169503124	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.291:15:4,0:3,0:0|1:169503118_T_G:169503118:3,8,0,4
chr5	169503126	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.331:13:3,0:2,0:0|1:169503118_T_G:169503118:1,8,0,4
chr5	169503129	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=29,8;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.355:12:3,0:2,0:0|1:169503118_T_G:169503118:1,7,0,4
chr5	169503133	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,19;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.452:9:3,1:0,1:0|1:169503118_T_G:169503118:1,4,0,4
chr5	169675693	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:4,5:2,10:1,5,5,10
chr5	169679354	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=198,276;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr5	169680139	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=145,224;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:14,3:15,0:17,13,3,0
chr5	169686007	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=193,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	169689604	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=224,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,8:2,5:3,1,12,1
chr5	169689659	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=186,103;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:18,6:14,0:21,11,6,0
chr5	169695446	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=173,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr5	169697707	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:1,7:2,5:2,1,9,3
chr5	169720293	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:20,5:11,0:15,16,5,0
chr5	169806001	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=176,97;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:2,2:4,4:0,6,2,4
chr5	170139756	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:3,1:4,1:7,1,2,0
chr5	170145749	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=215,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:7,5,2,0
chr5	170149674	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=142,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,4:3,2:7,2,5,1
chr5	170159997	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,282;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr5	170160749	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,257;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr5	170162666	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=199,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr5	170221185	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,288;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,0:5,3:9,2,2,1
chr5	170235729	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=169,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,0:6,3:7,5,2,1
chr5	170341326	.	TTA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TA;STR;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr5	170345932	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=213,167;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:170345932_G_A:170345932:0,2,0,1
chr5	170345942	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=213,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:170345932_G_A:170345932:0,2,0,1
chr5	170380523	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	170610273	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=104,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.917:22:0,9:1,12:0,1,11,10
chr5	170640800	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=259,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:170640800_AG_A:170640800:0,4,0,1
chr5	170640803	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=259,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:170640800_AG_A:170640800:0,4,0,1
chr5	170640827	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr5	170669692	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,3:3,1:2,2,1,3
chr5	170737299	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=134,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:12,2:5,1:11,6,1,2
chr5	170815125	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,1:4,7:1,5,0,8
chr5	170818897	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:1,6:2,2:0|1:170818897_A_G:170818897:0,3,1,7
chr5	170818906	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=147,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.693:11:1,5:2,3:0|1:170818897_A_G:170818897:0,3,1,7
chr5	170819887	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.551:27:6,11:6,4:5,7,5,10
chr5	170820024	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,3:5,4:1,7,3,4
chr5	170827115	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0|1:170827115_C_A:170827115:1,0,6,1
chr5	170827118	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0|1:170827115_C_A:170827115:1,0,6,1
chr5	170827311	.	T	TGGGAGATCATCTCATACTGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,334;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGAGATCATCTCATACTGA;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.650:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	170832243	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=84,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr5	170847555	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	171480055	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:5,0:10,4:1,14,1,3
chr5	171484497	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=187,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.442:16:7,4:2,3:4,5,2,5
chr5	171488293	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=220,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,3:2,5:0,5,0,8
chr5	171491650	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr5	171491682	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=190,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.344:12:4,1:4,1:0|1:171491682_C_T:171491682:6,2,3,1
chr5	171491697	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=172,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.310:16:7,0:3,3:0|1:171491682_C_T:171491682:6,5,3,2
chr5	171533581	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=185,70;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:8,0:0,2:8,0,2,0
chr5	171533734	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,3:10,0:9,12,2,1
chr5	171533782	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=186,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:9,4:7,6:8,8,4,6
chr5	171534682	.	T	TGCCCACAGGCTGACCGGGC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=197,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:4,1:2,3:6,0,3,1
chr5	171554396	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=175,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,1:8,1:6,6,0,2
chr5	171554473	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=144,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:1,4,1,3
chr5	171583610	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=165,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:7,1,2,0
chr5	171774363	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=168,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:1,4,1,3
chr5	171785892	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,2:3,7:4,1,1,8
chr5	171800765	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,157;MMQ=60,35;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:4,11:11,0:4,11,11,0
chr5	171809224	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=185,138;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:8,1:4,1:0,12,0,2
chr5	172114021	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	172261462	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=106,200;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,1,3
chr5	172261489	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=106,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr5	172315872	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=203,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:0,8,0,4
chr5	172324128	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=156,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:2,4,0,3
chr5	172324978	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr5	172336616	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=195,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,2:0,6:1,0,4,4
chr5	172336688	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=148,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.260:13:4,3:6,0:5,5,2,1
chr5	172342009	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=145,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.265:13:5,3:5,0:0|1:172342009_G_A:172342009:2,8,1,2
chr5	172342029	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,4:0.416:10:5,1:1,3:1|0:172342009_G_A:172342009:0,6,0,4
chr5	172347440	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.766:18:0,6:2,8:3,1,6,8
chr5	172351160	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:2,6,0,2
chr5	172395408	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=252,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,8:1,2:0,1,7,3
chr5	172395581	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=151,141;MMQ=56,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.757:19:2,6:2,6:1,3,4,11
chr5	172395664	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,2:0,5:0,2,0,7
chr5	172396394	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,15,9
chr5	172421760	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=134,97;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.493:6:2,2:1,1:2,1,1,2
chr5	172535553	.	AGG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=150,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr5	172539241	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,4:3,2:4,0,5,1
chr5	172560793	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=130,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,3:2,4:2,4,0,7
chr5	172573767	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=235,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,3:0,8:1,0,11,1
chr5	172585770	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,66;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,4:5,0:5,4,4,0
chr5	172585927	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr5	172659511	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,429;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	172745269	.	AAGAGAG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=AG;STR;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:1,0:0,2:0,3,0,3
chr5	173036315	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=117,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.233:31:11,0:13,6:13,11,0,7
chr5	173316729	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=106.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,16:0,18:0,0,16,18
chr5	174152100	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=148,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr5	174868700	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=290,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr5	174870150	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=265,163;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,8:3,5:1,4,7,6
chr5	174943551	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:5,1:7,1:8,5,1,1
chr5	175512075	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:0,3,2,2
chr5	175520358	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=179,236;MMQ=40,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:3,2:1,8,0,2
chr5	175530166	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=225,162;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,3:5,1:6,6,4,0
chr5	175717106	.	GAGC	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,124;MMQ=60,38;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AGC;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:7,2:7,0:10,5,0,2
chr5	175721962	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,151;MMQ=40,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:4,0,1,0
chr5	175723302	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=207,156;MMQ=40,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:0|1:175723302_C_G:175723302:4,5,0,2
chr5	175723304	.	C	CTGGTCGT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=207,156;MMQ=40,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:0|1:175723302_C_G:175723302:4,5,0,2
chr5	175723308	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=203,156;MMQ=40,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:175723302_C_G:175723302:5,5,0,2
chr5	175749408	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=115,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,1:15,1:13,15,2,0
chr5	175774865	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:8,3:8,4:8,8,4,3
chr5	175782709	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:7,7,1,1
chr5	175786437	.	CATT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:9,4:9,2:7,11,3,3
chr5	175792605	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	175798945	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=181,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.670:13:3,2:1,7:0,4,0,9
chr5	175815220	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=184,87;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,3:9,0:12,7,3,0
chr5	175815247	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=151,87;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.164:28:13,4:11,0:11,13,3,1
chr5	175815782	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=203,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.307:24:10,5:5,1:0|1:175815782_G_C:175815782:12,5,4,3
chr5	175815787	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=197,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:11,6:5,1:0|1:175815782_G_C:175815782:11,5,4,3
chr5	175815874	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=189,167;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:9,4:6,4:7,8,5,3
chr5	175819951	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=234,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:4,5:5,4:2,7,3,6
chr5	175843461	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr5	175913485	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:3,5,1,1
chr5	175913587	.	T	TCACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:175913587_T_TCACA:175913587:0,1,0,1
chr5	175913588	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:175913587_T_TCACA:175913587:0,1,0,1
chr5	175913591	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:175913587_T_TCACA:175913587:0,1,0,1
chr5	175919324	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=163,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:8,1:1,2:4,5,1,2
chr5	175921150	.	AGTT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:10,0:11,4:10,13,2,2
chr5	175923431	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=244,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,4:3,5:6,0,8,1
chr5	175956177	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,254;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,2:3,4:1,7,2,4
chr5	175956271	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=277,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:1,8:2,4:3,0,10,2
chr5	175956500	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=153,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.269:14:3,0:6,1:9,1,0,4
chr5	175956516	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=262,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:0,6:4,7:1,3,9,4
chr5	175959241	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,1:7,1:2,5,1,1
chr5	175992258	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	175992519	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=225,249;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:3,2,1,2
chr5	176002144	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:1,6:0,17:0,1,14,9
chr5	176002873	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=134,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.777:10:1,3:0,5:0,2,3,5
chr5	176002926	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=223,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.835:16:0,9:2,5:0,2,4,10
chr5	176004312	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr5	176004846	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=123,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,2:1,1:0,1,2,2
chr5	176004866	.	A	AGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=123,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GT;STR;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,1:1,4:0,1,3,2
chr5	176005084	.	T	TCTGTGGGCATGCTGG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=185,39;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,2:10,0:0|1:176005084_T_TCTGTGGGCATGCTGG:176005084:3,10,1,1
chr5	176005088	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=185,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:0|1:176005084_T_TCTGTGGGCATGCTGG:176005084:3,10,1,1
chr5	176005175	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:176005175_A_C:176005175:0,0,0,3
chr5	176005184	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:176005175_A_C:176005175:0,0,0,2
chr5	176017549	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:0,13:2,4:2,0,8,9
chr5	176018545	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,1,11
chr5	176026121	.	TCAAAGACCCAGGA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=148,246;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:5,2:5,2:0|1:176026121_TCAAAGACCCAGGA_T:176026121:7,6,0,4
chr5	176026135	.	TCCTCCTTCCTC	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=148,246;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:8,2:5,2:0|1:176026121_TCAAAGACCCAGGA_T:176026121:9,6,0,4
chr5	176026491	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=190,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:2,6:8,1:7,3,2,5
chr5	176053336	.	GGT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=GT;STR;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.826:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr5	176053645	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=236,246;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,2:1,0:1,1,2,1
chr5	176056529	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,12:0,0,11,11
chr5	176069831	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,3:0,6:0,0,4,7
chr5	176069862	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=229,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr5	176069863	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=120,243;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr5	176069866	.	C	CGCCCG,CCGCCCG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,28,32;MFRL=0,112,229;MMQ=60,60,60;MPOS=11,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.39,4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.388,0.500:5:0,1,2:0,1,1:0,0,0,5
chr5	176070756	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:10,0:6,2:5,11,0,2
chr5	176081856	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=175,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,1:4,1:5,0,1,1
chr5	176083175	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,4,5
chr5	176083997	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr5	176305466	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:1,2:1,4,4,2
chr5	176305678	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:1,5,0,2
chr5	176306676	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=205,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:2,1,5,0
chr5	176308870	.	C	CAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=152,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,3:5,1:3,4,1,3
chr5	176314434	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=263,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,2,1
chr5	176314459	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=109,189;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.763:5:0,1:0,3:0,1,1,3
chr5	176315299	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=200,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:2,0:2,5:4,1,4,1
chr5	176316455	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=138,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:7,6:10,2:11,6,4,4
chr5	176318322	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=193,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,1,1
chr5	176333133	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	176338288	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,3:1,2:4,2,5,0
chr5	176378433	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=120,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:2,2:5,2:6,2,1,3
chr5	176471591	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr5	176477781	.	C	CTTGTGTCATTTTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=180,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:4,4,1,1
chr5	176517326	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	176519287	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=251,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,2:1,5:3,1,5,2
chr5	176522728	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.732:12:2,4:0,5:2,1,4,5
chr5	176523562	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=220,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,1:1,5:2,1,3,3
chr5	176523597	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=220,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:2,3:1,6:1,2,7,2
chr5	176636550	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,17;MFRL=205,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.371:9:2,0:1,1:6,0,3,0
chr5	176637240	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:7,3:12,3:14,5,4,2
chr5	176637408	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=175,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,2:9,1:9,3,1,2
chr5	176637570	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=137,207;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,2:6,1:5,5,0,3
chr5	176694559	.	AC	CA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=175,192;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,0:11,2:12,11,0,2
chr5	176700885	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	176720766	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=215,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr5	176728878	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=204,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:7,6:8,3:7,9,1,8
chr5	176729736	.	ACC	A,AC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27,26;MFRL=228,150,178;MMQ=60,60,60;MPOS=27,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=C;STR;TLOD=3.21,12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,6:0.199,0.525:11:0,1,1:3,1,4:0,3,0,8
chr5	176730139	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=186,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,1:5,2:0|1:176730139_G_C:176730139:3,8,3,0
chr5	176730142	.	CACCGTG	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.178:15:5,1:6,1:0|1:176730139_G_C:176730139:4,9,2,0
chr5	176730154	.	CCCCTCCGGATGCACTCACGTTCTGATA	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=35,22;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=-1073741821;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:5,0:7,1:0|1:176730139_G_C:176730139:6,15,2,0
chr5	176733024	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,67;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:9,15,0,2
chr5	176733616	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=212,180;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,6:0,3:0,1,0,9
chr5	176765395	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=212,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:2,2:4,0:6,0,3,0
chr5	176798040	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=235,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,0:0,1:1,0,1,1
chr5	176798070	.	CGGGCCGGGGCCGGGGCCGGGGCCG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=198,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,5;RU=GGGCCG;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:2,0,2,0
chr5	176798306	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=158,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:8,5:5,4:5,8,5,4
chr5	176813404	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,3:5,1:8,6,2,2
chr5	176814901	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=270,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr5	176815004	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=177,81;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,7:5,1:7,3,7,1
chr5	176824137	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=202,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:2,1:0,5,0,2
chr5	176830627	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr5	176831119	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=227,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr5	176831177	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=146,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.568:7:2,1:1,3:2,1,2,2
chr5	176831980	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,6:0,2:0,0,5,4
chr5	176857769	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,17,0
chr5	176858049	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:2,0:2,2:0,4,0,3
chr5	176859414	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=210,128;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:1,14,0,2
chr5	176859848	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,6:3,5:2,4,4,7
chr5	176860965	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=169,52;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:12,0:9,2:0|1:176860965_G_T:176860965:14,8,1,1
chr5	176860982	.	G	GCTTTCCTTTATGGCTCAGGATGTGCT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=164,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:14,0:7,2:0|1:176860965_G_T:176860965:11,10,1,1
chr5	176868780	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,19;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.488:8:1,2:3,0:0|1:176868780_A_C:176868780:1,3,4,0
chr5	176868784	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=133,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.441:9:2,1:3,0:0|1:176868780_A_C:176868780:1,4,4,0
chr5	176885425	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:8,1:13,5,2,0
chr5	176886539	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=169,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr5	176887737	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=228,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:176887737_T_A:176887737:0,1,1,0
chr5	176887746	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,25;MFRL=228,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:176887737_T_A:176887737:0,1,1,0
chr5	176895817	.	GC	AA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,10,4
chr5	176917764	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,2:1,0:3,0,2,0
chr5	176919656	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:4,2:2,5,0,3
chr5	176929974	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=185,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,6:2,2:6,0,7,1
chr5	176930135	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,10,8
chr5	176930171	.	AGAG	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:1,7:7,3:5,3,6,4
chr5	176931706	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:3,1,1,4
chr5	176935215	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	176939051	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,9:0,5:0,1,8,6
chr5	176939688	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chr5	176939735	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr5	176940274	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:2,0,5,1
chr5	176940871	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=64.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0|1:176940871_G_C:176940871:0,0,8,11
chr5	176940873	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=121,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:0|1:176940871_G_C:176940871:7,10,1,1
chr5	176941793	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=177,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,0:4,2:6,5,0,2
chr5	176950879	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	176963349	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,8:0,0,13,3
chr5	176965887	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,210;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:13,3:8,0:15,7,3,0
chr5	177019688	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,12:0,0,5,15
chr5	177020602	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=123,306;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:6,1:12,2,2,0
chr5	177031602	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr5	177035488	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:2,2,1,3
chr5	177036043	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:1,6:0,4:0,1,1,9
chr5	177151456	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=199,210;MMQ=27,26;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,2,2
chr5	177166053	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=138,122;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:5,0:0,3:4,1,2,1
chr5	177166109	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=147,115;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:13,0:4,2:9,8,1,1
chr5	177422823	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:4,0,6,1
chr5	177466530	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=179,182;MMQ=24,23;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr5	177546564	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:13,6,0,2
chr5	177547336	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,0:3,4:5,1,2,2
chr5	177570759	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,4,7
chr5	177574901	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.557:23:6,7:4,5:6,4,7,6
chr5	177578009	.	AAC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=206,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,2:6,2:3,7,3,2
chr5	177633852	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.416:34:6,8:14,6:12,8,7,7
chr5	177634029	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=177,133;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,5:6,0:9,2,5,0
chr5	177637447	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=200,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,3:2,5:2,0,5,3
chr5	177639069	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=205,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr5	177642177	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=137,232;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr5	177658883	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr5	177658896	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=179,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,3:3,4:0,6,0,7
chr5	177673401	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=186,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.499:20:4,6:6,4:3,7,6,4
chr5	177675217	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:1,5:2,8:1,2,3,10
chr5	177679447	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,4,1
chr5	177679654	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:2,3,0,2
chr5	177679680	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=123,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:0,3,1,3
chr5	177684682	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=206,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr5	177686616	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:177686616_A_C:177686616:0,0,1,0
chr5	177686621	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,22;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177686616_A_C:177686616:0,0,1,0
chr5	177686622	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177686616_A_C:177686616:0,0,1,0
chr5	177686627	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,16;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:177686616_A_C:177686616:0,0,1,0
chr5	177686632	.	AT	CC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:177686616_A_C:177686616:0,0,1,0
chr5	177686639	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,15;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,0:0|1:177686616_A_C:177686616:0,0,1,0
chr5	177686815	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=131,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:2,7,1,1
chr5	177695865	.	G	GGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=244,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:177695865_G_GGA:177695865:0,2,0,1
chr5	177695869	.	G	GGAAGCTATTATTCTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=244,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.403:3:1,1:0,0:0|1:177695865_G_GGA:177695865:0,2,0,1
chr5	177695874	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:177695865_G_GGA:177695865:0,1,0,1
chr5	177715291	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.739:21:3,10:2,6:4,1,5,11
chr5	177715302	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=100,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.827:18:2,9:1,6:1,2,5,10
chr5	177715452	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=172,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:12,2:5,4:11,6,3,3
chr5	177715465	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=157,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:10,2:6,3:11,7,3,2
chr5	177715477	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=193,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.801:23:2,12:2,7:2,2,12,7
chr5	177717287	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=197,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,0:6,4:9,2,3,1
chr5	177987740	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.332:33:12,5:9,4:7,15,6,5
chr5	177987780	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=195,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,5:4,1:2,8,2,5
chr5	178030941	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=10,18;MFRL=210,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.507:6:0,0:0,1:0,3,1,2
chr5	178039525	.	T	TCA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=167,45;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.193:13:6,0:5,2:0|1:178039525_T_TCA:178039525:8,3,1,1
chr5	178039530	.	G	GGATCCCCTAGATT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=173,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:178039525_T_TCA:178039525:8,4,1,1
chr5	178039532	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=173,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:178039525_T_TCA:178039525:8,4,1,1
chr5	178039533	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=173,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:178039525_T_TCA:178039525:8,4,1,1
chr5	178040394	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	178040919	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=209,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr5	178140637	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=210,178;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:0,3,0,4
chr5	178140643	.	A	ACCC	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=272,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.303:4:3,1:0,0:0|1:178140643_A_ACCC:178140643:0,3,0,1
chr5	178140645	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=272,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.303:4:3,1:0,0:0|1:178140643_A_ACCC:178140643:0,3,0,1
chr5	178140646	.	A	AGTTTTTTTGTTTGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=272,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:178140643_A_ACCC:178140643:0,3,0,1
chr5	178140647	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=272,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:178140643_A_ACCC:178140643:0,3,0,1
chr5	178288214	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,174;MMQ=27,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:1,6,1,1
chr5	178358220	.	ATT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr5	178359697	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=142,465;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,0:10,2:9,6,1,1
chr5	178369673	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=177,282;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr5	178454997	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=181,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:2,1:8,1:9,1,0,2
chr5	178455198	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr5	178541152	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=133,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:12,3:6,4:8,10,2,5
chr5	178549791	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,5:2,5:0,3,1,9
chr5	178555097	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,2:6,3:3,9,3,2
chr5	178557142	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,2,3
chr5	178564704	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:178564704_C_T:178564704:0,0,1,0
chr5	178564706	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:178564704_C_T:178564704:0,0,1,0
chr5	178567054	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=357,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	178581259	.	C	CTCTTTCTTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=256,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	178581797	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,7:1,3:0,1,8,2
chr5	178634683	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=186,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0,5,0,4
chr5	178986978	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr5	178989473	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:2,2:3,0:5,0,2,1
chr5	178994473	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:4,7,1,1
chr5	178996435	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=172,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:7,1:2,5:2,7,2,4
chr5	179028818	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=124,104;MMQ=56,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.514:9:0,1:4,3:4,0,0,5
chr5	179028850	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=126,44;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,0:12,2:3,14,0,2
chr5	179036433	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:6,2:9,2:5,10,0,4
chr5	179041785	.	GAAAA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:0,1:0,1,2,1
chr5	179043075	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,10:0,0,15,7
chr5	179045210	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=145,186;MMQ=60,38;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,5:0.125:46:15,0:23,5:0|1:179045210_T_C:179045210:20,21,0,5
chr5	179045213	.	A	AC	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=145,186;MMQ=60,38;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,5:0.125:46:17,0:24,5:0|1:179045210_T_C:179045210:20,21,0,5
chr5	179048205	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=182,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:2,6:4,5:4,3,7,4
chr5	179048449	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=193,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:0,10,0,3
chr5	179069309	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr5	179069551	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,210;MMQ=60,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	179070556	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=159,164;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,3:0,0:0,4,0,3
chr5	179070578	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=159,164;MMQ=60,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.289:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr5	179136138	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr5	179147641	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=233,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:0,2,0,7
chr5	179149866	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,81;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,3:7,0:9,9,3,0
chr5	179150788	.	G	GT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:10,0:4,3:2,15,2,2
chr5	179153577	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	179227471	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:9,1:10,1:7,13,1,2
chr5	179260494	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	179260528	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=191,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	179267783	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=171,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,1:6,1:6,0,2,0
chr5	179271060	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=139,143;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr5	179271310	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	179294748	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=200,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:7,0:11,5,3,0
chr5	179299856	.	AG	CA,CC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=16,35,27;MFRL=226,146,197;MMQ=60,60,60;MPOS=14,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.33,7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.312,0.375:4:0,1,0:0,0,2:1,0,3,0
chr5	179299861	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=18,28;MFRL=186,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:0,2:4,0,2,0
chr5	179299867	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=22,21;MFRL=113,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,2:2,0,3,1
chr5	179334857	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	179405144	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:3,3,1,1
chr5	179407229	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=178,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,5:1,5:1,2,3,7
chr5	179439991	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	179498595	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=149,102;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:4,3:0,5:3,1,3,5
chr5	179528558	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=150,70;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr5	179545562	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=201,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr5	179555407	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=177,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:5,2,7,0
chr5	179563532	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr5	179565071	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr5	179565136	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	179663614	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=296,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	179667986	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr5	179728707	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,214;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr5	179729625	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0,9,0,2
chr5	179731695	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=191,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:2,1:3,4:5,0,5,1
chr5	179734139	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=177,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr5	179734145	.	GTGGGGGTGGGGGC	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=158,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGGGGTGGGGGC;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:4,1:6,0,2,0
chr5	179734312	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=137,204;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:2,5,0,2
chr5	179744062	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=239,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,1:8,2:8,4,1,2
chr5	179746036	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=204,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr5	179751111	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=229,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr5	179751355	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=202,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:1,12,0,2
chr5	179763018	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:1,2:0,3,0,2
chr5	179763398	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr5	179765413	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr5	179780292	.	CCTCCGTGGG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTCCGTGGG;STR;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,0:0,1,0,3
chr5	179780328	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.659:4:1,2:0,0:0|1:179780328_G_A:179780328:0,1,0,3
chr5	179780340	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	179780357	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0|1:179780328_G_A:179780328:0,0,0,2
chr5	179980527	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=126,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr5	179991806	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=228,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:0,9,0,2
chr5	179991841	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=215,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr5	179998454	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=202,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,2:7,0:2,13,2,0
chr5	180041001	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:180041001_G_C:180041001:0,0,4,0
chr5	180041008	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:180041001_G_C:180041001:0,0,4,0
chr5	180041208	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,1:0,6:0,0,4,4
chr5	180045703	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=148,236;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:180045703_G_T:180045703:1,0,2,0
chr5	180045704	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,25;MFRL=148,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:180045703_G_T:180045703:1,0,2,0
chr5	180045705	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=148,236;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:180045703_G_T:180045703:1,0,2,0
chr5	180046426	.	C	CTGGCCGCTTAGCTAAGGCACAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	180047863	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=52.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,10:0,5:0,0,9,7
chr5	180048986	.	G	GCCTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=241,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CCTC;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr5	180049927	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=273,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	180053307	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	180055862	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:180055862_T_G:180055862:0,0,4,0
chr5	180055864	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,1:0,1:0|1:180055862_T_G:180055862:0,0,4,0
chr5	180056192	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=288,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr5	180056620	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	180057057	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=186,77;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:3,0:11,2:5,9,0,2
chr5	180219304	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,248;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,1:8,1:8,6,1,1
chr5	180277646	.	GCATTCATAGGGCTTCTCCCCCGTGTGGATCCTTTTGTGGACTCTGAGCCCAGAGCTGTTCCTGAAGGCCTTCCCACACTCACCA	G	.	.	DP=85;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=142,80;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,4:0.071:71:9,0:19,4:30,37,2,2
chr5	180277739	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=144,93;MMQ=60,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:7,0:23,2:0|1:180277739_G_A:180277739:8,24,1,1
chr5	180277742	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=146,93;MMQ=60,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:8,0:23,2:0|1:180277739_G_A:180277739:8,25,1,1
chr5	180277748	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=146,93;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:9,0:21,1:0|1:180277739_G_A:180277739:7,24,1,1
chr5	180329458	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=175,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:1,3,2,3
chr5	180329532	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr5	180329536	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=176,192;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr5	180338300	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,3:5,7:4,5,9,1
chr5	180338440	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:7,2:3,3:4,6,3,2
chr5	180374484	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=121,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:3,6:1,6:3,1,6,6
chr5	180374575	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=206,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:5,4,1,1
chr5	180376363	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:180376363_G_C:180376363:0,0,0,1
chr5	180376368	.	C	CCCTGACCAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,0:0,1:0|1:180376363_G_C:180376363:0,0,0,1
chr5	180430797	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=92,186;MMQ=40,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:8,5:1,7:4,5,7,5
chr5	180431005	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=149,258;MMQ=55,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:0|1:180431005_G_T:180431005:0,2,0,1
chr5	180431006	.	C	CCCCCAGGTCTTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=149,258;MMQ=55,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:180431005_G_T:180431005:0,2,0,1
chr5	180477449	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr5	180481104	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.195:27:8,0:14,4:22,0,5,0
chr5	180481216	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:0,0:1,0:1,2,0,2
chr5	180482899	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=119,256;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr5	180486224	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	180582980	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	180625672	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=118,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,1:6,4:8,7,4,1
chr5	180626036	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=138,261;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:6,4,1,1
chr5	180627224	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=174,283;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:0,9,0,2
chr5	180650951	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.831:4:0,0:0,1:0|1:180650951_G_C:180650951:0,0,4,0
chr5	180650956	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.831:4:0,0:0,1:0|1:180650951_G_C:180650951:0,0,4,0
chr5	180650958	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,1:0|1:180650951_G_C:180650951:0,0,3,0
chr5	180650966	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:180650951_G_C:180650951:0,0,3,0
chr5	180650969	.	GAA	CCC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=188,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.674:4:0,0:0,2:0|1:180650951_G_C:180650951:1,0,3,0
chr5	180663941	.	GT	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:13,0:10,3:20,5,3,0
chr5	180669136	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=193,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:5,1:0,2:4,1,3,0
chr5	180669370	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=185,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,1:6,1:2,13,1,1
chr5	180686958	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=174,253;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:2,0:11,2:12,1,1,1
chr6	292447	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=256,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:0,0:1,0:0|1:292447_T_A:292447:1,0,2,0
chr6	292452	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=238,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,1:1,0:0|1:292447_T_A:292447:2,0,2,0
chr6	292694	.	GC	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=203,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:0,8,0,3
chr6	311797	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:6,1:1,1:7,0,3,0
chr6	312023	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.181:31:11,3:15,2:0|1:312023_C_T:312023:5,21,1,4
chr6	312029	.	TAATG	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:18,12:0.407:30:10,5:8,7:1|0:312023_C_T:312023:4,14,0,12
chr6	335251	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:5,2:4,2:0|1:335251_T_C:335251:0,10,0,4
chr6	335253	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:5,2:4,2:0|1:335251_T_C:335251:0,10,0,4
chr6	335268	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,4:5,3:0,11,0,7
chr6	348051	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=188,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:6,2,8,0
chr6	348080	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=285,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=71.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:0,15:1,8:0,1,18,5
chr6	349016	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=192,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:1,5:8,4:2,7,3,7
chr6	350940	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=179,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.351:18:8,4:4,2:1,11,0,6
chr6	397261	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=208,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,3:5,0:0|1:397261_G_A:397261:3,6,0,3
chr6	397269	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=208,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,3:5,0:0|1:397261_G_A:397261:2,7,0,3
chr6	398775	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=154,118;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:0|1:398775_G_A:398775:9,1,3,0
chr6	398783	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:5,2:4,3:0|1:398775_G_A:398775:9,1,4,1
chr6	407583	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=158,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:13,0:15,3:14,15,3,0
chr6	407656	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=69,145;MMQ=60,44;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr6	407662	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=69,158;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:407662_G_A:407662:0,4,0,1
chr6	407667	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=69,158;MMQ=60,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:407662_G_A:407662:0,4,0,1
chr6	407669	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,36;MFRL=69,158;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:407662_G_A:407662:0,4,0,1
chr6	407673	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=69,158;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:407662_G_A:407662:0,4,0,1
chr6	486768	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=177,367;MMQ=60,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.304:13:5,0:4,2:0,9,0,4
chr6	497520	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:6,5:3,5:4,6,0,10
chr6	564515	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=247,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,4:2,7:5,1,11,0
chr6	572480	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,4:3,6:1,3,7,3
chr6	572714	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=252,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr6	599042	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=236,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,6:1,7:1,2,9,4
chr6	656810	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=192,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.254:22:8,2:6,3:12,5,5,0
chr6	1313117	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1313117_A_C:1313117:0,0,0,1
chr6	1313121	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1313117_A_C:1313117:0,0,0,1
chr6	1315019	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0|1:1315019_T_TG:1315019:0,2,2,2
chr6	1315021	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0|1:1315019_T_TG:1315019:0,2,2,2
chr6	1395043	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=209,111;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:3,9:1,7:3,1,8,8
chr6	1612419	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:4,2:8,1:3,12,1,3
chr6	1613415	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=147,105;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:12,1:12,2:11,13,0,3
chr6	1624512	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,1:6,1:5,2,0,2
chr6	1624821	.	T	TGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=133,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,18;RU=G;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.313:15:6,1:4,0:10,0,0,5
chr6	1726623	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,1:6,1:10,2,2,0
chr6	1742908	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	2624262	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=147,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.192:19:8,2:7,1:7,9,2,1
chr6	2624374	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=185,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,1:2,6:0,4,1,6
chr6	2683439	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	2685518	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:8,2:3,0:5,6,0,2
chr6	2685677	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr6	2685904	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=180,249;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	2689217	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=142,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,2:3,1:3,6,0,3
chr6	2766465	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr6	2766727	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=196,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:0,6,0,6
chr6	2766779	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr6	2769205	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr6	2779680	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,2:7,0:7,10,1,1
chr6	2785563	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr6	2834265	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=362,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,2:0,4:0,1,0,8
chr6	2836266	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=191,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,9:3,1:1,4,3,7
chr6	2838046	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=247,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,6:2,3:1,1,9,0
chr6	2838102	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=170,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.613:24:2,9:7,5:6,3,10,5
chr6	2838248	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,4:0,1,4,6
chr6	2900762	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=157,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.204:32:10,0:16,6:9,17,2,4
chr6	2948614	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=157,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.486:29:6,7:8,7:7,8,7,7
chr6	2948965	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr6	2953252	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=203,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.710:22:4,12:2,4:3,3,11,5
chr6	2953445	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=175,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,9:1,3:0,1,4,8
chr6	2953496	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=182,261;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,1:2,1:0,9,0,2
chr6	2959420	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,0:5,7:6,3,4,3
chr6	3006821	.	CT	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,104;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.150:24:13,2:6,1:7,14,1,2
chr6	3010459	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=254,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,2:2,5:0,3,1,6
chr6	3012725	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=193,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:1,5:0,2:1,0,5,2
chr6	3019654	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=364,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	3078266	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	3081134	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=218,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,2,0
chr6	3085690	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	3118947	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=342,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr6	3156285	.	CTCA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=214,145;MMQ=40,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:2,6,0,2
chr6	3157579	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=208,322;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:3157579_G_C:3157579:2,0,1,0
chr6	3157584	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=208,322;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:3157579_G_C:3157579:2,0,1,0
chr6	3157798	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=193,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr6	3157809	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=195,322;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr6	3255416	.	CTGGTGGAAGTAGGATGTT	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.089:32:11,2:12,0:18,12,1,1
chr6	3263830	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	3264101	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr6	3264502	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,15:0,0,11,15
chr6	3264526	.	CT	TC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,7,13
chr6	3264582	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	3284265	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=208,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr6	3285375	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=191,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:2,10,2,0
chr6	3723764	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=186,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,3:0,7:1,0,10,0
chr6	3739193	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=206,74;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr6	3983633	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=155,37;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:3983633_A_T:3983633:5,9,1,1
chr6	3983636	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=155,37;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,0:7,2:0|1:3983633_A_T:3983633:5,9,1,1
chr6	4021554	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,12,0
chr6	4033065	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	4037582	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,4,1
chr6	4040924	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=231,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:5,0,5,0
chr6	4044297	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=124,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:3,6:0,2:1,2,1,7
chr6	4044344	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=199,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,7:1,4:0,2,0,11
chr6	4049422	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr6	4052167	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.626:6:2,2:0,2:0|1:4052167_C_A:4052167:1,1,3,1
chr6	4052171	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=141,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.331:7:2,2:3,0:1|0:4052167_C_A:4052167:3,2,1,1
chr6	4052383	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=97,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,4:3,5:1,3,2,7
chr6	4057200	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,4:1,3:1,2,5,2
chr6	4057233	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=167,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:3,5,4,2
chr6	4057429	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=194,231;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,6:2,1:0,3,3,4
chr6	4070133	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=123,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:7,0:5,3:7,5,2,1
chr6	4074612	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=249,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,5,2
chr6	4119516	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,2:8,1:10,6,1,2
chr6	4119553	.	ATT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=15,22;MFRL=181,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:0,0:2,1:1,5,0,2
chr6	4122249	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=161,99;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.479:27:7,6:7,7:6,8,8,5
chr6	4936074	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,1:0,5:0,0,0,7
chr6	4937728	.	C	CA,CAA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,32,31;MFRL=190,192,185;MMQ=60,60,60;MPOS=14,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=5.05,6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.332,0.332:9:2,1,1:0,2,2:3,0,5,1
chr6	4937742	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=265,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=41.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.706:15:1,2:3,3:0|1:4937742_C_CT:4937742:4,0,8,3
chr6	4937747	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=265,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.706:15:1,4:3,6:0|1:4937742_C_CT:4937742:4,0,8,3
chr6	4952413	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	5000027	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:7,2:8,3:11,5,4,1
chr6	5000779	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=118,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.202:21:8,1:8,2:9,8,2,2
chr6	5086070	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	5260816	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	5431883	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=125,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:14,1:9,5:13,10,2,4
chr6	5431960	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=245,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:1,3:1,9:2,0,3,9
chr6	5545654	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	5831924	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=140,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.687:17:1,4:3,8:4,1,10,2
chr6	5832125	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,4:0,6:0,1,1,9
chr6	6152137	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:6,3:8,3:0|1:6152137_C_G:6152137:6,8,3,3
chr6	6152140	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.317:20:6,3:8,3:0|1:6152137_C_G:6152137:6,8,3,3
chr6	6152211	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:2,1:9,2:4,7,0,3
chr6	6167621	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr6	6174786	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,7,5
chr6	6196141	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:6,4:8,2:5,10,1,5
chr6	6588881	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=214,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr6	7229470	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=250,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,1:6,1:6,4,1,1
chr6	7232186	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	7240577	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=177,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr6	7240876	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,276;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:15,3:7,0:5,17,0,3
chr6	7295605	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:5,2,3,1
chr6	7295755	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=241,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr6	7298287	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,1:2,3:0,2,1,3
chr6	7301834	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=270,271;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	7303735	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,214;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:1,3:9,2:8,2,5,0
chr6	7313406	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=215,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr6	7330194	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr6	7368917	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=263,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,4:1,1:0,2,3,2
chr6	7373249	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr6	7373537	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=230,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,1:6,3:4,4,1,3
chr6	7374207	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,2:9,0:7,7,1,1
chr6	7378899	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,30;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:10,4,1,1
chr6	7379346	.	A	ATCCCCAGTACCTGGAATAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=193,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	7387433	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=201,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.723:9:1,6:1,1:0,2,3,4
chr6	7387462	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=241,254;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,8:1,0:0,3,0,8
chr6	7390369	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=274,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,26:0.844:30:2,14:2,11:1,3,6,20
chr6	7396836	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,4:3,2:4,0,6,0
chr6	7396887	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=171,293;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,3:5,2:9,3,3,2
chr6	7401382	.	AAAAC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=168,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	7402835	.	GG	AA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=181,39;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:11,2,0,2
chr6	7404756	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=197,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.246:18:2,2:12,2:6,8,1,3
chr6	7410735	.	GTT	G,GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,23,34;MFRL=146,152,84;MMQ=60,60,31;MPOS=23,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=3.68,5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,3:0.185,0.248:13:6,1,0:2,0,2:2,6,0,5
chr6	7411750	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	7413094	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=143,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.210:22:9,4:6,0:14,4,4,0
chr6	7414657	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,5:2,4:1,2,0,9
chr6	7564139	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=254,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:0,3,0,5
chr6	7567970	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,4:0,5:0,1,8,1
chr6	7571874	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=299,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr6	7574805	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=176,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr6	7574852	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:9,2,2,0
chr6	7578189	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr6	7578819	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0|1:7578819_T_G:7578819:0,0,2,10
chr6	7578823	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,3:0,9:0|1:7578819_T_G:7578819:0,0,2,11
chr6	7579412	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	7585670	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:9,7:12,7:8,13,8,6
chr6	7590484	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=183,259;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.318:13:4,1:5,2:8,1,4,0
chr6	7590624	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=167,261;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:10,2:3,1:5,8,0,3
chr6	7590653	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=163,244;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:9,3:3,2:3,9,0,5
chr6	7595241	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=62,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.250:17:8,1:5,3:10,3,4,0
chr6	7606384	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=163,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:21,4:12,0:17,17,4,0
chr6	7879407	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=112,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:2,7:8,1:4,6,3,5
chr6	8016089	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=202,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr6	8016157	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=228,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	8026577	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=226,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:1,1:3,4:2,2,5,1
chr6	8428071	.	CAT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=216,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.464:13:2,3:5,1:7,0,6,0
chr6	8428137	.	A	AAGT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:5,0:6,3:8,3,2,2
chr6	8430396	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:10,2:6,4:4,12,3,3
chr6	9900599	.	T	TGAG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=140,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=54.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:1,7:5,7:5,1,9,5
chr6	10402438	.	C	CAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=185,266;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr6	10411775	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=118,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:14,0:6,3:16,4,3,0
chr6	10529087	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr6	10587038	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,8,10
chr6	10634216	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,123;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,0:5,5:4,8,0,5
chr6	10634953	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=230,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:10634953_T_C:10634953:0,3,0,1
chr6	10634956	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=248,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:10634953_T_C:10634953:0,2,0,1
chr6	10634960	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	10687746	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=162,63;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,3:4,1:8,3,3,1
chr6	10695136	.	GTT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	10724943	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=112,206;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.861:12:1,7:0,4:0,1,1,10
chr6	10729020	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	10756854	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=195,142;MMQ=55,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,1:4,1:0|1:10756854_C_T:10756854:0,6,0,3
chr6	10756875	.	GAC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=202,142;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0|1:10756854_C_T:10756854:0,4,0,3
chr6	10764727	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=241,154;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,6:5,2:3,3,3,5
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chr6	10802101	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=219,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:1,1:1,9:1,1,6,4
chr6	10875238	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	10876036	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=218,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:3,0,3,0
chr6	10887253	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=186,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:2,0,4,1
chr6	10887276	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=186,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,4:2,1:2,0,3,2
chr6	10891651	.	ATTT	A,AT,ATT	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,30,32,27;MFRL=173,213,216,169;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,5,5;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=20,17,18,19;RU=T;STR;TLOD=12.76,8.40,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,10,5,3:0.388,0.251,0.160:22:4,6,4,3:0,4,1,0:4,0,18,0
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chr6	10891677	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=17,15;MFRL=201,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.281:25:2,0:3,0:0|1:10891677_G_T:10891677:18,0,7,0
chr6	10891687	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=14,15;MFRL=176,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.272:23:2,1:1,1:0|1:10891677_G_T:10891677:16,1,6,0
chr6	10891781	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=171.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,26:0,29:0,0,36,19
chr6	10894255	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:8,5:6,4:8,6,3,6
chr6	10894268	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.372:17:4,4:6,2:5,6,1,5
chr6	10894381	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=204,272;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:6,5,0,2
chr6	10898944	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,0:4,2:4,1,2,0
chr6	10906154	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr6	10927692	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	10931587	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	10942994	.	CTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=231,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,1:1,1:1,1,1,2
chr6	10961649	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=133,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:8,1,0,3
chr6	10989873	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.385:13:3,4:5,1:4,4,5,0
chr6	10990493	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=235,262;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:2,1,2,0
chr6	11005842	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=197,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,1:6,2:0,7,0,3
chr6	11094681	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,0:1,1:0,2,0,3
chr6	11185967	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:1,0:2,4:0,3,0,4
chr6	11191325	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=150,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:2,6:5,0:0|1:11191325_C_A:11191325:3,5,6,0
chr6	11191328	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=150,201;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:3,6:5,0:0|1:11191325_C_A:11191325:3,5,6,0
chr6	11192575	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=103,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:3,6:11,7:4,10,3,10
chr6	11306153	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:4,4:10,3:13,1,6,1
chr6	11538534	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=194,263;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr6	11714806	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,5:3,5:1,5,2,8
chr6	11723538	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.654:9:2,4:0,2:3,0,5,1
chr6	11779088	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.816:9:1,6:0,1:0,1,0,8
chr6	12016009	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr6	12120090	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:3,5:1,5:4,0,5,5
chr6	12122854	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=191,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:8,10:6,0:10,4,10,0
chr6	12123232	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=173,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:9,1:6,1:10,5,0,2
chr6	12124870	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.334:19:8,4:5,2:7,6,4,2
chr6	12290892	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,36;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,2:10,0:9,5,1,1
chr6	12294137	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,2:6,2:4,6,3,1
chr6	13182685	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=191,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:5,0,3,0
chr6	13182995	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=190,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr6	13228008	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,71;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,0:2,2:6,2,1,1
chr6	13278648	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,1,13
chr6	13287388	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=185,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,0:7,5:0,10,0,5
chr6	13307824	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:7,1:10,3:7,10,3,1
chr6	13316780	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.404:8:1,1:4,2:3,2,3,0
chr6	13321097	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=207,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:2,4:7,2:8,1,6,0
chr6	13365913	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	13470113	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,12,3
chr6	13470428	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,0:13,2:15,8,0,2
chr6	13592135	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=212,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:11,2:6,3:8,9,2,3
chr6	13612061	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:0|1:13612061_A_T:13612061:9,15,1,1
chr6	13612068	.	GC	CG	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:0|1:13612061_A_T:13612061:8,14,1,1
chr6	13612071	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:11,2:0|1:13612061_A_T:13612061:8,15,1,1
chr6	13612075	.	A	ATTTTTCAGAATCAGGTTT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:0|1:13612061_A_T:13612061:6,14,1,1
chr6	13616712	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=149,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:6,0:12,2:10,9,1,1
chr6	13620877	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=260,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:2,1,2,0
chr6	13622567	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:10,2,3,0
chr6	13800626	.	TAA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=A;STR;TLOD=47.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,10:0,2:0,0,4,8
chr6	13977698	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=200,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,2:8,2:6,9,3,1
chr6	13978802	.	TCTC	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=147,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.217:17:7,2:7,1:7,7,1,2
chr6	13978837	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:5,1:6,6,1,1
chr6	14118138	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:2,3,1,2
chr6	14133863	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=190,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,2:9,0:9,4,2,0
chr6	14134083	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=173,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr6	15246896	.	CT	AG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,4:2,4:1,5,1,7
chr6	15246915	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=182,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:0,5,0,6
chr6	15374508	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,7:0,0,4,11
chr6	15374544	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr6	15410647	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:2,2:8,4:0,10,0,6
chr6	15468722	.	AGGGTGAG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.447:7:0,2:3,1:4,0,3,0
chr6	15497422	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:1,4:7,2:3,5,4,3
chr6	15501726	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=113,357;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr6	15507560	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=160,309;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:9,3:9,2:9,9,1,4
chr6	15511429	.	C	CCCAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=237,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr6	15513399	.	CGT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GT;STR;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr6	15523388	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=188,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:7,1:11,8:7,11,5,4
chr6	15593240	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=272,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=86.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,26:0.902:28:1,14:1,12:2,0,19,7
chr6	15638067	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr6	15638085	.	A	AGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=196,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	15651642	.	GAA	G,GAAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=11,26,26;MFRL=154,176,187;MMQ=60,60,60;MPOS=32,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=A;STR;TLOD=4.06,5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.221,0.192:9:0,0,0:0,1,1:0,5,1,3
chr6	15651657	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=159,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,0:5,0:1,11,1,1
chr6	15652452	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=195,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr6	16145325	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=248,82;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.477:21:4,4:7,6:7,4,4,6
chr6	16274791	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=239,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr6	16279189	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=212,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:0,5,2,2
chr6	16290862	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=184,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.301:15:6,4:2,0:3,8,2,2
chr6	16290889	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=182,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:7,2:1,0:1,7,0,2
chr6	16306579	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=205,61;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr6	16306977	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=229,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:3,4,1,2
chr6	16328240	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:11,7,2,0
chr6	17541460	.	A	ATGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=122,173;MMQ=60,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:17541460_A_ATGC:17541460:0,4,0,1
chr6	17541461	.	A	AAGAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=149,173;MMQ=60,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:17541460_A_ATGC:17541460:0,3,0,1
chr6	17541464	.	A	AATAGCCAATCAGAAGCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=149,173;MMQ=60,49;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:17541460_A_ATGC:17541460:0,3,0,1
chr6	17543036	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr6	17600619	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr6	17602797	.	CT	C,CTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32,31;MFRL=166,120,120;MMQ=60,60,60;MPOS=6,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=4.84,4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,3:0.250,0.241:13:4,2,0:3,1,2:7,0,5,1
chr6	17605106	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=120,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:2,3,1,2
chr6	17616256	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=213,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr6	17616493	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	17633061	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr6	17675386	.	GAA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.307:14:2,2:3,1:6,4,3,1
chr6	17764731	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=167,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,4:7,2:9,6,2,4
chr6	17777614	.	CT	C,CTTTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,32,32;MFRL=116,234,156;MMQ=60,60,58;MPOS=7,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,16;RU=T;STR;TLOD=4.50,4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,2:0.342,0.210:11:0,2,0:3,2,1:1,4,0,6
chr6	17779731	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,167;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,3:5,2:7,0,5,0
chr6	17785948	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	17790191	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,0:6,3:0,11,1,2
chr6	17799766	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr6	17800131	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,244;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:6,1,3,0
chr6	17804730	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,2:6,2:1,7,4,0
chr6	17809168	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:2,4,0,3
chr6	17809199	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr6	17817235	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,8,3
chr6	17817472	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=125,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:10,3:12,0:8,14,0,3
chr6	17817506	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=113,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,5:4,0:0,8,2,3
chr6	17834316	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=141,253;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr6	17834328	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=141,253;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr6	17834346	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=71,269;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr6	17837242	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:11,11,2,0
chr6	17852169	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=158,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.382:13:2,2:6,3:2,6,4,1
chr6	17855864	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr6	17856364	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:4,1:8,1:0|1:17856364_AG_A:17856364:4,9,0,2
chr6	17856371	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,1:6,1:0|1:17856364_AG_A:17856364:4,8,0,2
chr6	17856373	.	TT	AA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:4,1:6,1:0|1:17856364_AG_A:17856364:3,7,0,2
chr6	17898423	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=138,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.189:20:6,1:11,2:6,11,1,2
chr6	18122506	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=205,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:1,6,0,3
chr6	18134021	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=127,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.441:14:2,2:5,4:4,4,4,2
chr6	18139214	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=136,118;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.369:25:6,4:10,5:9,7,6,3
chr6	18139802	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=235,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,5:4,2:6,1,7,0
chr6	18139964	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:6,2:5,3:4,9,1,4
chr6	18143769	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,1,1
chr6	18148019	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,2:5,6:10,2,7,1
chr6	18148155	.	GAA	G,GA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=138,210,152;MMQ=60,60,60;MPOS=14,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=3.26,6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,2,4:0.128,0.227:19:5,1,1:5,1,2:2,11,1,5
chr6	18148247	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=246,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr6	18161706	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=123,80;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.382:8:3,0:2,2:0,5,0,3
chr6	18171684	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,3:6,0:4,7,2,1
chr6	18197475	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=139,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr6	18208319	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=198,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,6:1,2:1,1,7,1
chr6	18212794	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=131,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,0:6,2:3,11,1,1
chr6	18213988	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=145,209;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:10,1:5,4:7,8,1,4
chr6	18218068	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=113,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:9,9,1,1
chr6	18222102	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=119,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:0,0:5,2:3,2,2,0
chr6	18226340	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,4:3,4:5,0,7,1
chr6	18256625	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:9,1:12,2:10,11,3,0
chr6	18258516	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:9,4:4,7:8,5,9,2
chr6	18399750	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr6	18399809	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=189,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,2:6,3:3,5,3,2
chr6	18427753	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:10,0,2,0
chr6	18439876	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.193:22:9,3:8,0:13,5,4,0
chr6	18459736	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=215,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:4,0,5,0
chr6	18463633	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=105,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:1,4,0,4
chr6	19837966	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,312;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19837966_T_C:19837966:0,0,1,0
chr6	19837969	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,312;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19837966_T_C:19837966:0,0,1,0
chr6	20110043	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=198,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:0,6,1,3
chr6	20118580	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr6	20124860	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=176,299;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,1,1
chr6	20128852	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=179,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,1,1
chr6	20131499	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,193;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:8,2:2,0:1,10,0,2
chr6	20144637	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr6	20212410	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=193,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:8,4:8,5:6,10,2,7
chr6	20212493	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=179,286;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,1:3,2:4,3,0,3
chr6	20481614	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=129,114;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:9,6,0,2
chr6	20483165	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,2:7,1:5,8,3,0
chr6	20490390	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=114,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.660:7:1,1:1,3:2,0,3,2
chr6	20546826	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=149,196;MMQ=40,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr6	20548781	.	CTC	AAA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=13,15;MFRL=172,219;MMQ=60,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:0,0:1,0:0|1:20548781_CTC_AAA:20548781:4,1,2,0
chr6	20548791	.	C	T,A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,20,23;MFRL=158,174,219;MMQ=60,50,46;MPOS=23,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.65,6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.250,0.250:9:0,0,0:2,1,1:4,1,4,0
chr6	20548793	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=23,10;MFRL=174,219;MMQ=60,46;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:3,0:0|1:20548781_CTC_AAA:20548781:5,1,2,0
chr6	20548795	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,21;MFRL=172,219;MMQ=60,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:0,0:3,1:0|1:20548781_CTC_AAA:20548781:4,1,2,0
chr6	20649552	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,1:4,8:3,3,4,5
chr6	20739694	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,3:0,0:4,1,3,0
chr6	20758704	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=331,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,7,0
chr6	20758760	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:8,2:3,4:10,1,5,1
chr6	20758943	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr6	21108529	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=162,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,1:1,1:3,0,3,0
chr6	21231034	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=193,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,2,0
chr6	21595266	.	G	GGGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=215,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GGC;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	21595776	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=233,244;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr6	21596349	.	ATC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=221,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,1:13,1:9,9,2,0
chr6	21596500	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=200,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.484:10:2,3:2,2:3,2,5,0
chr6	21597192	.	GAA	G,GA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,34,25;MFRL=109,169,138;MMQ=60,60,60;MPOS=21,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=3.75,5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,3,4:0.102,0.142:33:10,1,2:8,2,0:12,14,2,5
chr6	21597753	.	CT	C	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=19,20;MFRL=219,229;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.505:21:5,2:0,5:6,4,0,11
chr6	21597776	.	AG	TT	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=27,15;MFRL=99,181;MMQ=60,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:13,0:19,0:0|1:21597776_AG_TT:21597776:4,32,2,0
chr6	21597780	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=32,21;MFRL=79,181;MMQ=60,42;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:14,1:21,0:0|1:21597776_AG_TT:21597776:4,33,2,0
chr6	21597783	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=33,22;MFRL=79,181;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:13,1:22,0:0|1:21597776_AG_TT:21597776:5,36,2,0
chr6	21597790	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=6;MBQ=26,14;MFRL=88,181;MMQ=60,42;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:19,0:26,0:0|1:21597790_A_C:21597790:6,41,2,0
chr6	21597792	.	G	C	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=32,12;MFRL=88,181;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:20,0:27,0:0|1:21597790_A_C:21597790:6,41,2,0
chr6	21597906	.	G	GTTTTCAATAAAATT	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.148:31:17,0:9,4:0|1:21597906_G_GTTTTCAATAAAATT:21597906:11,16,0,4
chr6	21597910	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.149:31:18,0:9,4:0|1:21597906_G_GTTTTCAATAAAATT:21597906:11,16,0,4
chr6	22571825	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=135,70;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,1:6,1:8,8,1,1
chr6	24174928	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=122,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,3:8,0:7,9,2,1
chr6	24174955	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=131,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:7,3:3,7:5,5,4,6
chr6	24205292	.	T	TTCTGTTATG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=157,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:9,0:0|1:24205292_T_TTCTGTTATG:24205292:10,8,1,1
chr6	24205295	.	C	CTTTGTCCTGGG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=154,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,2:10,0:0|1:24205292_T_TTCTGTTATG:24205292:11,8,1,1
chr6	24205296	.	A	AACCT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=154,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.126:21:8,1:11,0:0|1:24205292_T_TTCTGTTATG:24205292:11,8,1,1
chr6	24205476	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=224,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.350:12:3,0:3,1:2,6,4,0
chr6	24278200	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr6	24302087	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,8,12
chr6	24358356	.	GCA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:4,2:8,2:7,5,1,3
chr6	24358483	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,5,15
chr6	24403549	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=268,272;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:24403549_C_A:24403549:0,2,0,2
chr6	24403559	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=305,272;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:24403549_C_A:24403549:0,1,0,2
chr6	24405357	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,6:0,4:1,0,6,4
chr6	24412555	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,3:7,0:8,11,0,3
chr6	24415380	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,259;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,1:9,2:3,10,1,2
chr6	24416562	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=219,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,6:0,2:1,0,8,0
chr6	24416593	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=189,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:1,7:0,5:0,1,10,2
chr6	24418835	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=239,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.670:10:3,5:0,2:0|1:24418835_T_TG:24418835:0,3,2,5
chr6	24418854	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=239,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:3,3:0,1:0|1:24418835_T_TG:24418835:0,3,1,4
chr6	24418878	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=210,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:24418835_T_TG:24418835:0,1,0,3
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chr6	24437611	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,289;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr6	24445718	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,8,6
chr6	24448061	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr6	24448459	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:7,2:4,1:7,5,0,3
chr6	24450168	.	G	GCCT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCT;STR;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,1:1,6:0,2,1,6
chr6	24456902	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr6	24460679	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:2,5,0,2
chr6	24460707	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=200,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr6	24463020	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=285,92;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:0,5:3,8:1,2,9,4
chr6	24463055	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=284,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:1,5:1,8:0,2,2,11
chr6	24463059	.	ACTT	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=281,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:3,4:3,4:2,4,0,8
chr6	24467060	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,255;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,1:8,2:8,5,3,0
chr6	24467366	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,2:8,1:9,3,2,1
chr6	24475278	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=229,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:24475278_G_A:24475278:1,0,2,0
chr6	24475300	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=200,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:24475278_G_A:24475278:3,2,2,0
chr6	24475517	.	TATTA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=196,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	24476553	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=141,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr6	24480025	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AT;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr6	24505030	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=87,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:4,1,5,0
chr6	24505196	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:8,1:4,1:3,9,0,2
chr6	24515330	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=113,121;MMQ=56,48;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,0:0,1:3,0,1,0
chr6	24515350	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=35,12;MFRL=163,126;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.516:11:1,0:3,1:1,4,6,0
chr6	24515364	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=103,150;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:5,1:6,1:5,9,2,0
chr6	24515371	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=95,150;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,0:9,1:5,12,2,0
chr6	24547606	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr6	24547646	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=183,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:24547646_G_A:24547646:0,4,0,1
chr6	24547650	.	T	C,TATTTCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,27,29;MFRL=202,172,130;MMQ=60,60,60;MPOS=21,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.92,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.375,0.250:5:1,2,0:1,0,1:0,2,0,3
chr6	24547652	.	TGA	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=183,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:24547646_G_A:24547646:0,4,0,1
chr6	24551624	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=206,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:6,4,2,0
chr6	24554762	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,0:6,5:5,5,3,2
chr6	24578272	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=176,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,5:2,1:6,0,4,2
chr6	24580036	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=209,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,0:3,6:4,0,5,1
chr6	24580185	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.360:15:3,3:7,2:4,6,0,5
chr6	24582419	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=156,92;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:16,1,2,0
chr6	24583804	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=181,243;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:7,1,2,1
chr6	24651320	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,230;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:3,1:3,4,0,3
chr6	24666739	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=218,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,2:7,5:3,6,6,1
chr6	24667404	.	GTCC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,37;MFRL=275,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCC;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr6	24667662	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=200,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:0,11,0,2
chr6	24687765	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	24687933	.	A	ATTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=93,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=23,26;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.611:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr6	24687999	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=165,232;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr6	24698215	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=110,90;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:11,1:10,3:10,11,2,2
chr6	24714690	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,4:4,2:2,5,1,5
chr6	24784575	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=275,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:8,5,2,0
chr6	24806594	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=123,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.384:19:7,4:4,3:6,6,6,1
chr6	24806739	.	C	CTT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,36;MFRL=169,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,0:3,4:1,5,1,3
chr6	24806752	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,36;MFRL=198,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,1,3
chr6	24806777	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=171,256;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr6	24809853	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	24809874	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=259,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr6	24809881	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr6	24828318	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,10,2
chr6	24828560	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=181,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,4:3,3:1,5,0,7
chr6	24828566	.	CCATT	C,CCATTCATT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32,35;MFRL=0,192,276;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=5,4,6;RU=CATT;STR;TLOD=29.33,9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,8,3:0.603,0.323:11:0,4,1:0,3,2:0,0,1,10
chr6	24830651	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=180,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr6	24836161	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=201,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:3,6:0,6:0,3,0,12
chr6	24843174	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=162,1210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,3:7,0:7,9,1,2
chr6	24843231	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=175,62;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:5,0:6,2:8,3,1,1
chr6	24843334	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=188,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,2:3,3:6,4,2,3
chr6	24852962	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.753:9:0,4:1,2:0,2,0,7
chr6	24861285	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:14,0:8,2:10,12,2,0
chr6	24869300	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=226,172;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.779:25:2,6:3,14:4,1,10,10
chr6	24871021	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=214,203;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr6	24871032	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=183,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:4,1,1,1
chr6	24871197	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=110,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.630:9:1,1:2,4:1,2,2,4
chr6	25084691	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,5:5,5:5,4,6,4
chr6	25084718	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=140,191;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,7:3,4:3,4,7,4
chr6	25086968	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=127,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,3:1,5:1,0,6,2
chr6	25092031	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=131,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr6	25092335	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=211,262;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:0,3,0,5
chr6	25097450	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,4:4,3:2,3,0,7
chr6	25106745	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,7:0,2:0,1,3,6
chr6	25106783	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=232,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:0,1,1,8
chr6	25108885	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=157,35;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:12,0:18,2:17,14,1,1
chr6	25108989	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=210,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:25108989_AC_A:25108989:0,2,0,4
chr6	25108991	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=210,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:25108989_AC_A:25108989:0,2,0,4
chr6	25115176	.	CGTTTTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=205,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTTTTT;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,1:3,1:5,2,2,0
chr6	25115397	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=211,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr6	25279896	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=187,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:6,3:2,0:8,1,3,0
chr6	25280119	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=124,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:9,7:3,4:2,10,3,8
chr6	25426640	.	ATTT	A,AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32,29;MFRL=237,127,117;MMQ=60,60,60;MPOS=11,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.29,5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.303,0.476:6:1,2,2:0,0,1:1,0,5,0
chr6	25450026	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=280,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr6	25450595	.	T	TA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=135,109;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:21,0:17,2:17,21,0,2
chr6	25450952	.	CTTCCTTCT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=190,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:2,2:3,1:0,5,1,2
chr6	25472600	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr6	25491979	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=125,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:23,0:11,1:0|1:25491979_C_T:25491979:18,17,1,1
chr6	25491984	.	C	CCTTCTATTCTATG	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=125,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:23,0:12,2:0|1:25491979_C_T:25491979:17,18,1,1
chr6	25492296	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr6	25492354	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=215,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0,12,0,2
chr6	25492364	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=219,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,4:4,0:0,8,0,4
chr6	25510648	.	TA	CA,CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,155,222;MMQ=60,60,60;MPOS=24,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.88,4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,2:0.644,0.273:8:0,1,0:0,5,2:0,0,8,0
chr6	25511008	.	C	CAT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:6,9,1,1
chr6	25516126	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=172,273;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:1,7,1,1
chr6	25516158	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=183,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr6	25554148	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=166,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr6	25554180	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	25557121	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,17;MFRL=164,184;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.181:14:5,0:4,0:7,5,0,2
chr6	25557132	.	GT	G,TT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,14,16;MFRL=0,164,180;MMQ=60,60,60;MPOS=22,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.54,5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.478,0.370:6:0,0,1:0,0,0:0,0,0,6
chr6	25581060	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=149,261;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr6	25581453	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=180,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=61.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:10,18:5,0:10,5,18,0
chr6	25600763	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=172,63;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.126:29:10,0:16,3:16,10,1,2
chr6	25600931	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,0:13,2:18,6,2,0
chr6	25600968	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=184,0;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:1,1:8,2:4,5,2,1
chr6	25610203	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=184,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr6	25619581	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr6	25652568	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=218,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr6	25661887	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,3:2,6:0,3,2,7
chr6	25669833	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=198,84;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,1:4,1:3,6,1,1
chr6	25670143	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,8:5,0:7,0,8,0
chr6	25670304	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:6,3:12,0:7,12,2,1
chr6	25727355	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=173,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:5,2,0,2
chr6	25770707	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=128,85;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:4,1:3,2:4,4,1,2
chr6	25778055	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,2:3,0:6,0,2,0
chr6	25798932	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=283,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr6	25801057	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr6	25801252	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=210,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:1,5,1,1
chr6	25812069	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=233,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr6	25849779	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,326;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,2,1
chr6	25861811	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:25861811_T_G:25861811:5,6,2,0
chr6	25861818	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:0|1:25861811_T_G:25861811:5,7,2,0
chr6	25916165	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=219,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	25916176	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=219,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	25924160	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=199,278;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:25924160_G_C:25924160:0,3,0,1
chr6	25924161	.	T	TTCACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=199,278;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0|1:25924160_G_C:25924160:0,3,0,1
chr6	26017598	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:11,3:21,1:17,15,3,1
chr6	26021813	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=210,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,5:1,6:3,0,11,0
chr6	26027456	.	T	TA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:27,2:10,2:17,22,1,3
chr6	26031811	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=166,268;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:10,0,2,0
chr6	26031868	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=133,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:7,5:4,9:10,1,13,1
chr6	26031950	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=146,140;MMQ=60,49;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.110:52:27,0:20,5:25,22,0,5
chr6	26031962	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.424:38:13,9:9,7:11,11,9,7
chr6	26033354	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,212;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:14,2,2,0
chr6	26033809	.	T	TAAG	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=187,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,20:0.565:35:5,14:8,6:0|1:26033809_T_TAAG:26033809:5,10,6,14
chr6	26033810	.	A	AAGT	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=149,243;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:29,6:0.189:35:14,5:14,1:1|0:26033809_T_TAAG:26033809:8,21,3,3
chr6	26091336	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:2,1,1,3
chr6	26091627	.	GC	AA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=139,71;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,3:12,0:10,12,2,1
chr6	26094367	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,6:4,7:5,1,8,5
chr6	26104096	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=205,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,1:1,1:5,0,1,1
chr6	26108282	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,127;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,4:7,6:4,8,7,3
chr6	26124243	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=246,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,2:6,2:3,7,1,3
chr6	26124430	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=174,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,21:0.406:52:16,17:15,4:23,8,12,9
chr6	26184018	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=184,116;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.361:34:11,12:11,0:16,6,12,0
chr6	26189312	.	CC	GG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr6	26199014	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=191,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,1:10,2:17,3,3,0
chr6	26199524	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=91.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,13:0,0,8,17
chr6	26200050	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=157,190;MMQ=52,47;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:23,1:20,2:20,23,1,2
chr6	26200083	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=169,171;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.540:39:7,10:10,11:12,6,7,14
chr6	26200256	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:0,5,0,5
chr6	26217728	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=183,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,5:3,2:0,4,0,7
chr6	26235300	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr6	26240624	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=210,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:6,1,6,1
chr6	26240649	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=266,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,3:3,8:5,2,10,1
chr6	26252336	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=196,145;MMQ=52,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.460:26:7,0:7,11:0,14,0,12
chr6	26271713	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=309,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,1:1,7:0,2,0,8
chr6	26368890	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,37462;MMQ=34,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=54.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.543:44:11,23:9,0:6,14,24,0
chr6	26370707	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,123;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:5,11:5,4:7,3,6,9
chr6	26370920	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=213,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr6	26373465	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=169,176;MMQ=46,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=25,27;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.682:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr6	26373507	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:3,6,1,1
chr6	26373740	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=194,243;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:0,8,0,3
chr6	26374658	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=127,279;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,1:0,2:2,3,0,3
chr6	26385170	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=201,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr6	26385615	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=164,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr6	26391153	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0,6,1,2
chr6	26391190	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=167,219;MMQ=60,55;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr6	26392515	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:10,0,1,1
chr6	26406122	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=133,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:13,7,0,2
chr6	26408253	.	C	CATCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=210,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr6	26409729	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:3,6:15,5:13,5,6,5
chr6	26422260	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=205,225;MMQ=40,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,5:4,2:4,1,7,0
chr6	26422387	.	CCCT	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=169,49;MMQ=54,33;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCT;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.144:25:10,3:12,0:6,16,1,2
chr6	26423560	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=244,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,5:2,0:0,3,1,4
chr6	26428842	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,0:0,5:1,1,4,1
chr6	26463574	.	GG	TT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,254;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,1:6,1:8,5,0,2
chr6	26466389	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=245,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,11:0.857:12:1,7:0,4:0|1:26466389_G_A:26466389:0,1,1,10
chr6	26466392	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=245,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=76.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,21:0.917:22:1,16:0,5:0|1:26466389_G_A:26466389:0,1,1,20
chr6	26468660	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=102,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.426:45:16,11:9,8:9,17,9,10
chr6	26501424	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=197,224;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr6	26501471	.	AG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=195,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,2:3,4:9,2,4,2
chr6	26501598	.	GTC	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.208:12:5,1:5,1:1,9,2,0
chr6	26501777	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=272,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,3,2
chr6	26505135	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr6	26545468	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=128,65;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:15,2:16,0:0|1:26545468_G_A:26545468:15,16,0,2
chr6	26545488	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=120,65;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:15,2:15,0:0|1:26545468_G_A:26545468:12,19,0,2
chr6	26545632	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:5,7:5,7:6,4,11,3
chr6	27114360	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,243;MMQ=57,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.068:56:22,2:31,1:27,26,2,1
chr6	27114883	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:9,5:5,5:7,7,9,1
chr6	27216848	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	27219491	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=245,264;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr6	27220519	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=200,276;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr6	27424960	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr6	27440004	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,8:0,0,13,3
chr6	27775674	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=110,222;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,5:0.095:61:29,3:27,2:31,25,1,4
chr6	27775697	.	G	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=106,222;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,5:0.100:58:30,3:23,2:25,28,4,1
chr6	27778971	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,8:0.186:46:20,0:18,8:20,18,0,8
chr6	27858255	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.297:35:12,10:13,0:13,12,10,0
chr6	27879950	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=177,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,2:7,0:5,10,0,2
chr6	27879982	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=142,203;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:8,1:4,2:5,7,1,2
chr6	27880144	.	A	AACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=164,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	28094731	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=158,272;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,0:5,2:2,11,0,2
chr6	28117338	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=118,118;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:17,0:8,4:6,19,0,4
chr6	28117443	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=144,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,2,1
chr6	28214698	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=116,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:8,2,2,0
chr6	28219826	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr6	28239681	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=106,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,4:0,5:0,1,7,2
chr6	28239915	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:10,1:8,2:10,8,2,1
chr6	28239932	.	T	TG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=76.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,8:0,0,12,10
chr6	28254988	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=128,269;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:5,2:9,2:4,10,2,2
chr6	28255040	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=182,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr6	28265640	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=112,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr6	28268400	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,14;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,0:0,0,3,0
chr6	28268404	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=17,27;MFRL=290,203;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:1,0,2,0
chr6	28268420	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,15;MFRL=290,203;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,0:1,0:1,0,2,0
chr6	28268452	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:0,1:3,0,4,0
chr6	28268484	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=203,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.297:11:6,3:2,0:8,0,2,1
chr6	28269501	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:4,11,1,1
chr6	28269791	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:3,3:11,2:9,5,2,3
chr6	28270047	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=144,285;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:7,0:8,4:8,7,1,3
chr6	28270064	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,2:6,4:2,6,3,3
chr6	28329037	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,1:4,2:8,2,2,1
chr6	28331094	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=173,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:3,3:4,3:5,2,1,5
chr6	28331127	.	AA	GC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,7,10
chr6	28331252	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=244,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr6	28334079	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr6	28358975	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,0:7,3:5,10,0,3
chr6	28359073	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=182,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:4,3:9,2:9,4,2,3
chr6	28359307	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=182,13178970;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:12,0:5,2:7,10,0,2
chr6	28360744	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:15,5:7,0:10,12,5,0
chr6	28366262	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=180,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr6	28403225	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,9,4
chr6	28403603	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,14,2
chr6	28403629	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,1:4,2:10,3,2,1
chr6	28472253	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=200,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,1:5,2:3,8,1,2
chr6	28483482	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,4:5,9:2,7,4,9
chr6	28554543	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=188,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,1:2,3:0,4,0,5
chr6	28872446	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	28876509	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,4:3,4:6,3,4,4
chr6	28887903	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,78;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:16,0:11,5:13,14,5,0
chr6	28891176	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=153,268;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:9,2:7,0:4,13,0,2
chr6	28891458	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr6	28911802	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,14:0,0,9,18
chr6	28912076	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,2:5,6:4,6,2,6
chr6	28963248	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,2:1,6:0,1,2,6
chr6	29011927	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=165,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr6	29054717	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,90;MMQ=60,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,3:4,0:3,6,3,0
chr6	29054909	.	T	TTGTCTA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=166,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:3,7,1,1
chr6	29068690	.	ATTCT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=188,267;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCT;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:4,2:2,0:4,3,1,1
chr6	29068759	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=151,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,6:7,4:7,6,7,3
chr6	29069016	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=94,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,1:10,1:5,10,1,1
chr6	29069264	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=174,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,2:8,1:8,6,0,3
chr6	29069299	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=153,181;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:5,5,3,2
chr6	29069337	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=174,179;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,5:2,4:1,3,4,5
chr6	29080344	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=154,0;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,1:9,2:6,7,2,1
chr6	29080349	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=156,77;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:3,1:9,3:4,8,4,0
chr6	29080450	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:1,2,3,3
chr6	29080566	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=169,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr6	29141743	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=139,182;MMQ=50,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.870:9:0,2:0,6:0,1,4,4
chr6	29141772	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=107,201;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,1:3,4:4,2,2,3
chr6	29142020	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=161,138;MMQ=60,52;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,1:5,1:5,4,0,2
chr6	29230683	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=174,125;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:5,1,2,0
chr6	29231831	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,5:8,0:10,7,3,2
chr6	29274950	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=155,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,1:10,1:7,7,0,2
chr6	29323259	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,3:2,8:1,2,5,6
chr6	29323905	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=138,200;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:7,1:7,6,1,1
chr6	29342775	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=159,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:3,7,3,0
chr6	29364539	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,0:5,2:3,6,1,1
chr6	29364615	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:5,4:8,3:8,5,5,2
chr6	29364643	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=183,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:6,1:5,3:8,3,3,1
chr6	29364787	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=111,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.734:28:2,8:5,13:0,7,10,11
chr6	29364815	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,0:9,3:9,8,0,3
chr6	29364835	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=179,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,0:9,3:9,8,0,3
chr6	29364951	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=179,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:12,4:7,2:8,11,2,4
chr6	29365241	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=129,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,1:5,5:2,5,4,2
chr6	29365340	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=211,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:4,16,1,1
chr6	29394427	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	29395180	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,2:4,2:5,6,1,3
chr6	29407975	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=184,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.217:16:7,1:6,1:7,6,0,3
chr6	29408057	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:9,3:9,1:11,7,1,3
chr6	29408270	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,21;MFRL=174,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,0:1,5,0,2
chr6	29408528	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=181,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,6:3,5:4,4,4,7
chr6	29408554	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,2:6,6:7,3,4,4
chr6	29429765	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=163,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,2:7,1:5,7,2,1
chr6	29429785	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=124,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,1:12,1:9,8,2,0
chr6	29430865	.	CCAT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAT;STR;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:3,4:1,4,4,2
chr6	29430891	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=190,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.486:14:4,3:3,2:3,4,4,3
chr6	29431698	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:2,3,2,4
chr6	29454489	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=172,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:7,0,3,2
chr6	29455098	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=193,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:5,2,2,0
chr6	29455357	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=191,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,3:5,1:6,3,3,1
chr6	29523676	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,4,5
chr6	29523957	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:8,1:9,8,0,2
chr6	29555681	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr6	29555809	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,2:2,4:3,4,4,2
chr6	29555864	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=200,147;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,4:7,2:9,6,3,3
chr6	29571537	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=227,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:0,0:3,0:0|1:29571537_G_T:29571537:2,2,0,2
chr6	29571545	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=227,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:0,2:3,1:0|1:29571537_G_T:29571537:2,2,0,3
chr6	29576393	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=204,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:4,3,1,6
chr6	29580436	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=239,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:0,2,2,4
chr6	29581011	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=226,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:4,5:1,7:3,2,5,7
chr6	29581041	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=220,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:6,6:5,10:5,6,10,6
chr6	29581110	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=209,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,15:0.616:24:4,9:5,6:0|1:29581110_A_G:29581110:6,3,8,7
chr6	29581113	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=209,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,15:0.615:24:4,9:5,6:0|1:29581110_A_G:29581110:6,3,8,7
chr6	29590000	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,1:6,4:3,8,0,5
chr6	29591225	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=112,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:13,0:5,6:5,13,0,6
chr6	29591864	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=232,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:5,2:1,2:1,5,1,3
chr6	29596808	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=215,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:6,7:7,3:11,2,3,7
chr6	29600054	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=236,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:5,12:2,6:5,2,7,11
chr6	29600104	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=214,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:3,7:4,3:4,4,2,8
chr6	29625001	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,8:1,3:0,1,7,4
chr6	29627222	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=222,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,2:4,2:5,3,2,2
chr6	29634012	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,7:0,11:0,0,10,9
chr6	29638434	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=214,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:2,1,5,0
chr6	29643232	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=177,60;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:29643232_T_A:29643232:9,6,1,1
chr6	29643256	.	A	ATATCATTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=177,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:9,0:0|1:29643232_T_A:29643232:5,10,1,1
chr6	29643257	.	G	GACCCAGCA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=177,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:9,0:0|1:29643232_T_A:29643232:5,10,1,1
chr6	29643879	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=252,175;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,19;RU=TG;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.371:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	29644633	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=152,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:10,3:2,0:9,4,3,0
chr6	29691140	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:0,8:3,1:3,0,9,0
chr6	29691303	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,26:0.818:31:1,12:4,13:4,1,17,9
chr6	29691390	.	CT	GC	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=133.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,16:0,13:0,0,13,18
chr6	29691713	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=198,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,9:2,3:3,3,4,9
chr6	29691744	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=207,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,6:3,9:3,3,7,8
chr6	29691772	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:8,0:12,3:10,13,2,1
chr6	29691857	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=131,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:9,4:17,1:14,12,4,1
chr6	29692305	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr6	29692729	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.483:21:3,3:7,7:6,5,5,5
chr6	29693011	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=345,130;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=100.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,35:0.947:36:1,19:0,16:1,0,16,19
chr6	29693113	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=205,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:4,7:2,7:2,4,7,7
chr6	29693726	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:5,7,1,1
chr6	29694044	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=192,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:2,4:3,2:3,2,5,1
chr6	29794860	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=36,30;MFRL=215,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:0,8:4,3:1,3,3,8
chr6	29794897	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr6	29794906	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=298,164;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.755:9:0,4:1,3:0,2,0,7
chr6	29794933	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=298,177;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr6	29794956	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=259,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr6	29795636	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=226,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,7:1,5:1,0,2,11
chr6	29795657	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,25;MFRL=226,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:0,5:3,4:2,1,1,9
chr6	29795720	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,8,4
chr6	29795768	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=226,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,5:1,8:0,1,8,5
chr6	29795809	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=190,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,3:3,4:2,1,4,3
chr6	29795993	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr6	29796103	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=300,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,2:2,9:2,1,5,6
chr6	29796115	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=214,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,3:2,5:1,2,2,6
chr6	29796126	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,4:0,5:0,1,2,8
chr6	29796152	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=241,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,3:0,6:1,1,1,8
chr6	29796234	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=207,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:1,1,2,2
chr6	29796257	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=188,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr6	29796306	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=282,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:0,3:4,3:4,1,4,2
chr6	29796327	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=259,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:2,3:5,2:5,3,4,2
chr6	29796640	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=200,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,1:0,4:1,2,1,4
chr6	29796685	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=298,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,0,6
chr6	29797173	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=233,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,7:4,7:4,3,7,7
chr6	29797553	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=272,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:1,1,5,2
chr6	29797639	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:7,2:1,4:5,3,5,1
chr6	29797696	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=39.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:1,8:2,4:1,2,5,7
chr6	29797782	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=229,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,1:3,3:1,6,1,3
chr6	29798039	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=196,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,2:3,6:2,1,6,2
chr6	29798083	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:10,6,2,0
chr6	29798140	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=157,154;MMQ=52,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:2,5:3,8:2,3,4,9
chr6	29910265	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:5,2:9,3:14,1,4,1
chr6	29910276	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.653:24:3,3:5,13:6,2,12,4
chr6	29910277	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:4,2:14,3:14,5,4,1
chr6	29910286	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=92.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,9:0,11:0,0,17,8
chr6	29910324	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.388:34:8,6:13,7:7,14,6,7
chr6	29910358	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.447:34:9,7:9,8:8,11,4,11
chr6	29910429	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=15;MBQ=29,32;MFRL=149,160;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:4,5:5,5:0|1:29910429_C_G:29910429:2,8,4,7
chr6	29910437	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=15;MBQ=28,27;MFRL=149,180;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.571:19:3,5:5,4:0|1:29910429_C_G:29910429:2,6,4,7
chr6	29910450	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=15;MBQ=32,32;MFRL=187,218;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:4,7,2,0
chr6	29910457	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=15;MBQ=28,29;MFRL=180,187;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,4:2,5:1,3,5,4
chr6	29910460	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=15;MBQ=26,30;MFRL=210,160;MMQ=60,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,4:5,3:5,3,3,4
chr6	29910478	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=15;MBQ=28,30;MFRL=170,201;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,12:0.722:16:2,5:2,6:0|1:29910478_G_C:29910478:3,1,8,4
chr6	29910482	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=15;MBQ=32,28;MFRL=191,201;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,12:0.684:17:2,6:2,5:0|1:29910478_G_C:29910478:4,1,8,4
chr6	29910492	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=15;MBQ=28,26;MFRL=208,205;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.587:19:4,4:4,6:5,3,8,3
chr6	29910496	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=15;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=79.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,14,5
chr6	29910508	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=15;MBQ=26,27;MFRL=216,205;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.692:19:4,5:2,8:3,3,10,3
chr6	29910522	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=32,32;MFRL=191,204;MMQ=60,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:4,6:3,9:3,4,12,3
chr6	29910527	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=32,24;MFRL=194,204;MMQ=40,39;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,0:10,3:13,7,3,0
chr6	29910538	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=15;MBQ=32,26;MFRL=185,185;MMQ=40,38;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,0:12,2:17,8,2,0
chr6	29910558	.	T	A,C	.	.	DP=28;ECNT=15;MBQ=27,28,32;MFRL=220,168,136;MMQ=60,40,31;MPOS=19,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=88.58,7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,22,3:0.742,0.129:28:2,8,1:1,12,2:1,2,18,7
chr6	29910562	.	A	T,C	.	.	DP=27;ECNT=15;MBQ=28,26,32;MFRL=185,176,156;MMQ=53,40,45;MPOS=17,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=42.05,16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,15,6:0.552,0.241:26:2,7,1:3,8,5:3,2,15,6
chr6	29910717	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=62.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,17:0.450:38:10,6:10,11:0|1:29910717_A_G:29910717:12,9,5,12
chr6	29910719	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=139,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,17:0.429:40:9,4:12,11:0|1:29910717_A_G:29910717:13,10,5,12
chr6	29910721	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,16:0.425:38:10,4:12,10:0|1:29910717_A_G:29910717:13,9,4,12
chr6	29910742	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=134,240;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:13,2:16,1:10,19,2,1
chr6	29910759	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=128,285;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:12,3:12,1:0|1:29910759_T_C:29910759:6,21,4,0
chr6	29910761	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=128,285;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:12,3:14,1:0|1:29910759_T_C:29910759:6,21,4,0
chr6	29910801	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:7,4:0,8:2,5,5,7
chr6	29910820	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=149,182;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=48.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:1,9:0,7:0,1,7,9
chr6	29910834	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,53;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr6	29910865	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=228,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,3:4,5:4,3,5,3
chr6	29910892	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=175,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:3,4:7,1:6,5,4,1
chr6	29911000	.	T	C,G	.	.	DP=23;ECNT=11;MBQ=0,30,27;MFRL=0,174,190;MMQ=60,60,56;MPOS=11,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=45.69,21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,13,8:0.581,0.379:21:0,6,2:0,7,5:0,0,11,10
chr6	29911005	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=30,30;MFRL=190,172;MMQ=56,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.499:20:3,6:6,4:0|1:29911005_G_A:29911005:5,5,5,5
chr6	29911011	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=29,26;MFRL=190,175;MMQ=51,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:3,4:6,3:0|1:29911005_G_A:29911005:5,6,4,6
chr6	29911019	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=27,30;MFRL=192,177;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,3:3,5:4,8,4,4
chr6	29911029	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=11;MBQ=31,26;MFRL=166,178;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:8,3:7,5:7,11,5,4
chr6	29911037	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=11;MBQ=30,30;MFRL=162,176;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:9,3:6,8:7,9,5,6
chr6	29911056	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=11;MBQ=28,27;MFRL=163,178;MMQ=60,49;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:14,0:17,3:0|1:29911056_A_G:29911056:13,19,2,1
chr6	29911063	.	TA	GG	.	.	DP=38;ECNT=11;MBQ=28,33;MFRL=161,244;MMQ=60,53;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.128:37:13,0:18,4:0|1:29911056_A_G:29911056:13,20,2,2
chr6	29911064	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=11;MBQ=28,34;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.364:35:10,5:12,8:8,14,6,7
chr6	29911077	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=30,33;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:14,1:23,2:15,22,2,1
chr6	29911086	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=11;MBQ=25,32;MFRL=189,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.579:36:5,6:5,15:8,7,8,13
chr6	29911154	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=29,30;MFRL=157,162;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:9,6:5,7:5,10,10,3
chr6	29911190	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=15;MBQ=30,29;MFRL=217,165;MMQ=45,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.967:28:1,11:0,14:0,1,15,12
chr6	29911198	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=15;MBQ=29,32;MFRL=170,164;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.694:28:4,10:4,9:3,5,11,9
chr6	29911207	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=15;MBQ=31,28;MFRL=174,152;MMQ=40,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:4,10:3,7:3,4,10,8
chr6	29911228	.	A	T,C	.	.	DP=21;ECNT=15;MBQ=0,28,30;MFRL=0,139,190;MMQ=60,56,43;MPOS=19,29;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=40.96,7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,14,4:0.763,0.191:18:0,5,1:0,9,3:0,0,7,11
chr6	29911239	.	TT	CA	.	.	DP=22;ECNT=15;MBQ=27,32;MFRL=139,166;MMQ=56,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:4,2:9,3:5,9,3,2
chr6	29911240	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=15;MBQ=25,33;MFRL=242,129;MMQ=40,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.820:14:1,3:1,9:2,0,3,9
chr6	29911256	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=15;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=116.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,12:0,0,14,13
chr6	29911260	.	AC	CG	.	.	DP=27;ECNT=15;MBQ=28,29;MFRL=155,170;MMQ=40,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:8,5:10,1:9,10,3,3
chr6	29911319	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=15;MBQ=29,32;MFRL=169,9499;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.343:36:12,2:11,10:13,11,2,10
chr6	29911356	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=15;MBQ=35,25;MFRL=195,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.363:25:3,4:13,4:1,15,3,6
chr6	29911367	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=15;MBQ=34,27;MFRL=177,188;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:5,2:13,2:2,18,0,4
chr6	29911388	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=15;MBQ=34,25;MFRL=165,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,3:10,0:0,14,0,3
chr6	29911396	.	AT	GA	.	.	DP=18;ECNT=15;MBQ=25,31;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:4,2:9,2:0,13,0,5
chr6	29911419	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=15;MBQ=27,30;MFRL=163,213;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:5,1:0,9,0,2
chr6	29911892	.	CCG	C	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=158,59;MMQ=40,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.123:45:16,0:21,5:0|1:29911892_CCG_C:29911892:22,18,2,3
chr6	29911893	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=154,183;MMQ=40,39;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.084:40:17,1:20,2:21,16,2,1
chr6	29911897	.	AG	TT	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=154,59;MMQ=40,39;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,5:0.127:44:18,0:21,4:0|1:29911892_CCG_C:29911892:22,17,2,3
chr6	29911899	.	A	AACCCC	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=154,59;MMQ=40,35;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:14,0:19,2:22,17,1,3
chr6	29912028	.	AG	A	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=30,25;MFRL=189,217;MMQ=27,39;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.380:19:5,4:7,3:0|1:29912028_AG_A:29912028:9,3,0,7
chr6	29912030	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=189,217;MMQ=27,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.380:19:5,4:7,3:0|1:29912028_AG_A:29912028:9,3,0,7
chr6	29912085	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=30,26;MFRL=266,157;MMQ=39,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,4:4,2:6,5,6,0
chr6	29912108	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=34,33;MFRL=196,147;MMQ=39,30;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:6,6:8,4:6,8,6,4
chr6	29912147	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=196,148;MMQ=52,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.452:33:10,9:8,5:10,8,6,9
chr6	29912188	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=205,135;MMQ=52,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.567:35:10,6:5,14:6,9,12,8
chr6	29912204	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=8;MBQ=32,25;MFRL=185,147;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=83.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.578:37:8,6:7,14:9,7,14,7
chr6	29912227	.	TGGA	T	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=28,29;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.457:33:13,6:5,9:10,8,9,6
chr6	29912333	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.438:30:11,8:6,5:9,8,8,5
chr6	29912368	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:13,5:4,5:7,10,4,6
chr6	29912398	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=26,33;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:12,2:2,4:4,10,1,5
chr6	29912410	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=32,26;MFRL=212,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,7:4,2:2,6,3,6
chr6	29912413	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,1:2,3:4,8,1,4
chr6	29912493	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:29912493_G_T:29912493:0,0,0,4
chr6	29912510	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:29912493_G_T:29912493:0,0,0,3
chr6	29912754	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=135,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:5,1,5,0
chr6	29912766	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=130,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:4,1,3,1
chr6	29912796	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:11,2:3,3:8,6,2,3
chr6	29912830	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,10:0,9:0,0,8,11
chr6	29912852	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=155,219;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.260:21:10,3:5,2:0|1:29912852_T_C:29912852:4,12,4,1
chr6	29912856	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=155,223;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:11,2:5,2:0|1:29912852_T_C:29912852:4,12,4,0
chr6	29912925	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=205,214;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0|1:29912925_A_G:29912925:6,6,1,1
chr6	29912935	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,12:0,2:0|1:29912925_A_G:29912925:0,0,8,6
chr6	29912944	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,11:0,3:0|1:29912925_A_G:29912925:0,0,8,6
chr6	29913001	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=25,32;MFRL=176,219;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:7,0:12,3:11,8,2,1
chr6	29913037	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=147,243;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.228:24:8,1:11,4:10,9,3,2
chr6	29913042	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=13;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,14,13
chr6	29913067	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=27,32;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:8,7:4,9:7,5,9,7
chr6	29913074	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=13;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.965:26:0,14:0,10:0|1:29913074_A_G:29913074:0,0,15,11
chr6	29913078	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=13;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,14:0,9:0|1:29913074_A_G:29913074:0,0,14,11
chr6	29913098	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=13;MBQ=30,27;MFRL=158,239;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:12,3:9,2:9,12,3,2
chr6	29913135	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=33,33;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,1:6,7:7,6,2,6
chr6	29913144	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=32,20;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:5,2:14,0:0|1:29913144_G_C:29913144:8,12,1,1
chr6	29913145	.	T	TCCTTCCTGCAGACTAC	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=28,20;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:5,2:14,0:0|1:29913144_G_C:29913144:8,12,1,1
chr6	29913171	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=33,29;MFRL=137,182;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,2:6,5:5,8,3,4
chr6	29913191	.	TG	CA	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=29,34;MFRL=176,157;MMQ=60,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:6,4:7,6:0|1:29913191_TG_CA:29913191:6,8,3,7
chr6	29913197	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=13;MBQ=27,30;MFRL=176,157;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:6,4:8,5:0|1:29913191_TG_CA:29913191:6,8,3,7
chr6	29913266	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=197,209;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:1,1:8,1:3,6,1,1
chr6	29913374	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=202,223;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr6	29942857	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=193,68;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr6	29942983	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=181,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.517:21:7,6:3,4:5,5,8,3
chr6	29943005	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:10,5:6,0:10,6,2,3
chr6	29943035	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=191,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:11,6:10,0:0|1:29943035_G_A:29943035:12,10,3,3
chr6	29943039	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.266:28:12,6:8,1:0|1:29943035_G_A:29943035:11,10,4,3
chr6	29943254	.	AGGGCT	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=174,80;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:11,1:7,3:0|1:29943254_AGGGCT_A:29943254:10,11,3,1
chr6	29943269	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=174,80;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.199:23:12,1:7,3:0|1:29943254_AGGGCT_A:29943254:9,10,3,1
chr6	29943281	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=174,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,1:8,2:6,11,1,2
chr6	29943336	.	GGT	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=179,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.676:7:1,3:1,2:0|1:29943336_GGT_G:29943336:0,2,0,5
chr6	29943340	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=17,26;MFRL=179,147;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.671:7:0,3:1,2:0|1:29943336_GGT_G:29943336:0,2,0,5
chr6	30030114	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr6	30032495	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:13,3:14,1:10,17,2,2
chr6	30035089	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=231,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:6,3:8,3:12,2,6,0
chr6	30036333	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=231,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,2:7,5:11,2,7,0
chr6	30036471	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,1:10,1:8,17,1,1
chr6	30037018	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.267:28:9,0:10,0:0|1:30037018_A_C:30037018:1,20,7,0
chr6	30037024	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.267:28:11,5:9,0:0|1:30037018_A_C:30037018:1,20,7,0
chr6	30037027	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,7:0.250:30:11,4:9,0:0|1:30037018_A_C:30037018:1,22,7,0
chr6	30037032	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:11,1:11,0:0|1:30037018_A_C:30037018:2,20,6,0
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chr6	30039349	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr6	30040909	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:4,5,4,0
chr6	30041292	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=163,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:13,3:13,0:8,18,0,3
chr6	30042955	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=192,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr6	30071279	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr6	30071330	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=191,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:4,1,4,1
chr6	30075843	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,6,9
chr6	30075864	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=244,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:2,1:4,5:3,3,1,6
chr6	30075903	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=196,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,4:3,4:3,3,3,5
chr6	30076016	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0|1:30076016_C_T:30076016:0,0,2,4
chr6	30076018	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:30076016_C_T:30076016:0,0,2,4
chr6	30076755	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,248;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr6	30078275	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=150,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:4,4,3,5
chr6	30078330	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=135,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.469:13:3,4:4,2:2,5,3,3
chr6	30078376	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=157,287;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.355:20:5,0:8,6:5,8,0,7
chr6	30080274	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:1,4:7,2:6,3,2,4
chr6	30080496	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=181,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:0,7:5,2:2,3,4,5
chr6	30104783	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=210,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,3:2,2:6,1,4,1
chr6	30105174	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=154,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,4:1,0:1,3,1,3
chr6	30113955	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=235,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr6	30114725	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:18,4:9,2:22,5,4,2
chr6	30114803	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:8,2:8,1:0|1:30114803_G_A:30114803:4,12,1,2
chr6	30114825	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=189,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:30114803_G_A:30114803:3,12,0,2
chr6	30114842	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,2:5,1:3,8,0,3
chr6	30114897	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=211,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:1,1:6,3:2,6,1,3
chr6	30115367	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:7,0:6,1:0|1:30115367_CA_C:30115367:8,5,0,2
chr6	30115374	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:30115367_CA_C:30115367:10,5,0,2
chr6	30115408	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=170,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:2,4,0,2
chr6	30115484	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=29,36;MFRL=217,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,3:6,0:3,9,3,0
chr6	30121460	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.322:26:7,4:10,4:11,7,3,5
chr6	30121605	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=227,250;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0,6,0,2
chr6	30122154	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=69.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,4,16
chr6	30124631	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=195,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:1,0:3,4:0|1:30124631_C_T:30124631:5,1,4,0
chr6	30124637	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=192,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,0:4,4:0|1:30124631_C_T:30124631:4,1,4,0
chr6	30124667	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=197,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,1:6,4:5,2,4,1
chr6	30124697	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=189,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,2:8,3:10,4,4,1
chr6	30124879	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=198,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,3:4,2:1,4,1,4
chr6	30126177	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=195,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,2:8,1:10,3,2,1
chr6	30126225	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.270:13:1,3:7,0:10,0,1,2
chr6	30126285	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=198,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,4:9,2:7,7,3,3
chr6	30126303	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=197,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,3:7,1:8,7,2,2
chr6	30126424	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=220,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:3,4,1,4
chr6	30131503	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:3,3:6,7:5,5,6,4
chr6	30131546	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=229,157;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,2:6,3:3,6,2,3
chr6	30131585	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:5,7,1,1
chr6	30136217	.	CA	AT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=185,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:12,6,1,1
chr6	30136302	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=191,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:0,5,2,0
chr6	30136929	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:2,1:5,3:6,2,3,1
chr6	30137111	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=175,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:2,2,0,2
chr6	30138476	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	30138489	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	30138853	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=36,24;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.355:20:8,1:5,5:2,11,4,3
chr6	30138865	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=164,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:3,1:8,3:5,6,0,4
chr6	30138895	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=204,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,1:6,1:1,6,0,2
chr6	30139699	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:5,3:11,3:10,6,2,4
chr6	30154199	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=151,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,3:3,3:2,7,4,2
chr6	30157654	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr6	30166266	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:1,3:8,3:6,3,3,3
chr6	30228230	.	AC	CC,CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,34,32;MFRL=185,130,3598;MMQ=60,60,52;MPOS=30,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.36,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,2:0.303,0.149:17:5,4,0:4,1,2:5,5,6,1
chr6	30228379	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=171,157;MMQ=60,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,7:6,4:5,6,4,7
chr6	30228398	.	CG	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=150,159;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.448:16:4,3:5,4:3,6,2,5
chr6	30228416	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=199,157;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:2,5,1,6
chr6	30228879	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:2,2:7,3:0|1:30228879_C_T:30228879:6,5,3,2
chr6	30228881	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=27,35;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:4,2:7,3:0|1:30228879_C_T:30228879:6,5,3,2
chr6	30228938	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:7,3:10,4:7,10,6,1
chr6	30229013	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=140,135;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:9,1:6,5:7,8,3,3
chr6	30229034	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=172,147;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:8,1:4,4:5,7,3,2
chr6	30229267	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=136,222;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:5,2:8,1:6,7,2,1
chr6	30229280	.	CC	AT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=195,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,1:3,4:6,4,3,2
chr6	30229306	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=200,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,6:4,4:4,5,8,2
chr6	30229457	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:8,1:6,6:0|1:30229457_C_T:30229457:7,8,1,6
chr6	30229463	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:6,1:4,5:0|1:30229457_C_T:30229457:5,5,0,6
chr6	30229504	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=185,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:1,3,0,3
chr6	30229990	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=276,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:1,1:3,2:3,1,2,1
chr6	30230085	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=54,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,6:4,3:5,1,5,4
chr6	30230128	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=108,93;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,1,3
chr6	30231071	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:3,4:8,5:1,10,5,4
chr6	30231108	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=178,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,4:6,4:4,6,3,5
chr6	30231224	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0,6,0,2
chr6	30297018	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=223,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.343:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr6	30297529	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,4:5,6:3,6,4,7
chr6	30309105	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,6:6,2:7,7,5,3
chr6	30309508	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=110,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:3,2:4,1:4,4,2,1
chr6	30313227	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=175,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,0:7,2:7,6,1,1
chr6	30313268	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:6,10:2,4:5,3,8,6
chr6	30313440	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=252,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr6	30314116	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=205,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,2:6,1:7,0,3,0
chr6	30314566	.	TC	GA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:5,0:13,8:8,11,3,5
chr6	30314607	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,0:6,4:3,11,0,4
chr6	30457732	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=82,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=102.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,29:0.900:32:2,17:0,12:2,1,13,16
chr6	30458064	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=233,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=73.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,23:0.857:26:1,8:2,15:1,2,13,10
chr6	30460232	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=121,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.311:23:9,2:7,4:10,6,5,2
chr6	30515043	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=169,269;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:7,2:8,0:5,10,2,0
chr6	30521137	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.731:28:3,7:4,12:3,4,10,11
chr6	30523241	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=204,271;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	30529781	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=183,126;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.135:24:14,0:7,2:12,9,0,3
chr6	30539438	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,2,17
chr6	30546144	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,209;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:7,5,1,1
chr6	30548111	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=185,129;MMQ=40,36;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:30548111_G_A:30548111:3,0,1,0
chr6	30548116	.	TCC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=162,129;MMQ=40,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:30548111_G_A:30548111:3,1,1,0
chr6	30548137	.	GAA	G,GA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=19,19,30;MFRL=118,94,260;MMQ=60,60,57;MPOS=12,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=5.40,9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,4:0.222,0.292:12:0,1,0:3,0,3:2,4,5,1
chr6	30548157	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,10;MFRL=88,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.351:14:3,0:5,0:3,6,5,0
chr6	30551286	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	30552937	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	30553342	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=149,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:8,0:5,5:8,6,5,0
chr6	30553871	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:0,6:1,4:1,0,7,3
chr6	30557539	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,4:11,0:12,10,0,4
chr6	30558477	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=45.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr6	30570241	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:9,0:3,2:2,10,0,2
chr6	30571471	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,4:4,5:1,4,1,8
chr6	30573842	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=229,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:8,2:2,5:6,4,4,3
chr6	30574455	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=202,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.287:22:10,1:6,5:7,9,3,3
chr6	30575603	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=116,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,23:0.649:35:11,12:1,11:6,6,17,6
chr6	30575760	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=166,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.388:8:3,2:0,1:1,4,0,3
chr6	30576781	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.726:20:3,9:2,5:4,1,11,4
chr6	30593193	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=214,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr6	30608048	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=215,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30608048_C_T:30608048:1,0,1,0
chr6	30608052	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=215,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30608048_C_T:30608048:1,0,1,0
chr6	30611350	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=123,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:10,3:14,1:11,13,1,3
chr6	30613782	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.209:41:16,0:17,8:16,17,0,8
chr6	30617377	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=136,39487211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:7,0:11,2:0|1:30617377_C_T:30617377:5,13,1,1
chr6	30617388	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=131,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:23,3:0.142:26:6,0:14,3:1|0:30617377_C_T:30617377:7,16,1,2
chr6	30618688	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,173;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	30618906	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=153,303;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:5,3:8,1:3,11,4,0
chr6	30619285	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=301,255;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr6	30622613	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=179,241;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:4,4,1,2
chr6	30627216	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=189,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:2,0,2,1
chr6	30628082	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	30645123	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=25,12;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.388:8:3,0:2,1:0|1:30645123_A_C:30645123:0,5,3,0
chr6	30645127	.	TTC	AGG	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.389:8:3,0:2,0:0|1:30645123_A_C:30645123:0,5,3,0
chr6	30645136	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,29;MFRL=215,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:30645123_A_C:30645123:0,3,2,0
chr6	30645138	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,12;MFRL=215,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,0:0|1:30645123_A_C:30645123:0,3,2,0
chr6	30645144	.	T	TTTAGG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=215,270;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:30645123_A_C:30645123:0,3,1,0
chr6	30645145	.	GAA	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=167,270;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:30645123_A_C:30645123:0,2,1,0
chr6	30645150	.	GCA	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,16;MFRL=167,270;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:30645123_A_C:30645123:0,2,1,0
chr6	30652673	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=111,110;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.132:36:22,0:8,4:15,17,0,4
chr6	30652781	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=139,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:15,3:9,2:14,10,1,4
chr6	30657015	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,3:0,0,5,2
chr6	30668337	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:10,11,2,0
chr6	30668488	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,265;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:0,7,0,4
chr6	30670696	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=251,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,0:4,2:2,5,0,2
chr6	30671256	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=103,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:0|1:30671256_T_C:30671256:3,8,0,2
chr6	30671259	.	GGCT	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=103,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:0|1:30671256_T_C:30671256:3,8,0,2
chr6	30671276	.	G	GACCACAGCGT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:2,6,0,2
chr6	30671650	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:3,4:7,8:6,4,6,6
chr6	30672342	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.193:29:16,2:6,1:10,13,3,3
chr6	30675830	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=146,278;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:17,2:9,1:10,17,1,2
chr6	30676109	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr6	30679628	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=65.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,13,8
chr6	30680298	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=182,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:10,5:5,1:6,9,3,3
chr6	30680916	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=114,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=49.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.491:43:11,10:10,11:12,10,8,13
chr6	30688427	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:7,4:9,1:2,14,1,4
chr6	30698541	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=205,238;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:5,1:2,4,1,1
chr6	30698914	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr6	30708009	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=151,74;MMQ=60,28;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:15,4:13,0:11,19,1,3
chr6	30708143	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=171,328;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,1:3,2:2,6,1,2
chr6	30709357	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:7,3,2,0
chr6	30711805	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=91.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,17:0,10:0,0,18,9
chr6	30856863	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=192,261;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:7,1:4,8,2,0
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chr6	30882856	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=219,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.732:12:1,1:1,7:3,0,5,4
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chr6	30883920	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=241,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,24:0.806:29:2,13:3,11:2,3,15,9
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chr6	30885639	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,3:3,5:0,3,0,8
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chr6	30887988	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=237,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,5:2,3:2,2,3,5
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chr6	30889120	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=234,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,4:3,7:1,6,2,9
chr6	30890055	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=213,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,2:3,6:2,4,3,5
chr6	30890206	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=202,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:3,4:2,2:3,3,2,5
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chr6	30890569	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:1,0,0,7
chr6	30890871	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=201,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:3,2,1,4
chr6	30892054	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=112,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:3,4:0,8:1,2,9,3
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chr6	30892377	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=328,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr6	30893004	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:10,3:5,0:15,0,3,0
chr6	30893127	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,0:7,3:8,9,2,1
chr6	30893226	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=273,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:2,3:1,1:2,1,0,5
chr6	30893251	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=298,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,1:2,2,2,3
chr6	30893428	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=227,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:2,3:6,3:5,3,4,4
chr6	30893728	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=212,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:0,8:3,4:2,1,8,4
chr6	30893831	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=196,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,4:5,7:4,4,6,5
chr6	30893941	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:1,9,1,1
chr6	30899163	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr6	30899195	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=174,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:7,0,4,1
chr6	30899377	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=309,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,6:1,3:2,0,4,5
chr6	30899524	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=125,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,1:7,3:8,8,1,3
chr6	30899650	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=209,332;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:4,3,0,2
chr6	30916645	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=140,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:7,3:22,0:20,9,1,2
chr6	30917212	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr6	30918400	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=241,109;MMQ=32,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:2,5:5,1:5,3,4,2
chr6	30919391	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=127,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:16,1:7,5:13,12,2,4
chr6	30919701	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=197,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=94.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,28:0.853:32:1,10:3,18:1,3,13,15
chr6	30954245	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,11,11
chr6	30955681	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr6	31079074	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=260,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:0|1:31079074_C_T:31079074:3,0,7,0
chr6	31079076	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=260,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,3:1,3:0|1:31079074_C_T:31079074:3,0,7,0
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chr6	31079889	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,15:0.372:41:4,7:22,8:21,5,8,7
chr6	31083729	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=204,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr6	31083797	.	ACTT	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=39.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.612:16:2,4:4,6:0|1:31083797_ACTT_A:31083797:5,1,4,6
chr6	31083813	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:0|1:31083797_ACTT_A:31083797:5,1,3,5
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chr6	31084163	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=153,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,2:0,3:0,3,1,4
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chr6	31084684	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,8:4,2:5,1,8,2
chr6	31084787	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.434:21:7,4:5,5:0|1:31084787_A_G:31084787:3,9,4,5
chr6	31084792	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,15:0.696:21:4,6:2,9:0|1:31084787_A_G:31084787:2,4,5,10
chr6	31084964	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:5,5:1,7:5,1,9,3
chr6	31085200	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:2,5:6,8:6,2,9,4
chr6	31085269	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=130,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,5:5,5:4,5,4,6
chr6	31088037	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,7:2,2:3,0,8,1
chr6	31088202	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=150,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:3,3:1,0:1,4,0,3
chr6	31088232	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:0|1:31088232_A_G:31088232:0,1,0,6
chr6	31088241	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=151,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.702:8:1,5:0,1:0|1:31088232_A_G:31088232:0,2,0,6
chr6	31097301	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=193,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr6	31097453	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:3,6:6,7:5,4,4,9
chr6	31105633	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr6	31105891	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,6,13
chr6	31106133	.	CAG	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:3,3:3,3:0|1:31106133_CAG_C:31106133:2,6,7,0
chr6	31106140	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=27,23;MFRL=192,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:2,1:4,3:0|1:31106133_CAG_C:31106133:2,7,7,0
chr6	31106143	.	CAG	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:4,3:4,3:0|1:31106133_CAG_C:31106133:2,6,7,0
chr6	31106149	.	CAG	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=184,167;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:4,3:5,1:0|1:31106133_CAG_C:31106133:3,6,6,0
chr6	31106177	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,1:6,1:6,7,0,2
chr6	31106268	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=158,199;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.801:13:1,4:1,7:0|1:31106268_A_G:31106268:0,2,2,9
chr6	31106282	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=204,199;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:4,0:2,6:0|1:31106268_A_G:31106268:0,6,0,6
chr6	31106409	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=149,282;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:8,2,1,1
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chr6	31106500	.	TC	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=121,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.260:21:7,3:8,1:0|1:31106499_G_A:31106499:9,7,3,2
chr6	31106522	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=167,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:9,9,1,1
chr6	31106643	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=192,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,5:2,5:1,1,6,4
chr6	31106875	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=188,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,2:6,1:2,8,0,3
chr6	31106893	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=185,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,1:7,2:1,12,0,3
chr6	31107338	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=210,270;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr6	31111180	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:6,2:2,1:1,8,2,1
chr6	31112602	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=127,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:10,1:3,1:8,5,2,0
chr6	31112737	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr6	31112899	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=185,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr6	31112925	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=181,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr6	31113030	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=96,178;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.739:13:0,5:3,5:1,2,3,7
chr6	31113052	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:3,6:6,3:5,5,3,6
chr6	31113106	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=213,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,3:6,2,3,2
chr6	31113149	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,4,0
chr6	31113275	.	AG	GA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=113,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.668:25:6,7:2,9:4,4,11,6
chr6	31113326	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:6,4,0,2
chr6	31116178	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=89,61;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.260:11:6,2:2,0:2,6,2,1
chr6	31116189	.	CAGCATTGACCACAAGCCTCAGCT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=119,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:3,0:6,9,1,1
chr6	31116526	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=145,230;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr6	31117756	.	CAAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=232,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:4,0,1,0
chr6	31118565	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=115,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.309:24:8,3:8,4:7,10,4,3
chr6	31122330	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=126,254;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:14,2:12,3:13,13,3,2
chr6	31124849	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=177,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:7,4:7,5:9,5,3,6
chr6	31125067	.	C	CAACT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=125,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AACT;STR;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:1,4:0,4:1,0,8,1
chr6	31125158	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.668:25:4,5:4,12:3,5,11,6
chr6	31127562	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=182,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:0,6,0,5
chr6	31129616	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=176,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.825:26:1,10:3,12:3,1,8,14
chr6	31129642	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:2,8:5,7:5,2,6,9
chr6	31130502	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=377,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,5:1,1,2,6
chr6	31132414	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=209,219;MMQ=40,26;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr6	31132649	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=140,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:2,5:5,6:4,3,2,9
chr6	31133509	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=208,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:0,4:3,6:1,3,4,6
chr6	31133577	.	A	AAAGCCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=199,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.802:8:1,5:0,1:1,0,2,5
chr6	31133620	.	T	TAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=199,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,1,3
chr6	31133943	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=184,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,5:0,3:0,3,3,5
chr6	31138107	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=163,176;MMQ=50,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,5:2,3:3,3,5,4
chr6	31138377	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=221,193;MMQ=55,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:2,4,5,1
chr6	31236853	.	GT	AC,AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28,29;MFRL=88,220,153;MMQ=52,56,54;MPOS=17,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.89,22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,9:0.125,0.417:21:2,0,2:8,2,7:8,2,7,4
chr6	31236998	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=173,166;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:3,3:6,12:4,5,6,9
chr6	31237014	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=143,173;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,13:0.519:25:2,4:10,8:0|1:31237014_G_A:31237014:5,7,6,7
chr6	31237017	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=35,28;MFRL=139,173;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,13:0.483:27:2,5:11,8:0|1:31237014_G_A:31237014:6,8,6,7
chr6	31237027	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,13:0.452:29:4,4:12,8:0|1:31237014_G_A:31237014:8,8,6,7
chr6	31237048	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=143,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.425:31:5,6:13,7:8,10,9,4
chr6	31237061	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=151,214;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:3,6:9,8:6,6,9,5
chr6	31237124	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.468:26:5,5:8,7:9,5,8,4
chr6	31237162	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:9,7:12,8:9,12,6,9
chr6	31237230	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=149,152;MMQ=60,52;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=66.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,18:0.528:34:6,8:10,10:0|1:31237230_A_G:31237230:13,3,11,7
chr6	31237233	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=149,151;MMQ=60,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,17:0.514:33:5,6:10,10:0|1:31237230_A_G:31237230:13,3,11,6
chr6	31237255	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.558:37:7,9:9,9:11,5,12,9
chr6	31237323	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=153,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.378:22:6,4:7,4:0|1:31237323_A_G:31237323:3,11,0,8
chr6	31237333	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=150,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:5,3:4,4:0|1:31237323_A_G:31237323:3,7,0,7
chr6	31237353	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=146,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,3:0,4,0,8
chr6	31237405	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=220,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:1,4,1,4
chr6	31237437	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=220,239;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:1,2,1,3
chr6	31237660	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=128,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:1,1:5,2:0|1:31237660_A_G:31237660:6,0,4,0
chr6	31237664	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=124,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:0|1:31237660_A_G:31237660:4,0,4,0
chr6	31237703	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=14;MBQ=32,29;MFRL=137,173;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:5,3,4,1
chr6	31237723	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=14;MBQ=27,28;MFRL=131,179;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:1,4:8,3:0|1:31237723_G_A:31237723:5,4,5,3
chr6	31237727	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=14;MBQ=26,33;MFRL=131,179;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:1,5:8,3:0|1:31237723_G_A:31237723:5,4,5,3
chr6	31237767	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=14;MBQ=25,35;MFRL=137,139;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:3,2:7,5:0|1:31237767_T_C:31237767:7,3,2,6
chr6	31237769	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=14;MBQ=34,28;MFRL=140,139;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,12:0.520:23:2,2:6,6:0|1:31237767_T_C:31237767:7,4,4,8
chr6	31237771	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=14;MBQ=30,28;MFRL=133,139;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,12:0.565:21:2,3:6,9:0|1:31237767_T_C:31237767:6,3,4,8
chr6	31237773	.	TG	CC	.	.	DP=21;ECNT=14;MBQ=27,34;MFRL=133,139;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,12:0.565:21:2,3:5,9:0|1:31237767_T_C:31237767:6,3,4,8
chr6	31237779	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=14;MBQ=32,31;MFRL=133,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=47.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.538:24:4,4:7,8:0|1:31237767_T_C:31237767:7,4,4,9
chr6	31237786	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=14;MBQ=29,29;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,17:0.600:28:4,4:6,10:0|1:31237786_A_T:31237786:7,4,8,9
chr6	31237802	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=14;MBQ=30,34;MFRL=148,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=80.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,22:0.677:32:5,10:5,12:0|1:31237786_A_T:31237786:5,5,12,10
chr6	31237833	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=14;MBQ=28,24;MFRL=113,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,22:0.589:37:6,11:6,10:0|1:31237833_T_C:31237833:7,8,12,10
chr6	31237858	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=14;MBQ=27,28;MFRL=113,113;MMQ=60,52;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=47.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,15:0.456:33:9,7:8,6:0|1:31237833_T_C:31237833:8,10,9,6
chr6	31237876	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=14;MBQ=29,32;MFRL=113,113;MMQ=60,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:6,4:5,4:0|1:31237876_A_G:31237876:7,5,4,4
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chr6	31238992	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=8;MBQ=30,30;MFRL=161,141;MMQ=52,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.315:36:11,3:14,8:12,13,4,7
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chr6	31239010	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=8;MBQ=33,25;MFRL=140,161;MMQ=48,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,11:0.279:40:11,6:18,3:12,17,7,4
chr6	31239050	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=12;MBQ=32,20;MFRL=143,111;MMQ=60,43;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,15:0.348:44:19,8:10,5:0|1:31239050_G_A:31239050:11,18,8,7
chr6	31239057	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=12;MBQ=33,20;MFRL=148,106;MMQ=60,44;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,16:0.347:47:18,9:11,7:0|1:31239050_G_A:31239050:11,20,8,8
chr6	31239060	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=12;MBQ=24,32;MFRL=136,131;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,13:0.286:47:18,10:14,3:15,19,5,8
chr6	31239082	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=12;MBQ=32,29;MFRL=148,135;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,15:0.364:42:15,6:9,7:0|1:31239050_G_A:31239050:9,18,7,8
chr6	31239101	.	G	A,T	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=29,28,27;MFRL=65,160,142;MMQ=60,60,60;MPOS=22,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=32.77,33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,9,11:0.345,0.438:25:5,4,6:0,5,4:2,3,6,14
chr6	31239114	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=152,145;MMQ=60,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:8,1:4,3:0|1:31239114_G_T:31239114:4,11,1,3
chr6	31239116	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=12;MBQ=32,24;MFRL=159,145;MMQ=56,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:9,1:4,3:0|1:31239114_G_T:31239114:4,12,1,3
chr6	31239141	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=12;MBQ=28,30;MFRL=216,164;MMQ=54,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.415:10:4,3:2,1:0|1:31239141_C_T:31239141:1,5,1,3
chr6	31239151	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=26,31;MFRL=253,162;MMQ=52,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,2:2,1:0|1:31239141_C_T:31239141:0,5,2,3
chr6	31239170	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=12;MBQ=28,33;MFRL=216,164;MMQ=54,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.435:14:6,3:2,2:0|1:31239141_C_T:31239141:2,6,2,4
chr6	31239172	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=12;MBQ=34,29;MFRL=216,164;MMQ=54,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.435:14:5,3:2,2:0|1:31239141_C_T:31239141:2,6,2,4
chr6	31239205	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=30,23;MFRL=198,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:7,3:4,3:5,7,5,2
chr6	31239279	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=175,227;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:4,4:7,2,7,2
chr6	31239306	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:5,7:3,6:7,1,10,3
chr6	31239407	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=101.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,27:0.609:44:9,11:8,14:0|1:31239407_G_T:31239407:8,9,9,18
chr6	31239417	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=99.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,27:0.583:46:11,11:8,15:0|1:31239407_G_T:31239407:8,11,8,19
chr6	31239449	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=157,248;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,8:0.187:46:21,4:17,4:13,25,3,5
chr6	31239501	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,15:0.457:33:7,8:11,6:0|1:31239501_G_T:31239501:7,11,8,7
chr6	31239518	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=182,129;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,17:0.515:33:5,8:11,7:0|1:31239501_G_T:31239501:8,8,9,8
chr6	31239652	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=155,191;MMQ=60,36;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,1:8,1:0|1:31239652_G_A:31239652:1,13,0,2
chr6	31239660	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=166,196;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,2:6,1:0|1:31239652_G_A:31239652:0,13,0,3
chr6	31239681	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=166,187;MMQ=60,41;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:0|1:31239652_G_A:31239652:0,5,1,7
chr6	31239722	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr6	31239742	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=30,28;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:0,4:4,1:0|1:31239742_G_C:31239742:2,2,4,1
chr6	31239752	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=32,24;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:0,3:5,1:0|1:31239742_G_C:31239742:4,1,4,1
chr6	31239776	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=29,31;MFRL=131,167;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:1,5:6,5:5,2,9,2
chr6	31239802	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=133,172;MMQ=60,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:1,5:9,7:5,5,10,2
chr6	31239821	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=33,25;MFRL=133,171;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,14:0.500:28:7,5:6,9:0|1:31239821_G_T:31239821:7,7,11,3
chr6	31239827	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=9;MBQ=33,25;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,16:0.494:32:7,4:9,9:0|1:31239821_G_T:31239821:8,8,11,5
chr6	31239855	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=35,30;MFRL=134,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:6,5:7,7:7,6,6,6
chr6	31239868	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=35,33;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.525:23:4,6:6,6:6,5,5,7
chr6	31322133	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=27,35;MFRL=217,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:6,1:7,3:0|1:31322133_A_G:31322133:3,12,0,4
chr6	31322144	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=225,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:5,2:5,3:0|1:31322133_A_G:31322133:3,7,1,4
chr6	31322175	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=152,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,5:2,0:0,3,3,2
chr6	31322220	.	CGCCA	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=158,103;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.306:8:1,0:5,1:0|1:31322220_CGCCA_C:31322220:0,6,0,2
chr6	31322229	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=152,103;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:0,1:5,1:0|1:31322220_CGCCA_C:31322220:0,5,0,2
chr6	31322303	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.470:42:13,4:9,13:11,11,16,4
chr6	31322395	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=134,138;MMQ=60,55;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:3,1:9,1:4,10,1,1
chr6	31322402	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=115,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:2,1:10,1:2,10,2,1
chr6	31322459	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=116,186;MMQ=60,42;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,5:5,0:4,4,0,5
chr6	31322470	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=146,161;MMQ=60,54;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,7:1,3:2,1,2,8
chr6	31322513	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=198,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,4:0,2:1,2,1,5
chr6	31322782	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=84,269;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,3:2,6:3,1,9,0
chr6	31322790	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=173,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,1:6,3:9,1,4,0
chr6	31322888	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:3,3:8,7:8,3,7,3
chr6	31322911	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:8,1:8,5:11,5,5,1
chr6	31322980	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:6,2:14,4:0|1:31322980_C_T:31322980:8,14,1,5
chr6	31322996	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,7:0.243:31:8,2:13,5:0|1:31322980_C_T:31322980:7,17,3,4
chr6	31323012	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=164,257;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:3,3:16,1:7,13,1,3
chr6	31323020	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.312:27:7,1:11,7:0|1:31322980_C_T:31322980:5,14,2,6
chr6	31323039	.	T	TGAAGGGCTCCA	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.371:22:5,1:9,6:6,8,4,4
chr6	31323233	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=133,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.217:38:11,4:19,3:13,17,3,5
chr6	31323296	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=152,197;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:7,10:5,8:7,5,10,8
chr6	31323321	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=169,203;MMQ=48,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:13,2:12,1:13,12,2,1
chr6	31323337	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=144,152;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.349:30:8,7:9,3:9,11,4,6
chr6	31323409	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.341:36:18,7:6,5:7,17,6,6
chr6	31323468	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=184,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.374:30:12,7:7,4:12,7,7,4
chr6	31323500	.	CCT	C	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=31,35;MFRL=144,248;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:17,3:8,0:0|1:31323500_CCT_C:31323500:16,14,3,0
chr6	31323506	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=139,248;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:21,3:7,0:0|1:31323500_CCT_C:31323500:15,14,3,0
chr6	31323945	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=250,225;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:3,1:1,2:3,1,3,1
chr6	31323953	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=35,34;MFRL=229,225;MMQ=60,44;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:4,3,2,0
chr6	31324003	.	TC	GT,AG	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=26,29,29;MFRL=149,118,162;MMQ=60,40,31;MPOS=9,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=23.35,5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,7,2:0.333,0.125:21:3,2,0:9,5,2:9,3,3,6
chr6	31324022	.	TCC	T	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=26,33;MFRL=115,213;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:3,1:20,2:0|1:31324022_TCC_T:31324022:14,10,0,3
chr6	31324024	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=112,139;MMQ=60,40;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:3,0:16,3:12,7,1,2
chr6	31324025	.	G	GTC	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=27,35;MFRL=115,213;MMQ=60,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:4,1:19,2:0|1:31324022_TCC_T:31324022:14,10,0,3
chr6	31324036	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=23,27;MFRL=115,204;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:3,1:18,3:12,10,0,4
chr6	31324077	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=11;MBQ=30,31;MFRL=133,239;MMQ=60,34;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:6,0:16,4:0|1:31324077_C_G:31324077:10,13,2,2
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chr6	31324100	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=30,26;MFRL=132,239;MMQ=52,34;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:6,0:12,4:0|1:31324077_C_G:31324077:7,11,2,2
chr6	31324104	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=32,27;MFRL=162,111;MMQ=52,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:6,0:11,5:7,10,2,3
chr6	31324144	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=27,26;MFRL=154,156;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,1:5,2:4,10,0,3
chr6	31324151	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=33,29;MFRL=168,136;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.387:16:7,1:3,5:2,8,1,5
chr6	31324154	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=11;MBQ=32,25;MFRL=145,168;MMQ=60,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,1:3,8,0,5
chr6	31324200	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=34,32;MFRL=221,230;MMQ=60,41;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:4,2,2,2
chr6	31324208	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=33,29;MFRL=223,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:0|1:31324208_G_T:31324208:4,1,1,2
chr6	31324210	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=32,29;MFRL=223,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:0|1:31324208_G_T:31324208:4,1,1,2
chr6	31324245	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=11;MBQ=30,30;MFRL=219,233;MMQ=60,28;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:2,1,2,3
chr6	31324368	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=225,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:4,0:7,3:0|1:31324368_CA_C:31324368:6,6,2,1
chr6	31324372	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=225,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:5,0:7,3:0|1:31324368_CA_C:31324368:6,6,2,1
chr6	31324524	.	GCC	G	.	.	DP=17;ECNT=17;MBQ=28,35;MFRL=65,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:5,4:4,2:0|1:31324524_GCC_G:31324524:5,4,3,4
chr6	31324528	.	G	GTT	.	.	DP=22;ECNT=17;MBQ=32,34;MFRL=65,173;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=51.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,13:0.583:22:5,4:4,3:0|1:31324524_GCC_G:31324524:5,4,4,9
chr6	31324531	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=17;MBQ=31,28;MFRL=65,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=56.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,15:0.615:24:5,8:4,4:0|1:31324524_GCC_G:31324524:5,4,5,10
chr6	31324536	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=17;MBQ=24,27;MFRL=65,183;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,15:0.640:23:5,9:3,6:0|1:31324524_GCC_G:31324524:4,4,5,10
chr6	31324586	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=17;MBQ=28,27;MFRL=153,137;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=94.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,24:0.610:39:7,14:8,9:9,6,11,13
chr6	31324595	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=17;MBQ=30,31;MFRL=154,125;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=85.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,22:0.511:43:7,14:13,8:0|1:31324595_C_G:31324595:12,9,11,11
chr6	31324601	.	C	CG	.	.	DP=39;ECNT=17;MBQ=31,27;MFRL=154,125;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,18:0.463:39:8,9:12,8:0|1:31324595_C_G:31324595:12,9,10,8
chr6	31324603	.	CT	C	.	.	DP=39;ECNT=17;MBQ=31,32;MFRL=153,114;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,17:0.474:36:8,9:10,8:0|1:31324595_C_G:31324595:12,7,10,7
chr6	31324615	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=17;MBQ=30,33;MFRL=135,243;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:17,0:16,2:20,13,0,2
chr6	31324641	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=17;MBQ=28,31;MFRL=135,259;MMQ=60,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,1:11,1:0|1:31324641_T_A:31324641:14,11,1,1
chr6	31324643	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=17;MBQ=32,30;MFRL=129,229;MMQ=60,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:11,2:11,1:14,9,1,2
chr6	31324664	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=17;MBQ=28,31;MFRL=135,229;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:15,1:15,2:0|1:31324641_T_A:31324641:12,19,2,1
chr6	31324666	.	A	T,C	.	.	DP=35;ECNT=17;MBQ=28,26,30;MFRL=159,229,120;MMQ=60,40,50;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.44,39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,3,15:0.108,0.460:32:7,1,8:7,2,7:5,9,9,9
chr6	31324702	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=17;MBQ=29,30;MFRL=135,136;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,17:0.450:38:10,9:11,6:0|1:31324702_C_T:31324702:10,11,5,12
chr6	31324705	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=17;MBQ=28,27;MFRL=144,136;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,17:0.439:39:10,9:12,6:0|1:31324702_C_T:31324702:11,11,5,12
chr6	31324706	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=17;MBQ=31,25;MFRL=151,101;MMQ=55,35;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:17,3:16,1:14,21,3,1
chr6	31324742	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=17;MBQ=25,29;MFRL=150,151;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.642:17:3,8:2,3:3,3,3,8
chr6	31324788	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=12;MBQ=29,32;MFRL=194,201;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.291:22:7,3:9,3:0|1:31324788_T_C:31324788:8,8,3,3
chr6	31324790	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=28,31;MFRL=194,201;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:6,3:9,3:0|1:31324788_T_C:31324788:8,8,3,3
chr6	31324820	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=27,29;MFRL=181,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,1:13,2:15,8,1,2
chr6	31324829	.	GG	CA	.	.	DP=25;ECNT=12;MBQ=30,32;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:5,5:6,6:5,7,10,3
chr6	31324851	.	A	AC	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=28,28;MFRL=173,175;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=37.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:2,3:8,6:6,6,12,0
chr6	31324887	.	GG	CT	.	.	DP=32;ECNT=12;MBQ=33,34;MFRL=164,179;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,11:0.364:31:8,5:12,5:0|1:31324887_GG_CT:31324887:13,7,7,4
chr6	31324892	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=12;MBQ=27,32;MFRL=173,175;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.382:32:7,5:11,5:0|1:31324887_GG_CT:31324887:12,8,7,5
chr6	31324895	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=12;MBQ=27,33;MFRL=166,175;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,12:0.394:31:7,5:12,6:0|1:31324887_GG_CT:31324887:12,7,7,5
chr6	31324911	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=30,35;MFRL=162,196;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:13,1:16,2:16,13,1,2
chr6	31324925	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=28,31;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,16:0.415:39:10,9:13,6:0|1:31324925_A_G:31324925:13,10,7,9
chr6	31324931	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=12;MBQ=28,30;MFRL=156,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,18:0.475:38:9,8:11,8:0|1:31324925_A_G:31324925:10,10,8,10
chr6	31324953	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=12;MBQ=33,28;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=79.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,23:0.571:40:7,6:9,14:0|1:31324925_A_G:31324925:7,10,10,13
chr6	31324996	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=132,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:3,6:8,10:4,7,3,13
chr6	31325004	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.434:23:5,3:8,5:3,10,3,7
chr6	31325028	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=142,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:2,5:8,1:0|1:31325028_A_G:31325028:2,8,1,6
chr6	31325030	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=142,180;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:2,5:7,1:0|1:31325028_A_G:31325028:2,8,1,5
chr6	31325049	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=35,24;MFRL=152,162;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:2,4:5,0:0|1:31325028_A_G:31325028:0,7,1,3
chr6	31371430	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=111,248;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.377:19:7,2:4,4:6,6,4,3
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chr6	31378387	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=153,185;MMQ=60,48;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:4,6,3,2
chr6	31378768	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=321,237;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,3,1
chr6	31378956	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:12,2:3,1:8,8,2,1
chr6	31378977	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=147,98;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:7,4:5,1:6,6,3,2
chr6	31379109	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,2:6,1:0,7,0,4
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chr6	31379794	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=161,181;MMQ=59,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:7,3:4,3:0|1:31379773_C_T:31379773:8,4,3,4
chr6	31379807	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=156,181;MMQ=59,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:8,2:4,3:0|1:31379773_C_T:31379773:10,4,1,4
chr6	31379817	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=160,185;MMQ=58,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:9,2:3,2:0|1:31379773_C_T:31379773:9,4,0,4
chr6	31379823	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=156,185;MMQ=59,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:8,2:3,2:0|1:31379773_C_T:31379773:8,4,0,4
chr6	31379931	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=142,188;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:9,4:2,2:3,8,5,1
chr6	31380091	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=195,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:8,3,2,1
chr6	31380161	.	G	GCTGCTGCTGCT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=191,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:0,3:3,6:2,1,4,6
chr6	31380194	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=198,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:3,2:10,4:0|1:31380194_T_C:31380194:8,6,4,3
chr6	31380198	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=198,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:3,1:10,4:0|1:31380194_T_C:31380194:8,6,4,2
chr6	31382770	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=154,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:0,1:8,3:6,2,3,1
chr6	31382882	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,134;MMQ=54,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:14,1:3,3:3,14,2,2
chr6	31431082	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,29:0.611:47:7,18:11,10:7,11,13,16
chr6	31431723	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=163,266;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:4,8,1,1
chr6	31431813	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=165,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:10,2:7,2:0|1:31431813_A_G:31431813:9,8,3,1
chr6	31431820	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=178,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,8:0.390:21:7,3:6,5:1|0:31431813_A_G:31431813:7,6,5,3
chr6	31465915	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:4,1,4,2
chr6	31473546	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=115,176;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:4,4:4,8:3,5,8,4
chr6	31473844	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=203,156;MMQ=55,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:0,4:2,7:2,0,9,2
chr6	31473957	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=156,176;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:11,2:7,3:9,9,3,2
chr6	31474000	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=152,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:6,2:11,3:10,7,4,1
chr6	31475127	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=143,162;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:6,5:1,2:3,4,5,3
chr6	31477461	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=164,251;MMQ=45,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,5:2,2:2,0,7,0
chr6	31477531	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=189,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:6,4,2,1
chr6	31477681	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.828:15:1,7:1,6:0,2,2,11
chr6	31477767	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=128,259;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr6	31496776	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=207,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,5:3,3:4,2,5,3
chr6	31496925	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,79;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:2,4:9,2:7,4,6,1
chr6	31497457	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr6	31497478	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr6	31497622	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=151,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:2,2:9,1:8,3,2,1
chr6	31497706	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=135,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:6,9:6,4:9,3,7,6
chr6	31497744	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=107,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:4,3:3,4,3,3
chr6	31498244	.	G	GC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.244:26:13,0:7,6:14,6,3,3
chr6	31498497	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=204,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr6	31506527	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,2:9,0:14,2,2,0
chr6	31506624	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,9:0.345:27:10,4:8,5:0|1:31506624_T_C:31506624:11,7,5,4
chr6	31506648	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,13:0.400:33:11,5:7,8:0|1:31506624_T_C:31506624:10,10,6,7
chr6	31506691	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:9,2:4,8:7,7,5,5
chr6	31506744	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.477:21:6,3:5,7:4,7,4,6
chr6	31506854	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=184,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,7:2,4:2,2,8,3
chr6	31509355	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=88.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,26:0.458:57:11,11:10,13:0|1:31509355_G_A:31509355:24,7,18,8
chr6	31509372	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=84.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,24:0.446:54:8,12:18,12:0|1:31509355_G_A:31509355:22,8,15,9
chr6	31509432	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,25:0.542:46:12,14:9,11:9,12,6,19
chr6	31513864	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.400:31:8,9:8,3:11,8,9,3
chr6	31514153	.	GCTGT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=217,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGT;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr6	31514426	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=195,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:31514426_G_C:31514426:0,3,0,1
chr6	31514433	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=195,82;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:31514426_G_C:31514426:0,3,0,1
chr6	31514437	.	C	CAGTACTGCTCTCATGCCTAGCATTTTACTAAGAGCTTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=217,195;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.319:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr6	31525319	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr6	31525912	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,7:0,0,12,6
chr6	31540784	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=111,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,7:7,1:6,6,3,5
chr6	31555130	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,5:7,5:8,4,2,8
chr6	31555392	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,3:4,1:6,4,4,0
chr6	31583312	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=138,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:7,3:2,1:4,6,2,2
chr6	31584469	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=176,86;MMQ=60,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:9,0:8,4:3,14,0,4
chr6	31591557	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:11,1:15,1:11,15,1,1
chr6	31594628	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=166,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.569:16:2,3:2,6:3,4,6,3
chr6	31595882	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=140,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:0,3:7,1:4,3,2,2
chr6	31597100	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:6,0:18,3:14,10,1,2
chr6	31598293	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr6	31600304	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=190,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,1:1,2:2,5,2,1
chr6	31600326	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=206,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:5,5,0,2
chr6	31600467	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=198,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:5,1:9,1:0|1:31600467_G_A:31600467:9,6,0,2
chr6	31600469	.	C	CCTGATGAGGGGATCG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=198,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.152:17:4,1:10,1:0|1:31600467_G_A:31600467:9,6,0,2
chr6	31600820	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=145,237;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr6	31600851	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,19;MFRL=145,266;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr6	31601344	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=214,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,5:2,5:2,0,5,5
chr6	31601513	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=173,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:1,5,1,5
chr6	31601843	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:8,5:2,1:3,7,0,6
chr6	31602967	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,21:0.611:34:10,12:3,9:0|1:31602967_G_A:31602967:6,7,12,9
chr6	31602972	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=171,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:29,4:0.142:33:17,4:11,0:1|0:31602967_G_A:31602967:13,16,4,0
chr6	31603770	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=109,241;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,1:8,1:9,10,1,1
chr6	31604044	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr6	31605167	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,1:5,7:5,4,5,3
chr6	31606901	.	C	CAAAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAG;STR;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:3,4,4,1
chr6	31607050	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=290,311;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr6	31607096	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=226,311;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:2,3,1,2
chr6	31609272	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=173,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,3:6,0:7,4,0,3
chr6	31610123	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=100,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:4,0,1,0
chr6	31611777	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=162,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:5,1:7,7,2,0
chr6	31613165	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=196,381;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr6	31614102	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=252,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr6	31616366	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=196,224;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr6	31619555	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:5,2,2,0
chr6	31623873	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.373:27:9,3:8,6:8,9,3,7
chr6	31624922	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=184,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr6	31625507	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=195,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:7,5:8,3:8,7,4,4
chr6	31625541	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=202,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:2,12,2,0
chr6	31627523	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=205,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:4,7:4,8:3,5,9,6
chr6	31628113	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:2,6,0,3
chr6	31629953	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr6	31630241	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.433:21:5,7:7,2:4,8,4,5
chr6	31632134	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.196:37:13,3:17,3:20,10,4,3
chr6	31634758	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr6	31634776	.	C	CACCAAGTGAAACAATGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=191,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr6	31637807	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	31639757	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=138,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,2:8,1:5,8,3,0
chr6	31648174	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=204,75;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:6,2:3,9,1,1
chr6	31657413	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,6:4,5:1,5,7,4
chr6	31657754	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=187,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:3,1,3,0
chr6	31657924	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,2:6,2:2,9,4,0
chr6	31659731	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,3:5,4:0,9,2,5
chr6	31669149	.	TAC	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=152,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.605:18:5,4:2,7:2,5,4,7
chr6	31675297	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:4,6,0,4
chr6	31675501	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:8,9,1,1
chr6	31678028	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=223,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:2,2,2,0
chr6	31681493	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=0,368;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,0:1,0:0,2,1,0
chr6	31685654	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	31687008	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,5:6,3:2,7,3,5
chr6	31691657	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.462:22:6,5:5,5:7,5,5,5
chr6	31691850	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=162,284;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:7,1:0,1:1,6,1,1
chr6	31701654	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,192;MMQ=60,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:13,4:12,0:11,14,4,0
chr6	31708147	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=129,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,3:8,0,4,0
chr6	31708463	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=215,291;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr6	31709004	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,0:6,3:10,7,3,0
chr6	31710968	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=102,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:10,5:6,2:6,11,1,6
chr6	31712196	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=133,268;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:5,1,2,0
chr6	31726031	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=160,69;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:11,0:15,3:10,16,1,2
chr6	31726253	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=193,271;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:10,2,1,1
chr6	31727857	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=143,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:14,0:13,2:13,15,0,2
chr6	31727897	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:16,3:10,1:9,18,1,3
chr6	31729359	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,7:0,3:1,0,5,5
chr6	31731014	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=247,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:0,3,2,2
chr6	31733650	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=127,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.542:13:3,1:2,6:3,3,5,2
chr6	31733950	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=186,285;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,0:1,2:6,0,2,0
chr6	31734345	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=210,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,1:5,2:10,2,1,2
chr6	31734890	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=115,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.703:5:1,2:0,0:1,0,1,3
chr6	31740861	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=160,132;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:3,4:4,0:3,4,5,0
chr6	31743838	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:9,1:3,3:7,5,1,3
chr6	31745284	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=150,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:3,2:0,1:3,0,4,0
chr6	31745347	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=146,252;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:13,3:5,0:0|1:31745347_T_G:31745347:12,9,3,0
chr6	31745354	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=136,252;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:13,3:5,0:0|1:31745347_T_G:31745347:11,10,3,0
chr6	31745518	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=105,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,1:3,3,0,3
chr6	31746962	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=190,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr6	31748689	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=169,159;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,6:1,0:2,4,5,1
chr6	31749348	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=186,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:31749348_C_T:31749348:10,6,1,1
chr6	31749350	.	G	GATCCACGC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=186,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:31749348_C_T:31749348:10,6,1,1
chr6	31751056	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	31752072	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.153:17:5,0:9,2:0|1:31752072_C_CT:31752072:8,7,0,2
chr6	31752074	.	C	CTCT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.153:17:6,0:9,2:0|1:31752072_C_CT:31752072:8,7,0,2
chr6	31752078	.	G	GCTCTCTCACTCTCTC	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:31752072_C_CT:31752072:8,6,0,2
chr6	31752081	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:31752072_C_CT:31752072:8,7,0,2
chr6	31752084	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:0|1:31752072_C_CT:31752072:7,7,0,2
chr6	31765861	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=152,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.414:8:3,3:2,0:2,3,0,3
chr6	31766186	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=118,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:4,9:9,0:9,4,9,0
chr6	31766294	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:3,6,0,2
chr6	31778272	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=188,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,23:0.649:35:6,13:6,10:4,8,9,14
chr6	31783507	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=116,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.590:22:4,7:4,6:7,2,12,1
chr6	31783755	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,333;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	31785228	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,141;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.702:25:4,4:3,13:2,5,7,11
chr6	31797587	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=162,182;MMQ=52,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,4:6,3:5,4,6,1
chr6	31797769	.	A	AAAGTT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGTT;STR;TLOD=61.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.514:31:9,11:5,3:10,5,8,8
chr6	31797923	.	GTTTTTTTT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,14;MFRL=150,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=24,16;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:1,0:0,0:1,1,0,1
chr6	31830468	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.199:38:18,0:13,7:13,18,0,7
chr6	31832356	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.328:10:6,1:1,2:7,0,3,0
chr6	31837488	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=180,167;MMQ=53,42;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31837488_C_T:31837488:0,4,0,1
chr6	31837490	.	CA	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=180,167;MMQ=53,42;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31837488_C_T:31837488:0,4,0,1
chr6	31837501	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=192,167;MMQ=46,42;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:31837488_C_T:31837488:0,4,0,1
chr6	31838490	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:8,7:3,1:4,7,5,3
chr6	31838545	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=212,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,7:2,1:3,6,3,5
chr6	31838713	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:3,1,1,2
chr6	31839309	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.388:16:5,1:5,4:0|1:31839309_C_T:31839309:4,6,2,4
chr6	31839331	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:5,2:2,1:0|1:31839309_C_T:31839309:3,4,1,3
chr6	31842652	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=181,244;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:2,0:5,2:2,6,1,1
chr6	31848492	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:7,9,2,0
chr6	31851234	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=167,251;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:6,5:10,2:8,8,4,3
chr6	31855914	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=159,54373331;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:4,1:2,6,0,2
chr6	31856070	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:3,2,3,3
chr6	31860337	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:2,5,0,2
chr6	31864304	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=133,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,3:1,8:1,2,7,4
chr6	31864547	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,2:11,1:7,14,1,2
chr6	31865056	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	31907168	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr6	31910929	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=175,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,3:5,0:0|1:31910929_G_A:31910929:8,2,1,2
chr6	31910938	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=175,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:0|1:31910929_G_A:31910929:9,1,2,2
chr6	31911665	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=178,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,3:6,0:10,3,3,0
chr6	31914935	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,4:3,5:2,3,5,4
chr6	31919578	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=205,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr6	31922254	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=165,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:1,2,3,2
chr6	31928306	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=192,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:6,3:11,1:9,8,2,2
chr6	31928799	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=128,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,6:1,2:3,2,7,1
chr6	31929014	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:8,7:6,9:9,5,7,9
chr6	31930441	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.729:24:1,7:5,9:4,2,11,7
chr6	31930462	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:4,2:11,3:9,6,1,4
chr6	31932177	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr6	31933529	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=217,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,5:3,0:5,1,5,0
chr6	31933867	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=215,227;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:1,3,0,2
chr6	31935901	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=186,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,2:1,1:0,6,0,3
chr6	31935928	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=238,196;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,3:1,0:0,6,0,3
chr6	31936668	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:5,1,5,3
chr6	31936679	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:7,4:4,4:7,4,6,2
chr6	31946837	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr6	31948421	.	TCTC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=181,170;MMQ=52,49;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,2:5,6:5,2,6,2
chr6	31963624	.	G	GTAAGTGTAAACAGCCTTCTGAGCATGCTCTTCCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,92;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.321:5:2,1:2,0:0|1:31963624_G_GTAAGTGTAAACAGCCTTCTGAGCATGCTCTTCCA:31963624:1,3,0,1
chr6	31963626	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=156,92;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.321:5:1,1:2,0:0|1:31963624_G_GTAAGTGTAAACAGCCTTCTGAGCATGCTCTTCCA:31963624:1,3,0,1
chr6	31965493	.	C	CTATATACCTAATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	31994742	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=256,219;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:1,1:0|1:31994742_A_G:31994742:2,0,1,0
chr6	31994750	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=233,219;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:31994742_A_G:31994742:2,0,1,0
chr6	32006597	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,218;MMQ=53,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,5:3,1:3,2,2,4
chr6	32006858	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=235,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:3,4:2,2:2,3,5,2
chr6	32007063	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=270,198;MMQ=31,34;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr6	32007258	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,12;MFRL=170,177;MMQ=40,34;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.519:4:0,0:1,0:0|1:32007258_A_C:32007258:1,1,2,0
chr6	32007264	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=191,177;MMQ=60,34;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.381:6:1,1:2,0:0|1:32007258_A_C:32007258:1,3,2,0
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chr6	32026107	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=240,65;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:0,5:1,0:0,1,2,3
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chr6	32029183	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=221,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,2,1
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chr6	32050067	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=303,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.636:14:3,3:1,6:2,3,2,7
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chr6	32065013	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:3,6,0,2
chr6	32065023	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=182,146;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,3:3,0:3,5,0,3
chr6	32089142	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=202,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,2:3,6:3,2,2,6
chr6	32095392	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=117,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:18,2:10,1:23,7,3,0
chr6	32119898	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=106,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:1,3:1,8:1,1,3,8
chr6	32122386	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,3:6,5:2,6,4,4
chr6	32122472	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:7,4:10,2:10,7,3,3
chr6	32123361	.	C	CTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=173,265;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=TG;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr6	32123702	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:10,1:14,2:13,11,0,3
chr6	32125438	.	TCAATGCCAGCAGCTTCCTGGCCCTGATCAATGGGGAAAGAGACCATCC	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:7,0:12,2:17,25,1,1
chr6	32130428	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,0:9,4:6,7,0,4
chr6	32134510	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=184,262;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,2:3,1:4,4,1,2
chr6	32134656	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:11,0:6,3:9,8,1,2
chr6	32147291	.	CTT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.292:18:8,0:4,5:10,3,2,3
chr6	32147478	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,144;MMQ=46,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.404:40:16,9:8,7:13,11,7,9
chr6	32147761	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=117,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,26:0.645:40:7,10:7,16:5,9,12,14
chr6	32149260	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:5,3:14,1:11,8,1,3
chr6	32150272	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr6	32150434	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=143,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:12,0:8,9:11,9,0,9
chr6	32150498	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=171,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,3:8,1:3,12,4,0
chr6	32151934	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=140,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:15,0:8,4:15,8,3,1
chr6	32151994	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:9,8:2,6:5,6,2,12
chr6	32154285	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=188,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:9,10:4,8:9,4,12,6
chr6	32154998	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=133,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.162:29:11,0:13,4:18,7,3,1
chr6	32155249	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=198,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr6	32155581	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=160,261;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:6,4,1,2
chr6	32156482	.	CG	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.135:28:11,1:13,2:9,16,3,0
chr6	32159956	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=89,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.503:30:8,5:6,10:6,9,8,7
chr6	32165444	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=188,312;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr6	32166160	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35,35;MFRL=143,196,179;MMQ=60,60,60;MPOS=24,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=T;STR;TLOD=5.72,4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.240,0.308:10:1,3,3:3,0,0:4,0,5,1
chr6	32167009	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=213,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:0,5,1,4
chr6	32168771	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=124,299;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:5,2:5,0:3,8,1,1
chr6	32171683	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=74,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,4:0,3:2,1,3,4
chr6	32172065	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:4,8:3,8:4,3,9,7
chr6	32178773	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=4550441,227;MMQ=47,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr6	32183175	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=145,288;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,3:4,0:3,6,1,2
chr6	32184705	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=175,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:0,5:7,2:7,0,3,5
chr6	32184790	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=171,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:8,0:10,3:9,9,1,2
chr6	32185922	.	CAG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=47.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:0,4:3,8:0,3,2,10
chr6	32187605	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=183,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:3,3:1,4:2,3,3,4
chr6	32187836	.	G	GCC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=102,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=C;STR;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,4:3,2:5,1,4,2
chr6	32188099	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,1:9,2:7,9,1,2
chr6	32188383	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=155,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.748:14:2,7:1,3:0,3,6,5
chr6	32188996	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=147,268;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:4,9,2,0
chr6	32189032	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,5:2,4:1,5,5,4
chr6	32190217	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=222,236;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr6	32190620	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=197,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr6	32191581	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=169,237;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.534:11:2,1:2,3:5,0,5,1
chr6	32191658	.	T	TAGCAGC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=169,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=AGC;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.479:5:1,0:2,2:1,2,0,2
chr6	32191730	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=165,237;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:2,4:0,4:0,2,0,8
chr6	32268501	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=161,51;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,4:6,1:5,7,3,2
chr6	32270283	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=107,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:9,1,2,0
chr6	32270363	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=101,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:15,2:13,1:8,20,1,2
chr6	32290208	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,1:3,1:7,3,2,0
chr6	32290851	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:12,2:4,0:6,10,2,0
chr6	32290927	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,3:6,0:5,4,1,2
chr6	32290954	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:5,4,0,2
chr6	32291327	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=86,110;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=47.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:7,15:3,0:4,6,15,0
chr6	32291359	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=110,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.154:37:22,3:8,2:21,11,3,2
chr6	32292392	.	C	CAACT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:3,1,3,1
chr6	32292560	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=179,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.726:5:0,1:1,3:0|1:32292560_AT_A:32292560:0,1,0,4
chr6	32292571	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=179,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.438:5:0,1:2,1:0|1:32292560_AT_A:32292560:0,3,0,2
chr6	32298372	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=62,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,0:7,3:12,6,2,1
chr6	32298438	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=36,33;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:0|1:32298438_C_G:32298438:0,4,0,2
chr6	32298440	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=36,33;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0|1:32298440_C_G:32298440:0,3,0,3
chr6	32298444	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:0|1:32298438_C_G:32298438:0,4,0,2
chr6	32298446	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0|1:32298440_C_G:32298440:0,3,0,3
chr6	32303236	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=140,95;MMQ=60,43;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.365:23:10,2:5,6:5,10,0,8
chr6	32307446	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:3,2:5,0:2,6,1,1
chr6	32311152	.	G	GCACTCGCGTTTATTCCAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=287,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr6	32317467	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=204,382;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:6,1,1,1
chr6	32323529	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	32333936	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=185,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:12,3:6,2:9,9,3,2
chr6	32335777	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=163,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:1,10,1,1
chr6	32336495	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=131,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:12,2:7,3:15,4,5,0
chr6	32336586	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=142,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:11,0:11,5:9,13,4,1
chr6	32337630	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=222,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:9,3:9,0:15,4,2,1
chr6	32337686	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=142,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,3:6,0:7,5,3,0
chr6	32339348	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr6	32339541	.	G	GTTTAGAAATTTTCTCAGGCATGTGCTTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=197,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr6	32339548	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr6	32361821	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=150,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:7,0:10,5:7,10,1,4
chr6	32362416	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=183,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr6	32363816	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=180,238;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,0:3,3:6,1,3,0
chr6	32363844	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=176,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:6,2:8,3:11,3,4,1
chr6	32363955	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=169,238;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:10,2:8,3:9,9,2,3
chr6	32364034	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:5,2:11,0:8,8,1,1
chr6	32364190	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=264,257;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	32370616	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=233,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr6	32370684	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,1:8,4:12,3,3,2
chr6	32370835	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=174,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:10,2:10,2:14,6,3,1
chr6	32370890	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:8,9,0,2
chr6	32407709	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:8,1:13,5,2,0
chr6	32410137	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	32410159	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:7,0,3,0
chr6	32410210	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:7,1:13,2:0|1:32410210_T_C:32410210:15,8,1,2
chr6	32410215	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:10,1:16,2:0|1:32410210_T_C:32410210:17,10,1,2
chr6	32410941	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=147,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,3:7,4:8,4,4,3
chr6	32410987	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,4:5,4:3,4,5,3
chr6	32411035	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:8,2:7,3:8,7,4,1
chr6	32411307	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=236,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:0,5,2,2
chr6	32411523	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=104,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:8,3:15,4:9,14,6,1
chr6	32411726	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,3:1,4:1,4,0,7
chr6	32485397	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=156,243;MMQ=60,33;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr6	32485410	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=148,191;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:0,1:4,0:0|1:32485410_G_T:32485410:3,1,1,0
chr6	32485421	.	TC	GT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,36;MFRL=161,191;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:32485410_G_T:32485410:2,1,1,0
chr6	32485912	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=36,20;MFRL=96,47;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:32485912_CAA_C:32485912:0,5,1,1
chr6	32485917	.	CAA	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=144,47;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:1,2:0|1:32485912_CAA_C:32485912:0,7,1,1
chr6	32485922	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=29,20;MFRL=159,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:32485912_CAA_C:32485912:0,6,1,1
chr6	32485929	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=33,20;MFRL=159,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:32485912_CAA_C:32485912:0,6,1,1
chr6	32485931	.	CA	AG	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=34,20;MFRL=159,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:32485912_CAA_C:32485912:0,6,1,1
chr6	32485934	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=25,33;MFRL=163,47;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,1:0|1:32485912_CAA_C:32485912:0,5,1,1
chr6	32485952	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=33,35;MFRL=176,257;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0|1:32485952_C_G:32485952:0,5,0,3
chr6	32485972	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=32,35;MFRL=183,257;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:0|1:32485952_C_G:32485952:0,6,0,3
chr6	32487062	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=33,35;MFRL=212,309;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32487062_G_C:32487062:1,0,1,0
chr6	32487068	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=25,36;MFRL=212,309;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32487062_G_C:32487062:1,0,1,0
chr6	32487091	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=24,36;MFRL=158,309;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:32487062_G_C:32487062:2,0,1,0
chr6	32487094	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=24,34;MFRL=158,309;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:32487062_G_C:32487062:2,0,1,0
chr6	32487096	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,31;MFRL=158,309;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:32487062_G_C:32487062:2,0,1,0
chr6	32487144	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=26,26;MFRL=108,169;MMQ=51,38;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr6	32487170	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=27,27;MFRL=109,169;MMQ=33,38;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:5,2,2,0
chr6	32487175	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=29,27;MFRL=106,169;MMQ=30,38;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr6	32487268	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=165,180;MMQ=60,34;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:2,0:2,2,0,2
chr6	32487277	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=197,180;MMQ=60,34;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:3,3,0,2
chr6	32487294	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=172,273;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:4,5,0,2
chr6	32487309	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=157,261;MMQ=60,50;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.449:11:3,3:3,1:4,2,2,3
chr6	32487314	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=221,274;MMQ=50,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:4,1:5,6,2,0
chr6	32487353	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=28,35;MFRL=157,271;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,4:3,0:3,4,4,0
chr6	32489925	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=152,240;MMQ=60,41;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:0|1:32489925_C_T:32489925:5,6,2,0
chr6	32489933	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=22,34;MFRL=140,240;MMQ=60,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,1:5,1:0|1:32489925_C_T:32489925:5,5,2,0
chr6	32489939	.	TG	CA	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=140,240;MMQ=60,41;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:3,1:0|1:32489925_C_T:32489925:4,6,2,0
chr6	32489943	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=26,35;MFRL=141,240;MMQ=60,41;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:0|1:32489925_C_T:32489925:3,5,2,0
chr6	32489967	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=154,206;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr6	32497847	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=28,33;MFRL=123,166;MMQ=51,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:5,4:8,1:12,4,4,2
chr6	32497857	.	T	TA	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=24,27;MFRL=131,147;MMQ=51,34;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:6,4:17,0:0|1:32497857_T_TA:32497857:19,6,3,1
chr6	32497860	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=24,32;MFRL=131,147;MMQ=51,34;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:6,3:19,0:0|1:32497857_T_TA:32497857:19,6,3,1
chr6	32497863	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=13;MBQ=31,30;MFRL=122,220;MMQ=51,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:9,1:19,1:22,7,1,1
chr6	32497868	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=13;MBQ=32,26;MFRL=153,107;MMQ=52,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.331:34:11,1:12,10:16,7,7,4
chr6	32497887	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=13;MBQ=25,29;MFRL=132,175;MMQ=51,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,6:0.127:53:14,5:33,1:0|1:32497887_A_T:32497887:29,18,5,1
chr6	32497896	.	A	G,T	.	.	DP=52;ECNT=13;MBQ=29,20,29;MFRL=133,79,175;MMQ=52,27,40;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.78,18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:41,3,6:0.076,0.127:50:7,3,5:32,0,1:25,16,7,2
chr6	32497901	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=13;MBQ=30,20;MFRL=134,79;MMQ=51,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:13,3:38,0:34,17,2,1
chr6	32497904	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=13;MBQ=30,25;MFRL=131,236;MMQ=51,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.090:53:15,1:34,3:32,17,3,1
chr6	32497905	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=13;MBQ=27,25;MFRL=171,115;MMQ=52,47;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,22:0.417:53:12,3:18,19:21,10,14,8
chr6	32497918	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=133,180;MMQ=55,44;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:12,1:29,1:0|1:32497887_A_T:32497887:25,18,2,0
chr6	32497928	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=13;MBQ=33,34;MFRL=134,180;MMQ=58,44;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:12,1:24,1:0|1:32497887_A_T:32497887:20,18,2,0
chr6	32497961	.	TT	GC	.	.	DP=16;ECNT=13;MBQ=30,31;MFRL=123,178;MMQ=60,45;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,1:9,1:6,7,2,0
chr6	32498011	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=153,180;MMQ=51,45;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:7,6,0,2
chr6	32498033	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=193,121;MMQ=52,56;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,1:8,3:3,12,2,2
chr6	32498041	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=180,212;MMQ=54,52;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:5,13,0,2
chr6	32498067	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=181,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,4:3,5:1,7,2,7
chr6	32498094	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=210,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:4,2:2,1:0,7,1,2
chr6	32546743	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=11;MBQ=33,23;MFRL=214,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr6	32546795	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=26,30;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:32546795_T_A:32546795:3,0,1,0
chr6	32546800	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=30,33;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:32546795_T_A:32546795:3,0,1,0
chr6	32546803	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=30,27;MFRL=181,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:32546795_T_A:32546795:2,0,1,0
chr6	32546866	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=11;MBQ=28,27;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,1:3,1:7,3,0,2
chr6	32546918	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=34,24;MFRL=188,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.362:20:9,4:4,3:0|1:32546918_G_A:32546918:6,7,1,6
chr6	32546928	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=11;MBQ=35,30;MFRL=150,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.239:19:7,3:6,1:0|1:32546928_CA_C:32546928:4,11,1,3
chr6	32546938	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=28,27;MFRL=147,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:7,3:5,1:0|1:32546928_CA_C:32546928:4,10,1,3
chr6	32546941	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=11;MBQ=33,28;MFRL=156,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:6,3:3,3:0|1:32546918_G_A:32546918:4,5,1,5
chr6	32546950	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=11;MBQ=23,33;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:7,2:2,2:0|1:32546918_G_A:32546918:4,5,0,4
chr6	32546953	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=11;MBQ=33,26;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:6,2:2,2:0|1:32546918_G_A:32546918:3,5,0,4
chr6	32547903	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	32547947	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=34,30;MFRL=144,150;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,1:6,2:5,7,2,1
chr6	32547982	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=144,91;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,5:0.146:39:14,1:18,4:0|1:32547982_G_A:32547982:15,19,4,1
chr6	32547988	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=8;MBQ=26,30;MFRL=130,215;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,9:0.232:41:11,5:20,3:0|1:32547988_T_C:32547988:15,17,4,5
chr6	32547990	.	TG	AA	.	.	DP=43;ECNT=8;MBQ=27,27;MFRL=152,114;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,7:0.178:43:17,1:18,5:0|1:32547982_G_A:32547982:15,21,5,2
chr6	32547991	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=137,173;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,11:0.301:37:11,6:15,5:0|1:32547988_T_C:32547988:11,15,5,6
chr6	32547997	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=152,114;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,7:0.178:43:15,1:19,5:0|1:32547982_G_A:32547982:16,20,5,2
chr6	32548026	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=32,35;MFRL=135,194;MMQ=54,41;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:11,5:13,3:8,16,4,4
chr6	32548082	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=29,28;MFRL=152,139;MMQ=60,48;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:10,4:5,9:5,10,10,3
chr6	32548113	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=32,20;MFRL=175,109;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,10:0.439:23:7,3:6,7:0|1:32548113_G_A:32548113:4,9,7,3
chr6	32548120	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=34,25;MFRL=176,109;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:4,2:6,5:0|1:32548113_G_A:32548113:4,7,5,4
chr6	32548136	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=176,158;MMQ=55,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:1,4:4,4:0|1:32548136_T_G:32548136:1,5,1,7
chr6	32548141	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=10;MBQ=30,32;MFRL=176,142;MMQ=55,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:2,4:2,3:0|1:32548136_T_G:32548136:1,5,0,7
chr6	32548148	.	AA	GT	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=25,32;MFRL=142,215;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0|1:32548148_AA_GT:32548148:1,6,0,3
chr6	32548153	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=10;MBQ=33,28;MFRL=141,215;MMQ=46,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:0|1:32548148_AA_GT:32548148:0,6,0,3
chr6	32548155	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=10;MBQ=33,26;MFRL=185,124;MMQ=46,34;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr6	32548167	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=10;MBQ=25,31;MFRL=128,228;MMQ=46,33;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr6	32548178	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=25,32;MFRL=152,203;MMQ=52,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.786:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr6	32548430	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=16;MBQ=33,30;MFRL=176,225;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:3,1:5,1:7,1,1,1
chr6	32548435	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=16;MBQ=34,24;MFRL=170,176;MMQ=58,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr6	32548466	.	CA	TA,TC	.	.	DP=27;ECNT=16;MBQ=33,27,31;MFRL=174,106,225;MMQ=60,60,49;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.30,5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,3,2:0.148,0.103:24:9,2,1:10,1,1:18,1,4,1
chr6	32548470	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=16;MBQ=35,25;MFRL=165,140;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:11,2:10,3:21,1,4,1
chr6	32548489	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.189:35:13,3:16,3:24,5,6,0
chr6	32548492	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=16;MBQ=25,32;MFRL=149,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:13,3:18,2:27,4,4,1
chr6	32548497	.	AGAGC	A	.	.	DP=39;ECNT=16;MBQ=29,32;MFRL=149,112;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.179:37:11,4:17,2:28,3,5,1
chr6	32548505	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:14,2:20,1:29,5,3,0
chr6	32548507	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=16;MBQ=35,28;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,25:0.650:38:8,8:5,16:11,2,22,3
chr6	32548513	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=16;MBQ=33,33;MFRL=155,112;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:11,4:21,2:28,4,5,1
chr6	32548514	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=148,104;MMQ=60,58;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,8:0.209:41:14,2:18,5:0|1:32548514_G_A:32548514:29,4,7,1
chr6	32548520	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=16;MBQ=32,25;MFRL=139,104;MMQ=60,58;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,8:0.214:40:15,3:17,4:0|1:32548514_G_A:32548514:28,4,7,1
chr6	32548550	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=16;MBQ=33,25;MFRL=111,136;MMQ=52,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,8:0.168:49:22,3:18,4:27,14,2,6
chr6	32548569	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=16;MBQ=32,20;MFRL=150,84;MMQ=52,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,2:0.057:51:26,0:20,2:0|1:32548569_C_T:32548569:25,24,1,1
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chr6	32548581	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=16;MBQ=27,32;MFRL=148,178;MMQ=52,45;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:22,2:23,1:23,22,1,2
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chr6	32548660	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=30,31;MFRL=160,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:8,2:12,5:5,15,3,4
chr6	32548681	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=30,34;MFRL=156,168;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:0|1:32548681_T_C:32548681:1,3,1,4
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chr6	32548722	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=173,247;MMQ=60,46;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,2:1,3:0|1:32548722_C_A:32548722:0,5,0,5
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chr6	32548732	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=211,247;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,0:3,3:0,8,0,3
chr6	32548734	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=29,35;MFRL=211,247;MMQ=60,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.468:11:3,2:2,3:0|1:32548722_C_A:32548722:0,6,0,5
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chr6	32549246	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=18;MBQ=25,32;MFRL=183,208;MMQ=40,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:6,0,2,0
chr6	32549249	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=18;MBQ=33,32;MFRL=214,175;MMQ=47,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:5,0,3,0
chr6	32549259	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=18;MBQ=28,29;MFRL=169,185;MMQ=60,32;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,1:2,5:2,0,6,0
chr6	32549278	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=18;MBQ=25,33;MFRL=197,173;MMQ=47,32;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr6	32549284	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=18;MBQ=27,30;MFRL=169,195;MMQ=60,37;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:2,0,6,0
chr6	32549296	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=18;MBQ=27,33;MFRL=154,236;MMQ=60,47;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:5,1,3,0
chr6	32549331	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=18;MBQ=34,30;MFRL=172,252;MMQ=52,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,1:7,1:0|1:32549331_C_A:32549331:10,6,2,0
chr6	32549340	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=18;MBQ=34,32;MFRL=172,252;MMQ=52,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,1:12,1:0|1:32549331_C_A:32549331:14,9,2,0
chr6	32549359	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=18;MBQ=35,20;MFRL=189,88;MMQ=52,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:9,0:11,3:0|1:32549359_C_T:32549359:13,7,1,2
chr6	32549383	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=18;MBQ=33,20;MFRL=174,88;MMQ=47,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:10,0:10,3:0|1:32549359_C_T:32549359:10,10,1,2
chr6	32549401	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=18;MBQ=28,31;MFRL=170,164;MMQ=52,33;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.548:20:4,6:5,5:5,4,6,5
chr6	32549416	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=18;MBQ=33,27;MFRL=161,190;MMQ=52,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.170:29:12,2:11,3:12,12,4,1
chr6	32549452	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=18;MBQ=32,20;MFRL=189,86;MMQ=51,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:20,0:18,3:24,14,1,2
chr6	32549475	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=18;MBQ=27,34;MFRL=142,217;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.539:29:8,10:5,5:8,5,10,6
chr6	32549481	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=18;MBQ=32,29;MFRL=197,144;MMQ=54,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.209:30:16,2:8,3:17,7,2,4
chr6	32549497	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=18;MBQ=30,32;MFRL=164,183;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.399:27:8,8:8,2:9,7,9,2
chr6	32549501	.	A	C,T	.	.	DP=26;ECNT=18;MBQ=28,31,28;MFRL=148,151,226;MMQ=60,40,44;MPOS=14,17;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=29.56,3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,10,2:0.398,0.107:24:6,8,1:6,2,1:7,5,9,3
chr6	32549548	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=20;MBQ=33,28;MFRL=164,181;MMQ=55,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.435:37:9,12:11,4:10,11,8,8
chr6	32549563	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=20;MBQ=32,29;MFRL=163,269;MMQ=55,55;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:20,2:17,2:20,19,2,2
chr6	32549579	.	TG	T	.	.	DP=43;ECNT=20;MBQ=29,29;MFRL=170,191;MMQ=60,35;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,5:0.142:40:15,3:20,2:0|1:32549579_TG_T:32549579:13,22,5,0
chr6	32549584	.	C	CT	.	.	DP=42;ECNT=20;MBQ=32,35;MFRL=177,191;MMQ=60,35;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,5:0.136:42:15,3:20,2:0|1:32549579_TG_T:32549579:14,23,5,0
chr6	32549589	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=20;MBQ=28,30;MFRL=183,125;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:15,4:19,1:18,16,1,4
chr6	32549596	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=20;MBQ=26,33;MFRL=122,202;MMQ=60,52;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,32:0.870:36:1,17:3,14:2,2,14,18
chr6	32549611	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=20;MBQ=27,28;MFRL=210,129;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:11,2:10,3:9,14,3,2
chr6	32549625	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=20;MBQ=25,31;MFRL=209,238;MMQ=56,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:10,3:8,1:0|1:32549625_A_G:32549625:4,15,0,4
chr6	32549626	.	AAC	A	.	.	DP=24;ECNT=20;MBQ=25,23;MFRL=217,135;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:8,0:4,17,0,2
chr6	32549628	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=20;MBQ=33,26;MFRL=190,215;MMQ=60,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.542:21:6,7:3,5:1,8,2,10
chr6	32549630	.	AC	A	.	.	DP=22;ECNT=20;MBQ=26,26;MFRL=207,238;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:10,3:7,1:0|1:32549625_A_G:32549625:3,15,0,4
chr6	32549631	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=20;MBQ=27,31;MFRL=176,215;MMQ=60,52;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=47.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.687:17:3,7:2,5:1,4,2,10
chr6	32549636	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=20;MBQ=26,31;MFRL=212,226;MMQ=60,42;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,2:6,2:2,14,1,3
chr6	32549654	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=20;MBQ=25,25;MFRL=209,208;MMQ=60,52;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,5:4,1:1,8,0,6
chr6	32549663	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=20;MBQ=32,31;MFRL=191,253;MMQ=59,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.317:14:7,1:2,3:0|1:32549663_G_T:32549663:0,10,1,3
chr6	32549667	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=20;MBQ=32,34;MFRL=191,253;MMQ=59,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.317:14:6,1:2,2:0|1:32549663_G_T:32549663:0,10,1,3
chr6	32549669	.	TG	AT	.	.	DP=12;ECNT=20;MBQ=31,25;MFRL=212,209;MMQ=60,44;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,4:5,0:0|1:32549669_TG_AT:32549669:1,7,0,4
chr6	32549675	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=20;MBQ=33,30;MFRL=212,209;MMQ=60,44;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,4:4,0:0|1:32549669_TG_AT:32549669:1,7,0,4
chr6	32549681	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=20;MBQ=32,30;MFRL=151,216;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,5:1,5:0,2,1,9
chr6	32549711	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=20;MBQ=30,28;MFRL=187,191;MMQ=37,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.825:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr6	32551794	.	TCACACACACACACACACACACACACACA	T,TCACACACACACACACACACACACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29,29;MFRL=139,168,196;MMQ=60,60,40;MPOS=29,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,6,18;RU=CA;STR;TLOD=3.37,3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.296:4:0,1,1:0,0,0:2,0,2,0
chr6	32551841	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=164,196;MMQ=60,40;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:1,0:2,0:4,0,1,0
chr6	32552059	.	GA	AA,TT	.	.	DP=31;ECNT=13;MBQ=32,28,28;MFRL=140,185,164;MMQ=60,45,59;MPOS=20,19;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.55,49.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,14:0.184,0.445:30:5,2,6:6,3,7:3,8,6,13
chr6	32552075	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=13;MBQ=27,32;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.622:27:4,7:6,10:4,6,6,11
chr6	32552085	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=33,34;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,1:9,1:9,7,0,2
chr6	32552092	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=24,30;MFRL=140,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,1:10,1:8,11,1,1
chr6	32552130	.	CCT	AGA	.	.	DP=13;ECNT=13;MBQ=33,20;MFRL=146,66;MMQ=60,55;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:2,2:3,5:0|1:32552130_CCT_AGA:32552130:4,2,3,4
chr6	32552134	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=13;MBQ=30,32;MFRL=146,66;MMQ=60,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0|1:32552130_CCT_AGA:32552130:3,1,1,4
chr6	32552137	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=13;MBQ=36,32;MFRL=146,66;MMQ=60,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0|1:32552130_CCT_AGA:32552130:3,1,1,4
chr6	32552138	.	G	GTA	.	.	DP=10;ECNT=13;MBQ=35,32;MFRL=168,66;MMQ=60,41;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,2:2,3:0|1:32552130_CCT_AGA:32552130:3,2,1,4
chr6	32552140	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=13;MBQ=29,31;MFRL=168,66;MMQ=60,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,2:3,2:0|1:32552130_CCT_AGA:32552130:3,2,1,4
chr6	32552144	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=13;MBQ=28,26;MFRL=168,83;MMQ=60,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,2:3,2:0|1:32552130_CCT_AGA:32552130:3,2,0,4
chr6	32552146	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=13;MBQ=29,27;MFRL=170,83;MMQ=60,41;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:2,2:3,2:0|1:32552130_CCT_AGA:32552130:3,4,0,4
chr6	32552183	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=29,24;MFRL=170,269;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr6	32552206	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=170,269;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr6	32557319	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=19;MBQ=30,26;MFRL=166,211;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:1,5:4,5:0|1:32557319_A_T:32557319:5,0,9,1
chr6	32557339	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=31,26;MFRL=174,211;MMQ=49,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.510:20:2,5:8,5:0|1:32557319_A_T:32557319:9,1,9,1
chr6	32557365	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=19;MBQ=28,32;MFRL=161,265;MMQ=52,41;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:0|1:32557365_A_C:32557365:13,6,2,0
chr6	32557375	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=25,25;MFRL=157,265;MMQ=52,41;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:32557365_A_C:32557365:11,7,2,0
chr6	32557378	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=25,32;MFRL=153,265;MMQ=52,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:32557365_A_C:32557365:11,7,2,0
chr6	32557386	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=19;MBQ=32,31;MFRL=153,165;MMQ=52,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:5,1:12,1:0|1:32557386_C_G:32557386:10,8,2,0
chr6	32557405	.	G	T,A	.	.	DP=22;ECNT=19;MBQ=27,28,31;MFRL=150,156,167;MMQ=52,40,27;MPOS=10,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.29,7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,3,3:0.167,0.160:21:6,2,2:9,1,1:8,7,5,1
chr6	32557414	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=19;MBQ=28,28;MFRL=165,156;MMQ=52,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:9,2:8,1:0|1:32557414_A_T:32557414:11,7,2,1
chr6	32557423	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=19;MBQ=28,26;MFRL=153,167;MMQ=52,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:9,2:8,1:0|1:32557386_C_G:32557386:9,9,3,0
chr6	32557435	.	AC	CG	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=28,32;MFRL=150,140;MMQ=60,34;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:5,3:7,1:0|1:32557414_A_T:32557414:8,7,2,2
chr6	32557446	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=19;MBQ=33,30;MFRL=150,156;MMQ=58,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.271:20:9,3:6,2:0|1:32557414_A_T:32557414:7,8,2,3
chr6	32557477	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=19;MBQ=34,25;MFRL=165,123;MMQ=59,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,8:0.250:34:12,4:14,4:0|1:32557477_G_A:32557477:9,17,3,5
chr6	32557478	.	CG	AA	.	.	DP=34;ECNT=19;MBQ=29,28;MFRL=132,199;MMQ=51,58;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.278:34:11,5:14,4:9,16,3,6
chr6	32557483	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=19;MBQ=30,32;MFRL=145,167;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=92.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,23:0.706:32:3,11:6,12:1,8,9,14
chr6	32557486	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=19;MBQ=30,26;MFRL=150,123;MMQ=59,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,8:0.231:37:12,4:15,4:0|1:32557477_G_A:32557477:11,18,3,5
chr6	32557489	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=19;MBQ=29,29;MFRL=150,123;MMQ=59,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,8:0.231:37:14,4:15,4:0|1:32557477_G_A:32557477:11,18,3,5
chr6	32557506	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=19;MBQ=25,32;MFRL=127,143;MMQ=51,58;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.500:36:8,9:10,8:5,13,8,10
chr6	32557529	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=19;MBQ=32,33;MFRL=122,177;MMQ=55,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,3:8,4:10,7,3,4
chr6	32557552	.	A	C,G	.	.	DP=22;ECNT=19;MBQ=20,32,32;MFRL=85,122,157;MMQ=52,60,30;MPOS=10,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=43.78,5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,15,2:0.641,0.120:22:3,8,1:2,7,1:2,3,7,10
chr6	32557606	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=327,220;MMQ=50,58;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:12,2:5,2:1,17,1,3
chr6	32557617	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=220,186;MMQ=58,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:1,3,1,4
chr6	32605164	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=12;MBQ=25,32;MFRL=124,249;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:0|1:32605164_T_G:32605164:7,3,2,0
chr6	32605173	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=12;MBQ=25,32;MFRL=127,249;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:9,0:2,2:0|1:32605164_T_G:32605164:8,3,2,0
chr6	32605189	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=27,33;MFRL=127,204;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:9,1:2,3:7,4,4,0
chr6	32605197	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=160,204;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:7,1:6,2:12,6,3,1
chr6	32605207	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=32,34;MFRL=160,234;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:9,3:7,3:11,5,4,2
chr6	32605216	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=33,28;MFRL=165,197;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,1:8,2:12,7,2,1
chr6	32605234	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=33,29;MFRL=163,335;MMQ=60,37;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,2:11,2:15,7,3,1
chr6	32605257	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=12;MBQ=33,29;MFRL=142,209;MMQ=60,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:13,3:11,4:17,7,4,3
chr6	32605271	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=31,30;MFRL=134,303;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:19,2:14,1:23,11,0,4
chr6	32605274	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=12;MBQ=28,33;MFRL=128,252;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,10:0.289:36:16,4:10,6:17,9,4,6
chr6	32605295	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=12;MBQ=32,29;MFRL=129,180;MMQ=60,39;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:18,2:18,2:20,17,3,1
chr6	32605325	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=127,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:18,1:16,2:16,18,0,3
chr6	32605380	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=130,271;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:11,2:5,1:0,16,0,3
chr6	32605400	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=139,296;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,2:3,0:0,10,0,2
chr6	32609009	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=25,34;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:6,0,4,1
chr6	32609047	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=139,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:3,2:8,0:8,3,2,0
chr6	32609097	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=30,24;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:7,2:15,0:7,15,0,2
chr6	32609105	.	GT	AT,AC	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=34,22,28;MFRL=144,178,169;MMQ=60,60,60;MPOS=13,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.38,8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,2,3:0.107,0.143:25:7,2,0:13,0,2:6,14,2,3
chr6	32609126	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:2,1:11,2:5,10,2,2
chr6	32609147	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=27,25;MFRL=155,179;MMQ=60,47;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,0:10,3:0|1:32609147_A_T:32609147:7,10,3,0
chr6	32609169	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=148,218;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:0|1:32609147_A_T:32609147:6,7,2,0
chr6	32609173	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=134,186;MMQ=60,54;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,0:6,4:6,5,3,1
chr6	32609256	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=148,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:13,5:4,0:7,10,5,0
chr6	32609371	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=106,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr6	32609425	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=212,337;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	32609647	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,35;MFRL=152,207;MMQ=50,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32609647_T_G:32609647:2,0,1,0
chr6	32609652	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=152,207;MMQ=50,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32609647_T_G:32609647:2,0,1,0
chr6	32609654	.	GT	AG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=152,207;MMQ=50,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32609647_T_G:32609647:2,0,1,0
chr6	32609671	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=152,207;MMQ=50,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32609671_G_A:32609671:2,0,1,0
chr6	32609673	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=152,207;MMQ=50,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32609671_G_A:32609671:2,0,1,0
chr6	32609855	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=106,280;MMQ=60,36;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,1:7,2:8,8,2,1
chr6	32609873	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=108,280;MMQ=45,36;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:11,3:4,2:8,7,4,1
chr6	32610047	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=155,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:7,4:10,2:0|1:32610047_T_C:32610047:6,12,4,2
chr6	32610059	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=155,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:8,3:7,2:0|1:32610047_T_C:32610047:6,9,3,2
chr6	32610109	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=131,216;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,0,2
chr6	32610286	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=157,273;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,3:6,2:9,0,5,0
chr6	32610314	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=150,200;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:7,1,8,0
chr6	32610330	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.316:14:4,2:4,2:9,1,4,0
chr6	32610403	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:13,2:15,2:12,16,2,2
chr6	32610436	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=27,27;MFRL=156,207;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.214:26:12,4:8,1:0|1:32610436_T_C:32610436:13,8,2,3
chr6	32610445	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=32,24;MFRL=152,207;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.182:31:12,3:12,1:0|1:32610436_T_C:32610436:15,11,2,3
chr6	32610461	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=26,31;MFRL=135,183;MMQ=40,50;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.270:23:9,3:8,3:7,10,3,3
chr6	32610478	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=143,218;MMQ=40,47;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:10,3:7,1:0|1:32610478_C_G:32610478:8,10,3,1
chr6	32610481	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=145,218;MMQ=40,47;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:10,3:9,1:0|1:32610478_C_G:32610478:9,12,3,1
chr6	32610487	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=140,218;MMQ=45,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:9,3:10,1:0|1:32610478_C_G:32610478:10,12,3,1
chr6	32610535	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=26,33;MFRL=120,273;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.135:23:8,3:12,0:9,11,1,2
chr6	32627956	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:0|1:32627956_C_G:32627956:6,3,2,0
chr6	32627958	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:4,3,4,0
chr6	32627967	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=130,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:32627956_C_G:32627956:6,3,2,0
chr6	32627969	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=124,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:0|1:32627956_C_G:32627956:6,4,2,0
chr6	32627976	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=124,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:32627956_C_G:32627956:6,4,2,0
chr6	32627992	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=25,35;MFRL=69,238;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:5,5:10,1:0|1:32627956_C_G:32627956:10,6,4,2
chr6	32628022	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=107,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:9,5:11,2:12,8,4,3
chr6	32628030	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=31,29;MFRL=107,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.278:27:9,5:11,2:12,8,4,3
chr6	32628045	.	CAT	GGA	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=134,229;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:7,7:8,3:11,5,6,4
chr6	32628064	.	TC	CG	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=28,35;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:7,4:8,1:9,6,4,1
chr6	32628093	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=29,33;MFRL=143,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,3:6,0:0|1:32628093_T_C:32628093:4,6,2,1
chr6	32628098	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=155,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,2:2,3:6,3,0,5
chr6	32628103	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=143,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,4:3,0:0|1:32628093_T_C:32628093:4,6,2,2
chr6	32628122	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,2:4,0:0|1:32628122_G_C:32628122:2,10,0,2
chr6	32628127	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=30,33;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:3,0:0|1:32628122_G_C:32628122:1,9,0,2
chr6	32628538	.	GG	TA	.	.	DP=14;ECNT=11;MBQ=33,27;MFRL=192,249;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:4,2:5,2:0|1:32628538_GG_TA:32628538:10,0,4,0
chr6	32628549	.	TG	GA	.	.	DP=15;ECNT=11;MBQ=26,36;MFRL=198,274;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:3,2:5,1:0|1:32628538_GG_TA:32628538:9,2,4,0
chr6	32628556	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=11;MBQ=32,25;MFRL=199,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,1:9,1:11,2,2,0
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chr6	32628571	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=33,27;MFRL=199,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,1:10,1:0|1:32628568_A_G:32628568:11,5,2,0
chr6	32628595	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=28,32;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,2:7,6:5,8,7,1
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chr6	32628606	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=11;MBQ=33,28;MFRL=176,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:6,1:12,3:7,11,3,1
chr6	32628617	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=28,20;MFRL=183,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:7,0:15,2:10,12,1,1
chr6	32628621	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=29,31;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:4,3:12,4:6,10,4,3
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chr6	32628736	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.349:18:7,2:4,4:0|1:32628736_CA_TG:32628736:1,11,1,5
chr6	32628741	.	C	CTTAA	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=142,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.386:18:7,2:4,5:1,10,1,6
chr6	32628751	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=142,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:6,1:4,3:0|1:32628736_CA_TG:32628736:1,10,0,5
chr6	32628764	.	CC	TT	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=150,249;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:6,1:3,2:0|1:32628736_CA_TG:32628736:1,9,0,3
chr6	32628776	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=33,25;MFRL=183,249;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:6,2:3,3:0|1:32628736_CA_TG:32628736:1,10,0,5
chr6	32628779	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=183,249;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,2:3,3:0|1:32628736_CA_TG:32628736:1,8,0,5
chr6	32628784	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=33,26;MFRL=180,261;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:5,2:2,2:0|1:32628736_CA_TG:32628736:1,7,0,4
chr6	32629064	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=155,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:3,2:0,1:4,0,3,0
chr6	32629091	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=146,245;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,2:5,2:9,3,4,0
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chr6	32629141	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=14;MBQ=29,28;MFRL=159,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.207:27:9,3:12,1:0|1:32629137_T_G:32629137:12,10,5,0
chr6	32629161	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=26,31;MFRL=142,199;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,2:12,0:13,9,1,1
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chr6	32629227	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=14;MBQ=31,29;MFRL=132,186;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,8:0.300:28:7,6:12,2:0|1:32629227_C_T:32629227:10,10,5,3
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chr6	32629238	.	A	AGC	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=27,32;MFRL=133,169;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.286:26:7,4:12,2:0|1:32629227_C_T:32629227:9,10,4,3
chr6	32629243	.	CAGAA	C	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=32,35;MFRL=132,195;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:7,4:13,2:0|1:32629227_C_T:32629227:8,12,4,2
chr6	32629257	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=14;MBQ=30,30;MFRL=142,260;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:4,3:11,1:0|1:32629227_C_T:32629227:6,11,2,2
chr6	32629281	.	CA	TT	.	.	DP=20;ECNT=14;MBQ=33,33;MFRL=137,268;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:8,0:8,3:0|1:32629281_CA_TT:32629281:2,15,0,3
chr6	32629289	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=14;MBQ=33,28;MFRL=142,268;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:8,0:7,3:0|1:32629281_CA_TT:32629281:1,14,0,3
chr6	32629297	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=14;MBQ=30,36;MFRL=163,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:7,1:6,3:0|1:32629281_CA_TT:32629281:0,14,0,4
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chr6	32629320	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=14;MBQ=25,32;MFRL=170,252;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.411:15:5,3:4,3:0|1:32629314_G_A:32629314:0,9,0,6
chr6	32629650	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,34;MFRL=220,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:5,0,3,0
chr6	32629680	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=136,252;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0|1:32629680_A_G:32629680:1,1,3,0
chr6	32629697	.	T	TCTGTC	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=24,29;MFRL=138,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:1,4:7,0:0|1:32629680_A_G:32629680:6,2,4,1
chr6	32629708	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=100,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:3,3:7,3:0|1:32629680_A_G:32629680:6,4,4,2
chr6	32629716	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=116,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.399:18:3,4:7,2:0|1:32629680_A_G:32629680:7,4,5,2
chr6	32629802	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,220;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:4,3:13,1:6,11,1,3
chr6	32629889	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=151,213;MMQ=60,53;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:14,4:6,0:12,8,2,2
chr6	32629920	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=152,125;MMQ=56,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:8,5:2,8:3,7,9,4
chr6	32629935	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=149,165;MMQ=52,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,3:10,0:10,11,0,3
chr6	32630028	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=190,162;MMQ=40,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,1:7,1:5,14,2,0
chr6	32632523	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,36;MFRL=157,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:2,2:0,1:3,0,3,0
chr6	32632534	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr6	32632547	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr6	32632587	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=31,35;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,1:0|1:32632587_A_G:32632587:4,1,0,2
chr6	32632598	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=29,29;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0|1:32632587_A_G:32632587:4,1,0,2
chr6	32632601	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=28,34;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:3,1:2,1:0|1:32632587_A_G:32632587:4,1,0,2
chr6	32632650	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.547:22:4,9:5,3:6,4,10,2
chr6	32632688	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=27,29;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.453:22:6,6:6,3:9,3,6,4
chr6	32632714	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.436:17:5,4:5,3:7,3,2,5
chr6	32632770	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=8;MBQ=27,20;MFRL=154,113;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,13:0.466:28:9,6:6,6:0|1:32632770_A_G:32632770:7,8,7,6
chr6	32632777	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=33,20;MFRL=154,113;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,13:0.500:26:9,6:4,6:0|1:32632770_A_G:32632770:6,7,7,6
chr6	32632832	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,5:4,5:4,5,1,9
chr6	32632903	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=163,250;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr6	32632917	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=168,250;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	32632931	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=168,250;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	32632944	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=168,250;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	32634184	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=16;MBQ=29,27;MFRL=163,260;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:32634184_A_G:32634184:5,0,2,0
chr6	32634189	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=16;MBQ=32,24;MFRL=144,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:5,1,2,0
chr6	32634192	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=16;MBQ=28,32;MFRL=178,260;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,0:3,2:0|1:32634184_A_G:32634184:7,1,2,0
chr6	32634203	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=16;MBQ=25,25;MFRL=168,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.343:12:5,1:3,2:0|1:32634203_TC_T:32634203:7,1,3,1
chr6	32634209	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=16;MBQ=29,26;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.320:13:5,1:4,2:0|1:32634203_TC_T:32634203:7,2,3,1
chr6	32634243	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=16;MBQ=33,26;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,1:13,2:17,6,2,1
chr6	32634300	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=16;MBQ=31,35;MFRL=130,150;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.171:33:10,3:15,2:0|1:32634300_G_C:32634300:11,17,3,2
chr6	32634302	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=16;MBQ=26,35;MFRL=130,150;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.171:33:10,3:15,2:0|1:32634300_G_C:32634300:11,17,3,2
chr6	32634306	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=16;MBQ=26,30;MFRL=126,153;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.200:33:12,3:15,3:11,16,3,3
chr6	32634318	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=131,155;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.244:31:10,3:12,4:9,15,3,4
chr6	32634331	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=16;MBQ=33,32;MFRL=125,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:10,1:13,4:0|1:32634331_G_C:32634331:8,16,2,3
chr6	32634341	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=16;MBQ=27,33;MFRL=126,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,7:0.222:34:13,3:13,4:0|1:32634331_G_C:32634331:8,19,3,4
chr6	32634350	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=16;MBQ=29,32;MFRL=131,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:13,2:13,4:7,19,3,4
chr6	32634373	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=16;MBQ=32,29;MFRL=132,251;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:10,4:9,2:9,10,2,5
chr6	32634387	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=16;MBQ=33,30;MFRL=144,251;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:9,4:8,1:6,11,2,3
chr6	32634402	.	AAGC	A	.	.	DP=19;ECNT=16;MBQ=23,25;MFRL=136,237;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:7,4:5,1:5,9,1,4
chr6	32709179	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:3,5,2,2
chr6	32709204	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=173,307;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:6,1:4,1:4,6,1,1
chr6	32709309	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=126,160;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,2:3,5:2,3,2,5
chr6	32709363	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=134,185;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0|1:32709363_G_A:32709363:2,5,0,2
chr6	32709370	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=146,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0|1:32709363_G_A:32709363:1,5,0,3
chr6	32713018	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=85,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:8,6:5,5:8,5,5,7
chr6	32713030	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=74,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:6,7:8,3:10,4,4,6
chr6	32713188	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,4:2,5:0,4,3,6
chr6	32713487	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=205,83;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:5,0,1,1
chr6	32713771	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=157,236;MMQ=40,34;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,0:7,2:12,4,0,2
chr6	32713854	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.204:37:15,3:15,4:13,17,2,5
chr6	32713867	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=173,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:14,3:12,2:11,15,3,2
chr6	32713888	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=164,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,2:7,1:8,8,0,3
chr6	32714031	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=169,199;MMQ=60,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,1:8,1:0|1:32714031_G_A:32714031:11,11,2,0
chr6	32714033	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=169,199;MMQ=60,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:11,1:10,1:0|1:32714031_G_A:32714031:11,11,2,0
chr6	32714083	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=29,29;MFRL=169,166;MMQ=57,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:19,1:6,5:11,14,4,2
chr6	32714164	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=29,34;MFRL=150,199;MMQ=60,36;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:10,1:19,1:11,18,0,2
chr6	32714168	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=27,35;MFRL=101,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:7,3:11,7:6,12,2,8
chr6	32714175	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=178,62;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:7,4:15,2:5,17,2,4
chr6	32714182	.	GA	G	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=169,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.242:26:6,4:14,2:2,18,2,4
chr6	32724143	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=110,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,2,2
chr6	32724189	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=103,243;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,1:7,3:12,4,2,2
chr6	32724258	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,4:6,2:3,5,3,3
chr6	32724267	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=162,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:4,8,1,1
chr6	32724305	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=176,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,1:4,1:0|1:32724305_T_C:32724305:0,7,1,2
chr6	32724317	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,1:4,1:0|1:32724305_T_C:32724305:0,9,0,2
chr6	32724324	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=30,34;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:3,1:0|1:32724305_T_C:32724305:0,7,0,2
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chr6	32725193	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=236,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr6	32725456	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=11;MBQ=28,32;MFRL=245,210;MMQ=60,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,5,0
chr6	32725517	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=11;MBQ=27,32;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,0:3,6:8,0,4,2
chr6	32725523	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=26,25;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.472:15:5,1:3,6:7,1,4,3
chr6	32725619	.	TG	CA	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=30,34;MFRL=216,146;MMQ=55,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:6,4:3,4:0|1:32725619_TG_CA:32725619:2,7,2,6
chr6	32725625	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=29,32;MFRL=216,143;MMQ=55,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:6,5:3,4:0|1:32725619_TG_CA:32725619:2,7,4,5
chr6	32725653	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=33,33;MFRL=143,249;MMQ=58,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:11,1:6,3:0|1:32725653_C_T:32725653:7,10,0,4
chr6	32725663	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=25,33;MFRL=139,249;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:9,1:5,3:0|1:32725653_C_T:32725653:6,9,0,4
chr6	32725666	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=32,27;MFRL=139,249;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:8,1:5,3:0|1:32725653_C_T:32725653:5,10,0,4
chr6	32725672	.	A	AG	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=25,27;MFRL=172,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:5,4:1,6:0|1:32725672_A_AG:32725672:1,5,2,9
chr6	32725673	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=25,31;MFRL=172,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:5,5:1,6:0|1:32725672_A_AG:32725672:1,5,2,9
chr6	32725682	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=11;MBQ=32,36;MFRL=144,188;MMQ=60,33;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:3,9,0,2
chr6	32726577	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=197,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:6,0,6,0
chr6	32726769	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=179,181;MMQ=60,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:10,0:10,3:0|1:32726769_A_G:32726769:6,16,3,0
chr6	32726772	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=179,181;MMQ=60,47;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:11,0:11,3:0|1:32726769_A_G:32726769:6,16,3,0
chr6	32726788	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=184,182;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:11,1:12,3:7,16,4,0
chr6	32726803	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=182,221;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:11,2:9,6:9,11,4,4
chr6	32726838	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=35,30;MFRL=140,246;MMQ=51,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:5,4:4,6:7,2,4,6
chr6	32726966	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:0,6,0,4
chr6	32727002	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=198,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr6	32727004	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=237,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,3:0,4:0,2,0,7
chr6	32729335	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	32729459	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,2:2,3:7,2,4,1
chr6	32729642	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:9,7:7,5:5,11,5,7
chr6	32729734	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,4:2,4:3,6,1,7
chr6	32731170	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:6,0:8,7:11,3,0,7
chr6	32731313	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=163,298;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:5,1:1,8,0,3
chr6	32782976	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=144,222;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,8:0.176:47:26,7:13,0:20,19,8,0
chr6	32783086	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=155,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:8,3:12,1:8,12,3,1
chr6	32790099	.	G	GA,GAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,17,35;MFRL=150,156,116;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=4.99,4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,2:0.252,0.183:13:3,0,1:3,1,1:2,6,2,3
chr6	32796653	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=199,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:5,1,1,3
chr6	32796685	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=190,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:4,2,3,3
chr6	32796751	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=154,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.162:23:12,2:5,1:10,10,2,1
chr6	32796857	.	ACAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=262,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAC;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1,3,0,1
chr6	32797109	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=36,28;MFRL=195,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:0|1:32797109_G_A:32797109:8,1,5,0
chr6	32797115	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=201,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:4,2:4,3:0|1:32797109_G_A:32797109:7,2,5,0
chr6	32797168	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=194,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.518:21:5,6:5,4:4,6,8,3
chr6	32797297	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=197,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:4,5:1,5:0,5,0,10
chr6	32797620	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=177,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,1:4,4:10,0,5,0
chr6	32797684	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=145,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.523:21:6,7:4,4:4,6,6,5
chr6	32797876	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:3,6:1,5:1,3,3,8
chr6	32805307	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:6,7:11,5:10,7,5,7
chr6	32805470	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=112,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.741:25:2,11:4,7:3,3,16,3
chr6	32809223	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr6	32810443	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=118,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.586:22:2,8:6,4:6,3,10,3
chr6	32815480	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=171,320;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,0:3,3:0|1:32815480_A_G:32815480:2,7,0,3
chr6	32815483	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=171,320;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,0:4,3:0|1:32815480_A_G:32815480:2,7,0,3
chr6	32815491	.	CA	AT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=171,320;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,0:4,1:0|1:32815480_A_G:32815480:2,7,0,3
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chr6	32844970	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=197,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,1,4
chr6	32847309	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=39.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,6,5
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chr6	32904981	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=194,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:0,8:2,8:2,0,9,7
chr6	32916540	.	A	ACTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,5:0,0,8,1
chr6	32916555	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=166,237;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,1:7,1:8,4,1,1
chr6	32916699	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=214,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:2,2:7,4:2,7,1,5
chr6	32917042	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=178,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:2,2:14,3:13,5,2,3
chr6	32917544	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=162,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:3,5:8,0:6,5,4,1
chr6	32918628	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=233,117;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr6	32918644	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=249,117;MMQ=60,57;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr6	32942302	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:6,3:7,11:5,8,6,8
chr6	32943086	.	T	TGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=285,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GA;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,0:1,0,3,1
chr6	32943151	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=178,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:6,7:7,4:9,4,6,5
chr6	32943345	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,3:4,6:1,5,2,7
chr6	32943357	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,1:5,3:0,9,1,3
chr6	32943979	.	C	CT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.396:32:9,5:10,8:9,10,4,9
chr6	32944094	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=143,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,1:8,1:8,11,2,0
chr6	32944746	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:8,3:4,2:4,8,1,4
chr6	32945466	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=148,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:5,0:5,3:5,5,2,1
chr6	32945530	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,8:0,16:0,0,14,10
chr6	32946133	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:13,6:6,4:9,10,2,8
chr6	32974792	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=201,257;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,2:8,1:8,8,3,0
chr6	32974797	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=182,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:7,3:5,4:9,3,1,6
chr6	32974934	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=156,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,6:4,4:4,3,3,7
chr6	32975014	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=199,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:2,6:5,10:4,3,7,9
chr6	32975257	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:4,3:6,5:5,6,5,3
chr6	32975381	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=204,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:1,1,2,5
chr6	32975869	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,6:4,1:3,6,1,6
chr6	32977420	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=206,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	33036388	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=162,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:8,2:12,4:0|1:33036388_C_T:33036388:13,7,4,2
chr6	33036394	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=162,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:8,1:12,4:0|1:33036388_C_T:33036388:14,8,4,2
chr6	33036399	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=157,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.226:29:9,2:14,4:0|1:33036388_C_T:33036388:14,9,4,2
chr6	33036401	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=157,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.225:29:9,1:14,3:0|1:33036388_C_T:33036388:14,9,4,2
chr6	33036435	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=148,186;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.236:28:8,2:11,4:11,11,5,1
chr6	33036617	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=174,273;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.304:31:10,5:11,4:5,17,4,5
chr6	33036630	.	GA	TC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=166,284;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:7,6:10,4:4,13,5,5
chr6	33036708	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=194,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,3:5,0:0|1:33036708_CA_TG:33036708:2,6,2,2
chr6	33036717	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=195,250;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:4,4:5,0:0|1:33036708_CA_TG:33036708:3,6,3,1
chr6	33036950	.	CA	TG	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=31,28;MFRL=171,275;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:9,2:16,3:15,10,2,3
chr6	33036951	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=29,32;MFRL=160,279;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.348:28:7,4:11,6:12,6,3,7
chr6	33036959	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=29,27;MFRL=151,275;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:7,5:11,6:11,7,5,6
chr6	33036971	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=148,282;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:7,6:10,5:9,8,4,7
chr6	33036999	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=29,33;MFRL=166,241;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:8,4:9,3:9,8,2,5
chr6	33037080	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=170,248;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.377:22:7,3:7,5:0|1:33037080_G_A:33037080:5,9,3,5
chr6	33037082	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=28,35;MFRL=170,248;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.377:22:7,3:7,5:0|1:33037080_G_A:33037080:5,9,3,5
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chr6	33037560	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=193,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:5,2:7,3:0|1:33037557_C_T:33037557:4,9,3,2
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chr6	33037690	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=193,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:2,9,0,2
chr6	33041176	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=153,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:0|1:33041176_C_T:33041176:7,0,3,0
chr6	33041186	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=157,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,0:5,3:0|1:33041176_C_T:33041176:8,0,3,0
chr6	33041226	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:2,3:8,3:9,1,4,2
chr6	33043930	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.252:18:6,2:7,2:3,11,0,4
chr6	33048348	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=158,257;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,1:6,1:0|1:33048348_G_A:33048348:5,10,0,2
chr6	33048354	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:8,2:6,1:0|1:33048348_G_A:33048348:5,10,1,2
chr6	33048380	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:6,2:5,3:2,9,2,3
chr6	33048457	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=217,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.572:12:2,4:3,2:0|1:33048457_C_G:33048457:2,3,5,2
chr6	33048459	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=217,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:2,4:3,3:0|1:33048457_C_G:33048457:2,3,5,2
chr6	33048461	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=217,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:2,3:3,2:0|1:33048457_C_G:33048457:2,3,5,2
chr6	33048466	.	GG	TT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=217,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:0|1:33048457_C_G:33048457:2,3,6,2
chr6	33048542	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=28,26;MFRL=199,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.876:22:1,10:1,9:1,1,13,7
chr6	33048599	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0|1:33048599_C_A:33048599:0,0,6,8
chr6	33048602	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=12;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0|1:33048599_C_A:33048599:0,0,7,8
chr6	33048606	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=12;MBQ=34,32;MFRL=142,167;MMQ=51,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,3:6,4:3,5,2,5
chr6	33048628	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=12;MBQ=29,33;MFRL=142,176;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,4:7,3:5,5,1,7
chr6	33048640	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=27,32;MFRL=192,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,1:5,5:2,8,4,2
chr6	33048661	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=25,32;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:3,5:2,6:0|1:33048661_A_G:33048661:2,4,2,9
chr6	33048663	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=31,26;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:4,5:2,6:0|1:33048661_A_G:33048661:2,4,2,9
chr6	33048686	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=32,24;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,2:2,3:0|1:33048686_G_A:33048686:1,4,1,5
chr6	33048689	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=32,25;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,2:2,3:0|1:33048686_G_A:33048686:1,4,1,5
chr6	33048691	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=32,33;MFRL=164,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,1:2,3:0|1:33048686_G_A:33048686:1,4,0,5
chr6	33048694	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=12;MBQ=25,35;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,1:2,2:0|1:33048686_G_A:33048686:1,4,0,4
chr6	33052950	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=173,224;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:5,3:6,5:0|1:33052950_T_C:33052950:5,6,4,4
chr6	33052958	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=173,203;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:4,3:6,6:0|1:33052950_T_C:33052950:5,6,4,5
chr6	33052986	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=166,198;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,2:6,6:5,7,3,5
chr6	33053026	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=181,246;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr6	33053455	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=196,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:2,4:2,0,4,0
chr6	33053468	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=196,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,0:2,5:0|1:33053468_G_T:33053468:2,0,5,0
chr6	33053477	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:0|1:33053468_G_T:33053468:2,0,5,0
chr6	33053577	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,1:11,3:11,8,2,2
chr6	33053682	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=32,26;MFRL=165,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:6,11:3,5:1,8,2,14
chr6	33053723	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=183,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:3,3:2,4:0|1:33053723_T_C:33053723:1,4,3,5
chr6	33053728	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=27,28;MFRL=183,251;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:3,2:1,5:0|1:33053723_T_C:33053723:1,4,2,6
chr6	33053736	.	GGT	G	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=32,35;MFRL=204,303;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:3,6,0,2
chr6	33053737	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=34,33;MFRL=174,281;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.576:11:1,0:2,7:0,4,3,4
chr6	33053740	.	T	TCA,A	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=30,31,28;MFRL=183,303,281;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.05,13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,5:0.230,0.463:10:1,0,0:2,2,5:0,3,3,4
chr6	33053772	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=237,298;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:0|1:33053772_G_A:33053772:2,2,2,2
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chr6	33053902	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=31,35;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,1:0|1:33053902_A_G:33053902:2,0,4,0
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chr6	33053971	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=27,34;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,17:0.693:24:3,10:4,6:0|1:33053968_T_A:33053968:3,4,11,6
chr6	33053982	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=28,34;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.608:26:4,10:6,6:3,7,9,7
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chr6	33054071	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:4,12:1,4:3,2,6,10
chr6	33054074	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,8:4,2:4,8,5,5
chr6	33054091	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=29,27;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:2,3,1,6
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chr6	33054268	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,22:0.719:30:5,8:3,14:5,3,10,12
chr6	33054280	.	TG	CA	.	.	DP=34;ECNT=8;MBQ=26,33;MFRL=136,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=90.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,23:0.667:34:7,9:3,13:5,6,10,13
chr6	33054302	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=14;MBQ=28,32;MFRL=120,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.568:28:7,8:5,8:5,7,8,8
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chr6	33054353	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=14;MBQ=31,29;MFRL=128,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:2,3:6,3:0|1:33054353_G_A:33054353:3,5,3,3
chr6	33054355	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=14;MBQ=27,35;MFRL=128,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.438:14:2,3:6,3:0|1:33054353_G_A:33054353:3,5,3,3
chr6	33054373	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=14;MBQ=28,30;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.534:13:1,4:4,3:0|1:33054373_C_T:33054373:1,5,2,5
chr6	33054381	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=14;MBQ=32,33;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,12:0.650:18:1,5:5,7:0|1:33054373_C_T:33054373:1,5,2,10
chr6	33054386	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=14;MBQ=36,31;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=46.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,12:0.650:18:1,4:4,7:0|1:33054373_C_T:33054373:1,5,2,10
chr6	33054400	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=14;MBQ=33,36;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:0,4:4,5:0|1:33054400_T_C:33054400:0,4,0,9
chr6	33054404	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=14;MBQ=28,35;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:0,4:3,5:0|1:33054400_T_C:33054400:0,3,0,9
chr6	33054410	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=14;MBQ=28,35;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:0,4:3,5:0|1:33054400_T_C:33054400:0,3,0,9
chr6	33054413	.	TT	GA	.	.	DP=14;ECNT=14;MBQ=33,32;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,11:0.750:14:0,6:3,5:0|1:33054400_T_C:33054400:0,3,0,11
chr6	33054457	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=14;MBQ=29,32;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:1,0,0,4
chr6	33134102	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=171,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,1,3
chr6	33134392	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=222,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.817:20:3,7:0,9:1,2,5,12
chr6	33135391	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,16;MFRL=173,213;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.738:6:1,1:0,1:0,1,3,2
chr6	33136575	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=203,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,4:2,7:1,3,6,5
chr6	33136626	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=193,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:0|1:33136626_T_TA:33136626:0,2,0,1
chr6	33136627	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,22;MFRL=193,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:33136626_T_TA:33136626:0,2,0,1
chr6	33136638	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,12820963;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	33136675	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,25;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr6	33136692	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=55,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,0:2,3:0,8,0,3
chr6	33137727	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=238,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.869:21:1,8:1,10:0,2,12,7
chr6	33138498	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,6,7
chr6	33138677	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=207,66;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:1,5,1,3
chr6	33138746	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=251,328;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,2,2
chr6	33138839	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=299,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:2,4,4,0
chr6	33138955	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr6	33139047	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=149,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:5,0:11,5:11,5,0,5
chr6	33139328	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,10:0,0,11,7
chr6	33139475	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr6	33139547	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=189,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,1:6,1:2,12,0,2
chr6	33139662	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr6	33140009	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr6	33140983	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr6	33141161	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=293,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,1:0,7:1,0,6,2
chr6	33141253	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=15,32;MFRL=199,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.865:9:0,4:0,4:0,1,4,4
chr6	33141280	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:2,1,0,4
chr6	33141389	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=19,26;MFRL=293,244;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0,1,2,0
chr6	33141475	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:3,1,3,0
chr6	33141920	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr6	33142012	.	AG	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=77,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.313:24:8,3:8,4:9,8,3,4
chr6	33142253	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr6	33143756	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=183,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:3,6,0,2
chr6	33143948	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=211,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:3,1,2,1
chr6	33144243	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=214,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:3,6:9,3:5,7,4,5
chr6	33144373	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,11,6
chr6	33144466	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:4,12,1,1
chr6	33145369	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=151,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.516:12:1,3:3,3:2,4,3,3
chr6	33146053	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.456:15:5,3:3,2:0,8,4,3
chr6	33146440	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,3:3,0:8,1,3,0
chr6	33147589	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr6	33148878	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:4,3:10,5:8,7,4,4
chr6	33152835	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=135,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:5,8:0,3:5,1,7,4
chr6	33153528	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:13,3:1,2:5,9,4,1
chr6	33153632	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=197,247;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr6	33154656	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=253,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr6	33162540	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,2:9,0:5,8,2,0
chr6	33162650	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=181,264;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:8,1,0,2
chr6	33162682	.	ACCCCCAAGGGAGCCTCAGTGCCCCCCAG	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=163,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:4,1:3,0:12,12,1,1
chr6	33163451	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,5,8
chr6	33164432	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=227,111;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,0:6,3:1,12,3,0
chr6	33166034	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=200,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,3:7,4:12,0,4,3
chr6	33166967	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=127,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,0:5,3:7,6,0,3
chr6	33172905	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr6	33172932	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,9,6
chr6	33173748	.	CAGAG	C,CAGAGAGAG,CAGAGAGAGAG	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,34,34,33;MFRL=249,188,207,299;MMQ=60,60,60,50;MPOS=21,27,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,15,16;RU=AG;STR;TLOD=24.01,22.33,4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,8,8,2:0.277,0.341,0.102:25:3,5,5,1:3,3,3,1:6,1,7,11
chr6	33173842	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=207,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:5,4:9,3:10,4,2,5
chr6	33175575	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=206,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,1:2,4:6,0,4,1
chr6	33179689	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=142,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:1,1:3,3,3,0
chr6	33231285	.	C	CTCT	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=144,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.110:34:19,2:12,1:0|1:33231285_C_CTCT:33231285:7,24,0,3
chr6	33231287	.	G	GCTTGTAACT	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=141,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:18,2:12,1:0|1:33231285_C_CTCT:33231285:8,24,0,3
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chr6	33235755	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,4:3,4:3,6,5,3
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chr6	33239905	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=171,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:15,2:18,2:15,19,2,2
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chr6	33255103	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=149,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:8,4:5,6:6,7,5,5
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chr6	33258443	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.636:31:5,13:6,7:8,3,17,3
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chr6	33262762	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,1:6,1:5,16,1,1
chr6	33269394	.	GAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=284,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:0,1:4,1,2,0
chr6	33269675	.	CT	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
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chr6	33272855	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=180,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.734:12:1,5:1,4:1,2,7,2
chr6	33281842	.	GA	TT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,4:4,2:2,8,3,3
chr6	33283766	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=112,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.451:25:7,4:5,7:9,5,5,6
chr6	33287119	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=194,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:5,4:9,0:10,4,4,0
chr6	33288075	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=197,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:8,3:5,1:7,6,4,0
chr6	33288271	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=147,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:6,3:4,6:3,7,5,4
chr6	33288373	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=221,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:8,0:8,9,1,1
chr6	33289154	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:18,3:26,0:25,19,3,0
chr6	33289454	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=190,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:3,6,2,0
chr6	33290547	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=197,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,5:6,1:8,0,6,0
chr6	33359716	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=190,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.529:32:7,9:8,8:7,8,12,5
chr6	33359820	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr6	33366251	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr6	33379941	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=235,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.531:13:3,1:3,6:6,0,7,0
chr6	33381165	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=190,189;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,9:0.202:46:15,8:22,0:23,14,9,0
chr6	33381868	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:15,1:22,2:20,17,0,3
chr6	33382416	.	CTG	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=143,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,6:4,4:7,3,4,6
chr6	33382457	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.343:30:7,4:13,6:10,10,4,6
chr6	33382943	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,10,5
chr6	33382955	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:5,2:7,1:8,4,1,2
chr6	33383837	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=216,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.298:14:4,0:6,3:0,10,0,4
chr6	33385526	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,2:3,1:1,6,1,3
chr6	33400433	.	AA	CC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=117,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,1:3,1:0|1:33400433_AA_CC:33400433:0,4,3,0
chr6	33400438	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=117,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,0:0|1:33400433_AA_CC:33400433:0,4,2,0
chr6	33402876	.	AGG	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=241,203;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:3,1,1,0
chr6	33402879	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,12;MFRL=227,231;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:3,1,1,0
chr6	33402881	.	G	T,A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=35,15,15;MFRL=223,231,203;MMQ=60,40,40;MPOS=11,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.26,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,0,0:1,0,0:3,1,2,0
chr6	33402883	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=29,19;MFRL=231,203;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,0:1,0:4,1,1,0
chr6	33402884	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=24,16;MFRL=223,231;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:3,0:0,0:3,1,1,0
chr6	33402956	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.185:23:4,0:15,3:10,9,0,4
chr6	33403422	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=180,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	33406727	.	A	AAGGCTGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=232,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:33406727_A_AAGGCTGGC:33406727:1,3,0,1
chr6	33406730	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=232,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:33406727_A_AAGGCTGGC:33406727:1,3,0,1
chr6	33408465	.	TTC	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=200,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:2,1:6,0:5,3,0,2
chr6	33408542	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,0:10,3:8,7,2,1
chr6	33408680	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:5,2:6,0:5,7,1,1
chr6	33408890	.	ATG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=284,231;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=TG;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr6	33410139	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=221,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,4:0,1:3,1,5,0
chr6	33414626	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0|1:33414626_T_C:33414626:0,0,0,6
chr6	33414637	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:33414626_T_C:33414626:0,0,0,6
chr6	33414645	.	C	CTGAGCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=197,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr6	33422976	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,16,4
chr6	33541507	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=219,118;MMQ=60,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,5:3,0:3,0,4,1
chr6	33541719	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=95,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:13,3:10,1:12,11,2,2
chr6	33555348	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:3,7:1,4:3,1,5,6
chr6	33555690	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=238,314;MMQ=60,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33555690_G_C:33555690:0,1,0,1
chr6	33555694	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=238,314;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33555690_G_C:33555690:0,1,0,1
chr6	33555697	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=238,314;MMQ=60,36;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33555690_G_C:33555690:0,1,0,1
chr6	33555713	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,314;MMQ=60,36;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33555690_G_C:33555690:0,0,0,1
chr6	33608379	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,2,14
chr6	33623509	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=128,270;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:4,5,0,2
chr6	33630624	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=260,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:3,1,2,1
chr6	33630816	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,0:2,6:0,2,1,5
chr6	33630846	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr6	33631155	.	TGGGAGG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=230,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:0,3:3,5:0|1:33631155_TGGGAGG_T:33631155:3,0,8,0
chr6	33631163	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=270,188;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:0,3:1,5:0|1:33631155_TGGGAGG_T:33631155:2,0,8,0
chr6	33635808	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=231,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:33635808_T_A:33635808:0,4,0,1
chr6	33635812	.	GG	AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=237,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:33635808_T_A:33635808:0,3,0,1
chr6	33635815	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=237,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:33635808_T_A:33635808:0,3,0,1
chr6	33636232	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr6	33640048	.	G	GTTGGAAACTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=93,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr6	33641897	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=180,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:4,2,2,0
chr6	33641956	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:5,1:10,2:9,6,1,2
chr6	33644768	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0|1:33644768_T_C:33644768:0,0,8,6
chr6	33644773	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0|1:33644768_T_C:33644768:0,0,9,5
chr6	33646316	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=152,42;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:4,6,2,0
chr6	33646328	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=110,102;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:1,3:6,0:4,4,1,2
chr6	33646655	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=116,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.325:10:2,1:3,1:5,2,0,3
chr6	33647936	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=193,238;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.219:15:4,1:7,1:2,10,1,2
chr6	33650430	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=256,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,6:2,4:0,2,3,7
chr6	33650941	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=203,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,0:0,2:0,3,1,1
chr6	33651975	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=246,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,2:1,2:0,1,2,3
chr6	33652542	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=136,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:5,1:12,2:11,7,2,1
chr6	33653111	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,8,5
chr6	33653638	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=131,285;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:4,7,0,2
chr6	33654378	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr6	33654897	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,5,8
chr6	33655173	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=186,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,0:0,3:0,5,0,3
chr6	33655942	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=198,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:3,5,0,2
chr6	33656416	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=217,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:2,2,5,2
chr6	33657246	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr6	33659481	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=163,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:14,0:18,3:20,12,2,1
chr6	33660411	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	33696131	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=229,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr6	33740382	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,13:0,6:0,0,13,6
chr6	33740592	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr6	33744711	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=175,260;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:10,0,1,1
chr6	33748831	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=192,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=46.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.764:19:2,8:2,7:4,0,11,4
chr6	33754396	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=220,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr6	33754592	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:8,3:10,1:8,11,1,3
chr6	33768726	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=213,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:2,0,6,1
chr6	33768810	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=139,211;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:9,8:11,0:8,12,8,0
chr6	34026938	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.873:6:0,0:0,4:0,0,1,5
chr6	34211341	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,2:3,3:3,6,2,3
chr6	34212734	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=26,18;MFRL=175,142;MMQ=48,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.412:10:2,1:4,1:0|1:34212734_A_C:34212734:0,6,4,0
chr6	34212737	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=33,22;MFRL=175,142;MMQ=48,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.412:10:2,2:4,1:0|1:34212734_A_C:34212734:0,6,4,0
chr6	34212743	.	A	C,G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=0,34,34;MFRL=0,142,181;MMQ=60,56,47;MPOS=12,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.48,17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,5:0.352,0.563:9:0,2,2:0,1,3:0,0,4,5
chr6	34212748	.	TT	CC	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=175,142;MMQ=49,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.412:10:3,2:2,1:0|1:34212734_A_C:34212734:0,6,4,0
chr6	34212753	.	CAGG	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=189,152;MMQ=52,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.394:8:2,1:2,2:0|1:34212734_A_C:34212734:0,5,3,0
chr6	34214994	.	G	GTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TC;STR;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr6	34215221	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=154,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:2,1:5,3:0|1:34215221_G_A:34215221:6,1,3,1
chr6	34215228	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=170,158;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,2:0.231:11:2,1:7,1:1|0:34215221_G_A:34215221:7,2,2,0
chr6	34497330	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:17,0:17,2:19,15,0,2
chr6	34498328	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=200,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,1:7,4:7,5,2,3
chr6	34614443	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,117;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,0:14,2:15,10,0,3
chr6	34622416	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=162,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:4,7,2,0
chr6	34664207	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr6	34735652	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=77,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:1,1,1,0
chr6	34790986	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=106,225;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:7,8:4,0:8,3,8,0
chr6	34838577	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=215,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr6	34847935	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr6	34949451	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=167,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:5,0,3,1
chr6	34951138	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=106,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:0|1:34951138_TA_T:34951138:1,6,2,0
chr6	34951150	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=106,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:4,0:3,0:0|1:34951138_TA_T:34951138:1,10,2,0
chr6	34951159	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=106,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:4,0:6,0:0|1:34951138_TA_T:34951138:1,10,2,0
chr6	34962060	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,276;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,1:4,3:7,4,3,1
chr6	35047579	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=178,253;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,3:14,0:16,9,1,2
chr6	35047732	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,1:10,1:2,17,1,1
chr6	35051946	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=130,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:8,0:10,8,2,0
chr6	35053695	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:0,1:4,1:0,4,1,2
chr6	35056443	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=233,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,9:1,6:0,1,4,11
chr6	35056489	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=174,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:5,0:2,14:0,7,0,14
chr6	35107682	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=199,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr6	35205881	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=277,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr6	35211990	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=291,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	35213723	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=186,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:14,3:10,0:0|1:35213723_T_G:35213723:13,11,3,0
chr6	35213725	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=186,100;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:13,2:9,0:0|1:35213723_T_G:35213723:13,11,3,0
chr6	35213758	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=166,100;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:13,3:13,0:15,11,2,1
chr6	35216296	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:3,1,6,1
chr6	35255441	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,162;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:9,5:10,0:9,10,5,0
chr6	35258539	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=221,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,3:2,5:1,1,2,6
chr6	35259261	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=186,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,2:6,5:9,1,4,3
chr6	35260615	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:7,2:2,2:7,2,3,1
chr6	35260858	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=202,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr6	35278370	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.142:30:13,0:13,3:12,14,0,4
chr6	35280216	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:6,0:10,4:10,6,3,1
chr6	35280489	.	G	GGGCTC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=171,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:7,0:13,2:0|1:35280489_G_GGGCTC:35280489:7,13,1,1
chr6	35280491	.	G	GCGTC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=170,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:12,2:0|1:35280489_G_GGGCTC:35280489:7,14,1,1
chr6	35280493	.	GAA	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=167,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:12,2:0|1:35280489_G_GGGCTC:35280489:6,15,1,1
chr6	35280496	.	G	GC	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=161,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:13,2:0|1:35280489_G_GGGCTC:35280489:7,15,1,1
chr6	35280500	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=167,47;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,0:10,2:0|1:35280489_G_GGGCTC:35280489:4,15,1,1
chr6	35280616	.	A	AGCGTATCTAGAAGCTGGAAAAGGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,26;MFRL=256,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.477:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr6	35287203	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=211,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr6	35378778	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=243,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr6	35391787	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,9:1,6:1,0,7,8
chr6	35423489	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr6	35424188	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0,9,0,2
chr6	35425263	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=256,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.391:6:2,0:0,2:2,2,1,1
chr6	35426175	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,0:3,3:4,4,1,2
chr6	35427556	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,0:5,5:5,5,3,2
chr6	35430686	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,5:6,1:6,4,3,3
chr6	35436571	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,3:6,2:11,2,3,2
chr6	35442997	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=214,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:4,4,1,1
chr6	35443573	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=208,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:1,3,0,3
chr6	35445265	.	G	GTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=309,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35445265_G_GTC:35445265:0,1,0,1
chr6	35445267	.	A	ACAAATATTTTGTCTCCTGTAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=309,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35445265_G_GTC:35445265:0,1,0,1
chr6	35448189	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=187,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,5:3,6:3,1,4,7
chr6	35471246	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=184,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr6	35477025	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=250,124;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.836:22:2,11:1,8:2,1,11,8
chr6	35477152	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr6	35478612	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=272,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,3:1,0:2,0,1,3
chr6	35543541	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,8:7,0:12,0,8,0
chr6	35610681	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=240,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr6	35704831	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=208,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:11,0,1,1
chr6	35705142	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=174,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,0:9,3:5,15,0,3
chr6	35706063	.	T	G,TG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=28,33,24;MFRL=235,177,257;MMQ=60,60,60;MPOS=18,32;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.43,3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.378,0.252:5:2,1,0:0,1,1:2,0,3,0
chr6	35706074	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,23;MFRL=169,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.417:5:2,0:0,1:3,0,2,0
chr6	35706078	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,16;MFRL=168,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,0:0|1:35706078_C_G:35706078:4,0,2,0
chr6	35706081	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,16;MFRL=168,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,0:0|1:35706078_C_G:35706078:4,0,2,0
chr6	35706086	.	TC	GA	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=24,19;MFRL=163,257;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:4,0,1,0
chr6	35706087	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,10;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,0:0|1:35706087_C_A:35706087:3,0,1,0
chr6	35706089	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,17;MFRL=212,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:35706087_C_A:35706087:4,0,1,0
chr6	35715303	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=236,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,3:0,2:2,1,4,1
chr6	35747107	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=166,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:6,2,3,1
chr6	35747188	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=164,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,0:7,3:4,7,1,2
chr6	35765068	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=148,263;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.318:14:3,2:5,2:6,4,2,2
chr6	35765151	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=183,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,0:2,2:0,5,0,3
chr6	35773490	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=218,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:9,3:1,2:6,4,2,3
chr6	35787117	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,1,1
chr6	35836947	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=252,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:35836947_T_G:35836947:1,3,0,1
chr6	35836951	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=252,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:35836947_T_G:35836947:1,3,0,1
chr6	35836954	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=228,240;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,0:0,3,1,1
chr6	35840562	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,15;MFRL=211,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:2,0:0|1:35840562_G_T:35840562:1,1,0,1
chr6	35840568	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:35840562_G_T:35840562:1,3,0,1
chr6	35840579	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,11;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:0,0:0|1:35840562_G_T:35840562:0,3,0,1
chr6	35840584	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=21,30;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:0,1:1,1:1|0:35840562_G_T:35840562:0,2,0,2
chr6	35965685	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=190,80;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,0:4,4:4,6,0,4
chr6	35987222	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:4,0,7,0
chr6	36026959	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=176,256;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr6	36040642	.	AT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=84,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.633:25:3,10:6,6:2,7,7,9
chr6	36041707	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,342;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr6	36063821	.	TG	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=160,66;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.067:42:21,0:17,1:17,23,2,0
chr6	36098333	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr6	36098951	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=207,257;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr6	36098953	.	T	G,A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,30,27;MFRL=217,204,257;MMQ=60,60,60;MPOS=14,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.58,3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.376,0.248:5:0,2,0:2,0,1:2,0,3,0
chr6	36099206	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr6	36100427	.	A	ATCT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=163,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:12,0:12,2:12,12,1,1
chr6	36103921	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=154,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr6	36104803	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr6	36107014	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=151,38;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:8,2:4,0:8,6,1,1
chr6	36107172	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=230,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,3:2,6:1,3,2,7
chr6	36177908	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=204,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,3:4,0:6,0,3,0
chr6	36177934	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=162,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:3,4:8,0:7,4,3,1
chr6	36178319	.	ATGGG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=247,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr6	36179173	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:6,0:8,2:7,8,1,1
chr6	36181947	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,3:8,0:9,3,0,3
chr6	36189887	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr6	36261885	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=403,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:0,5:1,4:1,0,6,3
chr6	36269603	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=212,220;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,4:4,0:3,2,3,1
chr6	36274148	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=125,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:10,1:7,1:0|1:36274148_T_A:36274148:6,11,1,2
chr6	36274153	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=123,191;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:10,1:8,2:0|1:36274148_T_A:36274148:6,13,1,2
chr6	36288879	.	G	GGTCTCAGCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,261;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,1:4,3,3,0
chr6	36290030	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:9,4:2,0:9,2,3,1
chr6	36291080	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=146,323;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,2:7,0:6,3,0,2
chr6	36291985	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=173,270;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,0:8,2:6,7,0,2
chr6	36292007	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=201,270;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:0,0:8,2:3,5,0,2
chr6	36293230	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=194,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:5,6:6,5:3,8,0,11
chr6	36294627	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=215,253;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:2,2,0,2
chr6	36296514	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=121,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,1:7,3:1,11,1,3
chr6	36298328	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=122,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,0:3,5:1,4,0,5
chr6	36355372	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=139,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.387:19:4,6:6,1:6,6,2,5
chr6	36359695	.	TTTA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=110,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.772:7:1,4:0,1:0,1,1,5
chr6	36368169	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,2:1,4:1,0,5,1
chr6	36447287	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	36452603	.	TAAA	T,TAA,TAAAA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,28,28,28;MFRL=143,133,123,96;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,30,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,15,17;RU=A;STR;TLOD=4.89,6.33,5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,3,3,6:0.134,0.203,0.286:19:3,2,1,3:3,1,2,3:1,6,4,8
chr6	36452653	.	C	CAGAACCCATCAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,17;MFRL=93,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:0,0:2,0:0|1:36452653_C_CAGAACCCATCAA:36452653:0,2,0,1
chr6	36452658	.	T	TCACTGTGTCTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=93,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:36452653_C_CAGAACCCATCAA:36452653:0,2,0,1
chr6	36465715	.	CTTTTT	C,CTTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,23,19;MFRL=202,197,206;MMQ=51,42,60;MPOS=21,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,14,17;RU=T;STR;TLOD=4.18,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.356,0.367:7:0,1,0:1,1,0:0,2,0,5
chr6	36466165	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=150,257;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:21,0:10,4:19,12,4,0
chr6	36467791	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=105,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:1,4,2,2
chr6	36475200	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=157,316;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:3,1,5,0
chr6	36493265	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=161,253;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,2:1,1:1,0,4,0
chr6	36493330	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=147,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:3,1,2,2
chr6	36508036	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=230,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr6	36566575	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=64,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr6	36569717	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=T;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.650:10:2,5:1,1:3,0,3,4
chr6	36652339	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=201,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,6:4,1:2,2,1,6
chr6	36695519	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:0,4,1,4
chr6	36710269	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:0,8,1,4
chr6	36712962	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=231,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:0,5,1,1
chr6	36730797	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:1,3,2,0
chr6	36746581	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=188,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:5,3,5,1
chr6	36759741	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr6	36759768	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=180,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:3,1,5,0
chr6	36767920	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	36789940	.	C	CG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=119,240;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:3,1:6,1:4,6,2,0
chr6	36823502	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=343,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,5:1,3:3,0,8,0
chr6	36842427	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=391,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:1,11:0,4:1,0,12,3
chr6	36853786	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,3,2
chr6	36853857	.	T	TCGC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CGC;STR;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,5:0,0,3,4
chr6	36884407	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=217,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:0,9,0,2
chr6	36887308	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=171,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,4:6,3:7,3,6,1
chr6	36936771	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=229,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:10,3:4,0:5,10,0,3
chr6	36940343	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=186,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:8,0,3,0
chr6	36943436	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=200,127;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:12,0:13,4:11,14,0,4
chr6	36943605	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=197,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:0,8,0,2
chr6	36945062	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=219,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,0:7,3:2,9,0,3
chr6	36945945	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:1,3,0,5
chr6	36949527	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=202,246;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	36989391	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,4,10
chr6	37139322	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:9,1:0,2:0,9,0,3
chr6	37140670	.	ATTT	A,AT,ATT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32,32,30;MFRL=177,190,185,196;MMQ=60,60,60,60;MPOS=3,8,6;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,11,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.93,4.53,9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,3,3,6:0.153,0.153,0.269:22:4,3,3,4:5,0,0,2:10,0,12,0
chr6	37141962	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=189,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:0,5,0,4
chr6	37186693	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:12,2:7,2:8,11,4,0
chr6	37237544	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,0:2,5:0,3,0,5
chr6	37280844	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:0,6:2,4:0,2,0,10
chr6	37426517	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=166,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:13,0:13,3:10,16,0,3
chr6	37447075	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=195,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:0,5,2,4
chr6	37447994	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=184,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr6	37452897	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:11,2,2,0
chr6	37605972	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.301:18:6,1:6,4:4,9,0,5
chr6	37606305	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=191,73;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.202:16:9,1:4,1:6,7,2,1
chr6	37611796	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=180,243;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.430:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr6	37614918	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=274,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr6	37614924	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,12;MFRL=274,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:1,0:1,1,2,0
chr6	37615159	.	A	AATAT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=194,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:0|1:37615159_A_AATAT:37615159:0,5,0,1
chr6	37615161	.	G	GAAGT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=194,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:0|1:37615159_A_AATAT:37615159:0,5,0,1
chr6	37615164	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=194,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:2,0:0|1:37615159_A_AATAT:37615159:0,5,0,1
chr6	37615177	.	A	AGAAAAAAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=247,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr6	37618202	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=241,269;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,1,1
chr6	37620129	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=242,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:0,2:4,8:0,4,2,8
chr6	37620142	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=224,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:0|1:37620142_T_A:37620142:0,8,1,1
chr6	37620143	.	A	ATGGAATGGAATGGAATGGAAT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=224,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:0|1:37620142_T_A:37620142:0,8,1,1
chr6	37622628	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:6,2:11,1:6,11,0,3
chr6	38084569	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=175,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,6:3,5:0,6,1,10
chr6	38119942	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=187,231;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,1:3,1:12,1,2,0
chr6	38691328	.	GCAA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=158,238;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CAA;STR;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr6	38697788	.	C	CAGAAAAAGTGCAAGGAGGCCCTGGGTCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.245:7:4,0:2,1:2,4,0,1
chr6	38702468	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=214,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:0,2:0,2,0,4
chr6	38746090	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:0|1:38746090_A_G:38746090:4,1,3,0
chr6	38746098	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0|1:38746090_A_G:38746090:4,0,3,0
chr6	38750705	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=210,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr6	38771096	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:9,3:5,2:6,8,1,4
chr6	38773172	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=187,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:7,0,3,0
chr6	38781931	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.339:15:5,2:5,2:4,6,2,3
chr6	38791555	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=244,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr6	38794183	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=139,93;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.598:13:3,5:2,3:2,3,3,5
chr6	38805902	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=236,268;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	38820451	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=174,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:10,1:1,1:5,7,2,0
chr6	38828424	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=167,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:10,1:1,2:2,9,0,3
chr6	38828453	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=179,265;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:0,11,0,2
chr6	38840601	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:2,7,1,3
chr6	38843279	.	CC	TT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=234,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:38843279_CC_TT:38843279:4,0,2,0
chr6	38843283	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=225,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:38843279_CC_TT:38843279:5,0,2,0
chr6	38851305	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=175,264;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:0|1:38851305_C_T:38851305:0,4,0,3
chr6	38851308	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=251,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,3:0.444:7:4,0:0,3:1|0:38851305_C_T:38851305:0,4,0,3
chr6	38851585	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=184,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr6	38877605	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=182,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr6	38882937	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:6,3:1,1:6,1,3,1
chr6	38883082	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=92,43;MMQ=60,41;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,2:4,0:3,6,1,1
chr6	38885010	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=159,245;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:2,2,3,1
chr6	38899485	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr6	38905667	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=212,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr6	38906072	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=249,251;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr6	38913177	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=159,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,2:7,5:10,1,7,0
chr6	38950126	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=160,222;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:8,4,0,2
chr6	38957771	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,5:2,2:1,2,6,1
chr6	38979946	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr6	38980260	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:9,5,1,1
chr6	39033420	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:39033420_A_G:39033420:0,0,5,0
chr6	39033427	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:39033420_A_G:39033420:0,0,6,0
chr6	39033898	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	39046713	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=118,76;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,2:5,0:4,5,0,2
chr6	39073479	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=148,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:7,1:7,6,2,0
chr6	39162206	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr6	39313618	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr6	39325078	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=224,159;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:1,9:4,7:1,4,7,9
chr6	39325224	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=189,204;MMQ=43,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr6	39328257	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=194,74;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,3:10,0:7,8,2,1
chr6	39330135	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:5,1,5,1
chr6	39330180	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=135,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.412:17:4,2:6,4:4,6,4,3
chr6	39682367	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr6	39828862	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=270,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr6	39832111	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=178,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:1,0,8,0
chr6	39832363	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=216,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,5:0,3:0,3,0,8
chr6	39839164	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr6	39846137	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=244,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,5:2,6:3,0,5,6
chr6	39846997	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:39846997_C_T:39846997:2,0,1,0
chr6	39847003	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:39846997_C_T:39846997:1,0,1,0
chr6	39847006	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,10;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:39846997_C_T:39846997:1,0,1,0
chr6	39851679	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:4,1,4,1
chr6	39855427	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,291;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	39866805	.	A	AACAATGGGC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=194,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.392:8:4,1:1,2:0,5,0,3
chr6	39867937	.	TT	AG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=190,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:11,0:3,2:5,9,1,1
chr6	39869066	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=203,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,2:1,5:2,2,5,2
chr6	39869259	.	G	GGCAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.673:1:0,0:0,1:0|1:39869259_G_GGCAA:39869259:0,0,0,1
chr6	39869264	.	A	AAGACTTGCAGTGCCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39869259_G_GGCAA:39869259:0,0,0,1
chr6	39869266	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39869259_G_GGCAA:39869259:0,0,0,1
chr6	39873309	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=168,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,0:1,4:7,0,2,2
chr6	39873682	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=359,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	40998324	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=175,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:6,3,2,0
chr6	40998344	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=211,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:2,3,4,3
chr6	41011266	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,4:5,1:7,4,4,2
chr6	41011304	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=151,8691;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,4:5,0:12,4,0,4
chr6	41029109	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,3:5,1:10,4,1,3
chr6	41036770	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=216,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr6	41037778	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.342:33:11,6:11,5:13,9,5,6
chr6	41038845	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.375:35:8,7:13,5:14,8,8,5
chr6	41046802	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,2:4,5:7,2,3,4
chr6	41052002	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	41160101	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=197,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,1:2,1:6,1,2,0
chr6	41165819	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=178,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,3:5,0:0|1:41165819_C_T:41165819:7,2,2,1
chr6	41165840	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=159,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:41165819_C_T:41165819:5,3,1,1
chr6	41169021	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=182,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr6	41196095	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:41196095_C_T:41196095:0,0,8,4
chr6	41196104	.	C	CCTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:41196095_C_T:41196095:0,0,7,5
chr6	41197434	.	TG	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr6	41204329	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=184,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,3:3,2:3,3,4,1
chr6	41243991	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=137,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,2:1,4:1,6,2,4
chr6	41303784	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=188,251;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:2,2:6,2:0|1:41303784_G_A:41303784:4,5,2,2
chr6	41303805	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=198,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,1:5,2:0|1:41303784_G_A:41303784:5,3,2,2
chr6	41304241	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=197,245;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr6	41309698	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,5,9
chr6	41486990	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=228,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:2,3:0,2:3,0,5,0
chr6	41552429	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=266,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr6	41554993	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=214,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	41562514	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	41562530	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	41617308	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=259,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr6	41617626	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=169,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr6	41617658	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=208,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr6	41620975	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	41621168	.	TCTG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTG;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	41652604	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=16,28;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.514:14:1,5:2,2:1,6,4,3
chr6	41655814	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=146,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:1,3:4,4:0,6,1,6
chr6	41708152	.	CTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.505:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr6	41710176	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:8,4:6,0:8,6,1,3
chr6	41721682	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,6:4,4:2,4,8,2
chr6	41740483	.	CGTGTGTGTGTGT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,114;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,11;RU=GT;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.687:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	41748263	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=174,269;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:0,9,0,4
chr6	41748279	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr6	41754573	.	C	CCTT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=184,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,8:0.256:33:11,7:14,1:0|1:41754573_C_CCTT:41754573:15,10,6,2
chr6	41754576	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,6:0.199:33:14,4:13,2:1|0:41754573_C_CCTT:41754573:18,9,3,3
chr6	41755410	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,1:12,1:16,5,2,0
chr6	41876911	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24,34;MFRL=0,154,161;MMQ=60,58,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=A;STR;TLOD=4.67,3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.508,0.332:3:0,0,1:0,1,0:0,0,2,1
chr6	41888827	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,7:6,6:3,6,6,7
chr6	41898096	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=215,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr6	41898564	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=238,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:0,3,1,4
chr6	41903576	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=180,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr6	41904345	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=165,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:13,2:9,6:10,12,3,5
chr6	41905174	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=206,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,4:1,3:0,3,0,7
chr6	42018212	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=198,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:42018212_G_C:42018212:1,0,1,0
chr6	42018217	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=198,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:42018212_G_C:42018212:1,0,1,0
chr6	42018222	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=196,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:42018212_G_C:42018212:2,0,1,0
chr6	42018227	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=196,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42018212_G_C:42018212:2,0,1,0
chr6	42018229	.	GA	CC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=18,12;MFRL=196,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:42018212_G_C:42018212:2,0,1,0
chr6	42025058	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=357,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,4:0,2:1,0,3,3
chr6	42036395	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=234,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,3:4,0:0,5,0,3
chr6	42044945	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,4:3,9:4,2,4,9
chr6	42054564	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=78,242;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,1:2,1:0,9,2,0
chr6	42075377	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=143,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr6	42110263	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr6	42152645	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=204,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:4,2:9,1,0,2
chr6	42153609	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	42162575	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	42175927	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	42176120	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr6	42176743	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:0|1:42176743_TG_T:42176743:0,3,1,4
chr6	42176749	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,1:2,3:0|1:42176743_TG_T:42176743:0,3,1,4
chr6	42176776	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=156,214;MMQ=60,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:0|1:42176776_T_C:42176776:0,3,0,1
chr6	42176780	.	TGG	CAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=195,214;MMQ=60,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:42176776_T_C:42176776:0,4,0,1
chr6	42181773	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=219,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,7:1,4:1,0,10,1
chr6	42181960	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=285,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:0,10:2,2:0,2,5,7
chr6	42182088	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=248,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,1:0,3,0,3
chr6	42182183	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr6	42214379	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=225,272;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr6	42231086	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,0:6,2:10,5,2,0
chr6	42559866	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=181,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.298:11:4,0:4,3:8,0,1,2
chr6	42607841	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=209,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr6	42608123	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=214,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,1:1,1:1,2,0,2
chr6	42611872	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=250,234;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr6	42612312	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:1,2,0,5
chr6	42613379	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=165,295;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,1:6,3:0,10,0,4
chr6	42617961	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:5,1,5,0
chr6	42626341	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=119,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,2:6,1:6,4,2,1
chr6	42626564	.	TAAA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=99,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=A;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.355:9:2,1:2,1:3,3,0,3
chr6	42638354	.	TACATA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=179,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACATA;STR;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:1,1:5,0,2,1
chr6	42638564	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=186,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,1:3,2:0,5,0,4
chr6	42641704	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=180,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:4,3:3,2:1,6,1,4
chr6	42650766	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=110,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.631:20:3,9:4,3:5,2,8,5
chr6	42652667	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=127,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:0,2:0,1,3,2
chr6	42658752	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=117,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:6,1:11,3:11,8,3,1
chr6	42666020	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=170,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,2:3,0:4,2,2,0
chr6	42672407	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0|1:42672407_T_C:42672407:0,1,2,2
chr6	42672416	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=194,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0|1:42672407_T_C:42672407:0,1,1,2
chr6	42796138	.	CAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=290,207;MMQ=59,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:4,0,1,0
chr6	42828194	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	42847725	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=126,70;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.091:53:25,0:19,4:24,25,1,3
chr6	42851258	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=183,205;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:6,7,1,1
chr6	42853842	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr6	42883911	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=140,242;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:4,4,1,1
chr6	42893372	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=202,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:2,8,1,1
chr6	42928461	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=84,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr6	42928758	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	42931224	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,6:2,5:2,1,9,2
chr6	42931261	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=126,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:3,8:7,7:6,4,9,6
chr6	42932715	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,228;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:2,2,1,2
chr6	42934500	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,3:5,3:5,4,3,3
chr6	42934620	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=179,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr6	42935998	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:4,6:4,3:3,5,8,2
chr6	42937721	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=141,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,0:10,3:8,11,0,3
chr6	42942779	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=133,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:0,3,1,3
chr6	42974268	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,2:10,0:14,9,2,0
chr6	42985758	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=192,167;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,5:6,0:5,8,5,0
chr6	42985770	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=190,167;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:9,5:7,0:7,9,5,0
chr6	42993969	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	43006739	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=190,233;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:2,5,0,2
chr6	43017256	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,0:10,3:8,10,0,3
chr6	43021910	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=138,51863014;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr6	43021943	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,15;MFRL=182,244;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.548:5:1,0:1,1:2,0,3,0
chr6	43021980	.	G	GGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=225,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:3,0,0,1
chr6	43021990	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,19;MFRL=179,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.496:4:1,1:1,0:0|1:43021990_A_T:43021990:0,2,2,0
chr6	43021995	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,19;MFRL=179,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.496:4:1,0:1,1:0|1:43021990_A_T:43021990:0,2,2,0
chr6	43023371	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,4:7,2:3,9,3,3
chr6	43034228	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:7,9,0,2
chr6	43038063	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=194,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr6	43038938	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=205,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr6	43041126	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=204,165;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:43041126_C_T:43041126:0,2,0,1
chr6	43041136	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=204,165;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:43041126_C_T:43041126:0,2,0,1
chr6	43041790	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=212,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr6	43100066	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=232,175;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,4:4,0:4,2,4,0
chr6	43111445	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	43112382	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=195,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:0,7,0,4
chr6	43127577	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:6,4:9,1:5,10,2,3
chr6	43128607	.	C	CGGGATTATAGACAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=175,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:3,5,1,1
chr6	43146272	.	TAC	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=209,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,1:2,1:0,8,0,2
chr6	43146299	.	A	AGG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=197,237;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.328:10:3,3:4,0:0|1:43146299_A_AGG:43146299:0,7,0,3
chr6	43146302	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=197,237;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.329:10:3,2:4,0:0|1:43146299_A_AGG:43146299:0,7,0,3
chr6	43146303	.	A	ACC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=197,237;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:3,2:4,0:0|1:43146299_A_AGG:43146299:0,7,0,3
chr6	43153409	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=273,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:3,2:0,1:2,2,0,3
chr6	43155458	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:9,5:6,5:5,10,6,4
chr6	43166677	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=288,196;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.389:6:1,0:3,0:1,3,0,2
chr6	43172430	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=116,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:4,2,4,0
chr6	43173672	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=199,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr6	43173907	.	CC	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:8,3:3,2:3,9,3,2
chr6	43188716	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=141,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr6	43189375	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,1:6,1:6,3,1,1
chr6	43190923	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=201,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr6	43193499	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=154,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,1:8,1:12,4,2,0
chr6	43214319	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=199,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr6	43221264	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=220,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:4,1,2,2
chr6	43221291	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,15;MFRL=225,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:43221291_T_A:43221291:1,1,2,0
chr6	43221300	.	AT	CA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=174,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,0:0|1:43221291_T_A:43221291:2,1,2,0
chr6	43221310	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=235,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:43221291_T_A:43221291:2,2,1,0
chr6	43221313	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,13;MFRL=235,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:43221291_T_A:43221291:2,2,1,0
chr6	43225547	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.246:13:5,0:5,2:4,6,1,2
chr6	43225766	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=267,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:43225766_G_A:43225766:0,4,0,1
chr6	43225791	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=164,233;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:43225766_G_A:43225766:0,2,0,2
chr6	43230548	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=175,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr6	43230940	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,0:5,4:4,3,2,2
chr6	43230970	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=128,193;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,3:3,3:4,2,4,2
chr6	43231163	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=213,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr6	43237501	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=155,40;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:43237501_G_T:43237501:1,3,1,1
chr6	43237503	.	C	CGCTGAATGA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=155,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:43237501_G_T:43237501:1,3,1,1
chr6	43250387	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr6	43250725	.	GGAA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=228,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,2:1,0,6,2
chr6	43251118	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=220,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:1,3,1,4
chr6	43251298	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:4,4:7,3:6,5,2,5
chr6	43251880	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	43269029	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=229,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr6	43270326	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:43270326_A_G:43270326:0,0,3,0
chr6	43270329	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=293,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43270326_A_G:43270326:3,0,1,0
chr6	43270337	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=293,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43270326_A_G:43270326:3,0,1,0
chr6	43273604	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=163,192;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,5:5,1:2,3,3,3
chr6	43274017	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=121,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:2,2:10,0:3,9,2,0
chr6	43276388	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=181,248;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0|1:43276388_G_C:43276388:3,0,2,1
chr6	43276390	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=248,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,3:0.500:6:2,3:1,0:1|0:43276388_G_C:43276388:2,1,3,0
chr6	43399837	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,10,11
chr6	43401105	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=180,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,1:4,3:4,5,0,4
chr6	43412736	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=198,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,2:7,0:12,6,2,0
chr6	43413652	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,266;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,2:4,0:5,7,2,0
chr6	43414203	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,15;MFRL=100,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:43414203_C_T:43414203:0,3,1,0
chr6	43414205	.	CCC	AAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,15;MFRL=100,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:43414203_C_T:43414203:0,3,1,0
chr6	43414216	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	43414234	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,0:1,2:0,1,0,3
chr6	43415769	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	43416991	.	G	GTT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:43416991_G_GTT:43416991:3,1,0,1
chr6	43416993	.	C	CTA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:43416991_G_GTT:43416991:3,1,0,1
chr6	43416994	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,30;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:43416991_G_GTT:43416991:3,1,0,1
chr6	43416995	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:43416991_G_GTT:43416991:2,1,0,1
chr6	43416997	.	G	GAATACTTGA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:43416991_G_GTT:43416991:2,0,0,1
chr6	43422196	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=202,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:6,3:6,9:8,4,1,11
chr6	43469445	.	GACAC	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,201;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=26,24;RU=AC;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.775:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr6	43469505	.	GTC	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=161,209;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	43494319	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	43496662	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=249,165;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:4,2:2,5:1,5,2,6
chr6	43501580	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,5,2
chr6	43514527	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,30;MFRL=188,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.550:7:0,1:0,2:0,3,0,4
chr6	43517744	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=129,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:2,3,1,1
chr6	43519229	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.332:16:7,0:4,5:0|1:43519229_T_C:43519229:2,9,0,5
chr6	43519233	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:6,0:4,5:0|1:43519229_T_C:43519229:2,9,0,5
chr6	43521263	.	TAC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=279,281;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.625:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	43550264	.	TGTG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=206,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GTG;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:2,0:1,3,0,2
chr6	43596648	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=195,175;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:10,0:16,5:10,17,0,5
chr6	43646287	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,154;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:11,0:12,2:12,11,1,1
chr6	43655533	.	T	TCGTAATTTTTTCTCAATATCCTTATTTTAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,112;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,3:8,2:2,11,1,4
chr6	43745107	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=146,281;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr6	43746169	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,263;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:8,1:16,3:14,10,2,2
chr6	43746612	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=169,93;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:9,4:9,0:14,4,4,0
chr6	43748643	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	43968671	.	TC	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,15;MFRL=294,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:43968671_TC_AT:43968671:3,0,1,0
chr6	43968680	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,15;MFRL=274,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:43968671_TC_AT:43968671:4,0,1,0
chr6	44081510	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=195,246;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr6	44081934	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=159,188;MMQ=60,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:5,0:6,2:0,11,0,3
chr6	44081987	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:1,1:1,2:0,3,0,3
chr6	44084354	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=192,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:7,2:3,9,1,1
chr6	44102572	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=203,309;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr6	44103019	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,2:3,0:9,2,1,1
chr6	44104279	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=209,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	44107200	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=219,79;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,6:3,1:6,2,2,5
chr6	44107365	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=202,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:2,2:8,2:2,8,3,1
chr6	44107612	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=228,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr6	44108150	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:7,3:0,0:0,7,0,3
chr6	44117727	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=223,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:5,4:1,0:3,3,2,2
chr6	44120435	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,0:8,2:4,11,1,1
chr6	44122416	.	TCTC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=181,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:2,2,5,2
chr6	44134581	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr6	44134610	.	TTCC	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=17,34;MFRL=112,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCC;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:0,2:0,2,0,2
chr6	44136955	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=198,177;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:6,0,2,0
chr6	44140818	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=197,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,3:7,3:4,8,1,5
chr6	44144557	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=200,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:4,0:0,1:2,4,2,0
chr6	44144798	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=271,297;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr6	44147250	.	AAC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=86,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:9,2:4,1:12,3,2,1
chr6	44148247	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=154,103;MMQ=60,35;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:9,9,0,2
chr6	44148655	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:2,2:9,0:4,7,2,0
chr6	44151560	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=168,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,1:2,0:0|1:44151560_A_C:44151560:0,4,2,0
chr6	44151566	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=201,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0|1:44151560_A_C:44151560:1,5,2,0
chr6	44151765	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=214,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:0,5,0,3
chr6	44151804	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=225,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0,4,0,2
chr6	44216544	.	GTT	G,GT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=149,146,197;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=6.44,27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,4,14:0.151,0.520:27:7,1,9:2,3,5:2,7,7,11
chr6	44217374	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.512:31:7,12:8,3:10,5,9,7
chr6	44217910	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,1:12,2:6,16,1,2
chr6	44220076	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	44228162	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:6,3:8,2:11,3,4,1
chr6	44247951	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,14:0,0,12,10
chr6	44253617	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	44268806	.	T	TTGTC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,9,1
chr6	44269023	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,1,16
chr6	44269193	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,216;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.498:8:2,1:1,3:3,1,3,1
chr6	44270768	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,2,1
chr6	44270936	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=137,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,2:7,2:5,7,1,3
chr6	44270986	.	GC	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=195,246;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,1:4,1:5,8,1,1
chr6	44272599	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:9,2:0|1:44272599_G_A:44272599:8,12,0,2
chr6	44272600	.	A	AAATAT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:0|1:44272599_G_A:44272599:8,12,0,2
chr6	44273546	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=70,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.398:21:4,6:7,2:4,9,2,6
chr6	44273982	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=187,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:6,0:8,2:7,8,2,0
chr6	44274797	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr6	44279111	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,5:5,3,4,2
chr6	44279302	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=167,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:0,2:0|1:44279302_G_GA:44279302:1,1,1,2
chr6	44279309	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=167,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,1:0,2:0|1:44279302_G_GA:44279302:1,1,1,2
chr6	44280812	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:6,1,5,0
chr6	44320650	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=199,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:44320650_GA_G:44320650:2,5,1,1
chr6	44320654	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=199,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:44320650_GA_G:44320650:2,5,1,1
chr6	44320655	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=199,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:44320650_GA_G:44320650:2,5,1,1
chr6	44355682	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=193,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,6:4,3:0,10,1,8
chr6	44355699	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=198,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:5,7:4,2:0,9,0,10
chr6	44364261	.	GT	G,GTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34,24;MFRL=161,173,107;MMQ=33,56,60;MPOS=19,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=3.85,4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.334,0.333:6:0,1,0:1,1,1:0,2,0,4
chr6	44371690	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:4,4,2,2
chr6	44374056	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:9,3:2,0:3,8,2,1
chr6	44922313	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,1:9,1:3,11,1,1
chr6	45296618	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr6	45333093	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.385:8:5,2:0,1:0,5,0,3
chr6	45390274	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=87,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,2:8,0:4,11,2,0
chr6	45480190	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=235,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0,8,0,2
chr6	45514961	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=242,10811480;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:1,1:6,1:2,5,2,0
chr6	45870999	.	CAG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=131,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,1:5,1:3,5,1,1
chr6	45922849	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chr6	46048000	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=156,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,7:3,2:2,5,2,7
chr6	46107312	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=211,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,1:1,4:7,3,4,1
chr6	46190930	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:16,2:3,0:9,10,2,0
chr6	46521602	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:2,5,2,5
chr6	46554912	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=129,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:13,3:7,0:10,10,0,3
chr6	46604062	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=154,101;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,4:4,0:4,0,4,0
chr6	46630068	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=255,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr6	46636520	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=114,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:9,2:13,0:20,4,1,1
chr6	46649231	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=176,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,0:1,4:4,2,3,1
chr6	46655901	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=143,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr6	46658905	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=198,154;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0|1:46658905_C_G:46658905:2,4,2,0
chr6	46658915	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=131,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,4:0.627:6:1,3:1,1:1|0:46658905_C_G:46658905:2,0,2,2
chr6	46661974	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,23;MFRL=244,200;MMQ=50,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	46672381	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=118,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,2:4,1:6,6,2,1
chr6	46684222	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=136,121;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:3,3:9,3:3,9,2,4
chr6	46717652	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=218,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:12,2:3,4:6,9,2,4
chr6	46719576	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=469,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr6	46726441	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,4:4,2:5,0,5,1
chr6	46726680	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=123,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,1:4,1:4,6,0,2
chr6	46761495	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=202,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.648:18:3,8:3,4:4,2,3,9
chr6	46793175	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=236,146;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:6,9:3,3:4,5,5,7
chr6	46794048	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=257,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:5,1,5,2
chr6	46797329	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=161,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.662:10:2,5:1,1:1,2,2,5
chr6	46800768	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=127,174;MMQ=60,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.333:31:7,0:14,10:9,12,10,0
chr6	46803018	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=166,138;MMQ=40,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:6,2:1,3:0|1:46803018_A_T:46803018:7,0,3,2
chr6	46803022	.	AA	CT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=173,56;MMQ=40,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:0|1:46803018_A_T:46803018:10,2,1,1
chr6	46803029	.	A	ATTGCTACACATCCTT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=179,56;MMQ=40,44;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:6,2:0|1:46803018_A_T:46803018:12,2,1,1
chr6	46803345	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=267,128;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,3:5,6:1,6,3,6
chr6	46806939	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=218,176;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr6	46806948	.	G	GTTTGGGGCAGCT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=206,178;MMQ=60,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:1,1:3,4:0,4,0,5
chr6	46823695	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=114.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,16:0,23:0,0,15,24
chr6	46823805	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,4,9
chr6	46826715	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,43;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,8,8
chr6	46826768	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=121,156;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,2:9,0:6,8,2,0
chr6	46828670	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	46832741	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=36.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr6	46832813	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=65,140;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.936:14:1,5:0,8:1,0,5,8
chr6	46832968	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr6	46834906	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr6	46856263	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=181,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,2:2,3,0,3
chr6	46867717	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:2,7:0,7:2,0,12,2
chr6	46867898	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=200,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,1:6,2:0,8,0,3
chr6	46976924	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,241;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:11,5:10,1:7,14,1,5
chr6	46977783	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=175,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:3,3,1,1
chr6	46991831	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=147,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:5,4:5,0:6,5,3,1
chr6	46995508	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=108,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr6	47202666	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=164,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,0:3,3:1,11,0,3
chr6	47202669	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=183,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,1:4,1:1,10,0,2
chr6	47253631	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=242,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:4,0,3,0
chr6	47277329	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	47445927	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,10,6
chr6	47547070	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=210,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:1,2:0,0:2,0,2,0
chr6	47626685	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:2,1,4,1
chr6	47641307	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=205,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr6	47646842	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=101,199;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,3:4,4:4,5,3,4
chr6	47649265	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,4:4,3:7,3,2,5
chr6	47653536	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:4,0:0,3:4,0,3,0
chr6	47653812	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=182,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr6	47654662	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:7,7:3,4:7,3,9,2
chr6	47661387	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=179,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:8,1:3,4:9,2,3,2
chr6	47678455	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=211,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,5:3,3:4,0,7,1
chr6	47678678	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr6	47678718	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=181,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr6	47681494	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,9,3
chr6	47682212	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,1:7,9:3,6,6,4
chr6	47684591	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=115,203;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:3,3,1,3
chr6	47686101	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,16:0,12:0,0,18,10
chr6	47686235	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:2,3,1,3
chr6	47749728	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=216,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:1,4:2,0,8,0
chr6	47759446	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=186,259;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,2:3,1:10,0,3,0
chr6	47762938	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=269,238;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr6	47847637	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=125,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:14,1:4,1:8,10,2,0
chr6	47847683	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=208,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,5:1,2:0,2,1,6
chr6	49415351	.	TA	T,TAA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,24,25;MFRL=169,195,147;MMQ=60,60,60;MPOS=15,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=4.80,4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.307,0.254:9:1,1,0:3,1,2:3,1,4,1
chr6	49415383	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,15;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:4,0:4,0:8,5,4,0
chr6	49415386	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.198:17:4,0:6,0:9,5,3,0
chr6	49424047	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=201,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	49437853	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:6,0,3,1
chr6	49437959	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=40.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.414:27:9,0:6,11:0|1:49437959_G_A:49437959:8,8,0,11
chr6	49437964	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,11:0.400:28:10,0:6,11:0|1:49437959_G_A:49437959:9,8,0,11
chr6	49440599	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,4:7,1:7,8,3,2
chr6	49459978	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,3:5,0:6,7,0,3
chr6	49460026	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:49460026_A_T:49460026:0,3,1,0
chr6	49460030	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:49460026_A_T:49460026:0,3,1,0
chr6	49479694	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=151,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:5,0:3,2:3,5,1,2
chr6	49518808	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.287:26:12,4:6,3:8,11,4,3
chr6	49519124	.	TG	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=175,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:12,0:0|1:49519124_TG_T:49519124:10,15,1,1
chr6	49519134	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=174,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:14,0:0|1:49519124_TG_T:49519124:11,15,1,1
chr6	49574994	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr6	49660418	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,2,1
chr6	49663465	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=204,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,4:3,0:5,0,4,0
chr6	49755030	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=149,387;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:9,1:2,2:3,8,2,1
chr6	49815873	.	ATT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=170,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr6	49937257	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=207,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,5:5,1:3,6,5,1
chr6	50681785	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=173,86;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:16,1:15,1:20,11,2,0
chr6	50681817	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=122,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=T;STR;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.726:8:1,3:0,0:1,1,3,3
chr6	50789932	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:20,2:6,0:0|1:50789932_G_A:50789932:9,19,0,2
chr6	50789944	.	CTGTG	C,CTG	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,33,33;MFRL=175,142,227;MMQ=60,60,60;MPOS=13,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,5,6;RU=TG;STR;TLOD=4.81,4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,2:0.184,0.181:13:7,0,2:2,2,0:0,9,0,4
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chr6	52051274	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:6,4,1,3
chr6	52101873	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,150;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:10,4:11,0:10,11,4,0
chr6	52129667	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=254,242;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:0,6,0,4
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chr6	52130117	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=188,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52130104_CT_AC:52130104:0,2,0,1
chr6	52130245	.	C	CAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
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chr6	52137313	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=101,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:2,2,0,5
chr6	52142092	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=233,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,4:0,0:0,1,0,4
chr6	52142582	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,189;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr6	52144081	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=208,283;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr6	52147363	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,5:4,2:4,0,6,1
chr6	52147692	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,3:6,2:0,8,0,5
chr6	52267907	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,356;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	52267967	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=356,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr6	52269685	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=247,197;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:1,6:1,6:1,1,7,5
chr6	52270504	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=195,156;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:3,5:6,6:5,4,6,5
chr6	52270544	.	TTTG	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=160,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,2:13,1:16,9,3,0
chr6	52271194	.	AAG	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=217,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=59.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,17:0.600:28:5,8:6,9:0|1:52271194_AAG_A:52271194:7,4,5,12
chr6	52271204	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=163,228;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:26,3:0.128:29:12,1:14,2:1|0:52271194_AAG_A:52271194:12,14,1,2
chr6	52271400	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=219,141;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr6	52303399	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:4,6,0,2
chr6	52317597	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=155,289;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:10,2:6,2:7,9,1,3
chr6	52355206	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=423,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,3:1,8:0,1,1,10
chr6	52368034	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:13,2:17,3:13,17,2,3
chr6	52370939	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.611:13:3,3:1,5:2,3,3,5
chr6	52441754	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:0,7,0,7
chr6	52541811	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=246,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:0,5:1,6:1,0,11,0
chr6	52615564	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=189,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:1,7,1,1
chr6	52617731	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=146,194;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:2,5:9,2:4,7,5,2
chr6	52622814	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,252;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,0:4,4:1,6,0,4
chr6	52662263	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr6	52697601	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr6	52697825	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0|1:52697825_A_C:52697825:0,0,1,6
chr6	52697834	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,242;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0|1:52697825_A_C:52697825:0,0,1,8
chr6	52702324	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr6	52702529	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr6	52767271	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=148,74;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:5,3:5,7,1,2
chr6	52843477	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=208,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr6	52847273	.	T	TAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AC;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	52847551	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=231,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr6	52849481	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=290,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr6	52850155	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=179,245;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	52858859	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=176,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr6	52895851	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,1:8,1:12,9,1,1
chr6	52938468	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	52962715	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	52996708	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr6	52998788	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=188,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:1,1,3,0
chr6	52998834	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=208,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:0,1,7,0
chr6	52998856	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,4:0,6:1,1,7,3
chr6	53134104	.	C	CACAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:0,7,0,3
chr6	53138203	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.851:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	53140928	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:2,2,3,4
chr6	53160383	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:6,3:4,4:8,2,5,2
chr6	53365019	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,11:0,0,17,9
chr6	53370107	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=242,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,4:4,5:5,0,9,0
chr6	53370147	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,0:4,3:10,0,1,2
chr6	53370395	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=243,253;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr6	53379405	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=210,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr6	53519857	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.775:20:3,9:1,7:1,3,10,6
chr6	53519880	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=194,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,1:8,2:8,8,3,0
chr6	53520088	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	53520124	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,319;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	53707098	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=145,206;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,7:1,2:0,3,0,9
chr6	53764673	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=133,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,1:3,2:3,6,2,1
chr6	53767569	.	CAT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0,13,1,1
chr6	53778865	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=183,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr6	53784235	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=36,25;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr6	53784275	.	T	TTA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,1:2,2:3,3,3,0
chr6	53784315	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=146,94;MMQ=60,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:5,0:8,7,2,0
chr6	53785401	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=159,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:7,2:5,1:8,5,1,2
chr6	53785487	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=127,299;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,3:7,0:11,7,2,1
chr6	53989526	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.221:19:6,1:9,2:5,10,3,1
chr6	54013765	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=259,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr6	54025155	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=152,208;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:10,7,1,1
chr6	54067088	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr6	54095423	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	54186024	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=395,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr6	54792236	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=193,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:2,2:4,2:7,0,3,1
chr6	54805254	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=212,82;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:6,6,2,1
chr6	55113347	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=189,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0|1:55113347_T_C:55113347:5,0,4,0
chr6	55113350	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=36,28;MFRL=189,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0|1:55113347_T_C:55113347:5,0,4,0
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chr6	55924136	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=173,243;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr6	55966418	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr6	56047438	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=131,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.376:22:5,2:9,6:6,8,2,6
chr6	56327849	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=136,116;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.825:21:2,9:1,8:2,1,10,8
chr6	56333747	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=129,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,4:7,1:8,2,5,0
chr6	56334594	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=107,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,0:1,5:2,1,4,1
chr6	56350339	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=218,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr6	56357668	.	CAA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=270,251;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:0|1:56357668_CAA_C:56357668:5,0,2,0
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chr6	56359031	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:56359031_G_A:56359031:0,0,0,1
chr6	56359034	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56359031_G_A:56359031:0,0,0,1
chr6	56374754	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=162,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0,3,0,4
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chr6	56425088	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=178,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:7,10:11,0:10,8,10,0
chr6	56425284	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=256,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
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chr6	56437465	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:6,0,5,0
chr6	56437902	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=218,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,1:2,5:1,8,2,4
chr6	56438597	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=149,110;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:10,0:17,3:11,16,0,3
chr6	56462840	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=117,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.780:16:3,7:0,6:1,2,2,11
chr6	56467586	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=234,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr6	56468238	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=203,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,3:0,1:2,1,1,3
chr6	56468537	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=222,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=46.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:2,5:2,9:2,2,5,9
chr6	56470047	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:4,2:3,2:6,2,3,1
chr6	56471103	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=171,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:6,7:2,6:5,3,7,6
chr6	56473005	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=181,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,3:8,0:6,10,2,1
chr6	56476262	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:4,0,6,0
chr6	56476334	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=151,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.193:22:10,3:8,0:7,11,3,1
chr6	56479203	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=145,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:10,4:12,0:10,12,4,0
chr6	56482704	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=250,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,3:3,3:4,1,5,1
chr6	56482801	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=312,161;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:3,6:2,9:2,3,6,9
chr6	56483638	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:5,8,2,0
chr6	56494078	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=106,49;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:9,7,2,0
chr6	56506806	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:9,0:19,4:15,13,0,4
chr6	56507135	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,7,0
chr6	56818706	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr6	57244672	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,4:5,2:9,2,6,0
chr6	57244830	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=227,270;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:0,5,0,5
chr6	57246773	.	T	TAGG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=193,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGG;STR;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:10,3:3,4:12,1,7,0
chr6	57246785	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=199,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.309:23:11,4:5,3:13,3,6,1
chr6	57246815	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:14,4:5,3:13,6,3,4
chr6	57246969	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.453:22:6,6:6,3:2,10,1,9
chr6	57246982	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,5:5,3:2,8,2,6
chr6	57247022	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:1,2:5,1:0,7,1,2
chr6	57372199	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=196,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,4:3,1:7,0,5,0
chr6	57372361	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=35,25;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.591:42:6,15:11,10:5,12,7,18
chr6	57372365	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.266:43:15,5:15,6:8,24,4,7
chr6	57372374	.	CT	C	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.227:37:11,5:18,3:6,23,1,7
chr6	57372436	.	GC	CC,CT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,31,32;MFRL=195,157,128;MMQ=60,60,60;MPOS=15,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.19,9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,7,4:0.400,0.250:17:3,2,3:3,5,1:0,6,1,10
chr6	57393029	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=25,30;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:2,1:0|1:57393029_T_A:57393029:6,0,3,0
chr6	57393034	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=33,25;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0|1:57393029_T_A:57393029:6,0,3,0
chr6	57393040	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=29,24;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0|1:57393029_T_A:57393029:6,0,3,0
chr6	57393054	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=28,30;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:3,2:9,0,3,0
chr6	57393074	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:9,2:0|1:57393074_A_G:57393074:17,1,2,0
chr6	57393092	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=25,27;MFRL=160,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.216:21:7,1:9,3:0|1:57393074_A_G:57393074:16,1,3,1
chr6	57393112	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=25,34;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:10,3:13,1:18,7,3,1
chr6	57393125	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:5,9:8,7:12,1,10,7
chr6	57393199	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:12,8:6,4:4,14,3,9
chr6	57393216	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:6,7:4,4:0,10,2,9
chr6	57393222	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:10,1:5,2:0|1:57393222_A_G:57393222:1,15,0,3
chr6	57393228	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:9,1:3,2:0|1:57393222_A_G:57393222:1,12,0,3
chr6	57398047	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=30,35;MFRL=212,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:3,1:8,0,3,0
chr6	57398058	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=34,33;MFRL=199,235;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,2:2,2:7,0,4,0
chr6	57398081	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=28,32;MFRL=175,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:3,6:0,5:3,0,10,2
chr6	57398117	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=28,26;MFRL=172,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.307:24:8,2:9,5:0|1:57398117_T_TA:57398117:11,6,6,1
chr6	57398118	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=34,24;MFRL=172,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.307:24:8,1:9,4:0|1:57398117_T_TA:57398117:11,6,6,1
chr6	57398154	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=28,32;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,19:0.606:31:4,7:7,11:0|1:57398154_T_C:57398154:6,6,12,7
chr6	57398157	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=11;MBQ=27,32;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,17:0.581:29:4,7:8,10:0|1:57398154_T_C:57398154:6,6,10,7
chr6	57398163	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=27,30;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,18:0.543:33:4,8:11,9:0|1:57398154_T_C:57398154:8,7,9,9
chr6	57398186	.	G	GA	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.301:38:11,5:15,5:13,14,7,4
chr6	57398201	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=11;MBQ=26,30;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,26:0.614:42:6,11:10,14:7,9,13,13
chr6	57398226	.	T	A,G	.	.	DP=43;ECNT=11;MBQ=25,28,33;MFRL=127,165,161;MMQ=60,60,60;MPOS=17,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=41.26,23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,17,9:0.404,0.226:42:4,3,4:11,13,5:7,9,12,14
chr6	57398335	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=212,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.683:17:3,4:2,7:0,5,0,12
chr6	57398385	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=196,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:0,1:3,2:0|1:57398385_A_AT:57398385:0,3,0,3
chr6	57398395	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=196,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0|1:57398385_A_AT:57398385:0,3,0,3
chr6	57398412	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	57466987	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=120,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,3:4,5:5,2,7,1
chr6	57467279	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=204,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:2,0:4,6:0|1:57467279_T_C:57467279:0,7,1,5
chr6	57467282	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=204,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:3,0:3,7:0|1:57467279_T_C:57467279:0,7,1,6
chr6	57467303	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=201,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:3,0:1,7:1,3,0,8
chr6	57472255	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:2,9:4,6:5,1,15,0
chr6	57472299	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.414:39:12,11:11,5:18,5,13,3
chr6	57472315	.	AG	GA,GG	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=29,32,32;MFRL=115,171,168;MMQ=60,60,60;MPOS=9,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=62.25,14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,23,7:0.473,0.159:47:9,14,4:8,9,3:12,5,19,11
chr6	57472344	.	A	AT	.	.	DP=67;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=135,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,13:0.215:62:31,8:17,5:21,28,10,3
chr6	57472476	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=179,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:9,7:8,2:2,15,1,8
chr6	57472488	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=213,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:9,4:6,1:1,15,0,5
chr6	57472495	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=171,213;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:3,5:1,9,0,9
chr6	57472533	.	TT	CC,CT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=36,32,33;MFRL=141,210,198;MMQ=60,60,60;MPOS=14,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=17.11,6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,6,3:0.386,0.225:15:5,4,2:1,2,1:0,6,0,9
chr6	57498894	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,5:1,8:3,0,13,0
chr6	57498944	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=136,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=63.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.742:25:5,8:1,11:5,1,17,2
chr6	57499042	.	A	AT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.318:32:15,3:7,7:9,13,4,6
chr6	57512439	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=134,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:13,3:7,6:19,1,7,2
chr6	57512476	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,32:0.688:46:9,13:5,19:8,6,21,11
chr6	57512678	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=9;MBQ=34,29;MFRL=167,139;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.751:26:3,12:3,8:2,4,11,9
chr6	57512711	.	G	A,C	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=34,23,33;MFRL=186,158,139;MMQ=60,60,60;MPOS=4,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.62,51.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,14:0.185,0.555:24:1,2,8:5,2,5:3,3,3,15
chr6	57512718	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=30,25;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=45.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,7:6,4:3,8,2,10
chr6	57512775	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:1,6:2,3:0|1:57512775_T_G:57512775:0,3,0,9
chr6	57512779	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,10:0.733:13:1,5:1,3:0|1:57512775_T_G:57512775:0,3,0,10
chr6	57512787	.	T	TCACCAAGGC	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=32,29;MFRL=150,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.800:13:1,5:1,3:0|1:57512775_T_G:57512775:0,2,0,11
chr6	57512788	.	T	TTA	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=150,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.800:13:1,5:1,2:0|1:57512775_T_G:57512775:0,2,0,11
chr6	57512792	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=30,33;MFRL=150,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:0|1:57512775_T_G:57512775:0,2,0,7
chr6	57512793	.	AATT	A	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=27,26;MFRL=150,225;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:0|1:57512775_T_G:57512775:0,2,0,7
chr6	62407067	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:2,3,3,1
chr6	62611356	.	ACAAAACG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	62757808	.	T	TGTGCCTCTGCTATCCACACGGCTTGCTCCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:2,4,1,1
chr6	62887031	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	63921360	.	CA	AG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=309,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,4:0,4:2,0,8,0
chr6	63921361	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.913:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr6	63922376	.	T	TGGG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,15;MFRL=167,195;MMQ=60,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,0:0,5,2,0
chr6	63922500	.	ATTTTTT	A,ATT,ATTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27,16,16;MFRL=0,212,277,282;MMQ=32,55,60,60;MPOS=15,19,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=19,13,15,16;RU=T;STR;TLOD=26.29,3.16,4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,10,2,3:0.573,0.159,0.195:16:0,5,0,0:1,4,0,1:1,0,6,9
chr6	63922916	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=242,155;MMQ=60,48;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,4:2,5:1,1,3,6
chr6	63922929	.	A	AAAAT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=83,155;MMQ=60,47;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAAT;STR;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr6	63923011	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=245,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr6	63991209	.	A	AATATATAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,47;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=13,17;RU=AT;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	64289938	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,1:2,1:3,2,2,0
chr6	64395876	.	GA	TT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=221,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:64395876_GA_TT:64395876:0,2,0,1
chr6	64395883	.	G	GCTCAAAAAATTTAAGAAATAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=221,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:64395876_GA_TT:64395876:0,2,0,1
chr6	64416061	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:12,5:14,0:12,14,5,0
chr6	64431002	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=128,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.270:24:6,5:11,0:15,3,6,0
chr6	64516020	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:6,1,3,0
chr6	65016977	.	TGA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=224,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GA;STR;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.465:7:1,1:3,2:1,3,1,2
chr6	65098768	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,7:3,2:0,5,1,8
chr6	65300264	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=174,285;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:6,0:14,6:0|1:65300264_C_T:65300264:13,9,0,6
chr6	65300273	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=172,285;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:5,0:16,6:0|1:65300264_C_T:65300264:13,9,0,6
chr6	65301679	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=150,110;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,3:4,0:5,6,1,2
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chr6	65302915	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr6	65302987	.	ATATCT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=172,268;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,2:7,1:6,2,3,0
chr6	65335915	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	65596759	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,8:0,0:0,0,3,5
chr6	65611952	.	T	TATTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	65655883	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=189,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.727:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr6	66005740	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:3,1,1,2
chr6	66044767	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	66045077	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	66045118	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	66053835	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr6	66063513	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=107,262;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:15,4:8,0:7,17,1,3
chr6	66115281	.	G	GAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=A;STR;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.516:11:2,1:2,4:1,4,1,5
chr6	69666520	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:7,5:2,2:8,1,4,3
chr6	69666747	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.721:8:1,3:1,2:1,1,0,6
chr6	69724069	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,0:1,6:0,4,1,5
chr6	69759148	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,8,3
chr6	69772809	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=188,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:2,3:1,5:0|1:69772809_T_C:69772809:4,1,8,0
chr6	69772817	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=172,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,5:0.352:15:4,3:5,2:1|0:69772809_T_C:69772809:9,1,4,1
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chr6	70459209	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.350:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr6	70490511	.	A	C,G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,24,32;MFRL=165,195,191;MMQ=60,60,60;MPOS=34,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.69,11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.307,0.385:10:0,0,3:3,3,1:0,3,0,7
chr6	70490528	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr6	70500120	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=202,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr6	70637941	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=180,100;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,0:3,5:2,5,0,5
chr6	70744264	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=183,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr6	70778378	.	GC	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=110,228;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:3,2,1,2
chr6	70840124	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=86,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.189:30:14,2:9,4:13,11,1,5
chr6	70852607	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.561:7:0,1:3,3:3,0,4,0
chr6	70854183	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=181,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.739:17:1,5:3,8:2,2,7,6
chr6	70854208	.	CAG	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:0,3:2,6:1,1,3,6
chr6	70859478	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=250,246;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:70859478_C_T:70859478:4,0,1,0
chr6	70859487	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=250,246;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.442:7:3,0:1,3:0|1:70859478_C_T:70859478:3,1,2,1
chr6	70873331	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:6,6,2,0
chr6	70875976	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=261,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	70878156	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=184,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:2,5,2,5
chr6	70894894	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	70897967	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.364:25:8,4:8,4:4,12,2,7
chr6	70909252	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=217,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,3:3,1:4,1,3,1
chr6	70916998	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=232,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:1,5,0,4
chr6	70944123	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr6	70944465	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=185,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:7,0,4,2
chr6	70950281	.	AAT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=214,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	70951186	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=177,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:70951186_C_T:70951186:5,5,1,1
chr6	70951195	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=178,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:70951186_C_T:70951186:4,5,1,1
chr6	70962044	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=230,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	70963232	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr6	70964745	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:3,1:10,2:3,11,2,1
chr6	70965125	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=207,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:0,6,0,6
chr6	70970299	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,3:3,5:1,3,3,5
chr6	70976538	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:3,1:5,3:3,5,0,4
chr6	70979437	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.498:10:1,1:4,4:1,4,1,4
chr6	70981793	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=196,508;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:4,13,2,0
chr6	70981794	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=193,327;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.186:20:6,1:11,2:7,10,0,3
chr6	70983644	.	TAATA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=181,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AATA;STR;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr6	70983888	.	GT	G,GTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33,36;MFRL=177,168,156;MMQ=60,60,60;MPOS=22,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.48,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.272,0.271:8:2,1,0:2,1,2:0,4,0,4
chr6	70984562	.	TG	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=161,204;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr6	70991003	.	GAA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:2,3:3,0:6,0,3,0
chr6	71011596	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	71011831	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=133,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,2,2
chr6	71137992	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,276;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,2,1
chr6	71190577	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=217,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr6	71195952	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=185,85;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:6,0:13,3:7,12,1,2
chr6	71233621	.	TGG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=146,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:5,0,2,1
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chr6	72945492	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,5:2,3:0,3,0,8
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chr6	72968609	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=233,286;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:1,1:3,2:5,0,3,0
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chr6	73108872	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=189,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr6	73331983	.	AGCG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,342;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCG;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr6	73713679	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=174,82;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:7,2:13,2:6,14,2,2
chr6	73752822	.	T	TCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=198,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:7,0:1,2:7,1,1,1
chr6	73787255	.	TTTG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=214,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:0,0:1,4,1,1
chr6	73814907	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=202,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	73821169	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,3:2,1:0|1:73821169_T_C:73821169:0,6,0,4
chr6	73821193	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=189,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:0|1:73821169_T_C:73821169:0,5,0,3
chr6	73904104	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=242,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	73933501	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:1,1:7,3:3,5,3,1
chr6	73935135	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,8:0,1:0,0,3,6
chr6	73951987	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=59.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:1,12:0,5:0,1,5,12
chr6	73952058	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,6:1,2:2,1,7,1
chr6	73952103	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.290:22:9,5:7,1:0|1:73952103_A_C:73952103:11,5,4,2
chr6	73952109	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=154,157;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:8,3:8,1:0|1:73952103_A_C:73952103:11,6,3,3
chr6	73952112	.	GG	TA	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=148,142;MMQ=60,58;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:10,3:8,1:0|1:73952103_A_C:73952103:11,9,1,4
chr6	73952118	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=142,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:10,4:9,3:11,8,2,5
chr6	74063070	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:5,4,2,2
chr6	74063589	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,229;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:7,3,0,2
chr6	74079464	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,3:7,1:3,7,2,2
chr6	74107501	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:2,6,1,1
chr6	74114365	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=217,231;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:1,3,2,0
chr6	74115383	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,353;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:10,0,2,0
chr6	74119084	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr6	74123363	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:1,1:5,1:5,2,2,0
chr6	74138503	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,219;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:5,7,1,1
chr6	74155346	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,2:0,6:0,0,5,4
chr6	74155491	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	74189574	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,7,6
chr6	74192422	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=181,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	74192431	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=191,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr6	74228006	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,31:0.801:38:2,19:5,12:4,3,15,16
chr6	74228049	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=78.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,25:0.685:36:5,14:6,11:6,5,12,13
chr6	74228062	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=166,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.282:37:16,5:11,5:13,14,5,5
chr6	74320306	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr6	74325164	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:11,0:13,7:8,17,0,7
chr6	74325257	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=224,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:1,2:0,1:0,2,0,3
chr6	74345288	.	A	AGAACG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=260,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr6	74348328	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	74354402	.	TT	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:74354402_TT_CC:74354402:0,2,0,1
chr6	74354414	.	TG	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:74354402_TT_CC:74354402:0,2,0,1
chr6	74432923	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:3,9:6,1:3,6,6,4
chr6	74472123	.	C	CTCAGAAGCTAGAGCAGCCTA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=112,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:4,2:11,0:10,5,1,1
chr6	74490863	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	74491138	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	74493615	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=225,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr6	74495257	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=210,91;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr6	74498432	.	TAAG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	74518044	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=80,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:1,0:1,1:0|1:74518044_C_T:74518044:0,2,0,1
chr6	74518050	.	T	TGGAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=159,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:74518044_C_T:74518044:0,3,0,1
chr6	74518054	.	A	AAAAAGTATGTTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=96,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:74518044_C_T:74518044:0,2,0,1
chr6	74519713	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=140,36;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:10,6,1,1
chr6	74528293	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=172,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr6	75795122	.	G	GCACA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=160,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=CA;STR;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.497:8:1,2:3,1:0,4,0,4
chr6	75796364	.	GTATA	G,GTA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,23,13;MFRL=141,191,121;MMQ=60,60,60;MPOS=31,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=TA;STR;TLOD=5.58,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.337,0.330:6:1,1,0:0,0,0:0,2,0,4
chr6	75811880	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,1:2,6:0,5,0,7
chr6	75827354	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	75830974	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=108,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,4:1,3:3,0,6,1
chr6	75833876	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=180,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,7:4,3:1,4,6,4
chr6	75843812	.	A	ATTCCTTTTCCTCCACACCCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=164,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75843812_A_ATTCCTTTTCCTCCACACCCTT:75843812:0,1,0,1
chr6	75843813	.	G	GCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=164,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75843812_A_ATTCCTTTTCCTCCACACCCTT:75843812:0,1,0,1
chr6	75848376	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,2,1
chr6	75860778	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75860778_T_G:75860778:0,0,1,0
chr6	75860784	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,17;MFRL=280,132;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:75860778_T_G:75860778:1,0,1,0
chr6	75890933	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=225,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.683:11:2,3:1,4:0,3,2,6
chr6	75893457	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,8,4
chr6	75904455	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	75947715	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=129,78;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:3,0:2,4:1,4,1,3
chr6	75968720	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr6	76018526	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=187,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,2:12,0:12,8,2,0
chr6	76063262	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=178,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,0:8,3:12,5,2,1
chr6	76063412	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=177,137;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:0|1:76063412_G_T:76063412:2,7,0,3
chr6	76063419	.	C	CTGTGACTTGCCTTACTACAAAAAAAAAAAAAAAGCCT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=189,137;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:0|1:76063412_G_T:76063412:2,8,0,3
chr6	76357426	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=180,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:6,3:0,1:4,2,3,1
chr6	76373274	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	76385511	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,1:2,7:3,0,8,1
chr6	76386712	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=159,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	76405700	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:0,9,0,2
chr6	76425230	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=181,35871956;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:12,2:5,0:7,10,0,2
chr6	76538403	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=202,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr6	76550237	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=159,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:5,0,5,0
chr6	76554593	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr6	76595634	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr6	76596728	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=150,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,2:1,0:1,4,0,2
chr6	76600885	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.253:14:7,1:2,2:8,3,2,1
chr6	76607983	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=200,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr6	76618182	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.509:8:3,1:1,3:4,0,2,2
chr6	76656978	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr6	76715138	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=167,73;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:9,4:4,0:5,8,3,1
chr6	76720990	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=187,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:3,2,1,4
chr6	76728583	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=143,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.648:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	76735065	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr6	76743998	.	GCA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CA;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:1,0:8,2:8,2,1,1
chr6	76744298	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr6	76782049	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	78171941	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr6	78172992	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:6,4:8,5:9,5,3,6
chr6	79577412	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:10,4:5,5:9,6,4,5
chr6	79577644	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=231,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:4,8:2,7:2,4,2,13
chr6	79595167	.	A	ACTTAT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=194,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=95.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,23:0.828:27:1,12:3,9:1,3,9,14
chr6	79657391	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,4:4,7:4,2,7,4
chr6	79664748	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=271,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:0,3,1,3
chr6	79668306	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,129;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.256:37:18,0:10,9:10,18,0,9
chr6	79672788	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,60;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:9,2:10,0:11,8,3,0
chr6	79695003	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:3,2:3,1:7,0,4,0
chr6	79695029	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=234,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.355:18:4,4:5,2:12,0,5,1
chr6	79713483	.	T	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=116,127;MMQ=60,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.073:52:13,3:35,0:25,24,3,0
chr6	79752792	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=132,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr6	79787655	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=162,257;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.346:23:4,4:11,2:9,6,6,2
chr6	79911290	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,64;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr6	79911459	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=148,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr6	79913379	.	GAA	G,GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,19,27;MFRL=0,158,153;MMQ=60,60,60;MPOS=20,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.37,14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,8:0.275,0.656:11:0,0,3:0,1,3:0,0,4,7
chr6	79944355	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,7:2,5:2,3,1,11
chr6	80198800	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,0:10,3:11,10,1,2
chr6	80228535	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=128,134;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,1:9,1:0|1:80228535_T_G:80228535:9,10,1,1
chr6	80228541	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,35;MFRL=125,145;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.558:25:6,6:5,8:0|1:80228535_T_G:80228535:5,6,6,8
chr6	80228662	.	AGAGGAGACTATGAC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=250,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr6	80341320	.	CG	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=230,232;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.618:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	80631539	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr6	80724156	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=147,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,1:7,1:12,5,1,1
chr6	80724312	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=143,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.224:11:9,1:0,1:4,5,0,2
chr6	80732138	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=142,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.281:22:12,5:4,1:7,9,1,5
chr6	80744626	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=177,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:5,1,0,3
chr6	80747582	.	TATAATA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=118,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=ATA;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr6	80749841	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=206,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:8,0,2,0
chr6	80750093	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=235,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,1:2,1:1,9,0,2
chr6	80837242	.	A	ATT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.211:14:5,1:6,1:8,3,3,0
chr6	80912746	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=156,238;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr6	82883238	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=246,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	82910474	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:82910474_T_G:82910474:0,1,0,1
chr6	82910480	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:82910474_T_G:82910474:0,0,0,1
chr6	82910486	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:82910474_T_G:82910474:0,1,0,1
chr6	82910492	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:82910474_T_G:82910474:0,1,0,1
chr6	82912153	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=189,213;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr6	82921339	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=258,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,4:4,7:4,3,6,5
chr6	82922388	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=251,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,4:2,5:2,1,8,1
chr6	82924645	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	82930437	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=181,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:1,1:3,0:1,4,1,4
chr6	82941656	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=169,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	83075316	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=228,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:8,3,1,1
chr6	83077073	.	TATAAAG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=154,262;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATAAAG;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:15,0:3,3:5,13,3,0
chr6	83080337	.	TTTTATTGTTGTTGC	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,2:9,0:6,12,0,2
chr6	83080386	.	C	CTTTG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTG;STR;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.916:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr6	83080639	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	83666936	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:83666936_T_C:83666936:0,0,5,1
chr6	83666943	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:83666936_T_C:83666936:0,0,3,2
chr6	83733785	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=167,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:0,5:3,4:1,2,4,5
chr6	83754094	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	83822985	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=186,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,4:0,4:2,0,6,2
chr6	83828724	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:1,8:2,4:2,1,3,9
chr6	83831730	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=155,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:8,5:10,7:10,8,7,5
chr6	83831733	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=148,34;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,0:15,2:0|1:83831733_A_C:83831733:17,13,1,1
chr6	83831738	.	C	CTGCACTCCAG	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=143,34;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:12,0:15,2:0|1:83831733_A_C:83831733:17,12,1,1
chr6	83834957	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=201,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:13,2:3,0:6,10,0,2
chr6	83842101	.	CA	GT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:1,2:3,0:0|1:83842101_CA_GT:83842101:0,6,0,2
chr6	83842104	.	A	AAGG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:0|1:83842101_CA_GT:83842101:0,6,0,2
chr6	83856897	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,1:2,1:8,1,1,1
chr6	83861930	.	TACAC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=242,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=AC;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:2,2:3,4,1,1
chr6	83872513	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=141,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,3:9,0:10,8,2,1
chr6	83878974	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=123,73;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,3:10,0:12,7,2,1
chr6	83898300	.	GT	G,GTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=211,240,180;MMQ=60,60,60;MPOS=20,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.50,4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,3:0.231,0.300:10:2,2,1:3,0,2:5,0,5,0
chr6	83933732	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=187,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:83933732_AC_A:83933732:0,1,0,1
chr6	83933734	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=187,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:83933732_AC_A:83933732:0,1,0,1
chr6	83933742	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=187,109;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:83933732_AC_A:83933732:0,1,0,1
chr6	83938539	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=170,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,4:8,0:6,9,3,1
chr6	84061888	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,15;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:4,0:1,7,2,0
chr6	84108065	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=220,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:3,1,2,1
chr6	84117639	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=169,83;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,0:7,3:3,9,0,3
chr6	84117676	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,18;MFRL=204,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:84117676_A_C:84117676:0,4,0,1
chr6	84117678	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=204,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:84117676_A_C:84117676:0,4,0,1
chr6	84117680	.	G	GACCATGTTAGGCACTGGGGCCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=204,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:84117676_A_C:84117676:0,4,0,1
chr6	84233831	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=123,163;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,21:0.847:24:1,11:2,10:0,3,7,14
chr6	84266038	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=160,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:84266038_G_T:84266038:0,2,0,1
chr6	84266044	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:84266038_G_T:84266038:0,0,0,1
chr6	84284664	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr6	84284880	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=129,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,2:1,0:1,1,0,2
chr6	84290106	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:7,0,2,0
chr6	84290137	.	TAAAGA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.453:11:4,5:2,0:6,0,3,2
chr6	84290235	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.120:31:18,3:9,0:0|1:84290235_G_A:84290235:13,15,0,3
chr6	84290259	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:20,3:6,0:0|1:84290235_G_A:84290235:12,16,0,3
chr6	84292139	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=132,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,0,5
chr6	84317533	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:3,8:2,8:1,4,12,4
chr6	84320455	.	TATATATATATAA	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=191,0;MMQ=40,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:0,9,0,3
chr6	84320465	.	TAA	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=187,174;MMQ=43,38;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr6	84320466	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=192,184;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.669:9:1,4:2,2:0|1:84320466_A_AT:84320466:0,3,0,6
chr6	84320467	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=192,184;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.669:9:1,4:2,2:0|1:84320466_A_AT:84320466:0,3,0,6
chr6	84366385	.	C	CAAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:1,0,6,0
chr6	84375377	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	84649734	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=128,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.322:10:4,2:2,1:4,3,3,0
chr6	84650214	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=161,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:5,2:5,1:7,3,3,0
chr6	84764982	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=213,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,3:0,2:4,0,5,0
chr6	84799300	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=184,227;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr6	84872881	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=139,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.208:27:9,5:12,0:12,10,5,0
chr6	84872993	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=136,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:4,3:5,0:2,7,1,2
chr6	84894942	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=173,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:9,1:4,5:9,4,4,2
chr6	84896363	.	AG	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:84896363_AG_CT:84896363:0,0,0,1
chr6	84896368	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:84896363_AG_CT:84896363:0,0,0,1
chr6	86180926	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	86199329	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:1,9:3,4:1,3,1,12
chr6	86201861	.	G	GTCTGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:2,8,1,1
chr6	86224053	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=272,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:1,1,2,5
chr6	86246709	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=217,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr6	86246716	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=209,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr6	86248460	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,2:1,5:3,0,5,2
chr6	86277323	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=197,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:1,8,2,4
chr6	86303434	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=144,172;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:7,0:11,7:5,13,0,7
chr6	86324565	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=159,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:23,2:14,0:0|1:86324565_G_A:86324565:22,16,1,1
chr6	86324569	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=151,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:23,2:15,0:0|1:86324565_G_A:86324565:23,17,1,1
chr6	86324839	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=208,94;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:12,1:6,1:4,14,3,0
chr6	86346716	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.321:38:13,11:12,0:10,16,12,0
chr6	86346959	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=172,323;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=38.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.469:30:8,0:8,14:11,5,0,14
chr6	87726196	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.137:42:21,5:12,0:20,17,5,0
chr6	87726330	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=192,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr6	87726448	.	GTT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	87796161	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=226,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:5,0:3,4:4,4,1,3
chr6	87796233	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr6	87797953	.	AAAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr6	87928229	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=215,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr6	87967304	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=181,192;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:8,0:10,4:11,7,4,0
chr6	87967636	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=174,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:4,0:11,3:6,9,2,1
chr6	88046800	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=134,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.223:25:9,3:10,2:10,10,3,2
chr6	88049879	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=207,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:10,4,0,2
chr6	88075122	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,1:3,5:0,7,2,4
chr6	88108048	.	AGAT	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=93,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.498:24:6,6:6,5:8,4,9,3
chr6	88108050	.	ATG	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=140,65;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0|1:88108050_ATG_A:88108050:8,5,1,1
chr6	88108053	.	AG	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=140,65;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,2:11,0:0|1:88108050_ATG_A:88108050:16,7,1,1
chr6	88108060	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:0|1:88108050_ATG_A:88108050:15,7,1,1
chr6	88108183	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=134,129;MMQ=60,47;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr6	88109233	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=207,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:3,3,2,0
chr6	88119528	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=149,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.411:17:2,2:8,5:10,0,5,2
chr6	88119693	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=153,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,1:3,3:1,9,1,3
chr6	88125542	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=191,40;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,2:7,2:5,6,0,4
chr6	88126423	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=190,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,2:5,2:8,3,2,2
chr6	88140811	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=106,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,3:6,1:6,5,2,2
chr6	88170710	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:3,1:4,3,1,1
chr6	88210467	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=237,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:2,1:1,0:0,3,0,2
chr6	88224163	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:13,3:12,0:14,11,0,3
chr6	88226641	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=144,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:2,2,0,4
chr6	88226648	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:88226648_T_C:88226648:0,4,0,1
chr6	88226652	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:88226648_T_C:88226648:0,3,0,1
chr6	88231226	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:8,2:5,3:7,7,2,3
chr6	88231285	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,1:5,3:1,7,1,3
chr6	88255274	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=158,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr6	88255438	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=153,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:2,3,2,2
chr6	88273971	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=155,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr6	88299885	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:10,6:10,6:9,11,3,9
chr6	88300013	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=178,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:1,4,0,6
chr6	88303967	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,243;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr6	88311404	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.415:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr6	88311457	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=146,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:7,2:1,2:4,4,2,2
chr6	88317292	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	88317628	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:0,7,0,2
chr6	88331299	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=209,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr6	88346207	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=168,36;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:3,14,1,1
chr6	88366602	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:11,3:3,2:8,6,3,2
chr6	88366771	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=249,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr6	88376676	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=262,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,1:3,1:0|1:88376676_AT_A:88376676:3,2,2,2
chr6	88376682	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=253,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:3,3:2,1:0|1:88376676_AT_A:88376676:4,2,2,2
chr6	88385266	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,120;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:8,4:10,0:13,5,4,0
chr6	88411244	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=170,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:5,1,3,1
chr6	88773961	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=254,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:2,4,1,3
chr6	89323961	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=124,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,0:2,2:4,1,2,0
chr6	89511228	.	TAC	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr6	89511254	.	AAC	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,1:4,1:7,7,3,0
chr6	89563434	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=166,8300;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,0:14,3:12,13,3,0
chr6	89601638	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=186,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.434:9:2,1:3,3:0,5,1,3
chr6	89614670	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=165,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:4,3:10,0:2,12,1,2
chr6	89638988	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=10,25;MFRL=123,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.568:9:0,1:1,3:1,3,2,3
chr6	89790559	.	CTTCA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCA;STR;TLOD=46.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr6	89814766	.	CC	TT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=175,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:3,0:0,1:3,0,1,0
chr6	89814772	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr6	89814830	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:0,11:1,5:1,0,10,7
chr6	89827716	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=233,269;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr6	89862725	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,0:5,3:4,3,3,0
chr6	89864679	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=184,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr6	89871759	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=245,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,0:3,5:4,3,4,1
chr6	89888443	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=166,328;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr6	89891582	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=118,24821191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:4,2,2,0
chr6	89894968	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=156,294;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr6	89895202	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=146,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:2,2:2,1:0|1:89895202_G_A:89895202:0,5,1,3
chr6	89895207	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=146,238;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:1,3:3,1:0|1:89895202_G_A:89895202:0,5,1,3
chr6	89913108	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=244,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.801:13:0,6:2,5:0|1:89913108_C_G:89913108:0,2,9,2
chr6	89913112	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=244,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,12:0.812:14:0,6:2,6:0|1:89913108_C_G:89913108:0,2,9,3
chr6	89913286	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=219,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr6	89967498	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=162,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:10,2:8,3:7,11,0,5
chr6	89974063	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,13,2
chr6	89974066	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,2:7,3:8,2,5,0
chr6	89974115	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:3,5:10,3:5,8,3,5
chr6	89977322	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	89977906	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	90009581	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:3,12,0,2
chr6	90090068	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:12,4:7,0:12,7,3,1
chr6	90321955	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=190,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:3,1:8,8:6,5,8,1
chr6	90326360	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:4,3:8,2:4,8,3,2
chr6	90326471	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=320,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr6	90361811	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr6	90365504	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=174,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,2:15,1:11,12,3,0
chr6	90366329	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.493:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr6	90371202	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,7,7
chr6	90371704	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,5:0,2:0,0,7,1
chr6	90371986	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr6	90381849	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	90385754	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr6	90387233	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	90398197	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr6	90398315	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:8,1:12,4,1,1
chr6	90400292	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr6	90405306	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0,0,10,2
chr6	90405993	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr6	90411867	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=244,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:90411867_A_C:90411867:0,2,0,1
chr6	90411875	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=262,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:90411867_A_C:90411867:0,3,0,1
chr6	90415764	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=52.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,4:0,0,9,6
chr6	90418262	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,12:0,0,8,14
chr6	90426270	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	90428968	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr6	90432584	.	A	T,AAT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=19,23,33;MFRL=201,188,194;MMQ=41,60,60;MPOS=6,26;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.05,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.336,0.260:5:1,0,1:0,2,0:2,0,3,0
chr6	90432589	.	C	G,A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,16,17;MFRL=154,208,180;MMQ=60,51,40;MPOS=24,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.14,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.333,0.222:6:1,0,0:2,0,0:3,0,3,0
chr6	90432598	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,15;MFRL=167,208;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:2,0:4,0,2,0
chr6	90432645	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=155,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:7,17:7,0:8,6,17,0
chr6	90432662	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,7,10
chr6	90433206	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,169;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:9,1,2,0
chr6	90437699	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr6	90437718	.	A	AGTAGTTTTTTCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=243,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr6	90438631	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:3,3,2,0
chr6	90438933	.	T	TCGTAAAGAAAACATATTAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	90450135	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	90453248	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr6	90453492	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	90455429	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr6	90463149	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr6	90467905	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=245,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chr6	90468465	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr6	90468775	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	90503766	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.561:12:1,3:2,2:2,3,5,2
chr6	90504016	.	A	AAGTAAAAGGAAAAAGATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.671:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr6	90556397	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=114,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.288:11:4,1:2,2:3,5,0,3
chr6	90605836	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr6	91254396	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:0,4,2,3
chr6	91266350	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=190,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.490:14:2,3:5,4:1,6,2,5
chr6	91296420	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,5:0,5:2,0,10,1
chr6	93956676	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=146,104;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,2:9,1:10,6,3,0
chr6	93956769	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr6	93964319	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=141,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,1:0,4:2,0,4,1
chr6	93969126	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=127,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:8,0:1,2:0|1:93969126_A_T:93969126:6,3,0,2
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chr6	93969141	.	T	TGCGAGACTAATGC	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=149,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:93969126_A_T:93969126:5,4,0,2
chr6	93973658	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=153,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:1,7,0,3
chr6	94120192	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=202,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,4,0
chr6	94120219	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:5,2,3,0
chr6	94120639	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=192,55;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.202:16:7,0:6,2:7,6,2,1
chr6	94124530	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=184,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,3:0,1:0,1,2,2
chr6	96655096	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=221,207;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:2,5:5,5:7,0,6,4
chr6	96655105	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=256,209;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.892:16:1,7:0,8:1,0,14,1
chr6	96655106	.	TAC	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=221,186;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.275:15:6,1:5,3:11,0,4,0
chr6	96656088	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr6	96656129	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr6	96656148	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.872:13:1,5:0,7:0,1,11,1
chr6	96656767	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,6:0,0,13,8
chr6	96656775	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=41.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.858:19:1,9:1,8:2,0,10,7
chr6	96656811	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=163,231;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:10,0:3,4:7,6,2,2
chr6	96658152	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,16,4
chr6	96658260	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.962:20:0,12:0,8:0|1:96658260_C_G:96658260:0,0,6,14
chr6	96658262	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,11:0,8:0|1:96658260_C_G:96658260:0,0,6,14
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chr6	96969840	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:9,7:8,2:7,10,4,5
chr6	96971185	.	G	GTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=164,3362468;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:7,1:5,1:6,8,1,1
chr6	96986741	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=180,322;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,2:4,0:1,9,0,2
chr6	96996228	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=184,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:96996228_A_T:96996228:0,2,0,2
chr6	96996244	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=205,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:96996228_A_T:96996228:0,3,0,2
chr6	96999220	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=175,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr6	97000341	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,2:3,0:4,0,2,0
chr6	97338913	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=190,226;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:8,0,2,0
chr6	97339275	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,21;MFRL=215,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.551:7:0,1:3,1:0,3,2,2
chr6	97575196	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:3,0,3,0
chr6	97575295	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,0:8,5:9,5,1,4
chr6	97575423	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr6	97578888	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr6	97679540	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr6	97694582	.	A	ATAG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAG;STR;TLOD=69.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,4,12
chr6	97711369	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=252,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:97711369_A_G:97711369:0,2,0,1
chr6	97711379	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=252,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:97711369_A_G:97711369:0,2,0,1
chr6	98472564	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=167,234;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr6	99283376	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=225,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,0:1,2:1,0,0,2
chr6	99284219	.	AC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=196,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,2:6,2:11,4,1,3
chr6	99284446	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=181,93;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,1:4,1,2,1
chr6	99284712	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=219,191;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:8,0:20,4:21,7,0,4
chr6	99285558	.	GA	G,GAA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33,33;MFRL=165,150,194;MMQ=60,60,60;MPOS=17,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=7.98,4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,8,3:0.324,0.181:20:3,2,0:6,5,3:1,8,4,7
chr6	99322354	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=192,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr6	99323424	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=212,167;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:7,5:0,4:3,4,1,8
chr6	99347251	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=152,273;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,4:6,0:5,9,4,0
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chr6	99825227	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=301,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.841:10:0,6:1,3:1,0,9,0
chr6	99831542	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=187,251;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr6	99849180	.	GAGA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,239;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGA;STR;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:6,2:14,3:8,13,2,3
chr6	99853849	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	99853866	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr6	99891616	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=196,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:1,4,0,3
chr6	99894360	.	CAAAGA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=152,272;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAGA;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr6	99935975	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	99951679	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=148,229;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:5,7,1,1
chr6	99951750	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	99955243	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=204,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,2:2,1,7,0
chr6	99991578	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=288,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,4:3,0:0,3,0,4
chr6	99993188	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=235,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr6	99999019	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=258,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:0,4,0,6
chr6	100006244	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	100009630	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,226;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:2,10,1,1
chr6	100016240	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr6	100016340	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=179,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:7,6:8,8:6,9,9,5
chr6	100368759	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	100895344	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,0,8
chr6	100896567	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,11;MFRL=216,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0,2,0,1
chr6	100896574	.	A	AGGGTTGCGGGGCTTTTAGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=216,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr6	100911072	.	ATATGT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=325,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,5,1
chr6	100988266	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=213,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.307:8:2,0:0,0:1,5,0,2
chr6	101037718	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=190,269;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,1:2,1:7,2,1,1
chr6	101054999	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=194,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,7:4,1:2,8,0,8
chr6	101100783	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=222,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0|1:101100783_T_C:101100783:3,3,0,2
chr6	101100784	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=212,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,3:0.400:8:4,2:1,1:1|0:101100783_T_C:101100783:2,3,1,2
chr6	101110329	.	GTCCTGCCGAAGCAT	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=181,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:7,2:12,0:11,13,1,1
chr6	101163433	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=123,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,5:6,2:5,5,1,6
chr6	101214942	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=119,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101214942_A_G:101214942:1,0,1,0
chr6	101214952	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=126,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:101214942_A_G:101214942:2,0,1,0
chr6	101215223	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr6	101215244	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr6	101248474	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0|1:101248474_T_C:101248474:0,0,0,2
chr6	101248480	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:101248474_T_C:101248474:0,0,0,2
chr6	101253788	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=184,254;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr6	101312097	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr6	102124470	.	CT	C,CTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32,35;MFRL=104,133,174;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=8.13,6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,5,4:0.286,0.238:18:3,3,2:4,2,1:5,4,7,2
chr6	102247565	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:14,5:12,0:19,7,5,0
chr6	102307069	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=283,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:1,1,3,0
chr6	102337505	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=182,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:3,0:1,0:0|1:102337505_C_G:102337505:3,1,2,0
chr6	102337509	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=173,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,0:0|1:102337505_C_G:102337505:4,1,2,0
chr6	102376517	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:2,4,0,2
chr6	102503317	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,254;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:7,5,0,2
chr6	102513865	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=216,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr6	102516276	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=234,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:4,4,2,0
chr6	105233244	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr6	105300074	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:105300074_C_G:105300074:0,0,3,0
chr6	105300105	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0|1:105300074_C_G:105300074:0,0,5,3
chr6	105300262	.	C	CAG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=36,30;MFRL=207,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,0:1,13:0,1,6,7
chr6	105405211	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=182,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:105405211_C_CT:105405211:0,4,0,1
chr6	105405214	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=182,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:105405211_C_CT:105405211:0,4,0,1
chr6	105405220	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	105577172	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr6	105577224	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr6	105577401	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr6	105595261	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,4,8
chr6	105609771	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,0:2,3:3,4,0,3
chr6	105729844	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:1,3,0,2
chr6	105845901	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=206,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:105845901_A_C:105845901:0,3,0,1
chr6	105845904	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=206,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:105845901_A_C:105845901:0,3,0,1
chr6	105845906	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=173,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr6	106534484	.	AT	A,ATT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,25,25;MFRL=171,175,167;MMQ=60,60,60;MPOS=21,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.29,5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,3,5:0.110,0.175:31:13,3,3:10,0,2:5,18,0,8
chr6	106553225	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.283:17:7,0:2,2:4,8,5,0
chr6	106554281	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=141,268;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.130:44:22,0:16,5:16,23,0,5
chr6	106975415	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.224:19:7,2:8,1:2,13,1,3
chr6	106989212	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,3:1,3:0,1,3,3
chr6	106992592	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,6,12
chr6	106992844	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr6	106999658	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	107001456	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,4:0,0,5,8
chr6	107003810	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,4:0,13:0,0,1,16
chr6	107006347	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,8,3
chr6	107009119	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr6	107050867	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr6	107067163	.	AG	CA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=136,66;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,0:11,2:12,13,0,2
chr6	107069232	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	107069273	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=145,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,2:9,0:11,2,2,0
chr6	107077474	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=196,166;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.365:28:8,10:10,0:13,5,10,0
chr6	107096853	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=167,240;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,1:2,3:7,0,3,1
chr6	107100107	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,120;MMQ=60,31;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:6,6:11,0:12,5,7,0
chr6	107113618	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=150,242;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,1:2,2:8,1,3,0
chr6	107351195	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr6	107351457	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	107361476	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr6	107365376	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	107365411	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	107372242	.	GTTTTC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,7,5
chr6	107595430	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=113,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,2:9,0:8,9,2,0
chr6	107956095	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	107956569	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,2:8,0:9,11,2,0
chr6	108026317	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	108041801	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=247,370;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr6	108042213	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr6	108042216	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=276,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,5:1,4:1,3,2,7
chr6	108042282	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=216,275;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:108042282_C_T:108042282:0,1,0,1
chr6	108042297	.	C	CCATCAATTCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=216,275;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:108042282_C_T:108042282:0,1,0,1
chr6	108066144	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=169,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:6,0:21,3:15,12,3,0
chr6	108076672	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=224,279;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr6	108076870	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=10,10;MFRL=99,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.321:8:1,0:0,0:1,5,0,2
chr6	108093328	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,14,3
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chr6	108840870	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=179,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,1:5,4:10,1,4,1
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chr6	108985581	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=157,200;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:0|1:108985576_G_A:108985576:6,6,1,1
chr6	109175372	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	109190267	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	109233816	.	AA	TC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=179,147;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,0:1,5:0,9,0,5
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chr6	109319967	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.362:14:4,5:5,0:1,8,0,5
chr6	109466396	.	C	CTATAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATAT;STR;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:3,1,2,3
chr6	109480681	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.395:13:1,1:7,3:3,5,0,5
chr6	109673933	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=170,289;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,1:7,1:9,3,1,1
chr6	109689431	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=201,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:5,1,5,3
chr6	109703391	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=210,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr6	109721228	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=176,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,2:1,5:2,1,5,2
chr6	109752563	.	G	GAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=223,320;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:1,0:2,0:1,5,0,2
chr6	109752565	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=227,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.647:6:1,1:0,2:1,1,0,4
chr6	109763947	.	TC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,1:6,3:8,5,4,0
chr6	109764535	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,186;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:1,5,2,3
chr6	109765160	.	C	CTCCTGGTAACTCTGTGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=184,248;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	109766701	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=152,269;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:8,3:10,1:9,9,1,3
chr6	109767631	.	T	TGTGGTCTGGTCAGTGACCTGCCCAGG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,5:0,4:0,0,1,9
chr6	109768713	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=232,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.421:10:4,2:1,2:3,3,0,4
chr6	109769216	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=176,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	109769336	.	TCACACACA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=CA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	109770808	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr6	109775436	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=174,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:1,2,0,4
chr6	109786980	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=189,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr6	109797304	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	109814558	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.353:18:6,3:5,3:5,7,5,1
chr6	109830298	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr6	109835646	.	AC	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:10,3:3,1:3,10,1,3
chr6	109837859	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=212,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,1:0,2:1,4,1,2
chr6	109837879	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr6	109850199	.	AAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=196,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,3:0,3:1,0,1,5
chr6	109863238	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:0,1:2,5:3,0,4,2
chr6	109867161	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=171,225;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,0:10,3:7,14,0,3
chr6	109906329	.	GCTT	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=125,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTT;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:7,1:0,1:7,0,1,1
chr6	109906347	.	T	A	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=215,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=44.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,21:0.349:61:12,21:28,0:35,5,21,0
chr6	109906506	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	109954252	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,7:0,4:0,2,4,7
chr6	109954585	.	C	CTATATGGTCCTTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=226,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	109962904	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:109962904_A_C:109962904:0,0,1,3
chr6	109962915	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:109962904_A_C:109962904:0,0,1,1
chr6	110048489	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=232,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.489:10:3,1:2,3:1,4,2,3
chr6	110053721	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	110053824	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=168,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,1:2,1,3,1
chr6	110059510	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=132,238;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:3,6,3,0
chr6	110062551	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=204,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr6	110110943	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=153,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr6	110113889	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:0,3:6,2:2,4,2,3
chr6	110113923	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=160,131;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,0:6,2:2,6,0,2
chr6	110301945	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=202,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:1,1,3,1
chr6	110302005	.	TTTC	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:110302005_TTTC_T:110302005:0,4,0,1
chr6	110302010	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:110302005_TTTC_T:110302005:0,4,0,1
chr6	110302012	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:110302005_TTTC_T:110302005:0,4,0,1
chr6	110302016	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:110302005_TTTC_T:110302005:0,4,0,1
chr6	110514293	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=175,303;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:7,0,2,0
chr6	110549980	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,250;MMQ=60,32;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:6,0,3,0
chr6	110567200	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=163,76;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:6,1,1,1
chr6	110643956	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr6	110644112	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	110714040	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:4,2:7,5:6,5,6,2
chr6	110729542	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=156,86;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:8,0:9,6,3,0
chr6	110752337	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=163,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr6	110797605	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:110797605_G_A:110797605:0,0,2,0
chr6	110797612	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:110797605_G_A:110797605:0,0,2,0
chr6	110797703	.	CCGCGGG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:110797703_CCGCGGG_C:110797703:0,0,2,1
chr6	110797713	.	C	CCACCCCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=13,32;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,1:0,1:0|1:110797703_CCGCGGG_C:110797703:1,0,1,2
chr6	110797821	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr6	110942653	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr6	110948099	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=182,259;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:2,6,1,1
chr6	110988795	.	AC	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0,5,0,5
chr6	110991707	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=142,160;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:12,0:9,3:0|1:110991707_A_C:110991707:11,10,0,3
chr6	110991710	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=142,160;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:12,0:9,3:0|1:110991707_A_C:110991707:11,10,0,3
chr6	111213927	.	T	TC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=152,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.488:20:3,3:7,7:7,3,4,6
chr6	111280332	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:16,3:5,2:14,7,3,2
chr6	111281802	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=137,121;MMQ=60,35;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:4,0:9,5:5,8,0,6
chr6	111281880	.	A	ATAAATAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=241,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAATAT;STR;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,0:3,3:1,4,0,3
chr6	111283592	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=111,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,5:7,2:8,7,6,1
chr6	111283718	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:6,4,0,2
chr6	111321037	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=218,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	111329221	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=115,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.822:7:0,1:1,5:1,0,5,1
chr6	111345420	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:7,1:10,2:8,10,3,0
chr6	111527696	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	111527988	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,5:1,4:0,4,1,8
chr6	111587055	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=228,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,5:1,3:5,0,7,1
chr6	111695887	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=207,166;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,3:3,7:5,4,4,6
chr6	111695899	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=185,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:9,0:6,3:8,7,1,2
chr6	111711232	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=221,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,0:3,5:4,0,5,0
chr6	111726611	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,2:4,1:9,1,3,0
chr6	111896790	.	CAAAA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=A;STR;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,2:0,3:0,1,6,1
chr6	111995666	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,5:6,3:8,0,3,5
chr6	112025405	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=192,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,1:3,0:0|1:112025405_A_AC:112025405:0,3,0,1
chr6	112025406	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=192,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:112025405_A_AC:112025405:0,3,0,1
chr6	112041170	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=167,0;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:16,1:19,2:14,21,0,3
chr6	112375644	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=140,285;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,1:6,2:1,6,1,2
chr6	112389558	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,0:15,3:8,17,0,3
chr6	112389563	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:11,0:12,7:10,13,0,7
chr6	112389637	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=138,131;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.264:21:10,0:4,5:0,16,0,5
chr6	112390565	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=164,91;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:6,2:4,0:5,6,2,0
chr6	112397445	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=132,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:2,2:3,1,2,0
chr6	112420685	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=166,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr6	112420703	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=175,235;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr6	112430886	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=219,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	112435264	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:3,3:1,1:0|1:112435264_T_G:112435264:1,3,5,0
chr6	112435273	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=117,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:4,3:1,1:0|1:112435264_T_G:112435264:2,3,5,0
chr6	112435444	.	G	GAAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,253;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAT;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr6	112435796	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=168,260;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:6,0,4,0
chr6	112435807	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=162,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr6	112443134	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=127,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,2:0,3:2,1,4,1
chr6	112455586	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=226,324;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr6	112457471	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,220;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,3:2,6:1,1,0,9
chr6	112471621	.	GACAA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=118,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACAA;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr6	112471688	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=149,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:4,1,5,1
chr6	112476182	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=155,220;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:112476182_G_A:112476182:0,4,0,1
chr6	112476192	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=158,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:112476182_G_A:112476182:0,3,0,1
chr6	112476210	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=220,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr6	112486397	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=162,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:9,0:7,3:6,10,1,2
chr6	112506375	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.871:6:0,0:0,3:0,0,6,0
chr6	112506583	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr6	112528186	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=110,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:13,3:14,0:21,6,2,1
chr6	112535131	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.528:15:1,1:6,7:4,3,7,1
chr6	112537497	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,10:0,4:1,0,14,0
chr6	112575200	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,3:5,3:5,7,2,4
chr6	112672432	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=98,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:5,2:4,5,2,0
chr6	114178831	.	C	CGCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GCT;STR;TLOD=51.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr6	114181623	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=201,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:2,6,1,1
chr6	114270221	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:7,5:10,0:6,11,5,0
chr6	114281112	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:0|1:114281112_G_A:114281112:9,13,1,1
chr6	114281117	.	GGGTCATGC	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:12,2:0|1:114281112_G_A:114281112:12,12,1,1
chr6	116264354	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.414:13:2,2:3,3:2,6,4,1
chr6	116288912	.	TA	T,TAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27,28;MFRL=197,169,183;MMQ=60,60,60;MPOS=12,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.71,12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,6:0.261,0.579:10:0,2,3:1,1,2:0,1,2,7
chr6	116381395	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.368:22:11,7:3,0:8,6,8,0
chr6	116427506	.	CTT	C,CT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=19,22,27;MFRL=75,0,103;MMQ=60,60,60;MPOS=30,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=T;STR;TLOD=5.41,5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.310,0.396:10:0,1,2:1,2,0:2,1,4,3
chr6	116427511	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.171:15:6,0:7,2:9,4,1,1
chr6	116429623	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.786:12:1,4:1,6:0|1:116429623_T_A:116429623:0,2,4,6
chr6	116429631	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:4,1:3,2:0|1:116429623_T_A:116429623:2,5,1,2
chr6	116441229	.	T	TGGG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=123,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,1:3,4:3,1,4,2
chr6	116575344	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=236,247;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:0,2,0,6
chr6	116599665	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=142,207;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:11,3:14,1:14,11,2,2
chr6	116600465	.	T	TCAC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=213,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CAC;STR;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:8,1:1,4:5,5,3,2
chr6	116720534	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=192,165;MMQ=60,34;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:11,2:4,1:7,8,0,3
chr6	116752290	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=121,91;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:7,6,2,0
chr6	116782488	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=53.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,12,4
chr6	116783390	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,299;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	116836720	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,3:3,1:5,1,3,1
chr6	116864570	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:13,3:5,5:3,15,4,4
chr6	116878947	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=150,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.586:17:2,6:4,4:6,1,6,4
chr6	116901640	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=194,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr6	116912033	.	CTT	C,CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30,32;MFRL=173,196,157;MMQ=60,60,50;MPOS=5,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=4.66,4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,2:0.254,0.190:14:4,2,1:2,2,1:5,3,6,0
chr6	116914112	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.549:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr6	116943973	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.288:25:12,6:6,0:7,11,7,0
chr6	116968546	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr6	116979930	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr6	117019846	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=165,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:6,3,0,2
chr6	117026217	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:4,2,3,0
chr6	117053285	.	ACT	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=197,161;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,3:0,0:0|1:117053285_ACT_A:117053285:4,1,3,0
chr6	117053288	.	T	TATA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=197,161;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:0|1:117053285_ACT_A:117053285:4,1,3,0
chr6	117053290	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=197,161;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.397:8:2,2:3,0:0|1:117053285_ACT_A:117053285:4,1,3,0
chr6	117073874	.	AATAT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,253;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=AT;STR;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.784:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	117073905	.	GTA	G,GTATA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32,35;MFRL=0,272,207;MMQ=60,60,40;MPOS=16,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=TA;STR;TLOD=3.38,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.405,0.403:2:0,1,0:0,0,1:0,0,0,2
chr6	117086265	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=151,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,3:1,2:2,0,6,0
chr6	117113653	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=181,177;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:2,2,2,5
chr6	117114025	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=168,241;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,5:6,3:8,4,6,2
chr6	117114050	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=204,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:12,5,1,1
chr6	117128286	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,0:4,3:7,4,0,3
chr6	117150063	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,113;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,0:7,3:5,6,0,3
chr6	117198347	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	117198724	.	CAAT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=225,370;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAT;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,1:5,1:1,7,0,2
chr6	117215114	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:8,0:6,6:7,7,3,3
chr6	117239141	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=188,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:7,2,0,2
chr6	117240283	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=194,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr6	117243181	.	CT	C,CTTTTTT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,29,34;MFRL=183,139,146;MMQ=60,60,40;MPOS=34,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,19;RU=T;STR;TLOD=3.20,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.256,0.251:5:0,0,1:3,1,0:3,0,2,0
chr6	117243196	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=17,10;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.294:5:0,0:1,0:4,0,1,0
chr6	117243203	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,15;MFRL=141,146;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:117243203_A_T:117243203:4,0,1,0
chr6	117243211	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,17;MFRL=139,146;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,0:3,0:0|1:117243203_A_T:117243203:5,0,1,0
chr6	117246576	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=204,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:2,1,2,1
chr6	117249847	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=204,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr6	117250182	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=246,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr6	117587096	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=231,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:117587096_C_T:117587096:0,4,0,1
chr6	117587098	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=231,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:117587096_C_T:117587096:0,4,0,1
chr6	117587100	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=231,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:117587096_C_T:117587096:0,4,0,1
chr6	117587102	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=18,29;MFRL=231,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:0,0:0|1:117587096_C_T:117587096:0,4,0,1
chr6	117591619	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=165,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr6	117622150	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:6,2,1,1
chr6	117622184	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=158,234;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,1:6,1:0|1:117622184_G_C:117622184:5,3,1,2
chr6	117622188	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=158,234;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:2,2:5,1:0|1:117622184_G_C:117622184:5,3,1,2
chr6	117631463	.	T	TTAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=204,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TAA;STR;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:2,2:1,0:1,2,0,3
chr6	117639301	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=207,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:5,1,3,1
chr6	117641158	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:3,10,2,0
chr6	117658281	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:2,5:7,0:0|1:117658281_A_T:117658281:6,5,5,0
chr6	117658286	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.315:17:5,5:7,0:0|1:117658281_A_T:117658281:7,5,5,0
chr6	117674087	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=200,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr6	117678083	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,1:4,3:2,3,1,3
chr6	117686943	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=167,108;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:0,5,0,5
chr6	117706760	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=249,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.343:9:2,2:4,0:6,0,3,0
chr6	117708932	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=180,59;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:8,0:5,2:0|1:117708932_C_T:117708932:9,6,1,1
chr6	117708939	.	T	TTGAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=184,59;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:117708932_C_T:117708932:7,6,1,1
chr6	117710661	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=187,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,0:6,5:4,7,3,2
chr6	117714346	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr6	117724462	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=187,268;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:3,3,0,2
chr6	117724499	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=207,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,1,2
chr6	117725383	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=152,169;MMQ=57,50;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr6	117737390	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=104,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,5,1
chr6	117804083	.	C	CATTCTGATTTTGAAAATCAGAGAAACCAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	117842759	.	CTG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,2:0,5:2,2,3,4
chr6	117860058	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=231,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,2:4,4:0,7,1,5
chr6	117862048	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=196,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,5:6,3:4,5,7,1
chr6	117996818	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr6	118475798	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:1,3:1,2,0,4
chr6	118556628	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr6	118635122	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=126,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,5:1,2:1,0,7,0
chr6	118786486	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr6	118803195	.	TAAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,11;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.700:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr6	118845168	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=172,237;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	118881770	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,6:9,2:6,8,0,8
chr6	118886615	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=194,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,4,1
chr6	118973998	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=127,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:3,9,0,2
chr6	118974042	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=288,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr6	119148023	.	A	AGATACAGGGCTGCACACTG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.161:16:6,2:8,0:4,10,0,2
chr6	119149149	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=206,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,7:1,9:0,1,6,10
chr6	119296378	.	TAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=112,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	119300477	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,273;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr6	119346010	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=244,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr6	119501160	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=166,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:6,1:3,3:1,9,1,3
chr6	119501601	.	T	TAA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:9,2:1,2:0|1:119501601_T_TAA:119501601:2,8,1,4
chr6	119501618	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=203,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:9,3:4,2:0|1:119501601_T_TAA:119501601:1,12,1,5
chr6	119509785	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	119510739	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=428,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr6	119510777	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,35;MFRL=428,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr6	119511120	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=177,237;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,2:6,2:0,9,0,4
chr6	119522353	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=183,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr6	119522553	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=201,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,2:6,1:1,7,0,3
chr6	119611989	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=253,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:0,5,0,6
chr6	119623079	.	AT	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=232,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.655:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	119623358	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:0,4,1,4
chr6	119627976	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=275,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:3,0,7,0
chr6	119628029	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,6:1,5:1,2,8,4
chr6	119628198	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=276,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,4:1,1:0,2,1,5
chr6	121412191	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	121427283	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=125,168;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:15,1:14,2:10,21,2,1
chr6	121436422	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr6	121452695	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=215,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr6	121482295	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	121491472	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr6	121560155	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr6	121624876	.	A	AAAGCTTTTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=189,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:2,6,1,1
chr6	121626079	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr6	121768269	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=200,54;MMQ=57,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:7,2:0|1:121768269_C_A:121768269:6,8,0,2
chr6	121768274	.	C	CACAAAATTGAG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=165,54;MMQ=57,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:8,2:0|1:121768269_C_A:121768269:7,10,0,2
chr6	121768276	.	C	CTTTAAAAA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=165,54;MMQ=57,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,0:8,2:0|1:121768269_C_A:121768269:7,10,0,2
chr6	121769905	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,170;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,0:6,4:8,5,5,0
chr6	122720806	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=169,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:6,0,5,0
chr6	122720813	.	T	TGCCGTAGCTGCC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=219,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCCGTAGCTGCC;STR;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.457:9:3,2:1,1:4,1,4,0
chr6	122740474	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=198,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:3,2:9,2:0,12,0,4
chr6	122743502	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	122744761	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:11,4:12,0:18,5,4,0
chr6	122749156	.	G	GTC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.450:9:2,2:3,2:1,4,1,3
chr6	122752471	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=203,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr6	122752550	.	T	TTA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=211,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TA;STR;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,0:3,0,4,0
chr6	122768231	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,5:8,2:5,7,5,2
chr6	122772921	.	A	AATAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=184,101;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=AT;STR;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	122773119	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,248;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:8,6,1,1
chr6	122774955	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,85;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:3,0:11,3:6,8,0,3
chr6	122775192	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=218,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0|1:122775192_CA_C:122775192:3,0,1,1
chr6	122775194	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=218,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0|1:122775192_CA_C:122775192:3,0,1,1
chr6	122792765	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=195,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:7,7:5,2:0|1:122792765_G_C:122792765:9,3,8,1
chr6	122792768	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=195,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.458:22:7,8:5,2:0|1:122792765_G_C:122792765:9,3,8,2
chr6	123022496	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=203,236;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr6	123038887	.	CT	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr6	123039123	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=188,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,0:1,6:0,3,0,6
chr6	123039132	.	A	ACAGCTAGAGGTATGG	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=238,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.369:3:1,1:1,0:0|1:123039132_A_ACAGCTAGAGGTATGG:123039132:0,2,0,1
chr6	123039135	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=188,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:123039132_A_ACAGCTAGAGGTATGG:123039132:0,3,0,1
chr6	123039137	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,22;MFRL=188,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:123039132_A_ACAGCTAGAGGTATGG:123039132:0,3,0,1
chr6	123039201	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	123046260	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=167,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,1:4,1:5,2,2,0
chr6	123101348	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr6	123101373	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:7,2:1,1:8,0,3,0
chr6	123101647	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=128,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr6	123127597	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=253,42373544;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	123318301	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr6	123319382	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	123369910	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr6	123539684	.	CT	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr6	123539784	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:10,7,0,2
chr6	123539904	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,7:1,5:1,0,7,5
chr6	123580660	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	123581789	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,25;MFRL=184,125;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.586:8:1,3:0,1:1,2,2,3
chr6	123586488	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=246,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:3,5,2,0
chr6	123592184	.	C	CTGTGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=0,0;MMQ=54,22;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,15;RU=TG;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.509:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr6	123600100	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	123658680	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=248,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr6	123687432	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr6	123703168	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=150,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:6,4:1,1:5,2,6,0
chr6	123714656	.	GC	TT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=217,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr6	123714891	.	CAG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=186,268;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0,10,0,2
chr6	123819847	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	123833457	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,12,5
chr6	123851538	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr6	123851590	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=278,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.846:11:0,6:1,3:0|1:123851590_G_A:123851590:0,1,8,2
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chr6	123869769	.	TAA	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,3:1,6:0,3,0,9
chr6	123869784	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:0|1:123869784_A_C:123869784:0,12,0,2
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chr6	123892044	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,268;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr6	123892337	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=134,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
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chr6	124604111	.	T	TATC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=191,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:124604109_T_TCATAAATAATAG:124604109:10,0,1,1
chr6	124979689	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr6	125139473	.	TG	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=141,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,0:1,1,3,1
chr6	125366289	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=197,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr6	125402711	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=162,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.732:13:2,3:1,6:0,3,3,7
chr6	125541258	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:7,4:7,2:5,9,3,3
chr6	125569405	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=181,241;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:7,2,1,1
chr6	125597247	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=167,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,2:2,4:8,1,5,1
chr6	125597301	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:9,0:7,3:12,6,0,3
chr6	125597433	.	AAG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=178,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,1:2,8:0,4,0,9
chr6	125598199	.	TG	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,7:3,2:4,0,8,1
chr6	125614100	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:4,2:4,5,0,3
chr6	125614121	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:1,2:0,5,0,3
chr6	125621618	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=126,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:2,4:4,3:4,2,6,2
chr6	125621645	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=128,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,7:3,3:4,1,6,4
chr6	125623185	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=186,261;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,3:0,0:0,1,0,4
chr6	126075709	.	ATTT	A,AT,ATT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,27,25,25;MFRL=122,76,115,214;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,17,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.47,6.76,4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,2,4,3:0.149,0.250,0.209:16:3,1,2,1:2,1,2,1:2,5,0,9
chr6	126080623	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=184,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,1:3,1:6,4,1,1
chr6	126196142	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:8,3:5,3:4,9,4,2
chr6	126221008	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=134,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:3,1,3,0
chr6	126242004	.	CG	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr6	126249755	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=155,242;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.374:8:3,2:2,0:3,2,2,1
chr6	126288023	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,11,3
chr6	126319881	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr6	126320761	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=75.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,24:0.399:61:24,0:11,24:8,29,0,24
chr6	126334041	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr6	126669517	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=154,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:9,2,2,0
chr6	127471791	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,0,2
chr6	127476516	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:9,5:6,7:9,6,6,6
chr6	127476586	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=211,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,0:3,5:3,7,0,5
chr6	127608822	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:11,0:11,3:8,14,3,0
chr6	127608864	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,0:10,3:8,11,3,0
chr6	127608940	.	G	T	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,10:0.191:55:24,0:19,4:15,30,0,10
chr6	127768748	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=163,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,0:5,2:3,6,1,1
chr6	127768762	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=147,339;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,1:4,1:2,4,1,1
chr6	127768950	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=90,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,5:1,0:0,1,0,5
chr6	127768971	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=193,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr6	127770923	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=86,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:1,1,4,2
chr6	128176383	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr6	128297950	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=18,32;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.352:9:1,0:1,2:0,6,0,3
chr6	128297986	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=202,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0,3,1,3
chr6	128307118	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,2:5,1:0,14,0,3
chr6	128316412	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:9,0:12,2:14,7,0,2
chr6	128324241	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr6	128330249	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,4:0,0,9,4
chr6	128383562	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=120,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=51.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.829:21:2,13:1,5:3,0,10,8
chr6	128385998	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=195,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr6	128388990	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	128403745	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,12:0,0,8,12
chr6	128562312	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=202,84;MMQ=60,33;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,4:6,0:8,7,4,0
chr6	129204292	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=15,29;MFRL=233,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,4:0,0:1,0,4,0
chr6	129370975	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:8,2:1,2:9,0,4,0
chr6	129571330	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=120,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:2,4,0,6
chr6	129622055	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=188,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:1,9,1,1
chr6	129670548	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=122,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:2,6,1,1
chr6	129674593	.	CTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=204,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,3:3,1:1,5,0,4
chr6	129724894	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=254,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr6	129775215	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:6,2,3,0
chr6	129777382	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	129785391	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr6	129796620	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=283,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,0,3
chr6	129833696	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=220,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr6	129835814	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr6	129899842	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr6	129955117	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=225,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,5,0
chr6	129955151	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:1,1:3,1:4,0,1,4
chr6	129955327	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=221,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr6	130154686	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,6,9
chr6	130164764	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,10:0,0,3,14
chr6	130164856	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr6	130370404	.	C	CCT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=202,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=34.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,3:1,6:1,0,6,3
chr6	130371055	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=165,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr6	130387431	.	G	GTATATATATATA,GTATATATATATATATA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34,33;MFRL=0,185,154;MMQ=60,41,40;MPOS=19,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,14,16;RU=TA;STR;TLOD=7.15,9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.376,0.518:5:0,1,0:0,1,3:0,0,4,1
chr6	130387459	.	A	AAGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=119,82;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,0:0,1:3,0,0,1
chr6	130399854	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=115,39436464;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:2,1,0,2
chr6	130425540	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:7,3:2,2:9,0,5,0
chr6	130454535	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:6,0,4,0
chr6	130454616	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=179,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:11,3:7,2:9,9,4,1
chr6	130466413	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,4,3
chr6	130475945	.	GTA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=183,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TA;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr6	130496883	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=225,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr6	130505374	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.764:15:1,5:2,7:1,2,2,10
chr6	130530815	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=131,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,1,2
chr6	130535420	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=157,346;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,1:6,2:11,2,3,0
chr6	130536494	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=236,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr6	130762153	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,21277314;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:9,2:16,0:14,11,0,2
chr6	131179302	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=121,142;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:6,5,0,2
chr6	131186578	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=176,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:7,0,2,0
chr6	131190838	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:9,1:7,4:10,6,2,3
chr6	131197990	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	131211476	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.152:28:15,0:9,3:14,10,4,0
chr6	131211616	.	GAA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=19,18;MFRL=247,264;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.494:9:0,1:0,0:0,5,0,4
chr6	131220709	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,3:5,2:5,7,2,3
chr6	131276466	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=165,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.244:6:1,1:4,0:0,5,0,1
chr6	131481130	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.343:16:7,3:3,2:8,3,5,0
chr6	131481394	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	131490229	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=130,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:2,1,5,0
chr6	131490472	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr6	131520507	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=227,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr6	131540726	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=159,225;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:1,2,5,0
chr6	131894358	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=148,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr6	131900144	.	GC	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,266;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr6	131904704	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr6	131911634	.	TG	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr6	131911655	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=231,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr6	131912746	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=197,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:131912746_CT_C:131912746:0,1,0,1
chr6	131912751	.	TC	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,35;MFRL=197,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:131912746_CT_C:131912746:0,1,0,1
chr6	131912759	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:131912746_CT_C:131912746:0,0,0,1
chr6	131948469	.	GAA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.381:11:6,2:1,2:7,0,4,0
chr6	131948640	.	T	TGTATCTTATAAGATTTTACAAGTTGC	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.095:39:21,1:14,2:9,27,0,3
chr6	131948816	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,29,31,28;MFRL=115,75,136,122;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,17,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=A;STR;TLOD=8.42,13.78,4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:18,6,9,5:0.148,0.234,0.137:38:7,3,2,2:7,3,7,3:1,17,2,18
chr6	131949136	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=134,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:7,1:11,2:11,8,3,1
chr6	131958485	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:2,1,4,1
chr6	131997798	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=194,238;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr6	131999016	.	T	TTAAAGCAAAA	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=197,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:8,2:3,0:0|1:131999016_T_TTAAAGCAAAA:131999016:8,3,1,1
chr6	131999019	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=193,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:8,2:3,0:0|1:131999016_T_TTAAAGCAAAA:131999016:8,4,1,1
chr6	131999021	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=193,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:9,2:3,0:0|1:131999016_T_TTAAAGCAAAA:131999016:8,4,1,1
chr6	131999145	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:131999145_C_CCT:131999145:0,4,0,1
chr6	131999146	.	A	AAAGG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:131999145_C_CCT:131999145:0,4,0,1
chr6	132006987	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=162,88;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:7,0:10,5:0|1:132006987_G_A:132006987:7,10,0,5
chr6	132006990	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=162,88;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:6,0:10,5:0|1:132006987_G_A:132006987:7,10,0,5
chr6	132043349	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=123,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,5:2,6:4,1,7,4
chr6	132061605	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	132169052	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=219,160;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:132169052_T_TG:132169052:0,2,0,1
chr6	132169053	.	A	AGGAGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=219,160;MMQ=60,56;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:132169052_T_TG:132169052:0,2,0,1
chr6	132172294	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,6:6,1:8,1,5,2
chr6	132189178	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:8,5:9,0:7,10,5,0
chr6	132201081	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=112,244;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:2,3,2,0
chr6	132207964	.	C	CTCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=205,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr6	132270728	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=18,26;MFRL=169,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:2,1:0,1:2,4,2,2
chr6	132641675	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=231,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr6	132641888	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=223,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,1:2,2:1,7,0,3
chr6	132644035	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,4:7,3:2,8,2,5
chr6	132645195	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,2:10,2:9,10,1,3
chr6	132696016	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,289;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr6	132785074	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=74,70;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,3:10,0:10,8,2,1
chr6	132874693	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=179,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:132874693_C_T:132874693:6,5,1,1
chr6	132874702	.	A	ATCCACC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=174,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:7,0:6,2:0|1:132874693_C_T:132874693:9,4,1,1
chr6	132910612	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,4:3,7:3,5,3,8
chr6	132910622	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:5,10,0,2
chr6	132910877	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,16;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0,2,0,1
chr6	132910891	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=194,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:132910891_A_T:132910891:0,4,0,1
chr6	132910896	.	A	G,C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,31,35;MFRL=204,180,203;MMQ=60,60,60;MPOS=7,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,1,0:2,0,1:0,3,0,2
chr6	132910897	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,35;MFRL=194,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:132910891_A_T:132910891:0,4,0,1
chr6	132910900	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=204,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0,4,0,1
chr6	132966043	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=144,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	133048213	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=155,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr6	133055610	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:3,1:5,3:0|1:133055610_G_T:133055610:4,4,2,2
chr6	133055612	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:133055610_G_T:133055610:5,6,1,1
chr6	133073668	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:9,4,0,2
chr6	133076919	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:5,0,1,1
chr6	133092046	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,1:9,1:7,7,0,2
chr6	133108763	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,35;MFRL=174,254;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.411:8:0,1:4,2:0,5,0,3
chr6	133135807	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=174,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,2:6,6:10,0,8,0
chr6	133136029	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=186,259;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:6,1:12,4:11,7,2,3
chr6	133136041	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=173,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:5,1:12,3:11,6,4,0
chr6	133138067	.	ATT	A,AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30,29;MFRL=163,66,221;MMQ=60,60,60;MPOS=17,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.47,5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.249,0.333:9:2,1,1:1,1,2:3,1,5,0
chr6	133138749	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=71,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:1,2,1,3
chr6	133827148	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=169,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr6	133827354	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,3:2,1:1,3,0,4
chr6	133849789	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,226;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:3,4,6,0
chr6	133849966	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=131,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.331:19:7,1:6,5:5,8,2,4
chr6	134493397	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:19,3:13,3:17,15,3,3
chr6	134493877	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.227:33:14,0:12,7:10,16,0,7
chr6	134493947	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:2,2,1,4
chr6	134494548	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=85.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,11:0,16:0,0,11,16
chr6	134495291	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,0:3,6:0,3,1,6
chr6	135263632	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:8,5:9,0:10,7,6,0
chr6	135263664	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:7,6:11,0:5,13,6,0
chr6	135286438	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.552:9:3,3:0,2:0,4,0,5
chr6	135286505	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=219,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr6	135290355	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:7,6:14,5:21,0,7,4
chr6	135299959	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=216,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,2:0,4,2,3
chr6	135300362	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,95;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,3:8,0:8,9,2,1
chr6	135318854	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=255,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr6	135324051	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=242,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:135324051_T_C:135324051:0,1,0,3
chr6	135324052	.	TTTAAA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=242,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:135324051_T_C:135324051:0,1,0,3
chr6	135511108	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=297,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:2,2,1,4
chr6	135522939	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=185,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:3,4:0,4:0,3,1,7
chr6	135621517	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=247,311;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:135621517_C_A:135621517:4,0,1,0
chr6	135621520	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=247,311;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:135621517_C_A:135621517:4,0,1,0
chr6	135639644	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=199,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:3,2:6,0:7,3,2,0
chr6	135749682	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr6	135754471	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=366,195;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr6	135763866	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=187,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:3,8:4,7:3,4,3,12
chr6	135763899	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:0,9,0,2
chr6	135777115	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=123,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,1:4,2:1,4,1,2
chr6	135813251	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:1,0,5,1
chr6	136172996	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=290,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr6	136430001	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=203,111;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:0,1:4,1:0,7,0,2
chr6	136472439	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr6	136472496	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=186,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr6	136582113	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=202,176;MMQ=52,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:9,3:5,2:13,1,4,1
chr6	136582194	.	T	TAAA	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=117,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=A;STR;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.193:41:13,2:16,6:16,17,5,3
chr6	136582203	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=119,166;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.200:43:17,2:18,6:18,17,5,3
chr6	136582417	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=140,297;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:15,1:10,3:12,13,2,2
chr6	136589205	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=193,99;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr6	136589234	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=188,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:7,0,2,0
chr6	136597004	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=216,121;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:8,2:3,1:8,3,3,0
chr6	136599822	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=180,199;MMQ=60,42;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,1:4,1:3,6,1,1
chr6	136699001	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=195,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:5,10,0,2
chr6	136710543	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:6,0:19,3:10,15,3,0
chr6	136710669	.	TAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,14918976;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr6	136888889	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=150,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:8,2:11,1:9,10,1,2
chr6	136913664	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:8,2:8,4:8,9,3,3
chr6	136932603	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:1,2:0,4,0,2
chr6	137113248	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=226,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:3,2,4,0
chr6	137166682	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,11,1
chr6	137166831	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=130,96;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:10,4:15,0:10,15,0,4
chr6	137193436	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:4,2:5,2:4,6,0,4
chr6	137193496	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=210,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr6	137295016	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=146,211;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.530:2:0,1:1,0:0|1:137295016_T_C:137295016:1,0,1,0
chr6	137295024	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=146,211;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:137295016_T_C:137295016:1,0,1,0
chr6	137295046	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,35;MFRL=209,211;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:137295046_T_C:137295046:3,0,1,0
chr6	137295051	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,37;MFRL=209,211;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:137295046_T_C:137295046:3,0,1,0
chr6	137329934	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:1,10,1,1
chr6	137338276	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr6	137477823	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=202,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:4,4:2,1:5,2,4,1
chr6	137482982	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=188,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:0,8,1,3
chr6	137524870	.	GAA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:0,1:1,1:0,5,0,3
chr6	137540370	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=191,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.490:19:2,4:5,5:8,2,9,0
chr6	137540520	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:6,10:6,5:4,8,2,13
chr6	137814666	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=194,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr6	137815375	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=214,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:1,2:1,0:1,2,1,1
chr6	138195961	.	TCTC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=137,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:1,2:6,8:7,1,8,2
chr6	138196066	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.436:37:10,8:11,8:9,12,6,10
chr6	138197331	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,3:2,7:1,6,2,8
chr6	138417415	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=153,283;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr6	138531190	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,2:7,0:3,10,1,1
chr6	138613200	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=163,280;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,0,2
chr6	138617853	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,37;MFRL=226,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	138751629	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,254;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,3:6,2:7,7,1,4
chr6	138753659	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=147,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,0:11,2:0|1:138753659_C_T:138753659:9,6,1,1
chr6	138753669	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=158,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,0:11,1:0|1:138753659_C_T:138753659:10,7,1,1
chr6	138763221	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,295;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:10,6:7,0:8,9,0,6
chr6	138794628	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=268,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:1,3,0,3
chr6	138820271	.	G	GAC,GACAC	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,34,31;MFRL=119,66,170;MMQ=60,53,60;MPOS=18,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=AC;STR;TLOD=4.33,8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,4:0.238,0.399:11:2,2,1:3,0,1:4,1,6,0
chr6	138820315	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=100,83;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,5:0.077:74:30,5:37,0:27,42,5,0
chr6	138892814	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,2:7,1:7,1,3,0
chr6	139097174	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=208,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,3:5,5:7,0,7,1
chr6	139097321	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=134,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:12,3:5,0:6,11,0,3
chr6	139113869	.	T	TTAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=135,273;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAC;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,1:6,1,1,1
chr6	139186074	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=187,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr6	139202014	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,265;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr6	139207910	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=244,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr6	139208118	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=118,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr6	139229743	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr6	139234163	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=188,324;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	139355580	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=159,205;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,2:3,3:1,4,3,2
chr6	139355740	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=229,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr6	139363988	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=145,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:10,0:5,6:3,12,0,6
chr6	139487394	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,2:6,6:9,1,5,3
chr6	139487836	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.734:28:4,7:3,14:3,4,8,13
chr6	139581356	.	CAAAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,335;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAAT;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr6	139583914	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=138,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,2:8,2:4,10,1,3
chr6	139583990	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr6	142397170	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,1:9,1:8,6,2,0
chr6	142487469	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=133,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.588:10:4,2:0,4:2,2,1,5
chr6	142491463	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr6	142491552	.	TGATGAAGTGAG	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=141,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:2,2:7,0:5,8,1,1
chr6	142491584	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=189,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:2,6,1,3
chr6	142510676	.	GTATT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=203,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TATT;STR;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:4,2,0,4
chr6	142715195	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=167,261;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr6	142718801	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,12,15
chr6	142724918	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=176,223;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:0,1,5,3
chr6	142738314	.	CTTCTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:3,4:5,0,7,0
chr6	143074558	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=177,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:11,4:14,0:15,10,0,4
chr6	143081847	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr6	143090633	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=177,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,2:6,3:11,2,4,1
chr6	143381712	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=163,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:10,8:5,1:11,4,6,3
chr6	143382254	.	CGTGT	C,CGT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31,26;MFRL=185,162,173;MMQ=60,60,60;MPOS=20,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=GT;STR;TLOD=10.12,9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,4:0.296,0.355:12:3,0,1:0,3,2:3,1,4,4
chr6	143654625	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=125,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,1,3
chr6	143759753	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=176,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,1:6,1:8,9,2,0
chr6	143759840	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:11,0:7,7:4,14,0,7
chr6	143784031	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.413:10:3,3:3,1:4,2,3,1
chr6	143789181	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=223,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr6	144086394	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=210,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,1:1,6:2,1,6,1
chr6	144104469	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=188,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,0:3,3:1,6,1,2
chr6	144128095	.	TAA	T,TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25,25;MFRL=144,149,159;MMQ=60,60,60;MPOS=16,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=5.38,7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,4:0.266,0.367:11:1,1,2:0,2,2:4,0,7,0
chr6	144144678	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=212,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:4,0,4,1
chr6	144144815	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=173,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:8,0:0|1:144144815_CA_C:144144815:8,11,1,1
chr6	144144817	.	TCGTCCATAACGAAGAGTGAGACTATTTGGAA	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=173,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:10,2:8,0:0|1:144144815_CA_C:144144815:14,15,1,1
chr6	144144875	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=185,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:11,2:7,2:6,12,2,2
chr6	144165809	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=19,22;MFRL=85,213;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:0,0:0,2,0,5
chr6	144171401	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=142,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:0,7,0,3
chr6	144178419	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,4:2,4:3,0,6,3
chr6	144269123	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=194,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:0|1:144269123_TC_T:144269123:6,6,2,0
chr6	144269125	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=194,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:0|1:144269123_TC_T:144269123:6,6,2,0
chr6	144509845	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:6,1,2,3
chr6	144511720	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=228,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.342:7:2,2:3,0:2,3,2,0
chr6	144512235	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=218,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:4,1,1,1
chr6	144512671	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.922:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr6	144757090	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:11,4:8,0:10,9,4,0
chr6	144761429	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,2,1
chr6	144795922	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:4,10,0,2
chr6	144803541	.	ATTG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.232:13:7,1:3,2:3,7,2,1
chr6	144809978	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=196,76;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:3,3:7,0:1,10,1,2
chr6	144835040	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:7,2,1,2
chr6	144843091	.	AT	A,TT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28,28;MFRL=197,215,0;MMQ=60,60,60;MPOS=14,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.06,6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.446,0.336:7:0,1,1:1,2,2:1,0,4,2
chr6	144844188	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,107;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:4,2:15,0:14,5,2,0
chr6	144860586	.	G	GGCTGTTGTGAATCTTTTTTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:7,3:10,0:12,5,0,3
chr6	144872272	.	G	GAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=197,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=AC;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,1:0,2,0,3
chr6	145095557	.	TCCAA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=151,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:145095557_TCCAA_T:145095557:1,3,0,2
chr6	145095564	.	G	GAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=149,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:145095557_TCCAA_T:145095557:0,3,0,2
chr6	145114935	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=142,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:1,3:6,2:6,1,5,0
chr6	145118941	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=209,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr6	145120682	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=131,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:13,1:3,1:3,14,0,2
chr6	145124151	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=194,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:3,3,3,1
chr6	145124295	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.563:21:3,10:6,2:3,6,6,6
chr6	145148690	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.580:5:0,2:2,1:1,1,3,0
chr6	145157706	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:1,9,0,4
chr6	145162001	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=231,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,4:5,2:2,6,1,5
chr6	145167978	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=162,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,14:0.332:43:17,7:12,7:13,16,10,4
chr6	145168013	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=211,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:9,2:4,7:2,11,3,6
chr6	146007166	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=219,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,4:1,5:1,0,9,0
chr6	146126419	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=188,94;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:5,5:1,1:4,2,4,2
chr6	146126950	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=162,71;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.150:24:14,0:7,3:6,15,1,2
chr6	146207465	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=92,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,6:2,2:4,3,6,2
chr6	146207502	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=223,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:5,5:0,4:1,5,4,5
chr6	146207657	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=226,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr6	146216184	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:0,3,0,6
chr6	146239245	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=199,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:2,4:2,11:2,2,9,6
chr6	146243581	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=215,247;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr6	146244012	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=252,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:0,3,3,3
chr6	146244743	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=161,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:6,0,5,0
chr6	146247504	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=209,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr6	146262697	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,14,0
chr6	146264677	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=174,245;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:6,6:11,0:8,9,6,0
chr6	146268623	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=125,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.358:17:8,4:3,1:7,4,4,2
chr6	146275979	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:7,8,1,1
chr6	146480740	.	TTCTCTCTCTC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=211,132;MMQ=55,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=19,14;RU=TC;STR;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,0:1,2:0,2,0,3
chr6	146708057	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=143,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:15,3:12,0:16,11,2,1
chr6	146720871	.	TC	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=241,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:146720871_TC_GT:146720871:0,3,0,1
chr6	146720875	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=241,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:146720871_TC_GT:146720871:0,3,0,1
chr6	146755324	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=201,223;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,7:2,1:2,3,5,3
chr6	146870692	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:0|1:146870692_G_GA:146870692:6,12,0,2
chr6	146870700	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.122:22:10,0:9,2:0|1:146870692_G_GA:146870692:8,12,0,2
chr6	146966010	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:7,4:6,2:6,7,2,4
chr6	146975204	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=187,270;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr6	146975384	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=185,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,0:4,3:3,10,1,2
chr6	146975456	.	TTA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TA;STR;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	146987930	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=235,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,2:6,0:6,4,1,1
chr6	147012191	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr6	147012362	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=20,35;MFRL=118,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:15,2:0|1:147012362_T_G:147012362:6,16,0,2
chr6	147012367	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=113,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:13,2:0|1:147012362_T_G:147012362:6,14,0,2
chr6	147012372	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=20,35;MFRL=113,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:13,2:0|1:147012362_T_G:147012362:6,14,0,2
chr6	147012373	.	C	CTCTCTCTCTCT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=20,35;MFRL=113,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:13,2:0|1:147012362_T_G:147012362:6,14,0,2
chr6	147073639	.	TATA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:6,2:2,0:6,2,2,0
chr6	147091741	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,1:5,1:9,5,2,0
chr6	147103358	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr6	147103416	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	147631201	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,2:6,1:7,4,3,0
chr6	147635318	.	T	TAC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=AC;STR;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr6	147635547	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=258,233;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:0,3:3,4:0,3,2,6
chr6	147680176	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:6,0,2,0
chr6	148761456	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:6,5:7,1:6,7,3,3
chr6	148761603	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=188,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,4:2,0:1,5,1,3
chr6	148792522	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,87;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=27,24;RU=T;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.484:4:0,0:1,2:1,1,2,0
chr6	148835436	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,4:4,2,6,2
chr6	148835684	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	148840795	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=170,252;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:16,0:10,3:11,15,0,3
chr6	148853867	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr6	148854870	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=186,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,1,1
chr6	148861716	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=273,248;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:1,2,0,4
chr6	148865121	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=199,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:5,5,0,2
chr6	148867217	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=213,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.327:31:4,5:17,4:11,10,6,4
chr6	149274918	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=181,0;MMQ=60,35;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:4,2:3,1:6,1,0,4
chr6	149274938	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=0,198;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:5,1:4,9,2,0
chr6	149275118	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,0:6,6:1,8,0,6
chr6	149285719	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=165,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,4:4,2:1,4,3,3
chr6	149285768	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=157,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,4:2,4:0,2,0,8
chr6	149340390	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr6	149700577	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:9,7,1,1
chr6	149718650	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr6	149722333	.	TA	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:9,3:16,0:16,12,2,1
chr6	149780695	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=175,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:1,2:4,3:2,3,4,2
chr6	149780737	.	G	GACTA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACTA;STR;TLOD=41.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,3:2,7:0,5,6,5
chr6	149795342	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=230,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,7:4,1:7,2,4,4
chr6	149795692	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=121,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:8,2:3,1:4,7,0,3
chr6	149826691	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=162,201;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:16,0:13,5:18,11,0,5
chr6	149842148	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,268;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr6	149855742	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=133,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:5,1,2,0
chr6	149862453	.	G	GTAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=250,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TAAA;STR;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,1:1,0:2,0,3,1
chr6	149922782	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=134,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,1:9,1:7,5,2,0
chr6	149922909	.	T	TAGCTGGTAGTAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=145,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:3,1:5,0:1,7,0,2
chr6	149953835	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr6	149997657	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=201,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0|1:149997657_T_C:149997657:4,2,2,0
chr6	149997663	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=184,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.273:9:3,2:4,0:1|0:149997657_T_C:149997657:5,2,2,0
chr6	150004779	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=129,216;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:16,2:4,3:8,12,2,3
chr6	150063480	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=158,163;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr6	150063495	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=173,142;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:8,1,2,0
chr6	150064707	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=214,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr6	150123316	.	CTT	C,CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,35,34;MFRL=147,276,90;MMQ=60,60,60;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=4.06,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.272,0.272:8:1,2,0:3,0,2:4,0,3,1
chr6	150123401	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=139,0;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:9,8,0,2
chr6	150210994	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=115,256;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:5,2:12,0:0|1:150210994_T_C:150210994:10,7,2,1
chr6	150210999	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=115,256;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:5,3:13,0:0|1:150210994_T_C:150210994:10,8,2,1
chr6	150263186	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr6	150289707	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=121,244;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,3,0
chr6	150341990	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=129,186;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:2,3:5,3:0|1:150341990_A_G:150341990:6,1,6,1
chr6	150341993	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=129,166;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.466:13:2,2:5,3:0|1:150341990_A_G:150341990:6,1,5,1
chr6	150385730	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=180,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,5:5,4:9,2,4,5
chr6	150385886	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=113,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,2:9,2:4,13,2,2
chr6	150387302	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:1,0,0,6
chr6	150387312	.	A	G,C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,32,29;MFRL=162,176,125;MMQ=60,60,60;MPOS=15,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.02,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,1:0.556,0.222:6:0,3,1:1,1,0:1,0,0,5
chr6	150464356	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,405;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	150464625	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=176,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:8,5,1,1
chr6	151116867	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr6	151121760	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=214,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,1:1,2:0,1,4,0
chr6	151125724	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=277,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.840:14:0,6:1,5:2,0,9,3
chr6	151125896	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=202,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,7:1,5:1,0,5,7
chr6	151125975	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=181,290;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr6	151130691	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=182,241;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:2,3:3,2,1,3
chr6	151130958	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=169,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151130958_T_TTG:151130958:0,1,0,1
chr6	151130961	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=169,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151130958_T_TTG:151130958:0,1,0,1
chr6	151130966	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=169,103;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151130958_T_TTG:151130958:0,1,0,1
chr6	151130969	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=169,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151130958_T_TTG:151130958:0,1,0,1
chr6	151152499	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=122,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,2:5,0:14,2,2,0
chr6	151197152	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=320,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,4,3
chr6	151199071	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=216,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr6	151247439	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr6	151259770	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:6,2,2,0
chr6	151266504	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	151266564	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=125,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:9,4:6,1:9,6,4,1
chr6	151266717	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=81,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,2:2,2:2,5,1,3
chr6	151270369	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=245,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr6	151281567	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,6,10
chr6	151286224	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=270,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,4:1,6:0,1,3,7
chr6	151336631	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=171,134;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:7,7:8,0:0|1:151336631_C_T:151336631:12,4,7,0
chr6	151336633	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=171,134;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:8,7:8,0:0|1:151336631_C_T:151336631:12,4,7,0
chr6	151336739	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=117,257;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:13,2:9,2:11,11,3,1
chr6	151358011	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=159,202;MMQ=49,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:6,1,2,1
chr6	151358072	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=169,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:8,3:9,6:11,6,5,4
chr6	151358075	.	AAC	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=140,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:11,1:13,2:15,11,3,0
chr6	151358299	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=120,140;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,5:0,4:0,1,1,8
chr6	151358325	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr6	151362895	.	CTTG	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=264,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=105.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,26:0.846:30:2,12:2,14:3,1,11,15
chr6	151362942	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,8,13
chr6	151670284	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=225,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:0|1:151670284_CT_C:151670284:7,3,1,1
chr6	151670286	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=225,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:7,0:3,2:0|1:151670284_CT_C:151670284:7,3,1,1
chr6	151672499	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=182,40;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,3:6,0:7,8,2,1
chr6	151672516	.	A	AGTTCAGTTGTAATAGCTTGCG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=185,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:6,0:8,8,1,1
chr6	151674116	.	T	TGAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=97,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:0,2,2,1
chr6	151674326	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=139,196;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.670:16:2,6:3,5:3,2,2,9
chr6	151674566	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,19;MFRL=184,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,1:0|1:151674566_T_C:151674566:8,9,1,1
chr6	151674573	.	T	TATAC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=182,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:151674566_T_C:151674566:9,9,1,1
chr6	151726300	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=125,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.387:11:1,1:6,3:5,2,3,1
chr6	151726829	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=207,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:2,2,5,0
chr6	151742541	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	151743629	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=134,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,3:4,5:4,3,6,2
chr6	151754273	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=166,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.317:17:3,2:8,3:6,6,2,3
chr6	151857370	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	151857594	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,9,4
chr6	151859146	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr6	151869725	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	151894278	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr6	151894625	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=160,77;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:4,1:11,2:7,8,1,2
chr6	152129399	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,1,1
chr6	152163882	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=174,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:4,7,2,0
chr6	152202007	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	152265282	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=332,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:0,6:1,8:1,0,15,0
chr6	152265728	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=262,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	152446316	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,0:1,4:0|1:152446316_C_T:152446316:6,0,2,2
chr6	152446320	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,0:2,4:0|1:152446316_C_T:152446316:6,0,2,2
chr6	152461061	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=171,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:4,0:6,2:7,4,1,1
chr6	152464839	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=129,170;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,4:7,4:4,9,5,3
chr6	152476952	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=119,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:3,0,5,1
chr6	152523143	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:2,3:0,4:0,2,0,7
chr6	152534946	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr6	152534978	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr6	152539326	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=285,368;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr6	152539572	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=127,295;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.592:8:1,2:2,2:0,3,1,4
chr6	152542548	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=140,256;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:12,3:13,1:12,13,1,3
chr6	152560916	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=212,326;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr6	152565792	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,2:3,0:0|1:152565792_CT_C:152565792:2,9,0,2
chr6	152565796	.	GT	TG	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=181,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:2,0:0|1:152565792_CT_C:152565792:2,10,0,2
chr6	152565801	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=181,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:3,0:0|1:152565792_CT_C:152565792:2,10,0,2
chr6	152565803	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:0|1:152565792_CT_C:152565792:2,9,0,2
chr6	152565805	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:2,0:0|1:152565792_CT_C:152565792:2,9,0,2
chr6	152570415	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=123,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,4:0,4:2,0,3,5
chr6	152615042	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=157,248;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,1:7,2:7,7,2,1
chr6	152629586	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=212,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:0,9:1,4:1,0,11,2
chr6	152629617	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=120,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.682:17:3,6:2,5:3,2,7,5
chr6	152631833	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.320:25:7,6:9,0:14,3,8,0
chr6	152638209	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	152658191	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=101,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr6	152660310	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:8,1,4,0
chr6	152671475	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,6:1,6:1,0,1,11
chr6	152671553	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=15,29;MFRL=174,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,1:0,1:0,1,1,1
chr6	152671919	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=74,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:0,4:2,11:2,0,2,14
chr6	152671975	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	152673519	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	152688567	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	152690559	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr6	152694424	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=205,145;MMQ=60,28;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr6	152694437	.	TG	CA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,36;MFRL=217,184;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0|1:152694437_TG_CA:152694437:0,3,0,1
chr6	152694453	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=217,184;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:152694437_TG_CA:152694437:0,3,0,1
chr6	152697706	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=333,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:2,2,0,2
chr6	152711395	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:7,5,1,1
chr6	152711455	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=167,147;MMQ=60,46;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,0:11,4:15,8,0,4
chr6	152711470	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=167,147;MMQ=60,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:10,0:14,4:16,8,0,4
chr6	152711487	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=170,147;MMQ=60,46;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:9,0:11,4:10,10,0,4
chr6	152720692	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=148,100;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,5:8,0:15,0,5,0
chr6	152722228	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=160,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,2:7,3:6,3,4,1
chr6	152725255	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=199,279;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:152725255_C_T:152725255:3,0,1,0
chr6	152725257	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=199,279;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:152725255_C_T:152725255:3,0,1,0
chr6	152740681	.	TA	T,TAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,26,25;MFRL=164,242,135;MMQ=60,60,60;MPOS=21,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.66,5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,3:0.222,0.238:14:2,2,1:6,1,2:5,3,6,0
chr6	152751218	.	ATAG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=150,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAG;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:4,3,2,0
chr6	152751398	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.286:16:3,3:8,1:0,12,0,4
chr6	152751558	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=220,250;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:4,1,1,1
chr6	152755149	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=186,209;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:152755149_A_G:152755149:0,2,0,1
chr6	152755156	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=186,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:152755149_A_G:152755149:0,2,0,1
chr6	152768796	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=151,264;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,2:8,2:2,9,2,2
chr6	152772264	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=121,209;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:7,3,1,1
chr6	152784054	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=221,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,3:5,1:4,4,0,4
chr6	152784075	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=212,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:1,3,0,3
chr6	152793375	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=148,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.368:20:5,2:7,5:10,3,5,2
chr6	152793412	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=156,235;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:7,3:6,9:3,10,8,4
chr6	152809527	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=173,243;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:8,2,1,1
chr6	152823722	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=193,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:8,0,2,0
chr6	152826627	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=215,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr6	152847335	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,247;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,3:9,0:4,9,1,2
chr6	153332785	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,116;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,3:9,0:10,8,3,0
chr6	153332926	.	AATAAT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=146,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr6	153345309	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,304;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	154412004	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	154414375	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,15,1
chr6	154414446	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr6	154429085	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=54.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,15,5
chr6	154431393	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr6	154535444	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:2,4,0,3
chr6	154567666	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:4,0,7,0
chr6	154727825	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=134,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,5:3,3:1,3,5,3
chr6	154727852	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=152,140;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:154727852_T_C:154727852:0,3,0,1
chr6	154727854	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=152,140;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:154727852_T_C:154727852:0,3,0,1
chr6	154727868	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=156,140;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:154727852_T_C:154727852:0,3,0,1
chr6	154735973	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr6	154749225	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=191,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,6,1
chr6	154762376	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=184,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=A;STR;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.673:4:0,0:1,1:0|1:154762376_CAA_C:154762376:1,0,1,2
chr6	154762394	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=184,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:0,1:1,1:0|1:154762376_CAA_C:154762376:1,0,1,2
chr6	155109168	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.315:11:3,2:4,1:1,7,0,3
chr6	155114060	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,85;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:11,0:9,3:12,9,0,3
chr6	155116285	.	TTC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,263;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,0:6,4:0,10,1,3
chr6	155124583	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=403,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr6	155126695	.	CTT	C,CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,36,28;MFRL=180,204,219;MMQ=60,60,60;MPOS=22,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=4.10,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.272,0.275:8:0,0,0:2,2,1:0,4,0,4
chr6	155129784	.	CCTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=198,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,3:3,2:3,1,3,2
chr6	155131089	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=180,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,2:2,2:5,1,4,0
chr6	155131163	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.410:42:15,9:10,8:16,9,17,0
chr6	155152311	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr6	155485535	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=182,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,1:5,5:6,2,5,1
chr6	155485554	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,1:6,6:8,2,5,2
chr6	155504366	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,62;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:10,4:7,0:10,7,4,0
chr6	155561760	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0|1:155561760_T_C:155561760:0,0,4,8
chr6	155561770	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=108,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:4,1:9,1:0|1:155561760_T_C:155561760:5,8,0,2
chr6	155569378	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=186,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:0,2,0,7
chr6	155571113	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr6	155572986	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	155574198	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=124,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0|1:155574198_C_T:155574198:1,2,0,4
chr6	155574207	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=124,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,1:1,0:0|1:155574198_C_T:155574198:1,2,0,2
chr6	155575546	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=184,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:13,2:6,2:6,13,3,1
chr6	155579246	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=211,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.816:14:2,9:0,3:1,1,1,11
chr6	155581619	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=234,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr6	155597686	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=230,258;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	155635585	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:2,5:6,7:4,4,6,6
chr6	155635624	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,4:5,5:1,6,0,9
chr6	155635637	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:1,4:5,6:0,6,0,10
chr6	155728311	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=216,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,0:6,3:11,3,0,3
chr6	155750219	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,1,3
chr6	155774613	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:11,7,0,2
chr6	157405761	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.629:11:0,4:3,3:4,0,7,0
chr6	157431610	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=178,224;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:11,11:10,0:12,9,11,0
chr6	157495951	.	AT	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.309:29:8,0:9,9:16,4,8,1
chr6	157496158	.	T	TG	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=102,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=37.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,13:0.248:55:19,0:23,13:10,32,0,13
chr6	157507456	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=184,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr6	157507504	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,1:7,2:13,3,1,2
chr6	157507698	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=123,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,2:8,1:9,12,2,1
chr6	157522360	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=202,191;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,3:8,2:8,7,4,1
chr6	157528106	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=195,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:9,0:9,2:6,12,2,0
chr6	158013897	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=205,295;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:4,6,1,4
chr6	158014255	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=180,280;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0,6,0,5
chr6	158068481	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=196,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr6	158074504	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	158093660	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,4:0|1:158093660_CA_C:158093660:0,0,8,0
chr6	158093664	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,3:0|1:158093660_CA_C:158093660:0,0,8,0
chr6	158093669	.	CG	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=102,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:0,0:0,2:0|1:158093660_CA_C:158093660:0,1,8,0
chr6	158093673	.	CGTG	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=102,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:1,0:0,5:0|1:158093660_CA_C:158093660:0,3,7,0
chr6	158093679	.	CTGT	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=102,160;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:2,1:1,4:0|1:158093660_CA_C:158093660:0,3,6,0
chr6	158294104	.	CT	C,CTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,21,26;MFRL=178,159,99;MMQ=60,60,54;MPOS=8,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=3.23,3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.299,0.299:7:2,0,1:1,1,0:3,0,1,3
chr6	158322886	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,278;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.361:11:2,1:2,2:7,0,3,1
chr6	158361899	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=209,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,7:1,6:1,2,9,4
chr6	158438933	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr6	158450118	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=16,31;MFRL=168,167;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:1,1:0|1:158450118_T_TG:158450118:0,3,0,2
chr6	158450121	.	T	TCTCCTGCAGAGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=168,167;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:158450118_T_TG:158450118:0,3,0,2
chr6	158486110	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0|1:158486110_C_T:158486110:0,0,0,2
chr6	158486113	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=192,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:158486110_C_T:158486110:0,1,0,1
chr6	158486116	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=192,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:158486110_C_T:158486110:0,1,0,1
chr6	158487406	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	158492839	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:2,11,0,2
chr6	158499097	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=162,219;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr6	158502137	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=67,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:6,1:1,3:5,3,4,0
chr6	158502590	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr6	158504981	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,3:2,2:2,0,3,2
chr6	158514214	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=226,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:158514214_T_C:158514214:0,4,0,1
chr6	158514222	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=226,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:158514214_T_C:158514214:0,4,0,1
chr6	158514226	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=226,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:158514214_T_C:158514214:0,4,0,1
chr6	158535688	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=123,70;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:2,3:8,0:6,4,2,1
chr6	158535720	.	T	TTATAAAATGAGATAATACATTCAAGGAA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=179,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATAAAATGAGATAATACATTCAAGGAA;STR;TLOD=56.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.743:18:1,3:3,5:1,3,5,9
chr6	158549039	.	T	TAAA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,209;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=27,30;RU=A;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:158549039_T_TAAA:158549039:0,0,2,0
chr6	158549067	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,15;MFRL=99,209;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:158549039_T_TAAA:158549039:1,0,2,0
chr6	158549074	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,10;MFRL=99,246;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:158549039_T_TAAA:158549039:1,0,1,0
chr6	158549077	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,15;MFRL=99,246;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:158549039_T_TAAA:158549039:1,0,1,0
chr6	158549079	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,15;MFRL=159,246;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:158549039_T_TAAA:158549039:2,0,1,0
chr6	158549081	.	TC	AA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,15;MFRL=159,246;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:158549039_T_TAAA:158549039:2,0,1,0
chr6	158549086	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,16;MFRL=159,246;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:2,0:0|1:158549039_T_TAAA:158549039:2,0,1,0
chr6	158569886	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,5:4,1:4,1,4,2
chr6	158571641	.	A	AACAG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=207,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:6,2:0|1:158571641_A_AACAG:158571641:0,8,1,1
chr6	158571642	.	T	TCACTATTTCCATC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=207,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:6,2:0|1:158571641_A_AACAG:158571641:0,8,1,1
chr6	158571643	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=207,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:2,0:6,1:0|1:158571641_A_AACAG:158571641:0,8,1,1
chr6	158571655	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=205,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:0,4,0,3
chr6	158579237	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	158873376	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=169,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,4:4,1:0,7,0,5
chr6	158882836	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=142,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:0,7,0,4
chr6	158910543	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=136,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,2,1
chr6	158994577	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,6,12
chr6	159002119	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=169,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr6	159026194	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr6	159028203	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr6	159046076	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=179,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:1,1:0,8:1,0,7,2
chr6	159050943	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=223,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr6	159058589	.	ACCT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=187,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:1,5:6,4:3,4,7,2
chr6	159146622	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:12,0:11,2:17,7,1,1
chr6	159146690	.	CTTTTTTTG	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTTTTG;STR;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,2:5,3:3,9,1,4
chr6	159184462	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=110,182;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:3,4:5,4:3,5,4,4
chr6	159187877	.	GAC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=192,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:1,2:8,0,5,0
chr6	159188128	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=186,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:6,9:3,4:3,6,6,7
chr6	159188282	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:4,6,2,2
chr6	159191788	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:8,5:8,2:7,9,4,3
chr6	159192214	.	T	TGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=152,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:3,0,4,1
chr6	159197371	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:7,0,2,0
chr6	159204786	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=238,251;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0,4,0,5
chr6	159205632	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,2:3,6:8,1,5,3
chr6	159205668	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=168,107;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:9,7:8,8:12,5,8,7
chr6	159206251	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=194,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:4,0,4,0
chr6	159316430	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=201,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr6	159402038	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=171,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0,5,0,2
chr6	159646853	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=206,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr6	159647449	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=125,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,3:7,0:11,1,3,0
chr6	159653330	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=254,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,1:6,2:3,8,2,1
chr6	159657195	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr6	159659523	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr6	159660779	.	GCCACCACCCGCCGCACGA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCACCACCCGCCGCACGA;STR;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.917:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr6	159660879	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr6	159670276	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	159670303	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	159670309	.	GCATT	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=237,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:159670309_GCATT_G:159670309:0,4,0,1
chr6	159670315	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=237,172;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:159670309_GCATT_G:159670309:0,4,0,1
chr6	159677498	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,4:2,5:5,3,6,3
chr6	159682198	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=129,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0|1:159682198_A_G:159682198:0,1,2,0
chr6	159682206	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0|1:159682198_A_G:159682198:0,0,4,2
chr6	159689004	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=158,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:0,6,1,3
chr6	159689049	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=164,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr6	159692321	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=109,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:4,2,7,1
chr6	160106088	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=281,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,2:2,3:1,1,0,5
chr6	160106125	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=277,255;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr6	160114311	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=175,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,3:1,0:0,5,0,3
chr6	160174456	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=186,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,22:0.886:24:0,14:2,8:2,0,16,6
chr6	160188125	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=114,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:13,4:8,0:8,13,4,0
chr6	160199687	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,9:1,6:0,1,11,4
chr6	160201677	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr6	160202167	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr6	160207049	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=249,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:1,7:1,2:0,2,3,6
chr6	160208918	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,3:8,0:7,10,0,3
chr6	160211554	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=70.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,16,6
chr6	160211636	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,13,15
chr6	160211645	.	GGTT	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=118.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,15,13
chr6	160211728	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr6	160218605	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr6	160221475	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	160221488	.	G	GTGATTGCATATCAATGTGAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	160221690	.	GCTT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=206,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,3:1,6:1,0,8,1
chr6	160224346	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,3,6
chr6	160225559	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=58.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,11,5
chr6	160229889	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=185,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.813:19:1,10:2,6:3,0,9,7
chr6	160232921	.	GTTTTGT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,53;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	160234796	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=200,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr6	160236976	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:2,1,4,0
chr6	160237489	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	160237662	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.733:5:0,0:1,2:1,0,0,4
chr6	160237741	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=171,191;MMQ=60,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:160237741_T_A:160237741:0,4,0,1
chr6	160237745	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=177,191;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:160237741_T_A:160237741:0,3,0,1
chr6	160237751	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=197,191;MMQ=60,46;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:160237741_T_A:160237741:0,2,0,1
chr6	160239712	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:3,5:4,5:4,4,3,7
chr6	160328247	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:0|1:160328247_T_A:160328247:8,4,1,1
chr6	160328254	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=132,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:3,2:0|1:160328247_T_A:160328247:7,4,1,1
chr6	160328255	.	GAC	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=132,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,0:3,2:0|1:160328247_T_A:160328247:7,4,1,1
chr6	160328258	.	T	TTG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=149,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:7,0:3,2:0|1:160328247_T_A:160328247:6,4,1,1
chr6	160453561	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=180,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,5:1,7:2,1,8,4
chr6	160464289	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=215,145;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,38:0.867:43:4,23:1,15:2,3,25,13
chr6	160465486	.	TTGTC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=219,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,1:4,2:9,2,3,0
chr6	160465753	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=300,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0,1,0,7
chr6	160468383	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=213,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,1,2
chr6	160479051	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=105,231;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.270:35:11,9:15,0:14,12,9,0
chr6	160479882	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=269,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr6	160481537	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,2:5,3:5,3,3,2
chr6	160483635	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=107,170;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.265:31:14,0:9,7:8,15,0,8
chr6	160489215	.	CAG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=246,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=46.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.863:12:0,5:1,6:1,0,7,4
chr6	160492930	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:11,3:7,1:11,7,3,1
chr6	160499277	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,3:11,0:13,7,2,1
chr6	160524671	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=208,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr6	160524946	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=215,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:8,0:3,8:0,11,0,8
chr6	160553230	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,0:5,2:6,3,2,0
chr6	160553238	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=108,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,2:5,4:4,5,5,1
chr6	160557569	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=234,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:4,4,3,0
chr6	160560742	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=155,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,2:10,0:8,15,1,1
chr6	160560845	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=191,178;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:1,4:2,8:1,2,5,7
chr6	160560880	.	CATG	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=180,259;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,1:3,2:1,7,2,2
chr6	160560897	.	CTGGTAAGT	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=183,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGTAAGT;STR;TLOD=40.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,4:0,6:0,4,1,9
chr6	160560933	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=282,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:1,7,1,3
chr6	160564476	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=187,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr6	160575985	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,0:1,5:0,2,0,5
chr6	160576953	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=206,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,7:9,0:13,2,7,0
chr6	160579527	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=118,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,3:0,4:3,1,6,1
chr6	160645750	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,1:10,1:13,6,1,1
chr6	160663230	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=233,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr6	160666660	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=202,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr6	160668186	.	CCT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=219,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:2,2,1,3
chr6	160668389	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=208,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr6	160670178	.	TAAGG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=180,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGG;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr6	160670378	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:18,0:12,3:14,16,0,3
chr6	160670494	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr6	160671500	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,4,1
chr6	160831939	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=191,240;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr6	160857762	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr6	160868701	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=273,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:0,3:2,3:2,0,4,2
chr6	160962135	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,4:5,1:6,4,3,2
chr6	160966409	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=208,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.533:11:2,5:3,1:5,0,5,1
chr6	160966603	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=142,40777;MMQ=60,35;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:1,7,0,2
chr6	160968929	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=179,196;MMQ=51,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:3,1:2,4,0,2
chr6	160969738	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=200,79;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,3:7,1:2,8,0,4
chr6	160978442	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=210,196;MMQ=52,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:5,4,1,1
chr6	161007538	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=120,221;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,1:9,1:9,5,1,1
chr6	161010554	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,3:4,0:3,6,2,1
chr6	161010766	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=125,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:3,3,0,3
chr6	161012101	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=178,114;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:13,0:7,6:9,11,0,6
chr6	161071303	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:8,1,2,0
chr6	161071623	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=224,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr6	161128922	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=127,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:3,2:2,3:0,6,1,4
chr6	161137663	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=186,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,2:6,2:7,3,3,1
chr6	161143376	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:4,1,3,0
chr6	161143608	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=117,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:5,2:8,5:3,10,3,4
chr6	161143634	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=152,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:1,4,1,3
chr6	161152294	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=245,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:2,1,0,3
chr6	161154932	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=260,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,0:1,0:5,0,1,0
chr6	161154955	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=121,277;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr6	161160083	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,174;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,7:0,4:0,1,7,4
chr6	161502094	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,5:3,4:2,3,4,5
chr6	161509003	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr6	161514114	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=147,215;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:6,0:3,4:1,8,0,5
chr6	161514173	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=221,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr6	161519350	.	CCTG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=CTG;STR;TLOD=35.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.931:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr6	161527831	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr6	161531006	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,0,17
chr6	161532855	.	CT	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=257,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=103.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,34:0.947:35:1,14:0,20:0,1,19,15
chr6	161557703	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr6	161565305	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,66;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.434:14:8,1:0,5:1,7,3,3
chr6	161574367	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=196,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:8,2,0,3
chr6	161586840	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=242,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	161771219	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=161,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:13,2:8,2:11,10,2,2
chr6	161990483	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=166,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,2:3,6:0,6,2,6
chr6	161990516	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:0,4,0,6
chr6	162622304	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,227;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:1,5,1,1
chr6	162864317	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:3,4:1,1:3,1,4,1
chr6	163235158	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=183,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:1,2:4,1:6,0,3,0
chr6	163836376	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:1,9,0,2
chr6	163899794	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=207,250;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:4,1:4,3:6,2,4,0
chr6	165693624	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=225,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:0,3,2,3
chr6	165695049	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=106,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:6,3,0,2
chr6	165806114	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,0:6,4:5,5,2,2
chr6	165809963	.	CA	C,CAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34,35;MFRL=103,72,163;MMQ=60,60,60;MPOS=29,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.24,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,2:0.206,0.206:12:2,1,0:6,1,2:3,5,0,4
chr6	165827194	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,3:1,3:1,1,1,5
chr6	165863695	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0,0,6,3
chr6	165989776	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	166075362	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	166075428	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=89,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.250:34:1,0:25,8:21,5,0,8
chr6	166572005	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=204,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.646:12:1,3:2,5:1,3,5,3
chr6	166574246	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=347,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr6	166721424	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=170,243;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr6	166736235	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,2,1
chr6	166736362	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,4:7,2:8,7,2,4
chr6	166737980	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=188,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:4,6:6,9:7,3,10,5
chr6	166741921	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=180,224;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr6	166743760	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=148,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:1,3,1,5
chr6	166796433	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr6	166831694	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=83,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,5:2,1:5,4,2,4
chr6	166844057	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:5,6,1,1
chr6	166862136	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.891:7:0,2:0,3:0,0,7,0
chr6	166862308	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=216,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,0:7,3:10,5,2,1
chr6	166862431	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=211,237;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:8,1:4,1:0,12,0,2
chr6	166889160	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=189,390;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr6	166889331	.	CAG	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:13,0:4,5:7,12,3,2
chr6	166922813	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:8,3,2,0
chr6	167352104	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=218,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr6	167352564	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=258,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:167352564_G_A:167352564:0,2,0,1
chr6	167352573	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=258,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:167352564_G_A:167352564:0,2,0,1
chr6	167360104	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,2,1
chr6	167365862	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=190,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:4,0,5,0
chr6	167369748	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:167369748_C_T:167369748:0,0,0,1
chr6	167369751	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:167369748_C_T:167369748:0,0,0,1
chr6	167427114	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=171,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:6,3:1,2:2,5,3,2
chr6	167447489	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=85,240;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.449:5:1,1:2,1:1,2,1,1
chr6	167453519	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=187,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:2,2:2,1:1,3,0,3
chr6	167453529	.	T	TCTC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=230,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:1,9,0,2
chr6	167549477	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=213,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr6	167590454	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=151,110;MMQ=39,21;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,0:3,3:2,3,3,0
chr6	167592464	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	167592656	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr6	167595183	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,216;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	167595326	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,191332;MMQ=27,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:8,5:3,0:6,5,5,0
chr6	167595418	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,126;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:1,3,0,3
chr6	167704944	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=61,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.815:14:1,7:1,5:2,0,8,4
chr6	167709501	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.634:20:3,5:4,7:5,2,9,4
chr6	167711418	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,1:7,4:9,2,4,1
chr6	167728640	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=177,136;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:3,1:4,2:7,0,2,1
chr6	167728900	.	TC	CG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=179,143;MMQ=60,33;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:10,1:6,12,2,0
chr6	167752312	.	GTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=148,53;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,4;RU=TTCC;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.373:7:2,0:3,2:0|1:167752312_GTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC_G:167752312:1,4,1,1
chr6	167752345	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,35;MFRL=53,167;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.328:4:0,0:3,1:1|0:167752312_GTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC_G:167752312:1,2,0,1
chr6	167752359	.	C	CTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=53,167;MMQ=60,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:167752312_GTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC_G:167752312:1,1,0,1
chr6	167754439	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=156,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,0:15,2:4,19,0,2
chr6	167754764	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:8,5,1,1
chr6	167786643	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=171,166;MMQ=27,39;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,0:10,2:12,5,2,0
chr6	167789615	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,238;MMQ=52,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:4,3,1,3
chr6	167791406	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=159,144;MMQ=34,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,1:3,2:6,2,3,0
chr6	167791536	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=92,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,7:4,1:2,3,3,5
chr6	167796415	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,3,4
chr6	168298875	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,13,7
chr6	168316118	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=141,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:0,4:4,8:2,2,6,6
chr6	168319356	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=117,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr6	168348504	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=138,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.515:6:1,3:1,0:3,0,2,1
chr6	168349011	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=96,267;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:4,3:13,2:9,8,2,3
chr6	168377695	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=199,136;MMQ=60,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr6	168440639	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr6	168440829	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=190,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,2:1,0:1,5,2,0
chr6	168458074	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=174,255;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,3:1,2:0,2,1,5
chr6	168466504	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr6	168468098	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=176,95;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:9,0:11,9:11,9,9,0
chr6	168468186	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:1,2:3,5:2,2,1,6
chr6	168475822	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=122,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	168479790	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,3:1,1,1,7
chr6	168708027	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=223,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:168708027_G_T:168708027:2,0,1,0
chr6	168708045	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:168708027_G_T:168708027:3,0,1,0
chr6	168927213	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=204,270;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:1,6,0,3
chr6	168928225	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=176,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:1,4:2,2:3,0,7,0
chr6	168928251	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=200,256;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,3:8,0:9,2,3,0
chr6	168947956	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=235,257;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0,6,0,2
chr6	169008822	.	TC	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=165,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.555:29:11,6:1,8:2,11,10,6
chr6	169008945	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,272;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,1:9,3:5,13,1,3
chr6	169064735	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=127,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:4,5,2,0
chr6	169067074	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=128,174;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,9:0.227:42:19,9:14,0:13,20,9,0
chr6	169617934	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=262,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=42.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.855:18:1,5:1,11:1,1,9,7
chr6	169620247	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr6	169622263	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=195,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr6	169626218	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=137,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.394:8:0,0:3,1:4,1,3,0
chr6	169628169	.	CAA	C,CA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=17,34,33;MFRL=75,67,225;MMQ=60,60,60;MPOS=16,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.59,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.299,0.351:6:0,2,2:0,0,0:0,2,4,0
chr6	169628245	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:20,3:12,1:18,14,1,3
chr6	169628284	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:17,3:9,0:12,14,0,3
chr6	169629783	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=222,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:6,4:3,4:1,8,5,5
chr6	169634809	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=153,235;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:9,8,2,0
chr6	169635010	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=166,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,3:4,1:2,6,1,3
chr6	169635020	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=173,253;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,2:3,1:2,7,1,2
chr6	169637763	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=198,182;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,2:2,1:1,6,1,2
chr6	169640529	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,3:7,2:8,7,2,3
chr6	169646202	.	GCACACACATACACA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:2,3:2,1:8,0,4,0
chr6	169982927	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=223,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.223:25:11,3:8,2:16,4,5,0
chr6	170038674	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:8,4:13,5:10,11,4,5
chr6	170049421	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:4,3:1,0:1,4,2,1
chr6	170059145	.	AAC	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=175,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:6,1:6,2:9,3,2,1
chr6	170059234	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=205,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:9,3:7,2:10,6,2,3
chr6	170068025	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=180,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:1,0:5,1,2,0
chr6	170068058	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=167,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:5,4,2,0
chr6	170103140	.	CCA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:10,3:6,5:9,7,6,2
chr6	170103636	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,2:7,2:6,8,1,3
chr6	170103943	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=205,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,4:5,4:6,6,2,6
chr6	170106419	.	CTT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=122,243;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:5,3:9,2:6,8,2,3
chr6	170115779	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,3:6,2:9,3,2,3
chr6	170118085	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr6	170155331	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,4:6,5:11,1,6,3
chr6	170159023	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=225,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,8:1,5:2,0,12,1
chr6	170160870	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=137,247;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,0:8,2:9,10,0,2
chr6	170162515	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=167,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:7,1:5,2:8,4,2,2
chr6	170169819	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=209,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:1,9,0,2
chr6	170176407	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=104,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,1:2,0,6,0
chr6	170176787	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=151,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:1,4,1,5
chr6	170176847	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=151,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	170181708	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	170594819	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,5,6
chr6	170595430	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,1,8
chr6	170627651	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.783:17:3,5:0,3:1,2,8,6
chr6	170632383	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=196,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:12,2:4,0:2,14,1,1
chr6	170844377	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=187,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:9,10,1,1
chr6	170858045	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=149,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:4,2,5,1
chr6	170871013	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=233,199;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.347:22:7,4:8,3:9,6,5,2
chr6	170871046	.	ACAG	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,237;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=CAG;STR;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.878:3:0,0:0,2:0,0,1,2
chr6	170876017	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=146,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:7,2,2,0
chr6	170888012	.	T	TCTTTGG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=160,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:8,2:3,0:0|1:170888012_T_TCTTTGG:170888012:4,7,1,1
chr6	170888014	.	A	ATTCAGTTGAG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=160,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:8,1:3,0:0|1:170888012_T_TCTTTGG:170888012:4,7,1,1
chr6	170892100	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:0,8:1,8:0,1,10,6
chr6	170892848	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,1:4,4:0,7,0,5
chr6	170892919	.	T	TACTC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=258,248;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr7	197316	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=228,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.230:14:7,1:4,1:6,5,0,3
chr7	197535	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr7	538191	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=144,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,2:11,0:10,7,0,2
chr7	538277	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,2:3,0:0|1:538277_G_C:538277:2,6,1,2
chr7	538284	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=166,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,2:3,2:0|1:538277_G_C:538277:1,6,1,3
chr7	538348	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,1,1
chr7	551946	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr7	591125	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=166,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:6,12,0,2
chr7	618855	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,2:2,4:3,3,4,2
chr7	618869	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,3:4,5:4,4,5,3
chr7	646958	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=185,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.213:17:4,1:9,2:10,4,3,0
chr7	751220	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr7	780980	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,11:0,3:0,0,9,5
chr7	794471	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr7	794549	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:794549_TA_T:794549:0,1,0,1
chr7	794551	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:794549_TA_T:794549:0,1,0,1
chr7	796692	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=0,383;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:796692_C_T:796692:0,1,0,1
chr7	796700	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=0,383;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:796692_C_T:796692:0,2,0,1
chr7	803342	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	808749	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=216,206;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,6:3,1:7,1,6,1
chr7	813618	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr7	813650	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,6:0,0,12,4
chr7	813867	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,0,7
chr7	814612	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=75.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,7:0,18:0,0,17,8
chr7	825114	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr7	881858	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr7	882601	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:24,4:16,0:17,23,4,0
chr7	882829	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.321:16:4,2:6,3:8,3,3,2
chr7	890978	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=252,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.816:14:1,6:1,6:0,2,11,1
chr7	891184	.	C	CGAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=191,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAT;STR;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,2:0,4:0,3,0,6
chr7	899710	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr7	905786	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=263,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr7	912755	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=209,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:2,4:0,4:2,0,8,0
chr7	926962	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=171,138;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.190:33:16,0:11,5:0|1:926962_G_A:926962:18,9,6,0
chr7	926970	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=140,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:26,6:0.205:32:14,2:12,4:1|0:926962_G_A:926962:19,7,5,1
chr7	939896	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,22;MFRL=257,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:939896_C_T:939896:0,4,0,1
chr7	939903	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=257,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:939896_C_T:939896:0,4,0,1
chr7	939909	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=257,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:939896_C_T:939896:0,4,0,1
chr7	939915	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=257,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:939896_C_T:939896:0,4,0,1
chr7	940258	.	G	GGGCAAAGGCA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=176,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:1,9:2,6:1,2,8,8
chr7	940267	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=176,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=71.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.820:20:1,11:2,6:1,2,9,8
chr7	940296	.	AGCGCTGGGGTCCCCACAGAG	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=229,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.473:11:1,3:2,2:1,5,1,4
chr7	940298	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=370,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.842:10:1,5:0,4:0,1,3,6
chr7	940501	.	AGAAGGGCC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=390,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAAGGGCC;STR;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,1:0,4:1,0,7,0
chr7	940724	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=223,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.826:9:1,3:0,5:0,1,2,6
chr7	943998	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=200,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr7	944683	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr7	974905	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=210,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:4,1,3,3
chr7	974960	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=279,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:1,1,4,2
chr7	974987	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,17;MFRL=170,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.442:9:1,0:2,0:0|1:974987_C_G:974987:0,5,4,0
chr7	974998	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,0:0|1:974987_C_G:974987:0,5,2,0
chr7	1012822	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=176,134;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,3:7,0:10,3,3,0
chr7	1131356	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=124,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.366:20:6,4:6,3:9,4,3,4
chr7	1132394	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,2:12,0:14,7,2,0
chr7	1195089	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,109;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,0:4,2:10,4,0,2
chr7	1481919	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0|1:1481919_C_A:1481919:0,0,4,5
chr7	1481936	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=186,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:0|1:1481919_C_A:1481919:4,7,2,0
chr7	1482101	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=137,224;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,0:11,4:4,15,2,2
chr7	1482134	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=197,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,2:9,1:2,9,0,3
chr7	1511319	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=125,269;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,2:7,1:2,6,1,2
chr7	1511964	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:7,0:5,2:5,8,1,1
chr7	1517194	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:6,1,1,1
chr7	1518336	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=239,274;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr7	1519011	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=98,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:0,2:3,0:2,1,3,0
chr7	1519892	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=229,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:7,0,2,1
chr7	1519946	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=251,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,5:3,0:5,1,4,1
chr7	1520902	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=225,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr7	1522157	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=181,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:1522157_T_C:1522157:4,1,2,0
chr7	1522175	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0|1:1522157_T_C:1522157:0,0,9,2
chr7	1523559	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=254,232;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,1,2
chr7	1526903	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=170,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:3,1,3,0
chr7	1527687	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=258,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr7	1528947	.	T	TCCCGGGCCCGCCGAGGGGACGTGCGCACTCACTTCAGGCCCTGCTCCCAGC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=57.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.887:20:5,1:0,1:5,0,9,6
chr7	1529201	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=166,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,3:9,1:14,3,2,2
chr7	1532631	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:4,0,4,1
chr7	1533556	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=176,246;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:2,3:3,0:2,7,0,3
chr7	1533566	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=112,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:4,5:1,1:2,3,0,6
chr7	1534425	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,4,2
chr7	1534593	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr7	1535051	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=120,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr7	1538499	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=175,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:3,2:10,1:2,11,2,1
chr7	1538539	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=175,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,0:4,4:1,3,2,2
chr7	1538614	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=189,175;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr7	1540049	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr7	1579908	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=136,245;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:10,6,0,2
chr7	1579998	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=163,59;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:6,0:11,3,2,0
chr7	1586662	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:6,1,2,0
chr7	1588391	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=202,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr7	1589083	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	1590368	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	1590443	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=223,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:6,0,2,2
chr7	1786938	.	C	CCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=197,253;MMQ=56,50;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=CA;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.527:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr7	1787003	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=179,50;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:2,2:1,0:3,1,2,0
chr7	1787519	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=180,238;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.416:13:3,2:3,1:4,4,3,2
chr7	1787675	.	G	GTGCACCCATCACCCGAGCAGTGTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=238,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr7	1886805	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=98,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr7	1887442	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr7	1938031	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=216,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:5,3,1,2
chr7	1976556	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=206,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,2:3,5:1,8,0,7
chr7	2054314	.	CG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,10;MFRL=153,207;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:5,1:0,0:2,3,0,3
chr7	2119447	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=181,138;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,0:9,4:4,12,0,4
chr7	2252817	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=206,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,6:6,1:7,6,5,2
chr7	2257732	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=219,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,0:6,7:2,6,0,7
chr7	2258899	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	2260482	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,1:5,1:9,3,2,0
chr7	2260499	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,5:4,4:4,2,7,2
chr7	2260715	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=221,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr7	2269552	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=264,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,4:2,4:3,0,8,0
chr7	2289586	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=204,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,2:2,3:3,5,2,3
chr7	2289710	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	2290372	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=184,289;MMQ=50,55;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr7	2290433	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=133,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,5:4,1:7,4,5,1
chr7	2290685	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr7	2296493	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,8,5
chr7	2297212	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=232,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:2,1,1,1
chr7	2304191	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr7	2314652	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=283,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr7	2317934	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:2,5,0,3
chr7	2349366	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.255:13:2,2:6,1:6,4,2,1
chr7	2349608	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:0,4,0,7
chr7	2406737	.	CAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=18,35;MFRL=199,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.351:4:0,0:1,1:1,2,0,1
chr7	2409035	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr7	2412493	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	2414142	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,16,6
chr7	2418715	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=246,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:7,2,2,1
chr7	2473747	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=141,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,3:2,1:0,8,0,4
chr7	2552881	.	AGATG	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GATG;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.207:12:5,2:2,0:5,5,1,1
chr7	2552986	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=220,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,5:2,5:3,4,4,6
chr7	2565268	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0|1:2565268_C_A:2565268:0,0,11,6
chr7	2565283	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=146,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:12,2:3,3:0|1:2565268_C_A:2565268:12,3,3,2
chr7	2587122	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=199,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:2,5,0,2
chr7	2618070	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=104,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:4,1:2,7:3,3,3,5
chr7	2621567	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=242,260;MMQ=56,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr7	2623801	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=157,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.683:10:0,2:2,5:2,1,5,2
chr7	2626038	.	CCAGGGAATGG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAGGGAATGG;STR;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:0,2:1,2:0,1,0,5
chr7	2627578	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=166,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:1,4,2,1
chr7	2632724	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,98;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.193:34:10,0:18,6:12,16,6,0
chr7	2634449	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:2634449_A_C:2634449:0,1,1,0
chr7	2634453	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:2634449_A_C:2634449:0,1,1,0
chr7	2638278	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=173,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:2,11,1,1
chr7	2638347	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=243,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0,6,0,4
chr7	2640985	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=124,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.463:9:0,3:4,1:4,1,2,2
chr7	2641059	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:3,0:3,5:5,3,5,0
chr7	2646723	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,4:3,6:5,4,7,3
chr7	2647048	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=240,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:3,1:0,5,0,3
chr7	2647058	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=226,249;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr7	2649673	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:10,8,1,1
chr7	2649704	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:7,4:12,0:10,9,3,1
chr7	2686737	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=191,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr7	2686761	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:3,3:2,4:5,0,4,3
chr7	2687160	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=227,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr7	2689472	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,5,1
chr7	2691736	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:0,2:4,2:3,1,3,1
chr7	2696067	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,0:6,2:10,6,0,2
chr7	2696189	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:2,5,0,2
chr7	2699687	.	C	CG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=58.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,6,13
chr7	2773035	.	C	CAT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=172,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.692:24:5,7:2,8:5,2,12,5
chr7	2834869	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=238,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr7	2853995	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=187,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:8,5:9,4:7,10,5,4
chr7	2854010	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=184,105;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:6,7:10,4:7,9,4,7
chr7	2946552	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr7	2954801	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr7	2955097	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=240,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr7	2958298	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=306,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr7	2958986	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:16,2:5,0:15,6,1,1
chr7	2962241	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:1,1,6,1
chr7	2985361	.	GACAC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=AC;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	3179968	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:3179968_T_G:3179968:0,0,0,6
chr7	3179973	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,0:0,5:0|1:3179968_T_G:3179968:0,0,0,5
chr7	3179991	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr7	3180550	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=17,26;MFRL=334,261;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,1:0,0:1,0,2,0
chr7	3180657	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,10,7
chr7	3188513	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	3188549	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	3188576	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	3188712	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=93.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,10,16
chr7	3188738	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,5,12
chr7	3991646	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=266,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,2:6,3:0,12,0,5
chr7	4002204	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=212,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr7	4002375	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=204,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.332:28:11,5:8,4:9,10,4,5
chr7	4119285	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=156,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:0,6,1,3
chr7	4152863	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=210,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,0:5,4:8,2,4,0
chr7	4153647	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=156,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,0:4,2:8,3,1,1
chr7	4166959	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=264,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr7	4185313	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,10:6,0:10,2,0,11
chr7	4185592	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=218,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:2,6,2,4
chr7	4189020	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=196,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:5,4,1,1
chr7	4214046	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=247,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,2,1
chr7	4259708	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=204,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:8,4:2,4:10,0,6,2
chr7	4259953	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=243,200;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr7	4259989	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=224,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:0,4,0,3
chr7	4272845	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=221,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:3,1,1,1
chr7	4277443	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=190,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:6,2:3,0:3,7,0,2
chr7	4795076	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=216,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:0,9,0,2
chr7	4827497	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4827497_C_A:4827497:0,0,0,1
chr7	4827498	.	CG	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4827497_C_A:4827497:0,0,0,1
chr7	4827500	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4827497_C_A:4827497:0,0,0,1
chr7	4827508	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4827497_C_A:4827497:0,0,0,1
chr7	4830103	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=110,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:7,8,1,1
chr7	4831061	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,1:9,1:5,15,1,1
chr7	4839163	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,1:4,1:5,3,0,2
chr7	4839993	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=247,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr7	4841470	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr7	4843244	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:4,3,1,1
chr7	4871879	.	C	CAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=187,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:3,4,1,3
chr7	4946973	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,8,3
chr7	4946983	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=247,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,2:7,2:6,3,3,1
chr7	4947013	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=237,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:4,4:8,3:8,4,5,2
chr7	5026170	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,217;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	5104833	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=215,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:8,2:4,1:8,4,3,0
chr7	5112108	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=168,232;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:3,7,0,2
chr7	5232881	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr7	5239319	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=226,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.497:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr7	5257490	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,15,2
chr7	5262385	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,4:5,2:1,8,0,6
chr7	5267911	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=200,262;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr7	5269424	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=225,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:1,3:0,3,0,7
chr7	5327680	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,7:0,6:0,0,2,12
chr7	5331307	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,246;MMQ=60,28;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	5334378	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	5334469	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=118,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.406:20:7,3:5,5:9,3,7,1
chr7	5334472	.	CCT	C,CCTCT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,34,34;MFRL=100,132,227;MMQ=60,60,60;MPOS=25,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,6,8;RU=CT;STR;TLOD=4.87,24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,7:0.146,0.364:18:5,1,3:4,1,4:6,3,8,1
chr7	5334636	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=128,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr7	5336855	.	TCCCTTCTCTGTC	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=244,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCTTCTCTGTC;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.407:3:1,1:1,0:0|1:5336855_TCCCTTCTCTGTC_T:5336855:0,2,0,1
chr7	5336885	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=226,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:0|1:5336855_TCCCTTCTCTGTC_T:5336855:0,1,0,4
chr7	5338770	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=231,253;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,3:3,0:1,3,1,2
chr7	5340002	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	5342413	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,184;MMQ=60,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,1:9,1:4,15,2,0
chr7	5348468	.	T	TGC	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=27,15;MFRL=157,281;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.442:7:1,1:3,0:0|1:5348468_T_TGC:5348468:1,3,3,0
chr7	5348472	.	CAA	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.453:9:1,1:3,2:0|1:5348468_T_TGC:5348468:1,4,4,0
chr7	5348478	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=34,22;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.453:9:2,0:2,2:0|1:5348468_T_TGC:5348468:1,4,4,0
chr7	5348482	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=27,29;MFRL=165,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.499:8:2,1:2,2:0|1:5348468_T_TGC:5348468:0,4,4,0
chr7	5348485	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=156,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.383:11:2,1:2,2:0|1:5348468_T_TGC:5348468:3,4,4,0
chr7	5348488	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=155,220;MMQ=55,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.253:10:3,0:4,2:0|1:5348468_T_TGC:5348468:3,5,2,0
chr7	5348491	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=156,220;MMQ=50,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:3,0:4,2:0|1:5348468_T_TGC:5348468:4,5,2,0
chr7	5369489	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,4:3,2:3,0,5,1
chr7	5369522	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=255,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,7:1,6:0,1,8,5
chr7	5391424	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=164,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.318:23:9,6:7,1:11,5,3,4
chr7	5396459	.	GGC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=325,293;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr7	5396955	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=231,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr7	5401688	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:5401688_G_A:5401688:0,1,0,1
chr7	5401691	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:5401688_G_A:5401688:0,1,0,1
chr7	5410425	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=291,154;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:1,1,4,2
chr7	5416947	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,0:0|1:5416947_G_C:5416947:0,1,3,0
chr7	5416953	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,0:0|1:5416947_G_C:5416947:0,1,3,0
chr7	5416957	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,22;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0|1:5416947_G_C:5416947:0,1,3,0
chr7	5416960	.	C	CCCCA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0|1:5416947_G_C:5416947:0,1,3,0
chr7	5416962	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,0:0|1:5416947_G_C:5416947:0,1,3,0
chr7	5430283	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=181,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,4:2,6:1,2,1,9
chr7	5487458	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,9,7
chr7	5529758	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=174,154;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.515:25:5,5:7,7:1,11,3,10
chr7	5529922	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=268,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr7	5530782	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr7	5530827	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=174,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:0,1:8,3:4,4,3,1
chr7	5540769	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,14,5
chr7	5567596	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.257:33:15,3:10,5:12,13,3,5
chr7	5568366	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.249:25:9,3:10,2:5,14,1,5
chr7	5569327	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,2:3,3:4,5,4,1
chr7	5642987	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=144,235;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,3:3,1:6,3,2,2
chr7	5662647	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=152,106;MMQ=60,55;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:12,0:17,3:0|1:5662647_C_T:5662647:22,8,0,3
chr7	5662653	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=151,106;MMQ=60,55;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:13,0:19,3:0|1:5662647_C_T:5662647:22,10,0,3
chr7	5662658	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=150,106;MMQ=60,55;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.105:36:12,0:18,3:0|1:5662647_C_T:5662647:23,10,0,3
chr7	5752513	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=190,117;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:9,0:7,6:3,14,0,6
chr7	5760860	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=220,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	5780537	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=258,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:4,1:0,0:5,1,2,0
chr7	5800769	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	5920406	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr7	5923682	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=122,209;MMQ=27,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:2,3,0,2
chr7	5941209	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=172,147;MMQ=47,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:6,2,2,3
chr7	5941354	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=158,111;MMQ=30,39;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:8,6:4,2:5,7,4,4
chr7	5941411	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=177,112;MMQ=49,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:1,6,2,3
chr7	5944687	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=199,186;MMQ=45,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:4,3,1,5
chr7	5944913	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=301,247;MMQ=34,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,0,2
chr7	5958650	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=156,132;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr7	5959661	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,137;MMQ=27,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,1:2,1:0,8,0,2
chr7	5965214	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=178,170;MMQ=27,26;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,2:9,2:11,8,4,0
chr7	5965229	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=178,218;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,2:7,1:6,7,2,1
chr7	5965381	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=188,86;MMQ=27,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:2,0:2,3:3,1,1,2
chr7	5965398	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=158,86;MMQ=27,21;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:3,0,2,1
chr7	5967980	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=156,158;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:13,4:7,1:12,8,0,5
chr7	5968053	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=149,151;MMQ=27,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.494:8:2,3:2,1:0,4,2,2
chr7	5983195	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,36;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	6037057	.	GAAAA	G,GA,GAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=10,36,16,19;MFRL=103,138,184,146;MMQ=60,60,60,60;MPOS=27,18,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,13,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.62,3.20,4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,2,4,5:0.125,0.225,0.386:15:0,2,1,0:1,0,1,2:1,3,3,8
chr7	6038722	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,2:4,5:1,3,2,5
chr7	6038998	.	AC	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr7	6055081	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:0,5,1,1
chr7	6062926	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=18,15;MFRL=268,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,0:1,0:3,0,3,0
chr7	6062931	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=18,17;MFRL=302,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:0,0:2,0,3,0
chr7	6064470	.	CT	C,CTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,20,17;MFRL=239,161,215;MMQ=60,60,50;MPOS=21,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=T;STR;TLOD=3.09,3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.443,0.333:6:1,1,0:0,1,0:0,1,0,5
chr7	6066057	.	G	GC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:5,6:6,6:5,6,6,7
chr7	6071277	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=122,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,3:0,6:0,1,0,9
chr7	6076963	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:2,3:7,0:9,0,3,0
chr7	6078376	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=153,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr7	6084310	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=231,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,6:1,3:0,3,0,9
chr7	6088339	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,35;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:0,3:2,3:0|1:6088339_T_C:6088339:2,0,5,2
chr7	6088349	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:0,4:3,2:0|1:6088339_T_C:6088339:3,0,4,2
chr7	6088533	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,0:5,4:0,5,0,4
chr7	6156411	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=172,85;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:16,3:7,0:9,14,4,0
chr7	6175633	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=192,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.615:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr7	6185194	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,0:10,2:8,7,2,0
chr7	6185680	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6185680_G_T:6185680:0,0,1,0
chr7	6185683	.	A	ACC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,127;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:6185680_G_T:6185680:0,0,1,0
chr7	6185686	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6185680_G_T:6185680:0,0,1,0
chr7	6185968	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=267,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr7	6189717	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=146,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.362:23:4,7:10,1:8,7,3,5
chr7	6189750	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=194,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,7:4,2:4,4,3,6
chr7	6189780	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:7,1:5,2:5,8,2,1
chr7	6193464	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr7	6193521	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=207,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,1,3
chr7	6194429	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,1:5,1:0,9,0,2
chr7	6204498	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=188,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:5,1,1,1
chr7	6210444	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=202,245;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:6,3,0,2
chr7	6213396	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:1,5,2,2
chr7	6230059	.	GTT	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=138,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:1,0:4,1,1,0
chr7	6230097	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=95,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,0:2,8,2,0
chr7	6230210	.	A	ATGAATTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	6230269	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,357;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	6442142	.	AC	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=172,109;MMQ=39,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.420:5:1,1:2,0:0,3,0,2
chr7	6470296	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=111,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:0|1:6470296_A_T:6470296:1,4,0,2
chr7	6470299	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=111,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,1:4,1:0|1:6470296_A_T:6470296:1,4,0,2
chr7	6470331	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	6474362	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:9,9:7,0:12,4,9,0
chr7	6476180	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,2:7,0:3,10,2,0
chr7	6485740	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:0,0:6,2:0,7,1,2
chr7	6487293	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr7	6513779	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:7,1,4,0
chr7	6522129	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=227,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:6,3:3,5:6,3,4,5
chr7	6537566	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=227,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:4,2:4,2,3,1
chr7	6537913	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=193,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chr7	6541347	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=158,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr7	6542532	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,142;MMQ=60,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.394:41:10,0:15,16:10,15,0,16
chr7	6545619	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=261,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr7	6550479	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=155,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:7,3,2,0
chr7	6550494	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr7	6566442	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	6628242	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=173,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:8,5:12,3:13,7,5,3
chr7	6639687	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=144,80;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,3:9,0:11,5,3,0
chr7	6639953	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:1,5,0,6
chr7	6641635	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=184,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr7	6661256	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:10,4:8,0:9,9,2,2
chr7	6661480	.	ACAG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=152,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CAG;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:9,7,1,1
chr7	6732315	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=183,108;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:5,3:9,4:5,9,1,6
chr7	6744690	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=221,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:6,2,2,0
chr7	6798742	.	G	GACTGATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=227,201;MMQ=33,33;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	6806605	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=204,244;MMQ=45,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	6845516	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=149,201;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.784:21:2,8:2,9:4,0,13,4
chr7	6845594	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=142,172;MMQ=27,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,1:5,3:3,2,1,3
chr7	6845671	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=193,205;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr7	6852522	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,181;MMQ=27,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr7	6854512	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr7	6861880	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=167,206;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:1,0,2,2
chr7	7277807	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=213,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,4:1,5:2,0,8,1
chr7	7398457	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=233,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:2,7:2,9:1,3,4,12
chr7	7400239	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=216,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	7421310	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=199,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:1,6:0,4:0,1,1,9
chr7	7459602	.	AT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=174,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:8,2:13,0:0|1:7459602_AT_A:7459602:5,21,1,1
chr7	7459606	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=174,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,2:15,0:0|1:7459602_AT_A:7459602:5,21,1,1
chr7	7472438	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=177,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr7	7480376	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=207,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.611:21:6,4:2,7:7,1,9,4
chr7	7483350	.	C	CAGGCAGTAAGTGTGGAGAGG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=160,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,2:2,0:2,9,1,1
chr7	7491873	.	AG	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr7	7493244	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=276,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr7	7528951	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0,0,8,2
chr7	7545571	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=159,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr7	7557297	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr7	7571094	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,10,14
chr7	7622696	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,14,1
chr7	7628275	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr7	7645535	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr7	7677569	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=143,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,0:9,3:8,7,0,3
chr7	7916817	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:0,2:2,3:0|1:7916817_A_G:7916817:1,1,5,1
chr7	7916824	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0|1:7916817_A_G:7916817:1,1,4,1
chr7	8043504	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=175,274;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:7,2,4,0
chr7	8110475	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=188,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,5:4,4:7,0,8,1
chr7	8110773	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=198,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,4:6,3:1,10,0,7
chr7	8125964	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=120,292;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:7,6:6,5:5,8,6,5
chr7	8126040	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=208,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:7,0:12,5:9,10,0,5
chr7	8126096	.	CCAG	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=222,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CAG;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,1:8,1:7,7,2,0
chr7	8126194	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=193,252;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,4:6,3:1,10,1,6
chr7	8181286	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=201,318;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:8,1,2,0
chr7	8181555	.	C	CCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=221,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CA;STR;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.920:10:1,4:0,4:0,1,0,9
chr7	8196529	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=199,178;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.875:22:1,6:1,14:1,1,13,7
chr7	8196559	.	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	T	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=207,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=25,6;RU=A;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:9,2:12,1:19,10,2,1
chr7	8196566	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=194,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.274:23:7,4:9,3:10,6,5,2
chr7	8196567	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.962:20:0,9:0,11:0,0,13,7
chr7	8261042	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,359;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,1:8,1:6,8,0,2
chr7	8268155	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:4,2:4,2:8,0,2,3
chr7	8790549	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=135,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr7	10973362	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=215,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:0,4,1,6
chr7	11021935	.	TTG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.302:10:3,0:3,3:7,0,3,0
chr7	11022230	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=173,211;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:2,10:4,8:2,4,14,4
chr7	11030274	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=184,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:2,1:4,0:6,0,2,0
chr7	11053282	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=157,264;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr7	11076514	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=183,251;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:8,0,2,0
chr7	11078283	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=193,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:0,2:5,0,3,0
chr7	11091425	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=141,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.347:15:7,2:3,3:1,9,1,4
chr7	11101394	.	GTT	G,GT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=142,117,161;MMQ=60,60,60;MPOS=16,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=3.11,6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,2,4:0.118,0.245:18:3,1,2:6,1,2:9,3,4,2
chr7	11208989	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=132,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:11,3,1,1
chr7	11416378	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=213,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr7	11418931	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=221,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:5,2:11,5:9,7,3,4
chr7	11419378	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=191,239;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=43.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,9:1,3:0,1,0,12
chr7	11422310	.	G	GTATT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=143,311;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATT;STR;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,1:0,4,0,3
chr7	11446769	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=225,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,1:3,2:0,10,1,2
chr7	11446902	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=162,258;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:8,2,3,0
chr7	11485591	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=235,290;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr7	11487100	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=180,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:2,3:0,6,1,2
chr7	11509438	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=95,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:9,4:1,1:0|1:11509438_A_G:11509438:7,4,4,1
chr7	11509439	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=151,74;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,3:0.209:17:11,3:3,0:1|0:11509438_A_G:11509438:9,5,2,1
chr7	11521542	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=186,120;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:8,4:9,2:11,6,3,3
chr7	11521609	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,0:9,3:9,12,0,3
chr7	11521631	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.149:22:11,0:8,2:3,16,0,3
chr7	11581003	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=151,267;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,4:6,1:10,4,4,1
chr7	11630298	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=272,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.624:22:5,11:3,3:3,5,2,12
chr7	11633193	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,1:5,5:0,8,0,6
chr7	12263799	.	TG	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,0:5,4:9,0,3,1
chr7	12269260	.	A	ATGTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=104,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,4:2,7:4,2,9,2
chr7	12270565	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=180,266;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,2:0,4:3,0,6,0
chr7	12270625	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,1:1,2:5,2,3,0
chr7	12270770	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=157,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:2,4:10,5:5,7,3,6
chr7	12271452	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=118,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:5,3:11,5:9,7,3,5
chr7	12370908	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,0:0,2:0,5,0,2
chr7	12372999	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=203,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr7	12373082	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,3:7,1:7,8,4,0
chr7	12375667	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr7	12383892	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=178,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,12:0.283:44:17,0:14,12:13,19,0,12
chr7	12383967	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.294:32:8,4:15,5:10,13,4,5
chr7	12395813	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=113,180;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,31:0.865:35:2,10:2,20:3,1,23,8
chr7	12400799	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=182,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.221:34:16,7:11,0:13,14,7,0
chr7	12414620	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:7,2,2,1
chr7	12419039	.	TCA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.885:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	12420092	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,9:0,5:0,1,10,4
chr7	12420447	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=218,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,5:1,4:0,1,0,9
chr7	12617854	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:4,4:4,4:3,5,3,5
chr7	12644334	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr7	12644348	.	G	GGT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=240,255;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=GT;STR;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr7	12644370	.	A	AGAGGTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=264,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr7	12666360	.	TAC	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=157,242;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.226:29:10,2:11,4:17,6,1,5
chr7	12684340	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr7	12684406	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=171,214;MMQ=52,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:12684406_C_T:12684406:0,4,0,1
chr7	12684415	.	CA	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=184,214;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:12684406_C_T:12684406:0,4,0,1
chr7	12684423	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,28;MFRL=181,214;MMQ=60,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:12684406_C_T:12684406:0,3,0,1
chr7	12727826	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=217,166;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:1,8:5,4:5,1,11,1
chr7	12728770	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:24,2:17,1:19,22,0,3
chr7	12729925	.	GTT	G,GT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,28,33;MFRL=186,142,160;MMQ=60,60,60;MPOS=25,16;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.37,27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,4,15:0.140,0.511:29:3,2,6:6,1,7:7,3,7,12
chr7	12730250	.	G	GT,GTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28,34;MFRL=251,145,180;MMQ=60,60,60;MPOS=20,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.42,3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.401,0.305:7:2,1,0:0,1,2:0,2,1,4
chr7	12730362	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=241,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.801:18:1,7:2,8:3,0,10,5
chr7	13950838	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=132,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:11,3:9,3:10,10,2,4
chr7	13978645	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0|1:13978645_C_T:13978645:4,0,4,0
chr7	13978648	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,1:3,3:0|1:13978645_C_T:13978645:4,0,5,0
chr7	13978809	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,5:2,3:4,3,3,5
chr7	14026357	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=64.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.810:24:4,7:0,13:0,4,9,11
chr7	14028220	.	GAA	G,GA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,35,28;MFRL=142,131,160;MMQ=60,60,60;MPOS=26,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=7.43,12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,9:0.205,0.443:21:5,3,5:0,1,0:7,1,13,0
chr7	14028245	.	G	GA	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=75.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,42:0.869:48:4,16:2,12:4,2,31,11
chr7	14188806	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=208,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.406:25:5,6:10,4:7,8,6,4
chr7	14653054	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=138,244;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:12,0:12,3:13,11,1,2
chr7	14737622	.	AAAAG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=221,199;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAAG;STR;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.674:7:1,1:1,4:2,0,5,0
chr7	14775821	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=61.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.852:18:1,11:0,5:0|1:14775821_TG_T:14775821:1,1,5,11
chr7	14775824	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=61.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.851:18:2,11:0,5:0|1:14775821_TG_T:14775821:1,1,5,11
chr7	15346196	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30,28;MFRL=163,179,159;MMQ=60,60,60;MPOS=26,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=A;STR;TLOD=4.15,6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,5:0.177,0.327:14:5,1,2:2,1,1:0,7,1,6
chr7	15405301	.	CAT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:1,3:4,1:0,5,0,4
chr7	15426956	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,285;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr7	15430259	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=183,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:2,5:7,3:7,2,5,3
chr7	15430413	.	TGTAAA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=138,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTAAA;STR;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:13,2:11,2:9,17,4,0
chr7	15430599	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=222,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	15458186	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=133,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:13,3:15,9:17,11,6,6
chr7	15458294	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.413:10:3,3:2,1:1,5,1,3
chr7	15458330	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=204,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr7	15725797	.	ATGG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=196,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TGG;STR;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.412:11:1,3:4,1:7,0,3,1
chr7	15726066	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=186,236;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.558:21:4,7:5,3:3,6,0,12
chr7	15726117	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=219,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:4,3:4,2:0,8,0,5
chr7	16131260	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr7	16255602	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr7	16317762	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,0:7,3:5,8,3,0
chr7	16317859	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr7	16317896	.	A	ATCTTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=197,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr7	16341163	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,2:7,0:0|1:16341163_C_T:16341163:0,13,1,1
chr7	16341165	.	A	AGCCT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0|1:16341163_C_T:16341163:0,13,1,1
chr7	16341168	.	A	AGTTT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0|1:16341163_C_T:16341163:0,13,1,1
chr7	16341169	.	A	AATATAG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,1:7,0:0|1:16341163_C_T:16341163:0,13,1,1
chr7	16348059	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr7	16445673	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=100,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:8,3:8,2:7,9,2,3
chr7	16460893	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=198,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:2,4:2,0:0,5,0,4
chr7	16503932	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=186,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.632:22:3,6:4,8:6,2,8,6
chr7	16505054	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:2,1:1,4:3,0,5,0
chr7	16505341	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr7	16572051	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=285,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr7	16572376	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=80,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr7	16577376	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=121,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:0,2,3,4
chr7	16597114	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=222,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:1,6,1,4
chr7	16597174	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=205,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:6,2:1,8,0,3
chr7	16598655	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=242,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:2,7:1,3:1,2,2,8
chr7	16605861	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=190,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr7	16607177	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.467:14:3,3:3,2:2,6,0,6
chr7	16619686	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=114,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.260:10:0,0:8,2:6,2,2,0
chr7	16620928	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=209,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,2:5,1:7,3,1,2
chr7	16621052	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:2,7,0,2
chr7	16640300	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=219,237;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr7	16640358	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=131,238;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:0,3:2,3:2,0,5,1
chr7	16650427	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=175,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:3,4:3,1:0,6,1,4
chr7	16676080	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,0:5,0:9,7,0,2
chr7	16676082	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=16,28;MFRL=135,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.306:14:4,2:1,2:5,5,2,2
chr7	16684247	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=247,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:13,0,2,0
chr7	16705132	.	TTG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=177,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.243:14:5,3:3,0:5,6,0,3
chr7	16725501	.	CTTT	C,CTTTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33,26;MFRL=199,183,265;MMQ=60,60,59;MPOS=12,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,16,20;RU=T;STR;TLOD=4.37,4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.248,0.278:8:1,1,1:1,1,0:1,3,4,0
chr7	16736478	.	GC	AG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=204,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:0|1:16736478_GC_AG:16736478:6,0,2,0
chr7	16736479	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,8:0.897:8:0,2:0,6:1|0:16736478_GC_AG:16736478:0,0,8,0
chr7	16745589	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr7	16793504	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr7	16793677	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=199,251;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:4,2:10,3:5,9,3,2
chr7	16815786	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=237,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:5,6:2,8:6,1,12,2
chr7	16816000	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=237,180;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,27:0.824:32:3,11:2,16:1,4,10,17
chr7	16818799	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=202,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,8:1,3:0,3,0,11
chr7	16823021	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:6,4:6,3:12,0,5,2
chr7	16823095	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=162,128;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.761:23:0,11:5,7:2,3,11,7
chr7	16823117	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.294:21:9,1:6,4:5,10,1,5
chr7	16823169	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=171,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:2,4,1,5
chr7	16834393	.	A	AAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=248,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AG;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:2,1:6,0,2,0
chr7	16834444	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=132,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:7,1,8,0
chr7	16839501	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=190,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,3:4,1:0,6,1,3
chr7	16901185	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	16913520	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr7	16913557	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	16921639	.	GAC	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:11,1:4,1:4,11,1,1
chr7	17362188	.	T	TA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,99;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:23,0:17,3:18,22,0,3
chr7	17379926	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=326,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,0:0,4:0,2,0,4
chr7	17854484	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=197,120;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:6,7,0,3
chr7	17854532	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,4:3,5:5,3,8,1
chr7	17854575	.	GAA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=17,20;MFRL=144,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.476:6:0,1:0,1:0,3,0,3
chr7	17861093	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,3:6,4:6,5,4,3
chr7	17869766	.	CAAGATATAACA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=224,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr7	17874300	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=151,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:2,0,5,0
chr7	17890413	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=217,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.780:16:0,6:3,7:3,0,12,1
chr7	17908130	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:4,4:0,8:0,4,3,9
chr7	17913083	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,5:0,0,10,0
chr7	17932932	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=172,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:9,0:10,10:13,6,6,4
chr7	17979793	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=236,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.607:16:3,2:3,7:5,1,9,1
chr7	18067479	.	ACT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=157,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=72.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:2,9:5,9:3,4,3,15
chr7	18630208	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=209,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr7	18631098	.	ATG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=TG;STR;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.879:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr7	18668945	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,0:3,2:8,2,2,1
chr7	18674435	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=200,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,1:7,2:1,12,0,3
chr7	18788576	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=199,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:5,2:6,1,2,0
chr7	18914251	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=197,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:7,7:1,0:2,6,0,7
chr7	18975650	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=175,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr7	19015481	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.234:32:11,0:14,7:15,10,0,7
chr7	19184746	.	C	CTCT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=204,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=38.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,5:1,3:2,2,5,5
chr7	19738359	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:5,1:10,2:4,12,0,3
chr7	19763866	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,2:9,2:15,4,1,3
chr7	20180477	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,21;MFRL=198,226;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.389:8:1,0:1,1:5,0,3,0
chr7	20180507	.	G	GAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=96,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=AC;STR;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:0,0:2,2:1,1,2,1
chr7	20371395	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,15:0,6:0,0,17,4
chr7	20403353	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=79,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.732:11:2,3:1,5:1,2,1,7
chr7	20406542	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=186,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr7	20418926	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=201,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:11,5:8,1:13,6,3,3
chr7	20430960	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr7	20444532	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr7	20663070	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=215,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr7	20668259	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=132,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.102:37:17,3:16,0:0|1:20668259_G_A:20668259:29,5,3,0
chr7	20668277	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=191,132;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=56.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,20:0.616:32:7,9:4,10:1|0:20668259_G_A:20668259:10,2,15,5
chr7	20685508	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,5:6,3:6,6,7,2
chr7	20685786	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=216,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr7	20687181	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:8,6:10,3:13,5,4,5
chr7	20687332	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=243,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:1,6,0,7
chr7	20690984	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=201,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr7	20698077	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.319:13:4,1:5,2:8,1,0,4
chr7	20698270	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=143,171;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:1,5,1,3
chr7	20698804	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr7	20739632	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=183,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,2:2,5:6,2,5,2
chr7	20739774	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:1,2:4,2:3,2,1,3
chr7	20762543	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,7,0
chr7	20762609	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:4,3,4,2
chr7	20762646	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=164,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.478:23:5,4:7,7:3,9,6,5
chr7	20778773	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=151,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,4:3,2:0,3,0,6
chr7	20778844	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=241,356;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr7	20782474	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=121,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:2,1,4,2
chr7	20824940	.	AGCC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCC;STR;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.605:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr7	20825145	.	GGCAGCCGCGGCTGCTGCCGCGGCCGCC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=73,254;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:0,1:2,1,3,0
chr7	20826270	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.403:13:6,2:2,3:8,0,5,0
chr7	21468579	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=166,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,4:6,5:0,8,0,9
chr7	21468869	.	TCC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=205,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=C;STR;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,3:0,1,5,0
chr7	21469728	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=198,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,3:7,1:8,5,1,3
chr7	21470513	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=234,231;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	21470536	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=234,291;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	21582963	.	GA	TT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=148,292;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:5,0,3,1
chr7	21584820	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=148,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,1:7,2:1,8,0,3
chr7	21600674	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:8,5:9,0:11,7,5,0
chr7	21603750	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.289:12:5,0:1,2:8,1,2,1
chr7	21609623	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=133,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:6,0,6,0
chr7	21639818	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=229,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr7	21640618	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,280;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,1:3,1:10,2,0,2
chr7	21654970	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=164,334;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr7	21657185	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=162,298;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,2:2,2:4,0,4,0
chr7	21658855	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=139,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,2:2,2:3,5,1,3
chr7	21695416	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:8,0:2,2:9,1,2,0
chr7	21695649	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=247,282;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,1,1
chr7	21721130	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:4,1,0,3
chr7	21744039	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=192,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,0:3,4:5,5,3,1
chr7	21744318	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=184,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:0,9,1,3
chr7	21745061	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,245;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,1:8,3:11,5,3,1
chr7	21757636	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr7	21765636	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	21775210	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	21775443	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr7	21784193	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,1:7,1:6,10,0,2
chr7	21789442	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:3,7:3,7:1,5,1,13
chr7	21813318	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.915:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr7	21818486	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr7	21826199	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=194,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:6,4:3,3:4,5,6,1
chr7	21847457	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=240,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,4:0,2:4,0,5,1
chr7	21856390	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,7:3,1:0,3,0,8
chr7	21858043	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=119,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:2,4:0,2:1,1,0,6
chr7	21901540	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:5,2,3,4
chr7	21901566	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr7	21907452	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=90,239;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.600:18:2,4:4,6:0|1:21907452_G_GT:21907452:5,2,7,4
chr7	21907458	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=134,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,12:0.520:23:5,5:6,7:0|1:21907452_G_GT:21907452:8,3,7,5
chr7	21907696	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:2,3:1,7:0,3,0,10
chr7	21907722	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=19,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.683:4:0,0:0,2:0,1,0,3
chr7	21920556	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=199,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,2:5,9:1,5,1,10
chr7	21934317	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:9,0:12,5:9,12,0,5
chr7	21940557	.	AACTT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTT;STR;TLOD=70.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,16,0
chr7	21941861	.	ATCTT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=51.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr7	21943722	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=178,263;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,2:7,1:7,8,3,0
chr7	21943842	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:9,3:6,7:8,7,4,6
chr7	21945086	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=231,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:2,0,7,0
chr7	21945840	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=178,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,7:0,7:1,0,12,2
chr7	21947736	.	G	GGGTTGGGTTCATACGCCGCGTGATC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=202,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:1,0:3,2:4,0,1,1
chr7	21985338	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=194,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.309:27:9,5:10,3:0|1:21985338_G_A:21985338:10,9,5,3
chr7	21985347	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=91.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.965:25:0,12:0,13:0|1:21985338_G_A:21985338:0,0,14,11
chr7	21985484	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=187,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:9,3:8,3:8,9,2,4
chr7	22190135	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=125,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.278:9:3,0:3,0:2,5,0,2
chr7	22206854	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=236,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr7	22259670	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=35.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.576:26:5,4:5,11:5,6,7,8
chr7	22330700	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:9,0,2,0
chr7	22347861	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=215,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr7	22347888	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=205,263;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,3:4,0:8,0,3,0
chr7	22349769	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr7	22355166	.	CTATATA	C,CTATA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35,33;MFRL=0,244,233;MMQ=60,60,60;MPOS=31,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,7,9;RU=TA;STR;TLOD=3.32,3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.285,0.508:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chr7	22357716	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.721:16:3,5:1,6:0,4,0,12
chr7	22459324	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=185,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:8,1,1,1
chr7	22459509	.	AT	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:7,0:5,11,1,2
chr7	22771156	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.297:35:14,5:11,5:12,13,4,6
chr7	22852643	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=238,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:5,3,5,0
chr7	22852776	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=147,252;MMQ=60,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:11,0:5,3:4,12,0,3
chr7	22857589	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=164,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.519:23:7,8:4,4:5,6,9,3
chr7	22862467	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,2:6,4:0,10,0,6
chr7	22985868	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	23000783	.	G	GCTCT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=CT;STR;TLOD=52.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,12,0
chr7	23191636	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=167,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,1:5,1:12,2,2,0
chr7	23191664	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:10,1:6,3:11,5,3,1
chr7	23195555	.	CTTTAT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=85.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,8:0,0,7,13
chr7	23221870	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=237,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.394:11:0,3:4,1:0,7,2,2
chr7	23227632	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.261:18:5,3:5,1:8,6,4,0
chr7	23293098	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.219:14:3,0:8,3:4,7,1,2
chr7	23296616	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,3:11,0:12,10,3,0
chr7	23300049	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=216,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr7	23306020	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr7	23307634	.	ATGGG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=246,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGG;STR;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.587:10:1,1:3,5:1,3,1,5
chr7	23352512	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:2,3:2,9:3,1,1,11
chr7	23545047	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=183,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,3:9,0:15,0,3,0
chr7	23545119	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=125,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.513:15:2,5:4,1:6,2,5,2
chr7	23571558	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=215,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,2,2
chr7	23682603	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,45;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,2:6,0:11,6,2,0
chr7	23719766	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=126,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,5:2,3:6,0,8,0
chr7	23719779	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=125,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.634:20:4,7:3,5:7,0,12,1
chr7	23737795	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=164,69;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:11,0:9,3:11,9,2,1
chr7	23766954	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=203,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:4,1:1,8,0,3
chr7	23794139	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=35.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr7	23794183	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:0,6,0,4
chr7	23802463	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:9,5:4,4:5,8,4,5
chr7	23802579	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,9:1,1:0,1,1,9
chr7	23810605	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr7	23823355	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr7	23826066	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr7	23854717	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,12,5
chr7	23854838	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=83.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,9:0,17:0,0,10,16
chr7	23872024	.	C	CTTTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTG;STR;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	24324759	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=214,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr7	24324808	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=111,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:5,3:0,2:3,2,5,0
chr7	24325009	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:7,8:1,1:6,2,6,3
chr7	24329133	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=221,163;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,4:4,4:6,0,4,4
chr7	24329235	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=221,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:3,6,0,2
chr7	24718710	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=108,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,3:0,3:4,0,4,2
chr7	24746022	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=174,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,8:0.290:29:6,1:15,7:0|1:24746022_A_G:24746022:4,17,2,6
chr7	24746026	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=194,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,3:0.133:28:5,2:18,1:1|0:24746022_A_G:24746022:6,19,0,3
chr7	24747910	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,1:3,5:0,3,1,5
chr7	24756810	.	A	AGTCCCTCTGCTGAGGGATCCTCTGCTGGGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=194,269;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTCCCTCTGCTGAGGGATCCTCTGCTGGGG;STR;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.481:6:2,1:1,1:3,0,3,0
chr7	24758565	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=216,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr7	24758645	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=120,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,5:4,1:10,1,5,1
chr7	24784403	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:1,3:2,3:2,2,0,6
chr7	24789082	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=228,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr7	24839712	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr7	24888620	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,14,1
chr7	24902762	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=191,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.647:18:3,3:3,8:6,0,10,2
chr7	24903107	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=254,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.800:23:2,5:2,13:1,3,11,8
chr7	24903139	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.585:39:9,6:7,16:9,7,10,13
chr7	24903227	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,5:4,5:1,9,1,9
chr7	24904868	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr7	24904889	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=205,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:5,0,3,2
chr7	24911526	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=219,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,3:4,11:5,3,4,10
chr7	24911760	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:5,0:1,6:1,5,6,0
chr7	25182001	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=222,312;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	25182172	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=209,216;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,1:2,1,3,0
chr7	25194618	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:3,3:5,5:7,2,5,3
chr7	25194857	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=186,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:6,2:5,7:0,11,0,9
chr7	25198268	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=174,137;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr7	25207849	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,3:2,0:8,0,3,0
chr7	25264847	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=260,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr7	25989520	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=176,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:3,1:10,5:9,4,3,3
chr7	26225249	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=178,7703;MMQ=60,25;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.216:35:14,0:14,7:16,12,7,0
chr7	26247984	.	CTT	C,CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=236,133,165;MMQ=60,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.02,12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,6:0.148,0.405:15:2,0,2:4,2,4:6,1,8,0
chr7	26251843	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=159,259;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:12,1:13,4:8,18,5,0
chr7	26386122	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=213,168;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,2:6,4:3,9,4,2
chr7	26386154	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:0,5,1,2
chr7	26404071	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=280,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:2,2:0,5:2,0,7,0
chr7	26411423	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=193,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,1:6,2:10,0,3,0
chr7	26576535	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=224,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.710:29:4,7:4,14:5,3,11,10
chr7	26724279	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,5:3,2:4,0,7,0
chr7	26883761	.	TA	T,TAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31,31;MFRL=191,160,187;MMQ=60,60,60;MPOS=27,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=5.34,6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,5:0.243,0.295:17:3,1,2:5,2,3:1,7,1,8
chr7	27135313	.	GCGA	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=177,310;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.177:26:9,3:12,1:0|1:27135313_GCGA_G:27135313:17,5,2,2
chr7	27135314	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=174,218;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.358:29:11,2:8,8:14,5,6,4
chr7	27135316	.	ATGG	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=177,286;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TGG;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.274:25:5,5:12,2:13,5,4,3
chr7	27135319	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=177,286;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.267:25:6,4:11,2:0|1:27135313_GCGA_G:27135313:14,4,4,3
chr7	27147451	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=204,153;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.434:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr7	27147732	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=184,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,2:9,0:0|1:27147732_G_A:27147732:9,12,1,1
chr7	27147735	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=184,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,1:10,0:0|1:27147732_G_A:27147732:9,12,1,1
chr7	27169934	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,312;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	27170145	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,298;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	27203139	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=169,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:2,2:2,3:4,0,6,0
chr7	27213481	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=141,74;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:27213481_G_A:27213481:6,9,0,2
chr7	27213499	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=137,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.202:13:4,2:5,0:0|1:27213481_G_A:27213481:1,10,0,2
chr7	27222409	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=184,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.313:33:11,6:12,4:10,13,6,4
chr7	27224666	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=135,239;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.196:34:17,6:11,0:10,18,6,0
chr7	27238691	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	27282889	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=197,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:5,2,6,0
chr7	27566053	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=168,263;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr7	27582783	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=161,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr7	27671899	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr7	27788354	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=191,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.258:13:6,2:4,1:0,10,0,3
chr7	27842733	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=133,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:8,0:10,4:11,7,1,3
chr7	27868472	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=161,265;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:0,0:2,0:0|1:27868472_T_A:27868472:1,3,0,3
chr7	27868479	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,16;MFRL=186,265;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:1,0:0|1:27868472_T_A:27868472:0,2,0,3
chr7	27886011	.	C	CATATACGTATACGTGTAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=171,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.497:10:4,2:1,1:5,0,5,0
chr7	28031704	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=138,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,1:6,3:11,5,2,2
chr7	28534501	.	C	CT,CTT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32,24;MFRL=154,137,175;MMQ=60,60,60;MPOS=26,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=T;STR;TLOD=30.79,5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,15,3:0.586,0.140:26:2,8,1:5,6,1:4,4,9,9
chr7	28857606	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,6:1,3:1,0,9,0
chr7	28997497	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr7	28997596	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr7	28997765	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=176,197;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:7,0:5,2:8,6,1,1
chr7	28997776	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=166,297;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,2:4,1:5,4,2,1
chr7	29103582	.	TAAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=155,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.465:4:1,2:1,0:1,1,2,0
chr7	29103867	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr7	29103944	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	29105769	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:7,1:3,1:0|1:29105769_GA_G:29105769:1,11,1,1
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chr7	29105776	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,6:0.419:14:6,4:2,2:1|0:29105769_GA_G:29105769:0,8,1,5
chr7	29111525	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=112,174;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:5,2:6,4:0|1:29111525_G_A:29111525:5,6,3,3
chr7	29111541	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=116,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:0|1:29111525_G_A:29111525:4,4,2,3
chr7	29111620	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr7	29126185	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:9,5:13,0:10,12,0,5
chr7	29132212	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,0:0,4:2,0,4,0
chr7	29152416	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,4:6,6:3,8,4,6
chr7	29152448	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=163,85;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:5,4:2,7,1,5
chr7	29160604	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=210,183;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,0:7,5:5,6,1,4
chr7	29394220	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,2:1,0,4,1
chr7	29407518	.	TTC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TC;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.238:15:7,2:5,1:11,1,3,0
chr7	29520042	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,0:0,5:0,1,1,4
chr7	29544468	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,1,4
chr7	29605935	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=240,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,1:0,1:2,0,3,0
chr7	29606597	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=34.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr7	29606976	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	29874358	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=152,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.244:17:8,1:5,0:1,12,4,0
chr7	29944062	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=148,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr7	29954015	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:3,0:0,4:3,0,5,0
chr7	29976182	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=177,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:7,4,1,1
chr7	29976260	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=160,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,0:5,3:6,8,2,1
chr7	30029714	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:8,0,7,0
chr7	30062202	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=248,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr7	30085766	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.565:14:3,6:3,2:5,1,6,2
chr7	30087381	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=167,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:7,1:1,6:6,2,5,2
chr7	30092256	.	CAAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=A;STR;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr7	30101683	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=148,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,3:4,1:3,6,0,4
chr7	30113617	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.388:13:4,5:4,0:6,2,3,2
chr7	30174773	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=199,160;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.638:23:3,7:5,7:5,3,10,5
chr7	30468913	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=196,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:9,0,2,0
chr7	30477204	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=185,98;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.260:20:8,4:7,0:6,9,0,5
chr7	30491215	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=167,333;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.238:15:5,1:5,2:7,5,2,1
chr7	30491780	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,0:7,2:4,10,1,1
chr7	30496309	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr7	30536611	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=184,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr7	30536874	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=182,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:2,2,2,4
chr7	30544360	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:4,5:7,1:1,10,1,5
chr7	30634630	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr7	30643069	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=118,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,1:6,3:3,4,4,0
chr7	30655489	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:11,6:6,5:11,6,6,5
chr7	30656650	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=222,303;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	30662079	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:3,10,2,0
chr7	30668273	.	TG	AA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,1:12,1:0|1:30668273_TG_AA:30668273:6,13,0,2
chr7	30668277	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,1:12,1:0|1:30668273_TG_AA:30668273:6,13,0,2
chr7	30668280	.	A	AAAGAAAAAGAAAG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,1:12,1:0|1:30668273_TG_AA:30668273:6,13,0,2
chr7	30673345	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=158,343;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr7	30673512	.	TAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=12,31;MFRL=159,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,0:0,2:0,5,0,2
chr7	30693081	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=181,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,2:8,1:9,4,2,1
chr7	30694808	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,319;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr7	30695641	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=117,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.285:18:4,0:7,0:8,5,0,5
chr7	30701914	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=183,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,2:2,2:2,5,1,3
chr7	30705105	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,296;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:8,3,0,2
chr7	30728908	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,2:6,5:3,7,1,7
chr7	30739674	.	A	AATGTTGTGGCTAGTTTGATCTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=217,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr7	30795547	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	30805849	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=287,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.752:6:1,2:0,2:1,0,5,0
chr7	30805913	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=114,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,4:7,1:4,6,1,4
chr7	30817998	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:9,0,2,0
chr7	30876432	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=188,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.590:15:3,6:3,3:3,3,6,3
chr7	30891927	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,16;MFRL=124,66;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:11,0:13,1:7,17,1,2
chr7	30892972	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,5:5,0:5,4,3,2
chr7	30921989	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr7	31003819	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=254,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr7	31011485	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=235,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr7	31015622	.	GGC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,267;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr7	31016018	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:1,0:8,2:7,2,1,1
chr7	31121490	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr7	31125082	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr7	31125133	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=200,298;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:0,8,0,2
chr7	31127158	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:5,1:7,2,2,0
chr7	31127398	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=237,262;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:0,2:6,0:0,7,0,2
chr7	31135471	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=266,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,6:0,1:0,2,0,7
chr7	31594166	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,7:0,0,6,14
chr7	31594258	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=227,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,3,3
chr7	31614057	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr7	31681765	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=112,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.501:22:6,4:5,7:5,6,7,4
chr7	31681939	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=211,211;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,15:0.307:50:29,0:5,15:1,34,0,15
chr7	31682601	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=156,194;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:8,1:6,2:7,7,1,3
chr7	31691697	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=134,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,4:1,8:0,3,2,10
chr7	31735263	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=32858197,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:4,5:1,6:0,5,4,7
chr7	31876766	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr7	31918879	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=193,346;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr7	32209376	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:2,1,6,1
chr7	32209459	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,10,12
chr7	32248984	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	32249216	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=157,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr7	32527009	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr7	32528796	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:3,6:11,5:10,4,8,3
chr7	32530511	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=202,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr7	32535437	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=176,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:2,5,0,4
chr7	32593234	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.585:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr7	32593271	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,4:0,10:0,0,10,4
chr7	32594158	.	TTC	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:18,1:6,2:0|1:32594158_TTC_T:32594158:11,14,0,3
chr7	32594165	.	T	TC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:17,1:6,2:0|1:32594158_TTC_T:32594158:11,12,0,3
chr7	32594166	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:17,1:6,2:0|1:32594158_TTC_T:32594158:11,12,0,3
chr7	32594278	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,9:1,2:0,1,4,7
chr7	32598087	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	32598138	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr7	32598442	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr7	32598524	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr7	32609565	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=184,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr7	32613119	.	TAC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr7	32615553	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=273,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,4:1,5:0,1,6,3
chr7	32620325	.	T	TTG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TG;STR;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.916:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr7	33014404	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,182;MMQ=53,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr7	33016120	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr7	33059289	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=134,103;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:0,2:6,0:3,3,2,0
chr7	33059407	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	33060946	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=94,165;MMQ=58,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:8,8:4,10:5,7,9,9
chr7	33102462	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=210,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr7	33136983	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,2,6
chr7	33138875	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:6,1,5,2
chr7	33139147	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=192,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr7	33140340	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=187,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:33140340_T_A:33140340:6,13,1,1
chr7	33140344	.	C	CCAGCTCTCTA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=187,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,0:8,2:0|1:33140340_T_A:33140340:6,13,1,1
chr7	33195355	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=91,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:33195355_T_C:33195355:0,2,0,1
chr7	33195359	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=91,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:33195355_T_C:33195355:0,2,0,1
chr7	33217071	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:4,2:1,0:5,1,2,0
chr7	33297108	.	TCA	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=213,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0|1:33297108_TCA_T:33297108:0,3,0,2
chr7	33297110	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=257,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.393:3:1,1:1,0:1|0:33297108_TCA_T:33297108:0,2,0,1
chr7	33297114	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,21;MFRL=235,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:33297108_TCA_T:33297108:0,4,0,1
chr7	33297117	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=235,134;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:33297108_TCA_T:33297108:0,4,0,1
chr7	33376047	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,2:6,1:9,1,2,1
chr7	33380598	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=150,254;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:3,5,0,2
chr7	33380673	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=182,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	33388618	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr7	33388829	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=149,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr7	33392380	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:9,1,1,1
chr7	33644941	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=198,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:3,3:1,3:0|1:33644941_T_C:33644941:0,4,1,6
chr7	33644948	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=182,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:0|1:33644941_T_C:33644941:0,3,1,6
chr7	33945183	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=144,175;MMQ=60,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:6,10:0,0:6,0,10,0
chr7	33979555	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=121,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,0:11,3:6,14,3,0
chr7	34125622	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=186,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,1:11,1:11,11,0,2
chr7	34697982	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=187,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,6:1,3:1,0,9,0
chr7	34698210	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=109,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,2:6,4:4,5,2,4
chr7	34698234	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=109,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.329:13:3,2:5,2:3,6,0,4
chr7	34698251	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=220,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr7	34888010	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:1,1:2,1:3,0,3,0
chr7	34917664	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:4,1,2,0
chr7	34977685	.	C	CTCTACCAT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=207,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:6,2:7,0:0|1:34977685_C_CTCTACCAT:34977685:5,8,1,1
chr7	34977686	.	G	GCCAGC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=207,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.170:15:5,1:7,0:0|1:34977685_C_CTCTACCAT:34977685:5,8,1,1
chr7	34979748	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=66,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	34989364	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=192,212;MMQ=52,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr7	35009183	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=187,185;MMQ=33,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,1:6,4:3,6,1,4
chr7	35050217	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=134,152;MMQ=48,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:8,0:3,3:6,5,0,3
chr7	35050886	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=144,247;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:8,2,2,0
chr7	35241962	.	A	AGGGGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:35241962_A_AGGGGGG:35241962:0,0,1,0
chr7	35241963	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,0;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:35241962_A_AGGGGGG:35241962:0,0,1,0
chr7	35271254	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=161,119;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr7	35280404	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=194,180;MMQ=52,56;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,1:2,1:4,0,2,0
chr7	35280693	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=144,279;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,3:5,4:1,7,1,6
chr7	35288213	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=147,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr7	35288276	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,1:4,3:6,3,2,2
chr7	35288458	.	CAGAG	C,CAG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35,36;MFRL=194,129,172;MMQ=60,60,60;MPOS=26,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,6,7;RU=AG;STR;TLOD=5.48,4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,2:0.165,0.176:14:6,1,0:4,1,2:4,6,0,4
chr7	35289536	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=21,12;MFRL=167,81;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.343:9:1,0:2,1:0|1:35289536_A_C:35289536:3,3,3,0
chr7	35289543	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=177,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.265:12:3,0:4,0:0|1:35289536_A_C:35289536:6,3,3,0
chr7	35289889	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr7	35673870	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:6,2:4,2:8,3,4,0
chr7	35840898	.	G	GC	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=95.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,11,17
chr7	35930260	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=229,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr7	35930437	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=144,274;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr7	36278660	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,0:3,2:6,5,0,2
chr7	36324436	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:2,8:0,8:0,2,2,14
chr7	36338564	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=212,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.775:7:1,2:0,3:0|1:36338564_G_A:36338564:1,0,6,0
chr7	36338589	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=218,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.399:13:2,3:6,1:0|1:36338564_G_A:36338564:5,3,3,2
chr7	36338841	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=149,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:3,5,0,6
chr7	36366569	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr7	36370499	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	36370555	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,3:0,6:0,0,9,1
chr7	36406513	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr7	36438805	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,1:10,1:12,9,0,2
chr7	36445856	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=294,143;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.855:18:0,2:2,14:1,1,7,9
chr7	36446218	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=184,19151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:36446218_T_A:36446218:0,1,1,0
chr7	36446220	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=184,19151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:36446218_T_A:36446218:0,1,1,0
chr7	36446223	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=184,19151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:36446218_T_A:36446218:0,1,1,0
chr7	36446227	.	G	GACATAA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,19151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36446218_T_A:36446218:0,0,1,0
chr7	36446230	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,19151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36446218_T_A:36446218:0,0,1,0
chr7	36447287	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=195,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:7,0,4,2
chr7	36447349	.	A	ACTT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:6,3:7,2:8,5,6,0
chr7	36447600	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=220,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0,5,0,4
chr7	36456613	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,2:0,7:0,1,10,0
chr7	36462205	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,1:7,2:11,4,3,0
chr7	36465570	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.492:34:10,7:7,7:12,5,11,6
chr7	36465606	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,27,32,33;MFRL=175,130,110,227;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,18,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=3.93,5.34,6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,6,5,5:0.252,0.231,0.249:21:3,5,1,3:2,1,4,2:3,2,6,10
chr7	36466571	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:4,4:13,4:3,14,4,4
chr7	36466589	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:8,0:9,8:8,9,0,8
chr7	36552790	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,8,1
chr7	36588405	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=118,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr7	36588955	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=259,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:3,1,2,2
chr7	36656035	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,4:2,5:4,5,3,6
chr7	36656147	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,0:0,0,0,5
chr7	36661423	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,2,13
chr7	36698684	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=302,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:2,0,4,0
chr7	36726476	.	CGTGT	C,CGT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27,25;MFRL=0,208,200;MMQ=60,60,60;MPOS=25,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=GT;STR;TLOD=10.28,7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,3:0.512,0.402:7:0,3,1:0,1,1:0,0,0,7
chr7	36763560	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=188,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr7	36927078	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=150,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr7	36934448	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,17,9
chr7	37053134	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=198,301;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr7	37272769	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=193,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,3:6,1:6,2,1,3
chr7	37299056	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=176,280;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr7	37355590	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=51.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,6:0,9:0,0,3,12
chr7	37780765	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=172,253;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,1:7,0:4,6,2,0
chr7	37889786	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	37901581	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr7	37903853	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	37903904	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=224,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:2,6:0,6:2,0,9,3
chr7	37904065	.	TAAC	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=224,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,1:0,4:0,4,1,4
chr7	37904099	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=223,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr7	37905236	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:1,8,0,3
chr7	37916427	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=141,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=51.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.644:26:5,17:4,0:8,1,17,0
chr7	37923849	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=192,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,1:1,4:2,0,4,1
chr7	37924737	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chr7	37924879	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=264,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:1,1,0,5
chr7	37927779	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=215,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	37933983	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr7	37934234	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr7	37936384	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr7	37953720	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=210,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr7	37960262	.	AAGGCAGTGGCAGC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGCAGTGGCAGC;STR;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.679:16:0,5:4,6:2,3,5,6
chr7	37989775	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=142,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,3:6,3:9,2,4,2
chr7	38253923	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,3:8,1:9,1,3,1
chr7	38301741	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=183,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,1:5,3:5,2,2,2
chr7	38304926	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=135,113;MMQ=55,38;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,2:4,2:4,2,4,0
chr7	38305043	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=123,193;MMQ=52,34;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,1:9,1:7,11,0,2
chr7	38424539	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=122,225;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:2,4,2,2
chr7	38429370	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:6,2,3,0
chr7	38431644	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	38500782	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=219,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	38505014	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,2:3,1:8,2,3,0
chr7	38505025	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,8:1,2:2,1,7,3
chr7	38505712	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=203,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:9,2,2,0
chr7	38514868	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=193,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:3,3,3,0
chr7	38530568	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,4,1
chr7	38530807	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr7	38543371	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	38781018	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,5:2,0:1,6,1,4
chr7	38781822	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,274;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr7	38782905	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	38782944	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,3:5,3:9,1,5,1
chr7	38782951	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,4:4,5:6,1,8,1
chr7	38785062	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr7	38810880	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=166,265;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:1,2:2,1:0,4,0,3
chr7	38813711	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr7	38816441	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=221,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr7	38857364	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=231,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr7	38857378	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,2:4,0:9,2,3,0
chr7	38860933	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=222,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr7	38908876	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,2:6,4:2,7,3,3
chr7	39125413	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:1,3:0,7:1,0,10,0
chr7	39243750	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr7	39243963	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr7	39243978	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr7	39379698	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=289,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CA;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr7	39472669	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,1,1
chr7	39500352	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr7	39504345	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=301,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39504345_C_T:39504345:0,2,0,1
chr7	39504353	.	CAACA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=301,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39504345_C_T:39504345:0,2,0,1
chr7	39745676	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=162,163;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:6,15:2,0:8,0,16,0
chr7	40037161	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=130,62;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:19,2:7,1:0|1:40037161_C_T:40037161:11,15,2,1
chr7	40037179	.	C	CACCCCGCAACTCAGCCTCA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=119,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:14,2:2,0:0|1:40037161_C_T:40037161:7,10,1,1
chr7	40087320	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=234,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr7	40127710	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=210,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:4,3:1,1:4,1,2,2
chr7	40228033	.	C	CAA,CCAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=271,107,128;MMQ=40,50,60;MPOS=12,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.72,3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.340,0.463:6:0,1,0:1,1,3:1,0,3,2
chr7	40229012	.	AC	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=307,246;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:40229012_AC_TT:40229012:1,0,1,0
chr7	40229019	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=307,246;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:0,1:0|1:40229012_AC_TT:40229012:1,0,1,0
chr7	40356305	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=175,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:0|1:40356305_G_A:40356305:7,1,2,0
chr7	40356315	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,7:0.727:9:2,3:0,4:1|0:40356305_G_A:40356305:1,1,6,1
chr7	40356525	.	AT	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=89,126;MMQ=60,32;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr7	40900175	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=212,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0,6,0,5
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chr7	41730235	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41730232_T_A:41730232:0,1,0,1
chr7	41730239	.	C	CCAAGTATATGCTAATA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41730232_T_A:41730232:0,1,0,1
chr7	42004666	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.317:17:9,3:2,2:6,6,4,1
chr7	42005329	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=176,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:1,0:9,2:5,5,1,1
chr7	42064852	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=38.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,9:0,1:0,0,9,1
chr7	42116475	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=190,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:4,0:12,5:3,13,3,2
chr7	42951515	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr7	42957465	.	ATT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr7	42974827	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr7	42977195	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	42977243	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,218;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	43351273	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=234,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr7	43447365	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:0,7,0,2
chr7	43484310	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:3,8:5,7:5,3,8,7
chr7	43485248	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	43490509	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=72,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:11,1:2,1:5,8,1,1
chr7	43495878	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=198,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,6:2,7:0,6,5,8
chr7	43540264	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=188,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,1:8,5:9,3,6,0
chr7	43540803	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,10;MFRL=179,248;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:4,0,1,0
chr7	43548516	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:3,1,5,0
chr7	43591955	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,10:0,0,7,14
chr7	43594471	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,88;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	43622806	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=122,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.297:25:8,3:9,4:12,6,4,3
chr7	43635511	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=157,118;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:11,4:13,0:0|1:43635511_C_T:43635511:12,12,4,0
chr7	43635517	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=156,118;MMQ=60,49;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:11,4:11,0:0|1:43635511_C_T:43635511:11,12,4,0
chr7	43659182	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=179,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:7,4:8,3:7,8,5,2
chr7	43687074	.	TGGA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=161,245;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGA;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:18,1,2,0
chr7	43810695	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=184,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,3:4,5:3,5,5,3
chr7	43810820	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,3:7,1:9,6,1,3
chr7	43827414	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=216,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr7	43846644	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:14,0:10,4:11,13,0,4
chr7	43921483	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.150:29:7,3:15,0:16,9,4,0
chr7	43927512	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=175,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr7	43978186	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=207,132;MMQ=50,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr7	43978193	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=248,132;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:43978193_G_C:43978193:0,3,0,1
chr7	43978197	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=204,132;MMQ=50,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:43978193_G_C:43978193:0,4,0,1
chr7	43988188	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,5:4,1:9,2,6,0
chr7	44044907	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=219,190;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	44089904	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=185,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:5,4:12,5:5,12,5,4
chr7	44091343	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=196,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:7,2:1,1:8,0,3,0
chr7	44097330	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=188,104;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,3:9,0:9,4,3,0
chr7	44097696	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,2:9,4:5,9,4,2
chr7	44098142	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:6,1:4,5,0,4
chr7	44100393	.	T	TC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=141,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:13,2:4,0:13,4,2,0
chr7	44112873	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=206,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:2,2:5,2,2,3
chr7	44113656	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=233,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:2,3,1,2
chr7	44116010	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=191,272;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr7	44144201	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=238,279;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:44144201_C_G:44144201:3,0,1,0
chr7	44144222	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=17,13;MFRL=238,279;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:44144201_C_G:44144201:3,0,1,0
chr7	44147567	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,0:0,0,1,3
chr7	44148690	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=160,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.121:23:6,0:13,2:0|1:44148690_A_G:44148690:7,14,1,1
chr7	44148695	.	GC	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=165,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:15,2:0|1:44148690_A_G:44148690:7,17,1,1
chr7	44148697	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=165,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,0:12,2:0|1:44148690_A_G:44148690:7,17,1,1
chr7	44148701	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=165,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:15,2:0|1:44148690_A_G:44148690:8,16,1,1
chr7	44150358	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=154,149;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:11,4:4,0:10,5,4,0
chr7	44151009	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=218,252;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:1,2,6,1
chr7	44152119	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr7	44152549	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=153,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:4,1,1,1
chr7	44154865	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,5,6
chr7	44156146	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr7	44157117	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44157117_A_C:44157117:0,0,1,0
chr7	44157125	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=235,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44157117_A_C:44157117:1,0,1,0
chr7	44157127	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,12;MFRL=235,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:44157117_A_C:44157117:1,0,1,0
chr7	44157133	.	C	CCCG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=169,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:44157117_A_C:44157117:3,0,1,0
chr7	44157134	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,16;MFRL=167,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:44157117_A_C:44157117:4,0,1,0
chr7	44157138	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=167,221;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:44157117_A_C:44157117:4,0,1,0
chr7	44180079	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr7	44180226	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=284,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr7	44185088	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=178,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,1:4,1:8,2,1,1
chr7	44189274	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,32;MFRL=188,245;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:4,1,3,0
chr7	44189321	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:3,1:1,2:5,0,2,1
chr7	44189365	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=168,49;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:11,2:0|1:44189365_T_C:44189365:9,6,1,1
chr7	44189372	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=166,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:11,2:0|1:44189365_T_C:44189365:8,6,1,1
chr7	44189374	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=166,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:11,2:0|1:44189365_T_C:44189365:8,6,1,1
chr7	44189377	.	C	CATCTTA	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=166,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:11,2:0|1:44189365_T_C:44189365:8,6,1,1
chr7	44190468	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr7	44228636	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=294,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr7	44259561	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	44259574	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	44266077	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.713:12:2,2:1,7:2,1,5,4
chr7	44266184	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=144,265;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:9,1:7,3:10,6,2,2
chr7	44272314	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	44279075	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	44281475	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=192,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr7	44364862	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	44425669	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=168,75;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:9,0:9,4:8,10,2,2
chr7	44571774	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:3,9,2,0
chr7	44571831	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=112,216;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.636:14:1,0:3,9:1,4,0,9
chr7	44606098	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,11,4
chr7	44606217	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr7	44610490	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,10:0,13:0,0,8,16
chr7	44611077	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,11,5
chr7	44612347	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,5,13
chr7	44612454	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=66.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,8:0,0,14,8
chr7	44613103	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr7	44613379	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.442:41:10,10:13,8:10,13,13,5
chr7	44613611	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr7	44619302	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr7	44713401	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,2:8,0:8,4,1,1
chr7	44715476	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33,31;MFRL=155,165,0;MMQ=60,60,22;MPOS=24,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,18;RU=A;STR;TLOD=3.97,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.429,0.286:4:0,1,0:1,1,1:1,0,3,0
chr7	44802401	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	44802560	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=199,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,2:5,0:5,3,0,2
chr7	44803907	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=193,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr7	44803944	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:6,0,5,0
chr7	44805732	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=221,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:9,0,2,0
chr7	44836268	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.477:42:8,7:14,13:14,8,10,10
chr7	44840785	.	TAA	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=146,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	44840864	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=122,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:5,4:1,7:5,1,7,4
chr7	44840911	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=36,28;MFRL=166,117;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:9,4,0,2
chr7	45007550	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=178,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,2:8,1:4,10,2,1
chr7	45010371	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,1:3,3:3,2,2,2
chr7	45010734	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=160,278;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr7	45040032	.	G	GTCCTTGTGTCCTTGAATTGTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45040032_G_GTCCTTGTGTCCTTGAATTGTT:45040032:0,0,0,1
chr7	45040035	.	CG	TT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45040032_G_GTCCTTGTGTCCTTGAATTGTT:45040032:0,0,0,1
chr7	45104157	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=140,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:14,2:6,1:9,11,1,2
chr7	45120068	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:11,3:5,1:11,5,3,1
chr7	45120912	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=166,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr7	45124142	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=140,64;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:10,2:9,0:0|1:45124142_A_T:45124142:10,9,1,1
chr7	45124144	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=140,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:10,2:7,0:0|1:45124142_A_T:45124142:10,9,1,1
chr7	45124151	.	G	GCC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=155,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:45124142_A_T:45124142:8,9,1,1
chr7	45143090	.	G	GGACAGCC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:3,1:6,3:0|1:45143090_G_GGACAGCC:45143090:3,6,1,4
chr7	45143093	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.284:12:3,1:6,2:0|1:45143090_G_GGACAGCC:45143090:3,6,0,3
chr7	45143108	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,1:4,1:1,6,0,2
chr7	45144403	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr7	45148882	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=198,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:45148882_A_T:45148882:0,4,0,1
chr7	45148885	.	CCCTG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=198,71;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:45148882_A_T:45148882:0,4,0,1
chr7	45148893	.	AG	GA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=198,71;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:45148882_A_T:45148882:0,4,0,1
chr7	45223018	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,3,1
chr7	45614400	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=212,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr7	45688233	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.249:13:6,0:4,2:8,2,2,1
chr7	45697257	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=222,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:45697257_C_T:45697257:4,0,1,0
chr7	45697261	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,21;MFRL=222,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:45697257_C_T:45697257:4,0,1,0
chr7	45697295	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=225,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,3:2,6:3,0,7,2
chr7	45697297	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=177,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,4:1,6:1,0,9,2
chr7	45717695	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=184,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:9,1:8,8,0,2
chr7	45743128	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=294,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,5:2,4:1,2,5,4
chr7	45743403	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr7	45957055	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:7,4:9,3:0,16,2,5
chr7	47319723	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=98,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,5:2,4:6,2,2,7
chr7	47319852	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:3,2:11,3:10,5,3,2
chr7	47323456	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=134,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,3:5,3:0,5,3,3
chr7	47336893	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr7	47386050	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=242,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr7	47408732	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=170,263;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,4:0,0:1,2,1,3
chr7	47436558	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,3,10
chr7	47451295	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,2:0,10:0,0,11,2
chr7	47835814	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr7	47840510	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr7	47851654	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.320:13:3,2:5,2:2,7,1,3
chr7	47853498	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	47859239	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=207,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:3,3:1,4,0,3
chr7	47859241	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=199,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:0,0:3,1:1,3,0,2
chr7	47868937	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=220,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr7	47869751	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:5,10,0,2
chr7	47884555	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=217,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,5:1,7:3,0,10,2
chr7	47886707	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:0,7,0,3
chr7	47898561	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=127,299;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:3,3,1,1
chr7	47904737	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=273,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr7	47917087	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,2:6,4:4,6,2,4
chr7	47927744	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=203,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,1:4,2:7,5,1,2
chr7	47944315	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=192,239;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	47947863	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=105,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,4:2,0:1,2,1,3
chr7	47976357	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=203,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,1:4,2:7,0,3,0
chr7	47979920	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=147,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:1,0:1,0:2,5,0,2
chr7	48007308	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=18,17;MFRL=195,181;MMQ=54,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:2,0,2,0
chr7	48017989	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=136,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:11,12,1,1
chr7	48018455	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=173,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,3:2,1:0,8,0,4
chr7	48046714	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,2,2
chr7	48075810	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,7:6,0:8,1,8,0
chr7	48075836	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.285:28:12,6:8,0:16,4,8,0
chr7	48086151	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:6,8:5,1:0|1:48086151_G_A:48086151:6,5,6,3
chr7	48086161	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,13:0,14:0|1:48086151_G_A:48086151:0,0,11,17
chr7	48089394	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	48092601	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=225,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr7	48099738	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=177,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:2,5:7,3:8,1,7,1
chr7	48237802	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,2:7,1:11,3,3,0
chr7	48237824	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,2:6,2:6,6,4,0
chr7	48280454	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=122,281;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:7,6,1,1
chr7	48311657	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,51;MMQ=60,47;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:13,0:6,2:0|1:48311657_C_T:48311657:11,9,1,1
chr7	48311675	.	G	GCTCCATCTAAAGGAATGTTCAGCTCTGTTAGTTCAATC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=130,51;MMQ=60,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.122:24:10,0:10,2:0|1:48311657_C_T:48311657:12,10,1,1
chr7	48313510	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=165,109;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,4:3,3:5,4,4,3
chr7	48315360	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:2,1:12,2:6,8,1,2
chr7	48317667	.	GTA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:3,0:4,2:5,2,2,0
chr7	48335265	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=109,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr7	48443570	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=218,262;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr7	48506707	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=139,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:1,6,0,2
chr7	48506727	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=151,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,0,2
chr7	48511297	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=202,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr7	48520780	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=120,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:5,4:12,4:7,10,3,5
chr7	48522769	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:4,3:4,1:1,7,0,4
chr7	48522845	.	CA	GG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=181,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr7	48528732	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr7	48545879	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=137,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,1:3,2:3,5,1,2
chr7	48545976	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=105,138;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.915:21:0,6:1,14:0,1,10,10
chr7	48546011	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=116,230;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:6,2:11,1:7,10,1,2
chr7	48550677	.	CA	GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.219:21:10,4:5,0:11,6,4,0
chr7	48556566	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=184,235;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,1:5,2:0,7,0,3
chr7	48634295	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:8,1,1,1
chr7	48684185	.	CTTTT	C,CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=261,136,165;MMQ=60,60,60;MPOS=2,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,15,16;RU=T;STR;TLOD=3.31,9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,7:0.245,0.498:13:2,3,6:0,0,1:2,1,10,0
chr7	49815390	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr7	49951544	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=167,208;MMQ=50,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr7	50023122	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,6:2,1:0,2,1,6
chr7	50070921	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=128,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr7	50121269	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=252,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr7	50144059	.	T	TTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TA;STR;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	50175654	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:4,1,6,0
chr7	50175681	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=137,192;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:3,0:6,2:7,2,1,1
chr7	50198626	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,10,10
chr7	50455052	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=226,60;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:9,0:10,2:0|1:50455052_C_T:50455052:8,11,1,1
chr7	50455066	.	T	TTATGGGCCTCTGGTTTCAGGCTATTTCTTGCTC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=254,60;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:0|1:50455052_C_T:50455052:7,8,1,1
chr7	50468399	.	CGCCAGCAG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=202,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50468399_CGCCAGCAG_C:50468399:0,1,0,1
chr7	50468411	.	AG	TT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=264,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:50468399_CGCCAGCAG_C:50468399:0,2,0,1
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chr7	50544269	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr7	50547584	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=78,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,3:3,1:5,3,1,3
chr7	50566762	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	50571779	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:2,4,2,6
chr7	50660787	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:9,3:4,0:6,7,2,1
chr7	50672907	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	50694457	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr7	50799889	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=222,299;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr7	50800100	.	GAA	G,AAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,17,24;MFRL=186,207,215;MMQ=60,60,60;MPOS=20,29;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.96,4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.265,0.448:7:0,0,1:0,0,1:0,2,0,5
chr7	51085127	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr7	51096974	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,15:0,0,13,12
chr7	51098567	.	GTCT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=183,77;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:5,1:7,7,1,1
chr7	51153024	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=204,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:6,1:5,3:0|1:51153024_GT_G:51153024:2,9,2,2
chr7	51153027	.	CAATCAAAGTACTTTGTACCTATGAAGTACAAAGA	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=204,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:5,1:4,3:0|1:51153024_GT_G:51153024:2,9,2,2
chr7	53103794	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,286;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:3,2,4,1
chr7	54614698	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=60,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.646:6:0,2:2,2:1,1,2,2
chr7	54618010	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,2:2,5:0,6,0,7
chr7	54621526	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=144,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,0:7,3:9,1,3,0
chr7	55210188	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=167,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr7	55218903	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=207,272;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr7	55219159	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=168,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,1:4,2:0,12,0,3
chr7	55220177	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,4:3,1:7,1,4,1
chr7	55228053	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr7	55229390	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,91;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:0,14,0,3
chr7	55233185	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=161,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:17,2:2,2:0,19,0,4
chr7	55238268	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=163,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:3,8,0,2
chr7	55242609	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=164,218;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr7	55269062	.	GTC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=176,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.224:11:4,0:4,2:2,7,0,2
chr7	55433782	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=172,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,0:11,2:15,7,2,0
chr7	55468773	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	55499058	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=198,329;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:1,2,0,2
chr7	55540791	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=208,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:0,6:3,5:0,3,3,8
chr7	55565247	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55565247_TG_T:55565247:0,0,1,0
chr7	55565269	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,16;MFRL=58,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:55565247_TG_T:55565247:1,2,1,0
chr7	55565273	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,33;MFRL=100,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:55565247_TG_T:55565247:2,2,1,0
chr7	55902374	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=268,198;MMQ=44,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr7	55929539	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=128,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr7	55929789	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55929789_T_C:55929789:0,1,0,1
chr7	55929792	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55929789_T_C:55929789:0,1,0,1
chr7	55991292	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=144,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.496:14:4,4:3,3:3,4,2,5
chr7	56020902	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=158,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,0:7,3:6,8,1,2
chr7	56049990	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=159,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,4:4,0:3,8,1,3
chr7	56052439	.	AG	TT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,15;MFRL=301,398;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:56052439_AG_TT:56052439:2,0,1,0
chr7	56052443	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=20,15;MFRL=301,398;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:56052439_AG_TT:56052439:2,0,1,0
chr7	56052451	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,10;MFRL=203,399;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:56052451_C_A:56052451:3,0,1,0
chr7	56052459	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,15;MFRL=190,399;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:56052451_C_A:56052451:4,0,1,0
chr7	56052472	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,16;MFRL=190,399;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:2,0:5,1,2,0
chr7	56066633	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,0:5,2:0|1:56066633_C_T:56066633:3,5,2,0
chr7	56066649	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=187,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:56066633_C_T:56066633:2,5,2,0
chr7	56119730	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,3:1,6:0,1,0,9
chr7	56120188	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,114;MMQ=60,29;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.162:41:19,0:15,6:13,22,0,6
chr7	56122058	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=136,159;MMQ=50,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.911:20:1,9:0,10:1,0,7,12
chr7	56122062	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=164,154;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:10,10,0,2
chr7	56122113	.	GATGATATAA	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=148,154;MMQ=45,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:14,0:8,2:0|1:56122113_GATGATATAA_G:56122113:12,14,0,2
chr7	56122127	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=142,154;MMQ=50,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:9,2:0|1:56122113_GATGATATAA_G:56122113:11,13,0,2
chr7	56125762	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.309:27:10,6:9,2:6,13,4,4
chr7	56127964	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=162,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:9,3:10,0:0|1:56127964_A_G:56127964:12,9,3,0
chr7	56127971	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:10,3:12,0:0|1:56127964_A_G:56127964:12,11,3,0
chr7	56129361	.	CTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=179,93;MMQ=60,44;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=26,15;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.420:5:1,2:1,0:2,1,2,0
chr7	56142519	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=179,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr7	56147589	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.252:18:8,3:5,1:3,11,1,3
chr7	56147648	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:9,0:5,8:0,14,0,8
chr7	56148702	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56148702_T_TC:56148702:0,0,1,0
chr7	56148707	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:56148702_T_TC:56148702:0,0,1,0
chr7	56148712	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	56148715	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,15;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:56148702_T_TC:56148702:0,0,1,0
chr7	56148721	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,12;MFRL=130,163;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:56148702_T_TC:56148702:1,1,1,0
chr7	56148728	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,12;MFRL=164,163;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,0:0|1:56148702_T_TC:56148702:2,1,1,0
chr7	56149071	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,331;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	56149847	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=222,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.442:11:4,0:2,3:3,3,1,4
chr7	56169419	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=168,162;MMQ=60,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,4:3,2:2,5,2,4
chr7	56173970	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:3,2:0,4:4,0,6,0
chr7	56174115	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=138,149;MMQ=60,43;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.500:36:14,11:4,7:9,9,8,10
chr7	56174140	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:8,7:3,5:5,7,5,8
chr7	56183957	.	C	CGTGGCAGTTGCTGTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.382:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr7	57188889	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=192,300;MMQ=25,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:2,8,0,2
chr7	57194463	.	AAG	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=198,95;MMQ=50,55;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:57194463_AAG_A:57194463:1,8,0,2
chr7	57194468	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=202,95;MMQ=48,55;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:57194463_AAG_A:57194463:1,7,0,2
chr7	57194472	.	C	CACACA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=202,95;MMQ=48,55;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:0|1:57194463_AAG_A:57194463:1,7,0,2
chr7	57199906	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,5,1
chr7	63537638	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=199,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.802:8:0,6:1,0:1,0,6,1
chr7	63673455	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,32,32;MFRL=124,157,101;MMQ=60,60,60;MPOS=24,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,8,10;RU=T;STR;TLOD=8.17,15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,9:0.159,0.417:21:3,1,4:3,2,5:6,3,10,2
chr7	63673608	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=145,259;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,1:6,4:0,9,1,4
chr7	63680126	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=126,90;MMQ=60,22;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,3:7,0:5,9,3,0
chr7	63727211	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=146,3269809;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:4,2:4,0:0|1:63727211_T_A:63727211:3,6,2,0
chr7	63727214	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=146,3269809;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:4,2:3,0:0|1:63727211_T_A:63727211:3,6,2,0
chr7	64004792	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=162,160;MMQ=48,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.086:32:16,0:11,2:10,20,0,2
chr7	64004817	.	AACACAC	A,AACAC	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,25,25;MFRL=166,195,192;MMQ=60,60,60;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=AC;STR;TLOD=6.28,7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.220,0.469:7:0,1,2:2,1,1:0,2,0,5
chr7	64023272	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,2:7,1:9,4,1,2
chr7	64152468	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	64166642	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr7	64169061	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr7	64275284	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,7,5
chr7	64276008	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=145,161;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:13,7:9,0:12,10,7,0
chr7	64276089	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr7	64291225	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	64291244	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	64291267	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr7	64291896	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=129,92;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,6:7,0:6,9,6,0
chr7	64378148	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,3:5,0:2,7,0,3
chr7	64389505	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=141,143;MMQ=60,58;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.804:4:1,3:0,0:0|1:64389505_G_GT:64389505:0,1,0,3
chr7	64389507	.	A	ACAAAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=141,143;MMQ=60,58;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.804:4:0,3:0,0:0|1:64389505_G_GT:64389505:0,1,0,3
chr7	64389509	.	T	TGACAAAACA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,0:0|1:64389505_G_GT:64389505:0,0,0,5
chr7	64389512	.	T	TAATTAATTCTCATA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,206;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,1:0|1:64389505_G_GT:64389505:0,0,0,4
chr7	64438403	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr7	64439938	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr7	64864800	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=180,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,4:3,1:1,7,0,5
chr7	65419353	.	T	TTTA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TTA;STR;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.787:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	65435406	.	AC	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,0:1,7:0,4,0,7
chr7	65439879	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=118,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,5:1,5:0,2,5,5
chr7	65444359	.	T	TGA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GA;STR;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,5:2,5:3,0,5,5
chr7	65541185	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr7	65547028	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=102,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.412:3:1,0:0,1:0|1:65547028_G_A:65547028:1,1,0,1
chr7	65547033	.	C	CCTGAAAACTCCTGTGGAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=203,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65547028_G_A:65547028:0,1,0,1
chr7	65547035	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=203,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65547028_G_A:65547028:0,1,0,1
chr7	65547037	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=203,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65547028_G_A:65547028:0,1,0,1
chr7	65552497	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=196,258;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,5:2,1:0,2,1,5
chr7	65552614	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr7	65554352	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:1,4,2,3
chr7	65556936	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,2,1
chr7	65599246	.	CTT	C,CT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,34,30;MFRL=111,181,140;MMQ=60,60,60;MPOS=10,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=14.05,11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,8,9:0.329,0.362:25:5,5,2:1,3,4:6,2,15,2
chr7	65599414	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,22;MFRL=191,165;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,3:7,0:1,11,0,3
chr7	65599446	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=217,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,1:3,5:0,4,1,5
chr7	65617181	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:10,5,1,1
chr7	65751460	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=161,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	65817473	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:13,2:18,2:18,13,3,1
chr7	65842128	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=17,31;MFRL=190,269;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:65842128_G_A:65842128:1,0,1,0
chr7	65842135	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=148,269;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:65842128_G_A:65842128:2,0,1,0
chr7	65842403	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=189,267;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:65842403_G_C:65842403:1,3,0,1
chr7	65842421	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,19;MFRL=184,267;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:65842403_G_C:65842403:1,2,0,1
chr7	66094008	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=176,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:2,3:6,0,2,1
chr7	66098482	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=193,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr7	66136549	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,286;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr7	66147697	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr7	66262309	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,5:0,10:0,0,9,6
chr7	66274184	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:2,5,3,0
chr7	66409881	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=163,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr7	66459145	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=174,186;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:7,0,2,0
chr7	66463195	.	A	AT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.322:19:5,2:8,4:2,11,4,2
chr7	66479606	.	AC	GA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=195,124;MMQ=60,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:66479606_AC_GA:66479606:0,4,0,1
chr7	66479609	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=195,124;MMQ=60,49;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:66479606_AC_GA:66479606:0,4,0,1
chr7	66479635	.	CG	GT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr7	66514914	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=174,60;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.245:11:6,0:2,2:0|1:66514914_A_C:66514914:8,1,1,1
chr7	66514924	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=172,60;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:2,2:0|1:66514914_A_C:66514914:7,2,1,1
chr7	66514925	.	T	TTTCCTCTCTGTTTCTTTTTCCCTTCTTTCCTTCG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=147,60;MMQ=60,49;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:66514914_A_C:66514914:6,2,1,1
chr7	66520726	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=187,130;MMQ=60,44;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,0:1,1:3,0,1,1
chr7	66582460	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=131,167;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,0:5,2:4,7,2,0
chr7	66660078	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=209,192;MMQ=60,33;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:6,1,2,0
chr7	66660286	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=139,58;MMQ=40,35;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,0:5,2:10,5,1,1
chr7	66703238	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=149,68;MMQ=39,37;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,1,1
chr7	66770933	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=187,242;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,1:6,1:9,3,2,0
chr7	66773866	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=216,133;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,0:4,4:7,0,3,1
chr7	66774157	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,5:4,5:1,4,1,9
chr7	66774515	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=201,160;MMQ=57,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:1,3:3,1:4,0,4,1
chr7	66785029	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=126,216;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,3:8,2:7,6,2,3
chr7	69583230	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,15;MFRL=145,0;MMQ=54,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.222:15:1,0:3,0:4,8,0,3
chr7	69583231	.	TAAAAAAAA	T,TAAAAAAA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=13,31,28;MFRL=0,145,95;MMQ=60,48,60;MPOS=0,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,14,21;RU=A;STR;TLOD=17.70,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,8,2:0.544,0.167:13:0,1,0:0,6,2:0,3,1,9
chr7	69583271	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=212,145;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.244:31:3,0:19,7:0,24,0,7
chr7	70231070	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=213,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:7,4:3,1:7,3,3,2
chr7	70233139	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=195,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr7	70249868	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=150,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:3,3:9,2:8,4,3,2
chr7	70249908	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,5:9,2:9,6,4,3
chr7	70252185	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=191,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:1,14:0,11:1,0,17,8
chr7	70254674	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:4,0,5,0
chr7	70598059	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=204,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	70885883	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=382,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:0,4:2,3:0,2,6,1
chr7	70886107	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr7	71036473	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	71135192	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=297,273;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr7	71252943	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=190,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,0:5,5:1,6,0,5
chr7	72193864	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:6,5:1,1:0|1:72193864_T_C:72193864:5,2,4,4
chr7	72193867	.	CG	AA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:6,8:1,1:0|1:72193864_T_C:72193864:5,2,4,5
chr7	72193896	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=158,49;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:11,2:2,0:5,8,1,1
chr7	72277630	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=104,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,3:6,1:9,3,1,3
chr7	72278014	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=213,93;MMQ=52,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:72278014_T_A:72278014:0,1,0,1
chr7	72278015	.	G	GCTTCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=213,93;MMQ=52,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:72278014_T_A:72278014:0,1,0,1
chr7	72280978	.	G	GTGTGTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=184,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:1,3:5,1:6,0,4,1
chr7	72412796	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=191,168;MMQ=25,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr7	72416333	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr7	72470165	.	AC	GG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=180,114;MMQ=25,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:72470165_AC_GG:72470165:0,3,0,1
chr7	72470168	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=180,114;MMQ=25,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:72470165_AC_GG:72470165:0,3,0,1
chr7	72722611	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=220,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.676:4:0,2:1,1:0|1:72722611_A_C:72722611:0,1,3,0
chr7	72722614	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=220,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:1,0:0|1:72722611_A_C:72722611:0,1,3,0
chr7	72722618	.	GA	CC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=137,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,1:1,1:0|1:72722611_A_C:72722611:0,3,3,0
chr7	72722624	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=23,34;MFRL=137,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0|1:72722611_A_C:72722611:0,7,2,0
chr7	72722627	.	CGGG	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=137,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,1:4,1:0|1:72722611_A_C:72722611:0,9,2,0
chr7	72738350	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr7	72742181	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr7	72743316	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:7,3,3,1
chr7	72755468	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=205,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	72848499	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	72850178	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,166;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:4,3:3,6:3,4,7,3
chr7	72856829	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=159,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:9,3:8,0:11,6,0,3
chr7	72857049	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=174,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:3,2:8,4:7,4,4,3
chr7	72874137	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	72966638	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=218,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:0,6,1,2
chr7	72971968	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=183,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,0:1,1:0,3,0,2
chr7	72984780	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr7	72985103	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=201,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,0:5,2:6,5,1,1
chr7	72987354	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:4,1:1,2:1,4,1,2
chr7	73010421	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=182,340;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:5,0,0,2
chr7	73010442	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=216,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:3,1,3,0
chr7	73011873	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=171,219;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:1,3,0,1
chr7	73012011	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73012011_G_T:73012011:0,0,0,1
chr7	73012032	.	G	GCTCTCTCCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73012011_G_T:73012011:0,0,0,1
chr7	73012036	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73012011_G_T:73012011:0,0,0,1
chr7	73019975	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=158,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:3,2:2,0:4,2,2,0
chr7	73020301	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,9,7
chr7	73021407	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=157,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:73021407_C_T:73021407:0,4,0,1
chr7	73021416	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=166,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:73021407_C_T:73021407:0,4,0,1
chr7	73096993	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,326;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	73105363	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=136,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:5,7,0,2
chr7	73108402	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:8,3:4,1:5,7,3,1
chr7	73112057	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=198,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,0:1,1:0,2,2,2
chr7	73112131	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:4,1,3,0
chr7	73118033	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=67,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:0,4:0,1:0,1,3,2
chr7	73118046	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=150,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:7,5:3,0:7,3,5,1
chr7	73151480	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=210,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.254:16:3,0:4,1:3,9,0,4
chr7	73246365	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=177,74;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,2:8,0:11,6,1,1
chr7	73254690	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=144,88;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:7,13:2,0:8,1,13,0
chr7	73254812	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=142,210;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,7:3,5:1,4,1,11
chr7	73254910	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,23;MFRL=134,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.390:6:0,2:2,0:1,3,0,2
chr7	73279301	.	GTCTC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=220,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=TC;STR;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:5,1,2,1
chr7	73457503	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=229,13405096;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:1,2:7,0:0|1:73457503_G_A:73457503:5,3,0,2
chr7	73457517	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=200,13405096;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:1,2:9,0:0|1:73457503_G_A:73457503:5,5,0,2
chr7	73467650	.	C	CTG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,125;MMQ=60,56;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=TG;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.840:3:0,0:0,1:0,0,1,2
chr7	73469169	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=79,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,1:3,1:2,3,1,1
chr7	73470714	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=113,284;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,1:6,2:4,6,1,2
chr7	73470782	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.776:16:2,7:1,5:1,2,5,8
chr7	73472050	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=62,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,7:4,3:3,4,5,5
chr7	73474825	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=124,110;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,1:11,2:9,13,2,1
chr7	73483084	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=160,63;MMQ=60,22;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,0:6,3:5,12,0,3
chr7	73526347	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	73530046	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=193,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,2:1,0:1,0,3,0
chr7	73664227	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=192,258;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr7	73753135	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=189,1410;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:3,7,2,0
chr7	73771011	.	G	GAAGCTGAATTGACAAAGGACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=201,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr7	73778579	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=153,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:7,2,0,2
chr7	73803388	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:6,4,2,0
chr7	73811610	.	G	GTGGAACGAAGGAAATCCTCGTTTTCGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=217,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr7	73973935	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=187,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:5,7,2,0
chr7	74105219	.	ATGT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=185,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGT;STR;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr7	74105540	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=161,238;MMQ=50,49;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:1,0:0,1:0,2,0,3
chr7	74114847	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=205,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,5:4,4:2,5,2,7
chr7	74147031	.	C	CAGAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=192,196;MMQ=31,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:74147031_C_CAGAA:74147031:1,1,0,1
chr7	74147032	.	T	TAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=192,196;MMQ=31,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:74147031_C_CAGAA:74147031:1,1,0,1
chr7	74147094	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=167,218;MMQ=37,37;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	74160361	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=233,197;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr7	74203090	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=177,170;MMQ=60,37;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74203090_G_A:74203090:0,1,0,1
chr7	74203093	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=177,170;MMQ=60,37;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:74203090_G_A:74203090:0,1,0,1
chr7	74203095	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,170;MMQ=60,37;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74203090_G_A:74203090:0,0,0,1
chr7	74212036	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=187,147;MMQ=27,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,6:3,5:4,3,4,7
chr7	74212048	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=157,159;MMQ=27,34;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:5,7:2,7:6,1,5,9
chr7	74227254	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,231;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	74300286	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74300286_G_GT:74300286:0,0,0,1
chr7	74300288	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74300286_G_GT:74300286:0,0,0,1
chr7	74301294	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,69;MMQ=24,21;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:11,0:8,18:9,10,0,18
chr7	75052528	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=298,121;MMQ=55,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr7	75068456	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=142,94;MMQ=27,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:22,0:5,3:7,21,1,2
chr7	75070186	.	GG	AA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=139,100;MMQ=27,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,2:8,0:17,4,1,1
chr7	75070203	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=142,104;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.346:21:7,5:7,2:8,6,5,2
chr7	75145136	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=198,214;MMQ=40,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:3,1:2,1:4,1,0,2
chr7	75145411	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr7	75176196	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=240,87;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr7	75182960	.	AG	GA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:75182960_AG_GA:75182960:0,4,0,1
chr7	75182964	.	G	GTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:75182960_AG_GA:75182960:0,4,0,1
chr7	75182965	.	C	CAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=133,145;MMQ=60,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr7	75182966	.	GCC	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=177,135;MMQ=60,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr7	75183394	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=195,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:75183394_T_A:75183394:9,2,1,1
chr7	75183403	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=198,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:4,7:4,1:0|1:75183394_T_A:75183394:6,2,7,1
chr7	75185985	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=223,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr7	75191534	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=243,234;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:75191534_G_A:75191534:0,3,0,1
chr7	75191558	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=243,234;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:75191534_G_A:75191534:0,3,0,1
chr7	75203236	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=195,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.361:6:1,2:2,0:0|1:75203236_G_GA:75203236:1,3,1,1
chr7	75203238	.	A	AAATGGTTGGATGTATGAATGGTTG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=195,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.368:6:1,2:3,0:0|1:75203236_G_GA:75203236:1,3,1,1
chr7	75216202	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=236,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.593:5:0,1:1,2:0,2,1,2
chr7	75401551	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=192,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:0,5,1,2
chr7	75441108	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=245,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0|1:75441108_C_T:75441108:1,0,5,0
chr7	75441111	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=245,75;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0|1:75441108_C_T:75441108:1,0,4,0
chr7	75442587	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=16,20;MFRL=187,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.340:7:0,0:2,2:0|1:75442587_A_G:75442587:5,0,1,1
chr7	75442599	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=144,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.301:8:0,0:5,2:0|1:75442587_A_G:75442587:6,0,1,1
chr7	75442759	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=176,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:2,4,1,1
chr7	75442764	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=256,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:1,3,1,2
chr7	75442855	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=113,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:3,2,3,0
chr7	75610763	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=175,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:2,3:1,3:3,0,7,0
chr7	75612770	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=175,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:2,2:0,4:0|1:75612770_C_G:75612770:1,1,6,2
chr7	75612783	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=118,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:3,3:0,5:0|1:75612770_C_G:75612770:1,2,7,2
chr7	75612803	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:4,2:1,4:0|1:75612770_C_G:75612770:3,2,4,2
chr7	75614029	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=147,76;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:2,1,4,0
chr7	75614082	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,4:3,5:2,2,6,3
chr7	75614863	.	TG	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=158,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,2:3,1,4,1
chr7	75616817	.	GGACA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GACA;STR;TLOD=71.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,7,10
chr7	75621661	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,4,3
chr7	75633209	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr7	75643193	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=197,331;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,1:4,1:8,5,1,1
chr7	75651313	.	TA	T,TAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=11,28,29;MFRL=154,167,142;MMQ=60,60,60;MPOS=16,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.86,3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.300,0.298:7:0,2,1:1,0,1:0,3,0,4
chr7	75677430	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	75692927	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=159,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.317:23:11,4:5,3:7,9,6,1
chr7	75693009	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=240,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr7	75694079	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=174,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:11,4,2,0
chr7	75694345	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr7	75896535	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr7	75914934	.	G	GC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=60.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,8:0,11:0,0,13,8
chr7	76019738	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=273,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	76023088	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	76023131	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,0:0,0,4,1
chr7	76029822	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,2:9,0:11,5,1,1
chr7	76033544	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	76112487	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=197,214;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	76131586	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,110;MMQ=39,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,3:1,2,2,1
chr7	76131650	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=114,128;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:2,2,3,1
chr7	76131686	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=127,162;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:7,7,2,0
chr7	76131695	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=182,128;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:1,8:3,4:2,2,7,5
chr7	76131812	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.592:8:2,4:1,0:0,3,1,4
chr7	76132956	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=200,142;MMQ=47,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:76132956_G_A:76132956:0,4,0,1
chr7	76132958	.	C	CTTGCACCAGCATCAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=200,142;MMQ=47,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:76132956_G_A:76132956:0,4,0,1
chr7	76132962	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=117,279;MMQ=60,47;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	76142536	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:1,4,1,3
chr7	76239480	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=227,168;MMQ=39,27;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:1,0,6,0
chr7	76239503	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=175,153;MMQ=39,27;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:2,2:1,4:3,0,5,1
chr7	76240785	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=218,125;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,6:4,5:1,7,4,7
chr7	76241211	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=209,152;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:76241211_C_T:76241211:0,1,1,0
chr7	76241216	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76241211_C_T:76241211:0,0,1,0
chr7	76255032	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,5:5,0:4,3,2,3
chr7	76255452	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=195,130;MMQ=30,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,2:1,2:1,5,0,4
chr7	76255491	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=225,133;MMQ=46,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:0,4,0,3
chr7	76826313	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=164,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:1,0:2,2:0,4,0,2
chr7	76883717	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	76883989	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	76908199	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,2:6,3:4,6,4,1
chr7	76940613	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=160,249;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,1:7,2:9,1,1,2
chr7	76941547	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=198,245;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,1:4,1:0|1:76941547_C_A:76941547:0,11,0,2
chr7	76941549	.	A	AAT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=198,245;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:0|1:76941547_C_A:76941547:0,11,0,2
chr7	76943705	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=164,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:10,0:16,3:16,10,1,2
chr7	76950006	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=193,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr7	76950590	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=181,267;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr7	76958730	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=73.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,13,7
chr7	76959731	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:8,1:4,5:0,12,1,5
chr7	76984449	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=100,290;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr7	76984752	.	CAA	C,CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,32,32;MFRL=259,261,182;MMQ=60,60,60;MPOS=19,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.08,7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,4:0.210,0.396:10:0,1,3:3,1,0:0,4,2,4
chr7	77006554	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=A;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.505:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr7	77006717	.	CAA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,17;MFRL=186,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=A;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:0,0:3,0:0,3,0,4
chr7	77010580	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,344;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:2,2:8,1:7,4,3,0
chr7	77026460	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=208,300;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,2,1
chr7	77213000	.	G	GTTTTGGAATTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=181,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:0,6,1,1
chr7	77214936	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=135,288;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:9,1:0,1:3,6,2,0
chr7	77221481	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=218,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,2:6,0:6,3,0,2
chr7	77266378	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=160,257;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:7,2:4,1:6,6,1,2
chr7	77378760	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=182,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:4,2:0|1:77378760_A_G:77378760:6,7,1,1
chr7	77378766	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=186,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:0|1:77378760_A_G:77378760:6,8,1,1
chr7	77379265	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=167,101;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.417:22:5,0:8,9:0|1:77379265_TA_T:77379265:5,8,0,9
chr7	77379270	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=173,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:5,0:6,9:0|1:77379265_TA_T:77379265:5,7,0,9
chr7	77397906	.	ATAT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=220,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TAT;STR;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:2,3:5,0,2,1
chr7	77398191	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=188,245;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr7	77398198	.	GAA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:77398198_GAA_G:77398198:0,4,0,1
chr7	77398204	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:77398198_GAA_G:77398198:0,4,0,1
chr7	77402646	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:5,4:5,5:2,8,0,9
chr7	77407556	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=228,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr7	77469472	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=187,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,1:0,4:3,1,5,0
chr7	77469568	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=128,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,3:9,1:6,7,2,2
chr7	77469688	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=181,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr7	77539744	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,7:1,0:1,3,2,5
chr7	77756815	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr7	77762457	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=220,281;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,0,2
chr7	77764253	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=229,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:3,5:0,4:3,0,9,0
chr7	77764591	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr7	77797475	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	77830410	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=85,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.599:25:7,6:2,9:5,5,13,2
chr7	78118982	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=214,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr7	78119199	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:0,1:7,2:1,6,0,3
chr7	78119221	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,0:0,5:0,0,0,10
chr7	78256342	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=280,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr7	78256643	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr7	79818171	.	GGT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GT;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:2,0:6,2,1,1
chr7	79840212	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=222,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr7	80087981	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=159,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,1:2,1:4,0,2,0
chr7	80118004	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=185,278;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,1:9,1:2,11,1,1
chr7	80141069	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=223,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,2:2,5:1,2,7,0
chr7	80290369	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,4:2,9:2,2,11,2
chr7	80303460	.	ATAAG	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAAG;STR;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:8,1:10,1:2,16,0,2
chr7	80378148	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr7	80378175	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,4,5
chr7	80378319	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,6,12
chr7	80434918	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr7	80456708	.	GTTTT	G,GTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33,35;MFRL=174,163,71;MMQ=60,60,60;MPOS=25,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=23,19,22;RU=T;STR;TLOD=3.51,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.321,0.424:5:0,0,2:0,2,0:0,1,4,0
chr7	80456841	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,5,12
chr7	81346685	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=197,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:0,2:8,7:3,5,1,8
chr7	81350208	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=245,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:0,3,0,7
chr7	81350223	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=267,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,4:3,2:0,3,0,6
chr7	81359116	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=252,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr7	81372156	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=216,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr7	81374430	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=178,52;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:0|1:81374430_C_T:81374430:4,11,1,1
chr7	81374437	.	C	CTGTACTG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=178,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:81374430_C_T:81374430:3,10,1,1
chr7	81374500	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	81381326	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=320,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,5:1,0:2,0,5,0
chr7	81591716	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=86,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:13,2:7,1:12,8,1,2
chr7	81593454	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,2:3,8:3,4,7,3
chr7	81596813	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr7	81603871	.	G	GAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=176,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=A;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.497:10:1,3:3,0:3,2,3,2
chr7	81603945	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=17,25;MFRL=233,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.723:5:0,3:0,1:0,1,0,4
chr7	81634822	.	GA	G,CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,18,19;MFRL=0,135,155;MMQ=60,60,60;MPOS=27,16;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.37,6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,4:0.577,0.310:9:0,0,0:0,0,0:0,0,0,9
chr7	81641570	.	GAA	G,GAAAAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32,19;MFRL=47,132,183;MMQ=60,60,60;MPOS=22,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,16;RU=A;STR;TLOD=7.99,11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,5:0.195,0.413:12:4,1,0:0,1,2:0,4,1,7
chr7	81695842	.	TAA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=11,12;MFRL=122,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:2,0:0,1:0,6,0,3
chr7	82455963	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:3,11,0,2
chr7	82475786	.	TTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=232,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:1,3:1,0:2,0,2,1
chr7	82544087	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,29;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,0:6,2:8,4,1,1
chr7	82579296	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,3:6,0:5,6,3,0
chr7	82581488	.	T	TTCA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCA;STR;TLOD=47.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr7	82581742	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,84;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:8,4:10,0:11,7,4,0
chr7	82582982	.	TGGAGGAAGTGGTGGGGGAGGAGGGGGTGGTGGTGGAGGA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=218,219;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.438:3:1,1:0,0:1,1,1,0
chr7	82585009	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=215,165;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:5,4:14,0:11,8,4,0
chr7	82763534	.	A	AATAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=180,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=AT;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr7	82784017	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=168,272;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:2,2,6,1
chr7	82784880	.	T	A	.	.	DP=89;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=127,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,54:0.362:85:12,23:19,30:0|1:82784880_T_A:82784880:18,13,53,1
chr7	82784881	.	GTTGT	G	.	.	DP=88;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=127,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,54:0.340:87:12,24:19,30:0|1:82784880_T_A:82784880:19,14,53,1
chr7	82784886	.	C	CAGGA	.	.	DP=85;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=128,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,54:0.362:85:10,24:18,30:0|1:82784880_T_A:82784880:17,14,53,1
chr7	82784889	.	TG	AA	.	.	DP=82;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=128,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,52:0.329:82:11,16:19,29:0|1:82784880_T_A:82784880:16,14,51,1
chr7	82784892	.	T	A	.	.	DP=82;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=134,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,52:0.329:82:10,20:17,29:0|1:82784880_T_A:82784880:15,15,51,1
chr7	82784898	.	GA	AG	.	.	DP=82;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=128,161;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,51:0.291:82:11,16:17,25:0|1:82784880_T_A:82784880:17,14,51,0
chr7	82785304	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=181,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:10,1:10,4:6,14,5,0
chr7	83021799	.	TAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=194,154;MMQ=27,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.787:7:0,4:0,2:1,0,6,0
chr7	83022092	.	T	TGCCCCTGA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=200,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,1:8,1:3,9,0,2
chr7	83023587	.	TAC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=56,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.941:15:0,5:1,9:0,1,10,4
chr7	83026100	.	C	CAA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,36;MFRL=224,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr7	83026123	.	GGT	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=172,175;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:83026123_GGT_G:83026123:0,3,0,1
chr7	83026128	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=227,175;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:83026123_GGT_G:83026123:0,4,0,1
chr7	83026131	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=282,175;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:83026123_GGT_G:83026123:0,3,0,1
chr7	83029259	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=185,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr7	83029280	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr7	83029438	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.911:20:0,11:1,8:1,0,6,13
chr7	83029639	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=135,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr7	83031907	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr7	83032187	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	83034899	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=227,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,5:4,3:2,5,0,8
chr7	83035177	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=224,251;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr7	83036367	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:0,4:5,4:5,0,8,0
chr7	83036602	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=190,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr7	83047666	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,8,6
chr7	83095968	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=155,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr7	83098696	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=10,25;MFRL=102,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.799:6:0,3:0,2:0,1,0,5
chr7	83098714	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=102,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr7	83277699	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=84,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,3:1,2:1,1,5,0
chr7	83606595	.	AAT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr7	83610612	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=193,65;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:9,1,2,0
chr7	83631376	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=107,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:2,5,0,6
chr7	83631414	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:0,1:4,6:2,2,0,7
chr7	83631449	.	CAAAG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,36;MFRL=222,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr7	83643681	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=128,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,0:3,3:0|1:83643681_A_T:83643681:1,3,0,4
chr7	83643687	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=128,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0|1:83643681_A_T:83643681:1,3,0,3
chr7	83739762	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr7	83764309	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=105,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,2:2,3:1,1,0,5
chr7	83823737	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr7	84628989	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=167,88;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:5,6:6,8:4,7,4,10
chr7	84644346	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=247,243;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,5:3,2:2,1,6,1
chr7	84647477	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=203,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:4,3:1,3:5,1,6,0
chr7	84671616	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=119,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:2,0:8,10:2,9,0,11
chr7	84694695	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=194,310;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,3:6,0:10,0,3,0
chr7	86415987	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=197,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:2,10,1,2
chr7	86522420	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=132,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:2,1:4,2:1,6,0,3
chr7	86547664	.	GG	AT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=19,15;MFRL=243,227;MMQ=60,44;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:86547664_GG_AT:86547664:1,0,1,0
chr7	86547670	.	CT	AA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=17,10;MFRL=243,227;MMQ=60,44;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:86547664_GG_AT:86547664:1,0,1,0
chr7	86547674	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=15,23;MFRL=243,227;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:86547664_GG_AT:86547664:1,0,1,0
chr7	86547680	.	CT	AA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=19,15;MFRL=131,227;MMQ=60,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:86547664_GG_AT:86547664:3,0,1,0
chr7	86547687	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,15;MFRL=131,227;MMQ=60,44;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:86547664_GG_AT:86547664:3,0,1,0
chr7	86547691	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,15;MFRL=114,227;MMQ=60,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:86547664_GG_AT:86547664:2,0,1,0
chr7	86556333	.	AT	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	86567364	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=133,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr7	86594379	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=184,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,4:5,2:2,4,3,3
chr7	86594423	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=215,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr7	86795947	.	TAG	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=223,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=55.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.837:16:0,6:1,8:1,1,2,12
chr7	86822521	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=179,188;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,5:6,0:9,4,5,0
chr7	86978347	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=216,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,5:0,2:0,1,6,1
chr7	86998842	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr7	87005025	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=144,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,1:8,3:7,9,2,2
chr7	87005287	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=274,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:0,3:1,2,2,3
chr7	87006567	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=186,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr7	87011349	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:2,2,3,1
chr7	87021104	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=152,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:8,1:4,1:2,10,0,2
chr7	87022024	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=210,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,7:2,4:2,2,8,3
chr7	87022118	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=192,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:8,1:5,1:7,6,1,1
chr7	87032613	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=132,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:3,5:2,0:2,3,1,4
chr7	87053150	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr7	87053206	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=91,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:4,10:4,5:5,3,7,8
chr7	87053452	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=243,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr7	87069758	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr7	87082290	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=103,121;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:4,3,2,0
chr7	87101829	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=315,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr7	87138511	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	87138841	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=224,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:87138841_T_C:87138841:0,3,0,1
chr7	87138843	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=224,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:87138841_T_C:87138841:0,3,0,1
chr7	87160561	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=195,129;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:4,2,3,1
chr7	87165750	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,2:6,1:7,2,2,1
chr7	87168749	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	87173667	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=210,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr7	87174066	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=171,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr7	87178626	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,7:1,0:2,1,7,0
chr7	87179143	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=186,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,4:1,2:2,0,4,2
chr7	87180198	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=138,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr7	87196046	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=210,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr7	87323167	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	87476276	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=76,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:2,2,2,0
chr7	87485705	.	CTGT	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=142,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,2:4,0:0|1:87485705_CTGT_C:87485705:5,9,0,2
chr7	87485711	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:3,0:0|1:87485705_CTGT_C:87485705:5,9,0,2
chr7	87485713	.	T	TCA	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=142,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:0|1:87485705_CTGT_C:87485705:4,9,0,2
chr7	87485714	.	GGAT	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=142,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:0|1:87485705_CTGT_C:87485705:4,9,0,2
chr7	87485762	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=145,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr7	87825689	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=163,276;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:5,0,4,0
chr7	87840263	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:4,7:3,8:5,2,4,11
chr7	87908697	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=126,95;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,3:9,0:13,7,3,0
chr7	88847450	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=191,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.401:8:1,2:4,1:0|1:88847450_TA_T:88847450:2,3,3,0
chr7	88847451	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,8:0.894:8:0,3:0,5:1|0:88847450_TA_T:88847450:0,0,5,3
chr7	88847453	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=191,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0|1:88847450_TA_T:88847450:2,3,3,0
chr7	89790286	.	GA	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=163,87;MMQ=60,52;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,0:14,3:14,14,0,3
chr7	89792250	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=183,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,5:0,2:3,0,7,0
chr7	89797280	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	89861616	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=183,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,9:5,0:11,0,9,0
chr7	89861643	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=193,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:7,9:3,0:10,1,9,0
chr7	89861942	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,7,6
chr7	89867369	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=114,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:4,2,4,2
chr7	89884667	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=205,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:4,0,2,1
chr7	89884701	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:4,1,2,4
chr7	89897703	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=133,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:9,3:7,3:7,9,2,4
chr7	89901039	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,5,8
chr7	89903250	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=144,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:3,4,3,1
chr7	89906683	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=161,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,2:2,1:2,4,1,2
chr7	89926954	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=257,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr7	89927191	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr7	89933957	.	G	GTAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=171,182;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=TAGA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr7	89934197	.	AA	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:89934197_AA_TC:89934197:0,0,0,1
chr7	89934200	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:89934197_AA_TC:89934197:0,0,0,1
chr7	89934202	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:89934197_AA_TC:89934197:0,0,0,1
chr7	89938656	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=136,52;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,0:7,2:10,12,1,1
chr7	89938668	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=121,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:0|1:89938668_G_T:89938668:10,10,1,1
chr7	89938670	.	C	CAG	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=121,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,0:7,2:0|1:89938668_G_T:89938668:10,10,1,1
chr7	89938680	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=101,146;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:8,3:3,2:7,5,2,3
chr7	89939340	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=128,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,2:4,0:10,4,1,1
chr7	89969831	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=124,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:0,5:1,9:0,1,5,9
chr7	89969878	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=187,193;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:5,2:2,7,0,3
chr7	89976051	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:15,4:7,4:13,9,5,3
chr7	89983808	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,4,7
chr7	90014111	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr7	90043869	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=216,201;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:17,3:13,0:0|1:90043869_G_A:90043869:13,17,3,0
chr7	90043892	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=215,216;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:23,6:0.226:29:12,6:10,0:1|0:90043869_G_A:90043869:13,10,0,6
chr7	90225928	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=202,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:0,2:3,5:3,0,4,4
chr7	90233608	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:11,0:6,3:5,13,0,3
chr7	90233618	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.402:15:6,3:3,2:1,8,1,5
chr7	90338943	.	G	GAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=205,223;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:5,1:2,1:4,3,1,1
chr7	90339084	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=203,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:5,3:3,4:7,2,5,2
chr7	90356175	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:1,3,0,5
chr7	90377102	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.256:37:22,0:6,9:8,20,0,9
chr7	90492639	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr7	90547119	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr7	90747315	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=172,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,2:2,1,4,1
chr7	90894459	.	A	ACCG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,30;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CCG;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:2,0,2,0
chr7	90898289	.	CAA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=195,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:3,2:3,3,2,2
chr7	90898416	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,99;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:15,0:10,3:16,9,0,3
chr7	90899491	.	A	ATTTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=181,102;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=10,14;RU=T;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.351:12:3,1:4,0:3,5,3,1
chr7	91570290	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=234,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr7	91603049	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=192,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,2:11,0:10,5,1,1
chr7	91632560	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=218,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	91645387	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=186,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr7	91659150	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=198,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:5,0:2,3:6,1,2,1
chr7	91667687	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=189,220;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:91667687_G_T:91667687:2,0,1,0
chr7	91667692	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=189,220;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:91667687_G_T:91667687:2,0,1,0
chr7	91669960	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:3,3:3,0:6,1,3,1
chr7	91669979	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=181,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.391:19:3,3:3,1:7,5,7,0
chr7	91670153	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=143,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:16,0:17,3:19,14,3,0
chr7	91670318	.	ATT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=188,275;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr7	91707197	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:2,5,2,2
chr7	91713016	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=215,67;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	91727385	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=197,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:8,1:3,4:8,3,3,2
chr7	91753116	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=183,125;MMQ=40,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:9,0:11,3,2,0
chr7	91758111	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=175,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:5,3:1,0:6,0,3,0
chr7	91758422	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=191,222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,1:1,3:0,6,0,4
chr7	91761050	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,13;MFRL=179,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.310:10:4,0:3,1:7,0,1,2
chr7	91775437	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=199,102;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:3,3:6,2:7,2,1,4
chr7	91842554	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=141,268;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:3,4:8,0:5,6,3,1
chr7	91865662	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=215,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr7	92027187	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=145,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,6:0,7:0,1,2,11
chr7	92027537	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=167,220;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:8,5:8,0:3,13,3,2
chr7	92027554	.	CCAATATA	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=171,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:7,12,0,2
chr7	92028039	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=208,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:2,6:3,8:4,1,5,9
chr7	92077203	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=223,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:0,1:3,2:0,5,0,3
chr7	92100713	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,252;MMQ=60,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	92119284	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr7	92129161	.	CA	C,CAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33,32;MFRL=0,238,231;MMQ=60,60,60;MPOS=15,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.43,8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.334,0.445:6:1,2,0:0,0,3:1,0,1,4
chr7	92131289	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=176,200;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:9,5:4,5:8,5,7,3
chr7	92134147	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=127,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,4:11,0:6,16,4,0
chr7	92136499	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=180,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr7	92140397	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=191,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,3:3,7:2,4,4,6
chr7	92147479	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:3,2:12,1:9,6,1,2
chr7	92147580	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,2:4,2:4,7,3,1
chr7	92147584	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:5,5,2,3
chr7	92157802	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=190,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr7	92166146	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=130,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.495:16:4,6:2,2:3,5,7,1
chr7	92195460	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:92195460_A_C:92195460:0,2,0,1
chr7	92195467	.	A	ATTAGACTTTGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:0,0:2,1:0|1:92195460_A_C:92195460:0,2,0,1
chr7	92244422	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:7,4:8,4:13,2,8,0
chr7	92244529	.	G	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,20:0.373:53:17,2:16,15:12,21,0,20
chr7	92244630	.	TATACA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATACA;STR;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,3:3,1:2,10,0,4
chr7	92247333	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=241,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:2,2:5,3:5,2,3,2
chr7	92247539	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=141,238;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:1,1:8,2:2,7,1,2
chr7	92252249	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=197,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:6,0,2,1
chr7	92732769	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,3:6,1:7,6,2,2
chr7	92733766	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=211,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,0:3,3:4,6,1,2
chr7	92734797	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,219;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.179:37:10,6:21,0:17,14,6,0
chr7	92734983	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,73;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,1:6,3:9,6,2,2
chr7	92761880	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.126:34:12,0:16,3:21,9,0,4
chr7	92818503	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,2:5,2:8,2,3,1
chr7	92886812	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=138,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:2,6,3,2
chr7	92926605	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr7	92938116	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=150,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:15,1:6,2:14,7,2,1
chr7	93067334	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=220,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,4,1
chr7	93073147	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	93098135	.	T	TAAACAAACAAAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=167,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,6;RU=AAAC;STR;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:2,2:0,1:0,2,0,4
chr7	93116138	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	93116391	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	93520037	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:1,2:1,1:0,2,0,4
chr7	93551428	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:10,2:10,5:9,11,5,2
chr7	93551606	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,1,1
chr7	93555311	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=200,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr7	93623458	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	94026980	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=172,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:15,8,1,1
chr7	94030856	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=184,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.352:12:5,1:3,3:7,1,3,1
chr7	94030899	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:8,1:8,7,1,1
chr7	94033800	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:4,1:0,0:4,0,2,0
chr7	94037034	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=161,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr7	94037262	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=170,59;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.294:21:7,0:8,5:2,13,0,6
chr7	94039004	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:13,0:10,4:11,13,0,4
chr7	94039032	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,29:0.732:39:3,17:7,12:1,9,15,14
chr7	94039187	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=175,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:5,1:4,2:0,10,1,2
chr7	94039900	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=118,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:0,1:2,3:0,2,1,4
chr7	94040133	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr7	94040287	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=183,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:8,2:4,3:4,8,2,3
chr7	94040345	.	GTT	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=156,50;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.545:7:1,0:1,3:1,2,1,3
chr7	94040386	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=199,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:4,2:12,0:11,7,0,2
chr7	94043493	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=96,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,5:2,0:4,4,1,4
chr7	94047913	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=184,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.165:26:12,2:9,2:2,20,2,2
chr7	94048776	.	TTA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=182,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:7,3:2,3:5,4,5,1
chr7	94055933	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=243,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr7	94056244	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=168,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:4,0,5,1
chr7	94056251	.	GAAA	G,GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,34,31;MFRL=134,158,235;MMQ=60,60,60;MPOS=19,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.60,6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,3:0.284,0.329:11:3,2,2:1,1,1:4,1,3,3
chr7	94057008	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:7,0:7,2:6,9,2,0
chr7	94146975	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=173,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,4:6,5:4,7,4,5
chr7	94157585	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=133,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.644:6:1,1:0,3:0,2,0,4
chr7	94166874	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=138,84;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:12,0:11,4:7,16,0,4
chr7	94174854	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=200,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,7:4,7:4,4,9,5
chr7	94175073	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=164,253;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr7	94178749	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=240,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:0|1:94178749_T_C:94178749:2,0,3,0
chr7	94178761	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0|1:94178749_T_C:94178749:1,0,4,0
chr7	94247971	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=217,247;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,4,1
chr7	94257449	.	T	TACAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=AC;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr7	94285209	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=178,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr7	94292802	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=22,21;MFRL=170,316;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:94292802_T_TC:94292802:3,0,1,0
chr7	94292811	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,13;MFRL=147,316;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:0,0:0|1:94292802_T_TC:94292802:2,0,1,0
chr7	94292816	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,13;MFRL=147,316;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:1,0:3,0:0|1:94292802_T_TC:94292802:4,0,1,0
chr7	94297293	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=105,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=32.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.749:16:1,3:3,8:1,3,9,3
chr7	94298860	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,143;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:10,0:11,4:9,12,1,3
chr7	94931433	.	ACC	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=33,30;MFRL=191,192;MMQ=30,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr7	94931434	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=0,15;MFRL=0,191;MMQ=60,30;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.719:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr7	94931438	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:94931438_G_A:94931438:0,0,3,0
chr7	94931442	.	TGAGAA	T	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=15,15;MFRL=185,191;MMQ=40,30;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:94931442_TGAGAA_T:94931442:1,0,1,0
chr7	94931443	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,15;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:94931443_G_T:94931443:0,0,1,0
chr7	94931445	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,15;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:94931443_G_T:94931443:0,0,1,0
chr7	94931450	.	A	ATTTT,T	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,10,25;MFRL=0,191,185;MMQ=60,30,40;MPOS=-2147483648,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,0,1:0,0,2,0
chr7	94931452	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,19;MFRL=0,188;MMQ=60,35;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:94931438_G_A:94931438:0,0,2,0
chr7	94931456	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,17;MFRL=211,191;MMQ=60,30;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:94931442_TGAGAA_T:94931442:0,1,1,0
chr7	94931460	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=30,15;MFRL=106,191;MMQ=60,30;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:94931442_TGAGAA_T:94931442:0,2,1,0
chr7	94931462	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=30,15;MFRL=106,191;MMQ=60,30;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:94931442_TGAGAA_T:94931442:0,2,1,0
chr7	94935787	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=287,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr7	94946084	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:4,6,1,1
chr7	94947771	.	AGG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=195,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:94947771_AGG_A:94947771:0,3,0,1
chr7	94947775	.	A	ACAGAGCCCTAGAGAGGATATTAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=195,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:94947771_AGG_A:94947771:0,3,0,1
chr7	94953895	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=223,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr7	94989255	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	94989504	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=184,254;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:0,12,0,2
chr7	95024007	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:10,1:8,3:10,8,0,4
chr7	95024046	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=181,66;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,2:5,2:1,8,1,3
chr7	95025600	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,230;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:8,2:10,4:11,7,2,4
chr7	95034821	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,2:1,5:1,2,1,6
chr7	95035582	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=241,222;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:1,2,1,3
chr7	95039173	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:5,3,1,1
chr7	95053984	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=189,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.384:4:2,1:1,0:0|1:95053984_A_T:95053984:0,3,0,1
chr7	95054007	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=185,216;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.483:3:2,1:0,0:0|1:95053984_A_T:95053984:0,2,0,1
chr7	95125050	.	CTTTTT	C,CTTT,CTTTT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,31,32,32;MFRL=0,154,149,193;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,16,9;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,11,14,15;RU=T;STR;TLOD=7.02,6.95,5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,3,2:0.273,0.362,0.274:7:0,0,1,0:0,2,2,2:0,0,6,1
chr7	95125067	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,17;MFRL=183,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:0,0:2,0:3,1,3,0
chr7	95125074	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=20,15;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:1,0:2,1:3,2,3,0
chr7	95125115	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=142,85;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.181:18:6,1:9,1:10,5,2,1
chr7	95214911	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.265:17:7,2:5,2:8,5,4,0
chr7	95216262	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=304,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr7	95221269	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:5,4:0,6:0,5,6,4
chr7	95442690	.	T	TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.634:6:0,0:1,3:0,2,0,4
chr7	95457256	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=211,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:95457256_G_A:95457256:2,0,1,0
chr7	95457273	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=190,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0|1:95457256_G_A:95457256:3,0,2,0
chr7	95657456	.	ATC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,2:8,1:7,5,3,0
chr7	95709602	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=224,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,2:0,0:2,0,2,0
chr7	95709666	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=222,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,2:4,7:1,5,9,0
chr7	95775848	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=167,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.252:17:5,3:6,0:10,3,3,1
chr7	95775871	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=153,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:3,0:10,4,2,0
chr7	95813831	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=193,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr7	95818864	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.557:6:1,0:0,2:1,2,1,2
chr7	95838331	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=156,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr7	95864108	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.835:22:2,11:1,8:2,1,9,10
chr7	96338929	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr7	96635363	.	GGCA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=197,88;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCA;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:5,1:4,1:1,10,1,1
chr7	96651406	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr7	96653691	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=168,64;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:14,0:7,2:0|1:96653691_C_T:96653691:11,10,1,1
chr7	96653708	.	C	CTGCCCTGGATTGTGG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=174,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:10,2:0|1:96653691_C_T:96653691:10,12,1,1
chr7	97486143	.	A	AGACCTGG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=150,51;MMQ=60,43;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:8,2:0|1:97486143_A_AGACCTGG:97486143:7,6,1,1
chr7	97486145	.	A	ATCTTAGCAGCTTCAGCTT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=150,51;MMQ=60,43;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:5,0:7,2:0|1:97486143_A_AGACCTGG:97486143:7,6,1,1
chr7	97486213	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=190,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:0,9,0,4
chr7	97487730	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.359:20:4,1:9,6:7,6,2,5
chr7	97619327	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,17;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:3,0:0,0:0|1:97619327_A_AG:97619327:0,3,2,0
chr7	97619328	.	T	TGGCCCCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,16;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,0:0|1:97619327_A_AG:97619327:0,3,2,0
chr7	97619332	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:0,2:0|1:97619327_A_AG:97619327:1,3,2,0
chr7	97619338	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,0:2,1:0|1:97619327_A_AG:97619327:1,4,2,0
chr7	97784061	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=149,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,3:1,3:5,2,3,3
chr7	97816327	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=161,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:2,3,0,4
chr7	97842332	.	A	ACCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:97842332_A_ACCC:97842332:0,0,0,1
chr7	97842334	.	A	ACCACCCCTGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:97842332_A_ACCC:97842332:0,0,0,1
chr7	97842336	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:97842332_A_ACCC:97842332:0,0,0,1
chr7	97846856	.	CGAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr7	97851109	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr7	97852895	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:97852895_G_A:97852895:0,0,5,0
chr7	97852899	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:97852895_G_A:97852895:0,0,5,0
chr7	97862097	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=193,265;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr7	97874094	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=208,305;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:1,0,4,2
chr7	97874143	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=182,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,3:2,0:5,0,2,1
chr7	97920623	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr7	97921834	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=205,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr7	97922773	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=205,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,1:3,8:8,2,9,0
chr7	97922933	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,220;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.364:25:5,0:11,8:4,12,0,9
chr7	97923312	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=201,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,2:3,2:6,3,4,0
chr7	97944744	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=263,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,3,1
chr7	97944789	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=241,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,5:2,3:2,1,7,1
chr7	97944933	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=241,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0|1:97944933_A_AT:97944933:0,1,1,4
chr7	97944935	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=263,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,2:1,3:0|1:97944933_A_AT:97944933:0,2,1,4
chr7	97944937	.	A	ATAATAAT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=263,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,1:2,2:0|1:97944933_A_AT:97944933:0,2,1,4
chr7	97991792	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=136,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,4:5,1:0,8,0,5
chr7	98446320	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=208,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,2:4,0:2,7,2,0
chr7	98491328	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=158,120;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,5:4,0:9,0,0,5
chr7	98491347	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=148,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:11,5:7,0:9,9,5,0
chr7	98495299	.	G	GTT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=T;STR;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.891:5:0,4:0,1:0|1:98495299_G_GTT:98495299:0,0,5,0
chr7	98495304	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0|1:98495299_G_GTT:98495299:0,0,11,2
chr7	98500956	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=118,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,6,1
chr7	98503707	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr7	98513300	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,8,3
chr7	98527701	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=172,52;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:13,0:9,3:15,7,1,2
chr7	98545880	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,0:5,2:4,3,2,0
chr7	98551152	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,318;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	98553739	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,3:2,0,6,1
chr7	98558880	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,8,6
chr7	98638268	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=149,203;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:98638268_G_T:98638268:0,1,0,1
chr7	98638273	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=149,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:98638268_G_T:98638268:0,1,0,1
chr7	98645565	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=200,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:98645565_C_G:98645565:0,3,0,1
chr7	98645570	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:98645565_C_G:98645565:0,2,0,1
chr7	98648517	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=115,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr7	98650099	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=132,261;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:1,5,1,2
chr7	98655223	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=15,33;MFRL=201,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,1:1,2:0|1:98655223_G_T:98655223:0,5,0,3
chr7	98655224	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=201,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:0|1:98655223_G_T:98655223:0,5,0,3
chr7	98655231	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=201,273;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0|1:98655223_G_T:98655223:0,5,0,2
chr7	98658130	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=210,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr7	98658144	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=124,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,0:1,0,4,0
chr7	98775453	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=156,271;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr7	98775511	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=134,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,2:0,1:4,0,3,0
chr7	98961298	.	CTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=22,21;MFRL=139,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	98961314	.	T	TCTTGAACTTCACCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:98961314_T_TCTTGAACTTCACCA:98961314:0,3,0,1
chr7	98961317	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,36;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:98961314_T_TCTTGAACTTCACCA:98961314:0,3,0,1
chr7	98961320	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:98961314_T_TCTTGAACTTCACCA:98961314:0,3,0,1
chr7	98990526	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,15;MFRL=208,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:0,1:0,3,0,3
chr7	98998125	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=185,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:5,0:1,6:0,6,0,7
chr7	99006187	.	TGCG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=161,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCG;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	99050039	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=131,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,1:2,1:3,6,0,2
chr7	99074000	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=235,271;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,4,0
chr7	99077236	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr7	99245914	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:11,0:14,2:13,13,2,0
chr7	99303094	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr7	99306566	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	99306685	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:0,13:1,6:1,0,12,7
chr7	99314986	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,2,12
chr7	99365943	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=296,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,7:0,2:1,0,8,1
chr7	99367673	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=193,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,3:5,1:4,3,4,0
chr7	99447413	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=199,231;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:99447413_T_C:99447413:0,1,0,1
chr7	99447415	.	A	AGCAATG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=234,231;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:99447413_T_C:99447413:0,2,0,1
chr7	99447417	.	C	CACTCTTAGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=234,231;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,1:1,0:0|1:99447413_T_C:99447413:0,2,0,1
chr7	99457642	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=173,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:1,2:0,5,0,3
chr7	99457652	.	A	AGACAATGGCATGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=178,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr7	99459144	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=8736967,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr7	99473624	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=181,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr7	99474729	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=312,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr7	99501313	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=115,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:2,0:2,4,1,1
chr7	99514417	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=62,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,4:6,4:2,7,0,8
chr7	99516885	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,77;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,0:6,2:7,1,1,1
chr7	99521208	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=110,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:3,4:5,2:3,5,2,4
chr7	99566068	.	GA	AC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=126,115;MMQ=60,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:2,0:10,3:2,11,0,3
chr7	99569569	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:6,12,0,2
chr7	99621579	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr7	99674870	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=163,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,5,0
chr7	99686873	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=212,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,2:7,2:9,2,4,0
chr7	99687972	.	GAA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,244;MMQ=50,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.413:10:1,1:4,2:4,2,3,1
chr7	99689385	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.122:31:10,1:17,2:16,12,1,2
chr7	99691740	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,4:3,0:4,2,4,0
chr7	99692993	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,4:4,5:9,3,7,2
chr7	99693337	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,294;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	99696370	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=232,189;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=106.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.936:29:0,13:1,15:1,0,2,26
chr7	99697038	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=131,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.570:19:4,0:4,1:6,2,0,11
chr7	99699436	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=203,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:7,0,2,1
chr7	99699626	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=206,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.383:22:5,3:5,5:5,9,1,7
chr7	99700534	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,208;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:10,0:4,3:6,8,3,0
chr7	99700954	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=295,83;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99700954_T_C:99700954:1,0,1,0
chr7	99700964	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=239,42;MMQ=60,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,2:1,0:0|1:99700954_T_C:99700954:2,0,1,1
chr7	99701176	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=177,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,3:7,1:6,7,0,4
chr7	99701640	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=136,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:2,1,2,0
chr7	99707712	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=228,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,2:1,3:3,4,3,2
chr7	99708746	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=122,89;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,3:7,0:6,6,3,0
chr7	99711461	.	AC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=205,264;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.517:8:1,0:3,2:0,4,2,2
chr7	99751017	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,2:2,3:4,4,4,1
chr7	99752566	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=196,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,1:6,2:7,2,3,0
chr7	99753121	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=255,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:1,4,1,2
chr7	99758515	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:5,8,1,1
chr7	99764572	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=139,248;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.296:18:7,1:6,4:8,5,2,3
chr7	99768939	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=100,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:2,1:6,2:4,4,0,3
chr7	99768957	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=124,91;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.288:11:1,0:7,2:1,7,1,2
chr7	99778285	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=169,74;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,2:5,1:6,4,2,1
chr7	99795739	.	A	G	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=129,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=147.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,48:0.701:68:12,48:8,0:9,11,48,0
chr7	99797031	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:6,9,1,1
chr7	99798074	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:1,0:10,3:4,7,0,3
chr7	99801719	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=130,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:5,0:8,6,2,0
chr7	99802812	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:4,7:0,1:1,3,3,5
chr7	99811313	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:7,0,6,1
chr7	99811464	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,6,10
chr7	99818137	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:0,9:5,2:2,3,6,5
chr7	99818927	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=190,228;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr7	99821381	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,9,10
chr7	99821470	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,7,9
chr7	99831168	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=131,249;MMQ=38,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,4:0,3:3,1,5,2
chr7	99917455	.	AGG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=148,128;MMQ=54,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:0|1:99917455_AGG_A:99917455:2,0,0,1
chr7	99917460	.	G	GCTGAGAGACATGGAGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=154,128;MMQ=47,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:99917455_AGG_A:99917455:2,1,0,1
chr7	99917476	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=15,12;MFRL=188,208;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.787:6:0,0:0,2:0,1,0,5
chr7	99956252	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=231,7828;MMQ=27,29;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr7	99956893	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=243,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:2,1,3,0
chr7	99957128	.	GCCT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=194,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCT;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr7	99987805	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=216,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr7	99998607	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=216,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr7	100004446	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	100013669	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=137,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:7,2:8,0:5,12,0,2
chr7	100014846	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=217,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:3,1:12,1:3,12,0,2
chr7	100016844	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=216,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:2,5,0,3
chr7	100027994	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=107,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr7	100030745	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:9,7:7,6:8,9,4,9
chr7	100064704	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:3,2:11,0:9,5,1,1
chr7	100065156	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=184,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:4,1,3,0
chr7	100065443	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.321:14:3,3:4,1:6,4,2,2
chr7	100071996	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=138,133;MMQ=60,22;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:15,4:12,0:20,8,4,0
chr7	100072031	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=101,152;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.243:31:11,4:10,3:9,15,4,3
chr7	100083078	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=166,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,1:4,2:0,11,0,3
chr7	100153287	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=125,243;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,0:9,2:12,8,2,0
chr7	100179857	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=173,239;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,2:7,1:5,5,2,1
chr7	100197594	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=176,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:3,0:0,1:0|1:100197594_A_C:100197594:2,2,2,0
chr7	100197598	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=158,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:4,1:1,0:0|1:100197594_A_C:100197594:4,2,2,0
chr7	100197866	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=192,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr7	100201230	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:0,4:1,3:0,3,0,7
chr7	100212579	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:8,6,0,2
chr7	100212824	.	CAG	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=134,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.286:15:3,1:8,2:0|1:100212824_CAG_C:100212824:0,11,4,0
chr7	100212830	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,16;MFRL=137,191;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:3,0:7,1:0|1:100212824_CAG_C:100212824:0,10,3,0
chr7	100212868	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=179,1846;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr7	100218631	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=143,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.405:10:4,1:2,2:2,4,2,2
chr7	100228730	.	A	AATT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=206,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100228730_A_AATT:100228730:0,1,0,1
chr7	100228734	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=206,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:100228730_A_AATT:100228730:0,1,0,1
chr7	100228736	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100228730_A_AATT:100228730:0,0,0,1
chr7	100228738	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100228730_A_AATT:100228730:0,0,0,1
chr7	100228740	.	T	TCAA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100228730_A_AATT:100228730:0,0,0,1
chr7	100240771	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	100244494	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,15;MFRL=292,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:100244494_C_A:100244494:0,1,1,0
chr7	100244503	.	AGA	CCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=252,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:100244494_C_A:100244494:2,1,1,0
chr7	100244510	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=252,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:3,0:0|1:100244494_C_A:100244494:2,1,1,0
chr7	100247819	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=122,153;MMQ=60,36;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr7	100274063	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:3,1:7,1:8,3,2,0
chr7	100275079	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:11,0:7,8:10,8,0,8
chr7	100280896	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr7	100282538	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=205,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:7,1:2,5:4,5,2,4
chr7	100284510	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr7	100284913	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=49.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,7:0,7:0,0,13,2
chr7	100285757	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=158,116;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,3:6,3:6,7,4,2
chr7	100285941	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=224,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr7	100285974	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	100344359	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,2,2
chr7	100345106	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=305,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,1:1,2:2,1,3,0
chr7	100348940	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=139,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:0,6,1,2
chr7	100350683	.	CCCCACAGAAAAACCCACCATT	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=145,109;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:12,0:14,9,1,1
chr7	100350724	.	C	CCT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=145,163;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:0|1:100350724_C_CCT:100350724:4,12,0,2
chr7	100350727	.	T	TTGCAGCA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=145,163;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:0|1:100350724_C_CCT:100350724:4,12,0,2
chr7	100356017	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=199,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:7,1:1,1:3,5,1,1
chr7	100356349	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,12;MFRL=61,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.643:5:0,0:1,0:1,1,0,3
chr7	100359797	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:3,0,1,3
chr7	100360042	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=162,186;MMQ=40,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=24,21;RU=T;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,1:0,0:0,1,0,2
chr7	100361391	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.536:13:3,2:3,5:2,4,4,3
chr7	100361580	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=177,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:2,3,2,0
chr7	100364685	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:7,1:12,2:8,11,3,0
chr7	100364979	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,33;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	100366203	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=219,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:0,8:5,2:3,2,7,3
chr7	100369720	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,23;MFRL=98,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	100369730	.	T	TCCAAAGATAAACATAGGACAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=175,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:100369730_T_TCCAAAGATAAACATAGGACAG:100369730:0,2,0,1
chr7	100369732	.	TT	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=175,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:100369730_T_TCCAAAGATAAACATAGGACAG:100369730:0,2,0,1
chr7	100369737	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=175,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:100369730_T_TCCAAAGATAAACATAGGACAG:100369730:0,2,0,1
chr7	100371473	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=156,119;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:6,3:3,6:0|1:100371473_C_T:100371473:6,3,4,5
chr7	100371474	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=119,156;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:3,6:6,3:0|1:100371474_G_A:100371474:4,5,6,3
chr7	100371476	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=119,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:3,6:6,3:0|1:100371474_G_A:100371474:4,5,6,3
chr7	100371479	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=156,119;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:6,2:3,5:0|1:100371473_C_T:100371473:6,3,4,5
chr7	100373271	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=186,270;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:3,2,1,1
chr7	100373367	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=102,78;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:2,1,1,2
chr7	100374260	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=209,135;MMQ=50,53;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr7	100383605	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:6,3,2,0
chr7	100385459	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=208,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:2,0:10,2:9,3,2,0
chr7	100388501	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=A;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.694:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	100389928	.	GA	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=145,223;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr7	100391644	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr7	100395434	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=199,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100395434_C_CT:100395434:0,1,0,1
chr7	100395439	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=192,178;MMQ=47,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:100395434_C_CT:100395434:0,2,0,1
chr7	100395440	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=192,178;MMQ=47,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:100395434_C_CT:100395434:0,2,0,1
chr7	100401270	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	100410657	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:4,1:0,2:2,2,2,2
chr7	100411278	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,3:4,2:3,4,3,2
chr7	100411600	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:7,9,0,2
chr7	100416250	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=173,65;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr7	100417382	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:9,7,1,1
chr7	100452079	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=183,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:100452079_A_C:100452079:4,8,0,2
chr7	100452080	.	T	TTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTCG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=183,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:6,0:0|1:100452079_A_C:100452079:4,8,0,2
chr7	100456595	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=175,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,2:3,5:2,1,0,7
chr7	100456611	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=203,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,1:1,3:2,0,0,4
chr7	100465652	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=154,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,6:4,3:4,4,2,7
chr7	100467975	.	C	CCT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,12,5
chr7	100468398	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr7	100481658	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.402:18:4,0:7,6:10,1,6,1
chr7	100482026	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=187,179;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:8,0,4,1
chr7	100482526	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:4,6:8,7:4,8,7,6
chr7	100483078	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=232,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.343:8:3,1:2,2:1,4,0,3
chr7	100484381	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:6,3:10,5:12,4,4,4
chr7	100484917	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=188,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:3,3:3,1:4,3,3,1
chr7	100486035	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=122,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:4,8:5,6:6,3,9,5
chr7	100491159	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:3,5,2,0
chr7	100663606	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr7	100675139	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=227,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:4,5,1,1
chr7	100675376	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,9;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,3:4,2:8,3,3,2
chr7	100677502	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=166,189;MMQ=60,50;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,2:13,0:14,12,2,0
chr7	100677516	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=174,153;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.393:26:9,4:6,6:0|1:100677516_A_G:100677516:10,6,5,5
chr7	100677519	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=179,153;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,10:0.379:27:9,3:7,6:0|1:100677516_A_G:100677516:10,7,5,5
chr7	100677523	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=26,35;MFRL=174,161;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.414:27:8,5:6,5:0|1:100677523_A_C:100677523:8,8,6,5
chr7	100677526	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=174,159;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.393:26:8,5:7,3:0|1:100677523_A_C:100677523:8,8,6,4
chr7	100677816	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=130,139;MMQ=52,43;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.297:24:5,6:11,0:8,9,3,4
chr7	100677873	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=151,180;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.246:26:10,4:10,2:9,11,3,3
chr7	100677944	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=143,170;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.293:29:5,4:14,4:8,13,3,5
chr7	100677974	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=151,105;MMQ=56,39;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:5,3:16,1:7,15,2,2
chr7	100677983	.	TA	CC	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=24,35;MFRL=111,59;MMQ=56,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,0:10,3:7,15,1,2
chr7	100678013	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=158,98;MMQ=60,45;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:7,2:12,2:8,13,1,3
chr7	100678370	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=149,195;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:6,2:3,3:5,5,2,3
chr7	100678417	.	AA	CC	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=28,35;MFRL=164,170;MMQ=60,50;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,1:11,0:0|1:100678417_AA_CC:100678417:9,9,1,1
chr7	100678421	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=25,29;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:4,2:7,6:5,6,4,4
chr7	100678426	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=29,32;MFRL=177,170;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,1:9,1:0|1:100678417_AA_CC:100678417:9,9,1,1
chr7	100678433	.	AC	TA	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=27,31;MFRL=177,170;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,1:10,1:0|1:100678417_AA_CC:100678417:7,10,1,1
chr7	100678442	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=32,36;MFRL=177,170;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,1:9,1:0|1:100678417_AA_CC:100678417:7,10,1,1
chr7	100678481	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=28,27;MFRL=120,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:7,2:8,3:0|1:100678481_A_T:100678481:10,7,3,2
chr7	100678483	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=30,28;MFRL=120,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:7,2:10,3:0|1:100678481_A_T:100678481:10,7,3,2
chr7	100678610	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=194,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:5,1:6,3:0|1:100678610_A_T:100678610:6,5,1,3
chr7	100678616	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=169,162;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:5,1:4,3:0|1:100678610_A_T:100678610:6,3,1,3
chr7	100678622	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=36,27;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.398:13:4,2:4,3:0|1:100678610_A_T:100678610:5,3,2,3
chr7	100678740	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,107;MMQ=60,60;MPOS=33;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:3,5,2,2
chr7	100679221	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=221,78;MMQ=52,45;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:100679221_G_T:100679221:2,2,1,1
chr7	100679240	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=163,78;MMQ=52,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:0|1:100679221_G_T:100679221:6,2,1,1
chr7	100679296	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=184,88;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:5,1:10,2:0|1:100679296_C_T:100679296:10,5,2,1
chr7	100679316	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=202,97;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,1:9,1:0|1:100679296_C_T:100679296:9,6,1,1
chr7	100679318	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=202,97;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,1:9,1:0|1:100679296_C_T:100679296:9,6,1,1
chr7	100683723	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=163,57;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,2:4,0:4,7,1,1
chr7	100685611	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=168,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:2,0:0|1:100685611_C_A:100685611:5,5,1,1
chr7	100685613	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=168,71;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:2,0:0|1:100685611_C_A:100685611:5,5,1,1
chr7	100695058	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr7	100696685	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=138,75;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:3,0:7,3:5,5,2,1
chr7	100733565	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=122,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,5:5,2:4,5,1,6
chr7	100733628	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,35;MFRL=61,294;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:100733628_A_G:100733628:2,2,0,1
chr7	100733631	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,36;MFRL=61,294;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:100733628_A_G:100733628:1,3,0,1
chr7	100733632	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,35;MFRL=61,294;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:100733628_A_G:100733628:1,3,0,1
chr7	100733648	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=0,294;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100733648_A_G:100733648:0,1,0,1
chr7	100733656	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,28;MFRL=0,294;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100733648_A_G:100733648:0,1,0,1
chr7	100775087	.	A	AAAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,30;MFRL=127,153;MMQ=51,59;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AAC;STR;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.762:5:0,1:0,2:1,0,3,1
chr7	100776931	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=137,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,3:3,1:7,1,3,1
chr7	100777267	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=183,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr7	100780176	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	100800131	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	100800635	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,4:2,0:4,3,4,0
chr7	100803710	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=223,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr7	100815279	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr7	100816527	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr7	100817676	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	100841389	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr7	100850048	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:5,2:5,4,1,2
chr7	100855107	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=176,235;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,2:6,0:7,0,2,0
chr7	100859825	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr7	100860401	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=221,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr7	100860636	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	100865847	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=395,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:0,2:1,7:1,0,8,1
chr7	100867295	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=157,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:1,8,0,2
chr7	100875678	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:0,4:1,3:1,0,4,3
chr7	100883498	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:21,2:11,1:21,11,3,0
chr7	100962202	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:4,5,2,5
chr7	100965096	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	101006216	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:101006216_G_C:101006216:0,0,1,0
chr7	101006223	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:101006216_G_C:101006216:0,0,2,0
chr7	101006230	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=218,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:101006216_G_C:101006216:1,0,2,0
chr7	101006233	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=218,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:101006216_G_C:101006216:1,0,2,0
chr7	101183108	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=181,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr7	101194424	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=165,113;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:5,2:9,3:4,10,3,2
chr7	101194461	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=157,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:3,2:9,2:2,10,1,3
chr7	101196488	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=173,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr7	101196756	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=140,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	101199257	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	101200628	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=205,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:5,1,3,1
chr7	101200669	.	A	AG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=65.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,16,4
chr7	101200835	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr7	101265350	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	101266379	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	101267435	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=206,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,4:0,3:0,1,1,6
chr7	101671294	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,3:3,1:0|1:101671294_G_A:101671294:6,1,3,1
chr7	101671302	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=184,96;MMQ=50,55;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.465:13:2,5:4,1:0|1:101671294_G_A:101671294:5,2,4,2
chr7	101713567	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=111,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr7	101713590	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=111,280;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.664:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	101740827	.	T	TTC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:11,1:4,1:2,13,0,2
chr7	101758584	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=111,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,1:2,1:3,6,0,2
chr7	101837149	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=194,228;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:2,3:8,3:6,4,5,1
chr7	101844935	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=193,78;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,6:2,0:2,4,0,6
chr7	101870599	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,11,2
chr7	101892328	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,2,1
chr7	101918640	.	A	AGGGTGAGCAACACTGAAGTGCCCCAAGC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=152,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:4,7,1,1
chr7	101926087	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr7	101926184	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=208,235;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr7	101926411	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=217,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:1,3,1,3
chr7	101957917	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr7	102038153	.	CTGTGTG	C,CTG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,32,32;MFRL=0,319,159;MMQ=60,60,60;MPOS=32,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=TG;STR;TLOD=4.15,20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,8:0.184,0.622:13:2,2,4:1,0,4:3,0,4,6
chr7	102045170	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=180,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,3:3,0:1,3,0,3
chr7	102046359	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=252,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,0:3,2:0,3,1,2
chr7	102079441	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:7,0:6,2:8,5,1,1
chr7	102079534	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,3:10,0:10,7,1,2
chr7	102086891	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr7	102100127	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:7,3,1,1
chr7	102107697	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=214,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:1,0,4,0
chr7	102108900	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=197,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,1:3,1:2,2,0,2
chr7	102109609	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=233,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,1:0,1:0,2,0,3
chr7	102110366	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	102113093	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=221,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:2,2,5,1
chr7	102119410	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr7	102136550	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=271,177;MMQ=45,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:1,6:0,3:1,0,10,0
chr7	102213012	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=186,183;MMQ=27,26;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:8,1:14,3:5,17,1,3
chr7	102213065	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=219,206;MMQ=40,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.188:30:10,2:13,3:1,24,1,4
chr7	102246277	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=194,179;MMQ=27,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,1,0
chr7	102246311	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=175,182;MMQ=37,27;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:6,0,2,1
chr7	102246447	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=169,206;MMQ=39,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,1:7,1:8,8,1,1
chr7	102246500	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=126,172;MMQ=27,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.711:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr7	102277979	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,202;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102277979_G_A:102277979:0,0,0,1
chr7	102277987	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102277979_G_A:102277979:0,0,0,1
chr7	102279514	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,169;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,0:0,0:0|1:102279514_A_AC:102279514:0,0,1,0
chr7	102279520	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=161,169;MMQ=25,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:1,0:0,0:0|1:102279514_A_AC:102279514:0,1,1,0
chr7	102279527	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=161,169;MMQ=25,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:102279514_A_AC:102279514:1,2,1,0
chr7	102312080	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=169,198;MMQ=26,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr7	102398410	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=134,195;MMQ=57,39;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.450:19:4,5:7,3:5,6,4,4
chr7	102518909	.	A	AGT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,2:3,0:0,10,0,2
chr7	102553603	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=168,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:7,0:10,3:10,7,2,1
chr7	102574999	.	TGAA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=66.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,5:0,10:0,0,5,11
chr7	102582879	.	A	AGT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102582879_A_AGT:102582879:0,0,0,1
chr7	102582880	.	A	ACC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102582879_A_AGT:102582879:0,0,0,1
chr7	102582881	.	A	ACCACT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102582879_A_AGT:102582879:0,0,0,1
chr7	102582883	.	A	ATGGT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102582879_A_AGT:102582879:0,0,0,1
chr7	102582887	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102582879_A_AGT:102582879:0,0,0,1
chr7	102724372	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr7	102727051	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.375:11:3,2:1,1:4,3,3,1
chr7	102739043	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr7	102743893	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,7,8
chr7	102760722	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr7	102948040	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,3:0,12:0,0,9,6
chr7	102962304	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=202,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,8:6,0:8,1,8,0
chr7	103002471	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=176,131;MMQ=60,55;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:10,5:15,0:8,17,5,0
chr7	103003241	.	C	CT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,19;MFRL=183,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=T;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.641:7:2,1:0,0:2,1,1,3
chr7	103018016	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr7	103019613	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr7	103033573	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr7	103130403	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=215,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr7	103136102	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	103136913	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=198,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,4:3,0:4,0,4,0
chr7	103138517	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=65.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,11,7
chr7	103138727	.	TAAAA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,3;RU=A;STR;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:1,2,0,6
chr7	103141437	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=171,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr7	103155977	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=192,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr7	103160033	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,15;MFRL=223,262;MMQ=50,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:1,0:0,0:0,2,0,2
chr7	103162370	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr7	103162607	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=133,214;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,0:8,3:9,7,2,1
chr7	103175965	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr7	103194322	.	T	TAA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=168,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,1:0|1:103194322_T_TAA:103194322:3,2,0,2
chr7	103194323	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=168,88;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0|1:103194322_T_TAA:103194322:3,2,0,2
chr7	103194327	.	T	TTAAAAAAAAATTAAAACTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=188,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:103194322_T_TAA:103194322:1,2,0,2
chr7	103206001	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=211,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.451:7:1,0:2,1:0,4,0,3
chr7	103207234	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=118,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr7	103234985	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=245,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:3,3:5,0:1,7,0,3
chr7	103275803	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:4,2,3,0
chr7	103276930	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=126,85;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,1:6,2:4,7,0,3
chr7	103293106	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=130,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:9,4,0,2
chr7	103393790	.	G	GAAGTAATAAAAGATATGAATTCGCAGACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=236,206;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.482:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr7	103417134	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0|1:103417134_G_T:103417134:0,3,0,4
chr7	103417139	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=176,124;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0|1:103417134_G_T:103417134:0,3,0,3
chr7	103557697	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr7	103824679	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=197,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:5,1:3,1:0,9,0,2
chr7	103824722	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=242,210;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.631:2:1,1:0,0:0|1:103824722_C_T:103824722:0,1,0,1
chr7	103824724	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=242,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.631:2:1,1:0,0:0|1:103824722_C_T:103824722:0,1,0,1
chr7	103828928	.	GAC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=192,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	103835732	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=73,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr7	103838120	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr7	103841365	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=114,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:11,3:8,1:13,6,3,1
chr7	103844557	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=194,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,0:1,3:1,1,3,0
chr7	104377453	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	104707158	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.433:9:3,3:2,1:3,2,4,0
chr7	104741842	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	104745818	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr7	104748331	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=166,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,1:10,1:12,8,0,2
chr7	104748407	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=14,17;MFRL=187,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:0,0:1,1:0,4,0,4
chr7	104751143	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=173,64;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,3:4,0:7,4,3,0
chr7	104753240	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=175,232;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,2:5,1:0|1:104753240_A_C:104753240:0,8,3,0
chr7	104753246	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=160,232;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:3,2:5,1:0|1:104753240_A_C:104753240:3,9,3,0
chr7	104753252	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=160,232;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,2:6,0:0|1:104753240_A_C:104753240:3,9,3,0
chr7	104753254	.	CTGGTCCTG	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=171,229;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:6,1:6,0:0|1:104753240_A_C:104753240:15,11,2,0
chr7	104758250	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=215,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,1:6,2:5,3,2,1
chr7	104782891	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=203,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:4,12,0,2
chr7	104787010	.	ATATG	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,1:8,1:0|1:104787010_ATATG_A:104787010:10,11,0,2
chr7	104787016	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,1:8,1:0|1:104787010_ATATG_A:104787010:10,10,0,2
chr7	104787019	.	ATC	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,1:7,1:0|1:104787010_ATATG_A:104787010:8,10,0,2
chr7	104800939	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,9,5
chr7	104808386	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=190,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:3,1:4,2:5,2,2,1
chr7	104844328	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	105112489	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=206,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:3,0,4,0
chr7	105112744	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=225,247;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:5,0:1,12:0,6,0,12
chr7	105122660	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=200,260;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:4,0,3,0
chr7	105146593	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,7:0,2:0,0,5,4
chr7	105187848	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=211,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:105187848_T_C:105187848:0,3,0,1
chr7	105187851	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=211,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:105187848_T_C:105187848:0,3,0,1
chr7	105207817	.	A	AATAAAATTTAATAGTTGTGGAAAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=242,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	105250904	.	AG	GA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=68,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr7	105250905	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr7	105280051	.	AAGGAG	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=167,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:3,2:2,0:0|1:105280051_AAGGAG_A:105280051:0,6,1,1
chr7	105280059	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=167,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:105280051_AAGGAG_A:105280051:0,6,1,1
chr7	105280063	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=167,62;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,0:0|1:105280051_AAGGAG_A:105280051:0,6,1,1
chr7	105636765	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=239,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:3,1:5,1,0,2
chr7	105641846	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=143,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:3,3,2,0
chr7	105653433	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=168,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.169:21:9,0:9,3:10,8,1,2
chr7	105662862	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:20,0:15,2:12,23,2,0
chr7	105673209	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=195,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:5,4:1,0:0,6,0,5
chr7	105732429	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=175,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:1,5,0,4
chr7	105733619	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,1,9
chr7	105738368	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=300,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr7	105752555	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:5,2:4,3:9,0,5,1
chr7	105752820	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=216,301;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr7	105753082	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=175,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:0,2:1,3:0,2,0,5
chr7	105902124	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=157,144;MMQ=49,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.415:22:5,4:8,5:6,7,5,4
chr7	105904150	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=175,247;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr7	105910666	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=170,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.535:24:2,5:9,7:7,4,7,6
chr7	105910710	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:13,3:14,0:17,10,3,0
chr7	105912416	.	ACAAAAAAAAGGCTCGCAGTATAAACCCAAAGCC	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:5,1:7,1:19,6,2,0
chr7	106301545	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:9,4:14,2:12,11,3,3
chr7	106509331	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:6,6:5,8:9,2,6,8
chr7	106519943	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,8,6
chr7	106523670	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	106524689	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=150,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:5,4:8,3:8,5,3,4
chr7	106768839	.	G	GAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr7	106781445	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr7	106786952	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,6:2,1:0,4,2,5
chr7	106826439	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr7	106844031	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=163,40;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,0:8,2:0|1:106844031_C_CT:106844031:3,13,1,1
chr7	106844033	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=163,40;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:106844031_C_CT:106844031:3,13,1,1
chr7	106844038	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=163,40;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:7,2:0|1:106844031_C_CT:106844031:3,13,1,1
chr7	106844039	.	A	AGACCT	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=163,40;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:8,2:0|1:106844031_C_CT:106844031:3,13,1,1
chr7	106844045	.	CA	TC	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=174,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:0|1:106844031_C_CT:106844031:3,9,1,1
chr7	106964992	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=173,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:4,2:9,0:3,10,0,2
chr7	106965039	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=224,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:0,4,1,2
chr7	107002573	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:3,5,0,2
chr7	107198405	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=133,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,0:5,5:9,1,3,2
chr7	107207695	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=155,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr7	107216738	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr7	107217068	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,5:0,0,1,12
chr7	107218033	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=160,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr7	107393841	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:6,1:5,1:7,4,2,1
chr7	107431712	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,2:6,0:0,8,0,2
chr7	107531832	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=65.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,9:0,0,0,18
chr7	107542662	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=232,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr7	107545799	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=302,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:0,7:2,4:2,0,10,1
chr7	107559543	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=193,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,1:9,1:4,9,2,0
chr7	107564366	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:4,1,4,0
chr7	107564539	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=211,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.501:10:3,3:2,2:0|1:107564539_G_A:107564539:3,2,1,4
chr7	107564542	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=226,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.693:11:2,6:1,2:0|1:107564539_G_A:107564539:2,1,2,6
chr7	107575792	.	GTTTTTTTTTTTTT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=26,13;RU=T;STR;TLOD=38.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:0,1:2,8:2,0,10,0
chr7	107577448	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr7	107577456	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr7	107580839	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:0,6:3,4:0,3,0,10
chr7	107605123	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=214,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:3,4,1,2
chr7	107613379	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=238,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,4:0,7:1,0,11,0
chr7	107688603	.	CTTTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=178,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=24,19;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:0,0:1,0:1,2,0,1
chr7	107746246	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=129,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:107746246_T_C:107746246:4,2,1,1
chr7	107746253	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=160,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:2,0:0|1:107746246_T_C:107746246:3,3,1,1
chr7	107746432	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,3:5,1:6,8,2,2
chr7	107747081	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=218,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:2,2:6,1:0,10,0,3
chr7	107748337	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=168,284;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr7	107791018	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	107791047	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=92,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.307:8:0,0:6,2:5,1,2,0
chr7	107800925	.	CGG	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=177,68;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.296:25:7,0:9,7:0|1:107800925_CGG_C:107800925:10,8,1,6
chr7	107800937	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=192,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.307:24:8,0:7,1:0|1:107800925_CGG_C:107800925:10,7,1,6
chr7	107800953	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=194,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,5:2,5:5,1,3,7
chr7	107808639	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=294,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr7	107815858	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=130,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:1,4,0,4
chr7	107820911	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,7:0,0,1,11
chr7	107822198	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=134,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:2,1,4,1
chr7	107822396	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:1,1,1,2
chr7	107825067	.	GAC	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,1:4,1:1,5,1,1
chr7	107825108	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:0,3,1,3
chr7	107834613	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,11:0,10:0,0,11,10
chr7	107834624	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,11,11
chr7	107836117	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	107838637	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	107875170	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr7	108131925	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,3:1,2:2,4,2,3
chr7	108137253	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=250,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr7	108142919	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=175,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:1,3:8,4:3,6,0,7
chr7	108524425	.	G	GGAAATT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,14;MFRL=258,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:2,0:0,0:1,1,0,1
chr7	111372244	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=195,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:0,0:5,3:3,2,3,1
chr7	111379582	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	111379634	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,0,12
chr7	111382272	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=195,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr7	111386365	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:3,1:2,4:1,4,4,1
chr7	111386511	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr7	111487026	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=171,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:6,2,2,1
chr7	111512165	.	GC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=183,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:4,2:2,8,2,2
chr7	111535863	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=220,329;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr7	111580273	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=112,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:16,0:8,3:13,11,0,3
chr7	111629025	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=272,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:5,3:0,5:5,0,8,0
chr7	111629054	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=165,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:7,3:12,1:15,4,3,1
chr7	111936471	.	C	CTGCTCTTCCTAGAGACCTGAATTCTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=201,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr7	111958382	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=142,306;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr7	112095782	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=192,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr7	112101909	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=135,123;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.765:18:2,9:2,5:2,2,8,6
chr7	112107999	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=249,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,2:5,2:9,0,2,2
chr7	112115658	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=169,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr7	112130009	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=224,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:1,1,1,3
chr7	112723859	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,0;MMQ=60,58;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:8,11,0,2
chr7	113518604	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=129,160;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:7,13:6,0:7,6,13,0
chr7	113519719	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr7	113519752	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=172,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:12,0:4,3:5,11,0,3
chr7	114138972	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:11,0:8,4:8,12,0,4
chr7	114178279	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:4,1:0,5:2,2,5,1
chr7	114210814	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,2:7,2:8,5,2,2
chr7	114270077	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=270,23272010;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	114271579	.	CCAG	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,1306;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CAG;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:9,1:7,1:16,3,1,1
chr7	114303617	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=139,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.574:10:3,4:1,1:1,3,1,5
chr7	114304563	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=205,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr7	114655798	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:17,2:18,1:22,14,2,1
chr7	115890157	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,3:3,1:6,1,2,2
chr7	116140076	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr7	116140275	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr7	116140508	.	CG	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=205,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.312:27:6,7:13,1:9,10,0,8
chr7	116145957	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:3,4:5,0,4,1
chr7	116146149	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=148,196;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:13,0:6,5:8,11,0,5
chr7	116165233	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=163,197;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.137:27:12,3:12,0:0|1:116165233_C_T:116165233:11,13,2,1
chr7	116165237	.	G	GCC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=C;STR;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:13,3:12,0:0|1:116165233_C_T:116165233:12,13,2,1
chr7	116340270	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=201,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,0:3,2:3,10,0,2
chr7	116381121	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=191,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.449:14:1,0:5,3:0,8,0,6
chr7	116409675	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31,34;MFRL=197,158,223;MMQ=60,60,60;MPOS=13,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.05,11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,5:0.296,0.488:10:1,0,3:1,2,2:2,0,7,1
chr7	116411951	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:11,4:13,0:11,13,4,0
chr7	116421967	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=131,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr7	116550456	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr7	116556294	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=259,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:0,5,2,0
chr7	116596670	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,2:7,0:10,8,2,0
chr7	116596697	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,11,9
chr7	116606301	.	C	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=155,150;MMQ=50,40;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=20,39;RU=T;STR;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:1,0:0,2,0,3
chr7	116607501	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr7	116660604	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=229,244;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:0,0:4,2:8,0,3,0
chr7	116660803	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,0,16
chr7	116770715	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=251,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr7	116962933	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=185,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr7	117023237	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=226,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr7	117176568	.	AGATT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=200,243;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GATT;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:2,3:4,0,3,0
chr7	117176738	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=219,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:2,6,2,3
chr7	117188797	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=198,158;MMQ=40,27;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:10,4:7,1:4,13,2,3
chr7	117188840	.	AGTT	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=180,148;MMQ=40,34;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:8,2:13,11,0,2
chr7	117188850	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=180,157;MMQ=40,34;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:12,0:8,4:11,9,1,3
chr7	117199457	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=249,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,0:5,2:12,0,2,0
chr7	117199533	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.234:19:7,2:8,2:8,7,3,1
chr7	117235196	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=199,423;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr7	117267511	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=216,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr7	117267851	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=208,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	117417476	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=211,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr7	117426484	.	AAAAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=151,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAC;STR;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.584:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr7	117450792	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:2,5:6,4:7,1,6,3
chr7	117451124	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	117824239	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=134,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:12,1:15,4:12,15,3,2
chr7	117825834	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=145,81;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:5,1:2,2:1,6,1,2
chr7	117864990	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,118;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:5,4,0,2
chr7	117867977	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=187,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:2,2:1,0:5,0,3,0
chr7	120381647	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:8,6:16,0:12,12,6,0
chr7	120428607	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,10,1
chr7	120450658	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.927:12:0,2:0,7:0,0,5,7
chr7	120590816	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=119,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.623:8:1,1:0,2:2,1,1,4
chr7	120591135	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,12;MFRL=183,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.373:17:3,0:2,0:7,3,7,0
chr7	120613297	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,1:8,1:0|1:120613297_T_A:120613297:11,9,0,2
chr7	120613300	.	A	AAAAACTTTC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,1:8,1:0|1:120613297_T_A:120613297:11,9,0,2
chr7	120613419	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr7	120655676	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,1:4,3:7,3,3,1
chr7	120739962	.	GTT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,7,2
chr7	120740225	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=166,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr7	120764573	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr7	120776080	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:7,0,3,0
chr7	120884326	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:0|1:120884326_G_T:120884326:6,14,1,1
chr7	120884332	.	CA	GG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=149,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:10,2:0|1:120884326_G_T:120884326:7,14,1,1
chr7	120884334	.	A	ATACGCT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=149,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:9,2:0|1:120884326_G_T:120884326:7,14,1,1
chr7	120906533	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,240;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,0:7,4:2,9,0,4
chr7	120906699	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=191,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:1,2:7,1:7,1,3,0
chr7	120906744	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=143,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:10,3:15,2:20,6,4,1
chr7	120965464	.	G	GCACC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CACC;STR;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,2:8,1:2,9,0,4
chr7	121000021	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=240,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr7	121012196	.	G	GA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=192,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:8,2:6,1:6,8,1,2
chr7	121653374	.	GTGA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=145,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TGA;STR;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:6,1:2,2:0|1:121653374_GTGA_G:121653374:1,7,2,1
chr7	121653398	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=151,235;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:6,1:8,3:0|1:121653374_GTGA_G:121653374:6,8,3,1
chr7	121684718	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=212,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr7	121691401	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:2,2,0,1
chr7	121698827	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=203,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,6:2,2:6,0,8,0
chr7	121719586	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,4:2,1:1,1,4,1
chr7	121719823	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:0,8,0,2
chr7	121758290	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr7	121942442	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.205:13:7,2:2,0:3,8,0,2
chr7	121942832	.	G	GACA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACA;STR;TLOD=39.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.913:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr7	121942847	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=199,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,5:1,3:2,0,6,2
chr7	121944527	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=177,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,3:1,7:0,3,0,10
chr7	121960407	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=198,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,0,4
chr7	121960438	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=148,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr7	121965437	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=357,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr7	121985556	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:5,0,1,1
chr7	122033379	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=153,259;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,2:6,2:6,4,2,2
chr7	122091477	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=95,95;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:10,0:6,6:6,10,0,6
chr7	122091566	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=131,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,2:8,1:4,10,1,2
chr7	122255436	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	122376983	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:4,7:6,0:7,3,7,0
chr7	122757505	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.307:14:5,2:5,2:8,2,3,1
chr7	122757719	.	TAA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=14,31;MFRL=179,246;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:0,0:3,2:0,8,0,2
chr7	122763193	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=192,137;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.237:19:4,4:10,0:0|1:122763193_G_T:122763193:10,5,4,0
chr7	122763199	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=176,137;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.209:22:6,4:11,0:0|1:122763193_G_T:122763193:10,8,4,0
chr7	122808313	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=215,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr7	122809111	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=187,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr7	122809234	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=212,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,3:6,7:6,4,7,3
chr7	123142588	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=172,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr7	123190493	.	A	ACTGGATACCACAAATC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:3,5:1,1:2,2,6,4
chr7	123197559	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=190,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:5,4:10,2:3,12,5,1
chr7	123269118	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=230,184;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,6:1,4:2,2,5,5
chr7	123269976	.	G	GGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr7	123295964	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	123296320	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=206,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:0,5:1,5:0,1,6,4
chr7	123324546	.	AAT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=218,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:2,6:1,6:2,1,8,4
chr7	123324745	.	CCAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=233,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr7	123329060	.	GTCTC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=248,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=TC;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:1,0:1,1:3,0,1,0
chr7	123329092	.	C	A,CAGTGAAGTCTGAGGGGGTG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,10,17;MFRL=195,174,248;MMQ=60,60,40;MPOS=26,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.239,0.209:6:2,0,0:1,0,0:4,0,2,0
chr7	123329305	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=313,153;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr7	123332378	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:6,2:2,1:9,1,3,0
chr7	123334696	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=215,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=30.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.718:12:2,3:1,6:3,0,9,0
chr7	123509300	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=175,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr7	123672215	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=158,84;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:123672215_G_T:123672215:3,6,0,2
chr7	123672219	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=158,84;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:123672215_G_T:123672215:3,6,0,2
chr7	123673568	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,308;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr7	124469267	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=149,210;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:1,2:8,0:6,3,2,0
chr7	124475296	.	T	TAAACA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAACA;STR;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.838:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	124481245	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:4,8,0,2
chr7	124499002	.	AT	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,7:1,0:0,1,7,1
chr7	126079144	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:6,10:5,3:8,3,12,1
chr7	126544012	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=202,265;MMQ=49,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr7	126544124	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=164,100;MMQ=52,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:6,0:4,3:7,3,2,1
chr7	126883062	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=214,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.208:12:6,0:2,2:0|1:126883062_T_TC:126883062:4,6,2,0
chr7	126883067	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=216,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:5,0:2,1:0|1:126883062_T_TC:126883062:5,6,2,0
chr7	127013848	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=148,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.266:28:8,0:13,7:9,12,7,0
chr7	127014059	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=153,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.179:37:18,6:13,0:17,14,6,0
chr7	127015083	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=167,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr7	127224193	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr7	127228728	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=204,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,1:2,5:0,3,0,6
chr7	127230276	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=170,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,2:3,4:1,3,0,6
chr7	127236071	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=192,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:0|1:127236071_C_T:127236071:0,8,0,2
chr7	127236080	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:0|1:127236071_C_T:127236071:0,7,0,2
chr7	127236087	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:1,2:0|1:127236071_C_T:127236071:0,7,0,2
chr7	127236328	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,89;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,5:6,0:9,2,4,1
chr7	127253550	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=107,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,1:14,2:9,14,1,2
chr7	127253714	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=145,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,4:1,3:2,0,5,3
chr7	127254457	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=203,252;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr7	127326782	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:10,2:6,5:6,10,2,5
chr7	127343330	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=161,65;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:11,0:11,5:12,10,0,5
chr7	127347733	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:6,2:8,2:4,10,1,3
chr7	127361269	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=198,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:2,1:10,0,2,0
chr7	127447499	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=174,240;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:1,4:2,0,5,3
chr7	127668832	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=114,118;MMQ=60,21;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,9:0.150:64:30,9:24,0:27,28,9,0
chr7	127669431	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=191,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:6,0:10,9:8,9,0,9
chr7	127954936	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:15,1:19,2:15,19,3,0
chr7	127957602	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	127992437	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=251,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr7	128000091	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=121,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,6:1,0:1,0,1,5
chr7	128038555	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:5,3:9,5:5,9,3,5
chr7	128040047	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:128040047_T_C:128040047:0,0,1,0
chr7	128040049	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:128040047_T_C:128040047:0,0,1,0
chr7	128098198	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:6,1:11,4:7,10,2,3
chr7	128098268	.	GT	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=137,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=44.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:7,8:3,7:9,1,8,7
chr7	128117010	.	G	GCCGGCCACGAGTCAAGCTGCCCTAC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=189,220;MMQ=31,32;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCGGCCACGAGTCAAGCTGCCCTAC;STR;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.601:6:2,0:0,2:2,0,0,4
chr7	128117049	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=205,225;MMQ=37,44;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,2:4,0:6,5,2,0
chr7	128119648	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=194,253;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:0,6,0,4
chr7	128137993	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=178,200;MMQ=40,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr7	128141083	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=109,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:1,2,1,2
chr7	128142023	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr7	128142033	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,1,4
chr7	128315995	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=336,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	128358891	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:2,2,2,0
chr7	128388541	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=190,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr7	128400003	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:128400003_A_G:128400003:0,4,0,1
chr7	128400006	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:128400003_A_G:128400003:0,4,0,1
chr7	128409225	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=128,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:4,3:8,2:3,9,0,5
chr7	128415290	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=41,30;MFRL=149,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:6,1:0,2:0,6,0,3
chr7	128415860	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=149,275;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,3:6,4:0,9,3,4
chr7	128444889	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=200,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:0,9,0,2
chr7	128445888	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=132,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:13,0:12,4:14,11,0,4
chr7	128481058	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:1,3,0,1
chr7	128481215	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,0:5,1:4,1,2,0
chr7	128482839	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=183,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:2,1:1,2:2,2,2,1
chr7	128489155	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:128489155_G_GC:128489155:0,0,1,0
chr7	128489160	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,0:0|1:128489155_G_GC:128489155:0,0,1,0
chr7	128489164	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,15;MFRL=251,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:128489155_G_GC:128489155:1,0,1,0
chr7	128489168	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,12;MFRL=126,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:128489155_G_GC:128489155:2,0,1,0
chr7	128489176	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=215,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:128489155_G_GC:128489155:4,0,1,0
chr7	128493484	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=198,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chr7	128493915	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=158,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.323:13:2,0:4,1:0|1:128493915_T_G:128493915:5,4,0,4
chr7	128493920	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=158,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.324:13:3,0:4,0:0|1:128493915_T_G:128493915:5,4,0,4
chr7	128493927	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=167,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.347:12:2,0:2,1:5,3,0,4
chr7	128498630	.	TAC	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=180,189;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,2:4,0:0,7,0,2
chr7	128498632	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=184,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.253:10:4,0:3,2:0|1:128498632_C_T:128498632:0,8,0,2
chr7	128498653	.	AAATGTGC	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=187,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:128498632_C_T:128498632:0,7,0,2
chr7	128520401	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=28,23;MFRL=118,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:2,2:0|1:128520401_A_C:128520401:0,3,3,0
chr7	128520405	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=118,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,0:3,0:0|1:128520401_A_C:128520401:1,6,3,0
chr7	128520406	.	G	GGC	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=31,24;MFRL=118,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,0:4,2:0|1:128520401_A_C:128520401:1,6,3,0
chr7	128520407	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=118,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,0:5,3:0|1:128520401_A_C:128520401:1,6,3,0
chr7	128520411	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=140,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:2,0:6,2:0|1:128520401_A_C:128520401:3,7,3,0
chr7	128520416	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=143,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:6,1:0|1:128520401_A_C:128520401:3,8,2,0
chr7	128524788	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=164,215;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr7	128527093	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=217,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:2,4,1,1
chr7	128530276	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=142,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,6,0
chr7	128531229	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=210,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr7	128533514	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=48.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,7:0,0,6,11
chr7	128544473	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,104;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr7	128587351	.	CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=182,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.405:16:6,0:3,5:5,5,2,4
chr7	128587625	.	TGGGGGATTGG	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=67,210;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:2,0:0|1:128587625_TGGGGGATTGG_T:128587625:2,3,0,1
chr7	128587640	.	GGATTGGCAAGGAGGGTGGAGGGTGCTGGA	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=67,210;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0|1:128587625_TGGGGGATTGG_T:128587625:2,3,0,1
chr7	128587672	.	CCCTTGGGTGGG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=260,210;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:128587625_TGGGGGATTGG_T:128587625:0,1,0,1
chr7	128587684	.	AAAAGTGGGAGGGCGGATGGGGCTGGGCCTGGC	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=236,210;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:1,0:0|1:128587625_TGGGGGATTGG_T:128587625:2,2,0,1
chr7	128588434	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,1,3
chr7	128597257	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=199,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:7,3:14,0:18,4,3,0
chr7	128607384	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=140,114;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:1,1:7,5:5,3,3,3
chr7	128630227	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr7	128645292	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=143,305;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,1,4
chr7	128785008	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=210,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr7	128804218	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	128829109	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=288,211;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr7	128843169	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,41;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr7	128845018	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,8:0,2:0,1,6,4
chr7	128845277	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr7	128845325	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=201,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:1,0,1,2
chr7	128845907	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=495,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr7	128845981	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:3,5:5,0:7,4,5,0
chr7	128846000	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=180,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.292:17:6,3:6,0:7,5,5,0
chr7	128846469	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	128865130	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=255,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	128865338	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	129028857	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,2:1,6:1,0,7,1
chr7	129029391	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr7	129037029	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr7	129040153	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=185,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:5,6:10,4:6,9,8,2
chr7	129093012	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr7	129094195	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr7	129096534	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,2,13
chr7	129097963	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=178,263;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr7	129098313	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	129110452	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,2:6,2:9,4,3,1
chr7	129122636	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=202,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:129122636_T_C:129122636:3,0,1,0
chr7	129122638	.	CC	GA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=202,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:129122636_T_C:129122636:3,0,1,0
chr7	129122659	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=15,22;MFRL=203,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.325:11:2,0:1,3:5,3,3,0
chr7	129125344	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=352,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:129125344_C_T:129125344:1,0,2,0
chr7	129125352	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:129125344_C_T:129125344:0,0,2,0
chr7	129297466	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=187,134;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.214:7:2,0:3,1:1,5,0,1
chr7	129297467	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.317:4:0,1:3,0:0|1:129297467_G_A:129297467:0,3,0,1
chr7	129297480	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=152,134;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr7	129297483	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:129297467_G_A:129297467:0,3,0,1
chr7	129297488	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=180,134;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr7	129330260	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=165,159;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,0:6,3:6,10,3,0
chr7	129349101	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:1,2:7,1:2,6,0,3
chr7	129350170	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=176,179;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:2,2:1,5:2,1,7,0
chr7	129351402	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=180,45;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,0:8,2:0|1:129351402_G_A:129351402:7,9,1,1
chr7	129351407	.	T	TTG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=186,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:0|1:129351402_G_A:129351402:6,9,1,1
chr7	129351444	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=240,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr7	129357298	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:0,7,1,2
chr7	129410144	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	129410195	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=285,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:2,3:2,4:4,0,9,0
chr7	129414513	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=155,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,1:4,2:6,6,1,2
chr7	129497498	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=210,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr7	129498661	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=185,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:7,1,3,1
chr7	129592275	.	CG	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=168,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:4,2:7,1,2,2
chr7	129592291	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=18,15;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.254:14:1,0:4,0:0|1:129592291_A_C:129592291:7,4,3,0
chr7	129592297	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=22,12;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.317:14:2,1:4,0:0|1:129592297_A_C:129592297:6,4,4,0
chr7	129592299	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=20,12;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:2,0:4,0:0|1:129592291_A_C:129592291:5,4,3,0
chr7	129592309	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.358:12:2,1:4,0:0|1:129592297_A_C:129592297:3,5,4,0
chr7	129592348	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=172,121;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:7,6:12,0:10,9,6,0
chr7	129592510	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=139,278;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr7	129663259	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=201,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr7	129680882	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=216,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:7,10,1,1
chr7	129710567	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=155,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.357:6:1,0:3,1:3,1,0,2
chr7	129736880	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=169,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,3:4,1:4,5,2,2
chr7	129806441	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	129825148	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,1:7,1:6,7,1,1
chr7	129825215	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:3,1:1,1:2,2,2,0
chr7	129832377	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=230,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:6,2:9,0,3,0
chr7	129841939	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.518:21:4,4:6,6:2,8,1,10
chr7	129853233	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:0|1:129853233_T_C:129853233:4,1,3,1
chr7	129853251	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:2,2:4,5:0|1:129853233_T_C:129853233:4,2,6,1
chr7	129855837	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=150,136;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:8,7:9,10:8,9,11,6
chr7	129910463	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=215,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr7	129986226	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=248,274;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr7	129986521	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=196,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,2:2,5:0,4,0,7
chr7	130007901	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=176,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr7	130007913	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=176,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr7	130008159	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr7	130023179	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=176,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:7,1,2,0
chr7	130023657	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=139,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:2,3,0,2
chr7	130136107	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=171,305;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:0,5,0,3
chr7	130136902	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=136,248;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,5:3,1:3,1,6,0
chr7	130137692	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=135,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:1,1:2,11:3,0,11,1
chr7	130138155	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr7	130140766	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=115,316;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:2,3,1,4
chr7	130142617	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:2,4,1,1
chr7	130144943	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=176,283;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:0,3,1,5
chr7	130147307	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,35;MFRL=173,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr7	130147582	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=120,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:13,0:7,3:12,8,1,2
chr7	130148507	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=145,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:3,5:0,3:1,2,3,5
chr7	130148562	.	T	TTCTTAGGAAGTG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.780:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr7	130295848	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,2:9,1:11,7,3,0
chr7	130297119	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,1:0,0:0,0,0,3
chr7	130298550	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	130351797	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=141,95;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,0:5,4:5,7,0,4
chr7	130354106	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	130356691	.	CTTTAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=193,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TTTAT;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr7	130364253	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:130364253_A_T:130364253:0,1,0,1
chr7	130364256	.	AGG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:130364253_A_T:130364253:0,1,0,1
chr7	130364261	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:130364253_A_T:130364253:0,1,0,1
chr7	131060277	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=126,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,2:6,2:2,10,1,3
chr7	131099540	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=204,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:131099540_GG_AA:131099540:1,3,0,1
chr7	131099544	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=105,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:0,1:1|0:131099540_GG_AA:131099540:1,3,0,1
chr7	131099548	.	A	ATGTTAGCTCAGAGCACACACT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=116,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1|0:131099540_GG_AA:131099540:0,2,0,1
chr7	131155588	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=98,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,3,2
chr7	131155764	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=123,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	131191536	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=274,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:3,2:0,6:0,3,0,8
chr7	131191554	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=267,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,2:0,5:0,2,0,7
chr7	131194255	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,210;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.358:26:4,3:13,6:7,10,3,6
chr7	131195531	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=209,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.555:16:4,3:3,6:0|1:131195531_T_C:131195531:5,2,4,5
chr7	131195535	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=120,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,4:0.276:16:4,3:8,1:1|0:131195531_T_C:131195531:7,5,2,2
chr7	131195852	.	G	GGCTGTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=103,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:11,1:10,1:5,16,0,2
chr7	131815220	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=231,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,8:3,4:3,2,6,6
chr7	131815310	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0,0,10,12
chr7	131815312	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=188,265;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,0:10,2:9,10,0,2
chr7	131815343	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=258,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,6:1,5:0,1,4,7
chr7	131832627	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr7	131859496	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=199,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr7	131866429	.	ACAGCC	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,18;MFRL=205,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,0:5,1:0|1:131866429_ACAGCC_A:131866429:0,9,1,1
chr7	131866437	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,18;MFRL=205,67;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,0:4,1:0|1:131866429_ACAGCC_A:131866429:0,9,1,1
chr7	131866817	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=196,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:2,2,3,1
chr7	131866833	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=155,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:4,3,2,1
chr7	132193497	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=320,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr7	132570358	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=186,241;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr7	132709293	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,6:0,1:0,2,5,2
chr7	132766584	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:3,6:3,0:4,3,5,1
chr7	132938039	.	C	CCCTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=177,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,4:2,4:3,5,0,9
chr7	132990536	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr7	133502387	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=252,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,1,3
chr7	133682181	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=112,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,2:2,6:2,1,5,3
chr7	133863343	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,2:6,2:8,4,1,3
chr7	133881919	.	ATG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=32.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.922:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr7	133933671	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,35;MFRL=177,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,3:1,1:0,2,4,0
chr7	133979545	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=208,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,3:2,2:8,1,3,2
chr7	133979552	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=160,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:7,3:2,4:7,2,4,3
chr7	133979578	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=160,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:7,7:4,5:7,4,8,4
chr7	133984878	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=207,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.421:10:4,0:1,4:3,3,3,1
chr7	134131955	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,370;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	134135751	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	134136584	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr7	134143690	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr7	134212596	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=134,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,0:13,2:13,9,1,1
chr7	134212611	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=211,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,27:0.823:32:2,9:3,18:2,3,14,13
chr7	134217729	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=160,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,0:6,3:6,7,0,3
chr7	134250320	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=182,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,10:0.439:23:8,7:5,3:0|1:134250320_C_T:134250320:6,7,4,6
chr7	134250322	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=217,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,14:0.600:23:6,9:3,5:0|1:134250320_C_T:134250320:4,5,6,8
chr7	134261674	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,125;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.297:18:6,2:7,3:8,5,3,2
chr7	134261775	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=125,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:14,0:16,3:13,18,0,3
chr7	134261819	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=165,125;MMQ=52,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:8,8,1,2
chr7	134262441	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,2:7,1:6,4,1,2
chr7	134552544	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=130,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.270:35:18,5:8,4:19,7,4,5
chr7	134552634	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,2:2,5:0,5,0,7
chr7	134576441	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=220,197;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=142.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,43:0.936:45:0,9:2,30:0,2,10,33
chr7	134576449	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=144,213;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=42.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.397:41:9,0:14,16:6,19,0,16
chr7	134576547	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=218,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr7	134626034	.	GAA	G,GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=15,18,14;MFRL=50,147,131;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=4.62,3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.395,0.306:7:0,0,0:0,1,0:0,2,1,4
chr7	134650185	.	T	TCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=205,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:3,6,1,1
chr7	134673958	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=295,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr7	134678523	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=252,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:0,3,0,7
chr7	134730151	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	134849280	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,10:0,0,10,16
chr7	134850725	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	134852399	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.712:12:0,5:3,3:3,0,9,0
chr7	134852432	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,8:0,0,16,3
chr7	134872003	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=218,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:0,3,0,7
chr7	134873355	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=147,233;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	134877935	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:5,1,5,0
chr7	134878237	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,1:3,3:6,4,5,0
chr7	134879830	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,5:2,9:2,3,9,5
chr7	134880884	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,5:6,4:5,4,4,5
chr7	134881166	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=155,261;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:134881166_G_C:134881166:0,3,0,1
chr7	134881169	.	T	TAGAATCAGCCCTTCCTCCAAGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=155,261;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:134881166_G_C:134881166:0,3,0,1
chr7	134882680	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,8,0
chr7	134882693	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr7	134890855	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:0,7:4,3:1,3,2,8
chr7	134925241	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,3:2,1,3,2
chr7	134928033	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=208,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:3,2,6,2
chr7	134936728	.	T	TCAGAGA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=230,313;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CAGAGA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.375:3:0,1:2,0:0,2,1,0
chr7	134943057	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=253,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr7	134943087	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=225,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr7	134943116	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,3,2
chr7	134943328	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr7	135047703	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr7	135048033	.	G	GAAAGAAAGAAA,C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32,35;MFRL=0,152,246;MMQ=60,30,60;MPOS=-5,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,5:0.222,0.667:6:0,1,1:0,0,4:0,0,0,6
chr7	135083052	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:2,1:1,6,0,2
chr7	135095270	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:0,9:1,9:1,0,13,6
chr7	135099901	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,265;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:4,3:8,2:5,7,3,2
chr7	135256027	.	AT	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.280:20:3,3:4,2:1,13,1,5
chr7	135262533	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,1:2,2:9,0,1,2
chr7	135272535	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.458:11:3,2:3,3:5,1,4,1
chr7	135282698	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=258,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:1,1:5,3:6,0,4,0
chr7	135285579	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=131,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,2:5,4:8,2,6,0
chr7	135285788	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr7	135301521	.	TAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=196,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,1:5,1:1,6,0,2
chr7	135301790	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=178,186;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,9:2,0:8,0,10,0
chr7	135302332	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=134,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:10,4:10,0:19,1,5,0
chr7	135304693	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,10;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.363:14:3,0:3,0:1,8,0,5
chr7	135311120	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=38,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:4,9:1,1:2,3,2,8
chr7	135311167	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=231,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr7	135358888	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=91,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:10,3:7,4:10,7,4,3
chr7	135375921	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=198,0;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.454:6:1,2:2,1:0|1:135375921_C_A:135375921:2,1,2,1
chr7	135375925	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=198,0;MMQ=60,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.453:6:1,2:2,1:0|1:135375921_C_A:135375921:2,1,2,1
chr7	135378854	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=80,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:3,5,2,1
chr7	135387495	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=285,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:4,0,3,0
chr7	135393041	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=181,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:8,4:4,1:3,10,2,3
chr7	135412273	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=212,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,3:2,5:0,3,3,5
chr7	135419078	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=137,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:135419078_AT_A:135419078:3,3,1,1
chr7	135419080	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=137,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:135419078_AT_A:135419078:3,3,1,1
chr7	135419084	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=137,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:135419078_AT_A:135419078:3,3,1,1
chr7	135421790	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=184,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr7	135661674	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.699:1:0,0:0,1:0|1:135661674_C_CAG:135661674:0,0,1,0
chr7	135661675	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=113,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,0:0,0:0|1:135661674_C_CAG:135661674:0,1,1,0
chr7	135661679	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=113,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,0:0|1:135661674_C_CAG:135661674:0,1,1,0
chr7	135661683	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=113,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0|1:135661674_C_CAG:135661674:0,1,1,0
chr7	136587843	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr7	136588109	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	136700283	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,0:8,2:5,11,0,2
chr7	136701308	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:1,8:2,4:1,2,6,6
chr7	136939582	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,6,2
chr7	137076144	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,0:3,3:1,8,0,3
chr7	137080244	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=172,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,0:3,3:8,0,3,0
chr7	137092745	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=138,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:1,3,1,4
chr7	137092781	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=149,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:6,2:0,1:1,5,0,3
chr7	137237383	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=223,189;MMQ=56,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:137237383_T_G:137237383:0,4,0,1
chr7	137237392	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=223,189;MMQ=56,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:137237383_T_G:137237383:0,4,0,1
chr7	137284480	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=243,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr7	137284524	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=209,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,1:7,1:7,1,2,0
chr7	137363384	.	AT	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=172,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.283:10:2,0:5,3:3,4,1,2
chr7	137531147	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr7	137586073	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=157,102;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,3:3,1:6,2,4,0
chr7	137586108	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=156,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,2:2,0:0|1:137586108_G_A:137586108:4,3,0,2
chr7	137586116	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=156,51;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,2:2,0:0|1:137586108_G_A:137586108:4,3,0,2
chr7	137612913	.	CTGG	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGG;STR;TLOD=69.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.595:30:9,9:1,8:6,6,11,7
chr7	137773291	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=205,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:3,3:0,4:3,0,6,1
chr7	137773563	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=167,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr7	137782593	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33,34,32;MFRL=354,173,139,213;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,25,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.25,7.48,7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,4,3:0.187,0.340,0.320:10:1,1,3,1:0,1,1,1:1,0,8,1
chr7	137798593	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=172,252;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr7	137801413	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,6:1,2:1,3,2,6
chr7	137801444	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,1,5
chr7	137801463	.	AT	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr7	137801467	.	GTA	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr7	138145216	.	CAGG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=12,35;MFRL=465,214;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AGG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr7	138200117	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=206,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,5:1,6:0,1,2,9
chr7	138279228	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr7	138281355	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=255,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr7	138310629	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	138333920	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=183,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:138333920_G_A:138333920:2,1,0,1
chr7	138333933	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=37,33;MFRL=63321672,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0|1:138333920_G_A:138333920:2,0,0,3
chr7	138356722	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=206,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:0,2:6,2:0|1:138356722_C_T:138356722:6,0,4,0
chr7	138356730	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,2:0,8:0|1:138356722_C_T:138356722:0,0,11,0
chr7	138356733	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0|1:138356722_C_T:138356722:0,0,11,0
chr7	138363767	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=196,122;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.782:15:1,7:1,4:1,2,8,4
chr7	138417538	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=182,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.341:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr7	138417596	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.645:15:3,2:2,7:3,3,8,1
chr7	138417717	.	CA	TG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=181,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.206:17:8,1:6,2:0|1:138417717_CA_TG:138417717:5,9,3,0
chr7	138417718	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,15:0.945:15:0,7:0,8:1|0:138417717_CA_TG:138417717:0,0,8,7
chr7	138418910	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,6,2
chr7	138419085	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr7	138429851	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=91,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:2,4:0,4:2,0,5,4
chr7	138447631	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,4:3,3:6,5,3,4
chr7	138453892	.	GAA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=205,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr7	138546252	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=297,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:138546252_AC_A:138546252:0,1,0,1
chr7	138546255	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=297,97;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:138546252_AC_A:138546252:0,1,0,1
chr7	138555816	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	138583840	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,192;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:3,3:4,8:5,3,8,3
chr7	138597036	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=189,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr7	138603230	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:11,0:8,4:9,11,0,4
chr7	138713715	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,319;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr7	138713741	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=319,132;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,0:0,5:0,1,0,5
chr7	138719231	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=164,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:5,4,2,0
chr7	138732274	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=138,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr7	138749718	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=143,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:16,3:7,0:14,9,3,0
chr7	138764823	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=196,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:15,3:6,0:10,11,2,1
chr7	138764848	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=196,142;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:14,0:7,3:0|1:138764848_C_T:138764848:12,9,0,3
chr7	138764853	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=198,142;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:11,0:6,2:0|1:138764848_C_T:138764848:11,9,0,3
chr7	138853242	.	TGT	CTC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=126,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:138853242_TGT_CTC:138853242:0,1,0,1
chr7	138853255	.	A	AGGTGGT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=126,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:138853242_TGT_CTC:138853242:0,1,0,1
chr7	138853259	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=126,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:138853242_TGT_CTC:138853242:0,1,0,1
chr7	138853264	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=126,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:138853242_TGT_CTC:138853242:0,1,0,1
chr7	138853266	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=126,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:138853242_TGT_CTC:138853242:0,1,0,1
chr7	138872083	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,5:2,0:2,1,5,0
chr7	139044891	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=210,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr7	139097282	.	A	AC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=208,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,4:4,3:6,6,3,5
chr7	139102490	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:7,3:7,4:2,12,1,6
chr7	139138551	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=205,88;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,2,0
chr7	139164953	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,4:6,0:8,5,2,2
chr7	139167680	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	139224992	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=207,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr7	139260013	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=168,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:11,0:5,2:0|1:139260013_G_C:139260013:5,11,2,0
chr7	139260016	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=170,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:5,2:0|1:139260013_G_C:139260013:5,12,2,0
chr7	139285351	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=180,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:7,2:6,2:7,6,1,3
chr7	139288937	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,84;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:8,2:8,3:5,11,2,3
chr7	139661682	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=182,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:8,2,0,2
chr7	139724742	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,3:7,0:0,11,0,3
chr7	139726207	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	139727043	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=151,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,2:3,1:7,2,2,1
chr7	139728584	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=198,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr7	139754451	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=182,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.727:20:3,11:2,4:4,1,9,6
chr7	139757911	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=173,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:0,10,0,2
chr7	139801777	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=217,236;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:2,5,0,2
chr7	139811071	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	139820354	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=120,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr7	139826623	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,135;MMQ=60,29;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.153:28:13,0:11,3:6,18,0,4
chr7	139876715	.	ACCG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=201,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCG;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr7	140035402	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	140036999	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=196,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr7	140037053	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=146,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:2,2:4,5:7,0,6,1
chr7	140043442	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	140044979	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=37,23;MFRL=163,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,3:0,1,5,3
chr7	140045651	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=131,118;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:8,9:10,0:16,2,9,0
chr7	140051063	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=151,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.726:20:3,12:2,2:3,2,12,3
chr7	140051091	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=167,116;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:6,6:0,2:1,5,4,5
chr7	140051790	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=233,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:2,2,2,0
chr7	140051848	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=193,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,4:7,3:9,4,5,2
chr7	140055639	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140055639_G_C:140055639:0,1,0,1
chr7	140055640	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140055639_G_C:140055639:0,1,0,1
chr7	140055642	.	A	ACAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140055639_G_C:140055639:0,1,0,1
chr7	140055648	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140055639_G_C:140055639:0,1,0,1
chr7	140069361	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=280,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr7	140082363	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:2,4:0,4:1,1,1,8
chr7	140107680	.	CTTTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=160,277;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=26,13;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr7	140125602	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=210,225;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr7	140154395	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,61;MMQ=60,47;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.155:36:14,0:17,5:15,16,4,1
chr7	140154932	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,0;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:16,3:14,0:17,14,0,3
chr7	140218464	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,1:2,5:4,4,3,3
chr7	140244627	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=195,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr7	140255623	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=204,286;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	140257841	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	140257907	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=241,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:0,1,3,2
chr7	140258000	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=296,163;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,3:1,8:1,0,6,5
chr7	140258030	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=91,56;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,0:2,2:3,2,0,2
chr7	140267094	.	GAA	G	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=149,103;MMQ=55,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:140267094_GAA_G:140267094:0,4,1,0
chr7	140267102	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=128,103;MMQ=50,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:140267094_GAA_G:140267094:0,3,1,0
chr7	140267104	.	A	C,G	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=21,32,32;MFRL=89,103,128;MMQ=47,60,60;MPOS=4,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,0,1:0,1,0:0,2,1,1
chr7	140267108	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=128,103;MMQ=50,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:140267094_GAA_G:140267094:0,3,1,0
chr7	140267112	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=32,23;MFRL=103,128;MMQ=50,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:140267112_G_A:140267112:1,2,0,1
chr7	140267116	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=32,30;MFRL=89,128;MMQ=47,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:140267112_G_A:140267112:0,2,0,1
chr7	140267128	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=30,33;MFRL=0,177;MMQ=43,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140267128_G_C:140267128:0,1,0,1
chr7	140267132	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=24,25;MFRL=0,177;MMQ=43,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140267128_G_C:140267128:0,1,0,1
chr7	140267136	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=29,24;MFRL=234,177;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140267128_G_C:140267128:0,1,0,1
chr7	140267140	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=31,31;MFRL=234,177;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140267128_G_C:140267128:0,1,0,1
chr7	140267142	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=32,23;MFRL=234,177;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140267128_G_C:140267128:0,1,0,1
chr7	140390656	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=51,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.280:16:3,1:8,3:8,4,1,3
chr7	140396472	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	140449071	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=155,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,2:8,1:12,5,2,1
chr7	140706157	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr7	141362431	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=238,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,4:1,4:1,0,8,0
chr7	141362693	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=133,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.551:7:3,1:0,2:1,2,0,4
chr7	141374115	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=356,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr7	141420707	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=114,284;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:3,3,2,0
chr7	141429515	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=87,237;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr7	141478574	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:4,3:11,1:7,8,1,3
chr7	141478800	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,186;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:13,3:8,5:8,13,7,1
chr7	141537968	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=243,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr7	141635538	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr7	141672604	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=154,182;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,3:7,4:5,5,4,3
chr7	141705515	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr7	141705540	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	141730618	.	CTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=169,240;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,1:1,2:0,4,0,4
chr7	141733994	.	T	TTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TG;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	141736798	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=182,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:7,1:9,4:4,12,0,5
chr7	141738420	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=188,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:5,0:10,4:8,7,0,4
chr7	141738436	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=181,112;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:3,0:7,4:4,6,0,4
chr7	141738504	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=234,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr7	141750203	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=225,257;MMQ=52,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,1,2
chr7	141750472	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,1:5,2:7,2,3,0
chr7	141755987	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=290,210;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr7	141759846	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=226,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:2,3,0,2
chr7	141759994	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=165,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.613:6:1,2:1,2:1,1,4,0
chr7	141760008	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=148,240;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:5,1,5,0
chr7	141760040	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=187,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:4,3:11,0:12,3,2,1
chr7	141760228	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=197,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,1:3,1:2,4,0,2
chr7	141764164	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=383,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:1,2,6,1
chr7	141794763	.	ATT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr7	141796244	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=285,144;MMQ=51,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.625:17:4,2:2,7:4,2,4,7
chr7	141796250	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,6,9
chr7	141797564	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=264,217;MMQ=37,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr7	141799396	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=235,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,1:3,1:1,2,1,1
chr7	141955390	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,250;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:5,3:8,1:8,5,2,2
chr7	141957653	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,303;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	142457204	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=35,27;MFRL=238,202;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:142457204_G_A:142457204:3,0,1,0
chr7	142457210	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=30,32;MFRL=119,202;MMQ=45,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:142457204_G_A:142457204:2,0,1,0
chr7	142457313	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=31,33;MFRL=194,202;MMQ=60,36;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:3,3:7,0:0|1:142457313_C_G:142457313:7,3,4,0
chr7	142457316	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=194,202;MMQ=60,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.311:14:3,3:7,1:0|1:142457313_C_G:142457313:7,3,4,0
chr7	142457343	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=10;MBQ=32,28;MFRL=187,184;MMQ=60,43;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:6,3:8,4:0|1:142457343_C_T:142457343:8,6,5,2
chr7	142457347	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=32,28;MFRL=181,184;MMQ=60,43;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:6,3:8,4:0|1:142457343_C_T:142457343:9,6,5,2
chr7	142457365	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=33,23;MFRL=187,138;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:7,2:7,4:0|1:142457365_G_T:142457365:8,8,4,2
chr7	142457375	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=27,22;MFRL=193,138;MMQ=60,47;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:7,2:3,4:0|1:142457365_G_T:142457365:4,7,4,2
chr7	142457382	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=26,22;MFRL=160,138;MMQ=60,47;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:6,0:4,4:0|1:142457365_G_T:142457365:5,6,4,2
chr7	142457386	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=28,28;MFRL=177,71;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:7,0:4,2:0|1:142457365_G_T:142457365:5,7,1,2
chr7	142457473	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=36,34;MFRL=193,233;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,1:8,1:0|1:142457473_C_G:142457473:2,11,0,2
chr7	142457482	.	CG	TA	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=207,233;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,1:7,1:0|1:142457473_C_G:142457473:2,9,0,2
chr7	142457501	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=200,219;MMQ=60,39;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,2:6,1:0|1:142457501_A_T:142457501:1,9,0,3
chr7	142457505	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=200,219;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:4,1:6,1:0|1:142457501_A_T:142457501:1,9,0,3
chr7	142458371	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=206,311;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:7,2:5,2:7,5,1,3
chr7	142458451	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=189,200;MMQ=60,51;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:6,3:12,2:8,10,2,3
chr7	142458638	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=199,197;MMQ=60,34;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:0,9,1,3
chr7	142458666	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=176,237;MMQ=53,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:3,2:0,8,1,2
chr7	142459543	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=267,201;MMQ=60,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0|1:142459543_A_G:142459543:4,0,3,0
chr7	142459550	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=35,30;MFRL=267,195;MMQ=60,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:142459543_A_G:142459543:4,0,2,0
chr7	142459555	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=267,195;MMQ=60,34;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:0,1:0|1:142459543_A_G:142459543:4,0,2,0
chr7	142459558	.	TG	AT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=29,23;MFRL=229,195;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:1,1:0|1:142459543_A_G:142459543:6,0,2,0
chr7	142459562	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,17;MFRL=260,195;MMQ=60,34;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,0:0|1:142459543_A_G:142459543:5,0,2,0
chr7	142459679	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=194,189;MMQ=58,30;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,4:4,1:8,3,1,4
chr7	142460187	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=158,209;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:3,2:4,1:6,1,3,0
chr7	142460250	.	TAC	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=171,143;MMQ=60,58;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:11,1:5,3:0|1:142460250_TAC_T:142460250:10,7,2,2
chr7	142460254	.	TC	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=170,143;MMQ=60,58;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:12,1:4,3:0|1:142460250_TAC_T:142460250:9,8,2,2
chr7	142460261	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=118,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:2,11:4,4:4,2,7,8
chr7	142460339	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=139,114;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,10:0.238:44:15,6:17,4:16,18,5,5
chr7	142460642	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=34,35;MFRL=225,162;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,2:4,1:2,3,2,1
chr7	142460660	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=27,36;MFRL=159,203;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:4,2:3,1:0|1:142460660_T_C:142460660:5,2,2,2
chr7	142460669	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=33,35;MFRL=175,171;MMQ=60,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:4,3:5,1:0|1:142460660_T_C:142460660:6,3,3,3
chr7	142460671	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=28,33;MFRL=175,171;MMQ=60,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:4,4:5,2:0|1:142460660_T_C:142460660:6,3,3,3
chr7	142460690	.	C	CTCTT	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=159,218;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:3,3:6,3,2,5
chr7	142460710	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=10;MBQ=25,32;MFRL=158,171;MMQ=60,55;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.319:26:5,7:13,1:9,9,2,6
chr7	142460744	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=10;MBQ=32,35;MFRL=123,11038;MMQ=60,31;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,23:0.558:41:5,21:13,2:0|1:142460744_G_C:142460744:9,9,17,6
chr7	142460752	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=10;MBQ=32,32;MFRL=123,230;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,8:0.321:26:4,5:14,0:0|1:142460744_G_C:142460744:10,8,2,6
chr7	142460764	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=33,24;MFRL=123,229;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:3,5:12,0:8,7,2,3
chr7	142460778	.	TG	CT	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=27,30;MFRL=118,230;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:7,0:6,7,2,0
chr7	142561747	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=131,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,1:13,2:13,10,3,0
chr7	142566065	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=129,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:7,1,2,0
chr7	142566285	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,2:9,0:11,7,1,1
chr7	142569561	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=169,53;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,2:5,0:0|1:142569561_C_G:142569561:9,8,0,2
chr7	142569574	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=162,53;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:13,2:4,0:0|1:142569561_C_G:142569561:7,10,0,2
chr7	142569644	.	T	TG	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=154,69;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,0:6,2:0|1:142569644_T_TG:142569644:9,8,1,1
chr7	142569647	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=169,69;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:4,2:0|1:142569644_T_TG:142569644:9,10,1,1
chr7	142569653	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=174,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:4,2:0|1:142569644_T_TG:142569644:6,10,1,1
chr7	142569841	.	TTG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=292,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr7	142571774	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=79.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,27:0.664:40:7,24:6,0:8,5,27,0
chr7	142574510	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,183;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,0:13,2:8,14,2,0
chr7	142575562	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=192,238;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.304:34:9,0:15,10:8,16,0,10
chr7	142583330	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr7	142605801	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=199,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,0:4,3:5,5,0,3
chr7	142605826	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=241,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:1,5,0,3
chr7	142609850	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=172,125;MMQ=60,20;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.191:29:8,0:16,5:14,10,0,5
chr7	142723859	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=204,224;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,11:0.429:26:7,8:8,0:0|1:142723859_C_A:142723859:8,7,11,0
chr7	142723868	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=203,224;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.414:27:7,11:9,0:0|1:142723859_C_A:142723859:8,8,11,0
chr7	142836608	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=144,66;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,0:6,2:9,7,1,1
chr7	142836627	.	AGCC	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=187,66;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,0:6,2:0|1:142836627_AGCC_A:142836627:11,6,1,1
chr7	142836632	.	TCGTTG	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=201,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,0:7,2:0|1:142836627_AGCC_A:142836627:10,7,1,1
chr7	142836640	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=202,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:6,1:0|1:142836627_AGCC_A:142836627:9,7,1,1
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chr7	143020780	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:1,4,2,1
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chr7	143036337	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=237,143;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,6:4,3:3,5,6,3
chr7	143036548	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr7	143039311	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=263,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr7	143042552	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=222,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:7,1:0,1:4,3,2,0
chr7	143042913	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:143042913_T_TA:143042913:1,3,0,2
chr7	143042915	.	G	GCTTTTCCC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:143042913_T_TA:143042913:1,3,0,2
chr7	143043377	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=230,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,0:2,5:0,3,0,5
chr7	143043607	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=233,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:3,1,1,1
chr7	143043890	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=200,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:4,2,1,1
chr7	143054585	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	143078639	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=17,14;MFRL=206,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.289:11:0,1:2,0:0|1:143078639_A_C:143078639:7,1,3,0
chr7	143078643	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=15,13;MFRL=206,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.289:11:1,0:1,0:0|1:143078639_A_C:143078639:7,1,3,0
chr7	143078648	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=18,12;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.248:13:2,0:2,0:0|1:143078639_A_C:143078639:8,2,3,0
chr7	143078651	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=20,12;MFRL=181,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.266:12:3,1:2,0:0|1:143078639_A_C:143078639:7,2,3,0
chr7	143078928	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr7	143079806	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=243,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.865:20:1,9:1,9:0,2,8,10
chr7	143085822	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=183,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:6,2:10,4:3,14,4,2
chr7	143088675	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=153,260;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,0:4,5:5,4,0,5
chr7	143088823	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.648:23:2,7:5,8:6,2,10,5
chr7	143088867	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:0,6:4,1:1,3,4,3
chr7	143088897	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:1,6,0,6
chr7	143140759	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=158,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:12,0:6,5:0|1:143140759_G_C:143140759:5,13,0,5
chr7	143140762	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=158,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:12,0:6,5:0|1:143140759_G_C:143140759:5,13,0,5
chr7	143174892	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=225,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:2,1,4,0
chr7	143175928	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=167,116;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:4,0:10,4:2,12,0,4
chr7	143417322	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,25;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	143421644	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=134,159;MMQ=25,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:3,2,2,2
chr7	143554451	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=154,156;MMQ=27,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr7	143632979	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=151,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,0:9,2:11,5,1,1
chr7	143633297	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=216,257;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr7	143657427	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=144,263;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:6,2:16,3:13,9,3,2
chr7	143657473	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=155,259;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,2:7,1:5,9,2,1
chr7	143747481	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=177,258;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:2,1,2,0
chr7	143747870	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=147,186;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:5,4:2,6:3,4,3,8
chr7	143747906	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=181,108;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:11,3:9,0:7,13,3,0
chr7	143771937	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,6,10
chr7	143806688	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=238,0;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,3:6,2:8,4,3,2
chr7	143807674	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=202,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr7	143826697	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=248,140;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.812:19:1,9:2,7:1,2,9,7
chr7	143826729	.	ACTT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=223,162;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=49.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.769:15:2,7:1,5:2,1,6,6
chr7	143827198	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=254,257;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.650:6:2,0:0,4:0,2,0,4
chr7	143956100	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=215,212;MMQ=34,24;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr7	143956126	.	A	AGGGTGGGTGGGTCACTTGAGGCCAGGAGTTTG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=209,212;MMQ=34,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr7	143956742	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=114,128;MMQ=52,51;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:1,7,0,3
chr7	143964435	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,272;MMQ=60,35;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	144015434	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0|1:144015434_A_G:144015434:0,0,17,0
chr7	144015437	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,27;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.949:17:0,5:0,9:0|1:144015434_A_G:144015434:0,0,17,0
chr7	144015462	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=125,150;MMQ=27,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.149:31:12,2:15,2:11,16,2,2
chr7	144015687	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=240,212;MMQ=27,27;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr7	144063438	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=161,137;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr7	144068163	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=156,158;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr7	144068214	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=140,197;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,2:9,1:12,3,2,1
chr7	144074193	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=235,223;MMQ=40,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:144074193_A_C:144074193:1,0,1,0
chr7	144074198	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=235,223;MMQ=40,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:144074193_A_C:144074193:1,0,1,0
chr7	144075779	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=16,12;MFRL=150,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.563:5:0,0:0,0:0|1:144075779_A_C:144075779:2,0,3,0
chr7	144075786	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=151,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.487:6:0,1:2,1:0|1:144075779_A_C:144075779:2,1,3,0
chr7	144076915	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr7	144095944	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=181,216;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,9:6,0:7,3,9,0
chr7	144096002	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,12;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:3,1:0,1:1,4,5,0
chr7	144096839	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr7	144098486	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=258,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:144098486_G_T:144098486:1,2,0,1
chr7	144098487	.	C	CCCCAATCTCCATCAGTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=258,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:144098486_G_T:144098486:1,2,0,1
chr7	144098896	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:2,5:2,2:4,1,6,1
chr7	144098922	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=160,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,1,1
chr7	144101790	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=221,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,2:3,0:6,4,0,2
chr7	144150637	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,138;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:5,5:11,0:8,8,5,0
chr7	144245543	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=85,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.291:12:2,2:4,1:6,3,3,0
chr7	144462951	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=123,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.739:21:4,4:1,12:1,4,7,9
chr7	146805228	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr7	146997203	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,12:1,8:1,0,17,3
chr7	147183143	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=182,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,0:5,4:5,9,1,3
chr7	147259438	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr7	147335933	.	CT	C,CTT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,33,33;MFRL=160,125,181;MMQ=60,60,60;MPOS=16,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.32,5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,4:0.232,0.276:13:3,2,2:3,1,2:2,4,5,2
chr7	147335947	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,11;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.299:16:6,0:3,1:3,8,5,0
chr7	147600604	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=103,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,4:2,4:2,2,7,1
chr7	147674912	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=130,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:1,3:3,0,3,1
chr7	147869670	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=330,241;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	147926734	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,4:3,2:6,4,2,4
chr7	147964091	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=207,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.843:17:1,7:1,8:1,1,10,5
chr7	148080647	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=197,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr7	148311115	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=243,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.502:10:1,3:4,2:5,0,5,0
chr7	148311241	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=186,67;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:5,6,0,2
chr7	148312382	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=190,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:1,8:1,6:2,0,8,6
chr7	148312520	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.646:12:3,4:1,4:1,3,1,7
chr7	148463860	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr7	148464675	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr7	148480990	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:1,9:2,4:0,3,6,7
chr7	148483760	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=220,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr7	148484019	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=202,296;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr7	148487329	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=230,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr7	148487395	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=275,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,6:1,3:3,3,5,4
chr7	148496276	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=206,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr7	148504716	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=46.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,12,3
chr7	148504854	.	A	AGACTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=237,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GACTT;STR;TLOD=36.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:1,5:0,4:0,1,1,8
chr7	148504906	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=A;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	148506064	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=240,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr7	148506363	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:8,7,1,1
chr7	148508833	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,49;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,0,4
chr7	148529922	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=258,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr7	148543525	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr7	148543693	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.923:9:0,6:0,2:0,0,1,8
chr7	148700083	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=165,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,1:2,1:4,1,2,1
chr7	148702157	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=205,230;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr7	148702326	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=218,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,2:10,0:8,9,1,1
chr7	148702486	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr7	148702951	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.587:3:0,1:0,0:0|1:148702951_A_C:148702951:1,0,2,0
chr7	148702958	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.602:3:0,1:1,0:0|1:148702951_A_C:148702951:1,0,2,0
chr7	148705221	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,14,3
chr7	148712092	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=167,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:3,3:9,2:4,8,3,2
chr7	148809436	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=137,240;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,0:1,1:0|1:148809436_AT_A:148809436:0,3,0,1
chr7	148809448	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=153,240;MMQ=50,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:148809436_AT_A:148809436:0,4,0,1
chr7	148809451	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=240,153;MMQ=40,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1|0:148809436_AT_A:148809436:0,1,0,4
chr7	148809453	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=153,240;MMQ=50,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:148809436_AT_A:148809436:0,4,0,1
chr7	148823366	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0|1:148823366_A_G:148823366:0,0,2,11
chr7	148823383	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=164,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:3,2:5,1:0|1:148823366_A_G:148823366:1,7,1,2
chr7	148851213	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,9:0,0,9,9
chr7	148863414	.	CAGCTCCA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=246,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.852:11:0,5:0,5:0,1,4,6
chr7	148873497	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr7	148892659	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:1,4:1,0:1,1,5,0
chr7	148903773	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=116,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:14,1:12,4:11,16,3,2
chr7	148904343	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr7	148904624	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	148907825	.	AGGGAG	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGGAG;STR;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:6,1:5,8,1,1
chr7	148907849	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=248,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:2,6:1,8:0,3,5,9
chr7	148936762	.	A	ACGG,ACGGCGGCGG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30,32;MFRL=0,147,195;MMQ=60,60,60;MPOS=22,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,7,9;RU=CGG;STR;TLOD=19.50,13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,4:0.516,0.418:9:0,1,2:0,3,2:0,0,9,0
chr7	148947698	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:1,2:5,3:5,2,2,3
chr7	149172213	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,322;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:4,4,2,0
chr7	149172619	.	T	TTCGTAGACTGTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	149191027	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:1,8:2,6:2,1,14,0
chr7	149317216	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=154,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,5:0,3:0,1,0,8
chr7	149318471	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,217;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,4:3,1:4,3,2,3
chr7	149318703	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=174,208;MMQ=60,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:1,6,0,2
chr7	149417230	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=204,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,0:1,3:4,3,2,1
chr7	149418127	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=183,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr7	149419721	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=167,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,1:2,4:0,2,1,4
chr7	149420820	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=113,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.436:21:4,2:8,5:6,6,4,5
chr7	149421061	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	149426305	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=222,98;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,2:1,4:1,0,4,2
chr7	149430367	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=204,150;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:6,4:0,3:2,4,1,6
chr7	149462621	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,1:1,2:4,3,0,3
chr7	149476666	.	G	GC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=59.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,7:0,0,11,9
chr7	149477602	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,329;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:0,10,1,1
chr7	149477936	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,77;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,0:5,3:4,2,3,0
chr7	149480903	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=196,243;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr7	149482764	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=168,206;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:4,0:1,2:3,2,0,2
chr7	149482796	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:2,6,0,2
chr7	149486574	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr7	149491933	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=186,95;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.491:22:5,9:6,0:5,6,11,0
chr7	149499115	.	CAT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	149500013	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=109,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:1,3:3,1:3,2,4,0
chr7	149500301	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=270,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr7	149500472	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=271,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,3,1
chr7	149500992	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=189,271;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	149506211	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=64.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,11:0,0,9,9
chr7	149506471	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=278,277;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr7	149510637	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=152,779;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:6,4:4,5:9,1,9,0
chr7	149511509	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=177,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr7	149511787	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=319,226;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr7	149512177	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=192,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:2,1,2,1
chr7	149512911	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=142,274;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,0:2,2:0,5,1,1
chr7	149514651	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,303;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr7	149514870	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=93,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr7	149515188	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=149,255;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:2,5,0,2
chr7	149519864	.	AAT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=256,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149519864_AAT_A:149519864:0,1,0,1
chr7	149519867	.	GTA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=256,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149519864_AAT_A:149519864:0,1,0,1
chr7	149520406	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=17,25;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:0|1:149520406_C_T:149520406:1,0,1,0
chr7	149520410	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=12,27;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:149520406_C_T:149520406:1,0,1,0
chr7	149522366	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=127,227;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:3,3,1,1
chr7	149530062	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=249,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:149530062_G_C:149530062:0,4,0,1
chr7	149530069	.	A	ACAGTCCTTGAACCTCTGCTCTCTGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=269,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:149530062_G_C:149530062:0,3,0,1
chr7	149572842	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=200,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,2:3,4:0,3,0,6
chr7	149575707	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr7	149575725	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	149575747	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=186,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,6:0,2:1,0,8,0
chr7	149575884	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=186,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,5:2,2:2,3,2,5
chr7	149576818	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=412,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr7	150034713	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=187,96;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:5,3,0,2
chr7	150036138	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,0:8,3:9,8,0,3
chr7	150093701	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=264,152;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.893:16:1,6:0,9:0,1,5,10
chr7	150094851	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	150168058	.	A	AGAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=210,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	150174079	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=218,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr7	150217970	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=138,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,2:15,1:8,18,0,3
chr7	150218007	.	ATAGT	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=155,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:2,2:8,3:4,7,0,5
chr7	150218101	.	AATAT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AT;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	150267130	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	150269542	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=218,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,4:4,5:5,3,5,4
chr7	150269917	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=130,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.269:20:8,1:7,4:7,8,1,4
chr7	150325591	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=293,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.395:11:3,4:2,0:0,7,0,4
chr7	150327234	.	CAAAAA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=16,17;MFRL=196,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=22,17;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:0,0:0,0:0,3,0,1
chr7	150384013	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=210,254;MMQ=40,45;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:6,0,4,0
chr7	150384048	.	A	AAAAG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=198,153;MMQ=40,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AAAG;STR;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,4:1,1:3,0,7,1
chr7	150384052	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=146,198;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:5,1:5,1:7,3,3,0
chr7	150384193	.	CGTGTGT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=176,192;MMQ=48,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=25,22;RU=GT;STR;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,0:1,4:0,4,0,4
chr7	150416050	.	GGTGGTTATGCCTATTT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTGGTTATGCCTATTT;STR;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr7	150437927	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,0:3,5:6,1,3,2
chr7	150438089	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,0:4,6:3,4,2,4
chr7	150439409	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,0:16,2:14,14,0,2
chr7	150439856	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=172,110;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:5,0:2,4:3,5,0,4
chr7	150446792	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.408:12:4,2:3,1:5,2,5,0
chr7	150446820	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:4,5:3,2:4,3,4,3
chr7	150447071	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:8,2:9,6:7,10,3,5
chr7	150490431	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=225,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:2,1,3,1
chr7	150490497	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=222,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:3,1:5,4,1,1
chr7	150490797	.	GGACA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,231;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GACA;STR;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:1,3:1,1,1,4
chr7	150491084	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:7,9:3,7:6,4,9,7
chr7	150491108	.	TGA	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=122,21153202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GA;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:14,0:9,2:15,8,2,0
chr7	150493442	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:3,2:5,1,3,1
chr7	150498809	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=205,311;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	150498836	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	150500455	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,9,4
chr7	150500520	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=227,230;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.472:17:5,5:4,3:4,5,4,4
chr7	150500576	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=151,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:10,1,1,1
chr7	150500605	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:11,0:2,3:8,5,3,0
chr7	150500994	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=232,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:0,5,0,3
chr7	150555810	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:2,3:2,2:4,0,4,1
chr7	150555915	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:11,1:3,2:9,5,1,2
chr7	150557748	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=169,247;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:3,5,0,3
chr7	150558366	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=135,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr7	150645031	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=202,533;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:150645031_A_T:150645031:0,1,0,1
chr7	150645034	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=202,533;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:150645031_A_T:150645031:0,1,0,1
chr7	150645682	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr7	150647569	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	150647969	.	CC	TG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,6:0,0,10,3
chr7	150648439	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr7	150654622	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr7	150671705	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:150671705_A_C:150671705:0,0,2,0
chr7	150671707	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,19;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:150671705_A_C:150671705:0,0,2,0
chr7	150671713	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,22;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:150671705_A_C:150671705:0,0,2,0
chr7	150671715	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,18;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:150671705_A_C:150671705:0,0,2,0
chr7	150671721	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:150671705_A_C:150671705:0,0,2,0
chr7	150671723	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:150671705_A_C:150671705:0,0,2,0
chr7	150671725	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,20;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:150671705_A_C:150671705:0,0,2,0
chr7	150671728	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:150671705_A_C:150671705:0,0,2,0
chr7	150698247	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	150698879	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=185,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:3,2:4,1:7,1,3,0
chr7	150703915	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=195,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:6,0,2,0
chr7	150706383	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=197,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:0,9,0,3
chr7	150706436	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,256;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr7	150707943	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=171,213;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:4,1,1,1
chr7	150708089	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=133,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.495:16:7,5:1,2:2,6,4,4
chr7	150709571	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:8,0:7,2:6,11,1,1
chr7	150713636	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=193,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	150713902	.	G	GC	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=109.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,18:0,15:0,0,19,14
chr7	150720902	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,5:3,4:2,2,2,7
chr7	150721607	.	GACA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,351;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ACA;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	150747746	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr7	150751590	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=139,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:2,5,2,2
chr7	150752066	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=93,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:0,7:6,6:3,3,12,1
chr7	150754103	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=171,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.363:20:6,0:3,4:0|1:150754103_A_C:150754103:4,9,7,0
chr7	150754106	.	CAG	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:9,3:4,3:0|1:150754103_A_C:150754103:5,9,6,0
chr7	150754112	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=26,10;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:9,0:3,0:0|1:150754103_A_C:150754103:5,9,6,0
chr7	150754118	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=28,18;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:10,1:3,0:0|1:150754103_A_C:150754103:6,9,4,0
chr7	150754122	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=25,16;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:3,0:0|1:150754103_A_C:150754103:6,9,2,0
chr7	150754137	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:11,5:5,4:7,9,5,4
chr7	150759219	.	CGTGTGTGAGT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=217,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.512:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	150761880	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,1:2,2:2,5,2,1
chr7	150763555	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	150764103	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=35,15;MFRL=175,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:7,0:9,0:0|1:150764103_C_A:150764103:4,14,0,2
chr7	150764107	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=35,15;MFRL=183,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:9,0:8,0:0|1:150764103_C_A:150764103:4,14,0,2
chr7	150764110	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=35,15;MFRL=178,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,0:0|1:150764103_C_A:150764103:3,14,0,2
chr7	150773807	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=178,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.433:12:2,2:4,3:4,3,5,0
chr7	150813977	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=185,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:3,2:3,0:0,8,0,4
chr7	150825567	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	150825839	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=192,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr7	150864057	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=162,333;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,1:5,2:15,0,2,1
chr7	150873608	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,6:5,4:6,3,7,3
chr7	150883761	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=233,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,0:9,4:8,8,2,2
chr7	150883821	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=171,252;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:2,2,2,0
chr7	150883892	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:9,2:6,3:8,7,0,5
chr7	150905053	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=177,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:5,3:8,0:6,7,0,3
chr7	150916114	.	CAGG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGG;STR;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,3:8,0:10,4,2,1
chr7	150918586	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=82,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.573:9:3,4:1,1:3,1,5,0
chr7	150921294	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=243,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,1:2,1:0,6,0,2
chr7	150921296	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=267,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr7	150931229	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.226:29:12,6:10,0:13,10,6,0
chr7	150931328	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:8,0:5,12,2,0
chr7	150936124	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=238,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:4,9:4,8:6,2,11,7
chr7	150937377	.	C	CG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=58.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,3,14
chr7	150939193	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=187,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,1:8,1:8,4,2,0
chr7	150939359	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=140,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.223:19:9,3:6,0:4,11,1,3
chr7	150939396	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=196,261;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:10,1:4,1:2,12,1,1
chr7	150940657	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr7	150945547	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.265:20:8,0:5,4:6,9,0,5
chr7	150972141	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=149,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chr7	151046112	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=170,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.318:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr7	151048484	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=152,245;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.129:44:22,1:15,4:27,12,2,3
chr7	151064061	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.240:27:8,1:13,5:0|1:151064061_C_A:151064061:10,11,1,5
chr7	151064064	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=108,179;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,6:0.241:27:8,1:13,5:1|0:151064061_C_A:151064061:8,13,3,3
chr7	151064305	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=239,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr7	151073083	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=155,419;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:151073083_T_G:151073083:0,4,0,1
chr7	151073093	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=164,313;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:151073083_T_G:151073083:0,3,0,2
chr7	151078735	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	151093283	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:3,0:9,4:6,6,1,3
chr7	151106265	.	CTCG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.703:1:0,0:0,1:0|1:151106265_CTCG_C:151106265:0,0,1,0
chr7	151106269	.	A	AAG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:151106265_CTCG_C:151106265:0,0,1,0
chr7	151106272	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:151106265_CTCG_C:151106265:0,0,1,0
chr7	151106277	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:151106265_CTCG_C:151106265:0,0,1,0
chr7	151106280	.	CGATCCCGGCCGCACCCTGCTCTGCACCCGCA	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=158,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:0,1:0|1:151106265_CTCG_C:151106265:4,0,1,0
chr7	151127153	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:20,0:11,3:16,15,0,3
chr7	151164348	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=248,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:3,6:0,6:1,2,1,11
chr7	151168415	.	CAAT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=217,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=50.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:1,9:2,4:3,0,9,4
chr7	151254175	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=282,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,4:0,5:1,0,8,1
chr7	151254445	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr7	151262305	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr7	151265714	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	151267353	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=128,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,0:7,3:6,4,0,3
chr7	151269890	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	151269916	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	151292395	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:1,0,6,2
chr7	151573795	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=18,25;MFRL=223,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.390:6:2,2:0,0:0,4,0,2
chr7	151667964	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=152,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:4,1,2,0
chr7	151668063	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=128,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,2:7,2:2,10,1,3
chr7	151668225	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	151680185	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=200,0;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:3,8,0,2
chr7	151684168	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr7	151818777	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,8,16
chr7	151818808	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=219,260;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:1,12,0,2
chr7	151846021	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=206,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,0:4,3:6,5,0,3
chr7	151847936	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=150,44;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,1:5,0:0|1:151847936_G_A:151847936:9,2,1,1
chr7	151847939	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=150,44;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:0|1:151847936_G_A:151847936:9,2,1,1
chr7	151848583	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=171,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:13,1:8,2:10,11,1,2
chr7	151851560	.	T	TGAAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=245,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	151855991	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=148,83;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.155:21:8,0:10,2:10,8,0,3
chr7	151874147	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:4,0:1,2:2,3,0,2
chr7	151874498	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=237,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,1:10,2:7,12,1,2
chr7	151874894	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=189,216;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:6,3:10,0:9,8,3,0
chr7	151875113	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151875113_A_G:151875113:0,0,0,1
chr7	151875117	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151875113_A_G:151875113:0,0,0,1
chr7	151875121	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151875113_A_G:151875113:0,0,0,1
chr7	151878269	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.352:32:11,0:10,11:15,6,0,11
chr7	151880126	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,0:8,3:9,10,2,1
chr7	151884279	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=268,247;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	151891358	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=161,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:2,1:1,5,1,2
chr7	151917892	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=192,70;MMQ=38,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:151917892_T_C:151917892:0,4,0,2
chr7	151917896	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,25;MFRL=192,70;MMQ=38,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:151917892_T_C:151917892:0,4,0,2
chr7	151917897	.	ATGTC	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=183,70;MMQ=25,24;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:151917892_T_C:151917892:0,3,0,2
chr7	151917904	.	G	GCAAT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=210,70;MMQ=38,24;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:151917892_T_C:151917892:0,4,0,2
chr7	151917906	.	G	GCAACAAAAGCCAA	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=210,70;MMQ=38,24;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:151917892_T_C:151917892:0,4,0,2
chr7	151926935	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=9;MBQ=35,28;MFRL=157,224;MMQ=24,30;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:8,0:5,3:0|1:151926935_G_A:151926935:10,3,3,0
chr7	151926945	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=34,28;MFRL=156,167;MMQ=24,30;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:8,2:6,3:0|1:151926935_G_A:151926935:9,5,5,0
chr7	151926977	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=9;MBQ=29,28;MFRL=141,147;MMQ=24,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,10:0.215:49:27,6:12,4:29,10,10,0
chr7	151927021	.	C	A	.	.	DP=56;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=127,150;MMQ=24,24;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,19:0.371:52:17,10:14,8:23,10,12,7
chr7	151927023	.	G	C	.	.	DP=53;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=142,119;MMQ=24,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,8:0.166:52:25,5:18,3:30,14,5,3
chr7	151927025	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=9;MBQ=27,32;MFRL=141,124;MMQ=24,24;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,11:0.215:52:22,6:16,4:27,14,8,3
chr7	151927026	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=9;MBQ=25,30;MFRL=125,153;MMQ=24,24;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,12:0.236:53:23,6:16,5:28,13,8,4
chr7	151927067	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=9;MBQ=29,34;MFRL=137,116;MMQ=24,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,7:0.139:55:20,4:28,3:19,29,3,4
chr7	151927127	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=9;MBQ=27,32;MFRL=145,156;MMQ=25,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.257:29:13,3:9,4:5,17,0,7
chr7	151932819	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=206,167;MMQ=60,31;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,14:0.312:46:16,7:16,7:22,10,13,1
chr7	151932824	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=8;MBQ=29,28;MFRL=178,214;MMQ=60,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,11:0.244:47:17,5:19,6:30,6,8,3
chr7	151932830	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=8;MBQ=30,27;MFRL=188,158;MMQ=40,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:19,1:25,1:34,11,2,0
chr7	151932848	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=8;MBQ=25,34;MFRL=173,243;MMQ=40,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:13,2:20,1:25,10,3,0
chr7	151932876	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=145,124;MMQ=48,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:17,1:12,2:19,10,1,2
chr7	151932897	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=8;MBQ=32,20;MFRL=156,93;MMQ=49,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.116:40:24,0:12,4:22,14,3,1
chr7	151932908	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=8;MBQ=25,35;MFRL=150,178;MMQ=49,27;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:23,0:20,2:27,17,0,2
chr7	151932916	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=155,203;MMQ=49,40;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:23,1:23,2:29,18,0,3
chr7	151935730	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=174,185;MMQ=52,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.101:47:27,2:16,2:34,9,1,3
chr7	151935798	.	GA	TG	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=153,146;MMQ=40,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:13,2:11,1:9,15,2,1
chr7	151935853	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=146,183;MMQ=50,24;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,2:13,1:11,19,0,3
chr7	151935866	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=174,146;MMQ=50,37;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:13,3:15,0:0|1:151935866_G_A:151935866:9,20,1,2
chr7	151935871	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=33,25;MFRL=177,146;MMQ=50,37;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:13,3:15,0:0|1:151935866_G_A:151935866:9,19,1,2
chr7	151944961	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=190,211;MMQ=40,34;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:11,3:12,1:21,2,4,0
chr7	151944981	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=167,211;MMQ=37,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:8,2:12,1:17,3,3,0
chr7	151945007	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=153,170;MMQ=40,43;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.264:31:7,4:15,3:14,9,6,2
chr7	151945071	.	G	GT	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=151,191;MMQ=58,52;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,15:0.248:62:23,8:24,7:26,21,6,9
chr7	151945101	.	G	C	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=165,193;MMQ=45,27;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,9:0.158:61:25,7:27,2:24,28,6,3
chr7	151970775	.	C	G	.	.	DP=93;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=170,148;MMQ=52,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,6:0.075:90:34,3:48,3:53,31,5,1
chr7	151970797	.	A	T	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=138,163;MMQ=40,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,8:0.144:60:27,5:25,3:29,23,4,4
chr7	151970931	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=132,234;MMQ=27,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.302:21:11,4:4,2:5,10,1,5
chr7	151970939	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=33,26;MFRL=204,132;MMQ=27,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:9,5:8,1:7,11,0,6
chr7	151970977	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=191,191;MMQ=27,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.299:24:8,2:9,4:1,16,4,3
chr7	151971015	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=208,206;MMQ=39,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:7,2:10,3:4,13,0,5
chr7	151971043	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=290,240;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,5:3,3,1,8
chr7	151971052	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=290,256;MMQ=60,39;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:1,5,1,4
chr7	152012434	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=172,249;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.369:36:9,0:13,13:4,19,0,13
chr7	152142727	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=143,136;MMQ=59,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:4,2,0,2
chr7	152144203	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=156,152;MMQ=60,55;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.299:15:7,2:3,2:6,5,4,0
chr7	152346519	.	AAAAAAGT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=247,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.508:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	152513740	.	TAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=12,30;MFRL=147,199;MMQ=40,51;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.459:11:1,1:0,3:0,6,0,5
chr7	152550499	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.413:10:4,1:2,3:6,0,4,0
chr7	152550549	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=187,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:7,2:5,2:10,2,2,2
chr7	153749818	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=15,28;MFRL=225,388;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:153749818_TA_T:153749818:1,0,1,0
chr7	153749822	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=12,17;MFRL=225,388;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:153749818_TA_T:153749818:1,0,1,0
chr7	153749826	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,16;MFRL=0,388;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:153749818_TA_T:153749818:0,0,1,0
chr7	153749828	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,16;MFRL=0,388;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:153749818_TA_T:153749818:0,0,1,0
chr7	153749833	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,16;MFRL=0,388;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:153749818_TA_T:153749818:0,0,1,0
chr7	154002478	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=235,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:2,1:0,0:2,0,2,0
chr7	154237524	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=232,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,6:2,1:3,0,8,0
chr7	154519679	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=272,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:154519679_C_T:154519679:0,2,0,1
chr7	154519686	.	T	TTTCTGTGCCTGGCTTCCTTCAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=272,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:154519679_C_T:154519679:0,2,0,1
chr7	154564677	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=154,222;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.683:10:0,1:1,4:0,3,0,7
chr7	154596517	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr7	154645406	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:2,1,2,0
chr7	154664226	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,15;MFRL=207,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr7	154672662	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:6,3:4,1:3,7,2,2
chr7	154672679	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:1,6,2,1
chr7	154672717	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=171,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr7	154680910	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=254,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,1:3,1,4,1
chr7	154681175	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=258,140;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,0:1,1:0,2,2,0
chr7	154720399	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:16,4:20,0:17,19,4,0
chr7	154735950	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=179,275;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr7	154748908	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,0:5,5:3,3,3,2
chr7	154760666	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=172,256;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.424:12:3,3:3,1:6,1,4,1
chr7	154777771	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:13,0:7,3:8,13,1,2
chr7	154862591	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=182,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr7	154862709	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=184,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:5,6,0,2
chr7	154862735	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=194,134;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:5,0:4,2:6,5,0,2
chr7	155094172	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:5,2:2,1:2,5,0,3
chr7	155094593	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:1,8,0,2
chr7	155099855	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=150,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr7	155099925	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=177,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:3,1:4,2:6,1,2,1
chr7	155150765	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=207,109;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:0,3:1,8:0,1,5,6
chr7	155151270	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=193,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr7	155151307	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,2,4
chr7	155151498	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:155151498_A_G:155151498:0,0,0,1
chr7	155151517	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:155151498_A_G:155151498:0,0,0,1
chr7	155174774	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=126,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:4,2,3,1
chr7	155174801	.	ATGTGAG	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=126,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTGAG;STR;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,2:4,1:1,4,2,1
chr7	155187691	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=206,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr7	155301781	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=164,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr7	155457788	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=197,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:7,0,3,0
chr7	155458052	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:5,0:3,5:1,7,0,6
chr7	155465438	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=209,284;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr7	155499799	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=230,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,2:3,2:2,1,1,3
chr7	155500084	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=190,254;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:1,10,1,1
chr7	155503844	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:11,1:3,1:13,2,3,0
chr7	155530363	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,0:5,3:1,9,1,2
chr7	155532361	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=184,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,1:5,3:7,0,4,0
chr7	155532542	.	A	ACTACCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=169,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr7	155532573	.	GCAC	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=224,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CAC;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,0:6,3:9,3,2,1
chr7	155556456	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=196,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.340:18:5,2:7,3:9,3,5,1
chr7	155559403	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,2:5,2:1,11,0,4
chr7	155567956	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=214,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:0,8,0,2
chr7	155593438	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr7	155599300	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=283,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:0,2:2,4:0,2,5,2
chr7	156468481	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=134,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:4,13,0,2
chr7	156469096	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=216,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:10,3:8,7:13,5,9,1
chr7	156469133	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=214,201;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,0:9,3:12,7,1,2
chr7	156480633	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr7	156516951	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=192,231;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,1,5
chr7	156520738	.	T	TAGCAGAAACAATAGTCCAGAAGGCGGC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=217,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:1,8,1,1
chr7	156521493	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=155,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,3:6,1:0,7,0,4
chr7	156589212	.	A	AC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=112,285;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:5,0:15,6:5,15,0,6
chr7	156626447	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:9,8,2,0
chr7	156685519	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr7	156685545	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.859:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	156754975	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.384:24:7,1:8,7:0|1:156754975_A_G:156754975:7,8,3,6
chr7	156754981	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=142,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.385:24:7,1:8,8:0|1:156754975_A_G:156754975:7,8,3,6
chr7	156755780	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=149,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:5,3:12,0:12,5,2,1
chr7	156755965	.	G	GTCTTAAATTACTTTGTTTGCTGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=230,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	156761751	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,4:4,0:6,1,3,1
chr7	156761913	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:3,3,1,3
chr7	156762224	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=168,130;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,7:1,1:3,1,6,2
chr7	156762248	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=168,93;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,6:1,1:3,3,5,2
chr7	156762446	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=177,252;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	156798638	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr7	156971581	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=263,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,6:2,1:0,5,0,7
chr7	157000084	.	AA	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=174,140;MMQ=60,33;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:9,3,2,0
chr7	157047095	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:157047095_T_A:157047095:0,0,0,3
chr7	157047097	.	T	TTTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:157047095_T_A:157047095:0,0,0,3
chr7	157049530	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,7:0,0,8,2
chr7	157060291	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=169,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:5,2:11,1:11,5,2,1
chr7	157151234	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:5,9:6,7:6,5,7,9
chr7	157155938	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:10,8,1,1
chr7	157160110	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,177;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:8,4:5,3:4,9,4,3
chr7	157177772	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:157177772_G_T:157177772:0,4,0,1
chr7	157177774	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:157177772_G_T:157177772:0,4,0,1
chr7	157333542	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=142,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:4,0:0,7,0,3
chr7	157341556	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=184,223;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,1,1
chr7	157361734	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	157369564	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr7	157370688	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,8,11
chr7	157873975	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,7:2,2:5,3,4,5
chr7	157903478	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=191,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.695:7:1,1:0,4:2,0,2,3
chr7	157903504	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=183,269;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:4,2,2,3
chr7	157903538	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=164,236;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,1:5,3:4,2,1,3
chr7	157929294	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=153,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,2:2,0:7,0,1,1
chr7	157959578	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=285,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,4,1
chr7	158325310	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=A;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:158325310_C_CAA:158325310:0,0,2,0
chr7	158325316	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0|1:158325310_C_CAA:158325310:0,0,2,0
chr7	158325338	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr7	158325572	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=218,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:0,8,1,2
chr7	158438186	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:3,3:0,6:2,1,4,5
chr7	158444975	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,5:1,5:2,2,5,5
chr7	158450965	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=193,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,4,0
chr7	158455089	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr7	158457458	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=147,277;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,1:11,1:7,13,0,2
chr7	158468437	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=184,292;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	158473339	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	158476106	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=176,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:2,8,0,2
chr7	158476148	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=254,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,7:1,2:0,1,0,9
chr7	158478749	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=203,254;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,2:1,1:7,0,3,0
chr7	158483256	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=170,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:5,5,2,1
chr7	158528158	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,1:3,8:5,0,6,3
chr7	158528170	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,2:1,7:1,0,4,5
chr7	158529830	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=131,93;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:10,0:16,2:0|1:158529830_C_T:158529830:15,13,0,2
chr7	158529837	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=131,93;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:13,0:14,2:0|1:158529830_C_T:158529830:15,13,0,2
chr7	158545582	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=199,217;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr7	158552331	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr7	158555706	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=285,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,1:0,5:1,0,6,0
chr7	158566138	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=137,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:0,3:2,7:1,1,1,9
chr7	158586455	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=193,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,1:3,1:0,7,0,2
chr7	158591851	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr7	158649304	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	158662182	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=175,195;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:3,4:5,1:6,4,3,2
chr7	158662250	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr7	158662511	.	T	TTTTAAAC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=149,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTAAAC;STR;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.435:14:5,0:3,4:5,3,4,2
chr7	158664074	.	TGAA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:5,3:10,3:5,10,4,2
chr7	158672619	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=141,159;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:12,4:8,4:4,16,5,3
chr7	158694530	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=142,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,9:3,0:3,5,3,6
chr7	158711643	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=235,237;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr7	158715264	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=147,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr7	158718793	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	158726798	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=195,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:6,0,3,1
chr7	158727015	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:1,3:0,1,5,3
chr7	158727276	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=163,199;MMQ=58,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:0,8,0,2
chr7	158727303	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=139,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr7	158734627	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:5,8,0,2
chr7	158827401	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr7	158827414	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=170,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr7	158835631	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr7	158852103	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=210,262;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	158889566	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=139,239;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:5,1:12,3:10,8,2,2
chr7	158902425	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=179,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:4,0,5,0
chr7	158910068	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=143,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:8,1:1,1:5,5,1,1
chr7	158935333	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	194596	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=165,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:3,2:1,0:4,1,2,0
chr8	195562	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=179,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.152:17:8,2:6,0:6,9,1,1
chr8	363176	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=161,73;MMQ=52,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:6,9,2,0
chr8	363185	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=158,256;MMQ=43,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:3,3:4,0:2,5,1,2
chr8	382885	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=154,124;MMQ=52,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,24:0.568:42:10,24:8,0:8,10,24,0
chr8	442389	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=200,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,2:2,3:3,5,4,1
chr8	494658	.	GGGCGGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=157,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=GGC;STR;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr8	494804	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	665858	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,3:4,1:4,4,2,2
chr8	1496767	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=278,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr8	1496788	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=15,29;MFRL=278,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr8	1581226	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=160,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.341:15:5,3:5,1:2,8,3,2
chr8	1581299	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=201,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr8	1624806	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=177,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:4,11,1,1
chr8	1765371	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:2,3,2,2
chr8	1791433	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=247,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr8	1791638	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=178,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.808:8:1,3:0,4:1,0,3,4
chr8	1791663	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=36,29;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0|1:1791663_G_A:1791663:1,0,1,4
chr8	1791672	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=178,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,1:0,4:0|1:1791663_G_A:1791663:1,0,1,4
chr8	1791685	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=72,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr8	1806229	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=139,90;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,4:6,5:8,4,3,6
chr8	1806309	.	A	AGTCCCCAGGTGGGTCCCCAGGTGG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=194,234;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=GTCCCCAGGTGG;STR;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,0:0,1,0,5
chr8	1806333	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=226,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr8	1814588	.	GACAC	G,GAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35,36;MFRL=178,165,237;MMQ=60,60,60;MPOS=4,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=AC;STR;TLOD=12.92,5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,2:0.551,0.273:8:0,3,2:1,2,0:1,0,7,0
chr8	1817314	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=180,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:10,6:2,1:7,5,4,3
chr8	1830773	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,2:9,0:12,2,2,0
chr8	1830928	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=150,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:0,4,2,4
chr8	1842631	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:11,8,0,2
chr8	1846562	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=152,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr8	1871896	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,276;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:8,0:7,3:13,3,1,2
chr8	1900855	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr8	1953642	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,4,5
chr8	2005414	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr8	2005676	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=178,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,4:3,1:2,1,4,1
chr8	2007230	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	2007399	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=280,60;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr8	2017509	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=183,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,3:8,0:2,9,1,2
chr8	2024207	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=56.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,11,5
chr8	2024405	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=158,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,3:1,2:2,5,1,4
chr8	2024437	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr8	2024446	.	CG	TA,TG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,28,30;MFRL=0,235,153;MMQ=60,60,60;MPOS=19,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.14,9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.455,0.457:6:0,1,2:0,1,1:0,0,0,6
chr8	2033537	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=170,306;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:2,2:5,0:0,7,0,3
chr8	2037811	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:4,10:4,6:6,2,13,3
chr8	2037833	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,7:3,5:3,3,8,4
chr8	2040104	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=116,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:4,1,5,0
chr8	2040181	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=131,223;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:8,5:5,2:8,5,1,6
chr8	2040401	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=221,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:0,5,1,4
chr8	2040415	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=221,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,1,2
chr8	2041801	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:7,0:5,2:6,7,2,0
chr8	2048640	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,6:2,3:4,2,7,2
chr8	2048925	.	CAGG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=200,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr8	2050662	.	AA	CC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	2053942	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr8	2054012	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=99,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:3,5:0,3:2,1,7,1
chr8	2054171	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:2,5,1,6
chr8	2054195	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=78,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,3:2,6:3,1,2,7
chr8	2054476	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,0,2
chr8	2057090	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=221,95;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr8	2063920	.	CAT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=256,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:1,1:8,3:5,4,4,0
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chr8	2065734	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=113,91;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:6,7,0,2
chr8	2071261	.	A	AGAC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=129,242;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,3:2,2:1,1,2,3
chr8	2071306	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=258,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0|1:2071306_A_G:2071306:1,0,1,5
chr8	2071309	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=258,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0|1:2071306_A_G:2071306:1,0,1,5
chr8	2071611	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=157,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr8	2072152	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=186,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:10,1:2,1:6,6,2,0
chr8	2077072	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,2,1
chr8	2088896	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=178,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr8	2796277	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr8	2799981	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,5,0
chr8	2806920	.	G	GAAAGA,GAAAGAAAAGA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33,35;MFRL=0,170,131;MMQ=60,60,60;MPOS=6,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=3,4,5;RU=AAAGA;STR;TLOD=15.24,3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.643,0.242:5:0,2,0:0,2,1:0,0,1,4
chr8	2807678	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr8	2808860	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr8	2811708	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,4:2,0:1,3,2,2
chr8	2813083	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=130,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,1:7,1:4,5,1,1
chr8	2813145	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=125,125;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:2,7:19,0:15,6,8,0
chr8	2820187	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=202,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr8	2820682	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=14,30;MFRL=131,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:0,2:1,0,3,0
chr8	2824083	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:5,2,2,1
chr8	2836102	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr8	2910223	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr8	2954348	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=326,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,2:2,7:1,1,6,3
chr8	2964003	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr8	2964206	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr8	2965209	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,5,4
chr8	2965244	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=148,235;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,4:1,4:5,1,6,2
chr8	2966072	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr8	2966328	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=203,228;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr8	2967609	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=114,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr8	2967639	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=150,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.570:5:2,2:0,1:1,1,1,2
chr8	2967905	.	AG	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=232,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	3045428	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,2:5,5:3,3,3,4
chr8	3047380	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=205,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr8	3087809	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=174,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,7:3,2:1,3,5,4
chr8	3141586	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr8	3165207	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=120,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:4,4,3,1
chr8	3165319	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=97,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:4,3:9,0:4,9,1,2
chr8	3165777	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=184,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr8	3165814	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr8	3166082	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=216,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr8	3201012	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr8	3201034	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr8	3216589	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=16,12;MFRL=211,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:0,0:0,0:4,0,1,0
chr8	3224465	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=218,263;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.341:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr8	3224476	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=171,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr8	3224702	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=169,271;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:4,0:7,2:3,8,1,1
chr8	3224779	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,0:0,2:0,2,0,2
chr8	3226696	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr8	3226741	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=104,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:1,0,7,0
chr8	3226899	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,4:4,2:1,4,2,4
chr8	3226919	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr8	3253939	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=226,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:0|1:3253939_A_G:3253939:0,7,0,3
chr8	3253942	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=226,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:0|1:3253939_A_G:3253939:0,7,0,3
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chr8	3474342	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr8	3566106	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
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chr8	3855369	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:1,0,4,0
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chr8	4494811	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	4495107	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr8	4851787	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	6264073	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=182,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
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chr8	6264273	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.171:16:6,1:8,0:0|1:6264273_G_T:6264273:4,10,0,2
chr8	6264280	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=183,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.243:15:6,1:6,2:0|1:6264273_G_T:6264273:4,8,0,3
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chr8	6299532	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:6,0,2,0
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chr8	6302671	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=183,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:5,5:10,5:9,7,5,5
chr8	6335208	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=161,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.297:15:4,3:6,1:2,9,0,4
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chr8	6371448	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=258,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr8	6372172	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=122,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:4,1:5,4:5,4,4,1
chr8	6377330	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=186,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:6,0,5,0
chr8	6390027	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=103,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:3,3:3,5:2,4,3,5
chr8	6420092	.	TGG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.623:6:1,0:1,4:0|1:6420092_TGG_T:6420092:1,1,4,0
chr8	6420097	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,15;MFRL=156,142;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:1,0:1,0:0|1:6420092_TGG_T:6420092:1,1,1,0
chr8	6420534	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=195,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr8	6478956	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,35;MFRL=243,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:0,1:0|1:6478956_A_G:6478956:1,1,4,0
chr8	6478960	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=243,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,2:0,1:0|1:6478956_A_G:6478956:1,1,4,0
chr8	6478986	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=221,151;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:3,7:0,2:2,1,7,2
chr8	6479282	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	6500648	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6500648_G_A:6500648:0,0,0,1
chr8	6500650	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6500648_G_A:6500648:0,0,0,1
chr8	6582485	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=128,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.186:25:9,4:11,0:10,11,3,1
chr8	6588392	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=191,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.496:6:1,0:1,2:0,3,0,3
chr8	6673377	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,5,8
chr8	6681256	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=213,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:2,3:0,3:0,2,0,6
chr8	6690468	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=195,61;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:0,4,1,1
chr8	6728116	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=209,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr8	6728198	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=161,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,1:4,7:5,2,4,4
chr8	6728298	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=190,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,10:0.439:23:6,4:7,6:0|1:6728298_C_T:6728298:1,12,5,5
chr8	6728299	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=133,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,7:0.320:23:6,4:10,3:1|0:6728298_C_T:6728298:5,11,1,6
chr8	6735399	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=133,182;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:11,1:8,3:5,14,2,2
chr8	6735423	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,3,15
chr8	6735431	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=208,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,5:4,4:1,5,2,7
chr8	6783636	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,1:0,1:1,0,0,3
chr8	7308386	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,189;MMQ=59,27;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,2:6,1:5,7,2,1
chr8	7308729	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=148,156;MMQ=52,39;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:15,3:6,1:11,10,1,3
chr8	7308798	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=178,180;MMQ=52,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,4:5,1:0,10,0,5
chr8	7340278	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=178,184;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr8	7340323	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=182,218;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr8	7343806	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=127,148;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr8	7343921	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=220,210;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:7343921_A_G:7343921:0,2,0,1
chr8	7343922	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=220,210;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:7343921_A_G:7343921:0,2,0,1
chr8	7343924	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=220,210;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:7343921_A_G:7343921:0,2,0,1
chr8	7682657	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,300;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	7698527	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,106;MMQ=27,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:1,3,1,2
chr8	7752127	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=154,212;MMQ=27,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:1,0,2,0
chr8	8175780	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:6,2:4,12,2,0
chr8	8176387	.	C	CGGGGCG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=212,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGGCG;STR;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,4:1,1:2,0,6,0
chr8	8176825	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=190,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,0:3,8:1,4,1,7
chr8	8186052	.	CTTTAT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.763:2:0,1:0,1:0|1:8186052_CTTTAT_C:8186052:0,0,0,2
chr8	8186058	.	T	TGGACCCAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:8186052_CTTTAT_C:8186052:0,0,0,2
chr8	8234714	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=269,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:3,2,2,1
chr8	8234868	.	C	CGCCGCT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=174,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GCCGCT;STR;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.258:13:4,2:6,1:9,1,2,1
chr8	8559898	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=207,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,0:0,2:1,0,3,0
chr8	8560602	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	8654829	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=177,74;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:9,3:7,0:10,6,2,1
chr8	8655023	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,12:0,4:0,0,4,12
chr8	8747537	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=211,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:0,2,4,2
chr8	8747880	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=193,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr8	8747894	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr8	8887542	.	TAAC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=131,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:2,5:0,5:1,2,3,7
chr8	8998262	.	CT	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=300,370;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr8	8999187	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	9414159	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,2:2,3:0,5,1,4
chr8	9563797	.	CTT	C,CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=0,0,183;MMQ=60,60,60;MPOS=29,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=5.71,4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,3:0.305,0.352:10:1,1,1:2,3,2:3,0,5,2
chr8	9564600	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	9577794	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,328;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:9577794_A_AT:9577794:0,0,2,0
chr8	9577804	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,328;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0|1:9577794_A_AT:9577794:0,0,2,0
chr8	9588371	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=183,95;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:4,2:4,0:6,3,2,0
chr8	9593069	.	AG	GA	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,33;MFRL=162,110;MMQ=50,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:9593069_AG_GA:9593069:0,4,0,1
chr8	9593074	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=162,110;MMQ=50,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:9593069_AG_GA:9593069:0,4,0,1
chr8	9593075	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=162,144;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:9593075_C_CT:9593075:0,4,0,1
chr8	9593076	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,30;MFRL=162,144;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:9593075_C_CT:9593075:0,4,0,1
chr8	9593077	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=162,110;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:9593069_AG_GA:9593069:0,4,0,1
chr8	9593081	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,33;MFRL=150,173;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr8	9593086	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,31;MFRL=181,144;MMQ=50,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:9593075_C_CT:9593075:0,4,0,1
chr8	9619159	.	GAAA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=A;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:4,0:3,4,0,2
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chr8	10388826	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=114,190;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:3,1:11,2:6,8,2,1
chr8	10396056	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,169;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:8,0:1,3:5,4,2,1
chr8	10465399	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=224,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,4:1,6:0,1,4,6
chr8	10467627	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,14:0.834:16:0,2:2,7:0|1:10467627_T_C:10467627:0,2,3,11
chr8	10467629	.	T	TTTC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,17:0.857:19:0,4:1,7:0|1:10467627_T_C:10467627:0,2,3,14
chr8	10467637	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:0,3:2,7:0,2,3,12
chr8	10470035	.	C	CTGGCCGAGGCAGGAGCCAACT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=130,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr8	10532355	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr8	10532401	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr8	10583203	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,2:0,0:2,0,2,0
chr8	10584212	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	10677601	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr8	10677792	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=153,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:8,2:3,0:4,7,0,2
chr8	10683623	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=130,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,7:4,3:6,1,7,3
chr8	10683776	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:3,3:0,0:0,3,0,4
chr8	10689142	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,5:6,3:7,4,6,2
chr8	10690319	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:7,0,4,0
chr8	10690509	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=152,242;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,3:7,1:3,9,0,4
chr8	10690543	.	CAGA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=149,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:0,4,1,6
chr8	10692158	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,6:1,5:0,2,11,0
chr8	10692242	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=141,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,3:8,1:8,8,3,1
chr8	10692359	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=177,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr8	11142389	.	C	CG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,11,4
chr8	11142625	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr8	11157460	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=273,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr8	11162602	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,6:0,0,0,9
chr8	11162609	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=202,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr8	11174390	.	ATGAAAG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=159,73;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGAAAG;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:1,2:3,5,1,1
chr8	11174484	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=165,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr8	11177126	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=229,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr8	11177410	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=255,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,2:2,1:1,5,0,3
chr8	11177447	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=215,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr8	11282055	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=169,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:4,5,2,0
chr8	11301733	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=199,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,1:6,4:5,6,2,3
chr8	11301753	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,9,9
chr8	11400680	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=179,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr8	11400944	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	11415378	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=192,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:2,2:1,0:2,2,2,0
chr8	11415572	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=153,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,1:4,1:3,3,1,1
chr8	11415600	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=173,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr8	11418766	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=175,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,10:0.733:13:2,5:1,5:0|1:11418766_G_A:11418766:3,0,7,3
chr8	11418773	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=117,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,2:0.200:13:5,2:6,0:1|0:11418766_G_A:11418766:8,3,2,0
chr8	11629119	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=221,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:1,2,1,6
chr8	11629129	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr8	11637211	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=176,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,2:4,3:1,3,4,1
chr8	11643459	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:9,2,1,1
chr8	11666218	.	GTCCCACTCCCAC	G,GTCCCAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35,33;MFRL=0,167,184;MMQ=60,60,60;MPOS=26,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,4,5;RU=TCCCAC;STR;TLOD=11.44,11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.451,0.446:6:0,2,1:0,1,2:0,0,6,0
chr8	11666451	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,4:5,4:0,9,1,7
chr8	11683644	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=138,77;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:6,3:9,0:0|1:11683644_G_A:11683644:8,7,1,2
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chr8	11687938	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,5,7
chr8	11687959	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:0,1:2,3:0,2,1,4
chr8	11689008	.	CTCT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:3,3:0,0:2,1,3,0
chr8	11689119	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=225,139;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.836:16:0,10:2,4:1,1,4,10
chr8	11689228	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr8	11695872	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr8	11702542	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=214,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,4:3,1:3,0,5,0
chr8	11704518	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=225,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,0:0|1:11704518_T_C:11704518:0,1,3,0
chr8	11704522	.	GA	CC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:0,1:0|1:11704518_T_C:11704518:0,2,3,0
chr8	11704529	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0|1:11704518_T_C:11704518:1,3,3,0
chr8	11705139	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=176,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:1,2:1,4:2,0,5,2
chr8	11705342	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=111,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:6,5:3,8:3,6,7,6
chr8	11705380	.	A	AAGCCCCAGCTGGGCGAGGC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.596:18:4,4:3,3:0,7,1,10
chr8	11705535	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:4,2:4,3:7,1,5,0
chr8	11705677	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=233,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,3:2,2:2,6,1,4
chr8	11708355	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,3:3,0:7,2,3,0
chr8	11710301	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=198,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,2:0,2,0,5
chr8	11711059	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=188,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:0,2:2,2:0,2,0,5
chr8	11831948	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr8	11851694	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr8	11853596	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	12044201	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr8	12592956	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=236,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:0,1,1,6
chr8	12600606	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=215,268;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:7,0,3,0
chr8	12600622	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=245,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,3:2,5:2,0,7,1
chr8	12870139	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:6,2,4,0
chr8	12870438	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=189,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr8	12879062	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=90,138;MMQ=44,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:3,3,2,3
chr8	12879694	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=70,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.655:9:3,3:0,3:1,2,5,1
chr8	12879707	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=127,172;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,5:0,4:0,1,6,3
chr8	12880277	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=203,224;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr8	12880289	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=234,205;MMQ=49,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr8	12881297	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=141,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:1,2,1,1
chr8	12881317	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,1,2
chr8	12881388	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=184,76;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:8,2,2,0
chr8	12883855	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,31;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr8	12884135	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0|1:12884135_C_G:12884135:0,0,10,10
chr8	12884138	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=144,174;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:7,3:6,3:0|1:12884135_C_G:12884135:6,7,3,3
chr8	12884598	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,0:5,7:5,4,0,7
chr8	12886073	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,15;MFRL=0,147;MMQ=60,36;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.646:4:0,0:1,1:0,1,0,3
chr8	12886563	.	CAT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=91,340;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AT;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:2,2,1,1
chr8	12886669	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=0,116;MMQ=54,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr8	12886693	.	T	TTTTG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=89,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TTTG;STR;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:3,3,2,1
chr8	12948951	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:1,3,0,7
chr8	12950088	.	CCT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=282,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:5,0,3,1
chr8	12950110	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=218,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.497:10:1,0:4,5:4,1,5,0
chr8	12952174	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=275,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr8	12972981	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=224,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr8	12973078	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=122,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:0,10:4,1:3,1,5,6
chr8	13072066	.	C	CT,CTTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34,34;MFRL=0,0,273;MMQ=60,23,60;MPOS=20,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,18,20;RU=T;STR;TLOD=3.27,3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.328,0.509:3:0,1,0:0,0,2:0,0,2,1
chr8	13251063	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:5,2:3,4,1,1
chr8	13258927	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0|1:13258927_G_C:13258927:0,0,5,0
chr8	13258936	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0|1:13258927_G_C:13258927:0,0,6,1
chr8	13357587	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,3,6
chr8	13965581	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr8	14095008	.	C	CAACA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=201,150;MMQ=44,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AACA;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.496:6:2,0:1,3:3,0,3,0
chr8	14095199	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=161,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr8	14095201	.	TAT	GTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr8	14095250	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	14710957	.	C	CTGAG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=99,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:14710957_C_CTGAG:14710957:8,4,1,1
chr8	14710959	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=99,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0|1:14710957_C_CTGAG:14710957:8,4,1,1
chr8	14710961	.	GC	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=99,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,1:0|1:14710957_C_CTGAG:14710957:8,4,1,1
chr8	15480643	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=174,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,3:3,1:5,4,4,0
chr8	15508200	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,3:3,5:2,3,7,1
chr8	15601162	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=121,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:2,2:3,1:0,5,2,2
chr8	15615179	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=209,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:3,1,1,0
chr8	15621855	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr8	15978189	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	15978196	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=177,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr8	15998438	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=168,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,1:5,1:10,2,2,0
chr8	16026460	.	CGTTCATTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=211,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr8	16850498	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=168,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr8	16859398	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=257,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,2:0,2:1,1,2,2
chr8	16935234	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr8	17042416	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,37;MFRL=229,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr8	17063335	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=198,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr8	17067574	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=194,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,1,3
chr8	17068013	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=131,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,1:1,6:2,2,1,6
chr8	17074640	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:4,2,0,4
chr8	17092164	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr8	17100456	.	GA	G,GAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,35,34;MFRL=126,199,153;MMQ=60,60,60;MPOS=18,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.34,10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,6:0.286,0.507:11:1,3,3:0,0,1:1,1,7,2
chr8	17102669	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=142,142;MMQ=50,44;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,2:3,2:1,4,1,3
chr8	17137687	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.472:17:4,4:4,3:6,3,5,3
chr8	17143830	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=181,176;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=82.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,24:0.782:30:5,12:1,12:6,0,22,2
chr8	17159812	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr8	17166866	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=228,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr8	17170740	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=183,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr8	17206588	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,0:4,2:0,5,1,1
chr8	17400742	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,19;MFRL=126,182;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,0:6,0,2,0
chr8	17401878	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=463,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr8	17406183	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,4:0,13:0,0,11,6
chr8	17406367	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,7:0,2:0,0,1,8
chr8	17417899	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,2:6,0:7,10,0,2
chr8	17419689	.	ATTTTTTTTTTTTTTTTTT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=35,17;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	17421279	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr8	17434641	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr8	17491730	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=58,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:2,2,2,2
chr8	17504653	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:17504653_G_T:17504653:0,4,0,1
chr8	17504655	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:17504653_G_T:17504653:0,4,0,1
chr8	17504658	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:17504653_G_T:17504653:0,4,0,1
chr8	17504660	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:17504653_G_T:17504653:0,4,0,1
chr8	17511974	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=202,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr8	17532619	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr8	17532814	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=162,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:1,6,0,4
chr8	17541790	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:1,4:1,3,4,1
chr8	17579135	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr8	17726019	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.794:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr8	17726525	.	A	AATAGTCACATACC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=153,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,0:3,2:6,4,1,1
chr8	17732084	.	GC	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=225,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr8	17742929	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=216,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr8	17797409	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr8	17804665	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=143,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,4:1,5:0,2,8,1
chr8	17804748	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=134,86;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:15,0:10,4:6,19,0,4
chr8	17808167	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=116,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:7,3:8,1:7,8,3,1
chr8	17810738	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	17814680	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=222,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr8	17818031	.	TTTTTGTTTTTC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=194,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:0,0:2,1:0|1:17818031_TTTTTGTTTTTC_T:17818031:0,2,0,1
chr8	17818047	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=199,114;MMQ=50,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:17818031_TTTTTGTTTTTC_T:17818031:0,2,0,1
chr8	17819761	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=298,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr8	17822363	.	GC	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=185,243;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr8	17827260	.	A	AC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=219,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,5:1,5:1,1,4,6
chr8	17829756	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr8	17829877	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:11,2:8,0:12,8,2,0
chr8	17868029	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr8	17868245	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=162,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,4:3,2:0,3,2,4
chr8	17871598	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=17,25;MFRL=253,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.870:17:1,7:0,8:1,1,4,11
chr8	17871604	.	TAA	T,TA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,27,28;MFRL=136,171,187;MMQ=60,60,60;MPOS=28,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.33,5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.377,0.334:8:0,2,3:1,1,0:0,2,1,5
chr8	17871619	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=279,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,4:1,3:1,2,0,7
chr8	17885091	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=280,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=69.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.923:24:1,7:0,15:1,0,16,7
chr8	17916338	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=117,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:17916338_A_G:17916338:8,5,1,1
chr8	17916341	.	T	TATCTCATTTGAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=117,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:17916338_A_G:17916338:8,5,1,1
chr8	17916519	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=243,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17916519_G_A:17916519:0,1,0,1
chr8	17916521	.	A	ACAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=243,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17916519_G_A:17916519:0,1,0,1
chr8	17919031	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=211,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,4:3,0:0,7,0,4
chr8	17920567	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=251,229;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr8	17920807	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr8	17920820	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=183,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr8	17921921	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=186,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,10:2,3:2,2,7,6
chr8	17928753	.	G	GAAATA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAATA;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr8	17928762	.	T	TATA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr8	17928920	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=88,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr8	18074536	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr8	18258370	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=230,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,2,1
chr8	18393159	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=202,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.562:9:1,4:3,0:4,0,5,0
chr8	18413875	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,2:0,10:0,0,5,7
chr8	18430201	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:0,4:1,1:0,1,2,3
chr8	18432578	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr8	18432613	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=129,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.237:28:10,6:9,0:20,2,6,0
chr8	18656888	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:5,2:1,6,0,2
chr8	18658750	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=245,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,8:0,3:1,1,8,3
chr8	18658929	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:18658929_C_A:18658929:0,0,2,3
chr8	18658950	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:18658929_C_A:18658929:0,0,0,2
chr8	18666210	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,5:3,2:3,2,5,2
chr8	18793697	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	19192434	.	C	CCAGAACCCAAATAAATCAGTTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr8	19230955	.	GTA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TA;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr8	19297497	.	G	GAGCAAGACACACACAGA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=133,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:0,0:1,6,1,1
chr8	19362768	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,5:0,21:0,0,15,11
chr8	19674954	.	TGGC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=256,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr8	19680736	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=232,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,2:3,4:4,0,6,0
chr8	19680979	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr8	19681647	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr8	19682545	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=253,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr8	19689633	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr8	19690669	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=149,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,6:8,0:7,5,4,2
chr8	19703211	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=164,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,7:4,0:7,4,7,0
chr8	19805887	.	T	TGG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,19;MFRL=147,39;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:2,0:0|1:19805887_T_TGG:19805887:2,5,1,1
chr8	19805890	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=147,39;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:19805887_T_TGG:19805887:2,5,1,1
chr8	19805892	.	A	AGCG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=147,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:3,0:0|1:19805887_T_TGG:19805887:2,5,1,1
chr8	19809435	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:9,4:5,1:4,10,0,5
chr8	19813676	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=263,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr8	20005300	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=57,280;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,3,1
chr8	20007112	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=226,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:2,2:0,3:2,0,5,1
chr8	20008155	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:2,2:9,2:6,5,3,1
chr8	20022694	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=126,241;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,1,2
chr8	20028553	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=163,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:1,3:4,0:4,1,2,1
chr8	20028830	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr8	20030509	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr8	20036018	.	G	GA,GAA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,36,29;MFRL=140,118,150;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.07,10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,6:0.247,0.590:9:1,1,2:0,1,2:0,1,3,5
chr8	20036043	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,1,13
chr8	20036095	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr8	20037017	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=137,249;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr8	20068163	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr8	20068619	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:5,2,2,0
chr8	21550768	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr8	21550800	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=146,206;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:1,1,3,2
chr8	21551002	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=186,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr8	21608266	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:8,2:12,1:8,12,1,2
chr8	21632597	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=174,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:2,5,1,2
chr8	21645760	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=73,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:21645760_G_T:21645760:0,2,0,1
chr8	21645767	.	T	TAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=154,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:21645760_G_T:21645760:0,2,0,1
chr8	21645769	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=154,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:21645760_G_T:21645760:0,2,0,1
chr8	21768380	.	AAGAG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=141,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=AG;STR;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:3,4,2,4
chr8	21824547	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=262,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:1,3,0,5
chr8	21827162	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=326,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr8	21827833	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,7:1,3:1,0,5,5
chr8	21827880	.	A	AACAC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=239,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=AC;STR;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.689:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr8	21835465	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr8	21840052	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	21845275	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=175,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,1:6,2:4,6,3,0
chr8	21845428	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=229,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.696:18:3,9:2,2:1,4,2,11
chr8	21846488	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=121,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.260:10:5,0:3,2:7,1,1,1
chr8	21849566	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=242,227;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr8	21857267	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,7:0,0,0,13
chr8	21890581	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:21890581_T_C:21890581:0,0,8,1
chr8	21890589	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=202,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:0|1:21890581_T_C:21890581:3,0,5,1
chr8	21891888	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=211,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:1,1:5,3:3,4,2,2
chr8	21891939	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr8	21891968	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,10,7
chr8	21904195	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	21904212	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	21905716	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=194,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:0,1:4,1:0|1:21905716_A_C:21905716:0,4,2,0
chr8	21905720	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,11;MFRL=194,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:0,0:4,0:0|1:21905716_A_C:21905716:0,4,2,0
chr8	21924297	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
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chr8	22107986	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=181,219;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,1:8,1:8,8,1,1
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chr8	22211756	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:7,5,2,0
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chr8	22386122	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:14,0:9,3:6,17,0,3
chr8	22389900	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=195,262;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr8	22398414	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	22415610	.	G	GTGA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=174,160;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:0|1:22415610_G_GTGA:22415610:8,6,0,2
chr8	22415614	.	G	GCTCATACGTGTTTAACAACCAGCA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,160;MMQ=60,45;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,1:0|1:22415610_G_GTGA:22415610:8,5,0,2
chr8	22421395	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	22422923	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,0:3,3:0,8,0,3
chr8	22426650	.	TC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=151,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.390:16:3,1:7,5:6,4,5,1
chr8	22426858	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=202,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:22426858_AG_A:22426858:0,1,0,2
chr8	22426860	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=202,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:22426858_AG_A:22426858:0,1,0,2
chr8	22428658	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	22428685	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	22438313	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=217,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:0,1:4,1:1,3,0,2
chr8	22442287	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:4,0,4,2
chr8	22447010	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,19;MFRL=194,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:22447010_T_G:22447010:1,0,1,0
chr8	22447012	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=18,10;MFRL=194,250;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr8	22447014	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,15;MFRL=194,250;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:22447010_T_G:22447010:1,0,1,0
chr8	22460131	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,3:6,0:6,10,0,3
chr8	22460167	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:7,3:4,0:0|1:22460167_T_G:22460167:1,12,0,3
chr8	22460168	.	G	GGGCTCA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:8,3:5,0:0|1:22460167_T_G:22460167:1,12,0,3
chr8	22460204	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=186,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,0:0,6,0,4
chr8	22463697	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=85,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:3,2:4,4:2,5,2,4
chr8	22464064	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr8	22464390	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=181,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,5:5,1:7,2,4,2
chr8	22465385	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=253,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr8	22465427	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=144,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:5,0,5,0
chr8	22465560	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:10,3:12,1:6,16,0,4
chr8	22470710	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=192,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0,5,0,5
chr8	22473449	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=159,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.183:14:5,0:6,2:0|1:22473449_G_A:22473449:5,7,1,1
chr8	22473455	.	G	GCACAGGGATGCAGTGGCTCTGTAA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=159,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:0|1:22473449_G_A:22473449:7,6,1,1
chr8	22473465	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,5:5,2:6,2,3,4
chr8	22476740	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,1:8,1:5,12,1,1
chr8	22477131	.	ACAT	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAT;STR;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.416:22:4,7:8,2:0|1:22477131_ACAT_A:22477131:5,8,4,5
chr8	22477154	.	GAC	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=164,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,2:9,0:0|1:22477131_ACAT_A:22477131:10,11,1,1
chr8	22477160	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=166,53;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,2:10,0:0|1:22477131_ACAT_A:22477131:9,11,1,1
chr8	22477162	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=168,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,2:10,0:0|1:22477131_ACAT_A:22477131:8,11,1,1
chr8	22478980	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,95;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:11,2:9,0:14,7,2,0
chr8	22487388	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=174,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,4:1,3:1,2,7,0
chr8	22487422	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=208,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:1,2:2,6:1,2,5,3
chr8	22502207	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:3,1:2,5:3,2,4,2
chr8	22582274	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:4,0,4,0
chr8	22785013	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr8	22863004	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr8	22863017	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	22865320	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr8	22874933	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=147,92;MMQ=60,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:11,0:8,6:9,10,1,5
chr8	22874955	.	C	CT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=131,92;MMQ=60,47;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.167:34:13,0:16,5:16,13,0,5
chr8	22881852	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr8	22884848	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:1,0:0,1:0|1:22884848_A_AT:22884848:0,1,0,1
chr8	22884850	.	C	CAGATACTCCAGAAAGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:22884848_A_AT:22884848:0,1,0,1
chr8	22885109	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	22886130	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,5,12
chr8	22888407	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr8	22926313	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.393:16:4,3:5,3:8,2,5,1
chr8	22926498	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=63,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,0:0,7:0,2,0,7
chr8	22960704	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=246,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:1,9:2,4:0,3,6,7
chr8	22972321	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=74,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,3:1,5:2,3,2,6
chr8	23002137	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:2,1:11,1:3,10,0,2
chr8	23002444	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=123,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr8	23004629	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=263,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr8	23049292	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=221,139;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,11:1,4:1,0,8,7
chr8	23054779	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=248,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,4:3,5:1,4,1,8
chr8	23069574	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr8	23069737	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=121,69;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,0:7,3:5,11,1,2
chr8	23069805	.	C	CATCTGCTGAGAGCTACTTCCACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=135,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr8	23112662	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	23114024	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=140,39;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:4,4,0,2
chr8	23116012	.	T	TTGTGTTTAGAACTATATATGTGGCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=103,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	23116392	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=143,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.653:6:0,4:1,0:1,1,2,2
chr8	23116429	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=217,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:3,2,1,2
chr8	23116431	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr8	23116675	.	ATT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=126,182;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=24,22;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:2,0:0,1:0|1:23116675_ATT_A:23116675:2,0,0,1
chr8	23116694	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=148,182;MMQ=40,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:0|1:23116675_ATT_A:23116675:1,2,0,1
chr8	23116703	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=180,182;MMQ=35,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:23116675_ATT_A:23116675:0,4,0,1
chr8	23155706	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=142,270;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:1,7,0,2
chr8	23174425	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr8	23177619	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr8	23185977	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=145,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,1:3,2:4,7,2,1
chr8	23186007	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,6:0,0,9,11
chr8	23198732	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=172,247;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:1,8,2,0
chr8	23294392	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=273,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0|1:23294392_C_T:23294392:2,0,3,0
chr8	23294412	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0|1:23294392_C_T:23294392:2,0,3,0
chr8	23301340	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,1:7,3:8,3,1,3
chr8	23302164	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:2,5,0,2
chr8	23423758	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=84,162;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,6:0,5:0,2,2,9
chr8	23429448	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=85,239;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,2:0,2,0,3
chr8	23540417	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	23563908	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=195,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:3,0:0,2:3,1,1,2
chr8	24187723	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:24187723_G_A:24187723:0,0,0,1
chr8	24187725	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:24187723_G_A:24187723:0,0,0,1
chr8	24193264	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	24200788	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,36;MFRL=129,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:24200788_A_C:24200788:0,2,0,1
chr8	24200795	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=129,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:24200788_A_C:24200788:0,2,0,1
chr8	24200800	.	A	ACCTTGTGAAATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,27;MFRL=131,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:24200788_A_C:24200788:0,1,0,1
chr8	24208649	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr8	24208847	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=132,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,5:6,5:7,4,5,5
chr8	24208934	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:0,10,0,2
chr8	24211869	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=141,112;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.519:23:7,3:4,9:5,6,6,6
chr8	24211884	.	A	ATGTC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGTC;STR;TLOD=97.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,10:0,0,9,14
chr8	24211993	.	ACTAT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=130,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTAT;STR;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:0,7:1,4:0,1,4,7
chr8	24242035	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,3:6,1:7,4,3,1
chr8	24253182	.	TAC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=138,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.283:9:2,1:5,1:6,1,2,0
chr8	24326157	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr8	24339896	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr8	24348221	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr8	24348241	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=167,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:6,0,3,0
chr8	24349395	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:3,4:8,3:6,5,7,0
chr8	24350188	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=227,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,0,3
chr8	24365157	.	TCA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=142,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,1:0,2,0,4
chr8	24774683	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,11,5
chr8	24775028	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=91,74;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:19,1:11,2:17,13,0,3
chr8	24775415	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:4,2:8,2:0|1:24775415_C_T:24775415:5,9,0,4
chr8	24775421	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:5,2:9,2:0|1:24775415_C_T:24775415:5,9,0,4
chr8	24775424	.	CC	AT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:5,2:7,2:0|1:24775415_C_T:24775415:4,8,0,4
chr8	24811064	.	AG	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=63.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,8:0,15:0,0,9,15
chr8	24811126	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.188:33:5,0:22,5:21,6,0,6
chr8	25158026	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr8	25158072	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr8	25174495	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr8	25174710	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:25174710_C_T:25174710:0,0,0,3
chr8	25174723	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:25174710_C_T:25174710:0,0,0,2
chr8	25178481	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=148,57;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.127:22:4,0:15,2:13,7,1,1
chr8	25178504	.	T	TCCATTTTCATTCAAGAAATACCAGA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=146,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:4,0:16,2:10,11,1,1
chr8	25181356	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr8	25202915	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr8	25216620	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,1,9
chr8	25227229	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:25227229_T_G:25227229:0,0,0,8
chr8	25227234	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:25227229_T_G:25227229:0,0,0,7
chr8	25227255	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr8	25230267	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:0,1,1,4
chr8	25231044	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr8	25231117	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr8	25247821	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,0,2
chr8	25247861	.	AT	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=162,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr8	25257531	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,5,8
chr8	25280666	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr8	25287556	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	25301759	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=118,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.590:12:3,4:2,1:5,0,6,1
chr8	25315837	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,139;MMQ=52,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,2:0,3:0,3,0,5
chr8	25317691	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr8	25325653	.	AAAGAAAAG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,236;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.689:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	25327476	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,0;MFRL=151,117;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:12,0:3,0:0|1:25327476_A_G:25327476:9,8,3,0
chr8	25327484	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:12,3:4,0:0|1:25327476_A_G:25327476:8,9,3,0
chr8	25327571	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr8	25361046	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=125,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:11,0:3,2:9,5,0,2
chr8	25365278	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr8	25744257	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=203,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:1,1,1,3
chr8	25766097	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=283,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:0,2,0,6
chr8	25890549	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=222,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:5,1,3,1
chr8	25899596	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=188,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,0:4,4:5,3,0,4
chr8	25902171	.	CGG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=210,109;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=G;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.431:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr8	26223962	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:26223962_G_A:26223962:0,2,0,1
chr8	26223968	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:2,1:0|1:26223962_G_A:26223962:0,2,0,1
chr8	26249018	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr8	26265641	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,4:5,0:4,7,4,0
chr8	26265907	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,3:7,1:1,10,1,3
chr8	26366192	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:9,3,1,1
chr8	26366366	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=253,237;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:4,1,0,4
chr8	26441275	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,10,6
chr8	26441562	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=235,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr8	26484064	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=136,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:8,3,2,0
chr8	26501001	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=161,266;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,1:2,1:6,2,2,0
chr8	26505274	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,70;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:12,0:12,4:10,14,1,3
chr8	26628028	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,8,13
chr8	26906538	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr8	27097534	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=151,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.395:28:9,10:8,0:11,6,11,0
chr8	27099132	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=21,14;MFRL=100,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.388:8:2,0:0,1:3,2,3,0
chr8	27099137	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=50,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0|1:27099137_C_T:27099137:6,2,2,0
chr8	27099138	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,17;MFRL=100,87;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.268:9:5,0:2,1:1|0:27099137_C_T:27099137:5,2,2,0
chr8	27099142	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,13;MFRL=100,87;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.268:9:3,0:1,0:1|0:27099137_C_T:27099137:5,2,2,0
chr8	27099879	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,2:1,4:1,1,4,2
chr8	27255003	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=251,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr8	27255080	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=127,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:7,4:1,1:6,2,2,3
chr8	27255146	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:4,6:4,5:5,4,6,5
chr8	27255325	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=109,261;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:4,3:0,2:2,2,2,4
chr8	27255368	.	AGCAGCTCTCCTGCAGCCTC	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.833:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	27279726	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,144;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,3:5,0:6,0,3,0
chr8	27288033	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=11,34;MFRL=192,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,1:0,3:0,1,1,3
chr8	27289935	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=189,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,1,2
chr8	27291557	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr8	27291749	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=217,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:1,1,0,4
chr8	27294532	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	27294606	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=217,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,3:1,1:5,0,4,0
chr8	27294823	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,11,3
chr8	27295109	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=208,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,1:0,6:1,0,2,5
chr8	27297696	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr8	27310546	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,12,3
chr8	27315726	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr8	27316117	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	27321597	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr8	27326838	.	AGG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=G;STR;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:4,0:7,3,1,1
chr8	27358505	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=158,234;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:4,5,1,2
chr8	27361311	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=201,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr8	27369334	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,9,7
chr8	27394366	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.239:22:12,1:3,2:9,8,2,3
chr8	27396111	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=124,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:9,2:3,3:8,4,3,2
chr8	27402074	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=152,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,2:2,4:1,3,1,5
chr8	27402132	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr8	27456253	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,0,2
chr8	27462008	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr8	27463963	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:15,7:9,0:10,14,7,0
chr8	27472379	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	27509048	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:11,2,2,0
chr8	27514462	.	A	ATGTTCAAACAATTCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=221,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,1,1
chr8	27593650	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr8	27614138	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=178,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr8	27630152	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=230,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,4:4,4:2,4,1,8
chr8	27634576	.	G	GA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.151:29:12,1:12,3:13,12,2,2
chr8	27637666	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:5,1:6,1:9,2,1,1
chr8	27641609	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,7,11
chr8	27667793	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:1,1:9,1:7,3,1,1
chr8	27680576	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=131,265;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:12,5:9,3:12,9,6,2
chr8	27729406	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=96,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,4:7,0:9,3,3,1
chr8	27737180	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:3,2:5,3:7,2,3,2
chr8	27737198	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,8,9
chr8	27762235	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:6,2:0,2:5,1,4,0
chr8	27764627	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=222,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,6:2,4:1,2,7,3
chr8	27764644	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=132,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:7,7,2,0
chr8	27767231	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,0:7,4:4,8,2,2
chr8	27767276	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,21;MFRL=191,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,0:6,4:5,10,1,3
chr8	27767305	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=200,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.595:13:1,5:4,2:0,5,4,4
chr8	27767339	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=200,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr8	27779811	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=166,233;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr8	27823868	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=123,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr8	27823996	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=117,72;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:8,5:8,0:8,8,4,1
chr8	27880826	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr8	27886700	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=197,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,0:5,4:4,1,4,0
chr8	27918057	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0,0,13,5
chr8	27925204	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,5:7,5:4,5,5,5
chr8	27927849	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,8,12
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chr8	27957313	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=165,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr8	27967856	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=124,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,1:8,2:9,2,2,1
chr8	28013579	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=212,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,1:2,4:0,3,1,4
chr8	28016044	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=106,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,2,0
chr8	28210613	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,15,1
chr8	28217034	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=115,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:5,5:18,0:22,1,5,0
chr8	28286885	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:4,2:3,1:5,3,1,2
chr8	28304767	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=196,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,2:10,1:2,14,0,3
chr8	28304769	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=207,144;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:6,1:6,3:2,11,0,5
chr8	28304775	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=142,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,0:7,3:2,12,0,3
chr8	28310031	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=148,44;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,1,1
chr8	28341058	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr8	28575029	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=222,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:8,0:12,4:10,10,0,4
chr8	28588904	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=157,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,2:8,1:8,7,0,3
chr8	28600572	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=129,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr8	28608345	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=149,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:8,0:0,2:4,4,2,0
chr8	28628420	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=169,209;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr8	28635303	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=188,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,3:3,7:4,1,7,3
chr8	28638577	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=185,242;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr8	28645271	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,5:3,1:2,1,6,0
chr8	28651296	.	C	CAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=195,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:1,0:3,1,2,0
chr8	28651298	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:4,2:2,0:6,0,2,1
chr8	28654083	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=179,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:7,2:0|1:28654083_C_T:28654083:9,5,1,1
chr8	28654091	.	CATCTGGGTTTGCAGTGGGG	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=143,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,0:12,2:0|1:28654083_C_T:28654083:13,12,1,1
chr8	28692783	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=215,241;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,2:5,2:4,1,2,2
chr8	28876221	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr8	28906655	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,12;MFRL=271,250;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.580:5:0,0:1,1:0,2,0,3
chr8	28956836	.	A	ACCTGGGAC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=143,136;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:3,0:0|1:28956836_A_ACCTGGGAC:28956836:0,5,0,2
chr8	28956841	.	AAC	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:1,0:0|1:28956836_A_ACCTGGGAC:28956836:0,3,0,2
chr8	28956845	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=143,136;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:28956836_A_ACCTGGGAC:28956836:0,1,0,2
chr8	28966870	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=215,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:3,0,4,0
chr8	28984572	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,8:0,11:0,0,17,3
chr8	28989789	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,2:6,4:5,5,2,4
chr8	28989907	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,2:8,1:9,7,0,3
chr8	28998179	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=221,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr8	29005093	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,5,8
chr8	29005128	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=181,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:1,3,1,3
chr8	29005143	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr8	29006063	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:5,0:12,3:10,7,2,1
chr8	29035099	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,258;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,0:7,2:1,8,0,2
chr8	29048477	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=102,191;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:5,5,1,1
chr8	29053721	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=142,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.126:38:12,0:17,4:15,19,0,4
chr8	29053761	.	TAA	T,TA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,28,30;MFRL=227,202,166;MMQ=60,60,60;MPOS=16,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=8.28,15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,9:0.303,0.513:17:0,2,2:3,2,7:0,3,3,11
chr8	29194441	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=195,251;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,4:1,0:1,0,4,0
chr8	29203137	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=168,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,1:6,3:0,7,0,4
chr8	29207845	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=242,247;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr8	29207872	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=273,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0|1:29207872_G_A:29207872:0,4,0,2
chr8	29207891	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,18;MFRL=238,305;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:29207872_G_A:29207872:0,4,0,1
chr8	29921288	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:1,3:8,1:9,0,4,0
chr8	29923732	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=207,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:0,6,0,5
chr8	29931375	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,9,6
chr8	29940271	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,16,0
chr8	29940505	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=227,259;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr8	29989399	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:9,0,5,1
chr8	29990467	.	TTC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TC;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	29996313	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr8	30001915	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=287,207;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr8	30013787	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=30,12;MFRL=123,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,20:0.840:23:1,0:2,4:0|1:30013787_G_C:30013787:0,3,20,0
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chr8	30013800	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=27,12;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,15:0.571:26:3,2:8,0:0|1:30013797_GG_CC:30013797:3,8,15,0
chr8	30013803	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=32,12;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:3,1:7,1:0|1:30013797_GG_CC:30013797:3,8,10,0
chr8	30013808	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=29,31;MFRL=147,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,9:0.345:27:6,2:9,4:0|1:30013797_GG_CC:30013797:6,12,9,0
chr8	30013814	.	AA	CC	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,7:0.250:30:8,2:10,4:0|1:30013797_GG_CC:30013797:7,16,7,0
chr8	30013819	.	TG	CC	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=30,13;MFRL=147,141;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.211:31:11,0:13,1:0|1:30013797_GG_CC:30013797:8,17,6,0
chr8	30040534	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,1:4,1:9,0,1,1
chr8	30242747	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr8	30404962	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:9,0:8,6:5,12,0,6
chr8	30436586	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=137,115;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:7,0:0,2:0,7,0,2
chr8	30464535	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=211,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:12,0:4,4:16,0,4,0
chr8	30464626	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=175,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.137:31:13,0:14,3:17,10,4,0
chr8	30464719	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:5,1:2,2:0,11,0,3
chr8	30469805	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=101,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.542:18:3,5:5,3:6,2,6,4
chr8	30537223	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,27,21;MFRL=165,216,155;MMQ=60,60,60;MPOS=17,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=T;STR;TLOD=9.42,9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,6:0.342,0.519:11:0,1,1:1,3,4:0,1,0,10
chr8	30539623	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	30546636	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=107,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,4:4,0:5,4,3,1
chr8	30554006	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=281,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,3:0,6:0,1,3,6
chr8	30560659	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=148,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,0:7,2:5,8,1,1
chr8	30567423	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=160,229;MMQ=44,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.639:6:1,1:1,2:0,2,0,4
chr8	30569609	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=88,258;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,2:4,1:6,5,0,3
chr8	30601610	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr8	30601805	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,11,11
chr8	30608840	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=148,127;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:30608840_A_G:30608840:4,0,1,0
chr8	30608842	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=148,127;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:30608840_A_G:30608840:4,0,1,0
chr8	30609061	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:30609061_T_G:30609061:0,0,2,2
chr8	30609078	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:30609061_T_G:30609061:0,0,1,2
chr8	30612248	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=128,87;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,3:7,0:9,8,2,1
chr8	30620840	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=40.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,11:0,2:0,0,6,8
chr8	30620964	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr8	30623783	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,165;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,2:9,0:11,4,2,0
chr8	30623996	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr8	30651546	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=147,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:0|1:30651546_AT_A:30651546:13,9,0,2
chr8	30651550	.	A	AG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=145,208;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,2:10,0:0|1:30651546_AT_A:30651546:13,10,0,2
chr8	30651554	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=143,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,2:9,0:0|1:30651546_AT_A:30651546:11,10,0,2
chr8	30699494	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,2:2,1:9,0,3,0
chr8	30854033	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=221,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:2,0,4,2
chr8	30889771	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=172,249;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,3:7,2:5,5,3,2
chr8	30916085	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr8	30916691	.	T	TTTATAATAATACTTAATAATTTTATGTC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=144,57;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.147:26:13,3:10,0:9,14,2,1
chr8	30922346	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr8	30924557	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=247,174;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,1:1,5:1,2,3,3
chr8	30933816	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.270:17:7,1:5,3:2,11,0,4
chr8	30933859	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=244,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:0,1,0,8
chr8	30941317	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=212,206;MMQ=27,34;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,2,0
chr8	30958353	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=271,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,5:0,5:1,0,9,1
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chr8	30999110	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=133,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:0|1:30999110_G_A:30999110:7,11,1,1
chr8	30999115	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=133,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:10,2:0|1:30999110_G_A:30999110:7,12,1,1
chr8	30999122	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=122,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:3,2:11,1:0|1:30999122_C_T:30999122:6,9,0,3
chr8	30999123	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=162,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,13:0.739:17:3,2:1,11:1|0:30999122_C_T:30999122:0,4,6,7
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chr8	31000243	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=241,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:1,5,1,4
chr8	31004465	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=196,263;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr8	31005017	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,2,9
chr8	31024443	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=170,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:4,1,2,0
chr8	32406382	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=282,274;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr8	32505526	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=217,172;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:15,2:6,0:14,8,2,0
chr8	32505909	.	TAG	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=192,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:5,0:7,2:3,10,0,2
chr8	32579686	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=201,205;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr8	32600248	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=154,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:10,5:8,0:8,10,5,0
chr8	32613829	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr8	32616778	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:5,2,2,0
chr8	33311091	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	33347907	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,35;MFRL=244,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.763:5:0,1:0,3:0,1,0,4
chr8	33356191	.	GTT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.680:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr8	33356205	.	T	TTTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr8	33356825	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.420:10:3,1:3,2:1,5,0,4
chr8	33370098	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:6,4,0,2
chr8	33408557	.	CTT	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=141,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.154:17:5,2:9,0:0|1:33408557_CTT_C:33408557:9,6,0,2
chr8	33408561	.	C	CACACACACA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=141,167;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:0|1:33408557_CTT_C:33408557:9,6,0,2
chr8	33408563	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=141,167;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:9,0:0|1:33408557_CTT_C:33408557:9,6,0,2
chr8	33416303	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=162,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,0:1,4:0,2,0,5
chr8	33451026	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=48,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:5,3,3,3
chr8	33451264	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:5,7,1,2
chr8	35402145	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=230,207;MMQ=44,41;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr8	36662680	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,5:5,5:6,2,8,2
chr8	36666183	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=101,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:2,5:2,0:2,2,4,2
chr8	36675146	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=213,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:2,0:1,1:3,1,1,0
chr8	36691189	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=108,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:2,4:6,11:3,5,7,8
chr8	36697911	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:7,1,2,0
chr8	36746409	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=122,91;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.170:16:5,0:6,2:5,9,1,1
chr8	36746419	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=172,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,0:4,2:2,6,1,2
chr8	36746566	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=217,261;MMQ=52,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:36746566_A_T:36746566:4,0,0,1
chr8	36746569	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=217,261;MMQ=52,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:36746566_A_T:36746566:4,0,0,1
chr8	36746571	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=219,261;MMQ=43,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:36746566_A_T:36746566:3,0,0,1
chr8	36746574	.	T	TTTTTTTTGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=219,261;MMQ=43,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:36746566_A_T:36746566:3,0,0,1
chr8	36767085	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=274,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr8	36776267	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=264,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,2:1,4:3,0,6,0
chr8	36776302	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=164,130;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:8,4,0,2
chr8	36780209	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr8	36788693	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=207,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,5:0,4:0,1,3,6
chr8	37553420	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,17;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:37553420_A_AG:37553420:1,0,1,0
chr8	37553425	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=15,12;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:37553420_A_AG:37553420:1,0,1,0
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chr8	37706057	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,4:1,8:0,1,6,6
chr8	37706267	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:0,2,0,7
chr8	37728017	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.897:17:1,6:0,10:0|1:37728017_A_G:37728017:0,1,8,8
chr8	37728019	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.896:17:1,6:0,10:0|1:37728017_A_G:37728017:0,1,8,8
chr8	37728750	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=93,335;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:10,1:0,2:5,5,2,1
chr8	37797631	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr8	37964024	.	CT	C,CTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,19,17;MFRL=150,144,154;MMQ=60,60,43;MPOS=11,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=3.83,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.381,0.376:5:0,0,0:0,0,0:0,1,0,4
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chr8	37971675	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=138,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,0:3,2:6,2,2,0
chr8	37978750	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=160,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:37978750_A_C:37978750:0,4,0,1
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chr8	37985943	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=115,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:10,0:2,4:7,5,2,2
chr8	37986561	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr8	38003787	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=253,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.806:13:0,4:2,7:1,1,6,5
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chr8	38027483	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=208,231;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,3:2,3:0,5,0,6
chr8	38034342	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=239,257;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
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chr8	38099907	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:38099907_A_T:38099907:4,3,1,1
chr8	38099911	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:38099907_A_T:38099907:4,3,1,1
chr8	38099913	.	A	AGAGGATTCTTATGGAAGGTGC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:38099907_A_T:38099907:4,3,1,1
chr8	38110178	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,15;MFRL=193,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.441:7:1,0:1,1:0|1:38110178_G_T:38110178:3,1,3,0
chr8	38110186	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=193,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.441:7:2,0:2,0:0|1:38110178_G_T:38110178:3,1,3,0
chr8	38110200	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,17;MFRL=162,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:3,0:2,0:0|1:38110178_G_T:38110178:4,3,2,0
chr8	38124616	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=190,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:6,0:2,2:8,1,2,0
chr8	38125459	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,7:0.132:52:17,0:26,5:18,27,0,7
chr8	38148255	.	A	T,ACTTTCTT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,17,24;MFRL=249,120,167;MMQ=60,60,60;MPOS=31,0;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,0,1:2,0,0:0,4,0,2
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chr8	38148270	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=324,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:38148264_G_T:38148264:0,3,0,1
chr8	38250440	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=86,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.365:6:1,2:2,0:0|1:38250440_A_C:38250440:0,4,1,1
chr8	38250441	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=172,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:2,0:0|1:38250440_A_C:38250440:0,5,1,1
chr8	38250443	.	C	CAGGAGTTTTATG	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=182,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:38250440_A_C:38250440:0,6,1,1
chr8	38250445	.	A	ATAT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=182,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:2,0:0|1:38250440_A_C:38250440:0,6,1,1
chr8	38250447	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=110,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,0:0|1:38250440_A_C:38250440:0,4,1,1
chr8	38260132	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:8,11,2,0
chr8	38273323	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=167,167;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,6:7,0:10,1,6,0
chr8	38369831	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=124,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,6:3,0:4,1,5,1
chr8	38370200	.	GAGACACAGAC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=173,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGACACAGAC;STR;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr8	38373830	.	TAC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=461,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr8	38373924	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=124,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,0:6,3:7,3,2,1
chr8	38385795	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=143,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.915:21:0,9:1,11:1,0,13,7
chr8	38677932	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=251,165;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,3:2,4:1,3,2,5
chr8	38697649	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=272,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:1,7:2,6:2,1,12,1
chr8	38793682	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=227,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr8	38809663	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,13,4
chr8	38810707	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=188,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:6,2:9,0,3,0
chr8	38826290	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=268,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr8	38827185	.	GC	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=61.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,10:0,0,10,8
chr8	38835456	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=34.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,3:0,6:1,1,4,6
chr8	38839302	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.391:8:5,2:0,1:1,4,1,2
chr8	38851173	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=153,103;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:11,0:8,3:10,10,2,1
chr8	38851204	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:2,5:5,8:1,6,3,10
chr8	38853012	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=124,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:16,0:5,4:10,11,3,1
chr8	38854041	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=199,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:0,8,0,5
chr8	38884342	.	G	GTTCT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTCT;STR;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.561:14:3,2:3,5:3,3,2,6
chr8	38911953	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:2,3:0,8:2,0,12,0
chr8	38912121	.	GAA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=129,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.617:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr8	38940292	.	GAAATCTCAGGACTAGA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=142,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,1:3,10:2,2,1,10
chr8	38959498	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:1,8:3,7:0,4,6,9
chr8	38975580	.	CTT	C,CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27,32;MFRL=169,164,140;MMQ=60,60,60;MPOS=10,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.92,8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,4,5:0.232,0.296:18:3,2,1:3,0,3:6,3,7,2
chr8	39004620	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=195,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:0,1:2,3:1,1,3,2
chr8	39022522	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,9,5
chr8	39044603	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=213,303;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:39044603_C_T:39044603:0,4,0,1
chr8	39044606	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=213,303;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:39044603_C_T:39044603:0,4,0,1
chr8	39068766	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:4,1:5,1:5,5,2,0
chr8	39114676	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.419:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr8	39138775	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=206,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr8	39487022	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:0,8:1,0:1,0,1,7
chr8	39503079	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=172,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr8	39505826	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr8	39521419	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,5:1,6:1,1,3,8
chr8	39525750	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=393,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr8	39602328	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=135,257;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr8	39607098	.	G	GTGTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=262,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:2,2,1,0
chr8	39607105	.	C	CATGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.305:8:2,0:4,1:4,2,2,0
chr8	39618637	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr8	39645740	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=159,174;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:7,0:4,3:0|1:39645740_G_T:39645740:6,5,0,3
chr8	39645743	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=155,174;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:39645740_G_T:39645740:6,6,0,2
chr8	39682513	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=224,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr8	39695535	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=204,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr8	39776286	.	AAAC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAC;STR;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr8	39780131	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=135,44;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:3,5,2,0
chr8	39780922	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.846:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	39785321	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=106,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr8	39843139	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=154,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr8	39871036	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:39871036_A_G:39871036:0,0,5,2
chr8	39871045	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=152,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:4,2:5,1:0|1:39871036_A_G:39871036:6,3,3,0
chr8	39871298	.	T	TTAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	39872668	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr8	39872676	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr8	39873188	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr8	40011767	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.524:6:2,0:1,1:2,1,0,3
chr8	40389842	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,8:0,0,0,11
chr8	40532142	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=168,259;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:6,1,3,0
chr8	41122639	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr8	41122641	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,22;MFRL=254,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.638:3:0,0:0,1:0|1:41122641_T_C:41122641:1,0,2,0
chr8	41122645	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:41122641_T_C:41122641:0,0,2,0
chr8	41122650	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,22;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,1:0|1:41122641_T_C:41122641:1,0,2,0
chr8	41122653	.	CGAGGCT	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,30;MFRL=88,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0|1:41122641_T_C:41122641:2,0,2,0
chr8	41122663	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=25,12;MFRL=88,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:41122641_T_C:41122641:2,0,1,0
chr8	41122667	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.416:3:0,0:2,1:0|1:41122667_C_T:41122667:2,0,1,0
chr8	41122670	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,26;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:41122667_C_T:41122667:2,0,1,0
chr8	41364486	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=237,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:6,0,3,1
chr8	41471786	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	41478361	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=161,256;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.256:10:3,1:3,1:6,2,2,0
chr8	41517860	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr8	41517958	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=42.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,8,6
chr8	41519145	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr8	41519248	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=245,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,4,1
chr8	41519462	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr8	41529856	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,6,1
chr8	41530482	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	41551480	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=162,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:9,9,1,1
chr8	41555473	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr8	41555740	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr8	41561937	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=161,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:9,0:6,3:8,7,2,1
chr8	41571802	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,64;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,1:13,1:9,11,0,2
chr8	41580607	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,0:10,2:13,4,2,0
chr8	41591643	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=156,313;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,1,1
chr8	41804047	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=197,202;MMQ=50,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr8	41805249	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,2:9,1:9,7,3,0
chr8	41838503	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=183,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:0,6,0,4
chr8	41906512	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=223,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:0,6,1,3
chr8	42026393	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=185,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr8	42037630	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=211,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,4:6,3:5,6,3,4
chr8	42037794	.	C	CAA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=148,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:15,1:7,1:0|1:42037794_C_CAA:42037794:10,12,0,2
chr8	42037796	.	T	TCGATG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=148,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,1:7,1:0|1:42037794_C_CAA:42037794:10,12,0,2
chr8	42037924	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,7:3,2:1,3,2,7
chr8	42046470	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,156;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:3,3:12,0:10,5,3,0
chr8	42129657	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,122;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:11,0:10,11,2,0
chr8	42171933	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=141,115;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:14,0:8,3:13,9,0,3
chr8	42172014	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=206,137;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:42172014_T_C:42172014:0,2,0,1
chr8	42172017	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr8	42172020	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=206,137;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42172014_T_C:42172014:0,2,0,1
chr8	42172031	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,34;MFRL=198,137;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:42172031_A_G:42172031:0,3,0,1
chr8	42172033	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=36,32;MFRL=183,137;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:42172031_A_G:42172031:1,3,0,1
chr8	42175303	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,7,10
chr8	42186579	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr8	42188550	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	42196441	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,6:0,13:0,0,13,6
chr8	42207688	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=135,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr8	42220244	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=216,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:3,4:2,3:0,5,2,5
chr8	42231817	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=155,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,2:7,0:9,10,0,2
chr8	42259440	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:10,0:7,6:9,8,0,6
chr8	42295130	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:2,0:1,1:0,3,0,2
chr8	42296968	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=162,66;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:9,2:2,0:8,3,2,0
chr8	42317551	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:4,0:2,5:0,6,0,5
chr8	42317563	.	G	GTTGCTTTCGAATCTAAAATTATCATAAGAATC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=167,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr8	42323207	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,35,34;MFRL=135,133,0;MMQ=60,60,37;MPOS=22,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.27,3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.284,0.360:3:1,1,1:0,0,0:1,0,2,0
chr8	42323227	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,19;MFRL=133,0;MMQ=60,37;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:2,1,1,0
chr8	42552633	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=196,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,2,2
chr8	42565437	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	42612151	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=153,47;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0|1:42612151_A_AT:42612151:6,0,1,1
chr8	42612153	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=156,47;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,0:3,2:0|1:42612151_A_AT:42612151:6,1,1,1
chr8	42612158	.	CG	TA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=160,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:42612151_A_AT:42612151:6,2,1,1
chr8	42612165	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=160,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0|1:42612151_A_AT:42612151:6,2,1,1
chr8	42614378	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=143,237;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr8	42698055	.	AGA	CCC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=15,12;MFRL=261,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:42698055_AGA_CCC:42698055:1,0,1,0
chr8	42698062	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=15,35;MFRL=261,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:42698055_AGA_CCC:42698055:1,0,1,0
chr8	42698066	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,36;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:42698055_AGA_CCC:42698055:3,0,1,0
chr8	42698071	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=23,22;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:42698055_AGA_CCC:42698055:3,0,1,0
chr8	42698073	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,12;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:42698055_AGA_CCC:42698055:3,0,1,0
chr8	42698075	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,12;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:42698055_AGA_CCC:42698055:3,0,1,0
chr8	42711606	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,2:4,3:0,4,0,5
chr8	42742873	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=146,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:5,2:5,0:8,3,2,0
chr8	42761230	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=156,100;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr8	42761288	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=100,159;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr8	42780832	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,17;MFRL=220,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:3,0:2,1:0,5,0,3
chr8	42798394	.	GT	G,GTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,36,33;MFRL=171,138,145;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.47,5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.272,0.363:8:1,2,1:1,0,2:2,1,5,0
chr8	42812229	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:8,3:13,0:13,8,3,0
chr8	42852591	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=198,66;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,0:4,4:8,0,4,0
chr8	42863125	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:7,0:6,9:4,9,0,9
chr8	42868455	.	CTT	C,CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32,35;MFRL=107,105,139;MMQ=60,60,60;MPOS=22,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.77,7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.363,0.436:7:1,2,3:0,1,0:1,0,6,0
chr8	42959007	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr8	42977171	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=293,6273535;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr8	42977292	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=140,163;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:7,5,0,2
chr8	42977591	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,2:6,2:7,5,1,3
chr8	43002052	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=114,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.567:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr8	43013936	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=218,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:2,2:0,4:0,3,5,1
chr8	43054628	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,0:8,3:6,7,0,3
chr8	43147975	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,241;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:4,2:4,0:1,7,1,2
chr8	43152533	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,140;MMQ=60,22;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:9,0:9,5:9,9,0,5
chr8	48320563	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:3,6:0,3:0,3,3,6
chr8	48352784	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=196,0;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr8	48586506	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,6:5,1:4,5,3,4
chr8	48614641	.	TCTCTCTCTCTCTCTCTCTTACACACACA	T,TCA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32,29;MFRL=0,254,230;MMQ=60,40,40;MPOS=24,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.55,6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.310,0.416:8:2,0,1:1,2,1:2,1,0,5
chr8	48625965	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr8	48626090	.	AG	CA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:13,0:9,5:14,8,0,5
chr8	48639850	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=227,53;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,0:0|1:48639850_A_G:48639850:4,6,1,1
chr8	48639856	.	G	GAGTGATGCGTTTTACGTTTTGGAATCCAGATAAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=227,53;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:48639850_A_G:48639850:4,6,1,1
chr8	48713495	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,49;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:11,1:4,1:9,6,2,0
chr8	48736611	.	T	TGTAGGGCCAGAAAAAAAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=217,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:3,0:5,2:0,8,1,1
chr8	48740979	.	G	C,T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,33,27;MFRL=194,125,125;MMQ=60,60,60;MPOS=30,30;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.61,14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,6:0.319,0.316:19:2,0,6:5,6,0:1,6,0,12
chr8	48740987	.	A	AGACATTAGG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=36,37;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:2,6:9,0:0,11,0,6
chr8	48772274	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=140,132;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:7,0:12,3:6,13,0,3
chr8	48792003	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=210,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.349:9:2,2:4,1:6,0,3,0
chr8	48805816	.	A	AG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=76.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,10,11
chr8	48846519	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr8	48856449	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=158,175;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:3,0:12,12:10,5,0,12
chr8	48866909	.	ATT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,1:9,1:8,5,1,1
chr8	48874317	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:0,8,1,2
chr8	48879866	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,215;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,7:3,0:8,0,7,0
chr8	48962335	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.430:10:2,3:4,1:5,1,4,0
chr8	49641784	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr8	49643243	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,11:0,5:0,0,4,12
chr8	49987910	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr8	51306704	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr8	51363078	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=214,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,2:4,6:3,2,4,4
chr8	51465762	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=107,279;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:2,0:4,3:4,3,1,2
chr8	51664541	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.494:12:5,1:1,5:4,2,5,1
chr8	52233299	.	T	TAGG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=151,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:1,3:3,0:3,1,1,2
chr8	52233308	.	A	AAC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=111,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,3:3,0:0|1:52233308_A_AAC:52233308:4,1,1,2
chr8	52233310	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=111,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,3:4,0:0|1:52233308_A_AAC:52233308:4,1,1,2
chr8	52233408	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,3:5,2:6,4,4,1
chr8	52252171	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,1:4,2:5,5,1,2
chr8	52258380	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,294;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:9,1:3,1:10,2,1,1
chr8	52284654	.	C	CA,CAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,34,32;MFRL=216,193,182;MMQ=60,60,60;MPOS=17,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=17.59,4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,8,4:0.420,0.213:20:4,3,4:4,5,0:1,7,4,8
chr8	52325879	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,0,8
chr8	52336041	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr8	52361772	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=213,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr8	52384670	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=220,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr8	52384727	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=162,300;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,2,1
chr8	52384884	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=198,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:2,3,0,3
chr8	52387486	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:1,2:4,1:6,0,2,1
chr8	52412226	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr8	52567361	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:2,2:5,0:2,6,1,1
chr8	52721958	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:1,3:4,1:0,6,0,4
chr8	52732958	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=131,213;MMQ=44,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.144:39:12,4:22,1:23,11,4,1
chr8	52732972	.	A	AT	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=137,213;MMQ=52,49;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.205:37:10,4:20,3:16,14,5,2
chr8	52733003	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=131,117;MMQ=60,45;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.255:37:14,5:14,4:9,19,5,4
chr8	52733242	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=158,174;MMQ=52,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.179:37:14,4:17,2:12,19,0,6
chr8	52733340	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=137,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr8	53044632	.	G	GAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,84;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:15,2:3,1:8,10,0,3
chr8	53045839	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=178,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,0:5,2:6,10,2,0
chr8	53452359	.	TA	T,TAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28,26;MFRL=138,168,124;MMQ=60,60,60;MPOS=30,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.05,3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.323,0.249:9:3,2,1:1,1,1:4,0,5,0
chr8	53536504	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=187,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr8	53543090	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=13,12;MFRL=207,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.439:14:3,1:0,0:1,7,1,5
chr8	53558307	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=162,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,4:4,1:7,2,2,3
chr8	53570529	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=55.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,10,6
chr8	54745538	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:0,6:1,8:0,1,10,4
chr8	54866613	.	CCT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=225,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=40.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:0,6:2,5:2,0,7,4
chr8	54900676	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=196,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:4,3:0,0:5,0,2,1
chr8	55371080	.	C	CAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=241,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr8	55371538	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=348,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr8	55372573	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=171,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,0:7,3:0,10,0,3
chr8	55537138	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=185,251;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr8	55538800	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=143,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.513:37:8,0:10,18:9,9,19,0
chr8	55538984	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=166,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.271:34:12,0:13,8:11,14,0,9
chr8	55542931	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=183,52;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:0|1:55542931_T_TG:55542931:6,4,1,1
chr8	55542932	.	C	CTT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=183,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:55542931_T_TG:55542931:6,4,1,1
chr8	55542934	.	TTC	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=180,52;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:4,2:0|1:55542931_T_TG:55542931:7,5,1,1
chr8	55542940	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=180,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:0|1:55542931_T_TG:55542931:6,4,1,1
chr8	56270470	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=228,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
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chr8	56714971	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=205,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr8	56858888	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=156,267;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,3,1
chr8	56862946	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=175,245;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr8	56863439	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=228,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,1:2,4:0,2,0,5
chr8	56879202	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=174,121;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:5,2,2,0
chr8	56882183	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=267,243;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr8	56922427	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:6,0:13,3,2,0
chr8	56986417	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=226,268;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:1,5,2,3
chr8	56986531	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=203,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:3,1,6,0
chr8	56986737	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:1,3,1,5
chr8	57294501	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=148,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:13,1:2,1:10,5,1,1
chr8	57295200	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=146,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,5:2,2:2,4,5,2
chr8	57353826	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=119,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:0,1,4,3
chr8	57353921	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=179,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:6,0:5,3:8,4,1,2
chr8	57358563	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=192,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,0,2
chr8	59060698	.	TAA	T,TA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30,28;MFRL=0,238,273;MMQ=60,60,60;MPOS=25,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.72,8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.333,0.565:6:0,1,3:0,1,1:0,0,1,5
chr8	59060736	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=192,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.372:13:3,2:5,3:3,5,1,4
chr8	59062277	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=A;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.781:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr8	59343282	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=141,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr8	59345705	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=141,265;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,2:5,1:10,2,3,0
chr8	59346926	.	ATAT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=208,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.424:8:2,2:3,1:3,2,3,0
chr8	59409223	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=154,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:12,2:10,1:15,7,1,2
chr8	59409224	.	G	GTCACCTA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=161,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,2:11,0:15,8,1,1
chr8	59409264	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:11,3:11,0:12,11,3,0
chr8	59411042	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:0,1,3,4
chr8	59490557	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=139,139;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:14,2:5,0:18,1,2,0
chr8	59508244	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=163,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,1:11,1:1,18,0,2
chr8	59512334	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0|1:59512334_G_A:59512334:0,0,9,4
chr8	59512337	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=138,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.264:13:4,2:6,1:0|1:59512334_G_A:59512334:7,3,1,2
chr8	59515756	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr8	59518439	.	CAAAA	C,CAAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33,27;MFRL=109,0,127;MMQ=60,60,60;MPOS=14,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,12,15;RU=A;STR;TLOD=6.21,7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,6:0.163,0.399:17:3,2,3:3,1,1:3,5,4,5
chr8	59520476	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,0:7,2:0,10,0,2
chr8	59720604	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=273,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,3,2
chr8	59851853	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=134,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:8,4:10,2:0|1:59851853_A_G:59851853:11,7,3,3
chr8	59851859	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:22,2:0.115:24:12,0:10,2:1|0:59851853_A_G:59851853:12,10,1,1
chr8	59872615	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=128,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,2:11,1:5,16,0,3
chr8	61139319	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=328,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:2,1,5,0
chr8	61144790	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=134,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,2:2,1:7,1,3,0
chr8	61178676	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=172,264;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr8	61178685	.	T	TTCAGTAGAGATGGAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=264,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:61178685_T_TTCAGTAGAGATGGAG:61178685:0,4,0,1
chr8	61178688	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=264,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:61178685_T_TTCAGTAGAGATGGAG:61178685:0,4,0,1
chr8	61192534	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr8	61193522	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0|1:61193522_A_G:61193522:1,0,3,0
chr8	61193526	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0|1:61193522_A_G:61193522:1,0,3,0
chr8	61193588	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr8	61193760	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr8	61471310	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr8	61484779	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	61655690	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr8	61707572	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.339:30:12,5:7,4:15,5,7,3
chr8	61707725	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr8	61713126	.	A	ATGGACT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGGACT;STR;TLOD=48.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr8	61714245	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr8	61732521	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,5:0,0:0,0,6,0
chr8	61748893	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr8	61750860	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr8	61765560	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=188,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:10,5:9,3:7,12,4,4
chr8	62411925	.	G	GAAAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=549,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAT;STR;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,5:1,3:2,0,9,0
chr8	62416074	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr8	62438530	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=62.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,10,7
chr8	62438591	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=119,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:11,0:5,3:6,10,1,2
chr8	62475276	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.664:7:0,3:2,2:2,0,4,1
chr8	62475480	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=182,76;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr8	62475518	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=183,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:0,4,0,6
chr8	62479934	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=198,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr8	62489334	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,5:5,3:4,2,4,4
chr8	62496415	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=30,24;MFRL=201,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr8	62496421	.	A	AT,ATT	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,27,28;MFRL=160,200,181;MMQ=60,60,60;MPOS=12,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,16;RU=T;STR;TLOD=9.63,3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,2:0.365,0.261:8:0,1,1:2,1,1:2,1,5,0
chr8	62496438	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=29,22;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:2,1:4,1,3,0
chr8	62496443	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=17,13;MFRL=166,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.480:8:1,1:0,0:3,1,4,0
chr8	62496446	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=19,15;MFRL=160,203;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.251:9:1,0:2,0:6,1,2,0
chr8	62496448	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=30,15;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:1,0:3,0:6,1,2,0
chr8	62531670	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=182,281;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr8	62550924	.	TA	T,TAA,TAAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,11,28,31;MFRL=191,254,211,216;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,28,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,12,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.03,6.54,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,2,3,2:0.174,0.235,0.173:13:2,0,1,0:3,0,2,2:1,5,1,6
chr8	62555416	.	GA	G,GAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,35,25;MFRL=190,224,142;MMQ=60,58,60;MPOS=16,12;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.73,9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,4,8:0.173,0.345:22:6,2,4:1,2,1:7,3,7,5
chr8	62556590	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,4:4,2:5,6,2,4
chr8	62563718	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=233,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:1,4,0,5
chr8	62563764	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr8	62566053	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=156,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:5,0:9,4:14,1,4,0
chr8	62602295	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.203:17:4,1:8,2:1,13,1,2
chr8	62626962	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.890:7:0,4:0,0:0,0,2,5
chr8	62627004	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr8	63930289	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=244,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr8	63939839	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=213,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr8	63948134	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=197,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr8	63948185	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,25,28,27;MFRL=157,108,159,109;MMQ=60,60,60,60;MPOS=3,16,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=9.24,5.40,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,3,3,2:0.235,0.267,0.212:10:0,1,3,1:1,2,0,1:1,1,5,3
chr8	63948198	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=118,277;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.409:25:6,3:9,7:6,9,8,2
chr8	63976754	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,8:1,0:2,0,5,3
chr8	63978658	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.879:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr8	64081981	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=143,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.429:24:5,8:9,2:7,7,0,10
chr8	64098729	.	A	AG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,7,15
chr8	64099191	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=191,65;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:0|1:64099191_G_A:64099191:7,11,1,1
chr8	64099195	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=206,65;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,1:6,0:0|1:64099191_G_A:64099191:6,9,1,1
chr8	65495918	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:13,2:7,1:12,8,2,1
chr8	65496051	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:8,0:11,9:9,10,0,11
chr8	65528842	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=18,19;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:0,1:0,6,0,2
chr8	65537104	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=159,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.406:7:2,3:1,0:1,3,0,3
chr8	66517860	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=198,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,0:3,10:1,3,0,10
chr8	66619288	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=145,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.286:21:6,1:9,0:0|1:66619288_T_C:66619288:0,15,6,0
chr8	66619291	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.259:20:6,0:8,0:0|1:66619288_T_C:66619288:0,15,5,0
chr8	66619294	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=120,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.187:18:6,0:7,0:0|1:66619288_T_C:66619288:1,14,3,0
chr8	66619300	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=145,80;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,1:5,1:0|1:66619288_T_C:66619288:1,14,2,0
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chr8	66691934	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=160,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:6,2:8,5:10,4,7,0
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chr8	68170570	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=335,179;MMQ=60,53;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:68170570_T_TA:68170570:0,4,0,1
chr8	68170577	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=335,179;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:68170570_T_TA:68170570:0,4,0,1
chr8	68170581	.	GAC	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=335,179;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:68170570_T_TA:68170570:0,4,0,1
chr8	68170592	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=391,179;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:68170570_T_TA:68170570:0,3,0,1
chr8	68184178	.	T	TAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=203,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:0,2:7,0:2,5,1,1
chr8	68255322	.	GACCCCACCCCCCCACA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.693:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	68929993	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=133,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr8	68965500	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:7,2:10,2:6,11,1,3
chr8	68965521	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,4:5,4:2,7,0,8
chr8	68968166	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.363:20:4,3:9,4:0|1:68968166_C_A:68968166:6,7,4,3
chr8	68968171	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.363:20:4,2:8,4:0|1:68968166_C_A:68968166:6,7,4,3
chr8	68968198	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=182,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:7,0:10,10:6,11,0,10
chr8	68972907	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:7,4:3,0:6,4,3,1
chr8	68981979	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=204,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,3,0
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chr8	70513855	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=184,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:4,1,6,1
chr8	70514116	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
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chr8	70667688	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=124,20240580;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,1:4,1:10,6,2,0
chr8	70967727	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
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chr8	71037131	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:8,2:14,1:1,21,0,3
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chr8	71041229	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:7,1:2,1:0,9,0,2
chr8	71050372	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=204,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr8	71053711	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=209,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:1,2:8,1:0,9,0,3
chr8	71069289	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:8,6,2,0
chr8	71071695	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr8	71075154	.	T	TGGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=196,153;MMQ=41,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:71075154_T_TGGG:71075154:0,3,0,1
chr8	71075155	.	T	TTTTTTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=196,153;MMQ=41,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:71075154_T_TGGG:71075154:0,3,0,1
chr8	71128979	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.243:35:10,0:17,8:12,15,0,8
chr8	71506690	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:4,0:4,2:7,1,2,0
chr8	71510093	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr8	71550058	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,11,10
chr8	71550895	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.894:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr8	71556239	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr8	71619094	.	AATT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=218,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATT;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr8	72127764	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,3:3,0:3,5,2,1
chr8	72128874	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:6,3,2,0
chr8	72129009	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:3,5:8,1:5,6,4,2
chr8	72211834	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:6,2,3,2
chr8	72935039	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=211,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:5,2:0,2:0|1:72935039_C_T:72935039:4,1,4,0
chr8	72935045	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=246,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:2,5:0,2:0|1:72935039_C_T:72935039:1,1,7,0
chr8	72946622	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=171,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.225:16:5,2:6,1:4,9,0,3
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chr8	72963135	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:0,5,0,4
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chr8	72966124	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,3:2,1:1,3,1,3
chr8	72971570	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=128,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.572:12:3,2:2,5:0|1:72971570_C_T:72971570:3,2,5,2
chr8	72971579	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:5,1:7,3:0|1:72971570_C_T:72971570:6,6,4,0
chr8	72973909	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,2:7,1:9,7,1,2
chr8	72975619	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=188,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:3,0,6,0
chr8	72981221	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:0,2:7,2:5,2,2,2
chr8	73848139	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,250;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,2:2,1:7,1,3,0
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chr8	73926236	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=302,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=90.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.932:27:0,14:1,12:1,0,11,15
chr8	73951274	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:4,0,6,0
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chr8	73983994	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=201,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:4,4:1,4:0|1:73983988_TAA_T:73983988:3,2,7,1
chr8	73993200	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=161,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,2:3,6:5,0,5,3
chr8	73993267	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:8,5:8,2:9,7,2,5
chr8	74005337	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,345;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	74203576	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=145,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,5:1,6:0,1,3,8
chr8	74204423	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=132,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.463:7:0,1:4,1:4,0,2,1
chr8	74204653	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=206,244;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,1,1
chr8	74205710	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=183,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,3:7,1:12,1,4,0
chr8	74495084	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=102,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:7,2:6,4:5,8,2,4
chr8	74495118	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=17,18;MFRL=143,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,0:0,1:0,4,0,3
chr8	74507569	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=221,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr8	74859108	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,0:4,4:1,7,0,4
chr8	74859123	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=207,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr8	74868305	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:2,8:4,3:3,3,7,4
chr8	74890927	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:2,1:1,2:2,2,3,1
chr8	74890961	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=214,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:2,8:2,7:3,1,5,10
chr8	74891164	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=212,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:1,3,0,7
chr8	74891200	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=205,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:0,5,0,6
chr8	74893850	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=442,173;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr8	74893880	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr8	75156799	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=173,85;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,2:8,2:10,6,2,2
chr8	75262841	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chr8	75272287	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=216,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr8	75275312	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,1,13
chr8	75737818	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=253,263;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr8	75761295	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=179,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr8	75898368	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,126;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:9,4:10,0:10,9,4,0
chr8	75944409	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=154,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.338:15:5,1:5,4:6,4,4,1
chr8	76463755	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=145,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.324:19:6,4:7,1:2,11,1,5
chr8	76465304	.	A	AATC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=160,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:4,3,1,1
chr8	76465522	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=198,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,0:0,2:0,2,0,3
chr8	76468282	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=141,108;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,7:3,3:5,1,3,7
chr8	76468309	.	GTT	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=149,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:2,2,0,4
chr8	76472560	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=236,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,3:3,3:6,3,3,3
chr8	77618083	.	C	CAGAGCTGTTAACACTTAAGCTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=242,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.242:10:4,2:4,0:4,4,1,1
chr8	77618947	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,221;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:8,0:5,7:2,11,0,7
chr8	77776848	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=98,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.586:12:2,4:2,3:2,3,1,6
chr8	77896472	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr8	79578304	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:6,0,3,0
chr8	79598666	.	GTTTA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=113,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TTTA;STR;TLOD=45.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.886:14:1,6:0,7:0,1,8,5
chr8	79601420	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=242,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,3:1,5:3,0,8,0
chr8	80577224	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,22;MFRL=259,272;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,1:0,1:0,3,1,2
chr8	80678858	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=159,108;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:6,3:14,0:0|1:80678858_G_A:80678858:14,7,3,0
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chr8	80679385	.	G	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,5:0.107:54:23,3:26,2:44,5,2,3
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chr8	80956545	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
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chr8	81426293	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=171,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:0,8,0,3
chr8	81577410	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=286,256;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr8	81892766	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:4,1:10,3:4,10,1,3
chr8	81905294	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=221,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:3,2:5,2:5,3,3,1
chr8	81905314	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.385:16:4,4:6,2:6,4,4,2
chr8	82370727	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:13,1:5,1:7,11,1,1
chr8	82391183	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=176,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:2,6:2,4:2,2,2,8
chr8	82713832	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=168,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:0,0:1,2:0,3,1,2
chr8	82713930	.	A	AGAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
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chr8	82727721	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=265,128;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:82727713_ACAGTG_A:82727713:0,1,0,1
chr8	82741576	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=227,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:6,0,4,0
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chr8	85716963	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=222,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:1,7:2,5:1,2,8,5
chr8	85716976	.	TAAA	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=180,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.381:21:4,6:8,2:8,5,5,3
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chr8	86041624	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=99,99;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,0:14,3:14,15,3,0
chr8	86042370	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=163,335;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0,2,0,2
chr8	86048000	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=220,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr8	86114525	.	T	TTTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=188,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,2:1,4,0,3
chr8	86118507	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=133,257;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,2:1,0:2,4,0,2
chr8	86121311	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr8	86124444	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=176,248;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:2,4,0,2
chr8	86126827	.	C	CAACATT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr8	86158217	.	TTAAAC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=248,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr8	86163067	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=140,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.247:17:8,1:5,2:6,7,1,3
chr8	86163233	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=185,197;MMQ=50,44;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:86163233_T_TG:86163233:0,2,0,1
chr8	86163240	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=172,197;MMQ=60,44;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:86163233_T_TG:86163233:0,3,0,1
chr8	86163243	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=192,197;MMQ=60,44;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:86163233_T_TG:86163233:0,4,0,1
chr8	86171786	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=161,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:3,4,0,7
chr8	86171816	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr8	86180906	.	CTTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,207;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.404:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr8	86240951	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=276,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.758:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr8	86250431	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr8	86250709	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr8	86253980	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=205,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:86253980_T_C:86253980:0,1,0,1
chr8	86253982	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=205,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:86253980_T_C:86253980:0,1,0,1
chr8	86360458	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=200,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:0,5,0,9
chr8	86376375	.	GCCCCGAT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=119,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCCCGAT;STR;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.403:8:5,2:0,1:1,4,0,3
chr8	86385952	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.190:40:21,6:11,0:19,14,7,0
chr8	86389586	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr8	86392947	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=121,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,4:6,0:4,5,4,0
chr8	87076150	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr8	87111368	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:0,2:0,1,0,5
chr8	87151606	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	87151612	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,27;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr8	87151634	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:4,2,2,0
chr8	87414157	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:4,0,3,0
chr8	87443026	.	CCATATATATATA	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=35,36;MFRL=211,191;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0|1:87443026_CCATATATATATA_C:87443026:0,2,0,5
chr8	87443027	.	CATATATATATAT	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=23,36;MFRL=220,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=17,11;RU=AT;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.514:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr8	87443040	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,36;MFRL=211,191;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0|1:87443026_CCATATATATATA_C:87443026:0,2,0,5
chr8	87443042	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,36;MFRL=211,191;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,1:2,3:0|1:87443026_CCATATATATATA_C:87443026:0,2,0,5
chr8	87443058	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=211,191;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr8	87447658	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:11,1,0,2
chr8	87455070	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=213,221;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr8	87474066	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=156,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:16,4:12,0:13,15,2,2
chr8	87474085	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.501:30:11,6:4,9:6,9,6,9
chr8	87489562	.	AAC	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=194,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:6,5:8,4:4,11,5,4
chr8	87497176	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,1:5,2:3,9,2,1
chr8	87520894	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=176,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:2,0:3,2:0,6,0,2
chr8	87540872	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=138,227;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.249:17:10,2:3,1:7,6,2,2
chr8	87544832	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=160,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:7,3:10,3:9,8,3,3
chr8	87544915	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=188,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:0,9,0,2
chr8	87552426	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=157,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,5:6,1:4,2,5,1
chr8	87557153	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:0,5,0,5
chr8	87558939	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=167,87;MMQ=60,58;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:10,2:0|1:87558939_T_C:87558939:17,8,1,1
chr8	87558945	.	ATTTATTC	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=130,87;MMQ=60,58;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,0:11,2:0|1:87558939_T_C:87558939:15,10,1,1
chr8	87558961	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=120,87;MMQ=60,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:8,2:0|1:87558939_T_C:87558939:10,8,1,1
chr8	87560638	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:12,0:14,3:11,15,0,3
chr8	87567031	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=222,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,5:0,2:1,0,7,0
chr8	87567305	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr8	87568635	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=192,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:87568635_G_A:87568635:0,5,0,2
chr8	87568644	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:87568635_G_A:87568635:0,0,0,5
chr8	87570665	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=133,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,0:5,4:2,7,1,3
chr8	87570728	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr8	87666120	.	TTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=220,251;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr8	87751848	.	GT	G,TT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34,15;MFRL=0,212,110;MMQ=60,40,60;MPOS=9,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.71,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,3:0.410,0.397:4:0,1,0:0,0,1:0,0,1,3
chr8	89053890	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.332:28:10,0:9,9:9,10,0,9
chr8	89081541	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=99,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,6:1,2:1,0,7,1
chr8	89081730	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=129,274;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,3:3,3:3,7,2,4
chr8	89081734	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=199,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,3:4,2:3,8,2,3
chr8	89128634	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	90784979	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=132,260;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:7,8,1,1
chr8	90796365	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=115,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.259:21:7,0:7,0:10,5,0,6
chr8	90796369	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=17,14;MFRL=188,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=23,24;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.581:7:0,1:1,0:0,3,0,4
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chr8	95188916	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:11,4:9,2:6,14,2,4
chr8	95189986	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=174,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr8	95206799	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=155,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr8	95390921	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:1,4,0,3
chr8	95403809	.	GAC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:1,2:4,0,3,3
chr8	95406205	.	TTTATTCCCTAAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=225,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0,3,0,1
chr8	95470697	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=309,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr8	95501148	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=182,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,3:1,0:0,4,1,2
chr8	95507237	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.440:9:4,1:1,2:1,4,0,4
chr8	95507273	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=183,140;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:95507273_A_AG:95507273:0,4,0,1
chr8	95507281	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=183,140;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:95507273_A_AG:95507273:0,4,0,1
chr8	95507285	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=178,140;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:95507273_A_AG:95507273:0,3,0,1
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chr8	95853708	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=132,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:3,5:6,4,6,3
chr8	95853907	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=181,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0,6,0,2
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chr8	95885561	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=222,257;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:4,2,2,0
chr8	95905116	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=185,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.179:37:17,6:14,0:14,17,0,6
chr8	95906554	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
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chr8	96069973	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.282:18:8,1:2,4:9,4,4,1
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chr8	96260054	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,247;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.252:6:2,1:3,0:1,4,0,1
chr8	96281480	.	A	AGGGGACCTGGC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=183,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGACCTGGC;STR;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.328:13:5,2:4,2:0,9,0,4
chr8	97245322	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:3,0:2,1:5,0,2,0
chr8	97256341	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=124,98;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,0:0,5:0,1,2,3
chr8	97257982	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr8	97258719	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:1,3:0,1,1,7
chr8	97263418	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=266,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,1,2
chr8	97270991	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=220,278;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr8	97321898	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=223,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:2,4,1,5
chr8	97342536	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=143,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr8	97342582	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=185,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr8	97343176	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=135,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr8	97343326	.	ATCTTGT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=124,70;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTTGT;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:4,1:7,6,0,2
chr8	97345590	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=203,235;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:4,0,6,0
chr8	98078209	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:4,3:15,0:17,2,3,0
chr8	98699799	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=158,174;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.195:39:15,0:17,7:13,19,0,7
chr8	98731444	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:5,2:11,1:9,7,2,1
chr8	98817559	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=185,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr8	98817574	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:3,0:6,0:9,0,2,0
chr8	98827531	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=190,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,4:5,2:5,2,4,2
chr8	98828215	.	A	ACTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=153,110;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,3,1
chr8	98943229	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=154,193;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.231:27:11,5:10,0:6,15,6,0
chr8	98973560	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=99,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:3,1,2,0
chr8	98991221	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,7:1,4:1,2,4,7
chr8	99016092	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=238,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.593:5:0,1:1,2:0,2,0,3
chr8	99045454	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,2:5,0:0,5,0,2
chr8	99045978	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=212,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr8	99054796	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,3:3,4:3,0,7,0
chr8	99054836	.	C	CA,CAAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,35,24;MFRL=146,241,114;MMQ=60,60,60;MPOS=28,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,15;RU=A;STR;TLOD=5.66,5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,5:0.310,0.446:11:1,2,4:2,1,1:3,0,5,3
chr8	99057150	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=105,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,6:2,5:4,1,7,4
chr8	99057526	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=181,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:7,6:6,3:9,4,4,5
chr8	99114970	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:2,3:0,0:2,0,4,0
chr8	99118654	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr8	99135787	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=250,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr8	99140544	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr8	99152269	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,1:3,3:5,5,4,0
chr8	99153088	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:3,5:5,3:3,5,4,5
chr8	99153118	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=155,207;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:5,4,0,2
chr8	99153126	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:1,3:3,0:1,3,2,2
chr8	99153160	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,2:3,2:1,2,0,4
chr8	99158778	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=261,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,4:1,2:3,4,5,1
chr8	99160957	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=169,220;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,1:4,0,3,0
chr8	99162634	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=266,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr8	99162888	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=204,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:0,1,1,5
chr8	99170404	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,0:4,5:5,2,3,2
chr8	99208065	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=119,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:3,2:13,0:16,0,2,0
chr8	99444613	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,8:5,0:7,6,8,0
chr8	99560102	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:99560102_G_T:99560102:2,0,1,0
chr8	99560105	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:99560102_G_T:99560102:2,0,1,0
chr8	99608305	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=123,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:8,2:9,1:11,6,2,1
chr8	100147323	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=159,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:13,3:3,0:8,8,1,2
chr8	100148019	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=265,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,2:1,0:0,1,0,3
chr8	100160282	.	ATTTTT	A,ATTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=16,29,15;MFRL=181,0,148;MMQ=60,60,60;MPOS=22,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,12,15;RU=T;STR;TLOD=3.10,3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.203,0.206:6:0,0,0:0,1,0:0,4,0,2
chr8	100182293	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,0:11,2:8,8,2,0
chr8	100287579	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=185,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:1,0:0,5:0,1,0,5
chr8	100443679	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=240,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr8	100479917	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,0:1,3:0,7,1,2
chr8	100514065	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=131,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:9,10,0,2
chr8	100548975	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=244,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:4,2,1,1
chr8	100568593	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=210,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr8	100833518	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=175,198;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:9,5:15,0:17,7,5,0
chr8	100844550	.	TAG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=282,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr8	100865682	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.369:25:8,5:8,4:8,8,5,4
chr8	100871751	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,36;MFRL=154,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.718:4:0,1:0,2:0,1,0,3
chr8	100880628	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,69;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.129:33:12,3:16,0:14,15,2,2
chr8	100974810	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=195,48;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:4,6,2,0
chr8	100994389	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr8	100999637	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,23;MFRL=283,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,2:1,6:1,1,6,2
chr8	101020548	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=248,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,7:1,7:1,0,7,7
chr8	101020812	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:6,0:6,8,0,2
chr8	101053980	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr8	101059662	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr8	101117554	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:4,2,3,0
chr8	101149783	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=166,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,0:7,2:0|1:101149783_C_T:101149783:9,8,1,1
chr8	101149793	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=164,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,0:7,1:0|1:101149783_C_T:101149783:9,10,1,1
chr8	101149939	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=183,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:1,4,0,3
chr8	101157227	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=148,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.340:21:2,4:11,2:8,6,5,2
chr8	101163658	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=131,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:13,5:3,2:4,12,2,5
chr8	101163986	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=167,276;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:1,1:6,1:7,0,2,0
chr8	101174426	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=211,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr8	101203737	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=185,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,7:0,3:1,1,4,6
chr8	101206459	.	A	AGAC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=209,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,5:1,5:2,2,8,2
chr8	101206531	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=210,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,3:1,5:2,1,1,7
chr8	101232421	.	TCAGTACTG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=190,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:3,1:6,0,2,0
chr8	101232701	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,0,11
chr8	101251595	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=142,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:12,0:15,12:13,15,0,12
chr8	101253092	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=163,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.360:15:5,3:3,0:7,3,3,2
chr8	101253184	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=139,201;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:11,3:15,2:9,17,3,2
chr8	101281238	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=277,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,8:0,6:0,1,0,14
chr8	101629995	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=130,276;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.392:6:3,1:1,0:1,3,0,2
chr8	101661603	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=149,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:6,2:6,3,2,1
chr8	101661643	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=203,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.247:9:2,0:5,0:1,6,2,0
chr8	101718965	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=154,274;MMQ=60,47;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:6,2:8,2:0|1:101718965_G_A:101718965:11,4,4,0
chr8	101718968	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=154,274;MMQ=60,47;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:5,2:9,2:0|1:101718965_G_A:101718965:11,4,4,0
chr8	101718986	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:6,1:9,1:11,5,1,1
chr8	101718987	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=154,271;MMQ=60,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:8,1:9,6,2,0
chr8	101719201	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=111,276;MMQ=60,56;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.184:36:17,5:13,1:17,13,0,6
chr8	101719225	.	G	GGATGAGGTCTGGCAC	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=117,294;MMQ=60,59;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:15,3:14,0:14,15,0,3
chr8	101721705	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=124,100;MMQ=60,38;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,1:12,1:0|1:101721705_G_T:101721705:12,13,1,1
chr8	101721709	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=124,100;MMQ=60,38;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,1:12,1:0|1:101721705_G_T:101721705:12,13,1,1
chr8	101721756	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,36;MFRL=125,58;MMQ=60,42;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,0:11,2:5,14,0,2
chr8	101725026	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.341:16:4,3:6,1:4,7,1,4
chr8	101725362	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=151,466;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.106:36:20,1:12,2:0|1:101725362_T_C:101725362:17,16,0,3
chr8	101725374	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=151,466;MMQ=60,51;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:15,1:11,2:0|1:101725362_T_C:101725362:14,13,0,3
chr8	101933035	.	GGC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.693:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr8	101960854	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=157,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:0|1:101960854_C_CA:101960854:5,10,1,1
chr8	101960855	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=157,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:7,0:8,2:0|1:101960854_C_CA:101960854:5,10,1,1
chr8	101960883	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=228,158;MMQ=47,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:1,5,1,1
chr8	102504974	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,21:0,10:0,0,12,20
chr8	102570768	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=161,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,1:8,1:7,10,0,2
chr8	102585806	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=272,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr8	102585911	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=128,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:13,2:0|1:102585911_C_T:102585911:15,9,2,0
chr8	102585914	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=128,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:12,2:0|1:102585911_C_T:102585911:15,9,2,0
chr8	102644624	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=198,117;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:10,0:7,6:3,14,0,6
chr8	102676566	.	T	TGAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAA;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	102678798	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,4:3,1:3,6,4,1
chr8	102678972	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=205,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:2,8,0,4
chr8	102701456	.	CAA	C,CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=225,201,185;MMQ=60,60,60;MPOS=7,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.06,4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.300,0.321:10:2,2,2:2,1,1:3,1,6,0
chr8	103220351	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=59.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,16,2
chr8	103230953	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	103236194	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=164,242;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr8	103237239	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:11,4:11,2:11,11,0,6
chr8	103250991	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=152,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:8,4:10,5:12,6,8,1
chr8	103271447	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=242,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr8	103276753	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,4:6,3:6,4,3,4
chr8	103282467	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr8	103283313	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,3:4,2:8,1,3,2
chr8	103287850	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=169,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,1:7,2:5,10,1,2
chr8	103289166	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=187,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:5,0:8,3:10,3,3,0
chr8	103291515	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:0,5,0,4
chr8	103297642	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=182,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,2:7,3:5,5,4,1
chr8	103297707	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=189,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.371:33:13,11:8,1:11,10,6,6
chr8	103309660	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=150,234;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:9,3:10,2:13,6,2,3
chr8	103310587	.	A	AAAAAT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=134,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:7,7,2,0
chr8	103311667	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:5,4:9,0:9,5,2,2
chr8	103312181	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,3:0,5:2,0,6,2
chr8	103316228	.	G	A,GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27,32;MFRL=205,192,183;MMQ=60,60,60;MPOS=6,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.90,6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,3:0.213,0.313:10:1,2,2:4,0,1:5,0,4,1
chr8	103316494	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,37;MFRL=273,256;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr8	103317265	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:6,1:2,3:6,3,3,1
chr8	103324336	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=204,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:12,4,0,2
chr8	103327141	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=235,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr8	103339881	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr8	103372743	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr8	103372890	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=128,87;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:19,0:5,3:5,21,1,2
chr8	103373304	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=126,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:6,2:1,0:6,1,3,0
chr8	103563907	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=203,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,3:0,1:5,0,4,0
chr8	103664073	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,10:0.291:36:16,10:9,0:13,13,10,0
chr8	103667800	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,290;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.133:43:20,2:18,3:20,18,3,2
chr8	103846823	.	A	AAAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,0:0,0,2,1
chr8	103850896	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=185,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:8,0,3,0
chr8	103851052	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=189,156;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.379:19:7,5:5,2:2,10,3,4
chr8	103851069	.	A	AATGATGATTTC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=158,65;MMQ=60,47;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,2:9,0:6,10,1,1
chr8	103852064	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=213,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.477:12:3,2:3,4:2,4,2,4
chr8	104075165	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.272:12:8,2:1,1:9,0,3,0
chr8	104078514	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=193,43;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:7,1:1,2:6,2,2,1
chr8	104081025	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=173,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr8	104331088	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=204,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:0,2,0,6
chr8	104336672	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=260,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:3,2,3,0
chr8	104336788	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=168,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,2:6,1:6,6,1,2
chr8	104337218	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=157,296;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,3:4,0:8,4,3,0
chr8	104337367	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,6:3,2:2,7,4,4
chr8	104340719	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	104343822	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr8	104390224	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=257,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,5:0,4:2,0,5,4
chr8	104394744	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,108;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.834:22:2,9:1,10:1,2,7,12
chr8	104420100	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr8	104426910	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=234,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:1,2:2,0,4,0
chr8	104445009	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=171,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr8	104452281	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr8	104452313	.	C	CAAAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=18,36;MFRL=149,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:0,1:1,0,3,1
chr8	104452554	.	A	ATAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=157,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAT;STR;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr8	104453603	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=181,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr8	104513343	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=176,276;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:3,3,0,2
chr8	104709594	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=203,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:2,5,0,2
chr8	104922508	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,35;MFRL=288,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:104922508_CT_C:104922508:0,2,0,2
chr8	104922514	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=288,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:104922508_CT_C:104922508:0,2,0,2
chr8	104930646	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.233:19:8,2:5,2:13,2,4,0
chr8	104934028	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=120,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:1,2,0,6
chr8	104973378	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=127,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:3,3,1,2
chr8	105261135	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,17;MFRL=161,257;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:105261135_C_G:105261135:0,1,0,1
chr8	105261141	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=161,257;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:105261135_C_G:105261135:0,1,0,1
chr8	105261747	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,56;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:6,0:11,8:9,8,0,8
chr8	105263248	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=175,268;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,1:6,4:4,6,2,3
chr8	105263751	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=264,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,5:2,0:2,0,5,0
chr8	105264099	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=290,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:105264099_A_AC:105264099:0,1,0,1
chr8	105264101	.	A	AAAAACAAAAACTAAACAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=290,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:105264099_A_AC:105264099:0,1,0,1
chr8	105361030	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:8,0:7,4:6,11,0,4
chr8	105367096	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=122,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:5,1,4,2
chr8	105367121	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=174,124;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:5,2:6,3:8,3,3,2
chr8	105368476	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=171,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:105368476_T_TG:105368476:1,5,1,1
chr8	105368477	.	C	CCATATTTTGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,20;MFRL=171,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:105368476_T_TG:105368476:1,5,1,1
chr8	105404950	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,3:10,0:15,0,3,0
chr8	105459793	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr8	105503818	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,17;MFRL=303,255;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.718:4:0,0:1,1:0,1,0,3
chr8	105601176	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=173,44248159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:11,1:3,1:5,9,1,1
chr8	105601198	.	A	ACGCCGC,ACGCCGCCGCCGC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,24,28;MFRL=264,177,198;MMQ=60,60,41;MPOS=4,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,11,13;RU=CGC;STR;TLOD=3.53,6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.480,0.345:6:1,2,0:0,1,2:0,1,0,5
chr8	106331094	.	G	GGCGGCGGGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCGGCGGGA;STR;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.809:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr8	106573524	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr8	106573578	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=112,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:1,0,4,3
chr8	106646683	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=273,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr8	106814656	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:7,1:11,3:10,8,3,1
chr8	107371924	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=208,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,4:1,2:0,3,0,6
chr8	107670141	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=223,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,2:1,0,9,1
chr8	107751849	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,272;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:2,3,1,1
chr8	107754473	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,184;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:13,3:10,2:10,13,2,3
chr8	107754583	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,5:3,2:0,5,1,6
chr8	108315599	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:0,1:1,3:0,2,2,3
chr8	108970264	.	T	TCA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=213,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:0,9:2,2:2,0,8,3
chr8	108972953	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=112,136;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.280:30:7,0:15,8:17,5,0,8
chr8	109215368	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=222,249;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:0,7,1,4
chr8	109247189	.	CAAA	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=140,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=A;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.567:12:3,5:1,1:4,1,5,2
chr8	109247222	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.134:32:12,1:8,0:13,15,4,0
chr8	109247234	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=155,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:15,1:11,0:11,18,2,0
chr8	109247339	.	GAAA	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=A;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.098:39:14,3:19,0:3,33,0,3
chr8	109253929	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=192,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr8	109254003	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr8	109260776	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=107,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.628:19:2,6:4,6:5,2,11,1
chr8	109462215	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=234,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.564:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr8	109462791	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,2:4,7:0,5,0,9
chr8	109468230	.	T	TAGAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr8	109488937	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=186,312;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr8	109491399	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=150,198;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:2,2:0,0:1,1,0,3
chr8	109498656	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:1,0,7,0
chr8	109797096	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,11:0.260:44:19,11:14,0:8,25,11,0
chr8	110255556	.	A	AAGAAGTCT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=223,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:5,2:4,0:3,6,1,1
chr8	110293184	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=228,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.524:13:3,1:3,6:6,0,4,3
chr8	110376947	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=247,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:110376947_A_C:110376947:0,1,0,1
chr8	110376949	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=247,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:110376947_A_C:110376947:0,1,0,1
chr8	110397738	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=175,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:3,1:6,1:7,3,2,0
chr8	110400698	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=174,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:5,2:9,2:6,8,0,4
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chr8	110420245	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=166,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,4:5,0:6,1,4,0
chr8	110425552	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=205,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr8	110425594	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=205,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:0,9:3,2:3,0,10,1
chr8	110453466	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=133,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,7:3,2:3,3,7,2
chr8	110461518	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=182,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:2,4:3,0,4,1
chr8	110464253	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=271,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr8	110471796	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=127,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:0,6:1,7:1,0,12,1
chr8	110473907	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=201,235;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr8	110473965	.	AA	TT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.720:9:0,3:2,4:2,0,4,3
chr8	110476821	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=188,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:2,8,0,2
chr8	110491840	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=188,122;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:8,4:3,1:5,6,1,4
chr8	110491877	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=180,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,3:2,1:3,2,1,3
chr8	110495192	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=212,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,7:2,5:3,2,6,6
chr8	110499063	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=184,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,1:3,5:3,1,1,5
chr8	110502285	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,80;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:9,0:4,4:2,11,0,4
chr8	110504088	.	CTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=229,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,4;RU=T;STR;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr8	110516527	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=246,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr8	110519814	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=232,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr8	110523207	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,0:0,5:0,2,0,5
chr8	110527556	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=226,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr8	110535444	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.279:13:5,1:2,2:8,2,2,1
chr8	110984472	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=196,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:1,2,2,1
chr8	113254070	.	TGC	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,3:0,4:0,0,1,7
chr8	113254083	.	ACACG	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=193,222;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr8	113254085	.	ACG	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=193,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr8	113254087	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr8	113256845	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=219,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:4,5:5,1:2,8,0,6
chr8	113256865	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=219,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:0,6,0,5
chr8	113267709	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=209,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr8	113299275	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=200,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,3:6,1:5,2,3,1
chr8	113308243	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=99,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.472:15:1,0:7,7:3,5,1,6
chr8	113323471	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	113347604	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=184,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:4,3:14,0:9,9,3,0
chr8	113347769	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=162,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,3:0,2:0,3,0,5
chr8	113363350	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr8	113363511	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=101,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.495:13:6,2:0,4:2,5,2,4
chr8	113420495	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr8	113485014	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=200,295;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr8	113516209	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,2,6
chr8	113585637	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=119,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr8	113599196	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=183,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr8	113599207	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=183,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr8	113662299	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr8	113842039	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=242,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,3:1,6:0,1,2,7
chr8	114111197	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=115,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:0,2:2,3:1,2,1,4
chr8	114111250	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr8	114326877	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=190,109;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,3:6,0:6,6,3,0
chr8	116616186	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=163,62;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,0:8,3:10,5,2,1
chr8	116635872	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,5:3,1:3,2,2,4
chr8	116635942	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=191,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:3,0:3,2:1,5,1,2
chr8	117658821	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=180,90;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:11,0:5,3:3,13,1,2
chr8	117671310	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=251,276;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr8	117738320	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=186,46;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:6,6,2,0
chr8	117782385	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=199,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr8	117784025	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,25;MFRL=145,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:117784025_C_G:117784025:1,3,0,1
chr8	117784046	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,25;MFRL=190,214;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:117784025_C_G:117784025:0,2,0,1
chr8	117784053	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=214,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:117784053_C_A:117784053:0,3,0,1
chr8	117784057	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,35;MFRL=214,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:117784053_C_A:117784053:0,3,0,1
chr8	117784060	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,26;MFRL=214,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:117784053_C_A:117784053:0,3,0,1
chr8	117784062	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,31;MFRL=214,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:117784053_C_A:117784053:0,3,0,1
chr8	117784064	.	A	AAT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,24;MFRL=214,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:117784053_C_A:117784053:0,3,0,1
chr8	117861112	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.274:12:3,2:6,1:8,1,2,1
chr8	117869549	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=204,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,1:7,2:7,6,1,2
chr8	117955005	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=166,157;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,1:2,1:0,2,0,3
chr8	118533312	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=228,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=100.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,32:0.825:38:1,16:5,16:4,2,14,18
chr8	118533382	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=193,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,3:0,7:0,2,0,11
chr8	118830820	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=83,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,6:2,3:0,2,2,7
chr8	118831815	.	CGGGGAGCCT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=228,232;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,1:4,3:6,1,1,3
chr8	118831856	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=173,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:5,2:5,1:9,2,2,1
chr8	119122692	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=212,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,5:8,0:5,6,5,0
chr8	119123014	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:17,4:14,0:19,13,4,0
chr8	119451983	.	ATGT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=216,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGT;STR;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:0,1:0,2:1,0,3,0
chr8	119941173	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr8	120079748	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr8	120103568	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=258,208;MMQ=60,43;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,0:1,10:0,2,0,10
chr8	120220775	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	120435453	.	G	GGC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr8	120577248	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:2,0:2,9:0,4,0,10
chr8	120580546	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=15,28;MFRL=143,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.461:15:3,4:1,3:1,7,2,5
chr8	120581643	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=315,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr8	120594891	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=205,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:1,1:4,1:0,5,0,3
chr8	120598395	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:0,6:6,2:2,4,5,3
chr8	120599245	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:2,5:5,5:5,2,6,5
chr8	120602908	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=138,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:0|1:120602908_C_T:120602908:0,6,2,5
chr8	120602914	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=170,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:4,0:2,5:0|1:120602908_C_T:120602908:0,7,2,3
chr8	120606023	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:6,4:13,0:14,5,2,2
chr8	120613579	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=187,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr8	120613747	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=136,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,5:3,3:1,2,2,6
chr8	120631657	.	CAA	C,CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35,27;MFRL=164,143,145;MMQ=60,60,60;MPOS=15,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.37,4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.286,0.429:4:0,0,1:1,1,1:0,1,0,3
chr8	120744210	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:20,3:11,0:20,11,3,0
chr8	120744289	.	TC	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=178,196;MMQ=60,56;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.199:38:18,0:13,7:16,15,0,7
chr8	120744349	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:11,13,1,1
chr8	120795607	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=158,63;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,3:4,0:5,2,2,1
chr8	120801805	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=128,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:2,1,2,0
chr8	120805749	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=200,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:0,1,1,6
chr8	120814020	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=246,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,3:3,5:3,1,5,3
chr8	120818483	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:2,1,3,2
chr8	120818709	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,15;MFRL=0,308;MMQ=36,55;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.732:4:0,0:1,0:0,1,0,3
chr8	120847078	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,6:2,8:4,1,12,2
chr8	120847123	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=172,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.646:29:8,6:2,13:7,3,11,8
chr8	120886054	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=166,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,3:6,5:9,4,6,2
chr8	121209000	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=161,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.203:13:2,2:7,0:10,1,1,1
chr8	121243716	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=190,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:2,3,0,2
chr8	121262975	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=191,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:7,4,1,1
chr8	121263069	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=261,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr8	121263085	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=285,236;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:121263085_C_T:121263085:0,3,0,1
chr8	121263087	.	CT	TC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=285,236;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:121263085_C_T:121263085:0,3,0,1
chr8	121263102	.	GC	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=249,236;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:121263085_C_T:121263085:0,4,0,1
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chr8	121290573	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=140,237;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:2,1,4,0
chr8	121293142	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31,26;MFRL=138,110,94;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,16;RU=T;STR;TLOD=5.61,6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,4:0.299,0.392:8:1,2,0:1,0,2:2,0,4,2
chr8	121293331	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,0:3,5:3,1,1,4
chr8	121293376	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:1,6,0,2
chr8	121296045	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=127,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr8	121309862	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=138,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:2,9:5,7:4,3,7,9
chr8	121312875	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=169,126;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:8,0,2,0
chr8	121327673	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,189;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr8	121353651	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=175,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:1,7,0,3
chr8	121353692	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=190,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:0,5,0,4
chr8	121354505	.	GG	AA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:3,0,4,0
chr8	121383048	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,5:0,0,6,8
chr8	121383082	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr8	121426358	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=156,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr8	121426425	.	AGT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=283,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr8	121455558	.	GAAAA	G,GAA,GAAA,GAAAAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34,30,31,33;MFRL=158,156,189,111,155;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=13,15,20,15;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=14,10,12,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.73,9.57,7.74,9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:3,3,5,5,6:0.122,0.223,0.223,0.270:22:1,1,2,2,1:2,2,2,1,3:1,2,1,18
chr8	121471361	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr8	121483196	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:1,4,2,3
chr8	121509825	.	C	CTTT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=131,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:18,5:5,2:1,22,2,5
chr8	121518863	.	CTG	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=198,298;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:2,1:6,0,3,0
chr8	121518868	.	CTTT	CTT,C,CTTTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,35,32,32;MFRL=168,298,198,191;MMQ=60,60,60,60;MPOS=-2147483648,28,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,13,11,15;RU=T;STR;TLOD=10.95,7.03,3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,3,2,2:0.325,0.275,0.240:8:1,2,0,1:0,1,2,1:1,0,7,0
chr8	121530061	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr8	121530384	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=269,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=T;STR;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr8	121531154	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=230,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,1:1,10:0,3,1,10
chr8	121534786	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=239,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,3,1
chr8	121535050	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr8	123966159	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=156,229;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:10,2:8,3:7,11,2,3
chr8	124027628	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=195,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:4,1:7,2:11,0,3,0
chr8	124084909	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:7,0,4,0
chr8	124089526	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr8	124138936	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,3:5,2:4,3,0,5
chr8	124140805	.	C	CATA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATA;STR;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr8	124142489	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=160,128;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:5,5:2,7:2,5,8,4
chr8	124152970	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,5:2,1:5,3,4,2
chr8	124153095	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=157,169;MMQ=60,23;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.226:29:18,6:5,0:0|1:124153095_A_C:124153095:13,10,6,0
chr8	124153098	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=159,169;MMQ=60,23;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.219:30:19,6:4,0:0|1:124153095_A_C:124153095:13,11,6,0
chr8	124153115	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=154,169;MMQ=60,23;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.194:34:18,6:9,0:17,11,6,0
chr8	124154737	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=194,273;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:124154737_A_AT:124154737:0,2,1,0
chr8	124154756	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=194,273;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.411:3:0,0:0,0:0|1:124154737_A_AT:124154737:0,2,1,0
chr8	124157187	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=200,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:124157187_A_G:124157187:0,8,0,2
chr8	124157189	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=200,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:124157187_A_G:124157187:0,8,0,2
chr8	124206394	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:1,3:8,3:3,6,3,3
chr8	124250093	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=136,57;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:11,8,2,0
chr8	124266975	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=129,153;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:18,5:13,0:13,18,5,0
chr8	124357222	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:12,0:12,4:15,9,0,4
chr8	124359662	.	AGGG	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=159,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:124359662_AGGG_A:124359662:1,4,1,1
chr8	124359667	.	A	ATTC	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=159,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:124359662_AGGG_A:124359662:1,4,1,1
chr8	124359669	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=35,20;MFRL=154,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:2,2:0|1:124359662_AGGG_A:124359662:1,5,1,1
chr8	124359675	.	A	AAGTTCTTAGAG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,27;MFRL=154,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:124359662_AGGG_A:124359662:0,4,0,1
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chr8	124359691	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr8	124371970	.	C	CTGCAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=184,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,2:5,0:0,7,1,1
chr8	124381410	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=162,112;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:2,5,0,2
chr8	124381445	.	GTA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=188,240;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.681:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr8	124442146	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=17,30;MFRL=86,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,2:0,3:3,6,3,3
chr8	124448689	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr8	124453521	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=195,216;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr8	124525377	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=173,82;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr8	124659121	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=196,60;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:4,2:8,0,2,0
chr8	124659329	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr8	124663769	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr8	124664873	.	AT	GC	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=144.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,18:0,14:0,0,12,21
chr8	124665211	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,324;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	124693444	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=213,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:1,3:2,4:3,0,6,2
chr8	124696867	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=177,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.713:19:4,5:1,8:1,4,7,7
chr8	124708091	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=203,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr8	124710610	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=166,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,2:5,2:8,2,4,0
chr8	124749610	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=122,163;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,6:0,6:1,0,6,7
chr8	124749651	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=201,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.649:12:3,6:1,2:0,4,0,8
chr8	124749704	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=198,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:0,5,0,3
chr8	124796740	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=183,65;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:14,2:4,0:6,12,0,2
chr8	124817605	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=195,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,3:0,0:0,4,0,4
chr8	124822439	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=191,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr8	124822507	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=103,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.344:25:3,3:9,5:10,7,5,3
chr8	124968211	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:7,2:7,1:12,2,3,0
chr8	124982215	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,5:2,6:0,4,6,5
chr8	124985780	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=115,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.378:22:10,2:3,6:5,9,2,6
chr8	125072709	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=63.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,13,4
chr8	125072964	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=171,70;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:10,0:14,3:12,12,1,2
chr8	125076913	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr8	125080045	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,259;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,0:5,2:5,10,1,1
chr8	125088636	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr8	125107201	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0|1:125107201_G_A:125107201:0,0,4,8
chr8	125107207	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0|1:125107201_G_A:125107201:0,0,4,8
chr8	125334442	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=181,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:9,2:12,2:1,20,0,4
chr8	125384072	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:125384072_C_G:125384072:0,0,1,0
chr8	125384080	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:125384072_C_G:125384072:0,0,2,0
chr8	125384083	.	TG	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:125384072_C_G:125384072:0,0,1,0
chr8	125463083	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=228,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr8	125463098	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=233,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,1:2,5:3,0,6,0
chr8	125501033	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=195,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:1,4,0,2
chr8	125520940	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=106,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.287:16:10,0:2,4:2,10,1,3
chr8	125528102	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:9,2:9,3:8,10,3,2
chr8	125551364	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=191,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,0:7,5:3,8,4,1
chr8	125551567	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=183,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.727:20:3,9:2,6:0,5,2,13
chr8	125559415	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:0,7,0,2
chr8	125562029	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=117,181;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:10,2:6,3:7,9,3,2
chr8	125568182	.	AGG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=220,243;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=G;STR;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr8	125568591	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,2:8,0:6,12,1,1
chr8	125574925	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr8	125575323	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=211,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,2:3,3:0,3,0,5
chr8	125577869	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=83.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,27:0.903:29:2,18:0,7:0,2,15,12
chr8	125601780	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:5,4:8,1,6,0
chr8	125603315	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=194,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr8	125711882	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr8	125988507	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=202,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:9,2:4,0:13,0,2,0
chr8	126033091	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=147,71;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:10,5:15,0:17,9,4,1
chr8	126044437	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=184,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:3,2,2,0
chr8	126056215	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,7:0,11:0,0,9,11
chr8	126071380	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,2:4,1:11,0,3,0
chr8	126071452	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=124,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:6,2:16,0:15,7,1,1
chr8	126085363	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=135,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:7,7,1,1
chr8	126094614	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,1:11,1:11,12,2,0
chr8	126369898	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr8	126445505	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=156,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,3:4,3:9,0,6,0
chr8	126445537	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=124,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.237:19:5,4:10,0:0|1:126445537_C_T:126445537:12,3,2,2
chr8	126445544	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=120,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:5,4:10,1:0|1:126445537_C_T:126445537:12,3,2,3
chr8	126448789	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=241,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr8	128428061	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=189,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:3,5:2,9:5,0,13,1
chr8	128429315	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=96,201;MMQ=24,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:3,3,3,2
chr8	128429510	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=177,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:0|1:128429510_G_A:128429510:0,2,0,7
chr8	128429519	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=177,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:0|1:128429510_G_A:128429510:0,2,0,7
chr8	128752575	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=170,141;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:10,3:18,0:28,0,3,0
chr8	128753254	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=207,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr8	128972992	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,112;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,0:8,3:0,13,0,3
chr8	129021057	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,244;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:10,0,2,0
chr8	129021262	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=297,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:0,1:0,3:0,1,0,4
chr8	130761030	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=184,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0,9,0,2
chr8	130761644	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=141,248;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,0:4,4:4,2,3,1
chr8	130763708	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:6,1,3,0
chr8	130861655	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=164,126;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,0:7,4:2,14,0,4
chr8	130861671	.	AAC	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:3,1:10,1:0,13,0,2
chr8	130874614	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=180,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:5,3:5,1:1,11,0,5
chr8	130874674	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr8	131066928	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=171,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,2:2,3:8,0,3,2
chr8	131073099	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,87251624;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:12,3:9,0:13,9,0,3
chr8	131127831	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=143,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:8,1,2,1
chr8	131128920	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:13,0:12,3:11,14,0,3
chr8	131130594	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,331;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:1,4,1,3
chr8	131138344	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=162,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:9,1:4,3:6,7,1,3
chr8	131140418	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=168,267;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr8	131165086	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.297:15:3,2:7,2:2,9,1,3
chr8	131191571	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:8,8,1,1
chr8	131193153	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=210,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:2,3:4,3:0,6,1,6
chr8	131199416	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=180,229;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.419:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr8	131226752	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=134,241;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:7,0:1,4:7,1,3,1
chr8	131792607	.	C	CAA,CAAA,CAAAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31,32,31;MFRL=202,172,175,159;MMQ=60,60,60,49;MPOS=9,13,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,14,15,16;RU=A;STR;TLOD=5.36,11.10,3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,3,6,2:0.274,0.424,0.173:12:0,0,2,1:1,3,2,1:1,0,9,2
chr8	131812899	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr8	131848465	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=158,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:1,1,3,0
chr8	131859768	.	TAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=68,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:2,1:4,2:4,2,1,2
chr8	131859853	.	AGT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0|1:131859853_AGT_A:131859853:0,0,0,1
chr8	131859858	.	CTGGG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:131859853_AGT_A:131859853:0,0,0,1
chr8	131861762	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=196,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,6:4,0:6,0,6,0
chr8	131862097	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:2,0:1,6,1,2
chr8	131862132	.	ATCCCTTGCATCG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=173,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr8	131916318	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=150,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:0,10,0,3
chr8	131922191	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=244,260;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,0:1,7:0,6,0,7
chr8	132002770	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=168,201;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:7,1:10,4:7,10,1,4
chr8	132002814	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=158,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,1:5,1:2,8,0,2
chr8	132966028	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,5:4,2:7,0,7,0
chr8	132966045	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.339:11:4,2:2,2:6,1,4,0
chr8	132980709	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr8	132988478	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:0,7,0,3
chr8	132996440	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:11,2:8,13,2,0
chr8	132997353	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:0,5,0,2
chr8	133008823	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,2:0,3:0,1,0,6
chr8	133023163	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,5:4,2:2,5,2,5
chr8	133041242	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=208,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr8	133045480	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,319;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr8	133046927	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr8	133046977	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=237,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:2,5:1,3:1,2,6,2
chr8	133049810	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=251,231;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:1,4,0,5
chr8	133051077	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=151,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:5,8,1,1
chr8	133053714	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,285;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.816:9:1,4:0,3:0,1,8,0
chr8	133067271	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,0:10,3:9,12,0,3
chr8	133067315	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,4,15
chr8	133088640	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=15,15;MFRL=249,236;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.516:4:0,0:0,0:0|1:133088640_T_A:133088640:2,0,2,0
chr8	133088644	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=12,12;MFRL=249,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.516:4:0,0:0,0:0|1:133088640_T_A:133088640:2,0,2,0
chr8	133088647	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=15,12;MFRL=228,236;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:0,0:0,0:0|1:133088640_T_A:133088640:1,0,2,0
chr8	133088649	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=8,13;MFRL=228,236;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:0,0:0,0:0|1:133088640_T_A:133088640:1,0,2,0
chr8	133088652	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=228,236;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:1,0:0,1:0|1:133088640_T_A:133088640:1,0,2,0
chr8	133088655	.	GTC	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=17,17;MFRL=228,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:133088640_T_A:133088640:1,0,1,0
chr8	133099841	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:5,1,3,0
chr8	133107893	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.779:25:3,15:2,5:0,5,11,9
chr8	133112327	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=149,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:5,5,0,2
chr8	133116251	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=194,257;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:5,1,1,1
chr8	133117603	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=237,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr8	133142310	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:133142310_G_C:133142310:0,0,0,2
chr8	133142330	.	TG	GC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,296;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133142310_G_C:133142310:0,0,0,1
chr8	133184880	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,104;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,0:5,2:3,8,0,2
chr8	133196633	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:2,5,0,2
chr8	133634814	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,1,1
chr8	133637479	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,79;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,0:5,2:4,3,2,0
chr8	133637659	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,4:7,3:7,6,4,3
chr8	133723166	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=214,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,7:2,5:1,3,9,3
chr8	133740259	.	AGT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=GT;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.848:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	133764263	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=198,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:2,2:7,3:1,9,1,4
chr8	133764321	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=172,48;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,1,3
chr8	133769554	.	TGA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=125,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GA;STR;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,2:5,6:2,7,3,5
chr8	133811435	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=105,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.665:18:3,5:3,7:1,5,0,12
chr8	133816999	.	AT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=136,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,2:6,1:5,9,0,3
chr8	133836432	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=228,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr8	133837566	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,140;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.282:29:13,0:8,7:1,20,0,8
chr8	133848685	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=212,318;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr8	133854714	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr8	133858009	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,3:2,6:2,4,7,2
chr8	133880334	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,10,6
chr8	133881996	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,2:7,1:6,11,1,2
chr8	133885554	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=236,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:0,2:6,0:0,6,0,2
chr8	133895280	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=190,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:4,1:6,1:0,11,0,2
chr8	133899051	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:9,4:4,4:8,5,7,1
chr8	133900252	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=121,232;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,2:5,6:6,3,6,2
chr8	133900353	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=165,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:6,2:10,0:10,6,2,0
chr8	133900386	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=111,216;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:5,1:6,7:6,5,6,2
chr8	133910962	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr8	133911255	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=192,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,0:3,2:1,6,0,2
chr8	133913525	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=220,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:2,0,6,0
chr8	133920411	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:5,4:3,3:7,2,7,0
chr8	133920624	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=197,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,1,4
chr8	133920668	.	C	CCTGAGGGTTTGAGTTCAACCCTCACTGTTTTAGCAATGTGCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=243,301;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.564:6:1,3:1,0:0,3,0,3
chr8	133925209	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=219,251;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr8	133935627	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=173,74;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:13,0:10,3:14,11,1,2
chr8	133945737	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.296:10:3,0:4,0:5,2,2,1
chr8	133960936	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=233,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:4,0,3,0
chr8	133960991	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=218,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.685:10:1,5:1,2:3,0,5,2
chr8	133961237	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=163,261;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr8	133961279	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,300;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr8	133975144	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=131,258;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr8	133975406	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,3:5,1:0,6,0,4
chr8	133978703	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=169,1588863;MMQ=60,28;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.479:4:0,1:2,1:0|1:133978703_C_CTT:133978703:2,0,2,0
chr8	133978709	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=124,1588863;MMQ=60,28;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.352:6:1,1:2,1:0|1:133978703_C_CTT:133978703:4,0,2,0
chr8	133978711	.	CTGTG	C,GTGTG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,32,35;MFRL=123,214,1588863;MMQ=60,60,28;MPOS=22,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.327,0.333:4:1,0,1:0,1,1:1,0,3,0
chr8	133983955	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=165,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:5,2,2,0
chr8	133984821	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=49,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.532:9:0,3:2,2:2,2,4,1
chr8	134052198	.	G	GCACA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=136,355;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=CA;STR;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.494:6:1,0:1,0:3,0,3,0
chr8	134062266	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=175,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,3:7,2:3,8,0,5
chr8	134062983	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=177,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr8	134107223	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=202,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:4,7:2,8:6,0,12,3
chr8	134108718	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=201,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr8	134114716	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=191,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:4,0,7,0
chr8	134146931	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,286;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:16,4:13,0:13,17,4,0
chr8	134225068	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=241,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:1,5:0,4:1,0,5,5
chr8	134225396	.	T	TC	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=93.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,16:0,11:0,0,9,19
chr8	134225434	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,11:0,4:0,0,0,15
chr8	134237578	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=296,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:2,2,5,0
chr8	134239997	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=232,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr8	134251449	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr8	134254264	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=159,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.106:35:10,0:22,3:0|1:134254264_A_T:134254264:18,14,0,3
chr8	134254269	.	A	ACAATGGTTGTCATTTTATTTCCTTCT	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=160,94;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.105:37:9,0:21,3:0|1:134254264_A_T:134254264:18,16,0,3
chr8	134256667	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:11,2:7,5:9,9,4,3
chr8	134260174	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:10,3:14,0:11,13,1,2
chr8	134261065	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=248,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,4:2,5:2,4,2,7
chr8	134270548	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:4,5:1,7:5,0,8,4
chr8	134271506	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.191:13:9,1:2,1:3,8,0,2
chr8	134271521	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=183,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr8	134274226	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=193,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:1,0,7,0
chr8	134292452	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=155,138;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:9,4:8,0:10,7,4,0
chr8	134292516	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=205,139;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:3,10:2,9:4,1,3,16
chr8	134478353	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=159,312;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:10,2:1,0:3,8,0,2
chr8	134488007	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:11,1:15,1:0|1:134488007_G_A:134488007:22,4,2,0
chr8	134488015	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=177,257;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,2:0.096:29:12,1:15,1:1|0:134488007_G_A:134488007:23,4,2,0
chr8	135524644	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=170,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr8	135524938	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=86,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr8	135545058	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=146,252;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:2,2:4,4:5,2,6,0
chr8	135577530	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:7,2:5,2:0|1:135577530_G_A:135577530:10,2,5,0
chr8	135577533	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:7,2:5,3:0|1:135577530_G_A:135577530:10,2,5,0
chr8	135596318	.	A	AAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=184,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=AT;STR;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr8	135612595	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:2,1,4,2
chr8	135622716	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:9,3:9,0:10,8,3,0
chr8	135669810	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=166,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:5,3:4,3:5,5,2,4
chr8	135669901	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=198,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:8,3:7,2:8,7,3,2
chr8	135725039	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=220,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.587:3:0,1:1,1:0|1:135725039_C_A:135725039:1,0,2,0
chr8	135725043	.	G	GGCCC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,18;MFRL=220,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.587:3:0,0:1,1:0|1:135725039_C_A:135725039:1,0,2,0
chr8	135725048	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=220,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.587:3:0,1:0,1:0|1:135725039_C_A:135725039:1,0,2,0
chr8	135725054	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=21,26;MFRL=184,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.409:5:1,1:0,1:0|1:135725039_C_A:135725039:1,2,2,0
chr8	135725058	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=18,29;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:1,2:0,0:0,2,2,0
chr8	135812876	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,1:3,2:2,6,1,2
chr8	136560952	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=186,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr8	136561153	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=212,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,6:2,3:1,3,5,4
chr8	136657198	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr8	136659195	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:3,4:1,1:3,1,6,0
chr8	136659426	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr8	139149510	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=108,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.773:11:0,1:2,8:1,1,3,6
chr8	139151360	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:3,5,0,3
chr8	139151375	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=275,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr8	139151421	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=240,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:139151421_C_T:139151421:0,2,0,3
chr8	139151428	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,36;MFRL=240,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:139151421_C_T:139151421:0,2,0,3
chr8	139153374	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:139153374_G_C:139153374:0,0,5,0
chr8	139153385	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=200,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.498:8:1,4:3,0:0|1:139153374_G_C:139153374:3,1,3,1
chr8	139158317	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=130,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,6:2,3:1,2,5,4
chr8	139161029	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	139164185	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=231,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:139164185_T_C:139164185:1,2,1,1
chr8	139164192	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=181,218;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,2:0.373:6:4,2:0,0:1|0:139164185_T_C:139164185:3,1,1,1
chr8	139165272	.	TG	CA,CG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32,31;MFRL=123,128,239;MMQ=60,60,60;MPOS=12,19;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.08,4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,5,2:0.353,0.193:13:3,5,0:3,0,2:2,4,4,3
chr8	139165289	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,5:2,4:1,4,6,3
chr8	139165463	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.717:16:3,5:1,7:0,4,3,9
chr8	139165557	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=194,283;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr8	139180199	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,5:7,2:7,4,5,2
chr8	139189502	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=241,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr8	139190693	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	139190957	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=129,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:1,8,1,1
chr8	139255197	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=129,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:7,1:6,1:4,9,0,2
chr8	139263328	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=183,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr8	139269052	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr8	139277856	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	139277934	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=198,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,4:1,2:4,3,5,1
chr8	139323246	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	139614436	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=65.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,7,14
chr8	139617046	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,4:0,0,7,7
chr8	139618754	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr8	139620079	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=162,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,3:4,1:8,0,3,1
chr8	139620267	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr8	139631650	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,5,2
chr8	139635883	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr8	139635920	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr8	139648892	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr8	139658747	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr8	139668032	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr8	139668300	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,6:0,1:0,0,0,8
chr8	139672602	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr8	139674213	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:3,0,6,2
chr8	139675869	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,8,1
chr8	139676082	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	139688697	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr8	139696635	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr8	139702939	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=404,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr8	139734242	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=141,215;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr8	139737521	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=66,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,2:4,1:2,2,3,0
chr8	139763792	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=219,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr8	139767349	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.802:18:1,7:2,8:3,0,12,3
chr8	139808946	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,2:2,5:4,0,7,0
chr8	139819949	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr8	139889972	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr8	140630702	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=137,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:3,11,0,2
chr8	140630714	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=174,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0,13,1,1
chr8	141034189	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=228,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.297:12:4,2:5,1:0,9,0,3
chr8	141293914	.	T	TAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=239,304;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=A;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.306:8:4,1:1,1:6,0,2,0
chr8	141297613	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.878:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr8	141310486	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=139,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr8	141436826	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=206,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:0,2,0,5
chr8	141445349	.	AAGAAAACAAAAAACAAAAACC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=264,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAAAACAAAAAACAAAAACC;STR;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.621:8:2,2:1,2:0,3,1,4
chr8	141461017	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=191,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:8,1:3,3:8,3,3,1
chr8	141461266	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.239:19:8,1:6,3:7,8,2,2
chr8	141549346	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=130,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr8	141549383	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=65,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,4:2,4:2,2,6,2
chr8	141561393	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,2:6,1:5,4,2,1
chr8	141568725	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=92,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr8	141569652	.	G	GGCCTAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=121,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCCTAA;STR;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,2:4,0:2,3,0,2
chr8	141582896	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.373:25:10,3:5,6:11,5,3,6
chr8	141669818	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.947:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr8	141685506	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=188,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,4:1,6:2,1,5,5
chr8	141685641	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,7:0,1:0,0,2,6
chr8	141749052	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=191,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr8	141754888	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr8	141756991	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=19,20;MFRL=201,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,0:1,2:0,4,0,2
chr8	141757009	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=168,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:141757009_T_A:141757009:1,5,0,2
chr8	141757011	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=171,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:141757009_T_A:141757009:1,6,0,2
chr8	141757015	.	G	GGA	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=171,117;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:141757009_T_A:141757009:1,6,0,2
chr8	141757059	.	GA	AG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=260,164;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr8	141774471	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=212,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr8	141840739	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=197,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:0,8,0,2
chr8	142146708	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,2:4,6:4,1,7,1
chr8	142160876	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,0:6,2:10,2,0,2
chr8	142161116	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=217,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:0,6,0,5
chr8	142170884	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=185,134;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:7,6:2,1:3,6,4,3
chr8	142176507	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=214,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:0,5,0,5
chr8	142185580	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:1,3,1,2
chr8	142204326	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:12,3:5,2:7,10,2,3
chr8	142222234	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=31,12;MFRL=230,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,0:0|1:142222234_G_C:142222234:0,3,3,0
chr8	142222237	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=230,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0|1:142222234_G_C:142222234:0,3,3,0
chr8	142222241	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=230,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0|1:142222234_G_C:142222234:0,3,3,0
chr8	142222245	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=230,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:142222234_G_C:142222234:0,3,2,0
chr8	142222249	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=32,12;MFRL=199,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:2,0:1,0:0|1:142222234_G_C:142222234:0,4,1,0
chr8	142222253	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=25,23;MFRL=199,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:142222234_G_C:142222234:0,4,1,0
chr8	142222257	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=199,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:142222234_G_C:142222234:0,4,1,0
chr8	142222314	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=31,29;MFRL=167,49;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,2:7,0:9,5,1,1
chr8	142227349	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=200,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,2:3,0:0,11,0,2
chr8	142228077	.	AGAGCGGCCCCGCTCCGGT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=163,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:2,1:2,2:4,1,2,1
chr8	142229946	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=219,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:0,8,0,3
chr8	142230002	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=237,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0,7,0,2
chr8	142231944	.	GC	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=33.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,4:6,5:0,8,0,9
chr8	142238339	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:6,2:6,1:4,8,1,3
chr8	142366852	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,298;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	142435181	.	C	CTGTGTGTGTATCTCTATGCT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=181,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,0:4,2:6,6,1,1
chr8	142437815	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=168,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:5,0,3,0
chr8	142444780	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=235,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:0,1:5,3:2,3,1,3
chr8	142451399	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr8	142459664	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=149,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:3,0:2,2:5,1,2,0
chr8	142477436	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:142477436_T_TG:142477436:0,0,1,0
chr8	142477443	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:142477436_T_TG:142477436:0,0,1,0
chr8	142477447	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:142477436_T_TG:142477436:0,0,1,0
chr8	142477450	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:142477436_T_TG:142477436:0,0,1,0
chr8	142477456	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:142477436_T_TG:142477436:0,0,1,0
chr8	142480610	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=189,303;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,1:1,1:3,0,2,0
chr8	142484366	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	142487856	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=135,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,1:1,6:2,1,5,2
chr8	142488032	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,3:6,1:1,10,2,2
chr8	142488058	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr8	142488662	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.754:10:1,4:1,3:2,0,6,2
chr8	142489981	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=179,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:1,1,2,1
chr8	142490165	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=166,46;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr8	142505038	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=197,228;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,1,4
chr8	142505056	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr8	142505552	.	G	GGGATCACCAC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=107,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:7,4,0,2
chr8	142505578	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,5:1,5:2,1,4,6
chr8	142517130	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,26;MFRL=188,258;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:0,1:1,2,3,0
chr8	143310815	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=93,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:3,5:0,7:3,0,6,6
chr8	143365913	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,2:0,0,2,7
chr8	143381810	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=220,300;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr8	143396459	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:2,7,0,2
chr8	143399860	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=220,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr8	143412377	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=163,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,1:3,2:1,6,0,3
chr8	143558510	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	143560895	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=230,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,1:0|1:143560895_G_A:143560895:0,1,1,2
chr8	143560898	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=230,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:143560895_G_A:143560895:0,1,1,2
chr8	143560996	.	AGCCAGCT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=262,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:2,3:0,1:2,0,3,1
chr8	143561206	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=262,219;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:0,3,0,5
chr8	143563087	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=185,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.498:12:1,4:5,2:0,6,1,5
chr8	143563161	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=165,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr8	143599464	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=226,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,0:1,2:5,1,2,0
chr8	143599595	.	G	GGGGAAGGCTGTGGCC	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=167,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:2,5,1,1
chr8	143599631	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=150,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:2,1:0,5:0,2,0,6
chr8	143599634	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr8	143599651	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr8	143599665	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr8	143603269	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr8	143603318	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=202,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,1:1,2:3,0,3,0
chr8	143623827	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=250,370;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:143623827_C_T:143623827:0,3,0,1
chr8	143623840	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=250,370;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:143623827_C_T:143623827:0,1,0,1
chr8	143624025	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=180,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:143624025_T_A:143624025:1,3,0,1
chr8	143624027	.	GGC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=180,140;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:143624025_T_A:143624025:1,3,0,1
chr8	143740167	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=291,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr8	143746050	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=182,296;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr8	143746069	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=176,205;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,2,2
chr8	143746087	.	CCA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CA;STR;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr8	143747023	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=217,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:2,0:4,3,0,2
chr8	143762079	.	GGAGGAAGGGA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=259,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr8	143762724	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,269;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,1:3,1,3,0
chr8	143762932	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=232,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:1,4:1,3:0,2,0,8
chr8	143763259	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr8	143781858	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=272,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr8	143784500	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.460:26:5,3:9,8:5,9,5,7
chr8	143784885	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=206,298;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr8	143823858	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,3:4,0:2,7,2,1
chr8	143845950	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:143845950_A_G:143845950:0,0,4,0
chr8	143845953	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:143845950_A_G:143845950:0,0,4,0
chr8	143845982	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=141,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,3:0,2:1,0,6,0
chr8	143846593	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=102,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,2:0,0:1,5,0,2
chr8	143856967	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,2:6,2:7,1,4,0
chr8	143857208	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=188,246;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,4:5,1:5,2,4,1
chr8	143857265	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,8,6
chr8	143867157	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=133,246;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr8	143955916	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=188,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:3,4,2,1
chr8	143957856	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=165,257;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:0,8,2,1
chr8	143957886	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=189,205;MMQ=52,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:2,2,0,1
chr8	143958427	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:5,5,1,1
chr8	143993315	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=296,79;MMQ=60,57;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr8	143994321	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=185,219;MMQ=46,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,1,3
chr8	143994349	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=231,213;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:2,1,0,2
chr8	143994944	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	143995743	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:13,2:4,2:5,12,3,1
chr8	143995760	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=133,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:15,2:3,0:9,12,1,1
chr8	143995761	.	C	T,CAT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,26,20;MFRL=0,104,58;MMQ=60,60,60;MPOS=12,0;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=50.57,4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,18,2:0.832,0.125:20:0,14,2:0,3,0:0,0,10,10
chr8	143998426	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=207,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:2,1,3,1
chr8	143998662	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=253,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,2,1
chr8	144102493	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=128,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,6:1,0:0,1,0,6
chr8	144124512	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=172,203;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:6,3:8,4:9,5,3,4
chr8	144124548	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,2:5,3:8,3,0,5
chr8	144126244	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=379,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:1,4:0,5:0,1,0,9
chr8	144130550	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,11,1
chr8	144239660	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=195,305;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:6,2,4,0
chr8	144239996	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=172,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr8	144297028	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:2,1:3,3:3,2,4,1
chr8	144332012	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=177,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,1:1,9:4,0,8,2
chr8	144358302	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=191,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr8	144391728	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=136,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:2,1,1,2
chr8	144397798	.	G	GGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=206,219;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GA;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr8	144398029	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:2,5:2,1:3,2,2,4
chr8	144398123	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=240,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:3,0:1,3:0|1:144398123_G_C:144398123:3,1,1,2
chr8	144398132	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=165,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:3,1:0,4:0|1:144398123_G_C:144398123:2,1,2,3
chr8	144399856	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=159,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,5:1,0:2,0,5,0
chr8	144399885	.	AG	CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=252,200;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:2,1,6,0
chr8	144400036	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=197,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:8,3:2,1:5,5,0,4
chr8	144400065	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=229,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,5:1,0:2,4,4,1
chr8	144400089	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=197,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,1:3,3:7,3,4,0
chr8	144400188	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,2:9,0:14,10,2,0
chr8	144400200	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:14,2:12,0:13,13,2,0
chr8	144406579	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=206,257;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr8	144406627	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=149,306;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,2,0
chr8	144406881	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=205,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr8	144417051	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	144457864	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr8	144460569	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr8	144462169	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=276,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,6:1,1:1,1,1,6
chr8	144511953	.	ATGG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TGG;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	144520147	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=149,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:3,0,3,2
chr8	144522387	.	GA	TT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=186,133;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:8,3:1,3:5,4,2,4
chr8	144523018	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	144523345	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	144590112	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,1:1,2:1,5,0,3
chr8	144618379	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	144618480	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.433:12:2,2:4,3:6,1,5,0
chr8	144641441	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,15;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,0:0|1:144641441_T_A:144641441:0,1,1,0
chr8	144641448	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,12;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,1,0
chr8	144641449	.	C	CCA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=175,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:144641441_T_A:144641441:0,2,1,0
chr8	144641450	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,19;MFRL=175,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:144641441_T_A:144641441:0,2,1,0
chr8	144641454	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=175,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:144641441_T_A:144641441:0,2,1,0
chr8	144641458	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:144641441_T_A:144641441:0,3,1,0
chr8	144641462	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:144641441_T_A:144641441:0,3,1,0
chr8	144641753	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,3,14
chr8	144642151	.	G	GAGGGC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=137,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AGGGC;STR;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.323:13:6,1:3,2:3,6,2,2
chr8	144642178	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,5,10
chr8	144642986	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr8	144643125	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:144643125_A_C:144643125:1,1,2,0
chr8	144643138	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,12;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,0:0|1:144643125_A_C:144643125:2,2,2,0
chr8	144643152	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=23,13;MFRL=130,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:1,0:0|1:144643125_A_C:144643125:3,3,2,0
chr8	144643169	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.450:9:3,1:1,2:1,4,2,2
chr8	144643321	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,6:1,3:1,0,2,7
chr8	144643815	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=191,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,3:0,4:1,0,7,1
chr8	144644583	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=169,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:4,1,3,2
chr8	144649601	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	144649625	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr8	144649690	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=155,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr8	144650503	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=215,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr8	144650925	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=170,237;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr8	144651554	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:144651554_A_G:144651554:0,0,3,0
chr8	144651576	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:144651554_A_G:144651554:0,0,2,0
chr8	144652281	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=256,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:1,3,0,3
chr8	144653218	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,9:0,4:0,0,2,12
chr8	144654063	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=233,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:144654063_A_C:144654063:0,2,1,0
chr8	144654066	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=233,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:144654063_A_C:144654063:0,2,1,0
chr8	144654069	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=233,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:144654063_A_C:144654063:0,2,1,0
chr8	144654582	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=182,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr8	144654586	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr8	144657269	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=181,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,14:1,9:1,0,16,9
chr8	144657327	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=164,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.314:26:12,0:6,7:5,13,0,8
chr8	144657691	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=203,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.308:16:3,0:6,0:6,5,5,0
chr8	144659608	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,13:0,3:0,0,4,12
chr8	144660523	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	144660575	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	144681695	.	CG	AC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=198,130;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:5,7,0,2
chr8	144690338	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=126,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr8	144695087	.	CGGGCCTGCTCGTAGT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:4,2:0|1:144695087_CGGGCCTGCTCGTAGT_C:144695087:7,5,1,1
chr8	144695108	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:144695087_CGGGCCTGCTCGTAGT_C:144695087:3,5,1,1
chr8	144695176	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=186,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:1,2:1,0:2,0,1,2
chr8	144695499	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:3,1,1,1
chr8	144695867	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr8	144696259	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=212,327;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr8	144696461	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,250;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:12,1:2,1:8,6,0,2
chr8	144732026	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,13:0,6:0,0,11,8
chr8	144734989	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=201,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:6,5,1,1
chr8	144735659	.	ACACCTGTGTAACCACCAC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=138,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CACCTGTGTAACCACCAC;STR;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.211:22:9,1:4,3:10,8,2,2
chr8	144735977	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	144772151	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=212,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr8	144775871	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,167;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,7:0,7:0,1,9,5
chr8	144776713	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr8	144800004	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=197,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:1,4:0,3,1,6
chr8	144800552	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr8	144801347	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	144801681	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	144808003	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	144811278	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=172,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:1,2,2,2
chr8	144811338	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,8,3
chr8	144811361	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=173,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,2:2,0:7,4,1,1
chr8	144873666	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,6:0,0,1,9
chr8	144873779	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr8	144874366	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	144874554	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr8	144874753	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:144874753_A_C:144874753:1,0,1,0
chr8	144874763	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:144874753_A_C:144874753:1,0,1,0
chr8	144876159	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=126,252;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,0,2
chr8	144885663	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:144885663_G_A:144885663:0,0,0,1
chr8	144885667	.	CTG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:144885663_G_A:144885663:0,0,0,1
chr8	144885671	.	T	TCCCG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:144885663_G_A:144885663:0,0,0,1
chr8	144887656	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	144890873	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,2:0,3:0,0,2,4
chr8	144893031	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=251,221;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:144893031_G_A:144893031:1,2,0,1
chr8	144893033	.	CT	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=251,221;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:144893031_G_A:144893031:1,2,0,1
chr8	144893040	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	144894641	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr8	144898886	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=185,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:8,1:3,1:9,2,1,1
chr8	144900756	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=236,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr8	144911360	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr8	144917790	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=160,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr8	144919857	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=124,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:3,6,2,0
chr8	144940117	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=121,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,3:4,2:4,0,5,0
chr8	144941655	.	GGA	CAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:2,9,0,2
chr8	144945792	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr8	144990414	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=170,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:4,2:3,0:5,3,2,0
chr8	144990528	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:2,5,0,2
chr8	144991403	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=186,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:7,11,1,1
chr8	144991570	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,1:1,1:3,4,2,0
chr8	144993545	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,160;MMQ=60,56;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:4,9,1,1
chr8	145001311	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=183,259;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,0,2
chr8	145001372	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=166,208;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,2:3,1:9,0,3,0
chr8	145001784	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,33;MFRL=151,308;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,0:0,2:1,0,1,1
chr8	145003777	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=151,341;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.350:6:3,0:1,1:0,4,1,1
chr8	145004546	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.932:13:0,2:0,8:0,0,7,6
chr8	145007534	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=181,235;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,1:3,1:1,5,0,2
chr8	145008065	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:145008065_A_C:145008065:0,0,1,0
chr8	145008068	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,12;MFRL=178,249;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:145008065_A_C:145008065:1,0,1,0
chr8	145008073	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=178,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:145008065_A_C:145008065:1,0,1,0
chr8	145008079	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=178,249;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:145008065_A_C:145008065:1,0,1,0
chr8	145008706	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=159,229;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:5,1,2,0
chr8	145008931	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=150,259;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:6,2:5,1:4,8,0,3
chr8	145017887	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=234,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr8	145057868	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,184;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,4:3,2:2,1,2,4
chr8	145058037	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=203,343;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:7,1:1,1:4,4,1,1
chr8	145066004	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:5,3:9,2:8,6,3,2
chr8	145110901	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=220,254;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,2,0
chr8	145111696	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=177,161;MMQ=60,57;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=43.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.600:18:2,9:5,2:0|1:145111696_C_CT:145111696:0,7,0,11
chr8	145111698	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=177,161;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=43.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.600:18:2,9:5,2:0|1:145111696_C_CT:145111696:0,7,0,11
chr8	145112659	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=225,199;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:3,3,0,4
chr8	145133562	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=187,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:2,1:6,0,2,0
chr8	145151665	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:145151665_TGG_T:145151665:0,0,0,2
chr8	145151668	.	CAGTGGGCATGTGGAATACTTCTCCA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:145151665_TGG_T:145151665:0,0,0,2
chr8	145154706	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=185,78;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,0:2,2:1,4,2,0
chr8	145154998	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=150,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:10,0:2,2:0|1:145154998_T_G:145154998:6,6,1,1
chr8	145155002	.	G	GTTA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=150,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:10,0:2,2:0|1:145154998_T_G:145154998:6,6,1,1
chr8	145161896	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,9:0,0,9,4
chr8	145223191	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr8	145223226	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=174,71;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:145223226_C_T:145223226:9,5,1,1
chr8	145223228	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=174,71;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:145223226_C_T:145223226:9,5,1,1
chr8	145234508	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr8	145245631	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr8	145247168	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=262,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:1,2,3,1
chr8	145254159	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr8	145512920	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=196,73;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:8,8,1,1
chr8	145542021	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,4:6,0:3,6,1,3
chr8	145542112	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=272,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.319:4:1,0:1,1:0|1:145542112_A_G:145542112:1,2,0,1
chr8	145542113	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,29;MFRL=251,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:0,2:1,1,0,2
chr8	145542114	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=272,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:145542112_A_G:145542112:1,2,0,1
chr8	145542117	.	G	GTGGCTGGCTGTGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=272,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:145542112_A_G:145542112:1,2,0,1
chr8	145542316	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:1,1:3,1:2,2,2,0
chr8	145542541	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=198,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:7,0:7,7:6,8,0,7
chr8	145579262	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=193,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:6,0:12,3:8,10,1,2
chr8	145580028	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,3:5,2:9,4,3,2
chr8	145580984	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=242,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,2:0,1:2,2,3,0
chr8	145583535	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=121,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:13,3:7,0:8,12,1,2
chr8	145615776	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=232,195;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr8	145617114	.	CCA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=159,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,0:4,2:1,4,1,1
chr8	145618309	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=225,232;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:0,0:0|1:145618309_G_A:145618309:2,2,2,0
chr8	145618312	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=225,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:0,0:0|1:145618309_G_A:145618309:2,2,2,0
chr8	145618862	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=179,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:1,2,0,3
chr8	145619068	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=235,107;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:145619068_A_C:145619068:1,2,1,0
chr8	145619076	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=237,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:145619068_A_C:145619068:2,2,1,0
chr8	145620296	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,251;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr8	145621556	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:2,3:5,9:3,4,9,3
chr8	145621728	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=190,256;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:4,0:7,2:2,10,1,1
chr8	145622923	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=157,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr8	145623098	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=193,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:2,3:1,2:2,1,4,2
chr8	145624640	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=187,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,1,2
chr8	145625283	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,2:3,4:0,5,2,4
chr8	145625524	.	GCC	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=C;STR;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.775:2:0,0:0,1:0|1:145625524_GCC_G:145625524:0,0,0,2
chr8	145625538	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=203,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.601:3:0,0:1,2:0|1:145625524_GCC_G:145625524:0,1,0,2
chr8	145638386	.	C	CACCCCACAACAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=184,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:145638386_C_CACCCCACAACAG:145638386:0,1,0,1
chr8	145638389	.	C	CCTGGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=184,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:145638386_C_CACCCCACAACAG:145638386:0,1,0,1
chr8	145639320	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:5,2,3,0
chr8	145639521	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,1,4
chr8	145640560	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:5,1,3,0
chr8	145641254	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=171,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,2,0
chr8	145652408	.	G	GGT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=223,149;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.702:8:0,4:2,2:0|1:145652408_G_GGT:145652408:0,2,1,5
chr8	145652412	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=223,149;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:0,3:2,2:0|1:145652408_G_GGT:145652408:0,2,1,5
chr8	145654794	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	145660833	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:0,8:3,5:2,1,8,5
chr8	145662377	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:6,1,1,1
chr8	145663814	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=270,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,4:0,1:2,0,4,1
chr8	145665637	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr8	145665699	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=184,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.480:19:4,3:5,6:8,2,6,3
chr8	145666578	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=204,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.513:6:0,0:2,3:0|1:145666578_T_C:145666578:0,3,0,3
chr8	145666581	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=221,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:145666578_T_C:145666578:0,4,0,1
chr8	145666586	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=221,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:145666578_T_C:145666578:0,4,0,1
chr8	145667354	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=243,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:1,3:1,2:2,0,6,0
chr8	145667405	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr8	145668042	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=202,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr8	145668443	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=176,286;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,1:7,2:10,0,1,2
chr8	145668481	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:7,1:10,2,1,1
chr8	145677973	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	145678020	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	145689806	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:1,2:9,3:6,4,3,2
chr8	145690308	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr8	145690348	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr8	145691915	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=293,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr8	145692296	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	145692762	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=213,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.704:15:2,3:2,7:2,2,8,3
chr8	145692812	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0,0,15,8
chr8	145697244	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	145699601	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.837:4:0,1:0,1:0,0,4,0
chr8	145726215	.	CACT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=184,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr8	145730330	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=196,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:2,5,2,2
chr8	145734896	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:145734896_G_A:145734896:0,0,0,1
chr8	145734914	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:145734896_G_A:145734896:0,0,0,1
chr8	145737286	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:2,2,2,1
chr8	145737514	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=177,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.342:15:4,3:6,1:5,5,2,3
chr8	145738767	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr8	145739122	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:3,2:10,0:3,11,0,2
chr8	145739218	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.792:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr8	145739924	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=169,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:7,1:0,1:2,5,0,2
chr8	145741130	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,1:7,2:9,5,3,0
chr8	145742716	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr8	145756331	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	145757843	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=173,210;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr8	145763276	.	G	GAGC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=195,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:4,1:1,0:0,5,0,1
chr8	145806681	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr8	145830894	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr8	145979138	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=176,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:5,6:5,3:8,2,6,3
chr8	145999616	.	CTTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=189,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:9,4:6,1:7,9,1,4
chr8	146003567	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=147,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,1,1
chr8	146016630	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:6,2:4,3:8,3,4,1
chr8	146033347	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	146062982	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=176,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:1,1:3,2:0,4,0,4
chr8	146068594	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	146076524	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=174,189;MMQ=60,55;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:4,0:7,2:6,5,0,2
chr8	146107004	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=170,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:17,1:9,1:16,11,2,0
chr9	117428	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,231;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	118172	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=158,244;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0|1:118172_C_CG:118172:1,4,1,2
chr9	118173	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=158,244;MMQ=60,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,1:0|1:118172_C_CG:118172:1,4,1,2
chr9	121667	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=261,185;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:121667_G_A:121667:0,1,0,1
chr9	121670	.	T	TCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=261,185;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:121667_G_A:121667:0,1,0,1
chr9	173412	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=181,186;MMQ=24,27;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,1:10,2:6,11,2,1
chr9	215724	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=145,90;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.326:25:11,0:6,7:7,10,0,8
chr9	271572	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=222,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,3:3,1:2,1,4,0
chr9	286491	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:11,3:2,1:7,7,2,2
chr9	289479	.	A	AAT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,3:5,3:6,4,4,2
chr9	289481	.	C	CAT,T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,34,25;MFRL=113,236,162;MMQ=60,60,60;MPOS=27,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.16,15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,6:0.163,0.386:16:5,0,2:3,2,3:5,3,5,3
chr9	304769	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=169,237;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,1:5,1:0,6,0,2
chr9	316998	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=229,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:0,5:2,1:1,1,5,1
chr9	325811	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=178,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0|1:325811_T_TC:325811:0,1,0,4
chr9	325817	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=178,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:325811_T_TC:325811:0,1,0,3
chr9	327938	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=232,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr9	327996	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,4:3,1:7,0,4,1
chr9	328006	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,3:1,2:6,1,5,0
chr9	338906	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr9	340380	.	GGAGGCC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=159,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.278:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr9	370370	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=260,35279542;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:1,3,0,2
chr9	376122	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	376179	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr9	376186	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:3,1:4,1:7,1,2,0
chr9	376199	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=156,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:7,1,2,0
chr9	379965	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	380035	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=201,208;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr9	390636	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=214,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:0,4,0,5
chr9	396712	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr9	396749	.	TC	GA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=173,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:3,3:1,9:4,0,9,3
chr9	407157	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=208,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,2:0,5,0,4
chr9	421980	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=188,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr9	422157	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,4:5,3:0,6,3,4
chr9	432081	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=160,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr9	432140	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32,33;MFRL=0,167,109;MMQ=60,60,60;MPOS=20,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.65,7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.344,0.560:7:0,1,2:0,2,1:0,0,6,1
chr9	432330	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,6,9
chr9	433978	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,8,12
chr9	439453	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=180,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,1:4,5:0,4,1,5
chr9	439467	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,1:2,4:0,2,1,4
chr9	441826	.	TCC	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=231,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.280:16:4,2:7,2:0|1:441826_TCC_T:441826:12,0,2,2
chr9	441827	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=181,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,11:0.863:12:0,4:1,7:1|0:441826_TCC_T:441826:1,0,11,0
chr9	441829	.	TCAGGATGACATAACTAAGGAGAGCTTTTTATATTTTGTTC	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=202,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.201:23:4,2:7,2:0|1:441826_TCC_T:441826:15,4,2,2
chr9	442030	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=188,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,1:6,2:3,10,0,3
chr9	446352	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=109,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,6:5,7:3,6,5,8
chr9	449956	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,3:2,2:0,8,1,4
chr9	452006	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,19;MFRL=134,126;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.219:11:2,0:5,1:5,4,2,0
chr9	463578	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,0:9,3:7,10,0,3
chr9	676954	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=141,176;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,4:2,5:3,1,5,4
chr9	713421	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,3:3,0:8,2,0,3
chr9	734665	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:1,0,4,1
chr9	734679	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,5:1,4:1,2,6,3
chr9	735654	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr9	738238	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,7:2,1:4,0,6,2
chr9	740769	.	CTTTTTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=81,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=18,12;RU=T;STR;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.776:11:1,0:1,8:2,0,8,1
chr9	740972	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=129,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,2:3,8:1,5,0,10
chr9	741001	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=187,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,3:3,6:0,6,0,9
chr9	841971	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=187,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.532:6:0,1:0,1:0,3,0,3
chr9	847208	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr9	967981	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=184,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.788:17:1,5:2,8:3,0,11,3
chr9	990638	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=173,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:5,1,3,1
chr9	1053910	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr9	1056835	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,1:6,2:9,4,3,0
chr9	2029018	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=172,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:1,4:6,2:3,4,4,3
chr9	2039793	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:7,1:9,4:10,6,4,1
chr9	2039805	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=203,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.367:20:2,4:9,3:7,6,6,1
chr9	2088640	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,3:3,0:2,6,1,2
chr9	2170512	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=171,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,4:2,5:1,4,0,9
chr9	2182062	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr9	2182290	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=277,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr9	2191189	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=102,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr9	2645557	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:8,3,1,1
chr9	2717698	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr9	2729632	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=127,286;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.153:18:8,1:8,1:6,10,1,1
chr9	2810443	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:5,2:2,3:3,4,2,4
chr9	2810505	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr9	2819919	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=199,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr9	2831149	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,8,3
chr9	2833267	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr9	2916741	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=188,193;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,4:4,3:3,5,5,2
chr9	2916800	.	TCAGCTGGGGCTGTTGA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=162,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:4,2:3,7,1,1
chr9	2943518	.	A	ACT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=41.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr9	2948062	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=161,221;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr9	3013123	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=250,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr9	3014254	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr9	3228838	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=166,300;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:6,2:12,3:9,9,1,4
chr9	3247690	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,5,6
chr9	3271109	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=141,45;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,0:2,2:7,2,2,0
chr9	3301601	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:8,0:6,2:10,5,2,0
chr9	3346849	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=154,264;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr9	3829212	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=345,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr9	3855963	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,7:3,2:3,0,7,3
chr9	3879693	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr9	3932283	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr9	3932521	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr9	4125633	.	AGTGT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=216,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=GT;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:0,1:4,0,2,0
chr9	4285986	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr9	4544721	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=164,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:1,5,0,2
chr9	4561374	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=201,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,0:0,2:2,0,2,0
chr9	4561421	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=174,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:3,1,1,3
chr9	4564547	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=159,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:0,6,0,4
chr9	4566210	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr9	4576680	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:6,0:2,5:4,4,1,4
chr9	4622452	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=90,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,0:3,2:8,5,0,2
chr9	4662998	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=183,190;MMQ=60,21;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:10,0:6,4:10,7,0,4
chr9	4679906	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,3:4,5:4,5,2,6
chr9	4702100	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=250,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr9	4719364	.	G	GGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,0:0|1:4719364_G_GGA:4719364:0,0,0,1
chr9	4719368	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4719364_G_GGA:4719364:0,0,0,1
chr9	4719370	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4719364_G_GGA:4719364:0,0,0,1
chr9	4722685	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=237,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr9	4793254	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,2,13
chr9	4844507	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=94.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,17:0,0,15,16
chr9	4850421	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0|1:4850421_C_G:4850421:0,0,4,9
chr9	4850436	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=141,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.873:14:1,4:0,5:0|1:4850421_C_G:4850421:0,1,2,11
chr9	4860300	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,12:0,3:0,0,5,11
chr9	5044540	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,4:3,1:0,3,1,4
chr9	5050797	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.448:18:5,2:5,6:4,6,6,2
chr9	5069175	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,140;MMQ=60,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:4,0:10,5:7,7,0,5
chr9	5069837	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr9	5090635	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:4,5:3,3:0|1:5090635_C_A:5090635:1,6,5,3
chr9	5090641	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:5,6:3,3:0|1:5090635_C_A:5090635:2,6,5,4
chr9	5090934	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:1,6,2,1
chr9	5090966	.	ATTG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=127,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:2,2:1,4,0,2
chr9	5122910	.	GTT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:5122910_GTT_G:5122910:2,0,1,0
chr9	5122932	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.403:3:2,0:0,1:0|1:5122910_GTT_G:5122910:2,0,1,0
chr9	5233557	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=228,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:1,0,4,0
chr9	5233936	.	TCA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:0,0:0|1:5233936_TCA_T:5233936:0,2,0,1
chr9	5233940	.	T	TGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=194,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:5233936_TCA_T:5233936:0,3,0,1
chr9	5233943	.	T	TTTAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=194,152;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:3,1:0,0:0|1:5233936_TCA_T:5233936:0,3,0,1
chr9	5300042	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	5335470	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=194,145;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,0:7,3:7,4,2,1
chr9	5335608	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=165,299;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:7,1:1,1:3,5,0,2
chr9	5335639	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=37,29;MFRL=377,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.761:6:0,3:1,2:0,1,2,3
chr9	5457229	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=133,265;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:12,4:13,0:16,9,5,0
chr9	5467955	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=209,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,3:2,2:1,4,1,4
chr9	5535107	.	AA	CT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=212,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:5535107_AA_CT:5535107:0,2,0,1
chr9	5535110	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=212,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:5535107_AA_CT:5535107:0,2,0,1
chr9	5535112	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=212,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:5535107_AA_CT:5535107:0,2,0,1
chr9	5535113	.	CA	GG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=200,226;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:5535107_AA_CT:5535107:0,2,0,1
chr9	5535117	.	AACCCAT	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,28;MFRL=212,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:5535107_AA_CT:5535107:0,2,0,1
chr9	5549254	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=229,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:5549254_T_G:5549254:4,0,1,0
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chr9	5762533	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=179,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.647:18:2,9:4,2:2,4,7,5
chr9	5762600	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=105,325;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,1:8,2:12,2,2,1
chr9	5769998	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=314,251;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr9	5770047	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=272,267;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr9	5801121	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:2,2:8,1:9,1,3,0
chr9	5805001	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=158,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr9	5805020	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=119,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,0:4,3:6,0,2,1
chr9	5810056	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=162,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:6,2,1,1
chr9	5813077	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr9	5823849	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=148,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,0:6,3:7,4,2,1
chr9	5922340	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=131,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:6,0:9,11:4,11,0,11
chr9	5923326	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=243,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr9	5929167	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,3,14
chr9	5988333	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr9	6012229	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=276,204;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:6012229_T_G:6012229:2,0,1,0
chr9	6012230	.	CACAACACTTATTTGTAGTTACTTTTATAATAG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=276,204;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:6012229_T_G:6012229:2,0,1,0
chr9	6255881	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr9	6329888	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,7,9
chr9	6330915	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=186,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:1,5:1,6:2,0,9,2
chr9	6421000	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=191,35;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:5,5,1,1
chr9	6460773	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=193,135;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:7,5,0,2
chr9	6486949	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,84;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,0:3,6:1,6,0,6
chr9	6554844	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=148,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr9	6587054	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	6588350	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,46;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:9,6,0,2
chr9	6594942	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=374,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr9	6594978	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=139,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,3:1,3:2,1,3,3
chr9	6606680	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=111,204;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.394:23:7,0:6,8:7,7,0,9
chr9	6986267	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	6990351	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=215,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr9	6990566	.	G	GAGACGGAGTCTTGCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=140,26;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.286:8:3,0:3,1:2,4,1,1
chr9	7016001	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr9	7076371	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,5:1,3:3,1,7,1
chr9	7105548	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=228,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:1,2,1,4
chr9	7128054	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.451:31:13,13:3,0:14,3,14,0
chr9	7798518	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,21:0.786:26:3,10:2,11:2,3,16,5
chr9	7799363	.	ACCCCGCCT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCCGCCT;STR;TLOD=50.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.939:12:0,2:0,6:0,0,12,0
chr9	8319806	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=200,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:2,6,3,0
chr9	8320065	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=213,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr9	8331503	.	A	AACTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=131,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACTT;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr9	8331574	.	A	AAACTTACCATTCTTGAACTGT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=197,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.661:13:1,3:3,4:1,3,4,5
chr9	8338847	.	CAG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AG;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	8341018	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=146,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,2,1
chr9	8436703	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr9	8526530	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=201,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:0,2:2,0:3,0,1,1
chr9	8633413	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=128,74;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,2:10,0:5,9,1,1
chr9	8733869	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr9	12694347	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:4,2:3,2:2,5,3,2
chr9	12704725	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=224,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:2,6:0,3:0,2,3,6
chr9	12708910	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr9	12708958	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=206,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:3,0,6,0
chr9	12775861	.	T	TGGCGGC,TGGCGGCGGC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,15,15;MFRL=0,162,156;MMQ=60,60,50;MPOS=26,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,8,9;RU=GGC;STR;TLOD=6.31,36.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,10:0.202,0.732:12:0,0,1:0,0,1:0,0,1,11
chr9	12775889	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr9	12776120	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=206,165;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:5,0:2,5:0,7,0,6
chr9	12821853	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	13109111	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	13113999	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=192,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:2,4:5,2:4,3,3,4
chr9	13115422	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=181,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,1,3
chr9	13125130	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,35;MFRL=149,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr9	13125201	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=187,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,3:0,3:2,0,5,1
chr9	13126470	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=112,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr9	13175715	.	TGAG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=52.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,5:0,0,8,5
chr9	13192320	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,5,13
chr9	13250165	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	13928080	.	TATTC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=149,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,1:6,1:9,11,2,0
chr9	14120590	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=155,50;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,2:9,1:5,8,1,2
chr9	14120623	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,0:7,3:3,7,0,3
chr9	14120655	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr9	14155769	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,5:1,2:4,0,6,1
chr9	14306944	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr9	14619168	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=240,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr9	14640055	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr9	14658653	.	TAG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=192,175;MMQ=30,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr9	14658685	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=194,140;MMQ=35,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr9	14737616	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,1,4
chr9	14740300	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,2:1,6:0,3,0,8
chr9	14747133	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:0,1,3,5
chr9	14759725	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	14770825	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:3,4,1,2
chr9	14775705	.	C	CAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=24,27;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	14784719	.	GTG	ACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=214,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr9	14788886	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=130,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:4,4,2,0
chr9	14792856	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr9	14805053	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:13,1:6,2:12,7,2,1
chr9	14806902	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=78,287;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr9	14846122	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr9	14851617	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr9	14851703	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	14859356	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=175,132;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:2,5:8,3:4,6,4,4
chr9	14868653	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr9	15190494	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr9	15192720	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=253,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:1,3,0,5
chr9	15199813	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=108,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:3,8:16,4:4,15,3,9
chr9	15200017	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,16;MFRL=182,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:15200017_C_A:15200017:0,3,0,1
chr9	15200032	.	A	AAAAAAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=182,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:15200017_C_A:15200017:0,3,0,1
chr9	15200034	.	G	GCGTACCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=193,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:15200017_C_A:15200017:0,2,0,1
chr9	15203775	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=177,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,3:2,1:2,1,4,0
chr9	15210131	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=191,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.367:22:6,3:8,4:8,6,2,6
chr9	15458080	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=136,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,1:0,1,0,4
chr9	15466754	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=176,48;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,2:8,0:8,6,2,0
chr9	15468647	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=99,74;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:8,1:8,0:0|1:15468647_C_T:15468647:9,7,1,1
chr9	15468653	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=99,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:6,2:8,0:0|1:15468647_C_T:15468647:8,6,1,1
chr9	15469424	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=173,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr9	15469852	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=149,267;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:15469852_C_T:15469852:4,0,1,0
chr9	15469857	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=149,267;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:15469852_C_T:15469852:4,0,1,0
chr9	15469882	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=219,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:4,0,3,2
chr9	15486958	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr9	15623462	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=121,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr9	15695418	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr9	15784496	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:5,2,1,1
chr9	16215210	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=166,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.377:29:5,9:13,0:10,8,11,0
chr9	16419621	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=167,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,1:2,1:1,7,2,0
chr9	16419647	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:16419647_TC_T:16419647:0,3,0,1
chr9	16419649	.	TAGG	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:2,0:1,1:0|1:16419647_TC_T:16419647:0,4,0,1
chr9	16419657	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,35;MFRL=174,170;MMQ=51,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:1,0:0,1:0|1:16419647_TC_T:16419647:0,2,0,1
chr9	16419685	.	G	GAGAGGCCAGGGACAGATAGATCCTAGATCTGGCGA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	16552699	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,1:12,1:8,12,2,0
chr9	16699287	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:16699287_C_T:16699287:0,0,0,4
chr9	16699292	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0|1:16699287_C_T:16699287:0,0,0,4
chr9	16728057	.	TTA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=222,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16728057_TTA_T:16728057:0,1,0,1
chr9	16728060	.	A	AGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=222,205;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16728057_TTA_T:16728057:0,1,0,1
chr9	16738269	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr9	16738301	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,34;MFRL=171,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:16738301_T_C:16738301:4,0,0,1
chr9	16738303	.	A	AACAACAGTGGC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=171,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:16738301_T_C:16738301:4,0,0,1
chr9	16738307	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,1:0|1:16738307_A_C:16738307:0,0,4,0
chr9	16738312	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:16738307_A_C:16738307:0,0,4,0
chr9	16738338	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=35,34;MFRL=179,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,9:1,2:0,1,10,1
chr9	16738556	.	C	CTTTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=149,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,7;RU=T;STR;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,3:0,1,0,6
chr9	16870501	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=178,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr9	17135434	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=215,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:0,8,0,3
chr9	17235642	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=43.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,12:0,0,9,8
chr9	17236365	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.248:14:5,2:6,1:0|1:17236365_C_T:17236365:7,4,2,1
chr9	17236376	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:0|1:17236365_C_T:17236365:7,5,2,0
chr9	17273731	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,232;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:6,6:1,6:5,2,6,6
chr9	17273878	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=219,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:1,3,3,4
chr9	17273926	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=190,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr9	17308968	.	ATG	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=99,171;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:1,1,2,0
chr9	17308993	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:6,1,2,0
chr9	17309311	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=210,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,1:0,2:0,3,1,2
chr9	17330558	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr9	17388125	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=188,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:3,0,4,0
chr9	17394465	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	17395108	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	17409556	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,7:0,0:0,1,0,7
chr9	17457512	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,3:4,2:3,1,5,0
chr9	17457513	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.867:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr9	17464402	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr9	17464479	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,2:6,2:10,3,4,0
chr9	17579190	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:17579190_C_G:17579190:0,0,5,0
chr9	17579198	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:17579190_C_G:17579190:0,0,4,0
chr9	17579370	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	17747173	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:1,3,0,5
chr9	17795602	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=159,107;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:3,4:16,0:13,6,4,0
chr9	18533272	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=155,82;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:5,1,1,1
chr9	18574406	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=249,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr9	18622468	.	A	AGTCTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18622468_A_AGTCTG:18622468:0,0,0,1
chr9	18622469	.	A	AGACACCAAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18622468_A_AGTCTG:18622468:0,0,0,1
chr9	18657558	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=200,216;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:3,0:3,3:7,0,3,0
chr9	18662119	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=233,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr9	18684836	.	CTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=150,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:0,2:3,3,2,2
chr9	18775810	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=233,157;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.784:21:2,11:2,6:1,3,6,11
chr9	18795304	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr9	18817246	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr9	18826246	.	T	TC	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=153,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.393:26:11,0:4,10:0|1:18826246_T_TC:18826246:12,4,0,10
chr9	18826247	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=153,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.393:26:11,0:5,9:0|1:18826246_T_TC:18826246:12,4,0,10
chr9	18826261	.	GT	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=280,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.859:11:0,5:1,4:1,0,6,4
chr9	18826500	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=267,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,1:3,6:0,4,1,6
chr9	18887753	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr9	18889544	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=302,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.765:18:2,6:1,8:3,1,7,7
chr9	18889789	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=205,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,1:5,1:1,8,0,2
chr9	18928210	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=171,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,1:4,4:5,4,1,4
chr9	18928288	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=155,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,1:5,4,2,0
chr9	18928441	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:3,5,3,2
chr9	18928536	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=102,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.419:17:6,3:4,4:6,4,4,3
chr9	18950980	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=363,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr9	19049596	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=188,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.377:11:5,0:1,3:7,0,4,0
chr9	19050736	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:16,0:13,3:11,18,0,3
chr9	19051028	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=191,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr9	19062942	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	19078095	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:4,0,2,0
chr9	19086979	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr9	19087253	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=289,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:2,1:0,1:0|1:19087253_T_TG:19087253:0,2,0,2
chr9	19087254	.	C	CAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=289,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:2,1:0,1:0|1:19087253_T_TG:19087253:0,2,0,2
chr9	19089643	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr9	19123550	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=156,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.229:15:4,3:8,0:7,5,2,1
chr9	19123745	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=212,235;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr9	19126161	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=182,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:8,3,1,1
chr9	19126476	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=259,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,3:1,11:0,1,6,8
chr9	19295941	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	19299209	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.284:14:4,3:3,1:5,5,4,0
chr9	19299362	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=169,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr9	19328162	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:19328162_T_C:19328162:3,5,0,2
chr9	19328167	.	T	TAAATGTGACTCTCTGTGACAAAGGGC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:19328162_T_C:19328162:3,5,0,2
chr9	19346710	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=119,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:3,7:5,2:3,5,2,8
chr9	19350679	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=208,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr9	19357118	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=171,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,2:14,0:0|1:19357118_A_T:19357118:9,13,1,1
chr9	19357133	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=177,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,2:12,0:0|1:19357118_A_T:19357118:9,13,1,1
chr9	19369764	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=171,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.386:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr9	19369867	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=184,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:5,3:3,9:2,6,1,11
chr9	19376408	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.270:23:9,5:8,0:10,7,1,5
chr9	19379712	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=219,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr9	19409206	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=105,235;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,1:5,1:4,8,0,2
chr9	19550307	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=171,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr9	19550308	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr9	19573306	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=207,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:4,1,2,0
chr9	19619509	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr9	20414040	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,88;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,7:6,0:5,7,7,0
chr9	20448058	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=126,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:3,0:7,0,2,0
chr9	20620575	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,3:3,0:7,0,3,0
chr9	20620596	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:8,1:2,1:10,1,2,0
chr9	20716286	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=208,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr9	20720599	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=207,230;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr9	20740355	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,35;MFRL=113,254;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.534:8:3,0:1,4:1,3,1,3
chr9	20740433	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=236,286;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr9	20765097	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:1,3:2,4:1,2,2,6
chr9	20769987	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	20778631	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=192,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:2,4:3,1,7,2
chr9	20781979	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=214,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:0,6,1,5
chr9	20867056	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=127,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,5:7,0:3,9,0,5
chr9	20881888	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:7,4:5,5:9,3,5,4
chr9	20881924	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=159,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:10,7,1,1
chr9	20882117	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=227,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:0,1,0,6
chr9	20885240	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=77,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:7,4:4,5:6,5,2,7
chr9	20916828	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=139,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,2:6,1:5,4,3,0
chr9	20923579	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=318,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:2,1:0,3:3,0,4,0
chr9	20923618	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=262,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:1,1,4,1
chr9	20944558	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=121,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:7,0,4,1
chr9	20978306	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:0|1:20978306_A_G:20978306:6,1,4,0
chr9	20978312	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0|1:20978306_A_G:20978306:0,0,10,1
chr9	20982328	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=163,77;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,3:5,0:4,4,2,1
chr9	20982503	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr9	20986265	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=317,264;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr9	21026540	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	21026800	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr9	21077363	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=166,132;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.329:27:9,0:5,8:0|1:21077363_A_T:21077363:10,9,0,8
chr9	21077370	.	C	CCTCAGCCCCAGTCAT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=169,132;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,8:0.321:26:12,0:6,6:0|1:21077363_A_T:21077363:8,10,0,8
chr9	21077372	.	A	ACATCCGCACTTTC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=169,132;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,8:0.321:26:12,0:6,1:0|1:21077363_A_T:21077363:8,10,0,8
chr9	21227609	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,10614;MMQ=59,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:7,0:10,8:12,5,0,8
chr9	21351132	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=174,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,3:9,0:0|1:21351132_C_G:21351132:5,9,3,0
chr9	21351142	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=178,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,3:9,0:0|1:21351132_C_G:21351132:4,10,3,0
chr9	21367351	.	AA	GG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=204,163;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:1,5,3,0
chr9	21410117	.	ATTCT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:1,2:6,0,3,2
chr9	21440416	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=183,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,4:6,0:10,3,2,2
chr9	21440994	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=235,166;MMQ=34,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr9	21481478	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=154,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,2:7,0:3,6,0,2
chr9	21482089	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=138,175;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:6,7:9,5:6,9,6,6
chr9	21482125	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.477:21:4,6:6,4:3,8,4,6
chr9	21861902	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.280:16:7,1:3,3:8,4,4,0
chr9	22006325	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:22006325_C_CA:22006325:0,0,0,1
chr9	22006331	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22006325_C_CA:22006325:0,0,0,1
chr9	22029547	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=202,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,5:1,2:2,4,2,5
chr9	22447071	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=83,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:6,5,4,1
chr9	22451907	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=201,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0,9,1,1
chr9	24545030	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:3,7,1,1
chr9	25677588	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	25678887	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=228,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,1:1,5:1,1,2,4
chr9	26886129	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=146,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:16,0:18,4:20,15,3,1
chr9	26887298	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,3:4,2:5,6,3,2
chr9	26988783	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=192,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:2,2:9,1:2,9,0,4
chr9	26997759	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=171,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:5,5:13,0:8,10,5,0
chr9	26997779	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:5,5:10,0:7,8,5,0
chr9	26997968	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=194,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:0,3,2,3
chr9	27047241	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=190,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:4,3:5,0:0|1:27047241_A_T:27047241:8,1,2,1
chr9	27047246	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=249,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.867:13:1,6:0,6:0|1:27047241_A_T:27047241:1,0,10,2
chr9	27062721	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=159,129;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:3,9:6,1:6,3,3,7
chr9	27062802	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=187,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:5,1:2,3:0,7,0,5
chr9	27172838	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=139,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr9	27173180	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=105,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,5:1,6:1,1,7,4
chr9	27183613	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=186,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:5,5,1,1
chr9	27197673	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr9	27202726	.	AT	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	27203134	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,8:2,6:2,3,7,7
chr9	27206825	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=210,289;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr9	27212966	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=322,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,0,4
chr9	27213518	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,1:9,1:10,4,2,0
chr9	27218715	.	C	A,T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,30,20;MFRL=116,197,109;MMQ=60,60,60;MPOS=21,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.12,3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,3,2:0.159,0.118:22:12,0,2:5,3,0:11,6,3,2
chr9	27218726	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=109,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:12,2:7,4:11,8,4,2
chr9	27289812	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=442,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.657:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr9	27289832	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=312,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr9	27290933	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=183,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:27290933_A_G:27290933:1,1,2,0
chr9	27290951	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=200,87;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,0:0|1:27290933_A_G:27290933:4,1,2,0
chr9	27290984	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=208,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.737:13:1,5:2,5:2,1,9,1
chr9	27292529	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0,1,0,7
chr9	27296595	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,4,4
chr9	27455095	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,2:6,2:6,1,3,1
chr9	27455585	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=200,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr9	27561465	.	A	ATGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGT;STR;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr9	27562293	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=164,241;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr9	27562352	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr9	28889060	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr9	32405639	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=216,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:1,7,3,5
chr9	32418237	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=110,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:2,9:4,3:2,4,5,7
chr9	32418359	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:10,0:13,4:15,8,0,4
chr9	32420943	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,214;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:10,3:14,0:12,12,3,0
chr9	32429600	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=179,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr9	32431931	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=158,206;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:0,6,0,3
chr9	32436330	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=171,86;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:12,0:4,2:6,10,0,2
chr9	32450187	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=158,239;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,0:6,2:6,11,2,0
chr9	32481315	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=204,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:7,2:5,2:10,3,2,2
chr9	32481500	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	32485288	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=183,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,1:2,3:0,3,0,4
chr9	32488237	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,3:2,3:0,7,0,6
chr9	32525969	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=185,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,3,1
chr9	32526233	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:4,7:0,2:0,4,0,9
chr9	32568003	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=194,163;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:4,6,0,2
chr9	32568024	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=192,198;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,6:1,5:0,1,5,6
chr9	32633683	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=117,109;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,6:7,0:7,6,6,0
chr9	32786653	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=155,202;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,2:5,7:2,4,4,5
chr9	32973709	.	CAA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,25;MFRL=145,283;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:0,1:1,0:0,3,0,2
chr9	32974372	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr9	32974570	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=234,268;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr9	32986030	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,15;MFRL=173,152;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.279:15:5,0:6,1:0|1:32986030_T_A:32986030:8,3,0,4
chr9	32986040	.	AC	CA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=20,25;MFRL=130,130;MMQ=40,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.626:9:0,2:2,2:0,3,6,0
chr9	32986041	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=169,130;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.591:5:1,0:1,3:0|1:32986030_T_A:32986030:2,0,0,3
chr9	32986053	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=16,25;MFRL=109,174;MMQ=59,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:0,1:1,1:5,0,0,3
chr9	33026638	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:10,2:17,3:8,19,3,2
chr9	33036550	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:2,1:5,1:4,3,2,0
chr9	33036928	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=215,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr9	33047210	.	CAA	C,CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34,31;MFRL=184,172,255;MMQ=58,50,54;MPOS=17,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.78,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.251,0.284:8:1,2,0:3,0,2:4,0,4,0
chr9	33047398	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:10,1:0,1:4,6,1,1
chr9	33047425	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=167,244;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:9,1:3,2:4,8,0,3
chr9	33057062	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=239,291;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr9	33060416	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=168,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,0:1,2:8,1,2,0
chr9	33135085	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=218,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr9	33240165	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=181,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,4:6,2:4,3,2,4
chr9	33240225	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=165,118;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,5:7,5:4,5,6,4
chr9	33245076	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=165,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:7,3:7,2:8,6,3,2
chr9	33248325	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr9	33248451	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=119,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:7,2:6,0:0|1:33248451_G_T:33248451:4,10,1,1
chr9	33248459	.	G	GGTGGTTTGGGGGTCTGTAC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=135,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:0|1:33248451_G_T:33248451:3,11,1,1
chr9	33248462	.	AA	GT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=123,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,1:7,0:0|1:33248451_G_T:33248451:3,12,1,1
chr9	33255743	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,37;MFRL=226,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr9	33262655	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,170;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,0:5,2:9,0,2,0
chr9	33264540	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr9	33270748	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,6:2,1:1,5,0,7
chr9	33280749	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.249:21:8,1:8,4:11,5,5,0
chr9	33290688	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:0,5,0,6
chr9	33295247	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:12,1:18,1:16,15,2,0
chr9	33313886	.	T	TTGTTTTTCAGATAATCTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=286,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	33319027	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=150,71;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:9,0:11,3:8,12,2,1
chr9	33344252	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=145,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr9	33352826	.	C	CAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,53;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr9	33364821	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=195,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:3,2,1,3
chr9	33385353	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=198,190;MMQ=54,23;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:33385353_C_T:33385353:0,2,0,1
chr9	33385358	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=211,190;MMQ=60,23;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:33385353_C_T:33385353:0,3,0,1
chr9	33385364	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=215,190;MMQ=60,23;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:33385353_C_T:33385353:1,3,0,1
chr9	33385600	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=190,65;MMQ=60,38;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,1:0|1:33385600_G_A:33385600:2,5,2,0
chr9	33385602	.	AC	CT	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=19,28;MFRL=190,130;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:1,0:2,2:0|1:33385600_G_A:33385600:3,6,3,0
chr9	33385667	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=170,130;MMQ=50,30;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:12,0:9,4:13,9,2,2
chr9	33385690	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=176,130;MMQ=50,47;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.156:23:11,1:8,1:0|1:33385690_G_T:33385690:11,9,1,2
chr9	33385698	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=172,130;MMQ=56,47;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.179:20:9,1:8,2:0|1:33385690_G_T:33385690:8,9,1,2
chr9	33385919	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=208,181;MMQ=49,41;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:6,1:3,2:0|1:33385919_C_A:33385919:3,7,0,3
chr9	33385929	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,36;MFRL=217,189;MMQ=51,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:33385919_C_A:33385919:3,9,0,2
chr9	33385956	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=215,189;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:33385956_C_G:33385956:5,5,0,2
chr9	33385964	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=220,189;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:0|1:33385956_C_G:33385956:6,4,0,2
chr9	33386211	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=144,182;MMQ=60,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:10,4:13,0:11,12,2,2
chr9	33386226	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=155,170;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:8,5:10,3:5,14,4,4
chr9	33386228	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:8,5:5,9:7,6,2,12
chr9	33386243	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=189,182;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.273:31:8,4:13,4:6,17,3,5
chr9	33386284	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=203,214;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,4:7,2:3,11,1,5
chr9	33386378	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=213,229;MMQ=44,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:2,2:6,2:0|1:33386378_C_T:33386378:8,0,4,0
chr9	33386387	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=213,229;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:3,1:5,2:0|1:33386378_C_T:33386378:9,1,4,0
chr9	33386393	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=192,216;MMQ=40,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,0:5,2:0|1:33386378_C_T:33386378:9,3,3,0
chr9	33386395	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.936:13:0,5:0,7:0|1:33386378_C_T:33386378:0,0,10,3
chr9	33386399	.	CA	TG	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,25;MFRL=192,255;MMQ=40,38;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,1:0|1:33386378_C_T:33386378:9,3,2,0
chr9	33386940	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=170,159;MMQ=35,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:4,1:9,2:0|1:33386940_G_A:33386940:12,3,3,0
chr9	33386944	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=159,159;MMQ=38,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:6,1:11,2:0|1:33386940_G_A:33386940:12,6,3,0
chr9	33386947	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=157,159;MMQ=40,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:6,1:13,2:0|1:33386940_G_A:33386940:14,7,3,0
chr9	33386951	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=157,159;MMQ=47,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:7,1:13,2:0|1:33386940_G_A:33386940:15,7,3,0
chr9	33386989	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=168,159;MMQ=53,53;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.263:36:8,4:17,5:15,12,7,2
chr9	33391393	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=171,224;MMQ=23,23;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:0|1:33391393_T_A:33391393:8,1,3,1
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chr9	33391598	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=247,224;MMQ=60,23;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:33391591_T_C:33391591:0,6,0,2
chr9	33391611	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=312,197;MMQ=59,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:1,2:0|1:33391591_T_C:33391591:0,5,0,2
chr9	33395031	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=134,33886782;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,2:1,1:0|1:33395031_G_A:33395031:3,3,3,0
chr9	33395039	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=134,16943502;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:0|1:33395031_G_A:33395031:3,3,3,1
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chr9	33442986	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=129,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.352:18:7,3:4,3:5,7,2,4
chr9	33447547	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.355:15:4,1:5,3:2,8,0,5
chr9	33462823	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=145,329;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:7,13,1,1
chr9	33463215	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=176,82;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,3:5,0:7,5,3,0
chr9	33463744	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=213,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr9	33465182	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=206,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:1,5:8,5:6,3,4,6
chr9	33465651	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=199,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,3:2,5:5,0,8,0
chr9	33466844	.	T	TGAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=247,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:2,2,2,0
chr9	33467595	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=220,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
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chr9	33468682	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=206,246;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,3,2
chr9	33469427	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,3:2,3:6,1,4,2
chr9	33473893	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=118,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,1,5
chr9	33524725	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=130,255;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:4,4:4,4:3,5,1,7
chr9	33541056	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=199,147;MMQ=43,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,3:4,4:5,1,7,0
chr9	33541274	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=181,143;MMQ=52,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:8,5:5,6:4,9,5,6
chr9	33550329	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=184,191;MMQ=46,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr9	33555695	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=151,178;MMQ=40,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,5:4,1:4,3,4,2
chr9	33558025	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=127,167;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:6,3:7,0:11,3,3,0
chr9	33571221	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30,27,30;MFRL=158,214,117,217;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,16,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,9,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.41,7.65,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,2,6,2:0.154,0.357,0.158:15:4,1,5,1:1,1,1,1:3,2,8,2
chr9	33618433	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=142,123;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.343:30:5,10:15,0:8,12,10,0
chr9	33618460	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=208,123;MMQ=60,54;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.626:30:4,14:7,5:3,8,12,7
chr9	33629238	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=168,252;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,3:7,1:5,7,2,2
chr9	33629249	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=168,252;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,3:6,1:4,6,2,2
chr9	33637973	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=191,255;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:3,2:14,0:15,2,2,0
chr9	33662181	.	TCTGTAGCCCCAA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=122,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:10,1:14,1:16,14,0,2
chr9	33750453	.	A	ACACAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CACAG;STR;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,2:4,0,4,1
chr9	33794797	.	TGA	T	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=154,170;MMQ=60,38;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GA;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,0:9,2:0|1:33794797_TGA_T:33794797:11,12,1,1
chr9	33794809	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=154,170;MMQ=60,38;MPOS=34;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,0:9,2:0|1:33794797_TGA_T:33794797:12,12,1,1
chr9	33794812	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=154,170;MMQ=60,38;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:8,2:0|1:33794797_TGA_T:33794797:11,12,1,1
chr9	33794840	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=152,88;MMQ=60,22;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:15,2:12,0:9,18,1,2
chr9	33794877	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=35,21;MFRL=164,88;MMQ=60,22;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.272:19:7,3:7,1:4,10,1,4
chr9	33794890	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=30,23;MFRL=131,88;MMQ=60,22;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:7,3:7,2:4,11,1,4
chr9	33794894	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=160,131;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,3:5,3:4,7,1,6
chr9	33795613	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=31,25;MFRL=144,183;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:9,1:12,2:14,8,4,0
chr9	33795622	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=9;MBQ=25,32;MFRL=147,183;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:11,2:13,1:0|1:33795622_T_C:33795622:13,12,3,1
chr9	33795624	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=9;MBQ=26,32;MFRL=147,183;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:10,3:12,1:0|1:33795622_T_C:33795622:13,12,3,1
chr9	33795638	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=156,118;MMQ=60,44;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.200:28:8,3:13,2:0|1:33795638_C_T:33795638:11,12,3,2
chr9	33795640	.	ACCC	A	.	.	DP=29;ECNT=9;MBQ=24,29;MFRL=156,124;MMQ=60,42;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.148:29:6,2:7,2:0|1:33795640_ACCC_A:33795640:12,13,2,2
chr9	33795646	.	C	CAA	.	.	DP=29;ECNT=9;MBQ=32,34;MFRL=156,124;MMQ=60,42;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.148:29:9,2:13,2:0|1:33795640_ACCC_A:33795640:11,14,2,2
chr9	33795652	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=29,34;MFRL=164,178;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:7,4:12,2:0|1:33795638_C_T:33795638:6,14,3,3
chr9	33795703	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=29,30;MFRL=195,178;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:33795703_C_T:33795703:0,9,0,2
chr9	33795707	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=34,32;MFRL=195,178;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:0|1:33795703_C_T:33795703:0,9,0,2
chr9	33796703	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=184,246;MMQ=60,36;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:21,0:17,2:18,20,2,0
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chr9	33796802	.	TAAG	T	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=26,29;MFRL=162,103;MMQ=60,31;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,2:14,0:0|1:33796802_TAAG_T:33796802:11,15,0,2
chr9	33796808	.	TGG	T	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=28,12;MFRL=162,103;MMQ=60,31;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:10,0:14,0:0|1:33796802_TAAG_T:33796802:11,15,0,2
chr9	33796858	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=174,120;MMQ=46,36;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.195:24:8,1:12,3:4,16,1,3
chr9	33796889	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=29,34;MFRL=192,143;MMQ=60,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.411:15:2,1:6,5:0|1:33796889_A_G:33796889:1,8,0,6
chr9	33796896	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=180,143;MMQ=60,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:1,1:4,5:0|1:33796889_A_G:33796889:1,6,0,6
chr9	33796898	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=34,29;MFRL=180,143;MMQ=60,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:2,1:5,5:0|1:33796889_A_G:33796889:1,6,0,6
chr9	33797761	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=359,226;MMQ=53,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr9	33798017	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=30,32;MFRL=203,233;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.705:15:0,4:4,6:3,1,4,7
chr9	33798052	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=27,26;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,1:7,4:4,7,3,2
chr9	33798073	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=33,29;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:6,1:6,3:0|1:33798073_C_T:33798073:2,10,1,3
chr9	33798075	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=30,35;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:6,1:6,3:0|1:33798073_C_T:33798073:2,10,1,3
chr9	33798112	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=177,172;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr9	33798141	.	TG	CA	.	.	DP=8;ECNT=12;MBQ=32,36;MFRL=245,178;MMQ=60,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:0|1:33798141_TG_CA:33798141:0,5,0,3
chr9	33798145	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=12;MBQ=34,35;MFRL=245,178;MMQ=60,46;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:0|1:33798141_TG_CA:33798141:0,5,0,3
chr9	33798149	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=12;MBQ=29,28;MFRL=245,183;MMQ=60,46;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,0:3,4:0|1:33798141_TG_CA:33798141:0,5,0,4
chr9	33798152	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=30,35;MFRL=245,187;MMQ=60,45;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,0:3,4:0|1:33798141_TG_CA:33798141:0,5,0,5
chr9	33798163	.	TG	CA	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=30,36;MFRL=265,187;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,0:2,5:0|1:33798141_TG_CA:33798141:0,5,0,5
chr9	33798166	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=264,187;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,0:2,5:0|1:33798141_TG_CA:33798141:0,6,0,5
chr9	33798169	.	CC	TA	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=264,187;MMQ=60,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,0:3,5:0|1:33798141_TG_CA:33798141:0,6,0,5
chr9	33798428	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=174,235;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr9	33798440	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=174,223;MMQ=60,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr9	33798450	.	TCTA	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=172,227;MMQ=60,33;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,1:3,2:8,2,3,0
chr9	33798463	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=158,223;MMQ=60,30;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,2:3,2:6,3,4,0
chr9	33798485	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=169,223;MMQ=60,30;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,2:6,2:9,6,4,0
chr9	33798945	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=153,397;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:33798945_G_C:33798945:3,2,1,1
chr9	33798960	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=156,153;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0|1:33798945_G_C:33798945:2,1,2,1
chr9	33798972	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=173,369;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:7,1:2,1:0|1:33798945_G_C:33798945:9,1,3,0
chr9	33798974	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=173,369;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:8,1:2,2:0|1:33798945_G_C:33798945:9,1,3,0
chr9	33799163	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=30,23;MFRL=142,161;MMQ=60,49;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:8,4:13,0:0|1:33799163_C_A:33799163:12,9,2,2
chr9	33799181	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=142,227;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:8,5:11,0:0|1:33799163_C_A:33799163:10,9,2,3
chr9	33799186	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=30,26;MFRL=143,227;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:7,5:11,0:0|1:33799163_C_A:33799163:11,9,2,3
chr9	33799218	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=32,24;MFRL=153,258;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:8,3:5,0:0|1:33799218_G_A:33799218:8,6,0,3
chr9	33799224	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=153,258;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:8,3:5,0:0|1:33799218_G_A:33799218:8,6,0,3
chr9	33799230	.	CTCTG	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=158,177;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:3,0:0|1:33799218_G_A:33799218:5,6,0,2
chr9	33900109	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,3,1
chr9	33912102	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,3:1,1:0,2,0,5
chr9	33922626	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=204,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,4:5,3:3,5,3,4
chr9	33924312	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,2:5,2:4,8,1,3
chr9	33927973	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=197,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:5,8,0,2
chr9	33928074	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=197,244;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr9	33932688	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=173,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:1,3:3,4:1,3,1,7
chr9	33941913	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=12,19;MFRL=94,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:0,1:0,0:0,2,0,2
chr9	33943467	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=164,134;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,2:10,0:0|1:33943467_T_A:33943467:6,6,0,2
chr9	33943470	.	T	TCTTTAATGTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=154,134;MMQ=60,39;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:2,1:11,0:0|1:33943467_T_A:33943467:6,7,0,2
chr9	33944730	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr9	33948652	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=186,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr9	33986731	.	ATT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=245,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:3,5:4,1:4,4,5,1
chr9	33988919	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,309;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:7,0,5,0
chr9	33989201	.	CTTTTTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=267,310;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,10;RU=T;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.731:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr9	34017015	.	GA	G,GAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,34,32;MFRL=64,114,139;MMQ=60,60,60;MPOS=14,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.82,5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,7:0.218,0.562:11:0,2,2:0,0,4:0,2,8,1
chr9	34089395	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=194,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:2,0,4,2
chr9	34096597	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	34096873	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=262,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	34127211	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.328:23:7,4:5,3:13,3,4,3
chr9	34220855	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=241,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:2,3,1,2
chr9	34242192	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=199,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr9	34256347	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=164,223;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,6:6,2:6,3,3,5
chr9	34256375	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=148,244;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,6:6,2:3,8,5,3
chr9	34269386	.	ACTT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=246,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:8,3:0,2:3,5,0,5
chr9	34290407	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=163,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:2,8,1,4
chr9	34370701	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr9	34373041	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=215,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr9	34381192	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=235,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:6,3:4,2:5,6,1,4
chr9	34382581	.	T	TA,TAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26,29;MFRL=209,206,177;MMQ=60,60,54;MPOS=21,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=A;STR;TLOD=3.24,5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.300,0.299:7:1,0,2:2,2,0:3,0,4,0
chr9	34385559	.	G	GTAATTGGTCCACAAACAGGGGGGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=96,135;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.487:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr9	34402173	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	34402663	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=228,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:9,3:3,0:7,5,3,0
chr9	34517412	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=133,272;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:4,2:4,3,2,1
chr9	34521867	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=129,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:4,6:3,1:4,4,4,3
chr9	34556453	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:4,4:9,0:3,11,1,3
chr9	34617598	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=201,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:7,2,2,0
chr9	34618641	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:5,2:9,4:9,5,1,5
chr9	34623338	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:2,1,2,0
chr9	34635598	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=58.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,12,4
chr9	34647802	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.332:31:12,3:9,7:12,9,6,4
chr9	34648020	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=184,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:9,5:3,2:6,6,3,4
chr9	34648088	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:10,6:10,2:9,11,2,6
chr9	34649158	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=206,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.253:14:4,0:5,3:1,10,0,3
chr9	34649351	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=170,259;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.407:25:12,10:3,0:0|1:34649351_A_G:34649351:13,2,10,0
chr9	34649354	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=185,259;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:11,10:3,0:0|1:34649351_A_G:34649351:12,2,10,0
chr9	34655734	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,3:2,0:1,4,2,1
chr9	34657595	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.358:11:2,0:5,0:0|1:34657595_A_C:34657595:1,6,4,0
chr9	34657599	.	CAGACCT	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.305:13:2,2:6,2:0|1:34657595_A_C:34657595:1,8,4,0
chr9	34657663	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr9	34661549	.	G	GGATGGATGGACA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=182,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.418:17:3,2:7,5:1,9,1,6
chr9	34690400	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr9	34709755	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=159,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:1,0:10,3:5,6,3,0
chr9	34710084	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=131,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,3:3,3:5,5,3,3
chr9	34725271	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=253,250;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr9	34725742	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=119,151;MMQ=60,51;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,4:5,2:5,4,4,2
chr9	34726524	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=149,202;MMQ=60,49;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,3:1,1:3,0,2,2
chr9	34729452	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=143,187;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:5,3:3,4:3,6,4,3
chr9	34835861	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=195,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:4,3:5,8:4,5,9,2
chr9	34837574	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,5:4,2:5,0,6,1
chr9	34972352	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=185,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.180:18:9,0:6,2:7,8,1,2
chr9	34976568	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,0:8,2:9,8,2,0
chr9	34996915	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=234,318;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr9	35042785	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=104,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,2:4,4:4,0,6,0
chr9	35044175	.	CA	TG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,118;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:12,2:19,0:21,10,2,0
chr9	35057493	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:1,10,0,2
chr9	35060302	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=217,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:1,5:1,2:0,2,7,1
chr9	35060746	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=199,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:1,4:0,5:1,0,8,1
chr9	35060955	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=228,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,2,3
chr9	35061169	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=121,269;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:3,1:12,3:7,8,0,4
chr9	35061693	.	G	GACAGTACACAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=223,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAGTACACAA;STR;TLOD=66.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:1,13:1,2:1,1,6,10
chr9	35062972	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,13:1,4:1,1,11,6
chr9	35066579	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=256,231;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.776:7:1,1:0,5:1,0,6,0
chr9	35068201	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=231,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:4,2:3,4,3,0
chr9	35074917	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,2:3,6:3,2,5,3
chr9	35074986	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:13,0:11,4:13,11,0,4
chr9	35077203	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=202,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.403:23:7,4:6,5:8,6,4,5
chr9	35077441	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=237,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:0,1,1,7
chr9	35079361	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr9	35089048	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=285,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,5:3,1:3,1,5,1
chr9	35090210	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=206,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:35090210_C_CA:35090210:3,5,1,1
chr9	35090211	.	T	TGACGGCCACCAAGAGCTTTAG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=206,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:35090210_C_CA:35090210:3,5,1,1
chr9	35093020	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=181,79;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.701:24:3,7:3,10:3,4,10,7
chr9	35093206	.	CC	AT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=145,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:13,0:8,2:0|1:35093206_CC_AT:35093206:7,14,0,2
chr9	35093208	.	T	TTTTTTTAAA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=145,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:0|1:35093206_CC_AT:35093206:7,14,0,2
chr9	35093219	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=140,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.182:14:6,0:6,2:4,8,0,2
chr9	35100002	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=228,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,6:2,5:1,1,6,5
chr9	35100149	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:10,3:9,0:11,8,3,0
chr9	35100569	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=208,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.841:23:1,11:2,9:1,2,14,6
chr9	35101383	.	GCA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.715:26:2,13:5,6:7,0,14,5
chr9	35101870	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=212,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,25:0.743:33:3,13:5,12:3,5,13,12
chr9	35107316	.	CAAAA	C,CAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34,34;MFRL=0,190,163;MMQ=60,60,50;MPOS=14,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=24,20,22;RU=A;STR;TLOD=3.55,4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.357,0.488:3:0,1,2:0,0,0:0,0,3,0
chr9	35231047	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=104,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr9	35295984	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=123,253;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr9	35377772	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=152,248;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.285:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr9	35380996	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr9	35381504	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,5:2,1:6,1,6,0
chr9	35397115	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=206,45606974;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:4,3,0,2
chr9	35398324	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=272,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,2:6,0:3,5,1,1
chr9	35400272	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=189,280;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:4,3,5,0
chr9	35556250	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=218,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:3,2,3,2
chr9	35557804	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,1:6,1:10,2,2,0
chr9	35559213	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=148,216;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,0:4,5:3,7,3,2
chr9	35562812	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,16;MFRL=167,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.247:13:3,0:4,0:6,4,3,0
chr9	35563361	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,2:9,1:8,5,1,2
chr9	35606738	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr9	35607307	.	ATG	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=125,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TG;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:17,2:10,1:22,7,3,0
chr9	35607664	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=170,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,3:10,0:8,8,3,0
chr9	35612978	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=125,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:6,4,2,0
chr9	35615896	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=238,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr9	35616540	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=142,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:9,7:7,0:12,4,7,0
chr9	35650458	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,8,6
chr9	35660990	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,29:0.859:33:0,14:4,15:0|1:35660990_A_G:35660990:2,2,8,21
chr9	35660998	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=169,60;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.142:33:13,0:16,4:0|1:35660990_A_G:35660990:10,19,0,4
chr9	35663228	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=190,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,7:0,2:1,0,9,0
chr9	35677702	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr9	35679317	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=135,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.285:33:13,0:11,9:10,14,2,7
chr9	35679332	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=132,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.229:33:13,0:13,7:8,18,0,7
chr9	35681122	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=295,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr9	35682764	.	A	AG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:14,2:13,4:17,10,4,2
chr9	35700150	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=214,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,2,1
chr9	35704898	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=203,449;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr9	35707054	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:4,3:7,6:7,4,4,5
chr9	35711405	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,285;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,1:2,1:6,3,2,0
chr9	35711806	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr9	35712823	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=160,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:1,3:7,3:3,5,3,3
chr9	35713181	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=116,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,6:6,5:6,3,8,3
chr9	35720473	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=126,59;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,0:8,2:0|1:35720473_C_T:35720473:10,11,2,0
chr9	35720476	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=129,59;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:0|1:35720473_C_T:35720473:11,11,2,0
chr9	35724513	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=218,191;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.304:18:5,5:5,0:11,2,5,0
chr9	35735225	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=130,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.294:32:15,9:8,0:11,12,9,0
chr9	35739115	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.451:18:4,7:6,1:1,9,4,4
chr9	35739691	.	GCTCCTCT	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:19,2:8,0:0|1:35739691_GCTCCTCT_G:35739691:15,15,1,1
chr9	35739702	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=151,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,2:6,0:0|1:35739691_GCTCCTCT_G:35739691:12,9,1,1
chr9	35751221	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=147,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.322:23:10,5:5,2:14,2,5,2
chr9	35800396	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,244;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:17,0:12,3:16,13,0,4
chr9	35808334	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=207,232;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:2,4,1,1
chr9	35813874	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr9	35819413	.	G	GATGGATGGATGGATGGATGGATGGA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=204,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:4,10,0,2
chr9	35821718	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=192,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:1,5,0,4
chr9	35825413	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr9	35825541	.	TTTC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=166,234;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTC;STR;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:11,1,3,0
chr9	35834942	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=139,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,4:4,5:8,0,8,1
chr9	35845929	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=166,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,6:3,6:3,1,9,3
chr9	35906562	.	CCCGCCACACCCCTCACCACCTCCACCACCACCA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=231,209;MMQ=60,36;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:1,2:0,3,0,2
chr9	35958047	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=205,205;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:0,7:6,6:3,3,7,6
chr9	35958228	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	36063743	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,12,3
chr9	36109947	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=213,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:10,2:6,9:12,4,8,3
chr9	36110137	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=199,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,1:3,3:1,2,0,4
chr9	36117210	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=183,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.397:13:5,2:3,3:0,8,1,4
chr9	36148722	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=233,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr9	36169494	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:0,3:2,3:0,2,6,1
chr9	36169598	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=430,159;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,6:0,6:0,1,5,7
chr9	36171070	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=195,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,4:8,0:9,8,4,0
chr9	36191149	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=220,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:4,2,4,2
chr9	36198975	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=185,156;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:7,11:9,0:10,6,11,0
chr9	36211827	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=201,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,5:1,0:0,3,0,5
chr9	36246062	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:3,1,0,1
chr9	36276857	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=180,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.710:11:2,2:0,6:1,2,3,5
chr9	36345007	.	CTT	C,CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35,32;MFRL=159,211,231;MMQ=60,60,60;MPOS=31,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=4.25,3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.250,0.252:9:2,1,2:2,1,0:0,5,0,4
chr9	36581746	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:3,0:1,2:1,3,1,1
chr9	36643131	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=168,149;MMQ=56,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.316:14:5,1:4,3:1,9,0,4
chr9	36669228	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr9	36671219	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:0,8,0,6
chr9	36840734	.	C	CACACA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,36;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36840734_C_CACACA:36840734:0,0,0,1
chr9	36840737	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:36840734_C_CACACA:36840734:1,0,0,1
chr9	36840740	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:36840734_C_CACACA:36840734:1,0,0,1
chr9	36840742	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,25;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:36840734_C_CACACA:36840734:1,0,0,1
chr9	36840744	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:36840734_C_CACACA:36840734:1,0,0,1
chr9	37020622	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=175,234;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:4,3,4,2
chr9	37304168	.	A	AT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.950:15:0,8:0,7:0,0,7,8
chr9	37305481	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr9	37327757	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,59;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:10,1:5,2:12,4,1,2
chr9	37426524	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.953:17:0,8:0,9:0,0,11,6
chr9	37429661	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr9	37486383	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.767:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr9	37486603	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.384:32:9,4:10,8:9,11,6,6
chr9	37486629	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:6,11:8,7:7,7,9,9
chr9	37488009	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=237,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr9	37489298	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=174,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,2:5,7:4,4,6,3
chr9	37492679	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:6,2:9,3:9,6,1,4
chr9	37492794	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=194,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:0,7,0,5
chr9	37493529	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr9	37493548	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=141,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,3:4,2:2,2,5,0
chr9	37493588	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=186,237;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:2,4,3,2
chr9	37500895	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=212,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,4:2,5:1,3,1,8
chr9	37501844	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=223,263;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr9	37503087	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,4:6,3:3,9,5,2
chr9	37503124	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,8:0,0,14,8
chr9	37512734	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=219,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,2:2,1:1,6,1,2
chr9	37512808	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=175,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr9	37522975	.	C	CATCATCTCATAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=150,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:3,6,1,1
chr9	37707392	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=226,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.662:7:0,1:2,3:1,1,3,2
chr9	37708307	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr9	37708572	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=146,268;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:1,1,0,6
chr9	37719011	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=163,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,2:7,3:8,2,3,2
chr9	37733925	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=212,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,0,3
chr9	37737283	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=74,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,1:2,2:1,2,1,2
chr9	37746450	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=210,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,1:7,2:8,9,0,3
chr9	37776195	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr9	37781891	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=234,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:6,3:0,0:6,0,3,0
chr9	37782111	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=158,241;MMQ=60,57;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:3,3:9,2:4,8,0,5
chr9	37860258	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=143,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,6:2,1:0,2,1,6
chr9	37887570	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=166,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.370:11:3,3:4,1:7,0,4,0
chr9	37887603	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,10;MFRL=222,224;MMQ=60,44;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.243:20:2,0:5,0:10,5,5,0
chr9	37887606	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=198,224;MMQ=58,52;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.313:20:3,0:6,0:9,5,6,0
chr9	38398311	.	CTTTT	C,CT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,23,19;MFRL=176,177,257;MMQ=50,36,50;MPOS=24,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.46,3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.292,0.292:4:1,0,0:1,1,0:0,2,0,2
chr9	38398332	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=218,177;MMQ=48,36;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:38398332_C_G:38398332:0,4,0,1
chr9	38398343	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=226,177;MMQ=46,36;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:38398332_C_G:38398332:0,3,0,1
chr9	38398350	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=184,177;MMQ=43,36;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38398332_C_G:38398332:0,2,0,1
chr9	38411345	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=184,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr9	38414022	.	CCT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=12,32;MFRL=164,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:0,3:1,0,5,0
chr9	38414030	.	T	TCACACACA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=224,248;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,19;RU=CA;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.448:5:1,0:2,1:3,0,2,0
chr9	38414067	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=221,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.800:18:0,9:3,4:1,2,7,8
chr9	38528689	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=205,177;MMQ=60,52;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:0,7,0,2
chr9	38528797	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	38575787	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=195,241;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr9	38576999	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=212,195;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:2,1,5,1
chr9	38577239	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=188,125;MMQ=40,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,1:7,2:6,7,3,0
chr9	38586130	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,128;MMQ=40,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr9	39099874	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=190,182;MMQ=54,29;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chr9	39140562	.	A	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=92,92;MMQ=37,33;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=92.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,35:0.537:65:8,33:21,0:22,8,35,0
chr9	39171717	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=170,175;MMQ=38,38;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:2,4,1,1
chr9	40704360	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,22;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40704360_C_T:40704360:0,0,0,1
chr9	40704364	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,22;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40704360_C_T:40704360:0,0,0,1
chr9	40704367	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,22;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40704360_C_T:40704360:0,0,0,1
chr9	43627428	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=253,258;MMQ=40,28;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr9	43685083	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	43737549	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=154,174;MMQ=24,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.415:22:9,5:4,4:4,9,2,7
chr9	43844336	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=182,103;MMQ=24,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,0:2,4:5,1,2,2
chr9	43849658	.	GC	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=205,129;MMQ=60,42;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,4:1,5:2,2,8,1
chr9	43849836	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=157,126;MMQ=24,26;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:5,3,1,1
chr9	43849874	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=121,188;MMQ=24,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,1:2,3:3,4,3,1
chr9	43860959	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=175,192;MMQ=51,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,5:3,2:3,2,7,0
chr9	43861081	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=176,184;MMQ=52,37;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr9	45728080	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=266,179;MMQ=25,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:1,2,2,0
chr9	45733509	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=181,354;MMQ=25,26;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:3,4,2,0
chr9	45733796	.	T	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=133,146;MMQ=44,23;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.091:52:19,1:29,3:22,26,2,2
chr9	45734034	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=195,179;MMQ=24,23;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:3,3,2,1
chr9	46386902	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,23;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46386902_G_A:46386902:0,0,1,0
chr9	46386910	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,23;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46386902_G_A:46386902:0,0,1,0
chr9	46386956	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,23;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	46387102	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,209;MMQ=60,23;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	66553428	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	66553495	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,23;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr9	66553512	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=204,157;MMQ=23,24;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:2,1,3,1
chr9	66553848	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=168,92;MMQ=24,36;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.231:28:11,6:11,0:7,15,3,3
chr9	67938633	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=131,154;MMQ=23,22;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:13,2:9,2:11,11,4,0
chr9	67938651	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=135,220;MMQ=23,22;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:17,2:9,2:14,14,4,0
chr9	67938655	.	TC	CC,CG	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=28,35,20;MFRL=139,145,82;MMQ=23,22,23;MPOS=13,26;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.55,8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,3,3:0.118,0.118:31:14,2,2:11,1,0:11,14,5,1
chr9	67938664	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=28,23;MFRL=141,138;MMQ=23,22;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:11,4:10,1:11,11,5,1
chr9	67938672	.	TT	GA	.	.	DP=29;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=141,82;MMQ=23,23;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:14,2:11,1:12,13,1,2
chr9	67938721	.	CA	AG	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=139,138;MMQ=24,22;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,1:1,3:0,7,0,4
chr9	67938748	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=128,130;MMQ=24,22;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr9	67985126	.	AAAT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=179,118;MMQ=24,23;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:67985126_AAAT_A:67985126:0,2,0,1
chr9	67985131	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=179,118;MMQ=24,23;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:67985126_AAAT_A:67985126:0,2,0,1
chr9	67985133	.	GT	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=179,118;MMQ=24,23;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:2,0:0,1:0|1:67985126_AAAT_A:67985126:0,2,0,1
chr9	69218604	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,255;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	69247406	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=148,156;MMQ=26,23;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr9	69247479	.	AAAAAAAAC	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=140,227;MMQ=28,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:6,1:6,0:0|1:69247479_AAAAAAAAC_A:69247479:2,10,2,0
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chr9	69256741	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,222;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr9	69256816	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=152,173;MMQ=40,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:8,0,3,0
chr9	69256833	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=173,133;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,4:3,2:7,0,6,0
chr9	69403041	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=209,152;MMQ=24,24;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:4,0:3,4,1,2
chr9	69423550	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=133,273;MMQ=24,23;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:69423550_G_T:69423550:5,0,2,0
chr9	69423558	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=136,267;MMQ=24,23;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:3,4:4,0:0|1:69423550_G_T:69423550:7,0,4,0
chr9	69423615	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=136,262;MMQ=23,23;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,2:9,1:12,10,3,0
chr9	69423641	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=149,108;MMQ=23,22;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:8,1:6,3:6,8,3,1
chr9	69423792	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=123,273;MMQ=24,23;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr9	69423821	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,25;MFRL=123,273;MMQ=24,23;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:69423821_C_T:69423821:0,1,0,2
chr9	69423823	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,22;MFRL=123,273;MMQ=24,23;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:69423821_C_T:69423821:0,1,0,2
chr9	69439992	.	AC	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=220,231;MMQ=24,23;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:3,1,3,0
chr9	70972012	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	70993067	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	70993269	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,81;MMQ=48,20;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:5,5:4,0:6,3,5,0
chr9	71002440	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,5:4,2:9,1,3,4
chr9	71081202	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=247,132;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.386:3:0,1:2,0:0|1:71081202_T_C:71081202:0,2,0,1
chr9	71081204	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,25;MFRL=247,132;MMQ=60,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:71081202_T_C:71081202:0,2,0,1
chr9	71081206	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=247,132;MMQ=60,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:71081202_T_C:71081202:0,2,0,1
chr9	71081210	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=134,132;MMQ=60,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:71081202_T_C:71081202:0,3,0,1
chr9	71081212	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=35,30;MFRL=209,132;MMQ=60,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:71081202_T_C:71081202:0,4,0,1
chr9	71081215	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,26;MFRL=209,132;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:71081202_T_C:71081202:0,4,0,1
chr9	71081216	.	G	GGGTCAAGGGGT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=35,31;MFRL=209,132;MMQ=60,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:71081202_T_C:71081202:0,4,0,1
chr9	71114312	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=168,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:7,1:1,3:3,5,0,4
chr9	71395517	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=194,156;MMQ=60,55;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:4,9,0,2
chr9	71395528	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=203,156;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:7,9,0,2
chr9	71398839	.	TATTA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=150,240;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,4:6,3:5,7,4,3
chr9	71399228	.	CATTT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTT;STR;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,3:4,3:7,5,3,3
chr9	71538356	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	71555492	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr9	71555522	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr9	71629038	.	C	CGCGGCGGCG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=GCG;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.769:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	71650752	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	71667986	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr9	71687755	.	TTTG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=128,221;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTG;STR;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.504:8:4,3:0,1:0,4,0,4
chr9	71714693	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=198,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr9	71789386	.	T	TCGTGAG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CGTGAG;STR;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.492:14:2,2:4,4:3,4,6,1
chr9	71831398	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr9	71840424	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.265:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr9	71841110	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=142,103;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:16,0:14,3:9,21,0,3
chr9	71843023	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,12:0,5:0|1:71843023_C_A:71843023:0,0,3,15
chr9	71843039	.	TT	CC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=176,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,2:4,0:0|1:71843023_C_A:71843023:0,10,1,1
chr9	71843042	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=176,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,1:4,0:0|1:71843023_C_A:71843023:0,10,1,1
chr9	71849314	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=269,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:3,2:1,0:4,0,2,1
chr9	71851208	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=207,240;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:0,7,0,2
chr9	71854769	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=200,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr9	71855122	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr9	71865932	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr9	71865988	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=206,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,4,0
chr9	71986315	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr9	71999037	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=192,273;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr9	72000674	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,10:0,1:0,0,11,0
chr9	72000817	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=161,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,4:8,0:6,13,0,4
chr9	72002911	.	T	TGTTATA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=100.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,11:0,0,12,11
chr9	72003223	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:14,3:13,0:15,12,4,0
chr9	72064749	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr9	72067113	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.273:31:16,0:6,8:10,13,0,8
chr9	72082970	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr9	72338180	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr9	72338610	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=212,268;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr9	72374677	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,8,1
chr9	72374941	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=124,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,0:1,5:0,1,0,5
chr9	72472746	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=144,466;MMQ=59,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0|1:72472746_TA_T:72472746:3,0,3,0
chr9	72472763	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=228,144;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,2:0.300:8:5,2:1,0:1|0:72472746_TA_T:72472746:6,0,2,0
chr9	72501698	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr9	72740974	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr9	72783608	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr9	72901086	.	T	TGG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=179,207;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.233:15:6,1:5,1:0|1:72901086_T_TGG:72901086:0,12,3,0
chr9	72901096	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0|1:72901086_T_TGG:72901086:0,0,2,15
chr9	72933958	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr9	72939073	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:6,4:7,6:6,7,4,6
chr9	72961403	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=149,204;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr9	72961584	.	TTTTTCCCAAGCTCCTG	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:15,2:11,0:14,17,1,1
chr9	72962144	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:9,0:3,3:3,9,0,3
chr9	72962155	.	A	ACAGCTCAGACTCTCAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,18;MFRL=152,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,0:2,0:0,3,0,1
chr9	72962172	.	G	GGGCACACACCATGTAGGCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	72965438	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chr9	73002648	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr9	73150873	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=211,99;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:6,6:9,0:12,3,4,2
chr9	73150918	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=171,124;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:4,4:9,0:8,5,2,2
chr9	73164611	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,3:1,4:0,3,4,3
chr9	73213610	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr9	73213614	.	A	AAACTCT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=164,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:73213614_A_AAACTCT:73213614:0,4,0,1
chr9	73213616	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=164,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:73213614_A_AAACTCT:73213614:0,4,0,1
chr9	73213620	.	GG	CC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:73213614_A_AAACTCT:73213614:0,3,0,1
chr9	73213644	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=184,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr9	73218234	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:8,3:11,1:11,8,4,0
chr9	73234066	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr9	73236302	.	A	ATGGAGTCTTGCTCTTCCG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=200,95;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr9	73240312	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,5,4
chr9	73250037	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:2,0,5,1
chr9	73250096	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=140,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,5:5,3:7,4,4,4
chr9	73255432	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=154,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.727:8:0,5:1,1:2,0,6,0
chr9	73391409	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,2:2,5:1,2,2,6
chr9	73442724	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=189,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:3,2,4,0
chr9	73457832	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:2,0,5,1
chr9	73457861	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=233,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:1,5:2,3:1,2,7,1
chr9	73458045	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=189,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,0:0,2,0,3
chr9	73461558	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=319,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr9	73479436	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=36,10;MFRL=50,200;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.407:10:3,0:2,0:5,1,0,4
chr9	73479441	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,16;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.565:11:2,1:2,1:5,0,0,6
chr9	73479495	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=237,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0|1:73479495_T_TA:73479495:0,3,0,1
chr9	73479496	.	T	TTTGGCAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=237,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0|1:73479495_T_TA:73479495:0,3,0,1
chr9	73736320	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=129,286;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr9	74300640	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=291,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.788:17:2,6:1,7:2,1,8,6
chr9	74326961	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=154,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,1:6,3:7,3,4,0
chr9	74344928	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:2,2:8,2:3,7,2,2
chr9	74349645	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=186,107;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:6,0,2,0
chr9	74349917	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=195,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.483:12:1,3:5,2:0,6,0,6
chr9	74355185	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=261,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr9	74477617	.	TAAGA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr9	74533581	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=231,233;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:74533581_TG_CA:74533581:0,2,0,1
chr9	74533586	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=231,233;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:74533581_TG_CA:74533581:0,2,0,1
chr9	74561883	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr9	74586611	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=217,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74586611_T_C:74586611:0,1,0,1
chr9	74586617	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=217,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74586611_T_C:74586611:0,1,0,1
chr9	74586628	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=217,149;MMQ=52,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:74586611_T_C:74586611:0,3,0,1
chr9	74675343	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=167,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:8,4:3,0:8,3,4,0
chr9	74828718	.	CAAAAAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=170,0;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,10;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:1,1:0,0:2,1,1,0
chr9	74828827	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:4,3:10,0:7,7,0,3
chr9	74838023	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=195,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,1:6,2:7,3,3,0
chr9	74840757	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=160,72;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:0,6,0,2
chr9	74845949	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=223,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:6,1,3,0
chr9	74845989	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=184,190;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:5,1,2,1
chr9	74846187	.	TAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=206,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr9	74862221	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=178,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,2:3,4:5,1,4,2
chr9	74974534	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=193,232;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:3,7:0,3:0,3,0,10
chr9	74975492	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,1:6,3:10,1,4,0
chr9	74975711	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,4,12
chr9	74979593	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	75420448	.	C	CTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=139,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:3,0:3,1:2,5,0,2
chr9	75445494	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.188:35:12,1:17,5:18,11,6,0
chr9	75521060	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr9	75539077	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:0,2:1,2,0,4
chr9	75541942	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr9	75543974	.	T	TAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:1,4:0,3:0,1,1,7
chr9	75544038	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=222,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr9	75554982	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:1,3:0,1:1,0,5,0
chr9	75782510	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=288,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,15:1,10:1,0,5,20
chr9	75783937	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,15:0,0,22,9
chr9	77245162	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr9	77257293	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=167,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,1:7,2,1,1
chr9	77257346	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=133,235;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:1,2:6,1:5,2,2,1
chr9	77286876	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,0:3,3:1,8,1,2
chr9	77353300	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=112,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,1:5,2:8,2,1,2
chr9	77354626	.	G	GCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=261,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr9	77400718	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr9	77442616	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.866:13:0,3:1,9:1,0,9,3
chr9	77457028	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=154,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.536:9:0,3:1,2:3,1,5,0
chr9	77457174	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:2,17,0,3
chr9	77681818	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr9	77692555	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=181,248;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr9	77745424	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=245,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr9	77746804	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,247;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:1,7,1,1
chr9	77748151	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:5,1,3,0
chr9	77755949	.	TTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=219,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TA;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr9	78638797	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:3,2,1,1
chr9	78722328	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:1,2:0,5,0,5
chr9	78748980	.	CTT	C,CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33,32;MFRL=141,193,194;MMQ=60,60,60;MPOS=15,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=5.38,10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,5:0.181,0.292:18:3,3,2:5,0,3:9,1,7,1
chr9	78790143	.	GAATGGAATGA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=199,162;MMQ=33,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.506:6:1,1:1,1:0,3,0,3
chr9	78790231	.	CA	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=232,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.435:3:0,1:1,0:0|1:78790231_CA_AT:78790231:0,2,0,1
chr9	78790236	.	CA	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,26;MFRL=238,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78790231_CA_AT:78790231:0,1,0,1
chr9	78790239	.	A	AGTCATCATCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=238,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78790231_CA_AT:78790231:0,1,0,1
chr9	78796522	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=172,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,1:3,1:2,9,1,1
chr9	78799566	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr9	78803466	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=135,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:2,3:6,5:7,1,7,1
chr9	78804704	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=170,263;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr9	78809519	.	GT	G,GTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25,34;MFRL=181,154,176;MMQ=60,60,60;MPOS=30,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.79,6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.272,0.364:8:2,0,2:1,1,1:3,0,4,1
chr9	78842380	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=167,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,3,1
chr9	78842618	.	GC	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=238,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr9	78848542	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	78907078	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=203,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:3,2:4,1:6,2,3,0
chr9	78910089	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=183,198;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:78910089_G_A:78910089:6,0,2,0
chr9	78910100	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=169,198;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:78910089_G_A:78910089:7,0,2,0
chr9	78910108	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=167,198;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:78910089_G_A:78910089:5,0,2,0
chr9	78911794	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=156,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:1,8,0,2
chr9	78917015	.	T	TA,TAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25,27;MFRL=0,149,274;MMQ=60,60,60;MPOS=22,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=A;STR;TLOD=9.15,3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.563,0.332:6:0,3,1:0,1,1:0,0,6,0
chr9	78925814	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=160,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr9	78937877	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	78937901	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78937901_T_C:78937901:0,1,1,0
chr9	78937903	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,25;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78937901_T_C:78937901:0,1,1,0
chr9	78937929	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr9	78938236	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=184,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0|1:78938236_G_A:78938236:1,2,0,3
chr9	78938246	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:78938236_G_A:78938236:0,0,0,5
chr9	78938256	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:78938236_G_A:78938236:0,0,0,5
chr9	78965680	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:3,1,1,1
chr9	79003413	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0,1,4,0
chr9	79003440	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr9	79009204	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=190,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,1:0,5,0,3
chr9	79117751	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=60,174;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:10,2:3,4:6,7,1,5
chr9	79118129	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,92;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:17,0:11,2:13,15,0,2
chr9	79119829	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=105,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.279:15:2,3:4,1:8,3,3,1
chr9	79119842	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=105,106;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:5,4:11,0:12,4,4,0
chr9	79120552	.	C	CAGT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGT;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,1:2,1:6,3,2,0
chr9	79121384	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=182,256;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr9	79240050	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr9	79256806	.	TAC	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:4,2:14,0:15,5,2,0
chr9	79259592	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,11,4
chr9	79259850	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,5,6
chr9	79267532	.	G	GAC	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=154,59;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:13,0:7,2:0|1:79267532_G_GAC:79267532:12,8,1,1
chr9	79267534	.	T	TCA	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=159,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:13,0:7,2:0|1:79267532_G_GAC:79267532:13,10,1,1
chr9	79267537	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=160,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:8,2:0|1:79267532_G_GAC:79267532:13,11,1,1
chr9	79267540	.	GGGCT	G	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=159,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:8,1:0|1:79267532_G_GAC:79267532:11,12,1,1
chr9	79267549	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=155,126;MMQ=60,60;MPOS=-1073741819;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:12,1:8,1:0|1:79267532_G_GAC:79267532:10,10,0,2
chr9	79306919	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr9	79306956	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=176,24;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:9,6,1,1
chr9	79318367	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=192,233;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.630:11:3,6:0,1:0,4,4,3
chr9	79318375	.	GGTGACAGCCTGCAAC	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,10:0,2:0,0,4,9
chr9	79319050	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr9	79320640	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,6:0,0,7,11
chr9	79322673	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=157,216;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:5,3,0,2
chr9	79322674	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,5,5
chr9	79323348	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=112,256;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:6,5:2,1:2,6,4,3
chr9	79324135	.	A	ATGACTGTTGCAG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGACTGTTGCAG;STR;TLOD=79.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,7:0,7:0,0,10,8
chr9	79324179	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,12:0,0,14,6
chr9	79325370	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,0:13,2:10,10,0,2
chr9	79520956	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,2:7,0:2,6,1,1
chr9	79814799	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=181,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr9	79820141	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=175,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,5,0
chr9	79835101	.	TT	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=240,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,1:5,2:6,4,3,0
chr9	79835312	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=305,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.683:4:0,0:1,2:0,1,0,3
chr9	79836107	.	TTATGC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=188,97;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,0:8,2:10,6,1,1
chr9	79853318	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:79853318_A_T:79853318:4,7,1,1
chr9	79853324	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:7,2:0|1:79853318_A_T:79853318:4,7,1,1
chr9	79853325	.	G	GTTTCCTTCT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=155,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:79853318_A_T:79853318:3,7,1,1
chr9	79865187	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr9	79867288	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=190,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,2:3,3:4,4,2,3
chr9	79888146	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=84,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,1:2,5:5,1,4,2
chr9	79897218	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32,33,23;MFRL=119,143,197,196;MMQ=60,60,60,60;MPOS=33,32,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.88,5.87,3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,3,2:0.251,0.340,0.249:8:1,1,2,1:0,1,1,1:0,1,0,7
chr9	79910414	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=216,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr9	79922839	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=252,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr9	79952468	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=152,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,2:6,1:2,9,1,2
chr9	79954404	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=187,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:3,4:6,0,5,0
chr9	79954409	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=197,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.241:11:3,0:3,2:9,0,2,0
chr9	79954410	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=197,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.505:13:2,2:4,4:7,0,6,0
chr9	79955305	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.451:13:3,2:4,4:5,2,4,2
chr9	79955528	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:6,2:2,4:1,7,0,6
chr9	79968293	.	G	GTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=193,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.491:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr9	79974399	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=434,243;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr9	79996876	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=161,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:5,0:6,2:8,3,1,1
chr9	80020699	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=197,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr9	80020962	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=199,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr9	80022415	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=217,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:1,1,5,1
chr9	80038803	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr9	80040463	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=145,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:4,1,0,4
chr9	80336402	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=174,205;MMQ=60,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,1:7,2:3,9,2,1
chr9	80409345	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,7:1,3:2,1,10,0
chr9	80851527	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.724:27:5,11:2,9:5,2,8,12
chr9	80863088	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr9	80869721	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=139,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:9,5,2,0
chr9	80877777	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=187,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr9	80879005	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr9	80880849	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:6,10,2,0
chr9	80915403	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	80915599	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=129,226;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:6,0:13,4:13,8,0,4
chr9	80919756	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,6:1,9:1,1,7,8
chr9	80919955	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr9	80921145	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:6,0:1,2:7,0,2,0
chr9	80921421	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=188,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.526:21:5,0:4,11:6,4,0,11
chr9	80921446	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr9	80932515	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=301,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr9	80932574	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=210,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:2,3,5,3
chr9	80932789	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	82227589	.	C	CACCATTG	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.118:22:13,2:7,0:9,11,0,2
chr9	82264838	.	G	GTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=T;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.416:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr9	82267732	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=130,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,6:6,1:3,8,2,5
chr9	82320887	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:7,5:4,6:4,7,5,6
chr9	82336889	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	84207898	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.383:14:4,3:3,2:9,0,5,0
chr9	84215034	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.771:20:2,8:2,6:1,3,8,8
chr9	84226843	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=179,72;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,1:11,1:7,9,1,1
chr9	84267021	.	T	TAC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=227,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=AC;STR;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.737:9:0,3:2,3:2,0,7,0
chr9	84300583	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,67;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,2:5,0:11,4,0,2
chr9	84300694	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=133,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:9,2:12,2:10,11,3,1
chr9	84560188	.	C	CTTTTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=108,173;MMQ=30,30;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=44,49;RU=T;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.889:10:0,2:0,0:1,0,0,9
chr9	84562902	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,191;MMQ=27,39;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:5,2,2,0
chr9	84605493	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=175,52260;MMQ=60,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,4:3,0:1,8,0,4
chr9	84606265	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=168,305;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,2:11,0:9,9,0,2
chr9	84606849	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=164,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:8,1:12,4:8,12,4,1
chr9	84608623	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,107;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:9,5,1,1
chr9	85597720	.	CAGAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=234,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=AG;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.379:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr9	85611991	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=181,48;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:85611991_A_C:85611991:7,10,1,1
chr9	85611998	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=178,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:85611991_A_C:85611991:8,10,1,1
chr9	85612000	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=174,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:85611991_A_C:85611991:7,10,1,1
chr9	85612005	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=174,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:85611991_A_C:85611991:7,10,1,1
chr9	85677254	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr9	85905666	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=205,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:2,4,0,2
chr9	85913590	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:4,2,4,0
chr9	85924600	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=198,244;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr9	85924611	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=183,247;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:2,2:0,4,0,3
chr9	85926892	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.297:7:3,1:2,1:0|1:85926892_TG_T:85926892:3,2,0,2
chr9	85926894	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,18;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.297:7:2,0:1,0:0|1:85926892_TG_T:85926892:3,2,0,2
chr9	85987879	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.610:6:0,0:1,2:0,2,1,3
chr9	85987976	.	TAG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=241,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:85987976_TAG_T:85987976:0,3,0,1
chr9	85987981	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=241,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:85987976_TAG_T:85987976:0,3,0,1
chr9	86243933	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr9	86256381	.	CATGAT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=198,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:1,2:1,1,3,1
chr9	86256431	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=199,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.827:21:2,9:1,9:3,0,12,6
chr9	86278773	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=224,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,4:3,1:5,2,4,1
chr9	86278817	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:12,3,2,0
chr9	86279015	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.670:7:1,3:1,2:0|1:86279015_C_T:86279015:0,2,0,5
chr9	86279025	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0|1:86279015_C_T:86279015:0,5,0,2
chr9	86281195	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,2:1,0:2,1,2,0
chr9	86298048	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,36;MFRL=179,176;MMQ=60,39;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:86298048_C_CA:86298048:0,3,0,1
chr9	86298051	.	G	GCTGGGT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,35;MFRL=179,176;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:86298048_C_CA:86298048:0,3,0,1
chr9	86298052	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,34;MFRL=179,176;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:86298048_C_CA:86298048:0,3,0,1
chr9	86298053	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=183,150;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr9	86298060	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=35,27;MFRL=169,176;MMQ=55,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:86298048_C_CA:86298048:0,2,0,1
chr9	86298065	.	CG	TA	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=29,29;MFRL=187,163;MMQ=60,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr9	86298080	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=228,150;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:86298080_C_T:86298080:0,2,0,1
chr9	86298082	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=35,32;MFRL=228,150;MMQ=60,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:86298080_C_T:86298080:0,2,0,1
chr9	86354511	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=195,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr9	86354663	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:2,2:4,1:1,5,1,2
chr9	86399815	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr9	86457387	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=267,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr9	86474115	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=113,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,1:11,1:0|1:86474115_T_C:86474115:11,13,1,1
chr9	86474120	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=107,114;MMQ=60,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,5:0.214:26:13,0:8,5:1|0:86474115_T_C:86474115:12,9,0,5
chr9	86518796	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,0:6,2:6,9,2,0
chr9	86568874	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=188,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:0,1:0,3,0,4
chr9	86568890	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=251,150;MMQ=50,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr9	86584222	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=183,170;MMQ=60,45;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:13,2:4,2:14,5,4,0
chr9	86585557	.	ATT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=249,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=T;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:2,1:8,2:12,0,3,0
chr9	86588185	.	ATT	A,AT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30,28;MFRL=127,199,0;MMQ=60,60,60;MPOS=20,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=4.09,4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,3:0.193,0.204:17:2,1,1:9,2,2:8,3,5,1
chr9	86591857	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=196,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:8,5:5,6:9,4,9,2
chr9	86592026	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=162,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,6:4,4:1,6,2,8
chr9	86593077	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=224,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,3:6,1:9,2,2,2
chr9	86593246	.	TAAAA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=173,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=A;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.584:5:1,1:0,2:0,2,0,3
chr9	86617961	.	CTTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=T;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:2,0:0,1:1,1,0,1
chr9	86893061	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr9	86912861	.	G	GATTCAATA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=194,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,2:8,0:0|1:86912861_G_GATTCAATA:86912861:8,7,1,1
chr9	86912863	.	GTC	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=194,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,2:8,0:0|1:86912861_G_GATTCAATA:86912861:8,7,1,1
chr9	86920117	.	GAA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=176,293;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.441:6:2,1:2,1:4,0,1,1
chr9	87285595	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=221,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr9	87285915	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,349;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	87425498	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=165,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.126:36:14,3:18,1:12,20,1,3
chr9	87425619	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,7771885;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0,10,0,2
chr9	87570261	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:5,12,2,0
chr9	88287602	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.386:11:5,2:2,2:0,7,0,4
chr9	88590182	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=237,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:2,2:3,0:0,6,0,2
chr9	88618462	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=218,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:6,1,2,1
chr9	88631633	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=199,254;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,0:1,1:0|1:88631633_A_C:88631633:0,3,0,1
chr9	88631638	.	C	CTTTGCTGTTCTGTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,36;MFRL=198,254;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:88631633_A_C:88631633:0,2,0,1
chr9	88631640	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=198,254;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:88631633_A_C:88631633:0,2,0,1
chr9	88661563	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr9	88667582	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr9	88842769	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=199,117;MMQ=60,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,3:3,0:5,5,3,0
chr9	88886830	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=148,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr9	88916447	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=161,51;MMQ=60,35;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:9,0:13,3:11,11,0,3
chr9	88923395	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=165,165;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:13,0:13,3:14,12,0,3
chr9	88924057	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=213,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:2,5:0,7:2,0,10,2
chr9	88925534	.	ATG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr9	88934624	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=241,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr9	88937696	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=283,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr9	88937851	.	ATTT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=186,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,4;RU=T;STR;TLOD=75.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.793:22:2,10:2,8:4,0,9,9
chr9	88943171	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=201,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:6,0,1,1
chr9	89561919	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:2,2,2,2
chr9	89763574	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=215,224;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.866:13:0,7:1,5:1,0,12,0
chr9	89763851	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=64.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,2,17
chr9	89771569	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=147,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:7,3:5,0:3,9,1,3
chr9	90254175	.	CT	C,CTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32,31;MFRL=192,228,231;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=7.50,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,2:0.410,0.250:9:2,3,1:0,1,1:3,0,6,0
chr9	90254429	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=181,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,1:7,1:6,10,1,1
chr9	90258412	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=198,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:0|1:90258412_CTT_C:90258412:1,6,0,7
chr9	90258415	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=198,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:0|1:90258412_CTT_C:90258412:1,6,0,7
chr9	90264758	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=140,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,2,0
chr9	90264781	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=120,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:4,4:1,0:3,3,4,0
chr9	90266588	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=206,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:10,1:15,1:8,17,0,2
chr9	90313717	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:3,2,0,6
chr9	90316674	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=218,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,1:3,1:7,0,4,0
chr9	90316710	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,8:7,4:9,3,9,3
chr9	90320954	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr9	90321835	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,4:4,2:5,6,3,3
chr9	90342553	.	T	TAAAG	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=142,42;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:6,2:0|1:90342553_T_TAAAG:90342553:13,3,1,1
chr9	90342561	.	GCC	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=156,42;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:12,2:0|1:90342553_T_TAAAG:90342553:16,6,1,1
chr9	90342564	.	T	TGA	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=160,42;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:14,2:0|1:90342553_T_TAAAG:90342553:16,7,1,1
chr9	90342568	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=156,42;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:14,2:0|1:90342553_T_TAAAG:90342553:15,7,1,1
chr9	90342675	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=188,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,4:6,5:2,6,4,5
chr9	90387805	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=124,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:2,4:4,0:4,3,3,1
chr9	90498028	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=162,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,2:5,1:5,6,1,2
chr9	90499745	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=264,260;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr9	90503007	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=244,132;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,2:2,5:5,2,2,5
chr9	90503042	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=283,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:1,3,3,1
chr9	90534156	.	T	TTCTTGTCTCCCAGCGTCA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TCTTGTCTCCCAGCGTCA;STR;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.928:10:0,2:0,4:0,0,0,10
chr9	90534348	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	90586043	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,5,4
chr9	90588814	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr9	90588903	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,7,9
chr9	90589016	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr9	91262296	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,4:2,0:6,1,4,0
chr9	91262343	.	A	ATGG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGG;STR;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:5,1:2,1:4,3,2,2
chr9	91606203	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=212,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr9	91606247	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	91609130	.	G	GTTCTC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=186,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,2:3,0:0|1:91609130_G_GTTCTC:91609130:6,3,1,1
chr9	91609132	.	C	CCTGTGAAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=186,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:91609130_G_GTTCTC:91609130:6,3,1,1
chr9	91609711	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,6:3,0:4,7,6,0
chr9	91610480	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.254:20:4,4:11,1:5,10,2,3
chr9	91610595	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=156,314;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:7,1:10,3:10,8,3,1
chr9	91628546	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr9	91628567	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=154,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:4,0:1,8:0,5,0,9
chr9	91652415	.	TG	AA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=144,165;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:9,1:4,2:7,6,1,2
chr9	91652538	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=187,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr9	91653257	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.797:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr9	91653287	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:91653287_G_C:91653287:0,3,0,1
chr9	91653293	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:91653287_G_C:91653287:0,3,0,1
chr9	91661746	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:3,0,3,2
chr9	91667136	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=106,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr9	91680531	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=134,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,5:1,2:2,1,1,6
chr9	91680570	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=176,265;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr9	91680600	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=193,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0,4,0,4
chr9	91771148	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.396:16:5,1:3,5:6,4,3,3
chr9	91771403	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=126,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.365:33:14,5:7,6:9,12,7,5
chr9	91926088	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=190,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,1:2,3:8,0,4,0
chr9	91926180	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=129,256;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:8,3:18,2:15,11,2,3
chr9	91934555	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.655:27:2,9:7,9:6,3,11,7
chr9	91934787	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=205,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,1:0,6:0,4,0,7
chr9	91940644	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=148,65;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.220:21:10,4:5,0:6,11,0,4
chr9	91965592	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=178,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:6,2:12,0:5,13,1,1
chr9	92003749	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=166,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.239:19:8,3:6,1:12,3,2,2
chr9	92020433	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr9	92219921	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=254,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,3:2,1:7,0,4,0
chr9	93606103	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=266,255;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr9	93606676	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=259,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr9	93627484	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=146,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr9	93629347	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=113,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:3,0,5,2
chr9	93636438	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=108,108;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:7,8:15,0:18,4,8,0
chr9	93637015	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=167,189;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:6,5:3,7:5,4,4,8
chr9	93639803	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr9	93640120	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0|1:93640120_C_T:93640120:0,0,1,10
chr9	93640131	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:93640120_C_T:93640120:0,0,0,8
chr9	93641175	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,4:7,3:3,9,2,5
chr9	93641199	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=183,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,1:6,1:3,9,1,1
chr9	93641282	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=209,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr9	93650015	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=153,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.234:18:4,1:10,3:10,4,2,2
chr9	93650907	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,2:8,0:7,10,0,2
chr9	93657761	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=205,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,4:0,4:2,0,7,1
chr9	94118106	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=188,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:6,1,4,0
chr9	94118258	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:7,2:4,4:4,7,2,4
chr9	94118497	.	C	CGTAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=180,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,2:3,4:0,4,1,6
chr9	94172421	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:4,0:13,2:9,8,2,0
chr9	94479526	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=236,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:4,2,2,1
chr9	94485928	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=165,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:2,2,2,0
chr9	94487459	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=168,262;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr9	94499618	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr9	94538115	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=253,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:3,6,1,1
chr9	94830232	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,0:14,2:13,5,1,1
chr9	94841937	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=100,218;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,0,3
chr9	94973193	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:2,6,0,4
chr9	94991350	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=168,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:5,0:9,3:5,9,1,2
chr9	95002842	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:1,1:6,0,4,0
chr9	95004636	.	T	TTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0,4,1,0
chr9	95018903	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=152,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,6:6,1:7,0,6,1
chr9	95030582	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:6,0:16,2:8,14,0,2
chr9	95036794	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=217,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:2,7,3,6
chr9	95051488	.	CAAAAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=231,166;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=21,15;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.332:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr9	95051514	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,10;MFRL=161,166;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:2,0:6,0:0|1:95051514_C_A:95051514:6,4,3,0
chr9	95051530	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,11;MFRL=161,116;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:11,0:12,8,2,0
chr9	95051534	.	CT	AA	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=32,17;MFRL=134,199;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:9,0:11,1:16,8,2,0
chr9	95051538	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=152,166;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.147:25:10,0:12,0:0|1:95051514_C_A:95051514:14,8,3,0
chr9	95063939	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=119,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:14,0:11,7:13,12,0,7
chr9	95073605	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=163,181;MMQ=53,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr9	95078413	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,37;MFRL=131,246;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:9,0:12,2:9,13,0,2
chr9	95147840	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=149,289;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,2:7,2:12,2,4,0
chr9	95155563	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=159,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr9	95237024	.	CTCA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=302,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=TCA;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.624:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr9	95237222	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.457:9:3,3:2,1:1,4,0,4
chr9	95274261	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=169,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,1:6,1:3,4,0,2
chr9	95277093	.	GGTCCTCCTC	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=158,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTCCTCCTC;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:7,2:9,0:10,10,1,1
chr9	95284873	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=78,207;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.376:20:4,4:8,3:2,11,5,2
chr9	95285222	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=273,232;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr9	95362665	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,1:6,3:12,1,4,0
chr9	95378353	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=172,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.309:27:8,5:11,3:6,13,2,6
chr9	95378398	.	C	CCT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=171,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,1:6,1:0|1:95378398_C_CCT:95378398:1,9,0,2
chr9	95378400	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=171,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,1:7,1:0|1:95378398_C_CCT:95378398:1,9,0,2
chr9	95397418	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=175,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:3,5:0,5:2,1,7,3
chr9	95397659	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=228,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,1:6,2:0,13,0,3
chr9	95400261	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=167,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.536:7:3,1:0,1:2,1,4,0
chr9	95400642	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr9	95402950	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=111,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,2:7,1:8,3,2,1
chr9	95482481	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr9	95609030	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=205,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.317:29:16,5:3,3:7,13,4,5
chr9	95610116	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=144,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:4,0:13,2:9,8,0,2
chr9	95618605	.	TA	T,TAAA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,30,28;MFRL=183,163,202;MMQ=60,60,60;MPOS=20,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,14;RU=A;STR;TLOD=6.33,10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,4:0.308,0.436:9:0,0,1:2,3,3:0,2,2,5
chr9	95618657	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=207,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.555:9:2,0:2,5:0,4,0,5
chr9	95766471	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr9	95772738	.	GGAGA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=GA;STR;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.855:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	95840204	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,287;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:1,4:9,2:3,7,4,2
chr9	95874070	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr9	95874428	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr9	95888630	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:2,1:4,1:6,0,3,0
chr9	95992213	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr9	95992240	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=202,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr9	95993156	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:5,1,3,1
chr9	95993215	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:7,2:6,2:11,2,3,1
chr9	96000622	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,5,5
chr9	96015377	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr9	96024859	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr9	96024883	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:1,1:6,3:5,2,3,1
chr9	96025052	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:6,3:0,2:1,5,0,5
chr9	96025771	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,4:0,0:0,0,5,0
chr9	96026086	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	96026122	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=197,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:96026122_T_TG:96026122:4,0,1,0
chr9	96026131	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=197,227;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:96026122_T_TG:96026122:4,0,1,0
chr9	96026133	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,17;MFRL=197,227;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:96026122_T_TG:96026122:4,0,1,0
chr9	96030230	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=60.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,9,9
chr9	96031262	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr9	96051572	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=114,276;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:2,1,2,0
chr9	96055032	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=222,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,0:1,6:2,0,0,6
chr9	96061269	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr9	96209832	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:2,3:8,3:7,3,5,1
chr9	96209943	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=127,180;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,3:3,6:5,4,4,6
chr9	96209987	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=19,32;MFRL=127,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:1,2:1,1:1,5,0,3
chr9	96213146	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:2,3:10,4:8,4,6,1
chr9	96238578	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.666:22:5,10:2,4:5,2,7,8
chr9	96291995	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,2:5,3:2,6,0,5
chr9	96292025	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,4:3,3:0,6,0,7
chr9	96392182	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,3:1,3:2,0,5,1
chr9	96392371	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,160;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr9	96407822	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr9	96407848	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=202,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr9	96415653	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,0,7
chr9	96420390	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr9	96420402	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=244,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.488:8:1,0:3,0:1,3,4,0
chr9	96422420	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=187,200;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:4,3:0,6:4,0,8,1
chr9	96425138	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=248,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,2:0,6:1,0,7,2
chr9	96425336	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=227,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:1,3,0,2
chr9	96425777	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=137,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,3,1
chr9	96439004	.	C	CCCTGCCTCCACCACA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=234,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,1,3
chr9	96439801	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=151,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:96439801_A_C:96439801:0,2,1,0
chr9	96439807	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=168,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:96439801_A_C:96439801:1,2,1,0
chr9	96715068	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=166,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,0:2,4:4,4,1,3
chr9	96715494	.	CG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,337;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	96941099	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=223,267;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,1:5,0:9,1,2,1
chr9	97080944	.	GAGA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr9	97081795	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr9	97087944	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=256,133;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr9	97329737	.	C	CAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr9	97365642	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:2,1:10,1:6,6,2,0
chr9	97369083	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=132,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:5,3,3,0
chr9	97372172	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,2:9,1:11,6,1,2
chr9	97380043	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=257,59;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,3:1,1:1,1,2,2
chr9	97426330	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=18,28,25;MFRL=132,211,193;MMQ=60,60,60;MPOS=23,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=A;STR;TLOD=4.69,4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,4:0.158,0.242:16:2,2,0:3,0,2:2,8,2,4
chr9	97427423	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,83;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,0:11,2:12,10,0,2
chr9	97822941	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:1,3:2,5:2,1,8,0
chr9	97823150	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=201,84;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:1,9,0,2
chr9	97888730	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,2:5,3:8,1,5,0
chr9	98002831	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=181,242;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr9	98209387	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,1:8,1:6,10,1,1
chr9	98209594	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=114,280;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,0,2
chr9	98211572	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=201,262;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.255:10:2,2:3,0:0,8,0,2
chr9	98215968	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=217,302;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr9	98218474	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=262,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:0,2:4,0,4,0
chr9	98220322	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=121,255;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:8,1:4,2:8,4,2,1
chr9	98221861	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=232,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.777:25:2,11:3,8:4,1,6,14
chr9	98224360	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr9	98229297	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,241;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr9	98229389	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=249,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,7:0,4:0,2,8,3
chr9	98231008	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=170,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:6,3:11,6:10,7,5,4
chr9	98239067	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:12,0:8,3:0|1:98239067_C_T:98239067:10,10,0,3
chr9	98239073	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:11,0:8,3:0|1:98239067_C_T:98239067:10,10,0,3
chr9	98239730	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=177,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr9	98242925	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=193,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr9	98278961	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=95,68;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:10,0:10,3:4,16,0,3
chr9	98669620	.	GTT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,14;MFRL=237,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:1,0:0,3,0,2
chr9	98678164	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:1,6,0,4
chr9	98684728	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=127,48;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:0|1:98684728_T_G:98684728:6,10,1,1
chr9	98684734	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=132,48;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:10,2:0|1:98684728_T_G:98684728:5,13,1,1
chr9	98684741	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=145,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,0:12,2:0|1:98684728_T_G:98684728:3,13,1,1
chr9	98684744	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=145,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,0:12,2:0|1:98684728_T_G:98684728:3,13,1,1
chr9	98703711	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=120,221;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:5,0:2,2:6,1,3,0
chr9	98733033	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=195,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,0:1,2:0,7,0,2
chr9	98997910	.	ATCTTTGTGG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr9	99003264	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr9	99006578	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=136,259;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,0:7,3:8,6,1,2
chr9	99012032	.	C	CACACACAAGCACACACACACACACA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=166,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:3,2:8,0:10,1,0,2
chr9	99013663	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=122,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,1:0,7:0,2,5,4
chr9	99060612	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=157,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr9	99064202	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=205,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,1:4,2:8,3,2,1
chr9	99064425	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,2:3,0:1,4,0,2
chr9	99145727	.	CGCAG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:1,0:0,1:0,3,1,0
chr9	99160588	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.173:38:24,0:8,6:8,24,0,6
chr9	99220569	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=228,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr9	99233431	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=194,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.230:22:6,4:7,1:6,11,1,4
chr9	99285982	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,163;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,0:6,2:3,6,1,1
chr9	99296732	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=143,52;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:16,0:10,4:21,5,2,2
chr9	99314012	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=138,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr9	99522404	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=175,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:11,4:4,2:7,8,3,3
chr9	99580104	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=313,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,3,0
chr9	99700097	.	CCTCCGGGTGTCCTTGG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	99711898	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=146,153;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,2:3,0:7,3,2,0
chr9	99799101	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=204,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:1,1:2,4:0,4,0,5
chr9	99799114	.	TA	T,TAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27,29;MFRL=205,199,223;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=6.23,3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.401,0.299:7:0,0,1:2,2,1:0,2,0,5
chr9	100071728	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=134,223;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:7,3:9,1:9,7,1,3
chr9	100074446	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=126,237;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,3:8,1:9,6,1,3
chr9	100087239	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=199,78;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:3,1:0,2:3,0,4,0
chr9	100087345	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=100,228;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:9,3:5,2:8,6,5,0
chr9	100092348	.	C	CAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,10;MFRL=153,278;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=23,26;RU=A;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.591:5:0,0:2,0:1,1,0,3
chr9	100092968	.	A	AGAGGAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=224,280;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=GAG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	100105909	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=205,230;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:1,0:1,3,0,2
chr9	100116833	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,233;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,1:7,2:6,2,3,0
chr9	100122291	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=131,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,2:8,0:4,9,0,2
chr9	100124787	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=144,281;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr9	100132194	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=212,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,0:5,2:3,3,1,1
chr9	100139084	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.238:15:5,0:5,3:9,3,1,2
chr9	100194401	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,3:7,2:8,5,2,3
chr9	100194406	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=212,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:2,5:1,8:3,0,5,9
chr9	100234756	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:9,3:10,1:10,10,2,2
chr9	100237817	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=173,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr9	100243176	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=164,92;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:15,3:9,0:12,13,3,0
chr9	100245509	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,5:3,6:4,4,2,9
chr9	100258100	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.113:29:18,1:8,1:12,14,0,3
chr9	100361864	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=213,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,3:1,4:1,0,8,0
chr9	100364891	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,1:9,1:9,12,2,0
chr9	100366953	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=119,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,5,1
chr9	100372517	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=222,231;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.258:27:4,5:16,0:15,5,7,0
chr9	100407472	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=173,205;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:20,0:12,6:9,23,0,6
chr9	100418117	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=158,90;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr9	100418443	.	T	TTTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr9	100418450	.	A	AGTATTTTGTGTTTTCATTCTTTCTCTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	100428977	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:8,0,3,0
chr9	100432132	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=189,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr9	100437633	.	CT	C,CTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34,33;MFRL=181,180,219;MMQ=60,60,60;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=5.60,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,2:0.265,0.196:12:2,2,1:5,1,1:7,0,5,0
chr9	100447265	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,81;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.277:34:11,0:14,9:12,13,2,7
chr9	100617949	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:5,0:3,2:3,6,2,0
chr9	100675816	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:2,8:5,4:3,4,5,7
chr9	100684645	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:6,7:13,2:12,7,6,3
chr9	100689813	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:0,10,0,3
chr9	100692237	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=208,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr9	100692330	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=194,164;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,1:6,1:8,5,2,0
chr9	100700242	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.324:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr9	100756891	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:5,5:4,6:4,5,6,5
chr9	100760997	.	GTCATTT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=190,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCATTT;STR;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.685:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr9	100767530	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=274,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr9	100773613	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=174,76;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.178:31:8,5:18,0:14,12,4,1
chr9	100774646	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:5,1,5,0
chr9	100777705	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=32,25;MFRL=108,107;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,10:0.324:32:10,4:12,5:0|1:100777705_G_A:100777705:15,7,2,8
chr9	100777710	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=25,26;MFRL=127,107;MMQ=60,53;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,10:0.306:34:8,5:12,5:0|1:100777705_G_A:100777705:14,10,2,8
chr9	100777717	.	CC	TG	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=31,30;MFRL=127,110;MMQ=60,49;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,11:0.375:30:5,6:13,5:0|1:100777705_G_A:100777705:11,8,2,9
chr9	100777730	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=32,25;MFRL=127,110;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.462:24:4,6:9,4:0|1:100777705_G_A:100777705:6,7,2,9
chr9	100777743	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=32,26;MFRL=181,110;MMQ=60,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,10:0.344:30:12,5:5,4:0|1:100777705_G_A:100777705:3,17,1,9
chr9	100777754	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=31,25;MFRL=181,112;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.286:26:11,3:7,2:0|1:100777705_G_A:100777705:2,17,1,6
chr9	100777774	.	TG	GA	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=31,31;MFRL=175,130;MMQ=60,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:0,2:6,1:0|1:100777705_G_A:100777705:0,6,0,3
chr9	100777779	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=11;MBQ=33,30;MFRL=175,121;MMQ=60,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,1:5,1:0|1:100777705_G_A:100777705:0,6,0,2
chr9	100777784	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=31,34;MFRL=172,112;MMQ=60,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:100777705_G_A:100777705:0,3,0,1
chr9	100777789	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=28,27;MFRL=172,112;MMQ=60,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:100777705_G_A:100777705:0,3,0,1
chr9	100777790	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=28,29;MFRL=172,112;MMQ=60,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:100777705_G_A:100777705:0,3,0,1
chr9	100819070	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=353,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,7:0,3:1,0,9,1
chr9	100843409	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=157,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.315:17:5,2:6,3:0|1:100843409_A_T:100843409:5,7,2,3
chr9	100843417	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=71,119;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,13:0.779:16:2,4:1,8:0|1:100843409_A_T:100843409:1,2,5,8
chr9	100849500	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.638:17:3,5:2,5:2,4,5,6
chr9	100962504	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=143,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr9	100965472	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=216,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,2:3,3:3,0,5,0
chr9	100970850	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=304,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr9	100970881	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=186,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr9	100973178	.	A	AGAGGCCT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=242,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GAGGCCT;STR;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.550:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr9	100983566	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=203,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,5:1,4:0,2,1,8
chr9	100995721	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=174,154;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:0,6:1,4:1,0,2,9
chr9	100995758	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,5,9
chr9	101006210	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=264,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0|1:101006210_T_C:101006210:1,0,5,2
chr9	101006216	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=264,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0|1:101006210_T_C:101006210:1,0,4,2
chr9	101006436	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=218,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.787:12:2,4:0,6:0|1:101006436_C_A:101006436:0,2,3,7
chr9	101006443	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=16,27;MFRL=218,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.771:11:0,4:0,4:0|1:101006436_C_A:101006436:0,2,3,6
chr9	101053051	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=140,247;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:12,2:4,2:4,12,2,2
chr9	101053076	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=257,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.789:17:2,8:1,6:1,2,3,11
chr9	101056009	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=245,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:7,0,4,0
chr9	101061639	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=180,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,6:2,3:0,3,3,6
chr9	101068580	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=131,92;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,1:8,2:4,12,1,2
chr9	101068649	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=207,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:3,3,0,3
chr9	101068699	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=152,118;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr9	101243364	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr9	101258803	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=166,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,1:6,1:8,6,1,1
chr9	101258881	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:0,7,1,4
chr9	101340395	.	C	CTCTGCATATAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=196,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:101340395_C_CTCTGCATATAA:101340395:0,3,0,1
chr9	101340397	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=209,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:101340395_C_CTCTGCATATAA:101340395:0,4,0,1
chr9	101340400	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=209,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:101340395_C_CTCTGCATATAA:101340395:0,4,0,1
chr9	101340440	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=245,220;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr9	101513413	.	T	TAGTCACCCAAAGTAAAATTTCTCCACC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=194,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,2:4,0:1,9,1,1
chr9	101539601	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,0:1,4:1,0,3,1
chr9	101547146	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:8,9,0,2
chr9	101552955	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=74,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:0,4,0,5
chr9	101602293	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=126,94;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.142:30:8,3:18,0:17,9,4,0
chr9	101602476	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=227,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:2,3,0,2
chr9	101606549	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=190,251;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:1,3,1,4
chr9	101608393	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=131,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.199:36:12,0:15,5:12,17,4,3
chr9	101608419	.	C	CGCCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=150,85;MMQ=60,35;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,0:10,3:10,11,0,3
chr9	101749498	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=194,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:3,1,2,1
chr9	101749605	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=211,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:6,0:5,6,1,1
chr9	101759162	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,83;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:5,3:12,0:12,5,3,0
chr9	101759428	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=184,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:0,5,0,4
chr9	101767315	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=171,222;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,1:8,1:7,8,2,0
chr9	101767382	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=125,245;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:2,8,0,4
chr9	101767385	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=22,34;MFRL=125,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:3,3:4,3:2,6,0,6
chr9	101778265	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=153,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.358:37:10,6:13,7:10,14,8,5
chr9	101784438	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=149,283;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:2,7,1,1
chr9	101785558	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=156,280;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr9	101785598	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=149,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:6,2,1,1
chr9	101785633	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=192,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,1:10,1:12,2,1,1
chr9	101796906	.	T	TCTCCCTC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=92,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTCCCTC;STR;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,2:2,6:0,3,0,9
chr9	101804416	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=140,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:12,1:12,2:10,14,2,1
chr9	101810339	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:1,8,2,1
chr9	101812072	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:20,3:9,2:13,16,3,2
chr9	101814626	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,11,3
chr9	101816861	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=131,120;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.367:39:11,14:13,0:12,13,14,0
chr9	101817588	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=141,163;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:7,3:13,0:8,12,3,0
chr9	101818716	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=201,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr9	101822220	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=182,144;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.560:25:6,5:4,9:4,7,3,11
chr9	101822302	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=205,270;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,2:1,5:1,3,0,7
chr9	101984764	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=172,319;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,1:5,1:8,5,2,0
chr9	101990343	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=164,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:7,4:1,6:2,6,2,8
chr9	102067317	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr9	102068912	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,4:5,0:2,3,1,3
chr9	102625834	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,2:0,3:4,0,5,0
chr9	102625951	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,2:9,0:5,11,1,1
chr9	102691042	.	CTTCT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=127,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCT;STR;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.528:17:5,3:3,6:5,3,4,5
chr9	102713580	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr9	102713591	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:3,3,2,3
chr9	102730697	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30,29,31;MFRL=162,223,183,199;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,29,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.35,5.28,3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,2,3,2:0.176,0.275,0.232:10:1,1,2,1:2,1,1,1:3,0,6,1
chr9	102822307	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=106,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.380:9:3,2:3,1:5,1,3,0
chr9	103009082	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=186,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:103009082_G_T:103009082:0,4,0,1
chr9	103009084	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=186,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:103009082_G_T:103009082:0,4,0,1
chr9	103009086	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=218,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:103009082_G_T:103009082:0,2,0,1
chr9	103015184	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr9	103027226	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.430:13:5,1:3,3:2,6,3,2
chr9	103035427	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr9	103064589	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=99,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:8,2:0,6:4,4,3,5
chr9	103108941	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=166,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:3,3:5,4:6,2,6,2
chr9	103114793	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=187,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,4:2,8:0,4,0,12
chr9	103204153	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=110,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr9	103212778	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.296:12:7,2:2,1:9,0,3,0
chr9	103261022	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,2:9,0:8,9,2,0
chr9	103275675	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=190,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.487:12:4,2:1,4:0,6,0,6
chr9	103275692	.	T	A,TA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,24,26;MFRL=0,175,179;MMQ=60,60,60;MPOS=10,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=17.34,4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,3:0.630,0.307:10:0,3,2:0,4,1:0,0,0,10
chr9	103310212	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103310212_T_TA:103310212:0,0,1,0
chr9	103310213	.	T	TTTCAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103310212_T_TA:103310212:0,0,1,0
chr9	103312290	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=145,305;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:2,0,2,1
chr9	104124664	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr9	104125124	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=158,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:29,2:10,1:12,27,1,2
chr9	104130338	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=131,170;MMQ=48,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr9	104133551	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=125,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:0,2:9,0:5,4,1,1
chr9	104153155	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr9	104161450	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,7:3,2:1,6,0,9
chr9	104171995	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=178,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr9	104183969	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=158,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr9	104184022	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=195,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,1:2,2:4,3,3,0
chr9	104187041	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=209,235;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:8,0,2,0
chr9	104189680	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=269,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr9	104238142	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=175,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,1:3,2:6,2,3,0
chr9	104239493	.	A	AAAACAAAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=AAAC;STR;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.830:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr9	104297693	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,1:8,1:8,6,2,0
chr9	104302625	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=154,210;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,0:7,4:8,6,0,4
chr9	104319750	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:10,0:7,4:10,7,0,4
chr9	104340171	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=212,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,1,2
chr9	104432293	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,5:3,1:3,0,6,0
chr9	104433436	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=150,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,5:0,3:0,1,0,8
chr9	104448861	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=127,267;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,3:6,3:7,3,4,2
chr9	104449294	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=155,112;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:7,5:10,4:10,7,6,3
chr9	105757558	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr9	105757756	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr9	105765610	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	106857908	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr9	106864570	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,241;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:1,1,1,3
chr9	106885332	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=212,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,2:1,8:1,0,10,0
chr9	106894211	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=103,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr9	106896874	.	T	TATATTATAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=235,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATATTATAA;STR;TLOD=58.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.750:18:2,6:2,7:0,4,2,12
chr9	107266503	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=194,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr9	107266774	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,7,9
chr9	107267141	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=161,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:7,3,0,2
chr9	107267420	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=165,53;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,0:9,2:5,8,1,1
chr9	107267436	.	A	AAGATGGTGAGGACTGGGATTTAAT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=163,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:4,7,1,1
chr9	107361312	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=183,145;MMQ=40,27;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,5:6,2:5,5,4,3
chr9	107361439	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=210,148;MMQ=27,27;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.296:15:6,2:3,2:0|1:107361439_G_C:107361439:4,7,1,3
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chr9	107361451	.	GC	AG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=204,110;MMQ=34,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,0:4,1:0|1:107361439_G_C:107361439:2,6,1,2
chr9	107368000	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	107510145	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:4,7:3,0:0,7,0,8
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chr9	107531361	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,2:1,4:1,2,0,6
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chr9	107548570	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=188,86;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:8,1,2,0
chr9	107556793	.	T	TAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=18,20;RU=A;STR;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.927:9:0,4:0,1:0,0,2,7
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chr9	107558719	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:15,0:10,4:12,13,0,4
chr9	107562165	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=162,109;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,4:11,0:9,10,4,0
chr9	107564373	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,2:12,0:12,8,0,2
chr9	107566877	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,5:1,1:2,2,5,1
chr9	107571898	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=200,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:0,7,0,4
chr9	107586671	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=196,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr9	107586753	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=167,230;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.336:19:10,1:2,5:9,4,4,2
chr9	107593182	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:8,3:6,7:9,5,5,5
chr9	107593430	.	TAAAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=11,17;MFRL=208,292;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=A;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.283:5:0,0:0,0:0,4,0,1
chr9	107620867	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=124,179;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.472:15:6,3:2,4:6,2,5,2
chr9	107624123	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,1:1,2:1,1,1,4
chr9	108147627	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=42.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr9	108234163	.	GT	G,GTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,33,33;MFRL=162,210,127;MMQ=60,60,60;MPOS=27,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=3.13,7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,5:0.203,0.337:15:6,1,2:0,2,3:6,1,8,0
chr9	108234207	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=98,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.426:24:5,1:8,7:7,7,2,8
chr9	108296915	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:1,9,0,3
chr9	108296931	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,1:5,2:1,10,0,3
chr9	108363426	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=120,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.413:17:8,4:2,2:8,2,6,1
chr9	108456888	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=135,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:2,4:1,1:4,0,5,0
chr9	108483741	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=120,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr9	109686577	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=179,98;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:14,4:8,0:9,14,4,0
chr9	109689490	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr9	109689696	.	GG	CC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.366:17:6,2:3,2:0|1:109689696_GG_CC:109689696:2,9,6,0
chr9	109689700	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=183,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.313:17:8,0:3,1:0|1:109689696_GG_CC:109689696:3,9,5,0
chr9	109689704	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=189,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.261:17:7,0:5,1:0|1:109689696_GG_CC:109689696:3,10,4,0
chr9	109689710	.	AT	CC	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=180,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.208:17:7,0:7,1:0|1:109689696_GG_CC:109689696:3,11,3,0
chr9	109773401	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=142,363;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr9	110047132	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,12,8
chr9	110047316	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=51.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,1,13
chr9	110064265	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr9	110080967	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr9	110080976	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=205,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr9	110081018	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,6:4,6:5,4,9,3
chr9	110084417	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=177,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,1:6,2:2,9,1,2
chr9	110086149	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,12,8
chr9	110093970	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.695:17:3,3:2,8:4,1,6,6
chr9	110251157	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=169,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.376:11:0,1:3,1:5,2,4,0
chr9	111617006	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=164,53;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:0|1:111617006_T_C:111617006:12,7,1,1
chr9	111617012	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=150,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:111617006_T_C:111617006:12,5,1,1
chr9	111617015	.	CTG	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=150,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:111617006_T_C:111617006:12,5,1,1
chr9	111617020	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=150,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:8,0:7,2:0|1:111617006_T_C:111617006:12,5,1,1
chr9	111617544	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=308,258;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:111617544_C_T:111617544:0,1,1,0
chr9	111617552	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=308,258;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:111617544_C_T:111617544:0,1,1,0
chr9	111619266	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=155,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:4,0:1,6,1,2
chr9	111625117	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=188,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:10,1:2,1:3,9,2,0
chr9	111625215	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=202,153;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.285:23:7,0:5,6:7,10,0,6
chr9	111626090	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,325;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr9	111631381	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:12,0:7,7:10,9,1,6
chr9	111637289	.	A	AGC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=134,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:0|1:111637289_A_AGC:111637289:2,5,1,1
chr9	111637290	.	TAC	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=147,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:4,0:3,2:0|1:111637289_A_AGC:111637289:2,6,1,1
chr9	111637331	.	CC	AG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr9	111640524	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=190,296;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr9	111641627	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr9	111641911	.	GAACT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AACT;STR;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr9	111644528	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=191,140;MMQ=60,31;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr9	111653460	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=161,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:6,2:11,3:13,4,3,2
chr9	111655333	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=119,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:9,4,1,1
chr9	111655339	.	AAGC	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=120,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:3,2:7,0:0|1:111655339_AAGC_A:111655339:8,3,1,1
chr9	111655343	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=120,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,2:6,0:0|1:111655339_AAGC_A:111655339:8,3,1,1
chr9	111670513	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=265,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,3:2,4:2,0,7,0
chr9	111670707	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=129,248;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:4,2:11,3:3,12,0,5
chr9	111678428	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,2:10,0:9,5,2,0
chr9	111679747	.	CAAAA	C,CAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34,32;MFRL=112,186,132;MMQ=60,60,40;MPOS=14,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:0,1,0:2,0,1:2,1,2,0
chr9	111712910	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,5,9
chr9	111712924	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=209,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:1,1,2,7
chr9	111735141	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=21,26;MFRL=154,162;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.384:3:0,1:1,0:0|1:111735141_T_A:111735141:2,0,0,1
chr9	111735142	.	G	GAAC	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,32;MFRL=154,162;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:111735141_T_A:111735141:2,0,0,1
chr9	111735143	.	G	GAAGACCTTC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=154,162;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:111735141_T_A:111735141:2,0,0,1
chr9	111735146	.	G	GCT	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=35,32;MFRL=154,162;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:111735141_T_A:111735141:2,0,0,1
chr9	111735147	.	G	GCAAT	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=154,162;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:111735141_T_A:111735141:2,0,0,1
chr9	111735150	.	GGA	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=196,162;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111735141_T_A:111735141:1,0,0,1
chr9	111735156	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:111735141_T_A:111735141:0,0,0,1
chr9	111735157	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:111735141_T_A:111735141:0,0,0,1
chr9	111745671	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=180,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:3,0:1,4:0,5,0,4
chr9	111754950	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=129,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:8,1:4,3:9,4,3,1
chr9	111775502	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=128,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,4:1,8:1,0,12,0
chr9	111782670	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=128,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,9:1,6:1,1,11,4
chr9	111798423	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=216,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.550:9:2,2:1,3:3,1,5,0
chr9	111798751	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,1,8
chr9	111800234	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr9	111812603	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=223,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.563:18:4,4:2,6:2,6,4,6
chr9	111812825	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,6:0,8:0,0,8,6
chr9	111843055	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr9	111849692	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=238,232;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr9	111868885	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:1,6:0,9:0,1,2,13
chr9	111870811	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,2:8,0:9,14,1,1
chr9	111882167	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	111899743	.	TTCCC	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=130,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:10,2:3,0:0|1:111899743_TTCCC_T:111899743:8,6,1,1
chr9	111899748	.	ATCAAT	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=130,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:11,2:3,0:0|1:111899743_TTCCC_T:111899743:9,6,1,1
chr9	111899757	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=129,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0|1:111899743_TTCCC_T:111899743:8,4,1,1
chr9	111899928	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr9	111929080	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:111929080_A_G:111929080:0,0,1,0
chr9	111929084	.	C	CCGGGGGGGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:111929080_A_G:111929080:0,0,1,0
chr9	111936732	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr9	111936788	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=147,270;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:4,3,1,1
chr9	111945166	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr9	111962418	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=208,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr9	112015790	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=189,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,0:9,3:8,9,2,1
chr9	112020668	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr9	112025473	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr9	112168727	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,238;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:6,4,2,0
chr9	112170701	.	T	TAAAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAC;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.772:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	112172477	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=266,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:1,9:0,8:1,0,10,7
chr9	112182644	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=247,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr9	112182851	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=201,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:8,2:11,0:7,12,0,2
chr9	112190808	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=210,186;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,1:1,0:5,0,1,0
chr9	112199146	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,4:4,2:5,3,4,2
chr9	112225552	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=197,209;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.340:10:5,2:1,1:6,1,3,0
chr9	112225661	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=127,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,0:12,2:9,16,0,2
chr9	112642756	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=176,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,2:3,2,1,1
chr9	112694287	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:3,4,0,2
chr9	112898327	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	112899109	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=166,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,3:11,0:10,7,1,2
chr9	112899361	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=65,165;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:0,6:2,10:2,0,6,10
chr9	112899369	.	ACAG	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CAG;STR;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,1:6,2:4,6,2,1
chr9	112900301	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=191,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:4,5:12,0:8,8,5,0
chr9	112918531	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=206,241;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr9	112918581	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=161,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:3,5:7,6:9,1,8,3
chr9	112918815	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,4:7,3:1,9,1,6
chr9	113013588	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=130,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:1,8:9,3:7,4,9,2
chr9	113018600	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,12;MFRL=183,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:113018600_G_C:113018600:2,0,2,0
chr9	113018603	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=18,24;MFRL=186,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:0,0:0|1:113018600_G_C:113018600:3,0,2,0
chr9	113018606	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=26,12;MFRL=183,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:1,0:0|1:113018600_G_C:113018600:4,0,2,0
chr9	113018609	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=183,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,0:0|1:113018600_G_C:113018600:4,0,2,0
chr9	113018611	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,10;MFRL=183,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:113018600_G_C:113018600:4,0,1,0
chr9	113018625	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=17,22;MFRL=144,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.515:6:0,2:1,0:0|1:113018600_G_C:113018600:3,0,3,0
chr9	113086232	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=94,118;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.201:33:14,0:12,6:17,10,0,6
chr9	113088412	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=164,175;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:4,6:11,0:10,5,6,0
chr9	113091653	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=187,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr9	113096565	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=137,132;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:15,3:16,0:16,15,3,0
chr9	113137562	.	TTCTGAG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=214,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.647:12:2,2:1,6:3,1,8,0
chr9	113137745	.	T	TAAAAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=25,30;RU=A;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.887:5:0,0:0,2:0,0,1,4
chr9	113139489	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=168,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr9	113141815	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr9	113166697	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=142,207;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:3,2,4,4
chr9	113169630	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr9	113192467	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=253,314;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr9	113192655	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=209,162;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,1:8,1:7,6,1,1
chr9	113213726	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=128,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.840:10:1,4:0,4:0,1,4,5
chr9	113219727	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=235,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr9	113228096	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=150,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.670:7:2,2:0,3:0|1:113228096_T_C:113228096:2,0,3,2
chr9	113228098	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.272:9:3,2:4,0:1|0:113228096_T_C:113228096:4,3,2,0
chr9	113233956	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=227,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr9	113234618	.	CAG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=118,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:4,3:4,2:5,3,1,4
chr9	113275432	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,14;MFRL=80,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:113275432_C_G:113275432:0,2,0,1
chr9	113275436	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,11;MFRL=80,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:113275432_C_G:113275432:0,2,0,1
chr9	113275438	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,18;MFRL=80,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:113275432_C_G:113275432:0,2,0,1
chr9	113275445	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,21;MFRL=80,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:113275432_C_G:113275432:0,2,0,1
chr9	113276346	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=159,68;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,2:13,0:0|1:113276346_T_C:113276346:10,9,0,2
chr9	113276356	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,68;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:4,2:16,0:0|1:113276346_T_C:113276346:10,11,0,2
chr9	113449377	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=114,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,1:8,1:5,6,1,1
chr9	113530246	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,2:9,0:9,6,1,1
chr9	113547322	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=248,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:1,1,0,3
chr9	113562629	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,89;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:7,4:14,0:15,6,4,0
chr9	113563021	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:15,7:7,0:4,19,7,0
chr9	113637662	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=282,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:4,0,4,1
chr9	114124456	.	GAA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=57,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:0,1:4,1:3,1,0,2
chr9	114125835	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=220,222;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:3,1:6,0,1,1
chr9	114136169	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:3,1,5,1
chr9	114138702	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=156,253;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:10,2:2,0:8,4,1,1
chr9	114146686	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=269,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr9	114148835	.	G	GACAACCCCCAACTCAGACCTCTAAC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,1:0.421:7:1,1:0,0:0|1:114148835_G_GACAACCCCCAACTCAGACCTCTAAC:114148835:0,6,0,1
chr9	114148840	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=178,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114148835_G_GACAACCCCCAACTCAGACCTCTAAC:114148835:0,1,0,1
chr9	114148842	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=178,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114148835_G_GACAACCCCCAACTCAGACCTCTAAC:114148835:0,1,0,1
chr9	114151916	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=158,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,0:8,3:13,7,1,2
chr9	114152408	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=118,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,1:3,2:0|1:114152408_C_T:114152408:2,7,1,2
chr9	114152416	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=150,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,1:2,2:0|1:114152408_C_T:114152408:0,7,1,2
chr9	114155899	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,1:6,2:5,6,3,0
chr9	114170785	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=123,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.545:7:1,3:1,1:2,1,4,0
chr9	114173163	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=201,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr9	114184259	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,4:5,1:4,3,3,2
chr9	114185613	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,1,2
chr9	114293072	.	TATATATATAC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,234;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114293072_TATATATATAC_T:114293072:0,0,1,0
chr9	114293097	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=145,234;MMQ=60,40;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.506:2:0,0:1,1:0|1:114293072_TATATATATAC_T:114293072:1,0,1,0
chr9	114304121	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=142,142;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:18,0:11,4:7,22,0,4
chr9	114304739	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:11,0:11,3:0|1:114304739_T_A:114304739:8,14,0,3
chr9	114304743	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:9,0:9,3:0|1:114304739_T_A:114304739:8,12,0,3
chr9	114326505	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,36;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:16,2:10,0:20,6,2,0
chr9	114326547	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=125,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.361:28:12,5:6,4:7,11,2,8
chr9	114326557	.	T	TTTA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=TTA;STR;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.909:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr9	114348513	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=225,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr9	114355352	.	T	TCTGGCATGGGAGTGGCCTCTGCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=257,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	114409550	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=116,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,5:3,6:3,6,6,5
chr9	114412261	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=203,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr9	114467476	.	CAT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AT;STR;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.162:35:18,4:7,1:26,4,5,0
chr9	114484592	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	114484682	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=198,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:7,9:6,5:4,9,9,5
chr9	114484892	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=199,175;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:0|1:114484892_G_A:114484892:1,11,0,2
chr9	114484905	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=204,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:0|1:114484892_G_A:114484892:1,9,0,2
chr9	114486219	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=153,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:0,5,1,1
chr9	114489887	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:4,3,0,2
chr9	114521630	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=297,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr9	114543400	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=196,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,5:3,2:0,4,1,6
chr9	114659643	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:2,2:8,0:0,10,1,1
chr9	114659661	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,1:6,1:0,7,0,2
chr9	114695087	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:2,4:8,3:8,2,4,3
chr9	114873955	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,2:14,1:19,6,2,1
chr9	114919707	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr9	114919769	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=128,178;MMQ=60,43;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,3:6,0:7,3,3,0
chr9	114989616	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=237,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:6,0,5,0
chr9	114989723	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=148,148;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.195:39:13,7:18,0:17,15,7,0
chr9	114990841	.	T	TTATACTATA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=228,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,1:0,3,0,6
chr9	114993790	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr9	115024695	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=212,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:2,3:3,1,5,0
chr9	115024971	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=244,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr9	115030570	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	115038100	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=186,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.783:21:1,10:3,7:2,2,12,5
chr9	115060100	.	A	AC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=182,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.480:19:5,5:5,4:7,3,5,4
chr9	115060205	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=146,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:15,1:8,3:10,13,0,4
chr9	115092624	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=210,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:1,6:1,11:2,0,14,3
chr9	115142330	.	CG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=297,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:0,6:2,7:2,0,13,0
chr9	115142507	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=95.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,12:0,0,11,17
chr9	115216222	.	GATTA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTA;STR;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.776:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	115232670	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:10,3:7,0:12,5,2,1
chr9	115381041	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=193,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:9,0:13,3:13,9,0,3
chr9	115567015	.	A	ATG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr9	115593028	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=133,96;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.291:29:7,8:13,0:11,10,8,0
chr9	115593239	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr9	115598447	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr9	115651925	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=147,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:7,7,2,0
chr9	115652255	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:3,6,2,5
chr9	115759854	.	CTT	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.416:22:4,2:9,7:0|1:115759854_CTT_C:115759854:8,5,5,4
chr9	115759857	.	T	TGGA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.416:22:3,2:9,7:0|1:115759854_CTT_C:115759854:8,5,5,4
chr9	115760586	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	115811835	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=337,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,0:1,6:0,1,2,4
chr9	115920099	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=173,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:4,6:0,10:0,4,7,9
chr9	115928275	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr9	115933978	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=174,126;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:6,3:7,2:0|1:115933978_G_A:115933978:12,1,2,3
chr9	115933980	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=174,126;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.299:18:5,3:6,1:0|1:115933978_G_A:115933978:12,1,2,3
chr9	115934022	.	A	AACCTGGATT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:1,4:0,6:1,0,4,8
chr9	115935663	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:11,1,2,0
chr9	115936903	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=167,289;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:0,10,0,4
chr9	115938750	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=181,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,2:4,3:4,0,5,0
chr9	115946500	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=193,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:4,1,5,0
chr9	115946892	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:4,1:4,5:7,1,3,3
chr9	115950706	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,21:0.632:33:7,15:4,5:6,6,12,9
chr9	115950778	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,2:7,3:4,11,2,3
chr9	115952895	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=175,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.686:17:1,7:4,5:1,4,1,11
chr9	115959199	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=215,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:4,4:2,7:4,2,5,6
chr9	115961059	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=197,135;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.381:11:3,0:4,4:7,0,3,1
chr9	115965339	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=184,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,0:0,1,0,2
chr9	115968678	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=253,70;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr9	115968797	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,2:6,1:6,4,3,0
chr9	115968932	.	ACAGAAGTGGGAACAACAGTCATTCAGCCTCTAGG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=192,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr9	115969423	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=131,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr9	115969433	.	T	TAGA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr9	115973685	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=103,299;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr9	116019331	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:9,7:5,0:14,0,7,0
chr9	116029586	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,301;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	116038178	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=183,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:116038178_A_G:116038178:0,5,0,2
chr9	116038180	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=183,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:116038178_A_G:116038178:0,5,0,2
chr9	116045311	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr9	116048977	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,2:5,2:7,7,2,2
chr9	116091268	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=175,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:1,1:2,1,0,2
chr9	116091342	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=202,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:3,1:0,1:0,3,0,3
chr9	116093394	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=171,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,4:4,0:1,6,0,4
chr9	116116483	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=108,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:0,3:2,2:1,1,4,2
chr9	116116626	.	C	A,G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=36,31,31;MFRL=200,253,132;MMQ=60,60,60;MPOS=18,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.85,37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,12:0.143,0.619:18:2,1,7:2,1,5:1,3,8,6
chr9	116124523	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=203,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,3:1,4:2,0,7,0
chr9	116124659	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=125,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:15,4:16,0:10,21,4,0
chr9	116130510	.	ATC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=230,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,7:1,1:0,2,6,2
chr9	116183301	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=135,244;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,6:0,2:1,0,8,0
chr9	116184807	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=192,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:116184807_G_T:116184807:3,0,1,0
chr9	116184828	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=192,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,1:2,0:0|1:116184807_G_T:116184807:2,1,1,0
chr9	116187419	.	C	CAGG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:5,2:3,0:0|1:116187419_C_CAGG:116187419:0,8,1,1
chr9	116187420	.	T	TATCTGCAGGCACAGA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:5,2:3,0:0|1:116187419_C_CAGG:116187419:0,8,1,1
chr9	116187422	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:2,0:0|1:116187419_C_CAGG:116187419:0,8,1,1
chr9	116190531	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=99,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:3,6:3,3:2,4,1,9
chr9	116191223	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=72,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,0:5,4:4,8,0,4
chr9	116191667	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=169,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,4:6,2:5,3,6,0
chr9	116224452	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=144,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,4:8,1:9,8,2,3
chr9	116241707	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,3:3,8:4,2,6,5
chr9	116246535	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=128,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:2,5:6,3:3,5,2,6
chr9	116246613	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=220,155;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	116247994	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=133,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,7:2,4:3,5,2,9
chr9	116267829	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=105,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.289:12:6,1:2,1:2,7,2,1
chr9	116269520	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=144,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:3,1,3,0
chr9	116269892	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=190,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=59.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.741:25:5,10:1,9:4,2,8,11
chr9	116356430	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:3,4,2,2
chr9	116764832	.	TTTTGCAC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=227,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr9	116764883	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=220,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CT;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,1:0,0:0,1,1,1
chr9	116791233	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=167,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:1,5,0,4
chr9	116810890	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=285,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr9	116822610	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,8,12
chr9	116822620	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=201,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,2:6,4:4,7,0,6
chr9	116822650	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=152,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,3:0,8,0,4
chr9	116854361	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=219,245;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,1,4
chr9	116855675	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:12,4,1,1
chr9	116857234	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr9	116857656	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=202,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,4:0,0:0,1,0,4
chr9	116858431	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=189,105;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:13,6:9,1:12,10,7,0
chr9	116858625	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:4,4:3,8:5,2,8,4
chr9	116859769	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=143,245;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,1,2
chr9	116945381	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:2,4:9,6:4,7,6,4
chr9	116945454	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:0,1,0,7
chr9	116967263	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=140,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:0|1:116967263_T_G:116967263:1,0,8,0
chr9	116967270	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=181,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:2,2:1,4:0|1:116967263_T_G:116967263:3,0,6,0
chr9	116967952	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr9	116971709	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:2,4,5,2
chr9	116971809	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:5,3,2,0
chr9	116980145	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=132,128;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr9	116984665	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr9	116997994	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr9	117026581	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=238,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:0,1,7,1
chr9	117027165	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,4:6,2:6,4,5,1
chr9	117033096	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=262,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:1,7:1,8:0,2,6,10
chr9	117037915	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,2:2,3:7,0,5,0
chr9	117044458	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,4:3,6:5,1,8,2
chr9	117044484	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.664:19:4,5:2,7:5,1,9,4
chr9	117051614	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=109,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:1,8:5,1:3,3,6,3
chr9	117054542	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr9	117064306	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,1:4,4:4,5,2,3
chr9	117073006	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:2,2:3,2:0,5,1,4
chr9	117099292	.	T	TGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=117,278;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:117099292_T_TGG:117099292:0,2,2,0
chr9	117099297	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=117,323;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:117099292_T_TGG:117099292:0,2,1,0
chr9	117099301	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=117,323;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:117099292_T_TGG:117099292:0,2,1,0
chr9	117103917	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.259:16:6,1:3,0:9,3,0,4
chr9	117104450	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=198,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:0,3,0,3
chr9	117108122	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,1:8,1:9,3,2,0
chr9	117113222	.	T	TGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,15;MFRL=165,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=5,17;RU=G;STR;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.382:11:2,0:5,0:0|1:117113222_T_TGGGGGGGGGGGG:117113222:7,0,0,4
chr9	117113228	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,18;MFRL=165,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.382:11:1,1:5,1:0|1:117113222_T_TGGGGGGGGGGGG:117113222:7,0,0,4
chr9	117121840	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr9	117122202	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.927:25:1,11:0,13:1,0,15,9
chr9	117139741	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=172,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:6,2:9,7,1,1
chr9	117168551	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.767:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr9	117168810	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:8,0:8,5:6,10,0,7
chr9	117186547	.	CG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:8,0,2,1
chr9	117187505	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=263,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:117187505_A_T:117187505:0,1,0,1
chr9	117187513	.	T	TTTTTAAAACAAAATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=263,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:117187505_A_T:117187505:0,1,0,1
chr9	117350095	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,1:12,1:12,8,0,2
chr9	117390300	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=113,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,2:0,8:1,0,7,3
chr9	117400769	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:3,2,2,0
chr9	117553249	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=200,126;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:2,3:1,7:2,1,7,3
chr9	117568049	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:7,3:9,3:13,3,5,1
chr9	117783551	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=172,265;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.241:15:7,1:4,1:2,10,0,3
chr9	117791617	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,3:7,0:5,7,2,1
chr9	117797394	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=228,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr9	117800472	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=217,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr9	117803185	.	A	AAC,AACAC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,28,30;MFRL=189,250,189;MMQ=60,60,60;MPOS=25,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=AC;STR;TLOD=6.61,27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,9:0.185,0.472:19:5,1,5:2,1,3:3,4,10,2
chr9	117804544	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:9,2:15,2:12,13,3,1
chr9	117804667	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=172,241;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:1,18,0,2
chr9	117836188	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr9	117844239	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,5:0,2:0,1,0,7
chr9	117846450	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=219,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,4:2,5:4,0,9,0
chr9	117848112	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=200,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:0,10:1,6:1,0,15,1
chr9	117849641	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=326,279;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr9	118163498	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=229,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:4,5,3,4
chr9	118164375	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,31,29,32;MFRL=186,182,158,171;MMQ=60,60,60,60;MPOS=9,3,12;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=T;STR;TLOD=11.90,4.08,3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:15,5,3,3:0.189,0.137,0.093:26:4,0,2,1:8,5,1,1:10,5,9,2
chr9	118916379	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	118969686	.	T	TTATTTAAATAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:3,1:1,2:4,1,3,1
chr9	118989926	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	119129826	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr9	119139796	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=209,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:2,2:7,1:8,1,3,0
chr9	119139972	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:0,13,1,1
chr9	119202903	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=170,209;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:9,0:19,2:11,17,0,2
chr9	119204638	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=179,255;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr9	119491277	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:3,3,4,1
chr9	119582838	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=192,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:5,2:3,4:6,2,6,0
chr9	119582872	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:3,4:4,9:5,2,8,5
chr9	119738890	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr9	119770551	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.937:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr9	119770599	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=223,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:1,9,0,2
chr9	119903506	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr9	119903807	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr9	119977051	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr9	120466929	.	CAA	C,CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34,33;MFRL=0,253,228;MMQ=60,60,60;MPOS=12,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=8.03,15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,6:0.357,0.566:10:0,2,3:0,2,3:0,0,0,10
chr9	120471058	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr9	120475302	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=238,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,3:5,1:6,5,3,1
chr9	121971069	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=126,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,1:5,4:2,10,4,1
chr9	122001000	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:2,9:2,6:1,3,5,10
chr9	122004545	.	GAGGACAGGGAT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=265,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,7:1,2:0,2,1,8
chr9	123152099	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:6,3:9,4:7,8,2,5
chr9	123156742	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=193,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,2:1,0:5,0,2,0
chr9	123156761	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=100,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:4,1,3,0
chr9	123171656	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=253,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr9	123182170	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=184,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:13,2:12,2:16,9,1,3
chr9	123232511	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:4,0:4,3:4,12,0,3
chr9	123280950	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr9	123313246	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr9	123421879	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:1,7,0,2
chr9	123453653	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=221,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:9,5:5,0:10,5,2,3
chr9	123533885	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=225,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:123533885_TA_T:123533885:0,2,0,1
chr9	123533889	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=225,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:123533885_TA_T:123533885:0,2,0,1
chr9	123533894	.	A	AGCCGAGATGGCGCCAATGCACGCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=186,252;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.485:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr9	123540541	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=605120,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr9	123550027	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=196,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.833:16:2,9:0,5:1,1,8,6
chr9	123631642	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,2:6,2:2,6,0,4
chr9	123632829	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=233,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.808:24:1,7:3,13:3,1,5,15
chr9	123632841	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=192,251;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:2,2:9,3:3,8,1,4
chr9	123673890	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	123676482	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=192,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,3:3,5:4,0,5,3
chr9	123688217	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:10,5:7,2:9,8,3,4
chr9	123716103	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,2:6,5:7,3,3,4
chr9	123725926	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=185,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:7,7:8,5:9,6,8,4
chr9	123725956	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=168,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:12,2:17,1:17,12,0,3
chr9	123726029	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=185,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,1:5,4:5,5,0,5
chr9	123731408	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:6,2:8,6:5,9,5,3
chr9	123737040	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,0:4,9:3,6,7,2
chr9	123742565	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,0:5,6:0,9,0,6
chr9	123744236	.	T	TATGCCCTATCGCCA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=111,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,2:6,0:3,6,1,1
chr9	123744252	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=98,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:0,3:2,1:1,2,0,4
chr9	123753600	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:7,3:9,2:2,14,1,4
chr9	123758497	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:4,0:6,16:5,5,16,0
chr9	123758632	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,1:5,2:0,7,0,3
chr9	123760111	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=316,148;MMQ=60,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:123760111_TG_CA:123760111:0,3,0,1
chr9	123760115	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=236,148;MMQ=60,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:123760111_TG_CA:123760111:0,2,0,1
chr9	123760120	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=236,148;MMQ=60,46;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:123760111_TG_CA:123760111:0,2,0,1
chr9	123776390	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=190,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,2:5,1:1,7,0,3
chr9	123778688	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:2,0:6,3:2,6,0,4
chr9	123783993	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=163,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,1:6,4:5,7,1,4
chr9	123787697	.	T	TACAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=212,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=AC;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,1:2,0,3,0
chr9	123876029	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,1,1
chr9	123880570	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=158,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr9	123886277	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:10,2:10,1:10,10,1,2
chr9	123908345	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=247,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:2,0,3,1
chr9	123914874	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=140,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:14,3:6,5:11,9,3,5
chr9	123914929	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=171,101;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:7,3:14,0:10,11,3,0
chr9	123927477	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=205,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr9	123928486	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=318,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,1:0,3:0,2,2,2
chr9	123929686	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=188,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0|1:123929686_T_G:123929686:2,0,6,0
chr9	123929710	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:0|1:123929686_T_G:123929686:4,1,6,0
chr9	123929802	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.179:20:6,2:11,0:0|1:123929802_G_A:123929802:9,8,0,3
chr9	123929811	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=160,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.188:19:6,2:10,0:0|1:123929802_G_A:123929802:7,9,0,3
chr9	123937240	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=203,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,1:7,4:10,4,5,0
chr9	123952854	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=127,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:6,0:9,8,2,0
chr9	123955765	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=234,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,5:1,3:0,4,0,8
chr9	124044129	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=136,127;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:20,4:9,0:14,16,4,0
chr9	124045949	.	GTTCA	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TTCA;STR;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:3,3:2,4:0|1:124045949_GTTCA_G:124045949:3,3,2,5
chr9	124045957	.	ATT	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=165,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,6:0.242:27:9,4:11,2:1|0:124045949_GTTCA_G:124045949:10,11,3,3
chr9	124045960	.	CATTCATTCATTCAT	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=165,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,6:0.242:27:8,4:12,2:1|0:124045949_GTTCA_G:124045949:10,11,3,3
chr9	124046830	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=50.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.809:19:2,8:1,8:2,1,10,6
chr9	124073176	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=122,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:1,2,0,4
chr9	124074856	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,25;MFRL=363,213;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,1:0,0:0,1,0,2
chr9	124076329	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,2:7,1:1,13,1,2
chr9	124088768	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:2,9:1,5:2,1,9,5
chr9	124089173	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=216,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr9	124091135	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,4:0,5:1,0,7,2
chr9	124584920	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,16;MFRL=168,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,0:6,0:8,1,0,2
chr9	124632735	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,3:1,0,3,2
chr9	124633096	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=202,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,2:2,4:0,2,1,6
chr9	124906456	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,289;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:4,1:5,3:8,2,4,0
chr9	124906723	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,254;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:4,2:1,8,0,3
chr9	124910582	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=110,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,0:6,4:5,6,0,4
chr9	124929161	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,1:8,1:11,10,0,2
chr9	124929211	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,3:1,1:5,2,1,3
chr9	124962232	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=179,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:3,0:10,1:0|1:124962232_C_A:124962232:6,9,1,1
chr9	124962238	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=185,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:10,2:0|1:124962232_C_A:124962232:6,8,1,1
chr9	124962240	.	G	GAAATTAAAATTGCTAA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=185,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:9,2:0|1:124962232_C_A:124962232:6,8,1,1
chr9	124976475	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	124989573	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	125048044	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:13,0:7,3:9,11,2,1
chr9	125133479	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr9	125133507	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=192,87;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,3,1
chr9	125140206	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,2:6,3:4,6,3,2
chr9	125143637	.	ACC	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=165,65;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=C;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:3,0:10,2:0|1:125143637_ACC_A:125143637:9,5,1,1
chr9	125143646	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=162,65;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,0:11,2:0|1:125143637_ACC_A:125143637:9,6,1,1
chr9	125148748	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=173,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.340:18:4,0:8,5:5,7,6,0
chr9	125273385	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=200,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:5,3:3,2:2,6,2,3
chr9	125282393	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=112,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr9	125315376	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=216,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr9	125390799	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=129,97;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,1:3,1,2,1
chr9	125391290	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=230,41;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:125391290_C_A:125391290:4,4,1,1
chr9	125391294	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=231,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:125391290_C_A:125391290:5,4,1,1
chr9	125391297	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=231,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:125391290_C_A:125391290:5,4,1,1
chr9	125391300	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=231,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:125391290_C_A:125391290:5,4,1,1
chr9	125391770	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.733:9:2,6:0,1:0,2,6,1
chr9	125437902	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=174,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:4,9,0,2
chr9	125438351	.	TCTA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=252,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:125438351_TCTA_T:125438351:0,4,0,1
chr9	125438356	.	A	ATTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=252,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:125438351_TCTA_T:125438351:0,4,0,1
chr9	125438392	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=231,270;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.566:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr9	125512193	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=228,194;MMQ=56,40;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,5:1,4:0,2,4,5
chr9	125512438	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,332;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:2,6,2,0
chr9	125512826	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=242,178;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,8:1,3:1,2,5,6
chr9	125551167	.	TTA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=232,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr9	125618080	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=211,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,1:3,1:7,3,2,0
chr9	125620105	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=36.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr9	125622163	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=113,135;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.276:5:3,0:1,1:4,0,1,0
chr9	125637471	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,8:0,0,9,11
chr9	125659520	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr9	125673051	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=144,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,5:5,6:6,3,6,5
chr9	125674163	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:8,3:22,0:14,16,3,0
chr9	125747038	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr9	125752529	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:7,2:2,2:2,7,0,4
chr9	125760863	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=137,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,3:5,5:4,3,6,2
chr9	125761051	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=195,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr9	125797918	.	CGTGTGTGT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=GT;STR;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.787:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	125860942	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=154,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,3:6,0:11,7,3,0
chr9	125861038	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,2:6,0:6,8,0,2
chr9	125861695	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=181,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:3,1,1,2
chr9	125861888	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr9	125875138	.	A	AAGGGGC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=154,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGGGGC;STR;TLOD=56.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:4,3:2,8:4,3,7,7
chr9	125895271	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,2:13,0:3,21,0,2
chr9	125898643	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=134,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:4,3,1,1
chr9	125901860	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=154,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:11,0:14,3:12,14,0,3
chr9	125932152	.	CATAT	C,CATATAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31,34;MFRL=137,182,99;MMQ=60,60,60;MPOS=10,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,7,10;RU=AT;STR;TLOD=3.19,6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.249,0.454:4:0,0,2:1,1,0:1,0,2,1
chr9	126118517	.	AGCAGAGC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=140,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCAGAGC;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr9	126118600	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=172,58;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:3,3:3,2:4,2,2,3
chr9	126125539	.	A	AGTTCTGTAGTCAGACCAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=206,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	126128679	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	126129351	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	126139065	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=218,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:4,2,3,1
chr9	126143662	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=106,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,0:5,2:4,3,2,0
chr9	126145907	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr9	126146138	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=129,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,2:7,2:3,6,3,1
chr9	126146197	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr9	126202551	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr9	126202641	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,91;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,3:7,0:8,5,0,3
chr9	126202858	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=308,293;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:1,2:0,2,0,2
chr9	126217128	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=215,120;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.503:6:2,1:0,1:0,3,0,3
chr9	126439100	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr9	126531755	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,1:1,1:3,2,2,0
chr9	127076127	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,2,1
chr9	127089775	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=186,281;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:1,8,1,1
chr9	127160698	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=207,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:6,4,2,2
chr9	127177736	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=228,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=94.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,30:0.862:34:0,17:4,13:0,4,10,20
chr9	127230118	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=239,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,1,2
chr9	127237915	.	G	GGAGTGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=203,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,2:1,0:2,2,1,1
chr9	127244955	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	127244981	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.765:2:0,0:0,1:0|1:127244981_G_C:127244981:0,0,2,0
chr9	127244984	.	CAGG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:127244981_G_C:127244981:0,0,2,0
chr9	127253323	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=216,230;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:5,0:2,5,0,3
chr9	127255448	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.711:12:1,2:2,6:0,3,3,6
chr9	127495508	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=253,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,5,0
chr9	127561559	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=138,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.926:25:0,16:1,8:1,0,15,9
chr9	127618752	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=190,292;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:1,4,1,1
chr9	127618776	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,4,5
chr9	127619553	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:2,4:5,0,5,0
chr9	127619625	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=36.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr9	127619922	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr9	127620141	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.315:11:5,1:1,2:8,0,3,0
chr9	127620244	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=154,151;MMQ=54,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.224:31:11,2:13,3:9,15,4,3
chr9	127620713	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.274:27:6,7:14,0:11,9,7,0
chr9	127636024	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:16,0:17,2:12,21,0,2
chr9	127637215	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=108.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,17:0,12:0,0,23,6
chr9	127644882	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,7:0,0,1,8
chr9	127652621	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=176,217;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,1:2,4:5,1,5,0
chr9	127661521	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:127661521_T_C:127661521:0,0,6,0
chr9	127661526	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:127661521_T_C:127661521:0,0,6,0
chr9	127700935	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=146,96;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:13,4:7,0:8,12,4,0
chr9	127733926	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=176,261;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,5:3,3:4,2,5,3
chr9	127733988	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=187,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,2:3,0:3,7,1,1
chr9	127765856	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=18,33;MFRL=166,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.466:5:1,1:0,1:0,3,0,2
chr9	127951072	.	CAAT	C,CAATAATAAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33,24;MFRL=192,174,123;MMQ=60,60,60;MPOS=15,0;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,11;RU=AAT;STR;TLOD=6.50,8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,5:0.215,0.469:10:2,1,0:1,1,2:3,0,7,0
chr9	127982775	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:4,4,4,2
chr9	127999466	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,3:6,0:1,11,0,3
chr9	128070112	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=110,60;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:5,2:0|1:128070112_T_A:128070112:7,6,0,2
chr9	128070116	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=110,60;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:6,0:6,2:0|1:128070112_T_A:128070112:7,5,0,2
chr9	128070227	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=141,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0,5,0,4
chr9	128094981	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=36,22;MFRL=196,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:128094981_C_A:128094981:0,7,0,2
chr9	128094983	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=196,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:128094981_C_A:128094981:0,7,0,2
chr9	128112896	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=214,327;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,0,2
chr9	128121592	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=192,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr9	128124798	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=207,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,5:0,2:1,0,7,0
chr9	128201098	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr9	128206717	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=180,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr9	128327891	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=69.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,15,4
chr9	128711809	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=203,263;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr9	128723169	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,1:11,1:3,18,0,2
chr9	128723221	.	GA	TC	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=186,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:3,2:4,7:0|1:128723221_GA_TC:128723221:0,7,0,10
chr9	128723223	.	CAG	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=186,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:3,3:4,7:0|1:128723221_GA_TC:128723221:0,7,0,10
chr9	128723226	.	A	ACTCT	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=186,232;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:3,3:4,6:0|1:128723221_GA_TC:128723221:0,7,0,9
chr9	128723228	.	TGGA	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=186,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:3,3:3,5:0|1:128723221_GA_TC:128723221:0,7,0,9
chr9	128724304	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=229,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:1,1,6,0
chr9	129097817	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr9	129102840	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,10:0.250:42:17,5:14,5:15,17,6,4
chr9	129102994	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=216,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:1,7,0,3
chr9	129143242	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr9	129143315	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=445,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,3,2
chr9	129184309	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,296;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr9	129265397	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=95,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:1,5:9,4:11,0,6,3
chr9	129265612	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=183,210;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr9	129377855	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=130,249;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:3,4,0,3
chr9	129455489	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=153,97;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:7,0:12,4:12,7,1,3
chr9	129599382	.	CA	C,CAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,34,32;MFRL=246,228,129;MMQ=60,60,60;MPOS=14,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=7.09,11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,7:0.210,0.413:16:1,3,2:2,0,3:3,3,7,3
chr9	129599551	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=179,223;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.213:20:10,3:6,0:5,11,0,4
chr9	129600010	.	G	GCCTTTTTTC	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=128,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:10,0:15,2:0|1:129600010_G_GCCTTTTTTC:129600010:9,18,0,2
chr9	129600011	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=128,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:10,0:15,2:0|1:129600010_G_GCCTTTTTTC:129600010:9,18,0,2
chr9	129600019	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=128,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:14,2:0|1:129600010_G_GCCTTTTTTC:129600010:8,17,0,2
chr9	129600117	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.643:13:5,1:0,6:5,0,6,2
chr9	129644607	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:6,2:8,3:5,9,2,3
chr9	129646763	.	GT	G,GTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34,27;MFRL=181,179,195;MMQ=60,60,60;MPOS=16,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.32,7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,4:0.199,0.364:11:1,1,0:3,1,2:2,3,1,5
chr9	129647855	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=162,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,0:8,5:2,9,3,2
chr9	129740101	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,1:2,8:0,6,1,8
chr9	129752239	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.247:22:11,1:6,4:8,9,4,1
chr9	129812469	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,205;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,0:5,8:0,12,0,8
chr9	129831455	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=157,282;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr9	129853917	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=132,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr9	129930892	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,297;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr9	129973050	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=149,1771;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,3:8,0:7,13,0,3
chr9	130075672	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=234,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:0,6:3,4:3,0,8,2
chr9	130083140	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=125,265;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr9	130094526	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=174,256;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:12,4,1,1
chr9	130100305	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=203,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,5:2,0:5,0,4,1
chr9	130116709	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=186,230;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,3:6,0:0,15,0,3
chr9	130127691	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=210,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.411:12:4,1:3,3:0,7,1,4
chr9	130149403	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=179,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,6:2,0:4,1,3,3
chr9	130155331	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,2:4,0:8,2,1,1
chr9	130164889	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,3:6,0:3,7,3,0
chr9	130166382	.	CG	GG,GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34,30;MFRL=184,194,217;MMQ=60,60,60;MPOS=10,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.43,3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,2:0.385,0.230:10:3,2,1:1,2,1:0,4,1,5
chr9	130169301	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=203,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr9	130169874	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=191,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:1,4,0,2
chr9	130206295	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=238,237;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:0,1:2,1,2,0
chr9	130209908	.	CCA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=199,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,0:7,3:7,6,2,1
chr9	130210111	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:4,2:9,3:5,8,2,3
chr9	130210541	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=221,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,5:8,1:9,3,5,1
chr9	130213110	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:14,7:3,3:9,8,2,8
chr9	130213508	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,7:6,2:7,2,9,0
chr9	130219669	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=90,168;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.498:23:6,5:5,6:9,3,7,4
chr9	130219743	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=186,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,4:3,2:0,4,1,5
chr9	130236243	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:2,4,1,3
chr9	130241374	.	G	GCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=235,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr9	130241822	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=269,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr9	130242109	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:4,2,3,1
chr9	130243377	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=253,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr9	130257652	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=172,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:10,3:9,1:10,9,1,3
chr9	130258160	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=209,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr9	130259618	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=135,179;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,7:3,5:2,3,2,10
chr9	130264990	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,17;MFRL=201,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.524:11:0,1:3,1:3,2,0,6
chr9	130269786	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	130286150	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=165,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.324:22:12,4:3,2:2,13,2,5
chr9	130341095	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=91,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr9	130341359	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=215,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr9	130420813	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=186,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr9	130430321	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=156,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:9,0,1,1
chr9	130474530	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=135,53;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,2:6,1:5,4,1,2
chr9	130474572	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:4,0:12,2:9,7,0,3
chr9	130477768	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=252,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:3,7:1,3:3,1,9,2
chr9	130482693	.	G	GTCACAAGTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=177,253;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,0:1,1:1,1,0,1
chr9	130485618	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=182,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,4:3,7:1,3,5,6
chr9	130486384	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=196,225;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.621:10:1,3:3,3:0|1:130486384_C_T:130486384:4,0,4,2
chr9	130486385	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=196,225;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.621:10:1,3:3,3:0|1:130486384_C_T:130486384:4,0,4,2
chr9	130488494	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr9	130488749	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=184,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.701:14:1,0:2,10:0,4,0,10
chr9	130489189	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=71,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,2,2
chr9	130489743	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=189,227;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr9	130489747	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,10;MFRL=208,308;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0,4,0,1
chr9	130491998	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=220,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr9	130492039	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	130493724	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	130494811	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=162,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,4:1,1:2,0,4,1
chr9	130495890	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	130506906	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=165,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:5,3:7,5,2,1
chr9	130507125	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:10,2:3,2:6,7,3,1
chr9	130509531	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,2:5,1:1,10,2,1
chr9	130524817	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	130548589	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=215,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr9	130549738	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=113,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:5,1,3,2
chr9	130565267	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr9	130570872	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=156,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:6,0:7,7,0,2
chr9	130575372	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,0:6,2:7,0,2,0
chr9	130578404	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=180,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr9	130579599	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=199,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:5,3:0,7,0,3
chr9	130581072	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,105;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:18,4:6,0:12,12,4,0
chr9	130586688	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.608:21:5,10:3,3:5,3,8,5
chr9	130587052	.	A	AGGGAGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGAGG;STR;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,1:1,4:2,0,7,0
chr9	130587079	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=152,81;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,1:7,1:7,2,2,0
chr9	130587907	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,367;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	130592102	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:3,0:6,2:1,9,0,2
chr9	130634944	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,4:3,2:6,2,5,1
chr9	130635765	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=160,56;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:0|1:130635765_T_TC:130635765:2,5,1,1
chr9	130635770	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,18;MFRL=160,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,1:4,0:0|1:130635765_T_TC:130635765:2,5,1,1
chr9	130635773	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=156,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:130635765_T_TC:130635765:2,4,1,1
chr9	130635777	.	CC	GG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=156,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:130635765_T_TC:130635765:2,4,1,1
chr9	130649111	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr9	130657020	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr9	130670652	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,14,3
chr9	130670903	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr9	130672221	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,18,2
chr9	130674467	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=174,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr9	130674675	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:8,7:8,1:6,10,8,0
chr9	130689380	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:6,2:14,0:13,7,2,0
chr9	130690310	.	T	TGCCCCCCCC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:4,1:5,5:0|1:130690310_T_TGCCCCCCCC:130690310:3,6,6,0
chr9	130690314	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:3,1:4,5:0|1:130690310_T_TGCCCCCCCC:130690310:3,6,6,0
chr9	130690318	.	CTG	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=148,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:5,1:5,4:0|1:130690310_T_TGCCCCCCCC:130690310:3,7,5,0
chr9	130690325	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.315:14:5,0:3,1:0|1:130690310_T_TGCCCCCCCC:130690310:2,8,4,0
chr9	130707601	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:5,0:11,3,1,1
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chr9	130715922	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,11,10
chr9	130742295	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:13,0:11,3:16,8,3,0
chr9	130854052	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr9	130854083	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr9	130854127	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr9	130861039	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,8:0,0,7,10
chr9	130863664	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:16,0:17,4:17,16,0,4
chr9	130868831	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr9	130869499	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,7,3
chr9	130885418	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=218,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr9	130886906	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,1,15
chr9	130913608	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.664:16:5,5:0,5:5,0,7,4
chr9	130914170	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=100,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:3,3:7,6:5,5,4,5
chr9	130914434	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr9	130931586	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=208,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr9	130932396	.	AAC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=162,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,7:2,3:0,2,4,6
chr9	130940121	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=187,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr9	130940822	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=214,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,1:1,6:0,2,1,6
chr9	130942972	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=238,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:2,7:1,3:3,0,10,1
chr9	130980404	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,2:6,1:8,0,3,0
chr9	130981064	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=212,245;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,0,3
chr9	130984430	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=188,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,4:2,4:3,2,5,4
chr9	131008812	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=175,128;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,0:4,6:2,7,0,7
chr9	131015279	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=163,216;MMQ=55,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr9	131019412	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:5,4:13,0:9,9,4,0
chr9	131019738	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=178,258;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,1:8,2:5,6,2,1
chr9	131020216	.	C	CGCCCCCCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=328,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131020216_C_CGCCCCCCCA:131020216:0,1,0,1
chr9	131020224	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=298,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:131020216_C_CGCCCCCCCA:131020216:1,1,0,1
chr9	131023105	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=191,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr9	131025248	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=345,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.659:4:0,1:1,0:0|1:131025248_A_C:131025248:0,1,3,0
chr9	131025251	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,8;MFRL=345,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.659:4:0,0:1,0:0|1:131025248_A_C:131025248:0,1,3,0
chr9	131025255	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,19;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.561:5:0,0:1,1:0|1:131025248_A_C:131025248:0,2,3,0
chr9	131025258	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,0:0|1:131025248_A_C:131025248:0,2,2,0
chr9	131028226	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=131,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,2:10,1:9,12,1,2
chr9	131073970	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr9	131083939	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=157,127;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:11,0:6,5:10,7,0,5
chr9	131095699	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=189,81;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,3:3,0:5,1,1,2
chr9	131104909	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=153,144;MMQ=51,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:8,9,2,0
chr9	131112573	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=133,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:3,5:8,3:5,6,4,4
chr9	131112670	.	AGGTGCCCAG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=189,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:3,2:6,0:6,3,0,2
chr9	131115486	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=180,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:13,1:5,1:9,9,0,2
chr9	131115599	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=193,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:4,3,3,2
chr9	131117898	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=200,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:2,2:0,0:2,1,1,1
chr9	131140213	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=135,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:4,2,2,0
chr9	131191113	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=155,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:4,3:7,0:4,7,1,2
chr9	131193665	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=243,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr9	131197996	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=134,101;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:3,5,2,1
chr9	131243768	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=154,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.382:8:1,0:2,0:5,0,3,0
chr9	131245175	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,24,35;MFRL=251,224,0;MMQ=60,40,60;MPOS=8,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,16,18;RU=T;STR;TLOD=3.36,3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.292,0.282:4:1,1,1:0,0,0:1,1,1,1
chr9	131247240	.	GA	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=120,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:131247240_GA_CC:131247240:0,2,0,1
chr9	131247243	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=120,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:131247240_GA_CC:131247240:0,2,0,1
chr9	131284914	.	TAAAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=146,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=23,19;RU=A;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:2,1:3,2,2,0
chr9	131298766	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=148,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0|1:131298766_AG_A:131298766:1,5,1,1
chr9	131298768	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=148,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0|1:131298766_AG_A:131298766:1,5,1,1
chr9	131337389	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=130,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr9	131337661	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	131339524	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=185,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:9,4:14,0:10,13,4,0
chr9	131340306	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	131340535	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,1:8,1:3,8,0,2
chr9	131344034	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,0:7,3:8,10,3,0
chr9	131346479	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr9	131346710	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=211,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr9	131347165	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0|1:131347165_G_A:131347165:0,0,6,10
chr9	131347169	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.645:15:3,6:2,3:0|1:131347165_G_A:131347165:2,3,4,6
chr9	131348171	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=172,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,0:9,2:5,9,2,0
chr9	131348312	.	TAGG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=137,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr9	131351024	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=185,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr9	131353989	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr9	131356538	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=141,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:3,6:5,4:5,3,6,4
chr9	131356744	.	C	CCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=219,230;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	131361149	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,4:1,1:6,0,4,1
chr9	131371849	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:9,5:21,0:23,7,5,0
chr9	131374165	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr9	131379967	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,6:1,3:2,3,5,4
chr9	131380225	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:7,0,5,1
chr9	131388643	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:3,0,8,0
chr9	131389060	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	131392553	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=138,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,3,1
chr9	131392670	.	G	GACACTGTTTATATTTTGTGAGTATAATATA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=134,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.268:10:2,2:5,0:4,4,1,1
chr9	131395563	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=110,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:10,5,1,1
chr9	131396018	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=202,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:3,1:7,2,3,1
chr9	131398343	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	131398518	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=223,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:3,2,1,2
chr9	131398540	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:4,3,1,2
chr9	131451969	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=12,20;MFRL=239,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,2:0,0:0,1,1,1
chr9	131453331	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr9	131454120	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=180,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.666:22:4,9:3,6:5,2,8,7
chr9	131454935	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:10,3:5,4:8,7,6,1
chr9	131455903	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=110,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,2:7,4:9,4,5,1
chr9	131456213	.	A	AGAT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=196,380;MMQ=40,37;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GAT;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.152:17:11,1:4,1:12,3,1,1
chr9	131456306	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=151,80;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.129:38:16,4:17,1:13,20,4,1
chr9	131456385	.	G	GTA,GTATA	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,32,31;MFRL=175,143,161;MMQ=60,60,60;MPOS=12,1;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,9,10;RU=TA;STR;TLOD=15.09,24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,7,9:0.315,0.405:22:4,4,2:2,2,6:0,6,1,15
chr9	131468251	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr9	131475951	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,2,8
chr9	131479023	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr9	131482467	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=300,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,2:2,9:1,2,7,4
chr9	131484801	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,1:7,2:11,7,3,0
chr9	131495681	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=95,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,3:2,3:4,3,4,2
chr9	131502112	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr9	131502440	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=186,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,4:0,3:0,2,2,5
chr9	131502460	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr9	131504847	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=119,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.139:19:10,2:7,0:11,6,1,1
chr9	131505092	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	131513442	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=154,145;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:6,1:3,3:4,5,1,3
chr9	131513448	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=154,145;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.231:14:7,0:4,2:6,5,0,3
chr9	131516220	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,103;MMQ=60,48;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.343:33:9,0:13,11:8,14,11,0
chr9	131550722	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr9	131553768	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr9	131570178	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=174,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:131570178_T_C:131570178:5,3,1,1
chr9	131570183	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0|1:131570178_T_C:131570178:0,0,5,5
chr9	131583170	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=213,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,1,2
chr9	131585205	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	131585994	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,5:1,5:1,0,10,0
chr9	131586318	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,3:5,1:5,0,3,1
chr9	131587240	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=161,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,1:5,3:5,5,3,1
chr9	131588888	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=156,101;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,4:3,5:1,3,5,4
chr9	131589234	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr9	131592150	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=209,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,2:2,3:0,5,1,4
chr9	131598396	.	G	GCACCACACCCAGCCCTTCAATATTTTTTAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=198,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.311:6:0,0:3,1:2,3,0,1
chr9	131600111	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr9	131607591	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=156,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,1:2,4:5,0,2,3
chr9	131669987	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=204,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:5,3,0,2
chr9	131689361	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=301,98;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,7:1,2:2,0,7,2
chr9	131709701	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:6,7:7,4:6,7,7,4
chr9	131735559	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr9	131743701	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=192,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.263:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr9	131745548	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=190,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,5:3,1:4,2,5,1
chr9	131761437	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=270,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:1,4:1,8:2,0,9,3
chr9	131761659	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=378,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:1,0,0,6
chr9	131761899	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=124,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,5:1,6:2,1,8,4
chr9	131772389	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,15:0,4:0,0,8,11
chr9	131772920	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=139,135;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.280:15:5,3:6,0:6,5,0,4
chr9	131798891	.	CG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,5,7
chr9	131802783	.	TG	AT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=165,79;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.248:30:13,0:9,7:13,10,1,6
chr9	131832594	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:4,3:10,6:5,9,4,5
chr9	131832604	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=161,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:9,0:15,3:8,16,1,2
chr9	131848382	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=198,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,4,1
chr9	131860744	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=196,236;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,7:5,0:6,2,7,0
chr9	131860901	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,2,15
chr9	131862073	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr9	131862705	.	AGG	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr9	131862730	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr9	131862781	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr9	131871144	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,3:0,10:0,0,2,12
chr9	131871435	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=70,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=64.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.827:21:0,10:3,8:3,0,13,5
chr9	131873222	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=218,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.832:16:1,5:1,8:2,0,11,3
chr9	131873256	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=130,225;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,1:12,2:13,9,2,1
chr9	131882706	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,273;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:131882706_G_A:131882706:0,0,1,0
chr9	131882722	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=169,273;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:131882706_G_A:131882706:2,0,1,0
chr9	131882761	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr9	131882961	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=223,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr9	131896999	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=168,341;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr9	131897221	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr9	131898880	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr9	131899846	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,13:0,0,8,14
chr9	131900180	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=261,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr9	131904636	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=224,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:7,0,3,0
chr9	131909781	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:1,5,0,2
chr9	131940019	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=318,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr9	131940561	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	132084885	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr9	132374601	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,0:3,3:7,2,1,2
chr9	132377728	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,1:2,3:7,1,4,0
chr9	132382253	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=206,408;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,2,0
chr9	132395245	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=202,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr9	132396281	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,3:4,2:5,4,2,3
chr9	132396655	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=197,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr9	132400270	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=165,109;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:4,0:11,4:9,7,0,4
chr9	132400288	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=172,109;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:7,0:11,4:0|1:132400288_G_C:132400288:11,7,0,4
chr9	132400296	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=162,109;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:3,0:10,1:0|1:132400288_G_C:132400288:9,6,0,4
chr9	132401824	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=226,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:2,2,1,3
chr9	132404304	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:0,4,2,4
chr9	132404339	.	G	GCATCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr9	132569617	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=178,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:11,4:10,0:9,12,1,3
chr9	132572569	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:4,16,0,2
chr9	132581246	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=88,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:132581246_C_CT:132581246:0,2,0,1
chr9	132581251	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=88,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:132581246_C_CT:132581246:0,2,0,1
chr9	132581253	.	CA	TT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=88,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:132581246_C_CT:132581246:0,2,0,1
chr9	132590373	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,84;MMQ=60,53;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:8,1,1,1
chr9	132594136	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,255;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:2,2:7,1:6,3,3,0
chr9	132620224	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr9	132620458	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:132620458_C_A:132620458:0,0,0,7
chr9	132620464	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:132620458_C_A:132620458:0,0,0,6
chr9	132620707	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr9	132623224	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=34,12;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:4,0:4,0:0|1:132623224_G_C:132623224:0,8,3,0
chr9	132623227	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:0|1:132623224_G_C:132623224:0,8,3,0
chr9	132623231	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=30,12;MFRL=198,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,1:4,0:0|1:132623224_G_C:132623224:1,8,3,0
chr9	132623235	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=27,23;MFRL=211,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,1:5,1:0|1:132623224_G_C:132623224:1,7,3,0
chr9	132623239	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=211,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,0:5,0:0|1:132623224_G_C:132623224:1,7,3,0
chr9	132623241	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=31,15;MFRL=211,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,0:5,0:0|1:132623224_G_C:132623224:1,7,3,0
chr9	132623243	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=27,16;MFRL=211,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,0:0|1:132623224_G_C:132623224:1,7,2,0
chr9	132623917	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr9	132625417	.	CA	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0,0,5,4
chr9	132625602	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,10:0,5:0,0,5,11
chr9	132627480	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr9	132627723	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr9	132630231	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr9	132630664	.	TGAC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAC;STR;TLOD=48.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr9	132630822	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,306;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr9	132632162	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr9	132635653	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr9	132635944	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr9	132640726	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=182,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.623:29:5,12:4,6:3,8,7,11
chr9	132652677	.	G	GGA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GA;STR;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr9	132652942	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:132652942_G_A:132652942:0,2,0,1
chr9	132652948	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,16;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:132652942_G_A:132652942:0,2,0,1
chr9	132652958	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:132652942_G_A:132652942:0,1,0,1
chr9	132658044	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr9	132665331	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=132,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr9	132665339	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:132665339_T_C:132665339:0,2,0,1
chr9	132665350	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=208,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:132665339_T_C:132665339:0,3,0,1
chr9	132671359	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	132678195	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr9	132686233	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=114,67;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:15,0:8,5:17,6,1,4
chr9	132687407	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=122,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.191:13:5,2:6,0:0|1:132687407_T_G:132687407:5,6,1,1
chr9	132687408	.	T	TAACTGGGAC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=122,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:0|1:132687407_T_G:132687407:5,6,1,1
chr9	132687514	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=209,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:132687514_G_A:132687514:0,2,0,1
chr9	132687523	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=228,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:132687514_G_A:132687514:0,1,0,1
chr9	132687526	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=228,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:132687514_G_A:132687514:0,1,0,1
chr9	132689671	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr9	132720720	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=397,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.783:12:1,6:1,3:2,0,9,1
chr9	132816398	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr9	132838063	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=187,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.410:7:1,0:2,2:1,3,0,3
chr9	132841808	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	132848653	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr9	132854482	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr9	132862830	.	AA	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr9	132863035	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=195,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,1:2,2:2,7,0,3
chr9	132866883	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr9	132866906	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	132887249	.	TAA	T,TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31,28;MFRL=188,157,201;MMQ=60,60,60;MPOS=19,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=7.15,3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.447,0.333:6:0,0,2:1,3,0:0,1,0,5
chr9	132891113	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=205,263;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:0|1:132891113_G_A:132891113:2,5,0,2
chr9	132891115	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0|1:132891113_G_A:132891113:0,0,2,7
chr9	132897231	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	132962801	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr9	132962816	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,3:0,8:0,0,9,3
chr9	132963115	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:132963115_T_G:132963115:0,0,3,1
chr9	132963129	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:132963115_T_G:132963115:0,0,3,1
chr9	132963350	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,4:0,0,6,9
chr9	132980035	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr9	132984946	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=168,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,1:5,1:10,2,1,1
chr9	132985111	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr9	132985258	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=128,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:1,0:0|1:132985258_GC_G:132985258:3,0,3,0
chr9	132985262	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=128,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0|1:132985258_GC_G:132985258:3,0,3,0
chr9	133028196	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=199,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:133028196_G_A:133028196:2,0,2,0
chr9	133028204	.	CGGCAGT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=199,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGCAGT;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0|1:133028196_G_A:133028196:2,0,3,0
chr9	133058082	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=122,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:1,7:5,4:0,6,1,10
chr9	133072162	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=140,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:6,3,1,1
chr9	133231717	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	133233786	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,2:8,0:0|1:133233786_G_GC:133233786:6,6,1,1
chr9	133233788	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,2:8,0:0|1:133233786_G_GC:133233786:6,6,1,1
chr9	133259883	.	AG	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=180,43;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:133259883_AG_A:133259883:7,9,1,1
chr9	133259888	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=176,43;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:8,2:0|1:133259883_AG_A:133259883:8,9,1,1
chr9	133259893	.	CC	AG	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=183,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:7,2:0|1:133259883_AG_A:133259883:7,8,1,1
chr9	133259901	.	AA	TG	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=180,43;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:133259883_AG_A:133259883:6,8,1,1
chr9	133301391	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	133305157	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=228,273;MMQ=51,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr9	133339380	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=193,140;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,4:3,0:8,0,4,0
chr9	133346379	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr9	133346983	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,2,6
chr9	133355767	.	C	CTTGCTCAAACGCTGGCCACGGATCTCATATTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=151,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.210:13:3,2:7,0:9,2,1,1
chr9	133355874	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr9	133355902	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=163,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr9	133364631	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=175,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.507:8:3,2:0,3:0|1:133364631_TA_T:133364631:3,0,5,0
chr9	133364632	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=22,26;MFRL=140,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,6:0.875:7:0,4:1,1:1|0:133364631_TA_T:133364631:1,0,6,0
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chr9	133487939	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=150,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:0|1:133487934_CT_C:133487934:7,9,1,1
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chr9	133505952	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=144,236;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:5,0,3,1
chr9	133554065	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:2,4,0,2
chr9	133556992	.	TCGCCGCCGC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=CGC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	133573461	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=205,131;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,2:7,0:8,0,2,0
chr9	133710722	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:133710722_G_GC:133710722:0,0,2,0
chr9	133710743	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.797:3:0,1:0,2:0|1:133710722_G_GC:133710722:0,0,3,0
chr9	133754032	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=181,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr9	133755528	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=196,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,1:2,2:5,2,1,2
chr9	133760029	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=200,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,1:3,1:2,3,0,2
chr9	133768827	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=217,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.291:11:4,2:4,1:4,4,1,2
chr9	133924358	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=116,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,1:7,2:8,3,3,0
chr9	133928088	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=217,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:2,3,2,4
chr9	133932240	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=276,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:1,0,6,0
chr9	133936381	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr9	133942624	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr9	133942660	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	133944522	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,2:0|1:133944522_C_T:133944522:0,0,1,8
chr9	133944525	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0|1:133944522_C_T:133944522:0,0,1,7
chr9	133946849	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:4,2,2,0
chr9	133951180	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	133951230	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=238,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,3:2,2:1,1,3,2
chr9	133962853	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:6,2:15,1:17,4,1,2
chr9	133963058	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr9	133963217	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=146,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:3,2,0,2
chr9	133967240	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=204,264;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,2,1
chr9	133995729	.	CAG	C	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:8,1:8,3:0|1:133995729_CAG_C:133995729:2,14,4,0
chr9	133995735	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=29,17;MFRL=161,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:8,0:8,0:0|1:133995729_CAG_C:133995729:2,15,3,0
chr9	133995739	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=25,32;MFRL=161,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,1:7,2:0|1:133995729_CAG_C:133995729:2,15,3,0
chr9	133995745	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=28,15;MFRL=159,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:6,0:7,0:0|1:133995729_CAG_C:133995729:2,13,3,0
chr9	133995749	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=28,14;MFRL=159,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,0:0|1:133995729_CAG_C:133995729:1,14,2,0
chr9	133995753	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=160,61;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,0:8,0:0|1:133995729_CAG_C:133995729:1,13,2,0
chr9	133995775	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=33,23;MFRL=138,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,3:5,0:0,9,0,3
chr9	133996439	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=125,243;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:4,1:9,4:6,8,5,0
chr9	133996460	.	T	G,TG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33,25;MFRL=0,140,243;MMQ=60,60,60;MPOS=25,23;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=39.77,11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,14,5:0.689,0.273:19:0,5,2:0,9,3:0,0,11,8
chr9	134008447	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=124,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,2:8,1:14,5,2,1
chr9	134014642	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,850;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=23,20;RU=T;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.784:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	134026193	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=189,98;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:3,0:2,8:0|1:134026193_T_A:134026193:1,4,0,9
chr9	134026195	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=189,98;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:3,0:2,9:0|1:134026193_T_A:134026193:1,4,0,9
chr9	134062770	.	CTTTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=255,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=21,16;RU=T;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.491:6:1,0:0,2:1,2,0,3
chr9	134064345	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr9	134076950	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=18,24;MFRL=227,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.758:6:0,2:0,0:1,0,2,3
chr9	134105939	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr9	134145568	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,30;MFRL=289,178;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:134145568_G_A:134145568:3,0,1,0
chr9	134145574	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,34;MFRL=271,178;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:134145568_G_A:134145568:2,0,1,0
chr9	134145580	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=271,178;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:134145568_G_A:134145568:2,0,1,0
chr9	134145583	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=210,178;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:134145568_G_A:134145568:3,0,1,0
chr9	134145587	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=36,34;MFRL=210,178;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:134145568_G_A:134145568:3,0,1,0
chr9	134145589	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=210,178;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:134145568_G_A:134145568:3,0,1,0
chr9	134165368	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,314;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr9	134305461	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,15;MFRL=204,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,0:2,0:5,1,2,0
chr9	134323240	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr9	134342939	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:2,1:5,2:3,4,3,0
chr9	134346087	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr9	134348807	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr9	134348818	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr9	134349152	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr9	134351343	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=170,202;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:4,8:1,5:4,1,6,7
chr9	134358657	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr9	134358719	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=186,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.483:29:10,9:5,5:7,8,8,6
chr9	134360015	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr9	134361581	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,5,12
chr9	134361627	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr9	134363292	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=184,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:9,3,0,2
chr9	134381487	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:3,0,4,0
chr9	134382673	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr9	134382942	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=217,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:1,4,1,1
chr9	134384277	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr9	134384500	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	134385552	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=201,255;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:5,3,0,3
chr9	134385599	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr9	134386675	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr9	134386744	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,11,8
chr9	134386903	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,306;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr9	134387539	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=212,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.623:11:2,3:1,3:1,3,4,3
chr9	134394163	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr9	134395420	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=156,272;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:2,1:6,2:6,3,3,0
chr9	134395628	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr9	134397624	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr9	134398249	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=176,236;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr9	134398534	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr9	134404318	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:6,4,1,1
chr9	134404784	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=239,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:3,3,2,0
chr9	134406131	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,4:2,5:0,5,0,9
chr9	134458109	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=140,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,1:4,1:4,9,0,2
chr9	134463039	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=243,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr9	134465398	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,6:0,1:0,0,1,7
chr9	134467456	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=170,244;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:8,4:10,1:11,7,3,2
chr9	134467475	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=151,235;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,4:8,0:9,7,2,2
chr9	134467578	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=55.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,12:0,6:0,0,3,15
chr9	134473517	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=175,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,0:2,4:5,0,4,0
chr9	134477387	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=185,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr9	134477579	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:5,3:4,1:4,5,0,4
chr9	134479293	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr9	134480221	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.593:3:1,0:0,1:1,0,2,0
chr9	134480272	.	GGT	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=245,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=GT;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr9	134497450	.	C	A,G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25,31;MFRL=0,210,175;MMQ=60,60,60;MPOS=20,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.42,11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,4:0.454,0.455:8:0,3,3:0,1,1:0,0,0,8
chr9	134518575	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:8,2,3,1
chr9	134585181	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,2:1,0:0,5,1,1
chr9	134759400	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=174,234;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:6,5,1,1
chr9	134952790	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=186,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:4,1,4,2
chr9	135073309	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=172,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0|1:135073309_G_A:135073309:3,0,3,0
chr9	135073315	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=172,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0|1:135073309_G_A:135073309:3,0,3,0
chr9	135105964	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,12:0,0,10,10
chr9	135106043	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=183,54;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:3,9,0,2
chr9	135106054	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=188,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:1,6,1,4
chr9	135117178	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	135158690	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=177,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.499:28:8,4:6,10:8,6,6,8
chr9	135161766	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.642:6:0,1:1,3:1,1,4,0
chr9	135211609	.	AAC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=236,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr9	135218047	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=136,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:9,4,1,1
chr9	135221597	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr9	135251241	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	135271725	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=197,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,1:4,4:9,0,5,0
chr9	135271987	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=134,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr9	135273507	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	135273759	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr9	135374764	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=217,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:2,1:3,1:6,0,2,0
chr9	135375023	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,2:5,1:3,9,1,2
chr9	135388799	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=339,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr9	135412913	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=211,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.498:8:1,2:3,2:4,0,3,1
chr9	135470176	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=279,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,3:0,4:1,0,6,1
chr9	135522454	.	AAAGT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=206,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.502:10:0,2:4,3:1,4,2,3
chr9	135526546	.	CT	C,CTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32,36;MFRL=180,146,184;MMQ=60,60,60;MPOS=28,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.27,3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.285,0.304:10:2,2,2:2,1,1:2,2,1,5
chr9	135535272	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=236,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:135535272_A_G:135535272:0,1,0,1
chr9	135535277	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=236,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:135535272_A_G:135535272:0,1,0,1
chr9	135535280	.	C	CTCAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=236,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:135535272_A_G:135535272:0,1,0,1
chr9	135545201	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr9	135546405	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=193,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:1,7,0,5
chr9	135554526	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:7,0:8,8,2,0
chr9	135562800	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=180,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr9	135601354	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=142,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:1,5,0,3
chr9	135601367	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=142,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr9	135601391	.	G	GTCCCCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=204,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr9	135702490	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.407:13:5,1:1,4:1,7,1,4
chr9	135703525	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=182,200;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,0:3,9:0,10,0,9
chr9	135739226	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr9	135763603	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr9	135764081	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr9	135764097	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=186,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0|1:135764097_A_C:135764097:0,2,0,1
chr9	135764099	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=186,260;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:135764097_A_C:135764097:0,2,0,1
chr9	135772814	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,267;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:11,0:10,4:12,9,4,0
chr9	135776034	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,5:1,2:5,2,3,4
chr9	135777121	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:1,1:3,3:2,3,0,4
chr9	135781556	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:3,8,0,2
chr9	135781563	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,3:3,5:0,4,3,5
chr9	135782026	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,5:2,4:2,0,9,0
chr9	135786112	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,3:0,5,0,7
chr9	135787029	.	A	ATTAACAAGTGTTGGTAAGGGTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=208,165;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr9	135861998	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr9	135862592	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=202,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr9	135862632	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=171,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.754:10:2,5:0,3:2,0,5,3
chr9	135930164	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=162,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:12,1:2,1:7,7,1,1
chr9	135944001	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=122,247;MMQ=57,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,3:6,1:9,7,3,1
chr9	135977161	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:4,10,0,2
chr9	135977366	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.273:27:7,2:13,5:12,8,2,5
chr9	135977583	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=369,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr9	135978153	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.895:7:0,2:0,3:0,0,5,2
chr9	135978378	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=212,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,0,3
chr9	135979751	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,2,9
chr9	135982391	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=203,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr9	135985166	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=181,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,3:2,0:0,4,0,3
chr9	136031346	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=195,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,3:6,2:5,6,1,4
chr9	136031370	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:9,2:4,1:9,5,2,1
chr9	136037845	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,270;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,1:12,2:8,14,0,3
chr9	136081829	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,2:4,1:6,5,2,1
chr9	136083695	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=280,177;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:3,2,2,1
chr9	136083801	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=165,182;MMQ=60,36;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,5:2,5:3,1,8,2
chr9	136131225	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:13,6,1,1
chr9	136132908	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=142,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:4,6,2,0
chr9	136133380	.	CGGG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	136133582	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr9	136135096	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr9	136135137	.	GCTTCTGTCCACAC	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=195,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:0,5:0,3:0,1,5,3
chr9	136135195	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.822:16:2,5:0,8:1,2,6,7
chr9	136135237	.	AT	GC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=96,122;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.879:14:0,6:1,7:1,0,6,7
chr9	136135365	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	136150466	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	136150484	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	136150556	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	136198755	.	TGC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=174,253;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,1,0
chr9	136199466	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,233;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:6,1,2,0
chr9	136201470	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr9	136211248	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=207,258;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.381:11:2,3:5,1:0,7,0,4
chr9	136212192	.	G	GTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=191,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:136212192_G_GTT:136212192:0,1,0,1
chr9	136212194	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=191,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:136212192_G_GTT:136212192:0,1,0,1
chr9	136212199	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=191,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:136212192_G_GTT:136212192:0,1,0,1
chr9	136213521	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=279,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,6:1,8:0,1,3,11
chr9	136214955	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=204,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr9	136216311	.	A	ATCATTTCTGTCAC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=158,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:3,2:6,0:9,0,1,1
chr9	136223043	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=198,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr9	136224601	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,267;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:9,4:8,0:8,10,4,0
chr9	136234124	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,10,8
chr9	136260696	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=189,240;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,3,1
chr9	136272260	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=254,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:136272260_A_C:136272260:1,1,0,1
chr9	136272262	.	T	TGCACAGCCCAACAGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=254,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,0:1,1:0|1:136272260_A_C:136272260:1,1,0,1
chr9	136274058	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=260,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr9	136289374	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=325,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr9	136291539	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	136298729	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=227,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:3,1:5,2:7,2,2,1
chr9	136301902	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:136301902_G_C:136301902:0,3,1,0
chr9	136301909	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,12;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:136301902_G_C:136301902:0,3,1,0
chr9	136301914	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,32;MFRL=134,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:136301902_G_C:136301902:0,4,1,0
chr9	136301917	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=134,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:136301902_G_C:136301902:0,4,1,0
chr9	136301982	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,2:6,1:3,7,1,2
chr9	136305439	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=177,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:4,1:3,5:7,0,6,1
chr9	136305471	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=163,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:8,2,0,2
chr9	136311017	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr9	136324384	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=200,184;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,0:3,7:0,5,0,7
chr9	136379890	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:4,1,4,2
chr9	136380814	.	TGCACAGGCTCA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=231,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr9	136385437	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:0,6:1,3:0,1,3,6
chr9	136385453	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr9	136389751	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=209,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,1:1,3:5,1,4,0
chr9	136390015	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=199,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr9	136401606	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=18,34;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:0,3:0,1:1,0,4,0
chr9	136404808	.	G	GTCCCGGCTGTCCCGGCTGTCCCGGCTGTCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=181,205;MMQ=60,33;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr9	136409529	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,5:3,0:2,1,3,2
chr9	136409580	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,9,7
chr9	136412346	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=264,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=49.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,11:1,4:1,0,5,10
chr9	136412382	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr9	136419629	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=212,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:2,0:5,5:3,4,4,2
chr9	136426443	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=141,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:1,4,1,2
chr9	136433913	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	136435696	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=207,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr9	136439803	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=183,332;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr9	136439889	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=151,78;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:7,5,2,0
chr9	136509312	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=33.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:3,6:1,6:4,0,11,1
chr9	136512906	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=135,315;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:3,1,2,1
chr9	136517998	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,101;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:9,0,2,0
chr9	136522187	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=124,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:0,1:4,2:3,2,2,1
chr9	136532107	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=213,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr9	136532134	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=203,249;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr9	136535661	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=189,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,3:3,0:7,2,0,3
chr9	136536633	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,2:0,1:2,3,2,1
chr9	136536793	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,172;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:7,5:1,1:3,5,2,4
chr9	136561303	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr9	136561367	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,198;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:6,3,5,0
chr9	136561567	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr9	136569974	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=170,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,0:3,3:7,0,3,0
chr9	136570004	.	GT	AC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:4,1:1,5:6,0,5,1
chr9	136570005	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.927:12:0,4:0,7:0,0,11,1
chr9	136573648	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=269,282;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr9	136577848	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=207,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr9	136578311	.	T	TGTGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:136578311_T_TGTGG:136578311:0,4,0,1
chr9	136578312	.	C	CCGTTGTCCTGCCGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:136578311_T_TGTGG:136578311:0,4,0,1
chr9	136582395	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=81,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,3:0,2:2,1,5,0
chr9	136582556	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=137,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,3:6,0:4,4,3,0
chr9	136584196	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=89,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,1,2
chr9	136594864	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr9	136599315	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr9	136629256	.	CTG	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TG;STR;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.920:7:0,6:0,1:0,0,2,5
chr9	136629298	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=232,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,1,2
chr9	136635409	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=201,243;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:1,2:0,2:1,0,5,0
chr9	136637198	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=199,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.373:9:2,1:2,2:2,4,1,2
chr9	136637242	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=223,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr9	136640226	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=203,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,6:2,5:0,4,0,11
chr9	136641313	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=12,27;MFRL=178,214;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,2:0,0:0,1,0,2
chr9	136645004	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=193,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr9	136645746	.	TTCTGGCTCTGCGCACACAGGGA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=200,75;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:1,1:8,0,2,0
chr9	136648535	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr9	136648565	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=209,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,2:3,5:4,0,7,0
chr9	136648606	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,0:1,5:4,0,5,0
chr9	136648611	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=221,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,3:1,0,5,1
chr9	136652465	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,5:3,3:2,5,2,6
chr9	136654366	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:7,2:1,2:7,1,4,1
chr9	136654497	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=150,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:5,0:4,3:4,5,0,3
chr9	136654553	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=157,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr9	136657011	.	GGTGAGCGGGCTGTGCTGGGTGGGGTGTGTGTGACTGTGTGTGTAAGCAGGCTGTACTGGGTGGGGTGTGTGTGCAT	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=110,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.195:24:6,2:6,5:5,12,3,4
chr9	136657085	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=136,39;MMQ=60,60;MPOS=-1073741816;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.384:5:3,1:0,0:0,3,1,1
chr9	136672493	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,5:1,1:0,3,2,4
chr9	136672529	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=247,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:1,6:1,0:0,2,0,6
chr9	136804211	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=133,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:2,5:3,4:4,1,5,4
chr9	136898627	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=144,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:3,0:1,3:2,2,3,0
chr9	136898922	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,296;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	136901604	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=119,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:3,13:8,0:8,3,13,0
chr9	136906781	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=194,266;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr9	136907108	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=214,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,6:2,5:0,3,2,9
chr9	136913123	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=267,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:2,0,4,0
chr9	136913180	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=148,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:4,1,2,2
chr9	136918537	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:5,0:2,1:7,0,0,4
chr9	137004907	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=281,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,2:0,4:2,0,6,0
chr9	137006662	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,2:12,0:12,7,1,1
chr9	137007904	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=171,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:137007904_G_C:137007904:0,3,0,1
chr9	137007907	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=171,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:137007904_G_C:137007904:0,3,0,1
chr9	137013308	.	CTTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=154,128;MMQ=52,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=25,21;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.277:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr9	137013339	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,10;MFRL=100,135;MMQ=60,52;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,0:0,4,2,0
chr9	137013352	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,15;MFRL=56,71;MMQ=60,34;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,0:2,8,2,0
chr9	137013582	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=124,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr9	137017006	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr9	137017051	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=199,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,3:4,2:5,0,4,1
chr9	137019511	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,13,1
chr9	137021803	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=276,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr9	137299949	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr9	137320855	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=201,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr9	137321156	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=342,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr9	137328225	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=191,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr9	137328286	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,6,1
chr9	137592961	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr9	137623511	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,12;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,0:0,0:0|1:137623511_T_G:137623511:0,2,0,2
chr9	137623534	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,15;MFRL=169,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.486:6:2,0:0,1:0|1:137623511_T_G:137623511:0,3,0,3
chr9	137630568	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,5:1,5:1,0,4,6
chr9	137630587	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,5:1,4:1,0,2,7
chr9	137642478	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=263,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,2,1
chr9	137642577	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=209,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:6,1:8,1,3,1
chr9	137646046	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=184,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr9	137646217	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=186,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,1:4,2:2,4,1,2
chr9	137658730	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr9	137660375	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=208,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr9	137674636	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=18,16;MFRL=292,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:137674636_G_T:137674636:0,2,0,1
chr9	137674640	.	G	GTGACAAATTATC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=268,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:137674636_G_T:137674636:0,3,0,1
chr9	137674645	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=268,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:137674636_G_T:137674636:0,3,0,1
chr9	137687038	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=142,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.654:21:4,4:3,10:4,3,5,9
chr9	137688305	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:3,5,0,3
chr9	137688577	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=236,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr9	137688657	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=178,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:0,5:3,0:3,1,2,3
chr9	137688780	.	GCCTGTCCCCTCCAAAACCCA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.511:6:1,0:1,3:1,2,1,2
chr9	137693819	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:3,10,0,2
chr9	137702035	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:1,0:8,3:6,3,3,0
chr9	137702065	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:3,0:12,2:11,4,1,2
chr9	137702200	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,12:0.685:17:3,5:2,7:0|1:137702200_G_C:137702200:1,4,5,7
chr9	137702209	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:2,4:3,6:0|1:137702200_G_C:137702200:0,5,4,6
chr9	137704367	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=101,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,2:4,2:4,7,2,2
chr9	137704605	.	A	AGT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=115,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GT;STR;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.496:8:2,2:2,2:0|1:137704605_A_AGT:137704605:0,4,3,1
chr9	137704620	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=118,226;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:2,3:3,2:0|1:137704605_A_AGT:137704605:0,5,3,3
chr9	137707942	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=199,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,4:2,4:0,4,1,7
chr9	137708803	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr9	137708934	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=22,35;MFRL=128,185;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,4:4,1:2,2,4,1
chr9	137708960	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,36;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,2:4,1:2,2,2,1
chr9	137708973	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=165,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:2,2,1,1
chr9	137709780	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=214,286;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr9	137709795	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=226,286;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr9	137710961	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,1:0,4:0,3,2,3
chr9	137711997	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:4,3,2,1
chr9	137713942	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:4,7,0,2
chr9	137714027	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=104,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr9	137714044	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137714044_T_G:137714044:0,0,0,1
chr9	137714068	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137714044_T_G:137714044:0,0,0,1
chr9	137715150	.	AT	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr9	137717610	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr9	137721933	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=159,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:11,1:5,5:7,9,4,2
chr9	137734232	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=203,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,4:0,1,0,7
chr9	137772664	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:16,0:7,4:10,13,3,1
chr9	137772792	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr9	137778239	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=190,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,1:4,4:6,1,5,0
chr9	137779306	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=290,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr9	137806329	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=234,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:3,1:4,1:0|1:137806329_T_TC:137806329:4,7,0,3
chr9	137806334	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,36;MFRL=234,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:2,1:7,2:0|1:137806329_T_TC:137806329:4,7,0,3
chr9	137806344	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=227,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:2,1:8,2:0|1:137806329_T_TC:137806329:4,6,0,3
chr9	137806487	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=220,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:6,3,2,1
chr9	137967701	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr9	137968919	.	G	GAA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,8:0,0,12,6
chr9	137968951	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=111,107;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:13,4:7,2:10,10,4,2
chr9	137980016	.	GCTC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=254,274;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CTC;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr9	137982232	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=192,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.579:5:2,1:0,2:0|1:137982232_T_G:137982232:0,2,0,3
chr9	137982234	.	G	GTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=192,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.578:5:2,1:0,2:0|1:137982232_T_G:137982232:0,2,0,3
chr9	137998526	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=178,189;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:137998526_G_C:137998526:4,0,2,0
chr9	137998530	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=178,189;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:137998526_G_C:137998526:4,0,2,0
chr9	138011291	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=258,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:0,1:2,4:2,0,6,0
chr9	138391299	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=165,191;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,5:8,0:10,7,2,3
chr9	138391517	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=208,238;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,3:6,2:6,5,2,3
chr9	138438582	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=255,200;MMQ=39,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr9	138439005	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=180,165;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:5,4:6,5:5,6,5,4
chr9	138440726	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=200,159;MMQ=52,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:138440726_C_T:138440726:0,2,0,1
chr9	138440728	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=200,159;MMQ=52,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:138440726_C_T:138440726:0,2,0,1
chr9	138440756	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=224,234;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr9	138453801	.	GCGGGC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr9	138456254	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chr9	138515929	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=119,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,2:2,1:5,4,3,0
chr9	138516531	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=101,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,5:3,3:2,3,7,2
chr9	138517853	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr9	138518114	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=297,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:0,1,0,8
chr9	138523411	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr9	138557256	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,1,4
chr9	138586309	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,6:0,0,3,3
chr9	138586854	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=297,241;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:1,2,1,1
chr9	138587203	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=223,247;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr9	138588359	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,1:0,0,3,0
chr9	138589311	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=191,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:0,0:2,2:3,0,2,0
chr9	138590138	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	138590347	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=84,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.773:11:1,6:1,3:0,2,2,7
chr9	138594266	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=172,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,1:3,2:0,5,1,3
chr9	138606581	.	C	CGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=164,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:138606581_C_CGG:138606581:0,1,0,1
chr9	138606586	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,26;MFRL=164,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:138606581_C_CGG:138606581:0,1,0,1
chr9	138642912	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	138648829	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=112,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.484:2:0,1:1,0:0|1:138648829_C_G:138648829:0,1,0,1
chr9	138648837	.	AG	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:138648829_C_G:138648829:0,0,0,1
chr9	138648847	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.694:1:0,1:0,0:0|1:138648829_C_G:138648829:0,0,0,1
chr9	138648851	.	C	CTCCCATCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.815:3:0,2:0,0:0|1:138648829_C_G:138648829:0,0,0,3
chr9	138656783	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=159,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr9	138660548	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=287,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,0,3
chr9	138662273	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.217:15:4,1:8,1:5,7,2,1
chr9	138662309	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr9	138662661	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=207,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,4:1,0:1,0,4,0
chr9	138662962	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=189,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr9	138664661	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr9	138669261	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,5:5,3:3,3,2,6
chr9	138679895	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,1,1
chr9	138679911	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=125,260;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:2,1:4,2:5,2,2,1
chr9	138707727	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=173,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:5,2:9,1:10,4,1,2
chr9	138836941	.	GCCT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=196,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=37.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.613:16:4,7:2,3:2,4,7,3
chr9	138837113	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=184,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:1,3,1,2
chr9	138838140	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,8:0,0,7,9
chr9	138852789	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=280,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr9	138903671	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=134,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:4,2:2,2:1,6,2,2
chr9	138903824	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:4,4,0,2
chr9	138905884	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr9	139008803	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=243,245;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr9	139091797	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,301;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	139092679	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=188,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr9	139252603	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=148,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:0,2:6,1:4,2,0,4
chr9	139257411	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=186,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:4,4:7,2:7,4,3,3
chr9	139258462	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=293,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr9	139270901	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=137,133;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:3,4,5,2
chr9	139270975	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=124,69;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr9	139271919	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=253,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr9	139272669	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=177,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr9	139272826	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=191,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:139272826_GT_G:139272826:1,1,0,1
chr9	139272829	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=191,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:139272826_GT_G:139272826:1,1,0,1
chr9	139272832	.	CC	GG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:139272826_GT_G:139272826:2,1,0,1
chr9	139273790	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=225,99;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,3:0,3,1,2
chr9	139277994	.	CGCT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GCT;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:3,1:3,1:2,5,0,2
chr9	139288682	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=97,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.362:9:2,1:3,2:0|1:139288682_C_CT:139288682:3,3,2,1
chr9	139288688	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=194,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.383:11:3,1:4,3:0|1:139288682_C_CT:139288682:4,3,2,2
chr9	139288692	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=194,123;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.383:11:3,1:4,3:0|1:139288682_C_CT:139288682:4,3,2,2
chr9	139289825	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=201,128;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.342:15:4,1:6,3:3,7,2,3
chr9	139290011	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=228,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:1,1,3,0
chr9	139290251	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=174,217;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:2,1:1,1:1,3,0,2
chr9	139291498	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=136,154;MMQ=60,31;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:10,6:14,0:9,15,0,6
chr9	139292785	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:5,1:7,1:5,8,2,0
chr9	139301583	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=116,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:6,7:4,6:4,6,10,3
chr9	139302015	.	TAAAA	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=18,20;MFRL=267,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=A;STR;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.638:6:0,1:1,1:1,1,1,3
chr9	139302049	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=187,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr9	139302094	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr9	139302200	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=174,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,0:1,2:4,2,2,0
chr9	139304340	.	ACTGT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=196,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGT;STR;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,3:4,2:7,4,4,2
chr9	139304963	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=199,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr9	139306407	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:8,4:10,0:15,3,4,0
chr9	139307194	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=212,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.563:12:3,4:2,3:2,3,5,2
chr9	139309114	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=125,265;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr9	139313403	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.665:13:2,5:2,3:1,3,6,3
chr9	139324680	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:4,1,5,0
chr9	139324740	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:2,5,4,3
chr9	139325641	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=311,251;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr9	139327106	.	C	CACCACCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=218,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr9	139328551	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=142,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.542:13:3,4:2,3:2,4,2,5
chr9	139333049	.	GCCCT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCT;STR;TLOD=73.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,14,3
chr9	139341529	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=185,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:2,1:3,6:0,5,1,6
chr9	139342122	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=188,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:5,7,1,1
chr9	139347778	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=243,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr9	139354437	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=265,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,2,1
chr9	139357279	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=168,285;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:0,1:1,0:1,0,2,0
chr9	139358059	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=167,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.418:17:6,4:4,3:4,6,3,4
chr9	139358156	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=141,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:14,0:6,3:10,10,2,1
chr9	139360354	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr9	139368681	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=178,253;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,1:5,4:4,5,1,4
chr9	139371234	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.606:11:3,1:1,4:2,2,5,2
chr9	139395108	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=134,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:2,5,0,3
chr9	139396408	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=214,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,4:4,4:3,3,4,4
chr9	139396624	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=210,311;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,0:1,1:0|1:139396624_A_G:139396624:0,3,2,0
chr9	139396627	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=16,21;MFRL=211,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:1,0:0,1:1,2,1,1
chr9	139396631	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=210,311;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,0:0|1:139396624_A_G:139396624:0,3,2,0
chr9	139400904	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=247,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:0,1:3,1:4,0,2,0
chr9	139401504	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=258,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr9	139401723	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=225,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:7,2,0,2
chr9	139402663	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr9	139402908	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=205,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:0,3,0,8
chr9	139403240	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr9	139403268	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=214,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr9	139403554	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=18,30;MFRL=227,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.572:7:1,0:0,4:0,3,1,3
chr9	139405154	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:1,2,1,4
chr9	139405181	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:1,5,1,2
chr9	139405261	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr9	139407512	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=163,84;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.279:15:0,3:10,0:8,3,2,2
chr9	139410424	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr9	139410558	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=214,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:139410558_G_A:139410558:0,2,0,1
chr9	139410563	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=214,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:139410558_G_A:139410558:0,2,0,1
chr9	139410566	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=214,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:139410558_G_A:139410558:0,2,0,1
chr9	139410589	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	139411622	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=261,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr9	139411714	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=120,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:1,3:2,2:3,1,4,1
chr9	139411880	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,1:2,2:2,3,0,3
chr9	139412197	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=149,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:2,1,3,1
chr9	139564474	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=192,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr9	139565150	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=134,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:0,2:1,15:1,0,9,8
chr9	139565473	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,0:0,0:0|1:139565473_C_G:139565473:0,0,1,0
chr9	139565478	.	GT	AG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:139565473_C_G:139565473:0,0,1,0
chr9	139565483	.	G	GATGCTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:139565473_C_G:139565473:0,0,1,0
chr9	139566823	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr9	139572068	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr9	139616840	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.711:12:2,4:1,4:0,3,0,9
chr9	139617379	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=37,33;MFRL=170,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr9	139618283	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	139635199	.	C	CTCCTGGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	139635430	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=107,218;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:1,3,1,4
chr9	139639004	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	139639532	.	CGGCCCACGCACCACACAGCTCCCAACGTGGGCCCCGAGT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=172,170;MMQ=60,41;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.348:7:3,1:0,1:5,0,2,0
chr9	139650060	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=206,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr9	139651632	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:4,5,1,1
chr9	139652269	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=145,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,2:5,3:7,4,3,2
chr9	139656618	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr9	139658051	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr9	139685722	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr9	139686289	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=263,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.797:11:1,4:0,5:2,0,5,4
chr9	139686299	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,15;MFRL=177,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:4,0:3,0:4,3,3,0
chr9	139686357	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.938:16:0,8:0,5:1,1,8,6
chr9	139686556	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=357,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,2:2,6:3,0,4,4
chr9	139690738	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,2:2,6:4,0,7,1
chr9	139693452	.	CCCTGGGG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTGGGG;STR;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.502:10:1,3:1,2:5,0,5,0
chr9	139694276	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=168,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:1,2:4,4:2,3,1,5
chr9	139699196	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.278:9:1,0:5,2:2,5,2,0
chr9	139699964	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=211,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.635:9:2,3:1,2:0,3,0,6
chr9	139701108	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=202,142;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:1,5:2,5:1,2,4,6
chr9	139701983	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr9	139722965	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:7,4:6,5:8,5,5,4
chr9	139730129	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=185,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:2,0,6,0
chr9	139731934	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=196,245;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:1,0:3,0:0|1:139731934_A_C:139731934:1,3,3,0
chr9	139731936	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=196,245;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:1,1:3,0:0|1:139731934_A_C:139731934:1,3,3,0
chr9	139731941	.	AG	CC	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=29,24;MFRL=211,245;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.498:6:1,1:2,0:0|1:139731934_A_C:139731934:1,2,3,0
chr9	139731946	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=211,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,0:0|1:139731934_A_C:139731934:1,2,2,0
chr9	139731951	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=211,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:2,0:0|1:139731934_A_C:139731934:1,2,2,0
chr9	139731952	.	CAGCTG	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=36,35;MFRL=211,215;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:139731934_A_C:139731934:1,2,2,0
chr9	139734360	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:139734360_GG_AA:139734360:1,2,0,1
chr9	139734371	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139734360_GG_AA:139734360:0,1,0,1
chr9	139739643	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr9	139746992	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=232,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr9	139749640	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:2,4,1,1
chr9	139804274	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr9	139804346	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.664:16:4,5:1,5:3,2,5,6
chr9	139815053	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	139820421	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=278,180;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,4:5,0:0,7,0,4
chr9	139835558	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=173,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,1:5,1:3,8,1,1
chr9	139837206	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.309:20:9,1:5,4:8,6,6,0
chr9	139837700	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,350;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:139837700_A_C:139837700:0,0,1,0
chr9	139837712	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=101,350;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139837700_A_C:139837700:1,0,1,0
chr9	139837990	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=298,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,5:1,4:0,2,2,7
chr9	139839904	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=174,137;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,32:0.916:34:2,16:0,14:2,0,16,16
chr9	139840471	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=195,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:2,3:0,6:1,1,4,5
chr9	139840859	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr9	139847312	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=216,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0|1:139847312_A_C:139847312:1,2,2,0
chr9	139847315	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=206,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:139847312_A_C:139847312:2,2,2,0
chr9	139847318	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=206,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:139847312_A_C:139847312:2,2,1,0
chr9	139848273	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=222,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:2,5:3,5:0|1:139848273_A_G:139848273:2,3,3,7
chr9	139848278	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=240,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:2,5:3,5:0|1:139848273_A_G:139848273:3,3,3,7
chr9	139848688	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=232,147;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:2,7:0,9:1,1,7,9
chr9	139863732	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=289,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr9	139863777	.	GCC	ATT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=171,219;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.284:5:1,0:2,1:3,1,1,0
chr9	139864341	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=276,177;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,2:0,0:2,0,2,0
chr9	139864593	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=196,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,1,3
chr9	139874377	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:3,3:11,0:8,6,2,1
chr9	139875163	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=111,54;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:12,0:5,3:9,11,0,3
chr9	139878828	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr9	139879067	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,6,7
chr9	139879113	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=217,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.799:8:0,2:1,3:1,0,4,3
chr9	139887042	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr9	139889875	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:2,2:7,0:4,7,3,0
chr9	139902786	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	139902797	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	139903352	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	139904918	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr9	139905819	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=196,258;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:2,3,1,1
chr9	139906513	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,4,6
chr9	139906686	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	139908265	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr9	139908568	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,12;MFRL=273,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:1,0:0|1:139908568_G_C:139908568:0,2,3,0
chr9	139908570	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=273,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,0:0|1:139908568_G_C:139908568:0,2,3,0
chr9	139909918	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=148,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,1:7,3:5,4,3,1
chr9	139910648	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr9	139912178	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=189,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.841:10:1,5:0,4:0,1,3,6
chr9	139916483	.	GGGTGT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:139916483_GGGTGT_G:139916483:0,0,0,1
chr9	139916491	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:139916483_GGGTGT_G:139916483:0,0,0,1
chr9	139916833	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=166,190;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,1:8,1:12,1,1,1
chr9	139916850	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=159,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,1:9,1:13,5,1,1
chr9	139916879	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=159,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:9,3:11,1:14,6,2,2
chr9	139918788	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=252,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr9	139943545	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:139943545_C_T:139943545:0,0,1,0
chr9	139943549	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:139943545_C_T:139943545:0,0,1,0
chr9	139944496	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=185,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=103.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,26:0.900:28:1,8:1,16:0|1:139944496_T_C:139944496:0,2,11,15
chr9	139944509	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=181,124;MMQ=27,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,20:0.779:25:4,6:1,10:0|1:139944496_T_C:139944496:3,2,6,14
chr9	139945051	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr9	139946804	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr9	139960178	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=183,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:1,5:0,5:0,1,2,8
chr9	139960640	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	139973186	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr9	139973349	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=225,237;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr9	139973629	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=197,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,2:7,0:7,5,0,2
chr9	139973652	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=52.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,10:0,5:0,0,7,9
chr9	139975108	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr9	139977195	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr9	139990906	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr9	139992479	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,254;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr9	139994102	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr9	140001341	.	G	GAAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAC;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr9	140002501	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	140006089	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.408:8:2,0:2,3:4,1,3,0
chr9	140006491	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,1:5,2:3,9,2,1
chr9	140007271	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=262,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:4,2,0,2
chr9	140008836	.	T	TTC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=167,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.267:9:4,2:2,0:0|1:140008836_T_TTC:140008836:1,6,1,1
chr9	140008837	.	G	GTCTCCCGACCACAC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=167,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:0|1:140008836_T_TTC:140008836:1,6,1,1
chr9	140008899	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=260,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr9	140008934	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=121,202;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:4,1,6,1
chr9	140040156	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.915:10:0,1:0,5:0,0,8,2
chr9	140051041	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr9	140055876	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr9	140055892	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=18,27;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.309:8:1,0:1,1:1,5,0,2
chr9	140057123	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=126,53;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:6,1:3,1:3,7,0,2
chr9	140057154	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=196,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,1:3,1:2,6,0,2
chr9	140061988	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,12;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:1,0:7,1:0|1:140061988_G_C:140061988:0,8,3,0
chr9	140061992	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=170,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,1:7,0:0|1:140061988_G_C:140061988:0,8,2,0
chr9	140061996	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=170,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,2:6,0:0|1:140061988_G_C:140061988:0,8,2,0
chr9	140074578	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=182,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,1:6,1:6,1,2,0
chr9	140080583	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,319;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr9	140084376	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:0|1:140084376_G_A:140084376:1,9,1,1
chr9	140084378	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=165,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,2:0.212:12:7,1:3,1:1|0:140084376_G_A:140084376:2,8,0,2
chr9	140087024	.	TTCC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=184,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TCC;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:4,2:7,0:10,1,1,1
chr9	140099800	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,2:14,0:16,12,2,0
chr9	140100224	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=140,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr9	140108915	.	CTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=197,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.768:11:1,5:1,4:0,2,2,7
chr9	140110274	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr9	140115340	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=220,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,1:2,1:4,6,1,1
chr9	140115693	.	C	CAGAAAATTGTGAGGAGCTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	140119983	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=181,141;MMQ=60,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr9	140127615	.	AG	CC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=16,28;MFRL=198,317;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.248:11:1,2:0,0:6,3,1,1
chr9	140127620	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=20,18;MFRL=210,222;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.552:8:1,1:1,1:3,1,3,1
chr9	140127630	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.497:6:2,0:1,0:0|1:140127630_A_C:140127630:0,3,3,0
chr9	140127644	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.395:8:4,0:1,0:0|1:140127630_A_C:140127630:2,3,3,0
chr9	140139632	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=212,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:0,0:0|1:140139632_G_A:140139632:4,0,1,1
chr9	140139634	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=212,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:140139632_G_A:140139632:4,0,1,1
chr9	140139637	.	G	GAGAGGACACGATCCAAGAACCA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=212,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:140139632_G_A:140139632:4,0,1,1
chr9	140146651	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,5,6
chr9	140147094	.	C	CCT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,6,5
chr9	140150413	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=153,238;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,3:11,0:11,10,2,1
chr9	140157429	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.932:13:0,6:0,4:0,0,13,0
chr9	140157460	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,11,4
chr9	140157701	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr9	140158650	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,8,1
chr9	140158871	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	140161334	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr9	140161634	.	GGGGCT	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=81.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,12:0,8:0|1:140161634_GGGGCT_G:140161634:0,0,12,9
chr9	140161641	.	AGGTGGG	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=81.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0|1:140161634_GGGGCT_G:140161634:0,0,12,9
chr9	140161871	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chr9	140202194	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	140243844	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=117,174;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,0,2
chr9	140246050	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr9	140247294	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=189,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:140247294_C_T:140247294:0,4,0,1
chr9	140247308	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=189,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:140247294_C_T:140247294:0,4,0,1
chr9	140249253	.	AG	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,2,1
chr9	140317979	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	140320617	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=194,226;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:4,1,3,0
chr9	140322645	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,1,1
chr9	140323791	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=160,196;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,2:9,0:0|1:140323791_C_T:140323791:8,8,2,0
chr9	140323797	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=167,196;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,2:8,0:0|1:140323791_C_T:140323791:7,9,2,0
chr9	140323906	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,1,1
chr9	140331833	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=266,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,3:0,2:0,1,2,4
chr9	140332769	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	140344328	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=192,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,1:1,1:2,1,3,0
chr9	140348820	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=143,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:2,1:2,1:0|1:140348820_A_C:140348820:5,3,3,0
chr9	140348826	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,10;MFRL=138,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.265:13:1,0:4,0:0|1:140348820_A_C:140348820:7,3,3,0
chr9	140349874	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=205,232;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,3:4,1:2,3,3,1
chr9	140350080	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:6,2:13,0:10,10,0,2
chr9	140356374	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:1,1:0,5:1,0,3,4
chr9	140357848	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,4:6,0,5,3
chr9	140373575	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=175,198;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,2:8,0:3,6,0,2
chr9	140387628	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=232,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:140387628_C_A:140387628:0,6,0,2
chr9	140387631	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=232,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:140387628_C_A:140387628:0,5,0,2
chr9	140387632	.	T	TTACTAACA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=232,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:140387628_C_A:140387628:0,5,0,2
chr9	140389667	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=37,28;MFRL=308,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:140389667_C_T:140389667:0,2,0,1
chr9	140389669	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=308,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:140389667_C_T:140389667:0,2,0,1
chr9	140389674	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=308,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:140389667_C_T:140389667:0,2,0,1
chr9	140389676	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=308,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:140389667_C_T:140389667:0,2,0,1
chr9	140389683	.	CC	TG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=308,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:140389667_C_T:140389667:0,2,0,1
chr9	140392765	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=232,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:140392765_G_A:140392765:0,1,0,1
chr9	140392769	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=232,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140392765_G_A:140392765:0,1,0,1
chr9	140395071	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=203,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:5,1:0,2:5,0,3,0
chr9	140399983	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=229,243;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr9	140400275	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=115,233;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:1,1,3,2
chr9	140416025	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=128,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:0,1:4,1:5,0,2,0
chr9	140417381	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr9	140441722	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=206,128;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,4:2,0:6,0,4,0
chr9	140446912	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,2:6,0:7,4,1,1
chr9	140449755	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=179,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.180:21:7,3:9,0:0|1:140449755_C_CA:140449755:8,10,1,2
chr9	140449756	.	T	TATAGGACGACAGA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=177,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:8,3:9,0:0|1:140449755_C_CA:140449755:7,10,1,2
chr9	140449759	.	A	AAAAAACAGCAGTGTGCG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=172,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,3:9,0:0|1:140449755_C_CA:140449755:7,9,1,2
chr9	140482357	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr9	140510481	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=178,125;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:13,0:13,2:14,12,2,0
chr9	140510647	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=232,174;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140510647_T_C:140510647:0,1,0,1
chr9	140510649	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=232,174;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140510647_T_C:140510647:0,1,0,1
chr9	140510654	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=232,174;MMQ=60,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:140510647_T_C:140510647:0,1,0,1
chr9	140510658	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=240,174;MMQ=60,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.524:2:0,1:1,0:0|1:140510647_T_C:140510647:0,1,0,1
chr9	140605355	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,1:3,5:5,0,3,3
chr9	140637804	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=33,35;MFRL=237,214;MMQ=50,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0|1:140637804_CT_C:140637804:2,0,2,0
chr9	140637819	.	T	TTTA	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=27,28;MFRL=248,175;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:140637819_T_TTTA:140637819:3,0,1,0
chr9	140637820	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,15;MFRL=179,298;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:140637820_TA_T:140637820:3,0,1,0
chr9	140637821	.	AGC	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,10;MFRL=214,175;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:0,0:0|1:140637819_T_TTTA:140637819:2,0,1,0
chr9	140637823	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=12,16;MFRL=214,298;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:0,0:0|1:140637820_TA_T:140637820:2,0,1,0
chr9	140637827	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=12,32;MFRL=179,298;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,1:0|1:140637820_TA_T:140637820:3,0,1,0
chr9	140637837	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=24,21;MFRL=154,237;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:0,1:1,0:1|0:140637804_CT_C:140637804:2,0,2,0
chr9	140637842	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=19,15;MFRL=179,175;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:140637819_T_TTTA:140637819:3,0,1,0
chr9	140637932	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=191,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:5,4,1,1
chr9	140728894	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=194,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:1,8,0,2
chr9	140773612	.	G	GACGACACGGAGCCCTATTTCATCGGGATCTTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=179,2375;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.655:18:6,1:6,5:1,11,3,3
chr9	140777370	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:3,6:3,4:1,5,1,10
chr9	140777432	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=181,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:0,2:0,4,0,4
chr9	140811973	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=130,130;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:5,2,2,0
chr9	140866035	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=205,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:4,1:7,1:0|1:140866035_A_C:140866035:2,9,0,2
chr9	140866037	.	GA	AT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=205,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,1:6,1:0|1:140866035_A_C:140866035:2,9,0,2
chr9	140866041	.	C	CTT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=217,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,1:4,1:0|1:140866035_A_C:140866035:2,7,0,2
chr9	140938273	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,165;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,4:10,0:10,9,4,0
chr9	140995680	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=295,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:140995680_C_A:140995680:0,3,0,1
chr9	140995682	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=295,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:140995680_C_A:140995680:0,3,0,1
chr9	140995686	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=288,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:140995680_C_A:140995680:0,4,0,1
chr9	141015869	.	CTT	C,CT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=17,32,35;MFRL=137,103,221;MMQ=60,60,60;MPOS=14,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=3.17,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.247,0.247:5:0,0,1:0,1,0:0,3,2,0
chr9	141015899	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,15;MFRL=97,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:7,0:5,12,2,0
chr9	141107536	.	GGCAGCAGCAGCAGCAGCA	G,GGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCA,GGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,32,32,32;MFRL=209,107,162,157;MMQ=60,40,60,54;MPOS=26,24,21;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,6,13,14;RU=GCA;STR;TLOD=37.81,8.88,9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,11,3,3:0.400,0.171,0.169:22:4,5,2,2:1,6,1,1:3,2,4,13
chr9	141111397	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=163,67;MMQ=48,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr10	93993	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=217,217;MMQ=51,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,1:7,1:3,10,0,2
chr10	94018	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=222,232;MMQ=51,39;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:10,1:5,2:3,13,1,2
chr10	94026	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=218,227;MMQ=40,51;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:4,8:5,2:2,7,2,8
chr10	94083	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=170,204;MMQ=40,35;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:3,1,2,2
chr10	94136	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,261;MMQ=60,32;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr10	94545	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr10	95074	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=184,141;MMQ=49,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:5,0,6,0
chr10	95096	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=98,178;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.390:16:2,2:7,4:8,2,6,0
chr10	95188	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=135,65;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:14,0:6,2:0|1:95188_G_A:95188:10,10,1,1
chr10	95197	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=26,19;MFRL=139,65;MMQ=60,45;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,0:5,1:0|1:95188_G_A:95188:10,8,1,1
chr10	95226	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=20,29;MFRL=65,171;MMQ=45,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=69.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,17:0.858:19:0,9:2,8:0|1:95226_A_T:95226:1,1,6,11
chr10	95229	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=65,163;MMQ=45,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.850:18:0,7:2,8:0|1:95226_A_T:95226:1,1,5,11
chr10	267281	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=117,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:9,4:11,0:9,13,4,0
chr10	282897	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,1:0,8:0,0,3,6
chr10	285479	.	G	GTGT,GTGTT,GTGTTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32,35,34;MFRL=99,152,133,130;MMQ=60,60,60,60;MPOS=19,20,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=6.38,6.15,6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,3,3,3:0.268,0.302,0.301:10:1,2,2,0:0,1,1,2:0,1,1,8
chr10	292927	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,11:0,5:0,0,2,15
chr10	294953	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,10:0,8:0,0,10,8
chr10	329182	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=198,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.579:12:3,2:2,5:4,1,6,1
chr10	329188	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=154,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.317:14:2,3:8,0:0|1:329188_G_T:329188:8,2,3,1
chr10	329191	.	GC	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=154,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.317:14:2,3:7,1:0|1:329188_G_T:329188:8,2,3,1
chr10	329487	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=185,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr10	370737	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,2:6,1:10,0,3,0
chr10	370977	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,228;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	371001	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	373048	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=176,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:6,3:8,3:6,9,4,2
chr10	387060	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	394714	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,7:0,14:0,0,5,16
chr10	395266	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=171,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,3:1,5:1,0,6,2
chr10	395463	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr10	410825	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr10	428503	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr10	429903	.	GAAAAAAA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=178,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,9;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:4,0:0,1:4,1,1,0
chr10	435880	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=212,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:0,5:4,7:2,2,7,5
chr10	436848	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:2,4:8,1:2,8,0,5
chr10	444997	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,1:3,5:4,2,4,2
chr10	468748	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr10	518547	.	ACT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=243,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr10	530644	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr10	861110	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr10	875287	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=211,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:8,4:3,1:11,0,5,0
chr10	875556	.	T	TTA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=200,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:7,4:2,7:6,3,7,4
chr10	875660	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=174,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,0:5,3:4,7,2,1
chr10	910225	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=212,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,3:5,1:5,5,1,3
chr10	1038339	.	CAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0|1:1038339_CAAA_C:1038339:0,0,1,0
chr10	1038366	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,10;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:1038339_CAAA_C:1038339:4,0,1,0
chr10	1042023	.	A	AAAC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,8,10
chr10	1043058	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr10	1055055	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr10	1063085	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=127,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:11,4:11,0:13,10,4,0
chr10	1065406	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:2,1,3,1
chr10	1065458	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,3:7,3:7,3,4,2
chr10	1070461	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=258,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr10	1088746	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=213,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,4:5,3:1,6,1,6
chr10	1125997	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=119,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:9,9,1,1
chr10	1245893	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	1262872	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=157,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr10	1263076	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.565:10:4,3:0,0:1,3,2,4
chr10	1279598	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=368,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,4:4,1,6,3
chr10	1279617	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=163,104;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.132:21:11,0:6,2:12,7,2,0
chr10	1313266	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:9,0:7,5:1,15,0,5
chr10	1577017	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=188,203;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr10	1577067	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=94,191;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.605:13:4,5:1,3:2,3,6,2
chr10	1577218	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr10	3124516	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=215,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,5:3,7:6,0,11,1
chr10	3141468	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:5,2:8,0:6,7,3,0
chr10	3143054	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,24;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.634:3:0,2:0,0:0,1,0,2
chr10	3145885	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=264,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,1:0,4:1,0,6,0
chr10	3145906	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=264,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,4:0,6:1,0,9,1
chr10	3147192	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=214,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr10	3147456	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=229,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:0,4,4,3
chr10	3147501	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=197,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:0|1:3147501_C_T:3147501:3,7,1,2
chr10	3147508	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=184,240;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.528:13:3,3:3,3:0|1:3147501_C_T:3147501:3,3,1,6
chr10	3147518	.	GG	CC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=152,287;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:8,2:0|1:3147501_C_T:3147501:10,8,0,2
chr10	3150814	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=214,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:8,2:4,3:11,1,4,1
chr10	3154534	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=164,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:1,9,0,2
chr10	3155217	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=191,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr10	3155237	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=257,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr10	3155263	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=258,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,5:1,1:2,0,4,2
chr10	3155408	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=258,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:2,4:2,8:1,3,5,7
chr10	3155428	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=258,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,1:2,5:1,2,2,4
chr10	3155540	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=68.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,11:0,10:0,0,17,4
chr10	3155753	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=202,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,2:0,1,0,6
chr10	3160917	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=190,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:3,2,5,4
chr10	3162033	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=120,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,6:2,2:4,0,7,1
chr10	3167465	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=214,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr10	3171995	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=173,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,5:3,1:5,2,6,0
chr10	3172229	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=207,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr10	3172267	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=288,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr10	3174499	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.410:10:4,1:2,3:4,2,3,1
chr10	3175541	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=132,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:0,5,2,4
chr10	3178076	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:0,9,0,2
chr10	3179663	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=217,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:7,3,2,1
chr10	3179703	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:5,2:5,3:0|1:3179703_C_T:3179703:5,5,5,1
chr10	3179708	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:3,2:5,3:0|1:3179703_C_T:3179703:4,4,5,1
chr10	3180227	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=191,187;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,4:2,5:2,2,4,5
chr10	3180316	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=242,211;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0,5,0,5
chr10	3180343	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=165,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:2,4,2,4
chr10	3181282	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	3183747	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,3:3,5:3,0,7,1
chr10	3185573	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=167,57;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:11,0:10,3:13,8,1,2
chr10	3185798	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,6:5,2:1,6,5,3
chr10	3186458	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=220,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,4:3,8:4,4,6,6
chr10	3187749	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=163,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:4,7:3,5:7,0,12,0
chr10	3187924	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=67,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:2,6:2,8:0,4,3,11
chr10	3190265	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=191,211;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,10:1,4:1,0,7,7
chr10	3190298	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=191,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:0,5:1,6:1,0,7,4
chr10	3190369	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=205,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,3:8,5:5,7,5,3
chr10	3193557	.	TAAAAAAGAAACAA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=175,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,1:7,2:6,6,0,3
chr10	3199555	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=199,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr10	3200155	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=200,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,4:3,2:3,0,6,0
chr10	3200387	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	3201010	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=158,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:4,0,3,0
chr10	3201072	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=173,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,4,0
chr10	3201097	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,7:3,5:0,5,8,4
chr10	3202140	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=154,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,3:1,4:2,4,4,3
chr10	3205851	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=215,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,5:2,4:2,0,8,1
chr10	3207705	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,108;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:7,4:4,3:2,9,2,5
chr10	3208557	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=147,130;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.431:16:4,1:5,4:2,7,3,4
chr10	3208581	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=147,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:1,6,1,1
chr10	3208583	.	A	AGAGGAATGGCACGCTAGGGAAGGC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=147,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:1,6,1,1
chr10	3214995	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr10	3824422	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=283,294;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr10	4884784	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr10	4884800	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=193,249;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr10	4889525	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,5,9
chr10	4889770	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=169,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:3,10,1,1
chr10	5014678	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=153,146;MMQ=58,44;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,3:0,2:4,1,4,1
chr10	5014878	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,197;MMQ=27,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:12,1:14,1:12,14,0,2
chr10	5032239	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=145,204;MMQ=27,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:6,3:9,1:12,3,0,4
chr10	5032284	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=151,230;MMQ=39,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:7,2:14,2:8,13,2,2
chr10	5032286	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=191,148;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:4,5:6,9:5,6,5,9
chr10	5037718	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=207,217;MMQ=27,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr10	5040977	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:5,1:5,1:2,8,0,2
chr10	5042664	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=200,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:4,3:10,2:10,4,3,2
chr10	5045834	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=168,229;MMQ=52,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:2,2,3,1
chr10	5136707	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=152,175;MMQ=60,20;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:11,2:0|1:5136707_A_G:5136707:9,15,0,2
chr10	5136709	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=152,175;MMQ=60,20;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:11,2:0|1:5136707_A_G:5136707:9,17,0,2
chr10	5136711	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=152,175;MMQ=60,20;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:11,2:0|1:5136707_A_G:5136707:9,17,0,2
chr10	5141132	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=228,54;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:0,7,0,4
chr10	5144599	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=140,256;MMQ=50,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:3,2,0,4
chr10	5144621	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=203,249;MMQ=40,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:2,3,0,3
chr10	5144638	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=172,249;MMQ=34,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:2,4,0,3
chr10	5144657	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=239,249;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr10	5147909	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=206,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,3:7,1:0,10,0,4
chr10	5196273	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=206,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:2,0,6,1
chr10	5196479	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=192,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr10	5200059	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=169,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,1:3,2:0,8,0,3
chr10	5200075	.	CA	TG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=187,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr10	5200739	.	T	TAGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=242,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,1:2,1,5,0
chr10	5201979	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=203,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:5,0,5,0
chr10	5201996	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=151,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:11,2:4,1:13,2,3,0
chr10	5202104	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=176,206;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,2:7,1:6,7,0,3
chr10	5202144	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=176,206;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:7,2:6,1:0|1:5202144_G_GA:5202144:4,11,0,3
chr10	5202145	.	T	TTGAAA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=176,206;MMQ=60,40;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:8,2:7,1:0|1:5202144_G_GA:5202144:4,11,0,3
chr10	5202241	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr10	5203944	.	AC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=163,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,3:4,5:2,3,2,6
chr10	5242346	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr10	5247701	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=171,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,1:6,2:3,9,2,1
chr10	5260786	.	GTC	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:2,1:4,0:2,4,0,2
chr10	5260812	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr10	5436487	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=184,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr10	5446632	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:0,6:1,3:1,0,9,0
chr10	5498248	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,5:0,7:0,1,0,12
chr10	5540973	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=119,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:1,1,2,0
chr10	5568236	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:6,2:5,2:8,3,4,2
chr10	5682641	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr10	5682855	.	TG	CC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr10	5682868	.	C	CGCGGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:5682868_C_CGCGGG:5682868:0,4,0,1
chr10	5682869	.	A	AAATT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:5682868_C_CGCGGG:5682868:0,4,0,1
chr10	5682871	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:5682868_C_CGCGGG:5682868:0,4,0,1
chr10	5683649	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=160,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr10	5683848	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:11,2:8,0:9,10,1,1
chr10	5693379	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr10	5766337	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,4:3,10:3,3,9,5
chr10	5784509	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:2,6,1,2
chr10	5788110	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=163,293;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr10	5790991	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=170,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:6,0:15,2:12,9,2,0
chr10	5791121	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:5,7,0,2
chr10	5799506	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=120,142;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:9,8:7,0:7,9,8,0
chr10	5804865	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=193,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,1:2,5:3,0,5,1
chr10	5805087	.	AAC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:1,0:6,2:0,8,0,2
chr10	5827074	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.614:16:2,6:4,4:4,2,6,4
chr10	5837038	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=157,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr10	5853767	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=146,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.325:22:3,2:12,4:15,0,6,1
chr10	5853919	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=140,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.108:30:9,0:15,0:9,18,0,3
chr10	5853923	.	TA	T,TAA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,26,11;MFRL=140,142,123;MMQ=60,60,60;MPOS=12,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=8.11,4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,3:0.386,0.118:16:3,3,1:3,3,0:1,6,1,8
chr10	5920350	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	5922167	.	AGG	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,15;MFRL=0,145;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:5922167_AGG_A:5922167:0,1,1,0
chr10	5922171	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,15;MFRL=92,145;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:5922167_AGG_A:5922167:1,1,1,0
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chr10	6005674	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:2,2:4,1:3,4,3,0
chr10	6008030	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=191,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr10	6008121	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=165,44;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,0:4,2:0|1:6008121_A_G:6008121:7,5,1,1
chr10	6008127	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=165,44;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:7,2:0|1:6008121_A_G:6008121:8,6,1,1
chr10	6008130	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=176,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:7,2:0|1:6008121_A_G:6008121:9,5,1,1
chr10	6008132	.	T	TGGCTCATG	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=176,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:6,2:0|1:6008121_A_G:6008121:9,5,1,1
chr10	6054912	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=187,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.463:26:8,6:6,6:7,7,5,7
chr10	6054951	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=192,51;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:2,8,0,4
chr10	6061277	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr10	6061479	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,1:8,2:8,7,2,1
chr10	6061499	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=196,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:6,1:4,1:4,6,1,1
chr10	6061781	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,6:0,0,10,5
chr10	6063383	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	6063426	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=224,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:0|1:6063426_AG_A:6063426:7,2,1,1
chr10	6063429	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=224,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:6063426_AG_A:6063426:7,2,1,1
chr10	6063674	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr10	6066200	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:12,2:6,1:10,8,2,1
chr10	6146960	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,275;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:6,4:15,1:14,8,3,2
chr10	6156118	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,5,18
chr10	6245317	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=153,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:13,2:7,1:9,11,1,2
chr10	6258015	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr10	6258052	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr10	6258796	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,5,11
chr10	6258840	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr10	6259239	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,0,9
chr10	6261494	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=223,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:10,2,1,1
chr10	6261704	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=146,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.537:15:4,4:2,4:2,5,1,7
chr10	6262905	.	G	GTGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TGC;STR;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	6268422	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	6273170	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=187,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.367:13:6,4:2,0:8,0,3,2
chr10	6472962	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:6472962_T_G:6472962:0,0,0,3
chr10	6472969	.	G	GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=198,222;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:6472962_T_G:6472962:0,2,0,1
chr10	6521033	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,1:12,1:12,12,2,0
chr10	6533625	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:12,0:13,3:19,7,2,1
chr10	6533871	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=198,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr10	7205717	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,3:7,2:8,2,3,2
chr10	7230524	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,250;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr10	7242441	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=201,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:6,6:3,7:1,8,4,9
chr10	7318803	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:0,2:2,2:1,1,3,1
chr10	7423923	.	CA	C,CAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,34,25;MFRL=251,212,200;MMQ=60,60,60;MPOS=18,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=13.09,3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,6,2:0.502,0.213:11:1,2,1:1,3,0:0,3,0,8
chr10	7423960	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr10	7605067	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,8,7
chr10	7605077	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=62.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,10:0,0,8,9
chr10	7605101	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,9,9
chr10	7615195	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=99,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr10	7618993	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=199,72;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:7618993_G_A:7618993:1,6,1,1
chr10	7618997	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=199,72;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:7618993_G_A:7618993:1,6,1,1
chr10	7622047	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	7622075	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr10	7628055	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr10	7763006	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=214,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,0:4,3:0|1:7763006_A_C:7763006:0,9,0,3
chr10	7763012	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=214,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,0:6,3:0|1:7763006_A_C:7763006:0,9,0,3
chr10	7769604	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr10	7773688	.	A	AAAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,46;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	7773976	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=259,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,4:1,3:0,2,1,6
chr10	7785017	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=201,235;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr10	7788495	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=213,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,1:1,4:2,0,5,0
chr10	7798150	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	7811407	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=258,248;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr10	7830319	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr10	7838208	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr10	7838932	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=191,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr10	7839225	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=152,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr10	7844195	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:1,10:1,4:2,0,11,3
chr10	7844906	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=275,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr10	7849054	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	7849688	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=144,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:3,5:6,0:3,6,2,3
chr10	7866266	.	TTCA	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=149,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:10,3:5,0:0|1:7866266_TTCA_T:7866266:8,8,2,1
chr10	7866268	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,15:0.948:15:0,10:0,5:1|0:7866266_TTCA_T:7866266:0,0,8,7
chr10	7866557	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=176,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr10	7866576	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=176,256;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr10	8007559	.	GT	CC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,17:0.643:26:4,7:5,10:0|1:8007559_GT_CC:8007559:4,5,5,12
chr10	8007560	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,26:0.962:26:0,11:0,15:1|0:8007559_GT_CC:8007559:0,0,9,17
chr10	8055615	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=259,199;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr10	8093185	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,23:0.828:27:3,14:1,9:1,3,8,15
chr10	8111345	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=285,170;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:2,1:0,0:0|1:8111345_C_CTT:8111345:3,0,1,0
chr10	8111367	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,16;MFRL=149,170;MMQ=47,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,0:0|1:8111345_C_CTT:8111345:4,0,1,0
chr10	8111374	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,15;MFRL=95,228;MMQ=47,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:1,0:3,1,2,0
chr10	8111409	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=236,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.747:10:1,2:1,5:2,0,5,3
chr10	8111621	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,1:4,1:1,10,0,2
chr10	8115668	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=232,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.711:5:1,2:0,1:1,0,3,1
chr10	11047228	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,192;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr10	11060176	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=189,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr10	11290997	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=199,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr10	11299735	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,12:0,0,11,9
chr10	11312575	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=190,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,2:7,1:7,5,2,1
chr10	11316909	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr10	11316987	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=153,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:0,11:1,6:1,0,9,9
chr10	11330525	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=143,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,8:2,3:1,3,3,8
chr10	11330548	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=212,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:1,9,0,2
chr10	11330576	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=212,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:7,2:3,0:0,10,0,2
chr10	11356093	.	T	TTTTG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,5:0,0,6,7
chr10	11360673	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=201,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,1:3,2:5,4,3,0
chr10	11362789	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=201,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:1,1:0,1:1,0,2,1
chr10	11367780	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.601:17:3,6:4,4:4,3,7,3
chr10	11527332	.	TAAA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:11527332_TAAA_T:11527332:0,4,0,1
chr10	11527336	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:11527332_TAAA_T:11527332:0,4,0,1
chr10	11527340	.	T	TTGTACTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:11527332_TAAA_T:11527332:0,4,0,1
chr10	11532758	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,2:3,2:8,1,3,1
chr10	11543086	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=142,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:9,4:5,3:12,2,5,2
chr10	11560553	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=200,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:8,6:6,0:5,9,6,0
chr10	11789250	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr10	11789290	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr10	11789511	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr10	11797619	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr10	11797675	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=186,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr10	11912065	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=195,248;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	11973548	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=173,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:3,1,2,0
chr10	11978499	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:0,7:5,3:4,1,7,3
chr10	11978638	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=186,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:11978638_C_A:11978638:5,8,0,2
chr10	11978645	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=185,108;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:5,0:6,2:0|1:11978638_C_A:11978638:5,7,0,2
chr10	12009320	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=188,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,1:5,4:8,4,2,3
chr10	12041840	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=97,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:2,1,2,1
chr10	12055986	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=161,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,2:3,2:6,1,1,3
chr10	12056244	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=230,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr10	12071535	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,0:4,4:2,6,1,3
chr10	12123666	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0|1:12123666_C_T:12123666:2,2,0,4
chr10	12123667	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=172,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,3:0.364:9:3,2:3,1:1|0:12123666_C_T:12123666:1,5,1,2
chr10	12126490	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,1:3,1:6,0,2,0
chr10	12136395	.	CC	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=225,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12136395_CC_TA:12136395:0,1,0,1
chr10	12136398	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=225,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12136395_CC_TA:12136395:0,1,0,1
chr10	12140030	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=230,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr10	12142299	.	TTGA	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=169,230;MMQ=48,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:12142299_TTGA_T:12142299:0,4,0,1
chr10	12142305	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=169,230;MMQ=48,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:12142299_TTGA_T:12142299:0,4,0,1
chr10	12142328	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,32;MFRL=173,164;MMQ=55,36;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:12142328_A_G:12142328:0,3,0,1
chr10	12142337	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,27;MFRL=173,164;MMQ=55,36;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:12142328_A_G:12142328:0,3,0,1
chr10	12142339	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,29;MFRL=173,164;MMQ=55,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:12142328_A_G:12142328:0,3,0,1
chr10	12142345	.	CA	AG,TG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,26,29;MFRL=161,173,164;MMQ=58,41,36;MPOS=18,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,1,1:1,0,0:0,2,0,2
chr10	12142362	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=209,173;MMQ=57,41;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr10	12143227	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr10	12149939	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,12:0,4:0,0,9,7
chr10	12154833	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr10	12159647	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:0,1,3,2
chr10	12159845	.	ATCTCCCCTCTCCTATTTT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	12162191	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:10,1:10,3:13,7,4,0
chr10	12162338	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,2:1,0:0,3,0,3
chr10	12195881	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr10	12198019	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=163,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:0,5,0,5
chr10	12199893	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=177,84;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,1:8,4:9,4,4,1
chr10	12200125	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=120,251;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:5,3:2,1:0,7,0,5
chr10	12200160	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,48;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr10	12202866	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=175,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:3,3:5,1,3,0
chr10	12203197	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr10	12204196	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:8,5,0,2
chr10	12206436	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:7,0:14,2:7,15,0,2
chr10	12215870	.	CTT	C,CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33,31;MFRL=164,148,161;MMQ=60,52,40;MPOS=13,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.38,9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,5:0.229,0.465:10:3,1,3:0,1,2:1,2,0,7
chr10	12227067	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr10	12240619	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=230,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr10	12252060	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.377:30:8,0:10,11:1,18,0,11
chr10	12252217	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=186,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:6,0,4,0
chr10	12288302	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=79,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:1,1,0,3
chr10	12292636	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	12595443	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	12833090	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,8:5,0:9,2,8,0
chr10	12858409	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=172,272;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr10	12866356	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:0,5:1,4:1,0,10,0
chr10	12866501	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=204,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,0:7,2:8,10,1,1
chr10	12870714	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=254,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:2,0,4,1
chr10	12870907	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=161,263;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.562:7:2,1:0,2:2,1,0,4
chr10	12940377	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,18,3
chr10	12940432	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:17,0:9,3:13,13,1,2
chr10	12940455	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,12:0,9:0,0,8,13
chr10	13151199	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.317:13:4,0:4,0:3,6,4,0
chr10	13151224	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=218,100;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,2:4,1:5,4,0,3
chr10	13152504	.	GTT	G,GT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34,32;MFRL=0,210,189;MMQ=60,60,60;MPOS=20,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.30,22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,7:0.247,0.676:9:0,1,5:0,1,2:0,0,0,9
chr10	13152515	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=192,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,2:3,2:0,9,0,4
chr10	13167602	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=162,43;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:5,7,1,1
chr10	13167860	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr10	13175682	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=120,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr10	13178697	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:3,1,4,0
chr10	13212884	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr10	13213025	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=172,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:11,3:4,0:10,5,1,2
chr10	13214812	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=61.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,0,17
chr10	13224886	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=209,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:2,1,6,0
chr10	13233471	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=250,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr10	13237015	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=277,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,5:1,5:1,0,8,2
chr10	13239651	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=90,207;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,1:8,1:7,4,1,1
chr10	13240887	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=219,296;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr10	13275514	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr10	13275676	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=441,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,5:1,10:0,1,5,10
chr10	13275691	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=441,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.840:10:0,3:1,6:0,1,3,6
chr10	13320236	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=228,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr10	13320411	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr10	13330402	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:1,3,4,2
chr10	13343857	.	TA	T,TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26,27;MFRL=145,151,209;MMQ=60,60,60;MPOS=25,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.28,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.250,0.321:7:2,1,1:1,1,1:3,0,4,0
chr10	13489148	.	T	TGCAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCAGA;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	13489201	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:4,0,1,1
chr10	13534851	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=252,151;MMQ=39,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:1,10:11,4:1,11,7,7
chr10	13534858	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=162,252;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:12,0:4,11:8,8,0,11
chr10	13541724	.	T	TAAAAC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=232,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:3,7:1,4:4,0,9,4
chr10	13633928	.	GT	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.567:14:2,3:3,5:2,4,1,7
chr10	13658335	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=190,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr10	13693883	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=186,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,5:2,2:6,2,3,4
chr10	13696552	.	G	GCATATAGGGGTAAGTAAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=131,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:2,6,1,1
chr10	13696570	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=170,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0,6,1,1
chr10	13701469	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=178,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.346:21:8,5:6,2:4,10,1,6
chr10	13702231	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=200,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,5,0
chr10	13717076	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=200,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr10	13743251	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=168,264;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr10	13743517	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,0:6,2:1,9,0,2
chr10	13782110	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:13782110_A_C:13782110:0,0,7,2
chr10	13782124	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=127,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.848:11:0,3:1,7:0|1:13782110_A_C:13782110:1,0,7,3
chr10	13782474	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=111,71;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:8,2:12,0:14,7,2,0
chr10	13782605	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr10	13838604	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=210,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,1:4,3:2,5,3,1
chr10	14050018	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=183,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.310:27:13,8:6,0:0|1:14050018_T_A:14050018:14,5,8,0
chr10	14050024	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=183,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.310:27:14,7:5,0:0|1:14050018_T_A:14050018:14,5,8,0
chr10	14563097	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=213,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr10	14816448	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=163,244;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:7,3:10,3:7,10,3,3
chr10	14882040	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.318:14:4,3:5,1:4,6,3,1
chr10	14882060	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=122,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:3,3,6,2
chr10	14885598	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:5,3:12,2:5,12,2,3
chr10	14913452	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,3:6,0:10,1,3,0
chr10	14943176	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=169,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,7:4,5:2,7,5,7
chr10	14943184	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=157,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,0:7,3:5,13,1,2
chr10	14976326	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31,24;MFRL=280,201,131;MMQ=60,60,60;MPOS=5,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=A;STR;TLOD=5.32,3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.368,0.303:8:2,2,1:0,0,1:2,0,4,2
chr10	15014418	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr10	15014440	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:7,0,5,0
chr10	15014696	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=128,228;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15014696_T_G:15014696:0,1,0,1
chr10	15014698	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=128,228;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15014696_T_G:15014696:0,1,0,1
chr10	15014702	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=128,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15014696_T_G:15014696:0,1,0,1
chr10	15106379	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=85,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,2:4,1:3,3,3,0
chr10	15138833	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=148,82;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:5,0:9,2:0|1:15138833_C_T:15138833:3,11,1,2
chr10	15138835	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,82;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,0:9,3:0|1:15138833_C_T:15138833:3,11,1,2
chr10	15151311	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=202,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:15151311_CA_TG:15151311:0,1,0,1
chr10	15151317	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=202,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:15151311_CA_TG:15151311:0,1,0,1
chr10	15154974	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=72.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,5,17
chr10	15258148	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr10	15317834	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=109,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:6,0,1,1
chr10	15590372	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	15648243	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=201,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:2,7:1,9:1,2,12,4
chr10	15650403	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=206,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15650403_C_T:15650403:0,1,0,1
chr10	15650411	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15650403_C_T:15650403:0,0,0,1
chr10	15685983	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr10	15713507	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=208,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr10	15713541	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chr10	15729923	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,11,2
chr10	15761527	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	15902303	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=174,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:7,12:3,0:5,6,5,7
chr10	16526840	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=78,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:3,4,0,2
chr10	16547058	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.512:21:5,5:5,6:7,3,6,5
chr10	16556710	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,1,3
chr10	16736977	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=294,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,5:1,2:1,0,8,0
chr10	16795007	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=146,146;MMQ=27,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,17:0.400:43:19,0:7,17:3,23,0,17
chr10	16806545	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=219,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,4:4,1:0,4,1,4
chr10	16824091	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,10;MFRL=189,216;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.248:9:2,0:2,0:0|1:16824091_G_T:16824091:2,5,0,2
chr10	16824095	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=189,216;MMQ=60,59;MPOS=-1073741811;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.248:9:3,0:3,2:0|1:16824091_G_T:16824091:2,5,0,2
chr10	16824096	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=19,28;MFRL=189,216;MMQ=60,59;MPOS=-1073741812;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.265:9:1,0:2,2:0|1:16824091_G_T:16824091:2,5,0,2
chr10	16867154	.	G	GCTGTTCTTTGTCCTGCAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16867154_G_GCTGTTCTTTGTCCTGCAGT:16867154:0,1,0,1
chr10	16867156	.	A	AGTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16867154_G_GCTGTTCTTTGTCCTGCAGT:16867154:0,1,0,1
chr10	16867179	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	16870721	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=242,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:1,3:5,0:6,0,3,0
chr10	16876922	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=198,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:0,2:5,2:5,0,4,0
chr10	16877049	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=145,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:8,5,0,2
chr10	16877225	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=189,222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,0:2,5:0,6,0,5
chr10	16878204	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=114,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,6:3,9:4,2,6,9
chr10	16911556	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	16911605	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr10	16932582	.	A	AAGGTAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=212,215;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr10	16945905	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=233,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr10	16948177	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=231,234;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,3:2,5:2,0,5,3
chr10	16949447	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:1,0:5,2:7,0,2,0
chr10	16967445	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,4,9
chr10	16992184	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=230,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,0:2,4:0,6,0,4
chr10	17007847	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=190,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr10	17024404	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr10	17026010	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr10	17032281	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,0,2
chr10	17032559	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:17032559_A_C:17032559:0,0,0,8
chr10	17032561	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,4:0|1:17032559_A_C:17032559:0,0,0,8
chr10	17088006	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:3,2:10,6:5,8,4,4
chr10	17110595	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=37.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:8,12:2,2:7,3,9,5
chr10	17126545	.	C	CCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=224,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=CA;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,1,2
chr10	17130199	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,2:7,6:3,5,5,3
chr10	17146652	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=158,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:0|1:17146652_C_A:17146652:1,5,0,3
chr10	17146667	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0|1:17146652_C_A:17146652:1,3,0,2
chr10	17152855	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=182,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:2,1:7,1:10,0,2,0
chr10	17156096	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=157,123;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,0:14,3:15,10,0,3
chr10	17157402	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:9,1,4,0
chr10	17157630	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:0,2,3,4
chr10	17164569	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:6,4:11,1:8,9,3,2
chr10	17164625	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=193,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:1,5,0,4
chr10	17164760	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=103,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,3:0,1:3,0,4,1
chr10	17164809	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=135,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,0:5,0:6,9,3,0
chr10	17164818	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=125,109;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,0:6,0:7,9,2,0
chr10	17165545	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=133,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,3:5,3:6,7,4,2
chr10	17165552	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=137,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,2:4,3:6,8,4,1
chr10	17171265	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr10	17199419	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr10	17199830	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=152,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr10	17201179	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=158,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:11,2:0|1:17201179_T_C:17201179:10,10,1,1
chr10	17201188	.	G	GTCTACAT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=154,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:0|1:17201179_T_C:17201179:10,11,1,1
chr10	17202381	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.400:10:2,3:2,0:4,2,0,4
chr10	17204139	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.363:14:5,2:4,2:9,0,4,1
chr10	17204246	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=167,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.475:9:3,3:1,1:3,2,0,4
chr10	17204247	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.338:14:5,4:4,1:5,4,1,4
chr10	17204248	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,2:5,0:6,6,0,2
chr10	17210822	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:3,3:4,11:6,1,9,5
chr10	17214154	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=206,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr10	17243480	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,14,1
chr10	17365228	.	GCA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	17645569	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:5,3,2,0
chr10	17645814	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:3,3,3,3
chr10	17686234	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=199,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,1:3,4:3,0,4,1
chr10	17746575	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=231,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17746575_T_G:17746575:0,1,0,1
chr10	17746594	.	T	TTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=200,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:17746575_T_G:17746575:0,3,0,1
chr10	17747053	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=112,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:4,4,0,8
chr10	17747500	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=212,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:6,0,3,0
chr10	17751002	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=231,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:1,3,1,3
chr10	17756718	.	C	CTCCCTAGTAGCTGGGATTA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=175,55;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:17,1:6,2:14,9,1,2
chr10	18266783	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,3:3,1:3,3,4,0
chr10	18270140	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr10	18270422	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:3,2:3,5,2,4
chr10	18280054	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:2,3:2,0:2,2,3,0
chr10	18280071	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=153,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:2,0:4,1:4,5,2,0
chr10	18439926	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=171,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:10,4:2,2:1,11,0,6
chr10	18691018	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=210,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr10	18787195	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=162,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr10	18789724	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr10	18816633	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr10	18824958	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=132,225;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr10	18828371	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=185,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,4:8,2:7,6,3,3
chr10	18828635	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=184,132;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:9,3:4,3:7,6,2,4
chr10	18834797	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	18836957	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=226,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,5:3,2:3,0,7,0
chr10	18837223	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,0:0,4,0,3
chr10	18840919	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,5:0,5:0,1,3,7
chr10	18898701	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,5,0
chr10	18898729	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.610:16:3,3:3,6:5,1,7,3
chr10	18898960	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0,2,1,2
chr10	18931512	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=207,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr10	18931580	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=153,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr10	18937579	.	A	AAAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAG;STR;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,1:4,2:1,5,0,3
chr10	19492566	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=0,306;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,4:2,3:3,0,6,1
chr10	19492832	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=146,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:4,5:0,4:1,3,1,8
chr10	19493144	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=28,34;MFRL=149,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:2,1,3,0
chr10	19493210	.	G	GT	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=29,27;MFRL=126,71;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.413:14:6,2:2,3:6,2,4,2
chr10	19493229	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=26,10;MFRL=123,70;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.162:17:4,0:4,0:0|1:19493229_C_A:19493229:8,7,2,0
chr10	19493231	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=31,13;MFRL=135,70;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.152:18:6,0:4,0:0|1:19493229_C_A:19493229:9,7,2,0
chr10	19493234	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=32,15;MFRL=141,70;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.145:19:6,0:6,0:0|1:19493229_C_A:19493229:9,8,2,0
chr10	19493247	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=32,15;MFRL=127,70;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:7,0:0|1:19493229_C_A:19493229:7,9,2,0
chr10	19493250	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=33,14;MFRL=123,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:6,0:0|1:19493229_C_A:19493229:7,12,2,0
chr10	19493254	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=33,10;MFRL=118,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,0:6,0:0|1:19493229_C_A:19493229:7,11,2,0
chr10	19493256	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=35,20;MFRL=134,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,3:6,0:8,8,0,3
chr10	19493415	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,225;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,4:0,1:0,3,0,5
chr10	19546796	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,37;MFRL=103,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr10	19571941	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=237,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:5,2,1,1
chr10	19612946	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=163,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:7,3:6,6:6,7,4,5
chr10	19616400	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=159,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,2:2,0:2,1,2,0
chr10	19641231	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=207,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr10	19641239	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=219,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.653:2:0,1:1,0:0|1:19641239_CTG_C:19641239:0,1,0,1
chr10	19641253	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,26;MFRL=219,207;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.653:2:0,1:1,0:0|1:19641239_CTG_C:19641239:0,1,0,1
chr10	19678286	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
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chr10	19739459	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,1,3
chr10	19884376	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=176,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:19884376_G_C:19884376:3,5,1,1
chr10	19884380	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=77,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:5,2:0|1:19884376_G_C:19884376:3,12,1,1
chr10	19884385	.	C	CTCAGAACCCTCCAA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=77,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:19884376_G_C:19884376:3,11,1,1
chr10	19896830	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=156,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,3:2,5:1,3,2,6
chr10	20105936	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr10	20105996	.	TGGC	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGC;STR;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.733:9:1,4:1,3:2,0,6,1
chr10	20290956	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=213,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:4,2:0,5:0,4,0,7
chr10	20335880	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,0:8,3:11,6,0,3
chr10	20357050	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=121,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,1:5,2:10,3,2,1
chr10	20357222	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:20357222_A_T:20357222:2,9,0,2
chr10	20357231	.	A	ATTTATTT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:20357222_A_T:20357222:1,8,0,2
chr10	20357233	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=171,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,4:0.385:11:4,3:2,1:1|0:20357222_A_T:20357222:0,7,1,3
chr10	20436838	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=207,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,4:3,2:1,3,3,3
chr10	20436875	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=195,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,1,2
chr10	20500710	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=364,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,3:1,5:0,3,2,6
chr10	20506326	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=209,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:5,0,4,1
chr10	21076307	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=233,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr10	21104694	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=131,248;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr10	21106716	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,1:1,2,0,2
chr10	21108377	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,245;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:4,2,1,3
chr10	21112111	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=121,312;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:6,2,2,1
chr10	21141469	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:1,2:0,1,5,0
chr10	21147370	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	21148584	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr10	21157492	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	21157763	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	21176945	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr10	21177156	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=223,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:1,4:0,2,1,7
chr10	21185821	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr10	21188197	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=174,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr10	21435340	.	ACACT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=200,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,3:5,5:5,4,3,5
chr10	21461232	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=206,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:5,0,5,0
chr10	21461410	.	GA	G,GAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=18,33,18;MFRL=137,130,191;MMQ=60,60,60;MPOS=25,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.03,4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,4:0.198,0.323:12:1,1,1:0,1,0:0,6,0,6
chr10	21462763	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=165,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:6,2:7,0:0|1:21462763_G_A:21462763:3,10,0,2
chr10	21462767	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=165,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:6,0:0|1:21462763_G_A:21462763:1,10,0,2
chr10	21785648	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=320,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr10	21806029	.	GGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=172,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:3,3:5,0,3,0
chr10	21807469	.	GAAA	G,GAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,27,33;MFRL=194,0,157;MMQ=60,60,60;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.69,17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,8:0.131,0.450:19:1,1,5:4,0,1:2,7,7,3
chr10	21807779	.	C	CT,CTTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32,19;MFRL=232,316,55;MMQ=60,60,60;MPOS=10,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,19,21;RU=T;STR;TLOD=3.80,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,4:0.254,0.433:9:1,1,1:1,1,0:2,1,1,5
chr10	21808637	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,139;MMQ=60,39;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,0:10,2:0,16,0,2
chr10	21906185	.	AT	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.188:23:8,2:11,2:7,12,0,4
chr10	21962230	.	T	TGGGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:21962230_T_TGGGGG:21962230:0,0,1,0
chr10	21962238	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21962230_T_TGGGGG:21962230:0,0,1,0
chr10	21971254	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,1:4,3:0,10,2,2
chr10	22019790	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=154,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,0:6,3:13,2,2,1
chr10	22171242	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=162,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.172:19:10,2:6,0:6,10,2,1
chr10	22171245	.	C	CTTTCTTGACCACAAAGA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=154,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:6,0:8,10,1,1
chr10	22193422	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:3,2,3,0
chr10	22618191	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=192,138;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:7,7:9,0:0|1:22618191_T_A:22618191:14,2,7,0
chr10	22618196	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=192,138;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:7,6:9,0:0|1:22618191_T_A:22618191:14,2,7,0
chr10	22826093	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,12,3
chr10	22828835	.	AGAGAGG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,58;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.855:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	22829072	.	AGG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.698:1:0,1:0,0:0|1:22829072_AGG_A:22829072:0,0,0,1
chr10	22829081	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=194,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:22829072_AGG_A:22829072:0,1,0,1
chr10	22830719	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,8,4
chr10	22856544	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=166,90;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:7,0,2,0
chr10	22856560	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=166,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr10	22896779	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,242;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,3:2,1:5,1,3,1
chr10	23244917	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=194,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr10	23297301	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=169,211;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:2,4,3,3
chr10	23297336	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=125,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:2,2:4,4:1,5,2,4
chr10	23408139	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr10	23580283	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=193,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:0,3,0,5
chr10	23622202	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	23632970	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=207,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:0,3,1,5
chr10	24722204	.	T	TCATATACCTGTTAGCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=294,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:24722204_T_TCATATACCTGTTAGCC:24722204:0,2,0,1
chr10	24722208	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=294,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:24722204_T_TCATATACCTGTTAGCC:24722204:0,2,0,1
chr10	24727492	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=292,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr10	24790491	.	GC	TT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,1,3
chr10	24813443	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:4,5:8,2:6,6,1,6
chr10	24878129	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,6:0,2:0,1,8,0
chr10	24880712	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=199,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:3,3,3,3
chr10	24883773	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=234,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr10	24884779	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:6,6:4,5:4,6,7,4
chr10	24889901	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr10	24918827	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=166,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:5,2:5,3:5,6,1,4
chr10	25138719	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:7,3:8,4:7,8,3,4
chr10	25140411	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=238,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr10	25273311	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,227;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.291:14:9,1:1,2:4,6,0,4
chr10	25279379	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:1,2:8,0:7,2,1,1
chr10	25284889	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=227,320;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	25288454	.	TGCC	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=164,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:6,0:0|1:25288454_TGCC_T:25288454:4,7,1,1
chr10	25288465	.	T	TTC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=149,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:25288454_TGCC_T:25288454:3,6,1,1
chr10	25288466	.	GGA	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=157,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:5,0:0|1:25288454_TGCC_T:25288454:3,7,1,1
chr10	25288471	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=149,57;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:5,0:0|1:25288454_TGCC_T:25288454:2,7,1,1
chr10	25304677	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr10	25313198	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:11,0:10,2:6,15,0,2
chr10	25314799	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=138,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,0:4,2:1,10,0,2
chr10	25464666	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=265,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr10	25755730	.	CACACAT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=193,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr10	25755732	.	CACAT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=37,31;MFRL=195,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.695:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr10	26310403	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=161,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,1:1,0,3,1
chr10	26310597	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:2,4:2,2,4,5
chr10	26310679	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=212,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr10	26355862	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0|1:26355862_G_T:26355862:0,0,5,2
chr10	26355872	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:26355862_G_T:26355862:0,0,7,3
chr10	26355906	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chr10	26355992	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,7:0,0,3,8
chr10	26356014	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=42.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,3,7
chr10	26356037	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr10	26356066	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr10	26357625	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,360;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	26357820	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr10	26359180	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,6,13
chr10	26359200	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=44.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr10	26385222	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=200,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr10	26417531	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr10	26436287	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=216,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0|1:26436287_G_T:26436287:3,0,3,0
chr10	26436298	.	TGAG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=197,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAG;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,3:0.571:5:0,2:2,1:1|0:26436287_G_T:26436287:2,0,3,0
chr10	26443646	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr10	26457585	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr10	26457637	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=193,165;MMQ=48,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:10,0,3,0
chr10	26463130	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=227,160;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,5:0,5:1,1,7,3
chr10	26463587	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,315;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	26465792	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=200,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr10	26506999	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr10	26534809	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=198,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr10	26559571	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=207,126;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:2,5:2,3:1,3,7,1
chr10	26575221	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=204,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr10	26589703	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,190;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,6:3,0:2,3,6,0
chr10	26781157	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=224,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr10	26781355	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:1,5,0,4
chr10	26781388	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr10	26802633	.	ATT	A,AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=16,20,25;MFRL=139,152,140;MMQ=60,60,60;MPOS=20,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=6.17,11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,5:0.275,0.359:15:2,1,1:0,1,3:1,5,0,9
chr10	26851426	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=191,334;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr10	26856213	.	C	CCCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,380;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=CCG;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	26994345	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.244:14:9,3:2,0:2,9,1,2
chr10	27009334	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=191,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:0,3:1,5:0,1,1,7
chr10	27035478	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=218,183;MMQ=60,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr10	27052888	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=163,241;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,1:7,1:8,12,0,2
chr10	27065976	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,272;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:9,1:4,3:8,5,3,1
chr10	27306557	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=168,53;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:5,0:9,4:8,6,4,0
chr10	27317778	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:8,6:6,4:6,8,5,5
chr10	27318371	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=218,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:1,4,0,5
chr10	27322372	.	TTA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0|1:27322372_TTA_T:27322372:0,4,0,3
chr10	27322391	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=166,252;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:27322372_TTA_T:27322372:0,3,0,2
chr10	27326017	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=173,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr10	27326999	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=184,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,4:1,6:0,1,0,10
chr10	27333121	.	TA	T,TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30,30;MFRL=159,137,183;MMQ=60,60,60;MPOS=14,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.57,3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,3:0.317,0.248:12:1,2,0:3,2,3:0,5,2,5
chr10	27350092	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=145,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0|1:27350092_G_A:27350092:5,7,1,1
chr10	27350094	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=148,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,2:3,0:0|1:27350092_G_A:27350092:6,7,1,1
chr10	27350096	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=148,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:0|1:27350092_G_A:27350092:6,7,1,1
chr10	27350098	.	A	AGGGTCTTGTGTCCC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=148,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:0|1:27350092_G_A:27350092:6,7,1,1
chr10	27368126	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:2,5:1,5:1,2,2,8
chr10	27371647	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=289,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr10	27381431	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:2,4,0,2
chr10	27382236	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0|1:27382236_C_T:27382236:4,0,2,2
chr10	27382240	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,4:0.454:9:3,1:2,3:1|0:27382236_C_T:27382236:3,2,3,1
chr10	27382353	.	A	AGGTTTTTTTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=140,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:6,0:10,4,0,2
chr10	27382528	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=220,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:3,3,1,2
chr10	27382586	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=232,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:2,3:4,2:3,3,5,1
chr10	27389314	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=202,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr10	27400861	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=218,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,7:1,3:1,0,8,2
chr10	27401056	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:2,2,1,1
chr10	27404927	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,2:7,0:6,6,2,0
chr10	27405096	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,3:6,2:6,5,1,4
chr10	27405310	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,294;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	27406742	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=213,170;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:0,3,0,5
chr10	27409555	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr10	27412604	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:6,2:13,1:6,15,0,3
chr10	27437964	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=128,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,2:8,4:7,6,2,4
chr10	27437994	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:1,3,2,3
chr10	27442121	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:9,7:6,4:7,8,7,4
chr10	27443012	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:6,0,3,1
chr10	27444303	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=229,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr10	27444328	.	CT	AC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:2,0,5,0
chr10	27444329	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.884:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr10	27444344	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr10	27454111	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=197,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,1:1,8:2,2,0,9
chr10	27456003	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,3:0,0,7,1
chr10	27461953	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=164,256;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr10	27470602	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=266,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	27475494	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=129,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.719:15:2,4:1,6:1,3,1,10
chr10	27497074	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr10	27506854	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr10	27508837	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr10	27524081	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,79;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,3:8,0:6,8,1,2
chr10	27529549	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,7:3,8:4,2,6,9
chr10	27529565	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=101.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,15:0,0,11,18
chr10	27692099	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=144,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:3,3,5,1
chr10	27692359	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=202,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr10	27692371	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	27700887	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	27702042	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=189,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr10	27702256	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.826:15:2,6:0,7:1,1,4,9
chr10	27815665	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=209,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:4,1,4,1
chr10	27822619	.	TTC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,2:2,5:7,0,6,1
chr10	28032136	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=189,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:2,2:1,2:2,1,4,1
chr10	28032360	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,2:7,3:4,8,2,3
chr10	28151604	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=168,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:0,3,0,4
chr10	28196622	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=118,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:4,3,1,2
chr10	28224203	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=123,108;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:13,0:3,6:2,14,0,6
chr10	28233120	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=200,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,0:2,7:4,1,5,2
chr10	28233931	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.668:10:0,1:3,6:0|1:28233931_G_A:28233931:2,1,0,7
chr10	28233933	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:0,1:3,6:0|1:28233931_G_A:28233931:2,1,0,7
chr10	28247957	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=163,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr10	28258034	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,247;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	28259936	.	TAAACAAAC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=171,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=AAAC;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr10	28276273	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,4,1
chr10	28378733	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=167,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:3,0:6,2:0|1:28378733_A_C:28378733:2,7,1,1
chr10	28378737	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=167,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:28378733_A_C:28378733:2,7,1,1
chr10	28378740	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=167,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:28378733_A_C:28378733:2,7,1,1
chr10	28378758	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr10	28822621	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=176,80;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:0|1:28822621_G_A:28822621:0,7,1,2
chr10	28822632	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=174,80;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:6,2:2,0:0|1:28822621_G_A:28822621:1,7,1,2
chr10	28872481	.	CA	C,CAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=36,35,34;MFRL=205,196,173;MMQ=60,60,60;MPOS=19,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.78,7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,6:0.304,0.545:10:0,0,2:1,2,3:0,1,1,8
chr10	28879838	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=187,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,1:5,2:0,13,0,3
chr10	28899841	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	28903400	.	G	GTCTTCTTTAAAACA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,1:0,4:0,0,10,0
chr10	28905079	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,3:6,0:8,2,2,1
chr10	28970487	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,3:0,2:1,4,0,5
chr10	28970843	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=184,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:2,1:5,2:8,0,3,0
chr10	29137085	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr10	29162324	.	TAC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AC;STR;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	29578104	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=159,143;MMQ=40,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,1:10,1:8,10,2,0
chr10	29747155	.	GCTC	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=158,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,2:1,5:1,2,6,1
chr10	29747221	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=156,139;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.727:20:4,9:1,6:4,1,7,8
chr10	29747618	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=194,291;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr10	29754535	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=161,168;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,6:5,3:9,1,6,3
chr10	29759174	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.436:16:6,3:3,4:8,1,3,4
chr10	29759225	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=140,176;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.444:32:11,7:6,7:10,8,7,7
chr10	29760209	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=69,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.614:14:5,3:0,2:1,4,3,6
chr10	29762997	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr10	29769647	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=196,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:3,0:3,10:2,4,1,10
chr10	29770551	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=95,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.543:22:3,4:7,8:4,6,7,5
chr10	29775458	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=175,42;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:7,3,1,1
chr10	29776289	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,178;MMQ=40,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,5:1,2:0,3,1,6
chr10	29777558	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=260,158;MMQ=52,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:2,6,6,2
chr10	29782066	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,274;MMQ=56,34;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr10	29782306	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=187,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:12,2:8,3:7,13,2,3
chr10	29783813	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr10	29783984	.	GAAACT	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=159,270;MMQ=33,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:9,4:3,3:8,5,1,6
chr10	29784004	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=225,128;MMQ=40,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:4,9:2,1:1,5,7,4
chr10	29784188	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,35;MFRL=178,123;MMQ=51,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:29784188_A_G:29784188:0,1,0,3
chr10	29784190	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=178,123;MMQ=51,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:0,3:0|1:29784188_A_G:29784188:0,1,0,3
chr10	29801659	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,3:7,0:12,4,1,2
chr10	29801848	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=221,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr10	29801887	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr10	29813382	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:7,3,2,0
chr10	29818604	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=162,231;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:3,2:4,1,3,0
chr10	29818827	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,2:2,2:0,5,0,5
chr10	29820070	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:4,0,2,0
chr10	29822159	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:23,3:9,2:27,5,2,3
chr10	29834095	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:29834095_G_A:29834095:0,3,0,2
chr10	29834105	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:29834095_G_A:29834095:0,3,0,2
chr10	29834114	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=188,247;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0|1:29834095_G_A:29834095:0,3,0,2
chr10	29839513	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,1:6,2:9,4,3,0
chr10	29839787	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=175,194;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:8,5:2,3:8,2,5,3
chr10	29839864	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=234,120;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:0,12:2,4:1,1,7,9
chr10	29843833	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,124;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.344:24:8,6:8,2:9,7,4,4
chr10	29844067	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:1,3,2,4
chr10	29891161	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=125,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:3,2:12,2:11,4,3,1
chr10	29891321	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=188,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:2,4,0,3
chr10	30316500	.	ACTG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=138,98;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CTG;STR;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:3,1:6,1,2,1
chr10	30317073	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=161,77;MMQ=60,47;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,2:7,8:1,8,6,4
chr10	30318048	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=160,65;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.203:29:8,2:15,2:11,12,1,5
chr10	30604802	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=142,78;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:0|1:30604802_C_A:30604802:3,0,3,1
chr10	30604807	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=145,78;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:0|1:30604802_C_A:30604802:4,0,3,1
chr10	30611614	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr10	30615638	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	30626003	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr10	30629082	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	30629389	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=163,293;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.388:16:4,0:6,6:0|1:30629389_A_C:30629389:2,8,0,6
chr10	30629394	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=167,293;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:3,0:7,6:0|1:30629389_A_C:30629389:1,10,0,6
chr10	30637995	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=197,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,2:1,6:2,0,8,0
chr10	30638208	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,10;MFRL=104,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=22,21;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.245:11:3,0:2,0:5,4,0,2
chr10	30728250	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:15,2:9,2:14,11,1,3
chr10	30901722	.	GC	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,1:4,5:5,7,5,1
chr10	30901756	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:9,2:5,8:6,8,5,5
chr10	30915817	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=197,184;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,3:5,1:8,4,4,0
chr10	30915882	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=152,84;MMQ=60,44;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.273:16:4,1:8,3:6,6,2,2
chr10	30915930	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,36;MFRL=165,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:10,1:3,15,1,1
chr10	31134557	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr10	31138817	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=98,192;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.823:15:1,7:1,6:2,0,2,11
chr10	31138844	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=196,109;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=37.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:8,14:5,0:5,8,14,0
chr10	31166088	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=238,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr10	31791501	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=153,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr10	31803516	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr10	31809746	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,37;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:7,3,1,1
chr10	31810679	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=119,251;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.194:34:17,3:11,3:12,16,2,4
chr10	32096803	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,4:7,0:2,8,0,4
chr10	32097851	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=160,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,2:7,1:12,1,3,0
chr10	32099547	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=152,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.378:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr10	32106657	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr10	32106851	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=157,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr10	32115133	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	32143208	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=197,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr10	32304440	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=117,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,0:5,3:9,6,3,0
chr10	32307534	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=42.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0|1:32307534_T_TA:32307534:0,0,2,8
chr10	32307536	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0|1:32307534_T_TA:32307534:0,0,2,8
chr10	32311969	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,0,11
chr10	32317489	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:1,0:12,2:3,10,0,2
chr10	32323039	.	ATT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.611:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr10	32323732	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:16,0:16,5:18,14,0,5
chr10	32326247	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=95,128;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:5,0:12,6:10,7,0,6
chr10	32327037	.	TA	T,TAAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26,28;MFRL=128,138,99;MMQ=60,60,60;MPOS=9,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,17;RU=A;STR;TLOD=5.41,4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.309,0.304:10:0,2,1:4,1,2:2,2,4,2
chr10	32575793	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr10	32742234	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.337:10:5,2:1,1:0|1:32742234_A_G:32742234:6,1,3,0
chr10	32742256	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=65.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,15:0,3:0|1:32742234_A_G:32742234:0,0,14,4
chr10	32745133	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=146,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:5,4:5,0:8,2,2,2
chr10	32751831	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=160,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,1:6,3:9,1,2,2
chr10	32751901	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,7,7
chr10	32759918	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:4,1,4,0
chr10	32781030	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=257,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr10	32806972	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:2,1,0,3
chr10	32807434	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,78;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.214:16:10,1:3,2:4,9,2,1
chr10	32832214	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:4,1,6,2
chr10	32833081	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:9,0,3,0
chr10	32873103	.	GAT	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:1,2:4,0,3,0
chr10	32873179	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,3:10,0:12,8,3,0
chr10	33000616	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,3:5,0:6,5,3,0
chr10	33015736	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=142,28877373;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:8,14,1,1
chr10	33015782	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,6,11
chr10	33015855	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr10	33093858	.	TACAC	T,TAC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27,25;MFRL=0,173,215;MMQ=60,60,60;MPOS=18,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=AC;STR;TLOD=20.44,10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,4:0.577,0.357:11:0,4,3:0,3,1:0,0,11,0
chr10	33123774	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=156,113;MMQ=60,59;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.642:29:5,7:5,10:5,5,4,15
chr10	33134696	.	T	TACACACAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=279,299;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,17;RU=AC;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.623:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr10	33137515	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=105,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:2,3,4,0
chr10	33137551	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,3:4,3:3,6,2,4
chr10	33143396	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,5,10
chr10	33165226	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr10	33165422	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr10	33190398	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=199,186;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr10	33190567	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,8,10
chr10	33200782	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:4,1:4,2,2,1
chr10	33201128	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr10	33208720	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=156,1538615;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr10	33219008	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr10	33471761	.	GCACACA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=140,242;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=CA;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:1,0:3,1:0,5,0,1
chr10	33483561	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr10	33484577	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=236,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr10	33486693	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=182,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,0:6,6:2,10,0,6
chr10	33491480	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=262,235;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr10	33496681	.	A	AAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=266,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:1,6,0,3
chr10	33619562	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr10	33619713	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,1:14,1:14,10,1,1
chr10	34400340	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=178,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:12,2:5,2:8,9,3,1
chr10	34420607	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=219,253;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr10	34573008	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=211,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:3,1:6,2:9,0,3,0
chr10	34619946	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr10	34664027	.	A	ACCCGGCTGTATTTTGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=219,134;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	34666864	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=116,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:2,2,4,0
chr10	34985197	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=187,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.377:11:2,2:5,2:7,0,4,0
chr10	35103760	.	TCCCCGCC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=164,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:35103760_TCCCCGCC_T:35103760:0,1,1,0
chr10	35103771	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=164,218;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:35103760_TCCCCGCC_T:35103760:0,1,1,0
chr10	35103777	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=164,218;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:35103760_TCCCCGCC_T:35103760:0,1,1,0
chr10	35314130	.	TAA	T,TA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,23,31;MFRL=153,178,138;MMQ=60,60,60;MPOS=25,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=4.95,6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,5:0.213,0.315:16:5,1,1:0,2,4:1,6,2,7
chr10	35320383	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,1:7,2:6,4,2,1
chr10	35324076	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=114,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,8:1,5:0,1,8,5
chr10	35328088	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=196,232;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr10	35338590	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=139,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:10,6,0,2
chr10	35343315	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=102,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:35343315_G_T:35343315:3,1,0,1
chr10	35343324	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=102,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:35343315_G_T:35343315:1,1,0,1
chr10	35343525	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=183,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr10	35360310	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:2,3,0,3
chr10	35464778	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=120,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:2,7:6,8:3,5,7,8
chr10	35484949	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.226:29:11,5:12,1:14,9,5,1
chr10	35894666	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr10	35896571	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,4:6,2:2,10,3,3
chr10	35928224	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	35928387	.	CCCCCCGCCGCCGCCGGGT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=163,298;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.582:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr10	36811687	.	GGT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GT;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr10	36813180	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=172,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.413:27:6,5:10,6:0|1:36813180_T_A:36813180:6,10,3,8
chr10	36813198	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=82.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0|1:36813180_T_A:36813180:0,0,2,18
chr10	36813218	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=198,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.619:19:1,5:6,6:0|1:36813180_T_A:36813180:0,7,1,11
chr10	37433987	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=195,85;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:12,0:8,5:8,13,0,5
chr10	37441072	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=170,208;MMQ=49,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,6:3,0:5,1,2,4
chr10	37451532	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=160,87;MMQ=60,35;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.205:22:7,4:11,0:10,8,3,1
chr10	37451644	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=130,165;MMQ=52,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:6,1:1,9:3,4,4,6
chr10	37488541	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=218,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,5:3,4:5,0,8,1
chr10	37505089	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=204,179;MMQ=55,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:0|1:37505089_G_A:37505089:8,0,0,2
chr10	37505099	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=179,211;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,3:0.308:11:6,1:2,2:1|0:37505089_G_A:37505089:6,2,3,0
chr10	37505192	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=176,98;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:6,1:6,7:3,9,5,3
chr10	38127088	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=170,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr10	38127123	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=182,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:1,3,2,0
chr10	38145142	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=187,252;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr10	38241420	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=129,160;MMQ=60,45;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:10,0:10,4:0|1:38241420_G_T:38241420:10,11,0,4
chr10	38241425	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=121,160;MMQ=60,45;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.178:26:10,0:10,4:0|1:38241420_G_T:38241420:10,12,0,4
chr10	38246545	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr10	38260558	.	AACACACACACACACAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=75,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=21,13;RU=AC;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:0,0:1,2,1,0
chr10	38306128	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	38385441	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,261;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:7,0,2,0
chr10	38404112	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=159,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,4:5,4:4,5,3,5
chr10	42905431	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	42905510	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr10	42905741	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr10	42907201	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=110,164;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:8,5:7,5:7,8,7,3
chr10	42922568	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=192,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:1,2:0|1:42922568_A_G:42922568:4,0,3,0
chr10	42922579	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=187,161;MMQ=60,56;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0|1:42922568_A_G:42922568:5,0,4,0
chr10	42922595	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr10	42922618	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,41;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=22,23;RU=A;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.877:5:0,0:0,3:0,0,3,2
chr10	42924560	.	TCACCTTTGCTTGATATGATAATATAGTGCCAAGG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=164,170;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.535:16:3,5:1,3:4,4,3,5
chr10	42928605	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=139,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.539:9:3,1:1,3:3,1,5,0
chr10	42928668	.	GGAGTCTATC	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=177,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,3:5,3:6,6,4,2
chr10	42941685	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr10	42947000	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr10	42947147	.	A	ATGTGGTGGTTTGGTACAATTAGTTTGGTGGCAGGCT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=121,177;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr10	42947152	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=121,142;MMQ=60,21;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr10	43089334	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=165,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:14,0:15,3:15,14,1,2
chr10	43089340	.	C	CA	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=160,2372616;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,0:15,2:0|1:43089340_C_CA:43089340:17,13,0,2
chr10	43089345	.	G	GTCTGGCTTCTGTC	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=157,2372616;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:12,0:15,2:0|1:43089340_C_CA:43089340:15,12,0,2
chr10	43132232	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr10	43221378	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=149,166;MMQ=60,56;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:9,3,1,1
chr10	43232450	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=287,198;MMQ=51,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,5,1
chr10	43280057	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=T;STR;TLOD=40.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,2,9
chr10	43297564	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=142,283;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,1:6,1:12,3,1,1
chr10	43316170	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=112,147;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,1:5,3:4,7,2,2
chr10	43326627	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=108,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr10	43595836	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=58,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.658:7:0,1:2,4:2,0,5,0
chr10	43601749	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	43604390	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	43606941	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=127,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,1:1,0:2,0,0,2
chr10	43607756	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:43607756_G_A:43607756:0,0,0,3
chr10	43607759	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:43607756_G_A:43607756:0,0,0,3
chr10	43612226	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,284;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr10	43622217	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=116.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.974:31:0,11:0,20:0|1:43622217_T_C:43622217:0,0,9,22
chr10	43622225	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=155,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.199:28:8,0:15,4:0|1:43622217_T_C:43622217:8,15,0,5
chr10	43659536	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr10	43671378	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,6:0,1:0,0,6,2
chr10	43695049	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=174,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr10	43695148	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=153,39;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:6,4,1,1
chr10	43695279	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=225,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43695279_A_T:43695279:0,1,0,1
chr10	43695283	.	CTGG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=225,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43695279_A_T:43695279:0,1,0,1
chr10	43695288	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,26;MFRL=225,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:43695279_A_T:43695279:0,3,0,1
chr10	43695290	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=225,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:43695279_A_T:43695279:0,3,0,1
chr10	43698101	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr10	43869097	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,3,1
chr10	43932479	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr10	43971214	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=68,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:0|1:43971214_G_T:43971214:2,1,1,1
chr10	43971218	.	G	GCAGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=121,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,2:0.368:6:1,2:3,0:1|0:43971214_G_T:43971214:2,2,1,1
chr10	44104101	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:9,3:12,1:12,9,2,2
chr10	44112214	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:8,4:6,6:6,8,4,6
chr10	44112245	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=171,334;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,3:6,2:4,8,2,3
chr10	44112763	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:4,3,0,2
chr10	44340865	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,315;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:5,10,1,1
chr10	44341072	.	CATTGATT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,1:5,2:1,11,0,3
chr10	44868856	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=149,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:0,4:0,1,1,8
chr10	44871346	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:9,5:13,3:12,10,5,3
chr10	44873992	.	C	CCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=161,243;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:0,1:3,1:5,0,2,0
chr10	44874216	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,234;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,0,2
chr10	45423282	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=229,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,4:3,6:6,0,9,1
chr10	45427548	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=277,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:2,4:0,6:1,1,1,9
chr10	45465737	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=153,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,2:8,1:1,15,1,2
chr10	45473552	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=214,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,1:7,1:1,8,0,2
chr10	45496326	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:13,2:12,1:4,21,2,1
chr10	45499886	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=191,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:3,5:3,2:0|1:45499886_TC_T:45499886:5,1,6,1
chr10	45499897	.	A	AAAAATT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=193,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:3,6:3,2:0|1:45499886_TC_T:45499886:4,2,8,1
chr10	45500291	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=188,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:5,4:14,3:8,11,4,3
chr10	45500802	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=203,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr10	45869806	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=170,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,6:6,1:8,3,5,2
chr10	45891368	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:6,5,1,1
chr10	45891484	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=208,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr10	45924023	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=274,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr10	45924256	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=274,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,6:3,7:0,5,1,12
chr10	45939136	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=214,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:2,2,2,4
chr10	46120003	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:4,4:9,1:10,3,3,2
chr10	46122447	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,2:6,0:9,5,0,2
chr10	46249976	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=176,269;MMQ=40,31;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0,8,1,1
chr10	46960084	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,205;MMQ=55,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,1:6,2:0,13,0,3
chr10	46963738	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	46965220	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=115,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,0,7
chr10	46965988	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=195,271;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr10	46968762	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=182,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:3,7:5,6:0,9,0,13
chr10	46969496	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=226,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:0,3,1,6
chr10	46998795	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=228,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:8,2:10,3:18,0,5,0
chr10	46999577	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=166,227;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:7,2:2,2:5,4,3,1
chr10	46999591	.	C	CATGAGGGAG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=205,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATGAGGGAG;STR;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.466:15:6,5:2,2:6,2,4,3
chr10	46999596	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=159,220;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,5:4,2:8,4,5,2
chr10	46999604	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.843:17:1,10:1,5:2,0,11,4
chr10	47158935	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=131,107;MMQ=25,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:5,2:8,1:6,7,2,1
chr10	47747151	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=189,166;MMQ=24,24;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:47747151_G_C:47747151:1,2,0,1
chr10	47747154	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=189,166;MMQ=24,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:47747151_G_C:47747151:1,2,0,1
chr10	47756004	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr10	47756145	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=122,143;MMQ=50,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,5:5,1:2,7,0,6
chr10	47908009	.	ATG	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=141,50;MMQ=25,52;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:0|1:47908009_ATG_A:47908009:3,6,1,1
chr10	47908015	.	ATACT	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=141,50;MMQ=25,52;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:0|1:47908009_ATG_A:47908009:3,7,1,1
chr10	47908023	.	GGA	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=141,50;MMQ=25,52;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:47908009_ATG_A:47908009:1,7,1,1
chr10	48372005	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,3:7,0:11,7,3,0
chr10	48373663	.	CCT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:7,3:5,6:7,6,4,5
chr10	48386106	.	G	GCTAGC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=268,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:3,1:0,0:0|1:48386106_G_GCTAGC:48386106:0,3,0,1
chr10	48386109	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=268,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:3,1:0,0:0|1:48386106_G_GCTAGC:48386106:0,3,0,1
chr10	48386110	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=103,268;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1|0:48386106_G_GCTAGC:48386106:0,1,0,3
chr10	48386111	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=268,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:48386106_G_GCTAGC:48386106:0,3,0,1
chr10	48413758	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=181,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:6,2:5,2:6,5,2,2
chr10	48414570	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr10	48426798	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=209,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,1,5
chr10	48429650	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr10	48438734	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=121,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:1,2:0,2:1,0,1,4
chr10	49371779	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=218,167;MMQ=25,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr10	49389137	.	C	CTGCTTAGGATAGCTGTGGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=285,143;MMQ=25,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr10	49392575	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=92,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,0:1,7:2,3,6,1
chr10	49393792	.	T	TCAAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=292,227;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr10	49395348	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:1,4,0,2
chr10	49419975	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=146,259;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,2:6,1:7,1,3,0
chr10	49420008	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=146,259;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,2:7,1:5,5,3,0
chr10	49420066	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=171,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:4,4:9,0:7,6,3,1
chr10	49440346	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=122,225;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,2:3,1:4,5,1,2
chr10	49450443	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=265,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr10	49632498	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=203,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:1,1:5,1:5,1,2,0
chr10	49654342	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:7,0,1,1
chr10	49654403	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=177,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:4,2:9,4:6,8,3,3
chr10	49658248	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=246,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,6:1,3:1,1,5,4
chr10	49661341	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=244,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:2,4:0,9:1,1,7,6
chr10	49667713	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,10,6
chr10	49687556	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	49687594	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr10	49812917	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr10	49929491	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=238,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr10	49939139	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=197,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:7,4,2,0
chr10	49939305	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=197,74;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,3:8,0:9,7,1,2
chr10	49982685	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=143,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:9,8,0,2
chr10	49982764	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=166,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:2,11,0,2
chr10	49983890	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=58.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,11:0,7:0,0,3,15
chr10	49984956	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=149,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,1:8,1:7,8,0,2
chr10	49986898	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=261,279;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr10	49997881	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=188,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:6,1,2,0
chr10	49998063	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:8,6:8,2:3,13,2,6
chr10	49998707	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=195,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:2,2:5,3:0|1:49998707_C_T:49998707:7,0,5,0
chr10	49998712	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:4,2:4,3:0|1:49998707_C_T:49998707:9,0,5,0
chr10	50004285	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=196,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,8:6,0:6,3,7,1
chr10	50010903	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=122,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:0,9,0,2
chr10	50010932	.	TC	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr10	50013531	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=234,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.374:9:2,0:2,3:0,6,0,3
chr10	50022040	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:8,2,2,0
chr10	50031212	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=150,218;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:0,1:5,0,1,1
chr10	50038720	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=116,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:5,2,3,3
chr10	50038800	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=127,178;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,15:0.763:19:2,9:2,6:0|1:50038800_A_G:50038800:2,2,12,3
chr10	50038810	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=151,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:24,7:0.244:31:15,7:8,0:1|0:50038800_A_G:50038800:15,9,7,0
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chr10	50075461	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=197,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,0:1,5:0,2,0,5
chr10	50085267	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:4,3:3,2:3,4,1,5
chr10	50098566	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=255,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:1,2:2,0:4,0,2,0
chr10	50110015	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=140,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr10	50165411	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=198,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr10	50167952	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=255,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr10	50178250	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=198,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.315:10:4,1:3,1:4,3,2,1
chr10	50184862	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=153,173;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:9,10,2,0
chr10	50186317	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=167,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,1:5,4:7,3,2,3
chr10	50227870	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=188,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:0,2,1,6
chr10	50373321	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=161,69;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,2:9,0:6,8,2,0
chr10	50374819	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=200,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,1:2,3:7,0,3,1
chr10	50396507	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=220,163;MMQ=60,52;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr10	50530513	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=223,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,1:4,3:10,1,4,0
chr10	50531281	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=182,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:7,1:8,7,1,1
chr10	50533617	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,6,12
chr10	50534969	.	A	AACACACAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,78;MMQ=60,35;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=19,23;RU=AC;STR;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.762:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr10	50535607	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50535607_C_A:50535607:0,0,0,1
chr10	50535610	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50535607_C_A:50535607:0,0,0,1
chr10	50594509	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=100,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:4,1:8,2:7,5,2,1
chr10	50666808	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=212,252;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:8,1:9,2,1,1
chr10	50668528	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=208,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,2:5,1:0,8,1,2
chr10	50679077	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=188,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.443:23:9,7:3,3:6,7,6,4
chr10	50686600	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=237,320;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0,2,0,2
chr10	50691009	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	50691360	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,7,4
chr10	50701156	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr10	50701374	.	AAA	TCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr10	50701378	.	AAC	A,TAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,24,26;MFRL=167,163,160;MMQ=60,60,60;MPOS=7,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.40,3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:1,1,0:0,1,0,2
chr10	50732334	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=191,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:16,4:13,0:16,14,4,0
chr10	50818762	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr10	50822192	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,4:0,1:0,0,5,1
chr10	50822226	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr10	50822297	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=164,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.616:32:8,19:4,0:7,5,20,0
chr10	50828506	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr10	50828626	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,1:14,1:14,8,2,0
chr10	50835582	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=179,129;MMQ=60,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:6,1,2,0
chr10	50835603	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=174,129;MMQ=60,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:5,2:0,0:4,1,2,0
chr10	50863083	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,1:2,3:6,1,4,0
chr10	50863565	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr10	50887651	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr10	50901809	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=82.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,15:0,0,14,10
chr10	50902469	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=195,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr10	50902684	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=144,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,6:2,4:3,2,5,5
chr10	50916484	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=118,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:4,4:1,10:2,3,8,6
chr10	50943186	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=218,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr10	50944009	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=135,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:1,1,4,0
chr10	50944021	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=183,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:2,0:2,2:3,2,2,0
chr10	50947918	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,2:1,6:0,2,1,7
chr10	50952851	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=204,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:0,5,0,5
chr10	50953962	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=145,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:8,7,2,0
chr10	50959782	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=190,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr10	50960166	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:5,2:2,1:5,3,3,0
chr10	51093150	.	GTC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=181,213;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr10	51130658	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=222,173;MMQ=25,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr10	51130801	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=265,352;MMQ=25,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TA;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	51464880	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=182,239831;MMQ=52,31;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:11,3:4,0:6,10,0,3
chr10	51555936	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	51573317	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=170,176;MMQ=60,35;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,2:8,0:15,1,2,0
chr10	51573319	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=167,206;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,2:7,1:14,1,3,0
chr10	51573326	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=164,184;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,1:7,1:13,1,2,0
chr10	51573343	.	CA	C	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=94,169;MMQ=46,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:7,1:14,2:23,3,2,2
chr10	51581396	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:9,0:9,5:8,10,0,5
chr10	51584597	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=103,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:5,0:15,2:10,10,1,1
chr10	51620278	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,248;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	51620499	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=124,134;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:5,5:0,3:1,4,0,8
chr10	51623024	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=150,176;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.537:20:4,8:5,3:8,1,11,0
chr10	51623052	.	C	CT	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=150,178;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=81.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,22:0.469:47:13,13:10,7:0|1:51623052_C_CT:51623052:20,5,16,6
chr10	51623061	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=143,178;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=90.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,26:0.482:54:15,18:12,8:0|1:51623052_C_CT:51623052:21,7,18,8
chr10	51827896	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=162,147;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:5,2:9,1:0|1:51827896_C_T:51827896:7,7,0,3
chr10	51827900	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=162,147;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,2:9,1:0|1:51827896_C_T:51827896:7,7,0,3
chr10	51827934	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=175,139;MMQ=59,50;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr10	51829520	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,37;MFRL=165,168;MMQ=27,35;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr10	52005153	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:20,2:14,1:17,17,1,2
chr10	52005303	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=236,279;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr10	52070947	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=193,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:3,0,4,0
chr10	52086939	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.373:22:6,4:8,4:10,4,6,2
chr10	52502788	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=87,132;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.342:36:17,4:7,8:14,10,5,7
chr10	52502803	.	C	CGT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=124,141;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=GT;STR;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.202:17:9,2:5,1:6,8,1,2
chr10	52566432	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=162,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr10	52569765	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,0:10,2:13,9,0,2
chr10	52576068	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0,4,1,4
chr10	52610352	.	T	TTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=201,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TG;STR;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:4,0,3,0
chr10	52751070	.	AGCCGCCGCC	A,AGCCGCCGCCGCC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,30,32;MFRL=116,209,163;MMQ=60,60,60;MPOS=28,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,8,12;RU=GCC;STR;TLOD=9.63,7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,4:0.201,0.312:13:1,1,1:4,1,0:5,1,7,0
chr10	52751088	.	C	CGCT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.216:24:8,0:11,5:15,4,4,1
chr10	52751303	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=190,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:6,7,0,2
chr10	53457503	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=149,109;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:12,3:19,0:15,16,3,0
chr10	53667210	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=161,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:8,8:7,0:10,5,8,0
chr10	53814229	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,2:2,1:7,1,3,0
chr10	53814383	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=198,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:2,3:0,0:0,2,2,2
chr10	53893539	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=223,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,0:2,4:4,0,3,2
chr10	53921754	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=205,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,1:3,3:0,3,0,4
chr10	54050079	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=193,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,3,2
chr10	54074194	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=197,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:13,2:15,0:16,12,0,2
chr10	54076271	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=158,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:8,2:3,6:7,4,3,5
chr10	54528353	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54528353_C_G:54528353:0,0,0,1
chr10	54528361	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54528353_C_G:54528353:0,0,0,1
chr10	54528366	.	AAATAT	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54528353_C_G:54528353:0,0,0,1
chr10	54530636	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=307,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:0,4,0,5
chr10	54531226	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=145,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.175:21:9,1:8,2:0|1:54531226_C_T:54531226:10,8,1,2
chr10	54531235	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=160,223;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:18,4:0.207:22:9,2:9,2:1|0:54531226_C_T:54531226:8,10,4,0
chr10	54531461	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=216,283;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr10	54531490	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=266,283;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr10	55570254	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=218,265;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:5,0,2,0
chr10	55571485	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,18;MFRL=173,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.404:3:2,0:0,0:0|1:55571485_G_T:55571485:0,2,0,1
chr10	55571487	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=173,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:55571485_G_T:55571485:0,2,0,1
chr10	55626367	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=185,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.790:12:1,4:1,6:2,0,8,2
chr10	55663198	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:55663198_A_C:55663198:0,0,0,7
chr10	55663202	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0|1:55663198_A_C:55663198:0,0,0,7
chr10	55719652	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=198,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:1,2:2,10:0,3,1,11
chr10	55721621	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=112,411;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:12,0:5,3:6,11,3,0
chr10	55779909	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=179,265;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr10	55779915	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=265,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,5:1,3:2,0,6,2
chr10	55826470	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=239,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:3,0,5,1
chr10	55839196	.	A	ATCTGTATTTTCCAGGCTGGAGTCCATAAG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.218:11:6,1:3,1:3,6,0,2
chr10	55943184	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr10	55949092	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=183,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.224:19:6,3:8,0:8,7,2,2
chr10	55973889	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr10	55996761	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr10	56076975	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=245,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr10	56077209	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=185,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:1,1,1,4
chr10	56089263	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	58119976	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,8,4
chr10	59956556	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=222,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr10	59958956	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=219,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,3:4,2:8,1,5,0
chr10	59997499	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,54;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,2:9,0:5,11,2,0
chr10	59997644	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr10	60027122	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:14,4:4,5:13,5,8,1
chr10	60029163	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=242,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:0,2,0,5
chr10	60036815	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=200,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:9,1,2,0
chr10	60047268	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=141,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,4:8,0:11,2,4,0
chr10	60121167	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=177,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,0:8,2:10,7,1,1
chr10	60123486	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr10	60273121	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=196,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr10	60273155	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=182,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr10	60273189	.	ACGGC	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=167,255;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGGC;STR;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.758:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr10	60548276	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0,4,1,2
chr10	60558125	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=228,237;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,6:2,2:3,0,8,0
chr10	60563062	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=188,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr10	60573675	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=147,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:8,5:8,3:10,6,4,4
chr10	60996453	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr10	60998252	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,260;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr10	61007534	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=217,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:1,6:0,4:0,1,3,7
chr10	61007592	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	61014056	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=325,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr10	61062538	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:6,4:5,5:8,3,7,2
chr10	61083690	.	A	AGTTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,3:4,2:6,1,5,0
chr10	61111975	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=181,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:1,3:1,0,6,2
chr10	61112112	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=186,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,2:9,0:6,6,0,2
chr10	61122268	.	T	TTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,2,7
chr10	61412690	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=118,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:11,3:28,0:6,35,2,1
chr10	61413497	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=231,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,2:4,5:4,2,3,4
chr10	61414373	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=208,473;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	61443808	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=124,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:1,5:6,2:6,1,6,1
chr10	61552774	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=142,206;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.257:24:9,2:9,3:9,9,4,2
chr10	61574357	.	AAC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=151,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AC;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.369:14:2,2:6,3:4,5,4,1
chr10	61592447	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.291:15:7,2:4,2:3,8,1,3
chr10	61612466	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:1,4,0,5
chr10	61718039	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,69;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,3:8,0:6,8,2,1
chr10	61718423	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=158,51;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:61718423_G_C:61718423:3,8,1,1
chr10	61718430	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=35,20;MFRL=163,51;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:0|1:61718423_G_C:61718423:2,8,1,1
chr10	61718432	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=35,20;MFRL=158,51;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:61718423_G_C:61718423:2,7,1,1
chr10	61718435	.	T	TGA	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=158,51;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:61718423_G_C:61718423:2,7,1,1
chr10	61718438	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=158,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:61718423_G_C:61718423:2,7,1,1
chr10	61718440	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=158,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:6,0:3,2:0|1:61718423_G_C:61718423:2,7,1,1
chr10	61719232	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,4,4
chr10	61802342	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=191,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr10	61802353	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=191,222;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr10	61802374	.	AA	TT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=195,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,6:2,3:1,1,8,1
chr10	61802550	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.837:10:1,2:0,7:0|1:61802550_A_T:61802550:1,0,5,4
chr10	61802561	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=157,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.814:10:1,1:1,6:0|1:61802550_A_T:61802550:1,1,4,4
chr10	61802577	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=35.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.909:10:0,1:1,7:0|1:61802550_A_T:61802550:0,1,3,6
chr10	61815335	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr10	61815367	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,2:3,4:8,0,3,3
chr10	61819049	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr10	61823109	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	61829987	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=166,203;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.272:31:12,0:11,8:8,15,0,8
chr10	61830700	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,8037439;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:6,1:5,1:4,7,0,2
chr10	61834080	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:7,8:13,0:8,12,8,0
chr10	61834567	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=201,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:13,0:7,3:0|1:61834567_G_A:61834567:14,7,3,0
chr10	61834573	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=210,148;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,6:0.305:21:6,5:8,1:1|0:61834567_G_A:61834567:14,1,1,5
chr10	61834692	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=200,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:6,0:13,2:0|1:61834692_G_C:61834692:6,14,1,1
chr10	61834694	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=192,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:5,0:14,2:0|1:61834692_G_C:61834692:7,14,1,1
chr10	61834704	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=192,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:5,0:16,2:0|1:61834692_G_C:61834692:8,13,1,1
chr10	61835001	.	AAGATGACTTAACTGG	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=177,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:8,0:11,2:13,10,1,1
chr10	61840460	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=196,279;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr10	61842498	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,3:7,2:4,8,1,4
chr10	61843330	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=147,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:15,5:15,0:17,13,5,0
chr10	61844308	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=292,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr10	61926728	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=237,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr10	61941023	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,1:1,2:4,2,2,1
chr10	62444165	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	62540063	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=223,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,4:0,2:0,1,1,5
chr10	62544391	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=203,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.539:9:1,3:2,2:4,0,5,0
chr10	62551815	.	GC	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=198,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.731:24:1,8:5,10:1,5,8,10
chr10	62551889	.	AA	GT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=118.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,13:0,0,16,11
chr10	62553763	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,6,16
chr10	62631143	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=204,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr10	62631411	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=172,104;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:7,0:14,4:12,9,0,4
chr10	62631993	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=175,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:14,4:14,0:17,11,4,0
chr10	62634621	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=240,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr10	62634839	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=122,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:5,1:1,3:1,6,0,4
chr10	62634854	.	T	TGCTCGTTTATGGGGCTGTTTGAGACTA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=222,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,2:3,0:0,8,1,1
chr10	62652697	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=195,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:18,0:13,4:9,22,0,4
chr10	63422754	.	G	GGGGCCGACCCCGGCA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=105.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,7:0,0,14,10
chr10	63699895	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=153,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:9,1:4,3:9,4,4,0
chr10	63700228	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=140,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr10	63700245	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=189,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr10	63760087	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=164,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,3:3,2:4,5,1,4
chr10	63818920	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=188,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.556:9:1,3:3,2:4,0,5,0
chr10	63850649	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=142,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:18,0:18,2:20,16,0,2
chr10	63943966	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=213,106;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr10	63944176	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr10	63944188	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=177,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr10	63958112	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=187,116;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:4,4,3,4
chr10	63974950	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=127,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr10	63976912	.	TAGCTTC	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=150,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,1:11,1:11,12,1,1
chr10	63977069	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=218,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr10	63978077	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr10	63982984	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.634:17:4,3:2,8:5,1,8,3
chr10	64005711	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:4,11:6,2:7,3,9,4
chr10	64022582	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=187,15392227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,1:3,1:0,9,1,1
chr10	64136751	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr10	64148125	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=66.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,15,6
chr10	64148369	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,5,16
chr10	64415184	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=243,154;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.689:20:2,10:3,3:4,2,8,6
chr10	64415413	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=128,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:1,7,1,3
chr10	64914016	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.543:9:1,2:3,3:1,3,1,4
chr10	64944317	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=191,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,4,1
chr10	64950569	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=168,230;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr10	64953311	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	64953959	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=117,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,0:1,6:2,0,6,0
chr10	64960536	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	65225244	.	GA	CG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr10	65225450	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=224,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,2,0
chr10	67726514	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=119,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.786:7:1,4:0,2:0,1,1,5
chr10	68139142	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=246,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,1,2
chr10	69281585	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=159,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,2:3,8:4,2,5,5
chr10	69299446	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=177,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:9,1:3,2:4,8,1,2
chr10	69366602	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,0:6,3:5,3,2,1
chr10	69647332	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr10	69648569	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=175,210;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr10	69651125	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=169,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.665:10:2,2:1,4:3,0,4,3
chr10	69692330	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:3,1,3,0
chr10	69699478	.	GAT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AT;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	69750751	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=170,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:6,0:16,3:8,14,1,2
chr10	69750788	.	GA	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=19,32;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.821:20:1,6:0,8:0,3,4,13
chr10	69793831	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:6,4:12,0:8,10,4,0
chr10	69799072	.	CAAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=217,203;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=A;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:2,1,2,0
chr10	69881103	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=252,55;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr10	69926097	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=165,126;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:3,8:8,2:5,6,5,5
chr10	69934467	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=305,272;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr10	69935059	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=163,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:3,3,4,0
chr10	69935235	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr10	69954290	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:0,8,0,4
chr10	69955140	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=159,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:5,1,4,1
chr10	69959097	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=135,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.613:24:5,9:4,5:6,3,12,3
chr10	69959345	.	GCTGGGA	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:2,0:1,7,0,2
chr10	69959397	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=176,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr10	69961501	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,286;MMQ=60,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr10	69961763	.	A	AAGTTAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=225,227;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr10	69969986	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=206,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr10	70043916	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=165,246;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:6,1,2,0
chr10	70045264	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr10	70056600	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,11,2
chr10	70136774	.	TAGGGTGTAAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.283:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr10	70143774	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=104,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,5:3,3:2,3,4,4
chr10	70174707	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:8,1,2,0
chr10	70179719	.	A	AAGCAATGCCTCT,ACAGAGGTTTCCAGCTGGAAATGTGACACC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,24,24;MFRL=153,137,108;MMQ=60,60,60;MPOS=3,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,1:0,0,0:0,1,0,2
chr10	70179721	.	A	ACAAATCTGAGTTTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr10	70210007	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=208,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:2,0:1,5,1,1
chr10	70219089	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=260,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:70219089_G_T:70219089:0,1,0,1
chr10	70219090	.	AGG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=260,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:70219089_G_T:70219089:0,1,0,1
chr10	70219093	.	A	AAAGTTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=260,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:70219089_G_T:70219089:0,1,0,1
chr10	70231631	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=155,74;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:10,2:7,2:9,8,2,2
chr10	70252822	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=189,249;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.351:9:2,2:2,1:4,2,3,0
chr10	70266546	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	70332066	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=236,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,3,1
chr10	70332160	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=187,112;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:10,5:6,0:5,11,5,0
chr10	70497482	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	70502399	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:70502399_T_TG:70502399:0,4,0,1
chr10	70502400	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:70502399_T_TG:70502399:0,4,0,1
chr10	70502426	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr10	70521041	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	70531217	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,5,12
chr10	70532903	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=126,107;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:8,0:6,6:0,14,0,6
chr10	70673430	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr10	70695696	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=258,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:2,4:0,5:2,0,8,1
chr10	70696908	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	70716106	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=79.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,7:0,14:0,0,2,19
chr10	70734599	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr10	70847991	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,2:11,0:0|1:70847991_A_T:70847991:12,11,2,0
chr10	70847994	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.109:25:11,2:11,0:0|1:70847991_A_T:70847991:12,11,2,0
chr10	70922159	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=171,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,5:4,4:6,3,5,4
chr10	70945840	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=101,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:4,3,2,1
chr10	70945870	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.444:18:5,0:5,7:2,8,0,8
chr10	70946097	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=293,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:2,0:0,2:0,2,2,1
chr10	70947350	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=177,68;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,3:6,0:10,2,2,1
chr10	70955056	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=111,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,3:0,4:3,2,3,4
chr10	70958327	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:2,6:7,2:3,6,2,6
chr10	70968804	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.437:7:3,1:0,1:0,4,1,2
chr10	70992912	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,5:3,4:2,3,3,6
chr10	70992949	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=93,69;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:1,2:0,4,2,2
chr10	70992970	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,1,2
chr10	70998738	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=218,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:3,0,3,2
chr10	70998909	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=218,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,5:3,4:5,2,2,7
chr10	71008105	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=210,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,2:3,0,3,1
chr10	71010026	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,10:0,2:0,0,6,6
chr10	71016947	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=188,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:3,8:1,4:1,3,4,8
chr10	71048539	.	GTTTC	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=110,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTTC;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,1:7,1:5,7,1,1
chr10	71060696	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=135,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,3:1,2:2,0,0,5
chr10	71060707	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:2,1,0,5
chr10	71103597	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=240,165;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,21:0.759:27:3,11:3,10:0|1:71103597_C_G:71103597:3,3,11,10
chr10	71103607	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,10:0.355:29:11,6:8,4:0|1:71103597_C_G:71103597:10,9,5,5
chr10	71144702	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,4,9
chr10	71152091	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=82,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:2,3:4,10:1,5,1,12
chr10	71158524	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:14,2:16,0:12,19,2,0
chr10	71167119	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=229,231;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,0:6,5:0,10,0,5
chr10	71174989	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=190,237;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr10	71175609	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=211,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr10	71244832	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr10	71264325	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr10	71267412	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=173,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:2,1:1,4,0,4
chr10	71267417	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=189,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:2,1:0,4,0,3
chr10	71332842	.	CTG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:2,1:0,5,0,2
chr10	71391215	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:1,2:3,3,1,1
chr10	71392495	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71392495_T_A:71392495:0,0,1,0
chr10	71392501	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71392495_T_A:71392495:0,0,1,0
chr10	71583757	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=213,121;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr10	71647169	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr10	71647196	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.418:11:5,2:2,1:6,1,3,1
chr10	71647223	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=158,204;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,1:8,1:14,4,1,1
chr10	71647298	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:4,3:3,2:1,7,1,4
chr10	71649046	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=220,301;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:1,1,3,0
chr10	71649309	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr10	71655210	.	CAT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,2:2,3:4,1,5,0
chr10	71664661	.	CTT	C,CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32,33;MFRL=175,0,150;MMQ=56,58,60;MPOS=21,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=5.21,4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,3:0.354,0.335:10:2,0,2:0,3,0:2,1,6,1
chr10	71665676	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr10	71681766	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:0,9,1,1
chr10	71685532	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=10,33;MFRL=95,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.863:9:0,4:0,4:1,0,3,5
chr10	71697516	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr10	71853629	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,4:4,0:4,4,1,3
chr10	71868763	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,10,7
chr10	71876382	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,12,6
chr10	71877510	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=223,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:6,0,3,0
chr10	71880757	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr10	71964536	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=188,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:5,1,3,1
chr10	71969062	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=249,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,5:1,7:1,0,1,11
chr10	71970259	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr10	72026053	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.184:36:14,6:16,0:13,17,6,0
chr10	72061079	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr10	72061361	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	72195272	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=176,270;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr10	72289126	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=134,246;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,1:9,2:2,12,1,2
chr10	72290978	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr10	72291304	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=248,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr10	72298631	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=273,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,6:0,2:1,1,3,5
chr10	72307053	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=208,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:7,5:8,5:5,10,7,3
chr10	72326318	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:0,4:4,6:3,1,9,1
chr10	72326460	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:2,3,0,2
chr10	72360038	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=194,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:1,3:1,2:2,0,7,0
chr10	72360059	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=173,238;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr10	72360099	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr10	72432498	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr10	72432521	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr10	72434804	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,36;MFRL=196,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:72434804_C_CA:72434804:0,1,0,1
chr10	72434806	.	C	CATA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=196,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:72434804_C_CA:72434804:0,1,0,1
chr10	72434810	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=196,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:72434804_C_CA:72434804:0,1,0,1
chr10	72489914	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=169,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr10	72492155	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=198,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,3:8,0:1,12,1,2
chr10	72492212	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr10	72496375	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr10	72503936	.	A	AGTC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=187,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,2:10,0:0|1:72503936_A_AGTC:72503936:7,14,0,2
chr10	72503938	.	G	GCCCTCGTCAT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=187,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,2:10,0:0|1:72503936_A_AGTC:72503936:7,14,0,2
chr10	72504920	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=196,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,5:3,3:3,1,7,1
chr10	72513515	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.249:21:8,3:8,1:11,5,0,5
chr10	72518075	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=127,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:2,6,0,2
chr10	72532238	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=169,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:8,2:2,2:6,4,4,0
chr10	72533910	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.772:7:0,2:1,2:1,0,5,1
chr10	72576552	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:13,7,2,0
chr10	72614421	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:6,0,1,1
chr10	72619205	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,6,6
chr10	72619347	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=356,479;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	72620134	.	CT	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.323:31:7,3:13,7:9,12,5,5
chr10	72628054	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:7,3,1,1
chr10	72631820	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=217,224;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr10	72635143	.	ATT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=231,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=T;STR;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,4:6,1:8,3,3,2
chr10	72636450	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=252,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,1,3
chr10	72643671	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=183,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,2:1,6:0,1,6,2
chr10	73039860	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=307,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,2:0,3:0,1,1,5
chr10	73044382	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	73044674	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=204,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr10	73045284	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	73047427	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,0:10,2:6,7,1,1
chr10	73047593	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr10	73056277	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=137,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.279:9:4,0:1,2:6,1,2,0
chr10	73079111	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	73079147	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	73103904	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,68;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr10	73111258	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=175,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:3,0,6,0
chr10	73121645	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=234,233;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr10	73121913	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,12,8
chr10	73122388	.	G	GGCAGAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=94,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:0|1:73122388_G_GGCAGAA:73122388:5,4,0,2
chr10	73122389	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=94,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:0|1:73122388_G_GGCAGAA:73122388:5,4,0,2
chr10	73199501	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=199,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr10	73270982	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=203,188;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.688:11:1,4:2,4:2,1,1,7
chr10	73270995	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=203,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:2,1,1,6
chr10	73326757	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=238,265;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr10	73330584	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=164,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,0:12,2:8,10,0,2
chr10	73337850	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=166,273;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr10	73375280	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:9,3:13,0:14,8,3,0
chr10	73439051	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=37,29;MFRL=206,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:73439051_G_T:73439051:1,0,1,0
chr10	73439058	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,36;MFRL=206,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:73439051_G_T:73439051:1,0,1,0
chr10	73439101	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,0:0,5:0,0,2,3
chr10	73442383	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=37,16;MFRL=181,120;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:73442383_C_A:73442383:0,2,0,1
chr10	73442392	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,18;MFRL=181,120;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:73442383_C_A:73442383:0,2,0,1
chr10	73442398	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,30;MFRL=181,120;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:73442383_C_A:73442383:0,2,0,1
chr10	73442400	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,19;MFRL=181,120;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:73442383_C_A:73442383:0,2,0,1
chr10	73442405	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,17;MFRL=181,120;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:73442383_C_A:73442383:0,2,0,1
chr10	73442411	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,18;MFRL=199,120;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:73442383_C_A:73442383:0,3,0,1
chr10	73447393	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,2:11,1:14,5,1,2
chr10	73455201	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=106,173;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:5,8:4,6:2,7,10,4
chr10	73455273	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=208,173;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,4:1,5:3,2,4,5
chr10	73455308	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,5:1,5:0,3,0,10
chr10	73475776	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,265;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr10	73485149	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=154,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:20,2:15,2:21,14,3,1
chr10	73494159	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=204,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:0,4:4,3:0,5,0,7
chr10	73499561	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,0,5
chr10	73501374	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,4:1,5:3,0,8,1
chr10	73515103	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.589:27:7,6:3,9:9,2,12,4
chr10	73537416	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=196,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:7,7,2,0
chr10	73538109	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:6,0:3,2:3,6,0,3
chr10	73544086	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=168,282;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:1,0:9,2:6,4,1,1
chr10	73544689	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.412:27:6,4:10,7:9,7,7,4
chr10	73571088	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=189,53;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,0:9,2:7,8,0,2
chr10	73571581	.	C	CCT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=215,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,4:1,4:2,1,4,4
chr10	73578882	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:5,2:17,2:10,12,2,2
chr10	73581560	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=186,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:8,0,3,0
chr10	73581601	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=202,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:9,2:6,1:13,2,3,0
chr10	73594358	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=320,251;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr10	73765773	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=202,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,1,2
chr10	73766980	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=214,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:7,2,1,1
chr10	73822855	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:5,2,2,0
chr10	73846826	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=201,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,3:3,2:0,9,1,4
chr10	73912545	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,37;MFRL=159,272;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr10	73970451	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=134,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,2:2,2:6,1,3,1
chr10	74096276	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=164,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.234:14:6,0:2,0:7,4,3,0
chr10	74100642	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,11,7
chr10	74127853	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	74182917	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=220,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:1,6:0,9:1,0,13,2
chr10	74234817	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr10	74293584	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:74293584_A_T:74293584:0,0,0,6
chr10	74293601	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:74293584_A_T:74293584:0,0,1,8
chr10	74620218	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,63;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:74620218_C_T:74620218:10,5,1,1
chr10	74620236	.	T	TGTTTCAGTCCACATATATGTGG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=126,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:74620218_C_T:74620218:5,5,1,1
chr10	74620238	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=126,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,1:0|1:74620218_C_T:74620218:5,5,1,1
chr10	74671611	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,248;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:2,7,0,2
chr10	74690437	.	CTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=97,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:0,1:1,0:0|1:74690437_CTTT_C:74690437:0,3,0,1
chr10	74690445	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=141,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:3,0:0,1:1|0:74690437_CTTT_C:74690437:0,3,0,1
chr10	74690454	.	T	TAAGGAGACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=141,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:3,0:0,1:1|0:74690437_CTTT_C:74690437:0,3,0,1
chr10	74695287	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	74770716	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=135,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.291:29:7,8:13,0:16,5,8,0
chr10	74883921	.	TGA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=189,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:4,0,1,0
chr10	74896743	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.710:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr10	74920270	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=134,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:6,2:0|1:74920270_C_T:74920270:10,8,1,1
chr10	74920275	.	C	CATTTGTTCCATGTGGAGTTCG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:6,2:0|1:74920270_C_T:74920270:11,8,1,1
chr10	75034285	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.241:30:9,6:14,0:15,8,7,0
chr10	75113481	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=132,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:6,0:5,2:0|1:75113481_G_A:75113481:7,5,1,1
chr10	75113487	.	C	CGCTAAGTGACTAATGAT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=132,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:0|1:75113481_G_A:75113481:7,5,1,1
chr10	75113490	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=129,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:4,0:4,1:0|1:75113481_G_A:75113481:6,4,1,1
chr10	75135833	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:6,0,2,1
chr10	75139702	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=183,66;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:0|1:75139702_C_T:75139702:13,9,1,1
chr10	75139715	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=145,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,2:9,0:0|1:75139702_C_T:75139702:8,9,1,1
chr10	75260654	.	TAGTTGGGTA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=182,253;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.284:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr10	75264517	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr10	75290330	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=193,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:2,7,1,1
chr10	75294550	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=137,98;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,0:5,7:2,7,0,8
chr10	75302488	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31,31,32;MFRL=0,191,149,153;MMQ=60,60,40,40;MPOS=7,29,26;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.21,3.33,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,1,1,1:0.332,0.259,0.256:3:0,1,0,0:0,0,1,1:0,0,3,0
chr10	75302505	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=19,15;MFRL=161,149;MMQ=59,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.343:4:1,0:0,0:0|1:75302505_G_T:75302505:3,0,1,0
chr10	75302515	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,15;MFRL=161,149;MMQ=59,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.343:4:1,0:0,0:0|1:75302505_G_T:75302505:3,0,1,0
chr10	75391879	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=169,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:7,6,1,1
chr10	75519322	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,11,3
chr10	75519691	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr10	75523425	.	C	CTTTTTTTTTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,252;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=32,42;RU=T;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.821:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	75525999	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,8,8
chr10	75533116	.	CTG	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:14,0:12,2:13,13,0,2
chr10	75558296	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,341;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	75562161	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr10	75566357	.	AGGT	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.461:24:7,11:5,0:0|1:75566357_AGGT_A:75566357:11,2,10,1
chr10	75566361	.	AGAAAAGGAAGCATGGCTGGGAGAAATTATGGGGAAG	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,11:0.301:38:6,11:6,0:0|1:75566357_AGGT_A:75566357:18,9,10,1
chr10	75566944	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=131,82;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,8:0.205:42:15,0:18,8:17,17,0,8
chr10	75576885	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=133,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:2,2:7,1:1,13,1,2
chr10	75599201	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	75607696	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=51.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr10	75609076	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,120;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:6,0:14,9:12,8,0,9
chr10	75612881	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,2:0,15:0,0,12,5
chr10	75620757	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr10	75672607	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=40,32;MFRL=127,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.533:11:5,2:0,3:5,0,5,1
chr10	75672633	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=181,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,3:6,0:12,2,3,0
chr10	75673540	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=194,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:14,0:4,2:0|1:75673540_T_G:75673540:10,9,1,1
chr10	75673542	.	GA	TT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=194,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:14,0:4,2:0|1:75673540_T_G:75673540:10,9,1,1
chr10	75673687	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=214,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:5,9,0,2
chr10	75673731	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr10	75674740	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr10	75842152	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=217,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr10	75843100	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=304,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,3:5,1:7,0,4,0
chr10	75849921	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=91,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,0:6,6:6,5,3,3
chr10	75863750	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr10	75865159	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,242;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr10	75866929	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr10	75873892	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr10	75874077	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:19,1:19,1:24,15,2,0
chr10	75874192	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.880:8:1,4:0,2:1,0,0,7
chr10	75889760	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr10	75896586	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:4,0:10,4:3,11,0,4
chr10	75896601	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=222,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,4:1,5:0,1,1,9
chr10	76158177	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,5:0,11:0,0,16,0
chr10	76349020	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=127,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.141:32:10,1:11,2:11,17,3,1
chr10	76429870	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr10	76741743	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=191,84;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:0,8,0,3
chr10	76788462	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=212,179;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,3:5,0:8,6,3,0
chr10	76803567	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:1,1:3,1,1,1
chr10	76861680	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:7,1:2,9,1,1
chr10	76979101	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=173,89;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.280:30:9,8:13,0:12,10,8,0
chr10	76979218	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=195,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:3,4:4,0:0,7,1,3
chr10	77159842	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=32,12;MFRL=301,251;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.334:10:5,1:2,0:0|1:77159842_G_C:77159842:2,5,3,0
chr10	77159845	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=31,22;MFRL=301,251;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:5,0:1,1:0|1:77159842_G_C:77159842:2,5,3,0
chr10	77159848	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,12;MFRL=301,259;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,0:0|1:77159842_G_C:77159842:2,5,2,0
chr10	77159854	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=301,259;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:1,1:0|1:77159842_G_C:77159842:2,5,2,0
chr10	77159857	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=24,12;MFRL=301,259;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:1,0:0|1:77159842_G_C:77159842:2,5,2,0
chr10	77159860	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,18;MFRL=301,259;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,1:0|1:77159842_G_C:77159842:2,5,2,0
chr10	77160104	.	AGC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=163,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr10	77312183	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=248,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.529:7:2,2:1,2:0|1:77312183_TC_T:77312183:2,1,1,3
chr10	77312184	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=122,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,9:0.816:11:2,5:0,4:1|0:77312183_TC_T:77312183:1,1,3,6
chr10	77807092	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=127,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:3,5,3,3
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chr10	78729669	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=210,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,5:1,5:1,0,9,1
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chr10	78839127	.	AGTGTGT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=GT;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.336:4:1,0:2,1:3,0,1,0
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chr10	79556029	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=182,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:1,4,1,2
chr10	79566487	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=91,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,1:0,2:0|1:79566487_A_C:79566487:0,1,4,0
chr10	79566492	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,1:1,2:0|1:79566487_A_C:79566487:2,2,4,0
chr10	79566497	.	AG	CC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,1:2,1:0|1:79566487_A_C:79566487:2,2,4,0
chr10	79567794	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=194,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr10	79570810	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:1,0:3,2:4,1,2,0
chr10	79570873	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=229,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,4:3,2:5,2,5,1
chr10	79571893	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=155,268;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,1:1,2:0,1,2,2
chr10	79576933	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,313;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:1,4,0,3
chr10	79579047	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,2:0,9:0,0,10,1
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chr10	79579251	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=217,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr10	79579830	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=202,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:0,2,0,6
chr10	79588620	.	GCTCCAGC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=106,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:7,2,4,1
chr10	79590560	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=176,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:15,1:10,2:12,13,1,2
chr10	79590685	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=215,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0,4,0,4
chr10	79590726	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=265,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,8:0,3:0,1,0,11
chr10	79595417	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	79613091	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,2:3,2:3,6,3,1
chr10	79614189	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr10	79616605	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=183,182;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,23:0.858:26:1,14:2,9:1,2,8,15
chr10	79628961	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=166,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.249:25:10,2:9,4:11,8,2,4
chr10	79737428	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=186,348;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:4,6,0,2
chr10	79741824	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=155,238;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:79741824_AG_A:79741824:1,0,1,0
chr10	79741828	.	GT	AA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=169,238;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,0:0|1:79741824_AG_A:79741824:4,0,1,0
chr10	79741831	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=169,238;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:79741824_AG_A:79741824:4,0,1,0
chr10	79741833	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=169,238;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:79741824_AG_A:79741824:4,0,1,0
chr10	79769533	.	AGCACCAACACGGTTCCACTCATTTCACCAGTCTACCCCCACAGACACATACACACACCTGT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.102:28:4,0:3,2:14,12,1,1
chr10	79773394	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=178,36;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:0|1:79773394_G_GT:79773394:12,4,1,1
chr10	79773396	.	C	CAGGCAGAGCTGGGA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=178,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,2:9,0:0|1:79773394_G_GT:79773394:12,4,1,1
chr10	79777461	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=185,92;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:5,3:1,0:3,4,0,3
chr10	79777504	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:79777504_G_GA:79777504:0,1,0,1
chr10	79777509	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:79777504_G_GA:79777504:0,1,0,1
chr10	79777512	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:79777504_G_GA:79777504:0,1,0,1
chr10	79800426	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=180,69;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:5,12,1,1
chr10	79800485	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=213,93;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,0:3,3:0,7,0,3
chr10	80037648	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,5:3,1:3,1,3,3
chr10	80961519	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=229,239;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,1:0,5,0,2
chr10	81053094	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.254:14:6,3:2,0:9,2,3,0
chr10	81053475	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,1:6,2:1,9,0,3
chr10	81058088	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=147,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:8,2:10,3:18,0,5,0
chr10	81058359	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=184,255;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr10	81060474	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=163,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:2,4:6,6:7,1,6,5
chr10	81065201	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=214,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,0:2,3:6,3,2,1
chr10	81072523	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=213,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:7,1:1,14,0,2
chr10	81108956	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:0,4,0,6
chr10	81109535	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,1:10,2:9,8,1,2
chr10	81204896	.	A	ACGGTGGGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=162,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CGGTGGGG;STR;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:0,0:1,2:1,0,3,0
chr10	81273169	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=196,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.319:13:3,1:3,3:4,5,1,3
chr10	81317045	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=202,147;MMQ=27,27;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:7,1,3,0
chr10	81318545	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=188,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr10	81318621	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=193,182;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:3,2,2,2
chr10	81318820	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=182,184;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,2:1,6:1,0,2,6
chr10	81319267	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr10	81371554	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,144;MMQ=52,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,1:9,1:10,7,2,0
chr10	81372231	.	CG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=211,71;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,2:3,0:2,8,1,1
chr10	81374651	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:9,2,2,0
chr10	81374782	.	A	AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.167:21:10,0:8,2:4,14,1,2
chr10	81608629	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,272;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	81701770	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=200,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,2:5,0:5,6,0,2
chr10	81841641	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=165,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:12,5:8,0:5,17,0,5
chr10	81904638	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:2,3:2,1:3,1,4,1
chr10	81923205	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=212,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:6,11:8,6:7,7,9,8
chr10	81925792	.	ACG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CG;STR;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,4:0,0,10,0
chr10	81925982	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.280:15:5,3:3,1:1,10,0,4
chr10	81932539	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,252;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:3,4:10,0:6,7,4,0
chr10	82033683	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:1,5,1,1
chr10	82034262	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=142,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,1:0,3:4,1,2,2
chr10	82040346	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr10	82040602	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr10	82043576	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=199,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr10	82045354	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=176,103;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,2:7,2:8,7,1,3
chr10	82122202	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=95,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.227:29:10,6:12,0:12,11,6,0
chr10	82182296	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:3,2:5,3:1,7,3,2
chr10	82185828	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,0:5,4:0,10,0,4
chr10	82191643	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=132,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr10	82249108	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=109,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:8,2:4,2:2,10,1,3
chr10	82269238	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=134,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,4:6,3:2,7,2,5
chr10	82329822	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=292,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:2,0,3,0
chr10	82331292	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.297:18:5,2:8,3:6,7,4,1
chr10	82348596	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr10	82363300	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=172,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,1:7,2:6,6,2,1
chr10	82363405	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,1:6,1:7,6,1,1
chr10	82394052	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=77,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:5,3,4,0
chr10	83635892	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=158,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:9,0:18,3:8,20,1,2
chr10	84718677	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=178,89;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,3:6,2:10,3,4,1
chr10	85902394	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=217,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:3,8:7,3:5,5,9,2
chr10	85908688	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=267,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:0,3,2,3
chr10	85936160	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=209,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:0,3:1,1:1,0,3,1
chr10	85960274	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=15,23;MFRL=178,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:1,0:0,1:3,0,1,1
chr10	85962650	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=178,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr10	85994142	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=176,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,0:5,5:2,6,2,3
chr10	86014255	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=153,84;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr10	86018460	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=165,325;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr10	86185654	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,9,6
chr10	86185749	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=163,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:6,0:2,2:0,8,0,3
chr10	87361961	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr10	87407252	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=343,241;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr10	88024443	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr10	88024553	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=269,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.815:14:2,9:0,3:1,1,5,7
chr10	88126056	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr10	88203068	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,5:0,15:0,0,14,6
chr10	88203098	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=128,3254;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,0:12,2:11,8,2,0
chr10	88203208	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr10	88213604	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=203,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:2,2,0,2
chr10	88220866	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	88230874	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr10	88232556	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=124,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr10	88233628	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:3,3:1,2:4,0,6,0
chr10	88233745	.	GAAAGATCAACTGCTTCCATCCTTATAAAAGACTCTCAACTAAAAATCAT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.240:16:6,4:4,0:4,8,2,2
chr10	88256943	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,9,5
chr10	88260115	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:6,10,0,2
chr10	88277457	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=192,183;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:3,7,2,3
chr10	88281344	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:0|1:88281344_C_G:88281344:4,1,6,2
chr10	88281346	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,6:0,5:0|1:88281344_C_G:88281344:0,0,10,3
chr10	88417724	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=165,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr10	88419641	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=213,243;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:7,1:1,2:4,4,3,0
chr10	88421164	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=174,9540662;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:5,1:0,7,1,1
chr10	88439177	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=137,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:3,6:5,2:3,6,3,5
chr10	88439227	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,0:9,3:6,6,0,3
chr10	88445385	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,4:2,4:1,5,5,3
chr10	88649811	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=209,110;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:5,3,2,0
chr10	88683122	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:3,5:10,12:9,4,10,7
chr10	88718436	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=157,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,4:4,2:2,2,2,4
chr10	88718623	.	G	GACCCCTTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=169,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,2:1,0:2,4,1,1
chr10	88730106	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=270,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,6:1,3:1,0,4,5
chr10	88730177	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,2:0,0,8,0
chr10	88730374	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.631:25:4,7:5,9:4,5,3,13
chr10	88761483	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=167,104;MMQ=60,23;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.229:37:17,8:12,0:17,12,8,0
chr10	88768253	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=205,138;MMQ=60,49;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:0,6:2,10:1,1,9,7
chr10	88817407	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=162,82;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:11,4:8,0:13,7,4,0
chr10	88817578	.	GAAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,17;MFRL=95,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.578:5:0,0:1,0:1,1,0,3
chr10	88834244	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32,29,24;MFRL=168,165,219,92;MMQ=60,60,60,60;MPOS=11,6,9;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=7.23,8.27,9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,4,5,7:0.174,0.224,0.288:23:1,3,1,1:3,1,2,1:3,4,10,6
chr10	88911565	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,168;MMQ=47,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,0:6,2:7,5,0,2
chr10	88917974	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,243;MMQ=60,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr10	88935590	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=133,174;MMQ=58,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,1:1,5:3,1,4,2
chr10	88940096	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=166,211;MMQ=40,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:1,2,0,5
chr10	88988731	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=196,227;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.539:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr10	89120692	.	TCCA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=297,287;MMQ=23,23;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr10	89273012	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,0:6,4:2,10,0,4
chr10	89419638	.	CGCT	C,CGCTGCT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=168,161,215;MMQ=60,60,60;MPOS=12,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=GCT;STR;TLOD=6.47,11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,4:0.229,0.428:9:1,0,1:1,2,3:3,0,6,0
chr10	89419873	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=187,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr10	89469083	.	CAT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AT;STR;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.463:9:0,3:5,1:2,3,1,3
chr10	89472917	.	TG	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:18,0:10,3:20,8,3,0
chr10	89475552	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:8,10:6,2:11,3,2,10
chr10	89503261	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=164,53;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:15,0:10,2:11,15,1,1
chr10	89503283	.	C	CACCATGCCTGCCTAATTTTGTAT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=157,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:18,0:6,2:13,12,1,1
chr10	89544190	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=144,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr10	89544381	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=161,83;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,2:7,1:6,7,1,2
chr10	89653686	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=219,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:0|1:89653686_A_G:89653686:10,0,2,0
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chr10	89720653	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=18,16;MFRL=144,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:2,0:4,1:6,7,4,0
chr10	89720907	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=146,109;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr10	89725293	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,180;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:5,2:3,2:1,7,1,3
chr10	90034717	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=116,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,3:8,0:11,9,0,3
chr10	90034899	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=204,251;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr10	90074140	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=225,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0|1:90074140_G_A:90074140:3,0,4,0
chr10	90074145	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=193,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0|1:90074140_G_A:90074140:3,1,4,0
chr10	90122512	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=191,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:3,4:4,0:2,6,1,3
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chr10	90365290	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr10	90431541	.	AAC	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=122,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:15,3:15,1:24,9,3,1
chr10	90484243	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=145,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,3:3,3:5,1,6,0
chr10	90484420	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=132,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:10,3:6,2:4,13,1,4
chr10	90484422	.	GA	G,AA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,33,20;MFRL=150,170,106;MMQ=60,60,60;MPOS=19,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.95,3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,5,3:0.240,0.158:22:7,3,3:7,2,0:3,11,2,6
chr10	90497588	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=186,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr10	90499928	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=356,263;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr10	90524281	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=170,74;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:13,3:12,0:8,17,2,1
chr10	90534759	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=183,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr10	90537732	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=169,270;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.391:8:0,2:4,0:3,2,2,1
chr10	90538020	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=98,231;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:1,4,0,4
chr10	90574222	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=184,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:6,2:0,3:6,0,5,0
chr10	90580330	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=181,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,1,4
chr10	90673187	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=174,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:8,2:8,4:8,9,2,4
chr10	90676612	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.231:37:10,0:17,8:4,25,0,8
chr10	90680951	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=191,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr10	90695175	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=168,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:5,1:6,1:0,12,0,2
chr10	90701598	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.284:22:4,5:11,0:7,9,6,0
chr10	90733148	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=200,276;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr10	90750600	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,248;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:6,2:14,2:12,8,3,1
chr10	90767395	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.936:12:0,3:0,8:0,0,10,2
chr10	90770439	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,5:1,6:0,3,2,9
chr10	90966393	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:9,1:14,5:12,11,3,3
chr10	90975649	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:9,5:5,9:8,6,10,4
chr10	91007470	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr10	91137826	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=57,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.722:23:3,5:3,12:4,2,10,7
chr10	91172663	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=141,186;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr10	91176998	.	G	GTTAATACTTGTGATTGCATTAAGATCGGAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.367:7:3,1:1,1:3,2,0,2
chr10	91178000	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:10,2:3,2:3,10,3,1
chr10	91222258	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:14,0:5,2:2,17,0,2
chr10	91352931	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=146,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,0:4,2:4,5,2,0
chr10	91352966	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=132,175;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:0,4:4,4:2,2,5,3
chr10	91371445	.	CG	AA,AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33,27;MFRL=195,231,0;MMQ=60,60,60;MPOS=20,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=13.11,14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,5,6:0.300,0.350:17:1,5,3:5,0,3:5,1,3,8
chr10	91474699	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:3,1:2,1:6,0,2,0
chr10	91477123	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:7,6:10,1:11,6,6,1
chr10	91479354	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=98,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:15,3:8,0:8,15,3,0
chr10	91479371	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=167,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,3:9,0:11,10,3,0
chr10	91483908	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,5:2,2:1,5,1,6
chr10	91484823	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:13,3:5,3:8,10,4,2
chr10	91497902	.	C	CTAAAAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=205,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,0:5,2:1,5,0,2
chr10	91498778	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:8,3:5,4:6,7,3,4
chr10	91522605	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:0,3,1,3
chr10	92638707	.	C	CAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGT;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	92660420	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,3:8,0:7,8,3,0
chr10	92663108	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr10	92672564	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=193,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:3,1:5,2,2,0
chr10	92678748	.	A	AAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=170,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=AT;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,1:0,0:1,0,2,0
chr10	92982544	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	93000211	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:2,4,4,3
chr10	93392776	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=167,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.206:32:14,4:12,2:13,13,3,3
chr10	93579003	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.746:16:3,6:1,3:3,1,9,3
chr10	93579117	.	CTTT	C,CT,CTT,CTTTT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=19,32,28,20,32;MFRL=162,135,263,124,126;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=29,14,19,12;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=5.96,3.09,13.86,6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:7,3,2,9,4:0.128,0.098,0.333,0.174:25:3,0,2,2,3:0,3,0,3,0:3,4,7,11
chr10	93579134	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=152,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.134:28:10,0:8,0:9,16,2,1
chr10	93581957	.	TTAAGTA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=178,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAAGTA;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr10	93588061	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.202:31:13,0:12,5:12,13,6,0
chr10	93588201	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.773:11:1,6:1,3:0|1:93588201_G_C:93588201:0,2,1,8
chr10	93588208	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:1,5:0,3:0|1:93588201_G_C:93588201:0,1,1,8
chr10	93601285	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr10	93604600	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=277,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,0:2,2:2,0,3,0
chr10	93611176	.	A	ATATG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=217,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATG;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr10	93615493	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:6,0:9,8:4,11,0,8
chr10	93617157	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,2:8,0:14,3,2,0
chr10	93617306	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=232,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:5,4:3,12:2,6,7,9
chr10	93702405	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr10	93713405	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr10	93716899	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr10	93722199	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr10	93722349	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,1:8,1:9,8,1,1
chr10	93752074	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=206,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:1,2:1,0:1,2,2,2
chr10	93767797	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=41,30;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:1,0,9,0
chr10	93771192	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr10	93776061	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=167,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:4,3,2,0
chr10	93776240	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=184,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.639:12:0,5:3,0:0|1:93776240_C_CT:93776240:0,4,4,4
chr10	93776258	.	TG	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=186,103;MMQ=60,47;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:2,2:0|1:93776240_C_CT:93776240:2,6,1,1
chr10	93788516	.	A	ATT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=187,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.789:7:1,3:0,1:1,0,5,1
chr10	93851582	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=121,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.270:35:17,9:9,0:18,8,9,0
chr10	93851714	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=143,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:1,3,2,5
chr10	93904766	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:4,1:7,4:7,5,3,2
chr10	93999057	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,2:3,3:9,0,5,0
chr10	94215457	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:1,0:2,4:0,3,0,5
chr10	94216127	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=183,238;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:10,6,2,0
chr10	94235671	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=183,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:8,3:5,5:7,7,8,0
chr10	94274809	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=115,68;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,2:8,1:5,7,1,2
chr10	94294291	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=138,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:3,2,3,0
chr10	94369060	.	AGTGTGT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=172,182;MMQ=46,40;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=GT;STR;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:3,3:0,1:2,1,2,2
chr10	94369108	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=91,163;MMQ=60,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:4,2:8,0:4,9,2,0
chr10	94388744	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:1,1:0,2,0,2
chr10	94392513	.	A	ATAATT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAATT;STR;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr10	94408207	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,264;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:2,1,0,2
chr10	94409800	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,0:2,3:0,7,0,3
chr10	94675757	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=194,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:0,8,0,2
chr10	94693828	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=109,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,0:4,3:5,5,1,2
chr10	94700460	.	CTT	C,CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,35,35;MFRL=179,63,133;MMQ=60,60,60;MPOS=12,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.78,6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,4:0.243,0.293:15:5,4,3:0,0,1:6,1,8,0
chr10	94816807	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:0,4:3,3:1,2,0,7
chr10	94835071	.	AG	GA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:3,4,0,4
chr10	94835097	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=125,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr10	95079612	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=140,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.301:18:4,0:8,5:8,5,5,0
chr10	95083204	.	ATTTC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTC;STR;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr10	95093478	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:4,2:10,1:9,5,3,0
chr10	95095600	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=181,296;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr10	95121199	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=139,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,2:9,0:12,8,2,0
chr10	95123618	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=190,248;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,2:6,3:10,0,4,1
chr10	95132905	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=227,275;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0,8,0,2
chr10	95139526	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=153,244;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,0:5,4:6,1,4,0
chr10	95139582	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,1:7,2:9,3,1,2
chr10	95141060	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=158,85;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,4:11,0:15,7,4,0
chr10	95156872	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	95162496	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=235,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,7,0
chr10	95162525	.	TC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,11,4
chr10	95241999	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,2,15
chr10	95266683	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=204,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.765:11:0,5:2,4:1,1,8,1
chr10	95276673	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	95278829	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:0|1:95278829_A_G:95278829:0,6,0,6
chr10	95278841	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,4:2,1:0|1:95278829_A_G:95278829:0,5,0,5
chr10	95279653	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	95287643	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=126,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.565:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr10	95346879	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=268,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr10	95346938	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=260,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr10	95380790	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,2:1,3:0,2,1,4
chr10	95389083	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=205,121;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:4,2:6,2:7,4,2,2
chr10	95389124	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:2,1:5,1:3,4,1,2
chr10	95394455	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	95394560	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=160,52;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:0|1:95394560_T_C:95394560:8,7,1,1
chr10	95394563	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=157,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:0|1:95394560_T_C:95394560:8,8,1,1
chr10	95394569	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=160,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:5,2:0|1:95394560_T_C:95394560:8,9,1,1
chr10	95395247	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,2:5,6:5,2,6,2
chr10	95405665	.	CTA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=117,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,1:2,5:5,0,5,1
chr10	95405814	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=240,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,3:1,4:2,1,4,3
chr10	95418703	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=174,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:0,9,1,3
chr10	95418870	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:9,1,0,2
chr10	95443688	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	95444931	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=292,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:2,0,2,1
chr10	95454768	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,308;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	95458237	.	T	TGCTGCAGGGCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=326,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	95459698	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	95658258	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=228,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:5,0,6,0
chr10	95720752	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=140,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:11,1:13,2:10,14,2,1
chr10	95721367	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=261,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr10	95791445	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,2:8,2:9,4,2,2
chr10	95791525	.	CC	TT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=154,179;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.393:34:11,12:10,0:9,12,13,0
chr10	96006067	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=126,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,0:8,2:11,10,0,2
chr10	96014622	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=153,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:7,2,3,1
chr10	96018510	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:6,0,4,0
chr10	96025669	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=132,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:10,4:6,0:9,7,2,2
chr10	96039708	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,6:3,5:0,5,0,11
chr10	96043678	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=197,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.538:20:3,9:5,0:1,8,0,11
chr10	96043732	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=213,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0,7,0,3
chr10	96044734	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr10	96058433	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,5:4,0:3,2,1,4
chr10	96064168	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=121,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr10	96068480	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=110,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,1:1,1:2,2,0,2
chr10	96084372	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=112,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr10	96087802	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=221,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.453:20:5,4:6,4:3,8,3,6
chr10	96098373	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:6,10:5,8:7,4,10,8
chr10	96101364	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr10	96108988	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.397:18:5,4:6,3:9,2,5,2
chr10	96109114	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=183,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.282:26:11,3:8,4:10,9,2,5
chr10	96112233	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=177,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:0,8,0,2
chr10	96114640	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=218,264;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr10	96117965	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,146;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:1,2,0,3
chr10	96201615	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr10	96201839	.	CTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.541:2:1,0:0,0:1,0,0,1
chr10	96234479	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:4,4,2,0
chr10	96269745	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=150,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr10	96271298	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr10	96306111	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=189,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:6,4,1,1
chr10	96313815	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=203,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr10	96313960	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,5:6,8:4,5,6,7
chr10	96322404	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,149;MMQ=60,36;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,3:3,7:3,1,2,8
chr10	96322593	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=137,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:12,11:5,0:14,3,11,0
chr10	96334436	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=111,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,0:8,3:5,8,0,3
chr10	96334578	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr10	96341336	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=201,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr10	96353201	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=88,242;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:4,2,3,0
chr10	96353422	.	ATT	A,AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30,28;MFRL=137,162,246;MMQ=60,57,60;MPOS=22,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.72,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.335,0.333:6:2,1,0:0,1,2:0,2,1,3
chr10	96356571	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=318,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr10	96448129	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr10	96493058	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=106,251;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,3:8,0:7,5,1,2
chr10	96493089	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=165,36;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,0:5,2:7,9,1,1
chr10	96495232	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=162,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:3,1,2,1
chr10	96522365	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=221,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr10	96535124	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=128,264;MMQ=46,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:4,4,3,1
chr10	96698690	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=217,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr10	96701850	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=57,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:0,4,2,5
chr10	96701892	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=189,166;MMQ=40,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:4,5,1,1
chr10	96732097	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=195,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:1,2,0,3
chr10	96745983	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=205,166;MMQ=56,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr10	96802598	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=94,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:1,0,2,2
chr10	96802750	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:10,6:10,0:12,8,6,0
chr10	96824738	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:1,3:5,1:1,5,1,3
chr10	96827119	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,3:4,0:6,3,1,2
chr10	96827178	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,5:3,1:3,1,2,4
chr10	96954473	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=109,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0|1:96954473_A_T:96954473:0,3,1,3
chr10	96954479	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=109,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0|1:96954473_A_T:96954473:0,3,1,3
chr10	96954511	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr10	96966954	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=111,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.584:12:4,1:1,6:4,1,7,0
chr10	96970361	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=202,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,2:2,4:2,0,5,1
chr10	96974518	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=177,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr10	96974552	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr10	96974803	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=195,240;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr10	96979775	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=195,229;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,3:1,6:0,2,1,8
chr10	96979830	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	96984979	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=215,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:3,1,3,0
chr10	96997670	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=183,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:6,3,2,0
chr10	97023541	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=199,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,3:3,0,8,0
chr10	97023552	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr10	97023895	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,0,10
chr10	97031427	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=131,297;MMQ=60,36;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:15,3:9,0:15,9,0,3
chr10	97110879	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr10	97111178	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=150,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr10	97127462	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,247;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:2,2,2,2
chr10	97143933	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=178,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:4,4,2,0
chr10	97154682	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,1:5,4:6,1,5,1
chr10	97154698	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:5,3,5,1
chr10	97158713	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=121,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr10	97181855	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:5,1,3,1
chr10	97369939	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:6,4,2,0
chr10	97373418	.	TTATATGGTATGGC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=151,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:4,2:2,3:6,1,5,0
chr10	97373754	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=177,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:9,1:7,8,2,0
chr10	97373966	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=212,250;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr10	97380691	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=221,196;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,1:0,1:3,0,2,0
chr10	97381096	.	A	AGTTG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=244,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:4,0:1,1:0,5,0,1
chr10	97381098	.	ACAGG	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=210,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr10	97381108	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=174,100;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr10	97385242	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=151,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,3:1,5:1,3,1,7
chr10	97393450	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=172,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:97393450_G_A:97393450:0,1,0,1
chr10	97393475	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=311,245;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,11:0.857:12:0,10:1,0:0|1:97393450_G_A:97393450:0,1,10,1
chr10	97397227	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=233,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr10	97445501	.	CCT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=240,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CT;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr10	97446206	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=193,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:2,2,4,0
chr10	97446979	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:7,2,1,1
chr10	97453703	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=161,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,5:5,1:0,8,0,6
chr10	97515948	.	TG	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:7,1:9,1:12,7,1,2
chr10	97602059	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr10	97602091	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=99,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,6:3,1:4,2,5,2
chr10	97681697	.	TATA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=168,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=ATA;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:6,6,2,0
chr10	97684452	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=194,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:7,4,2,0
chr10	97772253	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=213,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,4:1,3:3,0,7,0
chr10	97772358	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=135,208;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:9,5:5,1:8,6,3,3
chr10	97772496	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=292,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr10	97786880	.	CA	C,CAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,33,32;MFRL=192,252,164;MMQ=60,58,40;MPOS=18,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.26,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.432,0.284:4:1,1,0:0,1,1:1,0,3,0
chr10	97786897	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,10;MFRL=208,164;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:97786897_C_A:97786897:4,0,1,0
chr10	97786899	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,15;MFRL=208,164;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:97786897_C_A:97786897:4,0,1,0
chr10	97804244	.	TCTC	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:12,0:6,2:5,13,1,1
chr10	97817713	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=167,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:15,2:0|1:97817713_G_C:97817713:7,17,1,1
chr10	97817720	.	C	CTCCCACCTGCACAT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=162,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:10,0:15,2:0|1:97817713_G_C:97817713:8,18,1,1
chr10	97817726	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=128,271;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:8,4:10,5:5,13,3,6
chr10	97920099	.	T	TC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=61.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,9:0,0,12,8
chr10	97920140	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,2:13,0:11,12,0,2
chr10	97922066	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=230,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.223:11:7,0:2,2:5,4,0,2
chr10	97922576	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=171,241;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:6,2:3,2:5,5,2,2
chr10	97923216	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=190,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.599:18:5,6:2,5:2,5,4,7
chr10	97956830	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:6,2:1,6:3,4,3,5
chr10	97959763	.	GCAT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=206,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAT;STR;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:2,0:2,3:4,0,4,0
chr10	97975167	.	GTA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=80,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TA;STR;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.714:9:0,2:2,5:1,1,2,5
chr10	97983526	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=198,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:6,2,4,0
chr10	97987095	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=269,136;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr10	97987144	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=278,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,6,1
chr10	97987378	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=88,241;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,3:1,1:1,1,0,4
chr10	97990488	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,6:7,0:7,5,6,0
chr10	98006857	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr10	98079058	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=117,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,0:6,2:0|1:98079058_C_A:98079058:8,8,1,1
chr10	98079060	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:7,2:0|1:98079058_C_A:98079058:13,8,1,1
chr10	98079069	.	A	AATGACT	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:7,2:0|1:98079058_C_A:98079058:13,8,1,1
chr10	98079070	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=112,222;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.216:23:9,3:8,0:9,9,5,0
chr10	98082517	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chr10	98084231	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	98088387	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr10	98095794	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	98097942	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:11,3:4,0:6,9,2,1
chr10	98105622	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr10	98105673	.	TCTG	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=228,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTG;STR;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:3,6:0,1:8,1,6,1
chr10	98107935	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=197,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr10	98113272	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=75,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.419:10:2,2:4,2:4,2,2,2
chr10	98113333	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=195,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.589:10:2,3:1,2:1,3,0,6
chr10	98114885	.	A	ATAATTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=166,247;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:98114885_A_ATAATTTT:98114885:1,0,1,0
chr10	98114888	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=166,247;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:98114885_A_ATAATTTT:98114885:1,0,1,0
chr10	98138640	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	98138841	.	C	CGACATTTTACCTGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=156,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,2:7,0:4,8,1,1
chr10	98144312	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,7,2
chr10	98144384	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=174,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:3,1:7,1:6,4,1,1
chr10	98146774	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=141,46;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:8,0:13,4:9,13,2,2
chr10	98240035	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,6:0|1:98240035_A_T:98240035:0,0,9,0
chr10	98240045	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0|1:98240035_A_T:98240035:0,0,9,2
chr10	98273390	.	GGCA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr10	98287094	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,8,10
chr10	98287150	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:7,5:15,3:14,8,4,4
chr10	98312891	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr10	98319367	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr10	98321928	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr10	98336609	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,15;MFRL=148,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,0:2,0:0|1:98336609_G_C:98336609:0,5,0,2
chr10	98336613	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,21;MFRL=205,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.499:4:1,0:0,1:1|0:98336609_G_C:98336609:0,2,0,2
chr10	98336626	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=148,231;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,3:1,0:0|1:98336609_G_C:98336609:0,3,0,3
chr10	98363832	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:1,9,0,2
chr10	98369536	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=214,169;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,1:4,7:6,2,7,1
chr10	98369563	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=191,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.202:22:5,1:13,3:13,5,2,2
chr10	98380363	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr10	98383329	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr10	98386433	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,8,4
chr10	98392872	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,4,4
chr10	98416533	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=217,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:6,7:2,5:6,2,8,4
chr10	98714904	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=215,232;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,0:11,3:9,10,0,3
chr10	98744438	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:9,6:9,0:7,11,6,0
chr10	98745879	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=203,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:8,5:6,2:5,9,4,3
chr10	98790674	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=125,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr10	98791434	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=121,49;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:0|1:98791434_C_T:98791434:7,2,1,1
chr10	98791439	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=127,49;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:98791434_C_T:98791434:6,2,1,1
chr10	98791444	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=132,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:3,2:0|1:98791434_C_T:98791434:5,4,1,1
chr10	98791450	.	A	AAT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=132,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:2,2:0|1:98791434_C_T:98791434:4,5,1,1
chr10	98797351	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr10	98817662	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=252,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,2:2,5:4,1,7,0
chr10	98817687	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=172,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,4:4,2:6,2,4,2
chr10	98825940	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=215,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr10	98989454	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=180,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:0,3:7,0:7,0,3,0
chr10	98995076	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=327,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:2,1,2,4
chr10	99019144	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=139,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:6,5,1,1
chr10	99019177	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr10	99080246	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=81.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,16:0,0,12,13
chr10	99080719	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=167,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,0:2,1:7,0,0,2
chr10	99116822	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	99130161	.	CCCCA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=196,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCA;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:1,0:3,4,1,1
chr10	99132911	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=110,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:6,3:8,3:8,6,3,3
chr10	99141376	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,329;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,2:6,2:8,4,3,1
chr10	99148171	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,1:6,1:5,3,1,1
chr10	99197112	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=187,260;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr10	99216432	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=240,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr10	99219404	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=125,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:2,5:5,2:2,5,4,3
chr10	99219885	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=224,153;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.826:15:1,3:1,10:0,2,7,6
chr10	99220088	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=263,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	99225738	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,1:3,2:6,5,2,1
chr10	99226370	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.432:12:4,0:2,5:2,5,1,4
chr10	99228657	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:2,1,1,0
chr10	99337473	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr10	99343332	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,96;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:5,1:6,5:4,7,0,7
chr10	99350433	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=149,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,0:5,3:3,7,2,1
chr10	99358511	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:6,1:4,3:7,3,4,0
chr10	99377019	.	AA	CC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=196,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:0|1:99377019_AA_CC:99377019:4,4,1,1
chr10	99377024	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=196,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,1:0|1:99377019_AA_CC:99377019:4,4,1,1
chr10	99426975	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=217,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.620:6:2,4:0,0:0,2,0,4
chr10	99433297	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr10	99437822	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=259,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:1,3:3,2:1,3,1,5
chr10	99439696	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=210,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0|1:99439696_A_G:99439696:0,3,0,3
chr10	99439703	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=210,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0|1:99439696_A_G:99439696:0,3,0,3
chr10	99439724	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=213,279;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:1,2:3,0:0,4,0,3
chr10	99503021	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	99504725	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr10	99510068	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=251,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,4:1,5:1,0,7,2
chr10	99510284	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=205,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr10	99516955	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,10,7
chr10	99517355	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,4:0,11:0,0,14,1
chr10	99518874	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr10	99518901	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,0:0,0,4,1
chr10	99519097	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,3,10
chr10	99529599	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,0:2,6:0,3,0,7
chr10	99639467	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=114,80;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,2:11,0:14,8,2,0
chr10	99655606	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=186,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,5:2,0,6,2
chr10	99682981	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=173,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr10	99991354	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:3,6,2,0
chr10	99991408	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,3:0,0,11,3
chr10	99995773	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=200,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:5,2:0,9:2,3,7,4
chr10	100012011	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	100013244	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr10	100013563	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,3,7
chr10	100021983	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,217;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr10	100022446	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,5,2
chr10	100147060	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=146,220;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,1:3,1:4,6,0,2
chr10	100147097	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=154,220;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:1,5,0,2
chr10	100148058	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=171,229;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:5,1,3,0
chr10	100167322	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=203,257;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:4,0:4,4:7,2,3,1
chr10	100174841	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=184,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:11,1:6,4:9,9,3,2
chr10	100190264	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=218,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr10	100190315	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=166,232;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:7,7:13,0:14,6,7,0
chr10	100193679	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=225,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,1:4,5:2,2,6,0
chr10	100193883	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=215,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:0,5,0,4
chr10	100195583	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=248,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:0,6,1,4
chr10	100219262	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=200,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:2,4:7,3:8,1,7,0
chr10	100219314	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=206,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.561:28:5,7:7,7:9,3,10,6
chr10	100219456	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=157,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:18,0:12,2:13,17,0,2
chr10	100219519	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=155,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,5:2,4:2,6,1,8
chr10	100242345	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,7:1,3:3,1,4,6
chr10	100250019	.	GACACACACAC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,10;RU=AC;STR;TLOD=66.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,7:0,0,0,16
chr10	100995237	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,1:3,4:6,1,5,0
chr10	101090479	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,3:8,0:12,6,1,2
chr10	101120787	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=105,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr10	101136746	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:101136746_C_CA:101136746:0,0,1,0
chr10	101136747	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,0:0|1:101136746_C_CA:101136746:0,0,1,0
chr10	101137063	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr10	101147692	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=183,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:6,6,0,3
chr10	101150256	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=186,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0,4,0,4
chr10	101163194	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=169,255;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:7,0,4,0
chr10	101190162	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=173,241;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:6,3,2,0
chr10	101370844	.	T	TGTGATAGG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:19,1:13,1:22,10,0,2
chr10	101372411	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=252,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=65.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.834:22:2,9:1,10:0,3,4,15
chr10	101373729	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=216,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:0,9,0,3
chr10	101439252	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=226,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,3:0,5:0,2,1,7
chr10	101458364	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=159,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.177:24:8,3:12,0:9,11,0,4
chr10	101462193	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	101464483	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,3:7,2:1,10,0,5
chr10	101486673	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,15;MFRL=146,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.381:8:4,0:1,0:4,1,3,0
chr10	101489216	.	CAAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=186,262;MMQ=44,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr10	101489236	.	A	AAAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,15;MFRL=208,218;MMQ=54,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.424:3:1,0:1,0:2,0,1,0
chr10	101489591	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=254,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr10	101492241	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=203,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr10	101502996	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,11:0.240:48:21,0:16,11:17,20,0,11
chr10	101510104	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:2,0:7,2:7,2,2,0
chr10	101515316	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:5,1,5,0
chr10	101551902	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr10	101553259	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=111,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,1:1,3:4,3,2,2
chr10	101557063	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:7,1:12,2:10,9,1,2
chr10	101590220	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,200;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:0,14,1,1
chr10	101591944	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,4:2,3:0,2,0,7
chr10	101594176	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=187,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:10,0:5,4:6,9,3,1
chr10	101595996	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=173,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:1,0:7,2:4,4,1,1
chr10	101603522	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=195,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,2:2,3:3,6,3,2
chr10	101604006	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=203,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr10	101605529	.	TCATCCCCCAGGTGAGCTCTAG	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=160,228;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:5,0:11,2:0|1:101605529_TCATCCCCCAGGTGAGCTCTAG_T:101605529:3,18,0,2
chr10	101605550	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=190,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,5:0.398:13:2,4:6,1:1|0:101605529_TCATCCCCCAGGTGAGCTCTAG_T:101605529:3,5,0,5
chr10	101606861	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:8,2:1,4:6,3,2,4
chr10	101610533	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=176,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,2:8,1:7,8,2,1
chr10	101610565	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=129,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:7,1:3,9,0,2
chr10	101611294	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.284:26:12,4:7,3:8,11,4,3
chr10	101639877	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=113,105;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,9:4,3:6,2,9,3
chr10	101654696	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,6:0,6:1,0,6,6
chr10	101655982	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=182,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:9,7:1,0:9,1,6,1
chr10	101658585	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=232,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr10	101668986	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=244,379;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr10	101823543	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	101825160	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr10	101841153	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=85.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,19,4
chr10	101912194	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=264,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr10	101927047	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=139,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:3,1:12,1:12,3,1,1
chr10	101938021	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=187,296;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr10	101953705	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	101977883	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,4,12
chr10	101978686	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=183,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:6,2,3,1
chr10	101980459	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr10	101996787	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,1:9,1:2,9,0,2
chr10	102016268	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr10	102027407	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,5,10
chr10	102048700	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=165,244;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,1:3,2:6,5,3,0
chr10	102048722	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=146,258;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:6,11,2,0
chr10	102048859	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=139,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:3,3,0,2
chr10	102050347	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=268,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr10	102054200	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:3,4:9,0:12,0,4,0
chr10	102088906	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	102089147	.	A	AAGGTCAGAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=162,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,1,1
chr10	102089174	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=191,234;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr10	102222825	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=276,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:3,0,4,0
chr10	102239829	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=214,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr10	102241574	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:102241574_T_TGG:102241574:0,0,1,0
chr10	102241577	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:102241574_T_TGG:102241574:0,0,1,0
chr10	102241585	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:102241574_T_TGG:102241574:0,0,1,0
chr10	102241590	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=86,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:0,0:0|1:102241574_T_TGG:102241574:1,1,1,0
chr10	102247887	.	C	CACCACGCCACCTGGCAACCACCATTCTACT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=65,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:1,3,0,1
chr10	102250694	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=224,129;MMQ=60,43;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,0:2,6:0,5,0,6
chr10	102265056	.	AAC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,71;MMQ=60,44;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AC;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr10	102267355	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=193,263;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,1:3,1:1,6,1,1
chr10	102269206	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=154,191;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,2:7,1:10,6,2,1
chr10	102275780	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=160,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr10	102289124	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:6,0:11,3:12,5,0,3
chr10	102296461	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=186,245;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,2:5,5:0,9,0,7
chr10	102506070	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,5,8
chr10	102506103	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=192,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:1,2,1,5
chr10	102539429	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=179,216;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr10	102584597	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=204,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:5,1,1,1
chr10	102584760	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=23,15;MFRL=136,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.480:8:1,0:3,0:0|1:102584760_A_C:102584760:1,3,4,0
chr10	102584769	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,15;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.351:9:3,1:2,0:0|1:102584760_A_C:102584760:1,5,3,0
chr10	102584773	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.351:9:3,3:2,0:0|1:102584760_A_C:102584760:1,5,3,0
chr10	102584777	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,0;MFRL=175,101;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,0:0|1:102584760_A_C:102584760:1,5,2,0
chr10	102689217	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,318;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:9,2:14,1:4,20,2,1
chr10	102689504	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=148,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:2,0,3,1
chr10	102698535	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=206,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr10	102703978	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=181,225;MMQ=42,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:1,2:0|1:102703978_C_T:102703978:0,1,0,4
chr10	102703980	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=36,29;MFRL=225,181;MMQ=52,42;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1|0:102703978_C_T:102703978:0,4,0,1
chr10	102703981	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=181,225;MMQ=42,52;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0|1:102703978_C_T:102703978:0,1,0,4
chr10	102703986	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=225,181;MMQ=52,42;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1|0:102703978_C_T:102703978:0,4,0,1
chr10	102738018	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=185,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:6,3,2,0
chr10	102738720	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=148,275;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,0:10,3:4,12,0,3
chr10	102739143	.	ATTTTT	A,AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27,33;MFRL=185,96,64;MMQ=60,60,60;MPOS=23,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,10,11;RU=T;STR;TLOD=4.23,4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,2:0.229,0.229:10:4,1,2:1,1,0:0,6,3,1
chr10	102739841	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=37,29;MFRL=95,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.601:6:2,0:0,4:2,0,2,2
chr10	102746231	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=160,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,2:8,2:9,2,4,0
chr10	102748553	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=198,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:10,9,1,1
chr10	102748733	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:15,1:15,2:18,13,2,1
chr10	102762667	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=140,140;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.287:26:16,0:2,7:1,18,0,7
chr10	102763855	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=132,81;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,2:11,0:10,5,2,0
chr10	102763900	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=165,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:5,3:6,6,1,2
chr10	102775349	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:4,0,5,0
chr10	102777768	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=127,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,5:1,1:2,0,6,0
chr10	102780265	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=171,279;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr10	102780312	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=143,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr10	102780354	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:3,4,3,4
chr10	102783678	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,1:0,5:3,3,5,1
chr10	102792094	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr10	102792287	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:8,1:13,1:8,13,0,2
chr10	102792295	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.750:22:1,7:4,10:2,3,6,11
chr10	102796774	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,268;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr10	102798346	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=184,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=78.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,25:0.867:28:1,11:2,14:0,3,18,7
chr10	102849445	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=155,238;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.305:14:5,0:3,1:6,4,0,4
chr10	102893840	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=134,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr10	102987588	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr10	103221870	.	CAGG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGG;STR;TLOD=47.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0,0,1,10
chr10	103281634	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=65,253;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,0:0,3:1,2,2,1
chr10	103290938	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=213,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,3:7,1:7,2,4,0
chr10	103294541	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:11,2:10,0:12,9,2,0
chr10	103345940	.	CTGTTG	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,5:6,1:1,11,2,4
chr10	103360454	.	TGATGCTTGCTTCTCATCCC	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=145,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:5,0:10,2:12,10,1,1
chr10	103361088	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=184,100;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:7,3:7,2:0|1:103361088_C_T:103361088:4,10,2,3
chr10	103361111	.	C	CTGAGGCAGGAGAACTGCTTGA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=188,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:6,2:9,0:0|1:103361088_C_T:103361088:2,13,1,1
chr10	103371179	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,3:2,0:2,5,1,2
chr10	103542959	.	CC	GG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=233,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:0,3:5,1:5,1,2,2
chr10	103559245	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=173,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:0,2:1,3:1,1,1,4
chr10	103565960	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=207,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr10	103572913	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=146,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr10	103573222	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=130,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr10	103588734	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=202,239;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.826:13:1,5:0,6:2,0,10,1
chr10	103589761	.	GGCACACCCAACCA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr10	103603162	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=119,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chr10	103609704	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=170,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:2,2:5,2:2,6,1,3
chr10	103699527	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=180,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr10	103717493	.	TA	T,TAAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28,27;MFRL=170,246,167;MMQ=60,60,60;MPOS=16,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,17;RU=A;STR;TLOD=5.57,9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,5:0.274,0.468:10:0,2,5:2,1,0:0,2,2,6
chr10	103751836	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=171,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:2,8,0,2
chr10	103766311	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:8,2:8,5:12,4,5,2
chr10	103771457	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,19;MFRL=168,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.224:18:4,2:4,0:7,7,2,2
chr10	103799758	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=112,253;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:4,5,2,0
chr10	103869633	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=271,257;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr10	103870748	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:10,1:9,1:10,9,2,0
chr10	103870936	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=185,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:2,3,4,1
chr10	103898622	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=166,229;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,0:6,3:12,4,0,3
chr10	103899922	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=161,229;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:16,4:7,0:0|1:103899922_G_A:103899922:13,11,4,0
chr10	103899924	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=161,229;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:15,4:8,0:0|1:103899922_G_A:103899922:13,11,4,0
chr10	103904763	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr10	103908080	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=298,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,3,1
chr10	103920172	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,320;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:5,4,2,0
chr10	103921684	.	TGA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,248;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GA;STR;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:11,0:11,4:13,10,1,3
chr10	103922063	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=141,253;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:0,5,0,2
chr10	103987361	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=177,77;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,3:7,0:11,9,3,0
chr10	104019816	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=149,79;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,3:6,0:4,6,2,1
chr10	104122505	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=182,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:104122505_T_C:104122505:0,3,0,1
chr10	104122512	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=182,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:104122505_T_C:104122505:0,3,0,1
chr10	104126352	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=147,263;MMQ=40,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:104126352_T_G:104126352:0,2,0,1
chr10	104126357	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=149,263;MMQ=40,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:104126352_T_G:104126352:0,3,0,1
chr10	104127171	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,3:3,5:4,0,5,3
chr10	104128954	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,11,7
chr10	104136695	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=168,113;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:11,3:12,0:16,7,3,0
chr10	104138996	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=132,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr10	104156390	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=206,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,5,0
chr10	104157727	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,12,4
chr10	104158972	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=168,261;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:104158972_CAA_C:104158972:1,0,1,0
chr10	104158999	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=17,16;MFRL=156,261;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:104158972_CAA_C:104158972:2,0,1,0
chr10	104159007	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,16;MFRL=156,261;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:104158972_CAA_C:104158972:4,0,1,0
chr10	104159011	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=156,261;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:104158972_CAA_C:104158972:4,0,1,0
chr10	104161967	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=140,250;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.320:20:4,3:9,3:7,7,0,6
chr10	104163569	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=208,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:1,1:1,5:2,0,5,2
chr10	104164488	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=182,286;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:7,3:6,1:7,7,2,2
chr10	104181185	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=262,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:1,4:2,8:1,2,1,11
chr10	104181366	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,389;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	104184213	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=228,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:4,6:2,0:2,4,2,4
chr10	104228978	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=161,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:104228978_A_T:104228978:7,11,1,1
chr10	104228985	.	G	GGGGAGCATCTCGGCACACA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=181,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:6,0:8,2:0|1:104228978_A_T:104228978:6,9,1,1
chr10	104228993	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=21,13;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.338:15:3,0:3,2:6,4,0,5
chr10	104230930	.	TTCGGTGCTGGG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=154,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.633:6:0,2:1,2:2,0,2,2
chr10	104231234	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	104232716	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=78,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,2:7,3:8,5,2,3
chr10	104232809	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr10	104240974	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=85,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,1:0,2:1,3,0,3
chr10	104241683	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:10,0:9,6:8,11,1,5
chr10	104242886	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,3:3,1:4,4,3,1
chr10	104243883	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=174,302;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,2,1
chr10	104244139	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=207,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,2:1,5:2,4,2,5
chr10	104248087	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=238,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:0,5,0,4
chr10	104248106	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=263,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr10	104250278	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,2,1
chr10	104264107	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,26:0.545:47:12,12:9,11:8,13,12,14
chr10	104268877	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=109,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,1:2,4:5,3,5,0
chr10	104353436	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,50;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:8,0:7,8,3,0
chr10	104356822	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=305,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,4:1,0,10,0
chr10	104375002	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=191,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:4,4,0,2
chr10	104375258	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=211,241;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:0,1:1,2:0,2,0,3
chr10	104378750	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=119,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:6,7:4,8:2,9,5,10
chr10	104387019	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=131,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,3:3,4:5,6,2,5
chr10	104389932	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr10	104415093	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=178,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:7,3:9,1:6,12,1,3
chr10	104415777	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=36,27;MFRL=232,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,4:3,1:5,3,2,3
chr10	104415810	.	GCTCTCCCTGGA	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=157,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:7,2:6,3:8,6,2,3
chr10	104415883	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=194,65;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,0:5,2:7,2,1,1
chr10	104415899	.	G	GCTAAGTAA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=213,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:7,2:9,6,1,1
chr10	104445545	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=155,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:4,3,2,0
chr10	104459079	.	TAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,7:0,0:0,0,7,0
chr10	104474107	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr10	104486974	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=236,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr10	104489011	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=248,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr10	104491981	.	ATGGGGAAGCCCTTCCATCC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=201,59;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:5,2:1,0:3,3,1,1
chr10	104492707	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=213,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,6:2,3:0,4,2,7
chr10	104572276	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr10	104573017	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=203,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,3:4,6:4,4,4,5
chr10	104591182	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=37,25;MFRL=277,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr10	104809704	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	104857205	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=144,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:1,7,0,2
chr10	104857218	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=179,92;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr10	104857234	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=179,92;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr10	104857941	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=167,239;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:2,3,0,3
chr10	104859644	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:2,2:9,0:8,3,1,1
chr10	104860852	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=139,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:15,3:11,0:11,15,0,3
chr10	105005683	.	T	TA,TAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27,28;MFRL=207,270,193;MMQ=60,60,60;MPOS=25,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=A;STR;TLOD=6.89,5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,3:0.302,0.221:14:2,2,3:5,2,0:6,1,7,0
chr10	105006287	.	AG	GT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=116,45;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:9,2:7,0:8,8,1,1
chr10	105007471	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=18,24;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.651:12:1,1:1,6:2,2,5,3
chr10	105110740	.	A	AGGAGGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGAGGC;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.770:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	105133368	.	CAT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=202,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AT;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr10	105139746	.	T	TTTTGA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=153,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:0|1:105139746_T_TTTTGA:105139746:7,6,1,1
chr10	105139749	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=153,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:0|1:105139746_T_TTTTGA:105139746:7,6,1,1
chr10	105141548	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:8,6:10,0:7,11,6,0
chr10	105144986	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	105145110	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=225,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:8,4,3,0
chr10	105154241	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=239,129;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:0,10,0,2
chr10	105164685	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=206,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr10	105174857	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,4:8,0:9,7,4,0
chr10	105176179	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=193,285;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr10	105178200	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,197;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.434:28:11,12:5,0:10,6,12,0
chr10	105178450	.	GG	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=189,236;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr10	105179214	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr10	105201565	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=17,28;MFRL=233,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.778:10:0,5:1,3:0|1:105201565_G_A:105201565:2,0,2,6
chr10	105201577	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=184,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,12:0.722:16:2,7:2,5:0|1:105201565_G_A:105201565:3,1,3,9
chr10	105204453	.	CT	GC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.411:15:6,3:3,3:0|1:105204453_CT_GC:105204453:3,6,2,4
chr10	105204454	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=185,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,13:0.870:14:0,9:1,4:1|0:105204453_CT_GC:105204453:1,0,3,10
chr10	105206874	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=217,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:2,7:0,6:2,0,11,2
chr10	105215016	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr10	105254055	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=217,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:105254055_A_C:105254055:3,0,1,0
chr10	105254059	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=217,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:105254055_A_C:105254055:3,0,1,0
chr10	105254090	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=244,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr10	105254180	.	C	CAATGTGTCACAGGAGACATTTTGTGAGATGG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=161,66;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.247:19:2,0:12,3:7,9,2,1
chr10	105428453	.	CAG	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=122,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AG;STR;TLOD=55.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,16:0.778:20:1,8:1,8:0|1:105428453_CAG_C:105428453:3,1,8,8
chr10	105428467	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=168,71;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:7,2:0|1:105428453_CAG_C:105428453:9,10,0,2
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chr10	105614884	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr10	105615074	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=189,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:0,6,0,5
chr10	105615105	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr10	105648768	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.392:21:9,5:4,3:10,3,6,2
chr10	105727656	.	AAG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=150,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,1:7,5:4,8,1,6
chr10	105752331	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=117,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.365:11:2,2:2,2:4,3,4,0
chr10	105752503	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=168,275;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:2,6,1,1
chr10	105752715	.	AT	A,ATT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,29,31;MFRL=151,195,141;MMQ=60,60,60;MPOS=2,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=8.98,8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,5,6:0.222,0.262:23:4,2,3:8,3,2:11,1,9,2
chr10	105759749	.	A	ATCTC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=158,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=TC;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,0:4,2:2,6,1,1
chr10	105762591	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=138,280;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:10,0:7,4:9,8,2,2
chr10	105765235	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=173,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:6,2:12,1:16,2,3,0
chr10	105765374	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=151,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.114:41:20,4:17,0:15,22,0,4
chr10	105765386	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=155,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:20,4:25,0:20,25,0,4
chr10	105768061	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=135,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.220:19:8,0:6,2:0|1:105768061_C_T:105768061:9,6,0,4
chr10	105768070	.	G	GGAAAAAGGAAAGGGGAAAGGGAAGGGA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.222:19:6,0:6,2:0|1:105768061_C_T:105768061:7,8,0,4
chr10	105768158	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr10	105781532	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:0,5,1,5
chr10	105793173	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr10	105796399	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=154,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:1,0,4,2
chr10	105796449	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	105796738	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,16,3
chr10	105797378	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=107,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,5:1,7:0,1,9,3
chr10	105797480	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:11,6,0,2
chr10	105799599	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=262,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,4:4,2:2,3,5,1
chr10	105800198	.	G	GTGTGTGTTTGTGTGCATGTGTGT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=181,237;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:105800198_G_GTGTGTGTTTGTGTGCATGTGTGT:105800198:1,6,0,2
chr10	105800202	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=181,237;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:105800198_G_GTGTGTGTTTGTGTGCATGTGTGT:105800198:1,6,0,2
chr10	105805436	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr10	105805580	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=74,116;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:1,2:10,0:7,5,0,2
chr10	105807470	.	C	G	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=93,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,11:0.171:68:19,0:37,11:23,34,11,0
chr10	105809727	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr10	105811218	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=113,230;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:17,1:11,3:12,16,1,3
chr10	105812690	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,278;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr10	105814826	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=264,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.766:11:0,2:2,5:1,1,4,5
chr10	105815116	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=114,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:6,5:10,13:11,5,9,9
chr10	105815202	.	T	TCACA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,271;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=19,21;RU=CA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.705:1:0,0:0,1:0|1:105815202_T_TCACA:105815202:0,0,0,1
chr10	105815241	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=271,86;MMQ=40,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1|0:105815202_T_TCACA:105815202:0,1,0,2
chr10	105815454	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=248,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr10	105816685	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr10	105821136	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr10	105821294	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	105837196	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.274:30:8,4:14,3:12,10,2,6
chr10	105882055	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=176,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:7,2:0,13,0,2
chr10	105883596	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,89;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:15,0:17,3:10,22,0,3
chr10	105893641	.	CAG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	105905380	.	TGAC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=182,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:1,7,1,1
chr10	105922056	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,0:5,3:5,4,3,0
chr10	105924157	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=225,254;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.563:7:0,0:3,4:0,3,0,4
chr10	105938913	.	CAG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=164,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AG;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.503:6:2,3:1,0:1,2,0,3
chr10	105942304	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=236,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr10	105942337	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	105947247	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:3,4,0,2
chr10	105947284	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=154,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr10	105948162	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=194,194;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:19,0:5,7:6,19,0,7
chr10	105956776	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=197,431;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr10	105957613	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=108,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:2,3,2,1
chr10	105967413	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,1:8,2:8,8,3,0
chr10	105990268	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=161,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:8,8:8,0:14,2,8,0
chr10	105991884	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,1:0,14:0,0,10,5
chr10	106014764	.	CCGG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGG;STR;TLOD=48.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr10	106037894	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=193,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:0,4:1,6:0,1,2,8
chr10	106039303	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	106124435	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=214,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:5,11:5,0:8,2,0,11
chr10	106124660	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr10	106153249	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=155,180;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.455:20:7,0:4,9:0|1:106153249_T_C:106153249:1,10,0,9
chr10	106153254	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.476:19:6,0:4,9:0|1:106153249_T_C:106153249:1,9,0,9
chr10	106159305	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,1:3,3:2,2,1,3
chr10	106166570	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,1:1,7:1,2,0,8
chr10	106207451	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=157,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:10,3:6,2:8,9,2,3
chr10	106207617	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:6,0:8,2:2,13,0,2
chr10	106214081	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=178,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,0:1,5:1,0,5,0
chr10	106602496	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr10	106907320	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=204,248;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr10	106907586	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=206,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:1,4,0,4
chr10	106916819	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=146,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:2,1,3,1
chr10	106924208	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=171,269;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,7:1,1:0,2,0,8
chr10	106970848	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=223,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr10	106982814	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=183,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr10	108337358	.	A	AATGTTGTCCCCAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=214,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:108337358_A_AATGTTGTCCCCAT:108337358:0,1,0,1
chr10	108337360	.	GG	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=214,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:108337358_A_AATGTTGTCCCCAT:108337358:0,1,0,1
chr10	108371571	.	A	AGTTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GTTT;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr10	108380213	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.479:17:5,4:3,4:7,2,2,6
chr10	108388923	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=209,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,1:5,1:9,2,2,0
chr10	108427594	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,2,0
chr10	108427624	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=179,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:108427624_A_G:108427624:0,2,0,2
chr10	108427644	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=203,77;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0|1:108427624_A_G:108427624:0,3,0,2
chr10	108439103	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:1,5,0,6
chr10	108466412	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,7,7
chr10	108469161	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=216,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:1,4,1,3
chr10	108521281	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=187,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:4,2:3,0:6,2,2,0
chr10	108536247	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=125,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,3:4,2:9,1,3,2
chr10	108536551	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr10	108589326	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:7,1,1,1
chr10	111625108	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr10	111630731	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=250,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,0:0,5:0,1,0,5
chr10	111631665	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=181,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,1:4,3:0,7,0,4
chr10	111633025	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.677:10:1,3:1,4:3,0,7,0
chr10	111637627	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=189,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,1:10,1:0|1:111637627_T_C:111637627:6,13,1,1
chr10	111637635	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=189,192;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,4:0.217:21:7,3:10,1:1|0:111637627_T_C:111637627:7,10,0,4
chr10	111640493	.	C	CAGAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=289,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=AG;STR;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,2:3,1:5,0,4,0
chr10	111646147	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=249,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.816:14:1,3:1,9:1,1,1,11
chr10	111647738	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,3:2,5:4,2,8,0
chr10	111667443	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=158,62;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.212:20:9,0:7,3:11,5,1,3
chr10	111667664	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=169,276;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:1,1:5,1:0,7,0,2
chr10	111878510	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:3,5,2,3
chr10	111878548	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr10	111886089	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	111988179	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=215,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr10	112004481	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,35;MFRL=230,263;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr10	112004562	.	CTTTT	C,CTTT	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,32,31;MFRL=167,127,145;MMQ=60,60,60;MPOS=11,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,10,13;RU=T;STR;TLOD=6.06,4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,3:0.166,0.223:15:4,0,1:6,2,2:9,1,5,0
chr10	112004577	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=22,15;MFRL=157,202;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.232:19:2,1:6,0:13,2,4,0
chr10	112004579	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=18,11;MFRL=151,226;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.280:19:2,0:3,0:12,2,5,0
chr10	112004588	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,10;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.196:22:5,0:5,0:14,3,5,0
chr10	112044842	.	TAAAAC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=195,313;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAAAC;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:1,1:2,2:0,4,0,3
chr10	112054908	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=145,265;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:2,1:4,0,5,0
chr10	112266822	.	GC	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,5:0,11:0,0,4,12
chr10	112327678	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,0,16
chr10	112328838	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,0,14
chr10	112333333	.	C	CTGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGT;STR;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr10	112340634	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=182,102;MMQ=60,52;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,4:6,0:11,1,4,0
chr10	112340650	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=137,102;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:6,4:8,0:12,2,4,0
chr10	112350308	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:10,1:6,2:5,11,0,3
chr10	112353082	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=179,170;MMQ=50,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr10	112356331	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr10	112362019	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,4,8
chr10	112541676	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.786:12:0,7:2,3:0|1:112541676_T_C:112541676:0,2,0,10
chr10	112541678	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.786:12:0,6:2,3:0|1:112541676_T_C:112541676:0,2,0,10
chr10	112543217	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:1,8:0,9:0,1,9,8
chr10	112544063	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=110,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,4:3,7:4,1,6,5
chr10	112570243	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=132,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:6,3:7,2:5,8,3,2
chr10	112570330	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=222,191;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,0:4,8:0,7,0,8
chr10	112583189	.	CTTTTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=74,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=27,13;RU=T;STR;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:0,10:0,0:0,2,10,0
chr10	112583341	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:19,3:9,0:9,19,0,3
chr10	112590810	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=95.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,14:0,0,17,12
chr10	112635871	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=170,196;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:8,0:4,8:3,9,0,11
chr10	112642952	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=235,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,2:8,1:0,12,0,3
chr10	112649269	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:4,2:7,2,3,0
chr10	112657916	.	GTT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,14;MFRL=147,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,0:1,0:0,5,0,2
chr10	112764594	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr10	112839579	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=118,173;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:4,5:2,7:1,5,2,10
chr10	113913222	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,427;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr10	113915574	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.433:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr10	113917982	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=165,263;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr10	113921354	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=203,225;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr10	113923595	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:6,5:1,3:0,7,4,4
chr10	113928056	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=98,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,0:4,3:3,3,1,2
chr10	114059330	.	TCTCTGTTTTC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTCTGTTTTC;STR;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.931:10:0,4:0,5:0,0,2,8
chr10	114061746	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=252,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr10	114061979	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr10	114063091	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.189:24:9,0:11,4:8,12,2,2
chr10	114164426	.	TTC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=151,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:4,1:7,0:8,3,0,2
chr10	114169190	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr10	114181683	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,9,8
chr10	114192285	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,3:6,3:2,8,0,6
chr10	114224502	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr10	114574945	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=58,198;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.623:6:1,3:1,0:0|1:114574945_A_C:114574945:1,1,4,0
chr10	114574948	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,19;MFRL=58,216;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.569:5:1,0:1,0:0|1:114574945_A_C:114574945:1,1,3,0
chr10	114575102	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:5,4:11,0:8,8,4,0
chr10	114710445	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,97;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,2:3,0:8,0,2,0
chr10	114710795	.	C	CCCCG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=210,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr10	114724473	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=216,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.596:5:0,1:1,2:0,2,0,3
chr10	114849353	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=242,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,2:0,7:0,1,1,8
chr10	114903633	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=206,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:3,1:6,3:8,1,4,0
chr10	114910760	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:8,9,0,2
chr10	114917927	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=261,559;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:1,3:3,0:0,5,0,3
chr10	114925369	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=174,231;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:10,1:4,3:6,8,0,4
chr10	114925413	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:5,0:6,2:1,10,0,2
chr10	115312811	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr10	115334179	.	T	TGAAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=148,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:2,7,1,1
chr10	115335843	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr10	115338305	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:4,0,3,0
chr10	115340492	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=132,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:2,1,1,1
chr10	115343017	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,3:7,0:7,5,3,0
chr10	115348726	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr10	115349397	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr10	115365635	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:4,7,1,1
chr10	115365939	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:7,0:4,8:8,3,0,8
chr10	115365972	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=208,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:9,0:4,8:4,9,0,8
chr10	115368327	.	A	AATAGGCAGGTCGACCAGGC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=137,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.367:6:0,0:4,2:2,2,1,1
chr10	115373851	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=151,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr10	115380483	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=17,18;MFRL=211,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.266:12:0,0:2,0:2,7,0,3
chr10	115380497	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.248:13:5,1:5,0:0,10,2,1
chr10	115388588	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=189,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr10	115394046	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr10	115400055	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=159,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:7,7,1,1
chr10	115401031	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=205,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,2:0,1:5,0,3,0
chr10	115401081	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=174,241;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,1:3,1:6,3,2,0
chr10	115405703	.	G	GA,A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,17,27;MFRL=141,153,263;MMQ=60,60,60;MPOS=5,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.49,3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.328,0.251:9:2,0,1:1,0,1:0,4,0,5
chr10	115405791	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=260,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr10	115412686	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=190,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,5:7,5:5,4,4,6
chr10	115413901	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=98,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,2:3,2:2,2,1,3
chr10	115457264	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:4,2:7,2,1,2
chr10	115480696	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=125,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr10	115515120	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=206,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr10	115533975	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=106,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,6:2,3:1,3,3,6
chr10	115535426	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,344;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr10	115540311	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=106,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr10	115612540	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.150:35:13,0:17,4:14,16,1,4
chr10	115614534	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=272,222;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,7:1,0:4,0,7,0
chr10	115663504	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,2:7,0:5,14,1,1
chr10	115664723	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,4:5,8:4,6,3,9
chr10	115805604	.	T	TTGTCTGTGTGTGTG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=169,272;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:11,0:7,3:0|1:115805604_T_TTGTCTGTGTGTGTG:115805604:8,11,0,3
chr10	115805613	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=145,272;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:13,0:9,3:0|1:115805604_T_TTGTCTGTGTGTGTG:115805604:9,17,0,3
chr10	115806232	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=203,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.413:19:6,2:5,6:7,4,6,2
chr10	115897044	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:17,0:11,3:7,21,0,3
chr10	115962812	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,2:9,0:8,7,1,1
chr10	115964736	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=193,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr10	115966147	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=195,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr10	115970280	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr10	115973379	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=120,553;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,0:3,2:3,10,2,0
chr10	115978402	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=217,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr10	115986015	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=218,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,1,3
chr10	115986065	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=284,302;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr10	116008464	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=122,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:13,3:11,1:16,8,2,2
chr10	116008497	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=98,142;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:13,1:10,2:9,14,1,2
chr10	116014827	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=201,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:2,4,2,0
chr10	116044587	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=162,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:4,0:2,2:6,1,2,0
chr10	116056981	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=210,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.330:16:6,1:5,4:5,6,2,3
chr10	116060194	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=224,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.815:14:1,10:1,2:1,1,3,9
chr10	116061306	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr10	116068176	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=260,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,5:1,9:2,0,10,5
chr10	116075228	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr10	116075271	.	T	TCC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=C;STR;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,4:0,0,7,4
chr10	116075520	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:5,3,1,1
chr10	116091555	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=82,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,25:0.899:27:2,13:0,12:1,1,14,11
chr10	116100320	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr10	116196142	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.335:10:2,1:5,1:0|1:116196142_A_AT:116196142:2,5,0,3
chr10	116196143	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.335:10:1,1:4,2:0|1:116196142_A_AT:116196142:2,5,0,3
chr10	116198969	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=156,87;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:9,3:7,0:7,9,1,2
chr10	116203911	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=13,18;MFRL=171,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.711:5:0,0:0,0:0,1,0,4
chr10	116205267	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=189,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr10	116209978	.	A	AAC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=152,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.617:16:6,6:0,4:1,5,0,10
chr10	116210018	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=174,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:0,4,0,6
chr10	116222749	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:4,4:6,3:7,3,6,1
chr10	116228026	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=167,108;MMQ=60,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.496:22:5,1:6,9:1,10,0,11
chr10	116228048	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=207,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr10	116228107	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	116251615	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:10,12,2,0
chr10	116304699	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=150,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:8,3,1,1
chr10	116304958	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=251,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,2:0,5:0,3,0,7
chr10	116391558	.	TG	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=178,275;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,1:3,3:10,1,4,0
chr10	116391739	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=186,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,1:6,2:2,8,0,3
chr10	116593175	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=175,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:0,6:3,5:1,2,3,8
chr10	116596071	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=275,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr10	116603071	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr10	116603483	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=148,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr10	116606173	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=199,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.646:12:3,2:1,6:3,1,3,5
chr10	116931101	.	C	CTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=88.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,15:0,7:0,0,7,15
chr10	117061496	.	T	TTTAAAAACCCTTACCTGTGAGCCACCCTGG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=153,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.188:17:6,0:5,2:7,8,0,2
chr10	117309040	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=196,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:6,8,1,1
chr10	117309098	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr10	117486910	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:3,2:0,6:2,1,4,4
chr10	117885028	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=192,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:4,10,0,2
chr10	118031376	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr10	118031619	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr10	118031647	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=205,245;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:0,6,0,5
chr10	118187399	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=235,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:0,2:2,5:0|1:118187399_T_G:118187399:2,0,8,0
chr10	118187405	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=235,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:0|1:118187399_T_G:118187399:2,0,7,0
chr10	118196314	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:20,0:9,4:15,14,0,4
chr10	118220810	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=197,257;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:5,1:2,9,1,1
chr10	118228665	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=139,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:6,2,2,0
chr10	118231406	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=183,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,4:1,4:0,1,2,6
chr10	118310705	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=116,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:8,0:13,2:11,10,0,2
chr10	118310802	.	CAAAAA	C,CAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,33,22;MFRL=270,242,109;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,11,14;RU=A;STR;TLOD=3.77,3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.284,0.489:6:0,2,2:0,0,0:0,1,1,4
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chr10	118327368	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=206,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:118327363_A_ATAC:118327363:1,4,1,1
chr10	118351182	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=198,244;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr10	118351414	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=220,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:3,7,1,1
chr10	118351905	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=258,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,5:0,2:1,0,5,2
chr10	118355695	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=118,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:0,3:4,5:4,0,6,2
chr10	118357490	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,8,6
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chr10	118363744	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=224,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr10	118364818	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr10	118364842	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=263,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:1,0,5,3
chr10	118368493	.	CCAAAA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CAAAA;STR;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.593:10:1,3:2,3:2,2,5,1
chr10	118380387	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=231,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr10	118380629	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=240,232;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.706:8:0,4:2,2:0,2,2,4
chr10	118383382	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=209,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr10	118383463	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=47.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,11,2
chr10	118383691	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=203,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:118383691_T_C:118383691:0,4,0,1
chr10	118383694	.	GT	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=203,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:118383691_T_C:118383691:0,4,0,1
chr10	118383703	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr10	118386325	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,239;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr10	118394551	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr10	118396278	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=234,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.407:13:5,4:3,1:6,2,1,4
chr10	118427645	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr10	118436068	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr10	118451810	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=282,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:1,1,3,0
chr10	118452044	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=251,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,2:1,0:0,2,0,3
chr10	118620777	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=269,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr10	118633548	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr10	118646129	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=171,238;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:2,4:3,7:0,5,1,10
chr10	118671273	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,1:7,7:7,3,5,3
chr10	118711531	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.257:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr10	119001151	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	119014023	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr10	119014931	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,6:0,10:0|1:119014931_C_T:119014931:0,0,7,12
chr10	119014948	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=78.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0|1:119014931_C_T:119014931:0,0,7,12
chr10	119026186	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=200,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr10	119026401	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr10	119027123	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=81,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:2,5:0,3:1,1,7,1
chr10	119029623	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=198,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:9,7,2,0
chr10	119029744	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:6,5:2,8:2,6,8,5
chr10	119042761	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr10	119043295	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=153,249;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,1:5,3:6,3,2,2
chr10	119044764	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:5,8,1,1
chr10	119134498	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,12;MFRL=188,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.588:8:0,0:2,1:1,2,0,5
chr10	119307524	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	119768551	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,11:0,0,11,10
chr10	119768587	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=116,66;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,7:0.250:30:11,7:11,0:0|1:119768587_C_A:119768587:10,13,7,0
chr10	119768605	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=119,66;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,7:0.235:32:12,7:10,0:0|1:119768587_C_A:119768587:12,13,7,0
chr10	120070709	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=202,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:6,3:3,4:4,5,5,2
chr10	120070843	.	G	GA,GGA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32,32;MFRL=95,133,189;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.40,9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,4:0.435,0.417:10:0,2,3:1,3,1:0,1,1,8
chr10	120095037	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=145,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:8,0:8,5:11,5,3,2
chr10	120513953	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,12;MFRL=141,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.230:22:10,0:3,0:11,6,0,5
chr10	120789882	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,280;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:120789882_C_G:120789882:0,0,1,0
chr10	120789884	.	G	GGGGGGGGCCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,280;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:120789882_C_G:120789882:0,0,1,0
chr10	120791778	.	TAAATACC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=125,258;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:2,5:6,4:4,6,4,5
chr10	120792214	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=221,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,2:6,0:6,10,1,1
chr10	120792297	.	G	GCTA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTA;STR;TLOD=68.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,14:0,2:0,0,10,6
chr10	120792684	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,52;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr10	120792703	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,4,4
chr10	120793384	.	TAAAA	T,TAAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27,28;MFRL=176,158,148;MMQ=60,60,60;MPOS=6,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,11,14;RU=A;STR;TLOD=16.45,3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,8,3:0.611,0.255:12:0,6,2:1,2,1:0,1,6,5
chr10	120795781	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,0:8,3:4,11,0,3
chr10	120797795	.	TCC	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=28,18;MFRL=156,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:14,1:21,0:0|1:120797795_TCC_T:120797795:16,21,1,1
chr10	120797800	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,18;MFRL=155,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:16,1:22,0:0|1:120797795_TCC_T:120797795:17,21,1,1
chr10	120801553	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=173,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:8,2:7,1:12,3,1,2
chr10	120810623	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr10	120817450	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr10	120820224	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr10	120832872	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr10	120877248	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=164,194;MMQ=40,45;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr10	120883117	.	CTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=T;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.739:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	120889022	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,5:7,2:8,2,4,3
chr10	120905940	.	CGTGTGT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=GT;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.687:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	120917269	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,10,6
chr10	120917445	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:1,9:0,8:0,1,9,8
chr10	120919179	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=78.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,16:0,7:0,0,17,7
chr10	120923780	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:0,1:1,1:0,1,0,4
chr10	120928938	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=207,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr10	120933901	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	120936701	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=158,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:2,4:0,2:1,1,2,5
chr10	120967376	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=233,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr10	121140511	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0|1:121140511_A_G:121140511:0,0,0,8
chr10	121140534	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0|1:121140511_A_G:121140511:0,0,0,8
chr10	121156151	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=207,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:2,8:0,4:2,0,11,1
chr10	121182742	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=176,56;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:3,0:11,2:8,6,1,1
chr10	121190040	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=221,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr10	121199189	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,3:0,11:0,0,6,8
chr10	121201616	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=182,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:1,3:3,9:2,2,6,6
chr10	121201626	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:2,1:9,3:5,7,2,2
chr10	121287019	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr10	121338401	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,0,18
chr10	121347839	.	TTTTC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTC;STR;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.827:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	121429762	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	121435955	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr10	121557940	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=143,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr10	121567370	.	TTTTCTGCAGTACACATTTTTTGC	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:6,1:3,1:13,5,2,0
chr10	121567407	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,1:7,1:8,8,2,0
chr10	121571507	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=203,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr10	121582556	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,4:6,4:6,3,5,3
chr10	121586882	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=222,147;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:11,2:6,5:10,7,4,3
chr10	121598024	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=175,125;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,4:6,0:14,0,4,0
chr10	121675238	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=120,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.543:9:0,3:4,1:3,2,4,0
chr10	121685448	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=206,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,2:1,4:3,0,6,0
chr10	121689030	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=199,321;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr10	122216790	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:5,1,3,0
chr10	122334561	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=181,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr10	122358463	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=227,161;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,4:1,6:0,2,6,4
chr10	122358656	.	A	AGTG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,298;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.872:5:0,4:0,1:0|1:122358656_A_AGTG:122358656:0,0,0,5
chr10	122358657	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,298;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.872:5:0,3:0,1:0|1:122358656_A_AGTG:122358656:0,0,0,5
chr10	122358876	.	TGA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GA;STR;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:9,3:3,0:6,6,2,1
chr10	122626038	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=202,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:7,2:1,0:5,3,1,1
chr10	122630587	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=178,259;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr10	122633505	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	122646113	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=185,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr10	122646126	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=185,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr10	122646379	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=165,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,1:3,2:0,9,0,3
chr10	122659490	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=231,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,2:1,0:5,0,3,0
chr10	122660701	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=188,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr10	122663585	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=223,122;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.736:17:4,9:0,4:2,2,8,5
chr10	122664388	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr10	122664967	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=272,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.835:16:1,6:1,7:0,2,5,9
chr10	122665310	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=190,222;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr10	122668296	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=192,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr10	123239047	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=173,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr10	123239112	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=178,194;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,1:10,2:10,5,0,3
chr10	123241794	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.389:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr10	123243197	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=174,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:7,5,1,1
chr10	123244920	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.226:29:14,6:9,0:10,13,6,0
chr10	123247037	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:123247037_C_T:123247037:0,2,0,2
chr10	123247044	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=128,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0|1:123247037_C_T:123247037:0,1,0,4
chr10	123247669	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=212,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr10	123279745	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr10	123503243	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,1:7,1:9,7,2,0
chr10	123503426	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	123503431	.	CTTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=216,188;MMQ=40,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=23,19;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr10	123673206	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=222,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=44.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:2,9:2,7:4,0,16,0
chr10	123681962	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=172,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:2,2,2,5
chr10	123718922	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=153,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:12,0:6,4:9,9,0,4
chr10	123719835	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=200,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,3:6,5:5,5,7,1
chr10	123724701	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,1:3,0,4,0
chr10	123724705	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr10	123724767	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,4:0,0,13,1
chr10	123810115	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=251,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr10	123842065	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr10	123842107	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=176,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,6:1,0:3,0,6,0
chr10	123974798	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=146,146;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,4:4,0:3,2,4,0
chr10	124009261	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=220,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr10	124034528	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:1,1:7,3:4,4,4,0
chr10	124036226	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=205,327;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr10	124036494	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:9,5:4,3:6,7,0,8
chr10	124089036	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=187,146;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,5:5,6:6,3,5,6
chr10	124091855	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=170,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr10	124091921	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=70,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:0,10:1,5:0,1,12,3
chr10	124095982	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,237;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:5,3:7,1:9,3,2,2
chr10	124096209	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=167,242;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:4,2:6,2:3,7,0,4
chr10	124152936	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr10	124157385	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.552:16:5,5:2,4:5,2,7,2
chr10	124157455	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=157,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,2:11,1:9,13,3,0
chr10	124159838	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=138,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:7,5:8,2:8,7,4,3
chr10	124175273	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	124183687	.	GTTTTT	G,GTTTTTTT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=35,35,32;MFRL=154,184,251;MMQ=60,60,60;MPOS=15,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,17,24;RU=T;STR;TLOD=5.89,4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.235,0.255:9:3,2,1:1,0,1:4,0,5,0
chr10	124183688	.	T	TTTC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=251,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.616:13:4,4:1,4:5,0,8,0
chr10	124183696	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=154,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:7,2:2,0:9,1,2,0
chr10	124183732	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,6:0,0,12,11
chr10	124184567	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=187,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr10	124189197	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=131,145;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,5:7,2:5,4,5,2
chr10	124216384	.	C	CTA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=135,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:9,3:7,6:12,4,5,4
chr10	124216397	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=131,249;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,1:8,2:12,7,1,2
chr10	124216410	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=130,252;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:11,1:9,3:12,8,2,2
chr10	124266905	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=140,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:15,2:12,1:15,12,3,0
chr10	124266991	.	GTTGT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTGT;STR;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.858:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	124271589	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,1,15
chr10	124271595	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=36,25;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,10:1,6:0,1,1,15
chr10	124273671	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,250;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:7,2,1,2
chr10	124320194	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=211,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr10	124325409	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:1,2,4,1
chr10	124325569	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=77,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,1:3,6:2,2,6,1
chr10	124325631	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr10	124329580	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=194,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.499:8:2,1:1,2:0|1:124329580_C_A:124329580:4,0,3,1
chr10	124329583	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=194,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.499:8:2,1:2,2:0|1:124329580_C_A:124329580:4,0,3,1
chr10	124329801	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:0,4,2,5
chr10	124330368	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=131,89;MMQ=60,53;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:5,4,1,1
chr10	124331722	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=220,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr10	124331944	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:124331944_C_T:124331944:0,2,0,1
chr10	124331957	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:124331944_C_T:124331944:0,3,0,1
chr10	124331963	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0|1:124331944_C_T:124331944:0,3,0,1
chr10	124331985	.	G	GAATCGTATCTGTAGTTTTGATGCCCTTTTCAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=194,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr10	124333308	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=110,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=37.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:1,6:0,9:0,1,3,12
chr10	124335866	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=200,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:4,3:3,10:5,2,10,3
chr10	124339184	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=150,186;MMQ=47,52;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:3,3:9,1:9,3,1,3
chr10	124344787	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=120,106;MMQ=60,21;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.280:30:5,7:16,0:15,7,8,0
chr10	124350189	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=123,80;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:16,5:3,0:6,13,5,0
chr10	124360516	.	C	CTCCCAAAATGCTGGGATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=359,219;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	124457452	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr10	124594153	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=185,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr10	124595874	.	GAAAA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,18;MFRL=69,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,12;RU=A;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.506:4:1,0:0,0:1,1,0,2
chr10	124697198	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr10	124742586	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,8:0,7:0,0,2,13
chr10	124746801	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=201,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:0,2:1,8:1,0,7,3
chr10	124747108	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=249,246;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr10	124749641	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=166,315;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:9,2,1,1
chr10	124810704	.	TAAA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=24,21;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.734:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	124810746	.	C	CT,CTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31,36;MFRL=0,103,107;MMQ=60,60,60;MPOS=25,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=4.16,3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.432,0.431:4:0,1,0:0,1,1:0,0,0,4
chr10	124812487	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr10	124812685	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=15,25;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.862:12:0,4:0,6:0,1,1,10
chr10	124813389	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	124914414	.	T	TCTGA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=157,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:10,0:4,3:10,4,3,1
chr10	124917238	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,2:10,2:11,8,3,1
chr10	124919918	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=139,85;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:5,6:16,0:15,6,6,0
chr10	124924484	.	CTT	C,CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32,26;MFRL=172,210,161;MMQ=60,60,60;MPOS=21,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=8.96,3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,2:0.397,0.200:12:3,2,1:2,3,0:4,1,5,2
chr10	125425822	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	125521533	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=229,160;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.681:20:3,7:3,6:4,2,13,1
chr10	125521721	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=255,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.800:18:1,11:2,4:0,3,4,11
chr10	125521751	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=255,244;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:0,3,0,8
chr10	125526689	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr10	125527964	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=210,197;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,2:5,1:9,0,3,0
chr10	125528007	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=210,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:2,3:6,2:6,3,2,3
chr10	125528297	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=190,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr10	125602021	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=181,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,1:3,3:2,4,0,4
chr10	125602072	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=231,158;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,0:3,5:0,4,0,5
chr10	125622250	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=110,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.465:11:3,1:3,4:1,5,3,2
chr10	125650793	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=182,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr10	125650829	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=169,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:5,2,2,0
chr10	125780752	.	CGG	C,CG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31,34;MFRL=0,217,163;MMQ=60,60,60;MPOS=30,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=G;STR;TLOD=9.15,16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,5:0.400,0.515:8:0,0,3:0,2,2:0,0,8,0
chr10	125780759	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=203,63;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:2,2:5,0:8,1,2,0
chr10	125780958	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,0:1,2:1,4,1,1
chr10	125801761	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=195,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.292:9:5,0:2,2:6,1,2,0
chr10	125801809	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=179,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:8,1:5,3:10,3,2,2
chr10	125805631	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:5,2:5,3:3,7,0,5
chr10	126086730	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr10	126093991	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=192,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,5:1,3:1,1,6,2
chr10	126100523	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=84,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,12:0.297:42:7,10:21,2:25,5,3,9
chr10	126136465	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr10	126185451	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=198,258;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr10	126185618	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=104,266;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:5,5:4,0:4,6,3,2
chr10	126185707	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=218,248;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr10	126384610	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=195,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr10	126395123	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr10	126505062	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,0:0,0,5,1
chr10	126517243	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.372:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr10	126518142	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=187,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr10	126660781	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr10	126670356	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:1,3:8,9:5,4,8,4
chr10	126671799	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,0:11,2:9,8,2,0
chr10	126678102	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=135,155;MMQ=40,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,9:0.253:37:15,4:11,5:0|1:126678102_G_A:126678102:13,15,2,7
chr10	126678112	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=7;MBQ=24,33;MFRL=135,155;MMQ=50,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,9:0.259:36:15,4:12,5:0|1:126678102_G_A:126678102:11,16,2,7
chr10	126678133	.	TG	T	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=29,30;MFRL=139,161;MMQ=40,27;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.272:31:9,4:14,4:8,15,1,7
chr10	126678148	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=145,161;MMQ=40,32;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:7,4:12,2:5,14,0,6
chr10	126678177	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=198,131;MMQ=40,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:10,1:3,1:0|1:126678177_G_T:126678177:6,7,0,2
chr10	126678180	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=34,26;MFRL=198,131;MMQ=40,25;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,1:2,1:0|1:126678177_G_T:126678177:6,7,0,2
chr10	126678189	.	TG	CA	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=29,28;MFRL=202,131;MMQ=52,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,1:2,1:0|1:126678177_G_T:126678177:7,9,0,2
chr10	126681215	.	CG	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=119,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:3,2:9,0:6,7,1,1
chr10	126681219	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=129,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:4,4:0,9:1,3,6,7
chr10	126681688	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr10	126682468	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=150,41;MMQ=60,47;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:16,2:15,2:19,12,2,2
chr10	126682485	.	CT	TG	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=150,41;MMQ=60,47;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.147:31:16,2:10,2:16,11,2,2
chr10	126682493	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=175,41;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:16,2:11,2:14,15,2,2
chr10	126682516	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=190,91;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:18,1:9,2:10,17,0,3
chr10	126683071	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=11;MBQ=34,34;MFRL=161,143;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,8:0.191:45:18,5:17,3:20,17,8,0
chr10	126683075	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=11;MBQ=28,32;MFRL=158,140;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.163:47:19,5:20,2:22,18,7,0
chr10	126683087	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=11;MBQ=28,32;MFRL=161,111;MMQ=52,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,13:0.291:46:16,8:17,5:17,16,10,3
chr10	126683103	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=11;MBQ=30,25;MFRL=154,108;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,12:0.301:41:13,9:16,3:16,13,8,4
chr10	126683123	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=11;MBQ=27,30;MFRL=153,103;MMQ=52,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,13:0.317:42:16,7:13,6:12,17,7,6
chr10	126683146	.	C	A	.	.	DP=49;ECNT=11;MBQ=33,25;MFRL=148,114;MMQ=52,32;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,11:0.237:48:19,5:17,5:0|1:126683146_C_A:126683146:10,27,5,6
chr10	126683151	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=11;MBQ=31,30;MFRL=150,103;MMQ=52,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.189:40:17,3:16,4:11,22,2,5
chr10	126683152	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=11;MBQ=32,27;MFRL=150,57;MMQ=52,31;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,10:0.231:45:16,5:18,5:0|1:126683146_C_A:126683146:10,25,4,6
chr10	126683162	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=11;MBQ=29,31;MFRL=153,122;MMQ=52,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.198:43:18,3:17,5:13,22,2,6
chr10	126683178	.	GCAAGTAGGGGTCATAAAATATGACGCTGAATC	G	.	.	DP=55;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=159,57;MMQ=52,31;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,8:0.167:52:19,3:18,5:18,26,4,4
chr10	126683190	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=11;MBQ=32,24;MFRL=172,147;MMQ=52,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.197:33:15,2:12,4:13,14,1,5
chr10	126686656	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=29,31;MFRL=150,71;MMQ=60,37;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:17,2:9,0:0|1:126686656_T_C:126686656:17,14,0,2
chr10	126686659	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=30,24;MFRL=150,71;MMQ=60,37;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:18,2:8,0:0|1:126686656_T_C:126686656:15,16,0,2
chr10	126686665	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=32,20;MFRL=152,119;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,5:0.166:34:21,1:7,3:0|1:126686665_G_T:126686665:11,18,2,3
chr10	126686666	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=32,23;MFRL=153,139;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.131:36:19,3:9,0:0|1:126686656_T_C:126686656:15,17,0,4
chr10	126686672	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=32,25;MFRL=154,119;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,5:0.167:34:21,2:7,3:0|1:126686665_G_T:126686665:11,18,2,3
chr10	126686680	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=12;MBQ=26,27;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:18,3:8,0:9,17,0,3
chr10	126686682	.	A	G,T	.	.	DP=30;ECNT=12;MBQ=25,32,24;MFRL=168,141,119;MMQ=60,60,55;MPOS=20,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.66,8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,3,3:0.121,0.121:30:18,3,1:6,0,1:8,16,1,5
chr10	126686687	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=12;MBQ=26,32;MFRL=168,139;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:16,4:6,2:9,15,1,5
chr10	126686690	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=167,119;MMQ=60,55;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:20,1:7,2:0|1:126686690_G_A:126686690:9,18,1,2
chr10	126686692	.	CC	TG	.	.	DP=32;ECNT=12;MBQ=32,29;MFRL=168,119;MMQ=60,55;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:19,1:5,2:0|1:126686690_G_A:126686690:10,18,1,2
chr10	126686693	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=12;MBQ=27,26;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:17,3:4,0:8,15,0,3
chr10	126686714	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=12;MBQ=27,31;MFRL=178,141;MMQ=60,55;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:16,5:6,2:9,13,1,6
chr10	126686827	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr10	126691538	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=16;MBQ=32,33;MFRL=131,0;MMQ=60,23;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:7,2:5,3:8,4,2,3
chr10	126691552	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=16;MBQ=27,33;MFRL=104,124;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,1:11,1:14,10,2,0
chr10	126691563	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=16;MBQ=28,27;MFRL=117,105;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.092:31:16,1:13,1:17,12,2,0
chr10	126691572	.	G	GGCCA	.	.	DP=40;ECNT=16;MBQ=32,31;MFRL=122,105;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.122:39:17,1:17,3:22,13,4,0
chr10	126691575	.	TATCC	CATCC,T	.	.	DP=43;ECNT=16;MBQ=26,35,26;MFRL=133,102,105;MMQ=60,45,40;MPOS=24,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=52.30,10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,15,4:0.390,0.120:40:10,8,1:9,7,3:13,8,13,6
chr10	126691577	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=16;MBQ=24,34;MFRL=133,95;MMQ=60,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.473:40:9,9:11,9:13,8,13,6
chr10	126691579	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=16;MBQ=31,26;MFRL=118,121;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.285:39:12,5:15,6:16,12,10,1
chr10	126691580	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=16;MBQ=30,34;MFRL=128,0;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.214:40:14,4:17,4:24,8,3,5
chr10	126691595	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=16;MBQ=33,29;MFRL=131,0;MMQ=60,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,8:0.179:48:14,4:22,4:0|1:126691595_G_A:126691595:30,10,3,5
chr10	126691598	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=16;MBQ=31,25;MFRL=131,0;MMQ=60,26;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,7:0.156:49:15,2:24,2:0|1:126691595_G_A:126691595:30,12,3,4
chr10	126691605	.	C	A	.	.	DP=53;ECNT=16;MBQ=31,29;MFRL=133,126;MMQ=60,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=116.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,31:0.581:53:9,9:12,16:13,9,22,9
chr10	126691608	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=16;MBQ=32,25;MFRL=133,126;MMQ=60,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=107.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,29:0.554:52:9,11:11,14:14,9,20,9
chr10	126691617	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=16;MBQ=32,30;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.145:46:15,3:22,3:27,13,3,3
chr10	126691631	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=16;MBQ=25,29;MFRL=135,145;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=81.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,21:0.512:41:7,7:12,11:0|1:126691631_T_A:126691631:11,9,14,7
chr10	126691634	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=16;MBQ=25,30;MFRL=135,146;MMQ=60,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=77.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,20:0.500:40:7,7:13,13:0|1:126691631_T_A:126691631:11,9,13,7
chr10	126691660	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=16;MBQ=32,26;MFRL=137,145;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.332:28:6,4:13,5:7,12,4,5
chr10	126692093	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,12;MFRL=156,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.352:11:4,0:0,1:1,6,0,4
chr10	126716346	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=211,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr10	126727587	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=30,29;MFRL=158,158;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:18,1:13,2:16,15,2,1
chr10	126727602	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=11;MBQ=29,29;MFRL=170,139;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=71.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,18:0.613:29:4,11:7,7:0|1:126727602_T_A:126727602:5,6,11,7
chr10	126727604	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=29,31;MFRL=170,139;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=71.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,18:0.613:29:4,11:7,7:0|1:126727602_T_A:126727602:5,6,11,7
chr10	126727614	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=11;MBQ=35,32;MFRL=144,141;MMQ=52,31;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:12,4:8,3:9,11,5,2
chr10	126727630	.	T	C,G	.	.	DP=29;ECNT=11;MBQ=29,32,34;MFRL=174,141,136;MMQ=56,31,43;MPOS=12,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=15.89,39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,7,12:0.266,0.434:27:3,4,8:5,3,4:3,5,11,8
chr10	126727647	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=33,31;MFRL=166,93;MMQ=52,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,3:6,0:3,11,0,3
chr10	126727690	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=30,27;MFRL=175,151;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,6:5,3:1,8,0,9
chr10	126727702	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=27,33;MFRL=160,152;MMQ=60,34;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.276:16:8,1:4,3:0|1:126727702_C_T:126727702:0,12,0,4
chr10	126727711	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=27,33;MFRL=164,156;MMQ=60,31;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:6,0:2,3:0|1:126727702_C_T:126727702:0,8,0,3
chr10	126727725	.	C	CAATATAAATT	.	.	DP=10;ECNT=11;MBQ=33,33;MFRL=236,158;MMQ=60,33;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0|1:126727725_C_CAATATAAATT:126727725:0,5,0,5
chr10	126727727	.	G	GTTCACAAACTCTATAGTTC	.	.	DP=10;ECNT=11;MBQ=32,31;MFRL=236,158;MMQ=60,33;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,1:2,1:0|1:126727725_C_CAATATAAATT:126727725:0,5,0,5
chr10	127422619	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=173,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:3,7:5,4:7,1,5,6
chr10	127426430	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,1:0,9:0,0,10,0
chr10	127426588	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,1,18
chr10	127426835	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,11,6
chr10	127436411	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0,0,7,6
chr10	127441573	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr10	127460952	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=167,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,4:1,5:1,1,3,6
chr10	127483396	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=174,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr10	127483573	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,1:1,3:1,5,1,3
chr10	127484617	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=132,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:8,1:1,7:7,2,8,1
chr10	127484653	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=132,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.542:18:6,2:2,6:5,3,5,5
chr10	127500718	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.718:12:1,3:2,6:3,0,9,0
chr10	127504660	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr10	127515069	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	127516279	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=-1073741809;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:0,9,0,2
chr10	127516304	.	AA	CG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr10	127522572	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=213,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:0,5,0,4
chr10	127524612	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=109,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,7:0,1:1,0,7,1
chr10	127529756	.	T	TTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=202,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TG;STR;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,4:0,1:3,0,3,2
chr10	127530325	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=107,184;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:2,4:7,8:5,4,6,6
chr10	127540894	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,325;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:7,0:7,9:9,5,9,0
chr10	127541877	.	ATGGT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:127541877_ATGGT_A:127541877:0,3,0,1
chr10	127541883	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:127541877_ATGGT_A:127541877:0,3,0,1
chr10	127548587	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:4,6:1,4:1,4,6,4
chr10	127585090	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=34,25;MFRL=213,243;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr10	127585097	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,32;MFRL=213,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:127585097_T_C:127585097:3,0,1,0
chr10	127585099	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=213,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:127585097_T_C:127585097:3,0,1,0
chr10	127585112	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=26,30;MFRL=212,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0|1:127585112_T_C:127585112:4,0,2,0
chr10	127585120	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=27,32;MFRL=210,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.337:7:2,0:3,2:0|1:127585112_T_C:127585112:5,0,2,0
chr10	127585173	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=27,34;MFRL=216,209;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.454:12:2,2:4,3:5,2,4,1
chr10	127585179	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=224,167;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.733:9:2,2:0,5:2,0,4,3
chr10	127585208	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=168,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,0:3,3:4,6,2,1
chr10	127585307	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=231,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:0,7,1,3
chr10	127585360	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=224,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,1,3
chr10	127585363	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=185,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:0,2,1,4
chr10	127685091	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,4:2,6:3,2,6,4
chr10	127693411	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=181,102;MMQ=60,49;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:6,7:10,0:13,3,8,0
chr10	127693432	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,18,8
chr10	127697165	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=143,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,1:5,4:3,5,1,4
chr10	127706028	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:0,5,0,4
chr10	127708428	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=213,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,5:1,3:1,2,0,8
chr10	127727768	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=164,189;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:2,1:4,0,4,0
chr10	127727808	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=165,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.320:10:3,2:3,0:4,3,3,0
chr10	127786969	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=85,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,5:2,4:4,1,5,4
chr10	127789605	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=103,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,0:1,4:2,0,4,0
chr10	127798336	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,144;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:10,5:7,0:12,5,5,0
chr10	127824044	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=199,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr10	127843740	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=225,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,4:1,5:2,0,8,1
chr10	127843756	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=225,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,5:1,5:2,0,8,2
chr10	127843921	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=242,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=48.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.819:20:1,6:2,9:0,3,3,14
chr10	127967602	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:127967602_G_A:127967602:0,0,0,1
chr10	127967607	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=242,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:127967602_G_A:127967602:0,1,0,1
chr10	127967660	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=212,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr10	128147561	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=205,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:5,2,2,0
chr10	128153623	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	128209769	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:1,4:1,1,7,1
chr10	128209797	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:3,6:1,4:2,2,8,2
chr10	128209959	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=205,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,5:0,4:0,1,2,7
chr10	128797527	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=170,503;MMQ=60,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr10	128797561	.	CATTTGGTACCCTGTT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=170,503;MMQ=60,42;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:2,0:7,0,0,2
chr10	128797717	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=147,237;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,2:6,1:4,7,2,1
chr10	128797755	.	T	TTCTCTATGTATGAGTGACAGCTTGTA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=158,162;MMQ=60,45;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr10	128797774	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=210,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:128797774_T_C:128797774:0,3,0,1
chr10	128797779	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,35;MFRL=202,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:128797774_T_C:128797774:0,4,0,1
chr10	128797809	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=203,287;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr10	128798495	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:12,3:5,1:10,7,3,1
chr10	128810685	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=151,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,2:8,0:4,8,1,1
chr10	128821415	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:5,1,2,0
chr10	128821616	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=153,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.331:16:2,1:9,4:0|1:128821616_T_G:128821616:6,5,2,3
chr10	128821636	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=172,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:5,1:9,3:0|1:128821616_T_G:128821616:4,10,1,3
chr10	128822873	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=154,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr10	128822886	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,2:2,2:6,1,2,2
chr10	128830336	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,248;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:8,0,6,0
chr10	128836112	.	CTT	C,GTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35,13;MFRL=138,187,135;MMQ=60,60,50;MPOS=22,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.06,3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,2:0.282,0.257:5:1,1,0:0,0,0:1,1,1,2
chr10	128840842	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr10	128851156	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=168,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:1,10,0,2
chr10	128923954	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	128952219	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=132,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,0:4,2:6,7,0,2
chr10	128952265	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	128974621	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,4,2
chr10	128974713	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0|1:128974713_C_T:128974713:0,0,0,6
chr10	128974716	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0|1:128974713_C_T:128974713:0,0,0,6
chr10	129046407	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=148,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,2:6,1:4,6,2,1
chr10	129178415	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.573:19:3,5:5,6:3,5,2,9
chr10	129182958	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=156,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.817:9:1,3:0,5:1,0,8,0
chr10	129183015	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=190,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,4:1,6:1,1,4,6
chr10	129202729	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=111,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,2:1,7:1,4,3,6
chr10	129207514	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=186,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,2:1,5:1,2,3,4
chr10	129209084	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,7:5,1:1,6,5,3
chr10	129224344	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=211,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:0,4,0,5
chr10	129237572	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr10	129242555	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=199,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,2:7,4:4,9,0,6
chr10	129245628	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=186,257;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:9,0:3,2:10,2,1,1
chr10	129249676	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,4,5
chr10	129249693	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=210,148;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,5:1,6:0,1,4,7
chr10	129249701	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,7:0,0,4,8
chr10	129681917	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=231,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,7:5,2:7,2,7,2
chr10	129690774	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=209,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:2,2:1,3:4,0,4,1
chr10	129690837	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=128,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,1:2,1:7,2,2,0
chr10	129846010	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=157,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,25:0.633:39:8,11:6,13:7,7,18,7
chr10	129854369	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,5,5
chr10	129864515	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:4,4:0,8:0,4,3,9
chr10	129869233	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr10	129899482	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:7,4,2,0
chr10	129902210	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:6,1:14,2:10,11,3,0
chr10	129903165	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=170,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,3:7,3:6,9,3,3
chr10	129904531	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=201,146;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,6:0.090:75:30,6:39,0:16,53,6,0
chr10	129904560	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=132,201;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.155:36:18,2:13,3:11,20,4,1
chr10	129905217	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.087:55:24,4:26,0:23,28,0,4
chr10	129906980	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=199,128;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,32:0.826:38:4,15:2,17:4,2,17,15
chr10	129907741	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr10	129909944	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=167,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,2:8,1:7,8,1,2
chr10	129911919	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,6:2,5:1,2,2,9
chr10	129911954	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=206,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0|1:129911954_C_A:129911954:0,5,0,2
chr10	129911956	.	AGT	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=206,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0|1:129911954_C_A:129911954:0,5,0,2
chr10	131265665	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	131639306	.	T	TCC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=186,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=C;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:0,3:1,2,1,2
chr10	131666271	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=182,271;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr10	131760352	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=75,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,4:0,4:3,1,7,1
chr10	131934628	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=151,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,2:2,5:4,0,7,0
chr10	131934654	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=143,297;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,0:4,5:8,2,5,0
chr10	131943423	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr10	131958422	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,5:1,2:0,5,0,7
chr10	131965026	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=205,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:2,3,1,2
chr10	131967640	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=205,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,3:3,2:7,2,4,1
chr10	131973052	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=189,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr10	131973442	.	T	TGAGGACACACATCGCAAATAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=206,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:3,1:0,0:0|1:131973442_T_TGAGGACACACATCGCAAATAA:131973442:0,3,0,1
chr10	131973447	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=206,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:3,1:0,0:0|1:131973442_T_TGAGGACACACATCGCAAATAA:131973442:0,3,0,1
chr10	132961555	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=204,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,1:0,5,1,3
chr10	133930596	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:9,8,0,2
chr10	133948456	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=212,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr10	133955569	.	C	CCG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CG;STR;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr10	133958541	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr10	133961494	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=275,138;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,2:0,10:0,1,5,8
chr10	133961564	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,5:0,3:0,0,3,6
chr10	133963042	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr10	133963466	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr10	133966552	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=126,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:4,3,2,2
chr10	133967593	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	133976706	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,9:1,2:1,0,8,3
chr10	134010439	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=169,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.265:8:2,1:4,1:5,1,1,1
chr10	134013856	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=240,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:1,7:1,7:1,1,11,3
chr10	134016115	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=303,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,3:1,8:2,0,9,2
chr10	134016396	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=274,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr10	134018447	.	G	GGCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,278;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCC;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:1,5,2,0
chr10	134021740	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr10	134022511	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=157,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,0:0|1:134022511_A_C:134022511:0,2,1,0
chr10	134022513	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=157,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:134022511_A_C:134022511:0,2,1,0
chr10	134022517	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=150,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:0,0:0|1:134022511_A_C:134022511:0,3,1,0
chr10	134022521	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=150,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:134022511_A_C:134022511:0,3,1,0
chr10	134036053	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0|1:134036053_G_A:134036053:0,0,7,0
chr10	134036057	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:134036053_G_A:134036053:0,0,7,0
chr10	134036073	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr10	134037877	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=199,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr10	134038715	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=108,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:0,5:5,2:4,1,6,1
chr10	134039132	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=188,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,3:5,1:5,2,1,3
chr10	134040290	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=263,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr10	134143866	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=154,171;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,5:3,0:7,1,5,0
chr10	134143942	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=108,134;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.495:34:12,6:5,9:8,9,9,8
chr10	134143985	.	GC	TT	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:9,8:7,4:6,10,4,8
chr10	134144005	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:11,4:4,3:6,9,1,6
chr10	134144016	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:12,2:3,1:5,10,2,1
chr10	134151034	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=188,76;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:1,3,2,2
chr10	134151288	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=163,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr10	134165291	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=203,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:1,2,2,4
chr10	134210667	.	CCGG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=193,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=CGG;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr10	134218708	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:3,13:12,0:10,5,13,0
chr10	134563141	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:9,2:4,2:6,7,3,1
chr10	134622507	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=68,253;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr10	134626453	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	134627593	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=219,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr10	134647453	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=214,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,1:0,1:5,0,2,0
chr10	134648988	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=187,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:134648988_C_A:134648988:1,7,1,1
chr10	134648990	.	G	GGAAGGTCTCCCCCAAGGGGATGC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=187,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:3,2:5,0:0|1:134648988_C_A:134648988:1,7,1,1
chr10	134650440	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=247,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:0,4:8,0:3,5,2,2
chr10	134663698	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=225,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,1:8,1:8,3,2,0
chr10	134664537	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=196,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:3,0,3,0
chr10	134664875	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=184,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr10	134681093	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=286,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:0,3,0,3
chr10	134699284	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=189,50;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:134699284_C_A:134699284:3,0,1,1
chr10	134699287	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=189,50;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0|1:134699284_C_A:134699284:3,0,1,1
chr10	134699291	.	G	GCTTGCAGTAAGCCAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,20;MFRL=189,50;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:134699284_C_A:134699284:3,0,1,1
chr10	134723394	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=265,240;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr10	134726335	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,2:1,5:0,5,2,5
chr10	134726369	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=205,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.725:8:1,2:0,4:0,2,0,6
chr10	134743376	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=218,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:134743376_A_C:134743376:0,3,0,1
chr10	134743382	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=218,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:134743376_A_C:134743376:0,3,0,1
chr10	134750604	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr10	134755298	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr10	134902314	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,360;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	134912314	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=172,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,3:2,5:0,2,0,8
chr10	134916121	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr10	134940790	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=150,38;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:0|1:134940790_C_T:134940790:10,5,1,1
chr10	134940800	.	C	CCGGGTGG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=151,38;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:6,2:0|1:134940790_C_T:134940790:10,6,1,1
chr10	134940802	.	G	GGGA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=151,38;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,0:6,2:0|1:134940790_C_T:134940790:10,6,1,1
chr10	134981690	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr10	134997480	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:1,4,4,0
chr10	134997514	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=192,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:3,0:1,5:0|1:134997514_A_G:134997514:1,3,0,5
chr10	134997524	.	T	TCTTG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=188,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:0|1:134997514_A_G:134997514:1,2,0,5
chr10	134999397	.	TGGGAGGAGAGGGGAGGGGC	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,25;MFRL=239,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGAGGAGAGGGGAGGGGC;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:0,2:3,0,2,0
chr10	134999416	.	CGGGAGGAGAG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,12;MFRL=217,127;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.289:5:2,0:2,0:0|1:134999416_CGGGAGGAGAG_C:134999416:4,0,1,0
chr10	134999433	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,16;MFRL=217,127;MMQ=60,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:134999416_CGGGAGGAGAG_C:134999416:4,0,1,0
chr10	134999436	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=217,127;MMQ=60,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:134999416_CGGGAGGAGAG_C:134999416:4,0,1,0
chr10	134999472	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=161,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:4,2,0,2
chr10	135020315	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=257,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,1:2,8:1,1,4,5
chr10	135024078	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=20,12;MFRL=157,361;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:1,0:0,0:0|1:135024078_A_C:135024078:1,1,1,0
chr10	135024083	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,32;MFRL=191,361;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:1,0:1,1:0|1:135024078_A_C:135024078:3,1,1,0
chr10	135024086	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,23;MFRL=196,361;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:135024078_A_C:135024078:2,1,1,0
chr10	135024089	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,12;MFRL=196,361;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:135024078_A_C:135024078:2,1,1,0
chr10	135024091	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,12;MFRL=196,361;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:135024078_A_C:135024078:2,1,1,0
chr10	135024094	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,12;MFRL=196,361;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:135024078_A_C:135024078:2,1,1,0
chr10	135024097	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=27,12;MFRL=196,361;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:2,0:0|1:135024078_A_C:135024078:2,1,1,0
chr10	135024305	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	135032566	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=203,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:10,0:5,4:6,9,0,4
chr10	135038467	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr10	135045022	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=198,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr10	135053123	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=210,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:2,1:2,3:5,0,3,1
chr10	135076523	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr10	135076758	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,3,17
chr10	135077121	.	C	CGTCAGCCCCGTGGGGAGGCCGTGCCACT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,2:0,4:0,0,14,0
chr10	135077311	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,4,12
chr10	135081684	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr10	135083812	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,11,0
chr10	135084232	.	C	CAGA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,7,6
chr10	135084601	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr10	135085321	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,5,3
chr10	135086203	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	135086380	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr10	135086676	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr10	135086766	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:5,3,2,0
chr10	135087189	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=244,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:0,0:1,3,3,0
chr10	135087198	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=244,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.442:7:3,1:0,1:0|1:135087198_A_C:135087198:1,3,3,0
chr10	135087204	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=233,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:4,0:1,0:0|1:135087198_A_C:135087198:2,3,3,0
chr10	135090183	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	135096784	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr10	135098672	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,4:0,11:0,0,5,10
chr10	135103311	.	C	CGCCCGCTGCGCCGCGGACGCCAAGTCCCT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=118,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:1,2:0,0:1,0,7,0
chr10	135106110	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=192,809;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:9,3:18,0:13,14,0,3
chr10	135111618	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:2,11,0,2
chr10	135113529	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=192,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:6,11,1,1
chr10	135141572	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	135170651	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=167,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:7,0:2,0:0|1:135170651_A_C:135170651:8,1,2,0
chr10	135170652	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,3:2,0:7,1,3,0
chr10	135170655	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=167,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:0|1:135170651_A_C:135170651:8,1,2,0
chr10	135171364	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	135178087	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr10	135179458	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr10	135192762	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr10	135194890	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr10	135197419	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=193,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,5:0,2:1,0,7,0
chr10	135202594	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,12:0,5:0,0,7,11
chr10	135204799	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:5,9:6,4:8,3,8,5
chr10	135209105	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	135211892	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,6:0,0,11,1
chr10	135213138	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:4,8,2,0
chr10	135232934	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr10	135237060	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	135340866	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr10	135350490	.	A	AGATGGGTGGAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GATGGGTGGAT;STR;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.866:5:0,1:0,1:0,0,4,1
chr10	135351174	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=189,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:4,0,6,0
chr10	135352344	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.326:35:14,11:9,0:10,14,11,0
chr10	135352509	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0|1:135352509_T_A:135352509:0,0,2,7
chr10	135352514	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0|1:135352509_T_A:135352509:0,0,2,7
chr10	135369054	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,4,3
chr10	135369643	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	135370407	.	G	GCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=245,284;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr10	135371279	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=168,0;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr10	135371466	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=342,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:3,0,5,2
chr10	135371625	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=128,261;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:11,0:9,5:10,10,2,3
chr10	135373679	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=125,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:11,3:5,5:5,11,4,4
chr10	135438929	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=153,134;MMQ=41,25;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:14,1:6,6:12,8,4,3
chr10	135438951	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=144,138;MMQ=52,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,10:0.367:28:14,4:4,6:0|1:135438951_G_A:135438951:9,9,4,6
chr10	135438955	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=144,138;MMQ=52,33;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,10:0.367:28:14,4:4,6:0|1:135438951_G_A:135438951:9,9,4,6
chr10	135438959	.	AC	A	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=25,29;MFRL=142,168;MMQ=52,25;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:18,0:8,3:12,16,2,1
chr10	135438967	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=144,155;MMQ=52,39;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,12:0.406:30:13,4:4,8:0|1:135438967_C_T:135438967:7,11,5,7
chr10	135438977	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=144,173;MMQ=52,39;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,14:0.441:32:15,4:3,8:0|1:135438967_C_T:135438967:8,10,6,8
chr10	135439196	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=257,304;MMQ=27,26;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,1,3
chr10	135439327	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=158,131;MMQ=27,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:3,1:0,1:2,2,0,3
chr10	135439339	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=153,143;MMQ=27,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,2:0,3:2,1,0,5
chr10	135439363	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=142,157;MMQ=27,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:2,5,0,2
chr10	135439388	.	A	AAC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=142,149;MMQ=27,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,1:3,1:5,6,1,1
chr10	135440214	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=157,206;MMQ=27,25;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.207:27:15,1:7,4:0|1:135440214_G_C:135440214:12,10,5,0
chr10	135440216	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=33,28;MFRL=157,206;MMQ=27,25;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.207:27:15,1:7,4:0|1:135440214_G_C:135440214:12,10,5,0
chr10	135440222	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=10;MBQ=31,25;MFRL=168,61;MMQ=25,50;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:17,1:9,2:16,10,2,1
chr10	135440270	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=30,22;MFRL=183,108;MMQ=27,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:9,5:0,0:0|1:135440270_G_A:135440270:3,6,1,4
chr10	135440278	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=29,25;MFRL=183,108;MMQ=27,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:6,3:0,0:0|1:135440270_G_A:135440270:1,6,0,3
chr10	135440305	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=10;MBQ=32,32;MFRL=158,158;MMQ=27,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr10	135440311	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=10;MBQ=27,33;MFRL=161,158;MMQ=26,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:1,1:0,4,0,3
chr10	135440320	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=10;MBQ=32,32;MFRL=158,184;MMQ=27,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0|1:135440320_C_T:135440320:0,5,0,2
chr10	135440328	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=10;MBQ=27,34;MFRL=158,203;MMQ=25,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:1,2:0|1:135440320_C_T:135440320:0,3,0,3
chr10	135440335	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=28,31;MFRL=157,205;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0|1:135440320_C_T:135440320:0,1,0,4
chr11	180116	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	193194	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:3,3,4,0
chr11	194332	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=189,237;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,1:5,1:5,4,1,1
chr11	197557	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,6:3,3:6,1,3,6
chr11	205757	.	AACTCTG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=225,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr11	206089	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:0,5,1,5
chr11	207275	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	209002	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,422;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	209894	.	ACCC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=189,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=C;STR;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,1,4
chr11	214163	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=95,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.715:12:0,5:3,3:0|1:214163_G_A:214163:2,1,8,1
chr11	214169	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,34;MFRL=95,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:0,4:3,5:0|1:214163_G_A:214163:2,1,8,1
chr11	214251	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:6,0:10,2:10,6,1,1
chr11	219089	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=186,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,0:5,2:3,5,0,2
chr11	243987	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=157,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:4,2,4,1
chr11	244106	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=28,33;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:7,4:4,6:0|1:244106_A_G:244106:6,5,7,4
chr11	244108	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,11:0.480:23:6,3:4,7:0|1:244106_A_G:244106:6,6,7,4
chr11	244115	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:7,3:5,6:0|1:244106_A_G:244106:7,5,5,4
chr11	244129	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=28,23;MFRL=139,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.465:19:6,2:4,5:6,4,5,4
chr11	244141	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=32,26;MFRL=154,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,5:5,7:4,6,4,8
chr11	244167	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=102,187;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.552:18:5,4:3,6:0|1:244167_C_T:244167:4,4,4,6
chr11	244171	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=28,36;MFRL=104,187;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:5,4:2,6:0|1:244167_C_T:244167:3,4,4,6
chr11	244414	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=165,119;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.629:25:6,7:3,9:6,3,13,3
chr11	244490	.	ATACCTTTTAG	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=220,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TACCTTTTAG;STR;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.532:15:2,3:5,5:3,4,3,5
chr11	244552	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=247,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,2:5,4:4,8,0,6
chr11	279798	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:5,1,4,1
chr11	280673	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=191,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,1:1,2:6,0,3,0
chr11	280816	.	AT	TC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=201,139;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:3,9:1,7:0,4,12,4
chr11	282625	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:1,0:4,3,2,0
chr11	290050	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=197,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,3:3,1:2,3,2,2
chr11	292798	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=220,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:6,4,2,1
chr11	293001	.	A	AG	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.279:26:8,3:11,2:8,11,3,4
chr11	293007	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=167,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:7,2:0|1:293007_T_A:293007:9,13,1,1
chr11	293013	.	G	GCAGATCATCT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=172,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:293007_T_A:293007:5,10,1,1
chr11	299586	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,326;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	308178	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=225,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,14:0.833:16:1,5:1,9:0|1:308178_T_C:308178:2,0,8,6
chr11	308180	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=225,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,14:0.834:16:1,5:1,9:0|1:308178_T_C:308178:2,0,8,6
chr11	314873	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=197,201;MMQ=49,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,0:3,4:6,3,3,1
chr11	320723	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=154,160;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:14,2:13,1:13,16,0,3
chr11	373401	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=239,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:373401_A_C:373401:1,0,1,0
chr11	373403	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=239,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:373401_A_C:373401:1,0,1,0
chr11	373809	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:3,8,2,0
chr11	375928	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=176,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,3:5,0:5,4,2,1
chr11	376487	.	C	CAATGCCGTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	379598	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=182,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:3,3,2,2
chr11	380774	.	A	AC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=205,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.560:14:2,3:4,5:6,0,4,4
chr11	396546	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:3,1:2,1:5,0,3,0
chr11	396701	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:0,4,2,3
chr11	397706	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr11	397732	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	397751	.	C	CTCCATCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=206,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:397751_C_CTCCATCA:397751:0,3,0,1
chr11	397754	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=206,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:397751_C_CTCCATCA:397751:0,3,0,1
chr11	400040	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=204,138;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,0:6,2:3,8,1,1
chr11	400719	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,338;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	403880	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=208,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,1,1
chr11	403939	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr11	404468	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:6,2:5,2:7,4,3,1
chr11	406999	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=160,94;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:3,0:6,2:5,4,2,1
chr11	407364	.	C	CATGGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=223,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATGGG;STR;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:0,2:1,1:1,0,4,0
chr11	409720	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	409815	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=209,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,1:4,4:4,7,2,3
chr11	418735	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:4,4,0,3
chr11	430203	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,270;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:3,4,0,3
chr11	433995	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=220,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:4,1:3,3:1,7,1,3
chr11	460303	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=112,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.565:23:3,8:6,5:6,4,4,9
chr11	486843	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=217,224;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr11	486855	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=214,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:4,0,3,0
chr11	487101	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=170,241;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr11	487136	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=159,265;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr11	489537	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=235,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,3:4,3:1,8,4,2
chr11	490035	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:3,2,1,3
chr11	490036	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=211,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:2,4:1,3,3,2
chr11	490492	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=153,231;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,0:7,2:4,5,1,1
chr11	494662	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=166,111;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:4,4,1,1
chr11	495057	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=183,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:1,5,0,3
chr11	495103	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=292,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr11	498442	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=124,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:3,4,2,0
chr11	498976	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=192,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr11	502013	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=216,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:9,1,3,0
chr11	502048	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=243,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:5,2,6,0
chr11	502129	.	ACTGGATGTCCAGGCT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=185,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGGATGTCCAGGCT;STR;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.459:9:1,2:3,2:1,4,1,3
chr11	502217	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=228,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr11	533558	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,0:10,2:13,9,0,2
chr11	533903	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=198,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:1,9,1,1
chr11	534197	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,3:4,0:8,1,3,0
chr11	534409	.	GCCCAGC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=184,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr11	541462	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,2:4,1:9,0,3,0
chr11	550028	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr11	551101	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,16;MFRL=124,287;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:551101_C_G:551101:1,1,1,0
chr11	551104	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=124,287;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:551101_C_G:551101:1,1,1,0
chr11	551108	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,12;MFRL=124,287;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,0:0|1:551101_C_G:551101:2,2,1,0
chr11	551114	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=103,287;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:551101_C_G:551101:1,2,1,0
chr11	551120	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,23;MFRL=166,287;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:551101_C_G:551101:1,3,1,0
chr11	551301	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=131,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:2,3,0,2
chr11	552547	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,6,12
chr11	552756	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	552787	.	TG	CC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	553866	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=240,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr11	554299	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr11	556457	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr11	556521	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,5,13
chr11	556599	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=159,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:1,3,0,2
chr11	557342	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,10,4
chr11	561750	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=167,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,1:3,2:6,3,3,0
chr11	581515	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=148,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,2:9,1:10,7,2,1
chr11	597554	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,47821427;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:2,3,2,0
chr11	605788	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	606656	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr11	608674	.	AGAGCAGG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:4,2:13,0:8,11,0,2
chr11	612843	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=227,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,2:2,1:3,2,0,3
chr11	612967	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=141,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,4:2,3:4,2,4,3
chr11	613165	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=202,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:2,2:11,6:10,3,7,1
chr11	613192	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.361:34:7,5:15,7:16,6,11,1
chr11	613208	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:7,7:12,8:11,8,12,3
chr11	613297	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=214,196;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.542:13:1,1:4,6:1,5,0,7
chr11	615010	.	GA	TT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=239,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr11	617967	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,5:0,15:0,0,9,12
chr11	618172	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=190,270;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr11	618675	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=95,137;MMQ=43,56;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.444:27:9,8:6,3:5,10,5,7
chr11	619671	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:2,3:7,5:5,4,5,3
chr11	619987	.	C	CCGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	621795	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=166,180;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.623:14:4,7:1,1:3,2,9,0
chr11	624796	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,18;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:0,1:1,0:0,1,2,0
chr11	639368	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=221,261;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:2,1:0,1:0|1:639368_T_TG:639368:2,0,2,0
chr11	639372	.	GGC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=261,221;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr11	639374	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.781:2:0,1:0,1:0|1:639368_T_TG:639368:0,0,2,0
chr11	654109	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=210,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr11	674454	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=155,188;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr11	674499	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:2,3:3,0:4,2,2,1
chr11	685061	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=193,85354590;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:2,0:1,1:0,4,1,0
chr11	686798	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.524:11:2,2:3,2:5,0,5,1
chr11	686839	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:5,1,2,2
chr11	700247	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=148,78;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,1,2
chr11	700526	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=237,240;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr11	702923	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,5:2,3:5,1,7,2
chr11	702953	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=133,309;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:10,2:4,1:9,5,3,0
chr11	709460	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.362:9:3,0:3,0:0|1:709460_T_C:709460:0,6,3,0
chr11	709464	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,1:3,2:0|1:709460_T_C:709460:2,6,3,0
chr11	709467	.	CAT	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,1:3,2:0|1:709460_T_C:709460:5,7,3,0
chr11	709473	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:8,0:3,0:0|1:709460_T_C:709460:5,7,3,0
chr11	710558	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=182,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:710558_G_A:710558:0,3,0,1
chr11	710567	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,36;MFRL=443,235;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:710558_G_A:710558:0,3,0,1
chr11	710600	.	CG	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=537,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	721877	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=217,252;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:5,1,1,1
chr11	723180	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=156,164;MMQ=42,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:0,0:8,2:7,1,2,0
chr11	726814	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:5,0:7,6:7,6,5,1
chr11	758927	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=94,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.526:15:3,3:4,5:4,3,4,4
chr11	760191	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:2,7,0,2
chr11	792805	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,298;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	793502	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=199,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,2:5,1:4,4,2,1
chr11	801153	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=191,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:6,6:2,4:2,6,5,5
chr11	801631	.	T	TG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=179,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.248:21:7,2:6,2:0|1:801631_T_TG:801631:4,12,1,4
chr11	801644	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,8:0.415:19:5,3:6,3:1|0:801631_T_TG:801631:1,10,3,5
chr11	802115	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:4,6:1,4:0|1:802115_A_G:802115:2,3,2,8
chr11	802125	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=148,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.707:15:3,6:1,4:0|1:802115_A_G:802115:1,3,2,9
chr11	802902	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=196,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,2:5,1:3,5,1,2
chr11	804027	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=120,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:6,1,2,0
chr11	811641	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=108,91;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:12,0:17,3:15,14,0,3
chr11	811661	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:12,2:14,2:13,13,2,2
chr11	822622	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=164,263;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:0,8,0,3
chr11	824496	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=285,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:3,4:1,1:2,3,0,5
chr11	824805	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	828784	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=162,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.576:12:4,3:0,3:1,4,1,6
chr11	830601	.	T	TGGTC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=181,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGTC;STR;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:4,2,3,3
chr11	831122	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=171,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr11	836023	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr11	836227	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,9:0,0,7,11
chr11	836539	.	TGG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=G;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr11	837662	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,30;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:0,1:0,1,0,3
chr11	838110	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=146,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.232:24:4,5:14,0:15,4,3,2
chr11	840319	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,4:0,2:4,0,6,0
chr11	842543	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:5,3:1,4:2,4,4,4
chr11	848974	.	C	CAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=128,90;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:848974_C_CAT:848974:0,2,0,1
chr11	848976	.	GGC	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=128,90;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0|1:848974_C_CAT:848974:0,2,0,1
chr11	848979	.	TGAC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=128,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:848974_C_CAT:848974:0,2,0,1
chr11	865447	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr11	865503	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,2:0,0,6,5
chr11	866044	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	866498	.	TG	CA,CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34,27;MFRL=0,116,191;MMQ=60,60,60;MPOS=12,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=13.50,7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,3:0.548,0.364:8:0,2,2:0,3,1:0,0,4,4
chr11	900894	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr11	900929	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=257,223;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,1,3
chr11	977322	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=209,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr11	981205	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=173,87;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,4:7,0:5,5,4,0
chr11	981269	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=159,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:981269_C_T:981269:7,6,1,1
chr11	981272	.	G	GTCTCTCTC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=147,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,6;RU=TC;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:981269_C_T:981269:6,6,1,1
chr11	981279	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=134,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:981269_C_T:981269:6,7,1,1
chr11	992691	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=103,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,2:3,1:5,5,1,2
chr11	993745	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=251,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:1,0,3,4
chr11	993907	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=247,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:1,2,1,1
chr11	1009307	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=182,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,4:8,4:7,5,7,1
chr11	1009416	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=123,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.092:46:22,1:20,2:20,22,1,3
chr11	1010649	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=190,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,5:6,3:3,8,4,4
chr11	1010694	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=141,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:1,4,0,5
chr11	1016609	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=179,814;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,15:0.364:42:11,7:14,8:11,16,7,8
chr11	1016640	.	G	A	.	.	DP=88;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=177,125;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,24:0.278:88:34,11:28,11:0|1:1016640_G_A:1016640:30,34,11,13
chr11	1016655	.	G	A	.	.	DP=121;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=168,126;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:89,30:0.254:119:46,12:39,15:0|1:1016640_G_A:1016640:41,48,13,17
chr11	1016662	.	G	A	.	.	DP=126;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=145,97;MMQ=57,30;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:113,12:0.101:125:58,6:49,6:52,61,8,4
chr11	1016665	.	C	T	.	.	DP=147;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=168,122;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,42:0.308:135:46,22:44,19:43,50,29,13
chr11	1016684	.	G	A	.	.	DP=173;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=129,209;MMQ=50,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:168,5:0.034:173:89,4:71,1:0|1:1016684_G_A:1016684:91,77,5,0
chr11	1016696	.	A	G	.	.	DP=180;ECNT=9;MBQ=29,29;MFRL=128,209;MMQ=50,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:175,5:0.033:180:99,4:69,1:0|1:1016684_G_A:1016684:106,69,5,0
chr11	1016704	.	C	A	.	.	DP=185;ECNT=9;MBQ=32,29;MFRL=130,125;MMQ=52,47;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:162,17:0.099:179:93,9:55,8:102,60,11,6
chr11	1016713	.	T	C	.	.	DP=185;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=126,147;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:157,25:0.140:182:90,14:56,6:101,56,17,8
chr11	1016715	.	T	C	.	.	DP=188;ECNT=9;MBQ=28,35;MFRL=125,187;MMQ=47,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:180,8:0.047:188:95,5:63,2:0|1:1016715_T_C:1016715:120,60,8,0
chr11	1016719	.	T	G	.	.	DP=178;ECNT=9;MBQ=27,34;MFRL=115,175;MMQ=48,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:169,9:0.055:178:100,7:64,2:0|1:1016715_T_C:1016715:113,56,8,1
chr11	1016722	.	T	G	.	.	DP=174;ECNT=9;MBQ=27,34;MFRL=111,175;MMQ=49,36;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:160,13:0.080:173:91,11:61,2:108,52,10,3
chr11	1016724	.	A	G	.	.	DP=177;ECNT=9;MBQ=29,32;MFRL=108,161;MMQ=57,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:147,26:0.154:173:89,18:57,8:97,50,21,5
chr11	1016776	.	C	G,T	.	.	DP=151;ECNT=18;MBQ=31,33,26;MFRL=153,154,129;MMQ=40,47,40;MPOS=17,19;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=48.78,178.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:48,22,66:0.162,0.487:136:34,6,34:14,16,31:34,14,53,35
chr11	1016779	.	G	A	.	.	DP=154;ECNT=18;MBQ=32,28;MFRL=141,155;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:142,12:0.083:154:68,10:66,2:0|1:1016779_G_A:1016779:92,50,8,4
chr11	1016789	.	T	A	.	.	DP=167;ECNT=18;MBQ=26,29;MFRL=141,154;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:152,15:0.095:167:76,10:61,4:0|1:1016779_G_A:1016779:97,55,9,6
chr11	1016795	.	C	G	.	.	DP=180;ECNT=18;MBQ=32,32;MFRL=141,156;MMQ=41,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:160,12:0.054:172:88,8:63,4:104,56,5,7
chr11	1016800	.	GG	AG,AC	.	.	DP=189;ECNT=18;MBQ=32,29,29;MFRL=143,155,121;MMQ=41,46,43;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=36.08,14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:170,13,6:0.073,0.036:189:91,9,2:58,3,4:102,68,9,10
chr11	1016802	.	T	A	.	.	DP=188;ECNT=18;MBQ=26,29;MFRL=140,155;MMQ=43,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:175,13:0.074:188:94,9:61,3:0|1:1016779_G_A:1016779:105,70,5,8
chr11	1016809	.	G	T	.	.	DP=189;ECNT=18;MBQ=32,27;MFRL=151,112;MMQ=43,35;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:177,8:0.045:185:106,4:64,3:100,77,6,2
chr11	1016810	.	G	T	.	.	DP=190;ECNT=18;MBQ=32,29;MFRL=145,155;MMQ=43,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:177,13:0.073:190:103,9:62,3:0|1:1016779_G_A:1016779:100,77,5,8
chr11	1016818	.	A	G	.	.	DP=197;ECNT=18;MBQ=28,35;MFRL=148,155;MMQ=44,49;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:185,8:0.046:193:104,4:69,4:95,90,6,2
chr11	1016819	.	G	T	.	.	DP=193;ECNT=18;MBQ=33,30;MFRL=145,155;MMQ=45,34;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:182,8:0.046:190:105,5:73,3:99,83,1,7
chr11	1016822	.	A	C	.	.	DP=199;ECNT=18;MBQ=27,31;MFRL=144,133;MMQ=45,33;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:184,11:0.061:195:102,8:71,3:0|1:1016822_A_C:1016822:95,89,8,3
chr11	1016825	.	G	A	.	.	DP=218;ECNT=18;MBQ=32,27;MFRL=143,118;MMQ=45,50;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:196,8:0.039:204:103,4:74,4:108,88,2,6
chr11	1016833	.	G	T	.	.	DP=228;ECNT=18;MBQ=32,28;MFRL=140,136;MMQ=51,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:206,21:0.096:227:106,14:89,6:104,102,14,7
chr11	1016834	.	G	A	.	.	DP=231;ECNT=18;MBQ=32,27;MFRL=135,139;MMQ=47,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=258.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:128,91:0.416:219:67,52:57,39:68,60,43,48
chr11	1016835	.	A	G	.	.	DP=235;ECNT=18;MBQ=28,35;MFRL=139,155;MMQ=49,59;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:221,4:0.022:225:122,3:92,1:113,108,3,1
chr11	1016836	.	A	T	.	.	DP=246;ECNT=18;MBQ=29,27;MFRL=139,137;MMQ=51,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:217,14:0.064:231:117,12:92,2:0|1:1016822_A_C:1016822:111,106,10,4
chr11	1016842	.	T	G	.	.	DP=281;ECNT=18;MBQ=28,32;MFRL=143,144;MMQ=55,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:229,34:0.130:263:130,21:88,12:114,115,15,19
chr11	1016845	.	C	G	.	.	DP=277;ECNT=18;MBQ=33,35;MFRL=147,133;MMQ=57,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:268,9:0.036:277:154,3:103,6:132,136,3,6
chr11	1016863	.	A	G	.	.	DP=194;ECNT=32;MBQ=27,35;MFRL=148,150;MMQ=60,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:187,7:0.041:194:106,1:66,6:88,99,1,6
chr11	1016869	.	AG	CA,GG	.	.	DP=184;ECNT=32;MBQ=28,33,34;MFRL=149,159,142;MMQ=60,60,30;MPOS=17,23;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=35.45,17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:136,13,8:0.087,0.047:157:75,7,1:59,5,7:65,71,4,17
chr11	1016880	.	C	T	.	.	DP=135;ECNT=32;MBQ=32,28;MFRL=132,142;MMQ=51,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:124,8:0.065:132:70,1:51,7:68,56,1,7
chr11	1016887	.	G	A	.	.	DP=130;ECNT=32;MBQ=32,26;MFRL=133,159;MMQ=45,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:119,11:0.091:130:62,6:54,4:62,57,3,8
chr11	1016890	.	G	A	.	.	DP=126;ECNT=32;MBQ=32,28;MFRL=154,121;MMQ=60,42;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=188.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,60:0.504:121:32,34:27,24:28,33,31,29
chr11	1016906	.	G	T	.	.	DP=89;ECNT=32;MBQ=33,28;MFRL=136,170;MMQ=47,47;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,8:0.099:89:45,5:29,2:42,39,2,6
chr11	1016912	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=32;MBQ=33,29;MFRL=134,159;MMQ=40,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,5:0.084:69:30,3:23,2:33,31,2,3
chr11	1016914	.	G	T	.	.	DP=59;ECNT=32;MBQ=34,28;MFRL=139,136;MMQ=60,39;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=176.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,43:0.721:59:10,20:5,20:10,6,20,23
chr11	1016928	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=32;MBQ=35,32;MFRL=124,140;MMQ=60,38;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=146.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,36:0.661:54:10,14:8,15:11,7,16,20
chr11	1016933	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=32;MBQ=30,28;MFRL=121,144;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,29:0.577:50:10,13:10,13:13,8,10,19
chr11	1016944	.	GG	TT	.	.	DP=44;ECNT=32;MBQ=32,28;MFRL=134,131;MMQ=56,32;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.155:44:20,4:15,2:20,18,3,3
chr11	1016954	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=32;MBQ=32,31;MFRL=132,169;MMQ=60,32;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.149:45:18,4:16,2:21,18,3,3
chr11	1016957	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=32;MBQ=28,32;MFRL=131,144;MMQ=60,45;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.213:45:18,5:15,4:20,16,3,6
chr11	1016959	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=32;MBQ=29,29;MFRL=131,144;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.213:45:19,4:17,4:20,16,3,6
chr11	1016961	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=32;MBQ=33,29;MFRL=135,169;MMQ=60,32;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.152:44:18,4:19,2:19,19,3,3
chr11	1016963	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=32;MBQ=35,28;MFRL=124,146;MMQ=60,47;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,8:0.196:44:17,4:17,4:20,16,2,6
chr11	1016968	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=32;MBQ=28,31;MFRL=122,148;MMQ=60,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.182:42:17,4:17,3:18,17,1,6
chr11	1016970	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=32;MBQ=34,29;MFRL=124,202;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.128:45:14,4:20,1:17,23,2,3
chr11	1016976	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=32;MBQ=28,32;MFRL=120,191;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.267:43:11,7:20,4:16,16,3,8
chr11	1016978	.	T	A,G	.	.	DP=43;ECNT=32;MBQ=28,27,35;MFRL=120,170,202;MMQ=60,47,40;MPOS=17,16;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.83,15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,6,5:0.152,0.130:43:10,3,4:20,3,1:16,16,3,8
chr11	1016988	.	ATGT	A	.	.	DP=47;ECNT=32;MBQ=28,24;MFRL=120,191;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.122:47:13,2:23,3:21,21,1,4
chr11	1016991	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=32;MBQ=28,25;MFRL=111,122;MMQ=60,51;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.217:40:10,3:19,3:16,15,5,4
chr11	1016995	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=32;MBQ=25,27;MFRL=121,193;MMQ=60,47;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.114:42:14,2:19,2:19,19,0,4
chr11	1017023	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=32;MBQ=32,29;MFRL=118,170;MMQ=60,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.104:46:17,1:22,3:22,20,4,0
chr11	1017029	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=32;MBQ=28,33;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,20:0.459:43:7,12:16,8:12,11,12,8
chr11	1017035	.	A	AAT	.	.	DP=56;ECNT=32;MBQ=29,30;MFRL=119,144;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,5:0.103:56:20,1:19,3:29,22,5,0
chr11	1017040	.	GGT	G	.	.	DP=68;ECNT=32;MBQ=33,32;MFRL=126,145;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,6:0.101:68:25,1:27,5:34,28,6,0
chr11	1017045	.	G	T	.	.	DP=71;ECNT=32;MBQ=32,25;MFRL=128,145;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,6:0.100:68:27,1:31,5:36,26,6,0
chr11	1017069	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=32;MBQ=27,28;MFRL=142,101;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,21:0.255:83:25,12:35,8:42,20,9,12
chr11	1017084	.	G	A	.	.	DP=96;ECNT=32;MBQ=33,28;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,31:0.341:92:27,14:34,17:33,28,22,9
chr11	1017110	.	C	T	.	.	DP=99;ECNT=32;MBQ=31,28;MFRL=143,144;MMQ=60,53;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,29:0.306:96:28,15:38,13:43,24,13,16
chr11	1017112	.	GT	CC	.	.	DP=96;ECNT=32;MBQ=32,32;MFRL=143,144;MMQ=60,53;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,29:0.309:95:26,16:37,13:42,24,13,16
chr11	1017154	.	T	G	.	.	DP=98;ECNT=16;MBQ=28,34;MFRL=144,188;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:84,9:0.105:93:39,2:39,6:0|1:1017154_T_G:1017154:37,47,1,8
chr11	1017158	.	G	T	.	.	DP=99;ECNT=16;MBQ=32,31;MFRL=145,188;MMQ=60,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:88,11:0.119:99:42,1:41,8:0|1:1017154_T_G:1017154:39,49,1,10
chr11	1017161	.	C	T	.	.	DP=97;ECNT=16;MBQ=30,32;MFRL=145,179;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:93,4:0.050:97:43,1:44,3:0|1:1017161_C_T:1017161:40,53,0,4
chr11	1017162	.	G	A	.	.	DP=97;ECNT=16;MBQ=31,29;MFRL=148,168;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,6:0.071:97:42,0:41,5:39,52,1,5
chr11	1017169	.	G	A	.	.	DP=100;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=145,188;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:95,5:0.058:100:37,2:49,3:0|1:1017161_C_T:1017161:40,55,0,5
chr11	1017173	.	G	A	.	.	DP=97;ECNT=16;MBQ=32,27;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,38:0.422:90:16,20:35,17:22,30,13,25
chr11	1017183	.	G	T	.	.	DP=91;ECNT=16;MBQ=33,29;MFRL=145,160;MMQ=57,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,20:0.235:85:27,6:38,12:25,40,9,11
chr11	1017186	.	A	G	.	.	DP=93;ECNT=16;MBQ=28,33;MFRL=150,179;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:80,12:0.138:92:31,4:42,8:0|1:1017154_T_G:1017154:35,45,2,10
chr11	1017191	.	G	A	.	.	DP=91;ECNT=16;MBQ=33,28;MFRL=152,94;MMQ=48,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:86,4:0.054:90:33,1:50,3:0|1:1017191_G_A:1017191:36,50,0,4
chr11	1017200	.	G	C	.	.	DP=80;ECNT=16;MBQ=33,29;MFRL=146,203;MMQ=45,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,5:0.074:79:27,2:39,3:31,43,1,4
chr11	1017203	.	A	G	.	.	DP=72;ECNT=16;MBQ=29,34;MFRL=160,94;MMQ=45,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,4:0.068:72:28,1:37,3:0|1:1017191_G_A:1017191:27,41,0,4
chr11	1017220	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=16;MBQ=28,29;MFRL=150,172;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=118.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,31:0.593:52:7,11:12,18:8,13,10,21
chr11	1017222	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=16;MBQ=28,30;MFRL=159,353;MMQ=40,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,2:0.054:54:17,0:28,2:0|1:1017222_T_C:1017222:18,34,0,2
chr11	1017226	.	T	G	.	.	DP=57;ECNT=16;MBQ=28,33;MFRL=163,353;MMQ=40,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,2:0.051:57:17,0:29,2:0|1:1017222_T_C:1017222:23,32,0,2
chr11	1017231	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=16;MBQ=28,34;MFRL=113,181;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=118.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,30:0.564:53:11,9:11,20:10,13,13,17
chr11	1017239	.	CG	TA,TG	.	.	DP=66;ECNT=16;MBQ=31,28,32;MFRL=127,168,351;MMQ=60,40,40;MPOS=12,15;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=89.08,6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,31,3:0.531,0.065:58:13,12,0:10,15,3:12,12,15,19
chr11	1017277	.	A	G	.	.	DP=110;ECNT=10;MBQ=28,35;MFRL=143,115;MMQ=40,34;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:105,4:0.045:109:59,3:43,1:0|1:1017277_A_G:1017277:67,38,4,0
chr11	1017280	.	G	T	.	.	DP=114;ECNT=10;MBQ=32,27;MFRL=144,133;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:110,4:0.043:114:62,2:44,2:0|1:1017280_G_T:1017280:72,38,4,0
chr11	1017283	.	C	T	.	.	DP=124;ECNT=10;MBQ=31,28;MFRL=144,115;MMQ=40,34;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:114,4:0.041:118:64,3:44,1:0|1:1017277_A_G:1017277:73,41,4,0
chr11	1017294	.	A	T	.	.	DP=128;ECNT=10;MBQ=29,27;MFRL=144,133;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:124,4:0.038:128:72,2:46,2:0|1:1017280_G_T:1017280:82,42,4,0
chr11	1017302	.	G	C	.	.	DP=135;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=141,152;MMQ=51,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:111,23:0.173:134:69,13:37,10:0|1:1017302_G_C:1017302:70,41,17,6
chr11	1017307	.	G	A	.	.	DP=137;ECNT=10;MBQ=32,28;MFRL=149,109;MMQ=40,45;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:124,6:0.052:130:74,1:40,5:79,45,5,1
chr11	1017317	.	G	T	.	.	DP=130;ECNT=10;MBQ=32,26;MFRL=145,140;MMQ=51,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:104,25:0.199:129:57,13:35,8:0|1:1017302_G_C:1017302:59,45,20,5
chr11	1017325	.	A	C	.	.	DP=132;ECNT=10;MBQ=27,30;MFRL=141,133;MMQ=42,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,37:0.302:124:46,24:32,13:47,40,21,16
chr11	1017337	.	TC	CA	.	.	DP=135;ECNT=10;MBQ=25,34;MFRL=116,142;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=121.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:92,37:0.291:129:42,23:42,12:51,41,23,14
chr11	1017363	.	C	G	.	.	DP=167;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=121,203;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:162,5:0.035:167:86,0:66,5:82,80,3,2
chr11	1017381	.	G	C	.	.	DP=180;ECNT=33;MBQ=32,32;MFRL=132,133;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:150,26:0.151:176:88,12:58,13:78,72,13,13
chr11	1017384	.	G	C	.	.	DP=179;ECNT=33;MBQ=32,32;MFRL=135,128;MMQ=60,44;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=116.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:130,41:0.238:171:75,22:51,18:65,65,24,17
chr11	1017386	.	C	T	.	.	DP=176;ECNT=33;MBQ=32,26;MFRL=135,109;MMQ=60,45;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:167,9:0.055:176:90,5:64,4:89,78,3,6
chr11	1017421	.	G	T	.	.	DP=96;ECNT=33;MBQ=33,28;MFRL=147,287;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,19:0.214:93:39,14:32,5:0|1:1017421_G_T:1017421:40,34,13,6
chr11	1017440	.	C	T	.	.	DP=82;ECNT=33;MBQ=30,29;MFRL=146,290;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,17:0.223:79:35,12:23,5:0|1:1017421_G_T:1017421:34,28,13,4
chr11	1017443	.	CGTG	C,GGTG,AGTG	.	.	DP=85;ECNT=33;MBQ=31,33,33,30;MFRL=145,56,163,168;MMQ=60,41,40,45;MPOS=10,17,15;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=31.64,81.41,15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:34,10,25,6:0.140,0.313,0.079:75:17,7,17,3:14,2,8,2:16,18,28,13
chr11	1017458	.	A	G	.	.	DP=74;ECNT=33;MBQ=29,30;MFRL=149,156;MMQ=50,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,4:0.067:73:34,3:28,1:0|1:1017458_A_G:1017458:39,30,3,1
chr11	1017461	.	G	T	.	.	DP=73;ECNT=33;MBQ=32,28;MFRL=145,156;MMQ=50,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,4:0.067:73:35,3:27,1:0|1:1017461_G_T:1017461:40,29,3,1
chr11	1017464	.	T	G,C	.	.	DP=74;ECNT=33;MBQ=28,33,35;MFRL=137,345,156;MMQ=60,40,48;MPOS=24,19;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=20.64,30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:57,7,10:0.104,0.143:74:28,5,7:22,2,3:31,26,13,4
chr11	1017466	.	T	C,A	.	.	DP=72;ECNT=33;MBQ=29,32,31;MFRL=138,352,156;MMQ=60,40,51;MPOS=22,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=17.22,10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:62,6,4:0.093,0.067:72:34,3,3:24,2,1:34,28,8,2
chr11	1017470	.	G	T	.	.	DP=70;ECNT=33;MBQ=33,28;MFRL=138,305;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,10:0.153:70:29,7:25,3:32,28,9,1
chr11	1017474	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=33;MBQ=33,28;MFRL=141,163;MMQ=60,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,3:0.062:63:28,2:27,1:0|1:1017461_G_T:1017461:34,26,3,0
chr11	1017483	.	T	G	.	.	DP=71;ECNT=33;MBQ=28,32;MFRL=136,305;MMQ=60,40;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,8:0.123:71:27,4:23,3:0|1:1017421_G_T:1017421:30,33,8,0
chr11	1017485	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=33;MBQ=32,30;MFRL=133,342;MMQ=60,40;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,6:0.093:73:36,3:25,2:0|1:1017485_G_A:1017485:34,33,5,1
chr11	1017489	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=33;MBQ=32,31;MFRL=142,94;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,2:0.038:77:45,1:26,1:0|1:1017458_A_G:1017458:39,36,2,0
chr11	1017495	.	ATGC	A	.	.	DP=79;ECNT=33;MBQ=28,27;MFRL=136,173;MMQ=60,33;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,6:0.083:79:41,5:25,1:0|1:1017485_G_A:1017485:36,37,3,3
chr11	1017497	.	GC	TT	.	.	DP=78;ECNT=33;MBQ=32,27;MFRL=135,163;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,3:0.040:75:41,1:26,0:0|1:1017497_GC_TT:1017497:36,36,1,2
chr11	1017498	.	C	G,T	.	.	DP=76;ECNT=33;MBQ=33,34,26;MFRL=133,141,95;MMQ=60,41,40;MPOS=14,17;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=26.03,4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:55,12,3:0.176,0.054:70:32,7,1:19,5,1:26,29,8,7
chr11	1017504	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=33;MBQ=32,20;MFRL=144,95;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,4:0.056:86:47,1:29,2:0|1:1017458_A_G:1017458:36,46,3,1
chr11	1017508	.	A	C	.	.	DP=98;ECNT=33;MBQ=27,28;MFRL=141,163;MMQ=60,52;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:92,5:0.038:97:50,3:37,2:0|1:1017497_GC_TT:1017497:44,48,1,4
chr11	1017514	.	A	G	.	.	DP=107;ECNT=33;MBQ=27,32;MFRL=127,163;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=133.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,43:0.403:107:36,22:27,19:30,34,22,21
chr11	1017528	.	T	A	.	.	DP=113;ECNT=33;MBQ=28,31;MFRL=135,270;MMQ=60,31;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:105,8:0.078:113:59,5:43,3:0|1:1017528_T_A:1017528:49,56,6,2
chr11	1017529	.	G	A	.	.	DP=115;ECNT=33;MBQ=32,28;MFRL=137,183;MMQ=60,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:105,6:0.052:111:58,4:43,1:49,56,4,2
chr11	1017535	.	TG	CA	.	.	DP=113;ECNT=33;MBQ=28,36;MFRL=135,198;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,4:0.043:113:60,0:42,4:52,57,1,3
chr11	1017545	.	G	T	.	.	DP=114;ECNT=33;MBQ=33,28;MFRL=117,268;MMQ=60,37;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:106,7:0.069:113:55,4:45,3:0|1:1017528_T_A:1017528:47,59,5,2
chr11	1017552	.	T	C	.	.	DP=113;ECNT=33;MBQ=28,20;MFRL=134,79;MMQ=54,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,7:0.070:110:48,7:46,0:51,52,4,3
chr11	1017556	.	G	A	.	.	DP=106;ECNT=33;MBQ=32,28;MFRL=109,168;MMQ=60,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=78.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,25:0.242:105:42,13:33,12:41,39,12,13
chr11	1017573	.	G	C	.	.	DP=97;ECNT=33;MBQ=32,32;MFRL=89,135;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,22:0.233:96:38,13:32,9:0|1:1017573_G_C:1017573:39,35,13,9
chr11	1017575	.	C	T	.	.	DP=100;ECNT=33;MBQ=30,28;MFRL=88,145;MMQ=60,34;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,32:0.358:90:31,20:26,10:34,24,18,14
chr11	1017581	.	A	G	.	.	DP=82;ECNT=33;MBQ=27,32;MFRL=89,228;MMQ=60,26;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:80,2:0.036:82:44,1:30,1:0|1:1017581_A_G:1017581:47,33,0,2
chr11	1017588	.	CT	C	.	.	DP=85;ECNT=33;MBQ=32,36;MFRL=90,228;MMQ=60,26;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,2:0.034:85:47,0:29,1:0|1:1017581_A_G:1017581:48,35,0,2
chr11	1017591	.	CG	GC	.	.	DP=79;ECNT=33;MBQ=30,33;MFRL=89,135;MMQ=60,34;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,12:0.160:79:32,8:28,3:0|1:1017573_G_C:1017573:37,30,8,4
chr11	1017596	.	T	G	.	.	DP=69;ECNT=33;MBQ=28,33;MFRL=102,57;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,9:0.142:68:37,2:21,7:34,25,5,4
chr11	1017655	.	G	A	.	.	DP=131;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=130,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:118,10:0.105:128:70,6:48,4:61,57,7,3
chr11	1017691	.	C	G	.	.	DP=99;ECNT=14;MBQ=33,32;MFRL=106,110;MMQ=60,45;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,17:0.189:93:37,11:38,6:41,35,11,6
chr11	1017744	.	T	C	.	.	DP=171;ECNT=14;MBQ=26,33;MFRL=146,234;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:157,10:0.065:167:73,7:77,3:90,67,5,5
chr11	1017746	.	T	G	.	.	DP=168;ECNT=14;MBQ=25,33;MFRL=128,315;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=265.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,70:0.440:160:37,36:48,33:50,40,43,27
chr11	1017755	.	CAG	TGA	.	.	DP=173;ECNT=14;MBQ=32,30;MFRL=151,389;MMQ=60,30;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:167,6:0.040:173:80,3:78,3:100,67,2,4
chr11	1017767	.	G	C	.	.	DP=179;ECNT=14;MBQ=32,31;MFRL=142,291;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=252.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:110,69:0.387:179:53,36:52,31:60,50,43,26
chr11	1017773	.	G	A	.	.	DP=177;ECNT=14;MBQ=28,27;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:144,28:0.166:172:68,18:69,10:87,57,15,13
chr11	1017783	.	A	G	.	.	DP=174;ECNT=14;MBQ=28,30;MFRL=133,174;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=278.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:92,77:0.456:169:44,43:44,31:45,47,43,34
chr11	1017789	.	A	C	.	.	DP=174;ECNT=14;MBQ=28,31;MFRL=156,125;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:130,36:0.217:166:65,18:60,17:68,62,17,19
chr11	1017833	.	C	T	.	.	DP=128;ECNT=14;MBQ=30,30;MFRL=128,139;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:104,13:0.117:117:54,5:45,8:0|1:1017833_C_T:1017833:45,59,2,11
chr11	1017834	.	G	A	.	.	DP=125;ECNT=14;MBQ=31,32;MFRL=129,111;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:113,3:0.034:116:55,3:53,0:0|1:1017834_G_A:1017834:42,71,3,0
chr11	1017844	.	TC	CG	.	.	DP=117;ECNT=14;MBQ=27,28;MFRL=131,139;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:107,9:0.084:116:52,2:39,5:0|1:1017833_C_T:1017833:55,52,1,8
chr11	1017845	.	C	G	.	.	DP=114;ECNT=14;MBQ=30,33;MFRL=131,119;MMQ=60,52;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,24:0.247:99:43,13:32,8:38,37,12,12
chr11	1017848	.	G	A	.	.	DP=109;ECNT=14;MBQ=33,25;MFRL=138,129;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,10:0.099:109:50,8:43,2:0|1:1017834_G_A:1017834:45,54,8,2
chr11	1017858	.	A	G	.	.	DP=96;ECNT=14;MBQ=28,26;MFRL=131,132;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,18:0.200:93:36,11:32,5:34,41,9,9
chr11	1017869	.	G	C	.	.	DP=137;ECNT=29;MBQ=32,31;MFRL=124,117;MMQ=57,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:113,19:0.149:132:58,14:51,5:58,55,13,6
chr11	1017883	.	C	T,A	.	.	DP=156;ECNT=29;MBQ=32,25,29;MFRL=117,115,150;MMQ=59,41,58;MPOS=23,25;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.87,88.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:116,6,30:0.044,0.197:152:65,3,22:49,3,7:60,56,22,14
chr11	1017891	.	GCA	G,TGA	.	.	DP=152;ECNT=29;MBQ=33,32,28;MFRL=117,153,94;MMQ=57,40,60;MPOS=21,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.94,11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:140,6,5:0.045,0.039:151:85,3,2:50,2,3:77,63,2,9
chr11	1017893	.	A	G	.	.	DP=152;ECNT=29;MBQ=28,27;MFRL=117,84;MMQ=60,33;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:124,21:0.146:145:77,10:45,9:66,58,13,8
chr11	1017894	.	T	TGC	.	.	DP=152;ECNT=29;MBQ=28,30;MFRL=117,153;MMQ=57,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:146,6:0.045:152:81,3:54,1:0|1:1017894_T_TGC:1017894:80,66,0,6
chr11	1017898	.	T	G	.	.	DP=153;ECNT=29;MBQ=27,32;MFRL=116,153;MMQ=55,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:143,6:0.046:149:82,4:54,2:0|1:1017894_T_TGC:1017894:78,65,0,6
chr11	1017899	.	A	T	.	.	DP=153;ECNT=29;MBQ=28,28;MFRL=121,94;MMQ=53,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:148,5:0.039:153:92,2:53,3:0|1:1017899_A_T:1017899:77,71,2,3
chr11	1017911	.	TG	CT	.	.	DP=143;ECNT=29;MBQ=29,20;MFRL=116,91;MMQ=51,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:133,7:0.046:140:81,4:48,3:71,62,4,3
chr11	1017912	.	G	A	.	.	DP=141;ECNT=29;MBQ=32,26;MFRL=116,71;MMQ=51,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:132,6:0.049:138:78,3:45,3:70,62,3,3
chr11	1017917	.	A	T	.	.	DP=118;ECNT=29;MBQ=28,30;MFRL=116,157;MMQ=51,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:114,4:0.042:118:72,2:37,2:0|1:1017899_A_T:1017899:56,58,1,3
chr11	1017921	.	C	A	.	.	DP=119;ECNT=29;MBQ=33,27;MFRL=122,134;MMQ=52,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:108,8:0.076:116:67,6:37,2:0|1:1017921_C_A:1017921:49,59,4,4
chr11	1017932	.	CA	TG	.	.	DP=104;ECNT=29;MBQ=33,29;MFRL=146,135;MMQ=46,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:91,10:0.107:101:53,6:30,4:0|1:1017932_CA_TG:1017932:37,54,6,4
chr11	1017935	.	A	G,C	.	.	DP=98;ECNT=29;MBQ=26,34,30;MFRL=146,168,135;MMQ=47,40,40;MPOS=15,9;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=21.20,30.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:79,8,10:0.090,0.109:97:52,3,6:23,5,4:35,44,7,11
chr11	1017939	.	G	C	.	.	DP=93;ECNT=29;MBQ=32,31;MFRL=146,130;MMQ=44,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,11:0.125:93:50,6:25,4:0|1:1017932_CA_TG:1017932:36,46,6,5
chr11	1017941	.	G	T	.	.	DP=85;ECNT=29;MBQ=32,28;MFRL=130,154;MMQ=40,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,12:0.149:85:45,10:27,2:0|1:1017921_C_A:1017921:29,44,7,5
chr11	1017955	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=29;MBQ=27,33;MFRL=143,247;MMQ=45,40;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,5:0.072:70:43,1:19,4:26,39,1,4
chr11	1017963	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=29;MBQ=31,28;MFRL=179,145;MMQ=40,45;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,14:0.221:66:29,11:22,2:0|1:1017921_C_A:1017921:19,33,8,6
chr11	1017968	.	T	A	.	.	DP=63;ECNT=29;MBQ=29,29;MFRL=184,146;MMQ=40,45;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,15:0.246:63:24,12:18,2:0|1:1017921_C_A:1017921:17,31,8,7
chr11	1017981	.	T	A	.	.	DP=56;ECNT=29;MBQ=29,26;MFRL=184,145;MMQ=40,47;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,16:0.293:56:18,12:17,1:0|1:1017921_C_A:1017921:16,24,9,7
chr11	1017988	.	G	T	.	.	DP=56;ECNT=29;MBQ=32,26;MFRL=161,177;MMQ=42,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,8:0.176:49:27,4:11,4:19,22,4,4
chr11	1017990	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=29;MBQ=32,28;MFRL=178,139;MMQ=40,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.100:47:26,4:14,0:20,23,4,0
chr11	1018001	.	A	C	.	.	DP=50;ECNT=29;MBQ=27,32;MFRL=139,221;MMQ=42,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.098:49:28,2:11,2:0|1:1018001_A_C:1018001:25,20,3,1
chr11	1018015	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=29;MBQ=30,28;MFRL=135,228;MMQ=44,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,5:0.133:43:19,2:11,3:0|1:1018001_A_C:1018001:22,16,4,1
chr11	1018024	.	CC	GA	.	.	DP=42;ECNT=29;MBQ=32,32;MFRL=143,105;MMQ=45,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=50.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,14:0.341:42:18,4:9,9:0|1:1018024_CC_GA:1018024:17,11,10,4
chr11	1018025	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=29;MBQ=29,29;MFRL=139,242;MMQ=53,30;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.230:28:11,0:6,4:0|1:1018001_A_C:1018001:13,9,4,2
chr11	1018031	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=29;MBQ=32,28;MFRL=88,153;MMQ=60,40;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.488:41:14,5:6,12:11,10,13,7
chr11	1018042	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=29;MBQ=28,32;MFRL=88,105;MMQ=46,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=67.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,18:0.404:45:11,8:13,9:0|1:1018024_CC_GA:1018024:13,14,12,6
chr11	1018048	.	A	G,T	.	.	DP=45;ECNT=29;MBQ=29,32,27;MFRL=86,108,241;MMQ=60,42,30;MPOS=15,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=71.62,11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,19,4:0.417,0.108:44:12,10,0:9,9,4:10,11,15,8
chr11	1018059	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=29;MBQ=32,26;MFRL=88,108;MMQ=60,45;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,21:0.440:48:15,10:12,9:0|1:1018024_CC_GA:1018024:14,13,14,7
chr11	1018228	.	GC	AG	.	.	DP=50;ECNT=18;MBQ=32,30;MFRL=88,145;MMQ=60,31;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,3:0.078:49:31,1:13,2:0|1:1018228_GC_AG:1018228:21,25,3,0
chr11	1018232	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=18;MBQ=32,27;MFRL=86,139;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,4:0.094:51:29,1:15,1:0|1:1018228_GC_AG:1018228:22,25,4,0
chr11	1018237	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=18;MBQ=32,29;MFRL=86,133;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,3:0.077:50:29,1:15,2:0|1:1018228_GC_AG:1018228:24,23,3,0
chr11	1018245	.	TT	GC	.	.	DP=46;ECNT=18;MBQ=27,31;MFRL=86,133;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:26,1:15,2:0|1:1018228_GC_AG:1018228:23,20,3,0
chr11	1018262	.	GT	CG	.	.	DP=30;ECNT=18;MBQ=33,31;MFRL=110,117;MMQ=60,35;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,1:15,1:0|1:1018228_GC_AG:1018228:20,8,2,0
chr11	1018295	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=18;MBQ=28,33;MFRL=105,98;MMQ=60,44;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.310:40:10,5:17,7:14,14,6,6
chr11	1018314	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=18;MBQ=32,32;MFRL=109,84;MMQ=60,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.115:41:11,3:22,1:13,24,3,1
chr11	1018316	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=18;MBQ=33,20;MFRL=122,100;MMQ=60,43;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.255:37:10,4:18,5:14,14,2,7
chr11	1018348	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=18;MBQ=32,32;MFRL=110,125;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,4:0.099:34:13,2:15,2:0|1:1018348_G_A:1018348:15,15,1,3
chr11	1018355	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=18;MBQ=25,33;MFRL=111,125;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.096:35:10,2:19,2:0|1:1018348_G_A:1018348:17,14,1,3
chr11	1018366	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=18;MBQ=32,23;MFRL=107,127;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.101:32:10,1:18,1:0|1:1018348_G_A:1018348:15,14,1,2
chr11	1018374	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=18;MBQ=23,29;MFRL=91,124;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.627:27:2,9:7,8:3,7,10,7
chr11	1018419	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=18;MBQ=32,28;MFRL=141,122;MMQ=51,38;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.255:41:14,3:17,7:15,16,8,2
chr11	1018456	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=18;MBQ=32,27;MFRL=187,111;MMQ=52,36;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.308:40:14,4:13,7:11,17,5,7
chr11	1018459	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=18;MBQ=32,22;MFRL=151,93;MMQ=52,36;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:18,1:16,3:0|1:1018459_G_T:1018459:14,21,1,3
chr11	1018473	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=18;MBQ=29,20;MFRL=199,68;MMQ=52,36;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:14,0:25,3:0|1:1018459_G_T:1018459:20,22,1,2
chr11	1018483	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=18;MBQ=33,31;MFRL=214,118;MMQ=52,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,13:0.293:45:11,6:19,4:0|1:1018483_C_G:1018483:19,13,1,12
chr11	1018496	.	G	T	.	.	DP=60;ECNT=18;MBQ=32,20;MFRL=149,111;MMQ=52,43;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,14:0.237:60:25,5:17,6:0|1:1018483_C_G:1018483:21,25,2,12
chr11	1018523	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=92,119;MMQ=60,43;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.342:36:19,5:5,7:10,14,3,9
chr11	1018552	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=127,88;MMQ=60,39;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.230:24:11,2:6,3:0|1:1018552_G_A:1018552:7,12,0,5
chr11	1018555	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=127,178;MMQ=60,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,1:6,1:0|1:1018552_G_A:1018552:7,12,0,2
chr11	1021368	.	CTTTTTTTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=36,36;MFRL=244,365;MMQ=50,58;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=20,11;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:1021368_CTTTTTTTTT_C:1021368:0,2,0,1
chr11	1021373	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=197,313;MMQ=50,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:2,0:0,1:1|0:1021368_CTTTTTTTTT_C:1021368:0,2,0,1
chr11	1021384	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=270,313;MMQ=49,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:1021368_CTTTTTTTTT_C:1021368:0,2,0,1
chr11	1021394	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=270,313;MMQ=49,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:1021368_CTTTTTTTTT_C:1021368:0,2,0,1
chr11	1021396	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=270,313;MMQ=49,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:1021368_CTTTTTTTTT_C:1021368:0,2,0,1
chr11	1023682	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=244,229;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr11	1025987	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=158,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:0,3:1,2,0,3
chr11	1026200	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=274,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr11	1028827	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,13;MFRL=252,249;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.691:4:0,0:0,0:1,0,3,0
chr11	1078320	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=191,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,3:8,3:8,6,3,3
chr11	1078393	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=179,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr11	1078456	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=187,245;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:1,1,1,3
chr11	1079879	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	1080627	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,1:4,1:4,1,0,2
chr11	1081351	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=269,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,2,0
chr11	1081381	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=140,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:1,1:3,2:3,2,2,1
chr11	1081392	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:4,2,2,1
chr11	1081577	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=213,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,1:7,2:7,3,1,2
chr11	1082419	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:6,3:0,1:1,5,1,4
chr11	1082520	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=244,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,2:1,2:0|1:1082520_A_G:1082520:3,1,3,1
chr11	1082533	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=213,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:0|1:1082520_A_G:1082520:1,0,3,1
chr11	1083179	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=185,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:3,2,2,0
chr11	1083620	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,23;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:3,1:0,0:0|1:1083620_G_C:1083620:0,3,2,0
chr11	1083624	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,25;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:1083620_G_C:1083620:0,3,2,0
chr11	1083629	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,10;MFRL=229,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,0:0|1:1083620_G_C:1083620:0,2,2,0
chr11	1083634	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,36;MFRL=233,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0|1:1083620_G_C:1083620:1,2,2,0
chr11	1083638	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=227,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:1083620_G_C:1083620:2,2,2,0
chr11	1083700	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=210,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:5,3,1,1
chr11	1084144	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=202,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr11	1087410	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=256,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,2:2,2:4,0,4,1
chr11	1090731	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=151,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,3:3,0:3,1,3,0
chr11	1092388	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.255:18:9,1:2,3:5,9,3,1
chr11	1093512	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=62,85;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.310:24:5,2:10,5:12,5,3,4
chr11	1093569	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=114,151;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.161:18:4,0:5,2:7,8,1,2
chr11	1093945	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=206,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr11	1094753	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=181,158;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:1,3,1,3
chr11	1094868	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=192,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:2,2,2,1
chr11	1095082	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=220,281;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:1,3:1,0:1,1,1,2
chr11	1096494	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=201,170;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:3,1:0,5:1,3,1,5
chr11	1098617	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=209,252;MMQ=60,46;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:5,1,2,0
chr11	1098637	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=208,268;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.433:12:4,1:2,4:7,0,4,1
chr11	1099308	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=186,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,2:4,2:2,5,1,3
chr11	1101864	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,306;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr11	1103255	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=188,77;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.244:14:4,0:7,3:5,6,2,1
chr11	1103786	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr11	1155289	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=103,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr11	1157476	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=131,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr11	1157615	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,69;MMQ=60,30;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,0:6,3:3,9,1,2
chr11	1159150	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	1161201	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,1,1
chr11	1161315	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,2,7
chr11	1161335	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.318:8:1,1:5,1:1,5,0,2
chr11	1161372	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,25;MFRL=232,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr11	1162415	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=157,62391711;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:1,8,0,2
chr11	1162445	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=273,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr11	1248197	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr11	1248491	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr11	1248731	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=253,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:1,2:1,4:0,2,2,4
chr11	1248960	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:1,3,1,2
chr11	1250603	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=221,294;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr11	1253856	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr11	1253942	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=205,0;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:1,4:1,2:1,1,5,2
chr11	1254038	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=207,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.357:6:2,1:1,0:0,4,1,1
chr11	1254940	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	1257867	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=149,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr11	1258061	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,26;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	1258175	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=32,24;MFRL=189,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:3,1:5,1,1,1
chr11	1258192	.	AT	TC	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=174,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:4,2:4,2:0|1:1258192_AT_TC:1258192:7,2,3,1
chr11	1258197	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=30,30;MFRL=173,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,2:3,2:0|1:1258192_AT_TC:1258192:6,3,4,1
chr11	1258199	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=173,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:6,2:3,3:0|1:1258192_AT_TC:1258192:6,3,4,1
chr11	1258217	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=28,24;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:4,5:3,4:0|1:1258217_T_G:1258217:3,4,5,5
chr11	1258226	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=30,26;MFRL=174,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.524:19:4,4:5,5:0|1:1258217_T_G:1258217:4,5,5,5
chr11	1258240	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=35,25;MFRL=172,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.492:19:3,5:6,4:5,5,5,4
chr11	1258283	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=28,28;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:3,4:7,3:6,6,2,5
chr11	1258387	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.397:8:4,2:1,1:0|1:1258387_G_A:1258387:0,5,0,3
chr11	1258389	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,1:1,1:0|1:1258387_G_A:1258387:0,5,0,3
chr11	1258391	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0|1:1258387_G_A:1258387:0,5,0,3
chr11	1258394	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,2:1,1:0|1:1258387_G_A:1258387:0,5,0,3
chr11	1258396	.	T	TATGCTGGCCGG	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=17,26;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,2:0,0:0|1:1258387_G_A:1258387:0,5,0,3
chr11	1260145	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=135,0;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:11,3:9,1:10,11,2,2
chr11	1260157	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=136,0;MMQ=60,53;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:9,2:6,0:0|1:1260157_G_C:1260157:8,8,1,2
chr11	1260160	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=136,0;MMQ=60,53;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:9,2:6,1:0|1:1260157_G_C:1260157:8,9,1,2
chr11	1260163	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=136,0;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:10,2:7,1:0|1:1260157_G_C:1260157:8,9,1,2
chr11	1260175	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=164,0;MMQ=60,53;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,2:7,1:5,9,1,2
chr11	1261640	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=164,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.345:9:2,0:4,2:0,6,1,2
chr11	1262907	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:4,3,1,2
chr11	1263021	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=187,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,2:5,2:2,3,2,2
chr11	1263523	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=167,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,3:4,2:6,5,0,5
chr11	1263776	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=131,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:3,1:7,1:11,1,1,1
chr11	1263813	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=168,81;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:5,0:11,3:8,9,2,1
chr11	1264808	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=159,236;MMQ=24,32;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:2,2,1,1
chr11	1264823	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,24;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,3:0,0,4,3
chr11	1264877	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=131,5296;MMQ=60,21;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.330:32:6,0:11,10:13,9,0,10
chr11	1264965	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=145,175;MMQ=51,32;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,1:4,3:1,9,1,3
chr11	1265987	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=162,121;MMQ=58,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:10,2:6,2:9,8,1,3
chr11	1266537	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=37,30;MFRL=224,165;MMQ=25,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr11	1267286	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=179,89;MMQ=27,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:0|1:1267286_C_T:1267286:5,9,1,1
chr11	1267293	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=172,89;MMQ=27,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,2:0|1:1267286_C_T:1267286:7,8,1,1
chr11	1267562	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=162,149;MMQ=27,27;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:7,2:3,1:8,4,3,0
chr11	1267571	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=159,234;MMQ=27,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:5,2:6,0:9,2,1,1
chr11	1268608	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr11	1268682	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=136,171;MMQ=33,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:2,2,2,1
chr11	1269627	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=130,247;MMQ=31,49;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:10,1:10,2:6,14,3,0
chr11	1269672	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=229,122;MMQ=52,24;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:4,3:1,2:3,2,3,2
chr11	1270716	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=163,91;MMQ=24,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr11	1271218	.	GCCA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=208,90;MMQ=40,50;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCA;STR;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,1:4,4:3,8,3,2
chr11	1272039	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=155,139;MMQ=25,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.495:22:3,1:8,9:4,7,6,5
chr11	1272226	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=124,200;MMQ=59,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:2,3:8,6:2,8,5,4
chr11	1272245	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,0:8,3:5,6,1,2
chr11	1272252	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=152,93;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:10,2:0|1:1272252_C_T:1272252:8,8,0,2
chr11	1272269	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=115,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:8,2:0|1:1272252_C_T:1272252:5,11,0,2
chr11	1272271	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=25,27;MFRL=115,93;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:8,2:0|1:1272252_C_T:1272252:5,12,0,2
chr11	1272274	.	A	ACGAACAT	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=24,26;MFRL=115,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:1272252_C_T:1272252:5,11,0,2
chr11	1272858	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.356:10:0,2:6,1:3,4,1,2
chr11	1277417	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=166,41;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:3,2,1,1
chr11	1279486	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=238,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr11	1281134	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,1,3
chr11	1284227	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=126,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,5:1,2:0,2,7,0
chr11	1307383	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=322,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1307383_G_A:1307383:0,1,0,1
chr11	1307389	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=322,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1307383_G_A:1307383:0,1,0,1
chr11	1411501	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr11	1462162	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=236,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr11	1464903	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr11	1466720	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=149,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,2,1
chr11	1471154	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	1471764	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=17,12;MFRL=172,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.448:7:0,0:2,0:0|1:1471764_G_C:1471764:3,1,3,0
chr11	1471771	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=109,258;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0|1:1471764_G_C:1471764:1,1,2,0
chr11	1472050	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=251,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.727:5:0,3:1,1:1,0,2,2
chr11	1472475	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr11	1472529	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=205,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:4,0,7,0
chr11	1477768	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:4,5,2,0
chr11	1491657	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=184,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:6,12,1,1
chr11	1492445	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	1501988	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=148,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:4,3,1,1
chr11	1619034	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,283;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,3:8,0:3,9,3,0
chr11	1619328	.	TCCCCCACAGCTGGAGCTGCAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACGGCCGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.228:19:0,3:4,0:11,4,1,3
chr11	1628844	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr11	1629747	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=283,0;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr11	1642884	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,120;MMQ=60,51;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.672:25:5,9:2,7:6,2,11,6
chr11	1651140	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=200,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.558:16:3,4:3,4:2,5,3,6
chr11	1651559	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=146,75;MMQ=58,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:4,8,1,1
chr11	1651594	.	AGTCC	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=118,196;MMQ=55,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.342:10:4,0:3,3:0|1:1651594_AGTCC_A:1651594:3,4,3,0
chr11	1651599	.	AGCTGCTGTAAGCCTTACTGCTGCCAG	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=110,196;MMQ=55,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,0:3,3:0|1:1651594_AGTCC_A:1651594:4,5,3,0
chr11	1651830	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=127,208;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:4,4:6,1:0|1:1651830_G_T:1651830:1,9,2,3
chr11	1651852	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,5:0.374:14:7,0:2,5:1|0:1651830_G_T:1651830:3,6,0,5
chr11	1718668	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,16;MFRL=133,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.194:17:8,0:2,1:12,2,3,0
chr11	1776332	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=255,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr11	1857042	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr11	1857112	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=129,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=50.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:1,7:0,9:0,1,9,8
chr11	1857930	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,19;MFRL=233,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.611:6:2,1:0,1:2,0,4,0
chr11	1861225	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=260,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr11	1861912	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,2:4,0:2,7,0,2
chr11	1874266	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=192,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr11	1890810	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:4,0,5,0
chr11	1890844	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=196,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:6,3,4,3
chr11	1890990	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=75,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.833:16:1,5:1,7:1,1,5,9
chr11	1891035	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,2:0,0,2,2
chr11	1901467	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=183,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr11	1902635	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr11	1902761	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=182,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:1902761_G_A:1902761:6,7,2,0
chr11	1902768	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=250,182;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.801:13:2,5:0,6:0|1:1902761_G_A:1902761:1,1,6,5
chr11	1910707	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	1911890	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr11	1944202	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=112,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,1:4,2:5,2,2,1
chr11	1946584	.	G	GCAGTGAGTGATGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1946584_G_GCAGTGAGTGATGA:1946584:0,0,0,1
chr11	1946587	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1946584_G_GCAGTGAGTGATGA:1946584:0,0,0,1
chr11	1950302	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=165,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:1,1,3,0
chr11	1950906	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=198,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:1950906_T_G:1950906:5,0,1,1
chr11	1950925	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=222,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0|1:1950906_T_G:1950906:4,0,2,1
chr11	1958076	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,301;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	1959766	.	TG	AA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=163,306;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=46.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:7,0:5,12:3,9,0,12
chr11	1968455	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,425;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	1968669	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.247:19:4,0:5,0:4,10,5,0
chr11	1968674	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,17;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:5,1:7,1:5,12,4,0
chr11	1976988	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr11	1983701	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr11	2018168	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=258,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr11	2154281	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=174,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:7,3,2,0
chr11	2156536	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,4:1,0,4,2
chr11	2169110	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	2182004	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,6,8
chr11	2182224	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,280;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr11	2186605	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,340;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr11	2187071	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	2187398	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr11	2188566	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr11	2189185	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=226,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,7:1,2:0,1,1,8
chr11	2191155	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	2192033	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2192033_G_A:2192033:0,0,0,1
chr11	2192036	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2192033_G_A:2192033:0,0,0,1
chr11	2192038	.	A	AAGT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2192033_G_A:2192033:0,0,0,1
chr11	2192040	.	G	GTACA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2192033_G_A:2192033:0,0,0,1
chr11	2192044	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2192033_G_A:2192033:0,0,0,1
chr11	2290900	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2290900_T_TG:2290900:0,0,1,0
chr11	2290905	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2290900_T_TG:2290900:0,0,1,0
chr11	2321800	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=137,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:8,3,2,0
chr11	2322954	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=164,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,2:4,1:4,0,3,0
chr11	2323358	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,194;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=37.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:7,0:3,13:7,3,13,0
chr11	2323528	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr11	2330077	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,8,6
chr11	2330479	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr11	2337012	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	2339041	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,36;MFRL=115,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:1,2,4,0
chr11	2416694	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:7,11,1,1
chr11	2418193	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=158,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0,6,0,4
chr11	2426717	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=151,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:6,1,2,0
chr11	2427364	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=340,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0,1,1,6
chr11	2427400	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=201,295;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr11	2432820	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=183,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,0:3,4:6,0,4,0
chr11	2434628	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=219,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr11	2434684	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:0,8:2,5:1,1,8,5
chr11	2434840	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=195,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,6:3,5:1,3,3,8
chr11	2438963	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=204,187;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,6:0,1:0,2,4,3
chr11	2439621	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=197,309;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:1,6,2,1
chr11	2439651	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=204,248;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:0|1:2439651_G_T:2439651:3,4,0,2
chr11	2439672	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=197,248;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:2439651_G_T:2439651:2,1,0,2
chr11	2439767	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=162,206;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,2:5,2:6,4,3,1
chr11	2439876	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=145,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,1:3,2:2,4,0,3
chr11	2441646	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,5:1,3:0,3,3,5
chr11	2441686	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr11	2444094	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=300,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:2,2:0|1:2444094_C_G:2444094:5,0,3,0
chr11	2444102	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=201,36;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.270:9:3,2:4,0:1|0:2444094_C_G:2444094:7,0,1,1
chr11	2483089	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=15,12;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.691:4:0,0:0,1:0,1,0,3
chr11	2542605	.	TA	GG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	2549329	.	TGG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=G;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr11	2592005	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=212,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr11	2593416	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=191,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr11	2604863	.	ACTT	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2604863_ACTT_A:2604863:0,0,0,1
chr11	2604867	.	ACGTT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=199,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:2604863_ACTT_A:2604863:0,2,0,1
chr11	2604874	.	GAA	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=205,111;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:2604863_ACTT_A:2604863:0,3,0,1
chr11	2683357	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=272,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr11	2797320	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=186,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,1,4
chr11	2905459	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	2909791	.	T	TCTCCCCA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,1:7,1:0|1:2909791_T_TCTCCCCA:2909791:11,9,0,2
chr11	2909793	.	G	GACTGTTT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,1:8,1:0|1:2909791_T_TCTCCCCA:2909791:11,9,0,2
chr11	2909795	.	C	CTCATCAACA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.122:22:12,1:8,1:0|1:2909791_T_TCTCCCCA:2909791:11,9,0,2
chr11	2929552	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,13,9
chr11	2929659	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr11	2930395	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=156,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr11	2930656	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=320,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr11	2937775	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=219,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr11	2938255	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=15,28;MFRL=225,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,18:0.792:22:1,13:0,5:0|1:2938255_T_C:2938255:1,3,6,12
chr11	2938257	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=225,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,18:0.792:22:2,13:2,5:0|1:2938255_T_C:2938255:1,3,6,12
chr11	2938300	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,1,9
chr11	2939378	.	T	TACTCGGGAG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=168,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.237:10:5,2:3,0:0|1:2939378_T_TACTCGGGAG:2939378:2,6,1,1
chr11	2939380	.	C	CTGAAGCAAGA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=168,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.237:10:5,1:3,0:0|1:2939378_T_TACTCGGGAG:2939378:2,6,1,1
chr11	2939392	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr11	2940492	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr11	2943770	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=153,630528;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,0:3,3:1,8,3,0
chr11	2946522	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,3:2,6:1,4,2,7
chr11	2973051	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,121;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:20,0:14,3:13,21,0,3
chr11	2973159	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=208,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr11	2979798	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=182,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:0,2,3,5
chr11	2986044	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=215,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr11	2990985	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=194,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr11	3000330	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,1:1,2:4,1,2,1
chr11	3026596	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=133,50;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:7,0:8,2:0|1:3026596_C_T:3026596:9,10,1,1
chr11	3026610	.	C	CTTTTTGCT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,19;MFRL=147,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,1:0|1:3026596_C_T:3026596:8,10,1,1
chr11	3026614	.	C	CTTTTCTTTCTTTCTTTCTT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=147,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:9,2:0|1:3026596_C_T:3026596:8,10,1,1
chr11	3026692	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=239,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.876:14:0,7:1,6:0|1:3026692_T_G:3026692:1,0,6,7
chr11	3026712	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=239,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.781:7:0,5:1,1:0|1:3026692_T_G:3026692:1,0,3,3
chr11	3028270	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	3036933	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=84,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.776:10:1,3:0,5:1,1,5,3
chr11	3109403	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=138,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:1,2:0|1:3109403_A_G:3109403:1,0,3,0
chr11	3109408	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=196,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0|1:3109403_A_G:3109403:2,0,3,0
chr11	3109426	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr11	3111782	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:8,3,5,0
chr11	3113596	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=198,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr11	3121521	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=162,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:6,1:1,4:0,7,1,4
chr11	3124435	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=216,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:4,6:1,4:4,1,5,5
chr11	3128915	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=250,264;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:1,2,2,0
chr11	3129200	.	GCCCCAC	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCCAC;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	3129231	.	C	CTTCTGCTTTTCCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=190,257;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr11	3381798	.	GAA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=342,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,1:0,1:2,1,2,0
chr11	3381843	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=236,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:4,3:3,0:7,1,2,1
chr11	3382069	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=115,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.670:13:0,5:4,4:1,3,3,6
chr11	3392351	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=189,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:0,2:5,1:0|1:3392351_T_C:3392351:0,5,0,3
chr11	3392357	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:0|1:3392351_T_C:3392351:0,5,0,2
chr11	3392745	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=184,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:3,0,5,1
chr11	3392972	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=210,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,2:3,4:0,5,0,6
chr11	3394894	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=213,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr11	3394960	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=299,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr11	3398760	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=64,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,3:2,1:2,0,3,1
chr11	3398795	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,4:1,2:1,3,3,3
chr11	3400334	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=139,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.598:20:5,4:2,8:3,5,6,6
chr11	3661585	.	A	ATGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGG;STR;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	3663011	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr11	3663170	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr11	3663201	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr11	3697446	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:6,7,1,1
chr11	3697862	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=179,208;MMQ=60,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,0:6,5:0,11,0,5
chr11	3697878	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=176,208;MMQ=60,47;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,0:4,4:0,8,0,5
chr11	3704704	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,1,2
chr11	3704770	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=239,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:1,1,0,3
chr11	3714396	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr11	3720608	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=173,47;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:1,0:7,2:0|1:3720608_G_A:3720608:2,6,1,1
chr11	3720617	.	T	TCCCCTTTACTTTTCACTCTG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=173,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:3720608_G_A:3720608:1,9,1,1
chr11	3733899	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,4:5,1:6,4,1,4
chr11	3735239	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:7,3:7,1:2,12,1,3
chr11	3740574	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=177,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,1:2,3:6,1,4,0
chr11	3742062	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=186,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:0,1:2,0:2,1,0,3
chr11	3746465	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=135,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr11	3752727	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:9,4:4,4:5,8,2,6
chr11	3765977	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=176,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr11	3797351	.	ATT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	3800096	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=213,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,2:4,2:6,4,3,1
chr11	3829419	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:3,6:0,4:3,0,7,3
chr11	3838489	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,0:2,11:5,0,11,0
chr11	3838646	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:11,8,1,1
chr11	3844102	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=148,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,0:8,3:13,2,3,0
chr11	3844126	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=136,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.134:28:15,0:10,2:18,7,3,0
chr11	3844311	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr11	3877721	.	G	GCTAAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3877721_G_GCTAAC:3877721:0,0,0,1
chr11	3877722	.	G	GAGAGGGATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=225,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:3877721_G_GCTAAC:3877721:0,1,0,1
chr11	3877726	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=225,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3877721_G_GCTAAC:3877721:0,1,0,1
chr11	4103524	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:3,10:4,5:4,3,6,9
chr11	4104060	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=52.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr11	4104087	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=71.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,12,9
chr11	4104745	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0,0,4,7
chr11	4116335	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr11	4123345	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr11	4133237	.	A	AAAAGCAG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=163,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,0:6,2:6,6,1,1
chr11	4133317	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,4,8
chr11	4139450	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.596:11:2,4:1,3:4,0,7,0
chr11	4150238	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=238,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:4150238_GT_G:4150238:1,2,1,0
chr11	4150254	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=119,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:4150238_GT_G:4150238:1,3,1,0
chr11	4159324	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	4389404	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=108,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.790:12:0,2:2,8:0,2,3,7
chr11	4409511	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=234,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,7:1,5:1,0,9,3
chr11	4470644	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=199,26;MMQ=60,31;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,0:6,2:7,4,1,1
chr11	4471500	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=151,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:14,4:5,1:9,10,1,4
chr11	4510285	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=147,198;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.219:21:2,3:14,1:7,10,2,2
chr11	4511163	.	C	CCAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=222,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	4592706	.	T	TAC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=157,235;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,2:6,1:4,8,0,3
chr11	4592708	.	C	CAG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,3:2,6,2,6
chr11	4593294	.	GTC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	4594739	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	4608650	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=235,7300;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,8:5,0:4,4,9,0
chr11	4615234	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr11	4615494	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=178,7315;MMQ=27,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,0:5,5:4,6,0,5
chr11	4615508	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=167,190;MMQ=24,51;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:2,2:9,1:3,8,2,1
chr11	4615518	.	A	AGGAAATTTGTAGTTGAAGAAATTG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=194,3741;MMQ=51,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.177:14:6,0:6,2:6,6,0,2
chr11	4621485	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr11	4622159	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr11	4624432	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:8,2,2,0
chr11	4661688	.	AC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=121,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:3,8,0,2
chr11	4662087	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=230,279;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr11	4676398	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=124,216;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.341:18:6,2:6,3:5,7,3,3
chr11	4676457	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=122,203;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:9,2:12,4:13,8,4,2
chr11	4790857	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=146,210;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:3,1:9,3:6,6,2,2
chr11	4790873	.	CG	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=187,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:2,1:8,3:5,5,2,2
chr11	4791111	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=106,258;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:5,0:3,2:6,3,1,1
chr11	4870261	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,172;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,3:4,5:5,5,6,2
chr11	4870298	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=197,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:5,3:3,1:4,5,2,2
chr11	4928866	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=209,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,2:0,5:1,1,3,4
chr11	4967468	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr11	4975900	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	4976667	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=175,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.216:15:4,0:8,2:8,4,3,0
chr11	5013421	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=105,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.645:15:2,4:3,3:3,2,4,6
chr11	5020117	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=202,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr11	5020189	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=175,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,3:4,3:6,3,4,2
chr11	5141980	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,6:2,1:2,2,4,3
chr11	5172786	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0,0,11,7
chr11	5172795	.	A	AC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=210,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,0:4,5:8,3,3,2
chr11	5173928	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=138,40;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.463:9:3,1:2,3:1,4,1,3
chr11	5221085	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.491:20:6,5:4,3:5,5,5,5
chr11	5221586	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=176,195;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:10,3:8,0:13,7,3,0
chr11	5247733	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=186,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,1:3,4:4,0,5,1
chr11	5247791	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,11,3
chr11	5269582	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=160,229;MMQ=52,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=61.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,15:0.763:19:3,6:1,8:0|1:5269582_AG_A:5269582:2,2,9,6
chr11	5269584	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=160,229;MMQ=52,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,15:0.762:19:2,6:1,9:0|1:5269582_AG_A:5269582:2,2,9,6
chr11	5269586	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=160,229;MMQ=52,49;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=61.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,15:0.762:19:3,5:1,9:0|1:5269582_AG_A:5269582:2,2,9,6
chr11	5269799	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=189,225;MMQ=27,34;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0|1:5269799_A_C:5269799:0,1,1,1
chr11	5269806	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,225;MMQ=60,34;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:5269799_A_C:5269799:0,0,1,1
chr11	5274717	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=174,240;MMQ=40,34;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,0,2
chr11	5275802	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,261;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr11	5289896	.	A	AAAAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAC;STR;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.779:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	5322737	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=75,108;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:6,5:7,4:7,6,5,4
chr11	5344499	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr11	5344552	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,10:0,1:0|1:5344552_C_T:5344552:0,0,10,1
chr11	5344561	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0|1:5344552_C_T:5344552:0,0,9,1
chr11	5345486	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,9,12
chr11	5364742	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=91,165;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,5:1,4:0,1,2,7
chr11	5364776	.	T	TGTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTC;STR;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr11	5372718	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:5,3,2,1
chr11	5372751	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=176,105;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:6,4,2,3
chr11	5373095	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0|1:5373095_T_C:5373095:2,5,0,2
chr11	5373104	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0|1:5373095_T_C:5373095:2,5,0,2
chr11	5475273	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=207,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,3:6,0:7,6,3,0
chr11	5475431	.	T	TCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,2:7,1:5,8,3,0
chr11	5510423	.	ATCT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=162,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,0:3,4:2,4,4,0
chr11	5510688	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=200,229;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,2:5,1:3,10,0,3
chr11	5510928	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr11	5530720	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=168,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:14,0:7,4:13,8,0,4
chr11	5537780	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:8,0:2,3:4,6,3,0
chr11	5537801	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,3:6,0:11,4,1,2
chr11	5566051	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,8:5,2:3,7,7,3
chr11	5566112	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,4:5,6:4,5,7,3
chr11	5566489	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=135,174;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:3,3:1,3:2,2,5,2
chr11	5566789	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=189,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr11	5566830	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	5602790	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=209,204;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:0,8:3,2:2,1,4,6
chr11	5603136	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:4,3,2,2
chr11	5617987	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=199,270;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr11	5625713	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=115,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,3,2
chr11	5631479	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=57,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,4:2,5:3,1,6,3
chr11	5654052	.	C	CTTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,198;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=22,26;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.690:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr11	5655150	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=142,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,3:2,3,2,5
chr11	5655760	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=158,195;MMQ=50,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AT;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:1,0:0,2:2,0,2,0
chr11	5662319	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr11	5663575	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=149,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,2:2,0:4,1,1,1
chr11	5663920	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	5664356	.	T	TATATATA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=178,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.482:15:2,2:6,3:8,0,6,1
chr11	5664974	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,2:0,6:0,0,0,9
chr11	5687341	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,15;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0,3,1,0
chr11	5700978	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=172,171;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.318:23:9,7:7,0:15,1,7,0
chr11	5701074	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,177;MMQ=52,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:5,4:4,0:3,6,1,3
chr11	5701409	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=201,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:1,6:2,8:2,1,3,11
chr11	5719848	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	5727812	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=175,100;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:4,5:9,0:9,4,5,0
chr11	5727829	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=175,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:9,5:10,0:12,7,5,0
chr11	5729946	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=225,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.619:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr11	5730248	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:5,1,3,0
chr11	5775903	.	G	GTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=218,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr11	5777023	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	5799889	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	5841990	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=169,53;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:0|1:5841990_T_G:5841990:12,7,1,1
chr11	5841998	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=170,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,2:9,0:0|1:5841990_T_G:5841990:13,7,1,1
chr11	5842000	.	G	GCCAGAAACTCCA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=170,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:0|1:5841990_T_G:5841990:13,7,1,1
chr11	5842628	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	5862845	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=146,228;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:8,5,1,1
chr11	5863013	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=128,242;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,3:7,1:7,5,1,3
chr11	5877909	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=190,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,5,0
chr11	5878991	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=182,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:0,11,0,2
chr11	6007350	.	C	CAA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=209,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:9,2:12,0:0|1:6007350_C_CAA:6007350:16,6,0,2
chr11	6007352	.	T	TATC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=198,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,1:12,0:0|1:6007350_C_CAA:6007350:18,6,0,2
chr11	6007354	.	G	GATTTAAAAAAAAA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=198,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,2:13,0:0|1:6007350_C_CAA:6007350:18,6,0,2
chr11	6007680	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,5,8
chr11	6007743	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,40;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,4,3
chr11	6191356	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=188,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:11,0:8,3:8,11,0,3
chr11	6220376	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	6232850	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=150,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:9,5:13,0:12,10,0,5
chr11	6238960	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,234;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr11	6239736	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,10;MFRL=188,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:6239736_C_A:6239736:3,0,1,0
chr11	6239739	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=247,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr11	6239740	.	TT	AA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=21,15;MFRL=188,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.359:4:2,0:1,0:0|1:6239736_C_A:6239736:3,0,1,0
chr11	6239743	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=15,30;MFRL=188,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,1:0|1:6239736_C_A:6239736:3,0,1,0
chr11	6243699	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=118,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:15,2:14,2:19,10,1,3
chr11	6243804	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,10:0,0,6,14
chr11	6243843	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,5:0,10:0,0,3,12
chr11	6243963	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,11,2
chr11	6243982	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,9:0,0,13,4
chr11	6265494	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:11,0:9,2:12,8,1,1
chr11	6281108	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr11	6291659	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=200,275;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:1,1,1,3
chr11	6292065	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=204,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:1,3,3,4
chr11	6292837	.	CG	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=216,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr11	6341748	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=191,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr11	6411935	.	TGCTGGC	T,CGCTGGC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28,34;MFRL=359,193,173;MMQ=60,60,60;MPOS=18,20;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=24.63,10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,7,5:0.471,0.399:13:1,4,3:0,2,2:1,0,9,3
chr11	6413478	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=183,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:3,6,1,1
chr11	6415392	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.267:24:7,2:11,4:7,11,3,3
chr11	6416959	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=237,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,8:1,2:1,3,5,5
chr11	6417004	.	CTAG	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAG;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:5,0:7,3,0,2
chr11	6432089	.	ATCC	A,CTCC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25,36;MFRL=196,234,214;MMQ=60,60,60;MPOS=19,23;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.66,13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,5:0.180,0.357:13:4,2,2:2,0,3:3,3,0,7
chr11	6453332	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=231,324;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr11	6461369	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=174,24;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:8,3,1,1
chr11	6461673	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=125,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,2:8,1:11,4,3,0
chr11	6462087	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:7,1:18,5:16,9,5,1
chr11	6477455	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=233,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:3,3,3,1
chr11	6486945	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,4:4,0:1,6,2,2
chr11	6500309	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,254;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,3:5,2:6,3,3,2
chr11	6502636	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,250;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:10,1,2,0
chr11	6519363	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=181,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr11	6524253	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	6532490	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=220,212;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,2:5,1:8,3,1,2
chr11	6541580	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=119,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,0:2,4:1,5,1,3
chr11	6549658	.	TGTGTGTGTAC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=236,284;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,1:4,0,2,0
chr11	6555179	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=156,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:13,0:3,0:0|1:6555179_T_G:6555179:7,9,0,2
chr11	6555193	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:15,2:3,0:0|1:6555179_T_G:6555179:8,10,0,2
chr11	6560141	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=196,258;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,5:2,2:1,5,0,7
chr11	6565487	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=108,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,5:4,4:3,2,4,5
chr11	6567895	.	C	CTGCCCTACTGCA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,6:0,0,12,3
chr11	6579539	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr11	6585502	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=44.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0,0,11,2
chr11	6587238	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=211,249;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:8,1:2,1:0|1:6587238_A_C:6587238:0,10,3,0
chr11	6587242	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=228,249;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:8,2:2,1:0|1:6587238_A_C:6587238:0,11,3,0
chr11	6587245	.	CTGG	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=228,249;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:9,1:2,0:0|1:6587238_A_C:6587238:0,11,3,0
chr11	6587252	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=228,258;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:0,5,0,4
chr11	6588398	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.444:18:5,0:5,7:5,5,0,8
chr11	6591157	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,1,1
chr11	6621516	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:2,4:3,4:0,6,1,7
chr11	6624617	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:9,1:3,6:6,6,3,4
chr11	6629233	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=143,3218673;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:7,5,2,0
chr11	6629530	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:4,3:8,5:7,5,2,6
chr11	6630028	.	TC	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=111.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,20:0,17:0,0,12,25
chr11	6630410	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=216,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:10,5:4,4:7,7,2,7
chr11	6631016	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.304:17:5,4:7,0:7,5,1,4
chr11	6631300	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,0:14,2:9,12,2,0
chr11	6632857	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=247,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,0:4,3:8,4,2,1
chr11	6635870	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:13,4:9,11:12,10,0,15
chr11	6636300	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=175,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,1:1,3:3,4,4,0
chr11	6637518	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,15,11
chr11	6637739	.	ATTTTTT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=230,257;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=20,14;RU=T;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:1,0:3,1,1,1
chr11	6644308	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=210,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,3:4,3:5,4,4,2
chr11	6645995	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:9,4:10,0:11,8,3,1
chr11	6647622	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=249,243;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:4,1,1,3
chr11	6647931	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:0,7,0,3
chr11	6647978	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=234,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,3:5,1:2,5,2,2
chr11	6648424	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=154,192;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:7,3:6,6:5,8,3,6
chr11	6648937	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=177,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,0:1,5:0,2,1,4
chr11	6648950	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=194,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr11	6654613	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,4:4,4:4,3,6,2
chr11	6655332	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=188,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,2:5,5:4,5,5,2
chr11	6662406	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=232,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:6,8,1,1
chr11	6703334	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=128,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.407:30:9,5:9,7:11,7,8,4
chr11	6703866	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=198,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,2:4,8:5,1,9,1
chr11	6703892	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:3,1:8,3:10,1,4,0
chr11	6807243	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=335,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,3:2,5:1,2,1,7
chr11	6867894	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,4:0,0:2,1,0,4
chr11	6867950	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	6898193	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=176,176;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:8,11:10,0:16,4,11,0
chr11	6898780	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=115,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:4,0:7,2:6,6,0,2
chr11	6913290	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=178,247;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:6,3,2,0
chr11	6942745	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.260:25:9,6:8,0:6,13,6,0
chr11	6942952	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=74,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:1,5:1,7:1,1,7,5
chr11	6943254	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:1,3,1,6
chr11	6962957	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=207,134;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr11	6962971	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=135,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr11	6962977	.	TGG	TTCATAGAAGG,T	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=30,32,29;MFRL=242,135,133;MMQ=60,60,42;MPOS=7,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:3,0,1:0,1,0:0,4,0,2
chr11	6962979	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,22;MFRL=276,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr11	6962982	.	C	G,CTGCT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,34,32;MFRL=276,135,133;MMQ=60,60,42;MPOS=2,-2147483648;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:3,0,1:0,1,0:0,3,0,2
chr11	6962985	.	T	TACTTAGAGATG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,28;MFRL=242,133;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:6962985_T_TACTTAGAGATG:6962985:0,4,0,1
chr11	6962987	.	C	CTTTCA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=276,133;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:6962985_T_TACTTAGAGATG:6962985:0,3,0,1
chr11	7022848	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,29;MFRL=225,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7022848_A_AG:7022848:0,1,0,1
chr11	7022849	.	T	TATAA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=225,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7022848_A_AG:7022848:0,1,0,1
chr11	7022850	.	C	CAAA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,36;MFRL=225,232;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7022848_A_AG:7022848:0,1,0,1
chr11	7022858	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,26;MFRL=225,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7022848_A_AG:7022848:0,1,0,1
chr11	7022859	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=225,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7022848_A_AG:7022848:0,1,0,1
chr11	7022861	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,23;MFRL=225,232;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7022848_A_AG:7022848:0,1,0,1
chr11	7060948	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=110,248;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:6,1:16,1:14,8,1,1
chr11	7061074	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=197,119;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:9,4:2,3:3,8,0,7
chr11	7063843	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,2:11,1:9,13,0,3
chr11	7064457	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=206,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,1:6,4:6,6,1,4
chr11	7071122	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=213,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.290:8:3,2:3,0:0|1:7071122_C_CA:7071122:0,6,1,1
chr11	7071124	.	A	ATCTGGAAGTG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=213,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:0|1:7071122_C_CA:7071122:0,6,1,1
chr11	7091569	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=247,172;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,1:1,7:0,3,6,2
chr11	7091772	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=224,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr11	7110751	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	7112035	.	GCAA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=179,273;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CAA;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,1,1
chr11	7334524	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=192,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr11	7439093	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=243,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:0,1:5,2:5,0,4,0
chr11	7439447	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=203,84;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:3,2:0,3,1,1
chr11	7441737	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,116;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,7:7,3:7,6,5,5
chr11	7441952	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=180,77;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr11	7487968	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,16;MFRL=146,88;MMQ=60,33;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,0:1,0:0|1:7487968_G_A:7487968:4,0,2,0
chr11	7487978	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,16;MFRL=106,88;MMQ=60,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:1,0:0|1:7487968_G_A:7487968:5,1,2,0
chr11	7570840	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=215,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.424:9:2,1:2,1:1,4,0,4
chr11	7586738	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=212,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:5,4:4,1:8,1,4,1
chr11	7614492	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.715:26:3,9:4,10:2,5,10,9
chr11	7614531	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=137,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:2,4:0,4,0,9
chr11	7649640	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=195,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.833:16:0,7:2,7:0,2,1,13
chr11	7650607	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=312,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr11	7650655	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=158,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:10,1,0,2
chr11	7656760	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=134,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.176:20:12,0:5,3:8,9,1,2
chr11	7660921	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:3,0,3,1
chr11	7663726	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=245,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr11	7669775	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=196,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,2:9,1:3,10,0,3
chr11	7670160	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:1,1:8,2:2,7,1,2
chr11	7670353	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,4:2,4:2,2,5,3
chr11	7670752	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,6:7,3:5,6,5,4
chr11	7670798	.	ACATCATCTCAG	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=142,61;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:17,0:8,2:12,16,1,1
chr11	7671974	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=223,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr11	7672272	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	7686596	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=368,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.934:28:0,16:1,10:1,0,19,8
chr11	7686602	.	G	GTGTT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=192,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGTT;STR;TLOD=77.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.700:28:2,14:6,4:7,1,12,8
chr11	7686858	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=203,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,0:5,3:0,6,0,3
chr11	7687669	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=94.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.932:27:0,10:1,16:0,1,11,15
chr11	7689633	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=53.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr11	7691019	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chr11	7693853	.	GCA	G,GCACACACA,GCACACACACA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33,35,28;MFRL=185,232,186,148;MMQ=60,60,60,59;MPOS=17,26,8;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,9,13,14;RU=CA;STR;TLOD=5.70,8.31,4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,3,2:0.233,0.308,0.227:9:0,0,0,1:2,2,3,1:2,0,2,5
chr11	7712661	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=253,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:0,3,3,3
chr11	7713096	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=175,435;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:1,1:0|1:7713096_A_G:7713096:3,2,1,1
chr11	7713102	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=174,435;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0|1:7713096_A_G:7713096:4,2,1,1
chr11	7717375	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:0,7,0,3
chr11	7720426	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=195,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr11	7720453	.	A	AGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=180,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr11	7721743	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=217,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr11	7723171	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,12:0,2:0,0,13,1
chr11	7723206	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=158,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:15,2:4,2:16,3,3,1
chr11	7723683	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=48.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr11	7725173	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:2,1,5,0
chr11	7817512	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=114,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.299:14:3,1:7,2:5,5,1,3
chr11	7817538	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=97,239;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:4,2:7,4:5,6,2,4
chr11	7818151	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,213;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,2:0,4:1,5,4,2
chr11	7818383	.	G	GATATGGTTACCAGGTAGATGC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.453:11:3,1:3,3:1,5,2,3
chr11	7818518	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr11	7846506	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=125,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr11	7847523	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,2:6,0:3,4,0,2
chr11	7949192	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,2,1
chr11	7949538	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=154,69;MMQ=58,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:4,1:9,1:10,3,1,1
chr11	7960045	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	7961130	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	7961144	.	T	TCTGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=125,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:7961144_T_TCTGG:7961144:0,1,0,1
chr11	7961146	.	A	AATTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=125,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:7961144_T_TCTGG:7961144:0,1,0,1
chr11	7981130	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=247,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr11	7982683	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:7,0:7,10:0|1:7982683_C_T:7982683:6,8,0,10
chr11	7982693	.	ATA	CCC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,0;MFRL=178,153;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,10:0.440:23:6,0:5,0:0|1:7982683_C_T:7982683:6,7,0,10
chr11	7984744	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=184,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,3:7,0:7,4,3,0
chr11	8016922	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,71;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:6,0:12,7:9,9,1,6
chr11	8061100	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr11	8115762	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr11	8117228	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.959:16:0,8:0,8:0,0,5,11
chr11	8118185	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:8118185_C_G:8118185:0,0,4,1
chr11	8118200	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,2:0|1:8118185_C_G:8118185:0,0,5,4
chr11	8119063	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr11	8120438	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:3,5,1,1
chr11	8122234	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,4,5
chr11	8122242	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=259,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,4:4,2:4,3,3,3
chr11	8122246	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=210,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,2:3,4:4,4,4,2
chr11	8123005	.	CTCTG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=149,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTG;STR;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,1:3,4:5,4,3,2
chr11	8132728	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=183,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.628:8:1,2:1,1:0,3,0,5
chr11	8284838	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr11	8284860	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:3,1,1,2
chr11	8284981	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	8284995	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	8474291	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=234,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr11	8483335	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,4:6,0:12,4,2,2
chr11	8496516	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr11	8640896	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=82,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,1,2
chr11	8641501	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	8642218	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=237,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,1,3
chr11	8644530	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr11	8646237	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=260,262;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,1,1
chr11	8660178	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=199,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,3:10,0:12,8,2,1
chr11	8662090	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=237,145;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.688:7:0,2:1,2:2,0,5,0
chr11	8664454	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=168,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr11	8669437	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=238,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,4:0,0:2,0,3,1
chr11	8669694	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=181,286;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:2,1,1,2
chr11	8670172	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr11	8704641	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,3:4,0:7,1,3,0
chr11	8704711	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,2:12,0:16,8,1,1
chr11	8706406	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=171,176;MMQ=59,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:4,6:10,3:8,6,4,5
chr11	8716968	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=175,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:3,3:2,4,1,2
chr11	8717003	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=84,162;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:3,5,2,3
chr11	8719264	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	8732300	.	GCACACA	G,GCACACACACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35,31;MFRL=0,205,160;MMQ=60,60,40;MPOS=23,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,17,22;RU=CA;STR;TLOD=3.53,3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.336,0.457:2:0,1,0:0,0,1:0,0,2,0
chr11	8732714	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=202,49;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:6,4,1,1
chr11	8934101	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr11	8938787	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=135,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:5,3:10,4:11,4,5,2
chr11	8938934	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,0:6,4:3,6,0,4
chr11	8941079	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=165,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:2,2:7,1:1,8,0,3
chr11	8942999	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,9:0,0,11,9
chr11	8943113	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:0,10,0,2
chr11	8947738	.	T	TTTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=192,179;MMQ=40,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:8947738_T_TTTC:8947738:0,3,0,1
chr11	8947752	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=192,179;MMQ=40,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:8947738_T_TTTC:8947738:0,3,0,1
chr11	8953659	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=216,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,3:1,6:4,1,8,1
chr11	8970083	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=127,262;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr11	9005036	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0,0,6,13
chr11	9043518	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=225,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:6,3,3,0
chr11	9047366	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=160,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:5,11,0,2
chr11	9049124	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=265,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,3,1
chr11	9051385	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr11	9051406	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=178,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:2,0,6,0
chr11	9068829	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=147,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr11	9069423	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=187,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,0:3,2:0|1:9069423_GT_G:9069423:8,1,1,1
chr11	9069426	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=187,50;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:9069423_GT_G:9069423:8,1,1,1
chr11	9069427	.	A	ATTCC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=187,50;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:9069423_GT_G:9069423:8,1,1,1
chr11	9072137	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=168,77;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:3,0:9,3:8,4,2,1
chr11	9072140	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,2:6,6:5,3,5,3
chr11	9081926	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.387:16:5,5:3,1:0|1:9081926_C_T:9081926:8,2,4,2
chr11	9081931	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=184,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,7:0.444:16:6,3:2,4:1|0:9081926_C_T:9081926:6,3,6,1
chr11	9091054	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=184,108;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:6,0:13,3:9,10,0,3
chr11	9096189	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=121,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:1,6:2,4:1,2,0,10
chr11	9166693	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=123,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:1,6,0,2
chr11	9167399	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr11	9171775	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:6,5:4,3:5,5,4,5
chr11	9182219	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=158,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,3:2,1:5,0,5,0
chr11	9199650	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:4,1:11,2:9,6,2,1
chr11	9215126	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,3:9,0:13,2,3,0
chr11	9225200	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,4:5,0:13,1,4,0
chr11	9304884	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=179,323;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr11	9309405	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=104,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr11	9310169	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=210,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr11	9316937	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr11	9321330	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.644:15:2,0:3,9:0,5,0,10
chr11	9336071	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=205,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr11	9450017	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=164,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:3,1:1,1:4,0,3,0
chr11	9455491	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=231,197;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:9455491_T_A:9455491:0,2,0,1
chr11	9455493	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=231,197;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:9455491_T_A:9455491:0,2,0,1
chr11	9459592	.	GTTTTTTTTTTTTTTTT	G,GTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33,24;MFRL=112,184,234;MMQ=60,60,60;MPOS=28,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=32,16,18;RU=T;STR;TLOD=3.08,7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.222,0.478:4:1,0,0:0,1,1:1,0,2,1
chr11	9459723	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=119,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:8,4:16,0:8,16,0,4
chr11	9516126	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=143,251;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr11	9516186	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,2:6,3:5,9,3,2
chr11	9519420	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=285,181;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr11	9522567	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,1:3,4:6,0,5,0
chr11	9595732	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=12,32;MFRL=240,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,0:0,2:1,0,2,0
chr11	9603236	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:7,1:13,2:3,17,2,1
chr11	9606939	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=183,47;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:12,2:6,1:9,9,1,2
chr11	9715628	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=105,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr11	9715646	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=105,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:1,6:2,4:2,1,7,3
chr11	9746137	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr11	9746201	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:4,1,2,0
chr11	9802952	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr11	9803027	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=176,132;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:12,1:6,2:13,6,3,0
chr11	9810593	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=188,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9810593_T_C:9810593:1,0,1,0
chr11	9810602	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=143,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:9810593_T_C:9810593:2,0,1,0
chr11	9812236	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=172,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,2:5,1:3,5,0,3
chr11	9830595	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,3:4,0:0,5,0,3
chr11	9833988	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:7,1,3,0
chr11	9861009	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:3,3,5,2
chr11	9875353	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	9878332	.	ATTTTT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=217,202;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=20,15;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr11	9989879	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,101;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:3,3:9,0:7,5,3,0
chr11	10019879	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=123,99;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:9,0:6,3:3,12,1,2
chr11	10050157	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=192,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,4:4,2:0,4,0,6
chr11	10215598	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=121,271;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr11	10508938	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.251:30:14,5:7,2:10,13,2,5
chr11	10515007	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=129,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:11,2:9,0:6,15,0,2
chr11	10518289	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr11	10518521	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=267,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr11	10521740	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=164,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:12,10,1,1
chr11	10522978	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=140,276;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:0|1:10522978_G_T:10522978:6,4,1,1
chr11	10522983	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=181,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,4:0.384:11:3,3:4,1:1|0:10522978_G_T:10522978:4,3,2,2
chr11	10523224	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=204,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,0:5,5:0,8,0,5
chr11	10526060	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=67.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,14,8
chr11	10581470	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=198,97;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,0:6,3:3,8,0,3
chr11	10601931	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=76,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,4:3,1:7,0,4,1
chr11	10602085	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=160,163;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:12,0:15,6:12,15,0,6
chr11	10603582	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:2,4,0,2
chr11	10631247	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.212:26:14,2:7,3:13,8,3,2
chr11	10645289	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,1:4,2:7,1,2,1
chr11	10649652	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=275,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:0,6:5,4:0,5,0,10
chr11	10653426	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=273,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:1,6:0,3:0|1:10653426_A_G:10653426:1,0,9,0
chr11	10653442	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=173,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0|1:10653426_A_G:10653426:3,0,4,0
chr11	10655609	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,7:0,6:0,0,5,9
chr11	10655623	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=118,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,3:8,0:5,11,0,3
chr11	10773049	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=115,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,4:1,4:2,1,0,8
chr11	10776652	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,1:8,2:10,10,3,0
chr11	10778482	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=207,210;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr11	10786023	.	A	AAGTTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGTTG;STR;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:2,2,5,1
chr11	10789470	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=154,50236278;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:7,11,0,2
chr11	10795803	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr11	10797276	.	CTTTCTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=274,258;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTCTT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	10820663	.	TAAAAAAAA	T,TAAAAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,25,28;MFRL=144,174,204;MMQ=60,60,60;MPOS=16,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,9,14;RU=A;STR;TLOD=6.44,6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,2:0.205,0.246:10:2,0,2:4,2,0:2,4,2,2
chr11	10821055	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=216,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:4,2,3,1
chr11	10822202	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=251,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=66.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.822:26:1,12:3,10:3,1,15,7
chr11	10823576	.	C	CACACTCCTAAAATAGTTTCATGTTTTAATAGCAAATGAAATCACATATATTGCATAATTTAACATTTGTTGCCTAA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=187,124;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,29:0.968:31:1,6:0,5:1,1,16,13
chr11	10823815	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,11,6
chr11	10824540	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,12,3
chr11	10824731	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=213,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:5,8:1,5:4,2,11,2
chr11	10827418	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,7:1,8:1,1,14,1
chr11	10828361	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=214,205;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:0,7:2,9:1,1,5,11
chr11	10828490	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr11	10828905	.	G	GGCCTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=469,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr11	11292635	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=206,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr11	11292859	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=219,130;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:1,1:4,4:0|1:11292859_G_T:11292859:0,5,0,6
chr11	11292864	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=219,130;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:1,1:4,6:0|1:11292859_G_T:11292859:0,5,0,7
chr11	11314538	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=206,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:3,7:1,7:3,1,9,5
chr11	11354393	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=149,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,5:1,4:0,1,1,8
chr11	11398698	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=219,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.786:7:1,1:0,5:0,1,6,0
chr11	11913464	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=126,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,0:4,3:7,2,3,0
chr11	11924406	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=121,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:12,3:4,0:9,7,1,2
chr11	11955290	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=150,3074;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,3:4,0:6,0,0,3
chr11	11957992	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=143,198;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:14,0:9,5:11,12,0,5
chr11	11972054	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=223,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr11	11986061	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=178,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,1:1,2:1,0,3,1
chr11	11986113	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=192,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:5,1:6,3:7,4,1,3
chr11	11989899	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=233,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,7:0,3:1,0,9,1
chr11	12183846	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:8,5:9,6:8,9,2,9
chr11	12231179	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,5:8,4:3,9,2,7
chr11	12242030	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr11	12246204	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=169,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:7,4:8,6:13,2,8,2
chr11	12246233	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=176,126;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:12,6:5,7:9,8,8,5
chr11	12263665	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=395,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr11	12265688	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.616:19:3,6:4,5:1,6,2,10
chr11	12279937	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=261,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr11	12279991	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=232,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,5:1,2:2,2,3,4
chr11	12283928	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=262,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,2:0,1:5,0,3,0
chr11	12313887	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr11	12315537	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=162,186;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:5,8:10,0:6,9,8,0
chr11	12345459	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	12379792	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	12495607	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=233,237;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr11	12495623	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr11	12517935	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=274,294;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr11	12534808	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,12,2
chr11	12535485	.	CACAGGCTCCTGCACTA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,272;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.464:11:2,4:1,1:4,2,4,1
chr11	12886540	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=196,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr11	12904464	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:4,0,6,0
chr11	12946677	.	G	GCAGGAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=241,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	12951623	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,261;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr11	12951926	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr11	13030731	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=190,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,1,2
chr11	13031253	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=220,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,3:4,0:7,5,1,2
chr11	13031705	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=172,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,4:5,6:5,5,5,5
chr11	13031846	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=178,181;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,6:5,1:1,7,2,5
chr11	13378499	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=129,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.172:21:14,0:4,2:0|1:13378499_G_A:13378499:8,10,2,1
chr11	13378502	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=129,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:13,0:4,3:0|1:13378499_G_A:13378499:8,10,2,1
chr11	13378507	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,36;MFRL=129,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:12,0:4,1:0|1:13378499_G_A:13378499:9,10,2,1
chr11	13382065	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=190,297;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:0,7,0,3
chr11	13398129	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr11	13399791	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr11	13400051	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr11	13407184	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=190,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,1:5,3:7,2,4,0
chr11	13514417	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr11	13733401	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:10,3:8,0:8,11,1,2
chr11	13984720	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=194,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,1:1,1:0,5,1,1
chr11	14004514	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=165,254;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,0:11,3:10,12,3,0
chr11	14101493	.	G	GC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=80.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,9:0,13:0,0,14,9
chr11	14264979	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:2,4,0,2
chr11	14276275	.	GGT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=125,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GT;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:13,1:5,2:6,13,1,2
chr11	14280763	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=197,256;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0|1:14280763_G_A:14280763:4,0,3,0
chr11	14280765	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=256,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.333:7:2,1:3,1:1|0:14280763_G_A:14280763:5,0,2,0
chr11	14303257	.	CCTG	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=160,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:4,2:1,0:0|1:14303257_CCTG_C:14303257:2,6,1,1
chr11	14303262	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=160,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:14303257_CCTG_C:14303257:2,6,1,1
chr11	14303264	.	T	TTA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=160,64;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:14303257_CCTG_C:14303257:2,6,1,1
chr11	14303282	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:1,6,0,3
chr11	14315915	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,3,1
chr11	14315918	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr11	14480292	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=101,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:1,4:1,2:0,2,0,8
chr11	14480326	.	T	TGAGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=230,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr11	14496136	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=186,38;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:4,0:8,1:0|1:14496136_C_CT:14496136:5,7,1,1
chr11	14496138	.	A	AAAAAAAAAAAAGTTTGGAAAGTTTGCAGCCT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=186,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.182:14:4,0:8,2:0|1:14496136_C_CT:14496136:5,7,1,1
chr11	14497269	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr11	14501296	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,2,6
chr11	14504774	.	CCACA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,194;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=CA;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	14512060	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr11	14516003	.	TT	AA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=163,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:0,3:2,2:0,2,2,4
chr11	14520549	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:2,3:2,2:0,5,0,5
chr11	14520566	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=204,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.788:6:1,1:0,2:0,1,0,5
chr11	14532338	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr11	14532383	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=199,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,2:5,0:6,3,2,0
chr11	14535078	.	CAA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.900:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr11	14539315	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28,24,26;MFRL=138,189,176,140;MMQ=60,60,60,60;MPOS=15,21,10;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15;RU=A;STR;TLOD=5.64,4.61,9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,4,3,5:0.249,0.217,0.431:13:0,3,1,2:1,1,2,3:0,1,7,5
chr11	14540671	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	14852490	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	14891266	.	CAGAAATCA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=215,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:14891266_CAGAAATCA_C:14891266:0,4,0,1
chr11	14891279	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=199,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:14891266_CAGAAATCA_C:14891266:0,3,0,1
chr11	14992569	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr11	15134195	.	G	GTATGTGATGTGAGCAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15134195_G_GTATGTGATGTGAGCAT:15134195:0,0,0,1
chr11	15134198	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15134195_G_GTATGTGATGTGAGCAT:15134195:0,0,0,1
chr11	15170644	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=197,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,4:1,4:3,0,7,1
chr11	15197186	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=241,253;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr11	15198584	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=173,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,1:1,3:5,1,2,2
chr11	15198772	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,3:1,2:1,0,2,3
chr11	15267597	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:6,4:8,0:6,8,2,2
chr11	16117460	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=215,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.654:9:0,2:3,4:3,0,6,0
chr11	16117572	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=173,95;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:13,0:13,4:16,11,0,4
chr11	16117684	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=12,19;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.457:9:0,0:0,1:0,5,1,3
chr11	16119285	.	AG	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=161,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:1,6,1,1
chr11	16205323	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=198,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr11	16205595	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=212,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr11	16208432	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=162,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:13,2:4,0:6,11,1,1
chr11	16340105	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:11,0:7,3:7,11,0,3
chr11	16760244	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,1:9,2:14,5,3,0
chr11	16776709	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=166,94;MMQ=57,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0|1:16776709_G_A:16776709:0,3,0,2
chr11	16776722	.	A	ATGCTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=166,188;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:3,0:0,1:1|0:16776709_G_A:16776709:0,3,0,1
chr11	16776725	.	GC	TT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=166,188;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:3,0:0,1:1|0:16776709_G_A:16776709:0,3,0,1
chr11	16810599	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=240,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,3:3,0:6,0,3,0
chr11	16816412	.	TG	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=253,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:16816412_TG_AT:16816412:0,2,0,1
chr11	16816416	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=253,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,1:0,0:0|1:16816412_TG_AT:16816412:0,2,0,1
chr11	16816521	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,281;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:12,3:10,1:14,8,4,0
chr11	16863049	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=213,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,0:2,8:3,3,5,3
chr11	16863087	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=88,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,2:8,5:6,6,4,3
chr11	16872645	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=203,277;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:10,0,2,0
chr11	16872653	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=198,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:3,0:5,3:8,0,4,0
chr11	16873799	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=221,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,6:2,3:5,1,5,4
chr11	16877497	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=221,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr11	17035801	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,17;MFRL=239,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:17035801_G_GC:17035801:0,1,1,0
chr11	17035812	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,31;MFRL=239,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17035801_G_GC:17035801:0,1,1,0
chr11	17035818	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=221,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:17035801_G_GC:17035801:0,2,1,0
chr11	17035820	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=221,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:17035801_G_GC:17035801:0,2,1,0
chr11	17035826	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:17035801_G_GC:17035801:0,3,1,0
chr11	17035830	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:17035801_G_GC:17035801:0,3,1,0
chr11	17096059	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=123,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.178:43:12,5:24,2:1,35,3,4
chr11	17111272	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:5,2,0,2
chr11	17113483	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr11	17113579	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=130,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,0:4,3:3,8,0,3
chr11	17126638	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=182,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr11	17126670	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=209,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:4,4:5,1,2,3
chr11	17139255	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=114,77;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,1:3,1:1,2,2,0
chr11	17139264	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=77,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:17139264_T_C:17139264:2,0,0,2
chr11	17139271	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:17139264_T_C:17139264:0,0,0,2
chr11	17177174	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,5:3,2:3,7,2,5
chr11	17190127	.	TAAAAAC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=193,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAAAAC;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:3,0:0,1:3,0,1,0
chr11	17332626	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:2,7,0,2
chr11	17333377	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=189,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,3:4,2:5,4,4,1
chr11	17337099	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:17337099_C_T:17337099:0,2,0,1
chr11	17337108	.	G	GTATACAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=190,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:17337099_C_T:17337099:0,3,0,1
chr11	17337112	.	G	GTTTTAAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=190,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:17337099_C_T:17337099:0,3,0,1
chr11	17337115	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=190,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:17337099_C_T:17337099:0,3,0,1
chr11	17351873	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=219,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:3,3:3,4:3,3,1,6
chr11	17352477	.	TACA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACA;STR;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:6,4:10,2:4,12,6,0
chr11	17408404	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr11	17408630	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.870:21:1,7:1,11:0,2,9,10
chr11	17410144	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.538:15:4,2:3,6:2,5,5,3
chr11	17414757	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=143,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr11	17415190	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	17416032	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,209;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr11	17417504	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=142,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,1,1
chr11	17429922	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	17430111	.	ATGG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=198,216;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,1,0
chr11	17435966	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=299,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr11	17436936	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr11	17450192	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=135,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:17450192_A_C:17450192:2,1,1,1
chr11	17450195	.	G	GAGGAGATAAATTAATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=135,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:17450192_A_C:17450192:2,1,1,1
chr11	17481948	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr11	17483145	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:9,5,2,0
chr11	17484971	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=283,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:1,5:3,7:3,2,4,8
chr11	17491571	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,0:1,6:3,0,6,0
chr11	17496516	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=257,111;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:1,9:1,1:1,1,4,6
chr11	17515801	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=131,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:8,5:17,0:23,2,5,0
chr11	17515833	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=123,237;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.192:19:11,1:4,2:9,7,0,3
chr11	17515970	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=168,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,2:3,1:6,4,0,3
chr11	17517235	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=188,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:5,4:1,9:2,4,5,8
chr11	17533397	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	17533635	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=244,258;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:0,3,1,5
chr11	17542583	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=191,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:0|1:17542583_C_T:17542583:0,5,0,4
chr11	17542586	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=191,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:0|1:17542583_C_T:17542583:0,5,0,4
chr11	17542872	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:8,6:1,2:4,5,4,4
chr11	17545091	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=223,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:3,2,2,3
chr11	17574588	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=123,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:4,1,3,1
chr11	17574758	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,0:3,2:6,7,0,2
chr11	17580050	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=142,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:5,3,2,3
chr11	17580998	.	TC	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr11	17591961	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr11	17594806	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	17598187	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:1,7:0,2:0|1:17598187_G_A:17598187:0,1,3,6
chr11	17598191	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:1,7:0,2:0|1:17598187_G_A:17598187:0,1,3,6
chr11	17612972	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,14,7
chr11	17615728	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=128,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.624:14:4,6:1,3:3,2,1,8
chr11	17627481	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,234;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:7,4,2,0
chr11	17627613	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,7:0,0,8,8
chr11	17633012	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr11	17633041	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=204,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr11	17633978	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	17653572	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=245,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr11	17655839	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=159,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:4,4,1,3
chr11	17656636	.	C	CCAGCACCCAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=213,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:4,3,1,1
chr11	17663862	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=160,269;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr11	17899795	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:4,2:4,2:1,7,0,4
chr11	17899810	.	AC	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=178,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:2,3:6,0:0|1:17899810_AC_A:17899810:1,7,0,3
chr11	17899815	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=178,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,3:5,0:0|1:17899810_AC_A:17899810:1,7,0,3
chr11	18014549	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,0:3,2:2,5,0,2
chr11	18034568	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18034568_T_C:18034568:0,0,0,1
chr11	18034592	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18034568_T_C:18034568:0,0,0,1
chr11	18044304	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr11	18047255	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=276,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,5:1,4:1,3,3,6
chr11	18054777	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=241,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,3:5,0,5,2
chr11	18101965	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:6,6,1,1
chr11	18111692	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=137,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.440:14:4,1:4,4:7,1,4,2
chr11	18127679	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=248,258;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr11	18194793	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=171,210;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,1:2,7:4,3,6,2
chr11	18194827	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=174,95;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,2:6,1:6,4,1,2
chr11	18194878	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=180,145;MMQ=60,43;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:6,4:8,3:8,6,7,0
chr11	18195051	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,8,17
chr11	18267135	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	18267373	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=140,173;MMQ=27,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,7:0,4:1,0,10,1
chr11	18267431	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=151,183;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:12,5:9,0:0|1:18267431_C_T:18267431:16,6,5,1
chr11	18267434	.	AA	GG	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=28,36;MFRL=151,178;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,7:0.242:31:12,6:10,0:0|1:18267431_C_T:18267431:17,7,6,1
chr11	18267463	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=148,183;MMQ=27,27;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,6:0.159:42:21,5:14,1:0|1:18267431_C_T:18267431:17,19,5,1
chr11	18267471	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=140,151;MMQ=27,27;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,26:0.674:38:9,15:3,10:9,3,10,16
chr11	18267478	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=32,21;MFRL=148,164;MMQ=27,27;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:20,2:12,0:0|1:18267431_C_T:18267431:16,18,3,1
chr11	18267600	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=198,199;MMQ=33,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:3,3,0,3
chr11	18267651	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr11	18290859	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=273,206;MMQ=21,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,2:0,3:0,1,3,2
chr11	18290874	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=239,256;MMQ=31,40;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,3:0,2:1,1,3,2
chr11	18290880	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,231;MMQ=60,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0,0,4,2
chr11	18290902	.	TT	CC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=205,243;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0|1:18290902_TT_CC:18290902:1,0,3,1
chr11	18290906	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=35,29;MFRL=205,243;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0|1:18290902_TT_CC:18290902:1,0,3,1
chr11	18290964	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=227,287;MMQ=60,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr11	18301605	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,1,3
chr11	18303404	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	18312953	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.800:18:2,6:1,9:3,0,13,2
chr11	18314579	.	C	CTT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=T;STR;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr11	18314618	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=226,189;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18314618_C_G:18314618:0,1,0,1
chr11	18314628	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=226,189;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18314618_C_G:18314618:0,1,0,1
chr11	18317458	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	18317699	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr11	18322269	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,221;MMQ=60,43;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr11	18333058	.	A	ATT	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=128,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=T;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:6,3:7,0:8,10,2,3
chr11	18333096	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=191,153;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr11	18333108	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=181,127;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:0|1:18333108_G_A:18333108:0,9,0,2
chr11	18333110	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=181,127;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,1:5,0:0|1:18333108_G_A:18333108:0,9,0,2
chr11	18357270	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,7,6
chr11	18379446	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:4,3:5,2:5,4,3,2
chr11	18379629	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr11	18422370	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=201,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:3,3,2,0
chr11	18424590	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr11	18428637	.	A	ATTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,15;RU=T;STR;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,0:1,0,5,1
chr11	18434355	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,79;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:6,6,2,0
chr11	18456235	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=137,116;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:3,0,4,0
chr11	18460090	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=164,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:1,2:3,3,1,2
chr11	18487425	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=200,333;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	18591715	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr11	18632984	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.826:9:1,1:0,7:1,0,6,2
chr11	18636481	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=206,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:1,8,1,1
chr11	18720304	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	18722791	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:3,3:4,1:2,7,2,2
chr11	18729597	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=194,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:7,4,0,2
chr11	18730895	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:2,0,5,0
chr11	18732119	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr11	18732386	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.384:19:7,4:4,3:3,9,5,2
chr11	18732426	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,5:0,4:0,0,2,9
chr11	18733579	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=145,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:5,1,6,0
chr11	18735321	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr11	18735396	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=159,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,3,1
chr11	18735465	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,0:5,3:9,6,2,1
chr11	18735753	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=117,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:3,4:2,8:2,3,5,7
chr11	18736247	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr11	18736270	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,23;MFRL=189,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:18736270_G_A:18736270:0,4,0,1
chr11	18736272	.	GC	TT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=189,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:18736270_G_A:18736270:0,4,0,1
chr11	18736877	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=217,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr11	18736942	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=217,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr11	18738603	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	18743022	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,1:7,1:12,1,2,0
chr11	18745614	.	ATGGGTG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=238,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:4,0,1,0
chr11	18793399	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr11	18793465	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=171,79;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,3:3,0:6,3,2,1
chr11	19078022	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=208,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr11	19177310	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=199,269;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:6,4,2,0
chr11	19197349	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.366:9:1,1:4,1:4,2,2,1
chr11	19206426	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr11	19246421	.	C	CTATGG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=176,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr11	19251070	.	GCTTGCC	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,261;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,0:8,2:10,9,2,0
chr11	19251968	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=296,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr11	19252107	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=172,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:6,0,3,1
chr11	19256250	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,9,3
chr11	19259115	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=205,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:0,6,0,4
chr11	19261797	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,2:5,1:1,11,0,3
chr11	19372616	.	G	GGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr11	19967872	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=230,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr11	20005892	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=209,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:0,4:1,2:0,1,0,7
chr11	20070225	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=162,259;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:8,2,1,1
chr11	20070276	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,2:8,0:11,8,2,0
chr11	20070325	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.216:35:12,7:16,0:20,8,7,0
chr11	20072779	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,7:0,11:0,0,15,3
chr11	20101508	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr11	20101524	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=187,276;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr11	20101744	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,10:0,0,6,12
chr11	20101769	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=170,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,5:6,0:2,6,1,4
chr11	20112373	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=195,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,3:4,2:3,2,4,1
chr11	20112417	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=174,128;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,6:2,4:0,2,7,3
chr11	20112440	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=147,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:6,4,1,1
chr11	20112649	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	20117232	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,8:6,3:5,5,7,4
chr11	20119298	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=211,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,1:6,1:8,10,1,1
chr11	20119312	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=215,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,2:7,1:6,9,1,2
chr11	20122392	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr11	20127046	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=226,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,4:0,5:1,0,6,3
chr11	20129376	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,249;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0,4,0,4
chr11	20178138	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=216,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:7,1:8,1:6,9,2,1
chr11	20178885	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,424;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	20398034	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	20403825	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,2,12
chr11	20404506	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=136,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,4:1,4:1,0,7,2
chr11	20404757	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr11	20409169	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr11	20411199	.	TAAAA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=A;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	20411287	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=154,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,6:6,0:10,2,6,0
chr11	20411418	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0|1:20411418_G_C:20411418:0,0,2,9
chr11	20411424	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0|1:20411418_G_C:20411418:0,0,2,10
chr11	20419028	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr11	20429454	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,5:0,9:0,0,8,6
chr11	20473655	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=63.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,14,4
chr11	20483748	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=113,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,2:3,6:1,3,0,8
chr11	20515555	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr11	20529755	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=231,244;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:20529755_C_A:20529755:4,0,1,0
chr11	20529757	.	TC	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=15,19;MFRL=231,244;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0|1:20529755_C_A:20529755:4,0,1,0
chr11	20628479	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr11	20639479	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	20648418	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr11	20649448	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr11	20658679	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:5,1:6,5,2,0
chr11	20676253	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,37;MFRL=150,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,0:5,2:7,7,0,2
chr11	20699394	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=198,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:1,0,8,0
chr11	20959429	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,6,7
chr11	20959482	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	21581665	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr11	21581997	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=293,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,3:0,6:0,1,0,9
chr11	21592228	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr11	22242729	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=232,166;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.721:23:4,8:2,9:2,4,8,9
chr11	22271823	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=126,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:7,0:10,8:12,5,1,7
chr11	22284516	.	GAATTGACAACCC	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,1:4,1:7,7,2,0
chr11	22296094	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=179,239;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:2,2,2,0
chr11	22297606	.	AT	A,ATT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28,30;MFRL=145,135,151;MMQ=60,60,60;MPOS=14,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.46,3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.401,0.299:7:1,1,2:1,2,0:2,0,4,1
chr11	22301077	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=187,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,4:7,1:11,2,3,2
chr11	22301410	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=214,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr11	22364758	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=209,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,4:3,0:3,0,4,0
chr11	22387086	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,2:5,2:6,4,2,2
chr11	22391534	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr11	22397739	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	22707139	.	CTG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=168,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,2:3,1:2,1,3,0
chr11	22747745	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr11	22851172	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=212,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:8,0,3,0
chr11	22851409	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr11	24750842	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=232,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:0,8,0,4
chr11	24784922	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=215,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,1:6,2:1,10,0,3
chr11	25098938	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:10,9:6,4:9,7,10,3
chr11	25100229	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=175,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:1,3:5,1:1,5,1,3
chr11	26353951	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=119,274;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,1,3
chr11	26353991	.	T	TAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=261,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,19;RU=A;STR;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr11	26547348	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=266,241;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0|1:26547348_G_A:26547348:0,1,0,5
chr11	26547353	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=230,263;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:3,3:0,3:0|1:26547348_G_A:26547348:0,3,0,6
chr11	26552679	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr11	26552696	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:26552696_T_A:26552696:0,0,5,0
chr11	26552702	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:26552696_T_A:26552696:0,0,5,0
chr11	26563464	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=139,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:3,3,5,0
chr11	26574740	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=199,87;MMQ=60,56;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr11	26574782	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=173,125;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.657:3:0,1:1,1:0|1:26574782_TG_T:26574782:0,1,2,0
chr11	26574790	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=37,16;MFRL=173,125;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.657:3:0,0:1,1:0|1:26574782_TG_T:26574782:0,1,2,0
chr11	26581382	.	TACACACACAC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=14,32;MFRL=240,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=20,15;RU=AC;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:2,0:1,2:0,10,0,2
chr11	26584625	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=252,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:3,1,3,0
chr11	26587079	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:12,0:12,8:15,9,0,8
chr11	26587355	.	AAGTG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:11,2:6,0:6,13,1,1
chr11	26619872	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=111,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,7:2,3:2,1,8,2
chr11	26620101	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=184,231;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr11	26621310	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=171,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:1,0:5,2:0|1:26621310_G_C:26621310:1,5,1,1
chr11	26621313	.	G	GATTACGTATAAAAAGTAGAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=167,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:0|1:26621310_G_C:26621310:1,6,1,1
chr11	26645894	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	26655658	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=216,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,2:1,5:2,0,8,0
chr11	26656714	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=201,259;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr11	26663394	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,3,2
chr11	26664727	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=143,101;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:13,4:11,0:17,7,4,0
chr11	26664758	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=162,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:18,5:11,0:17,12,4,1
chr11	26669167	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=261,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr11	26677867	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=131,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:1,4:3,10:4,0,9,5
chr11	26692594	.	T	TTGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=181,116;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,15;RU=TG;STR;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,2:6,1:7,3,4,2
chr11	26692631	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=158,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.627:36:6,8:7,12:5,8,12,11
chr11	26705310	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=100,155;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:1,5:2,3:2,1,2,6
chr11	26724994	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=165,222;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.589:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr11	26725547	.	G	GAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=214,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr11	27018159	.	TAC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=206,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.205:12:7,1:3,1:5,5,2,0
chr11	27018387	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=183,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:7,8,2,0
chr11	27018596	.	TAAC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:4,0:1,10,1,1
chr11	27371889	.	TT	AC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,2:14,1:10,13,0,3
chr11	27379127	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=155,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:2,6,1,1
chr11	27389403	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:9,1:1,1:8,2,2,0
chr11	27393813	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:9,1:9,2:13,7,1,2
chr11	27401743	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,6:3,5:3,1,8,3
chr11	27401927	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=109,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:4,2:0,1:0,4,0,3
chr11	27401940	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=169,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr11	27412535	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	27412782	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35,25,32;MFRL=0,254,175,278;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,28,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.53,8.97,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,4,2:0.256,0.436,0.229:8:0,1,2,1:0,1,1,1:0,0,0,8
chr11	27523164	.	T	TGAAGTTAAAATTTCAGGC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAAGTTAAAATTTCAGGC;STR;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,5:0,4:0,0,1,10
chr11	27523186	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr11	27528359	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=210,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:2,1:4,2,0,2
chr11	27681174	.	C	CTG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.915:8:0,4:0,1:0,0,1,7
chr11	27681176	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.920:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr11	27695910	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=206,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr11	28045260	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:6,4,3,2
chr11	28045419	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=195,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:3,8,0,2
chr11	28045430	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=139,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.603:10:2,3:2,3:1,3,0,6
chr11	28078468	.	GGGCTA	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,19;MFRL=288,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:2,0:0|1:28078468_GGGCTA_G:28078468:2,2,1,1
chr11	28078475	.	T	TGTAGC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=288,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:28078468_GGGCTA_G:28078468:2,2,1,1
chr11	28078478	.	ACACC	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,17;MFRL=288,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:28078468_GGGCTA_G:28078468:2,2,0,1
chr11	28078484	.	GATCCCAA	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=346,64;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:28078468_GGGCTA_G:28078468:2,1,0,1
chr11	28078494	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,19;MFRL=347,64;MMQ=60,60;MPOS=-11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:28078468_GGGCTA_G:28078468:0,1,0,1
chr11	28080640	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=124,188;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.531:15:4,0:3,8:4,3,0,8
chr11	28098520	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.285:11:2,1:3,0:6,2,3,0
chr11	28098524	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,10;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:3,0:6,0:9,2,3,0
chr11	28104605	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=250,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:6,4,0,2
chr11	28113094	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr11	30032330	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:11,3:8,0:9,10,3,0
chr11	30352473	.	C	CAG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=253,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.731:24:5,8:1,9:4,2,7,11
chr11	30352796	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,0:9,3:11,10,0,3
chr11	30358033	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,273;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,0:4,3:6,0,3,0
chr11	30438990	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=223,190;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:3,3:3,0:7,1,3,0
chr11	30900263	.	TAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=185,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:0,2:1,2,0,2
chr11	30902893	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	30922081	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr11	30930393	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	30933064	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=251,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr11	31327316	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=73,172;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:5,5:1,6:2,4,6,5
chr11	31482328	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=178,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:1,9:5,0:1,5,0,10
chr11	31484817	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=152,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:6,1:4,14:4,6,3,12
chr11	31653956	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr11	31703309	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,15;MFRL=0,445;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:31703309_A_AT:31703309:0,0,1,0
chr11	31703316	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,17;MFRL=0,445;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:31703309_A_AT:31703309:0,0,1,0
chr11	31703318	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,10;MFRL=0,445;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:31703309_A_AT:31703309:0,0,1,0
chr11	31703321	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,15;MFRL=0,445;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:31703309_A_AT:31703309:0,0,1,0
chr11	31703323	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,10;MFRL=0,445;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:31703309_A_AT:31703309:0,0,1,0
chr11	31703326	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,15;MFRL=0,445;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:31703309_A_AT:31703309:0,0,1,0
chr11	31703329	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,17;MFRL=0,445;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:31703309_A_AT:31703309:0,0,1,0
chr11	31812215	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=208,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,0:3,4:3,0,4,0
chr11	32113057	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr11	32118665	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:2,3:1,0:4,2,3,0
chr11	32118925	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	32122003	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=216,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr11	32122020	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=216,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:5,1,3,0
chr11	32122112	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=121,109;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:9,5:7,0:5,11,0,5
chr11	32122268	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=284,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr11	32125855	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,3:2,5:4,1,8,0
chr11	32449486	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=180,237;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:3,0,4,1
chr11	32449661	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=252,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,1,1
chr11	32452205	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=234,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32452205_C_T:32452205:0,1,0,1
chr11	32452208	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=234,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32452205_C_T:32452205:0,1,0,1
chr11	32456271	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=163,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,1:2,1:3,6,2,0
chr11	32456298	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=218,163;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:2,2,3,1
chr11	32461025	.	A	AAG,AGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,30,15;MFRL=165,210,223;MMQ=60,60,60;MPOS=9,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.99,7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.263,0.380:8:2,1,1:1,1,0:1,2,4,1
chr11	32461059	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=219,195;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,3:2,1:5,3,2,2
chr11	32461948	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=155,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.393:8:2,1:3,2:3,2,0,3
chr11	32608473	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr11	32615352	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr11	32623301	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=195,243;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,6:0.132:47:6,2:35,4:33,8,3,3
chr11	32623419	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,4:2,9:2,3,0,13
chr11	32635499	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=222,117;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:6,6,0,2
chr11	32674627	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr11	32722212	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr11	32860436	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:10,3:8,0:11,7,3,0
chr11	32874919	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:2,1:5,1:0|1:32874919_C_A:32874919:4,4,0,2
chr11	32874926	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=205,172;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,10:0.735:13:1,4:1,6:1|0:32874919_C_A:32874919:1,2,5,5
chr11	32875125	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=288,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:32875125_T_C:32875125:0,3,0,1
chr11	32875135	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=380,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32875125_T_C:32875125:0,1,0,1
chr11	32956492	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=114,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:9,1:16,3:12,13,2,2
chr11	32975333	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	33049341	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,4:6,2:7,5,2,4
chr11	33050100	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:5,0,3,0
chr11	33053107	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=195,146;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:2,3,2,2
chr11	33054562	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,3:2,3:3,4,0,6
chr11	33054596	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr11	33054754	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr11	33055078	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=197,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr11	33065547	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=216,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:0,5,0,4
chr11	33078643	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,46;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:4,2,4,0
chr11	33079445	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=205,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.409:15:6,2:3,4:7,2,6,0
chr11	33080407	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr11	33080496	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=113,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,2:2,9:4,4,5,6
chr11	33106616	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,1:9,1:8,6,1,1
chr11	33106908	.	C	CTTTATAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0,0,0,8
chr11	33113910	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr11	33118326	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr11	33118529	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=199,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr11	33182789	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,2:5,0:11,3,1,1
chr11	33307937	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr11	33308839	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=197,109;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,0:3,2:7,0,0,3
chr11	33360886	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=67.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.966:24:0,18:0,6:0,0,17,7
chr11	33362723	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr11	33373067	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=129,121;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,6:2,0:6,0,6,0
chr11	33374613	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.374:12:3,3:5,1:6,2,4,0
chr11	33564964	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=166,74;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:14,0:14,2:0|1:33564964_C_T:33564964:18,10,1,1
chr11	33564971	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=166,74;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:0|1:33564964_C_T:33564964:16,8,1,1
chr11	33565593	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:5,5,3,1
chr11	33565699	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=174,52;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:5,10,2,0
chr11	33581262	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=272,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:3,1,3,2
chr11	33581537	.	GCCACATACTA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=154,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.508:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr11	33604960	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=198,154;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:3,6,4,0
chr11	33628103	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=208,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr11	33628117	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=208,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr11	33631423	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:0,1,6,3
chr11	33667333	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=147,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.898:17:0,5:1,11:1,0,8,8
chr11	33667596	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,2:0,1,2,4
chr11	33680249	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=163,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:4,0:2,2:6,0,3,0
chr11	33689652	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,4:5,1:5,6,2,3
chr11	33795880	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=183,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,0:3,2:5,1,1,1
chr11	33880896	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.308:20:6,2:8,3:6,8,4,2
chr11	33886294	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,6:3,1:1,4,1,6
chr11	34093349	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=58.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,7,12
chr11	34107785	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,9:0,0,7,15
chr11	34149199	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	34152939	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,15:0,5:0,0,14,6
chr11	34154641	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,14,7
chr11	34158411	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=36.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr11	34158431	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr11	34165053	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:5,4:9,5:6,8,2,7
chr11	34167825	.	CGA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=259,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GA;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr11	34176214	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,3,2
chr11	34176299	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=122,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:8,4,1,2
chr11	34180864	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:6,7,2,0
chr11	34188981	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	34189564	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr11	34192593	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=185,107;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,1:7,2:9,10,0,3
chr11	34218812	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=181,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:5,2,1,1
chr11	34226041	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	34460472	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=113,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:1,8:1,8:2,0,14,2
chr11	34460541	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=269,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=85.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,28:0.829:33:3,18:2,10:1,4,13,15
chr11	34460711	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=195,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.420:14:2,3:6,1:0,8,0,6
chr11	34470679	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=157,238;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:5,3,1,1
chr11	34492443	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=130,256;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,0:5,3:6,2,2,1
chr11	34511541	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=198,124;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:5,9:2,2:5,2,5,6
chr11	34514941	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=152,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,1:1,3:4,0,4,0
chr11	34680053	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,4:4,3:4,1,7,0
chr11	34904399	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=264,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,3:2,8:1,2,2,9
chr11	34905145	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=212,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:0,1,0,8
chr11	34909827	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=54.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,3:0,8:0|1:34909827_GA_G:34909827:0,0,12,1
chr11	34909833	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0|1:34909827_GA_G:34909827:0,0,13,1
chr11	34910217	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=227,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr11	34910397	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,0:4,7:2,5,2,5
chr11	34910433	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=179,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,5:1,4:0,1,2,7
chr11	34912013	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=153,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:9,0,3,1
chr11	34916484	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr11	34916710	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr11	34937684	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=183,265;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr11	34937697	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=284,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:1,0,9,1
chr11	34937884	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:2,5:1,5:1,2,1,9
chr11	34937901	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=260,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,4:0,7:0,2,1,10
chr11	34937931	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=236,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr11	34938115	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=231,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr11	34953088	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=255,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,3:1,1:1,2,0,4
chr11	34978892	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=187,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:0,5:1,7:0,1,10,2
chr11	34982146	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=193,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.702:8:1,1:1,5:0|1:34982146_T_G:34982146:0,2,0,6
chr11	34982148	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=193,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:1,1:1,4:0|1:34982146_T_G:34982146:0,2,0,6
chr11	34988416	.	T	TCTCCTTTCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=101,176;MMQ=59,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:2,2:0,2:1,1,0,4
chr11	35198032	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=252,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr11	35201842	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=202,87;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:13,3:10,0:10,13,1,2
chr11	35218445	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,5:7,3:2,12,4,4
chr11	35222681	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=145,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,10:0.289:36:15,5:10,5:15,11,5,5
chr11	35223158	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=155,269;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr11	35244044	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=205,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr11	35323200	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=212,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr11	35327825	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,5:5,3:0,10,1,7
chr11	35334032	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:0,3,1,4
chr11	35338893	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:2,1,4,0
chr11	35454177	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=168,114;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:7,0:9,4:8,8,0,4
chr11	35456453	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr11	35461332	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=120,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35461332_G_A:35461332:0,1,0,1
chr11	35461333	.	G	GTCCTGCCCCATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=120,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35461332_G_A:35461332:0,1,0,1
chr11	35461335	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=120,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.486:2:1,0:0,1:0|1:35461332_G_A:35461332:0,1,0,1
chr11	35473551	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=225,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr11	35489662	.	AG	GT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr11	35489674	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:35489674_T_A:35489674:0,0,0,1
chr11	35489678	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:35489674_T_A:35489674:0,0,0,1
chr11	35642247	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,1:5,3:5,11,4,0
chr11	35685076	.	C	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,198;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,8:0.176:49:13,8:28,0:22,19,8,0
chr11	35747527	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=169,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:11,0:7,3:0|1:35747527_A_C:35747527:11,7,0,3
chr11	35747532	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=164,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:12,0:9,3:0|1:35747527_A_C:35747527:13,8,0,3
chr11	36057626	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=202,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:1,4:1,1:1,1,4,2
chr11	36103381	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr11	36251046	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=364,330;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr11	36298555	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,16,4
chr11	36299976	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,2:7,1:12,0,3,0
chr11	36300211	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=212,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:1,6,1,2
chr11	36302410	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=148,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.687:8:2,0:1,5:0,3,1,4
chr11	36311014	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=197,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:4,6:3,4:1,7,2,8
chr11	36424905	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=208,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,3:1,1:1,4,2,2
chr11	36459130	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=243,297;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr11	36483814	.	TCCCC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=125,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,1;RU=C;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.481:4:0,0:0,2:0|1:36483814_TCCCC_T:36483814:2,0,2,0
chr11	36483826	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,17;MFRL=125,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:2,0:0,0:0|1:36483814_TCCCC_T:36483814:2,0,2,0
chr11	36514290	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=241,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:0,8:2,5:0,2,1,12
chr11	36518824	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	36518906	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,290;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	36599048	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=153,15231687;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:10,0:5,2:7,8,1,1
chr11	36599066	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=162,15231687;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:5,7,1,1
chr11	36599069	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=112,168;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:2,5,4,3
chr11	36600625	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:10,0:9,7:10,9,0,7
chr11	36600684	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.301:14:7,1:3,3:2,8,4,0
chr11	36600947	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:8,4,2,0
chr11	36601096	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=184,284;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.350:12:6,3:1,1:5,3,2,2
chr11	36657775	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=557,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr11	36669778	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=190,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,1:3,3:0,3,1,3
chr11	40137666	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.349:29:12,0:7,9:10,9,1,9
chr11	43333587	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=192,253;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:9,1,2,0
chr11	43413157	.	TTTGCG	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=75,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTGCG;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.418:7:2,1:2,2:0|1:43413157_TTTGCG_T:43413157:1,3,1,2
chr11	43413158	.	TTGCG	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,6:0.897:6:0,3:0,3:1|0:43413157_TTTGCG_T:43413157:0,0,2,4
chr11	43418196	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=232,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr11	43471734	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,98;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:9,0:14,4:9,14,0,4
chr11	43472895	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr11	43515493	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:5,5,0,2
chr11	43702581	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=200,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,3:2,6:1,2,1,9
chr11	43702615	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr11	43772549	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=227,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,5:1,1:1,2,1,5
chr11	43775734	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	43852491	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=212,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.734:28:4,11:3,10:5,2,11,10
chr11	43876435	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:13,1:5,4:2,16,0,5
chr11	43905440	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:3,1,2,0
chr11	43905484	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,2:3,9:6,1,9,2
chr11	43908104	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.410:20:7,4:5,4:8,4,4,4
chr11	43940566	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr11	43940644	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,11,8
chr11	44076913	.	C	CCATGAGTTATAGGTAAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=138,320;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr11	44089161	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,1:0,8:1,0,7,3
chr11	44096322	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=226,157;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=T;STR;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0|1:44096322_CTT_C:44096322:0,4,0,5
chr11	44096330	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=193,157;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:1,2:1,3:0|1:44096322_CTT_C:44096322:0,5,0,5
chr11	44096334	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=193,157;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:1,2:2,1:0|1:44096322_CTT_C:44096322:0,5,0,5
chr11	44096338	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=193,157;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,2:3,1:0|1:44096322_CTT_C:44096322:0,5,0,3
chr11	44098985	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:1,2,0,4
chr11	44102775	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=170,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:44102775_A_C:44102775:10,8,1,1
chr11	44102780	.	G	GAGAAGGCAGGGGATGCGGAGTGA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=170,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:44102775_A_C:44102775:10,6,1,1
chr11	44104701	.	C	CCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=266,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CT;STR;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr11	44104885	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,4:6,3:5,4,4,3
chr11	44105374	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=165,84;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,1:4,5,0,2
chr11	44146257	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr11	44219286	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=318,227;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr11	44296828	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr11	44297253	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	44639852	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=181,42;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:0|1:44639852_C_T:44639852:4,11,1,1
chr11	44639858	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=181,42;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:0|1:44639852_C_T:44639852:4,11,1,1
chr11	44639919	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=17,12;MFRL=60,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.661:9:1,0:0,0:0,3,0,6
chr11	44948198	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,0:5,3:8,5,3,0
chr11	44950762	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.339:14:2,0:6,0:1,8,5,0
chr11	44950784	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=169,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr11	44959061	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=182,238;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:10,1:11,7,2,0
chr11	44959083	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=203,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:5,4:11,6:7,9,7,3
chr11	44959924	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=180,252;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr11	45245778	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=107,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr11	45672508	.	GGT	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=213,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:5,0:2,2:0|1:45672508_GGT_G:45672508:3,5,1,1
chr11	45672511	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=213,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:2,2:0|1:45672508_GGT_G:45672508:3,5,1,1
chr11	45672513	.	G	GCT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=230,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:45672508_GGT_G:45672508:3,4,1,1
chr11	45672594	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	45832295	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=146,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:6,4,2,0
chr11	45832935	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,322;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	45868850	.	C	CG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,9:0,0,6,10
chr11	45877529	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=105.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,16:0,0,20,13
chr11	45877688	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,2,12
chr11	45889241	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=148,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:14,0:7,2:9,12,1,1
chr11	45891508	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	45918523	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=175,219;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:11,1:4,2:8,7,0,3
chr11	45926431	.	TCCC	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=C;STR;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:4,4,1,2
chr11	45926445	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,4,5
chr11	45927353	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=197,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr11	45936035	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,1,3
chr11	45937267	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,3:0,14:0,0,12,5
chr11	45944994	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=144,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,5,1
chr11	45955622	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=184,66;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:5,0:10,3:9,6,1,2
chr11	45959669	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=120,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.691:14:3,3:1,7:2,2,9,1
chr11	45970374	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=132,105;MMQ=60,25;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:7,3:9,0:12,4,3,0
chr11	45970408	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=135,105;MMQ=60,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:8,4:16,1:13,11,3,2
chr11	45970516	.	GA	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,3:12,0:11,13,0,3
chr11	46001229	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=225,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,5:1,2:2,0,7,0
chr11	46105688	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=241,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.820:9:0,4:1,4:0,1,4,4
chr11	46332504	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr11	46342081	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=50.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,6,9
chr11	46342259	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=37.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,7,6
chr11	46391602	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,2:3,1:2,7,1,2
chr11	46392825	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:2,2,1,1
chr11	46393574	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=229,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,5:5,2:6,1,5,2
chr11	46393958	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=222,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:5,5:1,5:2,4,6,4
chr11	46394664	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=154,64;MMQ=60,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:46394664_G_A:46394664:0,7,1,1
chr11	46394666	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=154,64;MMQ=60,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:46394664_G_A:46394664:0,7,1,1
chr11	46394667	.	T	TCCTCTCCCACG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=17,20;MFRL=154,64;MMQ=60,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:0,2:0|1:46394664_G_A:46394664:0,7,1,1
chr11	46396479	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:2,5:8,2:3,7,3,4
chr11	46397323	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:2,2,2,0
chr11	46404338	.	CT	GG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0|1:46404338_CT_GG:46404338:0,1,2,2
chr11	46404341	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,0:0|1:46404338_CT_GG:46404338:0,1,2,2
chr11	46456444	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=179,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.625:30:6,6:5,13:4,7,3,16
chr11	46565495	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=114,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:6,0:8,5:11,3,3,2
chr11	46569434	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,18,35;MFRL=105,192,60;MMQ=60,60,60;MPOS=26,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,17;RU=A;STR;TLOD=3.77,4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.390,0.374:6:0,1,1:0,0,0:0,1,1,4
chr11	46667480	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=195,177;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,0:8,4:8,9,4,0
chr11	46701034	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=212,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:1,6,0,2
chr11	46702691	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=211,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,1:3,2:5,3,1,2
chr11	46702920	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,6,7
chr11	46722731	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,2,10
chr11	46724714	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=147,83;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,4:6,0:2,13,4,0
chr11	46742222	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=207,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,0:3,4:3,4,4,0
chr11	46744925	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=159,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:3,2,4,0
chr11	46747805	.	C	CAAGACCTGGCACAAGGTGATGCGCAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46747805_C_CAAGACCTGGCACAAGGTGATGCGCAA:46747805:0,0,0,1
chr11	46747807	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46747805_C_CAAGACCTGGCACAAGGTGATGCGCAA:46747805:0,0,0,1
chr11	46748196	.	A	AGGGGATGC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=141,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGATGC;STR;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:4,1:1,2:3,2,2,2
chr11	46751059	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=217,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:4,1:3,2:1,6,1,2
chr11	46760756	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:1,4:1,0:2,0,2,3
chr11	46776697	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	46802094	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,280;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	46804761	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,0:2,4:5,0,4,0
chr11	46810368	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=184,259;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:1,6,0,2
chr11	46810380	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=201,259;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:2,6,0,2
chr11	46812021	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=122,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,2:6,0:0|1:46812021_G_A:46812021:14,5,1,1
chr11	46812023	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=122,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:0|1:46812021_G_A:46812021:14,5,1,1
chr11	46812227	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr11	46817123	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.503:16:3,8:5,0:7,1,8,0
chr11	46817359	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=194,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr11	46822686	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr11	46840119	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,1:0,1,0,5
chr11	46880480	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,274;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,1:3,1:7,2,1,1
chr11	46886000	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=121,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:8,5:2,0:5,6,5,0
chr11	46889669	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:6,2,0,2
chr11	46889713	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	46897253	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:0,4:1,5:0,1,1,8
chr11	46897995	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,9,3
chr11	46900744	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=160,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,1:0|1:46900744_C_T:46900744:2,2,1,1
chr11	46900747	.	G	GGTTCACACCAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=160,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:46900744_C_T:46900744:2,2,1,1
chr11	46907827	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr11	46911457	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr11	46911704	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,2,8
chr11	46917983	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	47178778	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,1:5,5:4,5,3,3
chr11	47187067	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=175,215;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:0|1:47187067_G_A:47187067:4,6,0,2
chr11	47187071	.	GAAAAA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=17,32;MFRL=184,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,10;RU=A;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:2,1:2,1:0|1:47187067_G_A:47187067:3,6,0,2
chr11	47188281	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	47188314	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	47192980	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,1:8,2:13,6,3,0
chr11	47193367	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=197,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:1,3,2,2
chr11	47194924	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:6,1:1,4:7,0,4,2
chr11	47200402	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=253,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:6,1,6,0
chr11	47201924	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=168,291;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,1:0,4,1,2
chr11	47201981	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=159,260;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:1,1,3,0
chr11	47204175	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,3:0,0,6,5
chr11	47238522	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,17:0,0,10,14
chr11	47238665	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	47282834	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=146,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,1:4,1:4,10,0,2
chr11	47296639	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=168,45;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:13,0:9,2:0|1:47296639_C_T:47296639:10,12,1,1
chr11	47296659	.	GT	AC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=162,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:6,2:0|1:47296639_C_T:47296639:6,10,1,1
chr11	47296667	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=170,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:47296639_C_T:47296639:5,8,1,1
chr11	47298201	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr11	47308151	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=205,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	47311115	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=184,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0,4,0,1
chr11	47362431	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr11	47364301	.	CGGGT	C,TGGGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27,28;MFRL=164,245,429;MMQ=60,60,60;MPOS=28,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.35,3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,2,2:0.167,0.166:15:5,2,1:6,0,1:6,5,2,2
chr11	47364762	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	47365004	.	CACCTCCA	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,34;MFRL=184,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.483:4:0,1:2,1:0|1:47365004_CACCTCCA_C:47365004:1,1,2,0
chr11	47365008	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,15;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:47365008_T_A:47365008:0,1,1,0
chr11	47365011	.	A	ACC	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,15;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=C;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:47365008_T_A:47365008:0,1,1,0
chr11	47365014	.	CGAG	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=184,198;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.483:4:0,1:2,1:0|1:47365004_CACCTCCA_C:47365004:1,1,2,0
chr11	47365015	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,24;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47365008_T_A:47365008:0,1,1,0
chr11	47365023	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,12;MFRL=186,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:47365008_T_A:47365008:2,1,1,0
chr11	47365024	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:47365004_CACCTCCA_C:47365004:1,1,1,0
chr11	47365029	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=29,13;MFRL=187,176;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:0,0:2,0:1,1,2,0
chr11	47365121	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=190,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,3:7,0:5,5,2,1
chr11	47371484	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr11	47371699	.	GA	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=236,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr11	47371713	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=236,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:47371713_C_T:47371713:1,3,0,1
chr11	47371723	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=271,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:47371713_C_T:47371713:0,3,0,1
chr11	47380340	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=217,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,4,0
chr11	47380593	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=200,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,6:1,2:1,2,1,7
chr11	47397353	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=220,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:2,4,1,3
chr11	47431966	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,1,2
chr11	47432034	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=135,226;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr11	47436531	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,3,7
chr11	47444055	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=221,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr11	47446292	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=123,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,1:4,5:0,5,1,5
chr11	47460253	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=203,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,1:1,0:0|1:47460253_A_C:47460253:1,3,2,0
chr11	47460257	.	C	CCG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=203,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0|1:47460253_A_C:47460253:1,3,2,0
chr11	47460260	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=203,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,0:0|1:47460253_A_C:47460253:1,3,2,0
chr11	47460263	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=194,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:0,1:0|1:47460253_A_C:47460253:1,4,2,0
chr11	47460306	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr11	47462837	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr11	47463328	.	T	TGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:2,0:0,1:0|1:47463328_T_TGGG:47463328:1,1,1,0
chr11	47463330	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:1,0:0,1:0|1:47463328_T_TGGG:47463328:1,1,1,0
chr11	47463483	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr11	47469766	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47469766_G_C:47469766:0,0,0,1
chr11	47469768	.	AC	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47469766_G_C:47469766:0,0,0,1
chr11	47500400	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=199,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:6,3,2,2
chr11	47504935	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:8,0:2,3:9,1,3,0
chr11	47505869	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=128,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.462:13:3,3:4,3:7,0,6,0
chr11	47587577	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr11	47597074	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=221,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:47597074_G_A:47597074:2,1,1,0
chr11	47597079	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=221,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:47597074_G_A:47597074:2,1,1,0
chr11	47600352	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.821:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr11	47600361	.	CC	TT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=197,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.406:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr11	47600369	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=145,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.349:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr11	47600438	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.453:31:8,7:9,7:11,6,7,7
chr11	47601977	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	47611316	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	47640429	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=100,164;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:7,2:7,5:7,7,3,4
chr11	47648779	.	C	CGG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=36,30;MFRL=178,154;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:47648779_C_CGG:47648779:0,3,0,1
chr11	47648781	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=35,28;MFRL=183,154;MMQ=60,48;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:47648779_C_CGG:47648779:1,3,0,1
chr11	47648782	.	TGC	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=183,154;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:47648779_C_CGG:47648779:1,3,0,1
chr11	47648795	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=36,34;MFRL=188,154;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:47648779_C_CGG:47648779:1,2,0,1
chr11	47648797	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=35,30;MFRL=188,154;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:47648779_C_CGG:47648779:1,2,0,1
chr11	47648801	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=35,24;MFRL=188,154;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:47648779_C_CGG:47648779:1,2,0,1
chr11	47648806	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,34;MFRL=188,154;MMQ=60,48;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:47648779_C_CGG:47648779:1,2,0,1
chr11	47660287	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=26,35;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.200:28:11,2:12,3:0|1:47660287_T_C:47660287:13,10,3,2
chr11	47660294	.	CA	TG	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=129,38;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:9,3:10,3:0|1:47660287_T_C:47660287:11,11,3,3
chr11	47660301	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=26,28;MFRL=132,38;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:9,3:10,3:0|1:47660287_T_C:47660287:10,11,3,3
chr11	47660326	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=30,28;MFRL=153,38;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.184:25:7,2:12,2:0|1:47660326_G_A:47660326:9,12,2,2
chr11	47660328	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=28,26;MFRL=155,38;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:7,2:11,2:0|1:47660326_G_A:47660326:9,13,2,2
chr11	47660334	.	CA	TG	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=152,1904;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,2:12,0:0|1:47660326_G_A:47660326:10,13,1,1
chr11	47660338	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=29,29;MFRL=152,1904;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,2:13,0:0|1:47660326_G_A:47660326:10,13,1,1
chr11	47660341	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=158,1904;MMQ=60,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:6,2:14,0:0|1:47660326_G_A:47660326:8,12,1,1
chr11	47660536	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,4:8,0:6,10,4,0
chr11	47701629	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,14;MFRL=177,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,0:1,0:3,1,0,2
chr11	47711954	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,4:7,0:10,5,4,0
chr11	47712213	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=188,167;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:6,3,1,1
chr11	47736314	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr11	47744429	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,319;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	47745809	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,27;MFRL=123,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:47745809_T_A:47745809:0,3,0,1
chr11	47745816	.	G	T,A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,33,28;MFRL=228,109,132;MMQ=60,60,60;MPOS=13,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,0,0:1,1,1:1,2,0,2
chr11	47745817	.	T	TGGCAAACTATCCC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,33;MFRL=176,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:47745809_T_A:47745809:1,3,0,1
chr11	47745820	.	C	CCTA,CTAA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,35,32;MFRL=237,109,132;MMQ=60,60,60;MPOS=9,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,0,0:1,1,1:1,1,0,2
chr11	47745822	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=228,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:47745809_T_A:47745809:1,2,0,1
chr11	47745823	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=228,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:47745823_A_AT:47745823:1,2,0,1
chr11	47745824	.	A	AGT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=228,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:47745823_A_AT:47745823:1,2,0,1
chr11	47755552	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=124,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr11	47755578	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,16;MFRL=120,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:6,0:2,0:4,4,2,0
chr11	47772401	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr11	47774366	.	A	AAAAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,47;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAAC;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.693:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	47776047	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr11	47776283	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=229,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr11	47800628	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=131,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:4,1,2,0
chr11	47813436	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr11	47814280	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr11	47827631	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,290;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,1:7,1:9,0,2,0
chr11	47834346	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=196,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,2:2,0:5,0,2,0
chr11	47837408	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr11	47837638	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	48134261	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=168,215;MMQ=60,44;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,1:6,1:9,1,2,0
chr11	48142528	.	ATTTT	A,ATT,ATTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29,32,30;MFRL=134,217,165,153;MMQ=60,60,60,60;MPOS=17,25,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,12,14,15;RU=T;STR;TLOD=5.54,6.07,3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,3,2:0.242,0.329,0.262:8:1,2,2,1:0,0,1,1:1,0,5,2
chr11	48142888	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=181,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr11	48157869	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=204,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr11	48168449	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=163,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.215:35:16,7:12,0:11,17,7,0
chr11	48170870	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr11	48171793	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr11	48184971	.	CCTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=214,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0|1:48184971_CCTTT_C:48184971:4,0,2,1
chr11	48184983	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=214,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:48184971_CCTTT_C:48184971:4,0,1,1
chr11	48185897	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=149,112;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:12,5:9,0:14,7,5,0
chr11	48238302	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr11	48238421	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr11	48238944	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,277;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,2:7,2:7,8,1,3
chr11	48266582	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr11	48267589	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	48285981	.	CCTT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=60.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,5:0,9:0,0,9,5
chr11	48328079	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=196,205;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:3,12,2,0
chr11	48346487	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=25,29;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.401:13:1,3:7,2:0|1:48346487_TC_T:48346487:6,2,1,4
chr11	48346513	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=10;MBQ=27,34;MFRL=203,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:4,5:9,1:0|1:48346487_TC_T:48346487:8,5,3,3
chr11	48346523	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=169,259;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:3,5:6,1:0|1:48346487_TC_T:48346487:7,4,4,3
chr11	48346535	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=33,34;MFRL=204,259;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:3,5:5,2:0|1:48346487_TC_T:48346487:4,4,6,1
chr11	48346541	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=25,27;MFRL=183,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:3,5:6,2:0|1:48346487_TC_T:48346487:4,6,6,2
chr11	48346547	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=32,28;MFRL=163,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:2,6:6,2:0|1:48346487_TC_T:48346487:3,5,5,3
chr11	48346551	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=32,31;MFRL=163,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:2,6:6,2:0|1:48346487_TC_T:48346487:3,5,5,3
chr11	48346579	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=10;MBQ=34,30;MFRL=140,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,12:0.520:23:2,6:7,4:0|1:48346579_C_A:48346579:6,5,7,5
chr11	48346588	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=10;MBQ=28,33;MFRL=151,191;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,13:0.519:25:4,6:8,7:0|1:48346579_C_A:48346579:6,6,8,5
chr11	48346604	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=10;MBQ=28,33;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,16:0.447:36:5,5:13,10:0|1:48346579_C_A:48346579:8,12,10,6
chr11	48346615	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.457:33:6,5:11,10:9,9,9,6
chr11	48346660	.	TTTGCTGATC	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=186,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,14:0.456:31:6,5:10,8:0|1:48346660_TTTGCTGATC_T:48346660:10,7,7,7
chr11	48346681	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,14:0.484:29:9,5:6,9:0|1:48346660_TTTGCTGATC_T:48346660:9,6,5,9
chr11	48346924	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=207,179;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.407:25:12,5:3,5:0|1:48346924_T_C:48346924:7,8,8,2
chr11	48346932	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=208,179;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.407:25:11,5:4,4:0|1:48346924_T_C:48346924:7,8,8,2
chr11	48346961	.	AA	TG	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=172,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:13,5:7,9:8,13,10,4
chr11	48346999	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=166,196;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.429:33:12,3:7,11:8,11,7,7
chr11	48347100	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=173,190;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.469:34:7,9:11,6:8,10,7,9
chr11	48347124	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,16:0.460:35:5,9:14,7:0|1:48347124_A_G:48347124:7,12,8,8
chr11	48347130	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,20:0.525:38:5,10:12,7:0|1:48347124_A_G:48347124:5,13,12,8
chr11	48347140	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=169,187;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,17:0.486:35:5,9:12,7:0|1:48347124_A_G:48347124:6,12,10,7
chr11	48347142	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,17:0.500:34:5,9:12,7:0|1:48347124_A_G:48347124:5,12,10,7
chr11	48347144	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,17:0.500:34:5,10:12,7:0|1:48347124_A_G:48347124:5,12,10,7
chr11	48347342	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,13:0.451:29:7,7:9,5:0|1:48347342_G_A:48347342:5,11,6,7
chr11	48347346	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=27,29;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,13:0.451:29:7,6:9,6:0|1:48347342_G_A:48347342:5,11,6,7
chr11	48347358	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=172,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=38.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,12:0.448:27:6,7:8,5:0|1:48347358_C_T:48347358:5,10,3,9
chr11	48347363	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=186,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,12:0.433:28:6,3:10,5:0|1:48347358_C_T:48347358:5,11,2,10
chr11	48347392	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=172,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,7:6,3:3,10,0,10
chr11	48347419	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=25,32;MFRL=171,200;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,8:3,1:0,7,0,9
chr11	48366812	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=239,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:2,4:4,3:6,0,7,0
chr11	48366829	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=214,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,4:2,4:5,0,9,0
chr11	48366895	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=174,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,4:4,5:4,1,5,4
chr11	48367050	.	T	TAG	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=28,27;MFRL=181,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,6:4,4:6,5,5,5
chr11	48367073	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=27,34;MFRL=219,170;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:2,10:1,3:1,2,7,6
chr11	48367097	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=27,34;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:9,3:1,2:5,5,3,2
chr11	48367133	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=27,28;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.307:24:14,4:3,3:0|1:48367133_C_A:48367133:8,9,4,3
chr11	48367136	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=11;MBQ=27,29;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:14,4:3,4:0|1:48367133_C_A:48367133:8,9,5,3
chr11	48367155	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=28,27;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:9,4:4,3:0|1:48367155_T_A:48367155:8,6,4,4
chr11	48367159	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=33,28;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:9,4:4,4:0|1:48367155_T_A:48367155:8,6,4,4
chr11	48367163	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=11;MBQ=28,32;MFRL=163,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.364:20:9,4:4,3:0|1:48367155_T_A:48367155:7,6,4,3
chr11	48367170	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=11;MBQ=33,27;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.476:19:7,4:3,5:0|1:48367155_T_A:48367155:5,5,6,3
chr11	48367190	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=11;MBQ=29,26;MFRL=150,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.360:23:8,2:6,6:0|1:48367190_A_T:48367190:9,6,4,4
chr11	48367195	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=33,25;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:8,1:6,6:0|1:48367190_A_T:48367190:9,5,4,3
chr11	48367311	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:7,5:15,10:12,10,10,5
chr11	48367387	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=8;MBQ=34,28;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.503:26:3,6:9,7:4,9,6,7
chr11	48367419	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=34,28;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:7,5:8,4:0|1:48367419_G_A:48367419:5,11,4,5
chr11	48367424	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=35,35;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:7,5:9,4:0|1:48367419_G_A:48367419:5,11,4,5
chr11	48367455	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=30,29;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,1:9,2:5,17,1,2
chr11	48367469	.	TG	CA	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=30,34;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.410:20:7,2:5,6:0|1:48367469_TG_CA:48367469:3,9,1,7
chr11	48367474	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=27,34;MFRL=124,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:4,1:5,5:0|1:48367469_TG_CA:48367469:1,8,1,5
chr11	48367499	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=25,32;MFRL=123,153;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,1:4,5:1,7,1,5
chr11	48367511	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=29,34;MFRL=124,141;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,0:2,4:0,5,0,4
chr11	48373632	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	48373748	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,13:0.778:16:3,2:0,9:0|1:48373748_C_G:48373748:1,2,10,3
chr11	48373770	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=10;MBQ=28,29;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,17:0.693:24:5,5:2,11:0|1:48373748_C_G:48373748:2,5,12,5
chr11	48373797	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=10;MBQ=35,25;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,16:0.548:29:6,4:6,12:0|1:48373797_C_T:48373797:6,7,11,5
chr11	48373805	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=34,28;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,15:0.533:28:6,4:7,10:0|1:48373797_C_T:48373797:6,7,10,5
chr11	48373815	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=10;MBQ=28,32;MFRL=178,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=61.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,16:0.500:32:6,3:9,10:0|1:48373797_C_T:48373797:9,7,10,6
chr11	48373817	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=10;MBQ=34,25;MFRL=178,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,16:0.472:34:7,3:9,12:0|1:48373797_C_T:48373797:10,8,10,6
chr11	48373820	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=10;MBQ=29,31;MFRL=165,104;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.352:32:10,2:10,9:11,10,8,3
chr11	48373827	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=10;MBQ=30,29;MFRL=178,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,18:0.528:34:8,4:8,12:0|1:48373797_C_T:48373797:10,6,11,7
chr11	48373833	.	GA	AG	.	.	DP=37;ECNT=10;MBQ=33,29;MFRL=191,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=69.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,18:0.514:35:8,5:9,13:0|1:48373797_C_T:48373797:10,7,11,7
chr11	48374031	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=216,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:48374031_G_A:48374031:0,5,0,2
chr11	48374041	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=216,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,1:1,0:0|1:48374031_G_A:48374031:0,3,0,2
chr11	48510777	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=189,157;MMQ=52,51;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:0,6:3,8:2,1,7,7
chr11	49170334	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr11	49175551	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=183,237;MMQ=56,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:2,6,2,2
chr11	49176057	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr11	49192667	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=244,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,5:1,5:2,0,5,5
chr11	49192905	.	GAAAA	G,GAA,GAAA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=19,32,32,17;MFRL=128,220,209,261;MMQ=60,43,36,60;MPOS=24,21,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,12,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.87,3.68,4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,2,2,3:0.213,0.219,0.260:11:0,2,0,0:1,0,2,0:1,3,1,6
chr11	49192922	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=186,128;MMQ=49,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:2,0:8,3:0|1:49192922_G_C:49192922:2,8,0,3
chr11	49192924	.	CA	TT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=186,128;MMQ=49,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:1,0:6,3:0|1:49192922_G_C:49192922:2,8,0,3
chr11	49195090	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr11	49195123	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=166,313;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	49195127	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=17,26;MFRL=313,166;MMQ=51,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr11	49195129	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,240;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	49197548	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,212;MMQ=59,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:0,8,0,4
chr11	49207365	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=161,192;MMQ=52,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,1:14,1:11,14,0,2
chr11	49208379	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=207,200;MMQ=41,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:1,5,0,4
chr11	49974371	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,46;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr11	49974931	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,33;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr11	51411399	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=153,115;MMQ=52,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr11	51411914	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=152,216;MMQ=52,51;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,2:2,1:3,5,1,2
chr11	51412453	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	51516144	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,39;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:51516144_A_G:51516144:0,0,0,3
chr11	51516152	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,31;MFRL=209,206;MMQ=39,27;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51516144_A_G:51516144:0,1,0,1
chr11	51516155	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=209,206;MMQ=39,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51516144_A_G:51516144:0,1,0,1
chr11	55032847	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=178,167;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:1,5,2,0
chr11	55033179	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=98,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:10,0:16,4:18,8,4,0
chr11	55033273	.	CAAAA	C,CAAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,25,35;MFRL=145,160,148;MMQ=60,50,40;MPOS=14,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,12,15;RU=A;STR;TLOD=3.43,4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.220,0.335:8:0,0,0:2,1,3:1,2,1,4
chr11	55035809	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=145,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.197:19:10,2:5,1:11,5,2,1
chr11	55035894	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=153,131;MMQ=50,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:11,0:16,3:12,15,0,3
chr11	55035985	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:0,5,1,6
chr11	55111115	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=177,299;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:0|1:55111115_A_G:55111115:4,7,2,0
chr11	55111118	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=177,299;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:0|1:55111115_A_G:55111115:4,7,2,0
chr11	55111157	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=177,286;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,3:5,0:6,7,3,0
chr11	55111172	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=177,286;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,3:3,0:3,7,3,0
chr11	55111238	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=177,156;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,9:1,3:1,2,7,5
chr11	55322422	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,1:11,2:8,13,1,2
chr11	55322464	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,2:8,1:7,7,2,1
chr11	55322818	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=203,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.220:21:8,2:7,2:10,7,1,3
chr11	55322902	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=244,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr11	55322921	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=208,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr11	55339652	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,3:6,1:7,5,0,4
chr11	55339676	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=196,182;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:4,1,4,1
chr11	55339702	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=128,191;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:7,1,3,2
chr11	55339704	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=122,173;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:5,2:4,2:0|1:55339704_T_G:55339704:9,3,4,0
chr11	55339712	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=111,235;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:8,2:6,2:0|1:55339704_T_G:55339704:9,5,3,1
chr11	55340038	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=91,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.257:37:16,9:12,0:16,12,9,0
chr11	55340046	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=91,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.115:23:12,2:9,0:13,8,1,1
chr11	55340056	.	T	TAGGAAAG	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=94,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,2:8,0:12,12,1,1
chr11	55340552	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=219,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr11	55371231	.	TTG	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=212,68;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,0:1,2:6,4,1,1
chr11	55371375	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=224,110;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:2,3:9,0:4,7,3,0
chr11	55371916	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=415,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr11	55406095	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,1:1,1:6,1,0,2
chr11	55433089	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=225,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,1:8,4:7,6,2,3
chr11	55433297	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=206,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:4,9,0,3
chr11	55563846	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=170,157;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:8,3:17,0:6,19,0,3
chr11	55563886	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=179,116;MMQ=60,35;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,0:8,4:2,12,0,4
chr11	55578940	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=215,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:2,4,2,1
chr11	55606208	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=199,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:5,1,1,1
chr11	55656437	.	ATT	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=125,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.357:20:5,0:5,6:6,7,4,3
chr11	55656483	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=176,107;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:1,7:0,8:1,0,8,8
chr11	55657320	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=165,206;MMQ=55,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,1,1
chr11	55657394	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr11	55657399	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr11	55682111	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	55703139	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=153,415;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:14,0:5,2:8,11,2,0
chr11	55703247	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=114,206;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:7,5:10,1:12,5,3,3
chr11	55734972	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	55735808	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=171,127;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,1:8,1:0|1:55735808_G_A:55735808:9,5,2,0
chr11	55735813	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,1:7,2:0|1:55735808_G_A:55735808:7,6,3,0
chr11	55761081	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=198,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr11	55762060	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,4:3,7:1,6,4,7
chr11	55762167	.	CAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=210,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.527:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	55798152	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr11	55798533	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,3:7,0:8,9,0,3
chr11	55860780	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,10,6
chr11	55861153	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,1:5,2:7,4,1,2
chr11	55861277	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=200,251;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:4,1:5,3:0|1:55861277_GT_G:55861277:3,6,3,2
chr11	55861297	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=202,239;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:7,2:8,1:0|1:55861277_GT_G:55861277:9,6,3,1
chr11	55861306	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=202,251;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:7,3:7,2:0|1:55861277_GT_G:55861277:9,6,3,2
chr11	55872424	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=168,286;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr11	55873368	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,45;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr11	55889790	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:55889790_G_T:55889790:0,0,5,1
chr11	55889815	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=154,198;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.250:10:3,1:4,1:1|0:55889790_G_T:55889790:7,1,0,2
chr11	55890156	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=140,267;MMQ=60,57;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:2,2:11,1:8,5,1,2
chr11	55904846	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=178,108;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:7,2:0|1:55904846_C_T:55904846:9,12,1,1
chr11	55904849	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=173,108;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,0:7,2:0|1:55904846_C_T:55904846:9,11,1,1
chr11	55927442	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=185,241;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:3,5,0,2
chr11	55927811	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=145,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:55927811_T_C:55927811:1,1,1,1
chr11	55927813	.	T	TGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=145,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:55927811_T_C:55927811:1,1,1,1
chr11	55927815	.	G	GTGCAAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=145,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:55927811_T_C:55927811:1,1,1,1
chr11	55944048	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=196,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:3,1,2,2
chr11	55999503	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=200,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr11	56019644	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=174,240;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr11	56043702	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:5,5:2,2:3,4,2,5
chr11	56086806	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=176,251;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr11	56113898	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,108;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:7,2,0,2
chr11	56143125	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=13;MBQ=32,25;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:12,1:9,5:16,5,5,1
chr11	56143156	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=13;MBQ=35,27;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,14:0.441:32:11,5:7,8:0|1:56143156_C_T:56143156:11,7,10,4
chr11	56143158	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=13;MBQ=30,27;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,14:0.441:32:10,6:7,7:0|1:56143156_C_T:56143156:11,7,10,4
chr11	56143198	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=13;MBQ=33,25;MFRL=174,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,7:0.210:36:16,5:13,2:0|1:56143198_C_T:56143198:11,18,5,2
chr11	56143204	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=13;MBQ=33,27;MFRL=168,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,7:0.211:36:15,6:12,1:0|1:56143198_C_T:56143198:12,17,4,3
chr11	56143207	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=13;MBQ=33,28;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,8:0.231:37:15,7:12,1:0|1:56143198_C_T:56143198:12,17,5,3
chr11	56143216	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=13;MBQ=33,29;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,9:0.263:36:15,6:11,1:0|1:56143198_C_T:56143198:13,14,5,4
chr11	56143225	.	CT	TC	.	.	DP=39;ECNT=13;MBQ=33,28;MFRL=169,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,10:0.275:38:15,7:11,3:0|1:56143198_C_T:56143198:13,15,6,4
chr11	56143250	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=13;MBQ=34,30;MFRL=175,140;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,12:0.433:28:9,6:7,6:0|1:56143250_G_A:56143250:7,9,7,5
chr11	56143252	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=13;MBQ=30,29;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:8,7:7,5:7,8,7,6
chr11	56143255	.	T	TGA	.	.	DP=32;ECNT=13;MBQ=28,29;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=52.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,14:0.441:32:7,5:7,5:0|1:56143250_G_A:56143250:7,11,9,5
chr11	56143257	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=13;MBQ=33,28;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,14:0.469:30:5,7:9,6:0|1:56143250_G_A:56143250:5,11,9,5
chr11	56143259	.	AGT	A	.	.	DP=30;ECNT=13;MBQ=29,29;MFRL=186,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,14:0.500:28:5,7:9,6:0|1:56143250_G_A:56143250:5,9,9,5
chr11	56143357	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=30;MBQ=33,28;MFRL=256,180;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,4:4,4:0|1:56143357_G_A:56143357:5,5,4,4
chr11	56143360	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=30;MBQ=33,28;MFRL=258,180;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:6,4:5,3:0|1:56143357_G_A:56143357:5,7,4,4
chr11	56143370	.	GT	AG	.	.	DP=16;ECNT=30;MBQ=33,27;MFRL=258,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:8,3:4,1:0|1:56143357_G_A:56143357:5,7,1,3
chr11	56143375	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=30;MBQ=27,28;MFRL=253,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:8,2:4,1:0|1:56143357_G_A:56143357:6,9,1,2
chr11	56143378	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=30;MBQ=32,33;MFRL=253,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:9,1:6,1:0|1:56143357_G_A:56143357:6,9,1,2
chr11	56143381	.	TG	CA	.	.	DP=16;ECNT=30;MBQ=29,36;MFRL=245,179;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,1:6,1:0|1:56143357_G_A:56143357:6,8,1,1
chr11	56143394	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=30;MBQ=27,33;MFRL=253,171;MMQ=60,55;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:7,2:4,2:0|1:56143394_A_G:56143394:5,6,0,4
chr11	56143399	.	AC	GT	.	.	DP=15;ECNT=30;MBQ=25,32;MFRL=256,161;MMQ=60,58;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:5,2:3,3:0|1:56143394_A_G:56143394:4,6,1,4
chr11	56143402	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=30;MBQ=33,26;MFRL=253,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:5,2:4,3:0|1:56143394_A_G:56143394:3,6,3,5
chr11	56143408	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=30;MBQ=32,30;MFRL=231,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:5,3:6,6:0|1:56143408_C_T:56143408:6,6,3,6
chr11	56143411	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=30;MBQ=27,32;MFRL=226,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.455:20:6,3:5,6:0|1:56143408_C_T:56143408:5,6,3,6
chr11	56143414	.	CA	GG	.	.	DP=22;ECNT=30;MBQ=32,34;MFRL=217,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.458:22:6,3:6,7:0|1:56143408_C_T:56143408:5,7,3,7
chr11	56143424	.	A	ACGGC	.	.	DP=22;ECNT=30;MBQ=29,28;MFRL=198,178;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.458:22:4,3:7,6:0|1:56143408_C_T:56143408:7,5,3,7
chr11	56143425	.	TATCA	T	.	.	DP=24;ECNT=30;MBQ=26,31;MFRL=198,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.458:22:4,3:8,7:0|1:56143408_C_T:56143408:7,5,3,7
chr11	56143432	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=30;MBQ=30,32;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=48.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,4:6,9:6,3,5,8
chr11	56143434	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=30;MBQ=32,33;MFRL=106,178;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.792:22:0,7:4,11:3,1,8,10
chr11	56143489	.	AT	GA	.	.	DP=19;ECNT=30;MBQ=27,33;MFRL=120,205;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,4:4,6:3,5,8,2
chr11	56143501	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=30;MBQ=28,33;MFRL=127,227;MMQ=60,59;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:5,4:3,5:0|1:56143501_T_G:56143501:2,7,7,2
chr11	56143508	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=30;MBQ=25,25;MFRL=141,227;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.476:19:6,4:3,5:0|1:56143501_T_G:56143501:2,8,7,2
chr11	56143510	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=30;MBQ=29,32;MFRL=155,227;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:6,4:3,5:0|1:56143501_T_G:56143501:2,7,7,2
chr11	56143528	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=30;MBQ=28,33;MFRL=158,229;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.473:17:5,3:3,4:0|1:56143528_A_G:56143528:2,7,6,2
chr11	56143534	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=30;MBQ=29,33;MFRL=171,223;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:7,4:3,3:0|1:56143528_A_G:56143528:3,7,7,1
chr11	56143537	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=30;MBQ=27,26;MFRL=184,198;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:7,4:3,4:0|1:56143528_A_G:56143528:3,8,7,1
chr11	56143539	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=30;MBQ=30,32;MFRL=184,209;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.455:20:6,4:3,4:0|1:56143528_A_G:56143528:3,8,8,1
chr11	56143543	.	TT	CC	.	.	DP=18;ECNT=30;MBQ=30,31;MFRL=186,212;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:7,3:3,4:0|1:56143528_A_G:56143528:2,8,7,1
chr11	56143556	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=30;MBQ=29,30;MFRL=195,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,4:3,4:0|1:56143556_T_A:56143556:4,6,7,1
chr11	56143559	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=30;MBQ=33,27;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:8,4:3,4:0|1:56143556_T_A:56143556:6,6,7,1
chr11	56143561	.	AA	GG	.	.	DP=20;ECNT=30;MBQ=28,32;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:9,4:3,4:0|1:56143556_T_A:56143556:6,6,7,1
chr11	56143564	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=30;MBQ=33,25;MFRL=205,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.391:21:8,3:3,4:0|1:56143556_T_A:56143556:6,7,7,1
chr11	56143570	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=30;MBQ=28,34;MFRL=211,162;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:7,3:4,5:0|1:56143556_T_A:56143556:6,6,7,1
chr11	56143690	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=14;MBQ=33,27;MFRL=126,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,15:0.372:41:13,9:13,6:0|1:56143690_C_A:56143690:6,20,7,8
chr11	56143696	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=14;MBQ=35,27;MFRL=125,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,17:0.391:44:12,10:14,6:0|1:56143690_C_A:56143690:6,21,7,10
chr11	56143699	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=14;MBQ=30,33;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,16:0.378:43:13,9:13,6:0|1:56143690_C_A:56143690:7,20,6,10
chr11	56143716	.	TG	CA	.	.	DP=45;ECNT=14;MBQ=30,33;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,19:0.426:45:12,11:12,6:0|1:56143690_C_A:56143690:8,18,4,15
chr11	56143723	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=14;MBQ=30,33;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,19:0.444:43:12,11:11,8:0|1:56143690_C_A:56143690:8,16,4,15
chr11	56143725	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=14;MBQ=34,33;MFRL=125,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,19:0.455:42:12,10:11,8:0|1:56143690_C_A:56143690:8,15,4,15
chr11	56143729	.	CC	TG	.	.	DP=42;ECNT=14;MBQ=33,30;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,18:0.442:41:10,10:10,8:0|1:56143690_C_A:56143690:8,15,4,14
chr11	56143762	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=14;MBQ=34,27;MFRL=181,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,11:0.387:29:7,5:10,5:0|1:56143762_C_T:56143762:14,4,0,11
chr11	56143767	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=14;MBQ=32,31;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,10:0.355:29:6,4:11,5:0|1:56143762_C_T:56143762:15,4,0,10
chr11	56143782	.	T	TGA	.	.	DP=24;ECNT=14;MBQ=27,33;MFRL=170,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:8,1:10,3:0|1:56143762_C_T:56143762:15,4,0,5
chr11	56143784	.	CAT	C	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=33,30;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:8,2:10,3:0|1:56143762_C_T:56143762:16,4,0,6
chr11	56143795	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=33,26;MFRL=166,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:9,3:10,2:0|1:56143762_C_T:56143762:16,4,2,4
chr11	56143803	.	AG	GC	.	.	DP=27;ECNT=14;MBQ=30,32;MFRL=170,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.310:27:10,3:8,4:0|1:56143762_C_T:56143762:16,3,2,6
chr11	56143807	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=14;MBQ=33,28;MFRL=170,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,8:0.290:29:9,3:8,4:0|1:56143762_C_T:56143762:16,5,2,6
chr11	56143858	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=20;MBQ=32,20;MFRL=128,70;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:9,2:11,1:0|1:56143858_G_C:56143858:8,13,1,2
chr11	56143864	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=20;MBQ=33,20;MFRL=134,70;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:8,2:11,1:0|1:56143858_G_C:56143858:8,12,1,2
chr11	56143867	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=20;MBQ=30,20;MFRL=140,70;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:8,2:11,1:0|1:56143858_G_C:56143858:8,13,1,2
chr11	56143882	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=20;MBQ=32,23;MFRL=134,164;MMQ=60,58;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:7,3:11,1:0|1:56143858_G_C:56143858:7,13,1,3
chr11	56143885	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=20;MBQ=28,23;MFRL=140,164;MMQ=60,58;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:8,3:12,1:0|1:56143858_G_C:56143858:8,15,1,3
chr11	56143891	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=20;MBQ=28,24;MFRL=140,257;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.214:26:9,3:10,2:0|1:56143858_G_C:56143858:7,14,1,4
chr11	56143898	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=20;MBQ=32,31;MFRL=136,315;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:10,1:12,2:0|1:56143858_G_C:56143858:9,13,0,3
chr11	56143900	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=20;MBQ=32,31;MFRL=136,315;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:9,1:12,2:0|1:56143858_G_C:56143858:9,13,0,3
chr11	56143903	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=20;MBQ=32,31;MFRL=136,315;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:9,1:12,2:0|1:56143858_G_C:56143858:9,13,0,3
chr11	56143906	.	CA	TG	.	.	DP=25;ECNT=20;MBQ=33,30;MFRL=136,315;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:10,1:11,2:0|1:56143858_G_C:56143858:9,13,0,3
chr11	56143936	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=20;MBQ=26,35;MFRL=182,198;MMQ=60,58;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:8,1:6,3:0|1:56143936_A_G:56143936:5,9,0,4
chr11	56143942	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=20;MBQ=33,31;MFRL=182,198;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:7,0:4,3:0|1:56143936_A_G:56143936:4,8,0,4
chr11	56143963	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=20;MBQ=26,33;MFRL=193,139;MMQ=60,58;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:56143936_A_G:56143936:2,5,0,2
chr11	56143966	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=20;MBQ=35,32;MFRL=253,193;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr11	56143969	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=20;MBQ=27,36;MFRL=204,139;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:56143936_A_G:56143936:0,6,0,2
chr11	56143972	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=20;MBQ=34,31;MFRL=193,139;MMQ=60,58;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:56143936_A_G:56143936:0,7,0,2
chr11	56143976	.	CA	AG	.	.	DP=9;ECNT=20;MBQ=28,26;MFRL=193,139;MMQ=60,58;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:56143936_A_G:56143936:0,7,0,2
chr11	56143977	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=20;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr11	56143981	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=20;MBQ=31,34;MFRL=187,139;MMQ=60,58;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:56143936_A_G:56143936:0,6,0,2
chr11	56143984	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=20;MBQ=35,26;MFRL=187,139;MMQ=60,58;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,1:0|1:56143936_A_G:56143936:0,6,0,2
chr11	56144127	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	56185153	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.260:21:9,1:7,4:0|1:56185153_C_T:56185153:7,9,2,3
chr11	56185159	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,11:0.546:20:3,7:6,4:1|0:56185153_C_T:56185153:4,5,4,7
chr11	56230069	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=104,245;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:6,1:11,5:9,8,4,2
chr11	56230090	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=201,89;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:8,0:12,3:11,9,0,3
chr11	56230120	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=144,236;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:3,3:9,1:5,7,3,1
chr11	56230678	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=212,287;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:4,0,1,2
chr11	56230978	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=309,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	56258258	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:6,6,0,2
chr11	56380546	.	CCAGA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=204,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAGA;STR;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.611:21:4,7:4,6:6,2,6,7
chr11	56409565	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=141,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr11	56431075	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=205,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:5,0,3,0
chr11	56467763	.	A	AGAT	.	.	DP=8;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=199,286;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:0|1:56467763_A_AGAT:56467763:3,0,5,0
chr11	56467764	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=10;MBQ=35,27;MFRL=199,286;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:0|1:56467763_A_AGAT:56467763:3,0,5,0
chr11	56467787	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=210,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:2,4:4,0,9,0
chr11	56467810	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=32,25;MFRL=260,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:2,3:1,6:0|1:56467810_A_T:56467810:3,0,9,0
chr11	56467813	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=10;MBQ=30,33;MFRL=284,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:2,3:1,5:0|1:56467810_A_T:56467810:4,0,9,0
chr11	56467816	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=10;MBQ=35,25;MFRL=260,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,2:1,5:5,0,7,0
chr11	56467819	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=260,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:4,2:1,5:0|1:56467810_A_T:56467810:5,0,8,0
chr11	56467833	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=10;MBQ=27,32;MFRL=212,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:5,6:2,6:7,0,10,2
chr11	56467881	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=28,34;MFRL=199,188;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:6,4:3,5:7,2,6,4
chr11	56467926	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=29,32;MFRL=141,211;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.741:21:2,5:3,11:4,1,7,9
chr11	56468020	.	TG	CA	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=171,200;MMQ=57,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.355:27:9,3:9,6:10,8,3,6
chr11	56468044	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=296,196;MMQ=52,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,22:0.885:24:2,7:0,14:0|1:56468044_T_G:56468044:1,1,13,9
chr11	56468047	.	AC	GT	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=296,192;MMQ=52,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,20:0.876:22:2,7:0,13:0|1:56468044_T_G:56468044:1,1,13,7
chr11	56468048	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,260;MMQ=60,51;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.855:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr11	56468403	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=200,185;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,25:0.520:48:10,12:12,11:0|1:56468403_G_A:56468403:6,17,14,11
chr11	56468416	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=188,183;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,24:0.532:45:10,13:11,11:0|1:56468403_G_A:56468403:8,13,14,10
chr11	56468440	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,17:0.374:46:14,11:13,6:14,15,10,7
chr11	56468448	.	AA	GT	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=89.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,24:0.543:44:10,12:10,9:0|1:56468448_AA_GT:56468448:10,10,17,7
chr11	56468452	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=76.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,20:0.500:40:10,11:9,9:0|1:56468448_AA_GT:56468448:10,10,14,6
chr11	56468493	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.482:33:9,8:8,7:11,6,9,7
chr11	56468554	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=173,173;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,15:0.400:38:9,6:13,9:0|1:56468554_A_C:56468554:11,12,3,12
chr11	56468560	.	TA	CG	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,16:0.405:40:9,5:15,9:0|1:56468554_A_C:56468554:12,12,4,12
chr11	56468694	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=193,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:5,6:6,4:0|1:56468694_C_T:56468694:3,11,5,5
chr11	56468699	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=171,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=36.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:5,5:8,4:0|1:56468694_C_T:56468694:3,11,5,5
chr11	56468704	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=187,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:5,4:9,4:0|1:56468694_C_T:56468694:3,11,4,5
chr11	56468720	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=211,135;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:5,5:7,3:2,10,4,4
chr11	56468817	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=36,31;MFRL=225,241;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:1,0:3,6:0|1:56468817_G_T:56468817:0,4,0,6
chr11	56468819	.	CC	TT	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=225,241;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:1,0:2,6:0|1:56468817_G_T:56468817:0,4,0,6
chr11	56468828	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=35,36;MFRL=225,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:1,0:3,6:0|1:56468817_G_T:56468817:0,4,0,6
chr11	56468832	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=35,32;MFRL=225,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,0:3,5:0|1:56468817_G_T:56468817:0,4,0,5
chr11	56468835	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=225,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,0:3,5:0|1:56468817_G_T:56468817:0,4,0,5
chr11	56468870	.	GTG	ACA	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=252,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:56468870_GTG_ACA:56468870:0,3,0,1
chr11	56468877	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,27;MFRL=253,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:56468870_GTG_ACA:56468870:0,2,0,1
chr11	56508476	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,2:7,3:3,7,3,2
chr11	56508604	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=115,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,2:3,4:1,3,3,4
chr11	56508619	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,2,7
chr11	56510243	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=209,161;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,2,1
chr11	56757021	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=128,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:5,2,3,2
chr11	56757181	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:3,0:9,4:6,6,0,4
chr11	57004344	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:1,3:6,8:0,7,6,5
chr11	57075982	.	A	ACC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=136,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,2:13,0:0|1:57075982_A_ACC:57075982:12,11,0,2
chr11	57075986	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=136,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:8,1:12,0:0|1:57075982_A_ACC:57075982:12,11,0,2
chr11	57076057	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:8,1:3,1:2,9,0,2
chr11	57089222	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,0:0,5,2,0
chr11	57095728	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,25;MFRL=182,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.388:6:1,1:0,1:4,0,2,0
chr11	57117385	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=185,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,4:3,2:3,7,3,3
chr11	57118158	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=124,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.587:3:0,0:1,0:0|1:57118158_T_A:57118158:0,1,2,0
chr11	57118161	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=124,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.587:3:0,0:1,1:0|1:57118158_T_A:57118158:0,1,2,0
chr11	57118166	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.408:5:0,1:2,0:0|1:57118158_T_A:57118158:1,2,2,0
chr11	57118466	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=222,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,1:2,1:0|1:57118466_CA_C:57118466:0,6,0,3
chr11	57118472	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=222,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,1:2,1:0|1:57118466_CA_C:57118466:0,6,0,3
chr11	57135663	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,2:0,0,1,4
chr11	57137296	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=204,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:3,2:1,4:4,0,4,3
chr11	57137538	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	57147353	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	57148053	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,6,6
chr11	57157405	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=55,101;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:5,4:5,5:5,5,5,4
chr11	57176628	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=125,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,3:2,4:5,3,4,3
chr11	57176846	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=178,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr11	57184218	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr11	57235302	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=95,24;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:0|1:57235302_G_T:57235302:5,2,1,1
chr11	57235310	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=96,24;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:9,0:1,2:0|1:57235302_G_T:57235302:6,4,1,1
chr11	57243588	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:1,3:0,1,6,2
chr11	57258617	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=95,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:2,3:0,3:2,0,6,0
chr11	57259193	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=196,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:2,3:10,4:6,6,5,2
chr11	57265400	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=211,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,3:1,8:0,3,1,10
chr11	57268170	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr11	57268473	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:4,7,0,2
chr11	57313659	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr11	57320044	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr11	57321811	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=54,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.816:9:1,6:0,1:1,0,8,0
chr11	57321868	.	TAC	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=152,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:5,0:0|1:57321868_TAC_T:57321868:8,4,1,1
chr11	57321873	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=152,54;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:57321868_TAC_T:57321868:8,4,1,1
chr11	57321878	.	CAG	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=150,54;MMQ=60,60;MPOS=-1073741818;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:5,0:0|1:57321868_TAC_T:57321868:9,6,1,1
chr11	57321883	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=150,54;MMQ=60,60;MPOS=-1073741815;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:0|1:57321868_TAC_T:57321868:9,6,1,1
chr11	57365662	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=72,243;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:2,0,0,1
chr11	57367859	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,0:8,3:7,10,0,3
chr11	57413864	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=155,52;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:11,0:18,3:7,22,2,1
chr11	57413943	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=225,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,1:2,5:0,3,2,4
chr11	57414387	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,9,6
chr11	57414586	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=127,127;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.196:34:19,0:7,6:7,21,0,6
chr11	57461419	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=108,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,1:11,1:7,9,0,2
chr11	57461432	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=179,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,0:5,4:2,6,0,4
chr11	57461473	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	57464340	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=128,63;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:9,1:8,8,2,0
chr11	57472185	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=84,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.404:16:6,4:3,2:6,4,1,5
chr11	57479731	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	57504983	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr11	57505520	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=164,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:1,1:1,2:1,8,0,3
chr11	57509429	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr11	57563110	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:11,4:7,0:11,7,4,0
chr11	57563858	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=174,255;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,1:1,0:3,0,2,0
chr11	57798934	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:10,0:9,8:3,16,0,8
chr11	57798942	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=163,229;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.132:20:9,2:9,0:3,15,0,2
chr11	57957960	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=112,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,5:3,2:1,4,6,1
chr11	57958087	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:4,0:8,10:6,6,0,10
chr11	57971406	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,2:9,0:6,18,2,0
chr11	57983162	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=182,211;MMQ=40,48;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:3,3,3,2
chr11	57995330	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=250,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:4,2,2,0
chr11	57996288	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=119,178;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:11,0:10,4:12,9,4,0
chr11	57996312	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,8,9
chr11	58169843	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,491;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	58170738	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,4,5
chr11	58170927	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	58190112	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=119,120;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,3:4,3:3,2,4,2
chr11	58190747	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=190,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr11	58378382	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=262,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:1,0,8,0
chr11	58380192	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=204,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,3:2,0,5,2
chr11	58381686	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=246,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,4:0,5:1,1,8,2
chr11	58478026	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	58478039	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr11	58604806	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=130,164;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:7,2:9,3:8,8,4,1
chr11	58605812	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=178,118;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.305:34:11,0:13,10:14,10,0,10
chr11	58605922	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr11	58607181	.	A	AGCTAATTCAGCAGCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=170,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58607181_A_AGCTAATTCAGCAGCTG:58607181:0,1,0,1
chr11	58607184	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=170,233;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58607181_A_AGCTAATTCAGCAGCTG:58607181:0,1,0,1
chr11	58715285	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=150,267;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:5,2,2,0
chr11	58715513	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=252,191;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,2:2,7:0,2,0,9
chr11	58722992	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=216,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:12,8:4,0:12,4,0,8
chr11	58723224	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:11,1:12,2:9,14,2,1
chr11	58892376	.	CA	C,AA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29,28;MFRL=187,156,222;MMQ=60,60,60;MPOS=1,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.68,4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,3,2:0.192,0.131:17:8,2,0:4,1,2:9,3,3,2
chr11	58919519	.	G	GTAGGGAGGAGTCACAAATA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=144,35;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:5,4,1,1
chr11	58919813	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=186,194;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:5,3:13,0:9,9,1,2
chr11	58962910	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=1299436,259;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0|1:58962910_TA_T:58962910:0,2,0,3
chr11	58962928	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=1299436,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:58962910_TA_T:58962910:0,2,0,1
chr11	58972180	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,1:10,1:9,7,2,0
chr11	58978684	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,2:5,0:7,5,0,2
chr11	59132882	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:1,1,2,1
chr11	59189405	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	59210550	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr11	59210761	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=205,173;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:2,5,0,2
chr11	59210777	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=250,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:9,0:3,2:4,8,1,1
chr11	59224720	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,8,5
chr11	59283021	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=221,11154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,0:8,3:7,11,3,0
chr11	59369401	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr11	59406860	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=158,78;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:0,3:6,4:2,4,3,4
chr11	59420565	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=14,16;MFRL=200,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.289:5:1,0:0,0:0|1:59420565_G_T:59420565:0,4,0,1
chr11	59420569	.	AGT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=200,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.290:5:1,1:2,0:0|1:59420565_G_T:59420565:0,4,0,1
chr11	59423429	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:10,0:10,3:0|1:59423429_C_T:59423429:17,4,3,0
chr11	59423447	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:10,0:12,3:0|1:59423429_C_T:59423429:17,5,3,0
chr11	59423525	.	TAA	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=103,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.574:7:0,0:1,3:2,1,0,4
chr11	59426658	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=231,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,3:7,0:7,3,3,0
chr11	59558128	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=207,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.423:7:1,2:1,1:0,4,0,3
chr11	59575331	.	AGCACAGAC	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:59575331_AGCACAGAC_A:59575331:0,10,0,2
chr11	59575341	.	ACCAGGAT	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=175,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:59575331_AGCACAGAC_A:59575331:0,7,0,2
chr11	59575351	.	AGT	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=209,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:59575331_AGCACAGAC_A:59575331:0,5,0,2
chr11	59603321	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=128,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:9,0:3,2:0|1:59603321_C_T:59603321:6,7,1,1
chr11	59603328	.	C	CTTGGAATTAGGTTCTAAATGGAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=140,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:0|1:59603321_C_T:59603321:6,6,1,1
chr11	59609893	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=233,214;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:10,4:6,0:10,6,4,0
chr11	59623433	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:3,8:4,8:4,3,9,7
chr11	59623553	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=1862940,70;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:59623553_G_GT:59623553:1,1,0,1
chr11	59623554	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=1862940,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:59623553_G_GT:59623553:1,1,0,1
chr11	59623556	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=1862940,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:59623553_G_GT:59623553:1,1,0,1
chr11	59623560	.	G	A,T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28,25;MFRL=0,3725679,70;MMQ=60,60,60;MPOS=9,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.13,4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.254,0.523:2:0,0,1:0,1,0:0,0,1,1
chr11	59626477	.	TA	T,TAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,25,25;MFRL=228,171,126;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.12,8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.334,0.447:6:0,0,1:1,2,2:1,0,5,0
chr11	59829918	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=141,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,0:6,2:8,6,1,1
chr11	59830103	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,5,10
chr11	59834685	.	CTTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	59836986	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=63,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.307:8:4,2:2,0:3,3,2,0
chr11	59837577	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr11	59861484	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=144,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:6,4:13,0:11,8,4,0
chr11	59940396	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0|1:59940396_A_G:59940396:0,0,14,0
chr11	59940400	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,207;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,11:0,4:0|1:59940396_A_G:59940396:0,0,15,1
chr11	59940403	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,11:0,4:0|1:59940396_A_G:59940396:0,0,15,1
chr11	59940407	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0|1:59940396_A_G:59940396:0,0,17,1
chr11	59942815	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=150,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr11	59943109	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,3:3,5:0,3,0,8
chr11	59947252	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,263;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:5,1,0,2
chr11	60073702	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=60.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,5,15
chr11	60105199	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:3,10:3,1:5,2,7,4
chr11	60107290	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=330,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr11	60107356	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=152,52;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:0|1:60107356_G_A:60107356:7,10,1,1
chr11	60107362	.	TTC	T	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=138,52;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:10,2:0|1:60107356_G_A:60107356:5,11,1,1
chr11	60107366	.	A	AGC	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=130,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:11,2:0|1:60107356_G_A:60107356:5,12,1,1
chr11	60107370	.	TG	GC	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=29,20;MFRL=130,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:9,2:0|1:60107356_G_A:60107356:6,11,1,1
chr11	60107374	.	GG	AA	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=129,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:8,2:0|1:60107356_G_A:60107356:5,11,1,1
chr11	60107377	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=128,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,2:6,4:3,8,3,3
chr11	60107470	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr11	60152482	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,36;MFRL=173,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr11	60152531	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=234,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,1:4,1:9,1,2,0
chr11	60152563	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=63,164;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.736:17:3,4:1,8:3,1,7,6
chr11	60157107	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr11	60157166	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=198,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr11	60163958	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	60164204	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=123,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:5,2:1,0:0,6,1,1
chr11	60165352	.	ATT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=192,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,10:3,2:2,2,5,7
chr11	60183221	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=177,93;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:6,0:11,5:9,8,5,0
chr11	60198412	.	T	TATTGTTAAGATAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=243,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.491:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr11	60201232	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=142,225;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,1:9,1:7,7,2,0
chr11	60233490	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=155,121;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:9,0:0|1:60233490_C_A:60233490:8,11,2,0
chr11	60233492	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=155,121;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:9,2:10,0:0|1:60233490_C_A:60233490:8,11,2,0
chr11	60265164	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr11	60268492	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=163,86;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:9,4,2,0
chr11	60268679	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,6,6
chr11	60271325	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=122,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,2:6,5:3,8,3,4
chr11	60274319	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=237,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,0:4,1:0|1:60274319_G_A:60274319:2,7,1,1
chr11	60274321	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=237,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:60274319_G_A:60274319:2,7,1,1
chr11	60274325	.	C	CATGAGATCTGATGA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=237,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:60274319_G_A:60274319:2,7,1,1
chr11	60274393	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	60274640	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:0,6,1,2
chr11	60291504	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=115,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:5,0:0,2:1,4,0,2
chr11	60309947	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,6,4
chr11	60310083	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=113,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,2:1,3:1,5,2,3
chr11	60474500	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=189,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,5:7,0:6,8,5,0
chr11	60540982	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,1:1,1:0,6,1,1
chr11	60558375	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=180,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,3:4,0:5,0,3,0
chr11	60561613	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=205,239;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:1,3,2,2
chr11	60562975	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:4,0,4,1
chr11	60567230	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:5,2,4,0
chr11	60567275	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr11	60609900	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=198,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:7,2:16,0:13,10,2,0
chr11	60617646	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,5:0,13:0,0,14,4
chr11	60617834	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,0,7
chr11	60642325	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=256,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:1,6:3,1:3,1,7,1
chr11	60666116	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:7,2:5,5:4,8,3,4
chr11	60666388	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=153,197;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.214:35:13,6:15,1:11,17,2,5
chr11	60670846	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:7,1,3,0
chr11	60695375	.	A	G,AGCCGGCCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,35,26;MFRL=0,175,127;MMQ=60,60,60;MPOS=21,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=17.84,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,1:0.667,0.222:6:0,1,1:0,4,0:0,0,0,6
chr11	60695379	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:60695379_G_GT:60695379:0,4,0,1
chr11	60695382	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:60695379_G_GT:60695379:0,4,0,1
chr11	60698020	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=205,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:1,0:4,0:0|1:60698020_G_C:60698020:3,3,3,0
chr11	60698024	.	AG	CC	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=24,12;MFRL=173,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:1,0:3,0:0|1:60698020_G_C:60698020:4,3,3,0
chr11	60698029	.	AG	CC	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=25,24;MFRL=173,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:1,1:4,0:0|1:60698020_G_C:60698020:4,3,3,0
chr11	60698034	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=27,13;MFRL=244,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.498:6:1,0:2,1:0|1:60698034_A_C:60698034:1,2,3,0
chr11	60698036	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=244,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:1,0:2,0:0|1:60698034_A_C:60698034:1,2,3,0
chr11	60698054	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr11	60700950	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	60700991	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=228,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.710:11:0,4:2,4:3,0,5,3
chr11	60702924	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=199,244;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.206:17:6,0:5,1:0|1:60702924_T_G:60702924:7,7,0,3
chr11	60702931	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=178,249;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.247:17:3,0:5,1:0|1:60702924_T_G:60702924:6,7,0,4
chr11	60703260	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=84,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:2,1,4,1
chr11	60706864	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=262,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,3:0,5:3,0,8,0
chr11	60774209	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=147,147;MMQ=48,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:10,0:3,3:0,13,0,3
chr11	60775007	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=173,239;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,3:1,1:5,1,2,2
chr11	60776306	.	CG	TC,TG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,31,30;MFRL=184,157,178;MMQ=60,60,60;MPOS=13,9;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=17.76,25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,8,9:0.389,0.444:20:2,1,7:1,5,2:1,2,2,15
chr11	60776334	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=50.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,1,13
chr11	60778513	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,3:3,8:0,4,10,1
chr11	60778638	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=117,0;MMQ=60,56;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:17,0:15,2:17,15,2,0
chr11	60778650	.	C	CGT,CGTGT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,31,30;MFRL=124,93,127;MMQ=60,60,60;MPOS=29,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=GT;STR;TLOD=4.87,5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.394,0.385:9:0,2,0:3,1,2:1,2,2,4
chr11	60783108	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=149,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0|1:60783108_C_T:60783108:4,0,4,0
chr11	60783126	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:60783108_C_T:60783108:0,0,6,2
chr11	60783135	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0|1:60783108_C_T:60783108:0,0,6,2
chr11	60784934	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr11	60785038	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=188,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:0,1,4,3
chr11	60886048	.	T	TCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=171,295;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	60886356	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,12;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.322:10:3,1:4,0:3,4,3,0
chr11	60890563	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=211,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:2,1:0,4,1,4
chr11	60891270	.	CAGG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=200,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:60891270_CAGG_C:60891270:0,1,1,0
chr11	60891275	.	CCA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=200,251;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:60891270_CAGG_C:60891270:0,1,1,0
chr11	60891283	.	AT	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=200,251;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:60891270_CAGG_C:60891270:0,1,1,0
chr11	60893235	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=128,171;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:5,6:5,9:7,3,7,8
chr11	60893322	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:2,2,0,4
chr11	60899411	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.219:24:8,4:11,0:11,8,5,0
chr11	60974895	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=179,260;MMQ=25,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:5,2,1,1
chr11	60997837	.	GC	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,269;MMQ=60,37;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	61045969	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,70;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:3,3,0,2
chr11	61048332	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=189,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:4,5:8,0:8,5,5,0
chr11	61058476	.	AA	CC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=204,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:1,2,1,0
chr11	61058867	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,261;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:15,4:8,3:12,11,6,1
chr11	61067629	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=179,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,0:5,3:8,6,2,1
chr11	61081164	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=192,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,1:7,2:5,8,0,3
chr11	61097450	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=124,105;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,0:6,3:12,4,1,2
chr11	61100308	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr11	61106525	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr11	61108974	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,11,10
chr11	61110169	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,6,9
chr11	61118557	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:5,1:13,2:8,10,2,1
chr11	61123965	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,12,1
chr11	61165731	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=245,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:0|1:61165731_C_CA:61165731:1,0,3,5
chr11	61165741	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=245,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:1,3:0,6:0|1:61165731_C_CA:61165731:1,0,3,6
chr11	61189033	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=121,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.194:29:17,5:7,0:9,15,5,0
chr11	61205434	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=247,258;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr11	61253200	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=147,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr11	61253813	.	C	CTGACATG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=179,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:0|1:61253813_C_CTGACATG:61253813:4,11,1,1
chr11	61253815	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=146,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:9,0:0|1:61253813_C_CTGACATG:61253813:5,12,1,1
chr11	61253817	.	C	CTTTGT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=146,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:11,0:0|1:61253813_C_CTGACATG:61253813:5,12,1,1
chr11	61253973	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=233,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,4:1,3,5,3
chr11	61254376	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr11	61277031	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=216,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,1:0,1:1,0,3,0
chr11	61277698	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=172,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,3:5,1:4,5,4,0
chr11	61277775	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=178,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,2:2,1:4,4,1,2
chr11	61278246	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=221,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:4,0:10,3:8,6,2,1
chr11	61323525	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr11	61490486	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=158,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,0:5,3:2,8,0,3
chr11	61491097	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr11	61505168	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,1:9,1:7,13,0,2
chr11	61505696	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr11	61508074	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=214,102;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:2,3,1,1
chr11	61511133	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=186,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr11	61537648	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr11	61539020	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,0:6,4:4,6,2,2
chr11	61539346	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.299:25:5,7:11,0:10,8,7,0
chr11	61543499	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=139,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,3:2,1:5,3,3,1
chr11	61543961	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=205,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr11	61547237	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=215,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,3:0,3:4,1,6,0
chr11	61548559	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,4,2
chr11	61548874	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=178,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr11	61549025	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=123,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr11	61551927	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=244,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,0:0,3,0,4
chr11	61560081	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=213,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:1,6,0,4
chr11	61563132	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.269:27:11,6:8,0:9,11,7,0
chr11	61569830	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,0:1,3:4,0,3,0
chr11	61570783	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=166,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:3,3:4,5:6,2,5,3
chr11	61571004	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=180,66;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,2:3,0:4,4,0,2
chr11	61624885	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,9:0,2:0,0,7,4
chr11	61641211	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=34622545,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:0,3:0,3:1,0,6,0
chr11	61641396	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=104,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:1,4,0,4
chr11	61644499	.	T	TTCTGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	61645676	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,0:8,4:6,7,0,4
chr11	61645967	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:5,2:8,2:9,4,2,2
chr11	61647427	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=157,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr11	61658629	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=218,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,2:1,6:1,1,4,4
chr11	61670037	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=142,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.677:10:1,4:1,2:0,3,0,7
chr11	61724292	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,3:4,2:10,1,1,4
chr11	61724514	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=200,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,4:0,4:0,2,0,8
chr11	61724787	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=248,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:8,0,2,0
chr11	61725599	.	A	ATCCTCC,ATCCTCCTCC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,30,33;MFRL=162,195,131;MMQ=60,60,60;MPOS=12,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=5,7,8;RU=TCC;STR;TLOD=6.88,11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.293,0.394:9:3,1,2:1,1,1:3,1,5,0
chr11	61725666	.	C	CATTTATTT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=150,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,2:5,0:0|1:61725666_C_CATTTATTT:61725666:8,11,1,1
chr11	61725667	.	G	GTCAA	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=150,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:13,2:6,0:0|1:61725666_C_CATTTATTT:61725666:8,11,1,1
chr11	61725668	.	G	GAGTAA	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=150,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,2:6,0:0|1:61725666_C_CATTTATTT:61725666:8,11,1,1
chr11	61726871	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=210,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr11	61730036	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=113,163;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.496:22:5,4:6,6:7,4,5,6
chr11	61730553	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,1:10,1:8,11,0,2
chr11	61731534	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,15:0,0,14,13
chr11	61732811	.	A	AGTATGAC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTATGAC;STR;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.543:20:7,3:2,6:4,5,8,3
chr11	61896215	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr11	61897197	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	61906299	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr11	61908200	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:11,2:4,0:8,7,0,2
chr11	61914056	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr11	61919509	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=322,259;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:61919509_C_A:61919509:0,1,0,1
chr11	61919515	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=322,259;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:61919509_C_A:61919509:0,1,0,1
chr11	61959725	.	GTC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=352,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.611:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr11	61960763	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=303,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr11	61960809	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=174,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.872:13:1,6:0,6:0,1,5,7
chr11	61960827	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.803:18:2,8:1,7:2,1,6,9
chr11	62037583	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	62105391	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr11	62105441	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=194,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:4,0:2,4,2,1
chr11	62123989	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=221,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,0:2,6:0,4,0,6
chr11	62158924	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=129,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,0:0,4:3,0,4,0
chr11	62159187	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:1,2:0,1:0,1,0,4
chr11	62201458	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=206,257;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,1,2
chr11	62289067	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=172,121;MMQ=52,44;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,2:6,0:0|1:62289067_A_G:62289067:9,9,0,2
chr11	62289070	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=185,121;MMQ=52,44;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,2:4,0:0|1:62289067_A_G:62289067:9,9,0,2
chr11	62289078	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=185,121;MMQ=52,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,2:5,0:0|1:62289067_A_G:62289067:9,9,0,2
chr11	62289082	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=185,121;MMQ=52,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,2:4,0:0|1:62289067_A_G:62289067:8,8,0,2
chr11	62289096	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=180,121;MMQ=52,44;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.159:17:10,2:3,0:0|1:62289067_A_G:62289067:8,7,0,2
chr11	62289322	.	GG	CT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=171,161;MMQ=52,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:10,0:0|1:62289322_GG_CT:62289322:11,7,0,2
chr11	62289325	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=171,161;MMQ=52,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:11,0:0|1:62289322_GG_CT:62289322:11,7,0,2
chr11	62289326	.	A	ATTTTTTTTTTTT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=171,161;MMQ=52,40;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=5,17;RU=T;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,1:10,0:0|1:62289322_GG_CT:62289322:11,7,0,2
chr11	62290876	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,6:6,4:5,3,6,4
chr11	62291837	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:10,1:5,1:8,7,1,1
chr11	62293948	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=250,119;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,7:4,1:2,3,4,4
chr11	62303356	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=152,281;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:62303356_T_C:62303356:0,1,1,0
chr11	62303359	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=152,281;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:62303356_T_C:62303356:0,1,1,0
chr11	62303368	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=174,281;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:62303356_T_C:62303356:1,1,1,0
chr11	62303371	.	GA	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=196,281;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:62303356_T_C:62303356:2,1,1,0
chr11	62344128	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=117,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,3:10,0:9,7,3,0
chr11	62361266	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,1:1,2:6,0,2,1
chr11	62362520	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=169,153;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.278:34:16,3:8,6:13,12,0,9
chr11	62365619	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:1,6,2,5
chr11	62365665	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=186,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:4,3:3,9:5,2,5,7
chr11	62369018	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=195,272;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr11	62369881	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=136,105;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:0|1:62369881_G_A:62369881:4,1,1,2
chr11	62369884	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=144,69;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,2:2,0:0|1:62369881_G_A:62369881:3,1,1,2
chr11	62369905	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=215,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.644:10:3,1:0,1:3,0,0,7
chr11	62370155	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:5,1,3,1
chr11	62371568	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,162;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:14,5,2,0
chr11	62371773	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=273,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr11	62374347	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=133,133;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:62374347_G_A:62374347:1,0,1,0
chr11	62374349	.	TG	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,15;MFRL=133,133;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:62374347_G_A:62374347:1,0,1,0
chr11	62374356	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=133,133;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:62374347_G_A:62374347:1,0,1,0
chr11	62375573	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=197,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:9,0,1,1
chr11	62376665	.	A	ATGTACATGGTAATGGGGCGCCCTC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=237,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.421:5:2,2:1,0:0|1:62376665_A_ATGTACATGGTAATGGGGCGCCCTC:62376665:1,2,1,1
chr11	62376669	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=237,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:1,1:1,0:0|1:62376665_A_ATGTACATGGTAATGGGGCGCCCTC:62376665:1,2,0,1
chr11	62377155	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,237;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:9,1:9,7,1,1
chr11	62380732	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr11	62381703	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,5:4,3:7,0,6,2
chr11	62384869	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,320;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	62394297	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=208,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,4:5,4:8,2,5,3
chr11	62394881	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr11	62397177	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,13:0,4:0,0,5,12
chr11	62400016	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=112,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,4:4,2:4,4,5,1
chr11	62401716	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,15,1
chr11	62437298	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,14:0.417:34:9,14:8,0:0|1:62437298_T_A:62437298:6,14,14,0
chr11	62437304	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,14:0.417:34:10,14:9,0:0|1:62437298_T_A:62437298:6,14,14,0
chr11	62446118	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=209,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,1:0|1:62446118_T_C:62446118:0,11,2,0
chr11	62446122	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,22;MFRL=197,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,1:0|1:62446118_T_C:62446118:0,10,2,0
chr11	62446124	.	CAG	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=212,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,1:6,1:0|1:62446118_T_C:62446118:1,10,2,0
chr11	62455271	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	62459994	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=209,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,7:0,5:1,0,3,9
chr11	62460066	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr11	62476301	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,98;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.099:43:23,0:16,3:17,22,0,4
chr11	62487530	.	T	TCAAC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=265,43;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,2:12,0:0|1:62487530_T_TCAAC:62487530:7,9,1,1
chr11	62487532	.	T	TCGAGGCAAGA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=265,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:3,2:12,0:0|1:62487530_T_TCAAC:62487530:7,9,1,1
chr11	62488916	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=40.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,7:0,4:0,0,2,11
chr11	62489267	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0,0,7,3
chr11	62490160	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,2:9,1:8,11,0,3
chr11	62520308	.	C	CCTCAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=168,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.221:11:3,2:5,0:5,4,1,1
chr11	62521366	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,14;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.615:6:1,0:1,1:0|1:62521366_A_C:62521366:0,2,4,0
chr11	62521372	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,18;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.568:5:1,0:1,1:0|1:62521366_A_C:62521366:0,2,3,0
chr11	62533261	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=151,148;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:1,0:2,3,0,3
chr11	62546491	.	GTTTTT	G,GTTTTTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,13,13;MFRL=0,140,178;MMQ=60,60,35;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,13,19;RU=T;STR;TLOD=3.47,3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.340,0.513:3:0,0,0:0,0,0:0,0,0,3
chr11	62561637	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=209,236;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr11	62563490	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:1,3,1,0
chr11	62571016	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=168,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,0:6,2:6,11,2,0
chr11	62652063	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.881:23:1,13:1,8:0,2,10,11
chr11	62652582	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:9,1,1,1
chr11	62744772	.	G	GCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=179,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:5,2:2,0:0|1:62744772_G_GCA:62744772:1,7,1,1
chr11	62744773	.	G	GCACCCACATCCCAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=179,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:5,2:2,0:0|1:62744772_G_GCA:62744772:1,7,1,1
chr11	62744897	.	C	CTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=176,200;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr11	62744899	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=200,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,1,3
chr11	62747145	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr11	62748956	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=317,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	62751721	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=170,261;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.619:11:1,5:2,2:4,0,3,4
chr11	62751739	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,19;MFRL=234,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:1,0:6,4,2,0
chr11	62751751	.	TC	AA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,15;MFRL=181,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:1,0:0|1:62751751_TC_AA:62751751:5,3,2,0
chr11	62751754	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,10;MFRL=181,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:1,0:0|1:62751751_TC_AA:62751751:5,3,2,0
chr11	62767262	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=123,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:4,2:0,0:0|1:62767262_C_T:62767262:1,4,2,0
chr11	62767268	.	C	CCGTG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=208,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.332:7:5,2:0,0:1|0:62767262_C_T:62767262:2,3,1,1
chr11	62782446	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=145,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:5,7,0,2
chr11	62847352	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=198,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,4:6,1:6,2,4,1
chr11	62847562	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	62848367	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,3,4
chr11	62848995	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=118,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:4,5:0,6:4,0,10,1
chr11	62849111	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,4:7,2:2,9,3,3
chr11	62850684	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=156,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,5:4,4:6,4,9,0
chr11	62886609	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=176,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:4,4,1,1
chr11	62902172	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,8,6
chr11	62911079	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=133,185;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:6,9:2,6:4,4,9,6
chr11	62931484	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=108,276;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:8,5,2,0
chr11	62951064	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	62951312	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=156,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:2,8,1,3
chr11	62984811	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=160,52;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,0:2,2:6,4,2,0
chr11	62995875	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,248;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr11	62996038	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=204,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,3:2,3:1,6,3,3
chr11	62996774	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=269,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,2:7,2:6,3,3,1
chr11	63064782	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:8,1:3,5:8,3,5,1
chr11	63064823	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:2,10:9,3:6,5,6,7
chr11	63064845	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:16,0:7,5:8,15,2,3
chr11	63064970	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=275,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:3,0,2,5
chr11	63065224	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0,9,0,2
chr11	63066903	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=264,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr11	63067138	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=122,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,5:3,1:1,3,0,6
chr11	63069715	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	63069947	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:9,3:4,4:5,8,3,4
chr11	63071595	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=132,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,2:3,2:5,4,1,3
chr11	63071745	.	A	AAGATCTTAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=201,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	63072310	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=181,175;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,1:4,1:6,6,0,2
chr11	63072327	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=183,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,5:2,3:2,3,4,4
chr11	63078478	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=236,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,1,1
chr11	63137769	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,1:7,1:10,7,1,1
chr11	63138525	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=192,98;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr11	63138665	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=141,197;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.268:12:7,0:2,2:4,5,0,3
chr11	63138692	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=156,71;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:2,4,0,2
chr11	63149670	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32,30;MFRL=164,112,166;MMQ=60,60,60;MPOS=18,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,13;RU=A;STR;TLOD=4.81,5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,2:0.199,0.157:16:6,0,0:4,3,2:3,8,4,1
chr11	63176367	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=217,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,3:8,7,1,2
chr11	63177242	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.432:16:5,3:4,4:7,2,5,2
chr11	63258416	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,2:0,9:0,0,9,2
chr11	63277203	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=178,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,0:7,3:11,3,2,1
chr11	63278621	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=167,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:1,6,0,2
chr11	63278681	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=295,244;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr11	63304441	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=155,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.263:25:8,0:8,6:5,14,0,6
chr11	63357919	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr11	63381350	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	63381434	.	T	TGCCC	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=157,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:0|1:63381434_T_TGCCC:63381434:3,0,6,0
chr11	63381437	.	CAG	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=188,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:1,4:2,1:0|1:63381434_T_TGCCC:63381434:5,0,5,0
chr11	63381444	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=28,36;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,2:1,0:0|1:63381434_T_TGCCC:63381434:4,1,4,0
chr11	63381447	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=31,12;MFRL=226,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,0:3,0:0|1:63381434_T_TGCCC:63381434:4,2,3,0
chr11	63381454	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=29,12;MFRL=263,183;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,1:4,0:0|1:63381434_T_TGCCC:63381434:3,2,3,0
chr11	63398495	.	TCAG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=132,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAG;STR;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:6,1,2,1
chr11	63413962	.	AAAAT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=201,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAT;STR;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,6:1,5:1,0,8,3
chr11	63426632	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,294;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,0:4,2:7,5,0,3
chr11	63531175	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=217,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:5,1,1,2
chr11	63663130	.	CTTTTTTTTTTTTTT	C,CTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,35,33;MFRL=0,226,183;MMQ=60,60,60;MPOS=17,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=28,14,16;RU=T;STR;TLOD=6.92,5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.372,0.555:7:0,0,2:0,2,1:0,0,0,7
chr11	63666425	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=170,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,0:8,2:8,1,1,1
chr11	63668311	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:15,4:8,0:9,14,1,3
chr11	63668557	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr11	63669681	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=139,280;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,1:3,1:5,8,2,0
chr11	63673511	.	TTTTTTTATTTC	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=111,0;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:5,1:9,1:17,0,2,0
chr11	63673603	.	CTGTG	C,CTG	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,32,33;MFRL=0,179,150;MMQ=60,60,60;MPOS=31,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=TG;STR;TLOD=9.18,18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,6:0.335,0.604:10:0,1,2:0,3,4:0,0,6,4
chr11	63676313	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr11	63680297	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:0,10:1,6:0,1,8,8
chr11	63681513	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr11	63681648	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=285,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,3:0,6:1,0,4,5
chr11	63682312	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0|1:63682312_G_C:63682312:0,0,3,7
chr11	63682315	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0|1:63682312_G_C:63682312:0,0,3,7
chr11	63682318	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,7:0,2:0|1:63682312_G_C:63682312:0,0,3,7
chr11	63706428	.	CGG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=282,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:63706428_CGG_C:63706428:1,0,1,0
chr11	63706439	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=209,282;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.498:2:1,1:0,0:1|0:63706428_CGG_C:63706428:1,0,1,0
chr11	63706441	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0|1:63706428_CGG_C:63706428:0,0,3,0
chr11	63713239	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr11	63714579	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr11	63719621	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	63720086	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,6,8
chr11	63886066	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=204,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.425:16:3,3:6,4:5,4,3,4
chr11	63886399	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=226,265;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.699:15:2,6:2,5:3,1,2,9
chr11	63964657	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=200,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:2,0,5,1
chr11	63967770	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=175,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,2:0,5:1,1,2,5
chr11	63978067	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=195,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:3,3,3,4
chr11	63987339	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,0:4,7:4,1,5,2
chr11	63990996	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=220,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr11	63994696	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr11	63996700	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=154,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.670:7:1,0:1,1:0|1:63996700_A_C:63996700:1,1,5,0
chr11	63996705	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=154,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.666:7:1,0:1,1:0|1:63996700_A_C:63996700:1,1,5,0
chr11	63999240	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=219,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:3,0,7,0
chr11	63999529	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=226,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr11	64000410	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=181,292;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0,9,0,2
chr11	64003843	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=129,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:2,4:2,1:2,2,0,6
chr11	64004557	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	64004692	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=134,100;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:10,5:9,6:7,13,6,5
chr11	64010085	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:5,11,2,0
chr11	64011441	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,14:0,23:0,0,19,19
chr11	64011554	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=184,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,1:6,3:1,8,0,4
chr11	64011614	.	CTG	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=226,207;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TG;STR;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,2:1,2:1,0,0,4
chr11	64023178	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=150,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:3,0:8,3:0|1:64023178_C_T:64023178:7,4,2,1
chr11	64023180	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:3,0:10,2:0|1:64023178_C_T:64023178:9,6,1,1
chr11	64023184	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:3,0:12,1:0|1:64023178_C_T:64023178:9,6,1,1
chr11	64023752	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=187,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:3,0,5,0
chr11	64024056	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=212,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,2:1,11:0,1,5,8
chr11	64026007	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,1:8,1:6,6,2,0
chr11	64026634	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=173,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,3:6,2:1,6,1,4
chr11	64026639	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=209,181;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:0,3,0,6
chr11	64026685	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=257,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr11	64030944	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=53.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,13,2
chr11	64032494	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=168,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:9,1:2,1:0|1:64032494_CA_C:64032494:0,12,3,0
chr11	64032500	.	CAG	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:9,1:3,2:0|1:64032494_CA_C:64032494:0,13,3,0
chr11	64032505	.	CACTGGATG	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:9,0:3,1:0|1:64032494_CA_C:64032494:0,13,3,0
chr11	64032516	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=174,189;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:6,1:4,2:0|1:64032494_CA_C:64032494:0,11,3,0
chr11	64033555	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=136,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.266:17:6,3:5,1:6,7,3,1
chr11	64044284	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=223,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr11	64051823	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,227;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,1:6,1:5,8,1,1
chr11	64055773	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:8,1,2,0
chr11	64065584	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.357:25:7,2:9,5:7,9,5,4
chr11	64066859	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr11	64070940	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:4,4,2,0
chr11	64082437	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,2:0,0,4,7
chr11	64082807	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=171,263;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr11	64083252	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=11;MBQ=25,31;MFRL=169,151;MMQ=60,49;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,7:0.211:36:10,3:16,4:0|1:64083252_T_C:64083252:20,9,6,1
chr11	64083269	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=32,30;MFRL=162,151;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,6:0.206:32:12,2:14,3:0|1:64083252_T_C:64083252:17,9,5,1
chr11	64083276	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=29,25;MFRL=166,151;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,5:0.187:30:12,2:12,2:0|1:64083252_T_C:64083252:16,9,4,1
chr11	64083290	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=30,30;MFRL=160,182;MMQ=60,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.176:32:12,1:14,2:0|1:64083252_T_C:64083252:15,12,4,1
chr11	64083293	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=30,29;MFRL=160,159;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,6:0.206:32:11,2:15,3:0|1:64083252_T_C:64083252:14,12,3,3
chr11	64083295	.	CGGG	C	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=30,32;MFRL=164,159;MMQ=60,43;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,6:0.189:35:11,2:14,3:0|1:64083252_T_C:64083252:16,13,3,3
chr11	64083300	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=11;MBQ=30,29;MFRL=160,159;MMQ=60,43;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:12,3:14,3:0|1:64083252_T_C:64083252:14,13,3,3
chr11	64083318	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=11;MBQ=30,26;MFRL=173,167;MMQ=60,37;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.158:36:15,2:13,3:0|1:64083252_T_C:64083252:14,17,2,3
chr11	64083320	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=28,33;MFRL=169,167;MMQ=60,37;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.162:35:15,2:12,2:0|1:64083252_T_C:64083252:14,16,2,3
chr11	64083328	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=33,30;MFRL=173,159;MMQ=60,43;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:14,2:11,2:0|1:64083252_T_C:64083252:11,15,1,3
chr11	64083331	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=11;MBQ=30,30;MFRL=181,159;MMQ=60,43;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.152:31:13,2:13,2:0|1:64083252_T_C:64083252:11,16,1,3
chr11	64085074	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,1,15
chr11	64085938	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	64088435	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=104.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,16:0,0,12,17
chr11	64088562	.	TGGAGAGAGTCCTCTGTG	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=167,149;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGAGAGAGTCCTCTGTG;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.246:11:4,1:3,1:5,4,0,2
chr11	64108539	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=221,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,4:6,3:4,5,3,4
chr11	64110932	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=120,251;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:5,1,1,1
chr11	64116824	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:7,2,2,0
chr11	64116843	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr11	64119604	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=156,87;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,2:6,1:6,7,2,1
chr11	64120435	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	64121657	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=206,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr11	64124940	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=111,209;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,3:8,2:5,10,4,1
chr11	64124980	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=192,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,5:3,3:3,4,2,6
chr11	64127881	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr11	64127902	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=158,263;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:8,5,1,1
chr11	64137875	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,2:3,2:2,5,2,2
chr11	64138032	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=169,99;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr11	64138176	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	64138805	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=192,128;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,3:6,3:4,4,2,4
chr11	64326795	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=190,119;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr11	64332862	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr11	64361032	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=160,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:7,1:5,2:7,5,1,2
chr11	64365943	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr11	64387932	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=175,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,5:3,4:0,6,0,9
chr11	64402695	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=181,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,2:6,0:7,3,2,0
chr11	64416173	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=176,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.273:16:8,2:4,2:0|1:64416173_G_A:64416173:8,4,4,0
chr11	64416182	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:24,2:0.107:26:19,0:4,2:1|0:64416173_G_A:64416173:20,4,0,2
chr11	64421249	.	GT	G,GTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,33,32;MFRL=165,127,223;MMQ=60,60,60;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.89,3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.443,0.334:6:1,1,2:0,2,0:1,0,2,3
chr11	64465241	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=145,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:10,0:4,3:6,8,0,3
chr11	64496587	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	64497161	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	64497189	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr11	64503179	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,3:0,7:0,0,3,10
chr11	64503496	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr11	64503543	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr11	64506750	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=180,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr11	64507315	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,1,6
chr11	64507680	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr11	64507799	.	GA	CC,CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27,31;MFRL=0,252,153;MMQ=60,60,60;MPOS=15,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.74,8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.380,0.518:7:0,1,1:0,1,2:0,0,6,1
chr11	64514659	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=133,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,0:6,2:9,3,2,0
chr11	64520942	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr11	64521198	.	C	CGGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=220,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:64521198_C_CGGG:64521198:0,3,0,1
chr11	64521201	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=220,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:64521198_C_CGGG:64521198:0,3,0,1
chr11	64522066	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr11	64525216	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,6,3
chr11	64525464	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr11	64525644	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr11	64533498	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:2,0,0,1
chr11	64534323	.	CCCCACCCCCATCCCA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:4,1:1,0:6,9,1,1
chr11	64534502	.	AGGC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=98,257;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GGC;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,0:3,2:3,7,1,1
chr11	64535357	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr11	64535849	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr11	64536866	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=53.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,6:0,0,8,8
chr11	64537160	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=273,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,5:2,1:1,5,0,6
chr11	64559295	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	64563934	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr11	64565191	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=192,167;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:64565191_T_C:64565191:0,3,0,1
chr11	64565200	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=192,167;MMQ=40,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:64565191_T_C:64565191:0,3,0,1
chr11	64565209	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=192,167;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:64565191_T_C:64565191:0,3,0,1
chr11	64566771	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	64594490	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,8,3
chr11	64597574	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=222,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:0,2:6,2:3,3,2,2
chr11	64598944	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr11	64600900	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	64601933	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=368,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr11	64602757	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:2,1,2,2
chr11	64602782	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=171,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,6:4,1:5,2,4,3
chr11	64604178	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:64604178_T_C:64604178:0,0,2,0
chr11	64604195	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64604178_T_C:64604178:0,0,1,0
chr11	64605689	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	64606765	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr11	64606910	.	C	CCTGCTCCCA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:2,3,1,1
chr11	64607032	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=157,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:2,8,1,1
chr11	64607067	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=167,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr11	64622207	.	CTCCT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=228,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:0|1:64622207_CTCCT_C:64622207:0,7,0,2
chr11	64622214	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=239,201;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:0|1:64622207_CTCCT_C:64622207:0,6,0,2
chr11	64664774	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=185,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr11	64665358	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=213,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:2,8,1,1
chr11	64669417	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	64670671	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr11	64670913	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=196,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,1:6,1:4,4,0,2
chr11	64679362	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=181,331;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,2:7,1:7,8,2,1
chr11	64697950	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=206,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,2:5,2:7,3,2,2
chr11	64702200	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=202,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:4,1,1,1
chr11	64702291	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:9,7,1,1
chr11	64702765	.	C	CTCTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=227,301;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:1,1:1,1,3,0
chr11	64707978	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=137,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:2,2:6,1:6,4,3,0
chr11	64717436	.	CTCCAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=287,244;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	64726701	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=207,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:3,1,3,0
chr11	64757278	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=134,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:17,0:7,3:13,12,0,3
chr11	64781824	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=161,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:0,11,0,2
chr11	64785809	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=195,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:10,0,2,0
chr11	64794918	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,3:5,2:5,0,5,0
chr11	64799789	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=247,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.656:12:0,5:3,3:0,4,5,3
chr11	64799894	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=220,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,5:2,1:2,1,3,3
chr11	64802267	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr11	64807294	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=251,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:0,1,2,5
chr11	64813685	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:2,1:7,2:7,2,2,1
chr11	64815421	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	64820654	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:0,4:6,1:3,3,4,2
chr11	64820996	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=143,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:8,4:7,3:5,10,3,4
chr11	64825012	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=196,246;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,1:0,3,0,2
chr11	64851305	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,246;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:5,0,0,2
chr11	64851453	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=43.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,1:0,12:0,0,8,5
chr11	64863955	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:11,8,0,2
chr11	64863969	.	TG	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=145,254;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:4,0:4,2:8,4,1,2
chr11	64883864	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=186,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:1,0,8,0
chr11	64895914	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:1,0:15,2:8,8,0,2
chr11	64897453	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:1,6:1,4:0,2,2,8
chr11	64898357	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr11	64898739	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=121,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:11,2:12,0:12,11,2,0
chr11	64901141	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=223,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr11	64939498	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0,5,1,2
chr11	64939933	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=130,9393;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:19,0:1,2:13,7,1,1
chr11	64950843	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=342,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:1,2,3,1
chr11	64955369	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=111,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.377:16:5,2:3,3:6,4,4,2
chr11	64972354	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=224,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr11	64977424	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=188,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,6:3,3:0,4,4,5
chr11	64977937	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr11	64985236	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr11	64990911	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,9384035;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:5,7,1,1
chr11	65003812	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr11	65004386	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=250,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,2:0,1:0,1,0,4
chr11	65046984	.	C	CT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.168:28:11,1:12,3:15,9,2,2
chr11	65049278	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=183,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,0:5,3:2,9,0,3
chr11	65056575	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=101,241;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.374:11:4,0:2,1:5,2,0,4
chr11	65111216	.	C	CTTGCA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=193,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:3,0:0|1:65111216_C_CTTGCA:65111216:6,5,0,2
chr11	65111218	.	G	GGATGGGGACATGGCACTCTTGT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=193,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,1:3,0:0|1:65111216_C_CTTGCA:65111216:6,5,0,2
chr11	65123246	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:9,6:6,1:13,2,7,0
chr11	65147294	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=92,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:0,4:3,6:2,1,9,1
chr11	65161401	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,9:3,0:4,1,10,0
chr11	65178620	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,11,1
chr11	65304124	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=169,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.394:15:7,0:2,4:5,4,2,4
chr11	65320780	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr11	65347297	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=262,201;MMQ=54,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.518:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr11	65349063	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,229;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:4,1:5,4:4,5,3,3
chr11	65349146	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=116,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:7,5:2,5:4,6,7,3
chr11	65352062	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=226,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:2,2:2,4:1,3,1,5
chr11	65357697	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=141,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,4:5,0:2,8,0,4
chr11	65359625	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr11	65363275	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=241,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,5:1,3:0,2,1,7
chr11	65366847	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:2,0,5,2
chr11	65367253	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr11	65373621	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr11	65383755	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=210,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr11	65383866	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:9,6,0,2
chr11	65383896	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,3,8
chr11	65385449	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=112,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:11,2:15,0:12,14,2,0
chr11	65386533	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=204,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	65389631	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr11	65393467	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:9,6,1,1
chr11	65394322	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=151,241;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:6,0,5,0
chr11	65397990	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=192,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:65397990_AG_A:65397990:9,4,0,2
chr11	65397994	.	CTAT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=192,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:7,2:0|1:65397990_AG_A:65397990:10,5,0,2
chr11	65404381	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:5,5,1,1
chr11	65414291	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:0,0:1,1:0,1,1,1
chr11	65423082	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr11	65426316	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:6,0:6,6:0|1:65426316_G_T:65426316:3,10,0,6
chr11	65426318	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:6,0:6,6:0|1:65426316_G_T:65426316:3,10,0,6
chr11	65480596	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=299,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,6:0,3:0,1,0,9
chr11	65480791	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,10,1
chr11	65480824	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,0:8,3:9,3,3,0
chr11	65481166	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=78.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,13,10
chr11	65484116	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:6,1,0,2
chr11	65487613	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=142,75;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.205:37:14,0:15,7:21,9,1,6
chr11	65547236	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=170,202;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:9,0:3,3:7,5,0,3
chr11	65562229	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=183,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:1,6,0,2
chr11	65562796	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:2,7,0,2
chr11	65601644	.	GGTGGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.481:9:3,1:1,3:1,4,0,4
chr11	65617012	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:10,2:4,0:5,9,1,1
chr11	65617113	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr11	65618053	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,2:5,1:5,6,2,1
chr11	65623347	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:4,1,6,2
chr11	65623739	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.294:22:8,0:7,6:5,11,1,5
chr11	65630698	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=211,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.695:13:2,6:0,3:0,4,4,5
chr11	65631167	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,167;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.665:25:3,11:5,5:1,7,9,8
chr11	65631879	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:0|1:65631879_C_A:65631879:2,0,5,0
chr11	65631881	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:0|1:65631879_C_A:65631879:2,0,5,0
chr11	65631973	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,165;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,4:4,6:6,3,7,3
chr11	65633298	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=160,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,3:14,0:13,15,1,2
chr11	65635559	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=217,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,3:2,5:0,6,3,5
chr11	65637273	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=191,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,2:1,3:2,0,6,0
chr11	65637984	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,9,8
chr11	65639374	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=140,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:3,1,5,0
chr11	65647260	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=175,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:0,1,4,0
chr11	65647689	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,3:15,0:14,12,3,0
chr11	65649984	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=187,191;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.648:18:5,2:1,9:4,2,6,6
chr11	65651830	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=247,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:2,7:1,6:3,0,9,4
chr11	65655259	.	G	GCC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=236,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:3,3,4,2
chr11	65655393	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:7,4:7,3:8,6,2,5
chr11	65684855	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,12,0
chr11	65732651	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=205,166;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,1:7,3:7,4,2,2
chr11	65732800	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=188,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:5,1:4,4:6,4,1,4
chr11	65733289	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:2,1:2,5,0,2
chr11	65733393	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=94,187;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:2,3:4,15:1,5,7,11
chr11	65744275	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr11	65744421	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=238,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,5:0,0:1,0,4,1
chr11	65744597	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=141,300;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.408:5:2,0:1,1:0,3,0,2
chr11	65767153	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,3,13
chr11	65767215	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr11	65770658	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr11	65770907	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,1:5,0:6,6,0,4
chr11	65771050	.	TCACTGAG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=195,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CACTGAG;STR;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.402:13:2,3:3,2:5,3,2,3
chr11	65780702	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr11	65810239	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	65811208	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=227,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,2:2,1:0,8,0,3
chr11	65825455	.	AAAG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=230,181;MMQ=40,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,4:2,1:2,1,5,0
chr11	65825650	.	CCA	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=228,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:65825650_CCA_C:65825650:2,6,0,2
chr11	65825655	.	GAAC	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=230,89;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:5,0:0|1:65825650_CCA_C:65825650:3,6,0,2
chr11	65825659	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=230,89;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:0|1:65825650_CCA_C:65825650:3,6,0,2
chr11	65983522	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr11	66001418	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=189,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:1,5:2,7:2,2,6,6
chr11	66002681	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr11	66010633	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=74.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,16,5
chr11	66029130	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	66031450	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,5:0,10:0,0,9,9
chr11	66033301	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=167,236;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,1:4,1:4,7,1,1
chr11	66033670	.	AG	CC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,19;MFRL=175,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.200:19:5,0:10,2:0|1:66033670_AG_CC:66033670:0,15,4,0
chr11	66033673	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=175,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.201:19:5,0:10,0:0|1:66033670_AG_CC:66033670:0,15,4,0
chr11	66039392	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=205,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,3:7,1:3,7,2,2
chr11	66043253	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=156,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:4,0,4,2
chr11	66043695	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:4,6,1,1
chr11	66043767	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=189,86;MMQ=60,58;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr11	66045948	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=133,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,2:7,5:5,7,2,5
chr11	66050712	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=174,271;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:9,4:11,3:11,9,1,6
chr11	66050948	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,13,2
chr11	66051140	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=196,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,2:6,0:0,12,0,2
chr11	66052231	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=198,211;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,0:6,5:2,10,0,5
chr11	66052329	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=148,63;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:1,1:8,1:8,1,1,1
chr11	66052832	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=216,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,3:6,4:5,4,6,1
chr11	66062319	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=255,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr11	66063126	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=251,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:1,2:0,5,0,3
chr11	66100695	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=213,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr11	66101974	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.752:10:1,5:1,2:0|1:66101974_C_T:66101974:1,1,5,3
chr11	66101978	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=158,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:0|1:66101974_C_T:66101974:5,2,2,2
chr11	66102088	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=267,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,2:1,1:1,6,1,2
chr11	66102557	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=156,196;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:4,9,2,0
chr11	66102807	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr11	66103046	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,1:0,7:0,0,5,5
chr11	66107527	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=117,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:5,1,2,0
chr11	66108660	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=205,287;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,3:7,2:5,7,2,3
chr11	66108894	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:0,3:2,7:1,1,6,4
chr11	66109527	.	CTG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=104,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:2,2:0,3:2,0,3,2
chr11	66109779	.	AT	GA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	66131906	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr11	66133311	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr11	66134085	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=163,101;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr11	66135207	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=167,228;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:66135207_T_A:66135207:3,1,0,1
chr11	66135212	.	G	GATCTGCTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=167,228;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:66135207_T_A:66135207:3,1,0,1
chr11	66138894	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=50.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,3,10
chr11	66190745	.	AA	CC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=143,57;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:66190745_AA_CC:66190745:0,5,1,1
chr11	66190750	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=186,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:5,2:0|1:66190745_AA_CC:66190745:0,7,1,1
chr11	66190752	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=186,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:66190745_AA_CC:66190745:0,7,1,1
chr11	66190753	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=186,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:66190745_AA_CC:66190745:0,7,1,1
chr11	66190756	.	G	GGTGCAGC	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=193,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,1:0|1:66190745_AA_CC:66190745:0,6,1,1
chr11	66203661	.	G	GAGCACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	66243372	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=203,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,0:2,2:1,4,2,0
chr11	66259110	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,10;MFRL=171,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.509:2:0,0:1,0:0|1:66259110_C_A:66259110:0,1,1,0
chr11	66259112	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=171,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.508:2:0,0:1,0:0|1:66259110_C_A:66259110:0,1,1,0
chr11	66259117	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=158,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.403:3:0,0:2,1:0|1:66259110_C_A:66259110:0,2,1,0
chr11	66262606	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=128,337;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,0:3,4:4,1,4,0
chr11	66262806	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=48.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,6,7
chr11	66276802	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=16,31;MFRL=329,241;MMQ=52,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,1:0|1:66276802_T_G:66276802:0,3,0,1
chr11	66276807	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,13;MFRL=329,227;MMQ=52,58;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.408:5:3,0:0,0:0|1:66276802_T_G:66276802:0,3,0,2
chr11	66276813	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=329,227;MMQ=52,58;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.408:5:3,0:0,0:0|1:66276802_T_G:66276802:0,3,0,2
chr11	66278059	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr11	66282973	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,3:5,0:6,2,3,0
chr11	66288733	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,249;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:4,6,1,1
chr11	66293631	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=153,67;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:10,0:10,12,1,1
chr11	66298594	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=216,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr11	66318972	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=236,232;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,2:0,3:3,1,3,2
chr11	66321967	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=202,166;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:3,1:4,3,2,0
chr11	66324515	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,14;MFRL=249,185;MMQ=50,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:0,0:0|1:66324515_A_C:66324515:2,0,1,0
chr11	66324519	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=23,31;MFRL=249,185;MMQ=50,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:66324515_A_C:66324515:2,0,1,0
chr11	66324522	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,13;MFRL=249,185;MMQ=50,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:66324515_A_C:66324515:2,0,1,0
chr11	66324534	.	GCTCT	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=36,35;MFRL=113,185;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:0,0:0|1:66324534_GCTCT_G:66324534:1,1,1,0
chr11	66324547	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,15;MFRL=113,185;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:66324534_GCTCT_G:66324534:1,1,1,0
chr11	66324551	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=33,16;MFRL=76,185;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:66324534_GCTCT_G:66324534:3,1,1,0
chr11	66324555	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,10;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:66324534_GCTCT_G:66324534:2,1,1,0
chr11	66324583	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr11	66324762	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	66328877	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=201,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,5:4,4:1,4,4,5
chr11	66332174	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=178,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,2:7,1:4,9,2,1
chr11	66366867	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=169,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:6,1,0,2
chr11	66391392	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=164,42;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:8,0:7,2:7,8,1,1
chr11	66393051	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=160,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,3:6,0:9,6,2,1
chr11	66411626	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.252:18:6,1:5,2:10,4,0,4
chr11	66455246	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=257,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.408:5:3,1:0,0:0|1:66455246_A_C:66455246:1,2,2,0
chr11	66455251	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=257,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.408:5:3,0:0,0:0|1:66455246_A_C:66455246:1,2,2,0
chr11	66455518	.	GCT	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=171,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:66455518_GCT_G:66455518:4,5,0,2
chr11	66455526	.	GGA	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=165,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:66455518_GCT_G:66455518:4,4,0,2
chr11	66455530	.	G	GTGTGTGT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=165,117;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:66455518_GCT_G:66455518:4,4,0,2
chr11	66458676	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=241,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,1,1
chr11	66458696	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=192,288;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:4,1:4,2,2,0
chr11	66461846	.	C	CCCGTCACCTCCTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,19;MFRL=202,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,0:2,4,1,1
chr11	66469032	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:0,6:3,7:1,2,5,8
chr11	66472274	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr11	66481264	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=187,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr11	66512290	.	GGGC	G,GGGCGGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32,31;MFRL=141,152,196;MMQ=60,60,60;MPOS=20,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=GGC;STR;TLOD=6.12,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.336,0.258:5:0,1,0:2,1,1:2,0,3,0
chr11	66516041	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=142,197;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr11	66583759	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=198,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr11	66595649	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=210,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr11	66610831	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66610831_G_C:66610831:0,0,0,1
chr11	66610833	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66610831_G_C:66610831:0,0,0,1
chr11	66613357	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,281;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,0:8,3:8,7,3,0
chr11	66618064	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=223,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:66618064_C_T:66618064:1,1,0,1
chr11	66618069	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,31;MFRL=263,230;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:66618064_C_T:66618064:1,0,0,1
chr11	66618100	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=202,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:66618100_T_A:66618100:2,0,0,1
chr11	66618102	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=202,230;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:66618100_T_A:66618100:2,0,0,1
chr11	66618403	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=219,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:1,2:1,0:0,2,2,1
chr11	66620890	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=168,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:1,2,0,1
chr11	66813399	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr11	66998978	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=174,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:11,2,3,0
chr11	67034234	.	GCCAC	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=143,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.274:9:3,2:3,0:0|1:67034234_GCCAC_G:67034234:4,3,1,1
chr11	67034241	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=143,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0|1:67034234_GCCAC_G:67034234:1,2,1,1
chr11	67034266	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr11	67052466	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,2:0,12:0,0,5,10
chr11	67067298	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,1:6,1:8,3,1,1
chr11	67076810	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr11	67079459	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=117,21253115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:5,1:3,1:2,7,0,2
chr11	67166105	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=110,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,0:11,2:8,8,1,1
chr11	67174211	.	TGAG	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=173,155;MMQ=60,52;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:4,0:2,0:0|1:67174211_TGAG_T:67174211:4,5,0,2
chr11	67174215	.	T	TTTGG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,15;MFRL=170,155;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:4,0:3,0:0|1:67174211_TGAG_T:67174211:4,3,0,2
chr11	67174219	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=172,155;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:3,0:1,0:0|1:67174211_TGAG_T:67174211:4,2,0,2
chr11	67176380	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,2:5,3:8,0,5,0
chr11	67191676	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,2:8,0:9,11,1,1
chr11	67195986	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=154,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:6,0,4,0
chr11	67196544	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=14,33;MFRL=91,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,22:0.910:24:0,15:1,6:1,1,19,3
chr11	67202044	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=235,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,5:1,3:0,3,5,3
chr11	67205978	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:1,7:0,7:1,0,5,10
chr11	67207426	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=314,239;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:0,2,0,4
chr11	67210133	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=187,201;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,0:5,4:1,8,0,6
chr11	67220223	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=167,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.139:19:11,1:6,1:3,14,0,2
chr11	67223920	.	CA	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=254,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,6:2,1:0,2,1,6
chr11	67224956	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:4,0:0,2:3,1,2,0
chr11	67224988	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=198,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,6:1,3:0,2,7,2
chr11	67234910	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:3,1:4,6:7,1,7,0
chr11	67262282	.	C	CGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr11	67262289	.	G	GCGAGAGGA,GCGAGTGGA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32,32;MFRL=0,189,159;MMQ=60,60,60;MPOS=4,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.52,7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,3:0.509,0.404:7:0,1,1:0,3,1:0,0,7,0
chr11	67264679	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=210,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.843:17:1,9:1,6:1,1,8,7
chr11	67265503	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:6,3,0,2
chr11	67267345	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:11,3:9,0:12,8,3,0
chr11	67286713	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,18;MFRL=133,102;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:6,1:3,0:0|1:67286713_C_G:67286713:4,6,0,2
chr11	67286717	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=133,102;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:2,0:0|1:67286713_C_G:67286713:5,5,0,2
chr11	67286725	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=136,203;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.403:12:2,0:3,0:3,4,0,5
chr11	67288453	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=124,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,1:5,1:6,5,2,0
chr11	67289326	.	A	AGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=190,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:67289326_A_AGG:67289326:2,0,1,0
chr11	67289332	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=12,12;MFRL=190,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:0,0:0|1:67289326_A_AGG:67289326:2,0,1,0
chr11	67289334	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=303,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.612:3:0,0:0,0:0|1:67289334_A_C:67289334:0,1,2,0
chr11	67289337	.	CGATG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=221,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:1,2:1,0:0|1:67289334_A_C:67289334:1,1,2,0
chr11	67351531	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=313,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr11	67351540	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr11	67352256	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=223,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:1,9:0,9:0,1,8,10
chr11	67353844	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=130,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,5:2,3:3,2,6,2
chr11	67374581	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=221,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,5:1,1:1,1,0,6
chr11	67395714	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:1,5:0,4:1,0,7,2
chr11	67399735	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,4,3
chr11	67401635	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=198,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr11	67406829	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:7,1,2,0
chr11	67406864	.	T	TGC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,0:2,2:0|1:67406864_T_TGC:67406864:0,3,2,0
chr11	67406868	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,0;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,0:0|1:67406864_T_TGC:67406864:0,3,2,0
chr11	67412179	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,15;MFRL=214,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:67412179_T_A:67412179:4,0,1,0
chr11	67412184	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=214,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:67412179_T_A:67412179:4,0,1,0
chr11	67430589	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	67430762	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=128,178;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,3:2,6:3,4,6,3
chr11	67431038	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=234,239;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,2:2,6:3,0,4,4
chr11	67431110	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=73,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,2:1,2:0,2,3,1
chr11	67433708	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=209,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:1,2,2,4
chr11	67433758	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:3,2,1,1
chr11	67763047	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=0,205;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=C;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr11	67763224	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=239,178;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,1,1
chr11	67764105	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=168,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:3,1:7,3:5,5,1,3
chr11	67765163	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	67782947	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=162,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:2,3:6,1:5,3,1,3
chr11	67786064	.	A	AC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr11	67786398	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr11	67786764	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr11	67789293	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=54.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,6,9
chr11	67790006	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	67790278	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=181,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,2:3,0:0,4,0,3
chr11	67793448	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:3,3:6,0,2,1
chr11	67795378	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr11	67799731	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,9,11
chr11	67800494	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,10,7
chr11	67804074	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=173,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:2,4,0,2
chr11	67804156	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr11	67808938	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=189,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr11	67810341	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.274:13:4,1:3,2:8,2,2,1
chr11	67811262	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=212,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:3,2:3,3:5,1,3,2
chr11	67817578	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=171,210;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:3,8,1,1
chr11	67817876	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=207,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,1:3,1:8,2,2,0
chr11	67837771	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=226,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:6,1:0,2:2,4,0,3
chr11	67938848	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=214,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,1:2,1:2,4,0,2
chr11	67947097	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=237,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.568:7:1,1:0,1:0,3,0,4
chr11	67957518	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0,0,6,12
chr11	68131167	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,1:0,0,7,2
chr11	68133035	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=152,160;MMQ=60,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,1:2,1:8,0,1,1
chr11	68177318	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr11	68177708	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=213,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr11	68179166	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=168,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,2:0,1:0,1,0,3
chr11	68326165	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,0:3,2:0,7,1,1
chr11	68331715	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr11	68358209	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=198,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.220:21:10,4:4,0:4,13,4,0
chr11	68370770	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=142,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,1:4,1:12,1,1,1
chr11	68456244	.	TAGGG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=217,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr11	68456410	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,6:2,2:0,2,3,5
chr11	68476011	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr11	68522418	.	CATCCA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=210,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,0:0,1:0|1:68522418_CATCCA_C:68522418:0,1,0,1
chr11	68522427	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=210,85;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:68522418_CATCCA_C:68522418:0,1,0,1
chr11	68527600	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=192,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,1:3,1:4,0,2,1
chr11	68529072	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=152,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,0:7,3:10,6,2,1
chr11	68529172	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=207,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:3,10,2,0
chr11	68530318	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	68548260	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	68552549	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,0:0,3,0,2
chr11	68566647	.	GAAA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=A;STR;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,2:0|1:68566647_GAAA_G:68566647:0,0,2,3
chr11	68566651	.	A	ACGCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,2:0|1:68566647_GAAA_G:68566647:0,0,2,3
chr11	68566839	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr11	68583007	.	AA	TC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=239,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr11	68675930	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=256,282;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,2,2
chr11	68682402	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,6:7,4:3,7,3,7
chr11	68700701	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,3:2,1:4,0,5,0
chr11	68705876	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=214,212;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr11	68706935	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=236,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,0:0,4:2,0,3,1
chr11	68747421	.	AGGCAGCTCAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=198,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:2,0:2,1,2,0
chr11	68747529	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=178,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,0:2,3:3,2,2,1
chr11	68816370	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	68821648	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=223,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr11	68825037	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr11	68830295	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=155,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr11	68831293	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr11	68834968	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr11	68837794	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=99,314;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr11	68838028	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:2,1,0,2
chr11	68840014	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=253,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr11	68845867	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=248,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr11	68846098	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,11:0,0,11,10
chr11	68846519	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr11	68847247	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=181,70;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,1:6,3,2,0
chr11	68855233	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=207,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,5:1,1:2,0,6,0
chr11	69063454	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:8,4:10,6:9,9,5,5
chr11	69063476	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=171,173;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:4,8:9,5:8,7,6,7
chr11	69063728	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,237;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.200:33:20,2:7,4:15,12,1,5
chr11	69458676	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=169,65;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:11,2:0|1:69458676_T_C:69458676:13,8,1,1
chr11	69458680	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=188,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:11,2:0|1:69458676_T_C:69458676:13,8,1,1
chr11	69458685	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=179,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:0|1:69458676_T_C:69458676:12,8,1,1
chr11	69458691	.	C	CAACCTTTGCATACT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=169,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:0|1:69458676_T_C:69458676:11,9,1,1
chr11	69462856	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=218,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:1,6:5,5:3,4,4,7
chr11	69466115	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	69588020	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=185,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,4:1,6:2,0,9,1
chr11	69588729	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=128,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr11	69625385	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,224;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,5:6,4:10,2,1,8
chr11	69625511	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=105,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,6:1,5:0,1,1,10
chr11	69924917	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=213,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr11	69949135	.	GCC	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=C;STR;TLOD=68.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.956:21:1,8:0,12:0,1,14,6
chr11	69949327	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,4:0,5:0,2,3,6
chr11	69951994	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=214,217;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr11	69954412	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,10,5
chr11	69957940	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:0,1,2,8
chr11	69962642	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:2,1,0,2
chr11	69970412	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=145,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,3:4,5:5,5,4,4
chr11	69970637	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr11	69972311	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=111,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.202:13:5,0:4,0:0|1:69972311_A_C:69972311:1,10,2,0
chr11	69972313	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=117,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:6,0:4,0:0|1:69972311_A_C:69972311:1,11,2,0
chr11	69972316	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=117,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:7,0:4,0:0|1:69972311_A_C:69972311:1,11,2,0
chr11	69972322	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=125,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:8,2:3,0:0|1:69972311_A_C:69972311:0,12,2,0
chr11	69995755	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=195,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr11	69998632	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=120,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:9,0:17,2:5,21,1,1
chr11	69998645	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=145,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:6,2:0|1:69998645_T_TA:69998645:2,10,1,1
chr11	69998646	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=145,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:6,2:0|1:69998645_T_TA:69998645:2,10,1,1
chr11	69998647	.	T	TATTTA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=145,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,1:0|1:69998645_T_TA:69998645:2,8,1,1
chr11	69999122	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=287,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.852:11:0,3:1,7:0,1,10,0
chr11	69999252	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,6,7
chr11	70001976	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr11	70002012	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=140,191;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:2,3,1,2
chr11	70002058	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=140,68;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:13,6:7,0:10,10,5,1
chr11	70002185	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr11	70002987	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,3:0,3:1,1,3,3
chr11	70007484	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=309,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:2,1,1,4
chr11	70007865	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr11	70013508	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=216,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:1,2,1,0
chr11	70026000	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	70033826	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,17;MFRL=164,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.373:8:2,0:2,1:4,1,2,1
chr11	70049523	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=130,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,5:2,0:5,0,5,0
chr11	70118251	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.622:14:0,2:5,6:3,2,7,2
chr11	70171187	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=200,70;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr11	70171567	.	TAC	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=143,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:8,1:6,2:10,5,1,2
chr11	70172975	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=203,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr11	70179672	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=154,80;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:4,7:1,6:3,2,4,9
chr11	70183385	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.343:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr11	70190019	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=166,310;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:2,6,0,2
chr11	70194621	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,36;MFRL=176,286;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:1,0:0,1:0|1:70194621_T_C:70194621:0,2,0,1
chr11	70194624	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:70194621_T_C:70194621:0,0,0,2
chr11	70200594	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr11	70208311	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=204,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,3:3,5:5,3,4,4
chr11	70208350	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=67.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,14,7
chr11	70218548	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=213,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:4,4:8,1:6,6,3,2
chr11	70221204	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,1:3,3:2,7,3,1
chr11	70222604	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=131,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:10,3:4,2:9,5,2,3
chr11	70253389	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=141,273;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:16,4:6,4:11,11,6,2
chr11	70253586	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=189,236;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=53.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:4,6:1,10:2,3,7,9
chr11	70260598	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=235,245;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:4,0,5,0
chr11	70260609	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=235,214;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:4,0,6,0
chr11	70269159	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:6,4,0,2
chr11	70279927	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=185,271;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr11	70349061	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr11	70507761	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,2:14,0:9,15,0,2
chr11	70653296	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=253,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,0:4,2:2,3,0,2
chr11	70805808	.	AA	CC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70805808_AA_CC:70805808:0,0,0,1
chr11	70805811	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70805808_AA_CC:70805808:0,0,0,1
chr11	70829858	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=333,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr11	71146952	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	71149069	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	71149856	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr11	71152258	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,4:5,1:5,3,3,2
chr11	71153459	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=105,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:1,1,0,5
chr11	71164471	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=173,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.750:26:3,14:3,6:1,5,5,15
chr11	71166060	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=364,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr11	71169648	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=230,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr11	71174452	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=242,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,3:3,6:5,0,6,3
chr11	71174553	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:4,3,0,3
chr11	71174589	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr11	71183645	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	71184498	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=189,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,1:7,2:8,3,0,3
chr11	71185479	.	TG	CA,CG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34,29;MFRL=0,202,155;MMQ=60,60,60;MPOS=11,17;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.55,27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,9:0.185,0.749:11:0,1,4:0,1,5:0,0,8,3
chr11	71192313	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=180,231;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,2:4,1:8,2,3,0
chr11	71192366	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=180,258;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:10,1:7,2:10,8,1,2
chr11	71192529	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=17,22;MFRL=124,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.618:8:1,1:0,2:2,1,0,5
chr11	71196757	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=205,341;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:8,2:2,1:0,10,1,2
chr11	71203044	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=186,230;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:71203044_AC_A:71203044:1,5,0,2
chr11	71203046	.	A	ACTGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=186,230;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,2:0|1:71203044_AC_A:71203044:1,5,0,2
chr11	71302658	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=282,179;MMQ=27,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,2:0,1,1,5
chr11	71302685	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=282,185;MMQ=27,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:71302685_G_C:71302685:0,1,0,3
chr11	71302700	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=282,214;MMQ=27,37;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:71302685_G_C:71302685:0,1,0,2
chr11	71304932	.	TTCG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=224,178;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr11	71507311	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=178,162;MMQ=49,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,1,1
chr11	71510516	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,12;MFRL=166,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.326:10:1,0:2,0:6,1,3,0
chr11	71668362	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=64.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,17:0,5:0,0,4,18
chr11	71712175	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr11	71714526	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=120.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,12:0,15:0|1:71714526_G_C:71714526:0,0,18,10
chr11	71714528	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,12:0,16:0|1:71714526_G_C:71714526:0,0,19,10
chr11	71715215	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0|1:71715215_C_G:71715215:0,0,7,5
chr11	71715218	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0|1:71715215_C_G:71715215:0,0,6,5
chr11	71724123	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=203,282;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,1:8,2:7,7,1,2
chr11	71727422	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,7,7
chr11	71728908	.	AGTCAAC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr11	71729656	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,283;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr11	71730715	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr11	71733519	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr11	71734211	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr11	71740378	.	A	AAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	71806029	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,5:7,2:6,9,5,2
chr11	71806492	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=117,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.205:27:9,2:13,3:15,7,4,1
chr11	71809438	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:13,11,0,2
chr11	71850360	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=163,164;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=65.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,22:0.622:35:6,22:7,0:9,4,22,0
chr11	71850734	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=182,102;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,2:7,0:8,4,0,2
chr11	71906794	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=131,70;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,2:4,0:4,5,1,1
chr11	71907116	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=143,158;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:9,1,0,2
chr11	71932120	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr11	71932414	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:2,1:4,1:3,3,2,1
chr11	71941033	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=124,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:5,1:12,2:7,10,1,2
chr11	71941381	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=122,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.749:18:2,7:2,6:2,2,8,6
chr11	71941812	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=162,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,2:6,2:8,3,3,1
chr11	71946985	.	CAG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:4,1:5,1:0,10,2,0
chr11	72005011	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=188,151;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:2,7:6,0:7,2,7,0
chr11	72005335	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,13;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:2,0:0,0:0|1:72005335_A_T:72005335:1,2,2,0
chr11	72005336	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:2,1:1,1:0|1:72005335_A_T:72005335:1,2,2,0
chr11	72005340	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:2,0:0,0:0|1:72005335_A_T:72005335:1,2,2,0
chr11	72005346	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.376:6:2,1:1,0:0|1:72005335_A_T:72005335:2,2,2,0
chr11	72018193	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=208,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,2:11,0:16,5,2,0
chr11	72288725	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	72289176	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	72291688	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:6,4,2,0
chr11	72291883	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr11	72292353	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=35.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr11	72292860	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr11	72293039	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr11	72293079	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	72295203	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=236,232;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.609:3:0,1:1,0:0|1:72295203_G_C:72295203:1,0,2,0
chr11	72295209	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=236,232;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:72295203_G_C:72295203:1,0,2,0
chr11	72295211	.	TC	GA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,19;MFRL=230,285;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:72295203_G_C:72295203:2,0,1,0
chr11	72295502	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,11,7
chr11	72296039	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=225,227;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:2,7,1,3
chr11	72296069	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=225,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr11	72296353	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=199,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:6,2,6,0
chr11	72296700	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr11	72297152	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,118;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:13,3:8,0:10,11,3,0
chr11	72301050	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=176,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,1:10,1:5,11,2,0
chr11	72308511	.	TCCCTGC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCCTGC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr11	72326075	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,12:0.267:46:7,11:25,0:25,9,12,0
chr11	72326210	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=161,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,5:4,0:1,7,2,3
chr11	72396800	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=197,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:2,2,1,2
chr11	72396990	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=191,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,1,1
chr11	72399451	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=110,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,3:1,1:3,1,3,1
chr11	72399607	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,4:2,1:2,3,2,3
chr11	72403916	.	T	TTGCAGGGAGAAGTAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	72407734	.	C	CGCATCAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=194,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr11	72407977	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	72409189	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=95,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,2:1,5:1,4,2,5
chr11	72414189	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=216,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr11	72414214	.	G	GGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=216,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0|1:72414214_G_GGT:72414214:0,3,0,1
chr11	72414217	.	G	GCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=216,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:72414214_G_GGT:72414214:0,3,0,1
chr11	72422612	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=197,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.332:4:1,1:2,0:0|1:72422612_C_G:72422612:0,3,0,1
chr11	72422614	.	CTCAGAAG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=197,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:72422612_C_G:72422612:0,3,0,1
chr11	72528973	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	72536544	.	T	TGACCTTGTGGTCTGCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	72538141	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr11	72554407	.	A	AGGG	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=177,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:7,3:10,7:7,10,6,4
chr11	72560904	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=162,96;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:10,0:6,6:8,8,0,6
chr11	72947338	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=189,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.580:29:8,0:4,16:6,6,0,17
chr11	73009575	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=155,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	73009580	.	A	T,C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,31,31;MFRL=208,155,203;MMQ=60,40,60;MPOS=21,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:2,0,1:0,1,0:0,2,0,2
chr11	73009582	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=234,155;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0|1:73009582_G_A:73009582:0,4,0,1
chr11	73009584	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=203,155;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:73009582_G_A:73009582:0,3,0,1
chr11	73009585	.	G	GATCACGAGGTCAGGA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=226,151;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.384:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr11	73009588	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=21,32;MFRL=297,155;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:1,0:0,1:0|1:73009582_G_A:73009582:0,3,0,1
chr11	73020375	.	G	GCTC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CTC;STR;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr11	73022572	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,3:5,0:6,10,1,2
chr11	73066771	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=201,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:2,3,0,2
chr11	73073846	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr11	73100320	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr11	73104842	.	T	TC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=200,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.535:15:2,6:5,2:4,3,6,2
chr11	73106088	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	73106237	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=169,261;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:4,1:4,3:5,4,2,2
chr11	73106357	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=187,122;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:5,0:10,6:7,8,0,6
chr11	73106408	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:1,5,6,0
chr11	73122340	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=227,243;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr11	73131135	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=236,257;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:73131135_G_C:73131135:0,4,0,1
chr11	73131139	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=236,257;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:73131135_G_C:73131135:0,4,0,1
chr11	73141627	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=227,249;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr11	73179426	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=183,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:2,3:7,2:7,2,4,1
chr11	73362766	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr11	73390772	.	GAA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=199,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:3,6:0,2:1,2,6,2
chr11	73429958	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=183,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.410:9:1,1:2,2:0,5,0,4
chr11	73441772	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr11	73498933	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=166,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:23,1:11,3:24,10,3,1
chr11	73625569	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,254;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:7,0:6,10,1,2
chr11	73670675	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=120,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.354:15:4,0:5,5:6,4,0,5
chr11	73680195	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=148,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr11	73680254	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=182,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,0:5,6:8,3,1,5
chr11	73715115	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=212,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr11	73765552	.	GAAAAAAAAAA	G,GAAAAAAAA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=35,31,32;MFRL=156,200,145;MMQ=58,60,59;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=25,15,23;RU=A;STR;TLOD=3.12,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.199,0.262:5:2,0,0:1,1,1:3,0,2,0
chr11	73765579	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=17,17;MFRL=37,145;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.219:7:2,0:0,0:5,1,1,0
chr11	73765584	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=26,16;MFRL=73,151;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:0,0:0|1:73765584_G_T:73765584:7,2,2,0
chr11	73765591	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=73,151;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:1,2:0|1:73765584_G_T:73765584:8,2,2,0
chr11	73765596	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=93,151;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:3,0:0|1:73765584_G_T:73765584:9,3,2,0
chr11	73796608	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	73797016	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=280,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73797016_T_C:73797016:0,1,0,1
chr11	73797018	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=280,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73797016_T_C:73797016:0,1,0,1
chr11	73797020	.	T	TTAAAAGACACAGACTGGCAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=280,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73797016_T_C:73797016:0,1,0,1
chr11	73806478	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr11	73817520	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=113,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.299:14:4,0:6,3:3,7,0,4
chr11	73990342	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr11	74000240	.	C	CACCCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=310,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	74047683	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=230,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:0,6:1,12:0,1,12,6
chr11	74054014	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=137,150;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.335:28:6,8:12,1:8,11,7,2
chr11	74054346	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=229,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:0,7:1,2:0,1,6,3
chr11	74057931	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=227,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,5:2,2:0,3,0,7
chr11	74079487	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:1,8:8,0:8,1,8,0
chr11	74085420	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,7,4
chr11	74204269	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	74204727	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	74303841	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr11	74330980	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr11	74340196	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=192,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,5:3,1:2,1,6,0
chr11	74345550	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=252,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,5:1,4:1,0,8,1
chr11	74407676	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=182,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:1,3:0,7:0,1,2,8
chr11	74408384	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,2:4,4:1,10,1,5
chr11	74441796	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr11	74547232	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:12,2:6,1:6,12,1,2
chr11	74555056	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,2:3,6:0,7,2,6
chr11	74617309	.	G	GGT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,88;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,3:8,0:10,6,3,0
chr11	74641436	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=185,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.256:10:1,0:0,0:1,7,0,2
chr11	74660292	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:9,1:3,1:9,3,2,0
chr11	74660504	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=148,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:1,7,0,5
chr11	74676794	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:4,3,4,3
chr11	74800829	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=194,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr11	74862356	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr11	74862391	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr11	74883533	.	CCCCAAGGAAATG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,1:8,1:10,8,1,1
chr11	74978647	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:0|1:74978647_G_C:74978647:0,2,2,0
chr11	74978651	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:2,1:0|1:74978647_G_C:74978647:0,4,2,0
chr11	74978654	.	CGCGG	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0|1:74978647_G_C:74978647:0,4,2,0
chr11	74988021	.	G	GTCCCC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCCCC;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,1:3,1:0,8,1,1
chr11	74992267	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=192,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr11	75112817	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=130,50;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:11,4:12,0:4,19,0,4
chr11	75154389	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=244,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr11	75155412	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=197,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:7,8:1,0:7,1,8,0
chr11	75167704	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=223,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr11	75319267	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=139,170;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:9,0:15,6:12,12,0,6
chr11	75501852	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr11	75728007	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=161,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,3:10,0:7,11,0,3
chr11	75902571	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	75917334	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=94,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:1,2,1,1
chr11	76169154	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=202,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:8,0,3,0
chr11	76183924	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,4:1,3:0,2,0,7
chr11	76207199	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=116,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:4,1:1,1:5,0,3,0
chr11	76224337	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=202,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr11	76224464	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:11,0:6,3:0|1:76224464_T_A:76224464:7,10,0,3
chr11	76224470	.	C	CATTACTCTGATCTCTAGCACCA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:13,0:6,3:0|1:76224464_T_A:76224464:8,11,0,3
chr11	76227182	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:4,4:8,7:6,6,6,5
chr11	76234185	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.271:13:7,2:1,1:5,5,2,1
chr11	76237418	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=211,70;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr11	76255550	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.104:41:15,0:22,3:22,15,0,4
chr11	76260924	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=18,11;MFRL=223,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.550:5:0,0:0,0:2,0,3,0
chr11	76372564	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr11	76372603	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:76372603_G_GA:76372603:0,4,0,1
chr11	76372605	.	A	AGGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:76372603_G_GA:76372603:0,4,0,1
chr11	76372606	.	T	TCACAAAGGGGACACAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:76372603_G_GA:76372603:0,4,0,1
chr11	76506672	.	CCTG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,181;MMQ=48,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTG;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr11	76637651	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,6,15
chr11	76637730	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,6,6
chr11	76637785	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr11	76687448	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	76701657	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr11	76751541	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr11	76751584	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:76751584_CT_C:76751584:0,0,3,1
chr11	76751603	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:76751584_CT_C:76751584:0,0,2,1
chr11	76804629	.	AGTCTGTGTCTGTCAC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.694:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	76813961	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:8,2,2,0
chr11	76859069	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=200,235;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr11	76870497	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=128,104;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:3,2,2,0
chr11	76885779	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=193,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:4,1,4,0
chr11	76890242	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr11	76891585	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=188,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr11	76892943	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	76894235	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=170,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.643:15:4,6:1,3:2,3,4,6
chr11	76895770	.	GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=178,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:4,2:6,3:12,7,2,3
chr11	76901273	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=264,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr11	76901927	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:9,4:2,0:6,5,1,3
chr11	76909559	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:4,3,1,2
chr11	76909574	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=143,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,2:1,0:6,3,1,1
chr11	76916424	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr11	76918322	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=197,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr11	76919445	.	C	CTGAGT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAGT;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:2,3,0,2
chr11	76919468	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=19,28;MFRL=339,167;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.802:8:0,4:0,3:1,0,3,4
chr11	76919478	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=198,162;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:3,1,1,4
chr11	76919619	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=271,239;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.663:7:0,3:2,2:0|1:76919619_G_A:76919619:2,0,1,4
chr11	76919629	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=271,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0|1:76919619_G_A:76919619:2,0,1,2
chr11	76919865	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=151,73;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:0,1,1,3
chr11	76924130	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,3,4
chr11	76924874	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=214,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:4,1,2,1
chr11	76925075	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,2,9
chr11	76925753	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=172,273;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:0|1:76925753_G_A:76925753:3,6,0,2
chr11	76925758	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=230,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,2:0.230:11:6,2:3,0:1|0:76925753_G_A:76925753:3,6,0,2
chr11	76944015	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=238,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,4:1,4:3,0,6,2
chr11	76954788	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=49.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:2,7:3,8:3,2,9,6
chr11	76954812	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:0,6:1,12:1,0,10,8
chr11	76954898	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=123,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr11	76979465	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=151,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,2:6,3:5,3,3,2
chr11	76979889	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=201,293;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr11	76979900	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=201,293;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr11	76990492	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=120,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr11	77051683	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=177,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.720:23:5,8:1,9:5,1,13,4
chr11	77051820	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:3,3:10,1:4,9,1,3
chr11	77060189	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=21,15;MFRL=249,268;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:77060189_T_A:77060189:3,0,1,0
chr11	77060191	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=19,15;MFRL=249,268;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:77060189_T_A:77060189:3,0,1,0
chr11	77060194	.	CTG	AGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=15,15;MFRL=207,268;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0|1:77060189_T_A:77060189:4,0,1,0
chr11	77060199	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=23,10;MFRL=249,268;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,0:1,0:0|1:77060189_T_A:77060189:5,0,1,0
chr11	77090211	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr11	77090518	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	77330729	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=108,43;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,0:12,2:10,16,0,2
chr11	77335982	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,275;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,2:5,0:8,3,1,1
chr11	77377926	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=256,72;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:6,2,2,0
chr11	77388115	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=152,73;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr11	77389238	.	CTT	C,CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,25,33;MFRL=106,163,172;MMQ=60,60,60;MPOS=28,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=5.64,4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,4:0.389,0.393:10:0,1,2:1,1,2:1,1,4,4
chr11	77531810	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr11	77580817	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=159,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,5:6,0:3,6,4,1
chr11	77614770	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=199,161;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:1,7,0,2
chr11	77633307	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=107,155;MMQ=45,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:2,3,2,0
chr11	77635943	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,192;MMQ=60,37;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:4,7,0,2
chr11	77639495	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,91;MMQ=40,38;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:5,4:18,0:10,13,2,2
chr11	77652131	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=233,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:6,0,2,0
chr11	77671281	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=139,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,3:0,2:3,0,4,1
chr11	77775466	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	77781173	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr11	77784146	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=121,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:8,0:5,3:9,5,1,2
chr11	77790863	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	77811990	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,6,4
chr11	77815196	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=173,243;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr11	77825062	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:1,4,0,3
chr11	77825275	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=85,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,2,0
chr11	77832076	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr11	77838373	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:2,1,2,1
chr11	77850517	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=173,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.404:27:11,4:5,5:11,5,6,5
chr11	77850572	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=173,69;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:18,0:11,4:9,20,1,3
chr11	77920457	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=165,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:9,2,1,1
chr11	77921247	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=185,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,4:6,0:6,4,2,2
chr11	77924607	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=202,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr11	77924656	.	TTCTAAG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=201,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTAAG;STR;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:0,3:3,1,4,1
chr11	77924870	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,3:5,2:4,5,3,2
chr11	77931346	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=179,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,1:5,3:4,3,4,0
chr11	77937641	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=134,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.080:36:11,0:18,2:22,12,0,2
chr11	77937658	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=156,122;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.229:26:7,0:13,4:16,4,0,6
chr11	78128775	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=245,149;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:0|1:78128775_C_T:78128775:1,4,1,2
chr11	78128797	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=254,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:78128775_C_T:78128775:0,2,0,1
chr11	78154792	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:78154792_C_T:78154792:1,8,0,2
chr11	78154795	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,0:3,2:0|1:78154792_C_T:78154792:1,8,0,2
chr11	78154822	.	ATT	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=211,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.321:7:2,0:2,2:0|1:78154822_ATT_A:78154822:1,4,0,2
chr11	78154826	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=212,152;MMQ=60,60;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.365:6:2,0:2,2:0|1:78154822_ATT_A:78154822:0,4,0,2
chr11	78189558	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,2:6,4:1,6,4,2
chr11	78204073	.	CACAGAT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=120,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:0,3:2,2,4,0
chr11	78204299	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=170,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr11	78369308	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,0:10,2:9,8,1,1
chr11	78372410	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=188,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr11	78383336	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=166,249;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:12,2:5,2:9,8,2,2
chr11	78437182	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=149,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.750:22:2,5:3,12:1,4,10,7
chr11	78440736	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=195,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr11	78482113	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:9,2:8,3:10,7,2,3
chr11	78489628	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=107,85;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:11,3:15,0:17,10,3,0
chr11	78523143	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=195,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr11	78523216	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=175,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:10,3:10,0:6,14,2,1
chr11	78775730	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:10,5:9,0:15,4,5,0
chr11	82443417	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=293,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,4,1
chr11	82443754	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=297,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:3,1,1,3
chr11	82535963	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=138,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:7,1,4,1
chr11	82560858	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=182,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr11	82561339	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:7,2:1,2:5,3,2,2
chr11	82564294	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=114,177;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:8,3:8,2:7,9,2,3
chr11	82641364	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=189,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,2:9,1:1,12,0,3
chr11	82644781	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=120,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:11,2:9,15,0,2
chr11	82644904	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=186,236;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,3:5,0:8,5,3,0
chr11	82645477	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=201,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:4,1:0,1:0,5,0,2
chr11	82868670	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,120;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:23,0:24,3:20,27,0,3
chr11	82874970	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr11	82878393	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=150,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:10,3:13,2:9,14,4,1
chr11	82893611	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=199,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0,5,0,5
chr11	82895634	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=208,342;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:4,0,2,0
chr11	82895657	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=207,342;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr11	82895826	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=127,171;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:11,2:10,2:12,9,2,2
chr11	82921538	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=302,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr11	82936132	.	GTGA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=108,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TGA;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.620:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr11	82973045	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:1,3:8,2:4,5,2,3
chr11	82984770	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,1:3,2:5,7,2,1
chr11	82985161	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr11	83180169	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=213,280;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.464:7:3,0:1,3:3,1,3,0
chr11	83183676	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=205,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,5,1
chr11	83585583	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=127,275;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:3,2:0|1:83585583_T_TA:83585583:0,10,0,2
chr11	83585585	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=127,275;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:3,2:0|1:83585583_T_TA:83585583:0,10,0,2
chr11	83585608	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,36;MFRL=127,229;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:83585608_T_C:83585608:0,4,0,1
chr11	83585609	.	TAG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=127,229;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:83585608_T_C:83585608:0,4,0,1
chr11	83691458	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:7,0,2,0
chr11	83691501	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=102,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:3,2,4,0
chr11	83770626	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=185,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr11	83810113	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	83878075	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=177,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,5:0,3:0,1,1,7
chr11	83962251	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=187,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,23:0.801:28:4,12:1,11:3,2,14,9
chr11	84245594	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,7:3,0:7,3,7,0
chr11	84822798	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=80.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0|1:84822798_T_G:84822798:0,0,3,18
chr11	84822808	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=127,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:2,5:8,2:0|1:84822798_T_G:84822798:0,10,3,4
chr11	85347173	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,4:2,6:4,3,3,7
chr11	85365032	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=226,268;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:16,1:10,2:25,1,3,0
chr11	85366762	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:4,7:3,9:3,4,5,11
chr11	85367289	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=234,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr11	85374467	.	GAAA	G,GA,GAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33,33,36;MFRL=184,193,298,200;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,26,30;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=6.31,5.20,6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,2,3,3:0.177,0.235,0.246:13:1,0,1,2:3,1,2,1:5,0,8,0
chr11	85374993	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=159,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.607:23:2,8:6,6:5,4,7,7
chr11	85396271	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=174,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,3:3,4:4,5,2,5
chr11	85432040	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr11	85435001	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=232,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,1:0,1:1,0,3,0
chr11	85436699	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,14:0,4:0,0,10,8
chr11	85436715	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=196,262;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:11,2:2,0:7,6,0,2
chr11	85447611	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=116,102;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:2,6:8,6:5,6,8,4
chr11	85448679	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=95,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:6,4,0,2
chr11	85576113	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=261,241;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr11	85576127	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=244,58;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr11	85584151	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=213,83;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr11	85593529	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,1:4,2:4,2,1,2
chr11	85606335	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=37,76;MMQ=60,36;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:85606335_G_A:85606335:3,7,2,0
chr11	85606338	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,15;MFRL=73,76;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:5,0:0|1:85606335_G_A:85606335:4,7,2,0
chr11	85606339	.	ACT	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=73,76;MMQ=60,36;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,1:6,0:0|1:85606335_G_A:85606335:4,7,2,0
chr11	85606343	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=73,76;MMQ=60,36;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:85606335_G_A:85606335:4,7,2,0
chr11	85610109	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=283,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr11	85626569	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=142,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,0:1,6:0,2,2,4
chr11	85627039	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:6,2,2,0
chr11	85692342	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr11	85711823	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,78;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,0:9,3:7,12,1,2
chr11	85718469	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=231,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr11	85718641	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=120,146;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:3,1:5,7:3,6,3,5
chr11	85718663	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,2:3,7:2,2,2,7
chr11	85726013	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:1,0:9,2:3,7,0,2
chr11	85966177	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr11	85975337	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,2:5,4:2,4,1,5
chr11	85977117	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr11	85979636	.	CGT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=115,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=GT;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:2,2:0,3,0,2
chr11	86013380	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=179,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr11	86086393	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr11	86111700	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=181,242;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:2,2,5,0
chr11	86119396	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr11	86123357	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	86123599	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,335;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:7,1:4,10,0,2
chr11	86133784	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,4:0,12:0,0,7,9
chr11	86153911	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=143,170;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.771:20:1,4:3,11:3,1,7,9
chr11	86159331	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=165,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,1:9,2:5,9,0,3
chr11	86270684	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,5:4,4:4,1,7,2
chr11	86519925	.	CGTGT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=176,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=GT;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.208:12:7,0:3,2:5,5,1,1
chr11	86522315	.	T	TAGTTGGAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=145,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	86663537	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=205,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr11	86868347	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=185,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr11	86868361	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=36,35,36,33;MFRL=176,155,167,125;MMQ=60,60,60,60;MPOS=5,11,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.78,13.46,4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,4,6,3:0.256,0.407,0.223:14:1,3,4,1:0,1,2,2:1,0,12,1
chr11	87032215	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr11	87883171	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=215,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:0,9,0,2
chr11	87908346	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=169,264;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:0,2:1,2:0,2,2,2
chr11	87908563	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.598:15:4,5:1,4:2,4,2,7
chr11	88033661	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,9,3
chr11	88045815	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr11	88059683	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr11	88059694	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=15,28;MFRL=207,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.356:9:1,1:1,2:0,6,0,3
chr11	88059739	.	TA	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,292;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	88061405	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=224,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:0,5:5,4:3,2,0,9
chr11	88068004	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr11	88068052	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.931:10:0,3:0,6:0,0,9,1
chr11	88068329	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=242,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:0,1,0,7
chr11	88242024	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,8:0,6:0,0,8,6
chr11	88337922	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=142,72;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:8,4,0,2
chr11	88338165	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,3,3
chr11	88386431	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:5,5,0,2
chr11	89106507	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,10;MFRL=211,239;MMQ=53,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.345:9:3,0:2,0:4,2,3,0
chr11	89166059	.	A	ACCCCGTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=165,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:89166059_A_ACCCCGTC:89166059:0,2,1,0
chr11	89166061	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=165,60;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:89166059_A_ACCCCGTC:89166059:0,2,1,0
chr11	89223616	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=77,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:3,2,2,3
chr11	89224326	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=111,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:3,5:6,9:6,3,7,7
chr11	89224453	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=173,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:1,2:3,3:0,5,0,5
chr11	89402557	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=142,254;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:9,1,2,1
chr11	89402687	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=194,227;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr11	89413867	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=110,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:2,5,1,2
chr11	89424740	.	GTATATA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=185,118;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=TA;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr11	89443542	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=157,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:10,2:8,0:8,10,1,1
chr11	89443905	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,19;MFRL=160,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,1:0|1:89443905_G_A:89443905:3,3,1,1
chr11	89443910	.	G	GCTAGCCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=119,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:89443905_G_A:89443905:3,4,1,1
chr11	89444754	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,267;MMQ=52,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr11	89447313	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=157,256;MMQ=52,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr11	89451057	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=158,194;MMQ=27,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:89451057_A_G:89451057:1,3,1,1
chr11	89451071	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=143,194;MMQ=27,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:89451057_A_G:89451057:1,4,1,1
chr11	89537189	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=175,171;MMQ=57,58;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,0:2,2:4,1,0,2
chr11	89665509	.	TTTTATTTATTTA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,236;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=9,6;RU=TTTA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	89868692	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr11	89883595	.	GTT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=209,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr11	89896041	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=246,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:6,0,2,1
chr11	89896417	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=173,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:4,1,2,0
chr11	89903334	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=206,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:3,7,0,4
chr11	89903405	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=203,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr11	89909096	.	A	ATG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=82,55;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=TG;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.496:4:0,2:2,0:1,1,2,0
chr11	89914894	.	TAAAAA	T,TAAAA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,29,26;MFRL=154,130,288;MMQ=60,60,60;MPOS=14,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,11,15;RU=A;STR;TLOD=15.60,7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,4:0.354,0.330:14:0,0,2:5,4,1:1,4,1,8
chr11	89914940	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=190,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:0,4,0,4
chr11	89916053	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=112,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:0,4:1,1:1,0,4,1
chr11	89916080	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,35;MFRL=112,129;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.732:13:0,5:3,4:1,2,6,4
chr11	89916221	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=206,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:89916221_A_T:89916221:1,2,0,1
chr11	89916223	.	CA	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=206,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:89916221_A_T:89916221:1,2,0,1
chr11	89935908	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:3,7:5,3:6,2,8,2
chr11	89936093	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:1,4,2,2
chr11	89938615	.	AAG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,6:7,3:4,8,3,6
chr11	89951325	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=137,299;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:9,0:25,4:18,16,0,4
chr11	89951367	.	GAA	G,GA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=18,31,27;MFRL=159,203,192;MMQ=60,60,60;MPOS=27,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=6.51,7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,4:0.196,0.271:16:1,0,1:3,2,2:3,6,1,6
chr11	89956206	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,1:8,1:2,10,0,2
chr11	90602241	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,1:4,1:11,3,2,0
chr11	92257703	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=199,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr11	92497990	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=159,260;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr11	92498315	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=218,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.309:10:1,1:3,1:0,7,0,3
chr11	92564767	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=125,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,2:2,4:3,1,5,1
chr11	92590318	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=181,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,2:3,1:8,1,3,0
chr11	92592536	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr11	92592560	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=229,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr11	92599851	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	92599987	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,2:11,1:8,9,1,2
chr11	92600266	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=233,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,0:5,6:4,7,2,4
chr11	92620160	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=212,251;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,3:4,2:6,3,1,4
chr11	92623608	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr11	92702962	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=224,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:4,0,3,2
chr11	92714915	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=186,112;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,0:15,2:12,11,0,2
chr11	92931056	.	GC	TT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=214,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,0:2,1,0,2
chr11	93118515	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=249,309;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr11	93170909	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0|1:93170909_T_TC:93170909:0,0,0,5
chr11	93170925	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,1:0,6:0|1:93170909_T_TC:93170909:0,0,0,8
chr11	93212161	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,29;MFRL=283,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.677:6:0,2:0,2:2,0,4,0
chr11	93212457	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=177,252;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr11	93400052	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr11	93412774	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	93428891	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=0,294;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:93428891_G_T:93428891:0,1,0,1
chr11	93428901	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=0,294;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:93428891_G_T:93428891:0,1,0,1
chr11	93433233	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,139;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,3:5,0:5,3,3,0
chr11	93463145	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=128,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:2,2:2,1:3,2,2,1
chr11	93463273	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=144,116;MMQ=60,47;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.213:34:12,6:15,0:13,14,7,0
chr11	93463332	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=140.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,25:0,16:0,0,18,24
chr11	93469892	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:8,6:9,6:10,7,7,5
chr11	93480708	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr11	93487008	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,4,6
chr11	93487299	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=218,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:93487299_T_G:93487299:0,3,0,1
chr11	93487300	.	G	GGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=218,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:93487299_T_G:93487299:0,3,0,1
chr11	93487301	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=218,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:93487299_T_G:93487299:0,3,0,1
chr11	93493122	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=226,201;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr11	93494878	.	AAG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=147,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,1:4,5:3,5,1,5
chr11	93521405	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	93527219	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,8:0,6:0,0,1,13
chr11	93527282	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr11	93534929	.	T	TGA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0|1:93534929_T_TGA:93534929:0,0,7,0
chr11	93534930	.	TTC	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:93534929_T_TGA:93534929:0,0,7,0
chr11	93534990	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=149,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,7:0,1:0,1,7,1
chr11	93754508	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=316,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:2,7:2,3:4,0,10,0
chr11	93797520	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=151,90;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,5:6,0:10,3,5,0
chr11	93803717	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr11	93806416	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,5:0,11:0,0,9,7
chr11	93808607	.	A	AAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr11	93844034	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=3660909,201;MMQ=46,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:0,2:2,0,3,0
chr11	93844764	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=143,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.415:22:5,7:8,2:6,7,4,5
chr11	93886838	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=157,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,3:0,6:0,1,0,9
chr11	93913458	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=220,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:1,5,2,4
chr11	94113806	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=140,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.177:20:11,2:6,1:12,5,2,1
chr11	94134325	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:6,12,1,1
chr11	94134472	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	94163163	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=124,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:7,0:17,5:0|1:94163163_A_G:94163163:4,20,0,5
chr11	94163171	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:5,0:5,5:0|1:94163163_A_G:94163163:2,8,0,5
chr11	94170484	.	TTC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr11	94179125	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr11	94201037	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:4,4:8,0:3,9,3,1
chr11	94203868	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=192,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,7:0,6:0,1,0,13
chr11	94212048	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:2,2,1,3
chr11	94224222	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=255,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	94225807	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr11	94281335	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=181,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:8,2:2,1:6,4,1,2
chr11	94281413	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.906:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr11	94308355	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,227;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:0,4,0,3
chr11	94310726	.	C	CGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=275,99;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	94320179	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=181,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,1,1
chr11	94322338	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=200,62;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:3,5,2,0
chr11	94322352	.	AG	TA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=184,126;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,4:5,4:3,4,4,4
chr11	94354019	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=252,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,1:4,4:3,1,3,2
chr11	94501610	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=252,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr11	94501849	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr11	94533094	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=163,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:14,2:18,0:0|1:94533094_G_A:94533094:16,17,1,1
chr11	94533100	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=158,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:13,2:18,0:0|1:94533094_G_A:94533094:16,16,1,1
chr11	94564720	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=184,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:8,9,0,2
chr11	94592932	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=227,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0|1:94592932_A_T:94592932:2,10,0,2
chr11	94592938	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=205,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:4,1:0|1:94592932_A_T:94592932:1,10,0,2
chr11	94602309	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=213,256;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:6,0:3,3:8,1,3,0
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chr11	94704094	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,1:0,8:0|1:94704092_T_A:94704092:0,0,9,0
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chr11	95519243	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=164,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:10,5:7,4:11,6,6,3
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chr11	95555086	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=182,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:10,6:10,3:7,13,5,4
chr11	95569530	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=197,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:0,10,0,5
chr11	95590613	.	CTG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:3,0:8,0,2,0
chr11	95724874	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=134,80;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:15,0:5,3:10,10,0,3
chr11	95825374	.	TTGCTGCTGCTGC	T,TTGC	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=15,25,26;MFRL=173,160,208;MMQ=40,49,58;MPOS=31,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,9,10;RU=TGC;STR;TLOD=7.38,42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,12:0.197,0.757:16:0,1,5:0,1,3:0,1,7,8
chr11	96092376	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=174,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:3,4,0,2
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chr11	96123734	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=170,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,2:7,2:9,0,4,0
chr11	96125435	.	CTT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=181,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:7,2:6,5:9,5,3,4
chr11	96126288	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,36;MFRL=120,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.373:9:4,2:0,0:3,3,2,1
chr11	96126321	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=154,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:6,0:13,0:12,12,2,0
chr11	96126361	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.242:35:12,2:15,6:15,12,6,2
chr11	99427091	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr11	99690212	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr11	99690450	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=128,514;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,1:14,1:7,15,1,1
chr11	99690461	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=119,514;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:8,1:10,1:5,14,1,1
chr11	99786864	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=188,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,0:7,2:2,7,0,2
chr11	99941322	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr11	100061827	.	G	GAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=198,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=A;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:0,1:2,0:1,1,3,0
chr11	100142035	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr11	100168289	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr11	100168320	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=47.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr11	100169829	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=195,222;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr11	100226962	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=175,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:0,1:8,1:1,7,0,2
chr11	100641200	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:3,5,2,2
chr11	100730213	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr11	100784127	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,14,2
chr11	100803982	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:10,0:2,4:6,6,2,2
chr11	100804088	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=141,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,5:0,0:0,1,0,5
chr11	100807015	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=121,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:3,8,2,0
chr11	100807130	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=199,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:0,1,0,8
chr11	100814409	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	100814609	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,4,11
chr11	100819098	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr11	100819305	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr11	100820555	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=111,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:3,3,1,1
chr11	100820725	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr11	100830579	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=225,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,3:2,6:0,4,7,2
chr11	100830780	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr11	100863354	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:6,2:4,1:2,8,1,2
chr11	100863595	.	T	TGTCTGTGG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=213,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTCTGTGG;STR;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:4,3:3,1:4,4,2,2
chr11	100863733	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=130,180;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:5,8,1,1
chr11	100909809	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:7,0,1,1
chr11	100998105	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=209,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:0,4:1,3:1,0,7,0
chr11	100999838	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr11	101323856	.	TAAG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=214,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,2:0,1:2,1,0,3
chr11	101342931	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=210,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:2,3,0,3
chr11	101344177	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=191,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr11	101359750	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.444:18:6,2:3,5:6,4,5,3
chr11	101375549	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr11	101375615	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=199,253;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr11	101771248	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,7,11
chr11	101771381	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr11	101775663	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:2,2,0,4
chr11	101776407	.	TTATACCTCCAGCTAACTATACATCAACGTGTACATGCAATAACAACACAATACTAAAACATC	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.245:13:2,0:1,2:6,3,3,1
chr11	101776492	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=187,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,0:7,3:6,4,2,1
chr11	101778710	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr11	101818728	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:1,0,5,3
chr11	101857758	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr11	102056722	.	ATT	A,AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,28,29;MFRL=405,146,172;MMQ=60,60,60;MPOS=31,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=8.19,9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,4:0.334,0.419:9:0,0,1:1,3,2:1,1,6,1
chr11	102080325	.	GAA	G,GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=17,26,33;MFRL=172,0,164;MMQ=60,60,60;MPOS=30,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.09,7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,4:0.228,0.432:9:0,1,1:0,0,2:1,2,3,3
chr11	102100620	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=154,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:13,2:0|1:102100620_T_C:102100620:11,15,1,1
chr11	102100621	.	G	GT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=154,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,0:13,2:0|1:102100620_T_C:102100620:11,15,1,1
chr11	102100626	.	G	GTGGCTGTTAACAGTT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=154,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:0|1:102100620_T_C:102100620:10,14,1,1
chr11	102199608	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=134,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.265:19:9,2:2,3:7,7,4,1
chr11	102199610	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.161:19:7,2:7,1:7,9,3,0
chr11	102199611	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=134,192;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.313:21:9,1:4,6:7,7,5,2
chr11	102207851	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr11	102220663	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=137,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:16,0:15,3:18,13,2,1
chr11	102233746	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=192,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr11	102239300	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=170,81;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:5,2:3,2:2,6,1,3
chr11	102269679	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=182,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,3:0,4:0,3,0,7
chr11	102272619	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=150,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:2,1,1,1
chr11	102323160	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	102323184	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,37;MFRL=162,387;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.414:3:1,1:0,0:2,0,1,0
chr11	102391667	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	102398433	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=170,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.332:22:9,2:6,4:0|1:102398433_C_CT:102398433:7,8,3,4
chr11	102398436	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=170,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:9,1:6,4:0|1:102398433_C_CT:102398433:7,8,3,3
chr11	102448256	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	102449951	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=284,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr11	102465281	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=99,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:3,2:3,3:5,1,5,1
chr11	102465502	.	CAA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,17;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:1,0:1,1:1,4,0,3
chr11	102480587	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=182,82;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:5,5:9,0:14,0,5,0
chr11	102480783	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=173,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.316:13:2,1:7,2:3,6,0,4
chr11	102563618	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=220,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr11	102567207	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=132,95;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,3:3,8:1,6,3,8
chr11	102573396	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	102573451	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=192,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:8,2,1,1
chr11	102575523	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,35;MFRL=77,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:1,1:1,1:1,3,2,0
chr11	102576468	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:3,7,0,2
chr11	102584023	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr11	102584104	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=221,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,1:2,2:4,3,2,1
chr11	102584207	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=172,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,0:3,4:6,5,1,3
chr11	102584466	.	G	T,GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30,34;MFRL=0,0,127;MMQ=60,60,60;MPOS=24,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.29,7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.300,0.596:6:0,0,1:0,2,3:0,0,2,4
chr11	102584607	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=191,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:1,5,0,3
chr11	102585255	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=202,140;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,4:3,0:4,3,4,0
chr11	102585493	.	TTATATATATATATA	T,TTATATA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,22,19;MFRL=0,152,92;MMQ=60,60,46;MPOS=30,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,15,18;RU=TA;STR;TLOD=3.53,7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.334,0.506:3:0,0,0:0,1,1:0,0,0,3
chr11	102585536	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=183,152;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr11	102592049	.	T	TTG,TTGTG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,24,25;MFRL=0,179,186;MMQ=60,60,60;MPOS=12,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=TG;STR;TLOD=5.00,11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.339,0.578:6:0,1,0:0,1,3:0,0,6,0
chr11	102592064	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=188,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,5:4,0:9,0,6,0
chr11	102593248	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=183,125;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:4,11:6,4:5,5,7,8
chr11	102593273	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.223:25:13,3:6,2:8,12,2,3
chr11	102595413	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:7,3,1,1
chr11	102595579	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,2:8,1:5,8,1,2
chr11	102595633	.	C	CCCCATGTCCT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=241,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr11	102595666	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr11	102642716	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=103,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=47.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:2,9:3,5:4,1,9,5
chr11	102647173	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=132,291;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:8,3:7,0:4,12,0,3
chr11	102647310	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=132,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:5,1,3,1
chr11	102661080	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=134,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr11	102661099	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=212,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,2:6,5:7,2,5,2
chr11	102661595	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr11	102663476	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=150,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.353:12:6,2:1,2:0|1:102663476_A_AG:102663476:3,5,2,2
chr11	102663482	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:7,3:2,1:0|1:102663476_A_AG:102663476:3,6,1,3
chr11	102663503	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,36;MFRL=176,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:2,4,0,2
chr11	102666043	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,2:5,3:1,5,3,2
chr11	102666164	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=195,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,2:7,0:3,7,2,0
chr11	102668022	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:7,1:8,5:9,6,4,2
chr11	102668702	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:3,3,6,0
chr11	102707305	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=102,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:14,1:21,3:12,24,1,3
chr11	102707339	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=36,25;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:2,6:3,9:0,5,3,12
chr11	102709522	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=180,243;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr11	102711338	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=102,320;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:2,3,2,4
chr11	102713046	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=115,261;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:3,3:2,6,1,3
chr11	102737192	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=145,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:9,2:2,0:2,9,0,2
chr11	102738793	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=54.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,8:0,4:0|1:102738793_G_GT:102738793:0,0,2,11
chr11	102738795	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,9:0,3:0|1:102738793_G_GT:102738793:0,0,2,11
chr11	102824826	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:2,7:1,6:3,0,10,3
chr11	102825091	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=239,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:1,4:9,5:3,7,1,8
chr11	102954096	.	CAACATAA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,330;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AACATAA;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:4,1:2,7,0,3
chr11	102985018	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=179,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr11	102985879	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=106,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:6,4,2,0
chr11	103013954	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=143,117;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr11	103022842	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=203,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.724:8:2,5:0,0:2,0,6,0
chr11	103026040	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.645:10:0,2:2,5:2,1,5,2
chr11	103029373	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr11	103033914	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=151,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,5:1,5:2,1,3,7
chr11	103036713	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:11,0:15,4:13,13,0,4
chr11	103041040	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=220,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr11	103048249	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=202,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,1:7,2:9,1,3,0
chr11	103050028	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=114,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr11	103060309	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=195,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr11	103074349	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr11	103074390	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=143,75;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:6,2,2,0
chr11	103086399	.	G	GTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	103091546	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=159,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr11	103092945	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=223,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0|1:103092945_A_G:103092945:0,2,0,3
chr11	103092968	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=206,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:103092945_A_G:103092945:0,1,0,2
chr11	103092981	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=206,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:103092945_A_G:103092945:0,1,0,1
chr11	103101903	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:7,2:0,0:0|1:103101903_A_G:103101903:6,1,2,0
chr11	103101918	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,36;MFRL=181,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,2:1,0:0|1:103101903_A_G:103101903:8,2,2,0
chr11	103101926	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:7,1:1,0:0|1:103101903_A_G:103101903:6,2,2,0
chr11	103104930	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=211,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,6:2,1:0,3,2,5
chr11	103123938	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=132,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:7,2,3,0
chr11	103123999	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=123,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:10,5:6,2:9,8,4,3
chr11	103128510	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr11	103151034	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:4,1,3,0
chr11	103158278	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:2,4:5,7:1,6,5,6
chr11	103174000	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=127,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,1:11,1:6,10,0,2
chr11	103175289	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:6,1,1,1
chr11	103175465	.	T	TGTG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=95,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr11	103175497	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=180,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr11	103182774	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:0,7,2,2
chr11	103187438	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:3,3:2,4,0,5
chr11	103191672	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=134,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr11	103229110	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:1,3,2,0
chr11	103229173	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=372,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr11	103229188	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=372,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr11	103270607	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,3,3
chr11	103306594	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:4,0,7,0
chr11	103339246	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=111,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:5,2,2,0
chr11	103780455	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,6:2,4:2,1,5,5
chr11	103780610	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	103818344	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:4,2,5,1
chr11	103818496	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:6,0:8,7:3,11,0,7
chr11	103870754	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=192,62;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:4,4,2,0
chr11	103871039	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=172,78;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr11	103909897	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:4,5:8,0:3,9,2,3
chr11	104034494	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:2,1:7,0,2,0
chr11	104818011	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr11	104866461	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=215,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:3,3,1,3
chr11	104866466	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=184,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:3,6,2,0
chr11	104869708	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=201,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.928:25:1,11:0,13:1,0,10,14
chr11	104872981	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,1,21
chr11	104874179	.	T	TGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=194,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=GA;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr11	104877717	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=235,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr11	104877927	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=175,197;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:2,6:1,4:1,2,6,4
chr11	104893962	.	G	GAACAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:104893962_G_GAACAA:104893962:0,4,0,1
chr11	104893964	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:104893962_G_GAACAA:104893962:0,4,0,1
chr11	104896893	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=138,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:0,1:1,0:1,0,2,0
chr11	104899817	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:8,3:10,2:13,5,3,2
chr11	104900385	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=225,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,2:0,3:4,0,3,2
chr11	104901007	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=214,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,4:4,5:6,1,7,2
chr11	104901838	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=164,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:8,6,3,0
chr11	104903719	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:3,7:5,2:3,5,8,2
chr11	104912221	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=200,83;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,4:3,2:3,4,5,1
chr11	104912458	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:2,3,1,7
chr11	104915887	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:18,0,1,1
chr11	104971210	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=155,189;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:9,2:1,3:4,6,2,3
chr11	104971233	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=165,169;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:13,2:3,2:7,9,3,1
chr11	104972190	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:13,4:7,8:6,14,3,9
chr11	105732687	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=178,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:1,2:2,0:3,0,3,0
chr11	105732731	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=176,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:5,3,4,2
chr11	105768983	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,2:1,1,5,1
chr11	105789589	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.339:27:10,0:8,8:7,11,0,9
chr11	105795065	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=171,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr11	105842654	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=173,106;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:7,3:13,0:13,7,3,0
chr11	105880648	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:2,2,1,1
chr11	105923564	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=173,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:4,1,5,1
chr11	105965216	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.813:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	106579204	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=116,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.833:22:1,13:2,6:2,1,14,5
chr11	106647137	.	A	ACTCAAACT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=207,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTCAAACT;STR;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:2,1:3,2:2,3,2,1
chr11	107197606	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=136,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,3:2,4:3,0,5,2
chr11	107197640	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=182,129;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,1:5,3:5,3,4,0
chr11	107197869	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=154,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr11	107224225	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=218,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,2:3,1:10,0,3,0
chr11	107286834	.	TAAAATAAAATAA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=136,173;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAATAAAATAA;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.402:3:0,0:1,1:2,0,1,0
chr11	107286893	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=154,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,6:3,5:4,3,7,4
chr11	107288959	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,0:8,2:8,8,0,2
chr11	107304541	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=145,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:0|1:107304541_C_T:107304541:0,4,0,6
chr11	107304572	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=145,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:107304541_C_T:107304541:0,2,0,3
chr11	107313670	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=134,51;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:14,0:3,5:11,7,5,0
chr11	107325376	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	107326340	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=266,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr11	107381533	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	107381765	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr11	107402995	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,8,3
chr11	107403202	.	TAG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	107420530	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,10,9
chr11	107422437	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=143,166;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.457:6:1,2:1,1:3,0,3,0
chr11	107422440	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=182,166;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.581:5:0,2:1,1:2,0,3,0
chr11	107462977	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr11	107506507	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,1:5,1:2,8,1,1
chr11	107518175	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:5,0,3,0
chr11	107521187	.	A	ACGGTCATAATTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=177,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr11	107521647	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=75,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:12,0:9,2:0|1:107521647_T_G:107521647:1,21,0,2
chr11	107521656	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=75,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.112:25:7,0:5,2:0|1:107521647_T_G:107521647:0,23,0,2
chr11	107521661	.	A	AAAC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=137,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:0|1:107521647_T_G:107521647:0,11,0,2
chr11	107524975	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=192,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:4,2,0,2
chr11	107673628	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,4,0
chr11	107675566	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:1,3,0,4
chr11	107677399	.	C	T,CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,20,35;MFRL=196,93,179;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.20,8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,4:0.258,0.408:9:1,0,2:2,2,2:2,1,4,2
chr11	107904646	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,1:8,1:7,9,0,2
chr11	107920593	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=101,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,3:9,0:6,7,2,1
chr11	107925303	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,1:7,2:8,4,2,1
chr11	107925327	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,12,6
chr11	107925557	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:1,10:1,6:2,0,8,8
chr11	107940723	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=204,199;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:0,2:6,0,2,0
chr11	107943260	.	TAGTG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	107944199	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.278:34:14,0:11,9:13,12,0,9
chr11	108006047	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	108012510	.	A	AAAGT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr11	108013361	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=205,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr11	108014684	.	ACC	A,AC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27,28;MFRL=0,112,147;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=C;STR;TLOD=4.29,5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.385,0.492:5:0,1,0:0,1,2:0,0,1,4
chr11	108014799	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=124,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:3,7:5,4:4,4,3,8
chr11	108043746	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=138,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:10,0:2,3:0|1:108043746_C_T:108043746:7,5,0,3
chr11	108043754	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:7,0:2,3:0|1:108043746_C_T:108043746:6,3,0,3
chr11	108055930	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,3:8,0:12,2,0,3
chr11	108058769	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=185,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:3,0:2,2:5,0,2,2
chr11	108059000	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=181,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr11	108098459	.	TAA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:8,8:3,4:1,11,6,6
chr11	108100105	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,13;MFRL=141,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,0:2,1:0,3,0,3
chr11	108106637	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=210,130;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,0:6,6:0,12,0,6
chr11	108117915	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,107;MMQ=60,31;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr11	108119615	.	C	CAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=206,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=A;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr11	108121410	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=203,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.701:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr11	108124486	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr11	108129657	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:1,0,5,3
chr11	108138154	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=265,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:108138154_G_C:108138154:0,3,0,1
chr11	108138156	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=265,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:108138154_G_C:108138154:0,3,0,1
chr11	108138164	.	C	CCTCATTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=273,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:108138154_G_C:108138154:0,2,0,1
chr11	108141701	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=202,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr11	108141924	.	TGATGTGTTCTGTTAAGCTTATAAAGTTGAACTTTTTTTTTTTTTTTACCACAGCAATGTGTGTTCTTTGTATCGTCGTGACCAA	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=190,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.101:29:5,0:3,2:13,13,2,1
chr11	108141955	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=170,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,1:0,3:1,1,0,4
chr11	108143182	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,8,3
chr11	108150207	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=121,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:3,5:5,3:4,4,5,3
chr11	108151707	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.872:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr11	108159908	.	GAGGAA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=201,183;MMQ=43,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:2,0:2,0:0|1:108159908_GAGGAA_G:108159908:0,8,0,6
chr11	108159916	.	GTAAACAAATGAAAAATTTATCTCATAATTA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,19;MFRL=201,183;MMQ=43,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:2,0:3,0:0|1:108159908_GAGGAA_G:108159908:0,8,0,6
chr11	108163320	.	GT	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=7936631,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:108163320_GT_CA:108163320:1,1,0,1
chr11	108163326	.	T	TTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=7936631,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:108163320_GT_CA:108163320:1,1,0,1
chr11	108175462	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.222:19:9,2:6,1:8,7,3,1
chr11	108175463	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,2:6,2:9,7,3,1
chr11	108218196	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=323,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr11	108224697	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	108225483	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=185,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:2,0,8,0
chr11	108225661	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	108225694	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=242,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,0:5,2:0,5,0,2
chr11	108225710	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=36,31;MFRL=190,242;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr11	108277999	.	G	GGACAACTTGGTTCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=185,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	108345515	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,4:5,4:6,2,8,1
chr11	108352160	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr11	108409664	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=224,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr11	108535792	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=243,223;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr11	108546468	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=159,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:8,2:1,2:2,7,2,2
chr11	108549179	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=153,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.286:14:6,1:3,1:4,6,1,3
chr11	108549186	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.436:10:4,2:2,1:2,4,0,4
chr11	108577646	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=197,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:0,9,0,3
chr11	108722851	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,5:8,2:8,4,6,1
chr11	109295660	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=127,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.143:40:16,0:18,5:10,25,0,5
chr11	109296012	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=192,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,3:6,1:2,7,1,3
chr11	109964007	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	109964079	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	109964089	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	109964257	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	110023628	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=149,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,2:8,2:6,5,2,2
chr11	110103924	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=118,245;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:4,1,4,0
chr11	110106746	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	110128471	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=146,70;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:8,2:7,1:13,2,2,1
chr11	110128774	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=217,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,1:7,4:4,10,5,0
chr11	110134670	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=167,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:10,0:2,2:9,3,1,1
chr11	110150486	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=200,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr11	110450613	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=170,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:16,3:10,0:16,10,3,0
chr11	110452999	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:1,3:0,3:0|1:110452999_C_A:110452999:1,0,6,1
chr11	110453009	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:0|1:110452999_C_A:110452999:1,0,8,2
chr11	110453250	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr11	110461423	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=158,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:4,5,1,1
chr11	110477212	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=218,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr11	110479839	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=272,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr11	111156381	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,271;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:8,3:8,3:11,5,3,3
chr11	111156697	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,1:10,1:8,8,2,0
chr11	111156836	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=151,222;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,3:1,2,0,5
chr11	111167202	.	AT	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=199,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:111167202_AT_GC:111167202:0,3,0,1
chr11	111167206	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,22;MFRL=199,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:2,0:0|1:111167202_AT_GC:111167202:0,3,0,1
chr11	111168669	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,126;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,0:5,2:6,1,0,2
chr11	111225286	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:3,6,0,2
chr11	111249785	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr11	111249819	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr11	111338478	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=227,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,6:2,0:0,3,0,6
chr11	111368047	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,3:0,0,6,5
chr11	111368169	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=82,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr11	111369359	.	G	GGATAAACAACAATCAGAAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:5,4,1,1
chr11	111383756	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=134,291;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.194:29:11,2:12,3:16,8,2,3
chr11	111383789	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=150,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:8,4:7,2:6,9,3,3
chr11	111383813	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=138,260;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,4:5,1:0,10,0,5
chr11	111405065	.	CA	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=134,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:8,3:18,0:20,12,2,1
chr11	111558961	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=222,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr11	111575634	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=198,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr11	111597667	.	TTC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=147,241;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:9,5:4,2:7,6,4,3
chr11	111613480	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=437,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	111623088	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr11	111623153	.	A	ATAAAAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:111623153_A_ATAAAAT:111623153:0,0,0,1
chr11	111623154	.	G	GACTTAGGGAGGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.676:1:0,1:0,0:0|1:111623153_A_ATAAAAT:111623153:0,0,0,1
chr11	111631499	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=131,292;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:3,1,2,2
chr11	111635619	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=134,316;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:5,5,1,1
chr11	111635655	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:1,4,2,2
chr11	111707031	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:4,7:2,4:1,6,3,8
chr11	111741104	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,16;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.332:15:5,0:5,1:0|1:111741104_G_C:111741104:10,0,0,5
chr11	111741105	.	CAA	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=0,122;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=A;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.267:15:4,0:6,1:10,1,0,4
chr11	111741106	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,5:0.397:14:4,2:5,3:1|0:111741104_G_C:111741104:4,5,5,0
chr11	111742145	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	111746041	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=150,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:8,2:8,4:9,7,3,3
chr11	111746231	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=180,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:2,3:1,3:1,2,4,3
chr11	111747427	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr11	111747587	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=140,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,6:5,2:8,1,5,3
chr11	111749265	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=189,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,2:4,1:9,1,3,0
chr11	111750349	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=178,230;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:8,6:11,4:8,11,4,6
chr11	111750430	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	111753246	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=131,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:7,4:6,2:7,6,2,4
chr11	111781047	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:6,1:6,2:8,5,2,1
chr11	111795085	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=92,108;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:2,5,3,3
chr11	111795148	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=152,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr11	111796618	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=204,289;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,3:5,3:5,2,3,3
chr11	111796689	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=141,317;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:14,2,1,1
chr11	111839382	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=133,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:5,4:8,0:4,9,0,4
chr11	111844863	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=124,97;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:7,6:12,0:10,9,6,0
chr11	111848361	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=40.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr11	111853106	.	G	GC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=69.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,8:0,0,11,10
chr11	111857541	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=146,298;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:4,0,2,1
chr11	111863286	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:1,5,0,2
chr11	111889654	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr11	111896251	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=152,325;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:7,2,0,2
chr11	111897021	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,10;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.261:14:3,0:4,0:3,7,0,4
chr11	111897028	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=22,13;MFRL=175,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.431:9:2,0:1,0:1,4,0,4
chr11	111897050	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=158,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:4,1:2,1:1,6,0,2
chr11	111897079	.	T	TGTCACC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=175,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	111899428	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=230,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:2,6,1,1
chr11	111899635	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=176,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:3,7:5,3:2,6,3,7
chr11	111904072	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=143,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:9,2,0,2
chr11	111908162	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=146,129;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:0,1:3,4:3,0,0,5
chr11	111916001	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr11	111930576	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr11	111933088	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=150,238;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,2:3,1:8,2,2,1
chr11	111942362	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=190,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,2:5,2:9,2,1,3
chr11	111943853	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:10,1:9,9,0,2
chr11	111943977	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=138,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,3:3,4:0,4,0,7
chr11	111946418	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=189,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,0:2,2:2,7,0,2
chr11	111957665	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=140,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:7,2:17,2:10,14,1,3
chr11	111959562	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=160,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.403:23:4,7:9,2:10,4,8,1
chr11	111959587	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=167,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:19,0:12,2:0|1:111959587_G_A:111959587:21,11,1,1
chr11	111959590	.	G	GCTTTAATTATTTCCT	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=167,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:20,0:10,2:0|1:111959587_G_A:111959587:22,10,1,1
chr11	111959625	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=158,203;MMQ=54,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:11,7:8,6:7,12,6,7
chr11	112014269	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=230,174;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr11	112024222	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:2,1:3,3:5,1,3,1
chr11	112039896	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,2:7,0:10,0,2,0
chr11	112041128	.	TTTTGTCCTG	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=135,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:5,7:2,7:6,2,8,6
chr11	112064431	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=76.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,12:0,0,10,14
chr11	112064667	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,231;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,3:11,0:9,12,3,0
chr11	112065483	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=137,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:1,4:6,2:2,5,2,4
chr11	112071294	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=231,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:4,1,5,1
chr11	112071570	.	AA	TT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr11	112072930	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=186,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:1,1,0,5
chr11	112087101	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr11	112088499	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,11,8
chr11	112099382	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=159,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:0|1:112099382_G_T:112099382:9,7,1,1
chr11	112099389	.	T	TCACATAAATATTGCACAAAA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=165,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:8,2:8,0:0|1:112099382_G_T:112099382:9,7,1,1
chr11	112832276	.	AG	A,AGG	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=28,29,29;MFRL=169,115,159;MMQ=60,60,60;MPOS=22,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=G;STR;TLOD=3.12,9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,5:0.153,0.315:16:4,0,2:4,2,3:6,3,7,0
chr11	112832307	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=76.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,5:0,16:0,0,12,11
chr11	112832339	.	GC	G	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=99.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,5:0,15:0|1:112832339_GC_G:112832339:0,0,7,17
chr11	112832353	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,4:0,12:0|1:112832339_GC_G:112832339:0,0,3,16
chr11	112832358	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,4:0,10:0|1:112832339_GC_G:112832339:0,0,3,16
chr11	112832391	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=24,28;MFRL=175,227;MMQ=54,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.262:19:7,1:4,4:2,12,0,5
chr11	113073055	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=145,57;MMQ=60,56;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:9,2:7,1:16,1,4,0
chr11	113073066	.	T	TTTTTG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=112,144;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TTTTG;STR;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:6,5:3,4:9,1,9,1
chr11	113076912	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:0,10,0,2
chr11	113078035	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,1:5,3:10,4,1,3
chr11	113078808	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=190,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:0|1:113078808_A_T:113078808:0,6,0,2
chr11	113078809	.	C	CCATCTGTCTCTGG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=190,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:113078808_A_T:113078808:0,6,0,2
chr11	113105907	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=167,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:0,5,1,4
chr11	113111501	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=161,135;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:6,1:10,7:12,4,4,4
chr11	113111665	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=220,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:5,1:0,6,0,2
chr11	113133676	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,4:7,3:2,9,2,5
chr11	113186879	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=191,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,4:4,4:6,0,8,0
chr11	113193976	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=129,222;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,1:5,3:6,3,4,0
chr11	113209428	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,2:1,5:2,1,6,1
chr11	113211329	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=244,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.238:15:4,0:6,3:7,5,0,3
chr11	113230600	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,3,1
chr11	113233059	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=176,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,4:1,3:4,0,7,0
chr11	113234679	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=135,69;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr11	113239082	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:7,0,5,0
chr11	113266203	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,35;MFRL=186,231;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:113266203_G_C:113266203:0,4,0,1
chr11	113266207	.	A	ACCGCG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=214,231;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:113266203_G_C:113266203:0,3,0,1
chr11	113266210	.	G	GGTTC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=214,231;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:113266203_G_C:113266203:0,3,0,1
chr11	113266215	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=17,36;MFRL=218,129;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:113266215_T_C:113266215:0,1,0,1
chr11	113266221	.	GG	CT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,36;MFRL=218,129;MMQ=60,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113266215_T_C:113266215:0,1,0,1
chr11	113266226	.	C	CAGG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,36;MFRL=215,129;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:113266215_T_C:113266215:0,1,0,1
chr11	113266229	.	G	GGGCTCCTGGTGACCAGAGCAC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,35;MFRL=215,129;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113266215_T_C:113266215:0,1,0,1
chr11	113266702	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=134,249;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr11	113266733	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=97,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.602:6:2,0:0,0:2,0,4,0
chr11	113266821	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:8,3,0,2
chr11	113271049	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,253;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113271049_C_T:113271049:0,0,0,1
chr11	113271065	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,253;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113271049_C_T:113271049:0,0,0,1
chr11	113281397	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,245;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,5:6,2:8,0,6,1
chr11	113281487	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=196,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,0:11,3:10,8,3,0
chr11	113283459	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=135,230;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:7,2:16,2:10,14,3,1
chr11	113283477	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=160,224;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:5,2:10,3:6,9,4,1
chr11	113283484	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=197,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:3,3:8,4:6,5,3,5
chr11	113295305	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=159,254;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:9,0:5,2:4,11,0,2
chr11	113563730	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=14,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:0,1:5,1:0|1:113563730_A_C:113563730:0,5,5,0
chr11	113563741	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=14,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,1:6,2:0|1:113563730_A_C:113563730:1,9,3,0
chr11	113569575	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=183,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,5:4,4:5,2,8,1
chr11	113570490	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=168,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,5:0,6:0,1,0,11
chr11	113570852	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=202,112;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,5:3,5:1,4,5,5
chr11	113608450	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:1,5,1,2
chr11	113609854	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr11	113618470	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	113618936	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:0,5:2,3:2,0,8,0
chr11	113618968	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr11	113644261	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=191,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr11	113650759	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:5,8,1,1
chr11	113675542	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=183,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,4:4,1:6,3,4,1
chr11	113678924	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.799:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	113680018	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr11	113697927	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:0,2:4,2,1,1
chr11	113699915	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:7,0:8,2:0|1:113699915_G_T:113699915:8,8,1,1
chr11	113699919	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:8,2:0|1:113699915_G_T:113699915:8,8,1,1
chr11	113775551	.	GAGA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=264,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr11	113802601	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=193,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:2,6:0,7:1,1,7,6
chr11	113846006	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=228,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:2,1,6,1
chr11	113848184	.	G	GCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr11	113848273	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=242,145;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:5,4:3,10:6,2,6,8
chr11	113848474	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=138,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,1:6,2:5,3,3,0
chr11	113848505	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=166,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:8,4,1,1
chr11	113856681	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:5,6:1,5:2,4,11,0
chr11	113934465	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=226,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:8,0:1,3:4,5,1,2
chr11	113935225	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=198,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,0:8,4:12,3,1,3
chr11	114118165	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=211,81;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr11	114120999	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=220,313;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr11	114167476	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=167,254;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:3,7,0,2
chr11	114182778	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.214:34:13,0:13,6:13,14,0,7
chr11	114273673	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,3:8,4:2,11,2,5
chr11	114310469	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=187,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr11	114315188	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=214,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr11	114393652	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=230,265;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:5,7,1,1
chr11	114451129	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr11	114550334	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	114569054	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=108,148;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:4,3:6,9:5,5,7,5
chr11	114574819	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=205,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:1,6,1,3
chr11	114574843	.	A	AAGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=251,230;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:114574843_A_AAGG:114574843:0,3,1,0
chr11	114574844	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=251,230;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,1:2,0:0|1:114574843_A_AAGG:114574843:0,3,1,0
chr11	115049311	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=201,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:4,1,4,1
chr11	115102224	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=144,210;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:8,5:10,1:4,14,3,3
chr11	116629734	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr11	116631391	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=203,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,5:1,5:1,0,9,1
chr11	116631690	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:116631690_G_A:116631690:0,0,6,6
chr11	116631707	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0|1:116631690_G_A:116631690:0,0,4,9
chr11	116640768	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,41;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr11	116641028	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr11	116643436	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	116652958	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:15,0:9,3:9,15,0,3
chr11	116654435	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,6:0,0,0,9
chr11	116661257	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=239,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:116661257_C_G:116661257:4,0,1,0
chr11	116661260	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=239,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:116661257_C_G:116661257:4,0,1,0
chr11	116661826	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr11	116691511	.	GGACA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GACA;STR;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,2:1,5:1,0,7,0
chr11	116701153	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	116703640	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr11	116703671	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=159,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr11	116707684	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr11	116708020	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=273,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,3:0,4:3,1,4,3
chr11	116717289	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=174,76;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,0:7,3:4,13,2,1
chr11	116720089	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=197,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,3:0,1:0,1,0,4
chr11	116732512	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr11	116732856	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr11	116734545	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=194,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.819:20:0,7:3,10:1,2,10,7
chr11	116747158	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=366,215;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:116747158_C_G:116747158:0,1,0,1
chr11	116747164	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=366,215;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:116747158_C_G:116747158:0,1,0,1
chr11	116747169	.	C	CCCACAACATTATAAATTCTTCCTTAATCATTGTTTATGAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=366,215;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:116747158_C_G:116747158:0,1,0,1
chr11	116747810	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=231,112;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,0:4,4:1,8,0,4
chr11	116824884	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,3,10
chr11	117030581	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	117030624	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=274,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.747:10:1,5:1,3:2,0,7,1
chr11	117034388	.	CAAAAAAA	C,CAAAAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31,33;MFRL=0,61,174;MMQ=60,56,60;MPOS=14,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,11,16;RU=A;STR;TLOD=7.95,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,0,1:0,2,0:0,0,3,0
chr11	117034619	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr11	117052069	.	GTCTCT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr11	117053165	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,4:0,4:2,0,8,0
chr11	117059347	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=125,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:0,3:4,2:5,0,4,1
chr11	117059552	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:3,5:4,8:3,4,6,7
chr11	117064506	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=171,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:8,0,1,2
chr11	117064693	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr11	117077716	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=169,217;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,1:11,2:12,5,1,2
chr11	117090545	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:12,0:0,2:0,12,0,2
chr11	117090558	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=163,258;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:10,2:1,1:0,11,0,3
chr11	117095361	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,222;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,3:3,0:7,2,1,2
chr11	117100594	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=202,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr11	117109270	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	117109874	.	G	GCCTTCTTCTCACAGCTGTACTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:1,0:0|1:117109874_G_GCCTTCTTCTCACAGCTGTACTA:117109874:1,2,0,1
chr11	117109876	.	GTT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:0,1:2,0:0|1:117109874_G_GCCTTCTTCTCACAGCTGTACTA:117109874:1,2,0,1
chr11	117152540	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr11	117153420	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=231,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:7,2:5,7:7,5,6,3
chr11	117155696	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=220,350;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr11	117161422	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=210,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr11	117163765	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,8,7
chr11	117163824	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=125,152;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:5,8:2,5:3,4,5,8
chr11	117209268	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=102,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,2:5,1,3,3
chr11	117222647	.	GA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=18,24;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.316:20:2,1:3,2:2,12,2,4
chr11	117232492	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr11	117241760	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr11	117242070	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,154;MMQ=60,31;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:5,0:8,9:3,10,0,9
chr11	117251521	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	117261844	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=137,137;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.231:41:22,0:10,9:6,26,0,9
chr11	117266466	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=206,289;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:2,2,0,2
chr11	117266722	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=192,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr11	117266754	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=174,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.375:9:2,2:2,1:5,1,2,1
chr11	117266901	.	GCTGGGGGCTGGGGC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=190,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGGGGGCTGGGGC;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.521:4:2,2:0,0:1,1,0,2
chr11	117282649	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=179,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,3:3,0:4,2,1,2
chr11	117282800	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,11:0,0,10,4
chr11	117282979	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=228,282;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr11	117299015	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=224,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.547:11:4,2:0,4:4,1,6,0
chr11	117299039	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=223,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:4,3:2,4:5,1,3,4
chr11	117303256	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,0:7,12:4,8,0,12
chr11	117306291	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr11	117309581	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=201,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:5,1,2,0
chr11	117321420	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=213,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:4,3,0,2
chr11	117332148	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=180,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:117332148_CA_C:117332148:4,2,1,1
chr11	117332150	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=180,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:117332148_CA_C:117332148:4,2,1,1
chr11	117332153	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=174,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:117332148_CA_C:117332148:4,3,1,1
chr11	117332352	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	117351293	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=213,231;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.346:14:5,1:2,0:3,6,0,5
chr11	117376111	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=198,351;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr11	117403017	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=255,252;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,0:2,4:3,0,4,0
chr11	117647496	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=214,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:3,1,3,4
chr11	117667688	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.417:12:3,2:4,1:6,1,4,1
chr11	117691520	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,16;MFRL=142,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.338:7:2,0:1,1:0|1:117691520_G_C:117691520:2,3,2,0
chr11	117691525	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,14;MFRL=153,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:3,0:1,0:0|1:117691520_G_C:117691520:2,3,2,0
chr11	117691527	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=153,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:4,0:1,2:0|1:117691520_G_C:117691520:2,3,2,0
chr11	117691531	.	T	TGGCCCC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=29,14;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,0:1,1:0|1:117691520_G_C:117691520:1,3,2,0
chr11	117691533	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=143,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:2,0:1,1:0|1:117691520_G_C:117691520:3,3,2,0
chr11	117713561	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr11	117773110	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr11	117774291	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=208,243;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr11	117774587	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=261,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,0,2
chr11	117776471	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=99,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,2:6,1:2,7,2,1
chr11	117780744	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=224,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr11	117781435	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:0,7:1,7:1,0,4,10
chr11	117782638	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr11	117784434	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr11	117784714	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,5:3,2:0,5,2,5
chr11	117789242	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=145,267;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:7,2:8,0:8,7,1,1
chr11	117789312	.	CGGGCTGGAGATGCCT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGCTGGAGATGCCT;STR;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.763:9:2,4:0,3:0,2,3,4
chr11	117799923	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=148,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,1:7,1:12,1,1,1
chr11	117800083	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=134,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:13,2:7,0:3,19,0,2
chr11	117860305	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:13,5:7,1:7,13,2,4
chr11	117863945	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=169,83;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:8,0:7,2:4,12,2,0
chr11	117965421	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=274,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,1:2,4:8,0,5,0
chr11	117965646	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=260,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:8,0:0,5:1,7,0,5
chr11	117988223	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr11	117988539	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,4:1,7:1,0,11,0
chr11	118037813	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=207,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,2:2,4:0,4,0,6
chr11	118067426	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,112;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.241:19:9,2:4,2:12,3,3,1
chr11	118067621	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=277,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr11	118071097	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=172,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr11	118071310	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=149,236;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:4,1:11,2:9,6,1,2
chr11	118074117	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=131,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:6,1:1,4:6,1,2,3
chr11	118076697	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=181,86;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:15,0:13,3:11,19,1,2
chr11	118081468	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,3:4,6:3,5,0,9
chr11	118108003	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:0,4,2,5
chr11	118134785	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.325:22:7,4:8,2:8,7,2,5
chr11	118178007	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.291:15:7,2:4,2:0,11,2,2
chr11	118179197	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=231,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.638:9:2,4:1,2:0|1:118179197_A_G:118179197:0,3,3,3
chr11	118179200	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=206,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:3,1:0,2:0|1:118179197_A_G:118179197:2,2,1,2
chr11	118182801	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=140,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,3:6,5:8,3,5,3
chr11	118182829	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:9,2:8,7:7,10,6,3
chr11	118182938	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:3,11,2,0
chr11	118210106	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=228,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:0,3:2,10:2,0,9,4
chr11	118210424	.	T	TACACACAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=90,138;MMQ=49,40;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=16,20;RU=AC;STR;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.568:5:1,0:1,2:2,0,3,0
chr11	118215075	.	AGGCT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,237;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGCT;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:2,0:4,1,2,0
chr11	118221474	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=169,297;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:0,7,0,4
chr11	118239266	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr11	118245971	.	C	CTG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,217;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TG;STR;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:1,1,0,3
chr11	118255278	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:1,1:7,4:9,0,5,0
chr11	118263551	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=133,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:118263551_G_A:118263551:4,4,1,1
chr11	118263554	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=138,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:118263551_G_A:118263551:4,3,1,1
chr11	118279645	.	AAT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=169,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AT;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,1:7,1:9,0,2,0
chr11	118307413	.	CGCG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCG;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:5,0,2,0
chr11	118350832	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=176,120;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,5:4,0:6,3,5,0
chr11	118353037	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=156,240;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.363:6:1,2:2,0:3,1,2,0
chr11	118353054	.	C	G,A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,14,11;MFRL=157,240,204;MMQ=60,60,60;MPOS=29,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.30,4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,4:0.247,0.421:9:1,0,0:0,0,0:1,2,6,0
chr11	118353071	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=183,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:3,0:6,3,2,0
chr11	118354911	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:6,6,2,0
chr11	118362414	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=190,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:2,1,5,0
chr11	118368822	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=116,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,1:6,1:3,9,0,2
chr11	118370221	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=222,205;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:118370221_A_G:118370221:0,4,0,1
chr11	118370226	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=222,205;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:118370221_A_G:118370221:0,4,0,1
chr11	118370231	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=227,211;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr11	118372522	.	GT	TC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=138,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:4,2:13,0:0|1:118372522_GT_TC:118372522:2,17,0,2
chr11	118372527	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=138,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:3,2:5,0:0|1:118372522_GT_TC:118372522:2,17,0,2
chr11	118372529	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=167,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:4,0:0|1:118372522_GT_TC:118372522:2,7,0,2
chr11	118372532	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:118372522_GT_TC:118372522:1,7,0,2
chr11	118372533	.	A	ATC	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=27,23;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:118372522_GT_TC:118372522:1,7,0,2
chr11	118392075	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:12,1:5,2:5,12,0,3
chr11	118404999	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,2:8,1:7,7,0,3
chr11	118416073	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:3,2:2,5:4,1,5,2
chr11	118416253	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr11	118422385	.	CA	C,CAAAA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,30,31;MFRL=159,256,143;MMQ=60,50,40;MPOS=6,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,19,23;RU=A;STR;TLOD=7.19,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.438,0.279:4:1,1,0:0,1,1:1,0,3,0
chr11	118422406	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,16;MFRL=166,152;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:0,0:0|1:118422406_G_T:118422406:1,2,3,0
chr11	118422411	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=166,152;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,0:0,0:0|1:118422406_G_T:118422406:1,2,3,0
chr11	118422868	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,3:2,0:7,1,2,1
chr11	118451901	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=164,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr11	118454484	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.252:13:6,1:4,2:5,5,3,0
chr11	118506331	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=190,237;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:1,5,0,3
chr11	118514858	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:5,5,1,1
chr11	118529017	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,11,5
chr11	118529044	.	C	CG	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=65.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0|1:118529044_C_CG:118529044:0,0,11,5
chr11	118529069	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0|1:118529044_C_CG:118529044:0,0,7,7
chr11	118529078	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0|1:118529044_C_CG:118529044:0,0,7,7
chr11	118529595	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:0,2:4,9:2,2,6,5
chr11	118625609	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=166,242;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:0,7,1,3
chr11	118627073	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=190,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:4,1:2,4,0,2
chr11	118651809	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,5:2,1:4,2,4,2
chr11	118656835	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.369:28:6,0:10,10:9,9,0,10
chr11	118765257	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=204,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:6,1:2,8,0,2
chr11	118766356	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=202,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.379:11:3,1:4,3:3,4,3,1
chr11	118771450	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,1:9,1:7,9,1,1
chr11	118772930	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=190,293;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,0:11,2:4,12,0,2
chr11	118828394	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,8642491;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:10,0:7,2:9,8,1,1
chr11	118842780	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	118851138	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=264,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr11	118852081	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.830:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	118868842	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,6:0,0,8,0
chr11	118883880	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:13,3:10,1:19,5,3,1
chr11	118884009	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=22,20,23,28;MFRL=147,125,167,198;MMQ=60,60,60,60;MPOS=17,23,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=6.66,11.73,13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:12,5,8,9:0.139,0.233,0.276:34:4,1,3,4:3,2,2,3:3,9,7,15
chr11	118885668	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=258,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr11	118886232	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:5,6,1,1
chr11	118888619	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=145,279;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,1:8,2:15,5,3,0
chr11	118888831	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=156,277;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,1:9,1:7,9,1,1
chr11	118889058	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.335:31:8,5:12,5:9,12,3,7
chr11	118889114	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,2,16
chr11	118898435	.	AC	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=109.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,17:0,18:0,0,15,20
chr11	118916330	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,80;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,2:9,1:9,6,2,1
chr11	118919206	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chr11	118919214	.	AG	GC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=183,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:6,1:12,3,0,2
chr11	118920453	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,14,6
chr11	118926720	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr11	118938435	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=233,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr11	118939939	.	T	TC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=47.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,10:0,0,7,8
chr11	118939964	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=150,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,2:10,0:7,7,1,1
chr11	118944675	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,3:2,0:4,3,1,2
chr11	118947714	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=156,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.111:29:8,0:18,2:12,14,1,2
chr11	118949083	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=288,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:1,1,0,4
chr11	118949799	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=277,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,6:1,5:0,2,6,5
chr11	118952173	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=206,124;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.751:22:3,12:2,5:2,3,9,8
chr11	118952371	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=212,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:0,4,4,4
chr11	118955679	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=159,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,1:8,1:11,3,2,0
chr11	118958869	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=330,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:1,7:0,9:1,0,15,1
chr11	118959732	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=194,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,9:1,3:2,1,10,2
chr11	118970875	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0|1:118970875_T_C:118970875:0,0,8,0
chr11	118970878	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=195,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0|1:118970875_T_C:118970875:4,0,4,0
chr11	118971251	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=107,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=37.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,5:2,6:0,2,7,4
chr11	118971890	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=143,240;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:118971890_G_C:118971890:0,1,0,1
chr11	118971892	.	G	GTGTTGCATCCCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=143,240;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:118971890_G_C:118971890:0,1,0,1
chr11	118973112	.	AA	GC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=115.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,18:0,8:0,0,6,20
chr11	118973133	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:9,5:2,1:0,11,0,6
chr11	118983681	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	118984287	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=130.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,23:0,13:0,0,33,4
chr11	118985151	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=163,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr11	118997714	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=104,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:5,2:11,2:6,10,2,2
chr11	119002439	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=188,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,1:7,2:4,8,3,0
chr11	119002753	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,360;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	119003322	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=182,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,6:2,3:3,6,4,5
chr11	119004009	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=235,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:1,0:1,3:0,2,0,4
chr11	119004026	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=286,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr11	119024931	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,1:7,2:6,5,1,2
chr11	119025075	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,2:10,0:10,9,1,1
chr11	119027628	.	GT	TC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=129,47;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:8,2:0|1:119027628_GT_TC:119027628:6,10,1,1
chr11	119027638	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=129,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:8,2:0|1:119027628_GT_TC:119027628:7,11,1,1
chr11	119027639	.	T	TTCAA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=129,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:7,2:0|1:119027628_GT_TC:119027628:7,11,1,1
chr11	119027642	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=128,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:6,0:8,2:0|1:119027628_GT_TC:119027628:6,8,1,1
chr11	119031552	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=183,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:9,0:5,3:10,4,2,1
chr11	119031841	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr11	119043745	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,2:3,1:4,6,1,2
chr11	119054488	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr11	119056266	.	G	GAGAAACCA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=101,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.265:9:3,2:3,0:0|1:119056266_G_GAGAAACCA:119056266:2,5,1,1
chr11	119056268	.	G	GAGAAAGTTCTT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=101,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,0:0|1:119056266_G_GAGAAACCA:119056266:2,5,1,1
chr11	119056273	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=101,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:2,3,0,2
chr11	119065528	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=223,225;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:119065528_A_G:119065528:2,0,1,0
chr11	119065552	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=92,225;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:119065528_A_G:119065528:1,0,1,0
chr11	119065773	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=192,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,0:3,3:1,7,0,3
chr11	119144764	.	G	GCA	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=198,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:119144764_G_GCA:119144764:0,7,1,1
chr11	119144765	.	TTA	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=198,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:119144764_G_GCA:119144764:0,7,1,1
chr11	119144772	.	T	TCTGCTTTTGGTGAGGGCC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=198,60;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:2,2:0|1:119144764_G_GCA:119144764:0,7,1,1
chr11	119144791	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=149,198;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr11	119146659	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:3,2:0,6:3,0,6,2
chr11	119148573	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=66,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.866:20:2,10:0,8:1,1,8,10
chr11	119155618	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=151,242;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,3:1,0:6,1,2,1
chr11	119167805	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0,4,0,1
chr11	119181674	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=250,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:3,4:1,2:1,4,1,5
chr11	119185133	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=115,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr11	119185347	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,1:3,2:5,1,0,3
chr11	119205830	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,8:3,2:7,0,6,4
chr11	119206857	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,173;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:17,3:11,0:10,18,3,0
chr11	119207443	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,1:8,2:7,9,1,2
chr11	119215165	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=164,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,3:2,3:4,2,4,2
chr11	119215253	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=179,247;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:5,5:3,4:0|1:119215253_G_C:119215253:6,2,6,3
chr11	119215256	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=179,247;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:5,4:3,4:0|1:119215253_G_C:119215253:6,2,6,3
chr11	119217254	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=258,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:2,6:0,9:1,1,7,8
chr11	119217311	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=201,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:1,3:0,8:0,1,0,11
chr11	119227844	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=12,32;MFRL=129,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.898:12:0,6:0,3:0,1,9,2
chr11	119229033	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr11	119229374	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,6,0
chr11	119290034	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=54.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr11	119290062	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=168,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:4,6:9,0:11,2,6,0
chr11	119291480	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr11	119291688	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr11	119509485	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=217,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:7,2:3,0:6,4,2,0
chr11	119509625	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr11	119535415	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=246,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,6:1,0:2,0,6,0
chr11	119545220	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=173,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:1,3:8,4:8,1,6,1
chr11	119986167	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=61,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:2,8:0,6:0,2,8,6
chr11	119989107	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=169,272;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr11	119989123	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	120007889	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=198,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr11	120097498	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,2:6,1:5,4,2,1
chr11	120097537	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=145,52;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:0|1:120097537_G_T:120097537:10,6,1,1
chr11	120097554	.	G	GGTTGCAGT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=175,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:120097537_G_T:120097537:8,3,1,1
chr11	120097558	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=175,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:120097537_G_T:120097537:8,3,1,1
chr11	120175804	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:12,3:19,0:18,13,0,3
chr11	120186190	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=194,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:1,1:2,4:0,3,2,3
chr11	120187971	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=98,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.833:16:2,7:0,7:1,1,8,6
chr11	120188964	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,5:4,4:6,0,7,2
chr11	120291542	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,0:7,2:5,8,0,2
chr11	120292477	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=188,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:9,4:3,4:7,5,5,3
chr11	120312351	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=198,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,3:3,0:8,0,3,0
chr11	120319070	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=195,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,0:2,1:0|1:120319070_TAA_T:120319070:0,3,0,1
chr11	120319076	.	A	ATAGTTTTTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=195,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:120319070_TAA_T:120319070:0,3,0,1
chr11	120319078	.	T	TGGTGAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=195,78;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,0:2,1:0|1:120319070_TAA_T:120319070:0,3,0,1
chr11	120348128	.	GTT	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=230,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.411:3:0,0:1,1:0|1:120348128_GTT_G:120348128:1,1,1,0
chr11	120348148	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=200,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.292:5:3,0:1,0:0|1:120348128_GTT_G:120348128:2,2,1,0
chr11	120348150	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,10;MFRL=200,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.292:5:3,0:0,0:0|1:120348128_GTT_G:120348128:2,2,1,0
chr11	120530973	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.460:13:5,2:2,3:5,2,3,3
chr11	120690372	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=103,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:1,1,3,0
chr11	120707644	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=296,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr11	120732624	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=215,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:3,0,1,0
chr11	120823528	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr11	120823721	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:0,4,1,2
chr11	120831520	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=255,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:0,6:2,0:2,0,6,0
chr11	120837821	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=249,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr11	120924422	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=165,251;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:7,3:6,0:4,10,1,2
chr11	120980098	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=146,137;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.146:39:14,5:18,0:27,7,5,0
chr11	120989238	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.164:26:14,0:7,3:6,16,0,4
chr11	121028921	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=162,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:2,10,0,2
chr11	121037529	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=92,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.481:4:0,0:2,1:0,2,0,2
chr11	121038980	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=175,116;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:2,6,2,0
chr11	121175278	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=233,215;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr11	121348741	.	CAAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.402:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr11	121367557	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:1,2:3,2:3,1,4,0
chr11	121393212	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr11	121393226	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=184,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,0:2,4:4,1,4,0
chr11	121393450	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,1:6,6:4,4,6,1
chr11	121393684	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=182,91;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.554:18:4,4:4,5:3,5,5,5
chr11	121403345	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr11	121414361	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=219,206;MMQ=60,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,0:8,3:2,9,0,3
chr11	121416187	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=192,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,3:4,4:0,8,0,7
chr11	121424882	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,1:6,5:1,9,0,6
chr11	121426042	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=131,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,2:5,2:6,8,3,1
chr11	121437571	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=121,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,3:2,5:3,0,7,1
chr11	121445084	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=79.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,13:0,8:0,0,10,11
chr11	121454149	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:9,2:15,2:19,5,3,1
chr11	121456898	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=173,144;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:8,0:11,4:12,8,4,0
chr11	121456962	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,3:0,11:0,0,8,6
chr11	121460664	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=192,251;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr11	121460949	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=237,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:0,6,1,1
chr11	121475798	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr11	121483401	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.926:25:0,7:1,17:1,0,17,7
chr11	121489416	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,6:2,2:4,0,5,3
chr11	121489563	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.249:30:12,4:11,3:9,14,3,4
chr11	121489696	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=165,165;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,1:0|1:121489696_C_T:121489696:0,4,0,2
chr11	121489699	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=165,165;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:121489696_C_T:121489696:0,4,0,2
chr11	121493001	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=167,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:2,2,1,7
chr11	121493072	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.791:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	121986813	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,2:7,0:9,11,1,1
chr11	122647685	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=232,397;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,1:4,1:7,7,2,0
chr11	122650172	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:3,2,4,1
chr11	122653950	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=208,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,2:1,0:0,4,0,4
chr11	122665452	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=164,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr11	122665549	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,262;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,1:8,1:7,10,0,2
chr11	122678911	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,4:4,6:3,6,4,6
chr11	122680557	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:4,4:5,0:2,7,4,1
chr11	122709178	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=253,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr11	122720710	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr11	122724592	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=244,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:4,1,2,0
chr11	122738062	.	CAA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr11	122738261	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr11	122756687	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:7,1:13,4:7,13,4,1
chr11	122775227	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr11	122795782	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=113,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:1,2,0,3
chr11	122817187	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:2,0:4,1,2,0
chr11	122830080	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=120,164;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:11,0:5,7:8,8,0,7
chr11	122830214	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=376,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr11	122928934	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=115,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.504:10:0,2:3,1:3,2,2,3
chr11	122929624	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=201,263;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:5,2,0,2
chr11	123454978	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=113,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.796:8:0,2:1,2:1,0,4,3
chr11	123455101	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=317,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr11	123455109	.	G	A,GTAAAGAAATGTAATGCTTTAAGGAACA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25,32;MFRL=0,249,184;MMQ=60,60,60;MPOS=9,0;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.95,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,2,1:0,0,0:0,0,0,3
chr11	123477240	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr11	123504959	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=334,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:1,3,1,3
chr11	123516244	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,167;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,5:6,0:9,2,5,0
chr11	123524411	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:12,1:1,3:10,3,3,1
chr11	123600247	.	GGAGAAATGTCC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=191,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAGAAATGTCC;STR;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,2:1,1:0,1,3,0
chr11	123600538	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=168,397810;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:2,6,0,2
chr11	123676413	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=207,173;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:9,2,1,1
chr11	123754073	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=215,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,4:3,5:0,4,3,6
chr11	123754949	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=259,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.309:7:0,0:5,1:2,3,2,0
chr11	123778173	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=176,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr11	123813940	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=219,177;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.708:22:1,13:5,3:2,4,10,6
chr11	123847392	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=36,31;MFRL=271,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:3,0,4,1
chr11	123847473	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=113,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,1:6,2:8,7,3,0
chr11	123847522	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=171,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,2:9,0:7,8,2,0
chr11	123894006	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,246;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	123994008	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=237,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:4,1,5,1
chr11	124007455	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=181,133;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:124007455_CA_C:124007455:0,3,0,1
chr11	124007462	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=181,133;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:124007455_CA_C:124007455:0,3,0,1
chr11	124007701	.	CTT	C,CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31,32;MFRL=134,0,296;MMQ=60,60,60;MPOS=13,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.50,8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,4:0.200,0.349:12:3,1,1:3,1,3:5,1,6,0
chr11	124016724	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=173,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.590:10:2,3:1,3:0,4,0,6
chr11	124016740	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=145,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr11	124135438	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=190,22;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:7,3:11,2:12,6,1,4
chr11	124135481	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=195,99;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.471:30:6,8:9,5:9,7,8,6
chr11	124135677	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=185,205;MMQ=60,53;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:5,11,1,1
chr11	124179656	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=160,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr11	124190137	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=161,285;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr11	124293767	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=168,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr11	124309966	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,4,1
chr11	124439883	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=218,205;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,5:2,2:2,0,7,0
chr11	124494780	.	A	AT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.407:24:4,6:10,4:9,5,7,3
chr11	124500265	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=139,86;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,4:4,0:7,3,3,1
chr11	124500761	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,0:5,3:3,7,2,1
chr11	124501921	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=276,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:3,1,1,1
chr11	124508345	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=186,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr11	124509525	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr11	124517473	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.342:10:0,0:5,3:0,7,0,3
chr11	124519478	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=206,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:7,2:5,2:10,2,2,2
chr11	124539236	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,1:4,3:5,3,2,2
chr11	124545231	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=122,57;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:16,0:6,3:12,10,1,2
chr11	124609918	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=135,296;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:124609918_A_C:124609918:0,3,1,0
chr11	124609922	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=135,296;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:124609918_A_C:124609918:0,3,1,0
chr11	124609929	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=135,296;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:124609918_A_C:124609918:0,3,1,0
chr11	124610011	.	C	CG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=122,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:5,3:4,3:6,3,3,3
chr11	124619841	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=247,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	124623492	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=270,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr11	124623801	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=150,54;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:14,0:12,3:0|1:124623801_G_C:124623801:13,13,0,3
chr11	124623806	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=142,54;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:12,0:10,3:0|1:124623801_G_C:124623801:12,12,0,3
chr11	124739332	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=147,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:0,3:5,2:4,2,1,4
chr11	124739988	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:3,2,0,4
chr11	124740257	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=213,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:2,0:1,4,1,1
chr11	124740410	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr11	124740691	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr11	124740980	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=174,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:7,4:2,0:1,8,1,3
chr11	124742230	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,0:6,2:7,3,2,0
chr11	124742731	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	124747333	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=87,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:0,7:2,5:1,1,8,4
chr11	124748196	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=169,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:5,1:3,5:6,2,5,2
chr11	124749584	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=123,274;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:2,1,4,0
chr11	124750232	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr11	124750447	.	CCGGAGT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGGAGT;STR;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:8,5:3,5:3,8,1,9
chr11	124751241	.	A	ATGAAGACTGCCGACT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=231,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.375:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr11	124754887	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=162,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.427:19:6,0:5,8:6,5,0,8
chr11	124756406	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,263;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,4:4,0:4,3,2,2
chr11	124757560	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr11	124757758	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=172,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:2,2:0|1:124757758_T_C:124757758:2,4,1,2
chr11	124757762	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=180,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,1:1,2:0|1:124757758_T_C:124757758:1,4,1,2
chr11	124757815	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=261,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr11	124763647	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=154,120;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.547:20:3,8:6,3:3,6,6,5
chr11	124763989	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=199,99;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:1,3,1,2
chr11	124765168	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=136,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:0,4,0,7
chr11	124765182	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=113,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,0:1,5:0,2,0,5
chr11	124766591	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,12:0,0,8,17
chr11	124767776	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=16,13;MFRL=210,210;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.303:22:1,0:0,0:0,15,0,7
chr11	124790587	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	124792173	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=205,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,1:0,6:3,0,6,1
chr11	124792627	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=118,134;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr11	124793716	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:11,1:11,2:7,15,1,2
chr11	124856563	.	CTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.549:9:2,4:2,1:4,0,5,0
chr11	124856951	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	124908978	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=122,195;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:3,9,0,2
chr11	124946817	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:124946817_C_A:124946817:0,2,0,3
chr11	124946823	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:124946817_C_A:124946817:0,2,0,2
chr11	124947051	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	124949041	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=133,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:12,2:13,1:12,13,0,3
chr11	124949044	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=160,124;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:10,4:7,7:5,12,6,5
chr11	124949665	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=183,129;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.377:13:3,2:5,1:4,4,1,4
chr11	124949690	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=156,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.321:14:4,0:3,4:4,6,0,4
chr11	124951311	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=21,35;MFRL=115,194;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.319:17:6,2:5,3:8,4,2,3
chr11	124951467	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr11	124954282	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=185,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr11	124954652	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr11	124955274	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=221,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,3:1,3:2,0,5,1
chr11	124955977	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,4,7
chr11	124958122	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	124967487	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=105,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:1,7:4,9:2,3,8,8
chr11	124967678	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=106,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,3:5,4:2,4,0,7
chr11	124972208	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	125255715	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=103,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr11	125298871	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,13:0,6:0,0,9,10
chr11	125299804	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=210,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:2,0:4,2,2,0
chr11	125316073	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=164,250;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:3,2,2,1
chr11	125323965	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,2:0,6:0,1,7,1
chr11	125326024	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=194,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr11	125326026	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr11	125442503	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.523:10:3,3:2,2:0,5,2,3
chr11	125452221	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=184,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr11	125452300	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=47.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,7,9
chr11	125452313	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=117,245;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,2:3,1:3,8,1,2
chr11	125472337	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,113;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.423:12:2,2:4,2:4,3,2,3
chr11	125472719	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=130,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.352:32:13,11:8,0:9,12,11,0
chr11	125478209	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,1:7,1:8,11,0,2
chr11	125488247	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=159,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,0:1,1:4,0,2,0
chr11	125488282	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=188,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.364:11:2,0:3,0:5,2,4,0
chr11	125490765	.	ATT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=15,29;MFRL=139,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=T;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,0:0,2:0,2,1,1
chr11	125497466	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=175,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:9,1:1,2:7,3,2,1
chr11	125505377	.	G	GA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=155,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:8,1:14,2:12,10,2,1
chr11	125514573	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,5:1,8:1,1,1,12
chr11	125547660	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=125,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:3,3,2,0
chr11	125616483	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=66.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0|1:125616483_G_T:125616483:0,0,10,6
chr11	125616502	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,17:0.901:18:1,6:0,11:0|1:125616483_G_T:125616483:1,0,10,7
chr11	125617376	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=75,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.783:7:0,2:1,4:1,0,4,2
chr11	125617769	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=214,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr11	125618728	.	CACT	C,CCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33,31;MFRL=230,186,169;MMQ=60,60,60;MPOS=19,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,1,1:1,0,0:0,3,0,2
chr11	125647712	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,6,3
chr11	125647982	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr11	125648321	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=195,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:2,2:9,0:11,0,2,0
chr11	125648503	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,13,10
chr11	125648519	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=118,132;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:12,4,0,2
chr11	125659423	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:2,3:1,11:1,2,0,14
chr11	125708198	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	125763582	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,11;MFRL=278,87;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,0:3,0,2,0
chr11	125763610	.	AT	A,ATT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30,33;MFRL=214,255,209;MMQ=60,60,60;MPOS=27,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.19,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.248,0.248:9:3,0,2:2,2,0:5,0,4,0
chr11	125765714	.	TAG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=261,304;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,1,0
chr11	125766173	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr11	125766204	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0|1:125766204_G_C:125766204:0,0,1,11
chr11	125766207	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0|1:125766204_G_C:125766204:0,0,0,12
chr11	125770605	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=128,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr11	125770618	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	125778074	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=293,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:1,0,3,2
chr11	125780194	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=199,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:3,0,5,1
chr11	125788426	.	T	TGGGGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=355,262;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:125788426_T_TGGGGC:125788426:1,0,1,0
chr11	125788428	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,12;MFRL=355,262;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:125788426_T_TGGGGC:125788426:1,0,1,0
chr11	125788432	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=113961112,309;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,1:0,0:1,0,2,0
chr11	125788438	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,12;MFRL=56980734,262;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:125788426_T_TGGGGC:125788426:2,0,1,0
chr11	125850881	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,250;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:4,1,3,0
chr11	125859675	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:0|1:125859675_CT_C:125859675:2,5,0,2
chr11	125859678	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:125859675_CT_C:125859675:2,5,0,2
chr11	125864326	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=200,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:2,3:0,1:0,2,1,4
chr11	125867039	.	TATATAA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=238,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.589:10:2,3:2,3:0|1:125867039_TATATAA_T:125867039:4,0,6,0
chr11	125867053	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,5:0,6:0|1:125867039_TATATAA_T:125867039:0,0,11,1
chr11	125873723	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=128,187;MMQ=60,44;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.397:10:2,4:4,0:5,1,4,0
chr11	125887311	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=207,323;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr11	125889526	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=112,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,0:6,3:11,4,1,2
chr11	125889673	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=196,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,1,1
chr11	125893275	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=134,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,1:10,3:6,10,3,1
chr11	125893475	.	T	TAGATTCCTTTAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=360,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	126080757	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,5:3,5:5,1,5,5
chr11	126080776	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=127,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:5,1:9,6,2,0
chr11	126081336	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=110,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:0,8:3,3:2,1,10,2
chr11	126110978	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=217,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:1,2,0,3
chr11	126135139	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=239,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.721:16:2,4:2,7:1,3,6,6
chr11	126135785	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,3:2,7:5,2,5,5
chr11	126137263	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=168,78;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,0:10,2:9,14,1,1
chr11	126137274	.	AG	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=173,165;MMQ=60,56;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,0:9,2:10,14,0,2
chr11	126137854	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,6:3,1:3,3,6,1
chr11	126142990	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,3:4,1:4,3,0,4
chr11	126145931	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,1:0,6:3,0,7,0
chr11	126146244	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=71.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.967:24:0,9:0,15:0,0,22,2
chr11	126160687	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=164,265;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr11	126163064	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=240,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:1,2,0,3
chr11	126163691	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr11	126176376	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	126213395	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=184,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:1,1,0,3
chr11	126276326	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=240,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:5,5:2,0:6,1,6,0
chr11	126276406	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=80,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,0:4,3:2,9,2,1
chr11	126277216	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=190,248;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,3:10,1:6,10,3,1
chr11	126277570	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=166,277;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,2:2,0:2,6,0,2
chr11	126279365	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=198,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr11	126283300	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:126283300_C_G:126283300:3,0,1,0
chr11	126283305	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:126283300_C_G:126283300:3,0,1,0
chr11	126283785	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,272;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,3,1
chr11	126301449	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=134,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0,7,0,2
chr11	126301481	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	126305279	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,281;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	126310299	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=190,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr11	126315024	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=97,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.753:14:0,4:3,7:1,2,1,10
chr11	126316610	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr11	126391409	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr11	126391450	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=88,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr11	126396674	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=353,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,3:0,5:0,2,0,8
chr11	126432777	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=171,161;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:8,0:6,3:0|1:126432777_AG_A:126432777:8,7,0,4
chr11	126432783	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=171,161;MMQ=60,57;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:9,0:6,4:0|1:126432777_AG_A:126432777:8,7,0,4
chr11	128354803	.	CT	GA	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.106:35:13,0:15,3:0|1:128354803_CT_GA:128354803:19,13,0,3
chr11	128354807	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:15,0:17,3:0|1:128354803_CT_GA:128354803:19,13,0,3
chr11	128354946	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:13,2:11,0:8,16,0,3
chr11	128355859	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=196,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr11	128391937	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:8,4:2,2:2,8,2,4
chr11	128442949	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:11,3:4,0:12,3,3,0
chr11	128443083	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0|1:128443083_G_C:128443083:0,8,0,2
chr11	128443099	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=174,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:0|1:128443083_G_C:128443083:0,8,0,3
chr11	128638216	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	128642979	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=245,260;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr11	128652012	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr11	128772355	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=133,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr11	128774474	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=195,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:1,5,1,4
chr11	128782100	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=248,281;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,0:5,3:0,5,0,4
chr11	128786294	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=238,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.833:16:2,9:0,5:1,1,6,8
chr11	128807486	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:10,4:9,0:15,5,4,0
chr11	128842251	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	128843178	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=151,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:10,4:10,0:15,5,4,0
chr11	128846547	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=186,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,5:1,5:1,0,3,7
chr11	128857882	.	TAAG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr11	128932128	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=103,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,6:1,4:2,0,4,7
chr11	128936863	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,343;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	128963463	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=179,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:0,5:6,0:7,0,5,0
chr11	129312660	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,3:5,0:4,2,2,1
chr11	129321026	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=239,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,3:2,7:5,2,4,6
chr11	129727148	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=242,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:7,1,3,1
chr11	129735677	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=138,210;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr11	129743012	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=186,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:1,6:2,7:2,1,1,12
chr11	129746554	.	T	TCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=191,245;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,0:4,3:0|1:129746554_T_TCA:129746554:8,0,3,0
chr11	129746555	.	G	GAGTTA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=191,245;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,0:4,3:0|1:129746554_T_TCA:129746554:8,0,3,0
chr11	129752991	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,5:4,1:4,2,4,2
chr11	129753900	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=184,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=36.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:0,7:4,4:4,0,11,0
chr11	129753945	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:12,3:7,6:9,10,6,3
chr11	129754103	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=217,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,5:1,5:0,2,0,10
chr11	129754627	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=207,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.499:20:5,7:5,3:6,4,6,4
chr11	129754644	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=222,192;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:5,7:2,6:5,2,7,6
chr11	129785816	.	AAACT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=413,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr11	129817155	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:7,4:9,6:5,11,5,5
chr11	129998900	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr11	129999969	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,307;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:6,4,2,2
chr11	130058918	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=180,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:1,7,0,2
chr11	130060612	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr11	130060640	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:130060640_G_A:130060640:0,2,0,1
chr11	130060644	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:130060640_G_A:130060640:0,3,0,1
chr11	130064223	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=109,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr11	130064647	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,9,4
chr11	130064705	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=214,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr11	130066335	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=228,188;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,5:3,3:3,1,3,5
chr11	130066372	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=234,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:1,1,3,3
chr11	130066452	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=195,254;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:0,1:2,3:2,1,2,3
chr11	130068526	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:2,8,2,0
chr11	130068554	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,0:2,4:0,7,1,3
chr11	130068980	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=139,264;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:1,7,0,2
chr11	130069790	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	130131615	.	A	ACTTTGGG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=164,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:11,0:0|1:130131615_A_ACTTTGGG:130131615:9,12,0,2
chr11	130131616	.	A	AG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=164,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:10,0:0|1:130131615_A_ACTTTGGG:130131615:9,12,0,2
chr11	130131618	.	C	CCCGCCCTCCCTGGT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=164,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:12,0:0|1:130131615_A_ACTTTGGG:130131615:9,12,0,2
chr11	130278924	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=282,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr11	130284344	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr11	130286766	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=215,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr11	130331907	.	T	TGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr11	130332338	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=149,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.539:9:1,1:3,3:3,1,5,0
chr11	130332457	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=178,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:4,3:7,0:2,10,3,0
chr11	130339147	.	T	TGTGTGTGCATGTCTGCATGTATGTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=166,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:6,3,1,1
chr11	130340843	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,2:12,0:15,6,1,1
chr11	130775782	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr11	130776437	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr11	130776454	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr11	130776613	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=184,157;MMQ=50,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:2,6:0,7:0,2,3,10
chr11	130776646	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0,0,2,11
chr11	130776690	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=19,29;MFRL=235,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:0,2:0,2:0,1,1,3
chr11	130776701	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=235,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr11	130777813	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=218,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.764:15:1,5:2,7:2,1,9,3
chr11	130777886	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=280,121;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.739:21:3,7:2,9:2,3,12,4
chr11	130780225	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chr11	130780269	.	CCAAAA	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=18,35;MFRL=181,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.673:7:0,3:0,2:0,2,1,4
chr11	130780270	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=244,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr11	130781475	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=229,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr11	130781675	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=214,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,11:0.750:14:3,4:0,7:0|1:130781675_C_T:130781675:0,3,2,9
chr11	130781685	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=207,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,13:0.737:17:4,5:0,7:0|1:130781675_C_T:130781675:0,4,1,12
chr11	130781767	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	130784396	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,5:3,6:3,3,4,7
chr11	131531000	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,4,13
chr11	131531015	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,4,12
chr11	132177563	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,1:4,1:10,2,1,1
chr11	132177740	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=214,288;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr11	132184394	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=213,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,3,1
chr11	132200128	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=163,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.498:14:4,2:3,5:5,2,5,2
chr11	132306704	.	GG	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=183,99;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:0|1:132306704_GG_CA:132306704:0,7,1,1
chr11	132306708	.	TG	CA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=172,99;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:2,1:0|1:132306704_GG_CA:132306704:0,7,1,1
chr11	132527137	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,0;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,0:9,2:11,5,2,0
chr11	132813084	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr11	133712348	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=235,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr11	133712473	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=218,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:4,2:5,5:5,5,2,5
chr11	133788869	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=193,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr11	133791354	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	133792021	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:7,4:1,2:4,4,5,1
chr11	133797029	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,13;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.540:9:1,1:1,1:2,2,0,5
chr11	133805440	.	AGCCT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=229,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr11	134009860	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=161,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr11	134054705	.	TAC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=154,175;MMQ=50,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=AC;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:0,1:0,0:1,1,1,0
chr11	134062750	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=190,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:7,0:15,6:9,14,0,6
chr11	134105030	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr11	134118382	.	CA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.228:14:5,2:6,1:1,10,1,2
chr11	134121261	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr11	134126612	.	TG	CA,CG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25,27;MFRL=203,85,190;MMQ=60,60,60;MPOS=25,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.04,17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,6:0.252,0.594:9:1,1,4:0,0,2:0,1,0,8
chr11	134132559	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=332,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr11	134151397	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=170,256;MMQ=45,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr11	134151436	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=197,260;MMQ=43,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr11	134152030	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.543:22:7,5:3,7:3,7,1,11
chr11	134158817	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=116,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:5,2:0,0:1,4,1,1
chr11	134179756	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=211,838;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,0:3,4:0,7,4,0
chr11	134181101	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=165,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:8,2:2,1:1,9,1,2
chr11	134182682	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:6,3:11,0:12,6,4,0
chr11	134182856	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:0,1,1,9
chr11	134184141	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=181,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,2:1,1:5,1,3,0
chr11	134188851	.	ATTT	A,ATTTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,30,28;MFRL=202,198,115;MMQ=60,60,60;MPOS=20,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,16;RU=T;STR;TLOD=5.74,15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,8:0.204,0.692:11:1,1,5:0,1,3:0,1,4,6
chr11	134201864	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=208,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr11	134212895	.	TG	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:134212895_TG_AA:134212895:0,4,0,1
chr11	134212898	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:134212895_TG_AA:134212895:0,4,0,1
chr11	134214407	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=63184,132;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.634:9:1,6:2,0:0,3,1,5
chr11	134214445	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr11	134214863	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=173,248;MMQ=52,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:2,2,2,0
chr11	134217210	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=184,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.679:20:3,8:3,5:3,3,7,7
chr11	134217394	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=233,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:134217394_T_C:134217394:1,2,0,1
chr11	134217396	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=233,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:134217394_T_C:134217394:1,2,0,1
chr11	134234186	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=292,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr11	134234406	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=224,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr11	134237200	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:9,4:3,3:6,6,2,5
chr11	134239888	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=199,237;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr11	134244426	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=348,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,4,0
chr11	134244631	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,2,2
chr11	134251777	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=179,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr11	134253495	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.569:5:0,0:2,0:0|1:134253495_A_C:134253495:2,0,3,0
chr11	134253499	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.569:5:0,0:2,0:0|1:134253495_A_C:134253495:2,0,3,0
chr12	247339	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=18,32;MFRL=226,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:247339_A_C:247339:1,0,1,0
chr12	247343	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:247339_A_C:247339:3,0,1,0
chr12	247346	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,16;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:247339_A_C:247339:3,0,1,0
chr12	250239	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=162,268;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,1:5,2:3,4,3,0
chr12	266171	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,106;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:7,2,2,0
chr12	266822	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=178,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,2:12,0:0|1:266822_G_A:266822:8,12,1,1
chr12	266826	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=178,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:6,2:10,0:0|1:266822_G_A:266822:8,12,1,1
chr12	266835	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=224,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,2:0.165:16:4,1:10,1:1|0:266822_G_A:266822:9,5,0,2
chr12	271022	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr12	274572	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr12	274839	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=167,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,3:6,1:4,3,3,1
chr12	275065	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=176,225;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:9,5:11,1:9,11,5,1
chr12	278082	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=111,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr12	301843	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=124,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:5,5:0,5:3,2,5,5
chr12	302492	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=89,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,3:9,4:8,7,2,5
chr12	305254	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=180,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,0:6,3:9,0,3,0
chr12	310901	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=177,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:5,1:4,4:7,2,5,0
chr12	311816	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr12	330275	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=90,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr12	347068	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=195,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.710:11:1,2:1,6:1,2,7,1
chr12	351711	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=230,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,4,1
chr12	351927	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:10,0:4,5:4,10,0,5
chr12	394771	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=142,101;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.166:27:8,4:14,0:13,10,3,1
chr12	394919	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:394919_T_C:394919:0,4,0,1
chr12	394927	.	A	AATAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:394919_T_C:394919:0,4,0,1
chr12	416046	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=201,217;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.444:5:2,0:1,1:3,0,1,1
chr12	432383	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=82,68;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.142:33:15,0:13,4:0|1:432383_A_G:432383:19,10,1,3
chr12	432390	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=116,68;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.199:33:12,1:15,4:0|1:432383_A_G:432383:15,12,2,4
chr12	438271	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=241,232;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr12	442620	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=127,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:7,0,2,0
chr12	461290	.	A	AAAAAGAAAAAAAAAAGATTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=122,185;MMQ=60,36;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:461290_A_AAAAAGAAAAAAAAAAGATTTTT:461290:0,1,1,0
chr12	461299	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=134,185;MMQ=60,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:1,0:2,1:0|1:461290_A_AAAAAGAAAAAAAAAAGATTTTT:461290:2,1,1,0
chr12	463388	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:12,1:0|1:463388_C_T:463388:12,8,0,2
chr12	463397	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:11,2:0|1:463388_C_T:463388:11,10,0,2
chr12	464254	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	495217	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=188,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr12	520944	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:8,2:3,4:8,3,4,2
chr12	537841	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr12	539984	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,198;MMQ=52,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr12	540994	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr12	542517	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:3,7,0,2
chr12	547755	.	T	TGATTCCAATCGATGATGATTGCATCTGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr12	550911	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.489:8:2,2:1,2:0|1:550911_CT_C:550911:3,1,4,0
chr12	550929	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.637:12:1,0:3,0:0|1:550911_CT_C:550911:2,2,8,0
chr12	653984	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=113,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,3:2,6:5,1,8,1
chr12	659035	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:11,2:6,0:9,8,1,1
chr12	665655	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=225,243;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:7,1,2,0
chr12	666943	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=125,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chr12	675304	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=150,88;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:11,0:14,3:12,17,1,2
chr12	675441	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr12	772545	.	CTT	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:11,2:7,0:0|1:772545_CTT_C:772545:12,6,0,2
chr12	772553	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:6,0:0|1:772545_CTT_C:772545:10,7,0,2
chr12	772656	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=223,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:3,5:8,2:0|1:772656_A_T:772656:3,8,1,6
chr12	772673	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=245,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,4:0.263:17:6,1:7,3:1|0:772656_A_T:772656:3,10,1,3
chr12	862641	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=213,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr12	863517	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=190,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,4:4,6:3,6,3,7
chr12	936468	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=163,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,3:0,3:3,2,3,3
chr12	970093	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=207,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,0:0,1:1,0,2,0
chr12	970296	.	GA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.292:21:6,2:6,4:6,9,3,3
chr12	978527	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:14,0:7,2:13,8,0,2
chr12	978825	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr12	987298	.	G	GCCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=211,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:987298_G_GCCA:987298:4,0,1,1
chr12	987300	.	C	CCAGTTTTGACAAAGTAGCAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=211,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:987298_G_GCCA:987298:4,0,1,1
chr12	987482	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.257:33:13,4:10,4:15,10,4,4
chr12	987515	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:11,0:7,2:0|1:987515_A_G:987515:9,9,0,2
chr12	987525	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=145,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,2:0|1:987515_A_G:987515:6,9,0,2
chr12	987533	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.340:13:4,2:4,1:4,5,0,4
chr12	989800	.	CT	C,CTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33,27;MFRL=0,232,86;MMQ=60,60,60;MPOS=11,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=5.58,5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.501,0.376:5:0,2,0:0,1,2:0,0,4,1
chr12	990999	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=199,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,1:3,4:5,3,4,1
chr12	991009	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:5,2,5,2
chr12	991306	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=186,256;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr12	994431	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=195,62;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0|1:994431_C_T:994431:9,5,1,1
chr12	994454	.	C	CTGAGGATCACTGTTACAGAAAAAG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=187,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.183:14:6,0:6,2:0|1:994431_C_T:994431:9,3,1,1
chr12	994487	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr12	995291	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr12	996404	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=197,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,1:15,1:8,16,2,0
chr12	999762	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr12	1003837	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,77;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,3:4,6:4,7,3,6
chr12	1022452	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=193,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:4,3:5,2:0|1:1022452_C_T:1022452:9,0,5,0
chr12	1022453	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=225,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,5:0.375:14:4,3:5,2:1|0:1022452_C_T:1022452:9,0,5,0
chr12	1022679	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=178,342;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0,6,1,1
chr12	1040373	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=217,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,3:1,6:2,2,6,3
chr12	1214042	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=102,61;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr12	1219286	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=190,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr12	1224972	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=247,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,0:2,4:0|1:1224972_A_C:1224972:2,1,4,1
chr12	1224980	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=247,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.601:8:1,1:2,4:0|1:1224972_A_C:1224972:2,1,4,1
chr12	1292399	.	CTA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=129,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,5:4,1:8,0,6,0
chr12	1372114	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=156,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr12	1517464	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:1517464_G_T:1517464:0,1,0,1
chr12	1517467	.	A	AAAATAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1517464_G_T:1517464:0,1,0,1
chr12	1675847	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=185,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:2,1,3,1
chr12	1748838	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	1863728	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,5:0,0,1,6
chr12	1889823	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr12	1890126	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=143,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:18,0:18,2:0|1:1890126_G_T:1890126:17,20,0,2
chr12	1890136	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=26,35;MFRL=140,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:16,0:18,2:0|1:1890126_G_T:1890126:17,21,0,2
chr12	1890138	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=134,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:16,0:17,2:0|1:1890126_G_T:1890126:17,22,0,2
chr12	1890140	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=137,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:17,0:17,2:0|1:1890126_G_T:1890126:17,22,0,2
chr12	1890145	.	C	CCAGTGCTAATGTAAT	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=141,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:19,0:17,2:0|1:1890126_G_T:1890126:14,24,0,2
chr12	1893266	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=148,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:6,4:7,4:7,6,1,7
chr12	1895073	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,0:9,3:12,5,2,1
chr12	1902766	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=197,96;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,3:5,0:7,2,2,1
chr12	1909656	.	GC	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:3,3:8,2:0,12,0,5
chr12	1919543	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=198,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,5:1,1:3,2,2,4
chr12	1950011	.	A	AC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=169,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,7:1,4:0,1,3,8
chr12	1953727	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=175,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:6,2:0|1:1953727_A_T:1953727:1,11,1,1
chr12	1953730	.	T	TGC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=183,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,0:6,2:0|1:1953727_A_T:1953727:1,10,1,1
chr12	1955664	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:1955664_G_T:1955664:0,0,3,0
chr12	1955668	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,298;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:1955664_G_T:1955664:0,0,4,0
chr12	1955890	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr12	1967853	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=230,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:1,4,1,3
chr12	1969262	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=289,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:2,2,2,1
chr12	1993337	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr12	1995042	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=233,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr12	1995622	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=146,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,2:1,6:0,1,0,8
chr12	2016550	.	A	ATTGTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.771:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	2018987	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=184,284;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr12	2023915	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	2055266	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=316,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr12	2058245	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=114,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:11,9:5,3:6,10,7,6
chr12	2102623	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=170,237;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr12	2107036	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:3,2:9,1:10,2,2,1
chr12	2113348	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=177,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,1:1,1:2,0,2,0
chr12	2229476	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,4:6,2:4,8,5,1
chr12	2558186	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:4,6,1,1
chr12	2602307	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.270:24:9,3:8,3:12,6,4,2
chr12	2613521	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr12	2659044	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=197,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.570:5:0,0:2,3:1,1,2,1
chr12	2659082	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=214,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:5,2,1,1
chr12	2676683	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=237,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:1,0,6,2
chr12	2690702	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr12	2692186	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr12	2702535	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=202,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,2:3,0:1,7,0,2
chr12	2706720	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr12	2719655	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=21,12;MFRL=214,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.366:11:1,0:2,0:5,2,4,0
chr12	2719657	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=22,12;MFRL=214,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.374:11:1,1:3,0:5,2,4,0
chr12	2719678	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,19;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.223:11:3,0:3,1:5,4,2,0
chr12	2719934	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=164,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr12	2720988	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=236,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr12	2743360	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,641425;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.638:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr12	2743650	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr12	2757756	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr12	2757769	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr12	2757782	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=154,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,1,4
chr12	2760708	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=154,214;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:0,2:2,2:0,2,5,0
chr12	2760956	.	C	CTTATCCCTGCCTCCCACTGCCACACCATAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=178,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,0:3,2:3,3,1,1
chr12	2760970	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=170,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.772:7:1,2:0,2:0,1,2,4
chr12	2774241	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,437;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr12	2774668	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.592:3:1,1:0,0:1,0,2,0
chr12	2788754	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:12,1:12,1:11,13,2,0
chr12	2791635	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=299,148;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr12	2795019	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=166,126;MMQ=60,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:8,2:5,2:7,6,2,2
chr12	2795043	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=179,235;MMQ=60,30;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:5,5,1,1
chr12	2795255	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=279,186;MMQ=33,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,3:0,3:0,1,6,0
chr12	2910237	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=309,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:0,6:3,5:3,0,6,5
chr12	2926543	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=223,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr12	2926556	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=233,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr12	2930645	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=212,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:4,3:0,4:2,2,6,1
chr12	2933263	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=164,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,2:11,0:8,9,2,0
chr12	2936276	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr12	2936802	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.393:26:7,6:9,4:0|1:2936802_G_T:2936802:5,11,10,0
chr12	2936807	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=139,130;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.393:26:6,6:10,4:0|1:2936802_G_T:2936802:6,10,10,0
chr12	2981498	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=189,164;MMQ=60,35;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr12	2994727	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=355,67;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr12	3018675	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=154,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:1,2:1,3:2,2,3,2
chr12	3018802	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=173,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,3:5,1:2,6,1,3
chr12	3048700	.	A	ACTCCAAATTGCCCCACTCAAAGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=0,166;MMQ=49,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.486:3:0,0:1,1:1,1,0,1
chr12	3049938	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,7:4,5:2,7,0,12
chr12	3121318	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,48;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:3121318_C_T:3121318:3,0,1,1
chr12	3121328	.	TGCCACAGGTCTCCA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=147,48;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:3121318_C_T:3121318:3,0,1,1
chr12	3127652	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr12	3130938	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr12	3131206	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr12	3131238	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr12	3149483	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,12,9
chr12	3149689	.	A	ACTCTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=98,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:1,2,0,1
chr12	3310335	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=134,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:3,5,5,3
chr12	3701390	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.291:12:5,2:2,1:5,4,3,0
chr12	3702219	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,3,3
chr12	3736745	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=277,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,3:2,1:1,2,1,3
chr12	3751046	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=197,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,3:5,3:0,5,1,5
chr12	3757548	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr12	3768705	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,6:2,0:2,2,1,5
chr12	3788198	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=169,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:2,3:7,0:5,4,2,1
chr12	3923361	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=93,27;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:5,10,1,1
chr12	3939128	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=142,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.187:25:12,0:7,4:13,8,0,4
chr12	3982461	.	ATT	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:9,3:8,1:11,10,2,2
chr12	3982475	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.524:29:6,10:6,5:5,9,7,8
chr12	4383158	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr12	4409117	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:3,8,2,0
chr12	4430547	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	4461435	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=215,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:5,0,2,0
chr12	4481825	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=163,70;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:5,9,1,1
chr12	4481899	.	C	CG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,2:6,2:0,11,2,3
chr12	4553332	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,11:0,0,9,10
chr12	4553383	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,5:0,0,9,8
chr12	4554548	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr12	4626131	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr12	4655670	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=228,228;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr12	4657203	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=195,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,6:1,2:2,0,6,2
chr12	4708150	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:3,3,3,1
chr12	4714008	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=231,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:4,0,3,0
chr12	4719495	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=207,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.274:15:3,0:8,4:0|1:4719495_G_A:4719495:4,7,2,2
chr12	4719503	.	TTGA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=175,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.258:16:3,0:9,4:0|1:4719495_G_A:4719495:4,8,2,2
chr12	4722944	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=214,231;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.361:12:3,0:4,4:0|1:4722944_C_T:4722944:2,6,0,4
chr12	4722951	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=231,231;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,0:4,4:0|1:4722944_C_T:4722944:1,4,0,4
chr12	4722955	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=231,231;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,0:4,4:0|1:4722944_C_T:4722944:1,4,0,4
chr12	4725134	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	4735965	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=71,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0|1:4735965_T_TC:4735965:1,1,1,3
chr12	4735969	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=141,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,3:1,1:0|1:4735965_T_TC:4735965:1,2,1,3
chr12	4758188	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.635:12:2,1:2,5:4,0,8,0
chr12	4768103	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=171,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr12	4768193	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=138,287;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:12,2:5,1:7,10,2,1
chr12	4768354	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,2:0,1,2,3
chr12	4768437	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=295,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr12	4771682	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=169,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,1:8,1:9,5,2,0
chr12	4830000	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=178,126;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:5,4:6,4:7,4,6,2
chr12	4870196	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,1:8,1:9,6,1,1
chr12	4870363	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=225,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr12	4881766	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=204,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.668:10:3,1:0,6:0|1:4881766_C_T:4881766:1,2,1,6
chr12	4881775	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=228,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:4,1:0,6:0|1:4881766_C_T:4881766:1,3,1,6
chr12	4920804	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=166,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:9,5,1,1
chr12	4921147	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=209,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:3,6,1,1
chr12	4921782	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=123,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:2,5,1,1
chr12	4922291	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,227;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:3,3:2,0:3,3,3,0
chr12	4923529	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=201,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,2:4,0:5,5,0,2
chr12	4923795	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=155,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:10,2,2,0
chr12	5022591	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:3,0:8,9:6,5,0,9
chr12	5023959	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=217,100;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:4,9:3,4:3,4,5,8
chr12	5023963	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=153,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:7,12,1,2
chr12	5026305	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=131,131;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:18,0:15,4:12,21,0,4
chr12	5603989	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=180,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:13,0:7,2:7,13,1,1
chr12	5721962	.	A	C,G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32,34;MFRL=0,192,135;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=13.67,33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,10:0.333,0.612:15:0,3,6:0,2,4:0,0,10,5
chr12	5722181	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=206,239;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr12	5756783	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=217,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr12	5756824	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=270,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,5,1
chr12	5757029	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=207,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:1,7,0,2
chr12	5936828	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,330;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr12	5936901	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=195,235;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:6,0,2,0
chr12	6059126	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	6062853	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=217,20201655;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr12	6076781	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr12	6078580	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=186,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:4,2:4,0:2,7,0,2
chr12	6078616	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=281,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,1,6
chr12	6080823	.	G	GACAAGAAGACGAACAAAAGAGC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=36,20;MFRL=170,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:4,2:2,0:0|1:6080823_G_GACAAGAAGACGAACAAAAGAGC:6080823:4,2,1,1
chr12	6080825	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=163,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:4,1:2,0:0|1:6080823_G_GACAAGAAGACGAACAAAAGAGC:6080823:5,3,1,1
chr12	6085181	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=212,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr12	6085513	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=241,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr12	6092442	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=173,298;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:8,2:1,2:2,7,1,3
chr12	6094124	.	AAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=210,254;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr12	6094845	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=246,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,2:3,4:0,3,2,4
chr12	6125716	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=146,196;MMQ=46,46;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:12,5,2,0
chr12	6128984	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	6134715	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=164,225;MMQ=52,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,2:7,1:8,7,2,1
chr12	6134987	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,213;MMQ=60,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:6,1,3,0
chr12	6145529	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=194,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:6,5:3,4:6,3,6,3
chr12	6153659	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=280,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:0,2,0,5
chr12	6161963	.	G	GAGA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=210,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=50.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:0,4:2,8:1,1,1,11
chr12	6230288	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr12	6232426	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=136,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:0,5,0,8
chr12	6344600	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=185,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:3,7:4,8:6,1,9,6
chr12	6421495	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=132,159;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:6,2:8,0:8,6,1,1
chr12	6421514	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,2:8,1:3,11,2,1
chr12	6422272	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	6435753	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:3,1:3,1:2,6,1,1
chr12	6439255	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr12	6458084	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,9,11
chr12	6463640	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,1:8,1:7,8,0,2
chr12	6463862	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=171,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:4,6:2,5:4,2,7,4
chr12	6471334	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=143,74;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,3:7,0:7,6,2,1
chr12	6483463	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr12	6495635	.	C	CA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.493:22:8,3:3,8:5,6,4,7
chr12	6500105	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,2:3,4:0,3,1,5
chr12	6559810	.	T	TGCTTCCTGATTTCATGCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=185,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:6559810_T_TGCTTCCTGATTTCATGCC:6559810:0,4,0,1
chr12	6559812	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=210,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:6559810_T_TGCTTCCTGATTTCATGCC:6559810:0,3,0,1
chr12	6560573	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=213,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.741:25:4,7:2,12:2,4,5,14
chr12	6562931	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=222,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr12	6567787	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=216,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:5,3:0,3:4,1,5,1
chr12	6569983	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=216,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.868:20:1,11:1,7:2,0,12,6
chr12	6570163	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:0,2:3,5:0,3,0,7
chr12	6573716	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=198,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:1,7:4,6:0,5,2,11
chr12	6573749	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=221,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,5:3,1:0,5,0,6
chr12	6575191	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr12	6579565	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr12	6579757	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr12	6601980	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=154,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:10,2:1,3:10,2,3,2
chr12	6602367	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=196,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:0,7,0,3
chr12	6604415	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=220,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,3:3,4:6,3,2,6
chr12	6604418	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=138,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,1:3,4:4,7,4,1
chr12	6620495	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr12	6623382	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=145,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:0|1:6623382_A_G:6623382:4,0,5,1
chr12	6623389	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=127,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0|1:6623382_A_G:6623382:3,0,4,1
chr12	6626199	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:3,6,1,1
chr12	6630161	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=156,14111061;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.242:10:2,0:6,2:6,2,2,0
chr12	6632564	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:2,3,0,3
chr12	6635374	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=213,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,1:3,2:7,3,2,1
chr12	6635567	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=187,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.783:21:1,10:3,7:1,3,8,9
chr12	6638666	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,9:5,3:8,0,9,3
chr12	6640267	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,3:5,2:2,7,0,5
chr12	6640669	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,406;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.697:1:0,0:0,0:0|1:6640669_CT_C:6640669:0,0,0,1
chr12	6640677	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,406;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6640669_CT_C:6640669:0,0,0,1
chr12	6645565	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=182,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,4:2,1:6,1,5,0
chr12	6658737	.	AG	CC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=171,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:3,0:3,5,1,1
chr12	6669257	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=130,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:3,2,5,1
chr12	6670933	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:4,9,1,1
chr12	6672837	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:12,7,2,0
chr12	6675870	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=147,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,2:7,1:9,8,3,0
chr12	6679948	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=177,241;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,0:4,2:7,5,0,2
chr12	6687114	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=170,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:1,5,1,1
chr12	6690190	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=161,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:4,1,3,2
chr12	6691452	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,5:1,1:0,5,0,6
chr12	6692112	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:3,2,1,1
chr12	6702572	.	CCT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=133,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:9,3:6,2:9,7,4,1
chr12	6705225	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=126,102;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,0:11,4:8,14,0,4
chr12	6705380	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	6707485	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=184,100;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:7,12,2,0
chr12	6708898	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,25636029;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr12	6709614	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=170,330;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:0|1:6709614_A_C:6709614:0,6,2,0
chr12	6709621	.	GA	CC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=180,330;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:6,0:0|1:6709614_A_C:6709614:1,7,2,0
chr12	6710175	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=133,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:0|1:6710175_C_A:6710175:7,9,0,2
chr12	6710180	.	A	AGAGATTGAGGGT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=154,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:6,0:12,2:0|1:6710175_C_A:6710175:9,9,0,2
chr12	6715593	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=201,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,4:1,2:0,3,1,5
chr12	6715635	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=391,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr12	6729358	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,0:7,2:6,4,2,0
chr12	6747578	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,3:1,6:0,2,2,7
chr12	6754518	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=187,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr12	6756240	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr12	6756522	.	G	GTGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=126,60;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:5,2,2,2
chr12	6762026	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr12	6777295	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=153,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,2:6,0:4,9,0,2
chr12	6782306	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=141,93;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:3,0:0|1:6782306_G_A:6782306:15,2,2,0
chr12	6782313	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=147,93;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,2:5,0:0|1:6782306_G_A:6782306:16,4,2,0
chr12	6782321	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=135,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:13,4:5,0:11,7,3,1
chr12	6782597	.	C	CCTATTTGCAGGCTTCGCT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:6782597_C_CCTATTTGCAGGCTTCGCT:6782597:2,9,0,2
chr12	6782600	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=182,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,1:5,0:0|1:6782597_C_CCTATTTGCAGGCTTCGCT:6782597:2,10,0,2
chr12	6804546	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=176,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:6804546_C_T:6804546:9,5,1,1
chr12	6804555	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=170,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:8,0:6,2:0|1:6804546_C_T:6804546:9,6,1,1
chr12	6804902	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	6833773	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=174,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,0:6,3:14,3,2,1
chr12	6833786	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=159,37;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:6,0:14,5,1,1
chr12	6858971	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=150,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,1:8,2:7,9,3,0
chr12	6859191	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:8,1:9,3:10,7,1,3
chr12	6859308	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=187,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,2:7,1:11,7,2,1
chr12	6859797	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=52,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr12	6861043	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=146,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.273:31:12,4:11,4:18,5,6,2
chr12	6875833	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6875833_C_A:6875833:0,0,1,0
chr12	6875844	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:6875833_C_A:6875833:0,0,1,0
chr12	6879202	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=144,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,0:8,4:6,5,2,2
chr12	6879279	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=225,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:4,1,2,1
chr12	6883700	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=246,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:5,0,5,0
chr12	6909380	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=140,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,5:2,4:1,3,7,2
chr12	6909388	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=63.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,8,8
chr12	6909442	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=216,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,5:2,4:1,2,6,4
chr12	6909621	.	C	CACAT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=155,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:6909621_C_CACAT:6909621:2,8,1,1
chr12	6909623	.	CC	TA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:6,0:0|1:6909621_C_CACAT:6909621:2,8,1,1
chr12	6909629	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=157,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,1:6,0:0|1:6909621_C_CACAT:6909621:2,7,1,1
chr12	6924115	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=161,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:0|1:6924115_G_C:6924115:11,10,1,1
chr12	6924121	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=161,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:0|1:6924115_G_C:6924115:11,8,1,1
chr12	6924124	.	G	GCCAATT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=165,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:8,1:0|1:6924115_G_C:6924115:10,8,1,1
chr12	6925500	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=145,206;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,10:0.243:43:14,10:19,0:11,22,10,0
chr12	6928075	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=140,348;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,1:9,2:9,5,1,2
chr12	6928400	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:3,2,1,1
chr12	6928586	.	CA	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr12	6933787	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,2:6,2:8,5,2,2
chr12	6938023	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	6940442	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=131,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:7,3:9,0:9,8,0,3
chr12	6942672	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,229;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr12	6946305	.	G	GAGGGGACGCTGTTCCGACCTCACCAGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,236;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	6946493	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr12	6946545	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,2:0,0,8,1
chr12	6948468	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=173,173;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:1,0,5,3
chr12	6948692	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr12	6950403	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=173,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:5,4,2,0
chr12	6958349	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,2:7,0:5,4,1,1
chr12	6959095	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=222,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:1,2:0,4,0,3
chr12	6965437	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=191,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:10,1:3,2:10,3,3,0
chr12	6965805	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=250,232;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,1:3,2:3,2,4,0
chr12	6969731	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=195,263;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr12	6973339	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=177,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:8,2:6,3:6,8,2,3
chr12	6979010	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:1,5,0,3
chr12	7014962	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=220,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.268:17:2,0:8,4:12,1,4,0
chr12	7015915	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,0:5,2:0,5,0,2
chr12	7016449	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=224,113;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,1:7,2:4,8,2,1
chr12	7023224	.	TGGGGTGCCTAGGCCTGAGCGTTGCCTGGAGCCTAGGCCGGGGGCCGCCCTCGGGCAGGCGTGGGTGAGAGCCAAGACCGCGTGGGCCGC	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=190,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.140:24:9,2:3,3:0|1:7023224_TGGGGTGCCTAGGCCTGAGCGTTGCCTGGAGCCTAGGCCGGGGGCCGCCCTCGGGCAGGCGTGGGTGAGAGCCAAGACCGCGTGGGCCGC_T:7023224:4,15,4,1
chr12	7023300	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=190,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1|0:7023224_TGGGGTGCCTAGGCCTGAGCGTTGCCTGGAGCCTAGGCCGGGGGCCGCCCTCGGGCAGGCGTGGGTGAGAGCCAAGACCGCGTGGGCCGC_T:7023224:0,3,0,3
chr12	7026893	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,3,5
chr12	7026932	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr12	7043167	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=152,90;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.261:25:11,6:6,0:13,6,6,0
chr12	7043528	.	GGT	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GT;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:9,1:7,1:0|1:7043528_GGT_G:7043528:8,9,0,2
chr12	7043540	.	T	TGTG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=177,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:20,2:0.125:22:12,0:7,2:1|0:7043528_GGT_G:7043528:9,11,1,1
chr12	7044647	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	7045262	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=180,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:3,0:7,0:4,7,2,0
chr12	7045891	.	ACAGCAGCAGCAGCAG	A,ACAGCAGCAGCAG,ACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,25,22,20;MFRL=139,123,99,168;MMQ=60,60,48,31;MPOS=13,5,7;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,10,14,19;RU=CAG;STR;TLOD=19.26,4.30,6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,7,3,2:0.350,0.244,0.165:15:1,3,2,1:2,4,0,0:3,0,1,11
chr12	7046077	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:13,0:10,3:11,12,2,1
chr12	7049999	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=213,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,3:5,3:10,1,5,1
chr12	7053202	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=188,290;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:1,2:4,0,3,0
chr12	7053205	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=231,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr12	7053253	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,36;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,6:4,3:6,0,9,0
chr12	7053362	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=141,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.282:29:11,4:10,3:13,8,4,4
chr12	7054859	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr12	7065281	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=200,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:1,7:1,9:1,1,11,5
chr12	7065406	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.812:24:3,13:1,7:2,2,8,12
chr12	7065576	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=187,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=71.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,25:0.813:30:3,14:2,11:4,1,15,10
chr12	7066797	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=168,259;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.373:8:1,0:3,2:0|1:7066797_A_C:7066797:2,3,3,0
chr12	7066801	.	GA	CC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=168,260;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:7066797_A_C:7066797:2,3,2,0
chr12	7066806	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=168,260;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,0:0|1:7066797_A_C:7066797:2,3,2,0
chr12	7067023	.	TGAGATGGATGAGGTGTTCCGAGAGAGGAGGGGGCACTGACCCTATGTCCTCGGCTTAGG	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=195,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.106:34:8,2:6,3:10,17,1,6
chr12	7069295	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:14,2:10,1:14,10,2,1
chr12	7069425	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr12	7069620	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=144,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,4:2,4:1,3,2,6
chr12	7069654	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=226,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.690:11:1,5:2,2:0,3,1,7
chr12	7076236	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=218,253;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr12	7080210	.	A	AG	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=162.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.976:37:0,19:0,18:0|1:7080210_A_AG:7080210:0,0,17,20
chr12	7080212	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=162.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.976:37:0,18:0,18:0|1:7080210_A_AG:7080210:0,0,17,20
chr12	7084279	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=167,86;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.157:30:14,0:11,4:15,11,3,1
chr12	7090659	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,10,0
chr12	7092036	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=209,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:0,9,0,2
chr12	7125567	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=176,230;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:16,4:9,0:18,7,4,0
chr12	7169045	.	T	TCTTTAAAAAATAAATAAAAACA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=200,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.263:9:2,0:5,2:7,0,1,1
chr12	7175844	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,274;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:7,0:10,2:1,17,0,2
chr12	7177215	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:11,2:15,0:15,11,2,0
chr12	7177530	.	A	AAGGCTCCACCAGTTACCC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:3,0:11,2:10,4,0,2
chr12	7187784	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.237:18:11,2:3,2:11,3,4,0
chr12	7252506	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=237,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,2:2,1:5,4,1,2
chr12	7260825	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=182,211;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:2,0:2,0:13,0,3,0
chr12	7261609	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=286,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr12	7277203	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=196,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:0,0:5,1:0|1:7277203_A_C:7277203:0,6,3,0
chr12	7277207	.	AG	CC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=196,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,0:5,2:0|1:7277203_A_C:7277203:0,6,3,0
chr12	7277214	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=196,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,0:5,3:0|1:7277203_A_C:7277203:0,6,3,0
chr12	7277236	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,1:0,6:1,2,2,5
chr12	7283134	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr12	7287886	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=107,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,3:2,5:3,1,6,2
chr12	7287914	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr12	7293796	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,1:4,1:6,4,2,0
chr12	7301730	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=187,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:11,1:8,1:10,9,1,1
chr12	7310774	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=212,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr12	7351780	.	CGTTCT	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:7351780_CGTTCT_C:7351780:0,4,0,1
chr12	7351787	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:7351780_CGTTCT_C:7351780:0,4,0,1
chr12	7351789	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,27;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:7351780_CGTTCT_C:7351780:0,4,0,1
chr12	7351793	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=23,26;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:7351780_CGTTCT_C:7351780:0,4,0,1
chr12	7351802	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7351802_A_G:7351802:0,0,0,1
chr12	7351810	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=272,152;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:7351802_A_G:7351802:0,1,0,1
chr12	7360229	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,5:7,7:7,5,11,1
chr12	7463398	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	7470534	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr12	7476153	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=179,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:4,6:3,0:1,6,1,5
chr12	7521563	.	TGA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=GA;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:6,2:1,0:4,5,1,1
chr12	7525865	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr12	7549091	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=234,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr12	7551022	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr12	7551050	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr12	7596855	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=224,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,2:2,5:0,2,0,7
chr12	7638020	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=211,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:3,2:1,3:0,4,0,6
chr12	7639054	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=186,279;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:11,1,2,0
chr12	7639150	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,66;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:5,0:12,4:5,12,4,0
chr12	7639563	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:13,0:6,8:8,11,0,8
chr12	7640336	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=205,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,4:6,3:0,7,4,3
chr12	7803562	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr12	7805186	.	GAG	TTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=181,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:2,2:3,4,1,1
chr12	7807138	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=173,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:3,0:3,3:5,1,2,2
chr12	7868777	.	A	AT,ATT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,28,28;MFRL=203,103,0;MMQ=60,60,60;MPOS=16,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,8,9;RU=T;STR;TLOD=19.48,21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,11,10:0.418,0.403:25:3,7,6:1,4,4:0,4,15,6
chr12	7882213	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=111,81;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:7,5:6,0:10,5,5,0
chr12	7894132	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=114,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:7,6,0,2
chr12	7894192	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=129,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr12	7945829	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr12	7945871	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=126,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr12	7947017	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=251,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,2,2
chr12	7970347	.	T	TATAGATAGATAGATAGATAGATAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,13;RU=ATAG;STR;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr12	7970721	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	7980035	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	7980065	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=160,192;MMQ=54,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:3,3,0,2
chr12	7980306	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,263;MMQ=60,35;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	7982419	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=150,123;MMQ=52,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:9,0:1,2:3,7,2,0
chr12	7984447	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr12	7985460	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,4:0,3:0,3,1,6
chr12	8075685	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=125,275;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr12	8078340	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=234,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr12	8085547	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=136,270;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.188:30:11,1:11,4:16,9,5,0
chr12	8088766	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr12	8196445	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,8,7
chr12	8244415	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,1:9,2:9,9,1,2
chr12	8276432	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr12	8329574	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=175,253;MMQ=38,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:7,1:9,4:6,10,2,3
chr12	8374770	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,8,12
chr12	8374781	.	C	CACG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,9:0,0,7,14
chr12	8375427	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,212;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr12	8376181	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr12	8376205	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr12	8376535	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr12	8608583	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	8612336	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr12	8617982	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=226,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:4,0,5,0
chr12	8667897	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=145,272;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,0:10,2:13,9,1,1
chr12	8693240	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0|1:8693240_C_A:8693240:0,0,6,0
chr12	8693245	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:0,0:0|1:8693240_C_A:8693240:2,0,4,0
chr12	8693247	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:4,2:0,0:0|1:8693240_C_A:8693240:4,0,2,0
chr12	8693418	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=138,88;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.413:15:3,2:6,4:2,7,2,4
chr12	8693432	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=135,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.319:8:1,1:3,1:0|1:8693432_T_TG:8693432:0,6,1,1
chr12	8693433	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=135,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.319:8:2,1:4,1:0|1:8693432_T_TG:8693432:0,6,1,1
chr12	8693439	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=36,29;MFRL=135,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:8693432_T_TG:8693432:0,4,0,1
chr12	8757481	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=227,115;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,25:0.867:28:2,11:1,14:0,3,16,9
chr12	8757522	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:0,4:1,1:0,2,2,4
chr12	8759445	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=153,258;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:6,2,4,0
chr12	8765441	.	C	CCTGCCTCAGCCTCCGGAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=220,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.290:8:4,0:2,2:1,5,1,1
chr12	8765447	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr12	8802273	.	A	AAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=349,243;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	8806967	.	CAGAATGGGCTCTGGGGAAAGCCT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=157,99;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:1,0:4,2:5,3,1,1
chr12	8807195	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr12	8813345	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=217,237;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:1,1:5,1,2,1
chr12	8813433	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=168,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:8,2:0|1:8813433_G_C:8813433:8,9,1,1
chr12	8813437	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=168,69;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:8813433_G_C:8813433:8,9,1,1
chr12	8982250	.	CAAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=0,375;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.247:6:0,0:0,1:0,5,1,0
chr12	8988777	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,11,2
chr12	8994212	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr12	8995966	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=222,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,5:1,7:3,0,5,7
chr12	8998025	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=190,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.401:18:3,4:8,3:9,2,7,0
chr12	9006840	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=108,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.235:19:4,0:11,4:4,11,2,2
chr12	9007492	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=114,215;MMQ=60,57;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.372:9:1,2:5,1:1,5,0,3
chr12	9009999	.	T	TAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=194,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,2:1,4,3,3
chr12	9013442	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=89,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,1,1
chr12	9016573	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,4,10
chr12	9016600	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=139,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:2,10,1,1
chr12	9020489	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr12	9021053	.	C	CGTGT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=144,193;MMQ=35,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=GT;STR;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:1,3:0,0:0,1,1,3
chr12	9021256	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=203,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,5:2,8:1,3,3,10
chr12	9021316	.	T	TAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=17,28;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:0,1:0,1:0,1,0,3
chr12	9073734	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=136,23367337;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr12	9083596	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	9086683	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:5,0:3,2:0,9,0,2
chr12	9090668	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:1,8,0,2
chr12	9092036	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,15;MFRL=245,272;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:9092036_A_T:9092036:0,4,0,1
chr12	9092042	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=245,272;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:9092036_A_T:9092036:0,4,0,1
chr12	9092049	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=245,272;MMQ=40,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:9092036_A_T:9092036:0,4,0,1
chr12	9092058	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=244,272;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:9092036_A_T:9092036:0,3,0,1
chr12	9094548	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=129,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:3,10,0,2
chr12	9095905	.	T	TAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=200,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AC;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr12	9097933	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=195,251;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,2:5,4:10,0,6,0
chr12	9098212	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=216,260;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,0:4,5:1,10,0,5
chr12	9098995	.	G	GAAC	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=142,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAC;STR;TLOD=59.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:6,6:4,10:4,6,5,11
chr12	9099034	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,5:2,1:1,4,0,6
chr12	9220729	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,1:10,2:13,4,1,2
chr12	9222286	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=156,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:9,2,2,0
chr12	9223242	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=188,254;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,1:6,5:0,8,0,6
chr12	9227058	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=238,300;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr12	9227475	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=197,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr12	9229629	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,266;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,0,2
chr12	9242924	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=174,225;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,3:6,2:8,2,4,1
chr12	9246176	.	CTATGG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=191,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,2:7,1:6,4,0,3
chr12	9248352	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=186,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:9248352_T_G:9248352:2,1,0,1
chr12	9248357	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=172,164;MMQ=50,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:9248352_T_G:9248352:1,1,0,1
chr12	9248362	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=172,164;MMQ=50,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:9248352_T_G:9248352:1,1,0,1
chr12	9253894	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr12	9260280	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=123,232;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,2:5,0:1,6,0,2
chr12	9260288	.	C	CAGGTTCAGTGT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=228,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.364:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr12	9262727	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=225,274;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,2,1
chr12	9264946	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=125,260;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.248:26:4,1:15,5:14,6,3,3
chr12	9268473	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=130,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.449:27:4,5:11,7:9,6,4,8
chr12	9302313	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=118,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,0,2
chr12	9303440	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	9309995	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=206,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr12	9310008	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	9310307	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=114,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,1,1
chr12	9310959	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,13:0,3:0,0,11,5
chr12	9311251	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=230,281;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0|1:9311251_C_G:9311251:0,3,0,2
chr12	9311265	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:9311251_C_G:9311251:0,0,0,5
chr12	9313169	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=336,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr12	9334697	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=133,73;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,2:10,0:0|1:9334697_G_A:9334697:6,9,1,1
chr12	9334716	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=161,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:9334697_G_A:9334697:4,6,1,1
chr12	9334728	.	G	GAGTGAGACAAAATGGTCATA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=172,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGTGAGACAAAATGGTCATA;STR;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.665:7:0,3:2,0:0,2,0,5
chr12	9344878	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=212,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:2,2,1,3
chr12	9344962	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=290,241;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr12	9345408	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=217,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr12	9348893	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=218,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,1,2
chr12	9352908	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr12	9352945	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=141,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,3:4,0:5,2,2,1
chr12	9353875	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:5,0,2,1
chr12	9360879	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,107;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:7,0:5,11,3,0
chr12	9392205	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=125,100;MMQ=43,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:14,3:14,0:15,13,2,1
chr12	9571547	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr12	9571599	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=213,215;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,1:1,5:1,2,2,5
chr12	9571851	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,258;MMQ=60,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:9571851_G_C:9571851:0,0,1,0
chr12	9571860	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,258;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:9571851_G_C:9571851:0,0,1,0
chr12	9572244	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr12	9572796	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=214,157;MMQ=40,31;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:9572796_GA_G:9572796:1,0,1,1
chr12	9572799	.	TACGCCAGCA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=178,157;MMQ=31,31;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0|1:9572796_GA_G:9572796:1,1,1,1
chr12	9572871	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=141,188;MMQ=25,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,5:2,4:1,2,6,3
chr12	9574119	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=61.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,4,13
chr12	9574344	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,37;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr12	9577027	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=268,185;MMQ=50,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr12	9577310	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr12	9577992	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,186;MMQ=27,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:6,0,6,2
chr12	9578570	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=190,100;MMQ=60,43;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,3:5,0:4,1,1,2
chr12	9578589	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,34;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr12	9580122	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=204,144;MMQ=46,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr12	9580203	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=138,214;MMQ=28,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:2,4,4,1
chr12	9581636	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=141,185;MMQ=60,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:8,1,2,0
chr12	9582244	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,149;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:3,3:4,1:4,4,2,2
chr12	9583167	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=211,197;MMQ=27,25;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,2:2,1:8,1,3,0
chr12	9583430	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	9584916	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=260,272;MMQ=25,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,3,0
chr12	9585178	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=12,26;MFRL=212,239;MMQ=25,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.444:10:0,2:0,2:0,6,3,1
chr12	9590505	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=183,185;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr12	9596091	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr12	9750669	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=173,173;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,9:1,7:1,0,8,8
chr12	9751035	.	C	CAT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=65.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,14,1
chr12	9754221	.	A	AAAAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAC;STR;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.903:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr12	9885526	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,6:4,4:6,1,7,3
chr12	9885707	.	A	ATAAGT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=188,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAGT;STR;TLOD=44.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:6,3:8,7:6,8,7,5
chr12	9906067	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=200,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:0,8:1,10:0,1,12,7
chr12	9980243	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,5,9
chr12	9994445	.	GTGT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=66,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGT;STR;TLOD=84.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.934:21:0,14:0,6:0,1,12,8
chr12	10015082	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=116,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,25:0.604:41:6,11:10,14:6,10,13,12
chr12	10051433	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr12	10051667	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=203,136;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:1,6,0,2
chr12	10069302	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,128;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,5:0,5:0,1,5,5
chr12	10078946	.	CAAATT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.450:27:5,2:10,10:3,12,4,8
chr12	10124336	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=293,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:0,5:3,6:0,3,1,10
chr12	10124373	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=293,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,1:3,4:0,3,0,5
chr12	10131684	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=201,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=98.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.937:29:0,14:1,14:1,0,6,22
chr12	10131865	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=179,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr12	10137645	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr12	10145797	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=190,63;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.122:22:9,0:11,2:0|1:10145797_T_C:10145797:10,10,1,1
chr12	10145803	.	T	TTTTTTGTTTTGTTGG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=192,63;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:11,2:0|1:10145797_T_C:10145797:10,9,1,1
chr12	10145805	.	C	CCACAT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=192,63;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:11,1:0|1:10145797_T_C:10145797:9,8,1,1
chr12	10147722	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=146,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:9,3:6,6:9,6,7,2
chr12	10147850	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr12	10149406	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=205,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:3,2,7,0
chr12	10149619	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=194,85;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,3:7,0:7,7,2,1
chr12	10149657	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=260,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:3,4:0,7:2,1,2,9
chr12	10150942	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=112,48;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:10,3:20,0:10,21,3,0
chr12	10150961	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=100,194;MMQ=60,42;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,4:0.142:34:10,2:17,2:0|1:10150961_G_A:10150961:8,22,3,1
chr12	10150974	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=111,194;MMQ=60,42;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.165:29:9,1:13,2:0|1:10150961_G_A:10150961:5,20,3,1
chr12	10151762	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=189,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:4,0:3,2:2,5,1,1
chr12	10163461	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:1,8,0,2
chr12	10205420	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=126,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.384:10:1,2:3,1:1,5,1,3
chr12	10206925	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:2,5:8,3:4,6,2,6
chr12	10215582	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	10217326	.	C	CTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=100.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,11:0,0,14,11
chr12	10224123	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:5,3:10,0:2,13,1,2
chr12	10228154	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=133,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:15,5:17,0:18,14,5,0
chr12	10233834	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=173,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:4,7,1,1
chr12	10241795	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=157,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.130:35:16,1:15,3:16,15,2,2
chr12	10241829	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=202,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=112.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,37:0.944:39:1,15:0,22:1,1,14,23
chr12	10251385	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=108,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,11:1,9:1,0,16,4
chr12	10271055	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:1,6:1,7:2,0,4,9
chr12	10312648	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=196,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr12	10312878	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr12	10312914	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=285,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr12	10313075	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=109,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,3:1,4:2,2,4,3
chr12	10313134	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr12	10313358	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,1:5,5:4,2,5,1
chr12	10339210	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=100,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.533:11:0,4:5,1:1,4,1,5
chr12	10460543	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=222,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:5,0,4,0
chr12	10460605	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=206,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,0:6,4:3,6,3,1
chr12	10461883	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	10464017	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:4,5:1,0:4,1,5,0
chr12	10525878	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=173,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,3:8,0:5,6,1,2
chr12	10532434	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=212,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,5:0,1:0,1,0,6
chr12	10560824	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:5,0,6,0
chr12	10561913	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=220,268;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:7,1,2,0
chr12	10562089	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=119,155;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.457:44:13,13:11,7:14,10,9,11
chr12	10571091	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0|1:10571091_T_G:10571091:0,0,7,8
chr12	10571106	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=52.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,5:0,6:0|1:10571091_T_G:10571091:0,0,5,7
chr12	10571158	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:10571158_C_T:10571158:0,0,0,5
chr12	10571177	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:10571158_C_T:10571158:0,0,0,5
chr12	10571514	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	10571536	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=195,210;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr12	10572544	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,274;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	10573211	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=94,240;MMQ=27,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr12	10583696	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=214,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:6,5:2,6:4,4,8,3
chr12	10586956	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=184,180;MMQ=40,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,1:0,5:5,0,6,0
chr12	10586961	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=180,184;MMQ=27,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,5:5,0:6,0,5,0
chr12	10586978	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=182,176;MMQ=40,27;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:5,2:0,7:5,0,9,0
chr12	10587158	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=170,128;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:1,3,2,5
chr12	10587250	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=294,200;MMQ=33,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:2,4:0,7:0,2,1,10
chr12	10588647	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=185,174;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:0,3,0,7
chr12	10599270	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=195,138;MMQ=52,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:8,3:9,3:3,14,1,5
chr12	10600282	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=231,170;MMQ=55,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr12	10602077	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr12	10602624	.	TTTTAAG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.463:11:1,3:5,2:0,6,0,5
chr12	10603670	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,5,12
chr12	10603699	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=156,95;MMQ=60,29;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:3,0:9,3:3,9,0,3
chr12	10746385	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=170,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,5:3,4:0,5,5,4
chr12	10749588	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=126,74;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:3,0:7,3:2,8,0,3
chr12	10759032	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=159,241;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,2:6,2:2,9,0,4
chr12	10760380	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr12	10763119	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=193,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,3:2,3:6,0,6,0
chr12	10763236	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=96,303;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.162:35:15,3:15,2:7,23,2,3
chr12	10763352	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=180,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:2,5:8,0:0|1:10763352_G_A:10763352:0,10,0,5
chr12	10763355	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=180,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:2,5:8,0:0|1:10763352_G_A:10763352:0,10,0,5
chr12	10775195	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=119,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.260:25:12,5:7,1:9,10,3,3
chr12	10780205	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=321,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:2,7:2,3:4,0,8,2
chr12	10782289	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=240,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr12	10786757	.	T	TGAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GAA;STR;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,2:0,5:0,0,2,7
chr12	10786797	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=221,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:0,4,0,5
chr12	10854537	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.368:22:9,3:5,4:7,7,7,1
chr12	10856799	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=185,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0,5,1,1
chr12	10865971	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=198,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,1:3,2:0,7,0,3
chr12	10875488	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=183,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:2,1:4,2:1,7,1,2
chr12	10875525	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr12	10962065	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=191,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:6,4:12,0:9,9,4,0
chr12	11000934	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=221,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:2,1,4,1
chr12	11083677	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=183,74;MMQ=57,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,0:3,1:2,3,2,0
chr12	11126428	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=220,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0,4,0,2
chr12	11138956	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=191,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,0:6,3:6,4,2,1
chr12	11149532	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,1:7,1:8,4,2,0
chr12	11150551	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr12	11174261	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=136,138;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:9,1:3,1:0|1:11174261_C_G:11174261:7,5,2,1
chr12	11174264	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=136,138;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:8,2:3,1:0|1:11174261_C_G:11174261:8,5,2,1
chr12	11174271	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=29,32;MFRL=136,133;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:9,1:4,1:0|1:11174261_C_G:11174261:7,6,2,2
chr12	11174276	.	GT	AT,AC	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=28,29,27;MFRL=199,136,133;MMQ=60,60,50;MPOS=18,13;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=26.90,13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,9,4:0.536,0.200:17:3,6,2:1,3,2:3,1,7,6
chr12	11174282	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=27,31;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:9,2:8,2:0|1:11174261_C_G:11174261:12,6,2,3
chr12	11174286	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=32,25;MFRL=145,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:9,3:8,2:0|1:11174261_C_G:11174261:13,6,2,3
chr12	11174302	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:8,3:9,3:10,7,3,3
chr12	11174327	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=169,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:9,3:10,2:12,7,2,3
chr12	11174372	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=34,36;MFRL=160,134;MMQ=60,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:8,1:4,1:0|1:11174372_C_G:11174372:7,5,1,1
chr12	11174380	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=33,30;MFRL=140,134;MMQ=60,51;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,1:6,1:0|1:11174372_C_G:11174372:8,7,1,1
chr12	11174390	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=154,134;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,1:6,1:0|1:11174372_C_G:11174372:6,8,1,1
chr12	11174397	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=29,27;MFRL=137,128;MMQ=60,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:5,1:6,4:5,7,3,2
chr12	11174416	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=29,25;MFRL=161,92;MMQ=60,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,1:7,3:6,9,2,2
chr12	11174466	.	GA	AC	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=32,25;MFRL=162,139;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:9,2:7,1:0|1:11174466_GA_AC:11174466:11,7,0,3
chr12	11174476	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=31,25;MFRL=157,139;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:7,2:6,1:0|1:11174466_GA_AC:11174466:10,5,0,3
chr12	11174478	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=31,25;MFRL=157,139;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:5,2:7,1:0|1:11174466_GA_AC:11174466:10,5,0,3
chr12	11174492	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=157,169;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,1:8,1:10,5,0,2
chr12	11182998	.	CA	TC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=148,118;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.256:29:11,1:11,5:9,13,4,3
chr12	11183108	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=176,128;MMQ=40,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:9,6:5,4:8,6,6,4
chr12	11183174	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=159,274;MMQ=46,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,0:11,2:0|1:11183174_C_T:11183174:16,9,0,2
chr12	11183177	.	CC	TT	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=159,274;MMQ=46,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:11,2:0|1:11183174_C_T:11183174:16,9,0,2
chr12	11183191	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=132,215;MMQ=45,56;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.324:32:13,6:9,4:12,10,8,2
chr12	11183197	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=160,274;MMQ=51,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:16,0:11,2:0|1:11183197_C_T:11183197:20,10,0,2
chr12	11183202	.	TG	CA	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=27,34;MFRL=161,274;MMQ=51,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:19,0:8,2:0|1:11183197_C_T:11183197:19,10,0,2
chr12	11183208	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=8;MBQ=33,34;MFRL=161,274;MMQ=51,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:20,0:9,2:0|1:11183197_C_T:11183197:19,10,0,2
chr12	11183217	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=34,25;MFRL=224,134;MMQ=60,46;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.734:28:5,17:2,4:5,2,13,8
chr12	11183406	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=33,25;MFRL=166,90;MMQ=60,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:11,1:16,2:14,13,3,0
chr12	11183421	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=151,129;MMQ=60,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.160:29:12,2:13,2:0|1:11183421_C_T:11183421:12,13,4,0
chr12	11183427	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=159,129;MMQ=60,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:11,2:13,2:0|1:11183421_C_T:11183421:12,12,4,0
chr12	11183451	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=206,136;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.655:27:4,10:5,8:5,4,9,9
chr12	11183512	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=167,185;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:12,2:6,5:10,8,4,3
chr12	11183793	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=129,128;MMQ=60,32;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:6,1:9,5:0|1:11183793_G_C:11183793:7,8,1,5
chr12	11183797	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=129,180;MMQ=60,32;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:7,0:7,3:0|1:11183793_G_C:11183793:7,8,0,4
chr12	11183809	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=127,197;MMQ=60,32;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:6,6,0,2
chr12	11183832	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=156,139;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,2:3,5:4,4,4,3
chr12	11199734	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=199,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:0,7,0,3
chr12	11214066	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=13;MBQ=28,30;MFRL=177,132;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:14,2:12,2:0|1:11214066_T_C:11214066:14,13,2,2
chr12	11214074	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=13;MBQ=27,33;MFRL=162,132;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.152:31:13,2:9,2:0|1:11214066_T_C:11214066:13,14,2,2
chr12	11214080	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=123,132;MMQ=60,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:13,2:7,2:0|1:11214066_T_C:11214066:11,12,2,2
chr12	11214082	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=13;MBQ=28,32;MFRL=143,137;MMQ=60,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:13,2:7,2:0|1:11214066_T_C:11214066:10,10,2,3
chr12	11214091	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=13;MBQ=32,34;MFRL=143,132;MMQ=60,39;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:14,2:8,2:0|1:11214066_T_C:11214066:11,11,1,3
chr12	11214101	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=13;MBQ=28,33;MFRL=125,132;MMQ=60,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:15,2:9,2:0|1:11214066_T_C:11214066:12,12,1,3
chr12	11214133	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=33,31;MFRL=135,132;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:8,1:8,1:0|1:11214133_C_T:11214133:8,9,0,2
chr12	11214137	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=153,132;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,1:9,1:0|1:11214133_C_T:11214133:8,8,0,2
chr12	11214145	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=13;MBQ=33,29;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:5,2:8,2:6,8,2,2
chr12	11214153	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=13;MBQ=33,19;MFRL=162,166;MMQ=60,34;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,1:9,0:0|1:11214153_C_T:11214153:8,9,1,1
chr12	11214156	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=131,166;MMQ=60,34;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:8,0:0|1:11214153_C_T:11214153:9,9,1,1
chr12	11214161	.	TG	CA	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=25,33;MFRL=126,166;MMQ=60,34;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:8,0:0|1:11214153_C_T:11214153:11,10,1,1
chr12	11214167	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=33,34;MFRL=144,166;MMQ=60,34;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,2:8,0:0|1:11214153_C_T:11214153:11,9,1,1
chr12	11214299	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=11;MBQ=29,34;MFRL=176,143;MMQ=60,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.183:20:9,3:7,0:8,9,2,1
chr12	11214324	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=35,28;MFRL=180,143;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:6,5:8,0:0|1:11214324_C_T:11214324:4,10,4,1
chr12	11214326	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=11;MBQ=34,34;MFRL=179,143;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:6,5:8,0:0|1:11214324_C_T:11214324:4,11,4,1
chr12	11214330	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=11;MBQ=34,30;MFRL=180,142;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:6,5:8,1:0|1:11214324_C_T:11214324:3,11,5,1
chr12	11214336	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=25,27;MFRL=165,140;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:6,5:7,2:0|1:11214324_C_T:11214324:2,12,6,1
chr12	11214351	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=33,32;MFRL=141,133;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:10,3:4,3:0|1:11214351_G_C:11214351:5,10,6,0
chr12	11214360	.	C	A,T	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=27,29,32;MFRL=137,135,192;MMQ=60,40,60;MPOS=22,23;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=25.29,4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,7,2:0.333,0.132:20:8,4,1:3,3,1:3,8,5,4
chr12	11214363	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=30,31;MFRL=141,135;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:10,4:4,3:0|1:11214351_G_C:11214351:4,11,5,2
chr12	11214368	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=29,33;MFRL=141,135;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:9,4:3,3:0|1:11214351_G_C:11214351:4,11,5,2
chr12	11214386	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=28,30;MFRL=112,131;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.319:23:13,3:3,3:0|1:11214386_T_G:11214386:5,11,3,4
chr12	11214392	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=32,22;MFRL=112,127;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.345:24:12,3:3,5:0|1:11214386_T_G:11214386:5,11,3,5
chr12	11244067	.	A	ATT	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=212,134;MMQ=57,26;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0|1:11244067_A_ATT:11244067:4,3,2,0
chr12	11244070	.	TCC	T	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=28,26;MFRL=212,134;MMQ=57,26;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0|1:11244067_A_ATT:11244067:4,3,2,0
chr12	11244091	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=35,24;MFRL=220,144;MMQ=57,31;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:3,2:3,2:0|1:11244067_A_ATT:11244067:4,3,4,1
chr12	11244096	.	TG	CA	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=220,139;MMQ=57,28;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:2,3:4,2:0|1:11244067_A_ATT:11244067:4,3,4,2
chr12	11244102	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=202,144;MMQ=59,24;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:2,4:4,2:0|1:11244067_A_ATT:11244067:3,3,4,3
chr12	11244126	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=167,144;MMQ=55,31;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,3:5,2:3,2,1,4
chr12	11244149	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=198,144;MMQ=40,39;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,2:2,3:2,2,1,6
chr12	11244941	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=207,239;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr12	11285802	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr12	11285909	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=131,50;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:13,0:13,3:13,13,1,2
chr12	11286133	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=157,157;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,11:0.286:40:18,0:9,10:0|1:11286133_T_C:11286133:12,17,0,11
chr12	11286135	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=157,157;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,11:0.286:40:19,0:10,8:0|1:11286133_T_C:11286133:12,17,0,11
chr12	11286274	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=10;MBQ=33,28;MFRL=159,114;MMQ=60,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,1:13,1:0|1:11286274_C_T:11286274:12,11,0,2
chr12	11286276	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=159,114;MMQ=60,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,1:13,1:0|1:11286274_C_T:11286274:12,12,0,2
chr12	11286280	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=10;MBQ=33,26;MFRL=150,114;MMQ=60,46;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:11,1:13,1:0|1:11286274_C_T:11286274:16,12,0,2
chr12	11286282	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=10;MBQ=33,27;MFRL=150,114;MMQ=60,46;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,1:15,1:0|1:11286274_C_T:11286274:16,12,0,2
chr12	11286309	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=10;MBQ=33,36;MFRL=130,161;MMQ=60,32;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:12,0:16,2:0|1:11286309_G_C:11286309:18,10,0,2
chr12	11286314	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=10;MBQ=28,35;MFRL=129,161;MMQ=60,32;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:13,0:11,2:0|1:11286309_G_C:11286309:17,11,0,2
chr12	11286318	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=27,37;MFRL=148,161;MMQ=60,32;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,0:11,2:0|1:11286309_G_C:11286309:15,11,0,2
chr12	11286323	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=10;MBQ=28,29;MFRL=137,161;MMQ=60,32;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,0:11,2:0|1:11286309_G_C:11286309:13,10,0,2
chr12	11286336	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=28,35;MFRL=153,161;MMQ=60,32;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:11,7,0,2
chr12	11286360	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=30,33;MFRL=159,161;MMQ=60,32;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:9,9,0,2
chr12	11338539	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=159,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:0,2:2,3:0|1:11338539_C_A:11338539:3,0,5,0
chr12	11338555	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,0:1,4:0|1:11338539_C_A:11338539:2,0,3,2
chr12	11338559	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.669:7:1,0:0,4:0|1:11338539_C_A:11338539:2,0,3,2
chr12	11338589	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,1:2,6:1,3,4,3
chr12	11338613	.	CA	GG	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:1,4:2,7:1,2,3,9
chr12	11338957	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,3:2,0:4,5,2,1
chr12	11338983	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=232,157;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,6:2,3:3,3,5,4
chr12	11420333	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=210,118;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.697:11:3,3:0,5:3,0,3,5
chr12	11421093	.	T	TGGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=185,193;MMQ=42,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=G;STR;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.570:8:1,0:1,4:1,2,4,1
chr12	11421522	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=250,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:5,2,3,0
chr12	11421721	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr12	11461836	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,58;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,5,5
chr12	11462275	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,204;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.612:11:2,4:2,2:2,2,2,5
chr12	11506331	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,17;MFRL=0,289;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:11506331_G_A:11506331:0,0,1,0
chr12	11506333	.	GGT	CTA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,289;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:11506331_G_A:11506331:0,0,1,0
chr12	11506338	.	GG	AA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,17;MFRL=0,289;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:11506331_G_A:11506331:0,0,1,0
chr12	11506346	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,17;MFRL=0,289;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:11506331_G_A:11506331:0,0,1,0
chr12	11506348	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,16;MFRL=0,289;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:11506331_G_A:11506331:0,0,1,0
chr12	11506350	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,289;MMQ=60,40;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11506331_G_A:11506331:0,0,1,0
chr12	11506893	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=163,94;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,7:1,1:1,0,5,4
chr12	11507386	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=118,132;MMQ=60,23;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:11,2:3,0:11,3,2,0
chr12	11803220	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0|1:11803220_A_C:11803220:0,0,0,8
chr12	11803228	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:11803220_A_C:11803220:0,0,0,6
chr12	11992168	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=217,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:7,3:10,2:12,5,4,1
chr12	12006335	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=130,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:8,2:4,2:10,2,2,2
chr12	12247360	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=290,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr12	12247594	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:7,3,1,1
chr12	12247616	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=165,109;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:8,3:3,1:6,5,2,2
chr12	12251761	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr12	12274156	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=173,76;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:7,0:6,4:7,6,1,3
chr12	12274182	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=147,76;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:11,0:19,3:25,6,0,3
chr12	12291479	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=185,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:4,3,0,2
chr12	12312169	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=227,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:2,1:0,7,0,2
chr12	12397654	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=242,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr12	12397668	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0|1:12397668_T_A:12397668:0,0,0,5
chr12	12397670	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0|1:12397668_T_A:12397668:0,0,0,5
chr12	12483275	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=199,198;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.811:19:2,6:1,10:1,2,10,6
chr12	12483927	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr12	12495959	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=225,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,2:0,3:2,0,4,1
chr12	12618715	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=45.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,1,13
chr12	12629958	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,223;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:16,0:17,4:17,16,0,5
chr12	12630344	.	G	GCA	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=167,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,0:12,2:0|1:12630344_G_GCA:12630344:12,15,1,1
chr12	12630346	.	G	A,T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,27,20;MFRL=157,206,43;MMQ=60,60,60;MPOS=18,3;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.04,5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,4,2:0.156,0.091:29:13,2,0:10,2,2:11,12,2,4
chr12	12630348	.	T	TTA	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=168,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:14,0:12,2:0|1:12630344_G_GCA:12630344:12,16,1,1
chr12	12630669	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=218,197;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:1,2:7,2:5,3,3,1
chr12	12790737	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=196,257;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr12	12870695	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr12	12879057	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.429:28:4,4:12,7:6,10,6,6
chr12	12966967	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=273,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.919:22:1,11:0,10:1,0,21,0
chr12	12977400	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr12	12982430	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=123,162;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:14,8,2,0
chr12	13102605	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,3:1,8:1,2,5,6
chr12	13128263	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=185,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.215:26:10,4:10,1:12,9,4,1
chr12	13142174	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,8,4
chr12	13215685	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr12	13219556	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:9,1:6,4:10,5,2,3
chr12	13248445	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=243,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:1,0,6,2
chr12	13256353	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=136,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,1:5,1:7,5,1,1
chr12	13256448	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=136,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:13,0:18,3:16,15,0,3
chr12	13364426	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:7,3:10,1:9,10,3,1
chr12	13366504	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:10,2:8,3:8,10,0,5
chr12	13366599	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=142,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,1:5,4:5,6,2,3
chr12	13367623	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=137,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,0:8,2:10,10,1,1
chr12	13529068	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=173,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,0:4,4:4,0,4,0
chr12	13529105	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=200,245;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:2,1:8,2:8,2,3,0
chr12	13529401	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=167,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr12	13720272	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,3:0,2:0,0,0,8
chr12	13722876	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=183,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,0:7,5:5,8,1,4
chr12	13768354	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr12	13769664	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr12	14590981	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr12	14591220	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:5,6:4,8:3,6,6,8
chr12	14599919	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,18;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.336:14:1,0:4,2:5,4,5,0
chr12	14628773	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=99,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,2:4,5:6,2,5,2
chr12	14656931	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:3,2:5,2:2,6,0,4
chr12	14664250	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=148,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:5,3:6,5:8,3,4,5
chr12	14689449	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=171,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:14689449_T_G:14689449:8,3,1,1
chr12	14689451	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=185,97;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,3:0.285:12:5,2:4,1:1|0:14689449_T_G:14689449:6,3,2,1
chr12	14769468	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr12	14769665	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:6,1,1,1
chr12	14773895	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=209,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr12	14774249	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr12	14774849	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr12	14781503	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr12	14781678	.	G	GA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.492:21:7,5:3,3:1,10,5,5
chr12	14794062	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,15:0,5:0,0,9,11
chr12	14804994	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr12	14822855	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,296;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr12	14825885	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,1:4,2:3,9,0,3
chr12	14827463	.	AATC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr12	14834421	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:14834421_GA_G:14834421:0,0,0,2
chr12	14834427	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0|1:14834421_GA_G:14834421:0,0,0,2
chr12	14839210	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:2,9,0,2
chr12	14928470	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.186:19:8,1:8,2:4,12,1,2
chr12	14928493	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=189,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:7,1:13,4:9,11,3,2
chr12	14947675	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:5,7:2,5:0,7,2,10
chr12	14949720	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=213,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.529:9:3,0:1,4:3,1,3,2
chr12	14949890	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,264;MMQ=60,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.293:32:17,0:6,9:13,10,1,8
chr12	14950006	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=229,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr12	14993439	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=180,136;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.823:15:1,9:1,4:1,1,7,6
chr12	15034996	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr12	15037187	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=176,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.829:22:2,13:1,5:0,3,3,16
chr12	15038788	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=202,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:0,5:2,10:1,1,4,11
chr12	15067758	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr12	15073831	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,4:2,4:2,2,5,3
chr12	15090837	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=152,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,0:5,3:8,0,2,1
chr12	15095707	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:0,4,0,7
chr12	15102681	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,3:7,0:10,4,3,0
chr12	15102799	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:14,0:9,3:7,16,1,2
chr12	15131995	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr12	15273932	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=185,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,3,1
chr12	15273957	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=114,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:2,2,4,3
chr12	15370243	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=238,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,9:2,0:6,0,9,0
chr12	15652330	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr12	15656832	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr12	15661441	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=187,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:4,2,5,1
chr12	15661576	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=152,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:13,2:0|1:15661576_A_G:15661576:11,10,1,1
chr12	15661584	.	CT	TC	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=152,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:14,2:0|1:15661576_A_G:15661576:10,11,1,1
chr12	15679208	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,2:8,1:2,12,1,2
chr12	15702007	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:5,6:1,6:5,1,6,6
chr12	15704425	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=223,250;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0|1:15704425_G_T:15704425:3,0,3,0
chr12	15704434	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=231,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,10:0.647:15:3,10:2,0:1|0:15704425_G_T:15704425:5,0,10,0
chr12	15710351	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:3,2:9,0:5,7,1,1
chr12	15731724	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr12	15731744	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=158,237;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:5,1:6,2,5,1
chr12	15733119	.	ATGTGTCAAAC	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=190,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:15733119_ATGTGTCAAAC_A:15733119:0,4,0,1
chr12	15733135	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=192,167;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:15733119_ATGTGTCAAAC_A:15733119:0,3,0,1
chr12	15733155	.	C	CCTTGTCCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=192,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15733155_C_CCTTGTCCA:15733155:0,1,0,1
chr12	15733158	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=192,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15733155_C_CCTTGTCCA:15733155:0,1,0,1
chr12	15733159	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,26;MFRL=192,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15733155_C_CCTTGTCCA:15733155:0,1,0,1
chr12	15734800	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=223,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,1:3,4:3,3,0,5
chr12	15742313	.	GAA	G,GA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,34,35;MFRL=146,184,223;MMQ=60,53,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.65,7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,4:0.213,0.363:11:1,1,3:2,1,1:4,1,6,0
chr12	15742342	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.335:31:10,10:10,0:11,10,10,0
chr12	15748020	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr12	15776223	.	TAA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=16,22;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:3,2:3,0:3,11,1,3
chr12	15803992	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,7:0,0:0,0,0,7
chr12	15813477	.	TG	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=151,79;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:4,0:0|1:15813477_TG_CA:15813477:9,3,1,1
chr12	15813487	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=136,79;MMQ=60,53;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:0|1:15813477_TG_CA:15813477:9,4,1,1
chr12	15818880	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,13:0,4:0,0,2,15
chr12	15822229	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr12	15822244	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr12	15823828	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=151,188;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,0:7,3:9,7,0,3
chr12	15834190	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=123,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:8,0:13,4:12,9,2,2
chr12	16042821	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=125,136;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:10,10:1,0:9,2,10,0
chr12	16050808	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,5:0,14:0,0,12,7
chr12	16052742	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	16055926	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,5:0,0,2,6
chr12	16185463	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=T;STR;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,7:1,2:4,0,4,5
chr12	16713409	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.299:18:9,0:4,5:0|1:16713409_C_T:16713409:7,6,5,0
chr12	16713412	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.299:18:8,0:4,5:0|1:16713409_C_T:16713409:7,6,5,0
chr12	16713487	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=185,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:2,1:2,1:2,2,0,2
chr12	18234097	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=167,297;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,4:2,0:6,0,4,0
chr12	18234461	.	TAA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=183,242;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0|1:18234461_TAA_T:18234461:0,3,0,4
chr12	18234478	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,36;MFRL=183,242;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:0,1:2,3:0|1:18234461_TAA_T:18234461:0,3,0,4
chr12	18237688	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=193,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr12	18443955	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,7:1,4:2,0,3,8
chr12	18499777	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,6,10
chr12	18534672	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=160,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,1:5,1:0|1:18534672_C_G:18534672:14,0,2,0
chr12	18534686	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=139,216;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,3:0.190:19:9,3:7,0:1|0:18534672_C_G:18534672:14,2,3,0
chr12	18534866	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=108,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr12	18641326	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr12	18656174	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,254;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:8,0,3,0
chr12	18720057	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=313,298;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr12	18747387	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=190,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,2:4,0:7,1,2,0
chr12	18747528	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:5,1:2,7,0,2
chr12	18801017	.	TG	CA,CG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36,29;MFRL=0,227,166;MMQ=60,60,60;MPOS=21,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.32,8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.444,0.444:6:0,0,2:0,3,1:0,0,2,4
chr12	18849071	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=132,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,5:0,2:1,3,5,2
chr12	18854540	.	ATCCTCCTCC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=TCC;STR;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.879:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr12	18872325	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=137,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,2:0,0:4,1,2,0
chr12	19282670	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=301,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr12	19283135	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr12	19406863	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,14,2
chr12	19410474	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=120,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.250:16:4,0:6,1:2,10,1,3
chr12	19418588	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	19418874	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr12	19501282	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=307,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.356:9:3,2:3,1:6,0,2,1
chr12	19512563	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	19592600	.	GGGA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GGA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	19592792	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	19646838	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=92,90;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,11:0.261:44:20,0:12,11:6,27,0,11
chr12	19646943	.	CTGGTGTATTTCA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.838:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr12	19667636	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=125,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:13,2:13,2:8,18,3,1
chr12	20709733	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,0,13
chr12	20766685	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=207,263;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr12	20774299	.	TA	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,0:8,3:6,13,0,3
chr12	20783099	.	AC	CC,CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31,34;MFRL=0,185,196;MMQ=60,60,60;MPOS=5,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=13.82,5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,2:0.614,0.302:7:0,2,0:0,3,2:0,0,0,7
chr12	20786787	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr12	20786807	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=158,233;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:6,1:1,1:1,6,0,2
chr12	20803323	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr12	20803549	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=233,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:1,1,1,3
chr12	20833139	.	GGAA	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=169,76;MMQ=47,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAA;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:9,1:19,1:12,16,2,0
chr12	20868247	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,1:3,4:0,8,1,4
chr12	20870033	.	CTTTT	C,CTTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32,30;MFRL=176,234,142;MMQ=60,60,60;MPOS=21,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,7,10;RU=T;STR;TLOD=14.78,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,3:0.265,0.184:18:4,2,2:3,3,1:8,2,5,3
chr12	20870265	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr12	20874667	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,6:2,0:6,0,6,0
chr12	20875983	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=163,285;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:6,1,1,1
chr12	20876227	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=112,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,1:2,6:0,3,3,4
chr12	20885931	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=114,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:6,4:3,1:4,5,1,4
chr12	20903865	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=205,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:3,4,1,3
chr12	20905495	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0,4,0,4
chr12	20905505	.	T	TGTCATCGCAAC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.361:3:1,1:1,0:0|1:20905505_T_TGTCATCGCAAC:20905505:0,2,0,1
chr12	20905507	.	T	TTCTACGTGCCAGGC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.361:3:1,1:1,0:0|1:20905505_T_TGTCATCGCAAC:20905505:0,2,0,1
chr12	20968828	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	21011296	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=173,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,5,1
chr12	21011310	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr12	21011581	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr12	21013948	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,7:3,7:2,4,4,10
chr12	21014139	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=129,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:0,2,0,8
chr12	21014163	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=156,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,5:1,2:0,1,0,7
chr12	21015610	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,1:0,2:1,1,3,0
chr12	21028093	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=189,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr12	21036270	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=74,232;MMQ=54,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr12	21051489	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,3:1,5:0,2,3,5
chr12	21168758	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=128,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr12	21175691	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=169,240;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr12	21175703	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=147,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr12	21175719	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=142,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:4,0,6,0
chr12	21176247	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,9:4,5:1,6,2,12
chr12	21201572	.	ATG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,224;MMQ=60,55;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=TG;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.697:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	21207346	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,6:3,6:2,2,7,5
chr12	21220349	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=136,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:1,3,0,4
chr12	21327652	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,18;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:2,1:0,1:0,3,1,3
chr12	21331987	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=132,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:5,1:0,1:1,4,0,2
chr12	21358914	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=139,56;MMQ=60,58;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:21358914_AT_A:21358914:3,9,1,1
chr12	21358917	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=139,56;MMQ=60,58;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:21358914_AT_A:21358914:3,9,1,1
chr12	21375331	.	AATAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=AT;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	21377559	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	21457434	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=154,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,1:7,3:6,6,3,1
chr12	21531437	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=190,243;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr12	21590557	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=189,160;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:6,0,5,0
chr12	21593404	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,4,10
chr12	21598264	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=187,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=53.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.701:28:6,6:2,14:5,3,18,2
chr12	21609127	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr12	21621384	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=203,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:5,1,2,0
chr12	21623122	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=120,151;MMQ=52,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=55.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.795:22:3,10:1,8:2,2,9,9
chr12	21624309	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=279,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr12	21627745	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:3,3:1,8:2,2,10,3
chr12	21628791	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=226,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr12	21628812	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr12	21629987	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr12	21639385	.	TA	T,TAA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=24,25,28;MFRL=144,140,206;MMQ=60,60,60;MPOS=17,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=11.73,3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,6,2:0.467,0.224:11:2,3,1:1,3,0:2,1,7,1
chr12	21639528	.	GA	G,GAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=18,17,17;MFRL=178,171,199;MMQ=60,60,60;MPOS=21,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=11.58,10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,6,6:0.413,0.411:14:0,1,0:0,0,0:0,2,0,12
chr12	21639591	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	21643039	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=190,232;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,0:1,2:4,0,2,0
chr12	21644428	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=123,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.635:6:0,2:1,1:1,1,3,1
chr12	21644667	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=195,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:2,6:0,5:1,1,1,10
chr12	21655020	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=215,381;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr12	21661508	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=185,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,1:7,1:6,11,1,1
chr12	21680609	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:9,2:9,4:10,8,5,1
chr12	21692166	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=201,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:1,4:1,1:1,1,4,1
chr12	21711111	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.752:17:3,6:0,7:1,3,9,4
chr12	21712545	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=98,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:3,5:0,3:1,2,6,2
chr12	21712574	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=265,189;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:3,7:0,3:1,2,6,4
chr12	21712728	.	GACATTCTTTGAAATT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACATTCTTTGAAATT;STR;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr12	21713308	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,7,7
chr12	21715801	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=222,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr12	21715989	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=225,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:2,6:1,4:1,2,4,6
chr12	21716055	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=238,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:1,1,1,2
chr12	21716098	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=237,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:2,3,5,0
chr12	21727315	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr12	21789968	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,8,4
chr12	21791272	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=68.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,10:0,9:0,0,12,7
chr12	21791410	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=120,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.873:17:2,9:0,6:0,2,2,13
chr12	21791455	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr12	21794865	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,10,3
chr12	21796814	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr12	21799999	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr12	21807432	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr12	21807640	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr12	21807687	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=216,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,5:3,2:0,9,0,7
chr12	21918784	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=144,53;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:11,2:0|1:21918784_C_T:21918784:9,14,1,1
chr12	21918806	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=149,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:10,2:0|1:21918784_C_T:21918784:6,13,1,1
chr12	21918807	.	A	ATCT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=149,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:10,2:0|1:21918784_C_T:21918784:6,13,1,1
chr12	21918808	.	G	GCC	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=149,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:10,2:0|1:21918784_C_T:21918784:6,13,1,1
chr12	21958998	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=222,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.271:12:3,1:5,2:1,8,0,3
chr12	21995434	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=111,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:6,2:2,0:4,5,0,2
chr12	21997874	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=221,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:2,4,0,4
chr12	22005003	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=163,244;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,3:6,1:9,3,4,0
chr12	22005510	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	22017486	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr12	22035873	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr12	22047151	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr12	22063337	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=256,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr12	22063737	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr12	22063749	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,11,4
chr12	22063971	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=180,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr12	22068849	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,1:6,4:3,7,1,4
chr12	22078838	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=175,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr12	22078945	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,1:5,2:7,6,3,0
chr12	22215194	.	CTTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,13;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:0,0:2,0:2,1,1,0
chr12	22215408	.	GAATT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=135,278;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AATT;STR;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,1,2
chr12	22218105	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=170,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:14,2:11,2:11,14,2,2
chr12	22218118	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:14,5:10,0:10,14,5,0
chr12	22606738	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=126,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr12	22625135	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=214,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.378:19:9,4:3,3:9,3,6,1
chr12	22625661	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:8,5:9,1:11,6,1,5
chr12	22677349	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=271,300;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr12	22680851	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=170,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:1,5,0,2
chr12	22796994	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr12	23689301	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=253,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr12	23696045	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:12,2:3,0:15,0,2,0
chr12	23696116	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=210,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:2,3:3,3:4,1,6,1
chr12	23998888	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,11,4
chr12	24971103	.	TTTCACATTAAACATG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=243,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.409:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr12	24985653	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=113,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,2:9,0:10,3,1,1
chr12	25031449	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.650:15:4,6:1,4:3,2,7,3
chr12	25054891	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=254,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:1,6:0,7:0,1,1,12
chr12	25147300	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr12	25147362	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=405,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,2:1,1:0,3,0,3
chr12	25147385	.	AG	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=405,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr12	25148755	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,10,9
chr12	25232240	.	T	TG	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=163,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:10,0:14,6:11,13,0,6
chr12	25240964	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:1,2:6,2:5,2,2,2
chr12	25242776	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr12	25249743	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	25249785	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=203,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr12	25255094	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=177,76;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,4:7,0:9,5,3,1
chr12	25261735	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr12	25272027	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	25274593	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	25299921	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr12	25302481	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,15,0
chr12	25343707	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr12	25368593	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=208,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr12	25398280	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=141,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:15,1:14,3:16,13,1,3
chr12	25671959	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=220,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25671959_T_A:25671959:0,1,0,1
chr12	25671961	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=220,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25671959_T_A:25671959:0,1,0,1
chr12	25679932	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr12	25699523	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr12	25702522	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:0,9,0,2
chr12	25706134	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr12	26217513	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=236,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,1:3,2:2,6,0,3
chr12	26217990	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:10,2:8,1:17,1,2,1
chr12	26231843	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	26231898	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=129,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr12	26553023	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=189,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:6,1,4,1
chr12	26568456	.	TAAGAAAAGA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=260,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,4:3,6:0,4,2,8
chr12	26592288	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,6:2,3:2,2,0,9
chr12	26596618	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,3:0,10:0,0,1,12
chr12	26628357	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=191,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr12	26636911	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=151,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,1:5,2:1,4,0,3
chr12	26639346	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,12;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:2,0:2,2:1,3,0,5
chr12	26732987	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=207,162;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,2:6,5:3,6,4,3
chr12	26749831	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:1,3:8,3:5,4,4,2
chr12	26749930	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,0:9,2:7,13,0,2
chr12	26749945	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:7,0:7,2:0|1:26749945_G_C:26749945:4,11,0,2
chr12	26749949	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=169,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:26749945_G_C:26749945:3,11,0,2
chr12	26752897	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,0:1,6:5,2,5,1
chr12	26834804	.	T	TACTC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=242,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,3:1,4:0,2,7,0
chr12	26848410	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr12	26848663	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=209,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:0,2,0,7
chr12	27059149	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr12	27059224	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,5,6
chr12	27059422	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr12	27066350	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr12	27067069	.	A	ATTTTTT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=239,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,14;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.328:10:4,1:3,1:1,6,0,3
chr12	27067079	.	A	ATGTG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=171,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:5,3:5,1:0|1:27067079_A_ATGTG:27067079:1,10,0,4
chr12	27067080	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=171,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:5,3:6,1:0|1:27067079_A_ATGTG:27067079:1,10,0,4
chr12	27075705	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	27081566	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,4:0,9:0,0,13,0
chr12	27081873	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:1,9,2,0
chr12	27109412	.	C	CAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=AT;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr12	27110436	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=213,147;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr12	27128594	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.524:17:2,0:6,8:5,3,3,6
chr12	27143579	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=154,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,1:1,2:0,3,0,3
chr12	27143632	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=10,33;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr12	27152666	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	27175640	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr12	27235207	.	CATG	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=185,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:8,2:10,0:8,11,0,2
chr12	27461984	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr12	27468313	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,5,10
chr12	27470857	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=175,65;MMQ=60,36;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:9,10,0,2
chr12	27470866	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=157,212;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:0,8:7,3:3,4,7,4
chr12	27529219	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=199,240;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:2,1,2,1
chr12	27533367	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=195,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,4:0,5:0,1,1,8
chr12	27553794	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr12	27554096	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:9,0,2,0
chr12	27554699	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=213,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr12	27568977	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=223,218;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr12	27623490	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	27625823	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr12	27625879	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:27625879_G_A:27625879:0,0,0,5
chr12	27625887	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:27625879_G_A:27625879:0,0,0,6
chr12	27628742	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	27648777	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=133,226;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:8,1:10,3:0|1:27648777_C_T:27648777:6,12,2,2
chr12	27648786	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=122,221;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:6,2:8,3:0|1:27648777_C_T:27648777:5,11,2,3
chr12	27654981	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=208,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:3,6,0,2
chr12	27786415	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,1:4,6:0,7,2,5
chr12	27786499	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=208,240;MMQ=52,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr12	27799008	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=148,243;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,2:5,3:5,4,5,0
chr12	27800576	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,5:0,3:1,0,9,0
chr12	27800883	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr12	27811649	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr12	27813754	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,1:0,11:0,0,8,4
chr12	27813903	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr12	27813961	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	27813973	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:27813973_C_T:27813973:0,0,0,3
chr12	27813981	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:27813973_C_T:27813973:0,0,0,2
chr12	27820302	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	27832347	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=270,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,6:1,3:3,0,8,1
chr12	27841925	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=75,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.348:7:2,1:2,1:3,2,2,0
chr12	27842095	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=152,65;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:0|1:27842095_C_T:27842095:11,10,1,1
chr12	27842107	.	G	GTCCCCTAAAATT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=159,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:6,2:0|1:27842095_C_T:27842095:9,7,1,1
chr12	27908019	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr12	27916206	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=191,107;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:1,4,3,4
chr12	27916224	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:2,4:0,3:1,1,5,3
chr12	27944697	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=152,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:13,0:6,2:0|1:27944697_C_T:27944697:10,9,1,1
chr12	27944699	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=170,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.393:21:8,4:4,4:0|1:27944697_C_T:27944697:6,7,5,3
chr12	28412372	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=185,86;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.422:22:4,6:7,3:7,6,5,4
chr12	28515446	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=121,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:18,1:7,1:9,16,0,2
chr12	28605370	.	G	GCAGT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAGT;STR;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.494:10:2,2:3,3:4,1,5,0
chr12	28605426	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,11,13
chr12	29462224	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=227,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:0,1,0,8
chr12	29485449	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=265,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr12	29486745	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=216,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:3,4,1,4
chr12	29496224	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=179,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,6:3,3:6,4,1,8
chr12	29509450	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=155,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:1,2,0,5
chr12	29509513	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=155,236;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr12	29519980	.	CAAAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=249,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,11;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr12	29598373	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=192,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chr12	29604392	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,140;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.777:16:2,3:1,10:3,0,6,7
chr12	29607931	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=214,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,1,4
chr12	29631722	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=159,240;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr12	29631938	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=217,363;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:29631938_G_C:29631938:0,3,0,1
chr12	29631942	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,10;MFRL=217,363;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:29631938_G_C:29631938:0,4,0,1
chr12	29642573	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:2,3,3,1
chr12	29648191	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=194,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,4:4,1:2,4,5,0
chr12	29650702	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr12	29673735	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=216,268;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr12	29725237	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr12	29908580	.	A	ATTGTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=286,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,1:2,0,4,0
chr12	29920745	.	G	GTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=173,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TA;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr12	29921074	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr12	30787228	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:3,3,2,5
chr12	30814043	.	CTATTA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=294,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr12	30814259	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=294,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr12	30816624	.	GGA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=241,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	30818081	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr12	30822240	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=236,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr12	30826847	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=185,70;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr12	30827086	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=325,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr12	30843377	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,5:8,2:11,4,5,2
chr12	30848675	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=190,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr12	30864655	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr12	30873781	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:10,2:8,0:10,8,2,0
chr12	30873800	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=176,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:8,10,2,0
chr12	30878859	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=170,231;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,5:4,2:3,1,5,2
chr12	30879088	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=226,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:0,10,0,2
chr12	30887820	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=202,157;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:2,1:0,5:2,1,6,0
chr12	30893875	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:6,0,2,0
chr12	31132479	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr12	31135418	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=176,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.467:15:5,3:3,4:5,3,6,1
chr12	31135478	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr12	31135579	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=243,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:5,4:5,11:7,3,7,8
chr12	31135905	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=246,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr12	31144884	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,3,6
chr12	31237663	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=166,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:5,0:6,2:0|1:31237663_C_T:31237663:4,8,1,1
chr12	31237670	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=177,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:5,2:0|1:31237663_C_T:31237663:2,8,1,1
chr12	31237671	.	T	TCA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=177,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:5,2:0|1:31237663_C_T:31237663:2,8,1,1
chr12	31237674	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=188,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:31237663_C_T:31237663:2,6,1,1
chr12	31242440	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=124,177;MMQ=52,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:8,1:18,1:10,17,0,2
chr12	31245741	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=180,162;MMQ=50,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,1:3,1:7,4,2,0
chr12	31250834	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=137,71;MMQ=50,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,3:9,0:6,10,1,2
chr12	31256995	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=203,254;MMQ=40,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,1:6,3:5,2,1,3
chr12	31542191	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	31545103	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr12	31545381	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,2,6
chr12	31545682	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	31568221	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	31600400	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=162,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,4:1,0:1,0,4,0
chr12	31600586	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,140;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,0:7,4:5,11,0,4
chr12	31632449	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr12	31633258	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=231,254;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr12	31648723	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=272,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:1,0,5,2
chr12	31648728	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=272,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,3:1,6:1,0,6,3
chr12	31648948	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	31820564	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=231,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.549:7:1,3:2,0:3,0,4,0
chr12	31850220	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr12	32134280	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=171,83;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:7,7,0,2
chr12	32135441	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,7,6
chr12	32138924	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr12	32138974	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr12	32140361	.	CTTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=168,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,8;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr12	32446835	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	32446901	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr12	32459070	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=118,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr12	32480327	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:11,2,2,0
chr12	32487644	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=200,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr12	32490369	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=229,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:1,0,4,0
chr12	32490764	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=178,248;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:5,2:5,0:2,9,1,1
chr12	32490850	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=317,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr12	32491626	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=163,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,5,1
chr12	32491969	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=200,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,3:1,2:0,6,0,5
chr12	32530385	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=141,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,5:0,4:1,0,8,1
chr12	32761037	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=177,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:7,0:1,2:1,7,0,2
chr12	32763970	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,0:1,2:6,0,2,0
chr12	32772658	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=164,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:13,3:2,0:8,8,0,3
chr12	32772678	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=167,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:10,5:4,0:7,7,0,5
chr12	32777416	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,21;MFRL=151,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.519:8:4,3:0,1:0,4,0,4
chr12	32777495	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32777495_T_C:32777495:0,0,0,1
chr12	32777497	.	T	TCCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=239,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:32777495_T_C:32777495:0,1,0,1
chr12	32777499	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=239,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32777495_T_C:32777495:0,1,0,1
chr12	32777501	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=239,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32777495_T_C:32777495:0,1,0,1
chr12	32778039	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:0,2:6,2:2,4,1,3
chr12	32791820	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=187,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:1,6,2,1
chr12	32860302	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:9,2:3,8:6,6,4,6
chr12	32860314	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=146,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:0|1:32860314_A_G:32860314:9,10,2,0
chr12	32860318	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=145,101;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:10,2:8,0:0|1:32860314_A_G:32860314:10,10,2,0
chr12	32860401	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:1,6,0,2
chr12	32875477	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,77;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,0:8,3:7,10,0,3
chr12	32884308	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=143,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,2:11,0:10,7,2,0
chr12	32884741	.	A	AAAAAAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=122,47;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,1:3,0,4,0
chr12	32890161	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=122,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr12	32945486	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:0|1:32945486_G_T:32945486:4,3,2,4
chr12	32945495	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.648:15:3,6:2,4:0|1:32945486_G_T:32945486:3,2,2,8
chr12	32945721	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=135,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr12	32945769	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=232,283;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr12	32948969	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,1:3,1:0|1:32948969_CA_C:32948969:7,0,3,0
chr12	32948971	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:0|1:32948969_CA_C:32948969:7,0,3,0
chr12	32949029	.	A	AG	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=119,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.332:28:9,4:9,5:10,9,5,4
chr12	32949242	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=47,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:3,1:1,0:2,2,0,3
chr12	32949252	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=160,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.590:8:3,2:0,3:0,3,2,3
chr12	32974245	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=79,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.541:11:2,1:2,3:3,2,5,1
chr12	32996207	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=179,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:0|1:32996207_G_A:32996207:4,5,1,1
chr12	32996210	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,18;MFRL=179,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,1:4,0:0|1:32996207_G_A:32996207:4,5,1,1
chr12	33003657	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=203,209;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr12	33030818	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=186,228;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,2:7,0:5,11,2,0
chr12	33031799	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr12	33559972	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=168,101;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:4,2,0,2
chr12	33560081	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=170,78;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.205:27:12,5:10,0:13,9,5,0
chr12	33579034	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,50;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.175:16:8,1:5,1:14,0,1,1
chr12	33579459	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=246,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr12	33592320	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=162,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr12	34175508	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=146,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,4:5,6:8,3,4,6
chr12	39087609	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=126,175;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:0,5:5,5:4,1,6,4
chr12	39087687	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,0,12
chr12	39124173	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.885:10:0,7:0,2:0,1,1,8
chr12	39161547	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=176,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,0:11,2:6,10,0,2
chr12	39223255	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=157,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.256:33:7,0:18,8:7,18,0,8
chr12	39726112	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=153,84;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,2:11,0:12,8,2,0
chr12	39726737	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=218,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:7,0:9,4:6,10,3,1
chr12	39745624	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=121,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:4,3:13,3:11,6,4,2
chr12	39756878	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,1:2,6:5,0,6,1
chr12	39760399	.	A	AAAACCCCTATTGGCTTCCAGAACCTTCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=170,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	39760747	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=298,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr12	39997867	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr12	40011025	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=216,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.431:7:0,1:2,1:0,4,0,3
chr12	40034699	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:11,4:4,1:13,2,4,1
chr12	40037727	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,3,13
chr12	40040059	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=186,257;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr12	40040331	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=164,313;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr12	40040793	.	T	TAGGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=209,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	40077028	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=218,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,8:0,5:0,1,0,13
chr12	40114781	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=158,220;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:13,1:16,1:9,20,1,1
chr12	40345185	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.774:7:1,2:0,0:0,1,2,4
chr12	40499594	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=212,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:2,2,2,4
chr12	40619301	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr12	40619542	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,0,15
chr12	40626230	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr12	40626285	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr12	40634203	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=189,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr12	40657537	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=234,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,5,0
chr12	40657771	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=149,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr12	40671989	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=208,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:1,2,2,2
chr12	40681057	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=201,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr12	40681142	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr12	40688772	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=154,134;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:4,0:1,4:0|1:40688772_T_A:40688772:0,5,0,4
chr12	40688774	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=154,134;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:4,0:1,4:0|1:40688772_T_A:40688772:0,5,0,4
chr12	40702846	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.784:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	40703046	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:5,4,0,2
chr12	40708922	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=207,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr12	40709185	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=250,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,2:3,6:0,3,0,8
chr12	40713759	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=174,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,6:4,4:3,3,8,2
chr12	40714785	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr12	40715013	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=220,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr12	40716015	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=185,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:3,6:1,5:1,3,3,8
chr12	40716037	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,3:6,0:9,5,1,2
chr12	40717143	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,3:7,1:2,11,0,4
chr12	40740686	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=190,66;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:6,5,1,1
chr12	40748324	.	A	AGAATCTCCTATTCAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=265,240;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	40753303	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=216,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr12	40757186	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=196,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr12	40760764	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=148,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,3:6,0:10,1,2,1
chr12	40761358	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr12	40787264	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=164,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:5,2,0,2
chr12	40805329	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=214,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,3:5,0:7,1,2,1
chr12	40811848	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,1:1,2:6,0,3,0
chr12	40811863	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=36,30;MFRL=169,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:6,0:0,2:6,0,1,1
chr12	40811944	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=167,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:7,5:13,0:10,10,1,4
chr12	40812873	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=184,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:7,0,4,0
chr12	40812896	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,2:4,3:9,1,5,0
chr12	40812941	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=125,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:8,1:3,4:6,5,3,2
chr12	40814107	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=215,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,2:7,3:9,3,3,2
chr12	40814197	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.373:19:5,3:7,3:5,7,1,6
chr12	40815007	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:2,4:8,3:4,6,5,2
chr12	40815060	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=183,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:7,4:9,2:9,7,4,2
chr12	40815548	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr12	40815560	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr12	40820124	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=235,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr12	40820403	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:3,7,0,2
chr12	40821278	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=217,156;MMQ=52,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,1:2,4:4,5,2,3
chr12	40821736	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:0,0:7,4:6,2,3,2
chr12	40821745	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=24,29;MFRL=153,72;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:0,0:7,4:5,3,3,1
chr12	40821795	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=33,26;MFRL=201,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,4:6,3:6,3,3,4
chr12	40821847	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=132,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=63.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,23:0.647:35:2,7:10,15:8,4,17,6
chr12	40821867	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=159,123;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.282:26:8,1:11,6:11,8,4,3
chr12	40821871	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=137,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:4,5:11,5:8,7,5,5
chr12	40821960	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=211,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:0,8,0,4
chr12	40823474	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=123,85;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,3:3,0:0|1:40823474_G_A:40823474:2,4,1,2
chr12	40823493	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=117,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,5:2,0:0|1:40823474_G_A:40823474:1,2,1,4
chr12	40823513	.	A	AAGAGCACTTGTGCAGGGAAACTGCCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=151,311;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:40823474_G_A:40823474:0,4,0,1
chr12	40825542	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=239,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,0,2
chr12	40826154	.	T	TGTTA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=191,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:1,1:5,3:0|1:40826154_T_TGTTA:40826154:5,1,3,2
chr12	40826156	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=191,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:1,1:5,4:0|1:40826154_T_TGTTA:40826154:5,1,3,2
chr12	40826201	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,3:3,5,4,1
chr12	40826535	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=191,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:6,4,1,1
chr12	40827479	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr12	40829824	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,200;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,1:1,0:5,0,1,0
chr12	40830583	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=90,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.510:19:9,2:0,5:5,4,3,7
chr12	40830599	.	CGTGTGT	C,CGT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,22,26;MFRL=169,141,178;MMQ=60,60,60;MPOS=29,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,9,10;RU=GT;STR;TLOD=12.26,8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,3:0.417,0.327:10:0,1,3:2,1,0:0,3,0,7
chr12	40834376	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=199,156;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.823:15:2,7:0,5:1,1,5,8
chr12	40835596	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=218,270;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr12	40838146	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:4,5:0,8:2,2,4,9
chr12	40839467	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=308,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,6:1,1:0,2,2,5
chr12	40839521	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=267,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr12	40857214	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=244,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,3:2,4:1,1,6,1
chr12	40858122	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=214,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:5,3,2,0
chr12	40859036	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=199,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:1,8:1,8:1,1,9,7
chr12	40868879	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=97,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.619:11:2,4:1,2:3,1,4,3
chr12	40903100	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=198,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,6:4,4:0,8,5,5
chr12	40904082	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr12	40904612	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=147,85;MMQ=60,41;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:8,1:10,8,2,0
chr12	40904642	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=160,85;MMQ=60,41;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,1:10,1:9,8,2,0
chr12	40905383	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=184,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:6,5:13,0:4,15,4,1
chr12	40925454	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=195,259;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr12	40925479	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=133,259;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:7,2,2,0
chr12	40927890	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:1,0,5,1
chr12	40928476	.	T	TTCC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=186,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TCC;STR;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.419:22:9,4:2,5:11,2,7,2
chr12	40928587	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27,32;MFRL=163,187,193;MMQ=60,60,60;MPOS=26,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=21,18,20;RU=A;STR;TLOD=10.43,4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,3:0.396,0.333:10:0,0,2:2,2,0:2,1,1,6
chr12	40930312	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=168,221;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:11,0:3,5:8,6,0,5
chr12	40936683	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=186,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:2,3:8,1:3,7,2,2
chr12	40938751	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:5,1,1,3
chr12	40938944	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=182,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:7,3:1,4:2,6,4,3
chr12	40938975	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=213,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,2:5,1:7,7,2,1
chr12	40939131	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,1:9,1:6,13,1,1
chr12	40942168	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=207,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:40942168_A_C:40942168:2,2,0,2
chr12	40942172	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=184,110;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:40942168_A_C:40942168:2,3,0,2
chr12	40942190	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=176,244;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,2:1,0:1,3,2,0
chr12	40942463	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=213,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:0,0:1,2:0,1,0,3
chr12	40942491	.	A	ACT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr12	40948595	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,269;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.178:24:14,1:6,2:5,15,0,4
chr12	40950883	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=223,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:2,1,5,1
chr12	40951845	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=175,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:40951845_G_A:40951845:2,2,1,1
chr12	40951866	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=203,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:40951845_G_A:40951845:3,3,1,1
chr12	40952934	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr12	40953036	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,0:3,3:5,5,0,3
chr12	40957450	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=246,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr12	40961310	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,1:1,1:8,0,2,0
chr12	40961477	.	CCAGGACTGCCCAAAGCAAACCTGGTGTGCAGAAGCAAGTCATCTTAACTAATGAACGCCGAGATTCAGTTCTCATATTAAACAAACCCTGGCCGGGCGCGGTGGCT	C	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=183,48;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:12,0:6,2:15,20,1,1
chr12	40961512	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=210,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.248:18:4,2:10,2:0|1:40961512_C_T:40961512:6,8,4,0
chr12	40961521	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=210,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:4,2:10,2:0|1:40961512_C_T:40961512:6,8,4,0
chr12	40961605	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=208,161;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr12	41303825	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.413:15:5,3:4,3:7,2,3,3
chr12	41312365	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=171,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr12	41337846	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=173,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:7,5,0,2
chr12	41374697	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=162,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:4,1,1,1
chr12	41374953	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=234,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,3:0,1:0,3,0,4
chr12	41421642	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=186,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chr12	41463805	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,160;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,0:6,4:4,6,0,4
chr12	41946453	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,10,11
chr12	41961535	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=166,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:5,0,2,0
chr12	42481545	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=189,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr12	42481609	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=180,117;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:10,0:7,3:0|1:42481609_G_A:42481609:10,7,2,1
chr12	42481617	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=170,117;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:10,0:5,3:0|1:42481609_G_A:42481609:9,8,2,1
chr12	42481627	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=170,117;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.168:22:11,0:6,3:0|1:42481609_G_A:42481609:10,9,2,1
chr12	42481670	.	CA	TG	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=144,126;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,0:3,3:3,6,0,3
chr12	42481803	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr12	42499690	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=27,32;MFRL=143,100;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,0:8,1:0|1:42499690_T_C:42499690:12,6,2,0
chr12	42499692	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=30,24;MFRL=143,100;MMQ=60,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:0|1:42499690_T_C:42499690:12,6,2,0
chr12	42499694	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=10;MBQ=28,24;MFRL=143,100;MMQ=60,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:0|1:42499690_T_C:42499690:13,6,2,0
chr12	42499701	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=10;MBQ=31,28;MFRL=143,109;MMQ=60,43;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:9,1:9,3:0|1:42499690_T_C:42499690:13,7,4,1
chr12	42499711	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=10;MBQ=30,29;MFRL=141,109;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.182:31:8,2:14,3:0|1:42499690_T_C:42499690:16,10,4,1
chr12	42499714	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=10;MBQ=25,32;MFRL=142,109;MMQ=60,43;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.176:32:11,2:16,3:0|1:42499690_T_C:42499690:16,11,4,1
chr12	42499730	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=10;MBQ=27,26;MFRL=142,99;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,6:0.171:39:12,3:20,3:0|1:42499690_T_C:42499690:16,17,4,2
chr12	42499738	.	TC	CT	.	.	DP=41;ECNT=10;MBQ=28,31;MFRL=143,99;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,6:0.163:41:14,3:20,3:0|1:42499690_T_C:42499690:15,20,4,2
chr12	42499763	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=10;MBQ=28,20;MFRL=144,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,5:0.143:40:13,3:21,2:0|1:42499690_T_C:42499690:16,19,2,3
chr12	42499787	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=10;MBQ=32,25;MFRL=174,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,1:12,1:0|1:42499690_T_C:42499690:8,17,0,2
chr12	42503467	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=83,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,21:0.760:27:5,15:1,6:2,4,10,11
chr12	42503505	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,20:0,9:0,0,5,25
chr12	42538530	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=194,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr12	42717724	.	GAA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=202,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:2,1:3,1:7,0,2,0
chr12	42717811	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=28,25;MFRL=164,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.271:20:7,1:8,4:0|1:42717811_A_T:42717811:8,7,2,3
chr12	42717829	.	A	AG	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=150,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:20,2:0.125:22:9,0:11,2:1|0:42717811_A_T:42717811:10,10,0,2
chr12	42717834	.	TTG	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=128,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:23,2:0.111:25:7,0:12,2:1|0:42717811_A_T:42717811:12,11,0,2
chr12	42717837	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=128,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,2:0.120:23:8,0:12,2:1|0:42717811_A_T:42717811:11,10,0,2
chr12	42717839	.	T	TCC	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=128,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,2:0.120:23:9,0:11,2:1|0:42717811_A_T:42717811:11,10,0,2
chr12	42717842	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=156,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:20,2:0.123:22:9,0:11,2:1|0:42717811_A_T:42717811:10,10,0,2
chr12	42717961	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=245,168;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.256:12:4,1:5,2:1,8,0,3
chr12	42718013	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=275,207;MMQ=52,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.390:6:1,1:1,1:0,4,0,2
chr12	42749072	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:3,7,0,2
chr12	42835328	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=10,10;MFRL=207,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.539:9:0,1:0,0:0,4,0,5
chr12	42853520	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=149,305;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr12	43819298	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=151,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:8,0,6,0
chr12	43837782	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=220,251;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	43846272	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=248,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,3:1,1:1,1,3,1
chr12	43847941	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=258,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr12	43860526	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:6,6,1,1
chr12	43884330	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr12	43945603	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr12	44130260	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.195:39:10,7:22,0:27,5,7,0
chr12	44338153	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr12	44693288	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=205,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,1:5,1:9,0,2,0
chr12	44914073	.	A	AAGGCAGGCGGTTCACTTGAGACTGGAGTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=187,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr12	44914078	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=188,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:44914078_A_C:44914078:0,3,0,1
chr12	44914079	.	A	AGGTGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=188,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:44914078_A_C:44914078:0,3,0,1
chr12	44915878	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,89;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,1:11,1:10,8,2,0
chr12	44917186	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:3,8,1,1
chr12	44926334	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=228,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,5:4,3:3,2,5,3
chr12	45004796	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=225,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr12	45059237	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr12	45170006	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr12	45171186	.	A	ATGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=205,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	45209723	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=184,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr12	45269703	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=223,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0,5,1,3
chr12	45417412	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=159,280;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr12	45429911	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,3:9,0:4,12,1,2
chr12	45444340	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=196,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:5,3,2,0
chr12	45695735	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr12	45822946	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=165,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,0:6,3:8,6,1,2
chr12	46124013	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=15,13;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,0:1,0:1,7,0,4
chr12	46240704	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=150,287;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:12,4:18,0:15,15,4,0
chr12	46287170	.	TTC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=172,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TC;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.366:6:3,1:0,1:4,0,1,1
chr12	46317004	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=181,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr12	46322600	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=185,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,0:7,6:5,7,0,6
chr12	46367903	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=155,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.871:21:1,12:1,7:1,1,12,7
chr12	46367939	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=188,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:2,9:2,6:2,2,5,10
chr12	46755988	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=227,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,5:2,0:7,0,5,0
chr12	46758406	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=179,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.189:24:7,0:11,3:8,12,3,1
chr12	46759017	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.147:22:7,1:12,1:2,17,2,1
chr12	46764404	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,115;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,0:11,2:10,13,0,2
chr12	47162211	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=275,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr12	47163306	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr12	47170887	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr12	47172648	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=218,304;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:47172648_G_T:47172648:0,4,0,1
chr12	47172650	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=218,304;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:47172648_G_T:47172648:0,4,0,1
chr12	47172651	.	G	GTGTGTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,31;MFRL=218,304;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0|1:47172648_G_T:47172648:0,4,0,1
chr12	47173662	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,11:0,0,4,11
chr12	47178307	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,10,6
chr12	47182465	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=190,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr12	47186770	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=122,242;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,3:7,1:6,8,3,1
chr12	47471393	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=188,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:11,1:12,3:9,14,4,0
chr12	48081637	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=189,40;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,6:4,4:7,4,7,3
chr12	48091522	.	AACAGGG	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,1:8,2:5,10,0,3
chr12	48104746	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=258,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:0,4:1,3:0,1,2,5
chr12	48110325	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=162,255;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,7:0,4:0,1,1,10
chr12	48110608	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,18:0.827:21:3,9:0,7:0|1:48110608_A_G:48110608:2,1,15,3
chr12	48110613	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.524:19:5,6:4,4:0|1:48110608_A_G:48110608:8,1,7,3
chr12	48131728	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=191,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,1:6,1:6,1,1,1
chr12	48132451	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr12	48132889	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=155,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:4,2:2,1:6,1,2,1
chr12	48133843	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr12	48134214	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=283,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:2,4,0,4
chr12	48134360	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,2:5,2:5,0,4,0
chr12	48134381	.	CG	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=87,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.713:18:1,5:4,8:4,1,11,2
chr12	48134634	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=184,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.395:20:8,4:4,2:7,5,4,4
chr12	48134695	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=97,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:3,9:5,6:3,5,9,6
chr12	48141798	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=180,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,2:6,1:6,3,3,0
chr12	48142343	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=177,260;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,0:6,2:5,4,1,1
chr12	48142418	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=220,264;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,6:2,2:1,1,6,2
chr12	48142636	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=199,208;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:11,1:13,2:11,13,1,2
chr12	48143095	.	G	GCTCTGGT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=248,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTCTGGT;STR;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.752:6:0,1:1,1:1,0,5,0
chr12	48143360	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=201,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,2,3
chr12	48144243	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.774:20:1,11:3,5:1,3,9,7
chr12	48145104	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=246,266;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,2:3,0:3,2,1,1
chr12	48145153	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=182,263;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:10,0,1,1
chr12	48152432	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=188,267;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr12	48174640	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.216:12:4,1:5,1:0|1:48174640_G_A:48174640:7,3,1,1
chr12	48174641	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,3:0.285:12:5,1:4,2:1|0:48174640_G_A:48174640:6,3,2,1
chr12	48177906	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:4,1:3,7,3,1
chr12	48179347	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=208,236;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,0:5,2:1,5,0,2
chr12	48179478	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=156,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:2,2:1,1:3,0,3,1
chr12	48181778	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=297,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,8:1,9:1,1,11,6
chr12	48185165	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=167,246;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:6,3:7,1:0|1:48185165_G_A:48185165:5,8,0,4
chr12	48185167	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=167,246;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:6,3:7,1:0|1:48185165_G_A:48185165:5,8,0,4
chr12	48188683	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=174,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,1:13,1:12,8,2,0
chr12	48190166	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=233,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:1,1:2,1:0,4,1,1
chr12	48192347	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:4,3:3,0:5,3,2,1
chr12	48192723	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=165,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:11,2:14,0:8,17,2,0
chr12	48195939	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=204,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,4:3,1:3,0,5,0
chr12	48195970	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=187,54;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:2,0:0|1:48195970_A_C:48195970:8,3,2,0
chr12	48195973	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=187,54;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:48195970_A_C:48195970:8,3,2,0
chr12	48238837	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=243,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr12	48358279	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=158,236;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,1:3,6:0,5,0,7
chr12	48359527	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=227,233;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,2,1
chr12	48360620	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=220,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,2:1,4:0,3,1,5
chr12	48360947	.	T	TAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,18;MFRL=195,424;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=A;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,1:9,4,1,1
chr12	48373180	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	48373421	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	48373718	.	A	AC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr12	48374513	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr12	48374826	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=164,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr12	48375475	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=105,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,1:4,3:6,1,4,0
chr12	48376213	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=238,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,5:1,2:1,0,4,3
chr12	48376969	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,7:1,2:2,1,2,7
chr12	48377566	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,0:3,5:0,8,0,5
chr12	48377809	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=215,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,2:0,1,3,0
chr12	48377815	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=238,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:1,3:0|1:48377815_A_C:48377815:1,1,3,0
chr12	48377820	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=231,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,0:2,2:0|1:48377815_A_C:48377815:2,2,3,0
chr12	48377824	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=231,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0|1:48377815_A_C:48377815:2,2,3,0
chr12	48377970	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr12	48378006	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=296,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48378006_T_TG:48378006:0,1,0,1
chr12	48378010	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=296,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48378006_T_TG:48378006:0,1,0,1
chr12	48379856	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=185,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr12	48386553	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=195,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,2:0,6:1,0,8,0
chr12	48386577	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=195,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,5,1
chr12	48388995	.	TC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=126,289;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:6,3:7,0:7,6,3,0
chr12	48389023	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=205,126;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,1:3,6:7,2,3,4
chr12	48390435	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=141,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:3,5,2,2
chr12	48391416	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.260:20:6,2:9,2:13,2,2,3
chr12	48398002	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,8,6
chr12	48465559	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=171,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:4,0:0,6,1,2
chr12	48468652	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=191,296;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr12	48490246	.	T	TCTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=234,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,0:1,1:1,2,1,0
chr12	48516464	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=183,280;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr12	48527059	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,5:2,3:5,0,7,1
chr12	48535080	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=216,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:2,3,4,0
chr12	48535557	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=135,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,2:11,1:11,10,1,2
chr12	48537624	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,6,12
chr12	48538979	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:0,5,2,5
chr12	48547128	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,2:2,3,2,4
chr12	48578933	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=184,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.202:18:5,0:8,3:8,7,1,2
chr12	48596875	.	C	CA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=123,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.188:30:16,1:9,4:15,10,3,2
chr12	48723142	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,223;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.153:28:11,1:12,2:13,11,1,3
chr12	48738555	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	48741219	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr12	48877056	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=231,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,2,2
chr12	48877171	.	AC	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=127,56;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,0:7,3:3,11,0,3
chr12	48880381	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=122,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,1:9,2:11,2,3,0
chr12	48880550	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=125,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.195:24:10,0:6,4:7,13,0,4
chr12	48886787	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=119,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,0:8,3:6,11,0,3
chr12	48888763	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr12	48919659	.	TG	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=205,113;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.826:15:1,7:1,6:1,1,6,7
chr12	48963624	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=172,83;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:8,2,2,0
chr12	49054491	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=223,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr12	49061511	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=190,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.384:21:6,5:7,2:8,5,6,2
chr12	49062927	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:6,0:12,4:8,10,1,3
chr12	49073358	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	49086749	.	CAA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:5,1:12,0,2,0
chr12	49091972	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=19,24;MFRL=104,194;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.615:6:0,1:0,1:0,2,1,3
chr12	49093729	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,397952;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	49110248	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=230,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,7:1,4:2,0,10,1
chr12	49169535	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:5,0:5,4:2,8,0,4
chr12	49218171	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:1,7,0,2
chr12	49218546	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=206,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.625:17:0,2:6,7:5,1,5,6
chr12	49218810	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=194,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,2:1,2,2,3
chr12	49219569	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=113,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.383:16:6,4:3,1:3,7,1,5
chr12	49225846	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=130,58;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:11,3:12,0:19,4,3,0
chr12	49228077	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=170,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,3:5,5:7,3,6,2
chr12	49237652	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=189,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:4,1,2,1
chr12	49298059	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=276,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr12	49298340	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=196,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr12	49310724	.	GA	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=208,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,5:2,2:4,0,4,3
chr12	49312432	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=144,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr12	49312540	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:12,0:4,2:9,7,0,2
chr12	49312693	.	CAG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:3,5,1,2
chr12	49315717	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=180,191;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr12	49318794	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,0:1,1:0|1:49318794_T_C:49318794:0,2,2,0
chr12	49318797	.	CAGG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=120,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:1,1:0|1:49318794_T_C:49318794:0,3,2,0
chr12	49318930	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=176,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:0|1:49318930_C_T:49318930:2,7,1,1
chr12	49318937	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=176,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:49318930_C_T:49318930:2,8,1,1
chr12	49319036	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,7,6
chr12	49332723	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:10,1:17,2:17,11,0,3
chr12	49333896	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr12	49362779	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr12	49364391	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=182,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr12	49390597	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=187,111;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,0:11,2:9,9,0,2
chr12	49398862	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.356:20:5,2:8,4:9,4,3,4
chr12	49416046	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.433:14:2,2:6,3:3,5,3,3
chr12	49418801	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=163,67;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr12	49421179	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr12	49422795	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:9,2:12,2:9,12,2,2
chr12	49424616	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=190,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,5:2,1:6,1,4,2
chr12	49435324	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=183,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,1:4,1:5,5,1,1
chr12	49436724	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=199,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,3:2,2:4,3,4,1
chr12	49438380	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=218,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:3,1:3,6,0,2
chr12	49439659	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr12	49442356	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=144,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr12	49442799	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=214,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:10,0,2,0
chr12	49442813	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=209,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr12	49459279	.	TCAG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=88,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:49459279_TCAG_T:49459279:0,1,0,1
chr12	49459285	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=88,192;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:49459279_TCAG_T:49459279:0,1,0,1
chr12	49459288	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49459279_TCAG_T:49459279:0,0,0,1
chr12	49459290	.	AC	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49459279_TCAG_T:49459279:0,0,0,1
chr12	49460922	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:49460922_A_G:49460922:0,0,0,1
chr12	49460926	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,222;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:49460922_A_G:49460922:0,0,0,1
chr12	49497643	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=115,72;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,3:5,1:4,4,1,3
chr12	49498751	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=189,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr12	49500398	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:4,0,2,1
chr12	49521672	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=190,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:4,2:7,0,2,1
chr12	49522786	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=209,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr12	49523523	.	GAT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=207,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,2:6,2:1,9,0,4
chr12	49525008	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.342:33:9,4:13,7:14,8,9,2
chr12	49582692	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:12,3:3,1:14,1,3,1
chr12	49667103	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	49723581	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=184,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,0:4,2:9,1,2,0
chr12	49724804	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:49724804_A_C:49724804:0,1,1,0
chr12	49724807	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:49724804_A_C:49724804:0,1,1,0
chr12	49883371	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=87,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,1,2
chr12	49893815	.	CT	C,CTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=185,208,247;MMQ=60,60,60;MPOS=21,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.34,3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,3:0.197,0.195:17:6,2,0:5,1,3:11,0,6,0
chr12	49943122	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=240,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr12	49949556	.	G	GC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:4,2:14,0:0|1:49949556_G_GC:49949556:12,9,0,2
chr12	49949559	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:6,2:14,0:0|1:49949556_G_GC:49949556:12,9,0,2
chr12	50036431	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=178,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.294:32:12,0:11,9:6,17,0,9
chr12	50039684	.	G	GTATA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=165,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:9,10,1,1
chr12	50040811	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=174,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:4,5:2,1:2,4,1,5
chr12	50045193	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=235,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:2,6,1,1
chr12	50050151	.	AAC	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=147,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.280:10:1,2:5,1:6,1,3,0
chr12	50146173	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=188,201;MMQ=45,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.537:4:0,0:2,1:2,0,2,0
chr12	50149568	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=115,511;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:3,0:3,6,0,2
chr12	50151977	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.316:39:16,6:11,6:13,14,9,3
chr12	50152595	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:8,0:5,4:2,11,0,4
chr12	50152615	.	TTTGCA	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=179,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:50152615_TTTGCA_T:50152615:1,3,0,2
chr12	50152624	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:50152615_TTTGCA_T:50152615:0,3,0,2
chr12	50152626	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0|1:50152615_TTTGCA_T:50152615:0,3,0,2
chr12	50152630	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=208,145;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:50152615_TTTGCA_T:50152615:0,2,0,2
chr12	50155400	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=192,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,1:3,1:7,1,2,0
chr12	50155442	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:3,6:5,0:4,5,7,0
chr12	50281310	.	G	GCCTTTGAAGAGGAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr12	50282956	.	G	GGTACTGGAGAAGAGTATTCCCAAAAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=174,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,0:6,5,1,1
chr12	50284607	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=131,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:50284607_C_T:50284607:0,2,0,1
chr12	50284616	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=131,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:50284607_C_T:50284607:0,2,0,1
chr12	50290728	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr12	50297670	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	50348359	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=261,45;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:6,2,2,0
chr12	50349090	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr12	50349123	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=73,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,1:2,6:2,0,7,0
chr12	50349143	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,0:0,8:0,0,7,1
chr12	50349411	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr12	50356174	.	TGGG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,328;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=G;STR;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.776:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr12	50368013	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr12	50369553	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=244,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0,2,0,2
chr12	50386015	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.749:18:2,4:2,9:1,3,8,6
chr12	50391055	.	CTTTTTT	C,CTTTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31,17;MFRL=0,281,93;MMQ=60,60,51;MPOS=33,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,14,21;RU=T;STR;TLOD=3.51,3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.337,0.508:3:0,0,0:0,1,0:0,0,1,2
chr12	50393372	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:2,6:0,8:1,1,8,6
chr12	50473660	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,10,5
chr12	50480150	.	AGAGG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=201,296;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAGG;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:1,0:1,1:2,1,0,1
chr12	50529936	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr12	50535722	.	CAA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	50537060	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	50570910	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:10,0:14,3:14,10,0,3
chr12	50589669	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=113,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,2:3,2,1,1
chr12	50599709	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=131,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr12	50616346	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=171,241;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,5:1,2:0,2,0,7
chr12	50627994	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.497:8:3,1:1,3:1,3,0,4
chr12	50628065	.	AG	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=228,119;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	50642314	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr12	50744094	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,10,6
chr12	50744119	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=101,122;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,5:5,3:4,5,3,5
chr12	50744753	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=111,63;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,0:6,4:7,6,1,3
chr12	50745370	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=153,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,0:10,3:12,8,0,3
chr12	50749003	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=147,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,0:11,3:13,8,3,0
chr12	50749294	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=168,189;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:3,5:2,6:3,2,8,3
chr12	50750040	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr12	50824232	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=148,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:5,1,3,0
chr12	50829263	.	T	TTATTC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr12	50855195	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=321,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr12	51034721	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr12	51074409	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.583:5:1,0:1,1:2,0,3,0
chr12	51076844	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr12	51089572	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,7:0,0,9,2
chr12	51089616	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,7,7
chr12	51108183	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=118,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,0:8,3:8,7,0,3
chr12	51121629	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=126,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr12	51128832	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=92,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.622:14:3,3:2,5:4,1,2,7
chr12	51135167	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,7:0,0,10,2
chr12	51138687	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=178,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr12	51203226	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=44.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,7,8
chr12	51203371	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,13:0.824:15:0,6:2,7:0|1:51203371_C_T:51203371:1,1,3,10
chr12	51203376	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=141,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.800:13:0,4:2,4:0|1:51203371_C_T:51203371:1,1,3,8
chr12	51319346	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,4:2,4:0,4,1,7
chr12	51347742	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr12	51382232	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=227,85;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:0,5,2,3
chr12	51386066	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=168,0;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,5:5,2:2,9,4,3
chr12	51386530	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.611:8:1,3:1,2:3,0,4,1
chr12	51386533	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=22,21;MFRL=164,176;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.325:7:4,0:1,1:3,2,2,0
chr12	51386536	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,16;MFRL=155,163;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,1:0.193:8:4,0:3,0:4,3,1,0
chr12	51392897	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr12	51399050	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=150,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr12	51447506	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:3,2,2,1
chr12	51461425	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr12	51461793	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:1,3,2,4
chr12	51467510	.	GAA	G,GA	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=33,33,36;MFRL=186,295,182;MMQ=50,60,60;MPOS=8,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,18,19;RU=A;STR;TLOD=3.32,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,1:1,0,0:1,0,2,0
chr12	51467530	.	ATC	A	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=27,15;MFRL=239,186;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,0:0|1:51467530_ATC_A:51467530:2,0,1,0
chr12	51467532	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=17,10;MFRL=182,295;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr12	51467534	.	ATC	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=18,30;MFRL=239,186;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:51467530_ATC_A:51467530:2,0,1,0
chr12	51467535	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=15,15;MFRL=295,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr12	51467538	.	A	AAC	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=21,15;MFRL=205,186;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:51467530_ATC_A:51467530:3,0,1,0
chr12	51467546	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=18,13;MFRL=196,239;MMQ=55,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:1,0:2,0,2,0
chr12	51467548	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=27,15;MFRL=205,186;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:51467530_ATC_A:51467530:3,0,1,0
chr12	51467552	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=25,10;MFRL=250,186;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:51467530_ATC_A:51467530:2,0,1,0
chr12	51467557	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=23,15;MFRL=250,186;MMQ=60,50;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,0:1,0:0|1:51467530_ATC_A:51467530:2,0,1,0
chr12	51467596	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr12	51492509	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=153,232;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:6,0,4,0
chr12	51500320	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:5,4:7,3:0|1:51500320_GA_G:51500320:6,6,5,2
chr12	51500322	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:5,4:7,3:0|1:51500320_GA_G:51500320:6,6,5,2
chr12	51504799	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr12	51510234	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,0:3,3:3,8,1,2
chr12	51512637	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	51585304	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=181,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,0:1,5:5,0,5,0
chr12	51585335	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:5,1:0,5:4,1,7,1
chr12	51585599	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=97,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0|1:51585599_T_G:51585599:0,1,1,3
chr12	51585601	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=97,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0|1:51585599_T_G:51585599:0,1,1,3
chr12	51639879	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=176,73;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.147:25:10,0:12,3:0|1:51639879_G_A:51639879:10,12,1,2
chr12	51639883	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=175,73;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.147:25:9,0:12,2:0|1:51639879_G_A:51639879:10,12,1,2
chr12	51681846	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr12	51693357	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr12	51723598	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,4:1,3:0,2,6,4
chr12	51736576	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=141,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:1,4,0,3
chr12	51737520	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr12	51737713	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=239,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51737713_T_A:51737713:0,1,0,1
chr12	51737720	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=239,213;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51737713_T_A:51737713:0,1,0,1
chr12	51739471	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr12	51739722	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.823:4:0,0:0,0:0,0,0,4
chr12	51740387	.	ACTGG	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.882:15:1,9:0,4:0|1:51740387_ACTGG_A:51740387:1,0,7,7
chr12	51740393	.	CCATATCCACTT	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=65.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,15:0.889:16:1,9:0,5:0|1:51740387_ACTGG_A:51740387:1,0,7,8
chr12	51740407	.	CATAA	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=65.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,15:0.889:16:1,10:0,5:0|1:51740387_ACTGG_A:51740387:1,0,7,8
chr12	51740415	.	A	AAG	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=67.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.895:17:1,10:0,5:0|1:51740387_ACTGG_A:51740387:1,0,8,8
chr12	51740416	.	C	CG	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=67.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.895:17:1,10:0,5:0|1:51740387_ACTGG_A:51740387:1,0,8,8
chr12	51748326	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr12	51752085	.	GTT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=155,141;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.386:6:2,1:0,0:0,4,0,2
chr12	51752897	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr12	51773426	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=163,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:10,3:7,2:2,15,1,4
chr12	51844628	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,207;MMQ=60,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:17,5:14,0:22,9,5,0
chr12	51846090	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=190,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr12	51851126	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=199,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,4:1,4:3,1,4,4
chr12	51890940	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=203,216;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.210:36:19,0:9,7:9,20,0,7
chr12	51897968	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=170,259;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:1,5,0,2
chr12	51901253	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:10,3:18,0:9,19,0,3
chr12	52095022	.	C	CTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,2:6,0:4,6,0,2
chr12	52099153	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=86,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr12	52100566	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=194,239;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr12	52139669	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.532:9:2,2:1,2:4,0,4,1
chr12	52156255	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr12	52159438	.	G	GT,GTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31,32;MFRL=291,114,275;MMQ=60,60,60;MPOS=9,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=14.12,3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,7,2:0.548,0.208:12:0,4,1:3,3,1:3,0,7,2
chr12	52163789	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=112,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:3,4:1,3:2,2,2,5
chr12	52168109	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=182,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,0:7,2:4,16,2,0
chr12	52182452	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,253;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:8,4:6,3:8,6,4,3
chr12	52184271	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=177,187;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:1,3:6,5:4,3,4,4
chr12	52200028	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,9:0,0,11,3
chr12	52200962	.	TCTGCAGTGGTC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=170,71;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:4,0:8,2,1,1
chr12	52216186	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.277:27:8,0:10,7:6,14,0,7
chr12	52281920	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=182,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.382:8:3,1:2,1:5,0,2,1
chr12	52283302	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=169,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,1:2,1:1,6,0,2
chr12	52284274	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,231;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr12	52285209	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TA;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	52307145	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=241,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,2,1
chr12	52307308	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=307,252;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,1,2
chr12	52312944	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=203,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:7,1:4,1:0|1:52312944_T_C:52312944:2,9,0,4
chr12	52312964	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=196,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:5,3:3,1:0|1:52312944_T_C:52312944:0,8,0,4
chr12	52345497	.	TGCG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCG;STR;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.912:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr12	52369300	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.293:32:10,7:13,2:4,19,3,6
chr12	52404618	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr12	52408422	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	52448326	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,96;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,3:8,0:7,7,3,0
chr12	52449786	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=218,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,2,1
chr12	52450284	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:13,0:4,2:11,6,1,1
chr12	52565922	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=190,276;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr12	52574780	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,1:8,1:4,7,0,2
chr12	52626984	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:52626984_C_T:52626984:3,0,1,0
chr12	52626986	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:52626984_C_T:52626984:3,0,1,0
chr12	52627007	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr12	52627215	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=201,250;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr12	52631242	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=114,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:5,3:3,6:4,5,6,4
chr12	52631394	.	C	CAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,2:4,4:2,3,2,4
chr12	52632573	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=103,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:3,5,1,2
chr12	52635241	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,3:9,0:10,7,2,1
chr12	52635443	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,5:3,6:1,4,3,8
chr12	52639302	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,193;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:7,6:3,5:3,7,6,5
chr12	52642605	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=202,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52642605_C_T:52642605:0,2,0,1
chr12	52642607	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=202,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52642605_C_T:52642605:0,2,0,1
chr12	52680008	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=156,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:3,1:5,5:7,2,6,0
chr12	52681282	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=248,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,4,0
chr12	52681533	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:2,2:6,8:2,6,5,5
chr12	52681714	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,6,5
chr12	52681733	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=135,279;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:6,1,1,2
chr12	52681968	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=233,220;MMQ=52,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:1,1,0,4
chr12	52699213	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=237,151;MMQ=52,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:3,3,1,2
chr12	52699419	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=180,150;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:8,3:6,0:7,8,3,0
chr12	52699548	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=94,168;MMQ=60,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:14,2:9,1:11,12,1,2
chr12	52700100	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=158,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:2,3,0,2
chr12	52708978	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:4,0,5,0
chr12	52709032	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=141,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,3:3,6:3,3,6,3
chr12	52710198	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=197,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,2:3,4:7,0,5,1
chr12	52710246	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=184,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,1:5,3:5,2,1,3
chr12	52710309	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=197,240;MMQ=40,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:2,4:6,5:3,6,5,4
chr12	52710326	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=187,302;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.140:20:6,2:11,0:9,9,0,2
chr12	52710897	.	TG	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=112,158;MMQ=48,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:13,1:2,3:0,15,1,3
chr12	52711416	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=200,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,1:2,5:2,1,5,1
chr12	52711450	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=200,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,2:4,6:3,3,4,4
chr12	52711624	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=199,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:2,3,1,4
chr12	52711776	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=212,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,3,2
chr12	52712898	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=107,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:1,9:4,3:2,3,11,1
chr12	52713020	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=134,146;MMQ=60,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.324:45:13,11:17,0:11,19,15,0
chr12	52756034	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=114,74;MMQ=60,43;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.205:27:10,0:12,5:13,9,1,4
chr12	52776679	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,5:1,1:1,1,6,0
chr12	52778772	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=114,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:2,0:4,5:5,1,3,2
chr12	52789691	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=208,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:5,2:7,2:0|1:52789691_A_C:52789691:4,9,2,3
chr12	52789693	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=208,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:6,3:7,2:0|1:52789691_A_C:52789691:4,9,2,3
chr12	52821992	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=180,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,8:1,2:2,0,10,0
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chr12	52824562	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=222,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr12	52827534	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=224,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:4,3:6,0,3,0
chr12	52843666	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=177,133;MMQ=41,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:1,1,2,1
chr12	52843688	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=133,179;MMQ=39,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,3:6,3:6,5,3,3
chr12	52843729	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=170,162;MMQ=52,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,5:0.167:34:12,2:17,3:0|1:52843729_G_C:52843729:17,12,1,4
chr12	52843733	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=170,162;MMQ=52,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,5:0.166:34:12,2:17,3:0|1:52843729_G_C:52843729:17,12,1,4
chr12	52843779	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=149,137;MMQ=50,39;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,0:13,2:15,9,0,2
chr12	52844243	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=168,207;MMQ=60,25;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.180:37:12,4:15,2:12,19,6,0
chr12	52844477	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,4:7,5:0,10,1,8
chr12	52845271	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=138,226;MMQ=54,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:3,2:9,1:5,7,3,0
chr12	52845298	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=138,181;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:3,8,1,1
chr12	52845952	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=219,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:0,8,0,5
chr12	52862767	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=170,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:6,2,4,1
chr12	52862770	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=203,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,3:3,6:4,1,7,2
chr12	52862783	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:4,2:7,4:8,3,5,1
chr12	52863091	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=184,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:4,8,0,3
chr12	52863160	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=156,103;MMQ=60,52;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.413:22:6,5:6,3:7,6,6,3
chr12	52863709	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=194,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,5:2,2:1,6,0,7
chr12	52863732	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr12	52863736	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr12	52864240	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:2,1:5,0,1,1
chr12	52864843	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=192,236;MMQ=55,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:4,1,2,0
chr12	52865548	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=2263,139;MMQ=60,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:16,5:1,1:15,2,1,5
chr12	52865837	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=215,188;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:2,1,3,0
chr12	52866145	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=249,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0,1,0,7
chr12	52866930	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=246,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr12	52881428	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=205,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,3:3,4:3,0,7,0
chr12	52881910	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=180,68;MMQ=40,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,2:5,1:3,8,1,2
chr12	52882094	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:3,4:5,1:6,3,4,1
chr12	52882410	.	T	TGAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAA;STR;TLOD=48.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr12	52883932	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=221,238;MMQ=27,34;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr12	52883947	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=266,172;MMQ=40,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr12	52884557	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=216,156;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,10:2,4:4,1,6,8
chr12	52884860	.	C	CCCACTGGTCTTCAGTTTTCAG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=145,9854;MMQ=43,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:9,0:8,2:9,8,0,2
chr12	52885019	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=180,214;MMQ=59,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:1,3,3,1
chr12	52886343	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=110,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr12	52886371	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=110,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:6,1,2,0
chr12	52910851	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:12,2:4,2:13,3,3,1
chr12	52912959	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=198,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:3,7,1,4
chr12	52913029	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=247,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr12	52913517	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:3,10:8,6:8,3,11,5
chr12	52938535	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=256,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr12	52939393	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=145,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:4,2:12,0:7,9,1,1
chr12	52939407	.	AGAG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=118,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,0:5,3:5,4,1,2
chr12	52939994	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=189,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:7,4:1,0:8,0,4,0
chr12	52941784	.	CAG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=257,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:2,1:3,6:1,4,1,6
chr12	52942998	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr12	52944060	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=95,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,5:1,2:0,2,2,5
chr12	52946336	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,5:2,1:4,0,6,0
chr12	52946346	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=162,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:8,0:1,3:7,2,3,0
chr12	52946890	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=239,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,4:2,0:2,1,2,2
chr12	52961318	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=169,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr12	52964402	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.287:12:3,2:5,1:0|1:52964402_C_A:52964402:8,1,3,0
chr12	52964417	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=157,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.836:10:1,3:0,6:0|1:52964402_C_A:52964402:0,1,9,0
chr12	52964718	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=172,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr12	52965877	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=233,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:2,1:0,7,0,2
chr12	52966137	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=249,282;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,4:1,0,6,0
chr12	52966512	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=273,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.319:13:4,1:5,2:0,9,0,4
chr12	52967080	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=173,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,2:5,5:4,3,5,2
chr12	52981676	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=209,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:1,3,0,3
chr12	52985164	.	ACG	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=214,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0|1:52985164_ACG_A:52985164:4,0,2,0
chr12	52985166	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=269,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,5:0.736:6:1,2:0,3:1|0:52985164_ACG_A:52985164:1,0,5,0
chr12	52986132	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr12	52992812	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:1,4:8,7:5,4,7,4
chr12	52994739	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=203,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,3:6,2:8,0,5,0
chr12	53002956	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=289,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.871:13:0,6:1,6:0|1:53002956_T_C:53002956:0,1,6,6
chr12	53002960	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:5,2:8,1:0|1:53002956_T_C:53002956:6,7,0,3
chr12	53004654	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr12	53010024	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=163,149;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:6,2:10,1:4,12,2,1
chr12	53043636	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr12	53045777	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=263,174;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,0:2,4:0,7,0,4
chr12	53069222	.	CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=213,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.270:17:4,3:4,1:9,4,3,1
chr12	53071338	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,4:0,9:0,0,7,6
chr12	53071382	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:0,4:6,6:5,1,7,3
chr12	53071560	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=196,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,1:5,3:3,3,0,4
chr12	53073471	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=159,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:5,5:1,5:5,1,8,2
chr12	53073824	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=175,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.162:24:11,2:3,0:15,5,0,4
chr12	53084928	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=159,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,3:4,6:8,3,5,4
chr12	53089460	.	GACCC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.849:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr12	53096913	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr12	53097125	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:9,2:9,7:9,9,3,6
chr12	53097263	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=209,238;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:1,1,0,4
chr12	53165621	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=204,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:5,1:9,1:12,3,1,1
chr12	53167313	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,6,1
chr12	53170726	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=162,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:9,0:8,2:3,14,2,0
chr12	53184491	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chr12	53184559	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:4,1:5,1:6,3,2,0
chr12	53184619	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=203,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,3:3,2:6,3,4,2
chr12	53188209	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr12	53201413	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=287,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:1,7:0,4:0,1,8,3
chr12	53202380	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=154,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,3,1
chr12	53205708	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:15,1:11,5:9,17,6,0
chr12	53207321	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=195,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr12	53207583	.	C	CCACCAAAGCCACCAGTGCCGAAACCAGCTCCGAAGCCGCCGG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=56.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.638:28:5,1:5,4:6,8,9,5
chr12	53216989	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=116,193;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,3:9,0:9,4,1,2
chr12	53217056	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=202,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.498:12:4,6:2,0:1,5,3,3
chr12	53225382	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=143,119;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.292:12:5,3:2,0:5,4,3,0
chr12	53227573	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=160,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,1:4,2:8,7,3,0
chr12	53242440	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=195,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.764:19:2,7:2,8:0,4,6,9
chr12	53293539	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=167,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.181:15:7,1:2,1:4,9,2,0
chr12	53295058	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=236,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0|1:53295058_G_C:53295058:1,3,1,3
chr12	53295063	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=29,35;MFRL=263,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0|1:53295058_G_C:53295058:1,2,1,4
chr12	53295079	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=201,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,2:2,2:0|1:53295079_G_A:53295079:1,4,1,4
chr12	53295081	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=201,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0|1:53295079_G_A:53295079:1,4,1,4
chr12	53295109	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=206,308;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr12	53295551	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=171,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr12	53295917	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=277,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr12	53298769	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=172,181;MMQ=60,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr12	53343461	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr12	53400178	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr12	53415603	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,2:8,0:0|1:53415603_G_A:53415603:9,11,1,1
chr12	53415612	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=145,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:53415603_G_A:53415603:8,9,1,1
chr12	53415614	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=145,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:53415603_G_A:53415603:8,9,1,1
chr12	53416251	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,10,6
chr12	53421507	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr12	53421746	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.950:16:0,11:0,5:0,0,6,10
chr12	53432088	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,14,8
chr12	53432107	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,2:12,1:10,12,2,1
chr12	53432936	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr12	53433089	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,46;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,7:0,15:0,0,9,13
chr12	53434105	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr12	53449735	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=205,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,4:1,6:0,2,0,10
chr12	53451486	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=116,240;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:7,4,1,1
chr12	53451952	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=179,252;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:1,1:5,2:2,4,1,2
chr12	53452263	.	CCAGGTGGCAGG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,225;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CAGGTGGCAGG;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.292:8:1,2:3,0:5,1,1,1
chr12	53457268	.	CAG	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=159,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.306:24:5,1:10,6:0|1:53457268_CAG_C:53457268:0,17,7,0
chr12	53457274	.	CAG	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=35,12;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:6,1:10,1:0|1:53457268_CAG_C:53457268:0,18,6,0
chr12	53457280	.	CGG	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:6,1:10,1:0|1:53457268_CAG_C:53457268:2,18,6,0
chr12	53457286	.	CGG	C	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.207:27:8,1:13,3:0|1:53457268_CAG_C:53457268:3,19,5,0
chr12	53457293	.	C	CCCCCCCCCCCACCCCCCCACAGCCCCA	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=34,24;MFRL=154,177;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:7,1:11,0:0|1:53457268_CAG_C:53457268:3,17,2,0
chr12	53468404	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=175,56;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:8,2:4,1:6,6,2,1
chr12	53470825	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=242,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:1,1:2,0,2,0
chr12	53509933	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=116,198;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:8,8,1,1
chr12	53512756	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:4,6,0,2
chr12	53552475	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=167,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,2:6,1:2,8,1,2
chr12	53554442	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=197,140;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:5,7:8,0:13,0,7,0
chr12	53573454	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=156,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.477:7:2,3:1,0:3,1,3,0
chr12	53580131	.	TG	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=178,248;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,1:3,1:9,0,2,0
chr12	53585859	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr12	53586822	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=202,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.370:11:2,2:5,1:4,3,2,2
chr12	53587468	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=123,297;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:6,0:12,2:10,8,1,1
chr12	53587783	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=215,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:6,2:0,0:0,6,0,2
chr12	53662735	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=214,275;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,2:3,3:1,2,2,3
chr12	53664148	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=196,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,5:2,1:4,3,4,2
chr12	53664308	.	GTTTGGGGTTGCTCCACTGCCCTCAAACAGC	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=221,247;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTGGGGTTGCTCCACTGCCCTCAAACAGC;STR;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.633:10:1,5:0,1:1,3,4,2
chr12	53666713	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	53671549	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=141,295;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:2,0,4,1
chr12	53673424	.	T	TTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=129,270;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53673424_T_TTGG:53673424:1,0,1,0
chr12	53673425	.	A	ACCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=129,270;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53673424_T_TTGG:53673424:1,0,1,0
chr12	53676814	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr12	53677072	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr12	53677089	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr12	53681683	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=216,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr12	53682267	.	CAA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=183,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=45.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,7:1,4:2,0,5,6
chr12	53684619	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:4,0,2,3
chr12	53686703	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,5:0,0,5,10
chr12	53686974	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,13;MFRL=111,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,0:1,0:7,2,3,0
chr12	53686978	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=111,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:1,1:6,2,4,0
chr12	53690188	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,2:0,0,2,3
chr12	53691962	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=55.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,10:0,8:0,0,6,13
chr12	53692946	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=14,15;MFRL=194,141;MMQ=40,58;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:53692946_C_A:53692946:1,0,1,0
chr12	53692950	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,16;MFRL=0,168;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:53692946_C_A:53692946:0,0,2,0
chr12	53692952	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=17,15;MFRL=141,194;MMQ=58,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1|0:53692946_C_A:53692946:1,0,1,0
chr12	53692955	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,23;MFRL=0,168;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:53692946_C_A:53692946:0,0,2,0
chr12	53692959	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=19,15;MFRL=141,194;MMQ=58,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1|0:53692946_C_A:53692946:1,0,1,0
chr12	53692964	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=16,16;MFRL=147,194;MMQ=59,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:0,0:1|0:53692946_C_A:53692946:2,0,1,0
chr12	53692966	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=19,12;MFRL=147,194;MMQ=59,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:0,0:1|0:53692946_C_A:53692946:2,0,1,0
chr12	53702347	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=193,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:2,5,0,2
chr12	53702371	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr12	53708011	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr12	53714290	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr12	53714496	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=69.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,5:0,14:0,0,2,17
chr12	53714509	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,2:0,10:0,0,0,12
chr12	53818317	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=190,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,2:6,6:2,7,0,8
chr12	53823175	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=201,270;MMQ=51,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr12	53861636	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=185,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:3,1:9,2:3,10,0,3
chr12	53875006	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=162,156;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:13,0:8,2:0|1:53875006_C_T:53875006:11,10,0,2
chr12	53875013	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=162,156;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:14,0:7,1:0|1:53875006_C_T:53875006:10,11,0,2
chr12	53875989	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=198,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:10,2:10,0:8,12,2,0
chr12	53877562	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,5,12
chr12	53880653	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,2:6,3:8,1,5,0
chr12	53896044	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:0,10,0,5
chr12	53897439	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr12	53918473	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:5,5,0,2
chr12	53925573	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:9,2:7,2:8,8,1,3
chr12	53926423	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:2,0:1,2:0,5,2,1
chr12	53994853	.	CAA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=189,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.301:11:0,0:4,3:0,8,0,3
chr12	54066271	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr12	54339052	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=185,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,4:1,5:0,1,2,7
chr12	54385599	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,3:4,6:6,4,5,4
chr12	54404842	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:7,3,1,1
chr12	54405107	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=173,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:54405107_A_G:54405107:0,4,0,1
chr12	54405109	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=173,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:54405107_A_G:54405107:0,4,0,1
chr12	54405116	.	A	AAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=192,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr12	54422504	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:6,3:12,2:9,9,1,4
chr12	54575800	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=225,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr12	54651471	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=283,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,4:1,8:1,2,3,9
chr12	54675113	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.364:31:11,7:9,4:13,7,8,3
chr12	54677980	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,28:0.785:35:2,11:5,17:5,2,16,12
chr12	54686081	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=275,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:54686081_G_A:54686081:2,1,1,0
chr12	54686088	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=275,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:0,0:0|1:54686081_G_A:54686081:2,1,1,0
chr12	54687232	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	54734289	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=217,48;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.644:7:1,4:1,1:1,1,2,3
chr12	54734312	.	T	TGAAACCCTGTCTTTACAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=181,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:8,2:3,0:6,5,1,1
chr12	54764122	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=138,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:5,13,0,2
chr12	54764618	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr12	54764962	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	54767981	.	C	CAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=145,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AG;STR;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr12	54785149	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=8,23;MFRL=231,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:54785149_C_G:54785149:0,1,0,1
chr12	54785173	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=250,220;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:54785149_C_G:54785149:0,2,0,1
chr12	54802090	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=284,240;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,1,3
chr12	54805534	.	ACCCCTCG	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=15,15;MFRL=209,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:0,0:0,0:0|1:54805534_ACCCCTCG_A:54805534:2,0,2,0
chr12	54805546	.	AGGCCCCACCC	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=22,15;MFRL=214,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:0,0:1,0:0|1:54805534_ACCCCTCG_A:54805534:3,2,2,0
chr12	54805553	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=128,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.613:3:0,1:0,1:0|1:54805553_A_C:54805553:0,1,2,0
chr12	54805557	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=22,29;MFRL=180,209;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:1,1:2,1:0|1:54805553_A_C:54805553:3,2,2,0
chr12	54805558	.	GGCCTTGCCCCCAGGCTGCAGTCCCA	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=29,16;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.338:7:1,0:1,0:0|1:54805534_ACCCCTCG_A:54805534:2,3,2,0
chr12	54805753	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=195,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:4,4:5,2:0|1:54805753_G_T:54805753:3,7,3,3
chr12	54805765	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:3,4:6,1:0|1:54805753_G_T:54805753:2,7,3,3
chr12	54902263	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:9,1:7,8,1,1
chr12	54910837	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=190,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,6:4,3:0,6,1,8
chr12	54911768	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0,9,0,2
chr12	54913027	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=140,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,0:13,3:11,10,3,0
chr12	54917144	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=192,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,0:10,2:12,1,1,1
chr12	54925072	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,128;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,5:7,3:7,4,4,4
chr12	54932788	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr12	54943775	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:4,2:8,1:4,8,3,1
chr12	54969260	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:54969260_A_C:54969260:1,1,1,0
chr12	54969262	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,15;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:54969260_A_C:54969260:1,1,1,0
chr12	54969267	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:1,1:0|1:54969260_A_C:54969260:1,1,1,0
chr12	54974803	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,200;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:7,0:9,2:8,8,1,1
chr12	54977925	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=258,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,6:4,0:5,0,6,0
chr12	55028727	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:1,4,0,2
chr12	55038408	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=23,22;RU=T;STR;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.556:9:0,2:3,3:3,1,4,1
chr12	55042118	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:2,3,3,2
chr12	55249002	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:1,4:1,6:0,2,2,8
chr12	55250549	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=180,242;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.165:26:13,1:8,2:15,7,3,1
chr12	55250714	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:0,11,0,2
chr12	55354876	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=209,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:1,2:2,1:1,2,3,0
chr12	55356261	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,3:3,0:6,2,1,2
chr12	55360006	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=178,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:2,8,2,0
chr12	55367178	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,4:2,4:4,1,5,3
chr12	55368291	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=241,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:2,6,1,5
chr12	55368368	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:5,3,0,3
chr12	55422966	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=153,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,1:5,4:7,4,3,2
chr12	55523586	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,1,1
chr12	55524077	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:4,7,0,2
chr12	55641031	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=89,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr12	55714406	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,3:2,7:2,1,7,3
chr12	55714876	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=111,184;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:2,5:7,6:5,4,3,8
chr12	55725931	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=165,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.321:23:7,0:8,7:5,11,0,7
chr12	55758832	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	55759878	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	55794264	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr12	55820958	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=106,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.724:8:1,2:1,3:0,2,2,4
chr12	55886345	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=124,221;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.324:19:8,0:5,5:3,10,0,6
chr12	55944926	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	55945119	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,10,5
chr12	56030906	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=177,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,2:7,0:9,9,1,1
chr12	56030938	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,5:3,2:7,3,5,2
chr12	56079084	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:3,6:0,3:2,1,1,8
chr12	56082024	.	AGGACTTCACTGTGATGTTGGCCCGGACAATCACTTCCAG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=85,44;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.169:17:6,2:7,0:6,9,1,1
chr12	56082785	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr12	56087144	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=42,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.573:4:2,0:0,1:1,1,0,2
chr12	56088206	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,4:2,7:1,2,10,1
chr12	56088773	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=179,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.483:4:1,1:1,0:1,1,1,1
chr12	56089208	.	G	GGGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=195,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr12	56089209	.	C	A,T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,30,26;MFRL=195,125,229;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.250,0.453:4:1,1,1:0,0,1:1,0,3,0
chr12	56089273	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,8;MFRL=196,234;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,0:0|1:56089273_T_TG:56089273:0,1,3,0
chr12	56089277	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=161,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.592:5:1,2:0,1:0|1:56089273_T_TG:56089273:0,2,3,0
chr12	56089283	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=22,23;MFRL=196,265;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.339:7:3,1:0,0:0|1:56089273_T_TG:56089273:2,3,2,0
chr12	56090038	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,314;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr12	56091617	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=232,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:3,8:1,3:3,1,6,5
chr12	56093817	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,275;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,1,3
chr12	56096816	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=275,193;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:0,2,2,3
chr12	56105894	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:4,3:11,0:7,8,1,2
chr12	56105977	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:6,5:11,3:9,8,5,3
chr12	56106156	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=169,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:3,0:6,2:0|1:56106156_A_C:56106156:3,7,0,2
chr12	56106160	.	C	CCACCAGGGCCCCCGTCATCCTAAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=169,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:56106156_A_C:56106156:3,7,0,2
chr12	56115278	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=191,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr12	56120118	.	CTTTTTT	C,CTTTTTTTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,19,28;MFRL=0,192,248;MMQ=60,40,55;MPOS=31,0;POPAF=7.30,7.30;RPA=25,19,27;RU=T;STR;TLOD=3.07,4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,3:0.221,0.634:4:0,0,2:0,0,0:0,0,0,4
chr12	56120458	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.223:28:11,5:10,0:13,9,5,1
chr12	56184399	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=61.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.580:36:6,0:9,21:5,10,0,21
chr12	56197331	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	56213978	.	TA	T,TAAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,25,27;MFRL=170,133,81;MMQ=60,60,60;MPOS=21,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,14;RU=A;STR;TLOD=4.13,3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,2:0.231,0.187:13:5,1,1:3,1,1:8,0,4,1
chr12	56220974	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=242,170;MMQ=50,43;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.633:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr12	56221006	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=204,145;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:2,0:1,0:5,0,3,0
chr12	56221008	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=204,139;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.245:9:3,0:1,0:6,1,2,0
chr12	56226558	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:56226558_T_G:56226558:0,0,1,0
chr12	56226563	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:56226558_T_G:56226558:0,0,1,0
chr12	56226565	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:56226558_T_G:56226558:0,0,1,0
chr12	56226568	.	A	AGGGGGG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,7;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:56226558_T_G:56226558:0,0,1,0
chr12	56236043	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr12	56236318	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,1,7
chr12	56330915	.	C	CTT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:6,2:16,0:0|1:56330915_C_CTT:56330915:7,15,0,2
chr12	56330916	.	C	CTTCTTCTTCTTCTT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:6,2:14,0:0|1:56330915_C_CTT:56330915:7,15,0,2
chr12	56330918	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,2:15,0:0|1:56330915_C_CTT:56330915:7,15,0,2
chr12	56333108	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:8,6:11,0:10,9,5,1
chr12	56348028	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=78,178;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,4:2,7:1,2,6,5
chr12	56359850	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=166,243;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:0,4,0,5
chr12	56380950	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.504:6:1,3:2,0:0,3,1,2
chr12	56417403	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,14,4
chr12	56426577	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	56428344	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr12	56477694	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:1,5:1,4:0,2,3,6
chr12	56480474	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=175,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:2,4,0,2
chr12	56490965	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,154;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:11,2:15,0:16,10,2,0
chr12	56492739	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.698:4:0,0:1,2:0,1,0,3
chr12	56493822	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,0:9,2:9,8,0,2
chr12	56500502	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:6,0:4,1:0,11,0,4
chr12	56504143	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=161,79;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.347:12:6,4:2,0:7,1,3,1
chr12	56510922	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=145,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.505:10:3,3:2,1:5,0,4,1
chr12	56532892	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=240,235;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr12	56549428	.	G	GTCTGGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=287,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr12	56551173	.	CA	C,CAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32,17;MFRL=101,173,132;MMQ=60,60,60;MPOS=18,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=9.53,4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,3:0.281,0.199:18:2,2,0:6,3,1:7,3,6,2
chr12	56551339	.	C	CAAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=194,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,9;RU=A;STR;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:1,4:3,8:2,2,4,10
chr12	56553567	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=181,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr12	56553984	.	CACTT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=168,262;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:16,0:8,4:13,11,3,1
chr12	56564056	.	CTTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=140,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr12	56565392	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr12	56575742	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,11,4
chr12	56604380	.	C	CTGAGAACATCCAACT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=226,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr12	56604416	.	GAT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:56604416_GAT_G:56604416:0,0,0,3
chr12	56604420	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0|1:56604416_GAT_G:56604416:0,0,0,3
chr12	56607693	.	TTCCACTGCTACCTGTTGCCCCACCAAACCTGCCATCAGACCAACTCACCTGTACTGGCTCCTCCAAGAC	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.099:29:0,0:5,2:11,16,1,1
chr12	56607927	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	56618729	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=141,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:3,4,0,2
chr12	56618749	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:2,2,0,1
chr12	56625045	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr12	56629276	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr12	56629513	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=182,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr12	56649601	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0,0,16,5
chr12	56650742	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,14:0,9:0,0,15,8
chr12	56716212	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=196,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:5,3,2,0
chr12	56716811	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,3:6,0:10,1,3,0
chr12	56716903	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.234:32:11,0:14,7:8,17,2,5
chr12	56717466	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,4,5
chr12	56720353	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=178,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:9,0,1,1
chr12	56720534	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=189,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,2:10,1:11,8,2,1
chr12	56726518	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,16,1
chr12	56740791	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	56748223	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=228,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:3,0:5,3,0,2
chr12	56749080	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=139,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:6,3,2,0
chr12	56812228	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr12	56814256	.	G	GGAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=169,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAT;STR;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr12	56814563	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:6,2:8,1:0|1:56814563_G_A:56814563:8,7,3,0
chr12	56814570	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=156,251;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,4:0.250:18:8,1:6,3:1|0:56814563_G_A:56814563:8,6,3,1
chr12	56815281	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=94,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.844:17:1,5:1,10:1,1,4,11
chr12	56815849	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=209,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:6,0:9,10:9,6,0,10
chr12	56818982	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	56821998	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=176,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chr12	56822641	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr12	56824163	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	56826061	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr12	56826758	.	A	AAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr12	56827195	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,2:9,0:11,10,2,0
chr12	56827974	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr12	56844970	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr12	56845296	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0|1:56845296_T_C:56845296:0,0,0,8
chr12	56845303	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0|1:56845296_T_C:56845296:0,0,0,9
chr12	56866962	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,0:2,6:2,1,4,2
chr12	56869577	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=184,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,3:6,0:3,4,2,1
chr12	56871987	.	CAGGGAGACACCCCACAGGTCTGGGTTTGACTTGGCCAGCTGAGGGATGTAGGCTGCCACCTGGACATGAGTGGGTAGAGAAA	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.073:47:7,3:11,1:17,23,2,5
chr12	56915782	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr12	56982089	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,1:6,1:9,5,2,0
chr12	56992630	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.242:18:10,2:4,2:10,4,2,2
chr12	56993213	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=259,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:56993213_T_C:56993213:0,2,0,1
chr12	56993218	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=259,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:56993213_T_C:56993213:0,2,0,1
chr12	56993714	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:10,6:5,1:5,10,5,2
chr12	57004329	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:1,12,0,2
chr12	57030026	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=111,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:3,6:8,2:5,6,3,5
chr12	57058121	.	A	ACG	.	.	DP=14;ECNT=13;MBQ=30,31;MFRL=193,139;MMQ=50,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:6,2:5,1:0|1:57058121_A_ACG:57058121:9,2,3,0
chr12	57058128	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=33,32;MFRL=180,139;MMQ=54,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,2:5,1:0|1:57058121_A_ACG:57058121:11,1,3,0
chr12	57058134	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=13;MBQ=30,34;MFRL=166,139;MMQ=52,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:6,2:5,1:0|1:57058121_A_ACG:57058121:10,1,3,0
chr12	57058148	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=13;MBQ=25,35;MFRL=180,139;MMQ=51,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:5,2:4,1:9,1,3,0
chr12	57058162	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=13;MBQ=30,33;MFRL=177,139;MMQ=60,39;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:3,2:4,1:0|1:57058162_AT_A:57058162:7,2,3,0
chr12	57058164	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=13;MBQ=28,33;MFRL=177,139;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:3,2:5,1:0|1:57058162_AT_A:57058162:7,2,3,0
chr12	57058173	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=13;MBQ=27,33;MFRL=170,139;MMQ=60,38;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,3:4,0:0|1:57058162_AT_A:57058162:4,2,2,2
chr12	57058180	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=13;MBQ=28,32;MFRL=166,131;MMQ=60,32;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:4,3:5,0:0|1:57058162_AT_A:57058162:5,4,1,3
chr12	57058191	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=28,28;MFRL=161,139;MMQ=60,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:5,3:7,0:0|1:57058191_A_T:57058191:7,5,0,3
chr12	57058197	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=13;MBQ=33,32;MFRL=163,139;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,3:6,0:0|1:57058191_A_T:57058191:6,5,0,3
chr12	57058225	.	AT	GC	.	.	DP=26;ECNT=13;MBQ=25,32;MFRL=163,152;MMQ=60,38;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:10,3:11,1:0|1:57058225_AT_GC:57058225:12,10,0,4
chr12	57058235	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=13;MBQ=32,30;MFRL=156,152;MMQ=60,38;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.147:32:12,3:13,1:0|1:57058225_AT_GC:57058225:15,13,0,4
chr12	57058244	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=13;MBQ=31,31;MFRL=151,143;MMQ=60,38;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:13,0:15,1:0|1:57058225_AT_GC:57058225:15,13,0,2
chr12	57058450	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=190,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr12	57065713	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr12	57106810	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=171,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,6:1,4:2,1,8,2
chr12	57114307	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=83,201;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.679:16:1,6:3,5:2,3,8,3
chr12	57127841	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	57132186	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=161,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:1,1,1,2
chr12	57140506	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=106,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,2:0,6:1,1,8,0
chr12	57180855	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=216,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:4,1,3,0
chr12	57327655	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,12;MFRL=252,333;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:57327655_A_C:57327655:2,0,1,0
chr12	57327659	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=252,333;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:57327655_A_C:57327655:2,0,1,0
chr12	57345780	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=214,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.382:14:2,1:5,4:7,2,4,1
chr12	57396832	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=143,162;MMQ=60,43;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:8,0:10,11:7,11,0,11
chr12	57397034	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:6,10,1,1
chr12	57406684	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=182,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,0:6,7:4,8,0,7
chr12	57409381	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,292;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.792:3:0,0:0,1:0,0,3,0
chr12	57423932	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=194,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr12	57431402	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,2:3,4:4,4,1,5
chr12	57435052	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=153,110;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:12,1:5,5:8,9,3,3
chr12	57435122	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=146,231;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,5:7,0:4,7,2,3
chr12	57441417	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=180,55;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:9,0:9,3:8,10,0,3
chr12	57442139	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=157,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.192:19:8,1:7,2:3,13,0,3
chr12	57442181	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=161,252;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,3:5,1:0,9,0,4
chr12	57457959	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:8,2:3,3:5,6,2,3
chr12	57458046	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=226,221;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:5,3:3,0:0,10,0,3
chr12	57466646	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=138,111;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,0:10,3:8,10,0,3
chr12	57486278	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:7,4:5,5:5,7,5,4
chr12	57486647	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:4,10:4,6:3,5,10,6
chr12	57492745	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=165,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:7,4:10,1:7,10,0,5
chr12	57496256	.	A	AT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=164,150;MMQ=60,22;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:7,0:11,5:9,11,0,5
chr12	57496321	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:3,0:2,8:0|1:57496321_C_T:57496321:1,4,0,10
chr12	57496331	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,10:0.688:14:2,0:2,9:0|1:57496321_C_T:57496321:1,3,0,10
chr12	57496579	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:2,0:8,2:6,5,2,0
chr12	57548095	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=136,89;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:16,4:13,0:16,13,4,0
chr12	57560701	.	C	CCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=226,147;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.216:12:3,0:6,2:0|1:57560701_C_CCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCG:57560701:2,8,2,0
chr12	57560703	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,0;MFRL=226,147;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.216:12:3,0:6,0:0|1:57560701_C_CCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCG:57560701:2,8,2,0
chr12	57569714	.	TTTCTCCAACCGCCATGAAATCCGGCGCATCGATC	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=169,36;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.134:21:6,2:6,0:14,5,1,1
chr12	57574843	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=197,275;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr12	57578288	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,234;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:3,1:0,10,0,2
chr12	57581028	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr12	57587050	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=123,71;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,4:5,0:4,6,0,4
chr12	57587839	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=236,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:2,2,1,6
chr12	57588049	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr12	57588977	.	CG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=151,278;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:1,4,4,1
chr12	57589865	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr12	57591226	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=185,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,2:3,1:8,2,1,2
chr12	57591458	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=178,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0,7,1,2
chr12	57593894	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,1,8
chr12	57594288	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=146,94;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:15,0:2,3:8,9,1,2
chr12	57594955	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=156,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:3,0:4,3:3,5,1,2
chr12	57600611	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:57600611_T_C:57600611:0,2,0,1
chr12	57600616	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:57600611_T_C:57600611:0,2,0,1
chr12	57600618	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:57600611_T_C:57600611:0,2,0,1
chr12	57602815	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=198,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:3,0,5,2
chr12	57603417	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=297,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr12	57605168	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr12	57605207	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,17;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:57605207_T_G:57605207:0,0,1,0
chr12	57605216	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=193,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:57605207_T_G:57605207:1,0,1,0
chr12	57605221	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=193,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:57605207_T_G:57605207:1,0,1,0
chr12	57605225	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=193,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:57605207_T_G:57605207:1,0,1,0
chr12	57606386	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr12	57618999	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:4,2:4,0:1,7,3,0
chr12	57624768	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=137,111;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.092:52:27,0:21,4:20,28,4,0
chr12	57624793	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=123,155;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:15,3:16,0:12,19,0,3
chr12	57626582	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,284;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:9,1:6,3:9,6,1,3
chr12	57627717	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,263;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,1:4,3:8,2,1,3
chr12	57629277	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=179,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,3:8,0:13,0,3,0
chr12	57629600	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=183,62;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.147:31:14,4:13,0:11,16,2,2
chr12	57642408	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=162,132;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:7,0:11,0,2,0
chr12	57649739	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=129,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:7,5:6,0:0|1:57649739_C_T:57649739:9,4,5,0
chr12	57649743	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=129,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.299:18:7,5:6,0:0|1:57649739_C_T:57649739:9,4,5,0
chr12	57651942	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=187,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,1:5,1:0,8,0,2
chr12	57666402	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=186,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:57666402_G_GA:57666402:0,1,0,1
chr12	57666404	.	G	GCCTGCTACACCCTGCAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=186,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:57666402_G_GA:57666402:0,1,0,1
chr12	57690092	.	CG	TA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=198,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:57690092_CG_TA:57690092:3,0,1,0
chr12	57690096	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=198,138;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:57690092_CG_TA:57690092:3,0,1,0
chr12	57691990	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=228,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:2,4,0,3
chr12	57693060	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr12	57704005	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr12	57843014	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr12	57858414	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=158,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:3,1,5,1
chr12	57858835	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:5,2,3,2
chr12	57859932	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=214,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,6:2,5:4,0,10,1
chr12	57860054	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=182,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:6,11,0,2
chr12	57862016	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,104;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,0:8,3:7,10,0,3
chr12	57865928	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	57867726	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr12	57869241	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr12	57869447	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=144,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,5:3,4:0,5,4,5
chr12	57869476	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:2,6:2,3:0|1:57869476_G_A:57869476:0,4,6,3
chr12	57869486	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=177,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,11:0.751:14:2,7:1,4:0|1:57869476_G_A:57869476:0,3,6,5
chr12	57869500	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,6,8
chr12	57869530	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=113,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:4,5:1,5:3,2,4,6
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chr12	57870155	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=112,192;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:3,1,2,3
chr12	57870463	.	AG	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=154,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,6:5,6:4,6,5,7
chr12	57870648	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.556:36:7,10:8,10:9,7,11,9
chr12	57871434	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=153,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:4,2,0,2
chr12	57871555	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	57882764	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=130,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.246:18:6,3:4,1:6,8,3,1
chr12	57883801	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0,0,3,16
chr12	57905687	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,2,8
chr12	57918149	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=144,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:14,0:8,2:13,9,0,2
chr12	57918242	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:2,6,0,5
chr12	57920262	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,6:0,2:1,0,3,5
chr12	57920799	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=158,54;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,0:9,3:6,11,0,3
chr12	57940749	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,2:0,0,10,0
chr12	57975570	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr12	57977003	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=237,74;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,1:3,1:1,7,0,2
chr12	58000378	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,4,8
chr12	58003922	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr12	58007560	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=193,143;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.223:25:9,0:11,5:8,12,0,5
chr12	58008207	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.299:11:2,0:2,2:3,5,0,3
chr12	58008952	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr12	58014131	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,2:6,0:7,8,1,1
chr12	58018318	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,68;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:8,0:10,2:9,10,0,2
chr12	58023012	.	CTG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=176,254;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0,8,0,2
chr12	58026001	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	58090232	.	AGTCGG	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.831:3:0,3:0,0:0|1:58090232_AGTCGG_A:58090232:0,0,0,3
chr12	58090241	.	GGGGGC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=252,141;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:0,3:0,0:0|1:58090232_AGTCGG_A:58090232:0,2,0,3
chr12	58111575	.	CAAAAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,252;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=27,21;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:0,1:0,0:0,2,1,0
chr12	58127766	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr12	58131725	.	CG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	58135659	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=94.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,22,5
chr12	58135694	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=147,93;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:16,0:19,2:19,16,2,0
chr12	58145156	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=182,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,8:1,8:0,1,5,11
chr12	58149446	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	58165128	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.792:3:0,1:0,0:0,0,0,3
chr12	58165989	.	AGCTGGGCTGGGCTGGGCTGG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=165,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,1;RU=GCTGG;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.306:8:2,2:2,0:0|1:58165989_AGCTGGGCTGGGCTGGGCTGG_A:58165989:0,6,0,2
chr12	58166024	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=198,201;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:58165989_AGCTGGGCTGGGCTGGGCTGG_A:58165989:0,2,0,2
chr12	58177379	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.498:12:2,3:1,2:2,4,2,4
chr12	58201021	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=229,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr12	58201022	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=171,229;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:2,0:6,0,2,0
chr12	58202419	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=239,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr12	58204283	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,8,9
chr12	58217450	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=25,36;MFRL=135,308;MMQ=60,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.124:30:14,0:12,1:0|1:58217450_T_C:58217450:12,15,2,1
chr12	58217453	.	GG	AT	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=31,28;MFRL=131,308;MMQ=60,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:13,1:12,2:0|1:58217450_T_C:58217450:10,15,2,1
chr12	58217462	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=28,34;MFRL=156,308;MMQ=60,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:12,1:10,2:0|1:58217450_T_C:58217450:8,19,2,1
chr12	58217468	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=9;MBQ=25,35;MFRL=156,308;MMQ=60,30;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:13,1:13,2:8,20,2,1
chr12	58217470	.	TCA	T	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=29,28;MFRL=156,308;MMQ=60,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:13,1:12,2:0|1:58217450_T_C:58217450:7,20,2,1
chr12	58217473	.	G	GC	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=32,35;MFRL=156,308;MMQ=60,30;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:12,1:12,2:0|1:58217450_T_C:58217450:7,18,2,1
chr12	58217480	.	CC	GA	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=32,35;MFRL=157,308;MMQ=60,30;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:11,1:13,2:0|1:58217450_T_C:58217450:6,18,2,1
chr12	58217486	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=33,28;MFRL=157,308;MMQ=60,30;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:11,1:12,2:0|1:58217450_T_C:58217450:6,17,2,1
chr12	58217510	.	C	CTGCATTCT	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=33,34;MFRL=190,308;MMQ=60,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,1:10,1:5,13,2,0
chr12	58217696	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=31,25;MFRL=188,0;MMQ=60,37;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.393:26:7,3:9,6:0|1:58217696_G_T:58217696:8,8,6,4
chr12	58217698	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=12;MBQ=32,25;MFRL=202,0;MMQ=60,35;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,11:0.400:28:7,3:9,7:0|1:58217696_G_T:58217696:9,8,6,5
chr12	58217705	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=12;MBQ=28,33;MFRL=173,0;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,15:0.432:35:10,5:9,9:0|1:58217696_G_T:58217696:11,9,8,7
chr12	58217707	.	TG	CA,CG	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=27,32,27;MFRL=170,0,0;MMQ=60,52,35;MPOS=14,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.11,7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,3,5:0.110,0.167:32:10,0,3:13,3,2:14,10,4,4
chr12	58217737	.	GGGTC	G	.	.	DP=43;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=107,52;MMQ=60,36;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.198:43:18,2:15,6:20,15,4,4
chr12	58217738	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=169,0;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,14:0.389:37:12,5:9,9:0|1:58217738_G_A:58217738:14,9,7,7
chr12	58217741	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=12;MBQ=32,27;MFRL=170,0;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,14:0.379:38:14,5:8,9:0|1:58217738_G_A:58217738:14,10,7,7
chr12	58217744	.	T	TTC,C	.	.	DP=42;ECNT=12;MBQ=25,27,32;MFRL=171,52,0;MMQ=60,36,49;MPOS=-2147483648,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=20.85,36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,8,11:0.199,0.267:42:15,2,5:8,6,6:14,9,10,9
chr12	58217762	.	GC	AT	.	.	DP=43;ECNT=12;MBQ=31,29;MFRL=171,88;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.287:37:16,4:10,6:16,11,6,4
chr12	58217770	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=143,103;MMQ=60,39;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:21,1:17,2:27,13,1,2
chr12	58217774	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=143,90;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:15,2:16,2:22,12,2,2
chr12	58217780	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=27,27;MFRL=143,88;MMQ=60,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:17,1:15,2:21,11,1,2
chr12	58220809	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=158,0;MMQ=60,39;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=61.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,17:0.459:37:13,7:7,8:0|1:58220809_G_C:58220809:12,8,10,7
chr12	58220816	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=158,0;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,17:0.462:37:11,9:7,7:0|1:58220809_G_C:58220809:12,8,10,7
chr12	58220823	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=158,0;MMQ=60,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,17:0.462:37:10,8:6,8:0|1:58220809_G_C:58220809:11,9,9,8
chr12	58220841	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=90.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,24:0.595:40:11,10:5,9:0|1:58220809_G_C:58220809:6,10,10,14
chr12	58220844	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,22:0.575:38:10,12:5,10:0|1:58220809_G_C:58220809:6,10,9,13
chr12	59276618	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:9,4:12,0:16,5,4,0
chr12	59282168	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=156,221;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:12,5:15,0:13,14,5,0
chr12	59283804	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,121;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.270:35:12,0:14,9:16,10,0,9
chr12	59307726	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:12,1:7,2:13,6,3,0
chr12	60098722	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=147,235;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:8,0:6,9:0|1:60098722_T_C:60098722:6,8,0,9
chr12	60098729	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=147,235;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.417:22:6,0:6,9:0|1:60098722_T_C:60098722:7,6,0,9
chr12	60168373	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=100,162;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:3,7:9,0:8,4,8,0
chr12	60169265	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=165,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr12	62261077	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=135,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:2,2:0,1:2,1,2,2
chr12	62715412	.	CTGTAT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=180,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,1:4,3:3,7,0,4
chr12	62778065	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,10:0,1:0,0,4,8
chr12	62785524	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=250,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:4,1,5,0
chr12	62785537	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=161,264;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,1:5,1:8,1,2,0
chr12	62861111	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=222,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,6:1,7:1,2,3,10
chr12	62887754	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=126,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:10,5:14,0:11,13,5,0
chr12	62888729	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=171,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr12	62892905	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=276,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:0,6:3,3:0,3,0,9
chr12	62894636	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=116,91;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.304:34:11,4:13,6:12,12,3,7
chr12	62928747	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr12	62931846	.	ATTTGT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=106,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,5:1,1:8,0,6,0
chr12	62960017	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=165,236;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:9,1,2,0
chr12	62972210	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,36,35,34;MFRL=102,200,173,145;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,29,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.93,3.24,8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,2,2,5:0.166,0.171,0.379:13:3,2,1,2:0,0,1,2:2,2,8,1
chr12	62986620	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=230,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr12	62996647	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:7,0,5,0
chr12	63195529	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=232,289;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr12	63543553	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=187,263;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:63543553_C_T:63543553:3,0,1,0
chr12	63543555	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=187,263;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:63543553_C_T:63543553:3,0,1,0
chr12	64011062	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=15,30;MFRL=255,127;MMQ=27,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.895:16:0,4:0,11:1,0,8,7
chr12	64020321	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,54;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr12	64038369	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr12	64041195	.	C	CATAATAATA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,37;MFRL=190,163;MMQ=36,30;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=ATA;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.494:4:1,0:1,1:0,2,0,2
chr12	64055347	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,221;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.885:6:0,0:0,3:0,0,1,5
chr12	64061745	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,253;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr12	64202645	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=166,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:9,0:7,2:0|1:64202645_C_T:64202645:7,9,1,1
chr12	64202652	.	C	CTTGCTCCTATGGCTCCAT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=159,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:0|1:64202645_C_T:64202645:8,10,1,1
chr12	64383670	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=288,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,6:1,1:1,1,4,3
chr12	64488640	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=126,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,0:5,2:5,3,2,0
chr12	64491249	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=200,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	64521567	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,2:4,2:6,5,1,3
chr12	64588006	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:6,0:8,2:6,8,1,1
chr12	64668659	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=109,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.401:18:6,3:5,4:5,6,3,4
chr12	64669018	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=245,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr12	64669090	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=144,174;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:5,6:2,0:5,2,2,4
chr12	64671412	.	C	CTA,CTATA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32,29;MFRL=114,158,181;MMQ=60,60,60;MPOS=16,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=TA;STR;TLOD=13.43,4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,4:0.487,0.415:10:0,2,0:1,2,3:0,1,9,0
chr12	64671527	.	G	GCGGCAGGCCCAGAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=166,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:64671527_G_GCGGCAGGCCCAGAA:64671527:2,11,1,1
chr12	64671529	.	T	TGGGAAGTAC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=166,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,1:0|1:64671527_G_GCGGCAGGCCCAGAA:64671527:2,11,1,1
chr12	64678416	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=70,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr12	64678434	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=190,297;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,1,0
chr12	64724815	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=133,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.581:8:3,1:0,4:0,3,2,3
chr12	64746833	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=127,207;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0|1:64746833_C_T:64746833:4,0,0,3
chr12	64746840	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=128,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.495:6:1,2:2,1:0|1:64746833_C_T:64746833:3,0,1,2
chr12	64838752	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	64858100	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr12	64879165	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	64891401	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=172,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.317:14:4,2:4,2:9,1,4,0
chr12	64891418	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=22,15;MFRL=181,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.275:16:6,0:3,0:0|1:64891418_G_T:64891418:9,3,4,0
chr12	64891421	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=19,15;MFRL=181,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.275:16:3,0:2,0:0|1:64891418_G_T:64891418:9,3,4,0
chr12	65004316	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=209,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr12	65004387	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:2,1,2,0
chr12	65004520	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=151,80;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,2:8,0:5,9,0,2
chr12	65004550	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr12	65088448	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=353,354;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr12	65134536	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,0,8
chr12	65460368	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	65471467	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr12	65563703	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:65563703_A_C:65563703:0,0,0,1
chr12	65563712	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=275,262;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65563703_A_C:65563703:1,0,0,1
chr12	65609675	.	G	GTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr12	65609707	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:2,3:4,1,4,3
chr12	65609853	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=154,117;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,2:7,0:7,11,1,1
chr12	65633880	.	GTGAT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=141,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGAT;STR;TLOD=45.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.754:14:0,4:1,7:2,1,7,4
chr12	65762703	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=16,26;MFRL=219,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=C;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:0,0:0,3:0,1,0,5
chr12	66517828	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,3,13
chr12	66531694	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr12	66597419	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr12	66641813	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:6,1:9,3:4,11,1,3
chr12	66698438	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr12	66698461	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=105,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr12	66698954	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr12	66700361	.	T	TATATTTTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=179,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr12	66717692	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr12	66717716	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	66725137	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=193,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:8,4:8,3:8,8,5,2
chr12	66725160	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.393:21:4,5:8,3:7,6,4,4
chr12	66771108	.	ATT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=283,240;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.617:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr12	66786073	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr12	66786091	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,15,5
chr12	66786341	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr12	66786644	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr12	66814466	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=111,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr12	66814487	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=111,161;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,4:1,0:1,1,4,0
chr12	66838272	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=282,313;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=22,21;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr12	66838425	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=116,116;MMQ=60,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:14,0:7,2:9,12,0,2
chr12	66839228	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=119,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:16,0:4,3:8,12,0,3
chr12	66839263	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:11,0:3,6:9,5,0,6
chr12	66849408	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr12	66856667	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:5,3,5,2
chr12	66856847	.	T	TAGACCATTAGCAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=168,266;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:5,14,0,3
chr12	66909389	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=167,72;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:6,3:4,2:5,5,3,2
chr12	66911816	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=194,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr12	66932832	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=206,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,0:7,2:8,3,2,0
chr12	67696052	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=198,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr12	67701103	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=235,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:1,0,7,1
chr12	67706466	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=192,146;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.751:22:1,8:4,9:4,1,10,7
chr12	68054141	.	GA	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.183:31:7,2:7,2:11,15,3,2
chr12	68054196	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:16,0:10,6:10,16,0,6
chr12	68054877	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34,28;MFRL=184,89,98;MMQ=60,60,60;MPOS=14,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,9,11;RU=T;STR;TLOD=5.50,3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,4:0.193,0.378:11:3,2,1:1,0,2:2,3,3,3
chr12	68055117	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.231:37:14,8:15,0:17,12,8,0
chr12	68551722	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:16,0:18,2:17,17,1,1
chr12	68551735	.	G	T,GTT	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=34,32,20;MFRL=164,78,65;MMQ=60,54,60;MPOS=17,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.28,4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,6,2:0.189,0.077:34:13,0,0:13,6,2:13,13,2,6
chr12	68551738	.	G	GTT	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=148,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:12,0:20,2:0|1:68551738_G_GTT:68551738:14,21,1,1
chr12	68551739	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:12,0:20,1:0|1:68551738_G_GTT:68551738:13,22,1,1
chr12	68552041	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=143,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.620:13:1,3:2,2:2,3,0,8
chr12	68646521	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:7,6:1,1:1,7,3,4
chr12	68647250	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,61;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:12,0:6,3:11,7,0,3
chr12	68688939	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=192,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,4:0,2:3,0,6,0
chr12	68707287	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=122,227;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:13,4:0,1:9,4,3,2
chr12	68710042	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:4,16,0,2
chr12	68719216	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=107,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.578:36:6,9:9,11:9,6,12,9
chr12	68724951	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,5:3,7:2,4,5,7
chr12	69045836	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=139,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:13,4:2,0:5,10,0,4
chr12	69050335	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=88,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:0,3:3,0:0,6,0,3
chr12	69080728	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=189,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:5,4:2,11:6,1,14,1
chr12	69082669	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr12	69083237	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr12	69090573	.	CT	C,CTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=161,165,222;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=7.53,8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.400,0.400:7:0,2,1:1,1,2:1,0,6,0
chr12	69090754	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=161,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,5:1,4:0,1,1,8
chr12	69090803	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=208,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,0,2
chr12	69096626	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr12	69109344	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr12	69109617	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=236,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	69125513	.	GG	TT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=162,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,1:4,4,2,6
chr12	69125578	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=168,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr12	69141678	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=163,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,3:5,3,2,2
chr12	69153071	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=221,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,2,1
chr12	69214128	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.148:22:15,2:4,0:11,8,3,0
chr12	69218038	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,5:3,1:6,0,6,0
chr12	69218093	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.192:14:7,0:2,0:0|1:69218093_G_C:69218093:3,9,2,0
chr12	69218096	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,8;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.181:15:8,0:2,0:0|1:69218093_G_C:69218093:4,9,2,0
chr12	69218103	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.180:15:10,2:2,0:0|1:69218093_G_C:69218093:4,9,2,0
chr12	69218107	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,0;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:2,0:0|1:69218093_G_C:69218093:3,9,2,0
chr12	69229663	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=154,99;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,3:11,0:14,5,0,3
chr12	69250481	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:5,2:2,7,0,3
chr12	69279736	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	69633379	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=203,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:4,4:0,6:3,1,10,0
chr12	69646914	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=167,273;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.308:37:14,8:12,3:11,15,3,8
chr12	69651700	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:5,3:15,0:7,13,0,3
chr12	69652336	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr12	69653146	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=254,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr12	69667075	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=221,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr12	69742387	.	GGAA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAA;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:0,8,0,2
chr12	69753830	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=136,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:3,6:1,5:1,3,3,8
chr12	69753847	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=136,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,7:2,3:0,4,3,7
chr12	69756762	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	69759551	.	AT	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=116,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:14,2:14,2:9,20,2,2
chr12	69764850	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=204,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:0,6,0,5
chr12	69980028	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=66.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,23:0.829:27:1,13:3,10:4,0,14,9
chr12	69980141	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.764:19:2,7:2,8:1,3,5,10
chr12	69981862	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,4,8
chr12	69982129	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,2:0,6,0,5
chr12	69987494	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	69991627	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=154,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:1,0,1,3
chr12	69991733	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,2:7,2:9,2,3,1
chr12	69992230	.	G	GT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.477:23:3,3:9,7:3,9,5,6
chr12	70065126	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.813:8:0,4:0,3:1,0,7,0
chr12	70070848	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,0:8,2:5,7,0,2
chr12	70070942	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr12	70088085	.	AGT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=111,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:2,2,1,2
chr12	70088132	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=175,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:3,2:1,2:1,4,1,3
chr12	70091356	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,5:4,1:7,0,6,0
chr12	70149518	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=200,241;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr12	70188399	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70188399_T_C:70188399:0,1,0,1
chr12	70188404	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70188399_T_C:70188399:0,1,0,1
chr12	70195293	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	70195341	.	A	ATATTTTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=236,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATTTTT;STR;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:0,2:1,0:1,0,5,0
chr12	70672149	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=218,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr12	70724053	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,2:7,2:5,7,1,4
chr12	70740194	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=214,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr12	70747507	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=200,229;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:6,0:3,3:10,0,3,0
chr12	70794186	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=168,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr12	70915347	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr12	70915358	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=202,77;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,2:1,0:3,3,0,2
chr12	70918185	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:3,1,2,1
chr12	70928724	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.955:18:0,9:0,9:0,0,6,12
chr12	70933298	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=185,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,0:2,2:6,1,2,0
chr12	70933394	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,0:9,3:8,6,0,3
chr12	70933687	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=194,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,4:1,4:2,0,4,4
chr12	70938279	.	AGAG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=163,67;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:12,1,2,0
chr12	70949062	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=169,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:5,4,1,1
chr12	70949620	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=237,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.342:12:6,1:2,2:5,3,4,0
chr12	70949973	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=129,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr12	70953456	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=184,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr12	70953477	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=184,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr12	70954814	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=252,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,2:1,1:0,6,0,3
chr12	70956935	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=85,316;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:2,1:4,1:4,2,0,2
chr12	70963386	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=197,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:5,0,1,2
chr12	70964909	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=164,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:11,1:11,2:10,13,2,1
chr12	70965902	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=273,253;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr12	70970222	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=207,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:7,4:11,0:8,10,4,0
chr12	70970430	.	G	GAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=80,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:70970430_G_GAC:70970430:2,0,1,1
chr12	70970432	.	T	TGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=80,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:70970430_G_GAC:70970430:2,0,1,1
chr12	70984019	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=110,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:15,3:5,3:9,11,1,5
chr12	70984042	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=226,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:10,4:13,2:1,22,2,4
chr12	70984064	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=164,226;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.407:25:7,0:7,10:0|1:70984064_G_A:70984064:1,14,0,10
chr12	70984066	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=164,226;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.407:25:7,0:7,10:0|1:70984064_G_A:70984064:1,14,0,10
chr12	70988149	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=185,188;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr12	71003424	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=197,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr12	71050694	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=242,323;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr12	71078135	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=170,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr12	71523024	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=18,11;MFRL=225,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.381:11:1,0:1,0:7,0,4,0
chr12	71523043	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=17,24;MFRL=222,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.606:15:1,3:1,3:6,0,7,2
chr12	71523134	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:7,5:6,10:5,8,7,8
chr12	71523199	.	TAA	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=176,142;MMQ=60,44;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=47.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.792:17:2,11:1,1:1,2,1,13
chr12	71526414	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=185,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:3,1,2,1
chr12	71526677	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=276,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr12	71531639	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=240,256;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr12	71531663	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr12	71531889	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.601:28:6,10:5,7:8,3,14,3
chr12	71532099	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=298,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr12	71898287	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=208,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr12	71898358	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:3,8:3,5:4,2,8,5
chr12	71898430	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=177,56;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,3:9,0:9,13,3,0
chr12	71953540	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=205,242;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:71953540_G_C:71953540:0,2,0,1
chr12	71953542	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=205,242;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:71953540_G_C:71953540:0,2,0,1
chr12	71960329	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr12	71960533	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,13:0,6:0,0,9,10
chr12	71960584	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,6,5
chr12	71977712	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,12:0.277:45:17,0:16,12:10,23,0,12
chr12	72004882	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:2,0:6,0:2,10,0,4
chr12	72004883	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,16;MFRL=171,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.213:16:4,0:7,1:2,11,0,3
chr12	72004884	.	GAA	G,AAA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=20,18,26;MFRL=255,86,174;MMQ=60,60,60;MPOS=25,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.35,5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.338,0.220:8:0,0,1:2,0,2:0,3,0,5
chr12	72007084	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=162,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:6,3,2,0
chr12	72009112	.	CAAA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=165,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:5,0:1,10,1,1
chr12	72013185	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=133,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:8,2:15,1:7,17,3,0
chr12	72013727	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=130,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:4,4:12,0:8,8,4,0
chr12	72019989	.	T	TAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=AC;STR;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr12	72023336	.	TACACAC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=241,246;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=AC;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.316:4:0,0:2,1:3,0,1,0
chr12	72026778	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=174,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,2:9,0:4,11,1,1
chr12	72026872	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=375,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr12	72028508	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.183:14:5,0:7,2:0|1:72028508_C_T:72028508:7,5,1,1
chr12	72028514	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=159,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:8,2:0|1:72028508_C_T:72028508:10,6,1,1
chr12	72028516	.	A	AAGATACAG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=156,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:0|1:72028508_C_T:72028508:10,5,1,1
chr12	72028607	.	TAA	T,TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=16,22,29;MFRL=156,168,172;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=7.30,13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,8:0.281,0.542:14:0,0,2:0,2,5:0,2,3,9
chr12	72030252	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=257,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.907:19:1,10:0,8:1,0,11,7
chr12	72058416	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,3:10,0:4,16,0,3
chr12	72067966	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=218,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:2,3:5,0:7,1,3,0
chr12	72094530	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=191,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr12	72286900	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr12	72366590	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,11;MFRL=267,257;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:72366590_A_T:72366590:0,1,0,1
chr12	72366596	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=267,257;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:72366590_A_T:72366590:0,1,0,1
chr12	72388374	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,1,9
chr12	72425248	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:9,5,0,2
chr12	73012649	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.343:9:4,2:2,1:5,1,3,0
chr12	74932565	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=139.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,16:0,22:0,0,20,18
chr12	74932590	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:20,4:18,0:20,18,4,0
chr12	74933341	.	GCAGT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=192,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:4,2:7,3:7,5,3,2
chr12	74933853	.	GT	G,GTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,35,34;MFRL=128,200,208;MMQ=60,60,60;MPOS=22,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=19.23,5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,8,3:0.540,0.259:13:0,5,0:2,3,2:1,1,4,7
chr12	74934361	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=208,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,3:5,3:5,2,2,4
chr12	74934634	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,13:0,9:0|1:74934634_G_A:74934634:0,0,8,15
chr12	74934637	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,12:0,8:0|1:74934634_G_A:74934634:0,0,8,14
chr12	74934661	.	GTT	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=T;STR;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,8:6,3:6,5,6,5
chr12	74934909	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,0:7,2:0|1:74934909_A_T:74934909:12,5,0,2
chr12	74934926	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:74934909_A_T:74934909:14,4,0,2
chr12	74934935	.	T	TGTG	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:6,2:0|1:74934909_A_T:74934909:16,4,0,2
chr12	74934945	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=170,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.399:15:4,6:5,0:8,1,3,3
chr12	75435986	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=197,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.378:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr12	75676206	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=152,162;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr12	75687185	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=263,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr12	75692607	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=201,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.239:19:6,2:8,2:6,9,3,1
chr12	75692755	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=224,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,3:5,0:2,7,1,2
chr12	75693520	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=193,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,1:0|1:75693520_C_T:75693520:10,0,2,0
chr12	75693531	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=190,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:75693520_C_T:75693520:9,0,2,0
chr12	75693691	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=179,245;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,1:6,2:2,8,0,3
chr12	75693751	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=218,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr12	75698736	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	75706720	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:3,2:5,1:1,7,2,1
chr12	75784773	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=237,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,0:4,3:0,5,0,3
chr12	75804235	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:10,2:15,0:11,14,1,1
chr12	75816612	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=127,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,2,1
chr12	75816814	.	G	GACA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACA;STR;TLOD=33.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,4:3,5:3,3,2,7
chr12	75874913	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr12	75875576	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,5:6,3:10,1,7,1
chr12	75884330	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,14;MFRL=204,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,0:0|1:75884330_A_C:75884330:0,3,2,0
chr12	75884331	.	C	CGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=204,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,21;RU=G;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,0:0|1:75884330_A_C:75884330:0,3,2,0
chr12	75884335	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=212,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:75884335_C_T:75884335:0,2,0,1
chr12	75884342	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=206,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:75884335_C_T:75884335:0,1,0,1
chr12	75895619	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=214,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:7,4:7,3:8,6,3,4
chr12	75895724	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:11,0:21,4:15,17,0,4
chr12	75900382	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=203,194;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:5,1:5,5,0,2
chr12	75900588	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=158,32;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,2:8,4:6,6,4,2
chr12	75900702	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=180,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:1,2:3,5:1,3,2,5
chr12	75901961	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=193,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr12	76424937	.	TTGC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TGC;STR;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.907:7:0,6:0,1:0,0,4,3
chr12	76444510	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=250,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,5:2,5:0,3,0,10
chr12	76449900	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=180,102;MMQ=60,51;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:5,7:2,2:2,5,5,4
chr12	76453670	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=189,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,1:10,2:1,16,0,3
chr12	76453861	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=192,260;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:2,0,7,1
chr12	76453873	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=192,254;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,7:1,2:2,0,7,2
chr12	76453966	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=141,152;MMQ=52,51;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:4,6:5,8:6,3,10,4
chr12	76461137	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=150,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.475:19:6,5:4,4:0|1:76461137_T_C:76461137:8,2,7,2
chr12	76461145	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=157,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:5,4:5,4:0|1:76461137_T_C:76461137:10,2,6,2
chr12	76461257	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.425:14:3,3:5,3:0,8,1,5
chr12	76762923	.	A	AAAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=223,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,2:2,0,5,1
chr12	76763092	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=19,18;MFRL=226,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.593:17:1,1:1,3:1,6,2,8
chr12	76767065	.	A	AT,ATT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29,23;MFRL=0,151,193;MMQ=60,60,60;MPOS=16,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=15.19,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,2:0.671,0.250:9:0,4,0:0,2,1:0,0,6,3
chr12	76769209	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=199,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,3:0,3:0,5,0,6
chr12	76772220	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=211,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:76772220_G_A:76772220:3,1,0,1
chr12	76772225	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:1,1:0|1:76772220_G_A:76772220:4,1,1,1
chr12	76780051	.	TA	T,TAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28,28;MFRL=142,184,111;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=10.21,8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,7,7:0.381,0.425:17:1,3,2:2,4,4:1,2,5,9
chr12	76786349	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=285,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:2,5:0,12:1,1,10,7
chr12	77199250	.	AACTTG	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=112,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:2,1:6,3:0,8,0,4
chr12	77202798	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=232,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,3:0,7:1,0,10,0
chr12	77209613	.	GTT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=173,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:2,0:9,3,1,1
chr12	77216349	.	TTTG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=183,93;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:0,0:0|1:77216349_TTTG_T:77216349:0,2,1,0
chr12	77216359	.	AG	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,16;MFRL=205,93;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:77216349_TTTG_T:77216349:0,4,1,0
chr12	77239420	.	AAAAT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAT;STR;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:2,4:0,1:2,0,4,1
chr12	77254207	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr12	77419593	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,212;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.497:26:6,8:7,4:7,6,5,8
chr12	77423654	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=168,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:8,0:2,2:0|1:77423654_C_T:77423654:4,6,1,1
chr12	77423661	.	T	TCTA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=174,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:0|1:77423654_C_T:77423654:6,6,1,1
chr12	77423663	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=174,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0|1:77423654_C_T:77423654:6,6,1,1
chr12	77423665	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=174,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,1:0|1:77423654_C_T:77423654:6,6,1,1
chr12	77424135	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=203,245;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0,5,0,2
chr12	77437004	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=183,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:5,0:9,2:4,10,0,2
chr12	77438607	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=418,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,1:0,6:0,2,0,7
chr12	78225186	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=197,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,2:5,4:9,2,4,2
chr12	78334053	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr12	78334250	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=102,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.548:9:4,1:0,4:3,1,1,4
chr12	78334761	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=225,204;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,6:2,0:2,0,7,0
chr12	78392041	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,110;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,3:3,0:6,1,3,0
chr12	78511755	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:2,1,6,0
chr12	78513734	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=151,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,0:6,3:3,12,0,3
chr12	78534233	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=245,241;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr12	78540174	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=132,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.730:19:4,11:1,2:2,3,5,9
chr12	78562687	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr12	78569059	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr12	78582362	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr12	78582566	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr12	78590946	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	78590983	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:7,0,3,0
chr12	78591249	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr12	78592504	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=187,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:78592504_TG_T:78592504:1,0,0,1
chr12	78592516	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=187,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:78592504_TG_T:78592504:1,0,0,1
chr12	78593316	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=165,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,0:6,4:5,8,0,4
chr12	78594405	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=164,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.477:8:2,1:2,3:2,2,1,3
chr12	79611536	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=198,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr12	79685913	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:2,3,4,3
chr12	79689789	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=176,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:6,0,2,1
chr12	79747487	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr12	80169697	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.417:12:3,3:3,2:7,0,5,0
chr12	80175762	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=217,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr12	80175764	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	80190650	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.220:30:13,1:10,5:15,9,4,2
chr12	80191044	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=118,160;MMQ=60,42;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.142:30:17,0:9,3:11,15,4,0
chr12	80199504	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=134,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:12,0:7,7:10,9,0,7
chr12	80216051	.	A	ATATTGATGACTACTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=182,135;MMQ=60,43;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr12	80216060	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr12	80645799	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr12	80647155	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr12	80648399	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr12	80649004	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=219,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:1,2:5,2:0,7,0,4
chr12	80655692	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr12	80663825	.	GAA	G,GA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,35,28;MFRL=149,172,135;MMQ=60,60,60;MPOS=12,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.43,8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,5:0.251,0.451:11:0,2,0:3,1,3:3,0,6,2
chr12	80663838	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.369:14:4,1:5,4:7,2,4,1
chr12	80665397	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=145,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:4,1,4,1
chr12	80672064	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,3:0,3:0,1,1,5
chr12	80712307	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,3:0,0,11,3
chr12	80722385	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,1:2,1:6,1,2,0
chr12	80726708	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=297,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:2,1,4,0
chr12	80730466	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,5:5,2:5,7,5,2
chr12	80730561	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.363:19:0,3:11,3:7,5,5,2
chr12	80730664	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,251;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:3,2:12,4:6,10,2,4
chr12	80746234	.	G	GAAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAT;STR;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,2,7
chr12	80750741	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=206,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.737:13:1,7:2,3:0,3,1,9
chr12	80752057	.	C	CACTTTTTGTCTTCTTTTGGG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=180,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:8,0:7,2:10,5,0,2
chr12	80762163	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,223;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr12	80765683	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=216,261;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:80765683_TG_T:80765683:2,0,2,0
chr12	80765685	.	AAG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=216,261;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:80765683_TG_T:80765683:2,0,2,0
chr12	80765741	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr12	80765933	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=155,318;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:80765933_C_G:80765933:0,3,0,2
chr12	80765945	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=170,318;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:80765933_C_G:80765933:0,2,0,2
chr12	80838012	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr12	80839309	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr12	80878174	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0|1:80878174_T_A:80878174:0,0,8,0
chr12	80878181	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:80878174_T_A:80878174:0,0,8,0
chr12	80889165	.	T	TTTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TTG;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.793:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr12	80890325	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,6,9
chr12	80927999	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:1,3,0,3
chr12	80933465	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	80933734	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:6,1:2,1:2,7,0,2
chr12	80935300	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,3,2
chr12	81028838	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,3:8,0:7,10,1,2
chr12	81063264	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=133,74;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,3:2,0:0,3,1,2
chr12	81066851	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=160,262;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr12	81072638	.	ACTTTTCTCTAATC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=197,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:1,0:5,2,2,0
chr12	81102237	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,1:0|1:81102237_A_C:81102237:1,3,2,0
chr12	81102242	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:81102237_A_C:81102237:1,4,2,0
chr12	81102246	.	CAA	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,0:3,1:0|1:81102237_A_C:81102237:1,4,2,0
chr12	81112704	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=152,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:1,0:6,3:5,2,2,1
chr12	81112867	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=117,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:81112867_G_A:81112867:0,3,0,1
chr12	81112869	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=117,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:81112867_G_A:81112867:0,3,0,1
chr12	81112870	.	T	TTTTTACCAG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=117,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:81112867_G_A:81112867:0,3,0,1
chr12	81112882	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr12	81112913	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=186,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr12	81205271	.	TTGC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TGC;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:2,1:8,1:8,4,1,1
chr12	81226432	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=131,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.544:9:1,0:3,5:0|1:81226432_G_A:81226432:2,2,2,3
chr12	81226436	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=131,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:0|1:81226432_G_A:81226432:2,2,1,3
chr12	81533013	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=137,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:6,7,0,2
chr12	81533078	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=112,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.711:11:1,5:1,3:0,3,2,6
chr12	81624964	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=163,278;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:0,2,1,2
chr12	81647065	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,4:1,4:1,1,6,2
chr12	81647471	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr12	81655861	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=141,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:1,1,1,4
chr12	81661945	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,35;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr12	82747058	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=144,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:12,1:12,1:12,13,0,2
chr12	82751062	.	TATC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr12	82751955	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr12	82752633	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,9,8
chr12	82780761	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=168,120;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,0:4,4:1,9,0,4
chr12	82828426	.	T	TATAAG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATAAG;STR;TLOD=80.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,6:0,0,14,5
chr12	82832418	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr12	82850427	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr12	83358930	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=240,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,1,5
chr12	85285920	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.526:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr12	85408327	.	TG	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=113,73;MMQ=60,51;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:26,0:11,3:13,24,0,3
chr12	85423743	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=135,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,5:4,4:1,9,3,6
chr12	85439774	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:2,2,3,0
chr12	85451017	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr12	85531790	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=119,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:0,4:3,5:0,3,1,8
chr12	85547749	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,1:9,2:8,7,3,0
chr12	85554331	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=107,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr12	85554379	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:5,4,2,0
chr12	85638645	.	GA	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.447:27:8,6:7,6:5,10,1,11
chr12	85674356	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=282,225;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.586:8:2,0:1,3:0,3,0,5
chr12	86270500	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,1:6,3:4,6,2,2
chr12	88379543	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=157,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:10,0,2,0
chr12	88379566	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr12	88379883	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=184,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:1,4,0,3
chr12	88429323	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:9,1,2,0
chr12	88447355	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.891:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr12	88453608	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr12	88454594	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.909:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr12	88473049	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr12	88478316	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr12	88481496	.	CAAAAAA	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=193,191;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=24,18;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.344:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr12	88481519	.	AAC	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,19;MFRL=171,181;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:6,1:6,4,2,0
chr12	88481521	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,19;MFRL=169,165;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:5,0:5,4,2,0
chr12	88481524	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,10;MFRL=171,181;MMQ=60,40;MPOS=-1073741820;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,0:4,0:4,4,4,0
chr12	88483272	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr12	88496738	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=154,147;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:9,0:7,5:7,9,0,5
chr12	88496838	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr12	88510895	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=154,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:3,2:16,0:5,15,1,1
chr12	88514120	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=128,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr12	88522823	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,7:0,0,2,14
chr12	88525005	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:2,1:2,4,2,1
chr12	88525048	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,1,7
chr12	89819166	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=107,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,4:3,5:3,7,3,6
chr12	89853387	.	CAA	C,CA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,29,33;MFRL=114,184,172;MMQ=60,60,60;MPOS=5,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=4.15,5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,4:0.210,0.266:17:2,2,2:5,1,1:7,3,6,1
chr12	89853408	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=114,180;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.409:30:8,7:4,1:9,9,8,4
chr12	91347630	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:6,3:22,0:15,14,0,3
chr12	91358169	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=142,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr12	91372036	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=175,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:2,0:6,0:5,8,0,3
chr12	91372042	.	GAA	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,17;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.264:19:2,0:4,0:5,9,0,5
chr12	91445303	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=211,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:2,5,1,1
chr12	91501828	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.191:17:8,2:6,0:10,4,3,0
chr12	91550784	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=245,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:1,1:5,1:6,0,2,0
chr12	91552127	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=151,68;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:11,4:10,0:13,8,3,1
chr12	91572297	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=180,72;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:10,6:10,1:6,14,4,3
chr12	92539344	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=18,26;MFRL=187,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.584:14:3,4:0,3:2,4,3,5
chr12	92821860	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=35.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:5,5:1,5:2,4,2,8
chr12	93100366	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=210,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr12	93100895	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=199,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr12	93100951	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=199,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,0,2
chr12	93131203	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:1,6:0,3:1,0,7,2
chr12	93139234	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=135,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.203:20:12,0:4,4:13,3,3,1
chr12	93171314	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=169,161;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,12:0.302:41:14,11:14,0:0|1:93171314_C_A:93171314:17,12,12,0
chr12	93171316	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=169,161;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,12:0.302:41:14,12:15,0:0|1:93171314_C_A:93171314:17,12,12,0
chr12	93202801	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=144,102;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:2,4:3,1:3,2,5,1
chr12	93206878	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,5,13
chr12	93236402	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0|1:93236402_C_T:93236402:0,0,1,16
chr12	93236419	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.530:15:6,4:1,4:0|1:93236402_C_T:93236402:0,7,0,8
chr12	93247775	.	G	GATA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=222,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=ATA;STR;TLOD=61.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.893:16:1,6:0,7:1,0,1,14
chr12	93788339	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=149,279;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,1,1
chr12	93894823	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=187,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,1:2,3:5,0,4,1
chr12	93968423	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=265,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr12	94072948	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=284,202;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	94562875	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=157,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,2:3,3:3,0,4,1
chr12	94563134	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=177,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:4,3:0,1:0,5,0,4
chr12	94575402	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=169,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,3:5,0:1,6,0,3
chr12	94580286	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=168,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,3:3,8:2,4,1,10
chr12	94603300	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,3:5,1:9,0,3,1
chr12	94613764	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=134,246;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.267:17:4,2:8,2:11,2,4,0
chr12	94620432	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=184,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,2:3,9:4,3,6,5
chr12	94631496	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:6,3:9,1:8,7,0,4
chr12	94648493	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,2:1,6:2,0,7,1
chr12	94649103	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr12	94653226	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=212,195;MMQ=60,43;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:2,3,0,2
chr12	94673509	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=324,250;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr12	94688232	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=206,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:3,1,3,3
chr12	94692496	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=197,118;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,2:7,0:10,10,2,0
chr12	94698880	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=238,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr12	94976383	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=267,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr12	95044268	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=15,24;MFRL=224,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.700:4:0,0:0,2:0,1,0,3
chr12	95228100	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=142,189;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:5,6:10,0:11,5,6,0
chr12	95228126	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=157,189;MMQ=60,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:9,6:11,0:11,9,6,0
chr12	95397275	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=231,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:5,1,4,0
chr12	95397552	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	95422108	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	95422377	.	T	TCATCA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=217,239;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:1,1:4,1:0|1:95422377_T_TCATCA:95422377:0,5,0,2
chr12	95422382	.	AA	CC,CA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,32,35;MFRL=222,239,118;MMQ=60,60,60;MPOS=3,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.96,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.300,0.228:6:1,1,0:2,1,1:0,3,0,3
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chr12	95656580	.	GAAAAT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=193,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:4,1:8,0,2,0
chr12	95656936	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=217,222;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:0,4,0,2
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chr12	95681597	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:10,9:6,4:8,8,6,7
chr12	95694547	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
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chr12	95897997	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
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chr12	95927631	.	GT	AC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=139,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,0:10,2:6,9,1,1
chr12	95927762	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=244,189;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.811:19:2,5:1,11:3,0,8,8
chr12	96104138	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr12	96106943	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=136,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.444:18:5,3:5,4:9,1,7,1
chr12	96106994	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=129,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:11,0:10,3:13,8,2,1
chr12	96253003	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	96254880	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=159,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,1,1
chr12	96259951	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=154,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr12	96263439	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	96263453	.	TTAAAGG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=251,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr12	96292280	.	GAAAC	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=185,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAAC;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:4,4,1,1
chr12	96312686	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,6:7,4:8,1,8,2
chr12	96330311	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.290:15:5,3:6,1:1,10,1,3
chr12	96337164	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	96337183	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	96337225	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	96356048	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr12	96356280	.	A	AC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=366,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=41.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:0,8:1,5:0,1,4,10
chr12	96359426	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=275,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,7:0,1:2,0,7,1
chr12	96361514	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.422:12:3,2:3,2:6,1,4,1
chr12	96370511	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=125,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,2:7,3:4,8,2,3
chr12	96379663	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:1,0:5,2:6,0,2,0
chr12	96379806	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=220,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,5:1,6:0,1,6,5
chr12	96380753	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=194,273;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr12	96384345	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=154,257;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:3,2,1,2
chr12	96387829	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=194,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:4,8:3,7:2,5,8,7
chr12	96412675	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=136,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:96412675_A_T:96412675:4,4,1,1
chr12	96412680	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=136,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:96412675_A_T:96412675:4,4,1,1
chr12	96412685	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=136,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:96412675_A_T:96412675:4,4,1,1
chr12	96415842	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=234,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr12	96617304	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,0:5,3:8,5,3,0
chr12	96641016	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=140,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:16,1:4,2:12,8,3,0
chr12	96653501	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,3:0,0,11,3
chr12	96691355	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=290,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr12	96694162	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,9,7
chr12	96717741	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=149,85;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:9,6,0,2
chr12	97051632	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=182,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.643:6:1,3:1,1:1,1,3,1
chr12	97078749	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,5:0,3:1,0,6,2
chr12	97078977	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=129,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,2:7,0:0|1:97078977_G_A:97078977:8,8,1,1
chr12	97078980	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=129,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:97078977_G_A:97078977:9,8,1,1
chr12	97079040	.	CC	TG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=65,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.771:11:2,6:0,3:0|1:97079040_CC_TG:97079040:0,2,2,7
chr12	97079043	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=65,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.769:11:2,5:0,3:0|1:97079040_CC_TG:97079040:0,2,2,7
chr12	97085107	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,247;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr12	97098415	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=188,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,6,1
chr12	97147503	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=174,243;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:2,3:3,4:2,3,6,1
chr12	97158126	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=180,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr12	97303522	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:2,7:6,4:2,6,6,5
chr12	97303682	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=96,80;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.190:18:5,1:10,2:4,11,0,3
chr12	97306603	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=179,289;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:1,2:0,2,0,2
chr12	97311376	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,35,30;MFRL=185,159,156;MMQ=60,60,60;MPOS=24,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=T;STR;TLOD=7.78,6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,3:0.257,0.262:11:2,2,2:3,1,1:4,1,6,0
chr12	97311541	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=113,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.812:19:0,9:3,7:2,1,2,14
chr12	97328714	.	TGCTTATAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=162,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,3:1,3:1,0,4,2
chr12	97331219	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0|1:97331219_GT_G:97331219:0,0,0,5
chr12	97331233	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=158,72;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:97331219_GT_G:97331219:0,4,0,1
chr12	97331234	.	G	GTTTTTTTAAAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=158,72;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:97331219_GT_G:97331219:0,4,0,1
chr12	97331235	.	C	CATA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=158,72;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:97331219_GT_G:97331219:0,4,0,1
chr12	97337610	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=426,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr12	97339388	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	97339681	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=179,117;MMQ=60,36;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.207:14:2,2:8,0:0|1:97339681_G_A:97339681:1,11,0,2
chr12	97339682	.	A	ATAATTCTTCCTATAATTTCTTTTCTGTCCAT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=179,117;MMQ=60,36;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.211:13:2,2:8,0:0|1:97339681_G_A:97339681:1,10,0,2
chr12	98921574	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,4:2,3:2,0,6,1
chr12	98925650	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=157,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:1,5,2,4
chr12	98925715	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=171,262;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr12	98938158	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:11,0:11,4:12,10,0,4
chr12	98938295	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,2:9,1:6,12,2,1
chr12	98989187	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,1:2,2:8,1,1,2
chr12	99007586	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=126,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,2:13,0:12,10,2,0
chr12	99020600	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,0:5,5:1,9,0,5
chr12	99043280	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=105,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:16,3:10,0:12,14,2,1
chr12	99059932	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=124,119;MMQ=60,33;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.424:21:4,7:8,0:9,3,9,0
chr12	99116919	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=244,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr12	99117397	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:3,1:1,2:3,1,3,0
chr12	99129497	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr12	99166805	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:1,2:4,10:4,1,8,4
chr12	99175840	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=146,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,3:1,4:2,1,7,0
chr12	99447139	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr12	99478626	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=253,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,3:0,3:3,0,6,0
chr12	99478889	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr12	99640557	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=155,131;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:2,4:6,3:0|1:99640557_T_C:99640557:3,5,3,4
chr12	99640561	.	G	GTGC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=160,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,2:0.167:16:5,0:8,2:1|0:99640557_T_C:99640557:5,9,1,1
chr12	99640563	.	G	GTGGTGT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=161,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,2:0.176:15:5,0:7,1:1|0:99640557_T_C:99640557:4,9,1,1
chr12	100041939	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=139,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:0|1:100041939_AT_A:100041939:3,4,1,3
chr12	100041942	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=139,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:0|1:100041939_AT_A:100041939:3,4,1,3
chr12	100166935	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=170,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr12	100173822	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	100219207	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:3,6,1,2
chr12	100612443	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=232,215;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,0:3,10:0,4,0,10
chr12	100657398	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:9,3:9,0:13,5,4,0
chr12	100660759	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=190,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.311:27:9,5:9,3:9,10,4,4
chr12	100676960	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=197,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0,6,1,4
chr12	100709313	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=116,224;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:4,1:2,1:3,3,2,0
chr12	100709420	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,3:5,8:5,5,6,5
chr12	100717260	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:6,0,3,1
chr12	100729529	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:3,6,2,0
chr12	100787095	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,4:1,5:1,0,5,4
chr12	100806503	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,0:6,3:9,2,0,3
chr12	100811727	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=208,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr12	100811957	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=212,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:4,9,2,0
chr12	100813977	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	100988623	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,89;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:13,0:12,5:10,16,0,5
chr12	101333203	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=192,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:2,6,2,2
chr12	101365007	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=180,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:4,0,3,0
chr12	101381516	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=313,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr12	101436011	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=200,71;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,0:7,4:12,0,1,3
chr12	101491375	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=103,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:5,2,1,1
chr12	101520648	.	C	CTG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.241:10:4,1:4,0:4,4,0,2
chr12	101581317	.	CAA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=208,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:2,2,0,3
chr12	101584210	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=211,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,4:7,0:6,3,2,2
chr12	101674854	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,1:6,1:13,1,2,0
chr12	101679428	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=182,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:4,6:9,0:5,8,3,3
chr12	101679476	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,4:5,0:4,5,1,3
chr12	101685422	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr12	101685540	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,0:5,2:7,2,2,0
chr12	101685643	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:4,0:12,2:10,6,0,2
chr12	101687043	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=206,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:1,2,0,4
chr12	101693892	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=142,246;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0|1:101693892_G_A:101693892:0,3,1,1
chr12	101693897	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=191,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1|0:101693892_G_A:101693892:1,3,0,1
chr12	101696351	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=193,183;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,0:5,8:2,4,0,8
chr12	101701930	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:4,0,6,1
chr12	101705433	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=190,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.436:7:1,3:3,0:3,1,3,0
chr12	101705477	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=194,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.617:8:2,4:0,1:3,0,5,0
chr12	101728166	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=187,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:6,1,1,2
chr12	101728382	.	AT	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=244,22437;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,1,0
chr12	101732120	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=181,238;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,0:0,4,0,3
chr12	101732150	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=223,238;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr12	101734277	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=284,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:5,2,3,2
chr12	101736381	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=229,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:2,2,3,3
chr12	101746809	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.306:10:6,2:1,1:5,2,3,0
chr12	101755683	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr12	101757561	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=172,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.549:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr12	101759443	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr12	101764911	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,1:2,7,1,1
chr12	101779964	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr12	101789399	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:8,0:4,2:6,7,0,2
chr12	101790154	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=189,132;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,4:7,0:9,5,4,0
chr12	101795009	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr12	101870804	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:1,3,1,1
chr12	101988789	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=198,143;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,5:3,0:3,1,5,0
chr12	101988811	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=235,143;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:3,4:4,0:6,1,5,0
chr12	102023379	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=273,244;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:102023379_G_A:102023379:0,2,0,1
chr12	102023381	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=22,30;MFRL=273,244;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:102023379_G_A:102023379:0,2,0,1
chr12	102023383	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,35;MFRL=273,244;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:102023379_G_A:102023379:0,2,0,1
chr12	102023385	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,35;MFRL=273,244;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:102023379_G_A:102023379:0,2,0,1
chr12	102023388	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,35;MFRL=273,244;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:102023379_G_A:102023379:0,2,0,1
chr12	102023405	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=353,244;MMQ=60,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102023405_C_T:102023405:0,1,0,1
chr12	102023407	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=319,244;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:102023405_C_T:102023405:0,2,0,1
chr12	102023414	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,35;MFRL=319,244;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:102023405_C_T:102023405:0,2,0,1
chr12	102025926	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=109,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:4,2:2,3:4,3,2,3
chr12	102041757	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=116,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,0:0,4:1,1,3,1
chr12	102041967	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=221,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr12	102042985	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=183,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,3:3,1:5,0,4,1
chr12	102043265	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=91,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr12	102044912	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=139,269;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr12	102045031	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:7,2,1,1
chr12	102045231	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:1,5,0,6
chr12	102046595	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=84,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,5:0,4:1,1,1,8
chr12	102046874	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=195,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:3,2:6,0,3,1
chr12	102053675	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=116,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:4,0:1,5:1,4,1,4
chr12	102057166	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=245,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:3,1,3,0
chr12	102069264	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=156,247;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,1:3,0:0,5,0,2
chr12	102069293	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr12	102110692	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=304,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr12	102117149	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,67;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr12	102131090	.	TAA	T,TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29,31;MFRL=0,307,166;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=3.69,5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,3:0.487,0.419:7:0,1,0:0,2,3:0,0,0,7
chr12	102147142	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.228:23:7,1:11,3:8,10,4,1
chr12	102151113	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=194,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:3,4,0,3
chr12	102154900	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,7:5,1:5,3,7,1
chr12	102161843	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,3:6,0:6,8,1,2
chr12	102164836	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,238;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:13,0:9,4:9,13,4,0
chr12	102165004	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=174,130;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.252:9:3,0:2,1:0,7,0,2
chr12	102224491	.	AGCC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=179,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCC;STR;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.549:9:3,0:1,5:1,3,3,2
chr12	102271631	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=163,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:102271631_G_T:102271631:3,6,1,1
chr12	102271633	.	C	CCAAAATGCTGGGA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=163,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,1:3,0:0|1:102271631_G_T:102271631:3,6,1,1
chr12	102271635	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=163,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:6,1:3,0:0|1:102271631_G_T:102271631:3,6,1,1
chr12	102295218	.	TC	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,3:4,1:0,8,1,3
chr12	102301892	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:5,0,4,0
chr12	102308095	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=279,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr12	102433811	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr12	102471023	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=178,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:5,1,3,0
chr12	102559574	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=131,138;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.216:35:16,7:12,0:11,17,7,0
chr12	102559655	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=163,94;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,0:11,3:5,13,0,3
chr12	102559708	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=86,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr12	102576307	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28,33;MFRL=153,205,132;MMQ=60,60,60;MPOS=17,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=T;STR;TLOD=5.72,9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,4:0.249,0.418:9:3,1,2:0,1,2:3,0,6,0
chr12	102589675	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=241,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,8:2,2:5,0,10,0
chr12	102872155	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=198,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.695:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr12	103237468	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,198;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,3:2,6:1,2,3,6
chr12	103240630	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,2:3,2:4,1,2,2
chr12	103249164	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=191,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr12	103271193	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:2,2,4,0
chr12	103306550	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,2:5,1:13,1,2,1
chr12	103310787	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,2:6,1:13,2,3,0
chr12	103310979	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=226,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.235:11:2,1:5,1:2,7,0,2
chr12	103352171	.	CGCA	C,CGCAGCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27,35;MFRL=0,271,164;MMQ=60,60,60;MPOS=8,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=GCA;STR;TLOD=3.65,3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.419,0.403:2:0,1,1:0,0,0:0,0,1,1
chr12	103699685	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=195,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr12	103762816	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=156,152;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:2,0:9,4:0|1:103762816_G_C:103762816:2,9,0,4
chr12	103762820	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=163,152;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:3,0:9,4:0|1:103762816_G_C:103762816:2,10,0,4
chr12	103872281	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,1:2,1:0,3,0,2
chr12	104015999	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr12	104032074	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=207,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr12	104034048	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:6,2:7,3:2,11,0,5
chr12	104044241	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=123,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:5,0,4,3
chr12	104054560	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=177,162;MMQ=60,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,0:5,11:3,5,0,11
chr12	104056738	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,1:8,1:6,11,0,2
chr12	104063486	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=196,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr12	104064574	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=214,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:2,2:10,1:5,7,2,1
chr12	104067953	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	104069836	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=147,278;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.245:15:10,2:0,0:8,4,1,2
chr12	104069871	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=195,129;MMQ=40,34;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr12	104071158	.	TTCTC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=173,234;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=TC;STR;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:2,1:5,1,3,0
chr12	104076956	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=215,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr12	104089232	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=174,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,2:4,1:10,0,3,0
chr12	104092996	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=88,213;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:3,3:8,2:5,6,1,4
chr12	104098447	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=196,121;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.353:18:5,0:6,6:1,11,0,6
chr12	104099544	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,4:7,3:0,10,2,5
chr12	104107582	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=202,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr12	104109497	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=217,227;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr12	104111687	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr12	104124018	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=137,313;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:12,2:4,1:7,9,2,1
chr12	104124061	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,5,10
chr12	104125489	.	TC	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=230,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:104125489_TC_GT:104125489:0,4,0,1
chr12	104125495	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=230,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:104125489_TC_GT:104125489:0,4,0,1
chr12	104131352	.	TTCTC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=170,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=TC;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr12	104138918	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=224,282;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:10,1,1,1
chr12	104140517	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,3:7,1:2,8,0,4
chr12	104147171	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=239,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,3:5,0:3,7,1,2
chr12	104147207	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr12	104149022	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=293,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr12	104149251	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=224,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:6,7:2,6:5,3,7,6
chr12	104149520	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=231,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr12	104208672	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=138,74;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,3:5,0:5,4,2,1
chr12	104324182	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,3:1,0,6,0
chr12	104324266	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:5,7:7,7:7,5,10,4
chr12	104335532	.	GC	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=178,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.124:30:11,2:16,1:0|1:104335532_GC_G:104335532:9,18,1,2
chr12	104335538	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=174,64;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:10,2:21,0:0|1:104335532_GC_G:104335532:9,23,1,1
chr12	104335750	.	TAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=248,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr12	104341015	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=176,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:0,5:1,5:1,0,9,1
chr12	104345412	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.783:7:1,3:0,3:0,1,1,5
chr12	104359931	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,5:0,1:0,3,0,6
chr12	104373600	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,69;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,2:5,4:9,2,6,0
chr12	104374705	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=190,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,2:8,0:0|1:104374705_A_C:104374705:11,5,1,1
chr12	104374710	.	C	CTTTCTTTG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=181,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:8,0:0|1:104374705_A_C:104374705:13,5,1,1
chr12	104374712	.	T	TCGCAGG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=190,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:0|1:104374705_A_C:104374705:12,5,1,1
chr12	104379506	.	A	ATTGAGAGCGT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=163,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,1:8,1:5,12,0,2
chr12	104379517	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=173,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,0:8,3:2,13,1,2
chr12	104388291	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=207,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,5:4,1:2,5,1,5
chr12	104390558	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:9,1:6,2:5,10,1,2
chr12	104397006	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=108,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:14,2:0|1:104397006_G_T:104397006:10,12,1,1
chr12	104397011	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=94,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:5,0:14,2:0|1:104397006_G_T:104397006:9,12,1,1
chr12	104496724	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=174,239;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:3,3,5,1
chr12	104515109	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=287,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr12	104707151	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=187,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:0,6,1,3
chr12	104707180	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr12	104712858	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=177,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr12	104714847	.	CTT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=155,49;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.280:19:3,1:4,3:12,2,3,2
chr12	104720258	.	T	TGG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,19;MFRL=141,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.264:9:3,0:2,1:0|1:104720258_T_TGG:104720258:3,4,2,0
chr12	104720261	.	GAGAT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.225:11:4,0:2,0:0|1:104720258_T_TGG:104720258:3,6,2,0
chr12	104732818	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr12	104742310	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=205,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,0:2,3:0,7,0,3
chr12	104995800	.	A	AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=192,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.593:20:4,5:4,7:0,8,3,9
chr12	105260145	.	AAGAC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=164,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGAC;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:3,0,2,0
chr12	105260159	.	TACACACAC	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=176,272;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=AC;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr12	105321887	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=126,126;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:15,0:2,2:9,8,0,2
chr12	105424133	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:11,0:2,2:10,3,0,2
chr12	105431835	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=146,215;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,0:3,6:3,3,4,2
chr12	105433463	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=219,224;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:4,1,6,1
chr12	105433607	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=219,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:2,3,0,5
chr12	105434533	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=211,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr12	105440421	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=182,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr12	105454863	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr12	105462522	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=133,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.225:38:14,8:16,0:17,13,8,0
chr12	105464329	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=155,189;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,7:7,0:8,2,7,0
chr12	105508241	.	ACAT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=167,260;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAT;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:3,10,0,2
chr12	105531863	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=152,320;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr12	105534025	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr12	105534603	.	TAATC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=252,249;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr12	105536430	.	C	CTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,315;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	105538478	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.414:12:4,2:3,3:6,1,5,0
chr12	105538665	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=157,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:4,3:6,0:5,6,2,1
chr12	105543326	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr12	105556485	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=283,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr12	105558324	.	AAAT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=161,288;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAT;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr12	105570981	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:5,3:14,0:9,10,2,1
chr12	105582245	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=213,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:0,6:4,2:0,4,2,6
chr12	105583747	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=232,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:9,0,0,2
chr12	105591593	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=203,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:2,5,2,2
chr12	105593282	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,2:6,0:6,10,1,1
chr12	105601913	.	C	CACACACACACA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,94;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:9,4:17,0:13,13,0,4
chr12	105611333	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr12	105629865	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr12	105760369	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=164,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,5:6,2,4,2
chr12	106464785	.	G	C,GAGTAAACAGAAAAGTCCAAGAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34,32;MFRL=244,186,210;MMQ=60,60,60;MPOS=17,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.17,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.435,0.278:4:0,0,1:1,2,0:0,1,0,3
chr12	106480450	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=202,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:8,2:4,0:12,0,2,0
chr12	106708278	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=77,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.550:27:9,9:3,5:9,3,7,8
chr12	106708344	.	T	TTCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=135,162;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	106763106	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=151,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:10,0:7,1:0|1:106763106_C_T:106763106:3,14,1,1
chr12	106763121	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=150,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:6,0:6,2:0|1:106763106_C_T:106763106:3,11,1,1
chr12	106763364	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=169,92;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:12,2:7,1:14,5,2,1
chr12	106772042	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=126,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,2:9,1:12,7,1,2
chr12	106820982	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,11;MFRL=153,158;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,0:3,0:6,2,2,0
chr12	106820984	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,11;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,0:3,0:5,2,2,0
chr12	106820987	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,10;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,0:3,0:4,2,3,0
chr12	106820998	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=185,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:4,0:3,0:0|1:106820998_C_A:106820998:7,2,3,0
chr12	106821018	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=33,10;MFRL=161,167;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,0:0|1:106820998_C_A:106820998:10,5,2,0
chr12	106851143	.	A	ACTTTAATTTCTTTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=189,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr12	106890589	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=200,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,7:8,2:8,4,4,5
chr12	107002558	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	107002642	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=112,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,3:10,0:9,11,0,3
chr12	107078562	.	A	AAAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=106,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:1,2,5,2
chr12	107080617	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34,34;MFRL=0,243,85;MMQ=60,60,60;MPOS=14,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,10,11;RU=T;STR;TLOD=5.74,3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.384,0.493:5:0,0,2:0,2,1:0,0,3,2
chr12	107080636	.	TCTCC	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=85,274;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTCC;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:5,4,1,1
chr12	107080638	.	TCC	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.685:11:1,4:2,4:1,2,5,3
chr12	107083031	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=124,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,4:4,5:4,3,1,8
chr12	107083059	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=138,63;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:8,10,0,2
chr12	107090150	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:3,1:4,4:5,3,3,2
chr12	107126065	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,2:1,0:1,4,0,2
chr12	107126765	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.368:22:6,1:8,6:5,9,0,8
chr12	107141265	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=117,207;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:3,2:8,2:5,6,2,2
chr12	107253984	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:6,7:10,0:14,2,8,0
chr12	107364873	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=195,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:3,1,4,0
chr12	107391753	.	A	AAAAAGTGTTTCAAATAAGCACATTATTAAATT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=102,138;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.141:23:11,0:7,2:0|1:107391753_A_AAAAAGTGTTTCAAATAAGCACATTATTAAATT:107391753:9,12,0,2
chr12	107391763	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=143,138;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:6,2:0|1:107391753_A_AAAAAGTGTTTCAAATAAGCACATTATTAAATT:107391753:7,11,0,2
chr12	107713511	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,372;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	108003911	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr12	108004163	.	CCA	GAG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=161,53;MMQ=60,60;MPOS=-1073741819;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:0,1:0|1:108004163_CCA_GAG:108004163:2,2,0,2
chr12	108004169	.	CC	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=161,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:108004163_CCA_GAG:108004163:1,2,0,2
chr12	108008772	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:3,0,4,0
chr12	108042960	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:9,3:4,2:9,4,3,2
chr12	108045392	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=254,89;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:5,0:0,3:4,1,2,1
chr12	108051559	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=193,91;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,1:8,1:1,9,0,2
chr12	108086697	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:7,3:6,5:4,9,6,3
chr12	108127965	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=135,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:4,1,3,1
chr12	108136172	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr12	108140032	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,1:2,6:2,3,4,3
chr12	108140108	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=189,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:4,7,2,0
chr12	108140183	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:5,0:13,6:15,3,6,0
chr12	108146071	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=242,307;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr12	108150758	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=185,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr12	108154199	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:12,6:7,4:12,7,9,1
chr12	108169235	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,351;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	108170002	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,1:11,1:11,5,0,2
chr12	108600237	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=216,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,1:0,2:1,3,0,3
chr12	108626431	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=117,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,2,2
chr12	108687470	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,1,0
chr12	108912399	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=152,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:7,5:8,1:5,11,3,3
chr12	108913292	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=209,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr12	108918330	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:0,4,1,4
chr12	108919166	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=129,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:8,0,1,1
chr12	108919390	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=249,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.880:23:2,13:0,8:0,2,9,12
chr12	108924904	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,2:0,6:0,1,6,2
chr12	108929328	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=141,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:108929328_A_T:108929328:0,1,0,1
chr12	108929330	.	A	AGGCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=141,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:108929328_A_T:108929328:0,1,0,1
chr12	108932053	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr12	108932916	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	108943028	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr12	108960906	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr12	108962731	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,136;MMQ=60,56;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:2,10,0,3
chr12	108985210	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=514,243;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:108985210_G_A:108985210:1,0,1,0
chr12	108985213	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=514,243;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:108985210_G_A:108985210:1,0,1,0
chr12	108985945	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=133,173;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,1:4,3:2,7,2,2
chr12	109017454	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=25,19;MFRL=118,166;MMQ=60,27;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.245:33:11,1:8,2:14,11,1,7
chr12	109041165	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=268,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:4,4:3,1:0|1:109041165_T_G:109041165:7,0,0,6
chr12	109041171	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:3,4:3,0:0|1:109041165_T_G:109041165:7,0,0,8
chr12	109041174	.	G	GC,GCC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,12,12;MFRL=150,218,123;MMQ=60,60,60;MPOS=11,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.22,3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,5:0.206,0.319:16:4,0,2:3,0,0:8,0,0,8
chr12	109095137	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=184,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,2:6,3:0,12,0,5
chr12	109205189	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=220,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.731:13:3,5:0,4:0,3,0,10
chr12	109210945	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=212,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,1:4,2:0,10,0,3
chr12	109217007	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=125,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.448:16:7,3:2,3:5,4,6,1
chr12	109221013	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:1,8:12,6:7,6,10,4
chr12	109278747	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=174,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:4,6:3,1:6,1,5,2
chr12	109287984	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,3:3,0:6,0,3,0
chr12	109293109	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=199,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr12	109331162	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,6:1,3:0,1,3,6
chr12	109495843	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:7,0:9,7,0,2
chr12	109511144	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr12	109526189	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:13,2:5,2:10,9,3,1
chr12	109530278	.	G	GCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=168,280;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=CA;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr12	109540757	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=192,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:0|1:109540757_T_A:109540757:6,4,1,1
chr12	109540763	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=192,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:5,2:0|1:109540757_T_A:109540757:5,5,1,1
chr12	109540773	.	T	TGCTAGAACATG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=179,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:6,1:0|1:109540757_T_A:109540757:3,5,1,1
chr12	109547586	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=138,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:3,1,3,0
chr12	109605898	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr12	109635031	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=211,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0|1:109635031_A_G:109635031:0,1,0,3
chr12	109635041	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,29;MFRL=211,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:109635031_A_G:109635031:0,1,0,1
chr12	109637188	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=230,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:5,2,4,0
chr12	109637390	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=203,203;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:8,0:4,7:0,12,0,7
chr12	109644447	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=193,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,2:4,0:7,1,1,1
chr12	109650546	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=205,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr12	109670468	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0,0,9,8
chr12	109670657	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=182,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr12	109671701	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=159,243;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,5:2,3:3,2,6,2
chr12	109671738	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=166,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.630:11:3,7:0,0:1,3,4,3
chr12	109683575	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=216,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:1,0,5,5
chr12	109691991	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=147,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:4,1,4,1
chr12	109700096	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,14;MFRL=94,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,0:1,0:0,2,2,0
chr12	109701959	.	CAAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=218,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.414:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr12	109831348	.	CCAT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=412,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	109858918	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.546:5:0,2:1,1:1,1,0,3
chr12	109874230	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=186,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:3,3:4,2:5,3,2,3
chr12	109883254	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:2,1,6,1
chr12	109937392	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=266,59;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:7,2,1,1
chr12	109959276	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=182,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:9,0:16,3:17,8,0,3
chr12	109961951	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=173,54;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:2,0:9,2:2,9,0,2
chr12	109967900	.	G	GCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=214,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:109967900_G_GCA:109967900:1,3,1,1
chr12	109967901	.	GTGAA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=223,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:1,1:0|1:109967900_G_GCA:109967900:1,4,1,1
chr12	110002819	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr12	110006512	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,1:6,2:7,1,2,1
chr12	110028502	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=177,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr12	110221631	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr12	110222146	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,3:5,1:0,11,2,2
chr12	110231717	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=223,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:1,4:1,4:2,0,8,0
chr12	110318261	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr12	110353172	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=222,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,3:5,2:8,1,2,3
chr12	110405292	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:7,6,1,1
chr12	110426946	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=208,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	110450012	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.246:6:1,1:3,0:0|1:110450012_A_T:110450012:0,5,0,1
chr12	110450013	.	T	TAGCCTGGC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,1:3,0:0|1:110450012_A_T:110450012:0,5,0,1
chr12	110450015	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=194,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,0:3,1:0,5,0,1
chr12	110454085	.	CTT	C,CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31,32;MFRL=144,218,158;MMQ=60,60,60;MPOS=3,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.22,8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,3,4:0.151,0.236:20:4,0,0:3,3,4:13,0,6,1
chr12	110463714	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=244,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0,3,0,1
chr12	110463723	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,11;MFRL=285,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:1,0:1,0:0,4,0,2
chr12	110468632	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=133,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:110468632_G_A:110468632:0,3,0,1
chr12	110468635	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=133,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:110468632_G_A:110468632:0,3,0,1
chr12	110468637	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=190,134;MMQ=54,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:110468632_G_A:110468632:0,2,0,1
chr12	110566730	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=129,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.162:29:13,4:11,0:13,12,4,0
chr12	110566907	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=196,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,0:7,5:4,8,2,3
chr12	110570264	.	CAAA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=205,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr12	110570430	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=133,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,3:6,0:5,10,0,3
chr12	110573340	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=165,278;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:0,8,0,3
chr12	110618235	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=203,173;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,3:7,2:7,3,3,2
chr12	110819513	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=163,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:3,1,4,0
chr12	110834321	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=225,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.440:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr12	110873127	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,30;MFRL=184,163;MMQ=48,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr12	110874516	.	TACAC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=14,32;MFRL=185,206;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=AC;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,0:0,1:0,3,0,1
chr12	110905869	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,13,2
chr12	110924524	.	T	TGGAGGAATGTGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=147,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:1,2:3,0:0|1:110924524_T_TGGAGGAATGTGA:110924524:3,2,1,1
chr12	110924528	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=160,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:110924524_T_TGGAGGAATGTGA:110924524:3,1,0,1
chr12	110927882	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=206,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:5,2,2,0
chr12	110941725	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=168,250;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,1:8,1:2,8,0,2
chr12	110950775	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=182,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:2,2:0,4,0,2
chr12	110969485	.	A	AGT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.293:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr12	110989813	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,0:5,7:0,9,0,7
chr12	111072608	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=140,135;MMQ=60,52;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:7,0:6,2:0|1:111072608_C_T:111072608:1,12,0,2
chr12	111072617	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=174,135;MMQ=60,52;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:0|1:111072608_C_T:111072608:0,11,0,2
chr12	111087320	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,242;MMQ=60,41;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr12	111160512	.	G	GTAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=213,229;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:0,0:2,0:0|1:111160512_G_GTAA:111160512:1,3,0,2
chr12	111160513	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=17,25;MFRL=213,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:0,2:1,0:0|1:111160512_G_GTAA:111160512:1,3,0,2
chr12	111296320	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=166,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr12	111296332	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=113,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,4:3,1:2,1,5,0
chr12	111318935	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,1:8,2:9,5,1,2
chr12	111321811	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=178,78;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:7,2,0,2
chr12	111351963	.	GAC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=109,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:0,0:5,2:1,5,2,0
chr12	111356892	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=149,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:2,6,2,0
chr12	111651977	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=212,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,1:2,0,2,1
chr12	111745138	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=150,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,0:2,5:0,4,0,5
chr12	111745157	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:111745157_C_T:111745157:0,1,0,1
chr12	111745159	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:111745157_C_T:111745157:0,1,0,1
chr12	111745164	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:111745157_C_T:111745157:0,1,0,1
chr12	111745168	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:111745157_C_T:111745157:0,1,0,1
chr12	111745171	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,36;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:111745157_C_T:111745157:0,1,0,1
chr12	111746191	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=155,188;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,3:7,0:4,6,3,0
chr12	111757962	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	111760125	.	CAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=23,20;RU=A;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	111772279	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.402:10:2,0:4,2:0|1:111772279_A_C:111772279:1,5,4,0
chr12	111772285	.	CAG	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=224,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:3,1:4,1:0|1:111772279_A_C:111772279:2,5,3,0
chr12	111772560	.	G	GCTCAGGACT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=254,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:0,1:0|1:111772560_G_GCTCAGGACT:111772560:0,2,0,1
chr12	111772562	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=254,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:111772560_G_GCTCAGGACT:111772560:0,2,0,1
chr12	111776374	.	G	GACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:111776374_G_GACA:111776374:0,0,0,1
chr12	111776375	.	G	GGCCCCAGTGTGTGATGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:111776374_G_GACA:111776374:0,0,0,1
chr12	111884608	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:4,3:10,4:6,8,4,3
chr12	111951434	.	C	CGGTGCCCTCCTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=253,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr12	111990774	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=146,109;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,2:6,0:4,4,2,0
chr12	112036753	.	GGCT	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GCT;STR;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,0:0,4:1,0,3,1
chr12	112036797	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,3,4
chr12	112036929	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	112093320	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,283;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:3,2:4,0:4,4,2,0
chr12	112103691	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,167;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr12	112119387	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=237,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.613:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr12	112119500	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,3:8,0:10,4,0,3
chr12	112119554	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=162,200;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:14,5:12,0:10,16,0,5
chr12	112130570	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=166,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,0:11,3:10,9,0,3
chr12	112193554	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=174,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:5,2:9,2:5,9,1,3
chr12	112280697	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=208,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr12	112306512	.	CTTT	C,CT,CTT,CTTTT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,34,31,31,24;MFRL=169,98,154,150,191;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=9,21,12,3;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=14,11,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.35,3.46,11.23,5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:6,2,3,6,4:0.107,0.142,0.293,0.200:21:1,2,1,2,0:3,0,2,3,2:5,1,11,4
chr12	112330853	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=163,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:7,2:12,1:6,13,1,2
chr12	112479940	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:112479940_T_TC:112479940:0,0,0,1
chr12	112479943	.	A	ACAGTCCCCCAAACTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0|1:112479940_T_TC:112479940:0,0,0,1
chr12	112481732	.	AT	A,ATT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25,27;MFRL=0,206,214;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=T;STR;TLOD=6.64,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.449,0.444:6:0,1,0:0,1,3:0,0,0,6
chr12	112516538	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:1,7,0,2
chr12	112610714	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr12	112622525	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,0:2,2:7,4,0,2
chr12	112638688	.	CGTGT	C,CGT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30,29;MFRL=0,273,215;MMQ=60,60,60;MPOS=30,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=GT;STR;TLOD=4.99,11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.336,0.570:6:0,0,2:0,2,2:0,0,0,6
chr12	112646226	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr12	112670786	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:11,1,2,0
chr12	112677750	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:7,0:6,9:9,4,0,9
chr12	112677842	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=170,68;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:3,2:9,0:2,10,1,1
chr12	112688783	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:8,3:10,0:9,10,3,0
chr12	112690372	.	CA	AC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:112690372_CA_AC:112690372:1,2,0,1
chr12	112690383	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=185,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:112690372_CA_AC:112690372:0,2,0,1
chr12	112843695	.	TG	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=167,186;MMQ=54,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:7,0:13,2:0|1:112843695_TG_T:112843695:7,13,2,0
chr12	112843703	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=156,259;MMQ=40,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,4:0.185:25:8,0:12,4:1|0:112843695_TG_T:112843695:10,11,1,3
chr12	112893675	.	GTTT	G,GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,21,30;MFRL=155,74,136;MMQ=60,60,60;MPOS=17,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,15;RU=T;STR;TLOD=4.33,4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.250,0.280:8:1,0,1:2,1,1:3,1,2,2
chr12	112942438	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:2,14:10,0:13,0,15,0
chr12	113285429	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=201,195;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,6:2,0:4,1,6,0
chr12	113319471	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=218,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,4:1,3:1,0,7,0
chr12	113327933	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=134,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:1,6,0,2
chr12	113332348	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,493;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:5,2:6,0:8,3,2,0
chr12	113334668	.	CT	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=227,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:113334668_CT_AG:113334668:0,4,0,1
chr12	113334675	.	T	TTTTCTCTTAGGAAGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=222,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:113334668_CT_AG:113334668:0,3,0,1
chr12	113345088	.	TGAGA	T,TGA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=164,206,239;MMQ=60,60,60;MPOS=13,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=GA;STR;TLOD=4.93,13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,5:0.147,0.300:17:1,0,2:6,2,3:1,9,0,7
chr12	113405181	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=235,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,1:4,3:10,0,4,0
chr12	113407462	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=145,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:8,2:8,0:0|1:113407462_G_A:113407462:7,9,1,1
chr12	113407472	.	A	ACCAAGCAAAACTAAG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=145,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,2:11,0:0|1:113407462_G_A:113407462:7,12,1,1
chr12	113433329	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=189,326;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr12	113435293	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=177,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr12	113442640	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=217,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr12	113444117	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=219,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:2,0,4,1
chr12	113444418	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=172,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,3:5,1:4,3,2,2
chr12	113445768	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=149,81;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,1:5,3:1,8,1,3
chr12	113530899	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=171,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,3:4,1:5,2,3,1
chr12	113531295	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=301,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0|1:113531295_T_C:113531295:1,1,3,0
chr12	113531305	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=301,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0|1:113531295_T_C:113531295:1,1,3,1
chr12	113532544	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=129,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:3,0,5,1
chr12	113532885	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=177,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,1,1
chr12	113533050	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=76,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,3:1,3:0,1,2,4
chr12	113539822	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:1,5:1,5:0,2,2,8
chr12	113539829	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=118,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:2,2:4,2:1,5,1,4
chr12	113541904	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=124,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr12	113542098	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=178,81;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:1,3,3,4
chr12	113544874	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=167,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:0,1:4,2,1,1
chr12	113544912	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=191,109;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:11,8:3,0:9,5,8,0
chr12	113553408	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=268,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,3:4,0:6,0,2,1
chr12	113553589	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=27,16;MFRL=186,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:9,0:3,0:0|1:113553589_T_C:113553589:6,6,0,3
chr12	113553592	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=27,16;MFRL=186,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:9,0:2,0:0|1:113553589_T_C:113553589:6,6,0,3
chr12	113553599	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=132,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:3,1:1,3:0|1:113553589_T_C:113553589:6,2,0,7
chr12	113553605	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=35,12;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.639:12:2,0:1,0:0|1:113553589_T_C:113553589:3,1,0,8
chr12	113553608	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,17;MFRL=242,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.589:11:2,0:1,0:3,1,0,7
chr12	113553674	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=207,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:3,4:5,2:4,4,6,0
chr12	113554946	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=123,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,5:6,5:4,7,4,6
chr12	113557072	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=229,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:5,1:11,4,1,1
chr12	113559447	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:5,4:2,7:6,1,4,7
chr12	113559531	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=33787798,157;MMQ=57,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr12	113568797	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,239;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,1:3,4,1,1
chr12	113592411	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr12	113599225	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=210,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:0,9,1,1
chr12	113612455	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:7,4:8,4:7,8,4,4
chr12	113612791	.	CAGG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=157,245;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,1,0
chr12	113612798	.	CAGCCTGA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=157,245;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:113612798_CAGCCTGA_C:113612798:0,2,1,0
chr12	113612808	.	CCCAG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=225,245;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:113612798_CAGCCTGA_C:113612798:0,2,1,0
chr12	113614824	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,1:7,2:7,7,2,1
chr12	113617917	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=268,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.458:5:1,0:2,1:0,3,0,2
chr12	113623315	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,15;MFRL=185,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=G;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,0,1
chr12	113623325	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=13,35;MFRL=216,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:113623325_G_GT:113623325:0,3,1,0
chr12	113623326	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=17,10;MFRL=205,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,1:0,0:0,1,1,2
chr12	113623337	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=216,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:113623325_G_GT:113623325:0,3,1,0
chr12	113629637	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=125,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:4,1:4,5,1,1
chr12	113633320	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=145,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:6,0,2,0
chr12	113645626	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:9,7,2,0
chr12	113716734	.	GGT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=190,161;MMQ=50,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GT;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:4,2:1,7,0,2
chr12	113726152	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=195,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr12	113729500	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=164,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:5,2:3,6,1,2
chr12	113729506	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,0:5,3:4,6,0,3
chr12	113729634	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=197,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0|1:113729634_A_C:113729634:0,3,2,0
chr12	113729638	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=193,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,0:0|1:113729634_A_C:113729634:1,4,2,0
chr12	113733830	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=160,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,3:5,1:2,4,2,2
chr12	113737630	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:10,2:6,2:8,8,1,3
chr12	113754487	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:0,6,2,5
chr12	113758166	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,276;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,1:4,4:3,5,3,2
chr12	113796399	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=163,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr12	113818728	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=138,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr12	113825679	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=226,141;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,3:5,1:5,9,1,3
chr12	113825685	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=163,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,7:5,0:5,5,0,7
chr12	113826442	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=148,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:6,3:4,0:4,6,1,2
chr12	113826457	.	C	CCTCCTAAACATG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=171,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:4,2:4,0:0|1:113826457_C_CCTCCTAAACATG:113826457:3,5,1,1
chr12	113826459	.	C	CTTCT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=171,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,1:4,0:0|1:113826457_C_CCTCCTAAACATG:113826457:3,5,1,1
chr12	113835075	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,14;MFRL=205,247;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.345:9:2,0:4,1:1,5,3,0
chr12	114282678	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=121,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr12	114296745	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	114356357	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=177,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr12	114358581	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=214,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr12	114362621	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr12	114377899	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,6,6
chr12	114383559	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=226,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:3,0,5,1
chr12	114383800	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=180,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr12	114393028	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,2:7,5:3,7,3,4
chr12	114397634	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=86,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:17,2:13,1:9,23,2,1
chr12	114398071	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=210,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr12	114400007	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=165,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,1:6,1:11,6,1,1
chr12	114404084	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:13,0:6,2:0|1:114404084_A_G:114404084:11,14,1,1
chr12	114404085	.	C	CCAA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=147,361;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAA;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,2:0.116:23:10,2:11,0:1|0:114404084_A_G:114404084:11,10,0,2
chr12	114793240	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	114823187	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:6,0,4,0
chr12	114832510	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=113,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:1,0,4,1
chr12	114837219	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=201,302;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr12	115111912	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=125,123;MMQ=60,23;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,10:6,0:9,3,11,0
chr12	115118997	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=125,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,5:4,3:0,6,0,8
chr12	116412921	.	AT	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr12	116429018	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=127,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:9,2:10,0:12,7,1,1
chr12	116429173	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=236,225;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:5,7,2,0
chr12	116446414	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:6,11,1,1
chr12	116586414	.	CTA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=191,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TA;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr12	117013730	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=76,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.653:12:2,2:1,5:3,1,8,0
chr12	117014131	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=206,82;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.484:20:4,2:6,8:4,6,6,4
chr12	117014174	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=219,102;MMQ=60,47;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.375:11:3,1:4,3:4,3,1,3
chr12	117014396	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,10;MFRL=181,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.556:9:1,0:1,0:0,4,0,5
chr12	117187907	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr12	117287112	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=228,339;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr12	117290601	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr12	117349014	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	117402755	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	117423264	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr12	117465981	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=202,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,4:2,1:4,3,2,3
chr12	117494543	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=139,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:5,2,3,0
chr12	117595978	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=187,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:4,2:1,3:0,5,0,5
chr12	117611934	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=219,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:5,0,4,0
chr12	117705774	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=194,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,4,0
chr12	117715724	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:3,1:4,1,2,0
chr12	117718473	.	G	GGGTAAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	117718686	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:2,2,2,3
chr12	117749460	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=143,289;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr12	117992914	.	TACCCCTC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=161,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:3,0:11,2,2,0
chr12	118020037	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=179,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.205:16:7,1:4,1:9,4,3,0
chr12	118020045	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=138,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,3:4,2:8,1,2,3
chr12	118020115	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=189,137;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,2:4,5:3,6,4,3
chr12	118456825	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,2:5,1:6,3,2,1
chr12	118464688	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=132,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:1,2:2,0:2,2,1,2
chr12	118464903	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:118464903_T_A:118464903:0,1,0,1
chr12	118464905	.	G	GGATTTAAGAAAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:118464903_T_A:118464903:0,1,0,1
chr12	118464908	.	GGC	TTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:118464903_T_A:118464903:0,1,0,1
chr12	118473054	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=167,103;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:8,3:4,2:6,6,3,2
chr12	118476079	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=138,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,1:2,2:5,4,2,1
chr12	118476084	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=178,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:6,5,1,1
chr12	118480874	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=227,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:0,1,1,2
chr12	118508796	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=190,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:1,5:6,3:3,4,6,2
chr12	118509086	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=167,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr12	118509138	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,36;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,2:1,1:0|1:118509138_A_G:118509138:2,4,3,0
chr12	118509148	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=102,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:5,1:2,1:0|1:118509138_A_G:118509138:2,5,3,0
chr12	118509157	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=102,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:5,2:2,1:2,5,3,0
chr12	118511412	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=202,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,4,1
chr12	118520240	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=223,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:0,3,1,1
chr12	118575772	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=165,58;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:3,0:6,1,1,1
chr12	118588779	.	TGTA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,15;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,0:1,0:0,2,1,0
chr12	118673483	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,0:3,3:0,8,1,3
chr12	118821800	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,67;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.256:17:6,3:6,1:11,2,2,2
chr12	119563084	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=287,242;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr12	119563128	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=114,296;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,1:5,2:12,2,3,0
chr12	119563325	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,270;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:0,6,0,4
chr12	119568691	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=320,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr12	119592142	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,2:8,0:5,9,1,1
chr12	119594200	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=169,321;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:5,2,4,0
chr12	119937983	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=161,252;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,3:4,2:5,4,2,3
chr12	119938010	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=145,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,2:5,1:4,7,0,3
chr12	119957861	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=209,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,0:6,2:6,3,1,1
chr12	120067727	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=141,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr12	120078577	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=116,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:0,1,4,5
chr12	120106129	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.256:37:13,5:15,4:18,10,4,5
chr12	120110185	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:15,2:12,0:14,13,0,2
chr12	120112099	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.291:12:3,2:4,1:7,2,1,2
chr12	120114507	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,1:8,1:3,11,0,2
chr12	120126074	.	A	AAGG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=192,306;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGG;STR;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:2,0:7,2:4,5,0,2
chr12	120150196	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=172,310;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,1:4,1:0,7,1,1
chr12	120156408	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=227,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,6:1,1:3,0,7,0
chr12	120158203	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=206,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr12	120195082	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=209,307;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr12	120195354	.	TG	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=68,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.226:24:5,2:9,2:5,14,2,3
chr12	120196295	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=194,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:3,1,6,0
chr12	120220282	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=189,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.861:12:0,6:1,5:1,0,6,5
chr12	120221636	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,0:2,5:2,0,5,0
chr12	120241029	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:5,3,2,0
chr12	120270528	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,4:0,12:0,0,15,3
chr12	120295583	.	A	AAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=241,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr12	120427706	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,335;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	120436514	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=149,46;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:120436514_C_T:120436514:5,10,1,1
chr12	120436523	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=151,46;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:6,2:0|1:120436514_C_T:120436514:5,9,1,1
chr12	120436528	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=153,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:120436514_C_T:120436514:4,7,1,1
chr12	120436532	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=153,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:5,2:0|1:120436514_C_T:120436514:5,6,1,1
chr12	120436533	.	TCAGC	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=168,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0|1:120436514_C_T:120436514:4,6,1,1
chr12	120436540	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=187,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:120436514_C_T:120436514:3,6,1,1
chr12	120499446	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=199,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:9,0:2,2:8,3,2,0
chr12	120502638	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,1:7,1:10,8,0,2
chr12	120536640	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=196,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:8,6,2,0
chr12	120536783	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=204,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,4:2,2:3,5,3,3
chr12	120536799	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,18;MFRL=178,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:3,2:5,0:1,8,4,0
chr12	120536803	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:4,0:1,8,3,0
chr12	120541553	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=211,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr12	120546136	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=204,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0|1:120546136_G_A:120546136:3,0,4,0
chr12	120546145	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=195,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:0|1:120546136_G_A:120546136:3,1,3,0
chr12	120567206	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=186,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:4,0:7,2:5,6,2,0
chr12	120591251	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=229,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.498:10:2,1:3,4:1,4,1,4
chr12	120605913	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=197,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr12	120606163	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=250,58;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr12	120616512	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=195,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:14,0:8,2:0|1:120616512_G_T:120616512:9,14,1,1
chr12	120616516	.	T	TCTGTCG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=195,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:9,2:0|1:120616512_G_T:120616512:9,14,1,1
chr12	120621872	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,1:7,1:7,5,2,0
chr12	120628027	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=189,211;MMQ=32,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr12	120628054	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=177,189;MMQ=60,32;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:4,1:0|1:120628054_G_A:120628054:9,2,2,0
chr12	120628060	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=178,189;MMQ=60,32;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:5,1:0|1:120628054_G_A:120628054:11,2,2,0
chr12	120636601	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=192,56;MMQ=60,34;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:12,0:9,4:9,12,4,0
chr12	120750239	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,8:1,4:0,1,8,5
chr12	120783527	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	120791042	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,2:0,3:0,0,7,0
chr12	120794653	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr12	120796703	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr12	120800823	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=59.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,11,7
chr12	120806129	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr12	120897652	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=154,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,4:2,7:3,0,9,2
chr12	120901972	.	A	ATTGCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=180,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr12	120902007	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=187,250;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr12	120941978	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:120941978_A_AG:120941978:0,0,0,1
chr12	120941979	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:120941978_A_AG:120941978:0,0,0,1
chr12	120947948	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr12	120960102	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,1:4,5:3,5,3,3
chr12	120990519	.	T	TCACC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=153,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:3,0:1,2:0|1:120990519_T_TCACC:120990519:2,3,1,1
chr12	120990522	.	G	GCCCCTGGAAACC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=153,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:120990519_T_TCACC:120990519:2,3,1,1
chr12	120990525	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=153,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,1:0|1:120990519_T_TCACC:120990519:2,3,1,1
chr12	120995332	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,2:5,3:7,6,2,3
chr12	120998481	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr12	120998701	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=169,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:2,5,1,1
chr12	121004564	.	CAAAA	C,CAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34,31;MFRL=200,212,132;MMQ=60,60,60;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,16;RU=A;STR;TLOD=5.27,8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.196,0.356:9:1,1,0:1,1,2:4,0,4,1
chr12	121008958	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,5:1,2:2,1,6,1
chr12	121013581	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=37.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.379:35:10,0:12,13:15,7,0,13
chr12	121017264	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=207,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:8,2:5,2:7,6,3,1
chr12	121017288	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=160,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:10,2:7,1:13,5,0,3
chr12	121017439	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=207,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:3,8:4,5:4,3,5,8
chr12	121097622	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=95,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,6:1,2:3,1,7,1
chr12	121131891	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=113,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.793:22:1,8:3,10:1,3,12,6
chr12	121132100	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=144,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.805:13:0,6:2,5:1,1,0,11
chr12	121133037	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=117,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.710:8:1,2:1,4:0,2,2,4
chr12	121151062	.	CTCTCTTG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.800:18:0,10:2,5:3,0,9,6
chr12	121154433	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=202,60;MMQ=60,29;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,0:7,3:10,7,1,2
chr12	121157851	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,4:4,4:2,7,1,7
chr12	121175610	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=187,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:7,1,0,2
chr12	121176047	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,6:3,0:4,1,6,0
chr12	121176083	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,2:1,2:2,2,2,2
chr12	121206055	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=209,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,1:0,8:1,0,9,0
chr12	121221628	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=175,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr12	121222411	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=79,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:5,4:0,8:1,4,3,9
chr12	121248584	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,5,5
chr12	121416988	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=174,187;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr12	121426545	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr12	121426594	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=202,248;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:2,2:4,2:6,0,4,1
chr12	121431300	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=151,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:6,0,1,1
chr12	121431519	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=211,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.248:16:7,2:5,0:5,7,0,4
chr12	121434630	.	C	CTCATTCATTCAT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,7;RU=TCAT;STR;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.518:7:1,2:2,2:1,2,1,3
chr12	121437103	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=162,118;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,2:5,1:10,3,0,3
chr12	121437221	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=155,249;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,1:4,2:7,4,2,1
chr12	121442371	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=132,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr12	121448990	.	ATGACAG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:1,11,0,2
chr12	121454257	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:10,4:7,5:6,11,5,4
chr12	121454313	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:3,3:6,4:3,7,6,1
chr12	121469436	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,0:4,2:4,7,0,2
chr12	121594056	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=193,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:1,4:2,8:0,3,0,12
chr12	121598652	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=207,169;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:4,0:4,2:7,1,2,1
chr12	121600180	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=125,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,2:2,7:3,2,7,2
chr12	121603856	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr12	121615283	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=112,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:7,1:0,2:3,4,1,2
chr12	121618278	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:0,0:4,2:2,3,1,1
chr12	121622023	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr12	121647870	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=275,254;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:121647870_G_T:121647870:1,0,1,0
chr12	121647885	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=243,254;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:121647870_G_T:121647870:2,0,1,0
chr12	121659999	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=132,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr12	121660011	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=219,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:121660011_G_A:121660011:0,4,0,1
chr12	121660015	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=219,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:121660011_G_A:121660011:0,4,0,1
chr12	121666258	.	G	GTA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=201,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TA;STR;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr12	121682051	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=177,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr12	121690548	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=144,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.895:17:0,7:1,8:0|1:121690548_T_C:121690548:1,0,6,10
chr12	121690555	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=144,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.896:17:0,8:1,8:0|1:121690548_T_C:121690548:1,0,6,10
chr12	121706533	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:3,4:1,3:2,3,1,6
chr12	121711768	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,5:0,1:1,0,6,0
chr12	121764799	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,402;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	121766158	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=114,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:3,4:9,0:5,7,4,0
chr12	121789887	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=191,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr12	121789927	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=190,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,4:0,4:1,0,9,0
chr12	121790178	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr12	121840634	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,1:10,1:9,11,2,0
chr12	121854023	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=158,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,2:8,0:5,14,1,1
chr12	121858208	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=189,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:0|1:121858208_A_T:121858208:1,7,1,2
chr12	121858212	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=189,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:0|1:121858208_A_T:121858208:1,7,1,2
chr12	121867829	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,1:6,2:10,3,3,0
chr12	121879111	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr12	121880885	.	T	TG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,2:5,0:4,12,0,2
chr12	121881733	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,15;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:121881733_A_C:121881733:0,0,1,0
chr12	121881739	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,8;MFRL=253,272;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:121881733_A_C:121881733:1,0,1,0
chr12	121881745	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,26;MFRL=275,272;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:121881733_A_C:121881733:1,1,1,0
chr12	121881750	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,15;MFRL=275,272;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:121881750_T_A:121881750:1,1,1,0
chr12	121881753	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,26;MFRL=275,272;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:121881750_T_A:121881750:1,1,1,0
chr12	121881758	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=275,272;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:121881750_T_A:121881750:1,1,1,0
chr12	121881761	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=226,272;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:121881750_T_A:121881750:3,1,1,0
chr12	121882098	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=156,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:4,3,2,5
chr12	121882141	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=203,267;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:1,2,3,0
chr12	121947432	.	CC	TT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=110,37;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:0|1:121947432_CC_TT:121947432:4,2,1,1
chr12	121947436	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=110,37;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:121947432_CC_TT:121947432:4,2,1,1
chr12	121958764	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:6,4,1,1
chr12	121986954	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=217,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	122017868	.	TC	AA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=19,15;MFRL=137,312;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,0:0|1:122017868_TC_AA:122017868:4,0,1,0
chr12	122017872	.	TC	AA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,15;MFRL=137,312;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:122017868_TC_AA:122017868:4,0,1,0
chr12	122017894	.	GAA	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=132,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=A;STR;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:0,2:1,1:1,0,3,1
chr12	122017994	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=112,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,2:9,0:9,11,0,2
chr12	122064773	.	CCCGCCA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCGCCA;STR;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.870:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr12	122079295	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=212,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:3,5:8,2:6,5,3,4
chr12	122079599	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:2,5,0,2
chr12	122079635	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr12	122092319	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=135,91;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:6,6,0,2
chr12	122097043	.	GCACA	G,GCA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,27,27;MFRL=144,185,156;MMQ=60,56,60;MPOS=18,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=CA;STR;TLOD=22.08,3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,6,2:0.412,0.251:11:2,1,1:0,5,1:3,0,8,0
chr12	122097049	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=154,185;MMQ=60,56;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.431:15:5,1:3,5:0|1:122097049_A_G:122097049:8,1,6,0
chr12	122097051	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=154,185;MMQ=60,56;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.431:15:5,1:4,4:0|1:122097049_A_G:122097049:8,1,6,0
chr12	122097303	.	G	GTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=36,31;MFRL=248,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:122097303_G_GTA:122097303:3,0,0,1
chr12	122097304	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=248,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:1,0:0|1:122097303_G_GTA:122097303:3,0,0,1
chr12	122097306	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=248,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:122097303_G_GTA:122097303:3,0,0,1
chr12	122097346	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr12	122107475	.	C	CAAAGCCGCGGGAACAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=281,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:122107475_C_CAAAGCCGCGGGAACAG:122107475:0,1,0,1
chr12	122107476	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=281,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:122107475_C_CAAAGCCGCGGGAACAG:122107475:0,1,0,1
chr12	122208989	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	122209333	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=180,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.279:15:9,1:2,2:8,3,2,2
chr12	122212525	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=121,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,2:8,1:6,5,2,1
chr12	122212659	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:4,8,0,2
chr12	122213534	.	CCTTCCTCATCCT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=174,91;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:10,2,1,1
chr12	122231368	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr12	122242888	.	AC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=204,234;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:7,2:2,1:3,9,0,3
chr12	122243018	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=144,72;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:6,2:12,9:11,8,6,5
chr12	122243089	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=155,51;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.178:37:14,0:17,6:17,14,0,6
chr12	122252849	.	G	GCATCGGTCTATGTGGCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr12	122261230	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.687:1:0,0:0,1:0|1:122261230_CT_C:122261230:0,0,1,0
chr12	122261233	.	CACCA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=172,128;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:0,1:0|1:122261230_CT_C:122261230:0,1,1,0
chr12	122261241	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=172,128;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,0:0,1:0|1:122261230_CT_C:122261230:0,1,1,0
chr12	122284715	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=126,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,2:0,5:0,2,5,2
chr12	122292546	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:3,1,4,0
chr12	122295335	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:122295335_T_C:122295335:0,0,3,5
chr12	122295344	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=138,263;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0|1:122295335_T_C:122295335:1,4,2,1
chr12	122296784	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=197,54;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:1,7,1,1
chr12	122359172	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=234,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:0,3:1,4:0,1,5,2
chr12	122359397	.	G	GGAGGAGGAGGAGAAA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=81.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.960:19:0,9:0,4:0,0,9,10
chr12	122361929	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr12	122369762	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=138,127;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.399:28:10,7:7,3:7,10,6,5
chr12	122380838	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=195,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:7,4:7,2:7,7,2,4
chr12	122386807	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=218,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr12	122391961	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:122391961_G_A:122391961:0,0,1,0
chr12	122391963	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:122391961_G_A:122391961:0,0,1,0
chr12	122398599	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=126,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:7,13,2,0
chr12	122413196	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=185,189;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:8,3:0,2:4,4,3,2
chr12	122439369	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr12	122468756	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=226,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:1,0:2,2:2,2,0,2
chr12	122492956	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=229,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr12	122612350	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:5,1,2,0
chr12	122613599	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=312,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,4,1
chr12	122614387	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=166,256;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:6,1,1,1
chr12	122615515	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=329,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,9:1,5:0,1,9,5
chr12	122616759	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,5:0|1:122616759_G_A:122616759:0,0,8,3
chr12	122616766	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,3:0,6:0|1:122616759_G_A:122616759:0,0,8,4
chr12	122622207	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=272,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr12	122626381	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:3,4:5,3:4,4,3,5
chr12	122657383	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=238,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr12	122658379	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.332:13:5,2:4,2:0|1:122658379_T_C:122658379:5,4,3,1
chr12	122658383	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=55.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0|1:122658379_T_C:122658379:0,0,10,5
chr12	122684966	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	122689109	.	C	CCCG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=144,297;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CCG;STR;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr12	122702980	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=200,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr12	122723333	.	C	CAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:122723333_C_CAT:122723333:0,0,0,1
chr12	122723340	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:122723333_C_CAT:122723333:0,1,0,1
chr12	122723349	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=17,26;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:122723333_C_CAT:122723333:0,1,0,1
chr12	122748099	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=169,234;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:8,3,2,0
chr12	122758641	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=146,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,0:8,3:9,9,1,2
chr12	122817507	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=149,225;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,4:0,4:3,0,6,2
chr12	122825398	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=166,128;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,3:2,3:5,2,4,2
chr12	122837427	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=88,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:2,0:0,1:0|1:122837427_A_G:122837427:1,1,0,1
chr12	122837431	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=88,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:122837427_A_G:122837427:1,1,0,1
chr12	122838910	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=238,169;MMQ=55,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr12	122838913	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=238,169;MMQ=55,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:122838913_G_A:122838913:4,0,2,0
chr12	122838916	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=235,169;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:2,2:0|1:122838913_G_A:122838913:6,0,2,0
chr12	122838923	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=208,169;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr12	122838956	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=313,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,6:0,3:1,1,6,4
chr12	122839840	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=195,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:10,3:9,0:14,5,2,1
chr12	122845608	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:15,0:10,13,0,2
chr12	122862041	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,1:8,2:12,6,3,0
chr12	122962337	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=132,130;MMQ=60,52;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:2,2:0,0:2,2,2,0
chr12	122962501	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:5,1:8,7,2,0
chr12	122962859	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=169,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,0:3,2:0,8,0,2
chr12	122964708	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr12	122966016	.	TA	T,TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25,26;MFRL=139,194,154;MMQ=60,60,60;MPOS=15,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.48,5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,3:0.229,0.306:10:3,0,2:1,2,1:4,1,5,0
chr12	122983460	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=96,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,5:1,4:0,1,2,8
chr12	122991279	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=192,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr12	122991478	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=168,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,3:1,1:1,3,2,2
chr12	122993011	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,2:3,7:6,4,2,7
chr12	123001737	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:6,6:4,3:9,2,9,0
chr12	123028096	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=211,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:2,2,1,2
chr12	123031330	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=183,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr12	123061352	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	123064596	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr12	123067587	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=132,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,1,3
chr12	123071382	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=512,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr12	123089579	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=170,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:3,5,1,1
chr12	123103016	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=140,187;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:2,7,3,1
chr12	123103115	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=166,50740007;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:1,1:2,1:0,5,0,2
chr12	123110654	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=167,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:0,2,5,0
chr12	123200099	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=257,139;MMQ=60,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,4:1,4:2,2,6,2
chr12	123200937	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=221,121;MMQ=56,39;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:0,5:2,5:2,0,2,8
chr12	123201445	.	TAAAAA	T,TAA,TAAA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,15,17,10;MFRL=176,134,144,127;MMQ=54,51,50,51;MPOS=16,15,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,13,15,16;RU=A;STR;TLOD=4.35,5.39,5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,3,5,3:0.260,0.373,0.251:12:0,0,1,1:0,1,1,0:0,1,1,10
chr12	123201508	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr12	123201539	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=276,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr12	123246728	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=127,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,0:10,3:9,11,3,0
chr12	123265952	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr12	123265956	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=175,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,0:2,1:0|1:123265956_G_C:123265956:1,2,0,1
chr12	123265959	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,35;MFRL=175,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:123265956_G_C:123265956:1,2,0,1
chr12	123265961	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=175,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:123265956_G_C:123265956:1,2,0,1
chr12	123265962	.	G	GCCGAACTCATCCTTTTTTA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=175,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:123265956_G_C:123265956:1,2,0,1
chr12	123281967	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=242,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,3:1,1:1,1,1,3
chr12	123282532	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr12	123282574	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=170,220;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,2:2,0:0|1:123282574_T_C:123282574:5,0,3,0
chr12	123282577	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=170,220;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:0|1:123282574_T_C:123282574:5,0,3,0
chr12	123335287	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,340;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	123335483	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=135,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:3,5:2,5:0|1:123335483_A_G:123335483:4,1,4,6
chr12	123335488	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=36,27;MFRL=135,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:3,5:2,5:0|1:123335483_A_G:123335483:4,1,4,6
chr12	123335527	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=139,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:1,1,1,4
chr12	123339344	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:0|1:123339344_A_G:123339344:1,0,7,0
chr12	123339358	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:0|1:123339344_A_G:123339344:4,0,5,0
chr12	123339712	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=250,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.721:15:3,8:0,3:1,3,4,7
chr12	123340453	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=323,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,4:0,5:1,0,6,4
chr12	123341186	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,1:3,1:4,9,1,1
chr12	123341289	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=218,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,2:0,4:0|1:123341289_A_C:123341289:0,1,0,7
chr12	123341297	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=218,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0|1:123341289_A_C:123341289:0,1,0,5
chr12	123341833	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=249,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:2,3:1,7:0,3,1,9
chr12	123341863	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=249,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:2,5:1,2:0,3,0,8
chr12	123342628	.	CCTCTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=258,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr12	123343571	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,13:0.668:19:1,8:3,5:0|1:123343571_T_G:123343571:3,3,8,5
chr12	123343572	.	G	GGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,13:0.668:19:1,8:5,4:0|1:123343571_T_G:123343571:3,3,8,5
chr12	123344910	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=199,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr12	123345347	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=195,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,5:2,5:2,1,3,7
chr12	123345360	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=195,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,5:2,4:2,1,5,4
chr12	123345736	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=209,185;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,12:0.811:14:2,8:0,3:0|1:123345736_C_G:123345736:0,2,7,5
chr12	123345756	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=41.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,10:0.734:13:2,7:1,3:0|1:123345736_C_G:123345736:1,2,5,5
chr12	123352179	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr12	123425575	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=283,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:0,4,1,6
chr12	123433137	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=91,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,4:0,7:1,0,7,4
chr12	123460823	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=208,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.634:8:0,2:1,3:3,0,5,0
chr12	123466111	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=37,28;MFRL=136,292;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr12	123471402	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr12	123473254	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr12	123477311	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr12	123519028	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.279:8:4,0:1,0:2,4,2,0
chr12	123647725	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=205,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.871:21:0,10:2,9:0,2,3,16
chr12	123651162	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.718:12:2,5:1,4:1,2,8,1
chr12	123679171	.	A	ATTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=273,182;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,18;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	123687232	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,0:5,2:5,7,0,2
chr12	123687507	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,49;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,0:7,2:6,6,1,1
chr12	123694724	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=214,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr12	123699200	.	GTTT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=T;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	123703103	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr12	123746370	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=161,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:0|1:123746370_C_T:123746370:3,4,1,1
chr12	123746380	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=164,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:123746370_C_T:123746370:2,6,1,1
chr12	123789068	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=168,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:123789068_C_A:123789068:5,6,1,1
chr12	123789071	.	C	CGG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=168,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:123789068_C_A:123789068:5,6,1,1
chr12	123789072	.	ATT	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=168,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:0|1:123789068_C_A:123789068:5,6,1,1
chr12	123794022	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr12	123794450	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,1:0,9:0,0,0,10
chr12	123801672	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	123804678	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=250,251;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	123810662	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,6,3
chr12	123812207	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr12	123812611	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr12	123812629	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	123813493	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr12	123815146	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr12	123816007	.	T	TATGTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	123832710	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr12	123832746	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	123874010	.	AGGCGGC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,1271;MMQ=60,28;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=GGC;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.701:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	123875311	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=131,148;MMQ=60,29;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:12,1:17,2:19,11,0,3
chr12	123875394	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr12	123879666	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=173,145;MMQ=52,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:7,4:8,3:0|1:123879666_A_G:123879666:11,4,4,3
chr12	123879668	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=173,145;MMQ=52,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:7,4:8,2:0|1:123879666_A_G:123879666:11,4,4,3
chr12	123879768	.	AA	CG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=177,183;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,2:6,1:8,8,0,3
chr12	123880862	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr12	123889433	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=188,159;MMQ=60,21;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,3:11,0:14,7,3,0
chr12	123889492	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=111,151;MMQ=60,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:13,3:10,1:13,11,4,0
chr12	123892186	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,149;MMQ=40,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:12,5:9,9:10,11,4,10
chr12	123907563	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=189,253;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,1:5,1:13,1,2,0
chr12	123920915	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=133,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:0|1:123920915_T_C:123920915:1,12,0,2
chr12	123920919	.	C	CTGT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=133,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:123920915_T_C:123920915:1,12,0,2
chr12	123983941	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:4,5,4,1
chr12	124008073	.	AT	GC,GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33,33;MFRL=0,230,141;MMQ=60,60,60;MPOS=20,23;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.42,37.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,13:0.249,0.704:17:0,1,6:0,3,7:0,0,11,6
chr12	124018088	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	124069111	.	GGGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GGC;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr12	124071507	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.327:19:8,2:4,4:5,8,2,4
chr12	124074857	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=114,188;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.243:17:6,0:6,0:0|1:124074857_C_A:124074857:4,9,4,0
chr12	124074874	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=36,10;MFRL=115,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.167:21:6,1:12,0:0|1:124074857_C_A:124074857:5,13,3,0
chr12	124086620	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr12	124090605	.	ACT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=43.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.818:14:0,4:2,8:2,0,7,5
chr12	124090655	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:8,1:10,3:5,13,2,2
chr12	124092033	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:18,3:7,1:11,15,2,2
chr12	124097824	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=101,299;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:3,2:6,1:4,6,1,2
chr12	124099704	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,5:6,3:8,4,5,3
chr12	124099925	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=200,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr12	124101041	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=128,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.351:18:1,2:10,4:10,2,5,1
chr12	124102216	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=368,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,7:2,3:5,0,10,0
chr12	124102433	.	CGTTTTCAGATAGAATGCCTA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:2,0:5,3:3,4,1,2
chr12	124104460	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,7,0
chr12	124118519	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,151;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr12	124137108	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,54;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,2:5,0:6,4,0,2
chr12	124139422	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:4,4,2,0
chr12	124139597	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,1:5,1:1,8,0,2
chr12	124144150	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:9,2,1,1
chr12	124144279	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=230,278;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:3,1,2,2
chr12	124144572	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,3:7,1:7,6,2,2
chr12	124158450	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=235,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:124158450_T_C:124158450:0,2,0,2
chr12	124158455	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=235,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:124158450_T_C:124158450:0,2,0,2
chr12	124171323	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,4:0,1:2,0,4,1
chr12	124171610	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=198,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr12	124172499	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=193,228;MMQ=60,42;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:3,1,1,0
chr12	124172706	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=120,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:4,3:10,1:11,3,2,2
chr12	124172731	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=183,214;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:1,4:3,4:0|1:124172731_G_A:124172731:2,3,6,2
chr12	124172746	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:3,4:3,1:0|1:124172731_G_A:124172731:2,4,4,2
chr12	124172760	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=19,20;MFRL=171,273;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.617:3:0,1:0,0:0,1,0,2
chr12	124172817	.	G	GATTCT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=323,171;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	124177289	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=115,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:3,3,1,5
chr12	124179620	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=341,271;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,1,1
chr12	124179712	.	ATTTCT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,260;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:3,0,1,0
chr12	124179928	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,246;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr12	124191264	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=133,56;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:6,0:4,2:5,5,1,1
chr12	124192207	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=96,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:12,1:15,3:7,20,2,2
chr12	124197280	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:1,5,0,2
chr12	124209332	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:5,2:1,4:0|1:124209332_T_C:124209332:4,2,2,4
chr12	124209352	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=135,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:0|1:124209332_T_C:124209332:4,1,1,4
chr12	124210872	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=147,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:1,7,0,2
chr12	124220055	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:6,1,0,2
chr12	124228405	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=127,77;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,0:7,2:3,14,1,1
chr12	124241591	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=150,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr12	124242458	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=177,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,3:1,0:5,0,3,0
chr12	124252260	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,2:7,0:2,7,0,2
chr12	124265635	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=75,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:7,4:7,0:5,9,0,4
chr12	124267638	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr12	124268458	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:1,2,2,1
chr12	124274639	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=36,24;MFRL=96,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:11,2:4,0:0|1:124274639_G_A:124274639:10,5,0,2
chr12	124274645	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=96,54;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,1:4,0:0|1:124274639_G_A:124274639:10,8,0,2
chr12	124274758	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=276,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr12	124281440	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=208,196;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:124281440_TG_CA:124281440:0,4,0,1
chr12	124281443	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=208,196;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:124281440_TG_CA:124281440:0,4,0,1
chr12	124281449	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=208,196;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:124281440_TG_CA:124281440:0,4,0,1
chr12	124281478	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=199,207;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr12	124283799	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,87;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:1,4,1,2
chr12	124311162	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=211,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr12	124315327	.	TA	T,AA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=12,11,25;MFRL=241,205,212;MMQ=60,60,60;MPOS=23,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.78,3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.381,0.341:6:0,0,2:0,0,1:0,1,0,5
chr12	124319864	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=154,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr12	124330440	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=199,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,3:2,0:3,6,2,1
chr12	124330532	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=138,311;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,2:5,1:10,6,1,2
chr12	124332480	.	CAT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,238;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,2:8,1:13,3,1,2
chr12	124332702	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0,8,1,1
chr12	124333519	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr12	124350444	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,3:3,1:6,2,3,1
chr12	124352505	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=151,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:7,2,1,1
chr12	124352590	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=151,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:13,1:8,4:12,9,3,2
chr12	124355006	.	C	CCA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=184,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:4,2:0|1:124355006_C_CCA:124355006:4,13,1,1
chr12	124355008	.	G	GCCC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=184,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,0:5,2:0|1:124355006_C_CCA:124355006:4,13,1,1
chr12	124355010	.	G	GCTAATTTTTGTATTTTT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=184,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,0:4,2:0|1:124355006_C_CCA:124355006:4,13,1,1
chr12	124358121	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=139,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,2:10,1:9,8,2,1
chr12	124360032	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=146,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,2:5,2:3,10,0,4
chr12	124360117	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=183,253;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr12	124362256	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:2,1:4,1,4,1
chr12	124363724	.	GTGTC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGTC;STR;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	124364131	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=215,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,4,1
chr12	124366150	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr12	124378048	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=175,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr12	124398843	.	A	ACTG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=156,258;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:6,3:8,1:9,5,4,0
chr12	124399155	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=258,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr12	124399550	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=172,228;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:4,4,1,1
chr12	124401172	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=181,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:12,0:8,2:7,13,1,1
chr12	124409502	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=233,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr12	124409570	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=176,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:8,1,2,0
chr12	124409630	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:3,2:11,2:10,4,4,0
chr12	124409684	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=162,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:10,1:15,1:12,13,2,0
chr12	124409688	.	GT	G	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:9,2:12,4:10,11,3,3
chr12	124412881	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,2:6,3:7,0,5,0
chr12	124413836	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=118,41;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:8,0:2,2:0|1:124413836_A_T:124413836:7,4,1,1
chr12	124413842	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=118,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:124413836_A_T:124413836:7,4,1,1
chr12	124413844	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=118,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:124413836_A_T:124413836:7,4,1,1
chr12	124420076	.	C	CAGGA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=101,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr12	124496695	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:4,3:17,0:17,4,3,0
chr12	124499743	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=183,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,1:4,2:7,5,2,1
chr12	124796360	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,19;MFRL=183,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.275:8:1,0:1,1:4,2,2,0
chr12	124809879	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=195,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:8,0,3,0
chr12	124809925	.	C	CCG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=196,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.381:11:6,0:1,3:4,3,0,4
chr12	124810968	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr12	124811855	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=235,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,1:0,1:3,0,2,0
chr12	124813745	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=181,0;MMQ=60,47;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,2,0
chr12	124813750	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,1,0
chr12	124815504	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr12	124819844	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=238,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:124819844_C_G:124819844:1,3,0,1
chr12	124819853	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=238,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:124819844_C_G:124819844:1,3,0,1
chr12	124820013	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=229,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,6:0,3:1,0,6,3
chr12	124824721	.	C	CGCCGCTGCT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GCCGCTGCT;STR;TLOD=48.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,3:0,6:0,0,0,11
chr12	124832474	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=207,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,2:3,6:0,5,0,8
chr12	124832492	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr12	124835352	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=209,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:0,3,0,5
chr12	124838772	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:124838772_C_G:124838772:0,0,0,4
chr12	124838774	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=145,299;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.518:4:1,0:0,2:0|1:124838772_C_G:124838772:0,2,0,2
chr12	124839945	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=192,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,3:1,1:1,2,3,1
chr12	124846622	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	124848137	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr12	124859045	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=83.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,17:0,9:0,0,14,12
chr12	124885249	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=235,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr12	124885290	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=234,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr12	124887058	.	G	GGCT,GGCTGCT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,35,25;MFRL=200,142,139;MMQ=60,55,40;MPOS=14,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=GCT;STR;TLOD=4.97,5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.406,0.400:5:0,1,1:1,1,1:1,0,1,3
chr12	124915091	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	124934459	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,0:0,7:0,0,0,9
chr12	124968349	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr12	124979833	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=820,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:0,4:1,1:0,2,0,5
chr12	125263189	.	TC	AA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,15;MFRL=142,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.336:4:1,0:1,0:0|1:125263189_TC_AA:125263189:1,2,1,0
chr12	125263193	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,15;MFRL=179,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:125263189_TC_AA:125263189:0,4,1,0
chr12	125263197	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=179,219;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:125263189_TC_AA:125263189:0,4,1,0
chr12	125263204	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	125434434	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr12	125435194	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=209,75;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:5,1:5,2:7,3,1,2
chr12	125435388	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,6:0,9:0,0,5,11
chr12	125436850	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=173,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr12	125436897	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=171,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:1,4:2,0,8,0
chr12	125438336	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr12	125438414	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,14,1
chr12	125438516	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.969:30:0,13:0,16:0|1:125438516_T_C:125438516:0,0,13,17
chr12	125438523	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,12:0,15:0|1:125438516_T_C:125438516:0,0,13,15
chr12	125438549	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,7,12
chr12	125444910	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,2:6,1:9,8,3,0
chr12	125444975	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=106,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.842:10:1,7:0,2:1,0,5,4
chr12	125451277	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr12	125451487	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr12	125451532	.	G	C,T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27,27;MFRL=0,212,182;MMQ=60,60,60;MPOS=24,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.80,4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.560,0.333:6:0,2,1:0,2,1:0,0,1,5
chr12	125451589	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr12	125453232	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,1:0,0,0,7
chr12	125453235	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=135,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr12	125456004	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.833:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr12	125457203	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=189,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr12	125465023	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:2,3:5,3:3,5,6,0
chr12	125467238	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,0,4
chr12	125478381	.	C	CCTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=CTG;STR;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,1:0,0,3,0
chr12	125587478	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=185,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.282:14:4,2:2,1:7,3,1,3
chr12	125587706	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr12	125591844	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:1,1:6,3:1,6,2,2
chr12	125609428	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=177,233;MMQ=60,44;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:4,0:6,6:0|1:125609428_T_C:125609428:6,4,0,6
chr12	125609432	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=187,233;MMQ=60,44;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:3,0:6,6:0|1:125609428_T_C:125609428:5,4,0,6
chr12	125612839	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=189,240;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:1,8,0,3
chr12	125619308	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:3,2,3,2
chr12	125811056	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=192,247;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr12	125833964	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:1,3,5,2
chr12	126003934	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=221,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.619:19:3,7:4,5:0|1:126003934_T_C:126003934:6,1,11,1
chr12	126003940	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:4,6:7,3:0|1:126003934_T_C:126003934:9,2,8,1
chr12	126128871	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=202,264;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:1,5,0,3
chr12	126135195	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=190,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,2:6,3:8,0,5,0
chr12	129028401	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=183,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr12	129028469	.	GTC	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=176,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:3,0:10,3:9,4,3,0
chr12	129028708	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=204,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr12	129100970	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=200,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,4:1,4:0,3,0,8
chr12	129180705	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=152,57;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr12	129181701	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	129182053	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=215,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:129182053_AG_A:129182053:0,1,0,1
chr12	129182058	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=215,159;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:129182053_AG_A:129182053:0,1,0,1
chr12	129189556	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=202,255;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:2,0,5,0
chr12	129189561	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=216,278;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr12	129189591	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr12	129190474	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=210,208;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:2,3,2,1
chr12	129190499	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=207,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:4,3,1,1
chr12	129190913	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr12	129278864	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=169,105;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,1:7,4:6,8,3,2
chr12	129283711	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=209,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr12	129293267	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=166,274;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:5,0,6,0
chr12	129299435	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,1:9,2:6,9,1,2
chr12	129299675	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=214,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr12	129373100	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=192,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr12	129383848	.	GTGT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=186,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGT;STR;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,1:6,3:5,6,1,3
chr12	129559086	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=233,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,3:3,1:2,7,0,4
chr12	129566284	.	ATT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=180,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:2,1:1,0:3,1,1,1
chr12	130184625	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,263;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:3,5,2,2
chr12	130649316	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=159,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.741:5:0,3:0,1:0,1,2,2
chr12	130827271	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:7,2:3,2:0,11,0,4
chr12	130830906	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:9,2,1,1
chr12	130831707	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,283;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	130838987	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=230,260;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr12	130839645	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr12	130897150	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=122,277;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:6,2:8,3:9,5,1,4
chr12	130922880	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=194,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.330:10:3,0:4,0:0|1:130922880_A_C:130922880:0,7,3,0
chr12	130922884	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=184,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,0:4,2:0|1:130922880_A_C:130922880:0,8,3,0
chr12	130922889	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=174,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,1:5,1:0|1:130922880_A_C:130922880:0,9,3,0
chr12	130922893	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=168,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,0:0|1:130922880_A_C:130922880:2,9,2,0
chr12	130927303	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	130935710	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:0,4:1,0,4,2
chr12	131280714	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=210,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr12	131280752	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=217,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr12	131285663	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr12	131286119	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=209,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,5:5,2:0,9,0,7
chr12	131311641	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,16;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:3,0,1,0
chr12	131356520	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=271,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,4:2,0,6,0
chr12	131356731	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=17,35;MFRL=271,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.593:5:1,1:0,2:0,2,0,3
chr12	131357541	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:15,0:19,3:14,20,0,3
chr12	131359298	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:3,4,1,5
chr12	131360352	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=101,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,19:0.625:30:6,11:5,6:0|1:131360352_G_C:131360352:4,7,13,6
chr12	131360360	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=101,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,19:0.588:32:7,11:5,7:0|1:131360352_G_C:131360352:5,8,12,7
chr12	131471608	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,8,2
chr12	131471956	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr12	131485014	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=106,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:3,5,3,2
chr12	131485025	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=106,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:4,2:4,1:3,5,2,2
chr12	131488858	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=160,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:1,4,2,3
chr12	131490641	.	G	GAGGCTGCAGTGAGCCATGATTACACCACTA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=176,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:4,6,1,1
chr12	131498946	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	131593398	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,1:6,2:9,3,2,1
chr12	131605425	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.201:23:14,0:3,3:6,13,0,4
chr12	131620578	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:6,1,3,0
chr12	131620588	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0,0,10,1
chr12	131620738	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=144,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr12	131622833	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr12	132195674	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,358;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	132209932	.	ATG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=178,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:5,0:9,4:11,3,4,0
chr12	132240937	.	C	CAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=188,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AT;STR;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr12	132241229	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,5:0,10:0,0,4,12
chr12	132262794	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=146,93;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:12,2:22,2:15,19,3,1
chr12	132262911	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,4:0,4:0,1,1,7
chr12	132323089	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr12	132334673	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	132391408	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=202,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,1:9,1:8,6,1,1
chr12	132394789	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=174,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,2:10,2:6,10,4,0
chr12	132398247	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.279:12:5,0:3,3:5,4,2,1
chr12	132398253	.	AAAC	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=181,45;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:5,2:7,0:8,4,0,2
chr12	132398255	.	AC	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=160,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.419:14:4,3:4,3:5,3,3,3
chr12	132398256	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,10,6
chr12	132399798	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=185,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,1:5,2:4,2,2,1
chr12	132401989	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr12	132404212	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	132405708	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=193,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:132405708_A_C:132405708:0,2,0,1
chr12	132405710	.	GGC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=193,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:132405708_A_C:132405708:0,2,0,1
chr12	132405935	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=178,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr12	132414769	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	132445721	.	G	GCC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=133,63;MMQ=27,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:0|1:132445721_G_GCC:132445721:3,3,1,1
chr12	132445725	.	TG	GT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=153,63;MMQ=27,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:132445721_G_GCC:132445721:3,4,1,1
chr12	132476121	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=149,233;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr12	132496182	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:2,4,1,2
chr12	132502268	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:10,4:10,0:6,14,3,1
chr12	132539468	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=113,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:4,3,5,2
chr12	132539500	.	AT	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=137,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:11,2:7,2:15,4,3,1
chr12	132552040	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,242;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,0:3,4:0,8,0,4
chr12	132589480	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=141,257;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.560:5:0,1:1,1:0|1:132589480_A_C:132589480:0,2,3,0
chr12	132589486	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=141,257;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:132589480_A_C:132589480:0,2,1,0
chr12	132589490	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,35;MFRL=159,257;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:132589480_A_C:132589480:0,4,1,0
chr12	132589492	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=159,257;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:132589480_A_C:132589480:0,4,1,0
chr12	132589654	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=145,66;MMQ=27,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:132589654_G_GT:132589654:4,3,1,1
chr12	132589655	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=145,66;MMQ=27,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:132589654_G_GT:132589654:4,3,1,1
chr12	132635521	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=106,193;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:3,1,4,0
chr12	132635779	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr12	132683690	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=137,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr12	132683862	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr12	132685826	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=163,261;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:3,8,0,2
chr12	132685837	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,4:2,4:1,3,3,5
chr12	132685899	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=161,279;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr12	132688279	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr12	132824450	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=228,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:8,3:1,0:3,7,1,2
chr12	132834385	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:1,11,0,2
chr12	133067343	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	133067473	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,22;MFRL=194,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,0:0,1:1,0,1,1
chr12	133102462	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=163,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr12	133104461	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,8,3
chr12	133148970	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=167,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:4,7,1,1
chr12	133149091	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=161,161;MMQ=60,43;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.196:19:2,3:9,0:14,2,3,0
chr12	133158280	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,3,2
chr12	133158449	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=274,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:0,3,0,3
chr12	133195970	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=137,223;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr12	133196037	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=157,275;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:3,5,2,1
chr12	133196532	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=165,227;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.546:7:0,0:3,2:0|1:133196532_C_G:133196532:3,0,0,4
chr12	133196536	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=165,227;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.546:7:0,0:3,3:0|1:133196532_C_G:133196532:3,0,0,4
chr12	133196696	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=217,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.449:13:2,2:5,2:4,3,3,3
chr12	133196773	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=184,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.549:9:3,4:0,0:2,2,4,1
chr12	133197018	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,5:3,1:4,0,4,2
chr12	133198021	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=165,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:0,6,3,1
chr12	133202215	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=200,233;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:3,3,2,0
chr12	133208825	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=187,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:133208825_C_G:133208825:4,0,1,0
chr12	133208847	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=195,204;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:133208825_C_G:133208825:4,0,1,0
chr12	133208886	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=85,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:7,2:1,2:5,3,3,1
chr12	133210985	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:5,2:3,1:3,5,1,3
chr12	133214517	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=179,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:4,3:0,3:0|1:133214517_G_A:133214517:3,1,6,0
chr12	133214522	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:4,3:0,3:0|1:133214517_G_A:133214517:4,1,6,0
chr12	133214768	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,2:3,1:0,7,2,1
chr12	133218724	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,2,1
chr12	133218900	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=139,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,0:6,5:7,8,0,5
chr12	133220219	.	C	CTTCCT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=182,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.242:10:5,0:3,2:0|1:133220219_C_CTTCCT:133220219:1,7,0,2
chr12	133220220	.	G	GGGTGGCAGACATCCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=182,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:5,0:3,2:0|1:133220219_C_CTTCCT:133220219:1,7,0,2
chr12	133220321	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,3,2
chr12	133225446	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=211,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr12	133226159	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=172,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:1,4,1,2
chr12	133226196	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=171,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr12	133233705	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr12	133233946	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,261;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.432:28:7,10:9,0:12,4,12,0
chr12	133235789	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=138,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.707:5:1,0:0,2:0,1,2,2
chr12	133238076	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=198,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:4,2,4,3
chr12	133245149	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,1:3,4:2,1,1,4
chr12	133249139	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=217,330;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,1,1
chr12	133252725	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,2:9,0:9,6,1,1
chr12	133252796	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr12	133253310	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=182,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:0,0:7,2:0,7,0,2
chr12	133254083	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=187,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,2:4,6:4,3,5,3
chr12	133257929	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=164,159;MMQ=53,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:3,2:1,2:0|1:133257929_C_CT:133257929:0,5,0,4
chr12	133257938	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=165,120;MMQ=60,52;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.272:9:4,2:3,0:1|0:133257929_C_CT:133257929:0,7,0,2
chr12	133266813	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=228,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,3:8,0,3,2
chr12	133272380	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr12	133277983	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr12	133278003	.	TTTCC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTCC;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr12	133291679	.	A	ATCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=136,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr12	133294231	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:3,1,1,1
chr12	133294659	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:4,6,0,2
chr12	133310887	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=240,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr12	133311944	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=133,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.268:12:2,2:7,0:6,3,3,0
chr12	133324454	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=132,74;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:8,0:9,3:9,8,2,1
chr12	133327470	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=264,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr12	133349620	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=233,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:1,4:0,6:1,0,10,1
chr12	133349893	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr12	133354470	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	133363264	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:8,2:9,1:11,8,2,1
chr12	133363376	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:3,3:3,9:2,4,3,9
chr12	133363394	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=170,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,1:8,2:3,8,0,3
chr12	133372395	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=129,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,2,2
chr12	133373375	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=196,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr12	133373386	.	GGGCCC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=225,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr12	133378577	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	133383923	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,2:0,0,2,9
chr12	133384963	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=146,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.537:28:5,0:7,15:5,8,0,15
chr12	133385188	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=259,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,2:2,5:0,2,0,7
chr12	133420557	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,13;MFRL=206,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.405:5:1,0:2,0:3,0,2,0
chr12	133428131	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=212,272;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:1,1:2,1:4,0,2,0
chr12	133433237	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,0,3
chr12	133438274	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=196,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr12	133447242	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=149,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr12	133463969	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=197,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr12	133509562	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr12	133563333	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=204,252;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,0:4,3:5,0,3,0
chr12	133563379	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=198,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr12	133624693	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=196,149;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:3,0:9,7:3,9,0,7
chr12	133625276	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=196,288;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr12	133625288	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr12	133633459	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr12	133633536	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=169,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:6,1:10,2:11,5,3,0
chr12	133657933	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.506:12:3,3:3,2:0|1:133657933_A_AT:133657933:2,4,3,3
chr12	133657934	.	A	AATATAT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,158;MMQ=60,49;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;RPA=11,14;RU=AT;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,3:0.852:3:0,1:0,0:1|0:133657933_A_AT:133657933:0,0,0,3
chr12	133682074	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=216,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,3:2,0:4,3,2,1
chr12	133732100	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=120,40;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:6,4,1,1
chr12	133758537	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:14,0:5,3:12,7,1,2
chr12	133764701	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=278,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,1:0,1:0,2,0,2
chr13	19600069	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,200;MMQ=54,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:2,2,2,1
chr13	19600326	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=154,156;MMQ=40,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:0,6:7,1:4,3,3,4
chr13	19600365	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=161,78;MMQ=52,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:4,4:13,4:8,9,4,4
chr13	19601129	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=170,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.529:11:3,4:2,2:0,5,2,4
chr13	19601182	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=224,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:0,5,0,5
chr13	19752625	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,51;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr13	19753438	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr13	19761432	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=166,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:6,6,1,1
chr13	19761496	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=196,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr13	20000702	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr13	20004762	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr13	20004798	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr13	20006551	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=291,139;MMQ=27,56;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr13	20006777	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=235,197;MMQ=25,56;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:0,1:0,2:0,1,0,3
chr13	20039289	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,296;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr13	20039789	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=207,204;MMQ=52,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr13	20041323	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr13	20041493	.	TAA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=0,184;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.906:7:0,2:0,1:0,0,2,5
chr13	20048218	.	AAAATAAATAAATAAATAAATAAAT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=283,165;MMQ=21,52;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,5;RU=AAAT;STR;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.812:7:0,4:0,2:0,1,4,2
chr13	20067081	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,206;MMQ=40,32;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:3,5,0,2
chr13	20216208	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,11;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:4,1:5,1:6,7,4,1
chr13	20224118	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:6,7:7,3:7,6,7,3
chr13	20224138	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=178,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,1:10,2:13,8,2,1
chr13	20224387	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=174,217;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,1:7,1:4,10,0,2
chr13	20240743	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,6:2,5:0,2,2,9
chr13	20277413	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,85;MMQ=39,39;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.348:41:14,8:13,6:14,13,7,7
chr13	20279731	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=149,258;MMQ=33,26;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,2,0
chr13	20283661	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,93;MMQ=27,21;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:10,0:11,4:10,11,2,2
chr13	20325400	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=154,140;MMQ=45,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,3:5,0:8,4,3,0
chr13	20325625	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=194,225;MMQ=34,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,1,2
chr13	20356657	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=142,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:11,5:21,0:17,15,4,1
chr13	20399475	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=192,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr13	20413138	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=115,0;MMQ=60,37;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,0:2,2:0|1:20413138_A_C:20413138:2,3,2,0
chr13	20413142	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=115,0;MMQ=60,37;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,0:2,1:0|1:20413138_A_C:20413138:2,3,2,0
chr13	20425429	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr13	20426303	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,260;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,0:5,6:2,4,0,6
chr13	20567666	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,1:10,1:8,7,1,1
chr13	20579352	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=166,56;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:11,9,1,1
chr13	20579363	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=162,56;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:10,8,1,1
chr13	20579374	.	A	ACAAT	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=26,18;MFRL=155,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:5,1:0|1:20579374_A_ACAAT:20579374:6,9,1,1
chr13	20579377	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=155,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:4,2:0|1:20579374_A_ACAAT:20579374:6,8,1,1
chr13	20579381	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=159,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:4,2:0|1:20579374_A_ACAAT:20579374:6,8,1,1
chr13	20600927	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.446:9:4,1:1,3:0,5,1,3
chr13	20601532	.	G	GCTTTAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=196,259;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTTTAT;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr13	20608354	.	T	TTTTCTTGAGGTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,4:0,0,9,1
chr13	20608465	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,7:6,4:6,4,7,4
chr13	20608560	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,5:5,0:0,6,0,5
chr13	20610839	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=134,329;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr13	20633639	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,99;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,2:7,0:7,8,2,0
chr13	20638490	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=227,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:2,2:1,1:4,0,3,0
chr13	20656138	.	CTT	C,CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31,30;MFRL=166,187,214;MMQ=60,60,60;MPOS=9,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=5.62,8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,5:0.251,0.390:13:0,1,1:4,2,3:3,2,6,2
chr13	20657188	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=123,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:11,9:5,6:8,8,9,6
chr13	20762956	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,11,1
chr13	21006475	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr13	21013685	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=163,151;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,0:0|1:21013685_C_A:21013685:5,3,2,0
chr13	21013702	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=135,151;MMQ=60,43;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:4,0:0|1:21013685_C_A:21013685:9,4,2,0
chr13	21013705	.	TC	AA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=135,151;MMQ=60,43;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,0:6,1:0|1:21013685_C_A:21013685:9,4,2,0
chr13	21156999	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr13	21166569	.	TG	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=150,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,0:5,2:9,8,2,0
chr13	21166615	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=150,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr13	21170193	.	G	GTAAAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TAAAA;STR;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.871:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr13	21205124	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=154,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,3:3,0:8,1,3,0
chr13	21205140	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:5,4:3,0:8,1,4,0
chr13	21358061	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=190,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:3,3,0,4
chr13	21370398	.	GA	G,GAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=18,32,25;MFRL=156,224,206;MMQ=60,60,60;MPOS=26,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.63,3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,2:0.413,0.247:9:0,1,0:0,2,1:0,3,1,5
chr13	21416945	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr13	21429874	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=135,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:3,4:10,1:9,4,4,1
chr13	21549259	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=162,75;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.181:31:13,3:11,0:0|1:21549259_T_C:21549259:15,11,3,2
chr13	21549266	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=163,75;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:14,5:10,0:0|1:21549259_T_C:21549259:14,10,3,2
chr13	21555544	.	CT	GA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,5:1,0:0|1:21555544_CT_GA:21555544:2,1,5,0
chr13	21555554	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:2,5:1,1:0|1:21555544_CT_GA:21555544:2,1,5,1
chr13	21557400	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,32;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:7,7,1,1
chr13	21563311	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=195,247;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:1,2:6,0:5,3,1,1
chr13	21619789	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=194,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr13	21620085	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,12:0,0,11,11
chr13	21714920	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,4:2,7:2,1,3,8
chr13	21720956	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=128,181;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,3:1,4:2,2,6,1
chr13	21729267	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=90,203;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,3:4,3:2,9,3,3
chr13	21729290	.	C	CAGTTTTCTT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=125,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:6,1:4,3:0|1:21729290_C_CAGTTTTCTT:21729290:1,9,2,2
chr13	21729292	.	G	GTTGCTGA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=125,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:6,1:4,1:0|1:21729290_C_CAGTTTTCTT:21729290:1,9,2,2
chr13	21729943	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,11;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.322:15:6,0:2,0:4,6,0,5
chr13	21729952	.	TA	T,TAAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=15,29,10;MFRL=135,156,222;MMQ=60,60,60;MPOS=17,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,14;RU=A;STR;TLOD=5.90,8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,3:0.367,0.251:11:1,3,0:0,1,0:0,4,1,6
chr13	21732281	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=162,262;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,4:3,0:2,4,0,4
chr13	21735998	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=145,181;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,2:3,4:4,7,3,3
chr13	21742311	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,8:0.177:49:30,5:10,3:23,18,2,6
chr13	21742346	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=173,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:18,5:11,0:10,19,0,5
chr13	21742542	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=131,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:6,8,0,3
chr13	21746453	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr13	21746600	.	TG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=128,2108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:11,3:8,3:5,14,3,3
chr13	21750538	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=117,124;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:7,1,3,4
chr13	21751005	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr13	21751528	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr13	21751863	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=139,133;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:9,2:11,0:0|1:21751863_C_T:21751863:2,18,0,2
chr13	21751867	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=139,133;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,2:11,0:0|1:21751863_C_T:21751863:2,18,0,2
chr13	21751872	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=136,133;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,1:9,0:0|1:21751863_C_T:21751863:1,16,0,2
chr13	21752805	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=197,192;MMQ=40,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21752805_CA_C:21752805:0,1,0,1
chr13	21752816	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=198,192;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:21752805_CA_C:21752805:0,2,0,1
chr13	21752821	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,22;MFRL=198,192;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:21752805_CA_C:21752805:0,2,0,1
chr13	21752864	.	G	GCT	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21752864_G_GCT:21752864:0,0,0,1
chr13	21752865	.	TGG	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21752864_G_GCT:21752864:0,0,0,1
chr13	21752869	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21752864_G_GCT:21752864:0,0,0,1
chr13	21752876	.	CAAGG	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21752864_G_GCT:21752864:0,0,0,1
chr13	21753255	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr13	21976837	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=185,238;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr13	22067502	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:1,9,0,2
chr13	22096843	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:22096843_T_C:22096843:0,0,0,5
chr13	22096851	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=194,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:22096843_T_C:22096843:0,3,0,1
chr13	22096852	.	T	TGGTGTAAACCCATCTGAGGGTAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=194,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:22096843_T_C:22096843:0,3,0,1
chr13	22113669	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=200,222;MMQ=49,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:9,1,4,1
chr13	22178307	.	GG	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=158,342;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:22178307_GG_CA:22178307:0,2,0,2
chr13	22178308	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,4:0.828:4:0,1:0,3:1|0:22178307_GG_CA:22178307:0,0,0,4
chr13	22255167	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=183,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,3:5,1:6,3,3,1
chr13	22255301	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=185,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.536:15:2,5:4,3:3,4,4,4
chr13	22275583	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,4,12
chr13	23808879	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,0:6,7:2,8,0,7
chr13	23808914	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=199,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,2:5,1:0,5,0,3
chr13	23853468	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=186,255;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:1,3,3,1
chr13	23894744	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=27,33;MFRL=156,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:0|1:23894744_T_G:23894744:5,0,6,1
chr13	23894746	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=156,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:0|1:23894744_T_G:23894744:5,0,6,1
chr13	23894748	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=156,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:0|1:23894744_T_G:23894744:5,0,6,1
chr13	23894750	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=156,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:4,4:1,3:0|1:23894744_T_G:23894744:5,2,6,1
chr13	23894752	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=28,35;MFRL=156,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.501:14:5,4:1,3:0|1:23894744_T_G:23894744:5,2,6,1
chr13	23894760	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=33,17;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,5:0.287:19:7,0:6,0:1|0:23894744_T_G:23894744:8,6,5,0
chr13	23898454	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr13	23898664	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr13	23904973	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=196,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:4,7,0,2
chr13	23909823	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:8,5:4,2:10,2,5,2
chr13	23915544	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:5,0:10,2:4,12,0,2
chr13	23927963	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=195,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:8,9:8,2:3,13,6,5
chr13	24164216	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,2:5,0,6,0
chr13	24167564	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=155,60;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:7,6:11,0:4,14,6,0
chr13	24167574	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,0:9,2:0|1:24167574_C_A:24167574:11,9,0,2
chr13	24167579	.	C	CAGGTCATCTTCCCCCA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:24167574_C_A:24167574:10,9,0,2
chr13	24242023	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=148,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,2:4,8:6,0,10,0
chr13	24242801	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=108,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,2:4,7:5,2,7,2
chr13	24384129	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=258,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr13	24410278	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=250,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,2,1
chr13	24410498	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=18,18;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,0:0,1:2,8,1,2
chr13	24455825	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=166,55;MMQ=52,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:10,12,1,1
chr13	24798485	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=219,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:2,8,1,1
chr13	24845130	.	CCT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,1:5,4:1,9,0,6
chr13	24865057	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,7:4,2:2,3,4,5
chr13	24869025	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,2:0,10:0,0,3,9
chr13	24869048	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=157,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,1:5,5:1,5,0,6
chr13	24869062	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,1:4,5:1,4,0,6
chr13	25005446	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr13	25008695	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=188,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,2:4,4:4,3,5,1
chr13	25009197	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=195,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,2:5,4:6,6,4,2
chr13	25016632	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=213,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:4,1,1,1
chr13	25016687	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,8,4
chr13	25016723	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=184,271;MMQ=60,34;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:10,5,0,2
chr13	25016762	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=177,218;MMQ=52,39;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,1:9,2:11,6,1,2
chr13	25020757	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=147,202;MMQ=55,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.771:11:0,5:2,4:0|1:25020757_T_C:25020757:2,0,7,2
chr13	25020782	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=171,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:2,7:5,1:0|1:25020757_T_C:25020757:5,2,6,3
chr13	25020910	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.773:11:2,3:0,6:0,2,4,5
chr13	25021144	.	GTCT	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=140,197;MMQ=57,48;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,0:6,6:4,2,5,1
chr13	25021154	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=153,198;MMQ=57,47;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:0,0:7,5:5,2,4,1
chr13	25024028	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:0,8,0,3
chr13	25027904	.	AT	CC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=213,253;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr13	25029066	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=206,259;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr13	25029128	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=194,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,1:4,1:5,2,2,0
chr13	25029295	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=141,250;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,0:9,4:6,12,1,3
chr13	25029314	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,2:8,1:4,13,1,2
chr13	25029367	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=190,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:5,3:4,2:1,8,1,4
chr13	25033227	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=184,262;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,1:10,1:7,9,0,2
chr13	25049812	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr13	25052420	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=194,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,2:6,2:3,5,2,2
chr13	25065008	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=179,170;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:0,7,0,4
chr13	25068620	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=219,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr13	25068934	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr13	25072200	.	T	A,C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30,32;MFRL=162,153,193;MMQ=60,60,60;MPOS=10,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.55,16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,6:0.237,0.334:18:6,3,2:2,1,4:8,0,8,2
chr13	25073399	.	GTTT	G,GT,GTTTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34,35,33;MFRL=171,209,210,205;MMQ=60,34,58,55;MPOS=20,20,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,16;RU=T;STR;TLOD=3.21,8.39,5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,2,4,4:0.149,0.272,0.246:15:2,2,2,1:3,0,2,2:4,1,5,5
chr13	25074408	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:13,3,2,0
chr13	25074568	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=153,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:15,2:8,1:6,17,1,2
chr13	25077714	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=188,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:25077714_C_T:25077714:8,0,2,0
chr13	25077719	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=184,199;MMQ=60,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,0:5,1:0|1:25077714_C_T:25077714:12,1,2,0
chr13	25077725	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=184,199;MMQ=60,45;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:7,0:9,1:0|1:25077714_C_T:25077714:14,2,2,0
chr13	25276257	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=301,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr13	25283657	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,3:4,2:3,2,4,2
chr13	25285768	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=230,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr13	25341365	.	A	AATC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=214,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=ATC;STR;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr13	25355965	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.872:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr13	25363466	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=137,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.204:18:8,0:6,3:10,5,2,1
chr13	25363776	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr13	25367301	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=215,165;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,5:4,4:5,4,4,5
chr13	25370255	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr13	25373432	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=204,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr13	25373515	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,4:4,1:7,5,3,2
chr13	25399702	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr13	25399752	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr13	25404743	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=58.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,6,11
chr13	25418996	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=186,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:1,1:6,2:6,1,3,0
chr13	25442921	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr13	25444934	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=215,209;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr13	25451097	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=183,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr13	25457595	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,307;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	25458232	.	AGTT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=177,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:3,3:1,4:4,0,3,4
chr13	25458267	.	G	GAATT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=196,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AATT;STR;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:5,0,2,4
chr13	25458650	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=186,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.662:10:1,1:2,5:0,3,0,7
chr13	25459657	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=215,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:1,1:9,2:8,2,2,1
chr13	25459713	.	G	GTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=119,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=T;STR;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:7,1:1,3:4,4,4,0
chr13	25466774	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=239,74;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:6,0,5,1
chr13	25467017	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=149,69;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:3,10,0,2
chr13	25467020	.	AAAC	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:0,6,1,4
chr13	25486287	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=237,369;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr13	25670851	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=171,188;MMQ=60,45;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,2:7,1:2,10,3,0
chr13	25670868	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=173,186;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,2:8,0:0|1:25670868_G_A:25670868:5,8,2,0
chr13	25670873	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=29,35;MFRL=173,183;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,3:8,0:0|1:25670868_G_A:25670868:5,8,3,0
chr13	25670877	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=173,183;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:4,3:10,0:0|1:25670868_G_A:25670868:6,9,3,0
chr13	25670907	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=177,166;MMQ=60,40;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:5,2:11,1:9,7,3,0
chr13	25670919	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=14;MBQ=28,28;MFRL=177,193;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:5,3:11,2:9,7,5,0
chr13	25670953	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=14;MBQ=29,29;MFRL=175,200;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,7:0.276:27:9,3:11,4:0|1:25670953_G_A:25670953:12,8,5,2
chr13	25670955	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=14;MBQ=32,29;MFRL=175,200;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,7:0.276:27:8,3:11,4:0|1:25670953_G_A:25670953:12,8,5,2
chr13	25670978	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=14;MBQ=31,29;MFRL=132,191;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.310:27:8,4:11,4:0|1:25670978_C_T:25670978:12,7,4,4
chr13	25670981	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=14;MBQ=32,32;MFRL=123,188;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,9:0.312:30:8,5:10,3:0|1:25670978_C_T:25670978:12,9,5,4
chr13	25670984	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=14;MBQ=27,30;MFRL=128,186;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,8:0.300:28:10,5:10,3:0|1:25670978_C_T:25670978:12,8,4,4
chr13	25670988	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=27,32;MFRL=132,183;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.286:26:8,4:8,3:0|1:25670978_C_T:25670978:11,8,3,4
chr13	25671008	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=14;MBQ=30,29;MFRL=157,177;MMQ=60,41;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:4,3:9,3:0|1:25671008_C_T:25671008:7,7,3,3
chr13	25671015	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=14;MBQ=29,32;MFRL=157,177;MMQ=59,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:4,3:9,1:0|1:25671008_C_T:25671008:7,7,2,2
chr13	25671027	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=14;MBQ=28,28;MFRL=164,188;MMQ=58,41;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.251:22:7,3:9,2:7,10,2,3
chr13	25671062	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=14;MBQ=29,33;MFRL=176,235;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:8,3:10,4:10,8,3,4
chr13	25671080	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=14;MBQ=28,32;MFRL=160,242;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.310:27:10,4:9,4:0|1:25671080_A_G:25671080:12,7,3,5
chr13	25671089	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=32,28;MFRL=173,235;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.286:26:11,4:7,3:0|1:25671080_A_G:25671080:13,6,3,4
chr13	25671097	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=14;MBQ=30,26;MFRL=160,224;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:10,4:5,2:0|1:25671080_A_G:25671080:12,3,2,4
chr13	25671195	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=13;MBQ=28,35;MFRL=176,235;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:10,1:11,2:0|1:25671195_A_G:25671195:6,15,1,2
chr13	25671200	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=33,31;MFRL=180,235;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:9,1:10,2:0|1:25671195_A_G:25671195:6,14,1,2
chr13	25671206	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=27,36;MFRL=176,235;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:9,1:10,2:0|1:25671195_A_G:25671195:5,14,1,2
chr13	25671210	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=33,30;MFRL=180,194;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:8,2:10,2:0|1:25671195_A_G:25671195:5,13,2,2
chr13	25671214	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=29,35;MFRL=172,194;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:9,2:8,2:0|1:25671195_A_G:25671195:6,12,2,2
chr13	25671271	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=13;MBQ=30,34;MFRL=167,207;MMQ=52,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:7,2:8,2:0|1:25671271_A_G:25671271:10,5,2,2
chr13	25671272	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=13;MBQ=30,29;MFRL=167,207;MMQ=52,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:7,2:8,2:0|1:25671271_A_G:25671271:10,5,2,2
chr13	25671274	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=167,207;MMQ=52,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:7,2:8,2:0|1:25671271_A_G:25671271:10,5,2,2
chr13	25671292	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=34,28;MFRL=172,261;MMQ=60,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,1:11,2:13,6,1,2
chr13	25671310	.	TTATGA	T	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=26,30;MFRL=139,322;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:9,2:8,3:0|1:25671310_TTATGA_T:25671310:14,5,1,4
chr13	25671320	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=29,33;MFRL=139,322;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:11,2:8,3:0|1:25671310_TTATGA_T:25671310:14,5,1,4
chr13	25671332	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=13;MBQ=32,35;MFRL=139,382;MMQ=60,31;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,1:7,1:11,6,0,2
chr13	25671369	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=160,322;MMQ=40,40;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,2:6,1:8,8,0,3
chr13	25671742	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=204,321;MMQ=60,22;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:10,2:5,1:0|1:25671742_G_A:25671742:9,7,2,1
chr13	25671755	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=207,321;MMQ=60,22;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:9,2:3,1:0|1:25671742_G_A:25671742:8,5,2,1
chr13	25671759	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=201,321;MMQ=60,22;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:9,2:3,1:0|1:25671742_G_A:25671742:6,6,2,1
chr13	25671786	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=188,161;MMQ=60,37;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,2:5,0:0|1:25671786_G_A:25671786:6,6,2,0
chr13	25671795	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=209,161;MMQ=60,37;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:0|1:25671786_G_A:25671786:6,5,2,0
chr13	25832082	.	AAAAT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=74,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr13	25841842	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=127,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:2,1:3,3:5,1,4,0
chr13	25848404	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr13	25876011	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=184,92;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.293:21:7,3:8,2:4,11,2,4
chr13	25876047	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=213,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:11,2:3,3:4,10,0,5
chr13	25886932	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr13	25893363	.	GTTTATA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTATA;STR;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.922:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr13	25899091	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=228,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.807:6:0,4:1,1:1,0,5,0
chr13	25899115	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=17,17;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,0:0,0:7,0,2,0
chr13	25905416	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr13	25946489	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	26125651	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:0,4,1,5
chr13	26125731	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,299;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	26128096	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=214,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,3:2,3:0,5,0,6
chr13	26128128	.	CA	AG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr13	26137989	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr13	26144896	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,258;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:10,3:3,6:11,2,2,7
chr13	26151184	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=83,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.362:14:3,3:5,2:6,3,4,1
chr13	26155953	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.843:17:2,8:0,7:1,1,9,6
chr13	26273385	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr13	26273403	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=196,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:6,4,3,0
chr13	26273538	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr13	26434282	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=120,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:9,1:5,2:8,6,1,2
chr13	26434382	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=159,80;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:13,5:8,0:9,12,5,0
chr13	26436425	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=172,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,1:4,1:7,5,1,1
chr13	26535625	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr13	26586775	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=129,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.793:8:0,4:1,0:0,1,0,7
chr13	26788940	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=159,110;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:7,13:8,0:8,7,13,0
chr13	26923274	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,2:5,0:8,7,2,0
chr13	26923381	.	CAGTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=179,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr13	26974562	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,0:0,5:1,0,3,2
chr13	27239161	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=150,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:2,3,2,1
chr13	27256728	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:6,2:11,2:12,5,3,1
chr13	27256898	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=175,111;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:9,0:3,3:4,8,0,3
chr13	27643597	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=199,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:0,3,0,7
chr13	27827811	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr13	27828041	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:2,6,1,4
chr13	27829310	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr13	27830352	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=175,300;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:4,11,2,0
chr13	27845284	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr13	28003997	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,2:10,0:11,9,0,2
chr13	28010117	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=199,260;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr13	28011158	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=198,209;MMQ=54,55;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr13	28122408	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,229;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:8,0,1,1
chr13	28124681	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr13	28133956	.	TA	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.180:32:17,1:4,2:0|1:28133956_TA_T:28133956:22,5,3,2
chr13	28133963	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=107,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:32,10:0.250:42:15,10:17,0:1|0:28133956_TA_T:28133956:21,11,10,0
chr13	28196033	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=184,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,1:4,4:8,3,5,0
chr13	28498645	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,13;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.666:6:0,0:0,0:0,2,0,4
chr13	28519354	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=103,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,7:1,2:3,2,7,2
chr13	28519709	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=86,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.390:6:4,1:0,1:2,2,1,1
chr13	28537242	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:1,0,5,3
chr13	28537537	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,1:1,7:1,0,1,7
chr13	28539185	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=164,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,4:1,5:0,2,2,7
chr13	28562604	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=98,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,2:4,1:4,3,2,1
chr13	28562605	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=98,90;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:4,3,2,1
chr13	28589267	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=156,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,4:1,1:1,1,3,2
chr13	28589662	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr13	28592588	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,238;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:2,5:8,0:8,2,5,0
chr13	28602226	.	AAG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	28607989	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=133,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:2,4:1,6:3,0,5,5
chr13	28608459	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=183,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:6,2,2,1
chr13	28609678	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=199,123;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,8:7,0:5,5,8,0
chr13	28609825	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=111,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,1:1,5:0,2,1,5
chr13	28609846	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=111,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:0,2,1,5
chr13	28609991	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=149,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0|1:28609991_T_C:28609991:4,0,3,0
chr13	28609997	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=149,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0|1:28609991_T_C:28609991:4,0,3,0
chr13	28610183	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=114,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,3:4,2:1,3,1,4
chr13	28622356	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=199,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:6,0,7,1
chr13	28752135	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=214,78;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,0:2,3:0,6,0,3
chr13	28835527	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr13	28840988	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=208,33;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:0|1:28840988_G_A:28840988:2,5,1,1
chr13	28840992	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=208,33;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:28840988_G_A:28840988:2,5,1,1
chr13	28840994	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=208,33;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:28840988_G_A:28840988:2,5,1,1
chr13	28840996	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=208,33;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:28840988_G_A:28840988:2,5,1,1
chr13	28840999	.	T	TGATGAGAAATCC	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=208,33;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:28840988_G_A:28840988:2,5,1,1
chr13	28854692	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,87;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=24,25;RU=T;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.780:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr13	28866420	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=177,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr13	28882948	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=108,247;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,0:4,4:5,3,4,0
chr13	28885672	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr13	28886113	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr13	28893484	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr13	28942769	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=99,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:14,3:10,0:17,7,3,0
chr13	28942840	.	CTT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=146,123;MMQ=44,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:0,2:3,0:1,5,1,2
chr13	28958955	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr13	28971024	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=115,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr13	29041007	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=211,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:9,0,2,0
chr13	29238576	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:9,2:3,4:11,1,6,0
chr13	29274977	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=240,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,2:4,1:8,1,3,0
chr13	29275102	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,13:0,5:0,0,10,8
chr13	29278063	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr13	29278264	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:4,1:1,0:0,5,0,2
chr13	29291886	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr13	29600519	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:9,2:3,1:5,7,0,3
chr13	29607948	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr13	29608044	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=158,203;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:10,5:13,0:14,9,6,0
chr13	29674840	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr13	29674855	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr13	29855822	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,3:4,6:7,4,7,2
chr13	29898881	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:29898881_A_G:29898881:0,0,0,6
chr13	29898889	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,0:0,4:0|1:29898881_A_G:29898881:0,0,0,5
chr13	29898892	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=131,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:29898881_A_G:29898881:0,3,0,1
chr13	29898914	.	TG	CC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=115,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:29898881_A_G:29898881:0,2,0,1
chr13	30071310	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr13	30077088	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:1,1,5,0
chr13	30090404	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=62.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,3,14
chr13	30091179	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=259,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:7,0,2,0
chr13	30091516	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr13	30097307	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr13	30098215	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,4:0,3:1,0,7,0
chr13	30098226	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr13	30346188	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:1,2:2,4:3,0,5,2
chr13	30351248	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,3:1,6:3,0,5,4
chr13	30351266	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,1:2,5:4,3,2,4
chr13	30521992	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=192,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr13	30805627	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,3,14
chr13	30829601	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,2:6,0:7,3,2,0
chr13	30829757	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=168,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.641:7:0,1:0,0:0,2,1,4
chr13	31036642	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:10,1:15,5:12,13,4,2
chr13	31195409	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:1,0:0,3,0,2
chr13	31195435	.	A	ATGGAGTCTTGCTCTGTTGC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=205,140;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr13	31204948	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=124,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:1,5:5,1:4,2,4,2
chr13	31231513	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=192,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:1,4:1,2:3,0,6,0
chr13	31309830	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=179,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:2,8:3,4:2,3,5,7
chr13	31318308	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:7,1:2,2:4,5,1,2
chr13	31480720	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=246,303;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31480720_G_A:31480720:1,0,1,0
chr13	31480731	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,16;MFRL=246,303;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:31480720_G_A:31480720:1,0,1,0
chr13	31480827	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr13	31491615	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=151,245;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:10,3:2,0:6,6,0,3
chr13	31513931	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=205,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,2,1
chr13	31531195	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr13	31540569	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=T;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.810:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr13	31713185	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:7,10,2,0
chr13	31722620	.	TAAA	T,TAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=18,31,28;MFRL=264,201,177;MMQ=60,60,60;MPOS=21,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.71,5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,4:0.310,0.437:8:0,0,1:1,2,2:1,1,0,6
chr13	31725732	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=206,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:3,1,4,4
chr13	31728703	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=205,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,1:7,1:15,1,1,1
chr13	31732999	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=163,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,0:10,2:0|1:31732999_A_C:31732999:4,13,1,1
chr13	31733006	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=161,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,0:8,1:0|1:31732999_A_C:31732999:2,12,1,1
chr13	31733057	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr13	31735759	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=188,319;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:0,9,0,4
chr13	31789169	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr13	31796969	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr13	31821088	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.436:12:4,1:1,4:2,5,5,0
chr13	31821094	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=56,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.271:14:8,1:2,3:5,5,4,0
chr13	31821240	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=189,116022;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,1:9,1:8,14,1,1
chr13	31821256	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=284,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.783:21:2,10:2,7:1,3,6,11
chr13	31835236	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=260,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:31835236_A_T:31835236:1,1,0,1
chr13	31835243	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,14;MFRL=260,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:31835236_A_T:31835236:1,1,0,1
chr13	31835250	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,15;MFRL=249,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:31835236_A_T:31835236:1,1,0,1
chr13	31835254	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=20,17;MFRL=250,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:31835236_A_T:31835236:0,1,0,1
chr13	31835268	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr13	31843320	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,2:6,3:6,6,2,3
chr13	31850989	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=165,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,2:0,5:0,3,0,7
chr13	31860847	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=168,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:11,11:7,0:10,8,12,0
chr13	31903834	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.636:14:3,3:1,6:0|1:31903834_G_T:31903834:2,3,2,7
chr13	31903841	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:3,2:1,5:0|1:31903834_G_T:31903834:2,3,0,7
chr13	32313774	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=172,82;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:10,4:6,0:6,11,4,0
chr13	32332556	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=192,237;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:1,4,1,2
chr13	32335840	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=192,252;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:2,3,2,3
chr13	32340193	.	T	TA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=46.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.954:17:0,10:0,5:0,0,6,11
chr13	32348859	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,0:5,3:6,2,1,2
chr13	32371361	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:8,2:13,1:0|1:32371361_A_G:32371361:9,12,2,1
chr13	32371369	.	G	GA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:22,6:0.233:28:12,0:10,6:1|0:32371361_A_G:32371361:12,10,0,6
chr13	32371651	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr13	32606069	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=144,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:3,5:2,4:0|1:32606069_A_G:32606069:0,5,0,10
chr13	32606087	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=182,244;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,10:0.688:14:2,6:2,4:0|1:32606069_A_G:32606069:0,4,0,10
chr13	32653243	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=190,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr13	32698544	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=185,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.716:19:5,7:0,7:1,4,4,10
chr13	32698565	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=159,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,2:3,0:2,11,1,1
chr13	32698595	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=208,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:1,3,4,2
chr13	32705785	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=126,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:4,0,5,0
chr13	32721615	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=198,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr13	32723799	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=239,250;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr13	32735444	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=200,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.291:11:5,2:3,0:0,8,0,3
chr13	32747744	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:7,0:2,4:0,9,0,4
chr13	32758834	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:5,3:2,8:6,1,5,6
chr13	32776406	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=244,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr13	32786416	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=154,264;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.217:15:8,2:4,0:8,4,2,1
chr13	32792814	.	CAA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	32792845	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,15;MFRL=179,220;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:32792845_C_A:32792845:3,1,1,0
chr13	32792847	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,15;MFRL=179,220;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:32792845_C_A:32792845:3,1,1,0
chr13	32799841	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,1:7,2:11,0,3,0
chr13	32800145	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,2:5,1:2,10,0,3
chr13	32814019	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=155,137;MMQ=60,33;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:32814019_G_T:32814019:3,15,0,2
chr13	32814022	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=155,137;MMQ=60,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:8,1:0|1:32814019_G_T:32814019:3,15,0,2
chr13	32814024	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=205,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.383:13:5,1:3,3:1,7,1,4
chr13	32823882	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr13	32825913	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=209,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:1,0,3,1
chr13	32825941	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=233,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,4:0,4:2,0,7,1
chr13	32828553	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,6:5,5:1,9,3,8
chr13	32839725	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:6,2:12,0:8,10,1,1
chr13	32848907	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=224,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.690:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr13	32852585	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=181,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,1:8,2:12,4,1,2
chr13	32890572	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=124,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,1:9,1:11,9,2,0
chr13	32890749	.	AGTG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:2,2:10,0:0,14,0,2
chr13	32903685	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,3:0,3:0,3,2,4
chr13	32905265	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr13	32910328	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:3,0,4,1
chr13	32936646	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=146,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:2,8:5,6:5,2,7,7
chr13	32953388	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=170,231;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,1:2,7:5,0,8,0
chr13	33017158	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=121,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:6,9,1,1
chr13	33101731	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=214,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr13	33222831	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr13	33232334	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=198,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,5:2,3:1,1,8,0
chr13	33232524	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:4,5:11,2:12,3,3,4
chr13	33284243	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=155,234;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,2:6,0:4,13,2,0
chr13	33306363	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=54.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,19:0.435:44:11,0:14,19:11,14,0,19
chr13	33309563	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=251,243;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr13	33315186	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=85.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,6:0,0,9,12
chr13	33315188	.	G	GT,GTT	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,13,20;MFRL=243,135,119;MMQ=60,60,60;MPOS=16,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.29,3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,7,6:0.410,0.297:19:1,3,3:2,0,1:4,2,5,8
chr13	33315189	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=71.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,13:0,10:0,0,12,12
chr13	33315206	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=243,135;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,21:0.759:27:3,11:2,8:4,2,8,13
chr13	33320054	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr13	33329950	.	TTTTG	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=129,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTTG;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.104:26:13,1:10,1:14,10,1,1
chr13	33330032	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=130,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.304:34:13,0:11,10:10,14,0,10
chr13	33332208	.	CTT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,1:4,2:9,5,3,0
chr13	33332648	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr13	33333876	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=216,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:1,1,1,5
chr13	33334813	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,0:9,4:11,8,2,2
chr13	33344241	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=211,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.732:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr13	33349235	.	C	CTTTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,18;MFRL=132,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,19;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:0,1:0,1:0,1,0,4
chr13	33627829	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr13	33635835	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,4,12
chr13	33635939	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=160,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr13	33680854	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=182,240;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr13	33684752	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=193,112;MMQ=60,51;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:0,0:0|1:33684752_A_C:33684752:7,0,2,0
chr13	33684755	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=193,112;MMQ=60,51;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:0|1:33684752_A_C:33684752:7,0,2,0
chr13	33684757	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=193,112;MMQ=60,51;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:0|1:33684752_A_C:33684752:7,0,2,0
chr13	33686065	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=166,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:4,2:12,4:8,8,1,5
chr13	33703656	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=167,193;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:0,4:2,10:0,2,9,6
chr13	33703687	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:4,5,2,0
chr13	33739427	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=135,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:10,1:2,4:9,3,3,2
chr13	33739629	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr13	34398150	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:3,6,2,0
chr13	35618991	.	A	C,G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,17,34;MFRL=0,322,141;MMQ=60,60,60;MPOS=27,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,4:0.250,0.623:5:0,0,3:0,0,0:0,0,5,0
chr13	35738430	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,218;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,1:4,3:5,0,4,0
chr13	35806549	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=222,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr13	35926497	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,1,3
chr13	36006515	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=174,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:9,2:5,0:5,10,1,1
chr13	36141009	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr13	36220292	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=285,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,1:4,3:4,1,4,0
chr13	36224051	.	TACTGGG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTGGG;STR;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr13	36241588	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:8,0:12,3:8,12,0,3
chr13	36244990	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=242,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.414:8:1,2:2,1:5,0,3,0
chr13	36367641	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr13	36379727	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=216,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr13	36379975	.	T	TGTTGATTTTGTTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=155,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:1,1:0,0:0|1:36379975_T_TGTTGATTTTGTTG:36379975:0,1,0,1
chr13	36379977	.	C	CTTGCTTCTTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=155,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:1,1:0,0:0|1:36379975_T_TGTTGATTTTGTTG:36379975:0,1,0,1
chr13	36382285	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=173,244;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,1:6,2:10,0,2,1
chr13	36382312	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,2:3,4:6,1,5,1
chr13	36397031	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=174,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,2:6,2:1,9,0,4
chr13	36401731	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=186,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,4:5,0:9,2,3,1
chr13	36401746	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.353:18:6,6:5,0:9,3,4,2
chr13	36401909	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=225,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr13	36428595	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=188,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:7,0,5,0
chr13	36521433	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:3,2,4,1
chr13	36521460	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=165,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:5,3,1,4
chr13	36700349	.	TATA	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=195,256;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:36700349_TATA_T:36700349:0,2,0,2
chr13	36700351	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr13	36700353	.	TATTTTTTTGTTTTTG	T,TTTTTTTTGTTTTTG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,30,21;MFRL=256,176,213;MMQ=60,60,60;MPOS=27,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.250,0.297:4:2,1,0:0,0,1:0,2,0,2
chr13	36700354	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0|1:36700349_TATA_T:36700349:0,0,0,2
chr13	36700356	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=213,256;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0|1:36700349_TATA_T:36700349:0,1,0,2
chr13	36747798	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,13,3
chr13	36748842	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=181,272;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:3,2,1,2
chr13	36788529	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr13	36801256	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=172,232;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr13	36801485	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=244,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:4,6,0,2
chr13	36801579	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,6:0,1:0|1:36801579_A_G:36801579:0,0,0,8
chr13	36801587	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,6:0,2:0|1:36801579_A_G:36801579:0,0,0,9
chr13	36801612	.	T	TACACAC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,302;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=AC;STR;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.851:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr13	36805289	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,1:1,6:1,0,5,2
chr13	36822711	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr13	36822849	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=289,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr13	36822884	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	36822908	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	36827833	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr13	36827896	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr13	36828092	.	G	GTTTTGTAAGCA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,3:1,0,6,1
chr13	36871730	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,2,1
chr13	36940028	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr13	37269835	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,8:0,0,10,11
chr13	37271428	.	GCA	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=45.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,4:0,0,11,3
chr13	37271449	.	AATAT	A,AAT,AATATAT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33,30,33;MFRL=242,156,226,204;MMQ=60,60,60,56;MPOS=4,14,27;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=AT;STR;TLOD=3.19,13.07,4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,2,5,2:0.134,0.290,0.141:17:6,2,1,2:2,0,4,0:7,1,8,1
chr13	37271609	.	A	AT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=188,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=58.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.927:24:0,9:1,12:1,0,10,13
chr13	37401917	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=192,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,7:0,7:0,1,3,11
chr13	37439964	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	37524255	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=206,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr13	37526560	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr13	37546145	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:7,11,0,2
chr13	37546280	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,5:3,1:0,3,0,6
chr13	37569200	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,4,13
chr13	37579999	.	CAAAAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=182,328;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=23,17;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,1:0,0:1,2,1,0
chr13	37581051	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr13	37584838	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,2,11
chr13	37598113	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.795:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr13	37600284	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.559:23:4,9:6,4:6,4,9,4
chr13	37625770	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr13	38138730	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=264,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,0:0,4:2,3,1,3
chr13	38148893	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=343,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr13	38152959	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:3,4:1,1:3,4,2,3
chr13	38152963	.	TC	AA	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=28,18;MFRL=116,239;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,1:2,0:0|1:38152963_TC_AA:38152963:5,11,2,0
chr13	38152967	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,16;MFRL=110,239;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:3,0:0|1:38152963_TC_AA:38152963:5,12,2,0
chr13	38152971	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,15;MFRL=41,203;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.156:21:12,0:4,1:5,13,3,0
chr13	38152981	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=33,15;MFRL=82,239;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.126:22:13,0:5,0:0|1:38152963_TC_AA:38152963:5,15,2,0
chr13	38153130	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=127,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,6:3,7:1,4,5,8
chr13	38153351	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=128,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,4:1,8:2,1,8,4
chr13	38154189	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=117,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:0,1,0,7
chr13	38156706	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr13	38164445	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,255;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr13	38166357	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr13	38166418	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=197,227;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,2:1,4:0,3,1,5
chr13	38225578	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:7,0:7,5:6,8,0,5
chr13	38229521	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=317,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.636:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr13	38237872	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,4:0,12:0,0,3,13
chr13	38320594	.	TAA	T,TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28,30;MFRL=0,178,340;MMQ=60,60,60;MPOS=29,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=6.48,6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.451,0.450:6:0,0,1:0,2,2:0,0,0,6
chr13	38924083	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=148.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,28:0,20:0,0,27,21
chr13	38932174	.	TTG	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TG;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.807:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr13	38932205	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=137,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,1:7,2:10,6,2,1
chr13	38932206	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=156,0;MMQ=60,52;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.255:17:7,2:5,2:9,4,1,3
chr13	38932207	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=99,222;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.288:19:7,3:7,2:9,5,3,2
chr13	38932208	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr13	39262999	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,240;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:3,1:11,1:8,6,1,1
chr13	39263714	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0|1:39263714_T_C:39263714:0,0,11,9
chr13	39263731	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:12,3:11,1:0|1:39263714_T_C:39263714:10,13,2,2
chr13	39264635	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=150,43;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:5,6,1,1
chr13	39338612	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr13	39422845	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=168,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr13	39425913	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=127,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:3,9,1,1
chr13	39430207	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=164,206;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.309:7:2,0:1,0:0|1:39430207_G_T:39430207:4,1,2,0
chr13	39430212	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=164,206;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.309:7:3,0:2,0:0|1:39430207_G_T:39430207:4,1,2,0
chr13	39430443	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=210,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr13	39435552	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=176,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:3,1:0,0:3,0,1,1
chr13	39446869	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=209,169;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.741:25:5,5:1,14:4,2,17,2
chr13	39450139	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=199,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,0:5,2:4,1,1,1
chr13	39450500	.	TT	CA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=105,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:39450500_TT_CA:39450500:4,6,1,1
chr13	39450503	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=105,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:39450500_TT_CA:39450500:4,6,1,1
chr13	39452235	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=218,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr13	39542722	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=178,274;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:0,9,0,2
chr13	39608335	.	TA	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:7,3:6,2:4,12,2,4
chr13	39613199	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,10;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.838:4:0,0:0,0:0,0,4,0
chr13	39622075	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr13	40229724	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=276,351;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr13	40230043	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,269;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:7,3:10,1:13,5,1,3
chr13	40233404	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr13	40233691	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr13	40239139	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:1,10:1,6:1,1,12,4
chr13	40254281	.	TCAAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=195,231;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:0,8,0,4
chr13	40256483	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=219,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:0,2,0,7
chr13	40268930	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,4:3,1:1,9,0,5
chr13	40293288	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=52.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,18,0
chr13	40298620	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=16,34;MFRL=108,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:0,5:0,2:0|1:40298620_CT_C:40298620:1,3,7,0
chr13	40298622	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=108,128;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:2,5:1,2:0|1:40298620_CT_C:40298620:1,3,7,0
chr13	40298805	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr13	40301763	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=231,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0,5,1,1
chr13	40325310	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=123,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr13	41507597	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=183,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,0:8,7:7,10,0,7
chr13	41517985	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=107,98;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.721:23:4,8:2,9:3,3,10,7
chr13	41523876	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=154,253;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:0,2:5,0:4,1,2,0
chr13	41525586	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=141,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:0,3,0,7
chr13	41635665	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=201,313;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,1:7,2:12,0,3,0
chr13	41705495	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,16,8
chr13	41791440	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=106,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr13	41814298	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=137,199;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr13	41835076	.	T	TA,TAA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,29,29;MFRL=171,222,256;MMQ=60,60,60;MPOS=16,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=A;STR;TLOD=6.18,3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.402,0.299:7:0,1,1:2,2,1:0,2,0,5
chr13	41835089	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=172,293;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:0,3,0,5
chr13	41835106	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=241,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr13	41890923	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=206,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr13	41891172	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=241,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr13	41893105	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,3,3
chr13	41897180	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=174,289;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:2,2:6,3,0,2
chr13	41949804	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=239,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,1:2,3:0,4,0,5
chr13	42042873	.	ACT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=169,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CT;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr13	42043086	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr13	42044508	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr13	42189232	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=51.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,3,12
chr13	42275473	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr13	42306139	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=224,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:1,3:0,1:1,0,5,0
chr13	42335222	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=238,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:1,6:2,6:2,1,10,2
chr13	42352285	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr13	42407759	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr13	42439982	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=191,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:5,3,3,0
chr13	42461024	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=171,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:42461024_C_T:42461024:1,10,1,1
chr13	42461030	.	T	TCTGTAAAAGAAAAGTG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=171,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:42461024_C_T:42461024:1,10,1,1
chr13	42465490	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=322,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr13	42481712	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=212,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=54.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.834:22:2,7:1,12:1,2,13,6
chr13	42486383	.	TTA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=201,251;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TA;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr13	42701717	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=207,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:2,3:2,8:0,4,1,10
chr13	42701739	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr13	42701803	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,1,2
chr13	42733481	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:19,3:6,0:13,13,0,3
chr13	42772774	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=155,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,0:0,4:0,2,0,6
chr13	42780148	.	CTTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=106,163;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.288:5:2,1:1,0:3,1,1,0
chr13	42780292	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=171,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:0,4,1,2
chr13	42783012	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr13	42793298	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.845:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr13	42793766	.	AGGTTTTTC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=89.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,14,7
chr13	42794004	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr13	42803341	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,4,12
chr13	42869720	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.851:11:1,3:0,6:1,0,10,0
chr13	42882762	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,4,9
chr13	43155168	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	43155443	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=114,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=42.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.811:19:3,5:0,10:1,2,6,10
chr13	43358176	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=144,65;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:7,1,1,1
chr13	43358327	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=220,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:43358327_T_TA:43358327:0,2,1,0
chr13	43358330	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=220,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:43358327_T_TA:43358327:0,2,1,0
chr13	43358332	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=220,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:43358327_T_TA:43358327:0,2,1,0
chr13	43462352	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=189,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,1:6,3:5,5,2,2
chr13	43463299	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:0,11:2,5:1,1,8,8
chr13	43469157	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=119,170;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.423:21:3,3:9,4:6,6,4,5
chr13	43469211	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:3,9:7,3:6,4,6,6
chr13	43474371	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,3:0,10:0,0,11,2
chr13	43537287	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,2:5,0:5,0,2,0
chr13	43537480	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=171,60;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,0:3,2:0|1:43537480_T_C:43537480:2,10,1,1
chr13	43537491	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=169,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:3,2:0|1:43537480_T_C:43537480:1,9,1,1
chr13	43537492	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=169,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0|1:43537480_T_C:43537480:1,9,1,1
chr13	43537495	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=169,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,0:2,3:1,7,1,2
chr13	43537560	.	A	AGTTC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,26;MFRL=255,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:43537560_A_AGTTC:43537560:0,3,0,1
chr13	43537561	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,36;MFRL=255,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:43537560_A_AGTTC:43537560:0,3,0,1
chr13	43544819	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=237,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.853:11:1,6:0,4:0,1,1,9
chr13	43566099	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=264,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.751:22:3,8:2,9:4,1,12,5
chr13	43566373	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,36;MFRL=207,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.681:13:3,3:0,6:0,4,0,9
chr13	43681427	.	GA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=97,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.404:15:1,0:4,4:2,7,1,5
chr13	43788031	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=332,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr13	43839494	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr13	43843812	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr13	43872419	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr13	43930337	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr13	44411410	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=207,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.381:14:3,3:4,2:0|1:44411410_G_A:44411410:6,3,3,2
chr13	44411421	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=182,207;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,2:0.176:15:7,1:5,1:1|0:44411410_G_A:44411410:10,3,1,1
chr13	44434281	.	TAATG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=150,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr13	44462844	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:2,2:11,2:11,2,3,1
chr13	44948295	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=155,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.605:3:0,0:0,1:0|1:44948295_T_TG:44948295:0,1,0,2
chr13	44948302	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr13	44948307	.	TGGGGGCGGGGCC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.692:1:0,0:0,1:0|1:44948295_T_TG:44948295:0,0,0,1
chr13	45010283	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=105.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,16:0,15:0,0,9,22
chr13	45148705	.	TTGC	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=155,246;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TGC;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.160:16:3,1:11,1:6,8,1,1
chr13	45150279	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45150279_A_AG:45150279:0,1,0,1
chr13	45150283	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45150279_A_AG:45150279:0,1,0,1
chr13	45517486	.	AAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AC;STR;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.820:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr13	45556291	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=123,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:0,1:3,1:0,5,0,2
chr13	45726046	.	CTTTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	45914957	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.586:29:8,6:3,11:5,7,5,12
chr13	45915243	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=158,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:2,1:10,1:1,11,0,2
chr13	45964059	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=187,170;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr13	45973231	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=80,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.548:18:1,4:2,5:1,7,1,9
chr13	45976349	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,255;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:7,1,1,1
chr13	46039407	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=228,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr13	46050519	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=287,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:1,2,2,3
chr13	46057509	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=137,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:7,2:18,2:7,18,1,3
chr13	46066192	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=142,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,1:8,4:10,1,5,0
chr13	46077301	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr13	46085864	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr13	46093284	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=202,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr13	46099243	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=185,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,5:1,7:0,2,1,12
chr13	46099278	.	C	CTGTAATACCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=196,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr13	46104130	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr13	46108853	.	TG	CA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.960:25:0,11:1,13:0,1,7,17
chr13	46115908	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr13	46124290	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=192,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,3:2,6:2,1,7,2
chr13	46124375	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=132,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:6,6:14,3:12,8,4,5
chr13	46137837	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=114,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:9,7:4,3:7,6,4,6
chr13	46148943	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=121,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:1,3:1,1,3,1
chr13	46149088	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=120,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:2,7,0,2
chr13	46154128	.	AATT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATT;STR;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:1,6,1,3
chr13	46276503	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,4:4,1:6,8,3,2
chr13	46277016	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=97,257;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:1,5,0,5
chr13	46550039	.	G	GGTGATTTCAAGTTTTGGCAATTATGAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=244,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.385:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr13	46550061	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr13	46616462	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=193,150;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,1,2
chr13	46619026	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=238,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr13	46627677	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=184,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:0,7:1,9:1,0,15,1
chr13	46629995	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=322,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:1,3:1,1:1,1,1,4
chr13	46661825	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=211,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr13	46721230	.	A	ACTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=174,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:0,7,1,1
chr13	46728924	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=139,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:8,4:6,7:7,7,4,7
chr13	46824406	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:8,4:0,0:8,0,4,0
chr13	46824424	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=185,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,4:0,0:5,0,4,0
chr13	46836201	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr13	46930536	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=190,83;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:7,2:9,5:9,7,3,4
chr13	46937193	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=211,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr13	47127666	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=178,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,1:11,1:19,0,2,0
chr13	47243357	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=198,241;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr13	47261970	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,15:0,0,14,7
chr13	47279375	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,138;MMQ=54,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=28.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.540:27:10,8:2,6:0,12,11,4
chr13	47297352	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,8:0,8:0,0,9,7
chr13	47302934	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr13	47345450	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=333,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:47345450_A_G:47345450:2,0,1,0
chr13	47345458	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=224,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0|1:47345450_A_G:47345450:3,0,1,0
chr13	47356835	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:11,3:8,1:8,11,0,4
chr13	47361113	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=197,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:3,2:8,3:10,1,5,0
chr13	47408902	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr13	47409677	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=202,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,0:7,3:5,6,1,2
chr13	47466781	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=230,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr13	47469856	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=102,65;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,0:9,2:11,10,1,1
chr13	47469879	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:9,2:0|1:47469879_G_T:47469879:13,8,1,1
chr13	47469880	.	G	GACTGAT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,0:9,2:0|1:47469879_G_T:47469879:13,8,1,1
chr13	48523158	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=178,258;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:2,1:8,1:2,8,1,1
chr13	48523573	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=140,58;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,0:5,2:6,0,2,0
chr13	48528178	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr13	48563008	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,11:0,0,6,8
chr13	48571213	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	48575292	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,13,5
chr13	48664556	.	TA	T,TAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30,31;MFRL=129,129,0;MMQ=60,60,60;MPOS=22,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.69,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,2:0.344,0.213:11:1,1,1:2,3,1:0,5,3,3
chr13	48708665	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:16,0:6,2:9,13,0,2
chr13	48919358	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr13	48921884	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr13	48922984	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=214,293;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,2:4,1:9,0,3,0
chr13	48939204	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr13	48947469	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,7,1
chr13	48953655	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr13	48954159	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.512:8:1,2:2,2:3,1,4,0
chr13	48954282	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=176,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.242:22:6,3:9,2:7,10,1,4
chr13	48955676	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	48986219	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:5,4:11,0:5,12,0,4
chr13	49033747	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr13	49051012	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr13	49077088	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,2:9,1:3,14,1,2
chr13	49684436	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.413:19:7,3:3,3:9,2,5,3
chr13	49762677	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=155,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,3:7,0:12,7,1,2
chr13	49765113	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=135,112;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.257:29:9,7:13,0:14,8,7,0
chr13	49839889	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=196,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr13	49839979	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=207,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,5:2,6:2,2,6,5
chr13	49842225	.	G	GTTATAAATAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	49865727	.	G	GCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=121,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,0:1,3:1,0,3,1
chr13	49865748	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr13	49885033	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:8,0:7,8:6,9,0,8
chr13	49885216	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr13	49934045	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=325,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr13	49951193	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=170,194;MMQ=60,59;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:1,5:7,9:4,4,5,9
chr13	49951222	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=133,194;MMQ=60,58;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:7,0:8,8:10,5,0,8
chr13	49951310	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=205,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,3:4,4:0,5,2,5
chr13	50035151	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=178,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,3:6,2:8,1,5,0
chr13	50035208	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:6,6:8,5:9,5,8,3
chr13	50035344	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:10,1:2,1:3,9,2,0
chr13	50054308	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=140,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:2,4:7,0,6,1
chr13	50054346	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:5,6:10,3:10,5,6,3
chr13	50057781	.	T	TGAGAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=138,170;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr13	50065151	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=211,139;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr13	50087142	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=172,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,3:3,0:5,2,2,1
chr13	50092127	.	TACTC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=182,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,4:6,3:9,3,6,1
chr13	50095127	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=189,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:0,3,2,1
chr13	50096127	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=184,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:6,1:7,4:9,5,3,2
chr13	50098407	.	TAAAAC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAC;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:0,1:0,6,1,1
chr13	50100627	.	GTT	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=176,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,0:4,5:2,6,0,5
chr13	50100637	.	ATATT	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=186,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:4,0:3,5:0|1:50100637_ATATT_A:50100637:2,5,0,5
chr13	50100647	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=186,220;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:3,0:3,5:0|1:50100637_ATATT_A:50100637:2,5,0,5
chr13	50100667	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=195,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:0,4,0,4
chr13	50102810	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,310;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:1,6,0,4
chr13	50108252	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,7:4,3:5,4,7,3
chr13	50118998	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=201,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,2:6,2:3,5,1,3
chr13	50125678	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=165,260;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr13	50129599	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=209,251;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr13	50129615	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr13	50134020	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=179,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr13	50134150	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:7,1:9,3:10,6,1,3
chr13	50140975	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=199,98;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:3,0:2,2:1,5,2,0
chr13	50236153	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=179,167;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:50236153_A_G:50236153:1,3,0,1
chr13	50236161	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=179,167;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:50236153_A_G:50236153:1,3,0,1
chr13	50244041	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:0,1,1,7
chr13	50296026	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=159,208;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=65.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:0,13:1,5:1,0,17,1
chr13	50299648	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=140,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:0,5:1,0:0,1,2,3
chr13	50306823	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=227,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.571:17:2,4:4,5:0|1:50306823_GA_G:50306823:1,6,6,4
chr13	50306837	.	CA	GT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=165,244;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:24,2:0.105:26:9,2:8,0:1|0:50306823_GA_G:50306823:16,8,0,2
chr13	50502065	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,0;MFRL=128,216;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,0:0|1:50502065_C_T:50502065:5,6,2,0
chr13	50502074	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=138,216;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:0|1:50502065_C_T:50502065:5,7,2,0
chr13	50587654	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=58,138;MMQ=54,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=22,21;RU=T;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,3:2,1:3,1,2,4
chr13	50588485	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,0:0|1:50588485_A_T:50588485:0,0,1,0
chr13	50588487	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50588485_A_T:50588485:0,0,1,0
chr13	50588489	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50588485_A_T:50588485:0,0,1,0
chr13	50588495	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50588485_A_T:50588485:0,0,1,0
chr13	50588496	.	T	TTAACCACC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50588485_A_T:50588485:0,0,1,0
chr13	50589928	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,2:10,0:9,11,1,1
chr13	50590927	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=190,111;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:8,0:13,4:0|1:50590927_A_C:50590927:10,11,0,4
chr13	50590931	.	C	CTTTCTCTATATGTTTAGAAACA	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,41;MFRL=185,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.183:25:7,0:13,4:0|1:50590927_A_C:50590927:11,10,0,4
chr13	50590999	.	CTTTTT	C,CTTTT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,32,32;MFRL=170,204,184;MMQ=60,60,60;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,11,15;RU=T;STR;TLOD=7.76,16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,7:0.264,0.542:12:0,0,2:1,3,4:1,1,7,3
chr13	50592141	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=118,53;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:5,6,1,1
chr13	50594427	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=162,89;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:10,4:7,0:10,7,4,0
chr13	50594540	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=163,67;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:13,2:0|1:50594540_C_T:50594540:10,11,0,2
chr13	50594547	.	CAGAGA	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=164,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:12,2:0|1:50594540_C_T:50594540:9,13,0,2
chr13	50594553	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=164,67;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:13,2:0|1:50594540_C_T:50594540:8,13,0,2
chr13	50656504	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:5,1:9,0,2,0
chr13	51484356	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:1,2,0,2
chr13	51590472	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.397:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr13	51929375	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr13	51943057	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=168,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.412:27:8,6:8,5:8,8,4,7
chr13	51956122	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=171,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,2:1,5:4,0,6,1
chr13	52025255	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=151,108;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:11,2:19,0:14,16,2,0
chr13	52025330	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:6,2:8,1:2,12,1,2
chr13	52277693	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=190,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:2,6:3,5:1,4,6,5
chr13	52293343	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,47;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:7,0:11,5,2,0
chr13	52293532	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr13	52345978	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=198,261;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,0:14,2:14,11,1,1
chr13	52373814	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,0:0,5:0,0,0,6
chr13	52511362	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr13	52511606	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr13	52515334	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=152,231;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,0:6,6:3,7,0,6
chr13	52515354	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr13	52520704	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr13	52524560	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr13	52542796	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr13	52544978	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr13	52585548	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,1,7
chr13	52585591	.	T	TCGGCG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CGGCG;STR;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,0:0,0,0,8
chr13	52602919	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr13	52603775	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,10:0,0,8,15
chr13	52606784	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=157,132;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,3:7,0:4,10,3,0
chr13	52649973	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,15;MFRL=174,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.240:18:2,0:6,0:3,11,0,4
chr13	52649974	.	CA	C,CAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,32,32;MFRL=187,146,191;MMQ=60,60,60;MPOS=26,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=9.64,6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,6,4:0.402,0.235:15:1,2,1:4,4,2:1,4,0,10
chr13	52663491	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr13	52684801	.	TAC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.838:4:0,2:0,2:0|1:52684801_TAC_T:52684801:0,0,0,4
chr13	52684817	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=251,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:52684801_TAC_T:52684801:0,2,0,2
chr13	52701490	.	A	ACTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=57.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,7,6
chr13	52701637	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,6,11
chr13	52707240	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr13	52707751	.	T	TCACACA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=216,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,18;RU=CA;STR;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.697:4:0,1:1,0:1,0,3,0
chr13	52710044	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr13	52710058	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr13	52717950	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr13	52718050	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr13	52952928	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=240,244;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr13	52989863	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,13,0
chr13	53009048	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=59.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,9:0,0,4,15
chr13	53010353	.	A	AACAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=226,244;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,20;RU=AC;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.506:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr13	53029770	.	CGCGGTGGCGGTGGCGGTG	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=GCGGTG;STR;TLOD=84.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.957:19:0,11:0,8:0,0,4,15
chr13	53030565	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr13	53036398	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr13	53036702	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=142,74;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr13	53042529	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=157,131;MMQ=60,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,0:2,5:4,6,0,5
chr13	53217035	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,247;MMQ=60,29;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr13	53227301	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,2,11
chr13	53232489	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:1,9:0,6:0,1,10,5
chr13	53240884	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr13	53254082	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,9,4
chr13	53254296	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:1,7:0,8:0,1,6,9
chr13	53277639	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0|1:53277639_G_A:53277639:0,0,9,0
chr13	53277646	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:53277639_G_A:53277639:0,0,9,0
chr13	53287023	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr13	53419139	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=158,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:0,8,0,3
chr13	53419795	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,12;MFRL=250,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.684:7:0,2:1,0:0,2,0,5
chr13	53420886	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=202,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:4,3,1,1
chr13	53422190	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:6,10,1,1
chr13	53608479	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=167,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,2:2,7:5,1,6,3
chr13	53617421	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=133,242;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:3,5:5,1:4,5,1,5
chr13	53617495	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=216,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:2,0:3,0:0|1:53617495_G_C:53617495:0,6,0,2
chr13	53617500	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=16,14;MFRL=271,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:1,0:0,0:0|1:53617495_G_C:53617495:0,4,0,2
chr13	58299434	.	G	GA,GAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,18,18;MFRL=276,168,223;MMQ=60,60,60;MPOS=14,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.75,4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.344,0.334:6:0,0,0:1,0,0:0,2,0,4
chr13	60385060	.	A	ATTAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr13	60582651	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr13	60590299	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0|1:60590299_C_T:60590299:0,0,3,13
chr13	60590307	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.707:15:2,5:2,6:0|1:60590299_C_T:60590299:1,3,2,9
chr13	60971593	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr13	61057810	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=172,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr13	61068533	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=225,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr13	61084948	.	T	TAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=184,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:0|1:61084948_T_TAG:61084948:0,4,0,2
chr13	61084949	.	T	TGG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=184,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:0|1:61084948_T_TAG:61084948:0,4,0,2
chr13	61109375	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=174,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:4,1:2,1:0,7,1,1
chr13	61988107	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,4,9
chr13	67799924	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=179,75;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:13,3:15,0:14,15,2,1
chr13	67800793	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=175,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:17,2:3,0:0|1:67800793_T_A:67800793:10,10,2,0
chr13	67800796	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=176,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:15,2:2,0:0|1:67800793_T_A:67800793:9,10,2,0
chr13	70281723	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=178,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,2:3,1:5,3,2,1
chr13	70293715	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=196,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:3,1:0,9,0,2
chr13	70413346	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=260,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr13	70413365	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=212,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr13	70535355	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=210,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.464:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr13	70549942	.	CCA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=145,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=CA;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.265:9:1,1:3,0:1,6,0,2
chr13	70550028	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=209,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr13	70681305	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,2:4,1:9,2,2,1
chr13	72440658	.	TGCCGCCGCC	T,TGCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20,27;MFRL=0,365,176;MMQ=60,60,60;MPOS=30,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,7,8;RU=GCC;STR;TLOD=3.52,7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.334,0.507:3:0,1,1:0,0,1:0,0,3,0
chr13	73284411	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=164,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:10,4:9,5:15,4,5,4
chr13	73293249	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.496:8:4,0:0,3:0,4,0,4
chr13	73301804	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=186,266;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:2,2:0,0:1,1,1,2
chr13	73302157	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=72.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,14:0,9:0,0,11,12
chr13	73303315	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.376:11:5,0:1,3:1,6,0,4
chr13	73309067	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=172,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:5,4,1,1
chr13	73317585	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=202,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,1:4,8:5,1,8,1
chr13	73317847	.	CT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33,33,29;MFRL=75,214,187,263;MMQ=60,60,60,60;MPOS=28,16,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,12,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.71,5.48,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,3,2:0.214,0.316,0.234:9:1,2,2,1:1,0,1,1:0,2,0,7
chr13	73366704	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=182,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.530:13:1,4:5,3:0,6,2,5
chr13	73396037	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:6,4:10,2:4,12,4,2
chr13	73402075	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr13	73539340	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr13	73547913	.	T	TCCTCATAACAAACCCTCAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=197,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,1,1
chr13	73638070	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:4,4,0,2
chr13	73638125	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr13	73650108	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,36;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr13	73650112	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0|1:73650112_C_A:73650112:0,0,0,9
chr13	73650117	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:73650112_C_A:73650112:0,0,0,9
chr13	74420115	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,0:7,2:8,9,1,1
chr13	75861174	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:1,7,0,3
chr13	75863315	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=201,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.325:13:3,2:6,2:0,9,0,4
chr13	75869182	.	A	AAGTATAACAGAAGCTTGGTAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=196,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.322:7:3,2:2,0:0,5,1,1
chr13	75880384	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=212,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr13	75884088	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=194,66;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:10,2:0|1:75884088_C_CT:75884088:10,11,1,1
chr13	75884091	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=194,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:0|1:75884088_C_CT:75884088:10,11,1,1
chr13	75884290	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=88,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:1,3:7,3:3,5,2,4
chr13	75901836	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=209,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr13	75915215	.	TAT	CCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=129,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr13	76055336	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:76055336_G_C:76055336:1,0,1,0
chr13	76055341	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=170,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:76055336_G_C:76055336:3,0,1,0
chr13	76055397	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:1,2:4,2:6,1,3,1
chr13	76101863	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr13	76111702	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,6:3,1:2,3,3,4
chr13	76135028	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=184,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,6:0,3:2,0,1,8
chr13	76140814	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr13	76164073	.	GTCC	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=176,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCC;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:4,2:17,0:14,7,2,0
chr13	76169234	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr13	76210742	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=218,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:2,1:1,1:4,0,3,0
chr13	76335196	.	GAT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=202,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.586:10:2,4:2,2:0,4,1,5
chr13	76370755	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=196,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.505:11:3,2:1,3:4,1,4,2
chr13	76378694	.	G	GTCTAATGTATTCTA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=148,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:4,2:7,0:3,8,1,1
chr13	76378737	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=153,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr13	76383408	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=201,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr13	76395278	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,1:5,3:7,4,3,1
chr13	76419421	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr13	76430566	.	CCC	GGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:76430566_CCC_GGG:76430566:0,0,1,0
chr13	76430574	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:76430566_CCC_GGG:76430566:0,0,1,0
chr13	77522725	.	GACTT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=201,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTT;STR;TLOD=43.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:2,4:4,7:4,3,6,5
chr13	77527707	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,7,4
chr13	77570140	.	AT	CC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=137,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,1:13,1:14,8,1,1
chr13	77574494	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=201,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr13	77589725	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=380,63;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:1,2:0,1,1,4
chr13	77635527	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=233,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr13	77642968	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=174,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:2,0:4,5:0,6,0,6
chr13	77644862	.	GAAA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=12,18;MFRL=140,77;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.312:10:0,0:1,1:1,6,1,2
chr13	77653090	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=210,102;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr13	77661528	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr13	77669800	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=186,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:1,7,0,2
chr13	77725106	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr13	77732333	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr13	77759310	.	GCA	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=177,109;MMQ=60,46;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:13,3:13,0:0|1:77759310_GCA_G:77759310:16,11,3,0
chr13	77759316	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=177,109;MMQ=60,46;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.137:27:13,3:11,0:0|1:77759310_GCA_G:77759310:16,8,3,0
chr13	77792099	.	TAA	T,TA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31,31;MFRL=138,204,148;MMQ=60,60,60;MPOS=25,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.22,5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,4:0.150,0.259:16:4,0,1:5,2,3:3,7,1,5
chr13	77817170	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=106,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:7,4,1,1
chr13	77818100	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=207,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.332:20:5,2:3,2:5,8,0,7
chr13	77834801	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=165,258;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr13	77835520	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=242,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.684:14:2,3:2,7:0,4,1,9
chr13	77847736	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.278:34:10,0:15,9:12,13,2,7
chr13	78163291	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,97;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.186:25:12,4:6,0:9,12,4,0
chr13	78178451	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr13	78178550	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=121,306;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,1:10,1:4,11,1,1
chr13	78183167	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr13	78191824	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr13	78192271	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=160,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:10,2:0|1:78192271_G_C:78192271:2,10,0,2
chr13	78192283	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:1,0:8,2:0|1:78192271_G_C:78192271:1,10,0,2
chr13	78192291	.	TA	CC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:8,2:0|1:78192271_G_C:78192271:0,11,0,2
chr13	78211402	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=316,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr13	79216356	.	GAAAA	G,GAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35,27;MFRL=211,144,169;MMQ=60,60,60;MPOS=26,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,9,12;RU=A;STR;TLOD=3.06,3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,2:0.221,0.340:6:0,0,0:2,1,1:0,3,0,3
chr13	79894736	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=124,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,4:3,5:5,3,6,3
chr13	79894877	.	CAA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=222,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:1,2:2,0:0,4,0,2
chr13	79908574	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=182,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,1:9,2:1,16,0,3
chr13	79915389	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:0,7,1,4
chr13	79916792	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=68.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,12:0,8:0,0,13,10
chr13	79916973	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:5,4:3,9:2,6,6,7
chr13	79916994	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=138,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:4,12,0,2
chr13	79918323	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=178,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:3,2,4,0
chr13	79927219	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=172,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,3:5,0:8,2,3,0
chr13	79928477	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr13	79929326	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:2,2:6,2:6,2,1,3
chr13	79932617	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr13	79939921	.	TAAGAGA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=117,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr13	79940150	.	CTG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,4:5,4:6,2,5,3
chr13	79940811	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.280:15:5,1:6,2:9,2,3,1
chr13	79940845	.	A	ATCATGGCTCACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=103,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:4,0,0,1
chr13	79943166	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=244,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.431:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr13	79945233	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:3,7,1,1
chr13	79946072	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=169,227;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:2,1:1,2:1,3,1,2
chr13	79946104	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=182,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:0,5,0,3
chr13	79946163	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr13	80095005	.	CCAGCACCGCAGATTGTGCAGGCTGCGTCTT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.122:31:14,0:8,3:15,13,3,0
chr13	80095191	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	80910851	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=105,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,4:1,0:2,0,3,1
chr13	82264343	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=121,132;MMQ=60,49;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.395:36:11,9:11,5:13,9,7,7
chr13	82265105	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=150,259;MMQ=52,47;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,1:9,2:5,10,1,2
chr13	82265213	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=12,20;MFRL=138,198;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.608:3:0,1:0,0:0|1:82265213_TAA_T:82265213:0,1,1,1
chr13	82265231	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:82265213_TAA_T:82265213:0,0,1,2
chr13	86370317	.	A	AATGTG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=211,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:6,0:0|1:86370317_A_AATGTG:86370317:4,5,1,1
chr13	86370319	.	T	TCGAG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=211,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:3,2:6,0:0|1:86370317_A_AATGTG:86370317:4,5,1,1
chr13	88327687	.	ACAG	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=169,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:9,0:0|1:88327687_ACAG_A:88327687:8,9,0,2
chr13	88327693	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=153,87;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,2:10,0:0|1:88327687_ACAG_A:88327687:10,10,0,2
chr13	88327695	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=153,87;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:10,0:0|1:88327687_ACAG_A:88327687:10,10,0,2
chr13	92345387	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=195,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:6,1,1,1
chr13	92345579	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:5,2:5,2:4,6,2,2
chr13	92346005	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=157,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,2:4,2:3,4,2,2
chr13	92408741	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=195,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr13	94938785	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=174,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr13	94938808	.	GAT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=193,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr13	95230877	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:10,1,2,0
chr13	95235386	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=182,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,0:9,2:12,3,1,1
chr13	95243270	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr13	95273241	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=215,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr13	95363652	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:95363652_C_G:95363652:0,0,3,0
chr13	95363655	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,0:0|1:95363652_C_G:95363652:0,0,3,0
chr13	95673939	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=103,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.789:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr13	95714942	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=222,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,0:8,2:11,2,1,1
chr13	95714976	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=144,225;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.760:23:1,9:4,9:4,1,14,4
chr13	95715146	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=196,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,2:8,1:2,12,0,3
chr13	95715148	.	AAAAG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=95,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.675:17:1,7:4,5:1,4,1,11
chr13	95735604	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr13	95813600	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=198,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.324:7:0,2:5,0:1,4,1,1
chr13	95829870	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr13	95830181	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:8,5:8,0:14,3,5,0
chr13	95847020	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr13	95858686	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr13	95858704	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr13	95859974	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=215,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr13	95862860	.	AGAGT	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=116,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:0,0:2,3:3,0,3,0
chr13	95862873	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=189,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:4,1,4,0
chr13	95862896	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=222,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.580:15:2,2:4,7:6,0,7,2
chr13	95899354	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=162,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,0:4,3:3,3,3,0
chr13	95900071	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr13	96230279	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=56,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.833:16:2,6:0,8:1,1,3,11
chr13	96258410	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=234,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr13	96293523	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,1:3,6:4,1,5,2
chr13	96412461	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=151,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:4,6,2,0
chr13	96508611	.	A	ACACACGGACTTAGCC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,16;MFRL=172,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.161:22:13,1:6,0:3,16,2,1
chr13	96513187	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=199,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:1,6,0,4
chr13	96555149	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,213;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,2:5,3:6,7,4,1
chr13	96579462	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=101,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:3,4:5,7:4,4,6,5
chr13	96589076	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=191,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr13	96599271	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=121,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:2,2,2,2
chr13	96599433	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:1,1,0,5
chr13	96599445	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,2:0,3:1,2,0,5
chr13	96636170	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,36;MFRL=121,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:0,1:3,4:1,2,0,5
chr13	96648497	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=263,169;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:96648497_T_C:96648497:0,3,0,1
chr13	96648500	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=263,169;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:96648497_T_C:96648497:0,3,0,1
chr13	97484830	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=149,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,2:5,0:7,5,1,1
chr13	97986448	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=204,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr13	98086691	.	GGGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=207,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GGC;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr13	98087096	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=160,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:0,4,0,7
chr13	98628877	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.792:3:0,0:0,0:0|1:98628877_G_C:98628877:0,0,3,0
chr13	98628882	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.792:3:0,0:0,0:0|1:98628877_G_C:98628877:0,0,3,0
chr13	98628886	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:98628877_G_C:98628877:0,0,1,0
chr13	98628888	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:98628877_G_C:98628877:0,0,1,0
chr13	98628893	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:98628877_G_C:98628877:0,0,1,0
chr13	98634737	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:2,3:3,2,3,1
chr13	98637917	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.567:7:1,3:1,1:0,3,0,4
chr13	98641223	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=174,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr13	98649740	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,3:2,2:6,2,5,0
chr13	98658358	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:3,1,4,0
chr13	98658626	.	T	TACAGAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=191,99;MMQ=50,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr13	98660287	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,1:8,1:14,2,1,1
chr13	98662319	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=160,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.249:30:11,7:12,0:13,10,0,7
chr13	98666549	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=171,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.324:8:2,1:3,1:0,6,0,2
chr13	98670641	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr13	98865726	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=189,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:2,1:4,1:0,6,1,2
chr13	99017533	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=153,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr13	99037154	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=334,241;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr13	99042231	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:13,3:15,0:15,13,2,1
chr13	99042390	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=190,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,2:2,4:2,5,0,6
chr13	99061556	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=194,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,4:0,5:1,0,7,2
chr13	99061736	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=203,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:11,2:9,0:15,7,1,1
chr13	99063113	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=160,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:0,2,1,2
chr13	99083624	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr13	99091147	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,6:8,2:4,8,4,4
chr13	99093094	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr13	99098318	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=120,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.553:11:2,3:3,3:3,2,5,1
chr13	99098470	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,3:3,5:3,2,3,5
chr13	99098882	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:3,5:1,3:4,1,6,2
chr13	99100474	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=133,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:13,1:8,3:12,9,2,2
chr13	99100479	.	CCGTGTTGCAGGTGGATGGAAGTGATCCGCAGTGCCACCAGCTCTGCCTCGCGACCCCA	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=142,51;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.097:30:10,0:6,2:11,17,1,1
chr13	99100547	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=123,117;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,3:4,4:5,3,2,5
chr13	99105302	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=246,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr13	99112680	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,5,12
chr13	99112754	.	TT	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=194,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,3:0,5:0,1,1,7
chr13	99115927	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=118,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.694:24:4,8:3,9:5,2,12,5
chr13	99118590	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:5,1,2,0
chr13	99127052	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=114,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:0,2:2,13:2,0,11,4
chr13	99127252	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=220,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,7:0,4:0,1,2,9
chr13	99127496	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,9,12
chr13	99134626	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=346,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:0,6:1,4:0,1,0,10
chr13	99340037	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.368:14:2,3:6,1:1,8,1,4
chr13	99364008	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=189,237;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr13	99447005	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=259,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=58.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.875:22:1,15:1,4:1,1,3,17
chr13	99449579	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=184,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,7:1,2:2,1,5,4
chr13	99449755	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,5:1,2:1,1,3,4
chr13	99459963	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=156,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,2:6,1:5,8,2,1
chr13	99497547	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=180,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,3:8,0:13,4,3,0
chr13	99497648	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.183:20:12,0:4,3:9,8,0,3
chr13	99498215	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=153,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,9:0.222:43:14,0:20,9:15,19,0,9
chr13	99498227	.	G	GA	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=152,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:6,2:19,0:0|1:99498227_G_GA:99498227:13,12,1,1
chr13	99498228	.	G	GGAAAA	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=152,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:6,2:19,0:0|1:99498227_G_GA:99498227:13,12,1,1
chr13	99498229	.	C	CTTGGGTTCTTTTAA	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=152,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:6,1:18,0:0|1:99498227_G_GA:99498227:13,12,1,1
chr13	99505632	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:2,8:1,6:3,0,13,1
chr13	99505779	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,2:9,1:7,11,2,1
chr13	99519625	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=124,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr13	99520099	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=196,216;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:2,2:6,2:9,0,4,0
chr13	99520113	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=208,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.170:16:3,2:6,0:13,1,2,0
chr13	99534048	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr13	99536031	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr13	99536215	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:99536215_C_T:99536215:0,0,0,6
chr13	99536220	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0|1:99536215_C_T:99536215:0,0,0,4
chr13	99537202	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=70.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,10:0,0,17,6
chr13	99537217	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0,0,13,10
chr13	99538711	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr13	99538935	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,4:1,7:0,2,2,9
chr13	99540500	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,6,12
chr13	99555187	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr13	99566577	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,117;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:8,4:11,0:12,8,4,0
chr13	99578265	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr13	99607734	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=175,199;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,2:11,1:11,9,0,3
chr13	99853912	.	CAGTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=222,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:1,2:0,5,0,4
chr13	99890849	.	GTT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=222,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.511:2:0,0:1,1:0|1:99890849_GTT_G:99890849:0,1,0,1
chr13	99890862	.	CTTTCTAGATTTGCTTTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=208,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,1:0|1:99890849_GTT_G:99890849:0,4,0,1
chr13	99890886	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=208,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:99890849_GTT_G:99890849:0,4,0,1
chr13	99966516	.	CTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=146,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,0:2,1:2,5,0,3
chr13	99970429	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr13	99992518	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,15;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.584:8:1,0:1,0:2,1,5,0
chr13	99992539	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:1,0:4,0:5,2,3,0
chr13	100020212	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=142,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,4:7,1:3,7,0,5
chr13	100181915	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr13	100511077	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,325;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr13	100515161	.	A	AGACTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GACTT;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr13	100517195	.	CTG	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:6,1:9,4:6,10,2,3
chr13	100518400	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr13	100518634	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=164,281;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:5,1:8,2:4,9,2,1
chr13	100523386	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=207,268;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:1,3,0,3
chr13	100537221	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr13	100537232	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr13	100537291	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=156,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,1:10,1:12,8,1,1
chr13	100537376	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,7:0,0,2,14
chr13	100635010	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,12;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:100635010_A_C:100635010:0,0,1,0
chr13	100635013	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,35;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100635010_A_C:100635010:0,0,1,0
chr13	100635016	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,35;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100635010_A_C:100635010:0,0,1,0
chr13	100635019	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,12;MFRL=232,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:100635010_A_C:100635010:1,0,1,0
chr13	100635022	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=198,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:100635010_A_C:100635010:2,0,1,0
chr13	100635025	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=198,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:100635010_A_C:100635010:2,0,1,0
chr13	100635028	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=28,27;MFRL=211,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:100635010_A_C:100635010:4,0,1,0
chr13	100635031	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=30,12;MFRL=211,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:100635010_A_C:100635010:4,0,1,0
chr13	100635034	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=29,33;MFRL=211,226;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:100635010_A_C:100635010:4,0,1,0
chr13	100637102	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=173,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:8,1,2,0
chr13	100755044	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:1,1:2,1:4,0,2,0
chr13	100764074	.	ATG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=141,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,0:2,3:3,5,3,0
chr13	100861813	.	TAC	T,TACAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28,27;MFRL=0,208,241;MMQ=60,60,60;MPOS=19,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=AC;STR;TLOD=3.24,6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.333,0.500:3:0,1,2:0,0,0:0,0,0,3
chr13	100909920	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:9,0:17,3:11,15,0,3
chr13	100921056	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,6,11
chr13	101020695	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=240,79;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,4:2,3:2,0,6,1
chr13	101264633	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.436:28:5,7:8,5:9,7,10,2
chr13	101287340	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=105,211;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,6:7,3:5,7,5,4
chr13	101288992	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,209;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:10,5:1,3:2,9,1,7
chr13	101289969	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=194,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:0,5,2,4
chr13	101289998	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=144,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,2:0,8:0,1,2,8
chr13	101315175	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr13	101316378	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr13	101321067	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr13	101322732	.	T	TTCCTTGTTTTCTTCCTCTTGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr13	101720454	.	A	AAGAAATGAACAAAGCCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:101720454_A_AAGAAATGAACAAAGCCAC:101720454:0,1,0,1
chr13	101720457	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:101720454_A_AAGAAATGAACAAAGCCAC:101720454:0,1,0,1
chr13	101733890	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:9,2:9,0:11,7,0,2
chr13	101733959	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:0|1:101733959_GA_G:101733959:5,7,1,1
chr13	101733961	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=151,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,0:5,2:0|1:101733959_GA_G:101733959:5,7,1,1
chr13	101748024	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=174,79;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,3:1,14,1,2
chr13	101755480	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=251,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,3,0
chr13	101757011	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=285,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:2,4,0,2
chr13	101759863	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,0:9,2:6,7,1,1
chr13	101795422	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:5,1:10,3:10,5,2,2
chr13	101844479	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr13	101890040	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr13	102030837	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=305,90;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr13	102220193	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=191,82;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,0:4,2:5,8,0,2
chr13	102235752	.	CT	AG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.275:8:2,0:2,1:1,5,0,2
chr13	102235764	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,19;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:0,0:0,3,0,2
chr13	102344867	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr13	102366703	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=176,250;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:7,1:2,1:10,0,2,0
chr13	102368056	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr13	103249561	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=226,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr13	103257064	.	CAT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AT;STR;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:9,0,3,0
chr13	103271206	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=138,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,2:7,4:6,5,2,5
chr13	103279589	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,302;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr13	103282643	.	TGTTG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=190,318;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr13	103286280	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=196,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,1:12,1:15,5,2,0
chr13	103286329	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=196,134;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:8,10,2,0
chr13	103286474	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:5,2:9,3:4,10,2,3
chr13	103289409	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,227;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,2:1,2:7,0,3,1
chr13	103290535	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=114,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr13	103290574	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=125,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:2,2,5,1
chr13	103292810	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=198,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr13	103295485	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=153,298;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr13	103295551	.	CTTCT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=186,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTCT;STR;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:3,2:0,2:2,1,4,0
chr13	103296819	.	C	CAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,271;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr13	103297435	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=194,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:0,1,1,4
chr13	103301537	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chr13	103301708	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=180,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,5:6,0:7,4,5,0
chr13	103315948	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr13	103316113	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=217,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.799:13:0,7:2,4:2,0,4,7
chr13	103328579	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=177,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,3:5,3:7,0,6,0
chr13	103328619	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:5,5:6,7:6,5,8,4
chr13	103328660	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:16,2:11,3:17,11,2,3
chr13	103330718	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:1,5,0,3
chr13	103339194	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr13	103385299	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,6,16
chr13	103386283	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,13,10
chr13	103388599	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=195,106;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:9,0:11,3:10,10,0,3
chr13	103388666	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=205,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,1:8,1:9,9,0,2
chr13	103392709	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,2:4,2:5,6,1,3
chr13	103392728	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=196,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,5:4,1:4,5,3,3
chr13	103397890	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=186,159;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,1:6,5:8,3,2,4
chr13	103399761	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=207,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:6,2,1,1
chr13	103402772	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=216,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr13	103410710	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr13	103418728	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=183,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:3,1:9,1:8,4,1,1
chr13	103420671	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:7,1:5,4:0|1:103420671_T_TA:103420671:5,7,0,5
chr13	103420680	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.302:18:6,1:5,4:0|1:103420671_T_TA:103420671:5,8,0,5
chr13	103445609	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr13	103474031	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr13	103484060	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,6,8
chr13	103484107	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=229,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:0,3,1,5
chr13	103491172	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=293,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:2,3:0,4:0,2,0,7
chr13	103506362	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=36.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr13	103514091	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.909:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr13	103514459	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=163,91;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:11,0:8,5:7,12,1,4
chr13	103518769	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,5,9
chr13	103520666	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=192,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr13	103524762	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,16:0,5:0,0,1,20
chr13	103698630	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr13	103703579	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=169,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr13	107165255	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=250,244;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr13	107209378	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:11,4:5,5:10,6,6,3
chr13	107219860	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,19;MFRL=167,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.341:12:2,1:2,1:7,1,4,0
chr13	107862841	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=195,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr13	108183631	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr13	108862706	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=216,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,0:6,5:7,7,0,5
chr13	108882748	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=141,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:13,1:7,3:6,14,2,2
chr13	108883981	.	GC	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=200,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:5,3:7,2:8,4,3,2
chr13	108884021	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=252,623;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:6,5:17,0:8,15,0,5
chr13	108939239	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=160,64;MMQ=55,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:1,6,1,1
chr13	108939319	.	TG	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=203,162;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr13	109446080	.	ATTG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	109459020	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=226,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.652:24:4,7:4,7:7,1,10,6
chr13	109472601	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr13	109472849	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr13	109496928	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=325,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr13	109550561	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=230,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr13	109700709	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=159,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:10,3:17,0:10,18,0,3
chr13	109779906	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr13	109817158	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=176,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr13	110434310	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=188,256;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:6,0,4,0
chr13	110435302	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,1:0,2:0,2,0,3
chr13	110817171	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=181,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.205:12:6,0:4,2:9,1,2,0
chr13	110819457	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0|1:110819457_A_G:110819457:0,0,8,4
chr13	110819460	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0|1:110819457_A_G:110819457:0,0,8,4
chr13	110824974	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:4,0,6,0
chr13	110828891	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:3,7:4,6:5,2,5,8
chr13	110828922	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.588:20:5,6:2,5:5,3,4,8
chr13	110831837	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr13	110833564	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=204,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:5,0,8,0
chr13	110833751	.	CA	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=195,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.320:13:5,1:2,3:1,8,0,4
chr13	110835460	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:4,4:10,5:5,9,3,6
chr13	110838646	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr13	110838703	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=212,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,6:1,3:3,0,6,3
chr13	110839428	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=258,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr13	110844721	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=198,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,2:0,3:0,4,0,5
chr13	110845314	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=150,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,2:0,6:0,1,2,7
chr13	110847283	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=188,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr13	110850770	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=134,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,2:1,5:2,3,6,1
chr13	110851036	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=232,284;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:2,4,0,3
chr13	110859316	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=18,17;MFRL=174,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.514:10:1,0:1,0:1,4,0,5
chr13	110859690	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0,0,10,0
chr13	110861096	.	CTA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TA;STR;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,2:8,1:10,2,2,1
chr13	110862268	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=140,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:5,0,4,0
chr13	110862303	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=158,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,1:8,1:12,3,2,0
chr13	110866065	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:9,1,1,1
chr13	111009993	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=220,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0,10,0,2
chr13	111077400	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,5:0,0,3,6
chr13	111077450	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr13	111098110	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:5,0,2,1
chr13	111098270	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=157,251;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:7,7,0,2
chr13	111098338	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr13	111099122	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=205,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:4,0,4,2
chr13	111102183	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=284,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr13	111109960	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=173,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,3:4,2:8,4,0,5
chr13	111110418	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=106,314;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:9,1:7,8,1,1
chr13	111111023	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=266,238;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:111111023_T_C:111111023:3,0,2,0
chr13	111111043	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,15;MFRL=266,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,0:0|1:111111023_T_C:111111023:3,0,2,0
chr13	111111382	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=169,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr13	111114554	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,268;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:3,2:5,2:4,4,4,1
chr13	111117668	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=180,232;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,0:1,3:7,0,3,0
chr13	111117745	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=170,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,1:6,1:11,4,1,1
chr13	111121483	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=176,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr13	111132490	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr13	111132556	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=125,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.816:14:1,6:1,6:1,1,6,6
chr13	111132820	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=215,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr13	111134780	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=222,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr13	111137167	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr13	111141871	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=191,107;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:7,2:7,6,0,2
chr13	111142009	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=215,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:6,2:3,2:0|1:111142009_A_C:111142009:3,6,4,0
chr13	111142016	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=215,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.443:16:5,3:3,4:0|1:111142009_A_C:111142009:3,6,6,1
chr13	111142227	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr13	111143755	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr13	111145676	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=232,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,4:0,1:1,1,1,4
chr13	111147876	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=197,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:111147876_G_C:111147876:0,2,0,1
chr13	111147878	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=197,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:111147876_G_C:111147876:0,2,0,1
chr13	111147897	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	111153934	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr13	111154159	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=186,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0|1:111154159_C_T:111154159:1,1,0,5
chr13	111154160	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.331:7:3,1:2,1:1|0:111154159_C_T:111154159:0,5,1,1
chr13	111155428	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr13	111155773	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,11,9
chr13	111156153	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:4,1:9,3:6,7,2,2
chr13	111156411	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr13	111159054	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr13	111164198	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=163,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:1,2:1,1:2,0,4,0
chr13	111164614	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=15,35;MFRL=306,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0|1:111164614_T_C:111164614:0,1,0,2
chr13	111164628	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=306,222;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.711:4:1,2:0,1:0|1:111164614_T_C:111164614:0,1,0,3
chr13	111276726	.	ATATCT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:1,3,0,1
chr13	111277633	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=179,50;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:3,6,0,2
chr13	111279817	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=117,190;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,1:6,2:5,6,2,1
chr13	111287883	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=149,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:10,7,2,0
chr13	111290880	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:2,2:6,1:0,8,1,3
chr13	111294920	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr13	111319884	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=188,241;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr13	111358315	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=188,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:111358315_C_T:111358315:1,1,1,1
chr13	111358316	.	C	CTTCAGTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=188,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:111358315_C_T:111358315:1,1,1,1
chr13	111358319	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=188,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:111358315_C_T:111358315:1,1,1,1
chr13	111531885	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr13	111933098	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=222,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:2,5,0,3
chr13	111940637	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,313;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:6,1,2,0
chr13	111953903	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=250,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:0,6,1,4
chr13	111955465	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,6,11
chr13	111980478	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,12,6
chr13	111992288	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=210,169;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,3:1,5:1,3,5,3
chr13	111992314	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr13	112278338	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=202,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:8,4,1,1
chr13	112297403	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,3:0,0,14,0
chr13	112722080	.	GGGC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=203,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:0,1:2,1,2,0
chr13	112722435	.	ATGGGCG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=259,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TGGGCG;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr13	112723759	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=250,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.366:9:2,1:4,2:3,3,2,1
chr13	112724080	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=218,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:8,2:5,0:6,7,2,0
chr13	112724720	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=232,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,1:3,4:3,2,1,4
chr13	112725791	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=112,180;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.574:19:6,6:2,5:4,4,6,5
chr13	113030674	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=238,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,2:7,3:4,5,4,1
chr13	113032915	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr13	113032962	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=133,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,1:5,3:4,3,3,1
chr13	113047411	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,15;MFRL=171,64;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,1:0|1:113047411_C_T:113047411:5,6,1,1
chr13	113047417	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=165,64;MMQ=60,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0|1:113047411_C_T:113047411:5,5,1,1
chr13	113047419	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=158,64;MMQ=60,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:113047411_C_T:113047411:4,5,1,1
chr13	113055295	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr13	113153114	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=250,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:2,1,2,0
chr13	113158861	.	CATAT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AT;STR;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:4,1,3,0
chr13	113170683	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:4,3:4,1:8,0,5,0
chr13	113181415	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=287,234;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr13	113201852	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=193,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,4:6,1:7,4,4,1
chr13	113209322	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:8,0:6,10:0|1:113209322_G_T:113209322:2,12,0,10
chr13	113209328	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=180,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:8,0:5,9:0|1:113209322_G_T:113209322:2,12,0,10
chr13	113213605	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.382:16:5,0:4,5:9,1,5,1
chr13	113219465	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=218,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,0:7,4:6,4,0,4
chr13	113333684	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=128,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:6,3:1,3:4,4,2,4
chr13	113439586	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:5,1:3,1:4,4,1,2
chr13	113464948	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:10,5,0,2
chr13	113465109	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr13	113473598	.	CAT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=232,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,2:9,1:9,6,3,0
chr13	113479666	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=260,58;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr13	113487108	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=146,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,1,1
chr13	113496566	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=156,260;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:7,3,2,0
chr13	113513682	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=183,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,1:6,5:8,5,3,3
chr13	113525952	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	113527868	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=188,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr13	113536132	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:1,5:6,13:6,1,14,4
chr13	113622965	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	113634091	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=193,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:1,4,0,2
chr13	113639862	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.757:6:1,2:0,3:0|1:113639862_G_A:113639862:0,1,0,5
chr13	113639869	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:113639862_G_A:113639862:0,0,0,9
chr13	113639872	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0|1:113639862_G_A:113639862:0,0,0,9
chr13	113688133	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:3,1,3,0
chr13	113688269	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,3:6,2:7,7,3,2
chr13	113688286	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=240,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=49.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.845:17:1,7:1,8:0,2,6,9
chr13	113699488	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,244;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:3,1:0,3:2,1,3,1
chr13	113700923	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=139,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:13,5:4,0:13,4,5,0
chr13	113729535	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=137,243;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,0:2,3:0|1:113729535_C_T:113729535:0,6,0,3
chr13	113729539	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=137,243;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,0:1,3:0|1:113729535_C_T:113729535:0,6,0,3
chr13	113736946	.	C	CTGGGTATCGAGTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=217,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr13	113739518	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=203,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:1,3,1,4
chr13	113742777	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=134,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,4:3,3:4,4,3,4
chr13	113742805	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,3,5
chr13	113744139	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr13	113745611	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=232,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr13	113749475	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=221,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr13	113765103	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=143,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:6,4,0,2
chr13	113769917	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=160,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:8,1,2,0
chr13	113783711	.	G	GGGAGCCTGGGTGAAGA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.282:19:6,1:8,3:14,0,3,2
chr13	113783990	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr13	113792754	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=152,103;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,6:1,7:3,0,3,10
chr13	113792893	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=159,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr13	113798145	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=199,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr13	113801843	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr13	113813688	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=217,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr13	113818817	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr13	113832653	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=210,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:2,0:7,6:0,10,0,6
chr13	113833499	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr13	113849334	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=189,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:3,1:9,3:6,6,4,0
chr13	113852425	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,14,0
chr13	113854715	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,7,8
chr13	113862801	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr13	113882221	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=108,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.343:4:1,1:1,0:2,1,1,0
chr13	113888201	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,13:0,6:0,0,12,7
chr13	113889474	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,9:0,14:0,0,11,13
chr13	113891075	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr13	113900197	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr13	113907328	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=192,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:2,6:6,0:0|1:113907328_C_T:113907328:8,1,6,0
chr13	113907332	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:4,6:6,0:0|1:113907328_C_T:113907328:9,1,6,0
chr13	113909260	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=190,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:4,0:11,2:9,6,0,2
chr13	113917767	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,14,7
chr13	113965002	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=155,265;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:0,0:4,2:3,2,2,0
chr13	113975814	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=153,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:9,0:5,2:0|1:113975814_G_C:113975814:1,14,3,0
chr13	113975820	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=184,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:10,0:5,3:0|1:113975814_G_C:113975814:1,15,3,0
chr13	113975824	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=184,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:10,0:5,2:0|1:113975814_G_C:113975814:1,15,3,0
chr13	113975826	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=32,12;MFRL=184,257;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,0:0|1:113975814_G_C:113975814:1,15,2,0
chr13	113975828	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=32,12;MFRL=198,257;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,0:0|1:113975814_G_C:113975814:1,15,2,0
chr13	113975836	.	TA	GT	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=28,16;MFRL=196,257;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:11,0:6,0:0|1:113975814_G_C:113975814:2,15,2,0
chr13	113978969	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,0,8
chr13	114113737	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=166,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,1:0,7,1,1
chr13	114149891	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,1:6,2:6,7,3,0
chr13	114150358	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=109,233;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,1:6,1:1,7,0,2
chr13	114152919	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=243,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0|1:114152919_A_G:114152919:0,5,0,3
chr13	114152928	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=243,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0|1:114152919_A_G:114152919:0,5,0,3
chr13	114155982	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=198,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr13	114157846	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=128,108;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:7,0:7,9,1,1
chr13	114164526	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=180,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,2:7,2:9,4,2,2
chr13	114174889	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.566:14:5,6:1,2:4,2,4,4
chr13	114188291	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=141,222;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chr13	114201576	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=106,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,2:7,4:8,5,4,2
chr13	114202592	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=182,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,1:7,1:10,0,2,0
chr13	114203670	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=199,232;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:3,2:5,2:8,1,4,0
chr13	114288971	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=206,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:2,3,0,2
chr13	114291008	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=168,66;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:11,2:0|1:114291008_C_T:114291008:6,11,1,1
chr13	114291029	.	A	ATCC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=162,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:9,2:0|1:114291008_C_T:114291008:5,9,1,1
chr13	114291030	.	G	GCTTCAGC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=162,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:8,1:0|1:114291008_C_T:114291008:5,9,1,1
chr13	114323997	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=246,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,5:2,0:2,1,3,2
chr13	114498034	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=167,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,1:1,1:3,0,3,0
chr13	114502416	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=136,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.673:10:2,5:1,2:2,1,2,5
chr13	114503895	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=125,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:4,3:6,0:0|1:114503895_A_G:114503895:4,7,0,3
chr13	114503897	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=125,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,2:6,0:0|1:114503895_A_G:114503895:4,7,0,3
chr13	114503915	.	CA	TG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.906:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr13	114507836	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:114507836_A_G:114507836:0,0,2,0
chr13	114507840	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,1:0|1:114507836_A_G:114507836:0,0,2,0
chr13	114514704	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,5:4,4:3,2,6,3
chr13	114514771	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=149,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:2,2:7,7:5,4,4,5
chr13	114514907	.	GTT	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=149,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.466:17:1,1:8,7:1,8,1,7
chr13	114514918	.	T	A,TAAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28,26;MFRL=149,173,114;MMQ=60,60,60;MPOS=20,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=13.16,16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,8:0.342,0.446:16:0,1,0:3,4,7:0,3,2,11
chr13	114538616	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=155,95;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.253:16:7,2:4,2:2,10,1,3
chr13	114542676	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=193,21058479;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,1:5,1:4,4,1,1
chr13	114748773	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=193,141;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:8,2:6,0:7,7,3,0
chr13	114765199	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=211,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr13	114773126	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr13	114774813	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=274,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.771:20:3,5:1,10:4,0,12,4
chr13	114778593	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=306,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:1,1:0,3:1,0,3,2
chr13	114780638	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=246,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,1:3,5:3,1,6,0
chr13	114780648	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,5:0,0,8,1
chr13	114784421	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=182,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:8,2:1,0:3,6,0,2
chr13	114784435	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=182,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,6:1,2:0,3,1,7
chr13	114787031	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr13	114787053	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=193,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:114787053_A_C:114787053:0,4,0,1
chr13	114787054	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=193,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:114787053_A_C:114787053:0,4,0,1
chr13	114792842	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=212,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,5:2,7:3,2,5,7
chr13	115002097	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=198,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.563:9:2,4:2,1:2,2,5,0
chr13	115002339	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=157,81;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:8,9,0,2
chr13	115007533	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=115,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.316:13:2,0:7,1:8,1,3,1
chr13	115010254	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=205,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr13	115010330	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=156,245;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,1:2,2:7,1,1,2
chr13	115011550	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.348:12:5,2:1,2:2,6,1,3
chr13	115015966	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34,31;MFRL=169,281,165;MMQ=60,60,60;MPOS=2,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=A;STR;TLOD=7.71,6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.425,0.365:7:1,2,2:0,1,1:1,0,6,0
chr13	115027462	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=117,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,1:4,1:4,7,0,2
chr13	115037945	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,58;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:3,0:1,7,0,2
chr13	115047700	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr13	115064542	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=208,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr13	115091259	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,0:9,4:12,4,0,4
chr14	19378030	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=119,136;MMQ=25,24;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:4,4:8,2:6,6,6,0
chr14	19553764	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=161,134;MMQ=25,25;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.385:42:7,7:19,9:12,14,11,5
chr14	19558962	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=91,77;MMQ=25,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:3,4,1,1
chr14	20007701	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=196,144;MMQ=25,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:0,4,2,1
chr14	20249176	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,187;MMQ=56,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:16,1:8,2:11,13,2,1
chr14	20295510	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=198,223;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:3,0,6,0
chr14	20296384	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,1:10,1:9,15,1,1
chr14	20344373	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=T;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:1,2:0,0:0|1:20344373_CTT_C:20344373:5,1,2,0
chr14	20344394	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=19,10;MFRL=153,274;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:2,0:1,0:0|1:20344373_CTT_C:20344373:6,3,3,0
chr14	20344401	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=14,15;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:2,0:0|1:20344373_CTT_C:20344373:7,4,2,0
chr14	20344405	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=24,16;MFRL=153,274;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:3,0:3,0:0|1:20344373_CTT_C:20344373:7,5,3,0
chr14	20344580	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,274;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,1:4,2:6,5,1,2
chr14	20404736	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=181,141;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:0,2:2,0:2,1,2,0
chr14	20404767	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=192,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr14	20443943	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=202,200;MMQ=40,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,1:3,4:4,5,2,3
chr14	20501962	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:2,1,7,1
chr14	20502044	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=196,171;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,2:4,4:4,6,4,2
chr14	20528321	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:15,8:4,7:6,13,7,8
chr14	20528359	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,10,11
chr14	20528362	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=128,178;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:5,4:1,10:3,3,6,8
chr14	20528448	.	TCATAGATTTGCTCACTGAC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=175,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.403:13:3,3:4,2:2,6,2,3
chr14	20529148	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=156,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,3:4,6:5,4,3,6
chr14	20529232	.	TATA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=213,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ATA;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr14	20586432	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=153,82;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,2:7,0:7,3,2,0
chr14	20665840	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=220,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:4,3,3,2
chr14	20666175	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=178,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.764:15:1,9:2,3:1,2,5,7
chr14	20666556	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:3,1:11,1:5,9,0,2
chr14	20691888	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=203,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:10,1:3,7:9,4,5,3
chr14	20691962	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=101,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:2,5:13,2:9,6,5,2
chr14	20692453	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,288;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:6,4,3,2
chr14	20711190	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,2:4,0:3,6,2,0
chr14	20760066	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=227,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr14	20763446	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr14	20763824	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,27,10;MFRL=167,177,202;MMQ=60,60,60;MPOS=30,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=A;STR;TLOD=6.52,7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,4:0.201,0.312:13:2,2,0:3,0,1:5,1,2,5
chr14	20764031	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=154,301;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,1:6,1:0,7,0,2
chr14	20764094	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=278,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr14	20767618	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=209,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,2:2,5:3,3,3,4
chr14	20767706	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=181,242;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:1,1:0,2:0,1,1,3
chr14	20770036	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,130;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:3,8:2,11:1,4,12,7
chr14	20784718	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr14	20794509	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=189,249;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr14	20813289	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=106,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.230:37:18,5:11,3:11,18,2,6
chr14	20818602	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=196,236;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr14	20820537	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=136,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,3:4,0:3,8,2,1
chr14	20825321	.	T	TTTCAC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:0|1:20825321_T_TTTCAC:20825321:2,8,0,4
chr14	20825323	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:4,3:5,1:0|1:20825321_T_TTTCAC:20825321:2,8,0,4
chr14	20825362	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=192,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr14	20825813	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:7,8,0,2
chr14	20825965	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=195,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:1,2:6,2:2,6,2,2
chr14	20846521	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=55,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,1:1,1:1,4,2,0
chr14	20849169	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:14,4:4,0:8,11,1,3
chr14	20849940	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=232,243;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:4,2:2,4,2,0
chr14	20851962	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=184,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr14	20852747	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,1:11,1:9,12,1,1
chr14	20852931	.	A	AGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=214,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20852931_A_AGC:20852931:0,1,0,1
chr14	20852932	.	C	CACTCGTGACCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=181,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:20852931_A_AGC:20852931:0,1,0,1
chr14	20858944	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=181,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:8,0:3,4:5,6,0,4
chr14	20859013	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:3,2,1,2
chr14	20863811	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=174,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:2,3,1,3
chr14	20864720	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=205,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:5,1,2,0
chr14	20869819	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=203,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr14	20871645	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:1,0:8,3:2,7,1,2
chr14	20871670	.	CAAT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr14	20872740	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=221,225;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:5,1,2,0
chr14	20873030	.	T	TAGTCTTCAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=282,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	20873517	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20873517_A_C:20873517:0,0,1,0
chr14	20873523	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=113,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:20873517_A_C:20873517:1,0,1,0
chr14	20876007	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=181,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:7,2,2,0
chr14	20876621	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=141,266;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr14	20896928	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,0:3,9:10,2,9,0
chr14	20897882	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,2,1
chr14	20916958	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=188,158;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,1,6
chr14	20916987	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=191,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:1,3,3,4
chr14	20917442	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=189,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,3:2,5:0,2,2,6
chr14	20920043	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=226,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,0:1,5:3,0,5,0
chr14	20920340	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=223,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:1,5:4,8:3,2,7,6
chr14	20920360	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=223,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,5:3,5:3,2,3,7
chr14	21024605	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr14	21024619	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,2,2
chr14	21109859	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=161,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:5,2:6,2:4,7,1,3
chr14	21215692	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=268,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,1:0,4:2,0,4,1
chr14	21215728	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=268,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:4,3:0,5:3,1,7,1
chr14	21250676	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=81,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,2:1,8:0,1,0,10
chr14	21359808	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,2:2,7:2,0,8,1
chr14	21458131	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr14	21458320	.	CCCCG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=245,338;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,2:3,1:6,4,1,2
chr14	21460881	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=194,220;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr14	21463430	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr14	21463474	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr14	21468156	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=205,229;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:5,1,5,1
chr14	21486054	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=211,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,0:5,3:5,2,2,1
chr14	21486442	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=209,252;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,1:1,1:1,2,0,2
chr14	21488046	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=181,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,3:2,1:7,1,1,3
chr14	21490125	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,2:0,10:0,0,4,8
chr14	21491151	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=281,65;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:2,1:7,0:3,6,2,0
chr14	21491576	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=155,241;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.682:14:4,0:0,8:0,4,0,10
chr14	21499072	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=199,237;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,3,1
chr14	21499202	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=141,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:14,2:0|1:21499202_C_A:21499202:10,13,1,1
chr14	21499204	.	GT	G	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=141,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:6,0:15,2:0|1:21499202_C_A:21499202:11,14,1,1
chr14	21499213	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=143,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:7,1:14,2:0|1:21499202_C_A:21499202:10,13,2,1
chr14	21499237	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=159,80;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,2:11,0:0|1:21499237_G_A:21499237:11,9,1,1
chr14	21499247	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=159,80;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:4,2:11,0:0|1:21499237_G_A:21499237:9,9,1,1
chr14	21526044	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=152,257;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:5,2:5,1:7,4,3,0
chr14	21526079	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=145,235;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:6,4,5,0
chr14	21544842	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=147,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:1,4,4,2
chr14	21548872	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=213,317;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,2:8,0:7,8,2,0
chr14	21549134	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,317;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:3,8,0,2
chr14	21549893	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=154,223;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0|1:21549893_G_C:21549893:1,3,5,0
chr14	21549910	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=212,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:8,0:1,2:0|1:21549893_G_C:21549893:6,3,2,0
chr14	21555066	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=178,64;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0|1:21555066_GA_G:21555066:5,0,4,0
chr14	21555069	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=178,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:3,2:1,2:0|1:21555066_GA_G:21555066:5,0,4,0
chr14	21555642	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=368,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21555642_G_C:21555642:0,1,0,1
chr14	21555643	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=368,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21555642_G_C:21555642:0,1,0,1
chr14	21556963	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=75,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=44.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.722:19:1,6:4,8:2,3,8,6
chr14	21560752	.	GGAGGCT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=272,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAGGCT;STR;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.503:6:2,2:1,1:3,0,1,2
chr14	21569422	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,5:5,1:8,0,6,0
chr14	21571208	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=165,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,0:5,3:5,0,3,0
chr14	21623010	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	21623053	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	21623290	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=226,137;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,1:3,7:7,1,3,5
chr14	21623303	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=202,75;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,1:6,3:6,4,2,2
chr14	21698526	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.256:36:11,0:15,8:10,17,2,7
chr14	21698650	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	21763042	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=160,158;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr14	21763050	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21763050_C_T:21763050:0,0,0,1
chr14	21763055	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21763050_C_T:21763050:0,0,0,1
chr14	21771766	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=324,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21771766_T_TA:21771766:0,1,0,1
chr14	21771768	.	T	TCCCAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=324,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21771766_T_TA:21771766:0,1,0,1
chr14	21771770	.	C	CACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=324,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21771766_T_TA:21771766:0,1,0,1
chr14	21778717	.	AAAT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=123,306;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAT;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,2:4,1:11,1,1,2
chr14	21785790	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=440,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr14	21786026	.	A	ACTCCTGACCTCAGGT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=139,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:4,5,2,2
chr14	21794063	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,0:13,3:11,11,2,1
chr14	21820896	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=167,188;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:5,4:9,3:6,9,6,1
chr14	21821821	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:5,2:15,5:10,10,4,3
chr14	21828520	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:0,7:1,3:1,0,4,6
chr14	21829404	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr14	21831112	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=224,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:1,0,5,2
chr14	21831692	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr14	21832942	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=81,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:14,2:4,3:14,4,2,3
chr14	21833147	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,6:0,8:0,1,6,8
chr14	21836400	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.899:18:1,6:0,9:1,0,13,4
chr14	21859079	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=151,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:5,1,3,0
chr14	21859536	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr14	21860201	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,283;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	21861211	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr14	21864124	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=213,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr14	21869705	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.597:8:3,3:0,1:0,3,0,5
chr14	21874068	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr14	21883665	.	AAAATAAATAAATAAAT	A,AAAATAAATAAATAAATAAAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29,29;MFRL=190,164,192;MMQ=60,60,40;MPOS=34,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,5,10;RU=AAAT;STR;TLOD=3.20,3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.253,0.368:3:1,0,1:0,1,0:1,0,2,0
chr14	21894302	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=158,34;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,0:6,2:5,5,1,1
chr14	21930398	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=133,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,1:1,0:4,1,2,0
chr14	21930407	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=162,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:4,0:2,1:5,1,3,0
chr14	21930596	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:1,12:0,8:1,0,5,15
chr14	21944955	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=188,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.426:24:10,9:3,1:8,6,1,9
chr14	21950836	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=187,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:2,2,1,6
chr14	21955930	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr14	21960408	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0|1:21960408_A_G:21960408:3,1,2,2
chr14	21960424	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=113,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,6:0.390:16:4,4:6,2:1|0:21960408_A_G:21960408:5,5,5,1
chr14	21960969	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.407:15:2,2:6,3:5,4,3,3
chr14	21967109	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=172,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,1:4,1:0|1:21967109_T_G:21967109:6,5,1,1
chr14	21967133	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=203,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,5:0.299:18:9,3:4,2:1|0:21967109_T_G:21967109:9,4,1,4
chr14	21967469	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=165,76;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:21967469_C_T:21967469:10,9,1,1
chr14	21967494	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=185,76;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:21967469_C_T:21967469:5,8,1,1
chr14	21968876	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,229;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:1,6,3,0
chr14	21971246	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=206,274;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr14	21971729	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=275,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:4,2,6,2
chr14	21979255	.	CA	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=172,175;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,4:4,0:9,1,4,0
chr14	22037876	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=134,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:5,0,5,0
chr14	22037905	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:3,2:4,4:4,3,5,2
chr14	22038210	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,210;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,2:9,1:8,5,1,2
chr14	22133997	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,13:0,4:0,0,9,8
chr14	22539108	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=233,269;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.248:14:1,1:10,2:0|1:22539108_C_T:22539108:5,6,1,2
chr14	22539116	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=215,269;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:2,1:9,2:0|1:22539108_C_T:22539108:3,8,1,2
chr14	22997408	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=178,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,1:9,1:14,3,2,0
chr14	22997524	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=200,179;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:8,6:4,7:6,6,8,5
chr14	22997654	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=182,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:1,2:3,1:0,5,0,3
chr14	23044002	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,5:1,8:1,2,10,3
chr14	23058084	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=276,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.870:21:2,12:0,6:2,0,7,12
chr14	23072194	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=286,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.658:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr14	23072761	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=219,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:3,1:2,4,2,0
chr14	23078810	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=204,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:1,7,0,3
chr14	23079730	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=97,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.693:8:2,1:0,3:2,0,2,4
chr14	23235697	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:1,7:2,5:3,0,9,3
chr14	23239512	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:0,3:2,8:0,2,2,9
chr14	23239880	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0,0,2,6
chr14	23242828	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=44,120;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.815:25:0,10:4,11:0,4,14,7
chr14	23249137	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=145,37;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:4,7,1,1
chr14	23249292	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=225,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr14	23299009	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr14	23302565	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:6,1,2,0
chr14	23302585	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,10,2
chr14	23303293	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=207,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr14	23311042	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:23311042_CT_C:23311042:0,0,4,0
chr14	23311044	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:23311042_CT_C:23311042:0,0,4,0
chr14	23312718	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=279,243;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:2,4,0,3
chr14	23312863	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=217,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:2,7:2,2:4,0,8,2
chr14	23314675	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr14	23315331	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr14	23341666	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=213,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,6:3,2:0,4,0,8
chr14	23344789	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=122,83;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,0:2,6:4,4,0,6
chr14	23346222	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=199,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:7,6,0,2
chr14	23353871	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=193,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.499:24:7,6:5,6:10,2,7,5
chr14	23354368	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,2:7,1:6,3,2,1
chr14	23355200	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:5,6:11,0:12,4,4,2
chr14	23355510	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=212,91;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:23355510_T_C:23355510:0,7,0,2
chr14	23355516	.	AGGCC	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=171,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:3,2:0|1:23355510_T_C:23355510:1,6,0,2
chr14	23355525	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=192,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:23355510_T_C:23355510:1,3,0,1
chr14	23355527	.	C	CAGAGTAATA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=192,91;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:23355510_T_C:23355510:1,3,0,1
chr14	23371055	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=127,199;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,22:0.885:24:2,13:0,9:1,1,13,9
chr14	23371255	.	G	GGGC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GGC;STR;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,8:0,3:0,0,3,8
chr14	23373607	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,19;MFRL=215,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:1,1:0,4,0,3
chr14	23373986	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr14	23375564	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:8,1:2,7:4,6,3,5
chr14	23377702	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=244,188;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:23377702_AG_CA:23377702:0,1,0,1
chr14	23377705	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=244,188;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:23377702_AG_CA:23377702:0,1,0,1
chr14	23377708	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=244,188;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:23377702_AG_CA:23377702:0,1,0,1
chr14	23377712	.	AT	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=244,188;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:23377702_AG_CA:23377702:0,1,0,1
chr14	23389796	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=181,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,2:6,1:9,2,3,0
chr14	23391300	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=272,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr14	23391533	.	C	CACAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAA;STR;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr14	23391913	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,12,7
chr14	23393665	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=192,90;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:12,3:5,0:8,10,3,0
chr14	23394007	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr14	23394069	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,15:0,6:0,0,12,9
chr14	23396680	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=123,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:2,6:5,8:3,4,8,6
chr14	23416463	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=157,0;MMQ=60,31;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,2:11,1:9,10,1,2
chr14	23416476	.	GGC	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=146,0;MMQ=60,31;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:6,1:10,1:0|1:23416476_GGC_G:23416476:8,8,1,2
chr14	23416479	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=146,0;MMQ=60,31;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:5,1:9,1:0|1:23416476_GGC_G:23416476:8,8,1,2
chr14	23416485	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=127,0;MMQ=60,31;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,2:9,1:0|1:23416476_GGC_G:23416476:7,7,1,2
chr14	23416496	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=127,0;MMQ=60,31;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,2:9,1:6,8,1,2
chr14	23419607	.	T	TAG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=122,269;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:9,0:10,4:0|1:23419607_T_TAG:23419607:11,8,0,4
chr14	23419608	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=122,269;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:9,0:10,4:0|1:23419607_T_TAG:23419607:11,8,0,4
chr14	23419613	.	CAAAAT	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=122,269;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:8,0:10,4:0|1:23419607_T_TAG:23419607:9,12,0,4
chr14	23424186	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr14	23444394	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=235,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,1:0,0:0|1:23444394_A_C:23444394:0,2,0,1
chr14	23444395	.	T	TCTGAGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=235,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:23444394_A_C:23444394:0,2,0,1
chr14	23456736	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=180,243;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:6,7,2,0
chr14	23468319	.	T	TCAACTCATATCCAGTGATCGTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.650:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	23511347	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=178,242;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23511347_C_T:23511347:1,0,1,0
chr14	23511357	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=178,242;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23511347_C_T:23511347:1,0,1,0
chr14	23512147	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,2:5,3:4,5,3,2
chr14	23513312	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:7,2:1,0:0,8,0,2
chr14	23517594	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=176,98;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:4,0:9,4:4,9,2,2
chr14	23518791	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=122,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:4,1,4,0
chr14	23523996	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=181,83;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:5,6,2,0
chr14	23524235	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:11,3,2,0
chr14	23528501	.	TTC	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=134,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:12,4:19,0:18,15,1,3
chr14	23531717	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=172,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.091:42:15,3:24,0:11,28,1,2
chr14	23532865	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=196,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,2:5,2:1,9,0,4
chr14	23548783	.	A	AGAACGT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=129,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GAACGT;STR;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.160:28:10,1:14,3:14,10,0,4
chr14	23548787	.	C	CGTGAAT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=133,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.139:33:10,3:19,1:14,15,2,2
chr14	23549285	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,1:8,2:9,6,2,1
chr14	23549319	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=183,193;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:8,5:7,7:10,5,8,4
chr14	23549878	.	TTCC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=178,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TCC;STR;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:4,0:2,2:4,2,2,0
chr14	23550887	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr14	23562832	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,1:2,3:0,7,0,4
chr14	23566911	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=165,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:23566911_C_G:23566911:5,14,1,1
chr14	23566915	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=156,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,0:10,2:0|1:23566911_C_G:23566911:6,18,1,1
chr14	23566918	.	AC	TT	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=150,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,0:11,1:0|1:23566911_C_G:23566911:5,20,1,1
chr14	23567868	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,35,31;MFRL=114,221,134;MMQ=60,60,60;MPOS=24,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.86,5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,5:0.148,0.307:17:6,1,1:1,1,4:5,5,1,6
chr14	23568376	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=180,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,2:9,1:8,8,1,2
chr14	23568766	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=214,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=T;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:0,2:1,1:1,1,3,0
chr14	23569106	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,11,6
chr14	23569451	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=190,177;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:10,1,2,0
chr14	23569463	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=190,177;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:10,1,2,0
chr14	23596320	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,259;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:8,1,2,0
chr14	23596621	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=219,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,3:0,2:0,3,0,5
chr14	23607246	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=213,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,4:3,4:1,3,3,5
chr14	23607271	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=191,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:4,0:1,3:0,5,1,2
chr14	23609916	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	23634451	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=179,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,0:3,4:7,0,3,1
chr14	23712627	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=114,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr14	23727902	.	CTTTT	C,CTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34,21;MFRL=2105746,64,103;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,15,17;RU=T;STR;TLOD=3.62,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.340,0.200:5:1,2,0:1,0,1:2,0,1,2
chr14	23727919	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=17,33;MFRL=103,64;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.352:5:0,1:1,0:2,1,1,1
chr14	23729750	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=143,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr14	23731855	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.217:16:11,1:2,2:4,9,1,2
chr14	23732091	.	AT	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=170,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,1:7,5:7,5,3,4
chr14	23732300	.	G	GTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	23733725	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=197,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr14	23744800	.	ACAT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=257,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CAT;STR;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.759:14:1,6:1,5:2,1,1,10
chr14	23778198	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=89,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.409:37:9,6:13,9:13,9,10,5
chr14	23791115	.	C	CG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=282,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,1:0,0:1,1,1,1
chr14	23794558	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=200,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.420:10:2,0:2,3:0,6,0,4
chr14	23816803	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:4,5,0,2
chr14	23816998	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr14	23817823	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,13;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.449:9:1,0:2,1:2,3,4,0
chr14	23817829	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,15;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.536:9:1,0:3,0:1,3,5,0
chr14	23842040	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=182,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr14	23846443	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=239,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:23846443_T_C:23846443:3,1,1,0
chr14	23846448	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=239,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:23846443_T_C:23846443:3,1,1,0
chr14	23851325	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:1,5,1,5
chr14	23851400	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=261,73;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr14	23854324	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=188,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,1:0,4,0,2
chr14	23855216	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=179,167;MMQ=52,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:9,0:13,8,2,0
chr14	23855357	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=198,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:5,5:3,3:3,6,1,7
chr14	23855426	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=269,167;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr14	23855924	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=281,193;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr14	23856861	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=191,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:5,4,1,2
chr14	23856896	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=184,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,6:0,4:0,1,5,5
chr14	23858271	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=G;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:23858271_A_AG:23858271:0,0,1,0
chr14	23858283	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,199;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:23858271_A_AG:23858271:0,0,1,0
chr14	23858286	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,199;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:23858271_A_AG:23858271:0,0,1,0
chr14	23858289	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,16;MFRL=369,199;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:23858271_A_AG:23858271:1,0,1,0
chr14	23858300	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=369,199;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:23858271_A_AG:23858271:1,0,1,0
chr14	23858697	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=188,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:9,4:3,0:5,7,3,1
chr14	23861811	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=179,212;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,1:6,5:4,6,1,5
chr14	23861823	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=187,212;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,0:5,3:4,5,0,3
chr14	23861873	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=214,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr14	23865569	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=194,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:3,7,0,2
chr14	23865885	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,252;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:10,1:2,1:7,5,2,0
chr14	23866713	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:4,2,1,1
chr14	23872666	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=122,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,8:1,4:0,1,7,5
chr14	23874117	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=146,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr14	23874808	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.477:25:7,11:6,0:11,2,12,0
chr14	23876151	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:23876151_C_A:23876151:0,0,1,0
chr14	23876154	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:23876151_C_A:23876151:0,0,1,0
chr14	23882144	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=16,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.452:5:1,0:0,2:0,3,1,1
chr14	23882165	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,13;MFRL=86,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:1,0:0,0:0,2,0,2
chr14	23882186	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=138,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr14	23884889	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=134,250;MMQ=52,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:5,2,4,0
chr14	23888665	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=164,230;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,2:2,4:5,2,4,2
chr14	23895083	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,249;MMQ=52,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:0,5,2,3
chr14	23898650	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=231,232;MMQ=51,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:23898650_CA_TG:23898650:0,4,0,1
chr14	23898655	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=231,232;MMQ=51,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:23898650_CA_TG:23898650:0,4,0,1
chr14	23899725	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=127,234;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:3,0,4,0
chr14	23899793	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=125,145;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,3:5,3:4,8,5,1
chr14	23938813	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,14,1
chr14	23940081	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=245,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=80.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,19:0.909:20:0,12:1,6:0|1:23940081_A_G:23940081:1,0,15,4
chr14	23940086	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,13:0,9:0|1:23940081_A_G:23940081:0,0,18,5
chr14	23940089	.	AC	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=245,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=85.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,21:0.917:22:0,12:1,9:0|1:23940081_A_G:23940081:1,0,15,6
chr14	23945366	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,11,9
chr14	23947374	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr14	24038861	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:11,0:16,5:14,14,0,5
chr14	24040430	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=100,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:3,7,0,5
chr14	24113370	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:12,2:6,4:7,11,3,3
chr14	24423177	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:0,10,0,5
chr14	24435144	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=175,91;MMQ=57,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:9,5:5,1:7,7,2,4
chr14	24435308	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=203,180;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:1,2,2,1
chr14	24436333	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,1:8,2:11,0,3,0
chr14	24436381	.	GA	G,GAAA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,33,33;MFRL=126,216,41185;MMQ=60,60,59;MPOS=27,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,12;RU=A;STR;TLOD=4.09,3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,3,2:0.134,0.099:27:4,1,0:15,2,2:15,7,5,0
chr14	24473478	.	TAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.494:9:1,3:4,1:5,0,4,0
chr14	24516554	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=217,218;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24516554_A_C:24516554:0,1,0,1
chr14	24516557	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=217,218;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24516554_A_C:24516554:0,1,0,1
chr14	24520218	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=199,200;MMQ=50,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,7:6,2:0,10,1,8
chr14	24522821	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=225,243;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr14	24523594	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,1:3,4:3,4,3,2
chr14	24525634	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr14	24525782	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr14	24526033	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=231,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,0:2,4:1,2,2,2
chr14	24526287	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,7,7
chr14	24529751	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=192,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr14	24531641	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=74,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,4:5,4:8,1,6,2
chr14	24534781	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=216,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr14	24534915	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=185,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,1:1,6,0,2
chr14	24543873	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,9,8
chr14	24545366	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=221,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:1,3:0,10:0,1,3,10
chr14	24545835	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=217,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,5:0,3:1,2,1,7
chr14	24567934	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=247,161;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,0:4,4:0,5,0,4
chr14	24571860	.	CAAA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,264;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.252:6:0,0:4,1:5,0,1,0
chr14	24572495	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,264;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:7,3:1,0:2,6,1,2
chr14	24585023	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,60;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0,9,0,2
chr14	24587515	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,290;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr14	24587545	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=164,240;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:6,0,2,1
chr14	24587795	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,2:3,4:1,7,2,4
chr14	24601824	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=151,244;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr14	24615509	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=188,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:4,2:11,0:3,12,0,2
chr14	24621131	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=173,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:17,0:7,3:12,13,0,3
chr14	24624741	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:8,5:2,6:4,6,5,6
chr14	24641838	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=190,177;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:5,5,2,2
chr14	24646406	.	G	GGAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GAA;STR;TLOD=70.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,4:0,0,7,10
chr14	24647957	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=188,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:3,3,1,3
chr14	24649043	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=153,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,0:6,4:9,5,2,2
chr14	24649835	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=197,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:5,3:4,2:5,6,1,4
chr14	24652107	.	A	AG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=236,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.347:15:7,3:3,2:5,5,3,2
chr14	24653187	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=238,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr14	24677346	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,1:10,2:9,10,0,3
chr14	24686481	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,2:5,1:2,6,0,3
chr14	24706548	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:17,0:11,5:12,16,0,5
chr14	24710498	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,5:0.154:37:17,0:15,5:0|1:24710498_C_T:24710498:18,14,0,5
chr14	24710508	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=147,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.157:36:15,0:15,5:0|1:24710498_C_T:24710498:16,15,0,5
chr14	24710819	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=201,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr14	24718515	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,4,7
chr14	24735685	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=157,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,3:6,1:5,7,2,2
chr14	24737203	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=210,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:4,6:2,1:2,4,2,6
chr14	24760009	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=142,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:7,0:0,2:5,2,1,1
chr14	24760255	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:2,2,2,1
chr14	24760764	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,244;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,3:8,0:9,8,2,1
chr14	24765622	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=196,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,6:5,6:7,1,12,0
chr14	24765684	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:10,4:6,10:9,7,9,5
chr14	24769222	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:2,2:7,1:7,2,2,1
chr14	24769849	.	A	AGAG,AGAGGAG	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,26,28;MFRL=198,152,177;MMQ=60,60,60;MPOS=7,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,9,10;RU=GAG;STR;TLOD=20.49,23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,7,7:0.395,0.386:18:2,2,2:2,5,4:2,2,6,8
chr14	24771101	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=179,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,0:3,2:8,0,2,0
chr14	24771137	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr14	24772279	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:13,7:12,0:15,10,6,1
chr14	24772436	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=127,288;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:9,0:6,4:6,9,0,4
chr14	24772922	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=82.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,17:0,11:0,0,19,10
chr14	24775287	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,3:8,0:7,6,3,0
chr14	24776769	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=218,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,1:7,1:3,11,0,2
chr14	24780989	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=213,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.268:22:8,0:2,0:6,10,6,0
chr14	24786060	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=202,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.452:40:13,8:9,10:11,11,10,8
chr14	24786293	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.957:19:0,9:0,10:0,0,9,10
chr14	24787588	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:14,3:10,3:13,11,2,4
chr14	24791798	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,3:8,0:7,5,2,1
chr14	24792219	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=139,98;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,2:9,1:11,11,2,1
chr14	24793600	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,6:0,18:0,0,10,14
chr14	24793647	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=181,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.706:12:1,2:2,4:1,2,3,6
chr14	24795115	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=244,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:3,6:4,2:4,3,4,5
chr14	24795231	.	CCA	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=223,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:3,3:1,1:2,2,5,0
chr14	24795237	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,3:0,0,7,3
chr14	24795258	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=216,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,6:2,1:5,1,6,1
chr14	24795585	.	GT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=145,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.418:29:9,7:8,5:4,13,6,6
chr14	24798245	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=180,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr14	24799024	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:4,2,2,1
chr14	24799287	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=219,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:7,0:7,9,0,3
chr14	24799491	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=140,146;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:20,0:15,4:0|1:24799491_C_T:24799491:17,20,0,4
chr14	24799495	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=140,146;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:19,0:15,4:0|1:24799491_C_T:24799491:16,19,0,4
chr14	24799578	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=186,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,5:3,1:0,8,0,6
chr14	24801635	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr14	24801956	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:1,5,2,1
chr14	24802263	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr14	24806229	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.296:14:6,0:4,3:3,7,2,2
chr14	24806800	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=235,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.591:8:1,4:2,1:2,1,4,1
chr14	24808168	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:3,3:1,8:4,0,7,4
chr14	24837668	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=233,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.485:12:4,1:2,3:0,6,0,6
chr14	24838621	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:2,4:0,2:2,0,7,0
chr14	24843699	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=136,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.431:9:2,1:3,1:2,3,0,4
chr14	24845154	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=210,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:3,0,4,2
chr14	24846757	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	24846961	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=311,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:1,0,3,5
chr14	24868667	.	C	CCCCCCCCCCCCACAGCTA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,99;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.235:14:5,2:6,1:0,11,3,0
chr14	24882312	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,2:6,1:1,8,0,3
chr14	24882373	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=165,247;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,5,2
chr14	24882440	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr14	24885404	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:5,3,1,1
chr14	24898355	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr14	24900209	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0|1:24900209_C_G:24900209:0,0,0,6
chr14	24900230	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=224,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:0|1:24900209_C_G:24900209:0,5,0,2
chr14	24901249	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=104,151;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,13:0.343:39:21,7:4,6:4,22,7,6
chr14	24901844	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=120.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,15:0,17:0,0,9,23
chr14	24905337	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=136,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,0:8,3:9,6,3,0
chr14	24905533	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=102.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,9:0,21:0,0,27,3
chr14	24905548	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,19,5
chr14	24909281	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0,0,10,1
chr14	24909731	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr14	24910210	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr14	24910846	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,10:0,5:0,0,10,6
chr14	24910876	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,17,7
chr14	24910973	.	TT	GA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=124.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,9,19
chr14	24911852	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,11,5
chr14	24974963	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr14	24975509	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,5,3
chr14	25043068	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=238,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.799:6:0,4:0,1:0,1,0,5
chr14	25044089	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=247,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:0,6,0,3
chr14	25044712	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=199,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.692:8:2,2:0,2:0,2,1,5
chr14	25075937	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=155,79;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,0:7,2:5,8,0,2
chr14	25078914	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr14	25100247	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:17,0:6,5:15,8,3,2
chr14	25100282	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=148,187;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:18,1:7,3:10,15,1,3
chr14	25101629	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=131,278;MMQ=57,40;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:13,2:12,1:13,13,3,0
chr14	25102160	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=219,161;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,23:0.749:30:4,13:3,9:2,5,11,12
chr14	25103409	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=205,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:10,3:5,2:0|1:25103409_T_C:25103409:5,10,3,2
chr14	25103414	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=226,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:9,3:4,2:0|1:25103409_T_C:25103409:5,8,3,2
chr14	25281843	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,3:3,0:4,1,3,0
chr14	26917419	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,274;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:11,0:6,11:6,11,0,11
chr14	26941471	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=172,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:9,1:3,1:11,1,2,0
chr14	29236386	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=175,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.337:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr14	29236842	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	29238428	.	CCTTTT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=206,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:6,3:6,7,1,2
chr14	29239190	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=155,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,2:6,0:0|1:29239190_A_T:29239190:11,9,2,0
chr14	29239193	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=159,117;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,2:6,0:0|1:29239190_A_T:29239190:11,8,2,0
chr14	29261307	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=198,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:2,3:2,5:1,3,4,4
chr14	29261309	.	A	AAAC,AAC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,29,29;MFRL=220,193,140;MMQ=60,60,60;MPOS=23,10;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.23,25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,8:0.202,0.610:12:2,0,3:0,2,4:0,2,5,5
chr14	29261328	.	C	CCTTTGCT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=174,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:7,3,0,2
chr14	30047580	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,2,4
chr14	30066976	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=220,87;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr14	30068194	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=197,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:2,0,7,0
chr14	30098349	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=175,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,3:5,3:5,5,1,5
chr14	30102025	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:3,0,3,2
chr14	31050215	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=160,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,5:6,5:9,3,5,5
chr14	31062645	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=139,87;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,3:6,0:9,2,3,0
chr14	31164033	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:8,3:3,2:5,6,4,1
chr14	31188414	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=204,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr14	31191718	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:7,3:11,0:10,9,3,0
chr14	31204709	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,5:5,3:5,7,6,2
chr14	31344406	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,338;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr14	31347011	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	31350026	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31350026_TA_T:31350026:0,0,0,1
chr14	31350031	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31350026_TA_T:31350026:0,0,0,1
chr14	31350034	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31350026_TA_T:31350026:0,0,0,1
chr14	31350038	.	CA	GC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31350026_TA_T:31350026:0,0,0,1
chr14	31380191	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=136,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,2:1,2:5,1,4,0
chr14	31380215	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=221,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,6:1,3:2,0,6,3
chr14	31404277	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:3,4:0,2:3,0,6,0
chr14	31420047	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,3:6,0:6,4,3,0
chr14	31424790	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=182,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.282:13:3,1:6,1:7,3,2,1
chr14	31425457	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=188,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:5,2:7,4:6,7,2,4
chr14	31483761	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=213,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr14	31535325	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=146,162;MMQ=60,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,10:6,0:9,1,11,0
chr14	31535603	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr14	31538984	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=198,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:1,0,8,0
chr14	31549745	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr14	31574486	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=191,145;MMQ=50,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr14	31582276	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=120,240;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:13,1:6,1:14,6,2,0
chr14	31582380	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,6:0,6:0,0,4,8
chr14	31583160	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,87;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:8,1:1,1:5,4,0,2
chr14	31610964	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:3,2,4,0
chr14	31617880	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:5,1,6,0
chr14	31617991	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.172:21:11,2:7,1:0|1:31617991_A_C:31617991:10,8,0,3
chr14	31617993	.	AA	TC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:11,1:7,0:0|1:31617991_A_C:31617991:10,8,0,3
chr14	31626011	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=14,22;MFRL=244,179;MMQ=39,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.347:10:1,2:0,0:7,0,3,0
chr14	31626120	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=124,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:0|1:31626120_C_T:31626120:5,14,1,1
chr14	31626130	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:19,3:0.165:22:10,3:9,0:1|0:31626120_C_T:31626120:7,12,0,3
chr14	31626131	.	G	GCCCTCTCCTCCACCACTTT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=128,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:7,2:0|1:31626120_C_T:31626120:7,15,1,1
chr14	31787579	.	ATTAT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=221,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTAT;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr14	31793053	.	GAT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr14	31814566	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=17,25;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:31814566_C_A:31814566:0,1,0,1
chr14	31814568	.	A	ATTGTACATCACAGATTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31814566_C_A:31814566:0,1,0,1
chr14	31817159	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=201,239;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,0:5,3:0,12,0,4
chr14	31819966	.	TTTTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,308;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TTTG;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.785:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	31828076	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,9,7
chr14	31841162	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,2,3
chr14	31858025	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr14	31858209	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=218,11931733;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr14	31922408	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,1:5,1:8,3,2,0
chr14	31922515	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=165,198;MMQ=56,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:2,1:10,2:8,4,1,2
chr14	32034147	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,2:3,3:6,3,4,1
chr14	32142544	.	AT	A,ATT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31,31;MFRL=177,250,210;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.64,4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,3,5:0.165,0.240:21:6,2,2:6,1,1:9,4,5,3
chr14	32295772	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr14	32296018	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr14	32319233	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=36.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,11:0.750:14:1,3:2,8:0|1:32319233_G_A:32319233:3,0,11,0
chr14	32319241	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0|1:32319233_G_A:32319233:3,0,4,0
chr14	32319488	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=141,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,1,1
chr14	32563640	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,3,8
chr14	33046388	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,8:2,4:4,2,6,6
chr14	33046471	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=101,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,2:3,7:2,5,1,8
chr14	33165182	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=102,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:3,2:8,2:7,4,3,1
chr14	33204812	.	G	GTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=87,229;MMQ=41,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=T;STR;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.626:6:1,2:1,2:0|1:33204812_G_GTT:33204812:2,0,4,0
chr14	33204825	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=16,32;MFRL=85,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.571:7:0,0:1,2:0|1:33204812_G_GTT:33204812:3,0,4,0
chr14	33242863	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.773:11:0,5:2,4:2,0,9,0
chr14	33408424	.	CGCCA	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,280;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.771:2:0,0:0,2:0|1:33408424_CGCCA_C:33408424:0,0,2,0
chr14	33408432	.	CACGCACACGCACA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,280;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:33408424_CGCCA_C:33408424:0,0,2,0
chr14	33408450	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=214,280;MMQ=60,60;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:33408424_CGCCA_C:33408424:1,0,2,0
chr14	33408455	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=214,280;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:33408424_CGCCA_C:33408424:1,0,2,0
chr14	33408458	.	CACG	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=135,270;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:33408424_CGCCA_C:33408424:2,1,1,0
chr14	34029235	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,11;MFRL=199,172;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:3,0:2,0:8,0,2,0
chr14	34243477	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=374,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr14	34263034	.	TAAAA	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=208,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.505:2:1,0:0,1:0|1:34263034_TAAAA_T:34263034:1,0,1,0
chr14	34263053	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=208,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:34263034_TAAAA_T:34263034:1,0,1,0
chr14	34263057	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,15;MFRL=196,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:34263034_TAAAA_T:34263034:3,0,1,0
chr14	34263060	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,17;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:34263034_TAAAA_T:34263034:3,1,1,0
chr14	34396100	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr14	34985506	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=200,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr14	34985645	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0,4,4,1
chr14	34993987	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=123,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,3:7,0:3,15,0,3
chr14	35037008	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=122,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,4:2,5:1,5,7,2
chr14	35045136	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=326,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.761:6:0,2:1,2:0,1,1,4
chr14	35074765	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=201,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:0,1:1,2:0,1,3,0
chr14	35075022	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,1:6,1:0,7,0,2
chr14	35181984	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:35181984_CA_C:35181984:3,1,1,0
chr14	35181988	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:35181984_CA_C:35181984:3,1,1,0
chr14	35182337	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=178,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:10,0:0|1:35182337_G_A:35182337:10,10,0,2
chr14	35182340	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=34,17;MFRL=189,239;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:8,0:0|1:35182337_G_A:35182337:9,11,0,2
chr14	35182348	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=177,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.432:14:2,1:2,2:4,4,1,5
chr14	35182406	.	GATA	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ATA;STR;TLOD=52.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr14	35183825	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=9,12;MFRL=243,285;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:1,0:0|1:35183825_C_G:35183825:0,3,0,2
chr14	35183829	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=17,23;MFRL=243,285;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:1,1:0|1:35183825_C_G:35183825:0,3,0,2
chr14	35222626	.	A	ATTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=142,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTGT;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr14	35223956	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=200,250;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0|1:35223956_A_G:35223956:4,0,3,0
chr14	35223971	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0|1:35223956_A_G:35223956:0,0,10,1
chr14	35227880	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr14	35230906	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr14	35240664	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=211,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:3,0,7,0
chr14	35242709	.	CAA	C,CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34,35;MFRL=191,193,180;MMQ=60,60,60;MPOS=3,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.92,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,2:0.322,0.298:8:1,2,2:2,1,0:3,0,5,0
chr14	35243006	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr14	35245748	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=176,247;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:1,5,0,2
chr14	35249324	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=178,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr14	35263858	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=63,303;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr14	35295143	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=242,216;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr14	35476673	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr14	35477785	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=394,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,3:0,9:0,1,10,2
chr14	35482694	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=168,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:7,6,1,1
chr14	35482994	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:8,0,2,0
chr14	35488309	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr14	35497254	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=191,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.443:5:1,1:2,0:0|1:35497254_C_A:35497254:2,1,2,0
chr14	35497266	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=207,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.456:7:1,1:3,2:0|1:35497254_C_A:35497254:3,1,3,0
chr14	35497285	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=159,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.273:9:4,0:3,2:1|0:35497254_C_A:35497254:5,2,2,0
chr14	35515606	.	TGG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=210,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=64.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:1,8:0,6:1,0,14,2
chr14	35546498	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	35550279	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,2:5,0:0|1:35550279_T_C:35550279:9,9,0,2
chr14	35550281	.	TC	AA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,2:5,0:0|1:35550279_T_C:35550279:10,9,0,2
chr14	35550285	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,2:6,0:0|1:35550279_T_C:35550279:10,9,0,2
chr14	35550464	.	TAA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=187,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:1,5:3,7:2,2,4,8
chr14	35565856	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=158,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:5,4,1,3
chr14	35565873	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=244,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:2,3,4,1
chr14	35568424	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=142,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:7,3:3,1:4,6,3,1
chr14	35576458	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=134,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:7,3,2,0
chr14	35593477	.	ATTTT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=214,282;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.214:7:1,0:3,1:0,6,0,1
chr14	35595842	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=171,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr14	35596604	.	CATT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=319,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr14	35761573	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr14	35777358	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=205,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr14	35779894	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=109,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr14	35782300	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=240,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:1,2,1,5
chr14	35783706	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=226,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,2:0,6:1,0,0,8
chr14	35871960	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=256,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=62.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,23:0.665:34:7,11:4,11:8,3,15,8
chr14	35872094	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=228,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,5:2,6:2,4,0,11
chr14	35872307	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=342,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:4,3:0,4:2,2,7,1
chr14	36040029	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=218,90;MMQ=60,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:36040029_T_G:36040029:2,4,0,2
chr14	36040036	.	G	GACACATGAAAAAATGC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=224,90;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.335:7:3,2:2,0:0|1:36040029_T_G:36040029:2,3,0,2
chr14	36096255	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=93,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.774:17:1,6:0,3:1,3,8,5
chr14	36121087	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,2:0,9:0,0,2,9
chr14	36218039	.	CAAA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,18;MFRL=208,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.623:6:0,0:1,1:0,2,0,4
chr14	36231816	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr14	36334030	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr14	36334905	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=220,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,2:1,1,3,1
chr14	36768276	.	TG	CA,CG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33,31;MFRL=0,168,164;MMQ=60,60,60;MPOS=10,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.30,60.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,19:0.119,0.841:21:0,1,9:0,1,10:0,0,15,6
chr14	36789775	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0|1:36789775_A_T:36789775:0,0,10,15
chr14	36789795	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0|1:36789775_A_T:36789775:0,0,7,10
chr14	36789838	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=157,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:3,1:3,3:2,5,0,4
chr14	37051427	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=200,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,3:6,0:6,4,2,1
chr14	37051634	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=214,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.348:9:3,2:2,0:1,5,1,2
chr14	37132048	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=202,234;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:4,1,2,0
chr14	37149778	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=130,337;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:2,1:6,1,2,0
chr14	37180679	.	G	GTGCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:5,5,0,2
chr14	37203617	.	T	TTA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=110,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TA;STR;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr14	37203642	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=154,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:5,3:0,6:5,0,8,1
chr14	37344229	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=254,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,5:1,6:0,1,4,7
chr14	37344275	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=254,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr14	37891965	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=212,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:2,3:4,2:7,0,5,0
chr14	38016044	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=248,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:5,1,2,1
chr14	38060833	.	G	GGA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=202,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.267:9:4,0:3,2:0|1:38060833_G_GGA:38060833:2,5,1,1
chr14	38060834	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=202,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:0|1:38060833_G_GGA:38060833:2,5,1,1
chr14	38295646	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr14	38310606	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	38681226	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=219,127;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.623:22:2,4:6,9:4,4,3,11
chr14	38681278	.	CTTGT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=166,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTGT;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,0:5,2:3,7,1,1
chr14	38681764	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=143,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr14	38682319	.	AACACACAC	A,AAC,AACACAC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=15,24,25,20;MFRL=144,207,170,218;MMQ=60,60,60,60;MPOS=31,17,27;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,13,14,16;RU=AC;STR;TLOD=6.56,7.55,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,3,3,2:0.214,0.258,0.248:11:0,3,1,1:0,0,1,0:0,3,0,8
chr14	39502539	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr14	39502626	.	A	AAATAGAAC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0,0,0,11
chr14	39512122	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=183,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,5:0,5:0,1,3,8
chr14	39532492	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=231,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr14	39536319	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,4:1,0:3,3,4,0
chr14	39543814	.	T	TAAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=146,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr14	39560970	.	CAAGACAGTCAACAGGGAACTAATTAAATAACGAATACAAAAGAATCCTAGTAAAGCCATTTCAGAAATGAAACAGGTTATTTCTACTGTCATGGAGAGAGATCT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=183,251;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.272:6:2,0:0,1:0,5,0,1
chr14	39565403	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=247,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr14	39583481	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:2,10:1,6:3,0,11,5
chr14	39591565	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=173,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.825:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr14	39591627	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=19,12;MFRL=93,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.386:23:2,1:2,0:10,3,10,0
chr14	39594134	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=240,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr14	39605542	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr14	39619587	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=183,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,1:0,1,1,1
chr14	39620936	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.932:27:1,16:0,9:0,1,18,8
chr14	39621108	.	TACAACATTA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:1,11,0,2
chr14	39627433	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:1,5:0,4:1,0,9,1
chr14	39645863	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr14	39647188	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=161,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr14	39649829	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=101,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:15,0:15,2:0|1:39649829_G_A:39649829:21,13,1,1
chr14	39649832	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=101,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.082:34:16,0:15,2:0|1:39649829_G_A:39649829:19,13,1,1
chr14	39734700	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,217;MMQ=60,56;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,0:6,6:4,7,0,6
chr14	39748480	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=46.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,8,7
chr14	39773435	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr14	39773639	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr14	39784014	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=6;MBQ=19,32;MFRL=169,130;MMQ=50,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.737:11:1,4:0,3:0,2,1,8
chr14	39784042	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=191,160;MMQ=45,35;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr14	39784043	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=208,174;MMQ=40,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.315:4:3,1:0,0:0|1:39784043_T_C:39784043:0,3,0,1
chr14	39784046	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,29;MFRL=208,174;MMQ=40,30;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:39784043_T_C:39784043:0,3,0,1
chr14	39784048	.	A	AGT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,24;MFRL=208,174;MMQ=40,30;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:39784043_T_C:39784043:0,3,0,1
chr14	39784050	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,27;MFRL=208,174;MMQ=40,30;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:39784043_T_C:39784043:0,3,0,1
chr14	39784965	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,1:0,1,1,4
chr14	39796048	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr14	39815250	.	TTTC	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=101,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTC;STR;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,1:8,1:4,9,0,2
chr14	39815324	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=229,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr14	39818222	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr14	39868962	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,266;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:12,0:13,10,2,0
chr14	39870296	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=144,326;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr14	39871017	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=259,244;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:4,2,0,4
chr14	39871159	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=255,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr14	39871742	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=189,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr14	42355771	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	42357162	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=95,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,1:9,2:6,7,0,3
chr14	44973638	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr14	45414262	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,239;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,0:9,2:7,8,0,2
chr14	45432432	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.189:35:20,6:8,0:16,13,6,0
chr14	45513743	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	45564386	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=195,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.402:13:3,5:4,0:7,1,5,0
chr14	45587199	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,10;MFRL=139,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.639:10:0,0:1,0:2,1,7,0
chr14	45623896	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=155,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.164:28:13,4:11,0:14,10,2,2
chr14	45628283	.	TTA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TA;STR;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,2:7,2:8,2,3,1
chr14	45633522	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=203,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,1,1
chr14	45650813	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:4,4:10,5:11,3,5,4
chr14	45654410	.	TCTTA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=214,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTTA;STR;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,1:4,2:6,6,1,2
chr14	45711316	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=181,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,1:10,2:11,5,3,0
chr14	45712048	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=147,82;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:6,0:2,2:2,6,0,2
chr14	47314873	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:2,1,5,0
chr14	47315127	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:0,7,0,4
chr14	47324442	.	T	TAGAAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=296,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47324442_T_TAGAAGA:47324442:0,1,0,1
chr14	47324446	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,22;MFRL=296,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47324442_T_TAGAAGA:47324442:0,1,0,1
chr14	47324450	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=296,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47324442_T_TAGAAGA:47324442:0,1,0,1
chr14	47346759	.	C	CCGGACAAGCGCCTGTGATCCCAGCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=197,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0,4,0,1
chr14	47389181	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,2:6,0:15,3,1,1
chr14	47530841	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=166,140;MMQ=24,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:18,0:1,3:0|1:47530841_A_C:47530841:0,19,0,3
chr14	47530845	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=204,166;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=66.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,22:0.920:23:1,17:0,4:0|1:47530841_A_C:47530841:0,1,0,22
chr14	47687187	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=222,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,4,1
chr14	47770841	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=197,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,5:3,2:0,3,0,7
chr14	50050396	.	GA	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.185:29:9,2:6,1:8,16,0,5
chr14	50052646	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,143;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.132:36:16,4:16,0:15,17,4,0
chr14	50065705	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,5:2,6:2,6,7,4
chr14	50065717	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=82.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:1,13:0,10:1,0,12,11
chr14	50069282	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	50090224	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=124,166;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.264:16:10,0:2,3:2,10,0,4
chr14	50092471	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=405,152;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.875:22:2,17:0,3:0,2,12,8
chr14	50094913	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=169,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr14	50100683	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr14	50130195	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=295,238;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr14	50175792	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	50192346	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=141,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:9,2:5,1:0|1:50192346_G_A:50192346:11,3,2,1
chr14	50192347	.	T	TAAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=141,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=A;STR;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:9,2:5,1:0|1:50192346_G_A:50192346:11,3,2,1
chr14	50199375	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	50241258	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=64.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,11:0,0,11,7
chr14	50244835	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,1:0,9:0,0,8,2
chr14	50246912	.	ACTT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=156,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,2:9,0:9,4,1,1
chr14	50251369	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,20:0,10:0,0,19,11
chr14	50251888	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,9:0,0,11,7
chr14	50256005	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=135,65;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.072:39:11,0:26,2:12,25,1,1
chr14	50256020	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=115,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.263:35:11,0:15,8:11,15,0,9
chr14	50266091	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=42.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0|1:50266091_GA_G:50266091:0,0,10,0
chr14	50266095	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0|1:50266091_GA_G:50266091:0,0,10,0
chr14	50280815	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=169,106;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,0:11,2:11,9,1,1
chr14	50280823	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=170,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:1,1:7,3:3,6,3,1
chr14	50298153	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.863:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	50298962	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,11,6
chr14	50299051	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.886:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr14	50299081	.	GC	TG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=209,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:50299081_GC_TG:50299081:0,2,0,1
chr14	50299084	.	CCATCA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,25;MFRL=207,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50299081_GC_TG:50299081:0,1,0,1
chr14	50299090	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,30;MFRL=207,180;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50299081_GC_TG:50299081:0,1,0,1
chr14	50300310	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr14	50318564	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=166,313;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,0:13,2:9,13,2,0
chr14	50319327	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,21,1
chr14	50319499	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=86.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,11,16
chr14	50360908	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=205,127;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.172:19:5,0:11,2:6,10,0,3
chr14	50361045	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=149,178;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,5:0.103:56:22,0:28,5:37,14,5,0
chr14	50361171	.	CTT	C,CT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=19,19,19;MFRL=147,148,191;MMQ=60,60,60;MPOS=25,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,20,21;RU=T;STR;TLOD=5.70,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,6,3:0.429,0.297:13:0,0,0:0,2,0:0,4,1,8
chr14	50459609	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,6,10
chr14	50459673	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr14	50472359	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=157,91;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.361:34:13,0:9,12:14,8,12,0
chr14	50579480	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=332,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:0,2,1,4
chr14	50583302	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr14	50585574	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=108,81;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.219:12:5,1:5,1:3,7,0,2
chr14	50600995	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:0,4,1,5
chr14	50605267	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=204,237;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.385:6:2,1:2,1:4,0,1,1
chr14	50611845	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=334,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,5:1,8:1,0,10,3
chr14	50612401	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=288,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr14	50612414	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=288,250;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr14	50616878	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=228,144;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,3:4,6:2,5,3,6
chr14	50619927	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=148,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,1:1,3:3,3,0,4
chr14	50623657	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.557:7:1,0:2,4:0|1:50623657_G_A:50623657:3,0,4,0
chr14	50623679	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=206,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.630:6:0,0:2,4:0|1:50623657_G_A:50623657:2,0,4,0
chr14	50623683	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=206,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.671:7:0,1:2,4:0|1:50623657_G_A:50623657:2,0,5,0
chr14	50626836	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=203,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr14	50641347	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=245,79;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr14	50649088	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr14	50670965	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,6,7
chr14	50671133	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.379:19:6,5:6,2:4,8,1,6
chr14	50713679	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	50713876	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=141,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:4,6,1,1
chr14	50732042	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=99,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,3:4,0:3,2,2,1
chr14	50745123	.	A	ATTACTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=211,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:2,1,5,0
chr14	50750577	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=223,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,4:0,5:0,1,7,2
chr14	50769717	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=236,185;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,4:2,8:0,4,5,7
chr14	50789578	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=242,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr14	50790713	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,1:7,1:10,5,2,0
chr14	50792273	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=282,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:2,0,6,0
chr14	50808802	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=259,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr14	50808965	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=122,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr14	50824933	.	A	ATAGAAGCTGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=131,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr14	50824954	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	50844367	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=224,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.841:17:1,8:1,7:1,1,8,7
chr14	50844856	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=187,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,1:1,10:2,0,7,4
chr14	50856927	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=225,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:1,9:5,5:3,3,8,6
chr14	50863684	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,365;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	50863716	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	50895475	.	TAA	T,TA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29,29;MFRL=157,140,172;MMQ=60,60,60;MPOS=20,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=8.52,7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,4:0.335,0.340:12:1,2,2:1,2,2:0,4,2,6
chr14	50910416	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=173,257;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,1:7,1:8,4,1,1
chr14	50929508	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=63.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,5,15
chr14	50943034	.	TAA	T,TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30,25;MFRL=127,133,146;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=6.24,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,3:0.309,0.260:13:4,2,1:1,2,1:3,3,1,6
chr14	50948965	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,5:5,0:11,0,5,0
chr14	50949196	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr14	50952367	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=144,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:4,2:0,9,0,3
chr14	50971446	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,1:0,7:0,0,7,2
chr14	51054598	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=205,118;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,6:1,4:1,1,6,4
chr14	51058234	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr14	51060452	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=212,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr14	51062268	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=188,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr14	51062357	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=222,104;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:1,7:5,7:3,3,3,11
chr14	51095028	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=129,125;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,3:10,0:8,6,3,0
chr14	51095053	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=122,125;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.156:21:7,2:11,0:8,10,3,0
chr14	51096610	.	G	GTTCTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.890:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr14	51096644	.	G	GAAT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=258,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:1,6:4,6:4,1,8,5
chr14	51107452	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=111,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.697:11:2,5:1,3:2,1,5,3
chr14	51196142	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr14	51206021	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,12,11
chr14	51208236	.	T	TGTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr14	51219365	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:11,0:8,5:10,9,0,5
chr14	51219500	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=184,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,2:0,2:0,1,1,5
chr14	51224374	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,6,12
chr14	51224417	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,269;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:7,1:7,6:5,9,3,4
chr14	51226580	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=197,180;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,8:4,0:6,0,8,0
chr14	51228682	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr14	51228723	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=143,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr14	51239025	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,194;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:7,0:11,5,3,0
chr14	51289872	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=202,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.320:17:9,4:2,1:10,2,5,0
chr14	51289873	.	GGT	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=179,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:9,1:2,1:9,2,2,0
chr14	51289874	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=196,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.583:17:5,9:2,1:7,0,8,2
chr14	51289926	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=252,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,3:2,3:5,1,4,2
chr14	51345706	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,0:6,6:0,11,0,6
chr14	51347107	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,12,3
chr14	51347310	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=149,241;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:5,3:2,0:0,7,0,3
chr14	51348281	.	C	CTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=T;STR;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.612:8:2,3:0,0:2,1,3,2
chr14	51348411	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=98,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,0:9,4:5,8,0,4
chr14	51353493	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr14	51355517	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=228,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:3,1,6,0
chr14	51368495	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=172,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr14	51370784	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=107,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:5,1:5,4,2,1
chr14	51371130	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=123,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr14	51378590	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=172,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,7:6,1:2,6,4,4
chr14	51379807	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=146,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:10,3:3,0:4,9,2,1
chr14	51382183	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=161,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:4,3,0,2
chr14	51390736	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,7:5,2:4,4,3,6
chr14	51446216	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=157,219;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,8:4,5:3,3,7,6
chr14	51475794	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=250,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chr14	51491956	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=140,213;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,3:2,6:4,1,7,2
chr14	51492135	.	C	CCACACAGGTGTTTT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=65.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.949:15:0,7:0,5:0,0,0,15
chr14	51710508	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,5:1,3:4,0,7,1
chr14	51710551	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:5,3:0,4:5,0,5,2
chr14	51710732	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:4,0:3,4:2,5,0,4
chr14	51713960	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=203,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:9,2:6,7:5,10,7,2
chr14	51713995	.	A	ATAT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=206,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAT;STR;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,1:5,3:0,8,0,4
chr14	51716161	.	GT	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=163,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.322:20:7,5:3,1:9,5,4,2
chr14	51716188	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=215,128;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.611:29:5,13:6,4:8,3,10,8
chr14	52175047	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr14	52194407	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:1,2:6,0,3,0
chr14	52468641	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=180,244;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:0,6,0,7
chr14	52471017	.	G	GAAAT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAT;STR;TLOD=56.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:7,7:4,6:2,9,7,8
chr14	52474721	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,5:5,4:1,7,4,5
chr14	52477835	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=200,249;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr14	52480965	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=182,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:7,2,2,1
chr14	52481917	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=201,158;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:6,3:10,4:7,9,5,2
chr14	52485697	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=183,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:9,0,2,0
chr14	52495354	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	52495375	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr14	52496231	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=178,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:2,3,2,2
chr14	52496465	.	C	CAGAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=192,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,0:2,3:1,5,0,3
chr14	52505375	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=103,274;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr14	52505771	.	TT	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr14	52509101	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=196,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:0,2,0,6
chr14	52509131	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=214,227;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr14	52509483	.	TG	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:3,7:0,4:3,0,9,2
chr14	52509501	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=211,121;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:5,2,4,1
chr14	52527082	.	GAAAAAAA	G,GAAAAAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,35,17;MFRL=163,149,230;MMQ=60,60,60;MPOS=14,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,8,14;RU=A;STR;TLOD=8.99,3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,2:0.290,0.135:12:1,2,0:4,1,0:2,5,1,4
chr14	52781195	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr14	52794234	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr14	52906179	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr14	53019944	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,391;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	53138424	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=142,142;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:4,5:24,0:15,13,5,0
chr14	53175117	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,8:0.180:48:22,8:18,0:20,20,8,0
chr14	53177729	.	TGAGTGTTTGGCTTCTAAATATTAAACTCTCGTTA	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.836:10:2,5:0,3:1,1,7,1
chr14	53194419	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=288,149;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr14	53213128	.	AT	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.204:23:12,1:5,3:12,7,3,1
chr14	53223390	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=156,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr14	53235603	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=140,63;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:7,4:21,0:13,16,5,0
chr14	53250294	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,2:6,0:0,8,0,3
chr14	53325090	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,15,8
chr14	53326454	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr14	53345266	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr14	53386172	.	A	ATAAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAT;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr14	53513439	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.428:14:5,3:1,3:6,2,5,1
chr14	53513478	.	AAG	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=328,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=57.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.720:23:6,8:0,9:6,0,8,9
chr14	53522324	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=223,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr14	53525392	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr14	53539471	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr14	53619463	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=276,172;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:0,2,7,0
chr14	53619480	.	T	TGCCGCC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=258,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=GCC;STR;TLOD=42.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,5:2,2:1,2,10,1
chr14	54418986	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr14	54863837	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,2:3,0:1,9,0,2
chr14	54863886	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:54863886_G_A:54863886:0,5,0,2
chr14	54863891	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:54863886_G_A:54863886:0,5,0,2
chr14	54875591	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.683:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr14	54875607	.	AA	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=170,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr14	54944881	.	T	TA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.167:24:7,2:9,2:5,15,1,3
chr14	54947501	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,0:9,3:13,1,3,0
chr14	54976833	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=17,12;MFRL=186,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.320:13:0,0:2,1:0,9,0,4
chr14	55004865	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=143,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:8,5:9,0:6,11,5,0
chr14	55004896	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=131,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,1:11,1:6,17,1,1
chr14	55236970	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,2:3,4:4,5,2,4
chr14	55241645	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:10,1:15,5:9,16,2,4
chr14	55243152	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=197,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,3:6,4:5,4,4,3
chr14	55243209	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=188,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:5,3:5,1:5,6,1,3
chr14	55310492	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=204,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.332:31:18,5:3,5:17,4,4,6
chr14	55429902	.	AGGG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=G;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	55454119	.	C	CAATT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=156,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:0,6,0,4
chr14	55473900	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=174,189;MMQ=52,44;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:3,0,4,0
chr14	55473968	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,17;MFRL=62,136;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.553:9:2,0:2,2:0|1:55473968_G_A:55473968:1,3,3,2
chr14	55473973	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=123,136;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.436:12:3,0:3,3:0|1:55473968_G_A:55473968:2,5,3,2
chr14	55473978	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=124,136;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:3,1:4,3:0|1:55473968_G_A:55473968:1,6,3,2
chr14	55475515	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.596:8:1,2:0,2:0,3,0,5
chr14	55493350	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=185,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,6:2,4:5,0,9,1
chr14	55493408	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:8,8:6,10:10,4,14,4
chr14	55511365	.	T	TTTTC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:4,6:5,3:4,5,5,5
chr14	55513848	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,5:6,1:3,6,2,4
chr14	55529896	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=190,158;MMQ=55,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:9,3:9,4:9,9,1,6
chr14	55530120	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=228,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr14	55604710	.	TCTG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=197,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:3,1,5,0
chr14	55612006	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=141,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.582:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr14	55617578	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=141,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.282:23:5,3:10,3:3,14,1,5
chr14	55617612	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=157,86;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:0,2:8,0:1,7,1,1
chr14	55643752	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=171,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:1,3,3,4
chr14	55643774	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=164,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,5:2,3:1,4,3,5
chr14	55646315	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=130,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:10,6:7,0:12,5,6,0
chr14	55647512	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=195,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:55647512_A_G:55647512:5,9,1,1
chr14	55647516	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=195,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:55647512_A_G:55647512:5,9,1,1
chr14	55647575	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=205,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr14	55648115	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:0,7,0,3
chr14	55649173	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=236,215;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,1:5,5:4,4,1,5
chr14	55655643	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=130,94;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,3:6,0:11,5,3,0
chr14	55655686	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:7,12,2,0
chr14	55655692	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=112,97;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,7:3,7:6,3,5,9
chr14	55817200	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=150,77;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:16,0:18,3:23,11,0,3
chr14	55818162	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:11,1:8,5:9,11,2,4
chr14	55818514	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:8,6:6,4:6,8,5,5
chr14	55819994	.	GT	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=112,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.343:29:11,5:8,5:13,6,5,5
chr14	55847466	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=193,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr14	55848807	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,3:9,0:10,7,3,0
chr14	55848972	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=223,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,1,3
chr14	55878616	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=259,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.583:5:0,1:1,1:0,2,0,3
chr14	55878636	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr14	55881011	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=210,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,3:3,0:8,1,3,0
chr14	55902542	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=80.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,16:0,9:0,0,19,6
chr14	55907025	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=132,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr14	55907172	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr14	56085812	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr14	56096686	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=176,74;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,4:6,1:6,6,4,1
chr14	56100160	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr14	56101164	.	AAACT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=176,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,0:1,3:1,1,3,0
chr14	56101212	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,0:3,5:3,3,5,0
chr14	56104081	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=157,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,1:11,1:6,14,0,2
chr14	56104095	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=139,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.493:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr14	56106031	.	TGAC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=74,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAC;STR;TLOD=32.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:4,4:0,4:1,3,0,8
chr14	56108007	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=199,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr14	56108033	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	56108520	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=228,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:5,4:1,4:1,5,5,3
chr14	56114661	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=194,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr14	56114749	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,2:11,0:13,10,1,1
chr14	56114866	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=198,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,6:2,4:0,5,1,9
chr14	56115496	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:8,3:14,2:12,10,3,2
chr14	56115657	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:1,10,0,2
chr14	56116576	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=136,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.630:11:0,2:4,5:2,2,3,4
chr14	56122689	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=208,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr14	56125366	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=178,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,1,1
chr14	56126456	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,4,9
chr14	56133942	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=67,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,7:2,1:5,1,7,1
chr14	56139313	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=96,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,2:8,5:9,3,4,4
chr14	56142480	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=123,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr14	56144965	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=246,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr14	56146228	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:1,2,4,0
chr14	56645265	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=229,259;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,0:2,6:0,4,0,6
chr14	56755425	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr14	57070501	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=332,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:1,8:1,8:1,1,13,3
chr14	57072338	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=171,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:4,4:6,7:4,6,4,7
chr14	57082648	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:4,8:2,6:2,4,9,5
chr14	57083897	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=105,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:6,4:0,4:5,1,7,1
chr14	57092038	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr14	57099976	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,342;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.795:3:0,0:0,3:0|1:57099976_A_AT:57099976:0,0,0,3
chr14	57099988	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,342;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.795:3:0,0:0,3:0|1:57099976_A_AT:57099976:0,0,0,3
chr14	57101621	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:17,4:8,0:14,11,0,4
chr14	57114285	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=177,300;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:0,5,0,3
chr14	57271127	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=210,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:1,4,1,1
chr14	57676511	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0|1:57676511_T_A:57676511:1,3,1,3
chr14	57676515	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,1:1,3:0|1:57676511_T_A:57676511:1,3,1,3
chr14	57676823	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr14	57713422	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=198,201;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:4,5,1,1
chr14	57735954	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=207,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:4,1,5,0
chr14	57876265	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=46.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,0,16
chr14	57948380	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,3:0,4:0,0,4,5
chr14	57957654	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0|1:57957654_T_C:57957654:0,0,6,0
chr14	57957664	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0|1:57957654_T_C:57957654:0,0,6,1
chr14	57960144	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:57960144_C_G:57960144:6,0,2,0
chr14	57960152	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:57960144_C_G:57960144:6,0,2,0
chr14	58036494	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=235,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,2:2,3:5,2,4,1
chr14	58036726	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=151,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr14	58038544	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr14	58038742	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,0:3,5:1,6,0,5
chr14	58056257	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=154,60;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr14	58060586	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=150,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:1,3:3,6:4,0,9,1
chr14	58060598	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=129,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,4:3,7:4,1,9,2
chr14	58471355	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:2,0,5,1
chr14	58471378	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=130,221;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:2,0:3,2:6,0,2,0
chr14	58471390	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=17,11;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.256:9:0,0:2,0:7,0,2,0
chr14	58471699	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=124,256;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,2,2
chr14	58478873	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=180,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.574:17:4,5:3,5:3,4,6,4
chr14	58600107	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr14	58606173	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	58666882	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=116,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.531:15:5,2:2,6:5,2,6,2
chr14	58669660	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:1,2,1,4
chr14	58674823	.	CAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=63,234;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr14	58690427	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=122,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.309:14:8,2:2,2:7,3,1,3
chr14	58697260	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=179,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:0,4,1,2
chr14	58724817	.	C	CTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr14	58737766	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=79.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,18:0,8:0,0,17,9
chr14	58770389	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr14	58771632	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr14	58820568	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:8,2:9,1:7,11,0,3
chr14	58825825	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=110,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr14	58825878	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=129,74;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,1:13,1:8,10,0,2
chr14	58832006	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=173,52;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,2:12,0:0|1:58832006_A_C:58832006:7,16,1,1
chr14	58832021	.	A	AAGGGGAGGGGAGGGGAGAGGAG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=173,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:58832006_A_C:58832006:4,13,1,1
chr14	58832185	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=22,21;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.699:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	58838668	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=154,112;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:4,8:11,4:8,7,5,7
chr14	58869510	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr14	58874018	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=165,1990;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:5,1,0,2
chr14	58875860	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,93;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,0:6,3:3,5,1,2
chr14	58917225	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr14	58917359	.	G	GTTAACAAA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=181,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:13,6,1,1
chr14	58917454	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,10,7
chr14	58920240	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr14	58923395	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,15:0,0,9,13
chr14	58925147	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=123,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,2:9,1:10,4,1,2
chr14	58932772	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr14	58934371	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr14	58949144	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr14	58954588	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,4:0,4:2,0,7,1
chr14	58965715	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=202,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:4,7,0,2
chr14	59014404	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:59014404_C_A:59014404:0,0,0,1
chr14	59014408	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:59014404_C_A:59014404:0,0,0,1
chr14	59730422	.	AAGG	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,5:6,1:1,11,4,2
chr14	59730453	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,4:3,2:0,7,1,5
chr14	59757927	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:3,0:3,2:6,1,2,0
chr14	59787325	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=161,110;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.215:23:10,3:6,1:7,11,2,3
chr14	59789586	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,9,4
chr14	59790749	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=246,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr14	59790813	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.526:21:5,6:4,5:9,1,10,1
chr14	59791015	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=180,266;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,1:11,2:15,3,1,2
chr14	59792874	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=190,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:0,3,2,2
chr14	59798473	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=217,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:2,5:0,4:2,0,8,1
chr14	59820780	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=137,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.483:8:1,1:1,1:1,3,0,4
chr14	59834048	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=206,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:5,0,2,0
chr14	59930503	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=175,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,6:5,4:8,2,7,3
chr14	59931840	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	59942953	.	T	TCAAC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,4:0,0,0,12
chr14	59946094	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.334:13:5,0:4,4:0|1:59946094_G_C:59946094:2,7,0,4
chr14	59946099	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.869:13:0,5:1,7:0|1:59946094_G_C:59946094:1,0,1,11
chr14	59951446	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr14	59953355	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=245,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:0|1:59953355_A_G:59953355:5,0,5,0
chr14	59953379	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=192,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.869:13:1,5:0,7:0|1:59953355_A_G:59953355:1,0,11,1
chr14	59953393	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=174,201;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:0|1:59953355_A_G:59953355:11,3,2,0
chr14	59961640	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	59961970	.	TTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr14	59965429	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,327;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=43.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr14	59965705	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr14	60069865	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=207,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,1:7,0:0|1:60069865_T_A:60069865:9,3,2,0
chr14	60069869	.	C	CGG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=202,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,1:6,0:0|1:60069865_T_A:60069865:9,3,2,0
chr14	60069872	.	ATC	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=209,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,2:6,0:0|1:60069865_T_A:60069865:8,4,2,0
chr14	60072023	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=137,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,3:3,1:6,2,4,0
chr14	60073935	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=132,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr14	60076783	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:5,2:5,4,2,1
chr14	60575512	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=117,171;MMQ=60,23;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:3,5:1,6:3,1,9,2
chr14	60575869	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=248,141;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:4,1,2,5
chr14	60575897	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=181,635;MMQ=60,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,0:7,4:5,6,4,0
chr14	60577871	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	60581673	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:0,4:4,1:0|1:60581673_CT_C:60581673:2,3,5,0
chr14	60581683	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=177,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,5:0.428:12:4,2:3,3:1|0:60581673_CT_C:60581673:5,2,2,3
chr14	60582690	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:12,1:5,1:11,6,2,0
chr14	60587907	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=152,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.273:19:5,2:9,1:6,8,5,0
chr14	60611585	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=166,287;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr14	60616042	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,229;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:4,2:5,4,1,2
chr14	60616914	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=163,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:1,1:0,1:1,1,1,1
chr14	60712515	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=210,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:5,4:8,1,5,1
chr14	60921673	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=188,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.820:9:0,6:1,2:1,0,4,4
chr14	60928201	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:1,6:3,6:1,3,7,5
chr14	60935281	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=262,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr14	60944959	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=241,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.720:16:2,5:2,6:3,1,4,8
chr14	60945203	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=316,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr14	60978071	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=241,246;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr14	61180869	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,281;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:3,8,0,2
chr14	61190234	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	61278684	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=138,254;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:6,2:6,3:7,6,3,2
chr14	61285352	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=185,389;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:10,1,2,0
chr14	61441885	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,395;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:11,2:10,0:9,12,0,2
chr14	61442504	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=202,133;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:13,4:15,0:16,12,4,0
chr14	61449167	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.675:16:2,5:2,5:3,2,7,4
chr14	61451589	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=222,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:0,4,0,7
chr14	61497147	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=91.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,18:0,10:0,0,16,12
chr14	61497285	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,2,9
chr14	61503726	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=90,241;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:7,0:8,4,1,1
chr14	61789192	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr14	61915895	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,231;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:10,1:11,7,0,2
chr14	61920020	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=142,260;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,0:10,3:8,13,3,0
chr14	61924092	.	GGT	G,TGT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34,20;MFRL=241,175,152;MMQ=60,60,60;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.03,3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,4:0.184,0.226:14:6,2,0:2,0,2:1,7,3,3
chr14	61952124	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,2:2,3:0|1:61952124_G_C:61952124:3,0,6,0
chr14	61952133	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0|1:61952124_G_C:61952124:3,0,5,0
chr14	61952429	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=166,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.768:15:3,4:0,8:1,2,1,11
chr14	61995723	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.398:9:5,0:0,3:5,1,3,0
chr14	61997393	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=244,275;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0,4,1,4
chr14	62193571	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=304,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr14	62194131	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,2:4,1:8,2,2,1
chr14	62204748	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:2,0:3,3:4,1,3,0
chr14	62204766	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,16;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:3,0:3,0:5,3,4,0
chr14	62204769	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,11;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.402:10:2,0:2,0:4,2,4,0
chr14	62205175	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr14	62208005	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr14	62211578	.	CGTGTGTGTGT	C,CGTGT,CGTGTGT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30,30,27;MFRL=0,190,396,280;MMQ=60,60,60,60;MPOS=27,12,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,12,14,15;RU=GT;STR;TLOD=3.00,8.77,4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,1,3,2:0.188,0.460,0.278:6:0,0,1,1:0,1,2,1:0,0,0,6
chr14	62213553	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr14	62213848	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr14	62229113	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=229,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:1,2:0,2:1,0,5,0
chr14	62233806	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:2,4,1,1
chr14	62234159	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.588:8:1,0:1,3:0,3,0,5
chr14	62245718	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=215,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr14	62550877	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,5:5,5:7,3,6,4
chr14	63179333	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:4,1,4,0
chr14	63269317	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,7:2,4:1,3,2,9
chr14	63417281	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,10;MFRL=215,243;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:2,0:0|1:63417281_G_T:63417281:0,2,0,1
chr14	63417285	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=215,243;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:63417281_G_T:63417281:0,2,0,1
chr14	63453773	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,5:2,4:2,2,6,3
chr14	63671725	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=183,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:6,5:9,4:5,11,3,6
chr14	63747634	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=256,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,0:4,4:4,0,4,0
chr14	63779846	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=8121,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:1,7:0,5:0,1,1,11
chr14	63784407	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=52.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,11,5
chr14	63862085	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=68,114;MMQ=53,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,3:1,0:1,1,0,3
chr14	64066340	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=28,36;MFRL=173,95;MMQ=60,28;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,0:7,2:4,7,0,2
chr14	64066352	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=28,28;MFRL=175,189;MMQ=60,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,0:7,3:5,6,0,3
chr14	64066363	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=30,28;MFRL=170,189;MMQ=60,30;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,0:6,3:0|1:64066363_G_A:64066363:5,5,0,3
chr14	64066367	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=192,189;MMQ=60,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:4,0:6,3:0|1:64066363_G_A:64066363:5,8,0,3
chr14	64066373	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=184,189;MMQ=60,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:5,0:7,3:0|1:64066363_G_A:64066363:5,7,0,3
chr14	64066379	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=184,189;MMQ=60,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:5,0:7,3:0|1:64066363_G_A:64066363:5,7,0,3
chr14	64066394	.	AC	GT	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=28,34;MFRL=184,189;MMQ=60,30;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:8,0:7,3:0|1:64066394_AC_GT:64066394:7,9,0,3
chr14	64066398	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=33,18;MFRL=175,189;MMQ=60,30;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,0:8,0:0|1:64066394_AC_GT:64066394:8,9,0,3
chr14	64375985	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=56.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,0,17
chr14	64416814	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=211,239;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr14	64421392	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=130,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.783:7:0,1:1,5:0,1,6,0
chr14	64447776	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=127,226;MMQ=60,60;MPOS=0;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:27,2:7,1:20,15,2,1
chr14	64447812	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=139,91;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:14,3:10,0:14,11,3,0
chr14	64457079	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,5:3,2:2,1,7,0
chr14	64457638	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,3:6,5:6,6,6,2
chr14	64460536	.	AT	A,ATT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29,30;MFRL=132,159,178;MMQ=60,60,60;MPOS=12,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=4.54,10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,5:0.303,0.527:9:0,2,1:1,1,3:1,0,8,0
chr14	64462007	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=190,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,3:5,2:1,6,0,5
chr14	64491161	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=172,65;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0,9,0,2
chr14	64491569	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=129,129;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.335:25:2,8:14,0:16,1,8,0
chr14	64496872	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=209,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr14	64498037	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.643:29:3,15:7,3:4,6,2,17
chr14	64519034	.	CA	TG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:9,7:4,0:5,8,5,2
chr14	64519035	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=276,162;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.807:19:2,13:1,3:0,3,10,6
chr14	64519881	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=132,80;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:10,4:12,0:13,10,3,1
chr14	64520416	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=223,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr14	64523043	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=207,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr14	64532107	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=240,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr14	64532414	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=159,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,2:5,3:0,10,0,5
chr14	64537657	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=380,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:0,1,1,5
chr14	64537687	.	GA	TT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64537687_GA_TT:64537687:0,0,0,1
chr14	64537690	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64537687_GA_TT:64537687:0,0,0,1
chr14	64542872	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=229,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr14	64548132	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,3:3,1:5,2,3,1
chr14	64556271	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=160,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:8,5:4,6:9,3,4,7
chr14	64557567	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,5:3,4:4,3,4,5
chr14	64574341	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,0,3
chr14	64591968	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=71,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr14	64598936	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=111,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:1,0,7,1
chr14	64631943	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=169,234;MMQ=60,24;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,2:8,0:12,0,3,0
chr14	64633851	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=177,250;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr14	64637152	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=165,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:6,2:0|1:64637152_A_T:64637152:5,13,1,1
chr14	64637157	.	A	AAACAGTCCTTTTCTTTCTGG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=166,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:0|1:64637152_A_T:64637152:4,13,1,1
chr14	64655355	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,134;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:11,9:7,0:10,8,9,0
chr14	64669771	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr14	64676098	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:4,1:3,2:5,2,4,0
chr14	64680848	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=194,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr14	64685824	.	T	TTTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	64686207	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=174,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:2,4:0,1:0,2,0,6
chr14	64688175	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,295;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr14	64688459	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=187,178;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:1,0:6,5:0,8,0,5
chr14	64689831	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,0:5,3:10,0,3,0
chr14	64691643	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=140,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:1,4:3,2:0|1:64691643_G_C:64691643:4,0,6,0
chr14	64691644	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=126,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:1,4:0,5:0|1:64691643_G_C:64691643:1,0,9,0
chr14	64691817	.	G	GCTCTGATGAAGAGGAGT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,1:4,0:0|1:64691817_G_GCTCTGATGAAGAGGAGT:64691817:2,5,0,2
chr14	64691820	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:64691817_G_GCTCTGATGAAGAGGAGT:64691817:2,5,0,2
chr14	64694195	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,3:1,5:3,0,7,1
chr14	64699816	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,4:5,3:8,3,5,2
chr14	64723992	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=181,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,1:7,2:8,5,3,0
chr14	64724068	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=202,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,3:8,0:7,11,3,0
chr14	64749741	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=99,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,0,3
chr14	64855041	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=240,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:3,1,3,0
chr14	64867531	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,53;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,0:6,3:3,7,3,0
chr14	64882540	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:64882540_T_C:64882540:0,0,0,1
chr14	64882544	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:64882540_T_C:64882540:0,0,0,1
chr14	64886487	.	GTATTTCAT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATTTCAT;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr14	64905976	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=195,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:2,3,1,2
chr14	64908698	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr14	64920665	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr14	64935872	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:15,0:10,5:13,12,0,5
chr14	64937341	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,15;MFRL=119,177;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:12,0:7,14,2,0
chr14	64938541	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:8,0:6,8:6,8,3,5
chr14	64954381	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=175,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:5,0:4,2:5,6,0,2
chr14	65009223	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=136,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:11,3:18,1:15,15,4,0
chr14	65009534	.	CT	C,CTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34,35;MFRL=192,145,206;MMQ=60,60,60;MPOS=14,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=T;STR;TLOD=3.38,10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,6:0.166,0.364:17:4,3,1:4,0,5:6,2,5,4
chr14	65016876	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=249,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr14	65032226	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=206,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,5:1,1:0,3,2,4
chr14	65032278	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=130,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:5,3,1,6
chr14	65041352	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65041352_A_C:65041352:0,1,0,1
chr14	65041357	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=206,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:65041352_A_C:65041352:0,2,0,1
chr14	65041358	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,36;MFRL=206,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:65041352_A_C:65041352:0,2,0,1
chr14	65199481	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=221,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:5,2,4,1
chr14	65203499	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=202,216;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,5:5,4:3,4,6,3
chr14	65209680	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=186,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:6,0,3,0
chr14	65234100	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:10,1:6,2:7,10,0,3
chr14	65236278	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=261,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,2:5,3:6,0,5,0
chr14	65236453	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=183,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:1,6,1,2
chr14	65236547	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=190,251;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:1,4,0,2
chr14	65239772	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=274,238;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,1,2
chr14	65242125	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,0:2,4:4,3,2,2
chr14	65245863	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=148,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:6,1:2,6:8,0,4,3
chr14	65246006	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr14	65246350	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=229,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr14	65249130	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=184,56;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:11,0:0|1:65249130_C_T:65249130:3,14,1,1
chr14	65249144	.	G	GCTGGTCCTCCATGACGCTGAT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=187,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:0|1:65249130_C_T:65249130:2,14,1,1
chr14	65249283	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=200,245;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:2,5,1,1
chr14	65250939	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=79,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:2,6:5,2:3,4,5,4
chr14	65262425	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=230,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,3:1,5:0,4,0,8
chr14	65267469	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:5,7:2,7:3,4,4,10
chr14	65267901	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr14	65268167	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=172,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr14	65270272	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=197,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,1:8,2:11,0,3,0
chr14	65270391	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=164,191;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:7,1:10,5:8,9,3,3
chr14	65271634	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=145,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,3:7,3:8,3,3,3
chr14	65271650	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=154,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:3,3:1,8:2,2,7,4
chr14	65289751	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:6,10,0,2
chr14	65409134	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=191,267;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr14	65418475	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=167,262;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr14	65419385	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=277,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:65419385_G_C:65419385:0,4,0,1
chr14	65419387	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,16;MFRL=277,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:65419385_G_C:65419385:0,4,0,1
chr14	65419391	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=246,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:65419385_G_C:65419385:0,3,0,1
chr14	65419393	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,10;MFRL=246,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:65419385_G_C:65419385:0,3,0,1
chr14	65478923	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=308,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr14	65482514	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=195,107;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0,4,0,4
chr14	65499450	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=208,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,2:2,1:0,3,1,2
chr14	65499463	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=227,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,1,2
chr14	65543102	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:9,0,2,0
chr14	65550816	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=259,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,4,0
chr14	65568215	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=141,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.525:36:9,10:8,9:14,3,13,6
chr14	66028505	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=214,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:1,2,1,1
chr14	66083744	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=177,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:9,0,2,0
chr14	66200177	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=222,243;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr14	66953308	.	GTCTC	G,GTC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33,28;MFRL=223,148,159;MMQ=60,60,60;MPOS=16,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=TC;STR;TLOD=12.00,3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,2:0.334,0.198:12:3,3,0:3,1,2:5,1,5,1
chr14	66955046	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=218,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:66955046_A_G:66955046:1,1,0,1
chr14	66955048	.	AG	TT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=218,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:66955046_A_G:66955046:1,1,0,1
chr14	66957893	.	T	TATCAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=140,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:66957893_T_TATCAAA:66957893:0,1,0,1
chr14	66957895	.	T	TTTGATACTGAGTTATTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=140,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:66957893_T_TATCAAA:66957893:0,1,0,1
chr14	66964769	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=226,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.457:13:4,3:2,3:5,2,6,0
chr14	66965200	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=269,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.833:16:1,4:1,9:0,2,4,10
chr14	67389705	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:67389705_G_T:67389705:0,0,0,1
chr14	67389711	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:67389705_G_T:67389705:0,2,0,1
chr14	67555878	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,1:0,6:0,0,0,8
chr14	67664875	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:4,3,2,1
chr14	67671225	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=166,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,2:10,0:15,5,2,0
chr14	67770264	.	T	TACCTTCCCTCTTCTTGCG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=208,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:5,6,1,1
chr14	67805387	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:11,0:16,4:14,13,0,4
chr14	67807242	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.695:4:1,2:0,1:1,0,0,3
chr14	67814219	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=0,126;MMQ=49,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.682:4:0,2:0,1:0,1,2,1
chr14	67819567	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr14	67831805	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=280,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:67831805_G_T:67831805:0,1,0,1
chr14	67831807	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=280,215;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:67831805_G_T:67831805:0,1,0,1
chr14	67850152	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,126;MMQ=60,56;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,2:11,0:11,13,2,0
chr14	67878867	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	68022593	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=168,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:15,1:7,2:9,13,1,2
chr14	68028586	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=124,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:0,0:1,2,1,0
chr14	68038697	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,257;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:1,1,2,4
chr14	68039027	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr14	68040046	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:3,0:14,2:7,10,1,1
chr14	68040193	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr14	68041124	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,4:4,2:1,4,0,6
chr14	68042255	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=251,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,5:0,3:0,1,1,8
chr14	68042496	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr14	68043998	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=154,109;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:68043998_C_A:68043998:5,1,2,0
chr14	68044005	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:68043998_C_A:68043998:0,0,7,2
chr14	68045753	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	68045840	.	C	CTTCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr14	68046602	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=151,244;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr14	68053802	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:3,7:1,4:1,3,9,2
chr14	68053977	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,8:0,0,6,11
chr14	68056929	.	A	AAAAATATGTTCTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=220,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr14	68059503	.	CTTTA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,36;MFRL=223,263;MMQ=56,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTA;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr14	68059528	.	AG	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=263,206;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68059528_AG_GA:68059528:0,1,0,1
chr14	68059533	.	CT	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,31;MFRL=263,206;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68059528_AG_GA:68059528:0,1,0,1
chr14	68060375	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr14	68066949	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=203,230;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:1,1,1,2
chr14	68141105	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=177,210;MMQ=59,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.595:10:1,4:2,2:1,3,3,3
chr14	68151984	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=202,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr14	68156842	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr14	68191109	.	GTT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=111,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.726:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr14	68191368	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=188,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr14	68229170	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=159,69;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr14	68236522	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=196,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,1,1
chr14	68238687	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr14	68241648	.	CAAAA	C,CAAAAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30,24;MFRL=0,193,204;MMQ=60,60,60;MPOS=4,0;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,12,17;RU=A;STR;TLOD=6.57,4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.399,0.475:6:0,1,0:0,2,3:0,0,6,0
chr14	68244202	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=173,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,2,0
chr14	68246876	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=185,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:4,2:0,1:4,0,3,0
chr14	68248281	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=112,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,6:1,1:0,2,1,6
chr14	68252979	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=83,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.697:8:2,6:0,0:0,2,0,6
chr14	68257322	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=163,181;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.334:19:7,6:5,0:4,9,6,0
chr14	68265282	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=181,103;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:8,1:9,9,1,1
chr14	68271981	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:7,5:8,4:4,11,2,7
chr14	68273395	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=158,22;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:7,0:7,7,1,1
chr14	68273430	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=191,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,6:1,5:0,3,3,8
chr14	68274020	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=257,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr14	68280848	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr14	68282405	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr14	68290372	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=185,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:2,5,0,4
chr14	68301767	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.690:11:2,1:1,7:2,1,7,1
chr14	68301932	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0,9,1,1
chr14	68944245	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=240,285;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:5,0,5,0
chr14	68944321	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr14	68944343	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=82,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.345:20:9,3:2,2:11,2,7,0
chr14	69257215	.	GAGAGA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=186,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAGA;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:3,2:6,0:2,7,0,2
chr14	69259502	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.502:12:3,4:3,2:4,2,6,0
chr14	69259533	.	T	TG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.384:19:7,4:5,3:11,1,4,3
chr14	69262441	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=308,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:1,9:0,7:1,0,12,4
chr14	69345647	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:6,2,2,1
chr14	69349528	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=165,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:9,1,0,2
chr14	69369214	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,1:10,1:8,14,1,1
chr14	69376658	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,5,9
chr14	69392264	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=129,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,11:5,1:6,3,10,2
chr14	69392445	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=162,251;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:4,2:2,1:0,7,0,3
chr14	69445646	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr14	69445858	.	AGGGCT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGGCT;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr14	69558678	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr14	69585031	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=182,203;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,0:3,8:2,6,0,8
chr14	69695792	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=77,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,4:3,3:5,5,6,1
chr14	69697222	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:7,3:7,6:8,6,4,5
chr14	69704667	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=102,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:2,8,0,2
chr14	69707787	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.308:21:6,3:7,3:3,12,1,5
chr14	69707885	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=208,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr14	69791308	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=151,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr14	69814669	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=182,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,3:6,2:4,8,2,3
chr14	69818891	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr14	69847271	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=130,98;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:13,2:5,0:8,10,2,0
chr14	69861687	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:0,0:0,2,0,3
chr14	69921481	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:5,4:6,0:9,2,0,4
chr14	69969596	.	G	GAGAGAGA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:8,11,0,2
chr14	69988954	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr14	69992873	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr14	69994014	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=119,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,2:13,0:13,9,2,0
chr14	69994473	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr14	70170319	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,4:6,3:0,13,0,7
chr14	70442566	.	T	TTTTCATAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=67,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:1,3,0,1
chr14	70442570	.	A	AAGGTACCAGGTAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=87,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.490:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr14	70478173	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=187,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,1:0|1:70478173_CA_C:70478173:0,3,1,0
chr14	70478176	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=187,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,1:0|1:70478173_CA_C:70478173:0,3,1,0
chr14	70480215	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=382,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,2:1,1:0,2,1,3
chr14	70496867	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=195,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr14	70496936	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=114,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,0:5,1:0,9,2,0
chr14	70496942	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=36,10;MFRL=138,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,0:0|1:70496942_C_A:70496942:2,9,2,0
chr14	70496948	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=151,126;MMQ=60,60;MPOS=-1073741816;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,1:0|1:70496942_C_A:70496942:2,10,2,0
chr14	70530530	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=215,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:3,1:4,3:2,5,2,2
chr14	70530706	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr14	70793004	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr14	70795772	.	T	TAAAC,TAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25,26;MFRL=0,215,230;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.00,16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,4:0.250,0.625:5:0,0,3:0,1,1:0,0,5,0
chr14	70924566	.	CA	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=187,196;MMQ=54,34;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:3,6,2,0
chr14	70989762	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=161,245;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:11,2:8,2:11,8,4,0
chr14	70990398	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=232,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:5,3:11,1:7,10,1,3
chr14	71057900	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr14	71108926	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=164,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,1:4,0:0|1:71108926_C_T:71108926:5,0,2,0
chr14	71108942	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=164,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,2:3,0:0|1:71108926_C_T:71108926:7,0,3,0
chr14	71197529	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=80,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:71197529_G_A:71197529:0,1,0,1
chr14	71197532	.	AC	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=80,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:71197529_G_A:71197529:0,1,0,1
chr14	71197535	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71197529_G_A:71197529:0,0,0,1
chr14	71199452	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:2,9:9,2:6,5,8,3
chr14	71202650	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr14	71206801	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=113,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.162:35:14,5:16,0:17,13,5,0
chr14	71208996	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr14	71209025	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,4:0,1:4,0,5,0
chr14	71215729	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,0:4,3:2,5,1,2
chr14	71216856	.	AAT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=204,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr14	71216863	.	C	CAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr14	71227913	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.864:12:1,5:0,6:0,1,4,7
chr14	71228000	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=196,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,2:0,0:0,1,0,3
chr14	71267345	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,1:7,2:11,1,3,0
chr14	71445070	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,2:7,1:5,8,1,2
chr14	71485692	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr14	71500626	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=213,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.433:11:4,1:2,3:1,5,2,3
chr14	71502856	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,1:9,1:9,4,1,1
chr14	71502946	.	A	AGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=204,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr14	71502974	.	T	TGC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=183,185;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr14	71517327	.	GT	G,GTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,33,32;MFRL=173,213,0;MMQ=60,60,60;MPOS=21,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=10.85,3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,3:0.380,0.268:12:3,2,0:1,3,3:4,0,7,1
chr14	71522364	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr14	71555821	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=215,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr14	72055066	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=218,166;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,0:4,3:8,4,0,3
chr14	72055791	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:13,1:12,1:6,20,1,1
chr14	72201985	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,5:4,2:6,1,3,4
chr14	72204878	.	T	TAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=25,27;RU=A;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.797:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr14	72944943	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=204,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,21:0.847:24:1,8:2,13:1,2,8,13
chr14	72977054	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.593:5:2,2:0,1:0|1:72977054_CAT_C:72977054:0,2,0,3
chr14	72977057	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.648:6:2,2:0,1:0|1:72977054_CAT_C:72977054:0,2,0,4
chr14	72977081	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=113,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:72977054_CAT_C:72977054:0,2,0,4
chr14	72977084	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=113,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0|1:72977054_CAT_C:72977054:0,2,0,5
chr14	73190296	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=117,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:2,0:7,3:7,2,3,0
chr14	73190444	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=136,326;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:0,2:2,0:0,4,0,2
chr14	73198506	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,10,8
chr14	73220153	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=206,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:0,3:2,2:0,3,0,5
chr14	73360819	.	T	TTGTC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGTC;STR;TLOD=75.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,7,10
chr14	73404795	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=108,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,2,3
chr14	73408355	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr14	73408369	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr14	73409613	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr14	73409683	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=198,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:2,2:7,1:8,1,2,1
chr14	73412739	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr14	73413965	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=37,33;MFRL=213,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:1,9:0,4:1,0,5,8
chr14	73441529	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,1:8,2:9,4,2,1
chr14	73441749	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:73441749_G_A:73441749:0,6,0,2
chr14	73441755	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:73441749_G_A:73441749:0,6,0,2
chr14	73465003	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,17;MFRL=169,212;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.444:9:2,0:2,1:0,5,0,4
chr14	73465019	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=214,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,0:4,0:0,5,0,3
chr14	73465027	.	C	CAA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=194,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,0:3,1:0,6,0,2
chr14	73543178	.	T	TGGACTCGAATGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=191,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr14	73576023	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=278,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,2:3,2:6,0,3,1
chr14	73578328	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=181,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:7,3:15,0:11,11,3,0
chr14	73578837	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:2,2:6,2:5,3,1,3
chr14	73653636	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=164,57;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:0|1:73653636_G_T:73653636:7,4,1,1
chr14	73653660	.	GA	TT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=36,20;MFRL=178,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:73653636_G_T:73653636:4,8,1,1
chr14	73653665	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=178,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:0|1:73653636_G_T:73653636:4,8,1,1
chr14	73653666	.	AC	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=178,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:0|1:73653636_G_T:73653636:4,8,1,1
chr14	73664718	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=132,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:3,3:5,1:8,1,4,0
chr14	73719334	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,18;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,0:2,1:4,0,3,0
chr14	73730290	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=179,267;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:2,0,6,0
chr14	73732302	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	73733410	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,286;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:3,9,1,1
chr14	73735456	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=156,49;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:73735456_T_C:73735456:2,7,1,1
chr14	73735459	.	GA	TC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=156,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:0|1:73735456_T_C:73735456:2,8,1,1
chr14	73735464	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=156,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:73735456_T_C:73735456:1,8,1,1
chr14	73735466	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=156,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,0:4,2:0|1:73735456_T_C:73735456:1,8,1,1
chr14	73743367	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=155,243;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:8,7,2,0
chr14	73749074	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.498:20:6,4:4,6:6,4,5,5
chr14	73749156	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=199,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,6:5,2:3,6,4,4
chr14	73945644	.	CTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,274;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr14	73957682	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=226,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr14	73957981	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr14	73959703	.	CTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.279:13:5,0:4,3:7,3,0,3
chr14	73964840	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=154,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:7,6:8,0:10,5,6,0
chr14	74004639	.	CTG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=152,185;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0|1:74004639_CTG_C:74004639:0,1,0,1
chr14	74004653	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=152,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74004639_CTG_C:74004639:0,1,0,1
chr14	74040341	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=169,192;MMQ=56,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:1,0:4,3:0,6,0,3
chr14	74121468	.	AATAC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=ATAC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr14	74154117	.	T	TGA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=228,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.311:4:1,1:2,0:0|1:74154117_T_TGA:74154117:0,3,0,1
chr14	74154118	.	T	TATTGAAGCAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=228,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:74154117_T_TGA:74154117:0,3,0,1
chr14	74154121	.	A	ATTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=228,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:74154117_T_TGA:74154117:0,3,0,1
chr14	74154154	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=171,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr14	74156031	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:3,1,0,2
chr14	74179324	.	GCCT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=187,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CCT;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,2:4,0:11,3,2,0
chr14	74192165	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr14	74192726	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=186,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:9,0:7,3:14,2,2,1
chr14	74193427	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,5,6
chr14	74194063	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr14	74196266	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=228,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:3,0,3,0
chr14	74196981	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr14	74340797	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=122,137;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,3:6,2:6,3,4,1
chr14	74343839	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.187:23:11,0:7,3:11,8,0,4
chr14	74349227	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=135,193;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,4:7,2:8,7,0,6
chr14	74364674	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,251;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.697:1:0,0:0,1:0|1:74364674_CA_C:74364674:0,0,1,0
chr14	74364698	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=187,251;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:74364674_CA_C:74364674:1,0,1,0
chr14	74364701	.	G	GGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,17;MFRL=187,251;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:74364674_CA_C:74364674:1,0,1,0
chr14	74364706	.	GTCTC	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,19;MFRL=155,251;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:74364674_CA_C:74364674:2,0,1,0
chr14	74364984	.	TT	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=207,196;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,0:5,3:1,7,0,3
chr14	74407604	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=141,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr14	74416600	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=199,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,1:3,1:8,1,0,2
chr14	74428286	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=232,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:2,4,1,4
chr14	74433552	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,62;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,1:1,1:7,0,2,0
chr14	74439647	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=119,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,0:5,2:7,5,0,2
chr14	74441537	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=202,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,3:4,0:4,1,3,0
chr14	74444083	.	G	T,C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,11,18;MFRL=154,0,203;MMQ=60,60,60;MPOS=24,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.51,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.336,0.329:3:1,0,0:0,0,0:0,1,0,2
chr14	74444089	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,16;MFRL=179,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:74444089_G_T:74444089:0,2,0,1
chr14	74444090	.	GAA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=179,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,1:0,0:0|1:74444089_G_T:74444089:0,3,0,1
chr14	74444104	.	A	ATCCTGGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=156,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr14	74454819	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.498:14:3,1:4,6:0,7,1,6
chr14	74516631	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=129,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:8,8,0,2
chr14	74665543	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=100,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,5:0,5:2,0,8,2
chr14	74712063	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:74712063_A_C:74712063:0,4,0,1
chr14	74712067	.	C	CTGCTTAGCTCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:74712063_A_C:74712063:0,3,0,1
chr14	74726515	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr14	74727376	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=125,87;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:8,3:11,0:10,9,2,1
chr14	74753278	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.887:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr14	74755416	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=207,77;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,0:4,4:5,3,0,4
chr14	74757155	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=180,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:9,0:3,4:3,9,0,4
chr14	74759669	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	74825401	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=180,218;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:6,4,0,4
chr14	74874540	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=74,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:3,1,2,0
chr14	74874707	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=161,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:3,2,1,4
chr14	74876052	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=146,52;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:10,1:11,2:8,13,2,1
chr14	74876478	.	CT	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=112,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr14	74960401	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=210,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr14	74973556	.	A	ATG	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=78,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=TG;STR;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.440:10:1,1:4,1:0,6,0,4
chr14	74973583	.	C	CGCGCGCAT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.466:10:1,3:4,2:0,5,0,5
chr14	74976986	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr14	74983491	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=233,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.638:9:0,5:3,1:0|1:74983491_GT_G:74983491:3,0,6,0
chr14	74983495	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=233,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:0,5:3,1:0|1:74983491_GT_G:74983491:3,0,6,0
chr14	74983573	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=135,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:6,5:3,3:3,6,6,3
chr14	74988601	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=186,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,6:2,4:5,1,8,2
chr14	74989433	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr14	74991855	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=237,145;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,11:0,3:1,0,9,5
chr14	74991959	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:0,4,1,4
chr14	74992861	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=136,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:6,1:12,3:4,14,2,2
chr14	75002775	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=213,160;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr14	75016482	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr14	75019157	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr14	75022192	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=203,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:2,2:11,0:5,8,2,0
chr14	75137664	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=248,240;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr14	75139938	.	AAG	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0|1:75139938_AAG_A:75139938:1,2,0,1
chr14	75139947	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:75139938_AAG_A:75139938:1,2,0,1
chr14	75139950	.	TA	AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:75139938_AAG_A:75139938:1,2,0,1
chr14	75180079	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=194,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:8,2:8,0:13,6,2,0
chr14	75181481	.	CAAA	C,CA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31,29;MFRL=167,92,120;MMQ=60,60,60;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.16,6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,5:0.144,0.300:17:4,0,2:4,2,3:8,2,6,1
chr14	75200697	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=180,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:6,4:0,0:5,1,3,1
chr14	75230953	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=194,108;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:6,2:9,6:10,5,4,4
chr14	75276079	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=181,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:1,2:5,0,4,0
chr14	75276733	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,1:8,0:6,6,0,2
chr14	75278302	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.330:15:6,2:4,1:10,0,5,0
chr14	75282873	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=241,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr14	75287730	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=118,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:10,2:4,2:14,3,4,1
chr14	75290985	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:16,2:8,0:16,8,2,0
chr14	75355767	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=120,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,5:3,3:2,3,5,3
chr14	75356103	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=150,130;MMQ=45,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:3,2:0,2:0,3,0,5
chr14	75359441	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=139,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:5,5:2,1:7,0,5,1
chr14	75361113	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=141,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:11,3:10,0:12,9,2,1
chr14	75361177	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:1,2,1,3
chr14	75365062	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=121,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=51.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.532:30:6,8:8,8:7,7,7,9
chr14	75367740	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:1,1:3,2:4,0,4,0
chr14	75373626	.	C	CTGAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=182,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAT;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,1:5,1,2,1
chr14	75376232	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:3,4,2,1
chr14	75386530	.	T	TGG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=12,27;MFRL=130,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=G;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.807:5:0,2:0,2:0,1,4,0
chr14	75387940	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:75387940_T_A:75387940:0,0,5,0
chr14	75387946	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0|1:75387940_T_A:75387940:0,0,5,0
chr14	75387950	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=24,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0|1:75387940_T_A:75387940:0,1,5,0
chr14	75387955	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=145,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,2:1,2:0|1:75387940_T_A:75387940:0,2,5,0
chr14	75387960	.	TG	CC	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=74,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,2:1,1:0|1:75387940_T_A:75387940:1,3,3,0
chr14	75387965	.	AG	CC	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=27,21;MFRL=74,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,0:0|1:75387940_T_A:75387940:1,3,2,0
chr14	75415151	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,6:7,4:10,1,8,2
chr14	75415194	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=82.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,13:0,0,12,14
chr14	75416000	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=141,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:3,0,6,1
chr14	75470446	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr14	75483812	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=201,112;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:6,4:4,2:4,7,3,3
chr14	75485489	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr14	75489446	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr14	75489632	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=136,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:4,8:3,5:6,1,8,5
chr14	75505008	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=290,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:0|1:75505008_G_C:75505008:1,2,4,3
chr14	75505016	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:75505008_G_C:75505008:0,0,4,6
chr14	75505018	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=36,20;MFRL=251,71;MMQ=60,55;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.335:10:1,3:5,0:0|1:75505008_G_C:75505008:2,5,2,1
chr14	75506549	.	CATATATATATATAT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=18,11;RU=AT;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.516:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr14	75520065	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=179,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:4,4:4,3:9,0,7,0
chr14	75528571	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=248,190;MMQ=40,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:75528571_A_G:75528571:0,2,0,1
chr14	75528575	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=248,190;MMQ=40,24;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:75528571_A_G:75528571:0,2,0,1
chr14	75544101	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=210,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr14	75544189	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=229,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:6,7:3,4:8,1,9,2
chr14	75551254	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chr14	75551442	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr14	75553655	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr14	75562153	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=154,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:8,0:3,2:0|1:75562153_T_A:75562153:3,9,1,1
chr14	75562155	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=154,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:8,0:1,2:0|1:75562153_T_A:75562153:3,9,1,1
chr14	75562157	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=27,19;MFRL=140,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,0:2,1:0|1:75562153_T_A:75562153:2,8,1,1
chr14	75562160	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=151,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:75562153_T_A:75562153:1,8,1,1
chr14	75562163	.	C	CATGGAATGGGAACGAA	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=151,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:75562153_T_A:75562153:1,8,1,1
chr14	75562168	.	T	TTGTGC	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=174,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.292:8:5,2:1,0:0|1:75562168_T_TTGTGC:75562168:0,6,1,1
chr14	75562169	.	A	AACCATCACCACCATCCGTGCCT	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=24,25;MFRL=174,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.292:8:5,1:1,0:0|1:75562168_T_TTGTGC:75562168:0,6,1,1
chr14	75572559	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr14	75574087	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:3,1:4,3:5,2,2,2
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chr14	75587351	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,4:0,0,0,15
chr14	75590822	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=177,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,2:8,1:6,6,2,1
chr14	75601737	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:1,6,0,4
chr14	75601782	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=317,212;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr14	75614504	.	A	ACCCG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=177,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCCG;STR;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr14	75745626	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,2:6,8:9,0,9,1
chr14	75747326	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=160,62;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.095:50:24,4:22,0:19,27,4,0
chr14	75747407	.	AG	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=188,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=49.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.695:27:2,8:6,10:3,5,6,13
chr14	76101386	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=214,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:2,6,0,4
chr14	76118027	.	TTC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=176,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TC;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,1:8,1:8,6,1,1
chr14	76121282	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=166,249;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:14,3:13,3:12,15,4,2
chr14	76135869	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:1,1:4,2:2,4,1,2
chr14	76198818	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,0:2,5:0,3,0,5
chr14	76201482	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=122,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:3,0,6,0
chr14	76201660	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=167,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr14	76232398	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,14,7
chr14	76238073	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=155,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,4:7,0:9,5,4,0
chr14	76238254	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,17;MFRL=182,239;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:1,1:0,0:0,1,0,4
chr14	76245906	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=115,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,2:8,0:7,11,1,1
chr14	76259412	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,98;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.260:25:7,0:11,6:10,9,0,6
chr14	76349013	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=191,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,2:3,1:9,0,3,0
chr14	76432136	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=220,234;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr14	76524970	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:1,1,2,3
chr14	76525553	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=221,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,4,1
chr14	76542856	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=199,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:2,2:3,1:6,0,3,0
chr14	76549752	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:3,3:9,1:8,4,3,1
chr14	76662370	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=209,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,2:3,1:0,9,0,3
chr14	76662376	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=238,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:6,3:1,1:0,7,0,4
chr14	76906143	.	C	CAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=211,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:76906143_C_CAT:76906143:0,3,0,1
chr14	76906144	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=211,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:76906143_C_CAT:76906143:0,3,0,1
chr14	76906157	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=354,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr14	76948862	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=180,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,1,1
chr14	77229539	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:4,0:1,5:0,5,0,5
chr14	77244496	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=303,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr14	77257623	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=173,235;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.195:39:12,7:20,0:24,8,7,0
chr14	77273266	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=198,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr14	77276025	.	A	AATATACAACACAAATAAAACTGAGG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,2:11,0:5,17,0,2
chr14	77279064	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	77302449	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:7,2:1,3:9,0,5,0
chr14	77311296	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	77319796	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=72,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:3,6,1,1
chr14	77319806	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=0,72;MMQ=54,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.440:7:1,2:3,1:1,3,1,2
chr14	77327254	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	77333834	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=185,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:1,5,0,4
chr14	77333852	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=253,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr14	77336428	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=187,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,4:2,6:3,2,6,4
chr14	77493647	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=238,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:3,3:1,2:3,2,4,1
chr14	77493788	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=208,143;MMQ=60,40;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.405:8:2,1:3,1:0|1:77493788_C_T:77493788:0,5,0,3
chr14	77493791	.	CTGT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=208,143;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.405:8:2,2:3,1:0|1:77493788_C_T:77493788:0,5,0,3
chr14	77600344	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=165,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:1,3:6,3:1,6,3,3
chr14	77685383	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr14	77686303	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr14	77704974	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr14	77706108	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=240,5378;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr14	77708640	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=80,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:3,0:0,0:0|1:77708640_A_C:77708640:0,3,2,0
chr14	77708648	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=108,231;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:77708640_A_C:77708640:1,4,2,0
chr14	77709262	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=164,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,2:8,1:10,5,2,1
chr14	77709450	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=165,235;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr14	77709477	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=152,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr14	77746112	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=192,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr14	77750057	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=153,246;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,0:1,5:1,0,5,0
chr14	77750178	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=189,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:7,0:11,5,0,3
chr14	77751729	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr14	77755221	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr14	77767382	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:3,3,2,1
chr14	77772642	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=142,75;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:7,6:10,0:12,5,5,1
chr14	77794192	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=208,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,5:2,3:3,0,8,0
chr14	77795638	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=195,294;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr14	77809939	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=179,285;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:6,1,1,5
chr14	77844869	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=208,156;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.730:24:4,11:2,6:3,3,14,4
chr14	77846689	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,164;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:4,4:8,0:11,1,4,0
chr14	77846876	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=183,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:4,0:7,2:1,10,0,2
chr14	77857672	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=189,154;MMQ=40,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr14	77872509	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr14	77880493	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=98,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,1:6,1:2,5,0,2
chr14	77880524	.	CTTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,338;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.717:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr14	77889040	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=229,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:3,0,4,0
chr14	77889119	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=168,172;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:9,0:11,2:12,8,0,3
chr14	77907538	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,136;MMQ=60,31;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,0:7,5:0,11,0,5
chr14	77914752	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=105,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:6,0,3,0
chr14	77919587	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr14	77919659	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=150,142;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:11,0:16,3:17,10,0,3
chr14	77928476	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=117,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:0,1:4,2:4,1,2,1
chr14	77932017	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,3:5,1:1,6,2,2
chr14	77932111	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=100,277;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,5:0,0:0,2,0,5
chr14	77934758	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=128,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,0,3
chr14	77934905	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=67,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.342:12:8,2:0,0:1,7,0,4
chr14	77935659	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=228,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr14	77978621	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=181,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,1:11,1:10,5,1,1
chr14	77984573	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	77987958	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr14	78018614	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr14	78023519	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr14	78036935	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=168,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr14	78184661	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=250,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,1:3,1:3,3,1,1
chr14	78187164	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=126,87;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:9,0:2,6:7,4,0,6
chr14	78189697	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=205,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:0,5,0,5
chr14	78197283	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=216,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,3:4,2:7,0,4,1
chr14	78197413	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=174,148;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:9,0:13,3:13,11,0,3
chr14	78205299	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.373:22:5,5:9,3:13,1,4,4
chr14	78217743	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=132,247;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:6,4,1,1
chr14	78221501	.	ACT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=208,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0|1:78221501_ACT_A:78221501:0,8,0,2
chr14	78221504	.	C	CAAGA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=208,232;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:4,1:0|1:78221501_ACT_A:78221501:0,8,0,2
chr14	78234796	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,0:5,2:2,5,2,0
chr14	78285461	.	GT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=178,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.442:20:8,6:3,3:5,6,4,5
chr14	78325698	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr14	78353368	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=189,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr14	78365612	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=113,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:11,2:4,3:1,14,0,5
chr14	78374292	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=154,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:3,3:8,1:6,5,3,1
chr14	78374327	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=145,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,0:4,3:0,8,1,2
chr14	79181046	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr14	79276720	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=204,248;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.753:6:1,0:0,3:0|1:79276720_T_TA:79276720:0,1,1,4
chr14	79276733	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0|1:79276720_T_TA:79276720:0,0,1,6
chr14	79434678	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:13,1:5,3:6,13,1,3
chr14	80328321	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=182,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:8,1:3,8,0,2
chr14	80669639	.	TAAA	T,TA,TAA,TAAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,20,30,10,20;MFRL=120,82,120,161,133;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=16,15,25,24;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.15,9.84,3.08,3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:4,2,5,3,3:0.139,0.281,0.169,0.181:17:2,0,1,0,0:1,1,3,1,1:0,4,0,13
chr14	81025522	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=118,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:2,5:4,3:4,2,7,2
chr14	81025687	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,3:3,0:2,9,0,3
chr14	81046810	.	A	AACGAGTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=214,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACGAGTT;STR;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.436:7:0,0:4,2:0,4,1,2
chr14	81209493	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=145,73;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:4,3:7,0:5,6,1,2
chr14	81362140	.	A	AAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=196,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.676:4:0,1:1,2:0|1:81362140_A_AAC:81362140:1,0,0,3
chr14	81362142	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=196,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.676:4:0,1:1,2:0|1:81362140_A_AAC:81362140:1,0,0,3
chr14	81371088	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr14	81422257	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=225,273;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr14	81528412	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=147,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,1,1
chr14	81558806	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=202,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr14	81558965	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=173,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:1,8,0,2
chr14	81562998	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:5,1:4,4:4,5,3,2
chr14	81574664	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=186,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr14	81574687	.	T	TTCTC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=129,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TC;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr14	81574845	.	T	TTTTTTTCTTTTTAC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,1:1,5:1,4,4,5
chr14	81663835	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=149,162;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=58.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,15:0.552:27:10,0:2,13:0|1:81663835_A_G:81663835:2,10,0,15
chr14	81663843	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=156,162;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=59.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,15:0.593:25:7,0:2,15:0|1:81663835_A_G:81663835:2,8,0,15
chr14	81667852	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	81686922	.	CA	C,CAA,CAAAA	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=33,33,27,27;MFRL=158,257,67,102;MMQ=60,60,60,50;MPOS=19,19,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,12,14,16;RU=A;STR;TLOD=4.49,6.53,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,3,6,2:0.160,0.263,0.080:22:6,2,1,1:4,1,3,1:1,10,2,9
chr14	81686938	.	A	AT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=50.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:5,7:3,8:0,8,2,13
chr14	81686978	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=163,274;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:6,1:4,1:0,10,0,2
chr14	81737290	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	81743234	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:13,1:3,1:10,6,0,2
chr14	86087801	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=209,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:6,2,2,0
chr14	86090074	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,1:3,4:0,6,3,2
chr14	86093156	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=192,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.465:28:6,12:8,0:6,9,13,0
chr14	88406404	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,0:0,7:0,0,0,7
chr14	88407716	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=141,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:88407716_T_TA:88407716:2,0,2,0
chr14	88407734	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.915:10:0,4:0,3:0|1:88407716_T_TA:88407716:0,0,10,0
chr14	88407875	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,10,10
chr14	88407888	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=159,103;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,8:5,3:6,4,6,5
chr14	88407917	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=103,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.479:17:6,4:2,4:3,6,1,7
chr14	88411803	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr14	88411837	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=152,230;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:7,1,2,0
chr14	88414283	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr14	88417095	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=99,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=31.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.891:16:1,6:0,8:1,1,3,11
chr14	88417161	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=160,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,5:0,1:0,1,0,6
chr14	88429916	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=202,150;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr14	88434893	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:0,8,0,5
chr14	88442646	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr14	88442712	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=185,86;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:7,1:6,6,1,1
chr14	88442730	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=185,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.257:25:10,6:9,0:9,10,6,0
chr14	88448451	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr14	88448486	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=123,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:0,5:5,5:3,2,4,6
chr14	88448643	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=136,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:5,4,2,0
chr14	88448695	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:0,7,0,5
chr14	88450928	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=225,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:6,2:0,5:0,6,1,7
chr14	88452981	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,3:4,3:0,9,0,6
chr14	88454910	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr14	88478501	.	AGG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=232,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,3:2,0:0,7,0,3
chr14	88652205	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:7,2:6,3:2,12,4,1
chr14	88658764	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=199,229;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:6,1:8,4:3,11,1,4
chr14	88729931	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,283;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,1,1
chr14	88737193	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=127,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.866:20:2,14:0,4:1,1,5,13
chr14	88852031	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	88852279	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr14	88862529	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=116,165;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:9,2:6,4:8,7,3,3
chr14	88883005	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=184,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.466:15:4,2:4,5:7,1,4,3
chr14	88895669	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr14	88934651	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=272,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr14	88935925	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:4,6:2,4:4,2,5,6
chr14	88936254	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=101,239;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,3:6,4:6,2,3,4
chr14	88970925	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=176,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:1,4,0,3
chr14	88971758	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,4:4,1:4,4,2,3
chr14	88974417	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:1,3,0,4
chr14	88983670	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=233,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:3,1:0,4:0|1:88983670_G_A:88983670:0,3,0,5
chr14	88983673	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=183,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,3:0.444:7:0,3:4,0:1|0:88983670_G_A:88983670:0,4,0,3
chr14	89037482	.	C	CAT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=95,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.611:24:5,8:4,7:1,8,5,10
chr14	89042180	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=129,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,3:4,1,2,3
chr14	89063167	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=126,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,6:4,1:3,3,3,4
chr14	89075592	.	CTTTT	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=104,260;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,5;RU=T;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,2:7,0:19,5,1,1
chr14	89075598	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=120,67;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:15,3:8,0:18,5,2,1
chr14	89077103	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr14	89077291	.	ATTCAAATTCGTTTTTCTCATGTCAG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=185,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:2,0:3,3:1,8,2,1
chr14	89082396	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,5:2,3:2,0,7,1
chr14	89085181	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=183,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr14	89089149	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.913:8:0,5:0,2:0,0,0,8
chr14	89089162	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=189,222;MMQ=60,36;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:6,0:3,3:0|1:89089162_A_G:89089162:0,9,0,3
chr14	89089163	.	A	ATGT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=189,222;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:6,0:3,3:0|1:89089162_A_G:89089162:0,9,0,3
chr14	89094243	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=123,328;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr14	89116281	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=158,101;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:9,5:9,0:9,9,5,0
chr14	89151343	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr14	89154894	.	CTGT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=175,275;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TGT;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr14	89258877	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=171,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr14	89307320	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=180,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.686:17:2,6:3,6:2,3,7,5
chr14	89310261	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,2:3,1:2,8,0,3
chr14	89319310	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=222,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:11,3:6,2:9,8,3,2
chr14	89747473	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=310,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr14	89878865	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,241;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr14	90263525	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr14	90416321	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,888;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr14	90456188	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,2:5,4:0,7,1,5
chr14	90458397	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:3,1:0,6,0,2
chr14	90499389	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=109,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.323:11:5,2:2,1:5,3,3,0
chr14	90722824	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr14	90723000	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,9:0,0,9,12
chr14	90723059	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr14	90729565	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr14	90729931	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr14	90729984	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,9,6
chr14	90730265	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,14:0,5:0,0,6,13
chr14	90730560	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,2:4,1:1,6,0,3
chr14	90736477	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=140,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:8,2,2,0
chr14	90752908	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr14	90754538	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=254,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,5:1,4:1,1,6,3
chr14	90756550	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,1:4,1:4,8,2,0
chr14	90767746	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=123,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,3:6,0:3,12,0,3
chr14	90770210	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	90863489	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,13:0,1:0,0,14,0
chr14	90866346	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=158,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,2:3,9:6,1,8,3
chr14	91007618	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=197,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:0,0:1,2:2,0,2,0
chr14	91077186	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=148,63;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,3:10,0:8,13,1,2
chr14	91113471	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,4:4,0:0,9,0,4
chr14	91119311	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=160,133;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:2,4,2,0
chr14	91142816	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=149,251;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:6,0,5,0
chr14	91142817	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:4,0:9,1,2,0
chr14	91338538	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.226:29:10,6:12,0:7,16,6,0
chr14	91360733	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=108,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,5:6,4:5,6,6,3
chr14	91372685	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=18,20,25,32;MFRL=211,219,204,233;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,21,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=A;STR;TLOD=8.00,3.20,6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,4,2,3:0.357,0.217,0.286:10:0,2,1,1:0,0,0,1:0,1,0,9
chr14	91409615	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr14	91444926	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=233,219;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0,4,0,1
chr14	91467393	.	CTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=119,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:10,2:4,0:12,2,2,0
chr14	91467567	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=192,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:0,2,0,7
chr14	91626761	.	TAAAAAAAAAAAAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=158,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=24,10;RU=A;STR;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.449:7:1,2:2,1:1,3,0,3
chr14	91633483	.	CAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=141,264;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.290:5:2,1:1,0:4,0,1,0
chr14	91639611	.	AT	A,ATT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31,22;MFRL=142,0,104;MMQ=60,60,60;MPOS=14,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.74,4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,4:0.242,0.288:14:4,2,2:1,0,1:5,2,3,4
chr14	91642234	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=196,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:2,0:3,7:5,0,5,2
chr14	91662832	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:4,3:0,6,0,3
chr14	91666018	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=210,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr14	91671003	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=150,295;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:12,1,2,0
chr14	91671124	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=171,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=40.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.573:26:6,6:5,9:5,6,9,6
chr14	91681921	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=136,322;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:1,6,0,2
chr14	91744233	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:2,0:8,4:7,4,3,1
chr14	91749595	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=262,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.727:8:1,4:0,2:2,0,6,0
chr14	91763637	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:9,2:3,2:7,5,2,2
chr14	91780228	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=176,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:4,3,0,2
chr14	91808839	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,107;MMQ=60,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:7,0:5,8:4,8,0,8
chr14	91808854	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=107,110;MMQ=43,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.298:22:3,4:9,2:0,16,4,2
chr14	91883267	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr14	91925027	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,23;MFRL=142,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,3,1
chr14	91927717	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=142,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,6:8,2:5,8,3,5
chr14	91928301	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	91929281	.	CTTAAT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=252,197;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTAAT;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr14	91931653	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=190,132;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.209:30:12,0:12,5:8,16,0,6
chr14	91937143	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=159,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,3,1
chr14	91942318	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.683:17:3,7:2,5:1,4,6,6
chr14	91942342	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr14	91942407	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr14	91957235	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:91957235_AT_A:91957235:0,0,0,4
chr14	91957242	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:91957235_AT_A:91957235:0,0,0,2
chr14	91957244	.	ATT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.697:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	92040589	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=189,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:2,2:1,6,0,6
chr14	92074545	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr14	92102759	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=111,274;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,1:2,1:6,3,1,1
chr14	92140428	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:5,1,3,1
chr14	92185731	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=202,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,5:3,2:11,0,5,2
chr14	92189366	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=206,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:6,1,2,0
chr14	92191350	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr14	92251762	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr14	92258780	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.219:21:4,0:12,4:6,11,0,4
chr14	92264080	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=129,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.724:12:2,2:0,7:2,1,7,2
chr14	92279983	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,1:2,6:3,2,5,2
chr14	92280037	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=124,173;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:3,10:4,2:4,3,8,4
chr14	92343764	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr14	92403304	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:15,7,0,2
chr14	92409333	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=139,110;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.323:19:4,3:9,2:4,9,3,3
chr14	92436306	.	G	GTACA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=219,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr14	92440885	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=145,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,3:2,4:7,0,7,0
chr14	92440886	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=207,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:8,0,6,0
chr14	92440906	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,3:4,2:10,0,5,0
chr14	92440947	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=198,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:10,3:6,2:10,6,3,2
chr14	92441066	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,0:14,2:12,10,1,1
chr14	92441129	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=205,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.278:13:2,1:1,1:0,10,0,3
chr14	92460132	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=214,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:7,5,3,0
chr14	92466484	.	A	AAC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=204,119;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.351:9:4,0:2,3:0,6,0,3
chr14	92471307	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=184,116;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,3:5,0:8,6,3,0
chr14	92472041	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=153,217;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,4:6,0:9,5,4,0
chr14	92473994	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:7,1:5,3:6,6,4,0
chr14	92478198	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=348,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr14	92480511	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=184,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:7,0,1,1
chr14	92537379	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=179,158;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0|1:92537379_T_C:92537379:0,4,1,2
chr14	92537385	.	CTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=179,158;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=T;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0|1:92537379_T_C:92537379:0,4,1,2
chr14	92572927	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.300:15:2,2:6,2:3,8,0,4
chr14	92582655	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,29;MFRL=180,190;MMQ=40,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:0,1:0|1:92582655_T_A:92582655:1,2,0,2
chr14	92582680	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=207,190;MMQ=40,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.340:7:2,0:3,2:0|1:92582655_T_A:92582655:0,5,0,2
chr14	92582702	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=232,183;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,2:0.375:6:1,1:3,1:1|0:92582655_T_A:92582655:0,4,0,2
chr14	92584021	.	C	CTTTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=123,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,7;RU=T;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:2,0:7,2:0,9,0,2
chr14	92588155	.	AT	A,ATT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,25,28;MFRL=142,155,178;MMQ=60,60,60;MPOS=25,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=6.65,7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,6,6:0.241,0.253:24:6,3,2:5,3,4:2,10,2,10
chr14	92597228	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=197,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr14	92609334	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:8,4,2,0
chr14	92627668	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=184,256;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr14	92905817	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr14	92915625	.	TACAC	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=289,131;MMQ=40,54;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=AC;STR;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.503:6:3,3:0,0:0,3,0,3
chr14	92915649	.	C	CTAT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=127,290;MMQ=57,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:0,6,0,2
chr14	92915653	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=131,290;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:0,0:0|1:92915653_C_T:92915653:0,7,0,2
chr14	92915659	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=146,290;MMQ=57,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,2:0,0:0|1:92915653_C_T:92915653:0,6,0,2
chr14	92922681	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr14	92922713	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,7:3,3:3,1,8,2
chr14	92922782	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=239,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,7:5,1:3,5,3,5
chr14	92958612	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=123,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,4:4,0:1,9,0,4
chr14	92958625	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=174,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:0,7,1,6
chr14	92960025	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,2,11
chr14	93125415	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,245;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:4,0,7,0
chr14	93154537	.	TGGC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=192,118;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:1,2,0,2
chr14	93170741	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=124,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:0,4,1,6
chr14	93170901	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=220,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,2:2,5:0,2,6,1
chr14	93178044	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=192,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:9,2:12,0:0|1:93178044_G_A:93178044:10,12,1,1
chr14	93178057	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=185,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:8,2:10,0:0|1:93178044_G_A:93178044:10,9,1,2
chr14	93182466	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=111,286;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,1:6,5:2,5,6,0
chr14	93199080	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=96,241;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,1:6,2:8,3,1,2
chr14	93199203	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=174,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr14	93276806	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=165,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr14	93286207	.	TGA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=226,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GA;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr14	93286230	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=214,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr14	93290856	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=126,254;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:5,4:9,2:0|1:93290856_T_C:93290856:9,6,5,1
chr14	93290859	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=126,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:6,3:9,2:0|1:93290856_T_C:93290856:9,6,4,1
chr14	93290962	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=154,146;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=83.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,29:0.516:56:11,13:16,15:16,11,1,28
chr14	93303843	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=169,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,0:3,2:2,3,1,1
chr14	93303848	.	T	TTTG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=197,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,2,0
chr14	93303850	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=183,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:0|1:93303850_T_TG:93303850:3,1,0,3
chr14	93303854	.	TG	CT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=183,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:0|1:93303850_T_TG:93303850:3,1,0,3
chr14	93396098	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=201,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:9,2:3,2:6,6,2,2
chr14	93398670	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=228,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,3:5,0:7,1,3,0
chr14	93401316	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr14	93408256	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=188,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,6:9,2:5,9,1,7
chr14	93412609	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=226,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.255:10:3,2:3,0:7,1,2,0
chr14	93429060	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.595:13:1,4:4,2:3,2,7,1
chr14	93649501	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=210,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,2:7,2:9,1,4,0
chr14	93693422	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=197,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,4:3,3:0,4,1,6
chr14	93712644	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31,22,29;MFRL=0,155,172,190;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,23,29;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.89,3.41,3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,2,2:0.307,0.305,0.303:6:0,0,0,1:0,2,1,1:0,0,0,6
chr14	93720181	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=191,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr14	93814493	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=193,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:2,5,0,4
chr14	93953904	.	GC	AT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=196,219;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.305:5:2,1:1,0:4,0,1,0
chr14	93953907	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr14	93962691	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr14	93994870	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,7:2,2:2,2,6,3
chr14	93998806	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr14	94004314	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=135,231;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:12,1:5,1:11,6,1,1
chr14	94008753	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr14	94038251	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=187,51;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:0,1:11,1:4,7,1,1
chr14	94046445	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr14	94103602	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,224;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,4:5,2:5,7,4,2
chr14	94109829	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,245;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:4,0,5,0
chr14	94110125	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=237,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr14	94120171	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=175,92;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:8,0:14,3:12,10,0,3
chr14	94125561	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=141,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:14,5,1,1
chr14	94128891	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:6,4:3,0:4,5,4,0
chr14	94160611	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=181,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:2,1,4,1
chr14	94187906	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=201,286;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:94187906_G_T:94187906:1,3,0,1
chr14	94187910	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=194,286;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:94187906_G_T:94187906:1,1,0,1
chr14	94245452	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	94245649	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=174,215;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,1,4
chr14	94245652	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=187,226;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr14	94253947	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=171,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr14	94403973	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=181,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr14	94404217	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=108,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.456:20:8,8:3,1:5,6,1,8
chr14	94417675	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	94419665	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=176,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr14	94419888	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,10:0,2:0,0,3,9
chr14	94464432	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr14	94466081	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=169,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr14	94503674	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:2,2:1,0:3,1,2,0
chr14	94512282	.	A	AGGAGTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=178,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:2,3,1,1
chr14	94517533	.	C	CCACGG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:11,1:6,4:12,5,4,3
chr14	94563193	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=208,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,5,1
chr14	94563438	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr14	94567032	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.798:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr14	94567053	.	TTTG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=179,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTG;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,1,1
chr14	94568776	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=212,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,2:4,1:2,2,3,0
chr14	94578162	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=189,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:2,2:1,0:0,3,1,2
chr14	94578188	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr14	94582130	.	T	TGGCCATGGC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:2,1:8,0:6,7,2,0
chr14	94594768	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr14	94595989	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,1,9
chr14	94700138	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	94732107	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,1:11,2:8,9,3,0
chr14	94770990	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=181,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr14	94772429	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=117,205;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,3:5,3:6,5,3,3
chr14	94776401	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr14	94776441	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr14	94909630	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr14	94914455	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr14	94929541	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,10,11
chr14	94929660	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=140,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:0,0:8,2:0,8,0,2
chr14	94929708	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr14	94930956	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr14	94930980	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr14	94931016	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr14	94933709	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,6:0,15:0,0,5,16
chr14	94935807	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,2:6,3:6,6,1,4
chr14	94936198	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,142;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:6,0:17,4:8,15,0,4
chr14	94956134	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,4:6,2:1,8,0,6
chr14	95029852	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=256,141;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:0,2,3,2
chr14	95033275	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=208,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:4,3,1,1
chr14	95057270	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,2:6,1:6,3,1,2
chr14	95058360	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,0:2,3:7,0,2,1
chr14	95058631	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=138,241;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr14	95078677	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,9,3
chr14	95089988	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,0:10,3:8,7,0,3
chr14	95556747	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr14	95556785	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:8,1,2,0
chr14	95560563	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=191,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:0,4,0,3
chr14	95566103	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0|1:95566103_AC_A:95566103:0,0,11,0
chr14	95566105	.	ACAC	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=37.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0|1:95566103_AC_A:95566103:0,0,11,0
chr14	95591036	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=152,1766;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:1,6,0,2
chr14	95593186	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=11,16;MFRL=228,254;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,0:0,0:0,3,0,2
chr14	95670507	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:8,10:8,0:11,5,10,0
chr14	95670804	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=205,60;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.541:11:3,4:2,2:0,5,2,4
chr14	95675883	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=191,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.433:12:1,4:5,1:0,7,0,5
chr14	95682138	.	T	TTC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TC;STR;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,2:0,3:0,4,0,7
chr14	95682157	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=166,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,0:1,2:0,9,0,2
chr14	95682168	.	G	GATGTGTTTGGTTTTATGTTCC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=123,167;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,1:0,1:0,7,0,2
chr14	95898486	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=170,264;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:1,5,0,3
chr14	95898487	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=139,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,2:0,6:1,0,0,8
chr14	95899773	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:9,1:4,2:0|1:95899773_C_T:95899773:7,6,1,2
chr14	95899774	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=174,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,3:0.222:16:7,3:6,0:1|0:95899773_C_T:95899773:7,6,1,2
chr14	95903307	.	TAGA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=174,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:10,4:9,3:9,13,2,5
chr14	95906476	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=228,268;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr14	95918548	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=141,240;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:6,2:5,1:10,3,3,0
chr14	95918741	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=227,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:1,1:7,2:0,9,0,3
chr14	95918745	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=227,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,1:7,2:0,9,0,3
chr14	95918759	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=234,226;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,1:5,2:0,7,0,3
chr14	95932223	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=221,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr14	96135857	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:4,1:5,2:9,1,1,2
chr14	96157331	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=190,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:0,7,0,4
chr14	96157694	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=200,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:5,1:4,6:0|1:96157694_T_A:96157694:1,10,3,4
chr14	96157698	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0|1:96157694_T_A:96157694:0,0,4,13
chr14	96178173	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=171,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:96178173_G_A:96178173:1,1,0,1
chr14	96178192	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=171,185;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:96178173_G_A:96178173:1,1,0,1
chr14	96180242	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,279;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr14	96730142	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,8,6
chr14	96731029	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:7,10,0,2
chr14	96756844	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,1:11,1:11,8,1,1
chr14	96761514	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=183,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr14	96761557	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=182,270;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,1,2
chr14	96770952	.	CAA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.678:14:2,5:2,4:0,4,0,10
chr14	96776008	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=184,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr14	96779865	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr14	96783034	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=164,323;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,0:9,3:1,11,3,0
chr14	96783464	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:4,5:10,0:11,3,5,0
chr14	96788984	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:10,2:7,0:8,9,2,0
chr14	96790337	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,19;MFRL=120,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:1,1:4,0:2,3,0,2
chr14	96795997	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:1,3,0,5
chr14	96798551	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=172,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.430:11:3,2:2,3:6,0,5,0
chr14	96813703	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr14	96848565	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=194,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.279:19:3,2:6,3:0|1:96848565_CT_C:96848565:14,0,5,0
chr14	96848574	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=188,194;MMQ=60,43;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:18,2:0.136:20:6,2:12,0:1|0:96848565_CT_C:96848565:18,0,2,0
chr14	96848899	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr14	96858667	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=186,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.365:14:5,2:4,2:0,9,0,5
chr14	96916228	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=204,171;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.721:12:1,4:1,3:0,3,0,9
chr14	96916232	.	G	GT,GTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,31,31;MFRL=204,219,159;MMQ=60,60,60;MPOS=16,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=5.15,5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,3:0.384,0.313:10:1,3,1:2,1,2:0,3,0,7
chr14	96924328	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	96939138	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=128,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:96939138_G_C:96939138:1,2,0,1
chr14	96939140	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=128,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:96939138_G_C:96939138:1,2,0,1
chr14	96939145	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=163,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:96939138_G_C:96939138:0,2,0,1
chr14	96939147	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=163,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:96939138_G_C:96939138:0,2,0,1
chr14	96939157	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=156,94;MMQ=56,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:96939138_G_C:96939138:0,2,0,1
chr14	96939159	.	CT	TA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=156,94;MMQ=56,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:96939138_G_C:96939138:0,2,0,1
chr14	96987437	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=158,351;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:4,6,0,2
chr14	97002307	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,1:12,1:11,11,2,0
chr14	97022101	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=106,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr14	97342500	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=197,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.304:17:6,1:6,3:0,12,1,4
chr14	97411692	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.253:22:6,0:9,5:10,7,0,5
chr14	99640437	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr14	99880189	.	G	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=144,163;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,6:0.113:59:41,6:12,0:33,20,6,0
chr14	99929801	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=243,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:4,7:0,5:4,0,10,2
chr14	99961830	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=137,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,2:6,1:8,5,2,2
chr14	99969243	.	CCAG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=173,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CAG;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:8,0:7,2:7,8,0,2
chr14	100002473	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr14	100069742	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,302;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	100126183	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:100126183_A_C:100126183:0,0,0,2
chr14	100126193	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100126183_A_C:100126183:0,0,0,1
chr14	100141689	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=129,320;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,1:2,1:2,1,0,2
chr14	100141896	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	100158241	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=196,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr14	100166489	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=244,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr14	100172899	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=139,233;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr14	100182082	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=232,173;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:0,2:3,1:3,1,3,0
chr14	100192685	.	G	GGGGCTGCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=255,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGCTGCT;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.478:4:1,0:1,1:0,2,0,2
chr14	100317376	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=211,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,4:3,1:0,3,0,5
chr14	100341368	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=204,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:11,3:6,1:4,13,1,3
chr14	100341430	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=161,287;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr14	100363426	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=330,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr14	100363671	.	GA	CG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=129,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,4:1,4:1,4,4,4
chr14	100376715	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr14	100380948	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr14	100384032	.	TTGTG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=236,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=TG;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:3,1:5,0,1,1
chr14	100384232	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=228,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:1,3,0,6
chr14	100387242	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=199,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,4:1,5:0,2,4,5
chr14	100402326	.	ATTG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=222,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:0,1:3,10:3,1,10,1
chr14	100404067	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=208,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,6:1,0:2,0,6,0
chr14	100404351	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr14	100405757	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=222,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:2,5:3,2:0,5,0,7
chr14	100551221	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:4,1:8,2:2,12,0,3
chr14	100563762	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=197,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:1,1:4,0,2,0
chr14	100564021	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:4,12,0,3
chr14	100575973	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,3:4,4:5,5,5,2
chr14	100592959	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	100599164	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=120,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.557:14:4,5:2,2:1,5,1,7
chr14	100706095	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=206,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,1:5,4,1,1
chr14	100759738	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=127,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,1,2
chr14	100792093	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=196,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:1,3:2,7:2,1,7,4
chr14	100792220	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr14	100801423	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr14	100803364	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr14	100813077	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=239,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,8:0,4:0,1,8,6
chr14	100820980	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	100847631	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=167,59;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:6,3:15,0:11,10,2,1
chr14	101005236	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=230,151;MMQ=60,60;MPOS=0;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:1,3,2,1
chr14	101010364	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=194,218;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr14	101034298	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=197,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr14	101340805	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=171,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,6:1,1:1,0,3,4
chr14	101347037	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=177,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:2,0,2,2
chr14	101347100	.	C	CAGGCACTATAT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=120,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:101347100_C_CAGGCACTATAT:101347100:2,9,1,1
chr14	101347102	.	G	GGTTTGA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=120,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,1:5,0:0|1:101347100_C_CAGGCACTATAT:101347100:2,9,1,1
chr14	101349454	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,256;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:12,2:6,1:13,5,2,1
chr14	101350670	.	C	CTCT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=175,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=39.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,3:2,7:3,4,2,8
chr14	101350721	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=170,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:6,3:5,3:4,7,0,6
chr14	101489858	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=204,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr14	101490146	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=180,66;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.211:20:8,0:8,3:11,5,2,2
chr14	101492224	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=216,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,0:4,5:4,3,1,4
chr14	101492548	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=205,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr14	101493300	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=181,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:5,7,0,3
chr14	101495943	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=170,208;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=28.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,10:3,0:5,1,10,0
chr14	101496145	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr14	101498232	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=218,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr14	101506158	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=131,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:0,0:3,2:0,5,1,1
chr14	101512972	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0|1:101512972_C_T:101512972:0,0,0,4
chr14	101512974	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:101512972_C_T:101512972:0,0,0,4
chr14	101515153	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=166,269;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,2:6,0:0|1:101515153_G_A:101515153:1,7,0,2
chr14	101515155	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=166,269;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:0|1:101515153_G_A:101515153:1,7,0,2
chr14	101515162	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=188,269;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:101515153_G_A:101515153:0,6,0,2
chr14	101518760	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=110,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:11,4:9,2:12,8,1,5
chr14	101531733	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=237,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,1:9,1:9,4,1,2
chr14	101531854	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=252,138;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:3,3,1,6
chr14	101531867	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=187,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,2:6,1:4,8,1,2
chr14	101532217	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,2:6,2:7,6,2,2
chr14	102029446	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=101,40;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:13,0:4,3:9,8,1,2
chr14	102228118	.	G	GGGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GGC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	102252330	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,2:5,1:15,0,2,1
chr14	102349907	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:8,12:6,1:6,8,6,7
chr14	102360745	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=230,240;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:2,1,2,0
chr14	102431043	.	GGGC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=184,267;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGC;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,0:1,1:3,0,1,0
chr14	102445607	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=189,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr14	102446161	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=199,138;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:9,2:6,7:10,5,6,3
chr14	102449338	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr14	102449872	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:16,0:12,3:21,8,3,0
chr14	102450009	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=200,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.310:9:3,2:2,1:0,6,1,2
chr14	102451983	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=192,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:2,1:2,2:5,0,3,0
chr14	102452630	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=137,79;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.256:33:7,1:18,7:14,11,8,0
chr14	102457817	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:3,1:3,1:5,2,1,1
chr14	102461209	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,8:3,3:3,3,3,9
chr14	102463634	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=185,217;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.483:23:4,0:7,8:1,11,0,11
chr14	102466249	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=213,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:7,0,2,0
chr14	102466253	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=221,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:8,0,3,0
chr14	102466430	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=190,248;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.212:26:11,2:10,3:10,11,3,2
chr14	102467847	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:3,4:1,1:3,1,4,1
chr14	102483425	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=184,40489136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:9,1:9,8,2,0
chr14	102483881	.	C	CAGCT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGCT;STR;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,2:3,3:2,4,1,5
chr14	102486200	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=203,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.586:9:2,0:1,5:4,0,4,1
chr14	102493461	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,121;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,3:2,0:7,0,3,0
chr14	102496352	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:2,8,1,4
chr14	102499914	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=193,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr14	102504838	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,4:6,3:6,3,5,2
chr14	102505262	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=212,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:1,4,2,1
chr14	102505492	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=180,67;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,0:11,2:11,7,1,1
chr14	102506167	.	CTTTTATTTTCTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,271;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:2,1:1,8,0,2
chr14	102510863	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=126,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.366:17:8,4:3,2:6,5,4,2
chr14	102510874	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=96,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:5,5:0,3:3,2,4,4
chr14	102511064	.	AGGGTGGGTGGCGAGGGTCCCCTCACGCG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=212,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.394:6:0,0:1,2:0,4,0,2
chr14	102514435	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=176,240;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr14	102548224	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=186,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,3:2,6:0,2,0,9
chr14	102548384	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=165,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:6,0,4,0
chr14	102549839	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=128,221;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:1,0,5,1
chr14	102550065	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,11;MFRL=199,214;MMQ=60,56;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:3,0:8,0:9,3,0,6
chr14	102550069	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=176,214;MMQ=60,56;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:3,3:7,0:9,5,0,6
chr14	102550803	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=130,168;MMQ=60,51;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,27:0.758:35:5,12:3,15:4,4,12,15
chr14	102551795	.	T	TTAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAA;STR;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:1,4,1,5
chr14	102552773	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=148,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,18:0.761:23:2,10:3,7:0|1:102552773_A_G:102552773:0,5,2,16
chr14	102552775	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=148,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,18:0.760:23:2,9:3,7:0|1:102552773_A_G:102552773:0,5,2,16
chr14	102661281	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=147,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:11,4:10,0:16,5,3,1
chr14	102689213	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=174,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:11,3:3,0:0|1:102689213_T_G:102689213:7,7,4,0
chr14	102689217	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=165,116;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:8,4:3,0:0|1:102689213_T_G:102689213:7,5,4,0
chr14	102695563	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:4,3:3,0:7,1,3,0
chr14	102695610	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=177,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:9,10,0,2
chr14	102718052	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,1:5,3:7,3,4,0
chr14	102729910	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:6,3,2,2
chr14	102792224	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=215,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr14	102793279	.	T	TGGATTTGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=182,272;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr14	102808554	.	CGTGGA	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,1:2,1:0|1:102808554_CGTGGA_C:102808554:0,6,0,2
chr14	102808562	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0|1:102808554_CGTGGA_C:102808554:0,6,0,2
chr14	102825666	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	102891523	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=167,244;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,1:5,2:4,7,1,2
chr14	102894593	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,16:0,8:0,0,4,21
chr14	102894756	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=227,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:8,2:1,0:1,8,0,2
chr14	102900956	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=177,276;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:1,5,4,1
chr14	102918686	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=138,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:3,0,5,1
chr14	102918810	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=178,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:2,4,2,2
chr14	102964359	.	C	CGCCCAAGCTCCCAGCTCCTTCTGT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=85,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,1:1,0:1,0,3,1
chr14	103177420	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=115,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,1:2,4:0,2,0,5
chr14	103336544	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:4,4,0,2
chr14	103338324	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=113,114;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,4:5,4:9,4,6,2
chr14	103352422	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,1:3,1:5,1,2,0
chr14	103357603	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=229,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr14	103388952	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=186,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr14	103390383	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:2,6,2,6
chr14	103396086	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=186,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.361:17:6,0:4,5:8,3,2,4
chr14	103396693	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	103397055	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=276,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr14	103404838	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=240,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:103404838_T_C:103404838:0,4,0,1
chr14	103404841	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=240,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:103404838_T_C:103404838:0,4,0,1
chr14	103406215	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:12,0:4,2:8,8,1,1
chr14	103414179	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=79,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,5:1,2:1,2,1,6
chr14	103416190	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,3:8,0:8,5,3,0
chr14	103416768	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:4,0:6,1,3,0
chr14	103418939	.	G	GCTTGGGCGACATAACTTTGAGAGTTCCACTCAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=151,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:2,4,1,1
chr14	103425946	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=128,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.277:9:5,1:2,1:5,2,1,1
chr14	103434530	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr14	103438504	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=179,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:6,3:7,5:3,10,2,6
chr14	103440282	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr14	103444462	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=141,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,0:8,3:9,4,2,1
chr14	103466058	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=161,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,2:6,1:4,12,2,1
chr14	103567020	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:5,1:3,1:1,8,0,2
chr14	103571269	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=171,100;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,11:0.444:25:6,9:8,0:0|1:103571269_G_A:103571269:9,5,11,0
chr14	103571277	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=164,100;MMQ=60,48;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,11:0.428:26:8,11:7,0:0|1:103571269_G_A:103571269:10,5,11,0
chr14	103574714	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=172,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:7,1:1,3:6,3,3,1
chr14	103595997	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:4,0,5,0
chr14	103596488	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:1,2,2,1
chr14	103597322	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:3,1:5,0,2,0
chr14	103597565	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr14	103599597	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,256;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr14	103599938	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr14	103802163	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=201,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,5:3,2:6,2,6,1
chr14	103802527	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=209,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr14	103802926	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=194,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:6,4:4,0:10,0,4,0
chr14	103807442	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=197,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:1,3,0,3
chr14	103871604	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.251:26:10,0:8,6:7,13,0,6
chr14	103915215	.	GTGTT	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=179,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:0,2:5,3:0|1:103915215_GTGTT_G:103915215:5,0,5,0
chr14	103915225	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:0,2:5,3:0|1:103915215_GTGTT_G:103915215:5,0,5,0
chr14	103918182	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=147,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr14	103928657	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr14	103931879	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=293,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr14	103946636	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr14	103964807	.	ATT	A,AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,30,33;MFRL=77,103,144;MMQ=60,60,60;MPOS=13,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=5.18,11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,6:0.251,0.460:13:1,1,5:0,2,0:2,2,7,2
chr14	103996733	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=182,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:0,6,1,2
chr14	103999224	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=187,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:103999224_G_A:103999224:1,3,0,1
chr14	103999228	.	G	GCGCTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=235,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:103999224_G_A:103999224:1,1,0,1
chr14	103999231	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=235,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:103999224_G_A:103999224:1,1,0,1
chr14	104000802	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr14	104028196	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=144,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,1:2,1,1,2
chr14	104040414	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=169,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr14	104040415	.	CTTTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=25,20;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.295:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr14	104040444	.	G	A,T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,17,23;MFRL=181,169,155;MMQ=60,46,60;MPOS=23,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.17,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,2:0.222,0.333:6:2,0,0:1,0,1:1,2,3,0
chr14	104040450	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=179,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,0:2,1:2,2,2,0
chr14	104053764	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=202,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr14	104135774	.	A	AAAAAGAAAAAAAAAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=252,192;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:0,1:1,2:1,0,4,0
chr14	104135966	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=201,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,4:3,5:1,5,3,6
chr14	104136469	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr14	104136633	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=161,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:1,3,1,3
chr14	104136707	.	T	TGTTCTCAAATTCTTCCTGGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=159,161;MMQ=57,47;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	104139570	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr14	104143928	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr14	104145639	.	TTTC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=181,200;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,1:0|1:104145639_TTTC_T:104145639:4,0,1,0
chr14	104145643	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=181,200;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:104145639_TTTC_T:104145639:4,0,1,0
chr14	104151400	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=132,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.515:25:8,7:4,5:4,8,4,9
chr14	104165927	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,1,2
chr14	104193099	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.589:22:5,9:3,4:8,1,3,10
chr14	104194278	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,4:1,1:0,2,3,2
chr14	104199342	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=174,64;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:7,2:0|1:104199342_C_T:104199342:12,6,1,1
chr14	104199349	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=174,64;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:0|1:104199342_C_T:104199342:10,6,1,1
chr14	104199356	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=125,184;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,6:7,3:6,4,5,4
chr14	104202304	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.516:23:6,3:5,8:8,3,9,3
chr14	104203938	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=195,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:2,1,3,1
chr14	104216293	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=78,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,3:3,3:3,5,1,5
chr14	104219578	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.761:6:1,1:0,1:0,1,0,5
chr14	104220530	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=89,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:6,7,1,1
chr14	104251276	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,1:4,2:2,2,0,3
chr14	104394835	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr14	104394842	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=199,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:3,5,0,2
chr14	104394850	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=216,201;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:1,3:1,5:0,2,3,6
chr14	104429453	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,6,7
chr14	104441925	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=219,263;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr14	104465128	.	CTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=214,247;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr14	104470686	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=350,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:1,0,5,2
chr14	104470763	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr14	104473253	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=254,246;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:1,2:1,2:1,1,1,4
chr14	104481200	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=169,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,0:1,5:0,3,0,5
chr14	104491086	.	TACACACACACAC	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=208,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=20,14;RU=AC;STR;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.669:7:2,4:0,1:0|1:104491086_TACACACACACAC_T:104491086:0,2,0,5
chr14	104491114	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=171,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.333:7:4,2:1,0:1|0:104491086_TACACACACACAC_T:104491086:0,5,0,2
chr14	104497388	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	104498472	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr14	104500427	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,7,5
chr14	104500441	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,17;MFRL=110,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:3,0:0,0:0|1:104500441_C_CT:104500441:0,3,1,0
chr14	104500448	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=110,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:104500441_C_CT:104500441:0,3,1,0
chr14	104561998	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=186,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,2,5
chr14	104563874	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr14	104569801	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr14	104570904	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr14	104571826	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr14	104573690	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,3,7
chr14	104575460	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	104575466	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	104640011	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=218,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:1,3,3,3
chr14	104644147	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	105054260	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	105054709	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=201,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,1:0,2:0,2,1,2
chr14	105063253	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr14	105173862	.	ACCCCACCCCCAC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=125,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=CCCCAC;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr14	105174992	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=128,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:3,4,1,1
chr14	105177351	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=150,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,8:4,1:5,2,7,2
chr14	105178089	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=216,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:105178089_T_C:105178089:1,1,1,1
chr14	105178098	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=191,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:105178089_T_C:105178089:0,1,0,2
chr14	105179081	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,291;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr14	105180484	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	105181694	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=185,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,3:7,0:7,8,1,2
chr14	105185083	.	TAC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=173,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,2:3,4:6,3,4,2
chr14	105207134	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=200,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:2,1,3,3
chr14	105219467	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=209,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr14	105223194	.	C	CAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=294,330;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr14	105238604	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=206,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:3,0,5,1
chr14	105239192	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=142,217;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr14	105242228	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=213,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr14	105242966	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=199,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:3,0:1,3:5,0,3,1
chr14	105246533	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=216,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:3,5,1,2
chr14	105258892	.	CA	TG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.501:10:2,2:3,3:0|1:105258892_CA_TG:105258892:2,3,5,0
chr14	105258893	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,10:0.916:10:0,4:0,6:1|0:105258892_CA_TG:105258892:0,0,7,3
chr14	105270175	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=200,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:105270175_T_G:105270175:4,3,1,1
chr14	105270178	.	A	AAGT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=200,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:105270175_T_G:105270175:4,3,1,1
chr14	105270179	.	C	CAGTGAACG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=200,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:105270175_T_G:105270175:4,3,1,1
chr14	105270484	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.633:6:1,3:1,1:0,2,2,2
chr14	105270485	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=258,158;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.809:8:1,3:0,3:0,1,3,4
chr14	105342765	.	C	CATTACACACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,279;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr14	105344293	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,0:4,5:0|1:105344293_C_T:105344293:7,2,4,1
chr14	105344318	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:5,0:3,4:0|1:105344293_C_T:105344293:6,2,2,2
chr14	105344347	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,35;MFRL=114,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.340:10:3,0:3,3:3,4,1,2
chr14	105344872	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:1,6,1,4
chr14	105349877	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=152,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:105349877_C_T:105349877:1,6,1,1
chr14	105349886	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=144,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:105349877_C_T:105349877:1,5,1,1
chr14	105350868	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=122,130;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.830:16:0,3:2,8:2,0,2,12
chr14	105351637	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=217,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,4:0,3:2,0,5,2
chr14	105351673	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=217,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:2,6:0,3:2,0,5,4
chr14	105356137	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=337,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,1,3
chr14	105359306	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=249,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:2,1,6,2
chr14	105359827	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=246,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,2:0,5:2,0,7,0
chr14	105360746	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr14	105398787	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=246,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,5:1,3:0,1,0,9
chr14	105404384	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=210,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:4,6:1,1:5,0,5,2
chr14	105410183	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=207,163;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:1,7:1,9:1,1,9,7
chr14	105411700	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=147,115;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:0,1,4,3
chr14	105413781	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=162,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,2:9,0:0|1:105413781_C_T:105413781:9,5,0,2
chr14	105413790	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,11:0.706:15:4,3:0,8:1|0:105413781_C_T:105413781:0,4,7,4
chr14	105414737	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,260;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,1:10,3:11,5,2,2
chr14	105417285	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=221,158;MMQ=52,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:1,1,0,3
chr14	105417306	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=192,158;MMQ=44,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:105417306_T_A:105417306:1,2,0,1
chr14	105417308	.	TG	CC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=192,158;MMQ=44,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:105417306_T_A:105417306:1,2,0,1
chr14	105417311	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=192,158;MMQ=44,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:105417306_T_A:105417306:1,2,0,1
chr14	105417315	.	G	GGGCAAGTGC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=220,158;MMQ=50,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:105417306_T_A:105417306:1,1,0,1
chr14	105418260	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=125,168;MMQ=60,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.884:15:1,6:0,8:0|1:105418260_T_A:105418260:0,1,7,7
chr14	105418264	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=125,184;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.868:13:1,4:0,8:0|1:105418260_T_A:105418260:0,1,6,6
chr14	105419933	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=108,183;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:10,4:11,0:8,13,4,0
chr14	105420921	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=165,187;MMQ=60,31;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.319:20:7,0:6,6:0|1:105420921_G_A:105420921:8,6,6,0
chr14	105420927	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=177,187;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,17:0.783:21:3,5:1,12:0|1:105420921_G_A:105420921:2,2,12,5
chr14	105421236	.	CAGCCAGCAGGGTAGTGA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=193,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,2,2
chr14	105457771	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr14	105518336	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=242,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:1,3,2,1
chr14	105521613	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=159,251;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr14	105612885	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=226,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,2:4,1:1,3,0,3
chr14	105615026	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	105617550	.	C	CGCAGCCCCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=129,356;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCAGCCCCA;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,2:1,0:1,0,0,2
chr14	105618158	.	C	CATG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=178,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0,2,0,1
chr14	105618670	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=219,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:1,3,0,5
chr14	105622056	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr14	105644150	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=259,90;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:105644150_A_AC:105644150:0,1,0,1
chr14	105644151	.	T	TACC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=259,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:105644150_A_AC:105644150:0,1,0,1
chr14	105644155	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,18;MFRL=259,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:105644150_A_AC:105644150:0,1,0,1
chr14	105677499	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=105,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:4,4:10,1:7,8,4,1
chr14	105715556	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	105717265	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:3,4,1,4
chr14	105851374	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=180,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:2,3,2,1
chr14	105856174	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=153,285;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:105856174_C_T:105856174:7,0,2,0
chr14	105856183	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=153,285;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:105856174_C_T:105856174:9,0,2,0
chr14	105858057	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,0:0,4,2,0
chr14	105905126	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr14	105924538	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr14	105929443	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr14	105930685	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=146,146;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:5,13:11,0:17,0,14,0
chr14	105930923	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,7,5
chr14	105931562	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0|1:105931562_C_G:105931562:0,0,1,1
chr14	105931585	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:105931562_C_G:105931562:0,0,0,1
chr14	105935721	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,6,6
chr14	105936100	.	A	ACCTTGGCTGGTGGCC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,2:0,0,9,1
chr14	105945891	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=73,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.851:11:0,5:1,4:0,1,4,6
chr14	105953474	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr14	106050432	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,174;MMQ=59,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:4,0,3,0
chr14	106053289	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,33;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:106053289_A_G:106053289:0,0,0,1
chr14	106053293	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,209;MMQ=60,33;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:106053289_A_G:106053289:0,0,0,1
chr14	106054791	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=197,177;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:106054791_G_T:106054791:0,4,0,2
chr14	106054796	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=197,177;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,1:2,1:0|1:106054791_G_T:106054791:0,4,0,2
chr14	106067618	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr14	106067666	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,16;MFRL=266,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.454:7:2,0:1,0:0|1:106067666_C_G:106067666:2,2,3,0
chr14	106067669	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=266,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.454:7:2,1:1,1:0|1:106067666_C_G:106067666:2,2,3,0
chr14	106067673	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=266,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,1:1,1:0|1:106067666_C_G:106067666:2,2,3,0
chr14	106067679	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,14;MFRL=254,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.497:6:2,0:1,0:0|1:106067666_C_G:106067666:2,1,3,0
chr14	106090724	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=22,24;MFRL=143,123;MMQ=45,32;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,1:0|1:106090724_C_T:106090724:3,1,2,0
chr14	106090728	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=143,130;MMQ=45,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0|1:106090724_C_T:106090724:3,1,3,0
chr14	106090741	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=165,172;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:4,1,4,0
chr14	106090767	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=175,165;MMQ=43,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,2:5,1:0|1:106090767_C_T:106090767:8,2,2,1
chr14	106090774	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=175,165;MMQ=43,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:0|1:106090767_C_T:106090767:8,2,2,1
chr14	106090927	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,55;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,14:0,9:0,0,8,15
chr14	106091105	.	A	ATGCAT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=163,46;MMQ=56,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:6,7,1,1
chr14	106091333	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=196,129538;MMQ=52,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:9,4,0,2
chr14	106091353	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=192,129538;MMQ=52,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,0:5,2:8,6,0,2
chr14	106092486	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	106110330	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr14	106170671	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=197,215;MMQ=21,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr14	106170722	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=161,187;MMQ=57,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:1,0,3,2
chr14	106173501	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=196,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:12,2:6,1:14,4,3,0
chr14	106174515	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=171,320;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:106174515_C_G:106174515:0,2,0,1
chr14	106174518	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=171,320;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:106174515_C_G:106174515:0,2,0,1
chr14	106204232	.	CGAG	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=122,170;MMQ=39,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0|1:106204232_CGAG_C:106204232:0,4,3,0
chr14	106204240	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=123,170;MMQ=50,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,0:2,1:0|1:106204232_CGAG_C:106204232:0,5,3,0
chr14	106204244	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=123,170;MMQ=50,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0|1:106204232_CGAG_C:106204232:0,5,3,0
chr14	106204249	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,21;MFRL=122,181;MMQ=44,40;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,1:0,4,2,0
chr14	106206565	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=163,217;MMQ=35,32;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:2,2,1,1
chr14	106208166	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=191,153;MMQ=56,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:5,1,1,5
chr14	106209031	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=223,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr14	106235535	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=165,112;MMQ=55,39;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:4,3:4,1:7,1,2,2
chr14	106237105	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr14	106303699	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,2:3,2:7,1,4,0
chr14	106303948	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.891:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr14	106306841	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,172;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,1,1
chr14	106306959	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=186,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,4:4,0:4,5,3,1
chr14	106307054	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr14	106318440	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:106318440_T_C:106318440:0,0,3,3
chr14	106318450	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,3:0,5:0|1:106318440_T_C:106318440:0,0,5,4
chr14	106329435	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,13:0.779:16:1,6:2,7:0|1:106329435_T_G:106329435:2,1,8,5
chr14	106329449	.	ATG	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=188,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:2,4:3,5:0|1:106329435_T_G:106329435:2,3,3,7
chr14	106329453	.	A	ACC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:0|1:106329435_T_G:106329435:2,3,3,6
chr14	106329919	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr14	106330027	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=157,102;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:6,0:11,10:8,9,0,10
chr14	106330117	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=204,281;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:6,0:3,2:0|1:106330117_G_A:106330117:1,8,2,1
chr14	106330126	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=205,281;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,0:2,3:0|1:106330117_G_A:106330117:1,7,2,1
chr14	106330320	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,5:0,0,6,2
chr14	106330355	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=95,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,3:2,1:5,3,2,2
chr14	106330370	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,8,5
chr14	106346795	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr14	106346910	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=181,64;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:6,6,0,2
chr14	106346990	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr14	106347467	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,6:0,6:0,0,4,8
chr14	106349748	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:9,1:9,7,1,1
chr14	106349827	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=237,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,3:0,4:0,3,4,3
chr14	106350623	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr14	106350696	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=457,206;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:1,0,3,2
chr14	106354325	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=120,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,3:2,5:2,2,7,1
chr14	106354334	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=22,31;MFRL=120,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,3:3,6:2,2,6,4
chr14	106354343	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=120,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,3:4,6:2,4,6,3
chr14	106354353	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,5:6,4:6,4,5,4
chr14	106356974	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:4,1,3,0
chr14	106357446	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,2:6,1:10,2,2,1
chr14	106357527	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:6,2:5,5:3,8,4,3
chr14	106357644	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=226,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:2,2,0,3
chr14	106357673	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=271,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr14	106359259	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr14	106359285	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=189,146;MMQ=40,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr14	106359327	.	GC	AG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=150,214;MMQ=25,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:1,2,1,2
chr14	106359348	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=193,148;MMQ=40,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,1,2
chr14	106359495	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=296,144;MMQ=33,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr14	106359542	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,261;MMQ=60,32;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	106360281	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:5,4,5,0
chr14	106360292	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=129,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.391:16:5,3:5,3:5,5,6,0
chr14	106361418	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=123,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,2,1
chr14	106361561	.	GC	AT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:106361561_GC_AT:106361561:0,0,6,3
chr14	106361564	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:106361561_GC_AT:106361561:0,0,6,3
chr14	106363748	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=133,271;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:8,2,1,2
chr14	106363843	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,4898;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:4,7,0,2
chr14	106366544	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=130,218;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,3:6,1:7,3,3,1
chr14	106368604	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,144;MMQ=60,47;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0|1:106368604_A_G:106368604:0,0,1,3
chr14	106368614	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,47;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0|1:106368604_A_G:106368604:0,0,1,3
chr14	106369335	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:4,2:7,2,3,0
chr14	106369395	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=138,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.289:12:2,1:6,2:2,7,2,1
chr14	106369534	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,8,4
chr14	106369592	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=190,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0,8,0,2
chr14	106375638	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=167,227;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:1,1,4,0
chr14	106375649	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=210,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,3,0
chr14	106375721	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=131,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:3,3,3,1
chr14	106376144	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=275,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,5:0,6:1,0,11,0
chr14	106376354	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,7,10
chr14	106376385	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=217,129;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:2,1:4,2:1,5,0,3
chr14	106378962	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=274,0;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,4,1
chr14	106379020	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=176,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,2:3,4:3,2,4,2
chr14	106380171	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=155,102;MMQ=60,36;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:0|1:106380171_C_T:106380171:9,5,1,1
chr14	106380174	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0|1:106380171_C_T:106380171:0,0,10,6
chr14	106382849	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,55;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr14	106385233	.	AC	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,220;MMQ=60,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:106385233_AC_GT:106385233:0,0,4,0
chr14	106385245	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:106385233_AC_GT:106385233:0,0,4,0
chr14	106388170	.	T	TGGGTGG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:106388170_T_TGGGTGG:106388170:3,4,0,2
chr14	106388172	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:106388170_T_TGGGTGG:106388170:3,4,0,2
chr14	106388175	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=140,132;MMQ=55,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:106388170_T_TGGGTGG:106388170:3,5,0,2
chr14	106388588	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr14	106452628	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=200,180;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,4:3,4:4,0,7,1
chr14	106471388	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=201,191;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.518:21:3,9:7,1:3,7,9,2
chr14	106471410	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=191,135;MMQ=60,38;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:13,2:12,1:0|1:106471410_T_C:106471410:13,12,3,1
chr14	106471417	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=184,53961;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,6:0.194:34:15,4:13,2:0|1:106471410_T_C:106471410:15,13,4,2
chr14	106471426	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=191,107764;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=39.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,15:0.347:44:14,10:13,4:0|1:106471410_T_C:106471410:16,13,10,5
chr14	106471437	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=208,107764;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.454:42:14,15:9,4:10,13,12,7
chr14	106471547	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=215,171;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:1,10:3,6:3,1,6,10
chr14	106471580	.	GC	TT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=201,204;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,4:5,2:7,0,2,5
chr14	106471595	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,36;MFRL=195,171;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:1,3:7,7:7,1,3,7
chr14	106471689	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=201,106;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.588:32:4,11:9,8:5,8,8,11
chr14	106478023	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:106478023_GT_G:106478023:0,0,3,1
chr14	106478026	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,33;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:106478023_GT_G:106478023:0,0,3,1
chr14	106478311	.	A	ACCACTG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=212,221;MMQ=55,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:7,2:6,4:6,7,3,4
chr14	106478334	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=205,197;MMQ=40,33;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:9,1:5,11,2,0
chr14	106478401	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=207,139;MMQ=40,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,2:3,1:1,6,3,0
chr14	106478442	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=33,25;MFRL=172,221;MMQ=51,37;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:10,3:15,0:0|1:106478442_G_A:106478442:15,11,0,3
chr14	106478445	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=172,248;MMQ=51,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:10,2:16,0:0|1:106478442_G_A:106478442:15,11,0,2
chr14	106478456	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=172,248;MMQ=51,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:9,2:19,0:16,13,0,2
chr14	106478464	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=218,141;MMQ=52,51;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:5,7:15,3:9,11,6,4
chr14	106478637	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr14	106518930	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=199,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.183:20:6,1:9,2:1,16,1,2
chr14	106539088	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=173,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:3,4,0,3
chr14	106573144	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=219,199;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:6,1,2,0
chr14	106573172	.	CCAA	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=235,240;MMQ=60,31;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:3,1:6,1,2,0
chr14	106573352	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=188,205;MMQ=58,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:7,1:17,1:0|1:106573352_A_T:106573352:13,12,1,1
chr14	106573354	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=188,205;MMQ=58,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:7,1:17,1:0|1:106573352_A_T:106573352:13,12,1,1
chr14	106573357	.	GT	TA	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=184,205;MMQ=60,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:8,1:17,1:0|1:106573352_A_T:106573352:15,13,1,1
chr14	106573364	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=182,205;MMQ=58,25;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:7,1:16,1:0|1:106573352_A_T:106573352:14,12,1,1
chr14	106573559	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=177,161;MMQ=60,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,0:9,3:9,8,0,3
chr14	106586290	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=201,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,2:9,2:5,11,4,0
chr14	106622076	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=170,187;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.267:24:8,1:10,5:9,9,4,2
chr14	106622284	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.236:18:6,1:8,2:4,10,2,2
chr14	106622428	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr14	106667902	.	A	AC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=66.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,6:0,13:0,0,10,9
chr14	106668098	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr14	106668130	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,37;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr14	106668156	.	CCA	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,1:0,5:0|1:106668156_CCA_C:106668156:0,0,1,6
chr14	106668160	.	C	CATT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=0,210;MMQ=60,57;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0|1:106668156_CCA_C:106668156:0,0,1,6
chr14	106691579	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,293;MMQ=60,33;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr14	106691601	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,254;MMQ=60,39;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr14	106691620	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,235;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=45.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,12,2
chr14	106691778	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=172,150;MMQ=60,25;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:14,0:18,3:0|1:106691778_T_A:106691778:15,17,1,2
chr14	106691796	.	GTAA	G	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=172,158;MMQ=60,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,4:0.118:40:15,0:19,4:0|1:106691778_T_A:106691778:13,23,1,3
chr14	106691800	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=172,150;MMQ=60,40;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.102:37:14,0:19,3:0|1:106691778_T_A:106691778:13,21,1,2
chr14	106691868	.	GC	G	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=152,65;MMQ=40,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.230:24:9,3:10,2:0|1:106691868_GC_G:106691868:12,7,2,3
chr14	106691871	.	A	AG	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=152,65;MMQ=40,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:9,3:10,2:0|1:106691868_GC_G:106691868:13,7,2,3
chr14	106691875	.	CT	TC	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=32,24;MFRL=152,61;MMQ=40,53;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:10,2:13,2:0|1:106691868_GC_G:106691868:16,7,1,3
chr14	106725138	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=204,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.612:14:3,4:2,2:4,1,8,1
chr14	106725644	.	CCA	C	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=169,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.127:45:22,1:17,4:0|1:106725644_CCA_C:106725644:17,23,2,3
chr14	106725647	.	A	ATG	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=169,64;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.128:45:22,1:17,4:0|1:106725644_CCA_C:106725644:17,23,2,3
chr14	106725653	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:18,1:18,1:0|1:106725644_CCA_C:106725644:15,24,1,1
chr14	106733223	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=149,144;MMQ=60,38;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.143:33:13,2:14,2:0|1:106733223_T_G:106733223:16,13,2,2
chr14	106733228	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=146,143;MMQ=60,40;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:14,1:14,2:0|1:106733223_T_G:106733223:15,13,1,2
chr14	106733254	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=149,139;MMQ=60,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:8,1:13,1:11,10,1,1
chr14	106733437	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=184,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:11,2:9,4:9,12,3,3
chr14	106733458	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.345:24:8,2:8,6:0|1:106733458_G_A:106733458:6,10,5,3
chr14	106733461	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:7,1:8,5:0|1:106733458_G_A:106733458:6,10,4,3
chr14	106733463	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:7,1:6,5:0|1:106733458_G_A:106733458:6,9,3,3
chr14	106780634	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.275:23:11,3:6,3:6,11,2,4
chr14	106780668	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=156,105;MMQ=60,29;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=52.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.511:43:15,0:6,21:8,13,0,22
chr14	106780757	.	G	GTC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=196,216;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,0:6,2:0|1:106780757_G_GTC:106780757:8,8,1,1
chr14	106780760	.	TCC	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=211,216;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:0|1:106780757_G_GTC:106780757:8,9,1,1
chr14	106780801	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=218,229;MMQ=48,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,4:4,1:5,5,3,2
chr14	106781023	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=150,114;MMQ=60,39;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,0:6,3:3,9,2,1
chr14	106805772	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr14	106815662	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr14	106877551	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr14	106926146	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=152,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:9,1:6,4:10,5,4,1
chr14	106926754	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=152,101;MMQ=49,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:0|1:106926754_A_G:106926754:1,6,1,2
chr14	106926770	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=182,110;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:0|1:106926754_A_G:106926754:1,9,0,2
chr14	106993722	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=148,283;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:2,3:5,0:7,1,2,1
chr14	106993938	.	GTAC	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=134,211;MMQ=52,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TAC;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:16,1:6,1:0|1:106993938_GTAC_G:106993938:10,12,1,1
chr14	106993959	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=140,211;MMQ=52,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:17,0:7,1:0|1:106993938_GTAC_G:106993938:14,14,1,1
chr14	107012852	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr14	107034822	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=136,173;MMQ=60,44;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:7,0:8,2:9,6,0,2
chr14	107034846	.	TC	GT	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=27,35;MFRL=154,156;MMQ=60,44;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:8,1:10,2:0|1:107034846_TC_GT:107034846:10,9,1,2
chr14	107034854	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=154,156;MMQ=60,44;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:5,1:9,2:0|1:107034846_TC_GT:107034846:8,9,1,2
chr14	107034863	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=136,156;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:4,1:6,2:0|1:107034846_TC_GT:107034846:5,7,1,2
chr14	107034869	.	AG	CA	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=27,34;MFRL=161,134;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:4,2:8,2:0|1:107034846_TC_GT:107034846:5,7,1,3
chr14	107034873	.	GA	CC	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=186,134;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:4,2:7,2:0|1:107034846_TC_GT:107034846:6,7,1,3
chr14	107035020	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:18,2:14,2:21,12,2,2
chr14	107035038	.	GG	AT	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:18,2:13,1:0|1:107035038_GG_AT:107035038:20,11,2,1
chr14	107035042	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:20,2:12,1:0|1:107035038_GG_AT:107035038:19,13,2,1
chr14	107035064	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=162,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:16,1:11,0:0|1:107035064_G_A:107035064:17,14,2,0
chr14	107035066	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=33,25;MFRL=162,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:17,1:11,1:0|1:107035064_G_A:107035064:15,14,2,0
chr14	107035068	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=162,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:17,1:12,1:0|1:107035064_G_A:107035064:15,14,2,0
chr14	107048608	.	TCC	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=225,264;MMQ=40,30;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=C;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,1:9,1:10,1,2,0
chr14	107048654	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=215,188;MMQ=52,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0|1:107048654_A_G:107048654:2,1,3,0
chr14	107048656	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=215,188;MMQ=52,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0|1:107048654_A_G:107048654:2,1,3,0
chr14	107048988	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=185,208;MMQ=40,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:0|1:107048988_A_G:107048988:6,2,0,2
chr14	107048996	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=185,208;MMQ=40,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:3,1:0|1:107048988_A_G:107048988:6,2,0,2
chr14	107049049	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=163,123;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr14	107078395	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=154,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,0:6,3:6,8,2,1
chr14	107082637	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=190,150;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,0,2
chr14	107083725	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=136,218;MMQ=40,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.158:23:14,3:4,0:0|1:107083725_C_T:107083725:8,12,3,0
chr14	107083740	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=155,120;MMQ=40,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,13:0.538:24:5,11:5,2:1|0:107083725_C_T:107083725:5,6,6,7
chr14	107095498	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=148,242;MMQ=44,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:1,5:3,1:0|1:107095498_G_C:107095498:1,3,2,4
chr14	107095500	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=148,242;MMQ=44,34;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:1,5:3,1:0|1:107095498_G_C:107095498:1,3,2,4
chr14	107095503	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=148,242;MMQ=44,34;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:1,4:3,1:0|1:107095498_G_C:107095498:1,3,2,4
chr14	107095616	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=143,171;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:0,1,2,2
chr14	107114009	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=180,176;MMQ=40,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:5,8:2,3:1,6,6,5
chr14	107114193	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,26:0.675:38:8,15:4,11:7,5,11,15
chr14	107114213	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=153,286;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,2:9,1:8,14,2,1
chr14	107114310	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=204,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:1,11,1,1
chr14	107130977	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=168,162;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,1,1
chr14	107131072	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=179,115;MMQ=50,37;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:6,0:6,1:0|1:107131072_G_A:107131072:6,7,1,1
chr14	107131076	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=179,115;MMQ=49,37;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:7,1:0|1:107131072_G_A:107131072:6,7,1,1
chr14	107131349	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=228,286;MMQ=40,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,1,1
chr14	107131528	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=175,81137;MMQ=60,29;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:13,1:10,5:13,10,0,6
chr14	107169846	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:6,0,6,0
chr14	107170207	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=161,219;MMQ=60,57;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.200:38:20,4:11,3:18,13,3,4
chr14	107170219	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=178,193;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.261:36:19,3:8,6:15,12,4,5
chr14	107170243	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=163,250;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.285:33:16,4:8,5:12,12,6,3
chr14	107170398	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=36,28;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.495:20:3,9:7,0:3,7,3,7
chr14	107170410	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,6:8,0:2,11,1,5
chr14	107170472	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,4:4,0:0,8,0,4
chr14	107170485	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:0,7,0,3
chr14	107178748	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0|1:107178748_A_G:107178748:0,0,12,0
chr14	107178770	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0|1:107178748_A_G:107178748:0,0,16,1
chr14	107178773	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=78.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,5:0,10:0|1:107178748_A_G:107178748:0,0,16,2
chr14	107178775	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,5:0,11:0|1:107178748_A_G:107178748:0,0,16,2
chr14	107178795	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=97.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,17,7
chr14	107178832	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,49;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,16:0,13:0,0,13,17
chr14	107198866	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr14	107198874	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=177,189;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.203:13:3,1:5,1:9,2,2,0
chr14	107198901	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=123,182;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:7,3:10,1:10,7,3,1
chr14	107211283	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=165,0;MMQ=60,23;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:11,1:18,2:11,18,3,0
chr14	107282836	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=29,29;MFRL=193,115;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.207:27:8,2:14,1:0|1:107282836_T_A:107282836:11,11,2,3
chr14	107282846	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=34,20;MFRL=193,115;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.214:26:8,2:13,3:0|1:107282836_T_A:107282836:10,11,2,3
chr14	107282852	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=8;MBQ=29,27;MFRL=187,125;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.226:29:8,2:14,4:0|1:107282836_T_A:107282836:12,11,3,3
chr14	107282859	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=187,115;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.200:28:8,1:15,4:0|1:107282836_T_A:107282836:12,11,2,3
chr14	107282872	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=28,29;MFRL=175,115;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:7,1:13,4:12,8,2,3
chr14	107282909	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=27,30;MFRL=182,140;MMQ=60,46;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:12,1:8,3:12,8,2,2
chr14	107282926	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=28,25;MFRL=193,107;MMQ=60,46;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.152:31:12,1:13,3:0|1:107282926_A_T:107282926:11,16,1,3
chr14	107282935	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=8;MBQ=28,28;MFRL=187,135;MMQ=60,45;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,5:0.166:34:13,1:14,4:0|1:107282926_A_T:107282926:12,17,1,4
chr14	107283150	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=214,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:22,2:7,1:0|1:107283150_G_T:107283150:8,22,2,1
chr14	107283156	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=24,36;MFRL=214,292;MMQ=60,50;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:23,2:10,0:0|1:107283150_G_T:107283150:11,23,2,0
chr14	107283160	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=214,292;MMQ=60,50;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:24,2:11,0:0|1:107283150_G_T:107283150:13,22,2,0
chr15	20657855	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=208,157;MMQ=25,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr15	20666397	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=174,255;MMQ=27,27;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr15	20740321	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,10;MFRL=135,377;MMQ=53,55;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:20740321_C_A:20740321:0,1,1,0
chr15	20740327	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=135,377;MMQ=53,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20740321_C_A:20740321:0,1,1,0
chr15	22382728	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=157,178;MMQ=27,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,4:4,3:4,5,4,3
chr15	22382739	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr15	22383064	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=121,165;MMQ=40,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:5,2:4,9:3,6,7,4
chr15	22383066	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=152,125;MMQ=54,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:5,2:1,12:1,5,9,5
chr15	22414393	.	CA	C,CAAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=36,33,35;MFRL=205,226,256;MMQ=60,58,60;MPOS=18,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,14;RU=A;STR;TLOD=3.42,6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,7:0.149,0.455:15:2,1,2:4,1,5:0,6,4,5
chr15	22835874	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=149,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:22835874_T_G:22835874:5,10,1,1
chr15	22835883	.	G	GCAAGACCCTGTT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:8,2:0|1:22835874_T_G:22835874:6,11,1,1
chr15	22848150	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=221,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.641:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr15	22851110	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=148,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:2,8,0,2
chr15	22866621	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=223,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr15	22867111	.	GAA	G,GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=18,32,32;MFRL=0,216,0;MMQ=60,60,60;MPOS=27,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.93,5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.334,0.447:6:0,2,1:0,0,1:0,1,0,5
chr15	22869860	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,236;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,1:6,2:7,3,3,0
chr15	22926171	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=190,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr15	22928537	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr15	22929905	.	CA	GG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=193,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0|1:22929905_CA_GG:22929905:0,4,2,3
chr15	22929906	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=366,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,8:0.811:9:1,3:0,5:1|0:22929905_CA_GG:22929905:0,1,2,6
chr15	22933691	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=187,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:3,5,0,6
chr15	22936003	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=230,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.663:9:2,4:1,2:0,3,0,6
chr15	22940670	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr15	22940866	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=217,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,5:4,2:2,3,2,5
chr15	22955307	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=16,24;MFRL=224,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.802:8:0,6:0,0:0,1,1,6
chr15	22956626	.	A	AAACCACTACTTCATTCCCACCTCTCAGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=176,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:22956626_A_AAACCACTACTTCATTCCCACCTCTCAGT:22956626:0,5,0,2
chr15	22956628	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=176,72;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:22956626_A_AAACCACTACTTCATTCCCACCTCTCAGT:22956626:0,5,0,2
chr15	22960938	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=122,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:8,1:3,2:2,9,1,2
chr15	23000272	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr15	23006707	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:8,3:11,5:12,7,4,4
chr15	23006910	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=168,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr15	23019851	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=187,1634326;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,0:9,2:4,8,1,1
chr15	23052632	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr15	23086364	.	GGCC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	23811592	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=202,180;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:3,3:4,2:2,5,2,3
chr15	23812543	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,142;MMQ=60,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.333:37:5,12:20,0:13,12,12,0
chr15	23891018	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=134,103;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:4,3:4,0:6,3,3,0
chr15	24923844	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,3:8,0:6,6,3,0
chr15	24925054	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=130,97;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:18,1:12,2:22,8,3,0
chr15	24925129	.	GGTTTGTTT	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=GTTT;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:4,1:4,1:2,7,1,1
chr15	24925133	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,36;MFRL=128,342;MMQ=60,57;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:8,1:10,1:12,6,1,1
chr15	24925172	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=161,342;MMQ=60,57;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:3,1:1,8,1,1
chr15	24925484	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:2,2:5,0:2,6,0,2
chr15	24925755	.	TTGTGTG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;RPA=9,6;RU=TG;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.309:8:3,0:0,2:4,2,2,0
chr15	24926526	.	TGATA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=318,258;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GATA;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:1,1,1,1
chr15	25219512	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=169,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,2,3
chr15	25616863	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=162,177;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,0:4,4:2,7,4,0
chr15	25650695	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=179,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:6,2:1,4:2,5,3,3
chr15	25925195	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=197,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,5:3,0:6,0,4,1
chr15	25925536	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=197,194;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:4,0:5,5:0|1:25925536_T_C:25925536:0,9,0,6
chr15	25925539	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=197,194;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.411:15:3,0:5,6:0|1:25925536_T_C:25925536:0,9,0,6
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chr15	25981190	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=205,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.618:27:3,3:7,13:10,0,12,5
chr15	25981367	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=250,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr15	26026139	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=277,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,5:0,7:1,0,9,3
chr15	26793203	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=180,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:6,8,1,1
chr15	26806064	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=241,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:0,2,7,2
chr15	26866707	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:1,1:0,0:0|1:26866707_G_GT:26866707:0,1,0,1
chr15	26866710	.	A	AAAAAAACACATG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:26866707_G_GT:26866707:0,1,0,1
chr15	26866713	.	T	TATGGGTA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:26866707_G_GT:26866707:0,1,0,1
chr15	26866738	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	27018187	.	TGCC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr15	27018937	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=168,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:2,4,1,2
chr15	27160003	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=162,55;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,1:5,1:5,6,2,0
chr15	27188353	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	27772505	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr15	27772767	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=215,57;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,1:7,3:5,9,4,0
chr15	28096453	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=197,243;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:1,1:1,2:3,0,3,0
chr15	28116275	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,1:2,9:4,0,6,4
chr15	28200408	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr15	28211758	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr15	28228644	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr15	28263758	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=229,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:28263758_GC_G:28263758:0,5,1,1
chr15	28263761	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=229,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,0:0|1:28263758_GC_G:28263758:0,5,1,1
chr15	28263764	.	CGCCAGACG	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=230,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:3,0:0|1:28263758_GC_G:28263758:0,7,1,1
chr15	28272981	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=179,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:1,2:7,0:7,1,2,0
chr15	28356859	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=197,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.720:16:3,5:1,6:4,0,11,1
chr15	28357230	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr15	28359744	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr15	28361764	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,9,2
chr15	28377196	.	C	CCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr15	28377772	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr15	28380727	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=157,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,0:9,2:0|1:28380727_C_G:28380727:14,7,1,1
chr15	28380731	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=157,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,0:8,2:0|1:28380727_C_G:28380727:13,7,1,1
chr15	28414828	.	TG	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=171,132;MMQ=60,23;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.449:27:6,0:9,11:4,11,0,12
chr15	28419497	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr15	28437061	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr15	28447444	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=154,232637;MMQ=60,22;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,22:0.441:50:18,22:10,0:16,12,22,0
chr15	28447470	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=118,232795;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:21,0:17,2:0|1:28447470_C_T:28447470:25,14,0,2
chr15	28447484	.	A	AT	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=136,232795;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:23,0:19,2:0|1:28447470_C_T:28447470:26,18,0,2
chr15	28447485	.	C	CGTTT	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=138,232795;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:24,0:19,2:0|1:28447470_C_T:28447470:27,18,0,2
chr15	28447488	.	A	ACCCAGGAGGCGGAG	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=138,232795;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:22,0:19,2:0|1:28447470_C_T:28447470:26,19,0,2
chr15	28473275	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=197,241;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr15	28478799	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.343:30:11,6:9,4:9,11,6,4
chr15	28478981	.	C	CCGTCACACA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=134,403237;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.216:16:5,0:8,3:0|1:28478981_C_CCGTCACACA:28478981:3,10,0,3
chr15	28478983	.	G	GGTCCGTCATTCAT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=134,403237;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.216:16:5,0:7,3:0|1:28478981_C_CCGTCACACA:28478981:3,10,0,3
chr15	28508197	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=182,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:12,2:14,0:0|1:28508197_G_A:28508197:17,9,1,1
chr15	28508199	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=182,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,2:14,0:0|1:28508197_G_A:28508197:17,9,1,1
chr15	28515919	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=153,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.162:22:7,3:12,0:8,11,2,1
chr15	28517261	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=29,29;MFRL=249,229;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:13,0:3,2:16,0,3,0
chr15	28517282	.	TG	GC	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=249,211;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:14,0:5,3:0|1:28517282_TG_GC:28517282:19,1,4,0
chr15	28517287	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=27,30;MFRL=227,211;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:7,0:6,2:0|1:28517282_TG_GC:28517282:13,1,4,0
chr15	28517291	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=245,187;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:7,1:4,2:0|1:28517282_TG_GC:28517282:9,2,3,0
chr15	28517295	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=30,33;MFRL=239,190;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:7,1:4,3:0|1:28517295_A_G:28517295:10,2,4,0
chr15	28517303	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=29,27;MFRL=232,190;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:8,1:6,3:0|1:28517295_A_G:28517295:11,4,4,0
chr15	28517305	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=27,28;MFRL=231,190;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:8,1:7,3:0|1:28517295_A_G:28517295:12,4,4,0
chr15	28517310	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=34,30;MFRL=231,187;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.260:21:8,2:8,3:0|1:28517295_A_G:28517295:12,4,5,0
chr15	28517539	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=210,229;MMQ=58,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:0|1:28517539_G_A:28517539:1,5,0,2
chr15	28517546	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=210,229;MMQ=58,44;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:3,0:2,1:0|1:28517539_G_A:28517539:1,5,0,2
chr15	28517938	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=273,331;MMQ=60,41;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:28517938_T_C:28517938:3,0,1,0
chr15	28517946	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=273,331;MMQ=60,41;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:28517938_T_C:28517938:3,0,1,0
chr15	28517951	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,36;MFRL=249,331;MMQ=60,41;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:28517938_T_C:28517938:4,0,1,0
chr15	28518179	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=165,266;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:28518179_A_G:28518179:0,5,0,2
chr15	28518184	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=165,266;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:3,1:0|1:28518179_A_G:28518179:0,5,0,2
chr15	28518217	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=159,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:11,2:4,1:0,15,0,3
chr15	28518228	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=159,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.191:19:12,2:4,1:0|1:28518228_A_G:28518228:0,16,0,3
chr15	28518234	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=159,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:6,2:3,1:0|1:28518228_A_G:28518228:0,17,0,3
chr15	28769090	.	A	AATTGACAATCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=181,36;MMQ=27,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,2:1,0:3,2,1,1
chr15	29368221	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:1,3,1,1
chr15	29385204	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr15	29386593	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=56,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.819:8:1,3:0,4:1,0,2,5
chr15	29409214	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.219:15:5,0:3,1:8,4,0,3
chr15	29418745	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,0,8
chr15	29428556	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=211,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:1,1,3,0
chr15	29429159	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=199,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.595:13:2,5:3,2:5,0,8,0
chr15	29444130	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr15	29544523	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr15	29993859	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=164,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.177:20:10,0:7,3:8,9,1,2
chr15	30011963	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=178,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:5,8:5,0:0|1:30011963_A_C:30011963:10,0,8,0
chr15	30011968	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=178,194;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:4,6:3,0:0|1:30011963_A_C:30011963:8,0,8,0
chr15	30018553	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=194,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:3,2,4,1
chr15	30927867	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=122,132;MMQ=52,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,1,3
chr15	31203093	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr15	31217297	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=172,192;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:8,5:9,0:16,1,5,0
chr15	31218164	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=183,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,4:0,1:1,2,1,4
chr15	31220709	.	TTG	T,TTGTG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27,24;MFRL=188,219,105;MMQ=60,60,58;MPOS=15,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=TG;STR;TLOD=4.56,3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.300,0.295:7:1,1,0:2,1,1:2,1,4,0
chr15	31235005	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,2:2,1:8,0,3,0
chr15	31235357	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr15	31244083	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=276,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr15	31244263	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr15	31245880	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr15	31246972	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:14,4,1,1
chr15	31251333	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.829:9:0,5:1,3:1,0,2,6
chr15	31251366	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=193,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr15	31253221	.	ACCT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=125,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CCT;STR;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.447:7:0,2:2,1:1,3,1,2
chr15	31269235	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=219,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr15	31294672	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,87;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,0:7,3:3,11,0,3
chr15	31318567	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr15	31320703	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,62;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,1:5,1:1,14,0,2
chr15	31338500	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,0:5,2:2,6,0,2
chr15	31341564	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,1:2,4:5,1,4,1
chr15	31355516	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=171,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:0|1:31355516_G_A:31355516:4,9,0,2
chr15	31355520	.	ATA	TCT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.186:14:6,0:3,2:1|0:31355516_G_A:31355516:3,9,0,2
chr15	31355529	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,2:0.158:17:10,0:4,2:1|0:31355516_G_A:31355516:3,12,0,2
chr15	31355530	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,2:0.158:17:10,0:4,2:1|0:31355516_G_A:31355516:3,12,0,2
chr15	31357138	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=247,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:2,0,3,1
chr15	31359443	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=165,89;MMQ=60,52;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:4,0:3,2:2,6,0,2
chr15	31359457	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=207,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr15	31369223	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=143,253;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr15	31369258	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr15	31779595	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=184,265;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:4,4,1,3
chr15	31779838	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=197,286;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr15	31823108	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=161,255;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr15	32393660	.	A	AAG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=211,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.206:12:6,1:4,1:0|1:32393660_A_AAG:32393660:0,10,0,2
chr15	32393663	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.938:12:0,7:0,5:0|1:32393660_A_AAG:32393660:0,0,0,12
chr15	32446202	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,390;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	32450062	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	32926076	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:4,0,6,0
chr15	32971934	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=151,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,1:3,1:7,3,2,0
chr15	33023385	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=163,77;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,3:8,0:8,13,3,0
chr15	33026299	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=167,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:10,0:19,3:14,15,1,2
chr15	33200867	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:1,5,0,4
chr15	33218472	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,17;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.604:8:3,1:0,1:2,1,2,3
chr15	33256217	.	T	TACACAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,19;RU=AC;STR;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.856:4:0,1:0,0:0,0,4,0
chr15	33765761	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,5:3,3:0,4,4,4
chr15	33765803	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.845:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr15	33795950	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=163,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:6,6,1,1
chr15	33822953	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=203,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,3:3,0:0,6,0,3
chr15	33842260	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=291,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr15	33872143	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:6,1,2,1
chr15	33872177	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:5,2:8,1,2,1
chr15	33872401	.	C	CGCTATATAAACTAGAAACAAACCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=223,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	33872438	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=233,253;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr15	33873657	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.816:9:1,3:0,5:1,0,8,0
chr15	33873901	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=165,239;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,1:8,2:1,10,0,3
chr15	33876517	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,37;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr15	33876543	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr15	33893567	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=217,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:7,1:1,3:7,1,4,0
chr15	33893769	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=192,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,26:0.900:28:2,11:0,15:1,1,5,21
chr15	33893828	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=163,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,4:0,4:0,1,1,7
chr15	33895573	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=132,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:3,2:5,6:2,6,3,6
chr15	33920662	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=238,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:1,0:2,3:1,2,3,1
chr15	33922183	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=166,66;MMQ=60,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:33922183_T_A:33922183:9,6,1,1
chr15	33922189	.	A	AGCGATATG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=166,66;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:33922183_T_A:33922183:9,6,1,1
chr15	33922191	.	G	GGACAATTGCAGAAAAGGAAATAT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=165,66;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.156:18:7,0:7,1:0|1:33922183_T_A:33922183:10,6,1,1
chr15	33923314	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=279,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr15	33925364	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=127,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr15	33936554	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,1:8,1:4,13,2,0
chr15	33952723	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,255;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr15	33962559	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,9,2
chr15	33988758	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,2:3,0:0,8,0,2
chr15	33990250	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr15	33990294	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=220,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,4:0,0:0,2,0,4
chr15	33993320	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=125,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:8,1:3,1:6,7,0,2
chr15	34016274	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,7,8
chr15	34030865	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=198,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr15	34030887	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=231,291;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr15	34032225	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=73,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,4:3,1,1,4
chr15	34060740	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr15	34064043	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr15	34065658	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=230,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr15	34094048	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=237,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,2,2
chr15	34094187	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=204,111;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:6,0:11,4:0|1:34094187_A_T:34094187:7,10,0,4
chr15	34094189	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=204,111;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:6,0:11,4:0|1:34094187_A_T:34094187:7,10,0,4
chr15	34094201	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=236,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.645:15:1,3:4,6:1,4,3,7
chr15	34099822	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=206,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:7,6:4,2:0,11,3,6
chr15	34103272	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr15	34111876	.	A	AAAAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=AAAT;STR;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr15	34112865	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:6,0,4,1
chr15	34112906	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=148,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.669:15:1,5:2,5:3,2,5,5
chr15	34113054	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=228,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:0,2:1,3:0,1,1,4
chr15	34113592	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:5,1:3,2:4,4,1,2
chr15	34115088	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=249,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:3,0,4,0
chr15	34117927	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=160,318;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:34117927_T_C:34117927:0,4,0,1
chr15	34117945	.	TTTC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=226,318;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:34117927_T_C:34117927:0,4,0,1
chr15	34117947	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,4:0.841:4:0,3:0,1:1|0:34117927_T_C:34117927:0,0,0,4
chr15	34117954	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=270,245;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr15	34118994	.	C	CAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr15	34134279	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=161,83;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr15	34135826	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr15	34136971	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	34137292	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr15	34140452	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=178,107;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.428:14:4,5:4,0:7,1,6,0
chr15	34146886	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,8:0,0,6,3
chr15	34146922	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,6:0,12:0,0,9,10
chr15	34151985	.	GC	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	34156284	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr15	34156312	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,7:0,0,8,4
chr15	34159969	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=204,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.285:18:7,1:6,2:4,9,2,3
chr15	34356815	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=191,121;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:9,5:6,0:9,6,5,0
chr15	34357152	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=156,186;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,2:12,0:12,12,2,0
chr15	34380216	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.322:10:3,1:3,2:4,3,1,2
chr15	34397003	.	CA	GG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34397003_CA_GG:34397003:0,0,1,0
chr15	34397009	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,216;MMQ=60,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34397003_CA_GG:34397003:0,0,1,0
chr15	34397013	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,24;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34397003_CA_GG:34397003:0,0,1,0
chr15	34397019	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,216;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34397003_CA_GG:34397003:0,0,1,0
chr15	34397866	.	AAC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=244,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.728:5:0,2:1,2:1,0,1,3
chr15	34434467	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=209,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,8:0,6:1,0,10,4
chr15	34440800	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=184,136;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:6,5:7,0:8,5,5,0
chr15	34521962	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=174,101;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,0:11,3:9,10,0,3
chr15	34527408	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=102,109;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.249:21:13,0:3,4:5,11,0,5
chr15	34537435	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr15	34542606	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=191,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,2:3,2:2,4,0,4
chr15	34543055	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,15,6
chr15	34543259	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=180,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:5,3:2,10,2,1
chr15	34543298	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,0:0,3:0,2,0,4
chr15	34544630	.	GTACATT	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=157,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:34544630_GTACATT_G:34544630:0,7,0,2
chr15	34544638	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=202,96;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:34544630_GTACATT_G:34544630:0,5,0,2
chr15	34544640	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=211,96;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:34544630_GTACATT_G:34544630:0,6,0,2
chr15	34544643	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=211,96;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:34544630_GTACATT_G:34544630:0,6,0,2
chr15	34546451	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr15	34549843	.	ACAG	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=149,81;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CAG;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:14,2:8,1:12,11,1,2
chr15	34549902	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:8,0:15,6:10,14,0,7
chr15	34553130	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=143,102;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:6,2:12,2:8,10,2,2
chr15	34610964	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=185,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr15	34628570	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.460:24:4,8:9,3:10,3,6,5
chr15	34634324	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=123,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,4:3,1:2,5,2,3
chr15	34635200	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=124,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.352:32:10,3:11,8:13,8,7,4
chr15	34635241	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=171,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.256:37:13,2:15,7:14,14,5,4
chr15	34635337	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=171,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:4,13,1,1
chr15	34635369	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=175,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,1:6,3:0,11,0,4
chr15	34640959	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,596;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr15	34643103	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr15	34651290	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=224,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:10,0,2,0
chr15	34654718	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=153,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:1,6:4,4:3,2,9,1
chr15	34655092	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=173,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:4,2:3,10:1,6,4,8
chr15	34656513	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=200,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:9,0:10,1:0|1:34656513_G_C:34656513:6,13,1,1
chr15	34656518	.	G	GTC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=201,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:34656513_G_C:34656513:5,13,1,1
chr15	34656519	.	A	AGATAATATTG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=201,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:34656513_G_C:34656513:5,13,1,1
chr15	34678807	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=120,252;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:2,3:3,0:3,2,1,2
chr15	35045276	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:7,3:9,2:5,12,3,2
chr15	35045312	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,9,10
chr15	35084215	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr15	35084773	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=124,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:0|1:35084773_G_A:35084773:5,6,1,1
chr15	35084777	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:35084773_G_A:35084773:5,7,1,1
chr15	35168056	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,2,1
chr15	35174666	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=115,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.701:10:0,2:2,4:0,3,4,3
chr15	35196492	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr15	35207397	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr15	35219164	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=114,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,3:1,0:4,1,3,0
chr15	35230924	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=131,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,6:2,2:1,2,6,2
chr15	35230934	.	A	ATAGT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr15	35234130	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=186,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:0,0:5,2:4,1,2,0
chr15	35261649	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr15	35664298	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:4,3,5,2
chr15	35664406	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.547:11:4,3:1,3:0,5,0,6
chr15	35665694	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=160,35;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:6,4,1,1
chr15	35674184	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=274,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr15	35834547	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.916:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr15	36937405	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,9,5
chr15	36937550	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=206,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:1,6,0,2
chr15	36937606	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	36946441	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr15	36949952	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,12,4
chr15	36984409	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=203,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.826:21:1,8:2,10:0,3,5,13
chr15	36989469	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=221,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:3,1,1,2
chr15	37375938	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:8,7:9,5:12,5,9,3
chr15	37386615	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=151,122;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:3,2:11,0:14,0,2,0
chr15	37386705	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,67;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.134:27:9,1:15,2:8,16,1,2
chr15	37390440	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=110,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,1:2,3:4,3,2,2
chr15	37391752	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:5,2:7,1:1,12,0,3
chr15	38228475	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=201,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:6,4:9,0:14,1,3,1
chr15	38228992	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=204,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:7,0,3,0
chr15	38230437	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=121,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.524:17:2,3:6,6:3,5,4,5
chr15	38233301	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=115,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:2,3:9,1:6,5,3,1
chr15	38617113	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:38617113_C_T:38617113:0,0,0,5
chr15	38617115	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:38617113_C_T:38617113:0,0,0,5
chr15	38631840	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr15	38631920	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=209,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:1,3,3,0
chr15	38631930	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr15	38632148	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,5:0,5:0,0,0,11
chr15	38641773	.	G	GTT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0|1:38641773_G_GTT:38641773:0,0,0,7
chr15	38641774	.	A	AAAT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0|1:38641773_G_GTT:38641773:0,0,0,7
chr15	38641777	.	G	GTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:38641773_G_GTT:38641773:0,0,0,4
chr15	38762701	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=245,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr15	38792430	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=238,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:2,5,1,1
chr15	38795432	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=113,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:8,4:0,0:5,3,4,1
chr15	38988760	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:6,1,5,0
chr15	38990769	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=149,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:5,0:2,3:3,5,0,3
chr15	38990803	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=236,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:0,2,1,2
chr15	39545320	.	GT	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=113,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.434:19:5,5:3,3:5,6,4,4
chr15	39546537	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=196,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:5,1:6,2:5,7,2,1
chr15	39876412	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:2,8:0,5:0,2,4,9
chr15	39879517	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr15	39882060	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=182,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:9,4,1,1
chr15	39884667	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=179,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:12,0,2,0
chr15	39884817	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=178,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:8,3:15,0:12,12,2,1
chr15	39885533	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=182,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:11,3:7,2:15,3,4,1
chr15	39887529	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=153,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:12,3:6,2:9,9,5,0
chr15	39887649	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,1:4,1:3,8,1,1
chr15	40030440	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr15	40062825	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=143,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:6,2:4,0:3,7,0,2
chr15	40062838	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=146,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,2:3,1:2,8,0,3
chr15	40062855	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=155,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr15	40062884	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=161,295;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr15	40093501	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,1:8,1:10,7,0,2
chr15	40231625	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=218,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr15	40235552	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=55,316;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.277:5:2,1:2,0:2,2,1,0
chr15	40241507	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=176,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:6,2:0|1:40241507_C_G:40241507:2,13,1,1
chr15	40241513	.	GGAT	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=176,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:40241507_C_G:40241507:2,13,1,1
chr15	40253886	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=169,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr15	40254155	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr15	40259519	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=134,221;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr15	40265799	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,5:0,16:0,0,15,7
chr15	40268998	.	G	GGACGAC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=GAC;STR;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,1:4,5:4,6,4,3
chr15	40269052	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,3:5,1:2,5,1,3
chr15	40269102	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr15	40269126	.	T	TTTCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=217,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TTCC;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr15	40270214	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr15	40278192	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=304,222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr15	40282625	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr15	40284523	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr15	40285120	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr15	40300214	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,2:6,6:6,4,7,1
chr15	40313083	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=49.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,7,9
chr15	40322552	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=51.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,6:0,11:0,0,13,4
chr15	40324837	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr15	40327314	.	A	ACTTGGCAAAT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=82,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr15	40327392	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=186,188;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:40327392_TG_CA:40327392:0,1,0,1
chr15	40327396	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=186,188;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:40327392_TG_CA:40327392:0,1,0,1
chr15	40330629	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=140,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.438:16:2,4:7,2:3,6,0,7
chr15	40330693	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr15	40384099	.	GAA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=19,18;MFRL=136,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.136:19:6,0:0,0:4,13,0,2
chr15	40397936	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=215,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,5:1,6:1,0,11,0
chr15	40453307	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=16,31;MFRL=211,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.611:12:0,2:1,4:5,0,7,0
chr15	40453376	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=165,93;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,8:0.175:45:13,6:24,0:20,17,7,1
chr15	40453497	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=135,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.420:31:13,6:5,6:12,6,7,6
chr15	40491952	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:6,5:7,4:4,9,1,8
chr15	40494498	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=188,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,5:3,1:7,0,6,0
chr15	40494952	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=191,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.678:4:1,1:0,2:0|1:40494952_A_T:40494952:0,1,0,3
chr15	40494960	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=191,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:0,1:0|1:40494952_A_T:40494952:0,1,0,3
chr15	40500986	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0,6,0,4
chr15	40509600	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=244,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr15	40557268	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr15	40558744	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	40564576	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=161,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:4,3:5,0:3,7,2,1
chr15	40565705	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,4:3,6:2,4,6,4
chr15	40581159	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=222,99;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:1,3,0,1
chr15	40581164	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=229,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr15	40583093	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	40583458	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr15	40584164	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr15	40588825	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=224,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	40589830	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=215,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:0,6:2,11:1,1,7,10
chr15	40590831	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=170,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:11,9,2,0
chr15	40595414	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr15	40595627	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:0,2,0,5
chr15	40596284	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,35;MFRL=191,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:40596284_A_G:40596284:1,3,0,1
chr15	40596291	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,29;MFRL=191,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:40596284_A_G:40596284:1,3,0,1
chr15	40596295	.	G	GCTT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=35,34;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:40596284_A_G:40596284:0,3,0,1
chr15	40596298	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,26;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:40596284_A_G:40596284:0,3,0,1
chr15	40596303	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:40596284_A_G:40596284:0,3,0,1
chr15	40596304	.	CTG	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=36,31;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:40596284_A_G:40596284:0,3,0,1
chr15	40596310	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=36,27;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:40596284_A_G:40596284:0,3,0,1
chr15	40627777	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=188,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:4,5,0,2
chr15	40628052	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=186,67;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:1,10,0,2
chr15	40628671	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=227,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr15	40630284	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,93;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:10,9,0,2
chr15	40655845	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=214,172;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.725:8:0,2:1,4:2,0,6,0
chr15	40655873	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=238,164;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:3,0,7,1
chr15	40683780	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,4:3,1:0,5,3,2
chr15	40699940	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=156,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,23:0.692:33:3,10:6,13:5,5,10,13
chr15	40700006	.	G	GTT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=208,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:2,6,3,5
chr15	40700022	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=218,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:2,4,4,2
chr15	40703609	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr15	40705105	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=203,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr15	40705159	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=235,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,5:3,0:3,1,1,4
chr15	40708422	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=220,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:2,2,1,2
chr15	40758337	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:1,7,2,1
chr15	40861876	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,279;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,4:3,0:5,5,0,4
chr15	40897445	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=220,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr15	40898643	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,9,5
chr15	40903814	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr15	40907698	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr15	40915277	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=191,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:1,5,1,2
chr15	40916670	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=211,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,1:5,2,1,3
chr15	40920904	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=220,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.295:5:2,0:2,1:0|1:40920904_TA_T:40920904:0,4,0,1
chr15	40920908	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=220,219;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:40920904_TA_T:40920904:0,4,0,1
chr15	40939077	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=323,161;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:4,0,1,0
chr15	40949526	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:2,4,3,1
chr15	40954487	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=187,237;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr15	40998305	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.750:18:2,8:2,6:4,0,13,1
chr15	41032267	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,6:3,1:3,2,7,0
chr15	41047024	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr15	41065890	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=184,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.754:10:1,5:1,3:2,0,6,2
chr15	41066625	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,2:6,3:3,9,3,2
chr15	41071867	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=245,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:0,2:0,1:0,2,1,2
chr15	41099711	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=187,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:4,3:10,3:2,12,4,2
chr15	41099899	.	T	TGGGGC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=201,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGGC;STR;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.493:6:2,1:0,1:2,1,2,1
chr15	41101549	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=128,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.192:34:16,3:12,3:11,17,2,4
chr15	41104874	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr15	41105658	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=463,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,5:0,0:0,1,1,5
chr15	41108092	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=206,145;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=34.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:4,11:3,0:5,2,12,0
chr15	41137321	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=185,291;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	41146581	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:0,6:1,3:0,1,5,4
chr15	41148199	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,7:1,2:3,1,2,7
chr15	41165739	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=247,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:1,3:2,1:0,3,1,4
chr15	41166256	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=196,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,0:1,1:0|1:41166256_G_C:41166256:0,2,0,1
chr15	41166261	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=196,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:41166256_G_C:41166256:0,2,0,1
chr15	41166262	.	C	CTTTTTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=196,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:41166256_G_C:41166256:0,2,0,1
chr15	41166264	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=196,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:41166256_G_C:41166256:0,2,0,1
chr15	41193274	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr15	41224280	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=215,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr15	41224693	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.316:13:1,1:7,2:3,6,2,2
chr15	41272340	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,295;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr15	41275014	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:7,0,2,1
chr15	41313064	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=172,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,3:4,1:5,0,4,0
chr15	41346092	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr15	41348997	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,0:2,9:0,3,0,9
chr15	41364235	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=161,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,0:6,2:2,6,2,0
chr15	41476101	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,9,2
chr15	41476875	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	41483631	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0|1:41483631_T_TA:41483631:0,0,6,3
chr15	41483636	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:41483631_T_TA:41483631:0,0,6,3
chr15	41507865	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	41507883	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=128,174;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr15	41509288	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=262,122;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,1,3
chr15	41509383	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=320,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr15	41570909	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=210,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr15	41571139	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,210;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr15	41571186	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=215,266;MMQ=46,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr15	41624397	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=305,237;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr15	41663884	.	TAAA	T,TAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=23,28,30;MFRL=79,100,141;MMQ=60,60,60;MPOS=14,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.63,14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,5:0.242,0.346:13:3,2,0:1,1,5:1,4,0,8
chr15	41663896	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=100,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.358:14:6,0:2,5:2,7,0,5
chr15	41672441	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=171,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr15	41750096	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=347,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,7:1,5:0,4,0,12
chr15	41766966	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr15	41770636	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,15;MFRL=188,212;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:2,0:6,0,2,0
chr15	41772693	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=230,267;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:3,3,1,1
chr15	41794465	.	GCTCCCGCCCCGCCTGCCCCTCCGCCCT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=146,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.629:3:0,2:0,0:0,1,0,2
chr15	41797506	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=203,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:2,7,0,2
chr15	41797573	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=18,29;MFRL=126,239;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.562:9:1,4:1,1:2,2,5,0
chr15	41800362	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=140,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.193:18:8,3:6,0:8,7,2,1
chr15	41810439	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=223,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41810439_G_C:41810439:0,1,0,1
chr15	41810444	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=223,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41810439_G_C:41810439:0,1,0,1
chr15	41815649	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=213,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr15	41816190	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=188,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:4,1,1,1
chr15	41816259	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:4,2:6,3:9,2,3,2
chr15	41817212	.	A	AATTTTTGTTAAAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=141,35;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:5,2:2,0:2,5,1,1
chr15	41817367	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=184,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr15	41819283	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,2:2,3:5,4,1,4
chr15	41819322	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=208,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:3,8:1,3:2,2,7,4
chr15	41819998	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=225,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr15	41822163	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=214,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:4,3:3,6,4,3
chr15	41822238	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=35,20;MFRL=181,55;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:0|1:41822238_C_T:41822238:0,6,1,1
chr15	41822241	.	ACC	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=181,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:41822238_C_T:41822238:0,6,1,1
chr15	41822244	.	A	AGC	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=181,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:41822238_C_T:41822238:0,6,1,1
chr15	41822248	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=201,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:0,6,1,2
chr15	41822250	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=190,55;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:41822238_C_T:41822238:0,7,1,1
chr15	41823275	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=133,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:10,2:12,3:10,12,3,2
chr15	41827655	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,2:3,4:3,0,6,0
chr15	41827757	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=125,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,2:5,5:3,5,2,5
chr15	41853638	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=263,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:4,3,0,2
chr15	41857216	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:2,2,4,2
chr15	41859759	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=169,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:2,8,0,2
chr15	41860411	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,5,9
chr15	41861012	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=115,51;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,0:2,2:6,1,2,0
chr15	41863181	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:1,5:7,1:5,4,4,2
chr15	41865488	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=227,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,1:6,2:4,4,2,1
chr15	41870008	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=185,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr15	41989280	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	41991036	.	ATT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=124,238;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.279:12:2,1:4,2:7,2,3,0
chr15	41991146	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=119,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.178:15:10,0:2,2:0|1:41991146_TA_T:41991146:7,6,0,2
chr15	41991151	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=119,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.178:15:8,0:3,2:0|1:41991146_TA_T:41991146:7,6,0,2
chr15	41991156	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=119,79;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.159:17:10,0:4,2:0|1:41991146_TA_T:41991146:8,7,0,2
chr15	41991417	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,29;MFRL=194,121;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:0,0:1,5,0,3
chr15	42028354	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr15	42046568	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=168,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr15	42106923	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:8,2:5,4:7,6,3,3
chr15	42111745	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=210,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.508:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr15	42114414	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,11:0,5:0,0,12,4
chr15	42115426	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,8,6
chr15	42120437	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,5,6
chr15	42128855	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=203,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr15	42129055	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=158,241;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,2:5,1:7,5,2,1
chr15	42129158	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=158,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:5,9,1,1
chr15	42129168	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:5,3:4,2:3,6,2,4
chr15	42129176	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.537:15:3,5:2,3:1,6,4,4
chr15	42129373	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:2,2,0,3
chr15	42132896	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=210,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,1:2,4:3,3,0,5
chr15	42133885	.	TG	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=236,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,0,2
chr15	42134301	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=173,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.617:8:1,2:1,3:2,1,4,1
chr15	42134371	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=195,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,3:1,4:3,3,5,2
chr15	42134468	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=142,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:4,1:3,3,0,2
chr15	42134523	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=170,242;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,1,2
chr15	42134652	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=92,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:0,3:1,3:1,0,5,1
chr15	42134839	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.629:11:0,1:3,6:0,4,0,7
chr15	42136977	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=205,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:4,1,2,0
chr15	42137282	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=208,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:1,3,3,3
chr15	42138321	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=174,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.656:12:1,6:2,2:4,0,4,4
chr15	42139030	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:3,5,0,2
chr15	42139038	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:1,2,1,5
chr15	42143145	.	C	CCA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CA;STR;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:4,5:5,4:3,6,3,6
chr15	42143442	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,6:5,2:5,6,4,4
chr15	42143597	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=201,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,2:4,1:1,4,0,3
chr15	42144332	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	42144967	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=245,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=G;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.241:11:4,0:4,2:8,1,1,1
chr15	42144979	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=178,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.357:11:3,0:4,2:6,1,3,1
chr15	42146030	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr15	42147639	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=162,230;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:1,2:4,0,5,1
chr15	42147663	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr15	42148550	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,3:3,4:5,3,4,3
chr15	42154215	.	GGAGA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=199,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.399:3:0,0:1,1:0|1:42154215_GGAGA_G:42154215:1,1,0,1
chr15	42154220	.	TAG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=199,127;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:42154215_GGAGA_G:42154215:1,1,0,1
chr15	42154872	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=232,36;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,2:2,0:2,1,2,0
chr15	42155841	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.662:7:1,2:1,2:2,0,5,0
chr15	42156321	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,294;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr15	42170499	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=172,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr15	42171537	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=132,173;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:2,1:3,3:2,3,3,2
chr15	42171877	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=163,268;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.629:11:1,3:2,4:4,0,4,3
chr15	42172108	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=179,94;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,0:4,3:0,8,0,3
chr15	42182442	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:2,2,1,4
chr15	42185485	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=182,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,2:8,0:9,8,0,2
chr15	42235316	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=157,212;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,0:2,2:4,5,2,0
chr15	42280293	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=200,211;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:8,2:3,0:5,7,0,2
chr15	42289522	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	42292532	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr15	42297092	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,10,2
chr15	42298133	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,8,1
chr15	42305852	.	A	AGAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr15	42362298	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=211,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr15	42362821	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr15	42363576	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=243,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:2,2,2,1
chr15	42363769	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr15	42364652	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr15	42386544	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=202,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:4,0:4,2:8,1,2,0
chr15	42386564	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=200,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:4,1:5,1,2,0
chr15	42436599	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=160,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr15	42437711	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr15	42444871	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:4,4:8,4:6,6,3,5
chr15	42445474	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=169,87;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.166:20:8,0:6,2:15,2,2,1
chr15	42454156	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:8,1,2,0
chr15	42459520	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=195,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:6,5:8,0:13,1,5,0
chr15	42481234	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=217,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr15	42481312	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=166,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.254:10:1,0:5,2:5,3,0,2
chr15	42519136	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr15	42519139	.	A	AGAATGGATATTTACATGTAGGTTGCTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=216,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr15	42520829	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr15	42523341	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=43.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr15	42528676	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=119,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,2:1,3:0,1,0,6
chr15	42529892	.	CTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=305,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:1,1:2,0:0,3,1,0
chr15	42531768	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	42553218	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr15	42560312	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr15	42564369	.	CA	TG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=124.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,7,21
chr15	42568630	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,6,19
chr15	42579822	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	42580106	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr15	42584909	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0,0,14,5
chr15	42602498	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=104,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:9,4,1,1
chr15	42603083	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr15	42619508	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr15	42694944	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=38.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr15	42701688	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=241,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:1,1,1,2
chr15	42703406	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr15	42703886	.	CGGG	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=188,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=G;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.365:6:1,1:3,1:0|1:42703886_CGGG_C:42703886:4,0,2,0
chr15	42703903	.	AC	CA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=24,10;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:0,0:3,0:0|1:42703886_CGGG_C:42703886:3,2,2,0
chr15	42703906	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,17;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.411:8:0,0:4,0:3,2,3,0
chr15	42703911	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,17;MFRL=165,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.242:10:1,0:4,0:0|1:42703886_CGGG_C:42703886:5,3,2,0
chr15	42704105	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr15	42716196	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=159,35;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:9,6,1,1
chr15	42743805	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=152,149;MMQ=60,29;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:7,4:14,0:8,13,4,0
chr15	42743846	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=156,176;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:9,9:7,0:9,7,9,0
chr15	42820451	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr15	42839601	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,165;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.387:42:11,16:14,0:16,10,16,0
chr15	42851422	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,37;MFRL=214,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr15	42851464	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr15	42856020	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=120,221;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:2,7,2,0
chr15	43017769	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=162,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,0:12,2:8,15,0,2
chr15	43018371	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,15;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,0:1,0:2,2,0,2
chr15	43021791	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,246;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:6,2:7,0:8,6,0,2
chr15	43045415	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=192,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:3,5,0,2
chr15	43075531	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	43244699	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=235,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr15	43256121	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr15	43322113	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,5:0,0,6,1
chr15	43324942	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	43328663	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,6,2
chr15	43330175	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr15	43352041	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=60.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,9:1,11:0,1,5,15
chr15	43360287	.	TAAA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,10;MFRL=0,368;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr15	43378499	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,22;MFRL=272,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:43378499_G_T:43378499:0,3,0,1
chr15	43378503	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=272,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:43378499_G_T:43378499:0,3,0,1
chr15	43378508	.	ATGACATAAT	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=272,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:43378499_G_T:43378499:0,3,0,1
chr15	43378522	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=272,154;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:43378499_G_T:43378499:0,3,0,1
chr15	43398107	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=129,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.617:19:5,8:2,4:0|1:43398107_GA_G:43398107:6,1,10,2
chr15	43398108	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=221,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,20:0.908:21:0,13:1,7:1|0:43398107_GA_G:43398107:0,1,18,2
chr15	43430749	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=102,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.305:8:2,1:4,1:5,1,2,0
chr15	43430779	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,10;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.206:16:2,0:8,0:6,7,3,0
chr15	43443993	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:10,0:7,3:12,5,2,1
chr15	43453056	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr15	43478113	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,3,10
chr15	43478511	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,1,15
chr15	43481299	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=281,212;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.724:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr15	43481516	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,11;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:5,0:4,12,2,0
chr15	43483537	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=222,232;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr15	43499393	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=248,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:2,0,4,1
chr15	43525724	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:9,2,2,0
chr15	43527092	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:6,5:10,2:5,11,1,6
chr15	43528070	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=251,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,0:1,10:0,2,10,0
chr15	43568999	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr15	43571219	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=256,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr15	43627277	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,26;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:7,5,1,1
chr15	43678572	.	TATA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,0:1,3:2,0,1,2
chr15	43700229	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:11,2:3,1:10,4,0,3
chr15	43701350	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=245,3937547;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,1,1
chr15	43730486	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=76,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.239:19:5,2:9,2:10,5,4,0
chr15	43783923	.	T	TAG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=173,174;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:10,0:13,2:8,15,0,2
chr15	43784000	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,3,11
chr15	43815018	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=235,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:4,2,2,0
chr15	43817404	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=208,203;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:43817404_G_A:43817404:5,8,1,1
chr15	43817406	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=208,203;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:43817404_G_A:43817404:5,8,1,1
chr15	43821766	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=201,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:6,3:0,1:1,6,4,0
chr15	43890581	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,17;MFRL=191,210;MMQ=30,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.479:8:1,0:2,2:1,3,0,4
chr15	43893087	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,125;MMQ=52,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,14:0.375:38:11,14:13,0:11,13,14,0
chr15	43903237	.	T	TACTTCAAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=143,157;MMQ=60,21;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr15	43939711	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:43939711_T_A:43939711:0,3,0,1
chr15	43939713	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:43939711_T_A:43939711:0,3,0,1
chr15	43939716	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:43939711_T_A:43939711:0,3,0,1
chr15	43939717	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:43939711_T_A:43939711:0,3,0,1
chr15	43939720	.	TA	CT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:43939711_T_A:43939711:0,3,0,1
chr15	43988353	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=249,289;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr15	44053617	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr15	44062874	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	44066517	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.126:22:15,0:4,2:0|1:44066517_G_A:44066517:12,8,1,1
chr15	44066527	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=154,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:15,0:6,2:0|1:44066517_G_A:44066517:13,9,1,1
chr15	44068160	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=224,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:0,12:1,5:0,1,8,9
chr15	44084705	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr15	44089259	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=210,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,0:3,2:5,5,0,2
chr15	44091351	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=60.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,9:0,0,9,11
chr15	44105174	.	TTTTTACTCACGCTTCTCGATCTTCTCTGTCCCTCTTGATTCTTTTTAGCTCTCGAACTTTCCATGCCTCATATTCCTCCTCATCA	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.083:49:11,3:8,0:17,27,4,1
chr15	44127422	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=181,95;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr15	44166570	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:1,2:6,1:4,3,3,0
chr15	44176937	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=104,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:9,7,2,1
chr15	44177055	.	C	CCTT	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:1,1:1,0:0|1:44177055_C_CCTT:44177055:0,2,0,1
chr15	44177056	.	TCCA	T	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=30,27;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:0|1:44177055_C_CCTT:44177055:0,2,0,1
chr15	44177064	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,22;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44177055_C_CCTT:44177055:0,2,0,1
chr15	44177066	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=18,22;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:44177055_C_CCTT:44177055:0,2,0,1
chr15	44177071	.	G	GCAGA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0|1:44177071_G_GCAGA:44177071:0,0,0,1
chr15	44177073	.	T	TGAAGTTTTACTGTCATC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0|1:44177071_G_GCAGA:44177071:0,0,0,1
chr15	44177102	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=236,224;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr15	44211786	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=208,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:3,10,1,1
chr15	44487111	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,37;MFRL=176,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:4,0,1,0
chr15	44630402	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=137,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:6,6,2,0
chr15	44630588	.	G	GCAAAACACTATTCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	44671816	.	GTT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=114,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr15	44671842	.	TC	AA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,15;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:44671842_TC_AA:44671842:2,1,1,0
chr15	44671851	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=207,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:44671842_TC_AA:44671842:1,1,1,0
chr15	44671863	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,15;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:44671842_TC_AA:44671842:2,1,1,0
chr15	44778936	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=168,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:0,1:2,4:0,3,1,5
chr15	44789389	.	T	TATTTAA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:44789389_T_TATTTAA:44789389:0,8,0,2
chr15	44789391	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=35,24;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:44789389_T_TATTTAA:44789389:0,8,0,2
chr15	44789393	.	ATC	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:0|1:44789389_T_TATTTAA:44789389:0,8,0,2
chr15	44789399	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=36,27;MFRL=154,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:44789389_T_TATTTAA:44789389:0,7,0,2
chr15	44792032	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=173,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:5,2:8,5:5,8,4,4
chr15	44816256	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=114,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr15	44843698	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:11,2:16,0:13,14,2,0
chr15	44865649	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,193;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr15	44903083	.	G	GGAGGATC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:4,3,2,0
chr15	44914151	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=164,231;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.382:8:5,3:0,0:1,4,0,3
chr15	44961440	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=192,164;MMQ=60,43;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:7,4:5,0:7,5,4,0
chr15	44964708	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=194,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,0:5,7:0,10,0,7
chr15	45028919	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.728:12:2,5:1,4:1,2,1,8
chr15	45048757	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr15	45059390	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,8,2
chr15	45250704	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=167,137;MMQ=51,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,0:7,6:4,7,0,6
chr15	45250755	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr15	45253674	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=163,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.349:14:1,0:8,5:7,2,4,1
chr15	45270881	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,255;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:1,3,0,3
chr15	45353230	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,11,2
chr15	45357410	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=101,171;MMQ=27,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:1,3:0,6:1,0,7,2
chr15	45361011	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr15	45361180	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=125,158;MMQ=52,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:15,2:6,4:9,12,4,2
chr15	45361274	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=174,229;MMQ=52,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,2:7,0:1,9,0,2
chr15	45364706	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	45365762	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=194,130;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.437:16:5,1:4,5:0,9,1,6
chr15	45365783	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=218,197;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0|1:45365783_C_A:45365783:0,4,0,3
chr15	45365790	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=218,197;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,1:3,1:0|1:45365783_C_A:45365783:0,4,0,3
chr15	45365792	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=218,240;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:2,1:0|1:45365783_C_A:45365783:0,4,0,2
chr15	45387550	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	45388335	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=327,227;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,0:0,4:0,3,4,0
chr15	45391566	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,9,9
chr15	45392075	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,7,9
chr15	45398965	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr15	45399467	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr15	45399692	.	T	TAGTCA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=155,64;MMQ=52,29;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:2,0:4,2:0|1:45399692_T_TAGTCA:45399692:1,5,1,1
chr15	45399694	.	G	GAAACTGCAGTTTGCT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=155,64;MMQ=52,29;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:2,0:4,1:0|1:45399692_T_TAGTCA:45399692:1,5,1,1
chr15	45400164	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr15	45402940	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,16:0,6:0,0,9,13
chr15	45404066	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,9:0,2:0,0,7,4
chr15	45404979	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	45405463	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr15	45406718	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=206,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr15	45408065	.	G	GTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:9,3:13,0:7,16,0,3
chr15	45408691	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:45408691_C_G:45408691:0,0,10,2
chr15	45408699	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0|1:45408691_C_G:45408691:0,0,9,2
chr15	45408710	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr15	45408933	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr15	45409013	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,1,6
chr15	45409196	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	45409271	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	45413322	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=113,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,3:9,0:8,9,1,2
chr15	45424286	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:2,5,0,5
chr15	45427530	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=253,205;MMQ=52,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,2:1,5:1,2,2,6
chr15	45427863	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	45428712	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=160,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:6,3:9,1:8,7,4,0
chr15	45430276	.	A	ATG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,185;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=TG;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.793:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr15	45433646	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:2,2:4,2:0,6,1,4
chr15	45434075	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,24;MFRL=296,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45434075_T_TGG:45434075:1,0,1,0
chr15	45434080	.	CCA	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=266,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:45434075_T_TGG:45434075:2,0,1,0
chr15	45434082	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,12;MFRL=236,296;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:45434082_A_C:45434082:1,0,1,0
chr15	45434088	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,15;MFRL=166,296;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:45434082_A_C:45434082:3,0,1,0
chr15	45434091	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,10;MFRL=183,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,0:2,0,2,0
chr15	45434096	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=17,12;MFRL=187,296;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0|1:45434082_A_C:45434082:4,0,1,0
chr15	45437153	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:10,0:14,5:14,11,0,5
chr15	45439910	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr15	45445499	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=171,199;MMQ=21,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:0,2:5,1:6,0,3,0
chr15	45445572	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=179,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:9,0:13,3:17,7,3,0
chr15	45445746	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=180,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.699:14:2,4:1,5:0,4,0,10
chr15	45446084	.	CAA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=128,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.473:9:2,1:2,2:4,1,3,1
chr15	45453032	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=182,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:3,3:8,2:7,4,4,1
chr15	45456194	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr15	45457106	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=169,78;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:4,3,2,1
chr15	45457127	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=169,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:2,3,2,2
chr15	45460422	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=134,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr15	45545378	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=56,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,3:1,4:2,2,6,1
chr15	45555306	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=154,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,0:10,3:7,10,0,3
chr15	45556829	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,5,1
chr15	45557456	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=142,234;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:0,5,0,4
chr15	45557468	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=142,258;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr15	45557845	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=159,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:4,0:8,2:0|1:45557845_A_AT:45557845:6,6,1,1
chr15	45557846	.	A	ATTCACCTCTGGGGTGAGGACCAC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=159,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,0:8,2:0|1:45557845_A_AT:45557845:6,6,1,1
chr15	45658465	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=167,210;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,0:6,4:5,7,0,4
chr15	45658480	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=179,210;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,0:4,4:5,6,0,4
chr15	45777317	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=153,81;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:12,3,2,0
chr15	45777344	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=180,96;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,3:2,5:2,1,4,4
chr15	45897771	.	GTT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=15,24;MFRL=138,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.221:11:1,0:2,1:0,9,0,2
chr15	45951064	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=193,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr15	45968535	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr15	45981317	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=143,243;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,0:5,4:5,4,1,3
chr15	48053334	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.277:23:9,3:8,3:11,6,3,3
chr15	48055119	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=237,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr15	48056735	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,277;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:5,0,3,1
chr15	48056958	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,271;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,4:4,2:8,3,4,2
chr15	48058455	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr15	48058684	.	GTTGT	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=153,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr15	48058687	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:3,0:0,1:3,0,1,0
chr15	48058700	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=17,14;MFRL=182,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:0,0:1,0:5,0,2,0
chr15	48059137	.	CTT	C,CT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,32,30;MFRL=160,165,212;MMQ=60,60,60;MPOS=16,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.29,8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,2,4:0.140,0.237:19:7,2,2:6,0,2:11,2,6,0
chr15	48059144	.	TTTTTTACTTTTTTAGTTAATTGGAATTCATAAATTTTTGCTTTCTTTTGGTTAC	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=139,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.072:44:11,0:5,3:28,11,3,2
chr15	48059172	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.123:26:8,0:13,0:19,4,3,0
chr15	48413277	.	G	GAGAAGGAGAAGAAAGGGAGAAAGAGAGAAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=141,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:5,6,1,1
chr15	48450517	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	48458049	.	A	AGCATG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=212,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:5,3:9,0:15,0,3,0
chr15	48458051	.	ATATAT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=212,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,3:9,0:15,0,3,0
chr15	48460786	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr15	48494351	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=132,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,0:10,2:4,11,1,1
chr15	48536981	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=170,91;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:5,0:12,4:8,9,2,2
chr15	48539026	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0|1:48539026_A_T:48539026:0,0,9,0
chr15	48539043	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0|1:48539026_A_T:48539026:0,0,8,0
chr15	48541700	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr15	48561834	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.915:21:0,9:1,11:0,1,15,5
chr15	48580573	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=195,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,2:5,2:6,8,3,1
chr15	48584083	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,1:7,1:3,10,0,2
chr15	48634319	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=190,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,2:1,1:0,3,1,2
chr15	48717872	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:4,2:6,4,3,1
chr15	48720526	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=80.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,14:0,8:0,0,13,9
chr15	48729648	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr15	48736684	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr15	48779509	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=150,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:13,4,0,2
chr15	48779549	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:5,3:6,4:9,3,4,3
chr15	48805772	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,123;MMQ=60,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:8,0:12,4:13,7,0,4
chr15	48830007	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=177,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,1:9,2:4,15,1,2
chr15	49048705	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=169,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr15	49074454	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=184,83;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:3,4,0,3
chr15	49083577	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr15	49088198	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=185,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:8,2:10,1:14,5,2,1
chr15	49097733	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=197,174;MMQ=44,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:1,1:2,0,2,2
chr15	49118087	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=387,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:1,0,6,0
chr15	49149828	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	49288880	.	G	GAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AC;STR;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr15	49420816	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=135,238;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr15	49422885	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=197,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:4,1,4,0
chr15	49423098	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=37,31;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr15	49423114	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=179,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr15	49426032	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=151,199;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:9,0:7,5:5,11,0,5
chr15	49426048	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=178,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,4:5,7:4,3,2,9
chr15	49611721	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr15	49620971	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,1:0,0,0,4
chr15	49663405	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr15	49716478	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,2:6,2:7,2,3,1
chr15	49716743	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=152,48;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:8,0:7,3:0|1:49716743_C_T:49716743:9,7,0,3
chr15	49716748	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=152,48;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:7,0:6,3:0|1:49716743_C_T:49716743:7,6,0,3
chr15	49833966	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:4,8,0,2
chr15	49867122	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=236,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:3,0,6,0
chr15	49867148	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=219,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,2:1,5:2,0,7,0
chr15	49867323	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=244,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:1,7:2,3:0,3,2,8
chr15	49869141	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=233,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr15	49907383	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=110,47;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:49907383_G_A:49907383:7,10,1,1
chr15	49907390	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=117,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:7,2:0|1:49907383_G_A:49907383:7,9,1,1
chr15	49907394	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=110,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:6,2:0|1:49907383_G_A:49907383:4,9,1,1
chr15	49907397	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=106,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:49907383_G_A:49907383:3,6,1,1
chr15	49917341	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=137,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,0:5,2:8,5,1,1
chr15	49926871	.	G	GTATAGTCCTATAAGTTTGTCAT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,92;MMQ=52,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:7,2:10,0:8,9,0,2
chr15	50158695	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=211,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,3:6,0:4,10,0,3
chr15	50168813	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=236,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0|1:50168813_A_T:50168813:0,5,0,3
chr15	50168815	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=236,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0|1:50168813_A_T:50168813:0,5,0,3
chr15	50168818	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=242,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,0:3,3:0|1:50168813_A_T:50168813:0,7,0,3
chr15	50189448	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=248,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr15	50254280	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr15	50489677	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,13,4
chr15	50497354	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr15	50521265	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr15	50555550	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,2:10,0:12,9,0,2
chr15	50570999	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr15	50581604	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=188,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:50581604_C_T:50581604:4,0,1,0
chr15	50581607	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=188,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:50581604_C_T:50581604:4,0,1,0
chr15	50581906	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr15	50601811	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr15	50754453	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.273:15:3,3:7,1:4,7,3,1
chr15	50769520	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:5,3:10,0:6,9,1,2
chr15	50781963	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=280,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.826:15:1,5:1,8:2,0,13,0
chr15	50784990	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=169,96;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:8,2:12,1:9,11,2,1
chr15	50786508	.	G	GTAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=225,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:0,6,1,1
chr15	50787955	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	50791099	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=181,236;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:11,8,2,0
chr15	50821945	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=230,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:6,6:1,0:5,2,5,1
chr15	50822067	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=119,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:6,1,0,2
chr15	50822215	.	A	ATT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=278,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=T;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr15	50854029	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=203,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.407:11:2,2:3,2:0,7,1,3
chr15	50873112	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=137,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.388:8:3,2:2,1:2,3,1,2
chr15	50878509	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=22,32;MFRL=256,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr15	50878574	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=258,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:1,5:3,3:4,0,6,2
chr15	50878630	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=144,275;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:6,0:8,2:5,9,1,1
chr15	50885976	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=60,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,4:1,7:0,2,1,10
chr15	50888619	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr15	50899309	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=241,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr15	50901929	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=203,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.678:16:5,10:0,1:3,2,5,6
chr15	50903600	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=452,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr15	50906473	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=130,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:4,6,2,0
chr15	50911865	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=175,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr15	50916575	.	GATTTAC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,218;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	50920509	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=188,228;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr15	50924995	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr15	50926523	.	AAAAT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=128,147;MMQ=43,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAAT;STR;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:0,3:1,5:2,0,2,6
chr15	50941108	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr15	50950141	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=224,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,2,3
chr15	51012100	.	CATAAG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=92,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:1,2,2,0
chr15	51017577	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=174,69;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:0,8,0,2
chr15	51204394	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=161,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	51207818	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=157,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:7,2:6,1:3,10,2,1
chr15	51217475	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr15	51233812	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=246,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:2,14:3,5:2,3,9,10
chr15	51240398	.	ATGCAGTGACTT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=120,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr15	51276128	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	51293164	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=90,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=36.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,5:0,6:2,0,11,0
chr15	51350655	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=190,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.674:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr15	51386892	.	CCGGGCGGCG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGGGCGGCG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	51397262	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:4,2:9,5:6,8,3,4
chr15	51502986	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=219,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,5:3,3:4,2,6,2
chr15	51504811	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=231,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:0,4,0,5
chr15	51507508	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=213,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr15	51510702	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,8:2,2:2,0,8,2
chr15	51510868	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=183,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:1,5,2,5
chr15	51519945	.	A	AAAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=221,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,4:0,3:4,0,5,2
chr15	51520206	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=311,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr15	51529112	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=208,119;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:4,8:6,5:7,3,6,7
chr15	51529265	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=247,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr15	51675625	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=124,116;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.339:28:16,5:3,4:10,9,7,2
chr15	51675880	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=143,295;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:4,1,1,3
chr15	51675932	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=187,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.320:18:8,5:4,0:7,5,4,2
chr15	51675996	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:13,0:10,4:19,5,2,2
chr15	51676117	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=184,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:1,15,0,2
chr15	51689624	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.913:9:0,3:0,4:0,0,8,1
chr15	51692428	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,3:10,0:8,10,3,0
chr15	51743718	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=232,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr15	51748610	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=203,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,0:4,3:0,4,0,3
chr15	51749723	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=169,244;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.280:5:3,1:0,0:0|1:51749723_A_C:51749723:0,4,0,1
chr15	51749725	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=169,244;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:51749723_A_C:51749723:0,4,0,1
chr15	51749726	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr15	51749728	.	A	AGAGTGTCTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=169,244;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:51749723_A_C:51749723:0,4,0,1
chr15	51750609	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	51750652	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=193,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr15	51750846	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:3,8:4,6:4,3,8,6
chr15	51751028	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=138,219;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:6,0:12,7:1,17,0,7
chr15	51751091	.	TAGCAGC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AGC;STR;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr15	51758345	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=199,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.829:16:2,7:0,6:2,0,9,5
chr15	51770456	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.882:14:0,7:1,6:1,0,7,6
chr15	51780722	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,3:9,1:7,10,4,0
chr15	51783981	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=202,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:1,1,1,4
chr15	51792444	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=181,66;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.072:40:17,0:19,2:0|1:51792444_G_T:51792444:3,35,1,1
chr15	51792450	.	AGTTAGT	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=140,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:8,2:0|1:51792444_G_T:51792444:0,14,1,1
chr15	51792459	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=168,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:51792444_G_T:51792444:0,8,1,1
chr15	51857220	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=198,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,1:3,0,4,0
chr15	51914778	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=215,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:1,3,2,4
chr15	51973843	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	51981595	.	GGGGT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=220,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,2:0,2:0,3,1,3
chr15	52017135	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=204,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:9,2:12,3:13,8,3,2
chr15	52017345	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.730:20:2,5:3,10:1,4,4,11
chr15	52060657	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.436:7:1,0:3,2:0,4,1,2
chr15	52090327	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	52185937	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,189;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr15	52186158	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=183,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr15	52192538	.	C	CCTAATTGTACTGAATTGCAAATTGATA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=174,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.241:10:7,2:1,0:2,6,1,1
chr15	52246665	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,3:0,6:1,0,5,4
chr15	52252799	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=227,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:4,0,7,0
chr15	52257874	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=183,358;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:3,1,1,1
chr15	52415086	.	TAC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=321,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	52420489	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=126,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.241:26:12,0:7,5:0|1:52420489_A_C:52420489:9,11,1,5
chr15	52420497	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=126,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:11,0:6,4:0|1:52420489_A_C:52420489:6,12,0,5
chr15	52433415	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,3:10,0:6,12,3,0
chr15	52439786	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=163,121;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.209:22:9,0:9,3:0|1:52439786_T_C:52439786:6,12,0,4
chr15	52439792	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=166,121;MMQ=60,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.252:18:5,0:4,4:0|1:52439786_T_C:52439786:4,10,0,4
chr15	52486335	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=111,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr15	52487523	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=148,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:2,1,6,0
chr15	52503895	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=199,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,4:4,0:4,3,2,2
chr15	52504142	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=204,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr15	52505563	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	52515678	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr15	52527919	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=112,124;MMQ=60,36;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,0:5,3:6,10,0,3
chr15	52534344	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,9:0,0,8,10
chr15	52539650	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=171,347;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:12,2:11,1:9,14,3,0
chr15	52539673	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,11:0,0,11,14
chr15	52548784	.	A	ACACGCGCG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=115,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.863:12:0,1:1,5:1,0,5,6
chr15	52553007	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr15	52564895	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.165:34:16,2:13,2:14,15,1,4
chr15	52569261	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=136,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,0:7,3:7,4,1,2
chr15	52571270	.	G	GTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:1,1:2,0:0,6,0,2
chr15	52575170	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=198,238;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr15	52587880	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr15	52640990	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,20,26;MFRL=157,110,150;MMQ=60,60,60;MPOS=19,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=A;STR;TLOD=4.98,21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,11:0.163,0.527:20:3,0,4:2,2,2:4,2,7,7
chr15	52641120	.	T	TAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=153,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=A;STR;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:7,3:3,1:0,10,0,4
chr15	52667450	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=187,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:8,0,2,1
chr15	52667552	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,7,8
chr15	52668822	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=292,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr15	52671784	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=116,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,3:5,5:5,2,7,1
chr15	52675261	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr15	52681573	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr15	52681643	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=237,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:0,0:2,2:0,3,0,2
chr15	52689526	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,13:0,10:0,0,15,8
chr15	52702699	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr15	52708502	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=163,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,0:9,2:4,15,0,2
chr15	52708534	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,2:2,6:0,7,0,8
chr15	52725334	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,3:3,6:5,3,5,4
chr15	52725364	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=150,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:10,2:0|1:52725364_G_A:52725364:15,10,0,2
chr15	52725369	.	C	CCACTTGCAAATTCCACAAAAAG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=150,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:15,0:10,2:0|1:52725364_G_A:52725364:15,10,0,2
chr15	52821100	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	52844161	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:6,3:7,6:9,4,2,7
chr15	52892477	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.793:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	52893391	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.287:11:5,2:3,1:3,5,2,1
chr15	52897478	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=199,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:0,6,0,5
chr15	52901433	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=184,222;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:3,10:2,5:3,2,8,7
chr15	53230662	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=249,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr15	53815527	.	AAGAG	A,AAG,AAGAGAGAG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,27,28,25;MFRL=177,73,156,166;MMQ=60,60,60,60;MPOS=27,24,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,9,10,13;RU=AG;STR;TLOD=5.17,7.11,5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,2,3,5:0.130,0.175,0.313:16:3,1,1,3:3,1,2,2:0,6,0,10
chr15	53905779	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=185,274;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr15	53997089	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr15	53998314	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr15	54008889	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=114,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.502:22:5,9:5,2:5,6,2,9
chr15	54025176	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=217,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:6,2:8,4:8,6,5,1
chr15	54592355	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=51,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr15	54630758	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr15	54792210	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:10,1,2,0
chr15	54914716	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=231,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr15	54915975	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr15	54918943	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	54919119	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=154,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:6,0:0|1:54919119_G_A:54919119:6,5,1,1
chr15	54919129	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=164,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,2:5,0:0|1:54919119_G_A:54919119:5,7,1,1
chr15	55483104	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=184,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,1,1
chr15	55484826	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,23;MFRL=209,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,1:1,3:6,0,4,0
chr15	55489065	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=178,114;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:9,10:7,7:12,5,9,8
chr15	55489104	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=213,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:8,9:7,5:9,6,7,7
chr15	55497691	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.324:29:11,5:8,4:15,5,5,4
chr15	55516023	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:7,0,3,2
chr15	55612503	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=143,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:20,4:14,0:15,19,4,0
chr15	55613659	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr15	55621889	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=169,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:2,2:5,3:3,4,4,1
chr15	55642932	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=138,200;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:12,7:3,0:6,9,7,0
chr15	55652719	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=170,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.303:18:7,2:4,3:3,10,4,1
chr15	55652845	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=194,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,1:4,3:5,6,2,2
chr15	55710365	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=159,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.473:17:5,3:4,5:0|1:55710365_T_C:55710365:1,8,2,6
chr15	55710369	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0|1:55710365_T_C:55710365:0,0,3,14
chr15	55759193	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=157,193;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.611:25:7,12:3,3:8,2,9,6
chr15	55790444	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=210,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:12,2:12,0:0|1:55790444_G_T:55790444:13,11,0,2
chr15	55790446	.	C	CTGGAAAGGGCCCCTTGTCGT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=210,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,2:12,0:0|1:55790444_G_T:55790444:13,11,0,2
chr15	55841032	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=238,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr15	55881111	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=137,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr15	55912947	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=195,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,0:4,3:2,4,1,2
chr15	55972660	.	CTTT	C,CTT,CTTTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,35,34,35;MFRL=149,174,161,167;MMQ=60,60,60,60;MPOS=28,14,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,10,12,14;RU=T;STR;TLOD=7.13,5.64,3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,3,3,2:0.222,0.260,0.219:11:1,1,1,1:2,2,1,1:2,1,4,4
chr15	55974742	.	T	TTTTATTTA,TTTTATTTATTTA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30,32;MFRL=0,256,219;MMQ=60,40,33;MPOS=14,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,11,12;RU=TTTA;STR;TLOD=3.44,7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.347,0.523:3:0,1,1:0,0,1:0,0,0,3
chr15	56032519	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr15	56032665	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:8,2:7,3:7,8,3,2
chr15	56032975	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr15	56035010	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,6,8
chr15	56122664	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=154,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:1,7:1,5:2,0,8,4
chr15	56125135	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:3,2,2,0
chr15	56125182	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=251,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:2,3,3,1
chr15	56130030	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=156,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:6,3:11,0:10,7,1,2
chr15	56130286	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,5,4
chr15	56130689	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:7,2,2,0
chr15	56144639	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=147,113;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:5,4:13,0:13,5,4,0
chr15	56152598	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr15	56161919	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=194,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,0,3
chr15	56216752	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=148,252;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:7,3,1,1
chr15	56243598	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,52;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,0:8,4:8,5,1,3
chr15	56243766	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=116,71;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:10,4:6,3:10,6,5,2
chr15	56243792	.	TAAAA	T,TAA,TAAA,TAAAAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30,31,18,27;MFRL=0,283,229,157,179;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=19,30,30,22;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=17,13,15,16,18;RU=A;STR;TLOD=5.56,3.66,3.01,3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:0,2,2,2,2:0.182,0.198,0.170,0.358:8:0,1,0,0,2:0,1,2,1,0:0,0,3,5
chr15	56258785	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=182,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,1:5,1:0,12,0,2
chr15	56258809	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=187,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,3:3,1:0,8,0,4
chr15	56387083	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.160:34:19,0:11,4:14,16,4,0
chr15	56390186	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=195,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:9,0,2,0
chr15	56394295	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=169,266;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:9,1:3,3:11,1,4,0
chr15	56434956	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=134,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.254:10:5,1:1,1:7,1,2,0
chr15	56436657	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=124,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:6,6:1,4:3,4,5,5
chr15	56657581	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,11,6
chr15	56719797	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=266,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=61.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,23:0.857:26:1,10:2,13:1,2,11,12
chr15	56720715	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=251,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr15	56721264	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr15	56721406	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,0,10
chr15	56946296	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr15	56946703	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,1:3,1:1,3,0,2
chr15	56959028	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=118,139;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:13,7:3,2:6,10,6,3
chr15	56974684	.	GAAAA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=238,255;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.514:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr15	56981703	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr15	57212226	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:12,0:8,10:3,17,0,11
chr15	57523542	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr15	57524857	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=133,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:2,6:0,3:2,0,8,1
chr15	57526248	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=167,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:10,2:14,1:10,14,1,2
chr15	57555523	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	57731834	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,0:1,2:1,6,0,2
chr15	57732743	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr15	57744311	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr15	57744582	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=205,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:0,2,1,4
chr15	57746071	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=172,277;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr15	57809089	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.249:34:16,0:10,8:10,16,0,8
chr15	57817050	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=301,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr15	57821024	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=139,52;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:7,2:10,3:0|1:57821024_C_T:57821024:4,13,2,3
chr15	57821038	.	T	TTCCCCTTTGCCTTCCACCATATTTGTAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=151,56;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,2:7,1:0|1:57821024_C_T:57821024:2,14,2,1
chr15	57836823	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr15	57838258	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=175,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,4:3,5:3,4,5,4
chr15	57838348	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=162,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.165:26:9,2:13,2:10,12,2,2
chr15	57896508	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=172,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,5:5,0:7,3,5,0
chr15	57896658	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=196,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr15	57910164	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr15	57910444	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr15	57924586	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=216,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:5,3:3,4:4,4,8,0
chr15	57953564	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=199,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,5,1
chr15	57967262	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=173,59;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:57967262_C_T:57967262:9,10,1,1
chr15	57967268	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=173,59;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:57967262_C_T:57967262:9,10,1,1
chr15	57967275	.	GAA	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=172,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:5,2:0|1:57967262_C_T:57967262:5,10,1,1
chr15	57967281	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=173,59;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:5,2:0|1:57967262_C_T:57967262:5,9,1,1
chr15	57967285	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=24,24;MFRL=184,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.449:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr15	57976523	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	57976583	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr15	58004445	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=167,90;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:4,0:11,3:2,13,0,3
chr15	58247563	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr15	58253062	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=173,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:1,7:4,5:0,5,4,8
chr15	58253106	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=173,243;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr15	58253269	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr15	58256296	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=176,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,2:2,6:1,3,0,8
chr15	58257847	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=180,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,3,1
chr15	58357834	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:2,5,1,1
chr15	58357855	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=216,225;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:58357855_G_A:58357855:1,3,0,1
chr15	58357857	.	G	GCGCCTGTAATC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=216,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:58357855_G_A:58357855:1,3,0,1
chr15	58430763	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=119,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.458:33:7,10:11,5:12,6,6,9
chr15	58459075	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=176,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr15	58465171	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr15	58465483	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=198,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr15	58471556	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=233,288;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,3:3,0:2,8,0,3
chr15	58476092	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=240,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:4,0,4,0
chr15	58724371	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=190,300;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,1:3,2:3,5,0,3
chr15	58837910	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr15	58840450	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr15	58853212	.	GAC	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AC;STR;TLOD=67.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0|1:58853212_GAC_G:58853212:0,0,5,11
chr15	58853218	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=67.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0|1:58853212_GAC_G:58853212:0,0,5,11
chr15	58891949	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:2,2:0,5,0,3
chr15	58902487	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=186,79;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,0:6,3:13,1,2,1
chr15	59009930	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=210,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.324:9:5,1:1,2:1,5,1,2
chr15	59144199	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr15	59185929	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr15	59205812	.	TTCATTTTCACCAAATTCTTCAGAGTCCTTTAGTTCA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.117:24:6,2:10,0:9,13,1,1
chr15	59323048	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,9:0,0,11,8
chr15	59368361	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.247:13:4,1:5,0:0,10,3,0
chr15	59376415	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,121;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:5,2:10,0:6,9,2,0
chr15	59415880	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=219,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr15	59415891	.	G	GTATGGTGGTGTGCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=21,34;MFRL=264,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0,4,0,1
chr15	59415901	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=13,25;MFRL=272,285;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,0:0,1:0,2,0,2
chr15	59429577	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,3:9,0:10,4,3,0
chr15	59464039	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,16,1
chr15	59515434	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:0,4:4,2:0|1:59515434_C_T:59515434:2,3,3,3
chr15	59515446	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=185,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,4:0.383:11:3,1:3,3:1|0:59515434_C_T:59515434:2,5,0,4
chr15	59524056	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr15	59548475	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr15	59750910	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=188,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:0|1:59750910_G_A:59750910:2,9,1,1
chr15	59750919	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=184,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:59750910_G_A:59750910:2,12,1,1
chr15	59750930	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:0,5,2,6
chr15	59750960	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr15	59752053	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	59752166	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:14,6,0,2
chr15	59784648	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr15	59806473	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=182,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.307:8:1,1:4,1:5,1,2,0
chr15	59912625	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr15	59913056	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=323,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:59913056_C_T:59913056:0,1,0,1
chr15	59913060	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=323,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:59913056_C_T:59913056:0,1,0,1
chr15	59913061	.	G	GCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:59913056_C_T:59913056:0,0,0,1
chr15	59931429	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=227,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,4:4,2:3,6,3,3
chr15	59944300	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr15	59960261	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=131,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:5,6:12,4:7,10,5,6
chr15	59964798	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=68.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,13:0,5:0,0,16,3
chr15	59964987	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=173,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:0,9,0,2
chr15	59970298	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=184,279;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr15	59972353	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=241,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr15	59972372	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=248,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr15	59974566	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,8:2,2:6,2,7,3
chr15	59974777	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr15	59981242	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=220,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr15	59981719	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=211,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,4:3,2:0,4,0,6
chr15	60298221	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	60643302	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=219,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr15	60643853	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr15	60648214	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=231,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,5:0,7:1,0,3,9
chr15	60656724	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=161,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.112:33:13,2:17,1:14,16,1,2
chr15	60674672	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=262,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr15	60678160	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=118,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:3,2:9,3:6,6,3,2
chr15	60678298	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=187,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:0,7:1,12:0,1,5,14
chr15	60678328	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=187,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:0,5:3,5:1,2,0,10
chr15	60678350	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=245,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,6:2,4:1,1,0,10
chr15	60715800	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=130,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:7,3:5,6:8,4,5,4
chr15	60742063	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=217,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr15	60748769	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=164,208;MMQ=37,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.677:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr15	60748783	.	T	TACACAC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=0,210;MMQ=39,44;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,16;RU=AC;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:4,1:4,3:2,6,5,2
chr15	60748810	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=205,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,30:0.839:35:4,11:1,15:5,0,20,10
chr15	60797607	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	60824108	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,2,14
chr15	60850320	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr15	62165501	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=110,161;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:9,0:10,5:6,13,5,0
chr15	62167017	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:9,0,2,0
chr15	62172985	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:8,1:8,2:9,7,2,1
chr15	62209558	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:14,0:8,3:9,13,0,3
chr15	62211450	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=285,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,4:0,0:2,1,3,1
chr15	62219414	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=152,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:6,7,1,1
chr15	62228696	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=242,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr15	62243090	.	A	AATAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=AT;STR;TLOD=43.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr15	62246554	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=190,298;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr15	62256928	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,0:5,2:7,6,2,0
chr15	62361180	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=168,96;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:14,4:10,0:0|1:62361180_C_G:62361180:16,8,4,0
chr15	62361187	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=152,96;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:14,4:9,0:0|1:62361180_C_G:62361180:15,8,4,0
chr15	62456358	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	62939440	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=169,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr15	62967342	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr15	62967395	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=118,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:3,0,6,2
chr15	62967554	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,4,12
chr15	62979016	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:4,4:3,5:0|1:62979016_A_C:62979016:2,5,0,9
chr15	62979024	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=205,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,5:0.333:16:5,3:6,2:1|0:62979016_A_C:62979016:0,11,1,4
chr15	62986468	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=179,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:6,1,2,2
chr15	62989848	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:4,3,3,0
chr15	62990916	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=159,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr15	62993323	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=189,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,0:7,4:3,10,4,0
chr15	62994428	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,3:2,5:0,5,1,7
chr15	62994928	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=119,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,1:6,3:8,2,4,0
chr15	63004025	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=195,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr15	63009733	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=141,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,7:4,4:7,0,7,4
chr15	63012175	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=241,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr15	63014548	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.793:22:2,8:2,10:2,2,12,6
chr15	63019185	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=183,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,4:4,0:7,0,4,0
chr15	63030398	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,15,3
chr15	63040733	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=320,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	63044637	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=270,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,2:2,4:0,4,3,3
chr15	63054439	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=189,229;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,3:2,4:7,1,6,1
chr15	63063141	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=195,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:3,1:1,2:4,2,3,0
chr15	63063158	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,15;MFRL=141,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:3,0:7,6,3,0
chr15	63075920	.	CTGTGTG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=TG;STR;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.907:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr15	63111739	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=126,175;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,6:3,3:1,4,4,5
chr15	63125656	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,5:7,3:11,2,5,3
chr15	63127983	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.198:23:6,4:12,0:0|1:63127983_G_A:63127983:11,8,1,3
chr15	63128005	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=232,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,10:0.529:19:6,5:2,5:1|0:63127983_G_A:63127983:3,6,7,3
chr15	63131237	.	C	CAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=193,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AG;STR;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:0,8,0,4
chr15	63336188	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=149,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.476:8:1,0:2,0:0|1:63336188_A_C:63336188:0,4,4,0
chr15	63336195	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=149,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.476:8:1,0:3,0:0|1:63336188_A_C:63336188:0,4,4,0
chr15	63349096	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=259,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr15	63351687	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=226,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr15	63353911	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,168;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:11,11,2,0
chr15	63358047	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,11;MFRL=185,114;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:3,0:5,0:0|1:63358047_C_A:63358047:4,7,2,0
chr15	63358053	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=188,114;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.154:17:6,0:5,0:0|1:63358047_C_A:63358047:7,8,2,0
chr15	63363401	.	C	CATTTT,CATTTTGTTTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,36,35;MFRL=237,174,156;MMQ=60,55,54;MPOS=11,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.25,7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,2:0.264,0.401:5:0,0,0:2,1,1:0,2,0,3
chr15	63414723	.	TGG	CTC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,5:0,4:1,0,10,0
chr15	63447932	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=21,17;MFRL=136,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:3,2:5,0:5,11,1,5
chr15	63449543	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=47.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr15	63449680	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=296,146;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr15	63548699	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=139,172;MMQ=60,33;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:12,5:6,0:11,7,5,0
chr15	63548840	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:3,6,0,2
chr15	63554824	.	GTA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=206,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.746:17:0,4:3,9:2,2,11,2
chr15	63578709	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=199,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.484:6:2,2:1,1:0|1:63578709_C_CT:63578709:2,1,3,0
chr15	63578726	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,16;MFRL=145,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.382:8:1,0:2,1:0|1:63578709_C_CT:63578709:3,2,3,0
chr15	63578729	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=145,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.382:8:1,1:2,1:0|1:63578709_C_CT:63578709:3,2,3,0
chr15	63578732	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,15;MFRL=145,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.382:8:2,0:2,0:0|1:63578709_C_CT:63578709:3,2,3,0
chr15	63667933	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:18,0:14,3:14,18,3,0
chr15	63848805	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr15	63866708	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=258,247;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr15	63893411	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=229,200;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr15	63907940	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=227,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,0,2
chr15	63930798	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=124,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,0:4,3:1,5,1,2
chr15	63932513	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:5,1,5,3
chr15	63935149	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=120,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,3:2,5:2,0,7,1
chr15	63937657	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.316:20:5,2:9,4:12,2,3,3
chr15	63954197	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:12,0:16,12:14,14,0,12
chr15	63958762	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr15	63966513	.	CAAA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.266:19:6,5:6,0:8,6,3,2
chr15	63984772	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=115,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.597:10:0,4:3,2:3,1,5,1
chr15	63988337	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=157,41;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:10,8,1,1
chr15	63988357	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr15	63998863	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=139,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:1,1,3,0
chr15	63998914	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:2,4:4,1:5,1,5,0
chr15	63999112	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr15	64011104	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=89,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,1,4
chr15	64017798	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=182,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:1,4:1,4:0,2,0,8
chr15	64019758	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=188,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr15	64020073	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr15	64039050	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr15	64039879	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,1:2,6:7,0,6,1
chr15	64048990	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,376;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	64050300	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr15	64056437	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=20839900,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:0,2,1,5
chr15	64163029	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	64263532	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:5,1,4,0
chr15	64263784	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,2:5,4:2,5,1,5
chr15	64263795	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:2,4,0,6
chr15	64263854	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr15	64275645	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=186,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.449:15:3,3:5,1:8,0,7,0
chr15	64367775	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr15	64410460	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=146,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr15	64410484	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr15	64418221	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr15	64418483	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	64428657	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,2,10
chr15	64448365	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,10:0,5:0,0,7,9
chr15	64449015	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,67;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,0:12,2:12,13,0,2
chr15	64496611	.	TAAAA	T,TAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20,20;MFRL=0,84,112;MMQ=60,60,60;MPOS=7,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,16;RU=A;STR;TLOD=4.74,3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.398,0.470:5:0,1,1:0,2,0:0,0,3,2
chr15	64673578	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,0:13,2:8,12,0,2
chr15	64687760	.	GA	AC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=136,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:64687760_GA_AC:64687760:4,7,1,1
chr15	64687764	.	A	AATCCCCATTTCATCT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=136,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:3,2:0|1:64687760_GA_AC:64687760:4,7,1,1
chr15	64706259	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr15	64717896	.	A	ACTCCTGACCTTGTGATCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=267,136;MMQ=60,36;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr15	64737103	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr15	64972760	.	TTG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=152,252;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=TG;STR;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:2,1,3,1
chr15	64973611	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=211,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:5,2,0,5
chr15	64982594	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:11,0:7,2:12,7,2,0
chr15	65054562	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr15	65054571	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr15	65108652	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=210,261;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:1,4,2,2
chr15	65108707	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=208,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:3,1,1,2
chr15	65110362	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:2,2,3,3
chr15	65110391	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=146,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:3,1,2,1
chr15	65112259	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,0:2,5:0,3,0,5
chr15	65113493	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:3,9:0,4:2,1,4,9
chr15	65113764	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,150;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=24,22;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.806:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	65114636	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,14;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.320:13:4,0:5,1:0|1:65114636_A_C:65114636:0,9,4,0
chr15	65114641	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.264:16:5,0:5,2:0|1:65114636_A_C:65114636:2,10,4,0
chr15	65114643	.	CACTGT	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.204:16:6,0:6,3:0|1:65114636_A_C:65114636:3,10,3,0
chr15	65140715	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=202,243;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr15	65157196	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:9,0:9,5:5,13,0,5
chr15	65204285	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	65209718	.	GTGTC	G,GTGTCTGTC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,33,26;MFRL=157,161,205;MMQ=60,60,60;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=5,4,6;RU=TGTC;STR;TLOD=6.00,13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,4:0.166,0.374:11:1,1,0:4,1,3:1,4,2,4
chr15	65239827	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=161,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,2:8,1:5,9,1,2
chr15	65256116	.	AGCTGGAGTGTCACTCTTGTTGCCCAG	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=196,55;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.340:7:2,0:0,2:0|1:65256116_AGCTGGAGTGTCACTCTTGTTGCCCAG_A:65256116:0,5,1,1
chr15	65256159	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=180,55;MMQ=60,54;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:65256116_AGCTGGAGTGTCACTCTTGTTGCCCAG_A:65256116:0,7,1,1
chr15	65256161	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=180,55;MMQ=60,54;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:65256116_AGCTGGAGTGTCACTCTTGTTGCCCAG_A:65256116:0,7,1,1
chr15	65256166	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=180,55;MMQ=60,54;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,1:0|1:65256116_AGCTGGAGTGTCACTCTTGTTGCCCAG_A:65256116:0,7,1,1
chr15	65268979	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr15	65273147	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=213,242;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr15	65273399	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr15	65312614	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=142,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:0,1:3,1:0,9,0,3
chr15	65315961	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	65344035	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr15	65350743	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.562:21:6,3:3,8:5,4,8,4
chr15	65350968	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.321:14:5,2:2,2:4,6,1,3
chr15	65357491	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:2,7:1,7:3,0,9,5
chr15	65369567	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	65369610	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	65411612	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr15	65412325	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:3,2:2,1:4,1,2,1
chr15	65412372	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=339,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	65449169	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,11,9
chr15	65477364	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=183,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:2,3:4,1:4,8,2,2
chr15	65477368	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=158,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,4:6,1:2,10,4,1
chr15	65489662	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=215,97;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:7,10,1,1
chr15	65489688	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr15	65495820	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=133,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.868:13:0,7:1,4:0|1:65495820_A_G:65495820:1,0,5,7
chr15	65495827	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=133,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.867:13:0,5:1,5:0|1:65495820_A_G:65495820:1,0,5,7
chr15	65495844	.	TTG	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=185,318;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr15	65496587	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,10,1
chr15	65496862	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=213,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr15	65497706	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,1:11,1:10,9,2,0
chr15	65497849	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr15	65497884	.	T	TCTGTCTGTCTGTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=210,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr15	65497891	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=199,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr15	65551663	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=178,61;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr15	65623124	.	C	CTCTA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=259,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCTA;STR;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.498:8:1,1:3,3:1,3,0,4
chr15	65623166	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=157,270;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr15	65624228	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr15	65677460	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:65677460_G_T:65677460:0,1,0,1
chr15	65677463	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:65677460_G_T:65677460:0,1,0,1
chr15	65678141	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:6,2,3,0
chr15	65681183	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=169,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:1,5,2,0
chr15	65682429	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,0:0,0:0|1:65682429_C_G:65682429:0,0,1,0
chr15	65682431	.	CACCA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:65682429_C_G:65682429:0,0,1,0
chr15	65682438	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:65682429_C_G:65682429:0,0,1,0
chr15	65688076	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=180,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:0,2:2,0:1,2,1,1
chr15	65756072	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=186,335;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr15	65777438	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,0:7,2:5,7,0,2
chr15	65782451	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr15	65804537	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	65804986	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=219,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr15	65874368	.	TA	T,TAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27,28;MFRL=207,169,221;MMQ=60,60,60;MPOS=25,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=7.60,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,3:0.278,0.222:14:4,1,1:3,2,1:0,7,2,5
chr15	65917104	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=100,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:10,0:7,2:0|1:65917104_A_C:65917104:9,8,1,1
chr15	65917109	.	A	AGTATGGATTTTATG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=98,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:8,0:6,2:0|1:65917104_A_C:65917104:7,7,1,1
chr15	65946248	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=120,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.333:37:10,0:15,12:7,18,0,12
chr15	65956602	.	TAAA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=A;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,2:8,1:10,2,2,1
chr15	65959729	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=172,258;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:2,1:5,2:5,2,4,0
chr15	65962198	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:8,9,1,1
chr15	65968806	.	AGGCTTATTC	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=192,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,0:6,3:3,6,2,1
chr15	65994034	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=154,300;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:6,2:5,0:9,3,1,1
chr15	65998371	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:7,3,2,0
chr15	66007972	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=175,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:1,7,1,4
chr15	66023943	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:9,8:9,6:13,5,8,6
chr15	66024028	.	TGTG	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=147,77;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTG;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.087:32:15,2:14,0:0|1:66024028_TGTG_T:66024028:15,15,1,1
chr15	66024034	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=147,77;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:15,2:15,0:0|1:66024028_TGTG_T:66024028:15,15,1,1
chr15	66025010	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=187,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,0:4,2:5,0,1,1
chr15	66031024	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=133,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,1:8,1:8,4,2,0
chr15	66162034	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,4,13
chr15	66170080	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=225,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:4,3,3,4
chr15	66198552	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr15	66208422	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,0:0,7:0,0,6,1
chr15	66215138	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:1,3:1,2:2,0,4,2
chr15	66220735	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=174,85;MMQ=60,23;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:11,5:12,0:14,9,3,2
chr15	66223350	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=247,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr15	66249807	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=37,26;MFRL=223,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:2,3:0,2:2,0,6,0
chr15	66274847	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=203,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,1:0,3:1,4,0,4
chr15	66386853	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:7,5:9,4:3,13,4,5
chr15	66601254	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=148,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr15	66604032	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=12,26;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.763:5:0,2:0,2:1,0,3,1
chr15	66604276	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=169,94;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:3,8,1,1
chr15	66618342	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,3:2,4:5,3,4,3
chr15	66643979	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=209,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.862:9:0,0:0,3:0,1,2,6
chr15	66645341	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=227,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr15	66679601	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,281;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,2:6,1:10,1,3,0
chr15	66727597	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=207,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,2:3,4:4,5,1,5
chr15	66735551	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr15	66787801	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=142,190;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:4,2:0,0:0,4,0,2
chr15	66787826	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=150,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr15	66792761	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=176,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,1:4,6:2,5,0,7
chr15	66793480	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=111,242;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,1:0,5:1,1,1,5
chr15	66793677	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,4:5,6:5,6,7,3
chr15	66794037	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,4:1,5:3,0,8,1
chr15	66794298	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=18,19;MFRL=217,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.249:13:0,0:1,1:0,10,0,3
chr15	66795937	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=175,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,4:3,2:1,6,1,5
chr15	66801309	.	GCT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,205;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr15	66806308	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr15	66806517	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr15	66815908	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=142,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr15	66821174	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,5:1,3:4,0,5,3
chr15	66824526	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=147,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,1:3,6:5,0,5,2
chr15	66829677	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=224,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:66829677_CTT_C:66829677:0,1,0,1
chr15	66829680	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=224,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:66829677_CTT_C:66829677:0,1,0,1
chr15	66829683	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=264,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:66829677_CTT_C:66829677:0,1,0,1
chr15	67008737	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=117,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:5,4:5,2:7,4,4,2
chr15	67457485	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=134,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:2,3,1,2
chr15	67495298	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=248,256;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:16,1:6,1:12,10,1,1
chr15	67501033	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=194,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr15	67571929	.	A	AGCCGAGATTGTGCCACTGCACTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=77,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr15	67652097	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=69,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr15	67692404	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,6:6,0:9,2,6,0
chr15	67782440	.	AGGAAAT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr15	67792981	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=143,125;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.157:30:16,1:9,3:9,17,0,4
chr15	67879311	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=15,21;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.336:20:4,3:2,1:6,8,0,6
chr15	67933892	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=195,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:0,5,0,6
chr15	67984705	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=166,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr15	68040775	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=187,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:4,3,1,1
chr15	68041070	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr15	68118194	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=272,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:2,1,2,1
chr15	68122509	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=111,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.224:11:5,1:4,1:5,4,2,0
chr15	68346549	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	68445912	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr15	68492028	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=165,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:2,5:7,3:3,6,3,5
chr15	68603435	.	GAC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=188,83;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.216:16:6,1:7,2:7,6,2,1
chr15	68603625	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,11,11
chr15	68605067	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=199,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:1,2,1,1
chr15	68613922	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=184,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:0,6,1,2
chr15	68618961	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=241,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr15	68624175	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.776:10:1,4:0,4:2,0,6,2
chr15	68624641	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.680:13:1,2:2,7:3,1,8,1
chr15	68628143	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=162,201;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:4,4:2,8:4,2,6,6
chr15	68628163	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=201,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,3:7,2:6,4,2,3
chr15	68631740	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr15	68656960	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr15	68656990	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.658:6:1,0:0,3:0|1:68656990_T_C:68656990:1,1,4,0
chr15	68656995	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=21,32;MFRL=198,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,0:0,3:1,2,4,0
chr15	68657001	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=21,31;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:0,3:0|1:68656990_T_C:68656990:2,2,3,0
chr15	68695314	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.171:31:12,4:14,0:9,17,5,0
chr15	68695349	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:12,5:6,5:8,10,2,8
chr15	68724262	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr15	68937441	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=255,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,2,1
chr15	68987450	.	TTC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,1:5,3:7,2,3,1
chr15	69003871	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=99,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:2,2:1,8:1,2,4,6
chr15	69007656	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,3,10
chr15	69011389	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:69011389_A_C:69011389:0,0,4,0
chr15	69011394	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:69011389_A_C:69011389:0,0,5,0
chr15	69072346	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=173,90;MMQ=60,44;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr15	69112971	.	G	GCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=210,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=CA;STR;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.691:11:1,4:2,3:3,0,6,2
chr15	69327998	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,3,3
chr15	69329623	.	GA	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=151,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr15	69347593	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr15	69348935	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=121,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:8,3:3,0:0|1:69348935_G_A:69348935:8,4,2,1
chr15	69348946	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=135,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:9,3:6,0:0|1:69348935_G_A:69348935:10,9,2,1
chr15	69349087	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr15	69548046	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=117,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr15	69553728	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=222,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr15	69560651	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=162,57;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,3:10,0:9,9,2,1
chr15	69561518	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,6:0,12:0,0,9,10
chr15	69676944	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,37;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	69692324	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=202,68;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:7,4:8,0:9,6,3,1
chr15	69696249	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	69706799	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=157,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,0:7,2:8,9,1,1
chr15	69709686	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr15	69714638	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=214,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,1:7,2:8,3,1,2
chr15	69715487	.	TC	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=162,262;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.269:19:7,3:7,2:0|1:69715487_TC_T:69715487:8,6,4,1
chr15	69715488	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,19:0.951:19:0,10:0,9:1|0:69715487_TC_T:69715487:0,0,12,7
chr15	69730595	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,0:4,2:0|1:69730595_T_TG:69730595:8,7,0,2
chr15	69730601	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=157,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:0|1:69730595_T_TG:69730595:8,8,0,2
chr15	69732483	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr15	69745989	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=128,149;MMQ=60,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:16,4:17,0:15,19,0,4
chr15	69747675	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=64.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,15,8
chr15	70344616	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=222,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:6,0,4,0
chr15	70347303	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr15	70347362	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=13659824,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.768:11:2,4:0,4:2,0,7,2
chr15	70349744	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:4,1,2,2
chr15	70350457	.	C	A,G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25,26;MFRL=244,276,189;MMQ=60,60,60;MPOS=28,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.43,12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,5:0.391,0.407:12:0,3,2:2,0,3:1,1,8,2
chr15	70352968	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=242,134;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,3:4,2:2,8,2,3
chr15	70358260	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=35,27;MFRL=182,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:8,2:4,2:12,0,4,0
chr15	70358309	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=32,12;MFRL=203,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,0:7,0:0|1:70358309_C_G:70358309:3,10,3,0
chr15	70358312	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=25,22;MFRL=203,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:7,1:6,1:0|1:70358309_C_G:70358309:3,12,3,0
chr15	70358316	.	CTG	C	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=194,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:8,2:7,1:0|1:70358309_C_G:70358309:3,14,3,0
chr15	70358323	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=32,12;MFRL=179,260;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.258:21:8,0:8,0:0|1:70358323_G_C:70358323:1,15,5,0
chr15	70358328	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=27,29;MFRL=170,260;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.212:26:9,2:9,2:0|1:70358323_G_C:70358323:5,16,5,0
chr15	70358332	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=29,14;MFRL=156,287;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.132:28:9,0:14,0:0|1:70358323_G_C:70358323:8,17,3,0
chr15	70388449	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr15	70957154	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,143;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:6,0:3,13:3,6,0,13
chr15	70959457	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=149,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,0:7,2:9,10,0,2
chr15	70963356	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:4,2:9,2:10,5,3,1
chr15	70980198	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,1:7,3:3,11,0,4
chr15	70987525	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70987525_CA_C:70987525:1,0,0,1
chr15	70987527	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70987525_CA_C:70987525:1,0,0,1
chr15	70992005	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=151,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:4,2:1,8,0,3
chr15	70992010	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=138,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr15	71175296	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr15	71185837	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=203,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.731:13:1,3:2,6:3,0,10,0
chr15	71185853	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:3,1,6,0
chr15	71193216	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=181,112;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:6,1,1,1
chr15	71276480	.	GCAA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=311,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CAA;STR;TLOD=40.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,6:0,4:1,0,3,7
chr15	71403406	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=162,201;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:5,0,5,0
chr15	71447374	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	71535389	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=122,185;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:8,4:19,0:14,14,4,0
chr15	71535458	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=216,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.483:23:8,7:3,4:6,6,7,4
chr15	71548937	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:4,8:3,8:3,4,9,7
chr15	72023422	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=184,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:4,6:9,4:10,3,9,1
chr15	72037610	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=225,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,4:1,6:0,3,2,8
chr15	72050163	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=187,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr15	72050436	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:3,2:11,2:3,11,1,3
chr15	72050508	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=174,290;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr15	72105928	.	AC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=47.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,7:0,0,6,11
chr15	72122642	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=160,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,1:9,1:9,11,0,2
chr15	72142295	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr15	72180484	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=179,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,2:7,3:4,7,0,5
chr15	72190038	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=121,74;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:6,2:10,1:8,8,1,2
chr15	72195229	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=158,253;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr15	72231107	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=239,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr15	72283374	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=241,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr15	72338835	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:3,7,0,2
chr15	72431883	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=222,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr15	72433395	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr15	72454729	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0|1:72454729_C_G:72454729:0,0,5,6
chr15	72454738	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.361:9:3,0:3,3:0|1:72454729_C_G:72454729:1,5,2,1
chr15	72462165	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr15	72492779	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=129,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,0,2
chr15	72493063	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=190,223;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:1,2:8,0:0,9,0,2
chr15	72499252	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=206,254;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:8,2:9,3:5,12,1,4
chr15	72499401	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=230,254;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,2:5,1:6,2,3,0
chr15	72502777	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=154,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:6,1:17,1:10,13,0,2
chr15	72533768	.	CAG	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=123,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,2:5,1:9,6,3,0
chr15	72542280	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=120,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,5:1,0:4,2,4,1
chr15	72543144	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=171,276;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:1,0:1,1:0,2,3,0
chr15	72543149	.	CTCA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=166,276;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.496:6:1,0:1,2:0|1:72543149_CTCA_C:72543149:1,2,3,0
chr15	72543155	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=158,276;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.439:7:3,0:1,0:0|1:72543149_CTCA_C:72543149:1,3,3,0
chr15	72543656	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	72545857	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:4,2:4,2:1,8,3,1
chr15	72545876	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr15	72546765	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr15	72551994	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=137,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:7,3:8,0:9,7,3,0
chr15	72556799	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr15	72559214	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:1,5,0,5
chr15	72637960	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:1,4,0,3
chr15	72638712	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=217,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,0:2,3:4,4,1,2
chr15	72640193	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=194,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:1,9,0,3
chr15	72645352	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr15	72699569	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=179,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:3,0:6,4:7,2,0,4
chr15	72700173	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,1:6,1:10,2,2,0
chr15	72859047	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=194,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:2,4:0,4:0,2,0,9
chr15	72864578	.	ATT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.484:8:1,2:2,2:0,4,0,4
chr15	72879653	.	A	ATTG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTG;STR;TLOD=55.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,7:0,0,3,10
chr15	72987636	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=201,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr15	73021855	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=177,226;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:3,0,3,0
chr15	73028375	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr15	73064066	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,0:5,2:9,0,2,0
chr15	73408858	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr15	73409213	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=197,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,4:2,2:0,3,1,5
chr15	73418741	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=188,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.249:6:0,1:4,0:4,1,1,0
chr15	73528937	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=174,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:1,6,0,3
chr15	73541496	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,2:4,0:7,5,2,0
chr15	73541513	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=70,173;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:6,3:0,4:3,3,3,4
chr15	73551250	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:1,1,0,5
chr15	73566942	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,9:0,0,21,2
chr15	73567146	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=93,191;MMQ=60,21;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,0:3,6:0,4,0,6
chr15	73581444	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=82,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,4:2,3:1,1,4,3
chr15	73615999	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=203,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr15	73616635	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr15	73659991	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	73735523	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=195,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:6,6,1,2
chr15	73884282	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=133,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.514:27:8,9:5,4:7,6,10,4
chr15	73889752	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=18,18;MFRL=184,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:0,1:3,1:1,6,0,5
chr15	74000829	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,0:7,2:2,10,0,2
chr15	74032871	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=155,234;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.353:22:10,5:3,0:7,7,8,0
chr15	74033033	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr15	74043523	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=151,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr15	74173668	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr15	74176453	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	74177071	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=183,216;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.230:14:5,1:6,1:10,1,1,2
chr15	74178605	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=210,250;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0,4,0,5
chr15	74178925	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:3,0:6,5:4,6,1,4
chr15	74238725	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,283;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.702:1:0,0:0,0:0|1:74238725_A_C:74238725:0,0,1,0
chr15	74238733	.	CTCATCT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=128,283;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:74238725_A_C:74238725:1,0,1,0
chr15	74241749	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,7:6,1:9,4,5,3
chr15	74281382	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr15	74282833	.	G	GC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=157,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:3,0:15,2:2,16,0,2
chr15	74284406	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=203,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,1:5,1:11,1,2,0
chr15	74317362	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,2:1,1:0,6,0,3
chr15	74326717	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	74365264	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=184,232;MMQ=24,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr15	74365266	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=236,216;MMQ=24,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr15	74367358	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,206;MMQ=24,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,1,2
chr15	74428778	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.330:10:4,0:1,0:0|1:74428778_G_C:74428778:2,5,3,0
chr15	74428783	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.304:11:4,2:1,0:0|1:74428778_G_C:74428778:3,5,3,0
chr15	74428787	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=184,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.347:9:5,0:1,1:0|1:74428778_G_C:74428778:2,4,3,0
chr15	74472462	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=146,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:9,0:9,3:8,10,2,1
chr15	74477216	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	74477239	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=229,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr15	74481382	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	74483415	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr15	74528985	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr15	74529130	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:8,3:2,3:3,7,2,4
chr15	74536285	.	CAA	C,CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32,33;MFRL=139,207,205;MMQ=40,60,49;MPOS=22,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.68,3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,2:0.531,0.287:8:0,2,1:1,3,1:1,0,7,0
chr15	74536400	.	TAAG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=118,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,1:5,3:3,8,0,4
chr15	74558927	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	74572242	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr15	74572917	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	74588024	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr15	74588380	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=232,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr15	74623272	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=241,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,1:5,3:3,3,4,0
chr15	74623302	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,2:5,4:5,3,5,1
chr15	74628242	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=192,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,3:1,2:0,2,4,1
chr15	74637345	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,12;MFRL=123,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:1,0:0,0:3,0,4,0
chr15	74637680	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=194,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:0,3,0,5
chr15	74642584	.	TTCTAA	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=171,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:0|1:74642584_TTCTAA_T:74642584:2,8,1,1
chr15	74642590	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=171,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:74642584_TTCTAA_T:74642584:2,8,1,1
chr15	74642592	.	TGC	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=171,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:4,0:0|1:74642584_TTCTAA_T:74642584:2,10,1,1
chr15	74642598	.	G	GTT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=175,61;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:74642584_TTCTAA_T:74642584:0,10,1,1
chr15	74659609	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,3:2,5:3,3,8,0
chr15	74710593	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr15	74836503	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=152,155;MMQ=40,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:2,0:17,3:6,13,1,2
chr15	74907946	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	74920220	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=216,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr15	74921197	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=200,67;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:4,0,1,1
chr15	75013005	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=207,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,3:8,0:7,6,2,1
chr15	75042388	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=210,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,2:10,0:3,11,2,0
chr15	75043749	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=234,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1,3,0,1
chr15	75044238	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=218,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:2,3:2,9:1,3,8,4
chr15	75047032	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	75114322	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=249,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.710:11:1,3:1,5:0,3,0,8
chr15	75115895	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=213,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.753:9:1,3:0,4:2,0,3,4
chr15	75130015	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr15	75130573	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=114,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,9:0,2:0,1,5,6
chr15	75132490	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=216,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:2,2:0,1:2,0,4,0
chr15	75140854	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	75143819	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=132,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:9,0:4,6:5,8,0,6
chr15	75183935	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=214,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,5:1,3:1,2,2,6
chr15	75185670	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=249,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.801:18:1,10:2,5:2,1,4,11
chr15	75188425	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:4,0,2,0
chr15	75188506	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,1:8,1:12,8,1,1
chr15	75194999	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:16,0:17,2:18,15,0,2
chr15	75308837	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr15	75309170	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=21,23;MFRL=291,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.275:5:0,1:2,0:0,4,0,1
chr15	75309187	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=291,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr15	75310734	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,15;MFRL=162,276;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.246:28:5,2:15,0:19,1,8,0
chr15	75311036	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=212,365;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,2:3,5:1,2,4,3
chr15	75311108	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=136,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:4,1:8,3:10,2,3,1
chr15	75499187	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=153,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:75499187_CA_C:75499187:0,3,2,0
chr15	75499191	.	CACTA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=189,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0|1:75499187_CA_C:75499187:0,4,2,0
chr15	75499199	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,15;MFRL=195,187;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,0:0|1:75499187_CA_C:75499187:0,5,2,0
chr15	75499995	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=161,389;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:6,3,2,0
chr15	75586734	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=182,24464;MMQ=54,22;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:12,0:12,3:18,6,0,3
chr15	75630562	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=215,191;MMQ=40,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,5:4,1:5,2,1,5
chr15	75630635	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=213,269;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:1,1,2,2
chr15	75631768	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=102,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,1:1,1:3,3,0,2
chr15	75648412	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=156,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:3,3,0,2
chr15	75648617	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=138,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.130:29:17,0:7,3:16,10,2,1
chr15	75651022	.	C	CCCACATGCTGCCCAGCCCATA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.567:29:4,8:9,2:8,8,2,11
chr15	75651029	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=140,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,2:13,0:10,9,0,2
chr15	75653378	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,13:0,6:0,0,13,6
chr15	75654211	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=185,105;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.257:25:7,6:12,0:9,10,6,0
chr15	75664570	.	AA	TT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,5:3,1:0,4,0,6
chr15	75682136	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:11,0:12,5:13,10,0,5
chr15	75685026	.	C	CTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=172,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:5,0:9,2:0|1:75685026_C_CTT:75685026:9,5,1,1
chr15	75685033	.	GC	AG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=172,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:4,0:7,1:0|1:75685026_C_CTT:75685026:9,5,1,1
chr15	75699523	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:0,5:4,2:1,3,0,7
chr15	75702089	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=172,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=50.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.583:34:6,20:8,0:13,1,20,0
chr15	75766176	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=182,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,1,1
chr15	75782653	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=138,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,2:9,0:2,11,0,2
chr15	75816458	.	TAAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=A;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	75890689	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=119,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:0,1:5,1:5,1,2,0
chr15	75897466	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=150,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.234:18:6,0:8,3:6,8,4,0
chr15	75967814	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=109,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr15	75968465	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr15	75982053	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=153,177;MMQ=60,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,0:4,2:0|1:75982053_A_G:75982053:7,6,1,1
chr15	75982058	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=153,177;MMQ=60,33;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:75982053_A_G:75982053:7,6,1,1
chr15	75982072	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=159,225;MMQ=52,27;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,2:6,0:6,5,1,1
chr15	75982085	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=162,178;MMQ=52,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,3:4,1:4,5,2,2
chr15	76018560	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,0:1,1:3,1,0,2
chr15	76136674	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=124,276;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,2:8,1:9,8,3,0
chr15	76171382	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.315:10:5,2:2,1:7,0,3,0
chr15	76175828	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr15	76182949	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr15	76183191	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr15	76189326	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,2:9,1:5,9,0,3
chr15	76191644	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=152,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,1,1
chr15	76191743	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,245;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:3,3:7,2:5,5,5,0
chr15	76191852	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr15	76197071	.	A	ATCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	76205523	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.408:8:3,2:2,1:4,1,2,1
chr15	76222140	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.871:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr15	76248162	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=19,15;MFRL=208,188;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:76248162_G_T:76248162:1,0,1,0
chr15	76248170	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,188;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:76248162_G_T:76248162:0,0,1,0
chr15	76248176	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,15;MFRL=153,188;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:76248162_G_T:76248162:1,0,1,0
chr15	76248184	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=153,188;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:76248162_G_T:76248162:1,0,1,0
chr15	76248427	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=206,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,3:1,1:0,2,0,4
chr15	76462167	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:9,1:6,1:8,8,2,0
chr15	76462286	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:0,5,0,3
chr15	76518346	.	C	CCCTTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.762:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	76523771	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:1,8,0,2
chr15	76584686	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:2,0,2,1
chr15	76632907	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,2:0,10:0,0,3,9
chr15	76673627	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=172,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr15	76673716	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=103,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:6,3:11,3:13,4,4,2
chr15	76696768	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=255,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr15	76957958	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=69.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,14:0,4:0,0,16,2
chr15	77057864	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,314;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:4,6,0,2
chr15	77064389	.	TGAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	77085740	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr15	77087785	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=193,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:3,2:13,1:1,15,2,1
chr15	77241568	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr15	77310636	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr15	77317679	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=181,284;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,1:8,2:6,7,2,1
chr15	77323009	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	77323029	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr15	77328108	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr15	77344793	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=169,136;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.460:24:7,3:6,8:5,8,4,7
chr15	77471105	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=215,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,1:6,2:9,1,2,1
chr15	77764227	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=141,224;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.345:7:2,0:1,1:0,5,0,2
chr15	78301449	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:6,9,1,1
chr15	78317581	.	AAG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,2:4,1:9,9,3,0
chr15	78322564	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=172,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr15	78337225	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=169,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:5,5:4,6:7,2,8,3
chr15	78390287	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,2:8,0:8,8,1,1
chr15	78401534	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.726:2:0,0:0,2:0|1:78401534_T_TC:78401534:0,0,0,2
chr15	78401540	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.726:2:0,0:0,2:0|1:78401534_T_TC:78401534:0,0,0,2
chr15	78423433	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=226,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr15	78423479	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=132,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr15	78423596	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=172,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr15	78441886	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	78454795	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr15	78457242	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=185,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr15	78458485	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=177,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.628:25:5,6:4,9:7,2,8,8
chr15	78472006	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.240:26:12,5:8,0:9,11,6,0
chr15	78472121	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=125,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:11,2:6,1:9,9,3,0
chr15	78472157	.	TCA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=CA;STR;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.839:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	78473309	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr15	78474517	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	78474766	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=190,332;MMQ=60,41;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.403:3:1,1:0,0:2,0,1,0
chr15	78474776	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=15,13;MFRL=190,332;MMQ=60,41;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.404:3:0,0:0,0:0|1:78474776_A_C:78474776:2,0,1,0
chr15	78474785	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=188,332;MMQ=60,41;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:78474776_A_C:78474776:1,1,1,0
chr15	78474790	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,35;MFRL=188,332;MMQ=60,41;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:78474776_A_C:78474776:1,1,1,0
chr15	78485814	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:6,1,0,2
chr15	78556571	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=204,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:78556571_G_A:78556571:0,1,2,0
chr15	78556589	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:78556571_G_A:78556571:0,0,2,0
chr15	78557005	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr15	78557086	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr15	78558509	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,11:0,1:0,0,12,0
chr15	78558584	.	CAT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=139,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,2:3,3:6,6,4,1
chr15	78563103	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=197,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr15	78565616	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=129,247;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:0,7,0,3
chr15	78572359	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr15	78581892	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr15	78581938	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:3,1,4,1
chr15	78587910	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr15	78758853	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,3,9
chr15	78758902	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr15	78762882	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:6,0:13,4:7,12,4,0
chr15	78770554	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=204,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:4,0,2,1
chr15	78777312	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr15	78786410	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,6,12
chr15	78807231	.	C	CCTCT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=296,236;MMQ=51,40;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=CT;STR;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.816:9:0,1:0,4:1,0,8,0
chr15	78807252	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=175,239;MMQ=37,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,3:1,6:1,0,9,0
chr15	78807254	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=233,239;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:1,0:3,4:5,0,5,0
chr15	78834689	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=300,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,3:1,3:0,2,1,5
chr15	78836631	.	CTGA	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGA;STR;TLOD=70.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.751:22:2,7:3,9:3,2,7,10
chr15	78836689	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,13;MFRL=172,247;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:78836689_A_G:78836689:0,3,0,1
chr15	78836694	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=172,247;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:78836689_A_G:78836689:0,3,0,1
chr15	78836697	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,34;MFRL=155,247;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:78836689_A_G:78836689:0,2,0,1
chr15	78836719	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=26,32;MFRL=183,230;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0|1:78836719_A_G:78836719:0,3,0,4
chr15	78836721	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=183,230;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0|1:78836719_A_G:78836719:0,3,0,4
chr15	78839110	.	CTT	C,CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=19,20,19;MFRL=229,190,193;MMQ=40,60,60;MPOS=19,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=5.18,10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,5:0.309,0.558:9:0,0,0:0,2,2:0,1,0,8
chr15	78894339	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=184,125;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,6:1,5:1,2,6,5
chr15	78909452	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=216,163;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.785:12:2,5:0,4:1,1,2,8
chr15	78909480	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=240,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,5:1,7:1,2,4,8
chr15	78909539	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=236,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr15	78911261	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr15	78917399	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr15	79051759	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr15	79054900	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=161,159;MMQ=60,46;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.304:17:10,2:2,2:6,6,0,5
chr15	79054911	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=173,165;MMQ=60,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:8,2:2,1:0|1:79054911_A_G:79054911:4,6,0,4
chr15	79054919	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=166,165;MMQ=60,43;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:9,3:2,1:0|1:79054911_A_G:79054911:4,7,0,4
chr15	79054932	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=152,168;MMQ=52,39;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,2:2,3:3,6,0,5
chr15	79056526	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:1,1,0,4
chr15	79057949	.	TG	CC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=178,172;MMQ=45,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr15	79059449	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=87,130;MMQ=50,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr15	79059670	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=125,208;MMQ=60,53;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,0:2,5:2,0,5,0
chr15	79063474	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:4,3,2,1
chr15	79065380	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=293,174;MMQ=60,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr15	79065562	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr15	79066932	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=240,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:1,1,3,2
chr15	79070000	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,1:0,2,0,2
chr15	79080798	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=195,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,2:2,1:0,9,0,3
chr15	79083591	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr15	79092480	.	TG	AC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,337;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr15	79165441	.	G	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,6:0.116:54:27,1:20,4:25,23,1,5
chr15	79172744	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	79172834	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:11,2:3,1:9,5,3,0
chr15	79177479	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=223,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:79177479_T_C:79177479:0,3,0,1
chr15	79177481	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=226,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:79177479_T_C:79177479:0,4,0,1
chr15	79177488	.	C	CCCATCCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=226,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:79177479_T_C:79177479:0,4,0,1
chr15	79217816	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,164;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.451:18:5,0:5,7:2,8,0,8
chr15	79223719	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=188,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:6,2,1,1
chr15	79231518	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=112,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.833:19:1,5:1,9:0,3,5,11
chr15	79231523	.	G	A,GA,GAA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,26,19,36;MFRL=171,102,142,179;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,14,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=3.20,7.35,5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,5,3:0.125,0.417,0.275:12:2,1,0,2:0,1,1,1:0,2,3,7
chr15	79231616	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr15	79237180	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,7,0
chr15	79237403	.	GGA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	79254480	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,9,7
chr15	79264097	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr15	79277247	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	79277486	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:9,2:4,0:2,11,1,1
chr15	79288011	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=274,249;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:0,4:0,1,7,0
chr15	79291262	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	79296553	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr15	79298739	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=146,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:0,8,1,1
chr15	79298793	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=244,296;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr15	79310021	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,296;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:79310021_A_C:79310021:0,0,1,0
chr15	79310027	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,296;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79310021_A_C:79310021:0,0,1,0
chr15	79310337	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=181,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr15	79323938	.	AAG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=187,254;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AG;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	79324419	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=220,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.655:9:2,2:0,4:2,1,5,1
chr15	79324682	.	GGT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=161,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:79324682_GGT_G:79324682:0,3,0,1
chr15	79324686	.	G	GTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=161,215;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:79324682_GGT_G:79324682:0,3,0,1
chr15	79502096	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,2:7,2:8,5,3,1
chr15	79590314	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=189,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:5,2:2,1:6,1,1,2
chr15	79606408	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,1,10
chr15	79755685	.	GGT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,249;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:3,0:2,9,0,2
chr15	80137547	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=111,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,1:9,1:6,7,2,0
chr15	80137560	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=111,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,1:6,3:8,3,1,3
chr15	80181414	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=203,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,2:5,5:4,5,4,3
chr15	80259955	.	TGTAA	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.178:26:14,4:5,0:0|1:80259955_TGTAA_T:80259955:17,5,4,0
chr15	80259964	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.171:29:15,4:6,0:0|1:80259955_TGTAA_T:80259955:17,8,4,0
chr15	80412870	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=221,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,5:2,1:0,5,0,6
chr15	80414173	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,4:7,1:2,10,0,5
chr15	80450328	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=165,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,3:6,1:7,1,4,0
chr15	80450389	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=144,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,1:6,2:6,8,1,2
chr15	80452075	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=136,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,1:5,3:4,5,3,1
chr15	80452268	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,251;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.315:10:6,1:1,1:0,7,0,3
chr15	80452886	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=185,249;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:3,2:2,3,1,3
chr15	80460524	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:3,1:4,5,0,2
chr15	80460768	.	A	AGCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=134,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	80472381	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=256,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:80472381_A_G:80472381:2,0,1,0
chr15	80472383	.	CA	GG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=256,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:80472381_A_G:80472381:2,0,1,0
chr15	80472388	.	CA	GG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,16;MFRL=256,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:80472381_A_G:80472381:2,0,1,0
chr15	80472431	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=140,268;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr15	80473480	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=112,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:9,2:0|1:80473480_G_T:80473480:9,9,1,1
chr15	80473487	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=112,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:10,2:0|1:80473480_G_T:80473480:9,11,1,1
chr15	80473489	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=113,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:10,2:0|1:80473480_G_T:80473480:9,11,1,1
chr15	80762526	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr15	80806183	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr15	80845136	.	CT	TC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:9,3:5,1:4,10,2,3
chr15	80866418	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:2,5:8,0:10,0,5,0
chr15	80867480	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:1,12,0,2
chr15	81176721	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=37,33;MFRL=159,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,2,3
chr15	81180981	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=434,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr15	81187286	.	TA	T,TAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,28,27;MFRL=143,187,127;MMQ=60,60,60;MPOS=13,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=7.56,4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,5:0.238,0.290:17:5,3,3:2,1,0:7,1,7,2
chr15	81199236	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=175,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,4:0,0:0,3,0,4
chr15	81234328	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:9,0:8,6:6,11,0,6
chr15	81234741	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr15	81296942	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=156,78;MMQ=60,55;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:13,3:9,0:12,10,3,0
chr15	81296972	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=166,78;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:15,4:11,0:11,16,3,1
chr15	81427575	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=101,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:8,2:5,2:9,4,4,0
chr15	81427705	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=124,160;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.485:11:4,2:2,1:3,3,1,4
chr15	81430305	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=239,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr15	81440147	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=212,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.350:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr15	81578189	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=225,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:1,8:5,6:1,5,1,13
chr15	81589448	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=243,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,7:3,5:0,5,2,10
chr15	81625336	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=240,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:1,3:1,1:1,1,3,2
chr15	81631681	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,7,2
chr15	81635538	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:9,4,2,0
chr15	81649001	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr15	81651651	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=170,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:2,1,7,0
chr15	82335444	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	82431219	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr15	82450268	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=195,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr15	82512429	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=259,134;MMQ=40,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:4,1,2,4
chr15	82517458	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=171,232;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:2,2:3,0:6,0,2,0
chr15	82530630	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:5,0,4,0
chr15	82532963	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=205,172;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr15	82544927	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,189;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,4,1
chr15	82545214	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=316,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0,1,0,7
chr15	82563853	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=310,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr15	82563991	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,12,8
chr15	83215134	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=242,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,2:1,7:5,0,6,3
chr15	83215251	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=123,139;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:7,6:11,3:8,10,5,4
chr15	83221392	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=173,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,2:4,5:3,5,1,6
chr15	83240293	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=193,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:5,7:5,7:4,6,1,13
chr15	83328371	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:4,5:6,0:6,4,5,0
chr15	83328542	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=91,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:4,1,1,3
chr15	83333169	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:7,0:10,2:8,10,2,0
chr15	83334419	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=206,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr15	83433984	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,120;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:10,7:8,0:6,12,7,0
chr15	83447445	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=250,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:83447445_T_C:83447445:2,0,1,0
chr15	83447450	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=250,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:83447445_T_C:83447445:2,0,1,0
chr15	83447471	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr15	83449122	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:83449122_T_TC:83449122:0,0,0,1
chr15	83449125	.	CC	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:83449122_T_TC:83449122:0,0,0,1
chr15	83455423	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=217,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:0|1:83455423_G_A:83455423:4,0,2,3
chr15	83455427	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=190,159;MMQ=60,39;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:83455423_G_A:83455423:7,1,0,2
chr15	83495290	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,187;MMQ=40,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:3,6,1,1
chr15	83495578	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=153,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:8,2:16,1:13,11,3,0
chr15	83502065	.	AC	CG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,181;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:5,2:10,8,2,0
chr15	83521036	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=198,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:2,2:3,5:1,4,1,7
chr15	83561432	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=144,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:3,0:12,2:10,5,0,2
chr15	83658725	.	G	GGAAACAGCACGTTTTTTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,271;MMQ=40,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:0,6,0,3
chr15	83735926	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=211,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr15	83781474	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr15	83832698	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=196,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:1,3:3,4:4,1,6,1
chr15	83931986	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=153,123;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:5,3,0,2
chr15	83932526	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=195,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:4,2:10,3,1,1
chr15	83932798	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,1:9,1:11,10,0,2
chr15	83937081	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	84237456	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=205,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr15	84257351	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=187,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr15	84324441	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=126,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:4,2,4,2
chr15	84373319	.	C	CAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr15	84442240	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=199,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:7,2:4,2:11,1,4,0
chr15	84488529	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=164,42;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:3,1,1,1
chr15	84506892	.	G	GTGT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=179,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:84506892_G_GTGT:84506892:4,5,1,1
chr15	84506894	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=179,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,1:0|1:84506892_G_GTGT:84506892:4,5,1,1
chr15	84554018	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr15	84554033	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=203,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:84554033_G_A:84554033:0,2,0,1
chr15	84554038	.	TG	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=203,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:84554033_G_A:84554033:0,2,0,1
chr15	84568504	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=102,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,8:3,1:2,2,2,7
chr15	84611367	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=177,122;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.529:13:3,5:3,2:5,1,3,4
chr15	84611630	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.518:21:3,3:7,7:8,2,7,4
chr15	84611782	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=199,99;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:8,0:13,5:8,14,0,5
chr15	84651290	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,15:0,5:0,0,12,9
chr15	84651321	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=191,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:9,1:5,3:8,6,2,2
chr15	84657639	.	ATTTT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,232;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,8;RU=T;STR;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.842:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	85159553	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=213,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.496:24:7,7:5,4:7,5,6,6
chr15	85164470	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:7,1:4,11,0,2
chr15	85164977	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,1:10,2:13,7,2,1
chr15	85165193	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=146,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:4,3:11,0:8,7,2,1
chr15	85167035	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=226,145;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:85167035_T_C:85167035:0,1,0,1
chr15	85167040	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=226,145;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:85167035_T_C:85167035:0,1,0,1
chr15	85186637	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=228,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:3,0,7,0
chr15	85188775	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.485:25:8,3:4,9:7,6,4,8
chr15	85191274	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,251;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr15	85200520	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:8,7:3,4:4,7,8,3
chr15	85326955	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,3:6,2:8,4,3,2
chr15	85328148	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=206,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,2:6,3:6,8,3,2
chr15	85341519	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=187,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:7,0,6,1
chr15	85345132	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=202,70;MMQ=40,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:5,6,2,0
chr15	85382193	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:2,8:2,2:2,2,6,4
chr15	85402411	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=121,268;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,3:7,1:14,2,4,0
chr15	85406828	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=143,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:10,7,2,0
chr15	85438118	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=182,279;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr15	85438397	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=264,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:2,1,1,4
chr15	85448684	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=378,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:1,0,4,1
chr15	85448875	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=260,94;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,4:3,8:3,2,5,7
chr15	85448906	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=134,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:2,1:7,1:3,6,0,3
chr15	85452095	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=229,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.747:10:1,4:1,3:0,2,1,7
chr15	85461851	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=133,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:3,4,1,1
chr15	85467207	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=163,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,5:6,6:7,4,6,5
chr15	85478556	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=161,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:85478556_T_G:85478556:7,1,1,1
chr15	85478558	.	T	TACCACTGG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=161,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:85478556_T_G:85478556:7,1,1,1
chr15	85478560	.	C	CAG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=161,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:5,0:3,1:0|1:85478556_T_G:85478556:7,1,1,1
chr15	85486642	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=278,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,6:1,0:4,3,6,0
chr15	85487960	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr15	85619248	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:0,6,0,4
chr15	85632728	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=16,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,2:0,1:0,1,0,3
chr15	85656568	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=161,65;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr15	85659150	.	C	CAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=153,86;MMQ=60,31;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=A;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:1,1:1,1:0|1:85659150_C_CAA:85659150:4,0,2,0
chr15	85659167	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,15;MFRL=148,86;MMQ=60,31;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,0:0|1:85659150_C_CAA:85659150:7,1,2,0
chr15	85666463	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=166,247;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:0,10,1,1
chr15	85669452	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,3:6,1:8,6,2,2
chr15	86087212	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,4,11
chr15	86122875	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=195,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:6,3,1,3
chr15	86189006	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=252,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.549:11:2,3:3,3:4,1,6,0
chr15	86205523	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=251,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:3,1,6,0
chr15	86253768	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:8,8:4,4:9,3,7,5
chr15	86253911	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=159,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:11,1:11,2:8,14,0,3
chr15	86260700	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,2:6,3:0,7,0,5
chr15	86262256	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr15	86278174	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=268,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr15	86278770	.	AC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=122,71;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:12,2:5,0:12,5,2,0
chr15	86286675	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=171,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr15	86286725	.	TTCCCATCCACATACCAAGCTGATGAGGA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=171,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,0:5,2:9,5,1,1
chr15	86286878	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:14,0:7,3:9,12,3,0
chr15	86311188	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=201,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr15	86313048	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	86685220	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,2:10,0:16,4,2,0
chr15	86697766	.	G	GGTCTCGAGGGTGGT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:4,2:0|1:86697766_G_GGTCTCGAGGGTGGT:86697766:9,6,1,1
chr15	86697769	.	C	CTTTATTTATT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=146,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:4,1:0|1:86697766_G_GGTCTCGAGGGTGGT:86697766:9,6,1,1
chr15	86806029	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr15	86807420	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=230,17662007;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr15	86807830	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=203,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:7,5:6,2:6,7,5,3
chr15	86807843	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=192,152;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,3:6,2:9,6,2,3
chr15	86814866	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=109,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,4:4,5:4,3,6,3
chr15	86814949	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:5,1:6,5:5,6,0,6
chr15	87099537	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=209,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:3,5:2,2:3,2,4,4
chr15	87217488	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=164,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,3:1,7:2,2,5,5
chr15	87217721	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=127,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:2,3,0,7
chr15	87531281	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,7:0,0,9,3
chr15	88420291	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:7,0:9,4:12,4,0,4
chr15	88423463	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=118,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.722:12:1,2:2,7:1,2,8,1
chr15	88429076	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	88484048	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=128,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,1:3,1:2,5,0,2
chr15	88678680	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr15	88690609	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=151,141;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:14,4:11,0:16,10,4,0
chr15	88726584	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=212,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,1:5,0:0|1:88726584_C_T:88726584:8,1,2,0
chr15	88726586	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=212,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:6,0:0|1:88726584_C_T:88726584:8,1,2,0
chr15	89007833	.	TC	GG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,17;MFRL=213,238;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:89007833_TC_GG:89007833:1,0,1,0
chr15	89007837	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=213,238;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:89007833_TC_GG:89007833:1,0,1,0
chr15	89007839	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=238,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr15	89011232	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=167,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:9,1:16,2:13,12,3,0
chr15	89079672	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr15	89151262	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr15	89195526	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=301,121;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,6:0,7:0,1,6,7
chr15	89379348	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=215,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:8,0,2,0
chr15	89383494	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=208,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr15	89385151	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr15	89386543	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr15	89390434	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,4:0,12:0,0,11,5
chr15	89391160	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,6:0,2:0,0,8,1
chr15	89395215	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:10,3:7,0:8,9,3,0
chr15	89421435	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=117,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:4,0:7,5:5,6,0,5
chr15	89442606	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr15	89444760	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,4:0,0,4,3
chr15	89444793	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:5,8:6,0:8,4,8,0
chr15	89448973	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,13;MFRL=189,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:0,1:4,0:8,0,4,0
chr15	89449137	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=130,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,2:4,2:1,6,3,1
chr15	89450087	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=210,217;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr15	89659467	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=220,274;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr15	89731347	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,239;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:5,0,3,0
chr15	89734322	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=150,34;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:4,2:0|1:89734322_G_C:89734322:8,3,1,1
chr15	89734325	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=150,34;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:89734322_G_C:89734322:8,3,1,1
chr15	89734329	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=150,34;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:89734322_G_C:89734322:8,5,1,1
chr15	89734334	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=150,34;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:0|1:89734322_G_C:89734322:8,5,1,1
chr15	89754954	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:3,2,2,0
chr15	89758552	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr15	89804111	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=161,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:2,2:8,1:1,9,1,2
chr15	89805189	.	C	CTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,0:4,4:1,4,0,4
chr15	89816541	.	TAAAAAAA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=186,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=16,9;RU=A;STR;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,6:1,1:0,2,6,2
chr15	89817616	.	T	TGTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=174,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTG;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,0:0,1:0|1:89817616_T_TGTG:89817616:0,1,0,1
chr15	89817621	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=174,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:89817616_T_TGTG:89817616:0,1,0,1
chr15	89817622	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=174,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:89817616_T_TGTG:89817616:0,1,0,1
chr15	89817627	.	A	ATATCTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=174,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:89817616_T_TGTG:89817616:0,1,0,1
chr15	89826496	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=124,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,0:10,2:1,12,0,2
chr15	89844688	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=117,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:0,1:10,4:2,8,2,3
chr15	89859932	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=139,276;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,1:2,2:3,1,3,1
chr15	89860786	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,3:0,1:1,2,1,3
chr15	89862341	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,3:6,5:7,5,4,4
chr15	89862366	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,5:3,4:4,5,3,6
chr15	89863928	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=180,245;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr15	89865073	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=178,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:6,9,0,2
chr15	89866954	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr15	89867154	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=96,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:3,2:5,1:3,5,1,2
chr15	89869768	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=193,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr15	89876236	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,244;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,3:6,1:8,0,4,0
chr15	90020515	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=247,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.481:3:0,1:1,0:0|1:90020515_C_A:90020515:0,2,0,1
chr15	90020516	.	C	CATCATCTAGAGGCGACATTTTACATTTTTTAAATTAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=247,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.481:3:0,1:1,0:0|1:90020515_C_A:90020515:0,2,0,1
chr15	90023597	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=116,75;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.224:29:12,5:11,0:11,12,6,0
chr15	90128910	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=164,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:14,4,2,0
chr15	90128966	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=204,161;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.876:22:0,8:2,12:1,1,10,10
chr15	90129188	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,1,10
chr15	90129227	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr15	90135196	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr15	90135432	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr15	90144851	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,6:0,4:0,0,6,5
chr15	90144894	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=56.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:1,10:0,5:1,0,8,7
chr15	90144944	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,13:0,1:0,1,7,7
chr15	90161355	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,8,6
chr15	90168153	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=193,183;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:7,0:13,4:0|1:90168153_G_C:90168153:8,12,0,4
chr15	90168155	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:7,0:13,3:0|1:90168153_G_C:90168153:9,13,0,4
chr15	90168162	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=194,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:8,0:12,4:0|1:90168153_G_C:90168153:9,11,0,4
chr15	90169331	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=161,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:1,11,1,2
chr15	90172133	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:5,0,6,0
chr15	90173734	.	C	CAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=233,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:0,1,2,5
chr15	90174907	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=137,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,1:9,2:10,8,3,0
chr15	90174923	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=135,105;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,1:8,2:9,10,3,0
chr15	90174955	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=255,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.847:17:2,7:0,8:1,1,3,12
chr15	90176432	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr15	90177159	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=227,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr15	90188514	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	90189342	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	90190048	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=175,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:0,2:2,10:0,2,6,6
chr15	90191827	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	90192905	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	90195765	.	AA	GG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	90211047	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr15	90213134	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr15	90227268	.	TTTTG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=221,325;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr15	90245298	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=87,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:10,1:5,4:3,12,2,3
chr15	90248705	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=163,89;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:9,1,2,0
chr15	90265437	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr15	90273070	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=164,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr15	90274639	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=138,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:3,2,1,1
chr15	90274815	.	A	AGGATT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=176,1573;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,1:4,1:1,5,2,0
chr15	90281045	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=121,240;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,2,3
chr15	90328551	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.652:23:3,7:5,8:7,1,12,3
chr15	90328774	.	A	AAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=123,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,1:1,5:1,3,1,5
chr15	90333614	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=201,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:90333614_C_T:90333614:2,0,1,0
chr15	90333616	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,36;MFRL=201,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:90333614_C_T:90333614:2,0,1,0
chr15	90333654	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=200,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,1:6,1:7,0,1,1
chr15	90333851	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=158,246;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,1:6,1:0,6,0,2
chr15	90334345	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=106,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:5,1:9,3:4,10,1,3
chr15	90334415	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=213,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr15	90335379	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=217,243;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,2:2,1:4,1,2,1
chr15	90336373	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=194,290;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:2,4,0,2
chr15	90340719	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=192,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:90340719_G_A:90340719:4,0,2,0
chr15	90340725	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=224,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.497:6:1,0:2,3:0|1:90340719_G_A:90340719:3,0,2,1
chr15	90346842	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=224,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:4,3,1,1
chr15	90346861	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=238,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.658:13:2,4:2,3:2,2,5,4
chr15	90414642	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,7:1,6:1,0,12,1
chr15	90437230	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr15	90454140	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=221,278;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr15	90455940	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr15	90610722	.	AAC	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=159,113;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.273:42:13,11:17,0:13,18,11,0
chr15	90610807	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,2:3,5:1,4,0,7
chr15	90617539	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:0,5,0,6
chr15	90623052	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=195,189;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.727:8:0,2:1,4:1,1,1,5
chr15	90627616	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=220,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:2,2:1,2:1,3,2,2
chr15	90628322	.	G	GCAGGCAATGACAAAGA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=172,39;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:90628322_G_GCAGGCAATGACAAAGA:90628322:3,5,1,1
chr15	90628326	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=172,39;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:90628322_G_GCAGGCAATGACAAAGA:90628322:3,5,1,1
chr15	90628330	.	CC	AA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=172,39;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:2,2:4,0:0|1:90628322_G_GCAGGCAATGACAAAGA:90628322:3,5,1,1
chr15	90630892	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,264;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr15	90634684	.	CG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=200,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:3,4:0,5:3,0,9,0
chr15	90634941	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=120,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:1,3,0,3
chr15	90761136	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=232,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr15	90762951	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:3,0,4,0
chr15	90764202	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=150,110;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.488:23:5,1:5,10:5,7,6,5
chr15	90764348	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,1:3,5:1,7,2,4
chr15	90764357	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=108,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,0:5,3:2,8,1,2
chr15	90764359	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=21,33;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:3,0:3,6:1,6,2,4
chr15	90765093	.	CG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,1,3
chr15	90766754	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,2:2,5:3,1,3,4
chr15	90768156	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=226,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.684:10:2,5:0,2:2,1,4,3
chr15	90768543	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:6,7,1,1
chr15	90773782	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:9,4:4,5:6,7,3,6
chr15	90774447	.	TAGAG	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=197,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=AG;STR;TLOD=54.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:4,8:7,6:10,2,6,8
chr15	90775397	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:4,2:9,6:11,3,8,0
chr15	90799138	.	A	AACT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=178,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr15	90799320	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:3,1,1,1
chr15	90800408	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:8,11,0,2
chr15	90809633	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=115,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:0,5,1,7
chr15	90898052	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,122;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr15	90931457	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=219,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr15	90933991	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=181,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:11,2:8,2:15,4,3,1
chr15	90934037	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=125,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,8:0.176:49:19,8:22,0:26,15,8,0
chr15	90969335	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:1,3:6,5:4,3,4,4
chr15	90983706	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=93,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.686:17:0,5:5,7:3,2,8,4
chr15	90986637	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=106,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:9,2:6,1:9,6,1,2
chr15	90992687	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=267,211;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr15	91009147	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=202,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr15	91009177	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=188,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,4:0,2:3,0,6,0
chr15	91009192	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.658:12:3,5:0,3:2,2,7,1
chr15	91009381	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=186,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:1,1,2,5
chr15	91009484	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,3,2
chr15	91017232	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,12:0,11:0,0,11,12
chr15	91017274	.	T	TTTC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTC;STR;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:2,2:6,7:1,7,4,7
chr15	91020010	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=171,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,3:7,0:10,7,0,3
chr15	91020395	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=208,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:6,8,0,2
chr15	91021171	.	CT	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=156,206;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,0:5,3:1,7,0,4
chr15	91043183	.	ACTGT	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.501:6:1,2:1,1:0|1:91043183_ACTGT_A:91043183:3,0,2,1
chr15	91043192	.	ATGTT	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=62,309;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.455:7:1,2:3,1:3,1,2,1
chr15	91043197	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.547:7:0,2:2,2:0|1:91043183_ACTGT_A:91043183:3,0,2,2
chr15	91073464	.	GCGGCCA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.687:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	91083186	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr15	91147512	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr15	91347302	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr15	91358271	.	G	GGAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=205,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAA;STR;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.567:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr15	91419432	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	91420274	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:11,4:10,0:10,12,4,0
chr15	91420940	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	91421283	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=196,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr15	91423543	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr15	91428521	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr15	91430617	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,3:1,5,1,4
chr15	91430628	.	C	CTTCCCTTCCTTCCCTTCACAGGTGTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=144,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:1,9,1,1
chr15	91433265	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr15	91436227	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=219,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:3,2,3,0
chr15	91437388	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=181,231;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr15	91449015	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,2:3,5:5,1,2,5
chr15	91450441	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=201,258;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr15	91456102	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:2,6:8,2:6,4,6,2
chr15	91478736	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.428:7:0,0:2,1:3,1,3,0
chr15	91479054	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr15	91482935	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=37,35;MFRL=210,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,3:1,0,4,2
chr15	91491187	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:91491187_T_G:91491187:0,0,0,1
chr15	91491194	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:91491187_T_G:91491187:0,0,0,1
chr15	91491206	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,35;MFRL=327,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	91503049	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:1,1:5,1:3,3,2,0
chr15	91503088	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=125,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:5,4,2,0
chr15	91503752	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=209,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:1,2,0,2
chr15	91504181	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=205,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,2:5,2:9,1,4,0
chr15	91504956	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=169,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:13,1:2,1:9,6,2,0
chr15	91512355	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=123,120;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:12,0:8,5:9,12,0,5
chr15	91513832	.	GGGA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=218,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGA;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:3,1:1,6,0,2
chr15	91517479	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=181,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,1:1,1:0,7,1,1
chr15	91517780	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=162,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,2,1
chr15	91520098	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=158,178;MMQ=50,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:91520098_CA_TG:91520098:0,4,0,1
chr15	91520099	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=137,158;MMQ=58,43;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1|0:91520098_CA_TG:91520098:0,2,0,2
chr15	91543630	.	TA	T,TAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,28,24;MFRL=320,88,281;MMQ=60,60,60;MPOS=9,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=A;STR;TLOD=3.68,3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.334,0.220:6:3,2,0:0,0,1:3,0,3,0
chr15	91544539	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.515:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr15	91545211	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr15	91549511	.	TGGGGCCCACAGCCTGGTATAAGCAG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGGCCCACAGCCTGGTATAAGCAG;STR;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:0,1:3,1:6,2,2,0
chr15	91549822	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:3,2,4,0
chr15	91550125	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=151,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:10,2,0,2
chr15	91565502	.	G	GTGCACCTA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=166,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:10,2:6,0:0|1:91565502_G_GTGCACCTA:91565502:2,14,1,1
chr15	91565504	.	G	GGAAGCAGGTGAGGGCTGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:9,1:6,0:0|1:91565502_G_GTGCACCTA:91565502:2,14,1,1
chr15	91795758	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=128,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,2:5,1:4,11,2,1
chr15	91811892	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=176,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,1,1
chr15	91827534	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=169,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr15	91835693	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.283:29:11,0:10,7:12,9,0,8
chr15	92397106	.	AGCG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCG;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.707:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	92459187	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=160,259;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:2,6,3,2
chr15	92647822	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=301,261;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:92647822_T_G:92647822:0,1,0,1
chr15	92647828	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:92647822_T_G:92647822:0,0,0,1
chr15	92647834	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:92647822_T_G:92647822:0,0,0,1
chr15	92663630	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,9:0,4:0,0,10,3
chr15	92669362	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=193,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:5,4:11,0:9,7,4,0
chr15	92937268	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0|1:92937268_G_T:92937268:0,0,4,0
chr15	92937276	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0|1:92937268_G_T:92937268:0,0,6,0
chr15	92977616	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=185,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:3,13,0,2
chr15	92977670	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=144,239;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr15	93007372	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:10,7:10,0:11,9,0,7
chr15	93015278	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=211,249;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:4,0,3,0
chr15	93016128	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,1:3,1:7,5,0,2
chr15	93043545	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=116,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:0,2:6,3:3,3,2,3
chr15	93043606	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=149,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:9,1:4,1:8,5,0,2
chr15	93198671	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,1,9
chr15	93198678	.	TTGGAGC	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGAGC;STR;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.922:10:0,8:0,1:0,0,1,9
chr15	93198784	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	93488926	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=213,259;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr15	93496874	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=227,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:0,1,0,6
chr15	93515439	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,1:5,3:5,2,3,1
chr15	93522312	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=176,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.485:12:3,2:3,2:6,0,6,0
chr15	93522534	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=165,57;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:6,2:7,0:0|1:93522534_G_T:93522534:1,12,1,1
chr15	93522552	.	T	TGCTAACCCC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=173,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0|1:93522534_G_T:93522534:0,13,1,1
chr15	93522554	.	G	GAATGTGTGAATA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=173,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0|1:93522534_G_T:93522534:0,13,1,1
chr15	93527794	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:0,5,1,6
chr15	93540089	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	93543922	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:93543922_A_G:93543922:0,4,0,1
chr15	93543937	.	A	ACT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:93543922_A_G:93543922:0,3,0,1
chr15	93543938	.	TAA	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:93543922_A_G:93543922:0,3,0,1
chr15	93543942	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:93543922_A_G:93543922:0,3,0,1
chr15	93543945	.	A	AGCCTC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:93543922_A_G:93543922:0,3,0,1
chr15	93552330	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=226,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,6:4,3:8,1,9,0
chr15	93555717	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=212,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr15	93563164	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=224,286;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:0,0:2,4:2,0,2,2
chr15	93563331	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=192,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:8,5:16,0:11,13,5,0
chr15	93567526	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=234,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:4,0,4,1
chr15	93616283	.	A	AAGG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:3,0:8,4:3,8,0,4
chr15	93632123	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	94857665	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,10;MFRL=201,208;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.583:5:1,1:0,0:0,2,0,3
chr15	94858686	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr15	94899308	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=157,259;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,3:2,1:7,1,3,1
chr15	94899354	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=159,244;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,2:5,1:10,3,2,1
chr15	94899551	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=177,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,3:6,0:1,12,1,2
chr15	94927304	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=186,128;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,10:0.355:29:8,0:11,10:0|1:94927304_C_T:94927304:7,12,0,10
chr15	94927309	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=188,128;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=35.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.335:31:8,0:9,10:0|1:94927304_C_T:94927304:10,11,0,10
chr15	94945324	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr15	94945704	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.530:15:4,5:3,3:0|1:94945704_A_G:94945704:6,1,2,6
chr15	94945719	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0|1:94945704_A_G:94945704:0,0,9,9
chr15	96876611	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=170,443;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:2,4,0,3
chr15	96880510	.	ATTC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TTC;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,1:4,0,2,0
chr15	98504322	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=274,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:98504322_C_T:98504322:0,1,0,2
chr15	98504326	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=274,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:98504322_C_T:98504322:0,1,0,2
chr15	98512478	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=130,177;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:10,9,0,2
chr15	98512622	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=135,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,1:3,2:1,3,0,3
chr15	98513086	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.519:13:2,4:3,3:6,0,7,0
chr15	98514282	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=196,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:6,1,6,1
chr15	98514489	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr15	98995052	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,5,7
chr15	98995081	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,7:0,0,12,9
chr15	99192754	.	C	CTTTTTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=208,168;MMQ=40,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=24,30;RU=T;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr15	99442884	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=120,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:7,2:2,2:2,7,0,4
chr15	99456253	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=177,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,1:4,3:7,4,3,1
chr15	99456553	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr15	99465285	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:3,0,8,0
chr15	99467795	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=174,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,6:6,0:6,7,6,0
chr15	99467934	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.782:21:3,9:1,8:2,2,6,11
chr15	99478451	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=214,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:5,1,4,0
chr15	99478493	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,8,8
chr15	99478505	.	A	AC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=59.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,9,8
chr15	99500376	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=118,77;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:9,7,0,2
chr15	99511793	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,5,6
chr15	99511804	.	A	AC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=49.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,3:0,0,6,8
chr15	99646107	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr15	99678145	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=114,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:6,1,3,2
chr15	99679830	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=187,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:4,10,0,2
chr15	99796089	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr15	99901749	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=185,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,2:6,2:6,7,0,4
chr15	99903547	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=132,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr15	100173379	.	G	GAAT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=151,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:12,2:13,0:11,14,1,1
chr15	100243487	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,8,1
chr15	100246834	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr15	100251015	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:0,7,1,4
chr15	100269309	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr15	100271253	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=214,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr15	100514525	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=379,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr15	100514561	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=142,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:1,0,9,1
chr15	100533218	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=298,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr15	100537494	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=187,235;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr15	100592021	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=146,263;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr15	100594271	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=156,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,1:7,3:3,10,1,3
chr15	100594299	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=191,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:1,5,0,3
chr15	100693032	.	C	CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=199,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:2,2:1,1:0,3,0,9
chr15	100695347	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=227,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:1,2,3,0
chr15	100794363	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=143,197;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,3:6,3:3,5,2,4
chr15	100801603	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=238,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.748:10:1,5:1,2:2,0,8,0
chr15	100802495	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=151,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.787:12:1,0:1,7:0|1:100802495_G_A:100802495:1,1,7,3
chr15	100802499	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=151,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.800:13:1,2:1,9:0|1:100802495_G_A:100802495:1,1,7,4
chr15	100821426	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=199,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,4:1,0:5,0,2,2
chr15	100821647	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=175,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:1,6,1,3
chr15	100871329	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=197,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:1,8,0,2
chr15	100881995	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=216,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.413:15:4,3:5,3:5,4,2,4
chr15	100942843	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=203,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr15	100996038	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=108,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:2,0,5,1
chr15	100996076	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:2,1:2,5:3,1,3,3
chr15	101009530	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=238,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,6:2,4:4,3,8,2
chr15	101019529	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr15	101019692	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=196,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:8,2:7,1:4,11,0,3
chr15	101019693	.	GA	G,AA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,33,24;MFRL=178,237,169;MMQ=60,60,60;MPOS=21,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.02,6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,3:0.184,0.191:14:2,1,2:3,1,0:2,7,0,5
chr15	101020129	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.472:17:7,4:2,4:7,2,5,3
chr15	101043902	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=113,110;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:14,0:3,2:9,8,0,2
chr15	101112342	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=171,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,2:5,4:0,10,0,6
chr15	101120476	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:22,0:3,4:11,14,0,4
chr15	101152512	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=132,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:5,0:7,6,0,2
chr15	101440764	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:11,8,2,0
chr15	101440988	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,1,14
chr15	101441055	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr15	101448783	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr15	101464749	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=188,244;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:3,1:8,1:12,0,2,0
chr15	101523661	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr15	101529118	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr15	101550858	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,3:0,0,4,6
chr15	101550861	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,22,31,34;MFRL=0,181,178,137;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,18,26;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=T;STR;TLOD=4.19,5.61,3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,3,3,2:0.303,0.366,0.262:8:0,1,1,2:0,1,2,0:0,0,4,4
chr15	101551136	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	101561980	.	CGTGT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,302;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=GT;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.840:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	101562147	.	GA	AC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,1:4,1:0|1:101562147_GA_AC:101562147:3,11,0,2
chr15	101562150	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,1:4,1:0|1:101562147_GA_AC:101562147:3,11,0,2
chr15	101566118	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=175,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr15	101569467	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=181,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,1:3,5:2,4,0,6
chr15	101589765	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=228,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr15	101591834	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=220,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:3,0:1,3:4,0,3,0
chr15	101591857	.	CG	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr15	101593051	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=196,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr15	101601367	.	C	CACTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACTT;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:8,5,0,2
chr15	101601564	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=257,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr15	101717888	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=134,231;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:11,2:9,3:11,9,2,3
chr15	101717914	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=154,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:14,1:15,1:12,17,0,2
chr15	101718529	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=197,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:11,4,1,1
chr15	101816717	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=117,116;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,13:0.264:51:17,13:20,0:24,14,13,0
chr15	101826386	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.235:18:7,1:7,2:9,5,3,1
chr15	101862690	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=168,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:7,1,2,0
chr15	101866493	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=162,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr15	101871941	.	G	GA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=37.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.820:14:2,1:0,11:0,2,5,7
chr15	101872306	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=228,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,1:8,1:0,10,0,2
chr15	101872329	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=169,228;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,0:2,7:0,3,0,7
chr15	101888081	.	C	CT,T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,34,29;MFRL=144,144,144;MMQ=60,60,60;MPOS=8,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,3:0.222,0.444:6:0,0,3:2,1,0:0,2,0,4
chr15	101888085	.	G	GC,GGATGT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,29,28;MFRL=144,144,144;MMQ=60,60,60;MPOS=4,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,3:0.222,0.444:6:0,0,2:2,1,0:0,2,0,4
chr15	101888086	.	GTT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr15	101905084	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=172,229;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr15	101905327	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=137,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr15	101910511	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,6:1,1:4,0,4,3
chr15	101929632	.	ATT	A,AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29,30;MFRL=0,189,210;MMQ=60,60,60;MPOS=8,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=19.39,5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,8,3:0.643,0.285:11:0,4,2:0,3,1:0,0,11,0
chr15	101929825	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr15	101968084	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=198,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,0:5,2:3,3,2,0
chr15	101970250	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=193,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:8,7,2,0
chr15	101970308	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,1,10
chr15	101970323	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:0,7,0,4
chr15	101970336	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr15	101971737	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=214,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:101971737_A_AG:101971737:0,4,1,1
chr15	101971738	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=214,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:101971737_A_AG:101971737:0,4,1,1
chr15	101972149	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=131,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.469:30:6,14:9,0:14,2,14,0
chr15	102191869	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,11:0,0,15,7
chr15	102192034	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,0,13
chr15	102211654	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr15	102224223	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,1:9,1:21,3,1,1
chr15	102251993	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr16	64341	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,31;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	97610	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=223,310;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,0:5,3:0,13,0,3
chr16	97648	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=196,172;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:97648_A_G:97648:0,4,0,1
chr16	97656	.	CG	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=182,172;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:97648_A_G:97648:0,3,0,1
chr16	103423	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr16	103449	.	C	CG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr16	103923	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=241,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,4:0,5:1,0,9,0
chr16	104077	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=15,14;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.696:4:0,1:0,0:0,1,0,3
chr16	105444	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,1:5,8:5,2,3,6
chr16	106704	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=164,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:1,3,0,2
chr16	108796	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,2,4
chr16	109671	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=197,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,2,1
chr16	110165	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:1,0,2,2
chr16	112513	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr16	113493	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=249,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr16	113883	.	G	GCC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0|1:113883_G_GCC:113883:0,0,9,5
chr16	113886	.	GC	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=61.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0|1:113883_G_GCC:113883:0,0,9,5
chr16	113970	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=228,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:0,4,1,4
chr16	114535	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=237,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:2,3,2,3
chr16	115041	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=201,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr16	133013	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=15,15;MFRL=183,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.660:7:0,2:0,0:2,0,5,0
chr16	133020	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=171,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.462:8:2,0:1,0:3,1,4,0
chr16	136888	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,29;MFRL=165,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.845:8:0,2:0,5:0,1,0,7
chr16	138772	.	A	AG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=69.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,9:0,9:0,0,11,8
chr16	139636	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	142714	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:7,3:2,5:4,5,4,4
chr16	160566	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=188,78;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:160566_G_A:160566:6,5,1,1
chr16	160573	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=188,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:0|1:160566_G_A:160566:7,4,1,1
chr16	160668	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=257,173;MMQ=52,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,6:1,3:0,2,0,9
chr16	180406	.	AAAAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=276,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAC;STR;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr16	216190	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	240419	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=181,107;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:7,5:16,0:23,0,5,0
chr16	277420	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=141,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:1,0:6,4:0,7,0,4
chr16	304409	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=208,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:3,2:4,1:5,3,2,1
chr16	310243	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr16	313202	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=248,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr16	313406	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=222,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:0,5,2,2
chr16	324052	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=171,121;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,6:1,2:1,2,6,2
chr16	332558	.	CG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=196,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr16	334543	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=158,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:2,8,2,0
chr16	334580	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=196,146;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:1,2,0,3
chr16	338324	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=177,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:1,6,0,2
chr16	338332	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=222,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr16	354493	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,3:3,0:2,4,0,3
chr16	359953	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=236,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:3,1,6,1
chr16	396134	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=199,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:3,5,2,0
chr16	397044	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=72,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr16	418429	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:6,4:5,2:9,2,3,3
chr16	418462	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,14:0,6:0,0,14,6
chr16	419154	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,5:7,5:5,6,3,7
chr16	419283	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	422259	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:2,5,0,2
chr16	424420	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=169,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr16	425159	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=155,77;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,0:9,3:15,7,1,2
chr16	425277	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.419:14:4,2:4,2:4,4,1,5
chr16	425298	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.746:14:2,5:1,3:2,1,2,9
chr16	425533	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,36;MFRL=232,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:0,1:0,3,0,1
chr16	426476	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:2,2,2,2
chr16	427013	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr16	427309	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=179,233;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,4,1
chr16	427349	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=183,231;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:0,1,6,2
chr16	427657	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=240,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:2,0,3,2
chr16	427866	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=232,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.681:13:2,4:1,5:1,3,3,6
chr16	427925	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=223,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr16	427946	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=218,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:427946_G_A:427946:0,4,0,1
chr16	427947	.	G	GTTATAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=218,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:427946_G_A:427946:0,4,0,1
chr16	427948	.	G	GCCCT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=218,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:427946_G_A:427946:0,4,0,1
chr16	449162	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:2,0,3,3
chr16	449178	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,2:0,4:1,0,4,2
chr16	450140	.	C	CAG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,2:5,4:5,2,4,2
chr16	450165	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=142,195;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:2,2:8,4:6,4,4,2
chr16	455646	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=123,173;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,0:1,5:3,3,2,3
chr16	456239	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr16	456416	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=267,161;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr16	476436	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr16	476796	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:0,5,0,4
chr16	539088	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=200,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,1:1,1:0|1:539088_T_TAA:539088:0,2,0,2
chr16	539093	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=200,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:539088_T_TAA:539088:0,2,0,2
chr16	570454	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=230,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:2,3,3,2
chr16	570623	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=216,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:3,2,3,3
chr16	599857	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=136,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,2:8,1:9,3,2,1
chr16	601494	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,2:4,1:5,4,2,1
chr16	602046	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,7,10
chr16	602801	.	T	TTGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=15,16;MFRL=163,331;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0,3,1,0
chr16	602805	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=163,331;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:602805_GCA_G:602805:0,3,1,0
chr16	602809	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=256,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:602805_GCA_G:602805:1,1,0,1
chr16	602810	.	G	GAATTGCTTGAACCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=221,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,0:2,1:1|0:602805_GCA_G:602805:2,1,0,1
chr16	602813	.	A	AAG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=221,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,0:1,1:1|0:602805_GCA_G:602805:2,1,0,1
chr16	625886	.	C	CACCCACCTAATTTTTTTTGTTGTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=163,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:7,4,1,1
chr16	628994	.	TGGGC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=156,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGC;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:628994_TGGGC_T:628994:2,0,2,0
chr16	629006	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=156,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:628994_TGGGC_T:628994:2,0,2,0
chr16	667107	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=209,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr16	677511	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:3,7,1,1
chr16	677629	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,264;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:4,4:5,1:4,6,4,1
chr16	682566	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=176,284;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,0:2,2:4,6,1,1
chr16	699692	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=209,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr16	703721	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=153,273;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,3:6,0:6,4,3,0
chr16	703772	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,1:7,1:8,11,2,0
chr16	705920	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=232,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr16	707295	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr16	708419	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=180,242;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,1:8,3:8,4,0,4
chr16	709958	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,56;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	711582	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=217,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,0:2,3:1,5,2,1
chr16	712127	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr16	716428	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:5,6,1,1
chr16	716798	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=179,298;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,2:8,1:6,9,2,1
chr16	717085	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=196,346;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr16	725768	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	726907	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=175,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:3,2:10,9:6,7,5,6
chr16	732287	.	GC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=144,303;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:9,2:2,0:9,2,1,1
chr16	737186	.	C	CTCCA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=136,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:5,2:11,0:0|1:737186_C_CTCCA:737186:8,8,1,1
chr16	737187	.	G	GAGCTGATCACATGTGGATTAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=136,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:5,2:10,0:0|1:737186_C_CTCCA:737186:8,8,1,1
chr16	771750	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:4,1:1,2:0,6,0,3
chr16	772842	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:1,5,2,1
chr16	773111	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=155,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,3:7,0:5,9,3,0
chr16	774061	.	T	TGGGGGGGGGGG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,14;MFRL=146,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,17;RU=G;STR;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:1,0:6,0:7,0,0,4
chr16	775947	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0|1:775947_G_C:775947:3,2,2,1
chr16	775954	.	CC	AA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=155,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0|1:775947_G_C:775947:2,3,2,1
chr16	777627	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr16	782397	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=203,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,4:3,3:4,1,3,4
chr16	813783	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:813783_C_A:813783:0,0,0,1
chr16	813790	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:813783_C_A:813783:0,0,0,1
chr16	813793	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:813783_C_A:813783:0,0,0,1
chr16	813798	.	CTGCT	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:813783_C_A:813783:0,0,0,1
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chr16	814742	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=146,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:814742_T_A:814742:1,3,0,1
chr16	814749	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=146,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:814742_T_A:814742:1,3,0,1
chr16	815628	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
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chr16	817339	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,1:4,2:9,1,3,0
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chr16	828844	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
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chr16	830926	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=16,17;MFRL=186,201;MMQ=60,35;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.320:10:0,0:1,0:0|1:830924_T_A:830924:4,3,3,0
chr16	836992	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=192,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:4,3:1,1:0,5,1,3
chr16	837310	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:0,5:3,8:2,1,6,7
chr16	839184	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,5:4,5:5,3,7,3
chr16	840307	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=201,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:1,1:4,1:3,2,1,2
chr16	840597	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:2,2,2,0
chr16	841966	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,1:6,3:8,3,0,4
chr16	842373	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,0:4,1:7,2,0,2
chr16	842826	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=293,258;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr16	843084	.	C	CGGGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GGGTG;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr16	845901	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr16	847597	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=133,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr16	847901	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=176,261;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:4,3:8,2:7,5,3,2
chr16	857673	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=194,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:0|1:857673_G_A:857673:0,6,1,2
chr16	857697	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=194,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:3,2:2,1:0|1:857673_G_A:857673:1,5,0,3
chr16	863422	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:4,2,3,0
chr16	943107	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=225,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,5:4,6:3,5,4,7
chr16	943130	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=181,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,1:1,6:0,6,0,7
chr16	1130137	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,0:9,3:10,7,0,3
chr16	1130287	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.459:11:3,1:2,3:4,2,3,2
chr16	1131393	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=223,130;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.774:11:1,8:1,1:0,2,6,3
chr16	1131514	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr16	1244877	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=196,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr16	1245852	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=296,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,0:0|1:1245852_T_A:1245852:2,1,1,0
chr16	1245860	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=287,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:1245852_T_A:1245852:2,2,1,0
chr16	1257731	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=112,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,3:4,5:4,1,6,2
chr16	1259187	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=119,101;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,2:1,1:2,4,1,3
chr16	1260528	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=126,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:0,2,2,3
chr16	1261377	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:3,2,2,0
chr16	1261625	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,1:6,1:3,6,2,0
chr16	1265315	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:4,4,1,1
chr16	1272038	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,0:6,3:3,6,1,2
chr16	1272393	.	C	CACCCCTGCTATTTTTTTAAAAAAATG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=202,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:1,2,0,1
chr16	1273484	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=197,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:3,4,2,0
chr16	1273490	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=198,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:3,2,1,2
chr16	1273638	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	1275135	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr16	1275309	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=182,255;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:2,2,2,0
chr16	1278599	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=117,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr16	1279704	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=172,168;MMQ=55,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:1279704_A_G:1279704:1,2,0,1
chr16	1279710	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=184,168;MMQ=48,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0|1:1279704_A_G:1279704:1,3,0,1
chr16	1279714	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=172,168;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:1279704_A_G:1279704:0,3,0,1
chr16	1279717	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=172,168;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:1279704_A_G:1279704:0,3,0,1
chr16	1306268	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=187,136;MMQ=56,31;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:0,1:4,1:4,0,1,1
chr16	1306355	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=124,226;MMQ=60,37;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:0,4:6,1:3,3,3,2
chr16	1306377	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=147,312;MMQ=58,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,2:7,1:4,4,1,2
chr16	1306559	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=133,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:1,1:8,3:6,3,1,3
chr16	1308156	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=180,239;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,4:5,1:7,6,5,0
chr16	1364140	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=190,214;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=54.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:1,8:0,7:1,0,9,6
chr16	1364212	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=187,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.650:21:6,5:1,8:5,2,10,4
chr16	1364281	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=184,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,25:0.839:29:3,20:1,5:2,2,10,15
chr16	1365631	.	TCAC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAC;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,0:8,2:9,3,1,1
chr16	1370303	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=239,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,4:1,2:0|1:1370303_T_C:1370303:0,1,2,5
chr16	1370309	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=239,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,3:1,3:0|1:1370303_T_C:1370303:0,1,2,5
chr16	1370729	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=270,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,6:1,8:0,1,0,14
chr16	1370752	.	C	CAG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=270,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,5:1,5:0,1,0,10
chr16	1374656	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr16	1374818	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,3:0,1,2,2
chr16	1388888	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr16	1393020	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr16	1394430	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,2:8,2:5,9,3,1
chr16	1394551	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,8:1,2:0,1,6,4
chr16	1395420	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=164,252;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr16	1397518	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=310,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.874:14:0,8:1,5:0,1,9,4
chr16	1398077	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=229,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,1:0,2,2,1
chr16	1411747	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:5,1:4,5,2,0
chr16	1448761	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=281,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr16	1451627	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=194,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,1:7,2:1,9,3,0
chr16	1484338	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=234,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr16	1484392	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:1,5:1,1:2,0,7,0
chr16	1484473	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:1,5,1,3
chr16	1486598	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=286,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,1,5
chr16	1486875	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.660:7:1,1:1,3:0,2,2,3
chr16	1487975	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=156,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr16	1488015	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=151,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:4,2:2,2:0|1:1488015_A_G:1488015:5,2,2,2
chr16	1488039	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=146,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:3,3:2,1:0|1:1488015_A_G:1488015:4,2,3,1
chr16	1492307	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=255,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr16	1493030	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr16	1493037	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,1,5
chr16	1493759	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=221,233;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,2:3,0:4,0,3,0
chr16	1494371	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,4:1,0:3,1,1,3
chr16	1497125	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	1497640	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=159,198;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:2,1:1,2:2,2,2,1
chr16	1498520	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr16	1498572	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=154,229;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr16	1498775	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=284,68;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.527:4:1,2:1,0:0|1:1498775_CG_C:1498775:1,1,1,1
chr16	1498779	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=284,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,2:1,0:0|1:1498775_CG_C:1498775:1,1,1,1
chr16	1498781	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=284,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,1:1,0:0|1:1498775_CG_C:1498775:1,1,1,1
chr16	1498785	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=163,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1498775_CG_C:1498775:0,1,0,1
chr16	1498951	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=122,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:1,1:2,4:3,1,4,1
chr16	1499377	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:1,6,0,3
chr16	1499408	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=224,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr16	1500708	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr16	1504437	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=223,163;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:4,10:0,4:3,1,9,5
chr16	1507238	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=98,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:1,4,4,1
chr16	1510538	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=277,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,3:3,1:2,1,1,3
chr16	1510567	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr16	1511372	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=132,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr16	1511552	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,6:2,1:0,3,2,5
chr16	1511758	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr16	1515415	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=205,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr16	1537455	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=147,197;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0|1:1537455_T_C:1537455:3,2,1,1
chr16	1537458	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=147,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0|1:1537455_T_C:1537455:3,2,1,1
chr16	1537601	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=185,260;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,2:0,4:1,1,4,2
chr16	1547095	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=177,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,2:7,0:5,10,0,2
chr16	1547220	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr16	1549343	.	GC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,1:2,1:6,5,1,1
chr16	1557268	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=231,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr16	1560886	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=220,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr16	1568402	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=169,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,0:5,2:0,7,0,2
chr16	1570098	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=211,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:3,3,1,1
chr16	1573810	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr16	1592087	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=218,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:0,7,1,5
chr16	1604701	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=203,200;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.482:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr16	1605051	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr16	1608177	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=234,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,5:3,3:0,4,1,7
chr16	1616201	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=125,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,1:6,2:4,8,1,2
chr16	1621462	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=183,106;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,2:12,0:12,7,2,0
chr16	1639793	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=153,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,0:3,4:2,5,3,1
chr16	1642423	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=193,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,1:4,1:5,3,2,0
chr16	1652614	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=207,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr16	1657284	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:0,7:3,3:0,3,3,8
chr16	1657350	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=237,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:0,4,0,4
chr16	1664843	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr16	1710056	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	1716010	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=220,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,4:1,3:5,1,7,0
chr16	1719150	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=153,77;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:4,1:9,2:2,12,2,1
chr16	1797218	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.323:19:6,5:7,0:5,8,6,0
chr16	1814016	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=202,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:1814016_G_T:1814016:1,0,1,0
chr16	1814019	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=202,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1814016_G_T:1814016:1,0,1,0
chr16	1814964	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr16	1816951	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=187,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,2:9,0:5,7,1,1
chr16	1817397	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr16	1817754	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr16	1817768	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr16	1817935	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=243,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,5:0,2:2,0,3,4
chr16	1818152	.	CT	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,5,6
chr16	1818680	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,8:0,6:0,0,8,6
chr16	1822443	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=150,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,2:5,1:6,5,2,1
chr16	1822797	.	C	CACCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACCT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	1825768	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=171,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,12:0.297:41:11,2:18,9:13,16,2,10
chr16	1826302	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:1,6,0,2
chr16	1837900	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr16	1843576	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:3,5,1,1
chr16	1859406	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=202,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:1859406_G_A:1859406:0,4,0,1
chr16	1859417	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=202,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:1859406_G_A:1859406:0,4,0,1
chr16	1859432	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=206,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0|1:1859406_G_A:1859406:0,1,0,3
chr16	1859850	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=168,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,1:2,6:0,5,1,6
chr16	1869836	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=163,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.448:7:0,2:2,0:4,0,3,0
chr16	1877175	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=214,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:3,0,5,1
chr16	1878031	.	GC	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=231,168;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:2,1:2,1:0,5,0,2
chr16	1878275	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=138,171;MMQ=50,53;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.697:8:0,3:2,3:2,0,5,1
chr16	1878295	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=113,138;MMQ=60,43;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.171:25:11,0:6,3:9,12,4,0
chr16	1878300	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=125,138;MMQ=60,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:13,0:5,2:10,12,4,0
chr16	1878330	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=141,106;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.368:31:7,6:9,5:8,12,3,8
chr16	1878924	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=162,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.654:9:2,0:0,6:0,3,0,6
chr16	1878977	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=198,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:0,3,0,6
chr16	1887887	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=203,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.351:17:5,4:6,2:5,6,1,5
chr16	1889189	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=151,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr16	1891723	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	1894852	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=168,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,3:6,2:2,6,4,1
chr16	1904239	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:2,6,0,2
chr16	1907652	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=180,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr16	1907701	.	AG	CA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr16	1907946	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,1:5,4:2,5,1,4
chr16	1910373	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=108,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,5:1,3:2,1,6,2
chr16	1912021	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:2,1:8,3:6,4,2,2
chr16	1912139	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=203,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,2:1,4:0,1,1,6
chr16	1915886	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=176,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,2:6,4:1,6,1,5
chr16	1961551	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=255,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr16	1990994	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=123,187;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.578:24:5,3:5,11:4,6,11,3
chr16	1991014	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=142,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:4,2:14,2:9,9,3,1
chr16	1994743	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0|1:1994743_G_A:1994743:0,0,13,1
chr16	1994749	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=55.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0|1:1994743_G_A:1994743:0,0,12,1
chr16	1994931	.	C	CAAGAG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr16	1994980	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr16	1994992	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr16	2004718	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr16	2011126	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,11,7
chr16	2012320	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:7,1:4,1:1,10,0,2
chr16	2012453	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,5:7,3:9,5,3,5
chr16	2013314	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.966:26:0,16:0,10:0|1:2013314_T_C:2013314:0,0,6,20
chr16	2013316	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=123,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,2:11,0:0|1:2013314_T_C:2013314:5,20,0,2
chr16	2014424	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.520:29:8,5:5,10:7,7,3,12
chr16	2022074	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,241;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,4:3,1:3,0,5,0
chr16	2024131	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=17,24;MFRL=218,0;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:2024131_T_C:2024131:1,1,0,1
chr16	2024134	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=218,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:2024131_T_C:2024131:1,1,0,1
chr16	2025958	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,249;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:7,1:17,2:12,12,1,2
chr16	2026177	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=219,280;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:9,1:0,1:3,6,1,1
chr16	2026986	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=151,249;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:5,3,1,1
chr16	2027291	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=202,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,1:3,7:7,3,3,5
chr16	2027313	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=193,251;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:3,1:13,2:10,6,1,2
chr16	2027443	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,13;MFRL=188,259;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:2,0:5,1:5,3,0,3
chr16	2027955	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=163,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.152:18:9,2:5,0:5,11,2,0
chr16	2050346	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=15,27;MFRL=166,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.425:13:0,2:2,3:8,0,4,1
chr16	2050941	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=364,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr16	2051111	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=136,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,2:8,1:11,9,0,3
chr16	2053742	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=141,401;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:3,6,1,1
chr16	2059621	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	2059674	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	2059698	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2059698_T_G:2059698:0,0,0,1
chr16	2059701	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2059698_T_G:2059698:0,0,0,1
chr16	2070200	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:2,2,2,0
chr16	2070317	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=178,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2070317_C_A:2070317:1,0,0,1
chr16	2070325	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=187,208;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:2070317_C_A:2070317:2,0,0,1
chr16	2087658	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=220,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:2,4,4,4
chr16	2087785	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=187,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:1,5:7,4:5,3,5,4
chr16	2088085	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=237,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr16	2110571	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:4,4:1,0:5,1,4,0
chr16	2110608	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=153,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:2,2:0,3:2,1,5,0
chr16	2111779	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=129,270;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr16	2115506	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=83,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,5:3,3:4,3,3,5
chr16	2120402	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=138,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:2,1,4,0
chr16	2122395	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=12,8;MFRL=130,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.805:7:0,0:0,0:0,1,0,6
chr16	2125788	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,3:1,2:2,0,6,0
chr16	2125937	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,255;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,2,2
chr16	2140010	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=125,116;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:1,4,2,6
chr16	2140032	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=129,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:2140032_C_T:2140032:2,8,1,1
chr16	2140035	.	CC	AG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=129,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:0|1:2140032_C_T:2140032:2,8,1,1
chr16	2140039	.	G	GCAGCT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=129,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,2:6,0:0|1:2140032_C_T:2140032:1,7,1,1
chr16	2144299	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=224,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr16	2150323	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=158,127;MMQ=39,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,1:2,1:5,1,2,0
chr16	2152651	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=148,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,4:1,1:3,1,1,4
chr16	2154461	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=174,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr16	2156617	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,6431621;MMQ=60,30;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr16	2159098	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=184,266;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:4,8,0,2
chr16	2161928	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=163,192;MMQ=40,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0,4,0,4
chr16	2162979	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=255,189;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr16	2165958	.	GCCCACCA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,52;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCCACCA;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,0,2
chr16	2166755	.	GCC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,47;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2166755_GCC_G:2166755:0,0,0,1
chr16	2166758	.	C	CTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,228;MMQ=60,47;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2166755_GCC_G:2166755:0,0,0,1
chr16	2203456	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,1,13
chr16	2222598	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:4,1,2,1
chr16	2225823	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=237,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,1:4,3:5,5,3,1
chr16	2225971	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=197,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,1:8,1:5,5,0,2
chr16	2229670	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=275,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:2229670_C_A:2229670:3,0,1,1
chr16	2229672	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=275,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:2229670_C_A:2229670:3,0,1,1
chr16	2229677	.	A	AGAAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=275,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:2229670_C_A:2229670:3,0,1,1
chr16	2229678	.	C	CGCTTGAACCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=275,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:2229670_C_A:2229670:3,0,1,1
chr16	2230890	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:2230890_G_A:2230890:3,0,1,0
chr16	2230892	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:3,1:0,0:0|1:2230890_G_A:2230890:3,0,1,0
chr16	2231160	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,18;MFRL=331,198;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr16	2233565	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	2236928	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=208,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:6,2:2,0:3,5,2,1
chr16	2239646	.	CCC	TTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=186,0;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:2239646_CCC_TTT:2239646:0,1,1,0
chr16	2239655	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2239646_CCC_TTT:2239646:0,0,1,0
chr16	2239661	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2239646_CCC_TTT:2239646:0,0,1,0
chr16	2256047	.	AC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=17,28;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.641:12:1,4:0,4:3,1,4,4
chr16	2256326	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=174,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:2,0,4,1
chr16	2256461	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:4,10:10,3:7,7,7,6
chr16	2257309	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=164,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:12,0:11,3:8,16,0,3
chr16	2257346	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:3,3:13,0:1,15,1,2
chr16	2259766	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=98,254;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:2,2:0,3:1,2,1,4
chr16	2259865	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=213,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:2,1,2,2
chr16	2260567	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:2,2:3,6:3,2,1,7
chr16	2260612	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=202,190;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:0,5:1,8:1,0,3,10
chr16	2263836	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.438:25:6,5:8,5:4,10,6,5
chr16	2278462	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=126,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.348:31:8,0:12,8:8,12,0,11
chr16	2278509	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,1:6,4:2,6,1,5
chr16	2293296	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=216,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.280:16:4,2:7,2:7,5,3,1
chr16	2296851	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:4,2,2,0
chr16	2305539	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=233,190;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,1:0,4:3,0,5,0
chr16	2313343	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,1:3,1:1,10,0,2
chr16	2314401	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=229,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,2:9,2:6,7,0,4
chr16	2328298	.	GTGA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=185,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:2,0,1,0
chr16	2375961	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr16	2485896	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=188,241;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,2:3,8:3,4,4,6
chr16	2487420	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=199,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr16	2488211	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr16	2489520	.	G	GGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=128,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:2489520_G_GGC:2489520:1,3,0,1
chr16	2489521	.	T	TATCTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=128,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:2489520_G_GGC:2489520:1,3,0,1
chr16	2489533	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=141,256;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr16	2498828	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=200,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:2,1:1,2:1,2,3,1
chr16	2498849	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=197,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:4,2:1,2:1,4,4,1
chr16	2499011	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=126,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr16	2499786	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr16	2510603	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=183,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:1,2:5,2:5,1,4,0
chr16	2546068	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr16	2608001	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=125,174;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,1:11,2:3,14,0,3
chr16	2645965	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	2747857	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=138,76;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:4,1,3,1
chr16	2808363	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=9468114,237;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr16	2809104	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.343:30:11,5:9,5:9,11,5,5
chr16	2815811	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:11,2:7,3:7,11,1,4
chr16	2816464	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=203,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,2:4,0:8,5,2,0
chr16	2819118	.	TTCC	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=199,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TCC;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.291:8:3,1:3,1:4,2,1,1
chr16	2819142	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=195,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:4,2:4,3,3,0
chr16	2821988	.	TC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=39.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:0,5:7,7:6,1,8,5
chr16	2825594	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=137,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,1,5
chr16	2827110	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=151,117;MMQ=60,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.365:28:12,0:6,10:4,14,0,10
chr16	2834826	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr16	2835189	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	2836027	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=211,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,6:2,3:0,2,6,3
chr16	2849407	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=231,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:2,0:8,3:6,5,2,1
chr16	2854907	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,3:5,4:3,7,5,2
chr16	2868641	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=136,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:3,3,2,1
chr16	2871121	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,4:3,1:1,7,4,1
chr16	2871701	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=204,260;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,0,1
chr16	2880614	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=197,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,4,1
chr16	2880870	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=122,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:3,2:2,4:1,4,0,6
chr16	2882197	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=188,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr16	2903081	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	2905478	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=203,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,2:1,0:2,0,2,0
chr16	2949248	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=194,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr16	2979640	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=188,273;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr16	2979720	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=192,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:12,1,1,1
chr16	2983083	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=253,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr16	2988113	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=189,261;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,2,0
chr16	2988325	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=171,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:1,5,2,0
chr16	3016885	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,6,2
chr16	3017818	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=174,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:6,1:4,2:3,7,2,1
chr16	3021116	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=210,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,5,1
chr16	3021712	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=212,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,1:8,2:5,6,1,2
chr16	3024188	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr16	3063264	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	3071214	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=140,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,0:3,1:0|1:3071214_A_C:3071214:5,0,2,0
chr16	3071218	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=140,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:1,0:3,0:0|1:3071214_A_C:3071214:5,0,2,0
chr16	3074414	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=184,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:9,2:7,4:4,12,3,3
chr16	3074426	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.263:21:8,3:7,2:6,10,1,4
chr16	3078616	.	CATT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=152,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr16	3085158	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=155,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:3085158_A_AG:3085158:0,1,1,0
chr16	3085164	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=155,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3085158_A_AG:3085158:0,1,1,0
chr16	3097596	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=173,255;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr16	3106994	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	3108229	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=200,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:2,8,1,1
chr16	3117272	.	CTGTGTG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=TG;STR;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.812:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr16	3117937	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=251,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:1,8:0,8:0,1,9,7
chr16	3119297	.	C	CG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=190,98;MMQ=60,21;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.212:22:7,3:10,1:0|1:3119297_C_CG:3119297:14,4,1,3
chr16	3119304	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=176,98;MMQ=60,21;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.204:23:8,3:11,1:0|1:3119297_C_CG:3119297:14,5,1,3
chr16	3141713	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=215,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,7:0,3:1,0,3,7
chr16	3141861	.	C	CATTAGGAGAAGTATCTAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=215,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.265:9:5,2:2,0:4,3,1,1
chr16	3142463	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=184,267;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr16	3166618	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=69,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr16	3169262	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:11,0:4,2:7,8,1,1
chr16	3169422	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=198,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:1,7,2,0
chr16	3191331	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=167,254;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:0,8,1,1
chr16	3191356	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=250,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:0,2,1,6
chr16	3254470	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=197,39;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:11,2:5,6:8,8,4,4
chr16	3296429	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=244,304;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr16	3296478	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=220,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,0:6,4:8,0,4,0
chr16	3297175	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=99,165;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0|1:3297175_T_C:3297175:1,1,2,1
chr16	3297181	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=99,165;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0|1:3297175_T_C:3297175:1,1,2,1
chr16	3299371	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	3304463	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=212,81;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr16	3304762	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=113,132;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:4,5,0,2
chr16	3363256	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=188,173;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,0:4,7:0|1:3363256_T_C:3363256:0,10,0,8
chr16	3363263	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=190,173;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,0:4,8:0|1:3363256_T_C:3363256:0,10,0,8
chr16	3367061	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=226,215;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:3,1,1,2
chr16	3405875	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	3406756	.	GT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:12,3:6,2:9,9,2,3
chr16	3407048	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=184,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,1:4,1:5,7,2,0
chr16	3434966	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=224,265;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr16	3440390	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:6,3:9,4:0|1:3440390_C_T:3440390:9,6,3,4
chr16	3440394	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=85.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0|1:3440390_C_T:3440390:0,0,12,10
chr16	3452442	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,23;MFRL=121,177;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,1:2,0:0|1:3452442_C_T:3452442:10,2,0,2
chr16	3452448	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=121,177;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,1:2,0:0|1:3452442_C_T:3452442:10,2,0,2
chr16	3452453	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=72,177;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,1:0,0:0|1:3452442_C_T:3452442:9,1,0,2
chr16	3455079	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	3458219	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr16	3458295	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=198,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:10,7:3,0:0|1:3458295_A_G:3458295:10,5,7,0
chr16	3458298	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=198,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:10,6:5,0:0|1:3458295_A_G:3458295:10,5,7,0
chr16	3487556	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=179,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr16	3534892	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=181,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:0,2,1,6
chr16	3544040	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=122,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,1:0,1,0,5
chr16	3558262	.	CTT	C,CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34,31;MFRL=195,217,135;MMQ=60,60,60;MPOS=19,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.82,4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.275,0.356:8:3,1,0:0,1,3:3,0,4,1
chr16	3599655	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=137,240;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:7,3:2,3:7,2,4,2
chr16	3602227	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=62.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,12:0,6:0,0,7,11
chr16	3611610	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	3634746	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=108,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,4:5,3:4,5,7,0
chr16	3642646	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=196,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:5,1,3,0
chr16	3706043	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=195,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,1:5,1:11,4,1,1
chr16	3707409	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=212,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr16	3708282	.	AT	A,ATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,23,20;MFRL=87,99,167;MMQ=60,60,60;MPOS=24,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.12,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.333,0.247:9:0,1,1:4,1,0:1,3,0,5
chr16	3721821	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=157,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:5,5,0,2
chr16	3726160	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.635:17:2,4:4,7:1,5,5,6
chr16	3777693	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=182,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,2:3,0:8,0,0,2
chr16	3781407	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,17;MFRL=101,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:1,0:2,1:0|1:3781407_T_G:3781407:1,3,0,2
chr16	3781413	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=21,13;MFRL=101,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.441:7:1,0:3,0:0|1:3781407_T_G:3781407:1,3,0,3
chr16	3808052	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=10,20;MFRL=99,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.527:4:0,0:0,1:0,2,0,2
chr16	3832959	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,1:7,1:4,11,1,1
chr16	4015729	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=229,277;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,1:1,4:2,0,5,0
chr16	4016049	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=154,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,3:7,2:7,6,2,3
chr16	4016676	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.830:15:0,7:2,6:1,1,5,8
chr16	4024812	.	CGTGGTTG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,35;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:4024812_CGTGGTTG_C:4024812:0,1,0,1
chr16	4024821	.	A	ATCTTCTC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4024812_CGTGGTTG_C:4024812:0,0,0,1
chr16	4024826	.	CACATAAAG	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4024812_CGTGGTTG_C:4024812:0,0,0,1
chr16	4024838	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4024812_CGTGGTTG_C:4024812:0,0,0,1
chr16	4027423	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=242,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:4,0,6,0
chr16	4027688	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=204,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,4:5,2:1,5,1,5
chr16	4038952	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=170,265;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr16	4039141	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	4042049	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr16	4042211	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=184,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,2:6,2:6,6,2,2
chr16	4042449	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr16	4057603	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=112,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,0,2
chr16	4057637	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=193,251;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr16	4163787	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:13,2:22,1:14,21,0,3
chr16	4164364	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=204,187;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.679:20:2,4:4,9:4,2,7,7
chr16	4165257	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=198,204;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,2:7,2:8,4,3,1
chr16	4242093	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,23;MFRL=112,75;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:0,4:1,1:0,1,4,1
chr16	4253325	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=199,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,2:0,3,0,4
chr16	4254479	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	4254523	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=321,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,5:0,5:1,0,6,4
chr16	4254725	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	4308345	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=235,232;MMQ=60,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,0:3,4:0|1:4308345_A_C:4308345:0,7,0,4
chr16	4308351	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=235,232;MMQ=60,33;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,0:2,0:0|1:4308345_A_C:4308345:0,6,0,4
chr16	4390873	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=127,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,3:1,1:1,0,3,1
chr16	4391040	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:1,5,0,4
chr16	4393376	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=232,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,5:3,2:0,5,0,7
chr16	4407979	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.249:13:3,2:6,0:4,6,2,1
chr16	4412740	.	C	CAGCCCAGGCCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=170,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:0,6,1,1
chr16	4415410	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=151,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:6,1,2,0
chr16	4415455	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=168,255;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,2:8,0:8,7,1,2
chr16	4431202	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=151,186;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,5:3,4:4,5,7,2
chr16	4431239	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=186,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:4,1:7,5,2,0
chr16	4445327	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=115,137;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.628:24:3,8:4,7:4,5,6,9
chr16	4475868	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=218,253;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,6:1,0:2,0,6,0
chr16	4484328	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=188,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:4,0,4,0
chr16	4484396	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=127,186;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,0:5,7:7,2,4,3
chr16	4484613	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=223,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,0,2
chr16	4494549	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,203;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr16	4500544	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=154,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.376:11:3,1:3,2:3,4,0,4
chr16	4516092	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=189,249;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr16	4519548	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=165,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr16	4524060	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,1:5,2:11,1,2,1
chr16	4562806	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=194,121;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:5,2,2,0
chr16	4606798	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:3,5,2,0
chr16	4606844	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=147,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:5,4,0,2
chr16	4621725	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	4641814	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=100,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.403:8:3,2:2,1:3,2,0,3
chr16	4644785	.	C	CTAACTGACAATACGAGAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=182,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,2:4,0:0|1:4644785_C_CTAACTGACAATACGAGAT:4644785:3,6,0,2
chr16	4644787	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=182,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,2:4,0:0|1:4644785_C_CTAACTGACAATACGAGAT:4644785:3,6,0,2
chr16	4664833	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr16	4675116	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:0,3:2,3:0,2,0,7
chr16	4702641	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=168,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,1:3,1:9,1,2,0
chr16	4714639	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=185,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.546:22:5,6:4,5:7,3,3,9
chr16	4723451	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=205,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr16	4751045	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=201,167;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:4,3,1,4
chr16	4786456	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:6,0,7,1
chr16	4787987	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:4,1:6,3:2,8,0,4
chr16	4796595	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=252,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr16	4796871	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr16	4797457	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=197,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:8,6:1,5:4,5,2,9
chr16	4802754	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,147;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,4:5,0:5,3,4,0
chr16	4812209	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:7,1:1,3:6,2,5,0
chr16	4815501	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:5,2,4,0
chr16	4829684	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=186,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,1:11,1:7,13,1,1
chr16	4833615	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,1,1
chr16	4836155	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=196,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,6:2,0:1,2,0,6
chr16	4847640	.	GT	AC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=161,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,1:7,2:7,3,1,2
chr16	4851358	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.273:8:2,0:4,0:0,6,2,0
chr16	4867565	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=83,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:3,1,6,1
chr16	4873743	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=195,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.366:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr16	4895119	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,1:11,1:8,15,1,1
chr16	4897103	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=224,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr16	4897153	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=172,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:5,0,5,0
chr16	4903243	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=173,273;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr16	4908504	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=207,250;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:5,1,2,0
chr16	4911195	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=190,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr16	4918732	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=186,225;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:8,1,4,0
chr16	4920412	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=203,235;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:4,5,5,0
chr16	4923091	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=122,226;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,6:4,4:4,5,3,7
chr16	4923193	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=231,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,0:4,5:0,6,0,5
chr16	4930100	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=141,225;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,2:8,2:8,7,2,2
chr16	4933301	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr16	4935146	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,217;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:5,3:7,1:6,7,1,3
chr16	4938280	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	4940168	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=181,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,1:4,6:2,2,3,4
chr16	4940387	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	4940989	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0|1:4940989_A_C:4940989:0,0,0,10
chr16	4940994	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=202,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:2,1:1,5:0|1:4940989_A_C:4940989:0,3,0,6
chr16	4945221	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=249,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:0,4:2,0,6,2
chr16	4945225	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=168,249;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:8,2,2,0
chr16	4948936	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:0,5:4,3:4,0,8,0
chr16	4949137	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:2,4,2,1
chr16	4950940	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:8,1:4,2:5,8,2,1
chr16	4952598	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr16	4954060	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.696:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	4960984	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,13;MFRL=268,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.419:5:2,0:0,0:0|1:4960984_T_G:4960984:1,2,0,2
chr16	4960991	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=17,12;MFRL=268,229;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:0,0:0,0:0|1:4960984_T_G:4960984:0,3,0,1
chr16	4960995	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=226,229;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:4960984_T_G:4960984:0,2,0,1
chr16	4961003	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4960984_T_G:4960984:0,0,0,1
chr16	5009232	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=99,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr16	5009433	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=122,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.547:20:5,5:4,6:3,6,1,10
chr16	5037513	.	CTC	AAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr16	5040971	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr16	5041778	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr16	5046787	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr16	5058363	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,18;MFRL=247,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.438:7:1,1:2,0:3,1,3,0
chr16	5061085	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=155,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,0:2,6:3,1,4,2
chr16	5077352	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=182,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:5,5:8,4:6,7,6,3
chr16	5077395	.	TGGGAGGA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=15,30;MFRL=222,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGAGGA;STR;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.566:14:0,4:2,2:3,3,1,7
chr16	5078841	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,9,0
chr16	5105440	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=240,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:0,3,0,8
chr16	5112642	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr16	5122072	.	G	GGTCT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTCT;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:9,2:3,0:3,9,1,1
chr16	5123270	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,9:0,3:0,1,1,11
chr16	5125365	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,12,4
chr16	5127853	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr16	5128902	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,51;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	5143647	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=137,201;MMQ=28,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:1,6:1,2:0,2,1,7
chr16	5145595	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,243;MMQ=50,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,2:4,0:4,7,1,1
chr16	7102036	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.289:22:9,3:7,3:12,4,5,1
chr16	7657373	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=204,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:3,2:6,9:5,4,2,9
chr16	7657432	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=213,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr16	7680744	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=293,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chr16	7703785	.	G	GCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CT;STR;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,2:0,3:2,1,5,0
chr16	7704017	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=272,499;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr16	7704032	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,499;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	7726691	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr16	7726829	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:10,0:7,4:9,8,0,4
chr16	7743437	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,17;MFRL=179,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.246:6:1,0:2,0:0|1:7743437_C_G:7743437:1,4,1,0
chr16	7743440	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=173,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:2,0:0,4,2,0
chr16	7743445	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,13;MFRL=170,240;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:7743437_C_G:7743437:0,4,1,0
chr16	7759136	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=123,191;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:14,1:8,2:5,17,1,2
chr16	7759164	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,3,16
chr16	7759206	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=193,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,1,2
chr16	7760846	.	T	C,A,TAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35,27,20;MFRL=202,181,255,253;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,24,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=3.17,3.22,5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,1,2,2:0.200,0.295,0.303:6:1,0,1,1:0,1,1,0:0,1,0,5
chr16	8619750	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:3,2:4,2,1,2
chr16	8620014	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,3:7,2:5,6,2,3
chr16	8620096	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	8719720	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,0:0,5:0,2,0,5
chr16	8719726	.	G	GTTTGTAACACAGAGGGCATGTGCA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.336:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr16	8719738	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	8722542	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=246,111;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:6,1,2,0
chr16	8728772	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr16	8732882	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr16	8733071	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr16	8735120	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:1,5,0,4
chr16	8736028	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,18:0,12:0,0,21,10
chr16	8736150	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,6:0,5:0,0,4,8
chr16	8736246	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr16	8736360	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=185,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:7,6,1,1
chr16	8736499	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr16	8738350	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=185,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:2,1,5,0
chr16	8738398	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr16	8738427	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,10,6
chr16	8738499	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,9:0,0,10,12
chr16	8738622	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr16	8738641	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr16	8829715	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=151,242;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:3,2:1,5,0,2
chr16	8841834	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=176,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:3,1:0,1:3,0,3,0
chr16	8858580	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr16	8862212	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:8862212_C_T:8862212:0,0,0,4
chr16	8862232	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:8862212_C_T:8862212:0,0,0,1
chr16	8862592	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	8873493	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=201,251;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr16	8904877	.	T	TATG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATG;STR;TLOD=45.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,7:0,0,10,1
chr16	8905054	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=128,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:2,4,0,6
chr16	8941778	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=252,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr16	8948974	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr16	8949187	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:3,2:1,8,0,2
chr16	8952113	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=179,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr16	8952117	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=202,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr16	8952165	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=202,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr16	8988386	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.703:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr16	8988777	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=233,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,5:2,4:2,4,4,5
chr16	8989403	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr16	8992342	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:7,3:6,6:4,9,5,4
chr16	8992868	.	AC	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=15,31;MFRL=249,283;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.848:8:0,2:0,5:0,1,7,0
chr16	8994563	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:0,9,0,2
chr16	8995177	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr16	8995927	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=107,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:6,0,5,1
chr16	8996377	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:1,5,0,3
chr16	8998340	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=175,126;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,4:6,0:9,6,4,0
chr16	9004564	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,15,4
chr16	9010446	.	A	AC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=15,27;MFRL=125,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.947:18:0,7:0,10:0,1,5,12
chr16	9010979	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=136,96;MMQ=60,34;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:7,3,0,2
chr16	9014350	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr16	9014385	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr16	9014928	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	9015252	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	9017061	.	T	TACAACGATGTGGGGGTTTGTAGTTGCATCATTTAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=133,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=77.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.952:22:0,7:0,1:3,1,11,7
chr16	9186735	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=132,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.210:25:12,3:6,1:18,2,4,1
chr16	9186749	.	GT	G,GTT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,33,34;MFRL=124,161,162;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=8.39,11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,7,7:0.294,0.315:23:6,4,1:3,3,4:8,1,6,8
chr16	9858731	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=135,93;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:8,0:5,4:7,6,0,4
chr16	9934670	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=129,229;MMQ=47,57;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=A;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.530:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr16	9935037	.	C	CTTGGAGTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0|1:9935037_C_CTTGGAGTT:9935037:0,0,0,1
chr16	9935039	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0|1:9935037_C_CTTGGAGTT:9935037:0,0,0,1
chr16	9935043	.	T	TATGACAAATTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9935037_C_CTTGGAGTT:9935037:0,0,0,1
chr16	10524656	.	GGAC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=128,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAC;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:7,2:5,1:6,6,2,1
chr16	10567751	.	CTT	C,CT,CTTTTTTTT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,30,32,32;MFRL=63,0,83,113;MMQ=60,60,60,60;MPOS=5,5,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,21;RU=T;STR;TLOD=3.83,5.11,3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,3,3,8:0.169,0.222,0.356:18:0,1,1,3:2,2,2,2:2,2,11,3
chr16	10567768	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=185,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.292:23:5,1:10,0:12,5,4,2
chr16	10631912	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.656:27:3,8:6,10:4,5,11,7
chr16	10631945	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=148,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:3,1:9,3:4,9,0,4
chr16	10631985	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=196,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,3:0,9:0,1,0,12
chr16	10770075	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=141,271;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr16	10770091	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=149,240;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr16	10775822	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=214,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:1,8:1,4:1,1,6,6
chr16	10775855	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=157,210;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:5,10,1,1
chr16	10776063	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=241,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,2:0,1:0,1,0,4
chr16	10783088	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=149,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:2,1:4,2:6,1,3,0
chr16	10788106	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=235,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:1,0,8,0
chr16	10788129	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=235,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,5:0,3:1,0,8,0
chr16	10849451	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	10855341	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,8:0,0,6,7
chr16	10855521	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.409:12:1,3:6,2:7,0,5,0
chr16	10855776	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=151,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr16	10912132	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	10989374	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,3,3
chr16	10992646	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:6,0:10,6:6,10,0,6
chr16	10992715	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:3,5,6,2
chr16	10995832	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=289,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr16	10995850	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=237,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:1,1:2,3:2,1,5,0
chr16	10996449	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=258,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:2,1,2,2
chr16	10996682	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=118,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,2:6,1:2,10,0,3
chr16	11003064	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=151,86;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:11,4:7,0:7,12,2,2
chr16	11003101	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.618:19:4,9:3,3:1,6,2,10
chr16	11004150	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=202,296;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:1,2,2,3
chr16	11010121	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=213,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:3,0,1,0
chr16	11010150	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=184,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,1:4,2:4,0,3,0
chr16	11038720	.	GT	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=186,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:2,5,1,1
chr16	11056498	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=185,644;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:2,8,0,2
chr16	11064885	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=17,18;MFRL=208,283;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:1,0:3,0,2,0
chr16	11064896	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=208,347;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.352:6:2,0:2,0:4,0,2,0
chr16	11066338	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=137,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:15,2:17,0:0|1:11066338_G_A:11066338:15,20,0,2
chr16	11066346	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=161,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:22,2:17,0:0|1:11066338_G_A:11066338:19,20,0,2
chr16	11066724	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=206,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:8,2:2,1:10,0,3,0
chr16	11114006	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=145,278;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:7,2,1,1
chr16	11114051	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,3:10,0:9,10,3,0
chr16	11136048	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=175,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:2,2:9,1,2,0
chr16	11214668	.	AAC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=229,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=AC;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr16	11250413	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.789:17:1,8:2,6:3,0,10,4
chr16	11260440	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=144,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr16	11349403	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	11362005	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=158,225;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr16	11369855	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=13,25;MFRL=149,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.703:4:0,2:0,1:0,1,2,1
chr16	11444403	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=160,176;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr16	11444430	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,36;MFRL=160,172;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,4:4,1:8,0,5,0
chr16	11444454	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=185,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.570:18:1,5:1,5:6,2,8,2
chr16	11444469	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=112,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.322:23:9,4:7,3:11,5,5,2
chr16	11444716	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr16	11643631	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr16	11650325	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=150,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:7,1,2,1
chr16	11772512	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,13;MFRL=239,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.293:19:4,0:5,1:5,8,0,6
chr16	11772600	.	T	TTCTGA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=166,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:4,4:5,7:6,3,8,3
chr16	11773743	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:0,3,0,7
chr16	11794320	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:5,3:12,0:9,8,3,0
chr16	11828018	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr16	11846508	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=111,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,0:5,4:5,5,3,1
chr16	11849993	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=217,141;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:11849993_TG_T:11849993:4,0,1,0
chr16	11849997	.	G	GCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=217,141;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:11849993_TG_T:11849993:4,0,1,0
chr16	11850001	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=217,141;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:11849993_TG_T:11849993:4,0,1,0
chr16	11850003	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=239,141;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr16	11855306	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=129,26;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:13,0:9,2:15,7,1,1
chr16	11861199	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=237,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr16	11870137	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.547:13:1,4:5,2:4,2,5,2
chr16	11870494	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=250,267;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:2,2,2,1
chr16	11870524	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=212,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:6,1,3,0
chr16	11940764	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=198,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr16	11941695	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=158,116;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:2,3:3,0:3,2,1,2
chr16	11945231	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=116,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,2:5,6:4,5,3,5
chr16	11969878	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=206,284;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:3,2,1,1
chr16	11981390	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,6:4,0:7,0,6,0
chr16	11991944	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,1:0,4:0,4,1,4
chr16	12009530	.	CCCGCCGCCG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=12,34;MFRL=135,281;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=CCG;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr16	12060099	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,2:7,0:7,10,0,2
chr16	12136672	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=165,157;MMQ=52,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:1,5:4,3:6,0,8,0
chr16	12136750	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=181,139;MMQ=52,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:3,4:7,5:6,4,3,6
chr16	12136954	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,3,12
chr16	12142130	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=142,185;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,4,1
chr16	12142172	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=142,231;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0|1:12142172_T_G:12142172:0,1,6,1
chr16	12142175	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=142,208;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:0|1:12142172_T_G:12142172:0,1,7,1
chr16	12142341	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=207,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:3,5,2,0
chr16	12145813	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=106,51;MMQ=40,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:6,0:13,3:10,11,0,3
chr16	12145817	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=83,84;MMQ=40,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:6,1:13,2:6,13,2,1
chr16	12162969	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:3,2,4,2
chr16	12223637	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=131,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,0:7,2:8,5,1,1
chr16	12371915	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=202,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,3:4,5:2,6,2,6
chr16	12450163	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:4,6,1,4
chr16	12618465	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr16	12662586	.	AC	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=243,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr16	12759027	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr16	12897578	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=190,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:6,4:9,2:8,7,4,2
chr16	13328814	.	ACT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=1069997,285;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=CT;STR;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.579:5:1,1:0,2:1,1,3,0
chr16	14016109	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,2:5,1:2,8,0,3
chr16	14026007	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,11,5
chr16	14027965	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	14028096	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:7,6,0,2
chr16	14031520	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr16	14042058	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:12,0:7,3:10,10,0,3
chr16	14530726	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=162,203;MMQ=60,58;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr16	14649626	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr16	14675943	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=203,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:2,0,2,1
chr16	14678633	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:7,3:9,4:8,8,2,5
chr16	14687144	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=170,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.305:8:1,2:3,0:4,2,2,0
chr16	14700254	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=188,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,4:0,5:1,0,10,0
chr16	14749080	.	ATTT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=T;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.596:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr16	14932177	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=228,255;MMQ=25,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,3,1
chr16	14951447	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,202;MMQ=40,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,3:8,0:11,1,3,0
chr16	14978207	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=158,195;MMQ=25,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:4,1,0,2
chr16	14980545	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=204,1770081;MMQ=55,26;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:9,3,2,0
chr16	14989420	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=140,169;MMQ=25,25;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,15:0.262:59:16,9:28,6:23,21,9,6
chr16	14989423	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=135,160;MMQ=37,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,6:0.116:57:23,0:27,6:0|1:14989423_T_C:14989423:33,18,0,6
chr16	14989427	.	C	CCTCTTTTACTTTTTAAAGACTTCTTTA	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=135,160;MMQ=37,22;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,6:0.121:55:23,0:26,6:0|1:14989423_T_C:14989423:31,18,0,6
chr16	15091589	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33,26,26;MFRL=124,178,167,94;MMQ=57,39,51,51;MPOS=13,7,10;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,9,10,12;RU=T;STR;TLOD=7.86,8.74,9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:12,4,6,6:0.156,0.212,0.221:28:1,2,2,3:10,2,3,1:9,3,10,6
chr16	15092116	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=176,187;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:8,1,2,0
chr16	15100202	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=204,209;MMQ=40,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,2:7,1:8,1,3,0
chr16	15116521	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=164,160;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.242:35:12,2:15,6:17,10,6,2
chr16	15120411	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=170,207;MMQ=52,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,3:5,2:11,0,5,0
chr16	15120451	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=183,219;MMQ=37,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:6,4:7,2:11,3,5,1
chr16	15138299	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,85;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr16	15155687	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:10,3:18,0:11,17,2,1
chr16	15156971	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=173,160;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:4,0,5,0
chr16	15159022	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=194,227;MMQ=46,51;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.350:9:1,0:3,1:4,2,0,3
chr16	15162143	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=124,192;MMQ=43,50;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.294:9:6,2:1,0:2,5,1,1
chr16	15163874	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=147,98;MMQ=24,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:15163874_A_T:15163874:0,1,0,1
chr16	15163878	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=165,98;MMQ=24,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:15163874_A_T:15163874:0,2,0,1
chr16	15163880	.	G	GCCTGTTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=165,98;MMQ=24,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:15163874_A_T:15163874:0,2,0,1
chr16	15168760	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,2:5,1:0,7,0,3
chr16	15177555	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=222,6960651;MMQ=27,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr16	15187912	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=183,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:4,10:5,2:9,0,12,0
chr16	15596142	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,10,5
chr16	15702060	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=199,246;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr16	15705605	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=89,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,8:4,6:3,4,2,12
chr16	15710843	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,1:5,2:5,1,3,0
chr16	15718591	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr16	15724113	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=239,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr16	15727459	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr16	15730245	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=179,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:0,6,0,3
chr16	15771601	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=127,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,3:4,1:6,1,1,3
chr16	15790754	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=161,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr16	15811235	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=325,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr16	15813211	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,255;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,1:1,4:0,6,1,4
chr16	15813633	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,0,3
chr16	15813945	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=146,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,5,1
chr16	15818310	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,1,5
chr16	15820863	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:1,3:7,2:4,4,1,5
chr16	15839034	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=162,113;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:4,3:5,0:4,6,2,1
chr16	15843899	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	15843965	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=187,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr16	15853596	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=209,131;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:2,2:2,3:0,4,0,6
chr16	15853626	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=186,131;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,2:0,6,0,3
chr16	15853653	.	T	TCTCGAACTCCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=224,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr16	15857749	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=173,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,0:6,6:4,9,6,0
chr16	15872609	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:1,3,4,2
chr16	15872748	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:3,3,2,4
chr16	15872807	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=203,181;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr16	15892465	.	TAA	T,TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,23,28;MFRL=152,134,165;MMQ=60,60,60;MPOS=19,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.48,3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,3:0.175,0.232:14:5,1,2:4,1,1:7,2,5,0
chr16	15967361	.	T	TCTA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CTA;STR;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:6,0:9,2:10,5,1,2
chr16	16108282	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr16	16110253	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr16	16127068	.	GTGAA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=141,260;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TGAA;STR;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:0,0:7,2:1,7,0,2
chr16	16130514	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=106,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:2,2:0|1:16130514_C_A:16130514:0,3,0,3
chr16	16130524	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=106,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0|1:16130514_C_A:16130514:0,3,0,5
chr16	16142027	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:16,0:9,2:11,14,0,2
chr16	16150208	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=207,48;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr16	16161976	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr16	16165592	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=121,35;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:9,0:1,2:0|1:16165592_T_C:16165592:5,7,1,1
chr16	16165594	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=121,35;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:8,0:2,2:0|1:16165592_T_C:16165592:5,7,1,1
chr16	16165598	.	T	TAGAAGCTTCTTC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=121,35;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:0|1:16165592_T_C:16165592:5,7,1,1
chr16	16184232	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,12,4
chr16	16200756	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr16	16205141	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:16205141_A_G:16205141:0,0,3,0
chr16	16205143	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:16205141_A_G:16205141:0,0,3,0
chr16	16205161	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0|1:16205141_A_G:16205141:0,0,6,0
chr16	16205167	.	G	GTGGGGC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=104,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TGGGGC;STR;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,2:1,0,4,0
chr16	16205284	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:3,0:10,3:7,6,2,1
chr16	16205449	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr16	16205489	.	T	TCACATCTAATCCCAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,31;MFRL=192,238;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr16	16205501	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	16208739	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=163,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,5:7,3:6,4,3,5
chr16	16215930	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,2:5,0:6,10,1,1
chr16	16219596	.	G	GAAAAAAAAA,GAAAAAAAAAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,31,35;MFRL=125,127,160;MMQ=60,47,60;MPOS=15,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,16,17;RU=A;STR;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,1,1:0.187,0.187:8:4,0,1:1,1,0:5,1,2,0
chr16	16219602	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=176,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:5,1,3,0
chr16	16228389	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr16	16230256	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=165,84;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr16	16232201	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.530:11:2,4:3,2:4,1,5,1
chr16	16235017	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,0:5,2:7,4,1,1
chr16	16251435	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr16	16255195	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	16255372	.	C	CCTCCTTGGTAGCTGGGATTACAGGCATG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=175,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:9,2:3,0:6,6,1,1
chr16	16255424	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,2:3,2:1,6,1,3
chr16	16256767	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr16	16267079	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr16	16272670	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,11,9
chr16	16276790	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=181,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:7,3:10,0:6,11,1,2
chr16	16278948	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=221,220;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:0,2:4,0:0,4,1,1
chr16	16278975	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=220,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:1,1,0,5
chr16	16280889	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:16280889_C_T:16280889:0,0,2,0
chr16	16280895	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:16280889_C_T:16280889:0,0,2,0
chr16	16280921	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr16	16282648	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=168,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr16	16284272	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr16	16286614	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr16	16291816	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=223,192;MMQ=33,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:14,0:5,3:19,0,3,0
chr16	16291858	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=176,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:1,0:3,7:5,0,7,0
chr16	16291871	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,0:2,6:4,1,4,2
chr16	16291971	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=218,184;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:4,3:4,8:2,7,3,8
chr16	16291983	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,4:4,6:2,5,4,6
chr16	16292128	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=165,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0|1:16292128_C_T:16292128:0,4,0,4
chr16	16292133	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=165,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0|1:16292128_C_T:16292128:0,4,0,4
chr16	16358944	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,176;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr16	16363884	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=209,265;MMQ=25,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:4,1,3,0
chr16	16363917	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=179,227;MMQ=25,38;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:2,3,2,0
chr16	17221423	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr16	17294295	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=74,223;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr16	17451914	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=138,73;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:13,0:17,2:0|1:17451914_G_A:17451914:21,11,1,1
chr16	17451917	.	GAAA	G	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=140,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:14,0:17,2:0|1:17451914_G_A:17451914:23,12,1,1
chr16	17451960	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=158,78;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:12,0:12,2:15,15,1,1
chr16	17451987	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,21;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.640:11:1,1:3,4:0,4,0,7
chr16	18532017	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,277;MMQ=60,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr16	18550386	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,25;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	18804737	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=176,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:3,1:4,1:0,8,1,1
chr16	18823192	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=154,242;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:3,1:17,3:6,14,1,3
chr16	18827524	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr16	18839496	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=147,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:12,2:4,2:7,9,0,4
chr16	18841705	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:5,2:12,1:8,9,2,1
chr16	18853462	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=255,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr16	18858727	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,4:5,0:6,6,3,1
chr16	18861294	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,4:0.139:34:10,0:19,3:0|1:18861294_G_T:18861294:16,14,0,4
chr16	18861298	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,4:0.138:34:9,0:21,4:0|1:18861294_G_T:18861294:15,15,0,4
chr16	18875378	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=174,217;MMQ=47,36;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:7,5:9,0:5,11,5,0
chr16	18875513	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=179,246;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr16	18880574	.	C	CACTATGACT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,21;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	18882659	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,219;MMQ=60,41;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.448:15:5,6:3,1:8,0,7,0
chr16	18893709	.	TAA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=10,31;MFRL=170,204;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:0,0:0,1:0|1:18893709_TAA_T:18893709:0,3,0,1
chr16	18893713	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=170,204;MMQ=60,52;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:18893709_TAA_T:18893709:0,3,0,1
chr16	18908104	.	A	AAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=235,248;MMQ=37,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AT;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr16	19033125	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:11,1:4,2:4,11,2,1
chr16	19041491	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr16	19041718	.	G	GCT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=201,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,2:2,0:0|1:19041718_G_GCT:19041718:0,5,1,1
chr16	19041719	.	AAT	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=201,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,2:2,0:0|1:19041718_G_GCT:19041718:0,5,1,1
chr16	19041723	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=201,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,0:0|1:19041718_G_GCT:19041718:0,5,1,1
chr16	19046950	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=186,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:4,2,2,0
chr16	19051520	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=168,70;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr16	19063220	.	ATT	A,AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28,28;MFRL=163,159,191;MMQ=60,50,60;MPOS=21,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.88,5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.248,0.333:9:1,0,0:3,2,2:0,4,0,5
chr16	19067933	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=113,195;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,2:5,1:4,4,2,1
chr16	19078969	.	C	CT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=164,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:10,1:12,3:13,11,0,4
chr16	19079095	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=177,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.636:14:2,6:2,3:1,4,0,9
chr16	19083221	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=133,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:0,2:4,7:4,0,9,0
chr16	19130798	.	GT	G,GTT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=117,141,147;MMQ=60,60,60;MPOS=12,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.89,8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,5,5:0.128,0.148:38:13,3,4:13,2,1:12,16,3,7
chr16	19131759	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=19,35;MFRL=284,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,3:0,0:0,1,2,1
chr16	19131882	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,22;MFRL=416,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19131882_C_A:19131882:1,0,0,1
chr16	19131884	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,22;MFRL=416,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19131882_C_A:19131882:1,0,0,1
chr16	19131992	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=256,298;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19131992_G_C:19131992:1,0,0,1
chr16	19131994	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=256,298;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19131992_G_C:19131992:1,0,0,1
chr16	19132005	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=256,298;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19131992_G_C:19131992:1,0,0,1
chr16	19132080	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=219,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:0,0:3,2:1,2,1,1
chr16	19132369	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=189,257;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.338:13:3,2:2,2:3,6,1,3
chr16	19183957	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=207,239;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr16	19184695	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.796:3:0,0:0,0:0|1:19184695_A_C:19184695:0,0,3,0
chr16	19184698	.	CTG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.659:4:0,1:0,2:0|1:19184695_A_C:19184695:0,1,3,0
chr16	19184704	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:19184695_A_C:19184695:0,1,2,0
chr16	19184707	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:19184695_A_C:19184695:0,1,2,0
chr16	19278426	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,16;MFRL=224,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.559:14:1,1:3,1:2,4,0,8
chr16	19320460	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=120,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,2,2
chr16	19455318	.	AATGGATGG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=ATGG;STR;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr16	19455615	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr16	19460842	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,8,11
chr16	19471665	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,4,11
chr16	19481234	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=153,262;MMQ=43,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.682:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr16	19503598	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,3,6
chr16	19505588	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:19505588_G_C:19505588:8,5,1,1
chr16	19505598	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=158,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:19505588_G_C:19505588:11,7,1,1
chr16	19505602	.	T	TAAGGATTTCTAAGTACA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=160,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:7,2:0|1:19505588_G_C:19505588:11,8,1,1
chr16	19505730	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr16	19505751	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr16	19508573	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0|1:19508573_A_G:19508573:0,0,0,8
chr16	19508583	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:19508573_A_G:19508573:0,0,0,8
chr16	19509333	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,3,13
chr16	19547536	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=164,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,0:6,5:3,8,0,5
chr16	19553183	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,6:1,4:2,0,10,0
chr16	19557891	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=226,157;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:19557891_A_C:19557891:0,2,0,1
chr16	19557897	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=187,157;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:19557891_A_C:19557891:0,3,0,1
chr16	19559170	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,0:1,2:6,0,2,0
chr16	19559292	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:11,0:11,6:11,11,6,0
chr16	19586466	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=172,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:7,0:1,2:0|1:19586466_T_TG:19586466:4,4,0,2
chr16	19586470	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=173,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:6,0:1,1:0|1:19586466_T_TG:19586466:4,3,0,2
chr16	19619602	.	CT	C,CTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,34,34;MFRL=0,130,76;MMQ=60,60,60;MPOS=28,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=8.56,3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.507,0.298:7:1,3,0:0,0,2:0,1,2,4
chr16	19640099	.	T	TTTTA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=219,174;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TTTA;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.372:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr16	19711071	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=261,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr16	19775269	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=187,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:4,5,1,4
chr16	19883082	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=241,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr16	20084743	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=153,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr16	20322425	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr16	20322439	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr16	20334807	.	ACC	A,AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,23,21;MFRL=129,145,251;MMQ=60,60,60;MPOS=27,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=C;STR;TLOD=4.10,4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.334,0.411:5:1,0,1:0,1,0:0,1,0,4
chr16	20335529	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=221,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,1:3,1:6,4,1,1
chr16	20352313	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=205,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr16	20352756	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	20357398	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr16	20357443	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=181,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,2:4,0:10,1,1,1
chr16	20370981	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=207,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,0:0,1,0,5
chr16	20373712	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=138,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:3,0:8,4:8,3,2,2
chr16	20376734	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=191,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:0,2,3,1
chr16	20376755	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=201,153;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,6:1,2:1,1,5,3
chr16	20386115	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,5,5
chr16	20432545	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=131,223;MMQ=58,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr16	20439070	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=100,168;MMQ=60,34;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,0:2,2:6,1,0,2
chr16	20439288	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,165;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	20441020	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=186,98;MMQ=40,29;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,1:8,2:6,9,1,2
chr16	20441053	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=205,161;MMQ=40,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:4,4,3,3
chr16	20441077	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=211,196;MMQ=60,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:5,2,2,0
chr16	20441084	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=214,194;MMQ=60,39;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr16	20441215	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=198,144;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr16	20442510	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=194,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:4,1,2,1
chr16	20442653	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=194,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:2,1,1,2
chr16	20448520	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=235,135;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:2,4:2,2:0|1:20448520_T_C:20448520:2,2,4,3
chr16	20448527	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=235,135;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:0|1:20448520_T_C:20448520:2,2,4,3
chr16	20451086	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=213,192;MMQ=34,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:3,1,3,4
chr16	20480818	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=217,122;MMQ=49,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:6,2,2,3
chr16	20482368	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=227,172;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,4:1,3:3,0,4,3
chr16	20486913	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=213,182;MMQ=51,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,2:4,4:3,6,5,1
chr16	20487125	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,147;MMQ=52,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.632:14:2,4:2,4:1,4,2,7
chr16	20488803	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=166,254;MMQ=40,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,3:4,2:5,4,4,1
chr16	20489868	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=207,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr16	20492304	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=229,126;MMQ=33,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:0|1:20492304_A_T:20492304:0,4,0,6
chr16	20492307	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=229,126;MMQ=33,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:0|1:20492304_A_T:20492304:0,4,0,6
chr16	20492316	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=229,130;MMQ=37,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:0|1:20492304_A_T:20492304:0,2,0,5
chr16	20494408	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,2:7,1:11,7,2,1
chr16	20498079	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,174;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr16	20554613	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=221,165;MMQ=46,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,5:5,3,1,5
chr16	20557688	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=174,189;MMQ=34,34;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,1,5
chr16	20570466	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=219,267;MMQ=50,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:3,1,3,0
chr16	20570661	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,268;MMQ=60,34;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	20576267	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,36;MFRL=251,258;MMQ=27,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.763:5:0,1:0,3:0,1,0,4
chr16	20634775	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,0:4,5:3,2,2,3
chr16	20634789	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=161,778;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:5,4,0,2
chr16	20635418	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.553:16:4,4:3,4:3,4,2,7
chr16	20749284	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=185,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,0:5,1:1,7,0,2
chr16	20750133	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,1:1,5:1,0,6,0
chr16	20753123	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr16	20792188	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=130,253;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:5,2:11,2:3,13,1,3
chr16	20802172	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=107,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,2:7,3:9,3,2,3
chr16	20807786	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:6,8,0,3
chr16	20810174	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=152,80;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,0:12,3:10,16,0,3
chr16	20811745	.	TAGAACAAAGTCAA	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=156,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,2:12,0:0|1:20811745_TAGAACAAAGTCAA_T:20811745:3,15,0,2
chr16	20811762	.	TGCCAGCA	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=156,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:9,0:0|1:20811745_TAGAACAAAGTCAA_T:20811745:2,12,0,2
chr16	20811775	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=164,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:7,0:0|1:20811745_TAGAACAAAGTCAA_T:20811745:0,12,0,2
chr16	20811777	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=164,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:20811745_TAGAACAAAGTCAA_T:20811745:0,12,0,2
chr16	20824661	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=139,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:2,6,0,2
chr16	20824701	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr16	20838553	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=149,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,7:4,4:3,5,2,9
chr16	20843605	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,119;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:13,0:6,10:0,19,0,10
chr16	20856633	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=173,274;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr16	20857580	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,0:5,2:5,5,0,2
chr16	20860897	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=170,243;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,1:7,2:0,11,0,3
chr16	20871404	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:3,6,1,1
chr16	20873752	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=217,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:3,9,0,2
chr16	20986506	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=158,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:2,4:1,1,2,2
chr16	20996777	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:10,1:1,1:2,9,0,2
chr16	20999464	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	21030897	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr16	21035826	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=199,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr16	21048057	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=158,62;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,0:4,6:3,4,0,6
chr16	21048203	.	G	GGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	21071499	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	21082163	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=191,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:1,5,1,1
chr16	21082168	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=206,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:1,1:3,2:1,3,1,2
chr16	21123188	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=224,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:1,3,2,5
chr16	21123315	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=167,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,0:4,4:5,4,3,1
chr16	21136477	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,5,2
chr16	21139137	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=125,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:4,6,1,3
chr16	21147885	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=150,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:2,3,0,2
chr16	21151913	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=192,113;MMQ=27,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,2:8,2:4,6,1,3
chr16	21151920	.	G	GGCAGCCATGCACTAGTTCCTTGATCTTCATCTTA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=185,62;MMQ=60,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0,6,1,1
chr16	21152073	.	CA	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=208,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:0,2,1,3
chr16	21216992	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=178,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:9,3:3,5:7,5,6,2
chr16	21221024	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=229,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:7,2:3,1:3,7,2,1
chr16	21222596	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=211,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:2,3,1,2
chr16	21222941	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr16	21328346	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=197,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,5:2,6:1,3,6,5
chr16	21396859	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,201;MMQ=58,33;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr16	21690559	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=124,268;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:1,6,0,2
chr16	21747556	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=160,167;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr16	21992122	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	22114756	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:2,1:5,2:7,1,3,0
chr16	22128052	.	TT	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr16	22128196	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:3,2,1,2
chr16	22161180	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=150,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:4,5,0,2
chr16	22262737	.	CTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=235,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr16	22271671	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr16	22328094	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	23079353	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr16	23205657	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr16	23221183	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=66,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:4,8:0,2:1,3,3,7
chr16	23221238	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=150,295;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr16	23223300	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=198,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,2,1
chr16	23224106	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=122,252;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.238:15:3,3:7,0:6,6,1,2
chr16	23224416	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,174;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:11,4:4,0:9,6,3,1
chr16	23224517	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=127,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:7,3:1,0:2,6,1,2
chr16	23383247	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:2,2,2,5
chr16	23400494	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	23456578	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=216,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr16	23457290	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,18;MFRL=76,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,0:1,1:1,1,1,1
chr16	23486197	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=216,223;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.494:10:3,3:2,2:3,2,4,1
chr16	23489822	.	C	CGGAGGCCAT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=189,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.224:11:3,0:6,2:4,5,1,1
chr16	23490353	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=206,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr16	23491138	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=145,58;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.192:17:5,1:9,1:4,10,2,1
chr16	23506940	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=234,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,7:0,2:1,0,8,1
chr16	23521780	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	23535680	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr16	23540798	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=293,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.761:15:2,3:1,7:2,1,5,7
chr16	23541223	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=190,240;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr16	23593589	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=152,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,4:4,0:3,4,2,2
chr16	23593730	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr16	23596842	.	A	ATTTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=189,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,7;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr16	23625463	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	23646821	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=114,188;MMQ=60,37;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:23646821_T_C:23646821:11,8,0,2
chr16	23646825	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=114,188;MMQ=60,37;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:23646821_T_C:23646821:11,8,0,2
chr16	23647713	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=204,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr16	23677111	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,0:5,3:0,10,0,3
chr16	23698813	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:3,2:2,5,2,0
chr16	23702074	.	C	CCTGGCGGTCTTTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=219,309;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr16	23712351	.	GTCC	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=156,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,2:10,0:0|1:23712351_GTCC_G:23712351:11,8,1,1
chr16	23712356	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=156,88;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:10,0:0|1:23712351_GTCC_G:23712351:11,8,1,1
chr16	23712357	.	G	GGGA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=143,88;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:0|1:23712351_GTCC_G:23712351:10,8,1,1
chr16	23713586	.	C	CTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,36;MFRL=192,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:23713586_C_CTTT:23713586:0,4,0,1
chr16	23713589	.	G	GTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=192,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:23713586_C_CTTT:23713586:0,4,0,1
chr16	23713593	.	T	TCCAGGGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=219,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:23713586_C_CTTT:23713586:0,3,0,1
chr16	23718262	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=244,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,2:6,3:4,5,2,3
chr16	23721601	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr16	23768727	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=198,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,2:4,5:4,2,3,4
chr16	23768802	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=81,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:3,7:10,4:5,8,6,5
chr16	23847747	.	TGCGCCCTCC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=160,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCGCCCTCC;STR;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.561:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr16	23999845	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=121,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:9,5:12,0:10,11,4,1
chr16	24046655	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=203,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr16	24104328	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	24105669	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr16	24105701	.	A	ATTTTCACCAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24105701_A_ATTTTCACCAGT:24105701:0,1,0,1
chr16	24105703	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24105701_A_ATTTTCACCAGT:24105701:0,1,0,1
chr16	24135112	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=186,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:6,2:1,3:5,2,4,1
chr16	24185813	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=164,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,2:5,1:15,0,3,0
chr16	24185815	.	CT	C,CTT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,33,35;MFRL=127,154,166;MMQ=60,60,60;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=10.27,4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,7,2:0.408,0.212:13:3,3,2:1,3,0:4,0,8,1
chr16	24192020	.	AAC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=214,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr16	24357998	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=90,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:2,0,4,4
chr16	24372825	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=210,210;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:14,0:3,8:4,13,0,8
chr16	24552179	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=262,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr16	24560283	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:10,3,2,0
chr16	24564879	.	GTA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.760:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr16	24567318	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr16	24574645	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=215,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.572:7:3,3:0,1:0,3,2,2
chr16	24574691	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,22,31;MFRL=184,214,193;MMQ=60,60,60;MPOS=23,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,17;RU=T;STR;TLOD=7.51,8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,5:0.235,0.383:13:3,0,0:1,2,4:4,1,3,5
chr16	24578458	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=274,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,1:2,5:2,1,5,1
chr16	24583406	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,28:0.764:36:4,17:4,11:4,4,19,9
chr16	24583712	.	TAAAGAG	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,1:6,2:1,10,0,3
chr16	24741686	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=142,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.617:8:1,5:1,0:0,3,0,5
chr16	24762092	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=119,72;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.137:41:15,0:19,5:25,11,2,3
chr16	24769570	.	TTA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=219,213;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TA;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr16	24807165	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,8:0,3:0,0,9,3
chr16	24815560	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=138,96;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,3:9,0:7,12,2,1
chr16	24816492	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=258,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,6:3,2:0,4,1,7
chr16	24886886	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=213,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,4:2,3:2,0,7,0
chr16	24919245	.	C	CAGGGA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.780:7:1,4:0,2:1,0,3,3
chr16	24946796	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=198,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:3,3:5,1:2,6,4,1
chr16	24990187	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27,27;MFRL=0,193,82;MMQ=60,60,52;MPOS=16,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,20;RU=A;STR;TLOD=10.71,4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.545,0.248:7:0,3,1:0,1,1:0,1,6,0
chr16	24990207	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,16;MFRL=164,82;MMQ=60,52;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:3,0:6,4,2,0
chr16	25026464	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=204,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:1,0:0|1:25026464_G_C:25026464:4,0,2,0
chr16	25026469	.	CGCG	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=34,36;MFRL=204,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:25026469_CGCG_C:25026469:4,0,2,0
chr16	25026476	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=24,25;MFRL=204,204;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:25026464_G_C:25026464:4,0,2,0
chr16	25026479	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=10,12;MFRL=204,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,0:0,0:0|1:25026464_G_C:25026464:4,0,2,0
chr16	25026483	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=21,23;MFRL=175,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:2,0:0|1:25026469_CGCG_C:25026469:6,0,2,0
chr16	25026486	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=21,12;MFRL=175,204;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:2,0:0|1:25026469_CGCG_C:25026469:6,0,2,0
chr16	25163017	.	G	GGTGTGT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,16;RU=GT;STR;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.934:11:0,1:0,6:0,0,0,11
chr16	25180610	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr16	25235646	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=175,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:7,0:1,2:8,0,2,0
chr16	25239872	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=137,252;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:3,2:4,0:3,5,0,2
chr16	25704145	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	27079168	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=147,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,0:8,3:6,8,0,3
chr16	27080037	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,245;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.613:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr16	27215380	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=169,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,21:0.851:24:1,13:2,8:1,2,18,3
chr16	27227168	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=142,295;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr16	27236606	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=172,88;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,0:6,3:4,7,0,3
chr16	27268779	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,1:8,1:10,7,1,1
chr16	27356359	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=111,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:1,2,1,2
chr16	27357784	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,0:12,2:15,8,2,0
chr16	27357836	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=145,67;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.322:16:8,0:3,3:0|1:27357836_A_C:27357836:3,8,2,3
chr16	27357842	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=145,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.322:16:8,0:2,1:0|1:27357836_A_C:27357836:3,8,2,3
chr16	27363900	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=174,89;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,3:10,0:8,12,2,1
chr16	27445659	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=187,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:1,0:1,0:3,1,3,0
chr16	27445666	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=194,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:5,2:2,0:6,1,2,0
chr16	27456613	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=187,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.750:18:3,9:1,5:1,3,4,10
chr16	27456628	.	G	GCAGAGGT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=149,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:2,8,1,1
chr16	27472856	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=173,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,0:6,3:4,9,1,2
chr16	27473860	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=128,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:2,4,0,2
chr16	27475619	.	T	TGGGGGGGGG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,15;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,14;RU=G;STR;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,0:6,0:10,0,0,3
chr16	27476548	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=150,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,1,1
chr16	27481559	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=189,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,0:7,3:5,12,3,0
chr16	27506825	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,2:5,2:3,7,0,4
chr16	27510117	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr16	27512626	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=134,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.106:27:8,2:16,0:0|1:27512626_G_A:27512626:10,15,0,2
chr16	27512627	.	C	CACACACACAAACACATACACACACACACA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=134,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.106:27:8,2:15,0:0|1:27512626_G_A:27512626:10,15,0,2
chr16	27560943	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,12;MFRL=316,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:27560943_G_C:27560943:3,0,1,0
chr16	27560952	.	G	GGGGCC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=316,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:27560943_G_C:27560943:3,0,1,0
chr16	27560956	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=19,33;MFRL=316,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:27560943_G_C:27560943:3,0,1,0
chr16	27560960	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=17,35;MFRL=299,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:2,0,1,0
chr16	27560964	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=8,35;MFRL=299,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:27560943_G_C:27560943:2,0,1,0
chr16	27560968	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=17,27;MFRL=299,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:27560943_G_C:27560943:2,0,1,0
chr16	27561584	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,2:4,5:2,6,3,4
chr16	27629661	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=207,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,4:1,6:3,0,9,1
chr16	27709591	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=206,45;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:11,1,1,1
chr16	27709825	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=316,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:0,1:4,2:0,4,0,4
chr16	27713103	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:1,5,0,4
chr16	27733116	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	27752314	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr16	27777831	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr16	27802657	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=210,95;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.315:10:4,1:3,1:6,1,2,1
chr16	27840271	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,3:5,2:4,5,1,4
chr16	27856464	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=208,273;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:27856464_G_C:27856464:0,2,0,1
chr16	27856468	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=202,273;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27856464_G_C:27856464:0,3,0,1
chr16	27856472	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=202,273;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27856464_G_C:27856464:0,3,0,1
chr16	27856478	.	C	CTTCCTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=202,273;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27856464_G_C:27856464:0,3,0,1
chr16	27974418	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr16	28123115	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=225,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,0:2,3:5,1,1,2
chr16	28132951	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=171,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:3,2:4,2:4,4,3,1
chr16	28133152	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=151,249;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr16	28137248	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=214,220;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:0,4,0,7
chr16	28146513	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=157,222;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:6,2:5,2:10,2,3,1
chr16	28157351	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr16	28167920	.	C	CAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr16	28181306	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,0,16
chr16	28481650	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=144,208;MMQ=23,29;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr16	28481829	.	G	GTAACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,23;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0|1:28481829_G_GTAACT:28481829:0,0,0,1
chr16	28481831	.	A	ACTCCCTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,23;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0|1:28481829_G_GTAACT:28481829:0,0,0,1
chr16	28499963	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=177,79;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.156:21:9,2:9,0:10,8,1,2
chr16	28502781	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,204;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.213:20:7,3:9,0:11,5,4,0
chr16	28506872	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=152,109;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,31:0.667:46:11,15:4,16:6,9,12,19
chr16	28508048	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:8,2:5,9:5,8,5,6
chr16	28508069	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=154,182;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:8,2:5,6:6,7,3,5
chr16	28511206	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=181,192;MMQ=46,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:28511206_C_G:28511206:0,2,0,3
chr16	28511208	.	C	CACCCAAGACG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=211,132;MMQ=60,31;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:28511206_C_G:28511206:0,4,0,1
chr16	28511212	.	C	CCCGCCGCTCG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=211,132;MMQ=60,31;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:28511206_C_G:28511206:0,4,0,1
chr16	28549508	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=123,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:6,6:7,6:8,5,3,9
chr16	28550269	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=216,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr16	28596129	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,15;MFRL=236,200;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.566:5:2,0:0,1:2,0,3,0
chr16	28596884	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=239,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,0:4,3:5,0,2,1
chr16	28603287	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=153,98;MMQ=60,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr16	28603335	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=138,249;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:5,1:2,3:0|1:28603335_T_C:28603335:5,2,2,2
chr16	28603342	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=138,215;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:5,2:2,3:0|1:28603335_T_C:28603335:5,2,2,3
chr16	28603865	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=83,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,0:2,4:1,1,0,4
chr16	28604686	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=181,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,6:2,3:1,2,4,5
chr16	28607070	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=171,218;MMQ=33,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:10,2:3,6:8,5,5,3
chr16	28617057	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,0:3,3:4,0,3,1
chr16	28617128	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=196,188;MMQ=54,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:11,0:6,4:6,11,2,2
chr16	28617308	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:28617308_A_G:28617308:0,0,1,0
chr16	28617313	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:28617308_A_G:28617308:0,0,1,0
chr16	28617574	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=113,251;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:4,4,0,2
chr16	28617595	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=151,246;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,1:4,2:2,5,0,3
chr16	28617993	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=182,183;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,3:3,2:7,0,5,0
chr16	28618011	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=176,191;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:0|1:28618011_G_A:28618011:7,0,6,0
chr16	28618018	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=34,27;MFRL=166,191;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:0|1:28618011_G_A:28618011:6,0,6,0
chr16	28618037	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=26,30;MFRL=169,212;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:4,2:2,2:0|1:28618037_T_G:28618037:5,1,3,2
chr16	28618047	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=23,29;MFRL=116,199;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:0|1:28618037_T_G:28618037:2,2,3,4
chr16	28618065	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=26,30;MFRL=116,196;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:0|1:28618065_A_T:28618065:3,5,1,4
chr16	28618068	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=116,196;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:0|1:28618065_A_T:28618065:3,5,1,4
chr16	28618071	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=28,35;MFRL=116,196;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:0|1:28618065_A_T:28618065:3,5,1,4
chr16	28618237	.	TA	CG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.612:16:4,5:2,5:0|1:28618237_TA_CG:28618237:4,2,7,3
chr16	28618238	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,17:0.946:17:0,8:0,8:1|0:28618237_TA_CG:28618237:0,0,11,6
chr16	28618446	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,158;MMQ=52,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:1,3,0,4
chr16	28619995	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=170,209;MMQ=60,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,1:9,2:10,7,3,0
chr16	28620025	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=157,201;MMQ=52,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,2:11,2:10,10,4,0
chr16	28631314	.	T	TTGTGTG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=201,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=TG;STR;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:1,2:2,2:3,0,3,1
chr16	28631360	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=188,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:1,5:1,7:2,0,7,6
chr16	28631530	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr16	28734939	.	TG	GT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=241,185;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:28734939_TG_GT:28734939:0,1,0,2
chr16	28734944	.	G	GCAATGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=241,185;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:28734939_TG_GT:28734939:0,1,0,2
chr16	28837203	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=196,239;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,1:7,1:0,10,0,2
chr16	28843867	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,122;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:13,0:7,4:9,11,0,4
chr16	28844068	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=175,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:4,0,5,0
chr16	28844365	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=88,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:3,1,3,1
chr16	28845584	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=226,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:2,7:5,8:3,4,11,4
chr16	28847149	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=180,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:6,2:3,1:4,6,2,1
chr16	28847246	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=157,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,4:4,2:3,6,3,3
chr16	28847304	.	T	TCCC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,7;RU=C;STR;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:0|1:28847304_T_TCCC:28847304:0,7,3,0
chr16	28847309	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,1:3,2:0|1:28847304_T_TCCC:28847304:1,7,3,0
chr16	28847313	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.361:9:4,1:2,2:0|1:28847304_T_TCCC:28847304:1,5,3,0
chr16	28847430	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=171,55;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,2:6,0:0|1:28847430_C_T:28847430:8,9,1,1
chr16	28847452	.	C	CTG	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=168,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,2:9,0:0|1:28847430_C_T:28847430:14,10,1,1
chr16	28847453	.	C	CGGA	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=171,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,2:8,0:0|1:28847430_C_T:28847430:14,9,1,1
chr16	28847457	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=168,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,2:8,0:0|1:28847430_C_T:28847430:13,9,1,1
chr16	28847460	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=168,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,2:8,0:0|1:28847430_C_T:28847430:13,9,1,1
chr16	28847462	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=168,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,1:8,0:0|1:28847430_C_T:28847430:13,9,1,1
chr16	28847791	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=174,27;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,0:5,2:4,4,0,2
chr16	28855522	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:13,4:9,2:12,10,3,3
chr16	28855727	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.384:19:8,5:3,2:10,2,1,6
chr16	28856819	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:4,5:4,11:1,7,3,13
chr16	28857645	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=158,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,1:8,1:7,11,0,2
chr16	28878196	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.218:12:3,2:5,0:3,7,1,1
chr16	28878730	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:9,1:4,1:6,7,2,0
chr16	28880679	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:9,1:2,1:6,5,2,0
chr16	28883327	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr16	28883841	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=213,254;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:5,1:6,4,2,2
chr16	28890131	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:8,1:6,4:4,10,0,5
chr16	28890381	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,0:6,2:7,3,2,0
chr16	28893724	.	ACT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=184,266;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,2,1
chr16	28896010	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,0:0,0:0,0,0,4
chr16	28896021	.	G	GCTCAACTCCTAATACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=239,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr16	28906084	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=316,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:1,1,1,2
chr16	28913787	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=305,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,8:0,1:0,2,3,6
chr16	28915433	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=159,274;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:4,2,1,1
chr16	28922149	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	28922446	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:2,2,2,1
chr16	28925978	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr16	28936451	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:28936451_C_A:28936451:0,0,1,0
chr16	28936464	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:28936451_C_A:28936451:0,0,1,0
chr16	28943624	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,17;MFRL=195,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.288:5:3,0:1,0:3,1,1,0
chr16	28943631	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=257,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,0:1,1,3,0
chr16	28943635	.	AT	CA,CT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,12,12;MFRL=206,184,186;MMQ=60,60,60;MPOS=18,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.29,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,0,0:1,0,0:2,1,2,0
chr16	28943641	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=15,34;MFRL=178,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:0,1:0|1:28943641_A_C:28943641:5,1,2,0
chr16	28943646	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=24,15;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,0:0|1:28943641_A_C:28943641:5,2,2,0
chr16	28947500	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:3,2:11,0:7,9,1,1
chr16	28962755	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=110,256;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:1,0:2,2:1,3,0,2
chr16	28970046	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:8,0:4,2:4,8,1,1
chr16	28997512	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.337:10:3,0:2,0:0|1:28997512_A_C:28997512:4,3,3,0
chr16	28997516	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=19,12;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.337:10:0,0:2,0:0|1:28997512_A_C:28997512:4,3,3,0
chr16	28997522	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:3,0:2,0:3,3,3,0
chr16	29001015	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=197,232985;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,0:3,3:1,6,3,0
chr16	29001071	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=187,232985;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:4,0:6,3:6,5,3,0
chr16	29472649	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=161,199;MMQ=39,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,0:0,0:1,0,3,0
chr16	29676183	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=172,247;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,0:1,3:4,3,3,0
chr16	29676378	.	C	CT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=126,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,0:8,3:7,12,2,1
chr16	29677823	.	GCTCTCT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=165,83;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,8;RU=CT;STR;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.495:8:1,3:1,1:2,2,1,3
chr16	29677873	.	A	ACGCG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=171,152;MMQ=52,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=CG;STR;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,1:1,1:0,2,3,3
chr16	29678419	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=110,76;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,2:7,0:3,7,0,2
chr16	29678907	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,202;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29678907_G_A:29678907:0,0,0,1
chr16	29678912	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29678907_G_A:29678907:0,0,0,1
chr16	29679926	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	29680165	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=201,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.343:10:4,1:3,2:4,3,1,2
chr16	29680389	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=336,84;MMQ=60,59;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,1:1,1:1,3,2,0
chr16	29680524	.	CTT	C,CT	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,33,34;MFRL=123,150,0;MMQ=60,60,60;MPOS=20,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=6.47,3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,5,3:0.233,0.174:21:8,4,3:3,1,0:9,4,4,4
chr16	29681197	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=247,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.653:12:3,5:1,1:3,1,5,3
chr16	29809634	.	TACAC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=AC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	29810844	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,137;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.430:16:7,0:2,5:3,6,0,7
chr16	29814234	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,15:0,15:0,0,13,17
chr16	29817998	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=8,24;MFRL=118,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.840:10:0,4:0,5:0,1,8,1
chr16	29820785	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	29842003	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,13;MFRL=138,307;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:3,1,0,1
chr16	29853508	.	CTTG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=190,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29853508_CTTG_C:29853508:0,1,0,1
chr16	29853512	.	AGCCTAGG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=190,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29853508_CTTG_C:29853508:0,1,0,1
chr16	29853525	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,22;MFRL=190,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29853508_CTTG_C:29853508:0,1,0,1
chr16	29906523	.	TGT	ATA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,353;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:29906523_TGT_ATA:29906523:0,0,1,0
chr16	29906538	.	GT	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=149,353;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:29906523_TGT_ATA:29906523:0,2,1,0
chr16	29906542	.	GG	CC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,17;MFRL=149,353;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:29906523_TGT_ATA:29906523:0,2,1,0
chr16	29908044	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=139,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.335:25:2,8:14,0:17,0,8,0
chr16	29912802	.	G	GGGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGT;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:3,3,0,2
chr16	29912995	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=222,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:29912995_AC_A:29912995:1,0,1,0
chr16	29913001	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=222,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:29912995_AC_A:29912995:1,0,1,0
chr16	29934754	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,277;MMQ=60,55;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr16	29937081	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,248;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,1:6,2:9,1,3,0
chr16	29979588	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=264,264;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:15,0:4,9:2,17,0,9
chr16	29989216	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=180,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.373:22:5,7:9,1:4,10,4,4
chr16	29993108	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=119,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:10,2:7,1:8,10,2,1
chr16	29998200	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,231;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,1:5,1:2,6,1,1
chr16	30000901	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=110,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:13,2:12,1:11,14,0,3
chr16	30037037	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=161,89;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,6:6,0:7,5,6,0
chr16	30078492	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:4,3:7,3:8,3,6,0
chr16	30080081	.	A	AGGT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=191,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.126:21:13,2:5,0:0|1:30080081_A_AGGT:30080081:11,8,0,2
chr16	30080084	.	A	ATCTCATAAAGTACATTGTCAAGG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=191,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:14,2:5,0:0|1:30080081_A_AGGT:30080081:11,8,0,2
chr16	30081367	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=201,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.750:26:2,9:4,11:4,2,11,9
chr16	30093779	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,178;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:9,3,2,1
chr16	30208527	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=160,129;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,18:0.371:49:13,8:18,10:18,13,9,9
chr16	30376415	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,56;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:13,4:7,0:8,12,4,0
chr16	30380486	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:3,6:1,6:3,1,10,2
chr16	30386262	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	30390314	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr16	30393771	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,9,5
chr16	30407041	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	30407269	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	30410445	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.793:8:1,2:0,2:0,1,0,7
chr16	30440278	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=173,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:9,0,2,0
chr16	30492705	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=150,152;MMQ=60,40;MPOS=-1073741818;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:5,1:0|1:30492705_C_A:30492705:4,7,2,0
chr16	30492707	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,15;MFRL=150,152;MMQ=60,40;MPOS=-1073741819;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,0:0|1:30492705_C_A:30492705:4,7,2,0
chr16	30492709	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=147,159;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.248:13:5,0:5,2:3,7,3,0
chr16	30495412	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:2,2,4,2
chr16	30495600	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=201,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:30495600_T_A:30495600:2,4,1,1
chr16	30495603	.	GA	CT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=201,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:30495600_T_A:30495600:2,4,1,1
chr16	30495657	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,292;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	30500535	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=174,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.509:11:3,0:2,0:4,1,0,6
chr16	30500761	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=185,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr16	30505513	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=130,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:2,7:5,4:4,4,6,5
chr16	30507972	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=241,85;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr16	30510571	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=221,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:1,2,2,2
chr16	30516492	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=210,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,5:1,5:0,2,10,0
chr16	30522152	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=166,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:4,2:0,1:4,0,3,0
chr16	30536893	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=192,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,1:10,1:11,7,1,1
chr16	30536918	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=202,176;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:4,7:3,6:5,2,10,3
chr16	30667521	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:6,4:15,2:8,14,4,2
chr16	30672645	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=148,108;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.147:25:7,3:13,0:0|1:30672645_G_A:30672645:10,12,3,0
chr16	30672654	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=148,108;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.137:27:11,3:13,0:0|1:30672645_G_A:30672645:9,15,3,0
chr16	30673880	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=170,121;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:11,3:13,0:0|1:30673880_C_G:30673880:12,13,3,0
chr16	30673883	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=170,121;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:11,3:14,0:0|1:30673880_C_G:30673880:13,13,3,0
chr16	30676416	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=227,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:2,4,0,2
chr16	30680307	.	C	CCGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0|1:30680307_C_CCGG:30680307:0,0,1,0
chr16	30680308	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,0:0,0:0|1:30680307_C_CCGG:30680307:0,0,1,0
chr16	30680312	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:30680307_C_CCGG:30680307:0,0,1,0
chr16	30680316	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,0;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:30680307_C_CCGG:30680307:0,0,1,0
chr16	30718873	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:9,1:3,2:8,4,2,1
chr16	30724221	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr16	30727811	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=184,111;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:2,10,0,2
chr16	30733849	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=184,164;MMQ=60,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,4:6,0:9,0,4,0
chr16	30734852	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=282,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	30734963	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,15:0,13:0,0,20,10
chr16	30744826	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=220,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:5,1,3,1
chr16	30745976	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr16	30748661	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,2:5,1:4,8,3,0
chr16	30762640	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr16	30768492	.	GCTCTGGC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,1893;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTCTGGC;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.766:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr16	30770267	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr16	30770950	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=156,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,2:7,2:7,7,3,1
chr16	30772040	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr16	30773822	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr16	30794212	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=137,100;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.180:31:14,5:12,0:14,12,5,0
chr16	30935984	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.761:2:0,2:0,0:0|1:30935984_CA_C:30935984:0,0,2,0
chr16	30935991	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,0;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:30935984_CA_C:30935984:0,0,1,0
chr16	30938811	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,8:2,2:4,2,4,6
chr16	30965022	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=160,111;MMQ=60,31;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.162:23:9,3:8,0:11,9,3,0
chr16	30970567	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=190,190;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:13,0:5,4:2,16,0,4
chr16	30976445	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=214,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.383:6:2,0:1,0:0|1:30976445_G_C:30976445:2,2,2,0
chr16	30976449	.	AG	CC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=214,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.383:6:2,1:0,1:0|1:30976445_G_C:30976445:2,2,2,0
chr16	30976453	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=232,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,0:0|1:30976445_G_C:30976445:1,2,2,0
chr16	30976458	.	TG	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,12;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:30976445_G_C:30976445:1,1,2,0
chr16	30977637	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=146,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:9,0:6,2:7,8,2,0
chr16	30977799	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=267,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr16	30980902	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=126,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:4,8:3,8:5,2,8,8
chr16	30991820	.	A	ACCCCAAACAAACCTTCAATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=210,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:4,0:3,7,1,1
chr16	31004812	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=184,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.339:13:4,2:3,2:2,7,0,4
chr16	31008133	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:2,0:2,1:0|1:31008133_T_G:31008133:3,3,0,2
chr16	31008141	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.301:8:3,0:1,1:0|1:31008133_T_G:31008133:3,3,0,2
chr16	31012532	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=180,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:2,2:4,0:0,6,0,3
chr16	31044683	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=170,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,2:9,1:9,6,3,0
chr16	31050023	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=171,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:31050023_C_A:31050023:0,2,1,2
chr16	31050033	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=192,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0|1:31050023_C_A:31050023:0,4,1,2
chr16	31095107	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=154,77;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:8,0:14,3:10,12,2,1
chr16	31095171	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,3:6,3:4,8,1,5
chr16	31095204	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=210,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:0,5,0,4
chr16	31097574	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr16	31131614	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,7:6,4:6,6,3,8
chr16	31138445	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:5,4:9,3:5,9,4,3
chr16	31141993	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=254,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,2:2,2:2,6,2,2
chr16	31142233	.	GCTGCTGTGTGTC	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=198,250;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,1:7,0:0|1:31142233_GCTGCTGTGTGTC_G:31142233:9,4,0,2
chr16	31142250	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=198,250;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,1:0|1:31142233_GCTGCTGTGTGTC_G:31142233:10,1,0,2
chr16	31142254	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=198,250;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,1:4,1:0|1:31142233_GCTGCTGTGTGTC_G:31142233:10,1,0,2
chr16	31142271	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=177,221;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:4,1,6,1
chr16	31142381	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr16	31143993	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,1:6,2:4,4,2,1
chr16	31151521	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,9,0
chr16	31152697	.	T	TAAAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=194,449;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAC;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:1,0:2,1:0|1:31152697_T_TAAAC:31152697:3,0,1,0
chr16	31152717	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0|1:31152697_T_TAAAC:31152697:0,0,6,0
chr16	31153780	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr16	31191482	.	AC	GC,GT	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=0,32,20;MFRL=0,157,52;MMQ=60,60,60;MPOS=15,30;POPAF=7.30,7.30;TLOD=149.13,4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,43,2:0.918,0.061:45:0,24,0:0,19,2:0,0,22,23
chr16	31191496	.	GA	G	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=157,52;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:23,0:21,2:0|1:31191496_GA_G:31191496:24,21,1,1
chr16	31191502	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=165,52;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:21,0:18,2:0|1:31191496_GA_G:31191496:23,18,1,1
chr16	31191503	.	G	GA	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=165,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:21,0:19,2:0|1:31191496_GA_G:31191496:23,18,1,1
chr16	31191505	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=159,52;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:20,0:18,2:0|1:31191496_GA_G:31191496:23,18,1,1
chr16	31191510	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=165,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:21,0:16,2:0|1:31191496_GA_G:31191496:22,17,1,1
chr16	31194067	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:31194067_T_TC:31194067:0,3,0,1
chr16	31194069	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:31194067_T_TC:31194067:0,3,0,1
chr16	31195469	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=203,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:11,2:4,0:13,2,2,0
chr16	31196224	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.357:15:5,1:4,4:10,0,5,0
chr16	31201663	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.164:41:21,6:9,0:15,20,6,0
chr16	31202698	.	ATT	A,AT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,30,27;MFRL=172,0,128;MMQ=60,60,60;MPOS=16,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=3.98,5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,5:0.165,0.304:17:1,1,2:6,2,3:4,5,3,5
chr16	31273129	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,2,7
chr16	31283164	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=66.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,22:0.852:25:1,10:2,12:0,3,18,4
chr16	31283323	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=223,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,3:1,8:1,1,4,7
chr16	31288121	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=236,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:3,2:0,1:2,1,1,3
chr16	31335906	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=162,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:3,0,1,4
chr16	31336519	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr16	31339557	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=115,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:8,0:7,8,1,2
chr16	31339625	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=139,308;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr16	31342608	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr16	31371193	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr16	31384484	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,12;MFRL=309,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:31384484_A_C:31384484:1,0,1,0
chr16	31384492	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:31384484_A_C:31384484:0,0,2,0
chr16	31384496	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:31384484_A_C:31384484:0,0,2,0
chr16	31384501	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,12;MFRL=257,309;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:0,0:1|0:31384484_A_C:31384484:2,0,1,0
chr16	31388640	.	GA	G,GAAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=14,15,33;MFRL=148,173,30313174;MMQ=60,60,58;MPOS=19,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=A;STR;TLOD=3.48,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,1:0.490,0.201:7:0,0,0:0,1,1:0,2,1,4
chr16	31388641	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,10;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.403:7:1,1:3,0:2,2,0,3
chr16	31391126	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,607;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:11,0:4,3:10,5,3,0
chr16	31392384	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=224,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr16	31393308	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr16	31413601	.	GA	AC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=178,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:31413601_GA_AC:31413601:1,1,0,1
chr16	31413604	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=203,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31413601_GA_AC:31413601:1,0,0,1
chr16	31413606	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=203,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31413601_GA_AC:31413601:1,0,0,1
chr16	31413608	.	G	GTC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=203,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31413601_GA_AC:31413601:1,0,0,1
chr16	31413610	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=203,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:31413601_GA_AC:31413601:1,0,0,1
chr16	31422747	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=193,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,2:1,4,1,1
chr16	31425991	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=200,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,2:9,0:4,10,1,1
chr16	31427678	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr16	31434889	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=162,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr16	31435918	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=189,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.451:7:0,0:3,2:0,4,1,2
chr16	31439239	.	G	GCCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=C;STR;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:31439239_G_GCCC:31439239:0,0,0,4
chr16	31439243	.	GACC	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0|1:31439239_G_GCCC:31439239:0,0,0,3
chr16	31439248	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:31439239_G_GCCC:31439239:0,0,0,3
chr16	31439253	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:31439239_G_GCCC:31439239:0,0,0,3
chr16	31439256	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:31439239_G_GCCC:31439239:0,0,0,3
chr16	31447915	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,246;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,2:10,0:7,6,1,1
chr16	31475638	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=182,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:2,0:2,1,2,0
chr16	31475947	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=272,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31475947_G_T:31475947:0,1,0,1
chr16	31475948	.	C	CTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=272,234;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31475947_G_T:31475947:0,1,0,1
chr16	31477360	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=242,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31477360_C_A:31477360:0,1,0,1
chr16	31477376	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=242,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31477360_C_A:31477360:0,1,0,1
chr16	31488916	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr16	31496195	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,1:4,1:8,4,1,1
chr16	31497393	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=182,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr16	31503751	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	31519048	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,11,6
chr16	31724836	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=246,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,6:0,8:0,1,1,13
chr16	31770696	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,11,6
chr16	31770723	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,2:0,9:0,0,5,6
chr16	31926138	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,270;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:7,1:8,4:6,9,3,2
chr16	33965407	.	TG	CA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=178,222;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr16	33965449	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=205,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,3:1,2:0|1:33965449_G_C:33965449:1,1,5,0
chr16	33965456	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=225,197;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:0,4:3,2:0|1:33965449_G_C:33965449:2,1,5,1
chr16	33965459	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=225,192;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.668:10:0,4:3,3:0|1:33965449_G_C:33965449:2,1,6,1
chr16	33965507	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=154,138;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,1:8,2:6,5,2,1
chr16	33965533	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=14;MBQ=28,31;MFRL=154,150;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=109.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,28:0.708:39:5,12:6,12:0|1:33965533_A_C:33965533:6,5,26,2
chr16	33965538	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=14;MBQ=30,28;MFRL=145,140;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=132.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,32:0.767:41:4,12:5,12:0|1:33965533_A_C:33965533:5,4,26,6
chr16	33965539	.	G	GC	.	.	DP=42;ECNT=14;MBQ=34,32;MFRL=162,130;MMQ=60,46;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=133.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,32:0.750:42:4,15:5,13:0|1:33965533_A_C:33965533:6,4,26,6
chr16	33965554	.	A	G	.	.	DP=65;ECNT=14;MBQ=28,29;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=224.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,53:0.806:65:7,22:4,27:0|1:33965533_A_C:33965533:5,7,39,14
chr16	33965560	.	TT	AC	.	.	DP=67;ECNT=14;MBQ=25,28;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=241.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,57:0.841:67:6,23:3,26:0|1:33965533_A_C:33965533:4,6,39,18
chr16	33965589	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=14;MBQ=31,30;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=198.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,47:0.874:53:4,24:2,22:2,4,28,19
chr16	33965591	.	A	C	.	.	DP=53;ECNT=14;MBQ=26,32;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=190.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,45:0.836:53:6,23:2,22:0|1:33965591_A_C:33965591:2,6,28,17
chr16	33965593	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=14;MBQ=27,32;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=190.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,45:0.836:53:4,21:2,22:0|1:33965591_A_C:33965591:2,6,28,17
chr16	33965644	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=14;MBQ=25,32;MFRL=200,229;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:33965644_A_G:33965644:0,3,0,2
chr16	33965655	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=14;MBQ=28,26;MFRL=213,229;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:33965644_A_G:33965644:0,2,0,2
chr16	33965666	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=14;MBQ=33,25;MFRL=213,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0|1:33965644_A_G:33965644:0,2,0,4
chr16	33965669	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=14;MBQ=32,32;MFRL=213,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0|1:33965644_A_G:33965644:0,2,0,5
chr16	33965681	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=14;MBQ=30,34;MFRL=200,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,2:0,2:0|1:33965644_A_G:33965644:0,1,0,5
chr16	33965690	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=14;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:33965644_A_G:33965644:0,0,0,3
chr16	46642114	.	GGT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GT;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	46652227	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=183,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,2:14,0:0|1:46652227_G_A:46652227:12,16,1,1
chr16	46652234	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=173,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,2:14,0:0|1:46652227_G_A:46652227:12,14,1,1
chr16	46652286	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.542:9:0,2:3,3:0,4,0,5
chr16	46697098	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=271,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:0,1:6,2:1,5,0,3
chr16	46702740	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=175,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr16	46708574	.	TAAAAAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=157,132;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,8;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:1,0:2,1:1,4,0,1
chr16	46711268	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=108,70;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:2,0:14,2:9,7,1,1
chr16	46714529	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:0,4:1,2:1,0,5,2
chr16	46715191	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr16	46743675	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr16	46755213	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr16	46764482	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=188,254;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,5:0,1:1,0,3,3
chr16	46918908	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=174,360;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr16	46934689	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=131,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.191:17:7,0:7,2:7,7,1,2
chr16	47347780	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr16	47399670	.	CTTTTT	C,CTTTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31,33;MFRL=151,154,160;MMQ=60,60,60;MPOS=18,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,11,15;RU=T;STR;TLOD=5.93,5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,5:0.158,0.379:13:4,0,4:1,2,1:4,2,7,0
chr16	47462851	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=247,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,4:0,0:0,1,0,4
chr16	47486712	.	GAT	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,2:9,1:3,16,1,2
chr16	47486817	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=219,261;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr16	47630539	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.436:7:3,0:1,3:0,4,0,3
chr16	47684686	.	TATTA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=242,236;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:1,0,3,2
chr16	47703060	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=200,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:7,1,2,0
chr16	48118028	.	G	GGCCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.698:1:0,1:0,0:0|1:48118028_G_GGCCA:48118028:0,0,0,1
chr16	48118031	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48118028_G_GGCCA:48118028:0,0,0,1
chr16	48180287	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=220,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,2:7,1:4,12,2,1
chr16	48311290	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=167,97;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,2:10,0:9,14,2,0
chr16	48333505	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,123;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:4,2:5,0:9,2,2,0
chr16	49411696	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,3:8,0:9,8,3,0
chr16	49412531	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr16	49557441	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	49557482	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=174,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:2,3:3,2:4,1,4,2
chr16	49660139	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:6,3:12,0:0|1:49660139_G_A:49660139:6,13,1,2
chr16	49660141	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=105,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:0|1:49660139_G_A:49660139:6,14,1,1
chr16	49660145	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=107,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:11,0:0|1:49660139_G_A:49660139:5,13,1,1
chr16	49670805	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=201,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:3,4,1,1
chr16	49764948	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=228,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr16	50059500	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,16,1
chr16	50067905	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,218;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr16	50100214	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=172,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,3:0,3:0,2,0,6
chr16	50100253	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=207,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr16	50102618	.	G	GAAAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAT;STR;TLOD=35.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,5:0,0,4,5
chr16	50104234	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:1,4,2,4
chr16	50109478	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:5,3,2,0
chr16	50112971	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	50120122	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=103,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:10,4:6,0:10,6,4,0
chr16	50128572	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=149,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,3:1,4:3,3,2,5
chr16	50251590	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:4,8:10,7:3,11,4,11
chr16	50261735	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr16	50327439	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=131,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,2:1,6:1,0,2,6
chr16	50327456	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.754:10:0,2:0,5:0,2,1,7
chr16	50327462	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,2:3,6:1,2,0,8
chr16	50332831	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=160,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:10,6,1,2
chr16	50334840	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=160,384;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,2,0
chr16	50334969	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=268,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,0:5,2:6,0,2,0
chr16	50335150	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=169,252;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.353:12:2,2:3,2:0,8,2,2
chr16	50342141	.	GGGTGGGGACA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=175,240;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr16	50345778	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=136,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,2,4
chr16	50346084	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=115,286;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:9,7,0,2
chr16	50346114	.	AGGGGCT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,18;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,0:0,1:2,4,1,1
chr16	50346748	.	T	TCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=286,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,4:1,1:1,0,5,0
chr16	50354039	.	CAAAA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=203,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,3;RU=A;STR;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,1:3,3:5,1,2,2
chr16	50355996	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:0,8,0,3
chr16	50367633	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=120,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.765:14:1,6:2,5:0,3,2,9
chr16	50388657	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr16	50402240	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=121,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,0,4
chr16	50402569	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=174,259;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:3,1:3,1:7,0,2,0
chr16	50759547	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=170,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,3:1,4:1,4,0,7
chr16	50785890	.	AACATATATATACAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=244,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACATATATATACAC;STR;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.508:6:0,2:2,1:0,3,0,3
chr16	50816459	.	G	GTGTGT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=195,169;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:2,2:3,0:0|1:50816459_G_GTGTGT:50816459:0,5,0,2
chr16	50816460	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=195,169;MMQ=60,53;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,1:3,0:0|1:50816459_G_GTGTGT:50816459:0,5,0,2
chr16	50827601	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:1,3,0,5
chr16	51171493	.	CAG	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=225,196;MMQ=54,45;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr16	51171524	.	G	GAACATAAAGACATGTACTCACATAGAAACAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=249,225;MMQ=60,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.471:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	51174448	.	G	GCTTCAGCCTGAAATGAGGATTTAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,108;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:4,6,0,2
chr16	51175655	.	CGCT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=184,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=GCT;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.205:22:10,1:5,3:9,9,3,1
chr16	52473564	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=190,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:8,3,1,1
chr16	53191470	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.582:29:7,15:5,2:6,6,2,15
chr16	53256494	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,4:1,3:5,1,7,0
chr16	53265745	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=160,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:1,8,0,2
chr16	53272216	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=182,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,1,1
chr16	53288265	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr16	53327041	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=260,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,1:1,1:0,2,0,4
chr16	53340080	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr16	53348207	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=238,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr16	53349000	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=210,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:2,2,0,4
chr16	53352329	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr16	53476804	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,9:4,2:1,5,2,9
chr16	53480931	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.284:16:6,3:6,1:9,3,3,1
chr16	53493346	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr16	53496598	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:1,7,1,3
chr16	53513033	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:6,7:2,5:5,3,12,0
chr16	53513055	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:7,5:4,7:6,6,9,3
chr16	53513883	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=133,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:6,7,1,1
chr16	53526551	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:3,6:10,3:6,7,6,3
chr16	53672355	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=149,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,1,1
chr16	53682785	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=189,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr16	53686790	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:10,7,2,0
chr16	53692694	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:6,2,1,3
chr16	53698735	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=311,3724;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	53699003	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr16	53721906	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,3:1,7,1,6
chr16	53844164	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=162,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=27.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,0:3,9:1,6,0,9
chr16	53913911	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=21,23,24;MFRL=169,205,199;MMQ=60,54,60;MPOS=13,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=T;STR;TLOD=4.87,7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,3:0.239,0.227:15:3,3,2:3,0,1:1,7,0,7
chr16	53913930	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=146,185;MMQ=56,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,3:2,3:1,5,0,6
chr16	54318102	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr16	54318525	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,484;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:54318525_T_G:54318525:0,0,0,1
chr16	54318528	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,484;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:54318525_T_G:54318525:0,0,0,1
chr16	54319034	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=185,45;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
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chr16	54319571	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	54319994	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
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chr16	55359109	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=192,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:55359107_A_C:55359107:0,3,0,1
chr16	55359126	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=192,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr16	55360208	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=132,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr16	55363238	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=227,236;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr16	55513331	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=287,258;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0|1:55513331_G_C:55513331:3,0,2,0
chr16	55513338	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=287,300;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:55513331_G_C:55513331:3,0,1,0
chr16	55515695	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.334:22:6,5:9,2:11,4,6,1
chr16	55516767	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	55523617	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:8,9,0,2
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chr16	55527026	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=192,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:4,2:8,3:11,1,4,1
chr16	55527298	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.904:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr16	55530762	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=209,257;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,6:1,2:3,0,8,0
chr16	55530772	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=63.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,16,0
chr16	55530842	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,3:6,0:10,1,3,0
chr16	55532458	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=237,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:0,1:0,3,0,2
chr16	55536622	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=209,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,1,1
chr16	55536687	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=168,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,4:0,3:2,1,4,3
chr16	55539191	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=198,199;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.813:8:0,2:1,5:0,1,6,1
chr16	55543358	.	C	CAGAGATACCTGAGCCTGCAGCCAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	55562257	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr16	55562466	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=100,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:1,7:1,1:0,2,2,6
chr16	55562572	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=242,237;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr16	55579806	.	AT	A,ATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27,25;MFRL=227,230,212;MMQ=60,60,60;MPOS=22,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=T;STR;TLOD=3.74,3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,2:0.230,0.230:10:2,1,2:4,1,0:0,6,0,4
chr16	55583149	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=215,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr16	55600714	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.194:34:14,6:14,0:13,15,6,0
chr16	55728081	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr16	55730124	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,1:4,3:7,3,3,1
chr16	55733589	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=174,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.382:14:5,3:2,2:3,6,2,3
chr16	55735912	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:2,1,0,5
chr16	55844609	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=185,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:3,6:3,2:0|1:55844609_G_T:55844609:3,4,2,6
chr16	55844617	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=190,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:2,7:4,2:0|1:55844609_G_T:55844609:2,4,2,7
chr16	55844926	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=130,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,2:2,1:2,2,1,2
chr16	55847045	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=198,230;MMQ=58,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:0|1:55847045_A_G:55847045:0,5,0,4
chr16	55847051	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=219,230;MMQ=59,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0|1:55847045_A_G:55847045:0,4,0,4
chr16	55854412	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=165,188;MMQ=46,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,1:5,2:3,3,3,0
chr16	55854452	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=214,181;MMQ=60,55;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:0|1:55854452_G_A:55854452:0,8,1,5
chr16	55854455	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=204,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:4,3:5,4:0|1:55854452_G_A:55854452:0,9,1,6
chr16	55857396	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=193,216;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr16	55862605	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=288,167;MMQ=60,46;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr16	55862647	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=179,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.260:20:12,2:3,2:9,6,2,3
chr16	55862762	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=190,117;MMQ=52,29;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:15,3:4,2:8,11,3,2
chr16	55862955	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=207,298;MMQ=60,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:55862955_G_C:55862955:0,2,0,2
chr16	55862958	.	GC	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=207,298;MMQ=60,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:55862955_G_C:55862955:0,2,0,2
chr16	55862961	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=207,298;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:55862955_G_C:55862955:0,2,0,2
chr16	55866894	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=167,165;MMQ=60,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:13,2:6,3:12,7,5,0
chr16	55867006	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:5,6:10,3:8,7,4,5
chr16	55867042	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=209,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:4,2:5,2:2,9,1,3
chr16	55880323	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=242,46;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,0:2,2:7,2,1,1
chr16	55880639	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=216,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.302:21:8,5:7,1:7,8,4,2
chr16	55883761	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr16	55886715	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr16	55900128	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=175,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0,2,0,2
chr16	55909163	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr16	56362725	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,4:1,3:2,4,4,3
chr16	56377748	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=157,130;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:1,0:9,6:6,5,4,2
chr16	56389037	.	TACACACAC	T,TACAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,10,29;MFRL=175,191,214;MMQ=60,60,60;MPOS=33,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,11,13;RU=AC;STR;TLOD=3.08,6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,2:0.206,0.420:6:1,0,1:1,0,1:0,3,0,3
chr16	56396876	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=149,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:13,3:7,0:10,10,1,2
chr16	56401294	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=223,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:4,1,4,1
chr16	56436824	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:4,0,6,0
chr16	56441862	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=195,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.792:22:3,8:1,10:4,0,15,3
chr16	56442066	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:8,5:3,2:4,7,0,7
chr16	56448189	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,164;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,0:7,3:13,4,0,3
chr16	56501806	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=202,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,1:3,7:4,3,4,4
chr16	56530870	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=124,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.334:34:14,11:9,0:15,8,11,0
chr16	56536494	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=239,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:6,4,3,1
chr16	56539982	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:11,6:4,4:10,5,3,7
chr16	56553814	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.380:19:6,3:6,2:0|1:56553814_A_G:56553814:2,10,1,6
chr16	56553816	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:6,4:4,3:0|1:56553814_A_G:56553814:2,10,1,6
chr16	56667165	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,223;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr16	56667614	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=199,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,1:6,3:8,5,3,1
chr16	56667854	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=247,209;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,4:3,1:0,3,1,4
chr16	56673143	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=268,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.851:18:0,9:2,6:0|1:56673143_A_G:56673143:2,0,11,5
chr16	56673148	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=268,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=67.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.850:18:0,10:2,6:0|1:56673143_A_G:56673143:2,0,11,5
chr16	56685820	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=162,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:10,0:6,2:12,6,1,1
chr16	56686002	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=203,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0|1:56686002_G_C:56686002:0,1,0,5
chr16	56686005	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=203,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0|1:56686002_G_C:56686002:0,1,0,5
chr16	56686030	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr16	56686380	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:6,4:5,6:10,1,8,2
chr16	56686550	.	TG	GA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=167,193;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=46.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,13:0.311:43:20,0:10,13:15,15,0,13
chr16	56686818	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=258,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,3:2,0:3,2,2,1
chr16	56686852	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=108,81;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:8,3:4,1:11,2,1,3
chr16	56687031	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=165,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:1,1:2,2:0,4,0,3
chr16	56692574	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,85;MMQ=60,32;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,0:10,2:9,8,0,2
chr16	56700722	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:8,4:13,1:18,3,2,3
chr16	56702000	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=245,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr16	56716347	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,277;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.203:21:5,2:12,1:17,0,3,1
chr16	56716982	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=167,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,4:1,2:5,1,6,0
chr16	56832302	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=133,248;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,2,1
chr16	56864398	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=175,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=61.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.911:20:0,12:1,7:1,0,14,5
chr16	56864618	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,2,10
chr16	56868700	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:1,5:0,10:1,0,3,12
chr16	56873548	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,231;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,1:6,1:3,7,1,1
chr16	56901065	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=136,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,3:6,5:6,5,5,3
chr16	56912902	.	TC	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=139,87;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:2,0:5,1,1,1
chr16	56913419	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=202,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr16	56917953	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=127,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,2:3,4:2,1,2,4
chr16	56919235	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,1:4,3:5,6,0,4
chr16	56926176	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	56926828	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,196;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.917:22:1,0:0,21:1,0,20,1
chr16	56933519	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=131,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:6,2:11,3:7,10,2,3
chr16	56938290	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=212,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:10,5:6,4:8,8,7,2
chr16	56947092	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=164,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,0:5,2:6,0,2,0
chr16	56966071	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr16	56970692	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.278:34:7,2:16,7:14,11,2,7
chr16	56973335	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=120,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:0,5,0,4
chr16	56973959	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=124,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:18,2:8,0:11,15,1,1
chr16	57003723	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,8,1
chr16	57003977	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr16	57003980	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr16	57004889	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=122,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:10,1:6,2:10,6,2,1
chr16	57005825	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=162,241;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,0:6,2:9,0,2,0
chr16	57007451	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr16	57015463	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr16	57017474	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,4,8
chr16	57057619	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=259,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr16	57057654	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=17,32;MFRL=288,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.522:8:1,1:0,3:3,1,4,0
chr16	57057662	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=21,22;MFRL=194,305;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,0:1,1:5,1,2,0
chr16	57057667	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=137,299;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.358:9:2,0:3,0:5,1,3,0
chr16	57057841	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=185,253;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:0,7,0,3
chr16	57059241	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=370,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr16	57059484	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,260;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,1:7,1:8,9,0,2
chr16	57069992	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,3:4,2:3,4,2,3
chr16	57070004	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=234,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,7:1,4:1,1,5,6
chr16	57070164	.	GT	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:1,1:0,4,0,3
chr16	57071209	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=166,333;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0,7,0,2
chr16	57071226	.	TCC	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=191,333;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=C;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:0|1:57071226_TCC_T:57071226:0,7,0,2
chr16	57071232	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=333,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:2,1:0,5:0,2,0,7
chr16	57071236	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=36,28;MFRL=191,333;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:0|1:57071226_TCC_T:57071226:0,7,0,2
chr16	57074451	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=195,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr16	57077587	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=199,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr16	57085475	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=137,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:8,0:4,3:8,4,3,0
chr16	57085547	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=148,104;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,7:3,3:4,4,5,5
chr16	57111825	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=161,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,5:4,1:5,2,2,4
chr16	57113229	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr16	57114962	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=156,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:2,1:9,1:4,7,1,1
chr16	57114982	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=170,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:2,2:9,2:5,7,1,3
chr16	57115604	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:0|1:57115604_C_T:57115604:1,6,0,2
chr16	57115614	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=169,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.273:9:3,0:4,2:1|0:57115604_C_T:57115604:0,7,1,1
chr16	57115615	.	G	GTCCTTCAGCCAGGAGCCAGGCCCCCAAA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=169,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.273:9:3,0:4,2:1|0:57115604_C_T:57115604:0,7,1,1
chr16	57116287	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr16	57116514	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=173,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr16	57144920	.	TG	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=188,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr16	57159731	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=232,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:6,1,2,0
chr16	57171233	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,3:0,1,1,4
chr16	57238803	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=155,233;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.251:30:12,0:10,7:11,12,0,7
chr16	57242093	.	T	TTTTTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=187,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTTG;STR;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr16	57246810	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=192,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:4,1,3,0
chr16	57250002	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,17;MFRL=249,141;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.657:7:1,0:1,0:0,2,5,0
chr16	57255363	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=277,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:0,8:3,4:0,3,3,9
chr16	57272961	.	ACT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=162,262;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr16	57283689	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.163:35:17,5:12,0:17,13,5,0
chr16	57447951	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=206,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:1,3,0,2
chr16	57466473	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=155,91;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,8:0.204:42:16,0:18,8:0|1:57466473_C_T:57466473:16,18,1,7
chr16	57466486	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=167,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,7:0.195:39:13,0:18,7:0|1:57466473_C_T:57466473:13,19,0,7
chr16	57470752	.	TGGGC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=199,235;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr16	57481305	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr16	57481408	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0,4,0,1
chr16	57486613	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=261,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr16	57496841	.	TGCCCCCCTGCACCAGGGCTTTAGCTTTGGGA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=214,266;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:4,1:5,1:14,3,1,1
chr16	57497004	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:9,0:8,10:7,10,0,10
chr16	57499841	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=201,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:1,6:1,4:2,0,8,2
chr16	57503205	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=158,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,1:6,1:0|1:57503205_G_A:57503205:5,6,1,1
chr16	57503213	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=207,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,8:0.753:10:1,3:1,5:1|0:57503205_G_A:57503205:1,1,3,5
chr16	57503773	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr16	57507777	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,241;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:0,2:1,1:0,1,1,3
chr16	57508960	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=137,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:2,4:2,1:2,2,1,5
chr16	57508991	.	AG	CC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.358:9:4,0:2,1:0,6,3,0
chr16	57509164	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	57509572	.	ATCTC	A,ATCTCTCTC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25,15;MFRL=0,213,237;MMQ=60,60,40;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,20;RU=TC;STR;TLOD=3.02,10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,3:0.220,0.648:4:0,1,0:0,0,0:0,0,0,4
chr16	57509956	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=254,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr16	57624762	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=193,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:0,5,0,5
chr16	57625470	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:0,5:2,7:1,1,10,2
chr16	57687314	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr16	57689230	.	G	GGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=GT;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	57689385	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=114,141;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:3,6,1,1
chr16	57689765	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,5:5,0:5,2,5,0
chr16	57690606	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=204,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,5:1,3:1,1,0,8
chr16	57691265	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=240,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.664:16:3,3:2,7:2,3,6,5
chr16	57695510	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=211,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,2:0,3:4,0,5,0
chr16	57695568	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=138,2844184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:0,2:3,0:3,1,2,0
chr16	57697532	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	57707333	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,21;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,2:7,0:5,8,1,1
chr16	57710077	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:3,2:5,0:5,3,0,3
chr16	57710093	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:2,4:1,4:0,3,5,4
chr16	57710258	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=186,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr16	57713685	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=194,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.236:18:7,2:7,1:9,5,1,3
chr16	57713834	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=214,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:1,9,0,2
chr16	57719692	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=199,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,5:6,1:5,5,2,4
chr16	57733955	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	57738907	.	G	GAT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,135;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:2,0:11,3:6,7,0,3
chr16	57739041	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=209,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr16	57741296	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=206,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,2:0,2:0|1:57741296_C_T:57741296:1,0,5,1
chr16	57741306	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=206,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0|1:57741296_C_T:57741296:1,0,6,1
chr16	57741346	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=203,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr16	57741612	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=221,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:1,4,2,4
chr16	57778488	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=337,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:1,5:0,1:0,1,0,6
chr16	57794888	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=216,231;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,3,3
chr16	57803911	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	57805048	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	57805078	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr16	57806030	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr16	57918035	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,1:4,2:3,6,2,1
chr16	57921752	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:6,3:8,4:11,3,7,1
chr16	57937895	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=104,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:0,1:4,1:2,2,0,2
chr16	57946973	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr16	57949224	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=169,197;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,2:7,1:7,9,2,1
chr16	57949251	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,6:0,2:0,1,6,3
chr16	57950178	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr16	57951421	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=189,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:4,2:0,10:0,4,4,9
chr16	57953010	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=162,285;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:9,13,1,1
chr16	57954268	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,2:1,4:1,0,4,3
chr16	57974240	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:4,3:0,5:1,3,1,7
chr16	57984483	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr16	57991317	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr16	57998345	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr16	58012003	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=273,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr16	58019065	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0|1:58019065_TG_T:58019065:0,0,7,1
chr16	58019070	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,4:0|1:58019065_TG_T:58019065:0,0,7,1
chr16	58019253	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,6,2
chr16	58019396	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,7:0,0,6,13
chr16	58021275	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=140,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.144:22:6,2:9,0:5,14,3,0
chr16	58021395	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr16	58030401	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	58036347	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr16	58051178	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=282,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,6:1,1:1,0,5,2
chr16	58076252	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=188,63;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.127:21:5,0:14,2:12,7,1,1
chr16	58150111	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:58150111_T_C:58150111:0,3,0,1
chr16	58150117	.	CA	TC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:58150111_T_C:58150111:0,2,0,1
chr16	58150121	.	A	ACTGCACCTTGTATG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,27;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:58150111_T_C:58150111:0,2,0,1
chr16	58162890	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	58200464	.	ACT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=192,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.410:9:2,2:2,1:4,1,3,1
chr16	58201759	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr16	58292214	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,1,1
chr16	58301360	.	CTT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=133,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:7,1:12,2:11,9,0,3
chr16	58313578	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,34;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.661:3:0,1:0,1:0,1,2,0
chr16	58318721	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=188,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr16	58538662	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=242,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr16	58540595	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr16	58545550	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=157,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,0:4,3:0,10,0,3
chr16	58550300	.	A	AAC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=167,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:5,2,5,1
chr16	58557209	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=184,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr16	58557342	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:12,2:10,2:12,11,2,3
chr16	58558989	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=373,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr16	58573901	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:1,5,0,3
chr16	58575489	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,4:8,1:7,7,2,3
chr16	58577315	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.612:18:1,5:3,2:4,3,7,4
chr16	58580213	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:4,4,2,2
chr16	58585730	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=162,71;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.378:24:5,8:10,0:3,12,0,9
chr16	58589112	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=136,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:3,2,2,0
chr16	58592278	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=190,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:4,1,5,0
chr16	58594340	.	ATT	A,AT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=16,28,26;MFRL=153,218,149;MMQ=60,60,60;MPOS=25,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.37,3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.334,0.403:5:0,0,1:0,2,1:0,1,0,4
chr16	58594354	.	TAAGA	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=188,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.283:5:1,1:3,0:0|1:58594354_TAAGA_T:58594354:0,4,0,1
chr16	58594360	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=188,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:58594354_TAAGA_T:58594354:0,4,0,1
chr16	58620995	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=194,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr16	58622854	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.495:8:0,1:4,2:0,4,1,3
chr16	58703966	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=313,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:2,0,1,5
chr16	58704861	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=93,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr16	58705070	.	TCGC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=136,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CGC;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:5,2:7,5,0,2
chr16	58709824	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=182,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,0:1,1,2,2
chr16	58714092	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=190,261;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:58714092_G_C:58714092:0,2,0,1
chr16	58714093	.	G	GCAAACATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=190,261;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:58714092_G_C:58714092:0,2,0,1
chr16	58757668	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=167,173;MMQ=60,42;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:6,1,5,2
chr16	58757683	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=168,173;MMQ=60,42;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,4:4,6:6,3,6,4
chr16	61687440	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=185,91;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,3:6,0:10,0,2,1
chr16	61688006	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,0:11,2:5,10,0,2
chr16	61761039	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=166,95;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,3:8,0:11,4,2,1
chr16	65015908	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=152,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:5,2,5,0
chr16	65016285	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	65022114	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=127,180;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:2,8:5,9:4,3,11,6
chr16	65025658	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=104,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:2,10:4,8:3,3,10,8
chr16	65025849	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=125,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:2,2,2,1
chr16	66420750	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=187,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:6,2:12,0:10,8,0,2
chr16	66424235	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=221,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:2,1,3,0
chr16	66432303	.	GACCACCCC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=234,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACCACCCC;STR;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:1,1:1,3:3,0,4,0
chr16	66436460	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,310;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	66437131	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=215,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:0,2:3,1:0,3,0,4
chr16	66511627	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,0:6,2:3,4,0,2
chr16	66563005	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:1,10,0,2
chr16	66583028	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=303,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr16	66586759	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=184,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.280:16:4,1:7,3:0,12,0,4
chr16	66597143	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=171,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.330:22:6,4:9,3:6,9,3,4
chr16	66599773	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=216,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:4,0:10,5:12,2,3,2
chr16	66613841	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr16	66614097	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=208,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:7,2:1,3:3,5,3,2
chr16	66646591	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=213,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,4:1,2:0,3,1,5
chr16	66655964	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.393:31:7,6:12,6:13,6,8,4
chr16	66656147	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=127,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:9,7:9,4:11,7,4,7
chr16	66657471	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=197,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,4:0,2:0,5,0,6
chr16	66759682	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,0:0,8:0,0,9,0
chr16	66762847	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	66769909	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr16	66776562	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:5,9,2,0
chr16	66776657	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr16	66789125	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	66793226	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr16	66821984	.	ACT	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=194,221;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:2,0:0|1:66821984_ACT_A:66821984:10,2,2,0
chr16	66821988	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=191,221;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:66821984_ACT_A:66821984:8,2,2,0
chr16	66821990	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=191,221;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:66821984_ACT_A:66821984:8,2,2,0
chr16	66821996	.	ACTC	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=190,221;MMQ=60,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:3,0:0|1:66821984_ACT_A:66821984:10,3,2,0
chr16	66822000	.	AAAT	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=176,221;MMQ=60,27;MPOS=-1073741813;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:4,0:0|1:66821984_ACT_A:66821984:9,3,2,0
chr16	66822298	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr16	66837048	.	T	TACTGGCCTACCGAGAGACAAGACATAGCATATGAATAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=181,51;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:2,6,1,1
chr16	66851224	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	66861966	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr16	66878511	.	T	TGAATGGCTAATCCCACCCTATCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:66878511_T_TGAATGGCTAATCCCACCCTATCC:66878511:0,1,0,1
chr16	66878514	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:66878511_T_TGAATGGCTAATCCCACCCTATCC:66878511:0,1,0,1
chr16	66885403	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=172,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:9,0:11,3:0|1:66885403_C_T:66885403:13,8,2,1
chr16	66885407	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=172,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:8,0:12,3:0|1:66885403_C_T:66885403:13,8,2,1
chr16	66885409	.	G	GCAAAGCCATTCAACAAGTCTCTA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=172,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:7,0:13,1:0|1:66885403_C_T:66885403:13,8,2,1
chr16	66885615	.	A	ACCTGGCTAATTTTT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:10,2:15,0:14,13,0,2
chr16	66885652	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,12:0,0,7,10
chr16	66886559	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr16	66918097	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=20,16;MFRL=179,161;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:2,0:1,1:6,0,3,0
chr16	66918109	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=17,15;MFRL=186,164;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,0:1,0:7,0,4,0
chr16	66918112	.	A	AAAAAAAATTTTTAATTTTTTTG	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=182,164;MMQ=60,38;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:2,2:9,0,2,0
chr16	66918113	.	C	A,T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=13,15,25;MFRL=186,175,164;MMQ=60,60,38;MPOS=26,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.61,5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,2:0.324,0.214:10:1,0,0:1,1,2:5,0,5,0
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chr16	67174539	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=155,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:0|1:67174539_G_A:67174539:2,5,1,1
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chr16	67234971	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=201,146;MMQ=50,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:67234952_C_CTT:67234952:0,2,0,1
chr16	67237339	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0|1:67237339_T_TG:67237339:0,0,2,0
chr16	67237343	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:67237343_A_C:67237343:0,0,2,0
chr16	67237347	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,19;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:67237343_A_C:67237343:0,0,2,0
chr16	67237353	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=93,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:0,1:0|1:67237339_T_TG:67237339:4,1,2,0
chr16	67237356	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=23,12;MFRL=93,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,0:0,0:0|1:67237339_T_TG:67237339:4,1,2,0
chr16	67271533	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=152,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.307:13:4,0:4,2:8,1,0,4
chr16	67286352	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=191,127;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:1,1:3,0,1,0
chr16	67286361	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=173,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr16	67289749	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=138,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:8,1:11,4,2,0
chr16	67298362	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,2:8,1:8,10,0,3
chr16	67315128	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:1,1:3,2:1,3,2,1
chr16	67315165	.	C	CTTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,35;MFRL=167,167;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:67315165_C_CTTT:67315165:0,3,0,1
chr16	67315166	.	G	GAGTCATGGTCT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=167,167;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:67315165_C_CTTT:67315165:0,3,0,1
chr16	67315168	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=167,167;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:67315165_C_CTTT:67315165:0,3,0,1
chr16	67315187	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=167,168;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	67316600	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=157,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,7:4,3:3,3,5,5
chr16	67320712	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=92,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,3:9,0:7,7,2,1
chr16	67321960	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=206,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:1,2,0,3
chr16	67324957	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr16	67325828	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=291,191;MMQ=55,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr16	67325833	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=357,180;MMQ=50,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr16	67325836	.	GCACA	TCACA,G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,27,32;MFRL=357,225,135;MMQ=50,60,39;MPOS=1,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,0:1,0,1:0,1,0,2
chr16	67381494	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,9025552;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,0:2,2:2,3,0,2
chr16	67384060	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.477:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr16	67469689	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=106,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,0:7,3:4,10,1,2
chr16	67517144	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=238,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:5,1:7,1:1,12,2,0
chr16	67517356	.	CCT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	67572490	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=252,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:1,1,2,1
chr16	67576026	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=191,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:6,5,1,1
chr16	67645008	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=193,51;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,2:6,0:7,7,2,0
chr16	67671804	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,1:7,1:1,8,0,2
chr16	67679879	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=185,287;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:7,3,1,1
chr16	67680956	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,0:1,2:2,1,1,1
chr16	67681905	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:2,1:2,2,1,1
chr16	67682234	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,428;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	67683626	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,1,1
chr16	67686914	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr16	67687998	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,25;MFRL=234,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:67687998_G_T:67687998:2,0,1,0
chr16	67688000	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=15,10;MFRL=234,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.433:3:0,0:0,0:0|1:67687998_G_T:67687998:2,0,1,0
chr16	67688004	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=15,13;MFRL=264,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.432:3:0,0:0,0:0|1:67687998_G_T:67687998:2,0,1,0
chr16	67688008	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,15;MFRL=264,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:67687998_G_T:67687998:2,0,1,0
chr16	67688010	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=248,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:67687998_G_T:67687998:1,0,1,0
chr16	67688560	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=134,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,2:9,1:9,7,1,2
chr16	67691477	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=181,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:10,2:2,4:5,7,2,4
chr16	67691645	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=143,291;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,2:8,2:8,8,2,2
chr16	67691668	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:2,8:3,7:2,3,7,8
chr16	67695811	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.236:18:9,3:5,0:11,3,4,0
chr16	67805993	.	CAA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=118,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.448:5:1,0:1,1:1,2,0,2
chr16	67839513	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=188,108;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,0:5,4:0,10,0,4
chr16	67861134	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,6:3,2:4,1,3,5
chr16	67863451	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=138,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,5:1,1:0,3,3,3
chr16	67863825	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=148,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,0:12,2:0|1:67863825_A_T:67863825:9,12,1,1
chr16	67863830	.	C	CCACCTGAAAGCTTCA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=158,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:9,2:0|1:67863825_A_T:67863825:8,12,1,1
chr16	67876823	.	ACAG	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=191,162;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CAG;STR;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:3,3:4,4,1,3
chr16	67877904	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:13,2:17,0:15,15,2,0
chr16	67899189	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=209,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr16	67910315	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=217,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr16	67914052	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=153,70;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:2,8,2,0
chr16	67919601	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,2,0
chr16	67919606	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,14;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,0:0|1:67919606_A_C:67919606:1,6,2,0
chr16	67919612	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:3,1:0|1:67919606_A_C:67919606:2,7,2,0
chr16	67919617	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,0:0|1:67919606_A_C:67919606:3,7,2,0
chr16	67919619	.	TT	CC	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,0:3,1:3,7,2,0
chr16	67964441	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=177,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:13,1:6,1:8,11,0,2
chr16	67969449	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=179,106;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:4,6:10,0:5,9,6,0
chr16	67969621	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=188,219;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,0:1,1:0,4,0,2
chr16	67979422	.	C	CATGCCCCT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=202,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:3,9,1,1
chr16	67979423	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=209,160;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,2:6,1:3,8,1,2
chr16	67984434	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=203,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,0:6,2:5,6,0,2
chr16	68011576	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=111,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.295:25:3,2:15,5:7,11,4,3
chr16	68012230	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=220,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,1:11,1:6,9,1,1
chr16	68013471	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=204,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:6,0,5,0
chr16	68021498	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:10,3,0,2
chr16	68024995	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=133,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:5,2:12,3:11,6,5,0
chr16	68055769	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:11,2:0|1:68055769_C_T:68055769:9,12,1,1
chr16	68055771	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=144,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:13,2:0|1:68055769_C_T:68055769:9,12,1,1
chr16	68071938	.	TA	GG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=188,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:4,0:9,5,2,0
chr16	68071959	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=143,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,2:5,0:10,6,2,0
chr16	68088425	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=160,70;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:14,4:15,0:14,15,3,1
chr16	68090402	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr16	68119555	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=142,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:8,2:3,3:9,2,5,0
chr16	68155860	.	GTT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=152,255;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr16	68224582	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=171,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr16	68255166	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=127,119;MMQ=60,57;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:9,4:12,0:12,9,4,0
chr16	68255192	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=105,119;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.236:18:3,3:11,0:6,8,4,0
chr16	68264401	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=116,46;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,0:10,2:0|1:68264401_G_C:68264401:5,16,1,1
chr16	68264406	.	G	GCGTT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=112,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:7,2:0|1:68264401_G_C:68264401:5,13,1,1
chr16	68264409	.	A	AGGCT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=110,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:7,2:0|1:68264401_G_C:68264401:5,12,1,1
chr16	68279486	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	68288983	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=140,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:3,2:3,4:1,6,2,4
chr16	68289313	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=163,237;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,1:7,2:1,9,0,3
chr16	68289801	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=160,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:9,2:5,0:8,6,0,2
chr16	68324210	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=169,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:6,0,4,0
chr16	68335392	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=184,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:0,1,0,6
chr16	68373134	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=174,315;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	68373954	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	68382178	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=110,282;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.277:9:3,0:4,2:6,1,2,0
chr16	68387341	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=180,312;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:3,0:1,2:5,0,2,0
chr16	68387373	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=274,235;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,5,1
chr16	68387496	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,7,9
chr16	68391189	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	68395061	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=185,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr16	68395675	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:3,2:3,1:0,7,2,1
chr16	68397464	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=211,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:3,0:3,1:4,4,0,2
chr16	68397530	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr16	68398750	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:9,6,1,1
chr16	68398862	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,6:3,3:6,3,4,5
chr16	68711999	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=223,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:2,7:0,10:2,0,12,5
chr16	68712217	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr16	68716179	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,2:0,8:0,0,8,4
chr16	68718750	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,4,10
chr16	68721340	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr16	68721470	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=199,159;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:0,8:1,10:1,0,10,8
chr16	68721533	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=134,145;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:1,8:0,10:1,0,10,8
chr16	68729068	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.455:18:4,8:5,0:10,0,8,0
chr16	68729070	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,9:5,0:9,0,9,0
chr16	68729112	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr16	68729901	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=210,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:68729901_G_T:68729901:0,2,0,1
chr16	68729907	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=210,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:68729901_G_T:68729901:0,2,0,1
chr16	68729910	.	T	TTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=210,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:68729901_G_T:68729901:0,2,0,1
chr16	68771418	.	C	CGCCCCAGCCCCGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	68862165	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=129,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:9,3:15,0:11,14,0,3
chr16	68934314	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.325:22:12,4:3,2:10,5,7,0
chr16	69008037	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=150,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:8,1:6,6:9,5,4,3
chr16	69377299	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=191,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,3:7,0:6,4,3,0
chr16	69377553	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,4,9
chr16	69395434	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=110,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,4:2,3:2,2,2,5
chr16	69400916	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=174,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,0:9,2:0|1:69400916_G_T:69400916:9,9,1,1
chr16	69400921	.	C	CTTTTTCTTTTTTTT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=174,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:69400916_G_T:69400916:9,9,1,1
chr16	69400922	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=174,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,1:0|1:69400916_G_T:69400916:9,9,1,1
chr16	69458779	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:8,3:1,7:1,8,2,8
chr16	69492973	.	AT	A,ATT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33,29;MFRL=256,157,91;MMQ=60,60,60;MPOS=26,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=3.73,13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,8:0.227,0.524:14:3,3,2:0,0,4:2,1,6,5
chr16	69681341	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=197,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:11,0:4,3:6,9,0,3
chr16	69689671	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,234;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:4,5,2,0
chr16	69704122	.	C	CTG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=199,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:8,7:2,2:6,4,5,5
chr16	69704204	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.382:16:6,3:4,3:1,9,1,5
chr16	69711311	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	69728220	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=377,131;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:69728220_CA_TG:69728220:0,2,0,1
chr16	69728231	.	ACCTGC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=457,131;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:69728220_CA_TG:69728220:0,1,0,1
chr16	69728237	.	AC	A,GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27,35;MFRL=0,131,457;MMQ=60,40,60;MPOS=12,29;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,1,1:0,0,0,2
chr16	69752464	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,3,5
chr16	69782746	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=243,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr16	69783587	.	G	GTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=186,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,14;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr16	69786092	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=249,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:2,7:3,6:4,1,9,4
chr16	69873992	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=151,238;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,3:4,1:4,1,3,1
chr16	69905668	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,7:1,1:4,1,6,2
chr16	69942608	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:0,4:4,3:3,1,5,2
chr16	69951847	.	C	CCT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,3:0,8:0,1,0,11
chr16	69959223	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=200,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,4:2,3:2,0,7,0
chr16	69965024	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=124,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:2,1:3,8:3,2,8,1
chr16	69965592	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:0,6,3,5
chr16	69967093	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=144,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,4:4,6:0,9,1,9
chr16	69969917	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=235,65;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:5,1:3,6,1,1
chr16	69973655	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=261,257;MMQ=60,60;MPOS=35;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr16	69996985	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=134,119;MMQ=31,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,2:7,1:10,5,3,0
chr16	70162581	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=204,158;MMQ=57,59;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:10,0,2,0
chr16	70164248	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=185,257;MMQ=40,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:10,0,2,0
chr16	70170004	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,10;MFRL=0,142;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,1:0|1:70170004_C_A:70170004:0,0,3,0
chr16	70170016	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:70170004_C_A:70170004:0,0,3,0
chr16	70176321	.	CTT	C,CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,23,23;MFRL=211,237,192;MMQ=60,57,60;MPOS=28,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.34,4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,3:0.198,0.212:16:2,1,2:4,1,1:2,8,1,5
chr16	70177648	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=204,196;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:0,3,0,5
chr16	70182325	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=180,209;MMQ=52,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:7,3:3,1:9,1,4,0
chr16	70182489	.	ACTTCCCTTCC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=218,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=CTTCC;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:0,0:1,6,0,2
chr16	70187270	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,4:9,0:11,7,4,0
chr16	70190360	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=146,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,1:8,1:10,4,2,0
chr16	70211324	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,218;MMQ=27,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:2,3,0,2
chr16	70288652	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=147,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:4,5,1,1
chr16	70292798	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=170,255;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:2,0,4,0
chr16	70299358	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=202,82;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,0:6,3:6,1,0,3
chr16	70363125	.	CAAAA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=188,211;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.305:5:0,1:0,0:2,2,1,0
chr16	70363325	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=149,159;MMQ=27,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:2,5,0,3
chr16	70381020	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=188,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr16	70400857	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=187,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr16	70405981	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,192;MMQ=50,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:0,10,0,2
chr16	70428993	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,2:8,0:5,13,1,1
chr16	70504305	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:3,3,0,7
chr16	70513384	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=188,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,1:1,1:3,0,3,0
chr16	70514828	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=204,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr16	70515600	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.542:13:4,5:1,2:4,2,5,2
chr16	70530359	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=194,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:0,5,1,2
chr16	70531366	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=264,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr16	70531754	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=200,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr16	70542448	.	G	GTTGTGAGCATTAGGGAGGACGGAAAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=211,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	70551522	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,15;MFRL=137,203;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,0:3,3,2,0
chr16	70557530	.	G	GTT,GTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,14,32;MFRL=229,224,207;MMQ=60,60,60;MPOS=16,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.01,8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,4:0.239,0.361:10:1,0,3:3,0,1:0,4,0,6
chr16	70589206	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=190,165;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0,9,0,2
chr16	70595514	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=203,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.309:17:5,2:7,3:11,1,5,0
chr16	70599328	.	G	GTGT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:14,0:26,2:19,22,0,2
chr16	70601254	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=327,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:1,0,5,1
chr16	70602491	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=184,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr16	70680744	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=241,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:2,3:1,0:4,0,3,0
chr16	70693872	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=101,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,1:0,2:1,0,3,1
chr16	70711707	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=177,229;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.232:14:8,1:3,1:7,4,3,0
chr16	70715001	.	TGCATGCTCCATCCAGACTTGG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=188,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:70715001_TGCATGCTCCATCCAGACTTGG_T:70715001:0,2,0,1
chr16	70715029	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=188,133;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:70715001_TGCATGCTCCATCCAGACTTGG_T:70715001:0,2,0,1
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chr16	70732761	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=191,301;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:0,8,0,2
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chr16	70796535	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=229,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.747:10:1,5:1,2:0|1:70796515_G_A:70796515:1,1,3,5
chr16	70816893	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=138,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,6:1,3:0,2,6,3
chr16	70819580	.	TGAG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=194,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAG;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,2:7,0:12,2,2,0
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chr16	70862144	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,329;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:70862141_A_C:70862141:0,0,2,0
chr16	70873884	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=17,17;MFRL=252,168;MMQ=47,45;MPOS=-1073741820;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:2,0,2,0
chr16	70873898	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,12;MFRL=180,162;MMQ=60,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr16	70883570	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=199,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.469:30:8,7:8,7:13,3,11,3
chr16	70883943	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,1:1,3:1,6,0,4
chr16	70884524	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,29:0.566:51:9,18:13,11:0|1:70884524_C_G:70884524:6,16,13,16
chr16	70884534	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=144,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=89.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,23:0.533:43:10,14:9,8:0|1:70884524_C_G:70884524:5,15,11,12
chr16	70884647	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=98,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:1,1,0,6
chr16	70889147	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=123,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:8,6:9,4:8,9,5,5
chr16	70891640	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=135,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.154:37:16,2:14,3:17,15,4,1
chr16	70891778	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.503:36:7,9:10,9:7,11,6,12
chr16	70891790	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=181,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.224:29:12,2:10,4:7,16,3,3
chr16	70893911	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=196,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,6:1,2:3,1,8,0
chr16	70893924	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:10,4:6,1:13,3,4,1
chr16	70894087	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:10,8:11,1:11,10,3,6
chr16	70894123	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=192,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=78.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,26:0.643:40:9,12:5,14:3,11,5,21
chr16	70894145	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=158,184;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.368:28:12,0:5,10:2,16,0,10
chr16	70894880	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=179,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,1:7,2:2,10,0,3
chr16	70896015	.	GA	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:7,10:4,4:6,5,9,5
chr16	70896033	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:12,4:6,1:12,6,4,1
chr16	70896975	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.368:36:10,6:13,7:13,10,8,5
chr16	70897039	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=59.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,22:0.550:40:11,10:6,12:7,11,11,11
chr16	70900048	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,7:7,5:6,6,9,3
chr16	70900332	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=267,293;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr16	70902541	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=153,220;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:16,3:13,0:11,20,2,1
chr16	70902559	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=124,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,16:0.512:31:7,10:7,5:0|1:70902559_C_T:70902559:3,12,7,9
chr16	70902568	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=141,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,15:0.471:32:7,10:9,5:0|1:70902559_C_T:70902559:4,13,6,9
chr16	70902683	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:6,2:2,0:3,5,1,1
chr16	70905876	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,2:11,1:19,1,3,0
chr16	70905912	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=207,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:5,5:3,7:6,2,10,2
chr16	70908118	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=294,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	70908239	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=205,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:9,2,2,0
chr16	70908406	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=194,261;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:8,0:16,7:10,14,0,7
chr16	70908684	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=204,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:5,3:7,7:8,4,4,6
chr16	70908736	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,3:7,10:5,8,6,7
chr16	70913130	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=206,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,0:5,3:6,0,3,0
chr16	70913386	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.636:31:5,7:6,13:5,6,9,11
chr16	70913467	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=191,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:6,11:6,7:7,5,10,8
chr16	70913501	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.471:30:10,8:5,6:6,10,5,9
chr16	70916531	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=178,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,5:2,1:6,0,6,0
chr16	70916556	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=230,198;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,3:6,0:10,2,3,0
chr16	70916816	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=175,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:15,1:15,3:7,23,2,2
chr16	70916819	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:7,9:10,7:4,13,4,12
chr16	70916849	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=125,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.645:20:2,7:4,6:1,6,2,11
chr16	70916896	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr16	70917753	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=190,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:3,2:9,4:11,1,5,1
chr16	70917785	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=185,231;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:6,2:7,6:7,6,4,4
chr16	70917855	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=177,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=45.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.458:33:9,7:9,8:5,13,7,8
chr16	70918087	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=128,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,1:3,1:2,11,0,2
chr16	70926214	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,3:4,6:5,1,8,1
chr16	70926334	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.436:37:9,7:12,9:10,11,7,9
chr16	70926445	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=130,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.686:17:1,5:4,7:1,4,3,9
chr16	70926472	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,2:8,3:0,13,0,5
chr16	70928259	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=258,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,6:2,2:6,0,8,0
chr16	70928307	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.515:29:7,9:7,5:11,3,12,3
chr16	70928314	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=156,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.134:28:12,1:11,2:20,5,2,1
chr16	70930002	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=203,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:1,4:7,6:4,4,3,7
chr16	70930060	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr16	70934994	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=152,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,2:7,6:3,8,4,4
chr16	70935158	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,2:0,3:0,4,0,5
chr16	70937482	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=149,98;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:9,1,2,0
chr16	70937582	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:9,2:10,3:11,8,4,1
chr16	70937994	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:4,7:5,8:5,4,3,12
chr16	70942103	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=215,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:5,0,5,0
chr16	70942432	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:2,3:1,6:2,1,5,4
chr16	70942460	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,0:3,6:2,3,3,3
chr16	70942688	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.500:36:10,12:8,6:5,13,7,11
chr16	70942816	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=278,252;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr16	70952161	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=177,74;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.108:43:21,2:18,2:22,17,2,2
chr16	70952392	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=171,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:7,3:4,7:0|1:70952392_C_G:70952392:1,10,2,8
chr16	70952401	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=190,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,7:0.421:17:4,4:6,3:1|0:70952392_C_G:70952392:0,10,1,6
chr16	70954434	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=261,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:0|1:70954434_C_T:70954434:5,1,6,0
chr16	70954452	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=23,33;MFRL=76,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,4:3,4:0|1:70954434_C_T:70954434:4,1,9,0
chr16	70954513	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=77,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:1,8:6,4:5,2,5,7
chr16	70954571	.	CT	TA	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:6,6:5,11:7,4,8,9
chr16	70954606	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=35,26;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:3,4:9,10:7,5,10,4
chr16	70954691	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,1:8,1:5,11,2,0
chr16	70954703	.	GGCGCTCCTTCTCCGT	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=193,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:3,5:5,3:4,5,6,2
chr16	70954774	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:5,6:3,1:7,2,5,2
chr16	70954809	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=186,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.401:25:7,4:8,5:11,4,1,9
chr16	70954915	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,13:0,0,14,11
chr16	70954945	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=163,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:8,3:6,8:5,9,8,3
chr16	70955192	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=280,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr16	70970096	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=278,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:1,3:4,5:0,6,0,8
chr16	70972595	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=187,64;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.483:23:7,4:4,7:8,4,4,7
chr16	70972620	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.461:22:5,4:5,5:4,8,5,5
chr16	70972701	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=228,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,5:3,1:2,6,0,6
chr16	70972758	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=214,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,3:1,1:1,3,0,4
chr16	70975565	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.230:37:10,5:19,3:17,12,6,2
chr16	70977695	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=223,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:8,0,4,0
chr16	70986480	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,22:0.590:37:10,12:5,10:11,4,10,12
chr16	70986605	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:1,5,0,5
chr16	70989299	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=168,261;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,4:6,6:7,2,8,2
chr16	70989335	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=171,206;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.481:23:6,5:6,6:8,4,5,6
chr16	70993775	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=190,251;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:0,10,0,2
chr16	70995768	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=139,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr16	70995845	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=141,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:10,4:4,8:11,3,9,3
chr16	70996115	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=211,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.391:15:7,1:1,5:1,8,0,6
chr16	70998603	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=245,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,4:7,2:6,3,4,2
chr16	70998808	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.320:26:6,2:11,6:6,12,2,6
chr16	71004385	.	A	AAAGGCCAGGAGGATGTTATTGCATGCAGAGAAAAGAGCATGAGTACATAGCAGGGTCCAGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=183,128;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.551:7:0,1:2,0:4,0,3,0
chr16	71004695	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=171,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:4,5:1,9,0,9
chr16	71004731	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=151,231;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chr16	71007657	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=212,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,5:6,1:10,2,5,1
chr16	71007809	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,240;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,14:0.306:47:14,7:19,7:17,16,7,7
chr16	71008169	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=192,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.605:31:7,10:4,8:5,7,6,13
chr16	71008301	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=204,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:1,4,3,2
chr16	71008389	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=183,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:2,5:3,7:5,0,8,4
chr16	71008417	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:7,5:7,9:12,2,12,2
chr16	71008647	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.318:14:4,2:6,2:1,9,0,4
chr16	71012789	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,1:7,2:12,2,3,0
chr16	71012930	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.162:41:21,0:14,6:18,17,1,5
chr16	71015290	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=136,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=45.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:6,4:7,10:7,6,7,7
chr16	71015302	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=164,66;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.206:32:9,6:17,0:13,13,5,1
chr16	71015311	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=129,33;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:16,2:16,0:18,14,1,1
chr16	71015329	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=181,208;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.070:40:26,0:11,2:17,21,0,2
chr16	71015482	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.429:21:4,5:8,3:6,6,3,6
chr16	71015555	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr16	71019064	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=127,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:6,5:7,0:9,4,4,1
chr16	71022190	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=214,294;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:5,1:9,2,2,0
chr16	71025385	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=209,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:0,11,0,2
chr16	71025394	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=198,236;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:0,5,0,6
chr16	71025948	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=42.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:9,10:5,5:13,1,14,1
chr16	71026076	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.432:42:12,8:12,10:14,10,5,13
chr16	71026098	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=129,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,10:0.225:47:16,4:20,6:15,22,3,7
chr16	71026137	.	TA	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=105,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:7,5:9,4:4,12,1,9
chr16	71054061	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=176,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.346:21:1,5:10,1:8,6,3,4
chr16	71054090	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=131,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:15,5:15,0:16,14,5,0
chr16	71054178	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:8,8:7,7:6,9,8,7
chr16	71061495	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=188,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:4,7:8,5:7,6,10,2
chr16	71065560	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=207,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.341:15:5,2:5,2:9,1,4,1
chr16	71065868	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,4:1,3:0,4,0,7
chr16	71095987	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=237,292;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:4,0,2,1
chr16	71096118	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=134,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.094:29:9,0:18,2:0|1:71096118_C_T:71096118:20,7,0,2
chr16	71096125	.	C	CTTTCTCTCTGGCGGAACTCAGGTATG	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,39;MFRL=160,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:10,0:17,2:0|1:71096118_C_T:71096118:19,10,0,2
chr16	71096248	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:3,6:6,7:2,7,5,8
chr16	71096309	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:2,3:2,5:1,3,0,9
chr16	71096324	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=190,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:0,3,1,7
chr16	71098649	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=129,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:4,2:14,9:9,9,5,6
chr16	71098800	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=227,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,2:3,3:0,3,0,5
chr16	71098817	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=259,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,3:4,4:0,4,0,7
chr16	71101200	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=219,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,8:5,4:7,4,8,4
chr16	71101270	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=214,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,24:0.658:36:7,8:5,16:4,8,9,15
chr16	71103084	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=225,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:5,0,5,0
chr16	71103114	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=210,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.632:14:3,2:1,6:5,0,9,0
chr16	71103269	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.474:38:9,10:11,8:7,13,11,7
chr16	71103393	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=205,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,3:7,2:6,8,1,4
chr16	71103419	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=189,238;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,4:2,5:3,6,3,6
chr16	71113780	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,5:6,5:7,2,9,1
chr16	71122408	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=186,178;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,3:1,6:5,0,9,0
chr16	71127652	.	TATAAG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=141,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.723:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr16	71127700	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:5,6:0,3:2,3,7,2
chr16	71127850	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,237;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.737:13:2,6:1,3:2,1,3,7
chr16	71149536	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=168,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,1:4,5:8,2,6,0
chr16	71149782	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=189,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr16	71163452	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=197,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:10,0,3,1
chr16	71163579	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=220,159;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,22:0.620:35:4,8:9,13:5,8,13,9
chr16	71163606	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=203,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.297:35:9,3:16,7:12,13,4,6
chr16	71170981	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr16	71186740	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=204,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr16	71196410	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,4:6,6:10,1,5,5
chr16	71218926	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=62,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,1,4
chr16	71220755	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=143,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:9,3:15,1:11,13,3,1
chr16	71220880	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=220,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr16	71417783	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=152,313;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr16	71418367	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr16	71418404	.	AAAACACAC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=124,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr16	71483246	.	C	CA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=150,206;MMQ=60,51;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.289:29:9,0:12,8:8,13,0,8
chr16	71509990	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:8,1:4,2:6,6,1,2
chr16	71571282	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:5,4,2,0
chr16	71572374	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,0:10,3:8,9,0,3
chr16	71607384	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=111,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,1:8,3:5,5,2,2
chr16	71668800	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=264,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,0:1,2:0,1,0,3
chr16	71674310	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,3:9,0:8,6,0,3
chr16	71683894	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=163,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:71683894_G_C:71683894:1,5,1,1
chr16	71683896	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=163,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:71683894_G_C:71683894:1,5,1,1
chr16	71683897	.	TGTACAG	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=163,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:71683894_G_C:71683894:1,5,1,1
chr16	71697752	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=217,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr16	71701248	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=189,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,4:0,0:0,2,3,1
chr16	71718330	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:4,9:2,0:6,1,9,0
chr16	71718340	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=139,93;MMQ=60,53;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,2:3,0:0|1:71718340_A_T:71718340:15,2,2,0
chr16	71718346	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=139,93;MMQ=60,53;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:14,2:5,0:0|1:71718340_A_T:71718340:15,4,2,0
chr16	71718366	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=248,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.830:15:1,6:1,6:2,0,5,8
chr16	71724369	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=215,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:4,0,2,1
chr16	71736702	.	G	GTATTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATTTT;STR;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.887:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr16	71768500	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr16	71772795	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr16	71773284	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=210,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.718:12:3,6:0,3:0,3,0,9
chr16	71780485	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=242,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:1,2:3,3:3,1,4,1
chr16	71780599	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr16	71798630	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:3,0:14,2:8,9,0,2
chr16	71804956	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr16	71805160	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr16	71823348	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=160,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,2:8,0:8,12,1,1
chr16	71883597	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=188,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:8,12:3,0:8,3,12,0
chr16	71888738	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,153;MMQ=60,55;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,2:11,0:11,7,2,0
chr16	71951094	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=133,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,2:1,5:0,3,0,7
chr16	71955400	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=120,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:1,3,0,2
chr16	71955426	.	C	CAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=139,234;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr16	71956511	.	AATGCCC	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=199,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ATGCCC;STR;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,1:5,4:5,4,2,3
chr16	71956592	.	A	AAG	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=49.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,3:0,8:0|1:71956592_A_AAG:71956592:0,0,4,8
chr16	71956593	.	T	TGTGG	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,3:0,5:0|1:71956592_A_AAG:71956592:0,0,4,8
chr16	71956596	.	AA	GT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0|1:71956592_A_AAG:71956592:0,0,3,5
chr16	71981414	.	C	CTTTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=290,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTG;STR;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,3:3,3:1,2,4,3
chr16	71985423	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=201,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,4:4,0:6,2,5,0
chr16	71986764	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=262,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:0,3:3,9:2,1,8,4
chr16	71986946	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=302,156;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:1,5:1,4:0,2,6,4
chr16	71986995	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr16	71987960	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=44.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,3:0,13:0,0,15,1
chr16	71988106	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,8:1,3:0,2,7,4
chr16	71988220	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=350,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr16	72011040	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	72011181	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr16	72011193	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr16	72011213	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=150,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:0|1:72011213_G_GT:72011213:9,4,1,1
chr16	72011214	.	G	GATGTTTGACTCCAATGC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=150,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:72011213_G_GT:72011213:9,4,1,1
chr16	72011450	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,208;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:72011450_G_A:72011450:0,0,0,2
chr16	72011457	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,213;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72011450_G_A:72011450:0,0,0,1
chr16	72011461	.	T	TCCTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,213;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72011450_G_A:72011450:0,0,0,1
chr16	72012072	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	72012374	.	A	ATGTGTGTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,317;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,14;RU=TG;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	72018099	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr16	72020294	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,9:0,10:0,0,11,9
chr16	72020323	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,8,8
chr16	72048332	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=129,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,6:1,0:3,0,6,0
chr16	72048596	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=239,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr16	72050885	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr16	72054984	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=199,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,3:1,4:3,1,4,3
chr16	72057282	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,4:5,1:4,6,3,2
chr16	72058012	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=117,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:9,3:7,3:9,7,2,4
chr16	72088467	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,169;MMQ=40,39;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:4,1,3,0
chr16	72088652	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=160,85;MMQ=59,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:1,7,1,2
chr16	72088675	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=177,105;MMQ=40,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,3:2,1:1,4,1,3
chr16	72124495	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,1:4,2:11,0,3,0
chr16	72130103	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:8,4:13,2:11,10,3,3
chr16	72131740	.	ACT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=227,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr16	72132713	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,1:5,5:4,5,3,3
chr16	72133211	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=150,246;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr16	72139396	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr16	72139537	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,3,12
chr16	72142895	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=243,70;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr16	72146441	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=139,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:1,4,0,4
chr16	72153979	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=110,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:11,3:20,0:18,13,2,1
chr16	72159045	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=212,73;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr16	72821593	.	AGCCGCCGCC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=228,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,5;RU=GCC;STR;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:1,3:3,0:6,2,0,3
chr16	72830467	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=174,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:10,0,2,0
chr16	72832618	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=219,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.431:7:1,2:2,1:0,4,0,3
chr16	72845716	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,36;MFRL=205,208;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:72845716_G_GC:72845716:0,3,1,0
chr16	72845722	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,13;MFRL=210,208;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:72845716_G_GC:72845716:1,3,1,0
chr16	72845727	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=210,208;MMQ=60,43;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:72845716_G_GC:72845716:1,3,1,0
chr16	72845731	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=210,208;MMQ=60,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:72845716_G_GC:72845716:1,3,1,0
chr16	72863681	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=107,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:17,3:13,0:16,15,0,3
chr16	72991697	.	GCCGCCGCCGCCGCAGCCA	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.117:24:9,0:11,2:9,13,0,2
chr16	72991715	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=209,170;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.751:22:3,7:2,10:3,2,6,11
chr16	73164795	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=209,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:3,0,8,0
chr16	73165038	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:0,3,1,5
chr16	74330979	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=139,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,4:3,4:0,4,0,8
chr16	74336018	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.571:10:2,1:2,3:4,0,6,0
chr16	74443401	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	74443789	.	T	TG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=208,122;MMQ=25,28;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.321:25:11,4:6,4:11,6,5,3
chr16	74444361	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=157,121;MMQ=43,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr16	74447124	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=184,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,1:3,6:1,4,0,7
chr16	74447656	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=187,179;MMQ=50,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:2,8,0,2
chr16	74490529	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=175,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,1:3,2:7,3,2,1
chr16	74490556	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=178,164;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,2:5,2:8,6,3,1
chr16	74491733	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=180,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:8,3:5,6:9,4,6,3
chr16	74491786	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:11,0:13,3:11,13,0,3
chr16	74493530	.	GA	G,GAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,36,36;MFRL=82,214,134;MMQ=60,60,60;MPOS=27,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.26,6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,3:0.382,0.266:12:1,4,2:3,1,1:4,0,8,0
chr16	74503860	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:5,2:3,2:5,3,2,3
chr16	74511460	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=191,145;MMQ=60,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,0:3,4:0,9,0,4
chr16	74511475	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=210,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:74511475_CA_C:74511475:0,3,0,1
chr16	74511485	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=225,188;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:74511475_CA_C:74511475:0,3,0,1
chr16	74660174	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=223,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr16	74662597	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=181,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:0,7,0,2
chr16	74666634	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=237,272;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr16	74671866	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=97,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:2,1:2,2,0,2
chr16	74712905	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=278,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,4:0,5:1,0,2,7
chr16	74760292	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,37;MFRL=220,96;MMQ=56,31;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr16	74773885	.	CC	TT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=154,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:5,6,1,1
chr16	74908439	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr16	74920350	.	T	TAAAATAAAATAAAATAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=156,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:74920350_T_TAAAATAAAATAAAATAAG:74920350:0,3,0,1
chr16	74920351	.	C	CCTCCTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=156,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:74920350_T_TAAAATAAAATAAAATAAG:74920350:0,3,0,1
chr16	74920374	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	74922015	.	CAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=176,193;MMQ=56,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr16	74937828	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,5:5,3:5,4,7,1
chr16	74938083	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=196,272;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr16	74943890	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr16	74985516	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=197,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:0,1:1,2:0,2,1,2
chr16	74999625	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=136,283;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:5,2,1,1
chr16	75146711	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=127,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,4:1,7:1,0,8,3
chr16	75148604	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr16	75186727	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,56;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr16	75200595	.	CAT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=168,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr16	75204325	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=249,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr16	75240898	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	75263974	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,1,9
chr16	75267676	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,1:0,2:0,0,5,0
chr16	75269147	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=181,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:5,1,2,2
chr16	75269958	.	C	CCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=162,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CA;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:4,1:1,2:0,5,0,3
chr16	75276295	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr16	75338855	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr16	75339131	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr16	75445675	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,3:1,5:0,3,6,2
chr16	75445906	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr16	75448659	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=220,251;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr16	75467076	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	75512679	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=202,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,1:5,1:9,6,1,1
chr16	75565242	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=191,126;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.601:10:2,3:1,2:4,0,1,5
chr16	75565420	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=172,142;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:1,3,2,1
chr16	75573884	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=203,172;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,2:2,2,1,3
chr16	75575410	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr16	75576600	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=144,20209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:6,0:9,1:0|1:75576600_A_T:75576600:9,6,0,2
chr16	75576603	.	TG	CA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=143,20209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:75576600_A_T:75576600:8,6,0,2
chr16	75576607	.	G	GAGC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=143,20209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:75576600_A_T:75576600:8,6,0,2
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chr16	76482910	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=225,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,1,1
chr16	76495842	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:1,4:6,7:5,2,8,3
chr16	76496025	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,4:0,3:0,2,3,4
chr16	76523792	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,9,3
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chr16	76528976	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=65.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,11:0,0,9,13
chr16	76532392	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr16	76532583	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=74,174;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,6:0,4:0,1,5,5
chr16	76555015	.	CTT	C,CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33,34;MFRL=0,274,208;MMQ=60,60,60;MPOS=19,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=3.90,9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.331,0.564:6:0,1,2:0,1,2:0,0,5,1
chr16	76569754	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	76573590	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:6,1,3,0
chr16	76574500	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	76587647	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr16	76587697	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=240,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:8,4,1,1
chr16	76592313	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=240,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr16	77229657	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=174,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,1,1
chr16	77242083	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr16	77242233	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,1:3,5:3,1,2,4
chr16	77242284	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,6,9
chr16	77242513	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=318,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr16	77245239	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=188,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,2:3,0:1,12,1,1
chr16	77245971	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=125,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,1,3
chr16	77246847	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr16	77323235	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=207,149;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:7,7,2,0
chr16	77327226	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr16	77355141	.	G	GGACAGGCAGCTTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=206,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0,7,1,1
chr16	77393207	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=96,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,6:2,4:1,1,7,3
chr16	77395948	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=203,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr16	77398081	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=169,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,4:6,1:5,8,3,2
chr16	77769647	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr16	77769679	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=146,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,5:2,2:4,3,7,0
chr16	77775459	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	77850966	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=121,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:1,5,1,1
chr16	77850999	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=139,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,3:1,1:1,3,1,3
chr16	77912966	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=187,261;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr16	78062159	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=189,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr16	78062190	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=235,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr16	78064555	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=149,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.195:27:8,4:14,0:10,12,5,0
chr16	78133671	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=232,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,4:4,4:6,1,7,1
chr16	78142209	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr16	78142308	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,182;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.456:15:3,5:4,2:4,4,4,3
chr16	78148794	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr16	78148830	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=192,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,7:0,3:2,0,7,3
chr16	78149067	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=193,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,7:3,1:3,5,2,6
chr16	78198192	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=208,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.706:22:3,9:3,6:1,5,7,9
chr16	78198236	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:1,5,0,4
chr16	78312478	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=158,867;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:11,0:13,4:12,12,4,0
chr16	78312489	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=98,199;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:4,5:11,4:6,9,5,4
chr16	78312497	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=112,157;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.823:26:0,11:4,11:1,3,10,12
chr16	78312527	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=22,33;MFRL=98,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.358:26:6,4:11,5:4,13,5,4
chr16	78420882	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=76,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,5:2,2:0,2,1,6
chr16	78466689	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:9,0:3,5:1,11,0,5
chr16	79245465	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=162,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr16	79628455	.	AATTGGAATGAAAGGAATTTTAACACTATTTAGACAAAGATCAAACGCAGCGTAAAGGGGAAAGCTAGATTTCCTCATATGATTTTTTTTTTTTTAAATTTAGAGACTT	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=193,101;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,9:0.111:53:12,1:12,5:9,35,2,7
chr16	79628536	.	ATT	A,AT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,27,25;MFRL=240,214,221;MMQ=60,60,60;MPOS=17,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=6.81,24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,11:0.225,0.626:17:0,0,6:1,4,4:0,2,0,15
chr16	79633805	.	TGCC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,30;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCC;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:0,1:0,1:0,3,0,2
chr16	80574886	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=120.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,15:0,19:0,0,19,15
chr16	80577098	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,10,1
chr16	80638415	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=157,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,3:8,0:9,8,2,1
chr16	80666880	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:13,2:2,0:13,2,2,0
chr16	80719086	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr16	81015560	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	81051327	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.956:17:0,9:0,8:0,0,11,6
chr16	81053682	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr16	81062151	.	CTT	C,CT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,35,34;MFRL=0,185,173;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=52.02,4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,13,2:0.780,0.166:15:0,6,1:0,7,1:0,0,13,2
chr16	81062157	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=55.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,14:0.833:16:1,6:1,7:0|1:81062157_T_C:81062157:2,0,11,3
chr16	81062171	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,14:0.790:17:1,6:1,8:0|1:81062157_T_C:81062157:2,1,9,5
chr16	81077608	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:11,3:10,0:10,11,2,1
chr16	81078486	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=196,72;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:5,7,1,1
chr16	81094760	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr16	81116474	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,180;MMQ=40,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr16	81118289	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	81121145	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr16	81142358	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=204,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:1,1:0,2,0,5
chr16	81145675	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	81145737	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr16	81145755	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=347,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,3:1,4:1,1,4,3
chr16	81150938	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr16	81151163	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr16	81161473	.	G	GTACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=234,163;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,0:3,3:3,3,2,2
chr16	81161722	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=198,293;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,1,0
chr16	81164274	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr16	81164289	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=171,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr16	81164343	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr16	81167076	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=266,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr16	81167088	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=175,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr16	81167342	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr16	81173030	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=148,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:2,0,3,1
chr16	81173051	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=247,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:6,1,2,0
chr16	81181180	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=269,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:0,2,1,4
chr16	81181992	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=181,63;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr16	81182025	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=103,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr16	81183266	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr16	81185326	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	81187568	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=183,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:4,4:4,0:0|1:81187568_C_T:81187568:4,4,3,2
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chr16	81187634	.	GG	CT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,3:9,3:10,4,2,4
chr16	81187685	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,0:4,5:5,3,2,3
chr16	81187709	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,0:3,5:2,5,2,3
chr16	81187777	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=167,158;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:4,0:5,6:7,2,0,6
chr16	81190613	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,9,6
chr16	81190790	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr16	81193156	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr16	81193321	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:2,3:5,2:2,5,4,1
chr16	81193358	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=178,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:4,5,2,2
chr16	81193433	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr16	81194422	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=183,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,7:3,0:2,7,5,2
chr16	81194528	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=110,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:4,3:2,1:2,5,1,3
chr16	81197117	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	81198441	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=553,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr16	81199520	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=134,161;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,3:1,4:1,1,1,6
chr16	81199544	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=161,73;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr16	81199572	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr16	81201422	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	81201440	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0|1:81201440_TG_T:81201440:0,0,4,0
chr16	81201448	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:81201440_TG_T:81201440:0,0,4,0
chr16	81204720	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:1,6,3,1
chr16	81213422	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	81219329	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,2,3
chr16	81219396	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	81222447	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=89,222;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.289:5:1,1:0,0:1,3,1,0
chr16	81222672	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	81224234	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr16	81224423	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	81232336	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=199,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:6,2:1,2:6,1,3,1
chr16	81241249	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=157,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0|1:81241249_T_A:81241249:1,0,2,4
chr16	81241269	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:81241249_T_A:81241249:0,0,1,2
chr16	81242148	.	GTT	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=131,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:4,3:7,1:0|1:81242148_GTT_G:81242148:5,6,1,3
chr16	81242151	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=131,166;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:4,3:6,1:0|1:81242148_GTT_G:81242148:5,6,1,3
chr16	81242194	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,2,5
chr16	81249764	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	81253637	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=199,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:0|1:81253637_A_G:81253637:2,0,3,3
chr16	81253642	.	AG	TC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=199,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.704:8:0,3:2,2:0|1:81253637_A_G:81253637:2,0,3,3
chr16	81253917	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,10:0,0,9,9
chr16	81254023	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=131,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,5:2,2:1,1,1,6
chr16	81272625	.	AT	A,ATTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,21,17;MFRL=141,131,214;MMQ=60,60,60;MPOS=18,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,16;RU=T;STR;TLOD=7.33,3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,3:0.298,0.310:11:2,1,0:1,1,0:1,3,1,6
chr16	81295902	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=128,274;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,1:5,1:3,9,1,1
chr16	81301460	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=195,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:3,1,5,1
chr16	81303759	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:4,1:0,6:3,1,5,2
chr16	81320830	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr16	81348901	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=117,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,1:2,1:2,2,2,0
chr16	81390653	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=182,59;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr16	81398520	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=70,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,2:1,5:2,0,6,1
chr16	81410977	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=181,138;MMQ=60,22;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.257:24:9,0:9,5:10,8,0,6
chr16	81528953	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=168,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,0:5,5:7,1,5,0
chr16	81529174	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=149,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,4:2,1:0,6,0,5
chr16	81726863	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=126,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.640:15:3,4:2,4:3,2,3,7
chr16	81733268	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:3,6,0,2
chr16	81736324	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:17,2:10,3:15,12,1,4
chr16	81737695	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=108,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:2,1,1,5
chr16	81819532	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=144,99;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:6,5:10,0:15,1,5,0
chr16	81819768	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,9:0,28:0,0,18,19
chr16	81819820	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=165,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:6,1:13,2:2,17,0,3
chr16	81888237	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=248,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr16	81891998	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=240,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,5:1,4:0,4,2,7
chr16	81892041	.	GGGA	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=188,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:3,1:5,3:0|1:81892041_GGGA_G:81892041:0,9,0,4
chr16	81892043	.	GAAAA	G,GAAA	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,34,31;MFRL=0,178,223;MMQ=60,60,60;MPOS=13,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,9,12;RU=A;STR;TLOD=23.24,4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,2:0.651,0.269:8:0,2,1:0,4,1:0,0,0,8
chr16	81892048	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=188,154;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:3,1:5,3:0|1:81892041_GGGA_G:81892041:0,9,0,4
chr16	81892895	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=310,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr16	81902797	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,5:0,4:1,0,6,3
chr16	81904374	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:81904374_A_AT:81904374:0,0,5,0
chr16	81904375	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0|1:81904374_A_AT:81904374:0,0,5,0
chr16	81904433	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr16	81914619	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=154,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:11,0:4,2:2,13,0,2
chr16	81939150	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.787:12:1,2:1,8:0|1:81939150_G_C:81939150:0,2,2,8
chr16	81939157	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=176,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.250:10:2,1:6,1:1|0:81939150_G_C:81939150:0,8,0,2
chr16	81941319	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=265,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.731:13:1,4:2,5:1,2,4,6
chr16	81941934	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=195,248;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,2:0,1:5,0,3,0
chr16	81944267	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,240;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:3,7,0,2
chr16	81953081	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,14,7
chr16	81953101	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=158,224;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:10,9:10,0:8,12,9,0
chr16	81953368	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr16	81962071	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr16	81973442	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=226,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,3:3,0:11,0,2,1
chr16	81973474	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=139,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.835:16:1,10:1,4:0,2,11,3
chr16	82033054	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,3:7,0:7,4,3,0
chr16	82033601	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:7,13,2,0
chr16	82131578	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr16	82131623	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=217,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:6,0,4,0
chr16	82182286	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=144,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:4,0,6,0
chr16	82182832	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=233,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr16	82182866	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=233,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr16	82184973	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=170,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,3:2,2:2,0,3,2
chr16	82197883	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=193,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,0,4
chr16	82892081	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=93,42;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,0:9,2:8,7,1,1
chr16	83065573	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=220,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,0:8,4:14,0,4,0
chr16	83065904	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=156,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:0,5,0,6
chr16	83519982	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=176,244;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,4:0,1:2,0,5,0
chr16	83520078	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,5:1,0:5,2,4,1
chr16	83816828	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,1:1,5:1,1,5,1
chr16	83828683	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=140,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr16	83841560	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,6:3,3:4,0,9,0
chr16	83842816	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=160,304;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:2,0:4,2:6,1,2,0
chr16	83843067	.	CTTTTTTTT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,18;MFRL=126,103;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=23,15;RU=T;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.218:12:1,0:5,0:4,6,1,1
chr16	83843077	.	T	TAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=126,103;MMQ=40,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,0:5,2:1,6,1,1
chr16	83941980	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=329,327;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.465:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr16	83948515	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=207,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,5:4,0:5,0,5,0
chr16	83982960	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=190,237;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr16	83984706	.	CCT	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CT;STR;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.205:27:9,5:11,0:14,8,4,1
chr16	83984776	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=119,140;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=140.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,40:0.955:41:1,20:0,20:0,1,13,27
chr16	83991270	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=132,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.416:9:0,0:5,0:0,5,4,0
chr16	83992785	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr16	83994569	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=57,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,3:1,3:2,1,5,1
chr16	83994592	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=173,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.291:15:5,2:6,2:7,4,2,2
chr16	84035531	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=154,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,2:5,1:6,7,1,2
chr16	84043380	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,2:4,7:7,2,8,1
chr16	84046499	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=209,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr16	84050037	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=266,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr16	84050212	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:2,4:1,3,5,4
chr16	84063130	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,265;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,0:1,2:6,3,2,0
chr16	84070500	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=142,188;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:9,1:0|1:84070500_C_G:84070500:5,7,1,1
chr16	84070510	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,1:7,1:0|1:84070500_C_G:84070500:3,6,1,1
chr16	84070514	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:2,0:7,1:0|1:84070500_C_G:84070500:3,6,1,1
chr16	84070541	.	G	GCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,37;MFRL=228,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=C;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0,3,1,0
chr16	84075482	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr16	84075563	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,6,4
chr16	84088047	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=153,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,0:1,4:3,2,4,0
chr16	84089536	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr16	84089767	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=228,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:1,3,0,6
chr16	84093062	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=214,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:0,3,1,6
chr16	84100279	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=176,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr16	84101240	.	C	CACATTTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=264,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:1,11:1,0:2,0,8,4
chr16	84101875	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=263,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr16	84103519	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,205;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.282:37:9,10:18,0:12,15,10,0
chr16	84104478	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	84108306	.	TGT	CCA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=200,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:5,7,0,2
chr16	84115279	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=239,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr16	84121078	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=210,271;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr16	84124454	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=182,103;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,2:4,1:11,1,1,2
chr16	84124638	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=159,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr16	84132628	.	G	GAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr16	84132874	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=147,59;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:11,2:0|1:84132874_T_C:84132874:12,5,1,1
chr16	84132882	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=115,59;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:0|1:84132874_T_C:84132874:12,4,1,1
chr16	84132893	.	T	TTTTATTTCTCCTTCA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=147,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:10,5,1,1
chr16	84182823	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=192,109;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:84182823_A_G:84182823:0,3,0,2
chr16	84182831	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=192,109;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:84182823_A_G:84182823:0,3,0,2
chr16	84199444	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=123,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:4,5:9,2:10,3,3,4
chr16	84199513	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=117,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:5,7:8,7:8,5,8,6
chr16	84204043	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=209,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,3:1,6:0,2,0,9
chr16	84209498	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr16	84211483	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=133,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,3:3,5:1,2,2,6
chr16	84213541	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=193,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,2:1,4:1,1,3,5
chr16	84213748	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=186,244;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:1,4,2,1
chr16	84213965	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr16	84214837	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=229,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:4,3,2,4
chr16	84215133	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.499:20:3,7:7,2:5,5,6,4
chr16	84215314	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=195,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:7,5:0,3:4,3,4,4
chr16	84224805	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=291,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,3:3,5:3,1,5,3
chr16	84224967	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,3,3
chr16	84225327	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=234,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:2,1:0,1:0,2,0,3
chr16	84228199	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:2,5,0,3
chr16	84228237	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr16	84228612	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=217,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:1,2,4,1
chr16	84230376	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=177,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr16	84230624	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=162,229;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr16	84255809	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=119,254;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,2:7,3:4,8,3,2
chr16	84256103	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=190,257;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:10,2:4,1:7,7,2,1
chr16	84256225	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=177,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.306:24:9,5:8,2:6,11,2,5
chr16	84256422	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=177,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:8,1,2,2
chr16	84256613	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:17,0:6,7:11,12,0,7
chr16	84328752	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,5:0,6:0|1:84328752_G_T:84328752:0,0,4,9
chr16	84328756	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0|1:84328752_G_T:84328752:0,0,4,9
chr16	84328819	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	84351828	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=169,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,1:6,2:8,4,3,0
chr16	84357925	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr16	84358103	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=116,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.505:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr16	84358116	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=35,23;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=-1073741809;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr16	84358121	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr16	84358139	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr16	84441989	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=106,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:4,1,4,1
chr16	84449024	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0|1:84449024_G_A:84449024:2,0,3,0
chr16	84449032	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=138,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0|1:84449024_G_A:84449024:3,0,3,0
chr16	84455961	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=176,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:3,0,6,1
chr16	84456705	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=195,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,3:1,5:4,0,8,0
chr16	84456905	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,3:6,4:4,9,2,5
chr16	84459512	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	84472972	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=262,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,2:1,5:2,0,4,3
chr16	84473004	.	C	CTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=202,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:2,2,4,1
chr16	84473137	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr16	84473192	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:84473192_A_G:84473192:0,0,0,5
chr16	84473195	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:84473192_A_G:84473192:0,0,0,5
chr16	84474614	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=261,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr16	84476022	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:1,0,6,0
chr16	84476200	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=176,180;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,1:3,2:5,3,0,3
chr16	84476224	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:0,3:2,2:0,2,3,3
chr16	84476297	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.857:4:0,3:0,1:0|1:84476297_G_C:84476297:0,0,0,4
chr16	84476301	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:84476297_G_C:84476297:0,0,0,4
chr16	84480111	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr16	84485446	.	AAAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAC;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr16	84486700	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=234,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.652:6:1,4:0,0:1,1,4,0
chr16	84486867	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=101.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,12:0,21:0,0,21,13
chr16	84486918	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=89,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:5,8,2,0
chr16	84487032	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=143,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:84487032_T_C:84487032:0,4,0,1
chr16	84487034	.	T	TGCCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=143,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:84487032_T_C:84487032:0,4,0,1
chr16	84487037	.	C	CCTGCAAATATAATT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:84487032_T_C:84487032:0,3,0,1
chr16	84492683	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=133,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:2,2,3,2
chr16	84493080	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=205,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr16	84494450	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:1,3,1,4
chr16	84495301	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,2:6,1:7,2,2,1
chr16	84495770	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=186,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,4:3,1:1,6,0,5
chr16	84497169	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=92,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.603:13:3,3:2,5:3,2,6,2
chr16	84497186	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=134,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:3,3:4,2:5,2,2,3
chr16	84497279	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=155,212;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,2:9,0:10,5,2,0
chr16	84513463	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=122,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,6:4,2:3,2,7,1
chr16	84514061	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr16	84514341	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:7,2:4,4:3,8,1,5
chr16	84516309	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=168,122;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,1:4,1:5,4,1,1
chr16	84520173	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=84,444;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr16	84520223	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=167,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:2,0:7,3:9,0,3,0
chr16	84522867	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=169,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:8,6:7,2:12,3,6,2
chr16	84522897	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=169,125;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:9,8:8,4:12,5,5,7
chr16	84531780	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=273,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr16	84600595	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=241,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr16	84623636	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=186,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,5,1
chr16	84684640	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=190,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:0,2:7,2:0,7,0,4
chr16	84690467	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=207,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:6,1,2,2
chr16	84695126	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=164,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:9,0,2,0
chr16	84733560	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,2:2,0,5,0
chr16	84766970	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:5,1,3,1
chr16	84773795	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=218,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr16	84792428	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,3:4,6:2,4,3,6
chr16	84797631	.	CTT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=128,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:5,2:4,1:6,3,2,1
chr16	84797637	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=155,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,2:6,2:6,6,4,0
chr16	84801751	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=210,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr16	84808900	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=255,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,1:0,4:0,3,0,5
chr16	84872051	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:3,0,4,0
chr16	84879324	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=226,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:1,3:5,0,3,0
chr16	84882911	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=239,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,6:1,2:1,1,8,0
chr16	84882974	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=188,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:1,7:2,5:1,2,7,5
chr16	84883195	.	A	ATTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTG;STR;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.786:7:1,5:0,1:0,1,0,6
chr16	84884072	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr16	84884116	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=185,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:1,1,2,3
chr16	84900472	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr16	84902549	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=231,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:0,9:3,5:2,1,3,11
chr16	84906098	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=213,108;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,4:2,8:5,0,9,3
chr16	84906820	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=207,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr16	84907450	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=196,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:1,1,4,0
chr16	84907499	.	GTT	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=187,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=T;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:1,1:0,2:0,1,4,0
chr16	84907670	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr16	84911195	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=246,165;MMQ=58,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,1,3
chr16	84911219	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=246,190;MMQ=58,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr16	84922737	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=204,244;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr16	85010810	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:9,1:8,9,2,0
chr16	85011423	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=261,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:2,0,5,0
chr16	85011480	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=200,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,2:2,5:3,0,6,1
chr16	85011622	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=117,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,6:4,4:5,6,7,3
chr16	85015541	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=181,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:7,6:6,5:6,7,5,6
chr16	85023855	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=163,241;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:5,0,4,1
chr16	85105296	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=278,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr16	85105554	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=223,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr16	85106500	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=216,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,6:4,3:4,1,6,3
chr16	85109357	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=212,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,3:5,2:5,0,4,1
chr16	85111305	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=222,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,5:1,2:0,4,0,7
chr16	85112097	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=202,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,0:0,5:0,1,0,5
chr16	85120609	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr16	85133872	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,243;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:5,2,2,0
chr16	85138918	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=136,135;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,3:5,0:3,5,3,0
chr16	85139045	.	C	CAAGCTGAATGATTTGA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:2,0:4,5,1,1
chr16	85141556	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,6:4,3:5,2,4,5
chr16	85144036	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:13,0:5,2:4,14,1,1
chr16	85144080	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=146,355;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:2,5,0,3
chr16	85691294	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr16	85698766	.	C	CTTGTCTCTCTTCTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=152,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:4,2:3,0:2,5,1,1
chr16	85702042	.	C	CAGCTGAGGGAGGATCGCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	85775175	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr16	85775323	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=214,274;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.299:14:4,0:6,3:4,6,0,4
chr16	85813231	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr16	85813526	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr16	85813963	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,7,4
chr16	85814899	.	T	TAGTC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr16	85814995	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr16	85838503	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr16	85838532	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,8,6
chr16	85838804	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr16	85839543	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr16	85942496	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=209,218;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr16	85945076	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=199,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr16	85953682	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=206,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:6,3,2,1
chr16	86575460	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr16	86585905	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,3,7
chr16	86588655	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	86603225	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,1:0,0,1,3
chr16	86613440	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:3,8,0,2
chr16	86614217	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=225,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0|1:86614217_G_C:86614217:1,3,1,3
chr16	86614222	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=225,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:3,4:0,2:0|1:86614217_G_C:86614217:1,3,3,3
chr16	87376605	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=237,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.481:10:1,2:4,1:2,3,1,4
chr16	87376623	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.882:6:0,1:0,3:0,0,0,6
chr16	87377455	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=154,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr16	87416936	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,339;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:87416936_C_G:87416936:0,0,1,0
chr16	87416938	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,339;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:87416936_C_G:87416936:0,0,1,0
chr16	87416944	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,339;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:87416936_C_G:87416936:0,0,1,0
chr16	87432594	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=182,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.318:4:2,1:1,0:0|1:87432594_A_AT:87432594:0,3,0,1
chr16	87432597	.	T	TTCCCTGGCAGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=219,240;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:87432594_A_AT:87432594:0,4,0,1
chr16	87436463	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=161,124;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr16	87436720	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=112,135;MMQ=60,42;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.501:24:4,5:8,7:6,6,6,6
chr16	87436764	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=176,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.621:19:4,3:3,9:2,5,5,7
chr16	87445478	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,1:10,1:9,9,2,0
chr16	87446614	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=291,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,4:4,3:3,3,4,3
chr16	87451405	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	87452403	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,2:3,2,6,0
chr16	87452546	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr16	87453342	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=173,83;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:2,1:2,1:4,1,2,0
chr16	87454148	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:1,1,6,1
chr16	87457349	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:5,4,2,0
chr16	87677791	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr16	87742092	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=230,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.595:10:2,5:1,1:0,4,0,6
chr16	87748198	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=208,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:1,4:0,7:1,0,6,5
chr16	87764267	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=198,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:1,8:1,4:2,0,3,9
chr16	87788756	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:4,2,3,0
chr16	87788836	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,94;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:10,2:8,1:9,9,1,2
chr16	87788856	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=143,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:0|1:87788856_C_T:87788856:6,11,1,1
chr16	87788864	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=146,94;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:0|1:87788856_C_T:87788856:6,10,1,1
chr16	87870312	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=215,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:0,11,0,2
chr16	87903082	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr16	87935632	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=16,28;MFRL=216,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.619:8:1,2:0,3:3,0,2,3
chr16	87960560	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=311,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr16	88008712	.	C	CT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=92,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:12,4:4,8:6,11,6,7
chr16	88012150	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr16	88014554	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,203;MMQ=56,56;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr16	88017809	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,14:0,0,21,10
chr16	88051971	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=222,334;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr16	88066655	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:88066655_A_G:88066655:0,0,3,1
chr16	88066659	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0|1:88066655_A_G:88066655:0,0,3,1
chr16	88105916	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=223,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr16	88494945	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:88494945_CTT_C:88494945:4,0,1,0
chr16	88494947	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	88494949	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:88494945_CTT_C:88494945:4,0,1,0
chr16	88494976	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,6,2
chr16	88495654	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr16	88495798	.	C	CAAAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=158,126;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:88495798_C_CAAAA:88495798:0,2,0,1
chr16	88495803	.	A	ACCTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,17;MFRL=158,126;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:88495798_C_CAAAA:88495798:0,2,0,1
chr16	88495804	.	G	GACCACAGAGACATCATGTACCCAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=158,126;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:88495798_C_CAAAA:88495798:0,2,0,1
chr16	88497313	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	88497400	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,1:0,0,2,2
chr16	88500210	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=186,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr16	88505734	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=285,182;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,6:1,5:1,0,4,7
chr16	88505748	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=189,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:3,2,0,2
chr16	88593209	.	CCT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=185,265;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr16	88593210	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	88599687	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:88599687_G_A:88599687:0,0,2,0
chr16	88599695	.	GGA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:88599687_G_A:88599687:0,0,2,0
chr16	88599700	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:88599687_G_A:88599687:0,0,2,0
chr16	88599702	.	CTGG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:88599687_G_A:88599687:0,0,2,0
chr16	88599775	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	88620148	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=57,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,1,1
chr16	88643457	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr16	88664498	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,0:0|1:88664498_C_G:88664498:0,0,3,0
chr16	88664499	.	T	TGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,22;RU=G;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0|1:88664498_C_G:88664498:0,0,3,0
chr16	88664758	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,0:4,4:1,4,1,3
chr16	88675529	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	88678038	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=182,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr16	88688547	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,4:4,0:5,1,4,0
chr16	88695300	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=131,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:2,4:4,1:0,6,0,6
chr16	88695332	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr16	88695338	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr16	88697487	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=212,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:2,3:1,1:2,1,4,2
chr16	88709822	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=146,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:0,0:2,1:1,2,1,0
chr16	88709828	.	A	C,G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,12,12;MFRL=179,206,143;MMQ=60,60,60;MPOS=11,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.09,7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,4:0.223,0.546:6:1,0,0:0,0,1:1,0,3,2
chr16	88709837	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=17,12;MFRL=146,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.247:6:1,0:1,0:3,2,1,0
chr16	88712677	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=87,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr16	88713177	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=184,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,0:11,2:11,5,1,1
chr16	88713236	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr16	88713473	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr16	88713501	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=170,107;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:1,4:0,2:0,1,4,2
chr16	88714559	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=162,245;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:2,2:2,1:1,3,0,4
chr16	88718865	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=223,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr16	88719877	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=250,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,2:1,0:0,1,0,3
chr16	88721538	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,3,1
chr16	88725012	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=139,121;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:2,5:9,0:8,4,5,0
chr16	88752693	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=137,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,0:0,4:1,1,4,0
chr16	88763896	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=188,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,1:2,1:8,0,2,0
chr16	88764008	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=184,50;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:7,1:5,1:3,9,0,2
chr16	88772973	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	88776297	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=147,247;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr16	88777995	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=128,260;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:3,1:10,1:8,6,1,1
chr16	88780472	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=203,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr16	88780518	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=134,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:2,2,3,2
chr16	88780634	.	AGGTGTG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=123,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGTGTG;STR;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,1:4,4:4,3,1,4
chr16	88780685	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=10,28;MFRL=123,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.528:6:0,2:1,1:0,3,1,2
chr16	88780923	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:7,4:4,8:8,3,3,9
chr16	88780944	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=168,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,4:5,7:5,6,3,8
chr16	88781419	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=133,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:3,1,2,2
chr16	88782319	.	GC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,5:0,1:0,0,3,3
chr16	88783374	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=182,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,0:0,5:1,1,2,3
chr16	88786967	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,1:1,2:0,3,0,4
chr16	88787489	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	88787607	.	CCTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr16	88788477	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=140,269;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,2,1
chr16	88792985	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=200,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:5,6,0,2
chr16	88793068	.	T	TCAGCGGGGC	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CAGCGGGGC;STR;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.490:6:2,1:1,1:0|1:88793068_T_TCAGCGGGGC:88793068:2,1,3,0
chr16	88793090	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,1:1,2:0|1:88793068_T_TCAGCGGGGC:88793068:3,2,4,0
chr16	88793103	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=128,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:0|1:88793068_T_TCAGCGGGGC:88793068:3,2,3,1
chr16	88793910	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr16	88799238	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=224,235;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,1,3
chr16	88800372	.	GTCC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=137,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TCC;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,1:1,0:3,0,0,1
chr16	88872998	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:9,7,0,2
chr16	88874632	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=179,139;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:1,6:6,2:4,3,2,6
chr16	88876666	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=267,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:2,2,0,4
chr16	88880811	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,1:6,3:9,0,1,3
chr16	88901850	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=200,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr16	88904097	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=175,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,2:7,0:7,13,1,1
chr16	88904254	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=168,138;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr16	88909028	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=156,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr16	88923691	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=22,15;MFRL=204,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:88923691_G_T:88923691:1,0,0,1
chr16	88923695	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=204,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:88923691_G_T:88923691:1,0,0,1
chr16	88923710	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:88923710_G_T:88923710:0,0,0,1
chr16	88923713	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,11;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:88923710_G_T:88923710:0,0,0,1
chr16	88926276	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=135,46;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:10,3:11,0:10,11,3,0
chr16	88927221	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr16	88931363	.	A	AGGGAG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGAG;STR;TLOD=47.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,3:0,0,9,3
chr16	88931914	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=96,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,5:0,3:1,0,6,2
chr16	88943557	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,8:1,0:2,1,8,0
chr16	88951475	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	89167066	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	89167094	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:89167094_T_C:89167094:0,0,1,0
chr16	89167097	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:89167094_T_C:89167094:0,0,1,0
chr16	89167792	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,4:0,8:0,0,0,14
chr16	89167828	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=141,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr16	89168911	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	89168935	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr16	89168981	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr16	89169205	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0|1:89169205_C_G:89169205:0,0,0,8
chr16	89169219	.	CCT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0|1:89169205_C_G:89169205:0,0,0,7
chr16	89178457	.	G	GTGCCTGCTCATCTTCCCACCGAGTGCTTCCTTTCCTCCGCCGCCGTGGGTCTC,GTGCCTGCTCATCTTCCCACCGAGTGCTTCCTTTTCTCCGCCGCCGTGGGTCTC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32,24;MFRL=198,127,113;MMQ=60,60,60;MPOS=0,0;POPAF=7.30,7.30;TLOD=32.38,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,10,2:0.765,0.195:15:0,2,0:2,4,1:3,0,12,0
chr16	89180664	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,8:0,0,9,0
chr16	89180935	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr16	89187378	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr16	89261389	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.191:13:1,2:10,0:7,4,2,0
chr16	89287613	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr16	89288418	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	89291945	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=218,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:1,2:1,7:1,1,4,5
chr16	89291948	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=63.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,4:0,10:0|1:89291948_C_T:89291948:0,0,10,6
chr16	89291951	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,5:0,8:0|1:89291948_C_T:89291948:0,0,10,6
chr16	89292055	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=188,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:89292055_G_T:89292055:0,4,1,1
chr16	89292061	.	T	TAAGGAGTTTGGCTATGTGTAAAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=188,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:89292055_G_T:89292055:0,4,1,1
chr16	89341168	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=172,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr16	89345408	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=219,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr16	89347126	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:2,2,2,0
chr16	89351826	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=173,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:10,1:6,2:12,4,1,2
chr16	89352678	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=201,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr16	89371827	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=213,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr16	89371839	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=203,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr16	89576879	.	GTT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=259,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.585:3:0,1:0,1:0|1:89576879_GTT_G:89576879:0,1,2,0
chr16	89576895	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,10;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.480:4:0,0:1,0:0|1:89576879_GTT_G:89576879:0,2,2,0
chr16	89576904	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,15;MFRL=155,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.350:6:2,0:2,0:0|1:89576879_GTT_G:89576879:1,3,2,0
chr16	89577046	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0,4,0,5
chr16	89597057	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=175,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr16	89597221	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,1:2,4:3,5,1,4
chr16	89599108	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=197,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr16	89629218	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr16	89645167	.	CAAA	C,CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34,35;MFRL=182,170,238;MMQ=45,60,40;MPOS=9,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,16,17;RU=A;STR;TLOD=5.07,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.427,0.286:4:0,2,1:1,0,0:1,0,3,0
chr16	89645193	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,15;MFRL=193,210;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,0:5,1,2,0
chr16	89645437	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=190,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr16	89645447	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr16	89650371	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	89653032	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr16	89653563	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	89656251	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.596:8:1,1:2,4:1,2,4,1
chr16	89702453	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=183,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:4,5,2,0
chr16	89703424	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=241,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr16	89703797	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=257,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,0:3,3,1,2
chr16	89712889	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=113,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:0,1:3,4:0,3,4,1
chr16	89720409	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,3,11
chr16	89723870	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=217,403;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr16	89724572	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr16	89735923	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=219,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,0:2,1:0,4,0,2
chr16	89753031	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr16	89758973	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,4,10
chr16	89760492	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=114,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr16	89760552	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,5,4
chr16	89760712	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=128,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:2,2:2,1:1,3,0,3
chr16	89774396	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=163,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,3:1,9:0,1,3,9
chr16	89774411	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,3,10
chr16	89775422	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0|1:89775422_C_G:89775422:0,0,0,7
chr16	89775429	.	C	CCCCG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCCG;STR;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:89775422_C_G:89775422:0,0,0,6
chr16	89775831	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=18,20;MFRL=151,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,0:1,2:0,3,1,1
chr16	89778320	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=123,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:7,1,0,2
chr16	89783187	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,6:0,0,9,8
chr16	89790145	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:89790145_A_T:89790145:0,2,0,1
chr16	89790150	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:89790145_A_T:89790145:0,2,0,1
chr16	89790153	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:89790145_A_T:89790145:0,2,0,1
chr16	89793731	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=97,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:3,6:1,5:2,2,7,4
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chr16	89805261	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,1:0,9:0,0,6,4
chr16	89805977	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=127,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.337:22:5,4:8,3:5,10,1,6
chr16	89806347	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=199,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr16	89815217	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr16	89818491	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=84,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,5:3,1:3,1,4,2
chr16	89818732	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,290;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr16	89825164	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=198,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr16	89831418	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:5,2:7,8,0,2
chr16	89831510	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:2,4,1,2
chr16	89836323	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=129,162;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:2,3,2,2
chr16	89836507	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	89836865	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=282,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:0|1:89836865_A_G:89836865:2,0,6,0
chr16	89836872	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=265,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:0|1:89836865_A_G:89836865:3,0,6,0
chr16	89838078	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=206,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,8:5,1:5,1,7,2
chr16	89838086	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=166,206;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.273:16:8,1:4,3:8,4,3,1
chr16	89845110	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=237,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr16	89845194	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.515:12:1,4:3,2:6,0,4,2
chr16	89846195	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.551:10:1,2:3,2:4,0,6,0
chr16	89849296	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:2,2,1,1
chr16	89849480	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=166,118;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.801:18:3,4:0,11:2,1,7,8
chr16	89849583	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=183,262;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:0,3,0,7
chr16	89857964	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=20,35;MFRL=103,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.502:10:1,2:4,3:2,3,0,5
chr16	89858024	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:89858024_A_G:89858024:0,0,0,1
chr16	89858030	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:89858024_A_G:89858024:0,0,0,1
chr16	89858505	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=133,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:1,2,1,4
chr16	89858525	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,1,3
chr16	89859008	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0|1:89859008_G_A:89859008:1,4,0,3
chr16	89859015	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:2,2:0|1:89859008_G_A:89859008:0,4,0,3
chr16	89866160	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	89869761	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=251,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:0,5:1,12:0,1,7,10
chr16	89874628	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:6,1,5,0
chr16	89881085	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=209,151;MMQ=60,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr16	89911681	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=131,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:2,3,1,3
chr16	89925556	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:4,1,5,3
chr16	89935883	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,18;MFRL=180,248;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:2,1:2,0:4,0,5,0
chr16	89949956	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,1,3
chr16	89950982	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,5:2,6:5,3,5,6
chr16	89961356	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=228,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr16	89964952	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,2:5,4:7,1,3,3
chr16	89967217	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=203,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:3,2:4,3:3,5,1,4
chr16	89973777	.	CTCCCAGT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:89973777_CTCCCAGT_C:89973777:0,0,0,1
chr16	89973796	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:89973777_CTCCCAGT_C:89973777:0,0,0,1
chr16	89986117	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=146,223;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,3:5,1:9,0,2,2
chr16	89986130	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=179,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,2:3,2:2,3,3,1
chr16	89999026	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:11,9,1,1
chr16	90002290	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr16	90020861	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,307;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	90032255	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=224,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:5,1,2,1
chr16	90032296	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=147,168;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:4,4:4,1:8,0,4,2
chr16	90038522	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=217,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:8,3:6,3:9,5,3,3
chr16	90038896	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=248,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:1,1:1,5:0,2,1,6
chr16	90072817	.	G	GCAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=142,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:90072817_G_GCAA:90072817:1,2,0,1
chr16	90072819	.	TGC	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,32;MFRL=167,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:2,0:0,1:0|1:90072817_G_GCAA:90072817:1,3,0,1
chr16	90072826	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,35;MFRL=178,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:90072817_G_GCAA:90072817:1,1,0,1
chr16	90072827	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=20,33;MFRL=178,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:90072817_G_GCAA:90072817:1,1,0,1
chr16	90072830	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=178,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:90072817_G_GCAA:90072817:1,1,0,1
chr16	90093969	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=232,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr16	90094195	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=216,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:1,1,0,4
chr16	90095561	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=173,128;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.776:16:1,9:2,3:3,0,10,3
chr16	90095673	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=170,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:2,5,1,3
chr16	90096067	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=185,103;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:3,4:5,2:4,4,3,4
chr16	90097979	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	90097995	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr16	90108832	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=134,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr16	90109010	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr16	90109651	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:6,3,1,1
chr16	90109756	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=189,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,2:1,3:1,1,0,5
chr16	90133431	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=127,145;MMQ=56,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:90133431_G_A:90133431:0,2,0,1
chr16	90133435	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=214,145;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:90133431_G_A:90133431:0,3,0,1
chr16	90133439	.	C	CATAGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=214,145;MMQ=60,44;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:90133431_G_A:90133431:0,3,0,1
chr16	90141477	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0|1:90141477_T_G:90141477:0,0,1,7
chr16	90141489	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=155,208;MMQ=47,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:90141477_T_G:90141477:0,4,0,2
chr17	11830	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=204,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr17	11904	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=157,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,6:5,0:5,5,5,1
chr17	13905	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=190,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,7:3,1:3,1,6,2
chr17	65351	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=374,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr17	65610	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=279,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr17	69368	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:4,2,1,1
chr17	131516	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,67;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:8,1:2,3:5,5,2,2
chr17	131709	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=176,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr17	177359	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,4:2,4:0,3,2,6
chr17	295777	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.360:34:8,9:12,3:6,16,5,7
chr17	423051	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:3,0:11,3:4,10,3,0
chr17	505162	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:0,5,2,4
chr17	526746	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=214,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:3,2:8,5:6,5,2,5
chr17	530585	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,1:4,4:1,8,2,4
chr17	602469	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=203,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr17	636266	.	A	AGGGCC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=156,227;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGCC;STR;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr17	636320	.	T	TCTC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=123,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTC;STR;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.502:14:3,2:4,5:6,1,7,0
chr17	641336	.	C	CTTTTTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,17;MFRL=161,178;MMQ=59,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,24;RU=T;STR;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:0,1:0,0:0,2,3,0
chr17	648916	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,2:7,4:4,6,1,5
chr17	680299	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=209,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr17	685887	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:13,0:13,4:11,15,0,4
chr17	686296	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.403:13:6,2:2,3:8,0,5,0
chr17	686589	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=169,241;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.581:5:1,2:0,1:0,2,0,3
chr17	706862	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr17	726881	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=182,239;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:5,4,0,2
chr17	729238	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.203:21:7,0:10,3:8,9,4,0
chr17	902869	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,1:3,2:2,6,1,2
chr17	909451	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,5:3,4:3,4,3,6
chr17	910636	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr17	912914	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=119,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:2,0:7,3:5,4,1,2
chr17	953456	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=191,252;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr17	953737	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=198,253;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:4,3,3,0
chr17	960221	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=250,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.777:16:0,10:3,2:2,1,6,7
chr17	961149	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:3,8:1,3:3,1,10,1
chr17	961304	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=197,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.880:14:0,9:1,4:0,1,2,11
chr17	961900	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=260,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr17	970251	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.835:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	970561	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:970561_G_A:970561:0,0,0,1
chr17	970571	.	CAG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:970561_G_A:970561:0,0,0,1
chr17	986742	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=183,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:9,3:4,7:5,8,5,5
chr17	1264611	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,10;MFRL=170,111;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.327:10:4,0:1,1:0,7,0,3
chr17	1265304	.	TA	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=16,29;MFRL=135,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.322:30:4,2:5,7:2,18,2,8
chr17	1265318	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=130,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.185:30:10,0:15,5:4,21,0,5
chr17	1265325	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=173,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:5,3:5,2:2,10,1,4
chr17	1359363	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,6:2,4:1,4,5,5
chr17	1370459	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr17	1370702	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=202,6863827;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.350:6:3,1:1,0:0,4,2,0
chr17	1370720	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=182,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:2,1,1,3
chr17	1371123	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:3,0:2,2:1,5,1,1
chr17	1371473	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,3,3
chr17	1371818	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	1372987	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=156,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr17	1373518	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=99,148;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:1,2:5,6:4,2,5,3
chr17	1377878	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:4,3:1,0:0|1:1377878_T_C:1377878:3,2,3,0
chr17	1377884	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=143,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:0|1:1377878_T_C:1377878:5,3,2,0
chr17	1378073	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=26,32;MFRL=187,253;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:0|1:1378073_A_C:1378073:0,6,3,0
chr17	1378079	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=25,35;MFRL=188,253;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,3:3,0:0|1:1378073_A_C:1378073:1,6,3,0
chr17	1378083	.	CGG	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=225,253;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:0|1:1378073_A_C:1378073:1,6,3,0
chr17	1378088	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=28,22;MFRL=225,253;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,2:3,0:0|1:1378073_A_C:1378073:1,6,3,0
chr17	1378093	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=28,35;MFRL=207,253;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:0|1:1378073_A_C:1378073:2,6,3,0
chr17	1378095	.	GT	CC	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=207,253;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,3:3,0:0|1:1378073_A_C:1378073:2,6,3,0
chr17	1382836	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=197,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:0|1:1382836_CAG_C:1382836:0,3,4,0
chr17	1382844	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=197,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,0:2,4:0|1:1382836_CAG_C:1382836:1,4,4,0
chr17	1382850	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=197,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:0|1:1382836_CAG_C:1382836:1,4,3,0
chr17	1382853	.	GT	CC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=197,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:1382836_CAG_C:1382836:1,4,2,0
chr17	1384184	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:2,1:1,1:1,3,0,2
chr17	1387075	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=166,173;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:1,7,0,3
chr17	1395682	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=190,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:8,9:3,4:5,6,9,4
chr17	1399924	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=129,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:7,2,1,1
chr17	1412455	.	GC	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=49.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,14,2
chr17	1419755	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=179,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr17	1456429	.	C	CCCATTTTTTTTTTTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:6,16,0,2
chr17	1478891	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.298:14:6,2:4,1:8,2,3,1
chr17	1493999	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=250,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr17	1494027	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr17	1494738	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=91,57;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:7,0:2,2:0|1:1494738_G_T:1494738:6,3,1,1
chr17	1494745	.	CAGCTGAA	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=91,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:8,0:1,2:0|1:1494738_G_T:1494738:5,4,1,1
chr17	1494754	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=91,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:8,0:0,2:0|1:1494738_G_T:1494738:5,4,1,1
chr17	1495018	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=129,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:0,0:1,2:1,0,3,0
chr17	1516480	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,5,9
chr17	1518429	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=184,154;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:1518429_C_T:1518429:0,3,0,1
chr17	1518432	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=184,154;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:1518429_C_T:1518429:0,3,0,1
chr17	1518436	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=177,154;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:1518429_C_T:1518429:0,2,0,1
chr17	1518445	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,25;MFRL=170,154;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1518429_C_T:1518429:0,1,0,1
chr17	1530979	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.534:17:4,8:4,1:4,4,3,6
chr17	1538546	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr17	1538628	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:1538628_C_G:1538628:0,0,6,3
chr17	1538638	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=159,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:0|1:1538628_C_G:1538628:8,1,1,1
chr17	1542153	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,3:0,1,2,3
chr17	1542190	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr17	1548646	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=285,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	1550106	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=191,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:7,0,4,0
chr17	1556911	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=157,273;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,2:6,0:7,6,2,0
chr17	1561480	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=173,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:9,1,2,0
chr17	1561507	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=160,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,1:5,3:8,2,4,0
chr17	1576369	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=95,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,3:6,0:9,7,2,1
chr17	1576956	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=237,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:2,1,3,0
chr17	1577690	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,1:7,3:10,0,3,1
chr17	1578032	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=221,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:0,9,0,3
chr17	1582791	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=191,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:6,0:5,1:9,5,1,1
chr17	1582797	.	GAA	G,GA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,35,33;MFRL=159,176,224;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=4.57,5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,4:0.155,0.288:14:4,1,2:4,1,2:7,1,3,3
chr17	1584132	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=161,243;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,5:7,1:8,3,5,1
chr17	1584377	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=184,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:2,4,1,2
chr17	1585378	.	AACC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=148,241;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=ACC;STR;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:2,2:4,3:3,6,1,4
chr17	1615642	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=146,67;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:7,1:13,2:9,11,1,2
chr17	1635614	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=126,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,5:3,6:2,2,6,5
chr17	1635742	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=199,258;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:7,1:5,8,2,0
chr17	1640640	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=185,312;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,1:2,1:5,3,2,0
chr17	1649267	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	1657899	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	1673405	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr17	1674544	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=72,175;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.578:5:0,1:0,0:0,2,0,3
chr17	1675127	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=170,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr17	1675138	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=143,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr17	1675451	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,264;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:0,2,0,4
chr17	1678256	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr17	1678520	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=160,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:1678520_G_A:1678520:3,1,1,1
chr17	1678522	.	G	GTATGA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=160,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:0,0:0|1:1678520_G_A:1678520:3,1,1,1
chr17	1678525	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=36,20;MFRL=160,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:1678520_G_A:1678520:3,1,1,1
chr17	1678526	.	G	GTTC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=160,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:0,0:0|1:1678520_G_A:1678520:3,1,1,1
chr17	1679793	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=178,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,2:2,2:7,0,3,1
chr17	1679805	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=175,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:3,0,6,1
chr17	1684772	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=144,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,1:6,2:1,7,0,3
chr17	1686563	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=167,294;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:8,0,3,1
chr17	1686600	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=177,299;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:6,2:6,8,1,1
chr17	1690302	.	CAA	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=169,280;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:0|1:1690302_CAA_C:1690302:0,7,0,2
chr17	1690305	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=169,280;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:3,0:3,2:0|1:1690302_CAA_C:1690302:0,7,0,2
chr17	1707893	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=253,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:3,2:0,1:3,0,3,1
chr17	1715467	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	1733399	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=90,145;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:1,3:1,5:1,2,4,4
chr17	1748022	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=185,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr17	1756351	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=128,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:4,5:0,2:3,1,6,1
chr17	1778911	.	GTAGAA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=162,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,2:0,4:4,0,4,2
chr17	1783812	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=218,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,2:8,1:8,6,2,1
chr17	1787020	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=163,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:9,1,2,0
chr17	1792174	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,321;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:8,3:1,0:2,7,0,3
chr17	1933381	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,3:3,3:5,4,3,3
chr17	1943430	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	1943880	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:6,4:6,2:0|1:1943880_C_G:1943880:5,7,2,4
chr17	1943888	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.851:18:1,7:1,8:0|1:1943880_C_G:1943880:1,1,5,11
chr17	1945041	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=277,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:3,5:0,6:1,2,6,5
chr17	1945225	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=277,257;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr17	1960069	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:5,0:6,9,1,1
chr17	1964759	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=217,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=G;STR;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr17	1964803	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.307:8:3,0:1,2:5,1,2,0
chr17	1968983	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=162,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:3,6:0,3:0,3,0,9
chr17	1985050	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=100,265;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,2:2,2:1,1,4,0
chr17	2186100	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=33,25;MFRL=190,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.793:22:2,6:2,12:1,3,10,8
chr17	2186133	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=162,149;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,6:0.146:46:14,0:26,6:0|1:2186133_C_T:2186133:18,22,0,6
chr17	2186139	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=162,149;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,6:0.152:44:12,0:24,6:0|1:2186133_C_T:2186133:16,22,0,6
chr17	2186142	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,6:0.156:43:12,0:23,6:0|1:2186142_C_T:2186142:15,22,0,6
chr17	2186143	.	A	ATCTCTT	.	.	DP=43;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=162,149;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,6:0.156:43:12,0:23,6:0|1:2186133_C_T:2186133:15,22,0,6
chr17	2186150	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=210,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,6:0.194:34:11,0:16,6:0|1:2186142_C_T:2186142:12,16,0,6
chr17	2186156	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=28,36;MFRL=208,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,6:0.189:35:12,0:17,1:0|1:2186142_C_T:2186142:13,16,0,6
chr17	2196150	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=111,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,4:6,4:5,3,6,2
chr17	2202323	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=162,242;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,1:11,1:10,12,1,1
chr17	2203025	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=106,264;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,2:7,1:6,9,1,2
chr17	2203175	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=127,285;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.184:36:10,4:20,2:15,15,3,3
chr17	2227006	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=186,81;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,5:4,0:3,6,5,0
chr17	2238741	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=18,14;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:0,2:1,0:1,1,2,4
chr17	2238765	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=159,167;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:6,0:7,0:5,10,2,0
chr17	2279581	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=17,20;MFRL=141,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.634:6:0,1:0,1:0,2,0,4
chr17	2279597	.	G	GCCGCGCACTCGCTC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=207,252;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,1:3,1:0,4,0,3
chr17	2282839	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,29;MFRL=178,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.620:5:0,1:0,2:0,2,0,3
chr17	2298156	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.272:16:4,1:5,0:0|1:2298156_A_C:2298156:6,6,4,0
chr17	2298158	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.259:17:5,0:6,0:0|1:2298156_A_C:2298156:6,7,4,0
chr17	2298163	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.241:18:4,1:6,0:7,7,4,0
chr17	2310611	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=221,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr17	2318695	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=203,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:2,7:2,2:0,4,0,9
chr17	2367656	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=151,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:8,0:8,6:2,15,0,6
chr17	2371000	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:3,6:0,3:3,0,9,0
chr17	2573652	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr17	2585113	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=190,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,3:5,7:2,6,4,6
chr17	2595215	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr17	2595243	.	CCGCCCCGCCA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	2597111	.	CA	TC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=197,290;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr17	2597723	.	GCAGCGGGGACA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=225,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAGCGGGGACA;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:0,1:2,1:0,2,2,0
chr17	2597925	.	A	ACTTCACTAAGACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:2597925_A_ACTTCACTAAGACT:2597925:0,1,0,1
chr17	2597927	.	C	CTTTATGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:2597925_A_ACTTCACTAAGACT:2597925:0,1,0,1
chr17	2598627	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,4,9
chr17	2598639	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=129,121;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,2:3,2:0,6,3,1
chr17	2603966	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=178,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr17	2604375	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=206,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr17	2699935	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=225,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.366:9:2,2:3,1:1,5,1,2
chr17	2703764	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=149,110;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:4,1,1,2
chr17	2867372	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=102,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:2867372_G_T:2867372:4,3,1,1
chr17	2867387	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:1,0:0|1:2867372_G_T:2867372:2,1,1,1
chr17	2883500	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr17	2888249	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=139,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,4:5,3:7,0,6,1
chr17	2894569	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr17	2908816	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=139,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,0:3,3:1,6,0,3
chr17	2911423	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=145,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:11,2:0|1:2911423_T_C:2911423:6,12,1,1
chr17	2911428	.	G	GGTTTCCAAGCT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=140,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:2911423_T_C:2911423:6,10,1,1
chr17	2923767	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=76.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,14,7
chr17	2923933	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:11,2:10,4:2,19,3,3
chr17	2929286	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=246,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:1,9:2,4:3,0,6,7
chr17	2930223	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=178,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,4:5,6:8,0,5,5
chr17	2935577	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=125,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,2:4,1:9,1,3,0
chr17	2935591	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,11,4
chr17	2966695	.	AGT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=175,178;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:2966695_AGT_A:2966695:1,1,0,1
chr17	2966700	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=175,178;MMQ=27,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:2966695_AGT_A:2966695:1,1,0,1
chr17	2995994	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=152,69;MMQ=50,34;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:18,2:9,2:22,5,4,0
chr17	3100802	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=145,242;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:4,0,1,1
chr17	3119008	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,1:0,10:0,0,7,4
chr17	3119871	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=183,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,0,7
chr17	3182309	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=153,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:4,1:1,6,1,1
chr17	3195058	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=268,715;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:5,0:4,2:6,3,2,0
chr17	3195867	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=193,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,0:6,7:0,13,0,7
chr17	3213878	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,1:7,1:6,7,1,1
chr17	3214142	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=213,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,0:7,2:0|1:3214142_T_C:3214142:9,10,1,1
chr17	3214149	.	GTGAC	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=197,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:8,2:0|1:3214142_T_C:3214142:12,10,1,1
chr17	3214156	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=197,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:9,1:0|1:3214142_T_C:3214142:12,10,1,1
chr17	3214181	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=119,207;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,5:8,4:5,7,6,3
chr17	3214314	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,318;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:7,0:7,9,0,3
chr17	3337057	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=222,172;MMQ=40,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:1,7:0,8:0,1,8,7
chr17	3343406	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:6,3,2,0
chr17	3417123	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	3419689	.	CA	TG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=181,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,2:4,4:4,0,5,1
chr17	3419690	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,1:0,8:0,0,8,1
chr17	3424183	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr17	3427442	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=222,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr17	3427725	.	C	CAAAACCACAATGAGATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=131,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	3430271	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:1,2,1,6
chr17	3433543	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=143,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:0|1:3433543_A_G:3433543:2,6,1,1
chr17	3433549	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:0|1:3433543_A_G:3433543:0,5,1,1
chr17	3433595	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr17	3435872	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	3435935	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=219,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,2:1,0,6,0
chr17	3475367	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=63.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,6:0,0,18,0
chr17	3475405	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr17	3475564	.	CA	TA,TC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28,30;MFRL=0,230,228;MMQ=60,60,60;MPOS=24,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.57,7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,3:0.583,0.333:9:0,3,2:0,2,1:0,0,1,8
chr17	3480396	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=74,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:3,1,2,4
chr17	3486608	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:3,6,1,1
chr17	3489249	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=131,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr17	3493533	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr17	3514234	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,1:6,1:2,8,0,2
chr17	3524766	.	ATCCT	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=136,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCCT;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.284:5:2,0:1,1:0|1:3524766_ATCCT_A:3524766:1,3,0,1
chr17	3524785	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,36;MFRL=136,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:3524766_ATCCT_A:3524766:1,3,0,1
chr17	3524798	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=80,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:3524766_ATCCT_A:3524766:0,4,0,1
chr17	3527281	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:5,1:2,4:3,4,5,0
chr17	3527551	.	TGAAGAAAAG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=189,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:2,2:0,4,1,2
chr17	3533412	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=170,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr17	3552038	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=226,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr17	3553526	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,8,10
chr17	3553655	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	3558417	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,6,4
chr17	3558695	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=139,238;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0|1:3558695_A_G:3558695:0,2,0,4
chr17	3558698	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=238,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,2:0.375:6:1,1:3,1:1|0:3558695_A_G:3558695:0,4,0,2
chr17	3563339	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr17	3567461	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=111,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.712:11:2,4:0,4:2,1,6,2
chr17	3591822	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=226,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:1,1:2,1:4,0,2,0
chr17	3594276	.	TG	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.766:18:3,8:1,6:2,2,9,5
chr17	3594341	.	C	CCGGCAGTGGT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=183,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:1,7,1,1
chr17	3594959	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=180,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.183:20:6,0:10,3:12,5,3,0
chr17	3618298	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=183,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr17	3620138	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr17	3626763	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr17	3627473	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=208,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr17	3635645	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=189,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:5,5,3,2
chr17	3635768	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=188,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,1:7,4:3,7,3,2
chr17	3638037	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=232,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr17	3643101	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=164,71;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:3,3:10,0:6,7,2,1
chr17	3646977	.	C	CTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=170,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=T;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:0,2:3,1:0,6,0,5
chr17	3664477	.	A	AATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=186,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,1:1,5:1,1,2,4
chr17	3665116	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=250,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:4,0,6,0
chr17	3665160	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=254,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:2,0,2,3
chr17	3716259	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,1,1
chr17	3719447	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=170,76;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:8,0:10,3:8,10,1,2
chr17	3724724	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=160,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,2:0,1:0,1,0,3
chr17	3776867	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=365,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr17	3786802	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=129,205;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,1:4,1:5,5,0,2
chr17	3787593	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.298:14:5,0:5,3:9,1,3,1
chr17	3801080	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=170,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:3,1:2,2:4,2,1,2
chr17	3801252	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=127,82;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.246:13:3,2:7,0:5,5,3,0
chr17	3806664	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=184,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,1,1
chr17	3806794	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=205,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:3,2:1,3:3,1,6,0
chr17	3808497	.	AA	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=262,259;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr17	3808713	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr17	3848043	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:2,12,0,2
chr17	3854056	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=173,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:2,7,2,0
chr17	3856615	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:4,4,5,1
chr17	3910125	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=222,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,6:2,3:2,2,8,1
chr17	3922918	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=154,68;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:4,2,2,0
chr17	3923115	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:5,1:2,2:0,8,0,3
chr17	3928122	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr17	3953083	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=108,204;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,2:4,3:5,5,2,3
chr17	3955248	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=124,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:5,0:6,3:6,5,2,1
chr17	3961489	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=141,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0,5,2,2
chr17	3962450	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=242,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,0:0,4:2,0,3,1
chr17	3966280	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,1,2
chr17	3976075	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=145,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:0,3:1,1:0,1,1,3
chr17	3978531	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.628:22:2,10:6,4:5,3,5,9
chr17	3980318	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=118,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr17	3981148	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:7,1,5,0
chr17	3985832	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=125,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:0,4,0,5
chr17	3989934	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=185,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:4,3:4,0:5,3,2,1
chr17	3989968	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=64,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:1,2,2,4
chr17	3991943	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=253,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,4:0,1:4,1,5,0
chr17	3994170	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr17	4005521	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=82,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:4,0,6,0
chr17	4005770	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr17	4007875	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr17	4012850	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr17	4017575	.	GTATTA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=219,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr17	4027392	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr17	4045809	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	4046270	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,365;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	4058168	.	CCTT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=180,261;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:9,1:2,1:1,10,2,1
chr17	4060233	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=190,299;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:3,1:13,1:8,8,2,0
chr17	4071302	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr17	4083242	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=319,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:1,1:0,3:0,1,0,5
chr17	4098573	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr17	4098808	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:1,3,1,1
chr17	4100591	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	4100841	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,0:5,6:4,7,0,6
chr17	4120494	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=236,352;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,1:2,1:0,3,0,3
chr17	4199933	.	ATCTT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=210,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:5,1,5,0
chr17	4351396	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=149,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr17	4391132	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:1,4:5,10:1,5,8,6
chr17	4391135	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=151,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,0:13,2:8,10,1,1
chr17	4391153	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=131,166;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:0,4:5,9:1,4,6,7
chr17	4391201	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:0,4:5,6:2,3,2,8
chr17	4436005	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr17	4437214	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=226,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:0,2:0,2:0,1,1,3
chr17	4439313	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr17	4439501	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr17	4439795	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	4442636	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=240,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.505:4:0,2:2,0:0|1:4442636_G_GT:4442636:2,0,2,0
chr17	4442639	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=158,240;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.495:4:2,0:0,2:1|0:4442636_G_GT:4442636:2,0,2,0
chr17	4442641	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=158,240;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.495:4:2,0:0,2:1|0:4442636_G_GT:4442636:2,0,2,0
chr17	4442945	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,15;MFRL=100,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:9,0:5,0:8,6,0,2
chr17	4448104	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,304;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:3,2,2,1
chr17	4448853	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=271,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,6:0,1:0,1,5,2
chr17	4451908	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=166,70;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:0|1:4451908_C_T:4451908:8,7,1,1
chr17	4451911	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=166,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:0|1:4451908_C_T:4451908:8,7,1,1
chr17	4458314	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,231;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:3,4,2,2
chr17	4495570	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=145,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr17	4497084	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:8,0,3,0
chr17	4498656	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,2:0,5,1,5
chr17	4498682	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr17	4500072	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	4500170	.	C	CTTCTGCGCCCTGGTACACTCCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=107,477;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr17	4534834	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=144,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr17	4535385	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=213,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:1,3,5,1
chr17	4535413	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=213,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:1,1,2,2
chr17	4541744	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,240;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	4542717	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=188,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:6,1,3,0
chr17	4544729	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	4544978	.	G	GAGA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,6:0,0,2,6
chr17	4574841	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=140,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:6,2:12,0:3,15,0,2
chr17	4575442	.	CTCT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCT;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:4,1:6,1:6,5,1,1
chr17	4576173	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=165,198;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,3:6,0:5,9,3,0
chr17	4576620	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,3:5,3:6,5,4,2
chr17	4576801	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,0:6,3:0|1:4576801_T_G:4576801:4,9,0,3
chr17	4576807	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,0:7,1:0|1:4576801_T_G:4576801:4,9,0,3
chr17	4576808	.	G	GCCCTCCTTTTCCCTCCA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,0:7,1:0|1:4576801_T_G:4576801:4,9,0,3
chr17	4578007	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,4,6
chr17	4579301	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:10,1:5,3:11,4,3,1
chr17	4579638	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=146,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,3:5,6:7,2,5,4
chr17	4580137	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,4,13
chr17	4580224	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	4585821	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=124,168;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,0:7,3:9,8,0,3
chr17	4586253	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,9:0,5:0,0,7,7
chr17	4594847	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr17	4622551	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=190,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,2:5,0:7,3,1,1
chr17	4623456	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=147,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:2,1,3,0
chr17	4623676	.	C	CTCTCTCTCTCTCTCT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,2:6,0:5,9,0,2
chr17	4637886	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=219,149;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.783:21:1,7:3,10:1,3,6,11
chr17	4638010	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=178,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,1:0,7:0,1,2,6
chr17	4642069	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,9,6
chr17	4642787	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=259,232;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr17	4644491	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr17	4646533	.	C	CAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=A;STR;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr17	4646702	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=163,97;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:9,0:9,2:6,13,0,2
chr17	4647002	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr17	4647358	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=137,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:1,1:9,1:3,7,1,1
chr17	4648618	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,0:1,0:2,5,2,0
chr17	4675209	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=111,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,0:3,2:3,7,2,0
chr17	4686340	.	TT	GG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=69.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,6,10
chr17	4688996	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr17	4693054	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,7:0,0,10,8
chr17	4693338	.	C	CGAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=133,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:4693338_C_CGAA:4693338:0,1,0,1
chr17	4693341	.	A	AAACCAGGTGGGTGTCTAGGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=133,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:4693338_C_CGAA:4693338:0,1,0,1
chr17	4699947	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=122,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:6,1:13,2:13,6,1,2
chr17	4712757	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:1,5:1,11:0,2,7,9
chr17	4714021	.	G	GGAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAAA;STR;TLOD=37.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:0,5:1,4:0,1,9,0
chr17	4720131	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=235,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,4:2,3:2,0,4,3
chr17	4722299	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr17	4722715	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:4,4,0,2
chr17	4725920	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=224,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:2,0:3,0,2,0
chr17	4794452	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:14,0:13,2:14,17,0,2
chr17	4794492	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.606:11:1,3:3,2:0,4,1,6
chr17	4794495	.	G	GCACACACACACA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=127,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,18;RU=CA;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.315:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr17	4795619	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=158,259;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,0,2
chr17	4795620	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=259,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.573:4:1,0:1,2:0,2,2,0
chr17	4796656	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:1,6,1,1
chr17	4797305	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=155,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:8,7,0,2
chr17	4797718	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=182,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.420:14:5,3:3,1:6,2,3,3
chr17	4799289	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,242;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:6,0:11,4:12,5,1,3
chr17	4799897	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=156,241;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:9,0:2,6:6,5,6,0
chr17	4804865	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=167,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:10,1:7,2:7,11,2,1
chr17	4804902	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=182,114;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:8,6:6,1:6,9,2,5
chr17	4836006	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=169,156;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:6,0:13,3:7,12,0,3
chr17	4837788	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=194,37;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:3,0:7,2:6,4,1,1
chr17	4837952	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=38.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,3:0,9:0,0,6,6
chr17	4838370	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=294,220;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	4845686	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.351:19:5,1:2,1:6,6,7,0
chr17	4845768	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:4,6:3,8:3,4,3,11
chr17	4851487	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr17	4856084	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.496:12:2,3:4,3:2,4,3,3
chr17	4859974	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=188,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:17,0:7,7:8,16,0,7
chr17	4876443	.	A	AATTTCTCTCTCTCCAGTCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=249,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:4,0,0,1
chr17	4877120	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=243,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,1:1,4:0,2,1,4
chr17	4881776	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=179,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:1,5:6,4:6,1,7,2
chr17	4882952	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,4:4,2:2,2,6,0
chr17	4883818	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:4,3:2,1:6,0,5,0
chr17	4885982	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=156,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:1,1,3,0
chr17	4886037	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,8:4,2:2,4,8,2
chr17	4893357	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=197,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,3,2
chr17	4907907	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,9:0.188:51:28,0:14,9:15,27,0,9
chr17	4927032	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=221,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,1:0,0:0,1,2,0
chr17	4927425	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,3:9,0:10,3,0,3
chr17	4936584	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=191,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.396:13:3,2:3,1:2,6,5,0
chr17	4937273	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=168,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:8,1:3,1:1,10,2,0
chr17	4937982	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	4996470	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=148,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.884:6:1,2:0,3:0,1,3,2
chr17	4996915	.	AC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,6:0,0,7,9
chr17	4997787	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,11,15
chr17	4997813	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:11,2:16,1:10,17,1,2
chr17	4998894	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:7,2:1,0:4,4,1,1
chr17	4999672	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr17	5015226	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=212,238;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr17	5036122	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=188,221;MMQ=60,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:6,0,1,1
chr17	5036138	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=27,31;MFRL=184,194;MMQ=60,34;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,1:3,2:0|1:5036138_T_C:5036138:6,0,3,1
chr17	5036148	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=25,30;MFRL=198,171;MMQ=60,34;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,1:4,3:10,0,4,1
chr17	5036152	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=32,27;MFRL=209,171;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:6,2:4,3:0|1:5036138_T_C:5036138:11,0,4,1
chr17	5036161	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=34,29;MFRL=209,170;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:7,3:4,4:0|1:5036138_T_C:5036138:11,0,6,1
chr17	5036191	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=10;MBQ=35,29;MFRL=199,138;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:12,6:6,4:13,5,10,0
chr17	5036205	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=10;MBQ=28,32;MFRL=187,138;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,12:0.351:35:16,6:7,5:0|1:5036205_A_C:5036205:15,8,11,1
chr17	5036210	.	TC	GT	.	.	DP=32;ECNT=10;MBQ=28,35;MFRL=188,138;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,10:0.324:32:12,6:7,4:0|1:5036205_A_C:5036205:13,9,9,1
chr17	5036214	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=10;MBQ=30,27;MFRL=188,138;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,10:0.344:30:10,5:7,4:0|1:5036205_A_C:5036205:11,9,9,1
chr17	5036224	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=10;MBQ=31,35;MFRL=164,135;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,9:0.246:39:11,5:16,4:0|1:5036205_A_C:5036205:20,10,8,1
chr17	5036329	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=169,190;MMQ=60,34;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:1,9,1,3
chr17	5036784	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=32,20;MFRL=165,113;MMQ=60,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,1:8,2:8,8,1,2
chr17	5036843	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=35,25;MFRL=170,178;MMQ=40,33;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:4,0:2,10,0,2
chr17	5036849	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=29,27;MFRL=177,178;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:1,7:1,3:0,2,1,9
chr17	5036864	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=165,166;MMQ=40,26;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,3:3,0:1,6,1,2
chr17	5036923	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=32,25;MFRL=163,201;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,3:3,1:4,4,0,4
chr17	5036930	.	GGGGT	G	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=161,194;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:0|1:5036930_GGGGT_G:5036930:4,3,0,3
chr17	5036936	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=169,194;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,2:1,1:0|1:5036930_GGGGT_G:5036930:3,3,0,3
chr17	5036943	.	GGGA	G	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=36,32;MFRL=211,194;MMQ=60,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0|1:5036930_GGGGT_G:5036930:3,1,0,3
chr17	5038535	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=150,60;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,0:10,3:14,8,0,3
chr17	5038559	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=128,147;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:7,4:10,1:0|1:5038559_C_A:5038559:12,5,4,1
chr17	5038569	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=128,147;MMQ=60,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:9,4:10,1:0|1:5038559_C_A:5038559:12,7,4,1
chr17	5038576	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=126,147;MMQ=60,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:9,4:8,1:0|1:5038559_C_A:5038559:9,9,4,1
chr17	5039893	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,72;MMQ=60,52;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:5,2,1,1
chr17	5044640	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=151,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.316:11:5,1:3,1:6,2,3,0
chr17	5045630	.	T	TTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=231,226;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,1,2
chr17	5048207	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,204;MMQ=50,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,4:0,5:1,0,1,8
chr17	5066305	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=169,147;MMQ=60,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,4:1,3:2,1,3,4
chr17	5073730	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr17	5087602	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=273,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr17	5249998	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=195,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr17	5266377	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=144,202;MMQ=60,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.447:14:3,0:3,6:2,6,0,6
chr17	5268356	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=263,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.829:13:1,6:0,5:2,0,8,3
chr17	5268439	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=123,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.157:42:15,0:21,6:14,22,0,6
chr17	5276531	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=171,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr17	5281602	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=177,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr17	5290681	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=162,248;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,1:6,2:7,5,3,0
chr17	5290703	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=137,248;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,1:4,2:6,5,3,0
chr17	5290910	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=142,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:10,0:5,5:9,6,5,0
chr17	5298320	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,279;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:2,7,0,2
chr17	5302778	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	5308603	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.434:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr17	5324836	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=111,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:8,3:10,1:5,13,2,2
chr17	5335752	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=165,246;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr17	5336569	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=153,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,1:11,2:10,7,2,1
chr17	5336791	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,276;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,3:4,0:2,8,2,1
chr17	5337060	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=139,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,3:9,0:11,6,0,3
chr17	5337124	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:13,0:9,2:5,18,0,3
chr17	5337137	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=124,287;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:1,10,0,2
chr17	5338301	.	GAAAACAGACAAGGC	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAACAGACAAGGC;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,0:4,2:7,9,2,0
chr17	5347576	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=193,182;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:3,5,2,0
chr17	5358671	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,273;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,2:3,0:1,2,0,3
chr17	5367024	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:3,1:0,4,1,1
chr17	5383932	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=36,20;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.260:9:2,2:5,0:0|1:5383932_C_CA:5383932:1,6,1,1
chr17	5383935	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:0|1:5383932_C_CA:5383932:1,6,1,1
chr17	5383940	.	G	GACAAACAGCCCAA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:5383932_C_CA:5383932:1,6,1,1
chr17	5386034	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=151,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:7,9:6,0:12,1,10,0
chr17	5388568	.	T	TCAAC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,251;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:4,0:10,2:4,10,0,2
chr17	5421005	.	TC	AA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:3,0,5,0
chr17	5424129	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=257,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr17	5424376	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=280,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr17	5983942	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:4,1,3,2
chr17	6021541	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:0,2:2,1:1,1,0,4
chr17	6329846	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=207,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr17	6330153	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=204,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,2,0
chr17	6331803	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,13:0,0,9,9
chr17	6331836	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,4:0,5:0,1,4,5
chr17	6350727	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr17	6351013	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.267:28:8,7:13,0:11,10,7,0
chr17	6360823	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=255,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,6:5,0:10,0,6,0
chr17	6367470	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,1:6,3:9,2,3,1
chr17	6371738	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=218,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr17	6373737	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.736:21:4,6:1,8:1,4,8,8
chr17	6386911	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=164,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:0|1:6386911_A_C:6386911:2,10,1,1
chr17	6386914	.	AG	TA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=164,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:6386911_A_C:6386911:2,10,1,1
chr17	6387482	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	6428620	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=120,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:5,0,2,2
chr17	6441207	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=215,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr17	6483046	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=194,280;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:2,2:4,0:5,1,1,1
chr17	6493056	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr17	6493391	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=197,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr17	6515341	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=176,254;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,2:9,1:10,4,0,3
chr17	6524358	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=246,262;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr17	6545702	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,8:5,3:5,5,4,7
chr17	6553410	.	TA	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=156,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.172:29:10,5:13,0:6,18,1,4
chr17	6553583	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=187,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:6,1,4,0
chr17	6555546	.	C	CG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=37.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr17	6606537	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=191,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr17	6607435	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=246,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr17	6659324	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=122,292;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,0:6,3:5,2,2,1
chr17	6661584	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=184,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.396:16:1,1:7,5:1,9,0,6
chr17	6690354	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=164,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr17	6690522	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,15;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:3,1,1,0
chr17	6690683	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,1:7,1:9,7,2,0
chr17	6703985	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=175,272;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr17	6704273	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=100,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,4:4,2:2,3,2,4
chr17	6716385	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	6719367	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=150,244;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	6899559	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	6900383	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	6902179	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,6,8
chr17	6905935	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=208,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6905935_G_A:6905935:0,1,0,1
chr17	6905942	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=208,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6905935_G_A:6905935:0,1,0,1
chr17	6908565	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,71;MMQ=60,29;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:3,0:22,3:13,12,0,3
chr17	6909377	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:6909377_GC_G:6909377:0,0,4,0
chr17	6909379	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:6909377_GC_G:6909377:0,0,4,0
chr17	6909392	.	GGCTCT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:6909377_GC_G:6909377:0,0,3,0
chr17	6912967	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=225,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr17	6913652	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=20,22;MFRL=121,96;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:12,3:5,5:6,11,5,3
chr17	6913662	.	ATTAC	A	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=125,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:8,2:0|1:6913662_ATTAC_A:6913662:9,16,1,1
chr17	6913667	.	A	AAT	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=128,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:6,2:0|1:6913662_ATTAC_A:6913662:8,14,1,1
chr17	6913672	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=128,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:0|1:6913662_ATTAC_A:6913662:7,11,1,1
chr17	6913677	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=139,48;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:7,2:0|1:6913662_ATTAC_A:6913662:9,13,1,1
chr17	6913679	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=139,48;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:8,2:0|1:6913662_ATTAC_A:6913662:9,13,1,1
chr17	6915401	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:2,1,4,1
chr17	6917703	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,0,8
chr17	6927350	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,15,4
chr17	6928019	.	C	CCAG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=187,121;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=CAG;STR;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.831:9:1,4:0,4:0,1,2,6
chr17	6979179	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,3:7,3:7,6,3,3
chr17	6979218	.	AATAGG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATAGG;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr17	7004927	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,285;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:8,3,1,1
chr17	7011064	.	GCACACTACACACACCGCACACGTA	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=172,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CACACTACACACACCGCACACGTA;STR;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.652:9:0,6:0,0:1,2,2,4
chr17	7011129	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.533:26:8,5:3,8:1,11,5,9
chr17	7011144	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:6,9:9,5:6,9,3,11
chr17	7011254	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:4,1,1,1
chr17	7012073	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=193,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:8,2:4,3:0|1:7012073_G_T:7012073:7,5,5,0
chr17	7012077	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=192,184;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:7,2:4,3:0|1:7012073_G_T:7012073:6,5,5,0
chr17	7012079	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=192,184;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:7,2:4,3:0|1:7012073_G_T:7012073:6,5,5,0
chr17	7080041	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=12,15;MFRL=311,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:7080041_C_A:7080041:1,0,1,0
chr17	7080048	.	TT	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,19;MFRL=247,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.502:4:1,0:1,0:0|1:7080041_C_A:7080041:2,0,2,0
chr17	7080260	.	AG	CC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:8,2:7,1:0|1:7080260_AG_CC:7080260:0,16,4,0
chr17	7080266	.	AG	CC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:8,1:6,1:0|1:7080260_AG_CC:7080260:0,16,4,0
chr17	7080272	.	AG	CC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,1:0|1:7080260_AG_CC:7080260:0,14,2,0
chr17	7081801	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,110;MMQ=60,31;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:9,11,2,0
chr17	7094050	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:1,1:13,2:5,9,1,2
chr17	7111624	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=197,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr17	7121785	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,15,1
chr17	7123240	.	T	TGGGCGTGCAGGACGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGCGTGCAGGACGC;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.766:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr17	7129840	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,8:0,0,13,8
chr17	7129974	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr17	7132192	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=242,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr17	7132556	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=126,182;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,8:1,12:0,1,9,11
chr17	7145492	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,12:1,6:1,0,20,0
chr17	7150552	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,14:0,9:0,0,10,13
chr17	7156186	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=97.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,15:0,13:0,0,17,11
chr17	7158203	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr17	7160082	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	7160390	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr17	7164197	.	C	CTTTCTCCCTCCCT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.160:16:7,0:7,2:0|1:7164197_C_CTTTCTCCCTCCCT:7164197:9,5,0,2
chr17	7164198	.	G	GTCTGTTTCTCTCTC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.160:16:7,0:7,2:0|1:7164197_C_CTTTCTCCCTCCCT:7164197:9,5,0,2
chr17	7165348	.	GC	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=157,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:5,2:0|1:7165348_GC_G:7165348:6,9,1,1
chr17	7165357	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=157,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:7,2:0|1:7165348_GC_G:7165348:7,10,1,1
chr17	7165395	.	CG	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,6:0,0,4,9
chr17	7186986	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=159,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,3:4,3:4,7,4,2
chr17	7186994	.	AAC	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,18;MFRL=190,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:4,1:0|1:7186994_AAC_A:7186994:7,8,1,1
chr17	7186999	.	G	GGA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=187,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:0|1:7186994_AAC_A:7186994:4,8,1,1
chr17	7192198	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr17	7193055	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=236,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:0,0:1,7:0|1:7193055_GA_G:7193055:1,1,1,7
chr17	7193060	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=236,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:1,0:1,7:0|1:7193055_GA_G:7193055:1,1,1,7
chr17	7193255	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr17	7193448	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr17	7214824	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:7,9:8,4:9,6,5,8
chr17	7217028	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:6,2:12,0:7,11,1,1
chr17	7217336	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=138,190;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.206:45:18,8:18,0:13,23,9,0
chr17	7217463	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=172,158;MMQ=60,59;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,2:5,2:3,8,1,3
chr17	7217497	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,3:3,0:4,7,0,3
chr17	7220697	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=146,216;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:12,2:16,1:16,12,1,2
chr17	7221539	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=193,52;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.266:16:3,2:7,1:0|1:7221539_G_C:7221539:5,7,2,2
chr17	7221544	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=15,26;MFRL=193,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.369:14:2,3:2,1:0|1:7221539_G_C:7221539:4,5,2,3
chr17	7221558	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=167,85;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,5:0.285:19:7,5:7,0:1|0:7221539_G_C:7221539:3,11,5,0
chr17	7221707	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:3,2,3,1
chr17	7224319	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=175,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,4:2,3:2,4,1,6
chr17	7225425	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	7226274	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=182,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:9,3:5,0:7,7,2,1
chr17	7228469	.	GCC	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=12,35;MFRL=279,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=C;STR;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:0,3:1,1,0,4
chr17	7228479	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=279,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,0:1,5:1,1,1,5
chr17	7228685	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:5,8,0,2
chr17	7229545	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,4:8,3:9,4,5,2
chr17	7240627	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,96;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:14,0:8,4:9,13,0,4
chr17	7245882	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=148,174;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr17	7245885	.	C	G,T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,34,27;MFRL=148,205,142;MMQ=60,40,40;MPOS=14,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:3,0,1:1,1,0:0,4,0,2
chr17	7245902	.	T	TAGTGAGACCTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	7246965	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:6,3:10,1:9,7,3,1
chr17	7254315	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:3,3:3,3:1,6,6,1
chr17	7257847	.	GGT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=177,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=GT;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:1,1:4,2:7,1,3,0
chr17	7258938	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=136,264;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,3:8,1:12,6,2,2
chr17	7259073	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:4,0,6,0
chr17	7259083	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=185,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:2,5:1,2:3,0,8,0
chr17	7259317	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,17;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:6,1:8,0:6,12,2,0
chr17	7286185	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=217,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:1,0,4,0
chr17	7290533	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr17	7290787	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:0,1:0,2,2,3
chr17	7290821	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	7306727	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=126,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:16,1:8,2:9,15,1,2
chr17	7307103	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.797:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	7307287	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.866:20:1,5:1,13:1,1,15,3
chr17	7311773	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=136,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,1,1
chr17	7315363	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=140,205;MMQ=39,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:7315363_A_C:7315363:1,0,2,0
chr17	7315367	.	TC	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,19;MFRL=140,205;MMQ=39,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:7315363_A_C:7315363:1,0,2,0
chr17	7317622	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,17;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:7317622_C_G:7317622:2,2,1,0
chr17	7317625	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,15;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:7317622_C_G:7317622:2,2,1,0
chr17	7317626	.	GACCCCCT	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:7317622_C_G:7317622:2,2,1,0
chr17	7317639	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,12;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:2,2,1,0
chr17	7317642	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,15;MFRL=170,235;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,0:0|1:7317642_T_A:7317642:1,2,1,0
chr17	7317643	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,19;MFRL=170,235;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,0:0|1:7317642_T_A:7317642:1,2,1,0
chr17	7317647	.	A	C,AC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=0,32,24;MFRL=0,235,172;MMQ=60,60,60;MPOS=24,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,3:0.250,0.608:4:0,0,2:0,1,0:0,0,2,2
chr17	7318181	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:1,7,0,2
chr17	7318559	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr17	7340336	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=163,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr17	7345819	.	A	AGGTAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=204,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,2:2,0,6,0
chr17	7346302	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=196,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,0:0,5:2,0,4,1
chr17	7350544	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	7358803	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,4,11
chr17	7358861	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=294,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,1:1,3:0,1,1,4
chr17	7359357	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=214,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.378:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr17	7370155	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=203,109756;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,1,0
chr17	7386055	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,15:0,4:0,0,10,9
chr17	7386279	.	TG	CA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,51;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=176.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,23:0,17:0,0,13,27
chr17	7400041	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.905:8:0,6:0,0:0,0,0,8
chr17	7400448	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,4:0,0:0,0,1,4
chr17	7401335	.	G	GGCTCTGGGGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=271,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,0:4,2,1,2
chr17	7401572	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=270,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.799:8:1,1:0,5:0,1,0,7
chr17	7402256	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=206,143;MMQ=60,44;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr17	7402556	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,7,3
chr17	7403942	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr17	7404209	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr17	7404991	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,10,14
chr17	7405074	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr17	7406343	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr17	7411855	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr17	7411881	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,24;MFRL=255,144;MMQ=44,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:7411881_C_A:7411881:0,4,0,1
chr17	7411885	.	TT	CC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=255,144;MMQ=44,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:7411881_C_A:7411881:0,4,0,1
chr17	7412212	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr17	7412449	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:6,7,2,0
chr17	7413038	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=238,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr17	7414958	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr17	7417551	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,0,11
chr17	7452752	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=224,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:0,10:1,8:1,0,10,8
chr17	7453596	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:7453596_A_G:7453596:0,3,0,1
chr17	7453602	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=182,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:7453596_A_G:7453596:0,3,0,1
chr17	7460047	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=156,296;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:8,4,2,0
chr17	7467115	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=99,268;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.352:12:3,1:3,2:5,3,0,4
chr17	7467126	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=103,252;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.590:10:2,0:1,1:3,1,0,6
chr17	7467128	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=206,253;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:1,3:3,2,0,5
chr17	7467134	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=20,12;MFRL=218,252;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.402:10:1,0:1,1:3,3,0,4
chr17	7467136	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=218,253;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:0,1:2,2:1,3,0,5
chr17	7470285	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,5:0,0,6,4
chr17	7474277	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=214,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.778:25:2,7:3,13:2,3,6,14
chr17	7476296	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,14;MFRL=137,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.466:12:4,1:1,0:0,6,0,6
chr17	7477697	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:2,2:3,6,0,2
chr17	7479892	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=160,164;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:9,0:13,3:12,10,2,1
chr17	7480034	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:9,1:6,11,0,2
chr17	7480325	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=110,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:8,2:14,2,1,1
chr17	7484874	.	T	TGGGGGGGGGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=7,17;RU=G;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.881:6:0,1:0,0:0,0,0,6
chr17	7487108	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:6,1:15,1:19,2,2,0
chr17	7497335	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:4,9,0,2
chr17	7533423	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=402,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,3:0,4:1,0,9,0
chr17	7533461	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,0:2,4:5,3,4,0
chr17	7554772	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=255,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.619:8:1,4:1,1:3,0,5,0
chr17	7559037	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=189,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,1:5,2:6,5,3,0
chr17	7573897	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=207,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr17	7576443	.	C	CAAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=19,22;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7576443_C_CAAA:7576443:0,0,1,0
chr17	7576463	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=130,164;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:7576443_C_CAAA:7576443:1,0,1,0
chr17	7576468	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,16;MFRL=130,164;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:7576443_C_CAAA:7576443:1,0,1,0
chr17	7576473	.	CT	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,17;MFRL=130,164;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:7576443_C_CAAA:7576443:1,0,1,0
chr17	7577562	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=197,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:15,0:12,3:16,11,3,0
chr17	7578115	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=256,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,4,1
chr17	7578645	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=275,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr17	7579711	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=168,83;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,0:9,2:8,7,0,2
chr17	7579801	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=210,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:1,1:1,4:1,2,4,2
chr17	7592168	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.156:21:8,0:9,2:7,11,2,1
chr17	7606721	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=193,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:0|1:7606721_GC_G:7606721:3,2,2,0
chr17	7606722	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=185,181;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,6:0.693:8:1,3:1,3:1|0:7606721_GC_G:7606721:1,1,4,2
chr17	7612605	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=185,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:1,2,2,0
chr17	7640560	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:5,3:5,7,3,0
chr17	7646166	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=154,255;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,1:2,0,4,0
chr17	7662928	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=239,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr17	7673548	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,93;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:6,5,0,2
chr17	7674850	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=229,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,3:6,0:0,10,0,3
chr17	7690404	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=160,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,1:1,0:0,2,1,1
chr17	7691628	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=221,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,1,2
chr17	7695937	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=188,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr17	7700712	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.596:15:0,7:5,2:4,2,4,5
chr17	7701204	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=182,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr17	7701806	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=147,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,0:0,2:4,1,1,1
chr17	7702357	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr17	7705084	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=218,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr17	7705089	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=143,253;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr17	7710933	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=236,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	7721030	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=168,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,5:1,6:1,0,8,4
chr17	7721231	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,1,3
chr17	7721542	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=216,331;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:9,0,1,1
chr17	7724473	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=167,375;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:2,1,1,0
chr17	7726665	.	C	CAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=AG;STR;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.846:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr17	7733555	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr17	7733833	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=208,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,2:2,3:3,5,3,2
chr17	7735986	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=173,141;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.237:36:10,8:17,0:15,13,1,7
chr17	7750357	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=169,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:3,2:2,0:3,3,2,0
chr17	7750847	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=159,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:6,2:13,4:15,4,3,3
chr17	7751778	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=109,208;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:3,1:2,4:2,4,0,5
chr17	7752231	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=189,299;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:5,6,0,2
chr17	7752283	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=26,25;MFRL=263,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,2,0
chr17	7752286	.	A	ACC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=24,17;MFRL=213,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:7752286_A_ACC:7752286:0,4,1,0
chr17	7752292	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,12;MFRL=226,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:7752286_A_ACC:7752286:0,4,1,0
chr17	7752296	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,12;MFRL=189,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:7752286_A_ACC:7752286:0,3,1,0
chr17	7752300	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,12;MFRL=189,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:7752286_A_ACC:7752286:0,3,1,0
chr17	7752306	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,12;MFRL=189,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,0:2,0:0|1:7752286_A_ACC:7752286:0,3,1,0
chr17	7755387	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=175,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:8,1:9,2:9,8,1,2
chr17	7755732	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=195,247;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,4:7,3:10,2,4,3
chr17	7760638	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=17,22;MFRL=175,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.283:24:5,3:2,1:13,5,6,0
chr17	7761626	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=154,261;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:15,1:18,2:19,14,2,1
chr17	7788409	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	7793193	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=16,22;MFRL=209,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.348:7:1,0:1,2:0,5,0,2
chr17	7793972	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=124,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:14,1:9,1:13,10,1,1
chr17	7794011	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=146,143;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:18,3:13,0:25,7,3,0
chr17	7794202	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=191,263;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,5:2,3:3,2,4,4
chr17	7801509	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=202,239;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr17	7804405	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=213,333;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:2,1,0,2
chr17	7806529	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=76,260;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr17	7811998	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,7:2,3:1,2,3,7
chr17	7814860	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=202,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,3:5,3:4,8,3,3
chr17	7828326	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=132,81;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr17	7828329	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=132,81;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:4,0,1,1
chr17	7828558	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=204,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:1,1:2,3:0,4,2,3
chr17	7829005	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=132,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,0:14,2:10,12,0,2
chr17	7830610	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,1,1
chr17	7832766	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=177,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,2,1
chr17	7838383	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=119,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:7,0:13,4:7,13,0,4
chr17	7840679	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr17	7846836	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=202,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:1,3,1,3
chr17	7852528	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=208,230;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:1,1,1,4
chr17	7852887	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr17	7909773	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=198,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,4:3,0:6,1,2,2
chr17	7912759	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,317;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	7912855	.	G	GAGATGAGACACCATA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=148,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,0:3,2:5,2,1,1
chr17	7915689	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=201,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr17	7919170	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=179,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.343:18:5,2:6,3:9,3,3,3
chr17	7919208	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=160,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.278:5:1,1:3,0:3,1,0,1
chr17	7919754	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=165,232;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:5,3,1,2
chr17	7919833	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=140,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:3,4,3,2
chr17	7942434	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:5,0,1,1
chr17	7943127	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=187,98;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:7,2:4,0:0|1:7943127_C_A:7943127:11,0,2,0
chr17	7943133	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=187,98;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:0|1:7943127_C_A:7943127:11,0,2,0
chr17	7977105	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:1,4:1,8:0,2,0,12
chr17	7978819	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=300,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr17	7979463	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=132,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:0,4:1,5:1,0,7,2
chr17	7984373	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,12;MFRL=179,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.329:12:2,1:6,0:0,8,4,0
chr17	7999937	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=100,84;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.265:28:11,7:10,0:9,12,7,0
chr17	8013197	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=177,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:7,0,2,1
chr17	8014831	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=199,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:0|1:8014831_C_A:8014831:9,4,1,1
chr17	8014840	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=199,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0|1:8014831_C_A:8014831:10,3,1,1
chr17	8014863	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=159,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,4:4,1:1,3,4,1
chr17	8015579	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:1,3,2,1
chr17	8019067	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,5:4,1:1,6,2,4
chr17	8020376	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=201,215;MMQ=56,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,4:2,3:0,2,0,7
chr17	8045714	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=121,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:9,5:8,3:7,10,4,4
chr17	8046772	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=125,157;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.785:21:2,6:2,11:1,3,13,4
chr17	8047080	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=131,85;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.313:30:9,9:12,0:18,3,8,1
chr17	8048010	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=163,246;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:2,0,3,0
chr17	8048377	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=234,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:1,0:3,2:0,5,0,2
chr17	8050737	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=202,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.811:19:0,6:3,10:3,0,8,8
chr17	8051639	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=138,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,1:4,4:0,7,1,4
chr17	8052075	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=126,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.154:37:17,2:15,3:15,17,2,3
chr17	8053085	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=262,217;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,4:3,2:1,3,2,4
chr17	8064081	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=232,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr17	8064083	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr17	8066107	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr17	8079029	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=64,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:2,3:0,3:2,0,5,1
chr17	8110764	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:2,4:0,8:1,1,7,5
chr17	8137737	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,13,8
chr17	8138643	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=206,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr17	8139327	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=218,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=73.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:1,9:0,12:1,0,6,15
chr17	8139339	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=197,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.190:29:10,3:14,2:9,15,3,2
chr17	8141324	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:4,0:16,2:19,1,2,0
chr17	8141582	.	G	GAAACAAAGGGCATCCAAATTGGAATGGAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=155,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.320:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr17	8141707	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,7,9
chr17	8158273	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	8159232	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:1,4:0,5:0,1,2,7
chr17	8166378	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=232,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,5:1,4:1,0,2,7
chr17	8167962	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=235,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr17	8168805	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=204,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:1,1,1,5
chr17	8169006	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr17	8194319	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=219,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,5:1,6:0,1,2,9
chr17	8197663	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr17	8215534	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:0,1:1,6:0,1,2,5
chr17	8216737	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:5,3:2,3:6,2,6,0
chr17	8219478	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=214,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr17	8222816	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:4,0:8,3:3,9,3,0
chr17	8224133	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=189,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:1,1,3,1
chr17	8273604	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=101,180;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,0:6,3:8,6,0,3
chr17	8285398	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=187,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,3:2,5:2,0,6,2
chr17	8349984	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,5:0,0,6,0
chr17	8380438	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=174,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr17	8383894	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	8387438	.	G	GATGA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,9:0,0,11,4
chr17	8390733	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=194,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:1,7:0,10:0,1,14,3
chr17	8395894	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr17	8411812	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr17	8413305	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=201,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:1,8,0,2
chr17	8413314	.	CCA	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CA;STR;TLOD=42.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr17	8433828	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,355;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	8449767	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr17	8451744	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr17	8479841	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr17	8647337	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,362;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	8648018	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:8648018_A_AC:8648018:0,4,0,2
chr17	8648021	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:8648018_A_AC:8648018:0,4,0,2
chr17	8648023	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,1:2,0:0|1:8648018_A_AC:8648018:0,4,0,2
chr17	8656777	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,168;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,0:8,3:4,8,0,3
chr17	8725173	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=172,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:8,3:6,6:9,5,3,6
chr17	8725214	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=50.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,9,9
chr17	8742830	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=221,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,0:5,2:7,0,2,0
chr17	8742862	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=212,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:7,0,2,1
chr17	8743118	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr17	8784361	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,290;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,2:6,2:3,8,1,3
chr17	8785087	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=115,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:8,2:4,2:0|1:8785087_A_C:8785087:8,9,3,3
chr17	8785092	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=115,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.308:24:12,3:3,4:0|1:8785087_A_C:8785087:8,9,4,3
chr17	8792371	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=207,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr17	8794002	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=182,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr17	8794014	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=161,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr17	8809164	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,15;MFRL=262,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0,3,1,0
chr17	9066098	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,5:0,4:1,0,8,1
chr17	9083081	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr17	9086561	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr17	9124464	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:0,0:5,2:0|1:9124464_T_TC:9124464:0,5,0,2
chr17	9124472	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=37,30;MFRL=126,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,7:0.667:10:0,0:3,7:1|0:9124464_T_TC:9124464:0,3,1,6
chr17	9153861	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=242,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:4,4,5,3
chr17	9154078	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=255,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:0,5,0,3
chr17	9395041	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=220,196;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:5,0,0,4
chr17	9479048	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.634:12:2,3:2,3:2,2,4,4
chr17	9541877	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=115,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr17	9546551	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=201,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr17	9559656	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=247,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:3,1,3,1
chr17	9580047	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=102,72;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:9,4:9,0:8,10,3,1
chr17	9590259	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=99,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:9590259_C_T:9590259:1,2,0,2
chr17	9590263	.	CA	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:0|1:9590259_C_T:9590259:1,4,0,2
chr17	9680451	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=164,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:0,1:5,3:5,0,4,0
chr17	9680679	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=151,273;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr17	9683087	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=160,225;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr17	9694660	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	9764386	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:11,1,2,0
chr17	9764531	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=238,139;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,6:3,5:3,2,5,6
chr17	9764547	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=175,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,2:6,3:5,7,2,3
chr17	9765514	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=186,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr17	9769199	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=148,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.279:12:6,2:2,1:1,8,2,1
chr17	9783855	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,2,2
chr17	9791159	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=223,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr17	9791375	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:0,4,0,7
chr17	9801324	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:7,0,5,0
chr17	9808264	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:6,5,0,2
chr17	9808297	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=165,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:8,2:4,0:5,7,1,1
chr17	9820695	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=146,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,3:2,6:0,3,2,7
chr17	9820739	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=146,309;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr17	9821249	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,7:0,0:0,0,7,0
chr17	10205047	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr17	10205067	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr17	10216442	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=213,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:4,0,6,1
chr17	10219366	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=265,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:1,4,0,5
chr17	10222507	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=248,225;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	10223714	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:3,3,4,0
chr17	10231218	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=175,72;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,3:8,0:6,5,2,1
chr17	10231335	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=204,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,3:4,0:2,6,2,1
chr17	10235360	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=217,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,1:4,2:4,1,2,1
chr17	10243589	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=298,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:1,7:1,6:1,1,5,8
chr17	10258153	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=186,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.526:19:1,7:7,3:0|1:10258153_GT_G:10258153:4,5,5,5
chr17	10258155	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=186,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.524:19:1,7:8,3:0|1:10258153_GT_G:10258153:4,5,5,5
chr17	10263572	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=188,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:1,1:0,3,0,3
chr17	10263598	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=190,289;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,1:1,0:0,2,0,2
chr17	10267942	.	C	CAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=206,332;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr17	10297479	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=221,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,4:4,0:7,0,4,0
chr17	10304529	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,1:5,2:7,5,3,0
chr17	10304822	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=195,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,5:7,0:6,5,5,0
chr17	10310113	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=146,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:7,3:7,0:10,4,1,2
chr17	10310310	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=160,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,7:4,4:1,8,0,11
chr17	10317831	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=177,355;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,2,0
chr17	10318476	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=215,179;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.267:28:9,7:12,0:6,15,7,0
chr17	10318636	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,14,4
chr17	10348354	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,184;MMQ=52,49;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:2,5,3,0
chr17	10348705	.	A	AGAAGC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=142,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAAGC;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,1:1,10,0,2
chr17	10353704	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=204,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:7,1:2,3:8,1,3,1
chr17	10353985	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=156,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,1:7,1:6,12,1,1
chr17	10356704	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=222,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:10356704_C_T:10356704:0,4,0,1
chr17	10356711	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=194,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:10356704_C_T:10356704:0,3,0,1
chr17	10357281	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=260,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,4:2,4:0,2,0,8
chr17	10358170	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=224,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:4,3,2,0
chr17	10358400	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=214,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,2:8,1:3,9,0,3
chr17	10359782	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:3,1,5,1
chr17	10362746	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=189,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,2:2,3:2,5,0,5
chr17	10364191	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=234,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,3:5,2:5,4,4,1
chr17	10369540	.	CAT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=207,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,1:5,1:9,2,2,0
chr17	10370140	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=0,147;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:10370140_G_GA:10370140:1,2,0,2
chr17	10370146	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=101,147;MMQ=60,52;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:10370140_G_GA:10370140:1,3,0,2
chr17	10395919	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=219,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr17	10399897	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,301;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:2,4,1,2
chr17	10400963	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=210,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,6:0,6:1,0,8,4
chr17	10418275	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=128,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:5,1:8,1:7,6,0,2
chr17	10426343	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,0:1,6:1,0,6,0
chr17	10427268	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	10431275	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=299,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr17	10432638	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=226,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:3,5,0,2
chr17	10434925	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=88,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:7,3:3,1:6,4,3,1
chr17	10442977	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,2:5,1:0,5,0,3
chr17	10443877	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,3:9,0:12,4,3,0
chr17	10532884	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr17	10533434	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:7,3:14,0:6,15,1,2
chr17	10533595	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=265,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=60.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:1,9:1,7:1,1,8,8
chr17	10533602	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=209,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:7,4:5,4:6,6,3,5
chr17	10535349	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=232,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:1,5:2,8:0,3,2,11
chr17	10535428	.	TTTTTG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTTTG;STR;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	10535761	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=233,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr17	10536184	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0|1:10536184_A_G:10536184:0,3,0,2
chr17	10536189	.	A	AGACATCCTGTGACTGTGTCAGTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=147,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:10536184_A_G:10536184:0,4,0,1
chr17	10542803	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=246,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:3,7:0,5:1,2,2,10
chr17	10543183	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr17	10543218	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=232,258;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,1,3
chr17	10543281	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr17	10544018	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:1,3:1,0,3,5
chr17	10544696	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=254,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:1,3:0,4:0,1,2,5
chr17	10546130	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=221,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,3:1,7:4,0,4,6
chr17	10546345	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=161,148933;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:10546345_G_GT:10546345:0,5,0,2
chr17	10546348	.	A	AAAAAAATCCAAACAAC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=161,148933;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:10546345_G_GT:10546345:0,5,0,2
chr17	10546350	.	A	ATATAAC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=161,148933;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:10546345_G_GT:10546345:0,5,0,2
chr17	10548992	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,5,4
chr17	10549184	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=237,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,2:0,7:1,1,4,5
chr17	10550845	.	TTTTTG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTTTG;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.713:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	10552000	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=98,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.584:7:2,3:1,1:1,2,3,1
chr17	10553046	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr17	10555028	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=304,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.566:14:2,5:1,3:1,5,4,4
chr17	10614051	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=154,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr17	10728643	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,97;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.288:20:8,3:6,0:6,8,6,0
chr17	11459012	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=238,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:2,0,7,0
chr17	11511412	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr17	11513661	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,12,1
chr17	11515031	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,129;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.257:37:13,0:15,9:12,16,0,9
chr17	11522764	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	11523082	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr17	11536093	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=270,246;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr17	11543520	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=192,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr17	11543678	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,65;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:3,7,1,1
chr17	11550340	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=97,237;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:3,1,4,1
chr17	11572669	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=144,261;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:6,0:11,3:12,5,1,2
chr17	11593480	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=167,116;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:6,10,2,0
chr17	11593821	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=202,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr17	11603300	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,3,3
chr17	11604598	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	11607797	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=312,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:11607797_A_T:11607797:1,1,0,1
chr17	11607815	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11607797_A_T:11607797:0,0,0,1
chr17	11666674	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr17	11684571	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	11687721	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=168,282;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:7,0:10,4:9,8,2,2
chr17	11697049	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr17	11725337	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=177,275;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:8,3,2,3
chr17	11778240	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=116,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,4:4,0:6,4,3,1
chr17	11784823	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=288,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:11784823_T_C:11784823:0,2,0,2
chr17	11784829	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=288,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:11784823_T_C:11784823:0,2,0,2
chr17	11806266	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr17	11827112	.	GC	AA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=230,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,1:2,4,3,1
chr17	11827353	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr17	11835321	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=196,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.428:19:5,3:6,5:0|1:11835321_C_T:11835321:7,4,6,2
chr17	11835331	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=165,234;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,3:0.180:20:10,0:7,3:1|0:11835321_C_T:11835321:10,7,2,1
chr17	11881356	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=145,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:8,2:8,0:8,8,1,1
chr17	11887518	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,0:0,1:0,3,0,3
chr17	12620761	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,4:0,5:1,0,3,6
chr17	12647490	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,6,9
chr17	12656521	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:7,0:9,5,1,1
chr17	12844296	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr17	12855719	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=110,250;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:2,1,3,0
chr17	12859149	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=206,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,2:4,3:7,3,4,1
chr17	12896244	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,2:7,0:3,10,1,1
chr17	12897669	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,1:7,2:8,2,2,1
chr17	12898454	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr17	12898994	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=173,236;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr17	12903599	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=237,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=48.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,5:1,9:1,0,3,11
chr17	12905525	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=206,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr17	12905574	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=241,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:0,11:1,6:1,0,13,4
chr17	12905743	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=169,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=81.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,27:0.800:33:2,17:4,10:3,3,16,11
chr17	12906705	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=179,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr17	12909046	.	A	AATC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATC;STR;TLOD=50.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,4:0,0,7,5
chr17	12909162	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.419:22:9,8:3,1:5,8,4,5
chr17	12914920	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=208,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,5,1
chr17	12915139	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=185,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:2,8,0,2
chr17	12915184	.	AGAACGCCAATT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=203,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr17	12917856	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=134,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr17	12918980	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=201,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr17	12920260	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,24:0.808:29:2,10:3,14:0,5,8,16
chr17	12920526	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,19;MFRL=184,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,1:0,0:0,5,0,3
chr17	13399486	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=274,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.692:8:2,4:0,2:2,0,6,0
chr17	13400230	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=287,246;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	13972811	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.905:8:0,2:0,4:0|1:13972811_G_A:13972811:0,0,7,1
chr17	13972814	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=164,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0|1:13972811_G_A:13972811:5,1,2,0
chr17	13977813	.	C	CTTTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.887:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr17	14005373	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,12,1
chr17	14005386	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:0,4:1,6:1,0,8,2
chr17	14005647	.	C	CAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=174,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AT;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	14095309	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=129,147;MMQ=59,45;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,6:4,3:7,1,7,2
chr17	14095550	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=159,170;MMQ=57,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.272:42:17,6:14,5:13,18,4,7
chr17	14095566	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=160,258;MMQ=57,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:21,2:16,1:12,25,3,0
chr17	14095639	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=146,136;MMQ=49,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,1:11,3:13,10,0,4
chr17	14139565	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=163,186;MMQ=52,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,23:0.558:41:5,10:12,13:10,8,14,9
chr17	14139774	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr17	14140191	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=180,115;MMQ=27,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.393:8:3,0:2,3:0,5,1,2
chr17	14673431	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:9,1,2,0
chr17	14683347	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,3:14,0:10,13,0,3
chr17	15134175	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=221,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:7,0,2,0
chr17	15162389	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=97,241;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,2:7,1:10,4,3,0
chr17	15215660	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=172,151;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:3,4:11,2:9,5,2,4
chr17	15217389	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=140,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,5:6,1:6,3,5,1
chr17	15217437	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=126,158;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:4,7:8,5:4,8,6,6
chr17	15222535	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:1,1,0,3
chr17	15343524	.	C	CCTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CTT;STR;TLOD=80.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,5,14
chr17	15406123	.	CCTCTCT	C,CCT,CCTCTCTCT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31,34,31;MFRL=0,151,160,130;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,19,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,8,9,12;RU=CT;STR;TLOD=5.15,11.19,13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,4,5:0.157,0.360,0.423:11:0,0,4,2:0,2,0,3:0,0,11,0
chr17	15496612	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,154;MMQ=40,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:1,1:5,3:5,1,3,1
chr17	15498181	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=206,145;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,4:5,1:5,4,4,1
chr17	15498211	.	GAAAAGATA	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=193,139;MMQ=51,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,3:2,2:1,9,1,4
chr17	15500031	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=213,172;MMQ=52,45;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr17	15508521	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=146,207;MMQ=52,34;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:2,2,0,2
chr17	15516147	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=211,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.350:15:6,3:4,2:1,9,2,3
chr17	15516159	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=200,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:0|1:15516159_A_C:15516159:2,12,0,2
chr17	15516162	.	AA	CC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=207,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:0|1:15516159_A_C:15516159:2,11,0,2
chr17	15517372	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=174,176;MMQ=52,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.222:11:3,1:6,1:1,8,1,1
chr17	15546084	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,263;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	15546128	.	A	AGTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,263;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15546128_A_AGTG:15546128:0,0,0,1
chr17	15546130	.	C	CACAATCTGGG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,263;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15546128_A_AGTG:15546128:0,0,0,1
chr17	15546133	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,263;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15546128_A_AGTG:15546128:0,0,0,1
chr17	15554504	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=188,171;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:4,1:8,3:6,6,3,1
chr17	15554561	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=126,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:1,2:6,2:4,4,0,4
chr17	15604395	.	TG	CA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,45;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr17	15604444	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=137,186;MMQ=57,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:1,12:0,4:1,0,11,5
chr17	15611495	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=200,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.720:23:3,6:3,11:5,1,8,9
chr17	15613114	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=183,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.481:20:4,4:6,6:7,3,3,7
chr17	15620647	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr17	15640921	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=125,69;MMQ=39,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:7,0:2,2:0|1:15640921_G_T:15640921:2,7,1,1
chr17	15640926	.	G	GCTTTCTCTAGC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,69;MMQ=39,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:15640921_G_T:15640921:1,8,1,1
chr17	15641449	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=190,197;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:6,2:10,2:0|1:15641449_A_G:15641449:2,14,0,4
chr17	15641457	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=184,197;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:8,2:8,2:0|1:15641449_A_G:15641449:3,15,0,4
chr17	15641459	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=184,197;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:9,2:9,2:0|1:15641449_A_G:15641449:3,15,0,4
chr17	15641462	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=184,197;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:9,2:9,2:0|1:15641449_A_G:15641449:3,15,0,4
chr17	15641472	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=190,200;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.249:22:9,3:8,2:0|1:15641449_A_G:15641449:3,14,0,5
chr17	15643381	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=207,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:2,2,2,0
chr17	15643382	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=209,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.668:6:1,2:1,2:2,0,2,2
chr17	15905190	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=237,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:7,3,2,0
chr17	15909728	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=211,122;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.329:13:1,1:8,3:3,6,2,2
chr17	15928584	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=239,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr17	15930087	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=192,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,2:4,2:1,8,1,3
chr17	15950198	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=272,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:3,1,3,0
chr17	15961951	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:0,6,0,2
chr17	15961993	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr17	15968143	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=182,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:6,2,4,1
chr17	15973417	.	GTT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=197,293;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr17	15973844	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,3:7,3:3,10,2,4
chr17	15974872	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=163,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:9,0:11,5:11,9,2,3
chr17	15983711	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:14,2:5,0:10,9,1,1
chr17	16046845	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=111,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr17	16049626	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=235,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr17	16056614	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,1:7,2:9,8,3,0
chr17	16068278	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=11;MBQ=28,35;MFRL=154,202;MMQ=60,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:13,4:14,0:0|1:16068278_A_G:16068278:13,14,4,0
chr17	16068287	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=11;MBQ=28,29;MFRL=157,202;MMQ=60,33;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.147:32:13,3:14,0:0|1:16068278_A_G:16068278:13,15,4,0
chr17	16068328	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=11;MBQ=34,15;MFRL=166,135;MMQ=40,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:11,0:19,0:0|1:16068328_C_T:16068328:20,15,0,2
chr17	16068334	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=32,24;MFRL=169,135;MMQ=40,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:12,1:18,0:0|1:16068328_C_T:16068328:18,14,0,2
chr17	16068340	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=11;MBQ=32,25;MFRL=171,163;MMQ=40,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,9:0.257:37:13,3:15,6:0|1:16068340_C_T:16068340:11,17,8,1
chr17	16068342	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=11;MBQ=30,20;MFRL=171,149;MMQ=40,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.103:37:9,3:20,0:0|1:16068328_C_T:16068328:19,15,0,3
chr17	16068343	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=11;MBQ=30,30;MFRL=171,163;MMQ=40,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,9:0.263:36:10,3:15,6:0|1:16068340_C_T:16068340:11,16,8,1
chr17	16068362	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=34,25;MFRL=174,163;MMQ=40,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.277:34:12,3:13,6:7,18,8,1
chr17	16068377	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=11;MBQ=33,27;MFRL=171,154;MMQ=51,25;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.267:28:11,3:8,4:0|1:16068377_C_G:16068377:7,14,7,0
chr17	16068383	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=33,29;MFRL=171,152;MMQ=50,26;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,8:0.273:31:11,4:9,3:0|1:16068377_C_G:16068377:8,15,7,1
chr17	16068396	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=11;MBQ=33,25;MFRL=171,152;MMQ=50,26;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.315:33:13,5:9,5:9,14,4,6
chr17	16068506	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=178,132;MMQ=52,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,1:3,4:3,7,0,5
chr17	16068545	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=197,201;MMQ=40,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:5,3:3,4,0,3
chr17	16120595	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,14:0.295:46:16,10:16,0:20,12,14,0
chr17	16185248	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=212,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:5,0,2,0
chr17	16203386	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=218,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16203386_T_C:16203386:0,1,0,1
chr17	16203388	.	CCAGTCCT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=218,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16203386_T_C:16203386:0,1,0,1
chr17	16221271	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr17	16229232	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=220,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:2,4,1,2
chr17	16248083	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:1,7,0,2
chr17	16248088	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=152,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr17	16251859	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=156,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:0,7:1,7:0,1,10,4
chr17	16256240	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	16323589	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=205,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:2,1:4,1:0|1:16323589_C_A:16323589:1,5,1,1
chr17	16323602	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=187,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:4,0:0|1:16323589_C_A:16323589:0,5,1,1
chr17	16326253	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=168,230;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr17	16330919	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,233;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:0,9,0,2
chr17	16332072	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:0,0:3,5:3,0,5,0
chr17	16335191	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=89,219;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,0:1,3:1,3,1,2
chr17	16342813	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=238,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:2,6,2,0
chr17	16344314	.	A	ACT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:8,4:17,3:19,6,4,3
chr17	16344523	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=225,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,1:2,4:0,6,0,5
chr17	16351111	.	AAC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AC;STR;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr17	16469797	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr17	16470730	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:12,8:9,0:11,10,8,0
chr17	16525824	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=162,197;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:3,3:7,2:7,4,3,2
chr17	16527795	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.547:20:4,7:5,4:4,5,4,7
chr17	16550817	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,256;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr17	16552882	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=174,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.255:10:2,1:6,1:8,0,2,0
chr17	16623497	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=141,185;MMQ=32,48;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.291:11:4,2:4,1:5,3,2,1
chr17	16631111	.	TTG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=184,141;MMQ=25,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:16631111_TTG_T:16631111:0,1,0,1
chr17	16631114	.	T	TCAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=184,141;MMQ=25,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:16631111_TTG_T:16631111:0,1,0,1
chr17	16640776	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=203,296;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,3,1
chr17	16745274	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=199,172;MMQ=25,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,0:0,5:1,2,1,4
chr17	16745756	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=180,794061;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:16745756_C_CTT:16745756:0,5,0,2
chr17	16745759	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=180,794061;MMQ=25,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:16745756_C_CTT:16745756:0,5,0,2
chr17	16745762	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=180,794061;MMQ=25,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:16745756_C_CTT:16745756:0,5,0,2
chr17	16745767	.	C	CTGCCCTCTCT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=180,794061;MMQ=25,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:16745756_C_CTT:16745756:0,5,0,2
chr17	16746881	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=154,194;MMQ=39,38;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr17	16748666	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=116,192;MMQ=53,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,4:1,3:3,0,3,4
chr17	16842912	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:8,7:3,2:5,6,3,6
chr17	16946073	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	16960911	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=175,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,3:7,4:2,7,6,1
chr17	16961133	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=204,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	17030003	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=185,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:5,1,3,0
chr17	17035036	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr17	17039561	.	CCAG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=141,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=CAG;STR;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:2,2:1,4,4,0
chr17	17045861	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,239;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr17	17046145	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=195,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:0,6,1,3
chr17	17050573	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,4:3,1:5,1,1,4
chr17	17067385	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=134,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:5,0:4,4:7,2,0,4
chr17	17076164	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=167,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr17	17079636	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=111,90;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:1,2:2,2,3,0
chr17	17116976	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,1:9,1:9,4,2,0
chr17	17118442	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=272,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:0,8:1,1:1,0,5,4
chr17	17120344	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=184,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:2,2,4,0
chr17	17122286	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr17	17122327	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=199,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,5:2,2:6,0,4,3
chr17	17124625	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=254,242;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr17	17127471	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,2:3,5:1,3,1,6
chr17	17152359	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=19,14;MFRL=177,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:1,0:0,0:0|1:17152359_G_T:17152359:2,2,0,2
chr17	17152363	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=19,14;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:1,0:0,0:0|1:17152359_G_T:17152359:2,3,0,2
chr17	17158147	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=123,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:2,2,0,2
chr17	17168053	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=188,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.458:11:4,1:2,4:6,0,1,4
chr17	17168316	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=144,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr17	17179299	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr17	17179481	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,8:2,2:1,3,4,6
chr17	17183862	.	AC	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=162,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=46.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.650:24:4,8:4,7:5,3,5,11
chr17	17183866	.	AG	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=162,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.647:24:3,7:4,7:5,3,5,11
chr17	17184033	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=164,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,2:4,4:0,5,1,5
chr17	17184080	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=168,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr17	17184399	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,15,2
chr17	17412032	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr17	17480195	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr17	17697093	.	CCAGCAGCAGCAG	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,316;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=CAG;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:5,0:8,2:13,7,2,0
chr17	17717545	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.441:7:1,0:3,0:0|1:17717545_A_C:17717545:1,3,3,0
chr17	17717550	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.441:7:0,0:3,0:0|1:17717545_A_C:17717545:1,3,3,0
chr17	17726965	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=226,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,1,2
chr17	17726972	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=222,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:17726972_G_C:17726972:0,4,1,0
chr17	17726977	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=222,230;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:17726972_G_C:17726972:0,4,1,0
chr17	17726982	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=222,230;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:17726972_G_C:17726972:0,4,1,0
chr17	17726987	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=222,230;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:17726972_G_C:17726972:0,4,1,0
chr17	17750907	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=210,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,2:1,0,5,0
chr17	17770355	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=192,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,5:3,2:0,5,0,7
chr17	17772622	.	GA	G,GAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=16,33,27;MFRL=195,186,102;MMQ=60,60,60;MPOS=19,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.54,6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,6:0.230,0.591:9:0,2,3:0,0,1:1,0,4,4
chr17	17880877	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=142,287;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:6,1:11,3:13,4,3,1
chr17	17880955	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=154,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:10,0:18,3:15,13,0,3
chr17	17897739	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=145,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,2:5,4:2,6,0,6
chr17	17900990	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=220,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr17	17931884	.	CAAAA	C,CAAAAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33,31;MFRL=169,140,285;MMQ=60,60,60;MPOS=11,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,13,19;RU=A;STR;TLOD=3.03,6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,3:0.219,0.492:5:1,1,2:0,0,1:1,0,3,1
chr17	17942719	.	G	GGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=213,212;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GT;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr17	17962351	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=207,265;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr17	18003648	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=126,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:7,3,3,1
chr17	18003671	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,6,7
chr17	18003845	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=202,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,2:4,5:2,4,4,3
chr17	18024013	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr17	18025744	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:2,5,0,7
chr17	18030193	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=212,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:4,0:10,4:11,5,1,3
chr17	18030240	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=187,259;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,2:2,4:0,2,4,2
chr17	18030524	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=216,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,2:3,1:1,9,0,3
chr17	18034485	.	T	TTCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,15;MFRL=193,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,0:1,1:2,0,4,0
chr17	18034486	.	G	GGC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,8;MFRL=193,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.646:6:1,0:0,1:2,0,4,0
chr17	18042208	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=175,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:7,9,1,1
chr17	18042276	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,4,9
chr17	18042527	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr17	18042976	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=304,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr17	18043766	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr17	18044270	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=222,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,4,2
chr17	18045446	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,232;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:4,0:13,2:13,4,1,1
chr17	18046058	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,6,6
chr17	18047772	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,1:0,0,5,2
chr17	18051975	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,7:0,0,3,7
chr17	18052466	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr17	18054868	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr17	18054917	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr17	18057167	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=120,163;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:6,7:2,6:2,6,5,8
chr17	18057272	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr17	18057907	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=215,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr17	18059494	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=225,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.676:19:3,4:2,9:2,4,9,4
chr17	18060192	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=236,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:2,2:0,4:2,0,7,0
chr17	18060412	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,1:7,3:9,3,2,2
chr17	18075496	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=163,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,2:6,4:6,6,2,4
chr17	18098180	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr17	18111793	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=217,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr17	18111802	.	GTTTTTGT	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=236,234;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTTGT;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.506:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr17	18135753	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=197,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:3,1,5,0
chr17	18139896	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=182,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,5:1,2:3,4,4,3
chr17	18140080	.	CC	GG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=235,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0,3,1,0
chr17	18141705	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=265,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:2,1:0,2:2,0,3,1
chr17	18144720	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=208,188;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:2,0,6,0
chr17	18145379	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=193,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,4:4,3:3,4,4,3
chr17	18149854	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=214,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,6:1,4:1,1,6,4
chr17	18151424	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=196,255;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr17	18154278	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=165,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.152:28:10,0:14,3:12,12,3,1
chr17	18156541	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=180,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,3:4,7:5,2,10,0
chr17	18158542	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=176,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:3,2:12,4:10,5,3,3
chr17	18164404	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:3,4:9,6:7,5,6,4
chr17	18184011	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=113,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,1:5,4:2,5,2,3
chr17	18194362	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr17	18196109	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,331;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:8,1:14,2:6,16,0,3
chr17	18202996	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=130,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:4,7,0,2
chr17	18205660	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=217,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.598:30:5,11:6,7:7,5,6,12
chr17	18205750	.	TGGAGAGTGAA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=241,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGAGAGTGAA;STR;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:5,3:3,1:5,4,1,3
chr17	18208334	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=245,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr17	18208544	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=156,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:13,2:5,4:7,11,2,4
chr17	18218164	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=261,240;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr17	18231998	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr17	18232017	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:4,2:6,1:10,1,3,0
chr17	18232518	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=119,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:3,0:12,3:14,1,3,0
chr17	18233810	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:3,2,2,0
chr17	18239012	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=175,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,4:5,1:3,4,2,3
chr17	18291432	.	TCACAGC	T	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=110,201;MMQ=27,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,4:0.104:46:10,2:30,2:0|1:18291432_TCACAGC_T:18291432:35,7,4,0
chr17	18291456	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=110,196;MMQ=27,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,5:0.118:49:10,2:30,3:0|1:18291432_TCACAGC_T:18291432:33,11,4,1
chr17	18291470	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=148,194;MMQ=55,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:12,2:8,4:0|1:18291432_TCACAGC_T:18291432:8,13,5,1
chr17	18291544	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=107,207;MMQ=54,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:15,3:12,1:11,17,1,3
chr17	18291618	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=102,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,3:7,4:4,8,2,5
chr17	18380065	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=238,193;MMQ=40,33;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:8,0,2,0
chr17	18380137	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=140,93;MMQ=60,20;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,10:0.188:56:26,10:20,0:28,18,10,0
chr17	18380154	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=116,224;MMQ=60,43;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,8:0.132:66:37,5:21,3:42,16,3,5
chr17	18380163	.	GGA	G	.	.	DP=70;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=121,146;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GA;STR;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,7:0.116:66:34,3:22,4:39,20,2,5
chr17	18380298	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=159,243;MMQ=57,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:11,0:15,3:9,18,0,3
chr17	18387366	.	AAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=207,163;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:2,3,2,5
chr17	18391123	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.394:23:8,3:6,5:7,7,3,6
chr17	18394552	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,166;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,2,1
chr17	18394706	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=187,159;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,1,3
chr17	18397711	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,160;MMQ=26,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:5,5:5,4:2,8,2,7
chr17	18486836	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=134,40;MMQ=37,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.223:28:15,5:7,0:15,7,4,2
chr17	18491000	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,396;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	18498497	.	GAA	G,GAAA,GAAAA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,32,33,19;MFRL=195,146,182,104;MMQ=55,60,40,42;MPOS=30,22,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,9,12,13;RU=A;STR;TLOD=7.27,20.66,3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:13,3,13,2:0.101,0.407,0.086:31:8,1,6,1:4,2,3,0:5,8,8,10
chr17	18525855	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,165;MMQ=25,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:4,4,0,2
chr17	18541296	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=435,184;MMQ=27,33;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,4,1
chr17	18541775	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=167,202;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,2:2,6:0,3,1,7
chr17	18541852	.	ACCCAC	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=236,196;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0|1:18541852_ACCCAC_A:18541852:2,0,4,1
chr17	18541868	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=236,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.670:7:1,3:1,2:0|1:18541852_ACCCAC_A:18541852:2,0,4,1
chr17	18542074	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=262,188;MMQ=56,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.835:16:1,7:1,7:0,2,2,12
chr17	18542432	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=274,240;MMQ=52,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr17	18638151	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=244,147;MMQ=56,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,4:0,0:0,2,3,1
chr17	18648022	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=170,144;MMQ=27,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,3:6,0:1,8,0,3
chr17	18651211	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=166,129;MMQ=27,21;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:6,1:5,2:4,7,2,1
chr17	18651412	.	A	ATCCTGCCCTGTGCC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=200,63;MMQ=52,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:7,0:5,6,1,1
chr17	18651495	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=200,180;MMQ=40,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18651495_GG_AA:18651495:0,1,0,1
chr17	18651499	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=200,180;MMQ=40,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18651495_GG_AA:18651495:0,1,0,1
chr17	18651502	.	G	GTGGGGGGAATCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=200,180;MMQ=40,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18651495_GG_AA:18651495:0,1,0,1
chr17	18678548	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=202,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,4:7,0:3,9,2,2
chr17	18682677	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=197,208;MMQ=21,33;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.611:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr17	18684487	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=249,153;MMQ=51,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr17	18684527	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=191,214;MMQ=52,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:10,1:6,3:12,4,3,1
chr17	18694277	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,36;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr17	18708788	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=194,211;MMQ=46,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,1:9,2:8,8,3,0
chr17	18708830	.	GT	G,GTT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,32,26;MFRL=153,182,70;MMQ=60,57,60;MPOS=7,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=15.33,7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,7,10:0.338,0.452:21:2,4,8:2,3,0:4,0,11,6
chr17	18708981	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=195,246;MMQ=40,34;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:2,10,0,2
chr17	18709002	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=217,222;MMQ=40,33;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:3,1:1,5,1,3
chr17	18770733	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=100,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:0,4:3,1:0,3,0,6
chr17	18776020	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=232,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.777:7:0,2:1,4:0,1,1,5
chr17	18793061	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=229,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:2,1,4,1
chr17	18793225	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,4:5,4:2,8,4,4
chr17	18833810	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=210,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:4,1,4,0
chr17	18872337	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=113,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr17	18872625	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=213,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:5,2:1,1:5,1,4,0
chr17	18874685	.	C	CGGT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=182,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGT;STR;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:4,3,3,3
chr17	18874720	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=142,182;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:1,3,6,2
chr17	18874748	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=150,120;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,2:9,0:6,7,2,0
chr17	18882991	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,7,11
chr17	18923818	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=225,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,0:1,5:0,1,1,4
chr17	18927589	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=196,172;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:2,2:11,0:5,8,1,1
chr17	19188902	.	CTG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=262,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr17	19213335	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr17	19213351	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=176,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:19213351_T_G:19213351:1,2,0,1
chr17	19213354	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=176,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:19213351_T_G:19213351:1,2,0,1
chr17	19213358	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,24;MFRL=176,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:19213351_T_G:19213351:1,2,0,1
chr17	19213362	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=176,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:19213351_T_G:19213351:0,3,0,1
chr17	19232078	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,11,5
chr17	19235303	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,1:4,1:0|1:19235303_G_A:19235303:2,6,0,2
chr17	19235312	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=135,68;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.271:9:2,2:5,0:1|0:19235303_G_A:19235303:1,6,0,2
chr17	19247075	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=230,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.776:10:0,4:1,4:2,0,4,4
chr17	19250679	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=172,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,4:1,0:0,4,1,3
chr17	19261193	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=127,269;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:10,2:3,3:8,5,2,3
chr17	19263710	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=164,90;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.213:17:10,3:2,0:7,7,3,0
chr17	19265797	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,8:0,0,11,3
chr17	19282535	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=211,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr17	19284423	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=219,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,1:4,2:4,6,1,2
chr17	19314611	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	19314917	.	CTTTTT	C,CTT,CTTTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35,31,30;MFRL=0,88,136,117;MMQ=60,60,60,60;MPOS=11,10,12;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,13,15,17;RU=T;STR;TLOD=8.50,7.30,9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,4,3,4:0.264,0.251,0.418:11:0,3,2,1:0,1,1,2:0,0,10,1
chr17	19315752	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=159,44;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:8,3,2,0
chr17	19315779	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=158,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,0:9,3:9,6,2,1
chr17	19317654	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,212;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:2,1,3,0
chr17	19318031	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=149,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,2:1,2:1,0,2,2
chr17	19319015	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,5:3,2:5,0,2,5
chr17	19561011	.	GACTGAATT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTGAATT;STR;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.506:10:3,4:1,1:3,2,4,1
chr17	19564634	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=124,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr17	19606084	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19606084_T_A:19606084:0,0,0,1
chr17	19606085	.	T	TAAAGAAGCG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19606084_T_A:19606084:0,0,0,1
chr17	19609947	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=201,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:0,5:4,1:4,0,2,4
chr17	19610104	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.377:11:4,2:2,1:1,6,0,4
chr17	19642268	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=163,242;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr17	19643810	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=115,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:7,5:1,3:0,8,2,6
chr17	19687307	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr17	19699358	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,11,1
chr17	19699605	.	CAT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AT;STR;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.938:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr17	19749952	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=168,166;MMQ=60,55;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr17	19749978	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=22,10;MFRL=168,166;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:19749978_C_A:19749978:3,0,1,0
chr17	19749981	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=168,166;MMQ=60,55;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:19749978_C_A:19749978:3,0,1,0
chr17	19752997	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=110,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:3,3:3,3:8,5,6,0
chr17	19768201	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,3:4,0:3,10,0,3
chr17	19835112	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:6,7:8,0:5,9,6,1
chr17	19881062	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19881062_G_A:19881062:0,0,0,1
chr17	19881066	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19881062_G_A:19881062:0,0,0,1
chr17	20000131	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=214,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.761:23:3,11:2,7:2,3,6,12
chr17	20059591	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=178,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr17	20109104	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:10,0:5,5:5,10,0,5
chr17	20160925	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=188,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:1,5,0,4
chr17	20163616	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=146,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,3:4,2:4,5,2,3
chr17	20209474	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr17	20217337	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=168,147;MMQ=60,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:9,0:10,3:11,8,0,3
chr17	20321838	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=174,146;MMQ=43,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.404:12:2,1:5,4:4,3,4,1
chr17	20322514	.	C	CGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=141,145;MMQ=25,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr17	20769802	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=27,30;MFRL=128,176;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr17	20769832	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=27,25;MFRL=178,178;MMQ=52,28;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:6,2:8,5:0|1:20769832_C_T:20769832:8,6,8,0
chr17	20769845	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=172,163;MMQ=52,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,9:0.357:26:7,3:9,5:0|1:20769832_C_T:20769832:10,7,9,0
chr17	20769862	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=29,31;MFRL=181,148;MMQ=52,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,17:0.514:33:6,7:7,7:0|1:20769832_C_T:20769832:8,8,16,1
chr17	20769866	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=188,156;MMQ=52,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=65.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,19:0.555:34:6,8:9,8:0|1:20769832_C_T:20769832:7,8,18,1
chr17	20769896	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=8;MBQ=33,26;MFRL=182,148;MMQ=51,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=121.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,30:0.646:46:5,13:10,12:0|1:20769896_G_T:20769896:11,5,20,10
chr17	20769899	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=8;MBQ=28,27;MFRL=182,148;MMQ=51,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=121.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,30:0.646:46:5,15:11,15:0|1:20769896_G_T:20769896:11,5,20,10
chr17	20769904	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=8;MBQ=34,28;MFRL=180,148;MMQ=50,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=119.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,30:0.660:45:5,15:10,14:0|1:20769896_G_T:20769896:10,5,19,11
chr17	20769954	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=146,160;MMQ=57,36;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=90.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,24:0.595:40:8,12:6,12:0|1:20769954_T_G:20769954:7,9,4,20
chr17	20769964	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=8;MBQ=32,25;MFRL=157,166;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=87.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,22:0.622:35:5,12:6,9:0|1:20769954_T_G:20769954:5,8,2,20
chr17	20769968	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=173,167;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=82.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,21:0.595:35:7,13:7,8:0|1:20769954_T_G:20769954:4,10,2,19
chr17	20769995	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=173,170;MMQ=52,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,18:0.576:31:7,10:6,7:0|1:20769995_C_T:20769995:2,11,1,17
chr17	20770002	.	CC	AG	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=34,26;MFRL=189,175;MMQ=52,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,18:0.594:30:6,10:5,6:0|1:20769995_C_T:20769995:1,11,1,17
chr17	20770017	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=180,190;MMQ=43,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:9,3:7,1:0,17,1,3
chr17	20770042	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=35,32;MFRL=197,184;MMQ=52,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,5:4,3:0,6,0,8
chr17	20770088	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=255,212;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,3:5,2:0,5,1,4
chr17	20798977	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,212;MMQ=55,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,2:7,1:6,5,0,3
chr17	20906251	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,1:3,2:6,2,3,0
chr17	20906257	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,4:0,0,8,3
chr17	20906260	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=206,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.287:11:5,0:3,2:8,0,0,3
chr17	20906272	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=149,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:1,3:3,2:3,2,4,1
chr17	20908325	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr17	20914547	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=202,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:4,3:9,5:6,7,1,7
chr17	20914635	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,4:5,5:2,8,3,6
chr17	20921492	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr17	20924620	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	21087615	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=212,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:7,0,3,0
chr17	21087671	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=221,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:1,1,6,1
chr17	21147404	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr17	21188391	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=272,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr17	21201851	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,3:6,5:2,6,1,7
chr17	21201884	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=188,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:1,4:4,4:0|1:21201884_T_C:21201884:0,5,1,7
chr17	21201890	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:1,4:4,3:0|1:21201884_T_C:21201884:0,5,1,8
chr17	21201894	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:1,4:3,4:0|1:21201884_T_C:21201884:0,4,1,7
chr17	21201907	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:1,4:3,4:0|1:21201884_T_C:21201884:0,4,1,7
chr17	21202237	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=206,193;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,1:3,6:0,4,5,2
chr17	21202272	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=199,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,2:5,5:2,5,2,5
chr17	21202310	.	GC	AT	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=31,24;MFRL=122,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:2,4:7,1:0|1:21202310_GC_AT:21202310:2,7,0,5
chr17	21202316	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:2,3:5,1:0|1:21202310_GC_AT:21202310:1,7,0,4
chr17	21202317	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr17	21202318	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=122,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.422:10:2,3:4,1:0|1:21202310_GC_AT:21202310:1,5,0,4
chr17	21203820	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:4,3:3,4:0|1:21203820_G_C:21203820:4,4,4,4
chr17	21203825	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:0|1:21203820_G_C:21203820:4,4,4,4
chr17	21204308	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=193,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:4,2:8,2:0|1:21204308_G_T:21204308:6,6,2,3
chr17	21204314	.	TTG	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=193,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:3,3:8,2:0|1:21204308_G_T:21204308:5,7,2,3
chr17	21204318	.	A	ACG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=193,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:2,3:8,2:0|1:21204308_G_T:21204308:4,6,2,3
chr17	21205354	.	GA	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=228,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr17	21205396	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=195,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0|1:21205396_C_A:21205396:3,0,2,0
chr17	21205406	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0|1:21205396_C_A:21205396:3,0,2,0
chr17	21205594	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.229:13:6,1:4,2:3,7,2,1
chr17	21205604	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:5,1:2,7,0,3
chr17	21205642	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:4,4:2,3:0|1:21205642_T_G:21205642:0,7,0,7
chr17	21205654	.	AT	GA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:0|1:21205642_T_G:21205642:0,7,0,7
chr17	21206372	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=195,220;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:21206372_G_C:21206372:3,0,1,0
chr17	21206385	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=195,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:3,1:0,0:0|1:21206372_G_C:21206372:3,0,1,0
chr17	21206444	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=158,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:3,3,2,0
chr17	21206616	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=202,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:0,4,0,4
chr17	21206632	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=222,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0|1:21206632_C_T:21206632:0,4,0,3
chr17	21206635	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=222,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,0:2,2:0|1:21206632_C_T:21206632:0,4,0,3
chr17	21206642	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=222,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:21206632_C_T:21206632:0,4,0,2
chr17	21207813	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.215:26:8,3:12,2:13,8,3,2
chr17	21207916	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,10:0,0,1,21
chr17	21207938	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:8,3:5,3:0,13,0,6
chr17	21207945	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=46.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:5,7:1,6:0,6,0,13
chr17	21208292	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,34;MFRL=174,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,2:5,0:8,1,2,0
chr17	21208317	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=178,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:3,4:6,7:7,2,10,2
chr17	21208331	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=29,23;MFRL=178,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:8,0:12,5:14,7,2,3
chr17	21208347	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.364:31:6,2:13,9:10,10,6,5
chr17	21208349	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.272:31:6,3:17,5:11,12,5,3
chr17	21208449	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.310:27:8,2:10,6:0|1:21208449_G_T:21208449:8,11,8,0
chr17	21208456	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:8,2:8,6:0|1:21208449_G_T:21208449:6,11,8,0
chr17	21215424	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=189,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:6,4:11,5:10,7,5,4
chr17	21215434	.	A	AC	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:5,2:9,3:7,9,3,3
chr17	21215446	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:4,4:11,3:8,7,3,4
chr17	21215483	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=182,121;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,4:8,0:8,6,2,2
chr17	21215637	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.262:17:4,3:8,1:0|1:21215637_G_A:21215637:1,12,0,4
chr17	21215643	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:3,2:9,1:0|1:21215637_G_A:21215637:1,11,0,3
chr17	21216686	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=190,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,0:5,0,2,0
chr17	21216788	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=119,213;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,4:6,1:4,6,1,4
chr17	21216905	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21216905_G_A:21216905:0,0,0,1
chr17	21216907	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21216905_G_A:21216905:0,0,0,1
chr17	21217397	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:6,2:3,3:0|1:21217397_A_G:21217397:10,0,5,0
chr17	21217400	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:6,2:3,3:0|1:21217397_A_G:21217397:10,0,5,0
chr17	21217411	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=193,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:6,4:4,3:0|1:21217397_A_G:21217397:10,0,4,3
chr17	21217547	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=197,224;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,3:4,1:0|1:21217547_T_C:21217547:2,8,1,3
chr17	21217554	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=167,290;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:0|1:21217547_T_C:21217547:2,7,0,2
chr17	21217566	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=203,275;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:1,1:5,2:0,7,0,3
chr17	21217586	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=200,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:3,2:4,2:0|1:21217586_G_T:21217586:0,8,0,5
chr17	21217596	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=203,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:4,3:5,1:0|1:21217586_G_T:21217586:0,9,0,5
chr17	21318586	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=305,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21318586_G_C:21318586:1,0,1,0
chr17	21318595	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=305,244;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21318586_G_C:21318586:1,0,1,0
chr17	21318629	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	21318918	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=196,153;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.189:34:13,2:14,3:11,17,1,5
chr17	21318948	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=199,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:11,3:6,3:0|1:21318948_C_T:21318948:10,8,1,5
chr17	21318951	.	CA	TG	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=199,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:11,3:5,3:0|1:21318948_C_T:21318948:10,8,1,5
chr17	21318952	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=201,214;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.644:18:4,8:2,4:2,4,8,4
chr17	21319399	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=12;MBQ=28,34;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.189:35:12,3:17,3:16,13,3,3
chr17	21319436	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=30,28;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,7:0.195:39:13,3:18,4:0|1:21319436_G_A:21319436:15,17,2,5
chr17	21319439	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=28,32;MFRL=179,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,7:0.195:39:13,3:18,4:0|1:21319436_G_A:21319436:14,18,2,5
chr17	21319452	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=30,26;MFRL=186,188;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,6:0.184:36:13,2:15,3:0|1:21319436_G_A:21319436:14,16,2,4
chr17	21319465	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=29,32;MFRL=179,188;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:13,2:14,4:0|1:21319436_G_A:21319436:11,16,2,4
chr17	21319470	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=29,26;MFRL=180,181;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,8:0.257:33:11,2:11,5:0|1:21319436_G_A:21319436:10,15,2,6
chr17	21319473	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=12;MBQ=32,27;MFRL=194,164;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:7,5:14,3:10,14,2,6
chr17	21319488	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=204,167;MMQ=60,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:10,2:9,3:0|1:21319436_G_A:21319436:10,11,2,4
chr17	21319519	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=12;MBQ=35,33;MFRL=194,158;MMQ=52,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.259:25:9,3:10,3:0|1:21319519_G_C:21319519:10,9,3,3
chr17	21319523	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=12;MBQ=31,27;MFRL=203,187;MMQ=51,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.267:28:9,3:10,4:0|1:21319519_G_C:21319519:11,10,3,4
chr17	21319543	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=34,27;MFRL=204,187;MMQ=51,49;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,9:0.278:34:13,4:12,5:0|1:21319519_G_C:21319519:13,12,6,3
chr17	21319560	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=34,28;MFRL=203,236;MMQ=45,49;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,9:0.278:34:11,3:13,5:0|1:21319519_G_C:21319519:9,16,6,3
chr17	21319650	.	CGAG	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=199,173;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:8,3:15,3:13,11,1,5
chr17	21319682	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=197,178;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.231:26:10,3:10,3:7,13,0,6
chr17	21320350	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=10;MBQ=31,30;MFRL=191,130;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.485:27:4,8:8,5:7,7,8,5
chr17	21320365	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=29,30;MFRL=185,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,1:7,2:8,8,1,2
chr17	21320424	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=28,25;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:1,3:6,2:3,5,2,3
chr17	21320426	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=10;MBQ=29,26;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:1,3:7,1:0|1:21320426_T_A:21320426:3,6,2,2
chr17	21320429	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=10;MBQ=32,26;MFRL=194,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:1,4:7,1:0|1:21320426_T_A:21320426:3,5,3,2
chr17	21320436	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=31,32;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:1,4:7,1:0|1:21320426_T_A:21320426:3,6,4,2
chr17	21320440	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=34,28;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:2,5:5,1:0|1:21320426_T_A:21320426:3,6,4,2
chr17	21320451	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=27,27;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.406:16:3,5:6,1:0|1:21320426_T_A:21320426:5,5,4,2
chr17	21320480	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=10;MBQ=29,27;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.252:22:8,1:9,4:11,6,5,0
chr17	21320499	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=10;MBQ=28,32;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.715:26:4,6:3,13:4,3,13,6
chr17	21320529	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=14;MBQ=29,29;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.647:32:6,7:5,14:7,4,10,11
chr17	21320545	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=34,27;MFRL=172,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:13,1:8,4:11,10,2,3
chr17	21320555	.	CA	TG	.	.	DP=27;ECNT=14;MBQ=32,28;MFRL=170,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:9,8:4,6:10,3,4,10
chr17	21320578	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=34,26;MFRL=211,196;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:13,5:7,1:14,6,3,3
chr17	21320586	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=14;MBQ=28,34;MFRL=209,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:13,2:4,2:12,6,2,2
chr17	21320595	.	CA	TG	.	.	DP=22;ECNT=14;MBQ=33,29;MFRL=169,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,8:2,3:8,2,6,6
chr17	21320605	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=14;MBQ=29,31;MFRL=161,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.396:28:12,7:5,4:12,5,6,5
chr17	21320658	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=14;MBQ=31,28;MFRL=202,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.273:42:16,4:11,6:18,13,6,5
chr17	21320659	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=14;MBQ=31,28;MFRL=166,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.273:42:16,6:14,5:16,15,8,3
chr17	21320675	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=14;MBQ=27,33;MFRL=202,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=105.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,27:0.609:44:7,10:6,13:0|1:21320675_A_G:21320675:8,9,18,9
chr17	21320681	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=14;MBQ=31,29;MFRL=202,211;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,23:0.571:40:8,10:7,13:0|1:21320675_A_G:21320675:6,11,15,8
chr17	21320690	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=14;MBQ=32,33;MFRL=186,217;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,23:0.558:41:9,10:8,11:0|1:21320675_A_G:21320675:7,11,16,7
chr17	21320699	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=14;MBQ=32,25;MFRL=186,212;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,20:0.556:36:8,7:7,7:0|1:21320675_A_G:21320675:6,10,13,7
chr17	21320711	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=14;MBQ=32,34;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:11,4:9,8:10,10,9,3
chr17	21320787	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=11;MBQ=32,29;MFRL=142,215;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.178:37:15,2:16,4:14,17,2,4
chr17	21320796	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=11;MBQ=32,28;MFRL=121,172;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,21:0.595:35:6,8:7,12:0|1:21320796_C_T:21320796:8,6,9,12
chr17	21320798	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=28,32;MFRL=121,172;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,21:0.595:35:6,9:8,12:0|1:21320796_C_T:21320796:8,6,9,12
chr17	21320824	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=11;MBQ=32,28;MFRL=142,202;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,14:0.319:45:13,7:16,7:15,16,7,7
chr17	21320826	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=11;MBQ=33,28;MFRL=172,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,15:0.347:44:14,8:15,7:15,14,7,8
chr17	21320851	.	C	CA	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,12:0.310:40:13,6:13,6:0|1:21320851_C_CA:21320851:13,15,7,5
chr17	21320853	.	CAA	C	.	.	DP=43;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,12:0.289:43:13,6:13,6:0|1:21320851_C_CA:21320851:14,17,7,5
chr17	21320867	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=11;MBQ=32,30;MFRL=165,194;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,9:0.250:38:13,5:15,3:0|1:21320851_C_CA:21320851:14,15,5,4
chr17	21320882	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=28,33;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.570:33:6,9:8,9:6,8,10,9
chr17	21320890	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=11;MBQ=30,29;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.314:33:8,5:12,5:10,13,5,5
chr17	21320896	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:9,4:16,2:12,13,4,2
chr17	21320980	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=34,32;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:6,5:5,8:5,6,5,8
chr17	21320991	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=30,29;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:5,2:11,1:7,11,1,2
chr17	21320993	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,2:5,7:4,5,2,7
chr17	21321016	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=29,30;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:3,3,2,4
chr17	21321028	.	CC	TG	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=34,28;MFRL=183,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.658:13:2,3:2,4:1,3,3,6
chr17	21321050	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=31,29;MFRL=204,194;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,12:0.565:21:5,6:4,5:0|1:21321050_C_T:21321050:2,7,5,7
chr17	21321052	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=29,32;MFRL=204,194;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,12:0.565:21:5,6:4,5:0|1:21321050_C_T:21321050:2,7,5,7
chr17	21321064	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=206,166;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.298:25:9,3:7,4:5,13,4,3
chr17	21321250	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=170,1716;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.340:20:6,3:7,4:0|1:21321250_G_A:21321250:10,3,6,1
chr17	21321252	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=213,1692;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.196:20:6,2:9,2:0|1:21321250_G_A:21321250:13,3,3,1
chr17	21322607	.	CGT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=203,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=GT;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:2,1:0,1:3,1,1,1
chr17	21322695	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:15,1:8,2:14,11,3,0
chr17	21322847	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=149,1004;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:14,3:16,1:13,17,2,2
chr17	21322859	.	CTG	C	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=31,36;MFRL=96,246;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TG;STR;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:11,1:8,6:10,10,3,4
chr17	21322880	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=118,258;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,18:0.594:30:6,8:6,9:0|1:21322880_A_C:21322880:5,7,6,12
chr17	21322883	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=118,258;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,18:0.594:30:6,8:5,10:0|1:21322880_A_C:21322880:5,7,6,12
chr17	21322933	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=194,1760;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:13,1:4,4:4,13,1,4
chr17	21322972	.	GT	CC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=211,183;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:7,7:4,7:6,5,3,11
chr17	21322975	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=194,186;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.324:22:7,4:7,2:7,8,1,6
chr17	21323001	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=204,183;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.495:20:6,5:4,3:8,2,3,7
chr17	21323033	.	CG	TA	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=27,27;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:4,2:6,4:0|1:21323033_CG_TA:21323033:6,6,3,3
chr17	21323056	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=31,31;MFRL=171,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.363:20:5,2:7,5:0|1:21323033_CG_TA:21323033:8,5,4,3
chr17	21323074	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=28,35;MFRL=184,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:6,2:6,3:0|1:21323033_CG_TA:21323033:7,7,3,3
chr17	21323096	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=34,28;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,14:0.577:24:6,6:3,7:0|1:21323096_G_A:21323096:6,4,8,6
chr17	21323107	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=10;MBQ=28,33;MFRL=162,236;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:6,5:3,5:0|1:21323096_G_A:21323096:7,3,8,3
chr17	21323195	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=10;MBQ=30,27;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.384:19:7,3:3,4:0|1:21323195_T_C:21323195:2,10,2,5
chr17	21323214	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=10;MBQ=30,32;MFRL=162,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.432:19:7,4:1,4:0|1:21323195_T_C:21323195:2,9,3,5
chr17	21323244	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=26,30;MFRL=163,237;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:6,0:2,2:1,7,0,3
chr17	21323245	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=32,24;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:0|1:21323245_G_A:21323245:0,6,1,4
chr17	21323249	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=10;MBQ=32,23;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:4,3:2,2:0|1:21323245_G_A:21323245:0,6,1,5
chr17	25912828	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr17	25917810	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=213,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:3,6:0,2:1,2,7,1
chr17	25935057	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=162,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:6,0:7,0:0|1:25935057_T_G:25935057:8,5,0,2
chr17	25935063	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=210,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:4,0:2,1:0|1:25935057_T_G:25935057:6,2,0,2
chr17	25944269	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=135,78;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:0,2:1,0:2,0,1,1
chr17	25958421	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=153,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.377:16:3,0:4,0:4,6,0,6
chr17	25974441	.	C	CGGAAGGGAG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=185,174;MMQ=60,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:16,0:9,2:0|1:25974441_C_CGGAAGGGAG:25974441:11,14,0,2
chr17	25974443	.	T	TGGG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=185,174;MMQ=60,52;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=G;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:15,0:9,1:0|1:25974441_C_CGGAAGGGAG:25974441:11,14,0,2
chr17	26087021	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,1:8,1:6,6,2,0
chr17	26088337	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,249;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr17	26092555	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=118,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:0,2,1,3
chr17	26096473	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:5,3,2,0
chr17	26100321	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr17	26101214	.	GCA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=208,242;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:5,1:7,2:0|1:26101214_GCA_G:26101214:8,5,3,0
chr17	26101237	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=197,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.453:24:6,2:7,7:0|1:26101214_GCA_G:26101214:7,6,7,4
chr17	26101395	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=197,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:1,10,2,0
chr17	26108040	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=282,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,3:3,5:2,3,5,3
chr17	26109030	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=181,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:2,1:7,5:5,4,2,4
chr17	26125918	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr17	26206414	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr17	26495382	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=17,10;MFRL=240,187;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:1,0:0|1:26495382_C_A:26495382:5,0,2,0
chr17	26495386	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=19,15;MFRL=240,187;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:1,0:0|1:26495382_C_A:26495382:5,0,2,0
chr17	26495389	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,10;MFRL=240,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.471:6:1,0:2,0:3,0,3,0
chr17	26495400	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=17,19;MFRL=183,213;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.316:7:1,0:1,1:5,0,2,0
chr17	26646434	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,7:0,0,0,16
chr17	26669245	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr17	26684283	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	26684449	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,299;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	26684529	.	G	GGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	26687484	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=38.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr17	26687898	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=53.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,6:0,0,5,12
chr17	26692224	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr17	26694940	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=176,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:7,1:7,1:10,6,1,1
chr17	26694979	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=182,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.291:12:3,2:3,0:6,3,0,3
chr17	26695704	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=49.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:1,15:0,2:0,1,7,10
chr17	26695832	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=272,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:3,1,6,1
chr17	26697194	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,238;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,0:5,2:6,10,0,2
chr17	26708298	.	A	AGC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=108.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,13:0,9:0|1:26708298_A_AGC:26708298:0,0,7,18
chr17	26708302	.	GGT	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,12:0,12:0|1:26708298_A_AGC:26708298:0,0,7,18
chr17	26722890	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=200,269;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,1,1
chr17	26727721	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=51.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,8,6
chr17	26729428	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=147,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:0,3:0,1,0,5
chr17	26817258	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=188,188;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:26817258_T_C:26817258:2,1,1,0
chr17	26817260	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=188,188;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:26817258_T_C:26817258:2,1,1,0
chr17	26817269	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=178,188;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:26817258_T_C:26817258:3,1,1,0
chr17	26817273	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=178,188;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:26817258_T_C:26817258:3,1,1,0
chr17	26817337	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=33,23;MFRL=129,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,5:7,0:10,4,5,0
chr17	26817366	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=132,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:9,5:5,0:8,6,5,0
chr17	26818676	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr17	26850929	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr17	26851446	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=141,253;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr17	26851501	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.940:15:0,7:0,5:0,0,6,9
chr17	26861605	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=231,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:5,3:0,2:4,2,2,3
chr17	26862253	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=202,80;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr17	26888741	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=269,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26888741_C_CT:26888741:0,1,0,1
chr17	26888743	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=269,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26888741_C_CT:26888741:0,1,0,1
chr17	26888745	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=269,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26888741_C_CT:26888741:0,1,0,1
chr17	26904784	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:19,5:14,0:15,18,5,0
chr17	26906162	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,56;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:16,4:8,0:10,14,4,0
chr17	26912629	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=160,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.204:16:9,0:4,2:7,6,2,1
chr17	26947652	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=162,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,1:7,3:5,6,2,2
chr17	26958775	.	TG	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=181,209;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,0:3,6:1,6,0,6
chr17	26963902	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=137,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.651:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr17	26966455	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:10,0:5,9:5,10,0,9
chr17	26967476	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=235,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr17	27000391	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=270,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,6:0,3:1,0,8,1
chr17	27001405	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=155,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:12,1:0|1:27001405_G_T:27001405:11,9,1,1
chr17	27001410	.	T	TGGCGC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=155,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:14,2:0|1:27001405_G_T:27001405:12,11,1,1
chr17	27001412	.	A	ATCTCGGCTCACTGAAAG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=155,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,0:15,2:0|1:27001405_G_T:27001405:12,11,1,1
chr17	27001722	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=198,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:1,7,0,2
chr17	27002195	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=193,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,0:3,2:0,7,0,3
chr17	27002402	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:0,9:2,7:1,1,10,7
chr17	27004703	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:0,4:2,13:1,1,16,1
chr17	27005155	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=91,260;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:7,2:8,0:4,11,3,0
chr17	27025118	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=215,270;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr17	27027920	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,246;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:13,3:16,0:21,8,3,0
chr17	27028000	.	AA	TT	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=186,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:8,0:16,2:0|1:27028000_AA_TT:27028000:14,16,1,1
chr17	27028008	.	CTAGCTACTCCTACACGACCCCA	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=199,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:5,0:13,1:0|1:27028000_AA_TT:27028000:10,20,1,1
chr17	27028030	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=206,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:4,3:13,3:4,13,1,5
chr17	27044004	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:5,3:9,2:5,9,0,5
chr17	27061704	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.396:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chr17	27068167	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:10,9,1,1
chr17	27074832	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=198,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,1,0
chr17	27093542	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=221,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,4:0,2:2,0,4,2
chr17	27183732	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=206,179;MMQ=60,53;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.366:6:0,0:3,1:0,4,0,2
chr17	27185827	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr17	27187636	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr17	27207453	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=257,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,4:1,6:1,0,9,1
chr17	27210253	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=134,237;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,2:6,2:6,4,2,2
chr17	27225937	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr17	27228474	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:0,0:5,1:0|1:27228474_G_C:27228474:1,4,5,0
chr17	27228477	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,14;MFRL=186,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:0,0:4,2:0,4,6,0
chr17	27228482	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:1,1:6,3:0|1:27228474_G_C:27228474:4,4,5,0
chr17	27228487	.	CACGCAGGG	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:1,1:7,3:0|1:27228474_G_C:27228474:8,7,5,0
chr17	27228497	.	CTGCTG	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=33,25;MFRL=154,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:6,0:9,2:0|1:27228474_G_C:27228474:8,7,3,0
chr17	27290969	.	T	TG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.342:18:6,5:6,1:10,2,5,1
chr17	27382061	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=180,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,1:6,2:5,6,2,1
chr17	27401967	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=186,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:7,3:10,2:9,8,4,1
chr17	27413403	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=97,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:0,1:2,5:1,1,3,3
chr17	27413908	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr17	27420304	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr17	27421911	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=286,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,4:0,9:1,0,4,9
chr17	27424163	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=221,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,5,1
chr17	27425793	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr17	27437134	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,5:0,0,1,8
chr17	27437208	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,327;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	27437710	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,0,11
chr17	27442561	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr17	27448586	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=174,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:4,6,2,0
chr17	27449059	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.872:6:0,2:0,2:0,0,2,4
chr17	27492869	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr17	27576202	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.261:13:4,1:6,2:2,8,1,2
chr17	27614758	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:0,6,0,4
chr17	27794320	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=36,29;MFRL=162,156;MMQ=54,30;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:27794320_C_T:27794320:0,4,0,1
chr17	27794322	.	CC	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=162,156;MMQ=54,30;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:27794320_C_T:27794320:0,4,0,1
chr17	27794326	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=162,156;MMQ=54,30;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:27794320_C_T:27794320:0,4,0,1
chr17	27794330	.	AG	CA,TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,33,33;MFRL=184,156,145;MMQ=60,30,48;MPOS=23,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:0,1,0:2,0,1:0,3,0,2
chr17	27816599	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr17	27829588	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34,27;MFRL=0,259,69;MMQ=60,60,60;MPOS=20,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,10,12;RU=T;STR;TLOD=6.36,4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.429,0.428:4:0,1,1:0,1,0:0,0,3,1
chr17	27849410	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=134,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:7,3:8,6,2,1
chr17	27857698	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr17	27861329	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=113,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:4,1:13,1:5,12,1,1
chr17	27898828	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=233,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,4:1,4:2,4,5,3
chr17	27901975	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=301,334;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,1:0,1:2,1,0,2
chr17	27904322	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr17	27905673	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=187,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:7,1,3,0
chr17	27944089	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=240,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr17	27949742	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,3:1,2:6,0,5,0
chr17	27949934	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.914:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr17	28029938	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=172,274;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr17	28120851	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=179,141;MMQ=40,47;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,6:4,4:5,1,7,3
chr17	28323387	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=121,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:10,2:8,2:5,13,3,1
chr17	28323466	.	C	CACTCAAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=208,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:28323466_C_CACTCAAT:28323466:0,1,0,1
chr17	28323468	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=208,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:28323466_C_CACTCAAT:28323466:0,1,0,1
chr17	28323499	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	28378276	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=205,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,5:0,6:0,2,3,8
chr17	28386526	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=214,241;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr17	28407287	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=334,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,5:1,1:1,2,2,4
chr17	28408070	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	28410124	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=295,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,1,3
chr17	28417376	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=297,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:3,0,4,2
chr17	28444254	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=188,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,0:2,3:0,7,0,3
chr17	28499657	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=150,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,2:9,0:0|1:28499657_T_A:28499657:1,12,1,1
chr17	28499660	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=160,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:9,0:0|1:28499657_T_A:28499657:1,13,1,1
chr17	28499662	.	C	CAATCCTCTGTACTG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=160,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:8,0:0|1:28499657_T_A:28499657:1,13,1,1
chr17	28512027	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=168,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:10,2:9,0:13,6,1,1
chr17	28512343	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=115,100;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:11,0:10,2:8,13,0,2
chr17	28536154	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=154,62;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:6,2,1,1
chr17	28538532	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:2,1:6,2:1,9,0,3
chr17	28548810	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,1:8,2:6,8,2,1
chr17	28549809	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.249:34:16,3:10,5:12,14,8,0
chr17	28549898	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,1,13
chr17	28549978	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr17	28618972	.	T	TCGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=CGG;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr17	28659010	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=264,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.833:16:1,8:1,6:2,0,9,5
chr17	28711969	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:7,1:3,1:9,2,1,1
chr17	28778720	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=114,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,2:4,0:6,7,2,0
chr17	28811626	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:5,0:0,2:4,1,2,0
chr17	28811669	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=19,33;MFRL=100,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.123:23:4,0:4,2:20,1,0,2
chr17	28811834	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,1:6,2:4,5,0,3
chr17	28890203	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=205,186;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:2,1,6,1
chr17	28900861	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=167,202;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,1:5,1:2,3,2,0
chr17	28900915	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=392,190;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,1:2,6:2,1,5,2
chr17	29112963	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=88,35;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,2:11,0:0|1:29112963_T_G:29112963:9,6,1,1
chr17	29112967	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=105,35;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:4,2:12,0:0|1:29112963_T_G:29112963:10,6,1,1
chr17	29113016	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=92,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,0:4,2:6,8,2,0
chr17	29124515	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=179,298;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,0:3,2:2,5,0,2
chr17	29130878	.	TG	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=197,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:2,0:6,0,2,0
chr17	29161722	.	GGA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,0:12,2:14,11,0,2
chr17	29161955	.	ACAATGT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=140,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,0:8,2:8,11,0,2
chr17	29171137	.	GTATT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=161,0;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TATT;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr17	29184166	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=176,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:3,6,0,2
chr17	29195444	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,19;MFRL=109,235;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.450:7:2,0:1,1:1,3,0,3
chr17	29204592	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=122,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,2:12,0:5,16,0,2
chr17	29221227	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=183,263;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr17	29221581	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=152,288;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:4,11:5,0:9,0,11,0
chr17	29226630	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=167,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:2,4,0,2
chr17	29226652	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=167,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:1,6,0,2
chr17	29253838	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=110,194;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:12,6:10,0:15,7,6,0
chr17	29258948	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:8,4:7,1:6,10,0,5
chr17	29261178	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=110,275;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,0:3,2:5,3,1,1
chr17	29325662	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=124,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.472:8:2,0:2,2:4,0,3,1
chr17	29486152	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.678:26:4,9:4,9:2,6,5,13
chr17	29496809	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=204,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:0|1:29496809_C_T:29496809:6,0,2,0
chr17	29496819	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=181,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0|1:29496809_C_T:29496809:1,0,7,0
chr17	29508775	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:8,10:8,6:8,8,12,4
chr17	29508819	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,17;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.743:12:2,2:0,2:2,1,1,8
chr17	29508836	.	G	GCA	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:1,2:7,2:0|1:29508836_G_GCA:29508836:3,6,0,4
chr17	29508838	.	CTTT	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=36,34;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=T;STR;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.314:14:1,2:6,2:0|1:29508836_G_GCA:29508836:3,7,0,4
chr17	29508844	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=182,135;MMQ=60,60;MPOS=-1073741826;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:1,2:9,2:0|1:29508836_G_GCA:29508836:3,8,0,4
chr17	29528406	.	CT	C,CTT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31,35;MFRL=192,144,135;MMQ=60,60,60;MPOS=11,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=8.12,3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,5,3:0.249,0.152:21:5,2,1:7,3,1:6,7,4,4
chr17	29541437	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=126,179;MMQ=40,44;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,1:2,5:2,1,6,0
chr17	29545987	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.645:15:2,5:3,4:4,1,7,3
chr17	29546175	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=165,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,5:1,6:1,1,1,10
chr17	29557315	.	CAAATAAAAA	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=158,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,2:10,0:0|1:29557315_CAAATAAAAA_C:29557315:14,10,1,1
chr17	29557325	.	CGAAACTGTGTCA	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=152,54;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,2:12,0:0|1:29557315_CAAATAAAAA_C:29557315:15,10,1,1
chr17	29557343	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=144,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,2:10,0:9,8,1,1
chr17	29558037	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=137,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29558037_T_C:29558037:0,1,0,1
chr17	29558039	.	A	ACTCACAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=137,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0|1:29558037_T_C:29558037:0,1,0,1
chr17	29559932	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=196,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,3:5,0:3,6,2,1
chr17	29562544	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	29562852	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=165,137;MMQ=60,22;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,8:3,0:4,1,8,0
chr17	29563076	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=148,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.360:12:5,2:3,2:0|1:29563076_T_TG:29563076:0,8,0,4
chr17	29563085	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.336:13:5,2:3,2:0|1:29563076_T_TG:29563076:0,9,0,4
chr17	29645474	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=170,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:20,2:19,2:16,23,0,4
chr17	29647358	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=141,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:4,3:1,1:4,1,3,1
chr17	29647362	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=176,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:5,2:1,1:4,2,3,0
chr17	29653293	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=261,252;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr17	29654876	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=109,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:2,4:0,4:1,1,3,5
chr17	29663625	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:2,0:1,1,2,0
chr17	29663680	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=164,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:3,4,2,0
chr17	29670190	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr17	29679246	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:2,3:2,4:3,1,5,3
chr17	29844909	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=204,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:0,5,1,4
chr17	29848450	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=176,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,1,1
chr17	29848460	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=187,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr17	29850596	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,2:7,2:6,7,2,2
chr17	29850691	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=93,110;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0,3,1,0
chr17	29850698	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=169,47;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,0,2
chr17	29852092	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=208,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:1,11:0,9:1,0,11,9
chr17	29857370	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=137,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.148:22:10,2:9,0:12,7,0,3
chr17	29858832	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=260,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr17	30185892	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=233,277;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr17	30214413	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=158,158;MMQ=60,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr17	30214420	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=158,189;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:30214420_G_C:30214420:0,3,0,1
chr17	30214425	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=211,189;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:1,0:1,1:0|1:30214420_G_C:30214420:0,3,0,1
chr17	30214429	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=15,28;MFRL=214,189;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:0|1:30214420_G_C:30214420:0,1,0,1
chr17	30221877	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,7:4,0:5,0,7,0
chr17	30228656	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,1:4,3:0,8,0,4
chr17	30293149	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=109,148;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.369:19:6,3:5,4:7,5,6,1
chr17	30325942	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=169,103;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:7,0:19,4:9,17,0,4
chr17	30351638	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=161,155;MMQ=40,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,0:6,2:5,2,0,2
chr17	30376941	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=207,0;MMQ=58,24;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,1:3,1:7,1,0,2
chr17	30377000	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=105,146;MMQ=60,45;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.214:17:6,1:6,2:7,7,3,0
chr17	30509939	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr17	30625205	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,2:3,1:2,7,2,1
chr17	30643361	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=82,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,5:3,5:1,3,4,6
chr17	30659006	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=184,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr17	30665005	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,3:7,3:3,7,4,2
chr17	30685571	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,122;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=54.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,21:0.478:44:12,21:11,0:14,9,21,0
chr17	30685705	.	AT	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.377:11:4,3:2,1:1,6,0,4
chr17	30687599	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=193,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:6,0,4,0
chr17	30696292	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=194,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:8,1:8,5:9,7,3,3
chr17	30791509	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=159,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,1:1,1:2,3,2,0
chr17	30801760	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,0:9,3:7,7,2,1
chr17	30804571	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=130,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.109:25:15,0:7,2:0|1:30804571_C_T:30804571:14,9,1,1
chr17	30804574	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=111,247;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:22,4:0.177:26:15,2:7,2:1|0:30804571_C_T:30804571:13,9,1,3
chr17	30806920	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=173,25;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:5,8,1,1
chr17	30814599	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=240,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:9,0,2,0
chr17	30816107	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.324:23:7,4:7,3:7,9,1,6
chr17	30816798	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:15,4:6,2:12,9,5,1
chr17	30986119	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,2:7,2:8,1,4,0
chr17	31039045	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=194,129;MMQ=60,21;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:5,4:7,0:6,6,4,0
chr17	31039255	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=172,266;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,2:1,1:0,3,0,4
chr17	31082747	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=70,270;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr17	31094750	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:4,1:11,2:7,8,0,3
chr17	31107845	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=189,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0,5,0,4
chr17	31266419	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,46;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,1:0,6:0|1:31266419_T_C:31266419:0,0,5,3
chr17	31266438	.	A	AAGG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0|1:31266419_T_C:31266419:0,0,5,6
chr17	31266564	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:8,11,0,3
chr17	31319024	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=217,185;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0|1:31319024_A_C:31319024:1,1,2,4
chr17	31319033	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=217,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0|1:31319024_A_C:31319024:1,1,2,3
chr17	31319092	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,35;MFRL=227,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,0:0,2:0,2,0,2
chr17	31344549	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=186,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.648:9:0,5:2,0:2,1,4,2
chr17	31355227	.	A	AG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=77.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,12:0,0,17,9
chr17	31439097	.	AAG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=198,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,1:3,1:1,9,0,2
chr17	32647744	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=148,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:6,1,4,0
chr17	32688712	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr17	32904480	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=276,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr17	32908064	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=119,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.662:7:1,3:1,1:1,1,4,1
chr17	32953335	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=198,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:3,2:11,5:8,6,4,3
chr17	32954091	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr17	32956286	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=211,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr17	32961751	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=158,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:2,2,6,0
chr17	33266228	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=173,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:7,7,0,2
chr17	33286535	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=210,265;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,5:4,0:5,0,5,0
chr17	33286621	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=177,228;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,1:9,1:16,5,1,1
chr17	33286664	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,5:5,3:6,6,3,5
chr17	33288433	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=202,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.394:13:4,0:1,5:5,3,2,3
chr17	33289320	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=173,78;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,3:8,0:9,11,1,2
chr17	33289546	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:9,1:10,5:12,7,3,3
chr17	33289937	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,18:0,0,19,11
chr17	33289967	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=206,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:8,5:10,5:8,10,6,4
chr17	33309982	.	CTTTT	C,CTT,CTTT,CTTTTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,35,32,32,31;MFRL=51,87,240,215,132;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=29,12,13,14;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,12,14,15,17;RU=T;STR;TLOD=3.97,3.04,6.92,8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:4,2,2,4,6:0.127,0.140,0.218,0.296:18:2,2,1,2,1:1,0,1,2,4:3,1,12,2
chr17	33318811	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=136,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,1:7,1:5,11,0,2
chr17	33321293	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,147;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:8,5:8,0:7,9,5,0
chr17	33323252	.	TGTGA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=221,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTGA;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,1:0,1:0,5,0,2
chr17	33329995	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:10,3:8,2:9,9,3,2
chr17	33330150	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,2:1,5:1,5,1,6
chr17	33331575	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=215,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:1,3,1,2
chr17	33341834	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,2:5,8:5,4,4,6
chr17	33353332	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:6,0,1,4
chr17	33457406	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=200,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,2:9,0:5,8,2,0
chr17	33460385	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=160,118;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:7,4:3,0:6,4,4,0
chr17	33463568	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=184,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr17	33464733	.	T	TGGCC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=201,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.452:9:2,2:3,1:0|1:33464733_T_TGGCC:33464733:0,5,4,0
chr17	33464737	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=201,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,2:2,1:0|1:33464733_T_TGGCC:33464733:0,5,3,0
chr17	33464740	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0|1:33464733_T_TGGCC:33464733:0,4,3,0
chr17	33464746	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=200,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,0:0|1:33464733_T_TGGCC:33464733:0,5,3,0
chr17	33469224	.	CGGGCCCTAGCGCCCCGCGGCG	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=29,36;MFRL=215,220;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:33469224_CGGGCCCTAGCGCCCCGCGGCG_C:33469224:2,2,0,1
chr17	33469252	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=34,36;MFRL=211,220;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:33469224_CGGGCCCTAGCGCCCCGCGGCG_C:33469224:2,1,0,1
chr17	33469255	.	GCCCCCATC	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=30,34;MFRL=217,220;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:33469224_CGGGCCCTAGCGCCCCGCGGCG_C:33469224:2,2,0,1
chr17	33469261	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=26,19;MFRL=210,255;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:0|1:33469261_A_C:33469261:0,2,2,0
chr17	33469265	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=27,12;MFRL=220,255;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,0:0|1:33469261_A_C:33469261:0,3,2,0
chr17	33469267	.	GCA	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=31,34;MFRL=217,220;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:33469224_CGGGCCCTAGCGCCCCGCGGCG_C:33469224:2,2,0,1
chr17	33469269	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=27,22;MFRL=210,255;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:0|1:33469261_A_C:33469261:0,2,2,0
chr17	33469271	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=20,30;MFRL=217,220;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:33469224_CGGGCCCTAGCGCCCCGCGGCG_C:33469224:2,2,0,1
chr17	33469279	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=0,35;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr17	33486509	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=174,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:10,0:7,2:0|1:33486509_C_T:33486509:9,8,1,1
chr17	33486518	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=184,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,0:8,1:0|1:33486509_C_T:33486509:8,9,1,1
chr17	33497050	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=190,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,1:1,5:1,0,2,4
chr17	33497331	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	33501432	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,0,11
chr17	33502907	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=175,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.274:19:7,0:7,4:11,3,5,0
chr17	33502937	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=208,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:0,9:2,7:2,0,10,6
chr17	33510404	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=138,206;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,1:7,3:8,1,4,0
chr17	33510656	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=314,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr17	33513649	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=181,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,3:0,4:0,3,0,7
chr17	33520263	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=175,107;MMQ=48,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:0,3:1,6:1,0,6,3
chr17	33520965	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=194,136;MMQ=43,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:6,7:8,3:6,8,5,5
chr17	33521276	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=162,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:10,2:1,3:3,8,3,2
chr17	33586026	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=171,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.178:26:14,2:8,2:0|1:33586026_C_T:33586026:11,11,2,2
chr17	33586030	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,3:0.133:28:14,3:10,0:1|0:33586026_C_T:33586026:13,12,3,0
chr17	33591987	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=176,249;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,4:2,3:2,0,4,3
chr17	33592046	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,2:3,0:8,1,2,0
chr17	33592591	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=187,159;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,5:2,3:3,2,3,5
chr17	33592621	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=192,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,1:4,2:3,5,1,2
chr17	33690863	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr17	33738936	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	33748939	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=198,276;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr17	33770706	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=233,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:2,0,2,1
chr17	33770802	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=145,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:7,1,1,1
chr17	33807250	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	33880305	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=143,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:4,4:4,2:4,4,3,3
chr17	33881718	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.521:21:3,3:7,7:0|1:33881718_G_A:33881718:3,7,3,8
chr17	33881734	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=162,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.619:19:3,5:4,7:0|1:33881718_G_A:33881718:1,6,2,10
chr17	33881767	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=15,15;MFRL=228,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:0,0:2,0:2,7,0,3
chr17	33881769	.	TAAAA	T,TA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,30,28;MFRL=196,227,233;MMQ=60,60,60;MPOS=19,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,15;RU=A;STR;TLOD=5.56,7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.308,0.386:10:1,1,3:1,2,1:0,3,0,7
chr17	33902993	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,230;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,11:0.226:51:16,11:24,0:24,16,11,0
chr17	33921160	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr17	33968871	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,10,3
chr17	33984668	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=164,165;MMQ=60,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:15,4:7,0:12,10,4,0
chr17	33998683	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=195,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr17	33998753	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,37;MFRL=168,54;MMQ=60,46;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:4,2:6,2,0,2
chr17	33998963	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=167,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,0:7,3:2,9,0,3
chr17	34001121	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	34001139	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr17	34100350	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,5:0,0,5,7
chr17	34147533	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:3,1:4,3:0,7,0,4
chr17	34171590	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=114,293;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:5,0:6,6,2,0
chr17	34195806	.	A	AGCAGGAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34195806_A_AGCAGGAG:34195806:0,0,0,1
chr17	34195810	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34195806_A_AGCAGGAG:34195806:0,0,0,1
chr17	34195811	.	G	GTA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34195806_A_AGCAGGAG:34195806:0,0,0,1
chr17	34205489	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=194,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr17	34266410	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=40,35;MFRL=82,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	34340161	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr17	34344961	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=137,171;MMQ=40,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,0:6,3:1,7,0,3
chr17	34391617	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=118,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr17	34391783	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=128,244;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:5,4:5,1:4,7,2,3
chr17	34416453	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,15,1
chr17	34416665	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,4,14
chr17	34431852	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,266;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr17	34431884	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,8,9
chr17	34432125	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr17	34842521	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:5,3:8,10:7,6,5,8
chr17	34848633	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,1:6,4:7,2,4,1
chr17	34848796	.	C	CGAAAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=186,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.497:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr17	34849697	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=181,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:5,3,4,0
chr17	34852305	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=204,145;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr17	34855069	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=170,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.541:11:3,2:1,3:1,4,0,6
chr17	34861303	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,3:5,1:1,6,1,3
chr17	34862220	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr17	34862256	.	GTT	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,1:5,6:6,1,7,0
chr17	34866546	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr17	34866751	.	CAG	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:9,4:4,6:8,5,4,6
chr17	34869150	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0|1:34869150_C_A:34869150:0,0,5,0
chr17	34869155	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=185,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0|1:34869150_C_A:34869150:2,0,3,0
chr17	34893655	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:7,6,2,0
chr17	34894609	.	AT	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.243:32:13,6:8,2:9,15,3,5
chr17	34894657	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=164,173;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:0,9,0,2
chr17	34938035	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=206,167;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0|1:34938035_T_C:34938035:0,2,0,1
chr17	34938037	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=206,167;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:34938035_T_C:34938035:0,2,0,1
chr17	34938048	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=206,167;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:34938035_T_C:34938035:0,2,0,1
chr17	34938050	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=193,193;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr17	34938054	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=206,167;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:34938035_T_C:34938035:0,2,0,1
chr17	34943347	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=87,186;MMQ=48,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.611:6:1,0:1,1:2,0,4,0
chr17	34943374	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,15;MFRL=133,78;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.180:15:6,0:4,0:0|1:34943374_A_T:34943374:8,5,2,0
chr17	34943378	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=133,78;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.180:15:7,0:2,0:0|1:34943374_A_T:34943374:8,5,2,0
chr17	34943380	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,15;MFRL=131,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.183:15:7,0:2,0:8,5,2,0
chr17	34951327	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=202,251;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,0:4,2:7,0,2,0
chr17	34956585	.	CCA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=176,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:6,2:10,4:9,8,1,5
chr17	34964257	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:1,4,1,1
chr17	35295706	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr17	35300494	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=11,17;MFRL=141,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.665:4:0,0:0,0:0,1,0,3
chr17	35414006	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=192,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr17	35454702	.	AAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:3,1:9,0,2,0
chr17	35478362	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,8,14
chr17	35486486	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr17	35545446	.	A	ACACACACACACACAC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=182,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:10,3:9,0:0|1:35545446_A_ACACACACACACACAC:35545446:6,14,0,3
chr17	35545448	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=182,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:10,2:9,0:0|1:35545446_A_ACACACACACACACAC:35545446:6,14,0,3
chr17	35549275	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr17	35550448	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr17	35557289	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=244,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,4:0,3:2,2,5,2
chr17	35581887	.	TTATATA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=201,254;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=TA;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,0:2,1:4,1,1,0
chr17	35608889	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0,0,8,3
chr17	35609746	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	35630997	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=217,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr17	35632979	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr17	35634023	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=241,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:3,4:0,5:2,1,1,8
chr17	35696804	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:35696804_G_A:35696804:0,0,0,6
chr17	35696820	.	AAAAG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0|1:35696804_G_A:35696804:0,0,0,5
chr17	35733186	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:35733186_T_TCA:35733186:0,0,0,1
chr17	35733189	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:35733186_T_TCA:35733186:0,0,0,1
chr17	35733192	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:35733186_T_TCA:35733186:0,0,0,1
chr17	35733196	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:35733186_T_TCA:35733186:0,0,0,1
chr17	35745803	.	A	AGGAAGAATCCTCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=224,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	35783565	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=180,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,3:2,8:2,1,5,6
chr17	35783709	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=160,69;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,0:8,2:9,6,1,1
chr17	35818592	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=194,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,5:6,2:10,0,4,3
chr17	35818763	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=203,208;MMQ=53,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:3,2:3,2:0,7,0,4
chr17	35825459	.	TAA	T,TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,28,27;MFRL=149,206,133;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=5.91,5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,4:0.288,0.350:11:2,2,3:2,1,1:4,0,6,1
chr17	35834749	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,0:4,4:2,8,0,4
chr17	35873399	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=205,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=49.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.775:20:3,10:1,6:1,3,6,10
chr17	35873665	.	GTAAC	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=120,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TAAC;STR;TLOD=33.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.826:9:0,4:1,4:0,1,0,8
chr17	35936594	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr17	35944539	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr17	35956263	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr17	35978526	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	36003275	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr17	36047275	.	CG	TG,TT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29,27;MFRL=0,191,142;MMQ=60,60,60;MPOS=16,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.92,9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,4:0.500,0.416:9:0,3,2:0,2,2:0,0,8,1
chr17	36058980	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,4:0,0,12,0
chr17	36059246	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=253,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.835:16:1,4:1,10:0,2,4,10
chr17	36093655	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,3:9,0:9,8,1,2
chr17	36104700	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=215,75;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:1,0:4,4:1,4,0,4
chr17	36104953	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=188,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	36483905	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=153,110;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:10,4:13,0:13,10,4,0
chr17	36484547	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:10,0:8,6:11,7,0,6
chr17	36499324	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,1:9,1:5,7,1,1
chr17	36523806	.	GAT	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,141;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:13,0:2,9:4,11,0,9
chr17	36623602	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=96,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.536:13:3,3:3,4:2,4,1,6
chr17	36634213	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=186,208;MMQ=52,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr17	36638388	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=144,185;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,1:10,1:6,8,0,2
chr17	36642473	.	CTT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.687:7:1,2:0,3:0,2,0,5
chr17	36646291	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:4,3,3,3
chr17	36653940	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr17	36654080	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=148,0;MMQ=60,38;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:12,3:13,2:17,10,3,2
chr17	36656812	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=168,174;MMQ=50,51;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.242:18:6,4:7,0:11,3,4,0
chr17	36708648	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=198,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,2:4,2:8,1,3,1
chr17	36734700	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.501:6:3,2:0,1:0|1:36734700_T_C:36734700:3,0,3,0
chr17	36734706	.	CAGCCGG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=121,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:36734700_T_C:36734700:3,0,2,0
chr17	36861983	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,1:0,3:0,1,2,2
chr17	36863678	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=168,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:5,0:5,2:7,3,0,2
chr17	36873306	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=184,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:36873306_C_T:36873306:0,2,0,1
chr17	36873311	.	A	AGTTTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=184,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:36873306_C_T:36873306:0,2,0,1
chr17	36876554	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36876554_C_G:36876554:0,0,1,0
chr17	36876558	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36876554_C_G:36876554:0,0,1,0
chr17	36876563	.	CGGT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:36876554_C_G:36876554:0,0,1,0
chr17	36891457	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,8:6,0:4,6,4,4
chr17	36892438	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:9,1:2,1:4,7,0,2
chr17	36894573	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=132,90;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,3:10,0:6,9,3,0
chr17	36895206	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=200,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:3,1,2,5
chr17	36896746	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=180,217;MMQ=40,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr17	36909061	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,34:0.923:36:1,20:1,14:1,1,17,17
chr17	36909658	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=188,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.322:16:5,0:6,4:1,10,0,5
chr17	36925850	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=16,23;MFRL=171,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.521:4:0,1:0,0:2,0,2,0
chr17	36934124	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr17	36935575	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.323:10:3,0:4,3:0|1:36935575_T_TG:36935575:7,0,3,0
chr17	36935582	.	TTC	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=8,18;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.296:11:0,0:2,1:0|1:36935575_T_TG:36935575:7,1,3,0
chr17	36935588	.	GCTCA	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:0,0:6,2:0|1:36935575_T_TG:36935575:6,2,2,0
chr17	36935594	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=22,16;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:1,0:3,0:0|1:36935575_T_TG:36935575:4,3,2,0
chr17	36935598	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=26,17;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:5,0:0|1:36935575_T_TG:36935575:5,4,2,0
chr17	36935603	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=27,17;MFRL=161,195;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,0:4,0:0|1:36935575_T_TG:36935575:4,4,2,0
chr17	36981358	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=136,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.193:17:5,1:8,1:1,13,3,0
chr17	37006349	.	GTT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=51.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr17	37006500	.	A	AAATAAAAATAAAT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=177,144;MMQ=60,30;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.153:17:9,0:5,2:0|1:37006500_A_AAATAAAAATAAAT:37006500:5,10,0,2
chr17	37006503	.	C	CCCAATAGAT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=177,144;MMQ=60,30;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:9,0:6,2:0|1:37006500_A_AAATAAAAATAAAT:37006500:5,10,0,2
chr17	37054772	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,12:0.542:22:7,7:3,5:0|1:37054772_C_T:37054772:2,8,7,5
chr17	37054794	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:0|1:37054772_C_T:37054772:4,7,1,1
chr17	37070737	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=218,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,6:0,2:0,2,1,7
chr17	37239671	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=240,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.864:20:1,9:1,9:0,2,12,6
chr17	37253316	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr17	37307721	.	T	TGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	37317672	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,2,6
chr17	37322080	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.386:11:3,1:4,3:2,5,0,4
chr17	37331345	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=171,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:3,0,6,0
chr17	37333879	.	A	AGACCTTATCTGCACTTCTGCAGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	37340729	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:37340729_T_C:37340729:0,0,0,1
chr17	37340735	.	TT	CC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:37340729_T_C:37340729:0,0,0,1
chr17	37351285	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0,4,0,5
chr17	37357662	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,111;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr17	37359225	.	A	AATG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=156,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:10,2:6,0:0|1:37359225_A_AATG:37359225:10,6,1,1
chr17	37359228	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=156,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:0|1:37359225_A_AATG:37359225:10,6,1,1
chr17	37369416	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=183,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,2:0,0:0,1,0,3
chr17	37369894	.	A	AATGGGAAGTCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=179,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.418:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr17	37371301	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=138,167;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:4,0:5,4:3,7,0,4
chr17	37371519	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr17	37421767	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=267,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr17	37441679	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=191,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,1:1,3:4,0,3,1
chr17	37453485	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=186,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:0,7,0,4
chr17	37499604	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=171,254;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:0,2:6,2:1,5,0,4
chr17	37561613	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:4,1:8,3:2,10,3,1
chr17	37580140	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=224,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.507:6:1,1:1,2:0,3,0,3
chr17	37587534	.	CTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=145,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.523:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	37627762	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:15,3:16,0:15,19,3,0
chr17	37671910	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr17	37682657	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=187,260;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr17	37783620	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=278,191;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr17	37783627	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=14,12;MFRL=278,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:0,0:0,0:2,0,1,0
chr17	37783634	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chr17	37783787	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	37790371	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=96,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.664:16:2,3:3,7:1,4,3,8
chr17	37809946	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,0:10,4:10,9,0,4
chr17	37813338	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=187,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:0,5,1,2
chr17	37814080	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=129,202;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,1:4,4:5,4,2,3
chr17	37815899	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=185,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr17	37817223	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,1:2,1:4,4,1,1
chr17	37817389	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=167,296;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:2,2,0,2
chr17	37818561	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=92,178;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:14,2:5,1:10,9,3,0
chr17	37819241	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=166,277;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr17	37821770	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0,6,1,1
chr17	37822311	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=61,187;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0|1:37822311_A_C:37822311:0,2,0,3
chr17	37822319	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37822311_A_C:37822311:0,1,0,1
chr17	37829570	.	CC	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	37829604	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr17	37831035	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=234,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr17	37866005	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=218,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr17	37868715	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,3:2,8:1,2,5,6
chr17	37879762	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,1,4
chr17	37898543	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr17	37922259	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=140,199;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.263:36:11,4:16,5:11,16,4,5
chr17	37985801	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=215,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,3:0,0:0,4,0,3
chr17	38061150	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=142,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,3:4,0:7,6,0,3
chr17	38064563	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,15;MFRL=226,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.466:4:1,0:1,0:0|1:38064563_T_A:38064563:0,2,0,2
chr17	38064571	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=226,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.549:5:1,0:1,0:0|1:38064563_T_A:38064563:0,2,0,3
chr17	38064575	.	ATC	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=226,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.549:5:1,1:1,1:0|1:38064563_T_A:38064563:0,2,0,3
chr17	38066240	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=124,304;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr17	38066267	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=143,304;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr17	38068514	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=244,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,5:2,1:3,0,6,0
chr17	38122680	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:7,8:4,3:0|1:38122680_G_T:38122680:4,7,3,8
chr17	38122686	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:7,6:4,3:0|1:38122680_G_T:38122680:4,7,2,8
chr17	38122708	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,2:1,2:1,6,0,4
chr17	38126911	.	AACACACAC	A,AAC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,25,25;MFRL=164,217,201;MMQ=60,60,60;MPOS=13,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,9,10;RU=AC;STR;TLOD=7.95,11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.310,0.388:10:1,2,4:1,1,0:0,3,0,7
chr17	38127713	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr17	38127932	.	G	GTATAGAGAATATTGTGTTTGTTTTATTAGTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=173,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr17	38128714	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=189,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:2,1,2,0
chr17	38129996	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=174,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.433:12:4,2:2,3:3,4,2,3
chr17	38130139	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=101,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:9,6:5,2:5,9,1,7
chr17	38130155	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=131,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,2:4,0:2,12,0,2
chr17	38130492	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=204,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:7,0,2,0
chr17	38130575	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=148,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,3:7,0:6,7,3,0
chr17	38140524	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:1,0,4,2
chr17	38145088	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:4,1:1,1:0,5,0,3
chr17	38146263	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=222,12387967;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,1:4,1:3,2,1,1
chr17	38146482	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,22,27;MFRL=0,205,167;MMQ=60,60,60;MPOS=29,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,20;RU=T;STR;TLOD=5.59,4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,4:0.372,0.456:8:0,1,0:1,1,3:0,1,3,4
chr17	38146542	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=163,258;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr17	38152373	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=210,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.410:9:1,0:2,4:3,2,3,1
chr17	38153473	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=264,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr17	38153554	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,3,1
chr17	38153580	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=173,61;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:4,2,2,0
chr17	38153714	.	T	TGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=46.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,3:1,8:0,1,9,2
chr17	38153868	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,10;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:38153868_G_T:38153868:0,0,0,1
chr17	38153875	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=18,25;MFRL=254,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:38153868_G_T:38153868:0,1,0,1
chr17	38171668	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr17	38172192	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr17	38172452	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=275,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.871:13:1,4:0,7:1,0,10,2
chr17	38172942	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,5,7
chr17	38172973	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=304,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,3:1,6:1,0,5,4
chr17	38176476	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=133,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:1,5:0,6:0,1,10,1
chr17	38176805	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=252,102;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.256:6:1,0:3,1:0,5,0,1
chr17	38176821	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=219,102;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:38176821_G_T:38176821:0,3,0,1
chr17	38176823	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=219,102;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:38176821_G_T:38176821:0,3,0,1
chr17	38178149	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=213,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.771:14:1,6:1,5:3,0,9,2
chr17	38178296	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,19;MFRL=166,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:11,1:0|1:38178296_G_T:38178296:1,14,1,1
chr17	38178301	.	T	TTAAAACTCCCATGC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=166,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:4,0:10,2:0|1:38178296_G_T:38178296:1,14,1,1
chr17	38178627	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:6,5:9,4:7,8,7,2
chr17	38179290	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,2:4,5:5,0,7,0
chr17	38179667	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=284,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,1:1,8:0,1,2,8
chr17	38183090	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=192,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,2:3,5:5,3,4,3
chr17	38188844	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=183,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:5,0,4,0
chr17	38189055	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=175,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr17	38233808	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=164,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,2:8,0:11,3,0,2
chr17	38251158	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,154;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.198:27:9,5:13,0:13,9,3,2
chr17	38252203	.	C	CG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,8;MFRL=165,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.208:23:6,0:11,1:0|1:38252203_C_CG:38252203:16,2,0,5
chr17	38252204	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=165,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.208:23:6,2:10,1:0|1:38252203_C_CG:38252203:16,2,0,5
chr17	38252209	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=165,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.208:23:5,2:10,1:0|1:38252203_C_CG:38252203:16,2,0,5
chr17	38252667	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,14,7
chr17	38253228	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr17	38285676	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=126,2083;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:13,0:16,4:14,15,4,0
chr17	38289297	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=164,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:0|1:38289297_C_T:38289297:11,12,2,0
chr17	38289306	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=159,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:15,0:12,3:0|1:38289297_C_T:38289297:13,14,2,1
chr17	38320446	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,320;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	38324766	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr17	38326007	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:38326007_T_C:38326007:0,0,0,3
chr17	38326012	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:38326007_T_C:38326007:0,0,0,3
chr17	38348616	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=147,358;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:2,1:5,1:1,7,0,2
chr17	38420959	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=203,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:2,0:0|1:38420959_T_C:38420959:0,3,3,0
chr17	38420965	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=26,36;MFRL=185,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:0|1:38420959_T_C:38420959:1,3,3,0
chr17	38420968	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=185,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:0|1:38420959_T_C:38420959:1,3,3,0
chr17	38420973	.	CAGGGCGGCGTGCCAACGCA	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=185,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.366:9:0,2:4,1:0|1:38420959_T_C:38420959:1,5,3,0
chr17	38445727	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=135,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:7,0:11,2:0|1:38445727_C_T:38445727:11,8,4,0
chr17	38445737	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=134,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.191:24:7,0:13,4:0|1:38445727_C_T:38445727:11,9,4,0
chr17	38448020	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=310,184;MMQ=60,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr17	38451739	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.410:10:2,3:4,0:2,4,0,4
chr17	38520926	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=190,91;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr17	38546167	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=181,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr17	38554853	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=133,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,4:4,1:6,4,4,1
chr17	38556770	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:3,6:5,8:6,2,8,6
chr17	38557325	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=175,189;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.233:14:5,2:5,0:3,8,0,3
chr17	38563710	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=227,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:4,0,6,0
chr17	38572366	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,247;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,0:6,5:1,8,0,5
chr17	38609431	.	G	GAC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=206,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,6:1,0:0,3,0,6
chr17	38634649	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:8,2:13,0:8,14,1,1
chr17	38634672	.	T	TC	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=170,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.171:19:6,1:6,2:0|1:38634672_T_TC:38634672:0,16,3,0
chr17	38634677	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=170,232;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.156:21:8,1:9,2:0|1:38634672_T_TC:38634672:1,17,3,0
chr17	38634682	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=171,252;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,1:12,1:0|1:38634672_T_TC:38634672:2,18,2,0
chr17	38644752	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=181,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:3,0,3,0
chr17	38644906	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,206;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:6,2:14,0:8,12,2,0
chr17	38786451	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr17	38788348	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr17	38788468	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,165;MMQ=60,35;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,0:8,4:12,6,0,4
chr17	38792229	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=119,117;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:10,0:20,2:14,16,0,2
chr17	38792313	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,0:7,2:8,9,1,1
chr17	38798609	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=134,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr17	38801760	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.188:35:11,6:18,0:22,7,6,0
chr17	38802106	.	TA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.286:15:1,0:5,2:2,9,0,4
chr17	38813824	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr17	38813828	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr17	38816526	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,2:0,0,0,9
chr17	38816536	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=306,267;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr17	38856704	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=235,140;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr17	38905477	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=166,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:7,1,2,0
chr17	38923932	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,0:2,2:2,3,0,2
chr17	38925099	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=214,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr17	38926002	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=142,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.278:23:8,4:9,2:0|1:38926002_G_A:38926002:13,4,5,1
chr17	38926032	.	T	TGTATTTTTATATCTGTATTGACTTA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,5:0.126:26:10,0:11,2:1|0:38926002_G_A:38926002:14,7,4,1
chr17	38938222	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=228,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr17	38953540	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:6,12:2,2:1,7,2,12
chr17	38954687	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=262,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr17	38974612	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=181,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,4:5,1:8,0,5,0
chr17	38975307	.	TGCCGCCGTGGCC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=389,221;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCCGCCGTGGCC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr17	38976716	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:10,8:8,9:9,9,10,7
chr17	38976978	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=197,328;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr17	38976998	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=186,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:0,1,1,7
chr17	38990679	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=232,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr17	38990780	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:4,1:15,3:8,11,2,2
chr17	38990834	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=137.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,16:0,22:0,0,15,23
chr17	38990839	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.205:37:11,7:19,0:14,16,0,7
chr17	38991032	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=83,202;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,5:4,8:1,8,6,7
chr17	38991036	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=164,83;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:7,3:12,0:6,13,1,2
chr17	38991052	.	TT	GA	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=143,178;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:4,8:8,6:5,9,5,9
chr17	38992539	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=148,246;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr17	39018961	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:1,5,0,4
chr17	39021015	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.375:13:5,0:2,3:6,2,4,1
chr17	39022843	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=144,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:8,0,2,0
chr17	39081546	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=180,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:10,0,2,0
chr17	39092868	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:5,3:9,0:10,4,0,3
chr17	39118553	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=197,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:7,2:7,2:5,9,1,3
chr17	39118667	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=169,65;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.170:21:9,3:9,0:7,11,2,1
chr17	39118691	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=158,65;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:10,3:22,0:11,21,2,1
chr17	39120624	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,138;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,6:9,0:14,0,6,0
chr17	39120754	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,121;MMQ=60,20;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.179:31:12,0:14,5:10,16,0,5
chr17	39120850	.	TTG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=183,259;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TG;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:3,1:5,1:0,8,0,2
chr17	39123131	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,121;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.423:12:2,2:5,3:0,7,2,3
chr17	39134528	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=163,225;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,1:7,2:3,11,0,3
chr17	39134561	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=167,233;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:2,7,0,2
chr17	39134990	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=266,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr17	39135322	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=202,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,1:5,1:1,7,0,2
chr17	39138476	.	CG	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,237;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:8,1,2,0
chr17	39139256	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=213,230;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:39139256_A_T:39139256:4,0,1,0
chr17	39139274	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=232,261;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:1,2:0|1:39139256_A_T:39139256:7,0,2,0
chr17	39139279	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=232,261;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:39139256_A_T:39139256:7,0,2,0
chr17	39140221	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=146,81;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:10,2:9,3:8,11,4,1
chr17	39222207	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=157,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr17	39240426	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=154,157;MMQ=52,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.760:23:2,9:3,9:4,1,11,7
chr17	39253685	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=199,190;MMQ=60,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=48.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:4,11:3,4:4,3,14,1
chr17	39253749	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.552:22:5,7:3,5:4,6,10,2
chr17	39254335	.	A	AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=101,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.503:22:5,3:6,7:6,5,6,5
chr17	39254444	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,1,3
chr17	39257818	.	AGGGG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,292;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:39257818_AGGGG_A:39257818:0,0,1,0
chr17	39257823	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,292;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:39257818_AGGGG_A:39257818:0,0,1,0
chr17	39258027	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=118,87;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.688:30:5,3:4,18:4,5,9,12
chr17	39258495	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=185,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.498:14:2,3:5,3:2,5,0,7
chr17	39262814	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=275,98;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr17	39280487	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,5:3,3:1,2,0,8
chr17	39333956	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr17	39334241	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=210,258;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.230:15:4,0:7,2:6,6,2,1
chr17	39334506	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=186,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,7:1,2:0,5,2,7
chr17	39340597	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr17	39340910	.	TG	CA,CG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,36,30;MFRL=0,126,199;MMQ=60,60,60;MPOS=26,18;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,65.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,21:0.115,0.846:23:0,1,13:0,1,7:0,0,14,9
chr17	39341646	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0|1:39341646_C_T:39341646:0,0,0,6
chr17	39341648	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:39341646_C_T:39341646:0,0,0,6
chr17	39346595	.	T	TGCTGTGGGTCCAGCTGCTGCCAGCCTA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,2:0,3:0,0,9,7
chr17	39382808	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=209,170;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:6,2,3,2
chr17	39383073	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,178;MMQ=52,52;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,1:2,5:1,2,3,3
chr17	39388811	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=211,138;MMQ=40,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:3,3,0,2
chr17	39405960	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=136,183;MMQ=52,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,4:4,2:5,3,0,6
chr17	39406673	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=194,161;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:3,1:11,0:6,8,2,0
chr17	39406812	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=12;MBQ=34,25;MFRL=172,82;MMQ=60,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.230:24:9,1:7,4:0|1:39406812_C_T:39406812:7,12,2,3
chr17	39406820	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=33,24;MFRL=172,82;MMQ=60,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:9,1:7,4:0|1:39406812_C_T:39406812:6,13,2,3
chr17	39406828	.	C	CATG	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=33,30;MFRL=165,82;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:8,1:11,4:0|1:39406812_C_T:39406812:7,12,2,3
chr17	39406838	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=12;MBQ=33,26;MFRL=142,152;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:7,2:8,2:0|1:39406812_C_T:39406812:8,9,1,3
chr17	39406844	.	GTT	G	.	.	DP=23;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=141,152;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:7,1:10,2:0|1:39406812_C_T:39406812:9,10,0,4
chr17	39406848	.	C	CCT	.	.	DP=23;ECNT=12;MBQ=32,33;MFRL=141,152;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:7,2:12,2:0|1:39406812_C_T:39406812:9,10,0,4
chr17	39406851	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=12;MBQ=33,34;MFRL=141,152;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:6,1:11,2:0|1:39406812_C_T:39406812:10,9,0,4
chr17	39406853	.	ACC	A	.	.	DP=23;ECNT=12;MBQ=28,27;MFRL=142,137;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:6,1:12,2:0|1:39406812_C_T:39406812:10,10,0,3
chr17	39406856	.	AG	A	.	.	DP=23;ECNT=12;MBQ=29,26;MFRL=142,137;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:5,1:11,2:0|1:39406812_C_T:39406812:10,10,0,3
chr17	39406870	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=142,110;MMQ=60,35;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:7,1:12,2:0|1:39406812_C_T:39406812:8,12,1,3
chr17	39406877	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=33,24;MFRL=141,137;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:7,1:11,2:0|1:39406812_C_T:39406812:12,11,1,2
chr17	39406894	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=145,137;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:10,1:11,2:0|1:39406812_C_T:39406812:11,11,1,2
chr17	39412093	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,251;MMQ=49,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:11,1:11,2:8,15,3,0
chr17	39412279	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=172,169;MMQ=60,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:11,3:8,2:9,10,2,3
chr17	39412372	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=136,153;MMQ=60,54;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.679:20:3,6:3,7:3,3,9,5
chr17	39422553	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,2:1,0:0,2,0,2
chr17	39458573	.	TGTACAGATGGTTG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=177,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:2,2:4,1:4,2,2,1
chr17	39458956	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=181,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:12,0:12,3:14,10,3,0
chr17	39459167	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=162,293;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr17	39464046	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=213,161;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.322:16:7,2:4,2:6,5,0,5
chr17	39464487	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=190,138;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,1:7,2:9,7,2,1
chr17	39471752	.	TGCCCCCGCAGCCAGA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCCCCCGCAGCCAGA;STR;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.527:13:1,2:2,3:0|1:39471752_TGCCCCCGCAGCCAGA_T:39471752:5,1,5,2
chr17	39471778	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.464:15:2,2:5,3:0|1:39471752_TGCCCCCGCAGCCAGA_T:39471752:7,1,5,2
chr17	39471972	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=188,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr17	39472018	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=358,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr17	39506659	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:8,5:8,0:8,8,3,2
chr17	39537228	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:5,1,2,0
chr17	39553811	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:2,1,1,1
chr17	39580130	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=210,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:3,2,2,1
chr17	39580393	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=163,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:13,0:9,3:7,15,0,3
chr17	39580559	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,16:0.586:27:6,9:5,6:0|1:39580559_T_A:39580559:7,4,7,9
chr17	39580562	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,16:0.586:27:5,10:4,5:0|1:39580559_T_A:39580559:7,4,7,9
chr17	39580816	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=164,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr17	39593872	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr17	39594679	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=174,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,2:6,0:7,5,2,0
chr17	39594726	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=190,0;MMQ=59,46;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:10,2:4,0:8,6,0,3
chr17	39594934	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=180,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,4:0,4:0,1,4,5
chr17	39595661	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,6:1,3:0,2,1,8
chr17	39596393	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=137,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:4,1:1,3:2,3,4,0
chr17	39596402	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=90,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:3,2:0,5:1,2,5,3
chr17	39596538	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=212,266;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:1,2,1,4
chr17	39596611	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr17	39616288	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=187,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr17	39619093	.	GT	AC	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=192,163;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=149.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,35:0.878:39:1,26:3,8:0|1:39619093_GT_AC:39619093:2,2,18,17
chr17	39619115	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,25:0.578:43:12,18:6,7:0|1:39619093_GT_AC:39619093:6,12,12,13
chr17	39619388	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr17	39620262	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=233,238;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:1,1:1,3:2,0,5,0
chr17	39620733	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr17	39634576	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=189,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr17	39635340	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=156,289;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,3:2,0:0,9,0,3
chr17	39636044	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,12:0,0,5,16
chr17	39644057	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=279,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr17	39644467	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=167,78;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:10,4:6,0:12,4,4,0
chr17	39645572	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=217,238;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr17	39659183	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=67.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.875:22:0,11:2,9:2,0,8,12
chr17	39659194	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,9,14
chr17	39659529	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,15,2
chr17	39659724	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=245,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:7,4:7,2:2,12,0,6
chr17	39659913	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=155,193;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:1,7:4,4:4,1,7,4
chr17	39661273	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=169,14244610;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:3,0:2,3:5,1,3,0
chr17	39671045	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	39680580	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,4,11
chr17	39680796	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr17	39681552	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=193,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.253:18:4,3:8,1:3,11,0,4
chr17	39723425	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=250,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:0|1:39723425_CA_C:39723425:1,0,3,0
chr17	39723451	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:39723425_CA_C:39723425:0,0,7,0
chr17	39723990	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,1,12
chr17	39724047	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=12,33;MFRL=272,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,2:0,2:0,1,0,4
chr17	39725634	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:4,2:6,4,1,1
chr17	39726276	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:1,4:4,7:2,3,5,6
chr17	39726492	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=229,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:3,1:7,8:1,9,3,6
chr17	39728050	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.837:23:2,5:1,10:0,3,7,13
chr17	39742492	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr17	39742807	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,209;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,2:13,1:11,10,2,1
chr17	39742856	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=159,105;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.253:18:6,2:6,2:10,4,0,4
chr17	39742894	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=158,162;MMQ=57,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,15:0.760:19:2,4:2,6:0|1:39742894_G_A:39742894:2,2,4,11
chr17	39742898	.	GC	AT	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=223,158;MMQ=57,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,14:0.832:16:1,3:1,6:0|1:39742894_G_A:39742894:2,0,3,11
chr17	39742899	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.910:7:0,4:0,2:0,0,5,2
chr17	39767836	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=308,153;MMQ=57,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.821:15:1,5:1,6:0,2,10,3
chr17	39776817	.	GA	G,GAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=21,20,20;MFRL=174,162,172;MMQ=60,60,60;MPOS=12,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=9.90,4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,7,4:0.296,0.202:21:1,0,2:4,4,0:2,8,3,8
chr17	39778857	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=205,375;MMQ=55,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:1,1,1,2
chr17	39779160	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=206,216;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:5,4,3,1
chr17	39871640	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=124,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,3:6,0:6,5,0,3
chr17	39874137	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,8,3
chr17	39874267	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=208,162;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,31:0.942:32:0,15:1,16:1,0,14,17
chr17	39881483	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=227,283;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:39881483_C_T:39881483:0,2,0,2
chr17	39881487	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:39881483_C_T:39881483:0,0,0,4
chr17	39883789	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr17	39883972	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	39884419	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr17	39884684	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=191,291;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr17	39888102	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=237,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,2:1,1:2,0,1,2
chr17	39888455	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=129,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:2,4:0,2:2,0,3,3
chr17	39912581	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=156,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr17	39913645	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,6:3,3:5,0,5,4
chr17	39914070	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=201,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,1:3,3:0,6,1,3
chr17	39923614	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr17	39959511	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	39967087	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=148,258;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,0:8,2:6,6,1,1
chr17	39973387	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,2:4,0:1,6,0,2
chr17	39976024	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=167,285;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:6,0,1,1
chr17	39977862	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr17	39983644	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=279,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,2:1,11:1,2,8,5
chr17	39983808	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,14:0.714:19:1,5:3,9:0|1:39983808_G_C:39983808:2,3,10,4
chr17	39983820	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,17:0.784:21:2,5:2,12:0|1:39983808_G_C:39983808:2,2,10,7
chr17	39983849	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=211,102;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:3,5:1,10:2,2,7,8
chr17	39988601	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=238,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,3,2
chr17	40003421	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=385,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:1,1:0,2:2,0,3,0
chr17	40003762	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=238,199;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:2,2:1,0:0,5,0,2
chr17	40024023	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr17	40024866	.	AAAG	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:40024866_AAAG_A:40024866:2,1,1,0
chr17	40024873	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=21,15;MFRL=72,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:40024866_AAAG_A:40024866:3,1,1,0
chr17	40024879	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=72,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:40024866_AAAG_A:40024866:3,1,1,0
chr17	40024895	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,4,1
chr17	40025264	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.727:20:1,11:4,4:4,1,8,7
chr17	40025285	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=81.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,15:0,7:0,0,14,8
chr17	40025453	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,6:2,0:0,3,0,6
chr17	40025670	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=274,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,6:1,17:1,0,23,2
chr17	40027869	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=175,168;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr17	40028450	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=189,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,1:0,1,0,5
chr17	40049473	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr17	40053021	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	40065413	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=212,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr17	40068613	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=200,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:2,0,2,1
chr17	40095270	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=175,234;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:10,6:5,0:9,6,6,0
chr17	40118807	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	40120181	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=150,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,3:9,0:13,9,0,3
chr17	40123829	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:0,2:1,4:1,0,6,1
chr17	40128625	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=217,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr17	40152431	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr17	40169519	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	40259600	.	GA	CC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.346:9:3,0:2,0:0|1:40259600_GA_CC:40259600:1,5,3,0
chr17	40259601	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.427:7:3,0:1,1:0,4,3,0
chr17	40259609	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.216:15:4,0:7,0:0|1:40259600_GA_CC:40259600:4,8,3,0
chr17	40259613	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:4,1:8,1:0|1:40259600_GA_CC:40259600:4,8,2,0
chr17	40259980	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=213,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,6:2,5:4,0,9,2
chr17	40265977	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=186,266;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:6,2:14,1:9,11,2,1
chr17	40269280	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=207,289;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,2,1
chr17	40270029	.	ACTGAAGCTGAGGAGAGAGAGAGACGTCAGGGATGGGGGG	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=320,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.835:8:1,5:0,2:0,1,4,3
chr17	40270238	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr17	40271757	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=269,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.832:16:2,4:0,9:1,1,3,11
chr17	40271970	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=183,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,5:1,6:1,0,10,1
chr17	40272406	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=211,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.800:23:2,5:2,14:4,0,5,14
chr17	40278915	.	GCCAGGGC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=68,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCAGGGC;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.509:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr17	40314213	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:4,0,1,2
chr17	40315761	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=127,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:5,1:5,0:0|1:40315761_T_G:40315761:10,3,0,2
chr17	40315765	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=129,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.162:16:5,0:8,0:0|1:40315761_T_G:40315761:11,3,0,2
chr17	40318296	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=189,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,1:3,4:2,1,5,0
chr17	40342628	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,367;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	40370237	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,172;MMQ=57,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,3:6,0:4,6,2,1
chr17	40370397	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=218,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr17	40460362	.	C	CGATGGGGTGG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=139,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:4,2:6,0:0|1:40460362_C_CGATGGGGTGG:40460362:6,4,1,1
chr17	40460363	.	C	CAGCTGAGCCG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=139,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:4,2:6,0:0|1:40460362_C_CGATGGGGTGG:40460362:6,4,1,1
chr17	40481529	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=201,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,4:6,3:6,3,7,0
chr17	40491273	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=182,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr17	40557093	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=203,223;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.128:45:14,5:23,0:22,18,5,0
chr17	40619937	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr17	40639422	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,3:6,4:4,6,1,6
chr17	40642452	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr17	40646973	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=247,141;MMQ=60,32;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,0:3,0,4,0
chr17	40660596	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=151,153;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:13,0:10,4:11,12,4,0
chr17	40689613	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,2:0,0,0,8
chr17	40705100	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,3:3,3:4,2,2,4
chr17	40705715	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=190,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,3:2,3:0|1:40705715_G_A:40705715:5,0,4,2
chr17	40705724	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,1:1,2:0|1:40705715_G_A:40705715:5,0,3,2
chr17	40705955	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=201,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr17	40706881	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:40706881_T_G:40706881:0,1,0,1
chr17	40706906	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=14,28;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:40706881_T_G:40706881:0,1,0,1
chr17	40716520	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,182;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:10,3:5,4:8,7,4,3
chr17	40720605	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:4,2,1,3
chr17	40721360	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:7,2:8,5:4,11,4,4
chr17	40724961	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.215:15:5,2:7,0:6,6,3,0
chr17	40725656	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,2:3,3:2,7,0,5
chr17	40735469	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=171,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,1:4,2:6,1,2,1
chr17	40737043	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=232,257;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr17	40737117	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=19,27;MFRL=88,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:0,0:0,3:1,0,3,0
chr17	40738731	.	ATGAAC	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=133,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGAAC;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:14,2:12,0:14,13,1,1
chr17	40762313	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=197,169;MMQ=33,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:1,10,1,1
chr17	40811781	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,3:3,2:8,2,5,0
chr17	40812797	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.913:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr17	40812814	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=157,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr17	40817448	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr17	40822678	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.627:22:3,4:5,10:4,4,10,4
chr17	40826525	.	AAGG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGG;STR;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.889:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr17	40836975	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=178,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,2:1,2:3,3,4,0
chr17	40837075	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=205,151;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.245:20:6,3:7,1:0|1:40837075_C_T:40837075:10,6,0,4
chr17	40837081	.	A	ATGATCTGTCCCCTTCACACCTGCCCTGTGACT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=200,151;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:7,3:5,1:0|1:40837075_C_T:40837075:7,5,0,4
chr17	40841130	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr17	40842084	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=102,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:2,1:2,2,3,1
chr17	40842127	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=168,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:4,6,2,0
chr17	40842866	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=173,131;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:11,6:6,0:4,13,6,0
chr17	40849842	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=132,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:5,3:3,5:5,3,4,5
chr17	40850552	.	CGT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=178,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=GT;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.505:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr17	40854534	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=146,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,4:3,6:4,2,3,7
chr17	40856538	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=151,146;MMQ=60,53;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr17	40856573	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=172,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.444:9:2,3:1,0:3,2,3,1
chr17	40880759	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	40937458	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=140,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,0:5,2:7,3,2,0
chr17	40946892	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=111,73;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:4,0:10,1:0|1:40946892_C_T:40946892:5,9,1,1
chr17	40946902	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=111,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,0:8,2:0|1:40946892_C_T:40946892:4,11,1,1
chr17	40955603	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=98,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,0:9,3:5,12,2,1
chr17	40963904	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=141,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr17	40985648	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:14,1:16,3:19,11,3,1
chr17	40986454	.	GGAGA	G,GGA,GGAGAGAGA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,32,30,33;MFRL=166,231,260,142;MMQ=60,60,60,60;MPOS=30,21,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,18;RU=GA;STR;TLOD=4.35,9.77,5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,2,4,2:0.148,0.309,0.225:11:3,1,1,2:0,1,2,0:2,1,4,4
chr17	41004481	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,1:7,1:11,5,2,0
chr17	41004845	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=143,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:2,3,0,2
chr17	41008573	.	C	CCTGGTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=259,259;MMQ=40,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41008573_C_CCTGGTCT:41008573:0,1,0,1
chr17	41008579	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=259,259;MMQ=40,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41008573_C_CCTGGTCT:41008573:0,1,0,1
chr17	41008582	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=259,259;MMQ=40,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41008573_C_CCTGGTCT:41008573:0,1,0,1
chr17	41062877	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=125,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr17	41063466	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=216,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:2,0:0,2:1,1,1,2
chr17	41103938	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr17	41105628	.	TTCC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCC;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr17	41113131	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=195,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:0,3:10,0:10,0,3,0
chr17	41116291	.	CAGCCCT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGCCCT;STR;TLOD=69.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.952:16:0,13:0,3:0,0,5,11
chr17	41116565	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr17	41121207	.	GGGGC	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:3,0,3,2
chr17	41121210	.	GC	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=175,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.420:9:3,1:2,2:3,3,3,0
chr17	41121217	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=81,200;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:4,1:2,2:3,5,3,0
chr17	41121218	.	G	GAA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=200,0;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=A;STR;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:1,3:2,1:3,0,3,4
chr17	41122443	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr17	41132578	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr17	41150949	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=191,257;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,2:6,2:0,12,0,4
chr17	41154817	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=134,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:5,7:6,7:7,4,7,7
chr17	41154869	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=127,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:14,0:6,5:13,7,0,6
chr17	41164126	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr17	41165109	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=160,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:7,4:11,0:6,12,4,0
chr17	41165734	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=192,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,2:5,4:5,2,4,2
chr17	41180772	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	41209120	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=151,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:5,12,1,1
chr17	41215825	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=262,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:0,5:3,8:3,0,11,2
chr17	41219560	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:4,0,5,1
chr17	41219780	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=121,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0|1:41219780_T_C:41219780:0,1,1,4
chr17	41219804	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:41219780_T_C:41219780:0,0,0,4
chr17	41226601	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=168,217;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr17	41228525	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:8,7:8,0:12,5,7,0
chr17	41234439	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=145,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:11,3,2,0
chr17	41234470	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,6:0,8:0,1,9,5
chr17	41249363	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	41256074	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:0,2:1,0,5,0
chr17	41256089	.	AAAAAAAAAGAAAAG	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.760:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr17	41267858	.	A	ATAAATTGCCTAACATACACTACCAATATC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr17	41290674	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=104,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.860:19:2,8:0,9:2,0,8,9
chr17	41327791	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=177,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.184:20:7,1:8,2:12,5,2,1
chr17	41329847	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=312,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr17	41331306	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=222,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,9:0,2:2,0,10,1
chr17	41343469	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=121,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.298:35:15,0:9,10:9,16,0,10
chr17	41346283	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=207,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr17	41346388	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=176,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:4,4,2,0
chr17	41349063	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=151,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:12,0:3,2:8,7,0,2
chr17	41352643	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=192,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,6:1,5:0,3,5,6
chr17	41352720	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=178,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,1,0
chr17	41353806	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=230,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,6:1,3:0,4,6,3
chr17	41361881	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=198,0;MMQ=58,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.570:5:0,2:2,1:2,0,2,1
chr17	41365339	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr17	41477172	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=153,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.135:42:18,2:19,3:13,24,2,3
chr17	41561601	.	CGGAAGGA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGAAGGA;STR;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.671:13:1,6:3,3:0,4,1,8
chr17	41566783	.	CTCT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=158,243;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,3:2,1:5,1,3,1
chr17	41570427	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=197,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,2:4,1:7,5,2,1
chr17	41573730	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=142,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr17	41585657	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:4,2,5,1
chr17	41590928	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=194,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:1,0,0,3
chr17	41598217	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=157,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:11,0:7,2:0|1:41598217_G_C:41598217:11,8,0,2
chr17	41598224	.	C	CTCCCCTCTGCCCCAGCCCTTGTGTA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=154,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:6,1:0|1:41598217_G_C:41598217:10,6,0,2
chr17	41598940	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:1,4,2,2
chr17	41599383	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=207,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:1,6:2,1:2,1,5,2
chr17	41599518	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,75;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:11,5:9,0:4,16,4,1
chr17	41610083	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=124,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.250:13:1,0:7,0:0|1:41610083_A_C:41610083:3,7,3,0
chr17	41610089	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.233:14:1,0:8,2:0|1:41610083_A_C:41610083:4,7,3,0
chr17	41610094	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=136,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,0:0|1:41610083_A_C:41610083:4,6,2,0
chr17	41610364	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=222,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.591:13:2,0:3,6:0,5,0,8
chr17	41613691	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=166,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr17	41613794	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=125,245;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:9,1:2,1:6,5,2,0
chr17	41622507	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=212,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,0:2,4,1,4
chr17	41622740	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:4,3:7,3:2,9,2,4
chr17	41721041	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=129,279;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:1,5,0,2
chr17	41738602	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,2:8,0:10,8,2,0
chr17	41846964	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,10,7
chr17	41891437	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=155,253;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,1:8,1:7,7,2,0
chr17	41891473	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=152,217;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,1:7,1:4,8,2,1
chr17	41893360	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=136,275;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:8,0:4,2:7,7,0,2
chr17	41895302	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=136,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,4:3,0:2,1,4,0
chr17	41907099	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=170,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:8,0:10,4:10,8,1,3
chr17	41907509	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:2,6,0,2
chr17	41926325	.	G	GATGAAATGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	41955158	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=187,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,4:2,0:4,2,3,1
chr17	41955315	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=152,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.557:21:5,7:4,3:4,5,6,6
chr17	41958244	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=219,34;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,0:6,2:6,6,1,1
chr17	41960633	.	CG	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,5,3
chr17	42018471	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=141,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,4:3,3:3,0,5,3
chr17	42030614	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=194,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:4,3,2,1
chr17	42083840	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,9,2
chr17	42084097	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.638:11:1,2:1,4:0,4,4,3
chr17	42085150	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,10,10
chr17	42085972	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,13,10
chr17	42090587	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=279,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr17	42091697	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=191,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:9,1,2,0
chr17	42156471	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=204,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.375:9:2,1:2,2:3,3,1,2
chr17	42164948	.	G	GAGTCGTCCTGCCAGTGAACCCAGGCCAAAGGGAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=217,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.319:9:3,2:2,0:5,2,1,1
chr17	42170136	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=118,68;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:0|1:42170136_G_A:42170136:8,9,1,1
chr17	42170141	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,68;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:0|1:42170136_G_A:42170136:8,6,1,1
chr17	42171206	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,1:7,2:3,9,2,1
chr17	42239349	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,7:0,0,3,7
chr17	42249717	.	A	ATG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=209,209;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TG;STR;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:0,1:0,2,0,4
chr17	42254011	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=210,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,5:0,2:1,0,6,1
chr17	42254281	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=235,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr17	42264962	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr17	42266297	.	TTTC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=176,166;MMQ=60,56;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:42266297_TTTC_T:42266297:2,1,1,0
chr17	42266305	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=176,166;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:42266297_TTTC_T:42266297:2,1,1,0
chr17	42268274	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	42288128	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=173,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:7,1,1,1
chr17	42329004	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=59,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:1,3:2,2:1,3,2,3
chr17	42331825	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,8;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,0:0|1:42331825_T_TC:42331825:1,2,2,0
chr17	42331829	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,17;MFRL=126,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:1,0:0|1:42331825_T_TC:42331825:2,3,2,0
chr17	42331833	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:1,0:0|1:42331825_T_TC:42331825:2,4,2,0
chr17	42331837	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:0,0:0|1:42331825_T_TC:42331825:2,4,2,0
chr17	42335331	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=165,503;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:7,6:9,0:8,8,0,6
chr17	42337976	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:6,1:4,1:7,4,2,0
chr17	42392077	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:2,1,1,2
chr17	42398757	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=217,258;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,2:0,7:1,0,6,3
chr17	42400817	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,36;MFRL=58,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:42400817_G_C:42400817:0,8,2,0
chr17	42400823	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=116,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:4,0:0|1:42400817_G_C:42400817:0,9,2,0
chr17	42400828	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=203,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.242:10:4,2:3,0:0|1:42400828_A_C:42400828:1,7,2,0
chr17	42400831	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=171,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:0|1:42400828_A_C:42400828:2,7,2,0
chr17	42427544	.	G	GAGTC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=204,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGTC;STR;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,2:1,4:5,0,6,0
chr17	42427660	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=180,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:17,2:14,1:16,15,0,3
chr17	42427732	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=191,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,1:2,1:4,4,0,2
chr17	42428538	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=126,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:2,1:9,1:5,6,1,1
chr17	42455022	.	TGAGCCCCTG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=167,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:7,1,2,0
chr17	42478052	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,171;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:5,4:9,0:11,3,5,0
chr17	42483233	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.449:9:3,4:2,0:5,0,3,1
chr17	42501692	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:2,2:4,2,2,4
chr17	42744210	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=188,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:2,0:8,3:6,4,1,2
chr17	42745106	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=144,118;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,3:11,0:12,6,3,0
chr17	42751607	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=358,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr17	42786100	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:7,10:11,0:16,2,10,0
chr17	42786630	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:7,5:3,8:4,6,9,4
chr17	42824402	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr17	42824648	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr17	42824731	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	42847033	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=220,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr17	42850352	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.622:14:1,5:4,3:2,3,5,4
chr17	42851634	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:4,5:8,2,5,4
chr17	42853427	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=127,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:4,2,4,0
chr17	42854208	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=202,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,6:2,4:3,0,2,8
chr17	42854502	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=209,369;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:1,1,2,2
chr17	42855248	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=206,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:0,7:2,5:0,2,5,7
chr17	42855472	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=116,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.709:22:3,9:3,7:2,4,5,11
chr17	42927628	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=229,238;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr17	42929918	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=194,252;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,16:0.436:37:10,0:11,16:0|1:42929918_A_T:42929918:9,12,0,16
chr17	42929923	.	C	CCAGTGCCTAGCACATATAGAATGAATAAAAGT	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=31,36;MFRL=197,252;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=39.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,16:0.447:36:10,0:10,16:0|1:42929918_A_T:42929918:9,11,0,16
chr17	42929970	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=209,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:3,3,1,3
chr17	42929985	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=184,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:1,3,1,2
chr17	42932107	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=229,68;MMQ=60,58;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:2,3,0,2
chr17	42932193	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=270,86;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:1,4,1,1
chr17	42932474	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,239;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr17	42934372	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=225,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,2:2,5:7,0,6,1
chr17	42937749	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=173,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,1:6,2:7,6,2,1
chr17	42938011	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=180,159;MMQ=60,55;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr17	42942496	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:16,0:3,5:0,19,0,6
chr17	42945296	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=80,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,7:2,0:0,2,2,5
chr17	42945541	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr17	42949808	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=123,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,2:9,1:10,5,3,0
chr17	42957855	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,1:0,3:2,1,4,0
chr17	42960516	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=129,78;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.134:27:9,0:15,3:13,11,2,1
chr17	42960624	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=244,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,0:0,3:0,3,1,2
chr17	42961009	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=98,107;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:4,5:6,5:6,5,4,6
chr17	42962638	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=124,64;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:8,5,2,0
chr17	42978554	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,4:2,0:0,3,0,4
chr17	42978925	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:5,0:14,3:9,11,2,1
chr17	42979026	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=143,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:7,1:9,6:9,7,2,5
chr17	42980189	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=246,234;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:5,1:4,2:0,10,0,3
chr17	42981239	.	G	GAGT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=120,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,1:6,2:4,10,2,1
chr17	42984842	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=224,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:1,10,0,2
chr17	42988092	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,3:5,4:4,7,2,5
chr17	42992844	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=170,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr17	43008905	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,2:4,1:4,0,3,0
chr17	43009660	.	AGCAGGGAGCGGGTGG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=312,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	43013692	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=212,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:8,1:11,6:11,9,2,5
chr17	43101708	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.849:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr17	43107449	.	TAC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=212,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AC;STR;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,4:2,2:6,2,3,3
chr17	43107589	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=203,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,1,3
chr17	43163851	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,1:1,3:4,2,3,1
chr17	43171154	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,5:5,8:5,4,3,10
chr17	43181287	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr17	43183028	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=194,110;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,3:7,3:2,9,2,4
chr17	43183048	.	C	CCACAAAAA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=159,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:43183048_C_CCACAAAAA:43183048:2,7,1,1
chr17	43183050	.	A	AGTGTT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=159,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:5,0:0|1:43183048_C_CCACAAAAA:43183048:2,7,1,1
chr17	43183108	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=206,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr17	43191006	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=213,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr17	43192549	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=57.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,8:0,0,6,11
chr17	43192681	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=200,283;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr17	43195663	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,3:3,3:7,2,5,1
chr17	43195699	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:7,2:8,4:9,6,3,3
chr17	43213772	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr17	43214431	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:11,6:9,0:8,13,4,2
chr17	43227766	.	T	TTTGG	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTGG;STR;TLOD=191.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.980:44:0,21:0,20:0,0,20,24
chr17	43228673	.	CA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:8,1:7,2:2,15,0,3
chr17	43240081	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=213,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:4,2:0,1:3,2,3,0
chr17	43316520	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=229,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr17	43317798	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:2,1:2,2:3,2,2,1
chr17	43323101	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=133,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.115:28:14,0:11,2:11,14,2,1
chr17	43333785	.	AAGAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=107,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,4:3,0:3,3,2,2
chr17	43344073	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:5,5:6,9:4,7,5,9
chr17	43344555	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,59;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:15,5:15,0:11,19,5,0
chr17	43345009	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:7,1:11,1:10,8,0,2
chr17	43351039	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr17	43363941	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=171,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:5,2:7,3:3,10,3,2
chr17	43364293	.	C	CG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=78.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,12:0,0,5,19
chr17	43368114	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=213,206;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,0:5,3:0,13,0,3
chr17	43481129	.	G	GCAGGCGGCCTGGTAAGGCCAGGCCCTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=218,58;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr17	43507008	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,4,3
chr17	43515359	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,1:7,2:2,8,1,2
chr17	43517054	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=235,175;MMQ=50,56;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:0,6,0,4
chr17	43522775	.	TTGTG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=171,153;MMQ=27,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=TG;STR;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:9,2:2,2:11,0,4,0
chr17	43528158	.	G	GGCTTGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=230,190;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	43531320	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=176,75;MMQ=52,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:17,0:12,3:19,10,0,3
chr17	43545893	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=172,182;MMQ=60,57;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,3:7,2:3,7,1,4
chr17	43552537	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=186,208;MMQ=52,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:4,8,2,0
chr17	43552717	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,152;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:4,2,1,2
chr17	43552921	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=166,160;MMQ=52,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,3:7,3:4,8,5,1
chr17	43553150	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=108,154;MMQ=45,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,5:1,2:2,3,1,6
chr17	43555253	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=177,173;MMQ=57,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,3:3,0:4,5,2,1
chr17	43893751	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr17	43893769	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:43893769_GC_G:43893769:4,1,1,1
chr17	43893772	.	TGCCTG	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:43893769_GC_G:43893769:4,1,1,1
chr17	43898887	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr17	43907641	.	C	CAGGTGG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=195,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,0:2,3:2,5,1,2
chr17	43907745	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=218,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,1:3,2:2,3,2,2
chr17	43907896	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=177,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:4,2,1,2
chr17	43908151	.	CC	TT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=210,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr17	43910455	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=170,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,3,0
chr17	43910507	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=269,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:1,1,1,2
chr17	43910653	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr17	43911352	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=162,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:5,3,1,1
chr17	43911424	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=154,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:6,2:2,1:0|1:43911424_C_T:43911424:4,4,1,2
chr17	43911443	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=172,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.252:14:6,2:3,1:0|1:43911424_C_T:43911424:4,7,1,2
chr17	43912159	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=213,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,1:2,5,0,2
chr17	43922942	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=205,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:1,3:6,1:6,2,2,2
chr17	43923266	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=163,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr17	43924073	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:4,4,2,2
chr17	43924130	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=191,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:2,1:4,4:2,4,1,4
chr17	43924200	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=148,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.395:8:4,1:1,2:0|1:43924200_C_G:43924200:2,3,2,1
chr17	43924219	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:43924200_C_G:43924200:0,1,0,1
chr17	43924231	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:43924200_C_G:43924200:0,1,0,2
chr17	44039691	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=196,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:4,2,2,1
chr17	44049133	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=202,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,2:3,5:6,0,7,0
chr17	44049329	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:3,6,0,4
chr17	44051846	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:9,3:3,4:5,7,3,4
chr17	44060775	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=230,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,2:6,3:5,4,4,1
chr17	44061023	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,2:1,2:3,4,4,0
chr17	44061036	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:6,1:0,3:3,3,3,1
chr17	44061278	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:5,2:3,1:3,6,2,1
chr17	44064334	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,1:2,2:4,3,3,0
chr17	44067400	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,4:4,1:3,7,3,2
chr17	44068924	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=238,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:5,6:3,7:5,3,5,8
chr17	44071294	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:8,5:0,1:7,1,3,3
chr17	44073889	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:5,1:4,2:4,6,1,2
chr17	44073973	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:3,5,4,2
chr17	44076665	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=80,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.424:26:5,2:10,8:11,4,3,8
chr17	44077044	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=77.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,13:0,0,9,17
chr17	44091724	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=182,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,3:4,2:6,3,3,2
chr17	44101563	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=173,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,2:11,1:5,11,0,3
chr17	44108840	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:12,1:13,1:16,10,2,0
chr17	44108906	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=199,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:10,5:6,4:9,7,4,5
chr17	44110532	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=200,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.296:25:10,5:7,2:0|1:44110532_G_A:44110532:11,7,3,4
chr17	44110538	.	T	TTCAGTGAGACAAGATCTCACCACTGCACTCCA	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=196,53;MMQ=60,41;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,2:11,0:0|1:44110532_G_A:44110532:17,10,1,1
chr17	44110541	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=203,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:12,4:9,2:0|1:44110532_G_A:44110532:14,7,3,3
chr17	44110670	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=214,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,2:8,3:9,4,3,2
chr17	44110888	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=235,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,1:7,3:2,10,1,3
chr17	44111613	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=184,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:9,3:9,3:6,12,2,4
chr17	44115886	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=162,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,6:5,6:7,4,7,5
chr17	44117096	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=143,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:10,2:0|1:44117096_T_A:44117096:15,10,1,1
chr17	44117099	.	GT	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=143,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:10,2:0|1:44117096_T_A:44117096:15,10,1,1
chr17	44117119	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,7:4,3:7,3,4,6
chr17	44128125	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=210,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:0,6,0,3
chr17	44144993	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,7:0,13:0,0,8,12
chr17	44159725	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=189,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,4:2,0:7,0,4,0
chr17	44159849	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:8,5:6,1:6,8,1,5
chr17	44248769	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=207,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.391:36:10,9:12,4:15,7,9,5
chr17	44248814	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=200,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:10,12:7,8:9,8,11,9
chr17	44248837	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=204,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:10,7:13,1:10,14,3,5
chr17	44248848	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.227:33:15,3:11,4:9,17,3,4
chr17	44249096	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=218,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:12,2:11,1:20,3,3,0
chr17	44249199	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.305:34:10,6:14,4:14,10,6,4
chr17	44382820	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=113,113;MMQ=24,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,2,1
chr17	44590665	.	C	CCCAATCCCAGCCCCGACAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=220,187;MMQ=23,23;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	44626347	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=178,127;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.248:34:17,4:9,4:19,7,5,3
chr17	44626660	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,10:0,19:0,0,15,14
chr17	44627767	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=136,193;MMQ=45,33;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:3,0:6,1,2,0
chr17	44627783	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,10;MFRL=136,167;MMQ=24,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.586:8:2,0:0,0:2,1,5,0
chr17	44630893	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=148,70;MMQ=27,31;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:1,8,0,2
chr17	44630913	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=139,155;MMQ=27,24;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:44630913_G_T:44630913:0,4,0,1
chr17	44630917	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=139,155;MMQ=27,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:44630913_G_T:44630913:0,4,0,1
chr17	44632540	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	44632734	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=154,129;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.312:20:4,4:10,2:5,9,3,3
chr17	44770491	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=148,149;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:0,9,0,2
chr17	44782224	.	A	AGT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=143,138;MMQ=41,27;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:7,4:11,0:7,11,3,2
chr17	44782279	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=184,146;MMQ=52,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:7,5:8,0:3,13,0,5
chr17	44788253	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr17	44788310	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:12,3:6,2:11,7,5,0
chr17	44828909	.	C	CAT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:14,2:13,0:14,13,2,0
chr17	44828931	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:8,6:9,2:13,4,4,4
chr17	44833088	.	ATTTT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,0:0,1:3,0,1,0
chr17	44833217	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=98,115;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:9,6:6,4:5,11,5,5
chr17	44950237	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=220,221;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr17	45012577	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=175,55;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,3:8,0:9,10,3,0
chr17	45198400	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:2,5,0,7
chr17	45214416	.	AAG	TTT	.	.	DP=9;ECNT=15;MBQ=27,25;MFRL=163,174;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.458:9:2,1:3,3:0|1:45214416_AAG_TTT:45214416:5,0,4,0
chr17	45214420	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=15;MBQ=27,31;MFRL=163,170;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,1:0|1:45214416_AAG_TTT:45214416:5,0,3,0
chr17	45214430	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=15;MBQ=30,27;MFRL=147,170;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:0|1:45214416_AAG_TTT:45214416:7,0,3,0
chr17	45214434	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=15;MBQ=25,33;MFRL=142,167;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,1:6,0,4,0
chr17	45214453	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=15;MBQ=30,32;MFRL=166,170;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:4,1:5,2:10,0,3,0
chr17	45214465	.	TA	CG	.	.	DP=14;ECNT=15;MBQ=25,32;MFRL=147,178;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:3,2:5,3:0|1:45214465_TA_CG:45214465:7,2,5,0
chr17	45214473	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=15;MBQ=29,25;MFRL=142,185;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:2,2:6,2:0|1:45214465_TA_CG:45214465:6,2,4,0
chr17	45214482	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=15;MBQ=28,32;MFRL=136,243;MMQ=60,53;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:3,1:0|1:45214465_TA_CG:45214465:5,2,2,0
chr17	45214486	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=15;MBQ=29,35;MFRL=142,243;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:0|1:45214465_TA_CG:45214465:4,4,2,0
chr17	45214488	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=15;MBQ=28,34;MFRL=142,243;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:0|1:45214465_TA_CG:45214465:4,4,2,0
chr17	45214497	.	TTG	T	.	.	DP=11;ECNT=15;MBQ=29,28;MFRL=158,192;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,2:5,1:0|1:45214497_TTG_T:45214497:4,4,2,1
chr17	45214501	.	A	ACG	.	.	DP=13;ECNT=15;MBQ=28,28;MFRL=148,192;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:2,2:5,1:0|1:45214497_TTG_T:45214497:5,5,2,1
chr17	45214523	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=15;MBQ=28,33;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:3,3:8,2:0|1:45214523_A_C:45214523:5,6,4,1
chr17	45214527	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=15;MBQ=25,33;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:2,3:8,2:0|1:45214523_A_C:45214523:5,7,4,1
chr17	45214544	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=15;MBQ=29,32;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,5:7,5:5,5,7,3
chr17	45214582	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=18;MBQ=29,34;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=51.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,13:0.609:21:5,4:3,9:0|1:45214582_A_G:45214582:4,4,10,3
chr17	45214592	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=18;MBQ=28,33;MFRL=184,176;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,12:0.650:18:4,4:2,8:0|1:45214582_A_G:45214582:3,3,9,3
chr17	45214600	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=18;MBQ=30,34;MFRL=184,176;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,12:0.650:18:4,4:1,5:0|1:45214582_A_G:45214582:4,2,9,3
chr17	45214605	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=18;MBQ=28,32;MFRL=179,174;MMQ=60,53;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:5,4:1,6:0|1:45214582_A_G:45214582:4,3,9,1
chr17	45214606	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=18;MBQ=29,28;MFRL=172,941;MMQ=60,41;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:6,0:12,3,1,1
chr17	45214613	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=18;MBQ=28,25;MFRL=176,172;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:4,3:2,5:0|1:45214582_A_G:45214582:3,3,8,3
chr17	45214616	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=18;MBQ=28,32;MFRL=176,169;MMQ=60,47;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:4,2:2,6:0|1:45214582_A_G:45214582:3,3,5,3
chr17	45214617	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=18;MBQ=35,29;MFRL=176,169;MMQ=60,47;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:4,2:1,6:0|1:45214582_A_G:45214582:3,3,5,3
chr17	45214631	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=18;MBQ=30,27;MFRL=163,159;MMQ=60,41;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:0|1:45214631_G_A:45214631:3,3,1,2
chr17	45214633	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=18;MBQ=29,35;MFRL=163,159;MMQ=60,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:4,1:2,1:0|1:45214631_G_A:45214631:3,3,1,2
chr17	45214643	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=18;MBQ=31,34;MFRL=163,142;MMQ=60,43;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0|1:45214631_G_A:45214631:3,3,0,2
chr17	45214648	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=18;MBQ=35,26;MFRL=166,159;MMQ=60,44;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.307:10:3,2:4,1:3,4,0,3
chr17	45214651	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=18;MBQ=30,32;MFRL=166,194;MMQ=60,58;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:3,2:4,1:0|1:45214631_G_A:45214631:3,4,4,4
chr17	45214654	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=18;MBQ=36,28;MFRL=160,194;MMQ=60,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:0|1:45214631_G_A:45214631:4,4,4,4
chr17	45214669	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=18;MBQ=28,33;MFRL=166,181;MMQ=60,58;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,12:0.520:23:7,6:4,6:0|1:45214669_T_G:45214669:6,5,6,6
chr17	45214673	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=18;MBQ=28,30;MFRL=166,181;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,12:0.520:23:7,6:4,6:0|1:45214669_T_G:45214669:5,6,6,6
chr17	45214682	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=18;MBQ=28,29;MFRL=166,176;MMQ=60,58;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.538:24:8,6:3,7:0|1:45214669_T_G:45214669:5,6,8,5
chr17	45214699	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=18;MBQ=30,32;MFRL=166,181;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.562:21:6,6:3,5:4,5,8,4
chr17	45216132	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=10;MBQ=27,22;MFRL=167,76;MMQ=60,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:8,1:16,3:0|1:45216132_T_G:45216132:12,12,4,1
chr17	45216141	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=10;MBQ=28,29;MFRL=174,76;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,9:0.301:31:7,5:14,4:0|1:45216132_T_G:45216132:11,11,7,2
chr17	45216162	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=10;MBQ=28,20;MFRL=163,82;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,17:0.514:33:6,7:10,8:0|1:45216162_A_C:45216162:6,10,8,9
chr17	45216168	.	TT	CG	.	.	DP=34;ECNT=10;MBQ=31,26;MFRL=160,85;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=73.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,19:0.556:34:5,10:8,8:0|1:45216162_A_C:45216162:6,9,8,11
chr17	45216172	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=10;MBQ=29,32;MFRL=152,85;MMQ=56,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,19:0.606:31:4,10:7,9:0|1:45216162_A_C:45216162:4,8,8,11
chr17	45216210	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=10;MBQ=28,32;MFRL=176,93;MMQ=60,56;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.585:39:3,14:13,9:8,8,6,17
chr17	45216216	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=10;MBQ=28,32;MFRL=180,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=90.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,23:0.600:38:5,12:10,10:8,7,7,16
chr17	45216231	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=10;MBQ=28,32;MFRL=197,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:3,12:8,6:6,5,6,12
chr17	45216247	.	AT	TG	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=28,26;MFRL=197,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,15:0.532:28:5,8:8,6:0|1:45216247_AT_TG:45216247:7,6,5,10
chr17	45216257	.	C	CTTGCGTGGACT	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=192,878;MMQ=60,58;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:4,2:7,5:0|1:45216247_AT_TG:45216247:6,6,3,5
chr17	45229087	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=11;MBQ=26,30;MFRL=189,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr17	45229096	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=11;MBQ=25,32;MFRL=174,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr17	45229200	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=11;MBQ=35,25;MFRL=179,72;MMQ=60,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,1:10,1:0|1:45229200_G_T:45229200:12,12,0,2
chr17	45229207	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=29,26;MFRL=179,72;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,1:10,1:0|1:45229200_G_T:45229200:11,12,0,2
chr17	45229209	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=29,20;MFRL=179,72;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,1:11,1:0|1:45229200_G_T:45229200:11,11,0,2
chr17	45229221	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=11;MBQ=35,30;MFRL=163,72;MMQ=60,33;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.137:27:13,2:11,1:0|1:45229221_C_T:45229221:11,13,0,3
chr17	45229228	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=11;MBQ=28,31;MFRL=169,72;MMQ=60,33;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:13,2:9,1:0|1:45229221_C_T:45229221:12,13,0,3
chr17	45229234	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=11;MBQ=28,31;MFRL=156,72;MMQ=60,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:13,2:11,1:0|1:45229221_C_T:45229221:12,13,0,3
chr17	45229240	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=28,27;MFRL=148,72;MMQ=60,33;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:11,2:12,1:0|1:45229221_C_T:45229221:11,12,0,3
chr17	45229253	.	TT	GG	.	.	DP=27;ECNT=11;MBQ=29,31;MFRL=147,72;MMQ=60,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:10,2:13,1:0|1:45229253_TT_GG:45229253:13,11,0,3
chr17	45229261	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=29,31;MFRL=144,36;MMQ=60,38;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,2:10,0:0|1:45229253_TT_GG:45229253:12,12,0,2
chr17	45234298	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=207,119;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:7,7:8,3:7,8,9,1
chr17	45234343	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=8;MBQ=25,20;MFRL=143,113;MMQ=52,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=116.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,32:0.717:44:2,16:7,12:0|1:45234343_T_G:45234343:6,6,22,10
chr17	45234360	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=8;MBQ=25,30;MFRL=142,119;MMQ=52,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=112.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,30:0.660:45:5,16:9,13:0|1:45234343_T_G:45234343:9,6,21,9
chr17	45234406	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=201,136;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:3,1:7,2:0|1:45234406_CA_C:45234406:7,5,1,2
chr17	45234417	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=29,32;MFRL=143,136;MMQ=60,37;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:2,2:7,2:0|1:45234406_CA_C:45234406:5,4,2,3
chr17	45234420	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=25,31;MFRL=177,142;MMQ=60,37;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:2,1:7,2:0|1:45234406_CA_C:45234406:6,4,1,2
chr17	45234432	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=152,142;MMQ=60,37;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:2,1:5,2:0|1:45234406_CA_C:45234406:4,6,1,2
chr17	45234449	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=28,28;MFRL=143,161;MMQ=60,37;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:3,1:5,4:3,6,2,3
chr17	45234707	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=118,97;MMQ=40,25;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.384:24:8,4:7,5:0|1:45234707_T_A:45234707:8,7,3,6
chr17	45234710	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=117,97;MMQ=42,25;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:8,4:8,5:0|1:45234707_T_A:45234707:8,8,3,6
chr17	45234760	.	CAA	C,CA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=20,33,31;MFRL=99,155,130;MMQ=60,60,60;MPOS=30,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=6.09,4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,3:0.223,0.231:15:1,1,0:4,2,2:0,9,1,5
chr17	45234809	.	C	CTACTTACATACTAAAACTAAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=228,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr17	45247362	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=150,81;MMQ=60,50;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,0:5,3:5,8,1,2
chr17	45249365	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=164,144;MMQ=60,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:16,0:4,3:0|1:45249365_C_T:45249365:12,8,0,3
chr17	45249372	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=165,146;MMQ=60,25;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:14,1:4,3:0|1:45249365_C_T:45249365:11,8,0,4
chr17	45249391	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=26,35;MFRL=152,146;MMQ=60,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:11,1:7,2:0|1:45249365_C_T:45249365:10,9,0,4
chr17	45249399	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=146,148;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:11,1:8,2:0|1:45249365_C_T:45249365:12,8,0,3
chr17	45249408	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=149,148;MMQ=60,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:10,1:7,2:0|1:45249365_C_T:45249365:11,10,0,3
chr17	45291103	.	TG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=132,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,6:6,3:8,1,6,3
chr17	45299834	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=183,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:4,4:3,0:5,2,2,3
chr17	45360680	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=169,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:6,2:4,3:11,0,5,0
chr17	45367244	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=273,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr17	45367669	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=213,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:5,1:2,2:3,4,1,2
chr17	45368337	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=143,175;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.793:22:3,7:1,11:2,2,10,8
chr17	45368523	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=230,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr17	45377825	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=112,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,2:3,4:8,1,5,1
chr17	45380002	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=155,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr17	45422329	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:14,3,2,0
chr17	45425144	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=226,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,4:3,0:5,1,1,3
chr17	45438886	.	CAGTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=204,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,1:1,1:2,6,1,1
chr17	45468858	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=199,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.332:28:10,6:9,3:8,11,7,2
chr17	45481372	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=182,191;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:11,0:10,3:8,13,0,3
chr17	45608885	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,158;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.339:18:9,3:3,2:7,5,2,4
chr17	45663680	.	GTATA	G,GTA,GTATATA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30,32,25;MFRL=252,237,171,240;MMQ=60,56,60,35;MPOS=3,26,2;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,8,9,11;RU=TA;STR;TLOD=6.99,10.82,5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,3,5,3:0.168,0.262,0.173:19:3,1,1,1:5,2,4,2:6,2,9,2
chr17	45669428	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=205,167;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.811:12:1,7:1,3:1,1,5,5
chr17	45669524	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=226,170;MMQ=43,22;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:1,5,1,3
chr17	45669878	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=142,140;MMQ=60,44;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,1:9,1:6,8,1,1
chr17	45673653	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=153,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:5,0,2,0
chr17	45677192	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr17	45690028	.	ACTT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=223,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,1:3,0:0,5,0,1
chr17	45690029	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=186,213;MMQ=40,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr17	45695832	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=129,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.818:20:0,6:3,11:1,2,5,12
chr17	45695914	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=135,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,1:2,4:0,2,0,5
chr17	45699061	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=221,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,3:6,0:7,0,3,0
chr17	45727931	.	CCCT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=250,242;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr17	45734209	.	CTTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,6;RU=T;STR;TLOD=54.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr17	45741684	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=207,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,0:4,4:0,7,0,4
chr17	45750596	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=235,216;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=61.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.881:23:1,7:1,14:1,1,1,20
chr17	45754569	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	45757598	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	45774072	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=113,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:9,5:9,3:10,8,5,3
chr17	45774385	.	CAG	TGT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=193,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr17	45776024	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=165,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:4,3:12,0:0|1:45776024_C_G:45776024:10,6,3,0
chr17	45776029	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=165,207;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:4,3:14,0:0|1:45776024_C_G:45776024:10,8,3,0
chr17	45776058	.	G	GC	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=176,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,2:0.141:19:7,0:9,1:1|0:45776024_C_G:45776024:7,10,2,0
chr17	45776062	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=27,16;MFRL=176,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,2:0.142:19:4,0:10,1:1|0:45776024_C_G:45776024:7,10,2,0
chr17	45776065	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=35,20;MFRL=176,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,2:0.142:19:4,0:8,2:1|0:45776024_C_G:45776024:7,10,2,0
chr17	45776069	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=34,13;MFRL=172,101;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.184:14:4,0:8,0:1|0:45776024_C_G:45776024:2,10,2,0
chr17	45776997	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=155,239;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,0:7,3:7,9,3,0
chr17	45777166	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.393:15:6,0:3,4:0,9,0,6
chr17	45787835	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=161,264;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:5,3,2,0
chr17	45787911	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=220,102;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,0:4,3:8,3,0,3
chr17	45810742	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=12,24;MFRL=239,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,2:0,0:1,0,2,0
chr17	45821844	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:3,8:11,2:7,7,5,5
chr17	45822092	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=152,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:7,2:8,2:13,2,4,0
chr17	45885756	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=176,173;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:4,7:4,8:2,6,5,10
chr17	45885780	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=173,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,1:9,1:7,10,0,2
chr17	45886667	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=210,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:6,2,0,2
chr17	45888251	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=324,245;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr17	45893862	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=224,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:5,3,0,4
chr17	45894735	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:2,4:0,2:0,2,0,6
chr17	45896053	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=188,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr17	45896478	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=279,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr17	45897531	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,1:1,5:1,2,5,1
chr17	45901480	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=219,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:4,2:2,3:6,0,4,1
chr17	45904420	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.257:37:11,6:16,3:15,13,6,3
chr17	45905779	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=174,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:8,0,2,0
chr17	45905850	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=70.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,15,9
chr17	45916725	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=209,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr17	45992580	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr17	46022889	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,3:2,4:4,2,3,4
chr17	46023295	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=151,240;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:5,4:10,5:9,6,5,4
chr17	46023370	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=157,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:3,2:9,2:3,9,2,2
chr17	46048592	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=101,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:5,10:5,3:4,6,5,8
chr17	46048858	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=140,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr17	46051645	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=206,130;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:5,0,2,0
chr17	46051911	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=170,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr17	46052793	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=189,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:1,7:0,4:0,2,6,6
chr17	46053016	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=185,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:46053016_A_T:46053016:0,4,1,1
chr17	46053018	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=185,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:46053016_A_T:46053016:0,4,1,1
chr17	46053019	.	G	GTGTGTGTGTGT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=185,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:46053016_A_T:46053016:0,4,1,1
chr17	46054264	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=104,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:1,2:0,4:0,1,1,5
chr17	46055106	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=101,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,2:1,8:1,1,10,0
chr17	46055347	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=99,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.739:13:2,5:1,5:1,2,0,10
chr17	46103760	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=172,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:16,1:8,1:16,10,0,2
chr17	46110044	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.206:32:9,3:17,3:10,16,3,3
chr17	46135645	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,312;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,1:7,1:11,1,0,2
chr17	46136735	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=203,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:8,3:12,3:13,7,1,5
chr17	46152333	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=137,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.267:28:13,5:8,2:14,7,7,0
chr17	46152347	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=157,49;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:21,0:8,2:23,6,1,1
chr17	46152368	.	C	CCTGAGTT	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=169,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:26,0:6,1:26,8,1,1
chr17	46152559	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=263,204;MMQ=56,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.568:5:0,0:0,1:0,2,0,3
chr17	46190819	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	46198876	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chr17	46239985	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr17	46247998	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:10,5:10,0:11,9,5,0
chr17	46248074	.	CT	C,CTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=19,30,19;MFRL=140,0,158;MMQ=60,60,60;MPOS=25,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=6.43,6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.404,0.402:7:0,0,1:0,2,0:0,1,1,5
chr17	46607866	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=219,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:5,11,0,2
chr17	46620402	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=118,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:6,1:12,1:11,7,2,0
chr17	46621828	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=227,300;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr17	46622106	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=149,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:9,4:9,2:12,6,4,2
chr17	46622159	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=140,289;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:10,1:12,5:14,8,2,4
chr17	46622348	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=279,321;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr17	46629933	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=C;STR;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.837:4:0,1:0,0:0,0,0,4
chr17	46673723	.	TC	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:8,1,4,1
chr17	46692123	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:46692123_G_T:46692123:1,0,0,1
chr17	46692126	.	G	GAGAAACACAGTGAGACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:46692123_G_T:46692123:1,0,0,1
chr17	46799812	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=174,270;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr17	46846620	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=108,249;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:1,2:2,3:2,2,0,5
chr17	46862326	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=128,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,3:2,0:6,3,3,0
chr17	46868710	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:3,0,5,2
chr17	46882429	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=183,231;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr17	46926724	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=153,83;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:14,0:9,3:14,9,0,3
chr17	46926772	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,9,12
chr17	46972479	.	ATCTC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=TC;STR;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:6,3:3,4:10,3,4,3
chr17	46973139	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=59.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,18:0,4:0,0,5,17
chr17	46993370	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=174,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr17	46993612	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=158,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:46993612_GT_G:46993612:0,2,0,1
chr17	46993620	.	GTT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=158,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:46993612_GT_G:46993612:0,2,0,1
chr17	46993628	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46993612_GT_G:46993612:0,0,0,1
chr17	47021418	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=232,117;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0|1:47021418_A_C:47021418:0,7,0,3
chr17	47021428	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=206,111;MMQ=60,31;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0|1:47021418_A_C:47021418:0,6,0,2
chr17	47038391	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr17	47076449	.	AT	A,ATT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,29,31;MFRL=145,162,52;MMQ=60,60,60;MPOS=11,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=10.88,5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,7,4:0.260,0.170:25:5,2,1:9,5,1:9,5,10,1
chr17	47076551	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=211,103;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:3,3:1,8:3,1,7,4
chr17	47076557	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=163,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:8,1,1,2
chr17	47103981	.	TCCTTCCTTCCTTCCTG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,218;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.407:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr17	47120776	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=130,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.312:23:10,2:6,3:12,4,7,0
chr17	47122525	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=249,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr17	47123423	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=168,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.536:15:2,6:4,2:2,5,3,5
chr17	47219542	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=171,273;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,2:6,0:0,7,0,2
chr17	47230360	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=180,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr17	47236510	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,1:3,1:6,4,2,0
chr17	47238028	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr17	47243622	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=119,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:7,4:3,6:4,7,4,6
chr17	47243694	.	A	AAAAGGACCATGACCAGATAGGGAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr17	47293848	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,3:6,3:9,4,5,1
chr17	47296813	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=158,257;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:5,0,2,1
chr17	47376314	.	T	TGAGTTCATGTCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=197,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.319:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr17	47390014	.	GA	CA,CC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=36,34,16;MFRL=139,229,184;MMQ=60,60,60;MPOS=18,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.70,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.429,0.286:4:1,2,0:0,0,0:1,0,1,2
chr17	47390018	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,17;MFRL=227,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:47390018_A_C:47390018:2,1,0,1
chr17	47390020	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=36,15;MFRL=227,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:47390018_A_C:47390018:2,1,0,1
chr17	47390027	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,15;MFRL=229,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:47390018_A_C:47390018:3,1,0,1
chr17	47390031	.	AG	TT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,15;MFRL=229,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:47390018_A_C:47390018:3,1,0,1
chr17	47484228	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=188,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:12,1:14,3:9,17,2,2
chr17	47486894	.	GTTTTTTTTTTGT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.514:4:0,1:1,1:0|1:47486894_GTTTTTTTTTTGT_G:47486894:0,2,0,2
chr17	47486918	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:47486894_GTTTTTTTTTTGT_G:47486894:0,2,0,2
chr17	47579417	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=194,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,1:4,1:6,8,0,2
chr17	47584055	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	47677841	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.293:22:6,0:9,6:7,9,0,6
chr17	47688881	.	T	TAGAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=183,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=AG;STR;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:3,2:3,2:0,6,0,5
chr17	47696586	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=175,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:8,2:10,10,0,2
chr17	47696820	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=191,230;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:0,5,0,6
chr17	47780710	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=CA;STR;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr17	47781374	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=228,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,1:5,2:6,1,3,0
chr17	47783663	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,27:0.401:68:15,18:25,9:29,12,17,10
chr17	47783727	.	AGAAAAG	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=164,176;MMQ=49,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.662:14:2,2:2,3:0|1:47783727_AGAAAAG_A:47783727:1,4,1,8
chr17	47783738	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=22,23;MFRL=147,169;MMQ=45,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,10:0.730:14:1,3:1,3:0|1:47783727_AGAAAAG_A:47783727:1,3,1,9
chr17	47785064	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=137.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,43:0.978:43:0,15:0,27:0|1:47785064_C_A:47785064:0,0,22,21
chr17	47785079	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=164,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:15,0:30,2:0|1:47785064_C_A:47785064:18,29,1,1
chr17	47785100	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=175,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.078:46:14,0:25,2:0|1:47785064_C_A:47785064:17,26,2,1
chr17	47874224	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:13,2:0|1:47874224_C_T:47874224:15,11,0,2
chr17	47874228	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:13,0:15,2:0|1:47874224_C_T:47874224:15,14,0,2
chr17	47889035	.	AT	CC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=321,252;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr17	48050353	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=164,274;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:12,6:9,0:12,9,6,0
chr17	48051005	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=237,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:11,2,2,0
chr17	48141548	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,0:4,2:3,11,2,0
chr17	48151908	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=96.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,12,15
chr17	48153153	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=178,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:1,8,1,1
chr17	48153905	.	TGGG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=186,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,5;RU=G;STR;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:3,1:2,1:4,2,1,2
chr17	48154284	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=217,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:7,3:4,0:6,5,3,0
chr17	48157608	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:10,1,1,1
chr17	48158843	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:0,7,0,5
chr17	48165064	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=234,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:5,0,5,0
chr17	48172779	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:2,4:1,10:3,0,12,2
chr17	48183442	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:9,7,0,2
chr17	48183471	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,2:4,2:2,7,2,2
chr17	48184288	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,3:3,8:2,7,3,8
chr17	48184377	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=97,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,5:2,3:0,2,2,6
chr17	48186131	.	T	TCTC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=176,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CTC;STR;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:0,6,0,4
chr17	48187470	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,2:3,5:0,8,0,7
chr17	48212647	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr17	48212910	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=219,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:5,3:5,0:9,2,2,1
chr17	48213303	.	G	GGCCCCCCCCC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=200,278;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0|1:48213303_G_GGCCCCCCCCC:48213303:3,3,3,0
chr17	48213306	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=190,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:48213303_G_GGCCCCCCCCC:48213303:4,3,2,0
chr17	48213312	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=187,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:5,0:0|1:48213303_G_GGCCCCCCCCC:48213303:5,4,2,0
chr17	48213315	.	CAG	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=184,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,1:6,0:0|1:48213303_G_GGCCCCCCCCC:48213303:6,4,2,0
chr17	48226445	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr17	48226766	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=198,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.181:18:7,1:8,1:4,11,2,1
chr17	48243504	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,12:0,0,10,14
chr17	48245180	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=200,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,7:0,6:1,0,8,5
chr17	48246617	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=208,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.118:24:8,2:8,0:7,15,1,1
chr17	48252804	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,8,7
chr17	48263021	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.828:22:2,3:1,8:2,1,7,12
chr17	48265426	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:2,5:0,11:2,0,9,8
chr17	48266669	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr17	48267585	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=196,260;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.540:26:5,4:6,10:6,6,9,5
chr17	48267679	.	G	GAT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=153,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.240:10:3,2:4,0:0|1:48267679_G_GAT:48267679:3,5,0,2
chr17	48267680	.	G	GGGAATAGCATTGAATCTATACTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=153,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.240:10:3,2:5,0:0|1:48267679_G_GAT:48267679:3,5,0,2
chr17	48269302	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=175,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.815:25:3,15:1,6:3,1,11,10
chr17	48269426	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=204,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,2:1,6:2,3,4,4
chr17	48271433	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=305,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,6:1,7:1,0,3,10
chr17	48272055	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr17	48273439	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=193,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,3:3,5:5,3,8,0
chr17	48273464	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=229,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,4:2,5:4,4,8,1
chr17	48274291	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,15:0,0,17,4
chr17	48274309	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,13:0,0,16,7
chr17	48274666	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=201,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,2:7,2:1,13,1,3
chr17	48275489	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=217,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:4,6:7,4:6,5,7,4
chr17	48276593	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=206,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,3:9,0:6,11,0,3
chr17	48277059	.	AGCCCCAGGCCCCAGGCCCCAG	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=GCCCCAG;STR;TLOD=53.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.954:13:0,4:0,6:0,0,6,7
chr17	48277238	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=195,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:7,0:20,2:17,11,1,1
chr17	48356768	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=197,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:0,3,0,5
chr17	48423418	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	48432042	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,1,4
chr17	48432788	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=191,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,6:4,0:6,0,7,0
chr17	48433081	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=300,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,2,2
chr17	48445674	.	CCTGGTCAG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTGGTCAG;STR;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.856:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	48448023	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=222,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:1,8:2,5:0,3,0,13
chr17	48452978	.	A	AAGC	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=242,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGC;STR;TLOD=92.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,28:0.880:31:1,15:2,13:0,3,17,11
chr17	48453209	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:8,1:13,2:11,10,0,3
chr17	48457609	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,250;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,2,1
chr17	48469724	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=189,70;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,1:5,4:6,3,1,4
chr17	48474501	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=188,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,1:7,3:10,0,4,0
chr17	48539997	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,4:4,3:0,4,0,7
chr17	48540960	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=74,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,5:3,7:2,2,3,9
chr17	48541707	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,7:1,6:0,3,3,10
chr17	48542572	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr17	48543154	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=154,253;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:14,1:13,2:15,12,2,1
chr17	48546232	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	48549793	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=170,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,1:7,1:15,1,2,0
chr17	48551418	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:5,0:5,2:6,4,1,1
chr17	48557505	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=190,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.379:16:5,2:5,3:0,10,2,4
chr17	48560883	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:8,8:2,2:1,9,1,9
chr17	48562047	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=194,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:3,9:1,6:3,1,11,4
chr17	48596979	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=154,58;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,0:14,2:0|1:48596979_C_T:48596979:13,11,1,1
chr17	48596982	.	A	AC	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=154,58;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:13,2:0|1:48596979_C_T:48596979:12,11,1,1
chr17	48596985	.	T	TAGC	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=154,58;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:0|1:48596979_C_T:48596979:11,12,1,1
chr17	48596987	.	T	TCC	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=154,58;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,0:14,2:0|1:48596979_C_T:48596979:12,12,1,1
chr17	48599450	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,5:5,5:4,6,1,9
chr17	48602412	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=204,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:8,1:8,4:5,11,0,5
chr17	48605419	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:1,5:1,2:2,0,8,0
chr17	48606264	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=250,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.509:11:2,1:3,1:5,0,0,6
chr17	48606313	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=189,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,5:3,4:3,3,5,4
chr17	48606531	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=174,192;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:8,0:9,6:6,11,0,6
chr17	48606537	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,203;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.507:14:2,4:4,3:2,5,2,5
chr17	48613837	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=19565382,253;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr17	48618106	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,1:8,5:9,5,5,1
chr17	48625828	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=164,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:10,4:3,1:6,7,4,1
chr17	48626581	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=199,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.382:10:2,0:3,1:4,2,0,4
chr17	48629312	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=195,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:6,0:11,3,2,0
chr17	48646346	.	A	AGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=194,207;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,22;RU=GT;STR;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,1,3
chr17	48647011	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=181,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:3,0:2,5:5,0,6,0
chr17	48652833	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=164,234;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr17	48652875	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,3:1,5:4,0,6,2
chr17	48655493	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=228,246;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr17	48667734	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=196,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr17	48668013	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=168,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0|1:48668013_G_C:48668013:0,4,1,3
chr17	48668021	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=181,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,2:1,2:0|1:48668013_G_C:48668013:0,3,1,4
chr17	48668720	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,290;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	48669026	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=168,250;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:3,6:7,7:2,8,8,5
chr17	48678325	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr17	48683200	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,238;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,4:3,0:2,4,4,1
chr17	48693760	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=201,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,5:4,5:3,5,1,9
chr17	48701685	.	T	TGCCC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=146,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.311:11:5,1:2,2:0|1:48701685_T_TGCCC:48701685:1,7,3,0
chr17	48701692	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,1:3,1:0|1:48701685_T_TGCCC:48701685:1,10,2,0
chr17	48701697	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,1:4,1:0|1:48701685_T_TGCCC:48701685:2,10,2,0
chr17	48733187	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=185,102;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.279:19:8,1:6,4:9,5,3,2
chr17	48734097	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=193,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,2:13,0:8,14,1,1
chr17	48735774	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=145,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:11,1:22,2:18,15,2,1
chr17	48738266	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=170,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:8,2:4,1:6,6,3,0
chr17	48742622	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=182,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:6,0:1,11,0,2
chr17	48746135	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr17	48746923	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,5,12
chr17	48750231	.	GAA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=188,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr17	48752866	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=213,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:6,3,1,1
chr17	48752890	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=213,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,3:4,4:4,1,3,4
chr17	48753522	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr17	48761053	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:11,4:9,4:11,9,2,6
chr17	48776725	.	CCTGTTGCAGAGG	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,240;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,0:8,2:13,12,2,0
chr17	48777263	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=187,259;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,0:3,4:0,5,0,5
chr17	48785100	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=227,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr17	48797210	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=37.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,3,9
chr17	48817598	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=199,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,2:6,4:8,2,4,2
chr17	48821144	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=205,115;MMQ=60,21;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.242:37:12,5:15,2:12,16,0,9
chr17	48821201	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=147,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=42.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.848:11:1,5:0,5:0|1:48821201_T_C:48821201:0,1,0,10
chr17	48821207	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=147,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.846:11:1,5:0,5:0|1:48821201_T_C:48821201:0,1,0,10
chr17	48823815	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=253,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.903:18:1,10:0,7:1,0,16,1
chr17	48913351	.	CGCT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=207,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCT;STR;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:6,1:10,2:11,5,2,1
chr17	49048274	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=212,244;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.434:5:2,1:1,0:0,3,0,2
chr17	49054439	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=221,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:6,1:0,2:5,1,3,0
chr17	49067763	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=185,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:2,1,2,0
chr17	49076907	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=234,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.415:12:6,4:1,1:7,0,5,0
chr17	49097501	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,0:3,3:5,1,2,1
chr17	49124845	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=272,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr17	49156907	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=202,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:9,2:7,4:11,5,3,3
chr17	49231627	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=146,266;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:6,2:16,0,2,0
chr17	49247503	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=219,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.280:5:1,0:1,1:0,4,0,1
chr17	49280432	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=190,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:4,3,4,2
chr17	49281133	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=280,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,6:2,7:4,1,6,7
chr17	49343658	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:3,2:5,0:4,5,0,2
chr17	49362592	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.215:35:12,7:16,0:18,10,7,0
chr17	49371230	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=199,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:1,3:2,1,4,0
chr17	49371505	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr17	49713205	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=46.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,10,5
chr17	51062944	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=237,74;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,0:5,2:10,0,2,0
chr17	51063941	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=214,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:7,6:12,7:11,9,2,11
chr17	51900397	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=138,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:3,8:9,4:5,7,6,6
chr17	51901797	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:5,8:8,6:7,6,7,7
chr17	51902492	.	A	AAAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=208,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAT;STR;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.469:13:5,3:2,3:3,4,4,2
chr17	52992128	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=173,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.463:11:0,3:6,2:1,5,0,5
chr17	53007655	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr17	53013980	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.453:20:7,1:3,8:10,1,7,2
chr17	53026823	.	TAAAAG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=183,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAG;STR;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,1:2,4:3,0,5,0
chr17	53038783	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,0:0,5:0,0,0,6
chr17	53042017	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=163,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.445:16:4,2:5,4:0|1:53042017_C_G:53042017:7,2,6,1
chr17	53042023	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=163,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:5,5:4,3:0|1:53042017_C_G:53042017:7,2,6,2
chr17	53063743	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	53120855	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=194,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,2:5,2:7,3,3,1
chr17	53158361	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:4,1,3,1
chr17	53342796	.	G	GTTTC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTC;STR;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:7,2:4,5:7,4,6,1
chr17	53345146	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:11,5:12,0:14,9,5,0
chr17	53392852	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=186,247;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,1:4,7:0,5,0,8
chr17	53498990	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=253,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:6,1,5,0
chr17	53798184	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,115;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:17,3:17,0:17,17,3,0
chr17	53828706	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr17	53844833	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=216,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.861:12:0,8:1,3:0,1,5,6
chr17	53844847	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=126,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:0,8:1,1:2,0,3,6
chr17	53844875	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=168,137;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr17	53851071	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=109.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,14:0,12:0|1:53851071_A_G:53851071:0,0,14,12
chr17	53851078	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=112.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,12:0,13:0|1:53851071_A_G:53851071:0,0,11,15
chr17	53852111	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=78,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:0,5:5,4:4,1,6,3
chr17	54428067	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=217,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,0:1,4:3,0,4,0
chr17	54449917	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,10;MFRL=236,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.409:3:0,0:1,0:0|1:54449917_C_A:54449917:2,0,1,0
chr17	54449922	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,10;MFRL=253,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:1,0:2,0,2,0
chr17	54449926	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,15;MFRL=236,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:54449917_C_A:54449917:4,0,1,0
chr17	54517855	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=209,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,4:2,4:0,2,0,8
chr17	54554821	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32,28;MFRL=0,181,182;MMQ=60,60,60;MPOS=10,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.43,8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.334,0.571:6:0,1,0:0,1,3:0,0,4,2
chr17	54558280	.	GTGTA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=286,315;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr17	54872555	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=219,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:2,4,0,4
chr17	54872595	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=244,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:3,1:0|1:54872595_A_G:54872595:0,7,0,2
chr17	54872604	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=244,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0|1:54872595_A_G:54872595:0,7,0,2
chr17	54892348	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=195,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:6,4:9,2:2,14,0,6
chr17	54921322	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=126,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:9,2:3,2:9,3,3,1
chr17	54925262	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,4:0,6:1,0,5,5
chr17	54925480	.	C	CAT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=126,238;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AT;STR;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,1:3,2:0,9,0,3
chr17	54969078	.	TG	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=152,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:13,0:11,2:15,9,2,0
chr17	54972898	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,306;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:13,2:17,0:11,19,0,2
chr17	54981571	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=36,30,33,32;MFRL=285,222,204,198;MMQ=60,60,60,60;MPOS=5,11,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=4.93,5.03,6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,5,3,2:0.294,0.319,0.169:12:0,0,3,1:1,5,0,1:1,1,10,0
chr17	54981588	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=214,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:4,1:11,1:15,6,2,0
chr17	54981610	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=211,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.204:28:4,0:9,0:14,8,6,0
chr17	55016568	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=167,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:2,0:12,2:1,14,0,2
chr17	55026912	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=226,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,1:1,6:0,2,2,5
chr17	55027995	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=145,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:11,3:8,2:12,7,3,2
chr17	55038062	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,285;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	55058417	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=210,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,1:9,1:13,3,2,0
chr17	55058689	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr17	55065530	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=175,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:0,3:4,8:3,1,5,6
chr17	55065558	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=46.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:4,5:4,10:4,4,8,7
chr17	55074482	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=166,239;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:3,1:0,6,0,3
chr17	55182811	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=174,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:4,4:3,3:8,0,3,4
chr17	55187558	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=204,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:6,2:1,3:0,7,0,5
chr17	55334511	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=145,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.310:8:3,1:1,1:4,2,0,2
chr17	55334577	.	GCC	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=12,13;MFRL=120,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=C;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.663:5:0,0:0,0:0,2,0,3
chr17	55674375	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=237,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:2,2:6,3:0,8,0,6
chr17	55917353	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,2:6,2:0,10,0,4
chr17	56082856	.	TGCTTCTGCTACG	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=164,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCTTCTGCTACG;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.064:44:12,2:17,0:18,24,1,1
chr17	56083768	.	G	GGCC	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=214,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,9:0.311:30:9,3:10,4:0|1:56083768_G_GGCC:56083768:1,20,9,0
chr17	56083771	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=25,12;MFRL=218,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,9:0.302:31:11,0:10,0:0|1:56083768_G_GGCC:56083768:1,21,9,0
chr17	56083774	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=218,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,8:0.281:30:10,3:11,3:0|1:56083768_G_GGCC:56083768:1,21,8,0
chr17	56083777	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=25,33;MFRL=209,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,7:0.258:29:10,3:8,3:0|1:56083768_G_GGCC:56083768:1,21,7,0
chr17	56083783	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=218,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.207:27:9,2:9,1:0|1:56083768_G_GGCC:56083768:2,20,5,0
chr17	56083786	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=32,13;MFRL=209,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:11,0:0|1:56083768_G_GGCC:56083768:4,20,2,0
chr17	56083789	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=32,0;MFRL=218,174;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:11,0:0|1:56083768_G_GGCC:56083768:3,19,2,0
chr17	56083934	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr17	56232459	.	TTTTG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTTG;STR;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,1:4,0,3,0
chr17	56232719	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,54;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:8,13,0,2
chr17	56233034	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:8,2:10,4:8,10,3,3
chr17	56270121	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=245,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr17	56271060	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,22:0.719:30:1,17:7,5:7,1,16,6
chr17	56271094	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.734:28:1,14:6,7:5,2,16,5
chr17	56271497	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=195,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:6,2:0,4:2,4,1,5
chr17	56272291	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=167,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,1:5,2:7,5,2,1
chr17	56272378	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=116,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,7:6,3:6,7,4,6
chr17	56272390	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.844:21:1,11:1,7:1,2,8,10
chr17	56283026	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=158,225;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:6,5:9,2:4,11,4,3
chr17	56289717	.	TGCA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=165,239;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,0:9,2:12,2,1,1
chr17	56290334	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=120,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,21:0.786:26:4,9:1,12:4,1,8,13
chr17	56293925	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=35,26;MFRL=227,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:0|1:56293925_C_T:56293925:5,0,2,0
chr17	56293927	.	GTTAC	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=35,34;MFRL=209,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,1:0,1:0|1:56293925_C_T:56293925:6,0,2,0
chr17	56293933	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=209,186;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0|1:56293925_C_T:56293925:6,0,2,0
chr17	56293934	.	CCTG	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=212,186;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:1,1:0|1:56293925_C_T:56293925:7,0,2,0
chr17	56293939	.	CTGGAAATCACT	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=212,186;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:0|1:56293925_C_T:56293925:7,0,2,0
chr17	56293960	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,5:0.331:16:9,3:2,2:1|0:56293925_C_T:56293925:11,0,5,0
chr17	56326521	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.301:18:4,3:7,2:3,10,3,2
chr17	56326555	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=21,14;MFRL=209,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:1,1:3,0:3,5,0,5
chr17	56326557	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=17,25;MFRL=191,237;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.238:14:0,1:5,1:3,8,0,3
chr17	56348226	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=187,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.346:21:8,6:6,1:0|1:56348226_T_G:56348226:3,11,2,5
chr17	56348230	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,6:0.291:22:9,4:5,2:1|0:56348226_T_G:56348226:3,13,2,4
chr17	56348976	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:6,0,1,1
chr17	56384928	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,1:9,1:10,2,2,0
chr17	56388927	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=163,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,3:6,0:8,4,2,1
chr17	56403752	.	T	TC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=170,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.146:18:9,0:7,2:0|1:56403752_T_TC:56403752:3,13,0,2
chr17	56403754	.	T	TTCCTTCCTTCCTTC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=170,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:9,0:7,2:0|1:56403752_T_TC:56403752:3,13,0,2
chr17	56424710	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=205,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,2:5,1:2,9,1,2
chr17	56429585	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=228,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,3:8,1:1,10,0,4
chr17	56435080	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.227:33:12,4:14,3:18,8,3,4
chr17	56540110	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=169,252;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,0:4,4:10,0,4,0
chr17	56557551	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:9,0:6,6:7,8,0,6
chr17	56569842	.	T	TGA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=242,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=65.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:1,6:2,9:3,1,9,7
chr17	56581651	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=267,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:2,9:0,3:1,1,5,7
chr17	56581795	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:3,15,0,2
chr17	56588779	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:9,6,2,0
chr17	56598213	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=239,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,6:4,3:6,4,5,4
chr17	56598991	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=193,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:7,4:8,4:8,7,4,4
chr17	56603978	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.413:22:7,5:5,3:9,4,3,6
chr17	56604155	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=206,225;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.186:25:12,1:7,2:9,12,2,2
chr17	56634343	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,2:7,0:10,8,2,0
chr17	56636854	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.917:22:0,8:1,13:1,0,13,8
chr17	56637002	.	A	AAAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=187,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AAC;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr17	56654690	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr17	56654850	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:1,3,0,4
chr17	56695008	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=326,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr17	56737838	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=198,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,2:4,6:5,0,8,0
chr17	56738098	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:12,5:13,0:13,12,5,0
chr17	56769979	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=184,242;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:3,3,2,0
chr17	56798207	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=240,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:1,2,0,2
chr17	56833457	.	G	GGAACCC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=9,32;MFRL=150,196;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GAACCC;STR;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.758:6:0,2:0,2:1,0,1,4
chr17	57050365	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=214,302;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,2:5,2:0,14,0,4
chr17	57076893	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=183,255;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr17	57094617	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=194,245;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,5:2,2:2,0,5,2
chr17	57126842	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=305,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr17	57140035	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=136,167;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:7,0:8,9:4,11,0,9
chr17	57141768	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=204,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.393:10:4,1:2,2:0,6,2,2
chr17	57152920	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=133,200;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,1:2,0,3,0
chr17	57152924	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=215,109;MMQ=32,40;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=21,22;RU=A;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr17	57152941	.	A	AAAC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=157,200;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr17	57152946	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,15;MFRL=0,200;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,0:1,1:1,0,3,0
chr17	57152949	.	C	A,T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,15,15;MFRL=153,109,200;MMQ=60,40,40;MPOS=32,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.29,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:0,0,0:2,0,0:2,1,2,0
chr17	57152952	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=21,15;MFRL=191,155;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:2,0:3,1,2,0
chr17	57196719	.	CAT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=151,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:8,4:7,0:9,8,2,2
chr17	57208752	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=116,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:6,6:8,5:7,7,5,6
chr17	57272079	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:4,1:8,2:10,2,4,0
chr17	57288086	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=215,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:6,0:10,2:8,8,0,2
chr17	57311748	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=282,199;MMQ=59,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.733:9:1,3:1,4:2,0,7,0
chr17	57326151	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=211,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:4,6:8,3:6,6,3,6
chr17	57334668	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:1,3,0,3
chr17	57430829	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.195:39:15,0:17,6:25,7,0,7
chr17	57474396	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=136,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr17	57663590	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,11;MFRL=170,133;MMQ=52,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.274:9:5,0:1,0:0|1:57663590_G_T:57663590:3,4,0,2
chr17	57663596	.	TAA	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=192,133;MMQ=56,52;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.339:7:3,0:1,1:0|1:57663590_G_T:57663590:3,2,0,2
chr17	57663615	.	TC	AA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=185,418;MMQ=53,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:4,0:1,1:1,4,1,0
chr17	57697635	.	G	GAAGACAGTACATT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=231,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr17	57721907	.	T	TTTTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,43;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTG;STR;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.872:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr17	57725043	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:0,12:1,7:0,1,4,15
chr17	57733479	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr17	57741170	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:5,4:8,0:11,2,4,0
chr17	57743651	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=195,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:2,2:7,1:3,6,2,1
chr17	57743691	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,9,7
chr17	57744412	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=257,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr17	57750982	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=87.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,10:0,0,18,8
chr17	57758700	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=167,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:9,3:16,1:15,10,2,2
chr17	57762402	.	CT	C,CTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32,32;MFRL=190,237,235;MMQ=60,60,60;MPOS=11,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=8.48,7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,4:0.334,0.333:12:2,2,1:2,2,3:4,0,8,0
chr17	57889192	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=113,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:1,4:3,3:1,4,0,7
chr17	57940977	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=236,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr17	57943906	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=123,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:2,1,2,0
chr17	57944206	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,193;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	57963537	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=153,187;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,0:4,2:5,4,0,2
chr17	57963683	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	57968398	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=189,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr17	57990051	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:11,7:13,0:17,7,7,0
chr17	58011498	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=155,188;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:9,2:3,3:8,4,2,3
chr17	58013517	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=193,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.369:14:5,2:2,3:8,1,5,0
chr17	58031309	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=187,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr17	58145031	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,133;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:21,0:21,3:17,25,1,2
chr17	58149745	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=181,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:4,5:1,9,0,9
chr17	58153603	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=215,72;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:1,0:0,4,1,1
chr17	58156228	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=165,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:7,2:12,5:4,15,2,5
chr17	58156297	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,16;MFRL=124,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:58156297_T_G:58156297:2,0,1,0
chr17	58156301	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,16;MFRL=124,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:58156297_T_G:58156297:2,0,1,0
chr17	58284567	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,193;MMQ=57,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:3,7,0,2
chr17	58289521	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,3:5,1:1,11,0,4
chr17	58300951	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=118,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.217:12:5,1:4,1:2,8,0,2
chr17	58332659	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.846:3:0,0:0,1:0,0,0,3
chr17	58506926	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=203,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,0:4,4:3,6,2,2
chr17	58538196	.	TA	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,0:4,4:1,4,0,4
chr17	58740516	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=180,93;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,3:11,0:14,7,3,0
chr17	58740715	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=137,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:10,0:7,4:12,5,0,4
chr17	58786775	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=244,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:58786775_A_G:58786775:0,2,0,1
chr17	58786783	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,14;MFRL=244,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:58786775_A_G:58786775:0,2,0,1
chr17	58786787	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=238,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:58786775_A_G:58786775:0,3,0,1
chr17	59115434	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=188,174;MMQ=60,37;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:1,13,0,3
chr17	59482827	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=188,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr17	59560294	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=172,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:11,5,2,0
chr17	59763535	.	AAAGGTAAACCCAGGGAAAATTTGGTTACTTAGTTATTAAAATATTACATGCT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.156:20:9,0:2,4:2,14,2,2
chr17	59857809	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr17	59878522	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:3,0,4,0
chr17	59878808	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:11,1:4,1:6,9,0,2
chr17	59924612	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=196,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,5:3,3:0,5,1,7
chr17	59945123	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=170,235;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,1:8,1:11,10,1,1
chr17	59971067	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr17	59988879	.	A	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,189;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,8:0.174:50:14,8:26,0:30,12,8,0
chr17	59989126	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=176,256;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.497:8:0,1:4,3:0,4,2,2
chr17	60032650	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=187,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:6,0,4,0
chr17	60038908	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=215,200;MMQ=60,55;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.244:14:3,1:5,1:6,5,3,0
chr17	60040125	.	A	ACACACACACACACACGCAC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:7,2:16,0:16,7,0,2
chr17	60129875	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=108,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,3:6,2:10,4,3,2
chr17	60447749	.	T	TATCCCCTTTATCACTTTTTATTGTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=155,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:4,5,1,1
chr17	60451289	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=150,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:0|1:60451289_TC_T:60451289:0,5,1,1
chr17	60451291	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=150,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:0|1:60451289_TC_T:60451289:0,5,1,1
chr17	60451294	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=161,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,1:1,0:0|1:60451289_TC_T:60451289:0,6,1,1
chr17	60472623	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr17	60491298	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=191,205;MMQ=34,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr17	60598057	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=160,279;MMQ=54,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:60598057_AT_A:60598057:2,0,1,0
chr17	60598069	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,22;MFRL=180,279;MMQ=55,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:60598057_AT_A:60598057:3,0,1,0
chr17	60598072	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,17;MFRL=167,279;MMQ=57,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:60598057_AT_A:60598057:4,0,1,0
chr17	60598075	.	CA	GT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,17;MFRL=167,279;MMQ=57,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:60598057_AT_A:60598057:4,0,1,0
chr17	60598083	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,16;MFRL=167,279;MMQ=57,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:60598057_AT_A:60598057:4,0,1,0
chr17	60631055	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=167,111;MMQ=40,55;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.124:29:9,0:17,3:14,12,2,1
chr17	60631089	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=152,75;MMQ=55,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:14,2:18,0:20,12,0,2
chr17	60748926	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=188,80;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,0:8,3:14,0,2,1
chr17	60749447	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=184,273;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:5,14,2,0
chr17	60751363	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:3,4:8,0:7,4,4,0
chr17	60753904	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,4:6,3:3,5,3,4
chr17	60759340	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=98,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.702:8:2,3:0,3:0|1:60759340_A_G:60759340:1,1,1,5
chr17	60759347	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,3:0,4:0|1:60759340_A_G:60759340:0,2,1,6
chr17	60766786	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=199,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr17	60766804	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=102,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,1:1,4:2,0,5,0
chr17	60767135	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=148,297;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:1,1,2,2
chr17	60767461	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,7:1,2:3,1,8,1
chr17	60767953	.	GC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=82,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,5:1,8:2,0,8,5
chr17	60768243	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=96,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,1:1,6:3,0,5,2
chr17	60769406	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=148,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,5:4,4:7,0,8,1
chr17	60769803	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=154,207;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:1,1:4,2:1,5,1,2
chr17	60779025	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=259,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:0,7:1,5:1,0,9,3
chr17	60813550	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=182,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:8,2:11,4:8,11,1,5
chr17	60814273	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,158;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.572:40:8,15:9,8:10,7,11,12
chr17	60878976	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=183,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:5,2,3,2
chr17	61432774	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=236,255;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr17	61457217	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:2,6,2,4
chr17	61473325	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=249,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,4:1,4:0,2,0,8
chr17	61489269	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=266,306;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,1:4,1:7,1,1,1
chr17	61498560	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=219,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.172:38:15,3:17,3:13,19,3,3
chr17	61514981	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=307,252;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:61514981_C_CG:61514981:0,2,0,1
chr17	61514983	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=307,252;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:61514981_C_CG:61514981:0,2,0,1
chr17	61556527	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr17	61564522	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,2:4,0:0,6,0,2
chr17	61571210	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.248:13:6,2:4,0:8,2,3,0
chr17	61571908	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=181,370;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr17	61573927	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,18;MFRL=193,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:5,1:4,0:0|1:61573927_T_A:61573927:2,7,1,1
chr17	61573929	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=193,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,2:4,0:0|1:61573927_T_A:61573927:2,7,1,1
chr17	61573930	.	G	GTGTTACCATTAGTTTTTCTT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=193,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,2:4,0:0|1:61573927_T_A:61573927:2,7,1,1
chr17	61600717	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr17	61611423	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr17	61611567	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=131,98;MMQ=60,52;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:7,5,1,1
chr17	61615371	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr17	61615660	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,4:0,0,3,6
chr17	61621805	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	61622703	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=213,248;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,7:0,2:0,1,1,8
chr17	61655749	.	A	AAAAGCAGAGTTAACACTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=191,58;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:10,0,1,1
chr17	61660889	.	CG	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=79,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=64.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,33:0.962:35:0,13:2,19:0,2,13,20
chr17	61759270	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,2:8,2:8,10,1,3
chr17	61769761	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=189,59;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:11,0:12,4:0|1:61769761_G_A:61769761:12,13,2,2
chr17	61769765	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=191,59;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.147:32:13,0:12,4:0|1:61769761_G_A:61769761:13,15,2,2
chr17	61769770	.	C	CACTGAGTGACTGGCCCACAGT	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=191,59;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.147:32:14,0:13,4:0|1:61769761_G_A:61769761:13,15,2,2
chr17	61781331	.	T	TAGAACC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=148,67;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGAACC;STR;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:9,1:9,2:14,4,1,2
chr17	61790917	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=179,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:11,2:7,2:3,15,1,3
chr17	61804168	.	T	TGACTACTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=270,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr17	61838218	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,15;MFRL=162,209;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,0:8,0:6,9,2,0
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chr17	61884041	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=208,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,1:5,0:0|1:61884037_A_AAG:61884037:0,12,0,2
chr17	61911242	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=212,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:5,3:12,2:9,8,3,2
chr17	61958146	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=188,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,3:10,0:9,13,3,0
chr17	61958954	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.300:14:4,2:6,2:4,6,3,1
chr17	61986988	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=199,206;MMQ=40,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:0,2:2,6:2,0,6,3
chr17	61988014	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,11,3
chr17	61988141	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=179,14809;MMQ=60,22;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,12:0.260:45:14,0:19,9:15,18,0,12
chr17	61988540	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=170,179;MMQ=40,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:15,3:19,0:15,19,2,1
chr17	61994764	.	CGTAGTTCTTGA	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=166,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:10,2:13,0:14,15,1,1
chr17	61995030	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=189,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.934:28:1,16:0,10:1,0,13,14
chr17	61995324	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:10,1:7,11,2,0
chr17	61996183	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=237,156;MMQ=50,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:8,8,0,2
chr17	61996204	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=173,175;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,7:0,4:0,1,5,6
chr17	61996255	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=24,35;MFRL=173,194;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:1,7:0,4:0,1,2,9
chr17	61996273	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=219,196;MMQ=60,31;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:0,7,1,1
chr17	62006497	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr17	62022659	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=48.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,12,2
chr17	62042078	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr17	62045594	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=142,93;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:4,0:11,3:6,10,0,3
chr17	62048467	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr17	62049042	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.277:9:1,1:4,1:3,4,2,0
chr17	62049196	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=171,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,0:3,1:0|1:62049196_C_A:62049196:5,11,2,0
chr17	62049235	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0|1:62049196_C_A:62049196:0,0,4,9
chr17	62080969	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,8,6
chr17	62083929	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,8,8
chr17	62122145	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,10,3
chr17	62122677	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,12,7
chr17	62125272	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,12,12
chr17	62125306	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=186,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,1:12,1:8,13,1,1
chr17	62130129	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=198,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:7,1:3,2:8,2,3,0
chr17	62130389	.	G	GCCT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCT;STR;TLOD=61.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,0,14
chr17	62145657	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=153,77;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:13,2:23,0:0|1:62145657_G_A:62145657:15,21,1,1
chr17	62145660	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=147,77;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:13,2:19,0:0|1:62145657_G_A:62145657:14,21,1,1
chr17	62145672	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=147,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.373:30:9,4:10,7:7,12,4,7
chr17	62145728	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=166,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:0,2:7,2:0,7,0,4
chr17	62152578	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=120,201;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.621:27:5,8:5,8:4,6,4,13
chr17	62152611	.	TAA	T,TAAAA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,31,27;MFRL=164,183,178;MMQ=60,60,60;MPOS=19,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,17;RU=A;STR;TLOD=8.11,5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,3:0.285,0.232:13:2,1,1:3,3,1:1,5,0,7
chr17	62156923	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,5:1,2:5,0,7,0
chr17	62156933	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=56.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,5:0,0,14,1
chr17	62157004	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=71.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,27:0.667:40:4,12:8,15:9,4,14,13
chr17	62157061	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=184,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:16,0:26,3:14,29,0,3
chr17	62157142	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=161,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,29:0.732:39:3,7:7,21:3,7,8,21
chr17	62158012	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:10,0,3,0
chr17	62248386	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:1,2:7,3:8,0,3,2
chr17	62265838	.	TC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=58.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,11:0,0,5,14
chr17	62401118	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=211,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,1:3,3:4,2,3,1
chr17	62406971	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=198,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:9,3:6,4:10,5,5,2
chr17	62463825	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr17	62476375	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=201,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=51.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:4,4:4,12:5,3,6,10
chr17	62476429	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=193,164;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,3:4,8:1,5,6,5
chr17	62476451	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=155,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:7,1:15,1:17,5,0,2
chr17	62479028	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=220,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,3:4,6:3,3,6,4
chr17	62496481	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,0:11,2:6,16,0,2
chr17	62500753	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.480:29:5,7:10,6:11,4,9,5
chr17	62501006	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=291,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:1,7:1,6:0,2,1,12
chr17	62502136	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=29,15;MFRL=187,297;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.428:7:1,0:2,0:0|1:62502136_T_A:62502136:0,4,3,0
chr17	62502138	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=23,16;MFRL=187,297;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.429:7:2,0:1,0:0|1:62502136_T_A:62502136:0,4,3,0
chr17	62502142	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,22;MFRL=187,276;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:0|1:62502136_T_A:62502136:0,4,2,0
chr17	62502146	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=172,276;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:2,0:0|1:62502136_T_A:62502136:3,6,2,0
chr17	62502149	.	C	CCA	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=157,276;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,1:0|1:62502136_T_A:62502136:3,5,2,0
chr17	62503131	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:5,7:10,2:13,2,8,1
chr17	62506280	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.385:21:11,3:2,5:12,1,2,6
chr17	62519097	.	CGTGTGT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=249,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=GT;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr17	62528179	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=257,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.565:23:5,8:4,5:3,7,2,11
chr17	62530885	.	TAAG	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,0:11,3:3,19,1,2
chr17	62532640	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=238,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.330:15:3,2:7,3:10,0,5,0
chr17	62532923	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=188,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:1,7,0,2
chr17	62542504	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=215,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:7,4:1,3:1,7,1,6
chr17	62543675	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,12;MFRL=177,333;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.408:5:2,0:1,0:0,3,2,0
chr17	62557614	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=180,0;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:8,1:1,3:4,5,3,1
chr17	62587143	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:6,4,4,1
chr17	62602762	.	TA	T,TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29,24;MFRL=202,154,164;MMQ=60,60,60;MPOS=17,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=6.78,4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,2:0.421,0.214:11:2,1,0:2,4,1:1,3,2,5
chr17	62657972	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=89,83;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr17	62893412	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=196,156;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.249:30:11,3:12,4:7,16,2,5
chr17	62893457	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=183,198;MMQ=48,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,2:6,0:0,13,0,3
chr17	63014247	.	A	AGGATCTCAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,15;MFRL=182,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.289:6:2,0:2,0:5,0,1,0
chr17	63049698	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,248;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,2:14,0:11,15,0,2
chr17	63052714	.	TGCC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=196,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCC;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:1,2:5,0:0,7,0,2
chr17	63133804	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,5:0,10:0,0,1,14
chr17	63173756	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=221,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:6,2,5,1
chr17	63173959	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=159,45;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,1:4,1:1,8,0,2
chr17	63185371	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=147,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:13,1:13,1:12,14,1,1
chr17	63189825	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=192,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr17	63200441	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.221:34:12,3:15,4:13,14,3,4
chr17	63532365	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=210,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,2:1,1:6,0,1,2
chr17	63532914	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,72;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,1:2,1:9,1,2,0
chr17	63533423	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=174,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,1:5,1:4,6,1,1
chr17	63534036	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=146,259;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,4:4,0:0,4,0,4
chr17	63534221	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=254,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,1:7,2:9,0,2,1
chr17	63534250	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,13,1
chr17	63534478	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=127,261;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,3:4,8:3,4,2,9
chr17	63685174	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=213,219;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr17	63739352	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=149,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:2,1:5,2:1,6,0,4
chr17	63746794	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=138,287;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:18,0:17,3:14,21,3,0
chr17	64001925	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=280,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:4,3:1,1:0,6,0,4
chr17	64023552	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,3:5,3:6,6,5,1
chr17	64023781	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr17	64024340	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,3:1,3:4,0,6,0
chr17	64024375	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=169,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:9,3:3,4:12,0,6,1
chr17	64025435	.	T	TTAATCA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=228,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAATCA;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.325:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr17	64025926	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	64050007	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=263,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,1:0,5:1,4,1,5
chr17	64062830	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr17	64066163	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=203,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:3,7,0,2
chr17	64171119	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=212,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,0:11,3:14,3,3,0
chr17	64173170	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=125,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:0,6,0,8
chr17	64208396	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	64210528	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=113,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,4:4,4:3,3,3,5
chr17	64213104	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,3:0,3:1,1,1,5
chr17	64216644	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr17	64298881	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.799:3:0,0:0,0:0|1:64298881_A_C:64298881:0,0,3,0
chr17	64298888	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=240,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.668:4:1,0:0,0:0|1:64298881_A_C:64298881:1,0,3,0
chr17	64298959	.	T	TG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=196,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,4:6,0:7,11,3,1
chr17	64684525	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.091:42:23,1:16,2:21,18,0,3
chr17	64684642	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr17	64728707	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=128,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr17	64731813	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=193,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,1:6,1:2,11,0,2
chr17	64735035	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr17	64737717	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:1,4:5,6:3,3,8,2
chr17	64785191	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,2:0,0,0,7
chr17	64875035	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=214,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:1,5:7,4:7,1,5,4
chr17	64961276	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=229,208;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.432:7:3,0:0,2:0|1:64961276_C_A:64961276:0,4,0,3
chr17	64961302	.	ATATACACACGCGCGCGCGCGCGCGCG	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=229,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,1:0,2:0|1:64961276_C_A:64961276:0,4,0,3
chr17	65026515	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=245,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:10,0,2,0
chr17	65052184	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=204,82;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,3:7,0:12,3,1,2
chr17	65074354	.	G	GA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.268:26:10,5:8,1:10,9,4,3
chr17	65116491	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=188,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:9,1:2,2:7,4,3,0
chr17	65116674	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=195,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,3:13,0:10,11,2,1
chr17	65116809	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=211,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:65116809_G_A:65116809:0,3,0,1
chr17	65116816	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=211,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:65116809_G_A:65116809:0,3,0,1
chr17	65116822	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=211,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:65116809_G_A:65116809:0,3,0,1
chr17	65116826	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=246,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:65116809_G_A:65116809:0,2,0,2
chr17	65142070	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=225,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.423:12:4,1:2,0:0,7,0,5
chr17	65156919	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=212,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr17	65157277	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=177,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr17	65211949	.	CAA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:6,1:9,1:8,8,2,0
chr17	65340620	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr17	65341976	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=243,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:7,3:5,4:4,8,2,5
chr17	65548540	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=206,235;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:0,6,0,4
chr17	65549847	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=213,223;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:0,4,0,7
chr17	65574283	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,8,6
chr17	65574437	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=226,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr17	65665608	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.457:9:3,2:2,2:5,0,3,1
chr17	65718798	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=322,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.609:11:3,2:1,5:0,4,1,6
chr17	65718839	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=232,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:0,5,0,4
chr17	65718874	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=36,27;MFRL=244,245;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr17	65720346	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,3,2
chr17	65722849	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=301,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr17	65730404	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=209,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:3,3:2,0:4,1,2,1
chr17	65732959	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=300,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,0,4
chr17	65733119	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=179,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:4,5:7,6:8,3,11,0
chr17	65734514	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=201,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:0,7,0,6
chr17	65735563	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,1:2,3:4,0,4,0
chr17	65735655	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=225,109;MMQ=60,58;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.254:17:5,0:8,4:7,6,2,2
chr17	65739789	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=306,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:5,3:5,3:0|1:65739789_A_G:65739789:4,6,5,1
chr17	65739797	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=306,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.311:14:6,2:3,2:0|1:65739789_A_G:65739789:4,6,4,0
chr17	65871598	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=268,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:9,1:2,2:11,0,3,0
chr17	65882172	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,2:5,4:9,2,6,0
chr17	65882457	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=176,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=95.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,31:0.763:40:6,19:3,12:3,6,23,8
chr17	65887896	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=171,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,0:4,2:9,1,1,1
chr17	65909198	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=164,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:11,0:13,3:9,15,2,1
chr17	65919193	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,24;MFRL=231,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:65919193_AC_A:65919193:0,4,0,1
chr17	65919195	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,29;MFRL=231,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:65919193_AC_A:65919193:0,4,0,1
chr17	65919197	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=215,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:65919197_G_A:65919197:0,4,0,1
chr17	65919198	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=231,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:65919193_AC_A:65919193:0,4,0,1
chr17	65919202	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,26;MFRL=215,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:65919197_G_A:65919197:0,4,0,1
chr17	65919204	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=215,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:65919197_G_A:65919197:0,4,0,1
chr17	65942026	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=211,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,0:8,5:10,7,0,5
chr17	65955651	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr17	66036934	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,0:0,1,0,4
chr17	66038181	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=108,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,6:1,5:2,0,8,3
chr17	66038556	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=268,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr17	66038979	.	CAA	C,CA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,34,30;MFRL=137,137,164;MMQ=60,60,49;MPOS=19,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=A;STR;TLOD=5.51,4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,5:0.239,0.267:15:1,2,0:2,1,5:3,4,8,0
chr17	66039004	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,10;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.251:28:8,0:6,0:8,13,7,0
chr17	66039018	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=33,10;MFRL=172,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.235:30:10,0:9,0:7,16,7,0
chr17	66039350	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,22:0.719:30:3,12:5,10:3,5,13,9
chr17	66039938	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=174,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.349:13:2,2:6,2:7,2,4,0
chr17	66040400	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=174,207;MMQ=52,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:6,1:3,6,2,2
chr17	66041871	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=192,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.404:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr17	66247364	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=207,141;MMQ=60,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:11,0:14,4:2,23,0,4
chr17	66250522	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:6,5:4,8:6,4,10,3
chr17	66352775	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=114,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:9,1:4,2:10,4,3,0
chr17	66366546	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=68,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:4,4:3,4,5,1
chr17	66416357	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=153,245;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.213:20:7,1:9,2:12,4,2,2
chr17	66420766	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	66422158	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=255,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,5:0,0:1,0,4,1
chr17	66424923	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=275,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:0,1:4,8:3,1,6,3
chr17	66446803	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=195,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,3:5,0:10,2,2,1
chr17	66447073	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=132,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:2,2,0,5
chr17	66453410	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,0:7,6:10,0,3,3
chr17	66453572	.	GGCCCGGGAA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,2:4,1:1,10,0,4
chr17	66524986	.	AG	GA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=153,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:14,6,1,1
chr17	66524987	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.654:21:3,7:4,7:5,2,10,4
chr17	66526027	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=94,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.741:25:4,8:2,11:5,1,15,4
chr17	66533979	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=255,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,2:2,5:0,3,0,7
chr17	66548183	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=202,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr17	66550887	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,2:5,4:9,3,5,1
chr17	66871837	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.278:30:11,4:11,4:10,12,4,4
chr17	66880081	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr17	66880371	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,4,1
chr17	66880405	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=200,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:3,2,2,0
chr17	66883719	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=247,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:0,1,1,6
chr17	66899710	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=188,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr17	66899725	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=235,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:66899725_C_G:66899725:0,4,0,1
chr17	66899733	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=235,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:66899725_C_G:66899725:0,4,0,1
chr17	66904017	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=150,143;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:7,0:5,2:2,14,0,2
chr17	66904031	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=17,18;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:1,0:0,1:0,10,0,4
chr17	66925116	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=190,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,0:2,4:6,0,2,2
chr17	66925674	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=172,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,3:5,2:8,4,5,0
chr17	66925910	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=123,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0|1:66925910_T_C:66925910:0,4,0,4
chr17	66925923	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=120,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0|1:66925910_T_C:66925910:0,1,0,5
chr17	66928434	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=187,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,4:6,3:5,5,7,0
chr17	66938232	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr17	66938260	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr17	66972250	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:4,7:3,6:4,3,4,9
chr17	66972364	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=154,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,2:5,1:0,8,0,3
chr17	66986162	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr17	66992027	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=194,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,1:7,1:9,6,1,1
chr17	67023699	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=195,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:4,1,1,2
chr17	67023755	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,4:1,4:1,0,5,3
chr17	67024585	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=215,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,1:0,9:1,0,9,1
chr17	67024799	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=183,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:3,1:1,3:0,5,1,3
chr17	67031369	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=113,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:1,6:1,11:1,1,12,5
chr17	67045529	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:7,4:9,2:7,9,5,1
chr17	67075072	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,4:4,1:8,4,5,0
chr17	67075294	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,11,6
chr17	67081161	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:5,5:9,3:11,3,4,4
chr17	67081732	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=130,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.313:33:14,4:9,6:10,13,4,6
chr17	67081809	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:15,5:17,0:10,22,0,5
chr17	67081830	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=174,138;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:17,1:7,2:7,19,2,1
chr17	67092929	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=192,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,15:0.363:42:10,5:17,10:13,14,6,9
chr17	67092948	.	TA	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=185,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.339:26:5,4:11,5:3,14,3,6
chr17	67099208	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=180,267;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr17	67102358	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=143,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:0|1:67102358_A_C:67102358:6,12,1,1
chr17	67102368	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=147,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:7,2:0|1:67102358_A_C:67102358:4,12,1,1
chr17	67109662	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=221,204;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:7,3,4,0
chr17	67109673	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=227,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:7,2,4,0
chr17	67109894	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=243,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,6:6,2:6,6,1,7
chr17	67119593	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=251,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr17	67133352	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=174,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr17	67144884	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=233,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,0:2,2:7,0,2,0
chr17	67145190	.	TGA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=126,310;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GA;STR;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:12,3:9,3:9,14,3,3
chr17	67149557	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=187,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:18,1:11,2:14,15,1,2
chr17	67150176	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=230,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.815:25:2,2:2,19:2,2,3,18
chr17	67152893	.	CAAAT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=198,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAAT;STR;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,1:3,3:8,1,4,0
chr17	67160186	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=192,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:10,6:9,6:8,11,6,6
chr17	67170736	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:5,4:12,5:9,8,7,2
chr17	67171748	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=180,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,1:3,1:1,7,0,2
chr17	67178954	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=218,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.466:34:7,7:8,5:4,14,9,7
chr17	67178975	.	AG	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=218,216;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:11,0:13,1:10,16,0,2
chr17	67178976	.	GAAA	G	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,19;MFRL=221,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.417:16:1,1:4,2:5,4,0,7
chr17	67178996	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,15;MFRL=190,235;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:3,0:0,11,2,0
chr17	67188668	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr17	67193150	.	A	AGGGAGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=202,232;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGAGG;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:2,1:2,0:4,0,2,0
chr17	67211911	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=166,98;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,3:8,0:12,4,3,0
chr17	67212574	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=210,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,2:1,2:1,5,0,4
chr17	67245941	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr17	67257281	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,11:0.374:30:6,5:13,6:0|1:67257281_C_T:67257281:8,11,7,4
chr17	67257296	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=161,97;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:34,9:0.222:43:10,9:24,0:1|0:67257281_C_T:67257281:21,13,9,0
chr17	67274054	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	67280310	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr17	67282332	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr17	67287327	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=326,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:1,3:0,5:1,0,8,0
chr17	67290867	.	GTTTTATA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=181,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,0:9,2:1,12,1,1
chr17	67293535	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr17	67298888	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=160,48;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:12,2:0|1:67298888_G_A:67298888:10,8,1,1
chr17	67298896	.	G	GAATCCACCAT	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=160,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:0|1:67298888_G_A:67298888:10,7,1,1
chr17	67298897	.	G	GAAC	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=160,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:0|1:67298888_G_A:67298888:11,7,1,1
chr17	67298901	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,19;MFRL=160,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:12,1:0|1:67298888_G_A:67298888:12,9,1,1
chr17	67512924	.	G	GTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=144,291;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:5,4,3,0
chr17	67516340	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=251,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.424:12:6,2:1,3:6,1,4,1
chr17	67519863	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=214,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:67519863_G_T:67519863:0,1,1,0
chr17	67519866	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=214,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:67519863_G_T:67519863:0,1,1,0
chr17	67522919	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=24035590,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr17	68171189	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=205,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.155:23:7,2:11,1:12,8,1,2
chr17	68173048	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.132:45:24,1:15,5:20,19,0,6
chr17	68174168	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,21,33;MFRL=254,271,206;MMQ=60,60,60;MPOS=24,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,16;RU=T;STR;TLOD=5.72,3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.333,0.337:6:1,1,1:1,0,1:2,0,2,2
chr17	68176033	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=172,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,2:13,0:8,17,2,0
chr17	70118846	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,192;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:10,0:13,4:8,16,0,4
chr17	70119704	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=26,17;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.422:18:4,1:5,0:1,9,8,0
chr17	70119709	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.408:15:4,2:5,1:0|1:70119709_A_C:70119709:0,9,6,0
chr17	70119713	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:4,3:4,0:0|1:70119709_A_C:70119709:0,9,5,0
chr17	70119716	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:5,4:5,0:0|1:70119709_A_C:70119709:1,9,5,0
chr17	70120551	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	70845688	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr17	70845949	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=230,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.589:8:0,2:1,1:0,3,1,4
chr17	70846027	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr17	71027639	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=85,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:5,0,7,0
chr17	71081078	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr17	71192955	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=221,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.226:29:10,3:13,3:12,11,3,3
chr17	71193594	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=207,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,1:4,3:0,6,0,4
chr17	71193633	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=215,248;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,4:2,0:0,3,0,4
chr17	71195949	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=195,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,2:8,2:9,5,4,0
chr17	71196995	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=182,446;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:0,6,1,1
chr17	71197200	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr17	71201675	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,11,5
chr17	71201910	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=210,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,1:5,1:0,10,0,2
chr17	71202777	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=219,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.587:10:2,6:2,0:4,0,6,0
chr17	71202797	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=12,15;MFRL=218,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.246:13:1,1:1,0:0|1:71202797_C_A:71202797:9,1,3,0
chr17	71202801	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=17,10;MFRL=218,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.245:13:1,1:1,0:0|1:71202797_C_A:71202797:9,1,3,0
chr17	71203231	.	CAAAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=250,175;MMQ=50,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=22,17;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,0:0,1:1,1,1,0
chr17	71208960	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=259,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr17	71223424	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,17;MFRL=212,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.480:15:3,0:1,2:3,5,2,5
chr17	71223501	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=178,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,0:4,3:0,6,0,3
chr17	71231604	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,268;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,2:10,1:12,2,2,1
chr17	71239016	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,1:5,2:7,3,2,1
chr17	71344668	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=310,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr17	71344889	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,292;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr17	71346353	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr17	71346750	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,10,2
chr17	71346943	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,1,15
chr17	71357810	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:1,6:5,9:3,3,9,6
chr17	71358045	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr17	71377085	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,56;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:13,2:4,0:8,9,1,1
chr17	71382747	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr17	71397085	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:3,2:2,4:4,1,7,0
chr17	71397366	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=162,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.390:21:5,6:8,2:0|1:71397366_G_A:71397366:5,8,2,6
chr17	71397375	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=191,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,12:0.591:20:6,5:2,7:1|0:71397366_G_A:71397366:0,8,4,8
chr17	71415245	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=192,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr17	71418605	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,10:0,0,5,17
chr17	71419750	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=228,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0,1,0,7
chr17	71419970	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr17	71420035	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr17	71429776	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=207,251;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr17	71452208	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=200,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,2:6,1:2,8,1,2
chr17	72209858	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:6,3:8,7:3,11,4,6
chr17	72245613	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=203,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,1:5,3:0,6,0,4
chr17	72245629	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=205,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr17	72245986	.	CCACTGTGGGGCTCCTGGGAGACGGAGCCT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CACTGTGGGGCTCCTGGGAGACGGAGCCT;STR;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.895:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr17	72246382	.	TCTCG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=235,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,3:2,1:4,2,4,0
chr17	72248363	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=233,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,5:2,3:4,1,7,1
chr17	72248512	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=206,161;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,1:8,4:6,8,2,3
chr17	72248593	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=208,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:0,3,1,6
chr17	72249229	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=191,223;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:10,1:11,2:14,7,2,1
chr17	72256196	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=246,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr17	72277879	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=214,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,2:1,1:3,0,3,0
chr17	72281367	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,6,8
chr17	72283314	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr17	72285659	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=191,283;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr17	72285705	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=206,73;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:12,1,1,1
chr17	72285906	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=193,255;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:1,3:6,1:1,6,0,4
chr17	72297104	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=209,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:2,0,6,0
chr17	72297180	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.518:10:1,4:2,1:3,2,4,1
chr17	72305534	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,8:0,3:0,0,4,9
chr17	72306116	.	CCT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0,0,7,4
chr17	72308360	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=195,100;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,0:8,3:4,12,0,3
chr17	72308447	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	72310397	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=153,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,0:11,1:0|1:72310397_T_C:72310397:9,12,1,1
chr17	72310404	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=116,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,2:0.143:19:6,0:9,2:1|0:72310397_T_C:72310397:5,12,1,1
chr17	72324649	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=276,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,7:0,3:0,1,1,9
chr17	72338164	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	72339116	.	T	TGCCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=388,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:0,1:1,1:0|1:72339116_T_TGCCC:72339116:0,1,2,0
chr17	72339120	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=388,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:72339116_T_TGCCC:72339116:0,1,2,0
chr17	72339123	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=266,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0|1:72339116_T_TGCCC:72339116:1,1,2,0
chr17	72339130	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=230,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:2,1:0|1:72339116_T_TGCCC:72339116:2,1,2,0
chr17	72340337	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,18;MFRL=173,228;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:0,0:0|1:72340337_A_C:72340337:1,3,2,0
chr17	72340342	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,19;MFRL=173,228;MMQ=60,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:0|1:72340337_A_C:72340337:1,3,2,0
chr17	72340348	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=173,228;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,0:0|1:72340337_A_C:72340337:2,4,2,0
chr17	72340553	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,2:0,0,0,9
chr17	72346736	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr17	72350277	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=200,268;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:2,2,1,2
chr17	72356484	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=357,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,0:1,2:0,2,0,2
chr17	72363725	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=106,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:6,0:8,4:8,6,0,4
chr17	72367843	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=192,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr17	72443192	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,5:0,4:0,0,1,12
chr17	72469958	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=165,125;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.284:33:16,5:8,4:13,11,5,4
chr17	72477385	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=214,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.259:24:13,4:5,1:7,11,4,2
chr17	72518856	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=217,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:9,1:6,4:7,8,3,2
chr17	72537894	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,3,7
chr17	72538917	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	72541760	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:72541760_T_A:72541760:0,0,2,0
chr17	72541766	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:72541760_T_A:72541760:0,0,2,0
chr17	72541838	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr17	72541980	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr17	72608926	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=197,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:2,5,2,2
chr17	72613589	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=65,239;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,4:1,3:1,2,1,6
chr17	72613612	.	A	AGAAAACCATGTCCTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=202,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:0,7,1,1
chr17	72740346	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=186,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr17	72741449	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=140,98;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:13,0:17,3:13,17,3,0
chr17	72768970	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.277:27:9,3:10,4:14,6,4,3
chr17	72769694	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.470:13:3,4:3,2:4,3,3,3
chr17	72773387	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=202,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,4:3,5:8,1,9,0
chr17	72781536	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=192,244;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:3,11:5,0:8,0,11,0
chr17	72781754	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=171,335;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,1:5,1:5,11,0,2
chr17	72781757	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=181,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,3:6,0:5,10,0,3
chr17	72781812	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=200,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,2:4,4:0,7,0,6
chr17	72791088	.	A	AG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.933:12:1,7:0,3:1,0,10,1
chr17	72791266	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=302,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.874:22:1,11:1,7:0,2,4,16
chr17	72791618	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=182,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.686:17:2,4:3,8:5,0,12,0
chr17	72831993	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=217,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:5,3:1,2:6,0,6,0
chr17	72832032	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=206,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,2:6,1:11,2,2,1
chr17	72838481	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr17	72838767	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=208,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:3,4,0,2
chr17	72839130	.	A	AGCTCCGGGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	72839642	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	72843378	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=233,289;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:72843378_C_T:72843378:1,1,2,0
chr17	72843397	.	T	TGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=19,20;MFRL=277,289;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,0:0|1:72843378_C_T:72843378:0,1,2,0
chr17	72843402	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=277,265;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:72843378_C_T:72843378:0,1,1,0
chr17	72844165	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=213,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr17	72848730	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=179,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:1,2,2,0
chr17	72860878	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=229,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.374:13:6,1:2,1:3,5,5,0
chr17	72861145	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=270,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr17	72861974	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=195,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:2,7,1,2
chr17	72862705	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=191,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:5,2:0,4:2,3,1,5
chr17	72875447	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=260,235;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,2:7,0,5,0
chr17	72888836	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr17	72889676	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.786:20:1,6:2,9:2,2,5,11
chr17	72915450	.	T	TGGGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr17	72929380	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=212,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr17	72939663	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=228,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,4:1,7:0,2,9,2
chr17	72939854	.	AAC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,15;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=AC;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:1,0:0,1,0,2
chr17	72943434	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=157,203;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,0:1,3:6,1,1,2
chr17	72945334	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=177,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:10,7,1,1
chr17	72948369	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,14:0,5:0,0,12,8
chr17	72951823	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0|1:72951823_C_T:72951823:0,0,4,1
chr17	72951845	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0|1:72951823_C_T:72951823:0,0,6,0
chr17	72957962	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=230,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:3,4:4,5:2,5,6,3
chr17	72959000	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=195,257;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:2,0:1,3:2,1,5,0
chr17	72997364	.	T	TAGG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=205,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGG;STR;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:4,0:2,3:6,0,2,1
chr17	73043256	.	C	CCCCTCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73043256_C_CCCCTCT:73043256:0,0,0,1
chr17	73043260	.	G	GATCCAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73043256_C_CCCCTCT:73043256:0,0,0,1
chr17	73043263	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73043256_C_CCCCTCT:73043256:0,0,0,1
chr17	73089706	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr17	73094072	.	TCTC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=179,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTC;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr17	73096951	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=124,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr17	73124692	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	73125173	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	73126746	.	GT	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=94.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,11:0,13:0,0,11,14
chr17	73127024	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,5:0,0,11,7
chr17	73143574	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr17	73204530	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr17	73204535	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=193,69;MMQ=60,56;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=A;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.756:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr17	73208182	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.937:12:0,3:0,2:0,0,2,10
chr17	73208205	.	G	GTT,GTGTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34,34;MFRL=0,190,121;MMQ=60,60,60;MPOS=17,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=13.37,16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,6:0.437,0.509:11:0,2,1:0,3,5:0,0,1,10
chr17	73221439	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.967:27:0,14:0,12:0|1:73221439_C_T:73221439:0,0,13,14
chr17	73221447	.	C	CATG	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=155,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,2:12,0:0|1:73221439_C_T:73221439:12,13,0,2
chr17	73221448	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=155,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,2:12,0:0|1:73221439_C_T:73221439:12,13,0,2
chr17	73221451	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=155,215;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,2:13,0:0|1:73221439_C_T:73221439:13,13,0,2
chr17	73228101	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr17	73231817	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr17	73236605	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr17	73240836	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=57.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,5,12
chr17	73242501	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr17	73242895	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,2:0,0,0,11
chr17	73242935	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr17	73258085	.	GGC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr17	73258479	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr17	73258718	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=206,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:15,4:9,4:11,13,4,4
chr17	73279700	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr17	73282299	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr17	73282636	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr17	73316679	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=68.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,2,16
chr17	73328773	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=88.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,15:0,0,15,10
chr17	73482110	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr17	73484753	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr17	73485033	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr17	73485080	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=201,102;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:0,10,0,2
chr17	73485504	.	CG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=192,248;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:3,0:4,2:3,8,0,2
chr17	73485781	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr17	73488755	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,2:5,0:3,9,0,2
chr17	73489220	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,5,10
chr17	73489567	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,8,6
chr17	73490611	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr17	73492585	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=176,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:8,9,0,2
chr17	73493874	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=214,170;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:2,3:5,2:4,4,3,2
chr17	73494963	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr17	73497794	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr17	73498623	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,6,7
chr17	73498651	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=161,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.444:18:7,4:3,3:7,3,4,4
chr17	73499697	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr17	73500659	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,3:8,0:10,10,3,0
chr17	73501752	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,6,6
chr17	73502636	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=200,246;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,0:2,4:3,2,2,2
chr17	73504416	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,4,12
chr17	73509720	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=149,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:2,1:1,0:1,2,1,0
chr17	73513156	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=163,190;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:8,2:8,1:8,10,1,2
chr17	73513185	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,2:0,8:0,0,5,7
chr17	73513415	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=181,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:2,2:7,0:2,7,0,2
chr17	73513434	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=205,268;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:3,2,1,1
chr17	73513619	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=188,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:4,3:9,3:11,2,6,0
chr17	73515055	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.245:13:5,2:5,1:10,0,3,0
chr17	73515237	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,1:5,4:0,7,0,5
chr17	73519258	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=187,249;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:1,0:6,2:7,0,2,0
chr17	73539631	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,0,16
chr17	73552062	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=227,280;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:2,2,3,0
chr17	73552242	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=190,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:2,0:5,2:1,7,1,1
chr17	73554186	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=171,247;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:7,3:1,1:6,2,4,0
chr17	73554523	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr17	73554756	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=186,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,2:3,1:1,8,0,3
chr17	73559342	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,1:5,1:4,5,1,1
chr17	73564795	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,14;MFRL=168,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:4,1:4,0:0|1:73564795_A_C:73564795:4,7,3,0
chr17	73564807	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,12;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:3,1:4,0:0|1:73564795_A_C:73564795:4,7,3,0
chr17	73564812	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,0:4,0:0|1:73564795_A_C:73564795:4,7,3,0
chr17	73564817	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=172,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,0:5,0:0|1:73564795_A_C:73564795:4,6,3,0
chr17	73564962	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=134,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,1:4,3:0,11,4,0
chr17	73565262	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr17	73569511	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:8,1:1,5:7,2,5,1
chr17	73569666	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=181,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,2:3,1:3,5,2,1
chr17	73569735	.	T	TCTCCCGCCC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=17,28;MFRL=218,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CTCCCGCCC;STR;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:1,2:0,0:0,3,0,3
chr17	73569927	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=201,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr17	73570756	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,17;MFRL=278,166;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.548:5:1,1:1,0:1,1,0,3
chr17	73570774	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=270,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,3:1,0:2,1,0,3
chr17	73570842	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=220,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:2,2:4,1:5,2,2,1
chr17	73571030	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:1,5,3,1
chr17	73625629	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr17	73626208	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr17	73626817	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=246,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:6,1:4,3:0|1:73626817_G_A:73626817:2,8,1,3
chr17	73626829	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0|1:73626817_G_A:73626817:0,0,4,12
chr17	73626922	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=169,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.553:11:3,2:1,4:5,0,6,0
chr17	73626923	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=173,267;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.425:10:3,1:2,3:6,0,4,0
chr17	73626983	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=144,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.798:13:1,4:1,6:0,2,5,6
chr17	73627818	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	73658489	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr17	73663372	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=183,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:11,3:7,1:18,1,4,0
chr17	73698557	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,6:0,0,6,12
chr17	73702253	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=210,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.693:7:0,3:1,2:0,2,1,4
chr17	73702402	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	73720900	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,3,9
chr17	73723239	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=181,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.663:13:3,3:1,5:3,1,7,2
chr17	73723453	.	GC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,8:0,4:0,0,5,7
chr17	73732045	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	73732522	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=158,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,2:0,4:1,2,3,3
chr17	73732810	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,1:0,3:0,5,0,4
chr17	73733315	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=227,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr17	73735918	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=175,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:7,5,1,1
chr17	73746146	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr17	73746370	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=235,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.684:22:1,6:4,9:2,5,7,8
chr17	73746427	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr17	73746957	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,3:13,0:7,14,0,3
chr17	73751042	.	C	CACAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr17	73752954	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=205,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:12,1:5,2:8,10,0,3
chr17	73752999	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=181,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,9:1,0:0,2,3,6
chr17	73753651	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=187,235;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:5,1:6,1:0|1:73753651_A_C:73753651:2,11,3,0
chr17	73753657	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,11;MFRL=187,235;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:6,0:7,0:0|1:73753651_A_C:73753651:2,13,3,0
chr17	73753661	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,7:0,0,2,12
chr17	73754372	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=210,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,2:6,4:7,3,6,0
chr17	73759038	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr17	73759304	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr17	73759400	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,0:13,3:15,8,3,0
chr17	73759552	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:1,4:1,12:0,2,2,14
chr17	73761283	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=317,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:73761283_G_T:73761283:0,1,0,1
chr17	73761285	.	G	GTCTCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=317,219;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:73761283_G_T:73761283:0,1,0,1
chr17	73781075	.	GCC	G,GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,14,12;MFRL=0,175,171;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=C;STR;TLOD=9.95,6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,4:0.492,0.436:11:0,1,0:0,2,0:0,0,0,11
chr17	73819348	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=170,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.178:37:18,4:13,1:17,14,3,3
chr17	73820553	.	GTA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=285,412;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TA;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	73832238	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.208:15:7,0:4,0:1,11,3,0
chr17	73832384	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=173,241;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.270:23:8,3:9,2:3,14,1,5
chr17	73836529	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=237,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,1:1,1:1,7,2,1
chr17	73837142	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=109,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:7,1:5,2:6,6,1,2
chr17	73838857	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=199,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:2,2:3,1:4,2,3,0
chr17	73844748	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=146,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:3,9,1,1
chr17	73845858	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=177,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,1:6,8:2,8,0,9
chr17	73874684	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=204,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr17	73886888	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=139,213;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:7,4,2,0
chr17	73888672	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=223,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.342:10:5,2:0,1:0,7,0,3
chr17	73888972	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=328,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,0:2,1:0|1:73888972_A_T:73888972:0,3,0,1
chr17	73888975	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=328,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:73888972_A_T:73888972:0,3,0,1
chr17	73888980	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,31;MFRL=328,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73888972_A_T:73888972:0,1,0,1
chr17	73897828	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,3:12,0:10,12,3,0
chr17	73913965	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,7,7
chr17	73922941	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=171,256;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:12,0:6,3:6,13,0,3
chr17	73942973	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=0,196;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:0|1:73942973_T_G:73942973:0,4,0,2
chr17	73942979	.	CT	TC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=0,196;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:0|1:73942973_T_G:73942973:0,4,0,2
chr17	73942988	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=122,288;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:73942973_T_G:73942973:0,4,0,1
chr17	73942991	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=263,288;MMQ=60,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:73942973_T_G:73942973:0,2,0,1
chr17	73946030	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	73951561	.	GAACAGACCATTCTAACCCTATTGTGAGT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=172,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:4,2:8,1,2,0
chr17	73951864	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=319,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:1,5:1,7:1,1,8,4
chr17	73969784	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=174,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,0:8,3:6,10,0,3
chr17	73987782	.	GGGCTC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=309,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr17	73997474	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=170,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.801:18:1,8:2,7:1,2,9,6
chr17	74003119	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	74007748	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=179,173;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:5,0:7,4:5,7,0,4
chr17	74007846	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=201,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,3:7,2:4,5,5,1
chr17	74014228	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=210,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.402:15:6,0:3,4:5,4,5,1
chr17	74014468	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=210,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:0,3,3,4
chr17	74014628	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=193,200;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:1,5:9,4:8,2,6,3
chr17	74014668	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.710:29:5,9:3,12:8,0,12,9
chr17	74015158	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=201,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:0,10,0,2
chr17	74015590	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=240,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,13:0.778:16:2,6:1,6:0|1:74015590_C_T:74015590:3,0,8,5
chr17	74015595	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=216,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,13:0.752:17:2,6:1,6:0|1:74015590_C_T:74015590:3,1,8,5
chr17	74015819	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=168,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,4:5,2:0,5,0,6
chr17	74017492	.	CCCGCCCCTG	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=69,190;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCGCCCCTG;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:0,0:2,0,1,0
chr17	74017677	.	G	GCC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=242,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=C;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:1,2:1,2:0,2,0,5
chr17	74017700	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=306,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr17	74018393	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=178,447;MMQ=52,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,0:3,1:0|1:74018393_A_C:74018393:2,6,2,0
chr17	74018397	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=178,447;MMQ=52,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.251:10:3,0:3,2:0|1:74018393_A_C:74018393:2,6,2,0
chr17	74018402	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=188,447;MMQ=52,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,0:0|1:74018393_A_C:74018393:2,7,2,0
chr17	74018655	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr17	74019356	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:4,2:9,3:6,8,4,1
chr17	74019572	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=369,194;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,5:1,6:0,1,6,5
chr17	74036440	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=193,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:74036440_C_T:74036440:13,4,1,1
chr17	74036445	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=196,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:0|1:74036440_C_T:74036440:12,4,1,1
chr17	74036468	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=176,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:8,8:7,3:10,5,7,4
chr17	74036912	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=175,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.252:30:9,3:12,4:18,5,7,0
chr17	74039867	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,3:4,1:5,2,3,1
chr17	74041559	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=295,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:2,1:1,2:0,3,0,4
chr17	74043869	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,251;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:4,2:7,1,3,0
chr17	74046672	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=192,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr17	74073139	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:74073139_T_C:74073139:2,0,1,0
chr17	74073142	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:74073139_T_C:74073139:2,0,1,0
chr17	74076127	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=151,18546413;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr17	74077497	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=182,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:2,4,4,4
chr17	74079838	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=167,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.731:24:2,10:4,8:2,4,8,10
chr17	74081345	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=177,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr17	74083905	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=0,290;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr17	74084029	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=156,272;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:4,0,4,1
chr17	74084449	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=181,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:0,2:3,0,5,1
chr17	74084737	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=223,207;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:2,4,1,2
chr17	74085331	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=202,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.288:19:6,2:7,3:9,5,3,2
chr17	74090700	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=132,268;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,1:7,5:2,11,1,5
chr17	74094105	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=209,240;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:1,8,1,3
chr17	74133974	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=230,280;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:4,1:9,2,0,2
chr17	74151456	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=204,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:3,5,4,2
chr17	74152487	.	GT	CC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,122;MMQ=60,58;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:3,0:7,4:0,11,0,4
chr17	74158736	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:2,2:1,1:1,2,1,3
chr17	74160914	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=146,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:5,2:10,6:4,11,3,5
chr17	74161533	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=143,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.372:19:6,3:6,3:9,3,5,2
chr17	74162506	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:3,2:10,3:8,5,2,3
chr17	74162517	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:5,2:10,3:9,7,2,3
chr17	74162997	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=223,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr17	74163247	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=182,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:0,7:6,4:2,5,1,10
chr17	74169682	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=232,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr17	74169740	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,0:6,3:10,2,3,0
chr17	74208424	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=212,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:8,2,3,1
chr17	74208622	.	TA	T,TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31,30;MFRL=203,173,197;MMQ=60,60,60;MPOS=28,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=8.32,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,2:0.357,0.213:11:2,0,1:2,4,1:0,5,0,6
chr17	74261929	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:3,4:7,2:11,0,5,1
chr17	74276389	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=184,68;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:4,2:0|1:74276389_C_T:74276389:7,9,1,1
chr17	74276392	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=181,68;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:12,0:4,2:0|1:74276389_C_T:74276389:8,9,1,1
chr17	74276417	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=186,68;MMQ=60,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:13,0:6,2:0|1:74276417_T_C:74276417:11,8,1,1
chr17	74276424	.	G	GGTAGCATCCTGTGCATATATCTACCT	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=186,68;MMQ=60,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,0:5,2:0|1:74276417_T_C:74276417:13,8,1,1
chr17	74276558	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=210,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:8,9,0,2
chr17	74287645	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:12,9:8,0:10,10,9,0
chr17	74289249	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=198,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:2,9,1,1
chr17	74289988	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=201,76;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,8:4,0:5,4,8,0
chr17	74301082	.	GCA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=177,239;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CA;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,2:4,0:1,5,1,1
chr17	74324729	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr17	74326553	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:74326553_G_A:74326553:0,0,6,0
chr17	74326556	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0|1:74326553_G_A:74326553:0,0,6,0
chr17	74344633	.	A	C	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=139,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.092:52:29,0:19,4:16,32,0,4
chr17	74344668	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.302:31:13,4:9,5:8,14,2,7
chr17	74382945	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=176,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:8,10,2,0
chr17	74392722	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,208;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.216:29:10,5:13,0:16,7,6,0
chr17	74396486	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=195,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,2:7,3:7,4,2,3
chr17	74401405	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=43.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,4:0,9:0,0,5,8
chr17	74401522	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=217,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,0:3,4:4,5,0,4
chr17	74473346	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=177,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.152:22:8,1:8,1:8,11,1,2
chr17	74473830	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=172,100;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:9,2:3,0:1,11,1,1
chr17	74476045	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=193,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:2,3:3,3:2,4,2,4
chr17	74477691	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	74527846	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=221,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr17	74534650	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=136,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.799:13:1,8:1,2:1,1,7,4
chr17	74536333	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr17	74536335	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=234,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr17	74536762	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=212,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:1,6:0,7:0,1,0,13
chr17	74539092	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=105.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,17:0,17:0,0,22,12
chr17	74540017	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=218,64;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:74540017_A_G:74540017:0,16,1,1
chr17	74540024	.	CAAG	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=217,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:74540017_A_G:74540017:0,15,1,1
chr17	74540028	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=210,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:6,2:0|1:74540017_A_G:74540017:0,14,1,1
chr17	74559287	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,16:0,7:0,0,0,23
chr17	74563653	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=106,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,3:7,5:2,8,2,6
chr17	74569225	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	74570408	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr17	74581914	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	74581945	.	AA	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	74621635	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.841:10:0,6:1,3:0,1,0,9
chr17	74623076	.	AGAGAGGGGCTGGAGGGGGGCTGGAGGGGGCAG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=238,56;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.191:14:8,0:2,2:12,0,1,1
chr17	74639530	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=222,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:4,0,5,0
chr17	74684080	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0|1:74684080_G_A:74684080:0,0,2,0
chr17	74684090	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:74684080_G_A:74684080:0,0,1,0
chr17	74684096	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74684080_G_A:74684080:1,0,1,0
chr17	74684100	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,15;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:74684080_G_A:74684080:1,0,1,0
chr17	74706673	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	74721620	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:21,3:17,0:12,26,0,3
chr17	74729691	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.206:32:14,2:12,4:12,14,4,2
chr17	74734598	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=68.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,9:0,0,0,20
chr17	74736999	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:4,1:1,2:5,1,4,0
chr17	74750215	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=36.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,5,5
chr17	74920957	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr17	74922578	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr17	74922636	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr17	74922652	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,6,3
chr17	74936429	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=167,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,4:2,1:2,0,5,0
chr17	74944192	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:74944192_A_C:74944192:0,3,1,0
chr17	74944197	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,13;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:74944192_A_C:74944192:0,3,1,0
chr17	74944200	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,12;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:74944192_A_C:74944192:0,3,1,0
chr17	74944709	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=130,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,5:3,4:3,1,5,4
chr17	74944714	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=184,353;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:3,1:4,3:4,4,3,2
chr17	75207966	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=254,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr17	75316497	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,4:3,4:2,7,1,7
chr17	75442448	.	CT	C,CTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34,32;MFRL=198,251,156;MMQ=60,60,58;MPOS=21,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.29,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,2:0.351,0.236:10:2,1,0:2,2,1:1,3,1,5
chr17	75478481	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=218,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:0,4,0,7
chr17	75484781	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,5:7,0:12,2,4,1
chr17	75486959	.	CT	TA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=192,213;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:3,2:8,0:0|1:75486959_CT_TA:75486959:2,10,0,2
chr17	75486962	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=192,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,2:9,0:0|1:75486959_CT_TA:75486959:2,10,0,2
chr17	75488973	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=246,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:12,3:5,0:10,7,2,1
chr17	75489015	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=214,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:9,4:7,0:8,8,3,1
chr17	75489216	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=217,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr17	75494513	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,15;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:75494513_T_A:75494513:4,0,1,0
chr17	75494518	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,10;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:75494513_T_A:75494513:4,0,1,0
chr17	75494520	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=17,12;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:75494513_T_A:75494513:4,0,1,0
chr17	75494530	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=18,12;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:75494513_T_A:75494513:3,0,1,0
chr17	75494532	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=19,13;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:75494513_T_A:75494513:3,0,1,0
chr17	75494705	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=86,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:0,5:1,11:0,1,9,9
chr17	75494746	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:0,2:3,3:1,3,1,4
chr17	75494780	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=167,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,1:4,1:0,7,0,2
chr17	75494787	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0,0,0,9
chr17	75878123	.	AG	GT	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=171,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.100:48:21,1:22,3:20,24,1,3
chr17	75878128	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=171,90;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.104:46:22,1:18,3:19,23,1,3
chr17	75878480	.	AGT	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=190,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GT;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.098:30:18,0:8,2:14,14,0,2
chr17	75878494	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=186,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.098:29:16,2:10,0:13,14,0,2
chr17	75878715	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,136;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:12,6:22,0:16,18,6,0
chr17	76047561	.	TAAAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=301,371;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=A;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0,2,0,2
chr17	76093866	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:8,1:13,1:13,8,1,1
chr17	76113277	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=205,230;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr17	76113826	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,13;MFRL=183,250;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:0,0:3,0:3,2,1,0
chr17	76114941	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=188,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:4,1:3,3:7,0,5,0
chr17	76114963	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:7,0,5,0
chr17	76114975	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,1:3,3:8,0,4,0
chr17	76115181	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=150,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:3,1:4,1:1,7,0,2
chr17	76115301	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=243,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:7,4:1,6:3,5,7,3
chr17	76115353	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=170,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.749:18:1,9:3,4:1,3,8,6
chr17	76117570	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=194,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,1:4,1:5,2,2,0
chr17	76117720	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,0:4,2:2,7,0,3
chr17	76118834	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=171,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,1:8,1:2,13,1,1
chr17	76128386	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=180,235;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr17	76128662	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=214,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,2:0,1,2,3
chr17	76133746	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=220,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr17	76134828	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=231,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr17	76135402	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0|1:76135402_G_A:76135402:0,4,0,4
chr17	76135412	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:0,2:0|1:76135402_G_A:76135402:0,3,0,4
chr17	76137198	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	76142402	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=131,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,0:0,6:1,0,5,1
chr17	76156983	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:3,3:1,0:4,0,4,0
chr17	76162134	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=155,119;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,3:1,5:0,5,3,5
chr17	76162178	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=153,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,6:3,0:1,3,0,6
chr17	76182766	.	AAGGGG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AGGGG;STR;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.828:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	76187160	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=124,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,6:2,4:2,3,1,9
chr17	76187204	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,19;MFRL=217,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,0:0,0:0,2,0,2
chr17	76187211	.	G	GTAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=186,237;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr17	76188753	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,4:1,3,2,3
chr17	76198754	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:1,7:1,3:0,2,6,4
chr17	76201215	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,0:8,2:6,12,0,2
chr17	76210367	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=161,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,4:4,3:3,1,7,0
chr17	76210959	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=315,87;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr17	76212203	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,50;MPOS=-57;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:76212203_G_A:76212203:0,0,1,1
chr17	76212205	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,50;MPOS=-58;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:76212203_G_A:76212203:0,0,1,1
chr17	76212210	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,50;MPOS=-60;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:76212203_G_A:76212203:0,0,1,1
chr17	76212929	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	76235015	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr17	76392525	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=183,301;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:0,6,2,4
chr17	76394449	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=195,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:3,5,0,4
chr17	76394526	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=211,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:1,1:3,1:0,5,0,2
chr17	76395421	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,3:4,5:0|1:76395421_G_A:76395421:7,3,4,4
chr17	76395430	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=169,193;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.455:20:6,3:5,6:0|1:76395421_G_A:76395421:7,4,4,5
chr17	76395634	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=169,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,4:6,0:2,13,1,3
chr17	76396961	.	C	CTGTGTCTGTG	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=168,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:8,0:5,2:0|1:76396961_C_CTGTGTCTGTG:76396961:3,10,1,1
chr17	76396963	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=153,235;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:3,10,1,1
chr17	76396965	.	G	GTATGGGT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=168,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:76396961_C_CTGTGTCTGTG:76396961:3,10,1,1
chr17	76396967	.	C	CTGTGTGTCTTTG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=168,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:4,2:0|1:76396961_C_CTGTGTCTGTG:76396961:3,10,1,1
chr17	76399552	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:4,0,3,0
chr17	76399732	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=195,163;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:8,0:6,11:11,3,0,11
chr17	76410871	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,19;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:0,0:2,1:2,0,3,0
chr17	76411154	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=109,267;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:1,2:0,3,2,5
chr17	76422473	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=208,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr17	76425176	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:7,2,4,0
chr17	76433685	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=100,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:3,0,6,0
chr17	76446689	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr17	76451652	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=196,233;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr17	76451698	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr17	76451921	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,5,8
chr17	76456215	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:11,2:6,3:8,9,3,2
chr17	76456352	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,11:0,2:0,0,5,9
chr17	76457559	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr17	76458906	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=235,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:1,3:3,2:5,0,3,2
chr17	76481608	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=199,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,6:1,0:3,0,6,0
chr17	76481997	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=268,247;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:2,2,5,1
chr17	76482256	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=156,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:3,5:0,8:1,2,6,7
chr17	76482432	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=122,141;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,24:0.808:29:1,11:4,13:4,1,12,12
chr17	76487658	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:9,4:5,2:2,12,1,5
chr17	76490814	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=223,128;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,0:6,2:7,7,0,2
chr17	76491194	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,1:4,3:5,5,0,4
chr17	76495050	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,4:0,12:0,0,13,3
chr17	76496361	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,236;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,2:4,1:4,6,2,1
chr17	76496577	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr17	76497778	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=241,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:0,4:2,0,8,0
chr17	76498909	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=162,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:4,2,3,0
chr17	76502734	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=199,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:4,0,5,1
chr17	76503593	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.907:19:1,14:0,4:1,0,14,4
chr17	76506607	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,2,9
chr17	76506665	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=137,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:0,3,0,6
chr17	76525475	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=164,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,3:0,3:3,0,6,0
chr17	76525805	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=154,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,1:1,7:1,5,1,7
chr17	76525864	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=178,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr17	76526605	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=229,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,1:6,1:5,5,1,1
chr17	76528831	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:1,8,0,4
chr17	76535759	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=231,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,4:4,1:6,0,5,0
chr17	76536048	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=204,268;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:0,7,0,5
chr17	76554114	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=176,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,4:4,0:5,0,4,0
chr17	76554147	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=150,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:3,7:7,1:9,2,5,3
chr17	76556811	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,5:5,5:7,2,7,3
chr17	76558159	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	76705723	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:14,3:11,0:14,11,3,0
chr17	76794442	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=126,235;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.715:5:1,0:0,1:0|1:76794442_A_C:76794442:0,1,4,0
chr17	76794448	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=126,232;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.669:4:1,0:0,0:0|1:76794442_A_C:76794442:0,1,3,0
chr17	76794981	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=192,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:5,5:6,10:5,6,8,7
chr17	76798548	.	TTTTTTC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=186,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTTC;STR;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,1:4,3:7,7,2,2
chr17	76802290	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=126,104;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.123:39:21,0:10,4:15,20,0,4
chr17	76832133	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,1:5,3:6,4,3,1
chr17	76867185	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=112,310;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:3,2,0,3
chr17	76887344	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.355:23:6,5:8,2:5,10,0,8
chr17	76897974	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=85,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.635:17:4,5:2,6:3,3,2,9
chr17	76968325	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:17,3:7,0:12,12,0,3
chr17	76968341	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:15,3:6,0:12,10,0,3
chr17	76973339	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=223,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr17	76993546	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=192,212;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,4:6,6:6,3,6,4
chr17	77043550	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=187,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,4:5,0:9,2,4,0
chr17	77043574	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=202,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:1,6:3,6:2,2,8,4
chr17	77043605	.	TC	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=196,1916;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,2:10,0:8,10,1,1
chr17	77081222	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=188,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:7,1:2,4:9,0,4,2
chr17	77087005	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:6,5:5,6:4,7,2,11
chr17	77090637	.	TGGGAGGAGGGTGG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.721:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	77093582	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=155,269;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr17	77093734	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=137,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,1:0,1,3,2
chr17	77093768	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=101,124;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.637:14:2,3:2,6:1,4,8,1
chr17	77093850	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=190,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:11,8,1,1
chr17	77097606	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=208,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr17	77097649	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=210,153;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,4:5,4:5,6,6,3
chr17	77097686	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=205,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:9,0:6,2:7,8,0,2
chr17	77097811	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=210,233;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr17	77102966	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	77710817	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=186,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:10,3:5,1:8,7,3,1
chr17	77751983	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	77753170	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,16:0.325:49:16,11:17,3:17,16,9,7
chr17	77753245	.	C	CTG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=41.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:3,7:5,5:6,3,10,2
chr17	77755417	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=237,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,5:2,0:6,0,5,0
chr17	77758217	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=239,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:3,3:8,2:5,7,2,3
chr17	77758597	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,1:8,2:4,12,1,2
chr17	77768955	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:4,3:4,3:5,4,2,4
chr17	77769398	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=238,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:6,2:2,2:0,9,0,4
chr17	77809598	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=210,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr17	77811733	.	TAA	T,TA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,27,19;MFRL=136,128,233;MMQ=60,60,60;MPOS=15,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=4.11,5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,4:0.233,0.284:16:4,3,2:2,0,0:5,3,0,8
chr17	77914591	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=18,22;MFRL=187,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.296:12:2,2:2,0:7,2,3,0
chr17	77922612	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=185,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.784:12:1,5:1,4:2,0,7,3
chr17	78013724	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,11,10
chr17	78021037	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=222,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:2,2,5,1
chr17	78021214	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=220,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:2,3,0,4
chr17	78022378	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:9,1,2,0
chr17	78023614	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=268,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr17	78024094	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=159,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:6,2:13,7:10,9,4,5
chr17	78061757	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=205,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:78061757_A_C:78061757:2,2,1,0
chr17	78061772	.	G	GGGCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=205,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:78061757_A_C:78061757:2,2,1,0
chr17	78061776	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,35;MFRL=170,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:78061757_A_C:78061757:2,1,1,0
chr17	78069097	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=194,99;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.321:29:14,2:6,7:11,9,5,4
chr17	78069275	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=217,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:6,2:3,0:4,6,0,2
chr17	78071247	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=243,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr17	78073562	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=267,149;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,1:2,4:4,2,1,4
chr17	78073589	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:1,5,1,2
chr17	78079481	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=221,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:2,2,7,0
chr17	78079509	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=185,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:1,3,4,0
chr17	78079544	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=190,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,3,1
chr17	78081526	.	A	AGCAGCGG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=203,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.525:17:7,7:1,2:0|1:78081526_A_AGCAGCGG:78081526:2,6,3,6
chr17	78081551	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=203,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:5,7:1,2:0|1:78081526_A_AGCAGCGG:78081526:2,4,4,5
chr17	78081707	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=200,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:4,4:0,3:2,2,1,6
chr17	78082005	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=269,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr17	78083726	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=234,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,4:4,3:4,1,7,0
chr17	78084507	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=197,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,6:4,1:5,1,7,0
chr17	78084688	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=206,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.452:22:9,2:3,7:8,4,3,7
chr17	78086833	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,13;MFRL=276,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.487:8:0,0:2,1:0,4,0,4
chr17	78086839	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=17,15;MFRL=278,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.749:8:0,1:0,1:0,2,0,6
chr17	78086846	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=243,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,3:4,0:0,6,0,3
chr17	78087109	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=249,165;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:3,4:6,4:8,2,4,4
chr17	78090928	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:1,8,0,2
chr17	78091405	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,3:5,7:6,5,5,5
chr17	78158063	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,0,10
chr17	78175483	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=282,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:0,1:1,3:1,0,3,1
chr17	78176233	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=202,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.655:7:2,2:0,1:0,2,3,2
chr17	78178170	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=195,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.787:12:1,6:1,4:0|1:78178170_A_G:78178170:0,2,1,9
chr17	78178182	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=195,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.800:13:1,7:1,4:0|1:78178170_A_G:78178170:0,2,1,10
chr17	78178189	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=195,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.786:12:1,6:1,3:0|1:78178170_A_G:78178170:0,2,1,9
chr17	78178830	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=152,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:4,2:0,5:3,2,4,3
chr17	78181917	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=173,256;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.520:11:4,0:1,0:2,3,5,1
chr17	78187720	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=213,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,0:0|1:78187720_A_G:78187720:0,4,0,2
chr17	78187721	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=213,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:78187720_A_G:78187720:0,4,0,2
chr17	78187954	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=167,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:5,3,2,1
chr17	78188963	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=181,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr17	78201581	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=206,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:5,2,2,0
chr17	78210944	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=201,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr17	78219065	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=154,182;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:7,4:16,3:8,15,2,5
chr17	78219100	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,0:8,7:2,10,1,6
chr17	78222280	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=201,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,2:1,6:1,0,7,1
chr17	78222565	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=183,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr17	78223103	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	78263391	.	G	GAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=332,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=A;STR;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.872:13:1,4:0,3:1,0,7,5
chr17	78263429	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=193,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.769:26:3,8:1,10:6,0,5,15
chr17	78264298	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=105,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,1,2
chr17	78265667	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:0,6,0,4
chr17	78268496	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=216,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:3,0,6,2
chr17	78269255	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	78280030	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr17	78281088	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=291,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,0:1,5:0,1,1,4
chr17	78286986	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,1:5,2:4,7,0,3
chr17	78290883	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=201,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:5,0,1,1
chr17	78290885	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=172,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:2,1:3,1:4,1,3,0
chr17	78316974	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=222,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:10,4:8,2:10,8,2,4
chr17	78317624	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=192,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:5,1:16,3:10,11,1,3
chr17	78323500	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=181,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,3:6,0:8,1,1,2
chr17	78323757	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,3,16
chr17	78327229	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=206,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:6,0,6,0
chr17	78327745	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=186,305;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:0,2:6,2:6,0,3,1
chr17	78337684	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=215,256;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,2:3,1:0,9,0,3
chr17	78338198	.	CGAGT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAGT;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,1:10,1:11,9,1,1
chr17	78341484	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=204,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:9,0,2,0
chr17	78341982	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,0:10,4:1,15,0,4
chr17	78347054	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	78351506	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:8,2:4,3:5,7,3,2
chr17	78357478	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=178,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,1:8,2:12,2,3,0
chr17	78359309	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=117,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:7,7:6,8:7,6,8,7
chr17	78362300	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr17	78363711	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=177,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,3:11,0:9,12,1,2
chr17	78389399	.	GCA	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=159,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:15,2:0|1:78389399_GCA_G:78389399:17,8,1,1
chr17	78389402	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=159,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:16,2:0|1:78389399_GCA_G:78389399:17,8,1,1
chr17	78396091	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=189,256;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.232:14:5,1:6,1:2,9,0,3
chr17	78397274	.	G	GGCCC	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:78397274_G_GGCCC:78397274:0,0,6,0
chr17	78397278	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:78397274_G_GGCCC:78397274:0,0,6,0
chr17	78397285	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=207,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0|1:78397274_G_GGCCC:78397274:1,0,5,0
chr17	78397288	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=29,22;MFRL=207,227;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,3:0,0:0|1:78397274_G_GGCCC:78397274:1,0,5,0
chr17	78397292	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=32,23;MFRL=164,227;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,2:0,0:0|1:78397274_G_GGCCC:78397274:2,0,5,0
chr17	78397299	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=17,33;MFRL=207,235;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,3:1,0:0|1:78397274_G_GGCCC:78397274:2,1,3,0
chr17	78399004	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=207,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr17	78446932	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=300,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,4:3,2:3,0,6,0
chr17	78449211	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=254,191;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr17	78599655	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=181,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:2,4:0,3:0,2,2,6
chr17	78617439	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=210,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,3:4,6:7,2,9,0
chr17	78681590	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,5,1
chr17	78704572	.	G	GTTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=220,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:78704572_G_GTTT:78704572:0,2,0,1
chr17	78704573	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,34;MFRL=220,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:78704572_G_GTTT:78704572:0,2,0,1
chr17	78704575	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=105,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.597:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr17	78704576	.	G	GTGTTTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=213,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:78704572_G_GTTT:78704572:0,3,0,1
chr17	78765219	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=159,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:13,4:18,0:17,15,2,2
chr17	78797066	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=221,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,5:1,2:0,5,0,7
chr17	78820212	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr17	78829424	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=283,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr17	78854316	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=176,266;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,1:11,1:7,12,1,1
chr17	78854376	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:5,0:2,2:0,7,0,3
chr17	78859004	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=268,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr17	78866716	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=238,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:0,4,0,4
chr17	78867733	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=205,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr17	78882806	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=157,240;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:0,5,0,5
chr17	78882825	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr17	78896488	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=182,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,1:3,2:7,2,1,2
chr17	78897547	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=145,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,4:0,1:0,4,0,5
chr17	78897561	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr17	78914245	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=153,234;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,1:6,2:10,2,3,0
chr17	78923178	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.268:12:5,0:4,2:9,0,2,1
chr17	78933809	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.341:10:0,1:5,2:7,0,3,0
chr17	78969386	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=187,248;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,5:1,4:3,0,9,0
chr17	78969590	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=157,253;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.684:10:0,3:2,4:1,2,1,6
chr17	78970779	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=114,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,2:5,6:5,5,6,2
chr17	78970909	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=211,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:1,2,2,3
chr17	78971148	.	GC	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=53.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,14:0.682:20:2,6:4,8:0|1:78971148_GC_G:78971148:3,3,5,9
chr17	78971156	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=124,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,14:0.652:21:2,6:5,6:0|1:78971148_GC_G:78971148:3,4,5,9
chr17	78971182	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=115,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.527:13:0,2:6,4:0|1:78971148_GC_G:78971148:1,5,4,3
chr17	78972326	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,0,13
chr17	78972864	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=155,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,4,2
chr17	79009030	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=166,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,0:6,2:7,3,2,0
chr17	79009153	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=201,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.766:11:1,4:1,3:0,2,1,8
chr17	79031773	.	ACCCCCC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=237,261;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=16,10;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:0,1:0,4,0,1
chr17	79031825	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=225,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr17	79077957	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=341,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:0,1,0,10
chr17	79077980	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=341,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:1,6:0,4:0,1,0,10
chr17	79078610	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=197,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,1,2
chr17	79082362	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=202,284;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:4,4,4,1
chr17	79084643	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=170,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:79084643_C_A:79084643:0,3,1,0
chr17	79084648	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=170,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0|1:79084643_C_A:79084643:0,3,1,0
chr17	79090198	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=136,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,2:5,5:0,6,0,7
chr17	79093142	.	C	CCGCGTGCCCTACCTCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=257,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,1:1,0,4,0
chr17	79093427	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0,4,0,2
chr17	79093947	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=148,247;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:3,2:4,2:2,6,1,3
chr17	79094929	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=195,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.289:12:5,3:3,0:5,4,1,2
chr17	79095104	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=174,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:3,5,2,1
chr17	79096645	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=140,275;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr17	79096992	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	79098838	.	GGCAGGGTGA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=253,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCAGGGTGA;STR;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.681:7:1,4:1,1:0,2,2,3
chr17	79102193	.	TAGG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=239,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGG;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:3,1,3,0
chr17	79102258	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,2:8,0:7,5,1,1
chr17	79105850	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	79108141	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=288,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:0,3:1,6:1,1,5,4
chr17	79108318	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=193,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,3:3,0:2,5,0,3
chr17	79172119	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,1:3,2:4,7,1,2
chr17	79173398	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=275,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr17	79173462	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=257,277;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,1:6,4:2,5,0,5
chr17	79174259	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=190,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:8,2:7,6:4,11,6,2
chr17	79182667	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr17	79193657	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=196,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,3:5,0:5,5,2,1
chr17	79193730	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=200,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,2:2,3:7,3,3,2
chr17	79193771	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:0,5,1,3
chr17	79210707	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=188,244;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.430:16:6,2:3,3:3,6,4,3
chr17	79213305	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=196,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr17	79214722	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=174,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,3:11,1:15,4,4,0
chr17	79219452	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=172,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,2:6,1:9,3,2,1
chr17	79219500	.	AATG	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=182,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATG;STR;TLOD=40.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.573:19:4,6:4,5:3,5,6,5
chr17	79219566	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=209,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:6,1:4,5:6,5,3,3
chr17	79224985	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=236,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:5,2:8,4:0|1:79224985_C_T:79224985:9,4,5,1
chr17	79225000	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=190,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.310:27:7,4:12,4:0|1:79224985_C_T:79224985:13,6,6,2
chr17	79225013	.	TTTTAAAGGGGAGCAAGGGAGATAAAACGGTAATCACAAGCCATGTGACGATGCCGCAGGTG	T	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.211:43:5,4:10,4:17,18,6,2
chr17	79225092	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.294:32:13,3:10,6:11,12,6,3
chr17	79227092	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=137,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:0,5,0,4
chr17	79234241	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=244,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,3:3,1:4,7,1,3
chr17	79244802	.	TG	CG,CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30,36;MFRL=157,200,73;MMQ=60,60,60;MPOS=23,25;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=33.95,3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,11,2:0.603,0.148:17:1,7,0:3,4,2:3,1,5,8
chr17	79244903	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=200,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr17	79246270	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=143,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:3,4:2,1:5,0,3,2
chr17	79249997	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=160,274;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,1:5,1:0,7,0,3
chr17	79255912	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=188,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,2:2,5:3,0,6,1
chr17	79255998	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=136,243;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.249:30:10,4:13,3:12,11,4,3
chr17	79256220	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=166,279;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr17	79257138	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:4,2:5,1:8,1,3,0
chr17	79258787	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0,6,2,3
chr17	79268562	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=261,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr17	79278537	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=174,160;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:2,2,0,2
chr17	79288124	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=200,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:4,3:8,2:11,1,5,0
chr17	79288161	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=197,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:5,0:7,1:9,5,3,0
chr17	79288337	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=207,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.308:20:5,3:9,2:0,14,0,6
chr17	79409434	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=15,29;MFRL=307,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,3:0,0:1,0,3,0
chr17	79410917	.	G	GGGCTTTGTC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=179,36;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr17	79414897	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr17	79414914	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	79419025	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	79422252	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr17	79422289	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=192,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,1:2,8:1,1,8,1
chr17	79425141	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=200,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr17	79425558	.	C	CCTCCCCCGCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=195,242;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTCCCCCGCA;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,0,4
chr17	79426416	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=328,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:0,5:1,6:0,1,6,6
chr17	79426481	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,11:0,0,9,5
chr17	79478875	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=177,290;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:15,0:7,6:18,4,0,6
chr17	79479389	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=168,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,0:9,2:5,9,1,1
chr17	79479469	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:5,3:1,5:1,5,0,8
chr17	79495519	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=122,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:2,0,3,1
chr17	79508263	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=172,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,0:1,2:3,0,3,0
chr17	79508400	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr17	79508484	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr17	79508506	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	79513881	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=173,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.544:11:3,1:2,5:2,3,6,0
chr17	79532654	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=196,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:1,6,0,3
chr17	79534593	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=214,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,1:5,2:2,7,0,3
chr17	79536226	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr17	79539198	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=205,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:0,8,0,3
chr17	79564199	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:12,0,2,0
chr17	79571637	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=227,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,3:2,3:4,4,3,3
chr17	79573860	.	C	CTTAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=215,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTAA;STR;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.498:10:2,3:3,2:0,5,3,2
chr17	79577127	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=182,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,2:2,1:7,0,3,0
chr17	79589359	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=290,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:0,2,0,7
chr17	79589371	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=220,238;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr17	79609550	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=185,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:1,2:2,2:0,3,1,4
chr17	79614932	.	TTAAC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAAC;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.776:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	79618059	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=201,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,6:2,2:2,2,6,3
chr17	79618252	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,225;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:0,5,0,5
chr17	79618834	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=250,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr17	79637257	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,53;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:13,1,2,0
chr17	79648962	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=239,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,1:8,1:5,12,1,1
chr17	79653381	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=157,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,2:10,0:14,9,0,2
chr17	79657673	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:2,3,1,2
chr17	79667672	.	AG	CC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:5,1:4,1:0|1:79667672_AG_CC:79667672:0,9,6,0
chr17	79667678	.	AG	CC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=203,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:5,2:5,4:0|1:79667672_AG_CC:79667672:0,10,6,0
chr17	79667684	.	AG	CC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:7,2:6,4:0|1:79667672_AG_CC:79667672:1,12,6,0
chr17	79667690	.	AG	CC	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:7,1:6,3:0|1:79667672_AG_CC:79667672:2,12,5,0
chr17	79671363	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,14;MFRL=155,87;MMQ=60,54;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.148:19:8,0:7,0:0|1:79671363_A_C:79671363:2,15,2,0
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chr17	79791597	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=192,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:10,6:5,1:11,4,4,3
chr17	79791792	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=185,238;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:5,4:1,8,0,6
chr17	79803433	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:5,1:1,2:5,2,1,2
chr17	79804721	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=114,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.572:7:0,3:2,1:3,0,4,0
chr17	79805003	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=176,262;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:3,4,1,2
chr17	79813517	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=203,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:0,10,0,2
chr17	79817005	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=134,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,2:5,1:11,1,2,1
chr17	79827163	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.262:36:13,5:14,4:10,17,5,4
chr17	79857173	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=153,72;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,0:7,3:7,3,1,2
chr17	79862882	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,12:0,0,8,9
chr17	79867448	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.463:26:7,7:7,5:9,5,6,6
chr17	79872129	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=102,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.931:27:0,11:1,15:0,1,15,11
chr17	79892724	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=207,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,0:2,3:2,2,0,3
chr17	79893962	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=58.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.841:23:0,12:3,8:3,0,12,8
chr17	79894106	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:0,1:3,4,1,2
chr17	79899099	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=155,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,1:8,2:6,6,1,2
chr17	79911164	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=200,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:4,0:7,2:4,7,2,0
chr17	79911241	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=187,199;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr17	79915863	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:0,8,0,4
chr17	79952700	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,5:2,1:4,4,6,0
chr17	79954544	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=185,213;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:2,4:6,4:7,2,5,3
chr17	79977813	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=213,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,5:2,6:0,2,0,11
chr17	79990972	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr17	79994019	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=144,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:11,0:10,5:0|1:79994019_A_G:79994019:15,9,3,2
chr17	79994026	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=144,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:12,0:14,2:0|1:79994019_A_G:79994019:16,10,3,1
chr17	79994180	.	CG	GT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=182,260;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.143:23:3,1:13,0:8,12,0,3
chr17	79994980	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,284;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:4,1:3,2:0,8,0,3
chr17	79995579	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=239,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:79995579_C_CCT:79995579:0,2,0,1
chr17	79995582	.	C	CCAGATGCAGCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=239,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:79995579_C_CCT:79995579:0,2,0,1
chr17	79995616	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	80006504	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr17	80007018	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=206,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.324:23:5,2:9,5:7,9,5,2
chr17	80007055	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=210,282;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:2,10,1,1
chr17	80007080	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=194,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:0|1:80007080_T_C:80007080:0,6,0,2
chr17	80007088	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=208,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0|1:80007080_T_C:80007080:0,3,0,2
chr17	80007887	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=203,119;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,14:0.653:21:3,5:4,9:0|1:80007887_A_G:80007887:1,6,5,9
chr17	80007897	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=207,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,14:0.682:20:3,5:3,8:0|1:80007887_A_G:80007887:1,5,4,10
chr17	80008676	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr17	80011228	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=162,54;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:16,2:10,0:0|1:80011228_G_T:80011228:14,12,1,1
chr17	80011240	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=152,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,2:10,0:0|1:80011228_G_T:80011228:11,12,1,1
chr17	80011242	.	G	GTACTTCCAA	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=152,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,2:10,0:0|1:80011228_G_T:80011228:11,12,1,1
chr17	80011243	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=152,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,2:10,0:0|1:80011228_G_T:80011228:11,12,1,1
chr17	80011975	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=204,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,2:6,1:0,9,1,2
chr17	80012761	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:2,3,1,1
chr17	80012997	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=233,160;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,6:2,0:4,3,5,1
chr17	80014272	.	G	GCC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=220,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=C;STR;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:4,3:2,0:3,4,2,1
chr17	80014861	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=192,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.488:15:3,2:2,5:4,4,4,3
chr17	80014926	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=224,62;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:0|1:80014926_C_T:80014926:9,10,1,1
chr17	80014933	.	CGCCCAGAGAAGGGA	C	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=220,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,0:13,2:0|1:80014926_C_T:80014926:13,12,1,1
chr17	80014948	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=204,62;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:11,2:0|1:80014926_C_T:80014926:10,11,1,1
chr17	80014954	.	GGG	ATT	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=196,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:11,1:0|1:80014926_C_T:80014926:10,10,1,1
chr17	80018714	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=178,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,1:5,2:4,9,0,3
chr17	80022656	.	C	CG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=206,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,4:4,1:11,0,5,0
chr17	80038952	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr17	80039028	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=313,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,6:0,3:0,1,7,2
chr17	80039760	.	CGGGGTGGGGAGTGGCCACTGGGAGAGGGTGGGGTGGGCAGGGCTGCGGGGAGAAGGTG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=359,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.663:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr17	80040607	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,2,6
chr17	80040639	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=212,307;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:2,2,0,3
chr17	80043044	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:4,4:5,0:4,6,2,2
chr17	80043349	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=153,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.617:14:1,1:4,4:2,3,3,6
chr17	80044078	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=191,309;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:1,0:2,0,2,0
chr17	80044531	.	C	CATGCCTTGGTTTTTTGGACAGGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,18;MFRL=168,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr17	80045147	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:0,2,3,4
chr17	80045678	.	T	TGGGGGGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,14;MFRL=130,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,11;RU=G;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.384:6:2,0:1,0:3,1,0,2
chr17	80050554	.	CGG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=G;STR;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr17	80059758	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,8:6,2:6,5,2,8
chr17	80065244	.	C	CGGGAGTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=213,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GGGAGTG;STR;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,1:1,1,2,2
chr17	80091941	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:10,3:10,3:11,9,4,2
chr17	80092171	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	80121307	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=237,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:80121307_C_CA:80121307:0,3,0,1
chr17	80121308	.	T	TCATCTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=237,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:80121307_C_CA:80121307:0,3,0,1
chr17	80136866	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=238,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:10,3,2,0
chr17	80146089	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:2,3:2,3:3,1,6,1
chr17	80151805	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=209,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,3:1,0:3,3,1,2
chr17	80159403	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr17	80159907	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,315;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:80159907_C_CA:80159907:0,0,0,1
chr17	80159910	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,315;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:80159907_C_CA:80159907:0,0,0,1
chr17	80274093	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=173,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:6,2:12,0:0|1:80274093_G_A:80274093:11,7,0,2
chr17	80274094	.	C	CACACACA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=173,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,2:11,0:0|1:80274093_G_A:80274093:11,7,0,2
chr17	80274376	.	GA	TT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=220,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:80274376_GA_TT:80274376:1,3,0,1
chr17	80274381	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=220,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:80274376_GA_TT:80274376:1,3,0,1
chr17	80274384	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=190,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:80274376_GA_TT:80274376:1,2,0,1
chr17	80275253	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=260,126;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,2,1
chr17	80320003	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=198,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:4,0:3,3:4,3,3,0
chr17	80363122	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=8,12;MFRL=126,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:0,0:1,0:0|1:80363122_G_C:80363122:3,1,1,0
chr17	80363140	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,12;MFRL=103,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.352:6:0,0:2,0:2,2,2,0
chr17	80363147	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=103,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.252:6:0,0:4,0:0|1:80363122_G_C:80363122:2,3,1,0
chr17	80363150	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=103,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.248:6:0,0:4,0:0|1:80363122_G_C:80363122:2,3,1,0
chr17	80367353	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:0,6,0,5
chr17	80397484	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr17	80400406	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=174,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:9,0:8,4:10,7,1,3
chr17	80402296	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=242,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,3:7,0:10,1,3,0
chr17	80443385	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=204,79;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:16,3,0,2
chr17	80521135	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=190,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr17	80521248	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=153,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:9,2:5,2:7,7,2,2
chr17	80526139	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=177,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:1,4,0,3
chr17	80540585	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=194,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,6:3,3:3,1,6,3
chr17	80543959	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=190,302;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:15,0:13,10,2,0
chr17	80544855	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr17	80544930	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=200,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:7,3:5,7:11,1,10,1
chr17	80545156	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,1,14
chr17	80574532	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=145,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:5,5:3,5:1,7,4,6
chr17	80583230	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,6:2,3:4,0,8,1
chr17	80585033	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr17	80588733	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=151,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:6,2:5,0:7,4,1,1
chr17	80601769	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=82.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,18,5
chr17	80615643	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=244,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,2,1
chr17	80622290	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=233,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,1:3,2:11,0,3,0
chr17	80622344	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=160,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:11,1,2,0
chr17	80622483	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=179,96;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:5,1:7,3:2,10,1,3
chr17	80676946	.	A	ACCACCCC	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=113,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCACCCC;STR;TLOD=52.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.888:15:1,6:0,6:0,1,0,14
chr17	80676971	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:6,5:1,5:0,7,0,10
chr17	80677005	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr17	80680589	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr17	80684638	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr17	80685126	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr17	80693705	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr17	80696542	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr17	80698542	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	80698587	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=168,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,3,0
chr17	80699093	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=193,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr17	80706719	.	CTTG	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=169,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.725:16:3,6:1,5:2,2,5,7
chr17	80706928	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=197,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,3:3,5:0,4,1,7
chr17	80710097	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=274,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,2:1,3:0,2,2,4
chr17	80726290	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=139,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,1:8,2:10,7,2,1
chr17	80755615	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.313:11:2,3:4,0:5,3,2,1
chr17	80755760	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr17	80788157	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=206,272;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:15,4:13,0:15,13,0,4
chr17	80828057	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=169,266;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:5,2:11,3:9,7,2,3
chr17	80828281	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=220,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,6:3,4:7,2,4,6
chr17	80828303	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=161,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,2:4,0:1,8,1,1
chr17	80847663	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:1,11,0,3
chr17	80858669	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,2:5,1:0,8,0,3
chr17	80867281	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=205,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:5,4:2,3:0,7,1,6
chr17	80869550	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=108,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:5,7:3,5:6,2,10,2
chr17	80869706	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=163,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.340:21:7,2:6,3:6,8,4,3
chr17	80869775	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,5:2,2:0,7,0,7
chr17	80878389	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr17	80878412	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=126,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.534:12:3,4:3,2:3,3,5,1
chr17	80878428	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,11;MFRL=154,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,0:2,0:7,5,2,0
chr17	80887194	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=220,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,4:3,5:3,3,5,4
chr17	80887451	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=240,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr17	80890638	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=207,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,1:6,4:3,8,2,3
chr17	80895253	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:7,4:1,3:3,5,1,6
chr17	80897256	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=181,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:8,3:6,0:12,2,1,2
chr17	80914988	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:4,1,2,0
chr17	80919050	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=157,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:12,2:14,1:9,17,0,3
chr17	80923432	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=215,264;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr17	80962888	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=240,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr17	80993083	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=303,104;MMQ=60,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:80993083_T_C:80993083:0,3,0,1
chr17	80993085	.	CC	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=303,104;MMQ=60,30;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:80993083_T_C:80993083:0,3,0,1
chr17	80993089	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=303,104;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:80993083_T_C:80993083:0,3,0,1
chr17	81006286	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=204,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,5:5,2:8,0,7,0
chr17	81006430	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,1:11,1:8,16,1,1
chr17	81050833	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr17	81051007	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr18	180211	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=207,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,1:0,3:4,0,4,0
chr18	180232	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=14,15;MFRL=209,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,0:0,0:7,1,3,0
chr18	180235	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=19,15;MFRL=179,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:2,0:8,1,2,0
chr18	203081	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=180,211;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,1:5,1:11,2,0,2
chr18	224184	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=188,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,3:3,5:2,3,1,7
chr18	259587	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=145,264;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.465:30:9,0:7,13:15,1,14,0
chr18	260108	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=162,254;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.341:15:5,4:5,1:9,1,4,1
chr18	260109	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=211,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.420:18:7,4:4,3:9,2,6,1
chr18	319935	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=216,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:319935_T_C:319935:3,1,2,0
chr18	319944	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=141,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,3:0.362:9:0,1:6,2:1|0:319935_T_C:319935:5,1,3,0
chr18	335244	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=167,243;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,1:0,2,0,3
chr18	335316	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,36;MFRL=168,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr18	346561	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=180,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:10,0:7,4:5,12,0,5
chr18	357315	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr18	357570	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:1,5:7,1:2,6,0,6
chr18	480875	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=235,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr18	581201	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0|1:581201_T_A:581201:0,0,6,5
chr18	581202	.	GTT	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,7:0|1:581201_T_A:581201:0,0,6,6
chr18	582022	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=143,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:1,1,0,5
chr18	618124	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=89.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,15:0,12:0,0,8,19
chr18	624783	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr18	624824	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,11:0,1:0,0,9,3
chr18	625070	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr18	627629	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	645176	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr18	649851	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=159,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:4,2,2,0
chr18	658306	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=157,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,2:3,0:0|1:658306_G_GC:658306:7,6,1,1
chr18	658310	.	G	GCCGCGGAGCCGCTGGGACGCGGCTTAAC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=157,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,2:3,0:0|1:658306_G_GC:658306:7,6,1,1
chr18	658423	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=200,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr18	659698	.	TGCTGTGGTTTATCAAGGTAAAGAAGTC	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:8,2:13,0:15,12,1,1
chr18	659781	.	C	CTCCATTGCCTGTTTTTGTTG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=146,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.325:7:3,0:2,2:1,4,1,1
chr18	662370	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=179,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:3,4:1,1:1,3,1,5
chr18	672792	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=204,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:8,0,2,0
chr18	672836	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,2:5,3:6,5,3,2
chr18	673016	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,317;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:8,2:3,0:6,6,0,2
chr18	674440	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=177,295;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr18	678847	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=177,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr18	688463	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=240,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr18	691173	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=57,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,3:1,9:1,2,3,9
chr18	693767	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=168,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:5,0,5,0
chr18	693828	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,2:5,4:2,6,3,3
chr18	693977	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=229,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,0,2
chr18	693986	.	GCT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=158,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,0,3
chr18	694206	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=173,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,3:1,4:2,2,3,4
chr18	694284	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=206,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:8,12,2,0
chr18	694316	.	C	CACTCCTTGGGGAGATACAGTTGAGGTTTCCT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=209,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:7,2:15,0:9,14,0,2
chr18	697377	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=138,239;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr18	706589	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=65.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,10,9
chr18	712659	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr18	742858	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=242,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:1,0,7,1
chr18	743226	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr18	743436	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr18	748004	.	CA	TT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,0:8,2:8,7,0,2
chr18	751858	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=14,17;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:0,1:0,2,0,3
chr18	905537	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr18	908229	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,3:3,1:4,5,4,0
chr18	2544356	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=93,230;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr18	2606533	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,0:7,2:1,15,0,2
chr18	2606596	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=222,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr18	2688798	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=95,249;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr18	2698125	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr18	2705700	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,2:0,0,8,3
chr18	2738352	.	T	TAGAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGAC;STR;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,0:1,0,4,1
chr18	2738580	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr18	2750204	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:6,2:0,2:1,5,0,4
chr18	2751475	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,1,12
chr18	2760818	.	AGC	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=272,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.405:3:0,0:1,1:0|1:2760818_AGC_A:2760818:0,2,0,1
chr18	2760822	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=272,81;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:2760818_AGC_A:2760818:0,2,0,1
chr18	2760825	.	C	CTA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=36,35;MFRL=272,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:2760818_AGC_A:2760818:0,2,0,1
chr18	2760827	.	TTTTCTC	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=242,81;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:2760818_AGC_A:2760818:0,3,0,1
chr18	2760837	.	TAG	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=242,81;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:2760818_AGC_A:2760818:0,3,0,1
chr18	2760842	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=242,81;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:2760818_AGC_A:2760818:0,3,0,1
chr18	2771516	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=58.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,12,9
chr18	2771643	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=119,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:4,2:2,2:1,5,0,4
chr18	2775831	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.139:19:7,0:10,2:6,11,2,0
chr18	2777923	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:2,4:4,2:2,4,1,6
chr18	2796603	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=206,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:2796603_A_G:2796603:0,1,0,1
chr18	2796612	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=206,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:2796603_A_G:2796603:0,1,0,1
chr18	2796617	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=206,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:2796603_A_G:2796603:0,1,0,1
chr18	2847710	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=321,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.734:6:0,0:1,0:1,0,5,0
chr18	2847750	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=158,113;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,3:1,0:3,0,3,0
chr18	2884928	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:5,3,0,2
chr18	2884958	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:0|1:2884958_A_C:2884958:11,6,0,2
chr18	2884964	.	A	AGTTTGGTGTGTTTCTCCATAC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:7,2:0|1:2884958_A_C:2884958:11,8,0,2
chr18	2885118	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=159,138;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:3,6,1,1
chr18	2892159	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:9,5:11,0:11,9,5,0
chr18	2892562	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr18	2909831	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,5,9
chr18	2913431	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=192,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr18	2920288	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:9,2:3,2:8,4,3,1
chr18	2928569	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,1:10,1:8,8,2,0
chr18	2934536	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,281;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr18	2982817	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,13:0,0,2,16
chr18	3067385	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.184:36:18,6:12,0:17,13,0,6
chr18	3075503	.	C	CAAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,7,6
chr18	3075746	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,1:7,3:6,8,2,2
chr18	3075778	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:6,1:2,2:3,5,1,2
chr18	3084103	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=140,221;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr18	3084152	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr18	3085085	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:13,0:12,3:17,8,3,0
chr18	3085191	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=239,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,4:1,4:0,3,2,6
chr18	3089522	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=130,220;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,1:1,6:4,0,5,2
chr18	3094376	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,16;MFRL=196,218;MMQ=30,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,0:0,1:0|1:3094376_TG_T:3094376:0,5,0,3
chr18	3094378	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,16;MFRL=196,218;MMQ=30,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:4,1:1,0:0|1:3094376_TG_T:3094376:0,5,0,3
chr18	3100051	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr18	3100429	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,5:6,3:7,4,3,5
chr18	3112231	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:3,4:5,6:6,2,10,0
chr18	3112252	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:9,2:8,3:15,2,4,1
chr18	3116371	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:10,2:14,0:13,11,3,0
chr18	3120060	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=247,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr18	3126632	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr18	3126811	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:10,4:3,5:5,8,5,4
chr18	3129131	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr18	3131593	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=191,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr18	3169072	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3169072_A_T:3169072:0,1,0,1
chr18	3169075	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3169072_A_T:3169072:0,1,0,1
chr18	3169078	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3169072_A_T:3169072:0,1,0,1
chr18	3173816	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=188,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,2:4,7:5,0,9,0
chr18	3173873	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=141,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.647:12:4,4:0,4:2,2,6,2
chr18	3174056	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=189,224;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:5,4:2,1:4,4,2,3
chr18	3174084	.	C	CAT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=184,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,4:4,2:5,3,5,2
chr18	3188664	.	TACAC	T,TAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25,28;MFRL=185,194,296;MMQ=60,60,60;MPOS=10,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=AC;STR;TLOD=3.40,13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,5:0.229,0.463:10:1,0,3:2,2,2:3,0,7,0
chr18	3255700	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,260;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,1:7,3:11,2,3,1
chr18	3272798	.	AG	TA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr18	3272855	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr18	3272874	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr18	3273153	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr18	3277162	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,10,2
chr18	3277237	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,14,8
chr18	3277466	.	TG	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr18	3277691	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr18	3447871	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=74,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:2,2:1,3:1,3,0,5
chr18	3452222	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=169,256;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.868:12:0,8:1,3:1,0,5,6
chr18	3567472	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=206,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:8,1:5,2:11,2,1,2
chr18	3581966	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=130,196;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:21,3:8,1:18,11,1,3
chr18	3582272	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=233,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:1,7,0,3
chr18	3742572	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=220,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr18	3845163	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=168,71;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,5:6,0:4,6,4,1
chr18	3879272	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:6,5,0,2
chr18	5196981	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=189,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,5:2,4:1,4,5,4
chr18	5196992	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=41.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,6,8
chr18	5197170	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=172,318;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr18	5396324	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=133,251;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,2:8,0:7,9,1,1
chr18	5407839	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=133,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,4:2,3:0,4,0,7
chr18	5416160	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=196,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:9,2:3,0:8,4,2,0
chr18	5416327	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=21,18;MFRL=169,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.316:6:0,1:2,0:0|1:5416327_A_C:5416327:2,2,0,2
chr18	5416332	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=16,24;MFRL=169,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.319:6:0,1:0,0:0|1:5416327_A_C:5416327:2,2,0,2
chr18	5416335	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.374:5:1,1:1,0:0|1:5416327_A_C:5416327:1,2,0,2
chr18	5423631	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=241,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:2,4:0,2:0,2,0,6
chr18	5424367	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:12,1:7,3:6,13,2,2
chr18	5433570	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,2:1,3:0,1,3,3
chr18	5890203	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=147,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:11,7:8,0:12,7,6,1
chr18	5891202	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=201,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.703:5:0,2:1,0:1,0,3,1
chr18	5956145	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=175,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr18	5956425	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=235,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:1,3,0,5
chr18	5960165	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=181,107;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:2,5:6,1:0|1:5960165_G_A:5960165:2,6,3,3
chr18	5960183	.	T	TCTTGTGG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=163,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:8,0:0|1:5960165_G_A:5960165:5,9,1,1
chr18	5960184	.	A	ACACCC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=163,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:8,0:0|1:5960165_G_A:5960165:5,9,1,1
chr18	6301921	.	G	GTATGCATTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,82;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:7,0:0|1:6301921_G_GTATGCATTT:6301921:11,4,0,2
chr18	6301924	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=153,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,2:8,0:0|1:6301921_G_GTATGCATTT:6301921:11,4,0,2
chr18	6837446	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=118,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,3:0,6:1,1,5,4
chr18	6873354	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=102,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:1,1,3,0
chr18	6890591	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=105,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:1,5,1,1
chr18	6898415	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=121,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:7,3:10,4:12,5,2,5
chr18	6912004	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr18	6912143	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=66,181;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:1,0,4,6
chr18	6943235	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=189,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:4,8:6,0:5,6,8,0
chr18	6943264	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=134,183;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:14,3:5,3:14,5,4,2
chr18	6947143	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=196,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,3:2,8:1,2,8,3
chr18	6947362	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=213,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr18	6951060	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=207,248;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr18	6980457	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr18	6980487	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=193,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:7,5,2,0
chr18	6980523	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,5:1,6:2,0,4,7
chr18	6982443	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,3,0
chr18	6985468	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=225,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:3,5,4,0
chr18	6985499	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=197,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:2,1:7,3:6,3,5,0
chr18	6985506	.	TG	CA,CG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,31,32;MFRL=0,197,159;MMQ=60,60,60;MPOS=9,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=35.31,17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,6:0.572,0.373:15:0,2,2:0,7,4:0,0,13,2
chr18	6985631	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=163,192;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:1,0:4,4:0|1:6985631_C_T:6985631:2,3,0,4
chr18	6985655	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,0:0,6:0|1:6985631_C_T:6985631:0,0,1,5
chr18	6986050	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,238;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:4,0,4,0
chr18	6995512	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=187,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:7,2:3,2:0,10,0,4
chr18	6999368	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,255;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:7,1,2,0
chr18	6999694	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=206,255;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:2,4,2,3
chr18	6999851	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=126,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:2,7:10,0:7,5,7,0
chr18	7002387	.	GGGAGC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=157,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:7002387_GGGAGC_G:7002387:3,2,1,1
chr18	7002395	.	AC	TT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=157,45;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:7002387_GGGAGC_G:7002387:3,2,1,1
chr18	7011490	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=151,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,2:11,1:6,14,1,2
chr18	7011959	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=115,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:4,1,4,0
chr18	7015714	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=136,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,4,0
chr18	7024345	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=109,296;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:7,2,2,1
chr18	7026187	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=238,266;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:0,4,1,2
chr18	7034448	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=88,254;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:1,4,3,0
chr18	7034464	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=88,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,1:2,3:1,4,2,2
chr18	7035915	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=365,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:0,2:1,3:2,0,5,0
chr18	7049294	.	G	GTTTA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTA;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.356:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr18	7117782	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=228,327;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr18	7774104	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=190,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:7,2,2,2
chr18	7949077	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=199,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:7,0,2,0
chr18	8248041	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=191,279;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:5,6,1,1
chr18	8343333	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr18	8343381	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,4:5,1:6,1,4,1
chr18	8379095	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=322,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,2:1,1:1,0,4,0
chr18	8380473	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:0,4,1,5
chr18	8387058	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0|1:8387058_T_G:8387058:0,0,8,2
chr18	8387065	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0|1:8387058_T_G:8387058:0,0,8,2
chr18	8706808	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=319,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr18	8786117	.	C	CCA,CCCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23,32;MFRL=0,180,212;MMQ=60,60,60;MPOS=12,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.06,6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.375,0.500:5:0,1,2:0,0,1:0,0,0,5
chr18	8798374	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=206,256;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,1:3,4:1,7,0,5
chr18	8821484	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=156,35;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,2:3,0:3,6,1,1
chr18	8821556	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=210,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr18	8828788	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=211,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr18	8829035	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=208,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.324:8:2,1:3,1:1,5,0,2
chr18	8829037	.	T	TCA	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=29,18;MFRL=181,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.253:6:2,0:3,0:0|1:8829037_T_TCA:8829037:0,5,0,1
chr18	8829040	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=179,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,1:0.242:7:3,0:2,1:0|1:8829040_T_C:8829040:0,6,0,1
chr18	8829042	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=25,35;MFRL=181,225;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,0:2,1:0|1:8829040_T_C:8829040:0,5,0,1
chr18	8829043	.	C	CCAA	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=181,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0|1:8829037_T_TCA:8829037:0,5,0,1
chr18	8829045	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=181,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0|1:8829037_T_TCA:8829037:0,5,0,1
chr18	9104283	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,7:4,2:2,10,1,8
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chr18	9124799	.	CTT	C,CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34,34;MFRL=216,218,208;MMQ=60,60,60;MPOS=16,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=7.66,9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,5:0.386,0.465:10:1,4,4:0,0,1:1,0,9,0
chr18	9124936	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=134,201;MMQ=54,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:17,3:11,0:14,14,0,3
chr18	9182329	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=249,273;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9182329_T_TA:9182329:1,0,1,0
chr18	9182332	.	C	CTTCAGGTAGGTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=249,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,0:0|1:9182329_T_TA:9182329:1,0,3,0
chr18	9204535	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=154,107;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,3:1,7,3,1
chr18	9211758	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,172;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:5,3:15,0:5,15,3,0
chr18	9221883	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,1:5,1:8,2,0,2
chr18	9254727	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=143,154;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:5,0:10,5:8,7,0,6
chr18	9256122	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=142,119;MMQ=60,43;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:8,0:14,3:12,10,0,3
chr18	9258531	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=148,251;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:0|1:9258531_C_T:9258531:6,7,0,2
chr18	9258537	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=149,251;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0|1:9258531_C_T:9258531:6,6,0,2
chr18	9275563	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=162,254;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,1:7,1:8,4,1,1
chr18	9279524	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=134,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:4,1:10,2:6,8,3,0
chr18	9280856	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=203,248;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr18	9396597	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=267,254;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr18	9512985	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=277,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:2,4:0,6:2,0,10,0
chr18	9522606	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=287,230;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr18	9524601	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,1:11,1:11,7,1,1
chr18	9584463	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.251:26:12,6:7,0:20,0,6,0
chr18	9614096	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr18	9775372	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,9,8
chr18	9775411	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=209,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:1,5:0,5:0,1,1,9
chr18	9859134	.	A	AAATATT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=172,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:0,4:2,7:2,0,11,0
chr18	9886288	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,2:4,1:3,9,2,1
chr18	9888027	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=153,208;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.217:35:14,6:12,1:14,14,2,5
chr18	9888069	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=146,241;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:6,8:6,5:4,8,4,9
chr18	9954233	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,2:4,0:0,8,0,3
chr18	10455077	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr18	10455133	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr18	10468453	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=224,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:4,7:3,7:5,2,6,8
chr18	10471764	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=174,274;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,1:4,1:0|1:10471764_C_T:10471764:6,4,1,1
chr18	10471773	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=186,274;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,1:0|1:10471764_C_T:10471764:6,4,1,1
chr18	10672782	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=212,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,3:7,1:4,8,3,1
chr18	10677880	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.671:10:0,1:2,4:1,2,0,7
chr18	10680104	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,25;MFRL=288,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr18	10680132	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:10680132_C_T:10680132:0,0,6,0
chr18	10680142	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,1:0,6:0|1:10680132_C_T:10680132:0,0,8,0
chr18	10680163	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr18	10681721	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,0:11,3:11,9,0,3
chr18	10691192	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:7,1,2,1
chr18	10691216	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,1:6,2:8,2,1,2
chr18	11689669	.	C	CGGCCCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,299;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGCCCT;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.689:1:0,0:0,1:0|1:11689669_C_CGGCCCT:11689669:0,0,1,0
chr18	11689682	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,299;MMQ=60,45;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:11689669_C_CGGCCCT:11689669:0,0,1,0
chr18	11689697	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=200,299;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:11689669_C_CGGCCCT:11689669:1,0,1,0
chr18	11689699	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,250;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:11689669_C_CGGCCCT:11689669:0,0,2,0
chr18	11752943	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=227,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr18	11753716	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:3,9,1,1
chr18	11824829	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr18	11824880	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:11824880_T_A:11824880:0,0,8,1
chr18	11824886	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0|1:11824880_T_A:11824880:0,0,8,1
chr18	11852612	.	GTTT	G,GT	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=37,33,34;MFRL=123,159,169;MMQ=60,60,60;MPOS=23,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=T;STR;TLOD=11.18,43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,7,18:0.231,0.704:26:0,1,7:1,6,9:1,0,10,15
chr18	11853053	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,18:0,18:0,0,22,14
chr18	11864707	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr18	11868760	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=165,156;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:11868760_T_C:11868760:0,4,0,1
chr18	11868763	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=165,156;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:11868760_T_C:11868760:0,4,0,1
chr18	11884670	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=224,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,9:0,1:0,1,2,8
chr18	11893391	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=151,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr18	11999038	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=249,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,4:1,1:3,1,3,2
chr18	12014220	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=187,239;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:12,2:4,1:13,3,2,1
chr18	12014383	.	C	CA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:8,8:5,3:3,10,1,11
chr18	12014411	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=61.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,6:0,0,2,15
chr18	12027941	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=430,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr18	12028247	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0|1:12028247_A_G:12028247:0,0,0,9
chr18	12028249	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=253,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0|1:12028247_A_G:12028247:0,4,0,4
chr18	12057195	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:6,2:0,6:4,2,5,3
chr18	12057367	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=186,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:5,2:9,0:0|1:12057367_T_A:12057367:8,8,1,1
chr18	12057368	.	G	GGAGGCT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=186,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:0|1:12057367_T_A:12057367:8,8,1,1
chr18	12057389	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=117,179;MMQ=60,50;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.768:14:0,4:2,7:3,0,5,6
chr18	12057403	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=117,183;MMQ=60,50;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.696:17:0,4:4,8:3,2,5,7
chr18	12057854	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr18	12057904	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=277,324;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr18	12263067	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=240,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr18	12264512	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr18	12308273	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chr18	12308377	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=218,239;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,1,1
chr18	12308608	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=218,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:11,0,2,0
chr18	12308793	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:3,3:8,4:6,5,3,4
chr18	12358997	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=235,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:1,4,0,6
chr18	12359920	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=94,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.501:22:3,7:8,4:8,3,5,6
chr18	12360050	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=127,42;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,0:12,2:5,14,1,1
chr18	12421442	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=151,230;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr18	12512385	.	CAA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=143,303;MMQ=48,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.324:7:3,1:0,1:4,1,2,0
chr18	12512559	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=145,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,1,4
chr18	12512574	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr18	12634934	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0|1:12634934_CA_C:12634934:0,0,1,0
chr18	12634955	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=0,205;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:12634934_CA_C:12634934:2,0,1,0
chr18	12634959	.	TC	AA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,15;MFRL=0,205;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:12634934_CA_C:12634934:3,0,1,0
chr18	12634962	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=0,205;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,0:0|1:12634934_CA_C:12634934:3,0,1,0
chr18	12678370	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=106,255;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:6,5,1,1
chr18	12703067	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=235,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:4,3:2,2:6,1,5,1
chr18	12703192	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:4,3:1,1:0,5,1,4
chr18	12718647	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,5:5,0:1,9,1,4
chr18	12785944	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=164,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,1,1
chr18	12802054	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=138,19;MMQ=52,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,0:11,3:14,8,3,0
chr18	12951738	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=37,29;MFRL=315,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,5:0,5:1,0,9,1
chr18	12982759	.	TG	AA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=221,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,3:3,1:0,7,0,4
chr18	12982760	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=244,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.711:12:1,7:2,2:0,3,0,9
chr18	12985287	.	GCT	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=157,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,2:16,0:0|1:12985287_GCT_G:12985287:13,13,0,2
chr18	12985292	.	T	TGTGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=157,195;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:10,2:14,0:0|1:12985287_GCT_G:12985287:13,13,0,2
chr18	12986802	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=233,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.679:14:2,3:2,5:4,0,9,1
chr18	13001512	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=237,130;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,4:3,4:5,1,2,6
chr18	13001523	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=193,119;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:2,3,1,5
chr18	13008369	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr18	13008701	.	ATT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=197,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:0,0:0,0:0,5,0,2
chr18	13015291	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:6,1,3,0
chr18	13030383	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=197,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,1:4,5:5,0,5,1
chr18	13049948	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=189,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,6:4,1:0,5,0,7
chr18	13056287	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.150:25:9,3:11,0:8,14,3,0
chr18	13056380	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,0:5,2:3,9,0,2
chr18	13069926	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=181,124;MMQ=41,44;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.278:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr18	13072979	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=312,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,6:2,5:0,3,9,2
chr18	13104929	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=164,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:13104929_G_T:13104929:5,4,1,1
chr18	13104935	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=169,80;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:4,0:5,2:0|1:13104929_G_T:13104929:6,4,1,1
chr18	13666768	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=238,286;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr18	13671859	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=125,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:9,2:17,0:12,14,0,2
chr18	13671976	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=18,33;MFRL=178,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:0,1:1,2:0,3,1,2
chr18	13672065	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	13681513	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=208,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr18	13731574	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,1:8,5:6,8,3,3
chr18	13741449	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=312,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr18	13759816	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=162,239;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0|1:13759816_T_C:13759816:1,0,5,0
chr18	13759820	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=162,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0|1:13759816_T_C:13759816:1,0,6,0
chr18	13825727	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=175,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:1,2,3,1
chr18	13826350	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=198,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,1:6,3:6,7,1,3
chr18	13885711	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=209,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,3:0,1:0,3,0,4
chr18	14106195	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=132,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:14106195_A_C:14106195:8,3,1,1
chr18	14106199	.	T	TGTTC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=132,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:14106195_A_C:14106195:7,4,1,1
chr18	14183550	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=33,26;MFRL=227,143;MMQ=36,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,6:5,1:8,1,4,3
chr18	14183632	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=29,27;MFRL=175,228;MMQ=49,37;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:11,2:17,1:20,9,2,1
chr18	14183635	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=8;MBQ=32,24;MFRL=179,175;MMQ=49,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:12,1:18,2:0|1:14183635_C_T:14183635:20,11,3,0
chr18	14183638	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=147,192;MMQ=60,36;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=55.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:4,9:12,9:10,6,13,5
chr18	14183642	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=177,175;MMQ=50,37;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:15,1:19,2:0|1:14183635_C_T:14183635:21,14,3,0
chr18	14183646	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=177,172;MMQ=49,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.122:39:15,2:20,2:21,14,3,1
chr18	14183680	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=176,222;MMQ=42,25;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.139:41:17,3:19,2:18,18,3,2
chr18	14183710	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=27,32;MFRL=180,165;MMQ=40,25;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:8,5:10,1:5,13,1,5
chr18	14183720	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=33,20;MFRL=203,109;MMQ=28,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:4,1:6,4:0,10,1,4
chr18	14183734	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=27,32;MFRL=177,175;MMQ=60,25;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:0,7,0,5
chr18	14183752	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=27,33;MFRL=175,179;MMQ=37,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:8,1:6,2:0|1:14183752_C_T:14183752:1,14,0,3
chr18	14183755	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=175,179;MMQ=37,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:9,1:6,2:0|1:14183752_C_T:14183752:1,14,0,3
chr18	14183814	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=10;MBQ=27,33;MFRL=178,200;MMQ=48,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:7,1:3,2:0|1:14183814_T_C:14183814:4,6,1,2
chr18	14183818	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=31,26;MFRL=175,230;MMQ=47,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:8,2:3,2:0|1:14183814_T_C:14183814:5,6,1,3
chr18	14183840	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=29,29;MFRL=169,262;MMQ=37,38;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:4,1:5,3:4,6,2,2
chr18	14183876	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=33,29;MFRL=208,185;MMQ=47,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:6,0:6,2:0|1:14183876_G_T:14183876:8,5,1,1
chr18	14183885	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=29,28;MFRL=221,185;MMQ=47,25;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:6,2:0|1:14183876_G_T:14183876:9,5,1,1
chr18	14183891	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=10;MBQ=33,28;MFRL=220,185;MMQ=47,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:14183876_G_T:14183876:7,4,1,1
chr18	14183954	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=220,285;MMQ=47,28;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,0:2,4:4,1,1,3
chr18	14183978	.	TG	CA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=176,222;MMQ=47,22;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,0:1,5:4,1,1,4
chr18	14184006	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=211,216;MMQ=40,22;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,1:7,3:4,6,2,2
chr18	14184164	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=163,199;MMQ=27,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,3:4,0:5,8,3,0
chr18	14512069	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=207,175;MMQ=40,32;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr18	14534871	.	A	AAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=161,143;MMQ=25,24;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AC;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:3,3,2,0
chr18	14538010	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=188,138;MMQ=40,43;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,5:0,4:0,2,2,7
chr18	14542569	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=238,133;MMQ=51,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.381:11:3,2:4,2:5,2,1,3
chr18	14542890	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=171,165;MMQ=52,56;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:9,3:3,3:0|1:14542890_G_C:14542890:7,7,3,3
chr18	14542931	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=190,166;MMQ=51,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,7:0.235:32:14,2:11,4:1|0:14542890_G_C:14542890:13,12,3,4
chr18	14542949	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=178,163;MMQ=51,27;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,6:0.195:34:12,3:9,3:1|0:14542890_G_C:14542890:14,14,4,2
chr18	14748712	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,13;MFRL=209,251;MMQ=50,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,0:1,0:0,2,0,2
chr18	14752768	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=183,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr18	14760581	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,2:7,1:5,6,3,0
chr18	14772169	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,76;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:7,10,0,2
chr18	14779853	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=203,246;MMQ=60,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,2:1,1:0|1:14779853_C_A:14779853:6,0,3,0
chr18	14779862	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=33,36;MFRL=200,246;MMQ=60,44;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:6,2:1,0:0|1:14779853_C_A:14779853:7,0,3,0
chr18	14779869	.	AG	GA	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=206,242;MMQ=60,46;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:1,0:0|1:14779853_C_A:14779853:9,0,2,0
chr18	14779880	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=210,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,4:0.356:12:6,3:2,1:1|0:14779853_C_A:14779853:8,0,3,1
chr18	14779890	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=200,242;MMQ=60,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.159:17:8,2:6,0:0|1:14779853_C_A:14779853:13,2,2,0
chr18	14780019	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=166,238;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:7,3:11,2:0|1:14780019_G_T:14780019:7,12,0,5
chr18	14780024	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=27,33;MFRL=164,238;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:7,3:11,2:0|1:14780019_G_T:14780019:7,12,0,5
chr18	14780037	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=32,24;MFRL=173,238;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:10,3:12,2:7,16,0,5
chr18	14780056	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=191,199;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:7,3:9,1:0|1:14780056_A_G:14780056:3,13,0,4
chr18	14780064	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=191,199;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:6,3:7,1:0|1:14780056_A_G:14780056:3,12,0,4
chr18	14780082	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=35,27;MFRL=214,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr18	14796443	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,4:3,2:2,1,2,4
chr18	14848812	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=145,150;MMQ=55,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:6,15:7,0:6,9,15,0
chr18	14848820	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=150,162;MMQ=24,57;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:14,7:5,2:17,3,4,5
chr18	18540200	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=141,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,0:6,6:2,6,0,6
chr18	18567056	.	AGC	TTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=150,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:4,1:1,9,0,2
chr18	18608799	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,0:11,2:9,10,1,1
chr18	18690854	.	A	AT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:18,1:15,1:17,16,2,0
chr18	18983766	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr18	19020160	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr18	19024138	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=160,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:3,1,2,0
chr18	19024150	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=291,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:2,0,5,1
chr18	19034556	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=202,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,1,3
chr18	19065494	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr18	19075808	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=206,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr18	19100717	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=166,310;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:5,7,0,2
chr18	19100758	.	A	ATCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr18	19119801	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=163,150;MMQ=58,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.816:9:1,2:0,5:1,0,7,1
chr18	19119813	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=107,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.493:9:2,1:1,3:3,2,3,1
chr18	19119974	.	GAT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=332,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AT;STR;TLOD=45.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.898:17:0,8:1,8:0,1,1,15
chr18	19154051	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=190,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:5,3,2,0
chr18	19154141	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=169,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.180:20:11,2:6,1:0|1:19154141_G_A:19154141:5,12,1,2
chr18	19154143	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=244,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,18:0.906:19:1,11:0,6:0|1:19154141_G_A:19154141:1,0,4,14
chr18	19192255	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr18	19282515	.	A	ATTTTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.872:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr18	19284677	.	C	CGAGCGGGCGA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=190,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GAGCGGGCGA;STR;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,1:1,4:0,1,0,6
chr18	19408950	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,9,11
chr18	19423963	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr18	19780527	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,4:0,0,6,0
chr18	19780858	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=265,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,0:1,6:0|1:19780858_G_A:19780858:0,1,0,6
chr18	19780863	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=239,249;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:0,0:4,3:0|1:19780858_G_A:19780858:0,4,0,3
chr18	20555219	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr18	20564800	.	TTCA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=137,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCA;STR;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,2:4,5:10,0,7,0
chr18	20564802	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=150,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.299:11:6,0:2,3:8,0,3,0
chr18	20577789	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=178,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr18	20586472	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=183,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr18	20768981	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=298,309;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr18	20817276	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr18	20878105	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,272;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:2,5,0,2
chr18	20950158	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=157,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.387:11:2,2:2,2:2,5,4,0
chr18	20951333	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=138,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.164:20:7,2:10,0:12,5,2,1
chr18	20951338	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=133,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:9,0:0|1:20951338_T_C:20951338:13,5,1,1
chr18	20951343	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=133,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,2:8,0:0|1:20951338_T_C:20951338:11,5,1,1
chr18	21010709	.	G	GGATATAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=227,276;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr18	21017836	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=118,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.863:19:2,4:0,12:1,1,8,9
chr18	21033582	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,0,7
chr18	21044607	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:0,9:1,5:0,1,3,11
chr18	21046255	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,2:5,1:1,9,0,3
chr18	21053363	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=153,115;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,4:7,0:11,3,4,0
chr18	21055092	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr18	21083738	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.873:6:0,4:0,0:0,0,0,6
chr18	21088081	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,7,11
chr18	21095730	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=248,199;MMQ=60,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr18	21095748	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=193,161;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr18	21103971	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=248,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr18	21109250	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:6,1:2,4:3,5,1,5
chr18	21109269	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:3,2:4,4:2,6,0,6
chr18	21113285	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:4,0,2,1
chr18	21119291	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=191,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,3:6,1:10,1,4,0
chr18	21120035	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=240,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr18	21123536	.	TAAAAAAAAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,9;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:2,0:2,3,0,1
chr18	21124907	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=198,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.249:13:2,1:6,1:3,7,2,1
chr18	21124945	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=198,134;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.281:16:5,4:5,0:3,9,2,2
chr18	21125181	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=151,182;MMQ=60,33;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,0:3,5:0|1:21125181_T_C:21125181:1,4,0,5
chr18	21125187	.	T	TCCCAGGCTACACCGCGTAGGAAACTG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,37;MFRL=151,182;MMQ=60,33;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,0:3,5:0|1:21125181_T_C:21125181:1,4,0,5
chr18	21127910	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=106,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:6,1,4,0
chr18	21136635	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=168,57;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:0|1:21136635_G_A:21136635:1,11,0,2
chr18	21136645	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=200,57;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:21136635_G_A:21136635:1,9,0,2
chr18	21152232	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=319,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0,3,1,1
chr18	21209988	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr18	21293869	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=146,229;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:0,2:4,2:4,0,3,1
chr18	21294117	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=233,188;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr18	21328088	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=179,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:0,9,0,2
chr18	21329577	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=191,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,1:1,2:0,7,0,3
chr18	21333720	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:12,1:11,4:10,13,3,2
chr18	21338276	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,6:1,4:1,0,10,0
chr18	21338515	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=40.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0,0,0,13
chr18	21343354	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=175,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,5:2,2:5,3,3,4
chr18	21355912	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,3:6,0:1,7,1,2
chr18	21394384	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,227;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,2:3,1:6,4,3,0
chr18	21395358	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr18	21400005	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=195,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:0,7,1,2
chr18	21400028	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr18	21404334	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.851:11:0,5:1,5:1,0,10,0
chr18	21417026	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=153,302;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:12,1:15,1:13,15,2,0
chr18	21419662	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr18	21419924	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=180,95;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:13,0:12,5:7,18,0,5
chr18	21424991	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,5:4,2:3,8,2,5
chr18	21427556	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,2:9,1:7,11,0,3
chr18	21437721	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,4:2,1:5,1,5,0
chr18	21438632	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=149,234;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,1:8,2:9,8,2,1
chr18	21479181	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=155,106;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr18	21481340	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr18	21481383	.	CTGTA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=190,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr18	21492657	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=195,39;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:9,6,1,1
chr18	21511172	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=133,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.785:21:2,7:2,10:2,2,9,8
chr18	21519213	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:7,3:7,0:9,5,4,0
chr18	21526015	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=163,290;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr18	21526087	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=163,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:9,3:6,3:11,4,6,0
chr18	21529722	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:0,0:6,3:5,1,2,1
chr18	21644075	.	TTG	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=179,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.197:27:12,3:8,2:14,8,3,2
chr18	21662816	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr18	21663141	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr18	21694618	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr18	21723007	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=212,202;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:21723007_C_A:21723007:4,0,1,0
chr18	21723008	.	C	CATT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=21,13;MFRL=212,202;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:21723007_C_A:21723007:4,0,1,0
chr18	21723009	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,15;MFRL=193,239;MMQ=60,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.287:5:2,0:2,0:1|0:21723007_C_A:21723007:4,0,1,0
chr18	21723010	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=212,202;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:21723007_C_A:21723007:4,0,1,0
chr18	21723016	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,15;MFRL=176,239;MMQ=60,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.283:5:1,0:2,0:1|0:21723007_C_A:21723007:4,0,1,0
chr18	21739334	.	TAC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=189,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr18	22008913	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,9:0,11:0,0,7,13
chr18	22010421	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=118,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr18	22017890	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=171,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.340:13:3,2:5,2:4,5,3,1
chr18	22671999	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=165,72;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,3:6,0:4,9,1,2
chr18	22775092	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=106,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:7,0,2,0
chr18	22804244	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=156,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:9,1,2,0
chr18	23615874	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:12,0:8,3:7,13,1,2
chr18	23670628	.	G	GCCTCCCAAAGTGCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	23855113	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=300,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr18	23866482	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr18	23895352	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,231;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr18	23901198	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=200,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:0,2,0,4
chr18	24035650	.	TTTTG	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTG;STR;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:6,1:7,3:15,1,4,0
chr18	24035675	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:11,3:11,1:19,3,4,0
chr18	24035788	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.224:38:15,3:15,5:12,18,3,5
chr18	24039489	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr18	24056487	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=163,164;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:5,3,2,0
chr18	24496822	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=177,161;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,3:8,0:9,8,3,0
chr18	24497190	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:9,1:9,4:8,10,3,2
chr18	24628487	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:10,3:3,0:9,4,1,2
chr18	25565221	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=238,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,3:6,0:0,9,0,3
chr18	25569981	.	CAAAT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=226,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,1:0,3:6,0,4,0
chr18	25572837	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr18	25573622	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr18	25585717	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=196,228;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,5:1,0:2,0,5,0
chr18	25585996	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=159,158;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.324:19:5,0:8,5:0,13,0,6
chr18	25593694	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=216,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:5,3:8,6:12,1,6,3
chr18	25593713	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=216,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:9,0,5,2
chr18	28598866	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr18	28605715	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=228,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,4:5,7:4,3,7,4
chr18	28610877	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=208,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,2:7,3:11,0,3,2
chr18	28610887	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=196,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,1:8,5:11,2,5,1
chr18	28610901	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.686:17:1,1:4,10:5,0,8,4
chr18	28622524	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:10,3:3,2:3,10,0,5
chr18	28622595	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=186,278;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:8,3:3,1:4,7,0,4
chr18	28651496	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=170,3313;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,4:3,0:6,1,0,4
chr18	28659724	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr18	28662793	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:10,0,2,0
chr18	28666526	.	T	TTAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=94.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,10:0,0,16,6
chr18	28711519	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=126,170;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr18	28712660	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:4,10,1,1
chr18	28712686	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=205,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr18	28712737	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=197,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr18	28713843	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=181,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,3:4,0:10,2,3,0
chr18	28719674	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=131,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,4:1,5:0,1,7,2
chr18	28721882	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=184,260;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr18	28721913	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.407:8:1,2:3,1:0|1:28721913_C_T:28721913:5,0,1,2
chr18	28721922	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=163,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:28721913_C_T:28721913:2,0,1,3
chr18	28723596	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr18	28723832	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=198,298;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:28723832_G_A:28723832:0,3,0,2
chr18	28723835	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=198,298;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,0:0|1:28723832_G_A:28723832:0,3,0,2
chr18	28728384	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=197,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:1,3:1,0,8,0
chr18	28728411	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=173,242;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,2:5,1:8,0,3,0
chr18	28728693	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:0,1:5,2:0,5,0,4
chr18	28737299	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=139,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:1,3:6,4:5,2,5,2
chr18	28739495	.	C	CA,CAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,19,20;MFRL=160,166,223;MMQ=60,60,60;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=A;STR;TLOD=4.05,13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,8:0.213,0.472:16:3,0,2:2,1,2:1,4,0,11
chr18	28898201	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr18	28906460	.	TG	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,2:1,5:5,0,7,0
chr18	28908090	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr18	28913929	.	TTC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=181,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TC;STR;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr18	28916230	.	G	GAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr18	28916290	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=237,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,5:0,2:1,0,6,1
chr18	28916649	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=167,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr18	28919658	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=203,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr18	28919884	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=188,124;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,1:4,6:5,4,4,3
chr18	28919911	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=220,144;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:5,3:3,4:0|1:28919911_A_G:28919911:5,3,3,4
chr18	28919913	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=220,144;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:0|1:28919911_A_G:28919911:5,3,3,4
chr18	28923983	.	AT	CA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,36;MFRL=109,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.703:18:4,6:1,7:2,3,4,9
chr18	28923984	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.942:18:0,10:0,8:0,0,6,12
chr18	28935375	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr18	28968371	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=120,165;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:9,7:2,4:5,6,4,7
chr18	28969008	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:1,9:2,3:0,3,2,10
chr18	28983565	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:4,4,1,4
chr18	29027757	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:3,2,1,1
chr18	29036316	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=154,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:6,3:3,0:8,1,3,0
chr18	29038577	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=140,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:4,5,1,1
chr18	29041410	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=188,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:3,4:6,0:1,8,2,2
chr18	29045257	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:9,3:5,3:8,6,4,2
chr18	29046398	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=227,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr18	29046606	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:14,3:5,1:9,10,1,3
chr18	29049018	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=201,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:10,3:5,4:12,3,5,2
chr18	29098323	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=163,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:0,2:0,3,0,4
chr18	29098345	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=169,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr18	29101230	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=145,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.569:8:1,1:2,3:1,2,2,3
chr18	29104564	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=195,228;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:5,1,2,0
chr18	29104878	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,3:2,2:1,8,0,5
chr18	29110865	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=183,243;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr18	29110878	.	CATGTAT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ATGTAT;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr18	29116462	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr18	29122799	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,210;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,2:5,1:3,11,0,3
chr18	29125936	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=188,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:11,3:5,3:7,9,4,2
chr18	29126670	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=121,224;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,5:4,2:2,4,5,2
chr18	29178513	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:3,2:11,2:6,8,3,1
chr18	29207155	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr18	29211163	.	C	CTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=19,17;MFRL=194,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.706:5:0,0:0,1:0,1,0,4
chr18	29237860	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=144,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:6,0:1,2:7,0,2,0
chr18	29238076	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=16,18;MFRL=157,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.600:5:0,1:0,0:0,2,0,3
chr18	29264182	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr18	29264355	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=178,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:7,3:2,3:5,4,3,3
chr18	29340343	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=209,132;MMQ=39,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:2,2:9,2:4,7,1,3
chr18	29419462	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=191,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr18	29426868	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr18	29432367	.	AC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=125,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:8,1:6,2:6,8,3,0
chr18	29435778	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:5,7:2,3:4,4,0,10
chr18	29447468	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=149,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,1:9,2:5,9,2,1
chr18	29447515	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=216,133;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,0:4,7:0,7,0,7
chr18	29477840	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:8,3:12,0:9,11,0,3
chr18	29480820	.	GAAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=207,253;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:0,1:4,0,1,0
chr18	29487596	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=140,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:1,5,1,6
chr18	29488407	.	GACAA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,300;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACAA;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr18	29489049	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=17,14;MFRL=252,249;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr18	29496187	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr18	29496218	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=115,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,1:5,4:8,4,3,2
chr18	29511218	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=207,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr18	29598809	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=201,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,3:1,2:6,0,5,0
chr18	29599084	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=192,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.357:9:4,0:2,3:1,5,0,3
chr18	29617255	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,6,6
chr18	29617327	.	CTTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=166,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=25,13;RU=T;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.510:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr18	29704652	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:3,1,7,0
chr18	29708981	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr18	29784370	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,224;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:1,6,0,2
chr18	29788061	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=125,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:9,0:0|1:29788061_A_T:29788061:10,5,0,2
chr18	29788069	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=119,55;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:0|1:29788061_A_T:29788061:8,6,0,2
chr18	29788107	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,3:5,5:3,6,0,8
chr18	29790376	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=176,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,1:4,1:13,0,2,0
chr18	29790378	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=176,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.355:15:7,2:2,3:10,0,5,0
chr18	29793526	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:3,1:3,3,0,2
chr18	29795076	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,6:4,0:4,3,4,2
chr18	29795101	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=118,115;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,5:3,0:3,4,3,2
chr18	29797921	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=89,216;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:2,2,0,5
chr18	29797958	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=253,319;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr18	29800119	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr18	29848028	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=162,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,1:11,1:4,13,1,1
chr18	29848436	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=181,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:4,2:9,3:5,8,2,3
chr18	29850086	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=206,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:6,2:9,0,3,0
chr18	29867091	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=217,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,2:7,2:5,6,1,3
chr18	29867504	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:5,7,0,2
chr18	29972774	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=263,280;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr18	30257367	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=217,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:2,4:0,1:0,2,0,5
chr18	30275526	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,26;MFRL=195,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:0,1:0,3,1,1
chr18	30517962	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=156,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:11,2:4,1:7,9,3,0
chr18	30517984	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=170,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:14,2:6,0:0|1:30517984_G_A:30517984:10,10,1,1
chr18	30517994	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=170,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:15,2:7,0:0|1:30517984_G_A:30517984:11,11,1,1
chr18	30672631	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,6,0
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chr18	30950168	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,10:0,2:0,0,2,10
chr18	30977255	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr18	31187706	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=215,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr18	31241497	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr18	31250673	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=200,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:9,2:5,1:8,7,3,0
chr18	31263320	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=130,241;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr18	31323848	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:5,4,1,3
chr18	31463174	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=142,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr18	31599259	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=170,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,3:5,3:8,2,5,1
chr18	31599300	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:6,2:13,1:10,10,2,1
chr18	31684975	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=133,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,2:6,4:9,2,5,1
chr18	32335915	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:4,6,0,2
chr18	32386326	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=179,126;MMQ=60,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:8,0:2,3:0,10,0,3
chr18	32386340	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,2:2,2:0,8,0,4
chr18	32392090	.	T	TCAAAGAC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=176,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.261:9:4,2:3,0:3,4,1,1
chr18	32400909	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=195,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,4:6,1:1,8,1,4
chr18	32408900	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=251,298;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr18	32418186	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr18	32418634	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=263,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr18	32444040	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=339,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr18	32455379	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:3,3:4,2:4,4,1,4
chr18	32459704	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:1,2:6,3:4,4,4,1
chr18	32650341	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr18	32720189	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=174,241;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr18	32822352	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=190,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr18	32822382	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,15,2
chr18	32823245	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,0:11,3:12,10,0,4
chr18	32826088	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:2,5:2,8:2,2,10,3
chr18	32844056	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=212,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.352:18:5,2:6,4:8,4,3,3
chr18	32886528	.	T	TAGTC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,3:0,0,5,2
chr18	32888086	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.392:21:4,8:9,0:7,6,8,0
chr18	32888380	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=192,125;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.527:15:2,3:3,2:3,4,4,4
chr18	32888401	.	A	AAG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=79.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,10,17
chr18	32917176	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,251;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:3,0:9,2:12,0,2,0
chr18	32948446	.	T	TTTTA,TTTTATTTATTTA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32,32;MFRL=0,177,174;MMQ=60,40,46;MPOS=18,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,9,11;RU=TTTA;STR;TLOD=7.23,9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.400,0.495:5:0,1,1:0,1,1:0,0,0,5
chr18	32948510	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr18	33048554	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:7,4:11,2:9,9,5,1
chr18	33058318	.	GA	G,GAAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33,25;MFRL=131,126,152;MMQ=60,60,60;MPOS=25,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,18;RU=A;STR;TLOD=3.20,3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,3:0.229,0.222:15:2,2,1:3,1,0:4,4,1,6
chr18	33077660	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.598:30:4,11:7,7:7,5,17,1
chr18	33611062	.	TAAA	T,TAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=10,29,17;MFRL=127,97,252;MMQ=60,60,60;MPOS=22,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.30,5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,3:0.221,0.344:10:0,1,0:0,1,1:0,5,0,5
chr18	33706235	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,1:4,1:11,1,2,0
chr18	33706614	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,17:0,18:0,0,17,18
chr18	33713333	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,73;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:3,0:5,2:0,8,0,2
chr18	33718201	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,6:1,2:2,0,7,1
chr18	33722425	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr18	33722864	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,82;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:8,0:10,6:7,12,1,5
chr18	33725874	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=153,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,2:3,1:7,4,2,1
chr18	33738917	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.232:19:6,0:9,4:4,11,2,2
chr18	33744677	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=183,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr18	33751017	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:21,2:3,0:0|1:33751017_G_A:33751017:10,14,1,1
chr18	33751023	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=126,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:21,1:3,0:0|1:33751017_G_A:33751017:10,14,1,1
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chr18	33783030	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=154,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.251:17:3,0:9,3:9,4,3,1
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chr18	33785304	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr18	33793511	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
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chr18	33795565	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:9,4,2,0
chr18	33799930	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=123,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:0,0:6,2:6,0,2,0
chr18	33828980	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=136,229;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.420:22:7,4:5,5:5,8,1,8
chr18	33848663	.	A	ATACAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=115,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,2:3,4:0,5,0,6
chr18	34081849	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=204,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:5,3:4,10:4,5,8,5
chr18	34174958	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr18	34182800	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,1:12,1:0,17,0,2
chr18	34205385	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr18	34261473	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=132,193;MMQ=60,20;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,6:0.109:62:24,0:31,6:0|1:34261473_G_A:34261473:36,20,0,6
chr18	34261475	.	C	A	.	.	DP=62;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=132,193;MMQ=60,20;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,6:0.109:62:21,0:32,6:0|1:34261473_G_A:34261473:36,20,0,6
chr18	34261559	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=197,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=92.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,27:0.934:28:1,13:0,13:0|1:34261559_T_A:34261559:0,1,5,22
chr18	34261581	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=197,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=75.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,19:0.909:20:1,7:0,10:0|1:34261559_T_A:34261559:0,1,1,18
chr18	34273440	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=200,206;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr18	34297753	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:7,1,5,0
chr18	34298476	.	TAC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=117,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:8,2:0|1:34298476_TAC_T:34298476:7,7,1,1
chr18	34298485	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=109,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:7,2:0|1:34298476_TAC_T:34298476:6,8,1,1
chr18	34310668	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=110,148;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,4:2,8:4,2,8,4
chr18	34320586	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=177,113;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.464:24:3,11:9,0:10,3,0,11
chr18	34335360	.	CTTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,370;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=28,16;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr18	34380148	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=131,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,2:3,2:5,4,3,1
chr18	34465499	.	GTT	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=129,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,1:9,1:16,1,2,0
chr18	34465512	.	T	A,TA	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=25,28,25;MFRL=120,129,183;MMQ=60,60,60;MPOS=23,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.83,8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,5:0.265,0.289:21:5,2,1:6,2,4:9,2,10,0
chr18	34465686	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=163,40;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.289:8:1,1:4,1:0|1:34465686_C_CT:34465686:0,6,0,2
chr18	34465700	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=163,40;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:1,1:5,0:0|1:34465686_C_CT:34465686:0,6,0,2
chr18	34852895	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr18	35145660	.	T	TCTCG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CTCG;STR;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr18	39595382	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=225,244;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:6,1,2,0
chr18	40323764	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=203,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr18	40503734	.	G	GTA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=228,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:2,1:8,0:2,14,0,2
chr18	40503735	.	GAAA	G,GAA,AAAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,34,34,23;MFRL=171,283,258,155;MMQ=60,60,60,60;MPOS=11,21,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=6.69,7.80,3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,3,5,2:0.228,0.326,0.137:14:1,0,2,2:1,3,2,0:0,4,1,9
chr18	40853759	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:10,4:11,0:8,13,4,0
chr18	42456653	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.395:31:8,7:10,5:4,15,3,9
chr18	42456670	.	C	CTCTT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:4,6:9,5:3,10,6,6
chr18	42529996	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:0,2:11,1:4,7,1,2
chr18	42533130	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,7,15
chr18	43221341	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,4,11
chr18	43224110	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:2,7,2,0
chr18	43243679	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,10,5
chr18	43247001	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,6,7
chr18	43247784	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=108,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.853:18:2,10:0,6:1,1,10,6
chr18	43248212	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,0:0,7:0,0,7,0
chr18	43248504	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0|1:43248504_T_C:43248504:0,0,1,8
chr18	43248509	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0|1:43248504_T_C:43248504:0,0,1,7
chr18	43252786	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr18	43252819	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=128,100;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:10,0,2,0
chr18	43253100	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=242,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr18	43258919	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31,31;MFRL=185,171,305;MMQ=58,60,60;MPOS=12,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=T;STR;TLOD=3.59,3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.335,0.334:3:1,0,0:0,1,1:1,0,2,0
chr18	43258936	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=138,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:0,0:3,1:3,1,2,0
chr18	43262187	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=184,250;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr18	43262501	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,3:5,3:3,7,2,4
chr18	43262532	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=191,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:0,7,0,7
chr18	43307455	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr18	43310187	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=184,277;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:5,0,1,1
chr18	43314401	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,4:0,3:0,0,3,8
chr18	43319060	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,2:1,4:4,2,5,1
chr18	43319274	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=194,243;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.293:22:8,2:7,4:5,11,3,3
chr18	43319359	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr18	43328295	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:9,2:2,3:6,5,3,2
chr18	43405792	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:0,6,1,4
chr18	43432625	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=161,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:2,2:2,6,1,1
chr18	43450595	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:12,1:5,3:10,7,4,0
chr18	43450753	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=255,318;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:2,2:3,1:0,5,0,4
chr18	43458455	.	T	TCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=174,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:43458455_T_TCA:43458455:0,3,0,1
chr18	43458457	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=174,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:43458455_T_TCA:43458455:0,3,0,1
chr18	43458462	.	AT	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=174,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:43458455_T_TCA:43458455:0,3,0,1
chr18	43459947	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=197,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,5:5,0:13,0,5,0
chr18	43487885	.	TAA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=116,293;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.510:6:1,2:1,1:2,1,3,0
chr18	43495578	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,0:7,4:5,8,0,4
chr18	43497710	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:5,4:1,10:4,2,5,9
chr18	43519615	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,6:0.206:32:16,0:10,6:0|1:43519615_A_T:43519615:13,13,0,6
chr18	43519620	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.218:30:14,0:9,6:0|1:43519615_A_T:43519615:11,13,0,6
chr18	43523240	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=141,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:2,9,1,1
chr18	43523886	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr18	43534944	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,279;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.185:19:11,2:5,1:10,6,1,2
chr18	43547127	.	TG	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=75.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,10:0,13:0,0,13,14
chr18	43572126	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=160,44;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:0|1:43572126_G_T:43572126:7,13,1,1
chr18	43572132	.	TG	AA	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=180,44;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:7,2:0|1:43572126_G_T:43572126:5,15,1,1
chr18	43572137	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=171,44;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,0:6,2:0|1:43572126_G_T:43572126:5,14,1,1
chr18	43572143	.	AAA	CCC	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=149,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:11,0:5,2:0|1:43572126_G_T:43572126:5,12,1,1
chr18	43595850	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.220:25:5,1:12,3:13,7,2,3
chr18	43665982	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=176,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr18	43666280	.	TAGTTAATATATTAATACCTTAAGA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=156,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:4,1:5,2:6,8,2,1
chr18	43666952	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=126,289;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,1:10,1:7,11,2,0
chr18	43667528	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,223;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,1,1
chr18	43669980	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=208,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:1,4:12,2:3,10,0,6
chr18	43678024	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=193,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr18	43678035	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=193,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr18	43698309	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=174,255;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr18	43703223	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:10,2:3,2:6,7,3,1
chr18	43705598	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=178,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,0:2,3:7,0,3,0
chr18	43833701	.	T	TCTG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTG;STR;TLOD=67.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,6:0,9:0,0,13,3
chr18	44063598	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=137,157;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,6:3,4:2,3,6,4
chr18	44063718	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=182,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr18	44064946	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=149,249;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0,2,2,0
chr18	44109115	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,2:8,1:9,4,2,1
chr18	44114473	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr18	44124967	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=178,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr18	44135027	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=177,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr18	44135050	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:2,0,4,0
chr18	44149348	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=207,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,4:6,0:8,0,4,0
chr18	44174499	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:5,1:2,1:2,6,0,2
chr18	44262083	.	GGA	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:44262083_GGA_G:44262083:0,2,0,1
chr18	44262086	.	G	GTTTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:44262083_GGA_G:44262083:0,2,0,1
chr18	44262090	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=237,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:44262083_GGA_G:44262083:0,1,0,1
chr18	44262097	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=17,32;MFRL=222,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:0,0:0,1:0|1:44262083_GGA_G:44262083:0,2,0,1
chr18	44262099	.	G	GTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=222,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:1,0:1,1:0|1:44262083_GGA_G:44262083:0,2,0,1
chr18	44272034	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=248,264;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,7,0
chr18	44424105	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.811:8:0,1:0,0:0,1,0,7
chr18	44424651	.	CT	C,CTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27,33;MFRL=81,183,98;MMQ=60,60,60;MPOS=14,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.30,3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.511,0.299:7:0,1,1:1,2,1:1,0,4,2
chr18	44426877	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=164,295;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr18	44444219	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.203:13:3,0:5,0:0|1:44444219_G_T:44444219:3,8,0,2
chr18	44444231	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:2,2:4,0:0|1:44444219_G_T:44444219:1,8,0,2
chr18	44549025	.	T	TGC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=220,207;MMQ=25,25;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GC;STR;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,1:2,0,3,0
chr18	44549523	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=197,222;MMQ=25,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,0:10,2:0,14,0,2
chr18	44580919	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=188,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr18	44595809	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:2,1:2,2:1,3,3,1
chr18	44601611	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,5:7,3:11,1,5,3
chr18	44603846	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:6,0:5,6:5,6,0,6
chr18	44635048	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,13:0,6:0,0,13,6
chr18	44656709	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=188,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr18	44662852	.	GTT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=120,380;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr18	44702502	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=172,282;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:4,0,1,1
chr18	45394653	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:0|1:45394653_G_A:45394653:11,1,2,0
chr18	45394662	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:9,2:3,0:0|1:45394653_G_A:45394653:11,1,2,0
chr18	45395845	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.409:10:2,3:4,1:0,6,0,4
chr18	45396948	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=173,88;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:7,1:10,5:5,12,0,6
chr18	46284587	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,22:0,11:0,0,13,20
chr18	46284611	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=142,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:12,4:10,0:8,14,0,4
chr18	46284840	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=231,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.493:6:1,2:2,1:1,2,0,3
chr18	46343818	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=211,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,1:0,6:0,1,0,7
chr18	46385948	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=153,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:3,3:6,2:3,6,3,3
chr18	46468946	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=171,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,3:6,6:3,7,2,7
chr18	46570662	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=256,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:2,2:1,1:0,3,0,4
chr18	47014953	.	G	GTGT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGT;STR;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.247:22:10,4:7,1:8,9,1,4
chr18	47088655	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,8:1,5:1,0,9,4
chr18	47088826	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=12,28;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,5:0,0:0|1:47088826_C_T:47088826:1,0,0,5
chr18	47088830	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.754:6:1,5:0,0:0|1:47088826_C_T:47088826:1,0,0,5
chr18	47091827	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=155,144;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.209:41:15,0:18,8:15,18,0,8
chr18	47093790	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr18	47096016	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr18	47102002	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr18	47102037	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=393,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr18	47109955	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=196,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:8,1:4,4:6,6,5,0
chr18	47313642	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.506:15:3,3:4,2:2,5,5,3
chr18	47317767	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=224,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,4:0,1:3,0,5,0
chr18	47320560	.	G	GTAAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=185,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr18	47352999	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=118,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.291:15:6,2:5,2:4,7,2,2
chr18	47363009	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,5:1,2:5,0,6,1
chr18	47373466	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,5,1
chr18	47375932	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,211;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:8,2:7,9:11,4,4,7
chr18	47376103	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=203,254;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr18	47376128	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=181,247;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:2,2:0,4:0,2,1,5
chr18	47402280	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=113,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,0,5
chr18	47405425	.	T	TGAG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:7,4:10,2:7,10,4,3
chr18	47406913	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr18	47432975	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=123,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:5,4:3,2:5,3,3,4
chr18	47455923	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=105,170;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:5,5:2,6:3,4,6,5
chr18	47462804	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=180,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr18	47463587	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,5,5
chr18	47480631	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr18	47480660	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=195,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.784:15:0,4:2,8:2,1,8,4
chr18	47480898	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=251,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr18	47488625	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=209,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,1:6,2:8,2,3,0
chr18	47511113	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=139,118;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.270:20:3,2:12,3:11,4,2,3
chr18	47511133	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=159,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:5,2:16,2:10,12,4,0
chr18	47581681	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=191,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:9,0:3,2:0|1:47581681_T_C:47581681:6,6,1,1
chr18	47581684	.	T	TTTCCTCTTCAGTAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=191,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:9,0:3,2:0|1:47581681_T_C:47581681:6,6,1,1
chr18	47765121	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=176,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr18	47769551	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=174,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr18	47777244	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:8,5:5,6:5,8,3,8
chr18	47778172	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=293,266;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr18	47787402	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,13,1
chr18	47787620	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=21,16;MFRL=166,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.365:12:2,0:2,0:0|1:47787620_G_C:47787620:3,5,0,4
chr18	47787622	.	CAA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=183,242;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.791:7:0,2:1,3:0|1:47787620_G_C:47787620:0,1,0,6
chr18	47802971	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=223,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.861:12:0,5:1,6:0,1,4,7
chr18	47809800	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=204,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,1:11,1:10,7,2,0
chr18	47809825	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=232,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,2:5,0:5,7,3,0
chr18	47809835	.	T	TGGGGGGGGGC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=228,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:3,10,2,0
chr18	47809871	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=116,151;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:6,9:3,4:4,5,3,10
chr18	47810251	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.451:27:9,5:5,7:5,10,10,2
chr18	47810731	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr18	47811305	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=186,242;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,0:6,3:6,4,3,0
chr18	47902337	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:0,6,0,4
chr18	47906719	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,277;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr18	47917735	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=176,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr18	47918639	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,35;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,0:3,5:4,5,1,4
chr18	47918702	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=197,230;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:4,0:4,1:0|1:47918702_C_A:47918702:0,9,0,2
chr18	47918717	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=193,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.287:11:2,0:5,1:0|1:47918702_C_A:47918702:0,8,0,3
chr18	48190271	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=225,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,3:0,6:0,1,9,0
chr18	48190440	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=309,189;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,2:1,6:1,0,3,5
chr18	48190785	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=193,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:7,2:0,0:5,2,0,2
chr18	48190817	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=260,163;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.620:16:4,8:1,2:3,3,6,4
chr18	48241538	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=188,456;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,3:6,0:6,7,0,3
chr18	48326378	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,7:1,4:0,1,7,4
chr18	48335789	.	A	ACG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=133,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:0|1:48335789_A_ACG:48335789:4,5,1,1
chr18	48335790	.	A	AGGCC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=133,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:48335789_A_ACG:48335789:4,5,1,1
chr18	48346226	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:5,5:5,0:7,3,3,2
chr18	48446953	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=220,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,24:0.807:29:3,17:2,7:4,1,8,16
chr18	48584855	.	AT	A,ATTT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=17,24,16;MFRL=188,112,208;MMQ=60,60,60;MPOS=18,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,18;RU=T;STR;TLOD=7.56,5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,6,3:0.381,0.240:14:1,1,0:1,3,0:0,5,2,7
chr18	48723135	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=206,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:48723135_C_T:48723135:2,2,0,1
chr18	48723140	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=206,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:48723135_C_T:48723135:2,2,0,1
chr18	48723142	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=206,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0|1:48723135_C_T:48723135:2,2,0,1
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chr18	51731308	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=202,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:7,1,3,0
chr18	51795847	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,3:5,4:6,0,7,0
chr18	51795957	.	GCGA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=213,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CGA;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,1:3,1:6,4,0,2
chr18	51880587	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=159,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr18	51880841	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:4,7:1,4:3,2,9,2
chr18	51880986	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:5,6:4,7:3,6,2,11
chr18	51889056	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=223,256;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr18	51900472	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,9,0
chr18	51904461	.	C	CTTTA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTA;STR;TLOD=56.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,7:0,3:0,0,13,1
chr18	51904498	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=176,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.605:26:8,8:2,7:8,2,11,5
chr18	51904641	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:3,2:8,4:0|1:51904641_A_G:51904641:1,10,1,6
chr18	51904643	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=182,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:4,0:8,3:1,13,0,3
chr18	51904644	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=177,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.388:16:3,1:7,4:0|1:51904641_A_G:51904641:0,10,1,5
chr18	52551716	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr18	52555398	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr18	52571741	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr18	52575002	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,6,7
chr18	52585071	.	GACACACACAC	G,GAC,GACACACACACAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30,32,33;MFRL=290,117,193,192;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,28,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,10,11,16;RU=AC;STR;TLOD=7.65,8.23,5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,3,3,2:0.313,0.311,0.286:9:0,1,1,1:1,1,2,1:1,0,7,1
chr18	52608329	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr18	52927275	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,35;MFRL=174,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:2,1:4,2:1,9,0,3
chr18	52942827	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=185,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,2:2,1:5,1,3,0
chr18	53302845	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr18	54283362	.	CAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=210,279;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr18	54339818	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,8,9
chr18	54339977	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr18	54346482	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr18	54346510	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr18	54346745	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=189,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:1,3:2,3:0,4,0,6
chr18	54348514	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,13:0,0,12,7
chr18	54348650	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:0,10:0,7:0,1,8,9
chr18	54354074	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,7:0,6:0|1:54354074_C_T:54354074:0,0,13,2
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chr18	54694151	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=293,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,1:2,4:3,0,6,0
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chr18	55143589	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr18	55218139	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=189,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:0,11,0,2
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chr18	55283236	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,2,6
chr18	55283306	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=205,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr18	55287739	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr18	55288879	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,10,3
chr18	55289076	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr18	55315959	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:6,4:8,2:6,8,1,5
chr18	55317591	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,5:6,1:2,6,3,3
chr18	55321229	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:8,4,2,0
chr18	55322367	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=196,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr18	55328536	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=184,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:12,1:3,2:9,6,1,2
chr18	55338656	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=188,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,1:2,3:4,4,4,0
chr18	55352436	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr18	55352470	.	TTTA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTA;STR;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr18	55362816	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr18	55364830	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr18	55364852	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,9,7
chr18	55399021	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=115,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,1:11,1:11,13,2,0
chr18	55983293	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:15,1:9,1:10,15,1,1
chr18	55983330	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:1,7:5,3:2,4,2,8
chr18	55983364	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=195,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0,5,0,5
chr18	55997881	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=196,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,5:2,0:5,0,5,0
chr18	55997929	.	CTTCT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=225,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCT;STR;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:2,4,3,0
chr18	56054616	.	AT	A,ATT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32,22;MFRL=153,282,133;MMQ=60,60,60;MPOS=22,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.96,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.333,0.222:6:1,1,0:1,1,1:3,0,3,0
chr18	56149048	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=133,120;MMQ=60,26;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.452:24:8,4:5,7:4,9,9,2
chr18	56171297	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=141,118;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:16,0:12,3:11,17,0,3
chr18	56182145	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr18	56182174	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr18	56191351	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr18	56202059	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,16,1
chr18	56203252	.	AAAG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,1:8,1:5,8,2,0
chr18	56204387	.	ACAGTTGATGTGTCCT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.415:27:7,8:6,3:0|1:56204387_ACAGTTGATGTGTCCT_A:56204387:4,12,7,4
chr18	56204410	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,10:0.442:23:7,8:6,2:0|1:56204387_ACAGTTGATGTGTCCT_A:56204387:3,10,6,4
chr18	56204794	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:9,1:4,1:0|1:56204794_C_T:56204794:3,10,1,1
chr18	56204796	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,1:4,1:0|1:56204794_C_T:56204794:3,10,1,1
chr18	56204906	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,2:11,0:12,9,2,0
chr18	56204932	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:8,9:9,3:10,7,8,4
chr18	56205481	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr18	56246940	.	T	TA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.453:31:8,8:9,6:10,7,6,8
chr18	56247567	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:8,8:5,5:5,8,5,8
chr18	56274514	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr18	56279025	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=300,120;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:2,4:0,6:2,0,3,9
chr18	56383323	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr18	56390553	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=218,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr18	56400826	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=123,279;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,1:3,1:3,8,0,2
chr18	56414856	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,169;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:9,0:11,6:12,8,0,6
chr18	56585943	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,2:9,1:9,12,0,3
chr18	56651107	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr18	56807308	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=105,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:2,8:6,4:3,5,3,9
chr18	56807339	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=110,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.690:11:1,4:2,3:0,3,1,7
chr18	56825777	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,180;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:4,0,4,0
chr18	56897667	.	TGAAG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAAG;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,0:4,2:5,6,0,2
chr18	56940108	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,374;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56940108_G_A:56940108:0,0,0,1
chr18	56940110	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,374;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56940108_G_A:56940108:0,0,0,1
chr18	56940112	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,374;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56940108_G_A:56940108:0,0,0,1
chr18	57000303	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=132,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,1:8,3:8,2,2,2
chr18	57006031	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=135,76;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:10,0:9,3:0|1:57006031_G_C:57006031:7,13,1,2
chr18	57006036	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=135,76;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:10,0:9,3:0|1:57006031_G_C:57006031:7,12,1,2
chr18	57013170	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=218,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,3:7,3:7,5,4,2
chr18	57021738	.	AAC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AC;STR;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:3,5:8,2:5,6,5,2
chr18	57115133	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr18	57115203	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=239,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,3:1,5:2,1,2,6
chr18	57134152	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr18	57136741	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:12,3:8,1:13,7,4,0
chr18	57136869	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=183,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:2,3:0,3:0,2,2,4
chr18	57136902	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=179,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr18	57147351	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=155,243;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:8,1:12,6,1,1
chr18	57147390	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=175,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:10,3:6,4:8,8,5,2
chr18	57363878	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=174,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,2:6,1:7,6,3,0
chr18	57567638	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,2:11,0:19,4,2,0
chr18	57570053	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=134,250;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:17,2:24,1:24,18,1,2
chr18	59157764	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr18	59158065	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,3:0,0,4,10
chr18	59166762	.	T	TAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=118,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.494:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr18	59167836	.	G	GGAAGGTTCCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=217,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.280:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr18	59174817	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=113,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:3,2:1,3:1,3,1,4
chr18	59206197	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:1,1,5,1
chr18	59217504	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=190,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:5,5:4,2:4,6,1,6
chr18	59739962	.	TA	T,TAAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,28,26;MFRL=167,198,202;MMQ=60,60,60;MPOS=26,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=A;STR;TLOD=11.04,6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,6,3:0.425,0.258:13:1,3,1:3,3,2:1,3,2,7
chr18	59751715	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=170,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr18	59751901	.	C	CCCAAATA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:59751901_C_CCCAAATA:59751901:1,4,0,2
chr18	59751905	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=148,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,2:2,0:0|1:59751901_C_CCCAAATA:59751901:1,4,0,2
chr18	59763015	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=181,291;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:3,2,2,0
chr18	59777011	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=188,258;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,1:7,4:8,1,4,1
chr18	59806190	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.641:12:2,4:2,3:4,0,7,1
chr18	59807608	.	G	GT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=145,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:11,1:6,1:8,9,0,4
chr18	59807635	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.371:25:9,6:7,3:3,13,3,6
chr18	59824490	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=217,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0,4,1,1
chr18	59854993	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=192,242;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:7,1:8,4:10,7,4,1
chr18	59888588	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=159,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:11,2:10,2:14,7,3,1
chr18	59888802	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=189,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.485:10:1,0:2,4:1,4,0,5
chr18	59894428	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=218,246;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:1,3:4,0,3,0
chr18	59895014	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=204,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr18	59922722	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=137,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:1,2:4,1:1,5,1,2
chr18	59931282	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:16,1:11,1:15,12,2,0
chr18	59935998	.	G	GTAACC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAACC;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr18	59941254	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:14,3:8,1:15,7,3,1
chr18	59942586	.	GTT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=132,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,1:1,1:6,2,2,0
chr18	59942746	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.426:10:2,2:1,2:2,4,0,4
chr18	59947970	.	CTG	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=113,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:4,2:5,1:4,6,0,3
chr18	59947988	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=135,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:2,7,0,4
chr18	59954765	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:0,6,0,4
chr18	59958678	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:4,1,3,0
chr18	59966207	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=211,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr18	60027149	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=175,280;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr18	60027171	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=124,250;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr18	60027316	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:1,4,0,2
chr18	60051888	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=193,281;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr18	60211988	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=182,238;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,0:5,2:13,4,0,2
chr18	60212013	.	ATG	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:7,3:4,4:6,5,4,3
chr18	60225865	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=194,112;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=69.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.733:28:3,6:4,15:6,1,18,3
chr18	60227939	.	TAATTA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=206,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:1,2:0,5,1,4
chr18	60231753	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,0:4,2:11,0,2,0
chr18	60232405	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr18	60241548	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.234:32:15,0:10,7:12,13,0,7
chr18	60241849	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,77;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.122:39:11,4:24,0:15,20,3,1
chr18	60243683	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:11,2:13,1:16,8,0,3
chr18	60572437	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.612:11:0,4:3,3:3,1,6,1
chr18	60630531	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=193,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr18	60999137	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=187,79;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,2:6,0:4,7,0,2
chr18	61034175	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=264,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.684:10:1,3:1,4:3,0,7,0
chr18	61060873	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=288,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr18	61066463	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=221,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,7:3,1:1,3,5,3
chr18	61067959	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr18	61077757	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr18	61078888	.	G	GTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,13;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,17;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.413:3:0,0:0,0:0,2,0,1
chr18	61154351	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=187,367;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr18	61154388	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=180,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr18	61160385	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,1:0,2:1,3,0,3
chr18	61166271	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=153,169;MMQ=60,53;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,2:3,0:5,2,6,0
chr18	61166273	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=153,169;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,4:4,2:5,2,6,0
chr18	61166280	.	GTA	G,GTATATATA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,33,33;MFRL=90,205,169;MMQ=60,60,60;MPOS=34,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,13;RU=TA;STR;TLOD=5.23,7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,5:0.249,0.403:12:3,1,3:1,2,2:1,3,8,0
chr18	61170467	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr18	61170500	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr18	61170721	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.442:18:4,3:6,5:5,5,4,4
chr18	61225801	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr18	61226740	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=105,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,1,2
chr18	61228248	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr18	61231143	.	AAAAAT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=197,171;MMQ=45,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr18	61231417	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=156,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,3:1,6:0,1,0,9
chr18	61232686	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:11,9:2,0:10,3,9,0
chr18	61233739	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr18	61254525	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=195,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:1,2,4,1
chr18	61261515	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=147,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,0:0,2:0|1:61261515_T_C:61261515:6,0,2,0
chr18	61261540	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=147,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,0:1,2:0|1:61261515_T_C:61261515:10,0,2,0
chr18	61261565	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=155,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.298:18:8,1:5,4:0|1:61261515_T_C:61261515:11,2,3,2
chr18	61264298	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=127,206;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.377:30:10,6:8,5:12,7,7,4
chr18	61271065	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=206,254;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:0,2:6,1:6,0,3,0
chr18	61305359	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=155,183;MMQ=40,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,0:11,2:5,17,0,2
chr18	61308895	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr18	61309139	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=198,230;MMQ=52,34;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:1,4,2,2
chr18	61322849	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=202,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,6:4,6:7,1,9,3
chr18	61324033	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=137,205;MMQ=60,51;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,1:6,2:10,3,2,1
chr18	61325905	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:2,2:9,3:1,10,1,4
chr18	61326535	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=203,180;MMQ=39,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:0|1:61326535_A_G:61326535:9,0,2,0
chr18	61326540	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=24,33;MFRL=203,180;MMQ=39,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:0|1:61326535_A_G:61326535:9,0,2,0
chr18	61326597	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=29,34;MFRL=146,169;MMQ=40,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:0|1:61326597_A_C:61326597:3,0,4,2
chr18	61326602	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=146,158;MMQ=40,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:1,5:2,2:0|1:61326597_A_C:61326597:3,0,5,3
chr18	61326609	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=25,35;MFRL=146,157;MMQ=40,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:1,5:2,4:0|1:61326597_A_C:61326597:3,0,6,3
chr18	61326628	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=26,29;MFRL=173,161;MMQ=30,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=53.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.827:21:2,10:1,8:1,2,11,7
chr18	61328485	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=148,148;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,2:2,1:0,9,1,2
chr18	61377644	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=188,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:3,1:2,1:0,6,0,2
chr18	61388052	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=232,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr18	61388269	.	AAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=196,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,1:5,1:0,6,0,2
chr18	61390649	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=225,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.664:16:0,4:5,6:2,3,2,9
chr18	61465746	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=238,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr18	61465810	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,10:0,3:0,0,9,4
chr18	61465822	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=37.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.860:19:1,10:1,7:0,2,11,6
chr18	61468306	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr18	61558656	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=114,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:2,3:3,3:3,2,5,2
chr18	61558878	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=155,208;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.417:22:8,2:5,7:0|1:61558878_C_T:61558878:4,9,4,5
chr18	61558882	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=163,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:5,1:5,7:0|1:61558878_C_T:61558878:4,7,3,5
chr18	61562690	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,1,2
chr18	61564513	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=131,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:3,2:3,2:1,6,0,4
chr18	61564532	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=160,251;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:1,2:3,1:0,5,0,3
chr18	61569555	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=231,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr18	61569819	.	TTTAAGTTTCTGGGGC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=116,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.534:15:3,3:3,4:2,5,1,7
chr18	61569849	.	GTGAGA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=165,206;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGAGA;STR;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,4:4,5:0,5,1,8
chr18	61570470	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=128,230;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:6,1:13,5:8,11,4,2
chr18	61570503	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=153,255;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:8,3:8,3:5,11,1,5
chr18	61575166	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=221,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:3,2:1,4:4,0,5,1
chr18	61584642	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:4,3:9,2:10,3,3,2
chr18	61585145	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=146,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr18	61627300	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=207,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr18	61648990	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=142,262;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,2:9,0:12,11,1,1
chr18	61650865	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=114,115;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,5:2,5:2,4,6,4
chr18	63477317	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,18;MFRL=133,303;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr18	63511176	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=180,141;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:7,3:14,3:12,9,4,2
chr18	63530066	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=213,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:8,4:11,0:9,11,4,0
chr18	64239196	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=148,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr18	66365129	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=162,313;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:3,1,2,0
chr18	66367726	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=148,63;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:1,2:0,8,0,4
chr18	66503919	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,388;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:66503919_G_T:66503919:0,0,1,0
chr18	66503921	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,388;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:66503919_G_T:66503919:0,0,1,0
chr18	66504022	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=184,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:0,0:7,2:7,0,1,1
chr18	66504093	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,13,8
chr18	66513471	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr18	66513662	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:4,7:5,9:5,4,4,12
chr18	66513749	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=278,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,1,2
chr18	66678131	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,0:0,8:0,0,7,1
chr18	66678326	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=155,68;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,1:5,3:2,7,1,3
chr18	67068605	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=16,16;MFRL=182,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:0,1:0,0:0,2,0,4
chr18	67365585	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=175,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr18	67365926	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=293,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr18	67540368	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,4:3,1:7,2,4,1
chr18	67563060	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=173,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:14,1:9,3:11,13,2,2
chr18	67563089	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=198,98;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:12,0:16,2:0|1:67563089_G_A:67563089:15,15,0,2
chr18	67563095	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=199,98;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:10,0:15,2:0|1:67563089_G_A:67563089:14,13,0,2
chr18	67563309	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr18	67563348	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr18	67613926	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr18	67614674	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=352,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.848:18:1,6:1,10:1,1,4,12
chr18	67685007	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr18	67727003	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr18	67733234	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr18	67741117	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=35.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr18	67741309	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr18	67742801	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,2:0,10:0,0,1,11
chr18	67759333	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=136,188;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:3,5,2,0
chr18	67759440	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:3,5,0,2
chr18	67759515	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr18	67759549	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr18	67807347	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=114,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:2,4:11,0:8,5,4,0
chr18	67809647	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.741:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr18	67812773	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr18	67817744	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr18	67818046	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr18	67818066	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr18	67860719	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr18	67863850	.	T	TCTC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTC;STR;TLOD=84.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,12:0,8:0,0,7,13
chr18	70416367	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr18	70423192	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:4,0,2,0
chr18	70461508	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=216,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.314:36:18,11:6,0:3,22,11,0
chr18	70532185	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=232,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.507:6:1,2:2,1:2,1,2,1
chr18	70532840	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=122,120;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:11,1:10,2:9,12,2,1
chr18	70534387	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=223,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr18	70534595	.	CG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=192,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.298:11:2,1:6,2:3,5,1,2
chr18	71740799	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=142,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:7,0:6,2:3,10,1,1
chr18	71749359	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=239,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr18	71796889	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=247,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:0,0:1,3,0,2
chr18	71825719	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=169,288;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:6,4:8,1:6,8,1,4
chr18	71920966	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr18	71930734	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,5:0,0,4,6
chr18	71930758	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr18	72103646	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=190,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr18	72109415	.	G	GATAGTTGTATGAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=185,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr18	72109428	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=185,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr18	72167124	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=152,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,0:11,3:20,1,2,1
chr18	72168608	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,179;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.167:40:14,3:19,3:22,12,5,1
chr18	72173270	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:0|1:72173270_GC_G:72173270:0,9,0,2
chr18	72173278	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,1:4,1:0|1:72173270_GC_G:72173270:0,10,0,2
chr18	72178161	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=147,304;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,3:5,1:4,5,0,4
chr18	72179579	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=202,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:6,0,3,0
chr18	72180723	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=245,263;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr18	72185972	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr18	72186175	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=50.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,12,6
chr18	72186404	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr18	72223591	.	G	GTGC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=193,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TGC;STR;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.239:10:7,1:1,1:5,3,2,0
chr18	72226539	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,4,5
chr18	72238504	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=177,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:7,9,1,1
chr18	72250762	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:3,3,2,1
chr18	72346967	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=184,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:13,3:17,0:12,18,3,0
chr18	72347748	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=212,254;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr18	72593118	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr18	72921107	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,404;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr18	73001026	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=200,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:6,2:3,1:8,2,3,1
chr18	73001305	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=133,60;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:3,0:11,2:2,13,0,2
chr18	73130653	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.829:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr18	73130705	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=121,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.477:13:3,2:4,3:5,2,4,2
chr18	73139335	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=167,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:6,0,3,1
chr18	73139381	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,2:6,0:8,7,2,0
chr18	74082584	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=202,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr18	74090957	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr18	74153146	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=234,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:5,4:1,0:5,1,4,1
chr18	74153958	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=209,133;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:3,5:11,0:8,6,5,0
chr18	74583691	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=157,100;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,2:8,1:9,9,2,1
chr18	74591992	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.762:14:1,4:2,5:3,0,11,0
chr18	74593429	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=173,234;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:1,0:4,1:0,6,0,2
chr18	74637067	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=198,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:5,0,2,0
chr18	74680114	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=175,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr18	74680369	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr18	74692336	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=186,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,7:5,4:7,3,7,4
chr18	74692415	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=179,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,1:7,2:7,7,0,3
chr18	74962447	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr18	74980498	.	GCCT	G,GCCTCCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,27,29;MFRL=200,188,198;MMQ=60,60,60;MPOS=19,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=CCT;STR;TLOD=3.14,3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.247,0.290:4:0,0,1:2,1,0:2,0,2,0
chr18	74980601	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=152,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,3:8,5:6,7,1,7
chr18	76753588	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr18	76754466	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr18	76829525	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=229,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:1,2:2,1:0,3,0,4
chr18	77105878	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=200,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:77105878_A_T:77105878:0,5,1,1
chr18	77105880	.	C	CTGCCTG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=200,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:77105878_A_T:77105878:0,5,1,1
chr18	77107934	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=161,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,10:0.686:14:2,5:2,4:0|1:77107934_C_T:77107934:0,4,1,9
chr18	77107957	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=213,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,2:0.212:12:5,1:5,1:1|0:77107934_C_T:77107934:2,8,0,2
chr18	77108248	.	GAAAAA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=79,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=21,16;RU=A;STR;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,2:2,1:0|1:77108248_GAAAAA_G:77108248:1,2,1,3
chr18	77108254	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:1,1:0|1:77108248_GAAAAA_G:77108248:1,0,1,3
chr18	77137202	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=167,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.595:10:1,4:2,2:4,0,4,2
chr18	77156449	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr18	77209015	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=272,246;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:1,1:0,4,0,3
chr18	77210902	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:77210902_C_T:77210902:0,0,7,1
chr18	77210909	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=170,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:0|1:77210902_C_T:77210902:5,1,2,1
chr18	77211175	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=199,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr18	77211195	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr18	77246226	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.511:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr18	77246602	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=188,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:0,0:2,1:2,0,2,0
chr18	77456172	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr18	77458037	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=196,249;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:0,7,1,2
chr18	77477515	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:3,1,4,1
chr18	77477921	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=207,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:4,5,1,1
chr18	77489169	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=237,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr18	77513841	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=196,229;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:0,6,0,5
chr18	77663896	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr18	77694128	.	TAA	T,TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31,26;MFRL=0,160,186;MMQ=60,60,60;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.78,8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.333,0.556:6:0,0,1:0,2,2:0,0,0,6
chr18	77703476	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=195,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,0:8,2:3,9,0,2
chr18	77728045	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr18	77730585	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr18	77794410	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=336,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr18	77794481	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr18	77796574	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr18	77797321	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr18	77802296	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=276,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:77802296_T_G:77802296:0,2,0,1
chr18	77802297	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=185,276;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1|0:77802296_T_G:77802296:0,1,0,2
chr18	77802304	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=276,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:77802296_T_G:77802296:0,2,0,1
chr18	77805715	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=214,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:2,1,3,0
chr18	77805900	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:1,2:12,0:9,4,2,0
chr18	77805949	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=223,121;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,3:2,7:2,0,3,7
chr18	77894424	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,72;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:14,0:16,3:15,15,1,2
chr18	77896699	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=225,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.689:8:1,2:1,2:1,1,2,4
chr18	77926862	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=164,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,5:1,6:1,1,6,5
chr18	77927028	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=237,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:0,8:3,6:0,3,3,11
chr18	77927112	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=221,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr18	77960842	.	G	GTCCTTAACTTCTGTGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=209,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:0,0:2,1:2,0,0,1
chr19	291453	.	G	GTTATTGCAAGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	311787	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.314:10:4,0:3,2:4,3,3,0
chr19	327260	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=137,246;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:1,3:7,0:4,4,0,3
chr19	327323	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr19	327821	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=200,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,3:2,1:4,4,3,1
chr19	328028	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=228,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,0:4,4:3,4,0,4
chr19	334474	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=120,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,2:4,4:4,3,6,0
chr19	372551	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,9,0
chr19	372737	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:1,3,1,4
chr19	372775	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=143,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:1,1,0,3
chr19	373897	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr19	374453	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:6,4:1,0:1,6,1,3
chr19	376008	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	422516	.	ACCAG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=174,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:422516_ACCAG_A:422516:0,3,0,1
chr19	422522	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=174,84;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:422516_ACCAG_A:422516:0,3,0,1
chr19	422555	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	425305	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=255,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr19	439016	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=182,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,2:6,1:9,6,3,0
chr19	463810	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	472297	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	496532	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=119,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:7,2:7,3:4,10,1,4
chr19	507450	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=254,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr19	507765	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=229,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:3,2:2,1:0,5,0,4
chr19	536437	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr19	547224	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr19	547491	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=176,243;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	548500	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:5,1,2,0
chr19	548865	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	549080	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=134,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,3:6,1:5,8,2,2
chr19	549595	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr19	579549	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:4,2:11,0:8,7,0,2
chr19	580710	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:3,2:2,2:3,2,3,1
chr19	582253	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,1:3,2:8,3,3,0
chr19	582601	.	CCTCCTGAGCCAGGTGTGGTGGGTGGGTGGGCGGGAA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.302:10:3,1:2,0:7,1,0,2
chr19	603460	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=153,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr19	603513	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=220,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:4,1,3,0
chr19	604988	.	G	A,T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29,28;MFRL=190,226,135;MMQ=60,60,60;MPOS=8,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.11,4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.375,0.375:5:1,0,1:0,2,1:1,0,4,0
chr19	605171	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=117,149;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:4,5:3,10:3,5,6,9
chr19	605255	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=182,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,1,3
chr19	613827	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,23;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:0,2:4,0,3,0
chr19	615946	.	CCCG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=58,193;MMQ=56,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CCG;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr19	617195	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:617195_C_T:617195:0,0,2,0
chr19	617205	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=217,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0|1:617195_C_T:617195:1,0,3,0
chr19	617963	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=188,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	618976	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.257:33:14,8:11,0:15,10,8,0
chr19	619137	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:619137_A_C:619137:2,7,2,0
chr19	619142	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:619137_A_C:619137:2,8,2,0
chr19	619574	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:2,4:2,6:3,1,9,1
chr19	619772	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=286,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:1,3,0,7
chr19	623003	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=190,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr19	624683	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=245,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:1,0,3,4
chr19	625081	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=296,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:3,9:1,3:3,1,9,3
chr19	629438	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr19	629503	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=247,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr19	633529	.	G	GGCGCCGCCGCCGCCGCCGCC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,278;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:2,7,1,1
chr19	652206	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr19	652238	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=153,116;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.366:20:7,3:5,4:9,4,4,3
chr19	652739	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr19	652948	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=240,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:1,0,1,3
chr19	685620	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=252,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:685620_A_C:685620:1,0,1,0
chr19	685630	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,15;MFRL=205,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,0:0|1:685620_A_C:685620:3,0,1,0
chr19	687078	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:4,6,2,1
chr19	687112	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:0,8,2,1
chr19	687142	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr19	691833	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=139,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:3,5,3,2
chr19	726098	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=225,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:3,5:8,1:10,1,6,0
chr19	727544	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=123,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,2:2,1:0|1:727544_C_G:727544:3,3,3,1
chr19	727550	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=123,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.358:12:3,2:3,2:0|1:727544_C_G:727544:3,5,3,1
chr19	727552	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=123,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:3,2:4,2:0|1:727544_C_G:727544:3,5,3,1
chr19	731055	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=179,249;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:6,10,0,2
chr19	731077	.	GG	CT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=192,274;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:5,3:10,2:5,11,1,4
chr19	740560	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	797517	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=186,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr19	799316	.	CA	TG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=230,155;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:6,1,2,0
chr19	799342	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.440:14:5,2:3,4:6,2,5,1
chr19	803945	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=257,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	804142	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:5,7,0,2
chr19	804959	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=196,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.203:16:8,1:5,1:3,10,1,2
chr19	805441	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:9,1:4,2:8,5,3,0
chr19	806634	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=197,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:0,3,0,4
chr19	808577	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=171,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,4:5,0:5,1,2,2
chr19	808824	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=126,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr19	810445	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=228,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:2,1:0,5:3,0,6,0
chr19	815086	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	829723	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,8:0,2:0,1,3,7
chr19	830621	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr19	841100	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	843692	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	860852	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,3,1
chr19	871033	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=201,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:2,3:7,4:7,2,3,5
chr19	897571	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=117,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=39.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:0,5:2,6:1,1,5,6
chr19	899328	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=209,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:899328_C_CA:899328:1,0,1,0
chr19	899330	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,10;MFRL=209,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:899328_C_CA:899328:1,0,1,0
chr19	899334	.	C	CCCA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,25;MFRL=193,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:899328_C_CA:899328:3,0,1,0
chr19	899338	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=193,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:0,1:0|1:899328_C_CA:899328:3,0,1,0
chr19	899342	.	CACCA	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=180,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:899328_C_CA:899328:4,0,1,0
chr19	901955	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=146,265;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr19	920366	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=174,102;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr19	920642	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	929753	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,5:2,1:1,1,6,0
chr19	932466	.	TGAG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=129,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GAG;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.241:6:3,1:0,0:3,2,1,0
chr19	960187	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.957:19:0,11:0,8:0,0,3,16
chr19	960266	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.817:9:1,3:0,4:0,1,0,8
chr19	966966	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr19	968318	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=254,201;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr19	968345	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	984554	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0|1:984554_C_G:984554:0,2,1,5
chr19	984578	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:984554_C_G:984554:0,0,1,4
chr19	985815	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=195,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,2,2
chr19	985997	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=12,32;MFRL=289,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.851:8:0,2:0,4:1,0,1,6
chr19	989875	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:5,3:6,0:8,3,1,2
chr19	990819	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=193,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,3:1,6:3,0,9,0
chr19	991196	.	CGT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,3:0|1:991196_CGT_C:991196:0,0,7,2
chr19	991199	.	CCCAGG	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:991196_CGT_C:991196:0,0,7,2
chr19	991892	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	1004896	.	G	GCGTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=194,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:4,3,1,2
chr19	1005076	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,6:8,2:6,6,4,4
chr19	1008358	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	1008801	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,24;MFRL=198,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:1,1:0,4,2,0
chr19	1008805	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=198,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:2,0:1,1:0,4,2,0
chr19	1008811	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=198,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:1008811_CA_C:1008811:0,4,2,0
chr19	1008821	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=202,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0|1:1008811_CA_C:1008811:1,4,2,0
chr19	1008824	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=202,195;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0|1:1008811_CA_C:1008811:1,4,2,0
chr19	1009485	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=186,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	1009550	.	GGCCCCCGCGGAGGCCCCACCACACTCT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=194,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:0,1:2,1:2,2,0,2
chr19	1010973	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=212,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr19	1011215	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=164,98;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr19	1011823	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=172,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:0|1:1011823_A_G:1011823:2,3,5,1
chr19	1011846	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=250,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:3,5:0,2:0|1:1011823_A_G:1011823:0,3,2,5
chr19	1011856	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=282,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:3,4:1,1:0|1:1011823_A_G:1011823:1,3,0,5
chr19	1012379	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=359,285;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0|1:1012379_C_G:1012379:1,0,3,2
chr19	1012381	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=359,285;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0|1:1012379_C_G:1012379:1,0,3,2
chr19	1012611	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=133,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,3:1,2,3,4
chr19	1014537	.	ACGTGATGGGG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=157,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGTGATGGGG;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr19	1020673	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	1031212	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr19	1032369	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,13:0,0,6,16
chr19	1032702	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,2:1,0:1,1,1,2
chr19	1032778	.	TTC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=293,262;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr19	1036314	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=180,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.536:15:5,3:1,5:4,3,3,5
chr19	1036552	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,4,17
chr19	1036575	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=106,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:4,2:6,2:0,10,2,2
chr19	1037551	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=182,158;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.379:16:4,2:6,3:10,0,6,0
chr19	1037563	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:3,3:5,1:8,0,3,1
chr19	1037584	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=139,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:9,0,2,2
chr19	1037715	.	TG	CA	.	.	DP=33;ECNT=11;MBQ=28,33;MFRL=169,238;MMQ=60,35;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:16,1:11,1:0|1:1037715_TG_CA:1037715:19,11,2,0
chr19	1037718	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=33,27;MFRL=169,238;MMQ=60,35;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:18,1:10,1:0|1:1037715_TG_CA:1037715:18,10,2,0
chr19	1037731	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=31,28;MFRL=160,231;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:17,2:8,2:15,11,3,1
chr19	1037749	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=32,30;MFRL=159,184;MMQ=60,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,6:0.189:35:19,1:10,5:0|1:1037749_G_A:1037749:14,15,2,4
chr19	1037756	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=30,29;MFRL=159,180;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,5:0.167:34:19,0:9,5:0|1:1037749_G_A:1037749:14,15,1,4
chr19	1037766	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=30,29;MFRL=156,172;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:17,0:7,4:0|1:1037749_G_A:1037749:14,12,0,4
chr19	1037781	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=32,28;MFRL=164,172;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,4:0.139:34:16,0:13,4:0|1:1037749_G_A:1037749:16,14,0,4
chr19	1037791	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=32,31;MFRL=151,172;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:15,0:12,4:0|1:1037749_G_A:1037749:18,13,0,4
chr19	1037801	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=11;MBQ=29,32;MFRL=170,172;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:19,0:13,3:0|1:1037749_G_A:1037749:21,14,0,4
chr19	1037807	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=32,27;MFRL=170,164;MMQ=60,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:19,0:12,3:0|1:1037749_G_A:1037749:23,14,0,3
chr19	1037810	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=11;MBQ=29,30;MFRL=172,164;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:21,0:13,1:0|1:1037749_G_A:1037749:26,13,0,3
chr19	1037921	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=158,78;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:16,2:14,1:0|1:1037921_C_G:1037921:5,25,0,3
chr19	1037924	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=158,78;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:13,2:10,1:0|1:1037921_C_G:1037921:5,25,0,3
chr19	1037927	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=26,35;MFRL=162,176;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:10,0:11,1:0|1:1037921_C_G:1037921:4,23,0,2
chr19	1037932	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,12:0,0,1,24
chr19	1037968	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=31,22;MFRL=178,186;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.562:6:0,1:2,1:0,3,0,3
chr19	1037986	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr19	1043324	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=173,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:6,1,3,1
chr19	1043638	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=232,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr19	1043864	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,1:7,2:9,6,2,1
chr19	1044753	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,4:1,5:0,1,2,7
chr19	1048807	.	C	CAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=131,170;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,0:4,3:5,0,3,0
chr19	1048823	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=225,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.826:14:1,1:1,9:2,1,6,5
chr19	1049012	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:2,4:6,2:3,6,0,6
chr19	1049269	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=157,316;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,1:9,1:5,9,0,2
chr19	1051137	.	CTG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=184,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=29.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,2:1,1,4,4
chr19	1053299	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=238,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.780:12:1,5:1,2:1,1,7,3
chr19	1053677	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=260,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:3,0,4,1
chr19	1056018	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=305,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=41.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:0,5:1,9:1,0,1,13
chr19	1057863	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:9,1,2,0
chr19	1061698	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=238,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.802:6:1,1:0,3:1,0,4,1
chr19	1061804	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=130,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:6,2:11,4:7,10,1,5
chr19	1063443	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,7,0
chr19	1064899	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=205,329;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:6,3,3,1
chr19	1065018	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,1:0,2:0,0,1,4
chr19	1065044	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=223,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.536:7:1,1:2,0:1,2,0,4
chr19	1065197	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=305,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,2:2,6:2,1,5,3
chr19	1073073	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=177,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	1073409	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr19	1074064	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,8,12
chr19	1074252	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.785:21:1,7:3,10:2,2,7,10
chr19	1074956	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=220,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr19	1080955	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:7,0:14,2,2,0
chr19	1081120	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,2:2,4:0,4,0,6
chr19	1086043	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=237,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr19	1090020	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,0:0,0,5,0
chr19	1090068	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.315:18:8,2:3,0:10,2,0,6
chr19	1090803	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:2,1,2,0
chr19	1095151	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=189,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:4,3:1,2:6,0,4,1
chr19	1104078	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=236,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr19	1105621	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:1,2,7,0
chr19	1106477	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=209,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.738:21:1,4:4,11:3,2,8,8
chr19	1113482	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=15,12;MFRL=227,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:1113482_A_C:1113482:1,0,1,0
chr19	1113486	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=15,12;MFRL=227,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:1113482_A_C:1113482:1,0,1,0
chr19	1113487	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,13;MFRL=86,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:1,0:1|0:1113482_A_C:1113482:2,0,1,0
chr19	1113493	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=22,23;MFRL=114,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:1113482_A_C:1113482:2,0,1,0
chr19	1113495	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,17;MFRL=86,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,0:1|0:1113482_A_C:1113482:2,0,1,0
chr19	1113496	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=22,17;MFRL=114,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:1113482_A_C:1113482:2,0,1,0
chr19	1113500	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:1113482_A_C:1113482:1,0,1,0
chr19	1116935	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	1119699	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	1119876	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	1120101	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=223,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr19	1123652	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=204,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr19	1124031	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=116,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,6:3,5:3,5,2,9
chr19	1124053	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=270,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,8:0,5:0,1,4,9
chr19	1132007	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=184,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:4,0,3,1
chr19	1207149	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=126,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:6,8:11,8:7,10,11,6
chr19	1207238	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.564:19:2,4:6,5:0,8,2,9
chr19	1207300	.	CTCTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=233,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0,4,0,1
chr19	1219274	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=108,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.717:9:2,1:0,3:2,0,5,2
chr19	1231139	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=168,249;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1231139_G_T:1231139:0,1,0,1
chr19	1231142	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=8,25;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=0;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,2:0,1:0|1:1231139_G_T:1231139:0,1,0,3
chr19	1233706	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr19	1233729	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	1242597	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,252;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:6,0:18,4:14,10,0,4
chr19	1251747	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=194,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.546:16:2,3:3,3:0|1:1251747_A_C:1251747:2,5,9,0
chr19	1251751	.	C	CCCCCCCCCCCCCGG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=194,143;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.434:16:3,1:4,5:0|1:1251747_A_C:1251747:4,5,7,0
chr19	1271274	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,21:0.628:33:9,12:3,9:10,2,10,11
chr19	1271529	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:3,8:4,2:4,4,6,4
chr19	1278665	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr19	1356516	.	CAGG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=195,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,0:2,6:1,6,0,6
chr19	1362385	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=188,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:3,14,1,1
chr19	1364472	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=207,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:5,1,4,0
chr19	1366422	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=212,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:1,5:1,7:1,1,7,5
chr19	1370675	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,5:3,4:5,3,4,5
chr19	1391235	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=204,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr19	1398993	.	GC	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:12,1:3,1:6,9,0,2
chr19	1417508	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=174,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:9,3:7,0:10,6,1,2
chr19	1422299	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=163,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:3,2,3,0
chr19	1429935	.	C	CTCATTGCA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.268:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr19	1434881	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=218,150;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.800:13:1,5:1,6:0|1:1434881_C_T:1434881:0,2,0,11
chr19	1434888	.	G	GTGTCTCATTTGAGGAAATTATAAGA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=218,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.800:13:0,5:1,6:0|1:1434881_C_T:1434881:0,2,0,11
chr19	1453705	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr19	1457875	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,0:0,2:0,0,5,0
chr19	1457894	.	C	CGGGGGGG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=174,153;MMQ=59,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,10;RU=G;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.285:5:1,0:3,1:4,0,1,0
chr19	1457898	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=22,13;MFRL=143,174;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:0,0:1,1:2,1,4,0
chr19	1460388	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=158,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:1460388_A_C:1460388:0,2,0,1
chr19	1460391	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=158,78;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:1460388_A_C:1460388:0,2,0,1
chr19	1482029	.	TCCCTCGGG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=134,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:1,2,1,1
chr19	1482871	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=203,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,0:1,0,2,0
chr19	1483980	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	1487083	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr19	1488147	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,3:7,1:7,4,3,1
chr19	1489770	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,1:5,1:11,3,1,1
chr19	1490377	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=202,224;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr19	1495570	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=83,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:11,3:3,5:3,11,4,4
chr19	1496717	.	GCGCGCGCGCGCGC	G	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=35,34;MFRL=213,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.248:6:1,0:4,1:0|1:1496717_GCGCGCGCGCGCGC_G:1496717:0,5,0,1
chr19	1496728	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=29,30;MFRL=272,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:1496728_C_T:1496728:0,3,0,1
chr19	1496730	.	C	CGT	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=29,32;MFRL=241,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GT;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr19	1496731	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=33,27;MFRL=241,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:1496717_GCGCGCGCGCGCGC_G:1496717:0,4,0,1
chr19	1496732	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=30,32;MFRL=241,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:1496717_GCGCGCGCGCGCGC_G:1496717:0,4,0,1
chr19	1496740	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=29,31;MFRL=241,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:1496717_GCGCGCGCGCGCGC_G:1496717:0,4,0,1
chr19	1496741	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=35,24;MFRL=218,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:1496728_C_T:1496728:0,4,0,1
chr19	1496742	.	CGT	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=29,34;MFRL=241,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:1496717_GCGCGCGCGCGCGC_G:1496717:0,4,0,1
chr19	1496748	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=210,163;MMQ=60,60;MPOS=-13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:1496717_GCGCGCGCGCGCGC_G:1496717:0,3,0,1
chr19	1497121	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=198,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0|1:1497121_G_T:1497121:4,0,2,1
chr19	1497132	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=198,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,1:1,1:0|1:1497121_G_T:1497121:3,1,1,2
chr19	1497144	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:1497121_G_T:1497121:0,2,0,2
chr19	1497543	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.139:20:7,2:7,0:9,9,2,0
chr19	1497655	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,12;MFRL=206,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,0:0,0:0|1:1497655_A_C:1497655:1,2,2,0
chr19	1497657	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,14;MFRL=206,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:3,0:0,0:0|1:1497655_A_C:1497655:1,2,2,0
chr19	1497663	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=204,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:1,0:0|1:1497655_A_C:1497655:1,5,2,0
chr19	1497666	.	AA	CC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=204,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,0:1,0:0|1:1497655_A_C:1497655:1,5,2,0
chr19	1506710	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,3:2,4:3,3,0,7
chr19	1507483	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=149,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,4:2,3:1,3,3,4
chr19	1507535	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=170,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,1:4,9:9,1,9,1
chr19	1507710	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:1,3:2,1:0,4,0,4
chr19	1555434	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr19	1611856	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=216,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr19	1615852	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,1,4
chr19	1619333	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1619333_G_A:1619333:0,1,0,1
chr19	1619339	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1619333_G_A:1619333:0,1,0,1
chr19	1619749	.	A	AGGGTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=199,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGTG;STR;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:0,5:4,4:4,0,9,0
chr19	1619864	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=194,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.162:20:8,0:6,0:9,8,0,3
chr19	1622199	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=220,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:7,3,2,0
chr19	1784826	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=176,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:10,2,2,0
chr19	1784856	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=192,57;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:9,3,0,2
chr19	1784890	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=232,105;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,5:1,1:1,1,2,4
chr19	1789100	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	1790726	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,12;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0,3,1,0
chr19	1791654	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=242,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1791654_A_G:1791654:1,0,1,0
chr19	1791656	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=242,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1791654_A_G:1791654:1,0,1,0
chr19	1800474	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=191,70;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:1800474_G_GT:1800474:0,1,0,1
chr19	1800476	.	G	GAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=260,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:1,0:0,1:0|1:1800474_G_GT:1800474:0,2,0,1
chr19	1800480	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=12,32;MFRL=260,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:0,0:0,1:0|1:1800474_G_GT:1800474:0,2,0,1
chr19	1806210	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr19	1809836	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	1816369	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=210,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:1816369_G_A:1816369:0,5,1,1
chr19	1816376	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=215,220;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:1816369_G_A:1816369:1,3,0,1
chr19	1817134	.	C	CCCAGATGGGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCAGATGGGG;STR;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr19	1817866	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=218,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr19	1818403	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	1818459	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=104,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.816:9:1,4:0,3:1,0,6,2
chr19	1818952	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr19	1820343	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=178,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,0:13,3:13,9,0,3
chr19	1825927	.	TCTC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=181,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:6,9:4,2:7,3,7,4
chr19	1827020	.	TGGA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=16,22;MFRL=165,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GGA;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:0,1:1,4,0,2
chr19	1827067	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	1848243	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,294;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	1877652	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	1881453	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=167,273;MMQ=50,36;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.309:8:2,1:2,1:4,2,1,1
chr19	1905356	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:11,1,2,0
chr19	1908694	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=239,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr19	1913533	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=202,232;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr19	1914940	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr19	1915118	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr19	1924005	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	1924050	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,35;MFRL=155,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr19	1924076	.	TC	CT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr19	1952841	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=199,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:1,3,5,2
chr19	1954126	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=208,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0|1:1954126_C_CA:1954126:0,2,0,5
chr19	1954128	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=208,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0|1:1954126_C_CA:1954126:0,2,0,5
chr19	1979321	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:7,8,0,2
chr19	1986414	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=152,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:2,0,4,1
chr19	1986455	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=135,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:3,0:4,4:3,5,2,2
chr19	1987279	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=176,268;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.342:12:4,2:3,1:3,5,0,4
chr19	2037834	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=15,31;MFRL=159,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.730:5:0,3:0,0:0,1,2,2
chr19	2039764	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:0,6,1,2
chr19	2040061	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=263,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:5,1,5,0
chr19	2041032	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=188,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:1,4:3,7:4,0,11,0
chr19	2042886	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr19	2043138	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=138,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:14,0:12,3:0|1:2043138_C_T:2043138:10,18,0,3
chr19	2043147	.	G	GTGCAACGCAGTCCTATCTTCCAC	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=147,95;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:14,0:12,3:0|1:2043138_C_T:2043138:12,17,0,3
chr19	2073466	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:6,5:1,2:2,5,4,4
chr19	2097986	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=183,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:2,5:3,3:2,3,6,3
chr19	2098015	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=196,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,8:2,3:1,1,5,6
chr19	2098840	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=203,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:2098840_G_A:2098840:0,1,1,1
chr19	2098843	.	A	ATGACACATAAAGTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=203,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:2098840_G_A:2098840:0,1,1,1
chr19	2099109	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=197,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0|1:2099109_G_T:2099109:0,2,2,3
chr19	2099111	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:2099109_G_T:2099109:0,0,2,5
chr19	2099362	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=160,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr19	2109114	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:8,6,2,0
chr19	2113345	.	A	ACGGGGG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CGGGGG;STR;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.412:10:0,2:4,1:6,0,4,0
chr19	2114184	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.170:39:14,0:19,6:11,22,0,6
chr19	2121758	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr19	2129473	.	TC	CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr19	2130322	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=206,223;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr19	2137870	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chr19	2138787	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2138787_A_G:2138787:0,0,0,1
chr19	2138789	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2138787_A_G:2138787:0,0,0,1
chr19	2138798	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2138787_A_G:2138787:0,0,0,1
chr19	2138815	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2138787_A_G:2138787:0,0,0,1
chr19	2190947	.	TTGG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGG;STR;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr19	2191022	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr19	2193652	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:12,1,1,1
chr19	2194657	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=318,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr19	2207584	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=141,100;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:3,3:5,0:8,1,3,0
chr19	2208859	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chr19	2211050	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr19	2211192	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=129,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr19	2214057	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=190,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	2226928	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	2229671	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=202,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:9,0,2,0
chr19	2244903	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr19	2245457	.	AGCCAAGGAG	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=161,55;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCCAAGGAG;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:8,0:8,2:17,8,1,1
chr19	2246652	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	2250528	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr19	2253082	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=229,232;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr19	2253780	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	2253843	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	2255336	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr19	2269829	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=165,265;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr19	2271282	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,13,0
chr19	2271323	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,13:0,4:0,0,17,0
chr19	2271577	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=40.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr19	2271741	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=324,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,1:0,2:0,1,3,0
chr19	2278562	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr19	2279019	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=122,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,0:2,0:0|1:2279019_A_T:2279019:4,1,0,2
chr19	2279024	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=122,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:2279019_A_T:2279019:4,1,0,2
chr19	2280756	.	TCCTGCCGCTCCCTGCACCCA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=73,184;MMQ=60,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.539:4:0,1:1,1:2,0,2,0
chr19	2280885	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,265;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,1:6,2:8,5,1,2
chr19	2328281	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	2337377	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr19	2339949	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0|1:2339949_T_C:2339949:0,0,6,7
chr19	2339958	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:2339949_T_C:2339949:0,0,5,4
chr19	2340046	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=177,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,0:1,3:0,2,0,5
chr19	2340154	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	2341047	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr19	2341059	.	GT	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	2343326	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,3:6,0:2,6,0,3
chr19	2344484	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:6,0,1,1
chr19	2389839	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=182,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:9,3,0,2
chr19	2389872	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:4,6:1,4:4,1,6,4
chr19	2389954	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=165,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.800:13:1,5:1,6:0|1:2389954_G_A:2389954:1,1,3,8
chr19	2389958	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=165,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.800:13:1,5:1,6:0|1:2389954_G_A:2389954:1,1,3,8
chr19	2405641	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=270,277;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr19	2431809	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=184,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:5,9,2,0
chr19	2433928	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=200,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,1:1,1:2,3,1,1
chr19	2438570	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=148,66;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,0:12,2:5,12,1,1
chr19	2477316	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=285,245;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,1,3
chr19	2477665	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=226,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:3,1:1,0:0,5,0,2
chr19	2514966	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	2520716	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=151,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,0:5,2:4,4,0,2
chr19	2520732	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=179,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0|1:2520732_G_T:2520732:1,7,1,1
chr19	2520742	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=189,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:3,2:0|1:2520732_G_T:2520732:1,7,1,1
chr19	2520743	.	G	GTAGAAACGAACCTA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=189,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:2520732_G_T:2520732:1,7,1,1
chr19	2717880	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	2733275	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=191,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.230:15:9,2:3,1:0|1:2733275_C_T:2733275:7,5,2,1
chr19	2733281	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=185,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.465:13:5,3:2,2:0|1:2733275_C_T:2733275:4,3,4,2
chr19	2761358	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=250,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr19	2761603	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=216,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr19	2767179	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:4,4:5,5:5,4,4,5
chr19	2767192	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:2,3:5,2:4,3,2,4
chr19	2790394	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=207,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:5,2,2,0
chr19	2790610	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=116,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,1:8,2:3,13,1,2
chr19	2794988	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=192,162;MMQ=40,34;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:2,0:0,3,0,2
chr19	2795002	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=199,192;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:2795002_A_G:2795002:0,3,0,1
chr19	2795007	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=192,199;MMQ=40,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:2795007_A_G:2795007:0,3,0,1
chr19	2795009	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=192,199;MMQ=40,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:2795007_A_G:2795007:0,3,0,1
chr19	2795011	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=199,192;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:2795002_A_G:2795002:0,3,0,1
chr19	2796021	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,1:5,4:7,0,5,0
chr19	2805192	.	G	GAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=133,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr19	2807120	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=169,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr19	2833617	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=172,314;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr19	2834080	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,2:11,0:12,4,2,0
chr19	2834373	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=180,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,4:6,1:3,6,1,4
chr19	2834610	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=164,90;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:12,2:0|1:2834610_G_T:2834610:11,13,1,1
chr19	2834613	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=163,90;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:12,2:0|1:2834610_G_T:2834610:9,14,1,1
chr19	2834619	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=159,90;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:12,2:0|1:2834610_G_T:2834610:8,15,1,1
chr19	2834624	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=163,90;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:12,1:0|1:2834610_G_T:2834610:7,16,1,1
chr19	2834808	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=92,212;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.320:10:4,0:2,2:1,6,1,2
chr19	2834932	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=275,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	2850807	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=221,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr19	2873439	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=313,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:0,6:3,3:3,0,8,1
chr19	2876233	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=176,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,4:4,0:10,1,4,0
chr19	2876334	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=222,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr19	2877426	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=185,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:1,2,1,2
chr19	2877898	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,1:10,1:8,9,1,1
chr19	2878397	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=177,150;MMQ=60,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr19	2900915	.	GA	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=190,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr19	2900930	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=200,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr19	2901114	.	CGCCGAAGTCT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=217,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,6:1,2:0,2,2,6
chr19	2916048	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr19	2916325	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:0,9,0,2
chr19	2917542	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=229,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,4:6,2:6,5,2,4
chr19	2917612	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=240,165;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:4,6:3,7:2,5,4,9
chr19	2933480	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=214,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:1,10:0,6:0,1,10,6
chr19	2933826	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,5:8,3:7,6,4,4
chr19	2936443	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr19	2978135	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=244,267;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr19	2981487	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:5,5,1,1
chr19	2982047	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=99,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,1:2,7:3,0,7,1
chr19	2982293	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=198,210;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr19	2989697	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.657:12:1,5:2,3:0,4,4,4
chr19	2989801	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=152,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,8:1,0:1,2,4,4
chr19	2989810	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,4,6
chr19	2991814	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr19	2993427	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=220,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:3,3,3,0
chr19	2993918	.	CAAAAAAAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=135,208;MMQ=42,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=22,13;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr19	2993946	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,28;MFRL=135,207;MMQ=42,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:0,1:1,0,3,0
chr19	2994107	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,2,9
chr19	2994814	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	2994837	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	2994885	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=151,265;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,2,0
chr19	2994903	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=195,151;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,1,2
chr19	3006378	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,18;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.593:3:0,1:0,0:0|1:3006378_T_A:3006378:1,0,2,0
chr19	3006393	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=145,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.491:4:1,0:1,1:0|1:3006378_T_A:3006378:2,0,2,0
chr19	3006397	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=24,18;MFRL=145,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.491:4:1,1:0,0:0|1:3006378_T_A:3006378:2,0,2,0
chr19	3006399	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=24,15;MFRL=145,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.491:4:1,0:1,0:0|1:3006378_T_A:3006378:2,0,2,0
chr19	3006405	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=16,13;MFRL=145,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.491:4:0,0:0,0:0|1:3006378_T_A:3006378:2,0,2,0
chr19	3006410	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=8,23;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:3006378_T_A:3006378:2,0,1,0
chr19	3006414	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=20,12;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:3006378_T_A:3006378:2,0,1,0
chr19	3009025	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,143;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,0:2,5:0,4,0,5
chr19	3009039	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=146,143;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,0:1,5:0,2,0,5
chr19	3009788	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	3013616	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=227,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:2,1:0,3:2,0,5,0
chr19	3014647	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=114,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,3:0,4:2,2,3,4
chr19	3019660	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,6:5,3:2,5,3,6
chr19	3053802	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr19	3056213	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=232,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:3,1,4,0
chr19	3056236	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=157,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr19	3061344	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=215,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr19	3061354	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=213,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr19	3113305	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,6,5
chr19	3113346	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,2:7,0:9,5,0,2
chr19	3114901	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=18,24;MFRL=144,277;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.410:5:0,1:1,0:3,0,2,0
chr19	3119184	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr19	3119404	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr19	3136692	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=190,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr19	3148819	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=322,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr19	3151686	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=184,101;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.443:25:10,9:4,2:9,5,4,7
chr19	3155736	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=322,257;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr19	3157885	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.392:21:5,5:7,3:0|1:3157885_T_C:3157885:5,8,0,8
chr19	3157887	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.392:21:6,5:5,3:0|1:3157885_T_C:3157885:5,8,0,8
chr19	3157916	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:3,7,0,3
chr19	3196107	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,16;MFRL=213,507;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:3196107_T_G:3196107:4,0,1,0
chr19	3196109	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,16;MFRL=213,507;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:3196107_T_G:3196107:4,0,1,0
chr19	3196111	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=213,507;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:3196107_T_G:3196107:4,0,1,0
chr19	3196113	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,16;MFRL=213,507;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:3196107_T_G:3196107:4,0,1,0
chr19	3196121	.	AT	CC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=202,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr19	3198755	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=212,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr19	3198777	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=213,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.662:4:1,3:0,0:1,0,2,1
chr19	3201614	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=162,248;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3201614_A_G:3201614:0,1,0,1
chr19	3201624	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=162,248;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:3201614_A_G:3201614:0,1,0,1
chr19	3201695	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	3203864	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=185,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:3203864_T_G:3203864:1,0,0,1
chr19	3203888	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=182,260;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:3203864_T_G:3203864:1,1,0,1
chr19	3204172	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=184,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr19	3206235	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=195,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,2,2
chr19	3207338	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:4,5:3,3:0|1:3207338_T_C:3207338:4,5,3,5
chr19	3207348	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.479:21:6,4:5,5:0|1:3207338_T_C:3207338:5,6,3,7
chr19	3273818	.	TG	CC,CG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32,26;MFRL=160,197,221;MMQ=60,60,60;MPOS=11,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,3:0.250,0.500:5:0,0,1:1,1,2:1,0,1,3
chr19	3284819	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=313,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,3:3,4:2,1,6,1
chr19	3285012	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=207,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,1:0,4:0,1,0,6
chr19	3285042	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=227,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr19	3359636	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.488:12:2,0:1,0:5,1,6,0
chr19	3366532	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=206,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=G;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:2,0,2,0
chr19	3434413	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,272;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,1:7,1:2,10,0,2
chr19	3452683	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=177,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr19	3453793	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,142;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,0:7,1:10,7,0,2
chr19	3453961	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=190,329;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr19	3456738	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=196,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr19	3462869	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=130,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,1,1
chr19	3480358	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=104,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,4:4,1:1,5,2,3
chr19	3522946	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:10,4,1,1
chr19	3526452	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=213,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr19	3530687	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=140,140;MMQ=54,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:0,3:5,0:7,0,3,0
chr19	3534758	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,4:1,0:5,1,1,3
chr19	3543478	.	GCC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=C;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	3546185	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=212,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:6,3:5,1:7,4,2,2
chr19	3548057	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=158,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr19	3548313	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr19	3575422	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=225,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr19	3612207	.	T	TGCTGGGAGTACAGG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=179,137511;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,2:8,0:8,9,2,0
chr19	3613346	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	3613400	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:3613400_C_G:3613400:0,0,2,0
chr19	3613422	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:3613400_C_G:3613400:0,0,1,0
chr19	3613596	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr19	3619195	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,149;MMQ=60,21;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:7,0:9,6:5,11,0,6
chr19	3633273	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=195,298;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:3633273_G_C:3633273:1,0,1,1
chr19	3633280	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=296,200;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:3633273_G_C:3633273:2,0,0,1
chr19	3633283	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=195,396;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:3633273_G_C:3633273:1,2,1,0
chr19	3638857	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=109,261;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:3638857_G_A:3638857:2,2,2,0
chr19	3638865	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=179,63;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.333:7:1,2:4,0:1|0:3638857_G_A:3638857:4,1,1,1
chr19	3641672	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=228,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,10:1,1:1,0,11,0
chr19	3645947	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,4,4
chr19	3647440	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr19	3660944	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=132,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=87.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.926:25:0,23:1,1:1,0,24,0
chr19	3667461	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	3728275	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=208,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:5,1,2,0
chr19	3731985	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.354:15:7,0:3,5:5,5,3,2
chr19	3740716	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:4,1:7,1:7,5,2,0
chr19	3750205	.	T	TGG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=108,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=G;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:2,0:8,2:3,7,1,1
chr19	3750263	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=191,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr19	3750690	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=123,225;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,2:9,0:6,8,0,2
chr19	3778690	.	T	TGTCACTCAGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0|1:3778690_T_TGTCACTCAGG:3778690:0,1,0,1
chr19	3778693	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3778690_T_TGTCACTCAGG:3778690:0,1,0,1
chr19	3781566	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=140,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,0:6,3:6,3,1,2
chr19	3783070	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=180,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr19	3783926	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:6,6,0,2
chr19	3784757	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=166,303;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:0,0:1,2:1,0,2,1
chr19	3806159	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:3806159_C_T:3806159:0,0,0,1
chr19	3806162	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:3806159_C_T:3806159:0,0,0,1
chr19	3811457	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:3811457_G_C:3811457:0,0,0,4
chr19	3811458	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:3811457_G_C:3811457:0,0,0,4
chr19	3823493	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:3823493_C_G:3823493:0,0,0,1
chr19	3823495	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3823493_C_G:3823493:0,0,0,1
chr19	3908201	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=182,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr19	3910933	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=159,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:4,6,3,2
chr19	3917606	.	AAAGGAAGAAGAAG	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=101,172;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:3917606_AAAGGAAGAAGAAG_A:3917606:2,0,1,0
chr19	3917625	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=101,172;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:3917606_AAAGGAAGAAGAAG_A:3917606:2,0,1,0
chr19	3917630	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=101,172;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:3917606_AAAGGAAGAAGAAG_A:3917606:2,0,1,0
chr19	3917634	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=101,172;MMQ=60,40;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.404:3:1,0:1,1:0|1:3917606_AAAGGAAGAAGAAG_A:3917606:2,0,1,0
chr19	3941212	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=145,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:5,1,0,2
chr19	3959081	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	3963724	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=211,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,5:3,3:4,4,5,4
chr19	3965021	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=206,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	3979833	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:5,4:12,0:14,4,4,0
chr19	3980824	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr19	3984412	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=247,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr19	4013256	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,210;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:8,0:11,6:14,5,0,6
chr19	4024020	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,9:0,5:0,0,5,9
chr19	4028067	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr19	4033225	.	C	CTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=272,81;MMQ=60,36;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.308:6:1,0:2,1:0|1:4033225_C_CTT:4033225:2,3,0,1
chr19	4033226	.	C	CTGTGGGTCCACCCTGTGCTGTCAGCGTGTTAGGTG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=272,81;MMQ=60,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.308:6:1,0:2,1:0|1:4033225_C_CTT:4033225:2,3,0,1
chr19	4033614	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	4090572	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr19	4090659	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=174,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,2:10,1:6,12,1,2
chr19	4099187	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr19	4110408	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=200,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr19	4153659	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,2,1
chr19	4157247	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:2,0:9,2:6,6,0,2
chr19	4174950	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr19	4177051	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0,0,4,1
chr19	4179369	.	A	ACATAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	4180690	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr19	4202793	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=145,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:3,0,3,1
chr19	4207161	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	4208788	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=190,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:4,3:4,5:5,3,4,5
chr19	4210017	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:0,1:0|1:4210017_G_A:4210017:1,0,1,2
chr19	4210035	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=194,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,4:0.416:10:2,4:3,0:1|0:4210017_G_A:4210017:4,2,2,2
chr19	4210356	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:4,2,1,6
chr19	4210382	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=149,154;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=100.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,34:0.778:43:6,27:3,5:4,5,1,33
chr19	4210401	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,5:0,5:0,1,2,8
chr19	4210465	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,1,10
chr19	4212345	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	4216910	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,6,4
chr19	4217379	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=168,93;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr19	4219541	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr19	4229635	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=197,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:3,2:3,2:1,5,2,2
chr19	4236858	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=381,291;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr19	4254520	.	CTGTGTGTGTGGGTG	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=80,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,2:6,0:8,8,0,2
chr19	4282863	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=139,183;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,0:4,3:5,3,0,3
chr19	4288184	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=126,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:6,2,1,1
chr19	4290408	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=201,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,3:4,0:7,2,4,0
chr19	4294542	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=129,304;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:5,1:6,6,1,1
chr19	4294551	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=142,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,4:2,6:3,2,3,7
chr19	4297925	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr19	4297968	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=178,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:4,1,2,0
chr19	4302504	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=129,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:1,3,0,4
chr19	4324370	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr19	4325115	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=201,213;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr19	4325133	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=242,107;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:1,1,1,1
chr19	4327498	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=238,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0,4,0,3
chr19	4328860	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=96,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,3:4,0:1,8,0,3
chr19	4333625	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=179,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:4,0,1,1
chr19	4352838	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=117,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:6,1:0,1:6,0,2,0
chr19	4352959	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=138,175;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,4:4,2:2,7,4,2
chr19	4355035	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=208,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:4,1,4,0
chr19	4355054	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=139,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr19	4355088	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=185,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:7,8:2,0:7,2,8,0
chr19	4355203	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=155,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,1,4
chr19	4363289	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:2,2:3,0,3,0
chr19	4363508	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=183,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:3,4,0,2
chr19	4363553	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=183,62;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:2,7,0,2
chr19	4363564	.	TGA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=173,330;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GA;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:3,7,0,2
chr19	4365397	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	4366833	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,125;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:5,10:9,0:14,0,10,0
chr19	4423419	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=99,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:5,7:5,6:2,8,3,10
chr19	4423939	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=130,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:0,9,0,2
chr19	4433582	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=140,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:11,0:8,3:0|1:4433582_T_A:4433582:4,15,0,3
chr19	4433586	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=144,92;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:10,0:7,3:0|1:4433582_T_A:4433582:2,15,0,3
chr19	4442336	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.647:18:2,10:4,1:2,4,5,7
chr19	4445446	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=147,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:5,2,2,0
chr19	4475362	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=167,332;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,0:5,3:7,8,0,3
chr19	4475606	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,2:3,0:0,6,0,2
chr19	4488926	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=216,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr19	4488969	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=196,174;MMQ=46,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0,2,0,1
chr19	4491476	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=175,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr19	4493708	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.473:21:4,6:7,3:7,4,6,4
chr19	4493735	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=148,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,3:11,0:11,10,2,1
chr19	4496198	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=211,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr19	4498245	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=266,287;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr19	4498440	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=167,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:0,4,0,5
chr19	4499632	.	AAGCTGGCCGGGGAGG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=111,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGCTGGCCGGGGAGG;STR;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.734:5:1,0:0,4:0,1,2,2
chr19	4501328	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=124,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:4,9,1,1
chr19	4504786	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=209,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,0:5,2:5,3,1,1
chr19	4504997	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr19	4508905	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:1,5,2,5
chr19	4511038	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:4,2,3,1
chr19	4511181	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=257,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:5,3,3,3
chr19	4511453	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr19	4511525	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=200,109;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.800:18:1,11:2,4:2,1,8,7
chr19	4511647	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=23,32;MFRL=184,188;MMQ=53,41;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.811:12:1,6:0,4:1,1,6,4
chr19	4511674	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=35,25;MFRL=188,189;MMQ=41,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.315:14:6,1:2,3:0|1:4511674_C_T:4511674:4,6,4,0
chr19	4511677	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=189,189;MMQ=41,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:7,1:2,2:0|1:4511674_C_T:4511674:3,6,4,0
chr19	4511679	.	CA	TG	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=33,25;MFRL=189,187;MMQ=41,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:7,1:2,2:0|1:4511674_C_T:4511674:3,6,4,1
chr19	4511725	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=221,186;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.850:11:0,3:1,7:0|1:4511725_T_C:4511725:0,1,6,4
chr19	4511730	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=221,186;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.846:11:0,3:1,7:0|1:4511725_T_C:4511725:0,1,6,4
chr19	4511757	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=191,63;MMQ=58,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,1:9,2:7,6,2,1
chr19	4512669	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=210,101;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:0,6:1,4:1,0,5,5
chr19	4525637	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=195,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:2,1:4,1,2,0
chr19	4546200	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.837:4:0,2:0,0:0,0,2,2
chr19	4554583	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	4557056	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,5:0,0,7,7
chr19	4557299	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr19	4652883	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,8;MFRL=204,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.245:13:4,0:5,0:4,6,3,0
chr19	4653420	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=268,184;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr19	4657957	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=188,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:2,1,3,0
chr19	4659924	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=212,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:0,7:4,4:2,2,6,5
chr19	4660799	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=108,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:0,5:3,4:1,2,2,7
chr19	4670236	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,10:0,0,12,11
chr19	4670313	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr19	4684642	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,7:2,3:1,2,6,4
chr19	4690817	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=239,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:1,1,5,1
chr19	4697757	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=251,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr19	4700187	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=217,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,2:4,9:6,2,4,7
chr19	4714044	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=202,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr19	4720031	.	C	CCCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCT;STR;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr19	4794548	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=199,171;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.357:15:5,3:5,1:5,5,1,4
chr19	4794948	.	A	AAACCTCAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=199,253;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,2:7,2:5,6,2,2
chr19	4795390	.	AT	A,ATTT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,27,26;MFRL=129,140,203;MMQ=60,60,60;MPOS=21,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,17;RU=T;STR;TLOD=5.41,5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,5:0.227,0.354:15:1,2,3:2,1,0:3,3,4,5
chr19	4795647	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=175,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	4816160	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	4839220	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:10,1:2,1:9,3,0,2
chr19	4844633	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:3,3:3,3:4,3,4,2
chr19	4844665	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=179,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=32.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,6:5,5:3,3,8,3
chr19	4852137	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=149,184;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:5,3:5,0:5,5,1,2
chr19	4852151	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=184,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.523:15:6,3:1,4:3,4,3,5
chr19	4930693	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=188,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,3:1,5:2,3,4,4
chr19	4932808	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:4,0:5,7,1,1
chr19	4944555	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	4945974	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr19	4946002	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=185,0;MMQ=60,53;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr19	4946005	.	G	GGGGGGGGGGGT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=0,185;MMQ=53,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:4946005_G_GGGGGGGGGGGT:4946005:0,2,0,1
chr19	4946006	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,13;MFRL=0,185;MMQ=53,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:4946005_G_GGGGGGGGGGGT:4946005:0,2,0,1
chr19	4946045	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=217,0;MMQ=60,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr19	4947041	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=135,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr19	4947062	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:5,1:4,0:7,2,1,1
chr19	4954310	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=97.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,4:0,27:0,0,29,3
chr19	4954679	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=42.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr19	4960583	.	CTG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,2:2,1:2,1,3,0
chr19	5047691	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:2,1:1,4:0,3,1,4
chr19	5132051	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,6:0,1:0,0,2,5
chr19	5134096	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,2:1,2:0,1,0,5
chr19	5137187	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,0:0,0,3,0
chr19	5137192	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,426;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	5211568	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=175,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:0|1:5211568_G_A:5211568:1,0,3,1
chr19	5211572	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=208,157;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:5211568_G_A:5211568:4,0,0,1
chr19	5211967	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=211,377;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:3,2,1,1
chr19	5214533	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,14,7
chr19	5214689	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:7,5:11,2:6,12,3,4
chr19	5214697	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,8,14
chr19	5216896	.	C	CG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	5219899	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:5,1,4,0
chr19	5222071	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	5229420	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=121,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:5229420_A_AG:5229420:0,4,1,1
chr19	5229423	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=121,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:5229420_A_AG:5229420:0,4,1,1
chr19	5229425	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=185,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:1,0:0|1:5229420_A_AG:5229420:0,4,1,1
chr19	5229428	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=185,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:5229420_A_AG:5229420:0,4,1,1
chr19	5239051	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:9,3:15,0:14,10,3,0
chr19	5240173	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=90,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr19	5243886	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	5256251	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=183,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,0:2,2:0,4,0,4
chr19	5260878	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=293,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:1,4:1,11:1,1,6,10
chr19	5260879	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=293,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=67.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:1,4:1,12:1,1,6,10
chr19	5260933	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr19	5263061	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr19	5264967	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=271,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,3:0,8:0,1,12,0
chr19	5455422	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=172,259;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr19	5456808	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=185,238;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,0:1,2:4,5,1,1
chr19	5592842	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,3:11,0:10,9,3,0
chr19	5595354	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=257,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,3,0
chr19	5612620	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=178,18716;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:0,4,2,0
chr19	5613396	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=192,170;MMQ=50,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:2,0,2,0
chr19	5654132	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:9,2:16,2:15,11,0,4
chr19	5654502	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=146,1498;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.261:9:3,0:4,2:0,7,2,0
chr19	5661919	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	5664115	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=149,224;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:12,0:17,2:15,14,0,2
chr19	5667204	.	AC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=17,28;MFRL=194,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.483:13:2,4:1,2:3,4,2,4
chr19	5667928	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=188,120;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:6,0:7,4:1,13,0,4
chr19	5678723	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=179,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:5678723_G_A:5678723:0,2,0,1
chr19	5678725	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=179,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.403:3:1,1:0,0:0|1:5678723_G_A:5678723:0,2,0,1
chr19	5687059	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=287,276;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr19	5693556	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=189,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,2:2,3:4,3,2,3
chr19	5694618	.	G	GGAATGAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=283,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:5694618_G_GGAATGAC:5694618:1,1,0,1
chr19	5694622	.	TG	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=283,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:5694618_G_GGAATGAC:5694618:1,1,0,1
chr19	5696245	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:3,5:2,10:3,2,6,9
chr19	5707204	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr19	5707628	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=227,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr19	5713115	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.371:11:3,2:2,1:0|1:5713115_A_C:5713115:2,5,4,0
chr19	5713118	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.370:11:4,0:3,0:0|1:5713115_A_C:5713115:2,5,4,0
chr19	5733931	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:1,3,1,2
chr19	5759231	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	5770881	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=286,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:5770881_C_A:5770881:1,0,1,0
chr19	5770884	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=12,26;MFRL=286,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:5770881_C_A:5770881:1,0,1,0
chr19	5776326	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:5,2,0,2
chr19	5785580	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=180,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:5,1,2,1
chr19	5786478	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=173,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:3,3,2,0
chr19	5787408	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=149,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:3,2:2,1:0,5,1,2
chr19	5788228	.	GCA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,230;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,1:5,1:3,7,1,1
chr19	5789565	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=161,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:4,2:4,3:5,4,4,1
chr19	5789584	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:4,2:5,2:5,4,3,2
chr19	5791167	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:5,2:4,5:2,8,1,6
chr19	5824422	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	5831577	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=143,297;MMQ=55,50;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:8,2,3,1
chr19	5831602	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=139,241;MMQ=43,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,2:9,1:5,8,1,2
chr19	5832589	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=161,262;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,3:5,2:3,6,1,4
chr19	5832618	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=171,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,2:2,0:1,7,0,2
chr19	5866585	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr19	5903807	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,0,11
chr19	5923285	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=163,152;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:4,0:9,5:6,8,0,5
chr19	5923848	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=153,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,3:4,0:3,8,1,2
chr19	5928147	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=199,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,0:1,5:0,1,0,6
chr19	5928185	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	5994823	.	CGAG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=185,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr19	6002917	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=263,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:0,4,0,6
chr19	6013200	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=189,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,0:1,1:0|1:6013200_T_TC:6013200:0,3,0,1
chr19	6013207	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=189,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:6013200_T_TC:6013200:0,3,0,1
chr19	6026288	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,18;MFRL=238,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.593:5:0,1:1,0:0,2,1,2
chr19	6141471	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=195,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:1,0,7,1
chr19	6147743	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=270,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,6:2,4:0,2,0,10
chr19	6151703	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,5:0,7:0,1,6,6
chr19	6213684	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:6213684_C_G:6213684:0,0,1,0
chr19	6213686	.	CACCA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=138,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:6213684_C_G:6213684:2,0,1,0
chr19	6213694	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=138,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:6213684_C_G:6213684:2,0,1,0
chr19	6213734	.	C	CG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=159,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.598:13:4,4:1,4:4,1,6,2
chr19	6226920	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr19	6306971	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=266,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,0:1,2:0,2,1,2
chr19	6361845	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	6375453	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,12;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.253:6:3,0:2,0:4,1,1,0
chr19	6415710	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=218,277;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:3,2,2,0
chr19	6415795	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:1,5:3,2:2,2,6,1
chr19	6417855	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,227;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:5,1,3,0
chr19	6419275	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,5:6,2:2,8,2,5
chr19	6419306	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=159,290;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:1,9,0,2
chr19	6420440	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=91,66;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:10,7,1,1
chr19	6427408	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=177,288;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:4,2:16,0:16,4,1,1
chr19	6427433	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=145,306;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:5,2:14,1:12,7,2,1
chr19	6442182	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr19	6452305	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:7,0:1,4:6,2,3,2
chr19	6456339	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	6456457	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:4,6,0,2
chr19	6468128	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,178;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:2,5:10,0:4,8,5,0
chr19	6469042	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=265,241;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0|1:6469042_CT_C:6469042:0,2,0,3
chr19	6469053	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=265,241;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0|1:6469042_CT_C:6469042:0,2,0,3
chr19	6469735	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=232,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:0,3,1,4
chr19	6475613	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=134,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.659:15:3,7:0,3:2,3,5,5
chr19	6477324	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,1:7,1:7,4,1,1
chr19	6478925	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,2:1,5:2,3,0,7
chr19	6479950	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=121,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.310:11:3,0:3,0:0|1:6479950_A_C:6479950:2,6,3,0
chr19	6479956	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=24,26;MFRL=128,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.269:13:3,2:4,1:0|1:6479950_A_C:6479950:3,7,3,0
chr19	6479960	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=28,27;MFRL=131,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,1:5,1:0|1:6479950_A_C:6479950:4,7,3,0
chr19	6479965	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=126,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:6,1:6,0:0|1:6479950_A_C:6479950:5,9,3,0
chr19	6479969	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=27,29;MFRL=126,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:6,2:7,1:0|1:6479950_A_C:6479950:5,9,3,0
chr19	6479971	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=29,12;MFRL=133,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:6,0:7,0:0|1:6479950_A_C:6479950:5,9,3,0
chr19	6495453	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=167,91;MMQ=60,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,2:8,1:9,6,2,1
chr19	6535039	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=180,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:10,0:7,2:9,9,1,1
chr19	6535080	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=170,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:5,1:4,1:1,8,0,2
chr19	6591050	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=182,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:6591050_G_T:6591050:0,2,0,1
chr19	6591055	.	G	GTGAGTACCAGGATCTGCCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=182,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:6591050_G_T:6591050:0,2,0,1
chr19	6679360	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,8,4
chr19	6679563	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr19	6686659	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr19	6690571	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=185,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:5,0,4,0
chr19	6690613	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=202,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr19	6690728	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=178,70;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,2:9,1:7,7,2,1
chr19	6690742	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=139,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,1:8,2:0|1:6690742_A_G:6690742:7,6,1,2
chr19	6690744	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=147,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,1:7,2:0|1:6690742_A_G:6690742:7,7,1,2
chr19	6690746	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=139,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,1:8,2:0|1:6690742_A_G:6690742:6,7,1,2
chr19	6693571	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=168,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,1:0,0:0,1,1,1
chr19	6696342	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=187,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.696:7:1,4:0,1:2,0,4,1
chr19	6696496	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=100,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:4,4:0,3:1,3,3,4
chr19	6696557	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:2,2,1,5
chr19	6696691	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=182,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0|1:6696691_G_T:6696691:0,4,3,1
chr19	6696699	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=182,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:4,1:0,1:0|1:6696691_G_T:6696691:0,4,3,1
chr19	6697406	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,0:1,6:2,1,5,1
chr19	6697829	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,2:2,1:2,2,2,1
chr19	6702042	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	6702246	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=135,244;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr19	6702471	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=128,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,0:7,3:6,9,2,1
chr19	6702598	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:2,4:2,3,3,3
chr19	6709620	.	A	AGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.774:2:0,0:0,1:0|1:6709620_A_AGG:6709620:0,0,2,0
chr19	6709622	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,0:0|1:6709620_A_AGG:6709620:0,0,2,0
chr19	6709624	.	CCA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:6709620_A_AGG:6709620:0,0,1,0
chr19	6710572	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr19	6731304	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=222,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,2:3,1:4,5,0,3
chr19	6732018	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:6,2:7,6,0,2
chr19	6732965	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=158,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.412:10:3,0:1,0:3,3,4,0
chr19	6732982	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:2,2:3,4:3,3,3,4
chr19	6733517	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=191,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:4,1,6,0
chr19	6734131	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,5,4
chr19	6735929	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:4,5:9,6:6,7,6,5
chr19	6739934	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=214,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:0,5,0,3
chr19	6743617	.	TGGCGGGGGCGG	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,32;MFRL=85,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:6743617_TGGCGGGGGCGG_T:6743617:2,0,0,1
chr19	6743630	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,32;MFRL=85,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:6743617_TGGCGGGGGCGG_T:6743617:2,0,0,1
chr19	6743632	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=36,32;MFRL=85,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:6743617_TGGCGGGGGCGG_T:6743617:2,0,0,1
chr19	6743635	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,23;MFRL=85,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:6743617_TGGCGGGGGCGG_T:6743617:2,0,0,1
chr19	6743639	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,30;MFRL=85,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:6743617_TGGCGGGGGCGG_T:6743617:2,0,0,1
chr19	6743643	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=85,177;MMQ=60,60;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:6743617_TGGCGGGGGCGG_T:6743617:2,0,0,1
chr19	6743645	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,34;MFRL=85,177;MMQ=60,60;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:6743617_TGGCGGGGGCGG_T:6743617:2,0,0,1
chr19	6744762	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:3,6:1,8:4,0,3,11
chr19	6745105	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,34;MFRL=212,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:0,1:0,4:0,1,0,5
chr19	6750023	.	C	CACAATAAACAACA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=116,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,2:10,0:0|1:6750023_C_CACAATAAACAACA:6750023:6,7,1,1
chr19	6750026	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=131,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,2:10,0:0|1:6750023_C_CACAATAAACAACA:6750023:6,8,1,1
chr19	6750028	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=131,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:7,0:0|1:6750023_C_CACAATAAACAACA:6750023:6,8,1,1
chr19	6750030	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=131,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:7,0:0|1:6750023_C_CACAATAAACAACA:6750023:4,8,1,1
chr19	6750134	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	6751279	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=173,237;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:7,0:7,3:0|1:6751279_A_G:6751279:8,7,2,1
chr19	6751281	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=173,237;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:8,0:6,2:0|1:6751279_A_G:6751279:8,7,2,1
chr19	6751293	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=173,237;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:11,0:8,3:10,9,2,1
chr19	6751348	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=195,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:3,5:3,3:4,2,5,4
chr19	6754774	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,7,12
chr19	6760974	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:12,1:7,1:2,17,0,2
chr19	6821931	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=190,300;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr19	6822219	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=177,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:5,4,2,1
chr19	6825032	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=146,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:8,4,1,2
chr19	6828040	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=156,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr19	6832060	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr19	6897117	.	CT	AT,AA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,11,10;MFRL=128,289,180;MMQ=58,60,60;MPOS=3,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.57,3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.382,0.308:4:1,0,0:0,0,0:1,0,3,0
chr19	6897120	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,15;MFRL=280,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:6897120_T_A:6897120:3,0,1,0
chr19	6897123	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,15;MFRL=141,180;MMQ=58,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:6897120_T_A:6897120:3,0,1,0
chr19	6897392	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=173,280;MMQ=55,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:8,1:2,1:3,7,1,1
chr19	6901891	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=118,174;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:9,1:3,3:9,3,3,1
chr19	6906357	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,252;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:10,0,2,0
chr19	6908675	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31,32;MFRL=0,172,140;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=T;STR;TLOD=6.01,14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,6:0.251,0.657:9:1,0,1:0,2,3:1,0,5,3
chr19	6913878	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	6919495	.	G	GTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,21;MFRL=100,205;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:3,1,1,0
chr19	6919529	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=99,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=78.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.882:23:2,11:0,10:1,1,9,12
chr19	6935113	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,3,8
chr19	6935121	.	T	TAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=43.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,6:0,0,3,7
chr19	6937683	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr19	6939910	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=169,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr19	7032688	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,291;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	7051637	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=156,174;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:1,12:5,3:3,3,7,8
chr19	7051643	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=156,173;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.642:18:1,9:4,1:3,3,6,6
chr19	7082088	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=183,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,4:7,2:2,7,1,5
chr19	7117438	.	C	CATAAAT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=183,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.265:9:3,2:4,0:0|1:7117438_C_CATAAAT:7117438:1,6,1,1
chr19	7117440	.	C	CATAGTATTCCATG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=183,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:0|1:7117438_C_CATAAAT:7117438:1,6,1,1
chr19	7122913	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=198,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:3,8,1,1
chr19	7150418	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=220,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr19	7152989	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=88,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.409:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr19	7163230	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=80,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:3,4:0,5:1,2,6,3
chr19	7166109	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr19	7168194	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=213,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr19	7504767	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.466:15:2,2:6,5:6,2,6,1
chr19	7504770	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=164,283;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:2,0:10,2:9,3,2,0
chr19	7506668	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=181,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,1:2,7:3,3,4,4
chr19	7506755	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=166,229;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,1,1
chr19	7506982	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=172,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:8,3:1,5:1,8,2,6
chr19	7507009	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=172,225;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0,9,0,2
chr19	7507010	.	CCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=193,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,5;RU=CCTT;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.244:7:3,0:1,1:0,6,0,1
chr19	7512065	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=190,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:0,2,2,4
chr19	7516243	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr19	7518268	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr19	7524714	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=207,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,0:3,0,2,0
chr19	7524717	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=184,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:4,0,1,0
chr19	7524743	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr19	7529415	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=203,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:7,0,2,1
chr19	7535249	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=242,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr19	7568966	.	A	ATCTCTCTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=450,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,11;RU=TC;STR;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,0:1,2:1,0,0,4
chr19	7571094	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr19	7571140	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7571140_A_C:7571140:0,1,0,1
chr19	7571142	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7571140_A_C:7571140:0,1,0,1
chr19	7584086	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=211,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr19	7585144	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	7594159	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=211,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr19	7595121	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=214,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:4,0,6,0
chr19	7607441	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,4:1,4:0,2,5,3
chr19	7607564	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=222,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.826:13:1,4:0,7:0,2,5,6
chr19	7615585	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=188,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr19	7619199	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,6,8
chr19	7619239	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=255,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,2:0,5:1,1,2,5
chr19	7619647	.	GT	CC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=201,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr19	7619700	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr19	7619760	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=246,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,6,0
chr19	7620116	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=188,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:0,1,6,2
chr19	7621981	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	7624079	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=212,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:1,4:0,2,2,6
chr19	7626013	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,0:0,4:0,0,3,2
chr19	7626069	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=187,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,3:6,4:8,2,4,3
chr19	7626071	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,1:9,1:12,4,1,1
chr19	7626428	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=129,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,2:4,1:0,9,0,3
chr19	7675877	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=159,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:5,1:6,2,3,3
chr19	7675917	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=181,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,2:2,1:2,4,2,1
chr19	7684450	.	GGGGGGAT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=183,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:2,2:7,0,3,0
chr19	7687466	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=215,217;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr19	7687490	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=338,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:7687490_G_C:7687490:1,2,0,1
chr19	7687492	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=338,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:7687490_G_C:7687490:1,2,0,1
chr19	7687494	.	GGGCTC	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=338,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:7687490_G_C:7687490:1,2,0,1
chr19	7687502	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=338,217;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:7687490_G_C:7687490:1,2,0,1
chr19	7691052	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:14,0:6,4:8,12,3,1
chr19	7692058	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=179,237;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr19	7697779	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:7697779_T_C:7697779:0,2,0,1
chr19	7697787	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:7697779_T_C:7697779:0,2,0,1
chr19	7698226	.	C	CTAAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=146,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,2:3,0,5,0
chr19	7708159	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,1:3,1:0,5,1,1
chr19	7710040	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=191,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,2,1
chr19	7710210	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:0,6,1,5
chr19	7710269	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,3:0,3:0,2,1,5
chr19	7712425	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=127,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:1,3,2,4
chr19	7712474	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=75,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:4,0,4,1
chr19	7712585	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=151,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:1,1,0,7
chr19	7712710	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,1:0,7,0,2
chr19	7734369	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr19	7734814	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=243,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:2,2,1,3
chr19	7735089	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=220,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr19	7743821	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,228;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:3,3:11,0:6,8,2,1
chr19	7743879	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=170,122;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.493:28:10,5:4,7:8,6,9,5
chr19	7744075	.	ACC	A,AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25,17;MFRL=0,185,56;MMQ=60,60,60;MPOS=19,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=C;STR;TLOD=3.94,5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.471,0.413:6:0,2,0:0,1,0:0,0,1,5
chr19	7754136	.	A	ACTCCGGACT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=163,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:4,9,0,2
chr19	7755285	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=140,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:1,1:2,2:2,2,2,1
chr19	7755469	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=162,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:7755469_T_C:7755469:0,2,0,2
chr19	7755472	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=162,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,0:0|1:7755469_T_C:7755469:0,2,0,2
chr19	7755478	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:7755469_T_C:7755469:0,1,0,2
chr19	7755482	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0|1:7755469_T_C:7755469:0,1,0,2
chr19	7755485	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:7755469_T_C:7755469:0,0,0,2
chr19	7761812	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:1,1,1,3
chr19	7764545	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=216,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.764:15:2,9:1,3:3,0,9,3
chr19	7764741	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=263,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,5:1,1:0,3,0,6
chr19	7764772	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=243,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,1,3
chr19	7794605	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr19	7796497	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr19	7831700	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=103,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,2:4,7:3,5,7,2
chr19	7833876	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=133,304;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:1,6,0,2
chr19	7911343	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.748:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	7913752	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,2,1
chr19	7913974	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=152,178;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:3,3:1,1:1,4,1,3
chr19	7916475	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,13,11
chr19	7917919	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=86,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,4:3,3:2,1,4,3
chr19	7918103	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr19	7927465	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=149,256;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr19	7964907	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:12,6,2,0
chr19	7970635	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=136,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.450:29:11,7:4,5:9,7,5,8
chr19	7975087	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:2,4,2,0
chr19	7975464	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=109,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:4,2:0,6:2,2,4,4
chr19	7976112	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	7976529	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=260,240;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr19	7992052	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=168,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr19	7995987	.	TA	T,TAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,21,28;MFRL=189,160,151;MMQ=60,60,60;MPOS=11,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=6.20,5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,5:0.297,0.367:13:3,0,1:1,4,3:4,0,4,5
chr19	7997644	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:4,1:3,4:3,5,3,2
chr19	7997683	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.416:14:1,1:6,2:4,4,4,2
chr19	7997870	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=140,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr19	7998733	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=273,226;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:1,3,3,0
chr19	8000045	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.321:16:8,2:3,2:5,6,4,1
chr19	8000052	.	C	CTT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=19,30;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=20,22;RU=T;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.682:4:0,2:0,1:0,1,1,2
chr19	8000104	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=191,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,6:5,1:0,8,0,7
chr19	8002868	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=204,103;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,3:8,2:9,2,3,2
chr19	8032680	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=159,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.606:11:0,2:4,3:1,3,1,6
chr19	8121189	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=184,267;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr19	8127075	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,2:3,5:2,3,5,3
chr19	8136839	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,283;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	8137902	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=182,137;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:0,0:3,4:0|1:8137902_C_T:8137902:3,1,4,0
chr19	8137908	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=182,136;MMQ=60,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:0|1:8137902_C_T:8137902:3,1,4,1
chr19	8148314	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr19	8151239	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:5,1:3,6:0|1:8151239_G_C:8151239:3,5,2,5
chr19	8151261	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=186,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,9:0.625:14:1,6:3,3:1|0:8151239_G_C:8151239:0,5,2,7
chr19	8152140	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,37;MFRL=156,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr19	8156290	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=134,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,1,3
chr19	8160812	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=228,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr19	8167830	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	8168399	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=166,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr19	8176919	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=111,86;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:2,1:8,3:5,5,1,3
chr19	8181526	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=15,12;MFRL=148,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:0,0:0|1:8181526_A_C:8181526:2,0,1,0
chr19	8181530	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,19;MFRL=130,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.587:3:1,0:0,1:0|1:8181526_A_C:8181526:1,0,2,0
chr19	8181535	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=148,236;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:1,0:0,0:0|1:8181526_A_C:8181526:2,0,1,0
chr19	8190679	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,2:0,8:0,0,10,0
chr19	8191323	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr19	8196550	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=145,123;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:3,8,0,2
chr19	8197786	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	8197865	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	8200759	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr19	8200818	.	C	CAGGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=261,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,0:0,1:0|1:8200818_C_CAGGGG:8200818:0,2,1,0
chr19	8200819	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=261,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,0:0,1:0|1:8200818_C_CAGGGG:8200818:0,2,1,0
chr19	8201051	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=307,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,3,4
chr19	8201249	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=203,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr19	8202944	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr19	8316064	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=158,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.252:13:4,2:4,0:3,7,3,0
chr19	8319590	.	A	ATC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=188,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,0:1,1:0|1:8319590_A_ATC:8319590:0,1,0,1
chr19	8319591	.	G	GCTTGAAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=188,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,0:1,1:0|1:8319590_A_ATC:8319590:0,1,0,1
chr19	8320656	.	TGGGGCGGGGC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.677:7:1,4:0,1:2,0,4,1
chr19	8321583	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=135,44;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:2,0:9,2:0|1:8321583_G_T:8321583:5,6,1,1
chr19	8321590	.	GCA	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=135,44;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:1,0:9,2:0|1:8321583_G_T:8321583:5,6,1,1
chr19	8321594	.	GG	TT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=140,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:9,2:0|1:8321583_G_T:8321583:5,7,1,1
chr19	8321602	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=140,44;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:3,0:8,2:0|1:8321583_G_T:8321583:5,7,1,1
chr19	8321937	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:4,3:4,5,2,5
chr19	8321946	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=155,271;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:4,4,1,1
chr19	8321969	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=155,271;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:2,1:3,2,1,1
chr19	8386367	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,260;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:5,1:4,2:8,2,3,0
chr19	8386998	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=224,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.774:20:2,7:2,9:0,4,6,10
chr19	8387731	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:10,0:3,3:3,11,0,3
chr19	8389768	.	GTCACAGGTTGAC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=217,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.503:6:1,3:2,0:1,2,3,0
chr19	8398185	.	G	GATGCAATTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	8398531	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=171,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr19	8398714	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=196,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,1,3
chr19	8467235	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr19	8467433	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=146,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:0|1:8467433_C_CT:8467433:12,3,1,1
chr19	8467434	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=146,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:7,0:7,2:0|1:8467433_C_CT:8467433:12,3,1,1
chr19	8467436	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=146,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:8467433_C_CT:8467433:12,3,1,1
chr19	8467538	.	C	CTTGTTTTTTTCTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTGTTTTTTTCTTT;STR;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr19	8468337	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=201,163;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.372:19:8,1:4,5:2,10,4,3
chr19	8468474	.	TC	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=102,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:1,1,0,2
chr19	8495564	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,0:5,2:6,2,1,1
chr19	8495765	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=165,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,0:8,3:10,3,1,2
chr19	8528277	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=211,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr19	8528310	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=227,142;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=49.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,10:1,5:2,0,15,0
chr19	8536373	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=189,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,5:1,2:0,2,0,7
chr19	8548175	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.499:20:5,5:5,5:1,9,3,7
chr19	8550412	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	8551094	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	8551852	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=255,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:1,0,5,3
chr19	8555886	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,2:1,2:3,4,1,3
chr19	8556148	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=206,158;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:8556148_TG_CA:8556148:0,3,0,1
chr19	8556158	.	CC	TA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=206,158;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:8556148_TG_CA:8556148:0,3,0,1
chr19	8563595	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=183,114;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:9,0:14,5:10,13,0,5
chr19	8567548	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	8576307	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr19	8587381	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:8587381_G_T:8587381:0,1,0,1
chr19	8587384	.	C	CCTTAGGGTCTTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:8587381_G_T:8587381:0,1,0,1
chr19	8587782	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	8601362	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,1:1,0,0,3
chr19	8601407	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=147,102;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,2:5,0:8,8,2,0
chr19	8606932	.	G	GTCTCTGAGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=59,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:0,1:2,1,0,1
chr19	8617106	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=191,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr19	8645930	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr19	8654277	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=234,238;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,2,0
chr19	8654289	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=234,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:8654289_A_C:8654289:0,1,2,0
chr19	8654295	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,22;MFRL=234,238;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:8654289_A_C:8654289:0,1,2,0
chr19	8654297	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,19;MFRL=242,238;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,1:0|1:8654289_A_C:8654289:0,2,2,0
chr19	8654302	.	AT	CC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=234,238;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,1:0|1:8654289_A_C:8654289:0,3,2,0
chr19	8657074	.	C	CAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=199,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AG;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr19	8665893	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,81;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,3:6,0:2,8,2,1
chr19	8669873	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=181,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:3,2:0,8:3,0,6,4
chr19	8809100	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=112,249;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.389:8:1,1:3,1:3,2,1,2
chr19	8841558	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=175,148;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,1:5,2:8,3,1,2
chr19	8922662	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:6,3:5,0:8,3,3,0
chr19	8959696	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=152,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,3:9,0:8,5,2,1
chr19	8959797	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=171,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr19	8962434	.	C	CTTTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,21;RU=T;STR;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,2:0,2:0,0,2,3
chr19	8962461	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr19	8973507	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=132,101;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr19	8976865	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,10:0.274:38:20,0:8,8:17,11,0,10
chr19	8979112	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,241;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr19	8982146	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=199,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:3,1,1,1
chr19	8987133	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=95,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:4,8:1,2:2,3,5,5
chr19	8992940	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=29,36;MFRL=153,62;MMQ=60,37;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,1:7,0:0|1:8992940_A_G:8992940:5,9,1,1
chr19	8992942	.	AC	TA	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=26,27;MFRL=152,62;MMQ=60,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.161:18:7,2:6,0:0|1:8992940_A_G:8992940:5,10,2,1
chr19	8992947	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=26,29;MFRL=152,62;MMQ=60,37;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.161:18:7,2:8,1:0|1:8992940_A_G:8992940:5,10,2,1
chr19	8992971	.	TA	GG	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=152,93;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,1:10,1:0|1:8992971_TA_GG:8992971:8,7,1,1
chr19	8992980	.	CT	GG	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=153,93;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,1:11,1:0|1:8992971_TA_GG:8992971:8,8,1,1
chr19	8992988	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=147,93;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,1:11,1:0|1:8992988_G_A:8992988:10,8,1,1
chr19	8992993	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=30,28;MFRL=154,93;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,1:10,1:0|1:8992988_G_A:8992988:9,6,1,1
chr19	8992996	.	TG	AA	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=25,26;MFRL=154,93;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:4,1:10,1:0|1:8992988_G_A:8992988:9,6,1,1
chr19	8993392	.	CCTGTCCAGTGTGTAGGGGCCCAGCTCAGTGATGCTGTGGGTCAGCTGGCTCAGCTCCAAATACAGCTGCTCT	C	.	.	DP=41;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=157,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.072:41:7,0:8,2:17,21,1,2
chr19	8993426	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=152,179;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:7,3:9,1:8,8,0,4
chr19	8993443	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=185,199;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.165:22:9,2:10,1:0|1:8993443_C_T:8993443:9,10,0,3
chr19	8993449	.	CA	GC	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=163,199;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:10,2:9,1:0|1:8993443_C_T:8993443:10,10,0,3
chr19	8993452	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=26,32;MFRL=169,199;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.165:22:9,2:9,1:0|1:8993443_C_T:8993443:9,10,0,3
chr19	8993479	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=35,28;MFRL=167,199;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:8,2:15,1:0|1:8993479_G_T:8993479:7,18,0,3
chr19	8993481	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=35,28;MFRL=167,199;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:9,2:16,0:0|1:8993479_G_T:8993479:7,18,0,3
chr19	8993483	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=8;MBQ=34,27;MFRL=167,100;MMQ=60,30;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:8,2:15,0:0|1:8993479_G_T:8993479:9,18,0,2
chr19	8994113	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=94,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,2:4,5:4,2,6,1
chr19	8994285	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=171,251;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:2,2:7,3:8,2,3,2
chr19	8994373	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=129,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.750:18:1,6:3,8:2,2,9,5
chr19	8995853	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=142,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:1,5:2,5:2,1,6,4
chr19	8997343	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=34,29;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,4:2,5:3,2,6,3
chr19	8997415	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=9;MBQ=32,22;MFRL=166,99;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:11,0:15,2:0|1:8997415_G_A:8997415:15,11,2,1
chr19	8997421	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=166,103;MMQ=60,33;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:10,0:14,4:0|1:8997415_G_A:8997415:14,10,2,2
chr19	8997424	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=9;MBQ=31,29;MFRL=163,103;MMQ=60,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:9,0:16,4:15,10,2,2
chr19	8997454	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=33,27;MFRL=170,99;MMQ=60,38;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.225:29:8,1:14,4:0|1:8997454_G_A:8997454:16,7,2,4
chr19	8997463	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=9;MBQ=32,29;MFRL=167,99;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.255:29:7,1:12,6:13,9,2,5
chr19	8997472	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=161,99;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,7:0.258:29:4,1:16,5:0|1:8997454_G_A:8997454:13,9,2,5
chr19	8997481	.	CC	AT	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=31,27;MFRL=160,103;MMQ=60,38;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:4,1:15,5:0|1:8997454_G_A:8997454:12,9,1,5
chr19	8997499	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=33,27;MFRL=166,103;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:2,0:13,2:8,8,0,2
chr19	8999101	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=180,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:3,3:1,4,1,3
chr19	8999373	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=31,21;MFRL=140,124;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,2:10,0:9,6,2,1
chr19	8999381	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=32,20;MFRL=139,56;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:6,1:9,2:0|1:8999381_C_A:8999381:9,6,1,2
chr19	8999383	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=28,31;MFRL=146,97;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:4,3:7,3:0|1:8999383_A_G:8999383:7,5,3,3
chr19	8999386	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=28,31;MFRL=152,124;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:4,3:7,4:0|1:8999383_A_G:8999383:6,5,4,3
chr19	8999395	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=27,20;MFRL=139,56;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:7,1:9,2:0|1:8999381_C_A:8999381:11,6,1,2
chr19	8999429	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=11;MBQ=32,27;MFRL=135,118;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:10,4:14,2:17,7,3,4
chr19	8999438	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=29,26;MFRL=135,118;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,17:0.514:33:8,8:8,8:0|1:8999438_A_T:8999438:10,6,11,6
chr19	8999441	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=32,27;MFRL=128,114;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,8:0.249:34:12,3:12,5:0|1:8999441_G_A:8999441:14,12,7,1
chr19	8999443	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=25,32;MFRL=127,114;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,8:0.257:33:11,3:12,4:0|1:8999441_G_A:8999441:14,11,7,1
chr19	8999449	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=11;MBQ=33,25;MFRL=127,92;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,16:0.487:33:7,9:9,7:0|1:8999438_A_T:8999438:11,6,9,7
chr19	8999453	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=11;MBQ=32,27;MFRL=101,158;MMQ=57,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,2:14,1:17,11,2,1
chr19	8999623	.	GATCC	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=192,169;MMQ=60,51;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:8999623_GATCC_G:8999623:0,2,0,1
chr19	8999628	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,36;MFRL=192,169;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:8999623_GATCC_G:8999623:0,2,0,1
chr19	8999631	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=192,169;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:8999623_GATCC_G:8999623:0,2,0,1
chr19	8999633	.	G	GGT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=192,169;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:8999623_GATCC_G:8999623:0,2,0,1
chr19	8999635	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=192,169;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:8999623_GATCC_G:8999623:0,2,0,1
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chr19	9009761	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=34,29;MFRL=171,151;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,1:6,2:0|1:9009750_GA_TG:9009750:3,7,2,1
chr19	9009772	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=180,105;MMQ=60,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0|1:9009772_T_C:9009772:3,4,1,1
chr19	9009774	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=180,105;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0|1:9009772_T_C:9009772:3,4,1,1
chr19	9009776	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=180,105;MMQ=60,44;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0|1:9009772_T_C:9009772:3,4,1,1
chr19	9012840	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=27,28;MFRL=116,32;MMQ=60,33;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.226:29:8,3:14,3:14,9,2,4
chr19	9012848	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=108,0;MMQ=60,34;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:8,2:15,2:13,13,2,2
chr19	9012894	.	A	AG	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=27,27;MFRL=87,0;MMQ=60,34;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:11,1:17,2:0|1:9012894_A_AG:9012894:11,19,1,2
chr19	9012896	.	CA	GG	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=32,35;MFRL=87,0;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:9,3:21,0:0|1:9012896_CA_GG:9012896:10,20,2,1
chr19	9012897	.	AG	A	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=27,23;MFRL=87,0;MMQ=60,34;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.124:30:8,1:19,2:0|1:9012894_A_AG:9012894:9,18,1,2
chr19	9012902	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=8;MBQ=28,35;MFRL=87,0;MMQ=60,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:10,3:19,0:0|1:9012896_CA_GG:9012896:10,22,2,1
chr19	9012908	.	AG	GA	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=87,25;MMQ=60,35;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.211:30:8,4:16,2:5,19,4,2
chr19	9012917	.	AC	GT	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=26,33;MFRL=87,52;MMQ=60,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:6,2:15,0:3,18,1,1
chr19	9014104	.	AGG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=194,260;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:11,3,0,2
chr19	9014242	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=189,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:8,2:1,0:0|1:9014242_A_AT:9014242:1,8,0,2
chr19	9014243	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=189,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:8,2:1,0:0|1:9014242_A_AT:9014242:1,8,0,2
chr19	9014245	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=189,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,2:1,0:0|1:9014242_A_AT:9014242:1,8,0,2
chr19	9014456	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=149,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:6,0,4,1
chr19	9015364	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=8;MBQ=28,29;MFRL=139,0;MMQ=60,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.102:37:18,0:15,2:0|1:9015364_T_A:9015364:19,15,2,1
chr19	9015374	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=8;MBQ=34,29;MFRL=130,0;MMQ=60,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.089:43:19,1:18,2:0|1:9015364_T_A:9015364:21,19,2,1
chr19	9015382	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=132,0;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:22,1:19,2:0|1:9015364_T_A:9015364:22,21,2,1
chr19	9015392	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=137,0;MMQ=60,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:23,1:18,2:0|1:9015364_T_A:9015364:21,20,2,1
chr19	9015409	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=157,0;MMQ=60,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:23,1:19,2:21,22,2,1
chr19	9015435	.	GT	G	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=163,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,1:10,1:10,14,1,1
chr19	9015436	.	T	TG	.	.	DP=29;ECNT=8;MBQ=29,28;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.687:28:4,11:3,9:2,6,9,11
chr19	9015438	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=8;MBQ=25,27;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=79.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.700:28:4,11:4,7:2,6,9,11
chr19	9019429	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,269;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:1,4,3,2
chr19	9020211	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=232,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:1,4,0,4
chr19	9020666	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=199,238;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr19	9020821	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=94,55;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:21,1:14,1:0|1:9020821_T_A:9020821:23,15,0,2
chr19	9020829	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=94,55;MMQ=60,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.078:36:19,1:14,1:0|1:9020821_T_A:9020821:18,16,0,2
chr19	9024758	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr19	9024804	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=208,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:6,2,2,0
chr19	9024994	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,3:4,4:2,4,1,6
chr19	9025584	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=129,98;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,1:4,1:8,1,2,0
chr19	9027685	.	CCATTAAAG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,142;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr19	9028432	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr19	9033548	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:4,1,1,2
chr19	9043347	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr19	9043501	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=220,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:9043501_G_A:9043501:0,2,0,1
chr19	9043504	.	AG	TA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=220,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:9043501_G_A:9043501:0,2,0,1
chr19	9043514	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=220,80;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:9043501_G_A:9043501:0,2,0,1
chr19	9043515	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=220,80;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:9043501_G_A:9043501:0,2,0,1
chr19	9047206	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:6,2:6,0:6,6,2,0
chr19	9048342	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,5:2,4:1,3,5,4
chr19	9049149	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=101,204;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,5:6,1:5,7,2,4
chr19	9049396	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=201,224;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:6,3,2,2
chr19	9059808	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=83,147;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:1,2,3,2
chr19	9060605	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:4,5:6,3:5,5,4,5
chr19	9062415	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,296;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.183:20:7,3:9,0:12,5,1,2
chr19	9067021	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=142,69;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.163:26:11,0:11,3:8,14,1,3
chr19	9067864	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=130,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:11,6:6,0:7,10,6,0
chr19	9068587	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=116,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,0:16,2:17,11,0,2
chr19	9076278	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=72,175;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.684:20:2,6:4,8:2,4,7,7
chr19	9076858	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=153,178;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.587:20:7,5:1,6:6,2,6,6
chr19	9077803	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,3:6,5:3,7,3,5
chr19	9077902	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=232,260;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,3:4,1:0,5,0,4
chr19	9082436	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=201,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:1,7,1,1
chr19	9082948	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=173,56;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:5,9,1,1
chr19	9084835	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=220,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.411:10:4,1:2,2:3,3,2,2
chr19	9084860	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:3,1:4,1:2,5,1,1
chr19	9085958	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=207,103;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,6:4,1:4,6,3,4
chr19	9086890	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:11,7,1,1
chr19	9087673	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,103;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:13,2:6,0:8,11,2,0
chr19	9089458	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=168,48;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:10,0:11,3:14,8,1,2
chr19	9090182	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,7:6,2:4,7,6,3
chr19	9090201	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,18;MFRL=155,61;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,0:6,1:10,9,1,1
chr19	9090224	.	G	GCC	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=35,20;MFRL=138,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:5,2:0|1:9090224_G_GCC:9090224:7,6,1,1
chr19	9090226	.	T	TTTGAGGGTGGGACCGCTGCTA	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:5,2:0|1:9090224_G_GCC:9090224:8,6,1,1
chr19	9090228	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=138,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:5,1:0|1:9090224_G_GCC:9090224:8,5,1,1
chr19	9204016	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=121,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:10,4,1,1
chr19	9204917	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,298;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	9271919	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,0:7,3:7,11,0,3
chr19	9297160	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,140;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:6,5:10,0:6,10,5,0
chr19	9297605	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=214,346;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0|1:9297605_TC_T:9297605:0,3,1,1
chr19	9297606	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	9297614	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,16;MFRL=214,346;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,0:3,0:0|1:9297605_TC_T:9297605:0,3,1,1
chr19	9297617	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,15;MFRL=214,400;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:9297605_TC_T:9297605:0,3,1,0
chr19	9298174	.	T	TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=203,252;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.428:11:1,3:5,2:6,0,3,2
chr19	9361951	.	T	TCGCAAGCTCATC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=189,65;MMQ=48,22;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:3,7,1,1
chr19	9407634	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=196,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr19	9408163	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=201,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0,4,2,1
chr19	9408759	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=235,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:0,8,0,3
chr19	9449149	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:1,3:0,3:1,0,7,0
chr19	9449337	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=205,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:2,2,1,2
chr19	9489132	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr19	9490358	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=239,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:1,1,0,3
chr19	9490696	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=126,0;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,2:11,0:0|1:9490696_T_C:9490696:17,6,0,2
chr19	9490699	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=126,0;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,2:11,0:0|1:9490696_T_C:9490696:17,6,0,2
chr19	9492490	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,0:2,5:0,7,0,5
chr19	9492502	.	T	TGTAAGCACAGGTTTGGGGTCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=200,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:9492502_T_TGTAAGCACAGGTTTGGGGTCC:9492502:0,2,0,1
chr19	9492505	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=200,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,1:1,0:0|1:9492502_T_TGTAAGCACAGGTTTGGGGTCC:9492502:0,2,0,1
chr19	9526245	.	TT	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=196,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr19	9528423	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.385:8:2,2:2,1:5,0,3,0
chr19	9529212	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,124;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:15,0:10,4:16,9,0,4
chr19	9582092	.	TAAAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=184,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,5;RU=A;STR;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.828:9:1,5:0,3:1,0,1,7
chr19	9641821	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=188,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr19	9641835	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,35;MFRL=246,110;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:9641835_TG_CA:9641835:0,3,0,1
chr19	9641841	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=214,110;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:9641835_TG_CA:9641835:0,4,0,1
chr19	9641846	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=214,110;MMQ=52,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:9641835_TG_CA:9641835:0,2,0,1
chr19	9641848	.	GT	CC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,30;MFRL=181,110;MMQ=43,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:9641835_TG_CA:9641835:0,1,0,1
chr19	9646935	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:5,0:16,2:9,12,1,1
chr19	9724625	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,5:2,0:2,0,5,0
chr19	9870717	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=176,150;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:9870717_T_C:9870717:0,4,0,2
chr19	9870720	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=176,150;MMQ=60,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:9870717_T_C:9870717:0,4,0,2
chr19	9870725	.	TTG	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=177,150;MMQ=60,46;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:9870717_T_C:9870717:0,5,0,2
chr19	9939012	.	GG	AA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=160,62;MMQ=60,53;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:9,0:4,13,0,2
chr19	9964823	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr19	10071063	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,7,4
chr19	10078622	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=75,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:2,3,0,2
chr19	10080140	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=210,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,1,2
chr19	10080236	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=209,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:2,2,2,0
chr19	10080410	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=211,247;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:6,2,2,0
chr19	10080619	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:0,2:2,4:0,2,3,3
chr19	10083510	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	10084124	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr19	10084551	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:2,5:2,5:2,2,6,4
chr19	10087200	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=179,300;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,1:4,1:5,5,2,0
chr19	10089214	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=150,236;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.228:18:7,1:2,0:5,9,4,0
chr19	10089225	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=147,252;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.215:19:7,1:3,0:5,10,4,0
chr19	10089492	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=221,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.441:7:1,1:2,2:0|1:10089492_T_TG:10089492:0,4,3,0
chr19	10089498	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=203,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:1,0:2,0:0|1:10089492_T_TG:10089492:1,4,3,0
chr19	10089502	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=225,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:1,0:3,0:0|1:10089492_T_TG:10089492:1,3,2,0
chr19	10091267	.	A	ATCTC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=225,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TC;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.734:6:0,1:1,3:1,0,5,0
chr19	10091294	.	TCA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=CA;STR;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,1:1,2,1,2
chr19	10096686	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10096686_G_A:10096686:0,0,0,1
chr19	10096689	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:10096686_G_A:10096686:0,0,0,1
chr19	10097536	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=172,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:10097536_G_T:10097536:0,3,0,1
chr19	10097554	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=203,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:10097536_G_T:10097536:0,2,0,1
chr19	10099910	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=214,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:2,1:7,4:5,4,3,2
chr19	10102401	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,200;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,0:6,4:4,7,0,4
chr19	10103583	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,245;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,2:5,1:4,4,1,2
chr19	10104154	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=105,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:7,1:0,1:3,4,1,1
chr19	10104500	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=109,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:12,0:5,3:7,11,0,3
chr19	10106671	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:5,3,2,0
chr19	10107996	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=227,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:6,0,1,2
chr19	10108635	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=43,156;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:9,2:4,3:5,8,2,3
chr19	10108714	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,2:7,1:11,5,1,2
chr19	10108850	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=22,34;MFRL=116,174;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:0|1:10108850_A_G:10108850:2,6,0,3
chr19	10108864	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=74,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:1,2:0|1:10108850_A_G:10108850:1,2,0,3
chr19	10108929	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr19	10114206	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=206,58;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:10,6,0,2
chr19	10116508	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=228,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:3,5,0,2
chr19	10120879	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,17;MFRL=120,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:10120879_C_G:10120879:0,1,1,0
chr19	10120883	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=140,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:10120879_C_G:10120879:0,2,1,0
chr19	10120886	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=140,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:10120879_C_G:10120879:0,2,1,0
chr19	10120888	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,12;MFRL=120,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:10120879_C_G:10120879:0,3,1,0
chr19	10120893	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=113,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:10120879_C_G:10120879:1,3,1,0
chr19	10127654	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=101,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:1,1,3,0
chr19	10131999	.	TG	CA,CG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31,29;MFRL=140,252,153;MMQ=60,60,60;MPOS=3,26;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.23,5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,2,3:0.114,0.152:23:9,0,1:9,2,2:11,7,3,2
chr19	10200545	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=254,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.488:10:2,0:1,0:2,3,5,0
chr19	10218434	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr19	10220353	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=164,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:6,0:16,2:14,9,1,1
chr19	10220376	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=142,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:3,1:13,1:8,9,2,0
chr19	10220545	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=212,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:6,1:3,1:7,3,0,2
chr19	10220663	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=210,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:6,3:9,2:5,10,2,3
chr19	10221151	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,5,8
chr19	10225726	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.419:24:9,6:5,3:9,5,8,2
chr19	10226256	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,6:0,0,5,6
chr19	10226340	.	GTGCC	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TGCC;STR;TLOD=48.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.872:13:1,6:0,6:1,0,9,3
chr19	10229240	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.806:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr19	10229297	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,5,12
chr19	10229521	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,5:0,9:0,0,7,7
chr19	10229726	.	TGGCAGTCCTCACTCACCTCCC	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCAGTCCTCACTCACCTCCC;STR;TLOD=53.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.949:12:0,6:0,6:0,0,7,5
chr19	10251077	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=204,183;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:10251077_G_A:10251077:0,4,0,1
chr19	10251085	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=204,183;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.297:5:1,0:3,1:0|1:10251077_G_A:10251077:0,4,0,1
chr19	10251747	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=207,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:0,9:2,3:2,0,9,3
chr19	10270848	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=264,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:2,3,0,2
chr19	10274120	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=196,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr19	10277333	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,71;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.163:17:5,0:9,2:6,9,1,1
chr19	10279005	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=155,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:9,7,1,1
chr19	10279006	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:9,7,1,1
chr19	10305436	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=150,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:1,0:2,0:0|1:10305436_A_C:10305436:0,3,2,0
chr19	10305443	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,10;MFRL=155,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,0:4,0:0|1:10305436_A_C:10305436:1,6,2,0
chr19	10305447	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=167,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.244:10:3,1:5,0:0|1:10305436_A_C:10305436:1,7,2,0
chr19	10334443	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	10335502	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=205,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:2,9,0,2
chr19	10363455	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	10365202	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=39.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.545:29:5,15:8,0:8,5,16,0
chr19	10370542	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr19	10385743	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=137,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr19	10402131	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=177,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.876:22:1,8:1,12:2,0,10,10
chr19	10403947	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=212,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:0,8:1,9:1,0,9,8
chr19	10416444	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=124,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr19	10418784	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	10418838	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr19	10421279	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=188,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,0:1,2:1,6,0,2
chr19	10425986	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,183;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:10425986_A_G:10425986:0,0,2,0
chr19	10425992	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,45;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:10425986_A_G:10425986:0,0,2,0
chr19	10425995	.	G	GTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,183;MMQ=60,45;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=19,24;RU=T;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:10425986_A_G:10425986:0,0,2,0
chr19	10426628	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,1:5,6:1,8,3,4
chr19	10428406	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=173,264;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:7,2:8,2:10,5,4,0
chr19	10429120	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr19	10431300	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=107,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:2,1,3,0
chr19	10432334	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=148,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:4,3:2,1:3,4,2,2
chr19	10432336	.	G	GTCTTGATCTCTTCACCTTGTGAT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=193,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:4,5,1,1
chr19	10439225	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	10441117	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=80,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr19	10444826	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=204,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=42.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.843:17:1,7:1,8:1,1,6,9
chr19	10445165	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=192,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.358:17:4,3:7,2:4,7,2,4
chr19	10445854	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:8,1:7,1:8,7,0,2
chr19	10449392	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=239,105;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:0,8:2,5:2,0,7,6
chr19	10449501	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,2:6,0:7,8,2,0
chr19	10463187	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,190;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:8,3:16,0:17,7,3,0
chr19	10464687	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=184,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:0,2:3,3:3,0,2,3
chr19	10468668	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=197,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:10,4:0,3:5,5,3,4
chr19	10472103	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=220,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:10472103_C_G:10472103:2,0,1,0
chr19	10472110	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,18;MFRL=246,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:10472103_C_G:10472103:3,0,1,0
chr19	10472933	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=208,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:5,1:2,4:8,0,3,2
chr19	10473138	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:9,2:2,1:6,5,1,2
chr19	10473392	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=306,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	10477206	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:5,4:6,2:4,7,2,4
chr19	10477298	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=66,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:1,5,1,2
chr19	10478683	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=186,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:5,2:1,1:5,1,4,0
chr19	10561261	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:2,2:8,0,4,0
chr19	10561567	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,128;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,0:10,2:8,7,0,2
chr19	10568519	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=195,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:6,1,3,0
chr19	10602180	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=270,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr19	10625796	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,444;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	10659570	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=121,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,3:5,5:4,2,3,5
chr19	10659737	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=226,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,6:1,10:1,0,6,10
chr19	10659804	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.576:7:0,1:3,3:0,3,0,4
chr19	10662659	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:10,1:1,1:1,10,2,0
chr19	10665691	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr19	10665912	.	C	CCCGCCCTGCCCGCAGCGCACCTGGCT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=85.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,12:0,7:0,0,12,8
chr19	10668383	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr19	10668953	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,4,13
chr19	10673340	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=116,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,3:0,3:2,1,4,2
chr19	10676343	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.798:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	10676487	.	G	GC,GCC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32,31;MFRL=0,180,131;MMQ=60,60,60;MPOS=22,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=C;STR;TLOD=20.44,3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,3:0.689,0.252:12:0,3,2:0,6,0:0,0,4,8
chr19	10683811	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=159,97;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr19	10690321	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=260,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr19	10690557	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr19	10692244	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=139,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:10,0:8,4:10,8,2,2
chr19	10697773	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=18,32;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.753:13:1,5:0,5:2,1,9,1
chr19	10697801	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=183,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.708:22:1,9:5,7:2,4,13,3
chr19	10738452	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=147,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:0|1:10738452_C_T:10738452:14,5,1,1
chr19	10738457	.	C	CAG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=144,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:7,0:0|1:10738452_C_T:10738452:12,6,1,1
chr19	10738460	.	T	TTTGG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=144,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:0|1:10738452_C_T:10738452:12,6,1,1
chr19	10741907	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:3,2,1,4
chr19	10742275	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,19;MFRL=161,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:2,1:3,0:0|1:10742275_A_AC:10742275:3,3,1,1
chr19	10742280	.	TG	CT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=161,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.293:8:3,1:2,0:0|1:10742275_A_AC:10742275:3,3,1,1
chr19	10742287	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=150,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,1,3
chr19	10742463	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=210,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:5,1,3,0
chr19	10748853	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.249:30:8,7:15,0:9,14,7,0
chr19	10749043	.	T	TGA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=84,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:10749043_T_TGA:10749043:0,4,0,1
chr19	10749044	.	T	TATATTTTCTTTCTTTCTCAATGTC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=82,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr19	10749046	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=84,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:10749043_T_TGA:10749043:0,4,0,1
chr19	10749048	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=84,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:10749043_T_TGA:10749043:0,4,0,1
chr19	10749051	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=95,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:10749043_T_TGA:10749043:0,3,0,1
chr19	10749056	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=48,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:10749043_T_TGA:10749043:0,2,0,1
chr19	10790627	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,110;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.185:20:11,0:2,3:4,13,0,3
chr19	10799252	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,1:4,1:7,6,0,2
chr19	10818163	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=222,111;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:4,0:4,2:6,2,0,3
chr19	10907994	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=162,232;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,4:3,0:5,1,4,0
chr19	10908262	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=173,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr19	10935981	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=249,205;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr19	10935982	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=249,115;MMQ=40,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:10935982_G_A:10935982:0,4,0,1
chr19	10935985	.	C	T,A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,27,28;MFRL=266,205,115;MMQ=40,40,36;MPOS=2,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,1,0:1,0,1:0,3,0,2
chr19	10935998	.	GT	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=249,115;MMQ=40,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:10935982_G_A:10935982:0,4,0,1
chr19	10961273	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=201,263;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr19	10970558	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr19	10973923	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=162,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:15,1:5,1:8,12,0,2
chr19	11024628	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:9,5:3,1:6,6,6,0
chr19	11027513	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.440:14:3,3:4,3:1,7,3,3
chr19	11031464	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=219,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,4:5,3:4,5,5,2
chr19	11034677	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=226,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:4,4,1,1
chr19	11096836	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:4,1,2,1
chr19	11105706	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:3,0:10,6:5,8,2,4
chr19	11106790	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,0:1,2:2,0,3,0
chr19	11107133	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,6:4,4:4,5,5,5
chr19	11113902	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=202,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,4:4,0:2,2,1,3
chr19	11136031	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chr19	11136215	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,1,6
chr19	11136857	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=232,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr19	11137041	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:11,4:10,0:8,13,4,0
chr19	11168896	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:6,0,5,0
chr19	11170903	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,0:2,3:0,6,0,3
chr19	11210912	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:0|1:11210912_C_T:11210912:10,4,2,0
chr19	11210922	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,5:0.273:20:6,5:8,0:1|0:11210912_C_T:11210912:11,4,5,0
chr19	11216225	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=138,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:13,3:4,0:6,11,2,1
chr19	11216286	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=178,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:11216286_G_A:11216286:1,2,0,1
chr19	11216287	.	GGC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=178,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,0:0|1:11216286_G_A:11216286:1,2,0,1
chr19	11221454	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:11221454_T_C:11221454:0,0,1,7
chr19	11221457	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.670:7:2,2:0,3:0|1:11221454_T_C:11221454:0,2,0,5
chr19	11224007	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:10,1:7,11,0,2
chr19	11224181	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=198,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:3,1,1,1
chr19	11224491	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,1:2,1:0,8,0,2
chr19	11226967	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=216,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:4,2:0,0:0,4,0,2
chr19	11227452	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr19	11227480	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=230,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.768:14:1,6:1,5:3,0,8,3
chr19	11230821	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=180,106;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:9,10:3,0:5,7,11,0
chr19	11230881	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=52,47;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:5,1:0,1:3,2,1,1
chr19	11230899	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=52,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:2,7,1,1
chr19	11233941	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=140,161;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:4,5,1,2
chr19	11241915	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.334:19:6,5:7,1:9,4,6,0
chr19	11257772	.	AAG	A	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=176,154;MMQ=50,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:11257772_AAG_A:11257772:2,0,1,0
chr19	11257773	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=21,34;MFRL=184,168;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11257773_AG_A:11257773:1,0,1,0
chr19	11257775	.	ATC	A	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=19,15;MFRL=169,168;MMQ=50,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:11257773_AG_A:11257773:2,0,1,0
chr19	11257777	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=17,10;MFRL=184,154;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:11257772_AAG_A:11257772:1,0,1,0
chr19	11257779	.	A	AAATT	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=10,10;MFRL=169,168;MMQ=50,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:11257773_AG_A:11257773:2,0,1,0
chr19	11257781	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=17,15;MFRL=176,154;MMQ=50,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:11257772_AAG_A:11257772:2,0,1,0
chr19	11257782	.	T	TTA,G	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=16,26,16;MFRL=184,154,168;MMQ=60,40,40;MPOS=16,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.250,0.374:3:0,1,0:0,0,0:1,0,2,0
chr19	11257788	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=22,15;MFRL=176,154;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:11257772_AAG_A:11257772:4,0,1,0
chr19	11257793	.	CA	AT	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=31,10;MFRL=176,154;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:11257772_AAG_A:11257772:4,0,1,0
chr19	11257798	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=33,15;MFRL=184,154;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:11257772_AAG_A:11257772:3,0,1,0
chr19	11258593	.	AAAAAAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=314,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.548:9:2,5:2,0:4,0,3,2
chr19	11258603	.	AAAAG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=223,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAG;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.633:6:1,3:1,0:2,0,3,1
chr19	11280637	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=169,262;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,1:4,1:9,3,1,1
chr19	11285390	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=194,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,1:4,8:3,3,4,5
chr19	11303459	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=191,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=C;STR;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.718:4:1,3:0,0:0|1:11303459_GC_G:11303459:0,1,1,2
chr19	11303469	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.648:6:1,4:1,0:0|1:11303459_GC_G:11303459:1,1,1,3
chr19	11314807	.	CTGGGGATGAGGAG	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGGGATGAGGAG;STR;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.723:8:0,3:1,2:2,0,3,3
chr19	11323817	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=187,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:4,1:7,1:10,1,2,0
chr19	11323863	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=180,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,2:6,4:7,3,4,2
chr19	11324890	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr19	11325417	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=134,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr19	11326629	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr19	11327571	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.418:10:4,3:2,1:3,3,3,1
chr19	11327608	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=18,32;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.843:17:1,8:0,6:1,1,5,10
chr19	11332505	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:4,3:3,2:6,1,3,3
chr19	11333358	.	GA	TT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=191,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,3:5,3:9,0,6,1
chr19	11333596	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:1,3:4,1:1,5,2,2
chr19	11346252	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,2:6,1:5,5,1,2
chr19	11348521	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=224,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:1,2,1,1
chr19	11350488	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=110,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,2:2,4:4,4,4,2
chr19	11350931	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=168,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:6,3,1,1
chr19	11358700	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=126,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr19	11363368	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=200,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:7,1,2,0
chr19	11364495	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=172,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr19	11406952	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,4,1
chr19	11409061	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,2:6,4:1,5,2,4
chr19	11409111	.	ATT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	11409494	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr19	11411865	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=140,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:9,0:8,3:0|1:11411865_C_T:11411865:9,8,3,0
chr19	11411868	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=131,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:8,0:5,5:0|1:11411865_C_T:11411865:6,7,5,0
chr19	11417200	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr19	11436302	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr19	11446520	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=150,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr19	11473415	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=231,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr19	11474311	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=185,82;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,3:0,0:5,0,3,0
chr19	11474324	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=177,82;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,4:0,0:4,0,3,1
chr19	11485392	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.370:30:5,5:14,5:16,3,10,1
chr19	11486472	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=156,206;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.171:22:9,0:9,3:9,10,0,3
chr19	11489539	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=187,80;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	11492805	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=167,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:1,2,0,1
chr19	11493732	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr19	11534503	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=G;STR;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	11541685	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:3,3,2,3
chr19	11541709	.	T	TGCCCCTTAACAACATC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=180,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.323:7:1,0:4,2:0|1:11541709_T_TGCCCCTTAACAACATC:11541709:3,2,1,1
chr19	11541712	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=46,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.735:9:0,1:2,6:1,1,4,3
chr19	11541714	.	C	CCACAGCACG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=178,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.265:9:1,0:6,2:0|1:11541709_T_TGCCCCTTAACAACATC:11541709:4,3,1,1
chr19	11558240	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr19	11558340	.	A	AGAG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=138,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=GAG;STR;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.408:10:1,4:4,0:2,4,2,2
chr19	11558366	.	AGG	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=135,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,1:8,0:0|1:11558366_AGG_A:11558366:10,7,1,1
chr19	11558369	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=135,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,2:8,0:0|1:11558366_AGG_A:11558366:10,7,1,1
chr19	11577672	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=224,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr19	11597711	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=145,262;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,2:7,1:5,6,2,1
chr19	11617318	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=137,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:11617318_A_AT:11617318:0,3,0,1
chr19	11617320	.	G	GGGTTGTTTGCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=137,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:11617318_A_AT:11617318:0,3,0,1
chr19	11617343	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=199,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	11618908	.	TACAGAGGAACTGGGG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=138,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,0:5,2:2,7,0,2
chr19	11623849	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:4,7,0,2
chr19	11624158	.	A	ATATATCT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,25;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:11624158_A_ATATATCT:11624158:0,2,0,1
chr19	11624161	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,30;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:11624158_A_ATATATCT:11624158:0,2,0,1
chr19	11624163	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,27;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:11624158_A_ATATATCT:11624158:0,2,0,1
chr19	11624166	.	A	ATGG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,24;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:11624158_A_ATATATCT:11624158:0,2,0,1
chr19	11624167	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=36,25;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:11624158_A_ATATATCT:11624158:0,2,0,1
chr19	11624170	.	TGAAG	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:11624158_A_ATATATCT:11624158:0,2,0,1
chr19	11624176	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,34;MFRL=171,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	11652033	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=190,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:4,4,2,4
chr19	11657727	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:14,2:7,0:9,12,2,0
chr19	11660176	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=189,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,0:8,2:5,8,1,1
chr19	11660505	.	G	GTGTAGTCCTGGCTGAGCTGAGCCCTGTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=161,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:4,3,1,1
chr19	11687351	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,194;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:9,2:16,1:16,9,0,3
chr19	11687829	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=19,13;MFRL=242,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.292:5:1,0:1,0:2,2,1,0
chr19	11687908	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=138,298;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,1:12,1:11,7,1,1
chr19	11725413	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=130,68;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,2:5,1:3,7,2,1
chr19	11849538	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=160,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:9,1,1,1
chr19	11849736	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:3,5,0,2
chr19	11888407	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=148,603203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:11888407_C_T:11888407:15,2,0,2
chr19	11888414	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=154,603203;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,2:7,0:0|1:11888407_C_T:11888407:18,5,0,2
chr19	11891644	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:10,0:17,2:18,11,1,1
chr19	11918093	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:1,2,2,3
chr19	11918972	.	GCGGA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=201,250;MMQ=45,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:11918972_GCGGA_G:11918972:0,2,0,1
chr19	11918980	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=201,250;MMQ=45,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:2,1:0,0:0|1:11918972_GCGGA_G:11918972:0,2,0,1
chr19	11918987	.	A	AATGCACACTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=250,161;MMQ=50,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:11918972_GCGGA_G:11918972:0,3,0,1
chr19	11941221	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=201,175;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,5:3,2:3,1,3,4
chr19	11941256	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=193,210;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,2,2
chr19	11941363	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=201,190;MMQ=52,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:2,6,3,2
chr19	11941532	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=185,168;MMQ=40,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,3:5,5:4,3,0,8
chr19	11943769	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,36;MFRL=207,149;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:1,0:3,2:0|1:11943769_A_C:11943769:2,3,0,2
chr19	11943777	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=207,149;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:11943769_A_C:11943769:2,3,0,2
chr19	11943778	.	A	ACACACACACACAC	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=207,149;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:0|1:11943769_A_C:11943769:2,3,0,2
chr19	11943823	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,30;MFRL=269,255;MMQ=60,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,1,1
chr19	11943852	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=287,192;MMQ=55,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,3,1
chr19	12015440	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=142,110;MMQ=60,22;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,10:6,0:9,2,10,0
chr19	12024135	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,1:8,2:15,6,1,2
chr19	12128613	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=169,213;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.223:7:1,0:3,1:6,0,1,0
chr19	12157334	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr19	12185102	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=188,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:3,2,1,3
chr19	12187210	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=173,140;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:7,4:9,2:6,10,5,1
chr19	12187497	.	GCATGAAAGGACTCACACTGGAAAGCAACTGTATGAATCTAAACAATGTGAAAAAACCTTTGGATCTGTCAGAAACCTTCAAATT	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,142;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.142:36:5,0:9,6:14,16,5,1
chr19	12296873	.	AATAATTTTTCT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=197,80;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,2:9,0:7,7,1,1
chr19	12461452	.	G	GGTTTCAACT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=157,40271;MMQ=60,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,2:6,0:0|1:12461452_G_GGTTTCAACT:12461452:13,8,0,2
chr19	12461457	.	AG	CC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=154,40271;MMQ=60,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:15,2:6,0:0|1:12461452_G_GGTTTCAACT:12461452:13,9,0,2
chr19	12461460	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=157,40271;MMQ=60,43;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:15,2:5,0:0|1:12461452_G_GGTTTCAACT:12461452:13,8,0,2
chr19	12511857	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=191,148;MMQ=60,43;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,0:10,2:15,4,0,2
chr19	12542848	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=182,224;MMQ=27,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:12542848_G_C:12542848:1,2,0,2
chr19	12542851	.	AT	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=182,224;MMQ=27,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:12542848_G_C:12542848:1,2,0,2
chr19	12543333	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=217,205;MMQ=27,34;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr19	12543940	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=199,209;MMQ=27,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,0:4,3:1,5,0,3
chr19	12551616	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr19	12574740	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=A;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.660:4:0,2:0,0:0,1,2,1
chr19	12576573	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:0,1,0,6
chr19	12577723	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=150,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,5:1,3:0,3,0,8
chr19	12692275	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=120,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:14,2:0|1:12692275_C_T:12692275:12,8,1,1
chr19	12692297	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=119,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:8,0:15,2:0|1:12692275_C_T:12692275:11,15,1,1
chr19	12692342	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=120,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.317:36:11,0:13,11:11,14,0,11
chr19	12692454	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:3,5,2,6
chr19	12734664	.	TTTTTC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0|1:12734664_TTTTTC_T:12734664:0,0,1,4
chr19	12734687	.	G	GGGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:12734664_TTTTTC_T:12734664:0,0,1,2
chr19	12739675	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:11,0:6,6:8,9,0,6
chr19	12760287	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr19	12760664	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr19	12763350	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=117,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.685:10:1,0:2,4:0,3,0,7
chr19	12766740	.	G	GTGTTGAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=162,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:12766740_G_GTGTTGAA:12766740:1,7,1,1
chr19	12766741	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=162,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,1:0|1:12766740_G_GTGTTGAA:12766740:1,7,1,1
chr19	12768391	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,12:0,0,8,18
chr19	12768843	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:1,2:4,2:4,1,3,2
chr19	12772263	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=132,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,1:5,4:1,6,1,4
chr19	12780549	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=145,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:12,1:7,2:14,5,2,1
chr19	12787002	.	G	GAGAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=183,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGAC;STR;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr19	12800332	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.320:13:3,2:6,0:0|1:12800332_T_G:12800332:9,0,0,4
chr19	12800339	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=148,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.232:14:4,1:6,1:0|1:12800332_T_G:12800332:10,1,0,3
chr19	12802153	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,265;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:3,1:6,1:7,2,1,2
chr19	12805601	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.267:15:4,1:5,0:5,6,4,0
chr19	12826361	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=162,427;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,2:6,0:11,5,0,2
chr19	12848548	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=26,16;MFRL=177,259;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:2,0:5,1:0,7,0,3
chr19	12848557	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,16;MFRL=170,268;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,0:0|1:12848557_T_C:12848557:0,5,0,2
chr19	12848560	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=26,16;MFRL=174,268;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,0:0|1:12848557_T_C:12848557:0,4,0,2
chr19	12848563	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=24,16;MFRL=174,268;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,0:0|1:12848557_T_C:12848557:0,4,0,2
chr19	12848566	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,16;MFRL=174,268;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,0:0|1:12848557_T_C:12848557:0,4,0,2
chr19	12904104	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=197,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.133:30:16,2:9,2:2,24,0,4
chr19	12939792	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=202,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,2:1,8:1,2,1,9
chr19	12940764	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=229,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:9,0:14,4:10,13,4,0
chr19	12958958	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=246,232;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	12980161	.	A	ACTGGCTAGCCAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=197,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:1,6,1,1
chr19	12989715	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,30;MFRL=195,139;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:12989715_G_T:12989715:0,3,0,1
chr19	12989720	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=24,32;MFRL=195,139;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:12989715_G_T:12989715:0,3,0,1
chr19	12989722	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,30;MFRL=195,139;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:12989715_G_T:12989715:0,3,0,1
chr19	12989724	.	A	AGGT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=27,26;MFRL=202,139;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:12989715_G_T:12989715:0,3,0,1
chr19	12989726	.	ACAC	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,25;MFRL=202,139;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:12989715_G_T:12989715:0,3,0,1
chr19	12989730	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=27,31;MFRL=202,139;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:12989715_G_T:12989715:0,3,0,1
chr19	12989732	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,29;MFRL=202,139;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:12989715_G_T:12989715:0,3,0,1
chr19	12989736	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,26;MFRL=202,139;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:12989715_G_T:12989715:0,3,0,1
chr19	13002033	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,300;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	13002400	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=284,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:2,3,0,7
chr19	13002461	.	G	GACTCTTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=215,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0|1:13002461_G_GACTCTTA:13002461:0,1,0,1
chr19	13002463	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=215,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0|1:13002461_G_GACTCTTA:13002461:0,1,0,1
chr19	13010503	.	CC	TT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=129,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,0:9,2:10,9,1,1
chr19	13010643	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=305,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:0,2,0,6
chr19	13015530	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=214,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr19	13029188	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=166,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.790:12:1,6:1,4:0,2,1,9
chr19	13036038	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=46,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.460:8:4,1:0,3:1,3,1,3
chr19	13039284	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=204,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:6,5:4,6:5,5,7,5
chr19	13039632	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=147,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:3,4,2,0
chr19	13044544	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=159,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,1,1
chr19	13051094	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,12:0.289:43:21,4:10,8:14,17,12,0
chr19	13054661	.	GGATGAGGAGGACAAGGAGGAA	G	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,2:0.051:57:20,2:26,0:31,24,1,1
chr19	13054781	.	G	T	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=188,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,8:0.097:90:42,3:37,5:0,82,1,7
chr19	13184725	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=131,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:8,0:5,10,0,2
chr19	13216420	.	CC	TT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=127,47;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:4,13,1,1
chr19	13216436	.	T	TGGTCCCTCCTGCCAGAG	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,18;MFRL=128,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,0:5,1:3,11,1,1
chr19	13216451	.	G	GTCATATTCTCACCTGAA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=218,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:1,2:2,0:0|1:13216451_G_GTCATATTCTCACCTGAA:13216451:1,2,1,1
chr19	13216453	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=218,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,0:0|1:13216451_G_GTCATATTCTCACCTGAA:13216451:1,2,1,1
chr19	13220703	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,1:6,2:7,3,2,1
chr19	13223495	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=142,181;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr19	13226900	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.429:28:6,5:10,6:7,9,8,4
chr19	13249027	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,3:10,0:10,4,3,0
chr19	13255536	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=223,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,3:3,2,3,3
chr19	13260019	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=179,189;MMQ=40,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:8,0:1,2:0|1:13260019_A_G:13260019:0,9,0,2
chr19	13260023	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=189,189;MMQ=40,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:8,0:0,2:0|1:13260019_A_G:13260019:0,8,0,2
chr19	13260223	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=192,172;MMQ=40,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:2,1:4,0,2,0
chr19	13260256	.	GA	G,AA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,19,33;MFRL=188,190,194;MMQ=60,50,60;MPOS=32,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.89,4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,3:0.179,0.223:14:3,0,3:4,0,0:5,4,5,0
chr19	13318649	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=134,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.609:6:1,2:1,0:2,0,2,2
chr19	13323121	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=163,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:6,0:3,2:0|1:13323121_GT_G:13323121:5,4,2,0
chr19	13323123	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=163,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:6,0:2,2:0|1:13323121_GT_G:13323121:5,4,2,0
chr19	13323124	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.932:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr19	13323641	.	T	TAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=AC;STR;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.714:4:1,1:0,1:1,0,0,3
chr19	13335432	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=215,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:3,3,1,5
chr19	13338180	.	AAAG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=196,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAG;STR;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,0:5,3:7,2,1,2
chr19	13338352	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,178;MMQ=60,44;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,17:0.391:44:16,17:11,0:16,11,0,17
chr19	13339673	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=258,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr19	13355900	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr19	13366165	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=158,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	13373477	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=149,255;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:2,1:5,1:8,0,2,0
chr19	13387904	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=216,97;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:4,6:4,2:4,4,5,4
chr19	13396110	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=180,236;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,0:1,2:0,3,0,3
chr19	13410235	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=327,255;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	13411482	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=126,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.771:15:3,4:0,8:2,1,3,9
chr19	13414796	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,283;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	13440985	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	13441242	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:13441242_G_A:13441242:0,2,0,1
chr19	13441244	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:13441242_G_A:13441242:0,2,0,1
chr19	13441246	.	A	AAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:13441242_G_A:13441242:0,2,0,1
chr19	13443770	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr19	13445144	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr19	13445208	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=179,121;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,3:1,6:1,1,6,3
chr19	13616693	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=214,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:1,3:6,0,4,2
chr19	13865070	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:6,1,1,1
chr19	13865275	.	AT	TC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=239,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr19	13868117	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=139,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr19	13870153	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=153,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	13879463	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=217,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.595:13:4,2:1,5:4,1,4,4
chr19	13879745	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=152,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:3,1:11,2:7,8,1,2
chr19	13879847	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=155,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,2:8,0:7,7,1,1
chr19	13883099	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=203,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,2:1,1:2,5,2,1
chr19	13885437	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.326:25:10,3:7,4:10,7,3,5
chr19	13919554	.	CAAAAAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,207;MMQ=40,50;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=21,14;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.509:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr19	13947296	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,222;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:15,1:11,2:11,15,1,2
chr19	13991400	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,25;MFRL=208,75;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:13991400_C_A:13991400:0,3,0,1
chr19	13991403	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=208,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:13991400_C_A:13991400:0,3,0,1
chr19	13991406	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,18;MFRL=240,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:13991400_C_A:13991400:0,4,0,1
chr19	13991407	.	C	CAGG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=240,75;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:13991400_C_A:13991400:0,4,0,1
chr19	13991411	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,22;MFRL=208,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:13991400_C_A:13991400:0,3,0,1
chr19	13991413	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=208,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:13991400_C_A:13991400:0,3,0,1
chr19	14031326	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,3:2,2:6,3,4,1
chr19	14040085	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=245,136;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:3,3:4,0:8,0,3,0
chr19	14045033	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=123,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:2,3:0,1:1,2,4,0
chr19	14048587	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=128,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:6,2,2,2
chr19	14065074	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=231,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:3,3:6,0,5,0
chr19	14065488	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr19	14091556	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,33;MFRL=124,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:14091556_A_G:14091556:0,1,1,1
chr19	14091566	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=124,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14091556_A_G:14091556:0,1,1,0
chr19	14091568	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=124,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14091556_A_G:14091556:0,1,1,0
chr19	14104688	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=113,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.521:8:1,2:1,1:2,2,4,0
chr19	14139004	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,12,3
chr19	14139257	.	G	GCCTCGTAGGTTTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr19	14143151	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,1:1,1:2,0,2,0
chr19	14150303	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,239;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:5,1,2,0
chr19	14150512	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=141,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:6,2:0|1:14150512_G_GC:14150512:3,9,1,1
chr19	14150514	.	G	GAT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=141,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:14150512_G_GC:14150512:3,9,1,1
chr19	14150515	.	G	GCCTCCCTCGGGAGT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=141,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:14150512_G_GC:14150512:3,9,1,1
chr19	14161547	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=130,231;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.265:17:6,3:6,1:10,3,4,0
chr19	14162676	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=119,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,2:3,5:3,1,5,2
chr19	14166060	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=192,762;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:5,5,0,2
chr19	14199913	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=166,243;MMQ=60,36;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.306:24:7,7:10,0:10,7,7,0
chr19	14200267	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=193,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr19	14201169	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=191,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:14201169_C_CG:14201169:0,1,1,0
chr19	14201172	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,16;MFRL=191,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,0:0|1:14201169_C_CG:14201169:0,1,1,0
chr19	14201177	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=191,210;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:14201169_C_CG:14201169:0,1,1,0
chr19	14267095	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr19	14268872	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,1:6,1:5,6,1,1
chr19	14271580	.	G	GAAAATAGACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:14271580_G_GAAAATAGACA:14271580:1,3,0,1
chr19	14271585	.	G	GGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:14271580_G_GAAAATAGACA:14271580:1,3,0,1
chr19	14274246	.	G	GTCATAAATGGGATGTCTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr19	14294288	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr19	14499357	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr19	14499408	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=211,201;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:3,5,2,2
chr19	14499410	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=199,211;MMQ=27,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,6:0,5:0,1,5,6
chr19	14499421	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=211,228;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:6,1:3,1:5,5,0,2
chr19	14499545	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=145,218;MMQ=52,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:13,0:5,2:13,5,2,0
chr19	14507307	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=156,370760;MMQ=60,57;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:10,1:3,2:2,11,0,3
chr19	14507335	.	A	AAGCGAATG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=170,66;MMQ=60,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.242:10:6,2:2,0:0,8,1,1
chr19	14508385	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=242,176;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr19	14508445	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=166,256;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr19	14508964	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=113,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,5:6,6:7,4,3,8
chr19	14512448	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.347:12:0,1:7,2:6,2,3,1
chr19	14520079	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=178,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:4,3,5,2
chr19	14522434	.	GCCTTA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=207,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTTA;STR;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.603:18:6,5:1,6:1,6,0,11
chr19	14552325	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=246,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr19	14561722	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,12,9
chr19	14568742	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=231,145;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:14568742_A_AT:14568742:4,0,1,0
chr19	14568745	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=231,152;MMQ=60,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:14568742_A_AT:14568742:4,0,2,0
chr19	14568748	.	TG	CA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=231,152;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:14568742_A_AT:14568742:4,0,2,0
chr19	14568754	.	AA	GG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=231,152;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:0|1:14568742_A_AT:14568742:4,0,2,0
chr19	14575010	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=215,269;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr19	14578674	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=152,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,1:4,1:6,4,1,1
chr19	14578813	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=134,262;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:2,6,1,1
chr19	14580635	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:2,2:0|1:14580635_G_A:14580635:6,5,0,2
chr19	14580638	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,0:2,1:0|1:14580635_G_A:14580635:6,4,0,2
chr19	14580662	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=143,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,4:0,6:0,2,7,3
chr19	14580865	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=258,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0|1:14580865_G_T:14580865:3,2,1,2
chr19	14580869	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=180,258;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,5:0.600:8:2,4:1,1:1|0:14580865_G_T:14580865:1,2,3,2
chr19	14581756	.	TGCCTCAAGGGCCTCGTTGC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=215,175;MMQ=60,58;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCCTCAAGGGCCTCGTTGC;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.625:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr19	14582329	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:2,1,1,0
chr19	14582338	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=17,12;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:2,1,1,0
chr19	14590142	.	TGACAAGAGTGA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=366,180;MMQ=60,31;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr19	14590164	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=145,291;MMQ=40,41;MPOS=-1073741816;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr19	14590433	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=193,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,4:0,1:0,2,0,5
chr19	14600197	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,4:7,1:5,7,4,1
chr19	14600703	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,18;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,0:1,0:2,2,0,4
chr19	14627050	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,2,11
chr19	14627215	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=214,94;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr19	14676172	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=184,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,1:1,1:0,2,0,2
chr19	14736288	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=132,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,5:3,4:3,2,4,5
chr19	14736376	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=197,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:2,9,1,1
chr19	14740824	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=317,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,3:0,3:2,0,6,2
chr19	14741065	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=215,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,4:0,4:0,1,0,8
chr19	14743902	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=196,266;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,2:1,1:2,5,2,1
chr19	14744181	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	14755137	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=151,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.415:6:1,1:1,1:1,3,0,2
chr19	14758218	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=169,120;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.287:10:3,1:4,0:4,3,0,3
chr19	14758222	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,281;MMQ=60,49;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=T;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.837:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr19	14769339	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=106,71;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:6,4,2,0
chr19	14774309	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,3:10,0:11,5,0,3
chr19	14779550	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=96,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,1:5,2:6,6,2,1
chr19	14806017	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=159,243;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,1,1
chr19	14806031	.	C	CTTACACT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=220,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:14806031_C_CTTACACT:14806031:0,1,0,1
chr19	14806037	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=220,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:14806031_C_CTTACACT:14806031:0,3,0,1
chr19	14806039	.	T	TTATCCAAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=220,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:14806031_C_CTTACACT:14806031:0,3,0,1
chr19	14826849	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=221,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr19	14827076	.	CTTT	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=198,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=T;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.184:19:6,3:7,0:0|1:14827076_CTTT_C:14827076:1,15,0,3
chr19	14827093	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=193,146;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.171:19:8,2:6,0:0|1:14827076_CTTT_C:14827076:1,15,0,3
chr19	14857151	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,229;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.184:20:6,1:9,2:9,8,1,2
chr19	14857791	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=178,271;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:1,7,2,3
chr19	14875201	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,5:0,10:0,0,8,7
chr19	14877043	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,182;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:8,6,0,2
chr19	14878003	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,370753;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	14910262	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=203,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:5,9,2,0
chr19	14910654	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=152,216;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:14,4:11,0:11,14,4,0
chr19	14938933	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=221,148;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:5,4:5,1:6,4,2,3
chr19	14951680	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	14991885	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=107,11615;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:7,0:11,3:10,9,3,0
chr19	14991963	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=123,187;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,4:6,1:6,9,2,3
chr19	14992031	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=115,198;MMQ=45,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:6,1:4,2:6,4,1,2
chr19	15052983	.	T	TATC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATC;STR;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,4:0,4:0,0,4,5
chr19	15061216	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=163,97;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:4,5,3,4
chr19	15063757	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=218,155;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.371:14:2,2:7,3:5,4,5,0
chr19	15072787	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr19	15075020	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,5:1,7:3,0,11,1
chr19	15075069	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=128,41;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:13,8,1,1
chr19	15079104	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=140,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:6,4,1,1
chr19	15083485	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.230:30:12,4:12,2:16,8,4,2
chr19	15083795	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:1,2:2,1:0,3,0,4
chr19	15122291	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr19	15124474	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=221,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:6,2:0,1:4,2,2,1
chr19	15131180	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,36;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr19	15131213	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr19	15131261	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=36,26;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,2:2,7:2,1,6,3
chr19	15132545	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=142,348;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:3,2,1,1
chr19	15132574	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr19	15165933	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:3,1,2,0
chr19	15165966	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=134,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:2,3,2,0
chr19	15166130	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=253,197;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,0:3,2,6,0
chr19	15166335	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=142,93;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:9,0:14,3:14,10,0,3
chr19	15223218	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=184,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,0:2,2:5,3,2,0
chr19	15223466	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	15226611	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=204,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,5:1,8:1,0,6,7
chr19	15226646	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=173,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:6,3:4,8:5,6,5,6
chr19	15233631	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=241,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,2:3,2:2,4,2,2
chr19	15233904	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,13;MFRL=146,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,1:2,0:2,1,3,0
chr19	15235932	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=204,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,1:0,8:0,1,1,8
chr19	15271615	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:3,5,0,2
chr19	15273221	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0|1:15273221_T_C:15273221:0,0,12,1
chr19	15273231	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=49.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,3:0,7:0|1:15273221_T_C:15273221:0,0,10,3
chr19	15273248	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=53.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,5,10
chr19	15273381	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,50;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr19	15276143	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr19	15276919	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0|1:15276919_G_A:15276919:0,0,1,5
chr19	15276923	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:15276919_G_A:15276919:0,0,1,5
chr19	15278057	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr19	15280903	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,105;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:1,3:7,0:6,2,3,0
chr19	15281386	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=231,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:1,0,2,2
chr19	15281454	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=239,255;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:15281454_CCA_C:15281454:1,1,1,0
chr19	15281460	.	C	CGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=239,255;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:15281454_CCA_C:15281454:2,2,1,0
chr19	15281467	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=239,255;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:15281454_CCA_C:15281454:2,2,1,0
chr19	15285272	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr19	15289613	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.628:11:2,2:1,5:2,2,5,2
chr19	15290125	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,5,8
chr19	15291675	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=184,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,0:0,1:0,3,0,3
chr19	15292366	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,3:0,0,8,2
chr19	15299166	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=194,176;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.262:20:7,0:7,4:6,9,0,5
chr19	15300069	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr19	15302905	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=122,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.264:9:5,0:2,2:0|1:15302905_C_CT:15302905:4,3,1,1
chr19	15302906	.	G	GCAAGTCAGGGATGGAATGAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=122,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.278:9:5,0:2,2:0|1:15302905_C_CT:15302905:4,3,1,1
chr19	15308256	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=257,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15308256_C_T:15308256:1,0,0,1
chr19	15308257	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=198,257;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,0:1|0:15308256_C_T:15308256:0,1,1,0
chr19	15308265	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=212,257;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:15308256_C_T:15308256:1,1,1,0
chr19	15341719	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=148,113;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:4,6:10,0:12,2,6,0
chr19	15349321	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,0:2,8:1,6,0,8
chr19	15375623	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=174,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:11,2:7,0:1,17,0,2
chr19	15378266	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:12,0:22,3:15,19,0,3
chr19	15383582	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,2:3,1:9,0,3,0
chr19	15471856	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr19	15485350	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr19	15485556	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr19	15508130	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr19	15533821	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=221,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr19	15568529	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,366;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:10,0,2,0
chr19	15570931	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:3,2,1,1
chr19	15574858	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=134,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,1:9,1:10,7,1,1
chr19	15582673	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0|1:15582673_G_C:15582673:2,2,1,0
chr19	15582679	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:15582673_G_C:15582673:2,2,1,0
chr19	15654669	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,35;MFRL=230,137;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:1,1:1,0:0|1:15654669_GA_G:15654669:2,0,1,0
chr19	15654690	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=18,16;MFRL=230,137;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:0,0:0,0:0|1:15654669_GA_G:15654669:2,0,1,0
chr19	15654697	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=12,16;MFRL=84,137;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:15654669_GA_G:15654669:1,1,1,0
chr19	15654702	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,16;MFRL=133,137;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:15654669_GA_G:15654669:2,1,1,0
chr19	15654706	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,15;MFRL=138,137;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:15654669_GA_G:15654669:3,1,1,0
chr19	15654708	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,17;MFRL=133,153;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,0:2,1,2,0
chr19	15654711	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=23,16;MFRL=138,137;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:15654669_GA_G:15654669:3,1,1,0
chr19	15655035	.	TGCCGAGAAGAGATTCAGGAAGTCATGAAAG	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=136,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,5:0.163:34:8,4:5,0:0|1:15655035_TGCCGAGAAGAGATTCAGGAAGTCATGAAAG_T:15655035:19,10,2,3
chr19	15655090	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:11,3:8,0:0|1:15655035_TGCCGAGAAGAGATTCAGGAAGTCATGAAAG_T:15655035:10,10,0,3
chr19	15726345	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=186,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:6,0:0,2:6,0,2,0
chr19	15726583	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,1:5,1:6,8,1,1
chr19	15728737	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=183,274;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,3:5,2:9,0,5,0
chr19	15729056	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=194,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,0:7,3:0,11,1,2
chr19	15730498	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0|1:15730498_G_GC:15730498:0,0,6,6
chr19	15730502	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:5,4:4,0:0|1:15730498_G_GC:15730498:5,4,1,3
chr19	15739084	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,16,2
chr19	15739274	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=168,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:2,3:6,3:5,3,3,4
chr19	15739315	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=123,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:0,5:4,3:2,2,6,2
chr19	15739446	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=168,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,1:4,1:5,5,0,2
chr19	15739935	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr19	15739992	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=187,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.827:21:3,12:0,6:1,2,10,8
chr19	15740220	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr19	15740268	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,344;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	15752380	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:11,0:8,13,0,2
chr19	15756762	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=234,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:0,8,0,3
chr19	15763577	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=166,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:2,0:9,2:9,3,2,0
chr19	15763798	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr19	15769253	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=194,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,2:3,2:3,6,3,1
chr19	15769270	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,3:5,1:4,10,2,2
chr19	15769449	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=196,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:3,3:6,4:5,5,6,1
chr19	15769478	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,4:6,4:5,5,6,2
chr19	15769529	.	GC	TT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,4:6,3:5,5,2,5
chr19	15769992	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=189,145;MMQ=52,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,2:1,1:1,0,3,1
chr19	15770018	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=149,178;MMQ=27,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,4:0,1:0|1:15770018_T_C:15770018:1,0,4,2
chr19	15770020	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=149,178;MMQ=27,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:0|1:15770018_T_C:15770018:1,0,4,2
chr19	15770027	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=179,148;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:6,2:1,0:4,3,2,0
chr19	15784285	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=201,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr19	15784319	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr19	15784617	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=239,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr19	15788996	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=163,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:5,0,4,0
chr19	15789034	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=88,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:4,6:0,6:3,1,7,5
chr19	15789250	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=114,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,12:0.685:17:4,4:1,8:0|1:15789250_A_G:15789250:2,3,2,10
chr19	15789257	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=114,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,12:0.684:17:4,3:1,8:0|1:15789250_A_G:15789250:2,3,2,10
chr19	15789282	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=161,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:0,2,0,6
chr19	15789302	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=208,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr19	15789316	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=214,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr19	15791180	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=270,176;MMQ=40,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,23:0.828:27:2,10:2,13:2,2,13,10
chr19	15793370	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=169,125;MMQ=42,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:3,7,0,2
chr19	15795566	.	TTGTGTGTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=174,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=TG;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:1,0:3,0,2,0
chr19	15795842	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=234,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:2,2,3,3
chr19	15806667	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:7,1,3,0
chr19	15806703	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=189,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:3,4,4,3
chr19	15807062	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=201,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:2,2,2,3
chr19	15807157	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=198,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:4,3:6,2:0|1:15807157_A_G:15807157:2,8,2,3
chr19	15807175	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=198,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:6,4:8,2:0|1:15807157_A_G:15807157:5,9,3,3
chr19	15807212	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=133,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:11,2:11,3:21,1,3,2
chr19	15839910	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=167,227;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr19	15852223	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=126,156;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:11,1:4,3:8,7,3,1
chr19	15852242	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=158,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.608:21:2,10:6,3:5,3,6,7
chr19	15905127	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=148,167;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,3:9,0:8,4,0,3
chr19	15905894	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	15918322	.	GG	AA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=173,55;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:8,0:5,1:10,3,1,1
chr19	15918488	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=157,206;MMQ=40,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,2:6,1:0,8,0,3
chr19	15918986	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=219,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:15918986_T_C:15918986:0,4,0,1
chr19	15918988	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=219,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:15918986_T_C:15918986:0,4,0,1
chr19	15918991	.	T	TCAACA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=219,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:15918986_T_C:15918986:0,4,0,1
chr19	15990048	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=216,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,3:2,6:2,0,8,1
chr19	15996907	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=231,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:0,7,0,3
chr19	15997136	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=55,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.642:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr19	16000166	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=559,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:0,1,4,0
chr19	16008512	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=299,352;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr19	16024538	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=243,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,2:6,3:6,1,4,1
chr19	16024739	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=193,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.889:25:2,13:0,8:1,1,4,19
chr19	16024774	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,1,13
chr19	16025176	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=201,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,7:4,3:3,2,4,6
chr19	16025200	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=205,73;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:0|1:16025200_G_A:16025200:2,8,0,2
chr19	16025217	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=177,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,2:7,0:0|1:16025200_G_A:16025200:4,8,0,2
chr19	16025312	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=238,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:6,4:3,13:8,1,5,12
chr19	16034550	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=205,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:4,0:7,0,3,0
chr19	16038334	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:1,2,0,4
chr19	16040473	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=202,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,1:5,2:1,4,0,3
chr19	16045294	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=190,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	16060021	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=121,133;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:8,3:4,4:8,4,4,3
chr19	16060827	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr19	16178587	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,1:0,2:1,4,0,3
chr19	16186772	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,2:2,5:5,0,7,0
chr19	16186813	.	AC	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=16,19;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.439:12:1,1:0,1:2,5,5,0
chr19	16192807	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=172,102;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:15,3:11,0:11,15,2,1
chr19	16268207	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=40.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0,0,7,6
chr19	16275515	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,1:2,7:2,1,6,2
chr19	16275772	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=191,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,1,2
chr19	16280643	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=222,257;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:16280643_G_C:16280643:0,3,0,1
chr19	16280650	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=222,257;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:16280643_G_C:16280643:0,3,0,1
chr19	16320075	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=301,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr19	16321047	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=252,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.534:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr19	16337423	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=217,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,5:1,0:0,2,0,5
chr19	16338532	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr19	16339069	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=276,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr19	16345099	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=243,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,8:1,9:2,0,9,8
chr19	16435717	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=80.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,17,7
chr19	16472811	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=244,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.826:15:0,4:0,2:0,2,2,11
chr19	16487905	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,4:1,7:2,0,7,4
chr19	16504817	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=143,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.241:10:4,0:4,2:0|1:16504817_T_C:16504817:5,3,1,1
chr19	16504819	.	G	GTCCCACACA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=143,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:4,0:4,1:0|1:16504817_T_C:16504817:5,3,1,1
chr19	16504843	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:4,3,2,0
chr19	16506262	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.325:38:20,0:6,12:6,20,0,12
chr19	16513357	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=220,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr19	16514771	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=184,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr19	16539434	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=137,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.266:31:11,7:11,0:14,9,7,1
chr19	16552889	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=187,147;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:10,4:4,0:9,5,4,0
chr19	16552914	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=243,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,10:2,3:3,1,11,2
chr19	16590171	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=0,183;MMQ=24,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr19	16593189	.	CAACAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AACAA;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.777:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	16593415	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=188,278;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:3,4,2,1
chr19	16596168	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=182,141;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	16596169	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=182,141;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	16601154	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=135,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,3:1,4:4,2,5,2
chr19	16601168	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=127,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,5:4,3:5,2,6,2
chr19	16601194	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=122,99;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,2:5,2:5,4,1,3
chr19	16606742	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,6,11
chr19	16606766	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,7,6
chr19	16611527	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	16612365	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=285,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr19	16613797	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=207,118;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr19	16617646	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=120,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.864:13:1,7:0,2:0,1,5,7
chr19	16631322	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=180,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:1,6:2,4:1,2,3,7
chr19	16631776	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr19	16770093	.	CAAAAAAAAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=199,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=22,12;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.332:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr19	16772218	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,12;MFRL=170,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr19	16797240	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	16798927	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr19	16859957	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=115,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:2,2:7,0:8,1,3,0
chr19	16874788	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,2:5,1:1,9,1,2
chr19	16876099	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr19	16918485	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:7,2,5,1
chr19	16918527	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=200,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:7,4,2,0
chr19	16923494	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr19	16977307	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=152,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,2:6,0:6,5,1,1
chr19	16988456	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr19	16988476	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr19	17011950	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr19	17085865	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=172,232;MMQ=60,34;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:6,2,2,0
chr19	17085896	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=170,130;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:5,1:8,3:7,6,3,1
chr19	17088107	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=208,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr19	17088121	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=269,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr19	17100438	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,4:0,0:1,2,1,3
chr19	17111411	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=248,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	17113001	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:4,3:2,1:5,1,4,1
chr19	17122630	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=199,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr19	17133028	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=175,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:0,6,1,2
chr19	17160783	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.277:26:10,6:9,0:9,10,7,0
chr19	17166896	.	TAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	17173418	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=145,309;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:5,1,3,0
chr19	17179789	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=89,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:4,2:0,5:2,2,4,3
chr19	17186127	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,3:1,1:3,0,3,1
chr19	17186136	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,2:2,0,4,2
chr19	17212992	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr19	17263498	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=199,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,2:1,0:2,4,0,2
chr19	17264961	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=280,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17264961_G_C:17264961:0,1,0,1
chr19	17264963	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=280,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17264961_G_C:17264961:0,1,0,1
chr19	17273753	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=245,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,4:3,0:1,2,2,2
chr19	17283303	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=96,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr19	17283383	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr19	17286517	.	G	GAAC	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=135,146;MMQ=60,27;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.333:31:9,10:8,0:0|1:17286517_G_GAAC:17286517:10,11,9,1
chr19	17286519	.	G	GATGAGACAGTCT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=135,146;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.333:31:9,1:11,0:0|1:17286517_G_GAAC:17286517:10,11,9,1
chr19	17286593	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=103,73;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:3,6,0,2
chr19	17286633	.	CTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=203,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=T;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.407:5:0,0:2,1:1,2,0,2
chr19	17296679	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=217,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:4,1,2,0
chr19	17298679	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=216,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr19	17298724	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=216,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,4,1
chr19	17298893	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr19	17298946	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=208,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr19	17301863	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=323,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:0,1,9,1
chr19	17301880	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=255,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,5:0,5:1,1,8,2
chr19	17302056	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,1:0,0,1,3
chr19	17302112	.	ACT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=228,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:0,2:0,1,0,3
chr19	17303460	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=223,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr19	17308691	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=193,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0,11,1,1
chr19	17311442	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=12,29;MFRL=196,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.907:13:0,7:0,5:1,0,8,4
chr19	17311698	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,1:3,0:0|1:17311698_G_C:17311698:0,5,0,2
chr19	17311701	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:17311698_G_C:17311698:0,5,0,2
chr19	17311702	.	G	GTT	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:17311698_G_C:17311698:0,5,0,2
chr19	17311705	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,29;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:17311698_G_C:17311698:0,5,0,2
chr19	17311708	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:17311698_G_C:17311698:0,5,0,2
chr19	17313178	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr19	17313619	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=201,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:1,6:4,2:5,0,8,1
chr19	17316782	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=192,178;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,2:2,2:1,1,3,1
chr19	17317252	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr19	17321087	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=121,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,3:11,0:14,2,3,0
chr19	17321487	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=285,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,4:3,1:2,1,4,1
chr19	17321669	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=209,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:1,5:1,4:1,1,3,6
chr19	17326567	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=153,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:3,2:3,0:2,4,2,1
chr19	17330060	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,7,9
chr19	17336966	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr19	17337025	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=211,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,3:3,2:4,4,5,0
chr19	17337223	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=238,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,5:2,3:0,2,0,8
chr19	17337733	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=199,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,3:3,1:3,0,2,2
chr19	17338033	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:1,3,1,4
chr19	17338099	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=295,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr19	17339193	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=223,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr19	17339225	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=230,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:0,7,0,3
chr19	17346559	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	17351535	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,180;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:6,0:9,5:6,9,3,2
chr19	17362526	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=126,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr19	17366110	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	17367585	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=216,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr19	17369275	.	TGGGAGGCTGAGGC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=198,237;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.284:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr19	17379913	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=170,324;MMQ=60,33;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.262:18:9,0:4,2:2,11,0,5
chr19	17387254	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=236,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr19	17389575	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	17389716	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=188,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:5,0:6,5:8,4,0,5
chr19	17394124	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=140,116;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.376:22:9,2:5,6:6,8,4,4
chr19	17394839	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=170,339;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:3,0:2,3:4,2,2,1
chr19	17396389	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,152;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:10,0:9,3:9,10,0,3
chr19	17411627	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=138,224;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.488:10:2,0:1,0:4,1,5,0
chr19	17411640	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=189,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.298:21:3,0:9,0:12,3,6,0
chr19	17424932	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=182,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:6,5,0,2
chr19	17424947	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=189,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:6,0:3,2:7,5,2,0
chr19	17430319	.	AAG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=166,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:9,3:5,1:8,8,3,1
chr19	17434587	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	17438930	.	GGCGAGGCCCCGCCCCCT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=138,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCGAGGCCCCGCCCCCT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr19	17440871	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:4,3,0,2
chr19	17449157	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:21,1:5,2:17,9,1,2
chr19	17450446	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	17471717	.	CTTTTTCTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=19,33;MFRL=229,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.285:5:0,1:0,0:0,4,0,1
chr19	17471739	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=237,222;MMQ=50,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0|1:17471739_T_C:17471739:0,2,0,3
chr19	17471745	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=293,222;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0|1:17471739_T_C:17471739:0,3,0,3
chr19	17514646	.	T	TGGG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=G;STR;TLOD=52.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr19	17516400	.	A	AGCTGAAAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=48.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0,0,1,10
chr19	17531450	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:2,3:5,7:1,6,8,3
chr19	17533126	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,8:0,2:1,0,6,5
chr19	17534693	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr19	17535546	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr19	17535658	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr19	17535819	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=142,67;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr19	17571586	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:4,6,3,1
chr19	17571766	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr19	17599778	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=203,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:2,1:5,1:5,3,0,3
chr19	17599958	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=187,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,0:0|1:17599958_G_C:17599958:1,5,2,0
chr19	17599963	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=187,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,0:0|1:17599958_G_C:17599958:1,5,2,0
chr19	17599966	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=187,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:2,1:0|1:17599958_G_C:17599958:1,5,2,0
chr19	17599970	.	CAGGCCTCA	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=186,211;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,0:0|1:17599958_G_C:17599958:0,4,2,0
chr19	17599983	.	CT	GG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=186,211;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:1,0:0|1:17599958_G_C:17599958:0,3,2,0
chr19	17611261	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=147,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:1,3,1,2
chr19	17611490	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=187,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:1,5:2,3:1,2,3,5
chr19	17612251	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,0:2,2:2,5,0,2
chr19	17622391	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	17622614	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=229,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr19	17628737	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr19	17643065	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.447:9:2,2:3,2:4,1,4,0
chr19	17654075	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=176,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,1:5,2,2,0
chr19	17660439	.	G	GTTGCTCCTGAGTGGGCTGTCGTCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=189,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr19	17679227	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=179,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr19	17679548	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=205,77;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:4,6,1,1
chr19	17679597	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=232,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr19	17691924	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,10;MFRL=289,77;MMQ=60,55;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.408:5:1,0:2,0:2,1,2,0
chr19	17728502	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,10,8
chr19	17729120	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr19	17729148	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=227,234;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr19	17729672	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=95,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.809:11:0,3:2,5:1,1,4,5
chr19	17729787	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=247,161;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,3:1,7:0,1,4,8
chr19	17735618	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=124,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:5,0:11,3:8,9,2,1
chr19	17737650	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,248;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:0,7,0,4
chr19	17738295	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:6,4,1,1
chr19	17738777	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:8,1:1,3:1,8,1,3
chr19	17738850	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=196,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,1:0,1:0,2,0,3
chr19	17740217	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,4:4,3:0,5,0,7
chr19	17741422	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,3:0,3:3,0,5,1
chr19	17750183	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=194,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:6,2,2,0
chr19	17750550	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=213,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr19	17752289	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=165,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:17752289_C_T:17752289:4,8,2,0
chr19	17752297	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=165,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:0|1:17752289_C_T:17752289:4,8,2,0
chr19	17753834	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=185,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr19	17753838	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=160,154;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:17753838_A_G:17753838:0,3,0,2
chr19	17753842	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=252,154;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:17753838_A_G:17753838:0,5,0,2
chr19	17763392	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,7:3,3:1,3,6,4
chr19	17766066	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,0:1,3,2,0
chr19	17768818	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=266,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr19	17769166	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr19	17777366	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=202,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr19	17777431	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=86,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:5,3:6,3:5,6,3,3
chr19	17777595	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=209,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,1:1,1:2,1,0,2
chr19	17778832	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	17779041	.	TGCCGCTCA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,2:3,1:1,8,1,2
chr19	17830278	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=183,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,1,1
chr19	17835086	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=220,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:4,2:3,5:0,7,2,5
chr19	17835831	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=181,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:4,1:4,5:4,4,5,1
chr19	17844325	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	17883429	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:3,3:10,0:7,6,3,0
chr19	17885308	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=202,260;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr19	17885336	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=267,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr19	17887563	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=271,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr19	17888847	.	C	CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=A;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,1:1,0,4,0
chr19	17889044	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:0,6,0,3
chr19	17892193	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=220,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,6:1,5:1,0,5,6
chr19	17892478	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:1,3:0,3:1,0,4,3
chr19	17894075	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=235,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr19	17894878	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,320;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,0:6,2:5,2,2,0
chr19	17937758	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,19;MFRL=207,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0,3,1,0
chr19	17941294	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=108,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:5,1,6,2
chr19	17945352	.	T	TGCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=158,329;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:0,0:4,1:3,1,1,0
chr19	17946054	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=156,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	17950520	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,3:4,4,0,5
chr19	17950948	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=205,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr19	17951157	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=144,131;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:10,0:11,6:6,15,0,6
chr19	17951178	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=146,326;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,1:6,2:2,12,0,3
chr19	17954158	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=220,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:8,3:3,6:7,4,6,3
chr19	17955003	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=194,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:2,2,3,1
chr19	17970627	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=161,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.289:12:3,3:5,0:7,2,3,0
chr19	17994393	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=206,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr19	18054050	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=71,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:18054050_T_TC:18054050:1,1,2,0
chr19	18054056	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=111,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0|1:18054050_T_TC:18054050:1,2,2,0
chr19	18054060	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=111,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:18054050_T_TC:18054050:0,3,2,0
chr19	18054064	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=111,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:18054050_T_TC:18054050:0,3,2,0
chr19	18092442	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=230,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr19	18108956	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,5:7,3:9,3,5,3
chr19	18119399	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr19	18119678	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=210,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:7,4:1,1:3,5,2,3
chr19	18121509	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:11,6,0,2
chr19	18171886	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=271,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:5,4:12,2:15,2,4,2
chr19	18184313	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=93,68;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:11,4:11,0:11,11,2,2
chr19	18186752	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=114,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:1,7,0,2
chr19	18218444	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=155,280;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.232:24:11,1:7,4:10,9,2,3
chr19	18232778	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr19	18234994	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=260,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr19	18235352	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=158,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,6:2,3:3,0,8,1
chr19	18235424	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr19	18241571	.	GGAGA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=159,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:4,0:2,2:0|1:18241571_GGAGA_G:18241571:0,7,0,2
chr19	18241578	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=159,215;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:18241571_GGAGA_G:18241571:0,7,0,2
chr19	18242675	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=153,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr19	18242867	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=179,110;MMQ=60,37;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:5,0:13,3:12,6,0,3
chr19	18245446	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=136,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:9,4,1,1
chr19	18245512	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=114,160;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,4:6,3:4,6,0,7
chr19	18245527	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=164,114;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:3,2:4,3:1,7,3,3
chr19	18245807	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=173,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.311:14:3,2:6,2:0|1:18245807_C_T:18245807:4,6,2,2
chr19	18245813	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.601:13:2,2:3,6:0|1:18245807_C_T:18245807:1,4,3,5
chr19	18252829	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=94,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:0,5:6,3:1,5,5,3
chr19	18256574	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=152,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:6,1,1,1
chr19	18257875	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=18,27;MFRL=144,276;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.593:5:1,3:0,0:0,2,0,3
chr19	18257908	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=277,276;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr19	18257909	.	CTTTTT	C,CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20,33;MFRL=0,276,277;MMQ=60,60,60;MPOS=22,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,17,18;RU=T;STR;TLOD=3.12,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr19	18258368	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.547:20:2,0:6,10:1,8,0,11
chr19	18258459	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr19	18258512	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=222,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	18273410	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,0,7
chr19	18276856	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	18277206	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=346,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr19	18279770	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=238,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,1:6,1:5,5,0,2
chr19	18279816	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr19	18284686	.	CGCT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCT;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,1:3,1:16,0,2,0
chr19	18286244	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=188,276;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,2:7,1:1,9,2,1
chr19	18286546	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr19	18288678	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=152,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:14,2:0|1:18288678_G_A:18288678:10,11,1,1
chr19	18288681	.	C	CTTCTGTT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=152,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:14,2:0|1:18288678_G_A:18288678:11,11,1,1
chr19	18322000	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:3,9,1,1
chr19	18322095	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,1,9
chr19	18322177	.	C	CTA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,22;MFRL=247,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:18322177_C_CTA:18322177:0,1,0,1
chr19	18322178	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,27;MFRL=247,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:18322177_C_CTA:18322177:0,1,0,1
chr19	18322181	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=247,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:18322177_C_CTA:18322177:0,1,0,1
chr19	18324329	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=246,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,2:1,6:0,1,3,5
chr19	18331357	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=140,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.804:13:1,5:1,6:0,2,0,11
chr19	18332917	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=162,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,0:5,2:8,4,2,0
chr19	18376509	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=215,141;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,6:3,1:3,1,6,1
chr19	18376517	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=170,210;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,1:3,1:8,2,2,0
chr19	18376522	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=211,141;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,9:2,2:4,1,9,2
chr19	18378219	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:6,4:8,3:5,9,5,2
chr19	18378235	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:8,0:7,3:0|1:18378235_C_T:18378235:11,6,0,3
chr19	18378240	.	G	GCTCATCGTGATCCCGGCGACATACTACCT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:9,0:10,3:0|1:18378235_C_T:18378235:14,7,0,3
chr19	18420704	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=228,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,5:0,5:0,1,2,8
chr19	18423402	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=124,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.658:12:2,4:1,4:2,2,6,2
chr19	18426790	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=293,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr19	18426950	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=116,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:4,2:2,2:1,6,1,3
chr19	18466840	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chr19	18499780	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:18499780_A_G:18499780:0,0,0,4
chr19	18499784	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=192,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:2,0:0,1:0|1:18499780_A_G:18499780:0,2,0,2
chr19	18502728	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=191,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,1:1,5:1,0,6,0
chr19	18503019	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=181,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,2:0,1:0,2,0,3
chr19	18541579	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	18542701	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=190,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,1:7,1:10,4,1,1
chr19	18545747	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=180,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:3,2:8,0:6,5,2,0
chr19	18547813	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=209,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:2,2,1,0
chr19	18649084	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,1:8,2:4,12,1,2
chr19	18650278	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr19	18675612	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0|1:18675612_T_G:18675612:0,0,3,0
chr19	18675621	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=159,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:18675612_T_G:18675612:2,0,1,0
chr19	18675629	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=159,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,0:0|1:18675612_T_G:18675612:2,0,1,0
chr19	18675854	.	G	GGGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	18678016	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=174,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,1:3,2:4,5,1,2
chr19	18679155	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=213,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,4:3,4:3,3,8,0
chr19	18703077	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=214,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:0,5:2,1:0,2,0,6
chr19	18707814	.	C	CTGAGAGGGGCCCTCCTCTG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=136,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:5,11,0,2
chr19	18707878	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:0,3,1,5
chr19	18729084	.	TGGG	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=145,80;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.283:5:3,1:0,0:0|1:18729084_TGGG_T:18729084:3,1,0,1
chr19	18729088	.	TGGCAGGA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=145,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:18729084_TGGG_T:18729084:3,1,0,1
chr19	18778445	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=12,27;MFRL=208,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.877:10:0,3:0,6:1,0,4,5
chr19	18779609	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=248,130;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:2,0,0,3
chr19	18886415	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=121,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:6,3,3,2
chr19	18897043	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=101,128;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,0:7,3:4,6,0,3
chr19	18897068	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=201,128;MMQ=60,44;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,0:7,3:4,7,0,3
chr19	18897526	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr19	18956699	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr19	18973019	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=212,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:1,0:0,6,0,2
chr19	18973034	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=222,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr19	18974200	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:0,4:2,2:2,0,7,0
chr19	18976443	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,1:16,1:10,15,2,0
chr19	18979324	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr19	19011244	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,135;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,5:1,5:0,1,4,6
chr19	19015491	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=201,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr19	19021941	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=139,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,1:0.263:7:4,1:1,0:0|1:19021941_G_GC:19021941:1,5,0,1
chr19	19021943	.	T	TGTTAAGATCGTTTAGATTCTAGGATAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.272:6:2,1:1,0:0|1:19021941_G_GC:19021941:0,5,0,1
chr19	19032637	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=206,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:1,9:0,7:1,0,6,10
chr19	19035159	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr19	19035354	.	GC	TT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=242,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,2,2
chr19	19037053	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=157,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:8,3:5,1:11,2,4,0
chr19	19037294	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr19	19042142	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=135,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:7,0:6,6:7,6,0,7
chr19	19045257	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=150,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:19045257_C_A:19045257:2,6,1,1
chr19	19045259	.	C	CTTCCAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=150,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:19045257_C_A:19045257:2,6,1,1
chr19	19045261	.	T	TCAGTTC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=168,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:19045257_C_A:19045257:2,5,1,1
chr19	19049096	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=168,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,3:5,0:9,1,1,2
chr19	19121060	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=164,84;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.214:21:12,2:5,2:11,6,2,2
chr19	19130056	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,0:2,3:1,5,2,1
chr19	19137051	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,17;MFRL=217,258;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.567:5:1,0:0,1:0,2,0,3
chr19	19168183	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=127,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:2,2,3,1
chr19	19207064	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=175,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:19207064_C_T:19207064:0,3,1,0
chr19	19207067	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=175,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:19207064_C_T:19207064:0,3,1,0
chr19	19207087	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=176,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:19207087_CT_C:19207087:0,3,0,1
chr19	19207089	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=176,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:19207087_CT_C:19207087:0,3,0,1
chr19	19216613	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	19218828	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=133,259;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,2:6,1:5,6,0,3
chr19	19230816	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:1,6,3,2
chr19	19230868	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=188,328;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:3,1:4,2:4,4,3,0
chr19	19231787	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:5,1:8,2:9,4,3,0
chr19	19231817	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,1:8,2:11,4,3,0
chr19	19243843	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	19312817	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=116,209;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,1:5,1:6,8,1,1
chr19	19335083	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=142,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:2,2,2,5
chr19	19345765	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=217,201;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:1,3,4,0
chr19	19345802	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=181,263;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.248:13:3,1:7,1:4,6,1,2
chr19	19373669	.	A	AGGCG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=169,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGCG;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	19381285	.	G	GAACAGCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=12,31;MFRL=180,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:19381285_G_GAACAGCA:19381285:0,1,0,1
chr19	19381288	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=180,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19381285_G_GAACAGCA:19381285:0,1,0,1
chr19	19381291	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=180,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19381285_G_GAACAGCA:19381285:0,1,0,1
chr19	19387743	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.365:12:4,2:2,2:7,1,3,1
chr19	19431423	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=259,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,5:1,4:0,2,2,8
chr19	19431963	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=12,29;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.851:11:0,3:0,4:0,1,0,10
chr19	19447933	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.758:11:1,5:1,3:1,1,4,5
chr19	19449603	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	19451591	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=174,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,4:0,3:0,1,5,3
chr19	19451741	.	C	CAGAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=168,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:19451741_C_CAGAG:19451741:1,4,1,1
chr19	19451742	.	C	CTGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=168,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,0:0|1:19451741_C_CAGAG:19451741:1,4,1,1
chr19	19452249	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=159,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr19	19453521	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.711:11:0,3:2,5:1,2,5,3
chr19	19453560	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=12,26;MFRL=446,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.909:13:0,5:0,7:1,0,5,7
chr19	19453742	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	19454828	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=164,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr19	19545990	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=105,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,1:4,2:7,3,0,3
chr19	19547086	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr19	19606463	.	AACT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr19	19638482	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=129,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.343:12:0,1:6,1:0|1:19638482_A_C:19638482:2,6,4,0
chr19	19638488	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=129,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.299:14:0,0:9,1:0|1:19638482_A_C:19638482:4,6,4,0
chr19	19646272	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=134,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,6:5,2:8,1,5,3
chr19	19648346	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=135,200;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	19655217	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,0:2,2:2,6,1,1
chr19	19737735	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=172,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,2:3,0:0|1:19737735_GC_G:19737735:7,9,1,1
chr19	19737744	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=187,78;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,2:4,0:0|1:19737735_GC_G:19737735:6,10,1,1
chr19	19740729	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	19745479	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=199,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:5,8:8,3:6,7,8,3
chr19	19748197	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=159,71;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.218:21:8,0:7,4:0|1:19748197_C_T:19748197:12,5,1,3
chr19	19748219	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=160,71;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.262:17:7,0:6,4:0|1:19748197_C_T:19748197:9,4,1,3
chr19	19750822	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=198,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:19750822_C_T:19750822:3,0,1,1
chr19	19750824	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=198,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:19750822_C_T:19750822:3,0,1,1
chr19	19751456	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr19	19753292	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=218,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,8:2,3:3,1,4,7
chr19	19756662	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=118,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.271:12:5,0:3,2:4,5,3,0
chr19	19758190	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	19762676	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:1,8,0,3
chr19	19765269	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=212,237;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,6:1,0:3,0,6,0
chr19	19766817	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,3:3,0:7,0,2,1
chr19	19767541	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=179,97;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,0:7,5:6,9,0,5
chr19	19767977	.	T	TCTGTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=193,246;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTGTC;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.421:5:1,1:2,0:2,1,1,1
chr19	19770329	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=167,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:19770329_T_C:19770329:11,2,2,0
chr19	19770334	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=147,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,3:0.221:16:6,2:7,1:1|0:19770329_T_C:19770329:10,3,3,0
chr19	19773885	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:12,2:13,2:15,10,2,2
chr19	19789424	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=225,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr19	19916739	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=94,325;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:19916739_G_T:19916739:3,1,2,0
chr19	19916747	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=94,325;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:19916739_G_T:19916739:3,1,2,0
chr19	19976701	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=124,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,1:4,1:7,5,1,1
chr19	20003576	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=182,237;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,1:7,2:7,7,0,3
chr19	20117381	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=143,80;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:20117381_C_A:20117381:7,7,1,1
chr19	20117383	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=143,80;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:20117381_C_A:20117381:7,7,1,1
chr19	20117390	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=151,80;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,1:0|1:20117381_C_A:20117381:6,7,1,1
chr19	20150075	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=223,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,5:3,4:3,1,8,1
chr19	20150247	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=216,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr19	20296738	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=203,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr19	20735196	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.456:11:2,3:3,1:5,1,5,0
chr19	20735272	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=180,71;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:3,10,0,2
chr19	20736639	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=214,130;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:2,3:3,2:1,4,2,4
chr19	20736677	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=218,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,1,4
chr19	20748522	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=123,180;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:9,1:7,5:4,12,1,5
chr19	20807185	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,240;MMQ=60,27;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	20808374	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=165,129;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.278:12:6,2:3,1:1,8,2,1
chr19	20808515	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr19	20828410	.	A	AAAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=192,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,2:7,0:4,4,2,0
chr19	20829218	.	AAC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=178,255;MMQ=46,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:3,4,0,2
chr19	20844340	.	G	GAAGT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=166,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:0|1:20844340_G_GAAGT:20844340:1,3,3,5
chr19	20844361	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=174,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:0|1:20844340_G_GAAGT:20844340:1,4,0,2
chr19	21106262	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.383:18:4,1:7,4:4,7,1,6
chr19	21131481	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,4:7,3:15,0,5,2
chr19	21133129	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=238,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.298:14:2,1:8,2:4,6,3,1
chr19	21203488	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:4,1,4,1
chr19	21203552	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=78.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,11:0,0,11,14
chr19	21281765	.	TAAAAA	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=199,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,10;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.279:5:2,0:2,1:2,2,0,1
chr19	21281813	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,23;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:21281813_C_A:21281813:0,3,0,1
chr19	21281814	.	T	TTAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:21281813_C_A:21281813:0,3,0,1
chr19	21281815	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	21299774	.	T	TATA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=129,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.551:27:6,7:6,8:8,4,9,6
chr19	21300142	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=190,129;MMQ=55,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:0,0:2,3:2,0,2,3
chr19	21300628	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=206,255;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr19	21300964	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,138;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:6,2:6,7,2,0
chr19	21349311	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr19	21491951	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=90,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,1,1
chr19	21493255	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=125,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,3:8,0:11,6,3,0
chr19	21493257	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.438:11:5,2:1,3:6,0,5,0
chr19	21493258	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=193,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.824:21:3,9:0,9:3,0,11,7
chr19	21493278	.	TA	T,TAA	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=24,27,25;MFRL=84,145,170;MMQ=60,60,60;MPOS=24,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=21.85,5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,13,3:0.413,0.132:30:3,8,1:9,3,2:6,8,11,5
chr19	21493392	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=169,178;MMQ=60,37;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:17,4:13,0:10,21,0,4
chr19	21541806	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=227,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:2,2,2,0
chr19	21544466	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=237,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr19	21544503	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=197,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,1:5,2:4,1,3,0
chr19	21544514	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:1,1:6,2:5,2,3,0
chr19	21544714	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,0:3,6:2,5,3,3
chr19	21558007	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=163,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,1:5,2:11,0,2,1
chr19	21558015	.	A	ATG,ATGTG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,31,29;MFRL=217,86,158;MMQ=60,60,60;MPOS=11,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,9,10;RU=TG;STR;TLOD=4.26,22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,8:0.178,0.544:14:3,2,4:1,0,3:2,2,10,0
chr19	21558169	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,258;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:9,4:7,1:4,12,2,3
chr19	21558818	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,36;MFRL=116,110;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.376:9:3,1:1,2:2,4,0,3
chr19	21560141	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr19	21561408	.	CTT	C,CT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,31,33;MFRL=58,156,187;MMQ=58,60,60;MPOS=29,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=T;STR;TLOD=4.04,4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,4:0.209,0.295:15:6,1,2:1,1,2:4,4,5,2
chr19	21587890	.	A	ATG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=176,4933172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TG;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.325:7:3,2:2,0:3,2,2,0
chr19	21587918	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=36,24;MFRL=70,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:4,4,3,0
chr19	21588692	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=57,215;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=74.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,24:0.893:26:1,19:1,4:2,0,6,18
chr19	21588709	.	T	TAAAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,10;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=22,26;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.697:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr19	21607878	.	ATAAT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=209,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAAT;STR;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:8,2,2,4
chr19	21609556	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=165,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.754:10:1,4:1,4:1,1,5,3
chr19	21609743	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0|1:21609743_G_A:21609743:0,0,5,8
chr19	21609755	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=209,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:0|1:21609743_G_A:21609743:3,5,1,4
chr19	21688495	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=151,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:1,4:11,4:9,4,6,2
chr19	21688602	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=230,133;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,26:0.730:35:5,10:4,16:3,6,11,15
chr19	21712442	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.261:13:7,0:3,3:7,3,3,0
chr19	21713460	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=117,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:4,1:12,3:9,7,2,2
chr19	21719026	.	G	GTA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=206,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TA;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr19	21720909	.	TACAAAAAAAAAAAAAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,28;MFRL=228,178;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:21720909_TACAAAAAAAAAAAAAAA_T:21720909:0,1,0,1
chr19	21720927	.	A	ATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=228,178;MMQ=40,40;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:21720909_TACAAAAAAAAAAAAAAA_T:21720909:0,1,0,1
chr19	21927706	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=62,142;MMQ=49,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,5:0,3:1,1,5,3
chr19	21950337	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=204,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,1:5,2:1,4,0,3
chr19	22154954	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=191,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.597:20:4,4:3,8:7,1,8,4
chr19	22193451	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr19	22235307	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=98,232;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr19	22235491	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,1:2,3:0,4,2,2
chr19	22235526	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=142,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:0,2,2,2
chr19	22235577	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=263,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr19	22256396	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=128,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:3,6:2,1:1,4,2,5
chr19	22270879	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=124,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.126:34:16,3:14,0:20,10,4,0
chr19	22574818	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=277,187;MMQ=23,27;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:1,1,1,2
chr19	22575029	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=131,145;MMQ=27,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr19	22605103	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=206,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:0,3:2,1:2,0,2,3
chr19	22605120	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=237,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr19	22836865	.	C	CATAGGAGTCATATTCCATCA	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=124,47;MMQ=57,55;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:0,6,1,1
chr19	22836886	.	G	GATA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=146,102;MMQ=59,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.274:5:1,1:3,0:0|1:22836886_G_GATA:22836886:0,4,0,1
chr19	22836887	.	C	CACAAATGTTCTTAGCAG	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=146,102;MMQ=59,33;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.274:5:1,1:3,0:0|1:22836886_G_GATA:22836886:0,4,0,1
chr19	22836896	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=159,138;MMQ=60,57;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:22836896_A_C:22836896:0,3,0,1
chr19	22836901	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=159,138;MMQ=60,57;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.342:4:1,1:2,0:0|1:22836896_A_C:22836896:0,3,0,1
chr19	22846692	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,103;MMQ=57,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.306:24:11,7:6,0:11,6,7,0
chr19	22847343	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=106,423;MMQ=27,22;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:22847343_G_A:22847343:1,0,1,0
chr19	22847346	.	AG	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=106,423;MMQ=27,22;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:22847343_G_A:22847343:1,0,1,0
chr19	22847353	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=106,423;MMQ=27,22;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:22847343_G_A:22847343:1,0,1,0
chr19	23542290	.	AG	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,108;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,2:5,0:4,3,2,2
chr19	23542697	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=213,194;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,2:1,5:2,1,5,2
chr19	23545010	.	TTTA	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=184,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:4,2:10,0:0|1:23545010_TTTA_T:23545010:4,13,1,1
chr19	23545016	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=187,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:5,2:10,0:0|1:23545010_TTTA_T:23545010:4,12,1,1
chr19	23836322	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,1:7,5:9,6,4,2
chr19	23837434	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=182,246;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.265:28:13,0:8,7:7,14,0,7
chr19	23845038	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,44;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,5:0,10:0|1:23845038_T_G:23845038:0,0,5,11
chr19	23845042	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0|1:23845038_T_G:23845038:0,0,4,11
chr19	23845795	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.949:18:0,9:0,8:0,0,11,7
chr19	23869684	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr19	23869941	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,5,12
chr19	23926332	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	23938398	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,0;MMQ=60,45;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:1,12,0,2
chr19	23941459	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr19	30020678	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=235,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:5,2,2,0
chr19	30099457	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr19	30103153	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=151,238;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr19	30106145	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=128,70;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:30106145_T_TAA:30106145:0,4,1,0
chr19	30106146	.	TTCAG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=128,70;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:30106145_T_TAA:30106145:0,4,1,0
chr19	30303352	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	30303714	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=271,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,3:4,5:4,1,4,5
chr19	30311542	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,19;MFRL=192,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:1,1:3,2,1,1
chr19	30311787	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=220,73;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr19	30313523	.	CCTT	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:1,4:0,6,1,5
chr19	30313576	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=188,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr19	30313603	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,217;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	30433485	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	30433668	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	30500118	.	GTGA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=217,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TGA;STR;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.865:12:1,6:0,5:0,1,10,1
chr19	30503157	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:8,1:11,1:0|1:30503157_G_A:30503157:16,3,1,1
chr19	30503162	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=182,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:19,4:0.198:23:6,3:13,1:1|0:30503157_G_A:30503157:14,5,3,1
chr19	30934385	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr19	31840190	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr19	32844053	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:19,0:11,4:16,15,0,4
chr19	32845032	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=228,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:3,4:4,0:3,4,2,3
chr19	32899069	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=202,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr19	32944189	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,236;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:1,8,0,2
chr19	32949099	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.391:18:4,5:7,1:4,7,1,6
chr19	32954725	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=107,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:5,2,5,1
chr19	33072266	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=216,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:1,1:0,4:0,2,0,5
chr19	33096718	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=104,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:4,0,4,2
chr19	33106742	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=182,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,1:0,2,0,4
chr19	33106761	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr19	33113295	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr19	33131336	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=155,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:2,4:0,2,1,3
chr19	33133936	.	CG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=297,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,0:2,0,4,0
chr19	33134425	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:2,6:0,4:1,1,7,3
chr19	33140719	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=129,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:2,3,1,1
chr19	33149768	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=264,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr19	33149904	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=136,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,0:5,5:7,5,3,2
chr19	33168036	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,7:2,4:0,3,3,8
chr19	33168059	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,7:2,4:1,3,4,7
chr19	33168078	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:7,3:3,2:4,6,2,3
chr19	33168605	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=183,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:8,6,1,1
chr19	33168641	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=159,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:8,2,1,1
chr19	33169097	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=168,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:4,2:14,1:7,12,3,0
chr19	33169172	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=109,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=C;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.337:9:3,0:2,1:2,4,0,3
chr19	33183352	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=146,219;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr19	33211069	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=259,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr19	33229742	.	ACT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,3:3,0:8,1,3,0
chr19	33264348	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:4,7:4,6:4,4,8,5
chr19	33333302	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=199,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33333302_T_G:33333302:0,1,0,1
chr19	33333305	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=199,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33333302_T_G:33333302:0,1,0,1
chr19	33333306	.	CTTGT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,24;MFRL=199,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33333302_T_G:33333302:0,1,0,1
chr19	33349295	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr19	33349488	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=332,217;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr19	33350917	.	C	CTGAGTAGCTGGTTCTACAGGTGTGTGCCATCA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=166,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.288:10:5,0:1,2:1,7,1,1
chr19	33353343	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=167,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:0,3:0|1:33353343_A_G:33353343:3,0,4,0
chr19	33353357	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0|1:33353343_A_G:33353343:2,0,4,1
chr19	33353575	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=21,35;MFRL=96,189;MMQ=57,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:33353575_T_G:33353575:2,2,0,1
chr19	33353581	.	T	TGTTTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=96,189;MMQ=57,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:33353575_T_G:33353575:2,2,0,1
chr19	33353585	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=96,189;MMQ=54,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:0|1:33353575_T_G:33353575:2,1,0,1
chr19	33355513	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=200,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr19	33359479	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=213,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr19	33370161	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=96,118;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:1,2,4,2
chr19	33372687	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=243,233;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr19	33406206	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:0,1:2,1,2,0
chr19	33406442	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=71,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:2,6,1,1
chr19	33406484	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=184,292;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr19	33409061	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=193,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr19	33417044	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=188,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:4,1,3,0
chr19	33424277	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr19	33428425	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=80,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:1,1,3,0
chr19	33439158	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:2,2,5,0
chr19	33444456	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=186,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr19	33444556	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:2,2,4,0
chr19	33444576	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:5,4,4,0
chr19	33444588	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:5,4,3,0
chr19	33444773	.	CTTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,21;MFRL=192,212;MMQ=48,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,14;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.340:4:0,0:1,1:0,3,0,1
chr19	33464048	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=212,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,3:0,5:1,0,8,0
chr19	33464253	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=155,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:2,1:0,2:0,2,1,3
chr19	33467413	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:2,7,2,2
chr19	33467620	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,249;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:1,4:2,1:0,3,0,6
chr19	33470874	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr19	33481388	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=244,126;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:0,6:4,6:2,2,7,5
chr19	33487182	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=263,196;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr19	33490462	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=176,169;MMQ=60,32;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:11,4:6,1:11,6,6,0
chr19	33490480	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=159,174;MMQ=60,26;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:11,4:9,2:10,10,5,1
chr19	33490488	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:12,2:7,4:10,10,4,2
chr19	33490685	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr19	33493676	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=185,202;MMQ=57,37;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:6,0:2,2:0|1:33493676_C_T:33493676:8,0,2,0
chr19	33493681	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=175,187;MMQ=60,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,3:0.308:11:3,2:4,0:1|0:33493676_C_T:33493676:7,1,3,0
chr19	33493687	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,18;MFRL=178,187;MMQ=60,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,3:0.332:10:4,1:3,0:1|0:33493676_C_T:33493676:6,1,3,0
chr19	33498823	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=178,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr19	33498843	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=273,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr19	33498978	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=178,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,6:3,4:4,1,6,4
chr19	33502714	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=126,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:4,2,0,2
chr19	33512632	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=272,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr19	33579034	.	TTTTA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:2,0,1,0
chr19	33584176	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr19	33584330	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=125,117;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:8,4,2,0
chr19	33584479	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr19	33585219	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.889:5:0,1:0,2:0,0,0,5
chr19	33588747	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=151,72;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,1:4,1:5,5,1,1
chr19	33592337	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=207,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr19	33597816	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=66,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,5:3,4:1,4,2,7
chr19	33602757	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:2,2,2,3
chr19	33602881	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=249,269;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,1,2
chr19	33620993	.	T	TCC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=191,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:2,3:4,4:2,4,6,1
chr19	33635761	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,112;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,1:4,5:7,1,3,3
chr19	33635853	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=192,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:0|1:33635853_G_A:33635853:1,4,1,4
chr19	33635877	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0|1:33635853_G_A:33635853:0,5,0,3
chr19	33635887	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0|1:33635853_G_A:33635853:0,5,0,3
chr19	33638641	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=195,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,5:3,2:3,5,3,4
chr19	33642273	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	33663189	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=205,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,3:1,3:4,3,6,0
chr19	33666304	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=150,199;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:12,1:14,2:13,13,3,0
chr19	33696708	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=191,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,2,3
chr19	33700445	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,4:3,0:0,3,0,4
chr19	33701589	.	C	CATT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33701589_C_CATT:33701589:0,0,0,1
chr19	33701590	.	C	CCAGGGTGGGGGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33701589_C_CATT:33701589:0,0,0,1
chr19	33702245	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=175,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,6:2,3:2,2,5,4
chr19	33703103	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=181,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr19	33703706	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=258,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:2,3,2,0
chr19	33703909	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=185,66;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:0|1:33703909_C_T:33703909:5,8,1,1
chr19	33703917	.	A	AGG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=190,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:33703909_C_T:33703909:4,7,1,1
chr19	33703919	.	C	CCCTGCCATCCCT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=190,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:0|1:33703909_C_T:33703909:4,7,1,1
chr19	33872058	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.199:38:17,7:14,0:17,14,7,0
chr19	33953831	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr19	33984301	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=44.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.750:22:1,0:4,13:2,3,0,17
chr19	34180149	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,19;MFRL=199,293;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,1:5,0:10,5,2,0
chr19	34291283	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=166,274;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:6,2:7,3:11,2,2,3
chr19	34302214	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=217,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,3:5,1:7,0,4,0
chr19	34302673	.	CTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=112,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:3,1:2,3:4,4,3,1
chr19	34685617	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:12,2:4,1:0,16,0,3
chr19	34687746	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=168,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,2:5,3:0,9,0,5
chr19	34706440	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:4,0,3,2
chr19	34710532	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=244,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:1,2,2,2
chr19	34710807	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=212,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,5:3,1:3,2,1,5
chr19	34712654	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=214,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:9,6:1,4:3,8,1,9
chr19	34717269	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=150,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.341:4:0,1:3,0:2,1,1,0
chr19	34717280	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=19,17;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=23,24;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.519:2:0,0:0,0:0,1,1,0
chr19	34811103	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr19	34824582	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=144,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:2,0:7,1,0,2
chr19	34833052	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:17,0:6,2:12,11,0,2
chr19	34838948	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:6,1:14,1:4,16,1,1
chr19	34838998	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:2,1:6,5:1,7,2,4
chr19	34843761	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,0:4,3:0,8,1,3
chr19	34843874	.	AGCCTGCCT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=268,10706339;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=GCCT;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,1:1,1:0,2,0,2
chr19	34859457	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:4,1:6,2,2,0
chr19	34870005	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=189,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr19	34870441	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=144,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:34870441_C_T:34870441:5,6,1,1
chr19	34870443	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=144,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:34870441_C_T:34870441:5,6,1,1
chr19	34885006	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr19	34890291	.	GAAGCTA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,30;MFRL=173,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:34890291_GAAGCTA_G:34890291:2,2,0,1
chr19	34890300	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=173,84;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:34890291_GAAGCTA_G:34890291:2,2,0,1
chr19	34890322	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	34895879	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=118,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:8,6,2,0
chr19	34922865	.	T	TGTATAAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,6:0,8:0,0,4,10
chr19	34942872	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr19	34945331	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=183,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:0,0:6,2:5,3,2,0
chr19	34945387	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=181,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:7,0:8,2:9,6,2,0
chr19	34951356	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32,30;MFRL=173,153,155;MMQ=60,60,60;MPOS=17,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=12.08,4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,4:0.271,0.238:16:5,0,1:2,4,3:7,1,7,1
chr19	34951453	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:13,2:9,3:4,18,0,5
chr19	34954873	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr19	34984543	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=209,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:4,4,0,2
chr19	34985466	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=116,123;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,0:1,5:0,1,4,1
chr19	34986767	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,36;MFRL=201,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:34986767_A_C:34986767:0,2,0,2
chr19	34986776	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=200,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:34986767_A_C:34986767:0,1,0,2
chr19	35085310	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=175,394;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:9,2,1,1
chr19	35231472	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=196,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.617:19:4,3:3,8:5,2,9,3
chr19	35420966	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=270,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,4:1,6:0,1,0,10
chr19	35424504	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=129,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,2:6,2:7,3,4,0
chr19	35434238	.	AG	GA,GG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,35,31;MFRL=173,208,180;MMQ=60,60,60;MPOS=26,22;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.57,17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,6:0.277,0.422:14:2,0,3:2,4,3:2,2,5,5
chr19	35448803	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=196,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,4:2,4:2,2,7,1
chr19	35448956	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=166,262;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.201:23:13,2:5,2:12,7,2,2
chr19	35451330	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	35451742	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=170,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:5,2:5,3:6,5,3,2
chr19	35454604	.	AA	CG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=163,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,2:5,5:1,9,1,6
chr19	35491326	.	A	AGCCCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GCCCT;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.771:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chr19	35500919	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=169,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:2,4:3,11:2,3,7,8
chr19	35502534	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=179,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr19	35504304	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=177,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,0:4,2:0|1:35504304_T_C:35504304:4,5,1,1
chr19	35504306	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=177,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:0|1:35504304_T_C:35504304:4,5,1,1
chr19	35504627	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:1,6:6,6:3,5,6,6
chr19	35510102	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=155,207;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:2,11:6,5:7,1,9,7
chr19	35512400	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=177,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,1:3,6:6,0,6,1
chr19	35524309	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=188,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr19	35530641	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=150,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr19	35533550	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr19	35556123	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=198,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:2,4:2,6:2,2,7,3
chr19	35556281	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:4,6:1,5:1,4,4,7
chr19	35556300	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=213,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:2,5:1,4:0,3,3,6
chr19	35556357	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=191,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,3:1,1,4,3
chr19	35556640	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=206,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:1,3:1,2:2,1,2,3
chr19	35556659	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=69,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,1,4
chr19	35556715	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=195,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,3:2,4:4,3,5,2
chr19	35556729	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=201,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,7:4,3:5,3,7,3
chr19	35556744	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=198,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:6,2,3,4
chr19	35557260	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=219,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:4,1:1,1:0,6,0,2
chr19	35608148	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,5:1,4:1,1,9,0
chr19	35609972	.	GGAC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=162,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0|1:35609972_GGAC_G:35609972:3,0,4,0
chr19	35609981	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=214,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0|1:35609972_GGAC_G:35609972:3,0,5,0
chr19	35610245	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:2,3,4,3
chr19	35610266	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=166,93;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:13,3:5,0:10,8,3,0
chr19	35611913	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,13,3
chr19	35613623	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:3,0,3,1
chr19	35614253	.	G	GGT	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=GT;STR;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.233:23:12,1:6,4:10,8,1,4
chr19	35614272	.	ATG	A,GTG	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=28,25,32;MFRL=154,129,186;MMQ=60,60,60;MPOS=23,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.90,31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,3,10:0.134,0.406:28:6,3,6:8,0,4:8,7,5,8
chr19	35614274	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.513:32:6,13:9,4:8,7,8,9
chr19	35614288	.	A	AAT	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=29,23;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.101:27:15,2:9,0:0|1:35614288_A_AAT:35614288:15,10,0,2
chr19	35614289	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.105:26:15,2:9,0:0|1:35614288_A_AAT:35614288:14,10,0,2
chr19	35615995	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=175,213;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr19	35616016	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=171,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,5:2,3:2,0,8,0
chr19	35616086	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=214,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,4:2,4:3,3,6,2
chr19	35616087	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=183,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:6,2,3,3
chr19	35616464	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,0:4,6:0,6,0,6
chr19	35617122	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=137,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:2,2,6,0
chr19	35622492	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=183,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:1,4:2,3:0,3,2,5
chr19	35622646	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,14;MFRL=276,271;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.526:7:0,0:2,0:0|1:35622646_A_C:35622646:0,3,4,0
chr19	35622654	.	T	TGC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=276,271;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.526:7:0,0:3,1:0|1:35622646_A_C:35622646:0,3,4,0
chr19	35622658	.	CAA	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=36,14;MFRL=276,271;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.526:7:0,0:3,0:0|1:35622646_A_C:35622646:0,3,4,0
chr19	35622695	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,7,6
chr19	35632165	.	TCTGGCCCCGCCTCTCCCTGGCCCCGCCTCTCCCTAGCCCCCCTCTCC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=140,212;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.479:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr19	35633503	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=210,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,3:1,3:1,2,2,4
chr19	35642667	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=119,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,1:0,1,1,1
chr19	35642679	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.858:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr19	35648264	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=209,305;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,1,1
chr19	35651531	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:4,0,6,0
chr19	35655151	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:1,9:8,4:0,9,3,10
chr19	35660546	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,4:7,2:3,9,2,4
chr19	35757250	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=281,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:2,5:0,6:2,0,6,6
chr19	35757469	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=194,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.268:12:3,0:6,2:4,5,1,2
chr19	35758275	.	G	GGGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGA;STR;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr19	35770174	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,282;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr19	35800720	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	35802851	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=141,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:3,1:13,3:11,6,1,3
chr19	35804195	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,2:7,1:10,6,3,0
chr19	35837428	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:5,0,4,0
chr19	35837442	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,5:6,0:10,0,5,0
chr19	35863226	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=155,136;MMQ=27,34;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr19	35863383	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=144,196;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.232:14:6,2:5,0:5,6,2,1
chr19	35978567	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:7,2:12,2:11,8,3,1
chr19	35979464	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,4:5,6:7,2,5,5
chr19	35979862	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=185,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr19	35993661	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=183,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:5,1,5,1
chr19	35993750	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=132,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,3:9,0:5,13,0,3
chr19	35994376	.	GTT	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=185,184;MMQ=60,50;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.541:11:2,5:1,1:0|1:35994376_GTT_G:35994376:2,3,2,4
chr19	35994384	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=185,197;MMQ=40,41;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:6,5:1,2:0|1:35994376_GTT_G:35994376:2,5,2,6
chr19	35994390	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=185,200;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:6,5:1,2:0|1:35994376_GTT_G:35994376:2,5,1,6
chr19	35994466	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	35999251	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr19	36003430	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=172,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:9,6:6,3:7,9,6,3
chr19	36004106	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,6:3,6:5,3,6,6
chr19	36015491	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=327,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr19	36015865	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=274,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:0,4:1,10:0,1,5,9
chr19	36017801	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=148,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.191:19:9,0:5,3:0|1:36017801_T_C:36017801:6,10,0,3
chr19	36017806	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=148,108;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.191:19:7,0:3,3:0|1:36017801_T_C:36017801:6,10,0,3
chr19	36019101	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=149,71;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:9,4:12,0:11,10,2,2
chr19	36033457	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:8,0:10,9,1,1
chr19	36033825	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,2:4,5:4,2,7,0
chr19	36038390	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=210,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,8:4,4:1,5,2,10
chr19	36044524	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=385,227;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr19	36045772	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=232,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,5:2,3:2,0,8,0
chr19	36048741	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36048741_G_T:36048741:0,0,1,0
chr19	36048744	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36048741_G_T:36048741:0,0,1,0
chr19	36104890	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:5,4:4,7:4,5,3,8
chr19	36105908	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:4,0,2,1
chr19	36105986	.	C	CCTCAGCCTCCCTAGTAGCT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=180,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:4,2:2,0:1,5,1,1
chr19	36110889	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=17,21;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:1,0:6,3,2,0
chr19	36110898	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,15;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,0:4,0:6,3,3,0
chr19	36113459	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=134,226;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:5,2,3,0
chr19	36113658	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,2:4,6:3,2,2,6
chr19	36124176	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=74,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:3,0:3,4:1,6,0,5
chr19	36135279	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0,1,0,7
chr19	36135793	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,4:2,4:0,5,0,8
chr19	36164108	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=95,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:2,1,2,1
chr19	36168872	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,2:0,0:1,1,2,1
chr19	36207336	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,6:1,2:1,1,4,4
chr19	36213572	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=180,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:4,11,0,2
chr19	36214632	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr19	36221051	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=224,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,1:7,4:5,9,3,2
chr19	36224161	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=179,143;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr19	36224204	.	GCCCCGC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=190,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCCGC;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr19	36228667	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:1,2,1,2
chr19	36228800	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=198,57;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:8,0,2,0
chr19	36228954	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=204,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,2:3,4:4,3,3,3
chr19	36234668	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,3:5,0:9,2,3,0
chr19	36236183	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.451:13:3,2:4,2:0,7,6,0
chr19	36237319	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=150,139;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.100:48:33,4:11,0:35,9,4,0
chr19	36243190	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=169,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:5,3:2,1:3,4,1,4
chr19	36250651	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,91;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:10,0,2,0
chr19	36250682	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=124,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:10,3:8,0:8,10,2,1
chr19	36257741	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=168,52;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.265:17:8,1:4,3:6,7,1,3
chr19	36257932	.	CCT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=175,287;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CT;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	36258937	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr19	36268473	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:0,2:4,0:4,0,3,0
chr19	36269915	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=135,246;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:4,1:7,4:7,5,4,1
chr19	36270052	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=128,246;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,2:3,1:3,7,0,3
chr19	36273230	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,0:1,2:7,2,1,1
chr19	36276086	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,3:4,0:5,6,2,1
chr19	36276403	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=178,219;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:1,3,2,1
chr19	36304232	.	GGC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36304232_GGC_G:36304232:0,0,0,1
chr19	36304237	.	ACACC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36304232_GGC_G:36304232:0,0,0,1
chr19	36321910	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=215,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,0:0,4:1,1,2,2
chr19	36332668	.	CT	AA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=104,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:5,1:4,1:0|1:36332668_CT_AA:36332668:4,7,0,2
chr19	36332672	.	AC	GA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=104,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:5,1:0|1:36332668_CT_AA:36332668:4,7,0,2
chr19	36333483	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=181,34;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:2,8,2,0
chr19	36334594	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,1:0,7:0,0,1,7
chr19	36336209	.	CC	TT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:4,0:10,4:11,3,2,2
chr19	36350445	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=147,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr19	36354023	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	36362872	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=182,267;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:6,0:12,5:11,7,0,5
chr19	36362901	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=163,267;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:4,0:8,5:4,8,0,6
chr19	36367421	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,64;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,3:5,0:7,6,3,0
chr19	36369030	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,220;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,0:7,7:7,8,0,7
chr19	36369450	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=128,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.314:8:2,2:3,0:5,1,2,0
chr19	36388691	.	G	GCTAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=198,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	36398107	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=120,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:19,4:13,0:18,14,4,0
chr19	36398520	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,106;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:6,5:8,0:13,1,5,0
chr19	36431006	.	C	CTCTT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=239,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:36431006_C_CTCTT:36431006:1,7,1,1
chr19	36431007	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=239,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:36431006_C_CTCTT:36431006:1,7,1,1
chr19	36431011	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=239,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:36431006_C_CTCTT:36431006:1,7,1,1
chr19	36486445	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr19	36496328	.	G	GTTCCCTCTTTCTCA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=108,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:5,4:6,0:0|1:36496328_G_GTTCCCTCTTTCTCA:36496328:7,5,0,4
chr19	36496329	.	G	GTCCACTGCC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=108,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:5,4:6,0:0|1:36496328_G_GTTCCCTCTTTCTCA:36496328:8,5,0,4
chr19	36496335	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=108,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:8,4:7,0:0|1:36496328_G_GTTCCCTCTTTCTCA:36496328:8,7,0,4
chr19	36501445	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,11,1
chr19	36508392	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr19	36515258	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=152,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr19	36515560	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=217,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,4:3,4:0,5,2,6
chr19	36517461	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,3:3,1:4,1,3,1
chr19	36517655	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=202,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	36526281	.	TATA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=193,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr19	36558113	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,7,0
chr19	36558712	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=139,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,3:6,1:3,9,4,0
chr19	36558948	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,4:4,3:0,6,1,6
chr19	36572279	.	G	GTCATTTTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,19;MFRL=212,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,0:1,0:6,0,2,0
chr19	36572564	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=210,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr19	36581263	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr19	36582270	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=241,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,2:3,5:0,3,3,4
chr19	36585111	.	CAT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=206,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:4,1:1,4:1,4,1,4
chr19	36592752	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=234,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:1,3:0,2,0,8
chr19	36594659	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr19	36604723	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=160,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:13,2:0|1:36604723_G_C:36604723:10,11,0,2
chr19	36604732	.	A	ACTATAAAATGGACATTTAGCTATC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=135,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,0:16,2:0|1:36604723_G_C:36604723:10,12,0,2
chr19	36605647	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=90.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,12:0,13:0,0,15,11
chr19	36605794	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=53.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,1,14
chr19	36612396	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr19	36632060	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=142,209;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.235:28:4,4:14,2:14,8,5,1
chr19	36633277	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=232,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:0,4,0,4
chr19	36640769	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,8,8
chr19	36642310	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr19	36642552	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=184,272;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:1,0:3,0:0|1:36642552_A_C:36642552:0,4,3,0
chr19	36642560	.	CGA	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=185,272;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:1,0:3,3:0|1:36642552_A_C:36642552:0,5,3,0
chr19	36642561	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=233,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.487:6:1,0:1,2:0|1:36642561_G_GC:36642561:0,3,1,2
chr19	36642562	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=24,35;MFRL=233,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.487:6:2,0:1,2:0|1:36642561_G_GC:36642561:0,3,1,2
chr19	36642569	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=193,313;MMQ=60,50;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,1:0|1:36642552_A_C:36642552:0,6,2,0
chr19	36643432	.	CGGGGCT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=164,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGGGCT;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr19	36685316	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=138,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr19	36885067	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=253,271;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr19	36940965	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=183,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr19	36964376	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=188,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,5:2,0:1,3,1,4
chr19	36967352	.	T	TTTTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTC;STR;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	37063218	.	CA	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.278:25:9,5:8,2:9,9,1,6
chr19	37064240	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=249,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr19	37064267	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=182,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:0,2:1,5:1,0,7,2
chr19	37147330	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=214,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:4,2,5,1
chr19	37309432	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=203,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,4:3,0:4,6,4,0
chr19	37309589	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=187,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:6,0:9,9:4,11,9,0
chr19	37310841	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,1:6,1:4,8,1,1
chr19	37369138	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:20,0:7,6:6,21,0,6
chr19	37369525	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=170,346;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:6,1:0,2:0|1:37369525_CT_C:37369525:3,6,2,1
chr19	37369543	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=176,346;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.193:19:12,1:4,2:0|1:37369525_CT_C:37369525:4,12,1,2
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chr19	37369980	.	CATCT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=153,196;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37369966_T_C:37369966:1,0,1,0
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chr19	37582060	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=175,95;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:0,7,0,3
chr19	37643507	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=191,216;MMQ=60,22;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.241:31:13,7:11,0:14,10,7,0
chr19	37681098	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=226,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,1:4,1:3,4,0,2
chr19	37870233	.	AGACATCTT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=108,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:37870233_AGACATCTT_A:37870233:0,3,0,1
chr19	37870244	.	AAG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=108,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37870233_AGACATCTT_A:37870233:0,1,0,1
chr19	38028852	.	C	CTAGTGTATCCTGAGTTACAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=184,143;MMQ=60,38;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	38077474	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,5:2,3:2,0,7,1
chr19	38077661	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr19	38091983	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:16,4:10,0:14,12,4,0
chr19	38102336	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=201,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:6,1,2,0
chr19	38135444	.	C	CAAAAAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr19	38161161	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.238:15:5,2:7,1:4,8,3,0
chr19	38190845	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr19	38229378	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:1,13:0,6:1,0,8,11
chr19	38377409	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,294;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr19	38383370	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=169,93;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:4,5:10,0:5,9,5,0
chr19	38573508	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=174,230;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:5,5,1,1
chr19	38590811	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=243,278;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr19	38621473	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=148,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr19	38633159	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=58,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,2,0
chr19	38689086	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=171,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,2:7,1:6,8,0,3
chr19	38696847	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,2:6,2:7,7,3,1
chr19	38702878	.	T	TGGC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,16;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,0:0|1:38702878_T_TGGC:38702878:0,3,2,0
chr19	38702882	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=181,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0|1:38702878_T_TGGC:38702878:0,4,2,0
chr19	38702886	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:0,1:0|1:38702878_T_TGGC:38702878:0,5,2,0
chr19	38702890	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:38702878_T_TGGC:38702878:0,4,1,0
chr19	38708361	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:4,1,4,0
chr19	38708398	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=293,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:2,6:0,2:0,2,6,2
chr19	38709568	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=359,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,6,1
chr19	38709696	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,15;MFRL=68,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,0:3,0:2,1,0,1
chr19	38712919	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=239,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr19	38713139	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,0,2
chr19	38817899	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=170,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,1:2,1:4,3,1,1
chr19	38853536	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=193,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr19	38882863	.	CCCT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CCT;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.521:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr19	38899534	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,13;MFRL=169,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:38899534_T_G:38899534:0,1,0,1
chr19	38899537	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=169,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:38899534_T_G:38899534:0,1,0,1
chr19	38899550	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:38899534_T_G:38899534:0,0,0,1
chr19	38912597	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=207,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:2,2:9,0:9,2,2,0
chr19	38933120	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr19	38935350	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr19	38939481	.	GCTGAGGTGGGAGAA	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0|1:38939481_GCTGAGGTGGGAGAA_G:38939481:0,4,0,1
chr19	38939497	.	CGCTTG	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,34;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:38939481_GCTGAGGTGGGAGAA_G:38939481:0,3,0,1
chr19	38939504	.	GTCCAGGAGGTC	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:38939481_GCTGAGGTGGGAGAA_G:38939481:0,3,0,1
chr19	38939505	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	38939518	.	GGCTGCAGTGAGC	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=198,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:38939481_GCTGAGGTGGGAGAA_G:38939481:0,3,0,1
chr19	38943728	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=262,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr19	38945851	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr19	38946182	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=100,168;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:1,2,2,2
chr19	38946215	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,0,5
chr19	38948356	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr19	38948963	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:4,2:3,3:1,6,1,4
chr19	38949729	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=231,200;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:2,1,3,0
chr19	38949904	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:3,0:5,4:4,6,2,2
chr19	38950947	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=137,303;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:1,2:1,1:3,0,3,0
chr19	38953996	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr19	38968569	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	38979727	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=108,148;MMQ=60,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,5:3,0:4,0,5,0
chr19	38980828	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:8,1:7,1:8,8,1,1
chr19	38983044	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=114,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38983044_G_A:38983044:1,0,1,0
chr19	38983047	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=114,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:38983044_G_A:38983044:1,0,1,0
chr19	38993638	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr19	38994853	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=194,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,0:9,3:7,8,0,3
chr19	38996990	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:10,1:6,3:10,8,1,3
chr19	38997076	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=180,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:4,0:7,2:6,5,1,1
chr19	38997459	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=152,230;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:2,4:8,3:7,3,5,2
chr19	38997635	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=159,249;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:3,2:8,2:2,9,0,4
chr19	38997679	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=174,281;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr19	39001516	.	TA	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=243,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr19	39014642	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=154,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr19	39018457	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=125,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.345:15:4,0:3,0:5,5,0,5
chr19	39019153	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=196,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,2:9,0:7,7,1,1
chr19	39034534	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=128,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:3,3:6,2:3,6,1,4
chr19	39071079	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=164,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,2:6,1:4,7,2,1
chr19	39092227	.	G	GTCCA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=196,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:2,1:0|1:39092227_G_GTCCA:39092227:1,5,0,2
chr19	39092229	.	C	CCTCAA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=196,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0|1:39092227_G_GTCCA:39092227:1,5,0,2
chr19	39092231	.	G	GGGGGCACCCATGCCC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=196,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0|1:39092227_G_GTCCA:39092227:1,5,0,2
chr19	39098734	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=194,245;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:4,4,0,2
chr19	39191383	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=234,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	39191544	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=223,372;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,1,1
chr19	39218706	.	GCT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=146,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:1,2:6,1:1,6,2,1
chr19	39227107	.	TTTGACCAAGCCCCAGGGCAGG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=111,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTGACCAAGCCCCAGGGCAGG;STR;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.450:16:4,4:0,3:5,4,6,1
chr19	39228868	.	G	GCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=214,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,2:2,1:6,1,3,0
chr19	39262459	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,245;MMQ=60,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	39262681	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=100,179;MMQ=52,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr19	39281540	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,252;MMQ=60,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr19	39294263	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=188,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:6,8,0,2
chr19	39299300	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,31;MFRL=154,0;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.348:4:0,1:1,0:0|1:39299300_A_G:39299300:3,0,0,1
chr19	39299312	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=19,25;MFRL=154,0;MMQ=60,51;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.348:4:1,1:0,0:0|1:39299300_A_G:39299300:3,0,0,1
chr19	39299680	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=172,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr19	39303434	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=227,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,2:1,3:1,0,6,0
chr19	39303593	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr19	39306425	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:2,0,5,4
chr19	39307893	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=234,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,2:1,6:0,2,7,1
chr19	39307980	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,3:14,0:20,8,1,2
chr19	39321899	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=208,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,5:3,4:1,5,7,2
chr19	39328145	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=140,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:9,1:10,2:9,10,2,1
chr19	39329517	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=192,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:3,4:2,12:4,1,6,10
chr19	39330645	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=225,211;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr19	39330957	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:7,0:13,3:16,6,0,3
chr19	39331296	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr19	39334811	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr19	39334830	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	39338142	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr19	39360597	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:7,3,1,2
chr19	39360720	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr19	39361658	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,1,1
chr19	39371581	.	GCCACCGCTCCCTCCCC	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=169,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:3,1:0|1:39371581_GCCACCGCTCCCTCCCC_G:39371581:4,6,0,2
chr19	39371602	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.302:8:4,1:2,1:0|1:39371581_GCCACCGCTCCCTCCCC_G:39371581:1,5,0,2
chr19	39371809	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=136,331;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.185:23:12,0:7,3:10,9,0,4
chr19	39372244	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=100,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,0,4
chr19	39380030	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,5,6
chr19	39380409	.	CCAGATGCCCCAGGTAGCGTGAGGGTTGGAGCCAGGTGACCCCATCCCCACCCCTCA	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=123,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.327:33:1,0:7,9:12,10,0,11
chr19	39398416	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:0,4,1,6
chr19	39406167	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr19	39407014	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=178,70;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:1,3:1,3:0,3,1,5
chr19	39408360	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0,0,5,5
chr19	39408688	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr19	39409236	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=216,252;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,3:1,0,2,4
chr19	39410709	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:11,7,2,0
chr19	39412756	.	A	AT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=155,241;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.274:16:5,0:7,3:9,3,2,2
chr19	39417015	.	C	CACGCCCGGCTAATTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,0:0,1:0|1:39417015_C_CACGCCCGGCTAATTT:39417015:0,0,0,1
chr19	39417018	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39417015_C_CACGCCCGGCTAATTT:39417015:0,0,0,1
chr19	39421060	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=218,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:2,0:3,2:6,0,2,0
chr19	39421388	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=184,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:0,13:1,5:0,1,1,17
chr19	39437258	.	TCA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=189,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:0|1:39437258_TCA_T:39437258:0,2,0,4
chr19	39437270	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:39437258_TCA_T:39437258:0,0,0,7
chr19	39589334	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,231;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr19	39591484	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:6,2:2,0:2,6,1,1
chr19	39668325	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=148,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:4,2:1,0:4,2,0,2
chr19	39688815	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,7:3,2:5,2,3,6
chr19	39688901	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=204,146;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,2,1
chr19	39689802	.	T	TCCACC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=130,34;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:0|1:39689802_T_TCCACC:39689802:5,5,1,1
chr19	39689803	.	T	TGCC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=130,34;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:0|1:39689802_T_TCCACC:39689802:5,5,1,1
chr19	39691136	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=221,342;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0,4,1,1
chr19	39691216	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=251,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:3,0,3,1
chr19	39691239	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=195,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,1:5,4:8,0,4,1
chr19	39760336	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=162,220;MMQ=60,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,2,2
chr19	39787079	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=250,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:5,2,2,0
chr19	39805580	.	G	GGGGAATCTATCATCACACTGACTAGGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=221,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr19	39805887	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	39866245	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:11,1:3,2:12,3,2,1
chr19	39869047	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=198,293;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:6,1,2,0
chr19	39871286	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=191,238;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:3,2:5,1:7,2,1,2
chr19	39874100	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,3:11,0:8,10,2,1
chr19	39879144	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=134,247;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:5,2:17,2:8,14,4,0
chr19	39880961	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=150,298;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.256:37:11,0:17,9:16,12,0,9
chr19	39881015	.	T	TAGA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=153,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:2,3:3,3:0,5,1,5
chr19	39898843	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=130,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:16,3:16,0:12,20,0,4
chr19	39905903	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=211,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:4,4,2,2
chr19	39907036	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=102,190;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:3,1,1,1
chr19	39908214	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=165,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.335:16:3,3:7,2:4,7,5,0
chr19	39908367	.	G	GGCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=113,173;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:39908367_G_GGCA:39908367:1,2,0,1
chr19	39908371	.	G	GAACTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=113,173;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:39908367_G_GGCA:39908367:1,2,0,1
chr19	39912870	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,0:5,3:5,5,1,2
chr19	39914308	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr19	39914581	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,231;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:11,2:8,0:11,9,2,0
chr19	39914748	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=37,29;MFRL=122,175;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.943:33:1,16:0,16:1,0,15,17
chr19	39924129	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=105,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=83.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,25:0.899:27:0,14:2,10:1,1,15,10
chr19	39926601	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=150,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,2:0,0:0,1,0,4
chr19	39936502	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,6:0,0,16,5
chr19	39936693	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=185,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:0,1,1,8
chr19	39949764	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,5,2
chr19	39957030	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	39963415	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:3,3:4,3:7,0,5,2
chr19	39963828	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,2:0,8:0,0,6,4
chr19	39964247	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	39971622	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	39972581	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,2:7,6:7,5,3,5
chr19	39972766	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr19	39976464	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0,0,2,11
chr19	39976734	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr19	39976969	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=211,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.634:25:4,9:4,6:3,6,10,6
chr19	39977173	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=177,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:4,2:3,2:2,6,2,2
chr19	40009461	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=148,261;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.562:7:2,2:0,1:1,2,2,2
chr19	40030420	.	GGCC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCC;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	40093111	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,2:1,3:0,1,5,0
chr19	40096127	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	40172186	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=205,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,1:4,2:3,7,0,3
chr19	40174119	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,275;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:2,3:9,3:6,5,3,3
chr19	40225168	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=219,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:0,8,1,2
chr19	40225790	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=155,243;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr19	40275185	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=171,244;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr19	40318086	.	AG	GA,GG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,34,31;MFRL=190,223,197;MMQ=60,60,60;MPOS=14,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.23,13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,5:0.222,0.333:15:5,1,2:2,2,3:3,4,2,6
chr19	40318132	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=197,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,2:5,2:5,6,2,2
chr19	40318845	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,22;MFRL=208,219;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:0,0:1,0,3,0
chr19	40321322	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,3:7,3:3,7,4,2
chr19	40325078	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=181,210;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,6:3,0:5,0,6,0
chr19	40325098	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=158,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,6:3,0:7,0,6,0
chr19	40327312	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=168,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.121:23:10,0:10,2:13,8,2,0
chr19	40337080	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr19	40354067	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=222,92;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,1,1
chr19	40354131	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:8,6,0,2
chr19	40357341	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:6,1,2,0
chr19	40357360	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=195,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:7,2:1,1:6,2,3,0
chr19	40357824	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=223,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr19	40361112	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=111,282;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:2,2:1,2:1,3,0,4
chr19	40363926	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=162,227;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:10,1:2,1:5,8,2,0
chr19	40368268	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=5,178;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.670:4:1,1:0,1:0|1:40368268_G_C:40368268:0,1,3,0
chr19	40368275	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=5,182;MMQ=60,52;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:1,0:0,0:0|1:40368268_G_C:40368268:0,1,2,0
chr19	40368280	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=73,182;MMQ=54,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:2,0:0,0:0|1:40368268_G_C:40368268:1,1,2,0
chr19	40377028	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=136,148;MMQ=27,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:40377028_G_A:40377028:0,1,0,1
chr19	40377030	.	CGC	ATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=136,148;MMQ=27,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:40377028_G_A:40377028:0,1,0,1
chr19	40392680	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=190,154;MMQ=36,34;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr19	40395778	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=8,28;MFRL=224,186;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.527:6:0,2:1,0:3,0,3,0
chr19	40395990	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=173,103;MMQ=27,43;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:4,1:8,2:9,3,1,2
chr19	40399139	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=219,202;MMQ=25,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:2,2:9,1:11,0,3,0
chr19	40405847	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:4,0,5,1
chr19	40407877	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=211,114;MMQ=55,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,4:3,0:4,1,5,0
chr19	40408146	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=212,168;MMQ=49,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,4:4,2,3,5
chr19	40408821	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=169,216;MMQ=40,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,5:7,3:5,9,3,5
chr19	40408857	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=191,224;MMQ=60,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:1,8:11,3:6,6,1,10
chr19	40408910	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=206,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr19	40420083	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=180,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:6,2,2,0
chr19	40430428	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:5,3,0,2
chr19	40519547	.	C	CTT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=200,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,22;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:1,1:3,0,1,1
chr19	40519636	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=177,40;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:8,2:0|1:40519636_A_G:40519636:13,7,1,1
chr19	40519643	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=181,40;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:9,1:0|1:40519636_A_G:40519636:12,8,1,1
chr19	40519760	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,122;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:16,0:8,2:12,12,0,2
chr19	40590827	.	C	CAAAACAACAACAACAACAACAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=4021072,194;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:40590827_C_CAAAACAACAACAACAACAACAA:40590827:0,1,0,2
chr19	40590829	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=2010654,194;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.593:4:1,1:0,0:0|1:40590827_C_CAAAACAACAACAACAACAACAA:40590827:0,2,0,2
chr19	40595028	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=256,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,6:1,1:1,0,7,0
chr19	40720079	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	40729485	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=152,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.318:23:12,7:4,0:7,9,5,2
chr19	40739721	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:3,0,2,2
chr19	40742320	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	40744985	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=226,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	40747825	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:11,1:3,1:12,2,2,0
chr19	40747987	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=181,82;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:9,0:6,3:9,6,2,1
chr19	40761212	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=206,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr19	40788442	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=216,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:2,3:4,4:2,4,3,4
chr19	40788641	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr19	40839664	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr19	40875800	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0|1:40875800_C_G:40875800:0,0,5,2
chr19	40875810	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0|1:40875800_C_G:40875800:0,0,3,3
chr19	40886223	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=118,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.398:18:3,4:8,3:5,6,3,4
chr19	40889744	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=231,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:7,3:2,1:3,6,4,0
chr19	40900836	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=188,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.289:5:0,1:4,0:0|1:40900836_C_T:40900836:1,3,0,1
chr19	40900860	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=190,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:40900836_C_T:40900836:1,2,0,1
chr19	40900865	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr19	40900867	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=202,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:40900836_C_T:40900836:1,3,0,1
chr19	40902405	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=150,390;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:10,2:0|1:40902405_G_A:40902405:16,6,2,0
chr19	40902408	.	GT	CC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=150,390;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:10,2:0|1:40902405_G_A:40902405:16,6,2,0
chr19	40929363	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=168,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.586:17:5,4:1,6:1,6,5,5
chr19	40929520	.	G	GGGCGACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=226,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:40929520_G_GGGCGACA:40929520:1,2,0,1
chr19	40929523	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=226,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:40929520_G_GGGCGACA:40929520:1,2,0,1
chr19	40929553	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr19	40947305	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,0:3,4:7,0,4,0
chr19	40947373	.	GGATC	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=111,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GATC;STR;TLOD=55.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:4,5:15,10:12,10,7,8
chr19	40947751	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=162,202;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:5,4:9,1:13,1,2,3
chr19	40957446	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40957446_T_A:40957446:0,0,0,1
chr19	40957453	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40957446_T_A:40957446:0,0,0,1
chr19	40978640	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=113,144;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.575:19:3,7:4,3:2,6,5,6
chr19	40995950	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=194,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:2,1:2,2:4,0,3,1
chr19	40996048	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=160,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.165:22:7,0:12,3:0|1:40996048_C_A:40996048:11,8,2,1
chr19	40996061	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=168,103;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:5,0:13,1:0|1:40996048_C_A:40996048:9,11,2,1
chr19	41007797	.	GTC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=146,225;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:0,2:1,1,2,1
chr19	41010047	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=316,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:1,8:0,2:1,0,10,0
chr19	41010134	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.251:21:10,0:5,4:1,15,0,5
chr19	41025243	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=313,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr19	41034912	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,19;MFRL=254,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.438:9:0,2:4,0:3,2,4,0
chr19	41035116	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr19	41040334	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=226,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr19	41062902	.	AC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=96,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.398:11:2,1:2,2:1,6,0,4
chr19	41072347	.	CGAGACA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.690:1:0,1:0,0:0|1:41072347_CGAGACA_C:41072347:0,0,0,1
chr19	41072354	.	TGGTG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41072347_CGAGACA_C:41072347:0,0,0,1
chr19	41072361	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41072347_CGAGACA_C:41072347:0,0,0,1
chr19	41075662	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=194,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr19	41077891	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=231,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr19	41082993	.	GC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=198,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:2,1:1,7:2,2,2,6
chr19	41084471	.	A	AG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=159,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,0:12,3:6,14,0,3
chr19	41117203	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:3,10,0,2
chr19	41117754	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=193,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,5:8,3:9,3,7,1
chr19	41122891	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,1:7,1:6,6,1,1
chr19	41123093	.	A	AG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=51.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,9:0,6:0,0,6,10
chr19	41128415	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=191,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:4,2:12,1:9,7,0,3
chr19	41173880	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=134,180;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:3,3:7,1:0|1:41173880_C_T:41173880:6,4,3,1
chr19	41173892	.	CTGCTGT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=135,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGCTGT;STR;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:4,2:7,1:0|1:41173880_C_T:41173880:7,6,3,1
chr19	41186811	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:11,2,1,1
chr19	41188890	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,15;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,0:0,0:1,1,0,2
chr19	41206208	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=177,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:3,1:0,1:3,1,2,0
chr19	41211287	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=186,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,1:15,1:14,9,0,2
chr19	41220029	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,2:8,0:7,8,0,2
chr19	41220364	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=188,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:7,1:7,7,0,2
chr19	41251180	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=18,34;MFRL=216,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.572:7:0,0:0,4:0,3,0,4
chr19	41263403	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:11,3:11,1:10,15,3,1
chr19	41269076	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=225,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr19	41283365	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=239,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:1,11:0,8:0,1,4,16
chr19	41312612	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=160,271;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.215:26:7,4:13,1:15,6,5,0
chr19	41313202	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,0:5,4:4,5,1,3
chr19	41313367	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:11,7,2,0
chr19	41313467	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:16,0:8,3:11,13,0,3
chr19	41354712	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=214,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr19	41381840	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=167,112;MMQ=27,34;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,2:0,1,5,1
chr19	41381868	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=167,178;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.862:12:0,6:1,5:0,1,2,9
chr19	41382607	.	AG	CA	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,3:0,3:0|1:41382607_AG_CA:41382607:0,0,1,6
chr19	41382612	.	CG	TA	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:41382607_AG_CA:41382607:0,0,0,6
chr19	41382645	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,241;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:41382645_G_A:41382645:0,0,0,3
chr19	41382653	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,241;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:41382645_G_A:41382645:0,0,0,3
chr19	41382655	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,247;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:41382645_G_A:41382645:0,0,0,2
chr19	41382665	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,247;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:41382645_G_A:41382645:0,0,0,4
chr19	41383217	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,202;MMQ=50,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:9,3:7,2:7,9,2,3
chr19	41383344	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr19	41383378	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr19	41383989	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	41384637	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=197,141;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:1,5:2,5:2,1,5,5
chr19	41386209	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=266,176;MMQ=51,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,1,1
chr19	41386282	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=196,181;MMQ=52,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:2,1,4,0
chr19	41386366	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=145,237;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,4:6,3:3,5,5,2
chr19	41386584	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=314,120695;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.600:6:2,0:0,1:0,2,0,4
chr19	41386622	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=302,32020;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.742:6:0,3:1,0:0,1,0,5
chr19	41387647	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=195,216;MMQ=60,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,2:1,1:0|1:41387647_A_G:41387647:1,4,2,1
chr19	41387656	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=187,216;MMQ=60,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:0|1:41387647_A_G:41387647:2,4,2,1
chr19	41387669	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,6,9
chr19	41512792	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=216,262;MMQ=55,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:1,1,3,1
chr19	41515263	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,37;MFRL=139,153;MMQ=49,34;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:5,5,2,0
chr19	41595889	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr19	41622107	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=172,204;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,1:7,2:7,5,2,1
chr19	41622481	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=189,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,1:7,2:4,4,2,1
chr19	41633747	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,152;MMQ=46,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,1:1,2:5,1,3,0
chr19	41703660	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=171,238;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:1,1:5,1:7,0,2,0
chr19	41704832	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,2,15
chr19	41712413	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=116,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,2:6,6:4,7,3,5
chr19	41727197	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=156,303;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,2:7,1:0,10,0,3
chr19	41727231	.	GGGTCAA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=157,244;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGTCAA;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr19	41743861	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chr19	41748753	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=101,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:7,2,1,1
chr19	41748980	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=184,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr19	41748998	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=184,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:0|1:41748998_G_A:41748998:0,3,0,1
chr19	41749000	.	G	GATGTTGGGGTAGACAGA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=184,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:0|1:41748998_G_A:41748998:0,3,0,1
chr19	41749012	.	A	AGAAGGGAATGGCTGGATCTGAGAGATGT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=184,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.318:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr19	41754468	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=194,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:8,4:4,0:4,8,4,0
chr19	41765593	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,67;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,0:14,2:0|1:41765593_C_T:41765593:16,10,1,1
chr19	41765618	.	GA	TC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=142,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:0|1:41765593_C_T:41765593:11,9,1,1
chr19	41798145	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=147,227;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.169:31:17,4:9,0:12,14,5,0
chr19	41798181	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:12,0:7,5:7,12,0,5
chr19	41811730	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,4,15
chr19	41825776	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,306;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	41838206	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:7,1:5,2:0,12,1,3
chr19	41863777	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=17,31;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.560:11:1,2:1,3:3,2,6,0
chr19	41863820	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=180,204;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,2:11,0:9,6,1,1
chr19	41863994	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=177,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr19	41869487	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=181,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:3,1:0,6,0,3
chr19	41895839	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:3,0:2,2:3,4,0,3
chr19	41897674	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=126,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:0,2:6,1:6,0,3,0
chr19	41897688	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=113,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:0,2:7,1:6,2,3,0
chr19	41903671	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=167,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:13,4:5,1:0|1:41903671_A_G:41903671:16,2,5,0
chr19	41903675	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.539:24:7,10:4,3:0|1:41903671_A_G:41903671:9,2,11,2
chr19	41919944	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=146,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:2,5:7,2:7,4,5,2
chr19	41928336	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=140,299;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:7,0:1,2:0,9,0,2
chr19	41928765	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=206,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,1,1
chr19	41930528	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.303:8:3,0:2,0:0|1:41930528_A_C:41930528:1,5,2,0
chr19	41930534	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0|1:41930528_A_C:41930528:0,5,2,0
chr19	41930538	.	AT	CC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,0:0|1:41930528_A_C:41930528:0,6,2,0
chr19	41945837	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,23:0.888:25:2,11:0,11:0|1:41945837_T_A:41945837:1,1,8,15
chr19	41945848	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=172,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=82.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,20:0.874:22:2,10:0,9:0|1:41945837_T_A:41945837:1,1,7,13
chr19	41945904	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=222,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,3:0,5:0,2,1,7
chr19	41949870	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr19	42085873	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:0,1:1,14:0,1,9,8
chr19	42125660	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,334;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	42126448	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=181,245;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr19	42128202	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=164,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr19	42188032	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=108,243;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,2:0,1:0,1,2,1
chr19	42191934	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=207,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:6,0,2,0
chr19	42212753	.	A	AGCACAGAGACTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=204,223;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,1,2
chr19	42218984	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,1:9,2:14,4,2,1
chr19	42231341	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=193,307;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr19	42342923	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=215,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr19	42343155	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=150,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:4,2:1,2:3,2,2,2
chr19	42373341	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=254,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:2,0,3,2
chr19	42373893	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,3:1,1:1,5,2,2
chr19	42398206	.	A	AGTGTGT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=122,131;MMQ=60,36;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=GT;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.486:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr19	42408077	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=265,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:1,1,1,0
chr19	42408086	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=20,12;MFRL=265,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:42408086_AG_CC:42408086:1,1,1,0
chr19	42408090	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,15;MFRL=265,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:42408086_AG_CC:42408086:1,1,1,0
chr19	42408095	.	TC	GG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,16;MFRL=265,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:42408086_AG_CC:42408086:1,1,1,0
chr19	42408098	.	TC	AA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,15;MFRL=265,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:42408086_AG_CC:42408086:1,1,1,0
chr19	42470948	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,0:3,2:10,0,0,2
chr19	42471352	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=115,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,0,2
chr19	42557962	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=119,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:4,2:11,0:5,10,0,2
chr19	42563692	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=103,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,0:0,1:0|1:42563692_T_G:42563692:2,2,0,2
chr19	42563696	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,17;MFRL=92,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,0:0,0:0|1:42563692_T_G:42563692:2,1,0,2
chr19	42569463	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=195,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,1:11,1:7,11,2,0
chr19	42603776	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=131,290;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:9,2:13,1:8,15,2,1
chr19	42713835	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=174,302;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:11,4,1,1
chr19	42736267	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,14:0,4:0,0,9,9
chr19	42737174	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=183,268;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:5,1:2,1:7,0,3,0
chr19	42753283	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=194,121;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:7,2:3,4:8,2,1,5
chr19	42754403	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=202,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:6,0,1,1
chr19	42759122	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.525:15:2,3:5,5:5,2,3,5
chr19	42793590	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=191,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,1:3,1:3,7,0,2
chr19	42793611	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=141,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:42793611_AG_CC:42793611:1,3,0,1
chr19	42793615	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=61,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:42793611_AG_CC:42793611:0,2,0,1
chr19	42793619	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=121,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:42793611_AG_CC:42793611:1,2,0,1
chr19	42795554	.	TG	CA,CG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34,28;MFRL=176,206,138;MMQ=60,60,60;MPOS=27,26;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.43,12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,6:0.202,0.464:12:3,0,1:1,2,5:1,3,3,5
chr19	42797528	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,321;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	42819593	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=114,77;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:42819593_G_C:42819593:4,9,1,1
chr19	42819598	.	G	GCGGGCAGA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=107,77;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.168:16:7,0:5,2:0|1:42819593_G_C:42819593:4,10,1,1
chr19	42819599	.	T	TCACCTGAGG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=99,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:7,0:4,1:0|1:42819593_G_C:42819593:4,9,1,1
chr19	42820885	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:3,5,2,0
chr19	42848764	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr19	42848815	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=258,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:1,1,5,0
chr19	42855763	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=208,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.511:25:8,11:4,0:9,3,13,0
chr19	42860346	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,0:8,2:6,11,1,1
chr19	42872559	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=154,256;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:6,0,3,0
chr19	42880120	.	CGTGACG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=232,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTGACG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:2,2,1,0
chr19	42893236	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:2,1,0,2
chr19	42906271	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0|1:42906271_G_C:42906271:0,1,1,3
chr19	42906273	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=17,31;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:0,2:0|1:42906271_G_C:42906271:0,1,1,3
chr19	42914804	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=210,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:6,1,2,0
chr19	42946867	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=183,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,1:5,1,3,0
chr19	43013363	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=172,142;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,20:0.428:47:22,11:5,9:2,25,9,11
chr19	43013394	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.741:21:4,7:1,9:2,3,4,12
chr19	43025600	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=97,68;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:7,4:21,0:20,8,4,0
chr19	43032561	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=178,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:6,2:1,2:2,5,3,2
chr19	43032624	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr19	43243217	.	AA	GG	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=205,139;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,19:0.909:20:1,8:0,11:0|1:43243217_AA_GG:43243217:0,1,11,8
chr19	43243238	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=23,33;MFRL=205,146;MMQ=60,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.895:17:1,6:0,10:0|1:43243217_AA_GG:43243217:0,1,9,7
chr19	43243248	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,8:0|1:43243217_AA_GG:43243217:0,0,6,9
chr19	43243251	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=131,136;MMQ=40,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:0|1:43243217_AA_GG:43243217:4,2,2,6
chr19	43243266	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=162,136;MMQ=42,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:2,5:4,2:0|1:43243217_AA_GG:43243217:4,2,2,6
chr19	43257377	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr19	43257439	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,2:1,4:3,2,3,3
chr19	43259087	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=0,223;MMQ=29,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,2:0,1:2,1,3,0
chr19	43259413	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=150,38;MMQ=27,23;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:0|1:43259413_G_GT:43259413:4,7,1,1
chr19	43259415	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=150,38;MMQ=27,23;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:3,0:0|1:43259413_G_GT:43259413:4,8,1,1
chr19	43259418	.	GC	CT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=150,38;MMQ=27,23;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:3,0:0|1:43259413_G_GT:43259413:4,7,1,1
chr19	43268140	.	AG	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=201,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:8,8:8,3:7,9,5,6
chr19	43268469	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=154,187;MMQ=55,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:0|1:43268469_G_C:43268469:3,4,3,4
chr19	43268489	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=160,187;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:4,1:3,4:0|1:43268469_G_C:43268469:2,6,3,2
chr19	43371958	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=233,103;MMQ=53,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:3,1:6,4:3,6,2,4
chr19	43407877	.	CAA	C,AAA,CA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,21,15,23;MFRL=147,150,71,115;MMQ=52,58,33,54;MPOS=23,20,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=6.51,3.55,16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,4,3,9:0.177,0.124,0.393:22:3,0,0,4:2,2,1,2:4,2,0,16
chr19	43407960	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=181,211;MMQ=40,23;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr19	43411813	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,192;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:6,5,1,1
chr19	43420264	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:4,3:7,1:5,7,2,2
chr19	43430945	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,76;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr19	43433570	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=201,199;MMQ=48,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,2:7,5:5,4,4,3
chr19	43439490	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=188,164;MMQ=60,44;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr19	43439970	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=127,176;MMQ=60,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:4,2:5,2:5,5,1,3
chr19	43441337	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:2,3:0,4,0,3
chr19	43522911	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=127,199;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,6:4,8:4,3,9,5
chr19	43528770	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=166,309;MMQ=52,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,1:4,2:9,2,3,0
chr19	43528772	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=178,75;MMQ=49,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:4,2:12,1,1,1
chr19	43529026	.	CA	TG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,183;MMQ=60,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:2,10:4,7:4,3,12,5
chr19	43530379	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=166,141;MMQ=56,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.610:11:3,2:1,4:0|1:43530379_A_G:43530379:3,1,6,1
chr19	43530390	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=100,147;MMQ=32,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0|1:43530379_A_G:43530379:2,1,4,1
chr19	43530640	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr19	43570853	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=148,161;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr19	43579642	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:5,5:2,10:6,1,5,10
chr19	43579815	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,169;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr19	43585404	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=153,76;MMQ=51,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.211:31:12,3:11,3:0|1:43585404_A_T:43585404:11,14,4,2
chr19	43585428	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=153,0;MMQ=57,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:10,2:13,1:0|1:43585404_A_T:43585404:9,14,2,1
chr19	43586617	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=210,213;MMQ=49,26;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr19	43586835	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr19	43674405	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=229,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,1:4,5:0,5,0,6
chr19	43679644	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=144,238;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.313:10:4,1:3,1:0,7,0,3
chr19	43680051	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=105,143;MMQ=56,51;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:2,4:3,11:2,3,6,9
chr19	43687449	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=185,187;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr19	43688854	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=190,160;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:1,0,6,2
chr19	43702098	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=480,182;MMQ=24,24;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr19	43708186	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=139,179092;MMQ=60,21;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.192:34:12,0:16,6:17,11,6,0
chr19	43708839	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	43708968	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.888:25:2,8:0,6:2,0,13,10
chr19	43708978	.	TC	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=73.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.833:21:2,10:0,4:3,0,9,9
chr19	43709072	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=181,174;MMQ=52,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0,1,0,7
chr19	43762302	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=150,199;MMQ=52,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:7,8,2,0
chr19	43763344	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=202,242;MMQ=33,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,1,4
chr19	43765938	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=147,163;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:2,4,0,3
chr19	43766383	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=284,200;MMQ=48,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr19	43772389	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:1,6:6,4:3,4,2,8
chr19	43773599	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=116,240;MMQ=60,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:4,1:7,4:8,4,2,3
chr19	43773626	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=110,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,4:6,1:6,4,3,2
chr19	43857802	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,5:5,0:9,1,5,0
chr19	43857873	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=173,222;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:5,4:11,6:9,7,7,3
chr19	43857895	.	TG	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=173,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:9,0:8,2:13,5,2,0
chr19	43858317	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=194,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,5:4,5:6,0,8,2
chr19	43858578	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,2:4,4:0,5,0,6
chr19	43860053	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,189;MMQ=59,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,6:1,2:2,0,6,2
chr19	43865499	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr19	43910764	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr19	43920443	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=211,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:2,3,2,2
chr19	43922300	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=128,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,2:6,6:8,2,6,2
chr19	43983740	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=125,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr19	43999634	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=226,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:4,6:0,4:1,3,8,2
chr19	44001891	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,13,5
chr19	44008355	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=349,243;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	44012261	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=222,2440571;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr19	44012880	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=294,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:1,8:1,8:2,0,10,6
chr19	44031370	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr19	44047493	.	CGTGTGT	C,CGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,18,33;MFRL=0,132,137;MMQ=60,60,60;MPOS=21,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,16,17;RU=GT;STR;TLOD=3.01,7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.217,0.629:3:0,0,1:0,0,1:0,0,3,0
chr19	44048355	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:5,5,0,2
chr19	44050195	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:5,1:6,1:2,9,1,1
chr19	44055898	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=134,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.550:9:1,1:2,3:0,4,1,4
chr19	44079687	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,6:0,9:0,0,2,13
chr19	44101361	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=132,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.251:30:10,3:12,4:12,11,3,4
chr19	44111679	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44111679_T_A:44111679:0,0,1,0
chr19	44111691	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44111679_T_A:44111679:0,0,1,0
chr19	44111693	.	TG	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44111679_T_A:44111679:0,0,1,0
chr19	44117119	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=136,819;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,9:0.245:39:13,0:15,9:17,13,9,0
chr19	44117122	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=154,275;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:11,0:22,3:21,13,3,0
chr19	44128437	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=158,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:2,12,2,0
chr19	44131297	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=127.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.951:39:1,23:0,14:1,0,30,8
chr19	44153100	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=166,196;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,1:8,1:9,4,1,1
chr19	44156378	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=153,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:5,0:9,3:10,4,2,1
chr19	44159489	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=146,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,3:4,0,5,1
chr19	44224116	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=139,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,3:12,0:15,13,1,2
chr19	44237414	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=158,13425589;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:4,1:12,1:13,3,1,1
chr19	44248904	.	CCTAT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:6,2:6,9:9,5,8,3
chr19	44251903	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=198,354;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.449:7:2,1:0,1:3,1,0,3
chr19	44254972	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr19	44273516	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=193,292;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr19	44274041	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=189,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,1:6,2:0,7,0,3
chr19	44276370	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	44278415	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=161,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,5:0.113:51:25,1:20,4:25,21,5,0
chr19	44280837	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=221,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.773:11:1,5:1,4:1,1,0,9
chr19	44306389	.	GCCCCCA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=194,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:0,3:2,0,7,0
chr19	44306576	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=120,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,3:6,2:4,8,1,4
chr19	44351166	.	GGGAGAT	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=175,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.297:35:8,6:14,4:10,15,4,6
chr19	44352051	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=174,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,2:10,0:15,10,0,2
chr19	44352521	.	GAGA	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=154,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,17:0.581:29:3,14:7,3:0|1:44352521_GAGA_G:44352521:7,5,8,9
chr19	44352527	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=66.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,17:0.562:30:4,13:8,3:0|1:44352521_GAGA_G:44352521:7,6,8,9
chr19	44352529	.	CCATACTAATG	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=151,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=66.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,17:0.529:32:5,14:8,3:0|1:44352521_GAGA_G:44352521:9,6,8,9
chr19	44352665	.	TG	CA,CG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,33,32;MFRL=132,190,136;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.34,21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,8,8:0.365,0.366:22:3,5,3:3,3,5:3,3,7,9
chr19	44352688	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=134,225;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.316:20:7,3:7,3:9,5,3,3
chr19	44352690	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=130,285;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,2:10,1:11,7,2,1
chr19	44376681	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,2:3,2:6,3,4,0
chr19	44378063	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:12,3:17,2:16,15,4,1
chr19	44378224	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=187,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:6,2:3,6,2,1
chr19	44384292	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,3:3,0:3,6,1,2
chr19	44418680	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:6,1:7,7:0|1:44418680_G_C:44418680:8,6,4,4
chr19	44418693	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=170,180;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:6,3:8,7:0|1:44418680_G_C:44418680:9,5,4,6
chr19	44419030	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,13:0,0,18,8
chr19	44422982	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,3:2,2:7,1,3,2
chr19	44426265	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,2:5,3:7,2,5,0
chr19	44469034	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=182,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:10,0:4,5:13,1,4,1
chr19	44469577	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr19	44470331	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=132,280;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:12,2:18,1:12,18,2,1
chr19	44492568	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr19	44495598	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=128,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,2:2,5:3,0,7,0
chr19	44496145	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=243,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:0,1,1,9
chr19	44501116	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=241,164;MMQ=60,54;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,26:0.819:31:4,10:1,16:1,4,13,13
chr19	44501518	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:4,5:7,2:4,7,3,4
chr19	44511146	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:12,8:9,0:14,7,8,0
chr19	44580440	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=184,247;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.408:8:2,3:3,0:5,0,3,0
chr19	44585159	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=103.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,16:0,17:0,0,22,11
chr19	44586076	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr19	44589999	.	TCTC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=144,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:3,3:9,3:6,6,2,4
chr19	44604914	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=15,35;MFRL=145,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.882:14:0,6:0,6:1,0,8,5
chr19	44605123	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=219,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:3,6:1,8:3,1,3,11
chr19	44622337	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,82;MMQ=60,35;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:9,6:12,0:7,14,6,0
chr19	44634903	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	44635822	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=122,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:9,1:7,2:19,5,2,1
chr19	44652954	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.667:28:7,8:2,11:4,5,13,6
chr19	44662274	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,2:1,1,0,5
chr19	44676148	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr19	44681627	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=114,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:20,2:11,1:14,17,3,0
chr19	44739399	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,9:0,0,15,8
chr19	44770445	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.190:40:19,0:14,7:13,20,0,7
chr19	44770465	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=170,245;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:9,2:8,4:11,6,2,4
chr19	44802889	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=165,132;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:7,3:3,0:8,2,3,0
chr19	44832684	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,23:0.860:26:1,11:1,11:1,2,12,11
chr19	44832693	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=139,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:15,1:13,1:13,16,1,1
chr19	44833851	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,6,10
chr19	44847480	.	GA	G,AA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31,22;MFRL=0,231,303;MMQ=60,60,60;MPOS=10,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=33.78,3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,10,2:0.736,0.197:12:0,4,0:0,6,1:0,0,2,10
chr19	44890697	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=363,160;MMQ=60,48;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,15:0.891:16:1,10:0,4:0|1:44890697_A_G:44890697:1,0,8,7
chr19	44890706	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=179,90;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.209:17:12,0:2,3:0|1:44890697_A_G:44890697:7,7,2,1
chr19	44890801	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=266,148;MMQ=60,51;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,17:0.862:19:1,7:1,9:0|1:44890801_T_C:44890801:1,1,9,8
chr19	44890817	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=117,183;MMQ=60,47;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:18,2:7,1:0|1:44890801_T_C:44890801:17,12,2,1
chr19	44890841	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=144,210;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:13,2:10,2:0|1:44890801_T_C:44890801:10,13,3,1
chr19	44891405	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,2:10,1:11,8,1,2
chr19	44891554	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=173,198;MMQ=52,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,1:10,2:4,11,0,3
chr19	44891784	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,57;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,9,8
chr19	44892333	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr19	44896487	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=37,33;MFRL=130,144;MMQ=52,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:1,14:0,8:1,0,15,7
chr19	44933504	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=184,171;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,1:9,2:8,8,2,1
chr19	44946967	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,17;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:2,0:10,0:0|1:44946967_C_G:44946967:0,13,2,0
chr19	44946973	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.154:17:4,1:10,0:0|1:44946967_C_G:44946967:2,13,2,0
chr19	44946977	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.152:17:4,1:10,0:0|1:44946967_C_G:44946967:2,13,2,0
chr19	44980698	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,10:0.218:48:12,10:26,0:18,20,10,0
chr19	44988716	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr19	45015596	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=203,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr19	45015763	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:9,13,2,0
chr19	45016990	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=76.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,10:0,0,10,12
chr19	45017064	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=229,265;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:0,2,2,0
chr19	45024875	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,2:0,0,1,3
chr19	45024879	.	C	CGTGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=GT;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr19	45033379	.	GCACA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=CA;STR;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.760:6:0,0:1,5:1,0,4,1
chr19	45116919	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=155,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:8,2,2,1
chr19	45126994	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=369,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:1,9:0,6:0,1,12,3
chr19	45147518	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45147518_C_CA:45147518:0,0,1,0
chr19	45147542	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45147518_C_CA:45147518:0,0,1,0
chr19	45150407	.	T	TGCA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:45150407_T_TGCA:45150407:0,0,7,0
chr19	45150410	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0|1:45150407_T_TGCA:45150407:0,0,7,0
chr19	45157113	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr19	45176295	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=206,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:45176295_T_G:45176295:0,3,0,1
chr19	45176296	.	GCACCA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=214,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:45176295_T_G:45176295:0,4,0,1
chr19	45182028	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=149,182;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.691:11:2,7:1,0:3,0,8,0
chr19	45202701	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=106,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.290:15:6,0:4,4:6,5,3,1
chr19	45206532	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=223,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,1:0,3:5,0,3,1
chr19	45207036	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=171,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.453:13:1,3:5,3:0,7,1,5
chr19	45213701	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.524:11:4,2:1,2:4,1,4,2
chr19	45252198	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	45252218	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	45323073	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=224,348;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:0,10,0,2
chr19	45377098	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=255,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:3,2:6,0,3,0
chr19	45381917	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:0,10,0,2
chr19	45395619	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,4:5,2:4,3,6,1
chr19	45396219	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,2:7,2:2,7,2,2
chr19	45409221	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=117,62;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:1,2,0,2
chr19	45410002	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=227,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0,4,0,4
chr19	45411941	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	45419394	.	C	CAAAAAAAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=0,0;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,27;RU=A;STR;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:3,0:0,1:0|1:45419394_C_CAAAAAAAA:45419394:2,3,1,2
chr19	45419414	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=158,0;MMQ=60,55;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,1:5,1:0|1:45419394_C_CAAAAAAAA:45419394:4,7,1,2
chr19	45445447	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=214,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:45445447_G_GC:45445447:2,0,1,0
chr19	45445455	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=214,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:45445447_G_GC:45445447:2,0,1,0
chr19	45451620	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=162,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr19	45451656	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=136,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.406:10:2,1:4,3:5,1,3,1
chr19	45465362	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=139,94;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:7,0:9,4:6,11,0,4
chr19	45465363	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=96,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:3,3:9,4:1,11,3,4
chr19	45477910	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr19	45477951	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	45488434	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr19	45490482	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:9,0:8,6:7,10,0,6
chr19	45493635	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=134,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.674:7:1,2:1,3:1,1,5,0
chr19	45494247	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr19	45515130	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.518:15:3,3:4,5:5,2,7,1
chr19	45528799	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=161,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr19	45543619	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=149,112;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,0:6,5:4,11,0,5
chr19	45571560	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.792:3:0,0:0,0:0|1:45571560_A_C:45571560:0,0,3,0
chr19	45571563	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.792:3:0,0:0,0:0|1:45571560_A_C:45571560:0,0,3,0
chr19	45571567	.	TC	GG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,353;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:45571560_A_C:45571560:0,0,1,0
chr19	45571569	.	T	TGGGC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,353;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:45571560_A_C:45571560:0,0,1,0
chr19	45573405	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=194,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,1:3,6:0,4,0,7
chr19	45574137	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=15,27;MFRL=290,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:45574137_T_G:45574137:0,1,0,1
chr19	45574141	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=290,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:45574137_T_G:45574137:0,1,0,1
chr19	45656687	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=122,301;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr19	45662459	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=210,266;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr19	45667086	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=181,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,3,0
chr19	45681560	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr19	45716678	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	45769575	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=94,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:3,2:2,1:1,4,2,3
chr19	45774680	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=222,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,2,0
chr19	45774903	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:8,0:7,5:7,8,0,5
chr19	45781287	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=206,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,0:8,3:1,11,0,3
chr19	45781723	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr19	45783751	.	C	CACCTTGCTTCCTCTGAGATGACTGA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=194,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:8,2:10,0:6,14,0,2
chr19	45797593	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,3:7,2:8,3,2,3
chr19	45801157	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=173,228;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr19	45801337	.	T	TTCC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TCC;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.364:6:2,1:1,1:3,1,2,0
chr19	45853517	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	45855057	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:5,1:0,2:0,5,0,3
chr19	45856468	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=127,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,4:0,3:2,1,4,3
chr19	45868006	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:5,0,4,1
chr19	45872036	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,313;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:3,1:8,1:5,6,1,1
chr19	45883554	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:2,6,1,3
chr19	45898667	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr19	45898865	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=109,324;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr19	45899373	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=132,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:1,0:0|1:45899373_A_C:45899373:2,1,2,0
chr19	45899378	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=132,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,0:0|1:45899373_A_C:45899373:2,1,2,0
chr19	45899736	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=213,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:1,2,2,3
chr19	45911309	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=124,308;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:45911309_C_CA:45911309:2,0,1,0
chr19	45911330	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=168,278;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:0|1:45911309_C_CA:45911309:6,3,2,0
chr19	45912257	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=153,231;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:4,8,0,2
chr19	45913093	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,36;MFRL=117,282;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.595:5:0,1:1,2:1,1,0,3
chr19	45916897	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=115,164;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:7,0:6,12:3,10,0,12
chr19	45924362	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=94,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr19	45972039	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=195,298;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,3:3,1:0,8,0,4
chr19	45992734	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=113,224;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:7,8,2,0
chr19	46005300	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:17,5:11,0:14,14,5,0
chr19	46021305	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=146,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:5,6,1,2
chr19	46025388	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=217,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:4,1:0,2:3,1,4,0
chr19	46025692	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr19	46027752	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,9:2,0:4,0,8,1
chr19	46094169	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=219,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:6,5,1,1
chr19	46119024	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=140,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:12,4,1,2
chr19	46119867	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:0,8,0,3
chr19	46121020	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:1,6,0,2
chr19	46129875	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=257,232;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,1:0|1:46129875_C_G:46129875:3,0,1,0
chr19	46129879	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=257,232;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:46129875_C_G:46129875:3,0,1,0
chr19	46141677	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=175,320;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:5,0,2,0
chr19	46142053	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=104,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:12,1:6,4:10,8,2,3
chr19	46180150	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr19	46184845	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=152,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:11,3:3,0:7,7,0,3
chr19	46191021	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=159,263;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr19	46191549	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=192,79;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr19	46191828	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=145,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.620:16:3,4:2,6:1,5,4,6
chr19	46196634	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=247,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr19	46202172	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=170,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr19	46205050	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=167,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,4:2,5:2,1,6,3
chr19	46269313	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:8,5:3,4:4,7,5,4
chr19	46274972	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=229,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,5:7,5:7,3,6,4
chr19	46276056	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=212,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr19	46281745	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=178,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:5,0:1,3:4,2,3,0
chr19	46282503	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:6,4:6,4:7,6,4,4
chr19	46289503	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=153,259;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:3,4,1,3
chr19	46289541	.	GCTC	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=174,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTC;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,0:5,2:4,8,0,2
chr19	46294136	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=164,219;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:11,3:3,0:9,6,1,2
chr19	46299463	.	G	GGCTGGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=348,174;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	46305530	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=207,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.617:8:0,3:2,2:0,3,2,3
chr19	46307602	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=177,52;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:4,2:4,0:0|1:46307602_C_T:46307602:7,3,1,1
chr19	46307620	.	C	CCCT	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=198,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:46307602_C_T:46307602:8,3,1,1
chr19	46307621	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=198,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:4,0:0|1:46307602_C_T:46307602:8,3,1,1
chr19	46307624	.	A	AGG	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,18;MFRL=198,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,1:5,0:0|1:46307602_C_T:46307602:8,3,1,1
chr19	46307626	.	C	CCCCTCTA	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=198,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:46307602_C_T:46307602:8,3,1,1
chr19	46313825	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=195,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,4,2
chr19	46318963	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=169,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:1,5,1,3
chr19	46327053	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=205,188;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:8,2:4,2:8,4,1,3
chr19	46327166	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=211,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,6:3,1:0,6,0,7
chr19	46327185	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=190,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,6:1,1:0,2,0,7
chr19	46327209	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=214,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr19	46329387	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr19	46329438	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=171,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,2:1,5:2,1,6,1
chr19	46332194	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=200,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,4:3,5:2,4,8,1
chr19	46332305	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=160,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:0,7,2,0
chr19	46334553	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=164,246;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:0,1:3,3:2,1,4,0
chr19	46338492	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=137,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr19	46345782	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=165,246;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:1,6,0,3
chr19	46347228	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=696,181;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:46347228_AG_A:46347228:2,0,1,0
chr19	46347233	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=299,181;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:46347228_AG_A:46347228:4,0,1,0
chr19	46352203	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=223,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.697:8:1,3:1,2:0,2,2,4
chr19	46355911	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=101,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr19	46357811	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=202,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr19	46376175	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,22;MFRL=188,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.272:12:6,0:3,3:7,2,3,0
chr19	46376207	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:6,0:4,3:0|1:46376207_C_T:46376207:6,4,3,0
chr19	46376213	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:6,0:4,3:0|1:46376207_C_T:46376207:6,4,3,0
chr19	46388093	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:6,2:21,0:11,17,1,1
chr19	46418089	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=206,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr19	46443149	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,34;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,0:9,2:13,8,2,0
chr19	46476454	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	46498827	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,11:0.546:20:2,6:5,3:0|1:46498827_G_A:46498827:0,9,0,11
chr19	46498835	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=199,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:0,5:5,3:0|1:46498827_G_A:46498827:0,7,0,10
chr19	46506287	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=168,91;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:9,3:2,0:9,2,2,1
chr19	46511346	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=214,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:4,3:8,2:11,1,4,1
chr19	46511615	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=217,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr19	46521526	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=210,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.263:25:7,6:9,0:12,7,5,1
chr19	46522922	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=291,238;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr19	46526298	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr19	46543243	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=115,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:8,0:1,3:4,5,0,3
chr19	46543249	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=102,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,2:0,0:2,4,0,2
chr19	46543322	.	C	CGGGAGA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=224,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,1:1,0:1,4,0,1
chr19	46627592	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,5:0,7:1,0,8,4
chr19	46652396	.	TCTCTCTCTCTCC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=0,189;MMQ=51,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.895:16:1,7:0,8:0,1,0,15
chr19	46664400	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr19	46734022	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:14,4:10,1:12,13,4,1
chr19	46807185	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=191,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:10,2:2,2:5,7,1,3
chr19	46812126	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	46812336	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:2,0,4,2
chr19	46834683	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=261,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr19	46857286	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,1,12
chr19	46887007	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr19	46893238	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,10,2
chr19	46893465	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=219,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:0,7:0,9:1,0,11,6
chr19	46971773	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=124,161;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:2,4:5,5:3,4,3,6
chr19	46973038	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,206;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:3,4:8,0:8,3,4,0
chr19	46974306	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=115,263;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:1,4,1,1
chr19	46974307	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=263,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,1,4
chr19	46997016	.	C	CCGGCCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=196,275;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CGGCCT;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	47109011	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=161,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.565:25:4,10:5,4:9,2,10,4
chr19	47111663	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=235,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:2,1,4,2
chr19	47126614	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=266,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr19	47156201	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=284,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr19	47193850	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=131,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.721:23:2,8:4,9:5,1,11,6
chr19	47207654	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=250,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,1,2
chr19	47217113	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr19	47228985	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr19	47236268	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=205,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:5,2,0,2
chr19	47258674	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=206,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr19	47261836	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=262,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.852:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr19	47278859	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=129,151;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:2,5:4,7:11,3,6,6
chr19	47278866	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=139,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:8,8:10,0:7,11,8,0
chr19	47280263	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=128,246;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:11,7,1,1
chr19	47285598	.	CTCCAA	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=142,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:1,1:1,1:0|1:47285598_CTCCAA_C:47285598:0,3,2,0
chr19	47285608	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,0:0|1:47285598_CTCCAA_C:47285598:1,3,2,0
chr19	47285612	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,0:0|1:47285598_CTCCAA_C:47285598:1,3,2,0
chr19	47287390	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=143,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:9,0:16,5:11,14,0,5
chr19	47287939	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr19	47342867	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=171,292;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:10,4:3,0:0,13,0,4
chr19	47542425	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=239,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:1,2:2,1:2,2,0,3
chr19	47549791	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=292,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	47570709	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=199,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,0:2,1:2,4,1,1
chr19	47584699	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=202,238;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:2,0,7,0
chr19	47585517	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:0,3:2,5:1,1,4,4
chr19	47587772	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr19	47589560	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=276,293;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:47589560_A_C:47589560:1,0,1,0
chr19	47589567	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=196,293;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:47589560_A_C:47589560:3,0,1,0
chr19	47589635	.	C	CCTTT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=206,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,2:6,0:0|1:47589635_C_CCTTT:47589635:11,2,1,1
chr19	47589640	.	C	CCAGT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=206,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:5,0:0|1:47589635_C_CCTTT:47589635:11,2,1,1
chr19	47597871	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:7,0:5,3:0,13,0,3
chr19	47634313	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,0,11
chr19	47735875	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=188,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,18:0.404:45:16,6:11,12:10,17,6,12
chr19	47761543	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=340,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:0,6:1,9:1,0,12,3
chr19	47763573	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=272,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,5:0,4:2,1,4,5
chr19	47768128	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=245,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,3,3
chr19	47769839	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=229,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:1,0,8,0
chr19	47770015	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=194,162;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,7:1,5:2,1,2,10
chr19	47770032	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=151,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,2:3,2:2,7,1,3
chr19	47773786	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,9,8
chr19	47773973	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	47774329	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=203,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,5:3,8:4,1,11,2
chr19	47774447	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=222,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,23:0.727:31:2,10:6,12:5,3,16,7
chr19	47774946	.	CTG	C,CTGTGTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,16,30;MFRL=0,185,264;MMQ=60,40,40;MPOS=8,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,21,24;RU=TG;STR;TLOD=4.16,3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.533,0.325:3:0,0,1:0,0,0:0,0,0,3
chr19	47778412	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=286,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr19	47813275	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=128,183;MMQ=60,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:1,0:5,3:0|1:47813275_C_T:47813275:1,5,0,3
chr19	47813282	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=36,33;MFRL=128,183;MMQ=60,22;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:1,0:5,1:0|1:47813275_C_T:47813275:1,5,0,3
chr19	47813288	.	GT	TC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:47813275_C_T:47813275:1,3,0,1
chr19	47813292	.	TCCA	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:47813275_C_T:47813275:1,3,0,1
chr19	47813302	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,29;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0|1:47813275_C_T:47813275:0,1,0,2
chr19	47844653	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=226,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:3,4,2,3
chr19	47844901	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:10,6,0,3
chr19	47858327	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=135,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:11,1:10,2:14,7,1,2
chr19	47878858	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=230,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:1,0:3,3:3,1,2,2
chr19	47879874	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=236,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr19	47885180	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr19	47885413	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr19	47910739	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=196,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:1,0:5,2:2,5,0,2
chr19	47912323	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:2,2,3,0
chr19	47918096	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=32,23;MFRL=138,6871486;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.314:10:3,2:4,0:2,5,0,3
chr19	47918129	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=32,23;MFRL=141,7044940;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:3,3,0,2
chr19	47918144	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=22,21;MFRL=3435815,313;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:47918144_TG_T:47918144:2,2,1,0
chr19	47918155	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=26,31;MFRL=3435815,313;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:47918144_TG_T:47918144:2,2,1,0
chr19	47918159	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=0,12;MFRL=3435815,313;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:0,0:0|1:47918144_TG_T:47918144:2,2,1,0
chr19	47918171	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=30,16;MFRL=178,313;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:47918144_TG_T:47918144:2,0,1,0
chr19	47918177	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=24,28;MFRL=158,313;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:47918144_TG_T:47918144:3,0,1,0
chr19	47918180	.	TCA	GAC	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=25,24;MFRL=158,313;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:47918144_TG_T:47918144:3,0,1,0
chr19	47918186	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=29,16;MFRL=158,313;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:47918144_TG_T:47918144:3,0,1,0
chr19	47933728	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr19	47935352	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	47944710	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=129,136;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,6:1,3:0,3,1,9
chr19	47980153	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,203;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:4,3,0,2
chr19	48182522	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=137,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=48.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:4,4:6,11:5,5,12,3
chr19	48182568	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=214,38;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.751:22:4,5:1,12:4,1,7,10
chr19	48185489	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	48198243	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	48198557	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=157,227;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.309:8:2,2:2,0:5,1,2,0
chr19	48201836	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=185,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.450:9:0,2:3,2:0|1:48201836_T_TC:48201836:1,4,4,0
chr19	48201838	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=185,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.451:9:1,1:3,0:0|1:48201836_T_TC:48201836:1,4,4,0
chr19	48201843	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,16;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.338:10:1,0:3,0:0|1:48201836_T_TC:48201836:2,5,3,0
chr19	48201851	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=136,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.252:14:2,1:7,1:0|1:48201836_T_TC:48201836:4,7,3,0
chr19	48202125	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=188,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:2,0,2,3
chr19	48204972	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=24,15;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,0:0|1:48204972_A_C:48204972:2,9,2,0
chr19	48204977	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,18;MFRL=153,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,1:0|1:48204972_A_C:48204972:2,8,2,0
chr19	48204981	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=25,19;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:5,1:0|1:48204972_A_C:48204972:2,9,2,0
chr19	48204984	.	AG	CC	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=26,24;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,1:5,0:0|1:48204972_A_C:48204972:1,9,2,0
chr19	48204991	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:0|1:48204972_A_C:48204972:0,9,2,0
chr19	48204994	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=25,29;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:0|1:48204972_A_C:48204972:0,10,2,0
chr19	48205725	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	48219893	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:3,3:3,2:7,0,5,1
chr19	48239557	.	TG	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=191,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr19	48244045	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	48244692	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	48250203	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=124,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,2:5,4:6,4,4,2
chr19	48250320	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=150,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.353:17:5,4:6,2:7,4,1,5
chr19	48253579	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=196,219;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:1,5,3,1
chr19	48254392	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:2,2,0,3
chr19	48254707	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=85,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:0,1:6,2:6,0,3,0
chr19	48258717	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=126,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,2,1
chr19	48258826	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=261,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:3,1,0,3
chr19	48260079	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=214,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,1:0,1:2,1,2,0
chr19	48282077	.	C	CGCAGCGG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=124,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,3:1,2:1,3,3,4
chr19	48282172	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr19	48284025	.	C	CG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=163,275;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,2:6,1:7,8,0,3
chr19	48377821	.	CTC	AAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,15;MFRL=154,237;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:48377821_CTC_AAA:48377821:3,1,1,0
chr19	48377827	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=154,237;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:48377821_CTC_AAA:48377821:3,1,1,0
chr19	48377829	.	TCT	AAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,15;MFRL=154,237;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:48377821_CTC_AAA:48377821:3,1,1,0
chr19	48495304	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=235,114;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:2,5:5,5:0|1:48495304_G_A:48495304:5,2,6,4
chr19	48495306	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=235,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:2,5:4,5:0|1:48495304_G_A:48495304:5,2,6,4
chr19	48511854	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=232,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:4,1,2,1
chr19	48517341	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=216,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr19	48523164	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:48523164_T_G:48523164:1,0,0,1
chr19	48523172	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48523164_T_G:48523164:1,0,0,1
chr19	48525379	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:4,3,2,0
chr19	48533741	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:2,0:8,2:4,6,1,1
chr19	48533856	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=165,215;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:6,1:6,3:1,11,4,0
chr19	48537585	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=119,217;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:0,5,3,3
chr19	48543774	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	48543923	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=102,223;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,1:6,2:4,5,2,1
chr19	48544753	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr19	48551546	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr19	48558093	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,105;MMQ=60,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr19	48558388	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr19	48565469	.	A	AACGTTCTTCAAAAGACTGGAATCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=230,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48565469_A_AACGTTCTTCAAAAGACTGGAATCG:48565469:0,1,0,1
chr19	48565477	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48565469_A_AACGTTCTTCAAAAGACTGGAATCG:48565469:0,0,0,1
chr19	48570958	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=275,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,0:1,2:3,0,2,0
chr19	48571026	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:3,5,3,0
chr19	48593729	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=165,218;MMQ=52,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,0:7,3:3,7,1,2
chr19	48598916	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr19	48601350	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=121,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:3,2:3,5:3,3,5,2
chr19	48622483	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=175,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:2,7,1,2
chr19	48646732	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=159,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:4,3:4,2,2,1
chr19	48646883	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,0:4,4:3,4,0,4
chr19	48660195	.	C	CAAAAAAAAAAAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=154,144;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=24,36;RU=A;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:0,0:1,2:1,0,2,1
chr19	48660243	.	GAAGGGGCA	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=119,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:10,4:7,4:2,19,4,4
chr19	48660445	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=156,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:3,3,1,1
chr19	48715269	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,1,13
chr19	48734018	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=202,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:5,2:0,2:1,4,3,1
chr19	48737764	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=169,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:1,9,0,2
chr19	48800218	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=184,256;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr19	48800791	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=187,263;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr19	48801218	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,222;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr19	48801414	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=177,233;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,3:4,1:6,3,1,3
chr19	48801426	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=198,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,3:1,4:2,3,2,5
chr19	48821896	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,3:5,3:6,4,3,3
chr19	48830286	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=178,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr19	48832554	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:9,3:2,5:9,2,8,1
chr19	48833800	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=211,248;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr19	48887768	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.239:18:7,0:3,1:7,7,0,4
chr19	48923101	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=217,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:2,2,0,2
chr19	48924963	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=199,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:5,0,1,2
chr19	48949766	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,5,7
chr19	48954571	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	48975581	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,1:8,1:13,4,0,2
chr19	48981933	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=237,139;MMQ=60,32;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr19	49005787	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,147;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,4:7,0:2,8,5,0
chr19	49063664	.	A	AGCCAGTGGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=167,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr19	49079374	.	GAGAGT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=149,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.428:3:0,0:1,1:0|1:49079374_GAGAGT_G:49079374:0,2,0,1
chr19	49079384	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=-1073741821;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr19	49079390	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=15,12;MFRL=212,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.567:2:0,0:0,0:0|1:49079374_GAGAGT_G:49079374:0,1,0,1
chr19	49096065	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,154;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,3:2,4:2,6,3,4
chr19	49106935	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=198,311;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:5,0,1,1
chr19	49111003	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=281,104;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:1,0:1,2:0,3,1,1
chr19	49116076	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr19	49116134	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,7,6
chr19	49119900	.	C	CCAGCACAGCACAGCACAGCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,11;RU=CAGCA;STR;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.472:8:2,0:2,1:4,0,4,0
chr19	49120774	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=287,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.673:7:2,3:0,2:1,1,1,4
chr19	49122248	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=191,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr19	49123875	.	TAA	T,TAAAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29,28;MFRL=165,113,183;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,20;RU=A;STR;TLOD=3.15,5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.245,0.320:9:1,0,2:2,2,1:0,4,1,4
chr19	49129486	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=48556573,283;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr19	49131917	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=178,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr19	49141532	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:2,2:0,2:0,2,1,5
chr19	49143025	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,4:1,4:2,1,6,2
chr19	49143638	.	T	TGTTGTTGTTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=220,128;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.473:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr19	49148781	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=119,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:6,1:15,3:7,14,4,0
chr19	49165294	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	49166875	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=202,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.484:12:2,1:4,3:3,3,3,3
chr19	49207438	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	49207554	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,49;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	49208368	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=141,270;MMQ=60,50;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.443:5:1,0:2,2:0|1:49208368_CT_C:49208368:1,2,0,2
chr19	49208390	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=159,270;MMQ=60,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.440:5:1,0:1,2:0|1:49208368_CT_C:49208368:1,2,0,2
chr19	49216926	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,4:0,0,10,6
chr19	49217305	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=326,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,3:0,7:0,1,1,9
chr19	49218060	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=153,336;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,0:13,3:10,13,2,1
chr19	49218111	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=136,286;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.254:18:7,1:5,3:10,4,2,2
chr19	49227510	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr19	49228272	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=127,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,4:5,3:0,7,0,7
chr19	49230596	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=145,61;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:14,3:5,0:9,10,2,1
chr19	49246615	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,13;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.553:5:2,0:0,1:2,0,3,0
chr19	49246866	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=232,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr19	49247693	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:1,2:3,4:3,1,4,2
chr19	49247900	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=263,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr19	49248640	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=204,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,6:1,3:0,4,0,9
chr19	49253389	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0|1:49253389_C_T:49253389:1,0,5,0
chr19	49253399	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=174,246;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:49253389_C_T:49253389:4,0,1,0
chr19	49260101	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=184,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,5:2,4:4,1,8,1
chr19	49261368	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.748:10:1,4:1,1:1,1,4,4
chr19	49299827	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=208,228;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:2,3,1,1
chr19	49300431	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=201,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:2,2:10,0:8,5,1,1
chr19	49300605	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=201,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,3:1,6:0,1,3,6
chr19	49318380	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,2,3
chr19	49334991	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,52;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:6,0:6,8,0,2
chr19	49336014	.	GT	G,GTT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32,17;MFRL=163,114,41;MMQ=60,60,60;MPOS=24,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.75,8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,5,6:0.280,0.321:18:2,3,0:4,2,2:1,6,1,10
chr19	49339210	.	G	GCTACAGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=225,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:49339210_G_GCTACAGA:49339210:1,1,0,2
chr19	49339215	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=225,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:49339210_G_GCTACAGA:49339210:1,1,0,2
chr19	49339217	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=225,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:49339210_G_GCTACAGA:49339210:1,1,0,2
chr19	49339221	.	AC	TT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=225,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:49339210_G_GCTACAGA:49339210:1,1,0,2
chr19	49340858	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=227,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,1:3,4:1,6,1,4
chr19	49341418	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.316:4:2,0:1,0:0|1:49341418_T_G:49341418:2,1,0,1
chr19	49341427	.	G	GAAGTGCATAACAATGGGATATACCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=37,35;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:1,0:0,1:0|1:49341418_T_G:49341418:1,0,0,1
chr19	49342366	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=208,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr19	49342396	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=192,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:5,1,3,1
chr19	49351149	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:5,2:8,2:10,3,1,3
chr19	49364893	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:10,0:6,2:8,8,0,2
chr19	49376683	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=176,289;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,0:15,3:16,9,2,1
chr19	49379182	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=252,173;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:2,2:6,2:1,8,2,2
chr19	49379207	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=180,252;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,0:5,4:0,12,0,4
chr19	49384468	.	CTTTTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=221,170;MMQ=40,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,10;RU=T;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr19	49385253	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=147,222;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:4,1,6,0
chr19	49399676	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=182,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.476:11:3,2:1,3:4,2,5,0
chr19	49399821	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=100,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:1,3,1,5
chr19	49400511	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=181,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:6,4,3,1
chr19	49400991	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr19	49404393	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=221,237;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,1:5,1:1,8,0,2
chr19	49407660	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=192,55;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:2,4,2,4
chr19	49407715	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,16;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,1:3,0:0|1:49407715_C_T:49407715:2,5,1,2
chr19	49407733	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:0,0:0|1:49407715_C_T:49407715:1,2,0,2
chr19	49409004	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=203,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,1:8,3:8,5,3,1
chr19	49416456	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=161,254;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,2:5,1:2,9,2,1
chr19	49416554	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=205,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:1,1,0,3
chr19	49421829	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	49421903	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=120,251;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:9,3:6,1:7,8,3,1
chr19	49424354	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=14,25;MFRL=180,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,2:0,2:1,0,4,0
chr19	49424381	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:0,1:1,5:1,0,6,1
chr19	49425772	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr19	49459104	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=226,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,5:0,5:0,1,1,9
chr19	49459406	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=177,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:9,0,2,0
chr19	49464200	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=141,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:1,0:13,1:0|1:49464200_A_C:49464200:0,14,2,0
chr19	49464203	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,18;MFRL=142,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,0:7,1:0|1:49464200_A_C:49464200:0,9,2,0
chr19	49464206	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=132,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:6,0:0|1:49464200_A_C:49464200:0,8,2,0
chr19	49464971	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	49474027	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=223,258;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,1:6,3:5,2,3,1
chr19	49477527	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,1:12,1:8,13,2,0
chr19	49497189	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=152,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:5,4:12,2:4,13,2,4
chr19	49510242	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:1,0,8,0
chr19	49513349	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr19	49518484	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	49519230	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,8,7
chr19	49526119	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	49526191	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=203,248;MMQ=22,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0|1:49526191_G_A:49526191:1,0,0,4
chr19	49526203	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=203,262;MMQ=22,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,1:0|1:49526191_G_A:49526191:1,0,0,3
chr19	49527128	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr19	49527141	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr19	49535491	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=125,145;MMQ=57,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:1,3:0,0:0,1,0,4
chr19	49536514	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=117,143;MMQ=40,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:2,3,2,3
chr19	49540093	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr19	49558498	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=174,88;MMQ=60,45;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,2,1
chr19	49558509	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=174,150;MMQ=60,36;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,2:2,0:4,0,2,1
chr19	49558573	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=145,196;MMQ=48,37;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:4,2,1,1
chr19	49558667	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=22,32;MFRL=109,227;MMQ=60,38;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,1:6,3:4,4,4,0
chr19	49558678	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=109,222;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:4,1:6,2:6,4,3,0
chr19	49558690	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=183,222;MMQ=60,36;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:4,2,3,0
chr19	49558729	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=183,197;MMQ=60,44;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:2,2,0,2
chr19	49593543	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:5,0:12,4:9,8,0,4
chr19	49618681	.	CATG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	49619830	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=220,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,0:2,9:0,3,0,9
chr19	49621355	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=181,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr19	49621592	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,144;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.418:26:10,4:5,5:6,9,6,5
chr19	49632079	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=200,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:0,4:1,5:1,0,8,2
chr19	49632309	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=220,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,1,4
chr19	49632772	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=201,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,5:0,5:0,1,2,11
chr19	49637091	.	GCAGCTGGAGGCC	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=139,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:12,2:12,0:21,9,1,1
chr19	49638956	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=227,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr19	49643404	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr19	49644814	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=189,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:49644814_TG_T:49644814:2,7,0,2
chr19	49644816	.	AGAG	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=189,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,1:0|1:49644814_TG_T:49644814:2,7,0,2
chr19	49644826	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=189,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,1:0|1:49644814_TG_T:49644814:0,5,0,2
chr19	49644828	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=12,29;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.450:7:1,0:0,2:0,4,0,3
chr19	49645194	.	A	ATG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=238,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TG;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,0:2,0,3,0
chr19	49645210	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,3:1,0:6,0,3,0
chr19	49646006	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,3:1,3:1,1,6,1
chr19	49649498	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:1,2,0,4
chr19	49654421	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=240,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr19	49655174	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,4:5,3:4,2,6,1
chr19	49657710	.	A	ACAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=173,307;MMQ=60,42;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=CAT;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.420:5:2,2:1,0:2,1,0,2
chr19	49657889	.	T	TTCC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=166,133;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TCC;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.234:10:4,0:4,1:3,5,2,0
chr19	49658084	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.156:49:21,2:21,5:30,12,4,3
chr19	49661582	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=126,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:0,2:4,3:0,4,0,6
chr19	49671281	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,4:1,1:1,0,1,4
chr19	49671442	.	A	AGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GT;STR;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:2,1,4,0
chr19	49671772	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=151,207;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:8,2:6,7,2,0
chr19	49675017	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,2,1
chr19	49675233	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=110,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,5:4,2,7,2
chr19	49691822	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=192,190;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,0:4,6:7,0,6,0
chr19	49692373	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:2,3,1,4
chr19	49700109	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=135,260;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	49797887	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr19	49812742	.	T	TCCGTGAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=194,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:49812742_T_TCCGTGAA:49812742:1,1,0,1
chr19	49812746	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=194,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:49812742_T_TCCGTGAA:49812742:1,1,0,1
chr19	49813401	.	TACAGGCCGAGGATGAAGC	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=101,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:13,0:11,2:0|1:49813401_TACAGGCCGAGGATGAAGC_T:49813401:24,9,0,2
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chr19	49813449	.	G	GATTAAGAACATGT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=84,150;MMQ=60,60;MPOS=-17;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:11,2:0|1:49813401_TACAGGCCGAGGATGAAGC_T:49813401:8,13,0,2
chr19	49838891	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,9:0,14:0,0,9,15
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chr19	49925667	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:2,3:4,0,5,1
chr19	49926530	.	CCAG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=167,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CAG;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:1,0:4,2:2,5,0,2
chr19	49935927	.	A	AG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=68.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,11:0,11:0,0,9,13
chr19	49937022	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,1:5,2:5,8,1,2
chr19	49944730	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	49949589	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=71,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:1,4:7,6:4,4,7,4
chr19	49949624	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=98,47;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:10,0:16,2:16,13,1,1
chr19	49950413	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=235,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:2,5,1,2
chr19	49956690	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=189,222;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,1:2,3:2,5,4,0
chr19	49961732	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,0:6,3:11,3,0,3
chr19	49962892	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=248,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr19	49963987	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=16724699,157;MMQ=58,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:49963987_CC_TT:49963987:0,1,1,0
chr19	49963993	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,15;MFRL=16724699,157;MMQ=58,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:49963987_CC_TT:49963987:0,1,1,0
chr19	49963995	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,15;MFRL=16724699,157;MMQ=58,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:49963987_CC_TT:49963987:0,1,1,0
chr19	49964006	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,17;MFRL=8362417,157;MMQ=59,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:49963987_CC_TT:49963987:1,1,1,0
chr19	49964010	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,16;MFRL=8362417,157;MMQ=59,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:49963987_CC_TT:49963987:1,1,1,0
chr19	49965131	.	GG	AC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=221,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,2,2
chr19	49965173	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=199,187;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,4:0,1:0,1,3,3
chr19	49966081	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	49967808	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:4,3:1,4,1,6
chr19	49969310	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr19	49978959	.	CCTG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=119,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTG;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:2,1,0,1
chr19	49990793	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=197,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:11,4:3,3:9,5,6,1
chr19	49993377	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:5,0:6,3:0|1:49993377_TA_T:49993377:11,0,3,0
chr19	49993383	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:7,0:7,3:0|1:49993377_TA_T:49993377:14,0,3,0
chr19	49999647	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:9,6:5,6:7,7,5,7
chr19	50001170	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:8,8:10,4:9,9,5,7
chr19	50001385	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:3,3:3,0:0,6,0,4
chr19	50002686	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=255,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,4:6,5:8,1,9,0
chr19	50029454	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=105,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:1,3:0,2,0,3
chr19	50059718	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=286,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,5:2,5:2,1,1,9
chr19	50062293	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=233,11165128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,2:0,0:0,3,0,2
chr19	50063770	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=246,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr19	50086626	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=196,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.464:11:3,3:3,2:1,5,3,2
chr19	50093141	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=134,261;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,3:6,0:5,9,2,1
chr19	50093572	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=194,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,6:3,1:3,3,4,3
chr19	50095047	.	AGCCGG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCCGG;STR;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.821:8:0,5:1,2:0,1,2,5
chr19	50097932	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=234,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:2,0:2,10:3,1,8,2
chr19	50101245	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=199,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:7,2,2,0
chr19	50105239	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=267,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:0,4,0,5
chr19	50123737	.	G	GTGTTTTGGAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=126,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:2,1:0,0:0|1:50123737_G_GTGTTTTGGAA:50123737:1,1,0,1
chr19	50123739	.	G	GCCATTCATC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=126,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:50123737_G_GTGTTTTGGAA:50123737:1,1,0,1
chr19	50139932	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=189,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:6,2:11,1:11,7,3,0
chr19	50139935	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=186,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:13,6,1,1
chr19	50140068	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=246,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.823:15:2,8:0,4:1,1,6,7
chr19	50140092	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,7,5
chr19	50140209	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr19	50140246	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr19	50148261	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,2:2,6:1,2,5,3
chr19	50150122	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=175,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:0,6,0,3
chr19	50154904	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr19	50163981	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=165,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:5,3:12,0:11,6,2,1
chr19	50169020	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=240,243;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,3:1,0:1,0,3,1
chr19	50170197	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=196,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.280:15:6,2:5,1:9,2,2,2
chr19	50183587	.	C	CTATACTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=215,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr19	50183718	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=192,83;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:12,0,3,0
chr19	50185345	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=221,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:3,3:7,2:3,7,2,4
chr19	50189950	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=124,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.295:14:4,1:6,2:2,8,2,2
chr19	50216118	.	T	TG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=62.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,8:0,0,9,10
chr19	50251799	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=213,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:50251799_A_C:50251799:0,2,0,1
chr19	50251801	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=213,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:50251799_A_C:50251799:0,2,0,1
chr19	50265230	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:7,5:1,1:5,3,6,0
chr19	50265549	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr19	50295354	.	CAGGG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:50295354_CAGGG_C:50295354:1,3,0,1
chr19	50295359	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:50295354_CAGGG_C:50295354:1,3,0,1
chr19	50295363	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:50295354_CAGGG_C:50295354:0,3,0,1
chr19	50295365	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:50295354_CAGGG_C:50295354:0,3,0,1
chr19	50298807	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:50298807_C_T:50298807:2,0,1,0
chr19	50298823	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:50298807_C_T:50298807:2,1,1,0
chr19	50298833	.	CCACGTG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:2,0:1,1:0|1:50298807_C_T:50298807:2,1,1,0
chr19	50304336	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr19	50304360	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr19	50304392	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=262,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr19	50308893	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=232,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.597:13:4,4:1,3:2,3,2,6
chr19	50309860	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:1,0:2,2,3,1
chr19	50314707	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,2:8,2:10,4,0,4
chr19	50315423	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=192,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,2:0,3:4,0,5,0
chr19	50315698	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=191,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,1:0,3,1,3
chr19	50315773	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=223,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,2:2,6:1,2,4,4
chr19	50321981	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=186,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr19	50331678	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=212,257;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:6,0,2,0
chr19	50334012	.	C	CAACTTAGACAGACTAGGGAAAAGACTTTTCAAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=212,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:50334012_C_CAACTTAGACAGACTAGGGAAAAGACTTTTCAAT:50334012:0,2,0,1
chr19	50334017	.	CT	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=212,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:50334012_C_CAACTTAGACAGACTAGGGAAAAGACTTTTCAAT:50334012:0,2,0,1
chr19	50338453	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=210,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,1:6,5:3,5,1,5
chr19	50358133	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=235,126;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,2:0,4:1,1,1,5
chr19	50358183	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr19	50361907	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=119,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:2,4:3,0:4,2,2,4
chr19	50363175	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=272,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,2:1,7:1,0,8,1
chr19	50365558	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=207,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:0|1:50365558_C_T:50365558:2,7,2,0
chr19	50365586	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=161,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,0:2,0:0|1:50365558_C_T:50365558:1,4,1,0
chr19	50367395	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=193,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,0:8,3:9,8,2,1
chr19	50368361	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.356:20:7,3:6,3:11,2,7,0
chr19	50375035	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:7,5:7,11:7,7,5,11
chr19	50375141	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,60;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,3:15,0:5,18,3,0
chr19	50375242	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=187,99;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,2,0
chr19	50380858	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=186,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,4:3,6:4,0,10,0
chr19	50383566	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=169,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.125:34:11,3:19,0:16,14,3,1
chr19	50383591	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,16:0,0,16,9
chr19	50386340	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=124,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:6,3:4,1:3,7,1,3
chr19	50393043	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=222,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:0,3:4,5:2,2,3,5
chr19	50394193	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,32;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	50397805	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,35;MFRL=251,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50397805_G_GC:50397805:0,1,0,1
chr19	50397806	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=13,28;MFRL=251,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.506:2:0,0:0,1:0|1:50397805_G_GC:50397805:0,1,0,1
chr19	50397807	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=251,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50397805_G_GC:50397805:0,1,0,1
chr19	50397814	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=18,26;MFRL=251,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:50397805_G_GC:50397805:0,1,0,1
chr19	50397816	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=251,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50397805_G_GC:50397805:0,1,0,1
chr19	50397818	.	GT	AG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,24;MFRL=251,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50397805_G_GC:50397805:0,1,0,1
chr19	50397822	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=251,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50397805_G_GC:50397805:0,1,0,1
chr19	50399384	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=165,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.525:15:1,6:6,2:1,6,7,1
chr19	50412217	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,184;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:4,1,4,2
chr19	50413227	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=163,164;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:4,0:4,5:0|1:50413227_T_A:50413227:0,8,0,5
chr19	50413232	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=163,164;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:4,0:4,5:0|1:50413227_T_A:50413227:0,8,0,5
chr19	50435746	.	CTT	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=32,24;MFRL=210,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:7,1:4,0:0|1:50435746_CTT_C:50435746:2,9,2,0
chr19	50435747	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=180,223;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,6:0.539:11:2,5:3,1:1|0:50435746_CTT_C:50435746:2,3,0,6
chr19	50435749	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=210,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:4,0:0|1:50435746_CTT_C:50435746:2,9,2,0
chr19	50435756	.	GG	CC	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,12;MFRL=210,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,0:0|1:50435746_CTT_C:50435746:0,9,2,0
chr19	50435759	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=25,24;MFRL=210,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,1:4,0:0|1:50435746_CTT_C:50435746:0,9,2,0
chr19	50435763	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=210,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:50435746_CTT_C:50435746:0,9,2,0
chr19	50435862	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=105,207;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,4:1,4:0,3,1,7
chr19	50436371	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=94,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:1,2,1,4
chr19	50453517	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=112,325;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	50462244	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=181,166;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,4:3,2:6,4,2,4
chr19	50463670	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=140,210;MMQ=40,46;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:4,7,1,1
chr19	50463693	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=179,196;MMQ=57,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:3,6,2,2
chr19	50463727	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=180,168;MMQ=40,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,1:6,2:4,4,2,1
chr19	50484155	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:5,2:2,0:6,1,2,0
chr19	50484336	.	TGCCTAAGATATATACACA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,340;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCCTAAGATATATACACA;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:1,1:4,1:1,9,0,2
chr19	50492860	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:1,3:5,3:5,1,5,1
chr19	50493120	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,37;MFRL=185,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr19	50496281	.	G	GAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr19	50498604	.	GAGA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=229,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr19	50511108	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr19	50519231	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=202,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.459:11:2,5:4,0:5,1,3,2
chr19	50519249	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,5:6,4:5,3,3,6
chr19	50548692	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=173,71;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:9,0:14,3:14,9,2,1
chr19	50657786	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr19	50661588	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=124,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,0:7,3:4,5,1,2
chr19	50666349	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,2:5,0:4,7,0,2
chr19	50720793	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,1:0,2:0|1:50720793_C_T:50720793:5,0,3,0
chr19	50720795	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=188,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0|1:50720793_C_T:50720793:3,0,5,0
chr19	50726459	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:0,7:1,7:1,0,10,4
chr19	50727290	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	50727312	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=67,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:1,2,2,1
chr19	50727510	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=211,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.576:12:3,4:1,2:2,3,2,5
chr19	50728882	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=143,78;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:3,2:6,1,0,2
chr19	50728955	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=187,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:1,2,1,1
chr19	50750419	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=252,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.777:7:0,1:1,5:0,1,1,5
chr19	50764017	.	T	TGC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=223,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GC;STR;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:3,7:3,2:3,5,5,6
chr19	50766707	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	50770322	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50770322_T_G:50770322:0,0,0,1
chr19	50770326	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50770322_T_G:50770322:0,0,0,1
chr19	50770336	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50770322_T_G:50770322:0,0,0,1
chr19	50771322	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	50771609	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=184,162;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.874:14:1,8:0,4:0,1,1,12
chr19	50771635	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,6:0,2:0,1,1,7
chr19	50774898	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50774898_G_T:50774898:0,0,0,1
chr19	50774900	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50774898_G_T:50774898:0,0,0,1
chr19	50774901	.	T	TAC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50774898_G_T:50774898:0,0,0,1
chr19	50774904	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50774898_G_T:50774898:0,0,0,1
chr19	50775742	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=206,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:2,0,5,0
chr19	50779151	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=195,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:5,0,3,1
chr19	50779469	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=280,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr19	50779500	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=292,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr19	50779988	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:4,2,6,0
chr19	50796395	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=215,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,0:7,3:10,0,3,0
chr19	50796464	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=184,142;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:7,0:5,9:9,3,0,9
chr19	50796905	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,7,7
chr19	50796914	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,1:6,1:5,7,1,1
chr19	50796960	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr19	50805138	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr19	50812221	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr19	50812289	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=147,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.280:22:8,0:8,5:10,6,2,4
chr19	50812322	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=126,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.218:21:9,0:8,4:0|1:50812322_G_C:50812322:9,8,0,4
chr19	50812328	.	T	TTCCATAAG	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,36;MFRL=130,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:10,0:6,4:0|1:50812322_G_C:50812322:10,7,0,4
chr19	50880991	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=158,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:15,3:8,0:10,14,0,4
chr19	50881326	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=160,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,3:1,0:1,0,2,1
chr19	50881820	.	A	AAAC	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAC;STR;TLOD=54.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.717:29:5,6:3,14:2,6,8,13
chr19	50881822	.	A	ACAG	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=170,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CAG;STR;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:6,3:15,3:8,14,2,5
chr19	50882169	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=243,198;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:0,0:2,2:2,1,2,0
chr19	50909389	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr19	50922301	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=200,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:1,6,0,2
chr19	50922370	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,291;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	50931433	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:4,12,2,0
chr19	50941000	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=127,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.825:9:1,5:0,3:1,0,4,4
chr19	50951689	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=196,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,1:1,7:0,1,3,5
chr19	50957677	.	GTT	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=17,33;MFRL=182,119;MMQ=50,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,0:0,1:0,2,0,1
chr19	50957694	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=192,119;MMQ=45,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr19	50962062	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,17;MFRL=228,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.579:8:1,1:2,1:2,1,3,2
chr19	50967783	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr19	51015404	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=181,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,6:0,2:1,0,8,0
chr19	51015574	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=216,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,3:6,5:4,10,4,4
chr19	51015869	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=235,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:6,0,3,1
chr19	51017835	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.907:9:0,6:0,0:0,0,2,7
chr19	51051716	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=205,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,0:1,3:3,0,3,0
chr19	51128856	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=101,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr19	51133521	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr19	51135457	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=171,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr19	51175234	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=215,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,0:3,1:7,1,2,0
chr19	51192746	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=195,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr19	51200290	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=219,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,1:7,1:4,6,1,1
chr19	51207314	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=101,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:10,0:0,0:0|1:51207314_A_C:51207314:10,2,2,0
chr19	51207322	.	AT	CA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=101,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:12,0:1,0:0|1:51207314_A_C:51207314:10,4,2,0
chr19	51217550	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=110,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:4,3:9,2:4,9,2,3
chr19	51219808	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=215,150;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:2,5,2,0
chr19	51228746	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr19	51228802	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	51274313	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=207,93;MMQ=60,50;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:3,4,0,2
chr19	51297138	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=192,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,0:7,3:4,8,2,1
chr19	51297944	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=191,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,4:4,0:3,2,1,3
chr19	51323768	.	G	GAGGTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=169,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51323768_G_GAGGTGT:51323768:1,0,0,1
chr19	51323771	.	G	GCCTCAGGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=169,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51323768_G_GAGGTGT:51323768:1,0,0,1
chr19	51329931	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=161,61;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,0:2,2:7,2,2,0
chr19	51361644	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr19	51361937	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=321,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr19	51362803	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=122,171;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:4,9,1,1
chr19	51363398	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr19	51363448	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=139,213;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,1,2
chr19	51380110	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,5:3,1:4,2,0,6
chr19	51411893	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=191,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:8,2:3,0:5,7,2,0
chr19	51412013	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=138,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,5:4,2:3,6,2,5
chr19	51446863	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:6,5,1,1
chr19	51452250	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,8:0,12:0,0,14,7
chr19	51455814	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,5:0,0:1,2,2,3
chr19	51456005	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=176,248;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:51456005_T_G:51456005:0,4,0,2
chr19	51456015	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=176,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:51456005_T_G:51456005:0,4,0,1
chr19	51482951	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=257,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr19	51482969	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,3:0,0,7,1
chr19	51484984	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=162,249;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:51484984_C_T:51484984:3,0,2,0
chr19	51484990	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=162,249;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:51484984_C_T:51484984:3,0,2,0
chr19	51485194	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr19	51500918	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr19	51500933	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.443:9:2,2:0,1:0|1:51500933_A_C:51500933:3,2,4,0
chr19	51500939	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.405:10:3,1:3,1:0|1:51500933_A_C:51500933:4,2,4,0
chr19	51503524	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=265,247;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,2,2
chr19	51503653	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=194,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr19	51504075	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,2,2
chr19	51517975	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=174,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr19	51518222	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr19	51518730	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=138,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,1:9,1:7,7,1,1
chr19	51519451	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr19	51519480	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	51525703	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=185,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr19	51527851	.	TCCCAGCCCCCCACCCCGGCACCGC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=228,203;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:0,1:0|1:51527851_TCCCAGCCCCCCACCCCGGCACCGC_T:51527851:3,0,1,0
chr19	51527863	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,2:0.764:2:0,2:0,0:1|0:51527851_TCCCAGCCCCCCACCCCGGCACCGC_T:51527851:0,0,2,0
chr19	51527874	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=235,208;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.608:3:1,1:0,0:1|0:51527851_TCCCAGCCCCCCACCCCGGCACCGC_T:51527851:1,0,2,0
chr19	51528832	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=138,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,0:8,3:10,11,2,1
chr19	51532533	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=94,94;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,2:0,1:5,2,0,3
chr19	51535460	.	T	TCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,239;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr19	51537903	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,3:3,6:3,4,1,8
chr19	51563246	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,213;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.258:28:6,1:12,5:8,13,0,7
chr19	51563965	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr19	51582994	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=230,246;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:51582994_G_T:51582994:0,2,0,1
chr19	51583003	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=230,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:51582994_G_T:51582994:0,2,0,1
chr19	51584743	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=183,250;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:8,2:3,2:11,0,3,1
chr19	51631165	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:4,1,4,0
chr19	51631363	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,3:0,3:0,1,1,5
chr19	51633052	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr19	51649925	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=200,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:2,0:5,2:7,1,2,0
chr19	51649970	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=144,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:5,3:9,0:10,4,2,1
chr19	51656218	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=186,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,4:1,3:1,0,7,0
chr19	51767205	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=244,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr19	51767485	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	51825238	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=210,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr19	51831142	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=184,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:51831142_T_G:51831142:1,1,0,1
chr19	51831148	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=184,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:51831142_T_G:51831142:1,1,0,1
chr19	51835892	.	T	TG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=54.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,6:0,0,4,11
chr19	51837213	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=216,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,3:2,4:0,2,0,7
chr19	51837344	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=252,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:3,1,2,1
chr19	51842117	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=124,34;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,2:4,0:7,7,1,1
chr19	51853468	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=172,232;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr19	51856529	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,1:6,1:9,4,0,2
chr19	51874950	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=124,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,1:2,6:3,0,7,0
chr19	51875133	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=136,141;MMQ=60,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:5,0:13,5:6,12,0,5
chr19	51883727	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.690:24:4,7:3,9:6,1,11,6
chr19	51919120	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=168,167;MMQ=49,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,1:5,1:0|1:51919120_A_G:51919120:4,7,2,0
chr19	51919140	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=177,167;MMQ=50,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,1:6,1:0|1:51919120_A_G:51919120:6,8,2,0
chr19	51919434	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=156,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.413:10:4,2:1,1:4,2,3,1
chr19	51919507	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:8,0:7,2:12,4,1,1
chr19	51984725	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=106,191;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.768:15:2,4:1,7:1,2,8,4
chr19	51984738	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,1:5,3:5,2,3,1
chr19	51994851	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=167,240;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,1:4,2:3,2,3,0
chr19	52000198	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,123;MMQ=54,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:7,9,0,3
chr19	52002303	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=207,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr19	52002317	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	52003058	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=295,237;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,0,2
chr19	52003090	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=292,246;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr19	52004551	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=287,158;MMQ=52,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,4,2
chr19	52004791	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=211,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=50.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,13:0.738:17:4,7:0,5:0|1:52004791_G_GC:52004791:2,2,6,7
chr19	52004795	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=211,155;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,13:0.737:17:4,7:0,5:0|1:52004791_G_GC:52004791:2,2,6,7
chr19	52031148	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=162,292;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:0,2:7,0:1,6,0,2
chr19	52031162	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=280,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,1:1,1:1,3,0,2
chr19	52031331	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=173,96;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:52031331_C_T:52031331:7,2,2,0
chr19	52031338	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=157,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:52031331_C_T:52031331:5,3,2,0
chr19	52032964	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=523,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,3,2
chr19	52033251	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=125,69;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,2:7,0:0,14,1,1
chr19	52034940	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=207,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.822:15:2,9:0,1:1,1,7,6
chr19	52076481	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=210,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,3:4,1:7,0,4,0
chr19	52089806	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=202,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,5:1,4:3,0,9,0
chr19	52131112	.	T	TCCCCTGTCAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=183,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:3,0:3,2:4,2,1,1
chr19	52132524	.	TAC	T,TACACAC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,24,24;MFRL=281,210,204;MMQ=60,60,60;MPOS=16,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,19;RU=AC;STR;TLOD=9.47,4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,3:0.406,0.302:10:1,1,0:1,2,1:2,1,6,1
chr19	52132668	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=168,182;MMQ=51,21;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.127:41:15,2:20,2:10,26,0,5
chr19	52132687	.	G	GCC	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=181,167;MMQ=40,50;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:14,5:19,0:4,29,0,5
chr19	52148980	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr19	52148981	.	C	CA,CACA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34,27;MFRL=0,225,269;MMQ=60,55,50;MPOS=15,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.28,4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.447,0.445:4:0,2,2:0,0,0:0,0,1,3
chr19	52196453	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=210,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,6:4,2:6,0,4,4
chr19	52273760	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.131:25:13,0:9,2:8,14,2,1
chr19	52273868	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=205,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:52273868_G_GT:52273868:0,3,0,2
chr19	52273879	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=205,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:52273868_G_GT:52273868:0,3,0,2
chr19	52328111	.	GG	AA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr19	52328133	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=84,162;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:0,6,0,3
chr19	52443377	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=221,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,4:3,1:2,1,5,0
chr19	52449072	.	C	CTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,303;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	52471769	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=196,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:0,2:6,1:6,0,3,0
chr19	52471813	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=111,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:3,3:7,2:7,4,4,1
chr19	52519005	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr19	52529074	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=217,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr19	52569251	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:5,0:15,3:11,9,1,2
chr19	52570783	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,6:3,4:4,5,3,7
chr19	52579248	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=195,1181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:9,1,0,2
chr19	52619920	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=184,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.185:19:5,0:10,3:9,7,2,1
chr19	52658510	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=171,229;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,2:6,0:4,5,2,0
chr19	52660826	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:4,2:6,6:0,11,0,8
chr19	52660830	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.351:18:5,3:7,3:0,12,0,6
chr19	52663686	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=129,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:10,4:5,0:13,2,3,1
chr19	52693277	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=22,17;MFRL=204,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.793:8:0,0:1,3:1,0,6,1
chr19	52693289	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=313,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=30.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.821:9:0,2:1,5:0|1:52693289_G_GC:52693289:1,0,7,1
chr19	52693298	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=313,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.823:9:0,2:1,5:0|1:52693289_G_GC:52693289:1,0,7,1
chr19	52709171	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,0:4,6:6,1,5,1
chr19	52714434	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr19	52719011	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=189,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.607:16:2,6:4,3:5,1,8,2
chr19	52719190	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:3,4:7,1:3,8,2,3
chr19	52725338	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=188,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,1:8,2:11,2,3,0
chr19	52772768	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr19	52773013	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	52786700	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,19;MFRL=96,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.603:5:1,0:1,0:1,1,1,2
chr19	52803669	.	CTG	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=61.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.804:18:2,6:1,9:2,1,9,6
chr19	52825421	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,154;MMQ=60,49;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,0:8,2:5,7,2,0
chr19	52852523	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr19	52868883	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr19	52870052	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,1:1,4:0,6,0,5
chr19	52887085	.	TTTTC	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=172,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTC;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr19	52887145	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=211,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.788:17:1,3:2,11:2,1,8,6
chr19	52887246	.	T	TCAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=220,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CAA;STR;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.543:20:3,2:6,5:5,4,7,4
chr19	52888620	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=221,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:0,4,0,4
chr19	52909303	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr19	52909989	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr19	52920006	.	C	CTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=43.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr19	52934839	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=181,14810;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:1,7,0,2
chr19	52938309	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=114,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:2,5,3,2
chr19	52940931	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,1,1
chr19	52941540	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,3:1,4:1,4,4,3
chr19	52941847	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=206,139;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:0|1:52941847_A_T:52941847:5,2,3,2
chr19	52941853	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=180,580;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.250:10:3,0:5,2:1|0:52941847_A_T:52941847:5,3,2,0
chr19	52941861	.	AA	GT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=194,580;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.270:9:3,0:3,1:1|0:52941847_A_T:52941847:5,2,2,0
chr19	52942734	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=170,174;MMQ=40,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr19	53015487	.	AG	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=184,201;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.434:14:4,3:4,3:3,5,2,4
chr19	53050992	.	GTTT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	53057040	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=162,152496;MMQ=60,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,3:6,0:6,9,0,3
chr19	53057807	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=228,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:1,2:3,8:3,1,7,3
chr19	53077258	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=200,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr19	53077515	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=221,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:1,3,2,2
chr19	53085699	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:10,5:7,0:9,8,3,2
chr19	53086637	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=218,109;MMQ=52,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:3,1:7,4:7,3,3,2
chr19	53209553	.	GG	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=219,157;MMQ=40,49;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:6,2:7,7:6,7,4,5
chr19	53345414	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=167,262;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,2:4,1:1,9,1,2
chr19	53454475	.	C	CACT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=81,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.750:26:3,9:3,11:1,5,7,13
chr19	53459364	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:5,0:14,2:3,16,0,2
chr19	53572059	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=194,195;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:2,5,1,2
chr19	53572725	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,1:3,1:5,3,0,2
chr19	53572868	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:8,6:6,0:9,5,5,1
chr19	53577620	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=155,155;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr19	53643497	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=245,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr19	53651845	.	T	TTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=186,306;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr19	53667637	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=190,163;MMQ=53,52;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr19	53668302	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=171,199;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:2,0:9,2:0|1:53668302_A_T:53668302:7,5,1,1
chr19	53668311	.	CC	TT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=165,199;MMQ=60,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:6,2:0|1:53668302_A_T:53668302:6,4,1,1
chr19	53668319	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=165,199;MMQ=60,45;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:6,2:0|1:53668302_A_T:53668302:6,4,1,1
chr19	53669653	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=182,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr19	53747167	.	CTTCACCAAGTGG	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,1:3,1:6,12,0,2
chr19	53754662	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=199,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:3,1,1,0
chr19	53754736	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,6:0,2:0,3,5,3
chr19	53761591	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=186,228;MMQ=40,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr19	53761606	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=215,186;MMQ=42,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr19	53770349	.	C	CTCATTAAGGCTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=307,63;MMQ=52,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr19	53770764	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=175,123;MMQ=50,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:1,1,3,2
chr19	53770799	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=107,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:7,5,1,1
chr19	53793083	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=106,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,3:4,6:2,3,3,6
chr19	53794858	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=217,168;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,4:1,2:1,5,0,6
chr19	53794901	.	AGT	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=216,273;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GT;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr19	53794956	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	53901350	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=141,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,3:2,4:1,2,3,4
chr19	53910912	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=257,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:2,0,5,1
chr19	53912242	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,103;MMQ=60,52;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:2,5:2,5:1,3,7,3
chr19	53959804	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,2:5,2:4,6,2,2
chr19	53993551	.	T	TTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TG;STR;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr19	54072757	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr19	54080494	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:54080494_G_A:54080494:10,6,1,1
chr19	54080502	.	C	CATTTATTCATGTGTCTG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=159,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:10,2:0|1:54080494_G_A:54080494:11,6,1,1
chr19	54081132	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,162;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,3:7,0:5,9,3,0
chr19	54172317	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,238;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	54182249	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=148,187;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,1,4
chr19	54183107	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,129;MMQ=60,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:4,8:4,0:8,0,8,0
chr19	54185306	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=224,210;MMQ=50,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.627:6:2,0:0,4:0|1:54185306_A_G:54185306:2,0,4,0
chr19	54185311	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:54185306_A_G:54185306:0,0,5,1
chr19	54188219	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=124,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:1,5:2,4:2,1,6,3
chr19	54191869	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,0:2,4:3,3,1,3
chr19	54194080	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=167,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:4,2,3,0
chr19	54197633	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=111,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:0,2:2,4:2,0,4,2
chr19	54197761	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=114,318;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:7,2:0,0:2,5,1,1
chr19	54198559	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=128,208;MMQ=60,58;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:1,1:7,1:2,6,0,2
chr19	54201756	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=188,138;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,2:10,0:6,8,1,1
chr19	54209600	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=87,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr19	54211903	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=195,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:2,0,5,2
chr19	54219769	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr19	54224285	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=82,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.363:10:4,1:3,1:4,3,2,1
chr19	54230331	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=215,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr19	54234353	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,2:5,3:2,3,2,3
chr19	54238305	.	CTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr19	54240088	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,0:6,3:3,11,0,3
chr19	54242693	.	G	GCTGACCGTGGTAATA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=201,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,2:4,3:2,7,2,5
chr19	54244721	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=171,127;MMQ=60,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:2,3,1,3
chr19	54245744	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=188,202;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:3,3,2,0
chr19	54245839	.	A	AGT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=229,185;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.325:7:2,1:3,1:5,0,1,1
chr19	54245872	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=179,20465;MMQ=52,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,0:5,4:6,2,0,4
chr19	54257185	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:54257185_C_G:54257185:0,0,5,0
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chr19	54261644	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=114,203;MMQ=52,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr19	54261669	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr19	54264352	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=109,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:2,3,4,0
chr19	54265779	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=198,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr19	54265789	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=244,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:0|1:54265789_C_G:54265789:0,5,0,2
chr19	54265790	.	C	CTGTGCAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=244,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:54265789_C_G:54265789:0,5,0,2
chr19	54304706	.	T	TGAGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=124,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	54304711	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=110,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:54304711_TT_AA:54304711:0,1,0,1
chr19	54304715	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54304711_TT_AA:54304711:0,0,0,1
chr19	54310961	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	54313827	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=181,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,2:3,0:6,2,0,2
chr19	54314585	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	54378010	.	TTC	T	.	.	DP=39;ECNT=7;MBQ=29,29;MFRL=105,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,9:0.284:33:14,3:10,6:0|1:54378010_TTC_T:54378010:9,15,2,7
chr19	54378025	.	CTTTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=24,19,31,25;MFRL=101,65,248,134;MMQ=60,42,60,59;MPOS=17,27,19;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=22,18,19,21;RU=T;STR;TLOD=3.18,5.60,10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,2,3,4:0.140,0.208,0.263:20:3,0,1,1:4,0,2,1:3,8,2,7
chr19	54378030	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=237,127;MMQ=60,49;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.730:20:3,3:2,6:0,5,5,10
chr19	54378032	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=29,21;MFRL=128,248;MMQ=49,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.184:19:6,1:10,2:5,11,0,3
chr19	54378035	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=128,134;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.392:26:9,2:6,4:0|1:54378010_TTC_T:54378010:7,9,3,7
chr19	54378082	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=30,29;MFRL=179,185;MMQ=40,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:3,4,1,3
chr19	54378099	.	GA	AG	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=196,179;MMQ=60,40;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,4:1,2,2,3
chr19	54378453	.	CGTGTGTGTGTGTGT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=208,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,9;RU=GT;STR;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.732:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr19	54378795	.	G	T,GA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,10,35;MFRL=0,126,80;MMQ=60,60,60;MPOS=21,23;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.258,0.263:5:0,0,1:0,0,1:0,0,2,3
chr19	54378926	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=261,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:54378926_A_G:54378926:0,4,0,1
chr19	54378928	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,23;MFRL=261,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:54378926_A_G:54378926:0,4,0,1
chr19	54378930	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=261,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:54378926_A_G:54378926:0,4,0,1
chr19	54378946	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=295,275;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:54378946_T_TA:54378946:0,3,0,1
chr19	54378948	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,16;MFRL=295,275;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:54378946_T_TA:54378946:0,3,0,1
chr19	54378951	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,25;MFRL=295,275;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:54378946_T_TA:54378946:0,3,0,1
chr19	54379515	.	GAT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AT;STR;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:3,3:0,2:2,1,1,4
chr19	54379775	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=236,260;MMQ=59,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr19	54385437	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	54387313	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	54392851	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,12;MFRL=154,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr19	54395098	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:3,4,0,4
chr19	54403703	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=205,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:3,3,0,4
chr19	54418549	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr19	54445594	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	54483337	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=151,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.321:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr19	54483339	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=76,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr19	54501557	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=112,48;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:2,3,2,0
chr19	54544177	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=198,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,0:4,3:3,5,2,1
chr19	54544189	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=187,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,1:4,4:3,4,2,3
chr19	54545084	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:1,2:8,1:6,4,2,1
chr19	54545274	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=175,270;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:1,8,0,2
chr19	54545390	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=202,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:2,2,3,1
chr19	54545531	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=81,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:0,4:5,4:2,3,5,3
chr19	54561606	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:7,7,0,2
chr19	54562080	.	GAT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=147,91;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr19	54566901	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,1:3,2:4,0,4,0
chr19	54603130	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:7,1:2,3:0,9,0,4
chr19	54604194	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:0,7,0,4
chr19	54606405	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=197,225;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:5,1,3,1
chr19	54608928	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:8,8,2,0
chr19	54609170	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	54609178	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr19	54609301	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,1:8,4:7,4,2,3
chr19	54611287	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=204,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr19	54611560	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:2,2:4,2,4,1
chr19	54613551	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,105;MMQ=60,58;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:2,5,0,2
chr19	54622128	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=139,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.434:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr19	54627039	.	GCACA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,12;MFRL=171,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=CA;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:1,0:2,0:2,2,0,1
chr19	54627097	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr19	54627805	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=15,12;MFRL=215,230;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:0,0:0,0:1,0,2,0
chr19	54627817	.	T	TCTGGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54627817_T_TCTGGG:54627817:0,0,1,0
chr19	54627820	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:54627817_T_TCTGGG:54627817:0,0,1,0
chr19	54631659	.	C	CGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=206,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:54631659_C_CGG:54631659:0,2,1,0
chr19	54631662	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=206,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:2,0:0,0:0|1:54631659_C_CGG:54631659:1,3,1,0
chr19	54632352	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr19	54632423	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:3,2,1,1
chr19	54656661	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=123,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,3:6,3:5,6,5,1
chr19	54657877	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=210,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr19	54664752	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=175,190;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,3:4,7:4,5,3,7
chr19	54666060	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=197,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr19	54666357	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,5:2,6:2,1,7,4
chr19	54666493	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=115,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:17,2:9,0:14,12,2,0
chr19	54667709	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr19	54672460	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=283,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,1:1,5:0,2,3,3
chr19	54676872	.	GGCCAGGGGCAGGTGT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=175,239;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.504:6:1,2:2,1:1,2,0,3
chr19	54687334	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=186,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:2,0,5,1
chr19	54691225	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,8:2,1:1,4,1,8
chr19	54691979	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=174,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,1:0,4:5,0,4,1
chr19	54695163	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:3,2:2,3:4,1,2,3
chr19	54704997	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=188,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,3:2,5:6,0,7,1
chr19	54705207	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=185,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:6,8:4,4:4,6,5,7
chr19	54711258	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:7,10:7,8:10,4,10,8
chr19	54721410	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=207,178;MMQ=40,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr19	54721421	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=207,193;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr19	54722594	.	TG	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=136,290;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:2,0:4,3:5,5,3,0
chr19	54723118	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=118,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,2:8,0:10,7,2,0
chr19	54723885	.	C	CCCGGGTTCAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=169,268;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr19	54725019	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=115,172;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:3,5,1,3
chr19	54725995	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=235,196;MMQ=60,55;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,0:3,3:6,2,1,2
chr19	54726023	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=177,212;MMQ=39,58;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:2,3,3,3
chr19	54726562	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,25;MFRL=322,252;MMQ=21,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:54726562_G_T:54726562:1,0,1,0
chr19	54726566	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=322,252;MMQ=21,27;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:54726562_G_T:54726562:1,0,1,0
chr19	54726571	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,26;MFRL=316,252;MMQ=24,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:54726562_G_T:54726562:2,0,1,0
chr19	54726577	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=316,252;MMQ=24,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:54726562_G_T:54726562:2,0,1,0
chr19	54726581	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=316,252;MMQ=24,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:54726562_G_T:54726562:2,0,1,0
chr19	54726586	.	GT	TG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,25;MFRL=316,252;MMQ=24,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:54726562_G_T:54726562:2,0,1,0
chr19	54726665	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=259,200;MMQ=27,27;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr19	54726701	.	G	GTCC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=212,200;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCC;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:2,1:0|1:54726701_G_GTCC:54726701:5,0,2,0
chr19	54726711	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=200,200;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0|1:54726701_G_GTCC:54726701:4,0,2,0
chr19	54735495	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:6,0,2,0
chr19	54742999	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=190,151;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.411:15:0,3:9,3:0|1:54742999_C_A:54742999:5,4,0,6
chr19	54743004	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=190,151;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:0,3:9,3:0|1:54742999_C_A:54742999:5,4,0,6
chr19	54744104	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=124,140;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:5,5,2,0
chr19	54744654	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=248,198;MMQ=40,34;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:0,1:1,0:1,0,2,0
chr19	54744771	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=137,224;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:9,2:14,1:0|1:54744771_A_G:54744771:12,13,2,1
chr19	54744777	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=137,193;MMQ=60,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:9,3:16,1:0|1:54744771_A_G:54744771:12,13,2,2
chr19	54754865	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,122;MMQ=60,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	54755860	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,147;MMQ=52,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,3,1
chr19	54755994	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr19	54756024	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=165,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:2,2,1,1
chr19	54756118	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr19	54756142	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=163,277;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:54756142_T_C:54756142:3,1,1,0
chr19	54756146	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=22,12;MFRL=163,277;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:54756142_T_C:54756142:3,1,1,0
chr19	54756155	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=257,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:1,1,3,1
chr19	54756302	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr19	54756657	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr19	54759102	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=187,170;MMQ=27,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0|1:54759102_G_A:54759102:0,1,4,3
chr19	54759110	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,41;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:54759102_G_A:54759102:0,0,4,4
chr19	54779797	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:11,0:6,4:8,9,1,3
chr19	54779909	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=96,365;MMQ=60,55;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,1:3,2:2,6,0,3
chr19	54780394	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=181,404;MMQ=50,27;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:54780394_AC_A:54780394:2,0,1,0
chr19	54780398	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=207,404;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:0|1:54780394_AC_A:54780394:2,1,1,0
chr19	54781364	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=178,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:2,1,4,0
chr19	54781509	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=175,220;MMQ=40,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:0,5:4,3:2,2,2,6
chr19	54781569	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=217,210;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,1,1
chr19	54781843	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=177,173;MMQ=52,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:3,3:5,5:1,7,3,5
chr19	54782327	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=125,231;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:4,6,0,5
chr19	54782420	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=129,190;MMQ=58,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:0,1:4,1:2,3,1,1
chr19	54782620	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=195,361;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.472:6:2,1:1,0:3,0,3,0
chr19	54783128	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=163,260;MMQ=58,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:4,0:4,2:5,4,1,1
chr19	54783156	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=170,135;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,6:4,0:7,3,6,0
chr19	54801910	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=171,223;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:54801910_A_G:54801910:5,2,1,1
chr19	54801916	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=171,223;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:54801910_A_G:54801910:5,2,1,1
chr19	54802105	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:7,5,0,2
chr19	54803030	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=125,237;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,2:6,2:7,4,3,1
chr19	54803068	.	GC	AT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=142,256;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:7,1:11,4:10,8,4,1
chr19	54803483	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=158,232;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:2,2,0,3
chr19	54803504	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=175,232;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:2,6,0,3
chr19	54803621	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=115,229;MMQ=49,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,1:8,2:8,5,1,2
chr19	54804573	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=98,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:2,1:6,5:4,5,5,1
chr19	54804745	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=192,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:54804745_G_A:54804745:0,3,0,1
chr19	54804748	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=192,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:54804745_G_A:54804745:0,3,0,1
chr19	54804750	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,35;MFRL=187,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,0:2,1:1|0:54804745_G_A:54804745:0,3,0,1
chr19	54804752	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=187,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,0:3,1:1|0:54804745_G_A:54804745:0,3,0,1
chr19	54804755	.	AG	CT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=218,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:54804745_G_A:54804745:0,3,0,1
chr19	54823533	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=167,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:5,0,3,2
chr19	54824177	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=99,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr19	54848032	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=250,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr19	54848507	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=182,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:1,3:4,0:0|1:54848507_T_C:54848507:0,5,1,3
chr19	54848512	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=179,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0|1:54848507_T_C:54848507:0,4,1,3
chr19	54848590	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=195,159;MMQ=49,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr19	54848617	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=165,164;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:54848617_G_C:54848617:3,0,1,0
chr19	54848620	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=166,164;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:54848617_G_C:54848617:4,0,1,0
chr19	54849566	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=167,250;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:5,3:0,7,2,1
chr19	54870114	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=139,95;MMQ=60,44;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:7,9:6,0:9,4,9,0
chr19	54872687	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.157:36:20,5:11,0:0|1:54872687_G_A:54872687:17,14,5,0
chr19	54872690	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=169,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:33,3:0.104:36:21,3:11,0:1|0:54872687_G_A:54872687:22,11,0,3
chr19	54876324	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=176,192;MMQ=52,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.581:17:6,5:1,5:3,4,6,4
chr19	54881780	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=170,181;MMQ=33,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,0:5,2:5,1,2,0
chr19	54930394	.	GC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:3,10,0,2
chr19	54937593	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=191,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr19	54941046	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:4,1,1,1
chr19	54942419	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=50,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,1:2,3:2,2,1,3
chr19	54947646	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=196,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr19	54962467	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=230,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:2,8:1,5:1,2,9,4
chr19	54964019	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=144,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.585:10:2,1:2,5:0|1:54964019_C_T:54964019:0,4,0,6
chr19	54964020	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=173,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,4:0.356:12:3,2:5,2:1|0:54964019_C_T:54964019:0,8,0,4
chr19	54965527	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr19	54965860	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=193,244;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr19	54965889	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr19	54966579	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.815:25:2,13:2,7:2,2,11,10
chr19	54969075	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.317:13:6,0:3,3:3,6,2,2
chr19	54971897	.	C	CCG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,35;MFRL=100,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:1,3:2,0:0|1:54971897_C_CCG:54971897:0,3,3,0
chr19	54971898	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=100,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:1,3:2,0:0|1:54971897_C_CCG:54971897:0,3,3,0
chr19	54971902	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,16;MFRL=102,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:1,1:2,0:0|1:54971897_C_CCG:54971897:0,4,2,0
chr19	54972982	.	GCCCT	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=110,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCCT;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.127:21:9,1:7,1:2,17,1,1
chr19	54973988	.	GCCT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:4,0,1,3
chr19	55009497	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=144,137;MMQ=51,27;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,4:5,2:2,8,2,4
chr19	55019402	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=221,129;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:1,1,4,2
chr19	55019438	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr19	55044228	.	TTC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TC;STR;TLOD=74.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,7:0,11:0,0,9,9
chr19	55044241	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26,32;MFRL=152,186,185;MMQ=60,60,60;MPOS=25,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.45,6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,3:0.174,0.253:13:3,1,0:4,1,2:4,4,3,2
chr19	55044387	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=130,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,5:0,9:0,1,1,13
chr19	55047999	.	GAAAAAAA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=173,113;MMQ=57,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=21,14;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr19	55048036	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=153,173;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:3,0:5,2,2,0
chr19	55049066	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55049066_G_A:55049066:0,0,1,0
chr19	55049070	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=199,226;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:55049066_G_A:55049066:2,0,1,0
chr19	55049074	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=199,226;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:55049066_G_A:55049066:2,0,1,0
chr19	55049088	.	A	AAAAGAAAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=AAAG;STR;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr19	55085304	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=116,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:6,3,1,2
chr19	55086106	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=232,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:5,0,5,1
chr19	55086169	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=162,318;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,1:5,1:7,2,2,0
chr19	55098669	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=125,69;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:10,5:6,0:8,9,4,1
chr19	55107216	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:7,4,0,2
chr19	55107774	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=185,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,2:12,0:9,9,0,2
chr19	55142623	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=168,224;MMQ=50,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:9,7,1,1
chr19	55142861	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=216,235;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:3,3,1,2
chr19	55143839	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=132,254;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:55143839_T_A:55143839:2,1,0,2
chr19	55143849	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=132,254;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:3,0:0,1:0|1:55143839_T_A:55143839:2,1,0,2
chr19	55143982	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=114,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,3:6,1:8,6,4,0
chr19	55144100	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,202;MMQ=40,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.227:29:12,6:10,0:16,7,5,1
chr19	55144289	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=179,300;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr19	55144556	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:7,1:3,10,0,2
chr19	55144623	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=162,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:6,4:13,1:11,8,3,2
chr19	55144684	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=143,270;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:9,1:5,1:9,6,1,1
chr19	55144710	.	AG	TC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=143,270;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,1:7,1:0|1:55144710_AG_TC:55144710:12,9,1,1
chr19	55144720	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=143,270;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,1:8,1:0|1:55144710_AG_TC:55144710:11,7,1,1
chr19	55145058	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=170,244;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,1:10,2:12,6,2,1
chr19	55145093	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=114,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:9,2:9,3:10,8,2,3
chr19	55145454	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=169,237;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:9,2:11,1:11,9,0,3
chr19	55145481	.	CG	GA,GG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,34,33;MFRL=174,195,190;MMQ=60,58,48;MPOS=26,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.28,13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,2,5:0.115,0.231:23:5,0,2:11,2,3:7,9,2,5
chr19	55146036	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=167,236;MMQ=30,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:4,2,2,0
chr19	55146070	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=149,243;MMQ=36,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0|1:55146070_C_T:55146070:2,2,3,0
chr19	55146076	.	CA	TG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=154,243;MMQ=39,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0|1:55146070_C_T:55146070:1,2,3,0
chr19	55147844	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=272,276;MMQ=52,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55147844_G_A:55147844:1,0,1,0
chr19	55147850	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,15;MFRL=272,276;MMQ=52,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:55147844_G_A:55147844:1,0,1,0
chr19	55174895	.	C	CAAAAAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=27,34;RU=A;STR;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.787:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr19	55176535	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,1:1,1:5,2,2,0
chr19	55176702	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:5,3:0,0:3,3,0,3
chr19	55176705	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=160,263;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:5,2:0,0:1,5,2,1
chr19	55178222	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=157,161;MMQ=60,47;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:7,1:3,3:6,5,1,3
chr19	55236069	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=136,219;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,1:7,2:3,10,3,0
chr19	55236631	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	55236800	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=178,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:6,2:1,2:0,8,0,4
chr19	55237870	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	55239223	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=198,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:2,5,1,3
chr19	55240919	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=226,124;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr19	55240951	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=270,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr19	55246904	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=175,205;MMQ=50,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr19	55253521	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=163,172;MMQ=40,53;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:4,6,1,1
chr19	55253544	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,36;MFRL=152,163;MMQ=57,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,1:7,0:0|1:55253544_A_G:55253544:5,8,2,0
chr19	55253552	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=150,168;MMQ=57,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:6,2:7,1:0|1:55253544_A_G:55253544:6,8,2,1
chr19	55263802	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=211,200;MMQ=40,44;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,0:4,4:4,3,3,1
chr19	55263898	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=103,128;MMQ=40,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,5:3,4:4,5,4,5
chr19	55282351	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=126,143;MMQ=52,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,6:6,0:4,9,4,2
chr19	55286541	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	55294484	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr19	55294926	.	CA	TG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=249,114;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:4,4,4,3
chr19	55298081	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=144,96;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:2,2:12,0:5,9,2,0
chr19	55299822	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=123,103;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:12,0:6,3:8,11,0,3
chr19	55301595	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,1:7,1:5,5,2,0
chr19	55301617	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=124,176;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:2,2:10,2:6,6,3,1
chr19	55315307	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=168,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:5,6:10,1:9,6,3,4
chr19	55315334	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=123,107;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,3:10,0:8,10,3,0
chr19	55315440	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=209,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,1:1,5:0,1,1,5
chr19	55317439	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=270,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:3,0:3,3:4,2,3,0
chr19	55317456	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=193,209;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:8,1,1,1
chr19	55320200	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,1:6,1:11,2,2,0
chr19	55320239	.	G	GAA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=170,129;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,4:6,0:8,4,3,1
chr19	55320279	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=306,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:1,10:3,4:3,1,7,7
chr19	55324566	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=255,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:6,4:1,4:5,2,4,4
chr19	55324674	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=253,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.781:12:1,4:1,5:0,2,6,4
chr19	55325240	.	GA	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=157,88;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,2,0
chr19	55327891	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=163,216;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,0:5,3:6,0,3,0
chr19	55327930	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=196,178;MMQ=41,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:2,2:9,2:6,5,4,0
chr19	55327960	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=194,169;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:4,3:10,1:6,8,2,2
chr19	55328084	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=196,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:1,6:3,1:1,4,0,7
chr19	55328959	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=204,126;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,1:0,11:1,0,9,3
chr19	55328973	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=174,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,1:5,6:4,4,4,3
chr19	55328993	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=178,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:1,4:2,10:1,2,8,6
chr19	55329117	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=280,180;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:1,6,0,4
chr19	55341753	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=117,171;MMQ=56,43;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,2:1,4:2,2,1,5
chr19	55346409	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0|1:55346409_T_A:55346409:0,0,5,1
chr19	55346424	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=197,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:2,1:5,2:0|1:55346409_T_A:55346409:6,1,3,0
chr19	55346631	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=157,212;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:2,7,1,2
chr19	55346658	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=212,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr19	55349264	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,5:4,2:3,4,4,3
chr19	55349273	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,2:5,1:6,5,1,2
chr19	55350948	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=189,159;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.591:13:1,2:4,4:4,1,5,3
chr19	55350979	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:3,6:5,5:5,3,7,4
chr19	55351022	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=196,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,3:5,1:4,6,3,1
chr19	55359272	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=161,176;MMQ=52,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,6:0,5:0,1,7,4
chr19	55359436	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=194,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,3:3,6:0|1:55359436_G_C:55359436:3,2,2,7
chr19	55359444	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=194,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.600:18:4,5:3,6:0|1:55359436_G_C:55359436:5,2,2,9
chr19	55362719	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=195,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,7:2,4:1,1,3,8
chr19	55365240	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=129,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,0:6,3:5,5,1,2
chr19	55365527	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=211,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,3:1,0:1,0,0,3
chr19	55377211	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:5,0,3,0
chr19	55377813	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=188,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:10,5:3,5:2,11,5,5
chr19	55378083	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=224,142;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:4,3,4,2
chr19	55386858	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr19	55386890	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=303,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr19	55386920	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=256,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr19	55396613	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr19	55399311	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=255,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.702:8:0,4:2,2:0|1:55399311_G_T:55399311:2,0,6,0
chr19	55399314	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=206,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0|1:55399311_G_T:55399311:6,0,2,0
chr19	55399643	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:2,1,3,4
chr19	55399684	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=191,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,5:1,0:4,3,2,3
chr19	55417469	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=241,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:3,0:0,2:4,0,1,1
chr19	55421293	.	CAAAAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=158,0;MMQ=60,29;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=23,17;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.510:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr19	55423488	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=125,66;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,1:3,2:4,7,3,0
chr19	55438940	.	AAAAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=114,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,3,0
chr19	55439166	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr19	55439197	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr19	55444906	.	GCA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=204,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CA;STR;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,2:3,1:5,4,3,0
chr19	55447572	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=228,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:3,0,5,2
chr19	55450837	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=169,186;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:4,4,1,1
chr19	55451083	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=183,236;MMQ=27,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,3:3,2:4,5,3,2
chr19	55489230	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=160,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr19	55493095	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=201,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,2:2,1:0,9,1,2
chr19	55494651	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=145,130;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:5,3,1,1
chr19	55497462	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=173,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:6,2,2,0
chr19	55501427	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=59,73;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,1:3,1:3,9,1,1
chr19	55512316	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr19	55526345	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0|1:55526345_T_G:55526345:0,0,7,4
chr19	55526359	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0|1:55526345_T_G:55526345:0,0,9,4
chr19	55526373	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:1,5:4,0:0|1:55526345_T_G:55526345:4,1,3,2
chr19	55527171	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=200,243;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:55527171_G_A:55527171:0,4,0,1
chr19	55527189	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55527171_G_A:55527171:0,0,0,1
chr19	55529933	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	55539187	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,198;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,1:9,1:7,8,0,2
chr19	55543973	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=66,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr19	55549731	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=211,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55549731_C_T:55549731:0,1,0,1
chr19	55549733	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=211,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55549731_C_T:55549731:0,1,0,1
chr19	55549734	.	A	AGCAGGTCTCCTGTTAGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=211,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55549731_C_T:55549731:0,1,0,1
chr19	55560202	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=164,238;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr19	55570742	.	C	CTTATAGTATTTGTTCAAATATTATTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=314,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	55591721	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,1,2
chr19	55593417	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=177,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,6:1,3:2,1,8,1
chr19	55597369	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:4,3:6,0:6,5,1,2
chr19	55598000	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,15;MFRL=225,269;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.382:6:3,0:0,0:0|1:55598000_A_C:55598000:2,2,2,0
chr19	55598004	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,19;MFRL=225,269;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.382:6:2,0:0,1:0|1:55598000_A_C:55598000:2,2,2,0
chr19	55598011	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=172,269;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:0,1:0|1:55598000_A_C:55598000:3,2,2,0
chr19	55598016	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=195,269;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:0,1:0|1:55598000_A_C:55598000:2,2,2,0
chr19	55603388	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=242,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr19	55610066	.	CG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,2:1,5:3,0,5,2
chr19	55614760	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:7,5:8,1:9,6,5,1
chr19	55648430	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=16,24;MFRL=214,288;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.407:5:0,1:1,0:0|1:55648430_A_AC:55648430:3,0,2,0
chr19	55648432	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=15,29;MFRL=214,288;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.407:5:0,1:1,1:0|1:55648430_A_AC:55648430:3,0,2,0
chr19	55648436	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=15,12;MFRL=214,264;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,0:0|1:55648430_A_AC:55648430:3,0,1,0
chr19	55648438	.	G	GGC	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=24,28;MFRL=267,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:1,1:0|1:55648438_G_GGC:55648438:2,0,1,0
chr19	55648442	.	CTA	C	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=31,12;MFRL=267,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:55648438_G_GGC:55648438:2,0,1,0
chr19	55648450	.	CGAG	C	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=32,32;MFRL=135,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:55648438_G_GGC:55648438:2,0,1,0
chr19	55648457	.	CC	TT	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=18,23;MFRL=87,269;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.428:3:0,0:1,1:2,0,1,0
chr19	55648460	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=29,26;MFRL=135,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:55648438_G_GGC:55648438:2,0,1,0
chr19	55648462	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=22,32;MFRL=139,174;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:55648438_G_GGC:55648438:3,0,1,0
chr19	55648465	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=28,23;MFRL=139,174;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:55648438_G_GGC:55648438:3,0,1,0
chr19	55653297	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,5:4,0:2,3,2,3
chr19	55665584	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr19	55667500	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,3:2,7:4,0,8,2
chr19	55667879	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=113,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.570:5:0,0:2,0:0|1:55667879_A_C:55667879:1,1,3,0
chr19	55667881	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,15;MFRL=113,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.570:5:0,0:2,0:0|1:55667879_A_C:55667879:1,1,3,0
chr19	55667883	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,10;MFRL=113,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.570:5:0,0:2,1:0|1:55667879_A_C:55667879:1,1,3,0
chr19	55667885	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,8;MFRL=113,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.570:5:0,0:2,0:0|1:55667879_A_C:55667879:1,1,3,0
chr19	55668722	.	C	CCTGT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTGT;STR;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,4:3,1:0,3,1,4
chr19	55668805	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=194,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,3:0,3:1,0,4,2
chr19	55669033	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=146,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:0|1:55669033_C_G:55669033:4,5,1,1
chr19	55669035	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=157,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:4,0:0|1:55669033_C_G:55669033:4,6,1,1
chr19	55669037	.	TGAC	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=167,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,1:4,0:0|1:55669033_C_G:55669033:4,5,1,1
chr19	55670825	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:6,7:11,3:7,10,3,7
chr19	55670989	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:3,2,1,4
chr19	55671973	.	AGTCCCTGGCTTACCTGTTGTT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:4,2:1,0:3,2,0,2
chr19	55672055	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=199,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,5:1,0:0,1,2,4
chr19	55672156	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=19,27;MFRL=49872953,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:0,1:1,0,0,2
chr19	55672388	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,300;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:55672388_A_G:55672388:0,0,2,0
chr19	55672394	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=117,300;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:55672388_A_G:55672388:1,0,2,0
chr19	55672400	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=19,24;MFRL=173,220;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:0,1:0|1:55672388_A_G:55672388:1,1,1,0
chr19	55672601	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr19	55672846	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=246,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,6:1,4:0,1,0,10
chr19	55673145	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=227,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr19	55673654	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=95,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,6:0,1:1,2,2,5
chr19	55677490	.	GG	TA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=158,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:55677490_GG_TA:55677490:0,4,0,1
chr19	55677500	.	TCC	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=171,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:55677490_GG_TA:55677490:0,4,0,1
chr19	55677504	.	C	CTTT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,21;MFRL=171,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:55677490_GG_TA:55677490:0,4,0,1
chr19	55677506	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=171,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:55677490_GG_TA:55677490:0,4,0,1
chr19	55677509	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,22;MFRL=171,93;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:55677490_GG_TA:55677490:0,4,0,1
chr19	55677523	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr19	55686083	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=177,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,5:5,2:2,5,3,4
chr19	55686148	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=164,242;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,3:7,5:7,1,5,3
chr19	55686230	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=108,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:2,4,1,5
chr19	55686414	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=129,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:55686414_G_T:55686414:0,2,1,1
chr19	55686417	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=129,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:55686414_G_T:55686414:0,2,1,1
chr19	55686495	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=196,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.572:7:1,4:1,0:2,1,4,0
chr19	55686523	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=285,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,2,0
chr19	55686705	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=240,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr19	55686986	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=128,209;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.654:9:1,2:1,4:3,0,6,0
chr19	55687352	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=236,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.712:12:1,4:2,4:3,0,4,5
chr19	55687497	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=109,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,5:2,3:1,2,3,5
chr19	55690424	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:1,0:8,2:1,8,1,1
chr19	55693123	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:7,1,4,1
chr19	55698983	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=196,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:5,3,0,2
chr19	55699575	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=175,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,2:1,6:2,2,3,5
chr19	55708209	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=193,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:55708209_C_A:55708209:0,4,0,1
chr19	55708212	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=193,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.293:5:3,0:1,1:0|1:55708209_C_A:55708209:0,4,0,1
chr19	55710021	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:4,6:2,2:4,2,3,5
chr19	55710074	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:7,3,3,1
chr19	55710348	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=202,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr19	55713530	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=137,198;MMQ=60,50;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:8,2:7,0:0|1:55713530_G_T:55713530:6,9,0,2
chr19	55713535	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=253,137;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,15:0.800:18:2,8:1,7:0|1:55713530_G_T:55713530:2,1,6,9
chr19	55713739	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=60,110;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:0,4,1,2
chr19	55715090	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=232,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr19	55715464	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:55715464_T_C:55715464:0,4,0,2
chr19	55715467	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.365:6:2,1:1,1:0|1:55715464_T_C:55715464:0,4,0,2
chr19	55716683	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=171,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,3:7,0:8,7,2,1
chr19	55739515	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=209,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:1,0,3,1
chr19	55741961	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=153,250;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,1,2
chr19	55751123	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=183,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:1,6:1,6:0,2,9,3
chr19	55751238	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=162,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:5,1:5,10,1,1
chr19	55776823	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr19	55777219	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=268,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:0,0:1,1:0,1,2,0
chr19	55815894	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.892:16:0,8:1,7:0,1,9,6
chr19	55815906	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=156,258;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,3:8,1:8,7,3,1
chr19	55816775	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=209,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,2:5,1:6,4,1,2
chr19	55817912	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=177,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55817912_G_A:55817912:0,1,0,1
chr19	55817915	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=177,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55817912_G_A:55817912:0,1,0,1
chr19	55823344	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,1,2
chr19	55831576	.	AA	CC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:3,2,1,3
chr19	55831589	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=226,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,1:2,1:2,2,2,1
chr19	55831723	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,7,11
chr19	55831830	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=199,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:15,0:2,3:6,11,1,2
chr19	55832427	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr19	55854079	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:0,0:0,2:0|1:55854079_G_C:55854079:1,0,3,0
chr19	55854082	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,12;MFRL=184,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,0:1,0:0|1:55854079_G_C:55854079:1,0,2,0
chr19	55854085	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=163,240;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:55854079_G_C:55854079:2,0,1,0
chr19	55854087	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=163,240;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:55854079_G_C:55854079:2,0,1,0
chr19	55854093	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=184,240;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:55854079_G_C:55854079:2,1,1,0
chr19	55854313	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr19	55855184	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,1:7,1:5,9,1,1
chr19	55856215	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=123,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr19	55857777	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=153,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:2,1:0,2:0,2,0,4
chr19	55865350	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=133,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,2,1
chr19	55869879	.	GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.388:11:2,2:1,2:0|1:55869879_GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT_G:55869879:4,3,3,1
chr19	55869892	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,6:0.891:6:0,2:0,3:1|0:55869879_GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT_G:55869879:0,0,3,3
chr19	55869903	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,7:0.902:7:0,2:0,5:1|0:55869879_GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT_G:55869879:0,0,4,3
chr19	55872191	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=70,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.638:20:2,6:5,7:4,3,6,7
chr19	55872864	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=110,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:1,7,1,4
chr19	55880385	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,0:1,3:0,1,0,4
chr19	55899602	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=242,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:1,10:6,2:4,3,5,7
chr19	55899631	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=187,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.241:18:10,3:3,1:5,9,2,2
chr19	55903158	.	C	CAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr19	55912946	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=186,160;MMQ=60,31;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,3:1,4:3,0,7,0
chr19	55949853	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=217,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr19	55951945	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,3:5,1:10,3,3,1
chr19	55966346	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=40,29;MFRL=135,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,2:4,0:18,0,2,0
chr19	55966971	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:6,1,2,2
chr19	55999993	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=135,239;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,2:8,1:7,10,2,1
chr19	56001802	.	C	CCCAAGCAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=209,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:5,1:2,1:1,6,1,1
chr19	56001871	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	56004932	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,280;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	56005006	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	56009191	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:2,4:0,3:2,0,5,3
chr19	56012381	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=127,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:6,1,4,0
chr19	56024563	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr19	56024599	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,2,3
chr19	56029465	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,4:0,10:0,0,9,10
chr19	56029595	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=102,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.327:10:0,1:6,2:1,6,0,3
chr19	56030419	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,1:0,3,0,2
chr19	56030428	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=210,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr19	56041255	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr19	56089499	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=176,43;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:7,0:0,1:0|1:56089499_G_T:56089499:2,5,1,1
chr19	56089503	.	C	CCTCCTCCATCGGATT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,16;MFRL=187,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,0:0,1:0|1:56089499_G_T:56089499:2,4,1,1
chr19	56089506	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=187,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,0:0,1:0|1:56089499_G_T:56089499:2,4,1,1
chr19	56104136	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.915:10:0,5:0,4:0,0,2,8
chr19	56154518	.	GTTT	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=171,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.501:18:5,4:4,5:0|1:56154518_GTTT_G:56154518:5,4,4,5
chr19	56154545	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=169,204;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,4:0.227:20:8,1:8,3:1|0:56154518_GTTT_G:56154518:5,11,3,1
chr19	56154877	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=208,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr19	56156082	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=151,35;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,2:9,0:16,4,1,1
chr19	56162881	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:3,7:3,1:1,5,4,5
chr19	56163738	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=166,79;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,3:5,0:6,5,2,1
chr19	56164150	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:3,0:4,4:0,8,0,4
chr19	56170771	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	56175147	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=201,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.663:13:1,7:3,1:0|1:56175147_C_A:56175147:2,2,3,6
chr19	56175149	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,8:0,3:0|1:56175147_C_A:56175147:0,0,5,8
chr19	56179803	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=195,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:4,0:2,2:3,4,2,0
chr19	56180407	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,13;MFRL=128,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.545:7:0,1:2,0:2,1,4,0
chr19	56180417	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=34,12;MFRL=143,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.490:8:0,1:2,0:0|1:56180417_G_C:56180417:2,2,4,0
chr19	56180419	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=165,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.345:9:2,0:2,0:0|1:56180419_A_C:56180419:4,2,3,0
chr19	56180426	.	GA	CC	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=157,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.443:9:3,0:2,1:0|1:56180417_G_C:56180417:3,2,4,0
chr19	56180432	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=26,18;MFRL=122,253;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,0:2,0:0|1:56180419_A_C:56180419:5,3,2,0
chr19	56185250	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.607:16:2,3:4,6:5,1,6,4
chr19	56200404	.	C	CCTCTGGTTAGTCCAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56200404_C_CCTCTGGTTAGTCCAT:56200404:0,0,0,1
chr19	56200406	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56200404_C_CCTCTGGTTAGTCCAT:56200404:0,0,0,1
chr19	56200824	.	C	CCATTTAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=222,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:56200824_C_CCATTTAT:56200824:0,2,0,1
chr19	56200827	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,21;MFRL=222,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:56200824_C_CCATTTAT:56200824:0,2,0,1
chr19	56203985	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=240,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr19	56206195	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=171,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:1,0:4,0:0|1:56206195_A_C:56206195:1,4,2,0
chr19	56206201	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=171,231;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:1,0:4,0:0|1:56206195_A_C:56206195:1,5,2,0
chr19	56228338	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=102,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	56244865	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.312:23:7,6:9,0:8,8,7,0
chr19	56249445	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:2,1:5,5:2,6,4,2
chr19	56273136	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr19	56273902	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=150,148;MMQ=24,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:0|1:56273902_C_A:56273902:2,0,7,0
chr19	56273904	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=150,148;MMQ=24,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:0|1:56273902_C_A:56273902:2,0,7,0
chr19	56274061	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=155,107;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:56274061_G_GT:56274061:0,2,0,1
chr19	56274062	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=155,107;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:56274061_G_GT:56274061:0,2,0,1
chr19	56303740	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=176,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:8,1:7,4:11,5,5,0
chr19	56307679	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=11,30;MFRL=202,290;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr19	56320200	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=211,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.402:15:3,4:6,1:5,4,4,2
chr19	56320916	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:5,1:2,8,2,0
chr19	56321414	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,7,6
chr19	56321447	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=174,21699418;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:2,5,2,0
chr19	56372705	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=187,193;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,6:6,0:6,2,5,1
chr19	56372719	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=189,193;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:5,3:8,0:8,5,3,0
chr19	56382152	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=225,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:2,1,2,1
chr19	56393051	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=183,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr19	56410175	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:5,2,1,1
chr19	56410340	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr19	56413583	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=204,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,0:1,6:0,3,3,3
chr19	56421861	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=194,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr19	56423033	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=133,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr19	56443519	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=216,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:0,2,1,2
chr19	56459703	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	56464058	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr19	56473645	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	56477676	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=135,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:8,2:3,0:0|1:56477676_G_C:56477676:5,7,1,1
chr19	56477678	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=135,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:3,0:0|1:56477676_G_C:56477676:5,7,1,1
chr19	56477679	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=135,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:3,0:0|1:56477676_G_C:56477676:5,7,1,1
chr19	56477687	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr19	56477710	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=120,180;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,3,1
chr19	56487430	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=145,291;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,4:2,0:0|1:56487430_G_A:56487430:5,0,4,0
chr19	56487450	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=115,291;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:6,2:1,0:0|1:56487430_G_A:56487430:4,3,2,0
chr19	56487603	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=121,177;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:7,2:11,3:7,11,2,3
chr19	56490778	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,10,10
chr19	56490943	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=192,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:3,3:2,2:2,4,2,3
chr19	56499345	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	56499347	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=253,235;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr19	56511082	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=152,243;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,3:1,6:2,1,5,4
chr19	56511090	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=243,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:6,3,1,2
chr19	56515334	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,210;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:1,2:5,1:3,3,1,2
chr19	56520091	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,2,1
chr19	56520129	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=36,30;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,2,1
chr19	56520150	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=181,69;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,1,1
chr19	56538203	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr19	56539873	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=146,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:0|1:56539873_A_C:56539873:3,4,1,1
chr19	56539874	.	T	TTA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=146,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:56539873_A_C:56539873:3,4,1,1
chr19	56539935	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr19	56544000	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=171,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:7,2,1,1
chr19	56544204	.	C	CCCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=234,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:56544204_C_CCCT:56544204:0,2,0,2
chr19	56544209	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=234,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0|1:56544204_C_CCCT:56544204:0,2,0,2
chr19	56561749	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	56565233	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=79,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:1,3,0,4
chr19	56569566	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:6,4,2,0
chr19	56569596	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=153,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,2:5,1:7,4,2,1
chr19	56569629	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=143,233;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,1:7,1:8,6,2,0
chr19	56572832	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=124,97;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:5,3:5,1:4,6,2,2
chr19	56599405	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	56599437	.	CTCG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCG;STR;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr19	56600527	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=266,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr19	56614652	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=188,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr19	56691912	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:4,5,2,0
chr19	56693643	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr19	56694454	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,0:2,2:7,1,2,0
chr19	56701424	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=137,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:4,0:12,2:8,8,1,1
chr19	56701792	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=180,139;MMQ=52,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:4,0:5,4:5,4,1,3
chr19	56733460	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,193;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:16,3:10,2:9,17,3,2
chr19	56734908	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=243,200;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,2:2,2:7,0,4,0
chr19	56901293	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr19	56918560	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:0,8:1,7:1,0,5,10
chr19	56918574	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,2,12
chr19	56918598	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr19	57023025	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=T;STR;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr19	57027606	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=222,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,7:1,3:1,0,10,0
chr19	57035672	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.316:14:7,2:3,2:9,1,4,0
chr19	57050648	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=214,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	57058886	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=151,220;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:12,5:10,0:13,9,5,0
chr19	57060317	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=203,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:6,3:1,5:7,0,8,0
chr19	57060573	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=101,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,1:1,2:0,1,0,4
chr19	57062073	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr19	57066843	.	ATTAG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTAG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	57085977	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=224,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,3:7,0:8,4,1,2
chr19	57089375	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=249,174;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,4:5,4:4,3,3,5
chr19	57132828	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.184:15:5,0:6,2:3,10,1,1
chr19	57135023	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=94,149;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:11,2:7,3:8,10,3,2
chr19	57184136	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=229,170;MMQ=58,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:1,1,5,1
chr19	57325727	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=211,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,2:7,3:7,5,3,2
chr19	57326129	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=166,278;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:5,0:11,3:12,4,0,3
chr19	57328683	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:2,6,2,0
chr19	57647373	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:4,6,0,2
chr19	57648433	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr19	57649900	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,1:5,4:3,7,3,2
chr19	57653864	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=215,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr19	57654065	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:0,3:1,7:1,0,3,7
chr19	57654104	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr19	57665821	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=122,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:2,2:7,2:3,6,2,2
chr19	57666658	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=125,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,0:2,2:1,6,1,1
chr19	57678738	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=124,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:3,7,2,0
chr19	57723007	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=88,152;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,14:0.653:21:4,6:3,8:0|1:57723007_G_C:57723007:5,2,5,9
chr19	57723013	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=88,152;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,14:0.652:21:4,5:3,8:0|1:57723007_G_C:57723007:5,2,5,9
chr19	57723737	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:5,2:7,5:6,6,3,4
chr19	57742472	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,6,4
chr19	57742489	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.931:12:0,3:0,9:0|1:57742489_C_T:57742489:0,0,4,8
chr19	57742493	.	AGGACGAGCAGGATT	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.931:12:0,3:0,7:0|1:57742489_C_T:57742489:0,0,4,8
chr19	57742514	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=186,204;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,3:1,6:2,1,0,9
chr19	57743039	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr19	57743067	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=125,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:2,1:2,3:3,1,4,1
chr19	57743334	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:2,3:2,2:3,1,6,0
chr19	57752326	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,10:7,2:6,5,5,7
chr19	57755508	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=233,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr19	57759960	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.502:16:2,6:6,2:6,2,4,4
chr19	57768897	.	CTT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=126,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=46.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:3,4:6,6:4,5,6,6
chr19	57769270	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=266,282;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:57769270_T_C:57769270:0,1,0,1
chr19	57769283	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,31;MFRL=282,266;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:57769270_T_C:57769270:0,1,0,1
chr19	57769296	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,22;MFRL=282,266;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:57769270_T_C:57769270:0,1,0,1
chr19	57769483	.	GCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACACCTAGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=191,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.174:17:1,3:2,0:13,1,2,1
chr19	57769805	.	G	GTTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=317,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,16;RU=T;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.820:7:0,4:1,2:0,1,1,5
chr19	57769896	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=36.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,8:0,4:0,0,3,9
chr19	57769994	.	C	CTTCCA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=205,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,1:4,3,5,2
chr19	57770911	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:57770911_G_A:57770911:0,3,0,1
chr19	57770913	.	TGC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:57770911_G_A:57770911:0,3,0,1
chr19	57770916	.	C	CTAGAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=207,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:57770911_G_A:57770911:0,2,0,1
chr19	57771602	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:10,4:15,0:12,13,4,0
chr19	57772069	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:2,6,2,1
chr19	57773718	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.614:12:2,3:1,1:4,1,3,4
chr19	57774102	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=131,154;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:8,2:6,3:0|1:57774102_T_A:57774102:4,10,2,3
chr19	57774106	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=123,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,4:0.249:18:9,0:5,4:1|0:57774102_T_A:57774102:6,8,0,4
chr19	57795982	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=134,59;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,1:13,1:13,11,0,2
chr19	57802024	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	57832214	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:7,2:7,3:0|1:57832214_G_T:57832214:8,6,5,0
chr19	57832219	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,9:0.454:20:5,5:6,4:1|0:57832214_G_T:57832214:9,2,5,4
chr19	57834963	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=222,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:8,1:2,4:10,0,5,0
chr19	57835252	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=249,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr19	57863149	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=159,297;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr19	57865082	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=110,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,1:0,9:0,1,1,9
chr19	57867599	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,1:8,2:7,9,0,3
chr19	57883371	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=239,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:0,2,0,5
chr19	57901422	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=229,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,5:2,1:3,0,2,4
chr19	57911221	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=197,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:1,5,0,4
chr19	57922664	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,5:1,6:3,0,9,2
chr19	57929245	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,15;MFRL=181,219;MMQ=60,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:6,0:7,0:5,9,2,0
chr19	57932123	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=159,118;MMQ=60,46;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.239:26:12,0:6,5:8,12,0,6
chr19	57932132	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=164,118;MMQ=60,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.310:23:9,0:6,0:9,7,0,7
chr19	57954619	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=151,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:0|1:57954619_G_A:57954619:6,3,2,0
chr19	57954628	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=184,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,10:0.688:14:3,6:1,4:0|1:57954619_G_A:57954619:3,1,7,3
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chr19	57987895	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.383:11:2,2:5,2:0|1:57987895_C_T:57987895:5,2,4,0
chr19	57987905	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=196,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,6:0.437:14:4,1:4,5:1|0:57987895_C_T:57987895:8,0,4,2
chr19	57988666	.	A	AGCC	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=185,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GCC;STR;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.449:29:7,6:9,5:5,11,4,9
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chr19	58003580	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=205,150;MMQ=60,51;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:2,7:2,5:3,1,9,3
chr19	58003613	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=268,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,5:1,2:1,3,3,4
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chr19	58011421	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=214,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:8,2:4,2:6,6,2,2
chr19	58015981	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,261;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,3:5,1:5,1,3,1
chr19	58017659	.	C	CAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=178,254;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:3,0,1,0
chr19	58018618	.	ACCTTTTAAGTGCAATGAATGTGGGAGATTCTTTAGTGAGAATTCCAGCCTTGTTAAACATCAGAGGGTTCACACTGGAGCAAAG	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.064:48:11,2:10,0:22,24,1,1
chr19	58018848	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0,9,0,2
chr19	58024328	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=85,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:5,2,1,1
chr19	58058246	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=194,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr19	58089521	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,8:3,4:0,6,5,7
chr19	58090074	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,0:5,3:1,8,2,1
chr19	58102442	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=161,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:7,0:7,3:8,7,2,1
chr19	58118715	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=19,23;MFRL=0,147;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,0:0,1:0|1:58118715_CT_C:58118715:0,1,0,1
chr19	58118740	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=175,147;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:58118715_CT_C:58118715:0,3,0,1
chr19	58118742	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=175,147;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:58118715_CT_C:58118715:0,3,0,1
chr19	58118744	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=175,147;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:58118715_CT_C:58118715:0,3,0,1
chr19	58118748	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,35;MFRL=175,147;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:58118715_CT_C:58118715:0,3,0,1
chr19	58118752	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=198,147;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:58118715_CT_C:58118715:0,3,0,1
chr19	58199621	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=153,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:8,3:13,0:8,15,0,3
chr19	58231807	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,260;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr19	58232231	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:7,11,1,1
chr19	58258589	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=188,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr19	58265551	.	AG	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=187,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,1:7,1:11,7,0,2
chr19	58281272	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,17;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.457:11:6,0:0,0:0|1:58281272_A_G:58281272:0,6,5,0
chr19	58281276	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.424:12:5,1:1,2:0|1:58281272_A_G:58281272:0,7,5,0
chr19	58281280	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=144,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:5,0:2,0:0|1:58281272_A_G:58281272:2,7,4,0
chr19	58281285	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:0|1:58281272_A_G:58281272:2,7,3,0
chr19	58281289	.	AGA	CCC	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=26,17;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,1:4,0:0|1:58281272_A_G:58281272:2,7,2,0
chr19	58326001	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=164,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:6,3,2,0
chr19	58371274	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=160,127;MMQ=44,27;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:9,0:12,3:11,13,2,1
chr19	58419874	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=190,173;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:6,5:10,0:8,8,3,2
chr19	58420699	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,172;MMQ=60,39;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:8,5,1,1
chr19	58458711	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=188,57;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr19	58472948	.	GCA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=168,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr19	58472963	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	58483709	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr19	58485439	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=219,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,1,1
chr19	58491230	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=201,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,3:7,0:5,8,2,1
chr19	58511150	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:4,0,2,2
chr19	58549593	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr19	58574711	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=217,229;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr19	58574826	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=212,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:6,2,2,0
chr19	58579880	.	T	TACGAGCTTTTGTGTAAGTTTCATTGATAAATCACTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=216,132;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	58579923	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	58598784	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,6:0,1:1,0,2,5
chr19	58601221	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr19	58629830	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr19	58629878	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	58697290	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	58718360	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=49.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,10,3
chr19	58722891	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=189,194;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,6:5,0:10,0,6,0
chr19	58790359	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr19	58797583	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=272,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:2,1,1,3
chr19	58858676	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,6,0
chr19	58864724	.	T	TGCC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=178,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:1,2:10,0:0|1:58864724_T_TGCC:58864724:3,9,3,0
chr19	58864728	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=179,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:1,2:8,0:0|1:58864724_T_TGCC:58864724:3,10,3,0
chr19	58864734	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=186,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:3,1:9,1:0|1:58864724_T_TGCC:58864724:5,9,3,0
chr19	58864738	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=186,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,1:8,1:0|1:58864724_T_TGCC:58864724:5,9,2,0
chr19	58864867	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr19	58864879	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr19	58899466	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=289,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.835:16:0,6:2,8:1,1,12,2
chr19	58906163	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=230,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,10:0,4:0,1,6,8
chr19	58920580	.	G	GTC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=165,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:0|1:58920580_G_GTC:58920580:4,10,1,1
chr19	58920581	.	G	GGGCT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=165,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:0|1:58920580_G_GTC:58920580:4,10,1,1
chr19	58921416	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=191,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,2:10,1:9,11,2,1
chr19	58928898	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:7,2:12,7,2,0
chr19	58945636	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=184,201;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:9,9:9,0:7,11,9,0
chr19	58948365	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,106;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr19	58951096	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=171,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,2:8,1:13,8,3,0
chr19	58951123	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:16,1:13,2:14,16,3,0
chr19	58966968	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=179,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,0:8,2:9,5,2,1
chr19	58981230	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=204,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:3,1:5,3:4,5,1,3
chr19	58982135	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=158,95;MMQ=45,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,3:10,0:9,11,1,2
chr19	58989424	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=158,234;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.303:17:6,2:6,2:9,3,3,2
chr19	58991059	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=157,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.142:30:8,1:17,2:12,14,1,3
chr19	59009949	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=212,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,3:5,4:3,5,3,4
chr19	59010593	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,6:0,0,7,10
chr19	59010819	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=282,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,7:0,4:2,1,9,2
chr19	59022256	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=186,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,0:4,5:2,5,0,6
chr19	59025685	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,5,12
chr19	59025751	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	59027797	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:8,5,2,0
chr19	59028878	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:7,8,1,1
chr19	59056752	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:8,3:8,4:9,7,6,1
chr19	59058693	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,4:6,1:7,2,3,2
chr19	59067623	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=139,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.295:31:16,5:6,3:8,14,5,4
chr19	59068533	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=130,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.133:35:16,4:15,0:13,18,2,2
chr19	59074653	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,186;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:7,2:4,4:7,4,3,3
chr20	126155	.	GCAAA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=211,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAAA;STR;TLOD=60.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:3,8:4,7:4,3,6,9
chr20	138125	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=148,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:0|1:138125_G_T:138125:4,1,0,2
chr20	138148	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=148,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.276:9:1,2:5,0:0|1:138125_G_T:138125:3,4,0,2
chr20	138178	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=298,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,3:2,4:1,1,2,5
chr20	138298	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,25;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:138298_G_A:138298:1,2,0,1
chr20	138322	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=220,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:138298_G_A:138298:0,3,0,1
chr20	139362	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr20	139745	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr20	168466	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=212,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr20	168728	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr20	207889	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=176,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:5,1,4,0
chr20	210135	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=141,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:6,0:6,5,1,1
chr20	238435	.	CTGGTCT	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=260,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=52.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,5:2,7:4,2,2,11
chr20	238507	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=210,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,5:1,1:2,2,1,5
chr20	238530	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=170,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,5:0,0:1,3,1,4
chr20	238540	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=144,241;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.553:7:3,2:0,0:1,2,0,4
chr20	239688	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=265,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:0|1:239688_G_A:239688:2,2,3,2
chr20	239697	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=297,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:0,5:4,1:0|1:239688_G_A:239688:3,2,4,2
chr20	256573	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=205,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:3,2,2,0
chr20	257803	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0|1:257803_G_C:257803:4,1,2,1
chr20	257812	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=167,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:0|1:257803_G_C:257803:2,0,4,2
chr20	259156	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=172,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,5:1,0:0,4,0,5
chr20	270414	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=65,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr20	271081	.	GGGCGGGGCCAAGGAGATGTGGGCGGGGAGAGGACGGGGGTCAGAAGACCGAGGGCGACCTCGAGGCGAGGGCGGGACAGC	G	.	.	DP=51;ECNT=7;MBQ=32,34;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,2:0.059:49:8,2:11,0:33,14,1,1
chr20	271135	.	G	GC	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=80.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.927:25:0,11:1,11:1,0,14,10
chr20	271168	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=143,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.127:30:15,2:11,1:14,13,2,1
chr20	271225	.	T	TA	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=26,28;MFRL=116,141;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.470:27:5,8:3,5:7,7,4,9
chr20	271231	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=33,15;MFRL=140,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.147:29:14,0:8,0:0|1:271231_C_A:271231:5,20,4,0
chr20	271236	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=140,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.129:33:18,2:8,0:0|1:271231_C_A:271231:7,22,4,0
chr20	271242	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=33,15;MFRL=134,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:19,0:10,0:0|1:271231_C_A:271231:8,24,2,0
chr20	278687	.	CCGG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CGG;STR;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,4,5
chr20	279774	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=141,288;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:12,0:13,3:14,11,1,2
chr20	308976	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=183,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.303:17:8,1:4,3:5,7,3,2
chr20	334317	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=175,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr20	376798	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,0:5,0,3,0
chr20	389456	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,8:5,3:2,6,4,7
chr20	398039	.	TTG	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=TG;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.493:7:3,2:1,1:1,3,0,3
chr20	402710	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	402921	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=242,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.845:8:0,7:0,0:0,1,2,5
chr20	408100	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.282:22:9,0:7,5:12,4,0,6
chr20	409296	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=191,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:3,6,0,2
chr20	425641	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:5,3,3,0
chr20	468001	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=196,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr20	479974	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=185,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:7,2:0|1:479974_A_C:479974:3,16,1,1
chr20	479982	.	T	TTTCATTATTTAGAGAC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=190,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:0|1:479974_A_C:479974:0,13,1,1
chr20	480602	.	CAA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=236,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.802:8:0,4:1,3:1,0,0,7
chr20	480620	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=236,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:3,1:2,2:1,4,0,3
chr20	742237	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=216,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:4,0:1,2:5,0,4,0
chr20	742239	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=200,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:4,0,5,0
chr20	744662	.	A	ACAGGTCAAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,3:0,2,1,4
chr20	746423	.	GTATCTGCCC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=161,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.551:9:2,4:2,1:2,2,3,2
chr20	825394	.	GCTC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=234,251;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.342:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr20	853666	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=192,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,4:6,0:6,6,4,0
chr20	854940	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=247,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:4,5:2,4:4,3,5,4
chr20	861743	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,1:2,5:5,0,6,0
chr20	861757	.	G	GGGAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGAA;STR;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:6,2:8,1,3,0
chr20	866066	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	982720	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:3,5,2,0
chr20	982892	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=191,271;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr20	982903	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=271,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr20	1164476	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:6,8,0,2
chr20	1187752	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=46.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:2,6:11,10:5,8,8,8
chr20	1187761	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=160,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:8,0:18,3:13,13,0,3
chr20	1223234	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=158,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr20	1277157	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=236,247;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,4:0,1:0,1,1,4
chr20	1281223	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:15,1:10,2:15,11,1,2
chr20	1286711	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	1291018	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=156,223;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr20	1291393	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=284,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:2,1,3,0
chr20	1292964	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:1,0,5,1
chr20	1300395	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=209,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr20	1300995	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:7,0:8,7,2,0
chr20	1356261	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,2,14
chr20	1424303	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=176,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:4,1,2,0
chr20	1436448	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=149,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:2,8,0,2
chr20	1457045	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=204,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:9,2:5,4:0,14,0,6
chr20	1471903	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=185,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:12,1:7,4:13,6,2,3
chr20	1517979	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,4:3,5:4,4,5,4
chr20	1546742	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=202,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,3:1,4:1,1,7,0
chr20	1552645	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=215,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:10,7:7,4:3,14,4,7
chr20	1592052	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=217,291;MMQ=60,34;MPOS=-1073741823;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:4,2,2,0
chr20	1592120	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=297,209;MMQ=50,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:3,3:3,2:2,5,4,1
chr20	1592139	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=286,154;MMQ=52,32;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:1592139_G_T:1592139:2,3,1,1
chr20	1592141	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=286,154;MMQ=52,32;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:1592139_G_T:1592139:2,3,1,1
chr20	1592150	.	TGA	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=310,154;MMQ=52,32;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0|1:1592150_TGA_T:1592150:1,2,1,1
chr20	1592154	.	G	GAC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=310,154;MMQ=52,32;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0|1:1592150_TGA_T:1592150:1,2,1,1
chr20	1592175	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,35;MFRL=204,157;MMQ=54,35;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,2,0
chr20	1592383	.	A	ATT	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=232,224;MMQ=60,33;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=T;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0|1:1592383_A_ATT:1592383:3,3,0,2
chr20	1592390	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=35,30;MFRL=223,224;MMQ=60,33;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:1592383_A_ATT:1592383:3,4,0,2
chr20	1592399	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=219,224;MMQ=60,33;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:1592383_A_ATT:1592383:3,3,0,2
chr20	1592431	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=209,240;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1592431_A_G:1592431:1,1,0,1
chr20	1592434	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=209,240;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1592431_A_G:1592431:1,1,0,1
chr20	1592437	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=209,240;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1592431_A_G:1592431:1,1,0,1
chr20	1600524	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=110,227;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.143:22:9,2:10,1:11,8,3,0
chr20	1610812	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:6,1,1,1
chr20	1615883	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr20	1616137	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,179;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,6:5,5:3,6,5,6
chr20	1617163	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=204,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.394:13:4,3:3,1:2,6,1,4
chr20	1629604	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=164,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0|1:1629604_A_C:1629604:1,0,6,0
chr20	1629606	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=178,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0|1:1629604_A_C:1629604:4,0,3,0
chr20	1629814	.	CG	TT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=156,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,2:4,0:10,4,1,1
chr20	1895705	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=162,286;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.284:12:6,2:2,1:0|1:1895705_C_T:1895705:8,1,3,0
chr20	1895713	.	T	TAA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=155,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:7,2:3,2:0|1:1895705_C_T:1895705:9,1,4,1
chr20	1895714	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=155,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:7,3:2,2:0|1:1895705_C_T:1895705:9,1,4,1
chr20	1895949	.	A	AGT	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=24,29;MFRL=205,205;MMQ=56,45;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.534:13:3,3:3,4:0|1:1895949_A_AGT:1895949:1,5,3,4
chr20	1895950	.	CCT	C	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=34,32;MFRL=205,205;MMQ=56,45;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.534:13:3,3:3,4:0|1:1895949_A_AGT:1895949:1,5,3,4
chr20	1895963	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=176,196;MMQ=52,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:0|1:1895963_A_G:1895963:2,4,4,4
chr20	1895965	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=35,28;MFRL=176,196;MMQ=52,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:2,3:3,5:0|1:1895963_A_G:1895963:2,4,4,4
chr20	1895984	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=204,205;MMQ=52,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.399:13:3,2:5,3:0|1:1895984_C_A:1895984:6,2,2,3
chr20	1895990	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=29,30;MFRL=204,205;MMQ=52,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:3,2:5,2:0|1:1895984_C_A:1895984:6,2,3,2
chr20	1896051	.	CCGA	C	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=32,35;MFRL=205,219;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:2,5:3,2:0|1:1896051_CCGA_C:1896051:4,3,5,2
chr20	1896059	.	GT	AC	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=29,32;MFRL=205,188;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:2,5:5,2:0|1:1896051_CCGA_C:1896051:4,3,6,2
chr20	1961134	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:3,5,2,6
chr20	1961696	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=166,260;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1961696_C_T:1961696:0,1,1,0
chr20	1961703	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=148,260;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:1961696_C_T:1961696:1,1,1,0
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chr20	2413342	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=172,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:1,1:1|0:2413320_T_C:2413320:0,4,0,1
chr20	2413344	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=188,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1|0:2413320_T_C:2413320:0,3,0,1
chr20	2442273	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr20	2442545	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:16,1:15,2:17,14,0,3
chr20	2451393	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=158,39;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:7,0:10,2:0|1:2451393_C_T:2451393:5,12,1,1
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chr20	2464112	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=157,252;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:10,3:10,1:11,9,2,2
chr20	2474081	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=170,239;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr20	2517377	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=184,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,3:1,4:1,2,1,6
chr20	2517432	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=186,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr20	2517825	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=203,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,7:1,3:3,0,10,0
chr20	2542669	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,5:1,2:1,3,1,6
chr20	2552802	.	C	CTT	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=151,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:1,0:3,1,1,1
chr20	2552884	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=137,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:9,5:5,2:6,8,4,3
chr20	2552926	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=25,27;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.205:18:6,1:4,2:7,8,1,2
chr20	2552942	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=122,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:5,3:6,0:0|1:2552942_G_C:2552942:5,6,1,2
chr20	2552952	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=120,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:2552942_G_C:2552942:4,4,0,2
chr20	2552974	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=122,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,2:2,0:0|1:2552942_G_C:2552942:0,3,0,2
chr20	2559778	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:4,3,0,3
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chr20	2593006	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=219,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,3:2,8:0,3,2,9
chr20	2593822	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:10,8:10,0:8,12,8,0
chr20	2596730	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr20	2597978	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:3,9:1,4:2,2,1,12
chr20	2598019	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=102,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr20	2616556	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,2:0,7:0,0,7,3
chr20	2616679	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,2:1,5:2,0,2,5
chr20	2618094	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr20	2618134	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=129,63;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,3:9,0:9,6,2,1
chr20	2618140	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=226,95;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.864:20:0,10:2,8:2,0,10,8
chr20	2618308	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr20	2633234	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=24,33;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:2633234_T_G:2633234:1,0,4,0
chr20	2633244	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=23,34;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:2633234_T_G:2633234:1,0,4,0
chr20	2633325	.	GGGGCGC	G	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=163,286;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:5,2,2,3
chr20	2633378	.	A	AGAGCCTGGGCCT	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=29,27;MFRL=177,245;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.352:12:1,2:7,2:0|1:2633378_A_AGAGCCTGGGCCT:2633378:3,5,3,1
chr20	2633380	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=177,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.362:12:2,1:5,3:4,4,2,2
chr20	2633398	.	GGCCTGC	G	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=163,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCCTGC;STR;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:4,3,2,2
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chr20	2633842	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=200,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:5,0,5,0
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chr20	3026238	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=200,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
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chr20	3026361	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:8,2:7,0:0|1:3026351_G_C:3026351:4,13,3,0
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chr20	3176009	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=274,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:1,8:1,4:0,2,2,10
chr20	3176072	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=195,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:0,4,0,3
chr20	3184134	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=216,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,4:2,3:0,2,2,5
chr20	3199143	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=179,128;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:0|1:3199143_C_A:3199143:8,4,2,0
chr20	3199145	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=179,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:7,0:0|1:3199143_C_A:3199143:8,4,2,0
chr20	3199373	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=193,259;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr20	3203950	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=229,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:1,4:1,6:2,0,9,1
chr20	3208559	.	CCCAT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=124,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,0:0|1:3208559_CCCAT_C:3208559:0,4,2,0
chr20	3208568	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,15;MFRL=124,82;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:3,0:0|1:3208559_CCCAT_C:3208559:0,4,2,0
chr20	3209371	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=246,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,4:1,8:0,1,7,5
chr20	3211064	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,8:1,1:1,0,8,1
chr20	3211719	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=262,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,2:2,7:1,3,5,5
chr20	3214126	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=235,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,4,2
chr20	3233428	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=351,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3233428_G_T:3233428:0,1,0,1
chr20	3233429	.	G	GTAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=351,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3233428_G_T:3233428:0,1,0,1
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chr20	3563049	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=198,53;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:3563026_G_T:3563026:1,11,1,1
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chr20	3624704	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=188,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
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chr20	3649721	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=204,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:3649713_A_G:3649713:1,4,0,2
chr20	3650066	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,7:0,0,3,9
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chr20	3653044	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=209,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:4,4,3,0
chr20	3655085	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:4,0,2,0
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chr20	3657672	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=16,12;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:3657668_CA_C:3657668:1,0,1,0
chr20	3657803	.	AT	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,1,5
chr20	3670945	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=229,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr20	3671965	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=201,116;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:3,5:6,0:0|1:3671965_G_A:3671965:6,3,5,0
chr20	3671971	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=200,116;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:4,5:7,0:0|1:3671965_G_A:3671965:8,3,5,0
chr20	3674821	.	GAC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=216,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=AC;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr20	3682126	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:4,1,3,1
chr20	3684022	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=159,177;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:2,4:3,1,6,3
chr20	3684074	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=110,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:6,4,1,1
chr20	3721456	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr20	3723091	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr20	3730524	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=190,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:4,3,3,1
chr20	3731622	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=199,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr20	3732633	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr20	3740620	.	GCA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CA;STR;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:3,0,3,2
chr20	3759200	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=166,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,0:3,2:0,5,1,2
chr20	3759528	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=207,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,5:3,3:4,2,2,6
chr20	3766754	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	3778433	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr20	3779061	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:17,2:15,0:21,11,0,3
chr20	3780857	.	T	TGGACTGGAGACCTGGTGCTAG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=138,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.249:21:6,2:9,0:8,8,2,3
chr20	3782866	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=220,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:1,3:8,1:5,4,3,1
chr20	3783649	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=97.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,13,13
chr20	3838317	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=176,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:9,5:11,0:12,8,5,0
chr20	3846843	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=330,264;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr20	3870023	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=234,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:4,1:3,5:0,7,1,6
chr20	4055656	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr20	4155948	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=172,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,2:5,4:3,9,2,4
chr20	4167833	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=225,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr20	4202802	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=271,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.808:8:0,3:1,4:0,1,2,5
chr20	4680804	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=165,98;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,0:7,2:5,6,0,2
chr20	4706508	.	CTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=190,115;MMQ=53,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,4:1,2:0,4,4,6
chr20	4706654	.	GTGCCATCA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,330;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.777:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr20	4707495	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,46;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:13,3:16,0:21,9,2,1
chr20	4708516	.	CCACCTTCCAGGCTTAAGCGATTCTCA	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=202,184;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:0,0:0,5,0,2
chr20	4708548	.	CAT	CT,C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32,31;MFRL=220,194,173;MMQ=60,40,40;MPOS=-2147483648,-2147483648;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.29,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,1,1:1,0,0:0,3,0,2
chr20	4708552	.	C	CGAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=220,173;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr20	4708713	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=155,131;MMQ=43,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,1,2
chr20	4708778	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.708:18:1,3:3,8:1,4,3,10
chr20	4765034	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=213,126;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:1,6,0,2
chr20	4768475	.	A	AAGGGACT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=189,315;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.230:15:5,1:7,2:3,9,0,3
chr20	4768846	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.599:18:3,3:3,8:3,4,5,6
chr20	4773332	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=152,224;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0|1:4773332_G_C:4773332:0,3,0,4
chr20	4773338	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=144,224;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0|1:4773332_G_C:4773332:0,2,0,4
chr20	4776367	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=229,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:4776367_G_T:4776367:2,0,1,0
chr20	4776387	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:4776367_G_T:4776367:4,0,1,0
chr20	4776445	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=162,251;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.235:18:7,3:7,0:12,2,3,1
chr20	4778754	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=175,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,2:5,1:7,5,1,2
chr20	4843609	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:1,5,0,2
chr20	4854682	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=199,259;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,1:5,1:6,8,1,1
chr20	4880132	.	AGCTCAATGCCTTCTGC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=291,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.690:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chr20	5090161	.	AG	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr20	5155797	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=139,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:5,7,2,0
chr20	5169877	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=284,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.452:5:1,1:0,1:1,2,1,1
chr20	5528387	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=160,110;MMQ=60,31;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,11:0.286:40:20,6:9,5:9,20,11,0
chr20	5528518	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=183,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,2:8,2:3,10,0,4
chr20	5528534	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=157,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,1:7,2:2,8,0,3
chr20	5540645	.	TAAAACAGTTTTTAAAATTATATCCA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=143,106;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:11,0:11,2:13,14,1,1
chr20	5542052	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=153,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:10,1,2,0
chr20	5547384	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.366:39:11,8:14,6:11,14,9,5
chr20	5548081	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=187,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,8:0.219:39:8,3:23,5:24,7,6,2
chr20	5548208	.	TAA	T,TA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,24,21;MFRL=171,195,202;MMQ=60,60,60;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=10.41,8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,8,6:0.436,0.305:18:0,1,2:2,4,1:0,4,2,12
chr20	5554673	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=278,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:2,0:2,8:0|1:5554673_A_G:5554673:0,4,0,8
chr20	5554677	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=278,184;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:2,0:2,8:0|1:5554673_A_G:5554673:0,4,0,8
chr20	5556512	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=209,120;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,5:2,1:3,2,2,4
chr20	5556686	.	TAC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=146,255;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr20	5556720	.	C	CTGTTAAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=214,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:0,5,0,1
chr20	5574134	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=199,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.695:7:0,2:1,2:0,2,0,5
chr20	5753865	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.418:10:1,2:5,2:2,4,1,3
chr20	5844121	.	CA	TG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:5,0:2,12,0,2
chr20	5896950	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,183;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:6,4,0,3
chr20	5903282	.	TGAG	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAG;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.127:21:8,2:7,0:7,12,1,1
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chr20	5933090	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=135,123;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,11:0.261:44:22,0:11,11:17,16,11,0
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chr20	5953815	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=164,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:4,4,2,2
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chr20	6064606	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=199,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr20	6064635	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=213,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:1,1:3,4:4,0,4,1
chr20	6064839	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=179,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,5:3,2:1,4,0,7
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chr20	6065731	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:4,4:3,4:0|1:6065729_C_T:6065729:5,3,5,4
chr20	6078207	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,71;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,1:8,1:7,3,1,1
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chr20	6090879	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=218,251;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
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chr20	6096695	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:4,3,1,1
chr20	6100002	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr20	6100230	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=194,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,3:1,1:0,3,1,3
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chr20	7866261	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,241;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:7,3:9,1:6,10,2,2
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chr20	8639443	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=200,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:0,2,0,4
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chr20	8731580	.	CTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=199,169;MMQ=45,50;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=T;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:1,1:1,0:0,4,1,1
chr20	8741188	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=124,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:1,7,1,1
chr20	8769423	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,2:2,3:1,6,0,5
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chr20	8770130	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr20	8770822	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=111,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,4:3,5:5,3,4,5
chr20	8770932	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=119,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.372:16:4,2:6,4:0,10,2,4
chr20	8773096	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=188,253;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr20	8773155	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=182,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:8,0,2,2
chr20	8773295	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,9,11
chr20	8782769	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=183,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,0:2,2:0,13,1,1
chr20	8782884	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=247,259;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr20	8782901	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr20	9288654	.	T	TGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=273,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	9352957	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=143,40;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:4,0:13,2:10,7,1,1
chr20	9388639	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:0|1:9388639_C_G:9388639:5,11,2,0
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chr20	9453567	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
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chr20	9543681	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=160,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,1:6,1:0|1:9543681_C_T:9543681:3,9,0,2
chr20	9543688	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=160,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:4,1:7,1:0|1:9543681_C_T:9543681:3,9,0,2
chr20	9560712	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=215,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr20	9625003	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr20	10024950	.	GG	TT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=276,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr20	10026357	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=223,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:3,3,0,5
chr20	10030931	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr20	10035162	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=151,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:15,2:14,0:0|1:10035162_T_G:10035162:13,18,2,0
chr20	10035165	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=151,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:17,2:14,0:0|1:10035162_T_G:10035162:13,18,2,0
chr20	10035318	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=220,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr20	10256252	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=189,113;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:9,1:7,2:2,14,0,3
chr20	10258441	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,0:1,5:0,2,0,6
chr20	10258485	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=152,152;MMQ=47,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,0:0,3:0,4,0,3
chr20	10258492	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.449:2:1,1:0,0:0|1:10258492_C_CT:10258492:0,1,0,1
chr20	10258493	.	C	CACAGAGT	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.449:2:1,1:0,0:0|1:10258492_C_CT:10258492:0,1,0,1
chr20	10258495	.	A	AATCCTTTCTTTGGAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10258492_C_CT:10258492:0,1,0,1
chr20	10393145	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=189,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr20	10438780	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr20	10439002	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr20	10621923	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=183,259;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,3:4,0:1,4,3,0
chr20	10622080	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:4,4:5,2:7,2,5,1
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chr20	10629129	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=222,272;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:3,3:6,1:8,1,4,0
chr20	10633313	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr20	10639385	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:0,5:1,12:0,1,4,14
chr20	10644637	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=168,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:15,1:11,1:19,7,1,1
chr20	10653739	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=281,253;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr20	11790885	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=230,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,1:2,3:1,1,1,3
chr20	11830180	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=260,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:0,3:2,5:0,2,4,4
chr20	11903574	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=188,77;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:10,6:9,0:6,13,6,0
chr20	12989901	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:5,2:12,3:10,7,5,0
chr20	12990044	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=182,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:0,4:5,4:1,4,1,7
chr20	12990057	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=195,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.345:9:1,0:5,2:1,5,1,2
chr20	13029862	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	13060331	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=198,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:8,4:5,1:11,2,4,1
chr20	13074235	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=123,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,4:2,5:4,5,4,5
chr20	13090733	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=214,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr20	13098266	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=157,169;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.221:25:11,5:9,0:0|1:13098266_G_T:13098266:10,10,5,0
chr20	13098276	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=162,169;MMQ=60,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:10,5:8,1:0|1:13098266_G_T:13098266:9,9,6,0
chr20	13145534	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=208,235;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:1,2:1,5,0,2
chr20	13145567	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=144,235;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:13145567_T_C:13145567:0,2,0,2
chr20	13145569	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=144,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:13145567_T_C:13145567:0,2,0,2
chr20	13398144	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=210,58;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,0:5,2:7,9,2,0
chr20	13464014	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=157,313;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:2,7,1,1
chr20	13464030	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:3,1:6,1:2,7,0,2
chr20	13509263	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=187,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr20	13561632	.	TA	T,TAAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29,14;MFRL=144,203,147;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,18;RU=A;STR;TLOD=4.86,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,2:0.388,0.239:9:1,1,0:2,2,0:2,1,0,6
chr20	13695464	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr20	13695824	.	CA	C,CAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,35,36;MFRL=142,127,65;MMQ=60,60,60;MPOS=18,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.52,6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,4:0.220,0.293:15:4,1,0:4,2,3:3,5,1,6
chr20	13698006	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,7:0,0,12,7
chr20	13714368	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.282:23:11,0:5,6:10,7,0,6
chr20	13747441	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,11,5
chr20	13769127	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=187,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.783:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr20	13782409	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr20	13830179	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=129,350;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,3:5,0:7,2,0,3
chr20	13845987	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr20	13868745	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr20	14066168	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,37;MFRL=140,327;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr20	14306896	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:7,4:5,5:6,6,6,3
chr20	14306953	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=156,63;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.448:20:6,5:5,3:5,6,5,4
chr20	15480548	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:1,4,0,4
chr20	15967327	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=187,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,3:8,4:8,5,4,3
chr20	16253819	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=198,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,2:5,1:11,0,2,1
chr20	16348291	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:11,4:4,1:7,8,3,2
chr20	16351329	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,0:0,3:0,1,0,4
chr20	16352234	.	C	CA,CAAAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34,33;MFRL=0,205,215;MMQ=60,60,36;MPOS=12,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,18,22;RU=A;STR;TLOD=3.99,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.580,0.250:3:0,1,1:0,0,0:0,0,3,0
chr20	16359356	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=262,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.320:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr20	16359990	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=191,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:4,8,0,2
chr20	16362265	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=174,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:5,1,1,4
chr20	16407960	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=180,262;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr20	16475112	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=224,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr20	16486698	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:9,9:6,5:6,9,5,9
chr20	16493580	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=222,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,1:2,2:0,3,1,2
chr20	16496362	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=260,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,0,2
chr20	16553754	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=359,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr20	16712719	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=167,299;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.292:14:3,0:6,4:9,1,3,1
chr20	16729048	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=130,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:7,3:11,0:11,8,2,1
chr20	16729262	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,237;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr20	16729654	.	A	AAGATG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=182,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,2:0,6:0,1,3,5
chr20	16730464	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr20	16730479	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=101,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.776:10:0,5:1,3:1,1,8,0
chr20	16730522	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=118,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:0,7:5,3:3,2,8,2
chr20	16731718	.	T	TC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=98,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,0:10,2:0|1:16731718_T_TC:16731718:8,5,1,1
chr20	16731722	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=95,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:10,2:0|1:16731718_T_TC:16731718:8,4,1,1
chr20	17389830	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=285,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr20	17436895	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0|1:17436895_G_A:17436895:0,0,7,0
chr20	17436897	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=215,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:0|1:17436895_G_A:17436895:5,0,2,0
chr20	17446280	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=193,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:1,4,0,3
chr20	17462150	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr20	17474690	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=77.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,8:0,0,14,7
chr20	17475217	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:8,3:13,3:7,14,3,3
chr20	17477751	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=207,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:0,6,0,6
chr20	17479730	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=128,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,2:2,6:0,2,1,7
chr20	17479763	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=138,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr20	17489473	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=203,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:7,1,2,0
chr20	17594729	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=192,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.768:11:1,6:1,2:2,0,7,2
chr20	17595329	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=170,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr20	17596219	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	17596731	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=262,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr20	17597331	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=138,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr20	17597361	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr20	17599214	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr20	17602028	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=191,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr20	17623689	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=169,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:11,11,0,2
chr20	17674193	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=252,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr20	17674451	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr20	17705781	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=153,45;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:5,7,2,0
chr20	17705849	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=217,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr20	17948894	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=232,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr20	18005600	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=225,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:1,4,2,0
chr20	18022142	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:6,7:4,0:3,7,7,0
chr20	18022171	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:10,3:3,4:8,5,3,4
chr20	18142924	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:5,2:2,1:5,3,2,1
chr20	18143617	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=162,46;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:7,0:7,2:0|1:18143617_C_T:18143617:7,7,1,1
chr20	18143631	.	T	TTTGAGACCAGCCTGGGCAACACA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=179,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:18143617_C_T:18143617:5,8,1,1
chr20	18364964	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr20	18393275	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=218,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,8:3,3:3,1,7,4
chr20	18393312	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr20	18393499	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,7,12
chr20	18446024	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=182,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,5:3,3:0,6,0,8
chr20	18446050	.	A	ATGTGCACTTATAGC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=53.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0,0,0,13
chr20	18448079	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,10:0,13:0,0,22,2
chr20	18460614	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr20	18460641	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=251,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:2,0,5,0
chr20	18462492	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,0,13
chr20	18462518	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=47.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr20	18464110	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr20	18470646	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,2,4
chr20	18470664	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr20	18470980	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,14,3
chr20	18477614	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=199,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr20	18477870	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:0,8:5,2:0,5,1,9
chr20	18504999	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr20	18505403	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=227,267;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,2,3
chr20	18506616	.	TG	CA,CG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34,30;MFRL=0,175,182;MMQ=60,60,60;MPOS=23,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,44.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,14:0.156,0.795:16:0,2,6:0,0,8:0,0,7,9
chr20	18511456	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,7:0,0,9,5
chr20	18511484	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,2:2,0:1,7,1,1
chr20	18511504	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=120,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,7:2,2:0,4,1,8
chr20	18522933	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,2:5,1:7,4,2,1
chr20	18523864	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:6,4:1,5:1,6,2,7
chr20	18529233	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,1:2,4:5,4,2,3
chr20	18574483	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=151,66;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:18,0:12,2:0|1:18574483_C_T:18574483:15,15,1,1
chr20	18574507	.	G	GT	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=159,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:15,0:10,2:0|1:18574483_C_T:18574483:10,16,1,1
chr20	18574508	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=156,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:15,0:10,2:0|1:18574483_C_T:18574483:9,16,1,1
chr20	18574510	.	G	GC	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=156,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:15,0:9,1:0|1:18574483_C_T:18574483:9,16,1,1
chr20	18576912	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	18608937	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=217,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr20	18794963	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=197,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:10,3,2,0
chr20	18806046	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:5,0:2,3:0,7,0,4
chr20	18810705	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=168,252;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:3,2:9,2:5,7,2,2
chr20	19560555	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr20	19665647	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=185,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,1:9,1:13,0,2,0
chr20	19867273	.	T	TTGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=118,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:0,1:3,0:1,2,1,0
chr20	19915732	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=153,184;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.178:37:13,5:18,0:20,11,6,0
chr20	19941498	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=157,234;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:1,7,0,2
chr20	19941538	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=141,231;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr20	19955673	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=193,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:5,3:3,7:3,5,4,7
chr20	19955714	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=147,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:6,0:4,7:2,8,2,5
chr20	20003138	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=18,34;MFRL=149,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.391:11:1,2:2,2:0,7,0,4
chr20	20003196	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=147,284;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr20	20003201	.	A	ACTGCTGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=284,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr20	20020213	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=204,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,1:6,2:8,0,3,0
chr20	20021301	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,0:5,4:7,3,4,0
chr20	20033423	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=189,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:5,5:6,7:3,8,2,10
chr20	20037222	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr20	20037242	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:7,0,5,1
chr20	20056038	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr20	20071634	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=94,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:0,8:1,8:1,0,10,6
chr20	20123623	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=175,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.388:10:2,0:2,1:3,3,0,4
chr20	20139951	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr20	20140196	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr20	20150182	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr20	20152581	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr20	20168497	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr20	20180469	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:16,1:12,2:18,10,0,3
chr20	20243527	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=194,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.421:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr20	20243562	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,2:2,0,4,0
chr20	20257958	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,301;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.210:25:8,2:12,2:15,5,4,1
chr20	20269615	.	C	CAATTCCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.267:6:1,1:4,0:0,5,0,1
chr20	20269631	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr20	20377421	.	A	AC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=57.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,7:0,12:0,0,10,11
chr20	20501786	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=133,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:2,7,1,1
chr20	20553512	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,1:9,1:11,2,2,0
chr20	20565590	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,0:9,3:7,7,0,3
chr20	20609964	.	AACACACACACACAC	A,AACACACACACACACACACAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,27,26;MFRL=203,157,196;MMQ=40,60,40;MPOS=33,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,12,22;RU=AC;STR;TLOD=3.05,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.223,0.378:3:1,0,1:0,1,0:1,0,2,0
chr20	20610216	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,0:6,3:2,10,0,3
chr20	20661309	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:4,0:6,3:9,2,3,0
chr20	21106714	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=200,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr20	21117240	.	GTT	G,GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,35,32;MFRL=136,159,175;MMQ=60,60,60;MPOS=29,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.79,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.272,0.326:7:1,0,2:1,2,0:0,3,1,3
chr20	21126194	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=227,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,5:2,4:6,2,8,1
chr20	21142454	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=180,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.279:11:3,3:5,0:8,0,3,0
chr20	21186161	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=61.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,13:0,0,12,7
chr20	21186296	.	TAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=153,182;MMQ=39,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.613:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr20	21213547	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=199,264;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr20	21227314	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	21307107	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=186,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:4,7:2,7:4,2,8,6
chr20	21313109	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:0,1:1,2:0,2,0,3
chr20	21319828	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr20	21321294	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr20	21328715	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr20	21329950	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,281;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:0,1:2,3:3,0,3,1
chr20	21336825	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=206,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:1,7:0,7:0,1,6,9
chr20	21346441	.	TATATA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=210,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATATA;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr20	21362703	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=46.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,4:0,10:0,0,5,10
chr20	21362758	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr20	21493018	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=230,48;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:0,4,3,1
chr20	22562438	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=173,246;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,2:8,1:8,3,2,1
chr20	22562674	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,9,6
chr20	23028724	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:3,5:4,2:2,5,3,4
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chr20	23669630	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=140,238;MMQ=59,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,2:5,1:4,6,0,3
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chr20	23731593	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,206;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23731591_G_A:23731591:0,0,0,1
chr20	23805748	.	T	TAC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=208,162;MMQ=52,26;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:0|1:23805748_T_TAC:23805748:5,0,2,0
chr20	23805749	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=208,162;MMQ=52,26;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:0|1:23805748_T_TAC:23805748:5,0,2,0
chr20	23805832	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=196,191;MMQ=52,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:0,3,2,2
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chr20	23807028	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=213,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,6:1,2:3,0,5,3
chr20	23807308	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=179,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:0,1:2,1:0,3,0,2
chr20	24524218	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
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chr20	24938159	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=169,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:6,2:1,0:0,7,0,2
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chr20	24944933	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=191,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:4,0,6,1
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chr20	24950373	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr20	24950781	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=201,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,2:3,1:6,3,3,0
chr20	24959386	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:1,1,2,2
chr20	24964722	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr20	24973363	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=193,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr20	24993414	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:7,3:9,1:9,7,1,4
chr20	25002066	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=132,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:6,2:9,0:8,7,0,2
chr20	25004071	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,5,6
chr20	25027526	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:5,5:5,7:4,7,3,9
chr20	25027630	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=153,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr20	25028707	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=176,55;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,2:8,0:8,3,2,0
chr20	25038372	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,3:6,0:8,6,2,1
chr20	25057191	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.303:14:5,1:4,3:0,10,0,4
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chr20	25269145	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=150,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:25269145_T_A:25269145:9,7,1,1
chr20	25269151	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:25269145_T_A:25269145:6,7,1,1
chr20	25288505	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
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chr20	25472162	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:9,8,1,1
chr20	25755634	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=206,185;MMQ=53,23;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:0|1:25755634_C_T:25755634:4,4,0,2
chr20	25755640	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=206,185;MMQ=58,23;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:2,1:8,1:0|1:25755634_C_T:25755634:5,5,0,2
chr20	25755812	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=12;MBQ=28,32;MFRL=170,323;MMQ=40,24;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:9,2:15,2:18,8,4,0
chr20	25755816	.	G	A,T	.	.	DP=31;ECNT=12;MBQ=27,32,28;MFRL=172,323,256;MMQ=40,24,25;MPOS=22,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.10,5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,2,2:0.088,0.088:31:9,1,1:16,1,1:19,8,4,0
chr20	25755824	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=173,323;MMQ=40,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:9,1:21,1:0|1:25755824_C_A:25755824:21,10,2,0
chr20	25755827	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=26,32;MFRL=172,323;MMQ=40,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:10,1:21,1:0|1:25755824_C_A:25755824:20,11,2,0
chr20	25755829	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=31,28;MFRL=173,256;MMQ=40,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:10,1:19,1:21,11,2,0
chr20	25755850	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=12;MBQ=28,33;MFRL=165,288;MMQ=52,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:7,1:15,2:10,12,2,1
chr20	25755892	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=28,33;MFRL=163,201;MMQ=52,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.143:33:14,2:13,2:0|1:25755892_T_C:25755892:10,19,4,0
chr20	25755895	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=164,201;MMQ=52,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.147:32:14,2:13,2:0|1:25755892_T_C:25755892:11,17,4,0
chr20	25755907	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=169,201;MMQ=52,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:12,2:14,2:0|1:25755892_T_C:25755892:11,15,4,0
chr20	25755913	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=163,201;MMQ=52,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.166:28:11,1:13,2:0|1:25755892_T_C:25755892:10,14,4,0
chr20	25755988	.	AAG	A	.	.	DP=12;ECNT=12;MBQ=20,26;MFRL=141,192;MMQ=60,32;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AG;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.497:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr20	25756020	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=237,197;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.732:12:3,6:0,3:0,3,0,9
chr20	25829290	.	G	T	.	.	DP=50;ECNT=14;MBQ=33,29;MFRL=194,172;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.347:45:14,9:14,5:20,10,5,10
chr20	25829292	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=14;MBQ=32,29;MFRL=193,189;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,14:0.322:45:17,8:13,6:20,11,5,9
chr20	25829312	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=14;MBQ=32,28;MFRL=146,168;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,10:0.234:45:19,5:16,5:0|1:25829312_G_T:25829312:26,9,6,4
chr20	25829319	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=14;MBQ=30,27;MFRL=144,167;MMQ=60,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,7:0.186:41:18,1:14,4:0|1:25829312_G_T:25829312:26,8,4,3
chr20	25829342	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=14;MBQ=26,33;MFRL=133,168;MMQ=50,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,8:0.219:39:12,3:19,5:0|1:25829342_T_C:25829342:23,8,4,4
chr20	25829352	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=14;MBQ=25,31;MFRL=137,168;MMQ=50,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,10:0.256:41:12,5:19,5:0|1:25829342_T_C:25829342:23,8,5,5
chr20	25829384	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=14;MBQ=31,35;MFRL=144,164;MMQ=40,24;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:5,6:9,1:0|1:25829384_T_C:25829384:2,12,4,3
chr20	25829386	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=14;MBQ=27,35;MFRL=144,164;MMQ=40,24;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:5,6:9,1:0|1:25829384_T_C:25829384:2,12,4,3
chr20	25829435	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=14;MBQ=34,28;MFRL=178,164;MMQ=40,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.299:24:5,6:12,0:2,15,2,5
chr20	25829436	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=14;MBQ=30,33;MFRL=180,168;MMQ=40,37;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:7,4:6,5:3,12,1,8
chr20	25829470	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=14;MBQ=29,30;MFRL=183,240;MMQ=41,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,3:4,6:3,9,2,7
chr20	25829481	.	T	TATTAACA	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=30,31;MFRL=225,141294;MMQ=25,22;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:14,2:0|1:25829481_T_TATTAACA:25829481:2,22,0,2
chr20	25829483	.	G	GTCTTC	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=35,34;MFRL=225,141294;MMQ=25,22;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:13,2:0|1:25829481_T_TATTAACA:25829481:2,22,0,2
chr20	25829485	.	A	AATCAGCC	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=28,26;MFRL=225,141294;MMQ=25,22;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:14,2:0|1:25829481_T_TATTAACA:25829481:2,22,0,2
chr20	26061803	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=131,133;MMQ=40,29;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.321:16:7,4:4,0:7,4,3,2
chr20	26061830	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=132,54;MMQ=43,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:3,1:3,5,1,1
chr20	26061960	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=176,199;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:7,1:1,4:7,1,4,1
chr20	26062002	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=33,34;MFRL=189,168;MMQ=40,24;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.249:22:10,2:7,2:0|1:26062002_G_C:26062002:10,7,5,0
chr20	26062003	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=30,31;MFRL=170,268;MMQ=39,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:12,1:7,2:15,4,0,3
chr20	26062021	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=9;MBQ=32,26;MFRL=166,133;MMQ=40,24;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:8,2:6,2:0|1:26062002_G_C:26062002:11,4,6,0
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chr20	26062047	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=9;MBQ=27,32;MFRL=166,84;MMQ=60,53;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,11:0.364:31:11,5:7,5:0|1:26062002_G_C:26062002:14,6,4,7
chr20	26062057	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=166,100;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,15:0.444:34:11,9:7,5:0|1:26062002_G_C:26062002:12,7,5,10
chr20	26062078	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=9;MBQ=33,27;MFRL=184,163;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,17:0.486:35:10,9:7,7:0|1:26062002_G_C:26062002:8,10,4,13
chr20	26062094	.	CT	TC	.	.	DP=35;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=174,187;MMQ=59,36;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:17,1:14,1:9,23,1,1
chr20	26062097	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=34,29;MFRL=184,169;MMQ=60,34;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,14:0.441:32:9,7:7,6:0|1:26062002_G_C:26062002:7,11,3,11
chr20	26063442	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,35;MFRL=165,266;MMQ=40,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr20	26063469	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=160,243;MMQ=40,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr20	26063490	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=160,243;MMQ=44,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0|1:26063490_A_T:26063490:4,0,3,0
chr20	26063498	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=160,243;MMQ=44,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0|1:26063490_A_T:26063490:4,0,3,0
chr20	26063516	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=157,243;MMQ=60,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:2,1:2,1:5,0,2,0
chr20	26063560	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=94,197;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:4,3:10,1:8,6,2,2
chr20	26063625	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=24,32;MFRL=92,222;MMQ=60,26;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:8,5:3,2:0|1:26063625_T_C:26063625:4,7,3,5
chr20	26063643	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=20,25;MFRL=99,222;MMQ=60,26;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:7,6:1,2:0|1:26063625_T_C:26063625:4,4,3,5
chr20	26063645	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=20,26;MFRL=99,222;MMQ=60,26;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:6,6:1,2:0|1:26063625_T_C:26063625:4,4,3,5
chr20	26063684	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=25,31;MFRL=196,187;MMQ=58,28;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0|1:26063684_A_G:26063684:0,3,0,4
chr20	26063696	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=24,30;MFRL=197,189;MMQ=59,28;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:1,0:0|1:26063684_A_G:26063684:0,4,0,2
chr20	26063712	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=196,132;MMQ=58,31;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:26063684_A_G:26063684:0,3,0,1
chr20	26188782	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,21;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26188782_T_C:26188782:0,0,1,0
chr20	26188797	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,21;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26188782_T_C:26188782:0,0,1,0
chr20	26188805	.	GA	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,150;MMQ=60,21;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26188782_T_C:26188782:0,0,1,0
chr20	26188912	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=0,29;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:26188912_A_C:26188912:0,0,3,6
chr20	26188923	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:26188912_A_C:26188912:0,0,0,5
chr20	26188930	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=0,35;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0|1:26188912_A_C:26188912:0,0,0,5
chr20	26188934	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:26188912_A_C:26188912:0,0,0,3
chr20	26188936	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,28;MFRL=0,51;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:26188912_A_C:26188912:0,0,0,2
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chr20	29623139	.	A	G	.	.	DP=109;ECNT=9;MBQ=29,35;MFRL=156,190;MMQ=24,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=101.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,35:0.333:106:37,23:33,12:53,18,28,7
chr20	29623143	.	G	T	.	.	DP=112;ECNT=9;MBQ=33,28;MFRL=170,201;MMQ=24,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:107,5:0.053:112:57,4:46,1:0|1:29623143_G_T:29623143:81,26,3,2
chr20	29623147	.	C	T	.	.	DP=115;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=169,166;MMQ=25,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:98,16:0.146:114:52,9:44,5:0|1:29623147_C_T:29623147:70,28,14,2
chr20	29623156	.	G	A	.	.	DP=130;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=159,161;MMQ=30,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:97,27:0.221:124:46,17:47,10:75,22,17,10
chr20	29623159	.	A	G	.	.	DP=135;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=158,145;MMQ=27,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:115,18:0.141:133:62,7:52,11:0|1:29623147_C_T:29623147:80,35,16,2
chr20	29623164	.	T	C	.	.	DP=137;ECNT=9;MBQ=25,32;MFRL=146,188;MMQ=36,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:131,6:0.050:137:62,4:66,2:0|1:29623143_G_T:29623143:92,39,3,3
chr20	29623175	.	A	T	.	.	DP=132;ECNT=9;MBQ=28,25;MFRL=138,152;MMQ=40,24;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:113,12:0.101:125:57,4:53,8:73,40,8,4
chr20	29623179	.	A	T	.	.	DP=129;ECNT=9;MBQ=28,25;MFRL=138,137;MMQ=40,33;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:120,4:0.040:124:60,2:57,2:0|1:29623143_G_T:29623143:78,42,2,2
chr20	29623182	.	G	A	.	.	DP=127;ECNT=9;MBQ=33,28;MFRL=138,144;MMQ=40,46;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:120,5:0.047:125:62,0:56,5:76,44,5,0
chr20	29623214	.	C	T	.	.	DP=128;ECNT=14;MBQ=29,25;MFRL=136,144;MMQ=25,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:114,9:0.079:123:60,3:49,6:0|1:29623214_C_T:29623214:59,55,6,3
chr20	29623215	.	G	A	.	.	DP=128;ECNT=14;MBQ=30,30;MFRL=136,138;MMQ=27,24;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:114,9:0.072:123:62,2:51,7:57,57,8,1
chr20	29623217	.	C	T	.	.	DP=130;ECNT=14;MBQ=32,27;MFRL=136,156;MMQ=25,36;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:118,6:0.054:124:59,3:54,3:60,58,3,3
chr20	29623218	.	A	G	.	.	DP=132;ECNT=14;MBQ=27,24;MFRL=143,117;MMQ=26,25;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:106,22:0.175:128:44,18:57,4:53,53,11,11
chr20	29623223	.	T	C	.	.	DP=134;ECNT=14;MBQ=28,32;MFRL=138,138;MMQ=25,25;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,29:0.229:127:49,13:45,15:44,54,14,15
chr20	29623233	.	C	G	.	.	DP=138;ECNT=14;MBQ=33,32;MFRL=144,131;MMQ=25,41;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:129,9:0.071:138:64,3:50,5:0|1:29623214_C_T:29623214:52,77,3,6
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chr20	29623249	.	AA	GT	.	.	DP=162;ECNT=14;MBQ=24,32;MFRL=149,188;MMQ=24,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:129,6:0.051:135:72,6:52,0:0|1:29623249_AA_GT:29623249:35,94,3,3
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chr20	29626013	.	T	C	.	.	DP=136;ECNT=15;MBQ=28,34;MFRL=190,182;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=77.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:109,24:0.185:133:51,10:55,13:0|1:29626013_T_C:29626013:41,68,5,19
chr20	29626021	.	G	A	.	.	DP=132;ECNT=15;MBQ=33,27;MFRL=188,183;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=80.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:106,25:0.195:131:50,10:50,15:0|1:29626013_T_C:29626013:42,64,6,19
chr20	29626025	.	A	C	.	.	DP=129;ECNT=15;MBQ=27,36;MFRL=187,149;MMQ=40,35;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:120,8:0.069:128:60,2:59,6:44,76,2,6
chr20	29626027	.	C	T	.	.	DP=131;ECNT=15;MBQ=33,28;MFRL=177,198;MMQ=40,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=115.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,48:0.390:124:32,28:41,20:23,53,18,30
chr20	29626029	.	G	C	.	.	DP=129;ECNT=15;MBQ=33,34;MFRL=188,153;MMQ=50,37;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,16:0.132:127:54,4:52,11:34,77,7,9
chr20	29626045	.	C	A	.	.	DP=118;ECNT=15;MBQ=33,28;MFRL=173,216;MMQ=53,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:109,9:0.083:118:47,3:58,6:0|1:29626045_C_A:29626045:32,77,4,5
chr20	29626055	.	A	G	.	.	DP=104;ECNT=15;MBQ=28,33;MFRL=174,232;MMQ=53,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,5:0.056:103:34,3:60,2:30,68,2,3
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chr20	29626083	.	TA	T	.	.	DP=72;ECNT=15;MBQ=28,31;MFRL=171,204;MMQ=52,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,8:0.113:71:23,2:36,6:12,51,3,5
chr20	29628164	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=17;MBQ=32,30;MFRL=133,184;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,10:0.306:34:12,1:9,7:0|1:29628164_G_A:29628164:16,8,7,3
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chr20	29628237	.	C	A	.	.	DP=138;ECNT=17;MBQ=32,31;MFRL=139,139;MMQ=40,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:118,13:0.105:131:58,9:56,4:61,57,11,2
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chr20	29628251	.	A	G	.	.	DP=137;ECNT=17;MBQ=28,36;MFRL=140,248;MMQ=40,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:130,6:0.051:136:69,5:54,1:67,63,3,3
chr20	29628254	.	A	G	.	.	DP=135;ECNT=17;MBQ=27,34;MFRL=145,115;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:116,16:0.126:132:66,8:45,8:62,54,4,12
chr20	29628257	.	T	C	.	.	DP=133;ECNT=17;MBQ=28,29;MFRL=145,132;MMQ=40,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:123,10:0.081:133:62,8:50,2:0|1:29628241_G_C:29628241:62,61,5,5
chr20	29628271	.	C	T	.	.	DP=122;ECNT=17;MBQ=33,28;MFRL=153,189;MMQ=40,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,45:0.387:117:36,23:34,22:39,33,19,26
chr20	29628273	.	A	G	.	.	DP=122;ECNT=17;MBQ=28,35;MFRL=164,146;MMQ=40,35;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:114,8:0.073:122:51,6:52,2:0|1:29628241_G_C:29628241:56,58,4,4
chr20	29628274	.	TGAAGCAGGGGACATAGAA	T	.	.	DP=132;ECNT=17;MBQ=29,28;MFRL=168,146;MMQ=40,35;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:124,8:0.067:132:52,5:51,2:0|1:29628241_G_C:29628241:60,64,4,4
chr20	29628335	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=17;MBQ=25,28;MFRL=161,159;MMQ=57,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=71.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,21:0.458:46:12,9:13,12:0|1:29628335_A_T:29628335:7,18,14,7
chr20	29628341	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=17;MBQ=32,28;MFRL=151,158;MMQ=57,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=67.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,19:0.476:40:9,8:12,8:0|1:29628335_A_T:29628335:5,16,12,7
chr20	29628361	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=17;MBQ=25,35;MFRL=164,161;MMQ=57,34;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=66.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,22:0.489:45:10,10:13,10:0|1:29628335_A_T:29628335:4,19,8,14
chr20	29628415	.	T	A	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=186,158;MMQ=40,32;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,8:0.118:74:23,6:43,2:15,51,4,4
chr20	29628424	.	A	G	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=181,166;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,6:0.096:71:26,1:35,5:21,44,0,6
chr20	29628431	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=202,177;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=164.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,51:0.882:57:2,18:4,31:1,5,17,34
chr20	29631565	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=12;MBQ=28,32;MFRL=188,280;MMQ=49,22;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=56.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,26:0.529:49:10,0:12,26:12,11,0,26
chr20	29631576	.	TG	AA	.	.	DP=54;ECNT=12;MBQ=28,33;MFRL=184,280;MMQ=27,22;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,26:0.481:54:11,0:15,26:0|1:29631576_TG_AA:29631576:19,9,0,26
chr20	29631580	.	ATTC	A	.	.	DP=59;ECNT=12;MBQ=30,33;MFRL=185,280;MMQ=27,22;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,26:0.442:59:13,0:16,26:0|1:29631576_TG_AA:29631576:22,11,0,26
chr20	29631584	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=12;MBQ=32,33;MFRL=185,280;MMQ=27,22;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,26:0.457:57:11,0:19,26:0|1:29631576_TG_AA:29631576:21,10,0,26
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chr20	29631606	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=12;MBQ=28,32;MFRL=179,192;MMQ=27,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:16,1:16,2:25,7,3,0
chr20	29631613	.	TG	CA	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=28,32;MFRL=180,179;MMQ=27,26;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.225:38:15,3:15,5:22,8,8,0
chr20	29631627	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=12;MBQ=28,35;MFRL=172,182;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,5:0.130:44:19,3:19,2:0|1:29631627_T_C:29631627:31,8,5,0
chr20	29631632	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=12;MBQ=28,36;MFRL=171,182;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.127:45:20,3:19,1:0|1:29631627_T_C:29631627:32,8,5,0
chr20	29631704	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=12;MBQ=32,27;MFRL=157,160;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,17:0.276:63:28,12:18,4:17,29,6,11
chr20	29631725	.	T	G	.	.	DP=70;ECNT=12;MBQ=29,32;MFRL=166,158;MMQ=59,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=194.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,55:0.789:69:11,29:3,25:5,9,10,45
chr20	29631733	.	CT	AC,AT	.	.	DP=67;ECNT=12;MBQ=33,28,25;MFRL=169,161,158;MMQ=27,25,27;MPOS=22,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=58.87,31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,17,13:0.257,0.207:65:22,9,7:13,8,6:7,28,5,25
chr20	29632562	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=16;MBQ=33,30;MFRL=183,144;MMQ=33,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,6:0.101:67:26,4:32,2:40,21,6,0
chr20	29632564	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=16;MBQ=31,28;MFRL=170,186;MMQ=55,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=153.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,47:0.697:70:7,22:15,21:16,7,34,13
chr20	29632569	.	CAG	C	.	.	DP=112;ECNT=16;MBQ=32,35;MFRL=183,183;MMQ=40,27;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:101,9:0.090:110:38,5:41,4:74,27,8,1
chr20	29632583	.	T	C	.	.	DP=147;ECNT=16;MBQ=27,32;MFRL=188,131;MMQ=40,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:133,9:0.058:142:71,3:60,6:101,32,8,1
chr20	29632593	.	A	T,G	.	.	DP=176;ECNT=16;MBQ=28,26,33;MFRL=180,195,162;MMQ=42,27,40;MPOS=15,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.47,45.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:140,6,24:0.039,0.124:170:72,1,14:65,5,10:102,38,23,7
chr20	29632605	.	T	C	.	.	DP=208;ECNT=16;MBQ=25,34;MFRL=173,195;MMQ=40,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:202,6:0.033:208:109,1:89,5:0|1:29632605_T_C:29632605:148,54,4,2
chr20	29632611	.	AAAG	A	.	.	DP=217;ECNT=16;MBQ=28,29;MFRL=173,195;MMQ=40,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:209,6:0.032:215:108,1:91,5:0|1:29632605_T_C:29632605:151,58,4,2
chr20	29632632	.	A	G	.	.	DP=226;ECNT=16;MBQ=29,33;MFRL=168,196;MMQ=48,27;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:176,38:0.179:214:91,22:83,15:122,54,27,11
chr20	29632635	.	C	G	.	.	DP=224;ECNT=16;MBQ=32,33;MFRL=169,190;MMQ=46,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:198,13:0.057:211:105,4:89,9:138,60,6,7
chr20	29632638	.	C	A	.	.	DP=218;ECNT=16;MBQ=32,30;MFRL=170,170;MMQ=40,50;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:186,28:0.133:214:91,21:91,7:122,64,24,4
chr20	29632643	.	T	C	.	.	DP=218;ECNT=16;MBQ=28,30;MFRL=167,164;MMQ=40,50;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:204,12:0.059:216:101,5:90,6:130,74,10,2
chr20	29632660	.	G	T	.	.	DP=218;ECNT=16;MBQ=33,27;MFRL=164,146;MMQ=49,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:191,18:0.089:209:86,10:95,8:117,74,15,3
chr20	29632662	.	G	C,T	.	.	DP=220;ECNT=16;MBQ=33,32,25;MFRL=162,166,164;MMQ=57,32,50;MPOS=11,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=244.25,24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:120,78,10:0.375,0.051:208:57,35,3:60,40,6:69,51,62,26
chr20	29632673	.	T	C	.	.	DP=229;ECNT=16;MBQ=28,33;MFRL=162,207;MMQ=51,38;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:202,24:0.107:226:92,13:107,10:116,86,13,11
chr20	29632674	.	T	TA	.	.	DP=228;ECNT=16;MBQ=27,27;MFRL=163,155;MMQ=45,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:192,25:0.111:217:87,16:104,9:111,81,13,12
chr20	29632680	.	G	A	.	.	DP=261;ECNT=16;MBQ=33,30;MFRL=157,164;MMQ=49,27;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:233,9:0.040:242:110,4:119,5:128,105,6,3
chr20	29632707	.	G	A	.	.	DP=263;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=151,146;MMQ=51,50;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:232,24:0.091:256:111,11:117,13:122,110,14,10
chr20	29632709	.	C	T	.	.	DP=260;ECNT=9;MBQ=29,28;MFRL=149,150;MMQ=51,46;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=233.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:188,69:0.270:257:91,33:91,35:0|1:29632709_C_T:29632709:100,88,32,37
chr20	29632714	.	CT	AG	.	.	DP=249;ECNT=9;MBQ=33,28;MFRL=151,151;MMQ=51,46;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=233.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:180,68:0.276:248:85,33:86,31:0|1:29632709_C_T:29632709:92,88,32,36
chr20	29632719	.	C	T	.	.	DP=252;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=150,159;MMQ=50,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:228,20:0.083:248:104,11:108,9:112,116,6,14
chr20	29632726	.	CTATT	C	.	.	DP=254;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=155,155;MMQ=51,43;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATT;STR;TLOD=327.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:121,90:0.428:211:58,46:55,43:56,65,37,53
chr20	29632749	.	A	G,AT	.	.	DP=205;ECNT=9;MBQ=27,32,25;MFRL=163,161,148;MMQ=44,47,46;MPOS=11,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=61.81,7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:142,30,9:0.153,0.040:181:77,9,5:59,21,4:51,91,19,20
chr20	29632759	.	G	A	.	.	DP=176;ECNT=9;MBQ=33,28;MFRL=170,182;MMQ=46,42;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:149,20:0.122:169:73,13:73,7:53,96,8,12
chr20	29632761	.	T	C	.	.	DP=180;ECNT=9;MBQ=30,34;MFRL=140,172;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=572.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,148:0.898:164:4,78:12,63:2,14,54,94
chr20	29632792	.	C	G	.	.	DP=178;ECNT=9;MBQ=33,32;MFRL=170,194;MMQ=50,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:161,11:0.063:172:73,9:79,2:51,110,5,6
chr20	29633770	.	T	TAA	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=27,23;MFRL=198,179;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:4,0:3,2:7,0,3,0
chr20	29633823	.	A	G	.	.	DP=94;ECNT=9;MBQ=28,33;MFRL=165,164;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,31:0.318:90:31,15:27,14:44,15,23,8
chr20	29633844	.	T	C	.	.	DP=137;ECNT=9;MBQ=27,34;MFRL=171,144;MMQ=40,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:124,8:0.046:132:63,4:58,4:83,41,5,3
chr20	29633847	.	AT	A	.	.	DP=144;ECNT=9;MBQ=28,28;MFRL=173,147;MMQ=40,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:132,11:0.083:143:65,6:58,5:0|1:29633847_AT_A:29633847:89,43,9,2
chr20	29633849	.	GGC	G	.	.	DP=148;ECNT=9;MBQ=33,33;MFRL=176,147;MMQ=40,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:136,11:0.080:147:66,6:64,5:0|1:29633847_AT_A:29633847:92,44,9,2
chr20	29633853	.	T	TTA	.	.	DP=148;ECNT=9;MBQ=28,25;MFRL=178,147;MMQ=40,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:137,11:0.080:148:65,6:66,5:0|1:29633847_AT_A:29633847:93,44,9,2
chr20	29633854	.	G	A	.	.	DP=146;ECNT=9;MBQ=33,30;MFRL=180,147;MMQ=40,43;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:134,11:0.082:145:64,6:67,5:0|1:29633847_AT_A:29633847:91,43,9,2
chr20	29633887	.	G	A	.	.	DP=136;ECNT=9;MBQ=33,28;MFRL=179,180;MMQ=50,34;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:115,8:0.072:123:50,3:61,5:71,44,7,1
chr20	29633894	.	C	A	.	.	DP=123;ECNT=9;MBQ=32,24;MFRL=173,135;MMQ=51,29;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,11:0.101:115:40,6:60,5:66,38,6,5
chr20	29633900	.	AA	GA,GG	.	.	DP=161;ECNT=13;MBQ=28,32,33;MFRL=161,182,200;MMQ=51,42,49;MPOS=14,19;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=59.19,7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:126,25,4:0.169,0.032:155:55,11,1:65,14,3:76,50,20,9
chr20	29633902	.	C	A	.	.	DP=161;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=166,117;MMQ=50,50;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:147,7:0.049:154:62,4:80,3:91,56,5,2
chr20	29633915	.	C	T	.	.	DP=146;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=158,163;MMQ=51,27;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:132,5:0.043:137:53,3:71,1:72,60,5,0
chr20	29633916	.	G	T,A	.	.	DP=147;ECNT=13;MBQ=29,27,30;MFRL=151,162,161;MMQ=52,49,50;MPOS=18,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=245.12,119.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,65,38:0.468,0.284:136:17,29,12:16,36,23:17,16,59,44
chr20	29633927	.	C	A	.	.	DP=134;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=154,158;MMQ=51,49;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=240.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,63:0.471:134:31,29:38,33:0|1:29633927_C_A:29633927:44,27,27,36
chr20	29633929	.	A	G	.	.	DP=134;ECNT=13;MBQ=29,33;MFRL=153,159;MMQ=51,49;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=237.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,62:0.463:134:32,29:37,31:0|1:29633927_C_A:29633927:44,28,27,35
chr20	29633938	.	A	G	.	.	DP=118;ECNT=13;MBQ=28,33;MFRL=152,162;MMQ=51,27;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:97,20:0.176:117:43,10:51,9:45,52,13,7
chr20	29633952	.	C	T	.	.	DP=102;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=149,160;MMQ=51,49;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=158.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,42:0.413:102:26,17:27,21:0|1:29633927_C_A:29633927:31,29,14,28
chr20	29633966	.	GTTT	G,GT,GTT	.	.	DP=100;ECNT=13;MBQ=32,34,33,35;MFRL=108,166,161,181;MMQ=60,33,48,31;MPOS=11,15,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,7,8,9;RU=T;STR;TLOD=94.21,135.20,5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:9,25,39,3:0.377,0.456,0.056:76:3,9,15,0:5,12,21,1:2,7,21,46
chr20	29633983	.	A	G	.	.	DP=97;ECNT=13;MBQ=26,35;MFRL=162,181;MMQ=48,31;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,5:0.062:95:33,0:51,5:20,70,1,4
chr20	29633986	.	AT	CA,CT	.	.	DP=99;ECNT=13;MBQ=28,34,34;MFRL=157,188,180;MMQ=49,43,33;MPOS=15,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=28.42,33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:64,12,14:0.131,0.156:90:21,6,5:40,6,9:16,48,3,23
chr20	29634037	.	G	A	.	.	DP=104;ECNT=13;MBQ=33,26;MFRL=196,175;MMQ=57,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=76.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,25:0.255:100:30,12:45,13:0|1:29634037_G_A:29634037:11,64,4,21
chr20	29634049	.	G	C	.	.	DP=83;ECNT=13;MBQ=32,32;MFRL=197,180;MMQ=54,53;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=65.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,20:0.247:83:28,11:31,9:0|1:29634037_G_A:29634037:8,55,4,16
chr20	29847211	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=203,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,1:1,0,6,0
chr20	29960802	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,2:13,0:11,9,2,0
chr20	29965014	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:2,1,4,1
chr20	29966275	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr20	29978212	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:4,0:7,2:0|1:29978212_G_C:29978212:4,8,2,0
chr20	29978216	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0|1:29978212_G_C:29978212:0,0,6,8
chr20	30037783	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr20	30060720	.	GCA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=134,54;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr20	30156903	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=138,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.372:9:2,2:3,1:3,3,3,0
chr20	30232673	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=203,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,0:2,6:1,2,5,1
chr20	30253718	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,3:5,0:10,5,3,0
chr20	30347832	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,1:4,2:8,2,0,3
chr20	30363645	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,8:4,2:6,2,7,3
chr20	30371454	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=128,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr20	30409452	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=214,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,2:4,6:4,3,2,6
chr20	30411427	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:2,2,2,1
chr20	30414334	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=220,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr20	30414560	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,2:8,1:9,4,2,1
chr20	30419813	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:3,0,4,0
chr20	30436641	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=178,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,13:0.499:26:8,9:5,4:0|1:30436641_G_C:30436641:6,7,8,5
chr20	30436666	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=228,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,12:0.520:23:8,11:3,1:0|1:30436641_G_C:30436641:5,6,5,7
chr20	30449181	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=202,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr20	30449325	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=207,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr20	30450504	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=175,68;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:5,7,1,1
chr20	30450638	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=206,180;MMQ=60,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:30450638_G_C:30450638:1,2,0,1
chr20	30450642	.	C	CCCTCTCTTTCTCTTCCTCTCTCCTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=206,180;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:30450638_G_C:30450638:1,2,0,1
chr20	30450645	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=206,180;MMQ=60,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:30450638_G_C:30450638:1,2,0,1
chr20	30496370	.	T	TGC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=149,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:30496370_T_TGC:30496370:0,1,2,0
chr20	30496375	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,24;MFRL=137,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:1,0:0|1:30496370_T_TGC:30496370:1,1,2,0
chr20	30496381	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=149,225;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:2,0:0|1:30496370_T_TGC:30496370:2,1,2,0
chr20	30496386	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=149,225;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0|1:30496370_T_TGC:30496370:2,1,2,0
chr20	30511108	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=183,290;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr20	30527137	.	G	GATTAACTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=184,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr20	30584577	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=187,47;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:7,2:2,0:0|1:30584577_T_C:30584577:4,6,1,1
chr20	30584594	.	C	CAATAT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=201,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:30584577_T_C:30584577:6,5,1,1
chr20	30617734	.	TA	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=241,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:0,0:0|1:30617734_TA_CT:30617734:0,1,0,1
chr20	30617739	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=241,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30617734_TA_CT:30617734:0,1,0,1
chr20	30617742	.	AGCC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=241,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30617734_TA_CT:30617734:0,1,0,1
chr20	30671875	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=177,223;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:0,9,0,2
chr20	30729488	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=220,230;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:4,3,1,3
chr20	30746339	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=168,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:2,0:2,4,4,0
chr20	30749095	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:30749095_G_A:30749095:7,5,1,1
chr20	30749098	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:30749095_G_A:30749095:7,5,1,1
chr20	30753270	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=116,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:4,4:2,2:2,4,2,4
chr20	30795819	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:0,3,6,1
chr20	30897480	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=285,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr20	30904777	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=225,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr20	30914706	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:0,6,1,2
chr20	30919183	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=190,269;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:1,3,0,3
chr20	30946705	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=16,24;MFRL=181,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,0:1,1:0,4,0,2
chr20	30954295	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=151,221;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,2:7,5:8,7,1,6
chr20	30960067	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,85;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,0:4,5:1,8,0,5
chr20	31016314	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=111,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr20	31019024	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=218,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr20	31020646	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=193,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:5,3,2,0
chr20	31020834	.	ATAG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=234,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:31020834_ATAG_A:31020834:0,3,0,1
chr20	31020840	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=234,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:31020834_ATAG_A:31020834:0,3,0,1
chr20	31020842	.	A	ATGAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=234,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:31020834_ATAG_A:31020834:0,3,0,1
chr20	31023074	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:8,12,1,1
chr20	31025163	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=132,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:2,7:11,1:4,9,3,5
chr20	31025231	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=213,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr20	31074443	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.363:12:1,0:5,4:6,2,4,0
chr20	31099311	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	31108805	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=181,265;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:0,7,0,5
chr20	31172302	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,155;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:31172302_A_C:31172302:0,0,2,0
chr20	31172307	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:31172302_A_C:31172302:0,0,2,0
chr20	31189411	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=136,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.752:17:0,3:3,10:3,1,11,2
chr20	31196173	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:7,4,1,1
chr20	31238498	.	A	AGAGCCAGCCTCCTCCTGCGCAACTCCCAGGCCCTTATCAGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=161,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr20	31238587	.	G	GTGGTGTCTCATACTATCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=297,263;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr20	31291161	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,10:0,0,12,9
chr20	31291919	.	GGGCA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=178,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:0,2,2,4
chr20	31292184	.	T	TATG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=94.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,10:0,0,15,8
chr20	31292298	.	CAAAA	C,CA,CAA,CAAA	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=29,33,32,32,27;MFRL=147,160,214,195,130;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=25,18,19,21;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=15,11,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.07,6.95,9.98,8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:5,3,4,5,6:0.128,0.171,0.204,0.259:23:1,0,1,1,1:2,3,3,2,3:2,3,5,13
chr20	31292313	.	AGAGAG	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=160,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:7,1:18,0:0|1:31292313_AGAGAG_A:31292313:5,20,2,0
chr20	31292320	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=35,24;MFRL=158,83;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:4,1:11,0:0|1:31292313_AGAGAG_A:31292313:3,19,2,0
chr20	31292322	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=152,83;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:10,1:0|1:31292313_AGAGAG_A:31292313:2,14,2,0
chr20	31292641	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=220,60;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,2:5,0:5,3,0,2
chr20	31294314	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=149,177;MMQ=35,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.347:11:1,1:5,2:6,1,3,1
chr20	31294655	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr20	31315862	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:5,2:8,3:0|1:31315862_G_A:31315862:7,6,3,2
chr20	31315867	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=172,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:6,2:7,3:0|1:31315862_G_A:31315862:7,7,3,2
chr20	31367948	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:5,3:6,1:3,10,1,3
chr20	31368094	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:9,1,2,0
chr20	31369136	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=173,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.718:12:2,4:0,5:0,3,6,3
chr20	31374259	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=234,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,7:2,3:4,0,8,2
chr20	31374317	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:4,0:8,4,2,0
chr20	31374991	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=121,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,6:1,0:1,0,6,0
chr20	31375311	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=174,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,4:2,3:1,3,1,6
chr20	31380397	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:1,1,3,0
chr20	31381229	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr20	31383353	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.502:24:5,3:6,9:4,8,4,8
chr20	31383530	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=162,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:4,3:2,5,1,2
chr20	31387954	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=192,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.697:17:1,6:3,6:3,2,7,5
chr20	31388101	.	A	AAT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=164,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:11,0:7,2:0|1:31388101_A_AAT:31388101:7,11,1,1
chr20	31388108	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=164,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,1:0|1:31388101_A_AAT:31388101:7,11,1,1
chr20	31389009	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=287,202;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.830:10:0,3:1,4:1,0,9,0
chr20	31413831	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=167,207;MMQ=60,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,1:4,1:0|1:31413831_C_A:31413831:4,10,0,2
chr20	31413839	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=167,207;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,1:5,1:0|1:31413831_C_A:31413831:4,10,0,2
chr20	31427484	.	TTTTG	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTG;STR;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,3:3,6:5,2,9,1
chr20	31427566	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=164,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=61.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.527:36:9,9:8,10:10,7,7,12
chr20	31427635	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=192,176;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,3:4,8:1,5,2,9
chr20	31427694	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=226,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,1:3,3:3,7,0,4
chr20	31446742	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=240,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,3,0
chr20	31455355	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=119,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr20	31473483	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr20	31480936	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,3,1
chr20	31480961	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,6,7
chr20	31486206	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr20	31497525	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=237,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr20	31505356	.	G	GTTTCCACCCTCTTAAGCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:31505356_G_GTTTCCACCCTCTTAAGCC:31505356:0,4,0,1
chr20	31505361	.	CC	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:31505356_G_GTTTCCACCCTCTTAAGCC:31505356:0,4,0,1
chr20	31505365	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=110,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:31505356_G_GTTTCCACCCTCTTAAGCC:31505356:0,3,0,1
chr20	31507949	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=168,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:5,3,2,0
chr20	31571588	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,3:6,0:7,2,3,0
chr20	31573528	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr20	31573769	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr20	31577394	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,2:5,1:6,6,2,1
chr20	31583578	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=200,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:4,2:6,1:1,11,0,3
chr20	31590439	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,2:7,1:7,4,2,1
chr20	31590530	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:4,7,0,2
chr20	31592242	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=249,251;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:0,3,1,1
chr20	31598781	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=158,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:11,1:2,1:13,0,2,0
chr20	31604938	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=175,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:31604938_G_GA:31604938:3,3,1,1
chr20	31604940	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=175,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0|1:31604938_G_GA:31604938:3,3,1,1
chr20	31604942	.	C	CTGAGT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=175,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:31604938_G_GA:31604938:3,3,1,1
chr20	31604944	.	T	TTGAAGCTCAG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=175,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:4,2:2,0:0|1:31604938_G_GA:31604938:3,3,1,1
chr20	31608250	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=179,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:2,3,2,3
chr20	31609433	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=205,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr20	31609581	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=204,164;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,1:4,3:3,7,2,2
chr20	31619357	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=237,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr20	31619578	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,5:6,5:2,6,3,7
chr20	31622768	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:1,4,3,4
chr20	31624368	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:1,3,0,3
chr20	31625376	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=146,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:9,3:8,0:13,4,2,1
chr20	31626621	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=119,225;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,4:2,1:2,0,4,1
chr20	31630724	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=220,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:3,4,1,3
chr20	31644520	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:0,1,1,4
chr20	31647935	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=184,243;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr20	31651583	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=178,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr20	31656837	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	31660543	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=173,136;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:7,5:11,3:9,9,4,4
chr20	31677474	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=212,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:31677474_A_G:31677474:0,2,0,2
chr20	31677476	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=212,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:31677474_A_G:31677474:0,2,0,2
chr20	31688330	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=182,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:2,2,2,4
chr20	31757202	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=209,256;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr20	31760708	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=200,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:3,4:5,2:6,2,4,3
chr20	31768363	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=210,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:3,1,0,2
chr20	31814348	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=161,256;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,1:0,2:1,3,0,3
chr20	31825436	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=201,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr20	31826027	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=158,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:1,4,3,3
chr20	31826088	.	GGCAGTGACCCTGAA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=172,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:0,3,0,7
chr20	31828265	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,0,2
chr20	31876485	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=192,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr20	31897543	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=137,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:5,4,1,1
chr20	31897554	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,3:2,5:5,0,4,4
chr20	31954819	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=16,28;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:3,1:1,2:0,8,0,4
chr20	31954890	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,2:1,5:1,1,2,5
chr20	31975062	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=246,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr20	31975090	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=205,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:1,3:1,9:0,2,6,6
chr20	31981996	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,157;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr20	31984724	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=178,103;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:5,4,0,2
chr20	32000351	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=321,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.874:14:0,8:1,4:1,0,11,2
chr20	32211760	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=18,19;MFRL=57,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:0,1:3,0:0,8,0,3
chr20	32212690	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,250;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,6:2,4:3,2,7,3
chr20	32245546	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr20	32245869	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,279;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:0,5,0,3
chr20	32248163	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=131,97;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.363:20:5,3:3,4:0|1:32248163_C_T:32248163:9,4,3,4
chr20	32248171	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,5:0.262:21:6,5:7,0:1|0:32248163_C_T:32248163:8,8,5,0
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chr20	32399200	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr20	32436359	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=154,86;MMQ=60,25;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:12,3:22,0:14,20,3,0
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chr20	32664864	.	C	CCAG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=168,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:3,3:4,2:4,3,2,4
chr20	32691470	.	AGACT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=223,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GACT;STR;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,2:3,1:0,9,0,3
chr20	32856998	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=228,241;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr20	32881857	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=149,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:3,4:5,1:5,3,5,0
chr20	32891200	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,6:2,2:0,5,0,8
chr20	33001760	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=177,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:33001760_T_TG:33001760:0,10,0,2
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chr20	33037324	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=170,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:8,0:3,2:0|1:33037324_C_T:33037324:3,8,1,1
chr20	33037336	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,3:0.333:10:5,2:2,1:1|0:33037324_C_T:33037324:1,6,1,2
chr20	33057954	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,5:1,6:1,2,3,8
chr20	33057974	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,4:1,6:0,2,0,10
chr20	33068563	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=204,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,0:2,4:1,4,0,4
chr20	33104592	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.501:24:3,5:9,7:5,7,6,6
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chr20	33148861	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr20	33169495	.	AAGAG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=209,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=AG;STR;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.476:17:7,3:2,5:1,8,0,8
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chr20	33334540	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
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chr20	33338325	.	TA	T,TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28,28;MFRL=237,205,230;MMQ=60,60,60;MPOS=22,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.38,7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,4:0.267,0.367:11:2,2,2:2,1,1:0,4,0,7
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chr20	33342477	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=137,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,1:9,2:11,3,3,0
chr20	33345744	.	CTGT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TGT;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:5,1:9,1:6,10,1,1
chr20	33346556	.	ATC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=203,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,1:2,5:4,0,6,0
chr20	33346832	.	GT	G,GTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35,13;MFRL=326,248,174;MMQ=60,60,60;MPOS=24,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.91,6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.421,0.364:7:0,1,0:1,2,1:0,1,0,6
chr20	33451077	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr20	33463042	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=160,63;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,2:12,0:0|1:33463042_G_A:33463042:0,16,0,2
chr20	33463052	.	G	GGC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,2:0.175:15:4,0:9,2:1|0:33463042_G_A:33463042:0,13,0,2
chr20	33463053	.	T	TCCCAAAGTGCTA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,2:0.175:15:4,0:9,2:1|0:33463042_G_A:33463042:0,13,0,2
chr20	33463057	.	G	A,T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,24,32;MFRL=160,63,135;MMQ=60,60,60;MPOS=8,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.11,6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,2:0.176,0.176:14:1,2,0:9,0,2:0,10,0,4
chr20	33470694	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=115,148;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.609:13:1,4:3,4:3,2,2,6
chr20	33470705	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=148,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,3:8,0:4,10,3,0
chr20	33507379	.	AGTGTGTGTGT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=22,17;RU=GT;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.803:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr20	33508588	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr20	33509275	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=200,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.647:18:0,7:6,4:2,4,4,8
chr20	33509523	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:3,4:8,3:7,4,5,3
chr20	33533736	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=174,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:0,4,3,3
chr20	33568815	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,0:5,2:4,6,0,2
chr20	33573888	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,3:3,3:3,5,2,4
chr20	33574022	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,4:2,2:1,1,3,3
chr20	33575036	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=130,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:5,3:1,9:4,2,5,7
chr20	33575347	.	C	CAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=226,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:3,1,3,3
chr20	33575434	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=219,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,1:5,2:6,5,2,1
chr20	33584822	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr20	33584864	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr20	33587553	.	TCC	T,TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31,29;MFRL=0,211,166;MMQ=60,60,60;MPOS=12,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=C;STR;TLOD=4.55,4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.465,0.418:5:0,2,2:0,1,0:0,0,0,5
chr20	33591197	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=210,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.599:13:1,3:4,5:2,3,4,4
chr20	33592474	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr20	33593457	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.723:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr20	33593674	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:2,3:3,2:0,5,0,6
chr20	33594226	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.589:22:3,6:5,7:2,7,7,6
chr20	33595300	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=187,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:2,5:4,1:3,3,4,2
chr20	33604042	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=189,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr20	33609007	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=199,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,2:3,0:5,3,0,2
chr20	33622963	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=134,90;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:11,0:15,4:13,14,1,3
chr20	33632363	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=112,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:7,6,1,1
chr20	33632600	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,539;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	33637606	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=152,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr20	33642732	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=173,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,12:0.766:15:2,5:1,7:0|1:33642732_G_T:33642732:3,0,10,2
chr20	33642737	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=190,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,12:0.722:16:3,4:1,8:0|1:33642732_G_T:33642732:4,0,10,2
chr20	33706575	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr20	33711624	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=133,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:4,0,1,1
chr20	33711716	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:5,7,2,0
chr20	33713959	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=244,245;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,6:2,0:4,0,6,0
chr20	33713963	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=278,245;MMQ=60,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:0,8:1,2:1,0,10,0
chr20	33713975	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=230,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,4:2,2:2,0,6,0
chr20	33714187	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,6:4,4:1,6,5,5
chr20	33732752	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,10:0.289:36:12,10:14,0:15,11,10,0
chr20	33734905	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=180,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,4:6,4:8,1,4,4
chr20	33763932	.	TCTCTGCACAGTCCCCTGACCCTGACTGTCTATCCACAGTTC	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=182,46;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.155:18:3,0:3,2:12,4,1,1
chr20	33763951	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=201,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,5:1,4:1,1,8,1
chr20	33764632	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:1,5,2,6
chr20	33855284	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=197,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:5,3:0,1:0,5,1,3
chr20	33857711	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:4,4:9,2:7,6,4,2
chr20	33867697	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr20	33867924	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,0:8,3:3,8,1,2
chr20	33868014	.	T	TCCGAGATAATGCGGAGAGCCGAAAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=200,248;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr20	33872311	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=171,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:10,2:4,2:5,9,3,1
chr20	33876547	.	TG	CT,AG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,12,15;MFRL=203,145,180;MMQ=60,60,60;MPOS=28,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,0,0:0,0,0:1,3,2,0
chr20	33876556	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=189,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:1,1:0|1:33876556_G_C:33876556:2,4,3,0
chr20	33876560	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,2:3,1:0|1:33876556_G_C:33876556:2,5,3,0
chr20	33876562	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,1:3,1:0|1:33876556_G_C:33876556:2,5,3,0
chr20	33891916	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=149,177;MMQ=60,31;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.467:32:12,4:5,10:5,12,0,15
chr20	33894463	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=202,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.726:16:3,5:0,7:3,1,4,8
chr20	34025756	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=306,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,7:1,3:0,2,1,9
chr20	34050460	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=185,246;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34050460_G_T:34050460:0,1,0,1
chr20	34050463	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=185,246;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34050460_G_T:34050460:0,1,0,1
chr20	34051406	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=140,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:6,4:9,0:5,10,5,0
chr20	34054729	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=178,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:1,0:4,2:4,1,3,0
chr20	34055453	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=192,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr20	34062710	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,1:6,1:5,5,1,1
chr20	34067990	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=213,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr20	34079200	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,6,7
chr20	34091789	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=194,609;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:17,2:9,0:0|1:34091789_C_G:34091789:15,12,0,2
chr20	34091814	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=151,609;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:0|1:34091789_C_G:34091789:10,12,0,2
chr20	34096725	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,104;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:2,1:1,2:3,1,3,0
chr20	34099165	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=225,244;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.393:15:4,5:3,1:8,1,6,0
chr20	34099375	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=185,142;MMQ=60,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:13,8:7,0:8,13,8,0
chr20	34136791	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=310,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:2,1,5,1
chr20	34142257	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=204,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,1:0,4:0,3,0,5
chr20	34142287	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=200,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr20	34142887	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=191,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,0,2
chr20	34144107	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr20	34205035	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=305,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,3:2,4:2,1,6,1
chr20	34205389	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=284,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:1,1,4,1
chr20	34206141	.	G	GGAGGACC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,32;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,1:0,0:0|1:34206141_G_GGAGGACC:34206141:0,2,0,1
chr20	34206147	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:34206141_G_GGAGGACC:34206141:0,2,0,1
chr20	34206149	.	T	TCTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=17,19;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:34206141_G_GGAGGACC:34206141:0,2,0,1
chr20	34206151	.	G	GGGGGAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:34206141_G_GGAGGACC:34206141:0,2,0,1
chr20	34207062	.	CCCCGACT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:3,3:4,4,1,3
chr20	34208516	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr20	34208543	.	T	TGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr20	34214368	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=201,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr20	34215234	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=312,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,3:3,7:4,1,4,6
chr20	34218673	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,7:2,3:3,0,7,3
chr20	34218794	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=131,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,1:4,1:5,6,0,2
chr20	34219987	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=21,33;MFRL=174,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,14:0.750:18:1,5:1,9:0|1:34219987_A_C:34219987:0,4,5,9
chr20	34219990	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=174,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,14:0.750:18:1,4:2,9:0|1:34219987_A_C:34219987:0,4,5,9
chr20	34219994	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=203,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.707:15:2,3:2,6:0|1:34219987_A_C:34219987:0,4,4,7
chr20	34220060	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=198,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.373:25:6,5:9,4:10,6,6,3
chr20	34268874	.	T	TCCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=138,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCA;STR;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,0,4
chr20	34304616	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=171,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.295:14:5,2:3,2:9,1,3,1
chr20	34304684	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=180,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.221:19:6,3:9,0:7,8,2,2
chr20	34304783	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=315,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:0,1,5,4
chr20	34312658	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=209,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,4:0,4:1,2,4,4
chr20	34312713	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=245,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,1:1,4:1,1,0,5
chr20	34319765	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=245,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,1:1,6:0|1:34319765_A_C:34319765:3,0,7,0
chr20	34319775	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=242,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.694:11:1,1:2,7:0|1:34319765_A_C:34319765:3,0,8,0
chr20	34324612	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=216,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:34324612_C_CA:34324612:0,3,0,1
chr20	34324613	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=216,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:34324612_C_CA:34324612:0,3,0,1
chr20	34324626	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=259,164;MMQ=60,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:34324626_A_G:34324626:0,2,0,1
chr20	34324629	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=259,164;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:34324626_A_G:34324626:0,2,0,1
chr20	34328752	.	GT	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:16,2:14,0:15,15,1,1
chr20	34328848	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.819:20:1,10:2,7:0,3,3,14
chr20	34446395	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=276,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr20	34457513	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=217,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:1,2:2,1:0,3,1,3
chr20	34459814	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=303,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.776:7:0,2:1,1:0,1,0,6
chr20	34502107	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=193,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,3:2,7:0,5,6,4
chr20	34535373	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=222,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:3,2:1,4:5,0,5,1
chr20	34542365	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=254,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:1,6:4,5:1,4,1,10
chr20	34543125	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=205,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr20	34560526	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.686:17:3,7:2,5:3,2,11,1
chr20	34568414	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:8,0:3,2:6,5,1,1
chr20	34571846	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=188,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,3:1,2:2,0,5,1
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chr20	34828609	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=235,270;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
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chr20	35090854	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=321,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr20	35154398	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:4,3,0,2
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chr20	35288641	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=163,168;MMQ=60,21;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:3,1,3,0
chr20	35310999	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:9,2:13,1:12,10,1,2
chr20	35396526	.	CTTGATAAAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=217,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr20	35422960	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=90,145;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,2:7,3:5,5,5,0
chr20	35491033	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	35491551	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	35508959	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr20	35539757	.	ATTTATG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=137,272;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTATG;STR;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr20	35563410	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,3:1,0:6,3,3,0
chr20	35563624	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=219,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr20	35675574	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=209,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,2:6,0:1,7,0,2
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chr20	35695535	.	GAAA	G,GAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28,32;MFRL=164,185,195;MMQ=60,60,60;MPOS=7,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.08,4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,3:0.173,0.276:12:4,0,1:2,2,1:4,3,2,3
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chr20	35748039	.	G	GAAAGA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=261,72;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AAAGA;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,1:1,0,0,2
chr20	35748894	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr20	35786188	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr20	35788405	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:35788405_CAA_C:35788405:0,1,1,0
chr20	35788429	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,10;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,0:1,0:0|1:35788405_CAA_C:35788405:0,1,1,0
chr20	35807790	.	G	GCTTATAGACAGGGCCCCGCGGCCGGCACT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.840:4:0,2:0,0:0,0,3,1
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chr20	35828757	.	ATT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.904:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr20	35835657	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=226,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.606:15:1,6:3,3:5,1,7,2
chr20	35835889	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,1,13
chr20	35838372	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr20	35838591	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:35838591_T_C:35838591:0,0,0,7
chr20	35838597	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=171,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:0|1:35838591_T_C:35838591:0,6,0,2
chr20	35852395	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,5,10
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chr20	35860657	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:9,0,4,0
chr20	35869619	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr20	36022539	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=142,256;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:3,1:3,4,1,1
chr20	36031097	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=55.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr20	36361186	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=195,236;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:3,0,1,0
chr20	36375071	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:6,6:1,9:3,4,8,7
chr20	36431202	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=151,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr20	36488508	.	TCTCA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=124,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTCA;STR;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:0,4:1,5:0,1,3,6
chr20	36500313	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,267;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,4:4,0:3,4,3,1
chr20	36561844	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,23;MFRL=164,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr20	36561873	.	G	GCCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,17;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=C;STR;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.810:3:0,0:0,1:0|1:36561873_G_GCCC:36561873:0,0,3,0
chr20	36561876	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:36561873_G_GCCC:36561873:0,0,3,0
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chr20	36919758	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=236,178;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:2,3:8,7:4,6,7,3
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chr20	36932660	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.750:18:1,8:3,6:1,3,5,9
chr20	36932676	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=186,176;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,6:2,6:1,3,3,9
chr20	36932798	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=243,283;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr20	36937246	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr20	36946168	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=206,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr20	36946916	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=196,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:2,4,1,1
chr20	36952373	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=121,93;MMQ=60,56;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,0:8,3:0|1:36952373_A_T:36952373:4,9,0,3
chr20	36952378	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=142,93;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:4,0:9,3:0|1:36952373_A_T:36952373:4,10,0,3
chr20	36959566	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:0,5,0,7
chr20	36983630	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=156,273;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr20	36983670	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:5,0,4,0
chr20	36989269	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=203,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,2:5,1:10,0,3,0
chr20	36989302	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=165,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:6,0,4,1
chr20	36989381	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=142,205;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,6:7,4:4,6,6,4
chr20	36989410	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=164,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:5,2:10,1:7,9,1,2
chr20	36995463	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=125,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:2,5,1,2
chr20	36995478	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=140,535;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr20	36997632	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,6:1,2:6,0,4,4
chr20	37128284	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=123,78;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.188:28:11,0:12,4:6,17,0,5
chr20	37144993	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:16,2:8,5:12,13,0,7
chr20	37146288	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=148,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:11,3:13,0:7,17,0,3
chr20	37159827	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,39;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:9,4,1,1
chr20	37187110	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=196,269;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.328:10:5,1:2,2:5,2,1,2
chr20	37257590	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=101,220;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:6,3:8,3:0|1:37257590_C_G:37257590:7,7,3,3
chr20	37257593	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=155,65;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,2:0.155:17:7,0:7,2:1|0:37257590_C_G:37257590:8,7,1,1
chr20	37272589	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,1,1
chr20	37274861	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=149,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr20	37275580	.	TTC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr20	37278946	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=184,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:6,4,3,2
chr20	37279255	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=196,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:2,4,7,0
chr20	37353649	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=145,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,1:6,1:8,5,1,1
chr20	37356570	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:12,1:3,1:8,7,0,2
chr20	37377545	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=114,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:12,1:14,1:1,27,0,2
chr20	37383841	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.342:15:6,1:4,3:3,7,1,4
chr20	37394795	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=232,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr20	37396262	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=123,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,4:2,4:2,5,5,3
chr20	37400490	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=232,236;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr20	37534582	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=207,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr20	37555322	.	C	CGCG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GCG;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.692:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	37580130	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=192,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:8,0,2,0
chr20	37635027	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=162,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.544:22:6,8:4,4:2,8,1,11
chr20	37643659	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=206,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:0,8,0,3
chr20	37662835	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=190,75;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
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chr20	40102143	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=181,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,13:0.321:41:15,8:13,4:5,23,0,13
chr20	40122209	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=110,437;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,2:12,0:8,9,1,1
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chr20	40710508	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,0:10,2:11,12,1,1
chr20	40743829	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=153,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:6,2,3,2
chr20	40979430	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=154,191;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:1,4,0,3
chr20	40981002	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=230,236;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr20	41101274	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=226,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:0,2,0,4
chr20	41306488	.	G	GAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=A;STR;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.647:12:2,1:2,6:4,0,6,2
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chr20	41400246	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,18;MFRL=201,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:41400229_G_A:41400229:0,4,0,1
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chr20	42089140	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=217,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:6,4:8,9:11,3,7,6
chr20	42142645	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=244,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:0,7,0,2
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chr20	42165121	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=200,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:42165118_T_TATAA:42165118:5,6,1,1
chr20	42196261	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:4,5:9,0:10,3,5,0
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chr20	42198162	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=16,12;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.367:9:0,0:1,0:0|1:42198158_T_G:42198158:2,4,0,3
chr20	42199704	.	GGTGTGT	G,GGT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34,22;MFRL=0,101,153;MMQ=60,60,60;MPOS=25,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,16,17;RU=GT;STR;TLOD=4.17,10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.344,0.583:6:0,1,2:0,1,0:0,0,0,6
chr20	42205061	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=137,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr20	42242700	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=258,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr20	42249479	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.469:13:3,1:4,5:5,2,4,2
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chr20	42264726	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=144,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:0,3,0,6
chr20	42265700	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr20	42265966	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr20	42275499	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=157,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr20	42328749	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=191,244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr20	42328776	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=230,253;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr20	42355664	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=214,231;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:4,0:1,11:0,5,0,11
chr20	42679861	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=175,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr20	42694462	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=149,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,1:9,1:9,8,2,0
chr20	42697255	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:2,3,3,1
chr20	42745033	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=186,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,2:1,0:4,5,0,2
chr20	42788720	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,334;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	42814931	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=191,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.622:14:3,4:2,4:5,0,7,2
chr20	42969798	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=129,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,3,1
chr20	42973935	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=151,301;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,1:3,1:6,4,2,0
chr20	42979444	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,289;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:5,6,2,0
chr20	43034660	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=126,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:7,1,2,0
chr20	43034693	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,2:4,1:8,2,3,0
chr20	43042242	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:43042242_A_C:43042242:2,1,1,0
chr20	43042245	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,15;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:43042242_A_C:43042242:2,1,1,0
chr20	43042248	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,15;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:43042242_A_C:43042242:2,1,1,0
chr20	43042257	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,15;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:43042242_A_C:43042242:2,1,1,0
chr20	43043095	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=226,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:4,1,3,0
chr20	43048342	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,16;MFRL=167,208;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:43048342_T_A:43048342:1,1,1,0
chr20	43048346	.	TC	AA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,16;MFRL=167,208;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:43048342_T_A:43048342:3,1,1,0
chr20	43048355	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,15;MFRL=167,208;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:43048342_T_A:43048342:3,1,1,0
chr20	43048357	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,10;MFRL=167,208;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:43048342_T_A:43048342:3,1,1,0
chr20	43052570	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=284,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr20	43056985	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=192,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:8,1,1,1
chr20	43058096	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr20	43133584	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,281;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,3:6,1:4,9,0,4
chr20	43150507	.	T	TC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=163,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:12,3:8,1:15,5,3,1
chr20	43243363	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:2,6,0,2
chr20	43249591	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=196,245;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr20	43251434	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,227;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:14,4,1,1
chr20	43251767	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=220,235;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr20	43255250	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=68,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:2,3,0,2
chr20	43343930	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr20	43353644	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=164,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:3,4,0,2
chr20	43353709	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr20	43438782	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=85,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.505:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr20	43530234	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=197,169;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,3:5,3:6,5,5,1
chr20	43535162	.	AAAAAAAG	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=191,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.722:27:1,11:3,9:0,7,0,20
chr20	43538733	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=294,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr20	43547537	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=184,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:2,1:2,4:2,2,4,1
chr20	43565458	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=217,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:5,3,2,0
chr20	43567442	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,5:3,2:2,3,0,7
chr20	43600673	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,1:7,4:7,3,4,1
chr20	43743534	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=-1073741815;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr20	43752737	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=265,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,2:2,5:3,4,3,4
chr20	43803725	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=189,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,7:0,4:0,1,0,11
chr20	43836027	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=123,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:12,13:5,0:14,3,17,0
chr20	43836824	.	AG	CC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=148,108;MMQ=53,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:9,0:9,1:15,4,0,3
chr20	43882227	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:17,3:10,0:13,14,3,0
chr20	43883195	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:1,10,0,2
chr20	43926536	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=255,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:4,0,4,1
chr20	43926573	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=201,166;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,6:2,3:1,1,6,3
chr20	43927238	.	A	ACTCTGGG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=222,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:2,0:5,2:0|1:43927238_A_ACTCTGGG:43927238:2,5,1,1
chr20	43927240	.	G	GTGGGTCCAGCACC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=222,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:43927238_A_ACTCTGGG:43927238:2,5,1,1
chr20	43927242	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=222,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:5,1:0|1:43927238_A_ACTCTGGG:43927238:2,5,1,1
chr20	43929473	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=259,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,2:1,4:5,1,6,0
chr20	43929659	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=241,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:5,7:2,4:2,5,4,7
chr20	43955907	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,1:9,1:8,10,0,2
chr20	43964407	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr20	44002665	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:5,2:0,1:0,5,0,4
chr20	44004155	.	CATT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=141,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATT;STR;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:1,3,1,2
chr20	44006078	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,2,3
chr20	44048065	.	C	CG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:1,4:5,6:0,6,4,6
chr20	44053069	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.754:10:0,5:2,3:0,2,2,6
chr20	44098332	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=193,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:44098332_A_G:44098332:0,2,1,0
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chr20	44098343	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=238,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:44098332_A_G:44098332:1,2,1,0
chr20	44144118	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=149,304;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr20	44163988	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:3,1:6,1:2,8,0,2
chr20	44166513	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=196,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:5,4:3,0:8,0,0,5
chr20	44170712	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,3:4,1:9,2,0,4
chr20	44180813	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:1,9,2,0
chr20	44190705	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=144,315;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr20	44208011	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=205,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:0,5,1,4
chr20	44238910	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr20	44259490	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=109,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr20	44259673	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,5:2,1:2,4,4,2
chr20	44333052	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=198,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:4,2,2,1
chr20	44333326	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=266,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:0,1:2,2:1,2,0,3
chr20	44334588	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,2:1,5:1,0,2,5
chr20	44350931	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=207,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr20	44351095	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:4,4:6,1:3,8,1,4
chr20	44352740	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr20	44354349	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=256,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:0,6,0,4
chr20	44354372	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=202,256;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,5:0,1:0,2,0,6
chr20	44354387	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=202,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr20	44417593	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,3:7,1,4,1
chr20	44418471	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=138,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:6,1,2,2
chr20	44418482	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=149,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:8,1,0,2
chr20	44424164	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=214,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr20	44425026	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=124,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr20	44429633	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr20	44430740	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=204,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:7,3:5,1:3,9,1,3
chr20	44439646	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=185,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:8,6:6,3:7,7,5,4
chr20	44439753	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:14,2:16,1:14,16,3,0
chr20	44445434	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=197,196;MMQ=52,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:8,0:2,3:3,7,1,2
chr20	44468982	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,247;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr20	44469366	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.339:24:9,2:7,5:8,8,3,5
chr20	44469902	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=254,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.605:11:1,1:3,1:1,3,7,0
chr20	44470648	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=176,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.376:8:3,1:2,1:3,2,1,2
chr20	44470683	.	G	GCTGACAACTTTTTTTTTTCTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=138,183;MMQ=60,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.374:5:1,0:1,1:2,2,0,1
chr20	44472163	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:2,2,5,0
chr20	44483984	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr20	44511211	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=155,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,2:13,0:14,8,2,0
chr20	44512792	.	CTG	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,60;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,3:4,3:8,7,5,1
chr20	44512996	.	CTTTTTTT	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=136,133;MMQ=60,55;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;RPA=23,16;RU=T;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:5,1:1,1:3,7,0,2
chr20	44513003	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=122,135;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:4,1:3,6,2,1
chr20	44513024	.	AG	GA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=120,133;MMQ=60,55;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,1:4,1:0,11,0,2
chr20	44513357	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.568:26:4,6:7,8:6,5,6,9
chr20	44517360	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:3,1,3,3
chr20	44518843	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=122,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,4:0,2:2,1,4,2
chr20	44519643	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=167,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,1,3
chr20	44520237	.	CCTG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=209,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CTG;STR;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:3,1,3,0
chr20	44522005	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:5,3:4,2:2,7,3,2
chr20	44522594	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=177,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:5,3:0,5:3,2,7,1
chr20	44523248	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=242,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:4,0,6,0
chr20	44523442	.	TC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=177,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,2:4,6:4,6,3,5
chr20	44523782	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,3:6,1:5,6,0,4
chr20	44526783	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,1:7,2:2,9,0,3
chr20	44528055	.	AG	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,18;MFRL=255,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:3,0,1,0
chr20	44528446	.	G	GGC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=190,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.269:12:4,1:5,0:0,9,3,0
chr20	44530838	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=192,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.543:9:3,1:1,4:4,0,5,0
chr20	44569304	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=258,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:7,0:5,6,1,1
chr20	44578776	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,9:0,4:0,0,6,7
chr20	44588109	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr20	44588766	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=141,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr20	44592636	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=288,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr20	44596633	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=108,69;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:7,5:10,0:10,7,4,1
chr20	44596689	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:44596689_G_C:44596689:5,5,1,1
chr20	44596695	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=148,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:8,2:0|1:44596689_G_C:44596689:5,8,1,1
chr20	44596697	.	T	TGGAAAACAG	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=148,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:4,0:9,2:0|1:44596689_G_C:44596689:5,8,1,1
chr20	44599839	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,8,3
chr20	44640959	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=161,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,1:2,1:2,3,2,0
chr20	44641976	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=130,161;MMQ=60,60;MPOS=-13;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:4,2:8,1:0,12,5,0
chr20	44642532	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr20	44645010	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.315:10:4,1:3,1:1,6,1,2
chr20	44657965	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=212,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:8,2,1,4
chr20	44664210	.	G	GTGAGGAGAACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=306,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	44665875	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=178,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:8,3,1,1
chr20	44669299	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,116;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,0:4,3:0,10,0,3
chr20	44671875	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=202,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:4,4,0,4
chr20	44673546	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=153,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:2,2,2,0
chr20	44673722	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:3,3,4,1
chr20	44675136	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr20	44682124	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr20	44691380	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.143:40:16,5:17,0:15,20,5,0
chr20	44698893	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:6,4:10,5:8,8,7,2
chr20	44708041	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=179,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:8,3:9,2:7,10,3,2
chr20	44747086	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=204,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:1,3,0,3
chr20	44756888	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,18;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.329:12:3,2:5,0:6,2,0,4
chr20	44756943	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=19,23;MFRL=287,206;MMQ=50,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=T;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.502:4:0,1:0,0:0|1:44756943_CTT_C:44756943:0,2,2,0
chr20	44756968	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,15;MFRL=151,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.382:8:1,0:4,0:0|1:44756943_CTT_C:44756943:1,4,2,1
chr20	44839203	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=220,90;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.261:16:4,1:8,2:5,7,2,2
chr20	44856091	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44856091_G_C:44856091:0,0,1,0
chr20	44856096	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44856091_G_C:44856091:0,0,1,0
chr20	44856208	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:4,0,2,2
chr20	44985307	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr20	44997702	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=228,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr20	44999028	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,2:4,4:6,1,6,0
chr20	45002951	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=196,84;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.405:20:7,2:5,6:7,5,5,3
chr20	45003159	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:15,2:5,0:10,10,2,0
chr20	45003326	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,4:0,7:0,0,3,8
chr20	45003788	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr20	45113061	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,83;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:8,4:1,0:7,2,3,1
chr20	45113281	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:1,4,0,2
chr20	45113296	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=254,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:0,1,0,6
chr20	45113742	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=122,300;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:5,4,1,1
chr20	45131039	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=205,443;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:8,0:3,2:4,7,2,0
chr20	45188884	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=185,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr20	45192253	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=195,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:5,1:7,7:2,10,0,11
chr20	45192254	.	G	GAGA,GAGAGA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,34,35;MFRL=195,170,178;MMQ=60,60,60;MPOS=21,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.10,11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,2,4:0.186,0.317:18:4,0,1:7,2,3:2,10,0,6
chr20	45221091	.	A	AGGGTGTGTGTGT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=118,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:11,6,0,2
chr20	45221144	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:6,0:9,9:12,3,0,9
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chr20	47256479	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,308;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:5,0:2,2:1,7,1,1
chr20	47260936	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=143,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.241:19:7,3:6,1:9,6,4,0
chr20	47262322	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=231,245;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,1:3,3:8,0,3,1
chr20	47269874	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,255;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:10,1:7,1:13,6,0,2
chr20	47305109	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=180,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr20	47317276	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:7,3:7,2:10,4,3,2
chr20	47324870	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=177,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,1:5,1:5,6,0,2
chr20	47361725	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,3:3,1:2,6,0,4
chr20	47585642	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:0,1:4,4:5,0,3,2
chr20	47604825	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=206,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.802:18:0,10:3,5:3,0,7,8
chr20	47614665	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=247,74;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,4,1
chr20	47621554	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=192,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr20	47628363	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=37,28;MFRL=204,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,2:1,5:4,0,6,1
chr20	47632754	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=235,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:5,0,5,0
chr20	47634006	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=247,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.634:20:7,5:0,7:4,3,10,3
chr20	47675176	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=212,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr20	47682893	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=204,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,5:4,5:3,2,5,5
chr20	47691445	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,1,2
chr20	47734660	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=229,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,1:0,1:1,3,0,2
chr20	47734961	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=178,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,0:5,0:3,4,0,2
chr20	47739555	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=175,275;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr20	47739814	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,4:3,2:2,4,0,6
chr20	47770463	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=133,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:2,0:4,2:3,3,3,0
chr20	47775441	.	A	AAAATAAAT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=145,198;MMQ=60,59;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=AAAT;STR;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.448:9:4,1:1,2:2,3,4,0
chr20	47775474	.	A	AC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=124,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.442:23:5,5:8,3:4,9,9,1
chr20	47839653	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=201,269;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:2,6,0,4
chr20	47843146	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=166,262;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr20	47845472	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=26403121,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47845472_G_A:47845472:1,0,0,1
chr20	47845479	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=26403121,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47845472_G_A:47845472:1,0,0,1
chr20	47850118	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=228,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:7,1:3,9,2,0
chr20	47852822	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=209,298;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:2,2,1,3
chr20	47859217	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=92,214;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:9,5:11,1:17,3,1,5
chr20	47859254	.	CTTTTTTTTTTTTTT	C,CTTTTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,32,35;MFRL=116,235,143;MMQ=40,60,60;MPOS=31,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=23,9,24;RU=T;STR;TLOD=10.34,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,1:0.272,0.227:7:1,1,1:1,1,0:0,3,2,2
chr20	47860464	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=209,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:4,2:3,1:0,8,0,3
chr20	47870971	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:4,0,1,0
chr20	47871277	.	ACCTTGGAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=104,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr20	47872327	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=123,244;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:7,1,5,3
chr20	47872377	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=103,210;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,4:7,2:8,4,3,3
chr20	47874290	.	G	GAAAGTATCCTGTGAGAGCCTCTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=274,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.486:3:0,1:0,0:0,2,0,1
chr20	47882893	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=205,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr20	47892270	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=162,245;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,1:8,1:8,4,2,1
chr20	48130824	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,264;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:5,8,1,1
chr20	48130982	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=157,324;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr20	48156080	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,13;MFRL=119,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:0,1:0,0:3,2,3,0
chr20	48252858	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=132,81;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:13,1:8,3:10,11,1,3
chr20	48259107	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=176,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:3,2:6,0:5,7,1,1
chr20	48260203	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=151,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,5:4,0:3,6,3,2
chr20	48263445	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:5,0,7,0
chr20	48273299	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr20	48481412	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=189,168;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.557:14:3,0:3,7:2,4,0,8
chr20	48522585	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr20	48522608	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=169,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:4,0:4,2:6,3,1,1
chr20	48561893	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,10,11
chr20	48562083	.	G	GTTGGACACC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,5:0,0:0,0,1,5
chr20	48562797	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.673:7:2,2:0,3:0,2,2,3
chr20	48568503	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr20	48599549	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=197,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr20	48600268	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=177,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:5,0,2,1
chr20	48729599	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=22,13;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,0:0|1:48729599_A_C:48729599:2,0,2,0
chr20	48729605	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=15,19;MFRL=189,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:0,0:0,1:0|1:48729599_A_C:48729599:1,0,2,0
chr20	48729677	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr20	48729711	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:3,1:0,1:0,3,0,3
chr20	48744742	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=219,289;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,1:1,2:3,2,1,2
chr20	48809313	.	G	GTGTGCGTGCGTGTGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=207,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:1,1:0,0:0|1:48809313_G_GTGTGCGTGCGTGTGT:48809313:0,1,0,1
chr20	48809316	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,17;MFRL=207,214;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:48809313_G_GTGTGCGTGCGTGTGT:48809313:0,1,0,1
chr20	49191228	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.453:24:6,7:7,2:3,10,1,10
chr20	49195026	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,173;MMQ=60,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:13,4,0,2
chr20	49195248	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=214,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr20	49196167	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:6,1,4,1
chr20	49212822	.	G	GACCTGGAGTGGGCCTCC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=184,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:4,4,1,1
chr20	49214198	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:3,3,0,2
chr20	49225953	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr20	49227294	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=174,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr20	49227544	.	G	GGGCTTAGTGCCGGGCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,2:0,0,3,4
chr20	49236478	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=247,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,4:1,0:3,1,4,0
chr20	49247335	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,271;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,1,1
chr20	49354351	.	CT	C,CTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31,32;MFRL=121,238,0;MMQ=60,60,60;MPOS=9,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=7.42,8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,6:0.249,0.345:17:3,0,4:3,4,1:6,1,9,1
chr20	49434829	.	T	TGCCTGGAAGGCGTGGGTTTAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=117,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCCTGGAAGGCGTGGGTTTAG;STR;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.537:7:2,1:1,0:1,2,0,4
chr20	49507892	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=17,36;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.806:6:0,3:0,2:1,0,5,0
chr20	49508528	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=189,67;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:13,2:3,0:9,7,2,0
chr20	49551780	.	TA	T,TAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31,31;MFRL=131,122,154;MMQ=60,60,60;MPOS=15,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=6.49,12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,4,8:0.174,0.310:26:9,0,1:5,4,7:2,12,2,10
chr20	49575334	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:10,10:4,7:9,5,16,1
chr20	49576054	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=177,35;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:14,2:0|1:49576054_C_T:49576054:16,4,1,1
chr20	49576057	.	A	ATTTTTTTCCCTCTTTTGT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=177,35;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:6,0:14,2:0|1:49576054_C_T:49576054:16,5,1,1
chr20	49576970	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=163,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.143:35:13,1:17,4:13,17,3,2
chr20	49621399	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr20	50008012	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	50015107	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=213,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.580:5:1,2:0,1:2,0,3,0
chr20	50015300	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=17,34;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.467:15:1,1:0,6:1,7,1,6
chr20	50071258	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,2,11
chr20	50090474	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=176,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:6,0:3,2:10,0,2,0
chr20	50092287	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr20	50139584	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=178,253;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr20	50140039	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.319:13:7,1:2,2:7,2,3,1
chr20	50223975	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr20	50224161	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=174,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:1,4,1,1
chr20	50224206	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=192,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr20	50225206	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=145,238;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,1,1
chr20	50226813	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=365,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr20	50238545	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=187,275;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:6,2,2,0
chr20	50244098	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,1:0,9:0,0,8,2
chr20	50256107	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr20	50273578	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,2:5,0:10,5,2,0
chr20	50286484	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=266,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr20	50287553	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr20	50290654	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr20	50310483	.	A	ATC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=134,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:3,0,4,3
chr20	50314052	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:0,7,0,5
chr20	50329416	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr20	50342285	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr20	50342293	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:50342293_G_A:50342293:3,0,1,0
chr20	50342301	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:50342293_G_A:50342293:3,0,1,0
chr20	50342555	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr20	50384738	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=238,234;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50384738_C_G:50384738:1,0,1,0
chr20	50384756	.	AA	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=172,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:50384738_C_G:50384738:2,0,1,0
chr20	50400891	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=162,266;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,9:4,0:7,5,9,0
chr20	50406859	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=213,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:5,5,1,1
chr20	50408810	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=180,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,1:2,1:0,10,0,2
chr20	50705211	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=165,83;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:5,1:2,1:1,6,0,2
chr20	50768672	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=152,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.518:15:4,1:3,7:6,1,6,2
chr20	50782303	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=237,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr20	50782343	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=160,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:3,1,2,1
chr20	50782462	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=176,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:5,2:12,0:9,8,1,1
chr20	50782608	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=224,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:0,7,1,1
chr20	51870469	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=209,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:4,5,1,1
chr20	52557934	.	GGTGTGT	G,GGTGT,GGTGTGTGT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33,32,36;MFRL=261,183,137,153;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,17,29;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,8,10,12;RU=GT;STR;TLOD=10.31,5.34,7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,3,2,3:0.252,0.206,0.311:10:0,1,1,3:2,2,1,0:1,1,8,0
chr20	52601802	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,237;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:7,2:6,3:9,4,3,2
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chr20	52611540	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=135,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:9,1:5,4:9,6,3,2
chr20	52612549	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=182,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:5,3:13,2:6,13,2,3
chr20	52612571	.	C	CTTTTTT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=156,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:10,0:13,2:0|1:52612571_C_CTTTTTT:52612571:12,12,0,2
chr20	52612572	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=156,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:10,0:13,2:0|1:52612571_C_CTTTTTT:52612571:12,12,0,2
chr20	52645534	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=251,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr20	52645559	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=270,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:52645559_T_TA:52645559:0,2,0,1
chr20	52645561	.	AG	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=270,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:52645559_T_TA:52645559:0,2,0,1
chr20	52675188	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=82,158;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.321:13:4,2:4,1:3,6,2,2
chr20	52774579	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr20	52774601	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=164,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr20	52775728	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=148,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr20	52786073	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:8,0,5,0
chr20	52788314	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=241,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:0,5,0,5
chr20	53259964	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=184,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:4,2,1,1
chr20	54823779	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,6:0,0,8,5
chr20	54823805	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=243,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,6:5,1:7,3,6,1
chr20	54824029	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=229,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,3:5,5:6,7,6,2
chr20	54956707	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=201,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr20	54963137	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=96,876;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:5,2,0,2
chr20	54963303	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:5,2:11,0:0|1:54963303_C_T:54963303:3,13,0,2
chr20	54963320	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,4:0.277:16:6,0:6,4:1|0:54963303_C_T:54963303:1,11,0,4
chr20	54973971	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=232,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr20	54974424	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr20	55012154	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=199,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:0|1:55012154_G_C:55012154:5,1,2,0
chr20	55012160	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=197,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:55012154_G_C:55012154:6,1,2,0
chr20	55033856	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:0,5,0,5
chr20	55048283	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=227,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:2,1,2,0
chr20	55048496	.	T	TGAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=189,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr20	55049908	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=231,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr20	55093069	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=234,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr20	55905108	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=197,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr20	55909085	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=152,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.447:36:8,9:12,7:13,7,10,6
chr20	55909211	.	ATTTT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.604:7:0,3:3,1:0|1:55909211_ATTTT_A:55909211:0,3,0,4
chr20	55909233	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=190,128;MMQ=58,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0|1:55909211_ATTTT_A:55909211:0,3,0,3
chr20	55909723	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,3:3,0:4,1,3,0
chr20	55918377	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=196,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,4:5,4:8,3,6,2
chr20	55940426	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=173,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:8,4:5,0:11,2,2,2
chr20	55949872	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=233,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr20	55949894	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=250,76;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr20	55982579	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=267,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,21:0.759:27:3,9:3,12:1,5,10,11
chr20	56078486	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:2,3:7,6:5,4,5,4
chr20	56078690	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:1,2,2,3
chr20	56089629	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,1:11,2:13,8,1,2
chr20	56089711	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:9,1:18,1:18,9,1,1
chr20	56089869	.	GTT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=249,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.856:5:0,4:0,0:0,1,0,4
chr20	56098070	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr20	56099305	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr20	56137061	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=200,284;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:8,0,3,0
chr20	56137184	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,2:6,1:6,7,1,2
chr20	56138040	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=233,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:3,9:4,6:4,3,10,5
chr20	56138068	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=143,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:9,3:8,2:12,5,2,3
chr20	56179586	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=94,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,0:1,2:1,0,2,1
chr20	56185132	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=161,322;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr20	56191610	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=193,235;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0,11,0,2
chr20	56228019	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr20	56265366	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=15,15;MFRL=207,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:0,0:0,0:0|1:56265366_A_AG:56265366:3,0,2,0
chr20	56265370	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=12,24;MFRL=207,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:0,1:0,0:0|1:56265366_A_AG:56265366:3,0,2,0
chr20	56265376	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=13,15;MFRL=202,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:0,0:0|1:56265366_A_AG:56265366:2,1,2,0
chr20	56265389	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=206,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:56265366_A_AG:56265366:2,2,1,0
chr20	56726107	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,6,8
chr20	56793546	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,9:0,0,9,11
chr20	56793899	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr20	56811399	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=231,240;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr20	56821358	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=178,258;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,1:4,1:0,11,0,2
chr20	56823395	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,221;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:0,3:4,5:0,4,0,8
chr20	56826020	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:2,4:7,4:7,2,2,6
chr20	56826934	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,1:4,1:2,6,1,1
chr20	56846413	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=127,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.644:20:3,7:3,6:5,2,8,5
chr20	56846580	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,1,13
chr20	56886062	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.544:33:9,12:6,6:7,8,10,8
chr20	56886235	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:9,5:5,6:4,10,2,9
chr20	57243064	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=151,98;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:12,3:4,0:11,5,3,0
chr20	57266913	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,1:7,2:5,8,2,1
chr20	57268994	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:1,6,0,2
chr20	57273885	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=194,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr20	57415110	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,6,2
chr20	57415455	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=189,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:7,2,1,1
chr20	57415995	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,4,10
chr20	57430477	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=215,257;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr20	57466998	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=145,196;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,0:1,2:0,2,0,3
chr20	57478807	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:5,7:5,9:5,5,11,5
chr20	57564489	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=210,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,1:2,7:6,1,7,1
chr20	57565943	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,10,8
chr20	57569617	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=150,242;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:3,2:1,2:3,4,4,1
chr20	57569816	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,254;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,7:3,0:1,5,0,7
chr20	57570854	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=217,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr20	57572614	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=216,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,1,1
chr20	57598684	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.186:20:9,0:7,3:10,7,0,3
chr20	57610059	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=201,111;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:6,7:8,6:9,5,8,5
chr20	57612390	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=197,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.866:20:0,10:2,8:0,2,2,16
chr20	57613704	.	CAA	C,CA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,17,32;MFRL=104,138,187;MMQ=54,60,60;MPOS=28,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=A;STR;TLOD=4.37,5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,4:0.266,0.336:12:0,0,2:1,1,2:4,1,2,5
chr20	57613713	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=172,104;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,4:5,0:4,7,4,0
chr20	57617698	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=153,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,1:6,2:11,3,3,0
chr20	57769854	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=141,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:3,8,0,2
chr20	57828886	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=148,377;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr20	57828959	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=120,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:57828959_T_A:57828959:2,4,1,1
chr20	57828968	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=148,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:57828959_T_A:57828959:3,6,1,1
chr20	57829821	.	C	CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=121,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=47.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:3,3:1,9:2,2,5,7
chr20	58180249	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=211,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr20	58411441	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr20	58416501	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=149,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,2:7,1:9,4,1,2
chr20	58420336	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=170,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,5:2,7:3,3,5,7
chr20	58440385	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,4:5,0:7,1,4,0
chr20	58497481	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=189,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.493:16:3,6:2,2:4,4,0,8
chr20	58522016	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=205,65;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:15,0:8,2:9,14,1,1
chr20	58522029	.	C	CTTTTCCCATCCAAATATGT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=211,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:15,0:8,2:7,16,1,1
chr20	58523092	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=295,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.284:18:2,2:8,3:4,9,0,5
chr20	58523103	.	AG	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=271,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.300:14:3,1:7,3:0,10,2,2
chr20	58523104	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=303,155;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.697:18:2,4:4,8:0,6,2,10
chr20	58571125	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=200,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,1:3,5:0,3,0,6
chr20	58587484	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=227,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr20	58608828	.	A	ATGTGTGTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,20;RU=TG;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.836:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	58644995	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr20	58645179	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=157,237;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr20	58645861	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:10,0:11,6:8,13,0,6
chr20	59829847	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=263,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:5,4:3,4:6,2,5,3
chr20	60294279	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=225,157;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,7:1,3:0,1,6,4
chr20	60318561	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:4,1,4,0
chr20	60503472	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,2:5,0:2,9,1,1
chr20	60503489	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=191,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:1,7,0,2
chr20	60512079	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,0:0,7:0,2,0,7
chr20	60573983	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr20	60574216	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr20	60575830	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=183,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr20	60578183	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:4,3,1,1
chr20	60582540	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr20	60584328	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=178,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr20	60704108	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=110,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,1:7,1:8,12,1,1
chr20	60704117	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,5,18
chr20	60704185	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr20	60712347	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,9,1
chr20	60712511	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.928:25:0,12:1,12:0,1,7,17
chr20	60718420	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr20	60768615	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:6,6,2,0
chr20	60773041	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr20	60773684	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:4,2,1,1
chr20	60773903	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=158,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:3,2,2,1
chr20	60848348	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.499:24:5,10:7,2:8,4,8,4
chr20	60857034	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=174,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr20	60864390	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=82,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:1,1,1,2
chr20	60881643	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=35.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr20	60882888	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr20	60885142	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=295,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr20	60885428	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=214,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.531:11:1,2:3,2:0|1:60885428_C_A:60885428:2,3,1,5
chr20	60885448	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=157,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:0|1:60885428_C_A:60885428:0,1,4,5
chr20	60886611	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,6:5,5:5,1,6,5
chr20	60888126	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:3,1:3,2,1,1
chr20	60888510	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=122,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,1:3,1:4,4,1,1
chr20	60892100	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=235,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:3,1,1,1
chr20	60892692	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.641:15:1,4:4,4:1,4,7,3
chr20	60893506	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:1,0,4,0
chr20	60895738	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr20	60896031	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,13;MFRL=177,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.394:10:2,0:2,1:2,4,0,4
chr20	60897071	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr20	60897561	.	CC	GA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=174,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0|1:60897561_CC_GA:60897561:0,3,0,4
chr20	60897570	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=184,238;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0|1:60897561_CC_GA:60897561:0,2,0,4
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chr20	60897673	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,34;MFRL=205,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:60897662_AC_CT:60897662:1,0,0,1
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chr20	60905717	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,1:0,7:0,0,3,5
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chr20	60908882	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr20	60908892	.	A	AGTGGG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=181,257;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GTGGG;STR;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:1,1:0,2:1,0,3,0
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chr20	60909744	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
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chr20	60921044	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=162,267;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:1,4,2,0
chr20	60921324	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=220,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:0,5,0,4
chr20	60921701	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,3:0|1:60921701_A_G:60921701:0,0,7,5
chr20	60921721	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=309,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.778:12:2,3:0,3:0|1:60921701_A_G:60921701:1,1,6,4
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chr20	60927475	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
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chr20	60962955	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:15,2:11,1:14,12,1,2
chr20	60963346	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=184,61;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:3,1:5,2,2,0
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chr20	60966571	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=196,234;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:1,5,0,4
chr20	60967941	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=179,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,4:3,0:8,1,4,0
chr20	60969886	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr20	60969929	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr20	60971327	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,13,4
chr20	60990170	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:4,3,2,0
chr20	60992402	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=101,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:2,2,0,2
chr20	61040376	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:61040376_A_C:61040376:0,0,1,0
chr20	61040380	.	CAG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:61040376_A_C:61040376:0,0,1,0
chr20	61040386	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:61040376_A_C:61040376:0,0,1,0
chr20	61048549	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=236,153;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:2,3:7,6:5,4,3,6
chr20	61143364	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,345;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	61150928	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=154,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,2,1
chr20	61167632	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=273,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.712:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr20	61167934	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=209,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr20	61287727	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=223,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr20	61288015	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=152,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,0:6,3:9,2,3,0
chr20	61289958	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr20	61292375	.	G	GGGGGGCCCCCCCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:61292375_G_GGGGGGCCCCCCCC:61292375:0,0,1,0
chr20	61292380	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=230,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:61292375_G_GGGGGGCCCCCCCC:61292375:1,0,1,0
chr20	61292387	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=115,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,1:2,0:0|1:61292375_G_GGGGGGCCCCCCCC:61292375:1,1,1,0
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chr20	61326636	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr20	61331678	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr20	61428679	.	TGTCTGCTGGG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTCTGCTGGG;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.284:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr20	61439696	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=173,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:5,8,0,2
chr20	61439708	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=173,225;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,0:6,2:5,6,0,2
chr20	61441027	.	AGGATGGGG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGATGGGG;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:0,1:2,0:1,1,1,0
chr20	61441061	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=164,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:61441061_G_A:61441061:1,0,0,1
chr20	61441072	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=164,237;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:61441061_G_A:61441061:1,2,0,1
chr20	61456285	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:4,0:1,0:0|1:61456285_T_C:61456285:4,1,0,2
chr20	61456291	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,1:0,0:0|1:61456285_T_C:61456285:4,0,0,2
chr20	61461028	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=184,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,0:4,3:8,4,3,0
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chr20	61462020	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:61462011_TG_CC:61462011:0,0,0,1
chr20	61527563	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=133,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.324:19:6,5:7,0:8,5,4,2
chr20	61528271	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:13,1:7,2:12,8,1,2
chr20	61528306	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=105,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:11,4:6,3:7,10,2,5
chr20	61538427	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,181;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,6:8,0:11,2,6,0
chr20	61541028	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=200,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,4:6,1:8,2,5,0
chr20	61588745	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:4,3:1,0:5,0,3,0
chr20	61595537	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr20	61597946	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=40.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,6,5
chr20	61598731	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:5,5,1,1
chr20	61598899	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
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chr20	61869223	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=132,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.377:14:5,4:4,1:4,5,4,1
chr20	61870075	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=280,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr20	61870465	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=263,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr20	61872905	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,6,5
chr20	61873039	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,10,5
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chr20	61878950	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=174,186;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:7,0:8,8:7,8,2,6
chr20	61880274	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr20	61907075	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr20	61916379	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=244,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.431:9:2,0:3,2:0,5,0,4
chr20	61917241	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr20	61938832	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:61938832_A_C:61938832:2,0,1,0
chr20	61938835	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:61938832_A_C:61938832:2,0,1,0
chr20	61938839	.	CAGCCGG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:61938832_A_C:61938832:2,0,1,0
chr20	61943916	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,251;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,1,1
chr20	61946692	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr20	61950792	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:3,1:2,1:6,0,2,0
chr20	61951326	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr20	61951789	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,1:0,2:0,0,0,5
chr20	61952490	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr20	61953365	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr20	61960998	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=200,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:1,2,2,0
chr20	61990874	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:61990874_T_C:61990874:0,0,0,4
chr20	61990878	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=429,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:61990874_T_C:61990874:0,2,0,2
chr20	62039741	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,20;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.578:7:0,1:1,1:1,2,4,0
chr20	62076653	.	C	CTCGGAATGATGACGATGGTTGCCAGAATA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.132:20:8,1:10,1:11,7,0,2
chr20	62119559	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	62124459	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:4,4:3,2:6,1,4,2
chr20	62163787	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=18,32;MFRL=0,2284028;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:62163787_TG_T:62163787:0,1,0,1
chr20	62163789	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,17;MFRL=0,2284028;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:62163787_TG_T:62163787:0,1,0,1
chr20	62173029	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr20	62173794	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:4,0:12,2:11,5,2,0
chr20	62187439	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr20	62191475	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=241,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:3,2,0,2
chr20	62191492	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,14;MFRL=204,270;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,0:0|1:62191492_T_A:62191492:1,4,2,0
chr20	62191496	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=220,270;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:62191492_T_A:62191492:1,3,2,0
chr20	62191623	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=130,241;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,3:2,0:0,8,2,1
chr20	62193414	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr20	62193587	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=252,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:1,2:2,3:2,1,4,2
chr20	62195220	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=124,304;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr20	62196020	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=207,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:3,2,2,0
chr20	62196033	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=209,213;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr20	62201474	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,265;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:62201474_T_TA:62201474:0,0,1,0
chr20	62201489	.	T	TAAAAATAACCACAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=208,265;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:62201474_T_TA:62201474:1,0,1,0
chr20	62201492	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,15;MFRL=208,265;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:62201474_T_TA:62201474:1,0,1,0
chr20	62202240	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,2,9
chr20	62223371	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr20	62224083	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	62227180	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,328;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr20	62234240	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=155,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr20	62234241	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=168,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.613:6:0,2:2,1:2,0,4,0
chr20	62234273	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr20	62272583	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=193,194;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:4,0,5,0
chr20	62272658	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=348,187;MMQ=52,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:1,11:0,16:0,1,21,8
chr20	62272761	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.590:18:4,5:3,3:1,6,2,9
chr20	62273435	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr20	62275137	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr20	62275140	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=180,175;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:2,2,1,0
chr20	62290663	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=215,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr20	62292562	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	62292794	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,0:11,2:5,11,0,2
chr20	62292821	.	CGCT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=195,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCT;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:2,1:8,1:3,8,0,2
chr20	62294015	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=223,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,5:3,7:4,1,2,10
chr20	62297296	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:8,1,2,0
chr20	62303794	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr20	62309679	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=175,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,1:5,2:4,7,3,0
chr20	62319604	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=265,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:2,2,2,3
chr20	62323006	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=242,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,1:4,0,2,0
chr20	62324391	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=197,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:2,2,2,1
chr20	62326908	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,231;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:8,7,0,2
chr20	62332638	.	A	AC	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=191,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=54.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.882:23:1,13:1,8:1,1,12,9
chr20	62332641	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:15,1:8,1:12,11,1,1
chr20	62332668	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:11,2:10,0:0|1:62332668_G_A:62332668:14,7,0,2
chr20	62332675	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,21;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,1:10,0:0|1:62332668_G_A:62332668:13,7,0,2
chr20	62333115	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:1,4:3,0,6,0
chr20	62337622	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr20	62364885	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr20	62369846	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=211,71890;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,1:3,1:4,4,2,0
chr20	62369895	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=256,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:1,1,5,1
chr20	62370349	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=351,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr20	62372706	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=253,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,2:1,5:1,0,6,3
chr20	62374219	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr20	62374441	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr20	62378392	.	C	CAAGAGAAT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=286,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:0|1:62378392_C_CAAGAGAAT:62378392:2,2,1,1
chr20	62378393	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=286,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0|1:62378392_C_CAAGAGAAT:62378392:2,2,1,1
chr20	62378396	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=286,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:62378392_C_CAAGAGAAT:62378392:2,2,0,1
chr20	62407278	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0|1:62407278_G_GT:62407278:0,0,0,1
chr20	62407280	.	C	CAAACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0|1:62407278_G_GT:62407278:0,0,0,1
chr20	62571394	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=163,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:0|1:62571394_G_A:62571394:8,2,1,1
chr20	62571398	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=163,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,0:4,1:0|1:62571394_G_A:62571394:8,2,1,1
chr20	62571417	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=242,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=G;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.603:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr20	62571454	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,12;MFRL=151,322;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:62571454_G_C:62571454:2,1,1,0
chr20	62571457	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=22,27;MFRL=151,322;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:62571454_G_C:62571454:2,1,1,0
chr20	62571461	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=157,322;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:62571454_G_C:62571454:1,2,1,0
chr20	62576935	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=176,259;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:3,1:7,1:8,3,2,0
chr20	62578045	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=97,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:62578045_A_G:62578045:0,2,0,1
chr20	62578048	.	T	TTCAAGCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,30;MFRL=97,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:62578045_A_G:62578045:0,2,0,1
chr20	62578077	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	62597471	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=170,81;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.233:14:4,0:5,2:10,1,0,3
chr20	62599357	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=8,30;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.704:10:0,4:1,3:0,3,0,7
chr20	62606765	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=186,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr20	62606973	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:1,5,0,4
chr20	62608432	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=178,52;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:7,1:5,9,0,2
chr20	62612574	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.241:31:11,3:13,4:10,14,4,3
chr20	62614338	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:2,9:5,3:7,0,9,3
chr20	62614377	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=167,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,1:11,1:17,8,2,0
chr20	62616256	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,80;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,2:11,0:13,12,0,2
chr20	62631122	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,19;MFRL=153,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,1:7,0:0|1:62631122_T_C:62631122:7,7,1,1
chr20	62631145	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=132,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,3:6,0:0|1:62631122_T_C:62631122:5,6,1,2
chr20	62641554	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=181,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:10,2:0|1:62641554_C_T:62641554:8,11,1,1
chr20	62641557	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=181,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:10,1:0|1:62641554_C_T:62641554:8,11,1,1
chr20	62641575	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,4:5,3:5,6,2,5
chr20	62648208	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,6:5,0:4,6,3,3
chr20	62663416	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=197,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:2,3,0,3
chr20	62669614	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,18;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.300:14:4,1:5,1:0|1:62669614_CA_C:62669614:1,9,4,0
chr20	62669620	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.281:15:4,1:6,3:0|1:62669614_CA_C:62669614:1,10,4,0
chr20	62669625	.	CGCCTTCCT	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:5,0:9,3:0|1:62669614_CA_C:62669614:4,12,3,0
chr20	62669636	.	CTT	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:6,0:10,2:0|1:62669614_CA_C:62669614:6,15,3,0
chr20	62697751	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr20	62698188	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=160,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,1:3,1:10,0,2,0
chr20	62701092	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=149,203;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,1:9,2:11,4,1,2
chr20	62724016	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=211,61;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:5,1,2,0
chr20	62836520	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=224,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,3:4,1:1,8,0,4
chr20	62838866	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=103,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,2:3,5:5,0,5,2
chr20	62838933	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=120,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:5,9:3,5:2,6,10,4
chr20	62839888	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,379;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.615:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr20	62843304	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=204,227;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr20	62851020	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=219,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,6:2,1:3,2,5,2
chr20	62854417	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=201,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,4:3,5:4,3,6,3
chr20	62854444	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=201,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:8,1:5,1:9,6,2,0
chr20	62858693	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=174,223;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr20	62859329	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:7,0:9,3:8,8,1,2
chr20	62868043	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:3,3:7,1:5,5,1,3
chr20	62871232	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=168,182;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:0,4,1,2
chr20	62896665	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=111,196;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,3:4,7:5,4,3,7
chr20	62896696	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=173,76;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,0:12,3:10,14,1,2
chr20	62904542	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=145,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,6:3,3:5,4,5,4
chr21	10863087	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,224;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr21	10907137	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=198,225;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr21	10908803	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=204,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:8,3:11,6:13,6,6,3
chr21	10910253	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=156,171;MMQ=60,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:6,1:7,3:8,6,4,0
chr21	10910291	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=173,177;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:5,3:11,2:8,8,4,1
chr21	10910311	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=178,169;MMQ=60,42;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:4,2:11,3:8,7,2,3
chr21	10914285	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,137;MMQ=40,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,2:8,1:10,2,3,0
chr21	10916290	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=130,182;MMQ=52,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:10,3:7,1:14,3,4,0
chr21	10916293	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=130,166;MMQ=53,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:6,6:6,2:9,3,8,0
chr21	10916322	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=129,184;MMQ=52,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.214:40:16,5:16,3:20,12,4,4
chr21	10916534	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=36,34,33;MFRL=270,215,174;MMQ=60,60,46;MPOS=24,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=T;STR;TLOD=7.98,14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,5:0.316,0.413:12:1,3,3:2,1,2:0,3,1,8
chr21	10920041	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=228,213;MMQ=58,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr21	10920176	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,191;MMQ=49,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:11,2:10,2:9,12,1,3
chr21	10942036	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,2:6,1:1,9,2,1
chr21	10942660	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=184,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:9,1:15,3:19,5,2,2
chr21	10942842	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=187,244;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:13,3:16,1:13,16,1,3
chr21	10942924	.	CCTT	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=145,111;MMQ=52,55;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.212:45:16,5:20,4:17,19,4,5
chr21	10944828	.	CAAG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=178,190;MMQ=60,47;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:4,1:6,3:1,11,1,3
chr21	10951438	.	CAAAT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,157;MMQ=60,46;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAAT;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:13,2:11,1:8,17,0,3
chr21	10959771	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=148,139;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:6,1:16,3:14,8,3,1
chr21	10959881	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=155,141;MMQ=50,30;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,2:6,2:0,10,1,3
chr21	10973619	.	CATGG	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=131,102;MMQ=45,55;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=ATGG;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:4,0:9,2:7,7,1,1
chr21	10973787	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=144,190;MMQ=58,29;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:3,6:12,2:4,11,3,5
chr21	10973798	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=151,183;MMQ=59,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:3,5:9,2:3,9,2,5
chr21	11049503	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=188,215;MMQ=40,34;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:14,2:7,2:3,18,1,3
chr21	11049516	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,7:0,0,2,19
chr21	11058119	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=211,207;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:9,4:3,2:6,6,1,5
chr21	11058146	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=165,207;MMQ=52,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:18,2:10,2:17,12,0,4
chr21	11058330	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=142,198;MMQ=33,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,4:0.065:74:36,4:34,0:26,44,0,4
chr21	11058349	.	T	G	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=154,187;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=40.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,17:0.339:51:18,7:16,10:12,22,4,13
chr21	11058404	.	A	ACT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=247,191;MMQ=60,56;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CT;STR;TLOD=49.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.780:16:0,5:3,6:0,3,4,9
chr21	11098626	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=169,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:3,1,4,1
chr21	11098674	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,4:0,10:0,0,6,8
chr21	11098826	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=205,89;MMQ=60,37;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:2,7,0,2
chr21	11098863	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=319,220;MMQ=60,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr21	14982886	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=171,201;MMQ=45,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:1,1:6,9:3,4,4,6
chr21	14982952	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=170,181;MMQ=52,37;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:3,5,3,5
chr21	14990578	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=169,176;MMQ=27,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr21	14992475	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=158,211;MMQ=24,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:5,1,0,3
chr21	14995256	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=152,66;MMQ=52,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.211:13:3,2:7,0:0|1:14995256_G_T:14995256:2,9,0,2
chr21	14995257	.	G	GTGATTTCCAGTAAAGTCTCCAGAAATCA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=152,66;MMQ=52,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.211:13:2,2:5,0:0|1:14995256_G_T:14995256:2,9,0,2
chr21	15011825	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr21	15011980	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=163,190;MMQ=40,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:5,4,1,1
chr21	15011983	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=169,151;MMQ=44,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:5,3,1,2
chr21	15013735	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=133,58;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:6,8:1,10:1,6,14,4
chr21	15481234	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr21	15516951	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=161,154;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:11,0:5,8:7,9,0,8
chr21	15516976	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr21	15535889	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=146,281;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:0,5,1,1
chr21	15537727	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=156,249;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:2,8,0,4
chr21	15561341	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15561341_A_G:15561341:0,0,1,0
chr21	15561345	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15561341_A_G:15561341:0,0,1,0
chr21	15561781	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=214,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr21	15596882	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:2,4:0,2:0,2,0,6
chr21	15599144	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr21	15748186	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,3:0,6:0,0,1,10
chr21	15755349	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=226,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:1,6:5,6:6,0,7,5
chr21	15858207	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=182,91;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:2,3:8,0:10,0,2,1
chr21	15884949	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0,7,0,3
chr21	15893567	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=169,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,2:5,3:0,11,1,4
chr21	15893594	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr21	15954528	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=143,243;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:12,4:5,2:12,5,4,2
chr21	15966421	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=97,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:8,3:5,2:4,9,0,5
chr21	15974407	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=185,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:0|1:15974407_A_G:15974407:7,9,1,2
chr21	15974409	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0|1:15974407_A_G:15974407:0,0,8,11
chr21	15988184	.	CAAAAA	C,CAAA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,34,35;MFRL=89,123,126;MMQ=60,60,60;MPOS=27,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=25,20,23;RU=A;STR;TLOD=5.46,13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,4:0.200,0.334:12:1,2,4:0,0,0:1,5,6,0
chr21	15988213	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=116,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.309:21:4,1:8,0:0|1:15988213_C_A:15988213:6,9,6,0
chr21	15988220	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=116,126;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.121:22:7,0:10,0:0|1:15988213_C_A:15988213:8,12,2,0
chr21	15991989	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=132,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:12,5:8,2:9,11,2,5
chr21	16015250	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=222,83;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,0:1,5:1,0,5,1
chr21	16339852	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=146,240;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:8,3:9,2:10,8,3,2
chr21	17102680	.	ACCGCCGCCGCCGCCG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=85,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,3;RU=CCG;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:1,1:0|1:17102680_ACCGCCGCCGCCGCCG_A:17102680:4,3,1,1
chr21	17102711	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=158,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:3,0:7,2:0|1:17102680_ACCGCCGCCGCCGCCG_A:17102680:8,4,1,1
chr21	17181226	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=154,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:14,0:4,2:0|1:17181226_C_T:17181226:6,12,1,1
chr21	17181236	.	TTA	CGG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=134,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,0:4,2:0|1:17181226_C_T:17181226:5,12,1,1
chr21	17238521	.	AAT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AT;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr21	18814246	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=273,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.504:8:1,0:3,2:0,4,0,4
chr21	18885546	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,273;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:1,4,1,1
chr21	18932934	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr21	18938080	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=142,173;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:1,6,1,1
chr21	18966724	.	GACAA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=190,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACAA;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr21	18976385	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.361:20:8,5:5,2:12,1,5,2
chr21	19165942	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=186,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:4,3:0,5:0,4,0,8
chr21	19167479	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=178,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,4,0
chr21	19169218	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,189;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:6,4:10,4:8,8,6,2
chr21	19190427	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,12,0
chr21	19651241	.	GTTTT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=193,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=23,19;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:0,1:1,0:1,2,1,0
chr21	19653342	.	ATT	A,AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28,28;MFRL=162,216,171;MMQ=60,60,60;MPOS=16,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.02,18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,8:0.198,0.655:12:0,0,1:2,2,7:2,0,9,1
chr21	19666526	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=193,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.455:20:5,6:6,3:0|1:19666526_C_T:19666526:11,0,9,0
chr21	19666530	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=193,224;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:5,6:5,3:0|1:19666526_C_T:19666526:11,0,9,0
chr21	19666910	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=147,202;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,3:5,4:8,3,2,5
chr21	19685405	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=100,236;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:3,7,1,1
chr21	19687376	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr21	19701421	.	GCT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=176,238;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:2,0,3,1
chr21	19704296	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	19744415	.	A	ATGTGTG,ATGTGTGTGTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28,28;MFRL=0,217,224;MMQ=60,40,40;MPOS=6,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,23,25;RU=TG;STR;TLOD=4.18,3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.513,0.355:2:0,0,0:0,1,1:0,0,2,0
chr21	19752840	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=182,148;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:3,4:8,0:6,5,4,0
chr21	19770117	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=202,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:2,3,2,0
chr21	22658544	.	TTTTGTGA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTGTGA;STR;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.785:7:1,2:0,4:1,0,5,1
chr21	22696837	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,3,9
chr21	22696881	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr21	22746136	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=178,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:2,1:5,1:7,1,2,0
chr21	22841123	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=195,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:2,5,0,2
chr21	22910116	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=216,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:6,4:1,0:0|1:22910116_C_T:22910116:5,2,3,1
chr21	22910123	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=196,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:5,4:3,1:0|1:22910116_C_T:22910116:6,2,4,1
chr21	26541984	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=104,71;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:8,2:9,0:5,13,2,0
chr21	26960189	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=236,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr21	26961086	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=273,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,3:0,4:2,0,6,2
chr21	26965100	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=230,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.825:9:1,5:0,3:0,1,7,1
chr21	26966317	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,1,3
chr21	26973663	.	A	ATATACT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=70.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.907:19:1,7:0,6:1,0,10,8
chr21	26976250	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=197,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:3,10:4,8:2,5,9,9
chr21	26979628	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=326,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:1,5:0,4:1,0,10,0
chr21	27081840	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=197,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,1:6,0:0|1:27081840_G_T:27081840:2,12,1,1
chr21	27081842	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=197,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:0|1:27081840_G_T:27081840:2,12,1,1
chr21	27081844	.	G	GTAAATTTTTTTT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=197,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:0|1:27081840_G_T:27081840:2,12,1,1
chr21	27141273	.	C	CATTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATTT;STR;TLOD=52.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,8:0,0,10,2
chr21	27326859	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=208,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,6:1,5:2,0,7,4
chr21	27327100	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr21	27327862	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr21	27327918	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.257:33:10,1:15,7:11,14,7,1
chr21	27348447	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=210,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr21	27840793	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=177,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.361:23:7,6:7,2:7,8,5,3
chr21	27852724	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:4,1:7,1:0|1:27852724_A_G:27852724:5,6,0,2
chr21	27852726	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=139,151;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,3:0.267:13:2,3:8,0:1|0:27852724_A_G:27852724:2,8,3,0
chr21	27945141	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:12,2:8,2:12,8,3,1
chr21	28209876	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=189,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:4,5:8,4:9,3,7,2
chr21	28210657	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,8,11
chr21	28212943	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,277;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:1,6,0,4
chr21	28214238	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:9,6:4,9:4,9,9,6
chr21	28215826	.	C	CACA	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=214.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,25:0,22:0,0,27,23
chr21	28215836	.	GC	G	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=178.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,25:0,30:0,0,28,27
chr21	28216445	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr21	28217320	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr21	28296821	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:10,5,2,0
chr21	28305193	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:8,1:7,2:0|1:28305193_G_A:28305193:11,4,0,3
chr21	28305212	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:18,5:0.238:23:7,3:11,2:1|0:28305193_G_A:28305193:10,8,2,3
chr21	30250615	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,7,8
chr21	30257729	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=245,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:0,9:1,10:0,1,1,18
chr21	30303388	.	GGTGT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=GT;STR;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:1,3:0,0:2,0,3,0
chr21	30315681	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=151,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:6,1:7,6:5,8,2,5
chr21	30315730	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:0,5,0,4
chr21	30316304	.	T	TTTAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=172,120;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr21	30316305	.	G	GAT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=172,120;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.355:6:3,0:1,2:0|1:30316305_G_GAT:30316305:0,4,0,2
chr21	30316308	.	A	AAGAAATCT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=172,120;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.355:6:3,0:1,2:0|1:30316305_G_GAT:30316305:0,4,0,2
chr21	30318116	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:11,1,2,0
chr21	30318466	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=165,245;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:9,2:5,1:8,6,2,1
chr21	30330783	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=133,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.185:21:6,1:11,3:13,4,1,3
chr21	30333862	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=182,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:1,1:0,0:0,1,0,3
chr21	30338153	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:5,1:7,3:9,6,3,1
chr21	30338293	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr21	30343003	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,285;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:4,8,1,1
chr21	30354759	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,0:2,3:1,5,0,3
chr21	30357307	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr21	30365322	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=183,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,1:7,6:0,9,0,7
chr21	30378926	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=206,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:9,2:0|1:30378926_C_T:30378926:7,12,0,2
chr21	30378932	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=206,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:13,1:0|1:30378926_C_T:30378926:6,15,0,2
chr21	30391510	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,1:9,1:10,4,1,1
chr21	30391671	.	GAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr21	30408670	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=192,146;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:5,1:8,4:5,8,2,3
chr21	30414724	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=151,134;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr21	30433791	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=22,29;MFRL=117,237;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,2:11,1:9,7,2,1
chr21	30433809	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=159,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:0|1:30433809_A_T:30433809:14,10,1,1
chr21	30433814	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=159,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:0|1:30433809_A_T:30433809:14,10,1,1
chr21	30442475	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0|1:30442475_T_C:30442475:0,0,10,0
chr21	30442481	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0|1:30442475_T_C:30442475:0,0,10,0
chr21	30445774	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:11,1:8,4:15,4,2,3
chr21	30445961	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:1,5,1,4
chr21	30464916	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=170,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,2:0,0:1,1,1,1
chr21	30532437	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=171,265;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,1:5,1:0,8,0,2
chr21	30693791	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:11,1:2,1:4,9,0,2
chr21	30714776	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.623:22:5,9:3,4:3,5,10,4
chr21	30909637	.	T	TTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTCTCTCTC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=164,78;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.143:18:10,2:6,0:0|1:30909637_T_TTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTCTCTCTC:30909637:4,12,0,2
chr21	30909645	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=164,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:9,3:4,0:0|1:30909637_T_TTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTCTCTCTC:30909637:4,12,0,3
chr21	30910045	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=129,317;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,1:9,1:7,7,1,1
chr21	30925853	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.794:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	30925928	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=134,270;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:4,5,1,1
chr21	30927511	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,1:10,2:10,10,1,2
chr21	30961131	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=111,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:8,1,2,0
chr21	30963590	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr21	31538704	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:11,4:7,5:5,13,3,6
chr21	31538819	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=196,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:7,5:9,0:11,5,5,0
chr21	31539006	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=145,66;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.316:20:8,4:6,2:7,7,2,4
chr21	31654448	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr21	31709358	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=156,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:6,7,2,0
chr21	31709847	.	AG	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:11,2:14,1:14,11,2,1
chr21	31720724	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=166,237;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:7,6,1,1
chr21	31797936	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=213,264;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.205:18:2,0:9,3:10,5,0,3
chr21	31812772	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=299,125;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.862:12:0,6:1,5:0,1,8,3
chr21	31859677	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=207,162;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,23:0.803:28:1,9:4,14:1,4,10,13
chr21	31864339	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=170,116;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:9,0:2,2:2,9,0,2
chr21	31869157	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,1476;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:6,4,2,0
chr21	31869515	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=188,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:2,0:7,2:0,9,0,2
chr21	31913981	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,10:0,2:0|1:31913981_AG_A:31913981:0,0,11,2
chr21	31914000	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0|1:31913981_AG_A:31913981:0,0,12,5
chr21	31973516	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,10,7
chr21	32201951	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:8,3:6,3:5,9,3,3
chr21	32201969	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=81.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,9,13
chr21	32202106	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=196,218;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:3,1:5,3:0,8,1,3
chr21	32490970	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:11,2:9,1:11,9,1,2
chr21	32493204	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=192,241;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,1,4
chr21	32524852	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr21	32525302	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,10,3
chr21	32585809	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,3:2,1:0,5,1,3
chr21	32598003	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=106,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,1:2,0,4,0
chr21	32598005	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=207,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,0:2,0:0|1:32598005_C_A:32598005:4,0,2,0
chr21	32598012	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=206,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,0:0|1:32598005_C_A:32598005:5,0,2,0
chr21	33039774	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=186,304;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr21	33044154	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.089:32:14,1:14,1:10,20,0,2
chr21	33069126	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=218,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:4,2:0,8,0,3
chr21	33355760	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=127,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr21	33362554	.	GGA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GA;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	33371540	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,5,14
chr21	33641240	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=119,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:10,3:3,2:14,0,5,0
chr21	33641251	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=146,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.241:22:6,2:4,3:17,0,5,0
chr21	33690191	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,2:8,0:12,8,0,2
chr21	33690293	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:0,3,1,4
chr21	33691502	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,3:0,11:0,0,10,6
chr21	33691754	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=130,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.665:10:1,5:2,1:1,2,1,6
chr21	33694224	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=146,226;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,3:2,6:2,4,2,7
chr21	33697652	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=203,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,0:7,2:6,12,1,1
chr21	33706403	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=210,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:8,5:9,0:17,0,5,0
chr21	33709663	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=25,12;MFRL=242,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.611:6:2,0:0,0:0|1:33709663_G_C:33709663:1,1,4,0
chr21	33709668	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=21,8;MFRL=228,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.609:6:1,0:0,0:0|1:33709663_G_C:33709663:2,0,4,0
chr21	33709672	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=25,14;MFRL=228,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.609:6:2,0:0,0:0|1:33709663_G_C:33709663:2,0,4,0
chr21	33709676	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=22,12;MFRL=228,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.609:6:2,0:0,0:0|1:33709663_G_C:33709663:2,0,4,0
chr21	33709682	.	TG	AC	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=26,15;MFRL=217,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.376:6:1,0:2,0:0|1:33709663_G_C:33709663:3,1,2,0
chr21	33709689	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=186,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:3,0:4,1,2,0
chr21	33711229	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=188,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:3,0:6,2:2,7,0,2
chr21	33717717	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=157,91;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:12,0:14,3:13,13,0,4
chr21	33721843	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=441,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr21	33726201	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=182,270;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:4,0,4,0
chr21	33733468	.	AAAAG	A,AAAAGAAAGAAAGAAAG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28,28;MFRL=0,159,182;MMQ=60,60,40;MPOS=23,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,14;RU=AAAG;STR;TLOD=6.37,10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.394,0.474:5:0,0,0:0,2,1:0,0,0,5
chr21	33733506	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=186,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr21	33740637	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=239,237;MMQ=52,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,4,1
chr21	33840208	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=195,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:33840208_A_G:33840208:0,4,0,2
chr21	33840213	.	A	AAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=195,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AT;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:33840208_A_G:33840208:0,4,0,2
chr21	33867280	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=192,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:6,1,5,0
chr21	33975316	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=233,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,5:3,0:8,0,5,0
chr21	33975546	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=186,113;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,0:13,2:15,9,0,2
chr21	33982072	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=184,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:4,0,4,0
chr21	33997466	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr21	34003928	.	A	AAGTATT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=150,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=86.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.875:22:1,9:1,7:0,2,11,9
chr21	34017857	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=248,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr21	34050939	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=200,241;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0|1:34050939_TA_T:34050939:1,1,3,0
chr21	34050941	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=200,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0|1:34050939_TA_T:34050939:1,1,3,0
chr21	34059207	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr21	34072139	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=136,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,2:8,2:9,5,4,0
chr21	34117067	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=199,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.378:11:0,3:4,1:6,1,3,1
chr21	34127438	.	TAA	T,TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25,25;MFRL=199,243,169;MMQ=60,60,60;MPOS=21,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=5.07,11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,5:0.349,0.441:11:1,1,1:1,3,4:2,0,9,0
chr21	34127589	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=155,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,0:9,2:8,14,2,0
chr21	34128717	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr21	34133414	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,0:7,2:5,5,0,2
chr21	34134584	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=116,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,0:7,2:10,8,2,0
chr21	34136831	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=120,43;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:7,8,1,1
chr21	34157204	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=198,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.374:9:3,0:1,3:1,5,1,2
chr21	34157235	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=353,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.788:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr21	34165926	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,0:4,2:7,0,1,1
chr21	34169181	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chr21	34169317	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,7:3,4:4,5,3,8
chr21	34401161	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=140,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,1:4,1:7,6,1,1
chr21	34538065	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr21	34540800	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=141,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,2:14,0:0|1:34540800_G_A:34540800:12,12,1,1
chr21	34540805	.	G	GATTCACAGA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=132,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:0|1:34540800_G_A:34540800:9,11,1,1
chr21	34542150	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=110,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:8,3,0,2
chr21	34542356	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:5,1,4,1
chr21	34617213	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,7:0,0,12,6
chr21	34617404	.	TTGGTAAACATATTATTG	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=176,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.255:14:3,0:5,3:0|1:34617404_TTGGTAAACATATTATTG_T:34617404:1,10,3,0
chr21	34617426	.	GTTATATGGGGAGAGGTGA	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=185,65;MMQ=23,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:1,0:8,3:0|1:34617404_TTGGTAAACATATTATTG_T:34617404:1,20,3,0
chr21	34617729	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr21	34617950	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr21	34624386	.	C	CATCTATCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=ATCT;STR;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.872:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr21	34624917	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,12,4
chr21	34633052	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=108,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:34633052_T_G:34633052:5,8,1,1
chr21	34633062	.	TTTCTA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=161,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:34633052_T_G:34633052:4,9,1,1
chr21	34635065	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=188,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,2:3,4,1,4
chr21	34638859	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr21	34638893	.	C	CCGAAGGCTCTTAAGTCACT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=246,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr21	34648808	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=236,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr21	34649123	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=215,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,8:1,2:0,1,0,10
chr21	34697264	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=139,277;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,0:5,3:8,0,3,0
chr21	34707808	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=123,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:5,2:5,2,2,0
chr21	34726127	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=234,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,7:0,2:0,1,0,9
chr21	34793706	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr21	34805239	.	CG	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:34805239_CG_TT:34805239:0,3,0,1
chr21	34805242	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:34805239_CG_TT:34805239:0,3,0,1
chr21	34823252	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,1:6,1:1,6,0,2
chr21	34878454	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=177,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.580:10:4,2:0,3:0|1:34878454_CT_C:34878454:0,4,0,6
chr21	34878488	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=135,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:34878454_CT_C:34878454:0,3,0,1
chr21	34882159	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=50.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.530:32:7,0:8,17:7,8,0,17
chr21	34894623	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=171,317;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr21	34900934	.	A	ATGAATTGGAGCAGGTTCAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=186,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:0,6,1,1
chr21	34901062	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=191,164;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:2,0:0,2:2,1,1,1
chr21	34915324	.	CG	GC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,4:0,0,15,2
chr21	34926260	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,5:8,3:6,6,4,4
chr21	34941866	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=128,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:16,0:26,3:22,20,0,3
chr21	34948684	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=87.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0|1:34948684_G_GA:34948684:0,0,13,9
chr21	34948696	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,7:0,13:0|1:34948684_G_GA:34948684:0,0,13,9
chr21	34950609	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:5,3,1,1
chr21	34954602	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=145,284;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr21	34959776	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=127,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,3:8,0:10,11,3,0
chr21	35003786	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,0:13,2:16,9,2,0
chr21	35094849	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=216,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:3,4:2,0:4,1,4,0
chr21	35107734	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=184,235;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:0,1:2,2:0,2,0,4
chr21	35124253	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:2,4,0,4
chr21	35138326	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=172,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,3:4,2:5,6,0,5
chr21	35144568	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=155,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.158:29:14,2:11,2:13,12,2,2
chr21	35190802	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=194,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.397:13:4,3:4,2:5,3,2,3
chr21	35190869	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr21	35201281	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,4:3,4:3,6,1,7
chr21	35228953	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr21	35247611	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:5,0,2,2
chr21	35254453	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=209,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr21	35279604	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=243,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,4,1
chr21	35284502	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=152,298;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:3,1,3,0
chr21	35284734	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=195,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,3:2,6:1,2,0,9
chr21	35446136	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:0,7,0,5
chr21	35467472	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,9:0,0,12,5
chr21	35468725	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,1850;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,0:7,5:5,6,5,0
chr21	35469245	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:9,0:11,3:13,7,0,3
chr21	35469708	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,9:0,0,10,11
chr21	35469726	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=62.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,11,10
chr21	35470291	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=184,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:3,3:5,1:4,4,2,2
chr21	35470541	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=174,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:0|1:35470541_A_G:35470541:10,12,1,1
chr21	35470547	.	C	CTGCACA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=172,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:13,2:0|1:35470541_A_G:35470541:11,12,1,1
chr21	35470550	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=165,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:8,0:13,2:0|1:35470541_A_G:35470541:11,11,1,1
chr21	35475614	.	TAAAA	T,TAAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27,19;MFRL=204,143,201;MMQ=60,60,60;MPOS=30,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,12,15;RU=A;STR;TLOD=6.28,5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,4:0.178,0.340:12:0,1,2:4,1,0:1,5,4,2
chr21	35773104	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,2:5,0:8,6,1,1
chr21	35774246	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,240;MMQ=30,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr21	35791811	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=194,72;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:18,4:13,0:19,12,3,1
chr21	35893737	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=122,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,4:3,2:3,1,6,0
chr21	35895922	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.308:37:15,11:11,0:8,18,11,0
chr21	35899059	.	A	AC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=188,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.475:17:5,2:4,5:5,4,3,5
chr21	36042579	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=173,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:36042579_C_G:36042579:3,0,1,0
chr21	36042584	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=173,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:36042579_C_G:36042579:3,0,1,0
chr21	36079492	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=250,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,4,1
chr21	36079735	.	G	GCACACACACA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=0,193;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,21;RU=CA;STR;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.820:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr21	36080204	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,12,4
chr21	36080398	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=218,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:1,4,0,3
chr21	36080908	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr21	36081626	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:1,1:9,3:6,4,4,0
chr21	36171652	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.124:46:18,0:23,5:20,21,0,5
chr21	36193871	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr21	36206932	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr21	36265323	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,1:3,1:2,4,0,2
chr21	36421036	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=280,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,5:3,4:4,0,9,0
chr21	37408608	.	AACGT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=118,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACGT;STR;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:0,3:2,0:0,2,1,2
chr21	37414194	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr21	37420785	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=247,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr21	37425955	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,0:3,9:0,5,2,7
chr21	37425971	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=150,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:0,5,1,3
chr21	37429679	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=173.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,26:0,25:0,0,32,19
chr21	37429778	.	TAA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=230,255;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr21	37431265	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:5,4:0,9,0,6
chr21	37518362	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr21	37572679	.	TGCTGCTCACCCTGTACGAGAAGTACTTCCTCCCACTGCAGAA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=185,53;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.168:17:4,0:4,2:7,8,1,1
chr21	37572810	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=151,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.373:19:5,5:7,1:6,6,2,5
chr21	37583893	.	GT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,167;MMQ=60,56;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,0:14,3:10,13,0,3
chr21	37586877	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr21	37619931	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.241:15:6,2:6,1:4,8,0,3
chr21	37623447	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=92,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:2,0,4,0
chr21	37626011	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=223,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,5:1,0:1,0,5,0
chr21	37653705	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=58,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr21	37661180	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=163,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr21	37664372	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=103,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,1:5,2:2,3,1,2
chr21	37664554	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=154,157;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.631:6:1,2:0,1:0|1:37664554_C_CT:37664554:0,2,0,4
chr21	37664571	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.666:7:2,3:0,1:0|1:37664554_C_CT:37664554:0,2,0,5
chr21	37692507	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,3:3,3:3,5,3,3
chr21	37706087	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr21	37710272	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:9,0:3,4:1,11,0,4
chr21	37717288	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.268:39:5,10:24,0:19,10,10,0
chr21	37728892	.	C	CTTGAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=226,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.892:16:1,6:0,6:0,1,10,5
chr21	37729088	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr21	37732649	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=191,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr21	37734418	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:10,0:10,3:0|1:37734418_C_T:37734418:20,1,3,0
chr21	37734440	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,17:0.527:32:7,6:8,10:1|0:37734418_C_T:37734418:13,2,17,0
chr21	37734540	.	CT	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=91,211;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.440:12:4,4:2,0:6,1,2,3
chr21	37749689	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.311:17:4,1:7,4:9,3,3,2
chr21	37752631	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=207,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr21	37759957	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=196,94;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,2:5,6:7,2,5,3
chr21	37763939	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=144,0;MMQ=60,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,2:10,0:18,6,0,2
chr21	38081562	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:38081562_T_G:38081562:0,0,1,7
chr21	38081577	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:38081562_T_G:38081562:0,0,1,6
chr21	38084773	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=188,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.622:22:3,9:5,4:7,1,11,3
chr21	38092039	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr21	38092247	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=224,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr21	38113948	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr21	38113998	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr21	38129122	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=236,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr21	38132172	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=108,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:3,3:1,2:1,3,0,5
chr21	38139632	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,1:2,2:3,6,2,1
chr21	38302769	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.746:14:1,3:2,6:3,0,3,8
chr21	38444863	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,5,19
chr21	38444890	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=158,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:0,9,0,4
chr21	38460488	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,5:2,5:2,2,8,2
chr21	38462614	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=182,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr21	38466261	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=128,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr21	38467616	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:1,1:1,4:1,2,6,0
chr21	38469017	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,1,2
chr21	38495185	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr21	38495213	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr21	38495270	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=53.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,7:0,0,11,5
chr21	38496883	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,3:6,1:7,1,3,1
chr21	38501279	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.435:37:9,6:11,10:12,9,9,7
chr21	38504928	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=137,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr21	38511056	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=163,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:2,1:8,1:1,10,0,2
chr21	38522353	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,5:2,2:3,0,7,0
chr21	38523266	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=215,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,7:2,4:0,4,2,9
chr21	38525198	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,9,1
chr21	38525356	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=204,119;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.783:21:2,9:2,8:3,1,6,11
chr21	38525652	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr21	38528866	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=238,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:5,0,3,0
chr21	38528872	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr21	38531921	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr21	38532058	.	TG	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=114.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0,0,16,16
chr21	38532068	.	G	GA	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=101.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,15:0,14:0,0,16,14
chr21	38532086	.	TG	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=100.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,14,13
chr21	38534228	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=59.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0|1:38534228_A_AT:38534228:0,0,9,5
chr21	38534234	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.940:14:0,4:0,10:0|1:38534228_A_AT:38534228:0,0,9,5
chr21	38534389	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,0:4,7:1,9,0,7
chr21	38537963	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=182,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:7,2:2,0:0|1:38537963_AG_A:38537963:3,7,1,1
chr21	38537968	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=181,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:0|1:38537963_AG_A:38537963:3,8,1,1
chr21	38537973	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=181,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:3,0:0|1:38537963_AG_A:38537963:3,8,1,1
chr21	38537977	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=177,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,1:3,0:0|1:38537963_AG_A:38537963:2,8,1,1
chr21	38539745	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=208,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr21	38539836	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=58.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0|1:38539836_T_TA:38539836:0,0,8,7
chr21	38539844	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=179,128;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.428:19:3,7:8,1:0|1:38539836_T_TA:38539836:6,5,6,2
chr21	38567902	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=222,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0|1:38567902_C_T:38567902:3,1,4,0
chr21	38567911	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=246,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:0|1:38567902_C_T:38567902:2,1,5,0
chr21	38570055	.	TAAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=204,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.290:5:4,1:0,0:3,1,0,1
chr21	38570242	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,2:10,0:7,11,2,0
chr21	38599934	.	TG	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=81.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,9:0,15:0,0,10,15
chr21	38600154	.	CG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=69.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,14:0,0,0,21
chr21	38604570	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr21	38610870	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=132,66;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,1:4,1:8,6,0,2
chr21	38792786	.	TGGG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=184,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=G;STR;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:1,2:1,6,1,3
chr21	38850640	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=226,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,1,5
chr21	38858938	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:4,0:12,3:7,9,0,3
chr21	38862376	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr21	38862840	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=151,96;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr21	38862862	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr21	38865507	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:0,5,0,4
chr21	38877503	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=213,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr21	39087475	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=230,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr21	39493393	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:3,0:4,6:3,5,0,6
chr21	39775373	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr21	40181937	.	CT	C,CTT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,35,27;MFRL=158,95,152;MMQ=60,60,60;MPOS=3,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.94,5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,4,4:0.162,0.178:25:7,3,2:9,1,1:13,4,5,3
chr21	40182049	.	AT	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,6:0.137:48:18,4:22,1:14,28,1,5
chr21	40190470	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:11,2:16,0:10,17,2,0
chr21	40190620	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=171,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:3,1:6,1:1,8,1,1
chr21	40191389	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=151,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:5,1:7,2:9,4,2,1
chr21	40549289	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr21	40551943	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:4,4:4,4:0|1:40551943_A_G:40551943:3,5,0,9
chr21	40551944	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:4,4:4,5:0|1:40551943_A_G:40551943:3,5,0,9
chr21	40552408	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.750:18:0,6:4,8:0,4,0,14
chr21	40553845	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=193,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,6:3,1:0,8,0,7
chr21	40555160	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:2,3:3,1:5,1,2,2
chr21	40555351	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=187,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr21	40572072	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=194,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,2,1
chr21	40574191	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=213,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr21	40584527	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=186,91;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:2,5:5,5:6,1,7,3
chr21	40590198	.	T	TTTCACC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=174,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:0|1:40590198_T_TTTCACC:40590198:4,14,0,2
chr21	40590200	.	T	TC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=174,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:8,0:0|1:40590198_T_TTTCACC:40590198:4,14,0,2
chr21	40590201	.	G	GTTT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=174,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=T;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,2:8,0:0|1:40590198_T_TTTCACC:40590198:4,14,0,2
chr21	40590624	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=195,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr21	40590629	.	A	ATGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=206,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr21	40597215	.	A	AAAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr21	40604429	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=157,316;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:7,1:8,3:4,11,0,4
chr21	40627671	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:10,0:7,7:8,9,0,7
chr21	40630499	.	AA	TG	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=133,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,2:8,0:0|1:40630499_AA_TG:40630499:14,10,0,2
chr21	40630503	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=132,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,1:8,0:0|1:40630499_AA_TG:40630499:13,8,0,2
chr21	40636354	.	TAAAAA	T,TAA,TAAAA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,25,27,24;MFRL=179,219,181,172;MMQ=60,60,60,60;MPOS=11,20,29;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=19,14,16,18;RU=A;STR;TLOD=5.32,8.12,5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,5,2:0.204,0.442,0.243:10:1,1,4,0:0,1,1,2:1,0,8,1
chr21	40636385	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=20,15;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:7,0:3,0:11,6,3,0
chr21	40636388	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=20,16;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.198:21:7,0:5,0:10,7,4,0
chr21	40642189	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr21	40642386	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=149,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:1,6,0,7
chr21	40646230	.	CGA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GA;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,2,1
chr21	40648241	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=198,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:1,5,0,3
chr21	40648265	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr21	40650621	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,5:0,11:0,0,13,3
chr21	40652040	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=196,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.419:17:9,1:1,6:10,0,4,3
chr21	40684861	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr21	40684887	.	G	GGGGGGCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGGCC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr21	40685135	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=215,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:3,1,5,0
chr21	40685239	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:1,3:6,2:0|1:40685239_A_G:40685239:5,2,2,3
chr21	40685246	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:1,3:6,1:0|1:40685239_A_G:40685239:5,2,2,3
chr21	40685515	.	GCGC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CGC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr21	40715132	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.863:20:0,8:2,10:0,2,8,10
chr21	40715175	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=194,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr21	40717035	.	TCACACA	T,TCA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,29,28;MFRL=119,220,152;MMQ=60,60,60;MPOS=23,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=CA;STR;TLOD=4.73,11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,4:0.197,0.369:11:1,2,3:2,0,1:4,1,5,1
chr21	40795054	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=131,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:8,2:19,1:16,11,2,1
chr21	40847196	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=103,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr21	40847249	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr21	40871709	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,11;MFRL=118,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.308:14:4,0:1,0:10,0,4,0
chr21	40880881	.	CTTGAA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=117,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.470:11:3,4:2,1:3,3,4,1
chr21	40883530	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,15;MFRL=179,254;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.366:8:4,1:1,0:4,1,3,0
chr21	40883671	.	G	GAGA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGA;STR;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.463:26:9,7:4,3:8,6,7,5
chr21	40887080	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:3,6,0,2
chr21	40969620	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=153,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.315:17:4,2:7,3:0|1:40969620_G_A:40969620:6,6,4,1
chr21	40969621	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=175,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,3:0.220:16:4,1:9,1:1|0:40969620_G_A:40969620:9,4,1,2
chr21	40969898	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=124,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,0:6,6:7,4,0,6
chr21	40977763	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=173,272;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr21	40977826	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=114,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:4,1:4,3:3,5,1,3
chr21	40978013	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=214,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:2,6,1,1
chr21	40981609	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:9,3:6,2:8,8,2,3
chr21	41034562	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:10,6:8,0:5,13,6,0
chr21	41034787	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.253:6:4,1:1,0:2,3,0,1
chr21	41117310	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=203,190;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr21	41117368	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=203,170;MMQ=40,46;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr21	41117533	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=180,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr21	41137362	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=145,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr21	41137416	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,0:2,3:6,0,3,0
chr21	41137457	.	TC	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,2:3,5:6,3,5,2
chr21	41137499	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=162,211;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,4:9,0:10,7,1,3
chr21	41142741	.	AA	GG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr21	41142775	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr21	41142803	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=211,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr21	41160242	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=219,244;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr21	41165566	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=123,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:8,2:4,6:3,9,3,5
chr21	41270521	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:8,0:2,3:2,8,1,2
chr21	41270564	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:0,5,0,3
chr21	41434671	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr21	41446936	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=207,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:8,4,2,0
chr21	41452034	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=172,241;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,0:7,2:6,3,2,0
chr21	41514421	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=230,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr21	41516322	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=291,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr21	41516366	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=133,249;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:3,0:3,7:4,2,4,3
chr21	41710989	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,1:9,2:18,0,2,1
chr21	41725303	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,229;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,0:0,3:5,0,3,0
chr21	41725625	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:3,2:6,1:0|1:41725625_C_T:41725625:0,10,0,3
chr21	41725630	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=228,184;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,6:0.467:13:4,2:3,4:1|0:41725625_C_T:41725625:0,7,0,6
chr21	42553633	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=121,132;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr21	42555005	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=250,178;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.801:23:3,9:1,10:3,1,9,10
chr21	42556746	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:11,2:8,4:5,14,1,5
chr21	42598204	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:11,2:24,1:18,17,3,0
chr21	42615293	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=122,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,1:6,2:8,6,0,3
chr21	42622657	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=238,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,7:2,5:3,2,4,8
chr21	42622786	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=125,143;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,4:2,1:5,4,3,2
chr21	42622808	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:11,2:2,0:5,8,1,1
chr21	42622904	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=194,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr21	42629181	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:13,2:9,0:10,12,2,0
chr21	42720711	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=192,77;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr21	42767733	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=313,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,1:1,5:0,1,0,6
chr21	42771362	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr21	42775179	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,11:0.859:12:1,4:0,7:0|1:42775179_G_GT:42775179:1,0,7,4
chr21	42775180	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,11:0.859:12:1,4:0,7:0|1:42775179_G_GT:42775179:1,0,7,4
chr21	42808015	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=251,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,2:1,5:0,3,0,7
chr21	42808054	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=298,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,0:1,5:0,5,0,5
chr21	42808869	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=170,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr21	42811833	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=218,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:3,1:0,0:0|1:42811833_G_C:42811833:2,2,0,1
chr21	42811835	.	T	C,G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,25,22;MFRL=232,110,204;MMQ=60,60,60;MPOS=4,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.23,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.254,0.440:4:1,1,1:0,0,0:1,0,0,3
chr21	42811838	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=17,29;MFRL=210,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:42811833_G_C:42811833:1,2,0,1
chr21	42813011	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=130,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:0|1:42813011_G_A:42813011:0,1,0,8
chr21	42813029	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,58;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.809:4:0,2:0,2:0|1:42813011_G_A:42813011:0,0,0,4
chr21	42813566	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=215,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:2,1,3,0
chr21	42813933	.	A	AGTGTGT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=GT;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.689:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	42817354	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=188,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:9,2:2,2:6,5,1,3
chr21	42817582	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr21	42818106	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=162,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,4:0,4:0,1,0,8
chr21	42818132	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=195,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr21	42824449	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=209,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr21	42824733	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,181;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.776:16:2,4:1,8:1,2,6,7
chr21	42824874	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr21	42830399	.	A	AGTCCCCTCCTCACAGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTCCCCTCCTCACAGT;STR;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,1:5,1,4,0
chr21	42842713	.	C	CCTAAGGCCTCGGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,1,8
chr21	42843960	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:42843960_A_G:42843960:0,0,1,11
chr21	42843962	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.715:12:1,5:2,4:0|1:42843960_A_G:42843960:0,3,1,8
chr21	42848560	.	CAG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr21	42852311	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=189,322;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:0|1:42852311_G_A:42852311:7,0,2,0
chr21	42852320	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=322,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,8:0.750:10:0,2:2,6:1|0:42852311_G_A:42852311:2,0,8,0
chr21	42860307	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:4,1,6,2
chr21	42860485	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=89,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:0,2,1,3
chr21	43160908	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr21	43164345	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,6:0,0,0,9
chr21	43165824	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,4:0,5:1,0,9,0
chr21	43166725	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=119,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:4,1,2,0
chr21	43169357	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=177,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.692:24:2,7:5,10:4,3,4,13
chr21	43221555	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=88.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,29:0.811:35:3,18:3,11:2,4,17,12
chr21	43221983	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr21	43222779	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr21	43236252	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr21	43236284	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=188,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr21	43243585	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=168,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:3,0,4,0
chr21	43255509	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=211,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr21	43255727	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=171,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr21	43256252	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:7,6:4,2:5,6,4,4
chr21	43258000	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:4,5:2,4:6,1,7,2
chr21	43258171	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=36,22;MFRL=164,80;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.281:12:4,0:5,3:0|1:43258171_C_A:43258171:2,7,0,3
chr21	43258176	.	T	TTGCCCACCCTGAAGTGCAGTGGTGAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=164,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:3,0:4,3:0|1:43258171_C_A:43258171:2,7,0,3
chr21	43259665	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,0:2,0:0|1:43259665_G_C:43259665:9,0,3,0
chr21	43259668	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,1:1,1:0|1:43259665_G_C:43259665:9,0,3,0
chr21	43274653	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=179,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:8,0,6,0
chr21	43277301	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=195,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:11,5:11,0:13,9,5,0
chr21	43280405	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:1,6,4,1
chr21	43281668	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=274,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,2:0,0:1,1,1,2
chr21	43299261	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:0,4,2,4
chr21	43299327	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=173,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:43299327_C_A:43299327:4,0,1,0
chr21	43299348	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=173,102;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:43299327_C_A:43299327:3,1,1,0
chr21	43309191	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=81.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,15:0,10:0,0,19,6
chr21	43325742	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr21	43332606	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=196,158;MMQ=58,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr21	43334669	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,3:3,4:4,0,7,0
chr21	43334896	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr21	43334929	.	G	GAATA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=197,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:43334929_G_GAATA:43334929:0,3,0,1
chr21	43334930	.	G	GAATGGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=197,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:43334929_G_GAATA:43334929:0,3,0,1
chr21	43338175	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=202,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr21	43338933	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:4,5:4,2:0|1:43338933_A_T:43338933:5,3,6,1
chr21	43338948	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:6,4:8,3:0|1:43338933_A_T:43338933:8,6,6,1
chr21	43339143	.	C	CTGTG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=TG;STR;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0|1:43339143_C_CTGTG:43339143:1,3,0,5
chr21	43339154	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=165,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,2:1,2:0|1:43339143_C_CTGTG:43339143:1,2,0,5
chr21	43342046	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,4:6,3:6,5,7,0
chr21	43362203	.	GT	AC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=232,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:9,3,2,0
chr21	43373409	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=217,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr21	43411636	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:11,8:7,0:7,11,0,8
chr21	43413594	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:15,3:10,0:20,5,0,3
chr21	43496017	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr21	43496381	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.866:13:1,4:0,5:0,1,2,10
chr21	43519032	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,4:2,4:3,1,4,4
chr21	43519369	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr21	43530897	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=326,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr21	43531008	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=276,160;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:2,6:0,10:0,2,8,8
chr21	43531848	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=37,31;MFRL=99,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,1:2,4:0,2,1,4
chr21	43533975	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,165;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,0:6,5:1,14,0,5
chr21	43541342	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=117,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=41.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:2,4:0,9:2,0,4,9
chr21	43547414	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=223,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,1:7,1:2,10,1,1
chr21	43549794	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=203,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr21	43557802	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.711:1:0,1:0,0:0|1:43557802_G_GC:43557802:0,0,0,1
chr21	43557803	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.711:1:0,1:0,0:0|1:43557802_G_GC:43557802:0,0,0,1
chr21	43639245	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:43639245_C_T:43639245:0,0,1,0
chr21	43639258	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=211,253;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:43639245_C_T:43639245:1,0,1,0
chr21	43639332	.	CCCG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=229,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CCG;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr21	43679340	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=236,75;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr21	43679513	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.242:23:8,4:8,1:8,10,2,3
chr21	43680065	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:19,2:13,0:17,15,1,1
chr21	43693475	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=200,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.168:22:10,1:7,2:8,11,1,2
chr21	43708431	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr21	43710096	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=179,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:5,1,5,0
chr21	43732425	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=217,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:0,5,0,6
chr21	43766560	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr21	43766638	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,2:5,0:6,6,3,0
chr21	43767500	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr21	43769909	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=196,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:6,0,3,0
chr21	43770926	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=214,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.816:10:0,3:2,5:2,0,8,0
chr21	43805637	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=178,141;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,1:6,1:6,7,0,2
chr21	43805656	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=219,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,1:4,1:5,7,0,2
chr21	43808964	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=115,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.541:8:2,4:1,0:3,1,4,0
chr21	43826344	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=198,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.776:10:0,5:1,3:1,1,7,1
chr21	43826391	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=114,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.609:18:2,3:4,8:3,4,7,4
chr21	43829758	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,1,1
chr21	43846729	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr21	43852160	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=153,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:4,1:6,3:9,1,3,1
chr21	43852355	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=181,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:3,2:0,7,1,2
chr21	43862466	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=219,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr21	43892875	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=169,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.271:23:13,3:3,2:6,11,5,1
chr21	43897478	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.294:39:13,8:14,3:13,15,7,4
chr21	43905887	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=146,120;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.324:23:6,5:10,2:8,8,3,4
chr21	43906457	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=168,247;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:2,2,2,2
chr21	43916339	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:3,5:7,0:3,9,2,3
chr21	43938673	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:3,6:11,3:4,10,3,6
chr21	43959770	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:5,6:4,5:6,3,5,6
chr21	43963759	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:4,6:1,4:1,4,2,8
chr21	43967126	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=153,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,2:2,4:6,1,6,0
chr21	43988437	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=169,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:1,4:7,3:6,2,5,2
chr21	43999983	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=258,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:1,3,0,2
chr21	44000366	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=212,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,1:3,3:4,0,3,1
chr21	44073830	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=182,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr21	44073833	.	C	G,CG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30,12;MFRL=131,182,157;MMQ=60,60,60;MPOS=34,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.52,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.334,0.334:3:0,1,0:0,0,0:1,0,2,0
chr21	44073840	.	T	A,C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,15,12;MFRL=131,182,157;MMQ=60,60,60;MPOS=27,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.52,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.334,0.334:3:1,0,0:0,0,0:1,0,2,0
chr21	44074008	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=22,12;MFRL=186,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.307:7:4,0:0,0:0|1:44074008_A_C:44074008:1,4,2,0
chr21	44074012	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=186,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.309:7:4,0:0,0:0|1:44074008_A_C:44074008:1,4,2,0
chr21	44074014	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,12;MFRL=182,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:44074008_A_C:44074008:1,3,1,0
chr21	44074016	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,12;MFRL=182,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:44074008_A_C:44074008:1,3,1,0
chr21	44074022	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=178,228;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,0:0|1:44074008_A_C:44074008:0,3,1,0
chr21	44106372	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=187,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:11,0:4,2:6,9,0,2
chr21	44107989	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=197,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,4:1,4:2,1,5,3
chr21	44118958	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=188,222;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,1:1,6:1,0,7,0
chr21	44152149	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=248,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:1,2:5,6:5,1,5,3
chr21	44163839	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr21	44174275	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=173,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,0:0,5,0,2
chr21	44180613	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=178,341;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr21	44180916	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:3,2:1,5:4,0,5,3
chr21	44182135	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=317,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.725:9:1,3:1,4:2,0,6,1
chr21	44188249	.	GC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=223,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,1:0,6:1,0,6,1
chr21	44188475	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=149,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr21	44188485	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr21	44274642	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:12,1:1,1:10,3,1,1
chr21	44283490	.	TC	GG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,16;MFRL=161,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:0,0:2,0,2,0
chr21	44283718	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=177,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:13,1:6,3:11,8,3,1
chr21	44283785	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=213,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr21	44296992	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=162,243;MMQ=53,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr21	44329028	.	A	ATTAC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=138,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.187:19:7,0:9,3:0|1:44329028_A_ATTAC:44329028:5,11,0,3
chr21	44329029	.	G	GTGA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=138,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.187:19:7,0:9,3:0|1:44329028_A_ATTAC:44329028:5,11,0,3
chr21	44424347	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.351:18:4,2:6,4:10,2,5,1
chr21	44438181	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=107,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:2,1:3,2:0|1:44438181_G_A:44438181:1,7,3,0
chr21	44438184	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=133,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,0:5,1:0|1:44438181_G_A:44438181:2,8,3,0
chr21	44438186	.	ATGGTTT	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=133,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:4,0:6,2:0|1:44438181_G_A:44438181:4,10,3,0
chr21	44448718	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=215,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr21	44448763	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=221,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:4,4:2,2:4,2,2,5
chr21	44448775	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=229,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:2,3,2,5
chr21	44475786	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=292,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.777:7:0,3:1,3:0|1:44475786_C_T:44475786:0,1,5,1
chr21	44475796	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=17,35;MFRL=292,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,3:0,3:0|1:44475786_C_T:44475786:0,1,5,1
chr21	44475876	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:3,2:5,3:4,4,3,3
chr21	44478217	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=113,213;MMQ=60,56;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.271:15:2,1:6,1:7,4,1,3
chr21	44478393	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=164,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,2,3
chr21	44483276	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr21	44485715	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:0,6,1,5
chr21	44486324	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr21	44488755	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.617:5:2,1:0,0:0,2,0,3
chr21	44514488	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:3,1,4,0
chr21	44514969	.	A	ATG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr21	44515504	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.659:18:4,6:1,6:3,3,8,4
chr21	44515685	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=185,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,7:4,3:4,3,3,7
chr21	44527669	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,5:0,2:0,3,0,7
chr21	44579654	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:8,5,0,2
chr21	44579891	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=86,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr21	44581286	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=141,215;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.321:14:6,4:1,0:3,7,4,0
chr21	44589918	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=16,15;MFRL=215,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.495:4:0,0:0,0:0|1:44589918_A_C:44589918:0,2,2,0
chr21	44589919	.	C	CGGGGGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=215,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,8;RU=G;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:0,1:2,0:0|1:44589918_A_C:44589918:0,2,2,0
chr21	44590059	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=347,245;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr21	44839654	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=200,279;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,1:1,0:2,0,1,1
chr21	44841036	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=173,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,0:8,2:6,7,1,1
chr21	44841052	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=167,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:9,6,1,1
chr21	45064296	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=291,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.871:13:1,6:0,6:1,0,2,10
chr21	45076443	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=282,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=50.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.844:17:2,4:0,10:1,1,12,3
chr21	45077865	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	45089877	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=125,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,3:2,7:3,2,3,7
chr21	45092095	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.823:15:1,7:1,5:2,0,11,2
chr21	45107676	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=182,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,1:7,1:5,9,1,1
chr21	45169005	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr21	45170285	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr21	45175717	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=170,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0,9,1,1
chr21	45175958	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,6,9
chr21	45212606	.	GG	AA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=120,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,2:10,0:7,14,0,2
chr21	45215046	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=194,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,13:0.825:15:0,2:2,10:0|1:45215046_T_C:45215046:1,1,9,4
chr21	45215051	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,14:0.834:16:0,3:2,11:0|1:45215046_T_C:45215046:1,1,10,4
chr21	45217456	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=131,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:1,7:1,6:1,1,8,6
chr21	45217753	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=164,265;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:3,6,2,0
chr21	45220570	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr21	45220626	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr21	45222058	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=230,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr21	45472412	.	TG	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=216,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr21	45514141	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:45514141_TG_T:45514141:0,0,0,2
chr21	45514149	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:45514141_TG_T:45514141:0,0,0,2
chr21	45514168	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	45514188	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	45528875	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=146,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:12,0:8,4:11,10,0,4
chr21	45534032	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0,0,4,1
chr21	45538782	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr21	45539240	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr21	45539426	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr21	45540143	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr21	45540207	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr21	45547736	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=178,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr21	45550460	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,1:0,10:0,0,5,6
chr21	45561039	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,9,6
chr21	45642817	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=166,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr21	45643008	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0,4,1,2
chr21	45649543	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=190,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,1:2,4:1,2,0,5
chr21	45650009	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=248,277;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:3,2:1,1:0,5,1,2
chr21	45651413	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	45655124	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=18,27;MFRL=276,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:1,2:0,2:1,1,4,0
chr21	45656695	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=190,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:45656695_T_G:45656695:2,1,0,1
chr21	45656697	.	TC	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=190,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:45656695_T_G:45656695:2,1,0,1
chr21	45658474	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=175,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr21	45681153	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr21	45733911	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=136,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:2,5,1,2
chr21	45739953	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=136,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,3:2,0:2,1,1,2
chr21	45741854	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr21	45742115	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr21	45742141	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=186,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:45742141_G_T:45742141:0,2,0,1
chr21	45742147	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=192,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:45742141_G_T:45742141:0,1,0,1
chr21	45742935	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=163,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:4,3:11,0:9,6,2,1
chr21	45743594	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr21	45746214	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr21	45746225	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr21	45750248	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,10:0,0,7,8
chr21	45750275	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=183,250;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:4,0:6,6,1,1
chr21	45789011	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr21	45799164	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=188,259;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr21	45817620	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=236,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,3:0,5:0,1,5,3
chr21	45821794	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:1,4:3,10:1,3,2,12
chr21	45826434	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	45826462	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=220,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr21	45826744	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr21	45837790	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=121,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,5:1,1:3,1,5,1
chr21	45843707	.	TGAG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	45845807	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr21	45854925	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=145,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:4,0,4,0
chr21	45929075	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=202,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:9,4,1,1
chr21	45942016	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=186,187;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=30.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.416:34:13,0:7,14:5,15,0,14
chr21	45942026	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=201,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:10,3:4,1:3,11,2,2
chr21	45959097	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr21	45971357	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=157,172;MMQ=40,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:13,1:8,4:11,10,3,2
chr21	45971380	.	A	AGTGAGTGAGTGT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=221,155;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTGAGTGAGTGT;STR;TLOD=60.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.898:17:1,8:0,6:0,1,2,14
chr21	45977945	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:14,0:8,4:11,11,0,4
chr21	45977995	.	TGGGGCGGCAGAGGAGGGACACGCAGGAGGCCGGGCGGCAGCAGCTGGGCTGGCAGGTGGAGGCAGGGGCACAGCAGGAGGGGATGGGCACACAGCAGGTGGACCTGCACAC	T	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=159,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,22:0.116:60:3,14:5,2:18,20,10,12
chr21	45978090	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.961:19:0,8:0,8:0,0,7,12
chr21	45978607	.	G	GTGTATATTATGTGTGTGTGT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=92,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,1,1
chr21	45987701	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=193,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,3:6,0:12,3,2,1
chr21	45993619	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=118,115;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:4,6,2,0
chr21	46011170	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=208,139;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:7,4,0,2
chr21	46012240	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr21	46020473	.	C	CTCAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,1:0,0,4,1
chr21	46020527	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=29,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,7:0,7:1,0,10,4
chr21	46021494	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,48;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,5,5
chr21	46021530	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=197,212;MMQ=48,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.372:8:2,1:2,0:2,3,3,0
chr21	46021607	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,10,3
chr21	46021934	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,5,8
chr21	46021946	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,8,8
chr21	46021954	.	CTG	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=70.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,8,8
chr21	46047857	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,9:0,0,7,7
chr21	46047921	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,1:9,1:0|1:46047921_G_A:46047921:5,9,1,1
chr21	46047925	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0|1:46047921_G_A:46047921:0,0,6,11
chr21	46048158	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,40;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr21	46048217	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=187,183;MMQ=45,36;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr21	46048336	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr21	46057612	.	CCTGCTGTGTGCCTGT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:3,3:4,2:2,8,3,2
chr21	46058457	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr21	46066274	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=159,248;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:2,1:0,3:3,0,4,0
chr21	46066319	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr21	46067624	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=171,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr21	46074104	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr21	46074557	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,0:8,3:7,6,1,2
chr21	46077812	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr21	46078342	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:46078342_T_C:46078342:0,0,0,4
chr21	46078345	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:46078342_T_C:46078342:0,0,0,4
chr21	46078351	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:46078342_T_C:46078342:0,0,0,4
chr21	46078357	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr21	46086718	.	GA	CG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,4:0,0,5,10
chr21	46086757	.	GC	AT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,8:0,0,6,13
chr21	46086868	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,2:0|1:46086868_C_T:46086868:0,0,5,4
chr21	46086884	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,1:0|1:46086868_C_T:46086868:0,0,2,5
chr21	46086901	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0|1:46086868_C_T:46086868:0,0,0,6
chr21	46101688	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr21	46102090	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=160,153;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:2,8:0,7:0,2,10,6
chr21	46102148	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=141,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,0:7,4:3,11,0,4
chr21	46191270	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.910:9:0,4:0,2:0,0,5,4
chr21	46191447	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=208,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr21	46208128	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=261,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr21	46226786	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:4,6:6,3:8,3,7,2
chr21	46271452	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=136,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:5,6:8,5:8,5,10,1
chr21	46271660	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=220,241;MMQ=48,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:0,4,0,3
chr21	46275047	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=206,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:1,4:1,3:1,1,8,0
chr21	46306594	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=230,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,0:7,4:5,4,3,1
chr21	46315022	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=149,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:1,6,0,2
chr21	46320403	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=192,245;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,3:7,0:2,11,0,3
chr21	46321677	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=169,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:1,6,0,4
chr21	46326815	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:7,3:4,5:8,3,6,2
chr21	46327835	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=195,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:6,1:2,5:7,1,5,1
chr21	46328099	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr21	46354055	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr21	46355531	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=201,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,8:3,0:6,0,7,1
chr21	46389017	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:6,7:9,6:10,5,8,5
chr21	46389189	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=183,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:0,4:4,3:0,4,0,8
chr21	46393090	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=184,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:9,3:8,2:9,8,4,1
chr21	46492270	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=249,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,0:2,4:0,3,0,4
chr21	46554604	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,0:0,1:0|1:46554604_ATT_A:46554604:1,0,1,0
chr21	46554625	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,0:1,0:0|1:46554604_ATT_A:46554604:2,1,1,0
chr21	46591633	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=151,71;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:8,0:4,4:6,6,2,2
chr21	46685560	.	ATCACAGAGGTTCCAGAGTCAGGGAGAACTGGCG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=233,147;MMQ=60,44;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.459:5:1,0:0,2:0,3,0,2
chr21	46686199	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:2,6,0,2
chr21	46689999	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=207,239;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr21	46893767	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=220,241;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,0:3,4:1,2,4,0
chr21	46896381	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=111,127;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,17:0.345:50:19,11:14,6:23,10,13,4
chr21	46896415	.	G	GA	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=113,111;MMQ=60,39;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.139:41:24,0:11,5:19,17,0,5
chr21	46896427	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=202,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.161:22:10,1:8,1:9,10,2,1
chr21	46897893	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=245,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:2,0:1,2:0,6,1,2
chr21	46899723	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=254,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr21	46899947	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:4,4,2,0
chr21	46900332	.	GC	CG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=212,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:4,1:5,4,3,4
chr21	46900546	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr21	46901973	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=108,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,1:4,2:4,7,0,3
chr21	46902722	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:3,0:8,5:4,8,0,5
chr21	46906690	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=231,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:46906690_A_G:46906690:1,0,2,0
chr21	46906710	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=231,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:46906690_A_G:46906690:3,0,2,0
chr21	46906711	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=194,236;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1|0:46906690_A_G:46906690:3,0,2,0
chr21	46907338	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:0,0:1,3:2,0,3,0
chr21	46907395	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=176,72;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:2,7,1,1
chr21	46910654	.	TAAAG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:1,2,2,2
chr21	46910871	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0,6,1,1
chr21	46913517	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=123,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr21	46914413	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,1:10,1:13,3,2,0
chr21	46916516	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=300,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,5:1,2:1,0,6,4
chr21	46924425	.	CGGCCCCCCA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCCCCCCA;STR;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.850:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr21	46925416	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	46929535	.	GGGC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=231,347;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr21	46932328	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=156,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,3,2
chr21	46932383	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=199,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr21	46934826	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=182,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,1:2,4:8,1,3,2
chr21	46934861	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=188,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:12,2:2,5:10,4,4,3
chr21	46952094	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.642:17:4,3:0,7:2,4,1,10
chr21	46957633	.	T	TGGGGGGGGCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=223,271;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:46957633_T_TGGGGGGGGCC:46957633:1,0,2,0
chr21	46957638	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=223,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:46957633_T_TGGGGGGGGCC:46957633:1,0,1,0
chr21	46957642	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=14,12;MFRL=172,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:0,0:0,0:0|1:46957633_T_TGGGGGGGGCC:46957633:2,0,1,0
chr21	46957916	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=181,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr21	47319581	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=112,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:10,3:4,0:6,8,0,3
chr21	47320377	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,236;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,3:6,0:10,0,3,0
chr21	47320585	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=109,109;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:14,0:2,5:6,10,0,5
chr21	47350796	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:3,5:1,1:1,3,2,4
chr21	47401760	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr21	47404397	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr21	47406612	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.837:4:0,1:0,1:0,0,1,3
chr21	47409113	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:1,1,1,5
chr21	47410626	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,8,4
chr21	47412751	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:3,1,2,4
chr21	47414166	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=63,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:47414166_G_GA:47414166:1,1,0,1
chr21	47414170	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=63,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:47414166_G_GA:47414166:1,1,0,1
chr21	47414172	.	T	TGCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=17,29;MFRL=125,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:47414166_G_GA:47414166:0,1,0,1
chr21	47417303	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,4:8,3:8,5,2,5
chr21	47417578	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=237,89;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:3,4:3,3:4,3,3,4
chr21	47418234	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=206,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,1,1
chr21	47418728	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr21	47418916	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=134,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr21	47419012	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=210,225;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr21	47419697	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=229,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr21	47420565	.	AGGAGGGCGGCCGGGGAG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:0,3:3,0,2,1
chr21	47420723	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=175,95;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:5,2:3,4:3,5,3,3
chr21	47420726	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=167,108;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,4:1,6:1,3,5,5
chr21	47420761	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=152,313;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,1:4,2:2,8,1,2
chr21	47420769	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.671:10:2,4:1,3:0,3,1,6
chr21	47421864	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=100,269;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:4,2:1,1:5,1,3,0
chr21	47423576	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:7,3:6,2:0|1:47423576_C_T:47423576:7,8,3,2
chr21	47423586	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=188,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:7,3:6,2:0|1:47423576_C_T:47423576:6,7,3,2
chr21	47532544	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=250,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,2,2
chr21	47537882	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=201,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,5:2,5:0,2,8,2
chr21	47539065	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=180,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr21	47539790	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=234,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,8:2,3:4,0,8,3
chr21	47544451	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0|1:47544451_GC_G:47544451:1,0,4,0
chr21	47544454	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0|1:47544451_GC_G:47544451:1,0,4,0
chr21	47544541	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=190,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=48.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.843:17:0,12:2,3:0,2,10,5
chr21	47546244	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	47551833	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr21	47557074	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr21	47558473	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=158,186;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:47558473_G_C:47558473:0,1,0,1
chr21	47558476	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=158,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:47558473_G_C:47558473:0,1,0,1
chr21	47558485	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:47558473_G_C:47558473:2,1,0,1
chr21	47571383	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,0:0,0,4,0
chr21	47610957	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=184,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:8,0,2,1
chr21	47616071	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=317,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,3,2
chr21	47625913	.	C	CCTCCCAAAGTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=242,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr21	47626576	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=171,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:5,0:5,2:9,3,2,0
chr21	47635302	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=164,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr21	47635713	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:2,8,0,3
chr21	47639492	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=228,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr21	47641700	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=230,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:2,0,6,0
chr21	47647382	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:5,0,4,1
chr21	47647618	.	GAA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=191,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.354:13:1,2:3,1:1,8,1,3
chr21	47648729	.	CCCCGCCCCT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCCGCCCCT;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.706:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	47656712	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=165,258;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:8,0,2,0
chr21	47656732	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:8,3:0,0:6,2,3,0
chr21	47664746	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=113,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,1:6,2:5,8,2,1
chr21	47665116	.	GAAGA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=110,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGA;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:1,6,0,2
chr21	47666564	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=185,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:7,3:9,4:9,7,5,2
chr21	47666744	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=204,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:13,2:5,1:6,12,3,0
chr21	47671690	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=263,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr21	47674275	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=197,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:3,1,3,2
chr21	47676934	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:1,6,0,5
chr21	47678774	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr21	47681127	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr21	47685787	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=241,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,4:1,2:2,1,5,1
chr21	47686152	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=45.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0|1:47686152_C_T:47686152:0,0,0,11
chr21	47686174	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0|1:47686152_C_T:47686152:0,0,0,8
chr21	47705237	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=197,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,7:1,8:0,1,1,14
chr21	47707039	.	T	TAAAA,TAAAAA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,27,30;MFRL=191,170,145;MMQ=60,45,60;MPOS=19,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,14,15;RU=A;STR;TLOD=6.27,14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,4:0.198,0.398:10:4,1,1:0,1,3:2,2,1,5
chr21	47707050	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=206,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:3,5:0,7:1,2,3,9
chr21	47707054	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=191,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:3,2:2,8,1,3
chr21	47711229	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=216,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:1,6:1,6:2,0,10,2
chr21	47716230	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr21	47717350	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr21	47717616	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr21	47722391	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr21	47722578	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,4:0,0:0,1,1,3
chr21	47722588	.	TACA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=222,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:47722588_TACA_T:47722588:1,3,0,1
chr21	47722592	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=222,86;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:47722588_TACA_T:47722588:1,3,0,1
chr21	47742496	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=171,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr21	47744037	.	CG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr21	47766113	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=205,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,1:3,3:2,7,2,2
chr21	47766139	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=144,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,6:1,3:0,1,2,7
chr21	47773809	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:9,4:6,0:14,1,4,0
chr21	47774039	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,1:6,3:4,7,1,3
chr21	47786449	.	T	A,G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29,35;MFRL=0,203,123;MMQ=60,60,60;MPOS=9,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=15.07,5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,2:0.600,0.300:7:0,1,1:0,4,1:0,0,7,0
chr21	47786494	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=119,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,4:4,9:4,4,9,4
chr21	47818298	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=191,236;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr21	47819650	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=151,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:0|1:47819650_A_G:47819650:6,11,0,2
chr21	47819666	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=135,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,2:8,0:0|1:47819650_A_G:47819650:7,9,0,2
chr21	47821726	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=197,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:2,1:7,2:1,9,0,3
chr21	47838112	.	T	TATCTG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:1,2:10,3:7,5,3,2
chr21	47838123	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=197,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:2,2:9,3:8,3,3,2
chr21	47838182	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=78,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:0,1:5,3:2,3,2,2
chr21	47838297	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=202,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr21	47841791	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=172,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:2,1,3,0
chr21	47841933	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=192,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:5,6:2,3:0|1:47841933_T_C:47841933:1,6,2,8
chr21	47841941	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:7,7:4,4:0|1:47841933_T_C:47841933:3,8,3,8
chr21	47847470	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=247,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr21	47847757	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=168,249;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr21	47848350	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=156,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,1:3,3:5,4,1,3
chr21	47848545	.	CA	GG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=222,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:47848545_CA_GG:47848545:0,1,0,1
chr21	47848549	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=222,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:47848545_CA_GG:47848545:0,1,0,1
chr21	47848552	.	C	CCTTCTCTCTCTCTCTCTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=222,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:47848545_CA_GG:47848545:0,1,0,1
chr21	47850405	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=120,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,3:5,4:5,3,3,4
chr21	47851636	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=246,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:1,2,2,3
chr21	47852151	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr21	47855989	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:2,2:2,1:0,5,2,2
chr21	47858272	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,9:0.193:50:11,2:27,7:0|1:47858272_T_C:47858272:1,40,6,3
chr21	47858274	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:36,14:0.291:50:12,0:20,14:1|0:47858272_T_C:47858272:7,29,0,14
chr21	47859937	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:12,1,2,0
chr21	47862519	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=199,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:6,0:11,4:3,14,0,4
chr21	47863919	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=216,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr21	47864560	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,31;MFRL=135,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:47864560_CTTT_C:47864560:1,0,1,0
chr21	47864577	.	TC	AT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,10;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:47864577_TC_AT:47864577:1,1,1,0
chr21	47864578	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=36,17;MFRL=94,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:47864560_CTTT_C:47864560:0,1,1,0
chr21	47864581	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,10;MFRL=94,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0,1,2,0
chr21	47864582	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=18,15;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:47864577_TC_AT:47864577:2,1,1,0
chr21	47864583	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=36,17;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:1,0:0|1:47864560_CTTT_C:47864560:1,1,1,0
chr21	47864599	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=35,15;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,0:3,2,2,0
chr21	47904569	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=242,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr21	47910659	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=191,275;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:9,3:5,2:2,12,0,5
chr21	47917047	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=38.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,9:0,4:0,0,2,11
chr21	47931245	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=189,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:5,0,5,0
chr21	47959822	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,1:8,2:8,9,0,3
chr21	47961634	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=7625649,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0,2,3,0
chr21	47966810	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=182,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:5,2:8,5:7,6,3,4
chr21	47971539	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,12,7
chr21	47974700	.	C	CGGGGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=157,219;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,0:1,0:1,0,2,0
chr21	47974704	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47974704_G_C:47974704:0,0,1,0
chr21	47974708	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:47974704_G_C:47974704:0,0,1,0
chr21	47976819	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,0:3,0,2,0
chr21	47978321	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr21	47980570	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr21	47980760	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=197,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,3:4,2:2,7,0,5
chr21	47980800	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=196,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,2:5,3:0,10,0,5
chr21	47983657	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr21	47983680	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=144,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:0,4:3,1:3,0,6,0
chr21	47985554	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=138,255;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:6,3:5,1:11,0,3,1
chr21	47985743	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=170,152;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:14,0:13,10,2,0
chr21	47986633	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,3,7
chr21	48022375	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr21	48063476	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,206;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:15,5:12,0:11,16,3,2
chr21	48064304	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,2:11,0:10,13,2,0
chr21	48072916	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=195,278;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr21	48072958	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=339,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr21	48081768	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.298:14:3,2:7,1:7,3,2,2
chr21	48083526	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=257,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:0,1,1,6
chr21	48084361	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=173,242;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:3,0:2,8:0|1:48084361_G_A:48084361:0,5,0,8
chr21	48084367	.	T	TCCCCAAAC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=173,242;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:3,0:2,8:0|1:48084361_G_A:48084361:0,5,0,8
chr21	48084372	.	A	ATTATTCTATC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=170,242;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:48084361_G_A:48084361:0,4,0,1
chr21	48084373	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=170,242;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:48084361_G_A:48084361:0,4,0,1
chr22	16266885	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=226,219;MMQ=25,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr22	16266920	.	C	CAG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=175,195;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr22	16277923	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=199,190;MMQ=25,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,3:5,0:1,7,2,1
chr22	17264565	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,13,5
chr22	17264904	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=263,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:2,11:2,3:2,2,5,9
chr22	17265194	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=185,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:1,7:0,11:0,1,10,8
chr22	17288988	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=163,258;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:5,7,0,2
chr22	17473120	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=237,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:17473120_A_G:17473120:0,3,0,1
chr22	17473124	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=207,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:17473120_A_G:17473120:0,4,0,1
chr22	17473127	.	C	CGGATTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=207,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:17473120_A_G:17473120:0,4,0,1
chr22	17488823	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=155,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.732:13:2,4:1,6:2,1,5,5
chr22	17565932	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:17565932_T_C:17565932:0,0,2,0
chr22	17565949	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17565932_T_C:17565932:0,0,1,0
chr22	17566206	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,1:0,0,1,4
chr22	17581412	.	C	CCGTGGCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=148,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr22	17581434	.	G	GCCCCAGAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=158,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:0,0:3,1:0|1:17581434_G_GCCCCAGAA:17581434:0,3,0,1
chr22	17581436	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=158,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.321:4:0,0:3,1:0|1:17581434_G_GCCCCAGAA:17581434:0,3,0,1
chr22	17582776	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr22	17586583	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr22	17586595	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,4:3,5:0,3,0,10
chr22	17586609	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0|1:17586609_GT_G:17586609:0,0,0,9
chr22	17586614	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,3:0|1:17586609_GT_G:17586609:0,0,0,9
chr22	17586631	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr22	17586715	.	ATCAC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCAC;STR;TLOD=41.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,4,6
chr22	17590269	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr22	17590744	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,4:2,3:0,3,0,8
chr22	17600148	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr22	17602140	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,285;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:17602140_A_C:17602140:0,0,1,0
chr22	17602144	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,285;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17602140_A_C:17602140:0,0,1,0
chr22	17618937	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,1:3,3:6,3,2,2
chr22	17619292	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=370,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr22	17619716	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=190,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr22	17623880	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr22	17629262	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=159,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,1:6,1:7,2,2,0
chr22	17629544	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=305,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr22	17630389	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=169,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr22	17662679	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=189,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:6,3,3,0
chr22	17662699	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=189,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,2:5,5:6,5,3,4
chr22	17662917	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=188,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:2,1:5,2:2,5,1,2
chr22	17669151	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr22	17669406	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr22	17680519	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,8:0,2:1,1,1,9
chr22	17684355	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr22	17978600	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,2:1,7:1,2,1,8
chr22	18021760	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=207,282;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr22	18027817	.	CTTTT	C,CTTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34,35;MFRL=0,230,155;MMQ=60,60,60;MPOS=28,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,12,15;RU=T;STR;TLOD=6.30,8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,7:0.206,0.715:9:0,1,5:0,1,1:0,0,8,1
chr22	18032478	.	TTTTTTTTTTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=126,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:0,1:0,4,1,0
chr22	18064010	.	CGT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=201,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,2,0
chr22	18075566	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=15,19;MFRL=309,189;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr22	18077386	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:4,1:2,1:1,5,2,0
chr22	18084001	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr22	18084033	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=228,287;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr22	18095901	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=266,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr22	18165898	.	CAA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=139,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr22	18171650	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,256;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	18178859	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=146,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,3:0,5:2,0,7,1
chr22	18218464	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.830:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr22	18218475	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=107,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.755:6:0,1:0,2:0,3,0,3
chr22	18222263	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=132,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:1,5,0,3
chr22	18226521	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=210,261;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:1,0:3,3:4,0,2,2
chr22	18233000	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,310;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,1,2
chr22	18291791	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr22	18293650	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=314,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr22	18370066	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,1:0,9:0,0,4,6
chr22	18372020	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,3:0,5,2,5
chr22	18378002	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=209,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.537:15:4,4:2,4:6,1,6,2
chr22	18379160	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,7:4,1:0,6,2,6
chr22	18463747	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=157,230;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:6,1:3,1:4,6,1,1
chr22	18609065	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=37,25;MFRL=230,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr22	18609882	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=247,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr22	18643094	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=160,168;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.332:13:3,1:5,3:0|1:18643094_A_C:18643094:1,8,0,4
chr22	18643098	.	A	AAG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=160,168;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:3,1:5,3:0|1:18643094_A_C:18643094:1,8,0,4
chr22	18643100	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=159,168;MMQ=60,57;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:0|1:18643094_A_C:18643094:1,7,0,4
chr22	18649922	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=172,192;MMQ=53,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr22	18655860	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=214,181;MMQ=50,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,1,4
chr22	18835925	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=200,232;MMQ=25,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr22	18896301	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=143,346;MMQ=60,53;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:3,7,1,1
chr22	18899016	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=218,151;MMQ=31,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,4:1,1:0,1,3,2
chr22	18900669	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr22	18901090	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,3,7
chr22	18905964	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=170,215;MMQ=60,44;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,4:3,2:2,7,2,4
chr22	18907192	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=168,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:7,1:10,1:9,8,2,0
chr22	18910257	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,107;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr22	18910479	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=212,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,1:4,3:0|1:18910479_C_T:18910479:2,3,2,2
chr22	18910490	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=146,251;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.272:9:0,1:6,1:1|0:18910479_C_T:18910479:1,6,2,0
chr22	18910503	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=146,220;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:1,1:6,0:0|1:18910503_A_C:18910503:0,7,2,0
chr22	18910507	.	AG	CC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=146,220;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:1,0:6,0:0|1:18910503_A_C:18910503:0,7,2,0
chr22	18913156	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=231,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,4:2,5:3,1,5,4
chr22	19028476	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19028476_T_C:19028476:0,0,1,0
chr22	19028480	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19028476_T_C:19028476:0,0,1,0
chr22	19036232	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=211,272;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr22	19076797	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=197,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr22	19077049	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=182,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:1,5:1,0:0,2,1,5
chr22	19109751	.	G	GCGT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.210:12:6,2:4,0:0|1:19109751_G_GCGT:19109751:3,7,1,1
chr22	19109753	.	A	ACCCCGCTGGG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:5,2:4,0:0|1:19109751_G_GCGT:19109751:3,7,1,1
chr22	19119751	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=181,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,2:3,2:4,5,3,1
chr22	19122498	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=245,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr22	19126687	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=248,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr22	19132196	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=174,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,1:3,2:1,6,1,2
chr22	19163577	.	C	CAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr22	19184244	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr22	19187375	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=212,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,3:3,4:1,3,1,6
chr22	19187427	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr22	19189003	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,7:0,0,3,7
chr22	19189034	.	ACT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=115,246;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:4,2:1,5,0,2
chr22	19209682	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=171,261;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,2:3,1:0,8,1,2
chr22	19220648	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=223,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:3,0,5,1
chr22	19230441	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,48;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:5,8,1,1
chr22	19230460	.	C	CTGTACG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=157,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,0:1,2:2,4,1,1
chr22	19241688	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=122,36;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,0:14,2:9,9,1,1
chr22	19341514	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,69;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:6,4,2,0
chr22	19419093	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr22	19444022	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=252,87;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr22	19455376	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=198,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,23:0.858:26:3,10:0,13:1,2,18,5
chr22	19459157	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,5:0,0,7,0
chr22	19462466	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=35.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr22	19466527	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=124,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:19466527_G_C:19466527:1,1,1,0
chr22	19466532	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=124,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:19466527_G_C:19466527:1,1,1,0
chr22	19467652	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.814:25:3,12:1,7:1,3,13,8
chr22	19468655	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=208,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr22	19471609	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr22	19495967	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=259,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr22	19504318	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=166,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,4:1,4:1,0,6,3
chr22	19504470	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=66.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,13:0,6:0,0,1,18
chr22	19506456	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=183,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,4:3,1:2,4,0,5
chr22	19506476	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=154,345;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr22	19709485	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=152,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:0,7,0,3
chr22	19747082	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr22	19747303	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=209,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:19747303_G_C:19747303:0,2,0,1
chr22	19747308	.	C	CAACAGAGCAAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=209,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:19747303_G_C:19747303:0,2,0,1
chr22	19747309	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=209,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:19747303_G_C:19747303:0,2,0,1
chr22	19766910	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=151,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,1:10,2:12,9,3,0
chr22	19776365	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=221,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:4,1,3,1
chr22	19794366	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr22	19870831	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=111,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:3,2,2,1
chr22	19886443	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	19902896	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.345:12:3,2:5,1:1,7,0,4
chr22	19907192	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr22	19949952	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=302,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr22	19950428	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=218,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr22	19954916	.	AT	A,ATTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,25,27;MFRL=189,229,214;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=T;STR;TLOD=9.05,3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,5,3:0.313,0.218:15:1,2,0:5,2,2:2,5,0,8
chr22	19958669	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr22	19959366	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr22	19960184	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=143,293;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr22	19960188	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr22	19960590	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,16;MFRL=209,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:19960590_C_G:19960590:0,2,1,0
chr22	19960594	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=196,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:19960590_C_G:19960590:0,3,1,0
chr22	19960600	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=196,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:19960590_C_G:19960590:0,3,1,0
chr22	19960606	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=207,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:1,3,0,2
chr22	19969380	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=202,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:5,2,2,0
chr22	19978022	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=219,265;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr22	20049244	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,5:3,0:1,5,2,3
chr22	20049285	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:1,7,0,2
chr22	20074006	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=152,206;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.322:16:6,1:5,3:4,7,1,4
chr22	20077863	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=221,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,2,1
chr22	20080447	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,6:5,2:3,5,4,4
chr22	20096314	.	G	GCGCCTACCTTGCCAGACCCTGGGCA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=201,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.375:13:3,2:6,1:9,0,4,0
chr22	20100409	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=232,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:5,5,1,1
chr22	20100596	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=198,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,3:6,1:5,6,3,1
chr22	20102090	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,9:0,14:0,0,12,11
chr22	20102842	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.289:12:3,0:5,3:6,3,1,2
chr22	20103012	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=219,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr22	20103189	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=216,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:14,0,1,1
chr22	20104301	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr22	20104350	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=178,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:3,1:5,0:2,10,2,0
chr22	20113777	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=325,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,6,1
chr22	20116906	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=207,259;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr22	20126741	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=118,184;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr22	20127554	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,7:1,0:1,0,6,1
chr22	20128036	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=186,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.586:8:1,1:2,2:3,0,5,0
chr22	20128651	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr22	20128674	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=209,302;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,0,2
chr22	20132972	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr22	20134525	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=163,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,1:0,1:4,2,1,1
chr22	20136331	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=186,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,2:2,1:4,4,2,1
chr22	20136379	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=223,196;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,1:1,2:1,1,2,1
chr22	20136478	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,2:4,3:4,7,4,1
chr22	20136606	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=232,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,1,4
chr22	20136651	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=204,286;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:3,2,1,1
chr22	20255248	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=287,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.596:8:3,2:0,2:0,3,2,3
chr22	20458333	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=248,262;MMQ=25,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:4,3,1,1
chr22	20718692	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:0,5,0,4
chr22	20721058	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=193,184;MMQ=27,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,1:7,2:4,10,3,0
chr22	20755098	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr22	20779604	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,300;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	20779822	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,300;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	20780024	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:20780024_G_GC:20780024:0,0,2,0
chr22	20780029	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:20780024_G_GC:20780024:0,0,2,0
chr22	20780031	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:20780024_G_GC:20780024:0,0,2,0
chr22	20780590	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	20783485	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,2:3,7:3,7,4,5
chr22	20784630	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=275,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,3,0
chr22	20812244	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=195,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.117:28:10,2:15,0:14,11,3,0
chr22	20891545	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=138,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr22	20891568	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=184,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr22	20907303	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:7,1,4,0
chr22	20938548	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=210,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr22	20938629	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:3,0:7,1,0,2
chr22	20938775	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.491:12:5,4:1,2:1,5,0,6
chr22	21044705	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=167,169;MMQ=40,31;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:3,4,1,1
chr22	21044725	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=165,169;MMQ=40,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:5,3,1,1
chr22	21045012	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=138,208;MMQ=52,31;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,1:7,1:8,8,2,0
chr22	21045184	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=189,195;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr22	21064356	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=160,146;MMQ=40,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr22	21064387	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=174,188;MMQ=40,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr22	21068659	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=158,169;MMQ=25,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr22	21068850	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=106,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:10,2:1,1:5,7,0,3
chr22	21068878	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=170,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:8,7:4,0:4,8,3,4
chr22	21073122	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=182,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:5,3:9,3:7,7,3,3
chr22	21075537	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=201,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:4,2,5,1
chr22	21080721	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=239,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.785:12:0,4:2,5:0,2,8,2
chr22	21081964	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=232,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:1,0,9,1
chr22	21088146	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,182;MMQ=55,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:4,4:4,4:5,3,2,7
chr22	21088784	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=108,108;MMQ=34,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.477:42:7,20:15,0:20,2,20,0
chr22	21099097	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	21106055	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,1:9,1:6,11,2,0
chr22	21107153	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=105,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr22	21134385	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,159;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:13,3:14,0:24,3,3,0
chr22	21153590	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=274,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:2,5,0,2
chr22	21159269	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:8,4,1,1
chr22	21167605	.	G	GACA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=37,35;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACA;STR;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:2,4:0,1:2,0,6,0
chr22	21213380	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=131,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,6:1,3:4,2,4,5
chr22	21213416	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:5,8:4,4:7,2,6,6
chr22	21322325	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0|1:21322325_TC_T:21322325:0,0,0,4
chr22	21322351	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0|1:21322325_TC_T:21322325:0,0,0,6
chr22	21322376	.	TC	GG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,2:0|1:21322325_TC_T:21322325:0,0,0,6
chr22	21322380	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:21322325_TC_T:21322325:0,0,0,5
chr22	21322383	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:21322325_TC_T:21322325:0,0,0,4
chr22	21327834	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr22	21329123	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,5:0,13:0,0,8,10
chr22	21330608	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=209,264;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:5,3,0,2
chr22	21331918	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,7:2,4:2,0,8,3
chr22	21331950	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0,0,10,9
chr22	21332116	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=176,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.208:17:5,1:8,2:0|1:21332116_G_A:21332116:8,6,1,2
chr22	21332122	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=155,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.388:16:6,1:4,3:0|1:21332116_G_A:21332116:3,7,3,3
chr22	21332394	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr22	21334924	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=184,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr22	21335060	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=183,71;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:10,5:15,0:13,12,3,2
chr22	21337266	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=196,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:6,2,0,2
chr22	21337415	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,7,10
chr22	21341693	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=211,157;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:21341693_G_A:21341693:2,1,1,0
chr22	21341700	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,15;MFRL=203,157;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:21341693_G_A:21341693:2,2,1,0
chr22	21342387	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,1:4,1:5,8,1,1
chr22	21343995	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=236,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.448:9:1,2:3,0:1,4,1,3
chr22	21344002	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=234,156;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.625:11:1,4:2,3:1,3,1,6
chr22	21344023	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=203,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,1:4,1:0|1:21344023_G_A:21344023:1,8,0,2
chr22	21344024	.	AGCC	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=203,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,1:4,1:0|1:21344023_G_A:21344023:1,8,0,2
chr22	21344028	.	AGGGCGCAGG	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=203,157;MMQ=60,60;MPOS=-1073741820;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,3:4,1:1,8,1,3
chr22	21344905	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr22	21346485	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,6:1,4:1,1,6,4
chr22	21346719	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=199,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr22	21348084	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr22	21349037	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:21349037_A_G:21349037:0,0,0,2
chr22	21349050	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=325,317;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:21349037_A_G:21349037:1,0,0,1
chr22	21349676	.	TC	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=136,284;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,0:7,4:9,7,1,3
chr22	21350461	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr22	21350947	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=190,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,2:5,0:6,3,0,2
chr22	21356029	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	21369454	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=178,220;MMQ=43,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,4:3,1:7,0,5,0
chr22	21370237	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=117,126;MMQ=60,54;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,5:5,0:5,6,2,3
chr22	21372405	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr22	21377071	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0,5,1,1
chr22	21377958	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=221,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr22	21380900	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:4,5:7,2:6,5,5,2
chr22	21380944	.	G	GACACTTGATTTACTTTTC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=171,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:7,2:3,0:0|1:21380944_G_GACACTTGATTTACTTTTC:21380944:4,6,1,1
chr22	21380946	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=171,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.209:12:7,2:3,0:0|1:21380944_G_GACACTTGATTTACTTTTC:21380944:4,6,1,1
chr22	21388605	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=142,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr22	21409532	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=267,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:21409532_T_TG:21409532:0,1,0,2
chr22	21409537	.	C	CAACCCTTGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=267,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:21409532_T_TG:21409532:0,1,0,2
chr22	21567334	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	21568207	.	C	CGTCATTCCTTTGTCAGTCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=143,64;MMQ=25,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:1,4,1,1
chr22	21570185	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=252,229;MMQ=26,24;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:21570185_C_T:21570185:2,0,2,0
chr22	21570193	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,35;MFRL=252,225;MMQ=26,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:21570185_C_T:21570185:2,0,1,0
chr22	21570296	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=225,192;MMQ=24,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.732:12:2,7:0,2:1,2,9,0
chr22	21570310	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=191,225;MMQ=40,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:6,3:4,2:10,0,3,2
chr22	21570340	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=193,184;MMQ=40,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,2:6,3:10,5,5,0
chr22	21570373	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=112,180;MMQ=50,31;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,1:8,2:8,6,3,0
chr22	21570431	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=181,184;MMQ=46,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:7,5:7,2:4,11,2,5
chr22	21570436	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=181,184;MMQ=42,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:12,1:7,1:4,15,1,2
chr22	21576082	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=155,154;MMQ=50,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,5:4,1:9,1,5,1
chr22	21576088	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=151,180;MMQ=40,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,3:6,0:12,3,3,0
chr22	21579624	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=145,60;MMQ=27,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:21579624_C_A:21579624:1,2,1,1
chr22	21579625	.	T	TTGTTGTGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=145,60;MMQ=27,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:21579624_C_A:21579624:1,2,1,1
chr22	21742684	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=159,151;MMQ=25,25;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr22	21797094	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,320;MMQ=60,43;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21797094_C_G:21797094:0,0,1,0
chr22	21797102	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,320;MMQ=60,43;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:21797094_C_G:21797094:0,0,1,0
chr22	21829480	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=177,138;MMQ=25,29;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.426:12:6,2:1,3:2,5,2,3
chr22	21829507	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=158,163;MMQ=27,25;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,1:0|1:21829507_G_A:21829507:3,4,0,2
chr22	21829513	.	TTGTC	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=158,163;MMQ=27,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,0:2,1:0|1:21829507_G_A:21829507:4,3,0,2
chr22	21842655	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,238;MMQ=60,34;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr22	21984379	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=248,242;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr22	21988524	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:3,3:2,2:1,4,2,4
chr22	22007370	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:2,1:5,5:3,4,2,4
chr22	22007426	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=213,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:0,7,0,5
chr22	22007528	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:7,0,4,0
chr22	22024150	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=199,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,3:1,5:3,0,4,4
chr22	22024507	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr22	22025462	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=241,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr22	22036832	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=225,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr22	22040713	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=192,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr22	22041257	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:4,7,2,0
chr22	22042318	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,1:6,3:5,2,4,0
chr22	22042440	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,15;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,0:2,1:2,2,0,3
chr22	22048862	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:2,2:5,4,1,1
chr22	22055394	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:0,7:1,10:0,1,13,4
chr22	22055581	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,342;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr22	22058000	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=289,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:2,0:0,1:2,0,1,1
chr22	22221558	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr22	22287964	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=235,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.735:12:1,3:1,6:0,3,4,5
chr22	22288309	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=204,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr22	22313128	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,3:0,2:0,1,0,6
chr22	22318240	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=219,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr22	22319591	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,60;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr22	22319850	.	CCT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=102,201;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:1,1,0,1
chr22	22326433	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=171,262;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:22326433_T_G:22326433:0,2,0,1
chr22	22326436	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=171,262;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:22326433_T_G:22326433:0,2,0,1
chr22	22328851	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,113;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:9,11,0,2
chr22	22453698	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=216,0;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr22	22516883	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=158,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:5,2,2,1
chr22	22550110	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=189,1326;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:4,1,2,0
chr22	22550112	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=194,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:3,1,3,0
chr22	22550339	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=272,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:4,2:1,9:2,3,6,5
chr22	22550760	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr22	22555940	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=221,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr22	22569758	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=388,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr22	22599380	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=194,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:3,2,3,1
chr22	22673639	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr22	22676970	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=209,197;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,6:4,4:3,4,7,3
chr22	22682195	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=191,41221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:9,4:4,0:3,10,0,4
chr22	22697490	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=186,264;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr22	22707178	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=290,230;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:3,0,3,0
chr22	22707309	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=11;MBQ=33,26;MFRL=212,188;MMQ=60,49;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,1:1,5:5,2,4,2
chr22	22707349	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=33,20;MFRL=215,78;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,2:9,1:0|1:22707349_C_A:22707349:6,10,1,2
chr22	22707351	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=11;MBQ=34,20;MFRL=186,78;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,2:9,1:0|1:22707349_C_A:22707349:7,10,1,2
chr22	22707361	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=28,20;MFRL=183,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:7,2:9,1:0|1:22707349_C_A:22707349:9,9,1,2
chr22	22707366	.	CA	AC	.	.	DP=20;ECNT=11;MBQ=33,20;MFRL=181,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,2:9,1:0|1:22707349_C_A:22707349:8,9,1,2
chr22	22707369	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=11;MBQ=28,20;MFRL=176,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:6,2:9,1:0|1:22707349_C_A:22707349:6,9,1,2
chr22	22707388	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=29,30;MFRL=206,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:5,1:6,4:7,5,0,5
chr22	22707429	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=11;MBQ=29,35;MFRL=217,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:5,1:5,3:4,7,1,3
chr22	22707443	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=11;MBQ=28,26;MFRL=226,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:6,1:2,3:3,5,1,3
chr22	22707452	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=11;MBQ=35,34;MFRL=226,271;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:6,1:2,2:3,5,2,1
chr22	22707473	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=11;MBQ=33,31;MFRL=192,244;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:4,1:5,2:4,6,2,1
chr22	22707621	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=238,250;MMQ=60,34;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:4,2,1,1
chr22	22707646	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=218,250;MMQ=60,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,1:5,1:7,3,1,1
chr22	22707782	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=206,153;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:6,4,2,0
chr22	22707814	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=234,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:1,4:5,1:0|1:22707814_A_G:22707814:2,4,0,5
chr22	22707820	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=221,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:1,4:6,1:0|1:22707814_A_G:22707814:2,5,0,5
chr22	22707835	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=221,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:0,4:7,2:1,6,1,5
chr22	22712021	.	C	CCGGGGA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=207,241;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0|1:22712021_C_CCGGGGA:22712021:5,0,2,1
chr22	22712027	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=207,241;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0|1:22712021_C_CCGGGGA:22712021:5,0,2,1
chr22	22712196	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=177,88;MMQ=52,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.234:32:10,7:15,0:15,10,7,0
chr22	22712261	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=137,201;MMQ=50,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:3,5,2,2
chr22	22712276	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=186,164;MMQ=39,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:3,2,2,5
chr22	22724135	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.875:13:1,7:0,4:0,1,5,7
chr22	22730280	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,13,1
chr22	22730317	.	CA	GG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=179,229;MMQ=60,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:5,4,0,2
chr22	22730498	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=200,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,1:8,2:8,8,2,1
chr22	22730504	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=185,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,8:5,4:6,2,6,6
chr22	22730513	.	GGT	CCA	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=33,35;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:11,1:7,2:10,9,2,1
chr22	22730526	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:11,1:6,3:0|1:22730526_G_T:22730526:9,8,2,2
chr22	22730530	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:11,1:4,3:0|1:22730526_G_T:22730526:9,7,2,2
chr22	22730534	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=176,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:11,1:6,3:0|1:22730526_G_T:22730526:10,7,2,2
chr22	22730539	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=25,34;MFRL=176,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:11,0:5,2:0|1:22730526_G_T:22730526:10,7,1,2
chr22	22730787	.	GG	AA	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=27,24;MFRL=160,155;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:5,3:13,0:13,6,1,2
chr22	22730799	.	GA	CC	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=165,135;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,2:13,0:12,6,1,1
chr22	22730829	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=190,192;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,1:8,1:7,5,1,1
chr22	22730849	.	GTA	G	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=33,35;MFRL=187,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:5,2:6,1:0|1:22730849_GTA_G:22730849:6,5,2,2
chr22	22730853	.	G	GCC	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=34,35;MFRL=187,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:5,3:5,1:0|1:22730849_GTA_G:22730849:7,6,2,2
chr22	22730860	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=187,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:5,3:7,1:0|1:22730849_GTA_G:22730849:6,7,2,2
chr22	22730869	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:5,3:9,1:0|1:22730849_GTA_G:22730849:5,9,2,2
chr22	22730891	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=142,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:4,2:8,1:2,10,2,2
chr22	22735736	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=209,146;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,4:0,5:0,1,2,7
chr22	22782191	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=165,215;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:10,4:15,0:14,11,4,0
chr22	22782210	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=177,252;MMQ=60,44;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:10,3:13,0:12,11,3,0
chr22	22782234	.	GG	CA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=166,37153;MMQ=60,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:11,0:10,13,2,0
chr22	22782394	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=155,232;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0,6,0,4
chr22	22786410	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=119,248;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:5,6,1,4
chr22	22869085	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=196,142;MMQ=52,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:3,6:9,2:7,5,6,2
chr22	22890492	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:6,1:5,1:7,4,2,0
chr22	22930611	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=140,262;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,2:4,1:6,4,3,0
chr22	22930770	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=126,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.716:19:3,7:2,7:2,3,10,4
chr22	22937436	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=167,37;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:4,0:12,1:0|1:22937436_G_A:22937436:5,11,1,1
chr22	22937441	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=151,37;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:6,2:0|1:22937436_G_A:22937436:6,10,1,1
chr22	22937442	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=148,37;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,0:6,2:0|1:22937436_G_A:22937436:5,10,1,1
chr22	22988846	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=194,207;MMQ=34,22;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:0|1:22988846_C_T:22988846:1,5,1,1
chr22	22988864	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=217,207;MMQ=27,22;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:22988846_C_T:22988846:1,4,1,1
chr22	22988876	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=190,207;MMQ=26,22;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:22988846_C_T:22988846:1,5,1,1
chr22	22989076	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,269;MMQ=60,37;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	22989256	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr22	23010943	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=254,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,13:0.641:20:3,5:3,7:0|1:23010943_G_A:23010943:4,3,11,2
chr22	23010963	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=188,233;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,5:0.260:21:8,2:8,3:1|0:23010943_G_A:23010943:12,4,3,2
chr22	23029263	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,6,10
chr22	23029374	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,7,7
chr22	23029718	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=173,151;MMQ=40,39;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,2:8,1:6,8,3,0
chr22	23029754	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=208,60439;MMQ=57,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:4,0:7,11:3,8,0,11
chr22	23040362	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=324,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,9:1,7:1,0,13,3
chr22	23040389	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=220,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:2,10:3,9:4,1,10,9
chr22	23040586	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=239,210;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:4,4,1,1
chr22	23055752	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=204,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr22	23063645	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.751:22:2,6:3,11:2,3,7,10
chr22	23089826	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr22	23089857	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=341,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.867:13:0,7:0,5:0|1:23089857_G_A:23089857:0,1,9,3
chr22	23089865	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=341,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.883:15:0,8:1,5:0|1:23089857_G_A:23089857:0,1,11,3
chr22	23089941	.	ACT	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=230,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=64.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:2,8:1,5:3,1,9,7
chr22	23089996	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=193,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.736:21:5,6:0,8:4,1,8,8
chr22	23090423	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=194,222;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr22	23090438	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=194,164;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr22	23090468	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=184,198;MMQ=60,30;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:23090468_C_T:23090468:0,2,0,2
chr22	23090475	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=168,225;MMQ=60,47;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0|1:23090468_C_T:23090468:0,1,0,4
chr22	23101103	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=35,29;MFRL=217,176;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:3,7:1,5:4,0,11,1
chr22	23101132	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=215,159;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=69.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,21:0.863:24:1,12:1,8:3,0,17,4
chr22	23101159	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=172,157;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.931:27:1,13:0,13:1,0,16,10
chr22	23101216	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=26,32;MFRL=259,171;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,17:0.818:20:2,10:1,7:0|1:23101216_A_G:23101216:0,3,1,16
chr22	23101221	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=25,32;MFRL=219,178;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,16:0.739:21:3,9:2,7:0|1:23101216_A_G:23101216:0,5,1,15
chr22	23101247	.	GC	AT	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=33,26;MFRL=217,194;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=74.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.792:22:2,11:2,7:0,4,5,13
chr22	23101280	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=217,200;MMQ=60,42;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.793:22:2,8:2,10:1,3,12,6
chr22	23101347	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=396,152;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.772:20:1,6:3,10:2,2,9,7
chr22	23114239	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr22	23114285	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=176,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,3:2,5:5,0,6,2
chr22	23114748	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr22	23114993	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=363,157;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.683:17:3,4:2,7:3,2,5,7
chr22	23115001	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:6,2:8,2:6,8,2,2
chr22	23115038	.	TA	AT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=185,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:7,2:5,0:6,7,1,1
chr22	23135021	.	CA	AT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=153,83;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,2:9,0:0|1:23135021_CA_AT:23135021:6,11,0,2
chr22	23135025	.	GCCT	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=153,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,2:10,0:0|1:23135021_CA_AT:23135021:7,12,0,2
chr22	23135588	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=278,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0,4,0,5
chr22	23165242	.	A	AG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=241,187;MMQ=60,56;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=64.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:1,13:0,8:0,1,11,10
chr22	23165839	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=43.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,12:0,4:0,0,2,14
chr22	23213762	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=185,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:9,4:12,0:9,12,4,0
chr22	23223070	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:3,3:1,1:0,4,1,4
chr22	23241620	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=145,214;MMQ=59,56;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,5:2,1:2,0,6,0
chr22	23241753	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=60,176;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:1,3:3,2:3,2,2,3
chr22	23243481	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,246;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:23243481_C_A:23243481:0,0,3,2
chr22	23243495	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,235;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:23243481_C_A:23243481:0,0,3,3
chr22	23247207	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=170,271;MMQ=40,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,2:15,1:5,20,1,2
chr22	23260276	.	GGC	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=133,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.202:18:5,2:7,1:10,5,3,0
chr22	23260278	.	CGG	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=98,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.834:17:1,8:1,6:2,0,10,5
chr22	23263708	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=244,271;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr22	23480925	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=193,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr22	23492236	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=108,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.811:19:3,8:0,8:3,0,10,6
chr22	23492239	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=130,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,3:8,0:11,7,3,0
chr22	23501286	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=186,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,4:2,5:2,1,8,1
chr22	23502987	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr22	23503008	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr22	23503170	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:1,5:0,5:0,1,4,6
chr22	23503205	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=219,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,4,3
chr22	23503266	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr22	23503569	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,35;MFRL=219,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,4:1,0:1,0,3,1
chr22	23503580	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=219,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,5:1,0:1,0,4,1
chr22	23503651	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr22	23596203	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=175,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0,9,0,2
chr22	23627441	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr22	23630451	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=178,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr22	23631639	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=175,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,4:2,0:5,1,4,0
chr22	23631801	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:7,2:2,2:5,4,0,4
chr22	23631813	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=135,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.383:11:6,2:1,2:0|1:23631813_G_GC:23631813:4,3,0,4
chr22	23631823	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=143,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:7,2:1,2:0|1:23631813_G_GC:23631813:4,4,0,4
chr22	23632621	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:7,3:4,4:5,6,3,4
chr22	23632636	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=180,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,1:6,4:3,7,2,3
chr22	23632665	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr22	23634637	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=203,144;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr22	23637200	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=181,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:0,3:5,4:2,3,3,4
chr22	23653880	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,268;MMQ=27,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:6,1:8,1,4,0
chr22	23656148	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:9,2:9,2:10,9,2,2
chr22	23950905	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:3,1,0,2
chr22	23959766	.	GCAT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,186;MMQ=58,52;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CAT;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:6,2:9,7,2,0
chr22	23962744	.	T	TTTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=222,0;MMQ=60,35;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:3,1:0,0:2,1,0,1
chr22	23964282	.	GCAT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=94,259;MMQ=45,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CAT;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:2,1:4,1,1,1
chr22	23967147	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=158,167;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,2:7,4:2,7,2,4
chr22	24036657	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,7:4,2:1,7,5,4
chr22	24040431	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,0:7,2:4,5,2,0
chr22	24096464	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,244;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.252:22:8,3:9,2:9,8,2,3
chr22	24105601	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24105601_T_A:24105601:0,0,0,1
chr22	24105603	.	G	GCTGACGAAGGCGGATCAGAAGGTCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24105601_T_A:24105601:0,0,0,1
chr22	24106674	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=319,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:1,0,1,3
chr22	24107644	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:3,7,4,0
chr22	24107801	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=199,266;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:5,1,1,1
chr22	24108288	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=234,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:1,8:0,13:0,1,12,9
chr22	24108461	.	G	GGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr22	24109462	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=188,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:3,0,7,0
chr22	24109550	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,6:0,0,13,5
chr22	24109588	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=188,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:5,8,2,0
chr22	24122499	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=210,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.747:10:0,1:2,6:1,1,7,1
chr22	24125565	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,9,1
chr22	24129553	.	GGC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GC;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0,1,1,0
chr22	24145395	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr22	24145675	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr22	24158899	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,255;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr22	24167686	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	24176359	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=159,276;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:9,1:6,9,1,1
chr22	24179756	.	CAAGG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=192,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr22	24180123	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=179,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr22	24180449	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=184,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.776:10:0,5:1,3:2,0,8,0
chr22	24199262	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,23;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:24199262_G_A:24199262:1,0,0,1
chr22	24199264	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:24199262_G_A:24199262:1,0,0,1
chr22	24199266	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:24199262_G_A:24199262:1,0,0,1
chr22	24226130	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,1:3,1:3,9,1,1
chr22	24226242	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=202,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:3,2:0,1:1,2,1,3
chr22	24300580	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=199,120;MMQ=27,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,1:3,3:4,2,2,2
chr22	24300632	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=215,93;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0|1:24300632_A_G:24300632:1,2,1,1
chr22	24300634	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=12,20;MFRL=215,93;MMQ=27,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:0,0:0|1:24300632_A_G:24300632:1,2,1,1
chr22	24300660	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,30;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	24300683	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,28;MFRL=161,182;MMQ=30,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:24300683_G_A:24300683:0,2,0,1
chr22	24300701	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=180,182;MMQ=27,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24300683_G_A:24300683:0,1,0,1
chr22	24323231	.	C	CT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,50;MMQ=27,22;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.263:36:17,0:10,9:14,13,0,9
chr22	24325047	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr22	24377034	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,301;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	24452885	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	24455835	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,122;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,0:5,6:6,5,0,6
chr22	24472270	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,9:0,1:0,0,0,10
chr22	24480503	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr22	24492061	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,1:0,7:0,0,2,6
chr22	24582221	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=197,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:11,1,2,0
chr22	24584206	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=201,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:5,1,0,2
chr22	24621491	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:5,2,0,2
chr22	24622608	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:10,2:2,0:9,3,1,1
chr22	24622648	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=154,292;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,2:10,0:6,8,0,2
chr22	24628189	.	G	GCCC	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:24628189_G_GCCC:24628189:0,0,0,1
chr22	24628192	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=236,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:24628189_G_GCCC:24628189:0,1,0,1
chr22	24628194	.	CCTCA	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=214,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:24628189_G_GCCC:24628189:0,2,0,1
chr22	24628200	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,25;MFRL=214,235;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:24628189_G_GCCC:24628189:0,2,0,1
chr22	24628202	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=12,26;MFRL=214,235;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:24628189_G_GCCC:24628189:0,2,0,1
chr22	24628204	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=22,25;MFRL=214,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:24628189_G_GCCC:24628189:0,2,0,1
chr22	24628207	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,32;MFRL=214,235;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:24628189_G_GCCC:24628189:0,2,0,1
chr22	24628210	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,24;MFRL=214,235;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:24628189_G_GCCC:24628189:0,2,0,1
chr22	24640438	.	TCA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:2,0:6,2:10,0,2,0
chr22	24640544	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=149,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:9,4:18,0:12,15,0,4
chr22	24640612	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=164,95;MMQ=60,44;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:8,4:6,0:0|1:24640612_C_A:24640612:4,10,0,4
chr22	24640628	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=166,95;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:6,4:10,0:0|1:24640612_C_A:24640612:4,13,0,4
chr22	24698282	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=162,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:18,0:15,4:17,17,0,4
chr22	24730587	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=134,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:0,7,0,4
chr22	24836454	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	24891292	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr22	24937088	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=193,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,0:4,3:1,9,1,2
chr22	24938908	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr22	24944053	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,4,8
chr22	24944782	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr22	24951086	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	24953571	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr22	24953862	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=199,224;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,0:2,5:0,6,0,5
chr22	24964128	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,7,10
chr22	24979755	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=129,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:3,4:11,1:5,9,2,3
chr22	24984379	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=169,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr22	25003821	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=215,165;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:7,0,3,0
chr22	25003852	.	GGC	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=220,165;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:3,3:4,3:0|1:25003852_GGC_G:25003852:5,3,6,1
chr22	25003859	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=215,179;MMQ=60,30;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:2,5:6,3:0|1:25003852_GGC_G:25003852:5,4,6,2
chr22	25003922	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=175,163;MMQ=51,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:3,9:10,6:7,6,9,6
chr22	25003934	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=163,170;MMQ=27,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:7,3:8,8:8,7,7,4
chr22	25004008	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=215,159;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:4,5:3,0:1,6,0,5
chr22	25005829	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=214,255;MMQ=32,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr22	25007008	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=116,177;MMQ=43,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,1:11,2:9,8,2,1
chr22	25007023	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=157,109;MMQ=43,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,2:6,6:7,6,3,5
chr22	25007109	.	GGC	AAT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=157,215;MMQ=40,32;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:5,0:7,5:7,6,1,5
chr22	25010670	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=151,207;MMQ=40,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:1,2:0|1:25010670_G_A:25010670:6,0,2,0
chr22	25010682	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=161,207;MMQ=40,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:2,2:0|1:25010670_G_A:25010670:7,2,2,0
chr22	25010828	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,225;MMQ=50,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,1:3,3:6,5,2,2
chr22	25019294	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=169,152;MMQ=24,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr22	25024040	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=189,148;MMQ=40,34;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,3:5,3:8,2,1,5
chr22	25024072	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=165,148;MMQ=40,26;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:9,3:5,4:0|1:25024072_G_T:25024072:10,4,1,7
chr22	25024076	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=158,143;MMQ=40,23;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:10,2:5,4:0|1:25024072_G_T:25024072:11,4,1,6
chr22	25115959	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr22	25119300	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=267,251;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr22	25124095	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:4,2,3,2
chr22	25130079	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:7,12,0,2
chr22	25147324	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,1:6,2:9,1,2,1
chr22	25150209	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:2,1:2,1:1,4,0,2
chr22	25153954	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=143,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:18,0:12,4:11,19,0,4
chr22	25153982	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:13,3:13,0:4,23,0,3
chr22	25263240	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr22	25270455	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:3,3,2,1
chr22	25272453	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=164,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr22	25275393	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=194,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:0,1,4,1
chr22	25297755	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=156,100;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:6,0:2,3:6,2,2,1
chr22	25320206	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,0:7,2:5,12,1,1
chr22	25424549	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,1:4,1:4,4,2,0
chr22	25424579	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=170,191;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,2:6,1:4,6,1,2
chr22	25425439	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=192,163;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.289:18:3,2:10,2:3,10,4,1
chr22	25425469	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=177,206;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,0:9,2:2,12,0,2
chr22	25445405	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,279;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:4,1:7,1:0,11,0,2
chr22	25577688	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=105,322;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,1:7,2:8,6,3,0
chr22	25577733	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=258,100;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.714:26:3,11:4,8:5,2,10,9
chr22	25577846	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=243,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr22	25586564	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=182,86;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr22	25597331	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=194,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:1,8:5,5:3,3,10,3
chr22	25624030	.	G	GTGCAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=233,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr22	25624049	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	25625427	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=162,183;MMQ=40,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr22	25625554	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,6,10
chr22	25713904	.	GG	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=398,206;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0|1:25713904_GG_CA:25713904:1,0,3,0
chr22	25713908	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=398,215;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:25713904_GG_CA:25713904:1,0,4,0
chr22	25713933	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=352,224;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,5,0
chr22	25716011	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=168,128;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,6:5,0:3,6,7,0
chr22	25716068	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr22	25750814	.	C	CAGGGCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=191,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,2:0,3,1,6
chr22	25750873	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=218,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,1,2
chr22	26099513	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=149,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:13,1:9,1:15,7,0,2
chr22	26158910	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr22	26163996	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=267,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr22	26164079	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=155,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:4,9:1,4:3,2,10,3
chr22	26164807	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=185,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:4,6,1,1
chr22	26165109	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:9,11,1,1
chr22	26166011	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=270,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:1,4:1,7:1,1,9,2
chr22	26166077	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=202,85;MMQ=60,33;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:8,12,0,2
chr22	26167033	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=179,145;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,0:4,3:0,4,0,3
chr22	26193824	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=223,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chr22	26194093	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr22	26219412	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr22	26222505	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,1,5
chr22	26228797	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr22	26239906	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=250,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr22	26239950	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr22	26241994	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	26247607	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,4:5,0:0,7,0,4
chr22	26270190	.	A	ACC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=183,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=C;STR;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,1:0,3:2,0,5,1
chr22	26270206	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=137,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,3:2,6:5,1,7,2
chr22	26273843	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=149,292;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:26273843_T_G:26273843:1,0,1,0
chr22	26273850	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=149,292;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:26273843_T_G:26273843:1,0,1,0
chr22	26273889	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=131,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:2,1:0,3:1,1,3,1
chr22	26286748	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=186,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,0:8,2:16,7,1,1
chr22	26287408	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=155,33;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0|1:26287408_A_C:26287408:6,6,1,1
chr22	26287415	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=164,33;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,0:4,1:0|1:26287408_A_C:26287408:6,5,1,1
chr22	26298754	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr22	26317155	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr22	26317160	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr22	26342056	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr22	26342232	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=160,226;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:4,3,0,3
chr22	26343805	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,5,5
chr22	26346311	.	AT	A,ATT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30,28;MFRL=122,175,164;MMQ=60,60,60;MPOS=24,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=15.90,12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,7,6:0.478,0.416:14:1,4,3:0,3,3:1,0,9,4
chr22	26346494	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=238,135;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr22	26388304	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=276,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr22	26388337	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=180,78;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,0:5,5:6,2,3,2
chr22	26688292	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=245,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr22	26690407	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=112,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:3,2,2,3
chr22	26695077	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=203,202;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,5:3,1:2,6,3,3
chr22	26701854	.	TTC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=195,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,4:1,3:1,0,6,1
chr22	26706885	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,321;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr22	26769464	.	GA	G,GAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,35,30;MFRL=147,189,135;MMQ=60,60,60;MPOS=19,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.73,7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,5:0.231,0.470:10:2,0,1:1,2,2:2,1,1,6
chr22	26830478	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr22	26838981	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr22	26853980	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr22	26860200	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=191,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:11,3:6,3:11,6,1,5
chr22	26860269	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:7,3,2,2
chr22	26861545	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,6:0,0,5,9
chr22	26862153	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,7:0,0,13,2
chr22	26862212	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,10:0,5:0,0,10,5
chr22	26864658	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr22	26866723	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=185,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.347:24:8,3:7,5:9,7,6,2
chr22	26879823	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	26882142	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=234,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,4:2,0:0,3,0,4
chr22	26886191	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=198,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:11,0:7,6:4,15,0,7
chr22	26886953	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=141,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.497:14:3,5:4,2:6,1,6,1
chr22	26887099	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,5,12
chr22	26894974	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=198,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:2,7,0,2
chr22	26894985	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=215,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,1:2,6:1,3,1,6
chr22	26895061	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,5,6
chr22	26897766	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=132,211;MMQ=58,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26897766_A_T:26897766:1,0,1,0
chr22	26897773	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,36;MFRL=145,211;MMQ=59,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:26897766_A_T:26897766:2,0,1,0
chr22	26897774	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=185,132;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26897774_G_GC:26897774:2,0,1,0
chr22	26897777	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,15;MFRL=137,132;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:26897774_G_GC:26897774:4,0,1,0
chr22	26897779	.	GCT	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,19;MFRL=137,132;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:26897774_G_GC:26897774:4,0,1,0
chr22	26924149	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=132,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:7,6,1,1
chr22	26924312	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=154,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:1,2,0,3
chr22	26924336	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=160,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr22	26951185	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=110,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:3,5,0,2
chr22	27019177	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=220,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.275:13:4,2:6,1:8,2,3,0
chr22	27021425	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=255,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,4:3,5:3,1,7,2
chr22	27021457	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,12,7
chr22	28194894	.	CTGCTGT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=181,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGCTGT;STR;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,3:6,0:4,4,1,2
chr22	28194933	.	TTGC	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,15;MFRL=115,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TGC;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.510:2:0,0:1,0:1,0,0,1
chr22	28196476	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.348:18:8,5:4,1:4,8,6,0
chr22	28250933	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.258:24:3,0:15,5:9,9,4,2
chr22	28256019	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=204,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr22	28293980	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr22	28310322	.	G	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=117,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,11:0.200:58:25,0:22,11:18,29,0,11
chr22	28381376	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:1,2:2,1:1,3,1,2
chr22	28385873	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:7,2:15,4,1,1
chr22	28388568	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=196,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:7,3,2,0
chr22	28426128	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr22	28503580	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=166,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:4,3:10,3:8,6,3,3
chr22	28559595	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=263,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr22	28693496	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr22	29091037	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,141;MMQ=51,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,5:3,2:5,0,5,2
chr22	29121034	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:7,0:9,5:5,11,0,5
chr22	29130347	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:3,5:3,2:4,2,5,2
chr22	29449477	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=59,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,5:4,2:6,0,6,1
chr22	29449495	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=119,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,3:5,1:10,2,4,0
chr22	29456489	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,2:8,0:7,9,0,2
chr22	29490497	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr22	29533275	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=181,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:3,2,5,1
chr22	29533570	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=215,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:8,2:5,0:0|1:29533570_C_A:29533570:7,6,2,0
chr22	29533572	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=150,223;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,8:0.500:16:7,4:1,4:1|0:29533570_C_A:29533570:5,3,4,4
chr22	29656214	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=186,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:5,3,2,0
chr22	29656905	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	29664423	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=195,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:1,5:3,2:0,4,0,8
chr22	29668432	.	AATAATTAC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=169,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:4,5,1,2
chr22	29673921	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:7,0,4,0
chr22	29682881	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=208,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.525:11:2,3:2,3:5,0,6,0
chr22	29683033	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.282:29:12,0:9,7:10,11,0,8
chr22	29688632	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=155,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:1,9,0,2
chr22	29694004	.	CTTGA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=137,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr22	29695929	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=272,301;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,4:2,4:3,0,8,0
chr22	29724792	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=184,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:1,2:4,3:5,1,4,1
chr22	29725639	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.413:10:2,3:4,1:3,3,3,1
chr22	29730481	.	TTCTC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=275,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=TC;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr22	29759188	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=189,293;MMQ=21,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr22	29835189	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=223,121;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:1,2,0,4
chr22	29837537	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=191,153;MMQ=40,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:4,3:5,4,4,3
chr22	29837566	.	TTCC	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=183,126;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCC;STR;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,5:4,2:5,5,4,3
chr22	29838203	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=264,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0,8,0,2
chr22	29881884	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr22	29885036	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=157,164;MMQ=52,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,0:7,4:8,7,0,4
chr22	29885332	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=81,72;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:29885332_A_T:29885332:4,5,1,1
chr22	29885339	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=81,72;MMQ=60,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:29885332_A_T:29885332:5,4,1,1
chr22	29886413	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=108,253;MMQ=54,51;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:16,2:13,2:16,13,2,2
chr22	29908154	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=235,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:2,1,2,3
chr22	29915027	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:10,7,0,2
chr22	29916192	.	C	CTTGCTCTTCTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=187,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr22	29924212	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=199,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,6:4,2:5,4,4,4
chr22	29925105	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=121,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:7,3,2,0
chr22	29925284	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=293,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:1,1,0,3
chr22	29927805	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=127,80;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:2,1,2,0
chr22	29952016	.	CAG	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=121,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:8,3:6,1:7,8,2,3
chr22	29957570	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=127,286;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:2,6,1,1
chr22	29957911	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=111,234;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:1,2:3,2:1,4,1,3
chr22	29957944	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=56,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:1,0:1,1,0,2
chr22	29965168	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,267;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,1:6,2:6,1,3,0
chr22	30038152	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=223,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:14,1:3,3:15,2,4,0
chr22	30051705	.	CTT	C,CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,27,27;MFRL=203,180,172;MMQ=60,60,60;MPOS=13,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=5.19,7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,4:0.350,0.354:11:3,2,2:0,1,2:1,2,3,5
chr22	30077361	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr22	30124614	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=166,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:0,5,5,3
chr22	30124968	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=173,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:3,0,7,1
chr22	30127345	.	TAG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:2,1:4,2:1,5,2,1
chr22	30134523	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	30163332	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=123,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:7,0,6,1
chr22	30184950	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:3,1:1,4:5,0,5,0
chr22	30188611	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=147,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr22	30202774	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=112,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:2,2,3,2
chr22	30202984	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr22	30221662	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,127;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.249:21:10,4:6,0:7,9,5,0
chr22	30221826	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=194,243;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:1,5,0,2
chr22	30366924	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,17;MFRL=125,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.403:3:1,0:1,0:0|1:30366924_C_G:30366924:1,1,1,0
chr22	30366934	.	T	TTATTGGGGGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:30366924_C_G:30366924:0,1,1,0
chr22	30366947	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr22	30374621	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=278,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:1,2,0,2
chr22	30384572	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=137,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,7:2,2:1,3,4,5
chr22	30394731	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=196,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,1:6,2:3,5,2,1
chr22	30405151	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,2:8,3:1,10,3,2
chr22	30409351	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=131,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,7:0.165:46:21,7:18,0:25,14,7,0
chr22	30418161	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=110,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:0,3:2,2:0,2,1,5
chr22	30660517	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=269,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:0,4:1,5:0,1,0,9
chr22	30681797	.	T	TCTGCCCCAGCCCTTGGTGCTCCCC	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=60.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,1:0,8:0,0,11,3
chr22	30683285	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:8,6:2,3:4,6,7,2
chr22	30689388	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=184,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:1,7,0,2
chr22	30691631	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=215,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr22	30695512	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:6,13,2,0
chr22	30730711	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=158,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:0,4,0,5
chr22	30731387	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=101,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,5:2,0,7,1
chr22	30733111	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.387:26:8,5:7,4:10,6,7,3
chr22	30733914	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=122,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:5,5,2,2
chr22	30734716	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:2,2,5,1
chr22	30736763	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=147,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.193:17:8,0:5,2:13,1,0,3
chr22	30736835	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,3:5,3:3,9,0,6
chr22	30738737	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr22	30741104	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:18,2:11,0:19,10,2,0
chr22	30741230	.	CAGGGG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AGGGG;STR;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.894:5:0,2:0,2:0,0,1,4
chr22	30742327	.	TCTG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTG;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,0:7,2:12,4,1,1
chr22	30752696	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=111,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:2,3:5,1:2,5,3,2
chr22	30761940	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	30762140	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,3:2,1:4,1,1,4
chr22	30762148	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:3,0:5,2,0,2
chr22	30766365	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:8,5,2,0
chr22	30767536	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr22	30767729	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=127,207;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:3,1,1,1
chr22	30767781	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=209,241;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr22	30769901	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,11:0.480:23:6,6:5,4:0|1:30769901_G_C:30769901:8,4,9,2
chr22	30769906	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:7,6:3,4:0|1:30769901_G_C:30769901:8,3,9,1
chr22	30770157	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:1,2:2,1:0,3,0,4
chr22	30771458	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=204,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,0:6,3:8,0,2,1
chr22	30772246	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=21,15;MFRL=196,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.389:6:1,0:1,0:0|1:30772246_A_T:30772246:3,1,2,0
chr22	30772256	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=129,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:2,0:2,0:0|1:30772246_A_T:30772246:7,1,2,0
chr22	30772324	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:7,4:15,0:9,13,0,4
chr22	30772361	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=185,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:4,4:12,0:0|1:30772361_G_A:30772361:10,7,0,4
chr22	30772363	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=185,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:5,4:12,0:0|1:30772361_G_A:30772361:10,7,0,4
chr22	30776419	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=116,260;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:8,7,0,2
chr22	30812549	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,318;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr22	30822920	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr22	30863147	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=156,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:30863147_G_A:30863147:0,2,0,2
chr22	30863163	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=156,259;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,3:0,0:0|1:30863147_G_A:30863147:0,2,0,3
chr22	30864566	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=206,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:4,3,1,1
chr22	30864610	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,3:5,1:2,4,2,2
chr22	30864627	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=164,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:4,1:6,1:5,5,0,2
chr22	30864692	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=22,25;MFRL=90,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.803:23:1,12:3,7:3,1,9,10
chr22	30864897	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=192,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr22	30885727	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:0,1:4,0,3,0
chr22	30885980	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=238,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,2:6,0:3,4,0,2
chr22	30890749	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=272,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:30890749_A_C:30890749:2,0,1,0
chr22	30890751	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=17,32;MFRL=272,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:30890749_A_C:30890749:2,0,1,0
chr22	30890755	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=15,12;MFRL=272,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:30890749_A_C:30890749:2,0,1,0
chr22	30891859	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,288;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,2:6,2:5,5,3,1
chr22	30930080	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:2,3:1,3:1,2,3,4
chr22	30934886	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=147,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,2:6,1:5,4,2,1
chr22	30934887	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=191,132;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,1:5,2:5,3,2,1
chr22	30987861	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr22	31009118	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=285,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr22	31010242	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=244,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,0:0,5:1,0,5,0
chr22	31010556	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=244,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr22	31011504	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:2,2,2,1
chr22	31011557	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=195,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:0,1:1,3:2,0,4,0
chr22	31013498	.	C	CAG	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:0|1:31013498_C_CAG:31013498:2,12,0,2
chr22	31013500	.	C	CTCCCAAGTAGCTGAGACTACA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,1:9,0:0|1:31013498_C_CAG:31013498:2,12,0,2
chr22	31013508	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=187,109;MMQ=60,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,0:5,4:1,8,0,4
chr22	31013549	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=170,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr22	31018884	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,3,1
chr22	31089958	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.902:8:0,1:0,4:0,0,5,3
chr22	31090067	.	T	TCCACAACTA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=135,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=49.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.608:21:4,10:4,2:5,3,4,9
chr22	31091633	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr22	31266749	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr22	31285680	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=183,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:0,4,0,3
chr22	31286953	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=174,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:0,2:3,0:0,4,0,2
chr22	31329056	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=171,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,4:5,2:2,3,1,5
chr22	31329954	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr22	31335724	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=171,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.513:14:3,2:2,5:1,6,1,6
chr22	31337581	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=190,226;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:8,0:7,9:0,15,0,9
chr22	31491663	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=196,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr22	31494568	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=190,265;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,2:1,3:2,0,6,0
chr22	31496809	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:31496809_A_C:31496809:0,0,2,0
chr22	31496813	.	GG	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:31496809_A_C:31496809:0,0,2,0
chr22	31497054	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=166,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,1,5
chr22	31497112	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr22	31500246	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,96;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,4:6,0:9,0,5,0
chr22	31500363	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=151,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:7,0:5,6:0|1:31500363_C_T:31500363:4,8,0,6
chr22	31500367	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=151,89;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:6,0:5,6:0|1:31500363_C_T:31500363:4,8,0,6
chr22	31500536	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=204,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr22	31501788	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=187,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,3:3,2:6,3,3,2
chr22	31501833	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=170,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,1:5,1:7,3,0,2
chr22	31503560	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=137,287;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:31503560_C_T:31503560:0,2,0,1
chr22	31503580	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=91,287;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:31503560_C_T:31503560:0,2,0,1
chr22	31524144	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=189,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:31524144_C_T:31524144:0,3,1,0
chr22	31524150	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=201,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:31524144_C_T:31524144:0,4,1,0
chr22	31524152	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=201,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31524144_C_T:31524144:0,4,1,0
chr22	31529772	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=168,250;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr22	31530326	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=181,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:3,0:6,2,0,2
chr22	31532568	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,324;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	31534280	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=184,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:8,3,1,1
chr22	31583007	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr22	31600460	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:2,1,1,4
chr22	31644614	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=207,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:3,3:9,5:10,2,7,1
chr22	31658281	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=132,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:2,2,2,2
chr22	31663066	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=140,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:8,2:3,3:5,6,2,3
chr22	31664032	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,6:2,0:4,0,5,1
chr22	31672752	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,5:1,1:4,0,6,0
chr22	31672932	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,120;MMQ=50,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:10,1:11,1:10,11,2,0
chr22	31679110	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=113,161;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,4:1,1:4,2,5,0
chr22	31685129	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=126,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:2,3:9,2:7,4,5,0
chr22	31685458	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=195,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:1,4:4,4:3,3,7,1
chr22	31687127	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:13,3:18,0:13,19,0,3
chr22	31687142	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=101.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,11:0,19:0,0,12,18
chr22	31687313	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=78.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,11:0,0,4,19
chr22	31724958	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=218,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:3,6,0,2
chr22	31724972	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=205,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr22	31731648	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,47;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:9,2,2,0
chr22	31739023	.	TAC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=237,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,2:4,1:0,11,0,3
chr22	31740935	.	TG	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=177,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:0|1:31740935_TG_AT:31740935:6,3,1,1
chr22	31740938	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=179,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:2,0:0|1:31740935_TG_AT:31740935:6,4,1,1
chr22	31795769	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=122,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,4:3,4:2,5,2,7
chr22	31796563	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,5:3,0:4,2,5,0
chr22	31843567	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=207,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,2:8,3:8,6,0,5
chr22	31844293	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=197,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr22	31854370	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=128,273;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr22	31854434	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=141,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,3:4,3:2,2,6,0
chr22	31868006	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=381,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31868006_C_G:31868006:0,1,0,1
chr22	31868010	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=381,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31868006_C_G:31868006:0,1,0,1
chr22	31904170	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=158,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,5:1,4:4,2,4,6
chr22	31926725	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr22	31969243	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	32000902	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:12,2:6,0:12,6,1,1
chr22	32002294	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=119,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,2:1,5:2,1,4,3
chr22	32014250	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=266,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:2,2,0,5
chr22	32017705	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=187,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,2:7,1:9,5,2,1
chr22	32081436	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=215,157;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr22	32097775	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=140,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:1,3,0,3
chr22	32099783	.	ATTTT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=T;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.700:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	32100550	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr22	32108824	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=213,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:4,6:8,2:4,8,3,5
chr22	32110943	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=220,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,4:3,4:4,3,6,2
chr22	32110988	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=215,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,4:5,6:9,2,4,6
chr22	32112625	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=192,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:11,0:4,4:8,7,0,4
chr22	32113164	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:8,2:11,4:11,8,2,4
chr22	32179850	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr22	32194747	.	C	CTTTCACTTTATTCTGTGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr22	32198862	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:1,4,0,5
chr22	32200715	.	AG	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=197,164;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:32200715_AG_CA:32200715:3,0,1,0
chr22	32200719	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=197,164;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:32200715_AG_CA:32200715:3,0,1,0
chr22	32205632	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:4,5,2,2
chr22	32205703	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=172,154;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr22	32211371	.	CTTTT	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=97,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.297:7:3,1:1,1:3,2,1,1
chr22	32211412	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=166,124;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:1,4:1,0:1,2,0,4
chr22	32229977	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=82,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:11,5:5,3:7,9,3,5
chr22	32234630	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=165,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,3:3,0:7,1,2,1
chr22	32239739	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=183,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:2,1:9,4:2,9,4,1
chr22	32243020	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr22	32266546	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,2:2,2:6,0,3,1
chr22	32275789	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=188,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr22	32302346	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=182,147;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.338:30:13,0:7,9:7,13,0,10
chr22	32352275	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,160;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:12,12:6,0:9,9,0,12
chr22	32352791	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=121,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:6,1:2,1:4,5,0,2
chr22	32463875	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=223,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,5:2,6:3,0,8,3
chr22	32478972	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=43.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr22	32480738	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,315;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	32482321	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=159,286;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:2,4,0,2
chr22	32495412	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=202,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr22	32498233	.	C	CCTGGGCTCAGAACCTTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=76,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:2,4,1,1
chr22	32545547	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,3:9,0:13,3,0,3
chr22	32545637	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=227,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.284:12:3,1:6,2:0|1:32545637_A_T:32545637:4,5,0,3
chr22	32545654	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,36;MFRL=227,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:2,1:5,2:0|1:32545637_A_T:32545637:1,6,0,3
chr22	32545849	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr22	32547086	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,237;MMQ=53,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr22	32547626	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=159,213;MMQ=41,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:5,1:1,7,2,4
chr22	32548036	.	TA	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=93,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.134:37:11,2:20,3:13,19,2,3
chr22	32554985	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.587:17:4,5:2,5:5,2,6,4
chr22	32586740	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=136,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.166:21:7,3:11,0:15,3,3,0
chr22	32587302	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=159,207;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:10,1:3,1:6,7,1,1
chr22	32617062	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr22	32621619	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=194,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.264:16:8,2:3,1:7,5,4,0
chr22	32621674	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=163,54;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:12,2:5,0:7,10,1,1
chr22	32621692	.	T	TCAGAAAC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=173,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:5,0:7,9,1,1
chr22	32626908	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=229,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr22	32763635	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:2,2,1,1
chr22	32790001	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:5,0:10,5:6,9,0,5
chr22	32791003	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=176,229;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:5,2,1,3
chr22	32794129	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=196,86;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr22	32795641	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,112;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,4:5,7:2,5,6,5
chr22	32795751	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=202,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,5:4,4:2,5,5,4
chr22	32798004	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,0:5,7:0,11,0,7
chr22	32804313	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,0,4
chr22	32804656	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:4,0,1,1
chr22	32813176	.	CTTTTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,36;MFRL=126,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=17,11;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.274:7:1,0:4,1:2,4,0,1
chr22	32813221	.	A	ACTTCTATC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=195,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:32813221_A_ACTTCTATC:32813221:0,4,0,1
chr22	32813222	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=195,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:32813221_A_ACTTCTATC:32813221:0,4,0,1
chr22	32813226	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=195,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:32813221_A_ACTTCTATC:32813221:0,4,0,1
chr22	32827423	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.665:4:1,2:0,1:0|1:32827423_A_AT:32827423:1,0,2,1
chr22	32827426	.	A	ATTTATTTATTTATTTATTTATTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.665:4:1,2:0,1:0|1:32827423_A_AT:32827423:1,0,2,1
chr22	32833657	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	32841946	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=177,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,0:8,3:2,9,0,3
chr22	32843287	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=197,95;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,3:6,0:4,9,3,0
chr22	32871211	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=223,225;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:2,1:6,0,0,3
chr22	32871227	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=216,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:4,2:7,3,0,2
chr22	32871242	.	CG	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=216,235;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,1:3,1:4,2,1,1
chr22	32887150	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:6,6:7,1:5,8,3,4
chr22	32937740	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,234;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:1,7,2,3
chr22	33562887	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr22	33672947	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr22	33961046	.	A	ATATCTTCGTATAAAGACTAGAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=225,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0,8,1,1
chr22	34022284	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:5,5:2,5:5,2,5,6
chr22	35478486	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,2:0,0,3,4
chr22	35478688	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=155,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,3:0,5:1,1,1,7
chr22	35481776	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr22	35659293	.	GTT	G,GTTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,35,14;MFRL=184,191,189;MMQ=60,60,60;MPOS=23,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=T;STR;TLOD=4.26,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.276,0.258:8:0,0,0:2,2,0:0,4,0,4
chr22	35660875	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,211;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.562:21:4,5:5,6:3,6,6,6
chr22	35661332	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=180,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,0:4,3:6,5,0,3
chr22	35661343	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,0:3,3:5,3,0,3
chr22	35661457	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,0:9,3:15,4,3,0
chr22	35661543	.	GA	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.244:27:6,0:7,5:6,15,0,6
chr22	35661560	.	AG	GA	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:7,0:15,3:0|1:35661560_AG_GA:35661560:3,20,0,3
chr22	35661564	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.147:25:6,0:14,3:0|1:35661560_AG_GA:35661560:2,20,0,3
chr22	35680095	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:2,4,1,3
chr22	35681893	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=204,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr22	35683238	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=192,232;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr22	35695802	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,3:2,7:5,0,10,0
chr22	35695808	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:6,0:0|1:35695808_A_C:35695808:13,0,2,0
chr22	35695811	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=26,12;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.222:15:4,1:3,0:12,0,3,0
chr22	35695816	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,1:6,0:0|1:35695808_A_C:35695808:17,0,2,0
chr22	35695820	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=19,12;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:2,0:6,0:0|1:35695808_A_C:35695808:21,0,2,0
chr22	35695822	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=26,12;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:7,0:0|1:35695808_A_C:35695808:20,0,2,0
chr22	35696077	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=217,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,1:5,2:0,6,0,3
chr22	35717841	.	GTGGGGCACAGGGAGGA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=193,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:5,2:3,11,1,1
chr22	35741863	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=165,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr22	35796652	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=202,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr22	35797333	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:9,3:1,2:5,5,5,0
chr22	35799345	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=168,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:7,5,1,1
chr22	35799542	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=198,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:4,0:3,2:1,6,0,3
chr22	35802661	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:1,0:3,3:1,4,1,2
chr22	35808708	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=175,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.415:10:4,2:2,2:0|1:35808708_C_T:35808708:0,6,3,1
chr22	35808726	.	A	ACGGCCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,25;MFRL=93,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1|0:35808708_C_T:35808708:0,3,0,1
chr22	35808730	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=93,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1|0:35808708_C_T:35808708:0,3,0,1
chr22	35808731	.	A	AAAGCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=93,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1|0:35808708_C_T:35808708:0,3,0,1
chr22	35810052	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr22	35811892	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:7,1:3,9,2,0
chr22	36006923	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=64.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,11:0,0,10,8
chr22	36114047	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=159,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:0,0:3,2:0|1:36114047_C_T:36114047:0,3,0,3
chr22	36114054	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=181,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:36114047_C_T:36114047:0,2,0,1
chr22	36123304	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=268,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:36123304_G_GC:36123304:0,2,0,2
chr22	36123310	.	GA	TT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=268,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.496:4:1,1:0,1:0|1:36123304_G_GC:36123304:0,2,0,2
chr22	36140124	.	GTTT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=177,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=9,6;RU=T;STR;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,2:3,1:7,0,3,0
chr22	36161432	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=188,72;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:10,2,2,0
chr22	36164403	.	G	GTATATTAAATTAATAA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:19,0:14,2:0|1:36164403_G_GTATATTAAATTAATAA:36164403:11,22,0,2
chr22	36164404	.	C	CATGAATTG	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:19,0:14,2:0|1:36164403_G_GTATATTAAATTAATAA:36164403:11,22,0,2
chr22	36177892	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr22	36177894	.	A	ACCCCAATT,ATTTATCATTATTCATTTAAATTCCAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,24,24;MFRL=166,120,127;MMQ=60,60,60;MPOS=1,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.53,3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.335,0.325:3:1,1,1:0,0,0:0,1,0,2
chr22	36357579	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=101,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.113:29:10,0:13,0:0|1:36357579_A_C:36357579:6,20,3,0
chr22	36357591	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=26,18;MFRL=96,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:13,1:17,0:0|1:36357579_A_C:36357579:10,25,2,0
chr22	36357593	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=97,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:12,0:17,0:0|1:36357579_A_C:36357579:10,26,2,0
chr22	36357597	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=107,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:14,0:20,0:0|1:36357579_A_C:36357579:14,28,2,0
chr22	36537559	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,178;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.182:29:16,4:8,0:14,10,5,0
chr22	36541725	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=228,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr22	36545016	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=164,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:6,2,3,0
chr22	36556698	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:16,3:11,1:17,10,4,0
chr22	36556964	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=214,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:2,4:0,3:0,2,2,5
chr22	36587682	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=208,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:6,2,1,3
chr22	36587704	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=211,168;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,1:2,2:3,5,3,0
chr22	36587845	.	A	ACT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=146,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:8,1:7,1:5,10,0,2
chr22	36591274	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=200,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr22	36593628	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=204,207;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:4,1:1,2:0|1:36593628_A_AC:36593628:2,3,3,0
chr22	36593640	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=193,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:4,1:0,3:0|1:36593628_A_AC:36593628:2,2,4,0
chr22	36595254	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,2:6,1:7,0,3,0
chr22	36597877	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=201,26888;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:4,2:10,2:0|1:36597877_G_A:36597877:4,10,2,2
chr22	36597881	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=213,26888;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:3,1:9,2:0|1:36597877_G_A:36597877:3,9,2,2
chr22	36653094	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=192,69;MMQ=60,52;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:8,2:3,0:4,7,2,0
chr22	36657596	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr22	36657628	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,10,5
chr22	36657789	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:2,7:2,8:2,2,6,9
chr22	36661149	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=226,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.786:12:2,6:0,4:0|1:36661149_A_G:36661149:2,0,8,2
chr22	36661152	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=226,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.786:12:2,5:0,4:0|1:36661149_A_G:36661149:2,0,8,2
chr22	36682706	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=231,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:2,0:3,3:6,0,3,0
chr22	36690113	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=233,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,1,1
chr22	36691607	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,13,7
chr22	36695173	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,246;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr22	36705529	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr22	36708084	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=116,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:5,4:5,4,5,4
chr22	36708338	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=248,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:1,1,0,4
chr22	36710183	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,5:3,3:4,3,5,3
chr22	36712472	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr22	36712810	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,0,2
chr22	36716202	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=230,242;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr22	36716209	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=241,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:2,1,3,0
chr22	36722534	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,11,0
chr22	36744886	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=130,231;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=C;STR;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.790:6:1,3:0,1:0|1:36744886_GC_G:36744886:1,0,4,1
chr22	36744888	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=130,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.786:6:1,4:0,1:0|1:36744886_GC_G:36744886:1,0,4,1
chr22	36744890	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=130,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.786:6:1,4:0,1:0|1:36744886_GC_G:36744886:1,0,4,1
chr22	36872750	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:1,2,6,1
chr22	36872808	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=155,72;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:13,3:7,0:7,13,2,1
chr22	36877695	.	G	GGA	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=140,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,18:0.413:44:14,10:12,6:14,12,11,7
chr22	36877749	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=15,29;MFRL=151,196;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=26,27;RU=T;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.681:4:0,0:0,2:0,1,0,3
chr22	36886112	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=130,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,4:6,5:7,5,3,6
chr22	36889893	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=152,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.224:11:6,1:3,0:0|1:36889893_G_T:36889893:2,7,1,1
chr22	36889899	.	C	CAGTTCCTGAGTTCAAGCAAT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=152,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:5,2:3,0:0|1:36889893_G_T:36889893:2,7,1,1
chr22	36894283	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	36900271	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.793:22:2,8:2,10:1,3,7,11
chr22	36906943	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,1:3,2:6,1,1,2
chr22	36907098	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,2:5,5:3,6,1,6
chr22	36907821	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=175,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:9,0:8,6:8,9,1,5
chr22	36912724	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=185,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:6,4:5,2:6,5,4,2
chr22	36919375	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=203,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,4:3,1:1,6,1,4
chr22	36920062	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:0,10,0,2
chr22	36921779	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=178,88;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:12,2:4,0:11,5,2,0
chr22	36962353	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=162,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,3:2,1:4,3,4,0
chr22	36983404	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=282,234;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr22	37154413	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=154,178;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.207:27:8,0:13,5:0|1:37154413_G_C:37154413:10,12,0,5
chr22	37154418	.	G	GGAGGTGAGGGCAAATGGGGAAGAGCTGGTGTCA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=151,178;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:11,0:13,4:0|1:37154413_G_C:37154413:11,13,0,5
chr22	37164052	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=165,238;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:11,5:7,1:7,11,6,0
chr22	37171611	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=198,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,2:5,3:7,0,5,0
chr22	37196871	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=117,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:5,9:1,6:2,4,10,5
chr22	37268079	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=175,280;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:2,2:3,1:6,0,3,0
chr22	37268501	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.572:21:5,5:3,7:6,3,5,7
chr22	37268555	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr22	37272014	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=194,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.309:14:2,2:6,2:4,6,4,0
chr22	37318426	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=210,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr22	37319425	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=164,225;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.236:18:8,1:5,2:2,12,3,1
chr22	37331305	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr22	37334280	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:5,2,1,1
chr22	37387119	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=165,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr22	37387505	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=132,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:6,4,1,1
chr22	37407413	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,22;MFRL=252,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.374:9:0,1:0,1:0,6,0,3
chr22	37453452	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,10,6
chr22	37455382	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=151,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:8,0:7,7,1,1
chr22	37458475	.	TCTCCGCCCCCTTGCCCTGCATCACCCCCTCCTTACCGGCCCCAC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:0,0:0,1:0,4,1,0
chr22	37462023	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	37462813	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:5,2:2,3:5,2,3,2
chr22	37462926	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,12:0.650:18:4,4:2,8:0|1:37462926_G_A:37462926:2,4,2,10
chr22	37462936	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0|1:37462926_G_A:37462926:0,0,2,13
chr22	37462957	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:0|1:37462926_G_A:37462926:3,10,0,2
chr22	37464624	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,1:3,4:5,2,2,3
chr22	37466700	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=25,12;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.253:10:3,0:2,0:0|1:37466700_T_G:37466700:2,6,0,2
chr22	37466707	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,14;MFRL=196,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.304:8:1,0:3,0:0|1:37466700_T_G:37466700:2,4,0,2
chr22	37466710	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=15,24;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.339:7:1,0:0,1:0|1:37466700_T_G:37466700:2,3,0,2
chr22	37466713	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=22,32;MFRL=201,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.382:6:1,0:1,2:0|1:37466700_T_G:37466700:1,3,0,2
chr22	37466718	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=22,12;MFRL=201,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.382:6:1,0:1,0:0|1:37466700_T_G:37466700:1,3,0,2
chr22	37470604	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=161,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:1,0,6,2
chr22	37471385	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=224,256;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr22	37480797	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,22:0.851:25:3,14:0,5:1,2,11,11
chr22	37491545	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr22	37492201	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=238,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:1,1,0,5
chr22	37492585	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=204,205;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr22	37494407	.	CT	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=109,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:37494407_CT_AA:37494407:1,0,1,0
chr22	37494412	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,18;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:0,0:0|1:37494407_CT_AA:37494407:2,1,1,0
chr22	37528606	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:1,11,0,2
chr22	37531326	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=89,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:4,0:4,4,1,1
chr22	37532207	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=197,222;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:6,1,2,1
chr22	37533786	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=307,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,15:0.890:16:1,11:0,3:0|1:37533786_C_G:37533786:0,1,1,14
chr22	37533795	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=307,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:1,7:0,2:0|1:37533786_C_G:37533786:0,1,1,8
chr22	37535328	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=173,229;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,4:2,3:0,2,0,7
chr22	37539713	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,255;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:1,8,2,0
chr22	37578214	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=146,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:7,2:8,0:11,6,1,1
chr22	37578807	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=160,254;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:9,1:6,2:3,12,0,3
chr22	37578852	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=181,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr22	37578876	.	G	GCCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=201,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr22	37580334	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:8,0:3,3:9,2,2,1
chr22	37602583	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr22	37603021	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=154,236;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:6,2:6,7,1,1
chr22	37603051	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=199,236;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.181:18:8,0:7,2:5,10,1,2
chr22	37603358	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=152,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,0:9,2:12,1,1,1
chr22	37603744	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,2:6,1:2,10,1,2
chr22	37627234	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=170,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.438:14:2,1:6,5:0|1:37627234_T_C:37627234:8,0,5,1
chr22	37627246	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=169,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:2,0:7,3:0|1:37627234_T_C:37627234:7,2,4,1
chr22	37628053	.	A	AG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.649:18:5,8:1,4:4,2,6,6
chr22	37628145	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=194,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.469:11:3,2:2,3:0,6,0,5
chr22	37678551	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,14,3
chr22	37678565	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=197,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,3:6,4:5,2,6,1
chr22	37695256	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.267:28:13,4:8,3:16,5,3,4
chr22	37699197	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.702:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	37707637	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=213,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr22	37708004	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=178,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,1:5,2:7,3,2,1
chr22	37876870	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=167,116;MMQ=60,33;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:4,0:14,3:2,16,0,3
chr22	37888868	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr22	37898829	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=230,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:1,8,0,2
chr22	37899101	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=219,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,5:2,5:2,1,9,1
chr22	37904957	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=224,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,2:1,6:1,1,7,1
chr22	37964408	.	CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=226,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:0,1:3,5:0,3,3,3
chr22	38015671	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr22	38015930	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=218,248;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,0:2,5:0,5,0,5
chr22	38025375	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr22	38028046	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,2:6,3:7,4,4,1
chr22	38037105	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,17;MFRL=169,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=C;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.357:9:4,0:1,1:0|1:38037105_TC_T:38037105:5,1,0,3
chr22	38037119	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,4:0.333:13:2,3:7,1:1|0:38037105_TC_T:38037105:2,7,4,0
chr22	38037122	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,4:0.333:13:2,2:7,0:1|0:38037105_TC_T:38037105:2,7,4,0
chr22	38037124	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,3:0.285:12:2,0:7,0:1|0:38037105_TC_T:38037105:2,7,3,0
chr22	38038547	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:8,2:9,2:3,14,3,1
chr22	38039634	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=154,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,3:4,4:5,1,4,3
chr22	38040562	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=144,36;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:6,2,1,1
chr22	38040756	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=168,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,2:11,0:10,7,2,0
chr22	38040842	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=114,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:6,2:7,4:9,4,3,3
chr22	38042967	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=200,144;MMQ=60,34;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:38042967_G_T:38042967:1,2,0,1
chr22	38042968	.	T	TCAAGACCAGCCTGGCCAACG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=200,144;MMQ=60,34;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,0:2,1:0|1:38042967_G_T:38042967:1,2,0,1
chr22	38049875	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=77,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:15,0:15,2:15,15,0,2
chr22	38051205	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=256,256;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr22	38051628	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:38051628_C_G:38051628:1,2,1,0
chr22	38051632	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38051628_C_G:38051628:0,2,1,0
chr22	38061520	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=224,258;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr22	38062350	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=165,57;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.117:24:16,0:5,2:0|1:38062350_C_T:38062350:14,8,1,1
chr22	38062353	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=163,57;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:16,0:5,2:0|1:38062350_C_T:38062350:13,8,1,1
chr22	38062370	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=165,57;MMQ=60,52;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:7,2:0|1:38062350_C_T:38062350:12,10,1,1
chr22	38062375	.	C	CGTATGGGGAGTGTGTGGGTATGTGTGTG	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=165,57;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:0|1:38062350_C_T:38062350:11,9,1,1
chr22	38071639	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,3:10,0:13,2,1,2
chr22	38071731	.	A	AC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=139,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,1:7,3:3,8,3,4
chr22	38084039	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,14;MFRL=173,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.314:16:5,1:4,1:7,4,0,5
chr22	38109487	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr22	38119801	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=87,127;MMQ=55,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,1:8,1:10,4,2,1
chr22	38119818	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=127,45;MMQ=44,21;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:5,0:7,2:0|1:38119818_T_C:38119818:8,5,1,1
chr22	38119824	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=127,45;MMQ=40,21;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:38119818_T_C:38119818:6,3,1,1
chr22	38119825	.	A	ATGTGATCC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=127,45;MMQ=40,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:2,2:0|1:38119818_T_C:38119818:6,3,1,1
chr22	38120822	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=125,80;MMQ=60,34;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,0:8,3:8,13,0,3
chr22	38121696	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=151,77;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,3:7,0:4,6,0,3
chr22	38122462	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=240,265;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:3,1:0,1:0,4,0,2
chr22	38122572	.	GA	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=301,298;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38122572_GA_AC:38122572:0,1,0,1
chr22	38122578	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=301,298;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38122572_GA_AC:38122572:0,1,0,1
chr22	38122580	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=301,298;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38122572_GA_AC:38122572:0,1,0,1
chr22	38130385	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,2:3,4:3,0,3,3
chr22	38146847	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=209,246;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,1,3
chr22	38155317	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=193,289;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.272:13:4,2:4,1:6,4,1,2
chr22	38161835	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,15;MFRL=110,269;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.444:5:0,0:3,0:2,1,0,2
chr22	38168508	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=162,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr22	38202403	.	CG	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=226,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.738:16:1,6:3,6:3,1,10,2
chr22	38202458	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:7,0:12,2:9,15,0,3
chr22	38205987	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,0:5,2:4,14,0,2
chr22	38209242	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=325,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:3,2,3,0
chr22	38212762	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr22	38219800	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	38243675	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,6,7
chr22	38247597	.	G	GAGGCTGAGACA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=114,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0|1:38247597_G_GAGGCTGAGACA:38247597:0,1,0,1
chr22	38247600	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=114,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38247597_G_GAGGCTGAGACA:38247597:0,1,0,1
chr22	38251686	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:1,4:1,6:0,2,5,5
chr22	38254865	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38254865_A_T:38254865:0,0,0,1
chr22	38254866	.	T	TAGCTTGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38254865_A_T:38254865:0,0,0,1
chr22	38308048	.	ATG	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=102,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.561:7:2,1:1,2:1,2,0,4
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chr22	38369872	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=236,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:5,1,1,1
chr22	38379546	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=168,286;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,1:2,1:4,4,1,1
chr22	38430121	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.177:24:8,1:12,2:11,9,3,1
chr22	38461114	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=113,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:9,6:4,0:7,6,5,1
chr22	38463652	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=128,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,3:0,2:3,1,5,0
chr22	38463968	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=109,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,4,2
chr22	38464024	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=145,100;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,2:4,6:2,3,1,7
chr22	38467742	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=149,2130;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.194:24:11,0:6,4:12,8,4,0
chr22	38467784	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.552:16:5,5:2,3:5,2,5,4
chr22	38476820	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=260,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38476820_G_A:38476820:1,0,1,0
chr22	38476842	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38476820_G_A:38476820:0,0,1,0
chr22	38482352	.	GTGCGGGAGCGGGACTGGCCATCCCAGTACTCCGAGGGTGCTA	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=161,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.574:23:2,8:2,4:4,7,8,4
chr22	38483155	.	T	TTCATGGGTG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCATGGGTG;STR;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.297:28:6,3:8,3:7,13,3,5
chr22	38485064	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,280;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	38494011	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.688:1:0,0:0,1:0|1:38494011_C_G:38494011:0,0,1,0
chr22	38494016	.	CGAGGTCTG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38494011_C_G:38494011:0,0,1,0
chr22	38494028	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=19,12;MFRL=147,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.415:3:1,0:0,0:0|1:38494011_C_G:38494011:1,1,1,0
chr22	38503968	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=167,229;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:1,6:0,2:0|1:38503968_C_T:38503968:1,0,2,6
chr22	38503972	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=167,248;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:1,6:0,2:0|1:38503968_C_T:38503968:1,0,2,6
chr22	38504372	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=177,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:3,3,0,3
chr22	38509568	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=126,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:6,12,2,0
chr22	38521609	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=172,81;MMQ=60,39;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:8,2:9,4:11,6,5,1
chr22	38521768	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=179,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:0,1:0|1:38521768_A_AC:38521768:1,1,0,1
chr22	38521770	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,36;MFRL=179,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38521768_A_AC:38521768:1,1,0,1
chr22	38521772	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=179,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38521768_A_AC:38521768:1,1,0,1
chr22	38521778	.	TG	AC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=179,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38521768_A_AC:38521768:1,1,0,1
chr22	38521789	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=194,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr22	38535946	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:5,1,2,0
chr22	38539041	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr22	38564041	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,1:3,4:1,6,0,5
chr22	38612518	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=193,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,7:4,2:2,5,4,5
chr22	38612556	.	T	TAAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=213,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,7;RU=A;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:1,1,1,3
chr22	38641889	.	T	TGCCC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0|1:38641889_T_TGCCC:38641889:0,0,3,0
chr22	38641892	.	CAG	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,0:0|1:38641889_T_TGCCC:38641889:0,0,3,0
chr22	38641900	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:38641889_T_TGCCC:38641889:0,0,2,0
chr22	38641909	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:38641889_T_TGCCC:38641889:0,0,2,0
chr22	38641911	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:38641889_T_TGCCC:38641889:0,0,2,0
chr22	38641917	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38641889_T_TGCCC:38641889:0,1,1,0
chr22	38690147	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.262:12:5,1:4,1:5,4,2,1
chr22	38699050	.	GAGGC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGC;STR;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr22	38875549	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,10,2
chr22	38888123	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=165,109;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.268:13:3,1:6,3:2,7,0,4
chr22	38889657	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:6,4:7,3:11,2,4,3
chr22	38891984	.	TAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=142,75;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:2,1:3,1:2,4,0,2
chr22	38901916	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:38901916_A_C:38901916:0,1,4,0
chr22	38901922	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,1:2,1:0|1:38901916_A_C:38901916:1,1,3,0
chr22	38901924	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,1:2,0:0|1:38901916_A_C:38901916:2,1,3,0
chr22	38901926	.	CAGG	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:0,0:3,0:0|1:38901916_A_C:38901916:2,2,3,0
chr22	38945929	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=164,72;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,0:10,3:10,10,2,1
chr22	38948707	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr22	38962551	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=246,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr22	38993370	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,3:3,0:7,4,3,0
chr22	39003495	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=142,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,3:6,0:2,9,0,3
chr22	39024961	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr22	39034867	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=175,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:5,0:2,5,0,3
chr22	39069181	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=157,308;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:7,4:3,0:7,3,3,1
chr22	39079826	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=117,113;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:12,0:12,4:11,14,0,4
chr22	39117855	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=155,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:7,12,0,2
chr22	39122302	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:15,1:6,5:8,14,5,1
chr22	39134074	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=139,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,2:4,0:7,6,1,1
chr22	39136924	.	TGCTCTGCG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:4,0,1,0
chr22	39148483	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:4,2:13,4:8,9,6,0
chr22	39178817	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=179,77;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:1,6,0,2
chr22	39224248	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=237,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr22	39224501	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=202,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:2,6,2,0
chr22	39355717	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=128,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:2,4,1,3
chr22	39381826	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=152,150;MMQ=60,57;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.340:21:7,3:7,3:8,6,1,6
chr22	39382079	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,57;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,9:0,0,7,12
chr22	39387267	.	AG	CC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=15,18;MFRL=167,147;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.247:9:1,0:0,1:0|1:39387267_AG_CC:39387267:7,0,2,0
chr22	39387273	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=15,12;MFRL=196,147;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.273:8:0,0:1,0:0|1:39387267_AG_CC:39387267:5,1,2,0
chr22	39387666	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	39410500	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=199,262;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr22	39413747	.	GTCC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=188,0;MMQ=60,37;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCC;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:3,1,1,0
chr22	39413786	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=168,82;MMQ=60,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:5,4,2,0
chr22	39414224	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=199,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:1,1,4,2
chr22	39414240	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=212,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr22	39419101	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=223,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:39419101_A_T:39419101:0,4,0,1
chr22	39419105	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=223,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:39419101_A_T:39419101:0,4,0,1
chr22	39419107	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=223,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:39419101_A_T:39419101:0,4,0,1
chr22	39428396	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=166,230;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr22	39440310	.	C	CCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	39441258	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=193,170;MMQ=49,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:2,11,0,2
chr22	39445380	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,282;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:9,0,2,0
chr22	39448600	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,308;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,4:5,0:10,4,4,0
chr22	39476865	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39476865_C_CCA:39476865:1,0,1,0
chr22	39476866	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39476865_C_CCA:39476865:1,0,1,0
chr22	39476868	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=216,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr22	39476870	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=12,26;MFRL=216,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr22	39482434	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=150,248;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,3:9,0:10,9,3,0
chr22	39496199	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=183,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,2:0,1:5,0,3,0
chr22	39496322	.	TAAC	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=179,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:8,2:4,4:7,6,4,2
chr22	39496336	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,2:3,4:5,6,4,2
chr22	39496412	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=174,224;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:8,1:2,1:4,6,0,2
chr22	39499604	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=240,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr22	39499653	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=78,175;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:1,5,2,1
chr22	39499763	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=83,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:3,3,1,3
chr22	39626024	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr22	39629609	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=193,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0,8,0,2
chr22	39631963	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=185,283;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:0,8,0,2
chr22	39636899	.	GTCTC	G	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=144,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=TC;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.138:19:8,1:8,1:6,11,2,0
chr22	39636928	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=88,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.684:20:0,7:5,5:3,3,3,11
chr22	39636930	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=88,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.669:19:0,7:4,6:3,3,2,11
chr22	39636944	.	ACACT	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=88,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.821:8:0,2:1,5:0,1,0,7
chr22	39639853	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=217,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.772:7:1,3:0,1:1,0,4,2
chr22	39709653	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=151,138;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:8,4,1,1
chr22	39709776	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,3:5,4:1,7,3,4
chr22	39710244	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=131,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:2,5,0,7
chr22	39711351	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:10,1:13,2:14,10,2,1
chr22	39713105	.	C	T,CCCATGTGTCTGTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32,32;MFRL=259,179,112;MMQ=60,60,60;MPOS=27,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.62,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,1:0.500,0.250:5:1,1,1:0,2,0:0,1,0,4
chr22	39714303	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=173,259;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr22	39715140	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=127,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:3,4:3,6,1,6
chr22	39823015	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=184,313;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr22	39883344	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=91,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr22	39886713	.	CGT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=160,274;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GT;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:11,2:7,0:8,12,1,1
chr22	39888223	.	GTG	TAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:39888223_GTG_TAA:39888223:0,0,0,1
chr22	39888228	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39888223_GTG_TAA:39888223:0,0,0,1
chr22	39888232	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39888223_GTG_TAA:39888223:0,0,0,1
chr22	39907477	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=131,59;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:6,2:0|1:39907477_G_A:39907477:8,8,1,1
chr22	39907484	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=130,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:4,2:0|1:39907477_G_A:39907477:6,7,1,1
chr22	39907486	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=131,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:5,2:0|1:39907477_G_A:39907477:6,10,1,1
chr22	39907489	.	TCATA	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=27,18;MFRL=131,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:4,1:0|1:39907477_G_A:39907477:6,11,1,1
chr22	39907496	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=130,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:39907477_G_A:39907477:3,8,1,1
chr22	39917489	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=157,152;MMQ=50,22;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,14:0.305:46:9,12:23,0:18,14,14,0
chr22	39917515	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=172,138;MMQ=50,54;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:6,2:13,11:12,7,3,10
chr22	39917960	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=171,57;MMQ=60,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,4:3,2:3,4,1,5
chr22	39994105	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr22	39994293	.	C	CGCCCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=216,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GCCCT;STR;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr22	40030677	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=75,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:8,4:12,0:7,14,0,4
chr22	40043812	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr22	40055896	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=158,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:3,4:0,9:0,3,2,11
chr22	40058186	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.789:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr22	40059708	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,12;MFRL=134,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,0:0|1:40059708_G_C:40059708:0,3,3,0
chr22	40059712	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=134,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:40059708_G_C:40059708:0,3,3,0
chr22	40059716	.	TG	CC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=134,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:2,0:0|1:40059708_G_C:40059708:1,4,2,0
chr22	40059720	.	CAGGTT	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=145,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:2,0:0|1:40059708_G_C:40059708:2,5,2,0
chr22	40073291	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=292,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr22	40075473	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,380;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	40161214	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=0,137;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40161214_T_TG:40161214:1,0,1,0
chr22	40161215	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=0,137;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40161214_T_TG:40161214:1,0,1,0
chr22	40351855	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=159,287;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,2:7,1:6,6,1,2
chr22	40641980	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,2:4,5:6,2,5,2
chr22	40666317	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr22	40674062	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=161,63;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:2,3:12,5:6,8,3,5
chr22	40697176	.	TGCA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=182,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCA;STR;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:7,2:4,2:7,4,2,2
chr22	40708459	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:11,3:3,0:12,2,3,0
chr22	40755033	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=138,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:3,4:7,0:3,8,4,0
chr22	40755102	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=178,350;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,0:4,4:3,6,4,0
chr22	40755427	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=297,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.325:7:3,0:2,2:0,5,1,1
chr22	40803186	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:3,5:5,3:5,3,5,3
chr22	40813064	.	GAA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=18,33;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:1,0:2,2:1,12,0,2
chr22	40816749	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=338,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,2:1,0,3,1
chr22	40816886	.	GTGC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=207,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TGC;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:4,0:3,3,0,2
chr22	40820151	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=209,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:4,1,3,1
chr22	41075508	.	G	GGAAAGAGAAT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=176,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:4,7,0,2
chr22	41075543	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=185,215;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:0,3,2,3
chr22	41170063	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,5:0,0:0,1,2,3
chr22	41172351	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,4,8
chr22	41175263	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=228,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr22	41194909	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=183,260;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr22	41194947	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=168,124;MMQ=51,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.348:9:2,1:3,2:5,1,2,1
chr22	41194975	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.158:24:7,2:8,1:13,8,0,3
chr22	41194992	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.138:49:13,6:24,0:23,20,6,0
chr22	41195044	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:8,3:20,0:14,14,1,2
chr22	41195121	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.358:23:3,7:12,1:5,10,5,3
chr22	41195142	.	CT	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=149,242;MMQ=42,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.127:21:7,2:12,0:3,16,0,2
chr22	41195191	.	A	AGTGGCATGGTT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=301,150;MMQ=60,41;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:2,4:2,2:0,4,0,6
chr22	41222524	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=161,285;MMQ=50,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr22	41228138	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=141,0;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:6,3:4,0:6,4,1,2
chr22	41228147	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=98,63;MMQ=60,41;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:7,8,1,1
chr22	41244398	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:0,2:6,1:2,4,1,2
chr22	41252555	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,18;MFRL=244,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.310:7:1,0:4,1:0|1:41252555_T_G:41252555:0,5,0,2
chr22	41252558	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=17,21;MFRL=248,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.351:6:0,0:1,1:0|1:41252555_T_G:41252555:0,4,0,2
chr22	41266113	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=175,87;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,0:8,3:6,7,0,3
chr22	41310148	.	G	GA,GAAA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=36,33,36;MFRL=199,105,348;MMQ=45,40,40;MPOS=16,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,17,19;RU=A;STR;TLOD=3.50,3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.312,0.310:4:2,0,1:0,1,0:2,0,2,0
chr22	41310175	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,15;MFRL=128,227;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:2,0:4,0:0|1:41310175_C_A:41310175:5,4,2,0
chr22	41310184	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=105,153;MMQ=60,26;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:5,0:4,5,2,0
chr22	41310185	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,15;MFRL=128,227;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:3,0:5,0:0|1:41310175_C_A:41310175:4,5,2,0
chr22	41513094	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr22	41537234	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr22	41543741	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=202,248;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.433:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr22	41545024	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.468:10:2,1:1,4:4,1,3,2
chr22	41545906	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.164:20:6,0:9,2:4,13,3,0
chr22	41545922	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=147,169;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:5,0:15,2:9,13,0,2
chr22	41550954	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,4:1,2:1,0,7,0
chr22	41559963	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=183,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,2,1
chr22	41566595	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=121,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.228:23:10,2:8,2:12,6,3,2
chr22	41566661	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=226,117;MMQ=42,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:41566661_T_C:41566661:0,2,0,1
chr22	41566663	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=218,117;MMQ=43,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:41566661_T_C:41566661:0,3,0,1
chr22	41566667	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=218,117;MMQ=43,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:41566661_T_C:41566661:0,3,0,1
chr22	41566671	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=199,117;MMQ=42,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:41566661_T_C:41566661:0,4,0,1
chr22	41568480	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,8:3,3:3,1,8,3
chr22	41569609	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=180,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.598:18:3,7:4,4:5,2,8,3
chr22	41569887	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=179,248;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,3:7,1:0,9,0,4
chr22	41574969	.	TGTA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTA;STR;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,4:3,0:1,2,0,4
chr22	41601523	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr22	41605713	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=192,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,5:4,0:9,1,5,0
chr22	41609859	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr22	41610024	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,2,4
chr22	41616682	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,15;MFRL=168,215;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:4,0,1,0
chr22	41616685	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,15;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.422:7:1,0:2,0:4,0,3,0
chr22	41632697	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=231,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr22	41635425	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=134,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,2:4,0:8,4,1,1
chr22	41645500	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,30;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:0,2:0,1,0,6
chr22	41652213	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=128,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:11,2:0|1:41652213_C_G:41652213:7,9,1,1
chr22	41652221	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=128,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:12,2:0|1:41652213_C_G:41652213:7,10,1,1
chr22	41652223	.	T	TCCCCC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=128,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:11,2:0|1:41652213_C_G:41652213:7,10,1,1
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chr22	41911525	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=182,140;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.217:15:4,1:8,1:5,7,3,0
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chr22	42016699	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,1:4,5:6,1,6,0
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chr22	42033840	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.481:29:8,0:7,13:6,9,0,14
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chr22	42090069	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=342,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,5,0
chr22	42091027	.	A	AAG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AG;STR;TLOD=64.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.908:19:0,8:1,8:1,0,14,4
chr22	42092225	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,11,9
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chr22	42109917	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	42126598	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,68;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,1:7,1:5,15,2,0
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chr22	42139078	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,8:3,3:3,2,6,5
chr22	42141871	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,207;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,3:8,0:15,2,2,1
chr22	42144191	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=158,52;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,2:11,0:7,11,2,0
chr22	42150146	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:42150146_C_T:42150146:0,0,0,1
chr22	42150149	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,10;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:42150146_C_T:42150146:0,0,0,1
chr22	42189826	.	T	TTAAAAAAAAAGAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=114,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.380:3:1,0:1,1:0,2,1,0
chr22	42190309	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=256,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:5,0,2,0
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chr22	42273462	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=199,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:1,7,0,4
chr22	42289378	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=202,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr22	42297025	.	C	CAGGAGGTATGCGGCCAGCCAAGGAGGTGCCCAGGG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=127,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:42297025_C_CAGGAGGTATGCGGCCAGCCAAGGAGGTGCCCAGGG:42297025:1,3,1,1
chr22	42297029	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=127,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:42297025_C_CAGGAGGTATGCGGCCAGCCAAGGAGGTGCCCAGGG:42297025:1,3,0,1
chr22	42385596	.	A	AAGTGATTCTCATGCC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=180,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:5,2:5,0:3,7,1,1
chr22	42388826	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=189,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr22	42388841	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.790:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr22	42390225	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=156,304;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr22	42392811	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=122,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr22	42418185	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr22	42422981	.	T	TG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=150,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.403:15:3,4:5,1:0|1:42422981_T_TG:42422981:6,4,5,0
chr22	42422983	.	TTGGATATGGAACCCCACCTCTC	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=146,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.259:22:3,4:5,0:0|1:42422981_T_TG:42422981:10,7,5,0
chr22	42423020	.	ACCTCTCGGATATGGAGCCCCACCTGCAGGAAATGAAGGCCCG	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=161,225;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.160:35:5,2:10,0:0|1:42422981_T_TG:42422981:19,11,5,0
chr22	42458827	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:4,2,1,2
chr22	42461918	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=132,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,7:6,2:2,7,4,5
chr22	42463366	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=176,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr22	42463689	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=256,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,5:1,0:1,0,6,0
chr22	42524696	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	42525756	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,4:6,3:4,8,3,4
chr22	42525798	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,4:1,0:2,4,1,3
chr22	42525811	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=167,139;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:42525811_T_C:42525811:1,3,0,2
chr22	42525821	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=185,137;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:42525811_T_C:42525811:1,3,0,1
chr22	42526549	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=191,318;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr22	42526561	.	GG	TC	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=191,175;MMQ=60,44;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,2:1,3:0|1:42526561_GG_TC:42526561:1,0,4,2
chr22	42526567	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=191,175;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0|1:42526561_GG_TC:42526561:1,0,4,2
chr22	42526571	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=191,186;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:0|1:42526561_GG_TC:42526561:1,0,5,2
chr22	42526573	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=191,190;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:0,1:1,5:0|1:42526561_GG_TC:42526561:1,0,5,3
chr22	42526580	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=191,190;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.846:11:0,3:1,7:0|1:42526561_GG_TC:42526561:1,0,7,3
chr22	42609148	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=222,179;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,6:2,4:3,0,8,2
chr22	42609577	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=185,221;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.164:20:6,2:11,0:7,10,3,0
chr22	42611265	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,6:5,0:3,7,2,4
chr22	42807819	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=36,31;MFRL=261,155;MMQ=60,52;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:42807819_C_T:42807819:0,3,0,1
chr22	42807823	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,17;MFRL=261,155;MMQ=60,52;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:42807819_C_T:42807819:0,3,0,1
chr22	42807837	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,16;MFRL=225,155;MMQ=60,52;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:42807837_C_T:42807837:0,2,0,1
chr22	42807842	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=225,155;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42807837_C_T:42807837:0,2,0,1
chr22	42896553	.	TGGGGC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGGGC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr22	42896609	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=302,244;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr22	42897675	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=175,248;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr22	42897721	.	T	TTTCCCATTCCG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=407,216;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr22	42910360	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=286,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42910360_G_GC:42910360:0,1,0,1
chr22	42910363	.	G	GGCAGCCCAGGATCCAGCAGGGAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=286,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42910360_G_GC:42910360:0,1,0,1
chr22	42911103	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	42967142	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=190,189;MMQ=52,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:3,5:12,0:9,6,5,0
chr22	42969920	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=203,158;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.526:13:1,0:4,0:0|1:42969920_A_C:42969920:1,5,7,0
chr22	42969924	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=203,145;MMQ=60,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.498:12:2,3:4,0:0|1:42969920_A_C:42969920:1,5,6,0
chr22	42991633	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=190,124;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,0:4,3:4,6,0,3
chr22	42993786	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=60,109;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:1,2:4,0:4,1,2,1
chr22	42993809	.	C	CG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=160,93;MMQ=58,50;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:2,3:2,0:2,5,2,2
chr22	42998902	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=206,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:2,2,1,2
chr22	43026792	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=163,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr22	43027356	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr22	43045266	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43045266_A_C:43045266:0,0,1,0
chr22	43045276	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43045266_A_C:43045266:0,0,1,0
chr22	43203202	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:0,0:9,6:3,6,0,6
chr22	43218463	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:1,4,1,1
chr22	43223095	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr22	43267336	.	T	TC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=153,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:6,2:7,1:11,2,3,0
chr22	43275250	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=181,287;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:1,6,0,3
chr22	43278162	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=187,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:4,3:2,1:5,1,2,3
chr22	43286904	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr22	43289603	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.204:32:12,5:14,1:10,16,1,5
chr22	43447891	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=171,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,1:4,2:5,6,1,2
chr22	43520258	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=153,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0|1:43520258_A_C:43520258:0,2,1,2
chr22	43520263	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=153,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0|1:43520258_A_C:43520258:0,2,1,2
chr22	43524487	.	CCT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,3:3,5:5,1,4,4
chr22	43525176	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=195,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr22	43529029	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=121,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.609:10:0,1:2,5:3,1,5,1
chr22	43529517	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=175,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,5:2,4:0,5,1,8
chr22	43533360	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:1,7,1,2
chr22	43537225	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=175,111;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:7,0:11,2:9,10,0,2
chr22	43555194	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:2,2,2,0
chr22	43564963	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=257,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,6:0,1:0,1,1,6
chr22	43564978	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=246,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,2:0,0:0,4,0,2
chr22	43565443	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=190,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr22	43568512	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:5,5:10,2:6,9,4,3
chr22	43570463	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=190,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.202:16:6,3:7,0:6,7,1,2
chr22	43572308	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=171,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.630:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr22	43575774	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,6:0,7:1,0,3,10
chr22	43576670	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:4,0,5,0
chr22	43599917	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=284,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr22	43599991	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr22	43607040	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=133,102;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:2,3,3,2
chr22	43608673	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr22	43618632	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,9:0,1:0,0,8,2
chr22	43619062	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=232,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,1,1
chr22	43623337	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=166,150;MMQ=60,20;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr22	43623353	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,6:0,1:1,0,7,0
chr22	43715862	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=275,261;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr22	43985929	.	CAT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=175,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:7,0:1,3:6,2,2,1
chr22	44004420	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.164:28:10,3:14,1:13,11,2,2
chr22	44004498	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=173,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,3:4,5:1,6,5,3
chr22	44022578	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=125,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:2,5,3,4
chr22	44074076	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=132,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:1,1:1,4,0,2
chr22	44079611	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=122,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:15,1:7,1:16,7,2,0
chr22	44083327	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr22	44112776	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.424:26:10,10:5,0:8,7,11,0
chr22	44177972	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=247,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:2,0,7,0
chr22	44223635	.	CCA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=241,236;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=CA;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr22	44229417	.	CCT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=281,234;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr22	44229492	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr22	44235990	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44235990_G_T:44235990:0,0,0,1
chr22	44235992	.	G	GCTACCACAGGGCTTTTAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44235990_G_T:44235990:0,0,0,1
chr22	44258311	.	ACGCGCC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CGCGCC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	44279992	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=163,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,4,0
chr22	44279995	.	GAG	CCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=200,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.592:5:0,2:1,0:0|1:44279995_GAG_CCC:44279995:1,1,3,0
chr22	44280001	.	TA	CC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=163,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:44279995_GAG_CCC:44279995:0,1,2,0
chr22	44280006	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44279995_GAG_CCC:44279995:0,1,1,0
chr22	44283440	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=99,306;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,1:5,1:8,5,1,1
chr22	44283531	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=202,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:5,5,2,0
chr22	44283556	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr22	44285658	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=153,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0|1:44285658_G_A:44285658:4,3,2,1
chr22	44285667	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,9:0.666:13:3,4:1,5:1|0:44285658_G_A:44285658:2,2,6,3
chr22	44285765	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr22	44286950	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,284;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:5,6,2,0
chr22	44323074	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=149,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr22	44324676	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=183,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.792:12:1,5:1,5:1,1,6,4
chr22	44324727	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:7,3:6,3:0|1:44324727_C_G:44324727:8,5,3,3
chr22	44324730	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:7,3:6,3:0|1:44324727_C_G:44324727:8,5,3,3
chr22	44333172	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=233,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr22	44341986	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=124,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,3,0
chr22	44364536	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=173,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:5,1:7,2,2,1
chr22	44364594	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,4:4,3:3,2,3,4
chr22	44368039	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=187,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:7,0,1,1
chr22	44368196	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=186,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,2:7,3:3,7,4,1
chr22	44368204	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,3:3,7:1,4,5,5
chr22	44368740	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=113,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.308:10:5,2:1,1:4,3,3,0
chr22	44372069	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,4:2,5:1,5,4,5
chr22	44373866	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=200,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:44373866_G_A:44373866:0,3,0,1
chr22	44373875	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=184,199;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44373866_G_A:44373866:0,2,0,1
chr22	44377442	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=169,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr22	44379740	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=153,228;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,1:6,4:8,4,4,1
chr22	44379784	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:9,0:11,5:10,10,0,5
chr22	44395389	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,8:1,3:3,0,7,4
chr22	44495940	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=140,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,2:5,1:7,4,2,1
chr22	44496043	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=134,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:8,5:2,1:4,6,3,4
chr22	44515806	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=190,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,0:1,4:0,5,0,4
chr22	44528826	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,249;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,1:6,1:7,7,0,2
chr22	44535904	.	G	GCTTTCTGGCTGGCTCTGTCCCTCATCCTCCA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=150,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTTTCTGGCTGGCTCTGTCCCTCATCCTCCA;STR;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.744:10:0,1:2,3:2,0,5,3
chr22	44547355	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:8,3,1,1
chr22	44559715	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.451:11:2,0:4,5:3,3,4,1
chr22	44564402	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:1,4:3,0:4,0,4,1
chr22	44592403	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=250,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr22	44594476	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=212,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.621:16:3,6:2,4:3,3,5,5
chr22	44594584	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=150,185;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,3:4,3:4,7,3,3
chr22	44602172	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=208,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:4,5,4,0
chr22	44602222	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,1:7,4:8,4,3,2
chr22	44602229	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=143,189;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,3:2,9:5,1,7,5
chr22	44645534	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,18;MFRL=188,50;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:8,1:0|1:44645534_T_A:44645534:8,8,1,1
chr22	44645540	.	A	AACCCCCGCATCAAATAGAGCTCCC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=188,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:6,0:11,2:0|1:44645534_T_A:44645534:9,8,1,1
chr22	44681418	.	TGGGGCCCGCTGACCCGGCCGA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=176,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.130:29:8,2:3,1:12,14,3,0
chr22	44696712	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=158,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.593:8:1,1:1,0:0|1:44696712_A_C:44696712:1,2,5,0
chr22	44696714	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=158,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.593:8:1,1:1,0:0|1:44696712_A_C:44696712:1,2,5,0
chr22	44696720	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,13;MFRL=79,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.499:8:2,0:1,0:0|1:44696712_A_C:44696712:1,3,4,0
chr22	44761631	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:4,4:10,1:4,10,1,4
chr22	44965320	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=176,190;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.802:18:3,9:0,6:2,1,9,6
chr22	44965364	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=175,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:10,2:1,1:3,8,1,2
chr22	44967301	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:4,4:13,2:9,8,6,0
chr22	45075603	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:11,1,2,0
chr22	45075715	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=189,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:45075715_G_A:45075715:7,12,1,1
chr22	45075719	.	T	TCTGTGCCTCCCACTGTGGCCACCAG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=198,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:9,2:0|1:45075715_G_A:45075715:7,10,1,1
chr22	45075738	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=270,155;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,3:2,9:2,4,6,6
chr22	45121202	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:2,5,1,1
chr22	45126775	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,88;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.305:24:5,2:12,5:6,11,2,5
chr22	45128067	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=195,211;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,4:3,0:3,0,4,0
chr22	45182321	.	ATCT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=162,271;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:7,1:7,2:9,8,0,4
chr22	45198112	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=187,43;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,0:5,2:4,2,1,1
chr22	45205158	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,240;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,1:1,0:0,3,1,1
chr22	45218223	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,8,7
chr22	45255727	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=205,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:1,5,1,4
chr22	45255779	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=243,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,3:1,4,0,5
chr22	45281810	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,37;MFRL=167,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr22	45309653	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=164,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr22	45309728	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=152,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,1:9,1:13,5,2,0
chr22	45404774	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,436;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	45579422	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=112,266;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,2:0,1,1,2
chr22	45593661	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=190,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:4,3,1,1
chr22	45595721	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr22	45603485	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=123,139;MMQ=60,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:6,2:2,1:0|1:45603485_G_A:45603485:8,2,3,0
chr22	45603501	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=88,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.388:16:5,4:5,2:0|1:45603485_G_A:45603485:8,2,3,3
chr22	45603545	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=76,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,9:4,2:4,3,4,7
chr22	45607838	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=193,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:10,3,0,2
chr22	45607855	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=194,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.319:10:1,2:5,0:4,3,2,1
chr22	45622351	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=156,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:0,5,0,5
chr22	45682975	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr22	45723696	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:7,2,1,1
chr22	45728655	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=170,146;MMQ=49,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:45728655_T_C:45728655:0,4,0,1
chr22	45728657	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=170,146;MMQ=49,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:45728655_T_C:45728655:0,4,0,1
chr22	45731182	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,5:2,4:5,2,4,5
chr22	45732328	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=176,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,5:1,2:1,3,1,6
chr22	45736153	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=159,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr22	45741354	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=164,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:6,4,2,0
chr22	45748284	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,1:0,0,6,2
chr22	45749801	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr22	45754517	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,1:3,5:6,0,6,0
chr22	45754558	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,0:4,7:5,3,5,2
chr22	45755666	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:3,2,6,0
chr22	45758758	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=145,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:8,3:1,2:8,1,3,2
chr22	45765945	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=117,67;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.103:37:16,0:18,3:12,22,0,3
chr22	45779335	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=210,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,5:1,4:3,0,4,5
chr22	45794925	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=134,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr22	45809473	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=202,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,3:7,0:4,6,1,2
chr22	45810278	.	A	AC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=92.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,17,9
chr22	45813433	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=159,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,4:5,2:5,2,5,1
chr22	45827020	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=195,245;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0,5,0,2
chr22	45827043	.	ACCCCGCCCT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=274,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr22	45898074	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr22	45898252	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,296;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr22	45914461	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr22	45923827	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,12:0,8:0,0,14,6
chr22	45927112	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=118,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,6:7,2:2,8,5,3
chr22	45928841	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr22	45929577	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr22	45929594	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=214,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr22	45929690	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:7,1:8,4,2,0
chr22	45931262	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,2,13
chr22	45943093	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=191,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,2:4,4:4,6,1,5
chr22	45954029	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=95,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:3,3:6,4:4,5,4,4
chr22	45996328	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=201,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.255:10:1,2:5,0:3,5,0,2
chr22	46114398	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=104,264;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,2:6,0:3,9,1,1
chr22	46346121	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=81,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr22	46368130	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=125,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:3,2,0,2
chr22	46447795	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=188,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.741:14:1,5:1,5:0,3,0,11
chr22	46447855	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=184,160;MMQ=60,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr22	46493852	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=116,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.907:19:0,10:1,8:0,1,9,9
chr22	46505337	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr22	46505986	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr22	46508765	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr22	46594478	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=126,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:9,6,1,1
chr22	46615941	.	T	TATTCTCTACCATTGGTCTCTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=140,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr22	46631049	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:12,6,1,1
chr22	46631170	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=185,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:8,4,1,1
chr22	46640941	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=164,115;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.268:18:9,0:4,4:0|1:46640941_C_T:46640941:13,0,1,4
chr22	46640946	.	GCTCTGTGCAGGGTGCCGCCCGATGACCTAGCCCCAGTTGCACTCACGTCCGAGAACCGGGCTGGCTGGGGGTC	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=140,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.102:47:8,0:5,4:0|1:46640941_C_T:46640941:26,17,0,4
chr22	46654966	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=167,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:9,2:3,2:6,6,1,3
chr22	46671097	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=147,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:6,4:16,0:19,4,4,0
chr22	46688749	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,2:8,1:4,7,2,1
chr22	46693384	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.177:20:8,2:9,1:12,5,1,2
chr22	46724558	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr22	46739096	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=117,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.559:11:3,3:1,2:4,1,5,1
chr22	46752911	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,3:2,3:3,4,1,5
chr22	46761192	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:7,1:3,1:9,2,0,2
chr22	46761565	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:8,4:8,1:7,9,2,3
chr22	46765181	.	G	GTCAGGTCGCCGAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr22	46835037	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=153,327;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:6,1,2,0
chr22	46858687	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=133,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr22	46860316	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=186,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr22	46930944	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=113,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:4,5:8,0:6,6,2,3
chr22	47071531	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=167,233;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr22	47083010	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=164,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,15:0.800:18:1,6:2,9:0|1:47083010_T_C:47083010:1,2,9,6
chr22	47083012	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=164,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,15:0.801:18:1,6:2,9:0|1:47083010_T_C:47083010:1,2,9,6
chr22	47087514	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:11,2:6,0:12,6,2,0
chr22	47087670	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=196,167;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,1:9,1:5,9,1,1
chr22	47089274	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.430:14:3,3:5,2:4,4,4,2
chr22	47097450	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=258,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr22	47185265	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=119,198;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,1:5,3:4,5,4,0
chr22	47185299	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=157,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.250:34:12,4:14,4:11,15,5,3
chr22	47274638	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.763:15:0,6:3,5:2,1,5,7
chr22	47290858	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=311,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr22	47370343	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:2,4,0,4
chr22	47393493	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=292,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,2:3,4:3,0,4,2
chr22	47857656	.	TTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=228,257;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:0,2:1,0:0,1,0,3
chr22	47859131	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:5,2:15,0:10,10,2,0
chr22	47859199	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=140,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:0,5,1,3
chr22	47882574	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=145,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:7,3:2,0:4,6,1,2
chr22	48940714	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=185,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:9,1:5,2:10,4,1,2
chr22	48942294	.	CG	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=127,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:9,0:1,2:5,5,1,1
chr22	48942339	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.235:18:9,1:5,2:4,10,2,2
chr22	49042316	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=212,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr22	49103660	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:0,5:1,3:0,1,1,8
chr22	49834931	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=189,251;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr22	50014071	.	C	CCCTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCTT;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr22	50014369	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr22	50017234	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,13:0,6:0|1:50017234_A_G:50017234:0,0,13,6
chr22	50017242	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=157,133;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.320:20:7,6:6,0:0|1:50017234_A_G:50017234:7,7,6,0
chr22	50018639	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=214,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr22	50018651	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:50018651_C_T:50018651:0,0,0,5
chr22	50018654	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0|1:50018651_C_T:50018651:0,0,0,5
chr22	50191357	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50191357_C_T:50191357:0,0,1,0
chr22	50191362	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50191357_C_T:50191357:0,0,1,0
chr22	50192822	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=201,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr22	50217441	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=148,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:17,1:3,2:12,9,3,0
chr22	50277798	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=192,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,0:6,2:7,7,1,1
chr22	50277835	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,12:0,0,13,9
chr22	50278175	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=196,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:4,7,0,2
chr22	50279749	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=158,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:7,3:15,0:8,15,3,0
chr22	50283615	.	GTCTCT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=178,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:3,4:9,1:7,7,4,1
chr22	50302982	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=152,48;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:6,0:3,2:0|1:50302982_A_T:50302982:7,3,1,1
chr22	50302985	.	AAC	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=152,48;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:50302982_A_T:50302982:7,3,1,1
chr22	50302989	.	GT	TC	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=149,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:50302982_A_T:50302982:6,3,1,1
chr22	50302993	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=35,17;MFRL=149,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,1:0|1:50302982_A_T:50302982:6,3,1,1
chr22	50302997	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=149,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:50302982_A_T:50302982:6,3,1,1
chr22	50356274	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,2:0,6:1,0,8,0
chr22	50356302	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,6,5
chr22	50356555	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr22	50356850	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr22	50435480	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=171,270;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,1:4,1:8,4,1,1
chr22	50436000	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=175,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:2,2,4,0
chr22	50454825	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:12,1:5,2:8,9,2,1
chr22	50471620	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=193,107;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.496:12:2,1:3,4:5,1,3,3
chr22	50483625	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,315;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	50492952	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=169,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:6,0:1,3:0|1:50492952_A_G:50492952:5,2,3,0
chr22	50492970	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=169,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,1:2,2:0|1:50492952_A_G:50492952:4,3,2,1
chr22	50502447	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr22	50507019	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr22	50507064	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	50512617	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,3:5,4:5,3,5,2
chr22	50518723	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr22	50523078	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr22	50529268	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=235,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:50529268_G_A:50529268:2,0,1,0
chr22	50529269	.	C	CATATAAATATGTTAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=235,222;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:50529268_G_A:50529268:2,0,1,0
chr22	50537918	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:15,5,2,0
chr22	50552736	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=200,269;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr22	50555486	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr22	50567038	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=162,332;MMQ=52,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr22	50589120	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=188,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:7,3,2,0
chr22	50598030	.	CAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=126,0;MMQ=60,47;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr22	50617726	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr22	50639473	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	50639498	.	G	GCTCTACTCCTCCCTCTATCCCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50639498_G_GCTCTACTCCTCCCTCTATCCCT:50639498:0,0,0,1
chr22	50639502	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50639498_G_GCTCTACTCCTCCCTCTATCCCT:50639498:0,0,0,1
chr22	50639504	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50639498_G_GCTCTACTCCTCCCTCTATCCCT:50639498:0,0,0,1
chr22	50644969	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=198,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:1,8,0,2
chr22	50646916	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=277,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,1,1
chr22	50646936	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=345,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr22	50654064	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,373;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=G;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.707:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	50655098	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:4,1,3,1
chr22	50656096	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.795:8:1,3:0,2:1,0,6,1
chr22	50656412	.	G	GAGCAGAAGGGAAACTGGTGAGAATAAAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=188,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr22	50657112	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=91,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,6:2,3:4,1,4,5
chr22	50658053	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,9,10
chr22	50658501	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=235,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr22	50671787	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=179,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,1:5,1:9,6,1,1
chr22	50678571	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=239,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr22	50682064	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,246;MMQ=60,32;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:50682064_G_A:50682064:0,0,2,0
chr22	50682067	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,246;MMQ=60,32;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:50682064_G_A:50682064:0,0,2,0
chr22	50682070	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,246;MMQ=60,32;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:50682064_G_A:50682064:0,0,2,0
chr22	50682073	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=91,291;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:50682064_G_A:50682064:1,0,1,0
chr22	50682076	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,23;MFRL=91,291;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50682064_G_A:50682064:1,0,1,0
chr22	50682548	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=179,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:12,2:10,0:0|1:50682548_A_T:50682548:12,10,1,1
chr22	50682553	.	G	GGAGAGGTGGCAGTGAGCCGAGA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=179,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:11,2:9,0:0|1:50682548_A_T:50682548:11,9,1,1
chr22	50684296	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:1,7:1,4:1,1,4,7
chr22	50684740	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,0:7,2:7,10,1,1
chr22	50687660	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=191,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:50687660_GT_G:50687660:1,0,3,0
chr22	50687662	.	GGGTGGGGACCTGGGGCTTGAGGGTGAACTGTGGGGGAGGGGAGGGGCCCAGGGGGAGGGGGC	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:1,2:0,1:0|1:50687660_GT_G:50687660:8,0,3,0
chr22	50688235	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,5:0,11:0,0,12,4
chr22	50689030	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr22	50693554	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr22	50695270	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr22	50705059	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr22	50705817	.	G	GTACAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=146,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:7,2,1,1
chr22	50706381	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:1,1,0,4
chr22	50708565	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50708565_G_C:50708565:0,0,1,0
chr22	50708570	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50708565_G_C:50708565:0,0,1,0
chr22	50708577	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50708565_G_C:50708565:0,0,1,0
chr22	50708580	.	CAGCA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=139,237;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:50708565_G_C:50708565:1,0,1,0
chr22	50708731	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr22	50708815	.	AGGC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=233,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr22	50714289	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,6,6
chr22	50714491	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr22	50715020	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=154,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:8,5,1,1
chr22	50715029	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,9,6
chr22	50715973	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=232,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:2,1,5,0
chr22	50718397	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:4,2,2,0
chr22	50718409	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:9,2,2,0
chr22	50719165	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=151,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:4,2:4,2:3,6,0,4
chr22	50719426	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:7,1:7,7,1,1
chr22	50720181	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=210,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,0:2,2:1,5,1,1
chr22	50722408	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=247,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr22	50722541	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=18,12;MFRL=176,214;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.560:7:1,0:0,0:3,0,4,0
chr22	50727921	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=237,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:2,1,1,1
chr22	50750720	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=216,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,2:4,7:5,3,6,3
chr22	50751395	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=171,204;MMQ=60,28;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:50751395_G_C:50751395:3,1,1,0
chr22	50751400	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=171,204;MMQ=60,28;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:50751395_G_C:50751395:3,1,1,0
chr22	50751423	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=146,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,2,0
chr22	50752150	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,98;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0|1:50752150_C_T:50752150:3,0,1,2
chr22	50752169	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=134,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:0|1:50752150_C_T:50752150:5,0,3,2
chr22	50752313	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=178,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:0,9,0,2
chr22	50754052	.	TACTC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=124,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:1,2:3,1,3,0
chr22	50754363	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:4,0,3,2
chr22	50870692	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=201,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.225:18:3,1:7,0:8,6,4,0
chr22	50873546	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=262,155;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0|1:50873546_C_T:50873546:1,2,1,1
chr22	50873557	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,36;MFRL=298,192;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:50873546_C_T:50873546:1,1,1,0
chr22	50873561	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=298,192;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:50873546_C_T:50873546:1,1,1,0
chr22	50874873	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=109,94;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:2,6:6,6:4,4,4,8
chr22	50874893	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=112,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,5:7,5:2,7,3,7
chr22	50875908	.	GTCCC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=176,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TCCC;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr22	50876077	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=183,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0,1,2,3
chr22	50876235	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=201,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,4:1,7:3,0,7,4
chr22	50876314	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,0:4,3:7,6,0,3
chr22	50876357	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=196,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:3,6:0,5:1,2,2,9
chr22	50876526	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr22	50878196	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,6:4,1:4,4,2,5
chr22	50878546	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=126,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr22	50882590	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=182,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,5:8,3:9,4,4,4
chr22	50882752	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.798:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr22	50885893	.	CCA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=40.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.861:12:0,7:1,4:0,1,3,8
chr22	50886883	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:1,9,2,0
chr22	50894849	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=183,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,1,1
chr22	50895133	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:0,6:1,8:0,1,5,9
chr22	50897868	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=263,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,1,2
chr22	50898619	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=253,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:1,1:1,3:1,1,1,3
chr22	50898646	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=275,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:50898646_C_T:50898646:0,3,1,0
chr22	50898652	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=275,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:50898646_C_T:50898646:0,3,1,0
chr22	50899747	.	G	GACCTTTCTCTA	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=184,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:3,2:1,0:0|1:50899747_G_GACCTTTCTCTA:50899747:1,3,1,1
chr22	50899749	.	A	AGAAAAGAAAAG	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=24,26;MFRL=184,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:1,0:0|1:50899747_G_GACCTTTCTCTA:50899747:1,3,1,1
chr22	50899752	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=184,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:50899747_G_GACCTTTCTCTA:50899747:1,3,0,1
chr22	50899755	.	AGG	A,ATGG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,20,15;MFRL=0,211,167;MMQ=60,60,60;MPOS=17,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.06,3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.340,0.321:3:1,1,0:0,0,0:1,0,0,2
chr22	50899757	.	G	GAGT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=106,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.428:3:2,1:0,0:0|1:50899757_G_GAGT:50899757:1,1,0,1
chr22	50899759	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=106,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:50899757_G_GAGT:50899757:1,1,0,1
chr22	50899761	.	G	GCATTTGAATCAACT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=106,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:50899757_G_GAGT:50899757:1,1,0,1
chr22	50901211	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=173,72;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:4,4,1,1
chr22	50901259	.	G	C,T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31,24;MFRL=248,157,159;MMQ=60,60,60;MPOS=11,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.14,8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,4:0.364,0.453:8:0,2,3:1,1,1:1,0,4,3
chr22	50903221	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,2:2,3:2,0,4,1
chr22	50904196	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:4,0:16,2:11,9,0,2
chr22	50925997	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=207,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:1,5,2,0
chr22	50927442	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	50928357	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:50928357_G_A:50928357:0,3,0,1
chr22	50928375	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:50928357_G_A:50928357:0,2,0,1
chr22	50942761	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.593:5:1,1:0,2:1,1,2,1
chr22	50943423	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=141,259;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:3,1,4,1
chr22	50946164	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=179,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr22	50946928	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=197,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.657:4:1,0:0,0:0|1:50946928_C_G:50946928:1,0,0,3
chr22	50946935	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.796:3:0,0:0,0:0|1:50946928_C_G:50946928:0,0,0,3
chr22	50946965	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr22	50956386	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=204,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,6:2,3:2,2,4,5
chr22	50957520	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=271,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr22	50960101	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,1:0,10:2,0,7,4
chr22	50964153	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:2,8:2,4:3,1,11,1
chr22	50964862	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	50966197	.	CTTTTT	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=184,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=23,18;RU=T;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.418:5:0,2:2,0:0,3,0,2
chr22	50966213	.	TT	AC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:7,0:0,2:0|1:50966213_TT_AC:50966213:1,6,0,2
chr22	50966218	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,36;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0|1:50966213_TT_AC:50966213:0,5,0,2
chr22	50966220	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0|1:50966213_TT_AC:50966213:0,5,0,2
chr22	50966914	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=210,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=75.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.920:23:1,12:0,10:1,0,17,5
chr22	50968826	.	CAGAG	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,240;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=AG;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:5,1:8,1:13,1,1,1
chr22	50987843	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,4:5,2:5,3,1,5
chr22	50988062	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:3,1:4,3:4,3,0,5
chr22	50989197	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.403:13:3,3:4,1:5,3,4,1
chr22	51010788	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr22	51011936	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=313,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr22	51015210	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=300,237;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:2,1,3,3
chr22	51015481	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=231,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.748:14:2,6:1,4:0,3,3,8
chr22	51018128	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=137,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:0,0:13,3:5,10,1,2
chr22	51018579	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=201,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,7:1,1:1,0,5,3
chr22	51020668	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=248,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.855:12:1,7:0,2:0,1,7,4
chr22	51042032	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=97,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:4,4:8,2:0|1:51042032_G_T:51042032:7,5,4,2
chr22	51042034	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=97,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:4,4:8,2:0|1:51042032_G_T:51042032:7,5,4,2
chr22	51042513	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	51045480	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=331,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr22	51048774	.	T	TGTATGTCTGCGC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=23,16;MFRL=217,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.267:5:1,0:1,0:0|1:51048774_T_TGTATGTCTGCGC:51048774:0,4,0,1
chr22	51048778	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=217,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:51048774_T_TGTATGTCTGCGC:51048774:0,4,0,1
chr22	51048781	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr22	51048812	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=228,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr22	51063987	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr22	51064039	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:5,2,5,2
chr22	51064141	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr22	51117137	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=306,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:0,2,4,3
chr22	51133518	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr22	51135545	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr22	51137249	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=200,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,3:3,6:0,4,0,9
chr22	51142381	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,3:5,1:2,7,2,2
chr22	51143121	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=141,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:0,0:4,1:3,2,4,0
chr22	51150080	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=124,49;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.297:14:6,0:4,3:3,7,3,1
chr22	51153407	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=142,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:1,1:10,1:7,4,1,1
chr22	51182485	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=177,163;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:3,1,3,0
chr22	51211392	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=258,166;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:6,0:0,3:5,1,3,0
chrX	2700027	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=290,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:4,1:0,1:4,0,1,1
chrX	2700202	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=124,231;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,2:6,1:8,6,0,3
chrX	2729281	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chrX	2729540	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=274,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.826:9:1,6:0,1:0,1,3,5
chrX	2732356	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.655:12:2,6:2,2:3,1,6,2
chrX	2748292	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chrX	2774478	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chrX	2774700	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=211,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,1,2
chrX	2778199	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	2823131	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=164,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:2,2:5,0:4,4,0,2
chrX	2832661	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=209,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:2832661_A_T:2832661:3,8,2,0
chrX	2832668	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=211,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:2832661_A_T:2832661:3,7,2,0
chrX	2832696	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=209,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,0:8,2:4,9,2,0
chrX	2832708	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=35,25;MFRL=211,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:4,0:7,2:0|1:2832708_G_T:2832708:7,7,2,0
chrX	2832715	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=211,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:3,0:9,1:0|1:2832708_G_T:2832708:7,7,2,0
chrX	2832787	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:6,2:5,5:3,8,6,1
chrX	2832860	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=209,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:3,0:3,6:0|1:2832860_G_A:2832860:1,5,0,6
chrX	2832871	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:2,0:4,5:0|1:2832860_G_A:2832860:1,7,0,6
chrX	2832880	.	A	AAT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:2,0:4,4:0|1:2832860_G_A:2832860:0,6,0,5
chrX	2833533	.	GTTACGCCC	G	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=34,34;MFRL=211,0;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,0:0,3:0|1:2833533_GTTACGCCC_G:2833533:2,4,1,2
chrX	2833551	.	AC	TG	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=192,0;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,0:3,4:0|1:2833533_GTTACGCCC_G:2833533:2,5,1,3
chrX	2833580	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=25,34;MFRL=196,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,1:3,4:1,9,1,4
chrX	2833605	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=194,129;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,1:3,2:1,6,1,2
chrX	2833628	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=29,26;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:4,1:3,3:0|1:2833628_A_C:2833628:6,4,1,3
chrX	2833631	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=27,26;MFRL=135,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:4,1:5,3:0|1:2833628_A_C:2833628:7,4,1,3
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chrX	2836293	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=197,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0|1:2836283_A_G:2836283:0,7,1,2
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chrX	2836336	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=211,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chrX	2836349	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=32,36;MFRL=212,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:0,4,0,3
chrX	2853024	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=123,62;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:6,5,2,0
chrX	2871407	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	2876214	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=202,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chrX	2947247	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=81,82;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:3,3,2,0
chrX	2950961	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	2950998	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chrX	2951434	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chrX	3002219	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chrX	3190379	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=179,80;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:11,4:6,0:8,9,4,0
chrX	3240343	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,141;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:2,2,3,0
chrX	3240763	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=163,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,2:2,0:4,4,0,2
chrX	3242840	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:3242840_G_T:3242840:5,5,0,2
chrX	3242841	.	C	CTT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:3242840_G_T:3242840:5,5,0,2
chrX	3242843	.	C	CTCTCTCT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:3242840_G_T:3242840:5,5,0,2
chrX	3248502	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	3530194	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=347,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:3,0,1,1
chrX	3539376	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chrX	3539406	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=201,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,1:0,0:0|1:3539406_T_TG:3539406:0,2,0,1
chrX	3539407	.	C	CTTCTGTAATTTTCTATTAATACCATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=201,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3539406_T_TG:3539406:0,2,0,1
chrX	3592847	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=179,171;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:3,7,1,1
chrX	5810756	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=194,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.772:7:0,2:1,2:1,0,5,1
chrX	5811807	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,53;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chrX	6995315	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=150,104;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:3,1,2,1
chrX	7066051	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,1:5,10:4,2,5,6
chrX	7193970	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,263;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.634:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chrX	7890215	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
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chrX	8095173	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=205,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
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chrX	8138289	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,244;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:8138284_G_C:8138284:0,0,0,1
chrX	8504773	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=226,217;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:3,0,2,3
chrX	9622194	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chrX	9656179	.	TGCG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=158,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCG;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:5,1:3,1:3,5,1,1
chrX	9659766	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,28;MFRL=135,376;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:9659766_G_A:9659766:1,2,1,1
chrX	9659767	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=135,376;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:1,1:0|1:9659766_G_A:9659766:1,2,1,1
chrX	9659772	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=294,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:9659772_G_A:9659772:2,2,0,1
chrX	9659774	.	C	CACACA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,36;MFRL=294,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:9659772_G_A:9659772:2,2,0,1
chrX	9659776	.	C	CTTTGAG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=294,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:9659772_G_A:9659772:2,2,0,1
chrX	9659778	.	C	CAATGTGCA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=294,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:9659772_G_A:9659772:2,2,0,1
chrX	9661110	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=162,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:4,1:7,2,2,0
chrX	9661165	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=177,255;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:3,4,2,0
chrX	9665368	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:7,1,1,1
chrX	9677599	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,3,1
chrX	9682850	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=205,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chrX	9707811	.	C	CTTCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=241,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	9711595	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	9727431	.	C	CAGGGAAGTGGATTTGA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=195,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.181:13:4,2:7,0:5,6,1,1
chrX	9859197	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chrX	9862890	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,12;MFRL=192,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,0:0,0:0|1:9862890_A_C:9862890:1,1,2,0
chrX	9862893	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,10;MFRL=192,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:2,0:0,0:0|1:9862890_A_C:9862890:1,1,2,0
chrX	9862896	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,15;MFRL=192,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:2,0:0,0:0|1:9862890_A_C:9862890:1,1,2,0
chrX	9863072	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:3,6,1,1
chrX	9866420	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=340,240;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chrX	9907484	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=190,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chrX	9914667	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=114,246;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chrX	10062079	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=182,246;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chrX	10062163	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=171,263;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,1:4,2:7,5,3,0
chrX	10107413	.	TC	AA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=128,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0|1:10107413_TC_AA:10107413:2,4,2,0
chrX	10107417	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=128,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0|1:10107413_TC_AA:10107413:2,4,2,0
chrX	10107587	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=168,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:6,5,2,0
chrX	10166124	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=154,54;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:3,9,0,2
chrX	10417427	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:9,6,0,2
chrX	10491233	.	CAAAAA	C,CAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,32,27;MFRL=122,0,257;MMQ=60,60,60;MPOS=32,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,11,14;RU=A;STR;TLOD=3.11,6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,2:0.196,0.343:6:0,1,1:1,0,1:0,3,0,3
chrX	11136613	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=179,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,2:7,0:8,5,2,0
chrX	11174768	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=104,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:4,0:4,5:2,7,0,5
chrX	11200070	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chrX	11308610	.	CAAAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=18,13;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	11313027	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chrX	11776916	.	GC	TT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=157,279;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:1,5,0,3
chrX	11778471	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=169,294;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,2:6,0:9,0,2,0
chrX	11786839	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chrX	11793084	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=189,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chrX	12516777	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=152,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chrX	12628049	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=182,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,2:0,2,0,3
chrX	12633034	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=213,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:1,4,1,3
chrX	12708525	.	T	TTATTTATTACCATACTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:12708525_T_TTATTTATTACCATACTG:12708525:0,1,0,1
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chrX	12734120	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chrX	12828089	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:3,2,2,0
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chrX	12906003	.	GT	CA	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=142,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:0|1:12906001_G_GC:12906001:3,10,1,1
chrX	12906006	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=146,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:9,2:0|1:12906001_G_GC:12906001:3,11,1,1
chrX	12906011	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=146,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:9,2:0|1:12906001_G_GC:12906001:3,11,1,1
chrX	12906015	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=149,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:10,1:0|1:12906001_G_GC:12906001:4,11,1,1
chrX	12940136	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=182,1483;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,2:12,0:9,9,1,1
chrX	12994867	.	C	CTT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=18,34;MFRL=119,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,20;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.554:14:1,5:1,3:2,4,8,0
chrX	12994886	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=127,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.396:22:6,1:4,1:2,11,9,0
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chrX	13338588	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,159;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chrX	13613061	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=131,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chrX	13680714	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,21;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,1:8,0:0|1:13680714_C_G:13680714:10,8,0,2
chrX	13680718	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:13680714_C_G:13680714:9,8,0,2
chrX	13680720	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:7,0:0|1:13680714_C_G:13680714:11,8,0,2
chrX	13680723	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:8,0:0|1:13680714_C_G:13680714:11,8,0,2
chrX	13680724	.	C	CTTTTTTTTTTT	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,12;RU=T;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:0|1:13680714_C_G:13680714:9,8,0,2
chrX	13734539	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=94,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:0,2:3,6:2,1,6,2
chrX	13737928	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=35.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chrX	13767718	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,1:0,7:0,0,1,7
chrX	13771576	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=320,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.792:22:1,12:3,6:2,2,9,9
chrX	13775752	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chrX	13779124	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=213,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chrX	13779409	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=143,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,1:0,4,0,2
chrX	13786171	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=28,16;MFRL=143,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:6,0:14,0:0|1:13786171_A_T:13786171:7,14,1,1
chrX	13786178	.	G	GAAGC	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=144,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,2:14,0:0|1:13786171_A_T:13786171:7,15,1,1
chrX	13786180	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=140,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,2:13,0:0|1:13786171_A_T:13786171:7,15,1,1
chrX	13786182	.	G	GGTAA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=143,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,1:13,0:0|1:13786171_A_T:13786171:7,14,1,1
chrX	13803960	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=205,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,7:1,6:0,1,4,9
chrX	13835096	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=315,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:2,3:0,2:0,2,2,4
chrX	14599230	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,318;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chrX	14599572	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=229,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chrX	14625194	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=179,249;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:5,0,4,0
chrX	14625399	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,23,21;MFRL=87,200,144;MMQ=60,60,60;MPOS=29,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,17;RU=T;STR;TLOD=4.45,7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.359,0.363:8:0,1,0:2,2,2:0,2,1,5
chrX	14868806	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=188,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,0:1,2:1,1,0,3
chrX	14877404	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=124,257;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:7,6,1,1
chrX	14927189	.	GT	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	14930353	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,98;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.590:8:1,4:2,1:2,1,2,3
chrX	15266819	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=159,297;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chrX	15267033	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=173,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:4,8,1,1
chrX	15272913	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=188,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,2:3,0:8,5,0,2
chrX	15301533	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=201,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chrX	15307659	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.873:13:1,4:0,8:1,0,8,4
chrX	15365494	.	A	ATTACTTAGCGGTTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=270,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chrX	15408419	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=188,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chrX	15554602	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=10,33;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.451:10:1,1:0,3:0,6,1,3
chrX	15554625	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=198,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,1:3,2:0,6,0,4
chrX	15561271	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=136,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:1,5,1,1
chrX	15607586	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=139,143;MMQ=60,44;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,1:1,2,0,4
chrX	15657920	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=205,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chrX	15706830	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=92,300;MMQ=27,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:0,2,3,2
chrX	15709201	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=236,295;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chrX	15709454	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chrX	15711241	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,110;MMQ=56,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chrX	15792527	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,216;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chrX	15794764	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chrX	15794815	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chrX	15800600	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=241,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:1,1,5,0
chrX	15800751	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=169,105;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,2:7,1:7,4,2,1
chrX	15817963	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=130,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,5:1,3:1,1,4,4
chrX	15818114	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=187,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.585:15:3,5:3,4:2,4,3,6
chrX	15822390	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chrX	15827524	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=287,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chrX	15833865	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=167,0;MMQ=59,29;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:15,2:9,1:13,11,3,0
chrX	15836648	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=216,79;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,2,1
chrX	15863648	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:2,2:6,2:0,8,0,4
chrX	15863953	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chrX	16189670	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=267,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chrX	16709626	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=267,70;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:2,1,3,3
chrX	16737971	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:7,0:13,3:8,13,0,3
chrX	16754470	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chrX	16762002	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chrX	16857857	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,3:6,0:9,0,3,0
chrX	16867528	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=218,283;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,0:5,3:0,9,0,4
chrX	16870068	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=233,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,4:3,0:6,0,4,0
chrX	16872015	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=218,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,2:1,1:0,2,0,3
chrX	16876980	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=185,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,2:5,1:1,12,0,3
chrX	17080492	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=199,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,4,1
chrX	17092152	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=218,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:1,2:2,3:2,1,5,1
chrX	17157148	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chrX	17394066	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	17705850	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=54.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,15:0,2:0,0,14,4
chrX	17819554	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=174,43;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:4,2:0|1:17819554_G_A:17819554:5,6,1,1
chrX	17819559	.	A	AGTCCTGTCCTTAGG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=169,43;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:0|1:17819554_G_A:17819554:6,6,1,1
chrX	17819561	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=169,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:7,2:0|1:17819554_G_A:17819554:8,6,1,1
chrX	17819565	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=169,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:17819554_G_A:17819554:8,6,1,1
chrX	18195869	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=169,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:1,2,0,1
chrX	18265966	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,10:3,0:4,5,0,10
chrX	18275222	.	C	CAG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=268,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0|1:18275222_C_CAG:18275222:0,3,0,3
chrX	18275225	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=268,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0|1:18275222_C_CAG:18275222:0,3,0,3
chrX	18323147	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=156,69;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:10,1:7,4:8,9,1,4
chrX	18343198	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:18343198_T_G:18343198:0,3,0,1
chrX	18343206	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=18,19;MFRL=196,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,0:0|1:18343198_T_G:18343198:0,4,0,1
chrX	18525226	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,0:7,3:10,6,3,0
chrX	18582646	.	GATAT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=206,222;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=AT;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.311:10:1,1:6,2:0,7,0,3
chrX	18631213	.	T	TAAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,212;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=21,25;RU=A;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.802:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chrX	18690197	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=169,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,0:5,3:2,6,1,2
chrX	18800531	.	CTTTT	C,CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27,20;MFRL=285,141,207;MMQ=60,60,60;MPOS=23,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.48,18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,6:0.199,0.583:10:0,2,4:2,0,0:2,0,1,7
chrX	18824596	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=198,248;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:3,3,0,2
chrX	18836213	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=161,54;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:6,6,0,2
chrX	18842292	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=299,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chrX	18844012	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=56,259;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chrX	18926210	.	A	AGGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=193,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18926210_A_AGGT:18926210:0,1,0,1
chrX	18926214	.	AG	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=193,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18926210_A_AGGT:18926210:0,1,0,1
chrX	18926219	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=193,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18926210_A_AGGT:18926210:0,1,0,1
chrX	18926221	.	AC	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=193,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18926210_A_AGGT:18926210:0,1,0,1
chrX	18926918	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=223,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:5,1,2,0
chrX	18929128	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.809:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chrX	18944600	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=190,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:1,10,2,0
chrX	18970516	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=189,237;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:6,1,2,0
chrX	19018134	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=24,32;MFRL=151,167;MMQ=44,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:19018134_C_T:19018134:0,3,0,1
chrX	19018138	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,34;MFRL=151,167;MMQ=44,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:19018134_C_T:19018134:0,3,0,1
chrX	19018142	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,28;MFRL=151,167;MMQ=44,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:19018134_C_T:19018134:0,3,0,1
chrX	19018151	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,34;MFRL=151,167;MMQ=44,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:19018134_C_T:19018134:0,3,0,1
chrX	19018166	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=27,27;MFRL=150,199;MMQ=50,30;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:19018166_C_T:19018166:0,2,0,1
chrX	19018170	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=24,25;MFRL=150,199;MMQ=50,30;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:19018166_C_T:19018166:0,2,0,1
chrX	19018175	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,25;MFRL=150,199;MMQ=50,30;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:19018166_C_T:19018166:0,2,0,1
chrX	19018178	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,30;MFRL=150,199;MMQ=50,30;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:19018166_C_T:19018166:0,2,0,1
chrX	19024426	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=183,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chrX	19027979	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=277,135;MMQ=56,30;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chrX	19037666	.	ATT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=106,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.458:9:0,2:3,1:4,1,3,1
chrX	19363863	.	TCC	T,TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29,17;MFRL=0,125,141;MMQ=60,60,60;MPOS=14,19;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=C;STR;TLOD=10.22,8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,4:0.528,0.395:10:0,1,0:0,3,0:0,0,1,9
chrX	19371280	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,0:9,3:8,11,0,3
chrX	19375830	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,4:8,0:8,6,4,0
chrX	19389184	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=228,222;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:1,0:1,3:2,1,0,3
chrX	19688957	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,27,32;MFRL=131,89,127;MMQ=60,60,60;MPOS=28,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.04,9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,4,7:0.179,0.340:22:7,2,4:3,2,3:4,7,5,6
chrX	19854403	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=146,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:6,6,0,2
chrX	19955434	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=190,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chrX	20134769	.	TTC	GGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,8;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chrX	20204548	.	TAA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,11;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.336:9:3,1:1,0:0,6,0,3
chrX	20252889	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=165,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,6:5,0:5,3,3,3
chrX	21534509	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=172,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chrX	21534511	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chrX	21544904	.	A	ATTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=206,0;MMQ=60,39;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TTG;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chrX	21624997	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=195,89;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:5,1:2,3:4,4,1,3
chrX	21666938	.	GGA	TTT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=0,162;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,1:4,0:0|1:21666938_GGA_TTT:21666938:4,15,2,0
chrX	21666942	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=0,162;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.127:21:11,2:6,0:0|1:21666938_GGA_TTT:21666938:4,15,2,0
chrX	21666958	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:18,3:8,0:4,22,3,0
chrX	21857868	.	CTGG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=203,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TGG;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,0:7,2:9,8,1,1
chrX	21871574	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=153,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:5,14:10,0:6,9,14,0
chrX	21876795	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,31;MFRL=200,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:21876795_C_G:21876795:0,3,0,1
chrX	21876798	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=200,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:21876795_C_G:21876795:0,3,0,1
chrX	21876801	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=200,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:21876795_C_G:21876795:0,3,0,1
chrX	21876802	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=200,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:21876795_C_G:21876795:0,3,0,1
chrX	22003230	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=120,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,1:7,1:6,6,2,0
chrX	22012400	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.192:19:9,3:6,0:11,5,3,0
chrX	22051034	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=196,279;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chrX	22051299	.	C	CATG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=201,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:1,7,1,1
chrX	22129512	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chrX	22151809	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,0:1,4:0,7,0,4
chrX	22230975	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=122,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chrX	22231154	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	23019317	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=163,241;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,4:2,0:5,3,2,2
chrX	23019346	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=167,242;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,5:4,0:6,5,2,3
chrX	23682566	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chrX	23682877	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chrX	23682929	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chrX	23685964	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,7:3,2:0,6,5,4
chrX	23689636	.	AT	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=136,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,1:5,3:6,3,2,2
chrX	23693073	.	GAATACTGAATATTTTTTTTTTTTTACCTTTCAGCACATTTGTGTGTCCAACTGAAATTATCGCTTTTGGCGACAGACTTGAAGAATTCAGATCTATA	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,7:0.078:45:4,1:6,2:0|1:23693073_GAATACTGAATATTTTTTTTTTTTTACCTTTCAGCACATTTGTGTGTCCAACTGAAATTATCGCTTTTGGCGACAGACTTGAAGAATTCAGATCTATA_G:23693073:27,11,6,1
chrX	23693084	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=125,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,6:0.349:16:5,2:4,3:1|0:23693073_GAATACTGAATATTTTTTTTTTTTTACCTTTCAGCACATTTGTGTGTCCAACTGAAATTATCGCTTTTGGCGACAGACTTGAAGAATTCAGATCTATA_G:23693073:9,1,5,1
chrX	23701662	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=205,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chrX	23723261	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chrX	23726119	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=142,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chrX	23801593	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.911:20:0,6:1,13:1,0,7,12
chrX	23801702	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=41.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,7:1,5:2,1,4,8
chrX	23886691	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,250;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,1:3,2:4,3,1,2
chrX	23897003	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=190,56;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:2,2,0,2
chrX	24006138	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=215,90;MMQ=60,29;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:5,0:2,11:4,3,0,11
chrX	24084241	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=106,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.664:7:0,2:2,3:0,2,1,4
chrX	24225362	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=128,235;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:5,0,2,1
chrX	24229555	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=187,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:2,7,0,2
chrX	24516925	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31,35,31;MFRL=186,166,203,148;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,18,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.03,12.09,7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,2,6,4:0.136,0.319,0.227:18:3,2,5,3:3,0,1,0:4,2,10,2
chrX	24536954	.	GCACACA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=200,262;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=CA;STR;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.636:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chrX	24593453	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chrX	24608302	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=161,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.301:8:4,2:2,0:0|1:24608302_C_A:24608302:1,5,1,1
chrX	24608303	.	A	ATAAAGATG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=161,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,2:2,0:0|1:24608302_C_A:24608302:1,5,1,1
chrX	24665273	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=154,242;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:0,0:2,3:0,2,1,3
chrX	24735871	.	A	AAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=179,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:24735871_A_AAT:24735871:4,6,1,1
chrX	24735873	.	C	CTTACCCTCATAGAACA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=179,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:4,0:0|1:24735871_A_AAT:24735871:4,6,1,1
chrX	24745028	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=143,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.538:13:3,4:3,3:5,1,7,0
chrX	24745238	.	GGTTTTTAAAAGGGAAGTTAGGAAATTGATCTATTTATTTTAATGTGTCTACTTCCTTTTCTGTTTGTTTCTTCA	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=192,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,28:0.408:40:6,2:2,25:0,12,2,26
chrX	24751958	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,13:0,10:0,0,10,13
chrX	24760276	.	ACC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=C;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chrX	24766651	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chrX	24828137	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	24833074	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=235,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.614:7:2,3:0,1:2,0,3,2
chrX	24906306	.	GAT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=258,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:24906306_GAT_G:24906306:0,2,0,1
chrX	24906309	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=258,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:24906306_GAT_G:24906306:0,2,0,1
chrX	25028284	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=15,12;MFRL=234,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.323:7:1,0:0,0:0|1:25028284_A_C:25028284:5,0,2,0
chrX	25028291	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.754:6:1,2:0,2:0|1:25028291_G_C:25028291:1,0,5,0
chrX	25028293	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=14,12;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,1:0,0:0|1:25028291_G_C:25028291:1,0,5,0
chrX	25028301	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=9,30;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:0,2:0|1:25028291_G_C:25028291:1,0,4,0
chrX	25028304	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=15,30;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,2:0,1:0|1:25028291_G_C:25028291:1,0,3,0
chrX	25028307	.	AA	CC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,33;MFRL=212,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.297:5:1,1:0,0:0|1:25028284_A_C:25028284:4,0,1,0
chrX	27765399	.	AGAGGAG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=305,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=GAG;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chrX	27840086	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:8,2:3,0:4,7,0,2
chrX	27999127	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=169,64;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,1:8,1:9,8,1,1
chrX	27999580	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=190,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,0:9,4:9,9,1,3
chrX	29417510	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chrX	29972870	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
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chrX	30577846	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,8,6
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chrX	30877636	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=149,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,2:12,0:6,16,1,1
chrX	31089930	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:4,5,3,1
chrX	31144920	.	GAAAA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=A;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.837:3:0,0:0,1:0,0,0,3
chrX	31165667	.	AAAAG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=167,257;MMQ=20,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAG;STR;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:2,4:9,2:1,10,0,6
chrX	31191589	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:2,4:3,1,5,4
chrX	31222221	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:9,0:3,6:6,6,0,6
chrX	31224684	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,9,4
chrX	31224881	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chrX	31496350	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=181,121;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.858:19:0,7:2,10:0,2,7,10
chrX	31526303	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,12:7,0:5,6,12,0
chrX	31676096	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:2,2:6,0:4,4,1,1
chrX	31986607	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:6,3:5,2:3,8,1,4
chrX	32361421	.	ATTATTAAAATATCAATATATATGTATAGTGCACTTCTGGCTGCAGTTAT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:6,0:2,4:2,10,0,4
chrX	32363964	.	A	AAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	32466830	.	AATTTC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=239,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:32466830_AATTTC_A:32466830:0,2,0,1
chrX	32466839	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=239,172;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:32466830_AATTTC_A:32466830:0,2,0,1
chrX	32563263	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=157,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,0:1,6:1,1,4,2
chrX	32563488	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=330,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chrX	32659525	.	GTATA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,58;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=TA;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chrX	32867945	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=172,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,2:2,1:3,1,1,2
chrX	34150506	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=212,220;MMQ=52,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.530:9:2,3:2,0:0,4,0,5
chrX	35644531	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=152,167;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:6,0:7,16:5,8,0,17
chrX	35644545	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=152,167;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:6,0:5,15:6,5,0,17
chrX	35821055	.	AT	GA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=70,171;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,8:1,3:2,1,5,6
chrX	35821127	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=144,242;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:0,7:1,4:0,1,4,7
chrX	35821435	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=125,56;MMQ=60,50;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:7,3:12,0:10,9,3,0
chrX	35821464	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=191,128;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:0,12:1,7:1,0,12,7
chrX	35985722	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=226,105;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:6,2,2,0
chrX	36156447	.	ATT	A,AT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,28,29;MFRL=97,189,205;MMQ=60,60,60;MPOS=31,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.76,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,3,3:0.120,0.145:26:6,1,1:10,2,2:16,4,5,1
chrX	37026639	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=175,127;MMQ=40,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:10,0:4,2:5,9,0,2
chrX	37028898	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,1013;MMQ=60,45;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.248:17:3,3:10,0:7,6,0,4
chrX	37526763	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=191,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.451:7:2,3:2,0:1,3,0,3
chrX	37527510	.	C	CTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,290;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TA;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	37700014	.	C	CGTAAATTAGAAACCAATAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,27;MFRL=225,108;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chrX	37969787	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=197,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0,8,0,2
chrX	38037479	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=211,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:3,0,5,3
chrX	38158290	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,16:0.532:30:3,9:11,7:0|1:38158290_C_T:38158290:6,8,7,9
chrX	38158291	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,5:0.186:30:12,0:13,5:1|0:38158290_C_T:38158290:13,12,0,5
chrX	38169777	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chrX	38178019	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:4,0,4,1
chrX	38226515	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:7,0:8,3:4,11,0,3
chrX	38262808	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=245,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,1:2,5:2,0,4,2
chrX	38280206	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chrX	38535174	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=175,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chrX	38664817	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,35,21,34;MFRL=133,265,122,138;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,13,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,10,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.49,3.78,8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:14,2,4,6:0.099,0.147,0.243:26:6,1,3,3:5,1,0,3:7,7,4,8
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chrX	38665675	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=145,151;MMQ=60,33;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=49.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,19:0.361:53:17,18:17,0:17,17,19,0
chrX	38665688	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=146,151;MMQ=60,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,19:0.357:54:14,19:21,0:18,17,19,0
chrX	40456961	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chrX	40460183	.	T	TAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=A;STR;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,1:0,0,1,5
chrX	40496424	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=209,108;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,0:7,5:2,8,0,7
chrX	40514322	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,2,12
chrX	40551357	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=207,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chrX	40551599	.	TAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=16,28;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.418:9:0,3:2,1:0,5,0,4
chrX	40552028	.	CC	TG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=177,48;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:0|1:40552028_CC_TG:40552028:3,2,1,1
chrX	40552033	.	AA	CT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=193,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:40552028_CC_TG:40552028:3,3,1,1
chrX	40552037	.	G	GTGGGT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=209,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:40552028_CC_TG:40552028:2,3,1,1
chrX	40594581	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=15,21;MFRL=220,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.578:7:0,0:1,2:0,3,0,4
chrX	40996313	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=231,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:0,4,0,6
chrX	41012432	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=149,262;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chrX	41043944	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=218,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,1:1,8:0,4,1,8
chrX	41045992	.	A	AAAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=285,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:41045992_A_AAAC:41045992:0,1,0,1
chrX	41045993	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=285,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:41045992_A_AAAC:41045992:0,1,0,1
chrX	41045996	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=282,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:41045992_A_AAAC:41045992:0,2,0,1
chrX	41070012	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=252,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chrX	41075089	.	GTTT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=223,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.340:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chrX	41198265	.	TTA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=211,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TA;STR;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:7,2,3,0
chrX	41203119	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=190,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,2:6,1:3,9,1,2
chrX	41383297	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.326:10:3,0:2,0:4,3,0,3
chrX	41481957	.	CAGT	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=123,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,1:12,1:0|1:41481957_CAGT_C:41481957:4,14,0,2
chrX	41481963	.	GG	CA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=123,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,1:12,1:0|1:41481957_CAGT_C:41481957:4,14,0,2
chrX	41524788	.	AATCCAAATAAAAAGTT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=233,335;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.404:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chrX	41530655	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=242,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chrX	41554814	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=106,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,2:6,1:5,3,3,0
chrX	41604961	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=169,257;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:0,8,0,2
chrX	43595428	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,10:0,4:0,0,8,6
chrX	43601142	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chrX	43601363	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chrX	43661354	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=256,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chrX	43741616	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chrX	44109791	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=276,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chrX	44171875	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=276,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,3:2,1:1,3,2,2
chrX	44202890	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,0:0,0,2,2
chrX	44401408	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=238,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:1,5,0,3
chrX	44401934	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=208,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.384:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chrX	44833841	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=177,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chrX	44913058	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=134,87;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:5,3:17,0:17,5,3,0
chrX	44935877	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=174,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.504:8:0,2:4,2:4,0,4,0
chrX	44935924	.	CTTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=121,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.326:5:0,0:2,1:2,2,1,0
chrX	44938316	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=266,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:3,1:5,3:8,0,4,0
chrX	44949951	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=218,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,2:2,1,2,1
chrX	45050973	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=261,222;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chrX	46387692	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=339,339;MMQ=27,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:0,0:8,2:8,0,2,0
chrX	46387921	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:2,2,0,2
chrX	46466388	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=185,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.438:30:6,0:11,13:7,10,0,13
chrX	46472666	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:2,1,1,2
chrX	46887442	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.257:37:12,0:15,9:21,7,0,9
chrX	46893249	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=106,276;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chrX	46940540	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=118,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:7,2:4,2:5,6,2,2
chrX	46949403	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chrX	46951004	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=240,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chrX	46952219	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,5,1
chrX	46952398	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=199,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,3:0,3:0,3,1,5
chrX	47006877	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=173,1293;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:9,5:10,0:6,13,0,5
chrX	47057647	.	AT	GC,GT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,18,32;MFRL=0,44,167;MMQ=60,60,60;MPOS=10,17;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.91,51.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,18:0.130,0.831:20:0,0,7:0,1,11:0,0,9,11
chrX	47060844	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,1:7,3:8,2,3,1
chrX	47061018	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=196,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,8:1,8:1,0,7,9
chrX	47063160	.	T	TTGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=98,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47063160_T_TTGG:47063160:1,1,0,1
chrX	47063164	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:47063160_T_TTGG:47063160:1,2,0,1
chrX	47065132	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=254,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1,0,0,1
chrX	47071758	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,420;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:0,0:8,2:8,0,2,0
chrX	47073868	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=191,222;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:3,8,2,0
chrX	47086347	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=231,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,4:4,3:1,4,4,3
chrX	47107297	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:8,2:4,0:7,5,2,0
chrX	47307145	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=175,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:6,5,2,0
chrX	47429126	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=279,264;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:0,1:2,0:0|1:47429126_AG_A:47429126:2,3,0,2
chrX	47429132	.	G	GGC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=17,32;MFRL=279,264;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:0,2:2,0:0|1:47429126_AG_A:47429126:2,3,0,2
chrX	47429134	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=12,10;MFRL=279,264;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:0,0:2,0:0|1:47429126_AG_A:47429126:2,3,0,2
chrX	47430623	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=199,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chrX	47516527	.	AAG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=276,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:1,3:1,1,4,0
chrX	47516676	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=156,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:4,0:12,2:7,9,0,2
chrX	47662972	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,14:0,0,13,9
chrX	47663096	.	CAAT	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=196,149;MMQ=55,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:3,1:12,1:0|1:47663096_CAAT_C:47663096:6,9,0,2
chrX	47663103	.	AC	TT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=197,149;MMQ=59,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,1:9,1:0|1:47663096_CAAT_C:47663096:5,7,0,2
chrX	47663190	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=196,107;MMQ=52,38;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:47663190_C_G:47663190:4,5,0,2
chrX	47663200	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,50;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0|1:47663190_C_G:47663190:0,0,5,7
chrX	47755164	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	47775540	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=252,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:3,5,1,3
chrX	47916795	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:7,2:3,0:0|1:47916795_G_A:47916795:1,9,0,2
chrX	47916796	.	A	ACATCCC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:6,2:3,0:0|1:47916795_G_A:47916795:1,9,0,2
chrX	47919204	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=39.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.582:24:5,0:4,13:1,9,0,14
chrX	47920356	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chrX	47970842	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=239,185;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chrX	48053521	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,6,4
chrX	48053760	.	G	GTCTTTGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=245,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0,3,1,1
chrX	48116786	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,212;MMQ=43,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:1,6,2,0
chrX	48123139	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=135,167;MMQ=60,52;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:3,0,2,1
chrX	48123271	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=87,87;MMQ=60,29;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.334:25:9,0:7,8:7,10,0,8
chrX	48161114	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:5,4,3,1
chrX	48161281	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chrX	48163148	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=242,110;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:3,3,2,4
chrX	48164138	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chrX	48206911	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=71,256;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:7,1:31,3:31,9,2,2
chrX	48208935	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=176,249;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,2:5,3:3,7,4,1
chrX	48213511	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=133,66;MMQ=60,52;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:3,2:6,0:3,6,0,2
chrX	48318024	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:10,6:4,0:7,7,6,0
chrX	48324567	.	TCACTCCG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=198,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,0:2,1:0,5,0,1
chrX	48382408	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=132,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,3:7,0:7,10,2,1
chrX	48417487	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=211,118;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:3,9:0,0:1,2,9,0
chrX	48433499	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chrX	48433529	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,9,4
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chrX	48542432	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,35;MFRL=180,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.407:3:1,0:1,1:0|1:48542428_T_TCC:48542428:0,2,0,1
chrX	48542438	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,34;MFRL=180,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48542428_T_TCC:48542428:0,2,0,1
chrX	48542441	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=180,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48542428_T_TCC:48542428:0,2,0,1
chrX	48542445	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=180,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48542428_T_TCC:48542428:0,2,0,1
chrX	48542450	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=35,27;MFRL=180,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48542428_T_TCC:48542428:0,2,0,1
chrX	48558638	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=202,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0|1:48558638_C_T:48558638:5,8,1,1
chrX	48558643	.	C	CAACCTAACGAAGAAGAG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=190,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:0|1:48558638_C_T:48558638:6,7,1,1
chrX	48649426	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:48649426_A_AG:48649426:0,0,2,0
chrX	48649449	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:48649426_A_AG:48649426:0,0,2,0
chrX	48649456	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:48649426_A_AG:48649426:0,0,2,0
chrX	48673824	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=143,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,0:7,3:7,11,2,1
chrX	48675940	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=180,97;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chrX	48675946	.	G	GGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.479:2:0,1:1,0:0|1:48675946_G_GGA:48675946:0,1,0,1
chrX	48675948	.	C	CTGAAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.479:2:0,1:1,0:0|1:48675946_G_GGA:48675946:0,1,0,1
chrX	48675950	.	C	CCTAACACAGTCTTTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:0,1:1,0:0|1:48675946_G_GGA:48675946:0,1,0,1
chrX	48676611	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=183,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,0:1,1:2,2,4,0
chrX	48855719	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=142,73;MMQ=60,48;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.363:25:10,7:6,1:9,7,2,7
chrX	48887992	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,228;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:7,5,2,0
chrX	48898183	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chrX	48970697	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=247,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:3,3,3,3
chrX	48974081	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,30;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:8,5,1,1
chrX	49022311	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chrX	49022700	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,6:0,0,7,8
chrX	49065069	.	G	GTCTTTAACATTCATAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=151,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:7,0:3,7,1,1
chrX	49068003	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=189,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,0:6,8:1,9,0,8
chrX	49075777	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=212,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:4,2,4,1
chrX	49083004	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=203,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:7,0:1,2:4,4,2,0
chrX	49088142	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=228,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:5,4,1,1
chrX	49104815	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=247,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.725:8:1,3:0,3:2,0,6,0
chrX	49105610	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=271,223;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:1,2:1,1,4,1
chrX	49105746	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=204,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:49105746_G_T:49105746:0,2,0,1
chrX	49105748	.	G	GCTCCTGGCTCTGTTTTTTATCCTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=204,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:49105746_G_T:49105746:0,2,0,1
chrX	49126494	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=259,260;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chrX	49143395	.	C	CCACACCCTCAGT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=186,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:3,3,1,1
chrX	49646112	.	CTAAGGCCAGTAT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=150,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:10,2:10,0:16,10,1,1
chrX	49646968	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=18,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:2,1:2,3:0,9,2,3
chrX	49647042	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.258:28:10,6:11,0:11,10,0,7
chrX	49767904	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chrX	49853539	.	TAG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=118,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,2:4,1:5,7,0,3
chrX	49956994	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:2,6,0,2
chrX	49958918	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,196;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,0:5,7:5,6,0,7
chrX	49962075	.	CC	TT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chrX	50053897	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=197,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,2:2,0:3,7,2,0
chrX	50089789	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,113;MMQ=60,55;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:3,5,0,2
chrX	50118957	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chrX	50121146	.	A	AG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=61.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,9:0,0,6,13
chrX	50122932	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
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chrX	53114327	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=192,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:4,1,1,1
chrX	53115325	.	GTGA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGA;STR;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:13,0:3,3:11,7,2,1
chrX	53224001	.	C	CCCAGCAAAAACACACCACTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=234,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,1,0
chrX	53226311	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chrX	53226977	.	GG	AA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=226,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:3,4,1,1
chrX	53228148	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,8:0,0,16,9
chrX	53244004	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=178,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,0:7,2:10,9,1,1
chrX	53263664	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:3,4,1,1
chrX	53267346	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=137,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:4,4,1,1
chrX	53267360	.	C	CCTAATCTACCTCTAGATT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=123,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,2:4,0:5,3,1,1
chrX	53271091	.	C	CCCAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=179,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:53271091_C_CCCAG:53271091:2,2,0,1
chrX	53271094	.	A	AAAAGAATGTTGATTTAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=179,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:53271091_C_CCCAG:53271091:2,2,0,1
chrX	53271147	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chrX	53280421	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chrX	53283676	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=270,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chrX	53285022	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,0:9,2:9,5,0,2
chrX	53421740	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=144,60;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:5,2,3,0
chrX	53430649	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=175,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:6,0:5,2:6,5,2,0
chrX	53430718	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:2,12,0,3
chrX	53432410	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=233,120;MMQ=60,29;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chrX	53436232	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chrX	53455485	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=260,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.121:23:13,1:6,1:18,3,0,2
chrX	53561255	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=245,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chrX	53579930	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=212,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:53579930_G_A:53579930:0,3,0,1
chrX	53579936	.	T	TGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=212,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:53579930_G_A:53579930:0,3,0,1
chrX	53583163	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=112,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:8,0:7,5:8,7,2,3
chrX	53600652	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,267;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:1,2:5,2:5,1,3,2
chrX	53607754	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chrX	53616538	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=143,38;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:6,5,2,0
chrX	53622078	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chrX	53630516	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chrX	53631779	.	GG	CC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=205,44;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:53631779_GG_CC:53631779:3,5,1,1
chrX	53631787	.	TGACAGTGTCTGAA	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=182,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:0|1:53631779_GG_CC:53631779:3,6,1,1
chrX	53631804	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=205,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:53631779_GG_CC:53631779:2,6,1,1
chrX	53651692	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=214,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chrX	53652852	.	T	TGCCGGG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCCGGG;STR;TLOD=66.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,5:0,8:0,0,10,6
chrX	53658462	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=211,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:4,4,2,0
chrX	54011404	.	TCTC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=197,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTC;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:6,1:5,1:8,3,1,1
chrX	54021550	.	T	TGCTACTCCTCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=147,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,2:7,0:7,6,1,1
chrX	54042954	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,15;MFRL=0,212;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,1,0
chrX	54107692	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chrX	54114384	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:7,2:4,0:0,11,2,0
chrX	54117740	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,12:0,3:0,0,5,10
chrX	54161859	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chrX	54184101	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=170,62;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,3:7,1:7,4,0,4
chrX	54209302	.	G	GGGCGGC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=GGC;STR;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:4,2:3,2:2,5,1,3
chrX	54276581	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:5,0:1,11:2,4,0,11
chrX	54467121	.	A	T	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=193,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,4:0.069:70:27,0:38,4:60,6,4,0
chrX	54471045	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=108,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0|1:54471045_GT_G:54471045:0,3,0,2
chrX	54471050	.	TTTTTTGAGGA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=159,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:54471045_GT_G:54471045:0,4,0,1
chrX	54475347	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:9,0:5,9,0,2
chrX	54482964	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=185,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,2:6,1:7,6,0,3
chrX	54585146	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,101;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.239:15:6,0:5,3:2,10,0,3
chrX	54781530	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=221,102;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:4,3:1,7:2,3,4,6
chrX	54800637	.	CAAAAA	C,CAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32,25;MFRL=207,97,171;MMQ=60,60,60;MPOS=24,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.70,3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,2:0.302,0.233:11:3,2,1:2,1,0:4,2,0,5
chrX	54815101	.	TC	GG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,19;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:0,1:2,5,0,2
chrX	54836229	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=160,72;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:8,3:12,0:8,12,2,1
chrX	54840013	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.569:12:2,5:3,2:1,4,1,6
chrX	54949710	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,16:0.369:44:5,15:23,0:19,9,16,0
chrX	54961261	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,15;MFRL=211,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:54961261_TC_AA:54961261:1,0,1,0
chrX	54961264	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=20,15;MFRL=211,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:54961261_TC_AA:54961261:1,0,1,0
chrX	54961276	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chrX	55028691	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=199,122;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,2:6,7:5,7,6,3
chrX	55028782	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.274:19:6,0:8,4:8,6,2,3
chrX	55046660	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=184,112;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,5:2,0:2,2,5,0
chrX	55047413	.	CTTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=238,267;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.275:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chrX	55117850	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=186,212;MMQ=27,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:5,5,0,2
chrX	55172521	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=15;MBQ=35,29;MFRL=173,269;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.146:26:10,3:10,0:22,1,3,0
chrX	55172537	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=15;MBQ=30,30;MFRL=282,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=92.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,28:0.853:32:3,12:1,15:4,0,24,4
chrX	55172572	.	G	A	.	.	DP=145;ECNT=15;MBQ=32,30;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,13:0.220:61:19,8:23,5:35,13,10,3
chrX	55172586	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=15;MBQ=32,32;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,7:0.125:62:24,5:30,2:33,22,6,1
chrX	55172606	.	G	A	.	.	DP=76;ECNT=15;MBQ=32,28;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,19:0.277:70:25,10:25,9:26,25,12,7
chrX	55172630	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=15;MBQ=32,27;MFRL=136,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,20:0.295:69:25,11:24,9:22,27,10,10
chrX	55172645	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=15;MBQ=30,28;MFRL=168,121;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=185.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,58:0.776:74:7,29:9,26:7,9,23,35
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chrX	55172680	.	G	C	.	.	DP=65;ECNT=15;MBQ=33,28;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=62.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,18:0.292:63:21,12:23,6:0|1:55172680_G_C:55172680:23,22,7,11
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chrX	55172687	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=15;MBQ=30,33;MFRL=157,198;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,29:0.511:57:14,14:14,15:13,15,14,15
chrX	55172688	.	TG	T	.	.	DP=61;ECNT=15;MBQ=29,29;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,17:0.286:61:18,11:23,6:0|1:55172680_G_C:55172680:20,24,7,10
chrX	55172708	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=15;MBQ=29,32;MFRL=185,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=110.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,30:0.739:40:4,16:6,14:4,6,13,17
chrX	55172716	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=15;MBQ=32,28;MFRL=191,12975;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.200:38:17,4:11,3:10,21,5,2
chrX	55185568	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=158,54;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.274:27:8,6:11,1:10,10,6,1
chrX	55185656	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=169,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,8:0.167:52:28,3:16,5:0|1:55185656_C_A:55185656:19,25,4,4
chrX	55185661	.	C	CCGTACAGGGCAG	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=184,95;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,8:0.178:49:22,2:14,4:0|1:55185656_C_A:55185656:16,25,4,4
chrX	55246965	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chrX	55248320	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,97;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:2,3:1,5,2,1
chrX	55248376	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chrX	55249049	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=216,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:1,3,4,3
chrX	55286887	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=222,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chrX	55287031	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=120,268;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,2:6,0:11,6,0,2
chrX	55289593	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,345;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chrX	55478800	.	CAGG	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=183,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:0|1:55478800_CAGG_C:55478800:7,5,1,1
chrX	55478810	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=194,45;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,2:8,0:0|1:55478800_CAGG_C:55478800:7,6,1,1
chrX	55515394	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=188,175;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,4:7,0:8,4,4,0
chrX	55651001	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chrX	55651558	.	T	TAAGCCCACG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=139,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.278:12:4,2:5,0:4,5,2,1
chrX	55757744	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chrX	55757894	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:7,6,1,1
chrX	55782432	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chrX	56291516	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=258,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chrX	57146347	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=137,55;MMQ=27,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,4:8,0:8,9,4,0
chrX	57163322	.	C	CGCCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=216,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:57163322_C_CGCCA:57163322:5,4,1,1
chrX	57163323	.	T	TCATCAC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=216,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:57163322_C_CGCCA:57163322:5,4,1,1
chrX	57318907	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=228,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:6,3,2,0
chrX	57405045	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=196,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,5:4,1:5,1,3,3
chrX	57474943	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chrX	57515140	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=181,267;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:5,1,2,0
chrX	57515439	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=226,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,4:0,5:0,1,0,9
chrX	57937254	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:2,2:7,0:0,9,0,2
chrX	63409996	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=184,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,0:9,2:12,8,0,2
chrX	63490824	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,111;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,0:7,3:9,4,0,3
chrX	63570024	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chrX	64719744	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=199,64;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:8,0:0,2:4,4,2,0
chrX	64722301	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=157,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,0:8,2:6,6,1,1
chrX	64744430	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=174,63;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:13,9,1,1
chrX	64744550	.	GT	AC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=174,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:9,0:3,2:0|1:64744550_GT_AC:64744550:4,8,1,1
chrX	64744560	.	T	TATC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=175,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:1,2:0|1:64744550_GT_AC:64744550:3,8,1,1
chrX	64744562	.	T	TTTTGATTGTA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=187,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:1,2:0|1:64744550_GT_AC:64744550:2,6,1,1
chrX	64752337	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:2,1,0,2
chrX	64753438	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=94,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:2,2,2,0
chrX	64947600	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=171,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chrX	65253683	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=197,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,3:3,4:2,2,2,5
chrX	65259907	.	GGCC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=208,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCC;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chrX	65392388	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=181,53;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:65392388_C_T:65392388:2,11,1,1
chrX	65392409	.	C	CTTA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=142,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0|1:65392388_C_T:65392388:1,9,1,1
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chrX	69504073	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=216,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,3:4,0,5,1
chrX	69504078	.	TT	CG,GT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,34,29;MFRL=179,216,197;MMQ=60,60,60;MPOS=13,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.41,9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,5:0.230,0.463:10:2,2,2:1,0,3:3,0,6,1
chrX	69504153	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=110,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:9,3:4,0:5,9,0,3
chrX	69508447	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=243,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chrX	69561780	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=162,202;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:4,2:4,2:3,5,2,2
chrX	69561808	.	CAA	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=187,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:69561808_CAA_C:69561808:3,5,1,1
chrX	69561811	.	T	TGTGTGG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=187,57;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,2:6,0:0|1:69561808_CAA_C:69561808:3,5,1,1
chrX	69572603	.	ATCC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCC;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chrX	69573639	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:11,3:5,0:6,10,2,1
chrX	69595909	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.941:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chrX	69622371	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=158,50;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:8,2:9,2:14,3,4,0
chrX	69623899	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=168,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:0|1:69623899_G_C:69623899:7,12,1,1
chrX	69623907	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=168,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:9,0:0|1:69623899_G_C:69623899:4,11,1,1
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chrX	69669243	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=177,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:69669243_G_T:69669243:5,3,1,1
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chrX	70093038	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=229,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
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chrX	70330580	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=187,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.587:10:4,1:0,5:1,3,3,3
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chrX	70339498	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=178,257;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:2,3,2,2
chrX	70340738	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=188,263;MMQ=60,44;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chrX	70341169	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,2:2,5:4,1,5,2
chrX	70342820	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=198,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,3:3,0:2,2,0,3
chrX	70343621	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chrX	70343955	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=186,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,7:4,0:8,2,8,0
chrX	70344331	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chrX	70344747	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=171,256;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:2,3,0,3
chrX	70344763	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=174,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,1:1,3:2,1,0,4
chrX	70345437	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=222,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:3,3,2,0
chrX	70345683	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=218,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,0:1,2,1,3
chrX	70349818	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,15;MFRL=191,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,0:0|1:70349818_A_C:70349818:0,5,2,0
chrX	70349821	.	C	CCCGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=191,215;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:2,0:2,2:0|1:70349818_A_C:70349818:0,5,2,0
chrX	70352417	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=94,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:4,2,0,3
chrX	70356642	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=223,245;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chrX	70356895	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=210,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,0:3,4:6,5,0,4
chrX	70357892	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	70361145	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=104,71;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.426:19:5,0:5,7:4,7,7,1
chrX	70368779	.	GGA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GA;STR;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:2,2:5,1:0,9,0,3
chrX	70445407	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chrX	70460979	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=235,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:70460979_G_A:70460979:1,2,0,1
chrX	70460983	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=235,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:70460979_G_A:70460979:1,2,0,1
chrX	70460986	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=323,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:0,0:1,1:1,0,0,2
chrX	70469268	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,72;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.354:15:4,5:6,0:7,3,4,1
chrX	70510577	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=121,45;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,2:0.055:52:25,1:23,1:0|1:70510577_G_A:70510577:26,24,0,2
chrX	70510583	.	A	ATGG	.	.	DP=53;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=121,45;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.055:53:23,1:24,1:0|1:70510577_G_A:70510577:27,24,0,2
chrX	70510586	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=6;MBQ=35,26;MFRL=121,45;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,2:0.054:54:26,1:24,1:0|1:70510577_G_A:70510577:27,25,0,2
chrX	70510589	.	GC	AA	.	.	DP=55;ECNT=6;MBQ=36,26;MFRL=121,45;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.053:55:26,1:24,1:0|1:70510577_G_A:70510577:28,25,0,2
chrX	70510594	.	C	T,CAAAATT	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=29,30,33;MFRL=135,263,45;MMQ=60,60,60;MPOS=6,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.51,4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,2,2:0.131,0.070:20:7,2,1:9,0,1:7,9,1,3
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chrX	70516825	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,19;MFRL=163,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:5,0:0|1:70516825_G_A:70516825:8,3,1,1
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chrX	72433418	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=250,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:72433416_T_G:72433416:3,6,1,1
chrX	72433663	.	GTCC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=190,322;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TCC;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,2,0
chrX	72783208	.	TCGTCGC	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=164,80;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,0:6,2:12,9,1,1
chrX	72783499	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=18,12;MFRL=166,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.469:14:1,0:2,0:2,5,0,7
chrX	73749319	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chrX	73812917	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=203,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,3:6,0:3,5,0,3
chrX	74375871	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chrX	74494356	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:0|1:74494356_C_T:74494356:6,2,2,0
chrX	74494358	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:74494356_C_T:74494356:6,2,2,0
chrX	74494470	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,10:0,12:0,0,12,12
chrX	74494483	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,9:0,0,8,12
chrX	74523367	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,3,13
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chrX	76891628	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=208,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:76891628_A_C:76891628:0,4,0,1
chrX	76891631	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=208,260;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:76891628_A_C:76891628:0,4,0,1
chrX	76907781	.	TTCC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCC;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,1:2,1:1,6,0,2
chrX	76909558	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=196,51;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:9,4,2,0
chrX	76931741	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=196,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:9,3,1,1
chrX	77154957	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=203,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chrX	77254279	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.706:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	77264624	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=153,16178914;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,2:8,0:11,9,0,2
chrX	77286830	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chrX	77296047	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chrX	77369604	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=147,56;MMQ=60,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:10,0:7,3:7,10,1,2
chrX	78216053	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,1:3,1:5,4,0,2
chrX	78216530	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=172,38;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,1:5,0:0|1:78216530_A_T:78216530:6,3,1,1
chrX	78216533	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=172,38;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:0|1:78216530_A_T:78216530:6,3,1,1
chrX	78217399	.	TAA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:1,4,0,2
chrX	78426471	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=132,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,3:3,2:6,3,5,0
chrX	78426488	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=147,268;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,2:3,3:6,3,5,0
chrX	78426828	.	CTTGGTCTGCATCAGT	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=164,317;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:7,0:9,10,2,0
chrX	78426866	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=159,317;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,2:7,0:5,7,2,0
chrX	78617053	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=203,313;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chrX	78617999	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=119,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chrX	78618050	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=119,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,2:6,2:9,5,2,2
chrX	79698743	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=45.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:3,8:4,9:4,3,0,18
chrX	79932684	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=214,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:5,4,0,2
chrX	79937622	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=175,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.264:12:4,2:5,1:2,7,0,3
chrX	79942599	.	GTATA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=TA;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.701:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	79943569	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chrX	79947488	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=212,20905102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.208:12:4,0:4,0:7,3,0,2
chrX	79947504	.	T	TCCA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=200,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:6,3,0,2
chrX	79955472	.	T	TATACC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=166,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:1,2:5,0:2,5,1,1
chrX	79999796	.	T	TCAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=246,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	80064910	.	A	AC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.789:17:1,7:2,7:0,3,6,8
chrX	80373885	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:7,0,2,0
chrX	80534017	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	83124802	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chrX	83372478	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=161,104;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,0:5,6:2,8,0,6
chrX	83403148	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:8,0:2,4:1,10,0,4
chrX	83403178	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=144,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,6:2,1:0,3,0,7
chrX	83591825	.	A	ATC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=172,186;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,2:8,0:8,6,2,0
chrX	84363140	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=109,247;MMQ=49,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:6,3:1,6:0|1:84363140_A_G:84363140:5,2,4,5
chrX	84363145	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=199,109;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,2:0.165:16:7,2:7,0:1|0:84363140_A_G:84363140:7,7,2,0
chrX	84534383	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chrX	84560852	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=218,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:2,0:6,2:4,4,0,2
chrX	84563135	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,11,8
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chrX	85302610	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.349:29:11,0:8,9:6,13,0,10
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chrX	85906213	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=188,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:2,5,0,2
chrX	86071151	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=140,270;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:2,5,2,0
chrX	86869103	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=195,247;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,4:0,0:0,4,0,4
chrX	86869348	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=265,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chrX	86872866	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=178,329;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chrX	89177024	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=198,110;MMQ=27,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chrX	90692850	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:5,1:3,3:2,6,2,2
chrX	91137997	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,247;MMQ=40,34;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,2,2
chrX	91518011	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chrX	91873742	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,171;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=40.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:5,14:10,0:6,9,14,0
chrX	95990883	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=143,252;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chrX	96013128	.	CC	TT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=128,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:7,4,1,1
chrX	96167339	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=174,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,0:5,2:4,11,0,2
chrX	96171416	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=91,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.658:7:0,5:1,0:1,1,5,0
chrX	96197043	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:96197043_A_T:96197043:3,4,1,1
chrX	96197045	.	T	TATA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:96197043_A_T:96197043:3,4,1,1
chrX	96197046	.	G	GGTAC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:5,0:0|1:96197043_A_T:96197043:3,4,1,1
chrX	96197175	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chrX	96213213	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=231,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chrX	96502650	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=164,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chrX	96684809	.	CAAAA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,8;RU=A;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chrX	99840419	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=220,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chrX	99849017	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=97,221;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,1:6,3:5,7,2,2
chrX	99849051	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=165,230;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chrX	99887402	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.255:13:3,1:5,2:6,4,3,0
chrX	99905789	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,234;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:9,6:8,0:9,8,6,0
chrX	99919733	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chrX	99924443	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,36;MFRL=144,272;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chrX	99936147	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chrX	99941705	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chrX	99941713	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=201,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,2:6,1:8,2,2,1
chrX	99941980	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chrX	99943436	.	T	TTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=194,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:0,2:5,0:0,5,1,1
chrX	100075741	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0|1:100075741_T_G:100075741:0,0,1,7
chrX	100075747	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:100075741_T_G:100075741:0,0,1,7
chrX	100077193	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chrX	100093206	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.251:17:7,1:6,3:4,9,4,0
chrX	100098355	.	TAAG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,15:0,4:0,0,11,8
chrX	100103703	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=322,0;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100103703_A_C:100103703:1,0,0,1
chrX	100103705	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,22;MFRL=322,0;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100103703_A_C:100103703:1,0,0,1
chrX	100105008	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chrX	100105418	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0,1,1,6
chrX	100242305	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	100245606	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,5,9
chrX	100274462	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=252,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chrX	100293078	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chrX	100349485	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=254,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chrX	100357194	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:100357194_C_G:100357194:1,0,2,0
chrX	100357201	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:1,3:0,0:0|1:100357194_C_G:100357194:1,0,2,1
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chrX	100533958	.	GAAGTTATATTATGATTGCTCTACCTCAGTAAAGCTGCTTTTTTCCATTTCTTTGACATCAGGGACCTATGAAATAAAACACAATAAAC	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=162,64;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.100:27:11,0:4,2:11,14,1,1
chrX	100533982	.	CTCAGTAAAGCTGCTTTTTTCCATTTCTTTGACATCAGGGACCTATGAAATAAAACACAATAAACAAGTTATATTATGATACCTATATT	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.201:37:5,9:6,3:9,13,7,8
chrX	100604757	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=241,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
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chrX	100609064	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,34;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100609059_TC_T:100609059:0,0,0,1
chrX	100609547	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
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chrX	100617172	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,0:6,3:6,5,0,3
chrX	100666907	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=209,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:3,2:3,2:6,1,4,0
chrX	100666921	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=169,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.374:13:4,0:2,1:4,4,5,0
chrX	100668508	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=194,123;MMQ=60,44;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.416:34:13,14:7,0:10,10,14,0
chrX	100807909	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=134,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,3:3,5:5,3,4,4
chrX	100809673	.	G	GAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=105,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.186:25:8,2:5,1:11,10,3,1
chrX	100912568	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=208,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:11,1:4,1:6,9,1,1
chrX	100912776	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=234,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:0,4,0,3
chrX	101139885	.	C	CTGTTATTAATGAGGCAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=183,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	101141776	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chrX	101153103	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=138,136;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,9:5,2:3,5,11,0
chrX	101382237	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:7,10:7,0:7,7,10,0
chrX	101409254	.	GTT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:1,0:1,2:0,3,0,3
chrX	101573362	.	TCACCA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,229;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CACCA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	101615550	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,122;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:14,3:14,0:15,14,0,3
chrX	101623586	.	ATGGTGG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=199,189;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=TGG;STR;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.689:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chrX	101769995	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,130;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,0:11,2:12,7,0,2
chrX	101912752	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=171,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:4,6,2,0
chrX	101913597	.	TAAA	T,TAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,27,28;MFRL=150,198,118;MMQ=60,60,60;MPOS=22,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=A;STR;TLOD=5.09,6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,4:0.148,0.264:16:4,1,3:5,1,1:7,3,4,2
chrX	102006877	.	ATT	A,AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28,28;MFRL=327,184,186;MMQ=60,60,60;MPOS=20,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,18,19;RU=T;STR;TLOD=13.41,5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,9,5:0.516,0.328:16:1,2,1:1,5,3:1,1,5,9
chrX	102334556	.	T	TGGCTGGGTGTGGTGGCTCAGGCC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=164,260;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:8,0:4,2:4,8,0,2
chrX	102339606	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=241,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,5,0
chrX	102471969	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:13,0:7,3:11,9,3,0
chrX	102757176	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=209,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.306:8:0,1:6,1:3,3,2,0
chrX	102841146	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=191,124;MMQ=60,22;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.347:18:6,6:6,0:8,4,6,0
chrX	102962181	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	102968562	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=109,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:8,2:0|1:102968562_A_T:102968562:12,7,1,1
chrX	102968570	.	A	ATAAATT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=116,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:0|1:102968562_A_T:102968562:12,8,1,1
chrX	102978965	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=223,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:2,6,1,3
chrX	103080479	.	C	CAAATTTAGAGTTAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=201,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:6,0:7,5,1,1
chrX	103219004	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=266,162;MMQ=55,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chrX	103267152	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=190,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chrX	103295320	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=165,242;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chrX	103295543	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=186,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chrX	103359849	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=188,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:8,7:6,0:9,5,4,3
chrX	103360472	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=133,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:10,2:0|1:103360472_A_T:103360472:8,7,1,1
chrX	103360475	.	T	TTTTTAACTTTTCCATAGTGAACCTGC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=133,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:10,2:0|1:103360472_A_T:103360472:8,7,1,1
chrX	103430754	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,84;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,3:5,0:6,8,3,0
chrX	103495663	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	104464276	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0|1:104464276_CA_C:104464276:0,0,6,1
chrX	104464281	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:104464276_CA_C:104464276:0,0,6,1
chrX	105153001	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0,0,8,10
chrX	105179132	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=270,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chrX	105189958	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=153,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:8,0:1,4:2,7,0,4
chrX	105882931	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=142,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:105882931_G_C:105882931:4,10,0,2
chrX	105882933	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=142,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:7,2:0|1:105882931_G_C:105882931:4,10,0,2
chrX	106045910	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,6:4,3:4,3,9,0
chrX	106062043	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:4,3:1,3:0,5,0,6
chrX	106092542	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=121,132;MMQ=36,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:4,6:9,0:2,11,0,6
chrX	106144239	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=236,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chrX	106242970	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=222,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,4:6,0:6,2,4,0
chrX	106462267	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	106516786	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,2:7,2:7,3,1,3
chrX	106516824	.	AA	GG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=164,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:0|1:106516824_AA_GG:106516824:9,3,1,1
chrX	106516829	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=168,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,1:4,0:0|1:106516824_AA_GG:106516824:8,3,1,1
chrX	106516845	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,1:3,2:6,5,0,3
chrX	107159224	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=144,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:6,2:0|1:107159224_T_C:107159224:7,2,1,1
chrX	107159230	.	AG	TT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=145,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:0|1:107159224_T_C:107159224:6,2,1,1
chrX	107159234	.	T	TTCTTAATTGC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=145,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:0|1:107159224_T_C:107159224:6,2,1,1
chrX	107301359	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.235:19:4,2:11,2:9,6,2,2
chrX	107320589	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=173,87;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,6:8,0:2,10,0,6
chrX	107328436	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:0,3:3,6:0,3,0,9
chrX	107330842	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=200,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:2,2,3,1
chrX	107331894	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,5:0,6:1,0,9,2
chrX	107332133	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chrX	107393330	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=220,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chrX	107395023	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=140,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,1:6,1:4,3,1,1
chrX	107396365	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,2,5
chrX	107402926	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=188,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:7,6,2,0
chrX	107415825	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chrX	107417597	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=118,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:107417597_G_T:107417597:1,0,1,0
chrX	107417606	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:107417597_G_T:107417597:1,0,2,0
chrX	107418281	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=144,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,5,1
chrX	107423674	.	TACAC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=AC;STR;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.905:7:0,4:0,2:0,0,5,2
chrX	107430579	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chrX	107437848	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,5,3
chrX	107455014	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chrX	107463090	.	CCCATATTGTATT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chrX	107464558	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,4956579;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:2,1:12,1:6,8,1,1
chrX	107683501	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=183,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:2,1:0,2,0,2
chrX	107827760	.	GTT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=169,201;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,1:2,1:1,3,0,2
chrX	107918007	.	CT	C,CTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=15,19,19;MFRL=165,250,176;MMQ=60,60,60;MPOS=7,23;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,19;RU=T;STR;TLOD=5.16,5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.405,0.404:7:0,1,0:0,0,0:0,1,0,6
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chrX	108902549	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=248,240;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chrX	108904729	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,6,2
chrX	108917757	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chrX	108917773	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chrX	109387928	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=217,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chrX	109416688	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=278,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:0,1:4,3:0,8,0,4
chrX	109507669	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=205,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chrX	109931799	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=152,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:3,2,0,5
chrX	110389738	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:3,9,1,1
chrX	110406186	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=156,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.297:14:4,1:6,2:6,4,1,3
chrX	110435484	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=170,272;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:5,1:1,2:0,6,0,3
chrX	110555928	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.233:17:7,0:6,2:8,5,0,4
chrX	110653686	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=290,239;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chrX	110952106	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chrX	111090627	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=181,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:1,7,0,2
chrX	111698613	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=196,131;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:3,2,2,1
chrX	111699344	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=261,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:1,1,2,2
chrX	111914244	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=228,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:3,1,4,3
chrX	112022297	.	C	CAGG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=245,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGG;STR;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:1,5,4,1
chrX	113887186	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=184,45;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:8,5:8,0:8,8,5,0
chrX	113961410	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=238,109;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:4,5:0,3:0,4,2,6
chrX	113961424	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=112,244;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chrX	114082535	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=197,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,1:0,4:2,0,4,1
chrX	114141474	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=201,107;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,4:11,0:11,9,4,0
chrX	114238535	.	GTATTCAACATTCGCAAGAAAAATTCAGTTTATTGAGACTCA	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=59.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.558:34:4,0:3,18:9,6,19,0
chrX	114239897	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=198,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:3,2:4,5:2,5,2,5
chrX	114400164	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.273:31:6,8:17,0:17,6,8,0
chrX	114400318	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chrX	114424438	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=240,81;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:2,3,1,2
chrX	114425181	.	A	AGAGGCCGCTCGCCCAACGCCCACAGCG	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=62.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,2:0,0,6,12
chrX	114425238	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=270,133;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:1,3,2,6
chrX	114426124	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=167,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,0:7,2:3,5,0,2
chrX	114426144	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=158,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:0,0:8,2:2,6,2,0
chrX	114426171	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chrX	114538073	.	A	AAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=184,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:114538073_A_AAT:114538073:0,2,1,1
chrX	114538074	.	G	GCAACATGTTTTTCTCCAAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=184,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:114538073_A_AAT:114538073:0,2,1,1
chrX	114871127	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.816:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	114880423	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=155,286;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:5,0:11,2:8,9,2,0
chrX	114882091	.	G	GAATAAACAC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=182,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.319:4:2,1:1,0:0|1:114882091_G_GAATAAACAC:114882091:2,1,0,1
chrX	114882093	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=182,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:114882091_G_GAATAAACAC:114882091:2,1,0,1
chrX	115303915	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=134,105;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:12,0:10,4:8,14,0,4
chrX	115306244	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=205,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,5:4,0:2,4,1,4
chrX	115573812	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=140,253;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,0:4,3:8,0,3,0
chrX	115575989	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,4:0,0:2,0,4,0
chrX	115586325	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chrX	117035914	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,0:7,3:1,12,0,3
chrX	117520365	.	AAT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=160,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:9,2:7,2:7,9,1,3
chrX	117530912	.	GT	G,GTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33,30;MFRL=169,163,167;MMQ=60,60,60;MPOS=23,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=10.20,4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,3:0.344,0.214:16:3,2,1:3,4,1:5,2,9,0
chrX	117677642	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=144,231;MMQ=54,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chrX	117680173	.	C	CAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=21,24;RU=A;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.696:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chrX	117700141	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,3:8,0:6,7,1,2
chrX	117718669	.	TT	AA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=183,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,1,2
chrX	117733003	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=211,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=44.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,14:2,0:5,0,14,0
chrX	117742356	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=189,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:1,2:8,0:2,7,0,2
chrX	117775148	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:7,0:8,5:6,9,0,5
chrX	117805106	.	G	GTGTGTGTATTGTTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=154,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:5,8,1,1
chrX	117810737	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=256,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:2,1,3,2
chrX	117817266	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=265,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chrX	117874898	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chrX	117900793	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=141,104;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,8:4,0:6,4,8,0
chrX	117910519	.	T	TGAGACAAAGTCTCGCTC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=174,64;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:4,0:2,6,1,1
chrX	117960969	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=154,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:4,3:3,3,0,3
chrX	118147094	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.425:31:5,13:13,0:14,4,13,0
chrX	118147233	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=223,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chrX	118215229	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29,29;MFRL=0,381,378;MMQ=60,60,40;MPOS=5,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=23,20,22;RU=A;STR;TLOD=3.27,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.506,0.342:3:0,2,1:0,0,0:0,0,3,0
chrX	118215254	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,16;MFRL=0,382;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,0:2,2,2,0
chrX	118219404	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=180,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:118219404_T_TG:118219404:6,2,1,1
chrX	118219407	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=180,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:118219404_T_TG:118219404:6,2,1,1
chrX	118281635	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,360;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chrX	118284579	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chrX	118284610	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chrX	118603773	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,165;MMQ=60,36;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,1:3,4:3,6,1,4
chrX	118604367	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=31,26;MFRL=161,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:8,3:12,2:11,9,2,3
chrX	118604399	.	CT	GG	.	.	DP=41;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=152,64;MMQ=60,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,7:0.186:41:16,6:17,0:0|1:118604399_CT_GG:118604399:21,13,3,4
chrX	118604409	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=9;MBQ=30,29;MFRL=138,119;MMQ=60,29;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,8:0.205:42:14,7:17,1:0|1:118604399_CT_GG:118604399:20,14,3,5
chrX	118604412	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=143,119;MMQ=60,29;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,8:0.200:43:15,5:16,1:0|1:118604399_CT_GG:118604399:21,14,3,5
chrX	118604416	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=9;MBQ=28,35;MFRL=152,60;MMQ=60,28;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.175:38:16,5:16,1:0|1:118604399_CT_GG:118604399:18,14,3,3
chrX	118604428	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=9;MBQ=28,35;MFRL=149,0;MMQ=60,26;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,5:0.143:40:17,4:15,1:0|1:118604428_T_C:118604428:21,14,2,3
chrX	118604436	.	T	A,C	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=29,29,30;MFRL=324,0,164;MMQ=60,26,60;MPOS=7,15;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=15.33,89.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,29:0.140,0.760:37:2,4,17:1,1,12:2,1,18,16
chrX	118604444	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=9;MBQ=30,33;MFRL=178,119;MMQ=60,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:18,1:13,1:0|1:118604428_T_C:118604428:17,14,1,2
chrX	118604553	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,2:0,0,0,8
chrX	118699320	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,6,11
chrX	118750726	.	GAA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=163,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:118750726_GAA_G:118750726:1,3,0,1
chrX	118750731	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=163,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:118750726_GAA_G:118750726:1,3,0,1
chrX	118754064	.	CAA	C,CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34,23;MFRL=0,0,54;MMQ=60,60,60;MPOS=22,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=9.51,14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,6:0.461,0.474:12:0,4,2:0,2,2:0,0,2,10
chrX	118783881	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:7,0,1,1
chrX	118786793	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=182,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.345:9:2,1:4,1:4,2,2,1
chrX	118787022	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0,7,0,3
chrX	118893390	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=98,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,1:5,2:9,5,1,2
chrX	118893413	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=259,94;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:1,5:2,9:1,3,8,6
chrX	118894222	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chrX	118920809	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=190,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chrX	118925450	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=231,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,15:0.640:23:7,7:1,8:0|1:118925450_A_G:118925450:7,1,12,3
chrX	118925457	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=147,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,3:0.154:24:11,3:10,0:1|0:118925450_A_G:118925450:16,5,3,0
chrX	118925482	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=136,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,4:0.184:25:8,4:9,0:1|0:118925450_A_G:118925450:13,8,3,1
chrX	118974507	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
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chrX	118985598	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=120,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:4,2:1,5,1,1
chrX	118985711	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:0,1:0,0:0,1,1,0
chrX	119387833	.	C	CTGA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=216,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TGA;STR;TLOD=40.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:1,7:3,2:3,1,5,5
chrX	119390643	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.537:15:3,4:2,3:3,4,1,7
chrX	119390665	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=209,149;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:3,3,0,5
chrX	119394904	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=243,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=39.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:1,4:2,8:0,3,1,11
chrX	119425007	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=208,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chrX	119427747	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=150,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chrX	119510144	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	119573169	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=289,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.800:18:1,10:2,5:1,2,4,11
chrX	119590581	.	T	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=132,71;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.171:32:14,5:13,0:15,12,4,1
chrX	119669599	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chrX	119676896	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.435:12:3,3:3,1:2,5,1,4
chrX	119678040	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,80;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.301:18:7,0:5,5:10,3,1,4
chrX	119695296	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=17,22;MFRL=191,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:1,1:1,0:0|1:119695296_TG_T:119695296:2,4,1,1
chrX	119695331	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.667:1:0,0:0,0:1|0:119695296_TG_T:119695296:0,0,1,0
chrX	119708348	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=179,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:11,0,1,1
chrX	120182473	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=192,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,1:12,1:9,9,0,2
chrX	122318386	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,2:0,10:0,0,8,5
chrX	122336600	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=45.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,7,7
chrX	122338205	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=260,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,3:3,4:2,1,4,3
chrX	122528803	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=207,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,6:2,5:3,1,7,4
chrX	122537418	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=232,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,5:2,5:1,1,2,8
chrX	122598909	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=163,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:8,2:0|1:122598909_G_T:122598909:6,7,1,1
chrX	122598914	.	C	CCAGATTTCCATCTGATATCATT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=163,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:4,0:9,2:0|1:122598909_G_T:122598909:6,7,1,1
chrX	122747544	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=165,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,2:7,0:6,12,1,1
chrX	122758529	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=206,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,1,6
chrX	122765750	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=217,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chrX	122805421	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	123183965	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,1,1
chrX	123184949	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=84,136;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.495:4:0,2:1,0:0,2,2,0
chrX	123195593	.	CTTTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=105,246;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=25,20;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:1,0:0,1:1,1,1,0
chrX	123205006	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=168,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:3,0:0|1:123205006_C_A:123205006:8,2,2,0
chrX	123205008	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=168,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:3,0:0|1:123205006_C_A:123205006:10,2,2,0
chrX	123205011	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,17;MFRL=174,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.300:14:6,0:3,0:8,2,4,0
chrX	123205118	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=119,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:9,2:2,0:1,10,0,2
chrX	123499570	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,4:3,0:6,2,4,0
chrX	123538802	.	TAAACAAAC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=144,94;MMQ=60,53;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AAAC;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.510:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chrX	123554726	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=184,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chrX	123556498	.	GA	TC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=222,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:1,0:4,2:0|1:123556498_GA_TC:123556498:2,3,1,1
chrX	123556500	.	A	ACATTCACC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=222,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:123556498_GA_TC:123556498:2,3,1,1
chrX	123587110	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	123654641	.	TAAAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=15,10;MFRL=276,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=A;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chrX	123663825	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=218,54;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:123663825_C_T:123663825:4,5,1,1
chrX	123663834	.	C	CCACACCTCACA	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=237,54;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:123663825_C_T:123663825:3,3,1,1
chrX	123663836	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=34,20;MFRL=232,54;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:123663825_C_T:123663825:3,4,1,1
chrX	123663838	.	A	ATACACC	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=232,54;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,1:0|1:123663825_C_T:123663825:3,4,1,1
chrX	123663872	.	G	GATCCTAGAACTTGTTGTGTTTA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=37,35;MFRL=298,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123663872_G_GATCCTAGAACTTGTTGTGTTTA:123663872:1,0,0,1
chrX	123663876	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,24;MFRL=268,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:123663872_G_GATCCTAGAACTTGTTGTGTTTA:123663872:1,3,0,1
chrX	123663878	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,22;MFRL=268,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:123663872_G_GATCCTAGAACTTGTTGTGTTTA:123663872:1,3,0,1
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chrX	130218475	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=233,253;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:3,3,0,2
chrX	130219723	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=145,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:2,0:9,3:6,5,1,2
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chrX	130419646	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,299;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chrX	131202216	.	ATG	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TG;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:6,0:12,4,1,1
chrX	131203783	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=139,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chrX	131220073	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=248,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chrX	131231257	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,2:1,1:5,1,2,1
chrX	131231433	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=134,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:3,2:0|1:131231433_A_G:131231433:3,7,1,1
chrX	131231441	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=134,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:4,2:0|1:131231433_A_G:131231433:2,8,1,1
chrX	131233588	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=152,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:4,2:4,1:4,4,1,2
chrX	131234733	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=243,255;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:2,3,1,4
chrX	131763015	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=194,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,1:11,1:13,9,0,2
chrX	132351002	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,1:1,0,2,0
chrX	132437448	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=277,179;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:132437448_T_C:132437448:0,2,0,1
chrX	132437454	.	G	GGGTATGCCAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=277,179;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:132437448_T_C:132437448:0,2,0,1
chrX	132437456	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=277,179;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:132437448_T_C:132437448:0,2,0,1
chrX	132437459	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=277,179;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:132437448_T_C:132437448:0,2,0,1
chrX	132458578	.	CAAAA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=246,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chrX	132548738	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=293,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chrX	132888207	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=115,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.539:6:1,2:1,0:1,2,0,3
chrX	133379685	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.395:26:7,0:8,10:6,10,0,10
chrX	133511988	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=216,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:6,0,3,0
chrX	133620474	.	GTT	G,GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30,33;MFRL=151,153,203;MMQ=60,60,60;MPOS=3,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.56,4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,4,3:0.205,0.182:20:5,0,1:5,4,2:11,2,7,0
chrX	133680547	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=211,252;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:8,4,1,1
chrX	133927819	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,0:5,3:8,2,3,0
chrX	134025421	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:0,1:1,0:2,0,1,0
chrX	134025744	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=245,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chrX	134125707	.	AG	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=109,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.126:22:4,2:14,0:0|1:134125707_AG_A:134125707:9,11,1,1
chrX	134125712	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=124,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:3,2:10,0:0|1:134125707_AG_A:134125707:7,11,1,1
chrX	134125747	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=17,17;MFRL=213,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.635:9:1,1:0,2:0,3,1,5
chrX	134125984	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=184,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:9,0:3,2:6,6,1,1
chrX	134156121	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chrX	134185449	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:10,12,2,0
chrX	134427640	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=197,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,1:4,5:5,0,4,2
chrX	134654818	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chrX	134655178	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:3,0:11,2:7,8,2,0
chrX	134680249	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=181,95;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:5,10:10,0:12,3,10,0
chrX	134681065	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=162,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:14,0:6,2:10,10,2,0
chrX	134681216	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=156,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:14,0:6,6:4,18,0,6
chrX	134708007	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=87,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.673:8:1,4:1,0:2,1,0,5
chrX	134713855	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=224,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:1,3,2,3
chrX	134948167	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chrX	134983935	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,209;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chrX	134986768	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=221,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:4,0:3,3:0|1:134986768_A_G:134986768:1,6,1,2
chrX	134986769	.	ATT	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=221,50;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:4,0:3,2:0|1:134986768_A_G:134986768:1,6,1,2
chrX	134986772	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=221,50;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,0:3,3:0|1:134986768_A_G:134986768:1,6,1,2
chrX	134986775	.	CCA	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=221,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,0:1,3:0|1:134986768_A_G:134986768:1,6,1,2
chrX	134986780	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=232,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,0:0,2:0|1:134986768_A_G:134986768:0,3,1,2
chrX	134986781	.	G	GTATGTC	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=232,50;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:0|1:134986768_A_G:134986768:0,3,1,2
chrX	134993589	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chrX	135055694	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,9:0,0,13,2
chrX	135080623	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=57,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.625:11:1,2:3,5:4,0,6,1
chrX	135095664	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=152,253;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.546:4:1,0:0,2:0,2,0,2
chrX	135098958	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=190,158;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,0:5,7:1,9,0,7
chrX	135292022	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,4:0,7:0,0,9,3
chrX	135301822	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:5,4,1,2
chrX	135322440	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chrX	135323452	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,2:0,10:0,0,2,10
chrX	135431287	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=212,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.236:11:8,0:1,2:0|1:135431287_A_C:135431287:3,6,1,1
chrX	135431294	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=218,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:0|1:135431287_A_C:135431287:2,6,1,1
chrX	135485553	.	C	CTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGTTCACGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=250,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	135570712	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chrX	135586632	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=206,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:2,0:0|1:135586632_G_A:135586632:5,6,0,2
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chrX	135618305	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=206,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,5:3,3:3,1,6,2
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chrX	135741339	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=155,78;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,1:11,1:0|1:135741330_G_A:135741330:13,6,0,2
chrX	135754114	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=251,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,4,1
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chrX	135767783	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,13;MFRL=141,287;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.336:4:1,0:1,0:0|1:135767781_AG_A:135767781:2,1,1,0
chrX	135767786	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=15,15;MFRL=141,287;MMQ=60,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.332:4:0,0:1,0:0|1:135767781_AG_A:135767781:2,1,1,0
chrX	135956218	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=192,170;MMQ=50,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chrX	135956462	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=190,134;MMQ=40,31;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,17:0.514:33:7,6:9,10:0|1:135956462_G_C:135956462:11,5,8,9
chrX	135956467	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=180,134;MMQ=40,31;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,17:0.500:34:7,7:9,10:0|1:135956462_G_C:135956462:12,5,8,9
chrX	135957137	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=104,56;MMQ=54,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:0|1:135957137_A_T:135957137:10,0,2,2
chrX	135957161	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=114,104;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,7:0.445:16:7,5:2,2:1|0:135957137_A_T:135957137:8,1,7,0
chrX	135957501	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=127,275;MMQ=52,23;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:7,1,3,1
chrX	135957530	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=123,255;MMQ=56,23;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:8,4,2,0
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chrX	135957672	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=180,74;MMQ=52,43;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.287:18:4,2:9,2:7,6,2,3
chrX	135957690	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=158,74;MMQ=52,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:4,3:7,4:0|1:135957690_A_G:135957690:6,5,2,5
chrX	135957700	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=163,74;MMQ=52,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:4,3:5,3:0|1:135957690_A_G:135957690:4,6,2,5
chrX	135958696	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=160,69;MMQ=52,37;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.191:19:11,0:4,3:0|1:135958696_T_C:135958696:11,5,2,1
chrX	135958704	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=160,69;MMQ=52,37;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:9,0:3,3:0|1:135958696_T_C:135958696:9,5,2,1
chrX	135960119	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=188,85;MMQ=45,24;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:6,4:8,2:6,8,4,2
chrX	135960146	.	G	GAA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=193,85;MMQ=40,24;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.267:24:8,4:10,2:7,11,3,3
chrX	135961585	.	ATG	A,ATTTG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,30,28;MFRL=125,196,166;MMQ=60,60,60;MPOS=24,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.91,3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,2:0.234,0.188:13:2,1,2:5,2,0:5,3,4,1
chrX	135961587	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,13,5
chrX	136113755	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=188,409;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:12,0:10,5:12,10,0,5
chrX	136649661	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.384:19:5,0:6,6:4,8,0,7
chrX	136651224	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=215,55;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:0|1:136651224_G_A:136651224:8,2,1,1
chrX	136651229	.	T	TAC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=230,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:7,2:0|1:136651224_G_A:136651224:8,3,1,1
chrX	136651231	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=235,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:136651224_G_A:136651224:7,3,1,1
chrX	137749997	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chrX	138619436	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,2:9,0:10,7,0,2
chrX	138679532	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=253,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,0:0,4:2,0,4,0
chrX	138697246	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=213,260;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chrX	138711978	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=212,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:3,0:1,11:2,2,0,11
chrX	138724725	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chrX	138733848	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:5,3,6,1
chrX	138811003	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chrX	138825675	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,7,3
chrX	138856955	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=154,88;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:18,0:15,3:20,13,0,3
chrX	138882164	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=189,354;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:138882164_A_C:138882164:1,2,1,0
chrX	138882170	.	A	AGGGGGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=189,354;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,10;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:138882164_A_C:138882164:1,2,1,0
chrX	138882172	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chrX	139006253	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,10:6,0:11,2,10,0
chrX	139866086	.	C	CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=143,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:7,6,0,2
chrX	139866459	.	CGTCTTCCAACAAAGGTAT	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=199,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:1,2:8,5:0|1:139866459_CGTCTTCCAACAAAGGTAT_C:139866459:6,5,5,2
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chrX	139866492	.	GTACGTCTTCCAGAAAA	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=188,131;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,4:0.184:25:2,0:11,2:1|0:139866459_CGTCTTCCAACAAAGGTAT_C:139866459:11,10,2,2
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chrX	144910090	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,119;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,0:7,2:7,5,2,0
chrX	144911336	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:6,0:4,6:3,7,0,7
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chrX	146993599	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=279,237;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.491:6:0,0:3,3:3,0,3,0
chrX	147003404	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=153,312;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:9,1:10,5,1,1
chrX	147003564	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chrX	147015021	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chrX	147019192	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=182,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chrX	147026330	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chrX	147084813	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:9,5,2,0
chrX	147891558	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chrX	147919063	.	CAGTTA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGTTA;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chrX	148037055	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chrX	148048411	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=200,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:148048411_T_A:148048411:6,5,1,1
chrX	148048418	.	C	CCTAGTCCATCTT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=197,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:148048411_T_A:148048411:6,6,1,1
chrX	148055144	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chrX	148060032	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=186,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chrX	148062377	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chrX	148582549	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=276,179;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,2:0,5:2,0,3,4
chrX	148627384	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chrX	148628489	.	CA	AT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=205,189;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0|1:148628489_CA_AT:148628489:4,0,2,0
chrX	148628490	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,6:0.872:6:0,2:0,4:1|0:148628489_CA_AT:148628489:0,0,6,0
chrX	148794953	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chrX	148797197	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=174,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chrX	149637925	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,275;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=TG;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chrX	149887055	.	CCT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:149887055_CCT_C:149887055:0,0,3,0
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chrX	150910976	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=154,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:5,2,1,1
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chrX	150912978	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:4,4,0,2
chrX	151092126	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chrX	151283567	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,6,5
chrX	151283599	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,41;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chrX	151283627	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=225,249;MMQ=51,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:3,1:2,3:3,3,1,3
chrX	151304174	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=183,81;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:2,4,0,2
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chrX	151424488	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=213,414;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chrX	151514195	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chrX	151560868	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chrX	151899760	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chrX	151899789	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,9,6
chrX	151899818	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,8,7
chrX	151900967	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=210,261;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chrX	151904609	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chrX	151908931	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=59.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.535:39:6,20:12,0:7,11,21,0
chrX	151935387	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=191,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:0|1:151935387_C_A:151935387:2,6,0,2
chrX	151935392	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=207,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:151935387_C_A:151935387:3,7,0,2
chrX	151997273	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=206,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chrX	151998340	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=172,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0,3,2,3
chrX	152086580	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=184,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:2,0,4,1
chrX	152113744	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chrX	152128480	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=205,234;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.788:17:0,0:3,13:0,3,0,14
chrX	152225379	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=170,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.795:8:0,4:1,1:0,1,7,0
chrX	152720579	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=185,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:1,7,0,2
chrX	152727446	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=191,222;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chrX	152727535	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=259,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,2:1,4:2,1,3,3
chrX	152728155	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chrX	152770402	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chrX	152773615	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chrX	152807425	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chrX	152807923	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,2:0,10:0,0,4,8
chrX	152821887	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chrX	152825414	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,2,3
chrX	152825433	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chrX	152830322	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chrX	152864432	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=215,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chrX	152864477	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chrX	152864609	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	152909047	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=210,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,0:3,4:1,4,0,4
chrX	152915243	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	152937708	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=315,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chrX	152954003	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=194,216;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:152954003_G_T:152954003:1,0,1,0
chrX	152954025	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0|1:152954003_G_T:152954003:0,0,1,0
chrX	152960116	.	CG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=181,70;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:1,1:3,2,2,0
chrX	152968553	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=253,231;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chrX	153008911	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=221,144;MMQ=52,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:1,11:0,5:0,1,7,10
chrX	153009197	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chrX	153034752	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chrX	153037808	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=147,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chrX	153038516	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chrX	153038661	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,4:5,1:3,6,3,2
chrX	153039615	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chrX	153043109	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=199,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chrX	153043462	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=132,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,0:4,2:6,7,1,1
chrX	153044369	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chrX	153048403	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=209,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,2:2,8:1,2,5,5
chrX	153048647	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=211,357;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:0,2:2,0:0|1:153048647_GT_G:153048647:1,1,1,1
chrX	153048651	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=310,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:153048651_C_T:153048651:1,2,1,0
chrX	153048656	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=248,357;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:153048647_GT_G:153048647:2,1,1,1
chrX	153048657	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=263,145;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:0|1:153048651_C_T:153048651:1,1,1,0
chrX	153049345	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,3:1,5:1,2,1,8
chrX	153049354	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=230,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,1:2,6:2,2,1,6
chrX	153049389	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=214,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:2,3,4,1
chrX	153049739	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=224,113;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:3,1,2,3
chrX	153050157	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:153050157_AG_A:153050157:0,0,0,2
chrX	153050160	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:153050157_AG_A:153050157:0,0,0,2
chrX	153050162	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.763:2:0,0:0,2:0|1:153050157_AG_A:153050157:0,0,0,2
chrX	153050163	.	G	GTCCCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.763:2:0,0:0,2:0|1:153050157_AG_A:153050157:0,0,0,2
chrX	153052661	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chrX	153053422	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=306,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:2,2:1,1:3,0,0,4
chrX	153053698	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=269,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chrX	153055608	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=255,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:1,1,3,1
chrX	153055943	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,24;MFRL=134,252;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:0,0:0|1:153055943_A_C:153055943:1,2,2,0
chrX	153055949	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,19;MFRL=134,252;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:0,1:0|1:153055943_A_C:153055943:1,4,2,0
chrX	153055952	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=127,252;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,0:0|1:153055943_A_C:153055943:1,5,2,0
chrX	153055955	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,16;MFRL=127,252;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,0:0|1:153055943_A_C:153055943:1,5,2,0
chrX	153056311	.	C	CAG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=278,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AG;STR;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,0:2,2,5,1
chrX	153070999	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=261,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,5:2,2:1,1,3,4
chrX	153071153	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153071153_C_CT:153071153:0,0,0,1
chrX	153071155	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153071153_C_CT:153071153:0,0,0,1
chrX	153072107	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=129,307;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chrX	153073752	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=251,277;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chrX	153129556	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chrX	153131022	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=214,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:2,2,2,0
chrX	153131364	.	T	TGTAAGTGCAATCAAGGATCTGGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=246,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	153149118	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=137,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.763:5:0,0:0,4:1,0,3,1
chrX	153149708	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,9:0,2:0|1:153149708_G_GC:153149708:0,0,0,12
chrX	153149715	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0|1:153149708_G_GC:153149708:0,0,0,10
chrX	153150791	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=180,79;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:6,6:1,3:6,1,6,3
chrX	153170462	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=199,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:153170462_G_A:153170462:2,0,1,0
chrX	153170466	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,13;MFRL=199,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:153170462_G_A:153170462:2,0,1,0
chrX	153170980	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,3,4
chrX	153171623	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=173,55;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:3,2,2,0
chrX	153174819	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chrX	153174867	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=161,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:1,0,4,4
chrX	153175053	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chrX	153178459	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,3,6
chrX	153186484	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,5,5
chrX	153195393	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=185,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:3,0,3,1
chrX	153196345	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=260,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:3,7:1,3:1,3,2,8
chrX	153200020	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=234,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chrX	153200677	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,347;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	153207545	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=282,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chrX	153210179	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,1:0,0,0,4
chrX	153210195	.	G	GGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chrX	153215106	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,64;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:8,8,1,1
chrX	153216036	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=277,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,2:4,7:2,5,3,6
chrX	153216882	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=180,230;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,0:2,4:1,5,0,4
chrX	153218365	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=220,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,2,1
chrX	153219926	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=203,59;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:6,2:9,0:6,10,2,0
chrX	153220360	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chrX	153221814	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=239,234;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:2,5,0,2
chrX	153222835	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,5:0,5:0,1,7,3
chrX	153225634	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=214,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:2,2,1,1
chrX	153227770	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=189,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:3,4,1,6
chrX	153248248	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.782:24:0,15:4,4:2,3,10,9
chrX	153279830	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	153281633	.	G	GTTACAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chrX	153296853	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=209,280;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,2:8,1:7,5,2,1
chrX	153455674	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=322,313;MMQ=25,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:153455674_G_C:153455674:0,1,0,1
chrX	153455677	.	G	GCACCTGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=322,313;MMQ=25,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:153455674_G_C:153455674:0,1,0,1
chrX	153482563	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=197,204;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chrX	153588078	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=184,423;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:8,0:8,7,0,3
chrX	153588464	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=189,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:10,0:5,4:7,8,4,0
chrX	153592601	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=207,1372;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:6,1:0,1:2,4,2,0
chrX	153593066	.	GA	AG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=186,139;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,0:10,4:8,11,0,4
chrX	153633953	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chrX	153668022	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=66,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.814:10:1,5:0,2:1,1,5,3
chrX	153668172	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chrX	153690445	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=280,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:1,2,3,1
chrX	153698496	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=178,52;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:153698496_C_T:153698496:4,4,1,1
chrX	153698504	.	C	CTTG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=191,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.221:12:2,0:7,2:0|1:153698496_C_T:153698496:5,5,1,1
chrX	153698505	.	A	AGGAATCCCTGGATCC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=191,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.221:12:2,0:7,2:0|1:153698496_C_T:153698496:5,5,1,1
chrX	153735919	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	153744175	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,0:1,0:1,4,0,1
chrX	153906377	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=110,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.580:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chrX	154001559	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=13,25;MFRL=219,205;MMQ=40,50;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=T;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.615:3:0,1:0,0:0,1,1,1
chrX	154009592	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.308:14:5,1:2,1:5,5,2,2
chrX	154009617	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chrX	154009691	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=267,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:3,3,0,2
chrX	154013483	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chrX	154018367	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,18;MFRL=203,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0,4,0,1
chrX	154019323	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:12,0:4,2:9,7,0,2
chrX	154132090	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=225,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chrX	154225274	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,80;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:15,0:5,3:9,11,0,3
chrX	154300551	.	TCAAA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAAA;STR;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,3:7,0:6,6,2,1
chrX	154774663	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
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chrY	2655887	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=225,266;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:2655887_A_C:2655887:0,2,0,1
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chrY	6738163	.	G	GGGAGGAATGAGGGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=131,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrY	6932225	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:8,9,0,2
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chrY	6942729	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:6942725_CTCA_C:6942725:0,1,0,1
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chrY	14475392	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=149,0;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:14475389_G_A:14475389:0,1,1,0
chrY	14834192	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=195,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:14834192_CA_C:14834192:0,2,1,1
chrY	14834194	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=195,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:14834192_CA_C:14834192:0,2,1,1
chrY	14898094	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,2,2
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chrY	14958218	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,2,1
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chrY	15029495	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=184,189;MMQ=60,52;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.536:4:2,0:0,0:0,2,0,2
chrY	15467815	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,139;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=41.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.652:24:5,15:3,0:5,3,16,0
chrY	16942438	.	C	CCAAGTGTACTTTCCTTTCTTTCCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=107,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.421:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chrY	21154323	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=213,179;MMQ=58,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,4:1,5:1,0,9,0
chrY	21154569	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=195,127;MMQ=60,53;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.633:14:1,4:3,3:2,3,6,3
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chrY	21154706	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=226,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:21154703_C_CCTTATATA:21154703:0,1,0,1
chrY	21751588	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=212,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
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chrY	21870870	.	G	GAGCAACCACAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=175,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:3,3,1,1
chrY	21877660	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=181,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chrY	21897349	.	C	CTGAAG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.290:8:4,2:2,0:0|1:21897349_C_CTGAAG:21897349:2,4,1,1
chrY	21897352	.	A	AATAGTCACTTCCTAAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:4,1:2,0:0|1:21897349_C_CTGAAG:21897349:2,4,1,1
chrY	22751264	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chrY	22918579	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chrY	23545275	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=89,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,0:3,0,1,1
chrY	23545531	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=88,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:1,1,1,1